Jmol教材「窒素から見る生命の世界」の公開

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Jmol教材「窒素から見る生命の世界」の公開

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本間善夫（ecosci.jp）
日本コンピュータ化学会2014春季年会
（2014/05/29-30，東京工業大学大岡山キャンパス）
http://www.ecosci.jp/N/

◆ Jmol教材「窒素から見る生命の世界」
http://www.ecosci.jp/N/

◆ 窒素の循環と利用
http://www.ecosci.jp/N/
「視覚でとらえるフォトサイエンス化学図録」
（数研出版）
http://www.chart.co.jp/goods/item/
rika/5791.php

“水と油”で見る20種類のアミノ酸
アミノ酸
特性基 R hydropathy
極性 log P
酸性・
塩基性
極性・非極性 Cleftの分類等電点
O I I/O index
Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1....

◆ 生体分子中の窒素
http://www.ecosci.jp/N/
特別展「元素のふしぎ」 - 国立科学博物館
（2012/07/21-10/08）
http://www.kahaku.go.jp/exhibitions/
ueno/spec...

◆ 生体分子の構成元素例
このスライドに示した生体分子や
模型に含まれているのは以下の
元素だけです。

◆ 生命活動と生体を支える窒素
http://www.ecosci.jp/N/
http://www.rcsb.org/pdb/
education_discussion/ed
ucational_resources/mol-
mach-201...

◆“エネルギーの通貨”にも窒素が
http://www.ecosci.jp/N/
http://pdbj.org/mom?id=72

◆窒素固定を担うニトロゲナーゼ
http://www.ecosci.jp/N/
http://pdbj.org/mom?id=26
http://d.hatena.ne.jp/costep_
webteam/20070321
窒素固定 - Wi...

◆生物界で見られる4種類のテトラピロール
http://www.ecosci.jp/N/
●JAMSTEC公開PDF
『テトラピロールと地球環境』
https://www.jamstec.go.jp/
biogeos/j/elhrp/bioge...

http://www.ecosci.jp/N/
◆窒素は毒にも薬にも；「亀-C-C-N」構造
(-)-アドレナリンの受容体との結合
※参考文献：山川ほか「メディシナル
ケミストリー第5版」
●生田哲，「脳と心をあやつる物質」，講談社ブ
ルー...

◆窒素は毒にも薬にも；複素芳香族アミン
http://www.ecosci.jp/N/
http://www.huffingtonpost.jp/robust-
health/beer_b_5303896.html
複素芳香族アミンPhIPのD...

◆話題(1)：光エネルギーを化学エネルギーに
http://www.ecosci.jp/N/
光合成反応中心-集光アンテナタンパク質
複合体 PDBデータ3WMM
光化学系II
光化学系I
http://www.spring8.or.jp/ja...

◆話題(2)：鉄フタロシアニン結合PDBデータ
http://www.ecosci.jp/N/
鉄フタロシアニンが結合したヘム獲得タンパク質HasApほか
緑膿菌が分泌する鉄獲得タンパク質の
標的誤認識を利用する緑膿菌の増殖
阻害人工タンパク質...

◆話題(3)：エピジェネティクスとアザシチジン
http://www.ecosci.jp/N/

もひ
白芥子や時雨の花の咲つらん芭蕉
けしの花籬すべくもあらぬ哉蕪村
（中略）
話は飛ぶが、前にも言ったように、中国の伝説に出て来る蟇仙人に仕えている蟇は前足が二肢、後足が一肢という
変ったものだそうであるが、ちょうど虞美人草が虞美人の...

https://www.facebook.com/media/set/
?set=a.416653278358070.87786.1322
46190132115
◆生体分子となかよく !
https://www.googlesciencefa...

◆2012年ノーベル生理学医学賞；iPS細胞
http://pdbj.org/mom?id=112 http://www.asahi.com/news/intro/
TKY201210080380.html
http://stw.mext.g...

◆タンパク質の1次構造～4次構造
RCSB PDB
http://www.pdb.org/pdb/
http://www.youtube.com/watch?
v=qBRFIMcxZNM

◆タンパク質の1次構造～4次構造
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html

◆STEM教育って!?
http://diamond.jp/articles/-/50930
http://blogs.edweek.org/edweek/curriculum/2012/02/
president_obama_hosted_h...

◆3D分子を見よう！
PCでもスマホでもタブレットでも!!
Winmostar開発の分子ビューアで，
ecosci.jp提供の分子データを参照できます！
【試行中】Googleドライブと
Chem3D for iPadで分子
を見る！