生命の歴史を学ぶ生体分子モデル教材集

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生命の歴史を学ぶ生体分子モデル教材集

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本間善夫（ecosci.jp）
日本コンピュータ化学会2011春季年会＆10周年記念シンポジウム
（東京工業大学, 2010/06/16）
http://www.ecosci.jp/life/

1. はじめに
2011年3月11日に発生した東北地方太平洋沖地震により多くの尊い生命が失われ，無数
の悲しみが日本列島を覆ったばかりでなく，派生して起きた原子力発電所の事故とその
後の対応の遅れなどがあって放射線に脅えながら住み慣れた地を離れ...

◆ DNA修復／3.11東日本大震災を受けて
http://www.ecosci.jp/chem14/DNA_repair.html
損傷DNA修復酵素hOGG1／DNA複合体1ebm
http://www.mext.go.jp/
a_menu...

●生命の歴史を学ぶ生体分子モデル教材集
http://www.ecosci.jp/life/
DNAの脆弱性と強靭性
DNA修復
PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性｜金属原子を含む生体分子のSITEデータ集
古...

◆生命の誕生／物化生地
http://togetter.com/li/136859
画像：LS-EDI UT http://csls-db.c.u-tokyo.ac.jp/
※「生命の跳躍」ではp.152
生命の起源 – Wikipedia
※...

◆生命の誕生の場は？ (1)
「生命の跳躍」，p.393
それでも、ストロマトライトを構成する
青緑色の細菌「シアノバクテリア」は、
すでに微量だがその危険なガスを
大気に加えはじめていた。
国立科学博物館展示

◆生命の誕生の場は？ (2)／鉄硫黄クラスター
「生命の跳躍」，p.34
痕跡化した熱水孔と同様，顕微鏡サイズの小部屋の壁が
鉄硫黄化合物でできており，触媒の役目も果たしていた。
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4....

◆極限環境生物／チューブワーム
http://www.ecosci.jp/s/bm_tubeworm.html
http://en.wikipedia.org/wiki/
Lamellibrachia
※「極限環境生物学」ではp.96
チューブ...

◆光合成 (1)／光化学系I関連
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html
好熱性シアノバクテリアBP-1の光合成光化学系Iの構造3pcq
（鉄硫黄クラスター含む）

◆光合成 (2)／光化学系II関連
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html
光合成光化学系IIの構造例3arc
http://www.spring8.or.jp/ja/news_publications/
pre...

◆話題：不定形タンパク質(鍵と鍵穴以前)
http://www.ecosci.jp/s/idp.html
『しなやかなタンパク質』，日経サイエンス 2011年7月号
PDBデータ 1jsu（サイクリン依存性キナーゼ2〈A鎖〉／
サイクリンA〈B...

◆話題：地下生物圏，地球外生命
http://www.natureasia.com/japan/nature/
updates/index.php?i=83313
http://www.youtube.com/watch
?v=VNFDFGWH...