原子→分子→生体分子が湧き出すビッグ・ヒストリー（2016/07/29，江戸川大学）

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原子→分子→生体分子が湧き出すビッグ・ヒストリー（2016/07/29，江戸川大学）

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本間善夫（ecosci.jp / サイエンスカフェにいがた）
第4回江戸川大学サイエンスセミナー（2016/07/29）
http://www.ecosci.jp/BigHistory/

国立科学博物館展示
◆ビッグバンから元素の湧き出しへ
https://en.wikipedia.org/wiki/Chronology_of_the_universe
http://www.astro.ucla.edu/~wright/
BBN...

◆自然界の約90種類の元素はどうやってできた?
https://www.youtube.com/watch?v=rskUa_qGa8s
http://www.ecosci.jp/BigHistory/ 核図表（理研）から作成
http://ww...

◆ヒト，アート，科学・元素
https://school.bighistoryproject.com/media/khan/
articles/U7_Greco_Roman_2014_1270L.pdf
http://www.greece201...

◆無生物と生物｜結晶と非結晶

http://www.rcsb.org/pdb/101/static101.do?p=education_
discussion/educational_resources/
◆生体分子と生命の誕生
http://stw.mext.go.jp/...

「生命の跳躍」，p.393
それでも、ストロマトライトを構成する青緑色の細
菌「シアノバクテリア」は、すでに微量だがその危
険なガスを大気に加えはじめていた。
国立科学博物館展示
日本科学未来館展示
「生命の跳躍」，p.34
痕跡化した熱水孔と...

http://www.rcsb.org/pdb/101/static101.do?p=education_discussion/educational_resources/
◆湧き出す多彩な生体分子
http://www.ecosci.jp/

ヒト
約60兆個の細胞
“動物細胞には約1万種類，数にし
て約100億個のタンパク質分子が
存在し，…”
http://www.newtonpress.co.jp/
other/cell.html p.695
37

ゾウの時間ネズミの時間
◆ヘモグロビンはいろいろな生物に
マンモスのヘモグロビンハツカネズミのヘモグロビン
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html

◆ヘモグロビンで見る分子系統学
http://www.ecosci.jp/pdb/
hemoglobin_s.html
Genetics/生命の連続性 - データベース高度利用者養成
http://togodb.sel.is.ocha.ac.j...

◆生命を支えるエネルギーと元素
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html
●「見てわかる構造生命科学」（化学同人）
フルカラー図版・アニメー...

“水と油”で見る20種類のアミノ酸
アミノ酸
特性基 R hydropathy
極性 log P
酸性・
塩基性
極性・非極性 Cleftの分類等電点
O I I/O index
Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1....

◆タンパク質の1次構造～4次構造
http://www.chart.co.jp/software/
tab/ipad/sample.html
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
RCSB PDB...

◆画期的分子模型：
ウシロドプシンPDB 3PQR（GPCRの例）
http://www.ecosci.jp/pdb/km_3pqr.html
細胞の中と外を橋渡しする膜タンパク質
は多彩な働きを担っており，中でも
GPCR（Gタンパク質共役受...

◆画期的分子模型：
ヒトヘモグロビンPDB 2HHB（4量体）
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
高校化学・生物でタンパク質の1次構造
～4次構造を説明する際に，4次構造で
例示されるのが通例...

◆画期的分子模型：
光合成に関係するPDB 3ARCのA鎖
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps2.html
光合成光化学系IIに関与する巨大なタ
ンパク質の中にある光化学反応中心の
Mn4CaO5クラスターを含む1つの...

◆画期的分子模型：
Oct1/Sox2/DNA複合体PDB 1GT0
http://www.ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.html
DNAを含むデータとして選んだのが，
iPS細胞の山中4因子（Oct3/4・
Sox2・Klf4...

https://www.facebook.com/media/set/
?set=a.416653278358070.87786.1322
46190132115
◆生体分子となかよく !
http://pdb101.rcsb.org/
htt...

◆脳の発達を戦略としたヒトの誕生
- 脳の外部化としてのコンピュータと計算
科学
2013年ノーベル化学賞は計算化学分野
http://www.ecosci.jp/sccj_sa2013/
※2012年ノーベル化学賞はGPCR
http://w...

http://www.ecosci.jp/BigHistory/