原子→分子→生体分子が湧き出すビッグヒストリー（2015/11/03-06 日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ，日本科学未来館）

Deprecated: The each() function is deprecated. This message will be suppressed on further calls in /home/zhenxiangba/zhenxiangba.com/public_html/phproxy-improved-master/index.php on line 456
原子→分子→生体分子が湧き出すビッグヒストリー（2015/11/03-06 日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ，日本科学未来館）

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

Ad

本間善夫（ecosci.jp / サイエンスカフェにいがた）
日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ2016（2016/11/03-06）
http://www.ecosci.jp/sccj_sa2016/
http://www.ecosci...

◆近刊「ビッグヒストリー：われわれはどこか
ら来て、どこへ行くのか」（明石書店）
第1スレッショルドビッグバン：宇宙の起
源
第2スレッショルド恒星
第3スレッショルドより重い化学元素
第4スレッショルド恒星
第5スレッショルド生命の...

◆スレッショルド1 ビッグバン：宇宙
の起源
https://en.wikipedia.org/wiki/
Chronology_of_the_universe
http://www.astro.ucla.edu/~wright/
BBNS.h...

◆スレッショルド3 より重い化学元
素
https://www.youtube.com/
watch?v=rskUa_qGa8s
核図表（理研）から作成
http://www.rarf.riken.go.jp/enjoy/kakuzu/
htt...

◆スレッショルド3 より重い化学元
素
http://www.akashi.co.jp/book/b251054.html
http://www.akashi.co.jp/files/books/4421/4421_sample_p028-02...

http://www.rcsb.org/pdb/101/static101.do?p=education_
discussion/educational_resources/
http://stw.mext.go.jp/series.html
...

http://www.rcsb.org/pdb/101/static101.do?p=education_discussion/educational_resources/
http://www.ecosci.jp/
◆スレッショルド5 生命の...

http://www.rcsb.org/pdb/101/static101.do?p=education_discussion/educational_resources/
http://www.ecosci.jp/
◆スレッショルド5 生命の...

※生体分子の構造決定に用いる機器の例（X線回折法）
…日本コンピュータ化学会年会2007秋季年会で見学し
たSPring-8で撮影
タンパク質の1次構造から高次構造までを参照できるサイト例
http://themedicalbiochemist...

◆スレッショルド5 生命の誕生生物と無
生物「ビッグヒストリー」本 p.64“生命
とは?”
「ビッグヒストリー」本 p.76の『最
初の細胞はどこでどのように誕生した
のか？』にはブラックスモーカー。
http://www.ecosci.j...

「生命の跳躍」，p.393
それでも、ストロマトライトを構成する青緑色の細
菌「シアノバクテリア」は、すでに微量だがその危
険なガスを大気に加えはじめていた。
国立科学博物館展示
日本科学未来館展示
「生命の跳躍」，p.34
痕跡化した熱水孔と...

ゾウの時間ネズミの時間
◆ヘモグロビンはいろいろな生物に
マンモスのヘモグロビンハツカネズミのヘモグロビン
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html

◆ヘモグロビンで見る分子系統学
http://www.ecosci.jp/pdb/
hemoglobin_s.html
Genetics/生命の連続性 - データベース高度利用者養成
http://togodb.sel.is.ocha.ac.j...

◆生命を支えるエネルギーと元素
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html
●「見てわかる構造生命科学」（化学同人）
フルカラー図版・アニメー...

“水と油”で見る20種類のアミノ酸
アミノ酸
特性基 R hydropathy
極性 log P
酸性・
塩基性
極性・非極性 Cleftの分類等電点
O I I/O index
Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1....

◆スレッショルド8 現代社会／アントロポ
シーン
“分子”が社会で果たす役割「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペニシリン
なぜ高校「化学」で官能基を学ぶのか?
有機概念図簡易計算アプリ
http://www.ecosci.jp/ocd-...

◆スレッショルド8 現代社会／アントロポ
シーン
“分子”が社会で果たす役割 …“鍵と鍵穴”で見る「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペニシリン
抗生物質分子データ集
http://www.ecosci.jp/ab/ab_jmol.htm...

◆スレッショルド8 現代社会／アントロポ
シーン
“分子”が社会で果たす役割 …“鍵と鍵穴”で見る「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペニシリン
抗生物質分子データ集
http://www.ecosci.jp/ab/ab_jmol.htm...

◆画期的分子模型：
ウシロドプシンPDB 3PQR（GPCRの例）
http://www.ecosci.jp/pdb/km_3pqr.html
細胞の中と外を橋渡しする膜タンパク質
は多彩な働きを担っており，中でも
GPCR（Gタンパク質共役受...

◆画期的分子模型：
ヒトヘモグロビンPDB 2HHB（4量体）
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
高校化学・生物でタンパク質の1次構造
～4次構造を説明する際に，4次構造で
例示されるのが通例...

◆画期的分子模型：
光合成に関係するPDB 3ARCのA鎖
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps2.html
光合成光化学系IIに関与する巨大なタ
ンパク質の中にある光化学反応中心の
Mn4CaO5クラスターを含む1つの...

◆画期的分子模型：
Oct1/Sox2/DNA複合体PDB 1GT0
http://www.ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.html
DNAを含むデータとして選んだのが，
iPS細胞の山中4因子（Oct3/4・
Sox2・Klf4...

◆脳の発達を戦略としたヒトの誕生
- 脳の外部化としてのコンピュータと計算
科学
2013年ノーベル化学賞は計算化学分野
http://www.ecosci.jp/sccj_sa2013/
※2012年ノーベル化学賞はGPCR
http://w...

◆タンパク質の1次構造～4次構造
http://www.chart.co.jp/software/
tab/ipad/sample.html
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
RCSB PDB...