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Proposition de TER
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Génération aléatoire de séquences génomiques

Encadré par

Romain Rivière
romain.riviere@lri.fr
01 69 15 70 99

Alain Denise
alain.denise@lri.fr
01 69 15 63 69
 

Description

Il s'agit de développer un outil de génération aléatoire de mots, vérifiant certaines propriétés de comptage sur ses sous mots. Cette génération s'effectue en faisant appel à de l'algorithmique sur les graphes : arbres couvrants, chemins eulériens, recherche de stable maximum.

Un développement en Java est déjà existant. Des librairies de calcul sont fournis en C pour la résolution de certains problèmes connexes. Ce logiciel sera utilisé dans le cadre de recherche en bioinformatique, sur l'études des génomes en particulier.

Outils

Langage C