えーと、残ってた領域にMiracle入れたら、また同じことが (ええ加減しなさい)

http://www.miraclelinux.co.jp/products/product_info/readme.htm#notes_in

LILO について
　インストールの種類で [カステムシステム] 以外を選択した場合は、 MBR(Master Boot Record) に LILO(Linux Loader) がインストールされます。
　他の OS と混在(マルチブート)環境で、既にブートローダを MBR にインストールしてある場合には上書きされます。
　既存のブートローダを残したい場合には、インストールの種類で [カスタムシステム] を選択し、 必要なパッケージグループを選択してください。

はーい...