城ヶ峰と協力してイドを倒したヤシロ。印堂とセーラも残りのネフィリムを仕留め、パーティーの騒乱は幕を閉じた。しかし、戦いの最中に姿を消した《嵐の柩》卿はその後も消息不明。イシノオを殺すよう指示した黒幕の正体も、依然としてわからないままだ。
戦闘終結後、城ヶ峰の身に起きた驚愕の事態は新たな謎を生んだ。ヤシロの師匠・鷹宮清人は娘に何をしたのか。印堂の過去も明らかになり、物語は次のステージへ。

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印堂をかばって重傷を負ったヤシロは、弟子たちを指揮して連携プレーを取らせる。それぞれの欠点を補い合い、特性を活かす戦闘スタイルで、着実にネフィリムを倒していく3人。そんな中、満身創痍のヤシロに一体のネフィリムが襲いかかろうとする。ネフィリムを操るイドとレヴィも登場し、勇者一行の戦いはいよいよ佳境へーー！

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《嵐の柩》卿配下の黒服と対峙しながら、弟子3人に剣技の基本を教えるヤシロ。城ヶ峰・印堂・セーラはそれぞれ黒服の制圧を試みるが、あくまで敵を殺したくない城ヶ峰は苦戦を強いられる。必死に戦う彼女たちの前に、《嵐の柩》卿が姿を現した。ヤシロは《ハーフ・ドラゴン》の情報を引き出そうとするが、人型の異形が突如乱入し、状況は混沌を極めていく。

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ヤシロはイシノオが遺した最期のメッセージから、城ヶ峰・印堂・セーラの背後には《ハーフ・ドラゴン》につながる何かがあると直感する。BARグーニーズにやって来た城ヶ峰と印堂から、新たな特訓をせがまれたヤシロは、ある計画を思いつく。後日、弟子3人をともなったヤシロは、東京西部で最強とうたわれる大魔王《嵐の柩》卿のパーティー会場へと乗り込むのだった。

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イシノオの死に衝撃を受ける勇者たち。イドとレヴィがつけていた『割れた竜の顔』のバッジ、それは魔王同士の抗争を狙っている謎の組織《ハーフ・ドラゴン》のものだった。イシノオ殺害の黒幕の手がかりを求めて、文部科学省の魔王災害対策分室へ向かったヤシロは、とある政治家の息子に高額の賞金が懸けられていることを知る。その息子とは、数ヶ月前に戦った《諸手の楔》卿の部下で……。

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E3によって異様な力を発揮するイド。虎の子のバスタードソードを欠いた状態で応戦するヤシロは、訓練用の模造刀で必殺技を仕掛ける。気まぐれに城ヶ峰へ技の解説をしたことをきっかけに、彼女の父親とヤシロの意外な因縁が明らかになる。
不愉快な思い出を振り払うように、ヤシロはBARグーニーズへ戻るが……。

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城ヶ峰・印堂・セーラが通うアカデミーで、剣を使った実技試験が行われることになった。3人にとって実技試験は、進級か退学かを左右する重要なイベントである。ヤシロは自称「弟子」たちに稽古をつけるべく、夜のアカデミー校舎で特訓を開始する。激しい攻防を繰り広げながらも、的確に3人の欠点を指摘するヤシロ。ところが、そこで思わぬ敵と遭遇することになり……。

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ヤシロはセーラから、アカデミーの単位取得に必要な奉仕活動の監督役になってほしいと頼まれる。その奉仕活動とは、不審な集団に連れ去られた警察犬探し。行きがかり上、仕方なく捜索に付き合うことになったヤシロは、セーラと共に廃墟化したショッピングモールへ向かう。暗い建物内を進む2人を待ち受けていたのは、無数に光る目だった。

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イシノオの依頼で、いやいやながらも城ヶ峰の護衛を引き受けたヤシロ。彼女と新宿歌舞伎町のクラブに潜入して、《覗き屋》のマツギからE3を受け取り、「ある質問」をして帰るだけのはずだったが、E3を投与した男たちが少女2人を連れ込もうとしているところに遭遇し、またしても城ヶ峰の暴走が始まる！

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BARグーニーズでカードゲームに興じるヤシロのもとに、城ヶ峰・印堂・セーラが押しかけてくる。アカデミーで落第寸前の自分たちを「師匠」として指導してほしいというのだ。面倒なことに関わりたくないヤシロは3人を追い返すが、なおも諦めきれない印堂はヤシロを待ち伏せする。そんな時、ヤシロを付け狙う大魔王の眷属《諸手の楔》卿が襲いかかってきて……。

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魔王の人質になったセーラを救出するため、渋谷にある《琥珀の茨》卿の根城に向かうヤシロと城ヶ峰。次々と現れる敵を前に、ヤシロの異能が明らかになる。最奥の間にたどり着いたヤシロたちは、ついに《琥珀の茨》卿と対峙。しかし、予想外の出来事が起こり、ヤシロは絶体絶命のピンチに立たされる。その時、城ヶ峰がとった行動はーー。

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フリーランスの勇者《死神》ヤシロは、街のチンピラから勇者見習いの女子高生・城ヶ峰を助ける。行きつけのバーで飲んでいたヤシロのもとへ、先ほど助けた城ヶ峰とその同級生の印堂がやってくる。
城ヶ峰の話を聞くと、魔王《琥珀の茨》卿に連れ去られた友人を助けて欲しいと懇願される。