他のLinuxディストリビューションと異なる点の一つが、インストールやアップグレードに際してローカルでソフトウェアをコンパイルすることである。その際、ユーザーはUSEフラグを使って比較的簡単にコンパイルオプションを調整し、環境へ最適化することができる。ただし、Mozilla FirefoxやLibreOfficeなど一部のソフトウェアでは、導入時間の短縮などを目的として、予めコンパイルされたソフトウェアを導入することもできる。 また、推奨されているインストール方法も特徴的である。インストールメディアでシステムを起動し、最低限必要なパッケージをダウンロードし、Portageを使ってシステムを構築していく、というものである。 Gentoo Linuxはその「無限に近い適応性」のために、メタディストリビューションと説明されることもある[5]。Portage のカスタマイズ性の高さから、Chrom