Deprecated: The each() function is deprecated. This message will be suppressed on further calls in /home/zhenxiangba/zhenxiangba.com/public_html/phproxy-improved-master/index.php on line 456
RS64122B1 - Kristalni oblik (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata - Google Patents
[go: Go Back, main page]

RS64122B1 - Kristalni oblik (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata - Google Patents

Kristalni oblik (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata

Info

Publication number
RS64122B1
RS64122B1 RS20230253A RSP20230253A RS64122B1 RS 64122 B1 RS64122 B1 RS 64122B1 RS 20230253 A RS20230253 A RS 20230253A RS P20230253 A RSP20230253 A RS P20230253A RS 64122 B1 RS64122 B1 RS 64122B1
Authority
RS
Serbia
Prior art keywords
crystalline form
trka
trk
cancer
pain
Prior art date
Application number
RS20230253A
Other languages
English (en)
Inventor
Alisha B Arrigo
Derrick Juengst
Khalid Shah
Original Assignee
Array Biopharma Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=54848892&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RS64122(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Array Biopharma Inc filed Critical Array Biopharma Inc
Publication of RS64122B1 publication Critical patent/RS64122B1/sr

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/04—Centrally acting analgesics, e.g. opioids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D487/00—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04—Ortho-condensed systems
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/48—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving transferase
    • C12Q1/485—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving transferase involving kinase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/10—Protein-tyrosine kinases (2.7.10)
    • C12Y207/10001—Receptor protein-tyrosine kinase (2.7.10.1)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07B—GENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
    • C07B2200/00—Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
    • C07B2200/13—Crystalline forms, e.g. polymorphs
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/91—Transferases (2.)
    • G01N2333/912—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • G01N2333/91205—Phosphotransferases in general
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Psychiatry (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)

Description

Opis
UNAKRSNA POVEZANOST SA SRODNIM PRIJAVAMA
[0001] Ova prijava zahteva pravo prvenstva od SAD privremene prijave serijskog br.
62/080,374, podnete 16. novembra 2014. i 62/169,545, podnete 1. juna 2015. godine.
OSNOV
1. OBLAST PRONALASKA
[0002] Predmetni navodi se odnose na (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid (Formula I) i na njegove farmaceutski prihvatljive soli, na primer so hidrogensulfata, i dalje na novi kristalni oblik soli hidrogensulfata, koji ispoljava inhibiciju protein tirozin kinaze Trk familije, farmaceutske kompozicije koje ih sadrže, postupke za pravljenje kristalnog oblika, i na upotrebu jedinjenja i kristalnog oblika u lečenju bola, upale, kancera i određenih infektivnih bolesti. Pozivanje na postupke za lečenje u ovom opisu treba razumeti kao pozivanje na jedinjenje za upotrebu u postupku za lečenje ljudskog (ili životinjskog) tela terapijom."
2. OPIS STANJA TEHNIKE
[0003] Trk su visokoafinitetne receptorske tirozin kinaze koje aktivira grupa rastvorljivih faktora rasta nazvanih neurotrofini (NT). Familija Trk receptora ima tri člana - TrkA, TrkB i TrkC. Među neurotrofinima su (i) faktor rasta nerava (NGF) koji aktivira TrkA, (ii) neurotrofni faktor poreklom iz mozga (BDNF) i NT-4/5 koji aktivira TrkB i (iii) NT3 koji aktivira TrkC. Trk su široko rasprostranjeni u nervnom tkivu i uključeni u održavanje, signalizaciju i preživljavane nervnih ćelija (Patapoutian, A. et al., Current Opinion in Neurobiology, 2001, 11, 272-280).
[0004] Novija literatura je pokazala da su prekomerna ekspresija, aktivacija, amplifikacija i/ili mutacija Trk povezane sa mnogim kancerima uključujući neuroblastom (Brodeur, G. M., Nat. Rev. Cancer 2003, 3, 203-216), kancer jajnika (Davidson., B. et al., Clin. Cancer Res. 2003, 9, 2248-2259), kancer dojke (Kruettgen et al., Brain Pathology 2006, 16: 304-310), kancer prostate (Dionne et al., Clin. Cancer Res. 1998, 4(8): 1887-1898), kancer pankreasa (Dang et al., Journal of Gastroenterology and Hepatology 2006, 21(5): 850-858), multipli mijelom (Hu et al., Cancer Genetics and Cytogenetics 2007, 178: 1-10), astrocitom i meduloblastom (Kruettgen et al., Brain Pathology 2006, 16: 304-310), gliom (Hansen et al., Journal of Neurochemistry 2007, 103: 259-275), melanom<25>, tiroidni karcinom (Brzezianska et al., Neuroendocrinology Letters 2007, 28(3), 221-229), adenokarcinom pluća (Perez-Pinera et al., Molecular and Cellular Biochemistry 2007, 295(1&2), 19-26), krupnoćelijske neuroendokrine tumore<19>(Marchetti et al., Human Mutation 2008, 29(5), 609-616) i kolorektalni kancer (Bardelli, A., Science 2003, 300, 949). U predkliničkim modelima kancera, inhibitori Trk su efikasni i u inhibiranju rasta tumora i u zaustavljanju metastaze tumora. Konkretno, neselektivni inhibitori malog molekula TrkA, TrkB, TrkC i Trk/Fc himera bili su efikasni i u inhibiranju rasta tumora i u zaustavljanju metastaze tumora<25>(Nakagawara, A. (2001) Cancer Letters 169:107-114; Meyer, J. et al. (2007) Leukemia, 1-10; Pierottia, M.A. and Greco A., (2006) Cancer Letters 232:90-98; Eric Adriaenssens, E. et al. CancerRes (2008) 68:(2) 346-351). Stoga, očekuje se da inhibitor Trk familije kinaza bude koristan u lečenju kancera.
[0005] Pored toga, pokazano je da su inhibitori puta Trk/neurotrofin efikasni u brojnim predkliničkim životinjskim modelima bola. Na primer, pokazano je da su antagonistički NGF i TrkA-antitela (na primer, RN-624) efikasna u životinjskim modelima upalnog i neuropatskog bola i kliničkim studijama na ljudima (Woolf, C.J. et al. (1994) Neuroscience 62,327-331; Zahn, P.K. et al. (2004) J. Pain 5, 157-163; McMahon, S. B. et al., (1995) Nat. Med. 1, 774-780; Ma, Q. P. and Woolf, C. J. (1997) Neuroreport 8, 807-810; Shelton, D. L. et al. (2005) Pain 116, 8-16; Delafoy, L. et al. (2003) Pain 105, 489-497; Lamb, K. et al. (2003) Neurogastroenterol. Motil. 15, 355-361; Jaggar, S. I. et al. (1999) Br. J. Anaesth. 83, 442-448). Dodatno, novija literatura ukazuje na to da su nakon upale, nivoi BDNF i TrkB signalizacija povećani u gangliji dorzalnog korena (Cho, L. et al. Brain Research 1997, 749, 358) i nekoliko studija je pokazalo da antitela koja snižavaju signalizaciju putem BDNF/TrkB inhibiraju neuralnu hipersensitizaciju i povezani bol (Chang-Qi, L et al. Molecular Pain 2008, 4:27).
[0006] Pokazano je da NGF koji izlučuju tumorske ćelije i makrofagi koji invadiraju tumor direktno stimuliše TrkA smešten na perifernim vlaknima za bol. Upotrebom različitih modela tumora kod miševa i pacova pokazano je da neutralizacija NGF monoklonskim antitelom inhibira bol povezan sa kancerom do stepena sličnog, ili većeg od najveće tolerisane doze morfina. Pored toga, aktivacija puta BDNF/TrkB bila je uključena u brojne studije kao modulator različitih vrsta bola uključujući upalni bol (Matayoshi, S., J. Physiol. 2005, 569:685-95), neuropatski bol (Thompson, S.W., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96:7714-18) i hirurški bol (Li, C.-Q. et al., Molecular Pain, 2008, 4(28), 1-11). Budući da TrkA i TrkB kinaze mogu da predstavljaju medijator bioloških odgovora koje pokreće NGF, inhibitori TrkA i/ili drugih Trk kinaza mogu da obezbede efikasnu terapiju za stanja hroničnog bola.
[0007] Sadašnji terapijski režimi za bolna stanja koriste nekoliko klasa jedinjenja. Opioidi (kao morfin) imaju nekoliko nedostataka uključujući povraćanje, konstipaciju i negativne respiratorne efekte, kao i potencijal za zavisnost. Nesteroidni antiinflamatorni analgetici (NSAID, kao tip COX-1 ili COX-2) takođe imaju nedostatke, uključujući nedovoljnu efikasnost u lečenju jakog bola. Pored toga, COX-1 inhibitori mogu da izazovu ulceracije sluzokože. Shodno tome, postoji stalna potreba za novim i efikasnijim terapijama za ublažavanje bola, posebno hroničnog bola.
[0008] Pored toga, pokazano je da je inhibicija puta neurotrofin/Trk efikasna u terapiji u predkliničkim modelima upalnih bolesti. Na primer, inhibicija puta neurotrofin/Trk uključena je u predkliničke modele upalnih bolesti pluća, uključujući astmu (Freund-Michel, V; Frossard, N.; Pharmacology & Therapeutics (2008), 117(1), 52-76), intersticijalnog cistitisa (Hu Vivian Y; et. al. The Journal of Urology (2005), 173(3), 1016-21), upalnih bolesti creva, uključujući ulcerozni kolitis i Kronovu bolest (Di Mola, F. F, et. al., Gut (2000), 46(5), 670-678) i upalnih bolesti kože kao atopijski dermatitis (Dou, Y.-C.; et. al. Archives of Dermatological Research (2006), 298(1), 31-37), ekcem i psorijaza (Raychaudhuri, S. P.; et. al. Journal of Investigative Dermatology (2004), 122(3), 812-819).
[0009] Signalni put neurotrofin/Trk, posebno BDNF/TrkB, takođe je uključen u etiologiju neurodegenerativnih bolesti uključujući multiplu sklerozu, Parkinsonovu bolest i Alchajmerovu bolest (Sohrabji, Farida; Lewis, Danielle K. Frontiers in Neuroendocrinology (2006), 27(4), 404-414). Modulacija puta neutrofin/Trk može da bude korisna u lečenju ovih i srodnih bolesti.
[0010] Takođe se smatra da je TrkA receptor od ključnog značaja za proces oboljevanja u infekciji parazitom Trypanosoma cruzi (Šagasova bolest) kod ljudi (de Melo-Jorge, M. et al. Cell Host & Microbe (2007), 1(4), 251-261). Prema tome, inhibicija TrkA može da bude korisna u lečenju Šagasove bolesti i srodnih infekcija protozoama.
[0011] Inhibitori Trk mogu da budu korisni i u lečenju bolesti povezanih sa neravnotežom u regulaciji koštanog remodelovanja, kao što je osteoporoza, reumatoidni artritis i metastaze na kostima. Metastaze na kostima su česta komplikacija kancera, i javljaju se kod do 70 procenata pacijenata sa uznapredovalim kancerom dojke ili prostate(1) i kod približno 15 do 30 procenata pacijenata sa karcinomom pluća, debelog creva, želuca, bešike, materice, rektuma, tiroidee ili bubrega. Osteolitičke metastaze mogu da izazovu jak bol, patološke frakture, životno ugrožavajuću hiperkalcemiju, kompresiju kičmene moždine i druge sindrome kompresije nerava. Iz ovih razloga, metastaze na kostima su ozbiljna i skupa komplikacija kancera. Zbog toga bi agensi koji mogu da indukuju apoptozu proliferirajućih osteoblasta bili veoma korisni.
Ekspresija TrkA i TrkC receptora je zapažena u oblasti formiranja kosti u mišjim modelima frakture kosti (K. Asaumi, et al., Bone (2000) 26(6) 625-633). Pored toga, lokalizacija NGF je zapažena u gotovo svim ćelijama koje formiraju kost (K. Asaumi, et al.). Nedavno je pokazano da pan-Trk inhibitor inhibira tirozinsku signalizaciju aktivivranu neurotrofinima koji se vezuju za sva tri Trk receptora u humanim hFOB osteoblastima (J. Pinski, et al., (2002) 62, 986-989). Ovi podaci podržavaju upotrebu inhibitora Trk u lečenju bolesti koštanog remodelovanja, kao što su metastaze na kostima kod pacijenata sa kancerom.
[0012] Poznato je nekoliko klasa inhibitora malog molekula Trk kinaza za koje se navodi da su korisni u lečenju bola ili kancera (Expert Opin. Ther. Patents (2009) 19(3)).
[0013] Objave međunarodne patentne prijave WO 2006/115452 i WO 2006/087538 opisuju nekoliko klasa malih molekula za koje se navodi da su inhibitori Trk kinaza koji bi mogli da budu korisni u lečenju bola ili kancera.
[0014] Poznata su pirazolo[1,5-a]pirimidinska jedinjenja. Na primer, objava međunarodne patentne prijave WO 2008/037477 opisuje pirazolo[1,5-a]pirimidinska jedinjenja koja na poziciji 3 imaju alkil, aril ili heterocikličnu grupu. Za ova jedinjenja se tvrdi da su inhibitori PI3K i/ili mTOR lipidne kinaze.
[0015] PCT patentna objava br. WO 2008/058126 opisuje pirazolo[1,5-a]pirimidinska jedinjenja koja na poziciji 3 imaju fenil grupu. Za ova jedinjenja se tvrdi da su inhibitori Pim-kinaze.
[0016] SAD patentna objava br. 2006/0094699 opisuje pirazolo[1,5-a]pirimidinska jedinjenja koja na poziciji 3 imaju -C(=O)NH-fenil, -C(=O)(4-metilpiperidinil) ili -C(=O)NMe(CH2-trimetilpirazolil) grupu za upotrebu u kombinovanoj terapiji sa agonistom glukokortikoidnog receptora.
[0017] PCT patentne objave br. WO 2010/033941, WO 2010/048314, WO 2011/006074 i WO 2011/146336 opisuju jedinjenja koja ispoljavaju inhibiciju protein tirozin kinaze Trk familije, i koja su korisna u lečenju bola, kancera, upale, neurodegenerativnih bolesti i određenih infektivnih bolesti.
[0018] WO 2010/048314 opisuje u primeru 14A so hidrogensulfata (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida. WO 2010/048314 ne opisuje konkretan oblik ovde opisane soli hidrogensulfata kada se pripremi prema postupku iz primera 14A u tom dokumentu. Konkretno, WO 2010/048314 ne opisuje kristalni oblik (I-HS) kao što je opisan u nastavku dokumenta.
REZIME
[0019] Pronalazak je definisan priloženim patentnim zahtevima. Bilo kakvi navodi koje ne spadaju u obim priloženih patentnih zahteva ne čine deo pronalaska.
[0020] Predmetni navodi se odnose na (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin- 3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid (Formula I) i na njegove farmaceutski prihvatljive soli, na primer so hidrogensulfata, i dalje na novi kristalni oblik soli hidrogensulfata, koji ispoljava inhibiciju protein tirozin kinaze Trk familije, farmaceutske kompozicije koje ih sadrže, postupke za pravljenje kristalnog oblika, i na upotrebu jedinjenja i kristalnog oblika u lečenju bola, upale, kancera i određenih infektivnih bolesti.
[0021] Ovde je obezbeđen novi kristalni oblik jedinjenja formule I:
poznatog i kao (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin- 1-karboksamid. Konkretno, novi kristalni oblik sadrži so hidrogensulfata jedinjenja formule I u stabilnom polimorfnom obliku, u nastavku teksta označen kao kristalni oblik (I-HS) i LOXO-101, koji može da se okarakteriše, na primer, svojim obrascem rendgenske kristalografije - kristalni oblik (I-HS) koji ima formulu:
[0022] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 18.4±0.2, 20.7±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 10.7±0.2, 18.4±0.2, 20.7±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 10.7±0.2, 18.4±0.2, 19.2±0.2, 20.2±0.2, 20.7±0.2, 21.5±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 10.7±0.2, 15.3±0.2, 16.5±0.2, 18.4±0.2, 19.2±0.2, 19.9±0.2, 20.2±0.2, 20.7±0.2, 21.5±0.2, 22.1±0.2, 23.1±0.2, 24.0±0.2. 24.4±0.2, 25.6±0.2, 26.5±0.2, 27.6±0.2, 28.2±0.2, 28.7±0.2, 30.8±0.2 i 38.5±0.2.
[0023] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD suštinski kao što je prikazano na slici 29.
[0024] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik pokazuje početak do maksimuma od oko 193 do oko 205 ° Celzijusa, mereno diferencijalnom skenirajućom kalorimetrijom. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) pokazuje toplotu topljenja od oko 2415 mW, mereno diferencijalnom skenirajućom kalorimetrijom. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima DSC termogram suštinski kao što je prikazano na slici 26. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I- HS) je nehigroskopan.
[0025] Neki primeri izvođenja uključuju farmaceutsku kompoziciju koja sadrži farmaceutski prihvatljiv nosač i kristalni oblik (I-HS). Neki primeri izvođenja uključuju farmaceutsku kompoziciju napravljenu mešanjem kristalnog oblika (I-HS) i farmaceutski prihvatljivog nosača. Neki primeri izvođenja uključuju postupak za pravljenje farmaceutske kompozicije koji obuhvata mešanje kristalnog oblika (I-HS) i farmaceutski prihvatljivog nosača.
[0026] Predmetni navodi se takođe odnose na postupke za lečenje kancera, bola, upale i određenih infektivnih bolesti koji obuhvataju davanje subjektu kome je to potrebno terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS). Neki primeri izvođenja uključuju upotrebu kristalnog oblika (I-HS) u pripremi leka za lečenje kancera, bola, upale i određenih infektivnih bolesti, kod subjekta kome je to potrebno.
[0027] Ovde je obezbeđen i postupak za lečenje kancera posredovanog Trk kinazom kod subjekta kome je to potrebno, gde postupak obuhvata davanje subjektu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS). U nekim primerima izvođenja, kancer je posredovan kinazom Trk; TrkB; ili TrkA i TrkB. U nekim primerima izvođenja, pacijentu je dijagnostikovan, ili je identifikovano da ima, kancer povezan sa Trk.
[0028] Dalje je ovde obezbeđen postupak za lečenje kancera kod subjekta kome je to potrebno, gde postupak obuhvata: (a) određivanje da li je kancer povezan sa jednim ili više od prekomerne ekspresije, aktivacije, amplifikacije i mutacije Trk kinaze; i (b) ako se utvrdi da je kancer povezan sa jednim ili više od prekomerne ekspresije, aktivacije, amplifikacije i mutacije Trk kinaze, davanje subjektu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS). U nekim primerima izvođenja, obezbeđen je postupak za lečenje kancera kod subjekta kome je to potrebno, gde postupak obuhvata: (a) određivanje da li je kancer posredovan Trk kinazom; i (b) ako se utvrdi da je kancer posredovan Trk kinazom, davanje subjektu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS). Ovde je obezbeđen i postupak za lečenje subjekta koji obuhvata: (a) izvođenje testa na uzorku uzetom od subjekta kako bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili nivoa; i (b) davanje terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) subjektu za koga je utvrđeno da ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa.
[0029] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili nivoa je hromozomska translacija koja rezultuje translacijom fuzionog proteina Trk. Na primer, fuzioni protein Trk je izabran iz grupe koja se sastoji od: TP53-TrkA, LMNA-TrkA, CD74-TrkA, TFG-TrkA, TPM3-TrkA, NFASC-TrkA, BCAN-TrkA, MPRIP-TrkA, TPR-TrkA, RFWD2-TrkA, IRF2BP2-TrkA, SQSTM1-TrkA, SSBP2-TrkA, RABGAP1L-TrkA, C18ORF8-TrkA, RNF213-TrkA, TBC1D22A-TrkA, C20ORF112-TrkA, DNER-TrkA, ARHGEF2-TrkA, CHTOP-TrkA, PPL-TrkA, PLEKHA6-TrkA, PEAR1-TrkA, MRPL24-TrkA, MDM4-TrkA, LRRC71-TrkA, GRIPAP1-TrkA, EPS15-TrkA, DYNC2H1-TrkA, CEL-TrkA, EPHB2-TrkA, TGF-TrkA, NACC2-TrkB, QKI-TrkB, AFAP1-TrkB, PAN3-TrkB, SQSTM1- TrkB, TRIM24-TrkB, VCL-TrkB, AGBL4-TrkB, DAB2IP-TrkB, ETV6-TrkC, BTBD1-TrkC, LYN-TrkC, RBPMS-TrkC, EML4-TrkC, HOMER2-TrkC, TFG-TrkC, FAT1-TrkC i TEL-TrkC.
[0030] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti je jedna ili više tačkastih mutacija u genu. Na primer, gen NTRK je gen NTRK1, i jedna ili više tačkastih mutacija u genu NTRK1 rezultuje translacijom TrkA proteina koji ima supstitucije na jednoj ili više od sledećih aminokiselinskih pozicija: 33, 336, 337, 324, 420, 444, 517, 538, 649, 682, 683, 702 i 1879. U nekim primerima izvođenja, jedna ili više tačkastih mutacija u genu NTRK1 rezultuje translacijom TrkA proteina koji ima jednu ili više aminokiselinskih supstitucija: R33W, A336E, A337T, R324Q, R324W, V420M, R444Q, R444W, G517R, G517V, K538A, R649W, R649L, R682S, V683G, R702C i C1879T.
[0031] Karakteristike i prednosti opisane u ovom rezimeu i detaljnom opisu koji sledi nisu sveobuhvatne. Mnoge dodatne karakteristike i prednosti biće očigledne stručnjaku u ovoj oblasti imajući u vidu crteže, specifikaciju i patentne zahteve ovog dokumenta.
KRATAK OPIS CRTEŽA
[0032]
SL. 1 ilustruje obrazac rendgenske difrakcije praha (XRPD) kristalnog oblika (I-HS) pripremljenog prema primeru 2, prema jednom primeru izvođenja.
SL. 2 ilustruje istovremeni profil termogravimetrijskog/diferencijalnog termalnog analizatora (TG/DTA) kristalnog oblika (I-HS) pripremljenog prema primeru 2, prema jednom primeru izvođenja.
SL. 3 ilustruje profil dobijen diferencijalnom skenirajućom kalorimetrijom (DSC) kristalnog oblika (I-HS) pripremljenog prema primeru 2, prema jednom primeru izvođenja.
FIGS. 4A i 4B ilustruju snimke polarizovane svetlosne mikroskopije (PLM) kristalnog oblika (I-HS) pripremljenog prema primeru 2 pod (A) nepolarizovanom i (B) polarizovanom svetlošću, prema nekim primerima izvođenja.
SL. 5 ilustruje izotermni profil dobijen dinamičkom sorpcijom pare (DVS) kristalnog oblika (I-HS) pripremljenog prema primeru 2, prema jednom primeru izvođenja.
SL. 6 ilustruje profil dobijen infracrvenom spektroskopijom (IR) kristalnog oblika (I-HS) pripremljenog prema primeru 2, prema jednom primeru izvođenja.
SL. 7 ilustruje obrazac XRPD amorfnog oblika slobodne baze jedinjenja formule I, prema jednom primeru izvođenja.
SL. 8 je grafikon koji pokazuje dozno-zavisnu inhibiciju proliferacije ćelija CUTO-3F adenokarcinoma pluća koje sadrže fuzioni protein MPRIP-NTRK1 upotrebom kristalnog oblika (I-HS).
SL. 9 je grafikon koji pokazuje dozno-zavisnu inhibiciju proliferacije ćelija KM12 kolorektalnog kancera koje sadrže fuzioni protein TPM3-NTRK1 upotrebom kristalnog oblika (I-HS).
SL. 10 je grafikon koji pokazuje dozno-zavisnu inhibiciju proliferacije ćelija MO-91 akutne mijeloidne leukemije koje sadrže fuzioni protein ETV6-NTRK3 upotrebom kristalnog oblika (I-HS).
SL. 11 je imunoblot koji pokazuje da kristalni oblik (I-HS) inhibira aktivaciju MPRIP-TRKA kinaze, ERK1/2 u ćelijama CUTO-3F, i aktivnost AKT u ćelijama KM12. Ćelije su tretirane 2 časa kristalnim oblikom (I-HS) u naznačenim dozama.
SL. 12 je imunoblot koji pokazuje da kristalni oblik (I-HS) inhibira aktivaciju TPM3-TRKA kinaze, i nishodno reguliše aktivnost ERK1/2 i AKT u ćelijama KM12. Ćelije su tretirane 2 časa kristalnim oblikom (I-HS) u naznačenim dozama.
SL. 13 je imunoblot koji pokazuje da kristalni oblik (I-HS) inhibira aktivnost TEL-TRKC kinaze i ERK1/2 i AKT u ćelijama MO-91. Ćelije su tretirane 2 časa kristalnim oblikom (I-HS) u naznačenim dozama.
SL. 14 je šematski prikaz genske fuzije LMNA-NTRK1 identifikovane u uzorku tumora uzetom od pacijenta: spoj prva dva egzona LMNA (NM_170707) sa egzonom 11-17 u NTRK1 (NM_002529).
SL. 15 je fluorescentna mikrografija FISH analize odvajanja (break apart) NTRK1, koja je pokazala da i upareni zeleni (5’ NTRK1) i crveni (3’ NTRK1) signali odgovaraju normalnom genu (žuta strelica), a izdvojeni crveni signali (crvene strelice) su zapaženi u jedrima tumora (obojena plavo sa DAPI) ukazujući na hromozomsku deleciju koja dovodi do fuzije gena NTRK1.
SL. 16 je hromatograf sekvenciranja DNK proizvoda RT-PCR analize upotrebom prajmera LMNA (5’) i NTRK1 (3’) koji prikazuje tačku prekida fuzije između egzona 2 LMNA i egzona 11 u NTRK1.
SL. 17 je šematski prikaz testa ligacije usled blizine (proximity ligation assay - PLA) TRK-SHC1. Ovaj crtež prikazuje detekciju proksimalnih proteina (< 40 nM) TRK i SHC1 u tumorskim ćelijama. Upotrebljeno antitelo protiv TRK (zečje) može da detektuje c-kraj TRKA (kodiran pomoću NTRK1), TRKB (NTRK2), ili TRKC (NTRK3) proteina. SHC1 se detektuje pomoću antitela protiv SHC1 (mišje). Vezivanje sekundarnih antitela specifičnih za vrstu sa kovalentno vezanim komplementarnim nukleotidnim sekvencama omogućava in situ PCR reakciju za stvaranje DNK, koja može da se detektuje fluorescentnom in situ hibridizacijom koja se u postupku vizualizuje kao crvene tačke. Test ima potencijal da detektuje aktiviranu TRK bez obzira na mehanizam aktivacije (genska fuzija, mutacija, ili autokrina/parakrina aktivacija divljeg tipa) člana familije TRK receptora (TRKA/B/C).
SL. 18 je skup podataka koji validiraju PLA analizu TRK-SHC1. (A) Ćelijska linija CUTO-3, poreklom iz malignog pleuralnog izliva od pacijenta sa adenokarcinomom pluća IV stadijuma koji sadrži fuziju gena MPRIP-NTRK1, transfektovana je pomoću neusmerene kontrolne (NTC) siRNA, siRNA usmerene na NTRK1, ili je netretirana (kontrolna) i testirana je na ekspresiju TRKA proteina. Western blot analiza pokazuje značajno smanjenje nivoa proteina TRKA, i odgovara fuzionom proteinu MPRIP-TRKA, koji migrira sa prividnom molekulskom težinom od 170 kD. PLA analiza TRK-SHC1 je izvedena u ćelijama tretiranim kao u (A) i pokazala je snažan pozitivan signal u slučaju kontrolne siRNA (B), a proporcionalno smanjenje u slučaju NTRK1 siRNA (C). Ćelije CUTO-3 su tretirane sa DMSO (D) ili kristalnim oblikom (I-HS) u koncentraciji od 100 nM (E) tokom 2 sata pokazujući poremećaj kompleksa TRKA-SHC1 u uzorku tretiranom kristalnim oblikom (I-HS) u poređenju sa kontrolom. CULC001 je tumorski ksenotransplantat (PDX) dobijen od pacijenta koji potiče iz istog tumora kao i ćelijska linija CUTO-3 i sadrži fuziju gena MPRIP-NTRK1 (nije prikazano). CULC002 je PDX od NSCLC pacijenta bez poznatog pokretača (ALK, ROS1, EGFR, KRAS i BRAF negativan) i negativan je na fuziju NTRK1 gena na osnovu FISH analize odvajanja NTRK1 (nije prikazano). PLA analiza TRK pokazuje snažan signal u CULC001 (F), ali nema signala u jedrima tumora CULC002 (G). Paneli (H) i (I) pokazuju nervni snop iz CULC001 PDX. PLA za TRK-SHC1 je pozitivna samo u ovom delu uzorka tumora CULC002 i ukazuje na autokrinu signalizaciju u TRKA, TRKB, ili TRKC receptoru, budući da je ova familija eksprimirana u nervnom tkivu i služi kao interna pozitivna kontrola za ovaj inače negativan uzorak tumora.
SL. 19 je snimak testa ligacije usled blizine TRK SHC1 i kontrole. (A) Test ligacije usled blizine TRK-SHC1 pokazuje snažnu signalizaciju u jedrima tumora, a slabu signalizaciju u krvnom sudu sa debelim zidom. Jedra su obojena sa DAPI (plavo) i crveni signali predstavljaju pozitivan test PLA koji ukazuje na komplekse proteina TRKA-SHC 1. Krvni sud je naznačen unutar delimične elipse (isprekidana bela linija). (B) Presek susednog tumorskog tkiva obojenog hematoksilinom i eozinom prikazuje krvni sud sa debelim zidovima (unutar delimične elipse označene isprekidanom belom linijom) i bočna jedra tumora.
SL. 20 predstavlja niz snimaka koji prikazuju TRK i ALK PLA u uzorku ALK+ tumora. Analiziran je FFPE uzorak tumora ALK+ pacijenta (uzorak autopsije) upotrebom TRK-SHC1 PLA (A) koji pokazuje odsustvo signala ili ALK-GRB2 PLA (B) koji pokazuje snažnu signalizaciju ALK.
SL. 21 je niz od tri snimka kompjuterizovane tomografije subjekta koji ima nediferencirani sarkom. CT snimci su dobijeni nakon preoperativne hemoterapije i primarne resekcije tumora, gde strelica ukazuje na prisustvo nodusa od 18 mm u desnom plućnom krilu (A), početni snimak neposredno pre davanja doze kristalnog oblika (I-HS) u studiji (B), i nakon 1 ciklusa (28 dana) davanja doze kristalnog oblika (I-HS) (C). Uočeno je da pacijent ima metastatsku bolest samo u plućima i stoga snimci CT skeniranja pokazuju aksijalne (gore) i koronalne (dole) slike sa fokusom na torakalnu šupljinu. Slike pokazuju početnu brzu progresiju bolesti (A-B, interval od 13 nedelja) praćenu izraženim odgovorom tumora sa smanjenom veličinom i/ili rezolucijom brojnih plućnih metastaza (B-C, interval od 4 nedelje).
SL. 22 je grafikon koji pokazuje serumske nivoe CA125 kod pacijenta koji ima nediferencirani sarkom lečen kristalnim oblikom (I-HS) tokom vremena. Nađeno je da su serumski nivoi CA125 povišeni kod ovog pacijenta, i nakon toga su praćeni kao potencijalni indikator aktivnosti. Serumski CA125 je uzet na početku (-8. dan) pre davanja doze i u naznačenim vremenskim tačkama nakon početka doziranja od -3. dana do 56. dana, prikazujući vremenski zavisno snižavanje ovog tumorskog markera. Isprekidana crvena linija označava gornju granicu normale (35 U/mL) ovog laboratorijskog testa.
SL. 23 je grafikon koji pokazuje dozno-zavisnu inhibiciju proliferacije ćelija HCC78 koje sadrže fuzioni protein SLC34A2- ROS1 upotrebom kristalnog oblika (I-HS).
SL. 24 je grafikon koji pokazuje termografske podatke za AM(HS)1. Gornja linija grafikona je dijagram termogravimetrijske analize (TGA) za jedinjenje, dok je donja linija dijagram diferencijalne skenirajuće kalorimetrije (DSC).
SL. 25 je grafikon koji pokazuje termografske podatke za AM(HS)2. Gornja linija grafikona je dijagram termogravimetrijske analize (TGA) za jedinjenje, dok je donja linija dijagram diferencijalne skenirajuće kalorimetrije (DSC).
SL. 26 je grafikon koji pokazuje termografske podatke za kristalni oblik (I-HS). Gornja linija grafikona je dijagram termogravimetrijske analize (TGA) za jedinjenje, dok je donja linija dijagram diferencijalne skenirajuće kalorimetrije (DSC).
SL. 27 ilustruje preklapanje obrazaca rendgenske difrakcije praha (XRPD) za AM(HS)1, AM(HS)2 i kristalni oblik (I-HS). AM(HS)1 i AM(HS)2 su široke linije u donjem delu slike, dok kristalni oblik (I-HS) pokazuje oštre pikove.
SL. 28 ilustruje obrazac rendgenske difrakcije praha (XRPD) za AM(HS)1 i AM(HS)2. SL. 29 ilustruje obrazac rendgenske difrakcije praha (XRPD) kristalnog oblika (I-HS). SL. 30 je slika uzorka AM(HS)1 dobijena polarizovanom svetlosnom mikroskopijom pri uveličanju od 20X.
SL. 31 je slika uzorka AM(HS)2 dobijena polarizovanom svetlosnom mikroskopijom pri uveličanju od 20X.
SL. 32 je slika uzorka kristalnog oblika (I-HS) dobijena polarizovanom svetlosnom mikroskopijom pri uveličanju od 20X.
SL. 33 je dijagram higroskopnosti AM(HS) 1 korišćenjem dinamičke sorpcije pare (DVS).
SL. 34 ilustruje obrazac rendgenske difrakcije praha (XRPD) za AM(HS)1 pre DVS (gornja linija) i nakon DVS (donja linija).
SL. 35 je dijagram higroskopnosti AM(HS)2 korišćenjem dinamičke sorpcije pare (DVS).
SL. 36 ilustruje obrazac rendgenske difrakcije praha (XRPD) za AM(HS)2 pre DVS (gornja linija) i nakon DVS (donja linija).
SL. 37 je dijagram higroskopnosti kristalnog oblika (I-HS) korišćenjem dinamičke sorpcije pare (DVS).
SL. 38 ilustruje obrazac rendgenske difrakcije praha (XRPD) kristalnog oblika (I-HS) pre DVS (gornja linija) i nakon DVS (donja linija).
SL. 39 je dijagram zatezne čvrstoće u odnosu na pritisak kompresije za različite kompakte od 200 mg dobijene direktnom kompresijom mešavine koji sadrže kristalni oblik (I-HS) ili AM(HS)2. Na dijagramu, (1) je mešavina MCC:laktoza 2:1 sa AM(HS)2; (2) je mešavina MCC:laktoza 2:1 sa kristalnim oblikom (I-HS); (3) je mešavina MCC:skrob 1:1 sa AM(HS)2; (4) je mešavina MCC:skrob 1:1 sa kristalnim oblikom (I-HS).
SL. 40 je preklapanje DSC termografa AM(HS)1 u T0 (donja linija) i nakon 5 nedelja na 40°C/75%RH (gornja linija).
SL. 41 je preklapanje DSC termografa kristalnog oblika (I-HS) u T0 (donja linija) i nakon 5 nedelja na 40°C/75%RH (gornja linija).
SL. 42 ilustruje preklapanje obrazaca rendgenske difrakcije praha (XRPD)AM(HS)1 u T0 (široka linija) i nakon 5 nedelja na 40°C/75%RH (oštri pikovi).
SL. 43 ilustruje preklapanje obrazaca rendgenske difrakcije praha kristalnog oblika (I-HS) u T0 (dole) i nakon 5 nedelja na 40°C/75%RH (gore).
SL. 44 ilustruje preklapanje obrazaca rendgenske difrakcije praha kristalnog oblika (I-HS) (dole) i AM(HS)1 (gore) nakon 5 nedelja na 40°C/75%RH.
SL. 45 je grafikon koji pokazuje procenat promene zapremine ksenotransplantiranog (humanog) tumora poreklom iz ćelijske linije adenokarcinoma pluća CUTO-3F (CUTO-3.29) tokom vremena, kod miševa koji su tretirani vehikulumom (trouglovi) ili im je oralno davana dnevna doza od 60 mg/kg (krugovi) ili 200 mg/kg (kvadrati) kristalnog oblika (I-HS) nakon implantacije ksenotransplantata u miševe.
SL. 46 je grafikon koji pokazuje procenat promene zapremine ksenotransplantiranog (humanog) tumora poreklom iz ćelijske linije kolorektalnog kancera KM12 tokom vremena, kod miševa koji su tretirani vehikulumom (trouglovi) ili im je oralno davana dnevna doza od 60 mg/kg (krugovi) ili 200 mg/kg (kvadrati) kristalnog oblika (I-HS) nakon implantacije ksenotransplantata u miševe.
SL. 47 je grafikon koji pokazuje procenat promene zapremine ksenotransplantiranog (humanog) tumora poreklom iz ćelijske linije akutne mijeloidne leukemije MO-91 tokom vremena, kod miševa koji su tretirani vehikulumom (trouglovi) ili im je oralno davana dnevna doza od 60 mg/kg (krugovi) ili 200 mg/kg (kvadrati) kristalnog oblika (I-HS) nakon implantacije ksenotransplantata u miševe.
[0033] Slike prikazuju različite primere izvođenja ovog pronalaska samo u svrhu ilustracije. Stručnjak u ovoj oblasti lako će prepoznati iz sledeće diskusije da se alternativni primeri izvođenja ovde ilustrovanih struktura i postupaka mogu koristiti bez odstupanja od principa ovde opisanog pronalaska.
DETALJAN OPIS
[0034] Predmetni navodi se odnose na (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin- 3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid (Formula I) i na njegove farmaceutski prihvatljive soli, na primer so hidrogensulfata, i dalje na novi kristalni oblik soli hidrogensulfata, koji ispoljava inhibiciju protein tirozin kinaze Trk familije, farmaceutske kompozicije koje ih sadrže, i na postupke za pravljenje kristalnog oblika.
[0035] Ovde je dat novi kristalni oblik jedinjenja formule I:
[0036] Konkretno, novi kristalni oblik sadrži so hidrogensulfata jedinjenja formule I u stabilnom polimorfnom obliku, u nastavku dokumenta označen kao kristalni oblik (I-HS), koji može da bude okarakterisam, na primer, svojim obrascem rendgenske difrakcije.
[0037] Kao što je ilustrovano na SL. 1, u nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) može da se okarakteriše svojim obrascem rendgenske difrakcije praha (XRPD). XRPD je izvedena pomoću rendgenskog difraktometra D5000 sa CuKα1 izvorom dužine 0.1540562 nm, u vidu fino fokusirane zatopljene cevi proizvođača Siemens, skeniranjem uzoraka između 3 i 40 °2-teta sa korakom od 0.0200 °2-teta i vremenom po koraku od 1 sekunde. Efektivna brzina skeniranja bila je 0.0200 °/s pri naponu instrumenta od 40 kV i struji od 40 mA. Uzorci su analizirani upotrebom divergentnog proreza veličine 2 mm u režimu refleksije pod sledećim eksperimentalnim uslovima.
[0038] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 20 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), kao što je navedeno u tabeli 1.
Tabela 1. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0039] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 8 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), koji obuhvata pikove koji imaju relativni intenzitet veći od ili jednak oko 15%, kao što je navedeno u tabeli 2.
Tabela 2. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0040] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 5 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), koji obuhvata pikove koji imaju relativni intenzitet veći od ili jednak oko 25%, kao što je navedeno u tabeli 3.
Tabela 3. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0041] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 4 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), koji obuhvata pikove koji imaju relativni intenzitet veći od ili jednak oko 30%, kao što je navedeno u tabeli 4.
Tabela 4. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0042] U određenim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD koji je suštinski isti kao obrazac XRPD prikazan na slici 1.
[0043] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 18.4, 20.6, 23.0 i 24.0. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 10.6, 18.4, 20.6, 23.0 i 24.0. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 10.6, 18.4, 19.1, 20.2, 20.6, 21.5, 23.0 i 24.0. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 10.6, 15.3, 16.4, 18.4, 19.1, 19.8, 20.2, 20.6, 21.5, 22.0, 23.0, 24.0, 24.4, 25.6, 26.5, 27.5, 28.2, 28.6, 30.8 i 38.5.
[0044] U određenim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD koji je suštinski isti kao obrazac XRPD prikazan na slici 29.
[0045] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 20 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), kao što je navedeno u tabeli 1.
Tabela 5. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0046] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 8 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), koji obuhvata pikove koji imaju relativni intenzitet veći od ili jednak oko 15%, kao što je navedeno u tabeli 6.
Tabela 6. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0047] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 5 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), koji obuhvata pikove koji imaju relativni intenzitet veći od ili jednak oko 25%, kao što je navedeno u tabeli 7.
Tabela 7. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0048] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima obrazac XRPD sa najmanje 4 karakterističnih pikova (2θ stepeni ± 0.3), koji obuhvata pikove koji imaju relativni intenzitet veći od ili jednak oko 30%, kao što je navedeno u tabeli 8.
Tabela 8. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0049] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 18.5, 20.7, 23.2 i 24.1. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 10.8, 18.5, 20.7, 23.2 i 24.1. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 10.8, 18.5, 19.2, 20.3, 20.7, 21.6, 23.2 i 24.1. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na oko 10.8, 15.4, 16.5, 18.5, 19.2, 19.9, 20.3, 20.7, 21.6, 22.2, 23.2, 24.1, 24.5, 25.7, 26.5, 27.6, 28.3, 28.7, 30.9 i 38.6.
[0050] U nekim primerima izvođenja, imajući u vidu obrasce XRPD date na SL.1 i 29, kristalni oblik (I-HS) je okarakterisan time što ima XRPD pikove (2θ stepeni) kao što je prikazano u tabeli 9.
Tabela 9. XRPD pikovi kristalnog oblika (I-HS)
[0051] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) at 18.4±0.2, 20.7±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) at 10.7±0.2, 18.4±0.2, 20.7±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) at 10.7±0.2, 18.4±0.2, 19.2±0.2, 20.2±0.2, 20.7±0.2, 21.5±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) se karakteriše time što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) at 10.7±0.2, 15.3±0.2, 16.5±0.2, 18.4±0.2, 19.2±0.2, 19.9±0.2, 20.2±0.2, 20.7±0.2, 21.5±0.2, 22.1±0.2, 23.1±0.2, 24.0±0.2. 24.4±0.2, 25.6±0.2, 26.5±0.2, 27.6±0.2, 28.2±0.2, 28.7±0.2, 30.8±0.2 i 38.5±0.2.
[0052] Podrazumeva se da vrednosti od 2-teta rendgenske difrakcije praha za kristalni oblik (I-HS) mogu neznatno da variraju od jednog instrumenta do drugog i takođe u zavisnosti od varijacija u pripremi uzorka i varijacije serije do serije, tj. navedene vrednosti ne treba tumačiti kao apsolutne. Takođe je jasno da relativni intenziteti pikova mogu da variraju u zavisnosti od efekata orijentacije, tako da su intenziteti prikazani u XRPD tragu uključeni ovde ilustrativni i nisu namenjeni da se koriste za apsolutno poređenje. Shodno tome, treba razumeti da fraza "suštinski isti obrazac XRPD kao što je prikazano na slici 1 ili slici 29" znači da je za potrebe poređenja prisutno najmanje 90% pikova prikazanih na slici 1 ili slici 29. Podrazumeva se da relativni položaji pikova mogu da variraju ± 0.3 stepena u odnosu na položaje pikova prikazane na slici 1 ili slici 29. Dalje treba razumeti da je, u cilju poređenja, dozvoljena izvesna varijabilnost u intenzitetima pikova u odnosu na one prikazane na slici 1 i slici 29.
[0053] SL. 2 ilustruje istovremeni profil termogravimetrijskog/diferencijalnog termalnog analizatora (TG/DTA) kristalnog oblika (I-HS), prema jednom primeru izvođenja. Za analizu, oko 5 mg kristalnog oblika (I-HS) je izmereno u otvorenu aluminijumsku posudu i naneto u istovremeni termogravimetrijski/diferencijalni termalni analizator (TG/DTA) i držano na sobnoj temperaturi. Uzorak je zatim zagrevan brzinom od 10° Celzijusa/min od 25° Celzijusa do 300° Celzijusa za koje vreme je zabeležena promena težine uzorka zajedno sa bilo kojim diferencijalnim termičkim događajima. Za pročišćavanje je korišćen azotni gas pri brzini protoka od 100 cm<3>/min. TG/DAT profil kristalnog oblika (I-HS) pokazuje početni gubitak težine od 0.8% između 27.4° Celzijusa i 182.4° Celzijusa, što je praćeno gubitkom težine od 4.9% u TG krivoj između 182.4° Celzijusa i 225.0° Celzijusa, što se vidi kao endoterma na DTA krivoj. Ovi gubici težine bi mogli da predstavljaju dekompoziciju materijala.
[0054] SL. 3 ilustruje profil diferencijalne skenirajuće kalorimetrije (DSC) kristalnog oblika (I-HS), prema jednom primeru izvođenja. DSC analiza uzorka izvedena je upotrebom Seiko DSC6200 diferencijalnog skenirajućeg kalorimetra (opremljenog kulerom). Oko 5 mg kristalnog oblika (I-HS) je odmereno u aluminijumsku posudu za DSC i nehermetički zatvoreno probušenim aluminijumskim poklopcem. Posuda sa uzorkom je zatim ubačena u Seiko DSC6200 (opremljen kulerom), ohlađena, i držana na 25° Celzijusa. Jednom kada je dobijen stabilan odziv toplotnog toka, uzorak i referentni uzorak su zagrejani do 270° Celzijusa pri brzini skeniranja od 10° Celzijusa/min uz praćenje rezultujućeg odziva toplotnog toka. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) ima DSC termogram suštinski kao što je prikazano na slici 3. Kako se ovde upotrebljava, "suštinski kao što je prikazano na slici 3" znači da temperature endotermnog događaja prikazane na slici 3 mogu da variraju oko ± 5 °C.
[0055] Kao što je prikazano na SL. 3, DSC termogram kristalnog oblika (I-HS) pokazuje malu endotermnu promenu u početnom nivou između 122.9° Celzijusa do 152.8° Celzijusa, praćenu oštrom endotermom koja odgovara topljenju kristalnog oblika (I-HS) pri početnoj temperaturi topljenja od 190.8° Celzijusa, vršnoj temperaturi topljenja od 197.9° Celzijusa i toploti topljenja od 2 415 mW. Prelaz koji sledi endotermu topljenja može da bude izazvan dekompozicijom istopljenog kristalnog oblika (I-HS).
[0056] SL. 4A i 4B ilustruju snimke polarizovane svetlosne mikroskopije (PLM) kristalnog oblika (I-HS) pod (A) nepolarizovanom i (B) polarizovanom svetlošću, prema nekim primerima izvođenja. Prisustvo kristalnosti (dvojne refrakcije) je određeno korišćenjem polarizovanog mikroskopa Olympus BX50, opremljenog kamerom Motic i softverom za snimanje (Motic Images Plus 2.0). Sve slike su snimljene upotrebom objektiva 20x. Kristalni oblik (I-HS) ispoljava dvojnu refrakciju kada se ispituje pod polarizovanom svetlošću bez ispoljavanja određene morfologije ili aglomerata.
[0057] SL. 5 ilustruje izotermni profil dobijen dinamičkom sorpcijom pare (DVS) kristalnog oblika (I-HS), prema jednom primeru izvođenja. Za DVS merenje uzorak kristalnog oblika (I-HS) je podvrgnut cikličnim izmenama uslova vlažnosti da bi se odredila njegova higroskopnost. Uzorak je analiziran korišćenjem sistema za merenje površine DVS-1 sistema dinamičke sorpcije pare. Oko 10 mg kristalnog oblika (I-HS) stavljeno je u mrežastu posudu vage za sorpciju pare i ubačeno u vagu za dinamičku sorpciju pare kao dela sistema za merenje površine. Podaci su prikupljani u intervalima od 1 minuta. Azot je korišćen kao noseći gas. Uzorkovani kristalni oblik (I-HS) je podvrgnut linearnom profilu promene relativne vlažnosti (RH) od 20-90% u koracima od 10%, pri čemu je uzorak održavan u svakom koraku sve dok se ne postigne stabilna težina (99.5% kompletiranja koraka). Nakon završetka ciklusa sorpcije, uzorak je osušen po istom postupku, ali sve do 0% RH i konačno vraćen na početnu tačku od 20% RH. Grafički je predstavljena promena težine tokom ciklusa sorpcije/desorpcije, čime je omogućeno da se odredi higroskopna priroda uzorka.
[0058] Kao što je prikazano na SL. 5, izgleda da je kristalni oblik (I-HS) nehigroskopan. Malo povećanje mase od oko 1.7% zapaženo je između 0% i 90% RH tokom ciklusa sorpcije. Pored toga, uočena je veoma mala histereza između ciklusa sorpcije i desorpcije. Obrazac XRPD kristalnog oblika (I-HS) posle DVS analize (nije prikazano) sličan njegovom XRPD obrascu pre DVS analize prikazanom na SL. 1 ili SL. 29 ukazuje na to da tokom DVS analize nije došlo do promene kristalnog oblika (I-HS).
[0059] SL.6 ilustruje profil dobijen infracrvenom spektroskopijom (IR) kristalnog oblika (I-HS) za jedinjenje formule I, prema jednom primeru izvođenja. IR spektroskopija je izvedena na spektrometru Bruker ALPHA P. Dovoljno materijala kristalnog oblika (I-HS) stavljeno je na centar ploče spektrometra sa spektrom transmitance koji se dobija pri rezoluciji od 4 cm<-1>, vreme skeniranja pozadinskog šuma od 16 skeniranja, vreme skeniranja uzorka od 16 skeniranja, i sakupljanjem podataka od 4000 cm<-1>do 400 cm<-1>. Uočeni IR spektar kristalnog oblika (I-HS) prikazan je na SL.6.
[0060] Kristalni oblik (I-HS) ima niz svojstava koja ga čine iznenađujuće superiornim u odnosu na amorfni oblik (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata (AM(HS)). Na primer, kristalni oblik (I-HS) ima svojstva koja doprinose mogućnosti njegove izrade i proizvodnji komercijalnog proizvoda. Kao što je prikazano u primeru 8, kristalni oblik (I-HS) ima bolja svojstva tečljivosti u poređenju sa amorfnim API (AM(HS)), što dokazuje Karov i Hausnerov indeks. Na primer, kristalni oblik (I-HS) pokazuje vrednost Karovog indeksa veću od 20%. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) pokazuje Hausnerov odnos manji od 1.35 (npr. vrednost između oko 1.26 do oko 1.34). Razlike u svojstvima tečljivosti mogu da učine težim razvoj čvrstog oralnog doznog oblika za amorfni API u odnosu na kristalni API.
[0061] Kristalni oblik (I-HS) je takođe pokazao bolju stabilnost u ubrzanoj studiji stabilnosti sprovedenoj u LDPE kesi na 40 °C/75% RH tokom pet nedelja. Iako ni AM(HS) ni kristalni oblik (I-HS) nisu pokazali značajne promene u nivoima hemijskih nečistoća tokom studije, studija je otkrila da kristalni oblik (I-HS) ima stabilna fizičko-hemijska svojstva. Amorfni API se, s druge strane, konvertuje u kristalni oblik suštinski sličan kristalnom obliku (I-HS) prema XRPD, DSC, TGA, KF i polarizovanoj svetlosnoj mikroskopiji. Pored toga, amorfni API se promenio u aglomerisani prah sa smanjenim svojstvima tečljivosti tokom ispitivanja stabilnosti. Takve promene u fizičkim svojstvima jedinjenja, uključujući promenu iz amorfnog praha u kristalni materijal i/ili aglomerisani prah sa smanjenom tečljivošću, pri skladištenju bi učinile gotovo nemogućom proizvodnju čvrstog oralnog doznog oblika na bazi amorfnog jedinjenja za upotrebu od strane pacijenta. Osobine uočene za kristalni oblik (I-HS), međutim, su u skladu sa onim poželjnim za komercijalni proizvod, uključujući i stabilnu fizičku i hemijsku strukturu.
[0062] Kristalni oblik (I-HS), kao što je prethodno napomenuto, je nehigroskopan. Kako se ovde upotrebljava, "nehigroskopno" se odnosi na jedinjenje koje ispoljava manje od 2% dobitka težine na 25 °C i 80% RH nakon 24 do 48 časova (videti, npr., primer 10). Otkriveno je, međutim, da AM(HS) jedinjenje prelazi u tečno stanje nakon izlaganja vlazi. S obzirom na ovu tendenciju, upotreba AM(HS) jedinjenja zahtevala bi značajne mere predostrožnosti prilikom skladištenja i proizvodnje kako bi se sprečila ova promena oblika, dok kristalni oblik (I-HS) ne zahteva takve mere predostrožnosti tokom proizvodnje API. Takođe bi se očekivalo da se ova stabilnost na vlagu prenese na bilo koji čvrsti oralni dozni proizvod pripremljen korišćenjem kristalnog oblika (I-HS).
[0063] Najzad, kristalni oblik (I-HS) pruža značajno poboljšan profil nečistoća u odnosu na amorfni API. Sposobnost kontrole profila nečistoće je važna za bezbednost pacijenata, razvoj ponovljivog proizvodnog postupka i ispunjavanje zahteva regulatornih agencija pre upotrebe kod ljudi.
[0064] Ovde data jedinjenja, uključujući (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid (Formula I) i njegove farmaceutski prihvatljive soli, na primer so hidrogensulfata, i dalje novi kristalni oblik soli hidrogensulfata (kristalni oblik (I-HS)), koji ispoljava inhibiciju protein tirozin kinaze Trk familije, i jedinjenje, so hidrogensulfata i njen kristalni oblik mogu da se koriste u lečenju bola, upale, kancera i određenih infektivnih bolesti.
[0065] Neki primeri izvođenja uključuju upotrebu kristalnog oblika (I-HS) u lečenju poremećaja i bolesti koje mogu da se leče inhibiranjem kinaza TrkA, TrkB i/ili TrkC, kao što je stanje posredovano TrkA, TrkB i/ili TrkC, kao što je jedno ili više ovde opisanih stanja, uključujući kancer povezan sa Trk. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) može da bude koristan i u lečenju bola, uključujući hronični i akutni bol. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) može da bude koristan u lečenju više vrsta bola, uključujući upalni bol, neuropatski bol, hirurški bol i bol povezan sa kancerom, hirurškom operacijom i lomom kosti. Pored toga, kristalni oblik (I-HS) može da bude koristan za lečenje upale, aktivnih i hroničnih neurodegenerativnih bolesti i određenih infektivnih bolesti. Predmetni navodi se dalje odnose na farmaceutske kompozicije koje sadrže kristalni oblik (I-HS). U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija sadrži kristalni oblik (I-HS) i farmaceutski prihvatljiv razblaživač ili nosač.
[0066] Sposobnost kristalnog oblika (I-HS) da deluje kao inhibitori TrkA, TrkB i/ili TrkC može da se pokaže testovima opisanim u primerima A i B kao što je otkriveno u SAD patentu br.
8,513,263, izdatom 20. avgusta 2013.
[0067] U nekim primerima izvođenja, ovde je dat postupak za lečenje pacijenta kod koga je dijagnostikovan kancer povezan sa TRK, koji obuhvata davanje pacijentu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263). Familija Trk neurotrofinskih receptora, TrkA, TrkB i TrkC (kodiranih genima NTRK1, NTRK2, odnosno NTRK3) i njihovi neurotrofinski ligandi regulišu rast, diferencijaciju i opstanak neurona. Disregulacija u genu NTRK, Trk proteinu, ili njihovoj ekspresiji ili aktivnosti, ili nivou, kao što su translokacije koje uključuju kinazni domen NTRK, mutacije koje uključuju ligand-vezujuće mesto TRK, amplifikacije gena NTRK, varijante splajsovanja Trk iRNK i autokrina/parakrina signalizacija Trk su opisane kod različitih brojnih vrsta tumora i mogu da doprinesu tumorogenezi. Nedavno su opisane fuzije NTRK1 u podskupu pacijenata sa adenokarcinomom pluća<2>. Translokacije u NTRK1, NTRK2 i NTRK3 koje dovode do proizvodnje konstitutivno aktivnih TrkA, TrkB i TrkC fuzionih proteina su onkogene i preovlađuju u širokom spektru tipova tumora, uključujući adenokarcinom pluća, kancer tiroidee, kancer glave i vrata, glioblastom, i druge.
[0068] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje prekomernu ekspresiju divljeg tipa TrkA, TrkB, ili TrkC (npr. dovodi do autokrine aktivacije). U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje prekomernu ekspresiju, aktivaciju, amplifikaciju ili mutaciju u hromozomskom segmentu koji obuhvata gen NTRK1, NTRK2, ili NTKR3 ili njegov deo. U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje jednu ili više hromozomskih translokacija ili inverzija koje rezultiraju fuzijama NTRK1, NTRK2, ili NTRK3 gena, respektivno. U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, rezultat je genetskih translokacija u kojima je eksprimirani protein fuzioni protein koji sadrži ostatke iz ne-TrkA partnerskog proteina i TrkA, ne-TrkB partnerskog proteina i TrkB, ili ne-TrkC partnerskog proteina i TrkC proteina, i uključuje minimum funkcionalnog TrkA, TrkB, ili TrkC kinaznog domena, respektivno.
[0069] U nekim primerima izvođenja, fuzioni protein TrkA je jedan od fuzionih proteina TrkA prikazanih u tabeli 10, gde:
Tabela 10. Ilustrativni fuzioni proteini TrkA i kanceri
[0070] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje jednu ili više delecija, insercija, ili tačkaste mutacije/mutacija u TrkA proteinu. U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje deleciju jednog ili više ostataka iz TrkA proteina, koja rezultuje konstitutivnom aktivnošću kinaznog domena TrkA. U nekim primerima izvođenja, delecija uključuje deleciju aminokiselina 303-377 u TrkA izoformi 2.
[0071] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje najmanje jednu tačkastu mutaciju u genu NTRK1 koja rezultuje proizvodnjom TrkA proteina koji ima jednu ili više aminokiselinskih supstitucija u poređenju sa TrkA proteinom divljeg tipa (videti, na primer, tačkaste mutacije navedene u tabeli 11.
Tabela 11. Aktivirajuće tačkaste mutacije TrkA
[0072] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje varijaciju splajsovanja u TrkA iRNK koja rezultuje eksprimiranim proteinom koji predstavlja alternativno splajsovanu varijantu TrkA koja ima deletiran najmanje jedan ostatak (u poređenju sa TrkA proteinom divljeg tipa) što dovodi do konstitutivne aktivnosti kinaznog domena TrkA. U nekim primerima izvođenja, alternativno splajsovani oblik TrkA sa konstitutivnom aktivnošću ima delecije egzona 8, 9 i 11 što dovodi do ekspresije proteina kome nedostaju ostaci 192-284 i 393-398 u odnosu na TrkA izoforme 2, ima deleciju egzona 10 u TrkA, ili ima deleciju u genu NTRK1 koji kodira TrkA protein sa delecijom 75 aminokiselina u transmembranskom domenu (Reuther et al., Mol. Cell Biol. 20:8655-8666, 2000).
[0073] Kanceri identifikovani kao oni koji imaju disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, (videti ovde navedene reference, kao i sajtove www.cancer.gov i www.nccn.org) uključuju:
(A) Kancere kod kojih disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje jednu ili više hromozomskih translokacija ili inverzija koje rezultuju fuzionim proteinima TrkA, npr., uključujući:
(B) Kancere kod kojih disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje jednu ili više delecija, insercija, ili mutacija u TrkA proteinu, npr., uključujući:
(C) Kancere kod kojih disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje prekomernu ekspresiju TrkA divljeg tipa (autokrina aktivacija), npr., uključujući:
[0074] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje translokaciju koja rezultuje ekspresijom fuzionog proteina TrkB, npr., jednog od fuzionih proteina TrkB prikazanih u tabeli 12.
Tabela 12. Ilustrativni fuzioni proteini TrkB i kanceri
[0075] U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje translokaciju koja rezultuje ekspresijom fuzionog proteina TrkC, npr., jedan od fuzionih proteina TrkC prikazanih u tabeli 13.
Tabela 13. Ilustrativni fuzioni proteini TrkC i kanceri
[0076] U nekim primerima izvođenja, ovde je dat postupak za lečenje pacijenta kome je dijagnostikovan kancer povezan sa Trk, koji obuhvata davanje pacijentu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263). Na primer, kancer povezan sa Trk može da bude izabran iz grupe: nesitnoćelijskog kancera pluća, papilarnog tiroidnog karcinoma, multiformnog glioblastoma, akutne mijeloidne leukemije, kolorektalnog karcinoma, krupnoćelijskog neuroendokrinog karcinoma, kancera prostate, neuroblastoma, karcinoma pankreasa, melanoma, karcinoma skvamoznih ćelija glave i vrata, karcinoma želuca, Spitz kancera, papilarnog tiroidnog karcinoma, kancera debelog creva, akutne mijeloidne leukemije, sarkoma, pedijatrijskog glioma, intrahepatičnog holangikarcinoma, pilocitnog astrocitoma, glioma nižeg stepena, adenokarcinoma pluća, kancera pljuvačne žlezde, sekretornog kancera dojke, fibrosarkoma, nefroma i kancera dojke.
[0077] U nekim primerima izvođenja, kancer povezan sa Trk je odabran iz grupe: neograničavajući primeri kancera povezanih sa TRK uključuju: Spitzoidni melanom, Spitz tumore (npr., metastatske Spitz tumore), nesitnoćelijski kancer pluća (NSCLC), tiroidni karcinom (npr., papilarni tiroidni karcinom (PTC)), akutnu mijeloidnu leukemiju (AML), sarkom (npr., nediferencirani sarkom ili adultni sarkom mekog tkiva), pedijatrijske gliome, kolorektalni kancer (CRC), multiformni gliobastom (GBM), krupnoćelijski neuroendokrini kancer (LCNEC), tiroidni kancer, intrahepatički holangikarcinom (ICC), pilocitni astrocitom, gliom nižeg stepena, karcinom skvamoznih ćelija glave i vrata, adenokarcinom (npr., adenokarcinom pluća), kancer pljuvačne žlezde, sekretorni karcinom dojke, kancer dojke, akutnu mijeloidnu leukemiju, fibrosarkom, nefrom, melanom, bronhogeni karcinom, kancer B-ćelija, kancer bronha, kancer oralne šupljine ili farinksa, kancer hematoloških tkiva, kancer grlića materice, kancer želuca, kancer bubrega, kancer jetre, multipli mijelom, kancer jajnika, kancer pankreasa, kancer pljuvačne žlezde, kancer tankog creva ili slepog creva, kancer testisa, kancer mokraćne bešike, kancer materice ili endometrijuma, inflamatorne miofibroblastne tumore, gastrointestinalni stromalni tumor, ne-Hočkinov limfom, neuroblastom, sitnoćelijski kancer pluća, karcinom skvamoznih ćelija, ezofagealno-želudačni kancer, kancer kože, neoplazmu (npr., melanocitna neoplazma), Spitz nevuse, astrocitom, meduloblastom, gliom, krupnoćelijske neuroendokrine tumore, kancer kosti i karcinom rektuma.
[0078] U nekim primerima izvođenja, ovde data jedinjenja su korisna za lečenje kancera povezanih sa Trk kod pedijatrijskih pacijenata. Na primer, ovde data jedinjenja mogu da se koriste za lečenje infantilnog sarkoma, neuroblastoma, kongenitalnog mezoblastnog nefroma, glioma mozga nižeg stepena i glioma ponsa.
[0079] U nekim primerima izvođenja, ovde data jedinjenja su korisna za lečenje kancera povezanog sa Trk u kombinaciji sa jednim ili više dodatnih terapijskih agenasa ili terapija koje imaju isti ili drugačiji mehanizam delovanja.
[0080] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi su izabrani iz grupe: terapijskih agenasa usmerenih na receptor tirozin kinazu, uključujući kabozantinib, krizotinib, erlotinib, gefitinib, imatinib, lapatinib, nilotinib, pazopanib, pertuzumab, regorafenib, sunitinib i trastuzumab.
[0081] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi su izabrani od inhibitora puta signalne transdukcije, uključujući, npr., inhibitore puta Ras-Raf-MEK-ERK (npr., sorafenib, trametinib, ili vemurafenib), inhibitore puta PI3K-Akt-mTOR-S6K (npr., everolimus, rapamicin, perifosin, ili temsirolimus) i modulatore puta apoptoze (npr., obataklaks).
[0082] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi su izabrani iz grupe citotoksičnih hemoterapeutika, uključujući, npr., arsenik trioksid, bleomicin, kabazitaksel, kapecitabin, karboplatin, cisplatin, ciklofosfamid, citarabin, dakarbazin, daunorubicin, docetaksel, doksorubicin, etopozid, fluorouracil, gemcitabin, irinotekan, lomustin, metotreksat, mitomicin C, oksaliplatin, paklitaksel, pemetreksed, temozolomid i vinkristin.
[0083] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi su izabrani iz grupe terapija usmerenih na angiogenezu, uključujući npr., aflibercept i bevacizumab.
[0084] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi su izabrani iz grupe imuno-usmerenih agenasa, npr., uključujući aldesleukin, ipilimumab, lambrolizumab, nivolumab i sipuleucel-T.
[0085] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi su izabrani od agenasa koji su aktivni protiv nishodnog puta Trk, uključujući, npr., biofarmaceutike usmerene na NGF, kao što su NGF antitela i panTrk inhibitori.
[0086] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens ili terapija je radioterapija, uključujući, npr., terapiju radioaktivnim jodom, eksterno zračenje i terapiju radijumom 223.
[0087] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens/agensi uključuje bilo koju od gore navedenih terapija ili terapijskih agenasa koji predstavljaju standarde nege kod kancera kod kojih kancer ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa.
[0088] Postupci za detekciju disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuju, npr., detekciju translokacija gena NTRK, npr., primenom fluorescentne in situ hibridizacije (FISH) (npr., kao što je opisano u međunarodnim prijavama br. PCT/US2013/061211 PCT/US2013/057495.
[0089] U nekim primerima izvođenja, ovde je obezbeđen postupak za lečenje kancera (npr., kancera povezanog sa Trk) kod pacijenta, koji obuhvata davanje navedenom pacijentu kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) u kombinaciji sa najmanje jednom dodatnom terapijom ili terapijskim agensom. U nekim primerima izvođenja, najmanje jedna dodatna terapija ili terapijski agens je odabran od radioterapije (npr., terapija radioaktivnim jodom, eksterno zračenje i terapija radijumom 223), citotoksičnih hemoterapeutika (npr., arsenik trioksid, bleomicin, kabazitaksel, kapecitabin, karboplatin, cisplatin, ciklofosfamid, citarabin, dakarbazin, daunorubicin, docetaksel, doksorubicin, etopozid, fluorouracil, gemcitabin, irinotekan, lomustin, metotreksat, mitomicin C, oksaliplatin, paklitaksel, pemetreksed, temozolomid ili vinkristin), terapeutika usmerenih na tirozin kinazu (npr., afatinib, kabozantinib, cetuksimab, krizotinib, dabrafenib, erlotinib, gefitinib, imatinib, lapatinib, nilotinib, pazopanib, panitumumab, pertuzumab, regorafenib, sunitinib, ili trastuzumab), modulatora apoptoze i inhibitora signalne transdukcije (npr. everolimus, perifosin, rapamicin, sorafenib, temsirolimus, trametinib, ili vemurafenib), imuno-usmerenih terapija (npr., aldesleukin, interferon alfa-2b, ipilimumab, lambrolizumab, nivolumab, prednizon, ili sipuleucel-T) i terapija usmerenih na angiogenezu (npr., aflibercept ili bevacizumab), pri čemu je količina ovde datog jedinjenja ili njegove farmaceutski prihvatljive soli, u kombinaciji sa dodatnom terapijom ili terapijskim agensom, efikasna u lečenju navedenog kancera.
[0090] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agens je drugačiji inhibitor Trk. Neograničavajući primeri drugih inhibitora Trk uključuju (R)-2-fenilpirolidin supstituisani imadazopiridazin, AZD6918, GNF-4256, GTx-186, GNF-5837, AZ623, AG-879, altiratinib, CT327, AR-772, AR-523, AR-786, AR-256, AR-618, AZ-23, AZD7451, kabozantinib, CEP-701, CEP-751, PHA-739358, dovitinib, entrektinib, PLX7486, Gö 6976, GW441756, MGCD516, ONO-5390556, PHA-848125AC, regorafenib, sorafenib, sunitinib, TSR-011, VM-902A, K252a, 4-aminopirazolilpirimidin i supstituisano pirazolo[1,5-a] pirimidinsko jedinjenje.
[0091] U nekim primerima izvođenja, dodatni terapijski agensi uključuju: terapijske agense usmerene na receptor tirozin kinazu, kao što su afatinib, kabozantinib, cetuksimab, krizotinib, dabrafenib, erlotinib, gefitinib, imatinib, lapatinib, lestaurtinib, nilotinib, pazopanib, panitumumab, pertuzumab, sunitinib, trastuzumab, AG 879, AZ-23, AZ623, Gö 6976, GNF5837, GTx-186, GW 441756, MGCD516, RPI-1, RXDX101 i TSR-011; terapijske agense usmerene na RET, kao što su alektinib, apatinib, kabozantinib, dovitinib, lenvatinib, motesanib, nintedanib, ponatinib, regorafenib, sunitinib, sorafenib, vatalanib, vandetanib, AUY-922, BLU6864, DCC-2157, MGCD516, NVP-AST487, PZ-1, RXDX105, SPP86, TG101209 i XL-184; inhibitore puta signalne transdukcije, kao što su inhibitori puta Ras-Raf-MEK-ERK (npr., binimetinib, selumetinib, enkorafinib, sorafenib, trametinib i vemurafenib), inhibitori puta PI3K-Akt-mTOR-S6K (npr. everolimus, rapamicin, perifosin, temsirolimus), inhibitore drugih kinaza, kao što su baricitinib, brigatinib, kapmatinib, danusertib, ibrutinib, milciklib, kvercetin, regorafenib, ruksolitinib, semaksanib, AP32788, BLU285, BLU554, INCB39110, INCB40093, INCB50465, INCB52793, INCB54828, MGCD265, NMS-088, NMS-1286937, PF 477736, PLX3397, PLX7486, PLX8394, PLX9486, PRN1008, PRN1371, RXDX103, RXDX106, RXDX108 i TG101209; inhibitore kontrolne tačke, kao što su ipilimumab, tremelimumab, nivolumab, pidilizumab, MPDL3208A, MEDI4736, MSB0010718C, BMS-936559, BMS-956559, BMS-935559 (MDX-1105), AMP-224 i pembrolizumab; modulatore puta apoptoze (npr. obataklaks); citotoksične hemoterapeutike, kao što su arsenik trioksid, bleomicin, kabazitaksel, kapecitabin, karboplatin, cisplatin, ciklofosfamid, citarabin, dakarbazin, daunorubicin, docetaksel, doksorubicin, etopozid, fluorouracil, gemcitabin, irinotekan, lomustin, metotreksat, mitomicin C, oksaliplatin, paklitaksel, pemetreksed, temozolomid i vinkristin; terapije usmerene na angiogenezu, kao aflibercept i bevacizumab; imuno-usmerene agense, kao aldesleukin, interferon alfa-2b, ipilimumab, lambrolizumab, nivolumab, prednizon, sipuleucel-T; radioterapiju, kao što je terapija radioaktivnim jodom, eksterno zračenje i terapija radijumom 223.
[0092] Drugi dodatni terapijski agensi uključuju inhibitore RET kao što su oni, opisani u, na primer, SAD patentnima br. 8,299,057; 8,399,442; 8,937,071; 9,006,256; i 9,035,063; SAD objavama br. 2014/0121239; 2011/0053934; 2011/0301157; 2010/0324065; 2009/0227556; 2009/0130229; 2009/0099167; 2005/0209195; međunarodnim objavama br. WO 2014/184069; WO 2014/072220; WO 2012/053606; WO 2009/017838; WO 2008/031551; WO 2007/136103; WO 2007/087245; WO 2007/057399; WO 2005/051366; i WO 2005/044835; i J. Med.Chem.
2012, 55 (10), 4872-4876.
[0093] Ovi dodatni terapijski agensi se mogu davati sa jednim ili više jedinjenja koja su ovde data, kao deo istih ili odvojenih doznih oblika, putem istih ili različitih puteva primene, i prema istim ili različitim rasporedima primene u skladu sa standardnom farmaceutskom praksom poznatom stručnjaku u ovoj oblasti.
[0094] Ovde je data i (i) farmaceutska kombinacija za lečenje kancera (npr., kancera povezanog sa Trk) kod pacijenta kome je to potrebno, koja obuhvata (a) kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegovu so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.
8,513,263), (b) dodatni terapijski agens i (c) opciono najmanje jedan farmaceutski prihvatljiv nosač za istovremenu, odvojenu ili uzastopnu upotrebu za lečenje bolesti tumora, pri čemu su količine jedinjenja ili njegove soli i dodatnog terapijskog agensa zajedno efikasne u lečenju navedenog kancera; (ii) farmaceutska kompozicija koja sadrži takvu kombinaciju; (iii) upotreba takve kombinacija za pripremu leka za lečenje kancera (npr., kancera povezanog sa Trk); i (iv) komercijalno pakovanje ili proizvod koji sadrži takvu kombinaciju kao kombinovani preparat za istovremenu, odvojenu ili uzastopnu upotrebu; i postupak za lečenje kancera (npr., kancera povezanog sa Trk) kod pacijenta kome je to potrebno.
[0095] Takođe su obezbeđeni postupci za lečenje subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk (npr., subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk upotrebom kompleta za identifikovanje disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA, kod subjekta ili u uzorku biopsije uzetom od subjekta) (npr., bilo koji od kancera povezanih sa Trk koji su ovde opisani ili poznati u stanju tehnike) koji uključuju davanje subjektu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.
8,513,263). Obezbeđen je i kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) za upotrebu u lečenju kancera povezanog sa Trk kod subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk (npr., subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk upotrebom kompleta za identifikovanje disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA, kod subjekta ili u uzorku biopsije uzetom od subjekta) (npr., bilo koji od kancera povezanih sa Trk koji su ovde opisani ili poznati u stanju tehnike). Obezbeđena je i upotreba kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263) za proizvodnju leka za lečenje kancera povezanog sa Trk kod subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk (npr., subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk upotrebom kompleta za identifikovanje disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA, kod subjekta ili u uzorku biopsije uzetom od subjekta) (npr., bilo koji od kancera povezanih sa Trk koji su ovde opisani ili poznati u stanju tehnike).
[0096] Obezbeđeni su i postupci za lečenje subjekta (npr., subjekta za koga se sumnja da ima kancer povezan sa Trk, subjekta koji ima jedan ili više simptoma kancera povezanog sa Trk, ili subjekta koji ima povišen rizik od razvoja kancera povezanog sa Trk) koji uključuju izvođenje testa (npr., testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, i davanja (npr., specifičnog ili selektivnog davanja) terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) subjektu za koga je utvrđeno da ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa. Dodatni testovi, neograničavajući testovi koji mogu da se koriste u ovim postupcima su opisani u ovom dokumentu. Dodatni testovi su takođe poznati u stanju tehnike. Obezbeđena je i upotreba kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) za upotrebu u lečenju kancera povezanog sa Trk kod subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk putem koraka izvođenja testa (npr., in vitro testa (npr., testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, pri čemu prisustvo disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, identifikuje da subjekt ima kancer povezan sa Trk. obezbeđena je i upotreba kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263) za proizvodnju leka za lečenje kancera povezanog sa Trk kod subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk putem koraka izvođenja testa (npr., in vitro testa) (npr., testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, pri čemu prisustvo disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, identifikuje da subjekt ima kancer povezan sa Trk. Neki primeri izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba dalje uključuju evidentiranje u kliničkom kartonu subjekta (npr., računarski čitljiv medij) da kod subjekta za koga je utvrđeno da ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, putem izvođenja testa, treba da se primeni kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263).
[0097] U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, subjekt kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer sa disregulacijom gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., utvrđeno upotrebom testa ili kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA). U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, subjekt ima tumor koji je pozitivan na disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., utvrđeno upotrebom testa ili kompleta koji je odobrila regulatorna agencija). U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, subjekt može da bude subjekt sa tumorom/tumorima koji je pozitivan na disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., identifikovan kao pozitivan upotrebom testa ili kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA). U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, subjekt može da bude subjekt čiji tumori imaju disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., kada je tumor identifikovan kao takav upotrebom kompleta ili testa koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA). U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, sumnja se da subjekt ima kancer povezan sa Trk. U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, subjekt ima klinički karton koji ukazuje na to da subjekt ima tumor koji ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (i opciono klinički karton ukazuje na to da subjekt treba da bude lečen bilo kojom od ovde datih kompozicija).
[0098] Obezbeđeni su i postupci za lečenje subjekta koji uključuju primenu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) kod subjekta koji ima klinički karton koji ukazuje na to da subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa. Obezbeđena je i upotreba kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) za proizvodnju leka za lečenje kancera povezanog sa Trk kod subjekta koji ima klinički karton koji ukazuje na to da subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa. Obezbeđena je i upotreba kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263 za proizvodnju leka za lečenje kancera povezanog sa Trk kod subjekta koji ima klinički karton koji ukazuje na to da subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa. Neki primeri izvođenja ovih postupaka i upotreba mogu dalje da uključuju: korak izvođenja testa (npr., in vitro testa) (npr., testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, i snimanje informacija u kliničkom dosijeu subjekta (npr., računarski čitljiv medij) da je identifikovano da subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa.
[0099] Obezbeđeni su i postupci (npr., in vitro postupci) za izbor terapije za subjekta koji uključuju izbor terapije koja uključuje davanje terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) subjektu kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk (npr., subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk upotrebom kompleta za identifikovanje disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA, u subjektu ili u uzorku biopsije uzetom od subjekta) (npr., bilo kog od kancera povezanih sa Trk koji su ovde opisani ili poznati u stanju tehnike). Neki primeri izvođenja mogu dalje da uključuju davanje odabrane terapije subjektu kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk. Neki primeri izvođenja mogu dalje da uključuju korak izvođenja testa (npr., in vitro testa) (npr. testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, i identifikovanje da subjekt ima, ili dijagnostikovanje kod subjekta, za koga je utvrđeno da ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, kancera povezanog sa Trk.
[0100] Obezbeđeni su i postupci za izbor terapije za subjekta koji uključuju primenu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263), pri čemu postupci uključuju korak izvođenja testa (npr., in vitro testa) (npr., testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, i identifikovanje da subjekt ima, ili dijagnostikovanje kod subjekta, za koga je utvrđeno da ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, kancera povezanog sa Trk, i izbor terapijskog tretmana, koji uključuje davanje terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263), za subjekta kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk. Neki primeri izvođenja dalje uključuju davanje odabrane terapije subjektu kod koga je identifikovano da ima, ili kome je dijagnostikovan, kancer povezan sa Trk.
[0101] Takođe su obezbeđeni i postupci za izbor subjekta za lečenje koje uključuje primenu terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) koja uključuje izbor, identifikovanje, ili dijagnostikovanje kod subjekta kancera povezanog sa Trk, i izbor subjekta za lečenje koje uključuje primenu terapijski efikasna količina kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263). U nekim primerima izvođenja, identifikovanje da subjekt ima, ili dijagnostikovanje kod subjekta kancera povezanog sa Trk može da uključuje korak izvođenja testa (npr., in vitro testa) (npr., testa koji koristi sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, ili FISH analizu odvajanja) (npr., upotrebom kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA) na uzorku dobijenom od subjekta da bi se utvrdilo da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, i identifikovanje da subjekt ima, ili dijagnostikovanje kod subjekta, za koga je utvrđeno da ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, kancera povezanog sa Trk. U nekim primerima izvođenja, izbor terapije može da se koristi kao deo kliničke studije koja uključuje primenu različitih terapija za kancer povezan sa Alk.
[0102] U nekim primerima izvođenja bilo kog od ovde opisanih postupaka ili upotreba, test upotrebljen za određivanje da li subjekt ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, korišćenjem uzorka (npr., biološkog uzorka ili uzorka biopsije (npr., uzorka biopsije obloženog parafinom) uzetog od subjekta (npr., subjekta za koga se sumnja da ima kancer povezan sa Trk, subjekta koji ima jedan ili više simptoma kancera povezanog sa Trk, i/ili subjekta koji ima povećan rizik od razvoja kancera povezanog sa Trk) može da uključuje, na primer, sekvenciranje sledeće generacije, imunohistohemiju, fluorescentnu mikroskopiju, FISH analizu odvajanja, Southern blotting, Western blotting, FACS analizu, Northern blotting i amplifikaciju na bazi PCR analize (npr., RT-PCR). Kao što je dobro poznato u tehnici, testovi se tipično izvode, npr., sa najmanje jednom obeleženom probom nukleinske kiseline ili najmanje jednim obeleženim antitelom ili njegovim antigen-vezujućim fragmentom. Testovi mogu da koriste i druge postupke detekcije poznate u tehnici za detektovanje disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (videti, npr., ovde navedene reference).
[0103] U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS), ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) je korisno za lečenje hroničnog i akutnog bola, uključujući bol povezan sa kancerom, operacijom i prelomom kosti. Kristalni oblik (I-HS), ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) može da bude korisno u lečenju više vrsta bola, uključujući upalni bol, neuropatski bol i bol povezan sa kancerom, operacijom i prelomom kosti. Kristalni oblik (I-HS), ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) su takođe korisni za lečenje kancera uključujući neuroblastom, kancer jajnika, pankreasa i kolorektalni kancer. Kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) su takođe korisni za lečenje upale i određenih infektivnih bolesti. Pored toga, kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263) mogu takođe da se koriste za lečenje intersticijalnog cistitisa (IC), sindroma bolne bešike (PBS), urinarne inkontinencije, astme, anoreksije, atopijskog dermatitisa i psorijaze. Kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) mogu takođe da se koriste za lečenje demijelinacije i dismijelinacije podsticanjem mijelinacije, preživljavanja neurona i oligodendrocitne diferencijacije blokiranjem interakcije Sp35-TrkA. Kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) mogu da se koriste u lečenju više vrsta bola uključujući upalni bol, neuropatski bol, hirurški bol i bol povezan sa kancerom. Kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) mogu da se koriste u lečenju bolesti povezanih sa kostima (kao što su one koje uključuju resorpciju kosti). Primeri bolesti povezanih sa kostima uključuju metastatsku bolest kostiju, gubitak koštane mase izazvan lečenjem, osteoporozu, reumatoidni artritis, ankilozni spondilitis, Pagetovu bolest i parodontalnu bolest. Osteporoza se može pripisati (1) menopauzi kod žena, (2) starenju muškaraca ili žena, (3) suboptimalnom rastu kostiju tokom detinjstva i adolescencije koji je rezultovao neuspehom u dostizanju vršne koštane mase, i/ili (4) sekundarnom gubitku kosti usled drugih oboljenja, poremećajima u ishrani, lekovima i/ili medicinskim tretmanima. Ostale osteolitičke bolesti koje mogu da se leče ovde navedenim postupcima su u većoj meri lokalizovane. Poseban primer je metastatska osteoliza izazvana tumorom. U ovom stanju, karnceri kostiju ili metastaze na kostima izazivaju lokalizovanu osteolizu koja izaziva bol, slabost kostiju i prelome. Takva lokalizovana osteoliza takođe omogućava tumorima da rastu stvarajući više prostora za njih u kosti i oslobađajući faktore rasta iz koštanog matriksa. Lečenje svih kancera za koje je trenutno poznato da uzrokuju osteolizu izazvanu tumorom, koji uključuju hematološke maligne bolesti (npr., mijelom i limfom) i solidne tumore (npr. dojke, prostate, pluća, bubrega i tiroidee), razmatra se u predmetnim navodima. Kako se ovde koristi, termin lečenje uključuje profilaksu kao i lečenje postojećeg stanja.
[0104] Shodno tome, ovde je takođe dat postupak za lečenje bolesti ili medicinskih stanja kod subjekta kome je to potrebno, pri čemu se navedena bolest ili stanje može lečiti inhibitorom TrkA i/ili TrkB (npr., kancer povezan sa Trk), koji obuhvata davanje navedenom subjektu kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr. videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263 u količini efikasnoj za lečenje ili prevenciju navedenog poremećaja. U posebnom primeru izvođenja, ovde je dat postupak za lečenje bola, kancera, upale, neurodegenerativne bolesti ili infekcije Tripanosoma cruzi kod sisara, koji obuhvata davanje navedenom sisaru terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr. videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263). U drugom primeru izvođenja, ovde je dat postupak za lečenje osteolitičke bolesti kod sisara, koji obuhvata davanje navedenom subjektu kome je to potrebno terapijski efikasne količine kristalnog oblika (I-HS) ili jedinjenja formule I ili njegove soli, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br.8,513,263).
[0105] Kristalni oblik (I-HS) ili jedinjenje formule I ili njegova so, kao što je so hidrogensulfata (npr., videti primer 14A SAD patenta br. 8,513,263) može da se koristi u kombinaciji sa jednim ili više dodatnih lekova koji deluju istim ili drugačijim mehanizmom delovanja. Takvo kombinovano lečenje može da se postigne istovremenim, uzastopnim ili odvojenim davanjem pojedinačnih komponenti tretmana. Primeri uključuju antiinflamatorna jedinjenja, steroide (npr., deksametazon, kortizon i flutikazon), analgetike kao što su NSAID (npr., aspirin, ibuprofen, indometacin i ketoprofen) i opioidi (kao što je morfijum), i hemoterapijske agense.
[0106] U oblasti medicinske onkologije uobičajena je praksa da se koristi kombinacija različitih oblika lečenja za lečenje svakog pacijenta sa kancerom. U medicinskoj onkologiji, druga/druge komponente takvog kombinovanog lečenja, pored kompozicija koje su ovde date, mogu da budu, na primer, hirurška operacija, radioterapija, hemoterapija, inhibitori signalne transdukcije i/ili monoklonska antitela.
[0107] Shodno tome, kristalni oblik (I-HS) može da se primeni u kombinaciji sa jednim ili više agenasa odabranih između mitotičkih inhibitora, alkilirajućih agenasa, antimetabolita, antisens DNK ili RNK, interkalirajućih antibiotika, inhibitora faktora rasta, inhibitora signalne transdukcije, inhibitora ćelijskog ciklusa, inhibitora enzima, modulatora retinoidnih receptora, inhibitora proteazoma, inhibitora topoizomeraze, modifikatora biološkog odgovora, antihormona, inhibitora angiogeneze, citostatika antiandrogena, usmerenih antitela, inhibitora HMG-CoA reduktaze i inhibitora prenil-protein transferaze.
[0108] Kada ovde opisano jedinjenje ima najmanje jedan hiralni centar, jedinjenja mogu shodno tome da postoje kao enantiomeri. Kada jedinjenja poseduju dva hiralna centra, jedinjenja mogu dodatno da postoje kao dijastereomeri. Odnosno, jedinjenje formule I, pored toga što ima željenu konfiguraciju označenu nomenklaturom "(S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il) -pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat" (u daljem tekstu (S,R) izomer), takođe može da bude prisutno u manjim količinama kao izomer (R)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat (u daljem tekstu (R,R) izomer) i/ili takođe može da bude prisutno u manjim količinama kao (S)-N-(5-((S)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat (u daljem tekstu (S,S) izomer), i/ili može da bude prisutno u manjim količinama kao izomer (R)-N-(5-((S)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat" (u daljem tekstu (R,S) izomer). Treba razumeti da su svi takvi izomeri i njihove smeše obuhvaćeni obimom ovog pronalaska. Poželjno, gde je jedinjenje prisutno kao (S,R) izomer, (S,R) izomer je prisutan u višku većem od, ili jednakom, oko 80%, poželjnije u višku većem od, ili jednakom, oko 90%, još poželjnije u višku većem od, ili jednakom, oko 95%, još poželjnije u višku većem od, ili jednakom, oko 98%, još poželjnije u višku većem od, ili jednakom, oko 99%.
[0109] Jasno je da kristalni oblik (I-HS) sadrži dva centra asimetrije i zbog toga može da se pripremi i izoluje u smeši izomera kao što je racemska ili dijastereomerna smeša, ili u enantiomerno čistom obliku. Kada je stereohemija određena punim klinom ili isprekidanom linijom koja predstavlja određenu konfiguraciju, tada je taj stereoizomer tako određen i definisan.
[0110] Kako se ovde koristi, osim ako nije drugačije naznačeno, termin "izolovani oblik" će značiti da je jedinjenje prisutno u obliku koji je odvojen od bilo koje čvrste smeše sa drugim jedinjenjem/jedinjenjima, sistemom rastvarača ili biološkim okruženjem. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) je prisutan kao izolovani oblik.
[0111] Kako se ovde koristi, osim ako nije drugačije naznačeno, termin "suštinski čist oblik" znači da je molski procenat nečistoća u izolovanom jedinjenju ili kristalnom obliku manji od oko 5 molskih procenata, poželjno manji od oko 2 molska procenta, poželjnije, manji od oko 0.5 molskih procenata, najpoželjnije, manji od oko 0.1 molskog procenta. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) je prisutan kao suštinski čist oblik.
[0112] Kako se ovde koristi, osim ako nije drugačije naznačeno, izraz "suštinski bez drugog/drugih amorfnih, polimorfnih ili kristalnih oblika" kada se koristi za opisani kristalni oblik (I-HS) značiće da je molski procenat drugog/drugih amorfnih, polimorfnih ili kristalnih oblika izolovane baze kristalnog oblika (I-HS) manji od oko 5 molskih procenata, poželjno manji od oko 2 molska procenta, poželjnije manji od oko 0.5 molskih procenta, najpoželjnije manji od oko 0.1 molskog procenta. U nekim primerima izvođenja, kristalni oblik (I-HS) je prisutan kao oblik suštinski bez drugog/drugih amorfnih, polimorfnih ili kristalnih oblika.
[0113] Termini "polimorf" i "polimorfni oblik" odnose se na različite kristalne oblike jednog jedinjenje. To jest, polimorfi su različite čvrste materije koje dele istu molekularnu formulu, ali svaki polimorf može imati različita fizička svojstva čvrstog stanja. Stoga, jedno jedinjenje može da ima različite polimorfne oblike, gde svaki oblik ima različita i distinktivna fizičke svojstva čvrstog stanja, kao što su različiti profili rastvorljivosti, brzine rastvaranja, temperature topljenja, tečljivost, i/ili različiti pikovi rendgenske difrakcije. Razlike u fizičkim svojstvima mogu da utiču na farmaceutske parametre kao što su stabilnost pri skladištenju, kompresibilnost i gustina (što može da bude važno u formulaciji i izradi proizvoda) i brzina rastvaranja (što može da bude važan faktor u bioraspoloživosti). Tehnike za karakterizaciju polimorfnih oblika uključuju, ali nisu ograničene na, rendgensku difraktometriju praha (XRPD), diferencijalnu skenirajuću kalorimetriju (DSC), termičku gravimetrijsku analizu (TGA), monokristalnu rendgensku difraktometriju (XRD), vibracionu spektroskopiju, npr., infracrvenu (IR) i Ramansku spektroskopiju, spektroskopiju nuklearne magnetne rezonancije čvrstog stanja i rastvora (NMR), optičku mikroskopiju, optičku mikroskopiju na vrućoj fazi, skenirajuću elektronsku mikroskopiju (SEM), elektronsku kristalografiju i kvantitativnu analizu, analizu veličine čestica (PSA), analizu površine, merenja rastvorljivosti, merenja procesa rastvaranja, elementalnu analizu i Karl-Fišerovu analizu.
[0114] Termin "amorfan" označava čvrstu materiju u čvrstom stanju koje nije kristalno stanje. Amorfne čvrste materije su neuređeni rasporedi molekula i stoga ne poseduju prepoznatljivu kristalnu rešetku ili jediničnu ćeliju i stoga nemaju definisano dugodometno uređenje. Čvrsti oblik čvrste materije se može odrediti polarizovanom svetlosnom mikroskopijom, rendgenskom difrakcijom praha ("XRPD"), diferencijalnom skenirajućom kalorimetrijom ("DSC"), ili drugim standardnim tehnikama poznatim stručnjacima u ovoj oblasti.
[0115] Kako se ovde koristi, osim ako nije drugačije naznačeno, termini "lečenje", "tretman" i slično će uključivati zbrinjavanje i negu subjekta ili pacijenta (poželjnije sisara, poželjnije čoveka) u svrhu suzbijanje bolesti, stanja, ili poremećaja i uključuju davanje opisanog jedinjenja za ublažavanje simptoma ili komplikacija, ili smanjenje stope progresije bolesti, stanja, ili poremećaja.
[0116] Kako se ovde koristi, osim ako nije drugačije naznačeno, termin "prevencija" uključuje (a) smanjenje učestalosti jednog ili više simptoma; (b) smanjenje težine jednog ili više simptoma; (c) odlaganje ili izbegavanje razvoja dodatnih simptoma; i/ili (d) odlaganje ili izbegavanje razvoja poremećaja ili stanja.
[0117] Kako se ovde koristi, termin "kancer povezan sa Trk" biće definisan tako da uključuje kancere povezane sa, ili koji imaju disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr. bilo koji od tipova disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, opisanih ovde). Ovde su opisani neograničavajući primeri kancera povezanog sa Trk.
[0118] Kako se ovde koristi, termin "bol" treba da bude definisan tako da uključuje akutni, hronični, upalni i neuropatski bol, uključujući dijabetičku neuropatiju. Dalje, bol može biti centralno posredovan, periferno posredovan, uzrokovan povredom strukturnog tkiva, izazvan povredom mekog tkiva ili izazvan progresivnom bolešću. Bilo koja centralno posredovana, periferno posredovana, povreda strukturnog tkiva, povreda mekog tkiva ili progresivni bol povezan sa bolešću može biti akutni ili hronični.
[0119] Kako se ovde koristi, osim ako nije drugačije naznačeno, bol uključuje upalni bol, centralno posredovan bol, periferno posredovan bol, visceralni bol, strukturalno posredovani bol, bol povezan sa kancerom, bol povezan sa povredom mekog tkiva, bol povezan sa progresivnom bolešću, neuropatski bol, akutni bol od akutne povrede, akutni bol od traume, akutni bol od operacije, glavobolju, zubobolju, bol u leđima (poželjno bol u donjem delu leđa), hronični bol od neuropatskih stanja i hronični bol od stanja nakon moždanog udara.
[0120] Neki primeri izvođenja uključuju postupke za lečenje bola, pri čemu je bol akutni bol. Neki primeri izvođenja uključuju postupke za lečenje bola, pri čemu je bol hronični bol. Neki primeri izvođenja uključuju postupke za lečenje bola, pri čemu je bol neuropatski bol, uključujući dijabetičku neuropatiju. Neki primeri izvođenja uključuju postupke za lečenje bola, pri čemu je bol upalni bol.
[0121] U nekim primerima izvođenja, bol je izabran iz grupe koja se sastoji od osteoartritisa, reumatoidnog artritisa, fibromialgije, glavobolje, zubobolje, opekotina, opekotina od sunca, ujeda životinje (kao što je ujed psa, ujed mačke, ujed zmije, ujed pauka, ubod insekata, i slično), neurogene bešike, benigne hipertrofije prostate, intersticijalnog cistitisa, rinitisa, kontaktnog dermatitis/preosetljivosti, svraba, ekcema, faringitisa, mukozitisa, enteritisa, celulitisa, kauzalgije, išijadičnog neuritisa, neuralgije mandibularnog zgloba, perifernog neuritisa, polineuritisa, bola u postamputacionom patrljku, fantomskog bola u udovima, postoperativnog ileusa, holecistitisa, sindroma bola nakon mastektomije, oralnog neuropatskog bola, Charcotovog bola, refleksne simpatičke distrofije, Guillain-Barre-ovog sindroma, meralgije parestetike, sindroma pečenja u ustima, postherpetičke neuralgije, trigeminalne neuralgije, periferne neuropatije, bilateralne periferne neuropatije, dijabetičke neuropatija, postherpetičke neuralgije, trigeminalne neuralgije, optičkog neuritisa, postfebrilnog neuritisa, migrirajućeg neuritisa, segmentnog neuritisa, Gombault-ovog neuritisa, neuronitisa, cervikobrahijalne neuralgije, kranijalne neuralgije, genikulatne neuralgije, glosofaringijalne neuralgije, migrenske neuralgije, idiopatske neuralgije, interkostalne neuralgije, neuralgije mlečne žlezde, Morton-ove neuralgije, nazocilijarne neuralgije, okcipitalne neuralgije, crvene neuralgije, Sluder-ove neuralgije, splenopalatinske neuralgije, supraorbitalne neuralgije, vidian neuralgije, inflamatorne bolesti creva, sindroma iritabilnog creva, porođajnih bolova, bola nakon porođaja, menstrualnih grčeva, kancera, bola u leđima, bola u donjem delu leđa i bola kod sindroma karpalnog tunela.
[0122] Akutni bol uključuje bol uzrokovan akutnom povredom, traumom, bolešću ili operacijom (na primer, operaciju na otvorenom grudnom košu (uključujući operaciju na otvorenom srcu ili bajpas)). Akutni bol takođe uključuje, i nije ograničen na, glavobolju, postoperativni bol, bol kod kamena u bubregu, bol u žučnoj kesi, bol kod žučnog kamena, akušerski bol, reumatološki bol, bol u zubima ili bol izazvan sportsko-medicinskim povredama, sindrom karpalnog tunela, opekotine, mišićnoskeletna uganuća i istegnuća, mišićno-tetivna istegnuća, sindrome cervikobrahijalnog bola, dispepsiju, čir na želucu, čir na dvanaestopalačnom crevu, dismenoreju ili endometriozu.
[0123] Hronični bol uključuje bol izazvan upalnim stanjem, osteoartritisom, reumatoidnim artritisom ili kao posledica bolesti, akutne povrede ili traume. Hronični bol takođe uključuje, i nije ograničen na, glavobolju, bol u gornjem delu leđa ili bol u donjem delu leđa (izabran od bola u leđima koji je rezultat sistematske, regionalne ili primarne bolesti kičme (izabrano iz radikulopatije)), bol u kostima (izabran od bola u kostima usled osteoartritisa, osteoporoze, metastaza na kostima ili nepoznatih razloga), bol u karlici, bol u vezi sa povredom kičmene moždine, kardijačni bol u grudima, nekardijačni bol u grudima, centralni bol nakon moždanog udara, miofascijalni bol, bol kod kancera, bol kod AIDS-a, bol u srpastim ćelijama, gerijatrijski bol ili bol uzrokovan glavoboljom, migrenom, trigeminalnom neuralgijom, sindromom temporomandibularnog zgloba, sindromom fibromijalgije, osteoartritisom, reumatoidnim artritisom, gihtom, fibrozitisom ili sindromom torakalnog izlaza.
[0124] Neuropatski bol uključuje bol koji je rezultat hroničnih ili iscrpljujućih stanja ili poremećaja. Hronična ili iscrpljujuća stanja ili poremećaji koji mogu dovesti do neuropatskog bola uključuju, ali nisu ograničeni na, bolnu dijabetičku perifernu neuropatiju, postherpetičku neuralgiju, trigeminalnu neuralgiju, bol posle moždanog udara, bol povezan sa multiplom sklerozom, bol povezan sa neuropatijama, kao kod idiopatske ili posttraumatske neuropatije i mononeuritisa, neuropatski bol povezan sa HIV-om, neuropatski bol povezan sa kancerom, neuropatski bol povezan sa karpalnim tunelom, bol povezan sa povredom kičmene moždine, sindrom kompleksnog regionalnog bola, neuropatski bol povezan sa fibromialgijom, lumbalni i cervikalni bol, refleksnu simpatičku distrofiju, sindrom fantomskih udova i drugi sindromi bola povezanog sa hroničnim i iscrpljujućim stanjem.
[0125] "Akutni neurodegenerativni poremećaji ili bolesti" uključuju, ali nisu ograničeni na, različite vrste akutnih neurodegenerativnih poremećaja povezanih sa smrću ili oštećenjem neurona uključujući cerebrovaskularnu insuficijenciju, fokalnu traumu mozga, difuzno oštećenje mozga i povredu kičmene moždine, odnosno, cerebralnu ishemiju ili infarkt uključujući embolijsku okluziju i trombotičku okluziju, reperfuziju nakon akutne ishemije, perinatalne hipoksično-ishemijske povrede, srčani zastoj, kao i intrakranijalno krvarenje bilo kog tipa (uključujući, ali bez ograničenja, epiduralno, subduralno, subarahnoidno i intracerebralno), i intrakranijalne i intravertebralne lezije (uključujući, ali bez ograničenja, kontuziju, penetraciju, smicanje, kompresiju i laceraciju) i sindrom potresenog deteta. U nekim primerima izvođenja, akutni neurodegenerativni poremećaj je posledica moždanog udara, akutne ishemijske povrede, povrede glave ili kičme.
[0126] "Hronični neurodegenerativni poremećaji ili bolesti" uključuju, ali nisu ograničeni na, Alchajmerovu bolest, Pikovu bolest, bolest difuznog Levijevog tela, progresivnu supranuklearnu paralizu (Steel-Richardson-ov sindrom), multisistemsku degeneraciju (Shy-Drager-ov sindrom), hronična epileptička stanja povezana sa neurodegeneracijom, bolesti motornih neurona uključujući amiotrofičnu lateralnu sklerozu, degenerativne ataksije, kortikobazalnu degeneraciju, kompleks ALS-Parkinsonizam-demencija Guama, subakutni sklerozirajući panencefalitis, Hantingtonovu bolest, Parkinsonovu bolest, sinukleinopatije (uključujući višestruku sistemsku atrofiju), primarnu progresivnu afaziju, striatonigralnu degeneraciju, Machado-Joseph-ovu bolest/spinocerebelarnu ataksiju tip 3 i olivopontocerebelarne degeneracije, Gilles De La Tourette-ovu bolest, bulbarnu i pseudobulbarnu paralizu, spinalnu i spinobulbarnu mišićnu atrofiju (Kennedy-jevu bolest), multiplu sklerozu, primarnu lateralnu sklerozu, familijarnu spastičnu paraplegiju, Werdnig-Hoffmann-ovu bolest, Kugelberg-Welander-ovu bolest, Tay-Sach-ovu bolest, Sandhoff-ovu bolest, familijarnu spastičnu bolest, Wohlfart-Kugelberg-Welander-ovu bolest, spastičnu paraparezu, progresivnu multifokalnu leukoencefalopatiju, familijarnu disautonomiju (Riley-Day sindrom) i prionske bolesti (uključujući, ali bez ograničenja, Creutzfeldt-Jakob, Gerstmann-Straussler-Scheinker-ovu bolest, Kuru i fatalnu familijarnu nesanicu). U nekim primerima izvođenja, hronični neurodegenerativni poremećaj je izabran između Alchajmerove bolesti, Parkinsonove bolesti, multiple skleroze ili cerebralne paralize.
[0127] Termin "subjekt", kako se ovde koristi, se odnosi na životinju, poželjno sisara, najpoželjnije čoveka, koji je bio predmet lečenja, posmatranja ili eksperimenta. U nekim primerima izvođenja, subjekt je doživeo i/ili ispoljio najmanje jedan simptom bolesti ili poremećaja koji treba lečiti i/ili prevenirati. U nekim primerima izvođenja, pacijent je pedijatrijski pacijent (tj. pacijent mlađi od 21 godine u trenutku postavljanja dijagnoze ili lečenja). Termin "pedijatrijski" se dalje može podeliti na različite podpopulacije uključujući: novorođenčad (od rođenja do prvih 28 dana života); odojčad (od 29 dana do manje od dve godine starosti); decu (od dve do manje od 12 godina starosti); i adolescente (od 12 do 21 godine starosti (do, ali ne uključujući, dvadeset drugi rođendan)).
[0128] U nekim primerima izvođenja, identifikovano je da subjekt ima, ili mu je dijagnostikovan, kancer sa disregulacijom gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., utvrđeno upotrebom testa ili kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA). U nekim primerima izvođenja, subjekt ima tumor koji je pozitivan na disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., utvrđeno upotrebom testa ili kompleta koji je odobrila regulatorna agencija). Subjekt može da bude subjekt sa tumorom/tumorima koji su pozitivni na disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., identifikovan kao pozitivan upotrebom testa ili kompleta koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA). Subjekt može da bude subjekt čiji tumori imaju disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., pri čemu je tumor identifikovan kao takav upotrebom kompleta ili testa koji je odobrila regulatorna agencija, npr., FDA). U nekim primerima izvođenja, sumnja se da subjekt ima kancer povezan sa Trk. U nekim primerima izvođenja, subjekt ima klinički karton u kome je navedeno da subjekt ima tumor koji ima disregulaciju gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (i opciono klinički karton ukazuje na to da bi subjekt trebalo da se leči bilo kojom od ovde datih kompozicija).
[0129] Termin "Trk" ili "Trk protein" uključuje bilo koji od ovde opisanih Trk proteina (npr., protein TrkA, TrkB, ili TrkC).
[0130] Termin "gen NTRK" uključuje bilo koji od ovde opisanih gena NTRK (npr., gen NTRK1, NTRK2, ili NTRK3).
[0131] Termin "divljeg tipa" ili "divlji tip" opisuje nukleinsku kiselinu (npr., gen NTRK ili Trk iRNK) ili protein (npr., Trk protein) koji se nalazi u subjektu koji nema kancer povezan sa Trk (i opciono takođe nema povećan rizik od razvoja kancera ili stanja povezanog sa Trk i/ili se ne sumnja da ima kancer ili stanje povezano sa Trk) ili se nalazi u ćeliji ili tkivu subjekta koji nema kancer ili stanje povezano sa Trk (i opciono takođe nema povećan rizik od razvoja kancera ili stanja povezanog sa Trk i/ili se ne sumnja da ima kancer ili stanje povezano sa Trk).
[0132] Termin "regulatorna agencija" označava agenciju određene zemlje koja odobrava medicinsku upotrebu farmaceutskih agenasa u toj zemlji. Na primer, neograničavajući primer regulatorne agencije je američka Uprava za hranu i lekove (FDA).
[0133] Izraz "disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa" označava genetsku mutaciju (npr., translokacija gena NTRK koja rezultuje ekspresijom fuzionog proteina, delecija u genu NTRK koja rezultuje ekspresijom Trk proteina koji uključuje deleciju najmanje jedne aminokiseline u poređenju sa Trk proteinom divljeg tipa, ili mutacija u genu NTRK koja rezultuje ekspresijom Trk proteina sa jednom ili više tačkastih mutacija, alternativna verzija splajsovanja Trk iRNK koja rezultuje Trk proteinom koji dovodi do delecije najmanje jedne aminokiseline u Trk proteinu u poređenju sa Trk proteinom divljeg tipa), ili duplikacija gena NTRK koja rezultuje prekomernom ekspresijom Trk proteina) ili autokrinu aktivnost koja je rezultat prekomerne ekspresije gena NTRK u ćeliji, koja rezultuje patogenim povećanjem aktivnosti kinaznog domena Trk proteina (npr. konstitutivno aktivni kinazni domen Trk proteina) u ćeliji. Na primer, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može da bude mutacija u genu NTRK1, NTRK2, ili NTRK3 koji kodira Trk protein koji je konstitutivno aktivan ili ima povećanu aktivnost u poređenju sa proteinom kodiranim genom NTRK1, NTRK2 ili NTRK3 koji ne uključuje mutaciju. Na primer, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može da bude rezultat translokacije gena koja rezultuje ekspresijom fuzionog proteina koji sadrži prvi deo TrkA, TrkB, ili TrkC koji uključuje funkcionalni kinazni domen, i drugi deo partnerskog proteina (tj. koji nije TrkA, TrkB, ili TrkC). Gen koji kodira fuzioni protein može da uključuje, npr., sledeće egzone gena NTRK1 divljeg tipa: egzone 10-19, egzone 12-19, egzone 12-19, egzone 13-19, egzone 14-19, ili egzone 15-19. Gen koji kodira fuzioni protein može da uključuje, npr., sledeće egzone gena NTRK2 divljeg tipa: egzone 12-21, egzone 13-21, egzone 15-21, egzone 16-21, ili egzone 17-21. Gen koji kodira fuzioni protein može da uključuje, npr., sledeće egzone gena NTRK3 divljeg tipa: egzone 17-22 ili egzone 16-22. Neograničavajući primeri fuzionih proteina koji su rezultat translokacije NTRK gena opisani su u tabelama 1, 3 i 4.
[0134] Disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može, npr., da uključuje mutaciju/mutacije u genu NTRK1, NTRK2, ili NTRK3 koja rezultuje TrkA, TrkB, ili TrkC koji sadrži najmanje jednu (npr., dve, tri, četiri, ili pet) tačkastu mutaciju (npr., jednu ili više tačkastih mutacija što je navedeno u tabeli 6). Disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može, npr., da uključuje mutaciju u NTRK2 genu koja rezultuje TrkB proteinom koji sadrži tačkastu mutaciju V673M. Disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može, npr., da uključuje mutaciju u NTRK3 genu koja rezultuje TrkC proteinom koji sadrži tačkastu mutaciju H677Y.
[0135] Disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može da bude mutacija u genu NTRK1, NTRK2, ili NTRK3 koja rezultuje delecijom jedne ili više uzastopnih aminokiselina (npr., najmanje dve, najmanje tri, najmanje četiri, najmanje 5, najmanje 6, najmanje 7, najmanje 8, najmanje 9, najmanje 10, najmanje 15, najmanje 20, najmanje 30, najmanje 40, najmanje 50, najmanje 60, najmanje 70, najmanje 80, najmanje 90, najmanje 100, najmanje 110, najmanje 120, najmanje 130, najmanje 140, najmanje 150, najmanje 160, najmanje 170, najmanje 180, najmanje 190, najmanje 200, najmanje 210, najmanje 220, najmanje 230, najmanje 240, najmanje 250, najmanje 260, najmanje 270, najmanje 280, najmanje 290, najmanje 300, najmanje 310, najmanje 320, najmanje 330, najmanje 340, najmanje 350, najmanje 360, najmanje 370, najmanje 380, najmanje 390, ili najmanje 400 aminokiselina) u proteinu TrkA, TrkB, ili TrkC (osim delecije aminokiselina u kinaznom domenu TrkA, TrkB, ili TrkC koja bi dovela do inaktivacije kinaznog domena). U nekim primerima izvođenja, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može da uključuje deleciju u genu NTRK1 koja rezultuje TrkA proteinom kome nedostaje NGF-vezujuće mesto ili egzon 10, koji uključuje NGF-vezujuće mesto, od kojih je ovo drugo povezano sa akutnom mijeloidnom leukemijom.
[0136] U nekim primerima, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, može da uključuje alternativni oblik splajsovanja Trk iRNK, npr., varijantu splajsovanja TrkAIII ili alternativni oblik splajsovanja TrkA iRNK koji rezultuje proizvodnjom TrkA proteina kome nedostaju aminokiseline kodirane egzonom 10. U nekim primerima, disregulacija gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, uključuje amplifikaciju gena NTRK (npr., jednu, dve, tri ili četiri dodatne kopije gena NTRK) koje mogu da dovedu do, npr., autokrine ekspresije gena NTRK u ćeliji.
[0137] Termin "kancer ili tumor povezan sa Trk " označava kancer koji je povezan sa disregulacijom gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa (npr., kancer koji je povezan sa najmanje jednim primerom (npr., dva, tri, četiri ili pet primera) disregulacije gena NTRK, Trk proteina, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, ili nivoa, koji su ovde opisani).
[0138] Termin "sisar", kako se ovde koristi, odnosi se na toplokrvnu životinju koja ima ili je izložena riziku od razvoja bolesti opisane ovde i uključuje, ali nije ograničen na, zamorce, pse, mačke, pacove, miševe, hrčke i primate, uključujući ljude.
[0139] Termin "terapijski efikasna količina", kako se ovde koristi, označava količinu aktivnog jedinjenja ili farmaceutskog agensa koja izaziva biološki ili medicinski odgovor u sistemu tkiva, životinjskom ili ljudskom, koju traži istraživač, veterinar, lekar ili drugi kliničar, što uključuje ublažavanje simptoma bolesti ili poremećaja koji se leči. Konkretno, terapijski efikasna količina, kada se daje subjektu kome je potrebno takvo lečenje, dovoljna je za (i) lečenje ili prevenciju određene bolesti, stanja, ili poremećaja koji može da se leči inhibitorom TrkA i/ili TrkB, (ii) ublažavanje, olakšavanje, ili eliminisanje jednog ili više simptoma određene bolesti, stanja, ili poremećaja, ili (iii) sprečavanje ili odlaganje početka jednog ili više simptoma određene bolesti, stanja, ili poremećaja opisanog ovde. Količina kristalnog oblika (I-HS) koja će odgovarati takvoj terapijski efikasnoj količini variraće u zavisnosti od faktora kao što su stanje bolesti i njena težina, identitet (npr., težina) sisara kome je potrebno lečenje, ali ipak može bude rutinski određena od strane stručnjaka.
[0140] Kako se ovde koristi, termin "kompozicija" je namenjen da obuhvata proizvod koji sadrži navedene sastojke u navedenim količinama, kao i svaki proizvod koji nastaje, direktno ili indirektno, iz kombinacije navedenih sastojaka u navedenim količinama.
[0141] Da bi se pružio sažetiji opis, neki od kvantitativnih izraza koji su ovde dati nisu kvalifikovani terminom "oko". Podrazumeva se da bez obzira da li se termin "oko" koristi eksplicitno ili ne, svaka količina koja je ovde data treba da se odnosi na stvarnu datu vrednost, a takođe treba da se odnosi na aproksimaciju takve date vrednosti koja bi se razumno mogla zaključiti na osnovu uobičajene veštine u ovoj oblasti, uključujući aproksimacije zbog eksperimentalnih i/ili uslova merenja za takvu datu vrednost.
[0142] U nekim primerima izvođenja, termin "oko" se ovde koristi da znači približno, u oblasti, otprilike, ili oko. Kada se termin "oko" koristi zajedno sa numeričkim opsegom, on modifikuje taj opseg tako što proširuje granice iznad i ispod navedenih numeričkih vrednosti. Generalno, termin "oko" se ovde koristi za modifikovanje numeričke vrednosti iznad i ispod navedene vrednosti za varijansu od 10%.
[0143] Termin "oko" koji prethodi jednom ili više položaja pika na dijagramu rendgenske difrakcije praha znači da su svi pikovi grupe kojoj prethodi prikazani u smislu ugaonih položaja (dva teta) sa dozvoljenom varijabilnošću od ± 0.3°. Varijabilnost od ± 0.3° je namenjena da se koristi kada se uporede dva obrasca rendgenske difrakcije praha. U praksi, ako se piku difrakcionog obrasca iz jednog obrasca dodeli opseg ugaonih položaja (dva teta) što je izmereni položaj pika ± 0.3° i ako se ti opsezi položaja pikova preklapaju, onda se smatra da dva pika imaju isti ugaoni položaj. Na primer, ako je utvrđeno da pik iz jednog obrasca ima položaj od 11.0°, radi poređenja, dozvoljena varijabilnost omogućava da se piku dodeli položaj u opsegu od 10.7°-11.3°.
[0144] Termin "oko" koji prethodi vrednostima u DSC, TGA, TG, ili DTA, koje su prikazane kao stepeni Celzijusa, imaju dozvoljenu varijabilnost od ± 5° C.
[0145] Da bi se obezbedio sažetiji opis, neki od kvantitativnih izraza ovde su navedeni kao opseg od približno količine X do približno količine Y. Podrazumeva se da kada se navodi opseg, opseg nije ograničen na navedenu gornju i donju granicu, već radije uključuje ceo opseg od približno količine X do približno količine Y, ili bilo koji opseg u njemu.
[0146] Dalje su ovde navedene farmaceutske kompozicije koje sadrže kristalni oblik (I-HS) sa farmaceutski prihvatljivim nosačem. Farmaceutske kompozicije koje sadrže kristalni oblik (I-HS) kao aktivni sastojak mogu da se pripreme detaljnim mešanjem kristalnog oblika (I-HS) sa farmaceutskim nosačem prema konvencionalnim tehnikama farmaceutske kompaundiranja. Nosač može da ima širok spektar oblika u zavisnosti od željenog puta primene (npr., oralni, parenteralni). Tako za tečne oralne preparate kao što su suspenzije, eliksiri i rastvori, pogodni nosači i aditivi uključuju vodu, glikole, ulja, alkohole, arome, konzervanse, stabilizatore, sredstva za bojenje i slično; za čvrste oralne preparate, kao što su praškovi, kapsule i tablete, pogodni nosači i aditivi uključuju skrobove, šećere, razblaživače, agense za granulaciju, lubrikante, veziva, sredstva za dezintegraciju i slično. Čvrsti oralni preparati takođe mogu da budu obloženi supstancama kao što su šećeri ili da budu obloženi enteričnom prevlakom kako bi se izmenilo glavno mesto apsorpcije. Za parenteralnu primenu, nosač će se obično sastojati od sterilne vode i drugi sastojci se mogu dodati da bi se povećala rastvorljivost ili konzerviranost. Suspenzije ili rastvori za injekcije takođe mogu da se pripreme korišćenjem vodenih nosača zajedno sa odgovarajućim aditivima.
[0147] Kristalni oblik (I-HS) može da se primeni bilo kojim pogodnim putem, npr. u gastrointestinalni trakt (npr. rektalno ili oralno), nos, pluća, muskulaturu ili vaskulaturu, ili transdermalno ili dermalno. Kristalni oblik (I-HS) može se administrirati u bilo kom pogodnom obliku primene, npr. tablete, praškovi, kapsule, rastvori, disperzije, suspenzije, sirupi, sprejevi, supozitorije, gelovi, emulzije, flasteri, itd. Takve kompozicije mogu da sadrže komponente uobičajene u farmaceutskim preparatima, npr. razblaživače, nosače, modifikatore pH, zaslađivače, sredstva za povećanje zapremine, i dodatne aktivne agense. Ako se želi parenteralna primena, kompozicija će biti sterilna u obliku rastvora ili suspenzije pogodnog za injekciju ili infuziju. Takve kompozicije čine sledeći aspekt pronalaska.
[0148] Ovde su takođe obezbeđene farmaceutske kompozicije koje sadrže kristalni oblik (I-HS). Da bi se pripremile farmaceutske kompozicije koje su ovde date, kristalni oblik (I-HS) kao aktivni sastojak se detaljno pomeša sa farmaceutskim nosačem u skladu sa konvencionalnim tehnikama farmaceutskog kompaundiranja, pri čemu nosač može da ima širok spektar oblika u zavisnosti od oblika preparata poželjnog za primenu, npr., oralno ili parenteralno, kao što je intramuskularno. Za pripremu kompozicija u oralnom doznom obliku može da se koristi bilo koja od uobičajenih farmaceutskih podloga. Tako, za tečne oralne preparate, kao što su na primer, suspenzije, eliksiri i rastvori, pogodni nosači i aditivi uključuju vodu, glikole, glicerole, ulja, ciklodekstrine, alkohole, npr., etanol, arome, konzervanse, boje i slično; za čvrste oralne preparate kao što su na primer, praškovi, kapsule, kaplete, gel-kapsule i tablete, pogodni nosači i aditivi uključuju skrobove, šećere, razblaživače, agense za granulaciju, lubrikante, veziva, sredstva za dezintegraciju i slično. Odgovarajuća veziva uključuju, bez ograničenja, skrob, želatin, prirodne šećere kao što su glukoza ili beta-laktoza, kukuruzne zaslađivače, prirodne i sintetičke gume kao što su bagrem, tragakant ili natrijum oleat, natrijum stearat, magnezijum stearat, natrijum benzoat, natrijum acetat, natrijum hlorid i slično. Sredstva za dezintegraciju uključuju, bez ograničenja, skrob, metil celulozu, agar, bentonit, ksantan gumu i slično.
[0149] Zbog njihove lakoće primene, tablete i kapsule predstavljaju najpovoljniji jedinični oblik oralne doze, u kom slučaju se očigledno koriste čvrsti farmaceutski nosači. Po želji, tablete mogu biti obložene šećerom ili enterično obložene standardnim tehnikama. Za parenteralnu upotrebu, nosač će obično sadržati sterilnu vodu, mada i drugi sastojci, na primer, u svrhe kao što je olakšavanje rastvorljivosti ili konzerviranje, mogu da budu uključeni. Suspenzije za injekcije se takođe mogu pripremiti, u kom slučaju mogu da se koriste odgovarajući tečni nosači, sredstva za suspendovanje i slično. Farmaceutske kompozicije u ovom dokumentu će sadržati, po doznoj jedinici, npr., tablete, kapsule, praška, injekcije, kašičice, i slično, količinu aktivnog sastojka neophodnu za isporuku efikasne doze kao što je gore opisano.
[0150] Farmaceutska kompozicija ovde će sadržati, po pojedinačnoj doznoj jedinici, npr. tablete, kapsule, suspenzije, rastvora, kesice za rekonstituciju, praška, injekcije, IV, supozitorije, sublingvalnog/bukalnog filma, kašičice, i slično, od oko 0.1-1000 mg ili bilo koji opseg unutar navedenog, i mogu se davati u dozi od oko 0.01-300 mg/kg/dan, ili bilo kog opsega unutar navedenog, poželjno od oko 0.5-50 mg/kg/dan, ili bilo kog opsega unutar navedenog. U nekim primerima izvođenja, ovde date farmaceutske kompozicije sadrže, po pojedinačnoj doznoj jedinici, oko 25 mg do oko 500 mg ovde datog jedinjenja (na primer, oko 25 mg do oko 400 mg, oko 25 mg do oko 300 mg oko 25 mg do oko 250 mg, oko 25 mg do oko 200 mg, oko 25 mg do oko 150 mg, oko 25 mg do oko 100 mg, oko 25 mg do oko 75 mg, oko 50 mg do oko 500 mg, oko 100 mg do oko 500 mg, oko 150 mg do oko 500 mg, oko 200 mg do oko 500 mg, oko 250 mg do oko 500 mg, oko 300 mg do oko 500 mg, oko 400 mg do oko 500 mg, oko 50 do oko 200 mg, oko 100 do oko 250 mg, oko 50 do oko 150 mg). U nekim primerima izvođenja, ovde date farmaceutske kompozicije sadrže, po pojedinačnoj doznoj jedinici, oko 25 mg, oko 50 mg, oko 100 mg, oko 150 mg, oko 200 mg, oko 250 mg, oko 300 mg, oko 400 mg, ili oko 500 mg ovde datog jedinjenja. Doze, međutim, mogu da variraju u zavisnosti od zahteva pacijenata, težine stanja koje se leči i jedinjenja koje se primenjuje. U nekim primerima izvođenja, doze se daju jednom dnevno (QD) ili dva puta dnevno (BID).
[0151] Poželjno je da su ove kompozicije u jediničnim doznim oblicima kao što su tablete, pilule, kapsule, praškovi, granule, sterilni parenteralni rastvori ili suspenzije, dozirani aerosol ili tečni sprejevi, kapi, ampule, autoinjektorski uređaji ili supozitorije; za oralnu parenteralnu, intranazalnu, sublingvalnu ili rektalnu primenu, ili za primenu inhalacijom ili insuflacijom. Alternativno, kompozicija može biti predstavljena u obliku pogodnom za primenu jednom nedeljno ili jednom mesečno; na primer, nerastvorljiva so aktivnog jedinjenja, kao što je dekanoatna so, može da bude prilagođena tako da obezbedi depo preparat za intramuskularnu injekciju. Za pripremu čvrstih kompozicija kao što su tablete, kristalni oblik (I-HS) se meša sa farmaceutskim nosačem, npr. konvencionalnim sastojcima za tabletiranje, kao što su kukuruzni skrob, laktoza, saharoza, sorbitol, talk, stearinska kiselina, magnezijum stearat, dikalcijum fosfat ili gume, i drugim farmaceutskim razblaživačima, npr. vodom, da bi se formirala čvrsta preformulisana kompozicija koja sadrži homogenu smešu kristalnog oblika (I-HS). Kada se ove preformulisane kompozicije nazivaju homogenim, podrazumeva se da je aktivni sastojak ravnomerno raspoređen po kompoziciji, tako da kompozicija može lako da se podeli na podjednako efikasne dozne oblike kao što su tablete, pilule i kapsule. Ova čvrsta preformulisana kompozicija se zatim deli na jedinične dozne oblike gore opisanog tipa koji sadrže od 0.1 do oko 1000 mg, ili bilo koju količinu ili opseg unutar navedenog, aktivnog sastojka koji je ovde dat. Tablete ili pilule nove kompozicije mogu da se oblože ili na drugi način kompaundiraju da bi se dobio dozni oblik koji daje prednost produženog dejstva. Na primer, tableta ili pilula može da sadrži unutrašnju doznu komponentu i spoljašnju doznu komponentu, pri čemu je ova druga u obliku omotača preko prve. Dve komponente mogu da budu razdvojene enteričnim slojem koji služi da se odupre dezintegraciji u želucu i omogućava unutrašnjoj komponenti da netaknuta prođe u duodenum ili da se odloženo oslobađa. Različiti materijali mogu da se koriste za takve enteričke slojeve ili obloge, takvi materijali uključujući brojne polimerne kiseline sa takvim materijalima kao što su šelak, cetil alkohol i celulozni acetat.
[0152] Tečni oblici u koje ovde date nove kompozicije mogu da se inkorporiraju za primenu oralnim putem ili injekcijom, uključuju vodene rastvore, ciklodekstrine, odgovarajuće aromatizovane sirupe, vodene ili uljane suspenzije, i aromatizovane emulzije sa jestivim uljima kao što je ulje semena pamuka, susamovo ulje, kokosovo ulje ili ulje kikirikija, kao i eliksire i slične farmaceutske vehikulume. Pogodni disperzioni ili suspendujući agensi za vodene suspenzije, uključuju sintetičke i prirodne gume kao što su tragakant, bagrem, alginat, dekstran, natrijum karboksimetilceluloza, metilceluloza, polivinil-pirolidon ili želatin. Za parenteralnu primenu, poželjne su sterilne suspenzije i rastvori. Izotonični preparati koji generalno sadrže odgovarajuće konzervanse koriste se kada je poželjna intravenska primena.
[0153] Kristalni oblik (I-HS) može da se primeni u intranazalnom obliku putem lokalne upotrebe odgovarajućih intranazalnih vehikuluma, ili preko transdermalnih kožnih flastera koji su dobro poznati stručnjacima u ovoj oblasti. Da bi se primenila u obliku transdermalnog sistema za isporuku, primena doze će, naravno, biti kontinuirana, a ne povremena, tokom celog režima doziranja.
[0154] Da bi se pripremile ovde date farmaceutske kompozicije, kristalni oblik (I-HS) kao aktivni sastojak se detaljno meša sa farmaceutskim nosačem u skladu sa konvencionalnim tehnikama farmaceutskog kompaundiranja, gde nosač može da ima širok spektar oblika u zavisnosti od oblika preparata poželjnog za primenu (npr. oralni ili parenteralni). Pogodni farmaceutski prihvatljivi nosači su dobro poznati u tehnici. Opisi nekih od ovih farmaceutski prihvatljivih nosača mogu se naći u The Handbook of Pharmaceutical Excipients, u izdanju Američkog farmaceutskog udruženja i Farmaceutskog društva Velike Britanije.
[0155] Postupci za formulisanje farmaceutskih kompozicija su opisani u brojnim publikacijama kao što su Farmaceutski dozni oblici: tablete, drugo izdanje, revidirano i prošireno, sveske 1-3, uredili Lieberman et al; Farmaceutski dozni oblici: parenteralni lekovi, sveske 1-2, uredili Avis et al; i Farmaceutski Dozni oblici: disperzni sistemi, sveske 1-2, uredili Lieberman et al; objavio Marcel Dekker, Inc.
[0156] Jedinjenja obezbeđena ovde mogu da se primenjuju u bilo kojoj od prethodnih kompozicija i prema režimima doziranja utvrđenim u tehnici kad god je potrebno lečenje kancera, bola, upale, neurodegenerativne bolesti ili infekcije Tripanosoma cruzi.
[0157] Dnevna doza kristalnog oblika (I-HS) može da varira u širokom opsegu od 1.0 do 10000 mg po odraslom čoveku dnevno, ili više, ili u bilo kom opsegu unutar navedenog. Za oralnu primenu, kompozicije su poželjno obezbeđene u obliku tableta koje sadrže 0.01, 0.05, 0.1, 0.5, 1.0, 2.5, 5.0, 10.0, 15.0, 25.0, 50.0, 100, 150, 200, 250 i 500 miligrama aktivnog sastojka za simptomatsko prilagođavanje doze pacijentu koji se leči. Efikasna količina leka se obično isporučuje na nivou doze od oko 0.1 mg/kg do oko 1000 mg/kg telesne težine dnevno, ili u bilo kom opsegu unutar navedenog. Poželjno, opseg je od oko 0.5 do oko 500 mg/kg telesne težine dnevno, ili bilo koji opseg unutar navedenog. Poželjnije, od oko 1.0 do oko 250 mg/kg telesne težine dnevno, ili bilo koji opseg unutar navedenog. Poželjnije, od oko 0.1 do oko 100 mg/kg telesne težine dnevno, ili bilo koji opseg unutar navedenog. U jednom primeru, opseg može biti od oko 0.1 do oko 50.0 mg/kg telesne težine dnevno, ili bilo koja količina ili opseg unutar navedenog. U drugom primeru, opseg može biti od oko 0.1 do oko 15.0 mg/kg telesne težine dnevno, ili bilo koji opseg unutar navedenog. U još jednom primeru, opseg može biti od oko 0.5 do oko 7.5 mg/kg telesne težine dnevno, ili bilo koja količina u tom opsegu. Kristalni oblik (I-HS) može da se primenjuje u režimu od 1 do 4 puta dnevno ili u jednoj dnevnoj dozi.
[0158] Optimalne doze koje se primenjuju mogu lako da odrede stručnjaci iz ove oblasti, i one će varirati u zavisnosti od načina primene, jačine preparata, načina primene i uznapredovalosti bolesti. Pored toga, faktori povezani sa određenim pacijentom koji se leči, uključujući starost pacijenta, težinu, ishranu i vreme primene, rezultovaće potrebom za prilagođavanjem doze.
[0159] Stručnjak u ovoj oblasti će prepoznati da oba, in vivo i in vitro ispitivanja, koja koriste pogodne, poznate i opšte prihvaćene ćelijske i/ili životinjske modele, predviđaju sposobnost ispitivanog jedinjenja da leči ili spreči dati poremećaj.
[0160] Stručnjak u ovoj oblasti će dalje prepoznati da se klinička ispitivanja na ljudima, uključujući prva na ljudima, ispitivanja doznog opsega i efikasnosti, kod zdravih pacijenata i/ili onih koji pate od datog poremećaja, mogu obaviti postupcima koji su dobro poznati u kliničkim i medicinskim oblastima nauke.
[0161] Akronimi koji se nalaze u specifikaciji imaju sledeća značenja:
[0162] Sledeći primeri ilustruju pronalazak i prikazani su da pomognu u razumevanju pronalaska, i nisu namenjeni i ne treba da se tumače tako da na bilo koji način ograničavaju pronalazak izložen u patentnim zahtevima koji slede nakon toga.
[0163] U dole opisanim primerima, osim ako nije drugačije naznačeno, sve temperature su navedene u stepenima Celzijusa. Reagensi su nabavljeni od komercijalnih dobavljača kao što su Sigma-Aldrich Chemical Company, EMD, JT Baker, ili Pharco-Aaper, i korišćeni su bez daljeg prečišćavanja, osim ako nije drugačije naznačeno. Tetrahidrofuran (THF), heptan i drugi organski rastvarači su nabavljeni od komercijalnih dobavljača, kao što su Sigma-Aldrich Chemical Company, ACROS, Alfa-Aesar, Lancaster, TCI, ili Maybridge, i korišćeni kakvi su dobijeni.
[0164] Stručnjak u ovoj oblasti će prepoznati da se, tamo gde nije drugačije naznačeno, reakcioni korak/koraci izvode pod pogodnim uslovima, prema poznatim postupcima, da bi se dobio željeni proizvod. Stručnjak će takođe prepoznati da, kada se reakcioni korak, kako je ovde opisan, može izvesti u različitim rastvaračima ili sistemima rastvarača, navedeni reakcioni korak se takođe može izvesti u mešavini odgovarajućih rastvarača ili sistema rastvarača. Stručnjak u ovoj oblasti će prepoznati da, u specifikaciji i zahteva kako je ovde predstavljeno, gde se reagens ili klasa/tip reagensa (npr. baza, rastvarač, itd.) navodi u više od jednog koraka postupka, pojedinačni reagensi su nezavisno izabrani za svaki reakcioni korak i mogu biti isti ili različiti jedan od drugog. Na primer, kada se u dva koraka postupka navode organska ili neorganska baza kao reagens, organska ili neorganska baza odabrana za prvi korak može da bude ista ili različita od organske ili neorganske baze u drugom koraku.
[0165] Reakcije navedene u nastavku su uglavnom obavljene pod pozitivnim pritiskom azota (osim ako nije drugačije navedeno) u rastvaračima "stepena čistoće ACS" (American Chemical Society - američko hemijsko društvo), i reakcioni baloni su obično bili opremljeni gumenim zatvaračima za uvođenje supstrata i reagensa putem šprica ili levka za dodavanje.
[0166] Dva sistema tečne hromatografije visokih performansi sa reverznom fazom (HPLC) su korišćena za praćenje i analizu tokom postupka (in-process), korišćenjem acetonitrila i smeše voda/trifluorosirćetna kiselina kao mobilne faze. Jedan sistem je koristio Agilent Zorbax Extend C18 kolonu na 264 nm, dok je drugi sistem (u daljem tekstu "TRK1PM1 HPLC") uključivao Waters Xbridge fenil kolonu na 268 nm. Osim ako nije drugačije naznačeno, korišćen je prvi sistem. Silika za oba sistema je mešana u balonu sa jedinjenjem, a zatim filtrirana kroz polipropilensku tkaninu pre analize.
[0167] Oblik amorfne slobodne baze jedinjenja formule I: Oko 1 gram (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida se rastvori u minimalnoj količini vode i ohladi se na temperaturu od oko -26° Celzijusa, nakon čega sledi sušenje u uređaju za sušenje zamrzavanjem tokom 24 sata. Oko 20 mg amorfnog materijala dobijenog iz uređaja za sušenje zamrzavanjem je izmereno u bočici, kojoj je dodato 5 zapreminskih alikvota odgovarajućeg sistema rastvarača. Provereno je da li se smeša rastvorila i ako rastvaranje nije bilo očigledno, smeša je zagrevana na oko 40° Celzijusa i ponovo proverena. Ovaj postupak je nastavljen sve dok se ne primeti rastvaranje ili dok se ne doda 100 zapremina rastvarača. XRPD obrazac amorfnog materijala dobijenog eksperimentom sušenja zamrzavanjem prikazan je na SL.7.
[0168] Amorfna hidrogensulfatna so jedinjenja formule I je pripremljena kao što je opisano u primeru 14A u WO 2010/048314 (videti primer 3). XRPD obrasci dve različite serije amorfnog materijala pripremljenog ovim postupkom su prikazani na SL.28.
[0169] Ovde je takođe obezbeđen postupak za dobijanje kristalnog oblika (I-HS). U nekim primerima izvođenja, postupak obuhvata korake prikazane na šemi 1.
[0170] U nekim primerima izvođenja, ovde je dat postupak za pripremu kristalnog oblika (I-HS), koji obuhvata:
(a) dodavanje koncentrovane sumporne kiseline u rastvor (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida u EtOH kako bi se formirala hidrogensulfatna so (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida;
(b) dodavanje heptana u rastvor u koraku (a) da bi se formirala gusta suspenzija;
(c) filtriranje guste suspenzije da bi se izdvojio (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat;
(d) mešanje navedenog (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata sa 5:95 tež./tež. rastvorom voda/2-butanon;
(e) zagrevanje smeše iz koraka (d) na oko 65-70 °C uz mešanje dok težinski procenat etanola ne bude oko 0.5% da bi se formirala gusta suspenzija kristalnog oblika (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata; i
(f) izdvajanje kristalnog oblika (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata filtracijom.
[0171] U nekim primerima izvođenja, gore navedeno dalje obuhvata: (b1) zasejavanje rastvora iz koraka (a) sa (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfatom na sobnoj temperaturi i ostavljanje rastvora da se meša do formiranja guste suspenzije.
[0172] U nekim primerima izvođenja, ovde je dat postupak za pripremu kristalnog oblika (I-HS), koji obuhvata:
(a) reakciju 5-hloro-3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidina sa (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (R)-2-hidroksisukcinatom u prisustvu baze da bi se formirao (R)-5-(2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidin;
(b) obrada navedenog (R)-5-(2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidina pomoću Zn i hlorovodonične kiseline da bi se formirao (R)-5-(2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-amin;
(c) obrada navedenog (R)-5-(2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-amina pomoću baze i fenil hloroformata da bi se formirao fenil (R)-(5-(2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)karbamat;
(d) reakciju navedenog (R)-(5-(2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)karbamata sa (S)-pirolidin-3-olom da bi se formirao (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid;
(e) dodavanje sumporne kiseline navedenom (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamidu da bi se formirao (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat; i
(f) izdvajanje kristalnog oblika (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1, 5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata.
[0173] U nekim primerima izvođenja gore navedenog koraka (a), baza je aminska baza, kao što je trietilamin.
[0174] U nekim primerima izvođenja gore navedenog koraka (c), baza je baza alkalnog metala, kao što je karbonat alkalnog metala, kao kalijum karbonat.
Priprema A
[0175]
Priprema 5-hloro-3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidina
[0176] Korak A - Priprema natrijum pirazolo[1,5-a]pirimidin-5-olata: Rastvor 1H-pirazol-5-amina i 1,3-dimetilpirimidin-2,4(1H,3H)-diona (1.05 ekviv.) su sipani u balon okruglog dna opremljen mehaničkom mešalicom, rezervoarom za paru, refluksnim kondenzatorom, temperaturnom sondom J-Kem i N2adapterom za kontrolu pozitivnog pritiska N2. Uz mehaničko mešanje čvrsta supstanca je suspendovana sa 4 zapr. (4 mL/g) apsolutnog EtOH pod atmosferom azota, zatim dopunjena sa 2.1 ekvivalentom NaOEt (21 tež.% rastvor u EtOH), što je praćeno linijskim ispiranjem sa 1 zapr. (1 mL/g) apsolutnog EtOH. Gusta suspenzija je zagrejana do oko 75° Celzijusa i mešana na blagom refluksu dok nije zapaženo manje od 1.5 površinskih % 1H-pirazol-5-amina pomoću TRK1PM1 HPLC za praćenje napredovanja reakcije upotrebom 20 µL guste suspenzije razblažene u 4 mL dejonizovane vode i ubrizgavanjem 5 µL na 220 nm.
[0177] Nakon 1 dodatnog časa, smeša je dopunjena sa 2.5 zapr. (2.5 mL/g) heptana i zatim refluksovana na 70° Celzijusa 1 čas. Gusta suspenzija je zatim ohlađena do sobne temperature preko noći. Čvrsta supstanca je sakupljena filtracijom na stonom levka i polipropilenske filterske tkanine. Reaktor je ispran i napunjen na filter kolač sa 4 zapr. (4 mL/g) heptana sa izvučenim kolačem i čvrste materije su prebačene u tarirane posude za sušenje i sušene u pećnici na 45° Celzijusa pod visokim vakuumom dok njihova težina ne postane konstantna. Bledožuti čvrsti natrijum pirazolo[1,5-a]-pirimidin-5-olat dobijen je u prinosu od 93-96% (korigovano) i veći od 99.5% površine posmatrano pomoću HPLC (1 mg/mL razblaženja u dejonizovanoj vodi, TRK1PM1 na 220 nm).
[0178] Korak B - Priprema 3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidin-5(4H)-ona: Tariran balon sa okruglim dnom je napunjen natrijum pirazolo[1,5-a]pirimidin-5-olatom koji je rastvoren na 40-45°C u 3.0 zapr. (3.0 mL/g) dejonizovane vode, a zatim koncentrovan pod visokim vakuumom na 65° Celzijusa u vodenom kupatilu na rotacionom isparivaču sve dok nije zapaženo 2.4 x težine polaznog materijala (1.4 zapr./1.4 mL/g sadržaja dejonizovane vode). Urađena je gasna hromatografija (GC) za rezidualni EtOH (30 µL rastvora rastvorenog u ~ 1 mL MeOH) koja je pokazala manje od 100 milionitih delova sa tragovima isparenja etil nitrata koji su uočeni nakon naknadnog dodavanja HNO3. U nekim slučajevima, originalni rastvor je dopunjen sa dodatnih 1.5 zapr. (1.5 mL/g) DI vode, zatim koncentrovan pod visokim vakuumom na 65° Celzijusa u vodenom kupatilu na rotacionom isparivaču dok nije zapaženo 2.4 x težine polaznog materijala (1.4 zapr./1.4 mL/g sadržaja DI vode). Urađena je gasna hromatografija za rezidualni EtOH (30 µL rastvora rastvorenog u oko 1 mL MeOH) koja je pokazala <<100 milionitih delova zaostalog EtOH bez uočavanja isparenja etil nitrata posle naknadnog dodavanja HNO3.
[0179] Posuda sa okruglim dnom opremljena mehaničkom mešalicom, rezervoarom za paru, refluksnim kondenzatorom, temperaturnom sondom J-Kem i N2adapterom za kontrolu pozitivnog pritiska N2napunjena je sa 3 zapr. (3 mL/g, 10 ekviv.) >90 tež.% HNO3i ohlađena do oko 10° Celzijusa pod atmosferom azota korišćenjem eksternog kupatila za hlađenje sa smešom leda i vode pod atmosferom azota. Upotrebom levka za dodavanje za izjednačavanje pritisaka, rastvor HNO3je dopunjen sa 1.75-1.95 zapremina dejonizovanog vodenog rastvora natrijum pirazolo[1,5-a]pirimidin-5-olata (1.16-1.4 mL DI vode/g natrijum pirazolo[1,5-a]pirimidin-5-olat) brzinom koja omogućava održavanje unutrašnje temperature od 35-40° Celzijusa pri hlađenju. Uočena su dva azeotropa bez isparenja etil nitrata. Boca azeotropa, transportna linija (ako je primenjivo) i levak za dodavanje su isprani sa 2 x 0.1 zapr. (2 x 0.1 mL/g) dejonizovane vode dodate u reakcionu smešu. Kada je dodavanje završeno, temperatura je postepeno povećavana na oko 45-50° Celzijusa oko 3 časa, pri tome je HPLC pokazala > 99.5% površine konverzije natrijum pirazolo[1,5-a]pirimidin-5-olata u 3-nitropazolo[ 1,5-a]pirimidin-5(4H)-on.
[0180] Korak C - Priprema 5-hloro-3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidina: 3-nitropazolo[1,5-a]pirimidin-5(4H)-on je napunjen u balon sa okruglim dnom opremljenom mehaničkom mešalicom, grejnim omotačem, refluksnim kondenzatorom, temperaturnom sondom J-Kem i N2adapterom za kontrolu pozitivnog pritiska N2. Uz mehaničko mešanje čvrste materije su suspendovane sa 8 zapremina (8 mL/g) CH3CN, a zatim dopunjene 2,6-lutitinom (1.05 ekviv.) nakon čega je gusta suspenzija zagrejana na oko 50° Celzijusa. Upotrebom levka za dodavanje za izjednačavanje pritisaka, u smešu je kap po kap sipano 0.33 ekvivalenta POCl3. Ovo dodavanje je dalo gustu, bež suspenziju trimera koja je homogenizovana uz mešanje dok se ne primeti polupokretna masa. Dodatnih 1.67 ekvivalenta POCl3je sipano u smešu dok je ostavljeno da se temperatura stabilizuje, nakon čega je usledilo zagrevanje reakcione smeše do blagog refluksa (78° Celzijusa). Pri zagrevanju smeše primećeno je izvesno nadimanje koje je kasnije splasnulo kako je gusta suspenzija postala ređa.
[0181] Reakciona smeša je ostavljena da refluksuje do potpunog rastvaranja do tamnog rastvora i dok HPLC metodom (20 µL razblaženo u 5 mL CH3CN, TRK1PM1 HPLC, ubrizgavanje 5 µL, 268 nm) nije potvrđeno da nema više trimera (RRT 0.92), sa manje od 0.5% površine 3-nitropazolo[1,5-a]pirimidin-5(4H)-ona (RRT 0.79) zapažene pri ručnom uklanjanju bilo kakvih interferirajućih i rano eluirajućih pikova, povezanih sa lutidinom, iz oblasti integracije. Na skali od 1.9 kg, 0% površine trimera, 0.25% površine 3-nitropirazolo[1,5-a]pirimidin-5(4H)-ona i 99.5% površine 5-hloro-3-nitropazolo[1,5-a]pirimidina je primećeno posle 19 časova blagog refluksa korišćenjem TRK1PM1 HPLC na 268 nm
Priprema B
[0182]
Priprema (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (R)-2-hidroksisukcinata
[0183] Korak A - Priprema terc-butil (4-(2,5-difluorofenil)-4-oksobutil)-karbamata: 2-bromo-1,4-difluorobenzen (1.5 ekv.) je rastvoren u 4 zapremine THF (na osnovu težine terc-butil 2-oksopirolidin-1-karboksilata) i ohlađen na oko 5° Celzijusa. Rastvor 2.0 M iPrMgCl u THF (1.4 ekv.) je dodavan tokom 2 časa u smešu uz održavanje reakcione temperature ispod 25° Celzijusa. Rastvor je ostavljen da se ohladi na oko 5° Celzijusa i mešan je 1 čas (GC analiza je potvrdila formiranje Grinjara). Rastvor terc-butil 2-oksopirolidin-1-karboksilata (1.0 ekv.) u 1 zapremini THF je dodavan tokom oko 30 minuta uz održavanje reakcione temperature ispod 25° Celzijusa. Reakcija je mešana na oko 5° Celzijusa 90 min (pomoću HPLC je potvrđeno da terc-butil 2-oksopirolidin-1-karboksilat ima površinu manju od 0.5%). Reakcija je ugašena sa 5 zapremina 2 M vodenog rastvora HCl uz održavanje reakcione temperature ispod 45° Celzijusa. Reakcija je zatim prebačena u levak za odvajanje uz dodavanje 10 zapremina heptana i uklanjanje vodenog sloja. Organski sloj je ispran sa 4 zapremine zasićenog vodenog NaCl, a zatim je dodata 2 x 1 zapremina zasićenog vodenog NaCl. U organskom sloju rastvarač je zamenjen heptanom (<1% tež. THF, potvrđeno putem GC) na temperaturi destilacije od 35-55° Celzijusa i destilacionom pritisku od 100-200 mm Hg za 2 x 4 zapremine heptana koje su dodavane sa minimalnom destilacionom zapreminom od oko 7 zapremina. Smeša je zatim razblažena heptanom do 10 zapremina pri zagrevanju na oko 55° Celzijusa, čime je dobijena gušća čvrsta supstanca, i smeša je ostavljena da se ohladi na sobnu temperaturu preko noći. Gusta suspenzija je ohlađena na manje od 5° Celzijusa i filtrirana kroz polipropilensku filter tkaninu. Vlažni kolač je ispran sa 2 x 2 zapremine heptana. Čvrste materije su sušene pod vakuumom na 55° Celzijusa sve dok težina nije bila konstantna, dajući terc-butil (4-(2,5-difluorofenil)-4-oksobutil)-karbamat kao belu čvrstu supstancu na oko 75% do 85% teorijskog prinosa.
[0184] Korak B - Priprema 5-(2,5-difluorofenil)-3,4-dihidro-2H-pirola: terc-butil (4-(2,5-difluorofenil)-4-oksobutil)-karbamat je rastvoren u 5 zapr. toluena uz dodavanje 2.2 ekv. 12M HCl, pri čemu je zapažena blago egzotermna reakcija i razvoj gasa. Reakcija je zagrevana na 65° Celzijusa tokom 12-24 časa i praćena pomoću HPLC. Po završetku reakcija je ohlađena na manje od 15° Celzijusa u kupatilu led/voda. pH je podešen na oko 14 sa 3 ekvivalenta 2M vodenog rastvora NaOH (4.7 zapr.). Reakcija je mešana na sobnoj temperaturi 1-2 časa. Smeša je prebačena u levak za odvajanje sa toluenom. Vodeni sloj je uklonjen i organski sloj je ispran sa 3 zapremine zasićenog vodenog NaCl. Organski sloj je koncentrovan do ulja i ponovo rastvoren u 1.5 zapremine heptana. Dobijena suspenzija je filtrirana kroz filter papir GF/F i koncentrovana do svetlo žutog ulja 5-(2,5-difluorofenil)-3,4-dihidro-2H-pirola sa teorijskim prinosom od 90% do 100%.
[0185] Korak C - Priprema (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidina: Hloro-1,5-ciklooktadien iridijum dimer (0.2 mol%) i (R)-2-(2-(difenilfosfino)fenil)-4-izopropil-4,5-dihidrooksazol (0.4 mol%) su suspendovani u 5 zapremina MTBE (na bazi 5-(2,5-difluorofenil)-3,4-dihidro-2H-pirola) na sobnoj temperaturi. Smeša je mešana 1 čas i većina čvrstih materija je rastvorena, a rastvor je postao tamnocrven. Formiranje katalizatora je praćeno korišćenjem detektora HPLC/PDA. Reakcija je ohlađena na manje od 5° Celzijusa i 5-(2,5-difluorofenil)-3,4-dihidro-2H-pirol (1.0 ekv.) je dodat korišćenjem 0.5 zapremina MTBE za ispiranje. Difenilsilan (1.5 ekv.) je dodavan tokom oko 20 minuta uz održavanje reakcione temperature ispod 10° Celzijusa. Reakcija je mešana 30 minuta ispod 10° Celzijusa i zatim ostavljena da se zagreje na sobnu temperaturu. Reakcija je mešana preko noći na sobnoj temperaturi. Završetak reakcije je potvrđen HPLC metodom, a zatim je ohlađena na manje od 5° Celzijusa. Reakcija je ugašena sa 5 zapremina 2M vodenog rastvora HCl uz održavanje temperature ispod 20° Celzijusa. Posle 10 minuta kupatilo led/voda je uklonjeno i reakciona temperatura je ostavljena da poraste do sobne temperature uz mešanje tokom 2 časa. Smeša je prebačena u levak za odvajanje sa 3 zapremine MTBE. Vodeni sloj je ispran sa 3.5 zapremina MTBE, a zatim je dodato 5 zapremina MTBE u vodeni sloj uz podešavanje pH na oko 14 dodavanjem 0.75 zapremina vodenog 50% NaOH. Organski sloj je ispran sa 5 zapremina zasićenog vodenog rastvora NaCl, zatim koncentrovan do ulja, i razblažen sa 3 zapremine MTBE. Rastvor je filtriran kroz polipropilensku filtersku tkaninu i ispran 1 zapreminom MTBE. Filtrat je koncentrovan do ulja (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidina sa teorijskim prinosom od 95% do 100% i sa 75-85% e.v.
[0186] Korak D - Priprema (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (R)-2-hidroksisukcinata: (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (1.0 ekv.) je prebačen u balon sa okruglim dnom napunjen sa 15 zapremina (korigovano za potenciju) EtOH (stepen jačine 200). Dodata je D-jabučna kiselina (1.05 ekv.) i smeša je zagrejana na 65° Celzijusa. Sve čvrste materije su se rastvorile na oko 64° Celzijusa. Rastvor je ostavljen da se ohladi na RT. Na oko 55° Celzijusa u rastvor je zasejan sa (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (R)-2-hidroksi-sukcinatom (oko 50 mg, >97%e.v.) i mešan na sobnoj temperaturi preko noći. Suspenzija je zatim filtrirana kroz polipropilensku filtersku tkaninu i isprana sa 2 x 1 zapreminom EtOH (stepen jačine 200). Čvrste materije su sušene pod vakuumom na 55° Celzijusa, dajući (R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (R)-2-hidroksi-sukcinat sa 75% do 90% teoretskog prinosa i sa >96% e.v.
[0187] Pozivajući se na šemu 1, pogodne baze uključuju tercijarne aminske baze, kao što je trietilamin, i K2CO3. Pogodni rastvarači uključuju etanol, heptan i tetrahidrofuran (THF). Reakcija se pogodno izvodi na temperaturama između 5° Celzijusa i 50° Celzijusa. Odvijanje reakcije je uglavnom praćeno pomoću HPLC TRK1PM1.
[0188] Jedinjenja II (5-hloro-3-nitropazolo[1,5-a]pirimidin) i III ((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin (R)-2-hidroksisukcinat, 1.05 ekv.) su sipana u balon sa okruglim dnom opremljenom mehaničkom mešalicom, temperaturnom sondom J-Kem i N2adapterom za kontrolu pozitivnog pritiska N2. Dodat je rastvor 4:1 EtOH:THF (10 mL/g jedinjenja II), a zatim je dodat trietilamin (NEt3, 3.50 ekv.) preko levka za dodavanje sa temperaturom koja je dostigla oko 40° Celzijusa tokom dodavanja. Kada je dodavanje završeno, reakciona smeša je zagrejana na 50° Celzijusa i mešana 0.5-3 časa da bi se dobilo jedinjenje IV.
[0189] U balon sa okruglim dnom opremljenom mehaničkom mešalicom, temperaturnom sondom J-Kem i ulazom za N2, dodato je jedinjenje IV, što je praćeno dodavanjem tetrahidrofurana (10 mL/g jedinjenja IV). Rastvor je ohlađen na manje od 5° Celzijusa u ledenom kupatilu, dodat je i Zn (9-10 ekv.). Zatim je u kapima dodata 6M HCl (9-10 ekv.) takvom brzinom da se temperatura održava ispod 30° Celzijusa (za red veličine od 1 kg dodavanje je trajalo oko 1.5 časa). Kada je egzotermna aktivnost utihnula, reakcija je ostavljena da se zagreje na sobnu temperaturu i mešana je 30-60 min dok pomoću HPLC nije otkriveno jedinjenje IV. U to vreme, izjedna je dodat rastvor kalijum karbonata (K2CO3, 2.0 ekv.) u vodi (5 mL/g jedinjenja IV), a zatim je brzo ukapan fenil hloroformat (PhOCOCl, 1.2 ekv.). Oslobađanje gasa (CO2) je primećeno tokom oba gornja dodavanja, i temperatura se povećala na oko 30° Celzijusa nakon dodavanja fenil hloroformata. Formacija karbamata je mešana na sobnoj temperaturi 30-90 min. HPLC analiza je odmah usledila da bi se obezbedilo manje od 1% površine za prisutni amin i visok prinos jedinjenja VI u rastvoru.
[0190] U gornji rastvor dodat je amin VII ((S)-pirolidin-3-ol, 1.1 ekv. na osnovu teoretskog prinosa za jedinjenje VI) i EtOH (10 mL/g jedinjenja VI). Jedinjenje VII je dodato pre ili istovremeno sa EtOH da bi se izbeglo stvaranje primesa etil karbamata. Gore navedeni rastvor EtOH je koncentrovan do minimalne zapremine (4-5mL/g) korišćenjem šaržnog koncentratora pod sniženim pritiskom (nivoi THF bi trebalo da budu <5% GC), i ponovo je dodat EtOH (10mL/g jedinjenja VI) da bi se dobilo ukupno 10mL/g. Reakcija je zatim zagrevana na 50° Celzijusa 9-19 časova ili dok HPLC ne pokaže da jedinjenje VI čini manje od 0.5% površine. Reakcija je zatim ohlađena na sobnu temperaturu, i dodata je sumporna kiselina (H2SO4, 1.0 ekv. prema jedinjenju VI) preko levka za dodavanje da se dobije jedinjenje I-HS sa temperaturom koja se obično povećala na oko 30° Celzijusa.
Primer 1
Priprema kristalnog oblika (I-HS) (Postupak 1)
[0191] (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid (0.500 g, 1.17 mmol) je rastvoren u EtOH (2.5 mL) i ohlađen na oko 5° Celzijusa. U ohlađeni rastvor je dodata koncentrovana sumporna kiselina (0.0636 mL, 1.17 mmol) i mešana oko 10 min, uz zagrevanje do sobne temperature. Metil terc-butil etar (MTBE) (2 mL) je polako dodat u smešu, što je rezultovalo gumanjem proizvoda. EtOH (2.5 mL) je zatim dodat u smešu i zagrevan do približno refluksa dok se sve čvrste materije ne rastvore. Nakon hlađenja na sobnu temperaturu i mešanja oko 1 čas, formiralo se nešto čvrstih materija. Nakon hlađenja na oko 5° Celzijusa, čvrste materije su filtrirane i isprane sa MTBE. Posle filtracije i sušenja na vazduhu oko 15 minuta, (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat je izolovan kao čvrsta supstanca.
Primer 2
Priprema kristalnog oblika (I-HS) (Postupak 2)
[0192] Koncentrovana sumporna kiselina (392 mL) je dodata u rastvor 3031 g (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida u 18322 mL EtOH da bi se formirala hidrogen-sulfatna so. Rastvor je zasejan dodavanjem 2 g (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata i rastvor je mešan na sobnoj temperaturi najmanje 2 časa da bi se formirala gusta suspenzija hidrogen-sulfatne soli. Dodat je heptan (20888 g) i gusta suspenzija je mešana na sobnoj temperaturi najmanje 60 min. Gusta suspenzija je filtrirana i filter kolač je ispran smešom 1:1 heptan/EtOH. Čvrste materije su zatim osušene pod vakuumom na temperaturi okoline (temperatura pećnice podešena na 15° Celzijusa).
[0193] Osušena hidrogen-sulfatna so (6389 g iz 4 kombinovane serije) je dodata u 5:95 tež./tež. rastvor voda/2-butanon (ukupna težina 41652 g). Smeša je zagrevana na oko 68° Celzijusa uz mešanje sve dok težinski procenat etanola nije bio oko 0.5%, za koje vreme se formirala gusta suspenzija. Gusta suspenzija je filtrirana, a filter kolač je ispran sa 5:95 tež./tež. rastvorom voda/2-butanon. Čvrste materije su zatim sušene pod vakuumom na temperaturi okoline (temperatura pećnice podešena na 15° Celzijusa) da bi se dobio kristalni oblik (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata.
Primer 3
Priprema amorfnog oblika AM(HS)
[0194] U rastvor (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida (9.40 g, 21.94 mmol) u MeOH (220 mL) je polako dodata sumporna kiselina (0.1 M u MeOH, 219.4 mL, 21.94 mmol) na sobnoj temperaturi uz brzo mešanje. Posle 30 minuta, reakcija je prvo koncentrisana na rotacionom isparivaču do skoro suva, a zatim u visokom vakuumu tokom 48 h da bi se dobio amorfni oblik (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid sulfata (11.37 g, 21.59 mmol, prinos 98.43 %)). LCMS (apci m/z 429.1, M+H).
Primer 4
Priprema kristalne HCl soli formule I
[0195] Smeša (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida (0.554 g, 1.29 mmol) u EtOH (6 mL, stepen jačine 200) i MTBE (10 mL) je zagrevana na 50 ° Celzijusa uz mešanje da bi se dobio rastvor, nakon čega je usledilo dodavanje hlorovodonika (konc.) (0.108 mL, 1.29 mmol) u jednoj porciji. Reakciona smeša je zatim ostavljena da se prvo ohladi na sobnu temperaturu, zatim ohlađena na oko 5 °C u kupatilu sa ledom i vodom uz mešanje da bi se izazvala kristalizacija. Suspenzija je mešana 4 h u kupatilu sa ledom i vodom pre nego što je vakuumski filtrirana, filter kolač je ispran sa MTBE i osušen pod vakuumom na 55°C do konstantne težine, dajući kristalni (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrohlorid (0.534 g, prinos 89%)). LCMS (apci m/z 429.2, M+H).
Priprema kristalne HBr soli formule I
[0196] Smeša (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida (0.505 g, 1.18 mmol) u EtOH (6 mL, stepen jačine 200) i MTBE (10 mL) je zagrevana na 50 ° Celzijusa uz mešanje da bi se dobio rastvor, nakon čega je usledilo dodavanje bromovodonika (33% vod.) (0.213 mL, 1.18 mmol) u jednoj porciji. Reakciona smeša je zagrevana do refluksa da bi se dobio uglavnom bistar rastvor sa malom količinom uljastog ostatka na staklenom zidu reakcionog suda. Nakon hlađenja na sobnu temperaturu, pojavila se precipitacija i uljani ostatak je očvrsnuo. Smeša je ponovo zagrejana na 50 °C, zatim ostavljena da se ohladi na sobnu temperaturu i mešana preko noći. Suspenzija je filtrirana pod vakuumom, a filter kolač ispran sa MTBE i osušen pod vakuumom na 55°C do konstantne težine, dajući kristalni (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrobromid (0.51 g, 85% prinosa). LCMS (apci m/z 429.3, M+H).
Priprema kristalne mezilatne soli formule I
[0197] Smeša (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida (0.532 g, 1.24 mmol) u EtOH (2.7 mL, stepen jačine 200) i MTBE (5.3 mL) je zagrejana na 50 °C uz mešanje da bi se dobio rastvor, nakon čega je usledilo dodavanje metansulfonske kiseline (0.076 mL, 1.24 mmol) u jednoj porciji. Reakciona smeša je zagrevana do refluksa da bi se dobio uglavnom bistar rastvor sa malom količinom čestica. Nakon hlađenja na sobnu temperaturu, pojavila se precipitacija zajedno sa nešto uljanog ostatka. Dodato je još EtOH (0.5 mL, stepen jačine 200) i metansulfonske kiseline (0.010 mL) da bi se dobio rastvor. Reakciona smeša je ponovo zagrejana na 50 °C, zatim ostavljena da se ohladi do sobne temperature i mešana 1 h. Suspenzija je vakuumski filtrirana, a filter kolač ispran sa MTBE i osušen pod vakuumom na 55°C do konstantne težine, dajući kristalni (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid metansulfonat (0.51 g, prinos 78%)). LCMS (apci m/z 429.4, M+H).
Priprema kristalne kamzilatne soli formule I
[0198] Smeša (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida (0.500 g, 1.17 mmol) i S-(+)-kamforsulfonske kiseline (0.271 g, 1.17 mmol) u EtOH (3 mL, stepen jačine 200) i MTBE (5 mL) je zagrevana do refluksa uz mešanje da se dobije rastvor. Nakon hlađenja na sobnu temperaturu, pojavila se precipitacija. Suspenzija je mešana na sobnoj temperaturi preko noći, zatim filtrirana pod vakuumom, a filter kolač je ispran sa MTBE i osušen pod vakuumom na 55°C do konstantne težine, dajući kristalni (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)pirolidin-1-il)pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid ((1S,4R)-7,7-dimetil-2-oksobiciklo[2.2.1]heptan-1-il)metansulfonat.
Primer 5
Poređenje (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamidnih soli
[0199] Drugi oblici soli (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida, npr., hlorovodonična, bromovodonična, mezilatna i kamzilatna so (videti primer 4), upoređeni su sa kristalnim oblikom (I-HS) određivanjem njihove tačke topljenja pomoću diferencijalne skenirajuće kalorimetrije (DSC), povećanja težine pomoću dinamičke sorpcije pare (DVS) i stabilnosti na aluminijumskoj pločici na 40° Celzijusa i 75% relativne vlažnosti (RH). DSC i DVS merenja su obavljena kao što je gore opisano, a rezultati su sažeti u tabeli 14.
Tabela 14. Fizikohemijska svojstva kristalnih soli (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1- il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamida
Primer 6
Enzimski test TrkA i TrkB
[0200] Afinitet vezivanja jedinjenja za Trk kinazu se meri korišćenjem Invitrogen tehnologije LanthaScreen™ Eu Kinase Binding. Ukratko, His-označeni citoplazmatski domen rekombinantne humane Trk kompanije Invitrogen (5 nM TRK A - kat. br. PV3144 ili 10 nM TRK B - kat. br. PV3616) je inkubiran sa 5 nM Aleka-Fluor<®>Tracer 236 (PR9078A), 2 nM biotinilovanog anti-His (kat. br. M4408) i 2 nM streptavidina obeleženom europijumom (kat br. PV5899) zajedno sa ispitivanim jedinjenjem u puferu koji se sastoji od 25 mM MOPS, pH 7.5, 5 mM MgCl2, 0.005% Triton X-100 i 2% DMSO. Jedinjenje se tipično priprema u trostrukom serijskom razblaženju u DMSO i dodaje u test da bi se dobila odgovarajuća finalna koncentracija. Posle 60-minutne inkubacije na 22°C, reakcija se meri korišćenjem multirežimskog čitača ploča PerkinElmer EnVision putem TR-FRET detekcije sa dualnom talasnom dužinom i procenta kontrole (POC) izračunatog korišćenjem koeficijenta relativne emisije. 100 POC se određuje bez ispitivanog jedinjenja, a 0 POC se određuje pomoću koncentracije kontrolnog jedinjenja koja potpuno inhibira enzim. Vrednosti POC odgovaraju logističkoj krivoj sa 4 parametra, a vrednost IC50je tačka u kojoj kriva preseca 50 POC. Kristalni oblik (I-HS) je imao prosečni IC50od 8.4 nM kada je testiran u ovom testu za TrkA i prosečni IC50od 4.2 kada je testiran u ovom testu za TrkB.
Primer 7
TRK fuzioni proteini pokreću onkogenezu i inhibira ih
Kristalni oblik (I-HS)
[0201] Izvršen je niz eksperimenata da bi se utvrdilo da li će kristalni oblik (I-HS) inhibirati proliferaciju ćelija u tri različita modela ćelijske linije kancera koji sadrže različite fuzije gena Trk: ćelijska linija CUTO-3F, ćelijska linija KM12, i ćelija MO-91 linija. Ćelija CUTO-3F potiče od pacijenta sa plućnim adenokarcinom koji sadrži fuziju gena MPRIP-NTRK1. Ćelijska linija KM12 je ćelijska linija kolorektalnog kancera koja sadrži fuziju TPM3-NTRK1 (Vaishnavi et al., Nature Med. 19:1469-1472, 2013). Ćelijska linija MO-91 potiče od pacijenta sa akutnom mijeloidnom leukemijom koji ima fuziju ETV6-NTRK3 (Taipale et al., Nature Biotech. 31:630-637, 2013). Merenje proliferacije ćelija nakon tretmana kristalnim oblikom (I-HS) pokazalo je dozno zavisnu inhibiciju ćelijske proliferacije u sve tri testirane ćelijske linije (Slike 8-10). Vrednost IC50je bila manja od 100 nm za ćelije CUTO-3F (Slika 8) i manja od 10 nm za ćelije KM12 i ćelije MO-91 (Slike 9 i 10, respektivno).
[0202] U skladu sa inhibicijom ćelijske proliferacije, u ćelijama CUTO-3F primećena je inhibicija fosforilacije onkoproteina MPRIP-TRKA i ERK1/2 korišćenjem malih doza kristalnog oblika (I-HS) (Slika 11), inhibicija fosforilacije TPM3-TRKA, pAKT i pERK1/2 u ćelijama KM12 korišćenjem malih doza kristalnog oblika (I-HS) (Slika 12), i inhibicije fosforilacije TEL-TRKC onkoproteina (kodiranog sa ETV6-NTRK3), pAKT i pERK1/2 u ćelijama MO-91 korišćenjem malih doza kristalnog oblika (I-HS) (Slika 13). Ovi podaci zajedno pokazuju da su Trk fuzioni proteini konstitutivno aktivni, da regulišu kritične nishodne signalne puteve, kao što su MAPK i AKT, i da su inhibirani kristalnim oblikom (I-HS). Ovi podaci takođe ukazuju na to da kristalni oblik (I-HS) može da se koristi za lečenje različitih kancera koji eksprimiraju disregulisani Trk (npr., konstitutivno aktivan oblik Trk proteina (npr. Trk fuzioni protein ili Trk tačkasta mutacija)).
Primer 8
Kristalnim oblikom (I-HS) je uspešno lečen subjekt koji ima nediferencirani sarkom
[0203] Kod žene od 41 godine bila je prisutna čvrsta masa u levoj preponi. Prvobitno snimanje je korišćeno da bi se potvrdila masa od 10 cm unutar muskulature sa prednje strane njenog bedra.
Otvorena biopsija otkrila je nediferencirani sarkom. Početni snimci za određivanje stadijuma su pokazali višestruke bilateralne plućne nodule od 4-13 mm u skladu sa metastatskom bolešću. Žena je bila uključena u ispitivanje faze 2 sorafeniba sa hemoterapijom, preoperativnom zračenjem i operacijom koja štedi udove (Clinical-Trials.gov broj NCT02050919). Posle dve nedelje primene sorafeniba u dozi od 400 mg dnevno, pacijent je primao epirubicin u dozi od 30 mg/m<2>dnevno i ifosfamid u dozi od 2500 mg/m<2>dnevno sa mesnom tokom tri uzastopna dana, uz nastavak dnevne terapije sorafenibom. Tumor je progresivno postajao bolniji tokom ovih pet nedelja sistemske terapije. Tokom simulacije preoperativnog zračenja, primećeno je proširenje tumora kranijalno unutar mišića psoas, što je onemogućilo bezbednu primenu efikasnih doza zračenja zbog predviđene toksičnosti za creva. Pacijent je stoga isključen sa protokola i prebačen na hiruršku resekciju.
[0204] Resekcijom primarnog tumora dostignute su negativne margine i pregled patološkog uzorka je potvrdio 90% nekroze tumora. CT grudnog koša za ponovno određivanje stadijuma (prikazan na slici 21A) dobijen 9 nedelja nakon početnih skeniranja je pokazao pogoršanje metastatske bolesti, sa najvećim čvorom koji sada meri 18 mm. Postoperativni tok pacijenta je bio komplikovan polimikrobnom infekcijom rane koja je zahtevala ponovljeni debridman rane i produženu antibiotsku terapiju. Ponovljena CT grudnog koša je napravljena pre nastavka hemoterapije i pokazala je dramatičnu progresiju tokom prethodnih 9 nedelja, sa višestrukim plućnim nodulima većim od 3 cm, najvećim skoro 7 cm, i velikim pleuralnim izlivom u levom plućnom krilu. Nakon postavljanja tunelskog pleuralnog drena i iniciranja suplementacije kiseonika u kućnim uslovima, pacijent je primio doksorubicin u dozi od 75 mg/m<2>jednokratno, za vreme čekanja na uključivanje u lečenje kristalnim oblikom (I-HS).
[0205] Pacijentova dijagnostička, otvorena biopsija tumora je testirana korišćenjem FoundationOneHeme panela (Foundation Medicine, Cambridge, MA). Ova multi-ciljna sveobuhvatna analiza genomskog profila (CGP) korišćenjem sekvenciranja DNK i RNK stotina gena povezanih sa kancerom pokazala je prisustvo fuzije gena koji kodira egzone 1-2 lamin A/C gena (LMNA) i egzone 11 -17 gena NTRK1 što rezultuje fuzionim genom LMNA-NTRK1 (Slika 14). CGP je takođe pokazala gubitak tumorskog supresora CDKN2A/B (nije prikazano), ali nijednu drugu poznatu onkogenu mutaciju.
[0206] Nakon toga, analiza fluorescentnom in situ hibridizacijom odvajanja (FISH) izvedenom na uzorku tumora pacijenta pokazala je pretežno jedan 3' NTRK1 (crveni fluorescencijski signal) obrazac u 64% tumorskih jedara, u skladu sa genomskom alteracijom koja uključuje genski lokus NTRK1, najverovatnije sekundarno u odnosu na genomsku deleciju između dva gena s obzirom na lokaciju i orijentaciju oba LMNA i NTRK1 na velikom kraku hromozoma 1 (Slika 15). Ekspresija iRNK novog fuzionog transkripta sa genske fuzije je potvrđena metodom RT-PCR i sekvenciranjem (Slika 16).
[0207] Novi test ligacije usled blizine (PLA) je izveden korišćenjem uzorka tumora pacijenta da bi se procenila ekspresija proteina i funkcionalna aktivnost fuzionog onkoproteina. PLA je jedinstvena jer može da detektuje funkcionalne signalne komplekse između kinaze i jednog od njenih adaptera in situ. U ovom testu, merena je TRKA kompleksirana sa svojim preferiranim adapterom, SHC1, koji se vezuje za Y496 u TRKA kinaznom domenu (Slika 17). Test je validiran i u humanim ćelijskim linijama i u uzorcima tumora ksenotransplantata poreklom od pacijenta fiksiranim u formalinu (PDX) (Slika 18). Otkriveno je da isključivanje NTRK1 pomoću RNAi remeti komplekse TRKA-SHC1 u ćelijskoj liniji CUTO-3 koja sadrži fuzioni gen MPRIP-NTRK1 (Slika 18A-C), kao i inhibicija kristalnim oblikom (I-HS) (Slika 18D i 18E). TRK PLA detektuje funkcionalne signalne komplekse u uzorku tumora FFPE od ksenotransplantata poreklom od pacijenta (PDX), CULC001, koji sadrži fuzije MPRIP-NTRK1 gena, ali ne i PDX CULC002, koji ne sadrži poznatu onkogenu pokretačku mutaciju (Slika 18F i 18G). TRK-SHC PLA takođe može da detektuje neonkogene signalne komplekse kao što je prikazano pozitivnim signalom u regionu perifernog nervnog tkiva CULC001 PDX, gde familija receptora TRK ima visoku ekspresiju aktivnosti posredovane neurotrofinima. Primena ovog testa na uzorku tumora pacijenta pokazala je robusnu signalizaciju povezanu sa jedrima tumora, ali samo slab signal u krvnim sudovima (humane endotelne ćelije eksprimiraju TRKA, u skladu sa onkogenom signalizacijom onkoproteina LMNA-TRKA (Slika 19A i B). TRK-SHC1 PLA je pokazala negativan rezultat na uzorku tumora od ALK+ NSCLC pacijenta, dok je ALK-GRB2 PLA bila pozitivna (Slika 20), što dalje pokazuje sposobnost ovog testa da detektuje onkogenu signalizaciju u uzorcima humanog tumora.
[0208] Prisustvo fuzije LMNA-NTRK1 otkrivene testom FoundationOneHeme i zatim potvrđeno pomoću FISH i RT-PCR u kombinaciji sa dokazima ekspresije TRKA proteina i funkcionalne aktivnosti signalnog puta TRK u uzorku tumora pacijenta sugeriše da pacijent ima kancer koji pokreće TRK, pogodan za lečenje TRK-specifičnim inhibitorom.
[0209] Na osnovu više linija genetskih i funkcionalnih biomarkera koji sugerišu prisustvo pokretačkog onkogena TRK, pacijent je upućen na razmatranje uključivanja u fazu 1 ispitivanja kristalnog oblika (I-HS). Mesec dana kasnije, utvrđeno je da pacijent ispunjava uslove za ispitivanje i obezbeđen je pisani informisani pristanak. Osnovni CT snimak pokazao je kontinuiranu progresiju tumora sa višestrukim velikim plućnim metastazama u oba plućna krila, iako se pleuralni izliv povukao nakon postavljanja pleuralnog drena (Slika 21C). U kliničkoj slici pacijent je imao značajnu dispneju pri naporu, bilo mi je potrebno 5L dodatnog kiseonika da bi se održala zasićenost kiseonikom od 90%. Polazne laboratorijske vrednosti pokazale su povišen nivo tumorskog markera CA125 (Slika 22). Pacijent je primio početnu dozu od 100 mg kristalnog oblika (I-HS) tri dana pre početka kontinuiranog doziranja, a zatim istu dozu približno 12 časova kasnije istog dana, uz 48 časova farmakokinetičke i bezbednosne procene prema protokolu studije. Pacijent je tri dana kasnije započeo 1. dan 1. ciklusa. Pacijent je pregledan svake nedelje radi analize farmakokinetike i bezbednosti. Nisu zabeleženi nikakvi neželjeni događaji povezani sa lekovima, a kod pacijenta je dolazilo do nedeljnog poboljšanja po pitanju dispneje pri naporu tokom ovog perioda od 4 nedelje. Nivoi CA125 su se normalizovali tokom 1. ciklusa. CT je urađen pre početka 1. dana 2. ciklusa, koji je pokazao značajno poboljšanje u višestrukim plućnim metastazama i bio je prepoznat delimičan odgovor RECIST 1.1. Ponovljena CT je urađena pre 1. dana 3. ciklusa i pokazala je kontinuirani odgovor i tako potvrdila delimičan odgovor RECIST 1.1 (Slika 21C). Klinički, pacijent je imao značajno poboljšanu dispneju pri naporu i više nije bio potreban dodatni kiseonik sa zasićenošću kiseonikom od 97% na vazduhu u prostoriji. Nakon četiri meseca doziranja, kod pacijenta nije bilo neželjenih događaja koji bi se pripisivali kristalnom obliku (I-HS). Ovi podaci pokazuju da kristalni oblik (I-HS) može da leči nediferencirani sarkom kod subjekta, kao i druge kancere koji imaju disregulaciju Trk proteina (npr., konstitutivno aktivan oblik Trk proteina, npr., fuzione proteine Trk ili tačkaste mutacije Trk).
[0210] Fuzija LMNA-NTRK1 gena je ranije prijavljena kod Spitzoidnih nevusa i konstitutivno je aktivirana kada se eksprimira u ćelijama dovodeći do aktivacije ERK1/2, AKT i PLCγ, što pokazuje njenu onkogenost (Taipale et al., Nature Biotech. 31:630 -637, 2013). Foundation Medicine (FM) je prethodno testirala 1272 uzorka sarkoma mekog tkiva pomoću FoundationOneHeme CGP testa, što je dovelo do detekcije 8 NTRK1 ili NTRK3 fuzija, uključujući pacijenta opisanog u ovom izveštaju o slučaju (Tabela 15). Primetno je da je 6 od 8 pacijenata sa sarkomom sa NTRK fuzijama mlađe od 25 godina (Fišerov egzaktni test, P-vrednost = 4x10<-4>), a 4 od 8 je mlađe od 5 godina (Fišerov egzaktni test, P-vrednost = 2x10<-5>), što ukazuje na povećanu stopu detekcije NTRK fuzije među pedijatrijskim pacijentima (4.1%; 95% CI 1.8%-9.3%) i posebno onima mlađim od 5 godina (14.3%; 95% CI 5.7%-31.5%). Takođe je zanimljivo da jedna od detektovanih fuzija gena kombinuje većinu NTRK3 gena (egzon 1-17) sa 3' krajem HOMER2 gena (egzoni 2-9), koji sadrži domen dimerizacije (domen upredene zavojnice), i stoga predstavlja događaj 3' fuzije gena koji je sada opisan kod više drugih gena koji kodiraju RTK, kao što su EGFR, AXL i FGFR3 (Sleijfer et al., Eur. J. Cancer 46:72-83, 2010; Linch et al., Clin. Oncol. 11:187-202, 2014; Rutkowski et al., J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol.25:264-270, 2011).
Tabela 15. Kliničke karakteristike i detalji fuzionog gena NTRK pacijenata sa sarkomom mekog tkiva
5’ 3’ Prvi
Poslednji
Histologija 5’ gen egzon 3’ gen egzon Pol Uzrast sarkom mekog tkiva
(neodređeno) (n=179) LMNA 2 NTRK1 11 Ž 41 sarkom mekog tkiva LMNA 10 NTRK1 11 M 22 (neodređeno) (n=179)
fibrosarkom mekog tkiva LMNA 10 NTRK1 12 M Ispod 5 (n=28)
fibrosarkom mekog tkiva SQSTM1 2 NTRK1 10 Ž Ispod 5 (n=28)
švanom mekog tkiva TPM3 7 NTRK1 10 M Ispod 5 (n=3)
hemangiom mekog tkiva ETV6 5 NTRK3 15 Ž Ispod 5 (n=4)
solitarni fibrozni tumor
mekog tkiva
(n=28) TFG 6 NTRK3 14 M 17 sarkom mekog tkiva
(neodređeno) (n=179) NTRK3 17 HOMER2 2 Ž 68
[0211] Dalje je izveden eksperiment da se pokaže da kristalni oblik (I-HS) specifično inhibira aktivnost Trk kinaze. Na primer, kristalni oblik (I-HS) nije inhibirao ćelijsku proliferaciju ćelijske linije HCC78 koja potiče iz nesitnoćelijskog karcinoma pluća koji eksprimira fuzioni protein SLC34A2-ROS1 (Slika 23) (Vaishnavi et al., NatMed.19:1469-72, 2013).
Materijali i metode
Kliničko ispitivanje
[0212] NCT02122913 je tekuća multicentrična studija rastuće doze faze 1 koja procenjuje bezbednost i farmakokinetiku kristalnog oblika (I-HS), selektivnog pan-TRK, kod neselektivnih pacijenata sa metastatskim ili uznapredovalim solidnim tumorima bez standardnih terapijskih opcija. Studiju su odobrili institucionalni odbori za reviziju u svim institucijama koje upisuju pacijente, a pacijenti koji ispunjavaju uslove daju pismeni informisani pristanak za učešće. Kristalni oblik (I-HS) se isporučuje u kapsulama od 100 mg. Upisani pacijenti dobijaju rastuće doze kristalnog oblika (I-HS) po modifikovanom dizajnu 3+3, i dobijaju kristalni oblik (I-HS) dnevno ili dva puta dnevno do nepodnošljive toksičnosti, progresije bolesti ili povlačenja pristanka. Kod pacijenata sa merljivom bolešću, efikasnost se procenjuje prema kriterijumima RECIST 1.1.
Sekvenciranje sledeće generacije (NGS)
[0213] DNK i RNK su ekstrahovane i biblioteke sekvencioniranja sa ligiranim adapterima su uhvaćene hibridizacijom rastvora korišćenjem prilagođenih setova "mamaca" usmerenih na 405 gena povezanih sa kancerom i 31 često preuređenih gena pomoću DNK-sekvenciranja i 265 često preuređenih gena pomoću RNK-sekvenciranja (FoundationOne Heme). Sve uhvaćene biblioteke su sekvencionirane na velikoj dubini (Illumina HiSeq) u CLIA sertifikovanoj CAP-akreditovanoj laboratoriji (Foundation Medicine), u proseku >500x za DNK i >6M jedinstvenih parova za RNK. Podaci o sekvenci iz gDNK i cDNK su mapirani u referentni ljudski genom (hg19) i analizirani pomoću kanala za kompjutersku analizu da bi se otkrile genomske promene prisutne u uzorku, uključujući supstitucije, kratke insercije i delecije, preuređenja i varijante broja kopija.
Fluorescentna in situ hibridizacija (FISH)
[0214] FISH analiza odvajanja za NTRK1 je izvedena na 4-mikronskim pločicama iz uzoraka tumora fiksiranih u formalinu, obloženih parafinom (FFPE), kao što je prethodno opisano korišćenjem Vysis LSI NTRK1 (Cen) SpectrumGreen (kat. br.08N43-030) i Vysis LSI NTRK1 (Tel) SpectrumRed (Abbott Molecular, br. 08N43-030 i 08N43-020, respektivno) (Vaishnavi et al., Cancer Discov. 5:25-34, 2015).
RT-PCR i DNK sekvenciranje
[0215] Lančana reakcija polimeraze reverzne transkriptaze (RT-PCR) je izvedena kao što je prethodno opisano korišćenjem direktnog prajmera za LMNA (LMNA F1, 5’gagggcgagctgcatgat3’; SEQ ID NO: 1) (Weisner et al., Nat. Comm. 5:3116, 2014) i reverznog prajmera za NTRK1 (NTRK1 Y490rev, 5’cggcgcttgatgtggtgaac3’; SEQ ID NO: 2). Sekvenciranje DNK proizvoda RT-PCR izvedeno je korišćenjem Sanger DNK sekvenciranja u odseku patologije na Univerzitetu Kolorado.
Ćelijske linije
[0216] Dobijen je informisani pristanak za dobijanje besmrtnih ćelijskih linija od pacijenta. Ćelijska linija CUTO-3 i njeni derivati nastali su iz malignog pleuralnog izliva pacijenta sa plućnim adenokarcinom stadijuma IV koji sadrži fuziju gena MPRIP-NTRK1 kao što je prethodno opisano (Vaishnavi et al., Cancer Discov. 5:25-34, 2015; Davies et al., PLoS One 8: e82236, 2013). KM12 i MO-91 su prethodno opisani (Vaishnavi et al., Nature Med. 19:1469-1472, 2013; Taipale et al., Nat. Biotech.31:630-637, 2013).
Generisanje ksenotransplantata koji potiču iz pacijenta
[0217] Od pacijenta je dobijen informisani pristanak za generisanje mišjih ksenotransplantata dobijenih od pacijenta. Tumorsko tkivo pacijenta sa onkogen-negativnim plućnim adenokarcinomom (CULC001) je isečeno na komade od 3 x 3 x 3 mm koji su prebačeni u DMEM sa dodatkom 10% fetalnog goveđeg seruma (FBS) i 200 jedinica/mL penicilina i 200ug/mL streptomicina. Komadi tumora su umočeni u matrigel (Corning) i umetnuti u rezove na svakom boku 5 golih miševa. Pleuralna tečnost (CULC002) pacijenta sa plućnim adenokarcinomom koji sadrži fuziju gena MRPIP-NTRK1 je centrifugirana i dobijeni ćelijski talog je suspendovan u 5 ml ACK pufera (Lonza) tokom 2 minuta omogućavajući potpunu lizu crvenih krvnih zrnaca. Liza je zaustavljena dodavanjem 20 mL PBS i centrifugiranjem uzoraka. Talog je dva puta ispran PBS-om pre nego što je suspendovan u medijumu sa dodatkom DMEM kao što je gore navedeno. 100 µl ćelija (1 x 10<6>po boku) suspendovanih u 1:1 mešavini DMEM i matrigela (BD) je ubrizgano subkutano u bokove 5 golih miševa. Propagacija i održavanje rezultujućih ksenotransplantata je prethodno opisano (Keysar et al., Mol. Oncol. 7:776-790, 2013).
Testovi ligacije usled blizine
[0218] Ćelije su zasejane na pokrovna stakla (u ploči sa 48 bunarčića) ili u komore na predmetnom staklu u količini od 25-75 hiljada ćelija/bunariću. Ćelije su tretirane naznačenim dozama i tokom naznačenog vremena, a zatim fiksirane 15 minuta mućkanjem na sobnoj temperaturi u 4% paraformaldehida. Ćelije su isprane dva puta u PBS-u, a zatim je upotrebljen Duolink<®>in situ PLA<®>komplet miš/zec (crveno) kompanije SigmaAldrich u skladu sa protokolom proizvođača (kataloški br. DUO92101). Koncentracije antitela su optimizovane korišćenjem imunofluorescencije pre PLA eksperimenata. PLA FFPE tkiva miševa ili pacijenata pripremljeni su kako je opisano u histologiji. Dodatno, uzorci su tretirani sa 300 mM glicina 15 minuta pre koraka blokiranja, inače je analiza obavljena prema protokolu proizvođača. Ćelije su pričvršćene korišćenjem reagensa Prolong<®>gold protiv gašenja fluorescencije (sa DAPI) i ostavljene da očvrsnu preko noći pre snimanja. Slike su snimljene ili na standardnom invertovanom fluorescentnom mikroskopu Nikon sa uveličanjem 40x, ili na konfokalnom mikroskopu 3I Marianas spinning disc na odseku za naprednu svetlosnu mikroskopiju medicinskog kampusa Anschutz na Univerzitetu Kolorado sa uveličanjem 40x ili 100x. Korišćena su sledeća antitela: TRK (C17F1) i ALK (D5F3) kompanije Cell Signaling, SHC1 kompanije Novus i Grb2 (610111) kompanije BD.
Testovi proliferacije
[0219] Svi testovi proliferacije su izvedeni u medijumima sa dodatkom 5% FBS kao što je prethodno opisano korišćenjem Cell Titer 96 MTS (Promega) (Bouhana et al., EORTC-NCI-AACR 26<th>Symposium on Molecular Targets and Cancer Therapeutics, Barcelona, Spain 2014). Ćelije su zasejane u količini od 500-2000 ćelija/bunarčiću i tretirane tokom 72 časa koncentracijama leka opisanim na svakom grafikonu. Svaki test je izveden u tri primerka u najmanje 3 nezavisna biološka ponavljanja. Podaci su ucrtani i vrednosti IC50 izračunate korišćenjem softvera GraphPad.
Imunobloting
[0220] Imunobloting je izveden kao što je prethodno opisano (Vaishnavi et al., Nature Med.
19:1469-1472, 2013). Ukratko, ćelije su lizirane u puferu RIPA pomoću koktela inhibitora proteaze i fosfataze Halt Protease and Phosphatase Inhibitor Cocktail (Thermo Scientific) i razblažene u puferu za nanošenje uzorka (LI-COR Biosciences). Membrane su skenirane i analizirane pomoću sistema vizuelizacije Odissey i softvera (LI-COR). Korišćena su sledeća antitela kompanije Cell Signaling: pTRK Y490 (zečje poliklonsko, br. 9141), pERK1/2 KSP T202/I204 (br.9101), ukupni ERK1/2, pAKT S473 (zečje mAb, br. 4060), i ukupni AKT, mišje antitelo, klon D3A7 (br. 2920). TRK (C-14) zečje poliklonsko antitelo je nabavljeno od Santa Cruz Biotechnology. GAPDH (MAB374) i pTYR (4G10) su nabavljeni od kompanije Millipore.
Statističke analize
[0221] Intervali poverenja za detekcije stope NTRK fuzija u uzorcima pacijenata sa sarkomom izračunati su korišćenjem testa proporcija na 1 uzorku. Histološka klasifikacija bolesti je zasnovana na ontologiji bolesti Fondacije za medicinu. Uvećanje broja NTRK fuzija kod mlađih grupa pacijenata je testirano korišćenjem Fišerovog egzaktnog testa. Sva statistička testiranja su obavljena u R v 3.1.3.
Primer 9
Klinička bezbednost i aktivnost iz studije faze 1 kristalnog oblika (I-HS), selektivnog inhibitora TRKA/B/C, kod pacijenata sa solidnim tumorom sa fuzijama NTRK gena
Metode
[0222] U ovu otvorenu, multicentričnu studiju kristalnog oblika (I-HS) faze I sa porastom doze 3+3, koja je u toku, uključena su 23 pacijenta sa solidnim tumorima refraktornim na standardnu terapiju, normalnom funkcijom hematopoeze i glavnih organa. Kristalni oblik (I-HS) je davan oralno kao pojedinačna doza, nakon čega su sledile QD ili BID doze tokom kontinuiranih 28dnevnih ciklusa. Odgovor se meri RECIST kriterijumima, verzija 1.1. Serum se prikuplja za farmakokinetičku analizu u 1. dana i 8. dana 1. ciklusa. Bezbednosne informacije se prikupljaju za sve pacijente i definicija toksičnosti koja ograničava dozu primenjuje se na neželjene događaje bez obzira na vezu sa ispitivanim proizvodom.
Rezultati
[0223] Do danas, 23 pacijenta su lečena na svakom od prvih pet doznih nivoa u rasponu od 50 mg QD-150 mg BID. Kristalni oblik (I-HS) se dobro podnosi; maksimalna tolerisana doza (MTD) nije dostignuta i najčešći neželjeni događaji su umor 1 i 2 stepena (35%), vrtoglavica (26%) i anemija (22%). Dva pacijenta su imala toksičnost koja ograničava dozu (povišena AST, stepen 3 (dozni nivo 150 mg BID) i delirijum, stepen 3 nepovezan (dozni nivo 100 mg BID)).
[0224] PK analiza je pokazala da su maksimalne koncentracije kristalnog oblika (I-HS) u plazmi dostignute 30-60 minuta nakon doziranja i izloženost se povećavala u približnoj proporciji sa dozom. Nivoi nevezanog leka kristalnog oblika (I-HS) su se pokazali dovoljnim za približno 98% inhibicije TRKA/B/C pri vršnim koncentracijama na svim nivoima doze.
[0225] Tri od 23 pacijenta su imala NTRK-fuzije i lečena su dozom od 100 ili 150 mg BID. Ovi pacijenti su postigli delimičan odgovor: nediferencirani sarkom sa fuzijom LMNA-NTRK1 (smanjenje od 59%; 7 ciklusa+), c-kit-negativan GI stromalni tumor (GIST) sa fuzijom ETV6-NTRK3 (smanjenje od 30%; 2 ciklusa+) i analogni sekretorni karcinom dojke sa fuzijom ETV6-NTRK3 (smanjenje od 64%; 2 ciklusa+). Ovi podaci su podržani in vivo inhibicijom rasta tumora i regresijom u mišjim modelima ksenotransplantata TRK-fuzije.
Zaključci
[0226] Kristalni oblik (I-HS) se dobro toleriše i ima dovoljnu sistemsku izloženost za robusnu inhibiciju NTRK-fuzija, što je dokazano farmakokinetičkim nivoima leka, i tekućim kliničkim odgovorima uočenim kod 3 pacijenta sa NTRK-fuzijom uključena u ovu studiju. Ovi podaci dodatno potvrđuju ovu molekularnu metu kao onkogeni pokretač u različitim histologijama tumora.
Primer 10
Poređenje kristalnog oblika (I-HS) i amorfne sulfatne soli
[0227] Izvedeni su različiti eksperimenti da bi se uporedila svojstva amorfnog (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata i kristalnog oblika (I-HS). Ove studije uključuju profile nečistoća, stabilnost, svojstva tečljivosti i higroskopnost. U narednim studijama, dve serije amorfnog materijala (AM(HS)1 i AM(HS)2) su upoređene sa jednom serijom kristalnog oblika (I-HS). AM(HS)1 i AM(HS)2 su pripremljeni kao što je opisano u primeru 3. Kristalni oblik (I-HS) je pripremljen kao što je opisano u primeru 2.
Metode
Rezidualni rastvarači
[0228] Rastvori AM(HS)1, AM(HS)2 i kristalnog oblika (I-HS) su analizirani upotrebom "headspace" GC-MS analize.
Termogravimetrijska analiza (TGA)
[0229] Uzorci su stavljeni u posude od platine i izloženi porastu temperature od 10 °C/minutu do 300 °C.
Diferencijalna skenirajuća kalorimetrija (DSC)
[0230] Uzorci su stavljeni u naborane aluminijumske čuniće sa rupicom na poklopcu i podvrgnuti su porastu temperature od 10 °C/minutu do 250 °C pod azotom.
Rendgenska difrakcija (XRD)
[0231] Cu Kα zračenje na 44kV, 40mA kroz Ni filter sa divergencijskim prorezom od 2/3°, divergencijski H.L. prorez od 10mm, prorez za raspršivanje postavljen na "Auto" (prorez za raspršivanje određuje računar/instrument), prijemni prorez od 0.3mm. Kontinuirano skeniranje od 3° do 40° 2θ pri 2°/min; širina uzorkovanja (veličina koraka) od 0.02°/sekundi, vreme koraka od 0.4 tačke/sekundi. Uzorci su rotirani u ravni paralelnoj sa površinom uzorka pri 60 o/min.
Polarizovana svetlosna mikroskopija (PLM)
[0232] Uzorci su stavljeni na staklenu mikroskopsku pločicu, okupani u ulju niskog viskoziteta i prekriveni pokrovnim staklom. Ispitani su pod 20x objektivom sa unakrsno polarizovanim sočivima i filterom granične veličine od 530 nm. Slika je dobijena kamerom PAX-It i obrađena softverom PAX-It.
Dinamička sorpcija pare (DVS)
[0233]
1. Higroskopnost je proučavana na 25 ° C korišćenjem analizatora IGAsorp.
2. Oko 15 mg uzorka stavljeno je u tarirani držač za uzorke sa mrežom pri početnoj postavci vlažnosti u prostoriji od ~ 35%.
3. Ukupna brzina protoka vlažnog/suvog azota od 250 centimetara kubnih/min je korišćena tokom studije.
4. Čvrste materije su proučavane izvođenjem jednog punog ciklusa sledećeg programa: 60 minuta sušenja na 40 ° C pod suvim N2, praćeno podešavanjem od 0, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 i 95% RH, sa vremenom izlaganja na svakoj podešenoj tački vlažnosti koje zavisi od 99.5% pouzdanosti u pogodnom modelu F1 ili 60 minuta. Maksimalno dozvoljeno vreme za bilo koju zadatu tačku vlažnosti bilo je 120 min. Uzorak je održavan pod suvim N2nakon što je ciklus završen.
[0234] Procentualni dobitak težine je izračunat na osnovu suve težine materije.
Deo jedan: Fizička karakterizacija kristalnog oblika (I-HS)
[0235] AM(HS)1, AM(HS)2 i kristalni oblik (I-HS) karakterisali su izgled, rezidualni rastvarači, termogravimetrijska analiza (TGA), sadržaj vode po Karl Fišeru (KF), diferencijalna skenirajuća kalorimetrija (DSC), rendgenska difrakcija (XRD), mikroskopija polarizovane svetlosti (PLM) i higroskopnost pomoću dinamičke sorpcije pare (DVS). Podaci za fizičku karakterizaciju tri serije mogu se naći u tabelama 16-19 i na slikama 24-38.
Tabela 16. Izgled
Tabela 17. Rezidualni rastvarači
Tabela 18. Termogravimetrijska analiza i Karl Fišerova analiza (sadržaj vode)
Tabela 19. Analiza diferencijalne skenirajuće kalorimetrije
Zaključak fizičke karakterizacije
[0236] API oblici AM(HS) 1 i AM(HS)2 su amorfni bez dvostrukog prelamanja prema mikroskopiji polarizovane svetlosti i XRPD uzorak je takođe izrazito amorfan za obe serije bez vidljivih pikova rendgenske difrakcije. TGA za amorfna jedinjenja pokazuje gubitak težine korakom koji odgovara endotermnim događajima uočenim u diferencijalnoj skenirajućoj kalorimetriji. Prva dva endotermna događaja su prilično široka i mogu da ukazuju na isparavanje i/ili desolvaciju. Poslednji endotermni događaj se dešava na približnoj temperaturi rastopa uočenoj u kristalnom materijalu. Obe amorfne serije su prilično higroskopne sa značajnom histerezom nakon desorpcije. AM(HS)1 je dobio više od 13% svoje početne mase pri 80% RH. Isto tako, AM(HS)2 je dobio skoro 12% svoje početne mase pri 80% RH. Post-DVS XRPD pokazuje da nije došlo do promene oblika tokom dinamičke sorpcije pare, ali je primećeno da je prah prešao u tečno stanje u držaču uzorka što otežava uklanjanje praha u tečnom stanju iz držača uzorka.
[0237] Kristalni oblik (I-HS) je kristalne prirode sa mnogo difrakcionih pikova dobijenih rendgenskom difrakcijom i pravim dvostrukim prelamanjem saglasno mikroskopiji polarizovane svetlosti u svojoj morfologiji nalik aglomeratu. Kristalni oblik (I-HS) pokazuje termogravimetrijski gubitak težine od 6% što odgovara endotermnom početku topljenja na 193.7 °C. Kristalni oblik (I-HS) nije higroskopan, i dobija samo 1% početne mase na 80% RH.
Drugi deo: Svojstva praha kristalnog oblika (I-HS)
[0238] Sledeće studije su upoređivale kristalnu hidrogen-sulfatnu so sa prahom amorfne sulfatne soli, uključujući proučavanje svojstava tečljivosti svakog oblika koja su važna za proizvodnju čvrstog oralnog doznog oblika kao što je tableta ili kapsula. Izvedeni radovi uključuju nasipnu gustinu, tapkanu gustinu, ugao mirovanja i profile kompresije.
Mešavine
[0239] Mešavine su kreirane u skladu sa formulacijama predstavljenim u tabelama 20 i 21. Ove mešavine su tipične za formulacije tableta koje se mogu proizvesti kao tablete na bazi direktnog presovanja ili sabijanja na valjcima ili formulisane kapsule. Prvi API (tj. ili AM(HS) ili kristalni oblik (I-HS)), mikrokristalna celuloza (MCC), i ili skrob ili laktoza dodati su u bocu od ćilibarnog stakla od 30 centimetara kubnih i mešani na TURBULA<®>šejker-mikseru na 25 o/min.
3 minuta. Zatim su preostali ekscipijensi dodati u bocu i mešati na šejkeru TURBULA<®>na 25 o/min. dodatna 3 minuta.
Tabela 20. Formulacija tablete sa smešom MCC:laktoza 2:1, 50% opterećenja lekom
Tabela 21. Formulacija tablete sa smešom MCC:skrob 1:1, 50% opterećenja lekom
Ugao mirovanja
[0240] Ugao mirovanja je ugao koji formira horizontalna osnova površine i ivica konusne gomile granula. Izračunava se iz sledeće jednačine:
[0241] Ugao mirovanja je meren polaganim izlivanjem približno 1 g uzorka kroz levak sa unutrašnjim prečnikom otvora od 3/16". Prah je zatim padao 1 11/16" i pao na površinu prevrnute posude za kristalizaciju na kojoj nastala je gomila praha. Gomila je slikana nakon dodavanja celokupnog materijala. Ugao između površine posude i površine gomile meren je uglomerom na slikama. Vodilo se računa da se repliciraju isti položaji i udaljenosti padanja u postavci između različitih uzoraka.
Nasipna i tapkana gustina
[0242] Prah je dodat u prethodno izmereni graduisani cilindar od 10 mL kroz levak koji nije bio u direktnom kontaktu sa graduisanim cilindrom da bi se izbeglo prenošenje vibracija. Prah je dodavan do dostizanja zapremine od 10 mL, a zatim je graduisani cilindar sa prahom odmeren. Nasipna gustina je izračunata prema
Isti uzorak u graduisanom cilindru je tapkan sledećim redosledom: 100, 150, 250, 250 tapkanja. Zapremina je merena nakon svakog intervala. Tapkana gustina je izračunata prema
[0243] Karov indeks je izračunat prema sledećoj jednačini:
[0244] Hausnerov odnos je izračunat prema sledećoj jednačini:
Profili kompresije
[0245] Profili kompresije su generisani stvaranjem okruglih tableta prečnika 5/16" pri pet različitih pritisaka kompresije za svaku mešavinu. Podešavanja presovanja su bila 1 sekunda zadržavanja i 15% brzine pumpe. Tablete su kreirane za sve četiri mešavine praha korišćenjem sila kompresije od 700 kg, 1000 kg, 1500 kg i 2000 kg. Najveća sila kompresije je izabrana na osnovu rezultata prethodnih tableta. Zatim su izmereni masa tablete, dimenzije i sila kidanja. Ovi podaci su ucrtani pomoću šablona koji je rezultirao dijagramom pritiska kompresije u odnosu na zateznu čvrstoću (SL.39).
Rezultati
[0246]
Tabela 22. Referentne vrednosti
[0247] Rezultati su predstavljeni u tabelama 23 i 24 i na slici 39. Prema američkoj farmakopejskoj konvenciji (USP), svi uzorci spadaju u kategoriju prihvatljive ili loše tečljivosti mereno uglom mirovanja. Veći uglovi ukazuju na lošiji protok. Karov indeks (indeks kompresibilnosti) i Hausnerov odnos spadaju između prihvatljivog i veoma lošeg prema USP. Kristalni API se primetno razlikuje od amorfnog API i ove razlike su prisutne u svim mešavinama formulacija bez obzira na sadržaj amorfnog ili kristalnog API. Za kristalni API, Hausnerov odnos i Karov indeks ukazuju na to da su svojstva tečljivosti "prihvatljiva". Amorfni API ima znatno lošije osobine tečljivosti, kategorisan je kao "veoma loš" i kada je u pitanju Hausnerov odnos i Karov indeks. Videti tabelu 22 za relevantne USP tabele.
[0248] Prilikom kreiranja tableta za profile kompresije, mešavine kristalnog API su proizvele više tableta koje su se lomile pri izbacivanju iz alata. Činilo se da mešavine amorfnog API proizvode vizuelno bolje tablete, odnosno sa malo ili nimalo loma.
Tabela 23. Ugao mirovanja
Tabela 24. Nasipna i tapkana gustina
Zaključak o svojstvima praha
[0249] Na osnovu ugla mirovanja ispitivane mešavine formulacije kristalnog oblika (I-HS), amorfnog API i mešavine formulacije amorfnog API imaju "veoma loše" karakteristike tečljivosti. Međutim, na osnovu Karovog indeksa i Hausnerovog odnosa, kristalni API, kristalni oblik (I-HS), ima "prihvatljive" karakteristike tečljivosti. Značajno bolja svojstva tečljivosti ovde su prednost za razvoj i proizvodnju čvrstih oralnih doznih oblika. Takođe nije bilo velike razlike u profilu kompresije obe mešavine sa obe serije praha. Ovo ukazuje na to da (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfat, bez obzira na to da li je amorfan ili kristalan, nije pozitivno niti negativno uticao na tečljivost smeša pri opterećenju lekom od 50%.
Treći deo: Stabilnost AM(HS)1 i kristalni oblik (I-HS)
[0250] Alikvoti praha AM(HS)1 i kristalnog oblika (I-HS) stavljeni su u nezatvorene (otvorene) scintilacione bočice od 20 mL, a bočice smeštene u LDPE vrećicu su stavljene u komoru za ispitivanje stabilnosti održavanu na 40 °C/75% RH tokom pet nedelja. Nakon vađenja iz komore, uzorci su fizički okarakterisani izgledom, KF, TGA, DSC, XRD i PLM. Uzorci su takođe analizirani pomoću HPLC na hromatografsku čistoću, hiralni integritet i potenciju. Tamo gde je primenljivo, podaci predstavljeni u delu stabilnosti takođe uključuju originalne T=0 podatke za potrebe poređenja. Podaci se mogu videti u tabelama 25-29 i na SL.40-44.
Tabela 25. Izgled uzoraka za ispitivanje stabilnosti
Tabela 26. TGA i KF uzoraka za ispitivanje stabilnosti
Tabela 27. DSC uzoraka za ispitivanje stabilnosti
Tabela 28. HPLC podaci za uzorke za ispitivanje stabilnosti
Tabela 29. HPLC podaci: procenat površine pika prema RRT uzoraka za ispitivanje
stabilnosti
Zaključci o stabilnosti
[0251] Amorfno jedinjenje AM(HS)1 nije bilo stabilno u vlažnim uslovima i sklono je kristalizaciji tokom određenog vremenskog perioda. Ovo je dokazano prelaženjem u tečno stanje uzoraka ostavljenih u komorama za vlažnost i promenjenim izgledom i vizuelno i pod polarizovanim svetlosnim mikroskopom (podaci nisu prikazani). Amorfni materijal prelazi iz žutog praha koji slobodno teče u narandžasti aglomerisani prah koji ne teče slobodno. Polarizovana svetlosna mikroskopija, XRPD, DSC, TGA i KF amorfnog API se takođe značajno promenila tokom ubrzane studije stabilnosti da bi postala ista polimorfna forma kao kristalni oblik (I-HS). XRPD obrazac amorfnog jedinjenja AM(HS)1 transformiše se u XRPD obrazac kristalnog oblika (I-HS) tokom ubrzane studije stabilnosti. Polarizovana svetlosna mikroskopija prelazi iz ne-dvostruko prelamajuće u dvostruko prelamajuću pod unakrsno polarizovanom svetlošću, što ukazuje na promenu iz amorfnog u kristalni API. DSC na t = 0 ima dva endotermna događaja sa maksimumima topljenja na 68.3 °C i 152.8 °C koji nestaju u vremenskoj tački t = 5 nedelja. Ostao je samo jedan endotermni događaj za amorfni materijal sa maksimumom topljenja na 206 °C. Ovaj maksimum topljenja odgovara termografskom profilu kristalnog API. TGA profil amorfnog materijala na t = 5 nedelja se takođe promenio da bi odgovarao profilu i gubitka težine kristalnog API. Kristalni oblik (I-HS) nije pokazao higroskopnost, niti bilo kakvu promenu boje, morfologije ili kristalnosti nakon skladištenja u ubrzanim uslovima.
[0252] Hemijska čistoća API se nije značajno promenila tokom studije stabilnosti ni za AM(HS)1, ni za kristalni oblik (I-HS). Profili nečistoća amorfnog i kristalnog oblika (I-HS) se, međutim, značajno razlikuju. Amorfni materijal sadrži značajno veći nivo nečistoća (Tabele 22 i 23) u odnosu na kristalni oblik (I-HS). Veruje se da smanjene nečistoće u kristalnom obliku (I-HS) u odnosu na amorfni AM(HS)1 pri relativnom vremenu zadržavanja (RRT) 0.863 (0.00% naspram 0.98%) i 1.535 (0.00% naspram 0.12%) nastaju zbog izolovanja kristalnog oblika (I-HS) putem procesa kristalizacije koji odbacuje ove nečistoće i superioran je u odnosu na postupak izolacije amorfnog AM(HS)1. Čini se da postupak izolovanja amorfnog AM(HS)1 ne odbacuje ove nečistoće tako efikasno.
Opšti rezime studije
[0253]
1. Kristalni oblik (1-HS) ima bolja svojstva tečljivosti u odnosu na amorfni oblik AM(HS). Razlike u svojstvima tečljivosti će poboljšati razvoj čvrstog oralnog doznog oblika od kristalnog oblika (I-HS) u odnosu na AM(HS).
2. Studija stabilnosti u LDPE vrećici na 40 °C/75% RH tokom pet nedelja nije pokazala značajne promene u nivoima hemijskih nečistoća ni za jedan od oblika jedinjenja. Međutim, otkriveno je da kristalni oblik (I-HS) nema značajne promene u svojim fizikohemijskim osobinama tokom studije. Nasuprot tome, AM(HS) se preobrazio u kristalni oblik suštinski sličan kristalnom obliku (I-HS) prema XRPD, DSC, TGA, KF i polarizovanoj svetlosnoj mikroskopiji. Dodatno, AM(HS) se promenio u aglomerisani prah sa smanjenim svojstvima tečljivosti tokom ispitivanja stabilnosti. Promena osobina amorfnog AM(HS) u kristalni materijal ili aglomerisani prah sa smanjenom tečljivošću pri skladištenju AM(HS) onemogućila bi proizvodnju čvrstog oralnog doznog oblika za upotrebu kod pacijenata na bazi amorfnog jedinjenja.
3. AM(HS) prelazi u tečno stanje kada je izložen vlazi. Ovo bi zahtevalo značajne mere predostrožnosti prilikom skladištenja i proizvodnje da bi se sprečila ova pojava, dok kristalni oblik (I-HS) ne zahteva takve mere predostrožnosti tokom proizvodnje kristalnog oblika (I-HS) i bilo kog čvrstog oralnog doznog proizvoda pripremljenog korišćenjem kristalnog oblika (I-HS).
4. Kristalni oblik (I-HS) obezbeđuje značajno poboljšan profil nečistoća u poređenju sa AM(HS). Sposobnost kontrole profila nečistoće je važna za bezbednost pacijenata i zahtevaju je regulatorne agencije.
Primer 11
Kristalni oblik (I-HS) smanjuje rast tumora koji se karakterišu ekspresijom fuzionog proteina Trk
[0254] Izveden je niz eksperimenata da bi se utvrdilo da li će kristalni oblik (I-HS) inhibirati rast tri različita ksenotransplantirana (humana) tumora kod miševa, pri čemu svaki ksenotransplantirani tumor potiče iz ćelijske linije kancera. Svaka od tri različite ćelijske linije kancera, ćelijska linija CUTO-3F, ćelijska linija KM12 i ćelijska linija MO-91, eksprimira različitu fuziju Trk gena. Kao što je opisano u primeru 7, ćelijska linija CUTO-3F potiče od pacijenta sa adenokarcinom pluća koji sadrži fuziju gena MPRIP-NTRK1, ćelijska linija KM12 je ćelijska linija kolorektalnog kancera koja sadrži fuziju TPM3-NTRK1 (Vaishnavi et al., Nature Med. 19:1469-1472, 2013) i ćelijska linija MO-91 potiče od pacijenta sa akutnom mijeloidnom leukemijom koja sadrži fuziju ETV6-NTRK3 (Taipale et al., Nature Biotech.
31:630-637, 2013). Nakon implantacije jednog od ova tri različita ksenotransplantirana (humana) tumora kod miševa, praćena je promena zapremine svakog tumora. Takvi miševi su tretirani vehikulumom ili im je oralno davana dnevna doza od 60 mg/kg ili 200 mg/kg kristalnog oblika (I-HS) (Slike 45-47, respektivno) nakon implantacije ksenotransplantata.
[0255] Ovi podaci pokazuju da je primena kristalnog oblika (I-HS) u stanju da efikasno zaustavi rast, ili smanji stopu rasta, humanih tumora koji se karakterišu ekspresijom onkogenog Trk fuzionog proteina kod sisara.
[0256] Dok prethodna specifikacija podučava principe ovog pronalaska, sa primerima datim u svrhu ilustracije, biće jasno da praktikovanje pronalaska obuhvata sve uobičajene varijacije, adaptacije i/ili modifikacije koje se nalaze u okviru obima zahteva datih u nastavku.
Reference:
[0257]
1. Wiesner et al., Nature Comm.5:3116, 2014.
2. Vaishnavi et al., Nature Med.19:1469-1472, 2013.
3. Greco et al., Mol. Cell. Endocrinol.28:321, 2010.
4. Kim et al., PloS ONE 9(3):e91940, 2014.
5. Vaishnavi et al., Nature Med.19:1469-1472, 2013.
6. Fernandez-Cuesta et al., "Cross-entity mutation analysis of lung neuroendocrine tumors sheds light into their molecular origin and identifies new therapeutic targets," AACR Annual Meeting 2014, Abstract, April 2014.
7. Stransky et al., Nature Comm.5:4846, 2014.
8. Ross et al., Oncologist 19:235-242, 2014.
9. Doebele et al., J. Clin. Oncol.32:5s, 2014.
10. Jones et al., Nature Genetics 45:927-932, 2013.
11. Wu et al., Nature Genetics 46:444-450, 2014.
12. WO 2013/059740
13. Zheng et al., "Anchored multiplex PCR for targeted next-generation sequencing," Nature Med., published online on November 10, 2014.
14. Caria et al., Cancer Genet. Cytogenet.203:21-29, 2010.
15. Frattini et al., Nature Genet.45:1141-1149, 2013.
16. Martin-Zanca et al., Nature 319:743, 1986.
17. Meyer et al., Leukemia 21: 2171-2180, 2007.
18. Reuther et al., Mol. Cell. Biol. 20:8655-8666, 2000. 19. Marchetti et al., Human Mutation 29(5):609-616, 2008.
20. Tacconelli et al., Cancer Cell 6:347, 2004.
21. Walch et al., Clin. Exp. Metastasis 17: 307-314, 1999.
22. Papatsoris et al., Expert Opin. Invest. Drugs 16(3):303-309, 2007.
23. Van Noesel et al., Gene 325: 1-15, 2004.
24. Zhang et al., Oncology Reports 14: 161-171, 2005.
25. Truzzi et al., J. Invest. Dermatol.128(8):2031, 2008.
26. Kolokythas et al., J. Oral Maxillofacial Surgery 68(6):1290-1295, 2010.
27. Ni et al., Asian Pacific Journal of Cancer Prevention 13:1511, 2012.

Claims (22)

  1. Patentni zahtevi 1. Kristalni oblik (I-HS) koji ima formulu:
    naznačen time, što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 18.4±0.2, 20.7±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2, pri čemu kristalni oblik suštinski ne sadrži druge amorfne, polimorfne ili kristalne oblike, što znači da je molski procenat drugog/drugih amorfnih, polimorfnih ili kristalnih oblika izolovane baze kristalnog oblika (I-HS) manji od oko 5 molskih procenata.
  2. 2. Kristalni oblik prema patentnom zahtevu 1, naznačen time, što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 10.7±0.2, 18.4±0.2, 20.7±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2.
  3. 3. Kristalni oblik prema patentnom zahtevu 1, naznačen time, što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 10.7±0.2, 18.4±0.2, 19.2±0.2, 20.2±0.2, 20.7±0.2, 21.5±0.2, 23.1±0.2 i 24.0±0.2.
  4. 4. Kristalni oblik prema patentnom zahtevu 1, naznačen time, što ima difrakcione pikove XRPD (2θ stepeni) na 10.7±0.2, 15.3±0.2, 16.5±0.2, 18.4±0.2, 19.2±0.2, 19.9±0.2, 20.2±0.2, 20.7±0.2, 21.5±0.2, 22.1±0.2, 23.1±0.2, 24.0±0.2, 24.4±0.2, 25.6±0.2, 26.5±0.2, 27.6±0.2, 28.2±0.2, 28.7±0.2, 30.8±0.2 i 38.5±0.2.
  5. 5. Kristalni oblik prema patentnom zahtevu 1, gde kristalni oblik pokazuje početak do maksimuma od oko 193 do oko 205° Celzijusa, mereno diferencijalnom skenirajućom kalorimetrijom.
  6. 6. Kristalni oblik prema patentnom zahtevu 1, gde kristalni oblik pokazuje toplotu topljenja od oko 2415 mW, mereno diferencijalnom skenirajućom kalorimetrijom.
  7. 7. Kristalni oblik prema patentnom zahtevu 1, gde je kristalni oblik nehigroskpan.
  8. 8. Farmaceutska kompozicija koja sadrži farmaceutski prihvatljiv nosač i kristalni oblik prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7.
  9. 9. Postupak za pravljenje farmaceutske kompozicije koji obuhvata mešanje kristalnog oblika prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7 i farmaceutski prihvatljivog nosača.
  10. 10. Kristalni oblik prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7 za upotrebu u lečenju poremećaja izabranog iz grupe koja se sastoji od kancera, bola, upale, neurodegenerativne bolesti ili infekcije parazitom Trypanosoma cruzi.
  11. 11. Kristalni oblik prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7 za upotrebu u lečenju kancera posredovanog Trk kinazom.
  12. 12. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 11, gde je kancer posredovan kinazom TrkA.
  13. 13. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 11, gde je kancer posredovan kinazom TrkB.
  14. 14. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 11, gde je kancer posredovan kinazom TrkA i TrkB.
  15. 15. Kristalni oblik prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7 za upotrebu u lečenju pacijenta kome je dijagnostikovan, ili je identifikovano da ima, kancer povezan sa Trk.
  16. 16. Kristalni oblik prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7 za upotrebu u lečenju kancera povezanog sa jednim ili više od prekomerne ekspresije, aktivacije, amplifikacije i mutacije Trk kinaze, pri čemu upotreba prvo obuhvata određivanje da li je kancer povezan sa jednim ili više od prekomerne ekspresije, aktivacije, amplifikacije i mutacije Trk kinaze.
  17. 17. Kristalni oblik prema bilo kom od patentnih zahteva 1-7 za upotrebu u lečenju pacijenta koji ima disregulaciju gena NTRK, proteina Trk, ili njihove ekspresije ili nivoa.
  18. 18. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 15 ili 17, gde je disregulacija gena NTRK, proteina Trk, ili njihove ekspresije ili nivoa hromozomska translacija koja rezultuje translacijom fuzionog proteina Trk.
  19. 19. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 18, gde je fuzioni protein Trk izabran iz grupe koja se sastoji od: TP53-TrkA, LMNA-TrkA, CD74-TrkA, TFG-TrkA, TPM3-TrkA, NFASC-TrkA, BCAN-TrkA, MPRIP-TrkA, TPR-TrkA, RFWD2-TrkA, IRF2BP2-TrkA, SQSTM1-TrkA, SSBP2-TrkA, RABGAP1L-TrkA, C18ORF8-TrkA, RNF213-TrkA, TBC1D22A-TrkA, C20ORF112-TrkA, DNER-TrkA, ARHGEF2-TrkA, CHTOP-TrkA, PPL-TrkA, PLEKHA6-TrkA, PEAR1-TrkA, MRPL24-TrkA, MDM4-TrkA, LRRC71-TrkA, GRIPAP1-TrkA, EPS15-TrkA, DYNC2H1-TrkA, CEL-TrkA, EPHB2-TrkA, TGF-TrkA, NACC2-TrkB, QKI-TrkB, AFAP1-TrkB, PAN3-TrkB, SQSTM1-TrkB, TRIM24-TrkB, VCLTrkB, AGBL4-TrkB, DAB2IP-TrkB, ETV6-TrkC, BTBD1-TrkC, LYN-TrkC, RBPMS-TrkC, EML4-TrkC, HOMER2-TrkC, TFG-TrkC, FAT1-TrkC i TEL-TrkC.
  20. 20. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 15 ili 18, gde je disregulacija gena NTRK, proteina Trk, ili njihove ekspresije ili aktivnosti, jedna ili više tačkastih mutacija u genu.
  21. 21. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 20, gde je gen NTRK gen NTRK1, i jedna ili više tačkastih mutacija u genu NTRK1 rezultuje translacijom proteina TrkA koji ima supstitucije na jednoj ili više od sledećih aminokiselinskih pozicija: 33, 336, 337, 324, 420, 444, 517, 538, 649, 682, 683, 702 i 1879.
  22. 22. Kristalni oblik za upotrebu prema patentnom zahtevu 21, gde jedna ili više tačkastih mutacija u genu NTRK1 rezultuje translacijom proteina TrkA koji ima jednu ili više od sledećih aminokiselinskih supstitucija: R33W, A336E, A337T, R324Q, R324W, V420M, R444Q, R444W, G517R, G517V, K538A, R649W, R649L, R682S, V683G, R702C i C1879T.
RS20230253A 2014-11-16 2015-11-16 Kristalni oblik (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata RS64122B1 (sr)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462080374P 2014-11-16 2014-11-16
US201562169545P 2015-06-01 2015-06-01
EP20169707.5A EP3699181B1 (en) 2014-11-16 2015-11-16 Crystalline form of (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorophenyl)-pyrrolidin-1-yl)-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide hydrogen sulfate

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RS64122B1 true RS64122B1 (sr) 2023-05-31

Family

ID=54848892

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RS20230253A RS64122B1 (sr) 2014-11-16 2015-11-16 Kristalni oblik (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorofenil)-pirolidin-1-il)-pirazolo[1,5-a]pirimidin-3-il)-3-hidroksipirolidin-1-karboksamid hidrogensulfata

Country Status (31)

Country Link
US (5) US10799505B2 (sr)
EP (2) EP3699181B1 (sr)
JP (2) JP6914834B2 (sr)
KR (1) KR102649887B1 (sr)
CN (2) CN113354649B (sr)
AU (1) AU2015346046B2 (sr)
BR (1) BR112017010141A2 (sr)
CA (1) CA2967951C (sr)
CL (1) CL2017001249A1 (sr)
CO (1) CO2017005483A2 (sr)
CR (1) CR20170263A (sr)
CY (1) CY1125935T1 (sr)
DK (1) DK3699181T3 (sr)
ES (1) ES2941630T3 (sr)
FI (1) FI3699181T3 (sr)
HK (1) HK1244483A1 (sr)
HR (1) HRP20230271T1 (sr)
HU (1) HUE061448T2 (sr)
IL (2) IL290905B2 (sr)
LT (1) LT3699181T (sr)
MX (2) MX376478B (sr)
PH (2) PH12017500900A1 (sr)
PL (1) PL3699181T3 (sr)
PT (1) PT3699181T (sr)
RS (1) RS64122B1 (sr)
SG (1) SG11201703962XA (sr)
SI (1) SI3699181T1 (sr)
TW (2) TWI767858B (sr)
UA (1) UA123044C2 (sr)
WO (1) WO2016077841A1 (sr)
ZA (1) ZA201703501B (sr)

Families Citing this family (60)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010033941A1 (en) 2008-09-22 2010-03-25 Array Biopharma Inc. Substituted imidazo[1,2b]pyridazine compounds as trk kinase inhibitors
MY169791A (en) 2008-10-22 2019-05-15 Array Biopharma Inc Substituted pyrazolo [1,5-a] pyrimidine compounds as trk kinase inhibitors
AR077468A1 (es) 2009-07-09 2011-08-31 Array Biopharma Inc Compuestos de pirazolo (1,5 -a) pirimidina sustituidos como inhibidores de trk- quinasa
ME03376B (me) 2010-05-20 2020-01-20 Array Biopharma Inc Makrociklička jedinjenja kао inhibiтori trk kinaze
EP3628749A1 (en) * 2013-07-30 2020-04-01 Blueprint Medicines Corporation Ntrk2 fusions
US20160053301A1 (en) 2014-08-22 2016-02-25 Clearfork Bioscience, Inc. Methods for quantitative genetic analysis of cell free dna
CN113354649B (zh) 2014-11-16 2024-12-10 阵列生物制药公司 一种新的晶型
HK1253093A1 (zh) 2015-06-01 2019-06-06 Loxo Oncology Inc. 诊断和治疗癌症的方法
BR112018000808A2 (pt) 2015-07-16 2018-09-04 Array Biopharma Inc compostos de pirazolo[1,5-a]piridina substituída como inibidores de ret cinase
EP3368039A1 (en) 2015-10-26 2018-09-05 The Regents of The University of Colorado, A Body Corporate Point mutations in trk inhibitor-resistant cancer and methods relating to the same
US10045991B2 (en) 2016-04-04 2018-08-14 Loxo Oncology, Inc. Methods of treating pediatric cancers
FI3439662T3 (fi) 2016-04-04 2024-09-04 Loxo Oncology Inc (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorifenyyli)pyrrolidin-1-yyli)pyratsolo[1,5-a]pyrimidin-3-yyli)-3-hydroksipyrrolidiini-1-karboksamidin nesteformulaatioita
AU2017246547B2 (en) 2016-04-04 2023-02-23 Loxo Oncology, Inc. Methods of treating pediatric cancers
EP3458456B1 (en) * 2016-05-18 2020-11-25 Loxo Oncology Inc. Preparation of (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorophenyl)pyrrolidin-1-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide
US11319594B2 (en) 2016-08-25 2022-05-03 Resolution Bioscience, Inc. Methods for the detection of genomic copy changes in DNA samples
TWI752098B (zh) 2016-10-10 2022-01-11 美商亞雷生物製藥股份有限公司 作為ret激酶抑制劑之經取代吡唑并[1,5-a]吡啶化合物
TWI704148B (zh) 2016-10-10 2020-09-11 美商亞雷生物製藥股份有限公司 作為ｒｅｔ激酶抑制劑之經取代吡唑并[1,5-a]吡啶化合物
JOP20190092A1 (ar) 2016-10-26 2019-04-25 Array Biopharma Inc عملية لتحضير مركبات بيرازولو[1، 5-a]بيريميدين وأملاح منها
WO2018136661A1 (en) 2017-01-18 2018-07-26 Andrews Steven W SUBSTITUTED PYRAZOLO[1,5-a]PYRAZINE COMPOUNDS AS RET KINASE INHIBITORS
WO2018136663A1 (en) 2017-01-18 2018-07-26 Array Biopharma, Inc. Ret inhibitors
JOP20190213A1 (ar) 2017-03-16 2019-09-16 Array Biopharma Inc مركبات حلقية ضخمة كمثبطات لكيناز ros1
US10180422B1 (en) 2017-08-22 2019-01-15 Scripps Health Methods of treating a neuroendocrine tumor
TWI791053B (zh) 2017-10-10 2023-02-01 美商亞雷生物製藥股份有限公司 6-(2-羥基-2-甲基丙氧基)-4-(6-(6-((6-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-3,6-二氮雜雙環[3.1.1]庚-3-基)吡啶-3-基)吡唑并[1,5-a]吡啶-3-甲腈之結晶形式及其醫藥組合物
TWI876442B (zh) 2017-10-10 2025-03-11 美商絡速藥業公司 6-(2-羥基-2-甲基丙氧基)-4-(6-(6-((6-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-3,6-二氮雜雙環[3.1.1]庚-3-基)吡啶-3-基)吡唑并[1,5-a]吡啶-3-甲腈之調配物
WO2019084285A1 (en) 2017-10-26 2019-05-02 Qian Zhao FORMULATIONS OF A MACROCYCLIC TRK KINASE INHIBITOR
EP3684770B1 (en) 2017-10-31 2025-08-13 Assia Chemical Industries Ltd. Salts and solid state forms of larotrectinib
CN107987082B (zh) * 2017-11-14 2019-09-20 苏州东南药业股份有限公司 一种Larotrectinib的制备方法及其中间体
EP3730492A4 (en) * 2017-12-22 2021-08-11 Shenzhen TargetRx, Inc. SUBSTITUTED PYRAZOLO [1,5-A] PYRIMIDINE COMPOUND AND PHARMACEUTICAL COMPOSITION AND USE THEREOF
EP3740490A1 (en) 2018-01-18 2020-11-25 Array Biopharma, Inc. Substituted pyrazolo[3,4-d]pyrimidine compounds as ret kinase inhibitors
JP7060694B2 (ja) 2018-01-18 2022-04-26 アレイ バイオファーマ インコーポレイテッド Ｒｅｔキナーゼ阻害剤としての置換ピロロ［２，３－ｄ］ピリミジン化合物
US11472802B2 (en) 2018-01-18 2022-10-18 Array Biopharma Inc. Substituted pyrazolyl[4,3-c]pyridine compounds as RET kinase inhibitors
US11345703B2 (en) 2018-01-23 2022-05-31 Shenzhen Targetrx, Inc. Substituted pyrazolo[1,5-a]pyrimidine macrocyclic compound
MX2020008273A (es) 2018-02-06 2020-11-24 Univ Miami Inhibidores de la cinasa del complejo de activacion transcripcional notch ("nack") y metodos para el uso de los mismos.
WO2019191659A1 (en) 2018-03-29 2019-10-03 Loxo Oncology, Inc. Treatment of trk-associated cancers
WO2019220352A1 (en) * 2018-05-15 2019-11-21 Dr. Reddy’S Laboratories Limited Amorphous solid dispersion of larotrectinib sulfate and process thereof
CN110294761B (zh) * 2018-06-08 2020-09-08 南京雷正医药科技有限公司 作为Trk激酶抑制剂的取代的吡唑并[1,5-a]嘧啶化合物
CN117285467A (zh) 2018-07-31 2023-12-26 罗索肿瘤学公司 喷雾干燥的分散体和制剂
CN110857304B (zh) * 2018-08-24 2021-05-18 北京富龙康泰生物技术有限公司 Trk抑制剂、其制备方法和用途
CN112996794A (zh) 2018-09-10 2021-06-18 阿雷生物药品公司 作为ret激酶抑制剂的稠合杂环化合物
CN111138333B (zh) * 2018-11-02 2023-05-23 上海复星星泰医药科技有限公司 一种(r)-2-(2,5-二氟苯基)-吡咯烷的制备方法
CN109232582B (zh) * 2018-11-28 2021-02-05 安礼特（上海）医药科技有限公司 拉洛替尼硫酸氢盐晶型及其制备和应用
AU2019387290A1 (en) 2018-11-29 2021-05-27 Pfizer Inc. Pyrazoles as modulators of hemoglobin
CN109608464B (zh) * 2018-12-12 2021-09-24 上海健康医学院 一种放射性碘标记Larotrectinib化合物及其制备方法和应用
US12351571B2 (en) 2018-12-19 2025-07-08 Array Biopharma Inc. Substituted quinoxaline compounds as inhibitors of FGFR tyrosine kinases
EP3898626A1 (en) 2018-12-19 2021-10-27 Array Biopharma, Inc. Substituted pyrazolo[1,5-a]pyridine compounds as inhibitors of fgfr tyrosine kinases
CN109593803A (zh) * 2018-12-24 2019-04-09 上海健康医学院 (r)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷或其盐的制备方法
CN111057729B (zh) * 2019-06-03 2023-08-29 弈柯莱生物科技(上海)股份有限公司 一种(r)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷及其制备方法和应用
JP7785291B2 (ja) * 2019-08-08 2025-12-15 ユニヴェルシテ・ドゥ・ストラスブール ＴｒｋＢポジティブアロステリックモジュレーター
CN110804059B (zh) * 2019-09-30 2024-03-12 郑州泰基鸿诺医药股份有限公司 氨基甲酸酯类化合物、药物组合物及其应用
CN110981779B (zh) * 2019-11-23 2021-02-26 武汉理工大学 R-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的合成方法
CN111087398A (zh) * 2019-12-24 2020-05-01 上海万巷制药有限公司 一种制备拉罗替尼中间体的清洁工艺
CN111302997B (zh) * 2020-04-15 2022-03-29 江苏恒沛药物科技有限公司 “一锅法”制备拉罗替尼中间体的方法
MX2022015718A (es) * 2020-06-10 2023-01-24 Epics Therapeutics Sintesis del acido (2s,5r)-5-(2-clorofenilo)-1-(2'-metoxi-[1,1'-bi fenilo]-4-carbonilo)pirrolidina-2-carboxilico.
CN111763211A (zh) * 2020-08-05 2020-10-13 安庆多辉生物科技有限公司 拉罗替尼盐酸盐、制备方法与应用
RU2764955C1 (ru) * 2021-01-11 2022-01-24 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ") Способ комбинированного лечения метастатического колоректального рака у больных с резектабельными метастазами в печени и при отсутствии мутаций в генах KRAS и BRAF
RU2760174C1 (ru) * 2021-01-11 2021-11-22 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ") Способ комбинированного лечения метастатического колоректального рака у больных с резектабельными метастазами в печени и при наличии мутаций в генах KRAS и BRAF
WO2022168115A1 (en) * 2021-02-05 2022-08-11 Mylan Laboratories Limited A process for the preparation of larotrectinib or its salts
IT202100003887A1 (it) * 2021-02-19 2022-08-19 Olon Spa Procedimento per la preparazione di larotrectinib ad elevato grado di purezza
CN114478345B (zh) * 2022-02-10 2024-06-14 中瀚(齐河县)生物医药科技有限公司 一种(r)-2-(2,5-二氟苯基)吡咯烷的制备方法
WO2024023836A1 (en) * 2022-07-27 2024-02-01 Mylan Laboratories Limited Polymorphic form of larotrectinib sulfate

Family Cites Families (198)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NZ234143A (en) 1989-06-28 1991-10-25 Mcneil Ppc Inc Aqueous pharmaceutical suspension formulation for administering substantially insoluble pharmaceutical agents
DE69422306T4 (de) 1993-11-30 2000-09-07 G.D. Searle & Co., Chicago Substituierte pyrazolyl-benzolsulfonamide zur behandlung von entzündungen
US5877016A (en) 1994-03-18 1999-03-02 Genentech, Inc. Human trk receptors and neurotrophic factor inhibitors
US5844092A (en) 1994-03-18 1998-12-01 Genentech, Inc. Human TRK receptors and neurotrophic factor inhibitors
US5430021A (en) 1994-03-18 1995-07-04 Pharmavene, Inc. Hydrophobic drug delivery systems
CA2206201A1 (en) 1996-05-29 1997-11-29 Yoshiaki Isobe Pyrazole derivatives and their pharmaceutical use
JP3898296B2 (ja) 1996-08-28 2007-03-28 ポーラ化成工業株式会社 ピロロピラゾロピリミジン化合物及びこれを有効成分とする医薬
CA2285264A1 (en) 1997-04-25 1998-11-05 Michiyo Gyoten Condensed pyridazine derivatives, their production and use
UA74546C2 (en) 1999-04-06 2006-01-16 Boehringer Ingelheim Ca Ltd Macrocyclic peptides having activity relative to hepatitis c virus, a pharmaceutical composition and use of the pharmaceutical composition
US6534085B1 (en) 1999-09-23 2003-03-18 Bioresponse L.L.C. Phytochemicals for promoting weight loss
CA2412494C (en) 2000-06-22 2012-10-23 Genentech, Inc. Agonist anti-trk-c monoclonal antibodies
TWI312347B (en) 2001-02-08 2009-07-21 Eisai R&D Man Co Ltd Bicyclic nitrogen-containing condensed ring compounds
CA2975521A1 (en) 2001-05-30 2002-12-05 Genentech, Inc. Anti-ngf antibodies for the treatment of various disorders
US7101572B2 (en) 2001-12-07 2006-09-05 Unilab Pharmatech, Ltd. Taste masked aqueous liquid pharmaceutical composition
US20030199525A1 (en) 2002-03-21 2003-10-23 Hirst Gavin C. Kinase inhibitors
US7662826B2 (en) 2002-04-23 2010-02-16 Shionogi & Co., Ltd. Pyrazolo [1,5-a] pyrimidine derivative and nad (p) h oxidase inhibitor containing the same
US7449488B2 (en) 2002-06-04 2008-11-11 Schering Corporation Pyrazolopyrimidines as protein kinase inhibitors
ITMI20021620A1 (it) 2002-07-23 2004-01-23 Novuspharma Spa Composto ad ativita' antitumorale
JP4024624B2 (ja) 2002-08-26 2007-12-19 富士通株式会社 半導体装置の製造方法及び製造装置
US7119200B2 (en) 2002-09-04 2006-10-10 Schering Corporation Pyrazolopyrimidines as cyclin dependent kinase inhibitors
MXPA05002571A (es) 2002-09-04 2005-09-08 Schering Corp Pirazolopirimidinas como inhibidores de cinasa dependientes de ciclina.
US8580782B2 (en) 2002-09-04 2013-11-12 Merck Sharp & Dohme Corp. Substituted pyrazolo[1,5-a]pyrimidines as cyclin dependent kinase inhibitors
US7196078B2 (en) 2002-09-04 2007-03-27 Schering Corpoartion Trisubstituted and tetrasubstituted pyrazolopyrimidines as cyclin dependent kinase inhibitors
AU2003298942A1 (en) 2002-12-11 2004-06-30 Merck And Co., Inc. Tyrosine kinase inhibitors
US7550470B2 (en) 2002-12-11 2009-06-23 Merck & Co. Inc. Substituted pyrazolo[1,5-A]pyrimidines as tyrosine kinase inhibitors
GB0303910D0 (en) 2003-02-20 2003-03-26 Merck Sharp & Dohme Therapeutic agents
WO2004082458A2 (en) 2003-02-21 2004-09-30 The Johns Hopkins University Tyrosine kinome
JP2004277337A (ja) 2003-03-14 2004-10-07 Sumitomo Pharmaceut Co Ltd ピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン誘導体
US20070179161A1 (en) 2003-03-31 2007-08-02 Vernalis (Cambridge) Limited. Pyrazolopyrimidine compounds and their use in medicine
US20060094699A1 (en) 2003-04-11 2006-05-04 Kampen Gita Camilla T Combination therapy using an 11beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 inhibitor and a glucocorticoid receptor agonist to minimize the side effects associated with glucocorticoid receptor agonist therapy
JP2006522744A (ja) 2003-04-11 2006-10-05 ノボ　ノルディスク　アクティーゼルスカブ グルココルチコイド受容体アゴニスト療法に伴う副作用を最小化するための、１１β−ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼ１型阻害剤およびグルココルチコイド受容体アゴニストを使用する併用療法
WO2004089471A2 (en) 2003-04-11 2004-10-21 Novo Nordisk A/S NEW PYRAZOLO[1,5-a] PYRIMIDINES DERIVATIVES AND PHARMACEUTICAL USE THEREOF
US20070042941A1 (en) 2003-04-28 2007-02-22 Mitsuomi Hirashima Galectin 9-inducing factors
JO2785B1 (en) 2003-05-27 2014-03-15 شركة جانسين فارماسوتيكا ان. في Quinazoline derivatives
JP2005008581A (ja) 2003-06-20 2005-01-13 Kissei Pharmaceut Co Ltd 新規なピラゾロ［１，５−ａ］ピリミジン誘導体、それを含有する医薬組成物およびそれらの用途
EA009517B1 (ru) 2003-06-27 2008-02-28 Байер Кропсайенс Аг Пиразолопиримидины
AR045056A1 (es) 2003-07-15 2005-10-12 Amgen Inc Anticuerpos anti-ngf humanos neutralizantes como inhibidores selectivos de la via de ngf
US7491794B2 (en) 2003-10-14 2009-02-17 Intermune, Inc. Macrocyclic compounds as inhibitors of viral replication
CA2543116A1 (en) 2003-10-27 2005-05-19 Genelabs Technologies, Inc. Methods for preparing 7-(2'-substituted-.szlig.-d-ribofuranosyl)-4-(nr2r3)-5-(substituted ethyn-1-yl)-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine derivatives
MY141220A (en) 2003-11-17 2010-03-31 Astrazeneca Ab Pyrazole derivatives as inhibitors of receptor tyrosine kinases
PE20051046A1 (es) 2003-11-28 2006-01-11 Novartis Ag Derivados de diaril-urea en el tratamiento de enfermedades dependientes de la quinasa de proteina
MXPA06007017A (es) 2003-12-18 2006-08-31 Janssen Pharmaceutica Nv Derivados de pirido y pirimidopirimidina como agentes antiproliferativos.
CN1925855B (zh) 2003-12-19 2010-06-16 普莱希科公司 开发Ret调节剂的化合物和方法
WO2005068424A1 (en) 2004-01-20 2005-07-28 Cell Therapeutics Europe S.R.L. Indolinone derivatives as receptor tyrosine kinase ihibitors
US20050222171A1 (en) 2004-01-22 2005-10-06 Guido Bold Organic compounds
WO2005099363A2 (en) 2004-03-26 2005-10-27 Whitehead Institute For Biomedical Research Methods of diagnosing, preventing and treating cancer metastasis
CN1938311A (zh) 2004-03-30 2007-03-28 因特蒙公司 作为病毒复制抑制剂的大环化合物
PE20060664A1 (es) 2004-09-15 2006-08-04 Novartis Ag Amidas biciclicas como inhibidores de cinasa
PT1812440E (pt) 2004-11-04 2011-01-25 Vertex Pharma Pirazolo[1,5-a]pirimidinas úteis enquanto inibidores de proteínas cinases
JO3088B1 (ar) 2004-12-08 2017-03-15 Janssen Pharmaceutica Nv مشتقات كوينازولين كبيرة الحلقات و استعمالها بصفتها موانع كينيز متعددة الاهداف
DE102005003687A1 (de) 2005-01-26 2006-07-27 Sphingo Tec Gmbh Immunoassay zur Bestimmung der Freisetzung von Neurotensin in die Zirkulation
CN101119996A (zh) 2005-02-16 2008-02-06 阿斯利康(瑞典)有限公司 化学化合物
ES2347172T3 (es) 2005-02-16 2010-10-26 Astrazeneca Ab Compuestos quimicos.
EP1869049B1 (en) 2005-03-21 2009-03-04 Eli Lilly And Company Imidazopyridazine compounds
CN101208093A (zh) 2005-04-27 2008-06-25 阿斯利康(瑞典)有限公司 吡唑-嘧啶衍生物在治疗疼痛中的用途
US20080287437A1 (en) 2005-05-16 2008-11-20 Astrazeneca Ab Pyrazolylaminopyrimidine Derivatives Useful as Tyrosine Kinase Inhibitors
CN100406650C (zh) 2005-06-05 2008-07-30 徐斌 一种抗特大变位的模块式梳型桥梁伸缩缝装置
ITRM20050290A1 (it) 2005-06-07 2006-12-08 Lay Line Genomics Spa Uso di molecole in grado di inibire il legame tra ngf e il suo recettore trka come analgesici ad effetto prolungato.
US20070025540A1 (en) 2005-07-07 2007-02-01 Roger Travis Call center routing based on talkativeness
MX2008001166A (es) 2005-07-25 2008-03-18 Intermune Inc Nuevos inhibidores macrociclicos de la replicacion del virus de hepatitis c.
EP1910369A1 (en) 2005-07-29 2008-04-16 Astellas Pharma Inc. Fused heterocycles as lck inhibitors
CN101232871A (zh) 2005-08-03 2008-07-30 伊士曼化工公司 生育酚聚乙二醇琥珀酸酯粉末及其制备方法
EP1926734A1 (en) 2005-08-22 2008-06-04 Amgen Inc. Pyrazolopyridine and pyrazolopyrimidine compounds useful as kinase enzymes modulators
US20070049591A1 (en) 2005-08-25 2007-03-01 Kalypsys, Inc. Inhibitors of MAPK/Erk Kinase
WO2007022999A1 (en) 2005-08-25 2007-03-01 Creabilis Therapeutics S.P.A. Polymer conjugates of k-252a and derivatives thereof
DE102005042742A1 (de) 2005-09-02 2007-03-08 Schering Ag Substituierte Imidazo[1,2b]pyridazine als Kinase-Inhibitoren, deren Herstellung und Verwendung als Arzneimittel
US20070078136A1 (en) 2005-09-22 2007-04-05 Bristol-Myers Squibb Company Fused heterocyclic compounds useful as kinase modulators
AR057979A1 (es) 2005-10-06 2008-01-09 Schering Corp PIRAZOLPIRIMIDINAS COMO INHIBIDORAS DE PROTEíNA QUINASA. COMPOSICIONES FARMACEUTICAS.
BRPI0616985B1 (pt) 2005-10-06 2021-10-26 Merck Sharp & Dohme Corp. Composto de pirazolo[1,5-a]pirimidina, e, uso de um composto
ATE519757T1 (de) 2005-10-11 2011-08-15 Centre Nat Rech Scient 3 hydroxyflavon-derivate zur erkennung und quantifizierung von zell-apoptosen
AU2006301966A1 (en) 2005-10-11 2007-04-19 Array Biopharma, Inc. Compounds and methods for inhibiting hepatitis C viral replication
US8372851B2 (en) 2005-10-21 2013-02-12 Exelixis, Inc. Pyrazolo pyrimidines as casein kinase II (CK2) modulators
WO2007057399A2 (en) 2005-11-15 2007-05-24 Boehringer Ingelheim International Gmbh Treatment of cancer with indole derivatives
GB0524436D0 (en) 2005-11-30 2006-01-11 Novartis Ag Organic compounds
US8399442B2 (en) 2005-12-30 2013-03-19 Astex Therapeutics Limited Pharmaceutical compounds
US20080108611A1 (en) 2006-01-19 2008-05-08 Battista Kathleen A Substituted thienopyrimidine kinase inhibitors
WO2007087245A2 (en) 2006-01-24 2007-08-02 Merck & Co., Inc. Ret tyrosine kinase inhibition
KR100846988B1 (ko) 2006-03-06 2008-07-16 제일약품주식회사 신규한 티에노피리미딘 유도체 또는 이의 약학적으로허용가능한 염, 이의 제조방법 및 이를 함유하는 약학조성물
WO2007103308A2 (en) 2006-03-07 2007-09-13 Array Biopharma Inc. Heterobicyclic pyrazole compounds and methods of use
GB0606805D0 (en) 2006-04-04 2006-05-17 Novartis Ag Organic compounds
WO2007129161A2 (en) 2006-04-26 2007-11-15 F. Hoffmann-La Roche Ag Thieno [3, 2-d] pyrimidine derivative useful as pi3k inhibitor
CN104706637A (zh) 2006-05-18 2015-06-17 卫材R&D管理有限公司 针对甲状腺癌的抗肿瘤剂
EP1873157A1 (en) 2006-06-21 2008-01-02 Bayer Schering Pharma Aktiengesellschaft Pyrazolopyrimidines and salts thereof, pharmaceutical compositions comprising same, methods of preparing same and uses of same
TWI419889B (zh) 2006-07-05 2013-12-21 Mitsubishi Tanabe Pharma Corp 吡唑并〔１，５-ａ〕嘧啶化合物
EP2058309A4 (en) 2006-08-04 2010-12-22 Takeda Pharmaceutical CONDENSED HETEROCYCLIC COMPOUND
US7531539B2 (en) 2006-08-09 2009-05-12 Bristol-Myers Squibb Company Pyrrolotriazine kinase inhibitors
CN101594909A (zh) 2006-09-07 2009-12-02 比奥根艾迪克Ma公司 用于治疗炎性病症、细胞增殖性失调、免疫失调的irak调节剂
EP2067039A2 (en) 2006-09-12 2009-06-10 Novartis Forschungsstiftung, Zweigniederlassung Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research Non-neuroendocrine cancer therapy
WO2008037477A1 (en) 2006-09-29 2008-04-03 Novartis Ag Pyrazolopyrimidines as p13k lipid kinase inhibitors
JP2010508315A (ja) 2006-10-30 2010-03-18 ノバルティス アーゲー 抗炎症剤としてのヘテロ環式化合物
WO2008058126A2 (en) 2006-11-06 2008-05-15 Supergen, Inc. Imidazo[1,2-b]pyridazine and pyrazolo[1,5-a]pyrimidine derivatives and their use as protein kinase inhibitors
US20080234267A1 (en) 2007-03-20 2008-09-25 Karen Elizabeth Lackey Compounds and Methods of Treatment
US20080234262A1 (en) 2007-03-21 2008-09-25 Wyeth Pyrazolopyrimidine analogs and their use as mtor kinase and pi3 kinase inhibitors
CA2682016A1 (en) 2007-03-28 2008-10-02 Inovacia Ab Pyrazolo [1,5-a]pyrimidines as inhibitors of stearoyl-coa desaturase
NZ580327A (en) 2007-04-03 2012-02-24 Array Biopharma Inc IMIDAZO[1,2-a]PYRIDINE COMPOUNDS AS RECEPTOR TYROSINE KINASE INHIBITORS
EA019524B1 (ru) 2007-05-04 2014-04-30 Айрм Ллк СОЕДИНЕНИЯ И КОМПОЗИЦИИ КАК ИНГИБИТОРЫ КИНАЗЫ с-kit И PDGFR
CA2687909C (en) 2007-06-21 2015-09-15 Janssen Pharmaceutica Nv Indolin-2-ones and aza-indolin-2-ones
PT2176231T (pt) 2007-07-20 2016-12-09 Nerviano Medical Sciences Srl Derivados de indazol substituídos activos como inibidores de quinases
WO2009017838A2 (en) 2007-08-01 2009-02-05 Exelixis, Inc. Combinations of jak-2 inhibitors and other agents
MX2010001395A (es) 2007-08-10 2010-03-10 Regeneron Pharma Anticuerpos humanos de alta afinidad de factor de crecimiento de nervio humano.
EA201000484A1 (ru) 2007-10-16 2010-12-30 ВАЙЕТ ЭлЭлСи Тиенопиримидиновые и пиразолопиримидиновые соединения и их применение в качестве ингибиторов киназы mtor и киназы pi3
EP2214706A1 (en) 2007-10-23 2010-08-11 Novartis AG Use of trkb antibodies for the treatment of respiratory disorders
EP2217601A1 (en) 2007-11-08 2010-08-18 Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO) Imidazopyridazines for use as protein kinase inhibitors
CN101970440A (zh) 2007-11-28 2011-02-09 先灵公司 作为蛋白激酶抑制剂的2-氟吡唑并[1，5-a]嘧啶类
PE20091326A1 (es) 2008-01-17 2009-09-18 Irm Llc Anticuerpos anti-trkb mejorados
JP2009203226A (ja) 2008-01-31 2009-09-10 Eisai R & D Management Co Ltd ピリジン誘導体およびピリミジン誘導体を含有するレセプターチロシンキナーゼ阻害剤
KR101324804B1 (ko) 2008-05-13 2013-11-01 아이알엠 엘엘씨 키나제 억제제로서의 질소 함유 융합 헤테로사이클 및 그의 조성물
EP2323664B1 (en) 2008-07-29 2015-01-07 Nerviano Medical Sciences S.r.l. Use of a cdk inhibitor for the treatment of glioma
WO2010033941A1 (en) 2008-09-22 2010-03-25 Array Biopharma Inc. Substituted imidazo[1,2b]pyridazine compounds as trk kinase inhibitors
MY169791A (en) 2008-10-22 2019-05-15 Array Biopharma Inc Substituted pyrazolo [1,5-a] pyrimidine compounds as trk kinase inhibitors
EP2348860B1 (en) 2008-10-31 2015-05-27 Genentech, Inc. Pyrazolopyrimidine jak inhibitor compounds and methods
WO2010058006A1 (en) 2008-11-24 2010-05-27 Nerviano Medical Sciences S.R.L. Cdk inhibitor for the treatment of mesothelioma
EP3266795A1 (en) 2009-02-12 2018-01-10 Cell Signaling Technology, Inc. Method for detecting a fig-ros fusion polynucleotide
AR077468A1 (es) 2009-07-09 2011-08-31 Array Biopharma Inc Compuestos de pirazolo (1,5 -a) pirimidina sustituidos como inhibidores de trk- quinasa
ES2594927T3 (es) 2010-02-18 2016-12-23 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Métodos para prevenir las metástasis cancerosas
JP2013526852A (ja) 2010-04-06 2013-06-27 カリス ライフ サイエンシズ ルクセンブルク ホールディングス 疾患に対する循環バイオマーカー
US8383793B2 (en) 2010-04-15 2013-02-26 St. Jude Children's Research Hospital Methods and compositions for the diagnosis and treatment of cancer resistant to anaplastic lymphoma kinase (ALK) kinase inhibitors
TWI510487B (zh) 2010-04-21 2015-12-01 Plexxikon Inc 用於激酶調節的化合物和方法及其適應症
ME03376B (me) 2010-05-20 2020-01-20 Array Biopharma Inc Makrociklička jedinjenja kао inhibiтori trk kinaze
WO2012024650A2 (en) 2010-08-19 2012-02-23 Abbott Laboratories Anti-ngf antibodies and their use
WO2012034095A1 (en) 2010-09-09 2012-03-15 Irm Llc Compounds and compositions as trk inhibitors
UY33597A (es) 2010-09-09 2012-04-30 Irm Llc Compuestos y composiciones como inhibidores de la trk
JP2014005206A (ja) 2010-10-22 2014-01-16 Astellas Pharma Inc アリールアミノヘテロ環カルボキサミド化合物
EP2646468B1 (en) 2010-12-01 2018-07-25 AlderBio Holdings LLC Anti-ngf compositions and use thereof
MA34969B1 (fr) 2011-02-25 2014-03-01 Irm Llc Composes et compositions en tant qu inibiteurs de trk
WO2012125667A1 (en) * 2011-03-17 2012-09-20 Merck Sharp & Dohme Corp. TrkA KINASE INHIBITORS, COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF
WO2012125668A1 (en) * 2011-03-17 2012-09-20 Merck Sharp & Dohme Corp. TrkA KINASE INHIBITORS, COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF
CA2835835C (en) 2011-05-13 2019-04-02 Array Biopharma Inc. Pyrrolidinyl urea and pyrrolidinyl thiourea compounds as trka kinase inhibitors
US8656365B2 (en) 2011-09-01 2014-02-18 Infosys Limited Systems, methods, and computer-readable media for measuring quality of application programming interfaces
TW201312526A (zh) 2011-09-02 2013-03-16 Wintek Corp 觸控顯示面板
WO2013059740A1 (en) 2011-10-21 2013-04-25 Foundation Medicine, Inc. Novel alk and ntrk1 fusion molecules and uses thereof
EP2779833A4 (en) 2011-11-14 2015-03-18 Tesaro Inc MODULATION OF SPECIFIC TYROSINE KINASES
AU2012351748B2 (en) 2011-12-12 2016-04-14 Dr. Reddy's Laboratories Ltd. Substituted pyrazolo[1,5-a] pyridine as tropomyosin receptor kinase (Trk) inhibitors
TW201350479A (zh) 2012-04-26 2013-12-16 Ono Pharmaceutical Co Ｔｒｋ阻害化合物
ES2751944T3 (es) 2012-05-23 2020-04-02 Nerviano Medical Sciences Srl Proceso para la preparación de N-[5-(3,5-difluoro-bencil)-1H-indazol-3-il]-4-(4-metil-piperazin-1-il)-2-(tetrahidro-piran-4-ilamino)-benzamida
TWI585088B (zh) 2012-06-04 2017-06-01 第一三共股份有限公司 作爲激酶抑制劑之咪唑并［１，２－ｂ］嗒衍生物
EP2689778A1 (en) 2012-07-27 2014-01-29 Pierre Fabre Medicament Derivatives of azaindoles or diazaindoles for treating pain
EP2890815B1 (en) 2012-08-31 2019-03-20 The Regents of the University of Colorado Methods for diagnosis and treatment of cancer
JP6513567B2 (ja) 2012-09-07 2019-05-15 エクセリクシス， インク． 肺腺癌の治療で使用するためのｍｅｔ、ｖｅｇｆｒ、およびｒｅｔの阻害剤
US20140084039A1 (en) 2012-09-24 2014-03-27 Electro Scientific Industries, Inc. Method and apparatus for separating workpieces
JP2014082984A (ja) 2012-10-23 2014-05-12 Astellas Pharma Inc 新規ｎｔｒｋ２活性化変異の検出法
US11230589B2 (en) 2012-11-05 2022-01-25 Foundation Medicine, Inc. Fusion molecules and uses thereof
ES2755772T3 (es) 2012-11-07 2020-04-23 Nerviano Medical Sciences Srl Pirimidinil y piridinilpirrolopiridinonas sustituidas, proceso para su preparación y su uso como inhibidores de cinasas
RS55593B1 (sr) 2012-11-13 2017-06-30 Array Biopharma Inc Jedinjenja biciklične uree, tiouree, guanidina i cijanoguanidina korisna za lečenje bola
WO2014078325A1 (en) 2012-11-13 2014-05-22 Array Biopharma Inc. N-(monocyclic aryl),n'-pyrazolyl-urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as trka kinase inhibitors
WO2014078417A1 (en) 2012-11-13 2014-05-22 Array Biopharma Inc. Pyrazolyl urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as trka kinase inhibitors
US9981959B2 (en) 2012-11-13 2018-05-29 Array Biopharma Inc. Thiazolyl and oxazolyl urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as TrkA kinase inhibitors
WO2014078372A1 (en) 2012-11-13 2014-05-22 Array Biopharma Inc. Pyrrolidinyl urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as trka kinase inhibitors
MX374242B (es) 2012-11-13 2025-03-05 Array Biopharma Inc Compuestos de n-pirrolidinil, n' -pirazolil-urea, tiourea, guanidina y cianoguanidina como inhibidores de trka cinasa.
US9822118B2 (en) 2012-11-13 2017-11-21 Array Biopharma Inc. Bicyclic heteroaryl urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as TrkA kinase inhibitors
WO2014078328A1 (en) 2012-11-13 2014-05-22 Array Biopharma Inc. N-bicyclic aryl,n'-pyrazolyl urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as trka kinase inhibitors
WO2014078331A1 (en) 2012-11-13 2014-05-22 Array Biopharma Inc. N-(arylalkyl)-n'-pyrazolyl-urea, thiourea, guanidine and cyanoguanidine compounds as trka kinase inhibitors
CA2877847A1 (en) 2012-11-29 2014-06-05 Yeda Research And Development Co. Ltd. Methods of preventing tumor metastasis, treating and prognosing cancer and identifying agents which are putative metastasis inhibitors
US9127055B2 (en) 2013-02-08 2015-09-08 Astellas Pharma Inc. Method of treating pain with anti-human NGF antibody
AU2014219855B2 (en) 2013-02-19 2017-09-28 Ono Pharmaceutical Co., Ltd. Trk-inhibiting compound
WO2014130975A1 (en) 2013-02-22 2014-08-28 Bastian Boris C Fusion polynucleotides and fusion polypeptides associated with cancer and particularly melanoma and their uses as therapeutic and diagnostic targets
WO2014134096A1 (en) 2013-02-27 2014-09-04 Oregon Health & Science University Methods of treating cancers characterized by aberrent ros1 activity
WO2014152777A2 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Insight Genetics, Inc. Methods and compositions for the diagnosis and treatment of cancers resistant to ros1 inhibitors
WO2014150751A2 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Novartis Ag Biomarkers associated with brm inhibition
WO2014151117A1 (en) 2013-03-15 2014-09-25 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Identification and use of circulating nucleic acid tumor markers
AR095308A1 (es) 2013-03-15 2015-10-07 Glaxosmithkline Ip Dev Ltd Compuesto de 2-piridona, composición farmacéutica que lo comprende y su uso para preparar un medicamento
EP2968551B1 (en) 2013-03-15 2021-05-05 The Trustees of Columbia University in the City of New York Fusion proteins and methods thereof
AU2014254394B2 (en) 2013-04-17 2020-06-18 Life Technologies Corporation Gene fusions and gene variants associated with cancer
EP2997030B1 (en) 2013-05-14 2017-08-09 Nerviano Medical Sciences S.R.L. Pyrrolo[2,3-d]pyrimidine derivatives, process for their preparation and their use as kinase inhibitors
EP3019489A4 (en) 2013-07-11 2016-12-28 Betta Pharmaceuticals Co Ltd MODULATORS OF TYROSINE KINASE PROTEIN AND METHODS OF USE
US10705087B2 (en) 2013-07-26 2020-07-07 Japanese Foundation For Cancer Research Detection method for NTRK3 fusion
EP3628749A1 (en) 2013-07-30 2020-04-01 Blueprint Medicines Corporation Ntrk2 fusions
CN105848654B (zh) 2013-10-24 2018-10-02 乔治城大学 用于治疗癌症的方法和组合物
JPWO2015064621A1 (ja) 2013-10-29 2017-03-09 公益財団法人がん研究会 新規融合体及びその検出法
ES2933350T3 (es) 2014-01-24 2023-02-06 Turning Point Therapeutics Inc Macrociclos de diarilo como moduladores de proteína quinasas
KR101723997B1 (ko) 2014-02-05 2017-04-06 브이엠 온콜로지 엘엘씨 화합물의 조성물 및 이의 용도
TWI672141B (zh) 2014-02-20 2019-09-21 美商醫科泰生技 投予ｒｏｓ１突變癌細胞之分子
MA40434B1 (fr) 2014-05-15 2019-09-30 Array Biopharma Inc 1-((3s,4r)-4-(3-fluorophényl)-1-(2-méthoxyéthyl)pyrrolidin-3-yl)-3-(4-méthyl-3-(2-méthylpyrimidin-5-yl)-1-phényl-1h-pyrazol-5-yl)urée comme inhibiteur de la kinase trka
WO2015183837A1 (en) 2014-05-27 2015-12-03 Brian Haynes Compositions, methods, and uses related to ntrk2-tert fusions
WO2015184443A1 (en) 2014-05-30 2015-12-03 The Regents Of The University Of Colorado Activating ntrk1 gene fusions predictive of kinase inhibitor therapy
US20160032404A1 (en) 2014-08-01 2016-02-04 Pharmacyclics Llc Biomarkers for predicting response of dlbcl to treatment with a btk inhibitor
US10399959B2 (en) 2014-08-18 2019-09-03 Ono Pharmaceutical Co., Ltd. Acid-addition salt of Trk-inhibiting compound
EP4245376A3 (en) 2014-10-14 2023-12-13 Novartis AG Antibody molecules to pd-l1 and uses thereof
CN113354649B (zh) 2014-11-16 2024-12-10 阵列生物制药公司 一种新的晶型
CA2971024C (en) 2014-12-15 2023-09-26 Handok Inc. Fused ring heteroaryl compounds and their use as trk inhibitors
IL294183B2 (en) 2015-05-20 2023-10-01 Dana Farber Cancer Inst Inc shared neoantigens
MA43943A (fr) 2015-05-29 2018-12-12 Ignyta Inc Compositions et procédés pour traiter des patients avec des cellules mutantes rtk
HK1253093A1 (zh) * 2015-06-01 2019-06-06 Loxo Oncology Inc. 诊断和治疗癌症的方法
US9782400B2 (en) 2015-06-19 2017-10-10 Macau University Of Science And Technology Oncogenic ROS1 and ALK kinase inhibitor
AU2015101722A4 (en) 2015-06-19 2016-05-19 Macau University Of Science And Technology Oncogenic ros1 and alk kinase inhibitor
GB201511546D0 (en) 2015-07-01 2015-08-12 Immatics Biotechnologies Gmbh Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against ovarian cancer and other cancers
AU2016287568B2 (en) 2015-07-02 2020-08-20 Turning Point Therapeutics, Inc. Chiral diaryl macrocycles as modulators of protein kinases
EP3368039A1 (en) 2015-10-26 2018-09-05 The Regents of The University of Colorado, A Body Corporate Point mutations in trk inhibitor-resistant cancer and methods relating to the same
US20170224662A1 (en) 2016-01-22 2017-08-10 The Medicines Company Aqueous Formulations and Methods of Preparation and Use Thereof
JPWO2017155018A1 (ja) 2016-03-11 2019-01-17 小野薬品工業株式会社 Ｔｒｋ阻害剤抵抗性の癌治療剤
US10045991B2 (en) 2016-04-04 2018-08-14 Loxo Oncology, Inc. Methods of treating pediatric cancers
FI3439662T3 (fi) 2016-04-04 2024-09-04 Loxo Oncology Inc (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorifenyyli)pyrrolidin-1-yyli)pyratsolo[1,5-a]pyrimidin-3-yyli)-3-hydroksipyrrolidiini-1-karboksamidin nesteformulaatioita
CN109475545A (zh) 2016-04-19 2019-03-15 埃克塞里艾克西斯公司 三阴性乳腺癌治疗方法
EP3458456B1 (en) 2016-05-18 2020-11-25 Loxo Oncology Inc. Preparation of (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorophenyl)pyrrolidin-1-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide
WO2017201156A1 (en) 2016-05-18 2017-11-23 Duke University Method of treating kras wild-type metastatic colorectal cell carcinoma using cabozantinib plus panitumumab
JOP20190092A1 (ar) 2016-10-26 2019-04-25 Array Biopharma Inc عملية لتحضير مركبات بيرازولو[1، 5-a]بيريميدين وأملاح منها
JOP20190213A1 (ar) 2017-03-16 2019-09-16 Array Biopharma Inc مركبات حلقية ضخمة كمثبطات لكيناز ros1
WO2019084285A1 (en) 2017-10-26 2019-05-02 Qian Zhao FORMULATIONS OF A MACROCYCLIC TRK KINASE INHIBITOR

Also Published As

Publication number Publication date
US9782414B2 (en) 2017-10-10
MX376478B (es) 2025-03-07
JP2017535550A (ja) 2017-11-30
EP3218380B1 (en) 2021-03-17
ZA201703501B (en) 2021-09-29
AU2015346046B2 (en) 2020-06-25
TW202206436A (zh) 2022-02-16
US10285993B2 (en) 2019-05-14
EP3218380A1 (en) 2017-09-20
CA2967951C (en) 2023-11-07
HUE061448T2 (hu) 2023-07-28
US20180207162A1 (en) 2018-07-26
CN113354649B (zh) 2024-12-10
MX2017006412A (es) 2017-09-12
US20160137654A1 (en) 2016-05-19
PL3699181T3 (pl) 2023-05-22
SI3699181T1 (sl) 2023-06-30
UA123044C2 (uk) 2021-02-10
SG11201703962XA (en) 2017-06-29
CA2967951A1 (en) 2016-05-19
RU2017120846A (ru) 2018-12-18
TWI746426B (zh) 2021-11-21
CN107428760B (zh) 2021-04-27
RU2017120846A3 (sr) 2019-05-08
IL290905B2 (en) 2023-09-01
US10172861B2 (en) 2019-01-08
FI3699181T3 (fi) 2023-03-28
IL290905A (en) 2022-04-01
CN107428760A (zh) 2017-12-01
RU2723990C2 (ru) 2020-06-18
KR20170082628A (ko) 2017-07-14
LT3699181T (lt) 2023-05-10
US10799505B2 (en) 2020-10-13
PH12017500900A1 (en) 2017-12-04
CY1125935T1 (el) 2026-02-25
US20180021342A1 (en) 2018-01-25
CN113354649A (zh) 2021-09-07
TW201625636A (zh) 2016-07-16
CL2017001249A1 (es) 2017-12-15
MX2020011079A (es) 2020-11-09
CO2017005483A2 (es) 2017-11-30
CR20170263A (es) 2017-10-18
IL252270A0 (en) 2017-07-31
JP2021169496A (ja) 2021-10-28
NZ731909A (en) 2023-11-24
BR112017010141A2 (pt) 2018-03-06
KR102649887B1 (ko) 2024-03-22
IL252270B (en) 2022-04-01
WO2016077841A1 (en) 2016-05-19
HRP20230271T1 (hr) 2023-06-09
PH12021550809A1 (en) 2022-02-14
IL290905B1 (en) 2023-05-01
EP3699181A1 (en) 2020-08-26
HK1244483A1 (zh) 2018-08-10
ES2941630T3 (es) 2023-05-24
TWI767858B (zh) 2022-06-11
AU2015346046A1 (en) 2017-06-08
JP6914834B2 (ja) 2021-08-04
US20200000807A1 (en) 2020-01-02
EP3699181B1 (en) 2023-03-01
PT3699181T (pt) 2023-04-05
DK3699181T3 (da) 2023-03-20
US20170165267A1 (en) 2017-06-15
US10813936B2 (en) 2020-10-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10813936B2 (en) Crystalline form of (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorophenyl)-pyrrolidin-1-YL)-pyrazolo[1,5-A]pyrimidin-3-YL)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide hydrogen sulfate
AU2017246554B2 (en) Liquid formulations of (S)-N-(5-((R)-2-(2,5-difluorophenyl)-pyrrolidin-1-yl)-pyrazolo(1,5-a)pyrimidin-3-yl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide
TR201807101T4 (tr) İmidazo[4,5-c]kinolin-2-on bileşikler ve kanserin tedavi edilmesinde kullanımları.
TW202523326A (zh) 雜環及其用途
KR20210102261A (ko) Am2 수용체 억제제로서의 복소환식 스피로-화합물
HK40036794B (en) Crystalline form of (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorophenyl)-pyrrolidin-1-yl)-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide hydrogen sulfate
HK40036794A (en) Crystalline form of (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-difluorophenyl)-pyrrolidin-1-yl)-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide hydrogen sulfate
RU2723990C9 (ru) Кристаллическая форма (s)-n-(5-((r)-2-(2,5-дифторфенил)-пирролидин-1-ил)-пиразоло[1,5-a]пиримидин-3-ил)-3-гидроксипирролидин-1-карбоксамида гидросульфата