JP2533100B2 - ポリヌクレオドの誘導方法 - Google Patents
ポリヌクレオドの誘導方法Info
- Publication number
- JP2533100B2 JP2533100B2 JP61503532A JP50353286A JP2533100B2 JP 2533100 B2 JP2533100 B2 JP 2533100B2 JP 61503532 A JP61503532 A JP 61503532A JP 50353286 A JP50353286 A JP 50353286A JP 2533100 B2 JP2533100 B2 JP 2533100B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- support
- group
- amine
- linker
- nucleic acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 47
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 title description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 17
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 16
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 16
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 10
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 7
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 6
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 6
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- BLFRQYKZFKYQLO-UHFFFAOYSA-N 4-aminobutan-1-ol Chemical compound NCCCCO BLFRQYKZFKYQLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- WUGQZFFCHPXWKQ-UHFFFAOYSA-N Propanolamine Chemical compound NCCCO WUGQZFFCHPXWKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 2
- XMYQHJDBLRZMLW-UHFFFAOYSA-N methanolamine Chemical group NCO XMYQHJDBLRZMLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229940087646 methanolamine Drugs 0.000 claims description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 claims 1
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 claims 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 26
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 26
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 25
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 21
- -1 silver ions Chemical class 0.000 description 19
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 13
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 12
- 229940046166 oligodeoxynucleotide Drugs 0.000 description 11
- 125000006853 reporter group Chemical group 0.000 description 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 11
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 10
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 9
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 8
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 8
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 8
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 8
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 7
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 7
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 5
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 5
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 5
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 5
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 4
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 4
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 150000003141 primary amines Chemical group 0.000 description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 2-(chloromethyl)pyridine-3-carbonitrile Chemical compound ClCC1=NC=CC=C1C#N FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 3
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 3
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 3
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 3
- AFQIYTIJXGTIEY-UHFFFAOYSA-N hydrogen carbonate;triethylazanium Chemical compound OC(O)=O.CCN(CC)CC AFQIYTIJXGTIEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 3
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 3
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 3
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 229940014800 succinic anhydride Drugs 0.000 description 3
- YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 5-[(3as,4s,6ar)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate Chemical compound C([C@H]1[C@H]2NC(=O)N[C@H]2CS1)CCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N 0.000 description 2
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PLIKAWJENQZMHA-UHFFFAOYSA-N 4-aminophenol Chemical compound NC1=CC=C(O)C=C1 PLIKAWJENQZMHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 102000018832 Cytochromes Human genes 0.000 description 2
- 108010052832 Cytochromes Proteins 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 2
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 2
- LGRFSURHDFAFJT-UHFFFAOYSA-N Phthalic anhydride Natural products C1=CC=C2C(=O)OC(=O)C2=C1 LGRFSURHDFAFJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000037065 Subacute sclerosing leukoencephalitis Diseases 0.000 description 2
- 206010042297 Subacute sclerosing panencephalitis Diseases 0.000 description 2
- 150000001414 amino alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- OTBHHUPVCYLGQO-UHFFFAOYSA-N bis(3-aminopropyl)amine Chemical compound NCCCNCCCN OTBHHUPVCYLGQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 2
- JHIWVOJDXOSYLW-UHFFFAOYSA-N butyl 2,2-difluorocyclopropane-1-carboxylate Chemical compound CCCCOC(=O)C1CC1(F)F JHIWVOJDXOSYLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 2
- WZUDOUFCWWUEPP-ZIYJDXEPSA-N chembl2018414 Chemical compound CC(=O)NC(C)(C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CSC2C(N(CCCCCC(=O)NCCCCCCOP(O)(=O)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(NC(=O)C(C)=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C4=C(C(NC(N)=N4)=O)N=C3)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(NC(=O)C(C)=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(NC(=O)C(C)=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C4=C(C(NC(N)=N4)=O)N=C3)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C4=C(C(NC(N)=N4)=O)N=C3)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(NC(=O)C(C)=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)OP(O)(=S)OC[C@@H]3[C@H](C[C@@H](O3)N3C(N=C(N)C=C3)=O)O)C(=O)C2)=O)C(N)=O)CCC1 WZUDOUFCWWUEPP-ZIYJDXEPSA-N 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 2
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 2
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 2
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical group O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MURGITYSBWUQTI-UHFFFAOYSA-N fluorescin Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1C1C2=CC=C(O)C=C2OC2=CC(O)=CC=C21 MURGITYSBWUQTI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 2
- 238000007306 functionalization reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 description 2
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 2
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 2
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 2
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UJPKMTDFFUTLGM-UHFFFAOYSA-N 1-aminoethanol Chemical class CC(N)O UJPKMTDFFUTLGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BTJIUGUIPKRLHP-UHFFFAOYSA-N 4-nitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 BTJIUGUIPKRLHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YBJHBAHKTGYVGT-ZXFLCMHBSA-N 5-[(3ar,4r,6as)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid Chemical compound N1C(=O)N[C@H]2[C@@H](CCCCC(=O)O)SC[C@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZXFLCMHBSA-N 0.000 description 1
- SUTWPJHCRAITLU-UHFFFAOYSA-N 6-aminohexan-1-ol Chemical compound NCCCCCCO SUTWPJHCRAITLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonium chloride Substances [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000991587 Enterovirus C Species 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- WPPONCHFOIIFIJ-UHFFFAOYSA-N N1N=NN=[C-]1 Chemical class N1N=NN=[C-]1 WPPONCHFOIIFIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 108020004518 RNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 239000003391 RNA probe Substances 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical group O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 239000006096 absorbing agent Substances 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000005576 amination reaction Methods 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 1
- 150000001615 biotins Chemical class 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- KBPLFHHGFOOTCA-UHFFFAOYSA-N caprylic alcohol Natural products CCCCCCCCO KBPLFHHGFOOTCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000006482 condensation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 description 1
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical compound BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001934 delay Effects 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 229940031098 ethanolamine Drugs 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 125000002485 formyl group Chemical class [H]C(*)=O 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- PHNWGDTYCJFUGZ-UHFFFAOYSA-N hexyl dihydrogen phosphate Chemical compound CCCCCCOP(O)(O)=O PHNWGDTYCJFUGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000005567 liquid scintillation counting Methods 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- BBMCTIGTTCKYKF-UHFFFAOYSA-N n-Heptanol Natural products CCCCCCCO BBMCTIGTTCKYKF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZWRUINPWMLAQRD-UHFFFAOYSA-N n-Nonyl alcohol Natural products CCCCCCCCCO ZWRUINPWMLAQRD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AMQJEAYHLZJPGS-UHFFFAOYSA-N n-butyl carbinol Natural products CCCCCO AMQJEAYHLZJPGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MWKFXSUHUHTGQN-UHFFFAOYSA-N n-decyl alcohol Natural products CCCCCCCCCCO MWKFXSUHUHTGQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZSIAUFGUXNUGDI-UHFFFAOYSA-N n-hexyl alcohol Natural products CCCCCCO ZSIAUFGUXNUGDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N periodic acid Chemical compound OI(=O)(=O)=O KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N phloretic acid Chemical compound OC(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical group 0.000 description 1
- OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N phosphorous acid Chemical compound OP(O)O OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003169 placental effect Effects 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000000163 radioactive labelling Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 125000000548 ribosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 238000003345 scintillation counting Methods 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 150000005691 triesters Chemical class 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
【発明の詳細な説明】 〔産業上の利用分野〕 本発明は、一般に、誘導したポリヌクレオチドの製造
方法、特に、合成ポリヌクレオチドの3′末端の誘導に
関する。
方法、特に、合成ポリヌクレオチドの3′末端の誘導に
関する。
〔従来の技術および発明が解決しようとする問題点〕 官能基を核酸に結合させることによって、核酸の検出
および定量を行うことが可能である。ハイブリダイゼー
ション検定法においては、標識した核酸プローブを用い
て、相補的なヌクレオチド配列を有する標的核酸の試料
中の存在を調べる。標的核酸はその後、ハイブリダイゼ
ーションによって支持体に結合した核酸プローブに固定
されて、『サンドイッチ』を形成する。このようなサン
ドイッチは、支持体に結合された標識の量として検出可
能である。機能化技術は、核酸をレポーター基に結合す
るための反応基への結合、ならびに、支持体上の反応基
への核酸の結合の双方に用いることができる。従って、
核酸を誘導する方法は、ハイブリダイゼーション検定の
ための物質の調製において特に有効である。
および定量を行うことが可能である。ハイブリダイゼー
ション検定法においては、標識した核酸プローブを用い
て、相補的なヌクレオチド配列を有する標的核酸の試料
中の存在を調べる。標的核酸はその後、ハイブリダイゼ
ーションによって支持体に結合した核酸プローブに固定
されて、『サンドイッチ』を形成する。このようなサン
ドイッチは、支持体に結合された標識の量として検出可
能である。機能化技術は、核酸をレポーター基に結合す
るための反応基への結合、ならびに、支持体上の反応基
への核酸の結合の双方に用いることができる。従って、
核酸を誘導する方法は、ハイブリダイゼーション検定の
ための物質の調製において特に有効である。
ハイブリダイゼーション検定に用いるプローブの標識
付けの方法としては、放射性同位元素(例えば、32P、3
Hまたは125I)をプローブと結合させる方法がある。し
かしながら、放射性標識を検出するための二つの通常採
られている方法には、特有の困難性があるため、これら
方法の有用性は限定されている。一般的な検出技法の一
つであるオートラジオグラフィーは、写真乳剤中で銀イ
オンを還元して銀粒子を形成させる方法であり、この方
法は時間を要するという難点がある。他の一般的な検出
技法であるシンチレーションカウンティング法は、高価
な装置を必要とし、かつ一定の作業の遅れが慢性的に生
じる。さらに、放射性同位元素は、人体に対する安全上
の理由から特別に取扱う必要がある。
付けの方法としては、放射性同位元素(例えば、32P、3
Hまたは125I)をプローブと結合させる方法がある。し
かしながら、放射性標識を検出するための二つの通常採
られている方法には、特有の困難性があるため、これら
方法の有用性は限定されている。一般的な検出技法の一
つであるオートラジオグラフィーは、写真乳剤中で銀イ
オンを還元して銀粒子を形成させる方法であり、この方
法は時間を要するという難点がある。他の一般的な検出
技法であるシンチレーションカウンティング法は、高価
な装置を必要とし、かつ一定の作業の遅れが慢性的に生
じる。さらに、放射性同位元素は、人体に対する安全上
の理由から特別に取扱う必要がある。
125Iなどの幾つかの放射性同位体の貯蔵寿命は、比較
的短いので、臨床診断における放射性同位体の有用性は
さらに限定される。
的短いので、臨床診断における放射性同位体の有用性は
さらに限定される。
非放射性標識付けシステムにおいて検出を可能にする
ために、レポーター基を用いてプローブの『標識付け』
を行い、さらに、シグナルをレポーター基と会合させる
ことで検出が可能となる。レポーターは、プローブの存
在または位置を表示するために用いる薬剤である。シグ
ナルそのものは、直接的に感知できるものであり、分離
したシグナル分子、または分離可能なシグナル分子によ
って発生する。標識は、正確にはシグナル分子を取り込
むタイプのレポーターである。
ために、レポーター基を用いてプローブの『標識付け』
を行い、さらに、シグナルをレポーター基と会合させる
ことで検出が可能となる。レポーターは、プローブの存
在または位置を表示するために用いる薬剤である。シグ
ナルそのものは、直接的に感知できるものであり、分離
したシグナル分子、または分離可能なシグナル分子によ
って発生する。標識は、正確にはシグナル分子を取り込
むタイプのレポーターである。
標識をプローブに結合する方法が、Ward等の欧州特許
出願63,879号に開示されている。Wardは、ビオチンレポ
ーター分子がプリンまたはピリミジン環に共有結合した
プローブの製造方法を開示している。選択されたビオチ
ン、プリンおよびピリミジンは、次に、酵素法によっ
て、プローブを構成する核酸のリン酸ジエステル構造内
に直接取り込まれる。しかしながら、この酵素法は費用
が嵩む上に、操作が難しいという問題点がある。
出願63,879号に開示されている。Wardは、ビオチンレポ
ーター分子がプリンまたはピリミジン環に共有結合した
プローブの製造方法を開示している。選択されたビオチ
ン、プリンおよびピリミジンは、次に、酵素法によっ
て、プローブを構成する核酸のリン酸ジエステル構造内
に直接取り込まれる。しかしながら、この酵素法は費用
が嵩む上に、操作が難しいという問題点がある。
また、タンパク質によって標識をプローブに結合する
手順をとる方法もある。一本鎖ポリオウィルスRNAを、
ビオチンのN−ヒドロキシスクシンイミドエステルと反
応するタンパク質に自然連鎖させて、アビジン被覆した
球の特異的な結合によって検出可能で、かつビオチン化
したレポーター基を有するRNAプローブが得られる。Ric
hards等,Proc.Natl. Acad.Sci.(USA), 76:676−680
(1979)。同様に、ビオチン標識したチトクロームC
は、ホルムアルデヒドの存在下での反応によってRNAに
連結され、その後にアビジン被覆した球を標識付けする
ことができる。Manning等,Chromosoma(Berl.),53:1
07−117(1975)。にもかかわらず、標識付けを必要と
する核酸の全てが自然にタンパク質と結合することはな
く、また、核酸のチトクローム結合の位置ならびに量は
容易に予測できないので、末端標識付けのための化学合
成手法が求められている。
手順をとる方法もある。一本鎖ポリオウィルスRNAを、
ビオチンのN−ヒドロキシスクシンイミドエステルと反
応するタンパク質に自然連鎖させて、アビジン被覆した
球の特異的な結合によって検出可能で、かつビオチン化
したレポーター基を有するRNAプローブが得られる。Ric
hards等,Proc.Natl. Acad.Sci.(USA), 76:676−680
(1979)。同様に、ビオチン標識したチトクロームC
は、ホルムアルデヒドの存在下での反応によってRNAに
連結され、その後にアビジン被覆した球を標識付けする
ことができる。Manning等,Chromosoma(Berl.),53:1
07−117(1975)。にもかかわらず、標識付けを必要と
する核酸の全てが自然にタンパク質と結合することはな
く、また、核酸のチトクローム結合の位置ならびに量は
容易に予測できないので、末端標識付けのための化学合
成手法が求められている。
一つの化学合成方法として、核酸を酸化して3′−ア
ルデヒドに変換し、さらにアルキルジアミンまたはポリ
アミンを用いて縮合し、ビオチンの結合を行うレポータ
ー基を調製する方法がある。Broker等,Nucleic Acids
Res.,5:363−384(1978)。同様に、核酸の過沃素酸
塩酸化によって得たアルデヒドを用いて、核酸に蛍光標
識を結合することもできる。Bauman等,J.Histochem.,
Cytochem.,29;227−237(1981)。しかしながら、自動
化された核酸合成プロセスにおいて、支持体に結合した
ポリヌクレオチドに、レポーター基を結合させる技術が
望まれている。
ルデヒドに変換し、さらにアルキルジアミンまたはポリ
アミンを用いて縮合し、ビオチンの結合を行うレポータ
ー基を調製する方法がある。Broker等,Nucleic Acids
Res.,5:363−384(1978)。同様に、核酸の過沃素酸
塩酸化によって得たアルデヒドを用いて、核酸に蛍光標
識を結合することもできる。Bauman等,J.Histochem.,
Cytochem.,29;227−237(1981)。しかしながら、自動
化された核酸合成プロセスにおいて、支持体に結合した
ポリヌクレオチドに、レポーター基を結合させる技術が
望まれている。
5′標識付けの他の方法では、ビオチンを2−(ビオ
チニルアミド)エタノールに変換し、さらに、リン酸化
した重合体支持ヌクレオチドに縮合する。ビオチンのア
ミノエタノール誘導体を、リボース環の5′水酸基に縮
合し、ヌクレオチドの保護を取り除けば、安定したリン
酸ジエステル結合が得られる。Kempe等,Nucleic Acids
Res.,13:45−57(1985)。しかしながら、この方法に
よって特異的なレポーター基が結合するので、種々の望
ましいレポーター基を結合するのに用いることが可能
な、一般的な反応機能性を有するオリゴヌクレオチドの
調製を教示するものではない。
チニルアミド)エタノールに変換し、さらに、リン酸化
した重合体支持ヌクレオチドに縮合する。ビオチンのア
ミノエタノール誘導体を、リボース環の5′水酸基に縮
合し、ヌクレオチドの保護を取り除けば、安定したリン
酸ジエステル結合が得られる。Kempe等,Nucleic Acids
Res.,13:45−57(1985)。しかしながら、この方法に
よって特異的なレポーター基が結合するので、種々の望
ましいレポーター基を結合するのに用いることが可能
な、一般的な反応機能性を有するオリゴヌクレオチドの
調製を教示するものではない。
溶液中のヌクレオチドは、保護された6−アミノ−1
−ヘキサノールリン酸塩を用いた縮合によってアミン化
される。Baker等,J.Biol.Chem.,22:7135−7147(197
2)。しかし、これら方法の実施は困難であり、これま
で、固相合成には組み込まれていない。
−ヘキサノールリン酸塩を用いた縮合によってアミン化
される。Baker等,J.Biol.Chem.,22:7135−7147(197
2)。しかし、これら方法の実施は困難であり、これま
で、固相合成には組み込まれていない。
アフィニティークロマトグラフィーによるヌクレアー
ゼの精製を行うための、ヌクレオチドを支持体に結合す
る他の方法では、p−アミノフェノールで3′−誘導し
た1個のヌクレオチドを、リンカーによってゲルマトリ
ックスに結合させる。このリンカーは、臭化シアンおよ
びアジドを用いて、3,3′−ジアミノジプロピルアミン
をマトリックスに結合させることによって形成する。得
られたアミン化ゲルを無水コハク酸で処理し、そして、
カルボジイミドを用いてアミン化ヌクレオチドに結合す
る。Cuatrecasas,J.Biol.Chem.,12:3059-3065(197
8)。しかしながら、アミン化ヌクレオチドそのものの
調製は、手間を要する煩雑な手順を経て溶液中で実施さ
れる。Baker等,J.Biol.Chem.,22:7135−7147(1972)
を参照のこと。
ゼの精製を行うための、ヌクレオチドを支持体に結合す
る他の方法では、p−アミノフェノールで3′−誘導し
た1個のヌクレオチドを、リンカーによってゲルマトリ
ックスに結合させる。このリンカーは、臭化シアンおよ
びアジドを用いて、3,3′−ジアミノジプロピルアミン
をマトリックスに結合させることによって形成する。得
られたアミン化ゲルを無水コハク酸で処理し、そして、
カルボジイミドを用いてアミン化ヌクレオチドに結合す
る。Cuatrecasas,J.Biol.Chem.,12:3059-3065(197
8)。しかしながら、アミン化ヌクレオチドそのものの
調製は、手間を要する煩雑な手順を経て溶液中で実施さ
れる。Baker等,J.Biol.Chem.,22:7135−7147(1972)
を参照のこと。
よって、固相合成を行うポリヌクレオチドに、レポー
ター基を一般的に結合させる方法および組成が求められ
ているのである。
ター基を一般的に結合させる方法および組成が求められ
ているのである。
本発明は、上述した諸問題に鑑みて、機能化した3′
末端を有する調製された核酸の製造方法を提供するもの
である。
末端を有する調製された核酸の製造方法を提供するもの
である。
本発明の方法の第1態様では、カルボキシル酸で機能
化させた固相支持体、あるいはアミンで機能化させた固
相支持体を、選択した無水物で処理するか、あるいは、
一方の末端にてカルボキシル成分を含む分子と反応させ
ることによって、支持体と無水物残基の間にアミド結合
を形成し、そこにカルボキシル酸による機能を付与す
る。
化させた固相支持体、あるいはアミンで機能化させた固
相支持体を、選択した無水物で処理するか、あるいは、
一方の末端にてカルボキシル成分を含む分子と反応させ
ることによって、支持体と無水物残基の間にアミド結合
を形成し、そこにカルボキシル酸による機能を付与す
る。
本発明の方法の第2態様では、カップリング剤の存在
下で、第1態様で得た生成物を、選択したヒドロキシア
ルキルアミンリンカーと結合させる。この第2態様で得
られる生成物は、2個のアミド結合(アミン機能を付与
したビーズを用いる)および遊離水酸基を有する重合支
持体である。
下で、第1態様で得た生成物を、選択したヒドロキシア
ルキルアミンリンカーと結合させる。この第2態様で得
られる生成物は、2個のアミド結合(アミン機能を付与
したビーズを用いる)および遊離水酸基を有する重合支
持体である。
本発明の方法の第3態様では、ポリヌクレオチド連鎖
すなわち支持体の化学合成であり、遊離ヒドロキシル基
から開始し、さらにリンカーと核酸の間にリン酸エステ
ル結合を行う。
すなわち支持体の化学合成であり、遊離ヒドロキシル基
から開始し、さらにリンカーと核酸の間にリン酸エステ
ル結合を行う。
支持体上てポリヌクレオチド合成が完了した後、本方
法の第3態様で得た生成物を、アンモニア含有溶液中で
処理することによって、第一級アミン機能が付与された
3′末端を有するポリヌクレオチドを、支持体から加水
分解する。
法の第3態様で得た生成物を、アンモニア含有溶液中で
処理することによって、第一級アミン機能が付与された
3′末端を有するポリヌクレオチドを、支持体から加水
分解する。
本発明による望ましい方法では、合成時にアミノ基を
ポリヌクレオチドの3′末端に結合させる。固相支持体
は、多孔性でも非多孔性でもよく、すなわち、調整済ポ
アグラス、シリカゲル、ポリスチレン、アガロース、ま
たはセファデックス等の重合支持体でもよい。最適であ
るとは言い難いが、ニトロセルロース試験紙等の支持体
を用いることもできる。カルボキシル酸基を用いてもよ
いが、支持体は、望ましくはアミンで機能化させる。
ポリヌクレオチドの3′末端に結合させる。固相支持体
は、多孔性でも非多孔性でもよく、すなわち、調整済ポ
アグラス、シリカゲル、ポリスチレン、アガロース、ま
たはセファデックス等の重合支持体でもよい。最適であ
るとは言い難いが、ニトロセルロース試験紙等の支持体
を用いることもできる。カルボキシル酸基を用いてもよ
いが、支持体は、望ましくはアミンで機能化させる。
アミン機能が付与された固相支持体は、無水コハク酸
または無水ピリミジン等の無水物で処理する。加水分解
による除去が容易であり、また形成されるアミド結合が
対称性である等の理由で、無水フタル酸が、現在のとこ
ろ最も望ましい無水物である。
または無水ピリミジン等の無水物で処理する。加水分解
による除去が容易であり、また形成されるアミド結合が
対称性である等の理由で、無水フタル酸が、現在のとこ
ろ最も望ましい無水物である。
無水物の使用は便利ではあるが、2つの末端カルボキ
シル酸成分を有するいかなる分子も用いることもでき、
これらの官能基を、p−ニトロフェノールおよびジシク
ロヘキシルカルボジイミド(DCC)またはNHSを用いて活
性化させ、さらに、その結果得られた分子を固相支持体
に縮合することができる。
シル酸成分を有するいかなる分子も用いることもでき、
これらの官能基を、p−ニトロフェノールおよびジシク
ロヘキシルカルボジイミド(DCC)またはNHSを用いて活
性化させ、さらに、その結果得られた分子を固相支持体
に縮合することができる。
縮合反応剤中の化合物の中で、リンカーとして使用す
るのに適したものは、末端アミノ基および末端水酸基を
有する直鎖アミノアルコールを含む1−ヒドロキシアル
キルアミンである。この態様において、鎖中の炭素原子
は10個を超えず、1から6個の範囲であることが望まし
い。このようなアミノアルコールとしては、メタノール
アミン、エタノールアミン、プロパノールアミン、ブタ
ノールアミン、ペンタノールアミン、ヘクサノールアミ
ン、ヘプタノールアミン、オクタノールアミン、ノナノ
ールアミン、およびデカノールアミンがある。しかし、
原理的には、ポリヌクレオチドとの結合と、カルボキシ
ル機能を付与した支持体との結合とを、それぞれ形成す
るために用いることができる水酸基ならびにアミン基を
有する分子であれば、別段限定されないのは勿論であ
る。例えば、カルボキシル機能を還元した後に、ポリリ
シン鎖を用いることもできるが、支持体に結合するアミ
ン基だけが露出しており、他の基は全て適切なブロック
基によって保護されていることが、その際に必要とされ
る。同様に、リンカー分子と支持体の間のアミド結合の
形成と、競合あるいは阻害するその他の反応基をブロッ
クすることが望ましい。
るのに適したものは、末端アミノ基および末端水酸基を
有する直鎖アミノアルコールを含む1−ヒドロキシアル
キルアミンである。この態様において、鎖中の炭素原子
は10個を超えず、1から6個の範囲であることが望まし
い。このようなアミノアルコールとしては、メタノール
アミン、エタノールアミン、プロパノールアミン、ブタ
ノールアミン、ペンタノールアミン、ヘクサノールアミ
ン、ヘプタノールアミン、オクタノールアミン、ノナノ
ールアミン、およびデカノールアミンがある。しかし、
原理的には、ポリヌクレオチドとの結合と、カルボキシ
ル機能を付与した支持体との結合とを、それぞれ形成す
るために用いることができる水酸基ならびにアミン基を
有する分子であれば、別段限定されないのは勿論であ
る。例えば、カルボキシル機能を還元した後に、ポリリ
シン鎖を用いることもできるが、支持体に結合するアミ
ン基だけが露出しており、他の基は全て適切なブロック
基によって保護されていることが、その際に必要とされ
る。同様に、リンカー分子と支持体の間のアミド結合の
形成と、競合あるいは阻害するその他の反応基をブロッ
クすることが望ましい。
本発明に従って使用できるポリヌクレオチド生成のた
めの化学合成法としては、トリエステル合成、リン酸ト
リエステル法、テトラゾライド誘導体およびヌクレオシ
ドリン酸塩を用いる固相合成法、ならびに1984年3月14
日に公開された英国特許出願GB2,125,798号およびCarut
hers等,米国特許第4,415,732号に記載されたホスホラ
ミダイト法がある。
めの化学合成法としては、トリエステル合成、リン酸ト
リエステル法、テトラゾライド誘導体およびヌクレオシ
ドリン酸塩を用いる固相合成法、ならびに1984年3月14
日に公開された英国特許出願GB2,125,798号およびCarut
hers等,米国特許第4,415,732号に記載されたホスホラ
ミダイト法がある。
アンモニア溶液を用いて支持体結合した核酸配列を処
理すると、先に生成したアミド結合の加水分解が起こ
り、それによって、その3′末端に遊離第一級アミン機
能を含むアルキル鎖を有する生成オリゴヌクレオチド
が、溶液中に遊離放出される。オリゴヌクレオチドが、
一旦溶液から回収されると、遊離アミンは、容易にレポ
ーター基への結合を行うことができる。
理すると、先に生成したアミド結合の加水分解が起こ
り、それによって、その3′末端に遊離第一級アミン機
能を含むアルキル鎖を有する生成オリゴヌクレオチド
が、溶液中に遊離放出される。オリゴヌクレオチドが、
一旦溶液から回収されると、遊離アミンは、容易にレポ
ーター基への結合を行うことができる。
第一級アミン機能を3′末端に付与したオリゴヌクレ
オチドの合成過程を例示した以下の実施例を参照して、
本発明の方法を詳細に説明する。
オチドの合成過程を例示した以下の実施例を参照して、
本発明の方法を詳細に説明する。
実施例1 50μmolのアミノ基を含んだ、アミン機能を有する調
整済ポアグラス(イリノイ州、ロックランドに所在のPi
erce Chemical社から入手できる)500mgを、無水ピリジ
ン2mlと4−ジメチルアミノピリジン61mgの存在下で、
無水フタル酸、無水コハク酸あるは無水ピリジンのいず
れかの250mg(1mol)と、室温で、30分間反応させた。
得られた重合体を、塩化メチレン、エチルアルコール、
およびエーテルで洗浄し、乾燥させた。
整済ポアグラス(イリノイ州、ロックランドに所在のPi
erce Chemical社から入手できる)500mgを、無水ピリジ
ン2mlと4−ジメチルアミノピリジン61mgの存在下で、
無水フタル酸、無水コハク酸あるは無水ピリジンのいず
れかの250mg(1mol)と、室温で、30分間反応させた。
得られた重合体を、塩化メチレン、エチルアルコール、
およびエーテルで洗浄し、乾燥させた。
次に、それぞれの重合体(450mg、すなわち45mmol)
を、溶液中で、塩化メチレン1.5mlとジシクロヘキシル
カルボジイミド(DCC)330mgと、室温で、30分間反応さ
せた。ビーズよりも上層の溶液は傾瀉を行い、塩化メチ
レン2ml中の6−アミノ−1−ヘキサノール(117mg/モ
ル)の溶液で置換し、室温で、約8時間放置した。同様
の処理によって、各々の活性重合体の別の450mgを溶液
に入れ、傾瀉した後に、そのビーズを同等の条件下に
て、塩化メチレン2ml中の1モルのヘキサノールアミン
溶液と反応させた。
を、溶液中で、塩化メチレン1.5mlとジシクロヘキシル
カルボジイミド(DCC)330mgと、室温で、30分間反応さ
せた。ビーズよりも上層の溶液は傾瀉を行い、塩化メチ
レン2ml中の6−アミノ−1−ヘキサノール(117mg/モ
ル)の溶液で置換し、室温で、約8時間放置した。同様
の処理によって、各々の活性重合体の別の450mgを溶液
に入れ、傾瀉した後に、そのビーズを同等の条件下に
て、塩化メチレン2ml中の1モルのヘキサノールアミン
溶液と反応させた。
このようにして溶液から得られた6つのヒドロキシ機
能を付与したエステルは、以下の化学式を有するもので
あった。
能を付与したエステルは、以下の化学式を有するもので
あった。
(3)CPG−NH−CO−CH2−CH2−CO−NH−CH2−CH2−OH (4)CPG−NH−CO−CH2−CH2−CO−NH−(CH2)6−OH 各ヒドロキシメチルエステルは、オリゴヌクレオチド
を合成する支持体として用いることができるが、上記の
1、2、3および5の支持体だけを、オリゴヌクレオチ
ド合成の用途に用いた。オリゴヌクレオチド鎖を伸長す
るためのホスホラミダイト法(Caruthers、米国特許4,4
15,732号を参照)を用いて、ジメトキシトリチル基によ
って3′末端をブロックしたデオキシチミジン鎖を、支
持体の活性ヒドロキシ基によって各支持体上に合成し
た。これらの手順によって、13個のチミジンをポリヌク
レオチドに取り入れた時点で、支持体とのアミド結合を
加水分解し、3′端に遊離第一級アミン基を有する遊離
オリゴヌクレオチドを放出した。その結果、1グラム当
たり37〜40μmolのジメトキシトリチル(DMTr)基を含
む、支持体に保持された連鎖40mg各々を、室温において
濃縮水酸化アンモニウム(40mg当たり2ml)によって処
理した。その後、各溶液100μlを採取して、乾燥させ
た。この処置によるペプチド結合加水分解率を調べるた
めに、乾燥した生成物に、0.1M p−トルエンスルホン
酸を添加し、498nmの分光測光によってDMTr基を定量し
た。
を合成する支持体として用いることができるが、上記の
1、2、3および5の支持体だけを、オリゴヌクレオチ
ド合成の用途に用いた。オリゴヌクレオチド鎖を伸長す
るためのホスホラミダイト法(Caruthers、米国特許4,4
15,732号を参照)を用いて、ジメトキシトリチル基によ
って3′末端をブロックしたデオキシチミジン鎖を、支
持体の活性ヒドロキシ基によって各支持体上に合成し
た。これらの手順によって、13個のチミジンをポリヌク
レオチドに取り入れた時点で、支持体とのアミド結合を
加水分解し、3′端に遊離第一級アミン基を有する遊離
オリゴヌクレオチドを放出した。その結果、1グラム当
たり37〜40μmolのジメトキシトリチル(DMTr)基を含
む、支持体に保持された連鎖40mg各々を、室温において
濃縮水酸化アンモニウム(40mg当たり2ml)によって処
理した。その後、各溶液100μlを採取して、乾燥させ
た。この処置によるペプチド結合加水分解率を調べるた
めに、乾燥した生成物に、0.1M p−トルエンスルホン
酸を添加し、498nmの分光測光によってDMTr基を定量し
た。
室温において、、各溶液中のアミド結合の加水分解
(すなわち、溶液中へのDMTr−DNAの放出)を測定し
た。その結果を、下記の第1表に示した。
(すなわち、溶液中へのDMTr−DNAの放出)を測定し
た。その結果を、下記の第1表に示した。
第1表 時間 保持体/結合 加水分解率% 18時間 1/フタル酸アミド結合 57% 18時間 2/フタル酸アミド結合 57% 18時間 3/コハク酸アミド結合 23% 18時間 5/ピリジンアミド結合 63% 42時間 1/フタル酸アミド結合 92% 42時間 2/フルタ酸アミド結合 92% 42時間 3/コハク酸アミド結合 53% 42時間 5/ピリジンアミド結合 100% この結果によると、3′末端を機能化したオリゴヌク
レオチドが溶液中に最大限に放出されるのは、本発明の
方法に用いる無水物が、支持体中に対称アミド結合を生
じる場合であることがわかる。
レオチドが溶液中に最大限に放出されるのは、本発明の
方法に用いる無水物が、支持体中に対称アミド結合を生
じる場合であることがわかる。
以下の実施例において、本発明の方法の効率を調べ
た。
た。
実施例2 誘導された固相支持体上での合成によるオリゴデオキ
シヌクレオチドの3′末端の機能化効率を試験するため
に、下記の配列: (7)5′HO−AACAACTCCCTAACCCCTGCTTTTTAAAGAC を有するデオキシオリゴヌクレオチドを、40mg(約2
μmole)の各々の支持体(8)および(9)上にて、化
学的に合成した。
シヌクレオチドの3′末端の機能化効率を試験するため
に、下記の配列: (7)5′HO−AACAACTCCCTAACCCCTGCTTTTTAAAGAC を有するデオキシオリゴヌクレオチドを、40mg(約2
μmole)の各々の支持体(8)および(9)上にて、化
学的に合成した。
化学合成は、縮合反応に、5′−ジメトキシトリチル
−3′−メトキシ−NN′−ジメチルアミノホスホラミダ
イトを用いた固相亜リン酸塩法(Caruthers等,米国特
許4,415,732号)によって実施した。固相支持体(8)
上の最初の合成サイクルでは、5′−ジメトキシトリチ
ル−デオキシシチジル−3′−メトキシ−NN′−ジメチ
ルアミノホスホラミダイトを使用した。これ以降の工程
における、2つの支持体上の合成サイクルは共に同じと
した。最終サイクルの後に、ジメトキシトリチル基はDN
Aから除去され、さらに、合成サイクルが同一の2個の
支持体から、2個のオリゴデオキシヌクレオチドが除か
れた。最終サイクルの後に、ジメトキシトリチル基をDN
Aから除去し、さらに、30℃で、18時間、2mlの15M水酸
化アンモニウムを用いて、2つのオリゴデオキシヌクレ
オチドを支持体から取り出し、その後に保護を取り除い
た〔Matteucci等,J.Am.Chem.Soc.,103,3185−3191(19
81)〕。
−3′−メトキシ−NN′−ジメチルアミノホスホラミダ
イトを用いた固相亜リン酸塩法(Caruthers等,米国特
許4,415,732号)によって実施した。固相支持体(8)
上の最初の合成サイクルでは、5′−ジメトキシトリチ
ル−デオキシシチジル−3′−メトキシ−NN′−ジメチ
ルアミノホスホラミダイトを使用した。これ以降の工程
における、2つの支持体上の合成サイクルは共に同じと
した。最終サイクルの後に、ジメトキシトリチル基はDN
Aから除去され、さらに、合成サイクルが同一の2個の
支持体から、2個のオリゴデオキシヌクレオチドが除か
れた。最終サイクルの後に、ジメトキシトリチル基をDN
Aから除去し、さらに、30℃で、18時間、2mlの15M水酸
化アンモニウムを用いて、2つのオリゴデオキシヌクレ
オチドを支持体から取り出し、その後に保護を取り除い
た〔Matteucci等,J.Am.Chem.Soc.,103,3185−3191(19
81)〕。
オリゴデオキシヌクレオチドは、変性条件(7M尿素)
下で、12%のポリアクリルアミドゲル電気泳動によって
精製した。各レーンの最低速度泳動バンド(全紫外線吸
収物質の90%以上に相当する)をゲルから切断した。2
つのオリゴデオキシヌクレオチドをゲルから抽出し、10
mMのトリエチルアンモニウム重炭酸塩、pH7.0を用い
て、10mlのセファデックスG50/40(シグマ)カラムで脱
塩した。オリゴデオキシヌクレオチドの分光分析による
定量を行い、凍結乾燥した。
下で、12%のポリアクリルアミドゲル電気泳動によって
精製した。各レーンの最低速度泳動バンド(全紫外線吸
収物質の90%以上に相当する)をゲルから切断した。2
つのオリゴデオキシヌクレオチドをゲルから抽出し、10
mMのトリエチルアンモニウム重炭酸塩、pH7.0を用い
て、10mlのセファデックスG50/40(シグマ)カラムで脱
塩した。オリゴデオキシヌクレオチドの分光分析による
定量を行い、凍結乾燥した。
ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって生成物を分
析したところ、この生成物は均質であり、また支持体
(8)から得たデオキシオリゴヌクレオチドは、支持体
(9)から得たデオキシオリゴヌクレオチドよりも、か
なりゆっくりした移動度で泳動することがわかった。支
持体(8)から得たデオキシオリゴヌクレオチドの化学
式を、以下のように決定した。
析したところ、この生成物は均質であり、また支持体
(8)から得たデオキシオリゴヌクレオチドは、支持体
(9)から得たデオキシオリゴヌクレオチドよりも、か
なりゆっくりした移動度で泳動することがわかった。支
持体(8)から得たデオキシオリゴヌクレオチドの化学
式を、以下のように決定した。
さらに支持体(9)から得たデオキシオリゴヌクレオ
チドは、同じデオキシヌクレオチド配列であるが、最初
のデオキシヌクレオチドの3′末端が欠けていた。
チドは、同じデオキシヌクレオチド配列であるが、最初
のデオキシヌクレオチドの3′末端が欠けていた。
精製工程後に回収した生成物の収量を、以下の第2表
に示した。
に示した。
下記の実施例にて、3′−フルオレセイン標識オリゴ
ヌクレオチドを調製した。
ヌクレオチドを調製した。
実施例3 3′−アミンオリゴデオキシヌクレオチドを、実施例
1の方法に従って調製した。他のオリゴデオキシヌクレ
オチドも調製した。これは最初のものと同じではある
が、32P標識をも組み込んでおり、また1540cpm/fmの比
放射能を示した。100mM炭酸ナトリウム緩衝液17μl中
の32P標識オリゴデオキシヌクレオチド2.95nmolに、DMS
O中の25mMフルオレシインイソチオシアン酸塩(ウィス
コンシン州、ミルウォーキー所在のAldrich Chemical
社)17μmolを加えた。この溶液を撹拌した後、37℃
で、1時間、インキュベートした。さらに、炭酸塩緩衝
液17μlと、フルオレシインイソチオシアン酸塩溶液17
μlを加えた。37℃で、2時間置いた後に、オリゴデオ
キシヌクレオチドをエタノール沈澱させ、6M尿素、15%
ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって精製した。
1の方法に従って調製した。他のオリゴデオキシヌクレ
オチドも調製した。これは最初のものと同じではある
が、32P標識をも組み込んでおり、また1540cpm/fmの比
放射能を示した。100mM炭酸ナトリウム緩衝液17μl中
の32P標識オリゴデオキシヌクレオチド2.95nmolに、DMS
O中の25mMフルオレシインイソチオシアン酸塩(ウィス
コンシン州、ミルウォーキー所在のAldrich Chemical
社)17μmolを加えた。この溶液を撹拌した後、37℃
で、1時間、インキュベートした。さらに、炭酸塩緩衝
液17μlと、フルオレシインイソチオシアン酸塩溶液17
μlを加えた。37℃で、2時間置いた後に、オリゴデオ
キシヌクレオチドをエタノール沈澱させ、6M尿素、15%
ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって精製した。
生成物はオートラジオグラフィーによって同定し、適
切なバンドを分離し、さらに溶出剤として10mMトリエチ
ルアンモニウム重炭酸塩(TEAB)を用いて、セファデッ
クスG50/50カラムによって溶離、ゲル濾過を行った。生
成物を分離したところ、30%収量(0.75μmole)であっ
た。
切なバンドを分離し、さらに溶出剤として10mMトリエチ
ルアンモニウム重炭酸塩(TEAB)を用いて、セファデッ
クスG50/50カラムによって溶離、ゲル濾過を行った。生
成物を分離したところ、30%収量(0.75μmole)であっ
た。
ポリアクリルアミドゲル電気泳動ならびにオートラジ
オグラフィーによって生成物を分析した結果、生成物は
均質であり、また開始物質よりも特有のゆっくりとした
移動度で泳動することが分かった。
オグラフィーによって生成物を分析した結果、生成物は
均質であり、また開始物質よりも特有のゆっくりとした
移動度で泳動することが分かった。
生成物の紫外線分光分析の結果、この生成物は下記に
示すように、フルオレシイン機能が付与されたデオキシ
オリゴヌクレオシドの正しい分光特性を有することがわ
かった。
示すように、フルオレシイン機能が付与されたデオキシ
オリゴヌクレオシドの正しい分光特性を有することがわ
かった。
Am=26.36×104 A260=0.20 A260/A280=1.86 Am(フルオレシイン)=7.5×104 A495=0.06 以下の実施例にて、3′−ビオチン標識付けしたオリ
ゴデオキシヌクレオチドを調製した。
ゴデオキシヌクレオチドを調製した。
実施例4 標識付けしていない3′アミン核酸200pmol、およびp
H8.3の100mMの炭酸ナトリウム緩衝液40μmolに、ビオチ
ン−N−ヒドロキシスクシニミドエステル溶液(DMSO中
で10mg/ml)40μmolを加えた。この溶液を撹拌し、25℃
で、30分間インキュベートした。さらに重炭酸塩緩衝液
40μl、およびビオチン−N−ヒドロキシスクシニミド
エステル溶液40μlを添加した。
H8.3の100mMの炭酸ナトリウム緩衝液40μmolに、ビオチ
ン−N−ヒドロキシスクシニミドエステル溶液(DMSO中
で10mg/ml)40μmolを加えた。この溶液を撹拌し、25℃
で、30分間インキュベートした。さらに重炭酸塩緩衝液
40μl、およびビオチン−N−ヒドロキシスクシニミド
エステル溶液40μlを添加した。
30分後に、生成物をエタノール沈澱させ、6mol尿素−
20%ポリアクリルアミドゲルによる電気泳動によって精
製した。適切なバンドを、オートラジオグラフィーで同
定、分離し、ゲル溶離し、さらにセファデックスG50/50
カラムにおいてゲル濾過を行った。生成物を、放射性標
識で分析したところ、40%収量で分離され、20%ポリア
クリルアミドゲル上において均質であった。
20%ポリアクリルアミドゲルによる電気泳動によって精
製した。適切なバンドを、オートラジオグラフィーで同
定、分離し、ゲル溶離し、さらにセファデックスG50/50
カラムにおいてゲル濾過を行った。生成物を、放射性標
識で分析したところ、40%収量で分離され、20%ポリア
クリルアミドゲル上において均質であった。
下記の実施例では、ニトロセルロースフィルターに結
合した相補的標的DNAへの、3′末端修飾したオリゴヌ
クレオチドのハイブリダイゼーションを行った。
合した相補的標的DNAへの、3′末端修飾したオリゴヌ
クレオチドのハイブリダイゼーションを行った。
実施例5 核酸の3′を修飾させること、また、例えば、ビオチ
ンあるいはフルオレシインを用いてさらに機能性を付与
することの影響を調べるために、(上記のようにして合
成を行った)32P−標識付した3′アミンポリヌクレオ
チドを、ニトロセルロースに結合させた相補的標的DNA
にハイブッリドさせた。次に、これらのハイブリダイゼ
ーション錯体を、洗浄条件を次第に厳しい条件に変えて
洗浄し、本発明による3′末端の修飾が、これらの核酸
配列のハイブリダイゼーションに利用できる程度に及ぼ
す影響を調べた。
ンあるいはフルオレシインを用いてさらに機能性を付与
することの影響を調べるために、(上記のようにして合
成を行った)32P−標識付した3′アミンポリヌクレオ
チドを、ニトロセルロースに結合させた相補的標的DNA
にハイブッリドさせた。次に、これらのハイブリダイゼ
ーション錯体を、洗浄条件を次第に厳しい条件に変えて
洗浄し、本発明による3′末端の修飾が、これらの核酸
配列のハイブリダイゼーションに利用できる程度に及ぼ
す影響を調べた。
具体的には、20μgのプラスミドpUC18sac−1を、制
限酵素Hind IIIを用いて消化し、線状化した。1μgの
線状化プラスミドDNAを含む部分試料(2μl)を、ニ
トロセルロースフィルター上にスポットした。このニト
ロセルロースフィルターを、3MMのワットマン濾紙上で
飽和した0.5M水酸化ナトリウム、1.5M塩化ナトリウムに
浸して、前述のDNAを変性させた。次に、1.5M塩化ナト
リウム、0.5M Tris、pH8.0、で飽和した3MMのワットマ
ン濾紙にこの物質を暴露して中和し、さらに2×SSPEで
飽和した3MMのワットマン濾紙に移した。
限酵素Hind IIIを用いて消化し、線状化した。1μgの
線状化プラスミドDNAを含む部分試料(2μl)を、ニ
トロセルロースフィルター上にスポットした。このニト
ロセルロースフィルターを、3MMのワットマン濾紙上で
飽和した0.5M水酸化ナトリウム、1.5M塩化ナトリウムに
浸して、前述のDNAを変性させた。次に、1.5M塩化ナト
リウム、0.5M Tris、pH8.0、で飽和した3MMのワットマ
ン濾紙にこの物質を暴露して中和し、さらに2×SSPEで
飽和した3MMのワットマン濾紙に移した。
そして、ニトロセルロースを30分間風乾し、80℃で、
2時間、保温した。5×SSPEならびに各々0.2%のウシ
血清アルブミン、Ficollおよびポリビニルピロリドン中
で、50℃で、3時間プレハイブリダイゼーションを行っ
た。ハイブリダイゼーションは、1pmolの32P−ポリヌク
レオチドプローブ、200mgの変性ヒト胎盤DNA、および各
々0.2%のウシ血清アルブミン、Ficollおよびポリビニ
ルピロリドン、さらに0.2%のSDSを含む5×SSPE溶液2m
l中において、50℃で、15分間ニトロセルロースをイン
キュベートすることによって行った。次に、ニトロセル
ロースを、第3表に示すように種々の温度において、6
×SSC中で、5分間にわたって3回洗浄した。フィルタ
ーに残った放射能を、液体シンチレーションカウンティ
ングによって測定した。50%のハイブリダイゼーション
プローブが保持された温度が、その核酸の溶解温度であ
ると判断した。
2時間、保温した。5×SSPEならびに各々0.2%のウシ
血清アルブミン、Ficollおよびポリビニルピロリドン中
で、50℃で、3時間プレハイブリダイゼーションを行っ
た。ハイブリダイゼーションは、1pmolの32P−ポリヌク
レオチドプローブ、200mgの変性ヒト胎盤DNA、および各
々0.2%のウシ血清アルブミン、Ficollおよびポリビニ
ルピロリドン、さらに0.2%のSDSを含む5×SSPE溶液2m
l中において、50℃で、15分間ニトロセルロースをイン
キュベートすることによって行った。次に、ニトロセル
ロースを、第3表に示すように種々の温度において、6
×SSC中で、5分間にわたって3回洗浄した。フィルタ
ーに残った放射能を、液体シンチレーションカウンティ
ングによって測定した。50%のハイブリダイゼーション
プローブが保持された温度が、その核酸の溶解温度であ
ると判断した。
第3表 3′フルオレシイン標識核酸 温度(℃) ハイブリダイゼーション(%) 60 100 65 96 70 76 75 30 80 16 3′アミン核酸 温度(℃) ハイブリダイゼーション(%) 60 100 65 70 70 44 75 13 80 2 下記の核酸の理論溶解温度Tmは78%である。Suggs
等,Developmental Biology Using Purified Genes,Bro
wn等の編集,Academic Press,New York,683−693頁(198
1)。
等,Developmental Biology Using Purified Genes,Bro
wn等の編集,Academic Press,New York,683−693頁(198
1)。
第4表 Tm 3′フルオレシイン標識ヌクレオチド 72℃ 3′アミン核酸 67℃ 第3表および第4表を比較すれば、核酸の3′末端修
飾は、ハイブリダイゼーションTmにほとんど影響しない
ことが容易にわかる。
飾は、ハイブリダイゼーションTmにほとんど影響しない
ことが容易にわかる。
以上の説明を考慮すれば、当業者が、本発明の様々な
変更を想到することが考えられる。例えば、ヒドロキシ
アルキルアミンとして、還元カルボキシル基を有するポ
リリシンを使用することによって、多重レポーター基
(すなわち、ポリリシン成分の複数個のアミン基におけ
る)をポリヌクレオチドに結合することができる。従っ
て、特許請求の範囲の欄に示した限定のみを、本発明に
課すべきである。
変更を想到することが考えられる。例えば、ヒドロキシ
アルキルアミンとして、還元カルボキシル基を有するポ
リリシンを使用することによって、多重レポーター基
(すなわち、ポリリシン成分の複数個のアミン基におけ
る)をポリヌクレオチドに結合することができる。従っ
て、特許請求の範囲の欄に示した限定のみを、本発明に
課すべきである。
Claims (5)
- 【請求項1】リンカーによってアミノ基が結合したポリ
ヌクレオチドを調製する方法であって、以下の工程、す
なわち; 保持体結合したカルボキシル基およびヒドロキシア
ルキルアミンリンカー分子のアミノ基をアミド結合し; 前記リンカーの水酸基にて、3′端から5′端の方
向に、ポリヌクレオチドを合成し;および 前記カルボキシル基と前記リンカーのアミノ基の間
にあるアミド結合を加水分解する、 工程を含む、ことを特徴とするリンカーによってアミノ
基が結合したポリヌクレオチドを調製する方法。 - 【請求項2】前記ポリヌクレオチドが、デオキシリボ核
酸である特許請求の範囲第1項に記載の方法。 - 【請求項3】前記ポリヌクレオチドが、リボ核酸である
特許請求の範囲第1項に記載の方法。 - 【請求項4】前記リンカーが、1から10個の炭素原子を
含む特許請求の範囲第1項に記載の方法。 - 【請求項5】前記リンカーが、メタノールアミン、エタ
ノールアミン、プロパノールアミン、ブタノールアミ
ン、ペンタノールアミン、ヘクサノールアミン、ヘプタ
ノールアミン、オクタノールアミン、ノナノールアミ
ン、およびデカノールアミンからなるグループから選択
される特許請求の範囲第4項に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US744798 | 1985-06-13 | ||
| US06/744,798 US4739044A (en) | 1985-06-13 | 1985-06-13 | Method for derivitization of polynucleotides |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS62503103A JPS62503103A (ja) | 1987-12-10 |
| JP2533100B2 true JP2533100B2 (ja) | 1996-09-11 |
Family
ID=24994029
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP61503532A Expired - Lifetime JP2533100B2 (ja) | 1985-06-13 | 1986-06-13 | ポリヌクレオドの誘導方法 |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US4739044A (ja) |
| EP (1) | EP0224577B1 (ja) |
| JP (1) | JP2533100B2 (ja) |
| CA (1) | CA1301673C (ja) |
| DE (1) | DE3670641D1 (ja) |
| IL (1) | IL79113A (ja) |
| WO (1) | WO1986007361A1 (ja) |
Families Citing this family (163)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4849513A (en) * | 1983-12-20 | 1989-07-18 | California Institute Of Technology | Deoxyribonucleoside phosphoramidites in which an aliphatic amino group is attached to the sugar ring and their use for the preparation of oligonucleotides containing aliphatic amino groups |
| USRE43096E1 (en) | 1984-01-16 | 2012-01-10 | California Institute Of Technology | Tagged extendable primers and extension products |
| US5821058A (en) * | 1984-01-16 | 1998-10-13 | California Institute Of Technology | Automated DNA sequencing technique |
| DE3751468T2 (de) * | 1986-10-30 | 1996-02-29 | Daicel Chem | Verfahren zur herstellung von oligonukleotiden und verbindungen zur bildung hochmolekularer schutzgruppen. |
| US5185439A (en) * | 1987-10-05 | 1993-02-09 | Gen-Probe Incorporated | Acridinium ester labelling and purification of nucleotide probes |
| JPH084519B2 (ja) * | 1987-12-25 | 1996-01-24 | エフ・ホフマン―ラ ロシュ アーゲー | ハイブリッド形成用担体およびその調整方法 |
| AU3764989A (en) * | 1988-05-09 | 1989-11-29 | Salk Institute For Biological Studies, The | Method of making nucleic acid dimers |
| US4997928A (en) * | 1988-09-15 | 1991-03-05 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Fluorescent reagents for the preparation of 5'-tagged oligonucleotides |
| US5262536A (en) * | 1988-09-15 | 1993-11-16 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Reagents for the preparation of 5'-tagged oligonucleotides |
| US4988625A (en) * | 1988-11-09 | 1991-01-29 | Merck & Co., Inc. | Method for determining the functionalization of a solid support |
| US5667976A (en) * | 1990-05-11 | 1997-09-16 | Becton Dickinson And Company | Solid supports for nucleic acid hybridization assays |
| FR2679255B1 (fr) * | 1991-07-17 | 1993-10-22 | Bio Merieux | Procede d'immobilisation d'un fragment nucleique par fixation passive sur un support solide, support solide ainsi obtenu et son utilisation. |
| DE59209203D1 (de) * | 1991-08-28 | 1998-03-26 | Boehringer Mannheim Gmbh | Primer für matrizenabhängige enzymatische nukleinsäuresynthesen |
| JP3390468B2 (ja) * | 1991-10-16 | 2003-03-24 | バイエル コーポレーション | 新規の無水混合物法による遺伝子プローブの結合方法 |
| US5646261A (en) * | 1992-01-22 | 1997-07-08 | Hoechst Aktiengesellschaft | 3'-derivatized oligonucleotide analogs with non-nucleotidic groupings, their preparation and use |
| KR930016437A (ko) * | 1992-01-22 | 1993-08-26 | 귀틀라인, 슈미트 | 올리고뉴클레오티드 유사체, 이의 제조방법 및 용도 |
| US6033909A (en) * | 1992-01-22 | 2000-03-07 | Hoechst Aktiengesellschaft | Oligonucleotide analogs, their preparation and use |
| US5473060A (en) * | 1993-07-02 | 1995-12-05 | Lynx Therapeutics, Inc. | Oligonucleotide clamps having diagnostic applications |
| US5571903A (en) * | 1993-07-09 | 1996-11-05 | Lynx Therapeutics, Inc. | Auto-ligating oligonucleotide compounds |
| FR2707296B1 (fr) * | 1993-07-09 | 1995-09-29 | Genset Sa | Procédé de synthèse d'acides nucléiques sur support solide et composés utiles notamment comme support solide dans ledit procédé. |
| US5830658A (en) * | 1995-05-31 | 1998-11-03 | Lynx Therapeutics, Inc. | Convergent synthesis of branched and multiply connected macromolecular structures |
| WO1998035012A2 (en) * | 1997-02-12 | 1998-08-13 | Chan Eugene Y | Methods and products for analyzing polymers |
| US7875440B2 (en) | 1998-05-01 | 2011-01-25 | Arizona Board Of Regents | Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules |
| US6780591B2 (en) * | 1998-05-01 | 2004-08-24 | Arizona Board Of Regents | Method of determining the nucleotide sequence of oligonucleotides and DNA molecules |
| CA2370478A1 (en) | 1999-03-24 | 2000-09-28 | Serge L. Beaucage | N-acylphosphoramidites and their use in oligonucleotide synthesis |
| US6593464B1 (en) | 1999-05-24 | 2003-07-15 | Invitrogen Corporation | Method for deblocking of labeled oligonucleotides |
| US6818395B1 (en) * | 1999-06-28 | 2004-11-16 | California Institute Of Technology | Methods and apparatus for analyzing polynucleotide sequences |
| US7501245B2 (en) * | 1999-06-28 | 2009-03-10 | Helicos Biosciences Corp. | Methods and apparatuses for analyzing polynucleotide sequences |
| US7019129B1 (en) | 2000-05-09 | 2006-03-28 | Biosearch Technologies, Inc. | Dark quenchers for donor-acceptor energy transfer |
| US6936702B2 (en) | 2000-06-07 | 2005-08-30 | Li-Cor, Inc. | Charge-switch nucleotides |
| WO2001094609A1 (en) | 2000-06-07 | 2001-12-13 | Li-Cor, Inc. | Charge-switch nucleotides |
| KR100420785B1 (ko) * | 2000-09-29 | 2004-03-02 | 한국과학기술원 | 코돈검색 알고리즘을 이용한 탐침의 제조방법 |
| AU2002227156A1 (en) | 2000-12-01 | 2002-06-11 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity |
| JP2004523243A (ja) * | 2001-03-12 | 2004-08-05 | カリフォルニア インスティチュート オブ テクノロジー | 非同期性塩基伸長によってポリヌクレオチド配列を分析するための方法および装置 |
| US7118907B2 (en) * | 2001-06-06 | 2006-10-10 | Li-Cor, Inc. | Single molecule detection systems and methods |
| US7668697B2 (en) * | 2006-02-06 | 2010-02-23 | Andrei Volkov | Method for analyzing dynamic detectable events at the single molecule level |
| FR2828284B1 (fr) * | 2001-08-01 | 2003-10-31 | Bio Merieux | Procede de detection au niveau d'un support solide d'une complexation ou d'une hybridation entre au moins deux molecules base sur un signal amplifie au niveau du support |
| US20040054162A1 (en) * | 2001-10-30 | 2004-03-18 | Hanna Michelle M. | Molecular detection systems utilizing reiterative oligonucleotide synthesis |
| US7045319B2 (en) * | 2001-10-30 | 2006-05-16 | Ribomed Biotechnologies, Inc. | Molecular detection systems utilizing reiterative oligonucleotide synthesis |
| AU2002353001A1 (en) * | 2001-12-03 | 2003-06-17 | The Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary Of The Department Of He | Thermolabile hydroxyl protecting groups and methods of use |
| US20030148391A1 (en) * | 2002-01-24 | 2003-08-07 | Salafsky Joshua S. | Method using a nonlinear optical technique for detection of interactions involving a conformational change |
| US20060078893A1 (en) | 2004-10-12 | 2006-04-13 | Medical Research Council | Compartmentalised combinatorial chemistry by microfluidic control |
| GB0307428D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Compartmentalised combinatorial chemistry |
| GB0307403D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Selection by compartmentalised screening |
| US7745116B2 (en) * | 2003-04-08 | 2010-06-29 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Composition and method for nucleic acid sequencing |
| US20070048761A1 (en) * | 2005-05-20 | 2007-03-01 | Applied Dna Sciences, Inc. | System and method for authenticating multiple components associated with a particular product |
| US20100285985A1 (en) * | 2003-04-15 | 2010-11-11 | Applied Dna Sciences, Inc. | Methods and Systems for the Generation of Plurality of Security Markers and the Detection Therof |
| US20090286250A1 (en) * | 2006-05-19 | 2009-11-19 | James Arthur Hayward | Incorporating soluble security markers into cyanoacrylate solutions |
| US8372648B2 (en) | 2003-04-16 | 2013-02-12 | APDN (B.V.I.), Inc. | Optical reporter compositions |
| US8415164B2 (en) * | 2003-04-16 | 2013-04-09 | Apdn (B.V.I.) Inc. | System and method for secure document printing and detection |
| US8124333B2 (en) * | 2003-04-16 | 2012-02-28 | APDN, Inc. | Methods for covalent linking of optical reporters |
| US8420400B2 (en) * | 2003-04-16 | 2013-04-16 | APDN (B.V.I.), Inc. | System and method for authenticating tablets |
| US8426216B2 (en) * | 2003-04-16 | 2013-04-23 | APDN (B.V.I.), Inc. | Methods for authenticating articles with optical reporters |
| US8415165B2 (en) * | 2003-04-16 | 2013-04-09 | APDN (B.V.I.), Inc. | System and method for authenticating sports identification goods |
| US20050170367A1 (en) * | 2003-06-10 | 2005-08-04 | Quake Stephen R. | Fluorescently labeled nucleoside triphosphates and analogs thereof for sequencing nucleic acids |
| KR20070012779A (ko) * | 2003-10-29 | 2007-01-29 | 리보메드 바이오테그놀로지스 인코포레이티드 | 반복적 올리고뉴클레오티드 합성을 위한 조성물, 방법 및검출 기법 |
| US7169560B2 (en) | 2003-11-12 | 2007-01-30 | Helicos Biosciences Corporation | Short cycle methods for sequencing polynucleotides |
| US20060172408A1 (en) * | 2003-12-01 | 2006-08-03 | Quake Steven R | Device for immobilizing chemical and biochemical species and methods of using same |
| WO2005080605A2 (en) | 2004-02-19 | 2005-09-01 | Helicos Biosciences Corporation | Methods and kits for analyzing polynucleotide sequences |
| US20060046258A1 (en) * | 2004-02-27 | 2006-03-02 | Lapidus Stanley N | Applications of single molecule sequencing |
| US20050221339A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Medical Research Council Harvard University | Compartmentalised screening by microfluidic control |
| US20050239085A1 (en) * | 2004-04-23 | 2005-10-27 | Buzby Philip R | Methods for nucleic acid sequence determination |
| US7476734B2 (en) * | 2005-12-06 | 2009-01-13 | Helicos Biosciences Corporation | Nucleotide analogs |
| US20070117104A1 (en) * | 2005-11-22 | 2007-05-24 | Buzby Philip R | Nucleotide analogs |
| US20070117103A1 (en) * | 2005-11-22 | 2007-05-24 | Buzby Philip R | Nucleotide analogs |
| US7635562B2 (en) * | 2004-05-25 | 2009-12-22 | Helicos Biosciences Corporation | Methods and devices for nucleic acid sequence determination |
| US20060024711A1 (en) * | 2004-07-02 | 2006-02-02 | Helicos Biosciences Corporation | Methods for nucleic acid amplification and sequence determination |
| US20060024678A1 (en) * | 2004-07-28 | 2006-02-02 | Helicos Biosciences Corporation | Use of single-stranded nucleic acid binding proteins in sequencing |
| US7968287B2 (en) | 2004-10-08 | 2011-06-28 | Medical Research Council Harvard University | In vitro evolution in microfluidic systems |
| US20060118754A1 (en) * | 2004-12-08 | 2006-06-08 | Lapen Daniel C | Stabilizing a polyelectrolyte multilayer |
| WO2006065751A2 (en) * | 2004-12-13 | 2006-06-22 | Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Cpg oligonucleotide prodrugs, compositions thereof and associated therapeutic methods |
| US7220549B2 (en) | 2004-12-30 | 2007-05-22 | Helicos Biosciences Corporation | Stabilizing a nucleic acid for nucleic acid sequencing |
| US20060172328A1 (en) * | 2005-01-05 | 2006-08-03 | Buzby Philip R | Methods and compositions for correcting misincorporation in a nucleic acid synthesis reaction |
| US7482120B2 (en) * | 2005-01-28 | 2009-01-27 | Helicos Biosciences Corporation | Methods and compositions for improving fidelity in a nucleic acid synthesis reaction |
| US20060263790A1 (en) * | 2005-05-20 | 2006-11-23 | Timothy Harris | Methods for improving fidelity in a nucleic acid synthesis reaction |
| US7666593B2 (en) | 2005-08-26 | 2010-02-23 | Helicos Biosciences Corporation | Single molecule sequencing of captured nucleic acids |
| US7842823B2 (en) * | 2005-10-27 | 2010-11-30 | The Regents Of The University Of California | Fluorogenic probes for reactive oxygen species |
| US20070117102A1 (en) * | 2005-11-22 | 2007-05-24 | Buzby Philip R | Nucleotide analogs |
| US20070128610A1 (en) * | 2005-12-02 | 2007-06-07 | Buzby Philip R | Sample preparation method and apparatus for nucleic acid sequencing |
| WO2007070642A2 (en) * | 2005-12-15 | 2007-06-21 | Helicos Biosciences Corporation | Methods for increasing accuracy of nucleic acid sequencing |
| WO2007081385A2 (en) | 2006-01-11 | 2007-07-19 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic devices and methods of use in the formation and control of nanoreactors |
| EP2530167A1 (en) | 2006-05-11 | 2012-12-05 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic Devices |
| US9562837B2 (en) | 2006-05-11 | 2017-02-07 | Raindance Technologies, Inc. | Systems for handling microfludic droplets |
| US9790538B2 (en) | 2013-03-07 | 2017-10-17 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Alkaline activation for immobilization of DNA taggants |
| US20140106357A1 (en) | 2012-10-16 | 2014-04-17 | Applied Dna Sciences, Inc. | Security system and method of marking an inventory item and/or person in the vicinity |
| US10741034B2 (en) | 2006-05-19 | 2020-08-11 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Security system and method of marking an inventory item and/or person in the vicinity |
| EP2077912B1 (en) | 2006-08-07 | 2019-03-27 | The President and Fellows of Harvard College | Fluorocarbon emulsion stabilizing surfactants |
| WO2008097559A2 (en) | 2007-02-06 | 2008-08-14 | Brandeis University | Manipulation of fluids and reactions in microfluidic systems |
| US8592221B2 (en) | 2007-04-19 | 2013-11-26 | Brandeis University | Manipulation of fluids, fluid components and reactions in microfluidic systems |
| US9163053B2 (en) * | 2007-05-18 | 2015-10-20 | Fluidigm Corporation | Nucleotide analogs |
| WO2009124150A2 (en) | 2008-04-01 | 2009-10-08 | Biosearch Technologies, Inc. | Stabilized nucleic acid dark quencher-fluorophore probes |
| EP2297346B1 (en) | 2008-05-15 | 2015-04-15 | Ribomed Biotechnologies, Inc. | METHODS AND REAGENTS FOR DETECTING CpG METHYLATION WITH A METHYL CpG BINDING PROTEIN (MBP) |
| US8791258B2 (en) * | 2008-06-10 | 2014-07-29 | The Regents Of The University Of California | Pro-fluorescent probes |
| US8211644B2 (en) * | 2008-07-13 | 2012-07-03 | Ribomed Biotechnologies, Inc. | Molecular beacon-based methods for detection of targets using abscription |
| EP4047367A1 (en) | 2008-07-18 | 2022-08-24 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Method for detecting target analytes with droplet libraries |
| US12038438B2 (en) | 2008-07-18 | 2024-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Enzyme quantification |
| US9182406B2 (en) * | 2008-08-04 | 2015-11-10 | Biodesy, Inc. | Nonlinear optical detection of molecules comprising an unnatural amino acid possessing a hyperpolarizability |
| WO2010028288A2 (en) | 2008-09-05 | 2010-03-11 | Aueon, Inc. | Methods for stratifying and annotating cancer drug treatment options |
| US8669079B2 (en) | 2008-11-12 | 2014-03-11 | Cara Therapeutics, Inc. | Methods for genetic analysis of textiles made of Gossypium barbadense and Gossypium hirsutum cotton |
| US8940485B2 (en) | 2008-11-12 | 2015-01-27 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Methods for genotyping mature cotton fibers and textiles |
| AU2010225937B2 (en) | 2009-03-15 | 2014-09-18 | Ribomed Biotechnologies, Inc. | Abscription based molecular detection |
| WO2010111231A1 (en) | 2009-03-23 | 2010-09-30 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulation of microfluidic droplets |
| US10520500B2 (en) | 2009-10-09 | 2019-12-31 | Abdeslam El Harrak | Labelled silica-based nanomaterial with enhanced properties and uses thereof |
| US20110151457A1 (en) | 2009-12-22 | 2011-06-23 | Elitech Holding B.V. | Hypertheromostable endonuclease iv substrate probe |
| US10837883B2 (en) | 2009-12-23 | 2020-11-17 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Microfluidic systems and methods for reducing the exchange of molecules between droplets |
| US10351905B2 (en) | 2010-02-12 | 2019-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
| EP4484577A3 (en) | 2010-02-12 | 2025-03-26 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
| US9366632B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-06-14 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
| US9399797B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-07-26 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
| EP2619329B1 (en) | 2010-09-24 | 2019-05-22 | The Board of Trustees of The Leland Stanford Junior University | Direct capture, amplification and sequencing of target dna using immobilized primers |
| US9562897B2 (en) | 2010-09-30 | 2017-02-07 | Raindance Technologies, Inc. | Sandwich assays in droplets |
| EP3412778A1 (en) | 2011-02-11 | 2018-12-12 | Raindance Technologies, Inc. | Methods for forming mixed droplets |
| WO2012112804A1 (en) | 2011-02-18 | 2012-08-23 | Raindance Technoligies, Inc. | Compositions and methods for molecular labeling |
| GB2503604B (en) | 2011-03-21 | 2020-04-22 | Biodesy Llc | Classification of kinase inhibitors using second harmonic optical techniques |
| US20140027282A1 (en) * | 2011-04-22 | 2014-01-30 | Sony Corporation | Method of electrophoresing nucleic acids, method of concentrating and purifying nucleic acids, cartridge for nucleic acid electrophoresis, and method of producing cartridge for nucleic acid electrophoresis |
| US8809238B2 (en) | 2011-05-09 | 2014-08-19 | Fluidigm Corporation | Probe based nucleic acid detection |
| ES2537189T3 (es) | 2011-05-24 | 2015-06-03 | Elitech Holding B.V. | Detección de estafilococos áureos resistentes a la meticilina |
| EP3216872B1 (en) | 2011-06-02 | 2020-04-01 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Enzyme quantification |
| US8841071B2 (en) | 2011-06-02 | 2014-09-23 | Raindance Technologies, Inc. | Sample multiplexing |
| US8658430B2 (en) | 2011-07-20 | 2014-02-25 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulating droplet size |
| WO2013123409A1 (en) | 2012-02-17 | 2013-08-22 | NVS Technologies, Inc. | Polymer scaffolds for assay applications |
| WO2013138937A1 (en) | 2012-03-20 | 2013-09-26 | UNIVERSITé LAVAL | A nucleic acid detection method comprising target specific indexing probes (tsip) comprising a releasable segment to be detected via fluorescence when bound to a capture probe |
| US10202642B2 (en) | 2012-05-02 | 2019-02-12 | Ibis Biosciences, Inc. | DNA sequencing |
| EP3783111A1 (en) | 2012-05-02 | 2021-02-24 | Ibis Biosciences, Inc. | Dna sequencing |
| EP2850086B1 (en) | 2012-05-18 | 2023-07-05 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Heteroarylcyanine dyes |
| WO2013172942A1 (en) | 2012-05-18 | 2013-11-21 | Purdue Research Foundation | Methods for isolating proteins |
| US9266370B2 (en) | 2012-10-10 | 2016-02-23 | Apdn (B.V.I) Inc. | DNA marking of previously undistinguished items for traceability |
| US9297032B2 (en) | 2012-10-10 | 2016-03-29 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Use of perturbants to facilitate incorporation and recovery of taggants from polymerized coatings |
| SG11201502786TA (en) | 2012-10-12 | 2015-05-28 | Nvs Technologies Inc | Polymers having orthogonal reactive groups and uses thereof |
| US9303263B2 (en) | 2013-03-01 | 2016-04-05 | Vivonics, Inc. | Aptamers that bind CD271 |
| EP2964785B8 (en) | 2013-03-04 | 2020-10-21 | Fry Laboratories LLC | Method and kit for characterizing microorganisms |
| US9963740B2 (en) | 2013-03-07 | 2018-05-08 | APDN (B.V.I.), Inc. | Method and device for marking articles |
| JP2016517465A (ja) | 2013-03-14 | 2016-06-16 | エヌブイエス テクノロジーズ,インコーポレイティド | 生体分子を封鎖するための表面酸化および関連する方法 |
| US9347095B2 (en) | 2013-03-15 | 2016-05-24 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital assays for mutation detection |
| US9725724B2 (en) | 2013-05-16 | 2017-08-08 | Vivonics, Inc. | Neutral nucleic acid ligands |
| US11901041B2 (en) | 2013-10-04 | 2024-02-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analysis of nucleic acid modification |
| WO2015054188A1 (en) | 2013-10-07 | 2015-04-16 | Apdn (B.V.I), Inc. | Multimode image and spectral reader |
| US9944977B2 (en) | 2013-12-12 | 2018-04-17 | Raindance Technologies, Inc. | Distinguishing rare variations in a nucleic acid sequence from a sample |
| WO2015103367A1 (en) | 2013-12-31 | 2015-07-09 | Raindance Technologies, Inc. | System and method for detection of rna species |
| CN106103121B (zh) | 2014-03-18 | 2019-12-06 | 亚普蒂恩(B.V.I.)公司 | 用于安全应用的加密光学标记物 |
| US10745825B2 (en) | 2014-03-18 | 2020-08-18 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Encrypted optical markers for security applications |
| CN106536483B (zh) | 2014-05-09 | 2020-02-07 | 生物检索技术股份有限公司 | Cosmic猝灭剂 |
| US11053548B2 (en) | 2014-05-12 | 2021-07-06 | Good Start Genetics, Inc. | Methods for detecting aneuploidy |
| AU2015317692A1 (en) | 2014-09-17 | 2017-04-06 | Hologic, Inc. | Method of partial lysis and assay |
| US9988670B2 (en) | 2014-12-12 | 2018-06-05 | Elitechgroup B.V. | Methods and compositions for detecting antibiotic resistant bacteria |
| EP3230467A1 (en) | 2014-12-12 | 2017-10-18 | ELITechGroup B.V. | Methods and compositions for detecting antibiotic resistant bacteria |
| US10760182B2 (en) | 2014-12-16 | 2020-09-01 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Method and device for marking fibrous materials |
| WO2016106286A1 (en) | 2014-12-23 | 2016-06-30 | Biodesy, Inc. | Attachment of proteins to interfaces for use in nonlinear optical detection |
| EP3283499B1 (en) | 2015-04-15 | 2022-07-06 | Biosearch Technologies, Inc. | Dual quencher probes |
| US10647981B1 (en) | 2015-09-08 | 2020-05-12 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Nucleic acid library generation methods and compositions |
| JP7049683B2 (ja) | 2016-04-04 | 2022-04-07 | シノピア バイオサイエンシーズ,インク. | トラピジルを使用する錐体外路症候群の処置 |
| CN109070130B (zh) | 2016-04-11 | 2022-03-22 | 亚普蒂恩(B V I)公司 | 用于标记纤维素产品的方法 |
| CN109476695A (zh) | 2016-06-27 | 2019-03-15 | 丹娜法伯癌症研究院 | 用于测定rna翻译速率的方法 |
| US10995371B2 (en) | 2016-10-13 | 2021-05-04 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Composition and method of DNA marking elastomeric material |
| US10920274B2 (en) | 2017-02-21 | 2021-02-16 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Nucleic acid coated submicron particles for authentication |
| US11433074B2 (en) | 2017-06-22 | 2022-09-06 | Triact Therapeutics, Inc. | Methods of treating glioblastoma |
| WO2018237344A1 (en) | 2017-06-22 | 2018-12-27 | Triact Therapeutics, Inc. | METHODS OF PATIENT SELECTION AND TREATMENT OF CANCERS OVEREXPRESSING TRXR OR PRDX |
| EP3687501A4 (en) | 2017-09-29 | 2021-06-23 | Triact Therapeutics, Inc. | INIPARIB FORMULATIONS AND THEIR USES |
| MX2022011879A (es) | 2020-03-26 | 2023-01-11 | Sinopia Biosciences Inc | Derivados de trapidilo marcados isotopicamente. |
| EP4133113A1 (en) | 2020-04-06 | 2023-02-15 | Fast Track Diagnostics Luxembourg S.a.r.l. | Pcr based diagnostic kit, compositions and methods for amplification and detection of sars-cov-2 |
| EP4363611A1 (en) | 2021-06-30 | 2024-05-08 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Compositions and methods for enrichment of nucleic acids using light-mediated cross-linking |
| US20250019739A1 (en) | 2021-10-26 | 2025-01-16 | Caribou Biosciences, Inc. | Exonuclease-coupled real-time endonuclease activity assay |
| WO2026050087A1 (en) | 2024-08-27 | 2026-03-05 | Caribou Biosciences, Inc. | Real-time crispr endonuclease activity assay |
Family Cites Families (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4310662A (en) * | 1979-12-26 | 1982-01-12 | Genentech, Inc. | Nucleosidic phosphorylating agent and methods |
| JPS5796748A (en) * | 1980-12-05 | 1982-06-16 | Toyoda Mach Works Ltd | Automatic tool interchange apparatus |
| US4415732A (en) * | 1981-03-27 | 1983-11-15 | University Patents, Inc. | Phosphoramidite compounds and processes |
| CA1219824A (en) * | 1981-04-17 | 1987-03-31 | David C. Ward | Modified nucleotides and methods of preparing and using same |
| US4417046A (en) * | 1981-08-24 | 1983-11-22 | Eli Lilly And Company | Process for isolating oligonucleotide product from a coupling reaction mixture |
| IL69196A0 (en) * | 1982-08-20 | 1983-11-30 | Genex Corp | Solid phase synthesis of oligonucleotides |
-
1985
- 1985-06-13 US US06/744,798 patent/US4739044A/en not_active Expired - Lifetime
-
1986
- 1986-06-12 IL IL79113A patent/IL79113A/xx not_active IP Right Cessation
- 1986-06-13 JP JP61503532A patent/JP2533100B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1986-06-13 EP EP86904008A patent/EP0224577B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1986-06-13 CA CA000511561A patent/CA1301673C/en not_active Expired - Lifetime
- 1986-06-13 DE DE8686904008T patent/DE3670641D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1986-06-13 WO PCT/US1986/001281 patent/WO1986007361A1/en not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0224577A4 (en) | 1987-10-19 |
| US4739044A (en) | 1988-04-19 |
| IL79113A0 (en) | 1986-09-30 |
| WO1986007361A1 (en) | 1986-12-18 |
| CA1301673C (en) | 1992-05-26 |
| DE3670641D1 (de) | 1990-05-31 |
| EP0224577B1 (en) | 1990-04-25 |
| EP0224577A1 (en) | 1987-06-10 |
| JPS62503103A (ja) | 1987-12-10 |
| IL79113A (en) | 1992-03-29 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2533100B2 (ja) | ポリヌクレオドの誘導方法 | |
| EP0224578B1 (en) | Compositions and methods for functionalizing nucleic acids | |
| JP2502257B2 (ja) | オリゴヌクレオチドの高分子支持体系 | |
| EP0360940B1 (en) | Polynucleotide determination with selectable cleavage sites | |
| EP0101985A1 (en) | Oligonucleotide derivatives and production thereof | |
| JP2004325457A (ja) | 試料中の検体の存在又は量を検出する方法 | |
| EP0703296A1 (en) | Polynucleotide determination by strand replacement of a capture probe | |
| US6022714A (en) | Methods for attachment of a polynucleotide to a preselected material | |
| US7098326B2 (en) | Methods for the integrated synthesis and purification of oligonucleotides | |
| EP0155854A2 (en) | Non-radioactive biological probes | |
| JP4054683B2 (ja) | 固体支持体上へのオリゴヌクレオチドの固定化 | |
| JPH0374239B2 (ja) | ||
| WO1989001941A1 (fr) | Procede d'obtention par voie chimique d'oligonucleotides marques et applications biologiques | |
| Leuck | Pieken et al.(45) Date of Patent: Aug. 29, 2006 | |
| JPS60166694A (ja) | オリゴヌクレオチド誘導体およびその製造法 | |
| JP2000119199A (ja) | ヌクレオチドプローブ用非ヌクレオチド連結試薬 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| EXPY | Cancellation because of completion of term |