JP2976017B2 - 長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体 - Google Patents
長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体Info
- Publication number
- JP2976017B2 JP2976017B2 JP9113711A JP11371197A JP2976017B2 JP 2976017 B2 JP2976017 B2 JP 2976017B2 JP 9113711 A JP9113711 A JP 9113711A JP 11371197 A JP11371197 A JP 11371197A JP 2976017 B2 JP2976017 B2 JP 2976017B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- general formula
- group
- linked
- following general
- headed
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 title claims description 18
- -1 carboxyethyl group Chemical group 0.000 claims description 21
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical group CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N adenyl group Chemical group N1=CN=C2N=CNC2=C1N GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical group N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical group C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 5
- 150000004985 diamines Chemical class 0.000 claims description 5
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims description 5
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 claims 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 claims 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 42
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 32
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 15
- 238000000921 elemental analysis Methods 0.000 description 13
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 12
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 11
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 10
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 10
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 10
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 10
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 9
- QFTYSVGGYOXFRQ-UHFFFAOYSA-N dodecane-1,12-diamine Chemical compound NCCCCCCCCCCCCN QFTYSVGGYOXFRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 6
- 239000000463 material Substances 0.000 description 6
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 6
- 239000000047 product Substances 0.000 description 6
- YQLZOAVZWJBZSY-UHFFFAOYSA-N decane-1,10-diamine Chemical compound NCCCCCCCCCCN YQLZOAVZWJBZSY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000012046 mixed solvent Substances 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 5
- 125000001501 propionyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 5
- BTJIUGUIPKRLHP-UHFFFAOYSA-N 4-nitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 BTJIUGUIPKRLHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000003368 amide group Chemical group 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 238000000034 method Methods 0.000 description 4
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 4
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 4
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 239000010408 film Substances 0.000 description 3
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 3
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 3
- 238000010898 silica gel chromatography Methods 0.000 description 3
- 125000004044 trifluoroacetyl group Chemical group FC(C(=O)*)(F)F 0.000 description 3
- KLNPWTHGTVSSEU-UHFFFAOYSA-N undecane-1,11-diamine Chemical compound NCCCCCCCCCCCN KLNPWTHGTVSSEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FCZOVUJWOBSMSS-UHFFFAOYSA-N 5-[(6-aminopurin-9-yl)methyl]-5-methyl-3-methylideneoxolan-2-one Chemical compound C1=NC2=C(N)N=CN=C2N1CC1(C)CC(=C)C(=O)O1 FCZOVUJWOBSMSS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QXAYJKFBMWMARF-UHFFFAOYSA-N 6-Amino-9H-purine-9-propanoic acid Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2CCC(O)=O QXAYJKFBMWMARF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DIKPQAOTYWNSMY-UHFFFAOYSA-N C(=O)(O)C(C)CC=1C(NC(NC=1)=O)=O Chemical compound C(=O)(O)C(C)CC=1C(NC(NC=1)=O)=O DIKPQAOTYWNSMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N Dimethyl sulfoxide Chemical compound [2H]C([2H])([2H])S(=O)C([2H])([2H])[2H] IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VEZXCJBBBCKRPI-UHFFFAOYSA-N beta-propiolactone Chemical compound O=C1CCO1 VEZXCJBBBCKRPI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000007810 chemical reaction solvent Substances 0.000 description 2
- 239000000084 colloidal system Substances 0.000 description 2
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- JMLPVHXESHXUSV-UHFFFAOYSA-N dodecane-1,1-diamine Chemical compound CCCCCCCCCCCC(N)N JMLPVHXESHXUSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 2
- 150000003949 imides Chemical class 0.000 description 2
- 125000001570 methylene group Chemical group [H]C([H])([*:1])[*:2] 0.000 description 2
- BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L potassium carbonate Chemical compound [K+].[K+].[O-]C([O-])=O BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 229960000380 propiolactone Drugs 0.000 description 2
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001953 recrystallisation Methods 0.000 description 2
- 238000001226 reprecipitation Methods 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- WMUFBMFZOHGUPA-UHFFFAOYSA-N (2,3,4,5,6-pentachlorophenyl) 2,2,2-trichloroacetate Chemical compound ClC1=C(Cl)C(Cl)=C(OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl)C(Cl)=C1Cl WMUFBMFZOHGUPA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N Adenosine Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 1
- MYIBUDLIYKVIBS-UHFFFAOYSA-N CC1=CN(C(NC1=O)O)CCC(=O)NCCCCCCCCCCCNC(=O)CCN2C=C(C(=O)NC2O)C Chemical compound CC1=CN(C(NC1=O)O)CCC(=O)NCCCCCCCCCCCNC(=O)CCN2C=C(C(=O)NC2O)C MYIBUDLIYKVIBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GDQVHWCGZKZZJX-UHFFFAOYSA-N FC(C(=O)NC1=C2N=CN(C2=NC=N1)CCC(=O)NCCCCCCCCCCCCNC(CCN1C2=NC=NC(=C2N=C1)NC(C(F)(F)F)=O)=O)(F)F Chemical compound FC(C(=O)NC1=C2N=CN(C2=NC=N1)CCC(=O)NCCCCCCCCCCCCNC(CCN1C2=NC=NC(=C2N=C1)NC(C(F)(F)F)=O)=O)(F)F GDQVHWCGZKZZJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RMPHUOPNGUAPRG-UHFFFAOYSA-N Nc1ncnc2n(CCC(=O)NCCCCCCCCCCCNC(=O)CCn3cnc4c(N)ncnc34)cnc12 Chemical compound Nc1ncnc2n(CCC(=O)NCCCCCCCCCCCNC(=O)CCn3cnc4c(N)ncnc34)cnc12 RMPHUOPNGUAPRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000010976 amide bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 1
- GWVMVHBQZQWKSU-UHFFFAOYSA-N chloro-diphenyl-sulfanylidene-$l^{5}-phosphane Chemical group C=1C=CC=CC=1P(=S)(Cl)C1=CC=CC=C1 GWVMVHBQZQWKSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 1
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Natural products NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 125000004494 ethyl ester group Chemical group 0.000 description 1
- 239000012847 fine chemical Substances 0.000 description 1
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 238000004377 microelectronic Methods 0.000 description 1
- 125000000636 p-nitrophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)[N+]([O-])=O 0.000 description 1
- 229910000027 potassium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 1
- 238000001338 self-assembly Methods 0.000 description 1
- 238000009210 therapy by ultrasound Methods 0.000 description 1
- 239000010409 thin film Substances 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、核酸塩基であるア
デニンまたはチミン残基を分子の両端にもち、それらが
長鎖アルキレン鎖で架橋された新規な双頭型核酸塩基誘
導体およびその製造方法に関するものである。さらに詳
しくは、それぞれ単独成分又は混合成分系でラングミュ
アー・ブロジェット(LB)法により気水界面上に展開
し、基板に移しとることにより有機超薄膜を形成した
り、あるいは両者を混合することにより結晶性の集合体
を形成し、さらには核酸塩基を被験物質とするバイオセ
ンサー材料や機能性材料としてエレクトロニクス工業分
野、ファインケミカル工業分野などにおいて利用可能
な、長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導
体及びその製造方法に関するものである。
デニンまたはチミン残基を分子の両端にもち、それらが
長鎖アルキレン鎖で架橋された新規な双頭型核酸塩基誘
導体およびその製造方法に関するものである。さらに詳
しくは、それぞれ単独成分又は混合成分系でラングミュ
アー・ブロジェット(LB)法により気水界面上に展開
し、基板に移しとることにより有機超薄膜を形成した
り、あるいは両者を混合することにより結晶性の集合体
を形成し、さらには核酸塩基を被験物質とするバイオセ
ンサー材料や機能性材料としてエレクトロニクス工業分
野、ファインケミカル工業分野などにおいて利用可能
な、長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導
体及びその製造方法に関するものである。
【0002】
【従来の技術】従来の技術としては、シトシンの長鎖ア
ルキル誘導体(分析化学「AnalyticalChemistry」、第6
4巻、第960〜964頁、1992年)やアデノシン、チミジン
のアシル誘導体(コロイドと表面「Colloids and Surfa
ces」、第57巻、第383〜391頁、1991年)など核酸塩基
が分子の片末端のみに連結している核酸脂質関連化合物
が知られている。しかしながら、これらの化合物は核酸
塩基対間の相補的水素結合形成を分子集合体形成の原動
力としているため、一般に、水素結合形成にとって不利
な水中での集合体形成は起こらない。さらに、例えば、
有機溶媒中で水素結合形成が起こったとしても、薄膜や
球状の小胞体のような分子集合体として単離することは
不可能であり、集合体単体として工業的に利用しにくい
という欠点を有している。
ルキル誘導体(分析化学「AnalyticalChemistry」、第6
4巻、第960〜964頁、1992年)やアデノシン、チミジン
のアシル誘導体(コロイドと表面「Colloids and Surfa
ces」、第57巻、第383〜391頁、1991年)など核酸塩基
が分子の片末端のみに連結している核酸脂質関連化合物
が知られている。しかしながら、これらの化合物は核酸
塩基対間の相補的水素結合形成を分子集合体形成の原動
力としているため、一般に、水素結合形成にとって不利
な水中での集合体形成は起こらない。さらに、例えば、
有機溶媒中で水素結合形成が起こったとしても、薄膜や
球状の小胞体のような分子集合体として単離することは
不可能であり、集合体単体として工業的に利用しにくい
という欠点を有している。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、安価な原料
から容易に製造することができ、しかも高い自己集積性
を有し、核酸塩基対間の分子認識により安定な分子集合
体を形成しうる機能性材料として有用な新規な双頭型脂
質関連化合物およびその製造方法を提供することをその
課題とするものである。
から容易に製造することができ、しかも高い自己集積性
を有し、核酸塩基対間の分子認識により安定な分子集合
体を形成しうる機能性材料として有用な新規な双頭型脂
質関連化合物およびその製造方法を提供することをその
課題とするものである。
【0004】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、機能性材
料として有用な新規な長鎖アルキレン鎖で架橋された双
頭型核酸塩基誘導体について鋭意研究を重ねた結果、両
端に核酸塩基カルボキシエチル誘導体を有し、それがア
ミド結合によって長鎖のアルキレン基と連結した、長鎖
アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体が前記
目的に適合しうることを見出し、この知見に基づいて本
発明を完成するに至った。
料として有用な新規な長鎖アルキレン鎖で架橋された双
頭型核酸塩基誘導体について鋭意研究を重ねた結果、両
端に核酸塩基カルボキシエチル誘導体を有し、それがア
ミド結合によって長鎖のアルキレン基と連結した、長鎖
アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体が前記
目的に適合しうることを見出し、この知見に基づいて本
発明を完成するに至った。
【0005】すなわち、本発明は、下記一般式(1) X−(CH2)2−CONH−(CH2)n−NHCO−(CH2)2−X (1) (式中、Xはプリン塩基の9位を連結部位とするアデニ
ン残基またはピリミジン塩基の2位を連結部位とするチ
ミン残基を示し、nは10〜12の整数である)で表わ
される長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘
導体およびその製造方法を提供するものである。この一
般式(1)で表わされる構造を有する本発明化合物は文
献未載の新規化合物である。
ン残基またはピリミジン塩基の2位を連結部位とするチ
ミン残基を示し、nは10〜12の整数である)で表わ
される長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘
導体およびその製造方法を提供するものである。この一
般式(1)で表わされる構造を有する本発明化合物は文
献未載の新規化合物である。
【0006】
【発明の実施の形態】前記一般式(1)で表わされる長
鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体の両
端はプリン塩基の9位を連結部位とするアデニン残基ま
たはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチミン残基
である。一方、前記一般式(1)におけるアルキレン基
は、nが10〜12の長鎖アルキレン基であり、このよ
うなものとして、例えばデシレン基、ウンデシレン基、
ドデシレン基などが挙げられる。
鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体の両
端はプリン塩基の9位を連結部位とするアデニン残基ま
たはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチミン残基
である。一方、前記一般式(1)におけるアルキレン基
は、nが10〜12の長鎖アルキレン基であり、このよ
うなものとして、例えばデシレン基、ウンデシレン基、
ドデシレン基などが挙げられる。
【0007】前記一般式(1)で表わされる長鎖アルキ
レン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体において、X
がプリン塩基の9位を連結部位とするアデニン残基であ
るものは、例えば下記一般式(2) R−A−CH2−CH2−COOR1 (2) (式中、Aは、プリン塩基6位のアミノ基が保護され、
9位にカルボキシエチル基が連結したアデニン残基を示
し、Rは水素原子またはアミノ保護基、R1はカルボキ
シル活性基である)で表わされるアミノ基を保護したア
デニン誘導体活性エステルを、下記一般式(3) H2N−(CH2)n−NH2 (3) (式中、nは10〜12の整数である)で表わされるジ
アミンと反応させ、次いでRが水素原子以外の場合、ア
ミノ保護基を脱離させることにより得られる。また、前
記一般式(1)において、Xがピリミジン塩基の1位を
連結部位とするチミン残基であるものは、例えば、下記
一般式(5) T−CH2−CH2−COOR2 (5) (式中、Tはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチ
ミン残基、R2はカルボキシル活性基である)で表わさ
れるチミン誘導体活性エステルを、下記一般式(3) H2N−(CH2)n−NH2 (3) (式中、nは10〜12の整数である)で表わされるジ
アミンと縮合させることにより容易に製造することがで
きる。
レン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体において、X
がプリン塩基の9位を連結部位とするアデニン残基であ
るものは、例えば下記一般式(2) R−A−CH2−CH2−COOR1 (2) (式中、Aは、プリン塩基6位のアミノ基が保護され、
9位にカルボキシエチル基が連結したアデニン残基を示
し、Rは水素原子またはアミノ保護基、R1はカルボキ
シル活性基である)で表わされるアミノ基を保護したア
デニン誘導体活性エステルを、下記一般式(3) H2N−(CH2)n−NH2 (3) (式中、nは10〜12の整数である)で表わされるジ
アミンと反応させ、次いでRが水素原子以外の場合、ア
ミノ保護基を脱離させることにより得られる。また、前
記一般式(1)において、Xがピリミジン塩基の1位を
連結部位とするチミン残基であるものは、例えば、下記
一般式(5) T−CH2−CH2−COOR2 (5) (式中、Tはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチ
ミン残基、R2はカルボキシル活性基である)で表わさ
れるチミン誘導体活性エステルを、下記一般式(3) H2N−(CH2)n−NH2 (3) (式中、nは10〜12の整数である)で表わされるジ
アミンと縮合させることにより容易に製造することがで
きる。
【0008】前記一般式(2)で表わされるアデニンの
カルボキシエチル誘導体又は一般式(5)で表わされる
チミンのカルボキシエチル誘導体はそれぞれの核酸塩基
をβ−プロピオラクトンと反応させて得られる。反応溶
媒としては、ジメチルホルムアミド(DMF)やエタノ
ールが適当である。核酸塩基カルボキシエチル誘導体の
カルボキシル基の活性保護基としては、エチルエステ
ル、ペンタクロロフェニルエステル、p−ニトロフェニ
ルエステルなどを用いることができる。なかでも、アデ
ニン誘導体ではpーニトロフェニルエステルが、チミン
誘導体ではペンタクロロフェニルエステルがそれぞれ、
収率の点で優れている。カルボキシル基の活性化反応の
反応溶媒としては、ジメチルホルムアミドが溶解性の点
で優れている。製造中間体はカラムクロマトグラフィー
や再結晶法により、容易に単離、精製することができ
る。
カルボキシエチル誘導体又は一般式(5)で表わされる
チミンのカルボキシエチル誘導体はそれぞれの核酸塩基
をβ−プロピオラクトンと反応させて得られる。反応溶
媒としては、ジメチルホルムアミド(DMF)やエタノ
ールが適当である。核酸塩基カルボキシエチル誘導体の
カルボキシル基の活性保護基としては、エチルエステ
ル、ペンタクロロフェニルエステル、p−ニトロフェニ
ルエステルなどを用いることができる。なかでも、アデ
ニン誘導体ではpーニトロフェニルエステルが、チミン
誘導体ではペンタクロロフェニルエステルがそれぞれ、
収率の点で優れている。カルボキシル基の活性化反応の
反応溶媒としては、ジメチルホルムアミドが溶解性の点
で優れている。製造中間体はカラムクロマトグラフィー
や再結晶法により、容易に単離、精製することができ
る。
【0009】双頭型アデニン誘導体の両端にある二つの
アミノ保護基としては、無保護状態の水素原子、トリフ
ルオロアセチル基、塩化ジフェニルホスフィノチオイル
基を用いることができる。収率の大きさ、脱保護反応の
簡便性からトリフルオロアセチル基が望ましい。アミノ
基保護基は脱離したのち、最後に、溶媒を減圧留去し、
得られた粗生成物を再沈殿、再結晶によって分離精製す
ることによって高純度の粉末固体を得ることができる。
アミノ保護基としては、無保護状態の水素原子、トリフ
ルオロアセチル基、塩化ジフェニルホスフィノチオイル
基を用いることができる。収率の大きさ、脱保護反応の
簡便性からトリフルオロアセチル基が望ましい。アミノ
基保護基は脱離したのち、最後に、溶媒を減圧留去し、
得られた粗生成物を再沈殿、再結晶によって分離精製す
ることによって高純度の粉末固体を得ることができる。
【0010】一方、一般式(3)で表わされるジアミン
としては、例えば、1,10-ジアミノデカン、1,1
1-ジアミノウンデカン、1,12-ジアミノドデカンな
どを用いることができる。
としては、例えば、1,10-ジアミノデカン、1,1
1-ジアミノウンデカン、1,12-ジアミノドデカンな
どを用いることができる。
【0011】次に、本発明に従い、前記一般式(1)の
長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体を
製造するための好ましい態様について説明する。前記一
般式(2)または(5)の化合物と前記一般式(3)の
化合物の間のアミド結合形成反応におけるモル比として
は、一般式(3)の化合物1モル当り、一般式(2)又
は(5)の化合物2〜3モル、好ましくは2.1〜2.
2モルの割合である。反応温度は室温付近が望ましい。
溶媒としては、溶解性、反応速度の点から、ジメチルホ
ルムアミド、ジメチルスルホキシド(DMSO)、DM
F・ピリジン混合溶媒などが用いられる。このなかで
も、核酸塩基誘導体を良好に溶解するDMFが望まし
い。特に、前記一般式(2)又は(5)の化合物と一般
式(3)の化合物を完全に溶解させることが反応収率を
高めるために望ましい。反応時間としては、室温で1〜
3日を必要とする。反応終了後、溶媒を減圧留去し、得
られた粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー
によって分離精製することにより高純度の粉末固体を得
ることができる。
長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体を
製造するための好ましい態様について説明する。前記一
般式(2)または(5)の化合物と前記一般式(3)の
化合物の間のアミド結合形成反応におけるモル比として
は、一般式(3)の化合物1モル当り、一般式(2)又
は(5)の化合物2〜3モル、好ましくは2.1〜2.
2モルの割合である。反応温度は室温付近が望ましい。
溶媒としては、溶解性、反応速度の点から、ジメチルホ
ルムアミド、ジメチルスルホキシド(DMSO)、DM
F・ピリジン混合溶媒などが用いられる。このなかで
も、核酸塩基誘導体を良好に溶解するDMFが望まし
い。特に、前記一般式(2)又は(5)の化合物と一般
式(3)の化合物を完全に溶解させることが反応収率を
高めるために望ましい。反応時間としては、室温で1〜
3日を必要とする。反応終了後、溶媒を減圧留去し、得
られた粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー
によって分離精製することにより高純度の粉末固体を得
ることができる。
【0012】本発明の化合物は、例えば実測の元素分析
値が誤差範囲内で計算値と一致し、又、双頭型アデニン
誘導体では、赤外線吸収スペクトルが1541cm-1付近
にアミド基に由来する特性吸収(アミドII吸収帯)、1
601cm-1付近にプリン環アミノ基の変角振動に由来す
る特性吸収、1640〜1665cm-1にアミドカルボニ
ル基に由来する特性吸収(アミドI吸収帯)、3310
cm-1にアミドNH伸縮振動に由来する特性吸収を示す。
一方、双頭型チミン誘導体では、1549cm-1にアミド
基に由来する特性吸収(アミドII吸収帯)、1650cm
-1にアミドカルボニル基に由来する特性吸収(アミドI
吸収帯)、1687cm-1付近にピリミジン環カルボニル
基の特性吸収、3337cm-1にアミド及びイミドNH伸
縮振動に由来する特性吸収を示す。さらに、1H−NM
R(ジメチルスルホキシド−d6中、50℃)において
は、アデニン誘導体で、δ値が、1.2〜1.3ppm、
3.0ppm付近に長鎖アルキレン鎖のメチレン基に由来
するシグナル、2.7ppmおよび4.3ppm付近にプリン
塩基の9位に結合したカルボキシエチルプロトン、7.
0ppm付近にプリン塩基6位のアミノ基プロトン、7.
8ppm付近に連結鎖アミド基NHプロトン、8.0およ
び8.1ppm付近にプリン塩基2位、8位のプロトンに
由来するシグナルが、一方、チミン誘導体ではδ値が、
1.2〜1.3ppm、3.0ppm付近に長鎖アルキレン鎖
のメチレン基に由来するシグナル、2.4ppmおよび
3.8ppm付近にピリミジン塩基の1位に結合したカル
ボキシエチルプロトン、7.35ppm付近にピリミジン
塩基6位のプロトン、7.9ppm付近に連結鎖アミド基
NHプロトン、8.3ppm付近にピリミジン塩基3位の
イミドプロトンに由来するシグナルがそれぞれ観測でき
る。これらのことから、該化合物は、目的の長鎖アルキ
レン鎖で架橋された双頭型核酸塩基であると同定するこ
とができる。
値が誤差範囲内で計算値と一致し、又、双頭型アデニン
誘導体では、赤外線吸収スペクトルが1541cm-1付近
にアミド基に由来する特性吸収(アミドII吸収帯)、1
601cm-1付近にプリン環アミノ基の変角振動に由来す
る特性吸収、1640〜1665cm-1にアミドカルボニ
ル基に由来する特性吸収(アミドI吸収帯)、3310
cm-1にアミドNH伸縮振動に由来する特性吸収を示す。
一方、双頭型チミン誘導体では、1549cm-1にアミド
基に由来する特性吸収(アミドII吸収帯)、1650cm
-1にアミドカルボニル基に由来する特性吸収(アミドI
吸収帯)、1687cm-1付近にピリミジン環カルボニル
基の特性吸収、3337cm-1にアミド及びイミドNH伸
縮振動に由来する特性吸収を示す。さらに、1H−NM
R(ジメチルスルホキシド−d6中、50℃)において
は、アデニン誘導体で、δ値が、1.2〜1.3ppm、
3.0ppm付近に長鎖アルキレン鎖のメチレン基に由来
するシグナル、2.7ppmおよび4.3ppm付近にプリン
塩基の9位に結合したカルボキシエチルプロトン、7.
0ppm付近にプリン塩基6位のアミノ基プロトン、7.
8ppm付近に連結鎖アミド基NHプロトン、8.0およ
び8.1ppm付近にプリン塩基2位、8位のプロトンに
由来するシグナルが、一方、チミン誘導体ではδ値が、
1.2〜1.3ppm、3.0ppm付近に長鎖アルキレン鎖
のメチレン基に由来するシグナル、2.4ppmおよび
3.8ppm付近にピリミジン塩基の1位に結合したカル
ボキシエチルプロトン、7.35ppm付近にピリミジン
塩基6位のプロトン、7.9ppm付近に連結鎖アミド基
NHプロトン、8.3ppm付近にピリミジン塩基3位の
イミドプロトンに由来するシグナルがそれぞれ観測でき
る。これらのことから、該化合物は、目的の長鎖アルキ
レン鎖で架橋された双頭型核酸塩基であると同定するこ
とができる。
【0013】
【発明の効果】本発明の長鎖アルキレン鎖で架橋された
双頭型核酸塩基誘導体は、単独又は2成分を混合してエ
タノールなどの有機溶媒に極微量溶解させ、気水界面上
にラングミュアー・ブロジェット(LB)法により展開
し、適当な基板上に移しとることによって、分子オーダ
ーの厚さを有する有機超薄膜を得ることができる。さら
に、長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導
体の相補的成分の2成分を有機溶媒中に分散させ超音波
処理を施すことによって、単独では得られない結晶性集
合体を得ることができる。さらに、相補的成分の一方を
電極表面に配列固定化することにより、他の相補的核酸
塩基を含む化合物を電気的に検出することができる。本
発明の長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘
導体は、このような性質を有することから、例えば電子
・情報分野などにおけるマイクロ電子部品、医薬、化粧
品分野などにおける超薄膜や極微小構造体形成材料とし
て、あるいはセンサー用材料として、食品工業、農林業
などに有用であり、工業的利用価値が高い。
双頭型核酸塩基誘導体は、単独又は2成分を混合してエ
タノールなどの有機溶媒に極微量溶解させ、気水界面上
にラングミュアー・ブロジェット(LB)法により展開
し、適当な基板上に移しとることによって、分子オーダ
ーの厚さを有する有機超薄膜を得ることができる。さら
に、長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導
体の相補的成分の2成分を有機溶媒中に分散させ超音波
処理を施すことによって、単独では得られない結晶性集
合体を得ることができる。さらに、相補的成分の一方を
電極表面に配列固定化することにより、他の相補的核酸
塩基を含む化合物を電気的に検出することができる。本
発明の長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘
導体は、このような性質を有することから、例えば電子
・情報分野などにおけるマイクロ電子部品、医薬、化粧
品分野などにおける超薄膜や極微小構造体形成材料とし
て、あるいはセンサー用材料として、食品工業、農林業
などに有用であり、工業的利用価値が高い。
【0014】
【実施例】次に、本発明を実施例によりさらに詳細に説
明するが、本発明は、これらの例によってなんら限定さ
れるものではない。なお、薄層クロマトグラフィーのR
f値としては、クロロホルム/メタノール(容積比4/
1〜1/1)混合溶媒を展開溶媒としたときの値を示し
た。
明するが、本発明は、これらの例によってなんら限定さ
れるものではない。なお、薄層クロマトグラフィーのR
f値としては、クロロホルム/メタノール(容積比4/
1〜1/1)混合溶媒を展開溶媒としたときの値を示し
た。
【0015】参考例1 N,N−ジメチルホルムアミドにアデニン5.0g(3
7ミリモル)、β−プロピオラクトン4.3g(60ミ
リモル)と触媒量0.1g(2.5ミリモル)の水酸化
ナトリウムを加え、還流下で5時間加熱した。反応後、
減圧下で溶媒を完全に留去し、得られた白色の固体を水
から再結晶した。淡黄色の針状結晶として9−カルボキ
シエチルアデニン3.1g(収率=40%)を得た。こ
のものの物理的性質は次の通りである。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.2(クロロホル
ム/メタノール=1/1)融点:272〜278℃
7ミリモル)、β−プロピオラクトン4.3g(60ミ
リモル)と触媒量0.1g(2.5ミリモル)の水酸化
ナトリウムを加え、還流下で5時間加熱した。反応後、
減圧下で溶媒を完全に留去し、得られた白色の固体を水
から再結晶した。淡黄色の針状結晶として9−カルボキ
シエチルアデニン3.1g(収率=40%)を得た。こ
のものの物理的性質は次の通りである。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.2(クロロホル
ム/メタノール=1/1)融点:272〜278℃
【0016】参考例2 参考例1で得た9−カルボキシエチルアデニン0.4g
(1.9ミリモル)とP−ニトロフェノール0.3g
(2.2ミリモル)をピリジン20mlに溶解し、かき
混ぜながらP−ニトロフェノールトリフルオロ酢酸2.
0g(8.5ミリモル)を加え、50℃で2時間反応さ
せた。ついで溶媒を減圧下で完全に留去し、得られた固
体を少量のクロロホルムに溶かし、エーテルを加えて再
沈殿した。さらにクロロホルム/エーテル=1/1の混
合溶媒から再沈殿し、白色板状粉末としてP−ニトロフ
ェノール3−(6−トリフルオロアセトアミドプリン−
9−イル)プロピオネート0.6g(収率=75%)を
得た。このものの物理的性質は次の通りである。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.6(クロロホル
ム/メタノール=4/1)融点:166℃
(1.9ミリモル)とP−ニトロフェノール0.3g
(2.2ミリモル)をピリジン20mlに溶解し、かき
混ぜながらP−ニトロフェノールトリフルオロ酢酸2.
0g(8.5ミリモル)を加え、50℃で2時間反応さ
せた。ついで溶媒を減圧下で完全に留去し、得られた固
体を少量のクロロホルムに溶かし、エーテルを加えて再
沈殿した。さらにクロロホルム/エーテル=1/1の混
合溶媒から再沈殿し、白色板状粉末としてP−ニトロフ
ェノール3−(6−トリフルオロアセトアミドプリン−
9−イル)プロピオネート0.6g(収率=75%)を
得た。このものの物理的性質は次の通りである。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.6(クロロホル
ム/メタノール=4/1)融点:166℃
【0017】参考例3 参考例1における、アデニンの代わりにチミンを用い、
参考例1と同様な操作によって、1−カルボキシエチル
チミンを得た。このものの物理的性質は次の通りであ
る。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.4(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:205℃
参考例1と同様な操作によって、1−カルボキシエチル
チミンを得た。このものの物理的性質は次の通りであ
る。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.4(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:205℃
【0018】参考例4 参考例3で得られた1−カルボキシエチルチミン0.5
g(2.6ミリモル)をDMF10mlに溶解し、トリ
エチルアミン0.4ml、ペンタクロロフェニルトリク
ロロアセテート1.2g(2.9ミリモル)を加えて室
温で20時間撹拌した。反応液を減圧下で留去した後、
得られた固体を冷水で洗浄し、クロロホルム/メタノ−
ル=1/1の混合溶媒から再結晶した。無色針状結晶と
してペンタクロロフェニル 3−(2,4−ジヒドロキ
シ−5−メチルピリミジン−1−イル)プロピオネート
0.4g(収率=36%)を得た。このものの物理的性
質は次の通りである。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.8(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:220〜222℃
g(2.6ミリモル)をDMF10mlに溶解し、トリ
エチルアミン0.4ml、ペンタクロロフェニルトリク
ロロアセテート1.2g(2.9ミリモル)を加えて室
温で20時間撹拌した。反応液を減圧下で留去した後、
得られた固体を冷水で洗浄し、クロロホルム/メタノ−
ル=1/1の混合溶媒から再結晶した。無色針状結晶と
してペンタクロロフェニル 3−(2,4−ジヒドロキ
シ−5−メチルピリミジン−1−イル)プロピオネート
0.4g(収率=36%)を得た。このものの物理的性
質は次の通りである。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.8(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:220〜222℃
【0019】実施例1 参考例2で得たP−ニトロフェノール3−(6−トリフ
ルオロアセトアミドプリン−9−イル)プロピオネート
0.3g(0.75ミリモル)をDMF20mlに溶解
し、、イミダゾール0.06g(0.9ミリモル)、
1,12−ジアミノドデカン0.07g(0.35ミリ
モル)を加えた。室温で3日間かき混ぜた後、溶媒を減
圧下で留去し、得られた固体をエーテルで洗浄した。こ
の固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー[溶出
液:クロロホルム/メタノール=(9/1)から(4/
1)までグラジエント溶出]で精製することにより、
N,N’−ビス[3−(6−トリフルオロアセトアミド
プリン−9−イル)プロピオニル]1,12−ジアミノ
ドデカン0.1g(収率=40%)を得た。この、N,
N’−ビス[3−(6−トリフルオロアセトアミドプリ
ン−9−イル)プロピオニル]1,12−ジアミノドデ
カン0.1gを炭酸カリウム(7重量%)が溶解した水
/メタノール混合溶媒20ml(容積比=2/5)中で
一晩撹拌することにより、トリフルオロアセチル基を脱
保護した。溶媒を減圧下で留去し、得られた固体を水洗
いした後、エタノール/水混合溶媒(容積比=1/1)
から再沈殿することにより、N,N’−ビス[3−(6
−アミノプリン−9−イル)プロピオニル]1,12−
ジアミノドデカン0.07g(収率=93%)を白色粉
末として得た。このものの物理的性質及び元素分析値を
次に示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.4(クロロホル
ム/メタノール=2/1) 融点:229〜233℃ 元素分析値(C28H42O2N12・1/2H2Oとして) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 57.22 7.37 28.60 実測値(%) 57.64 7.32 28.64
ルオロアセトアミドプリン−9−イル)プロピオネート
0.3g(0.75ミリモル)をDMF20mlに溶解
し、、イミダゾール0.06g(0.9ミリモル)、
1,12−ジアミノドデカン0.07g(0.35ミリ
モル)を加えた。室温で3日間かき混ぜた後、溶媒を減
圧下で留去し、得られた固体をエーテルで洗浄した。こ
の固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー[溶出
液:クロロホルム/メタノール=(9/1)から(4/
1)までグラジエント溶出]で精製することにより、
N,N’−ビス[3−(6−トリフルオロアセトアミド
プリン−9−イル)プロピオニル]1,12−ジアミノ
ドデカン0.1g(収率=40%)を得た。この、N,
N’−ビス[3−(6−トリフルオロアセトアミドプリ
ン−9−イル)プロピオニル]1,12−ジアミノドデ
カン0.1gを炭酸カリウム(7重量%)が溶解した水
/メタノール混合溶媒20ml(容積比=2/5)中で
一晩撹拌することにより、トリフルオロアセチル基を脱
保護した。溶媒を減圧下で留去し、得られた固体を水洗
いした後、エタノール/水混合溶媒(容積比=1/1)
から再沈殿することにより、N,N’−ビス[3−(6
−アミノプリン−9−イル)プロピオニル]1,12−
ジアミノドデカン0.07g(収率=93%)を白色粉
末として得た。このものの物理的性質及び元素分析値を
次に示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.4(クロロホル
ム/メタノール=2/1) 融点:229〜233℃ 元素分析値(C28H42O2N12・1/2H2Oとして) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 57.22 7.37 28.60 実測値(%) 57.64 7.32 28.64
【0020】実施例2 実施例1における、1,12−ジアミノドデカンの代わ
りに、1,11−ジアミノウンデカンを用いた以外は、
実施例1と同様にして、N,N’−ビス[3−(6−ア
ミノプリン−9−イル)プロピオニル]1,11−ジア
ミノウンデカンを得た。このものの物理的性質及び元素
分析値を示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.6(クロロホル
ム/メタノール=2/1) 融点:224〜230℃ 元素分析値(C27H40N12O2として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 57.43 7.14 29.76 実測値(%) 57.55 7.05 29.88
りに、1,11−ジアミノウンデカンを用いた以外は、
実施例1と同様にして、N,N’−ビス[3−(6−ア
ミノプリン−9−イル)プロピオニル]1,11−ジア
ミノウンデカンを得た。このものの物理的性質及び元素
分析値を示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.6(クロロホル
ム/メタノール=2/1) 融点:224〜230℃ 元素分析値(C27H40N12O2として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 57.43 7.14 29.76 実測値(%) 57.55 7.05 29.88
【0021】実施例3 実施例1における、1,12−ジアミノドデカンの代わ
りに、1,10−ジアミノデカンを用いた以外は、実施
例1と同様にして、N,N’−ビス[3−(6−アミノ
プリン−9−イル)プロピオニル]1,10−ジアミノ
デカンを得た。このものの物理的性質及び元素分析値を
示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.7(クロロホル
ム/メタノール=2/1) 融点:220〜226℃ 元素分析値(C26H38N12O2として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 56.71 6.96 30.52 実測値(%) 56.79 6.80 30.75
りに、1,10−ジアミノデカンを用いた以外は、実施
例1と同様にして、N,N’−ビス[3−(6−アミノ
プリン−9−イル)プロピオニル]1,10−ジアミノ
デカンを得た。このものの物理的性質及び元素分析値を
示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.7(クロロホル
ム/メタノール=2/1) 融点:220〜226℃ 元素分析値(C26H38N12O2として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 56.71 6.96 30.52 実測値(%) 56.79 6.80 30.75
【0022】実施例4 DMF20mlに、参考例4で得たペンタクロロフェニ
ル 3−(2,4−ジヒドロキシ−5−メチルピリミジ
ン−1−イル)プロピオネート0.3g(0.7ミリモ
ル)と1,12−ジアミノドデカン0.07g(0.3
5ミリモル)を加えた。室温で一昼夜撹拌した後、溶媒
を減圧下で留去し、得られた固体をアセトンで洗浄し
た。この固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー
(溶出液:クロロホルム/メタノール=2/1)で精製
することにより、N,N’−ビス[3−(2,4−ジヒ
ドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イル)プロピオ
ニル]1,12−ジアミノドデカン0.1g(収率=5
0%)を白色粉末として得た。このものの物理的性質及
び元素分析値を次に示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.9(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:212〜214℃ 元素分析値(C28H44N6O6として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 59.98 7.91 14.99 実測値(%) 59.98 7.93 14.78
ル 3−(2,4−ジヒドロキシ−5−メチルピリミジ
ン−1−イル)プロピオネート0.3g(0.7ミリモ
ル)と1,12−ジアミノドデカン0.07g(0.3
5ミリモル)を加えた。室温で一昼夜撹拌した後、溶媒
を減圧下で留去し、得られた固体をアセトンで洗浄し
た。この固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー
(溶出液:クロロホルム/メタノール=2/1)で精製
することにより、N,N’−ビス[3−(2,4−ジヒ
ドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イル)プロピオ
ニル]1,12−ジアミノドデカン0.1g(収率=5
0%)を白色粉末として得た。このものの物理的性質及
び元素分析値を次に示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.9(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:212〜214℃ 元素分析値(C28H44N6O6として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 59.98 7.91 14.99 実測値(%) 59.98 7.93 14.78
【0023】実施例5 実施例4における、1,12−ジアミノドデカンの代わ
りに、1,11−ジアミノウンデカンを用いた以外は、
実施例3と同様にして、N,N’−ビス[3−(2,4
−ジヒドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イル)プ
ロピオニル]1,11−ジアミノウンデカンを得た。こ
のものの物理的性質及び元素分析値を示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.9(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:200〜204℃ 元素分析値(C27H42N6O6として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 59.32 7.74 15.37 実測値(%) 59.57 7.82 15.45
りに、1,11−ジアミノウンデカンを用いた以外は、
実施例3と同様にして、N,N’−ビス[3−(2,4
−ジヒドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イル)プ
ロピオニル]1,11−ジアミノウンデカンを得た。こ
のものの物理的性質及び元素分析値を示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.9(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:200〜204℃ 元素分析値(C27H42N6O6として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 59.32 7.74 15.37 実測値(%) 59.57 7.82 15.45
【0024】実施例6 実施例4における、1,12−ジアミノドデカンの代わ
りに、1,10−ジアミノデカンを用いた以外は、実施
例3と同様にして、N,N’−ビス[3−(2,4−ジ
ヒドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イル)プロピ
オニル]1,10−ジアミノデカンを得た。このものの
物理的性質及び元素分析値を示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.9(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:192〜195℃ 元素分析値(C26H40N6O6として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 58.63 7.57 15.78 実測値(%) 58.88 7.40 15.90
りに、1,10−ジアミノデカンを用いた以外は、実施
例3と同様にして、N,N’−ビス[3−(2,4−ジ
ヒドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イル)プロピ
オニル]1,10−ジアミノデカンを得た。このものの
物理的性質及び元素分析値を示す。 薄層クロマトグラフィーのRf値=0.9(クロロホル
ム/メタノール=1/1) 融点:192〜195℃ 元素分析値(C26H40N6O6として) C(%) H(%) N(%) 計算値(%) 58.63 7.57 15.78 実測値(%) 58.88 7.40 15.90
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (56)参考文献 特開 昭57−209297(JP,A) 特開 昭62−2164(JP,A) 特開 昭60−172994(JP,A) (58)調査した分野(Int.Cl.6,DB名) C07D 239/54 C07D 473/34 C07D 519/00 CA(STN) REGISTRY(STN)
Claims (3)
- 【請求項1】 下記一般式(1) X−(CH2)2−CONH−(CH2)n−NHCO−(CH2)2−X (1) (式中、Xはプリン塩基の9位を連結部位とするアデニ
ン残基またはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチ
ミン残基を示し、nは10〜12の整数である)で表わ
される長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘
導体。 - 【請求項2】 下記一般式(2) R1−A−CH2−CH2−COOR2 (2) (式中、Aは、プリン塩基6位のアミノ基が保護され、
9位にカルボキシエチル基が連結したアデニン残基を示
し、R1はアミノ保護基、R2はカルボキシル活性基であ
る)で表わされるアミノ基を保護したアデニン誘導体活
性エステルを、下記一般式(3) H2N−(CH2)n−NH2 (3) (式中、nは10〜12の整数である)で表わされる長
鎖ジアミンと反応させ、次いでアミノ保護基を脱離させ
ることを特徴とする、下記一般式(4) A−(CH2)2−CONH−(CH2)n−NHCO−(CH2)2−A (4) (式中、Aはプリン塩基の9位を連結部位とするアデニ
ン残基を示し、nは10〜12の整数である)で表わさ
れる長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導
体の製造方法。 - 【請求項3】 下記一般式(5) T−CH2−CH2−COOR3 (5) (式中、Tはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチ
ミン残基、R3はカルボキシル活性基である)で表わさ
れるチミン誘導体活性エステルを、下記一般式(3) H2N−(CH2)n−NH2 (3) (式中、nは10〜12の整数である)で表わされる長
鎖ジアミンと反応させることを特徴とする、下記一般式
(6) T−(CH2)2−CONH−(CH2)n−NHCO−(CH2)2−T (6) (式中、Tはピリミジン塩基の1位を連結部位とするチ
ミン残基を示し、nは10〜12の整数である)で表わ
される長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘
導体の製造方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP9113711A JP2976017B2 (ja) | 1997-05-01 | 1997-05-01 | 長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP9113711A JP2976017B2 (ja) | 1997-05-01 | 1997-05-01 | 長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH10298165A JPH10298165A (ja) | 1998-11-10 |
| JP2976017B2 true JP2976017B2 (ja) | 1999-11-10 |
Family
ID=14619228
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP9113711A Expired - Lifetime JP2976017B2 (ja) | 1997-05-01 | 1997-05-01 | 長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP2976017B2 (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP5207359B2 (ja) * | 2008-03-28 | 2013-06-12 | 独立行政法人産業技術総合研究所 | 金属配位型有機ナノチューブの大量製造法 |
-
1997
- 1997-05-01 JP JP9113711A patent/JP2976017B2/ja not_active Expired - Lifetime
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JPH10298165A (ja) | 1998-11-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US12195495B2 (en) | Nucleoside analogue, preparation method and application | |
| CA2627216C (en) | Polynucleotide labelling reagent | |
| Raddatz et al. | Hydrazide oligonucleotides: new chemical modification for chip array attachment and conjugation | |
| EP3735409B1 (en) | Enhancement of nucleic acid polymerization by aromatic compounds | |
| JP4012145B2 (ja) | ピロール−イミダゾールポリアミドの固相合成法 | |
| KR101072899B1 (ko) | 아미노산 스페이서가 결합된 펩티드 핵산의 합성 및 그의응용 | |
| JP2976017B2 (ja) | 長鎖アルキレン鎖で架橋された双頭型核酸塩基誘導体 | |
| EP1106619B1 (en) | Threading intercalator having oxidation-reduction activity | |
| US20050176647A1 (en) | Novel hairpin polyamide | |
| KR900001076B1 (ko) | N-[4-(3-아미노프로필)아미노부틸]-2,2-디히드록시에탄아미드의 제조방법 | |
| JPH0630574B2 (ja) | オリゴヌクレオチド‐西洋ワサビパーオキシダーゼ共有結合接合体 | |
| AU2005225589A1 (en) | Labelling reagents, methods for the synthesis of such reagents and methods for the detection of biological molecules | |
| CN107690427B (zh) | 一种制备恩杂鲁胺的新方法 | |
| JP2006519284A (ja) | 単官能化ペリレンテトラカルボン酸ビスイミド | |
| JPH04502474A (ja) | イセパミシンを調製するための改良法 | |
| CN117024485B (zh) | 一种2’-OMe腺苷的合成方法 | |
| CN117362373B (zh) | 一种dna编码化合物库构建2,4-咪唑烷二酮类化合物的方法 | |
| WO2007059912A1 (en) | Polynucleotide labelling reagent | |
| JPWO2002051797A1 (ja) | 新規な機能性ペプチド核酸モノマーとその製法 | |
| JPH05320122A (ja) | オリゴヌクレオチドの化学的合成法 | |
| JPH0692431B2 (ja) | ポリアセチルオリゴ糖誘導体 | |
| JPS6144854A (ja) | N−ジクロロアルキル安息香酸アミド及びその製造方法 | |
| JP3328694B2 (ja) | 含窒素複素環化合物の製造方法 | |
| JP4729739B2 (ja) | ピリジルベンズアミド化合物 | |
| CN115787103A (zh) | On-DNA苯并二氮杂环类化合物的合成方法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| S533 | Written request for registration of change of name |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313533 |
|
| R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
| EXPY | Cancellation because of completion of term |