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JP3407033B2 - Peptides having the function of suppressing gene transcription - Google Patents
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JP3407033B2 - Peptides having the function of suppressing gene transcription - Google Patents

Peptides having the function of suppressing gene transcription

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JP3407033B2
JP3407033B2 JP2000087540A JP2000087540A JP3407033B2 JP 3407033 B2 JP3407033 B2 JP 3407033B2 JP 2000087540 A JP2000087540 A JP 2000087540A JP 2000087540 A JP2000087540 A JP 2000087540A JP 3407033 B2 JP3407033 B2 JP 3407033B2
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Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、遺伝子の転写を抑
制する機能を有するペプチド、該ペプチドをコードする
遺伝子、該遺伝子を含有する組み換えベクター及び該組
み換えベクターを含む形質転換体に関する。
TECHNICAL FIELD The present invention relates to a peptide having a function of suppressing transcription of a gene, a gene encoding the peptide, a recombinant vector containing the gene, and a transformant containing the recombinant vector.

【0002】[0002]

【従来の技術】植物ホルモン、エチレンに応答するシス
制御エレメントに結合するタンパク質因子ERF(Ethy
lene Responsive Element binding Factor)は、ERF
ドメインと名付けたDNA結合ドメインを有する植物特
有の転写因子である。最近の研究から、ERFタンパク
質をコードする遺伝子は、マルチジーンファミリーを構
成していることが明らかになっている。これまでに、タ
バコ、シロイヌナズナ植物からERFドメインを有する
タンパク質因子をコードするcDNAが明らかにされて
いるが、本発明者らはさらに、タバコ、イネ、シロイヌ
ナズナのcDNAについて機能解析を行い、植物細胞内
でリプレッサーとして機能するドメインを明らかにし、
本発明を完成した。
BACKGROUND OF THE INVENTION The protein factor ERF (Ethy, which binds to cis-regulatory elements in response to the plant hormone ethylene)
lene Responsive Element binding Factor) is the ERF
It is a plant-specific transcription factor that has a DNA-binding domain named domain. Recent studies have revealed that the genes encoding the ERF proteins make up the multigene family. To date, cDNAs encoding protein factors having an ERF domain have been clarified from tobacco and Arabidopsis plants, but the present inventors have further performed functional analysis on cDNAs of tobacco, rice, and Arabidopsis thaliana to show intracellular Reveal the domain that acts as a repressor in
The present invention has been completed.

【0003】[0003]

【発明が解決しようとする課題】すなわち、本発明はD
NAに結合し遺伝子の転写を抑制する機能を有する高等
植物由来のペプチド、該ペプチドをコードする遺伝子、
該遺伝子を含有する組み換えベクター及び該組み換えベ
クターを含む形質転換体を提供することを目的とする。
That is, the present invention is D
A higher plant-derived peptide having a function of binding to NA and suppressing gene transcription, a gene encoding the peptide,
It is an object to provide a recombinant vector containing the gene and a transformant containing the recombinant vector.

【0004】[0004]

【課題を解決するための手段】本発明者らは、タバコ、
イネ、シロイヌナズナのcDNAについて機能解析を行
った結果、ERF因子のカルボキシ末端領域のアスパラ
ギン酸−ロイシン−アスパラギン(DLN)からなるモ
チーフを有する領域が、遺伝子の転写を抑制する機能を
有することを発見し、本発明を完成した。このようなD
LNモチーフを有し遺伝子の転写を抑制する機能を有す
るペプチドとしては、例えばタバコ由来のERF3に含
まれるペプチド;シロイヌナズナ由来のAtERF3
(配列番号1)、AtERF4、AtERF7及びAt
ERF8に含まれるペプチド;イネ由来のosERF3
に含まれるペプチドが挙げられる。
The present inventors have found that tobacco,
As a result of functional analysis of cDNA of rice and Arabidopsis thaliana, it was discovered that a region having a motif of aspartic acid-leucine-asparagine (DLN) in the carboxy-terminal region of ERF factor has a function of suppressing gene transcription. The present invention has been completed. D like this
Examples of the peptide having an LN motif and having a function of suppressing gene transcription include, for example, peptides contained in ERF3 derived from tobacco; AtERF3 derived from Arabidopsis thaliana.
(SEQ ID NO: 1), AtERF4, AtERF7 and At
Peptide contained in ERF8; osERF3 derived from rice
Examples include peptides included in.

【0005】[0005]

【発明の実施の形態】機能解析の方法は、それぞれのE
RF因子をコードしているcDNAから、タンパク質コ
ード領域を切り出し、これを酵母のGAL4転写因子の
DNA結合ドメインをコードしている領域と結合し、さ
らに植物細胞で機能するカリフラワーモザイクウイルス
35Sプロモーターの下流につないでエフェクタープラ
スミドを構築する。これをGAL4タンパク質結合部位
をプロモーター領域に結合した、ルシフェラーゼ遺伝子
からなるリポーター遺伝子と同時に、タバコ培養細胞あ
るいはシロイヌナズナ葉にエレクトロポーション法によ
り導入し、リポーター遺伝子であるルシフェラーゼ遺伝
子の活性を測定することによって調べた。
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
A protein coding region was excised from the cDNA encoding the RF factor, ligated to the region encoding the DNA binding domain of the yeast GAL4 transcription factor, and further downstream of the cauliflower mosaic virus 35S promoter that functions in plant cells. Construct an effector plasmid. This was investigated by measuring the activity of the luciferase gene, which is a reporter gene, by introducing it into the tobacco cultured cells or Arabidopsis thaliana leaves by the electroporation method at the same time as the reporter gene consisting of the luciferase gene having the GAL4 protein-binding site bound to the promoter region. It was

【0006】つぎに、リプレッサー因子に存在するリプ
レッサー機能を有する領域であるリプレッサードメイン
を同定するために、各遺伝子のコード領域を削除する方
法であるディリーション解析法を用いて、ERF因子の
どの領域にリプレッサードメインが存在するのかを調べ
た。
[0006] Next, in order to identify a repressor domain, which is a region having a repressor function existing in the repressor factor, the ERF factor was determined by using the deletion analysis method, which is a method of deleting the coding region of each gene. We investigated in which region of the protein the repressor domain resides.

【0007】[0007]

【実施例】アラビドプシス(和名シロイヌナズナ)AtER
F3遺伝子の単離 (プローブの作成)すでに塩基配列が決定されているタ
バコのERF3遺伝子のcDNAをクローニングしたプラスミド
pERF3を制限酵素EcoRIとNotIで消化し、アガロースゲル
電気泳動でERF3のcDNAを含む950bpのDNA断片を単離し
た。このDNA断片約50ngを100℃で10分変性した後、DN
Aラベリングキット(アマシャムファルマシア社製Ready
-To-GoDNA Labelling Beads)と5uLのアルファ32P-dCT
P(アマシャムファルマシア社AA0005)をもちいて標識
し、プローブを作成した。
[Example] Arabidopsis (Japanese name Arabidopsis) AtER
Isolation of F3 gene (preparation of probe) A plasmid cloned from the cDNA of tobacco ERF3 gene whose nucleotide sequence has been determined.
pERF3 was digested with restriction enzymes EcoRI and NotI, and a 950 bp DNA fragment containing ERF3 cDNA was isolated by agarose gel electrophoresis. After denaturing about 50 ng of this DNA fragment at 100 ° C for 10 minutes, DN
A labeling kit (Amersham Pharmacia Ready
-To-GoDNA Labeling Beads) and 5uL of alpha 32 P-dCT
A probe was prepared by labeling with P (Amersham Pharmacia AA0005).

【0008】(cDNAの作成とスクリーニング)アラビド
プシス植物体から葉を採取し、液体窒素中でミキサーを
用いて粉状に粉砕する。この粉砕した葉粉末10gに対し
20mLのRNA抽出バッファー(8M塩酸グアニジン、
20mM エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム(EDT
A)、20mM 2-(N-モルホリノ)エタンスルホン酸
(MES)、50mM メルカプトエタノール)と8mLのTE
溶液(10mM Tris-Cl pH8.0, 1mM EDTA)で飽和したフェ
ノールと2mLのクロロホルムを加えよく攪拌し、遠心
(10000g)して上清を回収する。上清に対して0.2倍容
量の1M酢酸と0.7倍容量のエタノールを加え-20℃で静
置した後、遠心(10000g)する。沈殿を2mLのTE溶液に
溶解し、500mLの10M塩化リチウム溶液を加え、0℃
で2時間静置し、遠心する。沈殿を70%のアルコール
で洗浄した後、風乾し、全RNA標品を得た。この全RANを
プロメガ社製Poly A Tract System 1000 を用いて全RNA
からmRNAのみを精製した。このmRNAを鋳型としてファル
マシア社製cDNAダイレクションクローニングキットを用
いて二本鎖cDNAを合成。これらをファルマシア社のプロ
トコールに従ってラムダgt11発現ベクターのEcoRI-NotI
制限酵素サイトに組み込んだのち、ラムダパッケージン
グキット(ファルマシア社)を用いてライブラリーを完
成させた。
(Preparation and screening of cDNA) Leaves are collected from Arabidopsis plants and ground into powder using a mixer in liquid nitrogen. 20 mL of RNA extraction buffer (8M guanidine hydrochloride,
20 mM disodium ethylenediaminetetraacetic acid (EDT
A), 20 mM 2- (N-morpholino) ethanesulfonic acid
(MES), 50 mM mercaptoethanol) and 8 mL TE
Phenol saturated with a solution (10 mM Tris-Cl pH8.0, 1 mM EDTA) and 2 mL of chloroform are added, stirred well, and centrifuged (10000 g) to collect the supernatant. 0.2 volumes of 1M acetic acid and 0.7 volumes of ethanol are added to the supernatant, and the mixture is left standing at -20 ° C and then centrifuged (10000g). Dissolve the precipitate in 2 mL of TE solution, add 500 mL of 10M lithium chloride solution, and
Let stand for 2 hours and centrifuge. The precipitate was washed with 70% alcohol and then air-dried to obtain a total RNA preparation. This total RAN was converted to total RNA using Poly A Tract System 1000 manufactured by Promega.
Only mRNA was purified from. Double-stranded cDNA is synthesized using this mRNA as a template and the Pharmacia cDNA Direction Cloning Kit. These are EcoRI-NotI of the lambda gt11 expression vector according to the Pharmacia protocol.
After incorporating into the restriction enzyme site, the library was completed using the lambda packaging kit (Pharmacia).

【0009】作成したアラビドプシスcDNAライブラリー
を組み込んだラムダファージがプレート(10cmx14cm)
一枚につき約4万個のプラークが得られる容量を、予め
0.5ccmLの10mMの硫酸マグネシウム溶液で縣濁しておい
た大腸菌1090株に縣濁して感染させ、選択するための薬
剤である50mg/Lのアンピシリン酸ナトリウムLB寒天培地
(1Lに対して10gトリプトン、10g塩化ナトリウム、5gイ
ーストイクストラクト、15g寒天)に展開し、37℃で培
養する。プラークが約2mmになった時点でニトロセル
ロース膜(S&S社製)に写し取り、変性液(0.2M NaOH,
1.5M NaCl)に浸した濾紙(ワットマン3MM)上に5分、中
和液(0.4M Tris-HCl, pH7.5, 2xSSC)に浸した濾紙上で
5分間静置した後、2xSSC溶液に5分間浸し、濾紙上で
20分間風乾する。
Lambda phage incorporating the prepared Arabidopsis cDNA library was plated (10 cm x 14 cm)
In advance, the capacity to obtain about 40,000 plaques
Suspend and infect Escherichia coli 1090 strain that had been suspended with 0.5 ccmL of 10 mM magnesium sulfate solution, 50 mg / L sodium ampicillate LB agar medium (10 g tryptone, 10 g per 1 L, which is a drug for selection) Develop in sodium chloride, 5g yeast extract, 15g agar) and incubate at 37 ℃. When the plaque is about 2 mm, it is transferred to a nitrocellulose membrane (S & S) and the denaturing solution (0.2 M NaOH,
After allowing to stand for 5 minutes on a filter paper (Whatman 3MM) soaked in 1.5M NaCl) and for 5 minutes on a filter paper soaked in a neutralizing solution (0.4M Tris-HCl, pH7.5, 2xSSC), add 5x to a 2xSSC solution. Soak for 1 minute and air dry on filter paper for 20 minutes.

【0010】80℃で120分乾燥させ、プラークDNAを
ニトロセルロース膜に固定する。ニトロセルロース膜
(10cmx14cm)1枚につき2mLのハイブリダイゼーシ
ョンバッファー(6xSSC, 0.05% skim milk)に浸し60
℃で2時間保温した後、100℃10分間加温し、急冷
によって変性させたERF3のプローブを含む新しいバッフ
ァーと交換し、60℃で12時間保温した。その後、フィ
ルター1枚につき5mLの0.1%のSDS(ドデシル硫酸ナ
トリウム)を含む2xSSC溶液で15分、0.1%のSDSを含む
0.5xSSCで15分、0.1%のSDSを含む0.2xSSCで15分洗
浄し、X線フィルムに感光させた。ERF3のプローブが結
合したプラークを寒天プレートから単離し、1mLのファ
ージバッファー(10mM Tris-HCl pH7.5, 10mM MgSO4)
に縣濁し、ファージを回収した後、上記のスクリーニン
グを3回繰り返し、単一プラークを得た。このプラーク
を再び大腸菌に感染させ増幅して、ファージよりDNAを
抽出し、cDNA領域を制限酵素EcoRIとNotIを用いて切り
出した。このDNA断片をプラスミドpT7D3(ファルマシア
社)の制限酵素EcoRI-NotI部位に組み込み、プラスミド
塩基配列の解析をおこなった。配列番号1に示すAtERF3
のcDNAの全長配列を持つプラスミドをpAtERF3と名付け
た。
The plaque DNA is fixed on a nitrocellulose membrane by drying at 80 ° C. for 120 minutes. Soak in 2mL of hybridization buffer (6xSSC, 0.05% skim milk) for each nitrocellulose membrane (10cmx14cm) 60
After incubating at 0 ° C. for 2 hours, it was heated at 100 ° C. for 10 minutes, replaced with a new buffer containing ERF3 probe denatured by rapid cooling, and incubated at 60 ° C. for 12 hours. Then, each filter has 5 mL of 2% SDS solution containing 0.1% SDS (sodium dodecyl sulfate) for 15 minutes, containing 0.1% SDS.
It was washed with 0.5xSSC for 15 minutes and 0.2xSSC containing 0.1% SDS for 15 minutes, and exposed to an X-ray film. ERF3 probe-bound plaques were isolated from agar plates and 1 mL phage buffer (10 mM Tris-HCl pH7.5, 10 mM MgSO4)
After the suspension, the phages were collected and the above screening was repeated 3 times to obtain a single plaque. This plaque was again infected with E. coli, amplified, DNA was extracted from the phage, and the cDNA region was excised using restriction enzymes EcoRI and NotI. This DNA fragment was inserted into the restriction enzyme EcoRI-NotI site of the plasmid pT7D3 (Pharmacia), and the plasmid nucleotide sequence was analyzed. AtERF3 shown in SEQ ID NO: 1
The plasmid having the full-length sequence of the cDNA of was named pAtERF3.

【0011】AtERF3リプレッションドメインの同定 エフェクタープラスミドの構築 (AtERF3全長を含むエフェクタープラスミドpGAL4DB-At
ERF3の構築:図1)クローンテック社製(Clontech社, U
SA)のプラスミドpBI221を制限酵素XhoIとSstIで切断
し、T4ポリメラーゼで平滑末端処理した後、アガロース
ゲル電気泳動でGUS遺伝子を除き、カリフラワーモザイ
クウイルス35Sプロモーター(以下CaMV35S)とノパリン
合成酵素遺伝子の転写終止領域(Nosターミネーター、
以下Nos-ter)を含む35S-Nosプラスミド断片DNAを得た。
クローンテック社製のpAS2-1ベクターを制限酵素HindII
Iで消化し、酵母 GAL4タンパク質のDNA 結合領域 ( 1-1
47 アミノ酸残基) をコードする 748 bp の DNA 断片
(以下GAL4DBD)をアガロースゲル電気泳動によって単離
した後、T4 DNAポリメラーゼで平滑末端化処理をした。
このGAL4DBDを含むDNA断片を、先ほどの35S-NosのDNAの
35SプロモーターとNosターミネータ間の平滑末端にした
部位に挿入し、35Sプロモーターに対して酵母 GAL4 タ
ンパク質のDNA 結合領域の ORF が順方向に並んでいる
ものを選抜してp35S-GAL4DBD ベクターを構築した。
Identification of AtERF3 repression domain Construction of effector plasmid (effector plasmid containing the full length AtERF3 pGAL4DB-At
Construction of ERF3: Figure 1) Clontech (Clontech, U
(SA) plasmid pBI221 is cleaved with restriction enzymes XhoI and SstI, blunt-ended with T4 polymerase, the GUS gene is removed by agarose gel electrophoresis, and transcription of cauliflower mosaic virus 35S promoter (CaMV35S) and nopaline synthase genes is performed. End area (Nos terminator,
35S-Nos plasmid fragment DNA containing the following Nos-ter) was obtained.
Restriction enzyme HindII for pAS2-1 vector manufactured by Clontech
Digested with I, DNA binding region of yeast GAL4 protein (1-1
A 748 bp DNA fragment (hereinafter referred to as GAL4DBD) encoding 47 amino acid residues) was isolated by agarose gel electrophoresis and blunt-ended with T4 DNA polymerase.
The DNA fragment containing this GAL4DBD was used to convert the 35S-Nos DNA
The p35S-GAL4DBD vector was constructed by inserting into the blunt end site between the 35S promoter and the Nos terminator and selecting the one in which the ORF of the DNA binding region of the yeast GAL4 protein was aligned in the forward direction with respect to the 35S promoter.

【0012】AtERF3のcDNAプラスミドpAtERF3とGAL4DBD
と読み枠(フレーム)が一致するように設計した5末ア
ッパープライマーprimer1(配列番号3:AtERF3塩基配
列1-20に結合)GATGAGGAGAGGAAGAGGCTCと制限酵素SalI
部位を持つ3末ローワープライマーprimer2(配列番号
4:AtERF3塩基配列651-678に結合)GTCGACTTAGAGACGTA
GATCGGTACAGTGAAGを用いてAtERF3全タンパク質コード領
域(配列番号1:AtERF3塩基配列1-678; アミノ酸配列1
-225)をPCR法によって増幅し、DNA断片を得た。PCR反
応の条件は、変性反応94℃1分、アニール反応47℃2
分、伸長反応74℃1分を1サイクルとしてで25サイクル
おこなった。以下全てのPCR反応は同じ条件でおこなっ
た。得たDNA断片を制限酵素SalIで消化した後、アガロ
ース電気泳動によって目的とするDNA断片を単離した。
このAtERF3をコードするDNA断片を、制限酵素SmaIとSal
Iで予め消化しておいた35S-GAL4DBDプラスミドに組み込
み、エフェクタープラスミドpGALDB-AtERF3を構築し
た。このエフェクタープラスミドpGALDB-AtERF3を構築
する手順を図1に示した。
AtERF3 cDNA plasmids pAtERF3 and GAL4DBD
5 terminal upper primer primer1 (SEQ ID NO: 3: bound to AtERF3 nucleotide sequence 1-20) GATGAGGAGAGGAAGAGGCTC and restriction enzyme SalI designed to match the reading frame
3rd lower primer having a site primer2 (SEQ ID NO: 4: bound to AtERF3 nucleotide sequence 651-678) GTCGACTTAGAGACGTA
Using GATCGGTACAGTGAAG, AtERF3 whole protein coding region (SEQ ID NO: 1: AtERF3 nucleotide sequence 1-678; amino acid sequence 1
-225) was amplified by the PCR method to obtain a DNA fragment. The conditions of PCR reaction are denaturation reaction 94 ° C for 1 minute, annealing reaction 47 ° C 2
The extension reaction was carried out for 25 cycles by setting the extension reaction at 74 ° C. for 1 minute as one cycle. Hereinafter, all PCR reactions were performed under the same conditions. The obtained DNA fragment was digested with the restriction enzyme SalI, and then the target DNA fragment was isolated by agarose gel electrophoresis.
The DNA fragment encoding this AtERF3 was digested with the restriction enzymes SmaI and Sal.
The effector plasmid pGALDB-AtERF3 was constructed by incorporating it into the 35S-GAL4DBD plasmid previously digested with I. The procedure for constructing this effector plasmid pGALDB-AtERF3 is shown in FIG.

【0013】(AtERF3アミノ酸166/225を含むエフェク
タープラスミドpGAL-166/225AtERF3の構築)pAtERF3プ
ラスミドとGAL4DBDをコードするフレームと読み枠が一
致するように設計した5末アッパープライマーprimer3
(配列番号5:結合部位AtERF3塩基配列495-518)TCCGG
AGGATTGTCACAGCGATTGと制限酵素SalI部位を持つ3末ロ
ーワープライマーprimer2(配列番号4:結合部位AtERF
3塩基配列 651-678)GTCGATTAGAGACGTAGATCGGTACAGTGAA
Gを用いてAtERF3のアミノ酸配列166/225コード領域に該
当する塩基配列496-678の領域を含むDNA断片をPCR法に
よって得た。このDNA断片を制限酵素SalIで消化し、ア
ガロース電気泳動によって目的とするDNA断片を単離し
た。このAtERF3のアミノ酸配列166/225にをコードするD
NA断片(DNA領域496-678)を、制限酵素SmaIとSalIで予め
消化しておいた35S-GAL4DBDプラスミドに組み込み、エ
フェクタープラスミドpGAL-166/225AtERF3を構築した。
(Construction of Effector Plasmid pGAL-166 / 225AtERF3 Containing AtERF3 Amino Acids 166/225) pAtERF3 plasmid and the 5th terminal upper primer designed to match the reading frame with GAL4DBD primer3
(SEQ ID NO: 5: binding site AtERF3 nucleotide sequence 495-518) TCCGG
Lower terminal primer primer2 with AGGATTGTCACAGCGATTG and restriction enzyme SalI site (SEQ ID NO: 4: binding site AtERF
3 nucleotide sequence 651-678) GTCGATTAGAGACGTAGATCGGTACAGTGAA
Using G, a DNA fragment containing the region of nucleotide sequence 496-678 corresponding to the amino acid sequence 166/225 coding region of AtERF3 was obtained by the PCR method. This DNA fragment was digested with the restriction enzyme SalI, and the target DNA fragment was isolated by agarose electrophoresis. D coding for this AtERF3 amino acid sequence 166/225
The NA fragment (DNA region 496-678) was incorporated into the 35S-GAL4DBD plasmid that had been previously digested with the restriction enzymes SmaI and SalI to construct the effector plasmid pGAL-166 / 225AtERF3.

【0014】(レポーター遺伝子の構築:図2及び図
3) プラスミドpUC18 を制限酵素EcoRIとSstI で消化する。
pBI221 (クローンテック社)を 制限酵素EcoRIと Sst
Iで消化し、Nos-ter (nopaline synthase terminator)
を領域含む270bpのDNA断片を挿入するアガロースゲル電
気泳動によって単離する。得られた断片を制限酵素EcoR
IとSstI で消化しておいたプラスミドpUC18 のEcoRI-Ss
tI部位に挿入する。カリフラワーモザイクウイルス35S
プロモーターTATAボックスを含む相補鎖のDNA1(配列
番号6)AGCTTAGATCTGCAAGACCCTTCCTCTATATAAGGAAGTTCA
TTTCATTTGGAGAGGACACGCTG及びDNA2(配列番号7)GATC
CAGCGTGTCCTCTCCAAATGAAATGAACTTCCTTATATAGAGGAAGGGTC
TTGCAGATCTAを合成する。合成したDNAを90℃2分加熱し
た後、60℃で1時間加熱し、その後室温(25℃)で
2時間静置してアニーリングさせ2本鎖を形成させる。
Nos-terを持つpUC18プラスミドを制限酵素 HindIIIと B
amHI で消化する。合成した2本鎖DNAをpUC18のHindIII
-BamHI部位に挿入し、TATA-boxとNos-terを含むプラス
ミドを構築する。上記の手順は、図2に示した。
(Construction of Reporter Gene: FIG. 2 and FIG. 3) The plasmid pUC18 is digested with restriction enzymes EcoRI and SstI.
pBI221 (Clontech) with restriction enzymes EcoRI and Sst
Digested with I, Nos-ter (nopaline synthase terminator)
It is isolated by agarose gel electrophoresis which inserts a 270 bp DNA fragment containing the region. The resulting fragment is the restriction enzyme EcoR
EcoRI-Ss of plasmid pUC18 digested with I and SstI
Insert at tI site. Cauliflower mosaic virus 35S
Complementary strand DNA1 containing the promoter TATA box (SEQ ID NO: 6) AGCTTAGATCTGCAAGACCCTTCCTCTATATAAGGAAGTTCA
TTTCATTTGGAGAGGACACGCTG and DNA2 (SEQ ID NO: 7) GATC
CAGCGTGTCCTCTCCAAATGAAATGAACTTCCTTATATAGAGGAAGGGTC
Synthesize TTGCAGATCTA. The synthesized DNA is heated at 90 ° C. for 2 minutes, then at 60 ° C. for 1 hour, and then left standing at room temperature (25 ° C.) for 2 hours to anneal to form a double strand.
The pUC18 plasmid containing Nos-ter was digested with restriction enzymes HindIII and B
Digest with amHI. Synthesized double-stranded DNA was used for HindIII of pUC18
-Insert at the BamHI site to construct a plasmid containing TATA-box and Nos-ter. The above procedure is shown in FIG.

【0015】このプラスミドを制限酵素SstIで消化し、
T4 DNA ポリメラーゼで平滑末端化処理をおこなう。ホ
タル・ルシフェラーゼ遺伝子(LUC)をもつプラスミドベ
クター PGV-CS2 (東洋インキ社製)を 制限酵素XbaI と
NcoIで消化し、T4 DNA ポリメラーゼで平滑末端化処理
をおこなった後、アガロースゲル電気泳動によって、ル
シフェラーゼ遺伝子を含む 1.65 kb の DNA 断片を単離
精製した。このDNA断片を上記のTATAボックスとNosター
ミネーターを含むプラスミドに挿入しTATA-LUC リポー
ター遺伝子を構築した。酵母の GAL4 タンパク質のDN
A結合配列を5コピー持つプラスミド pG5CAT(Clontech
社製) を 制限酵素SmaIと XbaIで消化し、T4 DNA ポリ
メラーゼで平滑末端化処理をおこなった後、5コピーの
GAL4 タンパク質のDNA結合配列含むDNA 断片をアガ
ロースゲル電気泳動で精製した。TATA-LUC ベクターを
制限酵素BglIIで消化し、T4 DNA ポリメラーゼで平滑末
端化処理をおこう。この部位に平滑末端化した5コピー
の GAL4 タンパク質のDNA結合配列含む DNA 断片を
挿入し、得られたプラスミドのうち GAL4 タンパク質の
DNA結合配列が順方向に向いているものを選抜し、リ
ポーター遺伝子GAL4-LUC を構築した。(図3参照)
This plasmid was digested with the restriction enzyme SstI,
Blunt end with T4 DNA polymerase. Plasmid vector PGV-CS2 (manufactured by Toyo Ink Co.) containing the firefly luciferase gene (LUC) was used as restriction enzyme XbaI.
After digestion with NcoI and blunt end treatment with T4 DNA polymerase, a 1.65 kb DNA fragment containing the luciferase gene was isolated and purified by agarose gel electrophoresis. This DNA fragment was inserted into the above plasmid containing the TATA box and Nos terminator to construct a TATA-LUC reporter gene. DN of yeast GAL4 protein
Plasmid pG5CAT (Clontech, which has 5 copies of A-binding sequence)
Digested with restriction enzymes SmaI and XbaI and blunt-ended with T4 DNA polymerase.
The DNA fragment containing the DNA binding sequence of GAL4 protein was purified by agarose gel electrophoresis. Digest the TATA-LUC vector with the restriction enzyme BglII and blunt end it with T4 DNA polymerase. A blunt-ended 5 copies DNA fragment containing the DNA-binding sequence of GAL4 protein was inserted into this site, and those having the DNA-binding sequence of GAL4 protein in the forward direction were selected from the obtained plasmids. -Builded LUC. (See Figure 3)

【0016】(レファレンス遺伝子の構築)ウミシイタ
ケ由来のルシフェラーゼ遺伝子をもつプロメガ社製カセ
ットベクター pRL-null を 制限酵素NheIと XbaI 制限
酵素で切断し、T4 DNA ポリメラーゼで平滑末端化処理
を行った後、アガロースゲル電気泳動で ウミシイタケ
・ルシフェラーゼ遺伝子を含む 948 bp の DNA 断片を
精製する。この DNA 断片をエフェクタープラスミドの
構築の際に用いたGUS遺伝子を除いたpBI221ベクターのG
US遺伝子があった領域にに挿入する。得られたプラスミ
ドのうち、ウミシイタケ・ルシフェラーゼ遺伝子がが順
方向に向いているものを選抜する(pPTRL の構築)。
(Construction of Reference Gene) A cassette vector pRL-null manufactured by Promega which has a luciferase gene derived from Renilla is cut with restriction enzymes NheI and XbaI and blunt-ended with T4 DNA polymerase, and then agarose. Purify a 948 bp DNA fragment containing the Renilla luciferase gene by gel electrophoresis. This DNA fragment was used in the construction of the effector plasmid.
Insert in the region where the US gene was. From the obtained plasmids, those in which the Renilla luciferase gene is oriented in the forward direction are selected (construction of pPTRL).

【0017】(レポーター遺伝子の活性測定法)タバコ
培養細胞プロトプラストにリポーター遺伝子とエフェク
タープラスミドをエレクトロポレーション法を用いて導
入し、エフェクターの効果をリポーター遺伝子の活性を
測定することによって調べた。 (プロトプラストの調製法)100 mL の MS 培地 (ムラ
シゲ・スクーグ培地用混合塩類、日本製薬社製 、3%シ
ョ糖、0.2 g/L KH2PO4, 0.2 g/L m-inositol, 2 mg/L g
lycine, 1 mg/L 塩酸チアミン、0.2 mg/L 2, 4-D, pH
を 5.8 に調節する) に7日間培養した タバコ培養細胞
BY-2 の前培養液3mlを加えて 26℃で3日間暗所で
培養した細胞を金属製のメッシュ(目の開きが 125 mm,
東京スクリーン社製)濾過回収し、0.4M マニトールを
含む MS 培地 で細胞を洗浄する。 洗浄した細胞を 25
mL の 0.4 M マニトールを含む MS 培地 に懸濁して1
0分間室温で放置3,000 rpm で1分間遠心して細胞を回
収する。この細胞を 20 mL の1%セルラーゼ(オノヅ
カRS, )と 0.1%ペクトリアーゼ Y-23(セイシン社
製)を含む MS 培地に細胞を再懸濁して、26℃で 90 分
間暗所で 60 rpm で回転振とうしながら細胞壁を消化す
る。その後、1,000 rpm で5分間遠心してプロトプラス
トを回収する。
(Method for measuring the activity of reporter gene) The reporter gene and effector plasmid were introduced into protoplasts of cultured tobacco cells by electroporation, and the effect of the effector was examined by measuring the activity of the reporter gene. (Protoplast preparation method) 100 mL of MS medium (mixed salts for Murashige-Skoog medium, Nippon Pharmaceutical Co., Ltd., 3% sucrose, 0.2 g / L KH2PO4, 0.2 g / L m-inositol, 2 mg / L g
lycine, 1 mg / L thiamine hydrochloride, 0.2 mg / L 2, 4-D, pH
To 5.8) cultured tobacco cells for 7 days
By adding 3 ml of BY-2 preculture medium and culturing the cells in the dark at 26 ° C for 3 days, the cells were made of a metal mesh (openness of 125 mm,
(Tokyo Screen) Collect by filtration and wash the cells with MS medium containing 0.4M mannitol. Washed cells 25
Suspend in 1 mL of MS medium containing 0.4 M mannitol.
Leave at room temperature for 0 minutes Centrifuge at 3,000 rpm for 1 minute to collect cells. The cells were resuspended in 20 mL of MS medium containing 1% cellulase (Onozuka RS,) and 0.1% pectolyase Y-23 (manufactured by Seishin) and spun at 60 rpm in the dark for 90 minutes at 26 ° C. Digest the cell wall with shaking. Then, centrifuge at 1,000 rpm for 5 minutes to collect protoplasts.

【0018】(エレクトロポレーションによる遺伝子導
入) 上記で得たプロトプラストを濃度が 2.5 X 10 細胞/
mL になるように エレクトロポレーション緩衝液 (5 m
M MES pH5.8, 70 mM KCl, 0.3 M マニトール)に再懸濁
する。 エレクトロポレーション用キュベット(ジーン
パルサーキュベット 0.4 cm elecrode, バイオラッド社
製)に構築したpGAL4-LUCレポーター遺伝子とエフェク
タープラスミド としてpGALDB-AtERF3あるいはそのデレ
ーションシリーズ(pGALDB-1/25AtERF3~pGALDB-204-225
AtERF3)のDNAを 各10ugと リファレンス遺伝子プラス
ミド1ugを 100 uL の 2X エレクトロポレーション緩衝
液(10 mM MES pH5.8, 140 mM KCl, 0.6 M マニトー
ル)を加えて、滅菌水で全量を 200 uL にする。 キュ
ベットに 600uL のプロトプラスト懸濁液を入れて、エ
レクトロポレーター(Genepulser II Electroporation
Systemバイオラッド社製)を用いて 600 V, 25 mF の条
件で DNA を導入する。導入後、キュベットからプロト
プラストを1,000 rpm で5分間遠心して回収し、 5 mL
の 0.4 M マニトールを含む MS 培地 にプロトプラスト
を再懸濁して、 26℃で6時間暗所で静置した後、レポ
ーター遺伝子の活性を測定した。
(Gene Transfer by Electroporation) The protoplasts obtained above were used at a concentration of 2.5 × 10 6 cells /
Electroporation buffer (5 m
Resuspend in M MES pH5.8, 70 mM KCl, 0.3 M mannitol). PGAL4-LUC reporter gene constructed in a cuvette for electroporation (Gene Pulcer cuvette 0.4 cm elecrode, manufactured by Bio-Rad) and pGALDB-AtERF3 as an effector plasmid or its deletion series (pGALDB-1 / 25AtERF3 to pGALDB-204-225)
AtERF3) DNA was added at 10 ug and reference gene plasmid 1 ug at 100 uL of 2X electroporation buffer (10 mM MES pH5.8, 140 mM KCl, 0.6 M mannitol), and the total volume was made up to 200 uL with sterilized water. To do. Add 600 uL of protoplast suspension to the cuvette and place it in an electroporator (Genepulser II Electroporation).
System Bio-Rad) is used to introduce DNA under the conditions of 600 V and 25 mF. After the introduction, collect the protoplasts from the cuvette by centrifugation at 1,000 rpm for 5 minutes, and collect 5 mL.
The protoplasts were resuspended in MS medium containing 0.4 M mannitol, and the reporter gene activity was measured after standing at 26 ° C. for 6 hours in the dark.

【0019】(ルシフェラーゼ活性測定)6時間静置し
たプロトプラスト懸濁液を 1 mL 採取して、2,000 rpm
で3 分間遠心してプロトプラストを回収した後、 Dual-
LuciferaseTMReporter Assay System (Promega 社製)
に添付されている Passive Lysis Buffer 50 uL に懸
濁する。プロトプラストを破砕した後、遠心して上清を
回収する。この細胞抽出液を5 uL 用いて Dual-Lucifer
aseTMReporter Assay System (Promega 社製)とルミネ
ッセンスリーダー(BLR-201, アロカ社製)を用いてル
シフェラーゼ活性測定を行なった。ホタル・ルシフェラ
ーゼおよびウミシイタケ・ルシフェラーゼ活性の測定を
測定キットの説明書に従って 10 秒間の発光を積分モー
ドでカウントした。リファレンス遺伝子の活性値ををリ
ポーター遺伝子の活性値で割り、その相対値であるRela
tive luchifarase activityを測定値として求めた。エ
フェクターを入れない場合の相対値を100として、エフ
ェクタープラスミドを同時に細胞に導入したときにリポ
ーター遺伝子の活性値の変動によってエフェクターの効
果を調査した。すなわち、pGAL4-LUCレポーター遺伝子
とpGALDB-AtERF3エフェクタープラスミドを導入したと
きのリポーターの活性値を減少させることから、pGALDB
-AtERF3は、レポーター遺伝子の活性を抑制する効果
(リプレッサー機能)があることを示している。以下、
リポーターの活性値を測定して、リポーターの相対活性
値が100以下になる場合に、導入したエフェクターに
はリプレッサー機能が存在するので、どのエフェクター
がリプレッサーとして機能するのかをレポーターの活性
を測定することによって調べた。
(Measurement of luciferase activity) 1 mL of the protoplast suspension, which had been allowed to stand for 6 hours, was sampled at 2,000 rpm.
After collecting the protoplasts by centrifugation for 3 minutes at
LuciferaseTM Reporter Assay System (Promega)
Suspend in 50 uL of Passive Lysis Buffer attached to. After crushing the protoplasts, centrifuge and collect the supernatant. Use 5 uL of this cell extract for Dual-Lucifer
Luciferase activity was measured using aseTMReporter Assay System (Promega) and luminescence reader (BLR-201, Aloka). For the measurement of firefly luciferase and Renilla luciferase activities, luminescence for 10 seconds was counted in integration mode according to the instruction of the measurement kit. The activity value of the reference gene is divided by the activity value of the reporter gene, and the relative value Rela
The tive luchifarase activity was obtained as a measurement value. When the effector plasmid was not introduced, the relative value was set to 100, and the effect of the effector was investigated by the fluctuation of the activity value of the reporter gene when the effector plasmid was simultaneously introduced into the cells. That is, since the activity value of the reporter when the pGAL4-LUC reporter gene and the pGALDB-AtERF3 effector plasmid was introduced was reduced, pGALDB
-AtERF3 has the effect of suppressing the activity of the reporter gene (repressor function). Less than,
When the relative activity value of the reporter is 100 or less by measuring the activity value of the reporter, the introduced effector has a repressor function, so the activity of the reporter is measured by determining which effector functions as the repressor. Investigated by doing.

【0020】(リプレッサードメインの同定)アラビド
プシスAtERF3の遺伝子の転写制御に関わる機能を解析す
るため、リポーター遺伝子pGAL4-LUCとpGALDB-AtERF3を
タバコ培養細胞より調整したプロトプラストにエレクト
ロポレーション法によって導入し、リポーター遺伝子の
活性を調べた。その結果、pGAL-AtERF3エフェクター
は、リポーター遺伝子の活性をエフェクターを導入しな
いリポーター遺伝子のみの場合(コントロール)に比べ
80%に減少させた。対照実験としておこなったAtERF3
のコード領域を含まないp35S-GALDBDは、リポーター遺
伝子の活性に影響を及ぼさなかった。このことは、AtER
F3が転写を抑制するリプレッサーとして機能しているこ
とを示している。
(Identification of repressor domain) In order to analyze the function involved in the transcriptional regulation of Arabidopsis AtERF3 gene, reporter genes pGAL4-LUC and pGALDB-AtERF3 were introduced into protoplasts prepared from cultured tobacco cells by electroporation. , The activity of the reporter gene was investigated. As a result, the pGAL-AtERF3 effector reduced the activity of the reporter gene to 80% as compared with the case of using the reporter gene alone without introducing the effector (control). AtERF3 performed as a control experiment
P35S-GALDBD, which does not contain the coding region of Escherichia coli, did not affect the activity of the reporter gene. This is AtER
It shows that F3 functions as a repressor that suppresses transcription.

【0021】次に、AtERF3遺伝子のタンパク質コード領
域をディリーションしたDAN断片もつエフェクタープラ
スミド、pGAL-166/225AtERF3が、リポーター遺伝子の活
性を抑制する機能をもつかを調べた。pGAL-166/225AtER
F3エフェクタープラスミドをリポーター遺伝子と共にタ
バコ培養細胞に導入し、リポーター遺伝子の活性を測定
した結果、pGAL-166/225AtERF3エフェクターは、pGALDB
-AtERF3を導入した場合と同様に、レポーター遺伝子の
活性をコントロールに比べ、約50%に抑えるリプレッ
サー機能があることが示された。(図4B)。この結果
から、AtERF3のリプレッサー機能を持つ領域(リプレッ
ションドメイン)は、AtERF3のアミノ酸配列、166/225
に存在することを明らかにした(図4B)。この60ア
ミノ酸からなる領域のアミノ酸配列を配列番号2に示し
た。
Next, it was examined whether pGAL-166 / 225AtERF3, an effector plasmid having a DAN fragment in which the protein coding region of the AtERF3 gene was deleted, has a function of suppressing the activity of the reporter gene. pGAL-166 / 225AtER
The F3 effector plasmid was introduced into tobacco cultured cells together with the reporter gene, and the activity of the reporter gene was measured.As a result, pGAL-166 / 225AtERF3 effector was identified as pGALDB.
Similar to the case of introducing -AtERF3, it was shown that there is a repressor function that suppresses the activity of the reporter gene to about 50% as compared with the control. (Fig. 4B). From this result, the region having the repressor function of AtERF3 (repression domain) is the amino acid sequence of AtERF3, 166/225.
It was revealed that it exists in (Fig. 4B). The amino acid sequence of this 60 amino acid region is shown in SEQ ID NO: 2.

【0022】本発明の遺伝子の転写を抑制する機能を有
するペプチドは、例えばガン遺伝子の転写調節領域に特
異的に結合するDNA結合タンパク質と融合させて、細
胞内で発現させることにより、ガン遺伝子の発現を効率
的に抑制することが可能となる。また、リプレッサー機
能は調べたところ遺伝子に非特異的であるが、DNAと
の結合が必要であることから、特定のDNAに結合する
DNA結合ドメインと融合することにより、遺伝子特異
的あるいは非特異的に転写を抑制することが可能とな
る。このことによって、例えば色素代謝系の酵素をコー
ドする遺伝子の発現を制御することが可能となり、これ
までには得られなかった色違いの花弁を有する花を創作
することができる。また、アレルゲンとなるタンパク質
の発現を抑制することによって、アレルゲンの少ない食
物の生産も可能となる。
The peptide having the function of suppressing the transcription of the gene of the present invention is fused with a DNA-binding protein that specifically binds to the transcriptional regulatory region of the oncogene, and expressed in the cell to express the oncogene. The expression can be efficiently suppressed. In addition, the repressor function was nonspecific to the gene when examined, but it is necessary to bind to DNA. Therefore, by fusion with a DNA binding domain that binds to specific DNA, the repressor function may be gene-specific or non-specific. It is possible to suppress the transfer. This makes it possible, for example, to control the expression of a gene encoding an enzyme of the pigment metabolism system, and to create a flower having petals of different colors, which has never been obtained before. In addition, by suppressing the expression of the protein that becomes an allergen, it becomes possible to produce foods that are low in allergen.

【0023】[0023]

【配列表】 SEQUENCE LISTING <110>Secretary of Agency of Industrial Science and Technology <120>Novel repression domain of plant specific transcription factor <130> <160> 7 <210> 1 <211> 678 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <400>1 atg agg aga gga aga ggc tct tcc gcc gtc gcc gga cct acc gtc gtt 48 Met Arg Arg Gly Arg Gly Ser Ser Ala Val Ala Gly Pro Thr Val Val 5 10 15 gcc gcc atc aac gga tct gta aaa gaa atc aga ttc aga ggc gta agg 96 Ala Ala Ile Asn Gly Ser Val Lys Glu Ile Arg Phe Arg Gly Val Arg 20 25 30 aag aga cct tgg gga cga ttc gca gct gag atc cgt gat cca tgg aaa 144 Lys Arg Pro Trp Gly Arg Phe Ala Ala Glu Ile Arg Asp Pro Trp Lys 35 40 45 aaa gct cgt gtt tgg tta ggt act ttc gat tcc gcc gaa gaa gct gct 192 Lys Ala Arg Val Trp Leu Gly Thr Phe Asp Ser Ala Glu Glu Ala Ala 50 55 60 cgc gct tac gac tcc gcc gct cgt aac ctc cgt ggt cct aaa gcc aaa 240 Arg Ala Tyr Asp Ser Ala Ala Arg Asn Leu Arg Gly Pro Lys Ala Lys 65 70 75 80 act aat ttc ccc atc gat tct tct tct cct cct cct cct aat ctc cga 288 Thr Asn Phe Pro Ile Asp Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Asn Leu Arg 85 90 95 ttt aat cag att cgt aat caa aat caa aac caa gtc gat ccg ttt atg 336 Phe Asn Gln Ile Arg Asn Gln Asn Gln Asn Gln Val Asp Pro Phe Met 100 105 110 gac cac cgg tta ttc acc gac cat caa caa cag ttc ccg att gtt aac 384 Asp His Arg Leu Phe Thr Asp His Gln Gln Gln Phe Pro Ile Val Asn 115 120 125 cgg cct act agt agc agc atg agc agc acc gtt gaa tcg ttt agc gga 432 Arg Pro Thr Ser Ser Ser Met Ser Ser Thr Val Glu Ser Phe Ser Gly 130 135 140 ccc aga cct acg acg atg aaa ccg gcc acg acg aag aga tat cct aga 480 Pro Arg Pro Thr Thr Met Lys Pro Ala Thr Thr Lys Arg Tyr Pro Arg 145 150 155 160 act cca ccg gtt gtt ccg gag gat tgt cac agc gat tgc gat tcg tcg 528 Thr Pro Pro Val Val Pro Glu Asp Cys His Ser Asp Cys Asp Ser Ser 165 170 175 tcg tct gta atc gac gac gac gac gat atc gca tcg tct tca cgg cga 576 Ser Ser Val Ile Asp Asp Asp Asp Asp Ile Ala Ser Ser Ser Arg Arg 180 185 190 cgg aat ccg ccg ttt caa ttc gat ctt aat ttt cca ccg ttg gat tgt 624 Arg Asn Pro Pro Phe Gln Phe Asp Leu Asn Phe Pro Pro Leu Asp Cys 195 200 205 gtt gac ttg ttc aat ggc gct gat gat ctt cac tgt acc gat cta cgt 672 Val Asp Leu Phe Asn Gly Ala Asp Asp Leu His Cys Thr Asp Leu Arg 210 215 220 ctc taa 678 Leu 225 <210> 2 <211> 60 <212> RPT <213> Arabidopsis thaliana <400> 2 Pro Glu Asp Cys His Ser Asp Cys Asp Ser Ser Ser Ser Val Ile Asp 5 10 15 Asp Asp Asp Asp Ile Ala Ser Ser Ser Arg Arg Arg Asn Pro Pro Phe 20 25 30 Gln Phe Asp Leu Asn Phe Pro Pro Leu Asp Cys Val Asp Leu Phe Asn 35 40 45 Gly Ala Asp Asp Leu His Cys Thr Asp Leu Arg Leu 50 55 60 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA <400> 3 gatgaggaga ggaagaggct c <210> 4 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA <400> 4 gtcgacttag agacgtagat cggtacagtg aag <210> 5 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA <400> 5 tccggaggat tgtcacagcg attg <210> 6 <211> 65 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA <400> 6 agcttagatc tgcaagaccc ttcctctata taaggaagtt catttcattt ggagaggaca 10 20 30 40 50 60 cgctg 65 <210> 7 <211> <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA <400> 7 gatccagcgt gtcctctcca aatgaaatga acttccttat atagaggaag ggtcttgcag 10 20 30 40 50 60 atcta 65[Sequence list] SEQUENCE LISTING    <110> Secretary of Agency of Industrial Science and Technology    <120> Novel repression domain of plant specific transcription factor    <130>    <160> 7    <210> 1 <211> 678 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana    <400> 1 atg agg aga gga aga ggc tct tcc gcc gtc gcc gga cct acc gtc gtt 48 Met Arg Arg Gly Arg Gly Ser Ser Ala Val Ala Gly Pro Thr Val Val                 5 10 15    gcc gcc atc aac gga tct gta aaa gaa atc aga ttc aga ggc gta agg 96 Ala Ala Ile Asn Gly Ser Val Lys Glu Ile Arg Phe Arg Gly Val Arg             20 25 30    aag aga cct tgg gga cga ttc gca gct gag atc cgt gat cca tgg aaa 144 Lys Arg Pro Trp Gly Arg Phe Ala Ala Glu Ile Arg Asp Pro Trp Lys         35 40 45    aaa gct cgt gtt tgg tta ggt act ttc gat tcc gcc gaa gaa gct gct 192 Lys Ala Arg Val Trp Leu Gly Thr Phe Asp Ser Ala Glu Glu Ala Ala      50 55 60    cgc gct tac gac tcc gcc gct cgt aac ctc cgt ggt cct aaa gcc aaa 240 Arg Ala Tyr Asp Ser Ala Ala Arg Asn Leu Arg Gly Pro Lys Ala Lys 65 70 75 80    act aat ttc ccc atc gat tct tct tct cct cct cct cct aat ctc cga 288 Thr Asn Phe Pro Ile Asp Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Asn Leu Arg                 85 90 95    ttt aat cag att cgt aat caa aat caa aac caa gtc gat ccg ttt atg 336 Phe Asn Gln Ile Arg Asn Gln Asn Gln Asn Gln Val Asp Pro Phe Met             100 105 110    gac cac cgg tta ttc acc gac cat caa caa cag ttc ccg att gtt aac 384 Asp His Arg Leu Phe Thr Asp His Gln Gln Gln Phe Pro Ile Val Asn         115 120 125    cgg cct act agt agc agc atg agc agc acc gtt gaa tcg ttt agc gga 432 Arg Pro Thr Ser Ser Ser Met Ser Ser Thr Val Glu Ser Phe Ser Gly     130 135 140    ccc aga cct acg acg atg aaa ccg gcc acg acg aag aga tat cct aga 480 Pro Arg Pro Thr Thr Met Lys Pro Ala Thr Thr Lys Arg Tyr Pro Arg 145 150 155 160    act cca ccg gtt gtt ccg gag gat tgt cac agc gat tgc gat tcg tcg 528 Thr Pro Pro Val Val Pro Glu Asp Cys His Ser Asp Cys Asp Ser Ser                 165 170 175    tcg tct gta atc gac gac gac gac gat atc gca tcg tct tca cgg cga 576 Ser Ser Val Ile Asp Asp Asp Asp Asp Ile Ala Ser Ser Ser Arg Arg             180 185 190    cgg aat ccg ccg ttt caa ttc gat ctt aat ttt cca ccg ttg gat tgt 624 Arg Asn Pro Pro Phe Gln Phe Asp Leu Asn Phe Pro Pro Leu Asp Cys         195 200 205    gtt gac ttg ttc aat ggc gct gat gat ctt cac tgt acc gat cta cgt 672 Val Asp Leu Phe Asn Gly Ala Asp Asp Leu His Cys Thr Asp Leu Arg     210 215 220    ctc taa 678 Leu 225    <210> 2 <211> 60 <212> RPT <213> Arabidopsis thaliana    <400> 2 Pro Glu Asp Cys His Ser Asp Cys Asp Ser Ser Ser Ser Val Ile Asp                     5 10 15 Asp Asp Asp Asp Ile Ala Ser Ser Ser Arg Arg Arg Asn Pro Pro Phe                20 25 30 Gln Phe Asp Leu Asn Phe Pro Pro Leu Asp Cys Val Asp Leu Phe Asn         35 40 45 Gly Ala Asp Asp Leu His Cys Thr Asp Leu Arg Leu         50 55 60    <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence    <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA    <400> 3 gatgaggaga ggaagaggct c    <210> 4 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence    <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA    <400> 4 gtcgacttag agacgtagat cggtacagtg aag    <210> 5 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence    <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA    <400> 5 tccggaggat tgtcacagcg attg    <210> 6 <211> 65 <212> DNA <213> Artificial Sequence    <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA    <400> 6 agcttagatc tgcaagaccc ttcctctata taaggaagtt catttcattt ggagaggaca         10 20 30 40 50 60 cgctg     65    <210> 7 <211> <212> DNA <213> Artificial Sequence    <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer DNA    <400> 7 gatccagcgt gtcctctcca aatgaaatga acttccttat atagaggaag ggtcttgcag         10 20 30 40 50 60 atcta     65

【図面の簡単な説明】[Brief description of drawings]

【図1】プラスミドpBI221からpGAL4DB-AtERF3を構築す
る手順を示す図である。
FIG. 1 shows the procedure for constructing pGAL4DB-AtERF3 from plasmid pBI221.

【図2】レポーター遺伝子GAL4-LUC を構築する手順の
前半部を示す図である。
FIG. 2 shows the first half of the procedure for constructing the reporter gene GAL4-LUC.

【図3】図2に引き続きレポーター遺伝子GAL4-LUC を
構築する手順の後半部を示す図である。
FIG. 3 is a diagram showing the latter half of the procedure for constructing the reporter gene GAL4-LUC subsequent to FIG.

【図4】Aはリポーター遺伝子とエフェクタープラスミ
ドを示す図である。図において、5XGAL4: GAL4転写因子
DNA結合配列、TATA: CaMV35SプロモーターTATAボックス
を含む領域、LUC: ルシフェラーゼ遺伝子、CaMV 35S:
カリフラワーモザイクウイルス35Sタンパク質遺伝子プ
ロモーター、GAL4 DB:酵母GAL4転写因子DAN結合ドメイ
ンコード領域、Nos:ノパリン合成酵素遺伝子転写終止領
域を表す。BはAtERF3およびAtERF3のディリーションが
リポーター遺伝子の活性(Relative Activity)に及ぼす
影響 を示す図である。図において、左の数字(166/22
5)は、AtERF3のアミノ酸領域を示す。真ん中のボック
スは左の数字に該当するアミノ酸配列領域を示す。右の
グラフは、左の領域をもつエフェクタープラスミドを導
入したときのリポーター遺伝子の活性を示す。エフェク
ターを入れないときのリポーター遺伝子の活性を100と
した。AtERF3およびAtERF3ディリーションのエフェクタ
ーでアミノ酸配列166/225を持つエフェクターがリポー
ター遺伝子の活性を50%に減少させ、転写を抑制する
効果を持つことが示されている。
FIG. 4A is a diagram showing a reporter gene and an effector plasmid. In the figure, 5XGAL4: GAL4 transcription factor
DNA binding sequence, TATA: CaMV 35S promoter region containing TATA box, LUC: Luciferase gene, CaMV 35S:
Cauliflower mosaic virus 35S protein gene promoter, GAL4 DB: yeast GAL4 transcription factor DAN binding domain coding region, Nos: nopaline synthase gene transcription termination region. B is a figure which shows the influence which the deletion of AtERF3 and AtERF3 has on the activity (Relative Activity) of a reporter gene. In the figure, the number on the left (166/22
5) shows the amino acid region of AtERF3. The box in the middle indicates the amino acid sequence region corresponding to the number on the left. The graph on the right shows the activity of the reporter gene when an effector plasmid having the region on the left is introduced. The activity of the reporter gene when no effector was added was set to 100. It has been shown that the AtERF3 and AtERF3 deletion effectors having the amino acid sequence 166/225 reduce the activity of the reporter gene to 50% and have the effect of suppressing transcription.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI C12N 5/10 C12N 5/00 A (56)参考文献 The Plant Cell, 1995,Vol.7,p.173−182 Biochem.J.,1999,Vo l.339,p.111−117 The Journal of Bi ological Chemistr y,1999,Vol.274,No.41,p. 29500−259504 Mol Gen Genet,1997, Vol.253,No.5,p.553−561 (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12N 15/09 C12N 15/29 C07K 14/415 BIOSIS/WPI(DIALOG) PubMed SwissProt/PIR/GeneS eq GenBank/EMBL/DDBJ/G eneSeq─────────────────────────────────────────────────── ─── Continuation of the front page (51) Int.Cl. 7 Identification code FI C12N 5/10 C12N 5/00 A (56) References The Plant Cell, 1995, Vol. 7, p. 173-182 Biochem. J. , 1999, Vol. 339, p. 111-117 The Journal of Biological Chemistry, 1999, Vol. 274, No. 41, p. 29500-259504 Mol Gen Genet, 1997, Vol. 253, No. 5, p. 553-561 (58) Fields surveyed (Int.Cl. 7 , DB name) C12N 15/09 C12N 15/29 C07K 14/415 BIOSIS / WPI (DIALOG) PubMed SwissProt / PIR / GeneS eq GenBank / EMBL / DDBJ / GeneSeq

Claims (5)

(57)【特許請求の範囲】(57) [Claims] 【請求項1】 (a)配列番号1で表されるアミノ酸配
列からなるペプチド、又は(b)アミノ酸配列(a)に
おいて1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは
付加されたアミノ酸配列からなる遺伝子の転写を抑制す
る機能を有するペプチド。
1. A peptide comprising (a) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, or (b) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence (a). A peptide having the function of suppressing gene transcription.
【請求項2】 (a)配列番号2で表されるアミノ酸配
列からなるペプチド、又は(b)アミノ酸配列(a)に
おいて1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは
付加されたアミノ酸配列からなる遺伝子の転写を抑制す
る機能を有するペプチド。
2. A peptide comprising (a) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, or (b) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence (a). A peptide having the function of suppressing gene transcription.
【請求項3】 請求項1又は2に記載のペプチドをコー
ドする遺伝子。
3. A gene encoding the peptide according to claim 1 or 2.
【請求項4】 請求項3に記載の遺伝子を含有する組み
換えベクター。
4. A recombinant vector containing the gene according to claim 3.
【請求項5】 請求項4に記載の組み換えベクターを含
む形質転換体。
5. A transformant containing the recombinant vector according to claim 4.
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