JP4053591B2 - Recombinant swinepox virus - Google Patents
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Description
本出願は、1995年６月７日に提出された合衆国特許出願第08/480,640号、1995年６月７日に提出された合衆国特許出願第08/488,237号、1995年６月７日に提出された合衆国特許出願第08/472,679号および1995年１月１９日に提出された合衆国特許出願第08/375,992号の一部継続出願の一部継続出願である。これら親出願の内容は、本明細書の一部をなす参照文献として本願に組み込まれる。
本願の中には、括弧内のアラビア数字によって、幾つかの出版物が参照される。これら文献の完全な書誌的引用は明細書の最後、即ち、請求の範囲の直前に見られる。これらの文献の開示は、本明細書の一部をなす参照として本願に組み込まれる。
〔発明の背景〕
豚痘ウイルス（ＳＰＶ）はポックスウイルス族（Poxviridae）に属している。このグループに属しているウイルスは、宿主細胞中の細胞質中で特徴的に発育する大型の二本鎖ＤＮＡウイルスである。ＳＰＶは、スイポックスウイルス（Suipoxvirus）属の唯一のメンバーである。ＳＰＶは、幾つかの特徴によって、他のポリウイルスから区別される。ワクシニア等の他のポックスウイルスが宿主範囲が広いのに比較して、ＳＰＶは種特異性を示す（１８）。組識培養細胞系にＳＰＶを感染させたものと、他のポックスウイルスを感染させたものとでは劇的に異なる（２４）。ＳＰＶは、ワクシニア・ウイルスと抗原交叉反応を示さず、またオルソ、レポリ、アヴィ、昆虫ポックスグループとＤＮＡレベルで、検出可能な総体的相同性を示さない（２４）。従って、従来技術において、他のポックスウイルスに関して知られ、記載されていることは、豚痘ウイルスの先行技術とはならない。ＳＰＶは、肌および局部的リンパ節においてのみ検出される病巣を持った自己規制感染を特徴とする、唯一穏やかな病原菌である。ＳＰＶの感染は非常に制限されているけれども、ＳＰＶから回復したブタは、ＳＰＶの感作に対して免疫性があり、活性免疫が発生したことがわかる（１８）。
本発明は、ワクチン抗原およびブタに対する治療剤のデリバー用ベクターとしてＳＰＶを使用することに関する。この原理は、ＳＰＶの下記特質によって支持される。ＳＰＶは、ブタにおいて唯一穏やかな病原菌であり、種特異的あり、防御免疫反応を誘導する。よって、ＳＰＶは、ベクターのワクチンおよび治療的特質によって与えられるその有益性とバランスさせなくてはならない本質的危険が少ない、ウイルス性ベクターデリバリーシステムの優れた候補である。
本発明の従来技術としては、バクテリア性プラスミド中でのＤＮＡクローン化および分析の技術がまずあげられる。利用される技術は、マニアチス等１９８３年の大部分およびサンブロック等１９８９年に詳述されている。これらの文献には、一般的組替えＤＮＡ技法の従来技術の状態が教示されている。
ポックスウイルスの中から５つ（ワクシニア、家禽ポックス、カナリアポックス、鳩およびアライグマポックス）が、本開示の前に、外来ＤＮＡ配列を含む様に加工された。ワクシニアウイルスは、外来遺伝子のベクターとして広範に使用されてきており（２５）、これは合衆国特許4,603,112および4,722,848の主題である。同様に、家禽ポックスが外来遺伝子のベクターとして使用されており、これは幾つかの特許出願、ＥＰＡ 0 284 416、PCT WO89/03429、およびPCT WO89/12684の主題である。アライグマ・ポックス（１０）およびカナリアポックス（３１）は、狂犬病ウイルス起源の抗原を発現するために使用されてきた。ポックスウイルス中へ挿入する外来遺伝子挿入物の例としては、スイポックスウイルス属由来の例は含まれない。このように、豚痘ウイルスを遺伝子工学的に加工する方法、即ち、どこに挿入するか、又どのようにブタポックス中の発現物を得るかという方法は教示されていない。
抗原のデリバリーシステムとして生ウイルスを使用するアイデアは、最初の生ウイルスワクチンまで立ち戻ると、大変長い歴史を有している。デリバーされた抗原は、外来性でなく、生ウイルスによってワクチン中に自然に発現されものであった。外来抗原をデリバーするにウイルスを使用することについては、組替えワクシニアウイルスの研究によって、現在では容易になってきた。ワクシニアウイルスはベクターであり、伝染性を引き起こす他の疾患起源の様々な抗原は外来抗原であり、該ワクチンは遺伝子工学によって作成される。これらの開示によってこれらの概念が明らかになる一方、明らかにならなかったのは、何によって最良のウイルスベクター候補が作られるかというより実践的疑問に対する答えであった。この質問に答えるにあたっては、ウイルスの病原性の詳細、複製部位、それが誘導する免疫反応の種類、ウイルスが外来抗原を発現する可能性、遺伝子工学の適合性、規制当局によって認可される可能性など、選択にあたっての全ての因子である。これらの実用上の問題については、先行技術は何等教示していない。
治療剤をデリバーするためにポックスウイルスを使用することに関わる先行技術としては、インターロイキン２（１２）をデリバリーするワクシニア・ウイルスの使用があげられる。この場合、インターロイキン２は、ワクシニア・ウイルス上で弱毒性効果を示したけれども、宿主における治療剤効果は実証されなかった。
本発明のウイルス性ベクターによってデリバーされる治療剤は、生物学的分子すなわち、ブタウイルス複製の副産物でなくてはならない。これによって、治療剤はまず、ＤＮＡ、ＲＮＡ又は蛋白に限られる。これらの化合物クラスに由来する治療剤の例として、アンチセンスＤＮＡ、アンチセンスＲＮＡ（１６）、リボソーム（３４）、サプレサーｔＲＮＡｓ（２）、インタフェロンに誘発される二本鎖ＲＮＡの形があげられ、また、インシュリン等のホルモンから、インターフェロンおよびインターロイキン等のリンホカイン、天然麻酔剤までの数多くの蛋白質治療剤の例があげられる。これらの治療剤の発見およびその構造および作用の解明によって、ウイルスベクターデリバリーシステムにおけるそれを使用する技量が容易になることはない。
〔発明の概要〕
本発明は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡに挿入される外来ＤＮＡ配列を含む組替え豚痘ウイルスであって、該外来ＤＮＡは、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡのHind III N断片内に挿入され、またブタウイルスに感染した宿主細胞中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
本発明は、更に相同性ベクター、ワクチンおよび免疫感作の方法を提供する。
【図面の簡単な説明】
図１Ａ−１Ｂ：
特徴的な長いターミナル・リピート（ＴＲ）領域を含むＳＰＶゲノムＤＮＡ（kasza株）の詳細な図が示される。酵素Hind IIIが制限マップが示される（２３）。断片は、サイズの減っていく順番に文字で表示される。ターミナル・リピートのサイズは、2.1Kbより大きいが、9.7Kbより小さい。
（図２Ａ−２Ｂ削除）
図３Ａ−３Ｃ：
515-85.1 ORFと、ワクシニア・ウイルス０１ＬＯＲＦの間の相同関係を示す。図３Ａには、二つのマップが示されている。図３Ａの第一のラインは、ＳＰＶ Hind III M断片の制限マップであり、第二のラインは、プラスミド515-85.1中のＤＮＡ挿入物の制限マップである。515-85.1［VV 01L様］ORFの位置もまた、該マップ中に示されている。図３Ｂおよび３Ｃに示されたＤＮＡ配列の位置は、図３Ａでは地図の下に太棒で示されている。図３Ｂは、その夫々のＮ末端におけるＶＶ０１ＬＯＲＦ（配列認識番号５）と515-85.1ORF（配列認識番号６）の間にある相同関係を示す。図３Ｃは、その夫々のＣ末端におけるＶＶ０１ＬＯＲＦ（配列認識番号７）と515-85.1ORF（配列認識番号８）の間にある相同関係を示す。
４Ａ−４Ｄ
相同性ベクター520-17.5におけるＤＮＡ挿入物が記載されている。図４Ａは、プラスミド520-17.5に会合するＤＮＡ断片の配向を示す図および各断片の起源を示す表が含まれている。図４Ｂには、断片の間にある連結部ＡおよびＢの各々に位置する配列が示される。図４Ｃには、連結部ＣおよびＤ（配列認識番号９、１０、１３および１６）に位置する配列が示される。図４Ｂおよび４Ｃには更に、各断片を生成する制限部位が記載されているのみならず断片を繋ぎ合せるために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。合成リンカー配列には、太棒で下線が施されている。幾つかの遺伝子をコードしている配列の位置、調整要素もまた提示されている。下記二つの取り決めが使用された。括弧（）中の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、初期プロモーター（ＥＰ１）、後期プロモーター（ＬＰ２）、ラクトースオペロンＺ遺伝子（lac Ｚ）および大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）。
図５Ａ−５Ｄ
相同性ベクター中538-46.16におけるＤＮＡ挿入物が詳細に記載されている。図５Ａには、プラスミド538-46.16に会合したＤＮＡ断片の配向を示す図および各断片の起源を示す表が含まれている。図５Ｂには、断片間の連結部ＡおよびＢに位置する配列が示される。図５Ｃには、連結部Ｃに位置する配列が示され、および図５Ｄには、連結部ＤおよびＥに位置する配列（配列認識番号１７、１８、２１、２６および２８）が示される。図５Ｂから５Ｄには、各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。該合成リインカー配列には、太棒で下線が施されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病ウイルス（ＰＲＶ），ｇ５０（ｇＤ）、糖蛋白６３（ｇ６３），初期プロモーター（ＥＰ１）、後期プロモーター１（ＬＰ１）（配列認識番号４６）、後期プロモーター２（ＬＰ２）、ラクトースオペロンＺ遺伝子（lacZ）、および大腸菌（Ｅ．coli）．
（図６−図１１Ｄ削除）
図１２Ａ−１２Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０１３および同ベクター570-91.64におけるＤＮＡ挿入物が詳細に記載されている。図12Aには、プラスミド570-91.64に会合したＤＮＡ断片の配向を示す図および各断片の起源を示す表が含まれている。図12Ｂには、断片間の連結部ＡおよびＢに位置する配列が示される。図12Cには、連結部Ｃに位置する配列が、および図１２Ｄには、連結部ＤおよびＥに位置する配列（配列認識番号６１、６２、６３、６４、６５）が示される。１２Ｂから１２Ｄには、各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）、大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ１（ＬＰ１），ポックス合成後期プロモーター２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）（配列認識番号４４），ｇＩＩＩ（ｇＣ）、塩基対（ＢＰ）。
（図１３Ａ−図１６削除）
図１７：
5.6キロ塩基対Ｈ ind III M豚痘ウイルスゲノムＤＮＡ断片を示すマップ。オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）は、各オープンリーディングフレームにおけるアミノ酸コードの数と共に示される。豚痘ウイルスのＯＲＦｓは、ワクシニアウイルスＯＲＦｓと著しい配列の同一性を示し、ワクシニアウイルスの命名法（５６および５８）によってラベルされている。Ｉ４ＬＯＲＦ（配列認識番号１９６）は、リボヌクレオチド・リダクターゼの大型ユニット（５７）とアミノ酸配列相同性を示し、また０１ＬＯＲＦ（配列認識番号１９３）は、ある真核生物の翻訳調節蛋白（１３）に特徴的なロイシン・ジッパー・モチーフに対するアミノ酸配列相同性を示す。Ｉ４ＬＯＲＦ中のＢｇｌ II部位および０１ＬＯＲＦ中のＡｃｃＩ部位は、ブタポックスゲノムの非必須領域中への外来ＤＮＡの挿入部位である。相同性ベクター738-94.4は、ヌクレオチド１６７９から２４５２（配列番号１８９）のＳＰＶ ＤＮＡの欠損を含む。底部の黒棒は、ＤＮＡ配列が既知である領域を示し、配列番号１８９および１９５を示す。制限部位ＡｃｃＩ，Ｂｇｌ II，およびHind IIIの位置が示されている。Ｉ３ＬＯＲＦ（配列認識番号１９０）、Ｉ２ＬＯＲＦ（配列認識番号１９１）、Ｅ１ＯＲ ＯＲＦ（配列認識番号１９４）が示される。配列認識番号２２１は、Hind III M断片の完全な５７８５塩基対配列を含んでいる。ＳＰＶ HindIII M断片内のオープンリーデイングフレームは、部分的なＩ４ＬＯＲＦ（４４５ＡＡ；ヌクレオチド２から１３３６）；Ｉ３ＬＯＲＦ（２７５ＡＡ；ヌクレオチド１３８７から２２１１）；Ｉ２ＬＯＲＦ（７５ＡＡ；ヌクレオチド２２１５から２４３９）；Ｉ１ＬＯＲＦ（３１３ＡＡ；ヌクレオチド２４４３から３３８１）；０１ＬＯＲＦ（６７７ＡＡ；ヌクレオチド３５２０から５５５０）；部分的Ｅ１ＯＲ ＯＲＦ（６４ＡＡ；ヌクレオチド５７８７−５５９６）。
（図１８Ａ−１８Ｄ削除）
図１９Ａ−１９Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０１５および相同性ベクター727-54.60におけるＤＮＡ挿入物が詳細に記載されている。図19Aには、プラスミド727-54.60に会合したＤＮＡ断片の配向を示す図および各断片の起源を示す表が含まれている。図19Ｂには、断片間の連結部ＡおよびＢに位置する配列が示され、図19Cには、連結部Ｃに位置する配列が、および図19Ｄには、連結部ＤおよびＥに位置する配列が示される。１９Ｂから１９Ｄには、各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病（ＰＲＶ）、大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ１（ＬＰ１），ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、糖蛋白Ｂ（ｇＢ）、塩基対（ＢＰ）。
（図２０Ａ−図２５Ｄ削除）
図２６Ａ−２６Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０４２および相同性ベクター751-07A1におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図には751-07A1に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。図２６Ａから２６Ｄには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号１９７）、（配列認識番号１９８）Ｃ（配列認識番号１９９）、Ｄ（配列認識番号２００）およびＥ（配列認識番号２０１）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、チキン・インターフェロン（ｃＩＦＮ），大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ１（ＬＰ１），ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、ポリメラーゼチェイン反応（ＰＣＲ）、塩基対（ＢＰ）。
図２７Ａ−２７Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０４３よび相同性ベクター751-56A1におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド751-56A1に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図２７Ａから２７Ｄには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号202）、（配列認識番号203）Ｃ（配列認識番号204）、Ｄ（配列認識番号205）およびＥ（配列認識番号206）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず幾つかの遺伝子コード領域を結合するために使用される合成リンカー配列、および調節要素もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、チキン・骨髄単球性成長ファクター（ｃＭＧＦ）、大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ１（ＬＰ１），ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰＥ２ＥＰ２）、ポリメラーゼチェイン反応（ＰＣＲ）、塩基対（ＢＰ）。
図２８Ａ−２８Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０４３よび相同性ベクター752-22.1におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド752-22.1に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図２８Ａから２８Ｄには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号207）、（配列認識番号208）Ｃ（配列認識番号209）、およびＤ（配列認識番号210）位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、ポリメラーゼチェイン反応（ＰＣＲ）、塩基対（ＢＰ）。
図２９Ａ−２９Ｂ：
図２９Ａ： ＳＰＶ Ｈｉｎｄ III N断片およびＳＰＶ Ｈｉｎｄ III Ｍ断片の一部における制限エンドヌークレアーゼマップおよびオープンリーデイングフレーム。豚痘ウイルスHind III NおよびHind III MゲノムＤＮＡの非必須部位への外来遺伝子の挿入物には、EcoR V部位（S-SPV-060）、SnaBI部位（S-SPV-061）、Hind III N（S-SPV-062）におけるBgl II部位、Hind III M（S-SPV−047）におけるBgl II部位がある。Ｉ７ＬＯＲＦ（配列認識番号２３０）およびＩ４ＬＯＲＦ（配列認識番号２３１）への外来遺伝子の挿入物によって、全オープンリーデングフレームは、豚痘ウイルスの複製に非必須であること、および外来遺伝子の挿入に最適である事が示唆される。外来遺伝子のその他の挿入部位には、二つのHind III部位およびAvaIおよびBamHIがあるがこれに限定されない。図２９Ｂ：ＳＰＶ Ｈｉｎｄ III Ｋ断片における制限エンドヌークレアーゼマップおよびオープンリーディングフレーム。豚痘ウイルスHind III ＫゲノムＤＮＡの非必須部位に挿入された外来遺伝子の挿入物には、EcoR I部位（S-SPV-059）があるがこれには限定されない。ＳＰＶ Hind III Ｋ断片の3.2kB領域内では、３つのオープンリーディングフレームが確認されている。Ｂ１８ＲＯＲＦ（配列認識番号２２８）への外来遺伝子の挿入によって、全オープンリーデングフレームは、豚痘ウイルスの複製に非必須であること、および外来遺伝子の挿入に最適である事が示唆される。また、Ｂ４ＲＯＲＦ（配列認識番号２２９）が外来遺伝子の挿入部位として確認された。ＳＰＶＢ１８ＲＯＲＦは、ワクシニアウイルス（ＶＶ）Ｂ１８ＲＯＲＦと相同性である。ＳＰＶＢ１８ＲＯＲＦは、ラビット繊維腫ウイルス（ＲＦＶ）の７７.2kd蛋白よりも相同性である。ＳＰＶＢ４ＲＯＲＦは、ワクシニアウイルス（ＶＶ）Ｂ４ＲＯＲＦと相同性である。ＳＰＶＢ４ＲＯＲＦは、ラビット繊維腫ウイルス（ＲＦＶ）のＴ５蛋白とより相同性である。確認されたオープンリーディングフレームは、ＳＰＶＨｉｎｄ III K断片の約３２００塩基対の内にある。ＳＰＶHind III K断片の残りの約３５００塩基対は、先にシークエンスされている（Ｒ．Ｆ．Massung et al. Virology 197, 511-528（1993））。
図30Ａ−30Ｃ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０４７および相同性ベクター779-94.31におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド779-94.31に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図30Ａから30Ｃには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号：）、（配列認識番号：）Ｃ（配列認識番号：）、Ｄ（配列認識番号：）およびＥ（配列認識番号：）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病（ＰＲＶ），大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、ポックス合成後期プロモータ １（ＬＰ１）、塩基対（ＢＰ）。
図３１Ａ−３１Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０５２および相同性ベクター789-41.7におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド789-41.7に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図３１Ａ−３１Ｄには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号：）、（配列認識番号：）Ｃ（配列認識番号：）、Ｄ（配列認識番号：）、Ｅ（配列認識番号：）およびＦ（配列認識番号：）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病（ＰＲＶ），大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、ポックス合成初期プロモータ１後期プロモータ２（ＥＰ１ＬＰ２）、ポックス合成後期プロモータ １（ＬＰ１）、塩基対（ＢＰ）。
図３２Ａ−３２Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０５３および相同性ベクター789-41.27におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド789-41.27に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図３２Ａ−３２Ｄには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号：）、（配列認識番号：）Ｃ（配列認識番号：）、Ｄ（配列認識番号：）、Ｅ（配列認識番号：），Ｆ（配列認識番号：）およびＧ（配列認識番号：）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病（ＰＲＶ），大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、ポックス合成初期プロモータ１後期プロモータ２（ＥＰ１ＬＰ２）、ポックス合成後期プロモータ １（ＬＰ１）、塩基対（ＢＰ）。
図３３Ａ−３３Ｄ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０５４および相同性ベクター789-41.47におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド789-41.47に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図３３Ａ−３３Ｄには、断片間の連結部Ａ（配列認識番号：）、（配列認識番号：）Ｃ（配列認識番号：）、Ｄ（配列認識番号：）、Ｅ（配列認識番号：），Ｆ（配列認識番号、）およびＧ（配列認識番号：）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病（ＰＲＶ），大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成初期プロモータ１後期プロモータ２（ＥＰ１ＬＰ２）、ポックス合成後期プロモータ １（ＬＰ１）、塩基対（ＢＰ）。
図３４Ａ−３４Ｅ：
豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０５５および相同性ベクター789-41.73におけるＤＮＡ挿入物の詳細な記載。図にはプラスミド789-41.73に会合したＤＮＡ断片の配向が示される。各断片の起源は表に示されている。断片間の連結部の夫々に位置する配列も示されている。図３４Ａ−３４Ｅは、断片間の連結部Ａ（配列認識番号：）、（配列認識番号：）Ｃ（配列認識番号：）、Ｄ（配列認識番号：）、Ｅ（配列認識番号：），Ｆ（配列認識番号：）、Ｇ（配列認識番号：）およびＨ（配列認識番号：）に位置する配列、および連結部に位置する配列が示される。各断片を生成するために使用される制限部位のみならず該断片を結合するために使用される合成リンカー配列が、各連結部について記載されている。幾つかの遺伝子コード領域および調節要素の位置もまた与えられている。下記二つの取り決めが使用される。（）内の数字は、アミノ酸を示し、角括弧［］中の制限部位は、構築の最中に破壊された部位の残片を示している。下記の略字が使用されている：豚痘ウイルス（ＳＰＶ）、擬狂犬病（ＰＲＶ），大腸菌（Ｅ．coli）、ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２（ＬＰ２ＥＰ２）、ポックス合成初期プロモータ１後期プロモータ２（ＥＰ１ＬＰ２）、ポックス合成後期プロモータ １（ＬＰ１）、塩基対（ＢＰ）。
〔発明の詳細な説明〕
本発明は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡ中に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡのHindIII Ｋ断片内に挿入されており、豚痘ウイルスに感染した宿主細胞中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
一態様において、この組み換え豚痘ウイルスは、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII Ｎ断片における略２ｋＢのHindIII〜BamHI亜断片内に挿入された前記外来ＤＮＡを含んでいる。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡのHindIII N断片における略２ＫｂのHindIII〜BamHI亜断片内のオープンリーディングフレーム内に挿入される。他の態様において、該オープンリーディングフレームはＩ７Ｌ遺伝子をコードする。
他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの略２ｋＢのHindIII〜BamHI亜断片内におけるEcoRV制限エンドヌクレアーゼ部位内に挿入される。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの略2.0ｋＢのHindIII〜BamHI亜断片内におけるSnaBI制限エンドヌクレアーゼ部位内に挿入される。
他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII N断片における略1.2ＫｂのBamHI〜HindIII亜断片内に挿入される。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡのHindIII N断片の略1.2ｋＢのBamHI〜HindIII亜断片内のオープンリーディングフレーム中に挿入される。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、Ｉ４Ｌ遺伝子をコードするオープンリーディングフレーム中に挿入される。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記略1.2ｋＢのBamHI〜HindIII亜断片内のBglII制限エンドヌクレアーゼ内に挿入される。
本発明は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡ中に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡのHindIII M断片内に挿入されており、豚痘ウイルスに感染した宿主細胞中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
一態様において、この組み換え豚痘ウイルスは、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII M断片における略２ＫｂのBglII〜HindIII亜断片内に挿入された前記外来ＤＮＡ配列を有する。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII M断片の略２ＫｂのBglII〜HindIII亜断片内のオープンリーディングフレーム中に挿入される。他の態様において、該オープンリーディングフレームは、Ｏ１Ｌ遺伝子をコードする。好ましい態様において、前記外来遺伝子は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの略２ｋＢのBglII〜HindIII亜断片内におけるBglII制限エンドヌクレアーゼ部位内に挿入される。
他の態様において、前記組み換え豚痘ウイルスは、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII Ｍ断片における略3.6ｋＢの大きい方のHindIII〜BglII亜断片内に挿入される。他の態様において、前記外来配列は、略3.6ｋＢの大きい方のHindIII〜BglII亜断片内のオープンリーディングフレーム中に挿入される。他の態様において、このオープンリーディングフレームは、Ｉ４Ｌ遺伝子をコードする。
一つの態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、前記HindIII Ｍ断片の非必須のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）内に挿入される。ＯＲＦの例には、Ｉ４Ｌ、Ｉ２Ｌ、Ｏ１ＬおよびＥ１０Ｌが含まれるが、これらに限定されるものではない。
他の態様において、前記組み換え豚痘ウイルスの外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII M断片における略２ＫｂのHindIII〜BglII亜断片内に挿入される。好ましい態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記略２ＫｂのHindIII〜BglII亜断片内に位置するBglII部位内に挿入される。
他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII M断片における大きい方のHindIII〜BglII亜断片内に挿入される。好ましい態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記大きい方のHindIII〜BglII亜断片内に位置するAccI部位内に挿入される。
他の態様において、前記組み換え豚痘ウイルスは、更に、豚痘ウイルスチミジンキナーゼをコードするオープンリーディングフレーム中に挿入された外来ＤＮＡ配列を具備する。一つの態様において、この外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスチミジンキナーゼをコードしているオープンリーディングフレーム内に位置したＮｄｅＩ部位中に挿入される。
本発明は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡ中に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡのHindIII Ｋ断片内に挿入されており、豚痘ウイルスに感染した宿主細胞中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスと提供する。
一つの態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII K断片における略3.2Ｋｂの亜断片内に挿入される。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、豚痘ウイルスゲノムＤＮＡの前記HindIII K断片における略3.2Ｋｂの亜断片内のオープンリーディングフレーム中に挿入される。他の態様において、該オープンリーディングフレームはＢ１８Ｒ遺伝子をコードする。他の態様において、該オープンリーディングフレームはＢ４Ｒ遺伝子をコードする。
本発明の目的において、「複製できる組み換え豚痘ウイルス」とは、当業者に周知の組み換え法、例えば、＜材料および方法＞の項の組み換えＳＰＶを作成するための相同組み換え法に記載した方法によって作成され、組み換え豚痘ウイルスの複製に不可欠の遺伝子物質を欠失されていない生の豚痘ウイルスである。
本発明の目的において、「豚痘ウイルスの複製に不可欠でない挿入部位」とは、ＤＮＡの配列がウイルスの複製のために必要とされない豚痘ウイルスゲノムにおける位置、例えば、複合タンパク結合配列、逆転写酵素または必須糖タンパクをコードする配列、パッケージングに必要なＤＮＡ配列等である。
本発明の目的において、「プロモータ」とは、外来ＲＮＡポリメラーゼが付着し、そこで外来ＲＮＡの複製が開始されるＤＮＡ分子上の特定のＤＮＡ配列である。
本発明の目的において、「オープンリーディングフレーム」とは、ＲＮＡに転写されてアミノ酸配列に翻訳されるコドンを含み、且つ終始コドンを含まないＤＮＡ切片である。
加えて、本発明は、当該組み換え豚痘ウイルスが導入される動物中で複製できる組み換え豚痘ウイルス（ＳＰＶ）であって、豚痘ウイルスＤＮＡと、前記組み換え豚痘ウイルスが導入される動物には本来存在しないＲＮＡをコードする外来ＤＮＡとを具備し、該外来ＤＮＡは、豚痘ウイルスの複製に不可欠ではない部位で豚痘ウイルスＤＮＡ中に挿入されており、且つプロモータの制御下にある組み換え豚痘ウイルスを提供する。
本発明は更に、ポリペプチドをコードする外来ＤＮＡ配列または外来ＲＮＡを提供する。好ましくは、このポリペプチドは動物において抗原性である。好ましくは、この抗原性ポリペプチドは、10個を越えるアミノ酸がペプチド結合によって結合された線形ポリマーであり、動物を刺激して抗体を産生させる。
本発明は更に、検出マーカーであるポリペプチドをコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウイルスを提供する。好ましくは、この検出マーカーはポリペプチドである大腸菌βガラクトシダーゼまたは大腸菌βグルクロニダーゼである。好ましくは、大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡの挿入部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内に位置するAccI制限エンドヌクレアーゼである。好ましくは、この組み換え豚痘ウイルスは、Ｓ−ＳＰＶ−００３（ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2335）と称するものである。このＳ−ＳＰＶ−００３豚痘ウイルスは、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に従って、ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2335の下に、アメリカ合衆国郵便番号20852メリーランド州ロックビル、パークローンドライブ12301に所在のアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション特許カルチャー寄託施設に寄託されている。
本発明の目的において、「検出マーカーであるポリペプチド」には、ポリペプチドの形の二量体、三量体および四量体が含まれる。大腸菌βガラクトシダーゼは、四つのポリペプチドまた亜はモノマーサブユニットで構成される四両体である。
本発明は更に、複製可能な組み換え豚痘ウイルスであって、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパク５０（ｇＤ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ II（ｇＢ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ III（ｇＣ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパクＨ、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパクＥ、遺伝性胃腸炎（ＴＧＥ）糖タンパク１９５、遺伝性胃腸炎（ＴＧＥ）マトリックスタンパク、豚ロタウイルス糖タンパク３８、豚パルボウイルスキャプシドタンパク、サープリナ・ヒドジセンテリエ（Serpulina hydodysenteriae）防御抗原、ウシ・ウイルス性下痢（ＢＶＤ）糖タンパク５５、ニューキャッスル病ウイルス（ＮＤＶ）赤血球凝集素−ノイラミニダーゼ、豚ｆｌｕ赤血球凝集素、もしくは豚ｆｌｕノイラミニダーゼである抗原性ポリペプチド、またはこれらに由来する抗原性ポリペプチドをコードする外来ＤＮＡを含んだ組み換え豚痘ウイルスを提供する。好ましくは、該抗原性ポリペプチドは、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパク５０（ｇＤ）である。好ましくは、該抗原性ポリペプチドは、ニューキャッスル病ウイルス（ＮＤＶ）赤血球凝集素−ノイラミニダーゼである。
本発明は更に、複製可能な組み換え豚痘ウイルスであって、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ５０（ｇＤ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ組み換え豚痘ウイルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスは、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。ＰＲＶｇ５０（ｇＤ）および大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウイルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である。好ましくは、この組み換え豚痘ウイルスは、Ｓ−ＳＰＶ−００８（ＡＴＣＣ受付番号2339）と称するものである。このＳ−ＳＰＶ−００８豚痘ウイルスは、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に従って、ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2339の下に、アメリカ合衆国郵便番号20852メリーランド州ロックビル、パークローンドライブ12301に所在のアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション特許カルチャー寄託施設に寄託されている。
本発明は更に、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩＩ（ｇＣ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウイルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスは、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。ＰＲＶ Ｃおよび大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウィルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である。好ましくは、この組み換え豚痘ウイルスは、Ｓ−ＳＰＶ−０１１、Ｓ−ＳＰＶ−０１２、またはＳ−ＳＰＶ−０１３と命名されたものである。Ｓ−ＳＰＶ−０１３と命名された豚痘ウイルスは、1993年６月16日に、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に従って、ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2418の下に、アメリカ合衆国郵便番号20852メリーランド州ロックビル、パークローンドライブ12301に所在のアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション特許カルチャー寄託施設に寄託された。
本発明は更に、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩ（ｇＢ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウィルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスは、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）および大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウイルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である。好ましくは、この組み換え豚痘ウイルスはＳ−ＳＰＶ−０１５（ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2466）と命名されたものである。このＳ−ＳＰＶ−０１５豚痘ウイルスは、1994年７月22日に、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に従って、ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2466の下に、アメリカ合衆国郵便番号20852メリーランド州ロックビル、パークローンドライブ12301に所在のアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション特許カルチャー寄託施設に寄託された。
本発明は更に、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ５０（ｇＤ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩＩ（ｇＣ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウイルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスもまた、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。ＰＲＶｇ５０（ｇＤ）、ＰＲＶｇＩＩＩ（ｇＣ）および大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウイルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である。
本発明は更に、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ５０（ｇＤ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩ（ｇＢ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウイルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスもまた、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。ＰＲＶｇ５０（ｇＤ）、ＰＲＶｇＩＩ（ｇＢ）および大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウイルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である
本発明は更に、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ５０（ｇＣ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩ（ｇＢ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウィルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスもまた、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。ＰＲＶｇＩＩＩ（ｇＣ）、ＰＲＶｇＩＩ（ｇＢ）および大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウイルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である
本発明は更に、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ５０（ｇＤ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩＩ（ｇＣ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩ（ｇＢ）をコードする外来ＤＮＡを含んだ、複製可能な組み換え豚痘ウイルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスもまた、大腸菌βガラクトシダーゼのような検出マーカをコードする外来ＤＮＡを含むように、更に加工することができる。
ＰＲＶｇ５０（ｇＤ）、ＰＲＶｇＩＩＩ（ｇＣ）、ＰＲＶｇＩＩ（ｇＢ）および大腸菌βガラクトシダーゼをコードする外来ＤＮＡを挿入するための、豚痘ウイルスゲノム内の好ましい部位は、豚痘ウイルスＤＮＡのHindIII Ｍ断片内のAccI部位である
本発明は更に、ニューキャッスル病ウイルス（ＮＤＶ）赤血球凝集素-ノイラミニダーゼをコードするＲＮＡをコードする外来ＤＮＡを含み、更に検出マーカーであるポリペプチドをコードする外来ＤＮＡを含む、複製可能な組み換え豚痘ウイルスを提供する。この組み換え豚痘ウイルスはＳ−ＳＰＶ−００９（ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2344）と命名されたものである。このＳ−ＳＰＶ−００９豚痘ウイルスは、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に従って、ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2344の下に、アメリカ合衆国郵便番号20852メリーランド州ロックビル、パークローンドライブ12301に所在のアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション特許カルチャー寄託施設に寄託されている。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、感染性ウシ鼻腔気管炎ウイルス由来の抗原性ポリペプチドをコードし、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主子中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。このような抗原性ポリペプチドの例は、感染性ウシ鼻腔気管炎ウイルス糖タンパクＥおよび糖タンパクＧである。本発明の好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０１７およびＳ−ＳＰＶ−０１９と称する組み換え豚痘ウイルスである。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、感染性咽頭気管炎ウイルス由来の抗原性ポリペプチドをコードし、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主子中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。このような抗原性ポリペプチドの例は、感染性咽頭気管支炎ウイルス糖タンパクＧおよび糖タンパクＩである。本発明の好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０１４およびＳ−ＳＰＶ−０１６と称する組み換え豚痘ウイルスである。
上記組み換え豚痘ウイルスの一つの態様において、前記外来ＤＮＡ配列はサイトカインである。他の態様において、該サイトカインはニワトリ骨髄単球増殖因子（ｃＭＧＦ）またはニワトリインターフェロン（ｃＩＦＮ）である。サイトカインには下記のものが含まれるが、これらに限定されるものではない：即ち、形質転換増殖因子ベータ、繊維芽細胞増殖因子、肝細胞増殖因子、インスリン様増殖因子、血管内皮増殖因子、インターロイキン１、ＩＬ−１受容体拮抗剤、インターロイキン２、インターロイキン３、インターロイキン４、インターロイキン５、インターロイキン６、ＩＬ−６可溶性受容体、インターロイキン７、インターロイキン８、インターロイキン９、インターロイキン１０、インターロイキン１１、インターロイキン１２、インターロイキン１３、アンジオジェニン、ケモカイネス（chemokines）、コロニー刺激因子、顆粒球−マクロファージ・コロニー刺激因子、エリスロポエチン、インターフェロン、インターフェロンガンマ、ｃ−ｋｉｔリガンド、白血球阻害因子、オンコスタチンＭ（oncostatin M）、プライオトロピン（pleiotrophin）、分泌性は血球プロテアーゼ阻害剤、幹細胞因子、腫瘍壊死因子、および可溶性ＴＮＦ受容体である。これらのサイトカイン類はヒト、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、ブタまたは鳥類に由来するものである。このような組み換えウイルスの好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０４２およびＳ−ＳＰＶ−０４３である。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、ヒト病原体由来の抗原性ポリペプチドをコードし、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主子中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
サイトカイン類を発現する組み換えＳＰＶは、単独で、もしくは疾病を起こす微生物のサイトカイン類または抗原遺伝子を含むワクチンと組み合わせて、免疫応答性を高めるために用いられる。
ヒトヘルペスウイルスから誘導されるヒト病原体の抗原性ポリペプチドには、Ｂ型肝炎ウイルスおよびＣ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス表面およびコア抗原、Ｃ型肝炎ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、単純ヘルペスウイルス−１、単純ヘルペスウイルス−２、ヒトサイトメガロウイルス、エプスタイン-バーウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ヒト・ヘルペスウイルス−６、ヒト・ヘルペスウイルス−７、ヒト・インフルエンザ、麻疹ウイルス、ハンターンウイルス（Hantaanvirus）、肺炎ウイルス、ライノウイルス、ポリオウイルス、ヒト呼吸器シンシチアウイルス、レトロウイルス、ヒトＴ細胞白血球ウイルス、狂犬病ウイルス、ムンプスウイルス、マラリア（Plasmodium falciparum）、百日咳菌、ジフテリア菌、発疹チフスリケッチア、ボレリア・ベルフドルフェリ（Borrelia berfdorferi）、破傷風トキソイド、悪性腫瘍抗原が含まれるが、こられに限定されるものではない。
本発明の一態様において、組み換え豚痘ウイルスは、Ｂ型肝炎ウイルスコアタンパクをコードする外来ＤＮＡ配列を含んでいる。好ましくは、このような組み換えウイルスはＳ−ＳＰＶ−０３１と命名されたものである。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主子において免疫を刺激することができるサイトカインをコードし、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
本発明の一つの態様において、組み換え豚痘ウイルスは、ヒト・インターロイキン−２をコードする外来ＤＮＡ配列を含む。好ましくは、このような組み換えウイルスはＳ−ＳＰＶ−０３５と命名されたものである。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、ウマ病原体から誘導された抗原性ポリペプチドをコードし、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
ウマ病原体の抗原性ポリペプチドは、ウマインフルエンザウイルスまたはウマヘルペスウイルスから誘導することができる。一態様において、この抗原性ポリペプチドは、ウマインフルエンザ・ノイラミニダーゼまたは赤血球凝集素である。このような抗原性ポリペプチドの例は、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／アラスカ９１ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／プラーク５６ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／マイアミ６３ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／ケンタッキー８１ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／ケンタッキー９２ノイラミニダーゼ、ウマ・ヘルペスイウルス１型糖タンパクＢ、ウマ・ヘルペスイウルス１型糖タンパクＤ、ストレプトコッカス・エクイ（Streptocoddus equi）、ウマ感染性貧血ウイルス、ウマ脳炎ウイルス、ウマ・ライノウイルス、およびウマ・ロタウイルスである。このような組み換え豚痘ウイルスの好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０３３、Ｓ−ＳＰＶ−０３４、Ｓ−ＳＰＶ−０３８、Ｓ−ＳＰＶ−０３９およびＳ−ＳＰＶ−０４１と命名されたものである。
更に、本発明は抗原性ポリペプチドを提供する。該抗原性ポリペプチドには豚コレラウイルスｇＥ１、豚コレラウイルスｇＥ２、豚インフルエンザウイルス赤血球凝集素、ノイラミニダーゼ、マトリックスおよび核タンパク、仮性狂犬病ウイルスｇＢ、ｇＣおよびｇＤ、並びにＰＲＲＳウイルスＯＲＦ７からなる群から誘導される組み換え豚痘ウイルスが含まれるが、これらに限定されるものではない。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、ウシ呼吸器シンシチアウイルスまたはウシ・パラインフルエンザウイルスから誘導された抗原性ポリペプチドをコードし、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。
例えば、上記の抗原性ポリペプチドは、感染性ウシ鼻腔気管炎ウイルスｇＥ、ウシ呼吸器シンシチアウイルス、ウマ病原体、ウマインフルエンザウイルス、齲歯呼吸器シンシチアウイルス付着タンパク（ＢＲＳＶ Ｇ）、ウシ呼吸器シンシチアウイルス融合タンパク（ＢＲＳＶ Ｆ）、ウシ呼吸器シンシチアウイルス核キャプシドタンパク（ＢＲＳＶ Ｎ）、ウシ・パラインフルエンザウイルス３型融合タンパクおよびウシ・パラインフルエンザウイルス３型赤血球凝集素ノイラミニダーゼから誘導することができる。好ましい態様において、この組み換え豚痘ウイルスはＳ−ＳＰＶ−０４５と命名されたものである。
ウシ呼吸器シンシチアウイルス由来の抗原性ポリペプチドをコードする外来ＤＮＡを含む組み換えウイルスの好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０２０、Ｓ−ＳＰＶ−０２９、およびＳ−ＳＰＶ−０３０と命名されたものである。また、ウシ・パラインフルエンザウイルス由来の抗原性ポリペプチドをコードする外来ＤＮＡを含む組み換えウイルスの好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０２８と命名されたものである。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、ウシ・ウイルス性下痢ウイルス（ＢＶＤＶ）糖タンパク４８または糖タンパク５３をコードし、また前記外来ＤＮＡ配列は、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。このようなウイルスの好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０３２、Ｓ−ＳＰＶ−０４０、Ｓ−ＳＰＶ−０４９、およびＳ−ＳＰＶ−０５０と命名されたものである。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列は、感染性嚢症ウイルスから誘導される抗原性ポリペプチドをコードし、また前記外来ＤＮＡ配列は、当該組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主中で発現することができる組み換え豚痘ウイルスを提供する。このような抗原性ポリペプチドの例は、感染性嚢症ウイルスポリタンパクおよびＶＰ２である。このようなウイルスの好ましい態様は、Ｓ−ＳＰＶ−０２６、およびＳ−ＳＰＶ−０２７と命名されたものである。
本発明は更に、豚痘ウイルスゲノムの非必須部位に挿入された外来ＤＮＡ配列を含む組み換え豚痘ウイルスであって、前記外来ＤＮＡ配列が抗原性ポリペプチドをコードする組み換え豚痘ウイルスを提供する。該抗原性ポリペプチドには下記のものが含まれるが、これらに限定されることはない：即ち、ＭＤＶ ｇＡ、ＭＤＶ ｇＢ、ＭＤＶ Ｄ、ＮＤＶ ＨＮ、ＮＤＶ Ｆ、ＩＬＴ ｇＢ、ＩＬＴ ｇＩ、ＩＬＴ ｇＤ、ＩＢＤＶ ＶＰ２、ＩＢＤＶ ＶＰ３、ＩＢＤＶ ＶＰ４、ＩＢＤＶポリタンパク、ＩＢＶスパイク、ＩＢＶマトリックス、鳥類脳脊髄炎ウイルス、鳥類レオウイルス、鳥類パラミクソウイルス、鳥類ロタウイルス、ニワトリ貧血ウイルス、サルモネラｓｐｐ．、大腸菌、パスツレラｓｐｐ．、百日咳菌ｓｐｐ．（Bordetella spp.）、エイメリアｓｐｐ．（Eimeria spp.）、ヒストモナスｓｓｐ．、トリコモナスｓｓｐ．、家禽線虫、条虫、吸虫、鳥類ダニ／シラミ、鳥類原生動物である。
本発明は更に、前記挿入された外来ＤＮＡ配列がプロモータの制御下にある組み換え豚痘ウイルスを提供する。一態様において、該プロモータは豚痘ウイルスプロモータである。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、内因性の上流豚痘ウイルスプロモータの制御下にある。他の態様において、前記外来ＤＮＡ配列は、異種上流プロモータの制御下にある。
本発明の目的において、前記プロモータには、合成豚痘ウイルスプロモータ、ポックス合成後期プロモータ１、ポックス合成後期プロモータ２、初期プロモータ２、ポックス０１Ｌプロモータ、ポックスＩ４Ｌプロモータ、ポックスＩ３Ｌプロモータ、ポックスＩ２Ｌプロモータ、ポックスＩ１Ｌプロモータ、ポックスＥ１０Ｒプロモータ、ＰＲＶ ｇＸ、ＨＳＶ−１アルファ４、ＨＣＭＶ即時型初期、ＭＤＶ ｇＡ、ＭＤＶ ｇＢ、ＭＤＶ ｇＤ、ＩＬＴ ｇＢ、ＢＨＶ−1.1 ＶＰ８およびＩＬＴ ｇＤが含まれるが、これらに限定されるものではない。別のプロモータは、当業者に周知の方法、例えば、材料と方法の項における「合成ポックスウィルスプロモーターの構築のための基本的手法」に記載した方法によって作成される。
本発明は、豚痘ウイルスのゲノムＤＮＡ中に外来ＤＮＡを挿入することにより組み換え豚痘ウイルスを製造するための、相同性ベクターを提供する。
この相同性ベクターは、当該組み換え豚痘ウイルスが導入される動物には本来的に存在しない実質的に二本鎖の外来ＤＮ（ＲＮＡ）配列からなる二本鎖ＤＮＡ分子を具備し、該外来二本鎖ＤＮＡの一端には、豚痘ウイルスの複製に不可欠でないゲノムＤＮＡの一方の側に位置する前記ウイルスゲノムに対して相同性である二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡを有し、前記外来ＤＮＡの他端には、前記豚痘ウイルスゲノムの他方の側に位置する前記ウイルスゲノムに対して相同性である二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡを有する。好ましくは、前記ＲＮＡはポリペプチドをコードする。
本発明の他の態様において、上記相同性ベクターの二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、HindIII Ｍ断片内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。他の対応において、上記相同性ベクターの二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、略２ｋＢのHindIII〜BglII亜断片内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。好ましい態様において、前記二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、このHindIII〜BglII亜断片の中に位置したBglII部位内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。
他の態様において、この二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、大きい方のHindIII〜BglII亜断片に含まれたオープンリーディングフレーム内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。好ましくは、該二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、大きい方のHindIII〜BglII亜断片に位置したAccI制限エンドヌクレアーゼ部位内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。
好ましい態様において、当該相同性ベクターは、752-29.33、751-07.A1、751-56.A1、751-22.1、746-94.1、767-67.3、738-94.4、および771-55.11と命名されたものである。
一つの態様において、前記ポリペプチドは検出マーカーである。好ましくは、検出マーカであるポリペプチドは、大腸菌βガラクトシダーゼである。
一つの態様において、前記ポリペプチドは動物において抗原性である。好ましくは、該抗原性ポリペプチドは、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパク５０（ｇＤ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇII（ｇＢ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇIII（ｇＣ）、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパクＨ、遺伝性胃腸炎（ＴＧＥ）糖タンパク１９５、遺伝性胃腸炎（ＴＧＥ）マトリックスタンパク、豚ロタウイルス糖タンパク３８、豚パルボウイルスキャプシドタンパク、サープリナ・ヒドジセンテリエ（Serpulina hydodysenteriae）防御抗原、ウシ・ウイルス性下痢（ＢＶＤ）糖タンパク５５およびg48、ニューキャッスル病ウイルス（ＮＤＶ）赤血球凝集素−ノイラミニダーゼ、豚ｆｌｕ赤血球凝集素、もしくは豚ｆｌｕノイラミニダーゼ、またはこれらに由来する。好ましくは、該抗原性ポリペプチドは、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）糖タンパク５０（ｇＤ）である。好ましくは、該抗原性ポリペプチドは、セルプリナ・ヒオディセンテリエ（Serpulina Hyodysenteriae）、口蹄疫ウイルス、豚これらウイルスｇＥ１およびｇＥ２、豚インフルエンザウイルス、アフリカ豚熱ウイルスまたはマイコプラズマ・ハイポニュモニエ、豚インフルエンザウイルス赤血球凝集素、ノイラミニダーゼおよびマトリックスおよび核タンパク、ＰＲＲＳウイルスＯＲＦ７、およびＢ型肝炎ウイルス核タンパク、またはこれらから誘導されたものである。
本発明の一つの態様において、相同性ベクター中の二本鎖外来ＤＮＡ配列は、ヒト病原体から誘導された抗原性ポリペプチドをコードする。
例えば、ヒト病原体の抗原性ポリペプチドは、ヒト・ヘルペスウイルス、単純ヘルペスウイルス−１、単純ヘルペスウイルス−２、ヒト・サイトメガロウイルス、エプスタイン-バーウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、ヒト・ヘルペスウイルス−６、ヒト・ヘルペスウイルス−７、ヒト・インフルエンザ、ヒト免疫不全ウイルス、狂犬病ウイルス、麻疹ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルスおよびＣ型肝炎ウイルスからなる群から誘導される。更に、ヒト病原体の抗原性ポリペプチドは、プラスモジウム・ファルシパルム（Plasmodium falciparum）、ボルデテリア・ペルトゥスシス（Bordetelia pertussis）および悪性腫瘍からなる群から選択される、マラリアまたは悪性腫瘍に関連していてもよい。
本発明の一態様において、前記相同性ベクターにおける二本鎖外来ＤＮＡ配列は、ヒト免疫応答を刺激することができるサイトカインをコードする。一つの態様において、このサイトカインは、ニワトリ骨髄単球増殖因子（ｃＭＧＦ）またはニワトリ・インターフェロン（ｃＩＦＮ）である。例えば、該サイトカインはインターロイキン−２、インターロイキン−６、インターロイキン−１２、インターフェロン、顆粒球−マクロファージ・コロニー刺激因子、およびインターロイキン受容体であることができるが、これに限定されるものではない。
本発明の一態様において、相同性ベクターにおける前記二本鎖外来ＤＮＡ配列は、ウマ病原体から誘導された抗原性ポリペプチドをコードする。
ウマ病原体の抗原性ポリペプチドは、ウマ・インフルエンザウイルスまたはウマ・ヘルペスウイルスから誘導することができる。このような抗原性ポリペプチドの例は、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／アラスカ９１ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／プラーク５６ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／マイアミ６３ノイラミニダーゼ、ウマ・インフルエンザウイルスＡ型／ケンタッキー８１ノイラミニダーゼ、ウマ・ヘルペスウイルス１型糖タンパクＢ、およびウマ・ヘルペスウイルス１型糖タンパクＤからなる群から選択される組み換え豚痘ウイルスである。
本発明の一態様において、前記相同性ベクターの二本鎖外来ＤＮＡ配列は、ウシ呼吸器シンシチアウイルスまたはウシ・パラインフルエンザウイルスをコードする。
例えば、該抗原性ポリペプチドは、感染性ウシ鼻腔気管炎ウイルスｇＥ、ウシ呼吸器シンシチアウイルス付着タンパク（ＢＲＳＶ Ｇ）、ウシ呼吸器シンシチアウイルス融合タンパク（ＢＲＳＶ Ｆ）、ウシ呼吸器シンシチアウイルス核キャプシドタンパク（ＢＲＳＶ Ｎ）、ウシ・パラインフルエンザウイルス３型融合タンパク、およびウシ・パラインフルエンザウイルス３型赤血球凝集素ノイラミニダーゼから誘導される。
本発明の一態様において、前記相同性ベクターの前記二本鎖外来ＤＮＡ配列は、感染性嚢症ウイルスから誘導される。このような抗原性ポリペプチドの例は、感染性嚢症ウイルスポリペプチドおよび感染性嚢症ウイルスＶＰ２、ＶＰ３またはＶＰ４である。
本発明の目的において、「相同性ベクター」とは、豚痘ウイルスゲノムの特定の部位に外来ＤＮＡを挿入するために構築されたプラスミドである。
本発明の一つの態様において、上記で述べた相同性ベクターの二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、豚痘チミジンキナーゼをコードするオープンリーディングフレーム内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。好ましくは、該二本鎖豚痘ウイルスＤＮＡは、豚痘チミジンキナーゼをコードするオープンリーディングフレーム中に位置するNdeI制限エンドヌクレアーゼ内に存在するゲノムＤＮＡに対して相同性である。
本発明は更に、上記の相同性ベクターであって、その外来ＤＮＡ配列が、前記外来ＤＮＡ配列の上流に位置するプロモータの制御下にある相同性ベクターを提供する。該プロモータは、内因性豚痘ウイルスプロモータまたは外因性プロモータであることができる。プロモータには、合成ポックスウイルスプロモータ、ポックス合成後期プロモータ１、ポックス合成後期プロモータ２初期プロモータ２、ポックス０１Ｌプロモータ、ポックスＩ４Ｌプロモータ、ポックスＩ３Ｌプロモータ、ポックスＩ２Ｌプロモータ、ポックスＩ１ＬプロモータおよびポックスＥ１０Ｒプロモータ、ＰＲＶ ｇＸ、ＨＳＶ−１・アルファ４、ＨＣＭＶ即時型初期、ＢＨＶ−１．１ ＶＰ８、感染性咽頭気管炎ウイルス糖タンパクＢ、感染性咽頭気管炎ウイルスｇＤ、マレック病ウイルス糖タンパクＡ、マレック病ウイルス糖タンパクＢ、マレック病ウイルス糖タンパクＤが含まれるが、これらに限定されるものではない。
本発明は、Ｓ−ＳＰＶ−０４４、Ｓ−ＳＰＶ−０４６、Ｓ−ＳＰＶ−０４７、Ｓ−ＳＰＶ−０４８、Ｓ−ＳＰＶ−０５２、Ｓ−ＳＰＶ−０５１、Ｓ−ＳＰＶ−０５３、Ｓ−ＳＰＶ−０５４、Ｓ−ＳＰＶ−０５５、Ｓ−ＳＰＶ−０５６、Ｓ−ＳＰＶ−０５７、Ｓ−ＳＰＶ−０５８、Ｓ−ＳＰＶ−０５９、Ｓ−ＳＰＶ−０６０、Ｓ−ＳＰＶ−０６１、Ｓ−ＳＰＶ−０６２と命名された組み換え豚痘ウイルスを提供する。
本発明は更に、有効免疫量の本発明の組み換え豚痘ウイルスと、適切なキャリアとを含有するワクチンを提供する。
豚痘ウイルスのための適切なキャリアは当該技術において周知であり、タンパク、糖などが含まれる。このような適切なキャリアの一例は、安定化された加水分解タンパク、ラクトース等のような１以上の安定家財を含有する、生理学的にバランスされた培養培地である。
本発明の目的において、「有効免疫量」の本発明の組み換え豚痘ウイルスは、１０3〜１０9ＰＦＵ／投与量の範囲である。
本発明はまた、動物を免疫化する方法であって、該動物がヒト、豚、牛、ウマヤギ（caprine）またはヒツジ（ovine）である方法を提供する。本発明の目的において、この方法には、疾患を生じるウイルス（類）に対して動物を免疫化することが含まれ、これらウイルス（類）には、仮性狂犬病ういるす、遺伝性胃腸炎（ＴＧＥ）ウイルス、豚ロタウイルス、豚パルボウイルス、サープリナ・ヒドジセンテリエ（Serpulina hydodysenteriae）、ウシ・ウイルス性下痢（ＢＶＤ）ウイルス、ニューキャッスル病ウイルス（ＮＤＶ）、豚インフルエンザウイルス、ＰＲＲＳ、ウシ呼吸器シンシチアウイルス、ウシ・パラインフルエンザウイルス３型、口蹄病ウイルス、豚コレラウイルス、アフリカ豚熱ウイルスまたはマイコプラズマ・ハイポニュモニエが含まれる。本発明の目的において、この免疫化方法にはまた、ヒト病原体、ウシ病原体、ウマ病原体、鳥類病原体に対して動物を免疫化することが含まれる。
この方法には、動物に対して、有効免疫投与量の本発明のワクチンを投与することが含まれる。このワクチンは、当業者に周知の何れかの方法、例えば筋肉内注射、皮下注射、副空内注射または静脈内注射によって投与すればよい。或いは、このワクチンは、鼻腔内または経口的に投与してもよい。
本発明はまた、豚が本発明のワクチン、特に組み換え豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−００８（ＡＴＣＣ受付番号ＶＲ2339）を含有する実施例で予防接種されているかどうか、または天然に存在する野生型の仮性狂犬病ウイルスに感染しているかどうかを決定するために、豚を試験する方法を提供する。この方法は、試験すべき豚から適切な体液のサンプルを取得することと、該サンプル中において仮性狂犬病ウイルスに対する抗体の存在を検出する（このような抗体が存在しないことによって、前記豚が予防接種も感染もされていないことが示される）ことと、仮性狂犬病ウイルスに対する抗体が存在する豚について、前記サンプル中において、天然に存在する仮性狂犬病ウイルスに感染した豚の体液中には通常存在するが、予防接種された豚には存在しない仮性狂犬病ウイルス抗原に対する抗体が存在していないことを検出することにより、該豚が予防接種されていることまたは感染していないことが示されることとを具備する。
本発明は、外来ＤＮＡ配列または遺伝子と共に挿入されると、診断試験として用い得る組み換えＳＰＶを提供する。一つの態様においては、ＦＩＶｅｎｖおよびｇａｇ遺伝子類、並びにＤ．イミティス（immitis）ｐ３９および２２ｋｄが、ＦＩＶによって起こされたネコ免疫不全を検出し、またＤ．イミティスによって起こされたイヌ糸状虫を検出するための診断試験に用いられる。
本発明はまた、複製できる組み換え豚痘ウイルスに感染した宿主細胞を提供する。一つの実施例において、宿主細胞は哺乳類細胞である。好ましくは、この哺乳類細胞はベロ細胞（Vero cell）である。好ましくは、前記哺乳類細胞はＥＳＫ−４細胞、ＰＫ−１５細胞またはＥＭＳＫ細胞である。
本発明の目的において、「宿主細胞」とは、ベクターおよびその挿入物を増殖させるために用いられる細胞である。害細胞の感染は、当業者に周知の方法、例えば、＜材料と方法＞の項における「感染−トランスフェクション法」に記載した方法によって達成された。
上記の組み換え豚痘ウイルスを構築し、選択し、精製するための方法は、下記の＜材料と方法＞の項で詳述する。
〔実験の詳細〕
＜材料と方法＞
豚痘ウィルスストック試料の調製
豚痘ウィルス（SPV）試料はイスコープの改良ダルベッコ培地（Iscove's Modified Dulbecco's Medium）（IMDM）と2mMのグルタミン，100units/mlのペニシリン，100units/mlのストレプトマイシンを含むRPMI 1640培地の1:1混合溶液中（これらの構成成分はシグマ社もしくは相当の供給元から得られ，そしてこれ以後EMSK陰性培地（negative medium）と呼ぶ）でブタ胎児腎臓（EMSK）細胞，ESK-4細胞，PK-15細胞もしくはベロ細胞を，0.01PFU/細胞の感染多重度で感染させることにより調製された．感染に先立ち，細胞単層は微量のウシ胎児血清を除去するためEMSK陰性培地を用いて１回洗浄された．その後，最初の接種原（10cmのプレートに対しては0.5ml；T175cmのフラスコに対しては10ml）に含まれるSPVは，30分間ごとに繰り返し拡散させつつ（redistributed），2時間細胞単層中へ吸収させられた．この期間の後，最初の接種原は規定の（recommended）容量まで完全EMSK培地（5%のウシ胎児血清を加えたEMSK陰性培地）を加えられた．プレートは細胞変性の効果が完全となるまで，5%CO2中37℃でインキュベートされた．培地と細胞は回収され，50mlのスクリューキャプ付き円錐管（conical screw cap tube）中で-70℃で凍結された．37℃で解凍されるとすぐに，ウィルスストックは1.0mlバイアルに分注され，-70℃にて再凍結された．力価は通常約106PFU/mlであった．
SPV DNAの調製
豚痘ウィルスDNAを単離するために，T175cm2フラスコ中の集密的EMSK細胞単層は多重度0.1で感染させられ，細胞が100%細胞変性の効果を示すまで4から6時間インキュベートされた．感染細胞はその後，培地中に細胞をこすり落とされ，臨床的な遠心分離（clinical centrifuge）にて300rpmで５分間遠心分離することにより回収された．培地は別の容器に移され，細胞ペレットはリン酸緩衝溶液1.0ml（PBS：水1L中に1.5gのリン酸二ナトリウム，0.2gのリン酸二水素カリウム，0.8gの塩化ナトリウム及び0.2gの塩化カリウムを含む）（T175あたり）中で穏やかに再懸濁され，連続2回の凍結−解凍処理（-70℃から37℃まで）を受けた．最後の解凍の際，細胞（氷上で）は30秒間2回の超音波処理を施され，1回目と2回目の間には45秒間の冷却時間をおいた．その後，細胞の残骸はHB4ローターで4℃下，3000rpm，5分間の遠心分離（ソーヴァル RC-5B超高速遠心機）（Sorvall RC-5B superspeed centrifuge）により取り除かれた．上清中に存在するSPVウィルス粒子（virions）は，その後SS34ローター（ソーヴァル）（Sorvall）で４℃下，15,000rpm，20分間の遠心分離によりペレット化され，10mMのトリス（pH7.5）中に再懸濁された．その後，この画分は36%ショ糖の密度勾配（10mMトリスpH7.5中でのw/v）中へ層状化され，SW41ローター（ベックマン）で4℃下，18,000rpm，60分間遠心分離（ベックマンL8-70M超遠心機）（Beckman L8-70M ultracentrifuge）された．ウィルス粒子ペレットは10mMのトリス緩衝溶液pH7.5中に再懸濁され，氷上で30秒間超音波処理を施された．この画分は20%から50%の連続的ショ糖密度勾配（continuous sucrose gradient）で層状化され，SW41ローターで4℃下，16,000rpm，60分間遠心分離された．その勾配の下方約4分の3に位置するSPVウィルス粒子のバンドが回収され，20%ショ糖溶液で希釈され，SW41ローターで4℃下，18,000rpm，60分間の遠心分離によりペレット化された．生成されたペレットは，その後微量のショ糖を除去するために10mMのトリス緩衝溶液pH7.5を用いて１回洗浄され，最終的に10mMのトリス緩衝溶液pH7.5中で再懸濁された，その後，EDTA，SDS及びプロテイナーゼKをそれぞれ20mM，0.5%及び0.5mg/mlの最終濃度になるように添加して誘導された溶解（lysis）（60℃，4時間）により精製されたウィルス粒子から，SPV DNAが抽出された．消化（digestion）の後，フェノール：クロロホルム（1:1）抽出が3回実施され，2倍量の100%エタノールの添加と-20℃，30分間のインキュベートにより試料は沈殿させられた．その後，試料はエッペンドルフミニフュージ（eppendorf minifuge）にて5分間，最高速度（full speed）で遠心分離された．上清は他の容器に移され，ペレットは風乾され，4℃にて1mM EDTAを含む0.01Mのトリス緩衝溶液pH7.5中で再水和された．
感染細胞溶解物（infected cell lysates）の調製
細胞溶解物の調製用に，血清を含まない培地が用いられた．25cm2フラスコまたは60mmペトリ皿中で集密的細胞単層（SPVに対しEMSK，ESK-4，PK-15またはVero，またはPRVに対してVERO）は100μｌのウィルス試料で感染させられた．細胞変性の効果が完全となった後，培地と細胞は回収され，細胞は3000rpm，5分間の臨床的な遠心分離（clinical centrifuge）でペレット化された．細胞ペレットは250μｌの破壊緩衝液（disruption buffer）（2%のドデシル硫酸ナトリウム，2%のβ-メルカプトエタノール）中に再懸濁された．試料は氷上で30秒間の超音波処理を施され，-20℃で保存された．
ウェスタンブロッティング法
細胞溶解物試料と標準タンパク質はラエムンリ（Laemnli）（1970）の方法に従ってポリアクリルアミドゲル上で泳動された．ゲル電気泳動後，タンパク質は変性され，サムブルックら（Sambrooke et al.）（1982）の方法に従って処理された．１次抗体はトリスナトリウム塩化物及びアジ化ナトリウム（TSA：水1L中に6.61gのトリス塩酸，0.97gのトリス塩基，9.0gの塩化ナトリウム及び2.0gのアジ化ナトリウムを含む）中にて5%の無脂肪乾燥ミルクで1:100の割合に希釈されたブタ抗PRV血清（Shope strain；lot370，PDV8201，NVSL，Ames，IA）であった．２次抗体はTSAで1:1000の割合に希釈されたヤギ抗ブタアルカリ性フォスファターゼ抱合体（goat anti-swine alkaline phosphatase conjugate）であった．
分子生物学的手法
制限エンドヌクレアーゼを用いた消化，ゲル電気泳動，ゲルからのDNAの抽出，ライゲーション，キナーゼを用いたリン酸化，ホスファターゼを用いた処理，細菌培養の成長，DNAを用いた細菌の形質転換法などを含む，細菌とDNAの操作に関する技術及びその他の分子生物学的方法はマニアティスら（Maniatis et al.）（1982）及びサムブルックら（Sambrook et al.）（1989）により示されている．例外として，これらの方法には若干の修正が加えられた．
DNAシークエンシング
シークエンシングはUSBシークエナーゼキット（USB Sequenase Kit）と35S-dATP（NEN）を用いて行われた．圧縮された領域（areas of compression）を解明するためdGTP混合物とdITP混合物の両方を用いる反応が実行された．あるいは，圧縮された領域（compressed areas）はフォルムアミドゲルで解析された．テンプレートにはダブルストランドのプラスミドサブクローンもしくはシングルストランドM13サブクローンを用い，プライマーはシークエンスされるべき挿入断片のすぐ外側のベクターに対して，あるいは以前に得られた配列に対して作成された．得られた配列は編集され，ドナスターソフトウエアー（Dnastar software）を用いて比較された．得られた配列の取り扱いや比較はコラルソフトウェア（Coral Software）のスーパークローンTM（SupercloneTM）とスーパーシーTMプログラム（SuperseeTM programs）を用いて行れた．
複製連鎖反応（Polymerase Chain Reaction）を用いたクローニング
種々のDNAの繰作に都合のよい制限（酵素）部位を導入するために複製連鎖反応（Polymerase Chain Reaction）（PCR）が用いられた．用いられた方法はインニスら（Innis，et al．）（1990）により示されている．一般に，増幅された断片はサイズ的には500塩基対より小さく，増幅された断片の臨界領域（criticalregion）はDNAシークエンシングにより確かめられる．それぞれの場合において用いられたプライマーは，以下に示す相同性ベクターの構築についての記述で詳しく述べられている．
組み換えSPV生成のための相同的組み換え法（Homologous Recombination Prodecure）
この方法は，豚痘ウィルスDNAとトランスフェクションされたプラスミド相同性ベクターの両方を含む組織培養細胞中に生じた，豚痘ウィルスDNAとプラスミド相同性ベクターDNA間の相同的組み換えに依拠する．相同的組み換えを生じさせるために，EMSK細胞単層はこれらの細胞中へのSPVの複製（すなわちDNA合成）を誘導するべく，感染多重度0.01PFU/細胞でS-SPV-001（カスザSPV株，17）（Kasza SPV strain，17）に感染させられる．その後，プラスミド相同性ベクターDNAは感染−トランスフェクション法（Infection-Transfected Procedure）に従い，これらの細胞にトランスフェクションされる．本方法で用いた相同性ベクターの構築は以下に示される．
感染−トランスフェクション法
EMSK細胞の6cmプレート（集密度約80%）はEMSK陰性培地中にて感染多重度0.01PFU/細胞でS-SPV-001に感染させられ，CO2濃度5%の加湿された環境下で37℃にて5時間インキュベートされた．用いられたトランスフェクション法は基本的にはリポフェクチンTM試薬（LipofectinTM Reagent）（BRL）の使用説明書に示された方法である．簡単に説明すると，6cmプレートのそれぞれにつき，15μgのプラスミドDNAが水で100μｌμまで希釈された．これとは別に50μgのリポフェクチン試薬が水で100μｌまで希釈された．その後，ポリスチレン製の5mlのスナップキャップ付き試験管中の希釈されたプラスミドDNAに，希釈されたリポフェクチン試薬100μｌが滴下的に加えられ，穏やかに混合された．その後，混合物は室温にて15から20分間インキュベートされた．この間に，ウィルスの接種原は6cmプレートから除去され，細胞単層はEMSK陰性培地を用いて１回洗浄された．その後，3mlのEMSK陰性培地がプラスミドDNA/リポフェクチン混合物に加えられ，その内容物細胞単層上にピペットで移された．細胞は一晩（約16時間），CO2濃度5%の加湿された環境下で37℃にてインキュベートされた．翌日，3mlのEMSK陰性培地は取り除かれ，5mlのEMSK完全培地に置き換えられた．細胞はウィルスによる細胞変性の効果が80%から100%になるまで，CO2濃度5%下37℃で3日間から7日間インキュベートされた．ウィルスはウィルスストックの調製で上記したようにして回収された．このストックはトランスフェクションストック（transfection stock）と呼ばれ，引き続いて組み換え豚痘ウィルス検出用のブルオガルスクリーン（Bluogal Screen）もしくは組み換え豚痘ウィルス検出用CPRGスクリーン（CPRG Screen）により，組み換えウィルスの検出がなされた．
β−ガラクトシダーゼを発現している組み換えSPVの検出（Screen）（ブルオガル（Bluogal）及びCPRG分析）
組み換えウィルスに大腸菌（E．coli）のβ−ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子が組み込まれた場合，組み換え体を含んでいるプラークは，２つの簡単な方法のうちのどちらか１つによって視覚化された．１番目の方法では，プラーク分析の間ブルオガル（BluogalTM）試薬（ベテスダ研究所）（Bethesda Research Labs）がアガロース上層（agarose overlay）に組み込まれ（200μg/ml），β−ガラクトシダーゼ活性を発現しているプラークは青になる．青いプラークはその後，新しい細胞（EMSK）上に選び取られ，青いプラークのさらなる単離により精製された．２番目の方法では，プラーク分析の間CPRG（ベーリンガー マンハイム）（Boehringer Mannheim）がアガロース上層（agarose overlay）に組み込まれ（400μg/ml），β−ガラクトシダーゼ活性を発現しているプラークは赤になる．赤いプラークはその後，新しい細胞（EMSK）上に選び取られ，赤いプラークのさらなる単離により精製された．どちらの場合においてもウィルスは，典型的には，３回のプラーク精製で精製された．
ブラックプラーク分析（Black Plaque Assays）を用いた組み換えSPV中における外来遺伝子発現の検出（screen）
組み換え豚痘ウィルスにより発現した外来抗原の発現を分析するために，EMSK細胞単層は組み換えSPVで感染させられ，アガロース栄養培地に重層され（overlayed），プラーク成長（plaque development）が生じるまで37℃で6日間から7日間インキュベートされた．その後，アガロース上層（overlay）はペトリ皿から除かれ，細胞は100%メタノールによりで室温で10分間固定され，風乾された．細胞の固定により表面抗原と同様に細胞質抗原も検出されるようになるが，未固定の細胞を用いることにより特異的な表面抗原の発現が検出可能である．その後，１次抗体はPBSを用いて適当な希釈倍率まで希釈され，細胞単層上に室温で２時間インキュベートされた．S-SPV-008由来のPRV g50（gD）の発現を検出するために，ブタ抗PRV血清（ショープ株；ロット370，PDV8201，NVSL，エームズ，IA）（shope strain；lot370，PDV8201，NVSL，Ames，IA）が用いられた（1:100希釈）．S-SPV-009由来のNDV HNの発現を検出するために，HNタンパク質に特異的なウサギ抗血清（rabbit anti-NDV#2）が用いられた（1:1000希釈）．その後結合していない抗体は，PBSを用いて室温下で細胞を３回洗浄することにより除かれた．2次抗体としては，ヤギ抗ブタ（PRV g50（gD）；S-SPV-008）もしくはヤギ抗ウサギ（NDV HN；S-SPV-009）のいずれかと西洋ワサビパーオキシダーゼの抱合体がPBSを用いて1:250に希釈され，室温下で2時間，細胞とともにインキュベートされた．その後，結合していない2次抗体は，PBSを用いて室温下で細胞を３回洗浄することにより除去された．その後，細胞は新しく調製された基質溶液（substratesolution）（PBS中に100μg/mlの4クロロ-1-ナフトール（4-chloro-1-naphthol），0.003%の過酸化水素を含む）とともに室温で15分間から30分間インキュベートされた．正しい抗原性を発現するプラークは黒く染色される．
診断法として使用されるためのウィルス性糖タンパク質の精製に関する方法
ウィルス性糖タンパク質は抗体アフィニティカラムを用いて精製される．モノクローナル抗体を生成するために，8週から10週齢のBALB/c雌マウスはS-SPV-009，-014，-016，-017，-018もしくは-019の107 PFUを2週から4週間隔で7回，腹膜内にワクチン接種（vaccinated）される．最後のワクチン接種から3週間後，マウスは相応のウィルス性糖タンパク質40mgを腹膜内に注射される．最後の抗原投与から3日後に脾臓が取り出される．
オイとハーゼンバーグ（Oi and Herzenberg）（41）の手法を改良した方法により，脾細胞はマウスNS1/Ag4プラスマ細胞腫細胞と融合される．脾細胞とプラスマ細胞腫細胞は10分間300x gの遠心分離で一緒にペレット化される．ポリエチレングリコール（分子量1300から1600）の50％溶液１mlが，1分間攪拌されながら細胞ペレットに加えられる．ダルベッコ改良イーグル培地（Dulbecco's modified Eagles's Medium）（5ml）が3分間にわたり細胞に加えられる．細胞は300x g，10分間の遠心分離によりペレット化され，10%のウシ胎児血清と100mMヒポキサンチン，0.4mMアミノプテリン及び16mMチミジンを含む培地（HAT）中に再懸濁される．100mlの標準の脾臓支持細胞層細胞（normal spleen feeder layer cells）を含有する8から10個の96穴の組織培養プレートに細胞（100ml）が加えられ，37℃でインキュベートされる．細胞には3日間から4日間ごとに新しいHAT培地が供給される．
ハイブリドーマ培養上清は，100ngのウィルス性糖タンパク質がコートされた96穴マイクロタイタープレート（96-well microtiter plates）中でのエリサ（ELIZA）分析により検査される．活性ハイブリドーマ由来の上清はさらにブラックプラーク分析（black-plaque assay）とウェスタンブロット（Western Blot）により解析される．選抜されたハイブリドーマは限界希釈（limiting dilution）により二度クローニングされる．プリスタン処理されたBALB/ｃマウスに5x106ハイブリドーマ細胞を腹膜内注射することにより腹水液（ascetic fluid）が生成される．
S-SPV-009，-014，-016，-017，-018もしくは-019由来の細胞溶解物は感染細胞溶解物の調製で示されたようにして得られる．糖タンパク質を含む細胞溶解物（100mls）は，2mlのアガロース親和性樹脂を通される．製造元（AFC培地，ニューブランズウィックサイエンティフィック，エディソン，ニュージャージー）（AFC Medium，New Brunswick Scientific，Edison，N.J.）の使用説明に従うと，そのカラムでは20mgの糖タンパク質モノクローナル抗体が固定化されている．カラムは非特異的に結合した物質を除くために，0.1%のノニデットP-40（Ｎｏｎｉｄｅｔ P-40）を含むリン酸緩衝溶液（PBS）100mlを用いて洗浄された．結合した糖タンパク質は100mM炭酸緩衝液（carbonate buffer），pH10.6（40）で溶出される．溶出前後の画分（pre-posteluted fractions）は，エリサ（ELISA）システム中でのSPVモノクローナル抗体に対する活性により純度（purity）がモニターされる．
エリサ検定（ELISA ASSAY）
ワクチン接種と抗原投与に引き続いておこる畜牛の免疫状態を測定するために，標準的な酵素結合免疫吸着剤検定法（ELISA）の手順が用いられる．
糖タンパク質抗原溶液（PBS中にng/mlにて100ml）（100ml at ng/ml in PBS）はマイクロタイター皿の穴に4℃下18時間吸着させられる．コートされた穴はPBSを用いて１回リンスされる．穴は1%のBSA（シグマ）（Sigma）を含むPBSを250ml加えることによりブロックされ，37℃で1時間インキュベートされる．ブロックされた穴は0.02%のツィーン20（Tween20）を含むPBSで１回リンスされる．50mlの供試血清（前もって1%BSAを含むPBS中で1:2に希釈された）が穴に添加され，37℃で1時間インキュベートされる．抗血清は除去され，穴は0.02%のツィーン20（Tween20）を含むPBSで3回洗浄される．特異的な抗原に対する抗体を含んでいる穴を視覚化するために，西洋ワサビパーオキシダーゼ（1%BSAを含むPBS中で1:500に希釈されたもの，キッケガードとペリー研究所社（Kirkegaard and Perry Laboratories，Inc.））に結合した抗ウシIgGを含む50mlの溶液が添加される．溶液は37℃で1時間インキュベートされ，その後溶液は除去され，0.02%のツィーン20（Tween20）を含むPBSで3回洗浄される．それぞれの穴に100mlの基質溶液（ATBS，キッケガードとペリー研究所社）（ATBS，Kirkegaard and Perry Laboratories，Inc.）が加えられ，15分間発色させられ．反応は0.1Mのシュウ酸の添加により終止させられた．色は自動プレート読みとり機（automatic platereader）にて吸光度410nmで読みとられた．
合成ポックスウィルスプロモーターの構築のための基本的手法
組み換え豚痘ベクターに関して，合成痘プロモーター（synthetic pox promoters）は，外来遺伝子発現の強度とタイミングを制御する能力を含むいくつかの利点を供する．ワクシニアウィルス（1,7及び8）中で決定されたプロモーターに基づいた３つのプロモーターカセットLP1，EP1及びLP2が設計された．それぞれのカセットはワクシニア中で決定されたDNA配列に制限酵素部位を配したものを含むように設計された．この制限酵素部位により，カセットはいかなる順番にでも，いかなる組み合わせにでも結合させて利用できるようになる．EcoRIもしくはBamHIサイトでフレーム内融合（inframe fusion）ができるように，イニシエーターメチオニンもそれぞれのカセット中に設計された．３つのリーディングフレームすべてに含まれる一連の翻訳終了コドンと初期（early）転写終止シグナル（early transcriptional termination signal）（9）もフレーム内融合（inframe fusion）サイトの下流に組み込まれた．それぞれのカセットをコードするDNAは標準的な手法に従って合成され，適当な相同性ベクターへクローニングされた（図4,5及び8参照）．
仮性狂犬病（Pseudorabies）ウィルス糖タンパク質遺伝子を含む組み換え豚痘ウィルスを用いたブタにおけるワクチン接種実験：
仮性狂犬病（Pseudorabies）非感染群からの離乳した幼ブタが，１つまたはそれ以上の仮性狂犬病（Pseudorabies）ウィルス糖タンパク質遺伝子（SPV/PRV）を有する組み換え豚痘ウィルスの効力を検査するために用いられる．約103から107プラーク形成単位（PFU）の組み換えSPV/PRVウィルスが筋肉内，皮下，あるいは経口的に幼ブタに接種される．
免疫性はPRV血清抗体のレベルを測定することと，ワクチン接種されたブタに仮性狂犬病（Pseudorabies）ウィルスの病原性株を抗原投与（challenge）することにより決定される．ワクチン接種の3から4週間後，ブタの接種したグループと接種していないグループはともに仮性狂犬病（Pseudorabies）ウィルスの病原性株（VDL4892）を抗原投与（challenge）される．抗原投与（challenge）後，ブタは14日間毎日，仮性狂犬病（Pseudorabies）の臨床的兆候を観察される．
ワクチン接種した時点，抗原投与の時点，及び接種後2から3週の間１週おきに血清試料が得られ，血清中和抗体を検査された．
ウシウィルス性下痢ウィルス（Bovine Viral Diarrhea Virus）g48とg53遺伝子のクローニング
カッツら（Katz et al.）（42）がヒトインフルエンザウィルスのHA遺伝子に関して示したのと基本的に同様のPCRクローニング手法により，ウシウィルス性下痢ウィルスg48とg53遺伝子はクローニングされた．マーデン-ダービイ（Madin-Darby）ウシ腎臓（MDBK）細胞中で成長したBVDウィルスシンガー株（BVD Virus Singer strain）から調製されたウィルスRNAは最初に，標的遺伝子に特異的なオリゴヌクレオチドプライマーを利用してcDNAに変えられた．その後，cDNAは複製連鎖反応（PCR）クローニング（15）のためのテンプレートとして用いられた．PCRプライマーは，SPV内での発現のための適当なシグナルを含むベクター中に，増幅したコード領域のクローニングを可能とする制限酵素サイトを組み込むように設計された．コードする領域のそれぞれにつき１対のオリゴヌクレオチドプライマーが必要であった．BVDVシンガー株（BVDV Singer strain）（49）由来のg48遺伝子をコードしている領域は，cDNAのプライミング（priming）のため以下のプライマー：
ウシ呼吸器合胞体ウィルス融合（Bovine Respiratory Syncytial Virus Fusion)，ヌクレオカプシド（Nucleocapsid）及び糖タンパク質遺伝子のクローニング
カッツら（Katz et al.）（42）がヒトインフルエンザウィルスのHA遺伝子に関して示したのと基本的に同様のPCRクローニング手法により，ウシ呼吸器合胞体ウィルス融合（Bovine respiratory syncytial virus fusion）（F），ヌクレオカプシド（Nucleocapsid）（N）及び糖タンパク質（G）遺伝子がクローニングされた．ウシ鼻甲介（nasal turbinate）（BT）細胞中で成長させたBRSVから調製されたウィルスRNAは最初に，標的遺伝子に特異的なオリゴヌクレオチドプライマーを利用してcDNAに変えられた．その後，cDNAは複製連鎖反応（PCR）クローニング（15）のためのテンプレートとして用いられた．PCRプライマーは，SPV内での発現のための適当なシグナル含むベクター中に，増幅したコード領域のクローニングを可能とする制限酵素サイトを組み込むように設計された．コードする領域のそれぞれにつき１対のオリゴヌクレオチドプライマーが必要であった．BRSV株375（VR-1339）由来のF遺伝子をコードしている領域は，cDNAのプライミング（priming）のため以下のプライマー：
コンカナバリンA（Concanavalin A）で処理されたニワトリ脾臓細胞から単離されたRNA
ニワトリ脾臓は3週齢のSPAFAS孵化ヒナから解剖して取り出され，洗浄され，細胞を解離するために注射筒/針を通して粉砕された．細胞質と残渣が除かれた後，細胞はペレット化され，PBSで二回洗浄された．細胞ペレットは赤血球細胞を溶血させるために低張性溶解緩衝液で処理され，脾細胞は回収され，PBSで二回洗浄された．脾細胞は5% FBSと5μg/mlのコンカナバリンA（concanavalin A）を含むRPMI中に5x106細胞/mlにて再懸濁され，39℃下で，48時間インキュベートされた．総RNAはグアニジンイソチオネート溶解剤（guanidine isothionatelysis reagehts）とプロメガRNA単離キット（プロメガ社RNA isolation Kit）（プロメガ社 マディソン ウィスコンシン）（プロメガ社Corporation，Madison WI）による手順を用いて細胞から単離された．4μgの総RNAが，適当なアンチセンスプライマーとAMV逆転写酵素（プロメガ社 マディソン ウィスコンシン）（プロメガ社Corporation，Madison WI）を含むそれぞれの第一鎖（1st strand）反応に用いられた．逆転写酵素反応に続いてcDNA合成が同じ試験管内で，適当なセンスプライマー（sense primers）とVentR DNAポリメラーゼ（ライフテクノロジーズ社，ベテスダ，メリーランド）（Life technologies，Inc．Bethesda，MD）を用いて行われた．
酵素のマーカー遺伝子を発現させる組み換えヘルペスウィルスの検出（Screen）
大腸菌β−ガラクトシダーゼ（uidA）マーカー遺伝子が組み換えウィルスに組み込まれた時，組み換え体を含むプラークは簡単な分析により視覚化された．プラーク分析の間，アガロース上層（agarose overlay）に酵素基質が組み入れられた（300μg/ml）．uidAマーカー遺伝子に関しては，基質X-グルクロChx（X-GlucuroChx）（5-ブロモ-4クロロ-3-インドリル-β-D-グルクロニック酸シクロヘキシルアンモニウム塩，バイオシンスAG）（5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-glucuronic acid Cyclohexylammonium salt，Biosynth AG）が用いられた．マーカー酵素活性を示したプラークは青に変わった．その後，青いプラークは新しいESK-4細胞上に選び取られ，青いプラークをさらに単離することにより精製された．酵素マーカー遺伝子が除去された場合の組み換えウィルス手法では分析に際し，親（世代）の青いプラークのバックグランドから白いプラークを精製したものが用いられた．どちらの場合においても，典型的には，３回のプラーク精製によりウィルスは精製された．
相同性ベクター515-85.1
プラスミド515-85.1は外来DNAをSPVに挿入する目的で構築された．このプラスミドは外来DNAが挿入されうる特異なAccI制限酵素サイトを含んでいる．AccIサイトに外来DNA挿入（断片）を有しているプラスミドが「組み換えSPV生成のための相同的組み換え法」に従って使用されると，外来DNAを有するウィルスが生じるだろう．相同性ベクター515-85.1内のDNA挿入（断片）の制限酵素地図を図4A-4Dに示す．このプラスミドは標準的な組み換えDNA技術を用い（22と29），以下に示す供給源からの２つ制限酵素（切断）断片を結合させることで構築される．１つめの断片はpSP64（プロメガ）（プロメガ社）のHindIIIからBamHIまでの約2972塩基対の制限酵素切断断片である．２番目の断片はSPV HindIII消化断片M（23）のHindIIIからBglIIまでの約3628塩基対の亜断片（sub-fragment）である．
相同性ベクター520-17.5
プラスミド520-17.5は外来DNAをSPVに挿入する目的で構築された．このプラスミドはSPV DNAに隣接して大腸菌β-ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子をもつ．マーカー遺伝子の上流はSPV DNAの約2149塩基対断片である．マーカー遺伝子の下流はSPV DNAの約1484塩基対断片である．このプラスミドが「組み換えSPV生成のための相同的組み換え法」に従って使用されると，マーカー遺伝子をコードするDNAを有するウィルスが生じるだろう．β-ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子は合成初期/後期（early/late）痘プロモーターの制御下にあることに留意されたい．プラスミドの詳細を図4A-4Dに示す．このプラスミドは標準的な組み換えDNA技術を用いて（22と30），以下の合成DNA配列をもつ供給源由来の制限酵素（切断）断片を加えることで構築されるだろう．この配列を図4A-4Dに示す．このプラスミドベクターはpSP64（プロメガ）（プロメガ社）のHindIIIからBamHIまでの約2972塩基対の制限酵素切断断片を起源とする．断片１はSPV HindIII消化断片M（23）のHindIIIからAccIまでの約2149塩基対の亜断片（sub-fragment）である．断片２はプラスミドpJF751（11）のBamHIからPvuIIまでの約3006塩基対の制限酵素断片である．断片3はSPV HindIII消化断片M（23）のAccIからBglIIまでの約1484塩基対の亜断片（sub-fragment）である．
相同性ベクター538-46.16
プラスミド538-46.16は外来DNAをSPVに挿入する目的で構築された．このプラスミドはSPV DNAに隣接して，大腸菌β-ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子とPRV g50（gD）遺伝子をもつ．外来遺伝子の上流はSPV DNAの約2149塩基対断片である．外来遺伝子の下流はSPV DNAの約1484塩基対断片である．このプラスミドが「組み換えSPV生成のための相同的組み換え法」に従って使用されると，外来遺伝子をコードするDNAを有するウィルスが生じるだろう．β-ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子は合成後期（late）痘プロモーター（LP1）の制御下に，g50（gD）遺伝子は合成初期/後期（early/late）痘プロモーター（EP1Lp1）の制御下にあることに留意されたい．プラスミドの詳細を図5A-5Dに示す．このプラスミドは標準的な組み換えDNA技術を用いて（22と30），以下の合成DNA配列をもつ供給源由来の制限酵素（切断）断片を加えることで構築されるだろう．この配列を図5A-5Dに示す．このプラスミドベクターはpSP64（プロメガ）（プロメガ社）のHindIIIからBamHIまでの約2972塩基対の制限酵素切断断片を起源とする．断片１はSPV HindIII消化断片M（23）のHindIIIからAccIまでの約2149塩基対の亜断片（sub-fragment）である．断片２はプラスミドpJF751（11）のBamHIからPvuIIまでの約3006塩基対の制限酵素断片である．断片3はPRV BamHI消化断片7（21）のEcoRIからStuIまでの約1571塩基対の亜断片（sub-fragment）である．EcoRIサイトはPCRクローニングによりこの断片に導入されたことに留意されたい．この手法において，以下に示されたプライマーはpSP64にサブクローニングしたPRV BamHI #7断片からなるテンプレートとともに用いられた．１つめのプライマー87.03（5'-CGCGAATTCGCTCGCAGCGCTATTGGC-3'）（SEQ ID NO：41）は，PRV g50（gD）配列（26）上で，遺伝子の3'末端方向にプライミング（priming）しながら略アミノ酸3の位置にバインド（sit down）する．２つめのプライマー87.06（5'-GTAGGAGTGGCTGCTGAAG-3'）（SEQ ID NO：42）は，逆鎖上で，遺伝子の5'末端方向にプライミング（priming）しながら略アミノ酸174の位置にバインド（sit down）する．PCR産物は，約509塩基対の断片を得るために，EcoRIとSalIで消化されてもよい．PRV BamHI #7のSalIからStuIまでの約1049塩基対の亜断片（sub-fragment）はその後，EcoRIからStuIまでの約1558塩基対の断片3を得るために約509塩基対のEcoRIからSalIまでの断片にライゲーションされてもよい．断片4はSPV HindIII消化断片M（23）のAccIからBglIIまでの約1484塩基対の亜断片（sub-fragment）である．
断片2はプラスミドpJF751（11）のBamHIからPvuIIまでの約3002塩基対の制限酵素断片である．断片3はPRV BamHI #2と#9の亜断片（sub-fragment）である，プラスミド251-41.AのNcoIからNcoIまでの約2378塩基対の断片である．この断片の末端のNcoIサイトとNcoIサイトはEcoRIリンカーにより置換された．断片4はSPV HindIII消化断片M（23）のAccIからHindIIIまでの約2149塩基対の亜断片（sub-fragment）である．断片1と断片4中のAccIサイトは合成DNAリンカーを用いてPstIに転換された．
相同性ベクター570-91.64
プラスミド570-91.64は外来DNAをSPVに挿入する目的で構築された．プラスミドはSPV DNAに隣接して大腸菌β-ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子とPRV gIII（gC）遺伝子をもつ．外来遺伝子の上流はSPV DNAの約1484塩基対断片である．外来遺伝子の下流はSPV DNAの約2149塩基対断片である．このプラスミドが「組み換えSPV生成のための相同的組み換え法」に従って使用されると，外来遺伝子をコードするDNAを有するウィルスが生じるだろう．β-ガラクトシダーゼ（lacZ）マーカー遺伝子は合成後期（late）痘プロモーター（LP1）の制御下に，gIII（gC）遺伝子は合成後期初期（late early）痘プロモーター（Lp2EP2）の制御下にあることに留意されたい．プラスミドの詳細を図12A-12Dに示す．このプラスミドは標準的な組み換えDNA技術を用いて（22と30），以下の合成DNA配列をもつ供給源由来の制限酵素（切断）断片を加えることで構築されるだろう．この配列を図12A-12Dに示す．このプラスミドベクターはpSP64（プロメガ）（プロメガ社）のHindIIIからBamHIまでの約2972塩基対の制限酵素切断断片を起源とする．断片１はSPV HindIII消化断片M（23）のBglIIからAccIまでの約1484塩基対の亜断片（sub-fragment）である．断片2はプラスミドpJF751（11）のBamHIからPvuIIまでの約3002塩基対の制限酵素断片である．断片３はPRV BamHI #2と#9の亜断片（sub-fragment）である，プラスミド251-41.AのNcoIからNcoIまでの約2378塩基対の断片である．この断片の末端のNcoIサイトとNcoIサイトはEcoRIリンカーにより置換された．断片４はSPV HindIII消化断片M（23）のAccIからHindIIIまでの約2149塩基対の亜断片（sub-fragment）である．断片1と断片4中のAccIサイトは合成DNAリンカーを用いてPstIに転換された。
相同性ベクター７２７−５４．６０
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するために、プラスミド７２７−５４．６０を構築した。これにより、ＳＰＶ ＤＮＡが隣接した仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇII（ｇＢ）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略２１４９塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより、上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドの詳細は第１９Ａ−１９Ｄ図に示されている。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、第１９Ａ−１９Ｄ図に示す合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記の起源に由来する制限断片を相互に結合させることにより構築することができる。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）から入手可能な略２９７２塩基対のＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対のＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ゲノムＰＲＶ ＤＮＡのＫｐｎＩ Ｃ断片（２１）内にあるＰＲＶ ｇＢ遺伝子をコードする配列を含む略３５００塩基対断片である。断片２は、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子のアミノ末端を含む略５３塩基対合成断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略７８塩基対ＳｍａＩ−ＮｈｅＩ断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略３３７０塩基対ＮｈｅＩ−ＥｃｏＲＩ断片（２１）とを含有する。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片４のＡＣＣＩ部位は、ＮｏｔＩリンカーを用いて非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７５１−０７．Ａ１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７５１−０７．Ａ１を用いた。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したニワトリインターフェロン（ｃＩＦＮ）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ｃＩＦＮ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本相同性ベクターは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、適切な合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１１４６塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、コンカナバリンＡ刺激ニワトリ脾臓細胞から分離されたＲＮＡの逆転写並にポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９）より誘導されたｃＩＦＮ遺伝子（５４）をコードする略５７７塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢｇｌＩ断片である。逆転写とＰＣＲのために用いたアンチセンスプライマー（６／９４．１３）は５’−ＣＧＡＣＧＧＡＴＣＣＧＡＧＧＴＧＣＧＴＴＴＧＧＧＧＣＴＡＡＧＴＧＣ−３’（配列番号：２１１）であった。ＰＣＲのため用いたセンスプライマー（６／９４．１２）は５’−ＣＣＡＣＧＧＡＴＣＣＡＧＣＡＣＡＡＣＧＣＧＡＧＴＣＣＣＡＣＣＡＴＧＧＣＴ−３’（配列番号：２１２）であった。逆転写とＰＣＲにより得られたＢａｍＨＩ断片はゲル精製され、５’末端に非反復ＥｃｏＲＩ部位を導入し３’末端に非反復ＢｇｌII部位を導入するための第２ＰＣＲ反応用鋳型として用いられた。第２ＰＣＲ反応では５’末端でプライマー６／９４．２２（５’−ＣＣＡＣＧＡＡＴＴＣＧＡＴＧＧＣＴＧＴＧＣＣＴＧＣＡＡＧＣＣＣＡＣＡＧ−３’、配列番号：２１３）を用い、３’末端でプライマー６／９４．３４（５’−ＣＧＡＡＧＡＴＣＴＧＡＧＧＴＧＣＧＴＴＴＧＧＧＧＣＴＡＡＧＴＧＣ−３’、配列番号：２１４）を用いて略５７７塩基対断片を産生した。このＤＮＡ断片は、ニワトリインターフェロンをコードする成熟タンパク質の１６２個アミノ酸とアミノ末端の３１個アミノ酸シグナル配列とを含んでなるニワトリインターフェロンタンパク質（５４）の第１番目アミノ酸から第１９３番目アミノ酸までをコードする配列を含有する。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３００２塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍ（２３）の略２１５６塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII制限亜断片である。本ＳＰＶ相同性ベクターのＡＣＣＩ部位は、非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７５１−５６．Ａ１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７５１−５６．Ａ１を用いた。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したニワトリ骨髄単球増殖因子（ｃＭＧＦ）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ｃＭＧＦ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本相同性ベクターは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、適切な合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１１４６塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、コンカナバリンＡ刺激ニワトリ脾臓細胞から分離されたＲＮＡの逆転写並にポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９）より誘導されたｃＭＧＦ遺伝子（５５）をコードする略６４０塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ断片である。逆転写とＰＣＲのために用いたアンチセンスプライマー（６／９４．２０）は５’−ＣＧＣＡＧＧＡＴＣＣＧＧＧＧＣＧＴＣＡＧＡＧＧＣＧＧＧＣＧＡＧＧＴＧ−３’（配列番号：２１５）であった。ＰＣＲのため用いたセンスプライマー（６／９４．５）は５’−ＧＡＧＣＧＧＡＴＣＣＴＧＣＡＧＧＡＧＧＡＧＡＣＡＣＡＧＡＧＣＴＧ−３’（配列番号：２１６）であった。ＰＣＲより誘導されたＢａｍＨＩ断片はサブクローニングを行ってプラスミドとし、第２ＰＣＲ反応用鋳型として用いた。第２ＰＣＲ反応では５’末端でプライマー６／９４．１６（５’−ＧＣＧＣＧＡＡＴＴＣＣＡＴＧＴＧＣＴＧＣＣＴＣＡＣＣＣＣＴＧＴＧ−３’、配列番号：２１７）を用い、３’末端でプライマー６／９４．２０（５’−ＣＧＣＡＧＧＡＴＣＣＧＧＧＧＣＧＴＣＡＧＡＧＧＣＧＧＧＣＧＡＧＧＴＧ−３’、配列番号：２１８）を用いて略６４０塩基対断片を産生した。このＤＮＡ断片は、ｃＭＧＦをコードする成熟タンパク質の１７８個アミノ酸とアミノ末端の２３個アミノ酸シグナル配列とを含んでなるｃＭＧＦタンパク質（５５）の第１番目アミノ酸から第２０１番目アミノ酸までをコードする配列を含有する。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３００２塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍ（２３）の略２１５６塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII制限亜断片である。本ＳＰＶ相同性ベクターのＡｃｃＩ部位は、非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７５２−２２．１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７５２−２２．１を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略８５５塩基対断片が配列し、本外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１１３塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は豚痘ウイルスＯ１Ｌ遺伝子プロモーターの制御下にあることが注目される。本相同性ベクターはまた第２の外来遺伝子が非反復ＢａｍＨＩあるいはＥｃｏＲＩ部位に挿入された合成後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）を含有する。本プラスミドの詳細は第２８Ａ−２８Ｄ図に示す。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、第２８Ａ−２８Ｄ図に示す合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６５（プロメガ社）の略２５１９塩基対ＨｉｎｄIII−ＳｐｈＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略８５５塩基対亜断片である。すなわちＤＮＡプライマーである５’−ＧＡＡＧＣＡＴＧＣＣＣＧＴＴＣＴＴＡＴＣＡＡＴＡＧＴＴＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＴＡ−３’（配列番号：１８５）と５’−ＣＡＴＡＡＧＡＴＣＴＧＧＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＴＴＡＴＡＣＴＡＡＣＡＡＡＡＡＴＡＡＧ−３’（配列番号：１８６）を用いてポリメラーゼ連鎖反応を行いＳｐｈＩ並にＢｇｌII末端を有する８５５塩基対断片を合成した。断片２は、大腸菌ｌａｃＺ遺伝子を含むプラスミドｐＪＦ７５１（４９）から誘導された３００２塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII断片である。断片３は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１１１３塩基対亜断片である。即ち、ＤＮＡプライマーである５’−ＣＣＧＴＡＧＴＣＧＡＣＡＡＡＧＡＴＣＧＡＣＴＴＡＴＴＡＡＴＡＴＧＴＡＴＧＧＧＡＴＴ−３’（配列番号：１８７）と５’−ＧＣＣＴＧＡＡＧＣＴＴＣＴＡＧＴＡＣＡＧＴＡＴＴＴＡＣＧＡＣＴＴＴＴＧＡＡＡＴ−３’（配列番号：１８８）を用いてポリメラーゼ連鎖反応を行いＳａｌＩ並にＨｉｎｄIII末端を有する１１１３塩基対断片を合成した。
相同ベクター７５２−２９．３３
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７５２−２９．３３を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したウマヘルペスウイルス１型ｇＢ遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略８５５塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１３塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は豚痘ウイルスＯ１Ｌ遺伝子プロモーターの制御下にあり、上記ＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子は後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。ＬＰ２ＥＰ２プロモーター／ＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子カセットは同族ベクター７３８−９４．４のＮｏｔＩ部位へ挿入された。同族ベクター７５２−２９．３３は、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６５（プロメガ社）の略２５１９塩基対ＨｉｎｄIII−ＳｐｈＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略８５５塩基対亜断片である。すなわち、ＤＮＡプライマーである５’−ＧＡＡＧＣＡＴＧＣＣＣＧＴＴＣＴＴＡＴＣＡＡＴＡＧＴＴＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＴＡ−３’（配列番号：１８５）と５’−ＣＡＴＡＡＧＡＴＣＴＧＧＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＴＴＡＴＡＣＴＡＡＣＡＡＡＡＡＴＡＡＧ−３’（配列番号：１８６）を用いてポリメラーゼ連鎖反応を行いＳｐｈＩ並にＢｇｌII末端を有する８５５塩基対断片を合成した。断片２は、大腸菌ｌａｃＺ遺伝子を含むプラスミドｐＪＦ７５１（４９）から誘導された３００２塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII断片である。断片３は、ＰＣＲ反応生成物（ＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ）と制限断片（ＢａｍＨＩ−ＰｍｅＩ）を連結して鎖長略２９４１塩基対（９７９個のアミノ酸）のＥｃｏＲＩ−ＰｍｅＩ断片であるＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子を生成したものである。上記ＰＣＲ断片は、ＥＨＶ−１ゲノムＤＮＡのＢａｍＨＩ“ａ”断片内の３’末端に自然ＢａｍＨＩ部位を有しこの遺伝子の５’末端に合成ＥｃｏＲＩ部位を有する略４２９塩基対断片である。上記制限断片は、ＥＨＶ−１ゲノムＤＮＡのＢａｍＨＩ“１”断片内のＢａｍＨＩからＰｍｅＩに至る略２５１２塩基対断片である。５’末端ＰＣＲ断片を製造する際、ＥＨＶ−１ ＢａｍＨＩ“ａ”並に“ｉ”断片から成る鋳型を用いて下記プライマーを適用した。第１プライマー５／９４．３（５’−ＣＧＧＡＡＴＴＣＣＴＣＴＧＧＴＴＣＧＣＣＧＴ−３’）（配列番号：１２８）は、ＥＨＶ−１ ｇＢ配列上の第２番目アミノ酸の位置に座し、上記ＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入しさらにＡＴＧ開始コドンを導入する。第２プライマー５／９４．４（５’−ＧＡＣＧＧＴＧＧＡＴＣＣＧＧＴＡＧＧＣＧＧＴ−３’）（配列番号：１２９）は、ＥＨＶ−１ ｇＢ配列上のプライマー５／９４．３の反対鎖上の略１４４番目アミノ酸の位置に座し、上記遺伝子の５’末端方向にプライミングを行う。ＰＣＲ生産物をＥｃｏＲＩとＢａｍＨＩを用いて消化して鎖長においてＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子の５’末端に対応する４２９塩基対断片を生成した。上記のように、断片３は、ＰＣＲ反応生成物（ＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ）と制限断片（ＢａｍＨＩ−ＰｍｅＩ）を連結して鎖長路２９４１塩基対（９７９個のアミノ酸）のＥｃｏＲＩ−ＰｍｅＩ断片であるＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子を生成したものである。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１１１３塩基対亜断片である。即ち、ＤＮＡプライマーである５’−ＣＣＧＴＡＧＴＣＧＡＣＡＡＡＧＡＴＣＧＡＣＴＴＡＴＴＡＡＴＡＴＧＴＡＴＧＧＧＡＴＴ−３’（配列番号：１８７）と５’−ＧＣＣＴＧＡＡＧＣＴＴＣＴＡＧＴＡＣＡＧＴＡＴＴＴＡＣＧＡＣＴＴＴＴＧＡＡＡＴ−３’（配列番号：１８８）を用いてポリメラーゼ連鎖反応を行いＳａｌＩ並にＨｉｎｄIII末端を有する１１１３塩基対断片を合成した。
相同性ベクター７４６−９４．１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７４６−９４．１を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した伝染性ウシ鼻気管炎ウイルス糖タンパク質Ｅ（ｇＥ）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略８５５塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１１３塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は豚痘ウイルスＯ１Ｌ遺伝子プロモーターの制御下にあり、上記１ＢＲＶ ｇＥ遺伝子は後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。ＩＢＲＶ ｇＥ遺伝子（カルボキシ末端膜内外領域のアミノ酸１５８個が欠如）の第１番目アミノ酸から第４１７番目アミノ酸をコードする１２５０塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ断片を相同性ベクター７５２−２２．１（第２８Ａ−２８Ｄ図）の非反復ＥｃｏＲＩ並にＢａｍＨＩ部位に挿入した。上記１２５０塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ断片は、ＩＢＲＶ（Ｃｏｏｐｅｒ）ゲノムＤＮＡを鋳型として用い、プライマー１０／９４．２３（５’−ＧＧＧＧＡＡＴＴＣＡＡＴＧＣＡＡＣＣＣＡＣＣＧＣＧＣＣＧＣＣＣＣ−３’；配列番号：２１９）をＩＢＲＶ ｇＥ遺伝子の５’末端（第１番目アミノ酸）で且つプライマー１０／９４．２２（５’−ＧＧＧＧＧＡＴＣＣＴＡＧＧＧＣＧＣＧＣＣＣＧＣＣＧＧＣＴＣＧＣＴ−３’；配列番号：２２０）をＩＢＲＶ ｇＥ遺伝子の第４１７番目アミノ酸で用いてポリメラーゼ連鎖反応（１５）を行い合成した。
相同性ベクター７６７−６７．３
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７６７−６７．３を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したウシウイルス性下痢症ウイルス糖タンパク質５３（ＢＶＤＶ ｇｐ５３）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略８５５塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１１３塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は豚痘ウイルスＯ１Ｌ遺伝子プロモーターの制御下にあり、上記ＢＶＤＶ ｇｐ５３遺伝子は後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。ＢＶＤＶ ｇｐ５３をコードする１１８７塩基対ＢａｍＨＩ断片を相同性ベクター７５２−２２．１（第２８Ａ−２８Ｄ図）の各非反復ＢａｍＨＩ部位に挿入した。上記１１８７塩基対ＢａｍＨＩ断片は、「ウシウイルス性下痢症ウイルスｇｐ４８並にｇｐ５３遺伝子のクローニング」に記載のポリメラーゼ連鎖反応（１５）により合成した。
相同性ベクター７７１−５５．１１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７７１−５５．１１を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したウシウイルス性下痢症ウイルス糖タンパク質４８（ＢＶＤＶ ｇｐ４８）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略８５５塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１１３塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は豚痘ウイルスＯ１Ｌ遺伝子プロモーターの制御下にあり、上記ＢＶＤＶ ｇｐ４８遺伝子は後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させることにより構築した。ＢＶＤＶ ｇｐ４８をコードする６７８塩基対ＢａｍＨＩ断片を相同ベクター７５２−２２．１（第２８Ａ−２８Ｄ図）の各非反復ＢａｍＨＩ部位に挿入した。上記６７８塩基対ＢａｍＨＩ断片は、「ウシウイルス性下痢症ウイルスｇｐ４８並にｇｐ５３遺伝子のクローニング」に記載のポリメラーゼ連鎖反応（１５）により合成した。
相同性ベクター５５１−４７．２３
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド５５１−４７．２３を構築した。本プラスミドには大腸菌β−グルクロニダーゼ（β−ｇｌｕ）標識遺伝子が後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下に取込まれる。上記標識遺伝子をＳＰＶゲノムの部位に挿入し組換え豚痘ウイルスを産生することは有用である。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い下記源由来の制限断片を結合して構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６５（プロメガ社）の略３００５塩基対ＨｉｎｄIII制限断片から誘導した。断片１は、プラスミドｐＲＡＪ２６０（Ｃｌｏｎｅｔｅｃｈ）の略１８２３塩基対ＥｃｏＲＩ−ＳｍａＩ断片である。ＥｃｏＲＩとＳｍａＩ部位はＰＣＲクローニングにより導入されたものであることが注目される。プラスミド５５１−４７．２３を用いて組換え豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０５９，Ｓ−ＳＰＶ−０６０，Ｓ−ＳＰＶ−０６１並にＳ−ＳＰＶ−０６２を産生した。
相同性ベクター７７９−９４．３１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７７９−９４．３１を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＢ（ｇII）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略５３８塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１８０塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドの詳細は第３０Ａ−３０Ｅ図に示す。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９８６塩基対ＨｉｎｄIII−ＰｓｔＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略５４２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢｇｌII制限亜断片である。断片２は、ゲノムＰＲＶ ＤＮＡのＫｐｎＩ Ｃ断片（２１）内のＰＲＶ ｇＢ遺伝子をコードする配列を含む略３５００塩基対断片である。断片２は、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子のアミノ末端を含む略５３塩基対合成断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略７８塩基対ＳｍａＩ−ＮｈｅＩ断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略３３７０塩基対ＮｈｅＩ−ＥｃｏＲＩ断片（２１）とを含有する。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１１８０塩基対ＢｇｌII−ＰｓｔＩ亜断片である。断片１と断片４のＢｇｌII部位は、ＨｉｎｄIIIリンカーを用いて非反復ＨｉｎｄIII部位へ変換した。
相同性ベクター７８９−４１．７
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７８９−４１．７を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＢ（ｇII）遺伝子とＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）遺伝子並に大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１５６０塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＤ遺伝子は合成早期／後期痘プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドの詳細は第３１Ａ−３１Ｄ図に示す。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＰＲＶ ｇＤ遺伝子の第３番目アミノ酸から第２７９番目アミノ酸をコードする配列を含有するＰＲＶ ＢａｍＨＩ ＃７断片の略１５５２塩基対亜断片である。ＥｃｏＲＩ部位とＡＴＧ翻訳開始コドンはＥｃｏＲＩ部位を有する５’プライマーを用いるポリメラーゼ連鎖反応から誘導される。３’末端のＳｔｕＩ部位は通常、ＰＲＶ ｇＩ遺伝子３’−ＰＲＶ ｇＤ遺伝子内にある。ＥｃｏＲＩ部位に始まる全オープンリーディングフレームは４０５個アミノ酸をコードする。断片３は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII Ｍ断片の略４８塩基対ＡｃｃＩ−ＮｄｅＩ亜断片である。断片４は、ゲノムＰＲＶ ＤＮＡ（２１）のＫｐｎＩ Ｃ断片内のＰＲＶ ｇＢ遺伝子をコードする配列を含む略３５００塩基対断片である。断片４は、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子のアミノ末端を含む略５３塩基対合成断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略７８塩基対ＳｍａＩ−ＮｈｅＩ断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略３３７０塩基対ＮｈｅＩ−ＥｃｏＲＩ断片（２１）とを含有する。断片５は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片６は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１５６０塩基対ＮｄｅＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片３のＡｃｃＩ部位は、ＰｓｔＩリンカーを用いて非反復ＰｓｔＩ部位へ変換した。断片３と断片６のＮｄｅＩ部位は、ＨｉｎｄIIIリンカーを用いて非反復ＨｉｎｄIII部位へ変換した。ＳＰＶ断片３と６に広がる、ＳＰＶ ＨｉｎｄIIIＭ断片の略５４５塩基対ＮｄｅＩ−ＮｄｅＩ亜断片（ヌクレオチド番号１５６０乃至２１０４；配列番号：）が欠失していた。
相同性ベクター７８９−４１．２７
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７８９−４１．２７を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＢ（ｇII）遺伝子とＰＲＶ ｇＣ（ｇIII）遺伝子並に大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１５６０塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＣ遺伝子は合成早期／後期痘プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドの詳細は第３２Ａ−３２Ｄ図に示す。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、図示合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１５６０塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限亜断片である。断片２は、ゲノムＰＲＶ ＤＮＡのＫｐｎＩ Ｃ断片（２１）内のＰＲＶ ｇＢ遺伝子をコードする配列を含む略３５００塩基対断片である。断片２は、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子のアミノ末端を含む略５３塩基対合成断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略７８塩基対ＳｍａＩ−ＮｈｅＩ断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略３３７０塩基対ＮｈｅＩ−ＥｃｏＲＩ断片（２１）とを含有する。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIIIＭ断片の略４８塩基対ＡｃｃＩ−ＮｄｅＩ亜断片である。断片５は、ＰＲＶ ＢａｍＨＩ ＃２並に＃９の亜断片であるプラスミド２５１−４１．Ａの略２３７８塩基対ＮｃｏＩ−ＮｃｏＩ断片である。本断片末端のＮｃｏＩ部位をＥｃｏＲＩリンカーにより置換した。断片６は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＡｃｃＩ−ＢｇｌII制限亜断片である。断片１と断片４のＮｄｅＩ部位は、ＨｉｎｄIIIリンカーを用いて非反復ＨｉｎｄIII部位へ変換した。断片４と断片６のＡｃｃＩ部位は、ＰｓｔＩリンカーを用いて非反復ＰｓｔＩ部位へ変換した。ＳＰＶ断片４と６に広がる、ＳＰＶ ＨｉｎｄIIIＭ断片の略５４５塩基対ＮｄｅＩ−ＮｄｅＩ亜断片（ヌクレオチド番号１５６０乃至２１０４；配列番号：）が欠失していた。
相同性ベクター７８９−４１．４７
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７８９−４１．４７を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＣ（ｇIII）遺伝子とＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）遺伝子並に大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１５６０塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＣ遺伝子は合成早期／後期痘プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＤ遺伝子も合成早期／後期痘プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドの詳細は第３３Ａ−３３Ｄ図に示す。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＰＲＶ ｇＤ遺伝子の第３番目アミノ酸から第２７９番目アミノ酸をコードする配列を含有するＰＲＶ ＢａｍＨＩ ＃７断片の略１５５２塩基対亜断片である。ＥｃｏＲＩ部位とＡＴＧ翻訳開始コドンはＥｃｏＲＩ部位を有する５’プライマーを用いるポリメラーゼ連鎖反応から誘導される。３’末端のＳｔｕＩ部位は通常、ＰＲＶ ｇＩ遺伝子３’−ＰＲＶ ｇＤ遺伝子内にある。ＥｃｏＲＩ部位に始まる全オープンリーディングフレームは４０５個アミノ酸をコードする。断片３は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII Ｍ断片の略４８塩基対ＡｃｃＩ−ＮｄｅＩ亜断片である。断片４は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片５は、ＰＲＶ ＢａｍＨＩ＃２並に＃９の亜断片であるプラスミド２５１−４１．Ａの略２３７８塩基対ＮｃｏＩ−ＮｃｏＩ断片である。本断片末端のＮｃｏＩ部位をＥｃｏＲＩリンカーにより置換した。断片６は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１５６０塩基対ＮｄｅＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片３のＡｃｃＩ部位は、ＰｓｔＩリンカーを用いて非反復ＰｓｔＩ部位へ変換した。断片３と断片６のＮｄｅＩ部位は、ＨｉｎｄIIIリンカーを用いて非反復ＨｉｎｄIII部位へ変換した。ＳＰＶ断片３と６に広がる、ＳＰＶ ＨｉｎｄIIIＭ断片の略５４５塩基対ＮｄｅＩ−ＮｄｅＩ亜断片（ヌクレオチド番号１５６０乃至２１０４；配列番号： ）が欠失していた。
相同性ベクター７８９−４１．７３
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７８９−４１．７３を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＢ（ｇII）遺伝子とＰＲＶ ｇＣ（ｇIII）遺伝子とＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）遺伝子並に大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１５６０塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＣ遺伝子は合成早期／後期痘プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあり、上記ＰＲＶ ｇＤ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドの詳細は第３４Ａ−３４Ｅ図に示す。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＰＲＶ ｇＤ遺伝子の第３番目アミノ酸から第２７９番目アミノ酸をコードする配列を含有するＰＲＶ ＢａｍＨＩ ＃７断片の略１５５２塩基対亜断片である。ＥｃｏＲＩ部位とＡＴＧ翻訳開始コドンはＥｃｏＲＩ部位を有する５’プライマーを用いるポリメラーゼ連鎖反応から誘導される。３’末端のＳｔｕＩ部位は通常、ＰＲＶ ｇＩ遺伝子３’−ＰＲＶ ｇＤ遺伝子内にある。ＥｃｏＲＩ部位に始まる全オープンリーディングフレームは４０５個アミノ酸をコードする。断片３は、ＰＲＶ ＢａｍＨＩ ＃２並に＃９の亜断片であるプラスミド２５１−４１．Ａの略２３７８塩基対ＮｃｏＩ−ＮｃｏＩ断片である。本断片末端のＮｃｏＩ部位をＥｃｏＲＩリンカーにより置換した。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII Ｍ断片の略４８塩基対ＡｃｃＩ−ＮｄｅＩ亜断片である。断片５は、ゲノムＰＲＶ ＤＮＡ（２１）のＫｐｎＩ Ｃ断片内のＰＲＶ ｇＢ遺伝子をコードする配列を含む略３５００塩基対断片である。断片５は、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子のアミノ末端を含む略５３塩基対合成断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略７８塩基対ＳｍａＩ−ＮｈｅＩ断片と、ＰＲＶ ＫｐｎＩ Ｃゲノム断片由来の略３３７０塩基対ＮｈｅＩ−ＥｃｏＲＩ断片（２１）とを含有する。断片６は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片７は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１５６０塩基対ＮｄｅＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片３のＡｃｃＩ部位は、ＰｓｔＩリンカーを用いて非反復ＰｓｔＩ部位へ変換した。断片３と断片６のＮｄｅＩ部位は、ＨｉｎｄIIIリンカーを用いて非反復ＨｉｎｄIII部位へ変換した。ＳＰＶ断片３と６に広がる、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII Ｍ断片の略５４５塩基対ＮｄｅＩ−ＮｄｅＩ亜断片（ヌクレオチド番号１５６０乃至２１０４；配列番号： ）が欠失していた。
相同性ベクター７９１−６３．１９
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７９１−６３．１９を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、本外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略２１４９塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片３は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片３のＡＣＣＩ部位は、ＮｏｔＩリンカーを用いて非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７９１−６３．４１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７９１−６３．４１を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、本外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略２１４９塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片３は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片３のＡＣＣＩ部位は、ＮｏｔＩリンカーを用いて非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７９６−１８．９
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７９６−１８．９を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、本外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略２１４９塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成早期痘プロモーター（ＥＰ１）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片３は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片３のＡＣＣＩ部位は、ＮｏｔＩリンカーを用いて非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７８３−３９．２
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７８３−３９．２を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したウシウイルス性下痢症ウイルス糖タンパク質５３（ＢＶＤＶ ｇｐ５３）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略２１４９塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は後期プロモーター（Ｌｐ１）の制御下にあり、上記ＢＶＤＶ ｇｐ５３遺伝子は後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させ構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＢＶＤＶ ｇｐ５３をコードする略１１８７塩基対ＢａｍＨＩ断片である。この１１８７塩基対ＢａｍＨＩ断片は「ウシウイルス性下痢症ウイルスｇｐ４８並にｇｐ５３遺伝子のクローニング」に記載のポリメラーゼ連鎖反応（１５）により合成した。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片４のＡｃｃＩ部位は、ＮｏｔＩリンカーを用いて非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７４９−７５．７８
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７４９−７５．７８を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接した伝染性嚢疾患ウイルス（ＩＢＤＶ）ポリメラーゼ遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。これらの外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１４８４塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略２１４９塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＩＢＤＶポリメラーゼ遺伝子は合成後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本プラスミドは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＩＢＤＶＲＮＡ鋳型からのポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）とｃＤＮＡクローニングにより合成した略２７００塩基対ＥｃｏＲＩ−ＡｓｃＩ制限断片である。ｃＤＮＡとＰＣＲプライマー（５’−ＣＡＣＧＡＡＴＴＣＴＧＡＣＡＴＴＴＴＣＡＡＣＡＧＴＣＣＡＣＡＧＧＣＧＣ−３’；１２／９３．４）（配列番号：）並に（５’−ＧＣＴＧＴＴＧＧＡＣＡＴＣＡＣＧＧＧＣＣＡＧＧ−３’；９／９３．２８）（配列番号：）を用いてＩＢＤＶポリメラーゼ遺伝子の５’末端に略１４００塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢｃｌＩ断片を合成した。また、ｃＤＮＡとＰＣＲプライマー（５’−ＡＣＣＣＧＧＡＡＣＡＴＡＴＧＧＴＣＡＧＣＴＣＣＡＴ−３’；１２／９３．２）（配列番号：）並に（５’−ＧＧＣＧＣＧＣＣＡＧＧＣＧＡＡＧＧＣＣＧＧＧＧＡＴＡＣＧＧ−３’；１２／９３．３）（配列番号：）を用いてＩＢＤＶポリメラーゼ遺伝子の３’末端に略１８００塩基対ＢｃｌＩ−ＡｓｃＩ断片を合成した。これらの二個の断片をＢｃｌＩ部位で連結して略２７００塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢｃｌＩ断片を産生した。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII亜断片である。断片１と断片４のＡｃｃＩ部位は、ＮｏｔＩリンカーを用いて非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
相同性ベクター７６１−７５．Ｂ１８
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７６１−７５．Ｂ１８を構築した。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したネコ免疫不全ウイルス（ＦＩＶ）プロテアーゼ（ｇａｇ）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。本外来遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡの略８５５塩基対断片が配列し、これらの外来遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡの略１１１３塩基対断片が配列する。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は豚痘ウイルスＯｌＬ遺伝子プロモーターの制御下にあり、上記ＦＩＶ ｇａｇ遺伝子は後期／早期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本相同性ベクターは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２５１９塩基対ＨｉｎｄIII−ＳｐｈＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略８５５塩基対亜断片である。すなわち、ＤＮＡプライマーである５’−ＧＡＡＧＣＡＴＧＣＣＣＧＴＴＣＴＴＡＴＣＡＡＴＡＧＴＴＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＴＡ−３’（配列番号：１８５）と５’−ＣＡＴＡＡＧＡＴＣＴＧＧＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＴＴＡＴＡＣＴＡＡＣＡＡＡＡＡＴＡＡＧ−３’（配列番号：１８６）を用いるポリメラーゼ連鎖反応を行いＳｐｈＩ並にＢｇｌII末端を有する８５５塩基対断片を合成した。断片２は、大腸菌ｌａｃＺ遺伝子を含有するプラスミドｐＪＦ７５１（４９）から誘導された３００２塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII断片である。断片３は、ＦＩＶ（ＰＰＲ株）（６１）由来のｃＤＮＡを用いるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により合成した略１８７８塩基対ＥｃｏＲＩ−ＢｇｌII制限断片である。プライマー（５’−ＧＣＧＴＧＡＡＴＴＣＧＧＧＧＡＡＴＧＧＡＣＡＧＧＧＧＣＧＡＧＡＴ−３’；１１／９４．９）（配列番号：）はＦＩＶ ｇａｇ遺伝子の５’末端から合成され、この遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を更にＡＴＧ開始コドンを導入する。プライマー（５’−ＧＡＧＣＣＡＧＡＴＣＴＧＣＴＣＴＴＴＴＴＡＣＴＴＴＣＣＣ−３’；１１／９４．１０）（配列番号：）は、ＦＩＶ ｇａｇ遺伝子の３’末端から合成する。ＰＣＲ産生物は、ＥｃｏＲＩとＢｇｌIIで消化してＦＩＶ ｇａｇ遺伝子に対応する鎖長の１８７８塩基対断片を生成した。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍの略１１１３塩基対亜断片である。すなわち、ＤＮＡプライマーである５’−ＣＣＧＴＡＧＴＣＧＡＣＡＡＡＧＡＴＣＧＡＣＴＴＡＴＴＡＡＴＡＴＧＴＡＴＧＧＧＡＴＴ−３’（配列番号：１８７）と５’−ＧＣＣＴＧＡＡＧＣＴＴＣＴＡＧＴＡＣＡＧＴＡＴＴＴＡＣＧＡＣＴＴＴＴＧＡＡＡＴ−３’（配列番号：１８８）を用いるポリメラーゼ連鎖反応を行いＳａｌＩとＨｉｎｄIII末端を有する１１１３塩基対断片を合成した。
相同性ベクター７８１−８４．Ｃ１１
外来ＤＮＡをＳＰＶに挿入するためプラスミド７８１−８４．Ｃ１１を用いた。これによりＳＰＶ ＤＮＡが隣接したネコ免疫不全ウイルス（ＦＩＶ）エンベロープ（ｅｎｖ）遺伝子と大腸菌β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子が取込まれる。このプラスミドを「組換えＳＰＶを発生するための相同組換え手順」に従って用いることにより上記外来遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。上記β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）標識遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、上記ＦＩＶ ｅｎｖ遺伝子は合成後期／早期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることが注目される。本相同性ベクターは、標準組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を用い、適切な合成ＤＮＡ塩基配列を有する下記源由来の制限断片を相互に結合させて構築した。プラスミドベクターは、ｐＳＰ６４（プロメガ社）の略２９７２塩基対ＨｉｎｄIII−ＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII断片Ｍ（２３）の略１４８４塩基対ＢｇｌII−ＡｃｃＩ制限亜断片である。断片３は、「ポリメラーゼ連鎖反応によるクローニング」に従い合成したＦＩＶ ｅｎｖ遺伝子（６１）の略２５６４塩基対ＢａｍＨＩ−ＢａｍＨＩ断片である。このＰＣＲ反応のための鋳型としてＦＩＶ ＰＰＲ株ゲノムｃＤＮＡ（６１）を用いた。ＦＩＶ ＰＰＲ株ゲノムｃＤＮＡの６２６３番目ヌクレオチドに始まるＦＩＶ ｅｎｖ遺伝子の５’末端に対応する上流プライマー１０／９３．２１（５’−ＧＣＣＣＧＧＡＴＣＣＴＡＴＧＧＣＡＧＡＡＧＧＧＴＴＴＧＣＡＧＣ−３’；配列番号：）を合成した。本法では５’末端にＢａｍＨＩ部位が導入された。このＢａｍＨＩ部位は、ＰＣＲ断片のクローニングの際破壊された。ＦＩＶ ＰＰＲゲノムｃＤＮＡの８８２７番目ヌクレオチドに始まるＦＩＶ ｅｎｖ遺伝子の３’末端に対応する下流プライマー１０／９３．２０（５’−ＣＣＧＴＧＧＡＴＣＣＧＧＣＡＣＴＣＣＡＴＣＡＴＴＣＣＴＣＣＴＣ−３’；配列番号：）を合成した。本法では３’末端にＢａｍＨＩ部位が導入された。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）の略３０１０塩基対ＢａｍＨＩ−ＰｖｕII制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄIII制限断片Ｍ（２３）の略２１４９塩基対ＡｃｃＩ−ＨｉｎｄIII制限亜断片である。本ＳＰＶ相同性ベクターのＡｃｃＩ部位は、非反復ＮｏｔＩ部位へ変換した。
〔実施例〕
実施例１
相同性ベクター５１５−８５．１
相同性ベクター５１５−８５．１は外来性ＤＮＡのＳＰＶへの挿入に有用なプラスミドである。プラスミド５１５−８５．１は、それに外来性ＤＮＡをクローン化し得る唯一のＡｃｃＩ制限部位を含有する。かかる外来性ＤＮＡインサートを含有するプラスミドを「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従って用いて、外来性ＤＮＡを含有するＳＰＶを得ることができる。この方法を首尾よく行うためには、挿入部位（ＡｃｃＩ）がＳＰＶの複製に必須ではない領域にあって、該部位に、ウイルスとプラスミドＤＮＡとの間の相同組換えを媒介するのに適した豚痘ウイルスＤＮＡがその端部に隣接することが重要である。相同性ベクター５１５−８５．１におけるＡｃｃＩ部位を用いて、外来性ＤＮＡを少なくとも３つの組換えＳＰＶに挿入する（実施例２−４参照）。
適当な挿入部位を規定するために、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片のライブラリーを創製した。これらの制限断片のうちいつくかを（ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｇ、ＪおよびＭ、図１Ａ−１Ｂ参照）制限マッピング解析に付した。可能な挿入部位として２つの制限部位が各断片で同定された。これらの部位は断片ＧにおけるＮｒｕＩ、断片ＪにおけるＢａｌＩおよびＸｂａＩ、および断片ＭにおけるＡｃｃＩおよびＰｓｔＩを含むものであった。β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子を可能な部位の各々に挿入した。得られたプラスミドを「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」で利用した。組換えウイルスの創製は「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶをスクリーニングするアッセイ」によって判断した。６つの部位のうち４つは組換えウイルスを生じることが判明したが、これらの各ウイルスが親ＳＰＶから精製除去される能力は大きく変動した。１つの場合において、ウイルスを１％のレベルを超えて精製できず、もう１つの場合において、ウイルスを５０％のレベルを超えて精製できが、および第３の場合において、ウイルスを９０％のレベルを超えて精製できなかった。これらのウイルスを精製できないことは、挿入部位における不安定性を示す。これは対応する部位を外来性ＤＮＡの挿入に不適当とする。しかしながら、１の部位（相同性ベクター５１５−８５．１のＡｃｃＩ部位）における挿入の結果、容易に１００％まで精製できたウイルスが得られ（実施例２参照）、これは外来性ＤＮＡの挿入のための適当な部位を規定する。
相同性ベクター５１５−８５．１をＤＮＡ配列解析によってさらに特徴付けた。相同性ベクターの２つの領域を配列決定した。第１の領域は、唯一のＡｃｃＩ部位に隣接する５９９塩基対配列をカバーする（図２Ａおよび２Ｂ参照）。第２の領域は唯一のＨｉｎｄＩＩＩ部位の上流の８９９塩基対をカバーする（図２Ａおよび２Ｂ参照）。第１の領域の配列はGoebelら,1990によって同定されたワクシニアウイルス（ＶＶ）ＯＩＬオープンリーディングフレームのアミノ酸１ないし令１１５に対して相同性を示すオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）をコードする（図３Ａ−３Ｃ参照）。第２の領域の配列は同ワクシニアウイルスＯＩＬオープンリーディングフレームのアミノ酸５６８ないし６６６に対して相同性を示すオープンリーディングフレームをコードする（図３Ａ−３Ｃ参照）。これらのデータは、ＡｃｃＩ部位はほぼアミノ酸４１において推定ＶＶ ＯＩＬ−様ＯＲＦを中断することを示し、これは、このＯＲＦがＳＰＶ複製につき必須でない遺伝子をコードすることを示唆する。Goebelらは、ＶＶ ＯＩＬ ＯＲＦはある種の真核生物転写調節蛋白質に特徴的なロイシンジッパー・モチーフを含有することを提案しているが、彼らはこの遺伝子がウイルス複製に必須か否かは知られていないことを示している。ＶＶ ＯＩＬ−様ＯＲＦの上流に位置するＤＮＡ配列（図２Ａ参照）は豚痘ウイルスのプロモーターを含有することが予測されるであろう。この豚痘ウイルスのプロモーターは豚痘ゲノムに導入された外来性ＤＮＡ対照要素として有用であろう。
実施例２
Ｓ−ＳＰＶ−００３
Ｓ−ＳＰＶ−００３は外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリ（Ｅ.coli）β−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ遺伝子）をＳＰＶ５１５−８５．１ ＯＲＦに導入した。外来性遺伝子（ｌａｃＺ）は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−００３はＳ−ＳＰＶ−１００（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター５２０−１７．５（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−００３と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現していたことを示す。ここに記載するアッセイはＶＥＲＯ細胞ならびにＥＭＳＫ細胞で行い、これはＶＥＲＯ細胞がＳＰＶ組換えワクチンの生産のための適当な基礎となろうことを示す。Ｓ−ＳＰＶ−００３は受託番号２３３５の下でＡＴＣＣに寄託された。
実施例３
Ｓ−ＳＰＶ−００８
Ｓ−ＳＰＶ−００８は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇ５０（ｇＤ）（２６）についての遺伝子をＳＰＶ ５１５−８５．１ ＯＲＦに挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ｇ５０（ｇＤ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−００８はＳ−ＳＰＶ−１００（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター５３８−４６．１６（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−００８と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−００８を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶ血清はＳ−ＳＰＶ−００８プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００９陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−００８で観察されたプラークはブタ抗血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。また、黒色プラーク・アッセイを固定されていない単層で行った。固定されていない単層上のＳＰＶプラークもブタ抗−ＰＲＶ血清との特異的反応性を呈し、これはＰＲＶ抗原が感染細胞表面で発現されることを示す。
ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶで感染させ、感染細胞溶解物の試料をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶ血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。図６に示すごとく、Ｓ−ＳＰＶ−００８感染細胞からの溶解物はほぼ４８ｋｄの特異的バンド、ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）（３５）の報告されたサイズを示す。
ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）はＨＳＶ−１（２６）のｇ５０（ｇＤ）同族体である。幾人かの研究者は、ＨＳＶ−１ ｇ５０（ｇＤ）を発現するＶＶはマウスをＨＳＶ−１での攻撃から保護することを示している（６および３４）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−００８はブタをＰＲＶ病から保護するためのワクチンとして価値があるはずである。
いくつかの他のＰＲＶ糖蛋白質がＰＲＶ病から保護するための組換え豚痘ワクチンの創製で有用であろうことが予想される。これらのＰＲＶ糖蛋白質はｇＩＩ（２８）、ｇＩＩＩ（２７）、およびｇＨ（１９）を含む。ＰＲＶ ｇＩＩ１暗号領域はいくつかの合成ｐｏｘプロモーターの後に作成された。Ｓ−ＳＰＶ−００８の創製で利用した技術は、全ての４つのこれらのＰＲＶ糖蛋白質遺伝子を発現する組換え豚痘ウイルスを創製するのに使用されるであろう。かかる組換え豚痘ウイルスはＰＲＶ病に対するワクチンとして有用であろう。ここに記載するＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらは、ワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸＨｅｒｄＣｈｅｋR，ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。Ｓ−ＳＰＶ−００８は受託番号ＶＲ２３３９の下でＡＴＣＣに寄託された。
（実施例４−５削除）
実施例６
Ｓ−ＳＰＶ−０１３
Ｓ−ＳＰＶ−０１３は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルスｇＩＩＩ（ｇＣ）についての遺伝子を相同性ベクター５７０−３３．３２の唯一のＰｓｔＩ制限部位（唯一のＡｃｃＩ部位に挿入されたＰｓｔＩリンカー）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子は合成後期初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０１３はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター５７０−９１．６４（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０１３と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０１３を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ヤギ抗−ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）ポリクローナル抗体はＳ−ＳＰＶ−０１３プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０１２で観察されたプラークはブタ抗−ＰＲＶ血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＭＳＫ細胞およびＶＥＲＯ細胞で行い、ＥＭＳＫ細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産に適した基礎となろうことが示される。
ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶで感染させ、感染細胞溶解物の試料をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ヤギ抗−ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）ポリクローナル抗体を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。図１６に示すごとく、Ｓ−ＳＰＶ−０１３感染細胞からの溶解物は、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）（３７）の報告されたサイズである２つの特異的バンド−９２ｋｄ成熟形態および７４ｋｄプレ−ゴルジ形態を示す。
組換体で発現されたＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）はマウスおよびブタにおいて有意な免疫応答を誘導することが示された（３７、３８）。さらにｇＩＩＩ（ｇＣ）をｇＩＩ（ｇＢ）またはｇ５０（ｇＤ）と共に発現させた場合、ビルレントＰＲＶでの攻撃からの有意な保護が得られる（３９）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−０１３はブタをＰＲＶ病から保護するためのワクチンとして価値があるはずである。ここに記載するＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらは、ワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋR，ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。Ｓ−ＳＰＶ−０１３は受託番号２４１８の下でＡＴＣＣに寄託された。
組換え豚痘ウイルスワクチンＳ−ＳＰＶ−００８およびＳ−ＳＰＶ−０１３を用いるアウエスキー病に対する保護
Ｓ−ＳＰＶ−００８およびＳ−ＳＰＶ−０１３を含有するワクチン（１×１０６ＰＦＵ／ｍｌ）（２種のウイルスの１：１混合物の２ｍｌ）を皮内接種または経口／咽頭スプレイによって、２群のブタ（群当たり５匹ブタ）に投与した。５匹ブタの対照群には皮内および経口／咽頭接種によってＳ−ＳＰＶ−００１を摂取させた。ワクチン接種から３週間後に、鼻孔内接種によってビルレントＰＲＶ株４９８２でブタを攻撃した。表は臨床的応答の要約を与える。該データは、Ｓ−ＳＰＶ−００１ワクチン接種対照と比較したＳ−ＳＰＶ−００８／Ｓ−ＳＰＶ−０１３ワクチン接種体におけるアウエスキー病からの保護の増加を支持する。
Ｓ−ＳＰＶ−０１５
Ｓ−ＳＰＶ−０１５は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩＩ（ｇＢ）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦ（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｃｏｔＩ制限部位で置き換えた）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０１５はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７２７−５４．６０（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０１５と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０１５を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０１５プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０１５で観察されたプラークは該抗血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産に適した基礎となろうことが示される。
ＰＲＶ ｇＩＩ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０１５で感染させ、感染細胞溶解物の試料をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０１５感染細胞からの溶解物は、ＰＲＶ ｇＩＩ糖蛋白質の予測されたサイズである、１２０ｋｄ、６７ｋｄおよび５８ｋｄに対応するバンドを呈した。
Ｓ−ＳＰＶ−０１５はブタにおいて仮性狂犬病ウイルスに対するワクチンとして有用である。優れたワクチンは、ブタにおいて仮性狂犬病に対する保護のためにＳ−ＳＰＶ−００８（ＰＲＶ ｇ５０）、Ｓ−ＳＰＶ−０１３（ＰＲＶ ｇＩＩＩ）と戦うことによって処方される。
従って、Ｓ−ＳＰＶ−０１５はブタをＰＲＶ病から保護するためのワクチンとして価値があるはずである。ここに記載するＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらは、ワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋR，ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。Ｓ−ＳＰＶ−０１５は受託番号２４６６の下でＡＴＣＣに寄託された。
実施例８
ＰＲＶ糖蛋白質の１種のみを発現する組換え豚痘ウイルスを用いることによって得ることができるものよりもＰＲＶ感染に対して保護する増強された能力を持つ組換え豚痘ウイルスを得るために、仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）に対する中和抗体の産生を誘導できる、１種を超える仮性狂犬病糖蛋白質を発現する組換え豚痘ウイルスを構築する。
１種を超えるＰＲＶ糖蛋白質を発現するかかる組換え豚痘ウイルスのいくつかの例がある：ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）およびｇＩＩＩ（ｇＤ）を発現する組換え豚痘ウイルス、ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）およびｇＩＩ（ｇＢ）を発現する組換え豚痘ウイルス；ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）およびｇＩＩＩ（ｇＣ）を発現する組換え豚痘ウイルス；およびｇ５０（ｇＤ）、ｇＩＩＩ（ｇＣ）およびｇＩＩ（ｇＢ）を発現する組換え豚痘ウイルスを発現する組換え豚痘ウイルス。前記引用ウイルスの各々は、組換え豚痘ウイルスのクローニングを容易とするであろうイー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）遺伝子を含有させ発現させるようにも設計される。
以下にリストするのは、ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）およびイー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）を発現する組換え豚痘ウイルスの３つの例である。
ａ）ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）遺伝子およびｌａｃＺ遺伝子を含有する豚痘ウイルス。全ての４種の遺伝子は、豚痘ウイルスゲノムのＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片内の唯一のＡｃｃＩ制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入する。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子は合成初期プロモーター（ＥＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、およびｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にある。
ｂ）ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）遺伝子およびｌａｃＺ遺伝子を含有する豚痘ウイルス。全ての４種の遺伝子は、豚痘ウイルスゲノムのＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片内の唯一のＡｃｃＩ制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入する。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、およびｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にある。
ｃ）ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）遺伝子およびｌａｃＺ遺伝子を含有する豚痘ウイルス。全ての４種の遺伝子は、豚痘ウイルスゲノムのＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片内の唯一のＡｃｃＩ制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入する。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩＩ（ｇＣ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＥＰ２ＬＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩＩ（ｇＢ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、およびｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にある。
組換え豚痘ウイルスワクチンＳ−ＳＰＶ−００８、Ｓ−ＳＰＶ−０１３およびＳ−ＳＰＶ−０１５を用いるアウエスキー病に対する保護
Ｓ−ＳＰＶ−００８、Ｓ−ＳＰＶ−０１３、またはＳ−ＳＰＶ−０１５を含有するワクチン（１×１０７ＰＦＵ／ｍｌウイルスの２ｍｌ）またはＳ−ＳＰＶ−００８、Ｓ−ＳＰＶ−０１３、およびＳ−ＳＰＶ−０１５の混合物（３種ウイルスの１：１：１混合物の２ｍｌ；１×１０７ＰＦＵ／ｍｌ）を筋肉内接種によって、４群のブタ（群当たり５匹ブタ）に投与した。５匹ブタの対照群には筋肉内接種によってＳ−ＳＰＶ−００１を摂取させた。ワクチン接種から４週間後に、鼻孔内接種によってビルレントＰＲＶ株４９８２でブタを攻撃した。仮性狂犬病の臨床的徴候につき１４日間毎日ブタを観察し、表は臨床的応答の要約を与える。該データは、Ｓ−ＳＰＶ−００８、Ｓ−ＳＰＶ−０１３、またはＳ−ＳＰＶ−０１５でワクチン接種したブタは、Ｓ−ＳＰＶ−００１ワクチン接種対照と比較して、仮性狂犬病ウイルスによって引き起こされたアウエスキー病に対する部分的保護を有し、組合せワクチンＳ−ＳＰＶ−００８／Ｓ−ＳＰＶ−０１３／Ｓ−ＳＰＶ−０１５でワクチン接種したブタは完全な保護を有したことを示す。
実施例１７
種々の病気を引き起こす微生物からの抗原を発現させるための豚痘ウイルスを利用するワクチンの開発を企画することができる。
伝染性胃腸炎ウイルス
豚痘ウイルスベクターで使用する、伝染性胃腸炎ウイルス（ＴＧＥ）の主要中和抗原、糖蛋白質１９５をクローン化した。該中和抗原のクローンは１９８７年７月２７日に出願された米国特許出願第０７８，５１９号に開示されている。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）をＳＰＶにおいて発現させるのに使用された、および本明細書に開示した手法はＴＧＥに適用できると考えられる。
ブタ・パルボウイルス
ブタ・パルボウイルス（ＰＰＶ）の主要キャプシド蛋白質を豚痘ウイルスベクターで使用するためにクローン化した。該キャプシド蛋白質は１９９１年１１月２６日に発行された米国特許第５，０６８，１９２号に開示されている。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）をＳＰＶにおいて発現させるのに使用された、および本明細書に開示した手法はＰＰＶに適用できると考えられる。
ブタ・ロタウイルス
ブタ・ロタウイルスの主要中和抗原、糖蛋白質３８を豚痘ウイルスベクターで使用するためにクローン化した。糖蛋白質３８のクローンは１９９１年１１月２６日に発行された米国特許第５，０６８，１９２号に開示されている。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）をＳＰＶにおいて発現させるのに使用された、および本明細書に開示した手法はＳＲＶに適用できると考えられる。
ブタ・コレラウイルス
ウシ・ウイルス性下痢（ＢＶＤ）ウイルスの主要中和抗原を、１９８８年７月２７日に出願された米国特許出願第２２５，０３２号に開示されているごとくにクローン化した。ＢＶＤおよびブタ・コレラウイルスは交差保護性であるので（３１）、ＢＶＤウイルス抗原は豚痘ウイルスベクターで使用するために標的化されている。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）をＳＰＶにおいて発現させるのに使用された、および本明細書に開示した手法はＢＶＤに適用できると考えられる。
セルプリナ・ヒオディセンテリエ（Serpulina Hyodysenteriae）
豚痘ウイルスベクターで使用するためのSerpulina Hyodysenteriae（３）の保護抗原はクローン化されている。ＰＲＶ ｇ５０（ｇＤ）をＳＰＶにおいて発現させるのに使用された、および本明細書に開示した手法はSerpulina Hyodysenteriaeに適用できると考えられる。
以下の微生物からの抗原も動物ワクチンを開発するのに利用できる：ブタ・インフルエンザウイルス、口蹄疫ウイルス、アフリカブタ熱ウイルス、ブタ・コレラウイルス、マイコプラズマ・ヒオニューモニエ（Mycoplasma hyopneumoniae）、ブタ生殖系および呼吸器系症候群／ブタ不妊症および呼吸器系症候群（ＰＲＲＳ／ＳＩＲＳ）。
以下の微生物からの抗原も動物ワクチンで利用できる：イヌ−ヘルペスウイルス、イヌ・ジステンパー、イヌ・アデノウイルス１型（肝炎）、アデノウイルス２型（呼吸器系病）、パラインフルエンザ、レプトスピラ・カニコラ（Leptospira canicola）、イクテロヘモラジア（icterohemorragia）、パルボウイルス、コロナウイルス、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgdorferi）、イヌ・ヘルペスウイルス、ボルデテラ・ブロンキセプティカ（Bordetella bronshiseptica）、ディロフィラエ・イミティス（Dirofilaria immitis）（イヌ糸状虫）および狂犬病ウイルス、２）ネコ−Ｆｉｖ ｇａｇおよびｅｎｖ、ネコ白血病ウイルス、ネコ免疫不全ウイルス、ネコ・ヘルペスウイルス、ネコ感染性腹膜炎ウイルス、イヌ・ヘルペスウイルス、イヌ・コロナウイルス、イヌ・パルボウイルス、（イヌおよびネコにおけるDirofilaria immitisを含めた）動物における寄生虫病、ウマ感染性貧血、ストレプトコッカス・エキィ（Streptococcus equi）、球虫類亜綱（coccidia）、エメリア（emeria）、ニワトリ貧血ウイルス、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgdorferi）、ウシ・コロナウイルス、パステレラ・ヘマリティカ（Pasteurella haemolytica）。
（実施例１８−２３削除）
実施例２４
相同性ベクター７３８−９４．４
相同性ベクター７３８−９４．４は１つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスベクターである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）についての遺伝子をＯ１Ｌオープンリーディングフレーム（配列番号：１１５）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子はＯ１Ｌプロモーターの制御下にある。該相同性ベクター７３８−９４．４は、Ｏ１Ｌ ＯＲＦの一部を示すヌクレオチド１６７９ないし２４５２（配列番号：１８９；図１７）からのＳＰＶ ＤＮＡの欠失を含む。
ＤＮＡプライマー５’−ＧＡＡＧＣＡＴＧＣＣＣＧＴＴＣＴＴＡＴＣＡＡＴＡＧＴＴＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＴＡ−３’（配列番号：１８５）および５’−ＣＡＴＡＡＧＡＴＣＴＧＧＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＴＴＡＴＡＣＴＡＡＣＡＡＡＡＡＴＡＡＧ−３’（配列番号：１８６）を用いるポリメラーゼ鎖反応によって上流ＳＰＶ配列を合成してＢｇｌＩＩおよびＳｐｈＩ末端をもつ８５５塩基対断片を得た。Ｏ１Ｌプロモーターはこの断片上に存在する。ＤＮＡプライマー５’−ＣＣＧＴＡＧＴＣＧＡＣＡＡＡＧＡＴＣＧＡＣＴＴＡＴＴＡＡＴＡＴＧＴＡＴＧＧＧＡＴＴ−３’（配列番号：１８７）および５’−ＧＣＣＴＧＡＡＧＣＴＴＣＴＡＧＴＡＣＡＧＴＡＴＴＴＡＣＧＡＣＴＴＴＴＧＡＡＡＴ−３’（配列番号：１８８）を用いるポリメラーゼ鎖反応によって下流ＳＰＶ配列を合成してＳａｌＩおよびＨｉｎＩＩＩ末端を持つ１１１３塩基対断片を得た。組換え豚痘ウイルスは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７３８−９４．４およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１（Kansza株）を利用して誘導した。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果は該組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。相同性ベクター７３８−９４．４から誘導された組換え豚痘ウイルスは、外来性抗原を発現させるための発現ベクターとして、および組換え豚痘ウイルスによって発現された外来性遺伝子に対して動物で保護免疫応答を生起させるためのワクチンとして利用される。Ｏ１Ｌプロモーターに加えて、ＬＰ１、ＥＰ１ＬＰ２、ＬＰ２ＥＰ２、ＨＣＭＶ即時型を含めた他のプロモーターが欠失領域に挿入され、１以上の外来性遺伝子がこれらのプロモーターから発現される。
実施例２４Ｂ
相同性ベクター７５２−２２．１は２つの外来性遺伝子を発現させるのに利用される豚痘ウイルスベクターである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）についての遺伝子をＯ１Ｌオープンリーディングフレーム（配列番号：１１５）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子はＯ１Ｌプロモーターの制御下にある。第２の外来性遺伝子は、ＬＰ２ＥＰ２プロモーター配列に従ってＥｃｏＲＩまたはＢａｍＨＩ部位に挿入されたＬＰ２ＥＰ２プロモーターから発現される。相同性ベクター７５２−２２．１は、Ｏ１Ｌ ＯＲＦの一部を欠失するヌクレオチド１６７９ないし２４５２（配列番号：１８９；図１７）からのＳＰＶ ＤＮＡの欠失を含む。相同性ベクター７５２−２２．１はＬＰ２ＥＰ２プロモーター断片の挿入によって相同性ベクター７３８−９４．４から誘導された（材料および方法参照）。相同性ベクター７５２−２２．１は、合成ＬＰ１プロモーターの制御下にあるｌａｃＺ遺伝子を入れることによってさらに改良される。該ＬＰ１プロモーターの結果、ＳＰＶ Ｏ１Ｌプロモーターと比較してより高いレベルのｌａｃＺ発現となる。
実施例２５
Ｓ−ＳＰＶ−０４１：
Ｓ−ＳＰＶ−０４１は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびウマ・ヘルペスウイルス１型糖蛋白質Ｂ（ｇＢ）についての遺伝子を７３８−９４．４ＯＲＦ（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；ヌクレオチド１６７９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＯｌＬプロモーターの制御下にあり、ＥＨＶ−１ ｇＢ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４１はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７５２−２９．３３（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４１と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４１はウマにおいてＥＨＶ−１感染に対するワクチンとして有用であって、ＥＨＶ−１糖蛋白質Ｂの発現に有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０４５：
Ｓ−ＳＰＶ−０４５は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および感染性ウシ鼻気管炎ウイルス糖蛋白質Ｅ（ｇＥ）についての遺伝子を７３８−９４．４ＯＲＦ（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；ヌクレオチド１６７９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＯｌＬプロモーターの制御下にあり、ＩＢＲＶ ｇＥ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４５はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７４６−９４．１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４５と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４５はＩＢＲＶ糖蛋白質Ｅの発現に有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０４９：
Ｓ−ＳＰＶ−０４９は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびウシ・ウイルス性下痢ウイルス糖蛋白質４８（ｇｐ４８）についての遺伝子を７３８−９４．４ ＯＲＦ（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；ヌクレオチド１６７９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＯｌＬプロモーターの制御下にあり、ＢＶＤＶ ｇｐ４８遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４９はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７７１−５５．１１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４９と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４９はウシにおいてＢＶＤＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＢＶＤＶ糖蛋白質４８の発現に有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０５０：
Ｓ−ＳＰＶ−０５０は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびウシ・ウイルス性下痢ウイルス糖蛋白質５３（ｇｐ５３）についての遺伝子を７３８−９４．４ ＯＲＦ（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；ヌクレオチド１６７９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＯｌＬプロモーターの制御下にあり、ＢＶＤＶ ｇＥ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０５０はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７６７−６７．３（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５０と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０５０はウシにおいてＢＶＤＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＢＶＤＶ糖蛋白質５３の発現に有用である。
実施例２６
各々ニワトリ・インターフェロン（ｃＩＦＮ）またはニワトリ骨髄単球成長因子（ｃＭＧＦ）を発現する組換え豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０４２またはＳ−ＳＰＶ−０４３は、家禽の病気に対するワクチンに添加すると、免疫応答を増強するのに有用である。ニワトリ骨髄単球増殖因子（ｃＭＧＦ）は哺乳動物インターロイキン−６蛋白質と相同であり、ニワトリ・インターフェロン（ｃＩＦＮ）は哺乳動物インターフェロンと相同である。特異的鳥類病に対するワクチンと組み合わせて用いると、Ｓ−ＳＰＶ−０４２およびＳ−ＳＰＶ−０４３は、限定されるものではないが、マレク病ウイルス、ニューカッスル病ウイルス、感染性咽頭気管炎ウイルス、感染性気管支炎、感染性包病ウイルスを含めた鳥類を引き起こすウイルスに対して増強された粘液性、体液性、または細胞媒介免疫を供する。
実施例２６Ａ
Ｓ−ＳＰＶ−０４２：
Ｓ−ＳＰＶ−０４２は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびニワトリ・インターフェロン（ｃＩＦＮ）についての遺伝子をＳＰＶ６１７−４８．１ ＯＲＦ（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｃｏＩ制限部位で置き換えた）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後記プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ｃＩＦＮ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４２はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７５１−０７．Ａ１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４２と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４２は細胞培養においてインターフェロン活性を有する。Ｓ−ＳＰＶ−０４２条件培地のニワトリ胚繊維芽細胞（ＣＥＦ）細胞培養への添加は、水泡性口内炎ウイルスによる、またはシチメンチョウのヘルペスウイルスによるＣＥＦ細胞の感染を阻害する。Ｓ−ＳＰＶ−０４２は家禽の病気に対するワクチンに添加すると、免疫応答を増強するのに有用である。
実施例２６Ｂ
Ｓ−ＳＰＶ−０４３：
Ｓ−ＳＰＶ−０４３は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびニワトリ骨髄単球増殖因子（ｃＭＧＦ）についての遺伝子をＳＰＶ６１７−４８．１ ＯＲＦ（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｃｏＩ制限部位で置き換えた）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後記プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ｃＭＧＦ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４３はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７５１−５６．Ａ１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４３と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４３は家禽の病気に対するワクチンに添加すると、免疫応答を増強させるのに有用である。
実施例２７
非必須部位の、豚痘ウイルスＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片の２．０ｋｂＨｉｎｄＩＩＩないしＢｇｌＩＩ領域への挿入
豚痘ウイルスＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片の２．０ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩないしＢｇｌＩＩ領域は外来性ＤＮＡのＳＰＶへの挿入で有用である。外来性ＤＮＡは該領域における唯一のＢｇｌＩＩ制限部位に挿入される（図１７；配列番号：１９５のヌクレオチド５４０）。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従って、外来性ＤＮＡインサートを含有するプラスミドを用いて外来性ＤＮＡを含有するＳＰＶを得る。この手法が首尾よく行われるためには、挿入部位がＳＰＶの複製に必須でない領域にあって、該部位に、ウイルスとプラスミドＤＮＡとの間の相同組換えを媒介するのに適した豚痘ウイルスＤＮＡがその端部に隣接することが重要である。豚痘ウイルスＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片の２．０ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩないしＢｇｌＩＩ領域における唯一のＢｇｌＩＩ制限部位はＳＰＶＩ４Ｌオーブンリーディングフレームの暗号領域内に位置する。該Ｉ４Ｌ ＯＲＦはワクシニアウイルスおよび天然痘ウイルス・リボヌクレオチド・レダクターゼ（大サブユニット）遺伝子（５６−５８）に対して配列同様性を有する。該リボヌクレオチド・レダクターゼ（大サブユニット）遺伝子はワクシニアウイルスのＤＮＡ複製に非必須であって、豚痘ウイルスにおける適当な挿入部位である。
実施例２８
Ｓ−ＳＰＶ−０４７
Ｓ−ＳＰＶ−０４７は２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルスｇＢ（ｇＩＩ）についての遺伝子を唯一のＨｉｎｄＩＩＩ部位（ＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片の２．０ｋｂ ＢｇｌＩＩないしＨｉｎｄＩＩＩサブ断片内にあるＢｇｌＩＩ制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入されたＨｉｎｄＩＩＩリンカー）に挿入した。該ＢｇｌＩＩ挿入部位は、ワクシニアウイルス・リボヌクレオシド二リン酸レダクターゼ遺伝子に対して有意な相同性を有するＳＰＶ １４Ｌオープンリーディングフレーム内にある。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＢ（ｇＩＩ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４７はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９９−９４．３１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４７と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０４７を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０４７プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０４７で観察されたプラークはブタ抗−ＰＲＶ血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＰＲＶ ｇＢ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０４７で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０４７感染細胞からの溶解物は、ＰＲＶ糖蛋白質Ｂの予測されるサイズである１２０ｋＤ、６７ｋＤおよび５８ｋＤに対応するバンドを呈した。
ＳＰＶ組換え体で発現されたＰＲＶ ｇＢはブタにおいて有意な免疫応答を刺激することが示されている（３７、３８；実施例８参照）。さらに、ＰＲＶ ｇＢを組換えＳＰＶで発現させ、ビルレントＰＲＶでの攻撃からの有意な保護が得られる（実施例６および８参照）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−０４７はＰＲＶ病に対してブタを保護するためのワクチンとして価値がある。ここに記載したＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらはワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋＲ、ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋＲおよびＣｌｉｎＥａｓｅＲ）と適合するであろう。
Ｓ−ＳＰＶ−０５２
Ｓ−ＳＰＶ−０５２は３つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルスｇＢ（ｇＩＩ）についての遺伝子を唯一のＨｉｈｄＩＩＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＮｄｅＩ部位に挿入されたＨｉｎｄＩＩＩリンカー；ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片のほぼ５４５塩基対ＮｄｅＩないしＮｄｅＩサブ断片（ヌクレオチド１５６０ないし２１０４；配列番号）が欠失されている）に挿入した。ＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）についての遺伝子を唯一のＰｓｔＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＡｃｃＩ部位に挿入されたＰｓｔＩリンカー）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＢ（ｇＩＩ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあって、ＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０５２はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７８９−４１．７（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５２と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０５２を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０５２プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０５２で観察されたプラークはブタ抗−ＰＲＶ血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＰＲＶ ｇＢおよびｇＤ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０５２で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０５２感染細胞からの溶解物および上清は、ＰＲＶ糖蛋白質Ｂの予測されるサイズである１２０ｋＤ、６７ｋＤおよび５８ｋＤに対応するバンド、およびＰＲＶ糖蛋白質Ｄの予測されるサイズである４８ｋＤに対応するバンドを呈した。
ＳＰＶ組換え体で発現されたＰＲＶ ｇＢおよびｇＤはブタにおいて有意な免疫応答を刺激することが示されている（３７、３８；実施例８参照）。さらに、ＰＲＶ ｇＢおよびｇＤを組換えＳＰＶで発現させ、ビルレントＰＲＶでの攻撃からの有意な保護が得られる（実施例６および８参照）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−０５２はＰＲＶ病に対してブタを保護するためのワクチンとして価値がある。ここに記載したＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらはワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋR、ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。
Ｓ−ＳＰＶ−０５３
Ｓ−ＳＰＶ−０５３は３つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルスｇＢ（ｇＩＩ）についての遺伝子を唯一のＨｉｎｄＩＩＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＮｅＩ部位に挿入されたＨｉｎｄＩＩＩリンカー；ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片のほぼ５４５塩基対ＮｄｅＩないしＮｄｅＩサブ断片（ヌクレオチド１５６０ないし２１０４；配列番号）が欠失されている）に挿入した。ＰＲＶ ｇＣ（ｇＩＩＩ）についての遺伝子を唯一のＰｓｔＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＡｃｃＩ部位に挿入されたＰｓｔＩリンカー）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＢ（ｇＩＩ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあって、ＰＲＶ ｇＣ（ｇＩＩＩ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０５３はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７８９−４１．２７（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５３と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０５３を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０５３プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０５３で観察されたプラークはブタ抗−ＰＲＶ血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＰＲＶ ｇＢおよびｇＣ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０５３で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０５３感染細胞からの溶解物および上清は、ＰＲＶ糖蛋白質Ｂの予測されるサイズである１２０ｋＤ、６７ｋＤおよび５８ｋＤに対応するバンド、およびＰＲＶ糖蛋白質Ｃの予測されるサイズである９２ｋＤに対応するバンドを呈した。
ＳＰＶ組換え体で発現されたＰＲＶ ｇＢおよびｇＣはブタにおいて有意な免疫応答を刺激することが示されている（３７、３８；実施例８参照）。さらに、ＰＲＶ ｇＢおよびｇＣを組換えＳＰＶで発現させ、ビルレントＰＲＶでの攻撃からの有意な保護が得られる（実施例６および８参照）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−０５３はＰＲＶ病に対してブタを保護するためのワクチンとして価値がある。ここに記載したＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらはワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋR、ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。
Ｓ−ＳＰＶ−０５４
Ｓ−ＳＰＶ−０５４は３つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルスｇＣ（ｇＩＩＩ）についての遺伝子を唯一のＨｉｎｄＩＩＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＮｅＩ部位に挿入されたＨｉｎｄＩＩＩリンカー；ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片のほぼ５４５塩基対ＮｄｅＩないしＮｄｅＩサブ断片（ヌクレオチド１５６０ないし２１０４；配列番号）が欠失されている）に挿入した。ＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）についての遺伝子を唯一のＰｓｔＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＡｃｃＩ部位に挿入されたＰｓｔＩリンカー）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＣ（ｇＩＩＩ）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にあって、ＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）遺伝子は合成初期／後期プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０５４はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７８９−４１．２７（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５４と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０５４を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０５４プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０５４で観察されたプラークはブタ抗−ＰＲＶ血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＰＲＶ ｇＣおよびｇＤ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０５４で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０５４感染細胞からの溶解物および上清は、ＰＲＶ糖蛋白質Ｃの予測されるサイズである９２ｋＤに対応するバンド、およびＰＲＶ糖蛋白質Ｄの予測されるサイズである４８ｋＤに対応するバンドを呈した。
ＳＰＶ組換え体で発現されたＰＲＶ ｇＣおよびｇＤはブタにおいて有意な免疫応答を刺激することが示されている（３７、３８；実施例８参照）。さらに、ＰＲＶ ｇＣおよびｇＤを組換えＳＰＶで発現させ、ビルレントＰＲＶでの攻撃からの有意な保護が得られる（実施例６および８参照）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−０５４はＰＲＶ病に対してブタを保護するためのワクチンとして価値がある。ここに記載したＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらはワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋR、ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。
Ｓ−ＳＰＶ−０５５
Ｓ−ＳＰＶ−０５５は４つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルスｇＢ（ｇＩＩ）についての遺伝子を唯一のＨｉｎｄＩＩＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＮｅＩ部位に挿入されたＨｉｎｄＩＩＩリンカー；ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｍ断片のほぼ５４５塩基対ＮｄｅＩないしＮｄｅＩサブ断片（ヌクレオチド１５６０ないし２１０４；配列番号）が欠失されている）に挿入した。ＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）およびＰＲＶ ｇＣ（ｇＩＩＩ）についての遺伝子を唯一のＰｓｔＩ制限部位（ＳＰＶ ＯｌＬオープンリーディングフレーム中の唯一のＡｃｃＩ部位に挿入されたＰｓｔＩリンカー）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＢ（ｇＩＩ）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＤ（ｇ５０）遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあって、ＰＲＶ ｇＣ（ｇＩＩＩ）遺伝子は合成初期／後記プロモーター（ＥＰ１ＬＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０５５はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７８９−４１．７３（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５５と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０５５を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０５５プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０５５で観察されたプラークはブタ抗−ＰＲＶ血清と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＰＲＶ ｇＢ、ｇＣおよびｇＤ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０５５で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＰＲＶポリクローナル血清を用いてＰＲＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０５５感染細胞からの溶解物および上清は、ＰＲＶ糖蛋白質Ｂの予測されるサイズである１２０ｋＤ、６７ｋＤおよび５８ｋＤに対応するバンド；ＰＲＶ糖蛋白質Ｃの予測されるサイズである９２ｋＤに対応するバンド；およびＰＲＶ糖蛋白質Ｄの予測されるサイズである４８ｋＤに対応するバンドを呈した。
ＳＰＶ組換え体で発現されたＰＲＶ ｇＢ、ｇＣおよびｇＤはブタにおいて有意な免疫応答を誘発することが示されている（３７、３８；実施例８参照）。さらに、ＰＲＶ ｇＢ、ｇＣおよびｇＤを組換えＳＰＶで発現させ、ビルレントＰＲＶでの攻撃からの有意な保護が得られる（実施例６および８参照）。従って、Ｓ−ＳＰＶ−０５５はＰＲＶ病に対してブタを保護するためのワクチンとして価値がある。ここに記載したＰＲＶワクチンはＰＲＶ ｇＸまたはｇＩを発現しないので、それらはワクチン接種動物を感染動物から区別するのに利用される現行ＰＲＶ診断テスト（ｇＸ ＨｅｒｄＣｈｅｋR、ｇＩ ＨｅｒｄＣｈｅｋRおよびＣｌｉｎＥａｓｅR）と適合するであろう。
実施例２９
ＳＰＶ−０５９
Ｓ−ＳＰＶ−０５９は１つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−グルクロニダーゼについての遺伝子（ｕｉｄＡ）をＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｋゲノム断片内にあるＳＰＶ Ｂ１８Ｒオープンリーディングフレーム中の唯一のＥｃｏＲＩ制限部位に挿入した。該ｕｉｄＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。ＳＰＶ ６．５ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｋ断片（配列番号）の３．２ｋｂ領域からの部分配列は、３つの可能なオープンリーディングフレームを示す。ＳＰＶ Ｂ１８Ｒ ＯＲＦはワクシニアウイルスＢ１８Ｒ遺伝子、ウサギ線維腫ウイルスからの７７．２Ｋ蛋白質、ワクシニアウイルスＣ１９Ｌ／Ｂ２５Ｒ ＯＲＦおよびヒト脳変異体からのアンキリン反復領域に相同な配列を示す。該Ｂ１８Ｒ遺伝子は高親和性および広い特異性を持つ可溶性インターフェロン受容体をコードする。ＳＰＶ Ｂ４Ｒオープンリーディングフレームはウサギ線維腫ウイルスのＴ５蛋白質に相同の配列を示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０５９はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９６−５０．３１およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。相同性ベクター７９６−５０．３１はプラスミド５５１−４７．２３（材料および方法参照）からのＬＰ２ＥＰ２プロモーターｕｉｄＡカセットを含有する平滑末端化されたＮｃｏＩ断片の、ＳＰＶ６．５ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｋ断片中の唯一のＥｃｏＲＩ部位（平滑末端化）への挿入によって創製された。「酵素マーカー遺伝子を発現する組換えヘルペスウイルスについてのスクリーニング」によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。青色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５９と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−グルクロニダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察されたプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０５９を精製し、これは外来性遺伝子、イー・コリｕｉｄＡを発現し、これは７．５ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｋ断片内のＥｃｏＲＩ部位が外来性遺伝子のための安定な挿入部位であることを示す。この挿入部位を利用する組換え豚痘ウイルスは外来性遺伝子の発現に、病気に対するワクチンとして、または発現された外来性遺伝子に対する抗体を生起させるための発現ベクターとして有用である。
ＳＰＶ−０６０
Ｓ−ＳＰＶ−０６０は１つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−グルクロニダーゼについての遺伝子（ｕｉｄＡ）をＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎゲノム断片内にある唯一のＥｃｏＲＶ制限部位に挿入した。該ｕｉｄＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。ＳＰＶ ３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片（配列番号）の部分配列は、２つの可能なオープンリーディングフレームを示す。ＳＰＶ Ｉ７Ｌ ＯＲＦはワクシニアウイルスの蛋白質Ｉ７に相同な配列を示す。該ＳＰＶ Ｉ４Ｌオープンリーディングフレームは、ワクシニアウイルスのリボヌクレオシド二リン酸レダクターゼ遺伝子に相同の配列を示す。Ｉ４Ｌ ＯＲＦおよびＩ７Ｌ ＯＲＦの間の、２つの可能なオープンリーディングフレームＩ５ＬおよびＩ６Ｌは機能が未知である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６０はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９６−７１．３１およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。相同性ベクター７９６−７１．３１はプラスミド５５１−４７．２３（材料および方法参照）からのＬＰ２ＥＰ２プロモーターｕｉｄＡカセットを含有する平滑末端化されたＮｃｏＩ断片の、ＳＰＶ３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片（図２９Ａ）中の唯一のＥｃｏＲＶ部位への挿入によって創製された。「酵素マーカー遺伝子を発現する組換えヘルペスウイルスについてのスクリーニング」によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。青色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６０と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−グルクロニダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察されたプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０６０を精製し、これは外来性遺伝子、イー・コリｕｉｄＡを発現し、これは３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片内のＥｃｏＲＩ部位が外来性遺伝子のための安定な挿入部位であることを示す。この挿入部位を利用する組換え豚痘ウイルスは外来性遺伝子の発現に、病気に対するワクチンとして、または発現された外来性遺伝子に対する抗体を生起させるための発現ベクターとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６１
Ｓ−ＳＰＶ−０６１は１つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−グルクロニダーゼについての遺伝子（ｕｉｄＡ）をＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎゲノム断片内にある唯一のＳｎａＢＩ制限部位に挿入した。該ｕｉｄＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。ＳＰＶ ３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片（配列番号）の部分配列は、２つの可能なオープンリーディングフレームを示す。ＳＰＶ Ｉ７Ｌ ＯＲＦはワクシニアウイルスの蛋白質１７に相同な配列を示す。該ＳＰＶ Ｉ４Ｌオープンリーディングフレームは、ワクシニアウイルスのリボヌクレオシド二リン酸レダクターゼ遺伝子に相同の配列を示す。Ｉ４Ｌ ＯＲＦおよびＩ７Ｌ ＯＲＦの間の、２つの可能なオープンリーディングフレームＩ５ＬおよびＩ６Ｌは機能が未知である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６１はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９６−７１．４１およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。相同性ベクター７９６−７１．４１はプラスミド５５１−４７．２３（材料および方法参照）からのＬＰ２ＥＰ２プロモーターｕｉｄＡカセットを含有する平滑末端化されたＮｃｏＩ断片の、ＳＰＶ３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片中の唯一のＳｎａＢＩ部位への挿入によって創製された。「酵素マーカー遺伝子を発現する組換えヘルペスウイルスについてのスクリーニング」によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。青色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６１と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−グルクロニダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察されたプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０６１を精製し、これは外来性遺伝子、イー・コリｕｉｄＡを発現し、これは３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片内のＳｎａＢＩ部位が外来性遺伝子のための安定な挿入部位であることを示す。この挿入部位を利用する組換え豚痘ウイルスは外来性遺伝子の発現に、病気に対するワクチンとして、または発現された外来性遺伝子に対する抗体を生起させるための発現ベクターとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６２
Ｓ−ＳＰＶ−０６２は１つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−グルクロニダーゼについての遺伝子（ｕｉｄＡ）をＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎゲノム断片内にある唯一のＢｇｌＩＩ制限部位に挿入した。該ｕｉｄＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。ＳＰＶ ３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片（配列番号）の部分配列は、２つの可能なオープンリーディングフレームを示す。ＳＰＶ Ｉ７Ｌ ＯＲＦはワタシニアウイルスの蛋白質Ｉ７に相同な配列を示す。該ＳＰＶ Ｉ４Ｌオープンリーディングフレームは、ワクシニアウイルスのリボヌクレオシド二リン酸レダクターゼ遺伝子に相同の配列を示す。Ｉ４Ｌ ＯＲＦおよびＩ７Ｌ ＯＲＦの間の、２つの可能なオープンリーディングフレームＩ５ＬおよびＩ６Ｌは機能が未知である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６２はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９６−７１．５１およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。相同性ベクター７９６−７１．５１はプラスミド５５１−４７．２３（材料および方法参照）からのＬＰ２ＥＰ２プロモーターｕｉｄＡカセットを含有する平滑末端化されたＮｃｏＩ断片の、ＳＰＶ３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片中の唯一のＢｇｌＩＩ部位への挿入によって創製された。「酵素マーカー遺伝子を発現する組換えヘルペスウイルスについてのスクリーニング」によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。青色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６２と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−グルクロニダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察されたプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０６２を精製し、これは外来性遺伝子、イー・コリｕｉｄＡを発現し、これは３．２ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｎ断片内のＢｇｌＩＩ部位が外来性遺伝子のための安定な挿入部位であることを示す。この挿入部位を利用する組換え豚痘ウイルスは外来性遺伝子の発現に、病気に対するワクチンとして、または発現された外来性遺伝子に対する抗体を生起させるための発現ベクターとして有用である。
実施例３０：
合成初期または合成痘プロモーターの制御下にあるイー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）を発現する組換え豚痘ウイルス
各々、合成痘プロモーターＬＰ１、ＬＰ２、およびＥＰ１の制御下にあるイー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）を発現する３つの組換え豚痘ウイルスＳ−ＳＰＶ−０５６、Ｓ−ＳＰＶ−０５７、およびＳ−ＳＰＶ−０５８を構築した。
Ｓ−ＳＰＶ−０５６はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９１−６３．１９（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。Ｓ−ＳＰＶ−０５７はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９１−６３．４１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。Ｓ−ＳＰＶ−０５８はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７９６−１８．９（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５６、Ｓ−ＳＰＶ−０５７およびＳ−ＳＰＶ−０５８と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
組換え豚痘ウイルスはヒト細胞系においてイー・コリβ−ガラクトシダーゼのごとき外来性遺伝子を発現するが、ヒト細胞系において複製しない。外来性遺伝子の発現を最適化するために、Ｓ−ＳＰＶ−０５６、Ｓ−ＳＰＶ−０５７およびＳ−ＳＰＶ−０５８を用いて、初期または後期合成ポックスウイルス・プロモーターの制御下にあるイー・コリβ−ガラクトシダーゼの最適発現レベルを比較する。組換え豚痘ウイルスの発現が欠失されているヒト細胞系は、限定されるものではないが、１４３Ｂ（骨肉腫）、Ａ４３１（類表皮癌）、Ａ５４９（肺癌）、Ｃａｐａｎ−１（肝臓癌）、ＣＦ５００（包皮繊維芽細胞）、Ｃｈａｎｇ Ｌｉｖｅｒ（肝臓）、Ｄｅｔｒｏｉｔ（ダウン包皮繊維芽細胞）、ＨＥＬ−１９９（胚性肺）、ＨｅＬａ（子宮頸部癌）、ＨＥｐ−２（表皮咽頭癌）、ＨＩＳＭ（腸平滑筋）、ＨＮＫ（新生児腎臓）、ＭＲＣ−５（胚性肺）、ＮＣＩ−Ｈ２９２（肺粘膜表皮癌）、ＯＶＣＡＲ−３（卵巣癌）、ＲＤ（横紋筋肉腫）、ＴＨＦ（単球白血球）、ＷＩＬ２−ＮＳ（Ｂリンパ球系、非分泌）、ＷＩＳＨ（羊膜）を含む。
実施例３１
Ｓ−ＳＰＶ−０５１
Ｓ−ＳＰＶ−０５１は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびウシ・ウイルス性下痢ウイルス糖蛋白質５３（ｇ５３）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＢＶＤＶ ｇ５３遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０５１はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７８３−３９．２（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０５１と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０５１を、ＰＲＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ＢＶＤＶ ｇ５３に対するマウス・モノクローナル抗体はＳ−ＳＰＶ−０５１プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０５１で観察されたプラークはＢＶＤＶ ｇ５３に対するモノクローナル抗体と反応し、これは該ウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＢＶＤＶ ｇ５３遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０５１で感染させ、感染細胞溶解物の試料をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ＢＶＤＶ ｇ５３に対するモノクローナル抗体を用いてＢＶＤＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０５１感染細胞からの溶解物および上清は、ＢＶＤＶ ｇ５３蛋白質の糖鎖付加および非糖鎖付加形態を示す５３ｋｄおよびそれを超えるバンドを呈した。
Ｓ−ＳＰＶ−０５１はウシにおいてＢＶＤＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＢＶＤＶ糖蛋白質５３の発現に有用である。
実施例３２：
Ｓ−ＳＰＶ−０４４：
Ｓ−ＳＰＶ−０４４は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および感染性包病ウイルス（ＩＢＤＶ）ポリメラーゼ蛋白質についての遺伝子を６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＩＢＤＶポリメラーゼ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４４はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７４９−７５．７８（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４４と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４４はＩＢＤＶポリメラーゼ蛋白質の発現に有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０４４は組換えＩＢＤＶ弱毒化ワクチンに対するイン・ビトロのアプローチで有用である。Ｔ３またはＴ７プロモーター（pBlueScriptプラスミド；Stratagene,Inc.）を用いて弱毒化ＩＢＤＶ株からのＲＮＡ鎖を細菌発現系で合成して、ＩＢＤＶゲノムの二本鎖短鎖および長鎖セグメントを合成する。豚痘ウイルスはＩＢＤＶポリメラーゼを発現するが、ＣＥＦ細胞中で複製しない。Ｓ−ＳＰＶ−０４４から産生されたＩＢＤＶポリメラーゼは、二本鎖ＲＮＡゲノム鋳型から感染性弱毒化ＩＢＤＶウイルスを合成する。得られた弱毒化ＩＢＤＶウイルスはニワトリにおいて感染性包病に対するワクチンとして有用である。
実施例３３：
Ｓ−ＳＰＶ−０４６
Ｓ−ＳＰＶ−０４６は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびネコ免疫不全ウイルス（ＦＩＶ）ｇａｇプロテアーゼ（ｇａｇ）についての遺伝子を７３８−９４．４ ＯＲＦ（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；ヌクレオチド１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＯｌＬプロモーターの制御下にあり、ＦＩＶ ｇａｇ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４６はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７６１−７５．Ｂ１８（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４６と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
ＦＩＶ ｇａｇ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０４６で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ネコ抗−ＦＩＶ（ＰＰＲ株）血清を用いてＦＩＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０４６感染細胞からの溶解物および上清は、ＦＩＶ ｇａｇ蛋白質の予測されたサイズである２６ｋｄおよび１７ｋｄにおけるバンドを呈した。組換え豚痘ウイルスにより発現されたＦＩＶ ｇａｇ蛋白質は適当に加工され、培地に分泌された。
Ｓ−ＳＰＶ−０４８
Ｓ−ＳＰＶ−０４８は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびネコ免疫不全ウイルス（ＦＩＶ）エンベロープ（ｅｎｖ）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｃｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＦＩＶ ｅｎｖ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０４８はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター７８１−８４．Ｃ１１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０４８と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０４６およびＳ−ＳＰＶ−０４８は単独でまたはネコにおけるＦＩＶ感染に対するワクチンとしての組合せにおいて有用であって、ＦＩＶ ｅｎｖおよびｇａｇ蛋白質の発現に有用である。ＦＩＶ ｅｎｖおよびｇａｇ蛋白質双方を発現する組換え豚痘ウイルスはネコにおいてＦＩＶ感染に対するワクチンとして有用である。
ヒト呼吸器系シンシチウムウイルスＦおよびＧ蛋白質を発現する組換え豚痘ウイルスはヒトの病気に対するワクチンとして有用である。
実施例３４
組換えポックスウイルスで発現されたニワトリＩＦＮのイン・ビトロ特性
細胞培養における組換えウイルスの増殖特性。野生型豚痘ウイルスと比較して、Ｓ−ＳＰＶ−０４２は胚性ブタ腎臓細胞（ＥＳＫ−４）において増殖しなかった。
ＳＰＶ／ｃＩＦＮ組換えウイルスで感染させた細胞からの上清につきウェスタンブロット分析を行った。ウサギおよびマウス抗血清を、濃縮ＳＰＶ／ｃＩＦＮ感染不和済みからのｃＩＦＮに対して生起させ、ウェスタン分析用の調製において、野生型ＳＰＶで感染させたＥＳＫ−４細胞に対して予め清澄化させた。ウサギおよびマウス抗−ｃＩＦＮ抗血清は、組換えＳＰＶ／ｃＩＦＮおよびＳＰＶ野生型ウイルス感染上清からのニトロセルロース上の変性蛋白質と反応した。１７−２０キロダルトンの推定分子量サイズ範囲を持つ反応性バンドがＳＰＶ／ｃＩＦＮレーンに存在し、ＳＰＶ野生型対照レーンでは存在しなかった。
水泡性口内炎ウイルスの増殖に対するＳＰＶ／ｃＩＦＮ（Ｓ−ＳＰＶ−０４２）、ＦＰＶ／ｃＩＦＮ、およびＦＰＶ／ｃＩＦＮ／ＮＤＶ感染細胞からの上清で発現されたｃＩＦＮの効果
ＳＰＶ／ｃＩＦＮ、ＦＰＶ／ｃＩＦＮ／ｃＩＦＮ感染細胞からのビリオン清澄化上清をウイルス阻害活性の存在につきテストし、結果を表１に示す。略言すれば、ＣＥＦ細胞を系列希釈したウイルス上清と共にインキュベートした。引き続いて、水泡性口内炎ウイルス（ＶＳＶ）の４０，０００プラーク形成単位（ｐｆｕ）／ウェルを添加し、４８時間後にＶＳＶ細胞障害効果（ＣＰＥ）につきウェルをスコア取りした。ｃＩＦＮを含有する組換えウイルス上清はＶＳＶ誘導ＣＰＥを阻害することが示され、他方、対照ウイルス上清は阻害しなかった。ＶＳＶ誘導細胞障害効果はウサギ抗−ｃＩＦＮ血清の存在下では逆になったであろう。
ＳＰＶ／ｃＩＦＮウイルスで感染したＥＳＫ−４細胞からの組換えｃＩＦＮを含有する上清を、ＣＥＦ細胞におけるシチメンチョウのヘルペスウイルス（ＨＶＴ）の増殖を阻害するその活性につきテストし、結果を表２に示す。略言すれば、系列希釈上清をＣＥＦ細胞と共にインキュベートし、次いで、１００ｐｆｕ／ウェルの野生型ＨＶＴで感染させた。４８時間後に全てのウェルでプラークを計数した。１０−１００単位のｃＩＦＮ活性はＨＶＴ（１００ｐｆｕ／ウェル）のプラーク形成を阻害した。野生型ＳＰＶからの上清はＨＶＴプラーク形成を阻害しなかった。
ＨＤ１１細胞または骨髄接着性細胞をＳＰＶ／ｃＩＦＮ上清からの１０００単位／ｍｌのｃＩＦＮ、リポ多糖（ＬＰＳ）（９ｎｇ／ｍｌ）またはｃＩＦＮおよびＬＰＳ双方と共にインキュベートし、結果を表３に示す。２４時間後、上清流体を収集し、亜硝酸塩レベルを測定した。これらのデータは、ＳＰＶ／ｃＩＦＮ上清から発現されたｃＩＦＮがＬＰＳの存在下でニワトリ・マクロファージを活性化する能力を有することを示す。
１．組換え豚痘ウイルスは、ＶＳＶ感染からのＣＥＦ細胞の保護によって測定して、生物学的に活性なニワトリ・インターフェロンを感染細胞の上清中に発現する。
２．組換えＳＰＶ／ｃＩＦＮ感染細胞からの上清で発現されたニワトリ・インターフェロンは用量依存的にＨＶＴでの感染に対してＣＥＦ細胞を保護することが示された。
３．ＳＰＶ／ｃＩＦＮから発現されたニワトリ・インターフェロンはＰＬＳと相乗的に作用して、一酸化窒素誘導によって検出して、ニワトリ・マクロファージを活性化する。
４．前記データは、ニワトリＩＦＮを発現する組換え豚痘ウイルスがイン・ビトロ、イン・ビボおよびイン・オボにおいて免疫変調剤として遊離な適用を有し得ることを示す。
実施例３５
ウイルスベクターによる送達系および／またはサブユニット・アプローチを用いるＩＢＤワクチンの構築の別法として、ＩＢＤウイルスＲＮＡを直接操作して、大（セグメントＡ）および小（セグメントＢ）二本鎖ＲＮＡサブユニット双方を表すｃＤＮＡクローンから誘導された全長ＲＮＡを用いてウイルスを再構築する。ＩＢＤウイルスの生成はこのようにして最初の２つのアプローチよりも優れたいくつかの利点を与える。まず、もしＩＢＤウイルスをＲＮＡ鋳型を用いて再度生成すれば、転写（ＲＭＡの生成）に先立ってウイルス・ゲノムのクローン化ｃＤＮＡコピーを操作することができる。このアプローチを用い、ビルレントＩＢＤ株を弱毒化するか、あるいは弱毒化ワクチン骨格のＶ２可変領域をビルレント株のそれで置き換えることができる。そうする場合において、本発明は、ワクチン株の安全性および効率を供しつつ、ビルレントＩＢＤ株に対する保護を提供する。さらに、このアプローチを用い、本発明により、関連ビルナウイルス感染性膵臓壊死ウイルス（ＩＰＮＶ）から誘導されたＲＮＡポリメラーゼおよびＩＰＮＶから誘導されたポリプロテインを用いて生成した温度感受性ＩＢＤウイルスが構築されテストされる。ＩＰＮＶポリメラーゼはＩＢＤＶのそれよりも低い温度で最適活性を有する。もしＩＰＮＶポリメラーゼがＩＢＤＶ上に存在する調節シグナルを認識すれば、ハイブリッド・ウイルスはニワトリに存在する高温で弱毒化されることが期待される。別法として、ＩＢＤＶ血清型２ウイルスから誘導されたＲＮＡポリメラーゼおよびＩＢＤＶ血清型１ウイルスから誘導されたポリプロテインを用いて生成されたＩＢＤウイルスを構築しテストできる。
最初にＢursaＶacワクチン株（Ｓterwin Ｌabs）を用いて、ＩＢＤＶの完全なゲノム（二本鎖ＲＮＡセグメントＡおよびＢ）を表すｃＤＮＡクローンを構築する。一旦セグメントＡおよびＢの全長コピーを表すｃＤＮＡクローンが構築されたならば、鋳型ＲＮＡが調製される。ＩＢＤＶは二セグメント化二本鎖ＲＮＡウイルスとして存在するので、pＢlueＳcriptプラスミド（Ｓtratagene，Ｉnc.）を用いて、各セグメントのセンスおよびアンチセンス両ＲＮＡ鎖を得る。これらのベクターは、イン・ビトロで実質量のＲＮＡを得るために高度に特異的なファージ・プロモーターを利用する。唯一の制限エンドヌクレアーゼ部位を３’ＰＣＲプライマーに作成して、転写の間にラン−オフ転写体の生成のためにＤＮＡを線状化する。
精製されたＲＮＡ転写体（４鎖）をニワトリ胚繊維芽細胞（ＣＥＦ）にトランスフェクトして該ＲＮＡが感染性であるか否かを判断する。ＩＢＤＶ特異的Ｍａｂｓを用いる黒色プラーク・アッセイによって判断してもしＩＢＤウイルスが生成すれば、さらなる操作は必要ではなく、ワクチン株の作成を開始できる。この方法の利点は、このようにして作成されたＩＢＤウイルスは純粋でほとんど／全く精製を要せず、新しいワクチンを創製するのに要する時間を大幅に減少させるということである。もし精製されたＲＮＡを用いて陰性結果が得られれば、ヘルパーウイルスの使用による機能的ウイルスＲＮＡポリメラーゼが必要である。ビルナウイルスは鎖置き換え（半保存的）メカニズムによってその核酸を複製し、ＲＮＡポリメラーゼは二本鎖ＲＮＡ分子の末端に結合し、環化された環構造を形成する（Ｍuller＆Ｎitschke，Ｖirology 159，174-177，1987）。豚痘ウイルスにおける約８７８アミノ酸のＲＮＡポリメラーゼ・オープンリーディングフレームを発現させ、この組換えウイルス（Ｓ−ＳＰＶ−０４４）を用いて、イン・トラントにて機能的ＩＢＤＶ ＲＮＡを得る。ウイルス・ベクターの生成的複製の徴候がない場合、豚痘ウイルスは免疫学的に認識可能な外来性抗原を鳥類細胞（ＣＥＦ細胞）にて発現した。本発明においては、ＳＰＶ複製で細胞を汚染することくなく、豚痘ベクターを用いてＩＢＤＶポリメラーゼ蛋白質をトリンスフェクトしたＲＮＡとして同一細胞内で発現させる。
ゲノムＲＮＡを用いてＩＢＤウイルスはイン・ビトロで生成されるということが証明されれば、感染性包病に対する改良された弱毒化ウイルス生ワクチンが開発される。生成するＩＢＤウイルスの新しく規定された系と共に組換えＤＮＡ技術を用いて、弱毒化ウイルスの構築を容易とするウイルス・ゲノム内の特異的欠失が作成される。この技術を用い、病原性の原因となるＩＢＤＶの領域および弱毒化された免疫原性ＩＢＤＶワクチンが同定される。本発明はビルレントＩＢＤ株または弱毒化ワクチン骨格のＶＰ２可変領域のビルレント株のそれでの置き換えを提供し、かくして、ワクチン株の安全性および効果を供しつつ、ビルレント株に対して保護する。
実施例３６
シチメンチョウのヘルペスウイルスの増殖に対するウサギ抗−ニワトリ・インターフェロン（ｃＩＦＮ）抗体の効果
ＳＰＶ／ｃＩＰＮ（ＳＰＶ０４１）感染ＥＳＫ−４細胞からの上清を感染４８時間後に収穫し、次いで、Ｃentricon 10カラム（Ａmicon）によって５−１０倍濃縮した。１ｍｌの濃縮上清をウサギに３週間間隔で３回注射し、次いで、血液採取した。次いで、このウサギ抗血清を培養で用いて、ＨＶＴの増殖に対するインターフェロンの効果を調べた。抗−ｃＩＦＮはプラーク・アッセイにおいてｃＩＦＮの添加によって誘導されたＨＶＴ（１：２００）およびＶＳＶ（１：８０）に対するブロックを逆行させることが示された。さらに、ＨＶＴウイルスＤＮＡのサブ−プラーキング・レベルで一時的にトランスフェクトしたＣＥＦの培地中への抗−ｃＩＦＮの添加（１：１００）は、ＨＶＴプラークの形成（２００プラーク／ウェル）を増強させることが示された。抗−ｃＩＦＮの不存在下でＨＶＴＤＮＡでトランスフェクトしたＣＥＦはプラークを生じなかった。
ＨＶＴはＣＥＦから産生されたインターフェロンに高度に感受性であって、ｃＩＦＮをブロックした場合、ＨＶＴ増殖が増強された。
出願人は、（１）ワクチン・ストックにおいてＨＶＴ力価を増加させるための添加剤としてのｃＩＦＮに対する抗体の使用；（２）コスミド再構築を介する新しい組換えＨＶＴウイルスの形成を容易とするための添加剤としてのｃＩＦＮに対する抗体の使用を含める。
実施例３７
Ｓ−ＳＰＶ−０６３
Ｓ−ＳＰＶ−０６３は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）ＮＰ（Ｈ１Ｎ１）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＮＰ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０６３はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８０７−４１．３（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６３と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０６３を、ＳＩＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＳＩＶポリクローナル血清またはヤギ抗−ＮＰポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０６３プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０６３で観察されたプラークはブタ抗−ＳＩＶ血清またはヤギ抗−ＮＰ血清と反応し、これは該ウイルスがＳＩＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＳＩＶ ＮＰ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０６３で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＳＩＶポリクローナル血清またはヤギ抗−ＮＰポリクローナル血清を用いてＳＩＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０６３感染細胞からの溶解物および上清は、ＳＩＶ ＮＰ蛋白質の予測されるサイズである５６ｋｄに対応するバンドを呈した。
Ｓ−ＳＰＶ−０６３はブタにおいてＳＩＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＳＩＶ ＮＰの発現で有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０６３はＮＡを発現するＳ−ＳＰＶ−０６６およびＳＩＶ ＨＡを発現するＳ−ＳＰＶ−０６５と組み合わせたワクチンとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６４
Ｓ−ＳＰＶ−０６４は１つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−グルクロニダーゼ（ｕｉｄＡ）についての遺伝子を６．９ｋｂ ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｊゲノム断片内の唯一のＸｈｏＩ制限部位に挿入した。該ｕｉｄＡ遺伝子は合成後期／前期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。ＨｉｎｄＩＩＩ Ｊゲノム断片はＡ５０Ｒ ＯＲＦの一部（ａａ２２７ないし５５２）を含有する。唯一のＸｈｏＩ部位はＡ５０Ｒ ＯＲＦ内にはない。ＸｈｏＩ部位は豚痘ウイルス・ゲノムの３’末端から２５ｋｂにある。
Ｓ−ＳＰＶ−０６４はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８０７−４２．２８およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。相同性ベクター８０７−４２．２８は、プラスミド５５１−４７．２３からのＬＰ２ＥＰ２プロモーターｕｉｄＡ遺伝子カセットを含有するＮｏｔＩ断片（材料および方法参照）の、６．９ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｊ断片中のＮｏｔＩ部位（ＤＮＡリンカーによって唯一のＸｈｏＩ部位はＮｏｔＩに変換した）への挿入によって生成した。「酵素的マーカー遺伝子を発現する組換えヘルペスウイルスについてのスクリーニングスクリーニング」によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。青色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６４と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−グルクロニダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察されたプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０６４を精製し、これは外来性遺伝子、イー・コリｕｉｄＡを発現し、これは６．９ｋｂ ＨｉｎｄＩＩＩ Ｊ断片内のＸｈｏＩ部位がウイルス増殖に必須でない部位であって外来性遺伝子のための安定な挿入部位であることを示す。この挿入部位を利用する組換え豚痘ウイルスは外来性遺伝子の発現に、病気に対するワクチンとして、または発現された外来性遺伝子に対して抗体を生起させるための発現ベクターとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６５
Ｓ−ＳＰＶ−０６５は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）ＨＡ（Ｈ１Ｎ１）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＨＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０６５はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８０７−８４．３（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６５と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０６５を、ＳＩＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＳＩＶポリクローナル血清またはヤギ抗−ＨＡポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０６５プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０６５で観察されたプラークはブタ抗−ＳＩＶ血清と反応した。ＳＩＶ外来性遺伝子。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＳＩＶ ＮＰ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０６５で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＳＩＶポリクローナル血清またはヤギ抗−ＨＡポリクローナル血清を用いてＳＩＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０６５感染細胞からの細胞溶解物および上清は、ＳＩＶ ＨＡ蛋白質の予測されるサイズである６４ｋｄに対応するバンドを呈した。
Ｓ−ＳＰＶ−０６５はブタにおいてＳＩＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＳＩＶ ＮＰの発現で有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０６５はＮＡを発現するＳ−ＳＰＶ−０６６およびＳＩＶ ＮＰを発現するＳ−ＳＰＶ−０６３と組み合わせたワクチンとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６６
Ｓ−ＳＰＶ−０６６は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）ＮＡ（Ｈ１Ｎ１）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＮＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０６６はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８０７−８４．３５（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６６と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
ＳＩＶ ＮＡ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０６６で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＳＩＶポリクローナル血清またはヤギ抗−ＮＡポリクローナル血清を用いてＳＩＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０６６感染細胞からの細胞溶解物および上清は、ＳＩＶ ＨＡ蛋白質の予測されるサイズである６４ｋｄに対応するバンドを呈した。
Ｓ−ＳＰＶ−０６６はブタにおいてＳＩＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＳＩＶ ＮＡの発現で有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０６６はＨＡを発現するＳ−ＳＰＶ−０６５およびＳＩＶ ＮＰを発現するＳ−ＳＰＶ−０６３と組み合わせたワクチンとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０７１
Ｓ−ＳＰＶ−０７１は少なくとも４つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）ＨＡ（Ｈ１Ｎ１）およびＮＡ（Ｈ１Ｎ１）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＨＡ、およびＮＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０７１はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８１７−８６．３５（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０７１と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０７１を、ＳＩＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ヤギ抗−ＨＡポリクローナル血清はＳ−ＳＰＶ−０７１プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０７１で観察されたプラークはヤギ抗−ＨＡ血清と反応し、これはウイルスがＳＩＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
ＳＩＶ ＨＡおよびＮＡ遺伝子産物の発現を確認するために、細胞をＳＰＶ−０７１で感染させ、感染細胞溶解物の試料および培養上清をＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。「ウェスタンブロッティング法」を用いて、該ゲルをブロットし、分析した。ブタ抗−ＳＩＶポリクローナル血清またはヤギ抗−ＨＡポリクローナル血清を用いてＳＩＶ特異的蛋白質の発現を検出した。Ｓ−ＳＰＶ−０７１感染細胞からの細胞溶解物および上清は、ＳＩＶ ＨＡおよびＮＡ蛋白質の予測されるサイズである６４ｋｄおよび５２ｋｄに対応するバンドを呈した。
Ｓ−ＳＰＶ−０７１はブタにおいてＳＩＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＳＩＶ ＨＡおよびＮＡの発現で有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０７１はＳＩＶ ＮＰを発現するＳ−ＳＰＶ−０６３と組み合わせたワクチンとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０７４
Ｓ−ＳＰＶ−０７４は少なくとも４つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−グルクロニダーゼ（ｕｉｄＡ）についての遺伝子およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）ＨＡ（Ｈ１Ｎ１）およびＮＡ（Ｈ１Ｎ１）についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｕｉｄＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、ＳＩＶ ＨＡおよびＮＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０７４はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８１７−１４．２（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０７４と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０７４を、ＳＩＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ブタ抗−ＳＩＶ血清はＳ−ＳＰＶ−０７４プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０７４で観察されたプラークはヤギ抗−ＨＡ血清と反応し、これはウイルスがＳＩＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
Ｓ−ＳＰＶ−０７４はブタにおいてＳＩＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＳＩＶ ＨＡおよびＮＡの発現で有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０７４はＳＩＶ ＮＰを発現するＳ−ＳＰＶ−０６３と組み合わせたワクチンとして有用である。
Ｓ−ＳＰＶ−０６９
Ｓ−ＳＰＶ−０６９は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびヒト呼吸器系シンシチウムウイルス（ＨＲＳＶ）融合（Ｆ）蛋白質についての遺伝子をＳＰＶ ７２８−９４．４ ＯＲＦ（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；ヌクレオチド１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）に挿入した。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＨＲＳＶ Ｆ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０６９はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８１０−２１９．Ａ１（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０６９と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
「組換えＳＰＶにおける外来性遺伝子発現についての黒色プラーク・スクリーニング」を用いて、Ｓ−ＳＰＶ−０６９を、ＳＩＶ特異的抗原の発現につきアッセイした。ＨＲＳＶ Ｆに対するモノクローナル抗体６２１（Ｂiodesign,Ｉnc.）はＳ−ＳＰＶ−０６９プラークと特異的に反応するがＳ−ＳＰＶ−００１陰性対照プラークとは特異的に反応しないことが示された。全てのＳ−ＳＰＶ−０６９で観察されたプラークはモノクローナル抗体６２１と反応し、これはウイルスがＰＲＶ外来性遺伝子を安定に発現していたことを示す。ここに記載したアッセイをＥＳＫ−４細胞で行い、ＥＳＫ−４細胞はＳＰＶ組換えワクチンの生産のために適した基礎となろうことが示された。
Ｓ−ＳＰＶ−０７８
Ｓ−ＳＰＶ−０７８は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびヒト呼吸器系シンシチウムウイルス（ＨＲＳＶ）付着（Ｇ）蛋白質についての遺伝子をＳＰＶ ６１７−４８．１ ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、ＨＲＳＶ Ｇ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０７８はＳ−ＳＰＶ−００１（Ｋasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター８２２−５２Ｇ．７（材料および方法参照）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０７８と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０６９およびＳ−ＳＰＶ−０７８はブタにおいてヒト呼吸器系シンシチウムウイルス感染に対するワクチンとして個々にまたは組み合わせて有用であって、ＨＲＳＶ ＦおよびＧ遺伝子の発現に有用である。
相同性ベクター８１０−２９．Ａ２
プラスミド８１０−２９．Ａ２は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入する目的で構築した。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびヒト呼吸器系シンシチウムウイルス（ＨＲＳＶ）融合（Ｆ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。外来性遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡのほぼ８５５塩基対断片がある。外来性遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡのほぼ１１１３塩基対断片がある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従って該プラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られるであろう。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は豚痘ウイルス０１Ｌマーカー遺伝子プロモーターの制御下にあり、ＨＲＳＶ Ｆ遺伝子は後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を合成ＤＮＡ配列に連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２、３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６５（プロメガ社）のほぼ２５１９塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＳｐｈＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳｐｈＩおよびＢｇｌＩＩ末端をもつ８５５塩基対断片を得るための、ＤＮＡプライマー５’−ＧＡＡＧＣＡＴＧＣＣＣＧＴＴＣＴＴＡＴＣＡＡＴＡＧＴＴＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＴＡ−３’（配列番号：１８５）および５’−ＣＡＴＡＡＧＡＴＣＴＧＧＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＴＴＡＴＡＣＴＡＡＣＡＡＡＡＡＴＡＡＧ−３’（配列番号：１８６）を用いるポリメラーゼ鎖反応によって合成したＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｍ（２３）のほぼ８５５塩基対サブ断片である。断片２はイー・コリｌａｃＺ遺伝子を含有するプラスミドｐＪＦ７５１（４９）から誘導した３００２塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ断片である。断片３は、ＨＲＳＶ株Ａ２（ＡＴＣＣ ＶＲ−１３０２）からのＲＮＡを用い、逆転写酵素およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したほぼ１７２８塩基対ＥｃｏＲＩ制限断片である。プライマー（５’−ＧＣＣＧＡＡＴＴＣＧＣＴＡＡＴＣＣＴＣＡＡＡＧＣＡＡＡＴＧＣＡＡＴ−３’；４／９５．２３）（配列番号）はＨＲＳＶ Ｆ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端のＥｃｏＲＩ部位およびＡＴＧ開始コドンを導入する。プライマー（５’−ＧＧＴＧＡＡＴＴＣＴＴＴＡＴＴＴＡＧＴＴＡＣＴＡＡＡＴＧＣＡＡＴＡＴＴＡＴＴＴ−３’；４／９５．２４）（配列番号）はＦ遺伝子の３’末端から合成し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化して、ＨＲＳＶ Ｆ遺伝子に対応する長さの断片１７２８塩基対を得た。断片４は、ＳａｌＩおよびＨｉｎｄＩＩＩ末端をもつ１１１３塩基対断片を得るための、プライマー５’−ＣＣＧＴＡＧＴＣＧＡＣＡＡＡＧＡＴＣＧＡＣＴＴＡＴＴＡＡＴＡＴＧＴＡＴＧＧＧＡＴＴ−３’（配列番号：１８７）および５’−ＧＣＣＴＧＡＡＧＣＴＴＣＴＡＧＴＡＣＡＧＴＡＴＴＴＡＣＧＡＣＴＴＴＴＧＡＡＡＴ−３’（配列番号：１８８）を用いるポリメラーゼ鎖反応によって合成したＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍのほぼ１１１３塩基対サブ断片である。
相同性ベクター８２２−５２Ｇ．７．
プラスミド８２２−５２Ｇ．７は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入する目的で構築した。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびヒト呼吸器系シンシチウムウイルス（ＨＲＳＶ）付着（Ｇ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。外来性遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡのほぼ１４８４塩基対断片がある。外来性遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡのほぼ２１４９塩基対断片がある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従って該プラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られるであろう。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は合成後期／初期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、ＨＲＳＶ Ｇ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。それは、以下の源からの制限断片を連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６５（プロメガ社）のほぼ２９７２塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍ（２３）のほぼ１４８４塩基対ＡｃｃＩないしＢｇｌＩＩ制限亜断片である。断片２は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）のほぼ３００６塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ制限断片である。断片３は、ＨＲＳＶ株Ａ２（ＡＴＣＣ ＶＲ−１３０２）からのＲＮＡを用い、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したほぼ８９９塩基対ＥｃｏＲＩ制限断片である。プライマー（５’−ＧＣＣＧＡＡＴＴＣＣＡＡＡＡＡＣＡＡＧＧＡＣＣＡＡＣＧＣＡＣ−３’；４／９５．２５）（配列番号）はＨＲＳＶ Ｆ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端のＥｃｏＲＩ部位およびＡＴＧ停止コドンを導入する。プライマー（５’−ＧＣＣＧＡＡＴＴＣＡＣＴＡＣＴＧＧＣＧＴＧＧＴＧＴＧＴＴＧ−３’；４／９５．２６）（配列番号）はＨＲＳＶ Ｇ遺伝子の３’末端から合成し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化して、ＨＲＳＶ Ｇ遺伝子に対応する長さの断片８９９塩基対を得た。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｍ（２３）のほぼ２１４９塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＡｃｃＩ制限部位亜断片である。
相同性ベクター８０７−４１．３
プラスミド８０７−４１．３は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入する目的で構築した。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）核蛋白質（ＮＰ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従って該プラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られるであろう。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＮＰ遺伝子は合成後期／初期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を適当な合成ＤＮＡ配列連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６４（プロメガ社）のほぼ２９７２塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍ（２３）のほぼ１４８４塩基対ＢｇｌＩＩないしＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＳＩＶ ＨＩＮ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＮＰ遺伝子のほぼ１５０１塩基対ＥｃｏＲＩないしＥｃｏＲＩ断片である。プライマー（５’−ＣＡＴＧＡＡＴＴＣＴＣＡＡＧＧＣＡＣＣＡＡＡＣＧＡＴＣＡＴＡＴＧＡＡＣ−３’；６／９５．１３）（配列番号）はＳＩＶ ＮＰ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで臭化してＳＩＶ ＮＰ遺伝子に対応する長さの断片１５０１塩基対を得た。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）のほぼ３０１０塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ制限断片である。断片４はＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｎ（２３）のほぼ２１４９塩基対ＡｃｃＩないしＨｉｎｄＩＩＩ制限亜断片である。
相同性ベクター８０７−８４．８
プラスミド８０７−８４．８は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入するために用いた。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）血球凝集素（ＨＡ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従って該プラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＨＡ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を適当な合成ＤＮＡ配列連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６４（プロメガ社）のほぼ２９７２塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍ（２３）のほぼ１４８４塩基対ＢｇｌＩＩないしＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＳＩＶ ＨＩＮ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＨＡ遺伝子のほぼ１７２１塩基対ＢａｍＨＩないしＢａｍＨＩ断片である。プライマー（５’−ＣＣＧＡＧＧＡＴＣＣＧＧＣＡＡＴＡＣＴＡＴＴＡＧＴＣＴＴＧＣＴＡＴＧＴＡＣＡＴ−３’；６／９５．５）（配列番号）はＳＩＶ ＨＡ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＢａｍＨＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＣＴＣＴＧＧＡＣＣＴＡＡＴＴＴＡＡＡＴＡＣＡＴＡＴＴＣＴＧＣＡＣＴＧＴＳ−３’；６／９５．６）（配列番号：）はＳＩＶ ＨＡ遺伝子の３’末端から合成し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化してＳＩＶ ＨＡ遺伝子に対応する長さの断片１７２１塩基を得た。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）のほぼ３０１０塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ制限断片である。断片４はほぼ２１４９塩基対ＡｃｃＩないし断片Ｍ（２３）である。
相同性ベクター８０７−８４．３５
プラスミド８０７−８４．３５は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入するために用いた。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）ノイラミニダーゼ（ＮＡ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。「組換えＳＰＶを創製するための手法」に従ってこのプラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＮＡ遺伝子は合成後期／初期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を適当な合成ＤＮＡ配列連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６４（プロメガ社）のほぼ２９７２塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍ（２３）のほぼ１４８４塩基対ＢｇｌＩＩないしＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＳＩＶ ＨＩＮ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＮＡ遺伝子のほぼ１４１４塩基対ＥｃｏＲＩないしＢｇｌＩＩ断片である。プライマー（５’−ＡＡＴＧＡＡＴＴＣＡＡＡＴＣＡＡＡＡＡＡＴＡＡＴＡＡＣＣＡＴＴＧＧＧＴＣＡＡＴ−３’；６／９５．１２）（配列番号；）はＳＩＶ ＮＡ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＧＧＡＡＧＡＴＣＴＡＣＴＴＧＴＣＡＡＴＨＨＴＨＡＡＴＧＧＣＡＧＡＴＣＡＧ−３’；６／９５．１３）（配列番号；）はＳＩＶ ＮＡ遺伝子の３’末端から合成し、遺伝子の３’末端にＢｇｌＩＩ部位を導入し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化してＳＩＶ ＮＡ遺伝子に対応する長さの断片１４１４塩基を得た。断片３は、プラスミドｐＪＦ７５１（１１）のほぼ３０１０塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ制限断片である。断片４は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｍ（２３）のほぼ２１４９塩基対ＡｃｃＩないしＨｉｎｄＩＩＩ制限亜断片である。
相同性ベクター８０７−８６，３５
プラスミド８０７−８６．３５は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入するために用いた。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）血球凝集素（ＨＡ）遺伝子およびノイラミラダーゼ（ＮＡ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従ってこのプラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は合成後期痘プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＳＩＶ ＮＡおよびＨＡ遺伝子は、各々、合成後期／初期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を適当な合成ＤＮＡ配列連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６４（プロメガ社）のほぼ２９７２塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍ（２３）のほぼ１４８４塩基対ＢｇｌＩＩないしＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＳＩＶ ＨＩＮ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＨＡ遺伝子のほぼ１７２１塩基対ＢａｍＨＩないしＢａｍＨＩ断片である。プライマー（５’−ＣＣＧＡＧＧＡＴＣＣＧＧＣＡＡＴＡＣＴＡＴＴＡＧＴＣＴＴＧＣＴＡＴＧＴＡＣＡＴ−３’；６／９５．５）（配列番号：）はＳＩＶ ＨＡ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＢａｍＨＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＣＴＣＴＧＧＧＡＴＣＣＴＡＡＴＴＴＴＡＡＡＴＡＣＡＴＡＴＴＣＴＧＣＡＣＴＧＴＡ−３’；６／９５．６）（配列番号：）はＳＩＶ ＨＡ遺伝子の３’末端から合成し、遺伝子の３’末端にＢａｍＨＩ部位を導入し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化してＳＩＶ ＨＡ遺伝子に対応する長さの断片１７２１塩基を得た。断片３は、ＳＩＶ Ｈ１Ｎ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＮＡ遺伝子のほぼ１４１４塩基対ＥｃｏＲＩないしＢｇｌＩＩ断片である。プライマー（５’−ＡＡＴＧＡＡＴＴＣＡＡＡＴＣＡＡＡＡＡＡＴＡＡＴＡＡＣＣＡＴＴＧＧＧＴＣＡＡＴ−３’；６／９５．１２）（配列番号：）はＳＩＶ ＮＡ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＧＧＡＡＧＡＴＣＴＡＣＴＴＧＴＣＡＡＴＧＧＴＧＡＡＴＧＧＣＡＧＡＴＣＡＧ−３’；６／９５．１３）（配列番号：）はＳＩＶ ＮＡ遺伝子の３’末端から合成し、遺伝子の３’末端にＢｇｌＩＩ部位を導入し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化してＳＩＶ ＮＡ遺伝子に対応する長さの断片１４１４塩基対を得た。断片４はプラスミドｐＪＦ７５１（１１）のほぼ３０１０塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ制限断片である。断片５はＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｍ（２３）のほぼ２１４９塩基対ＡｃｃＩないしＨｉｎｄＩＩＩ制限亜断片である。
相同性ベクター８１７−１４．２
プラスミド８１７−１４．２は外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入するために用いた。それには、イー・コリβ−グルクロニダーゼ（ｕｉｄＡ）マーカー遺伝子およびブタ・インフルエンザウイルス（ＳＩＶ）血球凝集素（ＨＡ）およびノイラミラダーゼ（ＮＡ）遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従ってこのプラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。βグルクロニダーゼ（ｕｉｄＡ）マーカー遺伝子は合成後期／初期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあり、ＳＩＶ ＮＡおよびＨＡ遺伝子は、各々、合成後期／初期痘プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を適当な合成ＤＮＡ配列に連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６４（プロメガ社）のほぼ２９７２塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＢａｍＨＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍ（２３）のほぼ１４８４塩基対ＢｇｌＩＩないしＡｃｃＩ制限亜断片である。断片２は、ＳＩＶ ＨＩＮ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＨＡ遺伝子のほぼ１７２１塩基対ＢａｍＨＩないしＢａｍＨＩ断片である。プライマー（５’−ＣＣＧＡＧＧＡＴＣＣＧＧＣＡＡＴＡＣＴＡＴＴＡＧＴＣＴＴＧＣＴＡＴＧＴＡＣＡＴ−３’；６／９５．５）（配列番号：）はＳＩＶ ＨＡ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＢａｍＨＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＣＴＣＴＧＧＧＡＴＣＣＴＡＡＴＴＴＴＡＡＡＴＡＣＡＴＡＴＴＣＴＧＣＡＣＴＧＴＡ−３’；６／９５．６）（配食列番号：）はＳＩＶ ＨＡ遺伝子の３’末端から合成し、遺伝子の３’末端にＢａｍＨＩ部位を導入し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化してＳＩＶ ＨＡ遺伝子に対応する長さの断片１７２１塩基を得た。断片３は、ＳＩＶ Ｈ１Ｎ１株（ＮＶＳＬ）からのＲＮＡを用い、逆転写（ＲＴ）およびポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）（１５、４２）によって合成したＳＩＶ ＮＡ遺伝子のほぼ１４１４塩基対ＥｃｏＲＩないしＢｇｌＩＩ断片である。プライマー（５’−ＡＡＴＧＡＡＴＴＣＡＡＡＴＣＡＡＡＡＡＡＴＡＡＴＡＡＣＡＴＴＧＧＧＴＣＡＡＴ−３’；６／９５．１２）（配列番号：）はＳＩＶ ＮＡ遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＧＧＡＡＧＡＴＣＴＡＣＴＴＧＴＣＡＡＴＧＧＴＧＡＡＴＧＧＣＡＧＡＴＣＡＧ−３’；６／９５．１３）（配列番号：）はＳＩＶ ＮＡ遺伝子の３’末端から合成し、遺伝子の３’末端にＢｇｌＩＩ部位を導入し、逆転写およびポリメラーゼ鎖反応のために用いた。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩで消化してＳＩＶ ＮＡ遺伝子に対応する長さの断片１４１４塩基対を得た。断片４はプラスミドｐＲＡＪ２６０（Clonetech）のほぼ１８２３塩基対ＮｃｏＩ制限断片である。断片５はＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｍ（２３）のほぼ２１４９塩基対ＡｃｃＩないしＨｉｎｄＩＩＩ制限亜断片である。
単一または複数のＰＲＲＳ遺伝子（ＯＲＦ２、ＯＲＦ３、ＯＲＦ４、ＯＲＦ５、ＯＲＦ６、またはＯＲＦ７を含有するＰＲＲＳ相同性ベクター
ＰＲＲＳ相同性ベクターは外来性ＤＮＡをＳＰＶに挿入するために用いた。それには、イー・コリβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ２、ＯＲＦ３、ＯＲＦ４、ＯＲＦ５、ＯＲＦ６、またはＯＲＦ７遺伝子が組み込まれており、それの側に隣接してＳＰＶ ＤＮＡがある。外来性遺伝子の上流にはＳＰＶ ＤＮＡのほぼ８５５塩基対断片がある。外来性遺伝子の下流にはＳＰＶ ＤＮＡのほぼ１１１３塩基対断片がある。「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」に従ってこのプラスミドを用いる場合、外来性遺伝子をコードするＤＮＡを含有するウイルスが得られる。βガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）マーカー遺伝子は豚痘ウイルスＯｌＬ遺伝子プロモーターの制御下にあり、ＰＲＲＳ遺伝子は後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にあることに注意されたい。該相同性ベクターは、以下の源からの制限断片を適当な合成ＤＮＡ配列に連結することによって、標準的な組換えＤＮＡ技術（２２および３０）を利用して構築した。該プラスミドベクターはｐＳＰ６４（プロメガ社）のほぼ２５１９塩基対ＨｉｎｄＩＩＩないしＳｐｈＩ制限断片から誘導した。断片１は、ＳｐｈＩおよびＢｇｌＩＩ末端を持つ８５５塩基対断片を生じさせるための、ＤＮＡプライマー５’−ＧＡＡＧＣＡＴＧＣＣＣＧＴＴＣＴＴＡＴＣＡＡＴＡＧＴＴＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＴＡ−３’（配列番号：１８５）および５’−ＣＡＴＡＡＧＡＴＣＴＧＧＣＡＴＴＧＴＧＴＴＡＴＴＡＴＡＣＴＡＡＣＡＡＡＡＡＴＡＡＧ−３’（配列番号：１８６）を用いるポリマラーゼ鎖反応によって合成したＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片Ｍ（２３）のほぼ８５５塩基対サブ−断片である。断片２は、イー・コリｌａｃＺ遺伝子を含有するプラスミドｐＪＦ７５１（４９）から誘導した３００２塩基対ＢａｍＨＩないしＰｖｕＩＩ断片である。断片３は、ＮＶＳＬ（参照株）から得られたＰＲＲＳのＵ．Ｓ．単離体からのゲノムＲＮＡを用いて逆転写およびポリマラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）によって合成したＥｃｏＲＩないしＢａｍＨＩ制限断片である。各相同性ベクターは１または複数のＰＲＲＳウイルスＯＲＦ２ないし７を含有する。ＰＲＲＳ ＯＲＦ２を合成するために、プライマー（５’−ＡＡＴＧＡＡＴＴＣＧＡＡＡＴＧＧＧＧＴＣＣＡＴＧＣＡＡＡＧＣＣＴＴＴＴＴＧ−３’；１／９６．１５）（配列番号：）はＰＲＲＳ ＯＲＦ２遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＣＡＡＧＧＡＴＣＣＣＡＣＡＣＣＧＴＧＴＡＡＴＴＣＡＣＴＧＴＧＡＧＴＴＣＧ−３’；１／９６．１６）（配列番号）を逆転写およびＰＣＲのために使用し、ＰＲＲＳ ＯＲＦ２遺伝子の３’末端から合成する。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩおよびＢａｍＨＩで消化してＰＲＲＳ ＯＲＦ２遺伝子に対応する長さの断片７７１塩基対を得た。ＯＲＦ３を合成するために、プライマー（ＴＴＣＧＡＡＴＴＣＧＧＣＴＡＡＴＡＧＣＴＧＴＡＣＡＴＴＣＣＴＣＣＡＴＡＴＴＴ−３’；１／９６．７）（配列番号）はＰＲＲＳ ＯＲＦ３遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＧＧＧＧＡＴＣＣＴＡＴＣＧＣＣＧＴＡＣＧＧＣＡＣＴＧＡＧＧＧ−３’；１／９６．８）（配列番号：）を逆転写およびＰＣＲのために用い、ＰＲＲＳ ＯＲＦ３遺伝子の３’末端から合成する。ＰＲＲＳ ＯＲＦ４を合成するために、プライマー（５’−ＣＣＧＡＡＴＴＣＧＧＣＴＧＣＧＴＣＣＣＴＴＣＴＴＴＴＣＣＴＣＡＴＧＧ−３’；１／９６．１１）（配列番号：）はＰＲＲＳ ＯＲＦ４遺伝子の５’末端から合成し、５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＣＴＧＧＡＴＣＣＴＴＣＡＡＡＴＴＧＣＣＡＡＣＡＧＡＡＴＧＧＣＡＡＡＡＡＧＡＣ−３’；１／９６．１２）（配列番号：）を逆転写およびＰＣＲのために用い、ＰＲＲＳ ＯＲＦ４遺伝子の３’末端から合成する。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩおよびＮａｍＨＩで消化してＰＲＲＳ ＯＲＦ４遺伝子に対応する長さの断片５３７塩基対を得る。ＰＲＲＳ ＯＲＦ５を合成するために、プライマー（５’−ＴＴＧＡＡＴＴＣＧＴＴＧＧＡＧＡＡＡＴＧＣＴＴＧＡＣＣＧＣＧＧＧＣ−３’；１／９６．１３）（配列番号：）はＰＲＲＳ ＯＲＦ５遺伝子の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＧＡＡＧＧＡＴＣＣＴＡＡＧＧＡＣＧＡＣＣＣＣＡＴＴＧＴＴＣＣＧＣＴＧ−３’；１／９６．１４）（配列番号：）を逆転写およびＰＣＲのために用い、ＰＲＲＳ ＯＲＦ５遺伝子の３’末端から合成する。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩおよびＢａｍＨＩで消化してＰＲＲＳ ＯＲＦ５遺伝子に対応する長さの断片６０３塩基対を得る。ＰＲＲＳ ＯＲＦ６を合成するために、プライマー（５’−ＣＧＧＧＡＡＴＴＣＧＧＧＧＴＣＧＴＣＣＴＴＡＧＡＴＧＡＣＴＴＣＴＧＣＣ−３’；１／９６．１７）（配列番号：）はＰＲＲＳ ＯＲＦ６遺伝子を５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＧＣＧＧＡＴＣＣＴＴＧＴＴＡＴＧＴＧＧＣＡＴＡＴＴＴＧＡＣＡＡＧＧＴＴＴＡＣ−３’；１／９６．１８）（配列番号：）を逆転写およびＰＣＲのために用い、ＰＲＲＳ ＯＲＦ６遺伝子の３’末端から合成する。ＰＣＲ産物をＥｃｏＲＩおよびＢａｍＨＩで消化してＰＲＲＳ ＯＲＦ６に対応する長さの５２５塩基対を得る。ＰＲＲＳ ＯＲＦ７を合成するために、プライマー（５’−ＧＴＣＧＡＡＴＴＣＧＣＣＡＡＡＴＡＡＣＡＡＣＧＧＣＡＡＧＣＡＧＣＡＧＡＡＧ−３’：１／９６．１９）（配列番号：）はＰＲＲＳ ＯＲＦ７の５’末端から合成し、遺伝子の５’末端にＥｃｏＲＩ部位を導入する。プライマー（５’−ＣＡＡＧＧＡＴＣＣＣＡＧＣＣＣＡＴＣＡＴＧＣＴＧＡＧＧＧＴＧＡＴＧ−３’；１／９６．２０）（配列番号：）を逆転写およびＰＣＲのために合成し、ＰＲＲＳ ＯＲＦ７遺伝子の３’末端から合成する。断片４は、ＳａｌＩおよびＨｉｎｄＩＩＩ末端を持つ１１１３塩基対を生じさせるための、ＤＮＡプライマー５’−ＣＣＧＴＡＧＴＣＧＡＣＡＡＡＧＡＴＣＧＡＣＴＴＡＴＴＡＡＴＡＴＧＴＡＴＧＧＧＡＴＴ−３’（配列番号：１８７）および５’−ＧＣＣＴＧＡＡＧＣＴＴＣＴＡＧＴＡＣＡＧＴＡＴＴＴＡＣＧＡＣＴＴＴＴＧＡＡＴ−３’）（配列番号：１８８）を用いるポリメラーゼ鎖反応によって合成したＳＰＶ ＨｉｎｄＩＩＩ断片Ｍのほぼ１１１３塩基対サブ断片である。
仮性狂犬病遺伝子を発現する組換え豚痘ウイルス
Ｓ−ＳＰＶ−０８６は少なくとも３つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＤおよびｇＩについての遺伝子をＳＰＶ ６１７−６８．１ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＤおよびｇＩ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０７７は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＩについての遺伝子をＳＰＶ ６１７ ４８．１ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＩ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０７９は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）および仮性狂犬病ウイルス（ＰＲＶ）ｇＢについての遺伝子をＳＰＶ ６１７ ４８．１ＯＲＦに挿入した（唯一のＡｃｃＩ制限部位は唯一のＮｏｔＩ制限部位で置き換えた）。ｌａｃＺ遺伝子は合成後期プロモーター（ＬＰ１）の制御下にあり、ＰＲＶ ｇＢ遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０７６、Ｓ−ＳＰＶ−０７７、およびＳ−ＳＰＶ−０７９はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクターおよびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０７６、Ｓ−ＳＰＶ−０７７、およびＳ−ＳＰＶ−０７９と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０７６、Ｓ−ＳＰＶ−０７７、およびＳ−ＳＰＶ−０７９はＰＲＶ糖蛋白質の発現につき「黒色プラーク・アッセイ」および「ウェスタンブロット」によってテストした。
Ｓ−ＳＰＶ−０７６、Ｓ−ＳＰＶ−０７７、およびＳ−ＳＰＶ−０７９はブタにおいてＰＲＶ感染に対するワクチンとして有用であって、ＰＲＶ ｇＤ、ｇＩまたはｇＢの発現に有用である。Ｓ−ＳＰＶ−０７１はＳ−ＳＰＶ−００１、Ｓ−ＳＰＶ−０１２、またはＳ−ＳＰＶ−０１３のごときＰＲＶ ｇＣを発現とする組換え豚痘ウイルスと組み合わせたワクチンとして有用である。
１４３Ｂ 骨肉腫＊
Ａ４３１ 類表皮癌＊
Ａ５４９ 肺癌＊
Ｃａｐａｎ−１ 肝臓癌＊
ＣＦ５００ 包皮繊維芽細胞
Ｃｈａｎｇ肝臓 肝臓
Ｄｅｔｒｏｉｔ ダウン包皮繊維芽細胞
ＨＥＬ−１９８ 胚性肺
ＨｅＬａ 子宮頸部癌＊
Ｈｅｐ−２ 表皮咽頭癌＊
ＨＩＳＭ 腸平滑筋
ＨＮＫ 新生児腎臓
ＭＲＣ−５ 胚性肺
ＮＣＩ−Ｈ２９２ 肺粘液性類表皮癌＋
ＯＶＣＡＲ−３ 卵巣癌＊
ＲＤ 横紋筋肉腫＋
ＴＨＰ 単球（白血病）＊
ＷＩＬ２−ＮＳ Ｂリンパ球系、非分泌
ＷＩＳＨ 羊膜
ＰＢＬ 末梢血液リンパ球
実施例３８
ＰＲＲＳ遺伝子ＯＲＦ２、ＯＲＦ３、ＯＲＦ４、ＯＲＦ５、およびＯＲＦ６を発現する組換え豚痘ウイルス
Ｓ−ＳＰＶ−０８０少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ２についての遺伝子をＳＰＶ ７３８−９４．４ ＯＲＦに挿入した（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＰＲＶ ＯＲＦ２遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０８１は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ３についての遺伝子をＳＰＶ ７３８−９４．４ ＯＲＦに挿入した（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＰＲＶ ＯＲＦ３遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０８２は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ４についての遺伝子をＳＰＶ ７３８−９４．４ ＯＲＦに挿入した（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＰＲＶ ＯＲＦ４遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０８３は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ５についての遺伝子をＳＰＶ ７３８−９４．４ ＯＲＦに挿入した（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＰＲＶ ＯＲＦ５遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０８４は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ６についての遺伝子をＳＰＶ ７３８−９４．４ ＯＲＦに挿入した（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＰＲＶ ＯＲＦ６遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０８５は少なくとも２つの外来性遺伝子を発現する豚痘ウイルスである。イー・コリβ−ガラクトシダーゼについての遺伝子（ｌａｃＺ）およびブタ生殖系および呼吸器系症候群ウイルス（ＰＲＲＳ）ＯＲＦ７についての遺伝子をＳＰＶ ７３８−９４．４ ＯＲＦに挿入した（ＳＰＶ ＯｌＬ ＯＲＦの７７３塩基対欠失；１６６９ないし２４５２の欠失、配列番号：１８９）。ｌａｃＺ遺伝子は豚痘ＰＯＩＬプロモーターの制御下にあり、ＰＲＶ ＯＲＦ７遺伝子は合成後期／初期プロモーター（ＬＰ２ＥＰ２）の制御下にある。
Ｓ−ＳＰＶ−０８０、Ｓ−ＳＰＶ−０８１、Ｓ−ＳＰＶ−０８３、Ｓ−ＳＰＶ−０８４およびＳ−ＳＰＶ−０８５はＳ−ＳＰＶ−００１（Kasza株）から誘導した。これは「組換えＳＰＶを創製するための相同組換え法」において相同性ベクター材料および方法（ＰＲＲＳ相同性ベクター）およびウイルスＳ−ＳＰＶ−００１を利用して達成された。「β−ガラクトシダーゼを発現する組換えＳＰＶについてのスクリーニング」（ＢＬＵＯＧＡＬおよびＣＰＲＧアッセイ）によってトランスフェクション・ストックをスクリーニングした。赤色プラーク精製の最終結果はＳ−ＳＰＶ−０８０、Ｓ−ＳＰＶ−０８１、Ｓ−ＳＰＶ−０８３、Ｓ−ＳＰＶ−０８４およびＳ−ＳＰＶ−０８５と命名した組換えウイルスであった。材料および方法に記載した青色プラーク・アッセイによってモニターした複数継代によって、このウイルスを、β−ガラクトシダーゼ発現、純度、およびインサートの安定性につきアッセイした。最初の３ラウンドの精製後、観察された全てのプラークは青色であり、これはウイルスが純粋で、安定であって外来性遺伝子を発現することを示す。
Ｓ−ＳＰＶ−０８０、Ｓ−ＳＰＶ−０８１、Ｓ−ＳＰＶ−０８３、Ｓ−ＳＰＶ−０８４およびＳ−ＳＰＶ−０８５はブタにおいてＰＲＲＳ感染に対するワクチンとして個々にまたは組み合わせて有用であって、ＰＲＲＳ ＯＲＦ２、ＯＲＦ３、ＯＲＦ４、ＯＲＦ５、ＯＲＦ６およびＯＲＦ７の発現で有用である。
実施例３９
以下の実験を行って、培養においてヒト細胞に感染する、およびｌａｃＺのごとき外来性ＤＮＡを発現する豚痘ウイルスの能力を測定した。
Ｓ−ＳＰＶ−００３をＭＯＩ＝０．１にて後記標記にリストしたヒト細胞系に２ないし３時間吸着させた。細胞をＰＢＳで３回すすぎ、増殖培地を添加し、細胞を３７℃で４日間インキュベートした。細胞を収穫し、３回の凍結／解凍によって２００マイクロリットルのＰＢＳ中に溶解物を調製した。細胞夾雑物をペレット化し、１０マイクロリットルの上清をＯＮＰＧアッセイによって、３７℃にて、ガラクトシダーゼ活性につき１／２時間アッセイした。表はＳ−ＳＰＶ−００３での種々のヒト細胞系の感染および細胞障害効果の相対的レベルおよびｌａｃＺの発現の結果を示す。
結果は、種々の細胞系はＳ−ＳＰＶ−００３を摂取し、ｌａｃＺを発現する能力が変化することを示す。ＣＰＥは全ての場合において最小であって、ウイルス複製の結果とはならなかった。１つの例外はＡ５４９細胞であり、これは、１つの例で、数ラウンドの細胞周期およびプレートからの剥がれを示さず、もう１つの例は継代の間の力価の１０倍増加であり、これは限定的ウイルス複製を示唆した。いくつかの細胞系は、細胞障害効果を持たない有意なｌａｃＺ活性を示す。
異なる痘プロモーターは、多数のヒト細胞系で組換え豚痘ウイルスからのｌａｃＺを発現する。ＥＰ１、ＬＰ１、ＬＰ２、ＥＰ１ＬＰ２、ＬＰ２ＥＰ２、またはＳＰＶ ＰＯｌＬプロモーターからのｌａｃＺを発現した６種の異なる豚痘ウイルスを構築した。ウイルスを各々用いて、Ａ５４９、Ｃｈａｎｇ肝臓、または１４３Ｂ細胞を０．１ｍｏｉにて感染させ、細胞を２および３時間後にすすぎ、次いで、３７℃で４日間インキュベートした。各細胞系はプロモーター活性の異なる階層を維持し、これは以下の実験で再現性があった。例えば、ＥＰ１、ＬＰ２ＥＰ２、およびＰＯｌＬプロモーターは１４３Ｂ細胞で最大の発現を与え、他方、ＬＰ２はＣｈａｎｇ肝臓細胞で最も強力であり、ＥＰ１ＬＰ２はＡ５４９で最も強力であった。Ｃｈａｎｇ肝臓およびＡ５４９細胞において、ＰＯｌＬプロモーターからの発現は最も貧弱であり、他方、１４３Ｂにおいては、ＬＰ２からの発現が貧弱であった。従って、異なるヒト細胞系は異なる方法で痘プロモーターを利用する。これは、異なる細胞系で複製経路に沿ってどれ位遠くまで豚痘ウイルスが進行できるかを反映し得る。
これらの初期および後期プロモーターは、組換え豚痘ウイルスによって感染されたヒト細胞型に応じてより低いまたはより高いｌａｃＺ活性を呈した。異なる標的組織に対して異なるプロモーターを選択することによって、豚痘ウイルスから標的組織に送達される外来性遺伝子産物の量を調節することができる。
組換え豚痘ウイルスはヒト感染性病気に対するワクチンとして、および治療剤をヒトに送達するのに有用である。組換え豚痘ウイルスはヒトにおいてウイルスまたは細菌感染に対するワクチンとして、および抗生物質、腫瘍抗原、細胞表面リガンドおよび受容体、サイトカインのごとき免疫変調分子を送達するための癌または遺伝病のための治療剤として有用である。
実施例４０
ヒト細胞系におけるｌａｃＺのＳ−ＳＰＶ−００３発現
細胞障害効果およびｌａｃＺ発現の測定
細胞型 細胞障害効果＊ ｌａｃＺ発現＊＊
Ａ４３１ − −
類表皮癌＊
Ａ５４９ ＋＋ ＋＋＋
肺癌＊
Ｃａｐａｎ−１ − −
肺癌＊
ＣＦ５００ ＋ ＋
包皮繊維芽細胞
Ｃｈａｎｇ肝臓 ＋ ＋＋＋
Ｄｅｔｒｏｉｔ ＋／− −
ガウン包皮繊維芽細胞
ＨＥＬ−１９９ ＋／− ＋＋＋
胚性肺
ＨＥｐ−２ − ＋
表皮咽頭癌＊
ＨＩＳＮ ＋ ＋
腸平滑筋
ＨＮＫ − ＋＋
新生児腎臓
ＭＲＣ−５ ＋／− ＋
胚性肺
ＮＣＩ−Ｈ２９２ − ＋＋＋
肺粘液性類表皮癌＊
ＯＶＣＡＲ−３ − ＋＋＋
卵巣癌＊
ＲＤ − ＋
横紋筋肉腫＋
ＴＨＰ − ＋
単球（白血病）＊
ＷＩＬ２−ＮＳ − −−−−
Ｂリンパ球系、非分泌
ＷＩＳＨ ＋／−
羊膜
ＨｅＬａ − ＋＋＋
ＰＢＬ − −
末梢血液リンパ球
＊ヒト細胞をＳＰＶで感染させた場合、細胞障害効果が時々観察される。ほとんどの細胞系において、この細胞障害効果は細胞の出現の変化によって示され、細胞は薄くなり、エッジに沿ってより凸凹になり；細胞は緊張しているように見える。この現象は以下のごとくに評価される。
−は感染および非感染細胞の間に差異のないことを示す。
＋／−は、ほとんどの細胞が正常に見えるにも拘わらず、単層が非感染のものと視覚的に異なることを示す。
＋は、単層が明らかに侵されており、ほとんどの細胞が緊張して見えることを示す。系列的継代後に力価が得られたある種の細胞（ＨｅＬａ、ＣＦ５００、１４３Ｂ）においては、１つの例外を除き、ＳＰＶの複製の証拠がなかったことに注意すべきである。
Ａ５４９は、細胞が感染の間に丸くなってプレートから剥がれた場合に、１つの例において細胞障害効果につき＋＋を与えたが、この観察は反復されなかった。また、Ａ５４９は継代の間に１０倍増加の力価の証拠をもう１つの例で示し、これは限定的ウイルス複製を支持し得ることを示す。
＊＊ ３５ｍｍ皿の１／２０からの細胞溶解物当たりのＡ260単位で表したβ−ガラクトシダーゼ活性
− 活性無し
＋ ０．２−０．９Ａ260単位
＋＋ ０．９−１．６Ａ260単位
＋＋＋ １．６Ａ260単位より大
（１）一般情報
（i）出願人：コシュラン，マーク Ｄ．
ユンカー，デイヴィッド Ｅ．
（ii）発明の名称：組換え型豚痘ウイルス
（iii）配列の数：２３１
（iv）通信宛先：
（A）名宛人：ジョン Ｐ．ホワイト
（B）通り：１１８５アベニュー・オブ・ジ・アメリカズ
（C）市：ニューヨーク
（D）州：ニューヨーク
（E）国：アメリカ合衆国
（F）郵便番号：１００３６
（v）コンピュータ読取り可能な形態：
（A）媒体タイプ：フロッピーディスク
（B）コンピュータ：ＩＢＭ・ＰＣコンパチブル
（C）オペレーティングシステム：ＰＣ−ＤＯＳ／ＭＳ−ＤＯＳ
（D）ソフトウエア：ＰａｔｅｎｔＩｎ リリース＃１．０、バージョン＃１．２５
（vi）現在の出願データ：
（A）出願番号：
（B）出願日：１９９６年１月１９日
（C）分類：
（viii）アトニー／エージェント情報
（A）氏名：ホワイト，ジョン Ｐ．
（B）登録番号：２８，６７８
（ix）電信情報：
（A）電話：（２１２）２７８−０４００
（B）テレファックス：（２１２）３９１−０５２５
（配列認識番号１のための情報−削除）
（２）配列認識番号２のための情報：
（i）配列特性：
(A)長さ：１３２アミノ酸
(B)型：アミノ酸
(D)トポロジー：直鎖状
（ii）配列の種類：タンパク質
（xi）配列の記載：配列認識番号２
（２）配列認識番号４のための情報：
（i）配列特性：
(A)長さ：２２０アミノ酸
(B)型：アミノ酸
(D)トポロジー：直鎖状
（ii）配列の種類：タンパク質
（xi）配列の記載：配列認識番号４
（i）配列特性：
(A)長さ：１２９アミノ酸
(B)型：アミノ酸
(C)鎖の数：二本鎖
(D)トポロジー：直鎖状
（ii）配列の種類：ペプチド
（iii）ハイポセティカル：ＹＥＳ
（iv）アンチセンス：ＮＯ
（v）フラグメント型：Ｎ末端
（vi）起源：
（A）生物名：ワクシニアウイルス
（B）株名：コペンハーゲン
（viii）ゲノム内での位置
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号５
（i）配列特性：
(A)長さ：１３２アミノ酸
(B)型：アミノ酸
(C)鎖の数：二本鎖
(D)トポロジー：直鎖状
（ii）配列の種類：ペプチド
（iii）ハイポセティカル：ＹＥＳ
（iv）アンチセンス：ＮＯ
（v）フラグメント型：Ｎ末端
（vi）起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（viii）ゲノム内での位置
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号６
（i）配列特性：
（A）長さ：１０１アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
（ii）配列の種類：ペプチド
（iii）ハイポセティカル：ＹＥＳ
（iv）アンチセンス：ＮＯ
（v）フラグメント型：Ｃ末端
（vi）起源：
（A）生物名：ワクシニアウイルス
（B）株名：コペンハーゲン
（viii）ゲノムでの位置：
(B)染色体上の位置：〜２３．２
(C)単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号７
（i）配列特性：
（A）長さ：１００アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
（ii）配列の種類：ペプチド
（iii）ハイポセティカル：ＹＥＳ
（iv）アンチセンス：ＮＯ
（v）フラグメント型：Ｃ末端
（vi）起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（viii）ゲノムでの位置：
(B)染色体上の位置：〜２３．２
(C)単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号８
（i）配列特性：
（A）長さ：１２０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
（ii）配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
（iii）ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源
（B）クローン：５２０−１７．５（ジャンクションＡ）
(x)出版物情報
（A）著者：フェラーリ，フランコ Ａ
トラシュ，カスリーン
ホック，ジェイムズ Ａ
（B）題名：ｓｏｐ０Ｂ遺伝子座の配列分析は多シストロン性転写ユニットを明らかにする
（C）刊行物：Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．
（D）巻：１６１
（E）号：２
（F）頁：５５６−５６２
（G）日付：１９８５年２月
（xi）配列の記載：配列認識番号９
(i)配列特性：
（A）長さ：１０２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５２０−１７．５（ジャンクションＢ）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：８５．．９
（D）他の情報：／コドン開始＝８５
／機能＝「ハイブリッドタンパクの翻訳開始」
／産物＝「Ｎ−末端ペプチド」
／番号＝１
／標準名＝「合成ＤＮＡ配列の翻訳」
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１００．．１０２
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／コドン開始＝１００
／機能＝「マーカー酵素」
／産物＝「ベータガラクトシダーゼ」
／証拠＝実験による
／遺伝子＝「ｌａｃＺ」
／番号＝２
／引用文献＝（［１］）
(x)出版物情報
（A）著者：フェラーリ，フランコ Ａ
トラシュ，カスリーン
ホック，ジェイムズ Ａ
（B）題名：ｓｏｐ０Ｂ遺伝子座の配列分析は多シストロン性転写ユニットを明らかにする
（C）刊行物：Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．
（D）巻：１６１
（E）号：２
（F）頁：５５６−５６２
（G）日付：１９８５年２月
（xi）配列の記載：配列認識番号１０
(i)配列特性：
（A）長さ：５アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１１
(i)配列特性：
（A）長さ：１アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１２
(i)配列特性：
（A）長さ：１０３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５２０−１７．５（ジャンクションＣ）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．７２
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／一部
／コドン開始＝１
／機能＝「マーカー酵素」
／産物＝「ベータガラクトシダーゼ」
／証拠＝実験による
／遺伝子＝「ｌａｃＺ」
／番号＝１
／引用文献＝（［１］）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：７３．．７８
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／コドン開始＝７３
／機能＝「ハイブリッドタンパクの翻訳終了」
／産物＝「Ｃ末端ペプチド」
／証拠＝実験による
／遺伝子＝「ｌａｃＺ」
／番号＝２
／標準名：合成ＤＮＡ配列の翻訳
(x)出版物情報
（A）著者：フェラーリ，フランコ Ａ
トラシュ，カスリーン
ホック．ジェイムズ Ａ
（B）題名：ｓｏｐ０Ｂ遺伝子座の配列分析は多シストロン性転写ユニットを明らかにする
（C）刊行物：Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．
（D）巻：１６１
（E）号：２
（F）頁：５５６−５６２
（G）日付：１９８５年２月
(xi)配列の記載：配列認識番号１３
（i）配列特性：
（A）長さ：２４アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１４
（i）配列特性：
（A）長さ：２アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１５
（i）配列特性：
（A）長さ：４８塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５２０−１７．５（ジャンクションＤ）
（xi）配列の記載：配列認識番号１６
（i）配列特性：
（A）長さ：５７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５３８−４６．２６（ジャンクションＡ）
(xi)配列の記載：配列認識番号１７
（i）配列特性：
（A）長さ：１０２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５３８−４６．１６（ジャンクションＢ）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：９１．．１０２
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／一部
／コドン開始＝１
／機能＝「マーカー酵素」
／産物＝「ベータガラクトシダーゼ」
／証拠＝実験による
／遺伝子＝「ｌａｃＺ」
／番号＝２
／引用文献＝（［１］）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／コドン開始＝７６
／機能＝「ハイブリッドタンパクの翻訳開始」
／産物＝「Ｎ末端ペプチド」
／番号＝２
／標準名：「合成ＤＮＡ配列の翻訳」
(x)出版物情報
（A）著者：フェラーリ，フランコ Ａ
トラシュ，カスリーン
ホック，ジェイムズ Ａ
（B）題名：ｓｏｐ０Ｂ遺伝子座の配列分析は多シストロン性転写ユニットを明らかにする
（C）刊行物：Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．
（D）巻：１６１
（E）号：２
（F）頁：５５６−５６２
（G）日付：１９８５年２月
(xi)配列の記載：配列認識番号１８
(i)配列特性：
（A）長さ：５アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１９
（i）列特性：
（A）長さ：４アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号２０
（i）配列特性：
（A）長さ：２０６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５３８−４６．１６（ジャンクションＣ）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．６３
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／一部
／コドン開始＝１
／機能＝「マーカー酵素」
／産物＝「ベータガラクトシダーゼ」
／証拠＝実験による
／遺伝子＝「ｌａｃＺ」
／番号＝１
／引用文献＝（［１］）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：６４．．６９
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／コドン開始＝６４
／産物＝「Ｃ末端ペプチド」
／証拠＝実験による
／標準名＝「合成ＤＮＡ配列の翻訳」
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１７７．．１８５
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／コドン開始＝１７７
／機能＝「ハイブリッドタンパクの翻訳開始」
／産物＝「Ｎ末端ペプチド」
／証拠＝実験による
／標準名＝「合成ＤＮＡ配列の翻訳」
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１８６．．２０６
（C）特徴を決定した方法：実験による
（D）他の情報：／一部
／コドン開始＝１８６
／機能＝「糖タンパク」
／産物＝「ＰＲＶ ｇｐ５０」
／証拠＝実験による
／遺伝子＝「ｇｐ５０」
／番号＝３
／引用文献＝（［２］）
(x)出版物情報
（A）著者：フェラーリ，フランコ Ａ
トラシュ，カスリーン
ホック，ジェイムズ Ａ
（B）題名：ｓｏｐ０Ｂ遺伝子座の配列分析は多シストロン性転写ユニットを明らかにする
（C）刊行物：Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．
（D）巻：１６１
（E）号：２
（F）頁：５５６−５６２
（G）日付：１９８５年２月
（x）出版物情報
（A）著者：ペトロフスキ，エリク Ａ／ティミンズ，ジェイムズ Ｇ／アルマントラウト，マーティー Ａ／マリシオリ，カルミン Ｃジュニア ヤンシー，ロバート Ｊ／ポスト，レオナルド Ｅ
（B）題名：シュードラビーウイルスｇｐ５０の遺伝子のＤＮＡ配列、Ｎ−結合グリコシル化を伴わない糖タンパク
（C）刊行物：Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．
（D）巻：５９
（E）号：２
（F）頁：２１６−２２３
（G）日付：１９８６年８月
(xi)配列の記載：配列認識番号２１
(i)配列特性：
（A）長さ：２１アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号２２
（i）列特性：
（A）長さ：２アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号２３
(i)配列特性：
（A）長さ：３アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号２４
(i)配列特性：
（A）長さ：７アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号２５
(i)配列特性：
（A）長さ：１０１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５３８−４６．１６（ジャンクションＤ）
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．１５
（D）他の情報：／一部
／コドン開始＝１
／機能＝「糖タンパク」
／産物＝「ＰＲＶ ｇｐ６３」
／遺伝子＝「ｇｐ６３」
／番号＝１
／引用文献＝（［１］）
(x)出版物情報
（A）著者：ペトロフスキ，エリク Ａ
ティミンズ，ジェイムズ Ｇ
ポスト，レオナルド Ｅ
（B）題名：単純ヘルペスウイルス及びバリセラ−ゾスターウイルスの糖タンパクに対して相同性を有する２つのシュードラビーウイルス糖タンパクの遺伝子を単離するためのラムダ−ｇｔｌｌの使用
（C）刊行物：Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．
（D）巻：６０
（E）号：１
（F）頁：１８５−１９３
（G）日付：１９８６年１０月
(xi)配列の記載：配列認識番号２６
(i)列特性：
（A）長さ：５アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号２７
(i)配列特性：
（A）長さ：５７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：環状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
(A)生物名：プラスミド
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５３８−４６．１６（ジャンクションＥ）
（xi）配列の記載：配列認識番号２８
（２）配列認識番号３０のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：５７７アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号３０
（２）配列認識番号３３のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：２アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号３３
（２）配列認識番号３５のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：５アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号３５
(i)配列特性：
（A）長さ：８アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号３６
（２）配列認識番号３８のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：１８アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号３８
(i)配列特性：
（A）長さ：２アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号３９
（２）配列認識番号４１のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：２７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(vi)起源：
（A）生物名：仮性狂犬病ウイルス
合成オリゴヌクレオチドプライマー
(xi)配列の記載：配列認識番号４１
(i)配列特性：
（A）長さ：１９塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(vi)起源：
（A）生物名：仮性狂犬病ウイルス
合成オリゴヌクレオチドプライマー
(xi)配列の記載：配列認識番号４２
(i)配列特性：
（A）長さ：７０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号４３
(i)配列特性：
（A）長さ：７４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号４４
(i)配列特性：
（A）長さ：３７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
（xi）配列の記載：配列認識番号４５
(i)配列特性：
（A）長さ：４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号４６
（２）配列認識番号６１のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号６１
(i)配列特性：
（A）長さ：１０４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：８１．．１２３０４
(xi)配列の記載：配列認識番号６２
（i）配列特性：
（A）長さ：８アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号６３
(i)配列特性：
（A）長さ：１８２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．６３
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１５６．．１８２
(xi)配列の記載：配列認識番号６４
（i）配列特性：
（A）長さ：２０アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号６５
（２）配列認識番号７６のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号７６
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号７７
(i)配列列特性：
（A）長さ：１１７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：９４．．１１７
(xi)配列の記載：配列認識番号７８
（i）配列特性：
（A）長さ：８アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号７９
(i)配列特性：
（A）長さ：１２６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１０３．．１２６
(xi)配列の記載：配列認識番号８０
（２）配列認識番号９１のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．６３
(xi)配列の記載：配列認識番号９１
(i)配列特性：
（A）長さ：２０アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号９２
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号９３
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号９４
(i)配列特性：
（A）長さ：１２４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(i)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１０４．．１２４
(xi)配列の記載：配列認識番号９５
(i)配列特性：
（A）長さ：７アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号９６
(i)配列特性：
（A）長さ：１２６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．３６
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１０３．．１２６
(xi)配列の記載：配列認識番号９７
(i)配列特性：
（A）長さ：１１アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号９８
(i)配列特性：
（A）長さ：８アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号９９
(i)配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．６３
(xi)配列の記載：配列認識番号１００
(i)配列特性：
（A）長さ：２０アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１０１
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０２
(i)配列特性：
（A）長さ：３０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０３
(i)配列特性：
（A）長さ：２０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０４
(i)配列特性：
（A）長さ：２６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０５
(i)配列特性：
（A）長さ：２０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０６
(i)配列特性：
（A）長さ：１９塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０７
(i)配列特性：
（A）長さ：２６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０８
(i)配列特性：
（A）長さ：３０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１０９
(i)配列特性：
（A）長さ：３０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１１０
(i)配列特性：
（A）長さ：４２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１１１
(i)配列特性：
（A）長さ：４２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１１２
（２）配列認識番号１１４のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：３８９アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１１４
(i)配列特性：
（A）長さ：６７７アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（ｇｅｎｏｍｉｃ）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(vii)直接の起源：
（B）クローン：５１５−８５．１
(viii)ゲノム内での位置：
（B）染色体上の位置：〜２３．２
（C）単位：％Ｇ
(xi)配列の記載：配列認識番号１１５
（２）配列認識番号１３４のための情報：
(i)配列特性：
（A）長さ：４２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシのウイルス性下痢ウイルス
（B）株名：Singer Strain
(xi)配列の記載：配列認識番号１３４
(i)配列特性：
（A）長さ：４０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシのウイルス性下痢ウイルス
（B）株名：Singer Strain
(xi)配列の記載：配列認識番号１３５
(i)配列特性：
（A）長さ：３３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシのウイルス性下痢ウイルス
（B）株名：Singer Strain
(xi)配列の記載：配列認識番号１３６
(i)配列特性：
（A）長さ：３１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシのウイルス性下痢ウイルス
（B）株名：Singer Strain
(xi)配列の記載：配列認識番号１３７
(i)配列特性：
（A）長さ：３７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシの呼吸系シンシチアウイルス
（B）株名：Strain ３７５
(xi)配列の記載：配列認識番号１３８
(i)配列特性：
（A）長さ：３５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシの呼吸系シンシチアウイルス
（B）株名：Strain ３７５
(xi)配列の記載：配列認識番号１３９
(i)配列特性：
（A）長さ：４０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシの呼吸系シンシチアウイルス
（B）株名：Strain ３７５
(xi)配列の記載：配列認識番号１４０
(i)配列特性：
（A）長さ：４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシの呼吸系シンシチアウイルス
（B）株名：Strain ３７５
(xi)配列の記載：配列認識番号１４１
(i)配列特性：
（A）長さ：４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシの呼吸系シンシチアウイルス
（B）株名：Strain ３７５
(xi)配列の記載：配列認識番号１４２
(i)配列特性：
（A）長さ：４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：ウシの呼吸系シンシチアウイルス
（B）株名：Strain ３７５
(xi)配列の記載：配列認識番号１４３
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
(xi)配列の記載：配列認識番号１４４
(i)配列特性：
（A）長さ：１２８塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１４５
（i）配列特性：
（A）長さ：１２０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
（xi）配列の記載：配列認識番号１４６
（i）配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１４７
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１４８
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１４９
(i)配列特性：
（A）長さ：１６８塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５０
（i）配列特性：
（A）長さ：１１２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
（xi）配列の記載：配列認識番号１５１
（i）配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５２
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５３
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５４
(i)配列特性：
（A）長さ：１０４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５５
（i）配列特性：
（A）長さ：１８５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５６
（i）配列特性：
（A）長さ：６６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５７
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５８
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１５９
(i)配列特性：
（A）長さ：１２７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６０
（i）配列特性：
（A）長さ：１２２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６１
（i）配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６２
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６３
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６４
(i)配列特性：
（A）長さ：６１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６５
（i）配列特性：
（A）長さ：４５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
（xi）配列の記載：配列認識番号１６６
（i）配列特性：
（A）長さ：１０５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６７
（i）配列特性：
（A）長さ：３１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６８
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
（genomic）
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１６９
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７０
（i）配列特性：
（A）長さ：１９３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７１
（i）配列特性：
（A）長さ：１２３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７２
（i）配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７３
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７４
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７５
（i）配列特性：
（A）長さ：１３３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
（xi）配列の記載：配列認識番号１７６
（i）配列特性：
（A）長さ：９９塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７７
（i）配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７８
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１７９
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８０
（i）配列特性：
（A）長さ：１４０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
（xi）配列の記載：配列認識番号１８１
（i）配列特性：
（A）長さ：１２３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８２
（i）配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８３
（i）配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８４
(i)配列特性：
（A）長さ：３９塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８５
（i）配列特性：
（A）長さ：４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８６
（i）配列特性：
（A）長さ：４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８７
(i)配列特性：
（A）長さ：３９塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１８８
(i)配列特性：
（A）長さ：３９４２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．３６９
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：３７０．．５９７
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：５９８．．１５３９
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１６７５．．３７０８
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：相補鎖（３７４８．．３９４２）
(xi)配列の記載：配列認識番号１８９
(i)配列特性：
（A）長さ：１２２アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ペプチド
(xi)配列の記載：配列認識番号１９０
(i)配列特性：
（A）長さ：７５アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号１９１
(i)配列特性：
（A）長さ：３１３アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号１９２
(i)配列特性：
（A）長さ：６７７アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号１９３
(i)配列特性：
（A）長さ：６４アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号１９４
(i)配列特性：
（A）長さ：５８３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(vi)起源：
（A）生物名：豚痘ウイルス
（B）株名：Kasza
（C）固体・単離クローン名：Ｓ−ＳＰＶ−００１
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：２．．５８３
(xi)配列の記載：配列認識番号１９５
(i)配列特性：
（A）長さ：１９４アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号１９６
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１９７
(i)配列特性：
（A）長さ：１３８塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１９８
（i）配列特性：
（A）長さ：１２０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号１９９
(i)配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２００
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０１
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０２
(i)配列特性：
（A）長さ：１４１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０３
(i)配列特性：
（A）長さ：１２０塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０４
(i)配列特性：
（A）長さ：１１６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０５
(i)配列特性：
（A）長さ：５１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０６
(i)配列特性：
（A）長さ：４５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０７
(i)配列特性：
（A）長さ：５７塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０８
(i)配列特性：
（A）長さ：２４９塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２０９
(i)配列特性：
（A）長さ：４５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１０
(i)配列特性：
（A）長さ：３３塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１１
(i)配列特性：
（A）長さ：３６塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１２
(i)配列特性：
（A）長さ：３５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１３
(i)配列特性：
（A）長さ：３２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１４
(i)配列特性：
（A）長さ：３４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１５
(i)配列特性：
（A）長さ：３２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１６
(i)配列特性：
（A）長さ：３２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１７
(i)配列特性：
（A）長さ：３４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１８
(i)配列特性：
（A）長さ：３２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２１９
(i)配列特性：
（A）長さ：３２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：二本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：ＮＯ
(iv)アンチセンス：ＮＯ
(xi)配列の記載：配列認識番号２２０
(i)配列特性：
（A）長さ：５７８５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(xi)配列の記載：配列認識番号２２１
(i)配列特性：
（A）長さ：７２２塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(xi)配列の記載：配列認識番号２２２
(i)配列特性：
（A）長さ：２３４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(xi)配列の記載：配列認識番号２２３
(i)配列特性：
（A）長さ：１２０５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(xi)配列の記載：配列認識番号２２４
(i)配列特性：
（A）長さ：３０５塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(xi)配列の記載：配列認識番号２２５
(i)配列特性：
（A）長さ：１７２１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．１７２１
（D）他の情報：
(xi)配列の記載：配列認識番号２２６
(i)配列特性：
（A）長さ：５７３アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号２２７
(i)配列特性：
（A）長さ：１４１４塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．１４１４
（D）他の情報：
(xi)配列の記載：配列認識番号２２８
(i)配列特性：
（A）長さ：４７１アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号２２９
(i)配列特性：
（A）長さ：１５０１塩基対
（B）型：核酸
（C）鎖の数：一本鎖
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：ＤＮＡ（genomic）
(iii)ハイポセティカル：Ｎ
(iv)アンチセンス：Ｎ
(ix)配列の特徴：
（A）名称／記号：ＣＤＳ
（B）存在位置：１．．１５０１
（D）他の情報：
(xi)配列の記載：配列認識番号２３０
(i)配列特性：
（A）長さ：５００アミノ酸
（B）型：アミノ酸
（D）トポロジー：直鎖状
(ii)配列の種類：タンパク
(xi)配列の記載：配列認識番号２３１
Within this application, several publications are referenced by Arabic numerals in parentheses. Full bibliographic citations for these documents can be found at the end of the specification, ie immediately before the claims. The disclosures of these documents are incorporated herein by reference as part of the present specification.
BACKGROUND OF THE INVENTION
Swinepox virus (SPV) belongs to the Poxviridae family. Viruses belonging to this group are large double-stranded DNA viruses that develop characteristically in the cytoplasm of the host cell. SPV is the only member of the genus Suipoxvirus. SPV is distinguished from other polyviruses by several features. Compared to the broad host range of other poxviruses such as vaccinia, SPV shows species specificity (18). There is a dramatic difference between infecting tissue culture cell lines with SPV and other poxviruses (24). SPV shows no antigen cross-reactivity with vaccinia virus and no detectable overall homology at the DNA level with ortho, lepoli, avi, and insect pox groups (24). Therefore, what is known and described in the prior art for other poxviruses is not prior art for swinepox virus. SPV is the only mild pathogen characterized by a self-regulating infection with lesions that are detected only in the skin and local lymph nodes. Although SPV infection is very limited, it can be seen that pigs recovered from SPV are immune to SPV sensitization and have developed active immunity (18).
The present invention relates to the use of SPV as a delivery vector for vaccine antigens and therapeutic agents for pigs. This principle is supported by the following characteristics of SPV. SPV is the only mild pathogen in pigs, is species specific and induces a protective immune response. Thus, SPV is an excellent candidate for a viral vector delivery system that has few inherent risks that must be balanced with the benefits afforded by the vector's vaccine and therapeutic attributes.
The prior art of the present invention includes firstly the technique of DNA cloning and analysis in a bacterial plasmid. The technology used is detailed in the majority of Maniatis et al. 1983 and Sunblock et al. 1989. These documents teach the state of the art of general recombinant DNA techniques.
Five of the poxviruses (vaccinia, poultry pox, canary pox, pigeon and raccoon pox) were engineered to contain foreign DNA sequences prior to this disclosure. Vaccinia virus has been used extensively as a vector for foreign genes (25), which is the subject of US Patents 4,603,112 and 4,722,848. Similarly, poultry pox has been used as a vector for foreign genes, which is the subject of several patent applications, EPA 0 284 416, PCT WO89 / 03429, and PCT WO89 / 12684. Raccoon pox (10) and canary pox (31) have been used to express antigens of rabies virus origin. Examples of foreign gene inserts inserted into poxviruses do not include examples from the genus Suipoxvirus. Thus, there is no teaching on how to genetically engineer swinepox virus, that is, where to insert it and how to obtain the expression in porcine pox.
The idea of using live virus as an antigen delivery system has a very long history when going back to the first live virus vaccine. The delivered antigen was not foreign and was naturally expressed in the vaccine by the live virus. The use of viruses to deliver foreign antigens has now been facilitated by studies of recombinant vaccinia viruses. Vaccinia virus is a vector, various antigens from other diseases that cause infectivity are foreign antigens, and the vaccine is made by genetic engineering. While these disclosures have clarified these concepts, what has not been clarified was an answer to practical questions rather than what makes the best viral vector candidates. In answering this question, details of the pathogenicity of the virus, the site of replication, the type of immune response it induces, the possibility that the virus will express foreign antigens, the suitability of genetic engineering, and the potential for regulatory approval All the factors for selection. The prior art teaches nothing about these practical problems.
Prior art involving the use of poxviruses to deliver therapeutic agents includes the use of vaccinia viruses that deliver interleukin 2 (12). In this case, although
The therapeutic agent delivered by the viral vector of the present invention must be a biological molecule, ie, a byproduct of porcine virus replication. Thus, the therapeutic agent is initially limited to DNA, RNA or protein. Examples of therapeutic agents derived from these compound classes include antisense DNA, antisense RNA (16), ribosome (34), suppressor tRNAs (2), and interferon-induced double-stranded RNA forms. Examples of protein therapeutic agents include hormones such as insulin, lymphokines such as interferon and interleukin, and natural anesthetics. The discovery of these therapeutic agents and elucidation of their structure and action do not facilitate the skill of using them in viral vector delivery systems.
[Summary of the Invention]
The present invention relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence to be inserted into swinepox virus genomic DNA, wherein the foreign DNA is inserted into a Hind III N fragment of swinepox virus genomic DNA, and A recombinant swinepox virus that can be expressed in an infected host cell is provided.
The invention further provides homology vectors, vaccines and methods of immunization.
[Brief description of the drawings]
1A-1B:
A detailed view of SPV genomic DNA (kasza strain) containing the characteristic long terminal repeat (TR) region is shown. A restriction map is shown for the enzyme Hind III (23). Fragments are displayed in letters in order of decreasing size. The terminal repeat size is larger than 2.1Kb but smaller than 9.7Kb.
(Figures 2A-2B deleted)
3A-3C:
5 shows the homology between 515-85.1 ORF and vaccinia virus 01LORF. In FIG. 3A, two maps are shown. The first line in FIG. 3A is a restriction map of the SPV Hind III M fragment and the second line is a restriction map of the DNA insert in plasmid 515-85.1. The location of the 515-85.1 [VV 01L-like] ORF is also shown in the map. The positions of the DNA sequences shown in FIGS. 3B and 3C are indicated by thick bars below the map in FIG. 3A. FIG. 3B shows the homology between VV01LORF (SEQ ID NO: 5) and 515-85.1 ORF (SEQ ID NO: 6) at their respective N-termini. FIG. 3C shows the homology between VV01LORF (SEQ ID NO: 7) and 515-85.1ORF (SEQ ID NO: 8) at their respective C-termini.
4A-4D
The DNA insert in homology vector 520-17.5 has been described. FIG. 4A contains a diagram showing the orientation of DNA fragments associated with plasmid 520-17.5 and a table showing the origin of each fragment. FIG. 4B shows the arrangement located at each of the junctions A and B between the fragments. FIG. 4C shows the sequences located at the junctions C and D (
5A-5D
The DNA insert at 538-46.16 in the homology vector has been described in detail. FIG. 5A contains a diagram showing the orientation of the DNA fragments associated with plasmid 538-46.16 and a table showing the origin of each fragment. FIG. 5B shows the sequence located at the junctions A and B between the fragments. FIG. 5C shows an array located at the connecting part C, and FIG. 5D shows an array located at the connecting parts D and E (sequence recognition numbers 17, 18, 21, 26 and 28). In FIGS. 5B to 5D, the synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. The synthetic reinker sequence is underlined with a thick bar. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudorabies virus (PRV), g50 (gD), glycoprotein 63 (g63), early promoter (EP1), late promoter 1 (LP1) (sequence recognition) No. 46), late promoter 2 (LP2), lactose operon Z gene (lacZ), and E. coli.
(FIG. 6-11D deleted)
Figures 12A-12D:
The DNA inserts in swinepox virus S-SPV-013 and the same vector 570-91.64 are described in detail. FIG. 12A contains a diagram showing the orientation of the DNA fragments associated with plasmid 570-91.64 and a table showing the origin of each fragment. FIG. 12B shows the sequence located at the junctions A and B between the fragments. FIG. 12C shows an array located at the connecting portion C, and FIG. 12D shows an array located at the connecting portions D and E (
(Deleted in FIGS. 13A-16)
Figure 17:
Map showing 5.6 kilobase pair HindIII M swinepox virus genomic DNA fragment. An open reading frame (ORF) is shown along with the number of amino acid codes in each open reading frame. The swinepox virus ORFs show significant sequence identity with the vaccinia virus ORFs and are labeled by the vaccinia virus nomenclature (56 and 58). I4LORF (SEQ ID NO: 196) shows amino acid sequence homology with the large unit of ribonucleotide reductase (57), and 01LORF (SEQ ID NO: 193) is characteristic of a certain eukaryotic translational regulatory protein (13). Amino acid sequence homology to a typical leucine zipper motif. The Bgl II site in I4LORF and the AccI site in 01LORF are the insertion sites for foreign DNA into non-essential regions of the porcine pox genome. Homology vector 738-94.4 contains a deletion of SPV DNA from nucleotides 1679 to 2452 (SEQ ID NO: 189). The black bar at the bottom indicates the region where the DNA sequence is known and shows SEQ ID NOs: 189 and 195. The locations of the restriction sites AccI, BglII, and HindIII are indicated. I3LORF (sequence recognition number 190), I2LORF (sequence recognition number 191), and E1OR ORF (sequence recognition number 194) are shown. Sequence recognition number 221 contains the complete 5785 base pair sequence of the Hind III M fragment. The open reading frame within the SPV HindIII M fragment consists of partial I4LORF (445AA;
(Figure 18A-18D deleted)
19A-19D:
The DNA inserts in swinepox virus S-SPV-015 and homology vector 727-54.60 have been described in detail. FIG. 19A contains a diagram showing the orientation of the DNA fragments associated with plasmid 727-54.60 and a table showing the origin of each fragment. FIG. 19B shows an arrangement located at the connecting portions A and B between the fragments, FIG. 19C shows an arrangement located at the connecting portion C, and FIG. 19D shows an arrangement located at the connecting portions D and E. Is shown. 19B to 19D describe for each linkage the synthetic linker sequence used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudo-rabies (PRV), E. coli (E. coli), late promoter of pox synthesis 1 (LP1), late promoter of
(Deleted in FIGS. 20A to 25D)
Figures 26A-26D:
Detailed description of DNA inserts in swinepox virus S-SPV-042 and homology vector 751-07A1. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with 751-07A1. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. 26A to 26D show the connection between fragments A (sequence recognition number 197), (sequence recognition number 198) C (sequence recognition number 199), D (sequence recognition number 200) and E (sequence recognition number 201). The sequence located and the sequence located in the junction are shown. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), chicken interferon (cIFN), E. coli (E. coli), late promoter of pox synthesis 1 (LP1), late promoter of
Figures 27A-27D:
Detailed description of the DNA insert in swinepox virus S-SPV-043 and homology vector 751-56A1. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 751-56A1. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. 27A to 27D show the connection between fragments A (sequence recognition number 202), (sequence recognition number 203) C (sequence recognition number 204), D (sequence recognition number 205) and E (sequence recognition number 206). The sequence located and the sequence located in the junction are shown. Also provided are synthetic linker sequences and regulatory elements used to join several genetic coding regions as well as the restriction sites used to generate each fragment. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), chicken myelomonocytic growth factor (cMGF), E. coli, pox synthesis late promoter 1 (LP1), pox synthesis
Figures 28A-28D:
Detailed description of the DNA insert in swinepox virus S-SPV-043 and homology vector 752-22.1. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 752-22.1. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. 28A to 28D show the sequence between the fragments, the sequence located at junction A (sequence recognition number 207), (sequence recognition number 208) C (sequence recognition number 209), and D (sequence recognition number 210), and the junction. The located sequence is shown. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. Several genetic coding regions and regulatory elements are also provided. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), E. coli (E. coli), late promoter of
Figures 29A-29B:
FIG. 29A: Restriction endonuclease map and open reading frame in SPV HindIII N fragment and part of SPV HindIII M fragment. For insertion of foreign genes into non-essential sites of swinepox virus Hind III N and Hind III M genomic DNA, EcoR V site (S-SPV-060), SnaBI site (S-SPV-061), Hind III N There is a Bgl II site in (S-SPV-062) and a Bgl II site in Hind III M (S-SPV-047). With the insertion of foreign genes into I7LORF (SEQ ID NO: 230) and I4LORF (SEQ ID NO: 231), the entire open reading frame is non-essential for swinepox virus replication and optimal for insertion of foreign genes. Something is suggested. Other insertion sites for foreign genes include, but are not limited to, two Hind III sites and AvaI and BamHI. FIG. 29B: Restriction endonuclease map and open reading frame in SPV HindIII K fragment. An insertion of a foreign gene inserted into a non-essential site of swinepox virus Hind III K genomic DNA includes, but is not limited to, an EcoRI site (S-SPV-059). Within the 3.2 kB region of the SPV Hind III K fragment, three open reading frames have been identified. The insertion of a foreign gene into B18RORF (SEQ ID NO: 228) suggests that the entire open reading frame is not essential for swinepox virus replication and is optimal for the insertion of foreign genes. Moreover, B4RORF (sequence recognition number 229) was confirmed as a foreign gene insertion site. SPVB18RORF is homologous to vaccinia virus (VV) B18RORF. SPVB18RORF is more homologous than the rabbit fibroma virus (RFV) 77.2 kd protein. SPVB4RORF is homologous to vaccinia virus (VV) B4RORF. SPVB4RORF is more homologous to the R5 rabbit fibroma virus (RFV) T5 protein. The confirmed open reading frame is within about 3200 base pairs of the SPVHindIII K fragment. The remaining approximately 3500 base pairs of the SPV Hind III K fragment have been sequenced previously (RF Massung et al. Virology 197, 511-528 (1993)).
Figures 30A-30C:
Detailed description of DNA inserts in swinepox virus S-SPV-047 and homology vector 779-94.31. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 779-94.31. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. FIGS. 30A to 30C show connections between fragments A (sequence recognition number :), (sequence recognition number :) C (sequence recognition number :), D (sequence recognition number :) and E (sequence recognition number :). The sequence located and the sequence located at the junction are shown. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudorabies (PRV), E. coli (E. coli), late promoter of
Figures 31A-31D:
Detailed description of DNA inserts in swinepox virus S-SPV-052 and homology vector 789-41.7. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 789-41.7. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. 31A-31D shows the connection part A (sequence recognition number :), (sequence recognition number :) C (sequence recognition number :), D (sequence recognition number :), E (sequence recognition number :) between fragments and A sequence located at F (sequence recognition number :) and a sequence located at the junction are shown. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudo-rabies (PRV), E. coli (E. coli), late promoter of
Figures 32A-32D:
Detailed description of DNA inserts in swinepox virus S-SPV-053 and homology vector 789-41.27. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 789-41.27. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. 32A-32D show the connection part A (sequence recognition number :), (sequence recognition number :) C (sequence recognition number :), D (sequence recognition number :), E (sequence recognition number :), between fragments. A sequence located at F (sequence recognition number :) and G (sequence recognition number :) and a sequence located at the junction are shown. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudo-rabies (PRV), E. coli (E. coli), late promoter of
Figures 33A-33D:
Detailed description of DNA inserts in swinepox virus S-SPV-054 and homology vector 789-41.47. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 789-41.47. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. 33A-33D, the connection part A (sequence recognition number :), (sequence recognition number :) C (sequence recognition number :), D (sequence recognition number :), E (sequence recognition number :), between fragments, A sequence located at F (sequence recognition number) and G (sequence recognition number :) and a sequence located at the junction are shown. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudorabies (PRV), E. coli (E. coli), early promoter of
34A-34E:
Detailed description of DNA inserts in swinepox virus S-SPV-055 and homology vector 789-41.73. The figure shows the orientation of the DNA fragment associated with plasmid 789-41.73. The origin of each fragment is shown in the table. Also shown are sequences located at each of the junctions between the fragments. 34A-34E show the connections between fragments A (sequence recognition number :), (sequence recognition number :) C (sequence recognition number :), D (sequence recognition number :), E (sequence recognition number :), F (Sequence recognition number :), sequences located at G (sequence recognition number :) and H (sequence recognition number :), and sequences located at the junction are shown. The synthetic linker sequences used to join the fragments as well as the restriction sites used to generate each fragment are described for each linkage. The position of several genetic coding regions and regulatory elements are also given. The following two conventions are used. Numbers in parentheses indicate amino acids, and restriction sites in square brackets [] indicate the remnants of sites that were destroyed during construction. The following abbreviations are used: swinepox virus (SPV), pseudo-rabies (PRV), E. coli (E. coli), late promoter of
Detailed Description of the Invention
The present invention relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into swinepox virus genomic DNA, wherein the foreign DNA sequence is inserted into a HindIII K fragment of swinepox virus genomic DNA, Provided is a recombinant swinepox virus that can be expressed in a host cell infected with a pox virus.
In one embodiment, the recombinant swinepox virus comprises the exogenous DNA inserted within the approximately 2 kB HindIII-BamHI subfragment in the HindIII N fragment of swinepox virus genomic DNA. In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an open reading frame within an approximately 2 Kb HindIII to BamHI subfragment in the HindIII N fragment of swinepox virus genomic DNA. In other embodiments, the open reading frame encodes the I7L gene.
In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an EcoRV restriction endonuclease site within an approximately 2 kB HindIII to BamHI subfragment of swinepox virus genomic DNA. In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into a SnaBI restriction endonuclease site within an approximately 2.0 kB HindIII to BamHI subfragment of swinepox virus genomic DNA.
In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted within an approximately 1.2 Kb BamHI to HindIII subfragment in the HindIII N fragment of swinepox virus genomic DNA. In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an open reading frame within the approximately 1.2 kB BamHI to HindIII subfragment of the HindIII N fragment of swinepox virus genomic DNA. In other embodiments, the foreign DNA sequence is inserted into an open reading frame encoding the I4L gene. In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into a BglII restriction endonuclease within the approximately 1.2 kB BamHI-HindIII subfragment of swinepox virus genomic DNA.
The present invention relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into swinepox virus genomic DNA, wherein the foreign DNA sequence is inserted into a HindIII M fragment of swinepox virus genomic DNA, Provided is a recombinant swinepox virus that can be expressed in a host cell infected with a pox virus.
In one embodiment, the recombinant swinepox virus has the foreign DNA sequence inserted within an approximately 2 Kb BglII-HindIII subfragment in the HindIII M fragment of swinepox virus genomic DNA. In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an open reading frame within an approximately 2 Kb BglII-HindIII subfragment of the HindIII M fragment of swinepox virus genomic DNA. In other embodiments, the open reading frame encodes an O1L gene. In a preferred embodiment, the foreign gene is inserted into a BglII restriction endonuclease site within an approximately 2 kB BglII-HindIII subfragment of swinepox virus genomic DNA.
In another embodiment, the recombinant swinepox virus is inserted within the larger HindIII-BglII subfragment of approximately 3.6 kB in the HindIII M fragment of swinepox virus genomic DNA. In another embodiment, the foreign sequence is inserted into an open reading frame within a larger HindIII to BglII subfragment of approximately 3.6 kB. In other embodiments, the open reading frame encodes the I4L gene.
In one embodiment, the foreign DNA sequence is inserted within a nonessential open reading frame (ORF) of the HindIII M fragment. Examples of ORFs include, but are not limited to I4L, I2L, O1L, and E10L.
In another embodiment, the recombinant swinepox virus foreign DNA sequence is inserted within an approximately 2 Kb HindIII-BglII subfragment in the HindIII M fragment of swinepox virus genomic DNA. In a preferred embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into a BglII site located within the approximately 2 Kb HindIII to BglII subfragment of swinepox virus genomic DNA.
In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into the larger HindIII-BglII subfragment in the HindIII M fragment of swinepox virus genomic DNA. In a preferred embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an AccI site located within the larger HindIII to BglII subfragment of swinepox virus genomic DNA.
In another embodiment, the recombinant swinepox virus further comprises a foreign DNA sequence inserted into an open reading frame encoding swinepox virus thymidine kinase. In one embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an NdeI site located within an open reading frame encoding swinepox virus thymidine kinase.
The present invention relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into swinepox virus genomic DNA, wherein the foreign DNA sequence is inserted into a HindIII K fragment of swinepox virus genomic DNA, Recombinant swinepox virus that can be expressed in host cells infected with pox virus is provided.
In one embodiment, the foreign DNA sequence is inserted within an approximately 3.2 Kb subfragment in the HindIII K fragment of swinepox virus genomic DNA. In another embodiment, the foreign DNA sequence is inserted into an open reading frame within an approximately 3.2 Kb subfragment in the HindIII K fragment of swinepox virus genomic DNA. In other embodiments, the open reading frame encodes the B18R gene. In other embodiments, the open reading frame encodes a B4R gene.
For the purposes of the present invention, “replicating recombinant swinepox virus” refers to recombination methods well known to those skilled in the art, for example, the methods described in Homologous recombination methods for making recombinant SPVs in the <Materials and Methods> section. It is a live swinepox virus that has been created and lacks the genetic material essential for the replication of recombinant swinepox virus.
For purposes of the present invention, “an insertion site that is not essential for swinepox virus replication” refers to a position in the swinepox virus genome where the DNA sequence is not required for viral replication, eg, complex protein binding sequences, reverse transcription. Examples include sequences encoding enzymes or essential glycoproteins, DNA sequences necessary for packaging, and the like.
For the purposes of the present invention, a “promoter” is a specific DNA sequence on a DNA molecule to which foreign RNA polymerase is attached where replication of the foreign RNA is initiated.
For the purposes of the present invention, an “open reading frame” is a DNA segment that contains codons that are transcribed into RNA and translated into an amino acid sequence and that do not contain a stop codon.
In addition, the present invention provides a recombinant swinepox virus (SPV) that can be replicated in an animal into which the recombinant swinepox virus is introduced, wherein the swinepox virus DNA and the animal into which the recombinant swinepox virus is introduced A recombinant swine that is inserted into the swinepox virus DNA at a site that is not essential for swinepox virus replication and that is under the control of a promoter.痘 Provide virus.
The invention further provides a foreign DNA sequence or foreign RNA that encodes the polypeptide. Preferably the polypeptide is antigenic in the animal. Preferably, the antigenic polypeptide is a linear polymer in which more than 10 amino acids are joined by peptide bonds to stimulate the animal to produce antibodies.
The present invention further provides a replicable recombinant swinepox virus containing a foreign DNA encoding a polypeptide that is a detection marker. Preferably, the detection marker is the polypeptide E. coli β-galactosidase or E. coli β-glucuronidase. Preferably, the insertion site for foreign DNA encoding E. coli β-galactosidase is an AccI restriction endonuclease located within the HindIII M fragment of swinepox virus DNA. Preferably, this recombinant swinepox virus is designated S-SPV-003 (ATCC accession number VR2335). This S-SPV-003 swinepox virus is in accordance with the Budapest Treaty on the International Approval of Deposits of Microorganisms in Patent Procedures under ATCC Receipt No. VR2335 under USC code 20852 Rockville, Maryland, Park Lane Drive 12301 Deposited at the American Type Culture Collection patent culture depository.
For the purposes of the present invention, “polypeptide as a detection marker” includes dimers, trimers and tetramers in the form of polypeptides. E. coli β-galactosidase is a tetrahedron composed of four polypeptides or sub-monomeric subunits.
The present invention further relates to a replicable recombinant swinepox virus, pseudorabies virus (PRV) glycoprotein 50 (gD), pseudorabies virus (PRV) g II (gB), pseudorabies virus (PRV) g III ( gC), pseudorabies virus (PRV) glycoprotein H, pseudorabies virus (PRV) glycoprotein E, hereditary gastroenteritis (TGE)
The present invention further provides a recombinant swinepox virus that is replicable and contains a foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) g50 (gD). This recombinant swinepox virus can be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase. A preferred site in the swinepox virus genome for insertion of foreign DNA encoding PRVg50 (gD) and E. coli β-galactosidase is the AccI site in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA. Preferably, this recombinant swinepox virus is designated S-SPV-008 (ATCC accession number 2339). The S-SPV-008 swinepox virus is in accordance with the Budapest Treaty on the International Approval of Deposits of Microorganisms in Patent Procedures, under ATCC Accession Number VR2339, and in Parklone Drive 12301, Rockville, Maryland, USA Deposited at the American Type Culture Collection patent culture depository.
The present invention further provides a replicable recombinant swinepox virus containing foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) gIII (gC). This recombinant swinepox virus can be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase. A preferred site in the swinepox virus genome for inserting foreign DNA encoding PRVC and E. coli β-galactosidase is the AccI site in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA. Preferably, the recombinant swinepox virus is designated S-SPV-011, S-SPV-012, or S-SPV-013. The swinepox virus, designated S-SPV-013, was issued on June 16, 1993 in accordance with the Budapest Treaty on the International Approval of Deposits of Microorganisms in Patent Procedures under the United States Postal Code 20852 under ATCC Accession Number VR2418. Deposited at the American Type Culture Collection patent culture depository located at Park Lane Drive 12301, Rockville, Maryland.
The present invention further provides a replicable recombinant swinepox virus containing foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) gII (gB). This recombinant swinepox virus can be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase. The preferred site in the swinepox virus genome for inserting foreign DNA encoding PRV gII (gB) and E. coli β-galactosidase is the AccI site in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA. Preferably, the recombinant swinepox virus is designated S-SPV-015 (ATCC accession number VR2466). This S-SPV-015 swinepox virus was founded on July 22, 1994 in accordance with the Budapest Treaty on the International Approval of Deposits of Microorganisms in Patent Proceedings under ATCC Accession Number VR2466, United States ZIP Code 20852 Maryland Deposited at the American Type Culture Collection patent culture depository located at Rockville, Park Lane Drive 12301.
The present invention further provides a replicable recombinant swinepox virus containing foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) g50 (gD) and pseudorabies virus (PRV) gIII (gC). This recombinant swinepox virus can also be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase. A preferred site in the swinepox virus genome for inserting foreign DNA encoding PRVg50 (gD), PRVgIII (gC) and E. coli β-galactosidase is the AccI site in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA.
The present invention further provides a replicable recombinant swinepox virus containing foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) g50 (gD) and pseudorabies virus (PRV) gII (gB). This recombinant swinepox virus can also be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase. A preferred site in the swinepox virus genome for inserting foreign DNA encoding PRVg50 (gD), PRVgII (gB) and E. coli β-galactosidase is the AccI site in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA.
The present invention further provides a replicable recombinant swinepox virus containing foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) g50 (gC) and pseudorabies virus (PRV) gII (gB). This recombinant swinepox virus can also be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase. A preferred site in the swinepox virus genome for inserting foreign DNA encoding PRVgIII (gC), PRVgII (gB) and E. coli β-galactosidase is the AccI site in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA
The present invention further provides replicable recombination comprising foreign DNA encoding pseudorabies virus (PRV) g50 (gD), pseudorabies virus (PRV) gIII (gC) and pseudorabies virus (PRV) gII (gB). Provide swinepox virus. This recombinant swinepox virus can also be further processed to include foreign DNA encoding a detection marker such as E. coli β-galactosidase.
A preferred site in the swinepox virus genome for inserting foreign DNA encoding PRVg50 (gD), PRVgIII (gC), PRVgII (gB) and E. coli β-galactosidase is AccI in the HindIII M fragment of swinepox virus DNA. It is a part
The present invention further includes a replicable recombinant swinepox comprising a foreign DNA encoding an RNA encoding a Newcastle disease virus (NDV) hemagglutinin-neuraminidase and further including a foreign DNA encoding a polypeptide which is a detection marker. Provide virus. This recombinant swinepox virus is designated S-SPV-009 (ATCC accession number VR2344). This S-SPV-009 swinepox virus is in accordance with the Budapest Treaty on the International Approval of Deposits of Microorganisms for Patent Proceedings under ATCC Receipt Number VR2344 and in Parklone Drive 12301, Rockville, Maryland, USA Deposited at the American Type Culture Collection patent culture depository.
The present invention further relates to a recombinant swinepox virus containing a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence contains an antigenic polypeptide derived from an infectious bovine rhinotracheitis virus. Provided is a recombinant swinepox virus that can be encoded and expressed in a host offspring infected with the recombinant swinepox virus. Examples of such antigenic polypeptides are infectious bovine rhinotracheitis virus glycoprotein E and glycoprotein G. A preferred embodiment of the present invention is the recombinant swinepox virus designated S-SPV-017 and S-SPV-019.
The present invention further relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence encodes an antigenic polypeptide derived from an infectious pharyngeal tracheitis virus. And a recombinant swinepox virus that can be expressed in a host offspring infected with the recombinant swinepox virus. Examples of such antigenic polypeptides are infectious pharyngeal bronchitis virus glycoprotein G and glycoprotein I. A preferred embodiment of the present invention is the recombinant swinepox virus designated S-SPV-014 and S-SPV-016.
In one embodiment of the recombinant swinepox virus, the foreign DNA sequence is a cytokine. In other embodiments, the cytokine is chicken bone marrow monocyte growth factor (cMGF) or chicken interferon (cIFN). Cytokines include, but are not limited to: transforming growth factor beta, fibroblast growth factor, hepatocyte growth factor, insulin-like growth factor, vascular endothelial growth factor,
The present invention further relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence encodes an antigenic polypeptide derived from a human pathogen, and Provided is a recombinant swinepox virus that can be expressed in a host offspring infected with swinepox virus.
Recombinant SPVs that express cytokines are used alone or in combination with vaccines containing cytokines or antigen genes of disease-causing microorganisms to enhance immune responsiveness.
Antigenic polypeptides of human pathogens derived from human herpesviruses include hepatitis B virus and hepatitis C virus, hepatitis B virus surface and core antigen, hepatitis C virus, human immunodeficiency virus, herpes simplex virus- 1. Herpes simplex virus-2, human cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, varicella-zoster virus, human herpesvirus-6, human herpesvirus-7, human influenza, measles virus, hantaanvirus , Pneumonia virus, rhinovirus, poliovirus, human respiratory syncytial virus, retrovirus, human T cell leukocyte virus, rabies virus, mumps virus, malaria (Plasmodium falciparum), pertussis, diphtheria, rash typhoid rickettsia, borre Includes, but is not limited to, Borrelia berfdorferi, tetanus toxoid, and malignant tumor antigens.
In one embodiment of the invention, the recombinant swinepox virus includes a foreign DNA sequence encoding a hepatitis B virus core protein. Preferably, such a recombinant virus is designated S-SPV-031.
The present invention further provides a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted at a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence stimulates immunity in a host offspring infected with the recombinant swinepox virus. Provided is a recombinant swinepox virus that encodes a cytokine that can be expressed in a host infected with the recombinant swinepox virus.
In one embodiment of the invention, the recombinant swinepox virus comprises a foreign DNA sequence encoding human interleukin-2. Preferably, such a recombinant virus is designated S-SPV-035.
The present invention further includes a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence encodes an antigenic polypeptide derived from an equine pathogen, Provided is a recombinant swinepox virus that can be expressed in a host infected with the recombinant swinepox virus.
The antigenic polypeptide of an equine pathogen can be derived from equine influenza virus or equine herpesvirus. In one embodiment, the antigenic polypeptide is equine influenza neuraminidase or hemagglutinin. Examples of such antigenic polypeptides include equine influenza virus type A / Alaska 91 neuraminidase, equine influenza virus type A / plaque 56 neuraminidase, equine influenza virus type A / Miami 63 neuraminidase, equine influenza virus type A. / Kentucky 81 neuraminidase, equine influenza virus type A / Kentucky 92 neuraminidase,
Furthermore, the present invention provides an antigenic polypeptide. The antigenic polypeptide is derived from the group consisting of swine cholera virus gE1, swine cholera virus gE2, swine influenza virus hemagglutinin, neuraminidase, matrix and nucleoprotein, pseudorabies virus gB, gC and gD, and PRRS virus ORF7. Recombinant swinepox virus is included, but is not limited to these.
The present invention is further a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted at a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence is derived from bovine respiratory syncytial virus or bovine parainfluenza virus. Provided is a recombinant swinepox virus that encodes the antigenic polypeptide and can be expressed in a host infected with the recombinant swinepox virus.
For example, the antigenic polypeptides described above include infectious bovine rhinotracheitis virus gE, bovine respiratory syncytial virus, equine pathogen, equine influenza virus, rodent respiratory syncytial virus adhesion protein (BRSV G), bovine respiratory syncytial Can be derived from thiavirus fusion protein (BRSV F), bovine respiratory syncytial virus nuclear capsid protein (BRSV N), bovine
Preferred embodiments of the recombinant virus comprising foreign DNA encoding an antigenic polypeptide derived from bovine respiratory syncytia virus are those designated S-SPV-020, S-SPV-029, and S-SPV-030. is there. Moreover, the preferable aspect of the recombinant virus containing the foreign DNA which codes the antigenic polypeptide derived from bovine parainfluenza virus is named S-SPV-028.
The present invention further relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence is bovine viral diarrhea virus (BVDV)
The present invention further relates to a recombinant swinepox virus comprising a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence comprises an antigenic polypeptide derived from an infectious cyst virus. The foreign DNA sequence that encodes and provides a recombinant swinepox virus that can be expressed in a host infected with the recombinant swinepox virus. Examples of such antigenic polypeptides are infectious cyst virus polyprotein and VP2. Preferred embodiments of such viruses are those designated S-SPV-026 and S-SPV-027.
The present invention further provides a recombinant swinepox virus containing a foreign DNA sequence inserted into a non-essential site of the swinepox virus genome, wherein the foreign DNA sequence encodes an antigenic polypeptide. Such antigenic polypeptides include, but are not limited to: MDV gA, MDV gB, MDV D, NDV HN, NDV F, ILT gB, ILT gI, ILT gD, IBDV VP2, IBDV VP3, IBDV VP4, IBDV polyprotein, IBV spike, IBV matrix, avian encephalomyelitis virus, avian reovirus, avian paramyxovirus, avian rotavirus, chicken anemia virus, Salmonella spp. Escherichia coli, Pasteurella spp. Bordetella pertussis spp. (Bordetella spp.), Eimeria spp. (Eimeria spp.), Histomonas ssp. Trichomonas ssp. Poultry nematodes, tapeworms, flukes, avian mites / lices, avian protozoa.
The present invention further provides a recombinant swinepox virus in which the inserted foreign DNA sequence is under the control of a promoter. In one embodiment, the promoter is a swinepox virus promoter. In other embodiments, the foreign DNA sequence is under the control of an endogenous upstream swinepox virus promoter. In other embodiments, the foreign DNA sequence is under the control of a heterologous upstream promoter.
For the purposes of the present invention, the promoter includes synthetic swinepox virus promoter, late
The present invention provides a homology vector for producing recombinant swinepox virus by inserting foreign DNA into swinepox virus genomic DNA.
This homology vector comprises a double-stranded DNA molecule consisting of a substantially double-stranded foreign DN (RNA) sequence that is not inherently present in the animal into which the recombinant swinepox virus is introduced. One end of the double-stranded DNA has a double-stranded swinepox virus DNA that is homologous to the viral genome located on one side of the genomic DNA that is not essential for swinepox virus replication, and The other end has a double-stranded swinepox virus DNA that is homologous to the viral genome located on the other side of the swinepox virus genome. Preferably, the RNA encodes a polypeptide.
In another embodiment of the present invention, the double-stranded swinepox virus DNA of the homology vector is homologous to the genomic DNA present in the HindIII M fragment. In another correspondence, the double-stranded swinepox virus DNA of the homology vector is homologous to the genomic DNA present in the approximately 2 kB HindIII to BglII subfragment. In a preferred embodiment, the double stranded swinepox virus DNA is homologous to the genomic DNA present in the BglII site located in this HindIII to BglII subfragment.
In other embodiments, the double-stranded swinepox virus DNA is homologous to the genomic DNA present in the open reading frame contained in the larger HindIII to BglII subfragment. Preferably, the double stranded swinepox virus DNA is homologous to the genomic DNA present within the AccI restriction endonuclease site located in the larger HindIII to BglII subfragment.
In preferred embodiments, the homology vectors have been named 752-29.33, 751-07.A1, 751-56.A1, 751-22.1, 746-94.1, 767-67.3, 738-94.4, and 771-55.11. Is.
In one embodiment, the polypeptide is a detection marker. Preferably, the polypeptide that is a detection marker is E. coli β-galactosidase.
In one embodiment, the polypeptide is antigenic in the animal. Preferably, the antigenic polypeptide is pseudorabies virus (PRV) glycoprotein 50 (gD), pseudorabies virus (PRV) gII (gB), pseudorabies virus (PRV) gIII (gC), pseudorabies virus (PRV) ) Glycoprotein H, hereditary gastroenteritis (TGE)
In one embodiment of the invention, the double stranded foreign DNA sequence in the homology vector encodes an antigenic polypeptide derived from a human pathogen.
For example, human pathogen antigenic polypeptides include human herpesvirus, herpes simplex virus-1, herpes simplex virus-2, human cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, varicella-zoster virus, human herpesvirus-6. , Human herpesvirus-7, human influenza, human immunodeficiency virus, rabies virus, measles virus, hepatitis B virus and hepatitis C virus. In addition, the antigenic polypeptide of the human pathogen may be associated with malaria or malignant tumors selected from the group consisting of Plasmodium falciparum, Bordetelia pertussis and malignant tumors.
In one embodiment of the invention, the double-stranded foreign DNA sequence in the homology vector encodes a cytokine capable of stimulating a human immune response. In one embodiment, the cytokine is chicken bone marrow monocyte growth factor (cMGF) or chicken interferon (cIFN). For example, the cytokine can be, but is not limited to, interleukin-2, interleukin-6, interleukin-12, interferon, granulocyte-macrophage colony stimulating factor, and interleukin receptor. Absent.
In one embodiment of the invention, the double-stranded foreign DNA sequence in the homology vector encodes an antigenic polypeptide derived from an equine pathogen.
The antigenic polypeptide of an equine pathogen can be derived from equine influenza virus or equine herpesvirus. Examples of such antigenic polypeptides include equine influenza virus type A / Alaska 91 neuraminidase, equine influenza virus type A / plaque 56 neuraminidase, equine influenza virus type A / Miami 63 neuraminidase, equine influenza virus type A. / Recombinant swinepox virus selected from the group consisting of Kentucky 81 neuraminidase,
In one embodiment of the invention, the double stranded foreign DNA sequence of the homology vector encodes bovine respiratory syncytial virus or bovine parainfluenza virus.
For example, the antigenic polypeptide includes infectious bovine rhinotracheitis virus gE, bovine respiratory syncytial virus adhesion protein (BRSV G), bovine respiratory syncytial virus fusion protein (BRSV F), bovine respiratory syncytial virus Derived from nuclear capsid protein (BRSV N), bovine
In one embodiment of the invention, the double-stranded foreign DNA sequence of the homology vector is derived from an infectious cyst virus. Examples of such antigenic polypeptides are infectious cyst virus viruses and infectious cyst viruses VP2, VP3 or VP4.
For the purposes of the present invention, a “homology vector” is a plasmid constructed to insert foreign DNA at a specific site in the swinepox virus genome.
In one embodiment of the invention, the double stranded swinepox virus DNA of the homology vector described above is homologous to the genomic DNA present in the open reading frame encoding swinepox thymidine kinase. Preferably, the double stranded swinepox virus DNA is homologous to the genomic DNA present in the NdeI restriction endonuclease located in the open reading frame encoding swinepox thymidine kinase.
The present invention further provides a homology vector as described above, wherein the foreign DNA sequence is under the control of a promoter located upstream of the foreign DNA sequence. The promoter can be an endogenous swinepox virus promoter or an exogenous promoter. Promoters include synthetic poxvirus promoter, pox synthesis
The present invention relates to S-SPV-044, S-SPV-046, S-SPV-047, S-SPV-048, S-SPV-052, S-SPV-051, S-SPV-053, S-SPV- 054, S-SPV-055, S-SPV-056, S-SPV-057, S-SPV-058, S-SPV-059, S-SPV-066, S-SPV-061, S-SPV-062 Provide the designated recombinant swinepox virus.
The present invention further provides a vaccine comprising an effective immunizing amount of the recombinant swinepox virus of the present invention and a suitable carrier.
Suitable carriers for swinepox virus are well known in the art and include proteins, sugars and the like. One example of such a suitable carrier is a physiologically balanced culture medium that contains one or more stable households such as stabilized hydrolyzed proteins, lactose, and the like.
For purposes of the present invention, an “effective immunity” of the recombinant swinepox virus of the present invention is 10Three-109PFU / dose range.
The invention also provides a method of immunizing an animal, wherein the animal is a human, a pig, a cow, a caprine or an ovine. For purposes of the present invention, the method includes immunizing an animal against the disease-causing virus (s), which include pseudorabies, hereditary gastroenteritis ( TGE) virus, swine rotavirus, swine parvovirus, Serpulina hydodysenteriae, bovine viral diarrhea (BVD) virus, Newcastle disease virus (NDV), swine influenza virus, PRRS, bovine respiratory syncytial virus , Bovine
This method includes administering to the animal an effective immunizing dose of a vaccine of the present invention. The vaccine may be administered by any method known to those skilled in the art, for example, intramuscular injection, subcutaneous injection, sub-intra-injection or intravenous injection. Alternatively, the vaccine may be administered intranasally or orally.
The present invention also relates to whether pigs have been vaccinated with an embodiment containing a vaccine of the present invention, in particular a recombinant swinepox virus S-SPV-008 (ATCC accession number VR2339), or a naturally occurring wild-type pseudonym. Provide a way to test pigs to determine if they are infected with rabies virus. This method obtains a sample of the appropriate body fluid from the pig to be tested and detects the presence of antibodies against pseudorabies virus in the sample (the absence of such antibodies causes the pig to vaccinate And in pigs that have antibodies against pseudorabies virus, in the sample, they are usually present in the bodily fluids of pigs infected with naturally occurring pseudorabies virus. Detecting that the antibody against the pseudorabies virus antigen not present in the vaccinated pig is not present, indicating that the pig has been vaccinated or not infected. To do.
The present invention provides a recombinant SPV that can be used as a diagnostic test when inserted with a foreign DNA sequence or gene. In one embodiment, the FIVenv and gag genes, and D. Immitis p39 and 22 kd detect feline immunodeficiency caused by FIV, and Used in diagnostic tests to detect dog filamentous worms caused by imimitis.
The invention also provides host cells infected with a recombinant swinepox virus capable of replication. In one embodiment, the host cell is a mammalian cell. Preferably, the mammalian cell is a Vero cell. Preferably, the mammalian cell is an ESK-4 cell, a PK-15 cell or an EMSK cell.
For the purposes of the present invention, a “host cell” is a cell used to propagate a vector and its insert. Infection of harmful cells was achieved by methods well known to those skilled in the art, for example, the method described in “Infection-Transfection Method” in <Materials and Methods>.
Methods for constructing, selecting and purifying the above recombinant swinepox virus are detailed in the <Materials and Methods> section below.
[Details of experiment]
<Materials and methods>
Preparation of swinepox virus stock sample
The swinepox virus (SPV) sample is in a 1: 1 mixture of RPMI 1640 medium containing Iscove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM), 2 mM glutamine, 100 units / ml penicillin, 100 units / ml streptomycin. (These components are obtained from Sigma or equivalent suppliers and are hereinafter referred to as EMSK negative medium) in pig fetal kidney (EMSK) cells, ESK-4 cells, PK-15 cells or Cells were prepared by infecting cells with a multiplicity of infection of 0.01 PFU / cell. Prior to infection, cell monolayers were washed once using EMSK negative media to remove trace amounts of fetal calf serum. The SPV contained in the initial inoculum (0.5 ml for 10 cm plates; 10 ml for T175 cm flasks) is then redistributed every 30 minutes in the cell monolayer for 2 hours. Was absorbed. After this period, the first inoculum was supplemented with complete EMSK medium (EMSK negative medium with 5% fetal calf serum) to the recommended volume. The plate is 5% CO2 until the cytopathic effect is complete.2Incubated at 37 ° C. Media and cells were harvested and frozen at -70 ° C in a 50 ml conical screw cap tube. Once thawed at 37 ° C, the virus stock was aliquoted into 1.0 ml vials and refrozen at -70 ° C. The titer was usually about 106 PFU / ml.
Preparation of SPV DNA
To isolate swinepox virus DNA, confluent EMSK cell monolayers in T175 cm2 flasks were infected at a multiplicity of 0.1 and incubated for 4-6 hours until the cells were 100% cytopathic. The infected cells were then harvested by scraping the cells into the medium and centrifuging at 300 rpm for 5 minutes in a clinical centrifuge. The medium is transferred to another container and the cell pellet is 1.0 ml phosphate buffer solution (PBS: 1.5 g disodium phosphate, 0.2 g potassium dihydrogen phosphate, 0.8 g sodium chloride and 0.2 g in 1 liter of water. Of potassium chloride) (per T175) and subjected to two consecutive freeze-thaw treatments (from -70 ° C to 37 ° C). During the final thawing, the cells (on ice) were sonicated twice for 30 seconds, with a 45 second cooling time between the first and second time. Thereafter, cell debris was removed by centrifugation (Sorvall RC-5B superspeed centrifuge) for 5 minutes at 4 ° C and 3000 rpm in an HB4 rotor. The SPV virus particles (virions) present in the supernatant are then pelleted by centrifugation at 15,000 rpm for 20 minutes at 4 ° C in an SS34 rotor (Sorvall) and in 10 mM Tris (pH 7.5). Resuspended. This fraction was then layered into a 36% sucrose density gradient (w / v in 10 mM Tris pH 7.5) and centrifuged at 18,000 rpm for 60 minutes at 4 ° C in a SW41 rotor (Beckman). Beckman L8-70M ultracentrifuge). The virus particle pellet was resuspended in 10 mM Tris buffer pH 7.5 and sonicated for 30 seconds on ice. This fraction was layered with a continuous sucrose gradient of 20% to 50% and centrifuged at 16,000 rpm for 60 minutes at 4 ° C with a SW41 rotor. A band of SPV virus particles located approximately 3/4 below the gradient was recovered, diluted with 20% sucrose solution, and pelleted by centrifugation at 18,000 rpm for 60 minutes at 4 ° C in a SW41 rotor. . The resulting pellet was then washed once with 10 mM Tris buffer solution pH 7.5 to remove traces of sucrose and finally resuspended in 10 mM Tris buffer solution pH 7.5. Then purified by lysis (60 ° C, 4 hours) induced by adding EDTA, SDS and proteinase K to final concentrations of 20 mM, 0.5% and 0.5 mg / ml respectively. SPV DNA was extracted. After digestion, phenol: chloroform (1: 1) extraction was performed three times, and the sample was precipitated by adding 2 volumes of 100% ethanol and incubating at -20 ° C for 30 minutes. The sample was then centrifuged at full speed for 5 minutes in an eppendorf minifuge. The supernatant was transferred to another container and the pellet was air-dried and rehydrated in 0.01 M Tris buffer pH 7.5 containing 1 mM EDTA at 4 ° C.
Preparation of infected cell lysates
A serum-free medium was used for the preparation of cell lysates. Confluent cell monolayers (EMSK, ESK-4, PK-15 or Vero for SPV, or VERO for PRV) were infected with 100 μl of virus sample in 25 cm2 flasks or 60 mm Petri dishes. After the cytopathic effect was complete, media and cells were collected and the cells were pelleted by clinical centrifuge at 3000 rpm for 5 minutes. The cell pellet was resuspended in 250 μl disruption buffer (2% sodium dodecyl sulfate, 2% β-mercaptoethanol). Samples were sonicated for 30 seconds on ice and stored at -20 ° C.
Western blotting method
Cell lysate samples and standard proteins were run on polyacrylamide gels according to the method of Laemnli (1970). After gel electrophoresis, the protein was denatured and processed according to the method of Sambrooke et al. (1982). The primary antibody is 5 in Tris sodium chloride and sodium azide (TSA: containing 6.61 g Tris hydrochloride, 0.97 g Tris base, 9.0 g sodium chloride and 2.0 g sodium azide in 1 liter of water). This was porcine anti-PRV serum (Shope strain; lot370, PDV8201, NVSL, Ames, IA) diluted 1: 100 with non-fat dry milk. The secondary antibody was goat anti-swine alkaline phosphatase conjugate diluted 1: 1000 with TSA.
Molecular biological techniques
Digestion with restriction endonuclease, gel electrophoresis, DNA extraction from gel, ligation, phosphorylation with kinase, treatment with phosphatase, growth of bacterial culture, bacterial transformation with DNA, etc. Techniques and other molecular biological methods related to bacterial and DNA manipulation, including Maniatis et al. (1982) and Sambrook et al. (1989), have been demonstrated. As an exception, these methods have been modified slightly.
DNA sequencing
Sequencing was performed using the USB Sequenase Kit and 35S-dATP (NEN). Reactions using both dGTP and dITP mixtures were performed to elucidate the areas of compression. Alternatively, compressed areas were analyzed with formamide gel. Templates were double-stranded plasmid subclones or single-strand M13 subclones, and primers were generated for the vector just outside the insert to be sequenced, or for previously obtained sequences. The resulting sequences were edited and compared using Dnastar software. The resulting sequences were handled and compared using Coral Software's Superclone ™ and Supersee ™ programs.
Cloning using the Polymerase Chain Reaction
The Polymerase Chain Reaction (PCR) was used to introduce convenient restriction (enzyme) sites for various DNA runs. The method used is shown by Innis et al. (1990). In general, the amplified fragment is smaller than 500 base pairs in size, and the critical region of the amplified fragment is confirmed by DNA sequencing. The primers used in each case are described in detail in the description of homology vector construction below.
Homologous Recombination Prodecure for Recombinant SPV Generation
This method relies on homologous recombination between swinepox virus DNA and plasmid homology vector DNA generated in tissue culture cells containing both swinepox virus DNA and the transfected plasmid homology vector. In order to induce homologous recombination, EMSK cell monolayers induce SV replication (ie, DNA synthesis) into these cells with a multiplicity of infection of 0.01 PFU / cell (S-SPV-001) 17) (Kasza SPV strain, 17). The plasmid homology vector DNA is then transfected into these cells according to the Infection-Transfected Procedure. The construction of the homology vector used in this method is shown below.
Infection-Transfection method
A 6cm plate of EMSK cells (concentration approximately 80%) was infected with S-SPV-001 at a multiplicity of infection of 0.01 PFU / cell in EMSK negative medium, and CO2The cells were incubated at 37 ° C for 5 hours in a humidified environment with a concentration of 5%. The transfection method used was basically the method indicated in the Lipofectin ™ Reagent (BRL) instructions. Briefly, for each 6 cm plate, 15 μg of plasmid DNA was diluted to 100 μl μ with water. Separately, 50 μg of lipofectin reagent was diluted to 100 μl with water. Thereafter, 100 μl of diluted lipofectin reagent was added dropwise to the diluted plasmid DNA in a 5 ml snap-cap test tube made of polystyrene and mixed gently. The mixture was then incubated for 15-20 minutes at room temperature. During this time, the virus inoculum was removed from the 6 cm plate and the cell monolayer was washed once with EMSK negative media. Subsequently, 3 ml of EMSK negative medium was added to the plasmid DNA / lipofectin mixture and pipetted onto its contents cell monolayer. Cells are overnight (approximately 16 hours), CO2The cells were incubated at 37 ° C in a humidified environment with a concentration of 5%. The next day, 3 ml of EMSK negative medium was removed and replaced with 5 ml of EMSK complete medium. The cells are CO2 until the cytopathic effect of the virus is reduced from 80% to 100%.2Incubation was performed at 37 ° C under 5% concentration for 3 to 7 days. The virus was recovered as described above in the virus stock preparation. This stock is called the transfection stock, and the detection of the recombinant virus is subsequently performed by the Bluogal Screen for detection of the recombinant swinepox virus or the CPRG screen for detection of the recombinant swinepox virus. It was made.
Detection of recombinant SPV expressing β-galactosidase (Screen) (Bluogal and CPRG analysis)
When the recombinant virus incorporated the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene, the plaques containing the recombinant were visualized by one of two simple methods. . In the first method, during the plaque analysis, the Bluogal ™ reagent (Bethesda Research Labs) is incorporated into the agarose overlay (200 μg / ml) and expresses β-galactosidase activity. The plaque turns blue. The blue plaques were then picked on new cells (EMSK) and purified by further isolation of blue plaques. In the second method, CPRG (Boehringer Mannheim) is incorporated into the agarose overlay (400 μg / ml) and plaques expressing β-galactosidase activity turn red during plaque analysis. Red plaques were then picked on new cells (EMSK) and purified by further isolation of red plaques. In both cases, the virus was typically purified by three plaque purifications.
Detection of foreign gene expression in recombinant SPV using black plaque assay (screen)
To analyze the expression of foreign antigens expressed by recombinant swinepox virus, EMSK cell monolayers are infected with recombinant SPV, overlaid on agarose nutrient medium, and 37 ° C until plaque development occurs Incubated for 6 to 7 days. The agarose overlay was then removed from the Petri dish and the cells were fixed with 100% methanol for 10 minutes at room temperature and air-dried. Cytoplasmic antigens can be detected as well as surface antigens by cell fixation, but specific surface antigen expression can be detected by using unfixed cells. Thereafter, the primary antibody was diluted to an appropriate dilution ratio with PBS and incubated on the cell monolayer at room temperature for 2 hours. In order to detect the expression of PRV g50 (gD) derived from S-SPV-008, porcine anti-PRV serum (Shoop strain; lot 370, PDV8201, NVSL, Ames, IA) (shope strain; lot370, PDV8201, NVSL, Ames) , IA) was used (1: 100 dilution). To detect the expression of NDV HN from S-SPV-009, rabbit anti-serum (rabbit anti-NDV # 2) specific for HN protein was used (1: 1000 dilution). Unbound antibody was then removed by washing the
Methods for purification of viral glycoproteins for use as diagnostic methods
Viral glycoproteins are purified using antibody affinity columns. To generate monoclonal antibodies, BALB / c female mice aged 8 to 10 weeks were treated with 107 PFU of S-SPV-009, -014, -016, --017, -018 or --012 for 2 to 4 weeks. The vaccine is vaccinated intraperitoneally seven times at intervals. Three weeks after the last vaccination, mice are injected intraperitoneally with the corresponding 40 mg of viral glycoprotein. The spleen is removed 3 days after the last challenge.
Spleen cells are fused with mouse NS1 / Ag4 plasmacytoma cells by a modified version of the technique of Oi and Herzenberg (41). Splenocytes and plasmacytoma cells are pelleted together by centrifugation at 300xg for 10 minutes. 1 ml of a 50% solution of polyethylene glycol (molecular weight 1300 to 1600) is added to the cell pellet with stirring for 1 minute. Dulbecco's modified Eagles' Medium (5 ml) is added to the cells over 3 minutes. Cells are pelleted by centrifugation at 300 x g for 10 minutes and resuspended in medium (HAT) containing 10% fetal bovine serum and 100 mM hypoxanthine, 0.4 mM aminopterin and 16 mM thymidine. Cells (100 ml) are added to 8 to 10 96-well tissue culture plates containing 100 ml of normal spleen feeder layer cells and incubated at 37 ° C. Cells are fed with fresh HAT medium every 3 to 4 days.
Hybridoma culture supernatants are examined by ELIZA analysis in 96-well microtiter plates coated with 100 ng of viral glycoprotein. The supernatant from the active hybridoma is further analyzed by black-plaque assay and Western Blot. Selected hybridomas are cloned twice by limiting dilution. Ascetic fluid is generated by intraperitoneal injection of 5x106 hybridoma cells into pristane-treated BALB / c mice.
Cell lysates from S-SPV-009, -014, -016, -017, -018 or --019 are obtained as shown in the preparation of infected cell lysates. Cell lysates containing glycoproteins (100mls) are passed through 2ml of agarose affinity resin. According to the instructions of the manufacturer (AFC Medium, New Brunswick Scientific, Edison, NJ) (AFC Medium, New Brunswick Scientific, Edison, NJ), 20 mg glycoprotein monoclonal antibody is immobilized on the column. The column was washed with 100 ml of phosphate buffered saline (PBS) containing 0.1% Nonidet P-40 to remove non-specifically bound material. The bound glycoprotein is eluted with 100 mM carbonate buffer, pH 10.6 (40). Pre-posteluted fractions are monitored for purity by activity against the SPV monoclonal antibody in the ELISA system.
ELISA ASSAY
Standard enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) procedures are used to measure the immune status of cattle following vaccination and challenge.
Glycoprotein antigen solution (100 ml at ng / ml in PBS) (100 ml at ng / ml in PBS) is adsorbed to the microtiter dish hole at 4 ° C for 18 hours. Coated holes are rinsed once with PBS. The wells are blocked by adding 250 ml of PBS containing 1% BSA (Sigma) and incubated at 37 ° C for 1 hour. Blocked holes are rinsed once with PBS containing 0.02% Tween20. 50 ml of test serum (previously diluted 1: 2 in PBS containing 1% BSA) is added to the wells and incubated at 37 ° C for 1 hour. The antiserum is removed and the wells are washed 3 times with PBS containing 0.02% Tween20. To visualize holes containing antibodies to specific antigens, horseradish peroxidase (diluted 1: 500 in PBS containing 1% BSA, Kirkegaard and Perry Labs) A 50 ml solution containing anti-bovine IgG bound to Laboratories, Inc.)) is added. The solution is incubated for 1 hour at 37 ° C, after which the solution is removed and washed 3 times with PBS containing 0.02% Tween20. 100 ml of substrate solution (ATBS, Kickegard and Perry Laboratories, Inc.) was added to each hole and allowed to develop for 15 minutes. The reaction was terminated by the addition of 0.1M oxalic acid. The color was read at an absorbance of 410 nm with an automatic plate reader.
A basic approach for the construction of synthetic poxvirus promoters
With regard to recombinant swinepox vectors, synthetic pox promoters offer several advantages, including the ability to control the intensity and timing of foreign gene expression. Three promoter cassettes LP1, EP1 and LP2 were designed based on the promoters determined in vaccinia virus (1,7 and 8). Each cassette was designed to contain a DNA sequence determined in vaccinia with a restriction enzyme site. This restriction enzyme site allows cassettes to be used in any order and in any combination. Initiator methionine was also designed in each cassette to allow inframe fusion at EcoRI or BamHI sites. A series of translation termination codons and early transcriptional termination signals (9) contained in all three reading frames were also incorporated downstream of the inframe fusion site. DNA encoding each cassette was synthesized according to standard procedures and cloned into an appropriate homology vector (see FIGS. 4, 5 and 8).
Vaccination experiments in pigs using a recombinant swinepox virus containing pseudorabies virus glycoprotein gene:
Used to test the efficacy of recombinant swinepox virus with one or more pseudorabies virus glycoprotein genes (SPV / PRV) in weaned pigs from the non-infected group of pseudorabies (Pseudorabies) It is possible. About 103 to 107 plaque-forming units (PFU) of recombinant SPV / PRV virus are inoculated into piglets intramuscularly, subcutaneously, or orally.
Immunity is determined by measuring the level of PRV serum antibodies and challenge the vaccinated pigs with a pathogenic strain of pseudorabies virus. Three to four weeks after vaccination, both swine and non-vaccinated groups are challenged with a pathogenic strain of pseudorabies virus (VDL4892). After challenge, pigs are observed daily for 14 days for clinical signs of pseudorabies.
Serum samples were obtained at the time of vaccination, at the time of antigen administration, and every other week for 2 to 3 weeks after vaccination and tested for serum neutralizing antibodies.
Cloning of Bovine Viral Diarrhea Virus g48 and g53 genes
The bovine viral diarrhea virus g48 and g53 genes were cloned using a PCR cloning procedure similar to that shown by Katz et al. (42) for the HA gene of human influenza virus. Viral RNA prepared from the BVD Virus Singer strain grown in Madin-Darby bovine kidney (MDBK) cells first utilizes oligonucleotide primers specific for the target gene. Changed to cDNA. The cDNA was then used as a template for replication chain reaction (PCR) cloning (15). PCR primers were designed to incorporate restriction enzyme sites that allow cloning of the amplified coding region into a vector containing the appropriate signal for expression in SPV. One pair of oligonucleotide primers was required for each encoding region. The region encoding the g48 gene from the BVDV Singer strain (49) has the following primers for priming cDNA:
Cloning of Bovine Respiratory Syncytial Virus Fusion, Nucleocapsid, and glycoprotein genes
Bovine respiratory syncytial virus fusion (F) using a PCR cloning technique similar to that shown by Katz et al. (42) for the HA gene of human influenza virus. Nucleocapsid (N) and glycoprotein (G) genes have been cloned. Viral RNA prepared from BRSV grown in bovine nasal turbinate (BT) cells was first converted to cDNA using oligonucleotide primers specific for the target gene. The cDNA was then used as a template for replication chain reaction (PCR) cloning (15). PCR primers were designed to incorporate restriction enzyme sites that allow cloning of the amplified coding region into a vector containing the appropriate signal for expression in SPV. One pair of oligonucleotide primers was required for each encoding region. The region encoding the F gene from BRSV strain 375 (VR-1339) contains the following primers for priming cDNA:
RNA isolated from chicken spleen cells treated with Concanavalin A
The chicken spleen was dissected and removed from 3-week-old SPAFAS hatchlings, washed, and crushed through a syringe / needle to dissociate the cells. After removal of cytoplasm and debris, the cells were pelleted and washed twice with PBS. Cell pellets were treated with hypotonic lysis buffer to lyse red blood cells, and splenocytes were collected and washed twice with PBS. Splenocytes were resuspended at 5 × 10 6 cells / ml in RPMI containing 5% FBS and 5 μg / ml concanavalin A and incubated at 39 ° C. for 48 hours. Total RNA is isolated from cells using guanidine isothionate lysis reagent and procedural RNA isolation kit (Promega RNA isolation Kit) (Promega Corporation Madison Wisconsin) (Promega Corporation, Madison WI). It was done. Four micrograms of total RNA was used for each first strand reaction containing the appropriate antisense primer and AMV reverse transcriptase (Promega Madison Wisconsin) (Promega Corporation, Madison WI). Reverse transcriptase reaction followed by cDNA synthesis in the same tube using appropriate sense primers and VentR DNA polymerase (Life Technologies, Inc. Bethesda, MD) (Life technologies, Inc. Bethesda, MD) It was conducted.
Detection of recombinant herpesvirus expressing enzyme marker gene (Screen)
When the E. coli β-galactosidase (uidA) marker gene was integrated into the recombinant virus, plaques containing the recombinant were visualized by simple analysis. During plaque analysis, the enzyme substrate was incorporated into the agarose overlay (300 μg / ml). For the uidA marker gene, the substrate X-glucuroChx (X-GlucuroChx) (5-bromo-4chloro-3-indolyl-β-D-glucuronic acid cyclohexylammonium salt, biosynth AG) (5-bromo-4- chloro-3-indolyl-β-D-glucuronic acid Cyclohexylammonium salt (Biosynth AG) was used. Plaques that showed marker enzyme activity turned blue. The blue plaques were then picked on new ESK-4 cells and purified by further isolation of the blue plaques. In the case of the recombinant virus method in which the enzyme marker gene was removed, white plaque purified from the background of the parent (generation) blue plaque was used for the analysis. In both cases, the virus was typically purified by three plaque purifications.
Homology vector 515-85.1
Plasmid 515-85.1 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. This plasmid contains a unique AccI restriction enzyme site into which foreign DNA can be inserted. If a plasmid with a foreign DNA insert (fragment) at the AccI site is used according to "Homologous Recombination Methods for Recombinant SPV Generation", viruses with foreign DNA will result. Figures 4A-4D show restriction enzyme maps of DNA insertions (fragments) in homology vector 515-85.1. This plasmid is constructed using standard recombinant DNA techniques (22 and 29) and ligating two restriction enzyme (cleavage) fragments from the following sources: The first fragment is an approximately 2972 base pair restriction enzyme cleavage fragment from HindIII to BamHI of pSP64 (Promega). The second fragment is an approximately 3628 base pair sub-fragment from HindIII to BglII of the SPV HindIII digested fragment M (23).
Homology vector 520-17.5
Plasmid 520-17.5 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. This plasmid carries the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene adjacent to the SPV DNA. Upstream of the marker gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. Downstream of the marker gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA. If this plasmid is used according to “Homologous Recombination Methods for Recombinant SPV Generation”, a virus with DNA encoding the marker gene will result. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the early / late 痘 promoter. Details of the plasmid are shown in Figures 4A-4D. This plasmid will be constructed using standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by adding a restriction enzyme (cleavage) fragment from a source with the following synthetic DNA sequence: This sequence is shown in Figures 4A-4D. This plasmid vector originates from an approximately 2972 base pair restriction fragment from HindIII to BamHI of pSP64 (Promega).
Homology vector 538-46.16
Plasmid 538-46.16 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. This plasmid has an E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and a PRV g50 (gD) gene adjacent to the SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. Downstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA. If this plasmid is used according to "Homologous Recombination Methods for Recombinant SPV Generation", viruses with DNA encoding foreign genes will be generated. The β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late synthesis (late) 痘 promoter (LP1) and the g50 (gD) gene is under the control of the early / late 痘 promoter (EP1Lp1) Please note that. Details of the plasmid are shown in Figures 5A-5D. This plasmid will be constructed using standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by adding a restriction enzyme (cleavage) fragment from a source with the following synthetic DNA sequence: This sequence is shown in Figures 5A-5D. This plasmid vector originates from an approximately 2972 base pair restriction fragment from HindIII to BamHI of pSP64 (Promega).
Homology vector 570-91.64
Plasmid 570-91.64 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. The plasmid has the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and the PRV gIII (gC) gene adjacent to the SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA. Downstream of the foreign gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. If this plasmid is used according to "Homologous Recombination Methods for Recombinant SPV Generation", viruses with DNA encoding foreign genes will be generated. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late synthetic late promoter (LP1) and the gIII (gC) gene is under the control of the late early 痘 promoter (Lp2EP2) I want to be done. Details of the plasmid are shown in Figures 12A-12D. This plasmid will be constructed using standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by adding a restriction enzyme (cleavage) fragment from a source with the following synthetic DNA sequence: This sequence is shown in Figures 12A-12D. This plasmid vector originates from an approximately 2972 base pair restriction fragment from HindIII to BamHI of pSP64 (Promega).
Homology vector 727-54.60
In order to insert foreign DNA into SPV, plasmid 727-54.60 was constructed. This incorporates the pseudorabies virus (PRV) gII (gB) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the PRV gB gene is under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). Details of this plasmid are shown in FIGS. 19A-19D. This plasmid can be constructed by using standard recombinant DNA techniques (22, 30) and ligating together restriction fragments derived from the following sources having the synthetic DNA base sequences shown in FIGS. 19A-19D. . The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment available from pSP64 (Promega).
Homology vector 751-07. A1
Plasmid 751-07. For inserting foreign DNA into SPV. A1 was used. This incorporates the chicken interferon (cIFN) gene flanked by SPV DNA and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the cIFN gene is under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). This homology vector was constructed by joining restriction fragments derived from the following sources having an appropriate synthetic DNA base sequence using standard recombinant DNA techniques (22, 30). The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 751-56. A1
Plasmid 751-56. For inserting foreign DNA into SPV. A1 was used. This incorporates the chicken bone marrow monocyte growth factor (cMGF) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of a synthetic late heel promoter (LP1) and the cMGF gene is under the control of a synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). This homology vector was constructed by joining restriction fragments derived from the following sources having an appropriate synthetic DNA base sequence using standard recombinant DNA techniques (22, 30). The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 752-22.1
Plasmid 752-22.1 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of the foreign gene is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid in accordance with the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the swinepox virus O1L gene promoter. The homology vector also contains a synthetic late / early promoter (LP2EP2) in which a second foreign gene is inserted into the non-repetitive BamHI or EcoRI site. Details of this plasmid are shown in FIGS. 28A-28D. This plasmid was constructed by ligating restriction fragments derived from the following sources having the synthetic DNA base sequences shown in FIGS. 28A-28D using standard recombinant DNA techniques (22, 30). The plasmid vector was derived from an approximately 2519 base pair HindIII-SphI restriction fragment of pSP65 (Promega).
Homologous vector 752-29.33
Plasmid 752-29.33 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the
Homology vector 746-94.1
Plasmid 746-94.1 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the infectious bovine rhinotracheitis virus glycoprotein E (gE) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of this foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the swinepox virus O1L gene promoter and the 1BRV gE gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). This plasmid was constructed by linking together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence using standard recombinant DNA techniques (22, 30). A 1250 base pair EcoRI-BamHI fragment encoding the 1st to 417th amino acids of the IBRV gE gene (lack of 158 amino acids in the carboxy-terminal inner and outer regions) is represented by homology vector 752-22.1 (28A-28D). (Figure) was inserted into the BamHI site as well as the non-repetitive EcoRI. The above 1250 base pair EcoRI-BamHI fragment uses IBRV (Cooper) genomic DNA as a template and
Homology vector 767-67.3
Plasmid 767-67.3 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the bovine viral diarrhea virus glycoprotein 53 (BVDV gp53) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of this foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the swinepox virus O1L gene promoter and the BVDV gp53 gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). This plasmid was constructed by linking together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence using standard recombinant DNA techniques (22, 30). A 1187 base pair BamHI fragment encoding BVDV gp53 was inserted into each non-repetitive BamHI site of homology vector 752-22.1 (Figures 28A-28D). The 1187 base pair BamHI fragment was synthesized by the polymerase chain reaction (15) described in “Cloning of gp53 gene along with bovine viral diarrhea virus gp48”.
Homology vector 771-55.11
Plasmid 771-55.11 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the bovine viral diarrhea virus glycoprotein 48 (BVDV gp48) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of this foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the swinepox virus O1L gene promoter and the BVDV gp48 gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). This plasmid was constructed by linking together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence using standard recombinant DNA techniques (22, 30). A 678 base pair BamHI fragment encoding BVDV gp48 was inserted into each non-repetitive BamHI site of homologous vector 752-22.1 (Figures 28A-28D). The 678 base pair BamHI fragment was synthesized by the polymerase chain reaction (15) described in “Cloning of gp53 gene along with bovine viral diarrhea virus gp48”.
Homology vector 551-47.23
Plasmid 551-47.23 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This plasmid incorporates an E. coli β-glucuronidase (β-glu) marker gene under the control of the late / early epilepsy promoter (LP2EP2). It is useful to produce the recombinant swinepox virus by inserting the marker gene into the SPV genome. This plasmid was constructed by ligating restriction fragments from the following sources using standard recombinant DNA techniques (22, 30). The plasmid vector was derived from an approximately 3005 base pair HindIII restriction fragment of pSP65 (Promega).
Homology vector 779-94.31
Plasmid 779-94.31 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the pseudorabies virus (PRV) gB (gII) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 538 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1180 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the PRV gB gene is under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). Details of this plasmid are shown in FIGS. 30A-30E. This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2986 base pair HindIII-PstI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 789-41.7
Plasmid 789-41.7 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene as well as the pseudorabies virus (PRV) gB (gII) gene and PRV gD (g50) gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1560 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. The β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late synthetic promoter (LP1), the PRV gB gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2), and the PRV gD gene is early in the synthesis. It is noted that it is under the control of the / late late promoter (EP1LP2). Details of this plasmid are shown in FIGS. 31A-31D. This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 789-41.27
Plasmid 789-41.27 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene as well as the pseudorabies virus (PRV) gB (gII) gene and PRV gC (gIII) gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 1560 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. The β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of a synthetic late cocoon promoter (LP1), the PRV gB gene is under the control of a synthetic late / early cocoon promoter (LP2EP2), and the PRV gC gene is early in the synthesis. It is noted that it is under the control of the / late late promoter (EP1LP2). Details of this plasmid are shown in FIGS. 32A-32D. This plasmid was constructed by using standard recombinant DNA techniques (22, 30) and ligating together restriction fragments derived from the following sources having the indicated synthetic DNA base sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 789-41.47
Plasmid 789-41.47 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene as well as the pseudorabies virus (PRV) gC (gIII) gene and PRV gD (g50) gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1560 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. The β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late cocoon promoter (LP1), the PRV gC gene is under the control of the synthetic early / late cocoon promoter (EP1LP2), and the PRV gD gene is also synthesized early. It is noted that it is under the control of the / late late promoter (EP1LP2). Details of this plasmid are shown in FIGS. 33A-33D. This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 789-41.73
Plasmid 789-41.73 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene as well as the pseudorabies virus (PRV) gB (gII) gene, PRV gC (gIII) gene and PRV gD (g50) gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1560 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. The β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of a synthetic late cocoon promoter (LP1), the PRV gB gene is under the control of a synthetic late / early cocoon promoter (LP2EP2), and the PRV gC gene is early in the synthesis. It is noted that the PRV gD gene is under the control of the late / early heel promoter (LP2EP2). Details of this plasmid are shown in FIGS. 34A-34E. This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 791-63.19
Plasmid 791-63.19 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of the foreign gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1). This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 791-63.41
Plasmid 791-63.41 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of the foreign gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1). This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 796-18.9
Plasmid 796-18.9 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of the foreign gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of a synthetic early selection promoter (EP1). This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 783-39.2
Plasmid 783-39.2 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the bovine viral diarrhea virus glycoprotein 53 (BVDV gp53) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late promoter (Lp1) and the BVDV gp53 gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having synthetic DNA base sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 749-75.78
Plasmid 749-75.78 was constructed to insert foreign DNA into SPV. This incorporates the infectious sac disease virus (IBDV) polymerase gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of these foreign genes is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late synthetic epilepsy promoter (LP1), and the IBDV polymerase gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2). This plasmid was constructed using standard recombinant DNA techniques (22, 30) by ligating together restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 761-75. B18
Plasmid 761-75. For inserting foreign DNA into SPV. B18 was constructed. This incorporates the feline immunodeficiency virus (FIV) protease (gag) gene and the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. Upstream of this foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA, and downstream of these foreign genes is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the swinepox virus OLL gene promoter and the FIV gag gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). This homology vector was constructed using the standard recombinant DNA technology (22, 30) and ligating restriction fragments derived from the following sources having a synthetic DNA base sequence. The plasmid vector was derived from an approximately 2519 base pair HindIII-SphI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 781-84. C11
Plasmid 781-84. For inserting foreign DNA into SPV. C11 was used. This incorporates the feline immunodeficiency virus (FIV) envelope (env) gene and E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene flanked by SPV DNA. By using this plasmid according to the “homologous recombination procedure for generating recombinant SPV”, a virus containing the DNA encoding the foreign gene can be obtained. It is noted that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the FIV env gene is under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). This homology vector was constructed by linking together restriction fragments derived from the following sources having an appropriate synthetic DNA base sequence using standard recombinant DNA techniques (22, 30). The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII-BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
〔Example〕
Example 1
Homology vector 515-85.1
Homology vector 515-85.1 is a plasmid useful for the insertion of foreign DNA into SPV. Plasmid 515-85.1 contains a unique AccI restriction site into which foreign DNA can be cloned. An SPV containing exogenous DNA can be obtained by using such a plasmid containing the exogenous DNA insert according to the “homologous recombination method for creating recombinant SPV”. To successfully perform this method, the insertion site (AccI) is in a region that is not essential for SPV replication and is suitable for mediating homologous recombination between the virus and plasmid DNA. It is important that the swinepox virus DNA is adjacent to its end. Exogenous DNA is inserted into at least three recombinant SPVs using the AccI site in homology vector 515-85.1 (see Example 2-4).
In order to define the appropriate insertion site, a library of SPV HindIII restriction fragments was created. Some of these restriction fragments (HindIII fragments G, J and M, see FIGS. 1A-1B) were subjected to restriction mapping analysis. Two restriction sites were identified in each fragment as possible insertion sites. These sites included NruI in fragment G, BalI and XbaI in fragment J, and AccI and PstI in fragment M. A β-galactosidase (lacZ) marker gene was inserted at each possible site. The obtained plasmid was used in “a homologous recombination method for creating a recombinant SPV”. The creation of the recombinant virus was judged by “assay for screening recombinant SPV expressing β-galactosidase”. Although four of the six sites were found to yield recombinant viruses, the ability of each of these viruses to be purified away from the parent SPV varied greatly. In one case, the virus could not be purified above a level of 1%, in another case the virus could be purified above a level of 50%, and in the third case, the virus was at a level of 90% Could not be purified beyond. The inability to purify these viruses indicates instability at the insertion site. This renders the corresponding site inappropriate for the insertion of foreign DNA. However, one site (of homology vector 515-85.1AccAs a result of the insertion at the I site), a virus was obtained that could easily be purified to 100% (see Example 2), which defines an appropriate site for the insertion of foreign DNA.
Homology vector 515-85.1 was further characterized by DNA sequence analysis. Two regions of the homology vector were sequenced. The first region covers the 599 base pair sequence adjacent to the unique AccI site (see FIGS. 2A and 2B). The second region covers 899 base pairs upstream of the unique HindIII site (see FIGS. 2A and 2B). The sequence of the first region encodes an open reading frame (ORF) showing homology to
Example 2
S-SPV-003
S-SPV-003 is a swinepox virus that expresses a foreign gene. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ gene) was introduced into the SPV515-85.1 ORF. The foreign gene (lacZ) is under the control of a synthetic early / late promoter (EP1LP2).
S-SPV-003 was derived from S-SPV-100 (Kasza strain). This is the homology vector 520-17.5 in “Homologous Recombination Method for Creating Recombinant SPV”.(Materials and methodsAnd the virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-003.Materials and methodsThe virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in. After the first three rounds of purification, all observed plaques were blue, indicating that the virus was pure, stable and expressed foreign genes. The assay described here is performed on VERO cells as well as EMSK cells, indicating that VERO cells will be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines. S-SPV-003 has been deposited with the ATCC under accession number 2335.
Example 3
S-SPV-008
S-SPV-008 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the pseudorabies virus (PRV) g50 (gD) (26) were inserted into the SPV 515-85.1 ORF. The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1) and the g50 (gD) gene is under the control of the synthetic early / late promoter (EP1LP2).
S-SPV-008 was derived from S-SPV-100 (Kasza strain). This is based on the homology vector 538-46.16 ("Homologous recombination method for creating recombinant SPV").Materials and methodsAnd the virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-008.Materials and methodsThe virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-008 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Porcine anti-PRV serum was shown to react specifically with S-SPV-008 plaques but not with S-SPV-009 negative control plaques. All S-SPV-008 observed plaques reacted with porcine antiserum, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The black plaque assay was also performed on an unfixed monolayer. SPV plaques on unfixed monolayers also show specific reactivity with porcine anti-PRV serum, indicating that PRV antigen is expressed on the surface of infected cells.
To confirm the expression of the PRV g50 (gD) gene product, cells were infected with SPV and samples of infected cell lysates were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV specific protein was detected using porcine anti-PRV serum. As shown in FIG. 6, lysates from S-SPV-008 infected cells show a reported size of a specific band of approximately 48 kd, PRV g50 (gD) (35).
PRV g50 (gD) is the g50 (gD) homologue of HSV-1 (26). Several investigators have shown that VV expressing HSV-1 g50 (gD) protects mice from attack with HSV-1 (6 and 34). Therefore, S-SPV-008 should be valuable as a vaccine to protect pigs from PRV disease.
It is anticipated that several other PRV glycoproteins will be useful in the creation of recombinant swinepox vaccines to protect against PRV disease. These PRV glycoproteins include gII (28), gIII (27), and gH (19). The PRV gII1 coding region was created after several synthetic pox promoters. The technology utilized in the creation of S-SPV-008 will be used to create a recombinant swinepox virus that expresses all four of these PRV glycoprotein genes. Such recombinant swinepox virus would be useful as a vaccine against PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are subject to current PRV diagnostic tests (gXHardCheck) used to distinguish vaccinated animals from infected animals.R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR). S-SPV-008 has been deposited with the ATCC under the deposit number VR2339.
(Example 4-5 deleted)
Example 6
S-SPV-013
S-SPV-013 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The unique PstI restriction site (the PstI linker inserted into the unique AccI site) of homology vector 570-33.32 with the gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus gIII (gC) Inserted into. The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1), and the PRV gIII (gC) gene is under the control of the synthetic late promoter (LP2EP2).
S-SPV-013 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 570-91.64 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods to Create Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-013. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-013 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Goat anti-PRV gIII (gC) polyclonal antibody was shown to react specifically with S-SPV-013 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-012 observed plaques reacted with porcine anti-PRV serum, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here is performed on EMSK and VERO cells, indicating that EMSK cells will be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm the expression of the PRV gIII (gC) gene product, cells were infected with SPV and samples of infected cell lysates were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. PRV specific protein expression was detected using a goat anti-PRV gIII (gC) polyclonal antibody. As shown in FIG. 16, lysates from S-SPV-013 infected cells showed two specific bands, the reported size of PRV gIII (gC) (37) -92 kd mature form and 74 kd pre-Golgi form. Show.
Recombinantly expressed PRV gIII (gC) has been shown to induce significant immune responses in mice and pigs (37, 38). In addition, when gIII (gC) is expressed with gII (gB) or g50 (gD), significant protection from attack with virulent PRV is obtained (39). Therefore, S-SPV-013 should be valuable as a vaccine to protect pigs from PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are subject to current PRV diagnostic tests (gX HardCheck) used to distinguish vaccinated animals from infected animals.R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR). S-SPV-013 has been deposited with the ATCC under accession number 2418.
Protection against Auesky disease using recombinant swinepox virus vaccines S-SPV-008 and S-SPV-013
Two groups of pigs by intradermal inoculation or oral / pharyngeal spray with vaccine containing S-SPV-008 and S-SPV-013 (1 × 10 6 PFU / ml) (2 ml of a 1: 1 mixture of two viruses) (5 pigs per group). A control group of 5 pigs received S-SPV-001 by intradermal and oral / pharyngeal inoculation. Three weeks after vaccination, pigs were challenged with virulent PRV strain 4982 by intranasal inoculation. The table gives a summary of clinical responses. The data support increased protection from Auesky disease in S-SPV-008 / S-SPV-013 vaccinated compared to S-SPV-001 vaccinated controls.
S-SPV-015
S-SPV-015 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The SPV 617-48.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with the unique NcotI restriction site) the gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus (PRV) gII (gB) Inserted into. The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1) and the PRV gB gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-015 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 727-54.60 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-015. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-015 was assayed for expression of PRV-specific antigens using "black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV". Porcine anti-PRV polyclonal serum was shown to react specifically with S-SPV-015 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-015 observed plaques reacted with the antiserum, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here is performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells will be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm expression of the PRV gII gene product, cells were infected with SPV-015 and samples of infected cell lysates were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV-specific protein was detected using porcine anti-PRV polyclonal serum. Lysates from S-SPV-015 infected cells exhibited bands corresponding to the predicted sizes of PRV gII glycoprotein, 120 kd, 67 kd and 58 kd.
S-SPV-015 is useful as a vaccine against pseudorabies virus in pigs. A superior vaccine is prescribed by fighting S-SPV-008 (PRV g50), S-SPV-013 (PRV gIII) for protection against pseudorabies in pigs.
Therefore, S-SPV-015 should be valuable as a vaccine to protect pigs from PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are subject to current PRV diagnostic tests (gX HardCheck) used to distinguish vaccinated animals from infected animals.R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR). S-SPV-015 has been deposited with the ATCC under accession number 2466.
Example 8
To obtain a recombinant swinepox virus with enhanced ability to protect against PRV infection over that which can be obtained by using a recombinant swinepox virus that expresses only one of the PRV glycoproteins, A recombinant swinepox virus expressing more than one pseudorabies glycoprotein capable of inducing the production of neutralizing antibodies against rabies virus (PRV) is constructed.
There are several examples of such recombinant swinepox viruses that express more than one PRV glycoprotein: recombinant swinepox virus expressing PRV g50 (gD) and gIII (gD), PRV g50 (gD) and gII A recombinant swinepox virus expressing (gB); a recombinant swinepox virus expressing PRV gII (gB) and gIII (gC); and a set expressing g50 (gD), gIII (gC) and gII (gB) A recombinant swinepox virus that expresses a swinepox virus. Each of the cited viruses is also designed to contain and express an E. coli β-galactosidase (lacZ) gene that will facilitate the cloning of recombinant swinepox virus.
Listed below are three examples of recombinant swinepox viruses that express PRV g50 (gD), PRV gIII (gC), PRV gII (gB) and E. coli β-galactosidase (lacZ).
a) Swinepox virus containing PRV g50 (gD) gene, PRV gIII (gC) gene, PRV gII (gB) gene and lacZ gene. All four genes insert into a unique AccI restriction endonuclease site within the HindIII M fragment of the swinepox virus genome. The PRV g50 (gD) gene is under the control of the synthetic early / late promoter (EP1LP2), the PRV gIII (gC) gene is under the control of the synthetic early promoter (EP2), and the PRV gII (gB) gene is It is under the control of the early promoter (LP2EP2) and the lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1).
b) Swinepox virus containing PRV g50 (gD) gene, PRV gIII (gC) gene, PRV gII (gB) gene and lacZ gene. All four genes insert into a unique AccI restriction endonuclease site within the HindIII M fragment of the swinepox virus genome. The PRV g50 (gD) gene is under the control of the synthetic early / late promoter (EP1LP2), the PRV gIII (gC) gene is under the control of the synthetic early / late promoter (EP1LP2), and the PRV gII (gB) gene is synthesized. The late / early promoter (LP2EP2) is under control and the lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1).
c) Swinepox virus containing PRV g50 (gD) gene, PRV gIII (gC) gene, PRV gII (gB) gene and lacZ gene. All four genes insert into a unique AccI restriction endonuclease site within the HindIII M fragment of the swinepox virus genome. The PRV g50 (gD) gene is under the control of the synthetic early / late promoter (EP1LP2), the PRV gIII (gC) gene is under the control of the synthetic late / early promoter (EP2LP2), and the PRV gII (gB) gene is synthesized The late / early promoter (LP2EP2) is under control and the lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1).
Protection against Auesky disease using recombinant swinepox virus vaccines S-SPV-008, S-SPV-013 and S-SPV-015
Vaccine containing S-SPV-008, S-SPV-013, or S-SPV-015 (2 ml of 1 × 10 7 PFU / ml virus) or S-SPV-008, S-SPV-013, and S-SPV- A mixture of 015 (2 ml of a 1: 1: 1 mixture of 3 viruses; 1 × 10 7 PFU / ml) was administered by intramuscular inoculation to 4 groups of pigs (5 pigs per group). A control group of 5 pigs received S-SPV-001 by intramuscular inoculation. Four weeks after vaccination, pigs were challenged with virulent PRV strain 4982 by intranasal inoculation. Pigs are observed daily for 14 days for clinical signs of pseudorabies and the table gives a summary of clinical responses. The data show that pigs vaccinated with S-SPV-008, S-SPV-013, or S-SPV-015 were compared to the S-SPV-001 vaccinated control in the Auesky caused by pseudorabies virus. Pigs with partial protection against disease and vaccinated with the combination vaccine S-SPV-008 / S-SPV-013 / S-SPV-015 showed complete protection.
Example 17
Development of vaccines utilizing swinepox virus for expressing antigens from microorganisms causing various diseases can be planned.
Infectious gastroenteritis virus
The main neutralizing antigen of infectious gastroenteritis virus (TGE),
Swine parvovirus
The major capsid protein of porcine parvovirus (PPV) was cloned for use in the swinepox virus vector. The capsid protein is disclosed in US Pat. No. 5,068,192 issued Nov. 26, 1991. It is believed that the techniques used to express PRV g50 (gD) in SPV and disclosed herein are applicable to PPV.
Swine rotavirus
The major neutralizing antigen of porcine rotavirus, glycoprotein 38, was cloned for use in the swinepox virus vector. A glycoprotein 38 clone is disclosed in US Pat. No. 5,068,192 issued Nov. 26, 1991. The techniques used to express PRV g50 (gD) in SPV and disclosed herein are considered applicable to SRV.
Swine cholera virus
The major neutralizing antigen of bovine viral diarrhea (BVD) virus was cloned as disclosed in US Patent Application No. 225,032, filed July 27, 1988. Since BVD and swine cholera virus are cross-protective (31), BVD virus antigens have been targeted for use in swinepox virus vectors. It is believed that the techniques used to express PRV g50 (gD) in SPV and disclosed herein can be applied to BVD.
Serpulina Hyodysenteriae
The protective antigen of Serpulina Hyodysenteriae (3) for use in the swinepox virus vector has been cloned. The procedure used to express PRV g50 (gD) in SPV and disclosed herein would be applicable to Serpulina Hyodysenteriae.
Antigens from the following microorganisms can also be used to develop animal vaccines: swine influenza virus, foot-and-mouth disease virus, African swine fever virus, swine cholera virus, Mycoplasma hyopneumoniae, swine reproductive system and respiratory tract Syndrome / pig infertility and respiratory syndrome (PRRS / SIRS).
Antigens from the following microorganisms can also be used in animal vaccines: canine-herpesvirus, canine distemper, canine adenovirus type 1 (hepatitis), adenovirus type 2 (respiratory system disease), parainfluenza, leptospira canicola ( Leptospira canicola, icterohemorragia, parvovirus, coronavirus, Borrelia burgdorferi, canine herpesvirus, Bordetella bronshiseptica, Dirofilae imimitis (Dirofil ) (Canine filamentous) and rabies virus, 2) feline-Fiv gag and env, feline leukemia virus, feline immunodeficiency virus, feline herpes virus, feline infectious peritonitis virus, canine herpes virus, canine coronavirus, Nu parvovirus, parasitic diseases in animals (including Dirofilaria immitis in dogs and cats), equine infectious anemia, Streptococcus equi, coccidia, emeria, chicken Anemia virus, Borrelia burgdorferi, bovine coronavirus, Pasteurella haemolytica.
(Example 18-23 deleted)
Example 24
Homology vector 738-94.4
Homology vector 738-94.4 is a swinepox virus vector that expresses one foreign gene. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) was inserted into the O1L open reading frame (SEQ ID NO: 115). The lacZ gene is under the control of the O1L promoter. The homology vector 738-94.4 contains a deletion of SPV DNA from nucleotides 1679 to 2452 (SEQ ID NO: 189; FIG. 17) representing a portion of the O1L ORF.
The upstream SPV sequence is synthesized by polymerase chain reaction with
Example 24B
Homology vector 752-22.1 is a swinepox virus vector used to express two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) was inserted into the O1L open reading frame (SEQ ID NO: 115). The lacZ gene is under the control of the O1L promoter. The second exogenous gene is expressed from the LP2EP2 promoter inserted into the EcoRI or BamHI site according to the LP2EP2 promoter sequence. Homology vector 752-22.1 contains a deletion of SPV DNA from nucleotides 1679 to 2452 (SEQ ID NO: 189; FIG. 17), which lacks a portion of the O1L ORF. Homology vector 752-22.1 was derived from homology vector 738-94.4 by insertion of the LP2EP2 promoter fragment (see Materials and Methods). Homology vector 752-22.1 is further improved by inclusion of the lacZ gene under the control of the synthetic LP1 promoter. The LP1 promoter results in a higher level of lacZ expression compared to the SPV O1L promoter.
Example 25
S-SPV-041:
S-SPV-041 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for
S-SPV-041 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 752-29.33 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-041. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-041 is useful as a vaccine against EHV-1 infection in horses and is useful for the expression of EHV-1 glycoprotein B.
S-SPV-045:
S-SPV-045 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for infectious bovine rhinotracheitis virus glycoprotein E (gE) were 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF; nucleotides 1679 to 2452) Of SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox OLL promoter and the IBRV gE gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-045 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 746-94.1 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-045. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-045 is useful for the expression of IBRV glycoprotein E.
S-SPV-049:
S-SPV-049 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for bovine viral diarrhea virus glycoprotein 48 (gp48) are 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF; nucleotides 1679 to 2452) Of SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox OLL promoter, and the BVDV gp48 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-049 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 771-55.11 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-049. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-049 is useful as a vaccine against BVDV infection in cattle and is useful for the expression of
S-SPV-050:
S-SPV-050 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for bovine viral diarrhea virus glycoprotein 53 (gp53) are 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF; nucleotides 1679 to 2452) Of SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox OLL promoter and the BVDV gE gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-050 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 767-67.3 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-050. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-050 is useful as a vaccine against BVDV infection in cattle and is useful for the expression of BVDV glycoprotein 53.
Example 26
Recombinant swinepox virus S-SPV-042 or S-SPV-043, respectively expressing chicken interferon (cIFN) or chicken bone marrow monocyte growth factor (cMGF), can be added to a vaccine against poultry disease to produce an immune response. Useful for augmentation. Chicken bone marrow monocyte growth factor (cMGF) is homologous to mammalian interleukin-6 protein, and chicken interferon (cIFN) is homologous to mammalian interferon. When used in combination with a vaccine against specific avian diseases, S-SPV-042 and S-SPV-043 include, but are not limited to, Marek's disease virus, Newcastle disease virus, infectious pharyngeal tracheitis virus, infectiousness Provide enhanced mucous, humoral, or cell-mediated immunity against viruses that cause bronchitis, birds, including infectious scab virus.
Example 26A
S-SPV-042:
S-SPV-042 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for chicken interferon (cIFN) were inserted into the SPV617-48.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with a unique NcoI restriction site). The lacZ gene is under the control of the synthetic postscript promoter (LP1), and the cIFN gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-042 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This is based on the homologous vector 751-07. In “Homologous recombination method for creating recombinant SPV”. Achieved using A1 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-042. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-042 has interferon activity in cell culture. Addition of S-SPV-042 conditioned medium to chicken embryo fibroblast (CEF) cell culture inhibits infection of CEF cells by vesicular stomatitis virus or by turkey herpesvirus. S-SPV-042 is useful to enhance the immune response when added to a vaccine against poultry disease.
Example 26B
S-SPV-043:
S-SPV-043 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for chicken bone marrow monocyte growth factor (cMGF) were inserted into the SPV617-48.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with a unique NcoI restriction site). did. The lacZ gene is under the control of the synthetic postscript promoter (LP1), and the cMGF gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-043 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This is based on homology vector 751-56. In “Homologous recombination method for creating recombinant SPV”. Achieved using A1 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-043. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-043 is useful to enhance the immune response when added to a vaccine against poultry disease.
Example 27
Insertion of a non-essential site into a 2.0 kb HindIII to BglII region of a swinepox virus HindIII M fragment
The 2.0 kb HindIII to BglII region of the swinepox virus HindIII M fragment is useful for the insertion of foreign DNA into SPV. Exogenous DNA is inserted into the unique BglII restriction site in the region (FIG. 17; nucleotide 540 of SEQ ID NO: 195). According to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, an SPV containing foreign DNA is obtained using a plasmid containing the foreign DNA insert. For this procedure to be successful, the swinepox virus is suitable for mediating homologous recombination between the virus and plasmid DNA where the insertion site is in a region not essential for SPV replication. It is important that the DNA is adjacent to its end. The only BglII restriction site in the 2.0 kb HindIII to BglII region of the swinepox virus HindIII M fragment is located within the coding region of the SPVI4L oven reading frame. The I4L ORF has sequence similarity to the vaccinia virus and smallpox virus ribonucleotide reductase (large subunit) gene (56-58). The ribonucleotide reductase (large subunit) gene is non-essential for DNA replication of vaccinia virus and is an appropriate insertion site in swinepox virus.
Example 28
S-SPV-047
S-SPV-047 is a swinepox virus that expresses two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus gB (gII) are transferred to a unique HindIII site (2.0 kb BglII to HindIII subfragment of the HindIII M fragment). Inserted into the inserted HindIII linker). The BglII insertion site is in the
S-SPV-047 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 799-94.31 (see Materials and Methods) and the virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods to Create Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-047. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-047 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Porcine anti-PRV polyclonal serum was shown to react specifically with S-SPV-047 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-047 observed plaques reacted with porcine anti-PRV serum, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm the expression of the PRV gB gene product, cells were infected with SPV-047, and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV-specific protein was detected using porcine anti-PRV polyclonal serum. Lysates from S-SPV-047 infected cells exhibited bands corresponding to the expected sizes of PRV glycoprotein B, 120 kD, 67 kD and 58 kD.
PRV gB expressed in SPV recombinants has been shown to stimulate a significant immune response in pigs (37, 38; see Example 8). In addition, PRV gB is expressed in recombinant SPV and provides significant protection from attack with virulent PRV (see Examples 6 and 8). Therefore, S-SPV-047 is valuable as a vaccine to protect pigs against PRV disease. Because the PRV vaccines described here do not express PRV gX or gI, they are compatible with current PRV diagnostic tests (gX HerdCheKR, gI HerdCheKR and ClinEaseR) that are used to distinguish vaccinated animals from infected animals. Let's go.
S-SPV-052
S-SPV-052 is a swinepox virus that expresses three foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus gB (gII) with a unique HihdIII restriction site (HindIII linker inserted at the unique NdeI site in the SPV OLL open reading frame; SPV HindIII An approximately 545 base pair NdeI to NdeI subfragment of the M fragment (
S-SPV-052 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 789-41.7 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-052. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-052 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Porcine anti-PRV polyclonal serum was shown to react specifically with S-SPV-052 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-052 observed plaques reacted with porcine anti-PRV serum indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm expression of the PRV gB and gD gene products, cells were infected with SPV-052, and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV-specific protein was detected using porcine anti-PRV polyclonal serum. Lysates and supernatants from S-SPV-052 infected cells were bands corresponding to the predicted sizes of 120 kD, 67 kD and 58 kD of PRV glycoprotein B, and 48 kD of predicted size of PRV glycoprotein D A band corresponding to was presented.
PRV gB and gD expressed in SPV recombinants have been shown to stimulate significant immune responses in pigs (37, 38; see Example 8). Furthermore, PRV gB and gD are expressed in recombinant SPV, resulting in significant protection from attack with virulent PRV (see Examples 6 and 8). S-SPV-052 is therefore valuable as a vaccine to protect pigs against PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are currently used to differentiate the vaccinated animals from the infected animals (gX HerdCheck)R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR).
S-SPV-053
S-SPV-053 is a swinepox virus that expresses three foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus gB (gII) with a unique HindIII restriction site (HindIII linker inserted at the unique NeI site in the SPV OLL open reading frame; SPV HindIII An approximately 545 base pair NdeI to NdeI subfragment of the M fragment (
S-SPV-053 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 789-41.27 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-053. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-053 was assayed for expression of PRV-specific antigens using "black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV". Porcine anti-PRV polyclonal serum was shown to react specifically with S-SPV-053 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-053 observed plaques reacted with porcine anti-PRV serum indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm expression of PRV gB and gC gene products, cells were infected with SPV-053, and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV-specific protein was detected using porcine anti-PRV polyclonal serum. Lysates and supernatants from S-SPV-053 infected cells were bands corresponding to the expected sizes of PRV glycoprotein B, 120 kD, 67 kD, and 58 kD, and the predicted size of PRV glycoprotein C, 92 kD. A band corresponding to was presented.
PRV gB and gC expressed in SPV recombinants have been shown to stimulate significant immune responses in pigs (37, 38; see Example 8). In addition, PRV gB and gC are expressed in recombinant SPV, resulting in significant protection from attack with virulent PRV (see Examples 6 and 8). Therefore, S-SPV-053 is valuable as a vaccine to protect pigs against PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are currently used to differentiate the vaccinated animals from the infected animals (gX HerdCheck)R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR).
S-SPV-054
S-SPV-054 is a swinepox virus that expresses three foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus gC (gIII) are inserted into a unique HindIII restriction site (a HindIII linker inserted into a unique NeI site in the SPV OLL open reading frame; SPV HindIII An approximately 545 base pair NdeI to NdeI subfragment of the M fragment (
S-SPV-054 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 789-41.27 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-054. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-054 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. It was shown that porcine anti-PRV polyclonal serum specifically reacts with S-SPV-054 plaques but not specifically with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-054 observed plaques reacted with porcine anti-PRV serum, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm the expression of PRV gC and gD gene products, cells were infected with SPV-054, and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV-specific protein was detected using porcine anti-PRV polyclonal serum. Lysates and supernatants from S-SPV-054 infected cells correspond to a band corresponding to the predicted size of PRV glycoprotein C, 92 kD, and a band corresponding to the predicted size of PRV glycoprotein D, 48 kD. Was presented.
PRV gC and gD expressed in SPV recombinants have been shown to stimulate significant immune responses in pigs (37, 38; see Example 8). Furthermore, PRV gC and gD are expressed in recombinant SPV, resulting in significant protection from attack with virulent PRV (see Examples 6 and 8). S-SPV-054 is therefore valuable as a vaccine to protect pigs against PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are currently used to differentiate the vaccinated animals from the infected animals (gX HerdCheck)R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR).
S-SPV-055
S-SPV-055 is a swinepox virus that expresses four foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus gB (gII) with a unique HindIII restriction site (HindIII linker inserted at the unique NeI site in the SPV OLL open reading frame; SPV HindIII An approximately 545 base pair NdeI to NdeI subfragment of the M fragment (
S-SPV-055 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 789-41.73 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-055. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-055 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Porcine anti-PRV polyclonal serum was shown to react specifically with S-SPV-055 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-055 observed plaques reacted with porcine anti-PRV serum indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm expression of the PRV gB, gC and gD gene products, cells were infected with SPV-055, and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. The expression of PRV-specific protein was detected using porcine anti-PRV polyclonal serum. Lysates and supernatants from S-SPV-055 infected cells are at bands corresponding to the predicted sizes of
PRV gB, gC and gD expressed in SPV recombinants have been shown to elicit significant immune responses in pigs (37, 38; see Example 8). In addition, PRV gB, gC and gD are expressed in recombinant SPV, resulting in significant protection from attack with virulent PRV (see Examples 6 and 8). S-SPV-055 is therefore valuable as a vaccine to protect pigs against PRV disease. Since the PRV vaccines described herein do not express PRV gX or gI, they are currently used to differentiate the vaccinated animals from the infected animals (gX HerdCheck)R, GI HerdCheckRAnd ClinEaseR).
Example 29
SPV-059
S-SPV-059 is a swinepox virus that expresses one foreign gene. The gene for E. coli β-glucuronidase (uidA) was inserted into the unique EcoRI restriction site in the SPV B18R open reading frame within the SPV HindIII K genomic fragment. The uidA gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). The partial sequence from the 3.2 kb region of the SPV 6.5 kb HindIII K fragment (SEQ ID NO :) shows three possible open reading frames. The SPV B18R ORF shows sequences homologous to the vaccinia virus B18R gene, the 77.2K protein from rabbit fibroma virus, the vaccinia virus C19L / B25R ORF and the ankyrin repeat region from human brain variants. The B18R gene encodes a soluble interferon receptor with high affinity and broad specificity. The SPV B4R open reading frame shows a sequence homologous to the T5 protein of rabbit fibroma virus.
S-SPV-059 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 796-50.31 and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Homology vector 794-50.31 is the only EcoRI in the SPV 6.5 kb HindIII K fragment of the blunt-ended NcoI fragment containing the LP2EP2 promoter uidA cassette from plasmid 551-47.23 (see materials and methods). Created by insertion at the site (blunted). Transfection stocks were screened by “screening for recombinant herpesviruses expressing the enzyme marker gene”. The final result of blue plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-059. The virus was assayed for β-glucuronidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, the observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-059 was purified and expressed a foreign gene, E. coli uidA, indicating that the EcoRI site in the 7.5 kb HindIII K fragment is a stable insertion site for the foreign gene. Show. Recombinant swinepox virus using this insertion site is useful for expression of foreign genes, as a vaccine against diseases, or as an expression vector for raising antibodies against the expressed foreign genes.
SPV-060
S-SPV-060 is a swinepox virus that expresses one foreign gene. The gene for E. coli β-glucuronidase (uidA) was inserted into a unique EcoRV restriction site within the SPV HindIII N genomic fragment. The uidA gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). The partial sequence of the SPV 3.2 kb HindIII N fragment (SEQ ID NO :) shows two possible open reading frames. SPV I7L ORF shows a sequence homologous to protein I7 of vaccinia virus. The SPV I4L open reading frame shows a sequence homologous to the ribonucleoside diphosphate reductase gene of vaccinia virus. The two possible open reading frames I5L and I6L between the I4L ORF and the I7L ORF are of unknown function.
S-SPV-060 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 79-71.31 and the virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Homology vector 786-71.31 is in the SPV 3.2 kb HindIII N fragment (FIG. 29A) of a blunt-ended NcoI fragment containing the LP2EP2 promoter uidA cassette from plasmid 551-47.23 (see Materials and Methods). Was created by insertion into the only EcoRV site. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant herpesviruses expressing the enzyme marker gene”. The final result of blue plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-060. The virus was assayed for β-glucuronidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, the observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-060 was purified and expressed a foreign gene, E. coli uidA, indicating that the EcoRI site within the 3.2 kb HindIII N fragment is a stable insertion site for the foreign gene. Show. Recombinant swinepox virus using this insertion site is useful for expression of foreign genes, as a vaccine against diseases, or as an expression vector for raising antibodies against the expressed foreign genes.
S-SPV-061
S-SPV-061 is a swinepox virus that expresses one foreign gene. The gene for E. coli β-glucuronidase (uidA) was inserted into a unique SnaBI restriction site within the SPV HindIII N genomic fragment. The uidA gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). The partial sequence of the SPV 3.2 kb HindIII N fragment (SEQ ID NO :) shows two possible open reading frames. The SPV I7L ORF shows a sequence homologous to protein 17 of vaccinia virus. The SPV I4L open reading frame shows a sequence homologous to the ribonucleoside diphosphate reductase gene of vaccinia virus. The two possible open reading frames I5L and I6L between the I4L ORF and the I7L ORF are of unknown function.
S-SPV-061 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 794-71.41 and the virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Homology vector 794-71.41 is the only SnaBI in the SPV 3.2 kb HindIII N fragment of the blunt-ended NcoI fragment containing the LP2EP2 promoter uidA cassette from plasmid 551-47.23 (see materials and methods). Created by insertion into the site. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant herpesviruses expressing the enzyme marker gene”. The final result of blue plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-061. The virus was assayed for β-glucuronidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, the observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-061 was purified and expressed a foreign gene, E. coli uidA, indicating that the SnaBI site within the 3.2 kb HindIII N fragment is a stable insertion site for the foreign gene. Show. Recombinant swinepox virus using this insertion site is useful for expression of foreign genes, as a vaccine against diseases, or as an expression vector for raising antibodies against the expressed foreign genes.
S-SPV-062
S-SPV-062 is a swinepox virus that expresses one foreign gene. The gene for E. coli β-glucuronidase (uidA) was inserted into a unique BglII restriction site within the SPV HindIII N genomic fragment. The uidA gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). The partial sequence of the SPV 3.2 kb HindIII N fragment (SEQ ID NO :) shows two possible open reading frames. The SPV I7L ORF shows a sequence homologous to the protein I7 of Watsinia virus. The SPV I4L open reading frame shows a sequence homologous to the ribonucleoside diphosphate reductase gene of vaccinia virus. The two possible open reading frames I5L and I6L between the I4L ORF and the I7L ORF are of unknown function.
S-SPV-062 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 794-71.51 and the virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Homology vector 79-71.51 is the only BglII in the SPV 3.2 kb HindIII N fragment of the blunt-ended NcoI fragment containing the LP2EP2 promoter uidA cassette from plasmid 551-47.23 (see Materials and Methods). Created by insertion into the site. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant herpesviruses expressing the enzyme marker gene”. The final result of blue plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-062. The virus was assayed for β-glucuronidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, the observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-062 was purified and expressed an exogenous gene, E. coli uidA, indicating that the BglII site in the 3.2 kb HindIII N fragment is a stable insertion site for the exogenous gene. Show. Recombinant swinepox virus using this insertion site is useful for expression of foreign genes, as a vaccine against diseases, or as an expression vector for raising antibodies against the expressed foreign genes.
Example 30:
Recombinant swinepox virus expressing E. coli β-galactosidase (lacZ) under the control of a synthetic early or synthetic sputum promoter
Three recombinant swinepox viruses S-SPV-056, S-SPV-057, and S-expressing E. coli β-galactosidase (lacZ), respectively, under the control of the synthetic sputum promoters LP1, LP2, and EP1 SPV-058 was constructed.
S-SPV-056 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 791-63.19 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). S-SPV-057 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 791-63.41 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). S-SPV-058 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 796-18.9 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was the recombinant viruses designated S-SPV-056, S-SPV-057 and S-SPV-058. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
Recombinant swinepox virus expresses foreign genes such as E. coli β-galactosidase in human cell lines, but does not replicate in human cell lines. To optimize the expression of foreign genes, S-SPV-056, S-SPV-057 and S-SPV-058 were used to control E. coli β under the control of an early or late synthetic poxvirus promoter. -Compare the optimal expression level of galactosidase. Human cell lines in which the expression of recombinant swinepox virus is deleted include, but are not limited to, 143B (osteosarcoma), A431 (epidermoid carcinoma), A549 (lung cancer), Capan-1 (liver cancer) ), CF500 (foreskin fibroblasts), Chang Liver (liver), Detroit (down foreskin fibroblasts), HEL-199 (embryonic lung), HeLa (cervical cancer), HEp-2 (epidermal pharyngeal cancer) HISM (intestinal smooth muscle), HNK (neonatal kidney), MRC-5 (embryonic lung), NCI-H292 (pulmonary mucosal epidermoid carcinoma), OVCAR-3 (ovarian cancer), RD (rhabdomyosarcoma), THF (Monocyte leukocytes), WIL2-NS (B lymphocyte system, non-secretory), WISH (amniotic membrane).
Example 31
S-SPV-051
S-SPV-051 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for bovine viral diarrhea virus glycoprotein 53 (g53) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is the only NotI restriction site). Replaced by site). The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1) and the BVDV g53 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-051 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 783-39.2 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-051. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-051 was assayed for expression of PRV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. The mouse monoclonal antibody against BVDV g53 was shown to react specifically with S-SPV-051 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-051 observed plaques reacted with a monoclonal antibody against BVDV g53, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm the expression of the BVDV g53 gene product, cells were infected with SPV-051 and samples of infected cell lysates were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. BVDV specific protein expression was detected using a monoclonal antibody against BVDV g53. Lysates and supernatants from S-SPV-051 infected cells exhibited a band of 53 kd and above indicating glycosylated and non-glycosylated forms of BVDV g53 protein.
S-SPV-051 is useful as a vaccine against BVDV infection in cattle and is useful for the expression of BVDV glycoprotein 53.
Example 32:
S-SPV-044:
S-SPV-044 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for infectious disease virus (IBDV) polymerase protein were inserted into the 617-48.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with a unique NotI restriction site). ) The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1) and the IBDV polymerase gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-044 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector 749-75.78 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-044. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-044 is useful for the expression of IBDV polymerase protein. S-SPV-044 is useful in an in vitro approach to a recombinant IBDV attenuated vaccine. RNA strands from the attenuated IBDV strain are synthesized in a bacterial expression system using the T3 or T7 promoter (pBlueScript plasmid; Stratagene, Inc.) to synthesize the double-stranded short and long segments of the IBDV genome. Swinepox virus expresses IBDV polymerase but does not replicate in CEF cells. IBDV polymerase produced from S-SPV-044 synthesizes infectious attenuated IBDV virus from a double-stranded RNA genomic template. The resulting attenuated IBDV virus is useful as a vaccine against infectious disease in chickens.
Example 33:
S-SPV-046
S-SPV-046 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for feline immunodeficiency virus (FIV) gag protease (gag) were deleted from 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF; nucleotides 1669 to 2452) Of SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox OLL promoter and the FIV gag gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-046 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This is based on the homology vector 761-75. In “Homologous recombination method for creating recombinant SPV”. This was accomplished using B18 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-046. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
To confirm the expression of the FIV gag gene product, cells were infected with SPV-046 and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. Feline anti-FIV (PPR strain) serum was used to detect the expression of FIV specific proteins. Lysates and supernatants from S-SPV-046 infected cells exhibited bands at 26 kd and 17 kd, the expected size of FIV gag protein. The FIV gag protein expressed by the recombinant swinepox virus was appropriately processed and secreted into the medium.
S-SPV-048
S-SPV-048 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for feline immunodeficiency virus (FIV) envelope (env) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is the only NctI restriction site). Replaced). The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1) and the FIV env gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-048 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This is based on the homology vector 781-84. In “Homologous recombination method for creating recombinant SPV”. Achieved using C11 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-048. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-046 and S-SPV-048 are useful alone or in combination as a vaccine against FIV infection in cats and are useful for the expression of FIV env and gag proteins. Recombinant swinepox virus expressing both FIV env and gag proteins is useful as a vaccine against FIV infection in cats.
Recombinant swinepox virus expressing human respiratory syncytial virus F and G proteins is useful as a vaccine against human diseases.
Example 34
In vitro properties of chicken IFN expressed in recombinant poxvirus
Growth characteristics of recombinant virus in cell culture. Compared to wild type swinepox virus, S-SPV-042 did not grow in embryonic porcine kidney cells (ESK-4).
Western blot analysis was performed on supernatants from cells infected with SPV / cIFN recombinant virus. Rabbit and mouse antisera were raised against cIFN from concentrated SPV / cIFN infected disciplines and precleared against ESK-4 cells infected with wild type SPV in preparation for Western analysis. . Rabbit and mouse anti-cIFN antisera reacted with denatured proteins on nitrocellulose from recombinant SPV / cIFN and SPV wild type virus infection supernatants. A reactive band with an estimated molecular weight size range of 17-20 kilodaltons was present in the SPV / cIFN lane and not in the SPV wild type control lane.
Effect of cIFN expressed in supernatants from SPV / cIFN (S-SPV-042), FPV / cIFN, and FPV / cIFN / NDV infected cells on the growth of vesicular stomatitis virus
Virion clarified supernatants from SPV / cIFN, FPV / cIFN / cIFN infected cells were tested for the presence of virus inhibitory activity and the results are shown in Table 1. Briefly, CEF cells were incubated with serially diluted virus supernatant. Subsequently, 40,000 plaque forming units (pfu) / well of vesicular stomatitis virus (VSV) were added and the wells scored for VSV cytotoxic effect (CPE) 48 hours later. Recombinant virus supernatant containing cIFN was shown to inhibit VSV-induced CPE, while control virus supernatant did not. The VSV-induced cytotoxic effect would have been reversed in the presence of rabbit anti-cIFN serum.
Supernatants containing recombinant cIFN from ESK-4 cells infected with SPV / cIFN virus were tested for their activity to inhibit turkey herpesvirus (HVT) growth in CEF cells and the results are shown in Table 2 . Briefly, serially diluted supernatants were incubated with CEF cells and then infected with 100 pfu / well of wild type HVT. Plaques were counted in all wells after 48 hours. 10-100 units of cIFN activity inhibited plaque formation in HVT (100 pfu / well). Supernatants from wild type SPV did not inhibit HVT plaque formation.
HD11 cells or bone marrow adherent cells were incubated with 1000 units / ml cIFN, lipopolysaccharide (LPS) (9 ng / ml) or both cIFN and LPS from SPV / cIFN supernatant and the results are shown in Table 3. After 24 hours, supernatant fluid was collected and nitrite levels were measured. These data indicate that cIFN expressed from SPV / cIFN supernatant has the ability to activate chicken macrophages in the presence of LPS.
1. Recombinant swinepox virus expresses biologically active chicken interferon in the supernatant of infected cells as measured by protection of CEF cells from VSV infection.
2. Chicken interferon expressed in supernatants from recombinant SPV / cIFN infected cells was shown to protect CEF cells against infection with HVT in a dose-dependent manner.
3. Chicken interferon expressed from SPV / cIFN acts synergistically with PLS to detect by nitric oxide induction and activate chicken macrophages.
4). The data show that recombinant swinepox virus expressing chicken IFN can have free application as an immunomodulator in vitro, in vivo and in ovo.
Example 35
As an alternative to constructing an IBD vaccine using a viral vector delivery system and / or subunit approach, both the large (segment A) and small (segment B) double-stranded RNA subunits can be manipulated directly by direct manipulation of the IBD viral RNA. The virus is reconstructed using full-length RNA derived from a cDNA clone representing Generation of IBD virus thus provides several advantages over the first two approaches. First, if the IBD virus is regenerated using an RNA template, the cloned cDNA copy of the virus genome can be manipulated prior to transcription (RMA generation). Using this approach, the virulent IBD strain can be attenuated, or the V2 variable region of the attenuated vaccine backbone can be replaced with that of the virulent strain. In doing so, the present invention provides protection against virulent IBD strains while providing the safety and efficiency of vaccine strains. Furthermore, using this approach, the present invention has constructed and tested a temperature sensitive IBD virus generated using RNA polymerase derived from the related birnavirus infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) and polyprotein derived from IPNV. Is done. IPNV polymerase has optimal activity at temperatures lower than that of IBDV. If IPNV polymerase recognizes a regulatory signal present on IBDV, the hybrid virus is expected to be attenuated at the high temperatures present in chickens. Alternatively, IBD viruses produced using RNA polymerase derived from
First, a BursaVac vaccine strain (Sterwin Labs) is used to construct a cDNA clone representing the complete genome of IBDV (double stranded RNA segments A and B). Once a cDNA clone representing the full length copy of segments A and B has been constructed, template RNA is prepared. Since IBDV exists as a two-segmented double-stranded RNA virus, the pBlueScript plasmid (Stratagene, Inc.) is used to obtain both sense and antisense RNA strands for each segment. These vectors utilize highly specific phage promoters to obtain substantial amounts of RNA in vitro. A unique restriction endonuclease site is created in the 3 'PCR primer to linearize the DNA for the generation of run-off transcripts during transcription.
The purified RNA transcript (4 strands) is transfected into chicken embryo fibroblasts (CEF) to determine whether the RNA is infectious. If an IBD virus is generated, as determined by a black plaque assay using IBDV-specific Mabs, no further manipulation is necessary and vaccine strain generation can begin. The advantage of this method is that the IBD virus generated in this way is pure and requires little / no purification, greatly reducing the time required to create a new vaccine. If purified results are obtained with purified RNA, a functional viral RNA polymerase by use of helper virus is required. Birnavirus replicates its nucleic acid by a strand displacement (semi-conservative) mechanism, and RNA polymerase binds to the ends of double stranded RNA molecules to form a circular ring structure (Muller & Nitschke, Virology 159, 174- 177, 1987). An approximately 878 amino acid RNA polymerase open reading frame in swinepox virus is expressed and this recombinant virus (S-SPV-044) is used to obtain functional IBDV RNA in-transit. In the absence of signs of productive replication of the viral vector, swinepox virus expressed an immunologically recognizable foreign antigen in avian cells (CEF cells). In the present invention, the IBDV polymerase protein is expressed in the same cell as the RNA transfected with the IBDV polymerase protein using the swinepox vector without contaminating the cells with SPV replication.
Once it has been demonstrated that IBD virus is generated in vitro using genomic RNA, an improved live attenuated virus vaccine for infectious scab is developed. Using recombinant DNA technology with a newly defined system of IBD virus to produce, specific deletions in the viral genome are made that facilitate the construction of attenuated viruses. Using this technique, the region of IBDV responsible for pathogenicity and an attenuated immunogenic IBDV vaccine are identified. The present invention provides a replacement of the virulent IBD strain or the VP2 variable region of the attenuated vaccine backbone with that of the virulent strain, thus protecting against the virulent strain while providing the safety and efficacy of the vaccine strain.
Example 36
Effect of rabbit anti-chicken interferon (cIFN) antibody on turkey herpesvirus growth
Supernatants from SPV / cIPN (SPV041) infected ESK-4 cells were harvested 48 hours post infection and then concentrated 5-10 fold on a
HVT was highly sensitive to interferon produced from CEF, and HVT proliferation was enhanced when cIFN was blocked.
Applicants have (1) the use of antibodies against cIFN as an additive to increase HVT titers in vaccine stocks; (2) to facilitate the formation of new recombinant HVT viruses via cosmid reconstruction. Include the use of antibodies to cIFN as an additive.
Example 37
S-SPV-063
S-SPV-063 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for swine influenza virus (SIV) NP (H1N1) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is the only NotI restriction site) Replaced). The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1), and the SIV NP gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-063 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 807-41.3 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-063. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-063 was assayed for expression of SIV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. It was shown that porcine anti-SIV polyclonal sera or goat anti-NP polyclonal sera react specifically with S-SPV-063 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-063 observed plaques reacted with porcine anti-SIV serum or goat anti-NP serum, indicating that the virus was stably expressing SIV foreign genes. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm the expression of the SIV NP gene product, cells were infected with SPV-063 and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. SIV-specific protein expression was detected using porcine anti-SIV polyclonal serum or goat anti-NP polyclonal serum. Lysates and supernatants from S-SPV-063 infected cells exhibited a band corresponding to the expected size of SIV NP protein, 56 kd.
S-SPV-063 is useful as a vaccine against SIV infection in pigs and is useful in the expression of SIV NP. S-SPV-063 is useful as a vaccine in combination with S-SPV-066 expressing NA and S-SPV-065 expressing SIV HA.
S-SPV-064
S-SPV-064 is a swinepox virus that expresses one foreign gene. The gene for E. coli β-glucuronidase (uidA) was inserted into a unique XhoI restriction site within the 6.9 kb SPV HindIII J genomic fragment. The uidA gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2). The HindIII J genomic fragment contains part of the A50R ORF (aa 227 to 552). There is no unique XhoI site in the A50R ORF. The XhoI site is 25 kb from the 3 'end of the swinepox virus genome.
S-SPV-064 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 807-42.28 and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Homology vector 807-42.28 is a NotI site in the 6.9 kb HindIII J fragment of the NotI fragment (see Materials and Methods) containing the LP2EP2 promoter uidA gene cassette from plasmid 551-47.23 (via the DNA linker). The only XhoI site was generated by insertion into (converted to NotI). Transfection stocks were screened by “screening screening for recombinant herpesviruses expressing enzymatic marker genes”. The final result of blue plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-064. The virus was assayed for β-glucuronidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, the observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-064 was purified and expressed a foreign gene, E. coli uidA, because the XhoI site in the 6.9 kb HindIII J fragment is a site that is not essential for virus growth and is a foreign gene. It shows that this is a stable insertion site. Recombinant swinepox virus using this insertion site is useful for expression of foreign genes, as a vaccine against diseases, or as an expression vector for raising antibodies against the expressed foreign genes.
S-SPV-065
S-SPV-065 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for swine influenza virus (SIV) HA (H1N1) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is the only NotI restriction site) Replaced). The lacZ gene is under the control of the late synthetic promoter (LP1) and the SIV HA gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-065 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 807-84.3 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-065. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-065 was assayed for expression of SIV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. It was shown that porcine anti-SIV polyclonal sera or goat anti-HA polyclonal sera react specifically with S-SPV-065 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-065 observed plaques reacted with porcine anti-SIV serum. SIV exogenous gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm the expression of the SIV NP gene product, cells were infected with SPV-065 and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. SIV-specific protein expression was detected using porcine anti-SIV polyclonal serum or goat anti-HA polyclonal serum. Cell lysates and supernatants from S-SPV-065 infected cells exhibited a band corresponding to the expected size of SIV HA protein, 64 kd.
S-SPV-065 is useful as a vaccine against SIV infection in pigs and is useful in the expression of SIV NP. S-SPV-065 is useful as a vaccine in combination with S-SPV-066 expressing NA and S-SPV-063 expressing SIV NP.
S-SPV-066
S-SPV-066 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for swine influenza virus (SIV) NA (H1N1) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is the only NotI restriction site) Replaced). The lacZ gene is under the control of the late synthetic promoter (LP1) and the SIV NA gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-066 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 807-84.35 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-066. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
To confirm expression of the SIV NA gene product, cells were infected with SPV-066 and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. SIV-specific protein expression was detected using porcine anti-SIV polyclonal serum or goat anti-NA polyclonal serum. Cell lysates and supernatants from S-SPV-066 infected cells exhibited a band corresponding to the expected size of SIV HA protein, 64 kd.
S-SPV-066 is useful as a vaccine against SIV infection in pigs and is useful in the expression of SIV NA. S-SPV-066 is useful as a vaccine in combination with S-SPV-065 expressing HA and S-SPV-063 expressing SIV NP.
S-SPV-071
S-SPV-071 is a swinepox virus that expresses at least four foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the genes for swine influenza virus (SIV) HA (H1N1) and NA (H1N1) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is Replaced with a unique NotI restriction site). The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1), and the SIV HA and NA genes are under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-071 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 817-86.35 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods to Create Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-071. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-071 was assayed for expression of SIV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Goat anti-HA polyclonal serum was shown to react specifically with S-SPV-071 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-071 observed plaques reacted with goat anti-HA serum, indicating that the virus was stably expressing the SIV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
To confirm expression of SIV HA and NA gene products, cells were infected with SPV-071, and samples of infected cell lysates and culture supernatants were subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The gel was blotted and analyzed using “Western blotting”. SIV-specific protein expression was detected using porcine anti-SIV polyclonal serum or goat anti-HA polyclonal serum. Cell lysates and supernatants from S-SPV-071 infected cells exhibited bands corresponding to the expected sizes of SIV HA and NA proteins, 64 kd and 52 kd.
S-SPV-071 is useful as a vaccine against SIV infection in pigs and is useful in the expression of SIV HA and NA. S-SPV-071 is useful as a vaccine in combination with S-SPV-063 expressing SIV NP.
S-SPV-074
S-SPV-074 is a swinepox virus that expresses at least four foreign genes. The genes for E. coli β-glucuronidase (uidA) and swine influenza virus (SIV) HA (H1N1) and NA (H1N1) were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is Replaced with a unique NotI restriction site). The uidA gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2), and the SIV HA and NA genes are under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-074 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using homology vector 817-14.2 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods to Create Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-074. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-074 was assayed for expression of SIV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Porcine anti-SIV serum was shown to react specifically with S-SPV-074 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-074 observed plaques reacted with goat anti-HA serum indicating that the virus stably expressed the SIV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
S-SPV-074 is useful as a vaccine against SIV infection in pigs and is useful in the expression of SIV HA and NA. S-SPV-074 is useful as a vaccine in combination with S-SPV-063 expressing SIV NP.
S-SPV-069
S-SPV-069 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for the human respiratory syncytial virus (HRSV) fusion (F) protein were deleted from the SPV 728-94.4 ORF (773 base pair deletion of the SPV OLL ORF; nucleotides) 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter, and the HRSV F gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-069 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This is described in “Homologous Recombination Method for Creating Recombinant SPV”. Achieved using A1 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-069. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-069 was assayed for expression of SIV-specific antigens using “black plaque screening for foreign gene expression in recombinant SPV”. Monoclonal antibody 621 against HRSV F (Biodesign, Inc.) was shown to react specifically with S-SPV-069 plaques but not with S-SPV-001 negative control plaques. All S-SPV-069 observed plaques reacted with monoclonal antibody 621, indicating that the virus stably expressed the PRV foreign gene. The assay described here was performed on ESK-4 cells, indicating that ESK-4 cells would be a suitable basis for the production of SPV recombinant vaccines.
S-SPV-078
S-SPV-078 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for human respiratory syncytial virus (HRSV) adhesion (G) protein were inserted into the SPV 617-48.1 ORF (the only AccI restriction site is the only one) Replaced with NotI restriction site). The lacZ gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2), and the HRSV G gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-078 was derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This is based on the homology vector 822-52G.in “Homologous recombination method for creating recombinant SPV”. 7 (see Materials and Methods) and virus S-SPV-001. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was a recombinant virus designated S-SPV-078. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-069 and S-SPV-078 are useful individually or in combination as vaccines against human respiratory syncytial virus infection in pigs and are useful for the expression of HRSV F and G genes.
Homology vector 810-29. A2
Plasmid 810-29. A2 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. It incorporates an E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and a human respiratory syncytial virus (HRSV) fusion (F) gene with SPV DNA adjacent to it. Upstream of the foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA. Downstream of the foreign gene is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. When the plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding a foreign gene will be obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the
Homology vector 822-52G. 7).
Plasmid 822-52G. 7 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. It incorporates an E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and a human respiratory syncytial virus (HRSV) adhesion (G) gene with SPV DNA adjacent to it. Upstream of the foreign gene is an approximately 1484 base pair fragment of SPV DNA. Downstream of the foreign gene is an approximately 2149 base pair fragment of SPV DNA. When the plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding a foreign gene will be obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2) and the HRSV G gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). It was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources: The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII to BamHI restriction fragment of pSP65 (Promega).
Homology vector 807-41.3
Plasmid 807-41.3 was constructed for the purpose of inserting foreign DNA into SPV. It incorporates an E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and a swine influenza virus (SIV) nucleoprotein (NP) gene with SPV DNA adjacent to it. When the plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding a foreign gene will be obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the SIV NP gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP2EP2). The homology vector was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources with the appropriate synthetic DNA sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII to BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 807-84.8
Plasmid 807-84.8 was used to insert foreign DNA into SPV. It incorporates an E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and a swine influenza virus (SIV) hemagglutinin (HA) gene, with SPV DNA adjacent to it. When the plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating recombinant SPV”, a virus containing a DNA encoding a foreign gene is obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the late synthetic epilepsy promoter (LP1) and the SIV HA gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2). The homology vector was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources with the appropriate synthetic DNA sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII to BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 807-84.35
Plasmid 807-84.35 was used to insert foreign DNA into SPV. It incorporates an E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and a swine influenza virus (SIV) neuraminidase (NA) gene with SPV DNA adjacent to it. When this plasmid is used according to the “technique for creating a recombinant SPV”, a virus containing a DNA encoding a foreign gene is obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the SIV NA gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP2EP2). The homology vector was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources with the appropriate synthetic DNA sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII to BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 807-86, 35
Plasmid 807-86.35 was used to insert foreign DNA into SPV. It incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and the swine influenza virus (SIV) hemagglutinin (HA) gene and neuramiradase (NA) gene, adjacent to the side of the SPV DNA There is. When this plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding a foreign gene is obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the synthetic late heel promoter (LP1) and the SIV NA and HA genes are each under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). The homology vector was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources with the appropriate synthetic DNA sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII to BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Homology vector 817-14.2
Plasmid 817-14.2 was used to insert foreign DNA into SPV. It incorporates the E. coli β-glucuronidase (uidA) marker gene and the swine influenza virus (SIV) hemagglutinin (HA) and neuramiradase (NA) genes, adjacent to which SPV DNA is located. is there. When this plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding a foreign gene is obtained. Note that the β-glucuronidase (uidA) marker gene is under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2), and the SIV NA and HA genes are each under the control of the synthetic late / early heel promoter (LP2EP2). I want. The homology vector was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources to the appropriate synthetic DNA sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2972 base pair HindIII to BamHI restriction fragment of pSP64 (Promega).
PRRS homology vector containing single or multiple PRRS genes (ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6, or ORF7)
The PRRS homology vector was used to insert foreign DNA into SPV. It incorporates the E. coli β-galactosidase (lacZ) marker gene and the porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6, or ORF7 gene Adjacent is SPV DNA. Upstream of the foreign gene is an approximately 855 base pair fragment of SPV DNA. Downstream of the foreign gene is an approximately 1113 base pair fragment of SPV DNA. When this plasmid is used according to the “homologous recombination method for creating a recombinant SPV”, a virus containing DNA encoding a foreign gene is obtained. Note that the β-galactosidase (lacZ) marker gene is under the control of the swinepox virus OLL gene promoter and the PRRS gene is under the control of the late / early promoter (LP2EP2). The homology vector was constructed utilizing standard recombinant DNA techniques (22 and 30) by ligating restriction fragments from the following sources to the appropriate synthetic DNA sequences. The plasmid vector was derived from an approximately 2519 base pair HindIII to SphI restriction fragment of pSP64 (Promega).
Recombinant swinepox virus expressing pseudorabies gene
S-SPV-086 is a swinepox virus that expresses at least three foreign genes. The genes for E. coli β-galactosidase (lacZ) and pseudorabies virus (PRV) gD and gI were inserted into the SPV 617-68.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with a unique NotI restriction site). ). The lacZ gene is under the control of the synthetic late promoter (LP1) and the PRV gD and gI genes are under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-077 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus (PRV) gI were inserted into the SPV 617 48.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with a unique NotI restriction site). The lacZ gene is under the control of the late synthetic promoter (LP1) and the PRV gI gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-079 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for pseudorabies virus (PRV) gB were inserted into SPV 617 48.1 ORF (the unique AccI restriction site was replaced with a unique NotI restriction site). The lacZ gene is under the control of the late synthetic promoter (LP1) and the PRV gB gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-076, S-SPV-077, and S-SPV-079 were derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was accomplished using the homology vector and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods to Create Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was recombinant viruses designated S-SPV-076, S-SPV-077, and S-SPV-079. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-076, S-SPV-077, and S-SPV-079 were tested for PRV glycoprotein expression by "black plaque assay" and "Western blot".
S-SPV-076, S-SPV-077, and S-SPV-079 are useful as vaccines against PRV infection in pigs and are useful for the expression of PRV gD, gI or gB. S-SPV-071 is useful as a vaccine in combination with a recombinant swinepox virus expressing PRV gC, such as S-SPV-001, S-SPV-012, or S-SPV-013.
143B Osteosarcoma *
A431 Epidermoid cancer *
A549 Lung cancer *
Capan-1 liver cancer *
CF500 Foreskin fibroblast
Chang liver liver
Detroit down foreskin fibroblasts
HEL-198 Embryonic lung
HeLa cervical cancer *
Hep-2 epidermal pharyngeal cancer *
HISM Intestinal smooth muscle
HNK newborn kidney
MRC-5 embryonic lung
NCI-H292 Lung myxoid epidermoid cancer +
OVCAR-3 ovarian cancer *
RD Rhabdomyosarcoma +
THP monocytes (leukemia) *
WIL2-NS B lymphocyte system, non-secretory
WISH amniotic membrane
PBL peripheral blood lymphocytes
Example 38
Recombinant swinepox virus expressing the PRRS genes ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, and ORF6
S-SPV-080 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF2 were inserted into the SPV 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF) A deletion of 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter and the PRV ORF2 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-081 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF3 were inserted into the SPV 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF) A deletion of 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter, and the PRV ORF3 gene is under the control of the late synthetic / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-082 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF4 were inserted into the SPV 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF) A deletion of 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter, and the PRV ORF4 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-083 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF5 were inserted into the SPV 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF) A deletion of 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter, and the PRV ORF5 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-084 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF6 were inserted into the SPV 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF) A deletion of 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter, and the PRV ORF6 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-085 is a swinepox virus that expresses at least two foreign genes. The gene for E. coli β-galactosidase (lacZ) and the gene for porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRS) ORF7 were inserted into the SPV 738-94.4 ORF (773 base pair deletion of SPV OLL ORF) A deletion of 1669 to 2452, SEQ ID NO: 189). The lacZ gene is under the control of the swinepox POIL promoter and the PRV ORF7 gene is under the control of the synthetic late / early promoter (LP2EP2).
S-SPV-080, S-SPV-081, S-SPV-083, S-SPV-084 and S-SPV-085 were derived from S-SPV-001 (Kasza strain). This was achieved using the homologous vector material and method (PRRS homology vector) and virus S-SPV-001 in “Homologous Recombination Methods for Creating Recombinant SPV”. Transfection stocks were screened by “screening for recombinant SPV expressing β-galactosidase” (BLUOGAL and CPRG assays). The final result of red plaque purification was the recombinant viruses designated S-SPV-080, S-SPV-081, S-SPV-083, S-SPV-084 and S-SPV-085. The virus was assayed for β-galactosidase expression, purity, and insert stability by multiple passages monitored by the blue plaque assay described in Materials and Methods. After the first three rounds of purification, all observed plaques are blue, indicating that the virus is pure, stable and expresses foreign genes.
S-SPV-080, S-SPV-081, S-SPV-083, S-SPV-084 and S-SPV-085 are useful individually or in combination as vaccines against PRRS infections in pigs, and include PRRS ORF2, Useful for expression of ORF3, ORF4, ORF5, ORF6 and ORF7.
Example 39
The following experiments were performed to determine the ability of swinepox virus to infect human cells in culture and express foreign DNA such as lacZ.
S-SPV-003 was adsorbed at MOI = 0.1 to the human cell lines listed below for 2 to 3 hours. Cells were rinsed 3 times with PBS, growth medium was added and cells were incubated at 37 ° C. for 4 days. Cells were harvested and lysates were prepared in 200 microliters PBS by 3 freeze / thaw cycles. Cell contaminants were pelleted and 10 microliters of supernatant was assayed for galactosidase activity for 1/2 hour at 37 ° C. by ONPG assay. The table shows the relative levels of infection and cytotoxic effects of various human cell lines with S-SPV-003 and the results of lacZ expression.
The results show that various cell lines take S-SPV-003 and the ability to express lacZ changes. CPE was minimal in all cases and did not result in virus replication. One exception is A549 cells, which in one example does not show several rounds of cell cycle and detachment from the plate, another example is a 10-fold increase in titer during passage, This suggested limited viral replication. Some cell lines show significant lacZ activity with no cytotoxic effect.
Different spider promoters express lacZ from recombinant swinepox virus in a number of human cell lines. Six different swinepox viruses were constructed that expressed lacZ from the EP1, LP1, LP2, EP1LP2, LP2EP2, or SPV POILL promoter. Each virus was used to infect A549, Chang liver, or 143B cells at 0.1 moi and cells were rinsed after 2 and 3 hours and then incubated at 37 ° C. for 4 days. Each cell line maintained a different hierarchy of promoter activity, which was reproducible in the following experiments. For example, the EP1, LP2EP2, and POIL promoters gave the greatest expression in 143B cells, while LP2 was the most potent in Chang liver cells and EP1LP2 was the most potent in A549. In Chang liver and A549 cells, expression from the POIL promoter was poorest, whereas in 143B, expression from LP2 was poor. Thus, different human cell lines utilize the sputum promoter in different ways. This may reflect how far the swinepox virus can progress along the replication pathway in different cell lines.
These early and late promoters exhibited lower or higher lacZ activity depending on the human cell type infected by the recombinant swinepox virus. By selecting different promoters for different target tissues, the amount of foreign gene product delivered from swinepox virus to the target tissue can be controlled.
Recombinant swinepox virus is useful as a vaccine against human infectious diseases and for delivering therapeutic agents to humans. Recombinant swinepox virus is a therapeutic agent for cancer or genetic diseases as a vaccine against viral or bacterial infections in humans and to deliver immune modulatory molecules such as antibiotics, tumor antigens, cell surface ligands and receptors, cytokines Useful as.
Example 40
S-SPV-003 expression of lacZ in human cell lines
Measurement of cytotoxic effect and lacZ expression
Cell type Cytotoxic effect * lacZ expression **
A431 − −
Epidermoid cancer *
A549 ++ ++++
lung cancer*
Capan-1 − −
lung cancer*
CF500 + +
Foreskin fibroblasts
Chang liver + +++
Detroit +/--
Gown foreskin fibroblasts
HEL-199 +/- +++
Embryonic lung
HEp-2 − +
Epidermal pharyngeal cancer *
HISN + +
Intestinal smooth muscle
HNK-++
Newborn kidney
MRC-5 +/- +
Embryonic lung
NCI-H292-+++
Lung myxoid epidermoid cancer *
OVCAR-3-+++
Ovarian cancer *
RD − +
Rhabdomyosarcoma +
THP-+
Monocytes (leukemia) *
WIL2-NS-----
B lymphocyte system, non-secretory
WISH +/-
Amniotic membrane
HeLa − +++
PBL − −
Peripheral blood lymphocytes
* Cytotoxic effects are sometimes observed when human cells are infected with SPV. In most cell lines, this cytotoxic effect is indicated by a change in the appearance of the cells, the cells become thinner and more uneven along the edges; the cells appear to be tense. This phenomenon is evaluated as follows.
-Indicates no difference between infected and uninfected cells.
+/- indicates that the monolayer is visually different from that of the non-infected even though most cells appear normal.
+ Indicates that the monolayer is clearly affected and most cells appear to be tense. It should be noted that there was no evidence of SPV replication in certain cells (HeLa, CF500, 143B) that obtained titers after serial passage, with one exception.
A549 gave ++ for cytotoxic effects in one example when cells were rounded and detached from the plate during infection, but this observation was not repeated. A549 also shows evidence of a 10-fold increase in titer during passage in another example, indicating that it can support limited viral replication.
** A per cell lysate from 1/20 of a 35 mm dish260Β-galactosidase activity expressed in units
-No activity
+ 0.2-0.9A260unit
++ 0.9-1.6A260unit
+++ 1.6A260Greater than unit
(1) General information
(I) Applicant: Kochelan, Mark D.
Junker, David E.
(Ii) Title of invention: Recombinant swinepox virus
(Iii) Number of sequences: 231
(Iv) Communication destination:
(A) Addressee: John P. white
(B) Street: 1185 Avenue of the Americas
(C) City: New York
(D) State: New York
(E) Country: United States
(F) Zip code: 10036
(V) Computer readable form:
(A) Media type: floppy disk
(B) Computer: IBM / PC compatible
(C) Operating system: PC-DOS / MS-DOS
(D) Software: PatentIn Release # 1.0, Version # 1.25
(Vi) Current application data:
(A) Application number:
(B) Application date: January 19, 1996
(C) Classification:
(Viii) Atony / Agent information
(A) Name: White, John
(B) Registration number: 28,678
(Ix) Telegraph information:
(A) Telephone: (212) 278-0400
(B) Telefax: (212) 391-0525
(Information for sequence recognition number 1-deletion)
(2) Information for sequence recognition number 2:
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 132 amino acids
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(Xi) Sequence description:
(2) Information for sequence recognition number 4:
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(Vi) Origin:
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(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(Xi) Sequence description:
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 132 amino acids
(B) type: amino acid
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(Ii) Sequence type: peptide
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(Vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
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(Viii) Position in the genome
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
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(Xi) Sequence description:
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 101 amino acids
(B) Type: Amino acid
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(Ii) Sequence type: peptide
(Iii) Hypothetical: YES
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(Vi) Origin:
(A) Organism name: Vaccinia virus
(B) Stock name: Copenhagen
(Viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(Xi) Sequence description:
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 100 amino acids
(B) Type: Amino acid
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(Ii) Sequence type: peptide
(Iii) Hypothetical: YES
(Iv) Antisense: NO
(V) Fragment type: C-terminal
(Vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
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(Viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 8
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 120 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(Ii) Sequence type: DNA (genomic)
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(iv) Antisense
(vi) Origin:
(A) Organism name: Plasmid
(vii) Direct origin
(B) Clone: 520-17.5 (Junction A)
(x) Publication information
(A) Author: Ferrari, Franco A
Trash, Kathleen
Hook, James A
(B) Title: Sequence analysis of the sopB locus reveals a multicistronic transcription unit
(C) Publication: J.M. Bacteriol.
(D) Volume: 161
(E) Issue: 2
(F) Page: 556-562
(G) Date: February 1985
(Xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 102 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(A) Organism name: Plasmid
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/ Function = "Marker enzyme"
/ Product = "Beta Galactosidase"
/ Evidence = experimental
/ Gene = "lacZ"
/ Number = 2
/ Cited document = ([1])
(x) Publication information
(A) Author: Ferrari, Franco A
Trash, Kathleen
Hook, James A
(B) Title: Sequence analysis of the sopB locus reveals a multicistronic transcription unit
(C) Publication: J.M. Bacteriol.
(D) Volume: 161
(E) Issue: 2
(F) Page: 556-562
(G) Date: February 1985
(Xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 5 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 1 amino acid
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 103 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Circular
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: Plasmid
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 520-17.5 (Junction C)
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
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(C) Method of determining the characteristics: by experiment
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/ Codon start = 1
/ Function = "Marker enzyme"
/ Product = "Beta Galactosidase"
/ Evidence = experimental
/ Gene = "lacZ"
/ Number = 1
/ Cited document = ([1])
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
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(C) Method of determining the characteristics: by experiment
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/ Function = "Translation of hybrid protein finished"
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/ Evidence = experimental
/ Gene = "lacZ"
/ Number = 2
/ Standard name: Translation of synthetic DNA sequence
(x) Publication information
(A) Author: Ferrari, Franco A
Trash, Kathleen
Hook. James A
(B) Title: Sequence analysis of the sopB locus reveals a multicistronic transcription unit
(C) Publication: J.M. Bacteriol.
(D) Volume: 161
(E) Issue: 2
(F) Page: 556-562
(G) Date: February 1985
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 13
(I) Sequence characteristics:
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(B) Type: Amino acid
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(I) Sequence characteristics:
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(B) Type: Amino acid
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(A) Organism name: Plasmid
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(B) Clone: 520-17.5 (Junction D)
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 16
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 57 base pairs
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: Plasmid
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 538-46.26 (Junction A)
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 17
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 102 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
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(vi) Origin:
(A) Organism name: Plasmid
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 538-46.16 (Junction B)
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
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(C) Method of determining the characteristics: by experiment
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/ Gene = "lacZ"
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/ Cited document = ([1])
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(C) Method of determining the characteristics: by experiment
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/ Function = “Translation of hybrid protein started”
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/ Number = 2
/ Standard name: “Translation of synthetic DNA sequence”
(x) Publication information
(A) Author: Ferrari, Franco A
Trash, Kathleen
Hook, James A
(B) Title: Sequence analysis of the sopB locus reveals a multicistronic transcription unit
(C) Publication: J.M. Bacteriol.
(D) Volume: 161
(E) Issue: 2
(F) Page: 556-562
(G) Date: February 1985
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 18
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 5 amino acids
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(I) Sequence characteristics:
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
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(A) Plasmid
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(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
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/ Evidence = experimental
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/ Number = 3
/ Cited document = ([2])
(x) Publication information
(A) Author: Ferrari, Franco A
Trash, Kathleen
Hook, James A
(B) Title: Sequence analysis of the sopB locus reveals a multicistronic transcription unit
(C) Publication: J.M. Bacteriol.
(D) Volume: 161
(E) Issue: 2
(F) Page: 556-562
(G) Date: February 1985
(X) Publication information
(A) Authors: Petrovsky, Eric A / Timmins, James G / Alman Trout, Marty A / Maliciori, Carmine C Junior Yancey, Robert J / Post, Leonardo E
(B) Title: DNA sequence of the gene of pseudorabies virus gp50, glycoprotein without N-linked glycosylation
(C) Publication: J.M. Virol.
(D) Volume: 59
(E) Issue: 2
(F) Pages: 216-223
(G) Date: August 1986
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 21
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 21 amino acids
(B) Type: Amino acid
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(I) Column characteristics:
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(B) Type: Amino acid
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(i) Sequence characteristics:
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(i) Sequence characteristics:
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(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 101 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(vi) Origin:
(A) Organism name: Plasmid
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(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
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(D) Other information: / partial
/ Codon start = 1
/ Function = "Glycoprotein"
/ Product = “PRV gp63”
/ Gene = "gp63"
/ Number = 1
/ Cited document = ([1])
(x) Publication information
(A) Author: Petrovsky, Eric A
Timmins, James G
Post, Leonard E
(B) Title: Use of lambda-gtll to isolate the genes for two pseudorabies virus glycoproteins with homology to herpes simplex and varicella-zoster virus glycoproteins
(C) Publication: J.M. Virol.
(D) Volume: 60
(E) No. 1
(F) Pages: 185-193
(G) Date: October 1986
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 26
(i) Column characteristics:
(A) Length: 5 amino acids
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(i) Sequence characteristics:
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(A) Organism name: Plasmid
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(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 28
(2) Information for sequence recognition number 30:
(i) Sequence characteristics:
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(2) Information for sequence recognition number 33:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 2 amino acids
(B) Type: Amino acid
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(2) Information for sequence recognition number 35:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 5 amino acids
(B) Type: Amino acid
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(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 8 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
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(xi) Sequence description: Sequence recognition number 36
(2) Information for sequence recognition number 38:
(i) Sequence characteristics:
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(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 2 amino acids
(B) Type: Amino acid
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(2) Information for sequence recognition number 41:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 27 base pairs
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(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(vi) Origin:
(A) Name of organism: pseudorabies virus
Synthetic oligonucleotide primers
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 41
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 19 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(vi) Origin:
(A) Name of organism: pseudorabies virus
Synthetic oligonucleotide primers
(xi) Sequence description: sequence recognition number 42
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 70 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 43
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 74 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 44
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 37 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 45
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 41 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 46
(2) Information for sequence recognition number 61:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 61
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 104 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Body / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 81. . 12304
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 62
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 8 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 63
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 182 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1. . 63
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 156. . 182
(xi) Sequence description:
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 20 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description:
(2) Information for sequence recognition number 76:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 76
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 77
(i) Array sequence characteristics:
(A) Length: 117 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 94. . 117
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 78
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 8 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 79
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 126 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 103. . 126
(xi) Sequence description:
(2) Information for sequence recognition number 91:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1. . 63
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 91
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 20 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 92
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 93
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 94
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 124 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(i) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 104. . 124
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 95
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 7 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 96
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 126 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1. . 36
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 103. . 126
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 97
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 11 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 98
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 8 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 99
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1. . 63
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 20 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: sequence recognition number 101
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: sequence recognition number 102
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 103
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 20 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Row type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 104
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 26 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 105
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 20 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 106
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 19 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 26 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 108
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 109
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 42 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 42 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: sequence recognition number 112
(2) Information for sequence recognition number 114:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 389 amino acids
(B) Type: Amino acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 114
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 677 amino acids
(B) Type: Amino acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(vii) Direct origin:
(B) Clone: 515-85.1
(viii) Location in the genome:
(B) Location on chromosome: ~ 23.2
(C) Unit:% G
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 115
(2) Information for sequence recognition number 134:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 42 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: Bovine viral diarrhea virus
(B) Stock name: Singer Strain
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 134
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 40 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: Bovine viral diarrhea virus
(B) Stock name: Singer Strain
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 135
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 33 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: Bovine viral diarrhea virus
(B) Stock name: Singer Strain
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 136
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 31 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: Bovine viral diarrhea virus
(B) Stock name: Singer Strain
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 137
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 37 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Name of organism: bovine respiratory syncytial virus
(B) Stock name: Strain 375
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 138
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 35 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Name of organism: bovine respiratory syncytial virus
(B) Stock name: Strain 375
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 139
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 40 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Name of organism: bovine respiratory syncytial virus
(B) Stock name: Strain 375
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 41 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Name of organism: bovine respiratory syncytial virus
(B) Stock name: Strain 375
(xi) Description of sequence:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 41 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Name of organism: bovine respiratory syncytial virus
(B) Stock name: Strain 375
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 142
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 41 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
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(vi) Origin:
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(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 144
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 128 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(B) Type: Nucleic acid
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(C) Number of strands: double strand
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(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
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(iii) Hypothetical: NO
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(A) Length: 51 base pairs
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
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(I) Sequence characteristics:
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(iii) Hypothetical: NO
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(xi) Description of sequence: Sequence recognition number 163
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
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(iii) Hypothetical: NO
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(xi) Description of sequence: Sequence recognition number 164
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 61 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
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(xi) Sequence description: Sequence recognition number 165
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 45 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 166
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 105 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
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(xi) Sequence description: Sequence recognition number 167
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 31 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 168
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(Genomic)
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 169
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
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(xi) Sequence description:
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 193 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 171
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 123 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 172
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
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(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 174
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 175
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 133 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 176
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 99 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 177
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
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(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 179
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 180
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 140 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(Xi) Sequence description: Sequence recognition number 181
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 123 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Description of sequence: Sequence recognition number 182
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 183
(I) Sequence characteristics:
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 184
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 39 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 185
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 41 base pairs
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(C) Number of strands: double strand
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(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 186
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 41 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
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(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 187
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 39 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 188
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 3942 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1. . 369
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 370. . 597
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 598. . 1539
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1675. . 3708
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: complementary strand (3748 ... 3942)
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 122 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: peptide
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 190
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 75 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: protein
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 191
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 313 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: protein
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 192
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 677 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: protein
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 193
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 64 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: protein
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 194
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 583 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(vi) Origin:
(A) Organism name: swinepox virus
(B) Stock name: Kasza
(C) Solid / isolated clone name: S-SPV-001
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 2. . 583
(xi) Sequence description:
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 194 amino acids
(B) Type: Amino acid
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: protein
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 196
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 197
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 138 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 198
(I) Sequence characteristics:
(A) Length: 120 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 199
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 200
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 201
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 202
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 141 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 203
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 120 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 204
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 116 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 205
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 51 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 206
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 45 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 207
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 57 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 208
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 249 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Description of sequence: Sequence recognition number 209
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 45 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 210
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 33 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: sequence recognition number 211
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 36 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: sequence recognition number 212
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 35 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 213
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 32 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 214
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 34 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 215
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 32 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 216
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 32 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 217
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 34 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 218
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 32 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 219
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 32 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of strands: double strand
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: NO
(iv) Antisense: NO
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 220
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 5785 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 221
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 722 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 222
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 234 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 223
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 1205 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 224
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 305 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 225
(i) Sequence characteristics:
(A) Length: 1721 base pairs
(B) Type: Nucleic acid
(C) Number of chains: single chain
(D) Topology: Linear
(ii) Sequence type: DNA (genomic)
(iii) Hypothetical: N
(iv) Antisense: N
(ix) Sequence features:
(A) Name / symbol: CDS
(B) Location: 1. . 1721
(D) Other information:
(xi) Sequence description: Sequence recognition number 226
(i) Sequence characteristics:
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