JP4346819B2 - 大腸菌における外来遺伝子の調節された高効率発現 - Google Patents
大腸菌における外来遺伝子の調節された高効率発現 Download PDFInfo
- Publication number
- JP4346819B2 JP4346819B2 JP2000529443A JP2000529443A JP4346819B2 JP 4346819 B2 JP4346819 B2 JP 4346819B2 JP 2000529443 A JP2000529443 A JP 2000529443A JP 2000529443 A JP2000529443 A JP 2000529443A JP 4346819 B2 JP4346819 B2 JP 4346819B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- promoter
- expression
- heterologous gene
- repressor
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 338
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 title claims abstract description 30
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 title claims description 170
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 title abstract description 54
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 76
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims abstract description 41
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims abstract description 11
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 75
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 claims description 62
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 claims description 56
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 claims description 56
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 claims description 56
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 claims description 56
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 claims description 56
- 102100021181 Golgi phosphoprotein 3 Human genes 0.000 claims description 55
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 54
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 44
- 230000031864 metaphase Effects 0.000 claims description 42
- 101150052329 motA gene Proteins 0.000 claims description 39
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 38
- 241001239379 Calophysus macropterus Species 0.000 claims description 35
- 101100217230 Enterobacteria phage T4 asiA gene Proteins 0.000 claims description 32
- 238000010367 cloning Methods 0.000 claims description 30
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 28
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 28
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims description 16
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims description 14
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 14
- 241000709744 Enterobacterio phage MS2 Species 0.000 claims description 13
- 101150071045 asiA gene Proteins 0.000 claims description 10
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 8
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 7
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 20
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 abstract description 17
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 abstract description 17
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 abstract description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 abstract description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 abstract description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 abstract description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 abstract description 2
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 abstract 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 abstract 1
- 101000832767 Homo sapiens Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 8 Proteins 0.000 description 98
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 76
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 64
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 63
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 58
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 56
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 50
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 42
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 33
- 239000000047 product Substances 0.000 description 26
- 108090000715 Brain-derived neurotrophic factor Proteins 0.000 description 25
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 25
- 102000004219 Brain-derived neurotrophic factor Human genes 0.000 description 24
- 229940077737 brain-derived neurotrophic factor Drugs 0.000 description 24
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 24
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 23
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 20
- 101710137500 T7 RNA polymerase Proteins 0.000 description 18
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 18
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 17
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 17
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 17
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 15
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 15
- 102100029268 Neurotrophin-3 Human genes 0.000 description 13
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 13
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 12
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 11
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 10
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 10
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 10
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 10
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 9
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 9
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 9
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 9
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 9
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 9
- 229940122055 Serine protease inhibitor Drugs 0.000 description 8
- 101710102218 Serine protease inhibitor Proteins 0.000 description 8
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 8
- 239000003001 serine protease inhibitor Substances 0.000 description 8
- 102000016267 Leptin Human genes 0.000 description 7
- 108010092277 Leptin Proteins 0.000 description 7
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 7
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 7
- NRYBAZVQPHGZNS-ZSOCWYAHSA-N leptin Chemical compound O=C([C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CCSC)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O NRYBAZVQPHGZNS-ZSOCWYAHSA-N 0.000 description 7
- 229940039781 leptin Drugs 0.000 description 7
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150039504 6 gene Proteins 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 6
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 6
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 6
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 6
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 6
- 101150057066 nahG gene Proteins 0.000 description 6
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 6
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 6
- 102100039619 Granulocyte colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 5
- 101000746367 Homo sapiens Granulocyte colony-stimulating factor Proteins 0.000 description 5
- 230000008859 change Effects 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 4
- 101000709520 Chlamydia trachomatis serovar L2 (strain 434/Bu / ATCC VR-902B) Atypical response regulator protein ChxR Proteins 0.000 description 4
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 4
- 241000701832 Enterobacteria phage T3 Species 0.000 description 4
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 description 4
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 4
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 4
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 4
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 4
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 4
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 4
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 4
- 230000000754 repressing effect Effects 0.000 description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- 101150118377 tet gene Proteins 0.000 description 4
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 4
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 4
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 4
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 4
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 4
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 4
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 3
- 241001522878 Escherichia coli B Species 0.000 description 3
- 101000701698 Escherichia phage P2 Spike protein Proteins 0.000 description 3
- 241000701533 Escherichia virus T4 Species 0.000 description 3
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 3
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 3
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 3
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 3
- 108090000951 RNA polymerase sigma 70 Proteins 0.000 description 3
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 3
- 102100036407 Thioredoxin Human genes 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000013461 design Methods 0.000 description 3
- 235000013861 fat-free Nutrition 0.000 description 3
- 101150030470 hepC gene Proteins 0.000 description 3
- 108010026228 mRNA guanylyltransferase Proteins 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 3
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 3
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 3
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 3
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 3
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 3
- 108060008226 thioredoxin Proteins 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- AXAVXPMQTGXXJZ-UHFFFAOYSA-N 2-aminoacetic acid;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol Chemical compound NCC(O)=O.OCC(N)(CO)CO AXAVXPMQTGXXJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 2
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710112514 Host translation inhibitor 5b Proteins 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 241000220317 Rosa Species 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 2
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 2
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 2
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 2
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150038678 0.7 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150084750 1 gene Proteins 0.000 description 1
- -1 19 43-54 (1982) Proteins 0.000 description 1
- 101150033839 4 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- 108050007599 Anti-sigma factor Proteins 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 101150035467 BDNF gene Proteins 0.000 description 1
- 108020000946 Bacterial DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 101000579252 Enterobacteria phage T4 Translation repressor protein Proteins 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- 101000636168 Grapevine leafroll-associated virus 3 (isolate United States/NY1) Movement protein p5 Proteins 0.000 description 1
- 101150043052 Hamp gene Proteins 0.000 description 1
- 101000920927 Meleagrid herpesvirus 1 (strain H2) Envelope protein UL45 homolog Proteins 0.000 description 1
- 102000005431 Molecular Chaperones Human genes 0.000 description 1
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 101150048735 POL3 gene Proteins 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000143014 T7virus Species 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- DPKHZNPWBDQZCN-UHFFFAOYSA-N acridine orange free base Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC2=NC3=CC(N(C)C)=CC=C3C=C21 DPKHZNPWBDQZCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000003466 anti-cipated effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001651 autotrophic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N benzoquinolinylidene Natural products C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000941 bile Anatomy 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000005059 dormancy Effects 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 230000001516 effect on protein Effects 0.000 description 1
- 108010030074 endodeoxyribonuclease MluI Proteins 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 1
- 230000000508 neurotrophic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 229920002704 polyhistidine Polymers 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011533 pre-incubation Methods 0.000 description 1
- 230000002028 premature Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013636 protein dimer Substances 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000037425 regulation of transcription Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000012146 running buffer Substances 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 229940094937 thioredoxin Drugs 0.000 description 1
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
- C07K14/4756—Neuregulins, i.e. p185erbB2 ligands, glial growth factor, heregulin, ARIA, neu differentiation factor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/53—Colony-stimulating factor [CSF]
- C07K14/535—Granulocyte CSF; Granulocyte-macrophage CSF
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2795/00—Bacteriophages
- C12N2795/00011—Details
- C12N2795/18011—Details ssRNA Bacteriophages positive-sense
- C12N2795/18111—Leviviridae
- C12N2795/18122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Virology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
発明の分野
本発明は、大腸菌(E.coli)や他の宿主細胞において、毒性遺伝子を含む外来遺伝子を発現することができる新しい改良された発現ベクターシステムに関する。さらに具体的には、本発明は、宿主細胞において、クローニングされた遺伝子のmRNAの翻訳を調節するために、バクテリオファージMS2コートタンパク質(MS2CP)とMS2認識部位とを利用する効率がよく厳密に調節された発現ベクターシステムに関する。さらに、本発明は、転写を制御する転写調節タンパク質、例えばバクテリオファージT4のmotAおよびasiAを利用する発現ベクターシステムに関し、以前に記載された非計画性システムよりも複雑ではなく、かつ用途の広い計画された誘導性プロモーターシステムを提供する。
【0002】
発明の背景
前核細胞は真核生物および前核生物のポリペプチドをコードするクローニングされた遺伝子の発現のための最良のシステムとなってきており、多くの発現システムが細菌における遺伝子産物の発現のために存在する。大腸菌における遺伝子の発現は分子プロセスの理解に手がかりとなる主要技術として確立されてきており、大腸菌発現システムは外因性タンパク質の生産と大規模な精製の標準的で一般的な方法となってきている。重要なことに、この技術は、以前では天然源からの単離によっては困難または不可能であった量および品質でタンパク質源を提供するようになった。
【0003】
微生物宿主に用いられる多くの特許化された発現システムが記述されている。一部の例では、記載された発現システムは一般の発現システムに関する一方で、他の例では、特許化された発現システムは比較的厳密な調節を可能とするように設計されるか、または特定のタンパク質の発現に個々に仕立てられている。そのような特許の例としては米国特許第4,767,708号(正に調節された外来プロモーターの調節下にあるクローニングされた細菌DNAポリメラーゼIを有する組換えベクターの構築);米国特許第4,503,142号(大腸菌のlacプロモーター/オペレーターの使用に基づくクローニングベクターと発現ベクターなどの種類のベクターの構築);および米国特許第4,578,355(高レベルの発現ベクターを構築するためにバクテリオファージラムダのPLプロモーターの利用)が挙げられる。
【0004】
pETベクター発現システムと称されるもう一つの広く用いられている発現システムは、目的の遺伝子を転写するための強力なT7 RNAポリメラーゼを利用している(Studier et al., J. Mol. Biol., 189:113−130(1986))。T7 RNAポリメラーゼはそれ自体のプロモーターに対して高い選択性があり、T7プロモーターは大腸菌のDNAには存在しないことが知られている。T7はその高度に選択的なポリメラーゼを用いて、転写を、感染中の宿主DNAではなくそれ自体のDNAに向けさせ、T7遺伝子1のクローニングされたコピーから提供される比較的少量のT7 RNAポリメラーゼが、多コピープラスミド中のT7プロモーターからの高レベルの転写を指示するのに十分である。さらに、T7 RNAポリメラーゼは大腸菌ポリメラーゼよりも少なくとも5倍以上活性がある(同上)。多くの異種タンパク質が、pETシステムを用いて高収率でうまく発現された(例えば、Dietrich et al., Eur. J. Biochem, 201:399−407(1991); Lathrop et al., Protein Expr. Purif., 3:512−517(1992); Aukhil et al., J. Biol. Chem., 268:2542−2553(1993)を参照されたい)。
【0005】
残念なことに、これらの報告や他の報告された発現系は、1)プロモーターのリークから生じる非誘導発現; 2)(さらに典型的には細菌での真核生物の遺伝子の発現に伴って)遺伝子産物が発現されたときに宿主細胞を殺すか、または激しく損傷させるとき、必要な程度まで発現を調節することができないこと; 3)発現の誘導のために、宿主の生化学的応答、またはコストが高くつくか、さもなければ不十分な誘導機構に依存しなければならないこと; 4)十分なレベルで目的の遺伝子を発現を発現できないこと; および5)プラスミドの不安定性などの問題に多かれ少なかれ悩まされている。そのような問題に十分に取り組んでうまく克服されるまでは、そのような発現システムの十分な潜在能力は完全には評価されず、利用されないだろう。
【0006】
すべての知られた誘導プロモーターシステムは、そのプロモーターの調節下にクローニングされている遺伝子の不適切な転写および発現を導く残留レベルの活性、すなわち「リーク」を有する。ほとんどの場合において、細胞は作られつつある遺伝子産物に対する耐性があり、すなわち、遺伝子産物は毒性がないために、これは問題とならない。しかし、作られつつある遺伝子産物に毒性があるか、または細胞に対して致死的である場合、これらの少量の発現でさえ有害となりうる。実際、どのクローニングベクターにおいても不安定であるために、「クローニングできない」ものとして特長付けられてきたある種の毒性遺伝子が存在する。
【0007】
Studier F. W.(J. Mol. Biol., 219:37−44(1991))は、Lysシリーズのベクターを開発することによりpETベクターのリーク発現の問題に取り組んだ。これらのベクターは、非誘導細胞に存在するT7 RNAポリメラーゼに結合し、標的遺伝子を転写するのを妨ぐT7リゾチームの遺伝子を有する。DubendorffとStudier(J. Mol. Biol., 219:45−59(1991))は、pETプラスミド中においてlacオペロン調節要素の追加のコピーを供与することによりこの問題に取り組んだ。Brownら(Gene, 127:99−103(1993))は変異T7ファージによる感染による誘導を用いて毒性POL3遺伝子をクローニングすることができた。残念なことに、これらのシステムや他の報告されたシステムはリークの問題を完全に軽減できず、またプラスミドの不安定性や高レベルのリゾチームおよび/またはファージ感染に伴う細胞溶解に問題がある。
【0008】
本発明はバクテリオファージMS2コートタンパク質の翻訳抑制能力を利用することによりプロモーターのリークの問題に取り組み、この問題を解決するものである。バクテリオファージMS2はかなり単純なライフサイクルを有するRNA含有ファージである(Van Duin, J.、「バクテリオファージにおける一本鎖RNAバクテリオファージ」(“Single−Stranded RNA Bacteriophages in The Bacteriophages”)、第4章、117〜167ページ、プレナムプレス、ニューヨーク(1988))。そのRNAは4つの遺伝子をコードし、そのうちの一つはゲノムをコピーするリプリカーゼ遺伝子であり、そのうちの別のものは多機能コートタンパク質遺伝子である。コートタンパク質の濃度が細胞内で増加するにしたがって、該タンパク質は二量体を形成して、リプリカーゼ遺伝子のリボソーム結合部位とATGとからなるヘアピン構造に結合する。次に、この結合はリプリカーゼ遺伝子からのその後の翻訳を抑制し、そのライフサイクルをゲノムのパッケージングに効果的にシフトさせる。
【0009】
MS2コートタンパク質の配列は発表されており(Fiers et al., Nature, 260:500−507(1976))、コートタンパク質の変異体が単離され、特性付けられており(Peabody & Ely, Nucleic Acids Research, 20(7):1649−1655(1992))、そしてコートタンパク質の翻訳リプレッサー活性の遺伝子的分析のために2プラスミドシステムの構築が記載されている(Peabody, D., Journ. of Biol. Chem. 265(10):5684−5689(1990))。
【0010】
バクテリオファージMS2は、メッセンジャーRNAに結合して翻訳を抑制するタンパク質を有することが知られている唯一のファージではない。例えば、バクテリオファージT4のRegAタンパク質およびM13の遺伝子Vタンパク質はそのような2種類の他のタンパク質である。しかし、RegAタンパク質、遺伝子Vタンパク質、およびMS2コートタンパク質間の主要な違いは遺伝子の開始部位に対するそれらの認識部位の置換に関する。例えば、RegAタンパク質の認識部位は該遺伝子のコード領域にある配列からなるので、それによって調節されうる遺伝子を制限する。遺伝子Vタンパク質はリボソーム結合配列の上流にある配列を認識するので、低いレベルの翻訳開始が依然あり得る。MS2に関しては、結合部位は遺伝子のコード領域をカバーしてはいないが、リボソーム結合配列と開始コドンを有する。よって、MS2システムは最も厳密な抑制を可能としながらも、該部位をなおも普遍的に用いられることを可能とする。
【0011】
MS2CPとMS2認識部位の具体的な使用を、ここで提供される実施例でさらに詳細に説明する。これらの実施例に示されるように、MS2システムのこの特有の使用によって、当業者は細菌における異種遺伝子の発現に通常伴うプロモーターリークの問題を効果的に解決することができる。誘導点以前の産物のリークは通常望ましくないから、商業的な生産の視点からこれが特に有用である。加えて、毒性遺伝子を効果的に発現する能力に関連しているので、これは当分野の研究者らにとっては非常に大きな価値を有する。なぜなら、これらの遺伝子の一部は限定された量で発現される場合に有益な用途があるからである。
【0012】
細菌発現システムの設計のもう一つの重要な局面は転写の調節である。多くの生物にとって、遺伝子発現のタイミングは特定の転写調節タンパク質の生産により調節されることが知られている。これが多くの異なるバクテリオファージについて特に当てはまり、それらのライフサイクルを通しての進展は、それらの発達の段階に対応する全種類の遺伝子の発現をもたらす異なった転写タンパク質の出現により調節される。例えば、バクテリオファージT4はそのライフサイクルをこのようにして進展することが古くから知られており、その実際の機構は最近になって解明された(Brody et al., FEBS Micro. Letters, 128:1−8(1995))。この溶菌ファージは、初期、中期および後期の3種類の遺伝子を有する。初期遺伝子プロモーターは強力な大腸菌プロモーターに非常に類似しており、感染直後に宿主RNAポリメラーゼにより認識される。二つの初期遺伝子産物のmotAとasiAの蓄積は転写を中期態様にシフトさせる。
【0013】
motAタンパク質は、プロモーターの〜30領域の配列を認識することによりRNAポリメラーゼをT4中期プロモーターに導く23.5kDaのタンパク質である。asiAタンパク質は、大腸菌のシグマ70に結合してそれを非機能的とする抗シグマ因子タンパク質であると元々は考えられた10.5kDaのタンパク質である。しかし、現在は、asiAのシグマ70への結合は、実際には、大腸菌プロモーターの〜35領域の認識を止めさせる高次構造の変化を引き起こし、asiAタンパク質はmotAタンパク質とシグマ70サブユニットとの橋渡しとして作用すると考えられている。さらに、asiAタンパク質はT4初期プロモーターの認識も抑制する。motAとasiAはT4中期プロモーターからの転写を特定するのには必要かつ十分である。これらの詳細は精製されたmotAとasiAおよび未修飾の大腸菌RNAポリメラーゼを用いるインビトロ転写アッセイにより決定された(Ouhammouch et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92:1451−1455(1995))。
【0014】
本発明は前核宿主細胞にクローニングされた遺伝子の転写を調節するT4中期プロモーターの新規で新しい使用を提供する。本プロモーターシステムの主要な利点は、このシステムが大腸菌プロモーターからの転写を抑制しながら、特定のプロモーターからの転写を指令することにあり、このようにして翻訳装置に対する競合を最小化し、かつプロテアーゼ遺伝子の転写を誘導することにより細胞が標的タンパク質の生産に応答するのを抑制する。ここに記載のT4中期プロモーターシステムを用いることにより、単一シグナルにより誘導可能な「段階化」発現サイクルにおいて標的タンパク質の誘導前にある種の付属タンパク質を発現することもできるので、そのような発現を達成するために通常は多誘導を必要とする最近の発現方法の複雑な性質を低減させている。T4中期プロモーターシステムの詳細はここで提供する実施例に記載する。
【0015】
本発明は、翻訳を厳密に調節するMS2システムの利用と、転写を調節するT4中期プロモーターの利用により、大腸菌および他の宿主細胞において、毒性遺伝子を含む外来遺伝子を発現することができる効率のよい厳密に調節された発現ベクターシステムを提供する。ここに記載されたシステムは、他の公知のシステムに伴う問題に取り組んだことに加えて、前に記載されたシステムよりもさらに普遍性のある段階化プロモーターシステムを初めて提供する。これらのシステムは細菌発現システム設計の領域の研究者らには非常に大きな価値があろう。
【0016】
発明の要約
本発明は、構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーを含む、宿主細胞における異種遺伝子のクローニングまたは発現に用いられる翻訳抑制システムを提供する。好ましい実施態様において、該翻訳リプレッサーはバクテリオファージMS2コートタンパク質である。
【0017】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための改良された方法を提供する。この方法は、プラスミドベクターにより形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該ベクターは、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位に連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列、および構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節する。好ましい実施態様において、翻訳リプレッサーはMSコートタンパク質である。一実施態様において、該ベクターは、バクテリオファージT7の0.3〜0.7初期遺伝子をコードするDNA配列(配列番号2)をさらに有する。
【0018】
さらに、本発明は、誘導プロモーターをコードするDNA配列と翻訳リプレッサー認識部位に連結された異種遺伝子を含む第一のプラスミドベクターおよび構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を含む第二のプラスミドベクターにより共形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節する、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための改良された方法を提供する。好ましい実施態様において、翻訳リプレッサーはMS2コートタンパク質である。
【0019】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための改良された方法であって、誘導プロモーターをコードするDNA配列および翻訳リプレッサー認識部位に連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列を含むプラスミドベクターにより形質転換され、構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を有する宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節する、該方法を提供する。好ましい実施態様において、翻訳リプレッサーはMS2コートタンパク質である。
【0020】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現ののための改良された方法であって、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位に連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列、および構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を有する宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節する、方法を提供する。好ましい実施態様において、翻訳リプレッサーはMSコートタンパク質である。
【0021】
さらに、本発明は、誘導プロモーターをコードするDNA配列、T7遺伝子1に連結されたMS2認識部位、および弱い構成プロモーターの調節下のMS2コートタンパク質遺伝子を含む「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」を提供する。
【0022】
さらに、本発明は、異種遺伝子を発現することができ、「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」を有する宿主細胞を提供する。
【0023】
さらに、本発明は、異種遺伝子の発現のための改良された方法であって、該異種遺伝子をT7プロモーターの調節下にコードするDNA配列を有する発現ベクターで形質転換され、「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」を有する宿主細胞を適切な条件下で培養することを含む該方法を提供する。
【0024】
さらに、本発明は、異なる濃度のMS2CPを作るように設計された異種遺伝子のクローニングまたは発現が可能な一連の宿主細胞を提供する。
【0025】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための段階化された誘導プロモーターシステムであって、細菌宿主プロモーターからの一般的な転写を抑制しながら、特定のプロモーターからの直接の転写を指令する制御転写調節タンパク質を有する該システムを提供する。好ましい実施態様において、転写調節タンパク質はmotAおよびasiAであり、該タンパク質はMS2CPにより制御されている。
【0026】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための改良された方法であって、T4中期プロモーターの調節下の該異種遺伝子をコードするDNA配列を含む第一のプラスミドベクター、および誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位にそれぞれ連結されたmotAとasiA遺伝子の配列、および構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーを含む第二のプラスミドベクターにより共形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該翻訳リプレッサーは該motAとasiA遺伝子の発現を調節し、かつ該motAとasiA遺伝子は該誘導プロモーターからの転写を抑制しながらT4中期プロモータからの直接の転写を指示する、該方法を提供する。好ましい実施態様において、翻訳リプレッサーはMS2コートタンパク質である。一実施態様において、第二プラスミドベクターがさらに付属タンパク質をコードするDNA配列を有する。
【0027】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための改良された方法であって、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位にそれぞれ連結されたmotAとasiA遺伝子配列、および構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーを有する宿主細胞であって、該翻訳リプレッサーは該motAとasiA遺伝子の発現を調節し、該motAとasiA遺伝子は誘導プロモーターからの転写を抑制しながらT4中期プロモータからの直接の転写を指示する、T4中期プロモーターの調節下の連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列からなるプラスミドベクターにより形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含む該方法を提供する。好ましい実施態様において、翻訳リプレッサーはMS2コートタンパク質である。
【0028】
さらに、本発明は、誘導プロモーターをコードするDNA配列、MS2認識配列にそれぞれ連結されたmotAおよびasiA遺伝子配列、および構成プロモーターの調節下のMS2コートタンパク質遺伝子を含む「MS−2に基づくT4カセット」を提供する。
【0029】
さらに、本発明は、異種遺伝子を発現することが可能で、「MS2に基づくT4カセット」を有する前核宿主細胞を提供する。
【0030】
さらに、本発明は、異種遺伝子のクローニングまたは発現のための改良された方法であって、T4プロモーターの調節下に該異種遺伝子をコードするDNA配列を有する発現ベクターにより形質転換され、「MS−2に基づくT4カセット」を有する宿主細胞を適切な条件下に培養することを含む、該方法を提供する。
【0031】
さらに、本発明は、配列番号1のDNA配列および配列番号2のDNA配列を提供する。
【0032】
図面の簡単な説明
図1は、本発明のシステムに用いられる野生型MS2コートタンパク質の完全遺伝子配列(配列番号1)である。該遺伝子は5’末端にNdeI部位を有し、3’末端にBamHI部位を有する。
【0033】
図2は、wtMS2CP発現実験の結果を示すSDSゲルの写真である。レーン1は0.6のODまで増殖させたBL21(DE3)宿主細胞(pT7−7中にwtMS2CP遺伝子を有する)からの非誘導の推定陽性クローンであり; レーン2〜14は37℃での4時間の誘導後にBL21(DE3)宿主細胞(pT7−7中にwtMS2CP遺伝子を有する)からの多様な推定陽性クローンである。レーン15は低範囲のAmershamレインボーマーカーである。
【0034】
図3は、本発明で開発されたpRINプラスミドベクターの模式図である。
【0035】
図4は、T7遺伝子1がクローニングされた種々のpRINプラスミドベクターを用いて実施された発現およびリーク実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。この特別なブロットは一晩の静置培養物のものであり、レーンの各セットは、同一ベクター中において下流ボックスをプラスまたはマイナス(m)したT7遺伝子1である。レーンの最初の3セットは、多様なMS2CPを有するpRIN11(PS4プロモーター)を用いている。レーンの最後の3セットは、多様なMS2CPを有するpRIN20(UV5 lacプロモーター)を用いている。レーン4は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0036】
図5は、T7遺伝子1がクローニングされた種々のpRINプラスミドベクターを用いて実施された発現およびリーク実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。この特定のブロットは指数増殖期の前誘導培養物(preI)のものであり、レーンの各セットは、同一ベクター中において下流ボックスをプラスまたはマイナス(m)したT7遺伝子1である。レーンの最初の3セットは多様なMS2CPを有するpRIN11(PS4プロモーター)を用いている。レーンの最後の3セットは多様なMS2CPを有するpRIN20(UV5 lacプロモーター)を用いている。レーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0037】
図6は、T7遺伝子1がクローニングされた種々のpRINプラスミドベクターを用いて実施された発現およびリーク実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。この特定のブロットは28℃で増殖させたIPTG誘導培養物のものであり、レーンの各セットは、同一ベクター中において下流ボックスをプラスまたはマイナス(m)した遺伝子1である。レーンの最初の3セットは多様なMS2CPを有するpRIN11(PS4プロモーター)を用いている。レーンの最後の3セットは多様なMS2CPを有するpRIN20(UV5 lacプロモーター)を用いている。レーン2は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0038】
図7は、「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」の模式図である。
【0039】
図8は、市販のBL21(DE3)株(レーン3〜5)、第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)株(レーン1〜2)、EE11−20株(レーン6〜8)、および第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20株(レーン9〜10)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの写真である。比較は標的産物遺伝子としてNT−3の発現に基づいた。レーン1、5、6および10は一晩(ON)培養物を表し、レーン4と7は前誘導(PreI)培養物を表し、そしてレーン2、3、8および9は、(28℃でIPTGを用いる)誘導(I−28)培養物を表す。
【0040】
図9は、市販のBL21(DE3)株(レーン3〜5)、第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)株(レーン1〜2)、EE11−20株(レーン6〜8)、および第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20株(レーン9〜10)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの写真である。比較は標的産物遺伝子としてBDNFの発現に基づいた。レーン1、5、6および10は一晩(ON)培養物を表し、レーン4と7は前誘導(PreI)培養物を表し、そしてレーン2、3、8および9は、(28℃でIPTGを用いる)誘導(I−28)培養物を表す。
【0041】
図10は、市販のBL21(DE3)株(レーン3〜5)、第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)株(レーン1〜2)、EE11−20株(レーン6〜8)、および第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20株(レーン9〜10)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの写真である。比較は標的産物遺伝子としてBDNFの発現に基づいた。レーン1、5、6および10は一晩(ON)培養物を表し、レーン4と7は前誘導(PreI)培養物を表し、そしてレーン2、3、8および9は、(28℃でIPTGを用いる)誘導(I−28)培養物を表す。
【0042】
図11は市販のBL21(DE3)株(レーン5〜7)とEE11−11M株(レーン2〜4)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの図である。これらの比較は標的産物遺伝子としてBDNFの発現に基づいた。レーン4と5は一晩(ON)培養物を表し、レーン3と7は前誘導(preI)培養物を表し、そしてレーン2と6は(28℃でIPTGを用いる)誘導(I−28)培養物を表す。レーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0043】
図12は標的産物遺伝子としてNT−3の発現を用いたEE11−11M株のリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン5は一晩(ON)培養物を表し、レーン4は前誘導(preI)培養物を表し、そしてレーン2と3は28℃でIPTG(I−28)または37℃でIPTG(I−37)を用いた培養物をそれぞれ表す。レーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0044】
図13は株EE11−11MでのpAMG25においてGCSFの10リットル発酵誘導の時間経過を示すSDSゲルの写真である。レーン1は誘導時の培養物である。レーン2は誘導時の培養物である。レーン3〜9は誘発物質(IPTG)の存在下でさらなる増殖時間後の培養物であり、例えばレーン3は1時間後、レーン4は2時間後、等々である。レーン10は、Amershamの低分子量レインボーマーカーである。最後のレーンはGCSFマーカーである。
【0045】
図14は、株EE11−11MでのpAMG25においてレプチンの10リットル発酵誘導の時間経過を示すSDSゲルの写真である。レーン1はAmershamの低分子量レインボーマーカーである。レーン2は誘導時の培養物である。レーン3〜8は誘発物質(IPTG)の存在下でさらなる増殖時間後の培養物であり、例えばレーン3は1時間後、レーン4は2時間後、等々である。レーン9はレプチンマーカーである。
【0046】
図15は、T7の0.4初期遺伝子がクローニングされたMS2に基づくシステムを用いて実施された発現実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。レーン2、4、6および8は42℃での4時間の誘導後の4種類の異なる0.4を有する培養物を表し、レーン3、5、7および9は同一培養物の非誘導試料である。レーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0047】
図16は、T7の0.6初期遺伝子がクローニングされたMS2に基づくシステムを用いて実施された発現実験の結果を示すSDSゲルの写真である。レーン2と4は2種類の異なる0.6を有する培養物を表し、レーン3と5は42℃での4時間の誘導後の同一試料である。レーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0048】
図17は、T7の初期遺伝子(0.3〜0.7)を有するように構築された3−7tオペロンの完全な遺伝子配列(配列番号2)である。
【0049】
図18は、T7初期タンパク質の非存在および存在下でのNDFアルファ/ベータの発現を比較するSDSゲルの写真である。3−7tオペロンはpRIN 10中に存在し、28℃から37℃への温度変化により誘導された。NDFアルファ/ベータはプラスミドpAMG33中に存在し、温度が28℃に戻るときにIPTGの添加により誘導される。ゲルの左半分はT7初期遺伝子の非存在下でのNDFアルファ/ベータの時間経過である。レーン1は初期タンパク質の誘導後であるが、NDFアルファ/ベータの誘導前である。レーン2〜4は誘発物質(IPTG)の存在下でさらなる増殖時間後の培養物で、例えばレーン2は1時間後、レーン3は2時間後、等々である。レーン5はAmershamの低分子量レインボーマーカーである。ゲルの右半分はT7初期タンパク質の存在下でのNDFアルファ/ベータ発現の時間経過である。レーン6は初期タンパク質の誘導後であるが、NDFアルファ/ベータの誘導前である。レーン7〜9は誘発物質(IPTG)の存在下でのさらなる増殖時間後の培養物である。
【0050】
図19は、T7初期タンパク質の存在下および非存在下におけるヒトテロメラーゼサブユニットTP2(301〜941 TP2)の末端切除物の発現を比較するゲルのウエスタンブロットの写真である。3−7tオペロンはpRIN10中に存在し、28℃から37℃への温度変化により誘導された。301−941 TP2はプラスミドpAMG22中に存在し、温度を28℃に戻すときにIPTGの添加により誘導される。レーン1はT7初期タンパク質の存在下における301−941 TP2の前誘導試料である。レーン2はT7初期タンパク質の存在下における28℃での2時間の誘導後の301−941 TP2の発現である。レーン3はT7初期タンパク質の存在下における37℃での2時間の誘導後の301−941 TP2の発現である。レーン4はT7初期タンパク質の非存在下における301−941 TP2の前誘導試料である。レーン5はT7初期タンパク質の非存在下における37℃での2時間の誘導後の301−941 TP2の発現である。
【0051】
図20は、株GM315、GM320、GM340およびGM350による種々の量のMS2コートタンパク質の受動的な生産を示すゲルのウエスタンブロットの写真である。これらの株を、それらが作られた元の親株に対して比較した。レーン1はGM315の対数期培養物を示す。レーン2、4、6、8および10は親株393である。レーン3と5はGM320であり、レーン7はGM340であり、レーン9はGM350である。
【0052】
図21は、種々の量のMS2コートタンパク質を有する株においてC型肝炎ポリメラーゼ(HepCpol)の発現を示すゲルの写真である(各発現実験の可溶性および不溶性フラクションも比較する)。レーン1は分子量マーカーである。レーン2は、MS2コートタンパク質を有さない株GM221で発現されたpAMG21におけるHepCpolの誘導培養物の全細胞抽出物である。レーン3はこの実験からの不溶性フラクションであり、レーン4は可溶性フラクションである。レーン5は、MS2コートタンパク質を有する株GM315で発現されたpAMG21におけるHepCpolの誘導培養物の全細胞抽出物である。レーン6はこの実験からの不溶性フラクションであり、レーン7は可溶性フラクションである。レーン8はGM315よりもさらに多くのMS2コートタンパク質を有する株320で発現されたpAMG21におけるHepCの誘導培養物の全細胞抽出物である。レーン9はこの実験からの不溶性フラクションであり、レーン10は可溶性フラクションである。
【0053】
図22は、本発明のシステムに用いられるT4 PuvsX中期プロモーターの完全DNA配列(配列番号3)である。該遺伝子は5’末端にAatII部位を有し、3’末端にClaI部位を有する。
【0054】
図23は、本発明のシステムに用いられるT4 PX中期プロモーターの完全DNA配列(配列番号4)である。該遺伝子は5’末端にAatII部位を有し、3’末端にClaI部位を有する。
【0055】
図24は、(ラムダプロモーターの調節下にある)標的産物遺伝子としてのT7遺伝子1の発現を用いたpAMG13のリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン5は28℃で一晩増殖させた静置試料を表し、レーン4は42℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン3は37℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0056】
図25は、T7遺伝子1がT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMG13のリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン4は28℃で一晩増殖させた静置試料を表し、レーン3は42℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は37℃で4時間誘導させた試料を表し、そしてレーン1は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表す。
【0057】
図26は、(uvsX T4中期プロモーターの調節下にある)T7遺伝子1がT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン4は28℃で一晩増殖させた静置試料を表し、レーン3は42℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は37℃で4時間誘導させた試料を表し、そしてレーン1は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表す。
【0058】
図27は、T7遺伝子1がT4オペロンpRIN11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン5は28℃で一晩増殖させた静置試料を表し、レーン4は37℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン3は28℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0059】
図28は、(uvsX T4中期プロモーターの調節下にある)NT−3がT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン4は42℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン3は37℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0060】
図29は、(uvsX T4中期プロモーターの調節下にある)BDNFがT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン5は42℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン4は37℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン3は28℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0061】
図30は本発明で開発されたpCBプラスミドベクターの模式図である。
【0062】
図31は本発明で開発されたpAWプラスミドベクターの模式図である。
【0063】
図32は、(T4 X中期プロモーターの調節下にある)T7遺伝子1がpAW20と共発現させられたpAMGXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン4は28℃で一晩誘導させた静置試料を表し、レーン3は28℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0064】
図33は、(T4 X中期プロモーターの調節下にある)SPIがpAW20と共発現させられたpAMGXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン3は28℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0065】
図34は、(T4 uvsX中期プロモーターの調節下にある)OPGがpAW20と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン4は28℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0066】
図35は、(T4 uvsX中期プロモーターの調節下にある)BDNFがpAW11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン1は非誘導試料を表し、レーン2は28℃で4時間誘導させた試料を表し、そしてレーン3は37℃で4時間誘導させた試料を表す。
【0067】
図36は、(T4 uvsX中期プロモーターの調節下にある)OPGがpAW11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン1はAmershamの低分子量レインボーマーカーであり、レーン2は非誘導試料を表し、レーン3は28℃で4時間誘導させた試料を表し、そしてレーン4は37℃で4時間誘導させた試料を表す。
【0068】
図37は、(T4 uvsX中期プロモーターの調節下にある)NT3がpAW11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン1は非誘導試料を表し、レーン2は28℃で4時間誘導させた試料を表し、そしてレーン3は37℃で4時間誘導させた試料を表す。
【0069】
図38は、(T4 X中期プロモーターの調節下にある)3MNDFがpAW11と共発現させられたpAMGXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン1は非誘導試料を表し、レーン2は28℃で4時間誘導させた試料を表し、そしてレーン3は37℃で4時間誘導させた試料を表す。
【0070】
図39は、(T4 uvsX中期プロモーターの調節下にある)BDNFが、0.6遺伝子をさらに付属タンパク質として有するT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。レーン5は42℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン4は37℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン3は28℃で4時間誘導させた試料を表し、レーン2は0.6のODになるまで28℃で増殖させた非誘導試料を表し、そしてレーン1は低範囲のバイオラッド分子量マーカーである。
【0071】
発明の詳細な説明
本発明の目的のために、「翻訳リプレッサー」はRNA片上の認識部位に特異的に結合して翻訳を抑制することのできるタンパク質と定義される。本発明において、MS2コートタンパク質およびMS2認識部位は翻訳リプレッサーシステムを提供するために用いられる。簡単に説明すれば、MS2CPの発表された配列を用いて、完全な遺伝子を構築するためのオリゴヌクレオチドを作った。次に、MS2CPが、大腸菌内で細胞増殖に対し明らかな効果を有しなく非常に高いレベルで受入れられることを決定した後、種々のコピー数のプラスミド中の弱い構成プロモーターの調節下にMS2CPを置く。この発想は低いレベルのMS2CPを連続的に作ることにあり、MS2認識部位を有するクローニングされた遺伝子は、それらの遺伝子を発現するのが有用になるまで完全な休止状態で維持できる。
【0072】
このアプローチを用いて、このMS2に基づくシステムが、例えばT7 RNAポリメラーゼ遺伝子を伴う厳密に調節された改良されたシステムを提供するために用いることができることが示された。クローニングされたT7遺伝子1はT7プロモーターの調節下に標的遺伝子の選択的な高レベルの発現を指令するT7 RNAポリメラーゼ源を提供する。しかし、重要なことは、T7 RNAポリメラーゼは非常に活性があり、選択性があるので、活性のあるT7 RNAポリメラーゼの基本レベルを調節すること、すなわちT7遺伝子1を非誘導状態で停止させ、標的遺伝子の早すぎる発現を妨げる。
【0073】
このように、本発明で利用される手法は、コード配列に連結させたMS2認識部位を有するT7遺伝子1のクローニング、および、弱い構成プロモーターの調節下にあるMSコートタンパク質のコピーとともに、この構築物の染色体への挿入を伴った。これらの2遺伝子はそれぞれのプロモーターが反対の方向に向けられるように末端同士を合わせてクローニングした。これにより、この「MS2で調節されたT7遺伝子1」構築物の染色体コピーを有する宿主細胞は、T7 RNAポリメラーゼを効果的に生産するようになり、それにより標的遺伝子の発現を誘発するために用いることができることが示された。
【0074】
本発明のシステムにおいて首尾よく試験された標的遺伝子としては、T7遺伝子1、神経栄養因子−3(NT−3)、脳由来神経栄養因子(BDNF)、セリンプロテアーゼインヒビター(SPI)およびオステオプロテグリン(OPG)、神経分化因子(NDF)アルファ/ベータ、C型肝炎ポリメラーゼ、ヒトテロメラーゼおよびそれらの類似体、誘導体および変種が含まれる。種々のMS2により調節されたシステムが、前核宿主細胞中において、クローニングされた遺伝子の、毒性のあるなしにかかわらず、向上した調節を提供できると考えられる。
【0075】
このMS2に基づくシステムは、ある種の毒性遺伝子を安定にクローン化し、発現するために用いることができることがさらに示された。ここで用いられる毒性遺伝子とは、宿主細胞におけるその発現によって、毒性遺伝子の発現がない場合に培養中の宿主細胞が達成したであろう正常な対数増殖を妨げる遺伝子である。本発明での例として、バクテリオファージT7の初期遺伝子を、motAとasiAとして、クローニングし、発現した。バクテリオファージT7の初期遺伝子のいくつかは毒性があることが知られている(Studier and Rosenberg, J. Mol. Biol., 153:503−525(1981))。特に、0.7遺伝子は大腸菌RNAポリメラーゼを抑制する機能をコードしていて致死的である。motAとasiAも毒性があることが現在知られている(Hinton et al., Methods in Enzymol.,274:43−57(1996)。そのような遺伝子を発現する能力は、これらの遺伝子のいくつかがファージ感染による大腸菌での異種遺伝子の発現に対して正の効果を有することが示されたので顕著な価値を有する。言い換えれば、標的遺伝子の発現直前に発現用細胞に存在するこれら遺伝子のクローニングされたコピーを持つのが有用な場合がある。
【0076】
ここに提供される実施例において、T7遺伝子1はUV5 lacプロモーター(Fuller, F., Gene, 19:43−54(1982)、PS4プロモーター(1995年10月12発行のWO95/267246(Bartleyら)およびluxプロモーター(1993年3月23日発行の米国特許第5,196,318号(Baldwinら))の調節下にあった。しかし、重要なことは、T7遺伝子1は、trpまたはlpp等の細菌プロモーターを含めた誘導プロモーター、ラムダPLまたはPR等のファージプロモーター、またはtacまたはtrc等の合成プロモーターの調節下に置くことができたことである。
【0077】
本発明のシステムに効果的なものとしてここに開発、記載されるのはMS2CPの変異体である。例えば、29位のバリン残基のコドンがイソロイシンのコドンに変わったMS2CPの変異体が構築された。この変異は、コートタンパク質の二量体がキャプシドサイズの凝集体へ会合する能力をもたらす(Peabody, D. S. and Ely, R., Nuc. Acid Res., 20(7):1649−1655(1992))。コートタンパク質は二量体としてそのmRNA標的に結合し、二量体の多量化がmRNAとの会合を抑制すると考えられているので、この変異はさらに多くのコートタンパク質を多量体よりも二量体の状態で保持することにより、実際のタンパク質濃度を高めることなく、存在する翻訳リプレッサーの効果的な濃度を増加させると期待されよう。MS2CPの他の変異体が本発明のシステムに効果的であることは、当業者らは理解するであろう。
【0078】
ここに提供される実施例は、具体的にはバクテリオファージMS2システムを利用するが、他の類似のシステム、例えば、Qβ、GA、SP、R17、f2およびfrが翻訳リプレッサーシステムとして同様に用いることができるとは予想できないことではなかろう。
【0079】
本発明で使用され評価された宿主細胞としては大腸菌B株BL21(DE3)±pLysSおよび大腸菌K株EE1120±pLysSが含まれる。他の通常用いられる大腸菌B株およびK株は本発明の実施に効果的であることが当業者らにより明確に理解されよう。多様な真核宿主細胞は本発明の実施に利用できることも理解されよう。
【0080】
強い転写ターミネーターももちろん本発明のシステムに用いられる。そのようなターミネーターを興味のあるプロモーター(例えば、T7遺伝子1の発現を指令するプロモーター)の上流に挿入することにより、隠れたプロモーター配列からのリードスルー転写が行なわれないので、さらに厳密に調節されたシステムが提供される。T1T2ターミネーター(Amman et al., Gene, 25:167−178(1983))が本発明の実施例で用いられたが、他の強力なターミネーター、例えば本発明のシステムで効果的に働くことが明らかに期待されるtHPがある(Nohno et al., Mol. Gen. Genet., 205:260−269(1986))。
【0081】
T7 RNAポリメラーゼが本発明の実施例で用いられたが、T7様ファージに由来する同等のRNAポリメラーゼも機能するであろう。そのようなファージが当分野において詳細に記載されている(例えば、Hausmann, R.、「バクテリオファージにおけるT7グループ」(“The T7 Group in The Bacteriophages”)、第8章、259−283ページ、プレナムプレス、ニューヨーク(1988)を参照されたい)。
【0082】
さらに、本発明において、誘導プロモーターの調節下のmotAおよびasiA遺伝子からなる特別に構築されたオペロンを用いたクローン化T4中期プロモーターのインビボ活性化のためのシステムの構築が述べられる。このプロモーターシステムの主要な利点は、大腸菌プロモーターからの転写を抑制しながら特定のプロモーターの転写を指令することにあり、こうして翻訳装置に対する競合を最小化し、かつプロテアーゼ遺伝子の転写を誘導することにより細胞が標的タンパク質の生産に応答するのを抑制する。該システムが、なかでも、標的タンパク質の生産に役立つある種の付属タンパク質の発現に有用でありうる「計画」発現サイクルを提供することも示された。
【0083】
さらに具体的には、この発想は、付属タンパク質がmotAとasiAプロモーターと同じように誘導されるプロモーター下にクローニングできることであり、またはそれらがすべて単一のオペロン構造の同一プロモーターの調節下に置くことができることにあった。その誘導シグナルが与えられるとき、これらの付属タンパク質およびmotAとasiAが同時に作られるであろう。motAとasiAが飽和レベル(存在するRNAポリメラーゼ分子数と等しいかまたはそれより若干高い)に達したときに、大腸菌プロモーターからの転写が抑制され、発現サイクルの当該段階を終わらせる。次に、RNAポリメラーゼは標的タンパク質の発現を導くT4中期プロモーターのみに向けられよう。大腸菌においてこれを行いうる利用可能なシステムは現在のところ存在しない。
【0084】
そのような付属タンパク質をこのように発現する能力は前核生物システムでタンパク質の発現を向上させるのに大きな利点を持ちうる。例えば、Yasukawaら(The Journ. of Biol. Chem.,270(432):25328−25331(1995))は、大腸菌チオレドキシン(Trx)または大腸菌シャペロン類GroESLの共生産が、大腸菌で作られる多様な脊椎動物タンパク質の溶解性を高めた(Trxが最も効果的であった)ことを報告した。これが重要で、有用な発見であるのは、真核生物のタンパク質がしばしば不溶性の会合体として大腸菌で作られ、これが巨大分子構造物の研究に対する障壁の一つであるためである。
【0085】
本発明において、motAとasiA遺伝子はラムダPLプロモーター下にクローニングされ、またlac由来のプロモーター下にもクローニングされた。しかし、重要なことは、trp、またはlppを含む細菌プロモーター、ラムダPLまたはPR等のファージプロモーター、またはtacまたはtrc等の合成プロモーターを含めた誘導プロモーターが機能しうることある。
【0086】
T4中期プロモーターが「リーク」しやすいことがわかり、さらに重要なことに毒性遺伝子のmotAとasiAは注意深く調節する必要があるために、MS2システムとT4中期プロモーターシステムの特徴が組み合わされた。motA/asiAオペロンは、それらの両遺伝子がMS2認識部位に連結させないかぎりクローニングできないことがわかった。よって、宿主細胞染色体に挿入される最適な「MS2−に基づくT4カセット」は、MS2コートタンパク質の認識配列に連結させたmotAおよびasiA遺伝子配列(±付属タンパク質配列)を持つmotA−asiA誘導プロモーター、および弱い構成プロモーターに機能的に連結させたMS2コートタンパク質を含有する。
【0087】
このシステムを利用すれば、低いレベルのMS2CPの生産によって、motA/asiAの生産(および望むなら付属タンパク質の生産)を引き起こして大腸菌転写を止めた後に、T4中期プロモーターにより引き起こされる標的遺伝子の生産の誘導が起こるまでT4中期プロモーターのリークとmotA/asiAの生産が妨げられる。
【0088】
さらに、ここで開発され記載されるのは、異なる濃度のMS2CPを産生するように設計された一連の大腸菌株である。これらの株は、それらの染色体DNAの特定の部位に組み込まれた修飾TETプロモーター配列の調節下にMSコートタンパク質を有している。TETプロモーター配列は、〜10および〜35領域の塩基を変更して、強力な大腸菌プロモーターのこれらの領域の共通配列と配列を相同化することにより修飾した。さらに、それらTETプロモーター配列はリボソーム結合部位の配列をランダム化させるオリゴヌクレオチドを用いて変更した。これらの変更はウエスタン分析により測定されたように、さらに高いレベルのMS2コートタンパク質を作る多くの形態の同定を可能とした。
【0089】
本発明の種々のMS−2含有株を利用して、慣用の技術ではクローニングできない毒性遺伝子や他の遺伝子をクローニングすることができる。例えば、毒性遺伝子を用いた研究の場合、最初の連結の達成は、毒性に最も影響を受ける工程であるために、クローニング法において最も困難な工程であることがわかっている。しかし、安定なクローンがいったん単離されたならば、次にそれを他の細胞系を無事に形質転換することができる。GM350を用いて、毒性または「クローニングできない」遺伝子をMS2認識部位に連結し、次にその連結物を用いてGM350を形質転換することができよう。GM350は最大生産量のMS2コートタンパク質を有するために(実際、非常に多くのMS2CPが作られるので誘導の際に発現が効果的に失われる)、GM350を用いて安定なクローンを同定し、得ることができる。いったん安定なクローンが得られ、その配列が決定されたならば、その組み換えプラスミドを用いて、少ない量のコートタンパク質を作る他のMS2株を形質転換することができる。各株におけるクローンの安定性が測定でき、該タンパク質が最終的にそのような一つの株で発現する。最初のクローンを得た後に毒性が持続する場合、低いレベルのMS2CP生産菌、例えば、GM315やGM320がこれらの構築物を安定化するのに有用であろう。
【0090】
下記の実施例は本発明をさらに十分に説明するために提供されるものであるが、その範囲を限定するものとして理解されるべきではない。実施例1は野生型MS2コート(wtMS2CP)タンパク質遺伝子の構築を説明し、次に大腸菌でのその発現能およびそのような発現が細胞増殖に対してもつ効果についてのwtMS2CPの試験結果を提供する。実施例2はMS2コートタンパク質遺伝子の2種類の変異体の構築を説明する。実施例3は翻訳抑制システムの開発に用いられるwtMS2CPまたはMS2CP変異体を有するpRINプラスミドベクターの構築を説明する。実施例4はT7遺伝子1のpRINプラスミドベクターへのクローニング、およびそれに続く該ベクターの発現およびシステムのリークに関する試験を説明する。実施例5は「MS2で調節されるT7遺伝子1カセット」の宿主細胞染色体への染色体挿入を説明し、次に多様な標的遺伝子を発現する宿主株の利用を示し、ならびに新しく開発された株のリークと発現特性が市販のT7 RNAポリメラーゼを有する株と比較される試験結果を提供する。実施例6は新しく開発された株の高密度の大規模発酵を説明する。実施例7は多様なT7初期遺伝子をクローニングするためのMS2システムの利用を説明する。実施例8は異種タンパク質生産を増強する際のT7初期遺伝子の試験を説明する。実施例9は、異なる濃度のMS2CPを作るように設計された株を作るために、多様な変更TETプロモーターの調節下にあるMS2コートタンパク質遺伝子の染色体挿入、および毒性遺伝子をクローニングする能力についてこれら株の試験結果を説明する。実施例10は、pAMGuvxsプラスミド、pAMGXプラスミド、および多コピープラスミドを用いるT4中期プロモーター系システムを開発するために用いられるオペロンpRINシステムの構築を説明する。実施例11は、実施例10で調製、記載されたpAMGuvxsプラスミド、pAMGXプラスミドおよびT4オペロンpRINシステムの試験を説明する。実施例12は、MS2システムを有する単一コピープラスミドへのmotA/asiAオペロンのクローニングを説明する。実施例13は実施例12で調製、説明された単一コピープラスミドの試験を説明する。実施例14は付属タンパク質を効率的に発現することにより標的タンパク質の発現を増強するMS2/T4に基づくシステムの利用を説明する。
【0091】
材料と方法
下記の実施例において、下記の細菌プラスミド/発現ベクターを利用する: pAMG13、pAMG21、pAMG22、pAMG25、pAMG33、および3002 nahG(それぞれが本出願に関連して既に寄託されたか、または寄託されている); pT7−7(Tabor and Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82:1074−1078(1985)); pACYC184(Chang et al., J. Bacteriol., 134:1141−1156(1978); Rose, Nucleic Acid Res., 16:355(1988a)); pKK223−3(Amman et al., Gene,25:167−178(1983)); pGP1−2(Tabor and Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82:1074−1078(1985));およびpSC101(Bernardi and Bernardi, Nuc. Acids Res., 12:9415−9426)。
【0092】
下記の実施例において、特に示されない場合は以下に提供される方法が用いられた。
【0093】
1.連結
すべての連結を40μlの最終容積で行った。約50ng〜500ngの各ベクターを用い、500ng〜2μlの各挿入物が用いられた。T4 DNAリガーゼを1ユニットの活性で加え、反応物を16℃で一晩インキュベートする。次に、反応物を2.5Mまでの酢酸アンモニウムの添加により沈殿させ、2.5容量のエタノールを加えた。次に、反応混合物を−80℃で少なくとも1時間インキュベートし、次に15,000rpm(4℃)で30分間遠心した。得られたペレットを当初の40μlに再懸濁し、4μlのアリコートを電気泳動に用いた。
【0094】
2.オリゴヌクレオチドのキナーゼ反応とアニーリング
オリゴヌクレオチドを水に20pmol/μlの濃度で再懸濁した。各オリゴヌクレオチドの12.5μlのアリコートをキナーゼ反応に用いた。これに2μlのATPを加え、2μlの連結緩衝液と2.5μlの水を加える。この反応を1μlのPNKの添加により開始し、37℃で1時間インキュベートする。次に、試料を15分間65℃に加熱する。次に、相補対を混合し、1分間100℃まで加熱し、室温まで冷却し、次に氷上に置く。この時点で、アニールされたオリゴヌクレオチドは連結する準備ができている。特に長い配列のために、全領域にまたがり、3末端に6〜12個の相補塩基を有する二種類のオリゴヌクレオチドが注文されよう。これらは100μlのPCR反応物中で鋳型とプライマー(1pmol/μlの最終濃度)の両者として用いられ、ゲル精製後の連結前に制限消化されよう。
【0095】
3.PCR反応
幾つかの標準的なプログラムをPCR操作のためにいつものように用いた。遺伝子またはオペロン断片を増幅する場合、その反応容量は100μlであった。10pmol/μlの各プライマーの10μlのアリコートを各反応物に添加して、鋳型を50ng〜250ng加える。反応を25サイクルで行う。最初の工程は94℃で30秒間であり、次に50℃で2分間であり、その後は72℃で3分間である。増幅された断片はSeaKem GTG(FMC)アガロースゲルでゲル精製した。該DNAをQiaex II(Qiagen社)を用いてアガロースから回収した。
【0096】
陽性クローンを同定するためのコロニーのスクリーニング反応は20μl容量で実施する。オリゴヌクレオチドは0.25pmol/μlの最終濃度で存在する。コロニーをピペットの先を用いて採取し、反応混合物に溶解する。1μlのアリコートを取って、これを適当な抗生物質を有するLBの5mlチューブに接種する。PCR反応は30サイクル行う。最初の工程は94℃で30秒間であり、その後は30秒間の37℃でのアニ−リングおよび30秒間の72℃での伸長である。大きな挿入物(>1000塩基)に関しては、伸長時間は1分間に延長する。次に、反応物をアガロースゲル(0.8〜1.0%)にかけ、陽性物をスタンダードに対する移動とベクター模擬反応により同定する。
【0097】
実施例1
本実施例は、野生型MS2コートタンパク質遺伝子(wtMS2CP)の構築を記載し、次に大腸菌での発現能およびその発現が宿主細胞の増殖に与える効果についてwtMS2CPの試験結果を提供する。
【0098】
MS2コートタンパク質の発表されたタンパク質の配列(Peabody, D., EMBO J., 12(2):595−600(1993))を用いて、大腸菌の好ましい利用コドンを用いる遺伝子を設計した。オリゴヌクレオチド909〜34および909〜53(表1を参照)を設計し、これらを用いて遺伝子を構築した。その全遺伝子配列を図1に示す。これらオリゴヌクレオチドは遺伝子の5’末端にNdeI部位および3’末端にBamHI部位を包含するように設計した。次に、この遺伝子をBamHIとNdeIの制限酵素で消化し、プラスミドpT7−7にクローニングした(Tabor and Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82:1074−1078(1985))。いったん陽性クローンが同定され、その配列が確認されたら、この遺伝子を、同し制限部位を用いて、プラスミド3002 nahGにサブクローニングした。
【0099】
市販のBL21(DE3)株(ウイスコンシン州、マディソン、ノバゲン社)を、wtMS2CPの大腸菌における発現能力を調べるために用いた。BL21(DE3)は、UV5 lacプロモーターの調節下にあるT7 RNAポリメラーゼ遺伝子の染色体コピーを有する大腸菌B株である。pT7−7にwtMS2CP遺伝子を有するBL21(DE3)のコロニーをプレートから取り、50mlのFalconチューブ中の5mlのLB−ampのアリコートに接種した。この調製物を一晩28℃で振盪しながら増殖させた。この一晩培養物を、15mlのチューブに1:100希釈(5mlに対して5μl)にて新しい培地に接種した。これらを0.6の適切なODになるまで振盪しながら28℃で増殖させた。
【0100】
wtMS2CP遺伝子の発現はIPTGを0.4mMまで加えることにより誘導した。インキュベーションは37℃で4時間振盪しながら続けた。1mlの試料を取り、細胞を遠心によりペレット化した。それらペレットを0.01 OD単位/μlの破砕緩衝液に再懸濁し、試料を5分間沸騰させた。各試料の6μlのアリコートを4〜20%SDSポリアクリルアミドゲル(Novex)で泳動した。ゲルをクマシーブルーで染色してタンパク質を可視化した。ゲルの写真(図2)で示されているように、レーン8、10、11および12はwtMS2CPの生産を示す。これらの生産培養物は、pT7−7中に機能的MS2CP遺伝子を有しないものよりも高い光学密度に達し、宿主細胞の成長に対して明らかな影響なしにMS2CPが効果的に発現できることを示した。
【0101】
実施例2
本実施例はMS2コートタンパク質遺伝子の二種類の変異体遺伝子の構築を記載する。
【0102】
29位のバリン残基のコドンがイソロイシンのコドンに変化したMS2コートタンパク質遺伝子の変異体タンパク質を、オリゴヌクレオチド1456〜55とオリゴヌクレオチド1456〜56(表1を参照)を用いたオーバーラップPCRにより構築した。以下、この特定の変異体をMS2CP−11と称する。
【0103】
101位のシステイン残基のコドンがアルギニンのコドンに変化したMS2コートタンパク質遺伝子の変異体タンパク質を、オリゴヌクレオチド1456〜61とオリゴヌクレオチド1456〜62(表1を参照)を用いたオーバーラップPCRにより構築した。以下、この特定の変異体をMS2CP−14と称する。
【0104】
実施例3
本実施例は翻訳抑制システムの開発に用いられるwtMS2CPまたはMS2CP変異体を有するpRINプラスミドベクターの構築を記載する。これらのpRINベクターは、プラスミドpACYC184に基づく多コピーベクター(15コピー)である(Chang et al., J. Bacteriol., 134:1141−1156(1978); Rose, Nucleic Acid Res., 16:355(1988a))。
【0105】
pACYC184プラスミドを制限酵素XbaIとHindIIIで消化した。オリゴヌクレオチド940〜29とオリゴヌクレオチド940〜30(表1を参照)をこれらの部位に連結するように設計し、後の利用のために新しい特有の部位を導入した。具体的には、アニールされたオリゴヌクレオチドを切断されたpACYC184ベクターにクローニングすることで、XbaIとHindIII部位を消して、唯一のPstIとSacI部位ならびに第二のSphI部位を導入した。次に、このプラスミドを制限酵素EagIで消化し、オリゴヌクレオチド941〜43および941〜44(表1を参照)を、EagI部位を壊して唯一のAatII制限部位が導入されたベクターにクローニングした。
【0106】
nahGプロモーターに連結させた野生型MS2コートタンパク質遺伝子を有する1036〜99断片(表1を参照)を、実施例1に記載の3002nahGクローンから、SacI部位がプロモーター配列の上流に存在し、BamHI部位が遺伝子の末端に存在するようにPCRにより構築した。次に、この断片をpACYC184由来のベクター(前の段落に記載)のSacIからBamHIにクローニングした。
【0107】
次に、nahGプロモーター配列を、下記のようにTETプロモーター配列で置換した: 合成TETプロモーターをオリゴヌクレオチド1016〜20および1016〜21(表1を参照)を用いて構築した。TET遺伝子の天然の出発点にNdeI部位の導入の変更を行って、pACYC184に元々あるTETプロモーター配列を用いて、プロモーターを設計した。プロモーターを構築物のSacIからNdeIまでに挿入して、wtMS2CP遺伝子をTETプロモーターに機能的に連結させた。
【0108】
rrnB T1T2終結配列を有するDNA断片を、プラスミドpKK223−3(Amman et al, Gene, 25:167−178(1983))を鋳型として用い、オリゴヌクレオチド1036〜6および1053〜71(表1を参照)を用いるPCRにより構築した。この断片を両末端に制限酵素AatIIとAvaIの部位を有するように構築した。上記のpACYC184由来のベクターをこれらの酵素で切断して、この断片を連結した。
【0109】
ラムダプロモーターの合成物およびベクターpAMG13からの多クローニング部位をAatIIからBamHIまでの範囲で切り出した。pACYC184由来のベクターをこれらの酵素で切断し、pAMG13からの断片を連結した。得られたプラスミドはpRIN10(wt)と命名した(図3)。3種類の類似のpACYC184由来のプラスミドも構築し、そのうちの一つはラムダプロモーターの代わりにPS4プロモーターを有し(pRIN11(wt)と命名)、一つはラムダプロモーターの代わりにUV5 lacプロモーターを有し(pRIN20(wt)と命名)、そして一つはluxプロモーターを有した(pRIN22(wt)と命名)(図3)。
【0110】
MS2CP−11およびMS2CP−14変異体を有するpRIN構築物も構築した。TETプロモーターにまだ連結している変異体の断片を、プロモーターの末端にSphI部位、およびMS2CP変異体遺伝子の末端にBamHIを有するように作られた。上記のpRINプラスミドをBamHIとSphIで切断し、プラスミド部分をゲルで精製してwtMS2CP断片を除去した。次に、それらの変異体断片をSphIとBamHI部位を用いて連結した。MS2CP−11変異体を有する構築物はpRIN10(11)、pRIN11(11)、pRIN20(11)、およびpRIN22(11)とそれぞれ命名され、MS2CP−14変異体を有する構築物はpRIN10(14)、pRIN11(14)、pRIN20(14)およびpRIN22(14)とそれぞれ命名された。
【0111】
実施例4
本実施例は、T7遺伝子1の種々のpRINプラスミドベクターへのクローニング、およびそれに続くプラスミドベクターの発現およびシステムリークに関する試験を記載する。
【0112】
T7遺伝子1を上記の種々のpRINプラスミドにクローニングした。T7遺伝子1遺伝子は、そのコード配列に連結させたMS2コートタンパク質認識配列を有するように、オリゴヌクレオチド949〜1および949〜2(表1を参照)を用いるPCRで構築した。使用された鋳型はプラスミドpGP1−2であった(Tabor and Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82:1074−1078(1985))。該遺伝子を種々のpRINプラスミドのXbaIからBamHIまでにクローニングした。多量化を抑制することで翻訳レプレッサーの効果的濃度の増加を導く能力についてMS2CP変異体を調べた。調べられたもう一つのパラメーターは遺伝子1の下流ボックス配列(オリゴヌクレオチド1477〜84)(表1を参照)の存在または非存在であった(この配列はリボソームに対する結合を高めることにより翻訳を増強することが示された(Sprengart et al., Nuc. Acids Res., 18(7):1719−1723(1990))。
【0113】
種々の構築物の一晩培養物を50mlチューブ内の5mlのLB−cam中で28℃にて増殖させた。これらを、15mlチューブ内の新しい5mlのLB−camに1:100の希釈で接種した。これらすべてを28℃シェーカーに戻した。培養物の試料を誘導直前に採取し、この場合の誘導工程はIPTGの0.4mMの最終濃度までの添加によるものであった。誘導された培養物のインキュベーションは3時間続け、1mlの試料を取った。すべての試料を遠心によりペレット化し、それらペレットを破砕緩衝液に再懸濁させた。5分間の沸騰後、6μlのそれぞれのアリコートを4〜20%SDSポリアクリルアミドゲル(Novex)で泳動した。
【0114】
次に、タンパク質をニトロセルロースに電気泳動により移した。ブロットをブロット−ツイーン中で2%の非脂肪乾燥ミルクにより一晩ブロックした(Harlow & Lane, Immunoblotting in Antibodies, A Laboratory Manual,第12章, Cold Spring Harbor Laboratory Press,(1988))。該ブロットにT7 RNAポリメラーゼに対するウサギ由来ポリクローナル抗体をプローブとして1時間反応させた。洗浄後、ブロットに、ロバ抗ウサギ西洋ワサビペルオキシダーゼ複合抗体(Amersham)をプローブとして1時間反応させた。これを洗浄し、ECL試薬(Amersham)で処理し、X線フィルムに露出させた。この露出は、感度を最大化する15分間とした。このフィルムをコダックのフィルムプロセッサーを用いて現像した。
【0115】
図4〜6は、種々の構築物を用いて実施したリークと発現実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。図4は一晩の静置培養物のブロットであり、図5は対数増殖期の前インキュベーション培養物(preI)のブロットであり、図6は28℃で増殖させたIPTG誘導培養物のブロットである。これらのブロットの写真により証拠付けられるように、コートタンパク質の存在が一晩のリークに対して劇的な効果を有することは明らかであり(図4と図5を比較されたい)、リークの最も高いコントロールを示す細胞中ではタンパク質蓄積レベルの若干の減少が見られる。より具体的には、そのシグナルは、対応するシステムにより実行されるコントロールの厳密性や程度の関数として、ブロットの左側のレーンでさらに強く、右側レーンで減少している; PS4プロモーターはUV5 lacプロモーターよりもリークしやすい; 下流ボックスの変異はリークを低下させるが、PS4プロモーターに関する誘導レベルに対してはほとんど影響を持たない; MS2CP変異体は一晩の指数増殖培養物においてT7遺伝子1のリークに対して野生型よりも厳密な調節を示す; 変異体は誘導の際の蓄積レベルに影響を与え、さらに厳密に調節された一晩培養物(UV5 lac)は誘導後に低いレベルのRNAポリメラーゼを示す; そしてMS2CP14変異体はMS2CP11変異体よりも高い効果を有するように思われ、その効果はwtMS2CPとMS2CP14との中間にある。
【0116】
実施例5
本実施例は宿主細胞の染色体への「MSで調節されたT7遺伝子1カセット」の染色体挿入を説明し、次に種々の標的遺伝子を発現させるそのような宿主株の利用を示し、ならびに新しく開発された株のリークと発現特性が、市販のT7 RNAポリメラーゼを有する株と比較された試験結果を提供する。
【0117】
「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」(上流ターミネーター配列、誘導プロモーター配列、MS2認識部位、T7遺伝子1、MS2コートタンパク質遺伝子(wtMS2CP、またはMS2CP−11またはMS2CP−14)および弱い構成プロモーター、例えばTETを有する)(図7を参照)を、制限酵素SphIとPpuMIを用いて種々のpRINプラスミドから切り出し、次に宿主染色体への部位特異的組込みのために特別に構築したM13ベクターのMMEbg(Blum et al., J. Bacteriology, 171(1):538−546(1989); Micheals, M.L., Gene, 93:1−7(1990))にクローニングした。wtMS2CP、MS2CP−11、またはMS2CP−14のいずれかを有する種々のカセットが得られた。
【0118】
この組込みは強制組換え機構により進行する。最初に、オリゴヌクレオチド1553〜73および1553〜74(表1を参照)をMMebgのBamHIとNotI部位に連結した。これらのオリゴヌクレオチドは唯一のSphIとPpuMI部位をベクターに導入する。次に、「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」をSphIとPpuMI部位に連結した。次に、XL1 Blue細胞を1mlのSOCに入れ、150μlのMOCK連結物、および300μlのXL1 Blueの一晩培養物+3.5ml LB+0.8%のトップアガーとともに150μlと30μlの挿入連結物を塗布することにより、該細胞を連結物によって形質転換させた。この混合物をLBプレートに注ぎ、37℃で一晩インキュベートした。プラークを採取して100μlの1×TEに入れた。
【0119】
プラークからの70μlの再懸濁ファージと5mlLB中の200μlのXL1 Blue ONによるPCRスクリーニング前に一晩の培養を開始した。これらの培養物は37℃で一晩振盪した。PCRによる各プラークのスクリーニングを行った。20μl PCR反応物中の2μlの再攪拌プラークを用いた。オリゴヌクレオチド305〜3と305〜14(T7遺伝子1にとっては内部塩基)(表1を参照)をこのスクリーニングに用いた。陽性クローンを1.0%アガロースゲルでの泳動反応により同定した。各一晩培養物の1mlのアリコートを遠心して、ファージを有する800μlの上清をエッペンドルフチューブに収容した。次に、各上清の200μlのアリコートを70℃で20分間インキュベートした。次に、100μlの熱処理ファージを、一晩培養物からのlac iQの表現型を有する大腸菌の独立栄養K株(F’tet/GM120細胞と命名)の100μlに加える。(GM120はATCC寄託No.55764を有する)。これらの試料を37℃で約1時間インキュベートした。次に、25μlのコントロールF’tet/GM120、25μlの熱処理ファージのみ、および各交差物の1:10希釈物の25μlをLB+Kn40プレートに塗布した。次に、これらプレートを37℃で一晩インキュベートした。交差物(または溶原化)から得られた精製コロニーをLB+Kn40プレート上で2回筋状に接種し、37℃で一晩インキュベートした。次に、コロニーを0.3%のウシ胆汁とLBに2回継代培養し、次に37℃で一晩攪拌した。次に、該細胞を、LBからLB+Knに塗布するレプリカとともにLBプレートに筋状に接種してカナマイシン感受性コロニーを同定した(ファージはカナマイシン感受性のコロニーにはもはや存在しないはずである)。
【0120】
次に、染色体への挿入を調べるためにPCRスクリーニングを下記のように行った: コロニーをプレートから採取して20μlのPCR混合物に接種した(陽性コロニーが同定された場合、同一のチップを用いて5mlのLBにも接種して一晩培養物に用いる)。15μlの各PCR試料を1.0%アガロースゲルで泳動して陽性コロニーを調べた。陽性コロニーがゲル上のサイズにより同定された場合、その対応する一晩培養物の37℃での振盪を開始した。次に、これらをLBプレートに塗布して37℃で一晩インキュベートした。
【0121】
細胞からF’因子を除くために、5mlのLB中のプレートの単一コロニーからの培養物の37℃で4時間の振盪を開始した。次に、アクリジンオレンジを用いた除去の発表された手法(Miller, Experiments in molecular genetics, Cold Spring Harbor Laboratory Press, pp. 104−106(1972))にしたがった。基本的には、細胞をLBに、レプリカプレートをLB+テトラサイクリンに塗布する。テトラサイクリン感受性細胞はF’マイナスとして単離されよう。これらプレートからのコロニーの一晩培養を開始し、次にM13 mp18で再感染させて、F’因子が確実に存在しない細胞とする。次に、300μlの一晩培養物をトップアガーと混合し、2μlのM13 mp18ファージ保存物とともにスポットする。プラークは存在しないはずである。この手法を用いて構築された二つの株をそれぞれEE11−11M(PS4プロモーター)とEE11−20(UV5 lacプロモーター)と名付けた。
【0122】
EE11−11MとEE11−20のリークと発現特性を、産物遺伝子NT−3または産物遺伝子BDNFをマーカーとして用いて、(既に記載の)市販のBL21(DE3)株と比較した。NT−3(またはBDNF)は、T7プロモーターと対象遺伝子との間にlac i部位を有し、かつリークを減少させるlac iQ遺伝子を有する市販のpET22bベクター(米国、ウイスコンシン州、マディソン、Novagen社)中に存在する。第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)と第二ベクターとしてpLysSを有するEE−11Mと第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20がさらに比較された(既に述べたように、pLysSはT7 RNAポリメラーゼを阻害し、リークを減少させる推薦される方法であるT7リゾチーム遺伝子を有する)。最後に、BDNF遺伝子を有するpAMG25プラスミドを用いてBL21(DE3)とEE11−20を比較した。
【0123】
具体的には、50mlのFalconチューブ中のLB+抗生物質(Kn40またはCm30)の一晩培養(5ml)を開始し、これらの培養物を28℃で振盪した。14mlガラスチューブ中の5mlのLB+抗生物質の新しいチューブに一晩培養物の1:100希釈物を接種した。チューブを28℃でそれらがOD600=〜0.8に達するまで振盪した。一晩培養物は実験の終わりまで28℃で振盪し続けた。各試料のアリコートを誘導前に取った。培養物を、20μlの100mM IPTGの添加(IPTGに関して0.4mMの最終濃度を与えた)により誘導した。誘導された培養物を28℃で4時間の振盪しながらインキュベートした。1mlの培養試料を取り、1.5mlのエッペンドルフチューブ中で15,000rpm(4℃)(Tomy MTX−160)で5分間遠心した。上清をデカントし、ペレットを保持した。次に、ペレットを破砕緩衝液に0.01 OD単位/μlにて再懸濁した。次に、試料を熱ブロック中で5分間100℃まで加熱し、次に2〜3分間冷却し、次に6μlの各試料を、2%SDSを加えた1×トリス−グリシン泳動緩衝液中の4〜20%トリス−グリシンSDSポリアクリルアミドゲルに載せた。ゲルを150Vで1.3時間泳動した。ゲルをクマシーブルーで染色してタンパク質を可視化した。
【0124】
NT−3を標的遺伝子として用いる図8に示されているように、EE11−20株は一晩培養物(ON)または誘導前(preI)のいずれでも検出可能なリークを有さない一方で、BL21(DE3)は明らかに有する。NT−3に関する誘導レベルは株間で比較できる。BDNFを標的遺伝子として用いる図9を見ると、EE11−20は再び誘導前に産物リークを示さないが、BL21(DE3)はBL21(DE3)は明らかに示す。EE11−20はBL21(DE3)よりもpET22bのBDNFのレベルを減少した。図10を見ると、pAMG25ベクターを用いて発現させたBDNFのレベルはET11−20とBL21(DE3)に関して同様であった。図8〜10に示された各実験について、pLySの存在はリークを減少させたが、(以前に文献で報告されたように)産物の発現も抑制した。最後に、図11と12を見ると、EE11−11Mは一晩または前誘導のリークを示さないが、BL21(DE3)と比較して相当するレベルのタンパク質を作ることが示される。さらに、EE11−11M株は、ベクター上のlac iの存在がタンパク質の蓄積に効果を有さず、実際、高いレベルの一部の産物を作る点においてEE11−20株よりも優れている(例えば、図8と図12を比較されたい)。
【0125】
市販の株の対照リークに導入された付加的な要素が本発明で開発された株には必要ではなく、本発明の株はリークの高い調節および誘導の際に相当なレベルの産物発現を示すことがこれらの結果から明らかである。
【0126】
実施例6
高密度発酵における異種タンパク質の発現に対してMS2コートタンパク質の存在が持つ効果を決定するために幾つかの産物を調べた。最初に、これらの条件は、小規模な振盪フラスコ、低い光学密度誘導のために用いられた条件を反映した。pAMG25にGCSFを含有するEE11−11Mの指数増殖培養物(光学密度=1.4)を用いて10リットルの発酵槽に接種した。これを28℃で0.8の光学密度まで増殖させてIPTGの添加により誘導した。最終光学密度12に達した誘導後に培養物をさらに10時間増殖させ、試料を毎時間採取した。図13に示されるように、GCSFの検出可能な前誘導リークが存在せず(レーン1)、タンパク質は誘導中生産され続けた。
【0127】
(pAMG25中のレプチンを用いて)第二の発酵を行ってEE11−11M株の性能を高密度で調べた。対数増殖接種材料(光学密度=1.32)を用いて10リットルの発酵を開始した。これを28℃で光学密度10まで増殖させた。次に、培養物をIPTGの添加により誘導した。増殖を6時間続け、培養物は最終光学密度41に達した。図14に示されるように、誘導前に明らかなリークは存在せず、レプチンは誘導時間にわたってよく産生される。
【0128】
これらの実験はMS2コートタンパク質の存在が大規模または高密度発酵に対して否定的な影響を有さないことを示す。
【0129】
実施例7
本実施例は、種々のT7初期遺伝子をクローニングするためにMS2システムの使用を記載する。T7遺伝子を単独で、およびオペロンとしてクローニングする。
【0130】
バクテリオファージT7の0.4と0.6初期遺伝子を、T7 356−DNA(Studier et al., J. Mol. Biol., 135:917−937(1979); Dunn & Studier, J. Mol. Biol., 166:477−535(1983))を鋳型として用いたPCRで増幅させた。各遺伝子は遺伝子の最初のコドンに(オリゴヌクレオチド1049〜5および1049〜7)(表1を参照)隣接してEcoRI部位を有するようにPCRで構築し、MS2コートタンパク質認識部位およびポリヒスチジンタグを多クローニング領域(オリゴヌクレオチド1035〜30および1035〜31)(表1を参照)のフレーム内に有するように修飾しておいたpAMG13にクローニングした。オリゴヌクレオチド1482〜18と1266〜69(表1を参照)を0.4遺伝子のために用い、オリゴヌクレオチド1266〜71と1443〜41(表1を参照)を0.6遺伝子のために用いた。
【0131】
MS2コートタンパク質はpRIN10からトランスで供給された。pRIN10を有するエレクトロコンピテント細胞をpAMG13との初期遺伝子連結物によって形質転換した。陽性クローンは形質転換体コロニーのPCRスクリーニングにより同定した。陽性培養物は一晩発現実験のスターターとして一晩増殖させた。LB Kan/Camの新しいチューブを1:100希釈(5mlに対して50μl)で接種し、28℃で約0.7のODになるまで振盪しながら増殖させた。これらを42℃シェーカーに変えることにより誘導し、インキュベーションを4時間続けた。1mlのアリコートを除去し、細胞をペレット化した。ペレットを破砕緩衝液で0.01 OD単位/μlで再懸濁し、5分間沸騰させた。これらを氷上で冷却し、6μlの各アリコートを10〜27%のSDSポリアクリルアミドゲルで泳動した。
【0132】
次に、タンパク質をニトロセルロースに電気泳動により移した。ブロットをブロット−ツイーン中で2%の非脂肪乾燥ミルクにより一晩ブロックした。該ブロットに、予想されたタンパク質配列に基づく合成ペプチドに対するウサギ由来ポリクローナル抗体をプローブとして1時間反応させた。この血清を1:2000に希釈した。洗浄後、ブロットに、ロバ抗ウサギ西洋ワサビペルオキシダーゼ複合抗体(Amersham)をプローブとして1時間反応させた。これを洗浄し、ECL試薬(Amersham)で処理し、X線フィルムに露出させた。この露出は4分間であった。このフィルムをコダックのフィルムプロセッサーを用いて現像した。図15に示されているように、0.4遺伝子の発現はMS2調節システムを用いて得られた。同様に、0.6遺伝子の発現が得られた(図16)。
【0133】
2種類のタイプの0.7遺伝子が構築された: 1)オリゴヌクレオチド1053〜66と1266〜73(表1を参照)を用いて完全長遺伝子を構築し; そして2)オリゴヌクレオチド1053〜66および1266〜72(表1を参照)を用いて末端が切除された遺伝子を構築した。この末端切除は、単一コピーベクター中にMS2部位のない完全長の遺伝子をクローニングしようと試みて単離され、コドン242にオーカー変異を有する変異遺伝子に基づいた。この初期終止はファージから単離された変異とコドン243の点で類似し(Studier, F. W., J. Mol. Biol., 79:227−236(1973))、当該変異体は宿主停止活性を失っていることが示されたが、キナーゼ活性を保持した(Michalewicz and Nicholson, Virology, 186:452−462(1992))。
【0134】
初期遺伝子のオペロンも連続的なPCRにより構築した。オリゴヌクレオチド1511〜32、1539〜60、1803〜86、1319〜59、1577〜83、1577〜84、1539〜65、1066〜72および1435〜93(表1を参照)を、各初期遺伝子に隣接する遺伝子と重なる配列を有し、かつ各コード領域の開始部位に隣接するMS2部位を導入するように設計した。各遺伝子はこれらのオリゴヌクレオチドを用いて個々にPCRで増幅した。次に、初期遺伝子をともに連続的に加えた。0.4遺伝子と0.5遺伝子を、それら両者を鋳型として用いて、外側プライマーを用いるだけで最初に連結した。これにより0.4〜0.5断片を得、次にこれを0.3断片などとともに半分の鋳型として用いて、3−7tオペロンと命名された完全な0.3〜0.7構築物を作った(配列番号2)(図17)。オペロン中の初期遺伝子のリークをさらに減少させるために、「下流ボックス」配列を0.3、0.6および0.7遺伝子中で変異させた。「下流ボックス」の相同性を減少させるために行われたほとんどの塩基変化は何の変化ももたらさなかったが、一つの保存アミノ酸の置換が各遺伝子で起こった。
【0135】
実施例8
本実施例は、実施例7で構築され記載された3−7tオペロンを用いて大腸菌における異種タンパク質の発現を増強させた実験の結果を示す。下記のシステムの発現特性を比較した: 1)pAMG33にクローニングされ、大腸菌GM221で発現されるか、または大腸菌GM221で発現されるpRIN10の3−7tオペロンとともにクローニングされたNDFアルファ/ベータ; 2)pAMG22にクローニングされ、大腸菌GM221で発現されるか、またはpRIN10の3−7tオペロンとともにクローニングされて大腸菌GM221で発現される301−941 TP2。
【0136】
各実験に関して、単一のコロニーをプレートから採取し、カナマイシンとクロラムフェニコールを含有するKanamycinor LBを有する二つの5mlのLB中で成長させた。チューブを一晩28℃で振盪した。カナマイシンを有する2XYTまたはカナマイシンとクロラムフェニコールを有する2XYTの1Lを有する4リットルのフラスコを準備した。これらに10mlの出発培養物を接種した。これらを28℃で振盪しながら0.8のODになるまで増殖させた。次に、1時間振盪しながら培養物を37℃に変えた。次に、これらを28℃に戻してIPTGを0.4mMで加えた。これらを1時間ごとに取り出しながらさらに3時間増殖させた。1mlの試料を5分間15Kおよび4℃で遠心した。上清をデカントし、ペレットを凍結した。500μlの各培養物を500μlの2XYT中に希釈し、その光学密度を測定した。次に、ペレットを解凍し、0.01 OD単位/μlの破砕緩衝液に再懸濁した。次に、6μlのこれらの破砕ペレットをSDSポリアクリルアミドゲル(4〜20%)にかけた。150Vで1.3時間の泳動後、ゲルをクマシーブルーで染色してタンパク質を可視化した。
【0137】
図18に示されているように、T7初期タンパク質の存在はNDFアルファ/ベータをタンパク質分解から保護する。T7初期タンパク質が存在しないとき、NDFアルファ/ベータは1時間の誘導により作られるが(レーン2)、2時間の誘導によっては検出できない(レーン3)。T7初期タンパク質が存在する場合、検出可能なさらに多いNDFアルファ/ベータが存在し、3時間の誘導にわたって蓄積し続ける(レーン7〜9)。
【0138】
図19に示されているように、宿主細胞はT7初期タンパク質の非存在下での誘導後に301−941 TP2を作らない(レーン5)。T7初期タンパク質が存在する場合、誘導後のタンパク質の生産は劇的に増加する(レーン2および3)。
【0139】
実施例9
本実施例は、異なる濃度のMS2CPを産生するように設計された一連の前核宿主株の構築と試験を記載する。これらの宿主株は、それらの染色体に挿入された修飾TETプロモーターに連結させたMS2CPを有する。
【0140】
株の構築。TETプロモーターに連結させたMS2CP−14変種のカセットを、オリゴヌクレオチド1674〜96とオリゴヌクレオチド1674〜97(表1を参照)を用いて構築した。このカセットをMMebgのNotIとBamHI部位にクローニングしてMMebg−MS2CP−14を作った。次に、TETプロモーターを下記の段階で最適化した: 1)〜10領域をオーバーラップPCRにより共通配列とした。変異体の半分は、オリゴヌクレオチド1011〜96と1784〜89および1758〜66と1674〜97を用いて構築した。次にそれら半分をオリゴヌクレオチド1674〜96と1674〜97を用いてともにPCRにかけた。次に、これをMMebgのNotIからBamHIまでの領域に再クローニングしてMMebg−MS2CP14(〜10)を得た; 2)〜35領域を共通領域にして完全に最適化させたTETプロモーターを作った。これを、MMebg−MS2CP14(〜10)が鋳型として働く半反応PCRを用いて再び行った。変異体の半分はオリゴヌクレオチド対の1011〜96と1784〜88および1803〜15と1674〜97(表1を参照)を用いて構築した。次に、これら半分の二つをオリゴヌクレオチド1674〜96と1674〜97を用いてともにRCRにかけた。これを、MMebgのNotIからBamHIまでの領域に再クローニングして(完全に最適化された)MMebg−MS2CP14を得た。MMebg−MS2CP14(〜10)とMMebg−MS2CP14(完全に最適化されたもの)の両方が野生型のプロモーター構築物よりもMS2コートタンパク質の増加生産を示した((〜10)については小さい増加および完全に最適化されたものについては非常に大きな増加)。
【0141】
MS2コートタンパク質中間体を既に記載した変異体に移送する変異型のプロモーターを構築するために、リボソーム結合部位(RBS)の配列をランダム化する技法を用いた。〜10共通配列変化を有するプロモーター領域の配列とKpnI部位までのMS2コートタンパク質遺伝子とを用いてオリゴヌクレオチド1822〜01、1822〜02および1863〜81を設計した。これらのオリゴヌクレオチドはリン酸化し、オリゴヌクレオチド1821〜99、1822〜03、1822〜04および1822〜05とアニールした。次に、連結生成物は、オリゴヌクレオチド1822〜06と1822〜07を用いたPCR鋳型として機能した。ここで、リボソーム結合配列中でランダム化されたこの断片はNotIからBamHIまでに連結することが可能であった。
【0142】
タンパク質生産に対するリボソーム結合部位の変化の効果を調べるために、ベータガラクトシダーゼアッセイを用いた。具体的には、MS2CP−14−LacZ融合物を、オリゴヌクレオチド1803〜52とオリゴヌクレオチド1803と53を有するLacZ断片を作り、これをMMebg−MS2CP−14のKpnIからBamHIに連結することにより構築した。この構築物は、ベータガラクトシダーゼ遺伝子LacZにフレーム内で融合させたMS2コートタンパク質遺伝子の始めに連結させた野生型TETプロモーターを含有する。前の段落に記載したこのランダム化RBS断片を次にこの構築物のNotIからKpnIに連結した。この最初の融合物とランダム化融合連結物を、実施例5に記載の手法の後に、染色体に組み込んだ。使用された宿主株は、ベータガラクトシダーゼ活性を欠如したF’tet/393AElacZ145Nであった。分解された溶原菌のベータガラクトシダーゼ活性を記載されたように(Miller,Experiments in moleuclar genetics, Cold Spring Harbor Laboratory Press, pp.352−355(1972))評定した。異なるレベルの活性を有する一連の変異体を同定した。これらのうち、3変異体のナンバー1、3および15を株の生産のために選択した。これらの特別な株をもたらしたMMebg−MS2CP−14−LacZをKpIからBamHIの範囲で消化してLacZ融合物を除去した。次に、MS2CP−14遺伝子を、KpnI〜BamHI断片のこれらベクターへの連結により再生した。宿主株393に組み込むことによりこれらの3変異体と(十分に最適化された)MMebg−MS2CP−14から株を構築した。得られた株はGM315(変異体1)、GM320(変異体3)、GM340(変異体15)およびGM350(完全に最適化)と命名した。
【0143】
MS2CPを作る株の試験。これらの株のMS2コートタンパク質を作る能力は指数増殖培養物のウエスタン分析により決定した。各株のコロニーをプレートから取り、これらを5mlのLBに接種した。これらを30℃で振盪しながら0.7の光学密度まで成長させた。1mlの試料を取った。すべての試料を遠心によりペレット化し、それらペレットを1mlの破砕緩衝液に再懸濁させた。5分間の沸騰後、6μlのそれぞれのアリコートを4〜20%SDSポリアクリルアミドゲル(Novex)上で泳動した。次に、ブロットをブロット−ツイーン中で2%の非脂肪乾燥ミルクにより一晩ブロックした(Harlow & Lane, Immunoblotting in Antibodies, A Laboratory Manual,第12章, Cold Spring Harbor Laboratory Press,(1988))。該ブロットにMS2コートタンパク質に対するウサギ由来のポリクローナル抗体をプローブとして1時間反応させた。洗浄後、ブロットに、ロバ抗ウサギ西洋ワサビパーオキシダーゼ複合抗体(Amersham)をプローブとして1時間反応させた。これを洗浄し、ECL試薬(Amersham)で処理し、X線フィルムに露出させた。このフィルムをコダックのフィルムプロセッサーを用いて現像した。図20に示されているように、対数期増殖中に受動的に発現されたMS2コートタンパク質の量はGM315とGM320において低いレベルでバックグランドにわたって検出でき、GM340とGM350においてかなり増加する。
【0144】
株を用いた異種遺伝子のクローニング。慣用の技術を用いて、C型肝炎のns5b遺伝子(Hep Cポリメラーゼ)のN末端のhisタグ融合物をクローニングするのが非常に難しいことがわかった。該遺伝子の完全長のものが単離されたときに、それらは、翻訳の初期停止を導くか、またはATGに存在する変異を有し、翻訳の開始をともに妨げた。この遺伝子のクローニングを容易にするために、MS2認識配列をそれに連結し、その連結物を用いてまず株GM350を形質転換した。完全長挿入物が検出され、それらの配列決定がなされ、正しいことが決定された。
【0145】
次に、GM350から得られた組換えhis付加ns5b遺伝子をpAMG21に置き、GM221、GM315およびGM320を形質転換するために用いた(GM221はMS2コートタンパク質を有さないが、GM315とGM320はGM350よりも少ない量のタンパク質を作った)。遺伝子はすべての3細胞系で安定であることがわかった。
【0146】
his付加hepCポリメラーゼを作る種々の株の能力を次に測定した。一晩培養物を、250ml三角フラスコ中で50mlの2XYTに1:100の希釈で接種した。これらを0.6の光学密度になるまで30℃で振盪しながら増殖させた。pAMG21ベクターはluxプロモーターを有しているので、hepCポリメラーゼの生産は自己誘発物質の30ng/mlの最終濃度での添加により達成する。インキュベーションを4時間続け、試料を採取する。細胞を遠心によりペレット化する。ペレットを10mlのPBSに再懸濁し、これをマイクロ液化する。試料を遠心して可溶性と不溶性のフラクションに分けた。これらを破砕緩衝液と混合し、試料を4〜20%のSDSゲルで泳動した。150Vで1.3時間後の泳動後に、ゲルをクマシーブルーで染色して、タンパク質を可視化した。
【0147】
図21に示されているように、hepCポリメラーゼがすべての3株で作られている。作られたタンパク質のほとんどが不溶性である。MS2コートタンパク質を含有する株にはいくぶんか高い発現があろう。このように、本実施例はこれらの株を用いうる方法を示す: 最も高い生産株のGM350は不安定な遺伝子を最初にクローニングするために用い、いったん安定なクローンが得られて正しいことが確認されたら、それを用いて残りの株を形質転換し、タンパク質産物の産生能力ならびに遺伝子の保持安定性が決定できる。
【0148】
実施例10
本実施例はpAMGuvxsプラスミドベクター、pAMGXプラスミドベクター、およびT4中期プロモーター系システムを開発するために用いられたT4オペロンpRINプラスミドベクターの構築を記載する。
【0149】
バクテリオファージT4中期プロモーターはPuvsXとPXの発表された配列(Hinton, D.M., J. Biol. Chem., 266(27):18034−18044(1991))を用いた合成により構築した(uvsX: オリゴヌクレオチド1084〜66とオリゴヌクレオチド1084〜67(表1を参照)、X: オリゴヌクレオチド1084〜68と1084〜69)(表1を参照)。PuvsXプロモーターをそれが有するNdeI部位を除去するために再構築した(オリゴヌクレオチド1202〜11とオリゴヌクレオチド1550〜85(表1を参照)。各構築物はAatIIとClaI認識部位を有するように設計された。PuvsXプロモーター構築物の完全な塩基配列を図22に示し、PXプロモーター構築物の完全な遺伝子配列を図23に示す。プラスミドpAMG13をAatIIとClaIで消化して合成ラムダプロモーターを除去し、ベクターをゲルで精製した。次に、T4中期プロモーターをこのプラスミドに連結してプラスミドベクターのpAMGuvsXとpAMGXを作った。
【0150】
motA/asiAオペロンを、各遺伝子の前にMS2コートタンパク質認識配列が来るように構築した。motAの発表された配列(Uzan et al., Mol. Microbiol., 4(9):1487−1496(1990)、およびasiA; Orsini et al., Jour. Bacteriology, 175(1):85−93(1993))をその構築のために用いた。該断片の始めにXbaI部位があり、終わりにXhoI部位があった(オリゴヌクレオチド1084〜63、1528〜19、1528〜20および1703〜53)(表1を参照)。この断片をXbaIとXhoIで消化し、次にいくつかのpRINプラスミドに連結して、例えば、T4オペロンpRIN10プラスミドベクター、T4オペロンpRIN11プラスミドベクター等を得た。
【0151】
実施例11
本実施例は、実施例10で調製、記載されたpAMGuvxs、pAMGXおよびT4オペロンpRINプラスミドベクターの試験を記載する。具体的には、リークを妨げ、産物遺伝子の発現を可能とするシステムの能力を調べるために発現実験を実施した。下記のシステムの発現とリーク特性を比較した: 1)pAMG13ベクターを有する大腸菌宿主GM221(ATCC寄託番号202077)にクローニングされ発現されたT7遺伝子1(すなわち、ラムダプロモーター調節下のT7遺伝子1); 2)pAMG13を有する大腸菌宿主GM221中にT4オペロンpRIN10とともにクローニングされ共発現されたT7遺伝子1; 3)pAMGuvsXを有する大腸菌宿主GM221のT4オペロンpRIN10とともにクローニングされ共発現されたT7遺伝子1(すなわち、uvsX T4中期プロモーター調節下のT7遺伝子1); 4)pAMGXuvsXを有する大腸菌宿主GM221中にT4オペロンpRIN11とともにクローニングされ共発現されたT7遺伝子1; 5)pAMGuvsXを有する大腸菌宿主GM225中にT4オペロンpRIN10とともにクローニングされ共発現されたNT−3; および6)pAMGuvsXを有する大腸菌宿主GM225中にT4オペロンpRIN10とともにクローニングされ共発現されたBDNF。
【0152】
各実験のために、単一コロニーをプレートから取り、クロラムフェニコールとカナマイシンを有する5mlの2XYTで生育させた。チューブを一晩28℃で振盪した。クロラムフェニコールとカナマイシンを含有する5mlの2XYTを有する50mlのチューブを準備した。新しいチューブに50μlの出発培養物を接種した。これらのチューブを28℃で振盪しながら0.6〜1.2のODになるまで増殖させた。PS4プロモーターを有する培養物(pRIN11)は20μlのIPTGで誘導する一方で、ラムダプロモーターを有する培養物(pAMG)は37℃または42℃のいずれかに変えることにより誘導した。これらすべての発現実験の誘導時間は4.0時間であった。1mlの各培養物を10分間遠心した。上清をデカントし、ペレットを凍結した。500μlの各培養物を500μlの2XYTに希釈し、その光学密度を測定した。次に、ペレットを解凍し、0.01 OD単位/μlの破砕緩衝液に再懸濁した。次に、6μlのこれらの破砕ペレットをSDSポリアクリルアミドゲル(4〜20%または16%)にかけた。150Vで1.3時間の泳動後、ゲルをクマシーブルーで染色してタンパク質を可視化した。
【0153】
図24〜図29のデータは下記のとおりに要約することができる: 1)pAMG13ベクターは、T7遺伝子がラムダプロモーターの調節下にある場合、誘導の際に大量のT7 RNAポリメラーゼを作ることができる(図24のレーン3と4を参照); 2)T4オペロンのタンパク質産物は大腸菌RNAポリメラーゼによるラムダプロモーターの認識を十分なくす(図25のレーン2と3を図24のレーン3と4に比較されたい); 3)T7遺伝子1がT4オペロンpRIN10とともにクローニングされて共発現されるpAMGuvsXにおいて大量のT7 RNAポリメラーゼを得ることができる(図24のレーン3と4を図26のレーン2と3に比較されたい); 4)T4オペロンpRIN11との共発現がT4オペロンpRIN10と同じくT7遺伝子1の生産に効果的である(図27のレーン3と4を図26のレーン2と3に比較されたい);および5)NT−3/BDNFがT4オペロンpRIN10とともにクローニングされて共発現されるpAMGuvsXから大量のNT−3とBDNFを得ることもできる(図28と図29を図26と比較されたい)。
【0154】
実施例12
本実施例は、MS2システムを有する単一コピープラスミドへのmotA/asiAオペロンのクローニングを記載する。
【0155】
単一コピーベクターはpSC101から得られた(Bernardi and Bernardi, Nuc. Acids Res., 12:9415−9426)。このベクターをNdeIで消化し、次に再環状化してプラスミドpSC101dNdeを得た。BglIIとNsiI部位を有するDNAリンカーをこのプラスミドのEcoRI部位に導入した。次に、T1T2、PS4プロモーターおよび多クローニング部位を有する、NsiIからBglIIまでのpAMG22の断片をそれにクローニングしてプラスミドpTS2を作った。次に、pTS2をMluIとXmnIで切断し、その末端を、クレノウ断片を用いて平滑化し(Sambrook et al., Molecular cloning, a laboratory manual, Second ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, pp.5.40−5.41(1989))、そして該プラスミドを再環状化してpTS2dを作った。標的プロモーター、MS2認識部位、MS2CP遺伝子およびTETプロモーターを有するpRINプラスミドベクターの断片を、オリゴヌクレオチド828〜31およびオリゴヌクレオチド1553〜72(表1を参照)を用いるPCRにより作った。これらの断片をAatIIとBglIIで消化し、次にpTS2dに連結して、pCBプラスミドベクター(図30を参照)を作った。次に、実施例10に記載されたmotA/asiAオペロンをこれらのpCBプラスミドベクターのXbI〜XhoIにクローニングしてpAWプラスミドベクター(図31を参照)を作った。
【0156】
もう一つの単一pCBプラスミドを、MS2コートタンパク質の調節用変異TETプロモーターを用いて構築した。TETプロモーターに連結させたMS2コートタンパク質遺伝子のカセットを、オリゴヌクレオチド1870〜97およびオリゴヌクレオチド1906〜27(表1を参照)を用いるPCRにより構築した。この断片をXhoIとBglIIで消化し、そしてpTS2dに連結してpCB11を作った。次に、実施例10で記載されたmotA/asiAオペロンをこのベクターのXbaI〜XhoIにクローニングしてpAW11(Ps4プロモーター)を作った。
【0157】
実施例13
本実施例は実施例12で調製、記載されたpAWプラスミドベクターの試験を記載する。産物遺伝子をT4 uvsXプロモーターかXプロモーター下にクローニングしたときの発現実験を実施した。下記のシステムの発現とリーク特性を比較した: 1)pAMGXを有する大腸菌GM221中で、pAW20とともにクローニングされ共発現されるT7遺伝子1(すなわち、T4 Xプロモーターの調節下のT7遺伝子); 2)pAMGXを有する大腸菌GM225中で、pAW20とともにクローニングされ共発現されるSPI(すなわち、T4 Xプロモーターの調節下のSPI); 3)pAMGuvsXを有する大腸菌GM225中で、pAW20とともにクローニングされ共発現されるOPG(すなわち、T4 uvsXプロモーターの調節下のOPG); 4)pAMGuvsXを有する大腸菌GM225中で、pAW11とともでクローニングされ共発現されるBDNF(すなわち、T4 uvsXプロモーターの調節下のBDNF); 5)pAMGuvsXを有する大腸菌GM225中で、pAW11とともにクローニングされ共発現されるOPG(すなわち、T4 Xプロモーターの調節下のOPG); 6)pAMGuvsXを有する大腸菌GM225中で、pAW11とともにクローニングされ共発現されるNT3(すなわち、T4 uvsXプロモーターの調節下のNT3); および7)pAMGXを有する大腸菌GM225中で、pAW11とともにクローニングされ共発現される3MNDF(すなわち、T4 Xプロモーターの調節下の3MNDF)。
【0158】
各実験のために、単一コロニーをプレートから取り、テトラサイクリンとカナマイシンを有する5mlの2XYTで生育させた。チューブを一晩28℃で振盪した。50mlのチューブをテトラサイクリンとカナマイシンを有する5mlの2XYTを用いて準備した。新しいチューブに50μlの出発培養物を接種した。これらのチューブを28℃で振盪しながら0.6〜1.2のODになるまで増殖させた。PS4プロモーターを有する培養物とUV5 lacプロモーターを含有する培養物は20μlのIPTGで誘導する一方で、ラムダプロモーターを有する培養物は37℃または42℃のいずれかに変えることにより誘導した。これらすべての発現実験の誘導時間は4.0時間であった。1μlの各培養物を10分間遠心した。上清をデカントし、ペレットを凍結した。500μlの各培養物を500μlのLBに希釈し、その光学密度を測定した。次に、ペレットを解凍し、0.01 OD単位/μlの破砕緩衝液に再懸濁した。次に、6μlのこれらの破砕ペレットをSDSポリアクリルアミドゲル(4〜20%または16%)にかけた。150Vで1.3時間の泳動後、ゲルをクマシーブルーで染色してタンパク質を可視化した。
【0159】
図32〜図34のデータは下記のとおりに要約することができる: 1)大量のT7遺伝子1を、T7遺伝子1がpAM20とともにクローニングされて共発現されるpAMGX中に得ることができる(図32); 2)大量のSPIを、SPIがpAM20とともにクローニングされて共発現されるpAMGX中に得ることができる(図33); および3)大量のOPGを、OPGがpAM20とともにクローニングされ共発現されるpAMGuvsX中に得ることができる(図34)。
【0160】
図35〜図38のデータは下記のとおりに要約することができる: 1)大量のBDNFを、BDNFがpAW11とともにクローニングされて共発現されるpAMGuvsX中に得ることができる(図35); 2)大量のOPGを、OPGがpAM11とともにクローニングされて共発現されるpAMGuvsX中に得ることができる(図36); 3)大量のNT3を、NT3がpAW11とともにクローニングされて共発現されるpAMGuvsX中に得ることができる(図37); そして4)大量の3MNDFを、3MNDFがpAW11ともにクローニングされて共発現されるpAMGX中に得ることができる(図38)。
【0161】
単一コピーpAWプラスミドを用いた試験は、MS2に基づくT4カセットが染色体に置かれている場合に生じるシステムと類似のものを提供するので、必要とされるMS2−T4中期プロモーター要素のそれぞれを宿主細胞の染色体に置いて、効果的で、厳密に調節されたシステムを提供することができることが本発明で期待される。
【0162】
実施例14
本実施例は、付属タンパク質を効率的に発現し、それにより標的タンパク質の発現を増強するMS2に基づくT4システムの利用を記載する。
【0163】
motAとasiAを有するT4オペロンを、開始部にXhoI部位を有し、その後にMS2認識部位およびasiA遺伝子(これもMS2認識部位よりも後に位置する)の末端にBamHI部位を有するようにPCRで構築した(オリゴヌクレオチド1351〜01および1260〜86)(表1を参照)。次に、この断片を、(T4オペロンpRIN10を与える)pRIN10の対応する部位にクローニングした。
【0164】
T7の0.6遺伝子を、XhoI部位を有し、その後にMS2認識部位を有しXhoI部位(オリゴヌクレオチド1443〜41および1465〜31)(表1を参照)で終わるように構築した。次に、この0.6断片を、対応する部位を用いてT4オペロンpRIN10に挿入した。これは、0.6遺伝子とT4転写因子の両方を発現することのできるプラスミド(0.6 T4オペロンpRIN10)を作る。次に、BDNFがpAMGuvsXを有する大腸菌宿主GM225中に0.6 T4オペロンpRIN10とともにクローニングされて共発現されるシステム(すなわち、T4 uvsX中期プロモーターの調節下のBDNF)を用いて、発現実験を行った(実施例11に記載した同じ実験方法にしたがって)。
【0165】
図39に示されるように、大量のBDNFがこのシステムを用いて得ることができ、これらの得られた量は0.6遺伝子を欠くT4オペロンpRIN10システムを用いて得られた量よりも優れていた(図29のレーン4と5を図39のレーン4と5に比較されたい)。したがって、付属タンパク質(0.6)は段階化プロモーター発現システムにおいて標的タンパク質の発現を増強した。
【0166】
これらの実施例で利用されたオリゴヌクレオチドを下記の表1に示す。
【0167】
【表1】
【0168】
【表2】
【0169】
【表3】
【0170】
【表4】
【0171】
【表5】
【0172】
DNA/宿主細胞の寄託
大腸菌(E.coli)K−12/GM350宿主細胞は、1999年1月20日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されている。
【0173】
大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号20281が与えられている。
【0174】
プラスミドベクターpAMG13を有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98641が与えられている。
【0175】
プラスミドベクターpAMG25を有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98642が与えられている。
【0176】
プラスミドベクター3002 nahGを有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98645が与えられている。
【0177】
プラスミドベクターpRIN10(wt)を有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98639が与えられている。
【0178】
大腸菌EE11−11M宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号202083が与えられている。
【0179】
大腸菌EE11−20宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号202082が与えられている。
【0180】
プラスミドベクターpAMGuvsXを有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98644が与えられている。
【0181】
プラスミドベクターpAMGXを有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98643が与えられている。
【0182】
プラスミドベクターT4オペロンpRIN10を有する大腸菌K−12/GM225は、1998年1月27日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98640が与えられている。
【0183】
プラスミドベクターpAW20を有する大腸菌K−12/GM225宿主細胞は、1998年1月28日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98638が与えられている。
【0184】
プラスミドベクターpAMG21を有する大腸菌K−12/FM−15宿主細胞はATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託され、寄託番号98113が与えられている。
【0185】
プラスミドベクターpAMG33を有する大腸菌K−12/GM221宿主細胞はATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に1999年1月20日寄託された。
【0186】
プラスミドベクターpAMG22は、1998年1月28日にATCC(米国、メリーランド州、ロックビル、12301パークローンドライブ所在のAmerican Type Culture collection)に寄託されており、寄託番号98646が与えられている。
【0187】
本発明は、ここまでに本発明を実施するための好ましい態様を有することが分かったか、もしくは提案される特別な実施態様を用いて説明してきた。本開示を鑑みて、当業者らは、多くの改良と変更が本発明の意図する範囲から離れることなく、例示した特定の実施態様で行いうることを理解するだろう。
【図面の簡単な説明】
【図1】 本発明のシステムに用いられる野生型MS2コートタンパク質の完全遺伝子配列(配列番号1)である。
【図2】 wtMS2CP発現実験の結果を示すSDSゲルの写真である。
【図3】 本発明で開発されたpRINプラスミドベクターの模式図である。
【図4】 T7遺伝子1がクローニングされた種々のpRINプラスミドベクターを用いて実施された発現およびリーク実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。
【図5】 T7遺伝子1がクローニングされた種々のpRINプラスミドベクターを用いて実施された発現およびリーク実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。
【図6】 T7遺伝子1がクローニングされた種々のpRINプラスミドベクターを用いて実施された発現およびリーク実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。
【図7】 「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」の模式図である。
【図8】 市販のBL21(DE3)株(レーン3〜5)、第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)株(レーン1〜2)、EE11−20株(レーン6〜8)、および第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20株(レーン9〜10)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの写真である
【図9】 図9は、市販のBL21(DE3)株(レーン3〜5)、第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)株(レーン1〜2)、EE11−20株(レーン6〜8)、および第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20株(レーン9〜10)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの写真である。
【図10】 市販のBL21(DE3)株(レーン3〜5)、第二ベクターとしてpLysSを有するBL21(DE3)株(レーン1〜2)、EE11−20株(レーン6〜8)、および第二ベクターとしてpLysSを有するEE11−20株(レーン9〜10)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの写真である。
【図11】 市販のBL21(DE3)株(レーン5〜7)とEE11−11M株(レーン2〜4)のリークと発現特性を比較するSDSゲルの図である。
【図12】 標的産物遺伝子としてNT−3の発現を用いたEE11−11M株のリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図13】 株EE11−11MでのpAMG25においてGCSFの10リットル発酵誘導の時間経過を示すSDSゲルの写真である。
【図14】 株EE11−11MでのpAMG25においてレプチンの10リットル発酵誘導の時間経過を示すSDSゲルの写真である。
【図15】 T7の0.4初期遺伝子がクローニングされたMS2に基づくシステムを用いて実施された発現実験の結果を示すウエスタンブロットの写真である。
【図16】 T7の0.6初期遺伝子がクローニングされたMS2に基づくシステムを用いて実施された発現実験の結果を示すSDSゲルの写真である。
【図17A】 T7の初期遺伝子(0.3〜0.7)を有するように構築された3−7tオペロンの完全な遺伝子配列(配列番号2)である。
【図17B】 T7の初期遺伝子(0.3〜0.7)を有するように構築された3−7tオペロンの完全な遺伝子配列(配列番号2)である。
【図18】 T7初期タンパク質の非存在および存在下でのNDFアルファ/ベータの発現を比較するSDSゲルの写真である。
【図19】 T7初期タンパク質の存在下および非存在下におけるヒトテロメラーゼサブユニットTP2(301〜941 TP2)の末端切除物の発現を比較するゲルのウエスタンブロットの写真である。
【図20】 株GM315、GM320、GM340およびGM350による多様な量のMS2コートタンパク質の受動的な生産を示すゲルのウエスタンブロットの写真である。
【図21】 種々の量のMS2コートタンパク質を有する株においてC型肝炎ポリメラーゼ(HepCpol)の発現を示すゲルの写真である。
【図22】 本発明のシステムに用いられるT4 PuvsX中期プロモーターの完全DNA配列(配列番号3)である。
【図23】 本発明のシステムに用いられるT4 PX中期プロモーターの完全DNA配列(配列番号4)である。
【図24】 標的産物遺伝子としてのT7遺伝子1の発現を用いたpAMG13のリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図25】 T7遺伝子1がT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMG13のリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図26】 T7遺伝子1がT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図27】 T7遺伝子1がT4オペロンpRIN11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図28】 NT−3がT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図29】 BDNFがT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図30】 本発明で開発されたpCBプラスミドベクターの模式図である。
【図31】 本発明で開発されたpAWプラスミドベクターの模式図である。
【図32】 T7遺伝子1がpAW20と共発現させられたpAMGXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図33】 SPIがpAW20と共発現させられたpAMGXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図34】 OPGがpAW20と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図35】 BDNFがpAW11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図36】 OPGがpAW11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図37】 NT3がpAW11と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図38】 3MNDFがpAW11と共発現させられたpAMGXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【図39】 BDNFが、0.6遺伝子をさらに付属タンパク質として有するT4オペロンpRIN10と共発現させられたpAMGuvsXのリークと発現特性を示すSDSゲルの写真である。
【配列表】
Claims (16)
- 構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーを含み、該異種遺伝子は誘導プロモーターおよびリプレッサー認識部位に機能的に連結されている、特定の異種遺伝子のクローニングまたは発現に用いられる翻訳抑制システムであって、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質(MS2CP)である該システム。
- 異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法であって、プラスミドベクターにより形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該ベクターは、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位および該誘導プロモーターに連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列、および構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節し、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質である、該方法。
- 異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法であって、第一のプラスミドベクターおよび第二のプラスミドベクターにより共形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、第一のプラスミドベクターは誘導プロモーターをコードするDNA配列ならびに翻訳リプレッサー認識部位および該誘導プロモーターに連結された該異種遺伝子を含み、第二のプラスミドベクターは構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節し、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質である該方法。
- 異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法であって、プラスミドベクターにより形質転換され、構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を有する宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該ベクターは、誘導プロモーターをコードするDNA配列、ならびに翻訳リプレッサー認識部位および誘導プロモーターに連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列を含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節し、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質である、該方法。
- 異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法であって、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位および該誘導プロモーターに連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列、ならびに構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーをコードするDNA配列を有する宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該翻訳リプレッサーは該異種遺伝子の発現を調節し、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質である、該方法。
- ベクターがさらに配列番号2を有する請求項2から4の何れか1項に記載の方法。
- T7遺伝子1をコードするDNA配列、誘導プロモーター、MS2認識部位、および構成プロモーターの調節下のMS2コートタンパク質遺伝子を含み、該T7遺伝子1は該誘導プロモーターおよび該MS2認識部位に連結されている「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」。
- 染色体に挿入された、請求項7に記載の「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」を有し、異種遺伝子を発現することができる宿主細胞。
- T7プロモーターの調節下の異種遺伝子をコードするDNA配列を含有するプラスミドベクターで形質転換され、染色体に挿入された、請求項7に記載の「MS2で調節されたT7遺伝子1カセット」を有する宿主細胞を適当な条件下で培養することを含む、異種遺伝子の発現のための方法。
- 異種遺伝子がT7初期遺伝子である請求項9に記載の方法。
- 異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法であって、第一のプラスミドベクターおよび第二のプラスミドベクターにより共形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、第一のプラスミドベクターは、T4中期プロモーターの調節下の該異種遺伝子をコードするDNA配列を含み、第二のプラスミドベクターは、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位および該誘導プロモーターにそれぞれ連結されたmotAとasiA遺伝子の配列、ならびに構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーを含み、該翻訳リプレッサーは該motAとasiA遺伝子の発現を調節し、かつ該motAとasiA遺伝子は該誘導プロモーターからの転写を抑制しながらT4中期プロモータからの直接の転写を指示し、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質である該方法。
- 第二のプラスミドベクターがさらに付属タンパク質をコードするDNA配列を有する請求項11に記載の方法。
- 異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法であって、誘導プロモーターをコードするDNA配列、翻訳リプレッサー認識部位および該誘導プロモーターにそれぞれ連結されたmotAとasiA遺伝子配列、ならびに構成プロモーターに機能的に連結された翻訳リプレッサーを有する宿主細胞であって、T4中期プロモーターの調節下に連結された該異種遺伝子をコードするDNA配列からなるプラスミドベクターにより形質転換された宿主細胞を適切な条件下で培養することを含み、該翻訳リプレッサーは該motAとasiA遺伝子の発現を調節し、かつ該motAとasiA遺伝子は誘導プロモーターからの転写を抑制しながらT4中期プロモータからの直接の転写を指示し、該リプレッサーがバクテリオファージMS2コートタンパク質である該方法。
- 誘導プロモーターをコードするDNA配列、それぞれがMS2認識配列および該誘導プロモーターに連結されたmotAおよびasiA遺伝子配列、ならびに構成プロモーターの調節下のMS2コートタンパク質遺伝子遺伝子を含む「MS−2に基づくT4カセット」。
- 異種遺伝子を発現する能力を有し、請求項14に記載の「MS2に基づくT4カセット」を有する前核宿主細胞。
- T4プロモーターの調節下の該異種遺伝子をコードするDNA配列を有する発現ベクターにより形質転換され、染色体に挿入された、請求項14に記載の「MS−2に基づくT4カセット」を有する宿主細胞を適切な条件下に培養することを含む異種遺伝子のクローニングまたは発現のための方法。
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US7279498P | 1998-01-28 | 1998-01-28 | |
| US60/072,794 | 1998-01-28 | ||
| US09/237,712 US6180391B1 (en) | 1998-01-28 | 1999-01-26 | Highly efficient controlled expression of exogenous genes in e. coli |
| US09/237,712 | 1999-01-26 | ||
| PCT/US1999/001725 WO1999038985A2 (en) | 1998-01-28 | 1999-01-27 | HIGHLY EFFICIENT CONTROLLED EXPRESSION OF EXOGENOUS GENES IN $i(E. COLI) |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2002501752A JP2002501752A (ja) | 2002-01-22 |
| JP2002501752A5 JP2002501752A5 (ja) | 2009-05-28 |
| JP4346819B2 true JP4346819B2 (ja) | 2009-10-21 |
Family
ID=26753754
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2000529443A Expired - Lifetime JP4346819B2 (ja) | 1998-01-28 | 1999-01-27 | 大腸菌における外来遺伝子の調節された高効率発現 |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6180391B1 (ja) |
| EP (1) | EP1051502B1 (ja) |
| JP (1) | JP4346819B2 (ja) |
| AT (1) | ATE345391T1 (ja) |
| AU (1) | AU731049B2 (ja) |
| CA (1) | CA2318813C (ja) |
| DE (1) | DE69933990T2 (ja) |
| DK (1) | DK1051502T3 (ja) |
| ES (1) | ES2275335T3 (ja) |
| PT (1) | PT1051502E (ja) |
| WO (1) | WO1999038985A2 (ja) |
Families Citing this family (19)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6423544B1 (en) * | 1998-12-31 | 2002-07-23 | Chiron Corporation | Compositions and methods for producing recombinant virions |
| EP1417347A4 (en) | 2001-05-02 | 2005-06-22 | Univ South Florida | VECTOR SYSTEM FOR THE SELECTION OF SEPARATED PROTEINS AND MEMBRANE-BONDED PROTEINS CODING GENES |
| US7695919B2 (en) | 2001-05-10 | 2010-04-13 | Battelle Energy Alliance, Llc | Antibody profiling sensitivity through increased reporter antibody layering |
| USRE46351E1 (en) | 2001-05-10 | 2017-03-28 | Battelle Energy Alliance, Llc | Antibody profiling sensitivity through increased reporter antibody layering |
| USRE44031E1 (en) | 2001-05-10 | 2013-02-26 | Battelle Energy Alliance, Llc | Antibody profiling sensitivity through increased reporter antibody layering |
| US6989276B2 (en) | 2001-05-10 | 2006-01-24 | Battelle Energy Alliance, Llc | Rapid classification of biological components |
| US20060177895A1 (en) * | 2003-12-12 | 2006-08-10 | Chung Chan | Methods for enhancing expression of recombinant proteins |
| RU2261913C1 (ru) * | 2004-01-15 | 2005-10-10 | Институт биоорганической химии им.академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук | РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pES6-1, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД ИНТЕРФЕРОН БЕТА-1b ЧЕЛОВЕКА, И ШТАММ Escherichia coli BDEES6 - ПРОДУЦЕНТ РЕКОМБИНАНТНОГО ИНТЕРФЕРОНА БЕТА-1b ЧЕЛОВЕКА |
| EP1859043A4 (en) * | 2005-02-22 | 2009-06-03 | David Tabaczynski | PHAGEN DERIVED VECTORS AND PROCEDURE FOR PROTEIN EXPRESSION |
| BRPI0608667B1 (pt) * | 2005-04-08 | 2018-05-02 | Bayer Cropscience Nv | Ácido nucléico específico, pares de iniciadores, sondas, kits e métodos para identificar o evento elite a2704-12 em amostras biológicas, confirmar a pureza de sementes e analisar sementes em relação à presença do referido evento elite |
| US8351674B2 (en) | 2007-05-31 | 2013-01-08 | Battelle Energy Alliance, Llc | Image portion identification methods, image parsing methods, image parsing systems, and articles of manufacture |
| WO2009021191A2 (en) | 2007-08-08 | 2009-02-12 | Barnes Wayne M | Improved t7 expression system |
| EP3366692A1 (en) | 2009-06-22 | 2018-08-29 | Amgen, Inc | Refolding proteins using a chemically controlled redox state |
| AU2010266093B2 (en) | 2009-06-25 | 2013-06-27 | Amgen Inc. | Capture purification processes for proteins expressed in a non-mammalian system |
| US9410965B2 (en) | 2009-09-17 | 2016-08-09 | Battelle Energy Alliance, Llc | Identification of discriminant proteins through antibody profiling, methods and apparatus for identifying an individual |
| US8969009B2 (en) | 2009-09-17 | 2015-03-03 | Vicki S. Thompson | Identification of discriminant proteins through antibody profiling, methods and apparatus for identifying an individual |
| JP7764009B2 (ja) * | 2021-03-26 | 2025-11-05 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 | 環境によって制御される生存能を有する細胞 |
| CN115747187B (zh) * | 2022-12-09 | 2023-06-20 | 厦门康基生物科技有限公司 | 一种重组酶UvsX及其表达基因和应用 |
| CN118995554B (zh) * | 2024-09-09 | 2025-07-04 | 江南大学 | 一种大肠杆菌整合表达体系及其在酶高效表达中的应用 |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4503142A (en) | 1982-06-25 | 1985-03-05 | Litton Bionetics, Inc. | Open reading frame vectors |
| US4578355A (en) | 1983-01-12 | 1986-03-25 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Plasmid cloning vector pAS1 |
| US4767708A (en) | 1984-08-07 | 1988-08-30 | Carnegie Mellon University | Enzyme amplification and purification |
| WO1997004110A1 (en) | 1995-07-14 | 1997-02-06 | Somatogen, Inc. | Methods for increasing protein expression |
-
1999
- 1999-01-26 US US09/237,712 patent/US6180391B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-27 CA CA002318813A patent/CA2318813C/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-27 EP EP99905493A patent/EP1051502B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-27 ES ES99905493T patent/ES2275335T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-27 AT AT99905493T patent/ATE345391T1/de not_active IP Right Cessation
- 1999-01-27 DE DE69933990T patent/DE69933990T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-27 PT PT99905493T patent/PT1051502E/pt unknown
- 1999-01-27 JP JP2000529443A patent/JP4346819B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-27 DK DK99905493T patent/DK1051502T3/da active
- 1999-01-27 AU AU25642/99A patent/AU731049B2/en not_active Expired
- 1999-01-27 WO PCT/US1999/001725 patent/WO1999038985A2/en not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO1999038985A3 (en) | 1999-11-18 |
| WO1999038985A2 (en) | 1999-08-05 |
| EP1051502B1 (en) | 2006-11-15 |
| ATE345391T1 (de) | 2006-12-15 |
| ES2275335T3 (es) | 2007-06-01 |
| JP2002501752A (ja) | 2002-01-22 |
| US6180391B1 (en) | 2001-01-30 |
| HK1030965A1 (en) | 2001-05-25 |
| DE69933990T2 (de) | 2007-09-20 |
| CA2318813A1 (en) | 1999-08-05 |
| AU2564299A (en) | 1999-08-16 |
| DK1051502T3 (da) | 2007-02-26 |
| DE69933990D1 (de) | 2006-12-28 |
| EP1051502A2 (en) | 2000-11-15 |
| PT1051502E (pt) | 2007-01-31 |
| CA2318813C (en) | 2006-06-06 |
| AU731049B2 (en) | 2001-03-22 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP4346819B2 (ja) | 大腸菌における外来遺伝子の調節された高効率発現 | |
| Brown et al. | Efficient translation of the RpoS sigma factor in Salmonella typhimurium requires host factor I, an RNA-binding protein encoded by the hfq gene | |
| Weigel et al. | The N‐terminus promotes oligomerization of the Escherichia coli initiator protein DnaA | |
| Reddy | Role of FtsEX in cell division of Escherichia coli: viability of ftsEX mutants is dependent on functional SufI or high osmotic strength | |
| Kawasaki et al. | Roles of Escherichia coli heat shock proteins DnaK, DnaJ and GrpE in mini-F plasmid replication | |
| Wang et al. | A set of ftsZ mutants blocked at different stages of cell division in Caulobacter | |
| Maruyama et al. | A dominant (mut D5) and a recessive (dnaQ49) mutator of Escherichia coli | |
| Davis et al. | Transcription and autoregulation of the stabilizing functions of broad‐host‐range plasmid RK2 in Escherichia coli, Agrobacterium tumefaciens and Pseudomonas aeruginosa | |
| JP2004528005A (ja) | 生物学的に活性なタンパク質およびペプチドのファージ依存性超産生 | |
| Trempy et al. | Alp suppression of Lon: dependence on the slpA gene | |
| JP4249832B2 (ja) | トリガーファクター発現プラスミド | |
| Bae et al. | Dominant‐negative mutants of prgX: evidence for a role for PrgX dimerization in negative regulation of pheromone‐inducible conjugation | |
| Ishiai et al. | Mini-F plasmid mutants able to replicate in Escherichia coli deficient in the DnaJ heat shock protein | |
| Kawasaki et al. | Mini-F plasmid mutants able to replicate in the absence of sigma 32: mutations in the repE coding region producing hyperactive initiator protein | |
| Obuchowski et al. | An RNA polymerase α subunit mutant impairs N‐dependent transcriptional antiterminationin Escherichia coli | |
| Hilliker et al. | The activity of Salmonella phage P22 gene 24 product in Escherichia coli | |
| Müller et al. | Cloning of mglB, the structural gene for the galactose-binding protein of Salmonella typhimurium and Escherichia coli | |
| US5384259A (en) | Construct and method for expression of tetracycline resistance genes in E. Coli | |
| HK1030965B (en) | Highly efficient controlled expression of exogenous genes in e. coli | |
| Baliko et al. | An Escherichia coli gene in search of a function: phenotypic effects of the gene recently identified as murI | |
| EP1208213B1 (en) | Method for production of proteins in host cells involving the use of chaperonins | |
| JPS61162170A (ja) | 構成性クレアチンアミジノヒドロラーゼを形成する微生物及びその製法 | |
| Slavcev et al. | Identification and characterization of a novel allele of Escherichia coli dnaB helicase that compromises the stability of plasmid P1 | |
| Ito et al. | Localization of nusA-suppressing amino acid substitutions in the conserved regions of the β′ subunit of Escherichia coli RNA polymerase | |
| Maiti et al. | Bacteriophage λ P gene shows host killing which is not dependent on λ DNA replication |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20060112 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20081007 |
|
| A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20081219 |
|
| A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20090105 |
|
| A524 | Written submission of copy of amendment under article 19 pct |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A524 Effective date: 20090407 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20090630 |
|
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20090715 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120724 Year of fee payment: 3 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120724 Year of fee payment: 3 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130724 Year of fee payment: 4 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| EXPY | Cancellation because of completion of term |