JP4353697B2 - Cancer preventive / therapeutic agent - Google Patents
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Description
【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、がんの予防・治療剤および診断薬などに関する。
【0002】
【従来の技術】
がんの化学療法においては、新しい抗がん剤の開発により延命効果が向上し、治癒に向かうケースも増えてきている。しかしながら、現在使用されている抗がん剤はDNAに傷害を与えたり、細胞分裂を阻害する細胞毒性の強いものが殆どであり、このため正常細胞に対しても少なからず傷害を与え、特に細胞分裂の盛んな骨髄などにしばしば強い副作用が現れる。
遺伝子発現を網羅的に解析するために、cDNAまたはオリゴヌクレオチドを固定化したマイクロアレイ法が開発され、疾患特異的な遺伝子発現の変化を見出す技術が普及し、その有用性が確認されている。例えば、Affymetrix社のGeneChipシステムはがんなどの疾患の診断や創薬標的遺伝子の発見に多用されつつある。
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞内に導入されると、相補的な配列を有するRNAとハイブリダイズし、RNaseHによるRNAの分解を誘導してタンパク質翻訳を阻害する、またはハイブリダイズによる直接的タンパク合成阻害ももたらす。目的の遺伝子機能を特異的に抑えることが可能なことから、遺伝子の機能解析手段として頻用されていると共に、いくつかのアンチセンスオリゴヌクレオチドは臨床応用開発が進んでいる。
最近、獲得免疫機構が存在しない昆虫においてToll受容体が自然免疫に関わる受容体として働いていることが明らかにされた。このToll受容体に相同性を示す分子、Toll-like receptors(Toll様受容体;TLRs)は哺乳類にも存在し、やはり自然免疫に関わっているとされている。TLRsは現在まで10種近くクローニングされている。例えば、TLR2およびTLR6は、リポタンパクや糖脂質の認識、TLR4はリポポリサッカライドの認識、TLR5はFlagellinの認識、TLR9はCpG DNAの認識にかかわることなどが報告されている(Nature Immunology 2(8)巻、675−680頁、2001年)。また、TLR1(Proc Natl Acad Sci U S A 95(2)巻、588-593頁、1998年)は、TLR2と協調して微生物産物認識に関わっている(非特許文献1:J Immunol. 165(12)巻、7125-7132頁、2000年)こと、TLR2とTLR6のへテロ受容体の作用を阻害する(非特許文献2:J Immunol. 166(1)巻、15-19頁、2001年)ことが報告されている。さらに最近、TLR1ノックアウトマウスの解析がなされ、TLR1は、TLR2とリガンド認識において共作用していることが再確認されると同時に、新たにTLR1リガンドとしてPam3CSK4等のトリアシルペプチド(非特許文献3:J Immunol. 169(1)巻、10-14頁、2002年)およびOspA(非特許文献4:Nat Med. 8(8)巻、878-884頁、2002年)が報告されている。また、シグナル伝達因子の研究も、TLR2やTLR4についての解析は進みつつあり、例えばReceptor-interacting serine/threonine kinase-2 (RIPK2)ノックアウトマウスの解析から、このキナーゼがTLR2やTLR4のシグナル伝達に働くことが示されている(非特許文献5:Nature. 416(6877)巻、190-194頁、2002年)ものの、TLR1シグナルについての知見は非常に乏しい。
一方、抗がん剤として頻要されるパクリタキセルはマウスマクロファージに対してリポポリサッカライド様の作用を示すが、Kawasakiらはこの作用がTLR4およびMD2のシグナルによることを見出した(非特許文献6:J Biol Chem. 275(4)巻、2251-2254頁、2000年)。ただし、TLR4およびマウスMD2の両者が必要であること、さらにこのMD2には種特異性があり、ヒトMD2ではパクリタキセルのLPS様作用は認められないと報告している。これらTLR1遺伝子の研究は免疫系の細胞に関するものが殆どで、TLR1遺伝子とがん(固形がん)との関連についての報告はない。
【非特許文献1】
J Immunol. 165(12)巻、7125-7132頁、2000年
【非特許文献2】
J Immunol. 166(1)巻、15-19頁、2001年
【非特許文献3】
J Immunol. 169(1)巻、10-14頁、2002年
【非特許文献4】
Nat Med. 8(8)巻、878-884頁、2002年
【非特許文献5】
Nature. 416(6877)巻、190-194頁、2002年
【非特許文献6】
J Biol Chem. 275(4)巻、2251-2254頁、2000年
【0003】
【発明が解決しようとする課題】
がん細胞に特異的に発現する分子を標的とし、がん細胞の増殖阻害、またはアポトーシス誘導を行える薬剤が切望されている。また、既存抗がん剤耐性がんへの有効な治療法や、副作用の低減の観点から既存抗がん剤への感受性を高める薬剤も切望されている。
【0004】
【課題を解決するための手段】
本発明者らは、上記の課題を解決するために鋭意研究を重ねた結果、がん組織に発現が顕著に増加する遺伝子を見出し、この知見に基づいて、さらに検討を重ねた結果、本発明を完成するに至った。
【0005】
すなわち、本発明は、
(1)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩を含有してなるがんの予防・治療剤、
(2)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩を含有してなるがんの予防・治療剤、
(3)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を有するタンパク質またはその部分ペプチドコードするDNAの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスヌクレオチド、
(4)上記(3)記載のアンチセンスヌクレオチドを含有してなるがんの予防・治療剤、
(5)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなるがんの予防・治療剤、
(6)がんが、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍である上記(1)〜(5)記載の予防・治療剤、
(7)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなるがんの診断薬、
(8) 配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAを含有してなるがんの診断薬、
(9)がんが、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍である上記(7)または(8)記載の診断薬、
(10)Toll様受容体の活性阻害作用を有する化合物またはその塩を含有してなるがんの予防・治療剤、
(11)Toll様受容体の発現阻害作用を有する化合物またはその塩を含有してなるがんの予防・治療剤、
(12)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とするがんの予防・治療剤のスクリーニング方法、
(13)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を含有することを特徴とするがんの予防・治療剤のスクリーニング用キット、
(14)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAを用いることを特徴とするがんの予防・治療剤のスクリーニング方法、
(15)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAを含有することを特徴とするがんの予防・治療剤のスクリーニング用キット、
(16)上記(12)もしくは(14)記載のスクリーニング方法または上記(13)もしくは(15)記載のスクリーニング用キットを用いて得られうるがんの予防・治療剤、
(17)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩を含有してなるアポトーシス誘導剤、
(18)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩を含有してなるアポトーシス誘導剤、
(19)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とするアポトーシス誘導剤のスクリーニング方法、
(20)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAを用いることを特徴とするアポトーシス誘導剤のスクリーニング方法、
(21)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩を含有してなる抗がん剤感受性増強剤、
(22)配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩を含有してなる抗がん剤感受性増強剤、
(23)哺乳動物に対して、配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩、または上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩の有効量を投与することを特徴とするがんの予防・治療方法、
(24)がんの予防・治療剤を製造するための、配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩、または上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩の使用などを提供する。
【0006】
【発明の実施の形態】
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質(以下、本発明のタンパク質または本発明で用いられるタンパク質と称することもある)は、ヒトや温血動物(例えば、モルモット、ラット、マウス、ニワトリ、ウサギ、ブタ、ヒツジ、ウシ、サルなど)の細胞(例えば、肝細胞、脾細胞、神経細胞、グリア細胞、膵臓β細胞、骨髄細胞、メサンギウム細胞、ランゲルハンス細胞、表皮細胞、上皮細胞、杯細胞、内皮細胞、平滑筋細胞、繊維芽細胞、繊維細胞、筋細胞、脂肪細胞、免疫細胞(例、マクロファージ、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー細胞、肥満細胞、好中球、好塩基球、好酸球、単球)、巨核球、滑膜細胞、軟骨細胞、骨細胞、骨芽細胞、破骨細胞、乳腺細胞、肝細胞もしくは間質細胞、またはこれら細胞の前駆細胞、幹細胞もしくはガン細胞など)もしくはそれらの細胞が存在するあらゆる組織、例えば、脳、脳の各部位(例、嗅球、扁桃核、大脳基底球、海馬、視床、視床下部、大脳皮質、延髄、小脳)、脊髄、下垂体、胃、膵臓、腎臓、肝臓、生殖腺、甲状腺、胆のう、骨髄、副腎、皮膚、筋肉、肺、消化管(例、大腸、小腸)、血管、心臓、胸腺、脾臓、顎下腺、末梢血、前立腺、睾丸、卵巣、胎盤、子宮、骨、関節、骨格筋などに由来するタンパク質であってもよく、合成タンパク質であってもよい。
【0007】
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、配列番号:1で表わされるアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、さらに好ましくは約70%以上、より好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。
【0008】
実質的に同質の活性としては、例えば、シグナル伝達活性(例、Toll様受容体(好ましくはTLR1)の細胞内シグナル伝達活性など)、リガンド結合活性(例、Toll様受容体(好ましくはTLR1)とリガンドまたは低分子との結合活性など)などが挙げられる。実質的に同質とは、それらの性質が性質的に(例、生理学的に、または薬理学的に)同質であることを示す。したがって、シグナル伝達活性、リガンド結合活性リガンド結合活性が同等(例、約0.01〜100倍、好ましくは約0.1〜10倍、より好ましくは0.5〜2倍)であることが好ましいが、これらの活性の程度、タンパク質の分子量などの量的要素は異なっていてもよい。
上記リガンドとしては、例えば、細菌由来のリポペプチド(好ましくはトリアシル化リポペプチドなど)、または化学合成によって得られるN-palmitoyl-S-dipalmitoylglyceryl(Pam3) Cys- Ser-(Lys)4 (CSK4)、N-palmitolyl-S-dilaurylgryceryl (N-Pam-S-Lau2) CSK4などのトリアシルペプチド、Borrelia burgdorferi由来のouter-surface lipoprotein (OspA)などが用いられる。シグナル伝達活性およびリガンド結合活性の測定は、公知の方法、例えばJ. Immunol. 166(1)巻、15-19頁、2001年に記載の方法またはそれに準じる方法に従って測定することができる。TLRファミリーはリガンド結合によってNF−κBシグナルを活性化する。従って、例えば、本発明で用いられるタンパク質〔例、Toll様受容体(例、TLR1など)〕の活性は、該タンパク質の発現ベクターを、NF−κB結合配列をプロモーターまたはエンハンサー中に含有するレポーター遺伝子などとともに細胞に導入し、必要に応じ、(a)微生物細胞破砕液、微生物培養上清、真核細胞破砕液、真核細胞培養上清などリガンドが含まれる液、(b)リガンド自身または(c)天然のリガンドと同等に結合活性を有する物質を添加して、該レポーター発現量を公知の方法により測定する。レポーター発現量は、例えば、ルシフェラーゼ活性、アルカリフォスファターゼ活性などを用いたレポータータンパク活性を指標とすることにより測定できる。
また、本発明で用いられるタンパク質(例、TLR1など)発現の有無における、抗がん剤(例、パクリタキセルなど)に対するアポトーシス活性を公知の方法で測定、比較し、シグナル伝達活性を測ることができる。リガンドの存在および非存在下での、抗がん剤(例、パクリタキセルなど)に対するアポトーシス活性を公知の方法で測定、比較し、シグナル伝達活性を測ることができる。
さらに、本発明で用いられるTLR1のシグナル伝達を、より感度よく測定するために、TLR1シグナル関連分子(例、TLR2、MD2など)を発現する能力を有している細胞を用いてもよいし、TLR1シグナル関連分子(例、TLR2、MD2など)を強制発現させて上記の活性を測定してもよい。
【0009】
また、本発明で用いられるタンパク質としては、例えば、▲1▼配列番号:1で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、▲2▼配列番号:1で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、▲3▼配列番号:1で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、▲4▼配列番号:1で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または▲5▼それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテインも含まれる。
上記のようにアミノ酸配列が挿入、欠失または置換されている場合、その挿入、欠失または置換の位置としては、とくに限定されない。
【0010】
本明細書におけるタンパク質は、ペプチド標記の慣例に従って左端がN末端(アミノ末端)、右端がC末端(カルボキシル末端)である。配列番号:1で表わされるアミノ酸配列を含有するタンパク質をはじめとする、本発明で用いられるタンパク質は、C末端がカルボキシル基(−COOH)、カルボキシレート(−COO-)、アミド(−CONH2)またはエステル(−COOR)の何れであってもよい。
ここでエステルにおけるRとしては、例えば、メチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチルなどのC1-6アルキル基、例えば、シクロペンチル、シクロヘキシルなどのC3-8シクロアルキル基、例えば、フェニル、α−ナフチルなどのC6-12アリール基、例えば、ベンジル、フェネチルなどのフェニル−C1-2アルキル基もしくはα−ナフチルメチルなどのα−ナフチル−C1-2アルキル基などのC7-14アラルキル基、ピバロイルオキシメチル基などが用いられる。
本発明で用いられるタンパク質がC末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有している場合、カルボキシル基がアミド化またはエステル化されているものも本発明で用いられるタンパク質に含まれる。この場合のエステルとしては、例えば上記したC末端のエステルなどが用いられる。
さらに、本発明で用いられるタンパク質には、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1-6アルカノイルなどのC1-6アシル基など)で保護されているもの、生体内で切断されて生成するN末端のグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基(例えば−OH、−SH、アミノ基、イミダゾール基、インドール基、グアニジノ基など)が適当な保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1-6アルカノイル基などのC1-6アシル基など)で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖タンパク質などの複合タンパク質なども含まれる。
本発明で用いられるタンパク質の具体例としては、例えば、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質(TLR1)などがあげられる。
【0011】
本発明で用いられるタンパク質の部分ペプチドとしては、前記した本発明で用いられるタンパク質の部分ペプチドであって、好ましくは、前記した本発明で用いられるタンパク質と同様の性質を有するものであればいずれのものでもよい。
具体的には、後述する本発明の抗体を調製する目的には、配列番号:1で表されるアミノ酸配列において第27〜578番目のアミノ酸配列を有するペプチドなどがあげられる。例えば、本発明で用いられるタンパク質の構成アミノ酸配列のうち少なくとも20個以上、好ましくは50個以上、さらに好ましくは70個以上、より好ましくは100個以上、最も好ましくは200個以上のアミノ酸配列を有するペプチドなどが用いられる。
また、本発明で用いられる部分ペプチドは、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは、1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは、1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは、1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入され、または、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは、1〜10個程度、より好ましくは数個、さらに好ましくは1〜5個程度)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されていてもよい。
【0012】
また、本発明で用いられる部分ペプチドはC末端がカルボキシル基(−COOH)、カルボキシレート(−COO-)、アミド(−CONH2)またはエステル(−COOR)の何れであってもよい。
さらに、本発明で用いられる部分ペプチドには、前記した本発明で用いられるタンパク質と同様に、C末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有しているもの、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基で保護されているもの、N端側が生体内で切断され生成したグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基が適当な保護基で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖ペプチドなどの複合ペプチドなども含まれる。
本発明で用いられる部分ペプチドは抗体作成のための抗原としても用いることができる。
【0013】
本発明で用いられるタンパク質または部分ペプチドの塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸、有機酸)や塩基(例、アルカリ金属塩)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸)との塩などが用いられる。
本発明で用いられるタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩は、前述したヒトや温血動物の細胞または組織から公知のタンパク質の精製方法によって製造することもできるし、タンパク質をコードするDNAを含有する形質転換体を培養することによっても製造することができる。また、後述のペプチド合成法に準じて製造することもできる。
ヒトや哺乳動物の組織または細胞から製造する場合、ヒトや哺乳動物の組織または細胞をホモジナイズした後、酸などで抽出を行ない、該抽出液を逆相クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーなどのクロマトグラフィーを組み合わせることにより精製単離することができる。
【0014】
本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、またはそのアミド体の合成には、通常市販のタンパク質合成用樹脂を用いることができる。そのような樹脂としては、例えば、クロロメチル樹脂、ヒドロキシメチル樹脂、ベンズヒドリルアミン樹脂、アミノメチル樹脂、4−ベンジルオキシベンジルアルコール樹脂、4−メチルベンズヒドリルアミン樹脂、PAM樹脂、4−ヒドロキシメチルメチルフェニルアセトアミドメチル樹脂、ポリアクリルアミド樹脂、4−(2’,4’−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル)フェノキシ樹脂、4−(2’,4’−ジメトキシフェニル−Fmocアミノエチル)フェノキシ樹脂などを挙げることができる。このような樹脂を用い、α−アミノ基と側鎖官能基を適当に保護したアミノ酸を、目的とするタンパク質の配列通りに、公知の各種縮合方法に従い、樹脂上で縮合させる。反応の最後に樹脂からタンパク質または部分ペプチドを切り出すと同時に各種保護基を除去し、さらに高希釈溶液中で分子内ジスルフィド結合形成反応を実施し、目的のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはそれらのアミド体を取得する。
上記した保護アミノ酸の縮合に関しては、タンパク質合成に使用できる各種活性化試薬を用いることができるが、特に、カルボジイミド類がよい。カルボジイミド類としては、DCC、N,N’−ジイソプロピルカルボジイミド、N−エチル−N’−(3−ジメチルアミノプロリル)カルボジイミドなどが用いられる。これらによる活性化にはラセミ化抑制添加剤(例えば、HOBt,HOOBt)とともに保護アミノ酸を直接樹脂に添加するかまたは、対称酸無水物またはHOBtエステルあるいはHOOBtエステルとしてあらかじめ保護アミノ酸の活性化を行なった後に樹脂に添加することができる。
【0015】
保護アミノ酸の活性化や樹脂との縮合に用いられる溶媒としては、タンパク質縮合反応に使用しうることが知られている溶媒から適宜選択されうる。例えば、N,N−ジメチルホルムアミド,N,N−ジメチルアセトアミド,N−メチルピロリドンなどの酸アミド類、塩化メチレン,クロロホルムなどのハロゲン化炭化水素類、トリフルオロエタノールなどのアルコール類、ジメチルスルホキシドなどのスルホキシド類、ピリジン,ジオキサン,テトラヒドロフランなどのエーテル類、アセトニトリル,プロピオニトリルなどのニトリル類、酢酸メチル,酢酸エチルなどのエステル類あるいはこれらの適宜の混合物などが用いられる。反応温度はタンパク質結合形成反応に使用され得ることが知られている範囲から適宜選択され、通常約−20℃〜50℃の範囲から適宜選択される。活性化されたアミノ酸誘導体は通常1.5〜4倍過剰で用いられる。ニンヒドリン反応を用いたテストの結果、縮合が不十分な場合には保護基の脱離を行なうことなく縮合反応を繰り返すことにより十分な縮合を行なうことができる。反応を繰り返しても十分な縮合が得られないときには、無水酢酸またはアセチルイミダゾールを用いて未反応アミノ酸をアセチル化することによって、後の反応に影響を与えないようにすることができる。
【0016】
原料のアミノ基の保護基としては、例えば、Z、Boc、t−ペンチルオキシカルボニル、イソボルニルオキシカルボニル、4−メトキシベンジルオキシカルボニル、Cl−Z、Br−Z、アダマンチルオキシカルボニル、トリフルオロアセチル、フタロイル、ホルミル、2−ニトロフェニルスルフェニル、ジフェニルホスフィノチオイル、Fmocなどが用いられる。
カルボキシル基は、例えば、アルキルエステル化(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、t−ブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、2−アダマンチルなどの直鎖状、分枝状もしくは環状アルキルエステル化)、アラルキルエステル化(例えば、ベンジルエステル、4−ニトロベンジルエステル、4−メトキシベンジルエステル、4−クロロベンジルエステル、ベンズヒドリルエステル化)、フェナシルエステル化、ベンジルオキシカルボニルヒドラジド化、t−ブトキシカルボニルヒドラジド化、トリチルヒドラジド化などによって保護することができる。
セリンの水酸基は、例えば、エステル化またはエーテル化によって保護することができる。このエステル化に適する基としては、例えば、アセチル基などの低級(C1-6)アルカノイル基、ベンゾイル基などのアロイル基、ベンジルオキシカルボニル基、エトキシカルボニル基などの炭酸から誘導される基などが用いられる。また、エーテル化に適する基としては、例えば、ベンジル基、テトラヒドロピラニル基、t−ブチル基などである。
チロシンのフェノール性水酸基の保護基としては、例えば、Bzl、Cl2−Bzl、2−ニトロベンジル、Br−Z、t−ブチルなどが用いられる。
ヒスチジンのイミダゾールの保護基としては、例えば、Tos、4−メトキシ−2,3,6−トリメチルベンゼンスルホニル、DNP、ベンジルオキシメチル、Bum、Boc、Trt、Fmocなどが用いられる。
【0017】
原料のカルボキシル基の活性化されたものとしては、例えば、対応する酸無水物、アジド、活性エステル〔アルコール(例えば、ペンタクロロフェノール、2,4,5−トリクロロフェノール、2,4−ジニトロフェノール、シアノメチルアルコール、パラニトロフェノール、HONB、N−ヒドロキシスクシミド、N−ヒドロキシフタルイミド、HOBt)とのエステル〕などが用いられる。原料のアミノ基の活性化されたものとしては、例えば、対応するリン酸アミドが用いられる。
保護基の除去(脱離)方法としては、例えば、Pd−黒あるいはPd−炭素などの触媒の存在下での水素気流中での接触還元や、また、無水フッ化水素、メタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロ酢酸あるいはこれらの混合液などによる酸処理や、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン、ピペリジン、ピペラジンなどによる塩基処理、また液体アンモニア中ナトリウムによる還元なども用いられる。上記酸処理による脱離反応は、一般に約−20℃〜40℃の温度で行なわれるが、酸処理においては、例えば、アニソール、フェノール、チオアニソール、メタクレゾール、パラクレゾール、ジメチルスルフィド、1,4−ブタンジチオール、1,2−エタンジチオールなどのようなカチオン捕捉剤の添加が有効である。また、ヒスチジンのイミダゾール保護基として用いられる2,4−ジニトロフェニル基はチオフェノール処理により除去され、トリプトファンのインドール保護基として用いられるホルミル基は上記の1,2−エタンジチオール、1,4−ブタンジチオールなどの存在下の酸処理による脱保護以外に、希水酸化ナトリウム溶液、希アンモニアなどによるアルカリ処理によっても除去される。
【0018】
原料の反応に関与すべきでない官能基の保護ならびに保護基、およびその保護基の脱離、反応に関与する官能基の活性化などは公知の基または公知の手段から適宜選択しうる。
タンパク質または部分ペプチドのアミド体を得る別の方法としては、例えば、まず、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基をアミド化して保護した後、アミノ基側にペプチド(タンパク質)鎖を所望の鎖長まで延ばした後、該ペプチド鎖のN末端のα−アミノ基の保護基のみを除いたタンパク質または部分ペプチドとC末端のカルボキシル基の保護基のみを除去したタンパク質または部分ペプチドとを製造し、これらのタンパク質またはペプチドを上記したような混合溶媒中で縮合させる。縮合反応の詳細については上記と同様である。縮合により得られた保護タンパク質またはペプチドを精製した後、上記方法によりすべての保護基を除去し、所望の粗タンパク質またはペプチドを得ることができる。この粗タンパク質またはペプチドは既知の各種精製手段を駆使して精製し、主要画分を凍結乾燥することで所望のタンパク質またはペプチドのアミド体を得ることができる。
タンパク質またはペプチドのエステル体を得るには、例えば、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基を所望のアルコール類と縮合しアミノ酸エステルとした後、タンパク質またはペプチドのアミド体と同様にして、所望のタンパク質またはペプチドのエステル体を得ることができる。
【0019】
本発明で用いられる部分ペプチドまたはそれらの塩は、公知のペプチドの合成法に従って、あるいは本発明で用いられるタンパク質を適当なペプチダーゼで切断することによって製造することができる。ペプチドの合成法としては、例えば、固相合成法、液相合成法のいずれによっても良い。すなわち、本発明で用いられる部分ペプチドを構成し得る部分ペプチドもしくはアミノ酸と残余部分とを縮合させ、生成物が保護基を有する場合は保護基を脱離することにより目的のペプチドを製造することができる。公知の縮合方法や保護基の脱離としては、例えば、以下の▲1▼〜▲5▼に記載された方法が挙げられる。
▲1▼M. Bodanszky および M.A. Ondetti、ペプチド・シンセシス (Peptide Synthesis), Interscience Publishers, New York (1966年)
▲2▼SchroederおよびLuebke、ザ・ペプチド(The Peptide), Academic Press, New York (1965年)
▲3▼泉屋信夫他、ペプチド合成の基礎と実験、 丸善(株) (1975年)
▲4▼矢島治明 および榊原俊平、生化学実験講座 1、 タンパク質の化学IV、 205、(1977年)
▲5▼矢島治明監修、続医薬品の開発、第14巻、ペプチド合成、広川書店
また、反応後は通常の精製法、例えば、溶媒抽出・蒸留・カラムクロマトグラフィー・液体クロマトグラフィー・再結晶などを組み合わせて本発明で用いられる部分ペプチドを精製単離することができる。上記方法で得られる部分ペプチドが遊離体である場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって適当な塩に変換することができるし、逆に塩で得られた場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって遊離体または他の塩に変換することができる。
【0020】
本発明で用いられるタンパク質をコードするポリヌクレオチドとしては、前述した本発明で用いられるタンパク質をコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。好ましくはDNAである。DNAとしては、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
ライブラリーに使用するベクターは、バクテリオファージ、プラスミド、コスミド、ファージミドなどいずれであってもよい。また、前記した細胞・組織よりtotalRNAまたはmRNA画分を調製したものを用いて直接 Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction(以下、RT−PCR法と略称する)によって増幅することもできる。
本発明で用いられるタンパク質をコードするDNAとしては、例えば、配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:2で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、前記した配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNAであれば何れのものでもよい。
【0021】
配列番号:2で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:2で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、さらに好ましくは約70%以上、より好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
ハイブリダイゼーションは、公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えば、モレキュラー・クローニング(Molecular Cloning)2nd(J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。より好ましくは、ハイストリンジェントな条件に従って行なうことができる。
ハイストリンジェントな条件とは、例えば、ナトリウム濃度が約19〜40mM、好ましくは約19〜20mMで、温度が約50〜70℃、好ましくは約60〜65℃の条件を示す。特に、ナトリウム濃度が約19mMで温度が約65℃の場合が最も好ましい。
より具体的には、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
【0022】
本発明で用いられる部分ペプチドをコードするDNAとしては、前述した本発明で用いられる部分ペプチドをコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。また、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
本発明で用いられる部分ペプチドをコードするDNAとしては、例えば、配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNAの一部分を有するDNA、または配列番号:2で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、本発明のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするDNAの一部分を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:2で表される塩基配列とハイブリダイズできるDNAは、前記と同意義を示す。
ハイブリダイゼーションの方法およびハイストリンジェントな条件は前記と同様のものが用いられる。
【0023】
本発明で用いられるタンパク質、部分ペプチド(以下、これらをコードするDNAのクローニングおよび発現の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)を完全にコードするDNAのクローニングの手段としては、本発明のタンパク質をコードする塩基配列の一部分を有する合成DNAプライマーを用いてPCR法によって増幅するか、または適当なベクターに組み込んだDNAを本発明のタンパク質の一部あるいは全領域をコードするDNA断片もしくは合成DNAを用いて標識したものとのハイブリダイゼーションによって選別することができる。ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、モレキュラー・クローニング(Molecular Cloning)2nd(J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。
DNAの塩基配列の変換は、PCR、公知のキット、例えば、MutanTM-super Express Km(宝酒造(株))、MutanTM-K(宝酒造(株))等を用いて、ODA-LA PCR法、Gapped duplex法、Kunkel法等の公知の方法あるいはそれらに準じる方法に従って行なうことができる。
クローン化されたタンパク質をコードするDNAは目的によりそのまま、または所望により制限酵素で消化したり、リンカーを付加したりして使用することができる。該DNAはその5’末端側に翻訳開始コドンとしてのATGを有し、また3’末端側には翻訳終止コドンとしてのTAA、TGAまたはTAGを有していてもよい。これらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合成DNAアダプターを用いて付加することもできる。
本発明のタンパク質の発現ベクターは、例えば、(イ)本発明のタンパク質をコードするDNAから目的とするDNA断片を切り出し、(ロ)該DNA断片を適当な発現ベクター中のプロモーターの下流に連結することにより製造することができる。
【0024】
ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド(例、pBR322,pBR325,pUC12,pUC13)、枯草菌由来のプラスミド(例、pUB110,pTP5,pC194)、酵母由来プラスミド(例、pSH19,pSH15)、λファージなどのバクテリオファージ、レトロウイルス,ワクシニアウイルス,バキュロウイルスなどの動物ウイルスなどの他、pA1−11、pXT1、pRc/CMV、pRc/RSV、pcDNAI/Neoなどが用いられる。
本発明で用いられるプロモーターとしては、遺伝子の発現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであればいかなるものでもよい。例えば、動物細胞を宿主として用いる場合は、SRαプロモーター、SV40プロモーター、LTRプロモーター、CMVプロモーター、HSV-TKプロモーターなどが挙げられる。
これらのうち、CMV(サイトメガロウイルス)プロモーター、SRαプロモーターなどを用いるのが好ましい。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、trpプロモーター、lacプロモーター、recAプロモーター、λPLプロモーター、lppプロモーター、T7プロモーターなどが、宿主がバチルス属菌である場合は、SPO1プロモーター、SPO2プロモーター、penPプロモーターなど、宿主が酵母である場合は、PHO5プロモーター、PGKプロモーター、GAPプロモーター、ADHプロモーターなどが好ましい。宿主が昆虫細胞である場合は、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターなどが好ましい。
【0025】
発現ベクターには、以上の他に、所望によりエンハンサー、スプライシングシグナル、ポリA付加シグナル、選択マーカー、SV40複製オリジン(以下、SV40oriと略称する場合がある)などを含有しているものを用いることができる。選択マーカーとしては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素(以下、dhfrと略称する場合がある)遺伝子〔メソトレキセート(MTX)耐性〕、アンピシリン耐性遺伝子(以下、Amprと略称する場合がある)、ネオマイシン耐性遺伝子(以下、Neorと略称する場合がある、G418耐性)等が挙げられる。特に、dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞を用いてdhfr遺伝子を選択マーカーとして使用する場合、目的遺伝子をチミジンを含まない培地によっても選択できる。
また、必要に応じて、宿主に合ったシグナル配列を、本発明のタンパク質のN端末側に付加する。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、PhoA・シグナル配列、OmpA・シグナル配列などが、宿主がバチルス属菌である場合は、α−アミラーゼ・シグナル配列、サブチリシン・シグナル配列などが、宿主が酵母である場合は、MFα・シグナル配列、SUC2・シグナル配列など、宿主が動物細胞である場合には、インシュリン・シグナル配列、α−インターフェロン・シグナル配列、抗体分子・シグナル配列などがそれぞれ利用できる。
このようにして構築された本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターを用いて、形質転換体を製造することができる。
【0026】
宿主としては、例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、酵母、昆虫細胞、昆虫、動物細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌の具体例としては、例えば、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)K12・DH1〔プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),60巻,160(1968)〕,JM103〔ヌクイレック・アシッズ・リサーチ(Nucleic Acids Research),9巻,309(1981)〕,JA221〔ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー(Journal of Molecular Biology),120巻,517(1978)〕,HB101〔ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー,41巻,459(1969)〕,C600〔ジェネティックス(Genetics),39巻,440(1954)〕などが用いられる。
バチルス属菌としては、例えば、バチルス・サブチルス(Bacillus subtilis)MI114〔ジーン,24巻,255(1983)〕,207−21〔ジャーナル・オブ・バイオケミストリー(Journal of Biochemistry),95巻,87(1984)〕などが用いられる。
酵母としては、例えば、サッカロマイセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)AH22,AH22R-,NA87−11A,DKD−5D,20B−12、シゾサッカロマイセス・ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)NCYC1913,NCYC2036、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)KM71などが用いられる。
【0027】
昆虫細胞としては、例えば、ウイルスがAcNPVの場合は、夜盗蛾の幼虫由来株化細胞(Spodoptera frugiperda cell;Sf細胞)、Trichoplusia niの中腸由来のMG1細胞、Trichoplusia niの卵由来のHigh FiveTM細胞、Mamestra brassicae由来の細胞またはEstigmena acrea由来の細胞などが用いられる。ウイルスがBmNPVの場合は、蚕由来株化細胞(Bombyx mori N 細胞;BmN細胞)などが用いられる。該Sf細胞としては、例えば、Sf9細胞(ATCC CRL1711)、Sf21細胞(以上、Vaughn, J.L.ら、イン・ヴィボ(In Vivo),13, 213-217,(1977))などが用いられる。
昆虫としては、例えば、カイコの幼虫などが用いられる〔前田ら、ネイチャー(Nature),315巻,592(1985)〕。
動物細胞としては、例えば、サル細胞COS−7,Vero,チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO細胞と略記),dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO(dhfr-)細胞と略記),マウスL細胞,マウスAtT−20,マウスミエローマ細胞,マウスATDC5細胞,ラットGH3,ヒトFL細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌を形質転換するには、例えば、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンジイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),69巻,2110(1972)やジーン(Gene),17巻,107(1982)などに記載の方法に従って行なうことができる。
【0028】
バチルス属菌を形質転換するには、例えば、モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジェネティックス(Molecular & General Genetics),168巻,111(1979)などに記載の方法に従って行なうことができる。
酵母を形質転換するには、例えば、メソッズ・イン・エンザイモロジー(Methods in Enzymology),194巻,182−187(1991)、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),75巻,1929(1978)などに記載の方法に従って行なうことができる。
昆虫細胞または昆虫を形質転換するには、例えば、バイオ/テクノロジー(Bio/Technology),6, 47-55(1988)などに記載の方法に従って行なうことができる。
動物細胞を形質転換するには、例えば、細胞工学別冊8 新細胞工学実験プロトコール.263−267(1995)(秀潤社発行)、ヴィロロジー(Virology),52巻,456(1973)に記載の方法に従って行なうことができる。
このようにして、タンパク質をコードするDNAを含有する発現ベクターで形質転換された形質転換体を得ることができる。
宿主がエシェリヒア属菌、バチルス属菌である形質転換体を培養する際、培養に使用される培地としては液体培地が適当であり、その中には該形質転換体の生育に必要な炭素源、窒素源、無機物その他が含有せしめられる。炭素源としては、例えば、グルコース、デキストリン、可溶性澱粉、ショ糖など、窒素源としては、例えば、アンモニウム塩類、硝酸塩類、コーンスチープ・リカー、ペプトン、カゼイン、肉エキス、大豆粕、バレイショ抽出液などの無機または有機物質、無機物としては、例えば、塩化カルシウム、リン酸二水素ナトリウム、塩化マグネシウムなどが挙げられる。また、酵母エキス、ビタミン類、生長促進因子などを添加してもよい。培地のpHは約5〜8が望ましい。
【0029】
エシェリヒア属菌を培養する際の培地としては、例えば、グルコース、カザミノ酸を含むM9培地〔ミラー(Miller),ジャーナル・オブ・エクスペリメンツ・イン・モレキュラー・ジェネティックス(Journal of Experiments in Molecular Genetics),431−433,Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972〕が好ましい。ここに必要によりプロモーターを効率よく働かせるために、例えば、3β−インドリルアクリル酸のような薬剤を加えることができる。
宿主がエシェリヒア属菌の場合、培養は通常約15〜43℃で約3〜24時間行ない、必要により、通気や撹拌を加えることもできる。
宿主がバチルス属菌の場合、培養は通常約30〜40℃で約6〜24時間行ない、必要により通気や撹拌を加えることもできる。
宿主が酵母である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、バークホールダー(Burkholder)最小培地〔Bostian, K. L. ら、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),77巻,4505(1980)〕や0.5%カザミノ酸を含有するSD培地〔Bitter, G. A. ら、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),81巻,5330(1984)〕が挙げられる。培地のpHは約5〜8に調整するのが好ましい。培養は通常約20℃〜35℃で約24〜72時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が昆虫細胞または昆虫である形質転換体を培養する際、培地としては、Grace's Insect Medium(Grace, T.C.C.,ネイチャー(Nature),195,788(1962))に非動化した10%ウシ血清等の添加物を適宜加えたものなどが用いられる。培地のpHは約6.2〜6.4に調整するのが好ましい。培養は通常約27℃で約3〜5日間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が動物細胞である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、約5〜20%の胎児牛血清を含むMEM培地〔サイエンス(Science),122巻,501(1952)〕,DMEM培地〔ヴィロロジー(Virology),8巻,396(1959)〕,RPMI 1640培地〔ジャーナル・オブ・ザ・アメリカン・メディカル・アソシエーション(The Journal of the American Medical Association)199巻,519(1967)〕,199培地〔プロシージング・オブ・ザ・ソサイエティ・フォー・ザ・バイオロジカル・メディスン(Proceeding of the Society for the Biological Medicine),73巻,1(1950)〕などが用いられる。pHは約6〜8であるのが好ましい。培養は通常約30℃〜40℃で約15〜60時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
以上のようにして、形質転換体の細胞内、細胞膜または細胞外に本発明のタンパク質を生成せしめることができる。
【0030】
上記培養物から本発明のタンパク質を分離精製するには、例えば、下記の方法により行なうことができる。
本発明のタンパク質を培養菌体あるいは細胞から抽出するに際しては、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、これを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、リゾチームおよび/または凍結融解などによって菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過によりタンパク質の粗抽出液を得る方法などが適宜用いられる。緩衝液の中に尿素や塩酸グアニジンなどの蛋白質変性剤や、トリトンX−100TMなどの界面活性剤が含まれていてもよい。培養液中にタンパク質が分泌される場合には、培養終了後、公知の方法で菌体あるいは細胞と上清とを分離し、上清を集める。
このようにして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれるタンパク質の精製は、公知の分離・精製法を適切に組み合わせて行なうことができる。これらの公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法などの溶解度を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ過法、およびSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動法などの主として分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィーなどの荷電の差を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーなどの疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動法などの等電点の差を利用する方法などが用いられる。
【0031】
かくして得られるタンパク質が遊離体で得られた場合には、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって塩に変換することができ、逆に塩で得られた場合には公知の方法あるいはそれに準じる方法により、遊離体または他の塩に変換することができる。
なお、組換え体が産生するタンパク質を、精製前または精製後に適当なタンパク修飾酵素を作用させることにより、任意に修飾を加えたり、ポリペプチドを部分的に除去することもできる。タンパク修飾酵素としては、例えば、トリプシン、キモトリプシン、アルギニルエンドペプチダーゼ、プロテインキナーゼ、グリコシダーゼなどが用いられる。
かくして生成する本発明のタンパク質の存在は、特異抗体を用いたエンザイムイムノアッセイやウエスタンブロッティングなどにより測定することができる。
【0032】
本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体は、本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩を認識し得る抗体であれば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体の何れであってもよい。
本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、抗体の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)に対する抗体は、本発明のタンパク質を抗原として用い、公知の抗体または抗血清の製造法に従って製造することができる。
〔モノクローナル抗体の作製〕
(a)モノクローナル抗体産生細胞の作製
本発明のタンパク質は、温血動物に対して投与により抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は通常2〜6週毎に1回ずつ、計2〜10回程度行われる。用いられる温血動物としては、例えば、サル、ウサギ、イヌ、モルモット、マウス、ラット、ヒツジ、ヤギ、ニワトリが挙げられるが、マウスおよびラットが好ましく用いられる。
モノクローナル抗体産生細胞の作製に際しては、抗原で免疫された温血動物、例えばマウスから抗体価の認められた個体を選択し最終免疫の2〜5日後に脾臓またはリンパ節を採取し、それらに含まれる抗体産生細胞を同種または異種動物の骨髄腫細胞と融合させることにより、モノクローナル抗体産生ハイブリドーマを調製することができる。抗血清中の抗体価の測定は、例えば、後記の標識化タンパク質と抗血清とを反応させたのち、抗体に結合した標識剤の活性を測定することにより行なうことができる。融合操作は既知の方法、例えば、ケーラーとミルスタインの方法〔ネイチャー(Nature)、256、495 (1975)〕に従い実施することができる。融合促進剤としては、例えば、ポリエチレングリコール(PEG)やセンダイウィルスなどが挙げられるが、好ましくはPEGが用いられる。
【0033】
骨髄腫細胞としては、例えば、NS−1、P3U1、SP2/0、AP−1などの温血動物の骨髄腫細胞が挙げられるが、P3U1が好ましく用いられる。用いられる抗体産生細胞(脾臓細胞)数と骨髄腫細胞数との好ましい比率は1:1〜20:1程度であり、PEG(好ましくはPEG1000〜PEG6000)が10〜80%程度の濃度で添加され、20〜40℃、好ましくは30〜37℃で1〜10分間インキュベートすることにより効率よく細胞融合を実施できる。
モノクローナル抗体産生ハイブリドーマのスクリーニングには種々の方法が使用できるが、例えば、タンパク質抗原を直接あるいは担体とともに吸着させた固相(例、マイクロプレート)にハイブリドーマ培養上清を添加し、次に放射性物質や酵素などで標識した抗免疫グロブリン抗体(細胞融合に用いられる細胞がマウスの場合、抗マウス免疫グロブリン抗体が用いられる)またはプロテインAを加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法、抗免疫グロブリン抗体またはプロテインAを吸着させた固相にハイブリドーマ培養上清を添加し、放射性物質や酵素などで標識したタンパク質を加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法などが挙げられる。
モノクローナル抗体の選別は、公知あるいはそれに準じる方法に従って行なうことができる。通常HAT(ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン)を添加した動物細胞用培地で行なうことができる。選別および育種用培地としては、ハイブリドーマが生育できるものならばどのような培地を用いても良い。例えば、1〜20%、好ましくは10〜20%の牛胎児血清を含むRPMI 1640培地、1〜10%の牛胎児血清を含むGIT培地(和光純薬工業(株))あるいはハイブリドーマ培養用無血清培地(SFM−101、日水製薬(株))などを用いることができる。培養温度は、通常20〜40℃、好ましくは約37℃である。培養時間は、通常5日〜3週間、好ましくは1週間〜2週間である。培養は、通常5%炭酸ガス下で行なうことができる。ハイブリドーマ培養上清の抗体価は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。
【0034】
(b)モノクローナル抗体の精製
モノクローナル抗体の分離精製は、公知の方法、例えば、免疫グロブリンの分離精製法〔例、塩析法、アルコール沈殿法、等電点沈殿法、電気泳動法、イオン交換体(例、DEAE)による吸脱着法、超遠心法、ゲルろ過法、抗原結合固相あるいはプロテインAあるいはプロテインGなどの活性吸着剤により抗体のみを採取し、結合を解離させて抗体を得る特異的精製法〕に従って行なうことができる。
〔ポリクローナル抗体の作製〕
本発明のポリクローナル抗体は、公知あるいはそれに準じる方法に従って製造することができる。例えば、免疫抗原(タンパク質抗原)自体、あるいはそれとキャリアー蛋白質との複合体をつくり、上記のモノクローナル抗体の製造法と同様に温血動物に免疫を行ない、該免疫動物から本発明のタンパク質に対する抗体含有物を採取して、抗体の分離精製を行なうことにより製造することができる。
温血動物を免疫するために用いられる免疫抗原とキャリアー蛋白質との複合体に関し、キャリアー蛋白質の種類およびキャリアーとハプテンとの混合比は、キャリアーに架橋させて免疫したハプテンに対して抗体が効率良くできれば、どの様なものをどの様な比率で架橋させてもよいが、例えば、ウシ血清アルブミンやウシサイログロブリン、ヘモシアニン等を重量比でハプテン1に対し、約0.1〜20、好ましくは約1〜5の割合でカプルさせる方法が用いられる。
また、ハプテンとキャリアーのカプリングには、種々の縮合剤を用いることができるが、グルタルアルデヒドやカルボジイミド、マレイミド活性エステル、チオール基、ジチオビリジル基を含有する活性エステル試薬等が用いられる。
縮合生成物は、温血動物に対して、抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は、通常約2〜6週毎に1回ずつ、計約3〜10回程度行なわれる。
ポリクローナル抗体は、上記の方法で免疫された温血動物の血液、腹水など、好ましくは血液から採取することができる。
抗血清中のポリクローナル抗体価の測定は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。ポリクローナル抗体の分離精製は、上記のモノクローナル抗体の分離精製と同様の免疫グロブリンの分離精製法に従って行なうことができる。
【0035】
本発明で用いられるタンパク質または部分ペプチドをコードするDNA(以下、アンチセンスヌクレオチドの説明においては、これらのDNAを本発明のDNAと略記する場合がある)の塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を有するアンチセンスヌクレオチドとしては、本発明のDNAの塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有し、該DNAの発現を抑制し得る作用を有するものであれば、いずれのアンチセンスヌクレオチドであってもよいが、アンチセンスDNAが好ましい。
本発明のDNAに実質的に相補的な塩基配列とは、例えば、本発明のDNAに相補的な塩基配列(すなわち、本発明のDNAの相補鎖)の全塩基配列あるいは部分塩基配列と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列などが挙げられる。特に、本発明のDNAの相補鎖の全塩基配列うち、(イ)翻訳阻害を指向したアンチセンスヌクレオチドの場合は、本発明のタンパク質のN末端部位をコードする部分の塩基配列(例えば、開始コドン付近の塩基配列など)の相補鎖と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアンチセンスヌクレオチドが、(ロ)RNaseHによるRNA分解を指向するアンチセンスヌクレオチドの場合は、イントロンを含む本発明のDNAの全塩基配列の相補鎖と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアンチセンスヌクレオチドがそれぞれ好適である。
具体的には、配列番号:2または配列番号:3で表わされる塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補的な、もしくは実質的に相補的な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド、好ましくは例えば、配列番号:2または配列番号:3で表わされる塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド(より好ましくは、配列番号:2または配列番号:3で表わされる塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド)が挙げられる。
アンチセンスポリヌクレオチドは通常、10〜40個程度、好ましくは15〜30個程度の塩基から構成される。
ヌクレアーゼなどの加水分解酵素による分解を防ぐために、アンチセンスDNAを構成する各ヌクレオチドのりん酸残基(ホスフェート)は、例えば、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオネートなどの化学修飾りん酸残基に置換されていてもよい。また、各ヌクレオチドの糖(デオキシリボース)は、2’−O−メチル化などの化学修飾糖構造に置換されていてもよいし、塩基部分(ピリミジン、プリン)も化学修飾を受けたものであってもよく、配列番号:2で表わされる塩基配列を有するDNAにハイブリダイズするものであればいずれのものでもよい。これらのアンチセンスヌクレオチドは、公知のDNA合成装置などを用いて製造することができる。
【0036】
本発明に従えば、本発明のタンパク質遺伝子の複製または発現を阻害することのできるアンチセンスヌクレオチド(核酸)を、クローン化した、あるいは決定されたタンパク質をコードするDNAの塩基配列情報に基づき設計し、合成しうる。かかるポリヌクレオチド(核酸)は、本発明のタンパク質遺伝子のRNAとハイブリダイズすることができ、該RNAの合成または機能を阻害することができるか、あるいは本発明のタンパク質関連RNAとの相互作用を介して本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御することができる。本発明のタンパク質関連RNAの選択された配列に相補的なポリヌクレオチド、および本発明のタンパク質関連RNAと特異的にハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドは、生体内および生体外で本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御するのに有用であり、また病気などの治療または診断に有用である。用語「対応する」とは、遺伝子を含めたヌクレオチド、塩基配列または核酸の特定の配列に相同性を有するあるいは相補的であることを意味する。ヌクレオチド、塩基配列または核酸とペプチド(蛋白質)との間で「対応する」とは、ヌクレオチド(核酸)の配列またはその相補体から誘導される指令にあるペプチド(蛋白質)のアミノ酸を通常指している。タンパク質遺伝子の5’端ヘアピンループ、5’端6−ベースペア・リピート、5’端非翻訳領域、ポリペプチド翻訳開始コドン、蛋白質コード領域、ORF翻訳終止コドン、3’端非翻訳領域、3’端パリンドローム領域、および3’端ヘアピンループは好ましい対象領域として選択しうるが、タンパク質遺伝子内の如何なる領域も対象として選択しうる。
目的核酸と、対象領域の少なくとも一部に相補的なポリヌクレオチドとの関係については、目的核酸が対象領域とハイブリダイズすることができる場合は、その目的核酸は、当該対象領域のポリヌクレオチドに対して「アンチセンス」であるということができる。アンチセンス(ポリ)ヌクレオチドは、2−デオキシ−D−リボースを含有しているポリヌクレオチド、D−リボースを含有しているポリヌクレオチド、プリンまたはピリミジン塩基のN−グリコシドであるその他のタイプのポリヌクレオチド、あるいは非ヌクレオチド骨格を有するその他のポリマー(例えば、市販の蛋白質核酸および合成配列特異的な核酸ポリマー)または特殊な結合を含有するその他のポリマー(但し、該ポリマーはDNAやRNA中に見出されるような塩基のペアリングや塩基の付着を許容する配置をもつヌクレオチドを含有する)などが挙げられる。それらは、2本鎖DNA、1本鎖DNA、2本鎖RNA、1本鎖RNA、さらにDNA:RNAハイブリッドであることができ、さらに非修飾ポリヌクレオチド(または非修飾オリゴヌクレオチド)、さらには公知の修飾の付加されたもの、例えば当該分野で知られた標識のあるもの、キャップの付いたもの、メチル化されたもの、1個以上の天然のヌクレオチドを類縁物で置換したもの、分子内ヌクレオチド修飾のされたもの、例えば非荷電結合(例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホルアミデート、カルバメートなど)を持つもの、電荷を有する結合または硫黄含有結合(例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど)を持つもの、例えば蛋白質(ヌクレアーゼ、ヌクレアーゼ・インヒビター、トキシン、抗体、シグナルペプチド、ポリ−L−リジンなど)や糖(例えば、モノサッカライドなど)などの側鎖基を有しているもの、インターカレント化合物(例えば、アクリジン、ソラレンなど)を持つもの、キレート化合物(例えば、金属、放射活性をもつ金属、ホウ素、酸化性の金属など)を含有するもの、アルキル化剤を含有するもの、修飾された結合を持つもの(例えば、αアノマー型の核酸など)であってもよい。ここで「ヌクレオシド」、「ヌクレオチド」および「核酸」とは、プリンおよびピリミジン塩基を含有するのみでなく、修飾されたその他の複素環型塩基をもつようなものを含んでいて良い。こうした修飾物は、メチル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、あるいはその他の複素環を含むものであってよい。修飾されたヌクレオチドおよび修飾されたヌクレオチドはまた糖部分が修飾されていてよく、例えば、1個以上の水酸基がハロゲンとか、脂肪族基などで置換されていたり、あるいはエーテル、アミンなどの官能基に変換されていてよい。
本発明のアンチセンス(ポリ)ヌクレオチド(核酸)は、RNA、DNA、あるいは修飾された核酸(RNA、DNA)である。修飾された核酸の具体例としては核酸の硫黄誘導体やチオホスフェート誘導体、そしてポリヌクレオシドアミドやオリゴヌクレオシドアミドの分解に抵抗性のものが挙げられるが、それに限定されるものではない。本発明のアンチセンス核酸は次のような方針で好ましく設計されうる。すなわち、細胞内でのアンチセンス核酸をより安定なものにする、アンチセンス核酸の細胞透過性をより高める、目標とするセンス鎖に対する親和性をより大きなものにする、そしてもし毒性があるならアンチセンス核酸の毒性をより小さなものにする。
こうして修飾は当該分野で数多く知られており、例えば J. Kawakami et al., Pharm Tech Japan, Vol. 8, pp.247, 1992; Vol. 8, pp.395, 1992; S. T. Crooke et al. ed., Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993 などに開示がある。
本発明のアンチセンス核酸は、変化せしめられたり、修飾された糖、塩基、結合を含有していて良く、リポゾーム、ミクロスフェアのような特殊な形態で供与されたり、遺伝子治療により適用されたり、付加された形態で与えられることができうる。こうして付加形態で用いられるものとしては、リン酸基骨格の電荷を中和するように働くポリリジンのようなポリカチオン体、細胞膜との相互作用を高めたり、核酸の取込みを増大せしめるような脂質(例えば、ホスホリピド、コレステロールなど)といった疎水性のものが挙げられる。付加するに好ましい脂質としては、コレステロールやその誘導体(例えば、コレステリルクロロホルメート、コール酸など)が挙げられる。こうしたものは、核酸の3’端あるいは5’端に付着させることができ、塩基、糖、分子内ヌクレオシド結合を介して付着させることができうる。その他の基としては、核酸の3’端あるいは5’端に特異的に配置されたキャップ用の基で、エキソヌクレアーゼ、RNaseなどのヌクレアーゼによる分解を阻止するためのものが挙げられる。こうしたキャップ用の基としては、ポリエチレングリコール、テトラエチレングリコールなどのグリコールをはじめとした当該分野で知られた水酸基の保護基が挙げられるが、それに限定されるものではない。
アンチセンス核酸の阻害活性は、本発明の形質転換体、本発明の生体内や生体外の遺伝子発現系、あるいは本発明のタンパク質の生体内や生体外の翻訳系を用いて調べることができる。該核酸は公知の各種の方法で細胞に適用できる。
【0037】
以下に、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、本発明のタンパク質と略記する場合がある)、本発明のタンパク質または部分ペプチドをコードするDNA(以下、本発明のDNAと略記する場合がある)、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)、および本発明のDNAのアンチセンスヌクレオチド(以下、本発明のアンチセンスヌクレオチドと略記する場合がある)の用途を説明する。
【0038】
本発明のタンパク質は、がん組織で発現が増加するので、疾患マーカーとして利用することが出来る。すなわち、がん組織における早期診断、症状の重症度の判定、疾患進行の予測のためのマーカーとして有用である。よって、本発明のタンパク質をコードする遺伝子のアンチセンスヌクレオチド、本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物もしくはその塩または本発明のタンパク質に対する抗体を含有する医薬は、例えば、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤などとして使用することができる。
【0039】
(1)疾病に対する医薬候補化合物のスクリーニング
本発明のタンパク質はがん組織で発現が増加し、アポトーシス抑制作用を有するので、本発明のタンパク質の活性を調節(促進または阻害、好ましくは阻害)する化合物またはその塩は、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤として使用することができる。アポトーシス作用調節剤、好ましくはアポトーシス誘導剤としても使用することができる。
また、本発明のタンパク質は抗がん剤(例、パクリタキセルなど)によって誘導されるアポトーシスを抑制する活性を有するので、本発明のタンパク質の活性を調節(促進または阻害、好ましくは阻害)する化合物またはその塩は、抗がん剤感受性増強剤としても使用することができる。
したがって、本発明のタンパク質は、本発明のタンパク質の活性を調節(促進または阻害、好ましくは阻害)する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
すなわち、本発明は、本発明のタンパク質を用いることを特徴とする本発明のタンパク質の活性(例えば、リガンド結合活性、シグナル伝達活性など)を調節(促進または阻害、好ましくは阻害)する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
より具体的には、例えば、(i)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞のリガンド結合活性またはシグナル伝達活性と、(ii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物のリガンド結合活性またはシグナル伝達活性の比較することを特徴する本発明のタンパク質の活性を調節(促進または阻害、好ましくは阻害)する化合物またはその塩のスクリーニング方法が用いられる。
上記スクリーニング方法においては、例えば(i)と(ii)の場合において、リガンド結合活性またはシグナル伝達活性を公知の方法、例えばJ. Immunol. 166(1)巻、15-19頁、2001年に記載の方法またはそれに準じる方法に従って測定し、比較する。
具体的には、リガンド結合促進または細胞内シグナル伝達促進作用を有する化合物をスクリーニングする場合は、(i)本発明のタンパク質発現ベクターを、NF−κBの結合配列をプロモーターまたはエンハンサー中に含有するレポーター遺伝子とともに細胞に導入して培養した場合と、(ii)本発明のタンパク質発現ベクターを、NF−κBの結合配列をプロモーターまたはエンハンサー中に含有するレポーター遺伝子とともに細胞に導入し、試験化合物の存在下、培養した場合の、レポーター発現量を比較する。レポーター発現量は、ルシフェラーゼ活性、アルカリフォスファターゼ活性などを用いたレポータータンパク活性を指標とすることにより測定できる。
具体的には、リガンド結合阻害または細胞内シグナル伝達阻害作用を有する化合物をスクリーニングする場合は、(i)本発明のタンパク質発現ベクターを、NF-κBの結合配列をプロモーターまたはエンハンサー中に含有するレポーター遺伝子とともに細胞に導入し、必要に応じ、(a)微生物細胞破砕液、微生物培養上清、真核細胞破砕液、真核細胞培養上清などリガンドが含まれる液、(b)リガンド自身または(c)天然のリガンドと同等に結合活性を有する物質を添加して培養した場合と、(ii)本発明のタンパク質発現ベクターを、NF−κBの結合配列をプロモーターまたはエンハンサー中に含有するレポーター遺伝子とともに細胞に導入し、必要に応じ、(a)微生物細胞破砕液、微生物培養上清、真核細胞破砕液、真核細胞培養上清などリガンドが含まれる液、(b)リガンド自身または(c)天然のリガンドと同等に結合活性を有する物質を添加して、試験化合物の存在下、培養した場合の、レポーター発現量を測定し、比較する。
上記リガンドとしては、例えば、細菌由来のリポペプチド(好ましくはトリアシル化リポペプチドなど)、または化学合成によって得られるN-palmitoyl-S-dipalmitoylglyceryl(Pam3) Cys- Ser-(Lys)4 (CSK4)、N-palmitolyl-S-dilaurylgryceryl (N-Pam-S-Lau2) CSK4などのトリアシルペプチド、Borrelia burgdorferi由来のouter-surface lipoprotein (OspA)などが用いられる。
レポーター発現量は、ルシフェラーゼ活性、アルカリフォスファターゼ活性などを用いたレポータータンパク活性を指標とすることにより測定できる。
また、本発明で用いられるタンパク質(例、TLR1など)発現の有無における、抗がん剤(例、パクリタキセルなど)に対するアポトーシス活性を公知の方法で測定、比較し、シグナル伝達活性を測ることができる。リガンドの存在および非存在下での、抗がん剤(例、パクリタキセルなど)に対するアポトーシス活性を公知の方法で測定、比較し、シグナル伝達活性を測ることができる。
さらに、本発明で用いられるTLR1のシグナル伝達を、より感度よく測定するために、TLR1シグナル関連分子(例、TLR2、MD2など)を発現する能力を有している細胞を用いてもよいし、TLR1シグナル関連分子(例、TLR2、MD2など)を強制発現させて上記の活性を測定してもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、COS7細胞、CHO細胞、HEK293細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。本発明のタンパク質を発現し得る細胞の培養方法は、前記した本発明の形質変換体の培養法と同様である。
試験化合物としては、例えばペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などがあげられる。
例えば、上記(ii)の場合におけるリガンド結合活性またはシグナル伝達活性が上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上減少させる試験化合物を本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物として、上記(ii)の場合におけるリガンド結合活性またはシグナル伝達活性が上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上上昇させる試験化合物を、本発明のタンパク質の活性を促進する化合物として選択することができる。
【0040】
本発明のタンパク質の活性を阻害する活性を有する化合物は、本発明のタンパク質の生理活性を抑制するための安全で低毒性な医薬、例えば、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして有用である。
本発明のタンパク質の活性を促進する活性を有する化合物は、本発明のタンパク質の作用を増強するための安全で低毒性な医薬として有用である。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、例えば、ペプチド、タンパク、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などから選ばれた化合物である。該化合物の塩としては、前記した本発明のペプチドの塩と同様のものが用いられる。
【0041】
さらに、本発明のタンパク質をコードする遺伝子も、がん組織において発現が増加するので、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を調節する化合物またはその塩も、例えば乳がん、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして有用である。
したがって、本発明のDNAは、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を調節(促進または阻害、好ましくは阻害)する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
スクリーニング方法としては、(iii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合と、(iv)試験化合物の存在下、本発明で用いられるタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合との比較を行うことを特徴とするスクリーニング方法が挙げられる。
上記方法において、(iii)と(iv)の場合における、前記遺伝子の発現量(具体的には、本発明のタンパク質量または前記タンパク質をコードするmRNA量)を測定して、比較する。
試験化合物および本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、上記と同様のものが挙げられる。
タンパク質量の測定は、公知の方法、例えば、本発明のタンパク質を認識する抗体を用いて、細胞抽出液中などに存在する前記タンパク質を、ウェスタン解析、ELISA法などの方法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
mRNA量の測定は、公知の方法、例えば、プローブとして配列番号:2またはその一部を含有する核酸を用いるノーザンハイブリダイゼーション、あるいはプライマーとして配列番号:2またはその一部を含有する核酸を用いるPCR法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
例えば、上記(iv)の場合における遺伝子発現量を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害する試験化合物を、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を抑制する化合物として、上記(iv)の場合における遺伝子発現量を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上上昇させる試験化合物を、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を促進する化合物として、選択することができる。
【0042】
本発明のスクリーニング用キットは、本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、または本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドを産生する能力を有する細胞を含有するものである。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物、例えば、ペプチド、タンパク、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などから選ばれた化合物またはその塩であり、本発明のタンパク質の活性(例、リガンド結合活性またはシグナル伝達活性など)を調節する化合物またはその塩である。
該化合物の塩としては、前記した本発明のタンパク質の塩と同様のものが用いられる。
本発明のタンパク質の活性を調節(好ましくは阻害)する化合物またはその塩、および本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を調節(好ましくは阻害)する化合物またはその塩はそれぞれ、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして有用である。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩を上述の医薬として使用する場合、常套手段に従って製剤化することができる。
【0043】
例えば、経口投与のための組成物としては、固体または液体の剤形、具体的には錠剤(糖衣錠、フィルムコーティング錠を含む)、丸剤、顆粒剤、散剤、カプセル剤(ソフトカプセル剤を含む)、シロップ剤、乳剤、懸濁剤などがあげられる。かかる組成物は公知の方法によって製造され、製剤分野において通常用いられる担体、希釈剤もしくは賦形剤を含有するものである。例えば、錠剤用の担体、賦形剤としては、乳糖、でんぷん、蔗糖、ステアリン酸マグネシウムなどが用いられる。
非経口投与のための組成物としては、例えば、注射剤、坐剤などが用いられ、注射剤は静脈注射剤、皮下注射剤、皮内注射剤、筋肉注射剤、点滴注射剤、関節内注射剤などの剤形を包含する。かかる注射剤は、公知の方法に従って、例えば、上記抗体またはその塩を通常注射剤に用いられる無菌の水性もしくは油性液に溶解、懸濁または乳化することによって調製する。注射用の水性液としては、例えば、生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液などが用いられ、適当な溶解補助剤、例えば、アルコール(例、エタノール)、ポリアルコール(例、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール)、非イオン界面活性剤〔例、ポリソルベート80、HCO−50(polyoxyethylene(50mol)adduct of hydrogenated castor oil)〕などと併用してもよい。油性液としては、例えば、ゴマ油、大豆油などが用いられ、溶解補助剤として安息香酸ベンジル、ベンジルアルコールなどを併用してもよい。調製された注射液は、通常、適当なアンプルに充填される。直腸投与に用いられる坐剤は、上記化合物またはその塩を通常の坐薬用基剤に混合することによって調製される。
【0044】
上記の経口用または非経口用医薬組成物は、活性成分の投与量に適合するような投薬単位の剤形に調製されることが好都合である。かかる投薬単位の剤形としては、錠剤、丸剤、カプセル剤、注射剤(アンプル)、坐剤などが例示され、それぞれの投薬単位剤形当たり通常5〜500mg、とりわけ注射剤では5〜100mg、その他の剤形では10〜250mgの上記抗体が含有されていることが好ましい。
なお前記した各組成物は、上記化合物との配合により好ましくない相互作用を生じない限り他の活性成分を含有してもよい。
このようにして得られる製剤は安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは温血動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、トリ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)に対して経口的にまたは非経口的に投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、その作用、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、乳がんの治療の目的で本発明のタンパク質の活性を調節する化合物またはその塩を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)においては、一日につき該化合物またはその塩を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物またはその塩の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、乳がんの治療の目的で本発明のタンパク質の活性を調節する化合物またはその塩を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)に投与する場合、一日につき該化合物またはその塩を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度をがん病変部に注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
また、上記化合物は、既存の抗がん剤(例、パクリタキセル、ドセタキセルなど)と組み合わせて用いることができ、抗がん剤の正常細胞に障害を及ぼす副作用が軽減される。この際、投与時期は限定されず、これらを投与対象に対し、同時に投与してもよいし、時間差をおいて投与してもよい。投与量は、臨床上用いられている用量を基準として適宜選択することができる。また、上記化合物と抗がん剤の配合比は、投与対象、投与ルート、対象疾患、症状、組み合わせ等に応じて適宜選択することができる。
【0045】
(2)本発明のタンパク質、その部分ペプチドまたはその塩の定量
本発明のタンパク質に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)は、本発明のタンパク質を特異的に認識することができるので、被検液中の本発明のタンパク質の定量、特にサンドイッチ免疫測定法による定量などに使用することができる。
すなわち、本発明は、
(i)本発明の抗体と、被検液および標識化された本発明のタンパク質とを競合的に反応させ、該抗体に結合した標識化された本発明のタンパク質の割合を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法、および
(ii)被検液と担体上に不溶化した本発明の抗体および標識化された本発明の別の抗体とを同時あるいは連続的に反応させたのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法を提供する。
上記(ii)の定量法においては、一方の抗体が本発明のタンパク質のN端部を認識する抗体で、他方の抗体が本発明のタンパク質のC端部に反応する抗体であることが望ましい。
【0046】
また、本発明のタンパク質に対するモノクローナル抗体(以下、本発明のモノクローナル抗体と称する場合がある)を用いて本発明のタンパク質の定量を行なえるほか、組織染色等による検出を行なうこともできる。これらの目的には、抗体分子そのものを用いてもよく、また、抗体分子のF(ab')2、Fab'、あるいはFab画分を用いてもよい。
本発明の抗体を用いる本発明のタンパク質の定量法は、特に制限されるべきものではなく、被測定液中の抗原量(例えば、タンパク質量)に対応した抗体、抗原もしくは抗体−抗原複合体の量を化学的または物理的手段により検出し、これを既知量の抗原を含む標準液を用いて作製した標準曲線より算出する測定法であれば、いずれの測定法を用いてもよい。例えば、ネフロメトリー、競合法、イムノメトリック法およびサンドイッチ法が好適に用いられるが、感度、特異性の点で、後述するサンドイッチ法を用いるのが特に好ましい。
標識物質を用いる測定法に用いられる標識剤としては、例えば、放射性同位元素、酵素、蛍光物質、発光物質、ランタニド元素などが用いられる。放射性同位元素としては、例えば、〔125I〕、〔131I〕、〔3H〕、〔14C〕などが用いられる。上記酵素としては、安定で比活性の大きなものが好ましく、例えば、β−ガラクトシダーゼ、β−グルコシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、パーオキシダーゼ、リンゴ酸脱水素酵素などが用いられる。蛍光物質としては、例えば、フルオレスカミン、フルオレッセンイソチオシアネートなどが用いられる。発光物質としては、例えば、ルミノール、ルミノール誘導体、ルシフェリン、ルシゲニンなどが用いられる。さらに、抗体あるいは抗原と標識剤との結合にビオチン−アビジン系を用いることもできる。
【0047】
抗原あるいは抗体の不溶化に当っては、物理吸着を用いてもよく、また通常タンパク質あるいは酵素等を不溶化、固定化するのに用いられる化学結合を用いる方法でもよい。担体としては、アガロース、デキストラン、セルロースなどの不溶性多糖類、ポリスチレン、ポリアクリルアミド、シリコン等の合成樹脂、あるいはガラス等が挙げられる。
サンドイッチ法においては不溶化した本発明のモノクローナル抗体に被検液を反応させ(1次反応)、さらに標識化した別の本発明のモノクローナル抗体を反応させ(2次反応)たのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することにより被検液中の本発明のタンパク質量を定量することができる。1次反応と2次反応は逆の順序に行っても、また、同時に行なってもよいし時間をずらして行なってもよい。標識化剤および不溶化の方法は前記のそれらに準じることができる。また、サンドイッチ法による免疫測定法において、固相用抗体あるいは標識用抗体に用いられる抗体は必ずしも1種類である必要はなく、測定感度を向上させる等の目的で2種類以上の抗体の混合物を用いてもよい。
本発明のサンドイッチ法による本発明のタンパク質の測定法においては、1次反応と2次反応に用いられる本発明のモノクローナル抗体は、本発明のタンパク質の結合する部位が相異なる抗体が好ましく用いられる。すなわち、1次反応および2次反応に用いられる抗体は、例えば、2次反応で用いられる抗体が、本発明のタンパク質のC端部を認識する場合、1次反応で用いられる抗体は、好ましくはC端部以外、例えばN端部を認識する抗体が用いられる。
【0048】
本発明のモノクローナル抗体をサンドイッチ法以外の測定システム、例えば、競合法、イムノメトリック法あるいはネフロメトリーなどに用いることができる。
競合法では、被検液中の抗原と標識抗原とを抗体に対して競合的に反応させたのち、未反応の標識抗原(F)と、抗体と結合した標識抗原(B)とを分離し(B/F分離)、B,Fいずれかの標識量を測定し、被検液中の抗原量を定量する。本反応法には、抗体として可溶性抗体を用い、B/F分離をポリエチレングリコール、前記抗体に対する第2抗体などを用いる液相法、および、第1抗体として固相化抗体を用いるか、あるいは、第1抗体は可溶性のものを用い第2抗体として固相化抗体を用いる固相化法とが用いられる。
イムノメトリック法では、被検液中の抗原と固相化抗原とを一定量の標識化抗体に対して競合反応させた後固相と液相を分離するか、あるいは、被検液中の抗原と過剰量の標識化抗体とを反応させ、次に固相化抗原を加え未反応の標識化抗体を固相に結合させたのち、固相と液相を分離する。次に、いずれかの相の標識量を測定し被検液中の抗原量を定量する。
また、ネフロメトリーでは、ゲル内あるいは溶液中で抗原抗体反応の結果生じた不溶性の沈降物の量を測定する。被検液中の抗原量が僅かであり、少量の沈降物しか得られない場合にもレーザーの散乱を利用するレーザーネフロメトリーなどが好適に用いられる。
【0049】
これら個々の免疫学的測定法を本発明の定量方法に適用するにあたっては、特別の条件、操作等の設定は必要とされない。それぞれの方法における通常の条件、操作法に当業者の通常の技術的配慮を加えて本発明のタンパク質の測定系を構築すればよい。これらの一般的な技術手段の詳細については、総説、成書などを参照することができる。
例えば、入江 寛編「ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和49年発行)、入江 寛編「続ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和54年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(医学書院、昭和53年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第2版)(医学書院、昭和57年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第3版)(医学書院、昭和62年発行)、「Methods in ENZYMOLOGY」 Vol. 70(Immunochemical Techniques(Part A))、 同書 Vol. 73(Immunochemical Techniques(Part B))、 同書 Vol. 74(Immunochemical Techniques(Part C))、 同書 Vol. 84(Immunochemical Techniques(Part D:Selected Immunoassays))、 同書 Vol. 92(Immunochemical Techniques(Part E:Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods))、 同書 Vol. 121(Immunochemical Techniques(Part I:Hybridoma Technology and Monoclonal Antibodies))(以上、アカデミックプレス社発行)などを参照することができる。
以上のようにして、本発明の抗体を用いることによって、本発明のタンパク質を感度良く定量することができる。
さらには、本発明の抗体を用いて本発明のタンパク質の濃度を定量することによって、本発明のタンパク質の濃度の増加(または減少)が検出された場合、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんである、または将来罹患する可能性が高いと診断することができる。また、本発明のタンパク質の濃度が高い場合、抗がん剤(例、パクリタキセルなど)投与効果が低いと診断することができる。
また、本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在する本発明のタンパク質を検出するために使用することができる。また、本発明のタンパク質を精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中の本発明のタンパク質の検出、被検細胞内における本発明のタンパク質の挙動の分析などのために使用することができる。
【0050】
(3)遺伝子診断薬
本発明のDNAは、例えば、プローブとして使用することにより、ヒトまたは温血動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)における本発明のタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAまたはmRNAの異常(遺伝子異常)を検出することができるので、例えば、該DNAまたはmRNAの損傷、突然変異あるいは発現低下や、該DNAまたはmRNAの増加あるいは発現過多などの遺伝子診断薬として有用である。
本発明のDNAを用いる上記の遺伝子診断は、例えば、公知のノーザンハイブリダイゼーションやPCR−SSCP法(ゲノミックス(Genomics),第5巻,874〜879頁(1989年)、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ユーエスエー(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America),第86巻,2766〜2770頁(1989年))などにより実施することができる。
例えば、ノーザンハイブリダイゼーションにより発現過多または減少が検出された場合やPCR−SSCP法によりDNAの突然変異が検出された場合は、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんである可能性が高いと診断することができる。
【0051】
(4)アンチセンスヌクレオチドを含有する医薬
本発明のDNAに相補的に結合し、該DNAの発現を抑制することができる本発明のアンチセンスヌクレオチドは低毒性であり、生体内における本発明のタンパク質または本発明のDNAの機能(例、リガンド結合活性またはシグナル伝達活性)を抑制することができるので、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして使用することができる。
上記アンチセンスヌクレオチドを上記の予防・治療剤として使用する場合、公知の方法に従って製剤化し、投与することができる。
また、例えば、前記のアンチセンスヌクレオチドを単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、常套手段に従って、ヒトまたは哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的に投与することができる。該アンチセンスヌクレオチドは、そのままで、あるいは摂取促進のために補助剤などの生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与できる。あるいは、エアロゾル化して吸入剤として気管内に局所投与することもできる。
さらに、体内動態の改良、半減期の長期化、細胞内取り込み効率の改善を目的に、前記のアンチセンスヌクレオチドを単独またはリポゾームなどの担体とともに製剤(注射剤)化し、静脈、皮下、関節腔内、がん病変部等に投与してもよい。
該アンチセンスヌクレオチドの投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、乳がんの治療の目的で本発明のアンチセンスヌクレオチドを投与する場合、一般的に成人(体重60kg)においては、一日につき該アンチセンスヌクレオチドを約0.1〜100mg投与する。
さらに、該アンチセンスヌクレオチドは、組織や細胞における本発明のDNAの存在やその発現状況を調べるための診断用オリゴヌクレオチドプローブとして使用することもできる。
上記アンチセンスヌクレオチドと同様に、本発明のタンパク質をコードするRNAの一部を含有する二重鎖RNA、本発明のタンパク質をコードするRNAの一部を含有するリボザイムなども、本発明の遺伝子の発現を抑制することができ、生体内における本発明で用いられるタンパク質または本発明で用いられるDNAの機能を抑制することができるので、例えば、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして使用することができる。
二重鎖RNAは、公知の方法(例、Nature, 411巻, 494頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。
リボザイムは、公知の方法(例、TRENDS in Molecular Medicine, 7巻, 221頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。例えば、本発明のタンパク質をコードするRNAの一部に公知のリボザイムを連結することによって製造することができる。本発明のタンパク質をコードするRNAの一部としては、公知のリボザイムによって切断され得る本発明のRNA上の切断部位に近接した部分(RNA断片)が挙げられる。
上記の二重鎖RNAまたはリボザイムを上記予防・治療剤として使用する場合、アンチセンスポリヌクレオチドと同様にして製剤化し、投与することができる。
上記アンチセンスヌクレオチドと同様に、本発明のタンパク質または本発明のタンパク質をコードするDNAのアプタマーも、本発明の遺伝子の発現を抑制することができ、生体内における本発明で用いられるタンパク質または本発明で用いられるDNAの機能を抑制することができるので、例えば、大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして使用することができる。
アプタマーは、公知の方法に準じて、製造することができる。
【0052】
(5)本発明の抗体を含有する医薬
本発明のタンパク質の活性を中和する作用を有する本発明の抗体は、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などの低毒性で安全な医薬として使用することができる。
本発明の抗体を含有する上記疾患の予防・治療剤などは低毒性であり、そのまま液剤として、または適当な剤型の医薬組成物として、ヒトまたは哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的(例、関節内投与)に投与することができる。投与量は、投与対象、対象疾患、症状、投与ルートなどによっても異なるが、例えば、成人の乳がんの治療・予防のために使用する場合には、本発明の抗体を1回量として、通常0.01〜20mg/kg体重程度、好ましくは0.1〜10mg/kg体重程度、さらに好ましくは0.1〜5mg/kg体重程度を、1日1〜5回程度、好ましくは1日1〜3回程度、粉末吸入剤により投与するのが好都合である。他の非経口投与および経口投与の場合もこれに準ずる量を投与することができる。症状が特に重い場合には、その症状に応じて増量してもよい。
本発明の抗体は、それ自体または適当な医薬組成物として投与することができる。上記投与に用いられる医薬組成物は、上記抗体またはその塩と薬理学的に許容され得る担体、希釈剤もしくは賦形剤とを含むものである。かかる組成物は、経口または非経口投与(例、静脈注射投与)に適する剤形として提供される。
なお前記した各組成物は、上記抗体との配合により好ましくない相互作用を生じない限り他の活性成分を含有してもよい。
【0053】
(6)本発明の「Toll様受容体の活性調節作用を有する化合物またはその塩を含有してなるがんの予防・治療剤」および「Toll様受容体の発現調節作用を有する化合物またはその塩を含有してなるがんの予防・治療剤」について
「Toll様受容体の活性調節作用を有する化合物」は、Toll様受容体の活性調節作用を有する化合物であればいかなるものでもよく、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして用いられる。
「Toll様受容体の発現調節作用を有する化合物」は、Toll様受容体の発現調節作用を有する化合物であればいかなるものでもよく、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス誘導剤、抗がん剤感受性増強剤などとして用いられる。
該予防・治療剤は、上記と同様にして製造される。
【0054】
(7)DNA転移動物
本発明は、外来性の本発明のタンパク質をコードするDNA(以下、本発明の外来性DNAと略記する)またはその変異DNA(本発明の外来性変異DNAと略記する場合がある)を有する非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物、
(2)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である第(1)記載の動物、
(3)ゲッ歯動物がマウスまたはラットである第(2)記載の動物、および
(4)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを含有し、哺乳動物において発現しうる組換えベクターを提供するものである。
本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物(以下、本発明のDNA転移動物と略記する)は、未受精卵、受精卵、精子およびその始原細胞を含む胚芽細胞などに対して、好ましくは、非ヒト哺乳動物の発生における胚発生の段階(さらに好ましくは、単細胞または受精卵細胞の段階でかつ一般に8細胞期以前)に、リン酸カルシウム法、電気パルス法、リポフェクション法、凝集法、マイクロインジェクション法、パーティクルガン法、DEAE−デキストラン法などにより目的とするDNAを転移することによって作出することができる。また、該DNA転移方法により、体細胞、生体の臓器、組織細胞などに目的とする本発明の外来性DNAを転移し、細胞培養、組織培養などに利用することもでき、さらに、これら細胞を上述の胚芽細胞と公知の細胞融合法により融合させることにより本発明のDNA転移動物を作出することもできる。
非ヒト哺乳動物としては、例えば、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、マウス、ラットなどが用いられる。なかでも、病体動物モデル系の作成の面から個体発生および生物サイクルが比較的短く、また、繁殖が容易なゲッ歯動物、とりわけマウス(例えば、純系として、C57BL/6系統,DBA2系統など、交雑系として、B6C3F1系統,BDF1系統,B6D2F1系統,BALB/c系統,ICR系統など)またはラット(例えば、Wistar,SDなど)などが好ましい。
哺乳動物において発現しうる組換えベクターにおける「哺乳動物」としては、上記の非ヒト哺乳動物の他にヒトなどがあげられる。
【0055】
本発明の外来性DNAとは、非ヒト哺乳動物が本来有している本発明のDNAではなく、いったん哺乳動物から単離・抽出された本発明のDNAをいう。
本発明の変異DNAとしては、元の本発明のDNAの塩基配列に変異(例えば、突然変異など)が生じたもの、具体的には、塩基の付加、欠損、他の塩基への置換などが生じたDNAなどが用いられ、また、異常DNAも含まれる。
該異常DNAとしては、異常な本発明のタンパク質を発現させるDNAを意味し、例えば、正常な本発明のタンパク質の機能を抑制するタンパク質を発現させるDNAなどが用いられる。
本発明の外来性DNAは、対象とする動物と同種あるいは異種のどちらの哺乳動物由来のものであってもよい。本発明のDNAを対象動物に転移させるにあたっては、該DNAを動物細胞で発現させうるプロモーターの下流に結合したDNAコンストラクトとして用いるのが一般に有利である。例えば、本発明のヒトDNAを転移させる場合、これと相同性が高い本発明のDNAを有する各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のDNAを発現させうる各種プロモーターの下流に、本発明のヒトDNAを結合したDNAコンストラクト(例、ベクターなど)を対象哺乳動物の受精卵、例えば、マウス受精卵へマイクロインジェクションすることによって本発明のDNAを高発現するDNA転移哺乳動物を作出することができる。
【0056】
本発明のタンパク質の発現ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミド、酵母由来のプラスミド、λファージなどのバクテリオファージ、モロニー白血病ウィルスなどのレトロウィルス、ワクシニアウィルスまたはバキュロウィルスなどの動物ウイルスなどが用いられる。なかでも、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミドまたは酵母由来のプラスミドなどが好ましく用いられる。
上記のDNA発現調節を行なうプロモーターとしては、例えば、▲1▼ウイルス(例、シミアンウイルス、サイトメガロウイルス、モロニー白血病ウイルス、JCウイルス、乳がんウイルス、ポリオウイルスなど)に由来するDNAのプロモーター、▲2▼各種哺乳動物(ヒト、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のプロモーター、例えば、アルブミン、インスリンII、ウロプラキンII、エラスターゼ、エリスロポエチン、エンドセリン、筋クレアチンキナーゼ、グリア線維性酸性タンパク質、グルタチオンS−トランスフェラーゼ、血小板由来成長因子β、ケラチンK1,K10およびK14、コラーゲンI型およびII型、サイクリックAMP依存タンパク質キナーゼβIサブユニット、ジストロフィン、酒石酸抵抗性アルカリフォスファターゼ、心房ナトリウム利尿性因子、内皮レセプターチロシンキナーゼ(一般にTie2と略される)、ナトリウムカリウムアデノシン3リン酸化酵素(Na,K−ATPase)、ニューロフィラメント軽鎖、メタロチオネインIおよびIIA、メタロプロティナーゼ1組織インヒビター、MHCクラスI抗原(H−2L)、H−ras、レニン、ドーパミンβ−水酸化酵素、甲状腺ペルオキシダーゼ(TPO)、ペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)、βアクチン、αおよびβミオシン重鎖、ミオシン軽鎖1および2、ミエリン基礎タンパク質、チログロブリン、Thy−1、免疫グロブリン、H鎖可変部(VNP)、血清アミロイドPコンポーネント、ミオグロビン、トロポニンC、平滑筋αアクチン、プレプロエンケファリンA、バソプレシンなどのプロモーターなどが用いられる。なかでも、全身で高発現することが可能なサイトメガロウイルスプロモーター、ヒトペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)のプロモーター、ヒトおよびニワトリβアクチンプロモーターなどが好適である。
上記ベクターは、DNA転移哺乳動物において目的とするメッセンジャーRNAの転写を終結する配列(一般にターミネターと呼ばれる)を有していることが好ましく、例えば、ウイルス由来および各種哺乳動物由来の各DNAの配列を用いることができ、好ましくは、シミアンウイルスのSV40ターミネターなどが用いられる。
【0057】
その他、目的とする外来性DNAをさらに高発現させる目的で各DNAのスプライシングシグナル、エンハンサー領域、真核DNAのイントロンの一部などをプロモーター領域の5’上流、プロモーター領域と翻訳領域間あるいは翻訳領域の3’下流 に連結することも目的により可能である。
正常な本発明のタンパク質の翻訳領域は、ヒトまたは各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来の肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来DNAおよび市販の各種ゲノムDNAライブラリーよりゲノムDNAの全てあるいは一部として、または肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来RNAより公知の方法により調製された相補DNAを原料として取得することが出来る。また、外来性の異常DNAは、上記の細胞または組織より得られた正常なタンパク質の翻訳領域を点突然変異誘発法により変異した翻訳領域を作製することができる。
該翻訳領域は転移動物において発現しうるDNAコンストラクトとして、前記のプロモーターの下流および所望により転写終結部位の上流に連結させる通常のDNA工学的手法により作製することができる。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの転移は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞のすべてに存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において、本発明の外来性DNAが存在することは、作出動物の後代がすべて、その胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを保持することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを有する。
本発明の外来性正常DNAを転移させた非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して、該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの転移は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに過剰に存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において本発明の外来性DNAが過剰に存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有する。
導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを過剰に有するように繁殖継代することができる。
【0058】
本発明の正常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の正常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を促進することにより最終的に本発明のタンパク質の機能亢進症を発症することがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の正常DNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能亢進症や、本発明のタンパク質が関連する疾患の病態機序の解明およびこれらの疾患の治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、本発明の外来性正常DNAを転移させた哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質に関連する疾患に対する予防・治療剤、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤のスクリーニング試験にも利用可能である。
一方、本発明の外来性異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。さらに、目的とする外来DNAを前述のプラスミドに組み込んで原科として用いることができる。プロモーターとのDNAコンストラク卜は、通常のDNA工学的手法によって作製することができる。受精卵細胞段階における本発明の異常DNAの転移は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において本発明の異常DNAが存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫は、その胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有する。導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを有するように繁殖継代することができる。
【0059】
本発明の異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の異常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を阻害することにより最終的に本発明のタンパク質の機能不活性型不応症となることがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の異常DNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症の病態機序の解明およびこの疾患を治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、具体的な利用可能性としては、本発明の異常DNA高発現動物は、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症における本発明の異常タンパク質による正常タンパク質の機能阻害(dominant negative作用)を解明するモデルとなる。
また、本発明の外来異常DNAを転移させた哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質または機能不活性型不応症に対する予防・治療剤、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤のスクリーニング試験にも利用可能である。
また、上記2種類の本発明のDNA転移動物のその他の利用可能性として、例えば、
▲1▼組織培養のための細胞源としての使用、
▲2▼本発明のDNA転移動物の組織中のDNAもしくはRNAを直接分析するか、またはDNAにより発現されたペプチド組織を分析することによる、本発明のタンパク質により特異的に発現あるいは活性化するペプチドとの関連性についての解析、
▲3▼DNAを有する組織の細胞を標準組織培養技術により培養し、これらを使用して、一般に培養困難な組織からの細胞の機能の研究、
▲4▼上記▲3▼記載の細胞を用いることによる細胞の機能を高めるような薬剤のスクリーニング、および
▲5▼本発明の変異タンパク質を単離精製およびその抗体作製などが考えられる。
【0060】
さらに、本発明のDNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症などを含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の臨床症状を調べることができ、また、本発明のタンパク質に関連する疾患モデルの各臓器におけるより詳細な病理学的所見が得られ、新しい治療方法の開発、さらには、該疾患による二次的疾患の研究および治療に貢献することができる。
また、本発明のDNA転移動物から各臓器を取り出し、細切後、トリプシンなどのタンパク質分解酵素により、遊離したDNA転移細胞の取得、その培養またはその培養細胞の系統化を行なうことが可能である。さらに、本発明のタンパク質産生細胞の特定化、アポトーシス、分化あるいは増殖との関連性、またはそれらにおけるシグナル伝達機構を調べ、それらの異常を調べることなどができ、本発明のタンパク質およびその作用解明のための有効な研究材料となる。
さらに、本発明のDNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症を含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の治療薬の開発を行なうために、上述の検査法および定量法などを用いて、有効で迅速な該疾患治療薬のスクリーニング法を提供することが可能となる。また、本発明のDNA転移動物または本発明の外来性DNA発現ベクターを用いて、本発明のタンパク質が関連する疾患のDNA治療法を検討、開発することが可能である。
【0061】
(8)ノックアウト動物
本発明は、本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞および本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞、
(2)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化された第(1)項記載の胚幹細胞、
(3)ネオマイシン耐性である第(1)項記載の胚幹細胞、
(4)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である第(1)項記載の胚幹細胞、
(5)ゲッ歯動物がマウスである第(4)項記載の胚幹細胞、
(6)本発明のDNAが不活性化された該DNA発現不全非ヒト哺乳動物、
(7)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうる第(6)項記載の非ヒト哺乳動物、
(8)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である第(6)項記載の非ヒト哺乳動物、
(9)ゲッ歯動物がマウスである第(8)項記載の非ヒト哺乳動物、および
(10)第(7)項記載の動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
【0062】
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞とは、該非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAに人為的に変異を加えることにより、DNAの発現能を抑制するか、もしくは該DNAがコードしている本発明のタンパク質の活性を実質的に喪失させることにより、DNAが実質的に本発明のタンパク質の発現能を有さない(以下、本発明のノックアウトDNAと称することがある)非ヒト哺乳動物の胚幹細胞(以下、ES細胞と略記する)をいう。
非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
本発明のDNAに人為的に変異を加える方法としては、例えば、遺伝子工学的手法により該DNA配列の一部又は全部の削除、他DNAを挿入または置換させることによって行なうことができる。これらの変異により、例えば、コドンの読み取り枠をずらしたり、プロモーターあるいはエクソンの機能を破壊することにより本発明のノックアウトDNAを作製すればよい。
【0063】
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞(以下、本発明のDNA不活性化ES細胞または本発明のノックアウトES細胞と略記する)の具体例としては、例えば、目的とする非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAを単離し、そのエクソン部分にネオマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子を代表とする薬剤耐性遺伝子、あるいはlacZ(β−ガラクトシダーゼ遺伝子)、cat(クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子)を代表とするレポーター遺伝子等を挿入することによりエクソンの機能を破壊するか、あるいはエクソン間のイントロン部分に遺伝子の転写を終結させるDNA配列(例えば、polyA付加シグナルなど)を挿入し、完全なメッセンジャーRNAを合成できなくすることによって、結果的に遺伝子を破壊するように構築したDNA配列を有するDNA鎖(以下、ターゲッティングベクターと略記する)を、例えば相同組換え法により該動物の染色体に導入し、得られたES細胞について本発明のDNA上あるいはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析あるいはターゲッティングベクター上のDNA配列とターゲッティングベクター作製に使用した本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列をプライマーとしたPCR法により解析し、本発明のノックアウトES細胞を選別することにより得ることができる。
また、相同組換え法等により本発明のDNAを不活化させる元のES細胞としては、例えば、前述のような既に樹立されたものを用いてもよく、また公知のEvansとKaufmanの方法に準じて新しく樹立したものでもよい。例えば、マウスのES細胞の場合、現在、一般的には129系のES細胞が使用されているが、免疫学的背景がはっきりしていないので、これに代わる純系で免疫学的に遺伝的背景が明らかなES細胞を取得するなどの目的で例えば、C57BL/6マウスやC57BL/6の採卵数の少なさをDBA/2との交雑により改善したBDF1マウス(C57BL/6とDBA/2とのF1)を用いて樹立したものなども良好に用いうる。BDF1マウスは、採卵数が多く、かつ、卵が丈夫であるという利点に加えて、C57BL/6マウスを背景に持つので、これを用いて得られたES細胞は病態モデルマウスを作出したとき、C57BL/6マウスとバッククロスすることでその遺伝的背景をC57BL/6マウスに代えることが可能である点で有利に用い得る。
また、ES細胞を樹立する場合、一般には受精後3.5日目の胚盤胞を使用するが、これ以外に8細胞期胚を採卵し胚盤胞まで培養して用いることにより効率よく多数の初期胚を取得することができる。
また、雌雄いずれのES細胞を用いてもよいが、通常雄のES細胞の方が生殖系列キメラを作出するのに都合が良い。また、煩雑な培養の手間を削減するためにもできるだけ早く雌雄の判別を行なうことが望ましい。
【0064】
ES細胞の雌雄の判定方法としては、例えば、PCR法によりY染色体上の性決定領域の遺伝子を増幅、検出する方法が、その1例としてあげることができる。この方法を使用すれば、従来、核型分析をするのに約106個の細胞数を要していたのに対して、1コロニー程度のES細胞数(約50個)で済むので、培養初期におけるES細胞の第一次セレクションを雌雄の判別で行なうことが可能であり、早期に雄細胞の選定を可能にしたことにより培養初期の手間は大幅に削減できる。
また、第二次セレクションとしては、例えば、G−バンディング法による染色体数の確認等により行うことができる。得られるES細胞の染色体数は正常数の100%が望ましいが、樹立の際の物理的操作等の関係上困難な場合は、ES細胞の遺伝子をノックアウトした後、正常細胞(例えば、マウスでは染色体数が2n=40である細胞)に再びクローニングすることが望ましい。
このようにして得られた胚幹細胞株は、通常その増殖性は大変良いが、個体発生できる能力を失いやすいので、注意深く継代培養することが必要である。例えば、STO繊維芽細胞のような適当なフィーダー細胞上でLIF(1−10000U/ml)存在下に炭酸ガス培養器内(好ましくは、5%炭酸ガス、95%空気または5%酸素、5%炭酸ガス、90%空気)で約37℃で培養するなどの方法で培養し、継代時には、例えば、トリプシン/EDTA溶液(通常0.001−0.5%トリプシン/0.1−5mM EDTA、好ましくは約0.1%トリプシン/1mM EDTA)処理により単細胞化し、新たに用意したフィーダー細胞上に播種する方法などがとられる。このような継代は、通常1−3日毎に行なうが、この際に細胞の観察を行い、形態的に異常な細胞が見受けられた場合はその培養細胞は放棄することが望まれる。
ES細胞は、適当な条件により、高密度に至るまで単層培養するか、または細胞集塊を形成するまで浮遊培養することにより、頭頂筋、内臓筋、心筋などの種々のタイプの細胞に分化させることが可能であり〔M. J. Evans及びM. H. Kaufman, ネイチャー(Nature)第292巻、154頁、1981年;G. R. Martin プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.)第78巻、7634頁、1981年;T. C. Doetschman ら、ジャーナル・オブ・エンブリオロジー・アンド・エクスペリメンタル・モルフォロジー、第87巻、27頁、1985年〕、本発明のES細胞を分化させて得られる本発明のDNA発現不全細胞は、インビトロにおける本発明のタンパク質の細胞生物学的検討において有用である。
【0065】
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、該動物のmRNA量を公知方法を用いて測定して間接的にその発現量を比較することにより、正常動物と区別することが可能である。
該非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、例えば、前述のようにして作製したターゲッティングベクターをマウス胚幹細胞またはマウス卵細胞に導入し、導入によりターゲッティングベクターの本発明のDNAが不活性化されたDNA配列が遺伝子相同組換えにより、マウス胚幹細胞またはマウス卵細胞の染色体上の本発明のDNAと入れ換わる相同組換えをさせることにより、本発明のDNAをノックアウトさせることができる。
本発明のDNAがノックアウトされた細胞は、本発明のDNA上またはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析またはターゲッティングベクター上のDNA配列と、ターゲッティングベクターに使用したマウス由来の本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列とをプライマーとしたPCR法による解析で判定することができる。非ヒト哺乳動物胚幹細胞を用いた場合は、遺伝子相同組換えにより、本発明のDNAが不活性化された細胞株をクローニングし、その細胞を適当な時期、例えば、8細胞期の非ヒト哺乳動物胚または胚盤胞に注入し、作製したキメラ胚を偽妊娠させた該非ヒト哺乳動物の子宮に移植する。作出された動物は正常な本発明のDNA座をもつ細胞と人為的に変異した本発明のDNA座をもつ細胞との両者から構成されるキメラ動物である。該キメラ動物の生殖細胞の一部が変異した本発明のDNA座をもつ場合、このようなキメラ個体と正常個体を交配することにより得られた個体群より、全ての組織が人為的に変異を加えた本発明のDNA座をもつ細胞で構成された個体を、例えば、コートカラーの判定等により選別することにより得られる。このようにして得られた個体は、通常、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体であり、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体同志を交配し、それらの産仔から本発明のタンパク質のホモ発現不全個体を得ることができる。
【0066】
卵細胞を使用する場合は、例えば、卵細胞核内にマイクロインジェクション法でDNA溶液を注入することによりターゲッティングベクターを染色体内に導入したトランスジェニック非ヒト哺乳動物を得ることができ、これらのトランスジェニック非ヒト哺乳動物に比べて、遺伝子相同組換えにより本発明のDNA座に変異のあるものを選択することにより得られる。
このようにして本発明のDNAがノックアウトされている個体は、交配により得られた動物個体も該DNAがノックアウトされていることを確認して通常の飼育環境で飼育継代を行なうことができる。
さらに、生殖系列の取得および保持についても常法に従えばよい。すなわち、該不活化DNAの保有する雌雄の動物を交配することにより、該不活化DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得しうる。得られたホモザイゴート動物は、母親動物に対して、正常個体1,ホモザイゴート複数になるような状態で飼育することにより効率的に得ることができる。ヘテロザイゴート動物の雌雄を交配することにより、該不活化DNAを有するホモザイゴートおよびヘテロザイゴート動物を繁殖継代する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を作出する上で、非常に有用である。
また、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のタンパク質により誘導され得る種々の生物活性を欠失するため、本発明のタンパク質の生物活性の不活性化を原因とする疾病のモデルとなり得るので、これらの疾病の原因究明及び治療法の検討に有用である。
【0067】
(8a)本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニング方法
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニングに用いることができる。
すなわち、本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、該動物の変化を観察・測定することを特徴とする、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病、例えばがんなどに対して治療・予防効果を有する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
該スクリーニング方法において用いられる本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものがあげられる。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などがあげられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
具体的には、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を、試験化合物で処理し、無処理の対照動物と比較し、該動物の各器官、組織、疾病の症状などの変化を指標として試験化合物の治療・予防効果を試験することができる。
試験動物を試験化合物で処理する方法としては、例えば、経口投与、静脈注射などが用いられ、試験動物の症状、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。また、試験化合物の投与量は、投与方法、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。
【0068】
例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんに対して治療・予防効果を有する化合物をスクリーニングする場合、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、試験化合物非投与群とがんの発症度合いの違いやがんの治癒度合いの違いを上記組織で経時的に観察する。
該スクリーニング方法において、試験動物に試験化合物を投与した場合、該試験動物の上記疾患症状が約10%以上、好ましくは約30%以上、より好ましくは約50%以上改善した場合、該試験化合物を上記の疾患に対して治療・予防効果を有する化合物として選択することができる。
該スクリーニング方法を用いて得られる化合物は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のタンパク質の欠損や損傷などによって引き起こされる疾患に対して治療・予防効果を有するので、該疾患に対する安全で低毒性な予防・治療剤などの医薬として使用することができる。さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸、有機酸など)や塩基(例、アルカリ金属など)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸など)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸など)との塩などが用いられる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、該化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の乳がん患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、該化合物を注射剤の形で通常成人(60kgとして)の乳がん患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0069】
(8b)本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物をスクリーニング方法
本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法において、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記した本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物の中でも、本発明のDNAがレポーター遺伝子を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうるものが用いられる。
試験化合物としては、前記と同様のものがあげられる。
レポーター遺伝子としては、前記と同様のものが用いられ、β−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)、可溶性アルカリフォスファターゼ遺伝子またはルシフェラーゼ遺伝子などが好適である。
本発明のDNAをレポーター遺伝子で置換された本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物では、レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの支配下に存在するので、レポーター遺伝子がコードする物質の発現をトレースすることにより、プロモーターの活性を検出することができる。
例えば、本発明のタンパク質をコードするDNA領域の一部を大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)で置換している場合、本来、本発明のタンパク質の発現する組織で、本発明のタンパク質の代わりにβ−ガラクトシダーゼが発現する。従って、例えば、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−gal)のようなβ−ガラクトシダーゼの基質となる試薬を用いて染色することにより、簡便に本発明のタンパク質の動物生体内における発現状態を観察することができる。具体的には、本発明のタンパク質欠損マウスまたはその組織切片をグルタルアルデヒドなどで固定し、リン酸緩衝生理食塩液(PBS)で洗浄後、X−galを含む染色液で、室温または37℃付近で、約30分ないし1時間反応させた後、組織標本を1mM EDTA/PBS溶液で洗浄することによって、β−ガラクトシダーゼ反応を停止させ、呈色を観察すればよい。また、常法に従い、lacZをコードするmRNAを検出してもよい。
上記スクリーニング方法を用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物である。
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸など)や塩基(例、有機酸など)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸など)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸など)との塩などが用いられる。
【0070】
本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物またはその塩は、本発明のタンパク質の発現の調節、該タンパク質の機能を調節することができるので、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤として有用である。
さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質またはその塩を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の乳がん患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を注射剤の形で通常成人(60kgとして)の乳がん患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
このように、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩をスクリーニングする上で極めて有用であり、本発明のDNA発現不全に起因する各種疾患の原因究明または予防・治療剤の開発に大きく貢献することができる。
また、本発明のタンパク質のプロモーター領域を含有するDNAを使って、その下流に種々のタンパクをコードする遺伝子を連結し、これを動物の卵細胞に注入していわゆるトランスジェニック動物(遺伝子移入動物)を作成すれば、特異的にそのタンパク質を合成させ、その生体での作用を検討することも可能となる。さらに上記プロモーター部分に適当なレポーター遺伝子を結合させ、これが発現するような細胞株を樹立すれば、本発明のタンパク質そのものの体内での産生能力を特異的に促進もしくは抑制する作用を持つ低分子化合物の探索系として使用できる。
【0071】
本明細書において、塩基やアミノ酸などを略号で表示する場合、IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclatureによる略号あるいは当該分野における慣用略号に基づくものであり、その例を下記する。またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特に明示しなければL体を示すものとする。
【0072】
また、本明細書中で繁用される置換基、保護基および試薬を下記の記号で表記する。
【0073】
本願明細書の配列表の配列番号は、以下の配列を示す。
〔配列番号:1〕
TLR1のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:2〕
配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有するTLR1をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:3〕
TLR1をコードする全長遺伝子を含むDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:4〕
実施例2で用いられたアンチセンスの塩基配列を示す。
〔配列番号:5〕
実施例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:6〕
実施例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:7〕
実施例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:8〕
実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:9〕
実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:10〕
実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:11〕
実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:12〕
実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:13〕
実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:14〕
実施例3でベクターに挿入したDNA断片の塩基配列を示す。
【0074】
以下において、実施例により本発明をより具体的にするが、この発明はこれらに限定されるものではない。
【実施例】
実施例1
乳がん組織で特異的に発現亢進している遺伝子群を明らかにするため、乳がん組織2例、その他23種類の正常組織から抽出されたtotal RNA(表1)を材料とし、oligonucleotide microarray (Human Genome U95A, U95B, U95C, U95D, U95E; Affymetrix社) を用いて遺伝子発現解析を行った。
実験方法は、Affymetrix社の実験手引き書(Expression analysis technical manual)に従った。その結果、乳がん組織にのみ、TLR1遺伝子の発現が検出された。解析した全ての正常組織では、検出限界以下であった(表2)。
【0075】
【表1】
【表2】
【0076】
実施例2
乳がん特異的に発現が観察されたTLR1遺伝子のアポトーシスに及ぼす影響を解析するために、TLR1アンチセンスオリゴヌクレオチド導入実験を行った。まず、配列番号:3で表される塩基配列に対するアンチセンス(配列番号:4)を設計後、phosphorothioate化オリゴヌクレオチドを合成し、HPLC精製して導入実験に用いた(Amersham Pharmacia Biotech)。コントロールオリゴヌクレオチドとしては配列番号:4で示される塩基配列のリバース配列(配列番号:5)を同様にphosphorothioate化し、HPLC精製して用いた(Amersham Pharmacia Biotech)。
被験細胞として乳がん細胞株MDA−MB−231(In Vitro、14(11)巻、911-915頁、1978年、ATCCより購入)を用い、オリゴヌクレオチド導入前日に18x103個の細胞を24ウェルプレート(Falcon社製)に播種した。オリゴヌクレオチド導入にはOligofectAMINE(Invitrogen社製)を使用し、そのプロトコールに従った。導入後7時間でRNeasy mini kit(Qiagen社製)のプロトコールに従ってRNAを抽出し、ThermoScriptRT-PCR system(GIBCO BRL社製)を用いてcDNAを調製した。RCR反応は、2種のプライマー(配列番号:6および配列番号:7)、およびQuantumRNA 18S Internal Standards (Ambion社製)の18S rRNA用プライマーおよびコンペティマーをマニュアルに従い同時に添加してMultiplexPCRを行った。PCR反応後、反応液を電気泳動し、エチジウムブロミドによって染色されるバンドの強弱をBioImageIQソフトウェア(GenomicSolutions社製)によって18S rRNAのバンド強度で補正後、比較した。
一方、アポトーシスに及ぼす影響はアンチセンスオリゴヌクレオチド導入後3日目にCell death detection ELISA(Roche社製)を用いてコントロールオリゴ導入サンプルと比較した。
その結果、アンチセンス導入後7時間でTLR1の発現(RNA)はコントロール(リバース)オリゴヌクレオチド導入時(100%)に比べ55%に減少した。導入後3日目でアポトーシスはコントロール(100%)に比べ186%に増加していた。
これより、TLR1はがん特異的に発現しているだけでなく、がん細胞の増殖やアポトーシスに関与していることが明らかとなった。
【0077】
実施例3
(1)TLR1、MD2発現ベクターの作製
TLR1の発現系を作製するためにTLR1の全長遺伝子のクローニングを行った。
2種のプライマー(配列番号:8および配列番号:9)を使用し、Marathon ready cDNAライブラリー(Clontech社製)を鋳型として、Pfuポリメラーゼ(Straragene製)添付のプロトコールに従ってPCRを行った。PCRは、10xPfu buffer 2μl、10mM each dNTP mixture(Clontech製) 0.4μl、20mMに調製した上記2種のプライマー 各0.8μl、鋳型cDNA溶液 0.5μl、Pfuポリメラーゼを0.1μlを含む20μlの反応液を、94℃、2分の前処理後、94℃・30秒、55℃・30秒、72℃・3分の反応を42サイクルおこなった後に、72℃・7分反応させることによりおこなった。
PCR反応後、生成物をアガロースゲル電気泳動で分離し、目的のバンドを切り出してpCR4Blunt-TOPO vector(Invitrogen社製)にクローニングした。挿入断片の塩基配列を確認した結果、ヒトTLR1塩基配列と一致していたため、さらに2種のプライマー(配列番号:10および配列番号:11)を用いて上記で得られたベクターを鋳型としてPCRを行った。PCRは、10xPfu buffer 2μl、10mM each dNTP mixture(Clontech製) 0.4μl、50mMに調製した上記2種のプライマー 各0.2μl、鋳型cDNA溶液 0.5μl、Pfuポリメラーゼを0.4μlを含む20μlの反応液を、94℃、2分の前処理後、94℃・30秒、55℃・30秒、72℃・3分の反応を25サイクルおこなった後に、72℃・7分反応させることによりおこなった。Pfuポリメラーゼ(Straragene製)を用いてPCR反応後、pCR4-TOPO vector(Invitrogen社製)添付のプロトコールに従いPCR産物の両末端にAを付加し、生成物をアガロースゲル電気泳動で分離し、目的のバンドを切り出してpCR4-TOPO vector(Invitrogen社製)にクローニングした。配列に誤りの無いことを確認後、制限酵素BclII(ニッポンジーン製)で消化し、同様にBclIIで処理したp3XFLAG-CMV-14(SIGMA製)にLigation kit ver.2(Takara製)を用いて挿入した。配列に誤りの無いことを再度確認し、得られたTLR1発現ベクターを以下の実験に用いた。
一方、2種のプライマー(配列番号:12および配列番号:13)を使用し、ヒト脾臓由来cDNAライブラリー(Clontech社製)を鋳型として、KODポリメラーゼ(東洋紡製)を用いてPCRを行った。PCRは、10xKOD buffer 2μl、2.5mM each dNTP mixture(Clontech製) 1.6μl、50mMに調製した上記2種のプライマー 各0.2μl、鋳型cDNA溶液 1μl、KODポリメラーゼを0.2μlを含む20μlの反応液を、94℃、2分の前処理後、94℃・30秒、55℃・30秒、72℃・3分の反応を42サイクルおこなった後に、72℃・7分反応させることによりおこなった。
PCR反応後、生成物をアガロースゲル電気泳動で分離し、目的のバンドを切り出し、制限酵素KpnI、NotIで消化後、同様の制限酵素で消化したpcDNA3.1/Hyg(+)(Invitrogen製)にライゲーションし、MD2発現ベクターを得た。このベクターへの挿入断片の塩基配列を配列番号:14に示す。挿入断片の塩基配列を確認した結果、ヒトMD2の塩基配列と一致していた。
【0078】
(2)TLR1のレポーター活性に及ぼす影響
次に、TLR1のがん細胞における活性を見るために、上記(1)で得られた発現ベクターをNCI-H1299細胞(ATCCより購入)に導入して種々のレポーター活性に及ぼす影響を見た。
以下に示す発現ベクターのトランスフェクション前日にNCI-H1299株を2×104個ずつ24ウェルプレート(Falcon製)に播種し、Fugene6(Roche製)を用いて添付のプロトコールに従いトランスフェクションを行った。上記実施例3(1)で得られたTLR1発現ベクターおよび対照として用いたpcDNA3.1ベクターは0.19μg/ウェル使用した。レポーターとしては分泌型アルカリフォスファターゼ遺伝子の上流にAP1サイトまたはNF−κBサイトを有するベクター(いずれもClontech製)、または蛍ルシフェラーゼ遺伝子の上流にISREサイトを有するベクター(Clontech製)を0.19μg/ウェル、レポーター活性を補正するために用いたpRL-TK(東洋インキ製)は0.13μg/ウェルを用いた。レポーターである分泌型アルカリフォスファターゼ活性または蛍ルシフェラーゼ活性は、トランスフェクション後2日目にそれぞれGreat EscAPe SEAP Fluorescence Detection Kitキット(Clontech製)、ピッカジーンデュアルシーパンジー ダブル ルシフェラーゼ アッセイシステム(東洋インキ製)のプロトコールに従って測定した。pRL-TKによって発現される海シイタケルシフェラーゼ活性はピッカジーンデュアルシーパンジー ダブル ルシフェラーゼ アッセイシステム(東洋インキ製)のプロトコールに従って測定し、レポーター活性値を補正した。
その結果、TLR1の発現により、AP1レポーター活性は対照として用いたpcDNA3.1ベクターに比して5.6倍、NF−κBレポーター活性は3.3倍、ISREレポーター活性は1.7倍それぞれ亢進していた。
これより、TLR1を発現させることによって、肺がん由来NCI-H1299株では特にリガンドを加えなくともAP1シグナル、NF−κBシグナル、ISREシグナルを作動させることがわかった。
したがって、これらのプロモーター−レポーターアッセイを行うことにより、TLR1シグナル調節作用を有する化合物をスクリーニングできる。
【0079】
(3)パクリタキセルによるアポトーシス誘導に対する影響
次にTLR1シグナル作動ががんに及ぼす効果を見るために、パクリタキセルによるアポトーシス誘導に対する影響を観察した。
発現ベクタートランスフェクション前日に、HCT116(ATCCより購入)を5×105個、10cmディッシュ(Falcon製)に播種し、Fugene6(Roche製)のプロトコールに従ってトランスフェクションを行った。上記実施例3(1)で得られたTLR1発現ベクターおよびMD2発現ベクターを、またはコントロールとして用いたpcDNA3.1ベクター(Invitrogen製)を、いずれもディッシュあたり11μgになるように表3に示した組み合わせで使用した。トランスフェクション後4時間でトリプシン処理によって細胞を回収し、3×103個ずつ96ウェルプレート(Falcon製)に播種し、TLR1のリガンドであるN-palmitoyl-S-dilauryl-glyceryl CSK4(Pam3CSK4)(ペプチド研究所製)を添加(1μg/ml)および/または抗がん剤であるパクリタキセル(Sigma製)を添加(0.125 μM)し、アポトーシスへの影響を見ることとした。
96ウェルプレートで培養2日後に、Cell Death Detection ELISA plus kit(Roche製)を用いて、添付のプロトコールに従いアポトーシスを検出した。図1に示すように、パクリタキセルが存在すると非存在時よりも吸光度が高く、パクリタキセルによりアポトーシスが誘導されていることが確認された(白バー対灰色バー)。それに対し、Pam3CSK4を添加することにより、吸光度が低下していることから、TLR1リガンド添加によって、アポトーシスが低下していることがわかった(灰色バー対斜線バー)。さらにはPam3CSK4を添加しなくともTLR1とMD2をトランスフェクションすることによってパクリタキセルで誘導されるアポトーシスが減少していることがわかった(灰色バー対黒バー)。
このことから、TLR1シグナルが、抗がん剤によるアポトーシスを減弱させる効果があることが明らかとなった。
【0080】
【発明の効果】
本発明で用いられるタンパク質は、がんの診断マーカーであり、したがって、該タンパク質の活性を調節(好ましくは阻害)する化合物またはその塩、該タンパク質の遺伝子の発現を調節(好ましくは阻害)する化合物またはその塩、本発明の抗体、本発明のアンチセンスヌクレオチドなどは、例えば大腸がん、乳がん、肺がん、前立腺がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、脾臓がん、腎がん、膀胱がん、子宮がん、卵巣がん、精巣がん、甲状腺がん、膵臓がん、脳腫瘍または血液腫瘍などのがんの予防・治療剤、アポトーシス促進剤などとして安全な医薬として使用することができ、抗がん剤に耐性を示すがんの治療剤としても使用できる。また、抗がん剤(例、パクリタキセルなど)への感受性を高めるため、既存の抗がん剤の用量を減らし、副作用を軽減すこともできる。
【0081】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 パクリタキセルによるアポトーシス誘導に対する影響を調べた結果を示す。[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION
The present invention relates to a preventive / therapeutic agent and diagnostic agent for cancer.
[0002]
[Prior art]
In cancer chemotherapy, the development of new anti-cancer drugs has improved the life-prolonging effect, and the number of cases toward healing is increasing. However, most anti-cancer agents currently used are highly cytotoxic, which damages DNA or inhibits cell division, and thus damages normal cells to some extent. Strong side effects often appear in the actively divided bone marrow.
In order to comprehensively analyze gene expression, a microarray method in which cDNA or oligonucleotide is immobilized has been developed, and a technique for finding a disease-specific change in gene expression has spread and its usefulness has been confirmed. For example, Affymetrix's GeneChip system is being used extensively in the diagnosis of diseases such as cancer and the discovery of drug discovery target genes.
When an antisense oligonucleotide is introduced into a cell, it hybridizes with RNA having a complementary sequence, induces RNA degradation by RNase H, and inhibits protein translation, or inhibits direct protein synthesis by hybridization. Also bring. Since it is possible to specifically suppress the target gene function, it is frequently used as a gene function analysis means, and some antisense oligonucleotides have been developed for clinical application.
Recently, it has been clarified that the Toll receptor works as a receptor involved in innate immunity in insects where there is no acquired immune mechanism. Toll-like receptors (Toll-like receptors; TLRs), which are homologous to the Toll receptor, are also present in mammals and are also considered to be involved in innate immunity. Nearly 10 TLRs have been cloned to date. For example, TLR2 and TLR6 have been reported to recognize lipoproteins and glycolipids, TLR4 to recognize lipopolysaccharide, TLR5 to recognize Flagellin, and TLR9 to recognize CpG DNA (Nature Immunology 2 (8 ), 675-680, 2001). TLR1 (Proc Natl Acad Sci USA 95 (2), 588-593, 1998) is involved in microbial product recognition in cooperation with TLR2 (Non-patent Document 1: J Immunol. 165 (12)). Vol. 7125-7132 (2000), and inhibition of the action of TLR2 and TLR6 heteroreceptors (Non-patent Document 2: J Immunol. 166 (1), 15-19, 2001) It has been reported. More recently, TLR1 knockout mice have been analyzed, and TLR1 has been reconfirmed to be synergistic with TLR2 in ligand recognition. At the same time, PLR is newly used as a TLR1 ligand. Three CSK Four (Non-patent Document 3: J Immunol. 169 (1), 10-14, 2002) and OspA (Non-patent Document 4: Nat Med. 8 (8), 878-884, 2002) has been reported. In addition, research on signal transduction factors is also proceeding with analysis on TLR2 and TLR4. For example, from the analysis of receptor-interacting serine / threonine kinase-2 (RIPK2) knockout mice, this kinase acts on signal transduction of TLR2 and TLR4. (Non-patent Document 5: Nature. 416 (6877), 190-194, 2002), however, knowledge about the TLR1 signal is very poor.
On the other hand, paclitaxel, which is frequently used as an anticancer agent, exhibits a lipopolysaccharide-like action on mouse macrophages, but Kawasaki et al. Found that this action is due to signals of TLR4 and MD2 (Non-patent Document 6: J Biol Chem. 275 (4), 2251-2254, 2000). However, it is reported that both TLR4 and mouse MD2 are necessary, and that MD2 is species-specific and that paclitaxel has no LPS-like action in human MD2. Most of these TLR1 gene studies are related to cells of the immune system, and there is no report on the relationship between TLR1 gene and cancer (solid cancer).
[Non-Patent Document 1]
J Immunol. 165 (12), 7125-7132, 2000
[Non-Patent Document 2]
J Immunol. 166 (1), 15-19, 2001
[Non-Patent Document 3]
J Immunol. 169 (1), 10-14, 2002
[Non-Patent Document 4]
Nat Med. 8 (8), 878-884, 2002
[Non-Patent Document 5]
Nature.416 (6877), 190-194, 2002
[Non-Patent Document 6]
J Biol Chem. 275 (4), 2251-2254, 2000
[0003]
[Problems to be solved by the invention]
Drugs that target molecules specifically expressed in cancer cells and can inhibit cancer cell growth or induce apoptosis are highly desired. In addition, effective treatments for existing anticancer drug-resistant cancers and drugs that increase sensitivity to existing anticancer agents from the viewpoint of reducing side effects are also eagerly desired.
[0004]
[Means for Solving the Problems]
As a result of intensive studies to solve the above problems, the present inventors have found a gene whose expression is remarkably increased in cancer tissue, and as a result of further investigation based on this finding, the present invention It came to complete.
[0005]
That is, the present invention
(1) Cancer comprising a compound or a salt thereof that inhibits the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a partial peptide thereof, or a salt thereof Preventive and therapeutic agents,
(2) It contains a compound or its salt that inhibits the expression of the gene of the protein or its partial peptide or its salt that contains the same or substantially the same amino acid sequence as SEQ ID NO: 1. Cancer prevention / treatment agents,
(3) a nucleotide sequence complementary or substantially complementary to the nucleotide sequence of a protein having the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a partial peptide thereof, or the An antisense nucleotide containing a portion,
(4) A preventive / therapeutic agent for cancer comprising the antisense nucleotide according to (3) above,
(5) A preventive / therapeutic agent for cancer comprising an antibody against a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, or a partial peptide thereof, or a salt thereof,
(6) Cancer is colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovary The preventive / therapeutic agent according to (1) to (5) above, which is cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor,
(7) a diagnostic agent for cancer comprising an antibody against a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as that represented by SEQ ID NO: 1, or a partial peptide thereof, or a salt thereof;
(8) a diagnostic agent for cancer comprising a DNA encoding a protein having the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a partial peptide thereof,
(9) Cancer is colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovary The diagnostic agent according to (7) or (8) above, which is cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor,
(10) A prophylactic / therapeutic agent for cancer comprising a compound having a Toll-like receptor activity inhibitory action or a salt thereof,
(11) A prophylactic / therapeutic agent for cancer comprising a compound having a Toll-like receptor expression inhibitory action or a salt thereof,
(12) Screening for a prophylactic / therapeutic agent for cancer, comprising using a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as SEQ ID NO: 1, or a partial peptide thereof, or a salt thereof. Method,
(13) A prophylactic / therapeutic agent for cancer, comprising a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a partial peptide thereof, or a salt thereof. Screening kit,
(14) Screening for a prophylactic / therapeutic agent for cancer, comprising using a DNA encoding a protein having the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a partial peptide thereof. Method,
(15) A cancer preventive / therapeutic agent characterized by comprising a DNA encoding a protein having the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a partial peptide thereof. Screening kit,
(16) A prophylactic / therapeutic agent for cancer obtainable by using the screening method according to (12) or (14) or the screening kit according to (13) or (15),
(17) Induction of apoptosis comprising a compound containing an amino acid sequence identical or substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a partial peptide thereof, or a salt thereof, or a salt thereof, or a salt thereof Agent,
(18) A compound or a salt thereof that inhibits the expression of a gene of a protein or a partial peptide thereof or a salt thereof containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Apoptosis inducer,
(19) A method for screening an apoptosis-inducing agent, comprising using a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a partial peptide thereof, or a salt thereof,
(20) A method for screening an apoptosis-inducing agent, comprising using a DNA encoding a protein having the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a partial peptide thereof,
(21) An antibody comprising a compound or a salt thereof that inhibits the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, or a partial peptide thereof, or a salt thereof. Agent sensitivity enhancer,
(22) A compound or a salt thereof that inhibits the expression of a gene of a protein or a partial peptide thereof or a salt thereof containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Anticancer drug sensitivity enhancer,
(23) a compound or a salt thereof that inhibits the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a partial peptide thereof or a salt thereof with respect to a mammal; Or a method for preventing or treating cancer, comprising administering an effective amount of a compound or salt thereof that inhibits the expression of the gene of the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof,
(24) The activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, or a partial peptide thereof, or a salt thereof for producing a prophylactic / therapeutic agent for cancer Provided is a use of a compound or a salt thereof, or a compound or a salt thereof that inhibits the expression of a gene of the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof.
[0006]
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
A protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (hereinafter also referred to as the protein of the present invention or the protein used in the present invention) is human or warm blood Animal (eg, guinea pig, rat, mouse, chicken, rabbit, pig, sheep, cow, monkey, etc.) cells (eg, hepatocytes, splenocytes, neurons, glial cells, pancreatic β cells, bone marrow cells, mesangial cells, Langerhans cells, epidermis cells, epithelial cells, goblet cells, endothelial cells, smooth muscle cells, fibroblasts, fiber cells, muscle cells, adipocytes, immune cells (eg, macrophages, T cells, B cells, natural killer cells, obesity) Cells, neutrophils, basophils, eosinophils, monocytes), megakaryocytes, synoviocytes, chondrocytes, bone cells, osteoblasts, osteoclasts, mammary cells, hepatocytes Or stromal cells, or progenitors of these cells, stem cells or cancer cells) or any tissue in which these cells exist, such as the brain, brain regions (eg, olfactory bulb, amygdala, basal sphere, hippocampus) , Thalamus, hypothalamus, cerebral cortex, medulla, cerebellum), spinal cord, pituitary gland, stomach, pancreas, kidney, liver, gonad, thyroid, gallbladder, bone marrow, adrenal gland, skin, muscle, lung, digestive tract (eg, large intestine, Small intestine), blood vessels, heart, thymus, spleen, submandibular gland, peripheral blood, prostate, testis, ovary, placenta, uterus, bone, joint, skeletal muscle, etc. Also good.
[0007]
The amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is about 50% or more, preferably about 60% or more, more preferably about 70% or more, with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. More preferred is an amino acid sequence having a homology of about 80% or more, particularly preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more.
Examples of the protein containing an amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 include an amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. A protein having substantially the same activity as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is preferable.
[0008]
The substantially equivalent activities include, for example, signal transduction activity (eg, intracellular signal transduction activity of Toll-like receptor (preferably TLR1)), ligand binding activity (eg Toll-like receptor (preferably TLR1)) And the like, and the like. Substantially homogeneous indicates that their properties are qualitatively (eg, physiologically or pharmacologically) homogeneous. Therefore, it is preferable that the signal transduction activity and the ligand binding activity are equal (eg, about 0.01 to 100 times, preferably about 0.1 to 10 times, more preferably 0.5 to 2 times). However, quantitative factors such as the degree of these activities and the molecular weight of the protein may be different.
Examples of the ligand include bacterial-derived lipopeptides (preferably triacylated lipopeptides), or N-palmitoyl-S-dipalmitoylglyceryl (Pam Three ) Cys- Ser- (Lys) Four (CSK Four ), N-palmitolyl-S-dilaurylgryceryl (N-Pam-S-Lau 2 ) CSK Four Triacyl peptides such as Borrelia burgdorferi and outer-surface lipoprotein (OspA) are used. Signal transduction activity and ligand binding activity can be measured according to a known method, for example, the method described in J. Immunol. 166 (1), pages 15-19, 2001 or a method analogous thereto. The TLR family activates the NF-κB signal by ligand binding. Thus, for example, the activity of a protein [eg, Toll-like receptor (eg, TLR1)] used in the present invention is expressed by a reporter gene containing an expression vector of the protein in an NF-κB binding sequence in a promoter or enhancer. (A) microbial cell lysate, microbial culture supernatant, eukaryotic cell lysate, eukaryotic cell culture supernatant and other liquids containing ligand, (b) ligand itself or ( c) A substance having a binding activity equivalent to that of a natural ligand is added, and the expression level of the reporter is measured by a known method. The amount of reporter expression can be measured, for example, using reporter protein activity using luciferase activity, alkaline phosphatase activity, or the like as an index.
In addition, the signal transduction activity can be measured by measuring and comparing the apoptotic activity against anticancer agents (eg, paclitaxel, etc.) in the presence or absence of expression of proteins (eg, TLR1 etc.) used in the present invention. . Apoptotic activity against an anticancer drug (eg, paclitaxel, etc.) in the presence and absence of a ligand can be measured and compared by a known method to measure signal transduction activity.
Furthermore, in order to measure the signal transduction of TLR1 used in the present invention with higher sensitivity, a cell having the ability to express a TLR1 signal-related molecule (eg, TLR2, MD2, etc.) may be used. The above activity may be measured by forcibly expressing a TLR1 signal-related molecule (eg, TLR2, MD2, etc.).
[0009]
Examples of the protein used in the present invention include (1) 1 or 2 or more (for example, about 1 to 100, preferably about 1 to 30 in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, preferably Is an amino acid sequence from which about 1 to 10, more preferably a number (1 to 5) amino acids have been deleted. (2) 1 or 2 or more (for example, 1 to 2) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 An amino acid sequence added with about 100, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5) amino acids, (3) represented by SEQ ID NO: 1. An amino acid in which one or more (for example, about 1 to 100, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5)) amino acids are inserted into the amino acid sequence Array, ▲ 4 1 or 2 or more (for example, about 1 to 100, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably a number (1 to 5) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. And so-called muteins such as proteins containing amino acid sequences in which amino acids are substituted with other amino acids, or (5) amino acid sequences obtained by combining them.
When the amino acid sequence is inserted, deleted or substituted as described above, the position of the insertion, deletion or substitution is not particularly limited.
[0010]
The protein in the present specification has an N-terminus (amino terminus) at the left end and a C-terminus (carboxyl terminus) at the right end according to the convention of peptide designation. The protein used in the present invention, including the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, has a carboxyl group (—COOH), carboxylate (—COO) at the C-terminus. - ), Amide (-CONH 2 ) Or ester (—COOR).
Here, as R in the ester, for example, C such as methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, etc. 1-6 Alkyl groups such as C, such as cyclopentyl, cyclohexyl, etc. 3-8 A cycloalkyl group such as phenyl, α-naphthyl and the like 6-12 Aryl groups such as phenyl-C such as benzyl, phenethyl and the like 1-2 Alkyl groups or α-naphthyl-C such as α-naphthylmethyl 1-2 C such as alkyl group 7-14 Aralkyl groups, pivaloyloxymethyl groups and the like are used.
When the protein used in the present invention has a carboxyl group (or carboxylate) other than the C-terminus, a protein in which the carboxyl group is amidated or esterified is also included in the protein used in the present invention. As the ester in this case, for example, the above C-terminal ester or the like is used.
Further, in the protein used in the present invention, the amino group of the N-terminal amino acid residue (eg, methionine residue) is protected by a protecting group (for example, a C-form such as formyl group, acetyl group, etc.). 1-6 C such as alkanoyl 1-6 A group protected by an acyl group, an N-terminal glutamine residue produced by cleavage in vivo, pyroglutamine oxidized, a substituent on the side chain of an amino acid in the molecule (eg, —OH, —SH) , Amino group, imidazole group, indole group, guanidino group, etc.) are suitable protecting groups (for example, C such as formyl group, acetyl group, etc.) 1-6 C such as alkanoyl group 1-6 Examples thereof include those protected with an acyl group or the like, or complex proteins such as so-called glycoproteins to which sugar chains are bound.
Specific examples of the protein used in the present invention include a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (TLR1).
[0011]
The partial peptide of the protein used in the present invention is a partial peptide of the protein used in the present invention as described above, and preferably any one having the same properties as the protein used in the present invention described above. It may be a thing.
Specifically, for the purpose of preparing the antibody of the present invention described later, a peptide having the 27th to 578th amino acid sequence in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 and the like can be mentioned. For example, it has at least 20 or more, preferably 50 or more, more preferably 70 or more, more preferably 100 or more, most preferably 200 or more amino acid sequences of the constituent amino acid sequences of the protein used in the present invention. Peptides are used.
In addition, the partial peptide used in the present invention has one or more (preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5)) amino acids in its amino acid sequence deleted, or 1 or 2 or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5)) amino acids are added to the amino acid sequence, or the amino acid 1 or 2 or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5)) amino acids are inserted into the sequence, or in the amino acid sequence One or more amino acids (preferably about 1 to 10, more preferably about several, and more preferably about 1 to 5) may be substituted with other amino acids.
[0012]
In the partial peptide used in the present invention, the C-terminus is carboxyl group (—COOH), carboxylate (—COO). - ), Amide (-CONH 2 ) Or ester (—COOR).
Furthermore, the partial peptide used in the present invention includes those having a carboxyl group (or carboxylate) in addition to the C terminus, as well as the N-terminal amino acid residue (eg, the protein used in the present invention described above). , The amino group of the methionine residue) is protected with a protecting group, the N-terminal side is cleaved in vivo and the glutamine residue produced is pyroglutamine oxidized, the substituent on the side chain of the amino acid in the molecule is Also included are those protected with an appropriate protecting group, or complex peptides such as so-called glycopeptides linked to sugar chains.
The partial peptide used in the present invention can also be used as an antigen for antibody production.
[0013]
As a salt of a protein or partial peptide used in the present invention, a salt with a physiologically acceptable acid (eg, inorganic acid, organic acid) or base (eg, alkali metal salt) is used. The acid addition salts that are acceptable are preferred. Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid) or organic acids (eg acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, succinic acid). Acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, succinic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid) and the like.
The protein used in the present invention or a partial peptide thereof or a salt thereof can be produced from the aforementioned human or warm-blooded animal cells or tissues by a known protein purification method, or can include a trait containing DNA encoding the protein. It can also be produced by culturing the transformant. Moreover, it can also manufacture according to the below-mentioned peptide synthesis method.
When producing from human or mammalian tissue or cells, the human or mammalian tissue or cells are homogenized and then extracted with acid, etc., and the extract is subjected to chromatography such as reverse phase chromatography or ion exchange chromatography. Can be purified and isolated.
[0014]
For the synthesis of the protein or partial peptide used in the present invention or a salt thereof, or an amide thereof, a commercially available resin for protein synthesis can be used. Examples of such resins include chloromethyl resin, hydroxymethyl resin, benzhydrylamine resin, aminomethyl resin, 4-benzyloxybenzyl alcohol resin, 4-methylbenzhydrylamine resin, PAM resin, 4-hydroxymethylmethyl. Examples include phenylacetamidomethyl resin, polyacrylamide resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-hydroxymethyl) phenoxy resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-Fmocaminoethyl) phenoxy resin, and the like. it can. Using such a resin, an amino acid in which the α-amino group and the side chain functional group are appropriately protected is condensed on the resin according to various known condensation methods according to the sequence of the target protein. At the end of the reaction, the protein or partial peptide is excised from the resin, and at the same time, various protecting groups are removed, and further, intramolecular disulfide bond forming reaction is performed in a highly diluted solution to obtain the target protein or partial peptide or their amides. To do.
For the above-mentioned condensation of protected amino acids, various activating reagents that can be used for protein synthesis can be used, and carbodiimides are particularly preferable. As the carbodiimide, DCC, N, N′-diisopropylcarbodiimide, N-ethyl-N ′-(3-dimethylaminoprolyl) carbodiimide and the like are used. For activation by these, a protected amino acid is added directly to the resin together with a racemization inhibitor (for example, HOBt, HOBt), or the protected amino acid is activated in advance as a symmetric acid anhydride, HOBt ester or HOBt ester. It can later be added to the resin.
[0015]
The solvent used for the activation of the protected amino acid and the condensation with the resin can be appropriately selected from solvents known to be usable for protein condensation reactions. For example, acid amides such as N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide, N-methylpyrrolidone, halogenated hydrocarbons such as methylene chloride and chloroform, alcohols such as trifluoroethanol, dimethyl sulfoxide, etc. Examples include sulfoxides, ethers such as pyridine, dioxane, and tetrahydrofuran, nitriles such as acetonitrile and propionitrile, esters such as methyl acetate and ethyl acetate, and appropriate mixtures thereof. The reaction temperature is appropriately selected from a range that is known to be usable for protein bond forming reactions, and is usually selected from the range of about -20 ° C to 50 ° C. The activated amino acid derivative is usually used in an excess of 1.5 to 4 times. As a result of a test using the ninhydrin reaction, if the condensation is insufficient, sufficient condensation can be performed by repeating the condensation reaction without removing the protecting group. When sufficient condensation is not obtained even if the reaction is repeated, acetylation of the unreacted amino acid with acetic anhydride or acetylimidazole can prevent the subsequent reaction from being affected.
[0016]
Examples of the protective group for the amino group of the raw material include Z, Boc, t-pentyloxycarbonyl, isobornyloxycarbonyl, 4-methoxybenzyloxycarbonyl, Cl-Z, Br-Z, adamantyloxycarbonyl, and trifluoroacetyl. , Phthaloyl, formyl, 2-nitrophenylsulfenyl, diphenylphosphinothioyl, Fmoc and the like.
The carboxyl group is, for example, alkyl esterified (eg, linear, branched or cyclic alkyl ester such as methyl, ethyl, propyl, butyl, t-butyl, cyclopentyl, cyclohexyl, cycloheptyl, cyclooctyl, 2-adamantyl, etc. ), Aralkyl esterification (for example, benzyl ester, 4-nitrobenzyl ester, 4-methoxybenzyl ester, 4-chlorobenzyl ester, benzhydryl esterification), phenacyl esterification, benzyloxycarbonylhydrazide, t-butoxy It can be protected by carbonyl hydrazation, trityl hydrazation or the like.
The hydroxyl group of serine can be protected, for example, by esterification or etherification. Examples of the group suitable for esterification include, for example, lower (C 1-6 ) Aroyl groups such as alkanoyl group and benzoyl group, groups derived from carbonic acid such as benzyloxycarbonyl group and ethoxycarbonyl group are used. Examples of the group suitable for etherification include a benzyl group, a tetrahydropyranyl group, and a t-butyl group.
Examples of the protecting group for the phenolic hydroxyl group of tyrosine include Bzl, Cl 2 -Bzl, 2-nitrobenzyl, Br-Z, t-butyl and the like are used.
Examples of the protecting group for imidazole of histidine include Tos, 4-methoxy-2,3,6-trimethylbenzenesulfonyl, DNP, benzyloxymethyl, Bum, Boc, Trt, Fmoc, and the like.
[0017]
Examples of the activated carboxyl group of the raw material include a corresponding acid anhydride, azide, active ester [alcohol (eg, pentachlorophenol, 2,4,5-trichlorophenol, 2,4-dinitrophenol, And esters thereof with cyanomethyl alcohol, paranitrophenol, HONB, N-hydroxysuccinimide, N-hydroxyphthalimide, HOBt) and the like. As the activated amino group of the raw material, for example, a corresponding phosphoric acid amide is used.
Examples of the method for removing (eliminating) the protecting group include catalytic reduction in a hydrogen stream in the presence of a catalyst such as Pd-black or Pd-carbon, anhydrous hydrogen fluoride, methanesulfonic acid, trifluoro. Acid treatment with romethanesulfonic acid, trifluoroacetic acid or a mixture thereof, base treatment with diisopropylethylamine, triethylamine, piperidine, piperazine, etc., reduction with sodium in liquid ammonia, and the like are also used. The elimination reaction by the acid treatment is generally performed at a temperature of about −20 ° C. to 40 ° C. In the acid treatment, for example, anisole, phenol, thioanisole, metacresol, paracresol, dimethyl sulfide, 1,4 Addition of a cation scavenger such as -butanedithiol, 1,2-ethanedithiol, etc. is effective. The 2,4-dinitrophenyl group used as the imidazole protecting group of histidine is removed by thiophenol treatment, and the formyl group used as the indole protecting group of tryptophan is the above 1,2-ethanedithiol, 1,4-butane. In addition to deprotection by acid treatment in the presence of dithiol or the like, it can also be removed by alkali treatment with dilute sodium hydroxide solution, dilute ammonia or the like.
[0018]
The protection of the functional group that should not be involved in the reaction of the raw material, the protecting group, the removal of the protecting group, the activation of the functional group involved in the reaction, etc. can be appropriately selected from known groups or known means.
As another method for obtaining an amide form of a protein or partial peptide, for example, first, the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid is amidated and protected, and then the peptide (protein) chain is formed on the amino group side to the desired chain length. After the extension, a protein or partial peptide from which only the N-terminal α-amino group protecting group of the peptide chain is removed and a protein or partial peptide from which only the C-terminal carboxyl group protecting group has been removed are produced, and these The protein or peptide is condensed in a mixed solvent as described above. The details of the condensation reaction are the same as described above. After purifying the protected protein or peptide obtained by condensation, all the protecting groups can be removed by the above method to obtain the desired crude protein or peptide. This crude protein or peptide can be purified using various known purification means, and the main fraction can be lyophilized to obtain an amide form of the desired protein or peptide.
In order to obtain a protein or peptide ester, for example, the α-carboxyl group of the carboxy-terminal amino acid is condensed with a desired alcohol to form an amino acid ester, and then the desired protein or peptide amide is obtained in the same manner as the protein or peptide amide. An ester of a peptide can be obtained.
[0019]
The partial peptide used in the present invention or a salt thereof can be produced according to a known peptide synthesis method or by cleaving the protein used in the present invention with an appropriate peptidase. As a peptide synthesis method, for example, either a solid phase synthesis method or a liquid phase synthesis method may be used. That is, a partial peptide or amino acid that can constitute the partial peptide used in the present invention is condensed with the remaining portion, and when the product has a protective group, the target peptide can be produced by removing the protective group. it can. Examples of known condensation methods and protecting group removal include the methods described in (1) to (5) below.
(1) M. Bodanszky and MA Ondetti, Peptide Synthesis, Interscience Publishers, New York (1966)
(2) Schroeder and Luebke, The Peptide, Academic Press, New York (1965)
(3) Nobuo Izumiya et al., Basics and Experiments of Peptide Synthesis, Maruzen Co., Ltd. (1975)
(4) Haruaki Yajima and Shunpei Sugawara, Biochemistry Experiment Course 1, Protein Chemistry IV, 205, (1977)
(5) Supervised by Yajima Haruaki, Development of follow-up medicine, Volume 14, Peptide synthesis, Hirokawa Shoten
Further, after the reaction, the partial peptide used in the present invention can be purified and isolated by combining ordinary purification methods such as solvent extraction, distillation, column chromatography, liquid chromatography, recrystallization and the like. When the partial peptide obtained by the above method is a free form, it can be converted to an appropriate salt by a known method or a method similar thereto, and conversely, when obtained as a salt, the known method or a method equivalent thereto. It can be converted to the free form or other salts by methods.
[0020]
The polynucleotide encoding the protein used in the present invention may be any as long as it contains the base sequence encoding the protein used in the present invention described above. Preferably it is DNA. The DNA may be any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the cells / tissues described above, cDNA library derived from the cells / tissues described above, and synthetic DNA.
The vector used for the library may be any of bacteriophage, plasmid, cosmid, phagemid and the like. Moreover, it can also be directly amplified by reverse transcriptase polymerase chain reaction (hereinafter abbreviated as RT-PCR method) using a total RNA or mRNA fraction prepared from the cells / tissues described above.
Examples of the DNA encoding the protein used in the present invention include a DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or a hybrid with the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 under highly stringent conditions. Any DNA may be used as long as it encodes a protein containing a soybean base sequence and having substantially the same quality as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
[0021]
Examples of DNA that can hybridize with the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 under highly stringent conditions include, for example, about 50% or more, preferably about 60% or more, with the base sequence represented by SEQ ID NO: 2. More preferably, DNA containing a base sequence having a homology of about 70% or more, more preferably about 80% or more, particularly preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more is used.
Hybridization can be performed according to a known method or a method analogous thereto, for example, the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). Moreover, when using a commercially available library, it can carry out according to the method as described in an attached instruction manual. More preferably, it can be carried out according to highly stringent conditions.
The highly stringent conditions are, for example, conditions in which the sodium concentration is about 19 to 40 mM, preferably about 19 to 20 mM, and the temperature is about 50 to 70 ° C., preferably about 60 to 65 ° C. In particular, the case where the sodium concentration is about 19 mM and the temperature is about 65 ° C. is most preferable.
More specifically, as the DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or the like is used.
[0022]
The DNA encoding the partial peptide used in the present invention may be any DNA as long as it contains a base sequence encoding the partial peptide used in the present invention described above. Further, any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the cells / tissues described above, cDNA library derived from the cells / tissues described above, and synthetic DNA may be used.
Examples of the DNA encoding the partial peptide used in the present invention include DNA having a part of DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2, or the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 and high string A DNA containing a part of a DNA encoding a protein that contains a base sequence that hybridizes under a gentle condition and has substantially the same activity as the protein of the present invention is used.
The DNA that can hybridize with the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 has the same significance as described above.
Hybridization methods and highly stringent conditions are the same as those described above.
[0023]
Means for cloning DNA that completely encodes the protein and partial peptide used in the present invention (hereinafter, in the description of cloning and expression of DNA encoding them, these may be simply abbreviated as the protein of the present invention) As described above, a synthetic DNA primer having a part of the base sequence encoding the protein of the present invention is used to amplify by PCR method, or DNA incorporated into an appropriate vector encodes a part or all region of the protein of the present invention. Can be selected by hybridization with a DNA fragment or synthetic DNA labeled. The hybridization method can be performed according to the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989), for example. Moreover, when using a commercially available library, it can carry out according to the method as described in an attached instruction manual.
DNA base sequence conversion is performed by PCR, a known kit such as Mutan. TM -super Express Km (Takara Shuzo Co., Ltd.), Mutan TM -K (Takara Shuzo Co., Ltd.) can be used according to a known method such as ODA-LA PCR method, Gapped duplex method, Kunkel method or the like, or a method analogous thereto.
The DNA encoding the cloned protein can be used as it is or after digestion with a restriction enzyme or addition of a linker if desired. The DNA may have ATG as a translation initiation codon on the 5 ′ end side, and may have TAA, TGA or TAG as a translation termination codon on the 3 ′ end side. These translation initiation codon and translation termination codon can be added using an appropriate synthetic DNA adapter.
The protein expression vector of the present invention is, for example, (a) excising the target DNA fragment from the DNA encoding the protein of the present invention, and (b) ligating the DNA fragment downstream of the promoter in an appropriate expression vector. Can be manufactured.
[0024]
Examples of vectors include E. coli-derived plasmids (eg, pBR322, pBR325, pUC12, pUC13), Bacillus subtilis-derived plasmids (eg, pUB110, pTP5, pC194), yeast-derived plasmids (eg, pSH19, pSH15), λ phage, and the like. In addition to animal viruses such as bacteriophage, retrovirus, vaccinia virus and baculovirus, pA1-11, pXT1, pRc / CMV, pRc / RSV, pcDNAI / Neo and the like are used.
The promoter used in the present invention may be any promoter as long as it is suitable for the host used for gene expression. For example, when animal cells are used as a host, SRα promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, HSV-TK promoter and the like can be mentioned.
Of these, the CMV (cytomegalovirus) promoter, SRα promoter and the like are preferably used. When the host is Escherichia, trp promoter, lac promoter, recA promoter, λP L When the host is a Bacillus genus, the promoter, lpp promoter, T7 promoter, etc., SPO1 promoter, SPO2 promoter, penP promoter, etc. When the host is yeast, PHO5 promoter, PGK promoter, GAP promoter, ADH promoter, etc. Is preferred. When the host is an insect cell, a polyhedrin promoter, a P10 promoter and the like are preferable.
[0025]
In addition to the above, an expression vector containing an enhancer, a splicing signal, a poly A addition signal, a selection marker, an SV40 replication origin (hereinafter sometimes abbreviated as SV40ori) and the like is used as desired. it can. Examples of selection markers include dihydrofolate reductase (hereinafter sometimes abbreviated as dhfr) gene [methotrexate (MTX) resistance], ampicillin resistance gene (hereinafter Amp). r A neomycin resistance gene (hereinafter Neo) r G418 resistance) and the like. In particular, when a dhfr gene-deficient Chinese hamster cell is used and the dhfr gene is used as a selection marker, the target gene can also be selected by a medium not containing thymidine.
If necessary, a signal sequence suitable for the host is added to the N-terminal side of the protein of the present invention. When the host is Escherichia, PhoA signal sequence, OmpA, signal sequence, etc., and when the host is Bacillus, α-amylase signal sequence, subtilisin signal sequence, etc. are used in yeast. In some cases, MFα • signal sequence, SUC2 • signal sequence, etc. When the host is an animal cell, insulin signal sequence, α-interferon signal sequence, antibody molecule / signal sequence, etc. can be used.
A transformant can be produced using a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention thus constructed.
[0026]
As the host, for example, Escherichia bacteria, Bacillus bacteria, yeast, insect cells, insects, animal cells and the like are used.
Specific examples of the genus Escherichia include, for example, Escherichia coli K12 • DH1 [Procedures of the National Academy of Sciences of the USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 60, 160 (1968)], JM103 [Nucleic Acids Research, 9, 309 (1981)], JA221 [Journal of Molecular Biology (Journal of Molecular Biology). Biology), 120, 517 (1978)], HB101 [Journal of Molecular Biology, 41, 459 (1969)], C600 [Genetics, 39, 440 (1954)], etc. Used.
Examples of Bacillus bacteria include, for example, Bacillus subtilis MI114 [Gen, 24, 255 (1983)], 207-21 [Journal of Biochemistry, 95, 87 (1984). )] Etc. are used.
Examples of yeast include Saccharomyces cerevisiae AH22, AH22R. - NA87-11A, DKD-5D, 20B-12, Schizosaccharomyces pombe NCYC1913, NCYC2036, Pichia pastoris KM71, and the like.
[0027]
As insect cells, for example, when the virus is AcNPV, larvae-derived cell lines (Spodoptera frugiperda cells; Sf cells), MG1 cells derived from the midgut of Trichoplusia ni, High Five derived from eggs of Trichoplusia ni TM Cells, cells derived from Mamestra brassicae or cells derived from Estigmena acrea are used. When the virus is BmNPV, sputum-derived cell lines (Bombyx mori N cells; BmN cells) and the like are used. Examples of the Sf cells include Sf9 cells (ATCC CRL 1711), Sf21 cells (Vaughn, JL et al., In Vivo, 13, 213-217, (1977)).
As insects, for example, silkworm larvae are used [Maeda et al., Nature, 315, 592 (1985)].
Examples of animal cells include monkey cell COS-7, Vero, Chinese hamster cell CHO (hereinafter abbreviated as CHO cell), dhfr gene-deficient Chinese hamster cell CHO (hereinafter referred to as CHO (dhfr). - Abbreviated cells), mouse L cells, mouse AtT-20, mouse myeloma cells, mouse ATDC5 cells, rat GH3, human FL cells and the like.
To transform Escherichia, for example, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 69, 2110 (Proc. Natl. Acad. Sci. USA) 1972), Gene, Vol. 17, 107 (1982), and the like.
[0028]
Transformation of Bacillus can be performed, for example, according to the method described in Molecular & General Genetics, 168, 111 (1979).
To transform yeast, for example, Methods in Enzymology, 194, 182-187 (1991), Processings of the National Academy of Sciences of -The method can be carried out according to the method described in Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929 (1978).
Insect cells or insects can be transformed, for example, according to the method described in Bio / Technology, 6, 47-55 (1988).
In order to transform animal cells, for example, Cell Engineering Supplement 8 New Cell Engineering Experiment Protocol. 263-267 (1995) (published by Shujunsha), Virology, Vol. 52, 456 (1973).
In this way, a transformant transformed with an expression vector containing DNA encoding the protein can be obtained.
When cultivating a transformant whose host is an Escherichia bacterium or Bacillus genus, a liquid medium is suitable as a medium used for the culture, including a carbon source necessary for the growth of the transformant, Nitrogen sources, inorganic substances, etc. are contained. Examples of the carbon source include glucose, dextrin, soluble starch, and sucrose. Examples of the nitrogen source include ammonium salts, nitrates, corn steep liquor, peptone, casein, meat extract, soybean cake, and potato extract. Examples of inorganic or organic substances and inorganic substances include calcium chloride, sodium dihydrogen phosphate, and magnesium chloride. In addition, yeast extract, vitamins, growth promoting factors and the like may be added. The pH of the medium is preferably about 5-8.
[0029]
As a medium for culturing Escherichia, for example, M9 medium containing glucose and casamino acid [Miller, Journal of Experiments in Molecular Genetics] 431-433, Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972]. In order to make the promoter work efficiently as necessary, a drug such as 3β-indolylacrylic acid can be added.
When the host is an Escherichia bacterium, the culture is usually carried out at about 15 to 43 ° C. for about 3 to 24 hours, and if necessary, aeration or agitation can be added.
When the host is a genus Bacillus, the culture is usually performed at about 30 to 40 ° C. for about 6 to 24 hours, and if necessary, aeration or agitation can be added.
When cultivating a transformant whose host is yeast, examples of the medium include a Burkholder minimum medium [Bostian, KL et al., Proceedings of the National Academy of Sciences of Science. The USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 77, 4505 (1980)] and SD medium containing 0.5% casamino acid [Bitter, GA et al., Proceedings of the National -Academy of Sciences of the USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 81, 5330 (1984)]. The pH of the medium is preferably adjusted to about 5-8. The culture is usually performed at about 20 ° C. to 35 ° C. for about 24 to 72 hours, and aeration and agitation are added as necessary.
When culturing a transformant whose host is an insect cell or an insect, a medium such as 10% bovine serum immobilized in Grace's Insect Medium (Grace, TCC, Nature, 195,788 (1962)) is added. What added the thing suitably is used. The pH of the medium is preferably adjusted to about 6.2 to 6.4. The culture is usually performed at about 27 ° C. for about 3 to 5 days, and aeration and agitation are added as necessary.
When cultivating a transformant whose host is an animal cell, examples of the medium include a MEM medium containing about 5 to 20% fetal bovine serum [Science, Vol. 122, 501 (1952)], DMEM medium. [Virology, 8, 396 (1959)], RPMI 1640 medium [The Journal of the American Medical Association 199, 519 (1967)], 199 medium [Proceeding of the Society for the Biological Medicine, Vol. 73, 1 (1950)] is used. The pH is preferably about 6-8. Culture is usually performed at about 30 ° C. to 40 ° C. for about 15 to 60 hours, and aeration and agitation are added as necessary.
As described above, the protein of the present invention can be produced inside the cell, the cell membrane, or outside the cell of the transformant.
[0030]
Separation and purification of the protein of the present invention from the culture can be performed, for example, by the following method.
When extracting the protein of the present invention from cultured cells or cells, after culturing, the cells or cells are collected by a known method, suspended in an appropriate buffer, and subjected to ultrasound, lysozyme and / or freeze-thaw, etc. For example, a method of obtaining a crude protein extract by centrifugation or filtration after destroying cells or cells by the method is appropriately used. Protein denaturants such as urea and guanidine hydrochloride in the buffer, Triton X-100 TM A surfactant such as may be contained. When the protein is secreted into the culture solution, after completion of the culture, the cells or cells and the supernatant are separated by a known method, and the supernatant is collected.
Purification of the protein contained in the thus obtained culture supernatant or extract can be performed by appropriately combining known separation / purification methods. These known separation and purification methods include mainly molecular weights such as methods utilizing solubility such as salting out and solvent precipitation, dialysis, ultrafiltration, gel filtration, and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Method using difference in charge, method using difference in charge such as ion exchange chromatography, method using specific affinity such as affinity chromatography, and difference in hydrophobicity such as reverse phase high performance liquid chromatography A method using a difference in isoelectric point, such as a method, isoelectric focusing method, or the like is used.
[0031]
When the protein thus obtained is obtained in a free form, it can be converted into a salt by a known method or a method analogous thereto, and conversely, when obtained as a salt, by a known method or a method analogous thereto, It can be converted to the free form or other salts.
The protein produced by the recombinant can be arbitrarily modified or the polypeptide can be partially removed by allowing an appropriate protein modifying enzyme to act on the protein before or after purification. Examples of protein modifying enzymes include trypsin, chymotrypsin, arginyl endopeptidase, protein kinase, glycosidase and the like.
The presence of the protein of the present invention thus produced can be measured by enzyme immunoassay or Western blotting using a specific antibody.
[0032]
The antibody to the protein or partial peptide or salt thereof used in the present invention may be either a polyclonal antibody or a monoclonal antibody as long as it can recognize the protein or partial peptide or salt thereof used in the present invention.
An antibody against the protein or partial peptide used in the present invention or a salt thereof (hereinafter, in the description of the antibody, these may be simply abbreviated as the protein of the present invention) is known using the protein of the present invention as an antigen. The antibody or antiserum can be produced according to the production method.
[Production of monoclonal antibodies]
(A) Preparation of monoclonal antibody-producing cells
The protein of the present invention is administered to a warm-blooded animal by itself, together with a carrier or a diluent, at a site where antibody production is possible by administration. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance antibody production ability upon administration. The administration is usually performed once every 2 to 6 weeks, about 2 to 10 times in total. Examples of the warm-blooded animal used include monkeys, rabbits, dogs, guinea pigs, mice, rats, sheep, goats and chickens, and mice and rats are preferably used.
When producing monoclonal antibody-producing cells, select a warm-blooded animal immunized with an antigen, for example, an individual with a confirmed antibody titer from a mouse, and collect spleen or lymph nodes 2 to 5 days after the final immunization. Monoclonal antibody-producing hybridomas can be prepared by fusing the antibody-producing cells to be fused with allogeneic or xenogeneic myeloma cells. The antibody titer in the antiserum can be measured, for example, by reacting the labeled protein described below with the antiserum and then measuring the activity of the labeling agent bound to the antibody. The fusion operation can be performed according to a known method, for example, the method of Kohler and Milstein [Nature, 256, 495 (1975)]. Examples of the fusion promoter include polyethylene glycol (PEG) and Sendai virus. Preferably, PEG is used.
[0033]
Examples of myeloma cells include warm-blooded animal myeloma cells such as NS-1, P3U1, SP2 / 0, AP-1, and P3U1 is preferably used. The preferred ratio between the number of antibody-producing cells (spleen cells) and the number of myeloma cells used is about 1: 1 to 20: 1, and PEG (preferably PEG 1000 to PEG 6000) is added at a concentration of about 10 to 80%. Cell fusion can be efficiently carried out by incubating at 20 to 40 ° C., preferably 30 to 37 ° C. for 1 to 10 minutes.
Various methods can be used to screen for monoclonal antibody-producing hybridomas. For example, the hybridoma culture supernatant is added to a solid phase (eg, microplate) on which a protein antigen is adsorbed directly or together with a carrier, and then a radioactive substance or An anti-immunoglobulin antibody labeled with an enzyme or the like (when the cell used for cell fusion is a mouse, an anti-mouse immunoglobulin antibody is used) or protein A, and a method for detecting a monoclonal antibody bound to a solid phase; Examples include a method in which a hybridoma culture supernatant is added to a solid phase on which a globulin antibody or protein A is adsorbed, a protein labeled with a radioactive substance or an enzyme is added, and a monoclonal antibody bound to the solid phase is detected.
The selection of the monoclonal antibody can be performed according to a known method or a similar method. Usually, it can be performed in a medium for animal cells supplemented with HAT (hypoxanthine, aminopterin, thymidine). As the selection and breeding medium, any medium may be used as long as it can grow a hybridoma. For example, RPMI 1640 medium containing 1-20%, preferably 10-20% fetal calf serum, GIT medium (Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) containing 1-10% fetal calf serum, or serum-free for hybridoma culture A culture medium (SFM-101, Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.) etc. can be used. The culture temperature is usually 20 to 40 ° C, preferably about 37 ° C. The culture time is usually 5 days to 3 weeks, preferably 1 week to 2 weeks. Culturing can usually be performed under 5% carbon dioxide gas. The antibody titer of the hybridoma culture supernatant can be measured in the same manner as the antibody titer in the above antiserum.
[0034]
(B) Purification of monoclonal antibody
Monoclonal antibodies can be separated and purified by known methods such as immunoglobulin separation and purification methods (eg, salting-out method, alcohol precipitation method, isoelectric point precipitation method, electrophoresis method, ion exchanger (eg, DEAE)). Desorption method, ultracentrifugation method, gel filtration method, antigen-binding solid phase or a specific purification method for obtaining an antibody by dissociating the binding using an active adsorbent such as protein A or protein G. it can.
[Preparation of polyclonal antibody]
The polyclonal antibody of the present invention can be produced according to a known method or a method analogous thereto. For example, an immune antigen (protein antigen) itself or a complex of it and a carrier protein is prepared, and a warm-blooded animal is immunized in the same manner as the above-described monoclonal antibody production method, and an antibody against the protein of the present invention is contained from the immunized animal. The product can be produced by collecting and purifying the antibody.
Regarding the complex of immunizing antigen and carrier protein used to immunize warm-blooded animals, the type of carrier protein and the mixing ratio of carrier and hapten are such that antibodies are more effective against hapten immunized by cross-linking to carrier. As long as it is possible, any substance may be cross-linked at any ratio. For example, bovine serum albumin, bovine thyroglobulin, hemocyanin and the like are about 0.1 to 20, preferably about 1 with respect to hapten 1 by weight ratio. A method of coupling at a rate of ˜5 is used.
Various coupling agents can be used for coupling of the hapten and the carrier, but active ester reagents containing glutaraldehyde, carbodiimide, maleimide active ester, thiol group, and dithiobilidyl group are used.
The condensation product is administered to a warm-blooded animal by itself, together with a carrier and a diluent, at a site where antibody production is possible. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance antibody production ability upon administration. Administration is usually performed once every about 2 to 6 weeks, about 3 to 10 times in total.
Polyclonal antibodies can be collected from blood, ascites, etc., preferably from blood of warm-blooded animals immunized by the above method.
The polyclonal antibody titer in the antiserum can be measured in the same manner as the antibody titer in the antiserum described above. Separation and purification of the polyclonal antibody can be performed according to the same immunoglobulin separation and purification method as the above-described monoclonal antibody separation and purification.
[0035]
Complementary or substantially complementary to the base sequence of DNA encoding the protein or partial peptide used in the present invention (hereinafter, in the description of antisense nucleotide, these DNAs may be abbreviated as the DNA of the present invention). An antisense nucleotide having a nucleotide sequence complementary to or a part thereof includes a nucleotide sequence complementary to or substantially complementary to the nucleotide sequence of the DNA of the present invention, Any antisense nucleotide may be used as long as it has an action capable of suppressing expression, but antisense DNA is preferred.
The base sequence substantially complementary to the DNA of the present invention is, for example, about 70 of the total base sequence or partial base sequence of the base sequence complementary to the DNA of the present invention (that is, the complementary strand of the DNA of the present invention). %, Preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more of a base sequence having a homology. In particular, among the entire base sequences of the complementary strand of the DNA of the present invention, (a) in the case of an antisense nucleotide directed to translation inhibition, the base sequence of the portion encoding the N-terminal site of the protein of the present invention (for example, the start codon) An antisense nucleotide having a homology of about 70% or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more with a complementary strand of a nearby base sequence) (b) In the case of an antisense nucleotide directed to RNA degradation by RNase H, it is about 70% or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, most complementary to the complementary strand of the entire base sequence of the DNA of the present invention including introns. Antisense nucleotides having a homology of about 95% or more are preferred respectively.
Specifically, an antisense polynucleotide having a base sequence complementary to or substantially complementary to the base sequence of DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3, or a part thereof Preferably, for example, an antisense polynucleotide having a base sequence complementary to the base sequence of DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3 or a part thereof (more preferably, SEQ ID NO: 2 Or an antisense polynucleotide having a base sequence complementary to the base sequence of the DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 3 or a part thereof.
The antisense polynucleotide is usually composed of about 10 to 40 bases, preferably about 15 to 30 bases.
In order to prevent degradation by a hydrolase such as nuclease, the phosphate residues (phosphates) of each nucleotide constituting the antisense DNA are changed to chemically modified phosphate residues such as phosphorothioate, methylphosphonate and phosphorodithionate. May be substituted. In addition, the sugar (deoxyribose) of each nucleotide may be substituted with a chemically modified sugar structure such as 2′-O-methylation, and the base portion (pyrimidine, purine) is also chemically modified. Any one may be used as long as it hybridizes with DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 2. These antisense nucleotides can be produced using a known DNA synthesizer.
[0036]
According to the present invention, an antisense nucleotide (nucleic acid) capable of inhibiting the replication or expression of the protein gene of the present invention is designed based on the base sequence information of the DNA encoding the cloned or determined protein. Can be synthesized. Such a polynucleotide (nucleic acid) can hybridize with the RNA of the protein gene of the present invention, inhibit the synthesis or function of the RNA, or through interaction with the protein-related RNA of the present invention. Thus, the expression of the protein gene of the present invention can be regulated and controlled. The polynucleotide complementary to the selected sequence of the protein-related RNA of the present invention and the polynucleotide capable of specifically hybridizing with the protein-related RNA of the present invention are the protein gene of the present invention in vivo and in vitro. It is useful for regulating / controlling the expression of and for treating or diagnosing diseases and the like. The term “corresponding” means homologous to or complementary to a specific sequence of nucleotides, base sequences or nucleic acids including genes. “Corresponding” between a nucleotide, base sequence or nucleic acid and peptide (protein) usually refers to the amino acid of the peptide (protein) in the instruction derived from the nucleotide (nucleic acid) sequence or its complement. . 5 'end hairpin loop of protein gene, 5' end 6-base pair repeat, 5 'end untranslated region, polypeptide translation initiation codon, protein coding region, ORF translation stop codon, 3' end untranslated region, 3 ' The end palindromic region and the 3 ′ end hairpin loop can be selected as the preferred region of interest, but any region within the protein gene can be selected as the subject.
Regarding the relationship between the target nucleic acid and a polynucleotide complementary to at least a part of the target region, if the target nucleic acid can hybridize to the target region, the target nucleic acid It can be said that it is “antisense”. Antisense (poly) nucleotides are polynucleotides containing 2-deoxy-D-ribose, polynucleotides containing D-ribose, other types of polynucleotides that are N-glycosides of purine or pyrimidine bases Or other polymers with non-nucleotide backbones (eg, commercially available protein nucleic acids and synthetic sequence specific nucleic acid polymers) or other polymers containing special linkages, provided that the polymers are found in DNA or RNA And a nucleotide having a configuration allowing base attachment). They can be double-stranded DNA, single-stranded DNA, double-stranded RNA, single-stranded RNA, and also DNA: RNA hybrids, and unmodified polynucleotides (or unmodified oligonucleotides), and more publicly known Modified, such as those with labels known in the art, capped, methylated, one or more natural nucleotides replaced with analogs, intramolecular nucleotides Modified, such as those having uncharged bonds (eg, methylphosphonates, phosphotriesters, phosphoramidates, carbamates, etc.), charged or sulfur-containing bonds (eg, phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.) ), For example, proteins (nucleases, nuclease inhibitors, and toxins) , Antibodies, signal peptides, poly-L-lysine, etc.) and sugars (eg, monosaccharides), etc., side chain groups, intercurrent compounds (eg, acridine, psoralen, etc.), chelates Compounds containing compounds (for example, metals, radioactive metals, boron, oxidizing metals, etc.), those containing alkylating agents, those having modified bonds (eg, α-anomeric nucleic acids, etc.) It may be. Here, the “nucleoside”, “nucleotide” and “nucleic acid” may include not only purine and pyrimidine bases but also those having other modified heterocyclic bases. Such modifications may include methylated purines and pyrimidines, acylated purines and pyrimidines, or other heterocycles. Modified nucleotides and modified nucleotides may also be modified at the sugar moiety, for example, one or more hydroxyl groups are replaced by halogens, aliphatic groups, etc., or functional groups such as ethers, amines, etc. It may have been converted.
The antisense (poly) nucleotide (nucleic acid) of the present invention is RNA, DNA, or modified nucleic acid (RNA, DNA). Specific examples of the modified nucleic acid include, but are not limited to, nucleic acid sulfur derivatives and thiophosphate derivatives, and those resistant to degradation of polynucleoside amides and oligonucleoside amides. The antisense nucleic acid of the present invention can be preferably designed according to the following policy. That is, to make the antisense nucleic acid more stable in the cell, to increase the cell permeability of the antisense nucleic acid, to increase the affinity for the target sense strand, and to be antitoxic if toxic Make sense nucleic acids less toxic.
Thus, many modifications are known in the art, such as J. Kawakami et al., Pharm Tech Japan, Vol. 8, pp. 247, 1992; Vol. 8, pp. 395, 1992; ST Crooke et al. Ed ., Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993, etc.
The antisense nucleic acid of the present invention may be altered or contain modified sugars, bases and bonds, provided in special forms such as liposomes, microspheres, applied by gene therapy, It can be given in an added form. In this way, the additional form includes polycationic substances such as polylysine that acts to neutralize the charge of the phosphate group skeleton, lipids that enhance interaction with cell membranes and increase nucleic acid uptake ( For example, hydrophobic substances such as phospholipids and cholesterols). Preferred lipids to be added include cholesterol and derivatives thereof (for example, cholesteryl chloroformate, cholic acid, etc.). These can be attached to the 3 ′ end or 5 ′ end of the nucleic acid and can be attached via a base, sugar, or intramolecular nucleoside bond. Examples of the other group include a cap group specifically arranged at the 3 ′ end or 5 ′ end of a nucleic acid, which prevents degradation by a nuclease such as exonuclease or RNase. Such capping groups include, but are not limited to, hydroxyl protecting groups known in the art, including glycols such as polyethylene glycol and tetraethylene glycol.
The inhibitory activity of the antisense nucleic acid can be examined using the transformant of the present invention, the in vivo or in vitro gene expression system of the present invention, or the in vivo or in vitro translation system of the protein of the present invention. The nucleic acid can be applied to cells by various known methods.
[0037]
The protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter sometimes abbreviated as the protein of the present invention), the DNA encoding the protein or partial peptide of the present invention (hereinafter abbreviated as the DNA of the present invention) An antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter sometimes abbreviated as the antibody of the present invention), and an antisense nucleotide of the DNA of the present invention (hereinafter referred to as the antisense nucleotide of the present invention). The application of which may be abbreviated) will be described.
[0038]
Since the expression of the protein of the present invention increases in cancer tissues, it can be used as a disease marker. That is, it is useful as a marker for early diagnosis in cancer tissues, determination of the severity of symptoms, and prediction of disease progression. Therefore, a medicament containing an antisense nucleotide of a gene encoding the protein of the present invention, a compound or a salt thereof that inhibits the activity of the protein of the present invention, or an antibody against the protein of the present invention is, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer. , Prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer It can be used as a prophylactic / therapeutic agent for cancer such as brain tumor or blood tumor, apoptosis inducer and the like.
[0039]
(1) Screening of drug candidate compounds for disease
Since the expression of the protein of the present invention increases in cancer tissue and has an inhibitory effect on apoptosis, a compound or a salt thereof that regulates (promotes or inhibits, preferably inhibits) the activity of the protein of the present invention is, for example, colon cancer, Breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, It can be used as a prophylactic / therapeutic agent for cancer such as pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor. It can also be used as an apoptosis action regulator, preferably an apoptosis inducer.
In addition, since the protein of the present invention has an activity of suppressing apoptosis induced by an anticancer agent (eg, paclitaxel, etc.), a compound that regulates (promotes or inhibits, preferably inhibits) the activity of the protein of the present invention The salt can also be used as an anticancer drug sensitivity enhancer.
Therefore, the protein of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that modulates (promotes or inhibits, preferably inhibits) the activity of the protein of the present invention.
That is, the present invention relates to a compound that modulates (promotes or inhibits, preferably inhibits) the activity (eg, ligand binding activity, signal transduction activity, etc.) of the protein of the present invention, characterized by using the protein of the present invention A salt screening method is provided.
More specifically, for example, (i) a ligand-binding activity or signaling activity of a cell having the ability to produce the protein of the present invention, and (ii) a cell having the ability to produce the protein of the present invention and a test compound A method for screening a compound or a salt thereof that modulates (promotes or inhibits, preferably inhibits) the activity of the protein of the present invention, which is characterized by comparing the ligand binding activity or signal transduction activity of the mixture, is used.
In the above screening method, for example, in the case of (i) and (ii), ligand binding activity or signal transduction activity is described in a known method, for example, J. Immunol. 166 (1), pages 15-19, 2001. Measure and compare according to the method of or similar to the above.
Specifically, when screening for a compound having a ligand binding promotion or intracellular signal transduction promoting action, (i) a reporter containing the protein expression vector of the present invention in a promoter or enhancer containing a binding sequence of NF-κB. When introduced into a cell together with the gene and cultured, (ii) the protein expression vector of the present invention is introduced into the cell together with a reporter gene containing the binding sequence of NF-κB in a promoter or enhancer, and in the presence of the test compound The reporter expression level when cultured is compared. The reporter expression level can be measured by using reporter protein activity using luciferase activity, alkaline phosphatase activity, or the like as an index.
Specifically, when screening for a compound having a ligand binding inhibition or intracellular signal transduction inhibition action, (i) a reporter containing the protein expression vector of the present invention in a promoter or enhancer containing a binding sequence of NF-κB. Introduced into the cell together with the gene, and if necessary, (a) a microbial cell disruption solution, a microorganism culture supernatant, a eukaryotic cell disruption solution, a eukaryotic cell culture supernatant, or a solution containing a ligand, (b) the ligand itself or ( c) when cultured with a substance having a binding activity equivalent to that of a natural ligand; and (ii) the protein expression vector of the present invention together with a reporter gene containing the binding sequence of NF-κB in a promoter or enhancer. Introduce into cells, and if necessary, (a) microbial cell disruption fluid, microbial culture supernatant, eukaryotic cell disruption fluid, eukaryotic cell culture supernatant Ligand-containing solution, (b) ligand itself or (c) a substance having binding activity equivalent to that of a natural ligand is added, and the amount of reporter expression when cultured in the presence of a test compound is measured and compared. To do.
Examples of the ligand include bacterial-derived lipopeptides (preferably triacylated lipopeptides), or N-palmitoyl-S-dipalmitoylglyceryl (Pam Three ) Cys- Ser- (Lys) Four (CSK Four ), N-palmitolyl-S-dilaurylgryceryl (N-Pam-S-Lau 2 ) CSK Four Triacyl peptides such as Borrelia burgdorferi and outer-surface lipoprotein (OspA) are used.
The reporter expression level can be measured by using reporter protein activity using luciferase activity, alkaline phosphatase activity, or the like as an index.
In addition, the signal transduction activity can be measured by measuring and comparing the apoptotic activity against anticancer agents (eg, paclitaxel, etc.) in the presence or absence of expression of proteins (eg, TLR1 etc.) used in the present invention. . Apoptotic activity against an anticancer drug (eg, paclitaxel, etc.) in the presence and absence of a ligand can be measured and compared by a known method to measure signal transduction activity.
Furthermore, in order to measure the signal transduction of TLR1 used in the present invention with higher sensitivity, a cell having the ability to express a TLR1 signal-related molecule (eg, TLR2, MD2, etc.) may be used. The above activity may be measured by forcibly expressing a TLR1 signal-related molecule (eg, TLR2, MD2, etc.).
As the cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the above-described DNA encoding the protein of the present invention is used. As the host, animal cells such as COS7 cells, CHO cells, HEK293 cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on the cell membrane by culturing by the aforementioned method is preferably used. The method for culturing cells capable of expressing the protein of the present invention is the same as the method for culturing the transformant of the present invention described above.
Examples of the test compound include peptides, proteins, non-peptide compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts and the like.
For example, a test compound in which the ligand binding activity or signal transduction activity in the case of (ii) is reduced by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more compared to the case of (i) above. As a compound that inhibits the activity of the protein of the present invention, the ligand binding activity or signal transduction activity in the case of (ii) above is about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably compared to the case of (i) above. Can be selected as a compound that promotes the activity of the protein of the present invention.
[0040]
The compound having the activity of inhibiting the activity of the protein of the present invention is a safe and low-toxic drug for suppressing the physiological activity of the protein of the present invention, such as colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, and esophagus. Cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, etc. It is useful as a prophylactic / therapeutic agent for cancer, apoptosis inducer, anticancer agent sensitivity enhancer and the like.
The compound having the activity of promoting the activity of the protein of the present invention is useful as a safe and low toxic pharmaceutical for enhancing the action of the protein of the present invention.
The compound or salt thereof obtained using the screening method or screening kit of the present invention is, for example, a peptide, protein, non-peptide compound, synthetic compound, fermentation product, cell extract, plant extract, animal tissue extract. Or a compound selected from plasma and the like. As the salt of the compound, the same salts as those of the peptide of the present invention described above can be used.
[0041]
Furthermore, since the gene encoding the protein of the present invention is also increased in expression in cancer tissue, a compound or a salt thereof that regulates the expression of the gene encoding the protein of the present invention may be used, for example, breast cancer, colon cancer, breast cancer, Lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreas It is useful as a prophylactic / therapeutic agent for cancer such as brain tumor or blood tumor, apoptosis inducer, anticancer agent sensitivity enhancer and the like.
Therefore, the DNA of the present invention is useful as a reagent for screening for a compound or a salt thereof that regulates (promotes or inhibits, preferably inhibits) the expression of a gene encoding the protein of the present invention.
As a screening method, (iii) when cells having the ability to produce the protein of the present invention were cultured, and (iv) cells having the ability to produce the protein used in the present invention were cultured in the presence of the test compound. A screening method characterized by comparison with the case.
In the above method, the expression level of the gene (specifically, the amount of the protein of the present invention or the amount of mRNA encoding the protein) in the cases of (iii) and (iv) is measured and compared.
Examples of the cell having the ability to produce the test compound and the protein of the present invention include those described above.
The amount of protein is measured by a known method, for example, by using an antibody that recognizes the protein of the present invention, the protein present in a cell extract or the like according to a method such as Western analysis, ELISA method or the like or a method equivalent thereto. can do.
The amount of mRNA is measured by a known method, for example, Northern hybridization using a nucleic acid containing SEQ ID NO: 2 or a part thereof as a probe, or PCR using a nucleic acid containing SEQ ID NO: 2 or a part thereof as a primer. It can be measured according to the method or a method according to it.
For example, a test compound that inhibits the gene expression level in the case of (iv) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more compared to the case of (iii). As a compound that suppresses the expression of the gene encoding the protein of (iv), the gene expression level in the case of (iv) is about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably compared to the case of (iii) above. A test compound that increases by about 50% or more can be selected as a compound that promotes the expression of the gene encoding the protein of the present invention.
[0042]
The screening kit of the present invention contains cells having the ability to produce the protein or partial peptide used in the present invention or a salt thereof, or the protein or partial peptide used in the present invention.
The compound or salt thereof obtained using the screening method or screening kit of the present invention is the above-mentioned test compound, for example, peptide, protein, non-peptide compound, synthetic compound, fermentation product, cell extract, plant extract. A compound selected from animal tissue extracts, plasma, and the like, or a salt thereof, and a compound or a salt thereof that modulates the activity (eg, ligand binding activity or signal transduction activity) of the protein of the present invention.
As the salt of the compound, the same salt as the protein salt of the present invention described above can be used.
A compound that modulates (preferably inhibits) the activity of the protein of the present invention or a salt thereof, and a compound that modulates (preferably inhibits) the expression of a gene encoding the protein of the present invention or a salt thereof are, for example, colon cancer, Breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, It is useful as a prophylactic / therapeutic agent for cancer such as pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, apoptosis inducer, anticancer agent sensitivity enhancer and the like.
When the compound or salt thereof obtained using the screening method or screening kit of the present invention is used as the above-mentioned pharmaceutical, it can be formulated according to conventional means.
[0043]
For example, compositions for oral administration include solid or liquid dosage forms, specifically tablets (including dragees and film-coated tablets), pills, granules, powders, capsules (including soft capsules). Syrup, emulsion, suspension and the like. Such a composition is produced by a known method and contains a carrier, diluent or excipient usually used in the pharmaceutical field. For example, lactose, starch, sucrose, magnesium stearate and the like are used as carriers and excipients for tablets.
As a composition for parenteral administration, for example, injections, suppositories and the like are used, and injections are intravenous injections, subcutaneous injections, intradermal injections, intramuscular injections, intravenous injections, intraarticular injections. Includes dosage forms such as agents. Such an injection is prepared according to a known method, for example, by dissolving, suspending or emulsifying the antibody or a salt thereof in a sterile aqueous or oily liquid usually used for injection. As an aqueous solution for injection, for example, isotonic solutions containing physiological saline, glucose and other adjuvants are used, and suitable solubilizers such as alcohol (eg, ethanol), polyalcohol (eg, Propylene glycol, polyethylene glycol), nonionic surfactants [eg, polysorbate 80, HCO-50 (polyoxyethylene (50 mol) adduct of hydrogenated castor oil)] and the like may be used in combination. As the oily liquid, for example, sesame oil, soybean oil and the like are used, and benzyl benzoate, benzyl alcohol and the like may be used in combination as a solubilizing agent. The prepared injection solution is usually filled in a suitable ampoule. A suppository used for rectal administration is prepared by mixing the above-mentioned compound or a salt thereof with an ordinary suppository base.
[0044]
The above oral or parenteral pharmaceutical compositions are conveniently prepared in dosage unit form to suit the dosage of the active ingredient. Examples of the dosage form of such a dosage unit include tablets, pills, capsules, injections (ampoules), suppositories, etc., and usually 5 to 500 mg, especially 5 to 100 mg for injections, Other dosage forms preferably contain 10 to 250 mg of the above antibody.
Each of the above-described compositions may contain other active ingredients as long as undesirable interactions are not caused by blending with the above compounds.
Since the preparation thus obtained is safe and has low toxicity, for example, humans or warm-blooded animals (eg, mice, rats, rabbits, sheep, pigs, cows, horses, birds, cats, dogs, monkeys, chimpanzees, etc. ) Orally or parenterally.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on its action, target disease, administration subject, administration route, etc. For example, a compound or salt thereof that modulates the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating breast cancer is used. When administered orally, generally for adults (with a body weight of 60 kg), the compound or salt thereof is about 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-0.1 per day. 20 mg is administered. When administered parenterally, the single dose of the compound or a salt thereof varies depending on the administration subject, target disease, etc., but for example, a compound that modulates the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating breast cancer or When the salt is usually administered to an adult (in a body weight of 60 kg) in the form of an injection, the compound or a salt thereof is about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 1 day. It is convenient to administer about 0.1 to 10 mg to a cancer lesion site by injection. In the case of other animals, an amount converted per 60 kg body weight can be administered.
Moreover, the said compound can be used in combination with the existing anticancer agent (for example, paclitaxel, docetaxel etc.), and the side effect which damages the normal cell of an anticancer agent is reduced. In this case, the administration time is not limited, and these may be administered simultaneously to the administration subject or may be administered with a time difference. The dose can be appropriately selected based on the clinically used dose. Moreover, the compounding ratio of the said compound and anticancer agent can be suitably selected according to an administration subject, an administration route, an object disease, a symptom, a combination, etc.
[0045]
(2) Quantification of the protein of the present invention, its partial peptide or its salt
Since the antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes abbreviated as the antibody of the present invention) can specifically recognize the protein of the present invention, the quantification of the protein of the present invention in the test solution, particularly It can be used for quantification by sandwich immunoassay.
That is, the present invention
(I) The antibody of the present invention is competitively reacted with a test solution and the labeled protein of the present invention, and the ratio of the labeled protein of the present invention bound to the antibody is measured. A method for quantifying the protein of the present invention in a test solution, and
(Ii) The test solution and the antibody of the present invention insolubilized on the carrier and the labeled another antibody of the present invention are reacted simultaneously or successively, and then the activity of the labeling agent on the insolubilized carrier is measured. The method for quantifying the protein of the present invention in a test solution is provided.
In the above quantification method (ii), it is desirable that one antibody is an antibody that recognizes the N-terminal part of the protein of the present invention and the other antibody is an antibody that reacts with the C-terminal part of the protein of the present invention.
[0046]
In addition to quantification of the protein of the present invention using a monoclonal antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes referred to as the monoclonal antibody of the present invention), detection by tissue staining or the like can also be performed. For these purposes, the antibody molecule itself may be used, or the F (ab ′) of the antibody molecule. 2 , Fab ′, or Fab fractions may be used.
The method for quantifying the protein of the present invention using the antibody of the present invention is not particularly limited, and an antibody, antigen or antibody-antigen complex corresponding to the amount of antigen (for example, the amount of protein) in the solution to be measured is not limited. Any measurement method may be used as long as it is a measurement method in which the amount is detected by chemical or physical means and calculated from a standard curve prepared using a standard solution containing a known amount of antigen. For example, nephrometry, competition method, immunometric method and sandwich method are preferably used, but the sandwich method described later is particularly preferable in view of sensitivity and specificity.
Examples of the labeling agent used in the measurement method using the labeling substance include radioisotopes, enzymes, fluorescent substances, luminescent substances, lanthanide elements, and the like. Examples of radioisotopes include [ 125 I], [ 131 I], [ Three H], [ 14 C] and the like are used. As the enzyme, a stable enzyme having a large specific activity is preferable. For example, β-galactosidase, β-glucosidase, alkaline phosphatase, peroxidase, malate dehydrogenase and the like are used. As the fluorescent substance, for example, fluorescamine, fluorescein isothiocyanate and the like are used. As the luminescent substance, for example, luminol, luminol derivatives, luciferin, lucigenin and the like are used. Furthermore, a biotin-avidin system can also be used for binding of an antibody or antigen and a labeling agent.
[0047]
For insolubilization of an antigen or antibody, physical adsorption may be used, or a method using a chemical bond usually used to insolubilize or immobilize a protein or an enzyme may be used. Examples of the carrier include insoluble polysaccharides such as agarose, dextran, and cellulose, synthetic resins such as polystyrene, polyacrylamide, and silicon, or glass.
In the sandwich method, the test solution is reacted with the insolubilized monoclonal antibody of the present invention (primary reaction), and further labeled with another monoclonal antibody of the present invention (secondary reaction), and then on the insolubilized carrier. By measuring the activity of the labeling agent, the amount of the protein of the present invention in the test solution can be quantified. The primary reaction and the secondary reaction may be performed in the reverse order, or may be performed simultaneously or at different times. The labeling agent and the insolubilization method can be the same as those described above. In the immunoassay by the sandwich method, the antibody used for the solid phase antibody or the labeling antibody is not necessarily one type, and a mixture of two or more types of antibodies is used for the purpose of improving measurement sensitivity. May be.
In the method for measuring the protein of the present invention by the sandwich method of the present invention, the monoclonal antibody of the present invention used for the primary reaction and the secondary reaction is preferably an antibody having a different site to which the protein of the present invention binds. That is, the antibody used in the primary reaction and the secondary reaction, for example, when the antibody used in the secondary reaction recognizes the C-terminus of the protein of the present invention, the antibody used in the primary reaction is preferably For example, an antibody that recognizes the N end other than the C end is used.
[0048]
The monoclonal antibody of the present invention can be used in measurement systems other than the sandwich method, for example, competitive method, immunometric method, nephrometry, and the like.
In the competition method, the antigen in the test solution and the labeled antigen are reacted competitively with the antibody, and then the unreacted labeled antigen (F) and the labeled antigen (B) bound to the antibody are separated. (B / F separation), the labeling amount of either B or F is measured, and the amount of antigen in the test solution is quantified. In this reaction method, a soluble antibody is used as an antibody, B / F separation is performed using polyethylene glycol, a liquid phase method using a second antibody against the antibody, and a solid-phased antibody is used as the first antibody, or As the first antibody, a soluble method is used, and a solid phase method using a solid phase antibody as the second antibody is used.
In the immunometric method, the antigen in the test solution and the immobilized antigen are subjected to a competitive reaction with a certain amount of labeled antibody, and then the solid phase and the liquid phase are separated, or the antigen in the test solution is separated. Are reacted with an excess amount of labeled antibody, and then a solid phased antigen is added to bind the unreacted labeled antibody to the solid phase, and then the solid phase and the liquid phase are separated. Next, the amount of label in any phase is measured to quantify the amount of antigen in the test solution.
In nephrometry, the amount of insoluble precipitate produced as a result of the antigen-antibody reaction in a gel or solution is measured. Laser nephrometry using laser scattering is preferably used even when the amount of antigen in the test solution is small and only a small amount of precipitate is obtained.
[0049]
In applying these individual immunological measurement methods to the quantification method of the present invention, special conditions, operations and the like are not required to be set. What is necessary is just to construct | assemble the measurement system of the protein of this invention, adding the usual technical consideration of those skilled in the art to the usual conditions and operation methods in each method. For details of these general technical means, it is possible to refer to reviews, books and the like.
For example, Hiroshi Irie “Radioimmunoassay” (Kodansha, published in 1974), Hiroshi Irie “Sequential Radioimmunoassay” (published in Kodansha, 1979), “Enzyme Immunoassay” edited by Eiji Ishikawa et al. 53)), edited by Eiji Ishikawa et al. “Enzyme Immunoassay” (2nd edition) (Medical Shoin, published in 1982), edited by Eiji Ishikawa et al. 62), “Methods in ENZYMOLOGY” Vol. 70 (Immunochemical Techniques (Part A)), Id. Vol. 73 (Immunochemical Techniques (Part B)), Id. Vol. 74 (Immunochemical Techniques (Part C)), Id. 84 (Immunochemical Techniques (Part D: Selected Immunoassays)), ibid.Vol. 92 (Immunochemical Techniques (Part E: Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods)), ibid. )) (From Academic Press ) And the like can be referred to.
As described above, the protein of the present invention can be quantified with high sensitivity by using the antibody of the present invention.
Furthermore, when an increase (or decrease) in the concentration of the protein of the present invention is detected by quantifying the concentration of the protein of the present invention using the antibody of the present invention, for example, colorectal cancer, breast cancer, lung cancer, prostate Cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor Alternatively, it can be diagnosed that the cancer is a blood tumor or is likely to be affected in the future. In addition, when the concentration of the protein of the present invention is high, it can be diagnosed that the effect of administering an anticancer agent (eg, paclitaxel, etc.) is low.
The antibody of the present invention can be used for detecting the protein of the present invention present in a subject such as a body fluid or tissue. In addition, for the production of an antibody column used for purifying the protein of the present invention, detection of the protein of the present invention in each fraction during purification, analysis of the behavior of the protein of the present invention in a test cell, etc. Can be used.
[0050]
(3) Genetic diagnostic agents
The DNA of the present invention can be used, for example, as a probe for humans or warm-blooded animals (eg, rats, mice, guinea pigs, rabbits, birds, sheep, pigs, cows, horses, cats, dogs, monkeys, chimpanzees, etc.) Can detect an abnormality (gene abnormality) of DNA or mRNA encoding the protein of the present invention or a partial peptide thereof, for example, damage, mutation or decreased expression of the DNA or mRNA, It is useful as a gene diagnostic agent for increase or overexpression.
The gene diagnosis using the DNA of the present invention includes, for example, the known Northern hybridization and PCR-SSCP method (Genomics, Vol. 5, pp. 874-879 (1989), Proceedings of the -National Academy of Sciences of USA (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America), 86, 2766-2770 (1989)).
For example, when overexpression or decrease is detected by Northern hybridization, or when DNA mutation is detected by PCR-SSCP method, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, gastric cancer Cancer such as liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor Can be diagnosed as likely.
[0051]
(4) Medicine containing antisense nucleotide
The antisense nucleotide of the present invention, which can complementarily bind to the DNA of the present invention and suppress the expression of the DNA, has low toxicity, and functions of the protein of the present invention or the DNA of the present invention in vivo (eg, Ligand binding activity or signal transduction activity), for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, gastric cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, renal cancer. , Bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, preventive and therapeutic agent for cancer such as brain tumor or blood tumor, apoptosis inducer, anticancer agent sensitivity enhancer Can be used as such.
When the antisense nucleotide is used as the above-mentioned preventive / therapeutic agent, it can be formulated and administered according to a known method.
Further, for example, after inserting the above-mentioned antisense nucleotide alone or into an appropriate vector such as a retrovirus vector, an adenovirus vector, an adenovirus associated virus vector, etc., in accordance with conventional means, a human or mammal (eg, rat, rabbit) , Sheep, pigs, cattle, cats, dogs, monkeys, etc.) orally or parenterally. The antisense nucleotide can be formulated as it is or with a physiologically recognized carrier such as an adjuvant for promoting intake, and can be administered by a gene gun or a catheter such as a hydrogel catheter. Alternatively, it can be aerosolized and locally administered into the trachea as an inhalant.
Furthermore, for the purpose of improving pharmacokinetics, prolonging the half-life, and improving cellular uptake efficiency, the above-mentioned antisense nucleotides are formulated alone (injection) together with carriers such as liposomes, and are intravenously, subcutaneously, intraarticularly. Alternatively, it may be administered to a cancerous lesion or the like.
The dosage of the antisense nucleotide varies depending on the target disease, administration subject, administration route, etc. For example, when the antisense nucleotide of the present invention is administered for the purpose of treating breast cancer, it is generally used for adults (weight 60 kg). ), About 0.1 to 100 mg of the antisense nucleotide is administered per day.
Furthermore, the antisense nucleotide can also be used as a diagnostic oligonucleotide probe for examining the presence and expression status of the DNA of the present invention in tissues and cells.
Similarly to the above-mentioned antisense nucleotide, double-stranded RNA containing a part of RNA encoding the protein of the present invention, ribozyme containing a part of RNA encoding the protein of the present invention, and the like are also included in the gene of the present invention. Since the expression can be suppressed and the function of the protein used in the present invention or the DNA used in the present invention in vivo can be suppressed, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophagus Cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, etc. It can be used as a prophylactic / therapeutic agent for cancer, apoptosis inducer, anticancer agent sensitivity enhancer and the like.
The double-stranded RNA can be produced by designing based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, Nature, 411, 494, 2001).
The ribozyme can be designed and produced based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, TRENDS in Molecular Medicine, 7, 221, 2001). For example, it can be produced by linking a known ribozyme to a part of the RNA encoding the protein of the present invention. Examples of the RNA encoding the protein of the present invention include a portion (RNA fragment) adjacent to the cleavage site on the RNA of the present invention that can be cleaved by a known ribozyme.
When the above double-stranded RNA or ribozyme is used as the prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered in the same manner as the antisense polynucleotide.
Similar to the above-described antisense nucleotide, the protein of the present invention or the aptamer of the DNA encoding the protein of the present invention can also suppress the expression of the gene of the present invention, and the protein used in the present invention or the present invention in vivo. Can suppress the function of DNA used in, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, Prevention / treatment agent for bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, apoptosis inducer, anticancer agent sensitivity enhancer, etc. Can be used as
Aptamers can be produced according to known methods.
[0052]
(5) Medicament containing the antibody of the present invention
The antibody of the present invention having the action of neutralizing the activity of the protein of the present invention includes, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, Kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, preventive or therapeutic agent for cancer such as brain tumor or blood tumor, apoptosis inducer, anticancer agent It can be used as a safe drug with low toxicity such as a sensitivity enhancer.
The prophylactic / therapeutic agent for the above-mentioned diseases containing the antibody of the present invention has low toxicity and can be used as a solution or as a pharmaceutical composition of an appropriate dosage form as a human or mammal (eg, rat, rabbit, sheep, pig). , Cattle, cats, dogs, monkeys, etc.) or or parenterally (eg, intra-articular administration). The dose varies depending on the administration subject, target disease, symptom, administration route, etc. For example, when used for treatment or prevention of breast cancer in adults, the dose of the antibody of the present invention is usually 0. About 0.01-20 mg / kg body weight, preferably about 0.1-10 mg / kg body weight, more preferably about 0.1-5 mg / kg body weight, about 1-5 times a day, preferably 1-3 times a day It is convenient to administer by a powder inhaler about once. In the case of other parenteral administration and oral administration, an equivalent amount can be administered. If symptoms are particularly severe, the dose may be increased according to the symptoms.
The antibody of the present invention can be administered per se or as an appropriate pharmaceutical composition. The pharmaceutical composition used for the administration comprises the antibody or a salt thereof and a pharmacologically acceptable carrier, diluent or excipient. Such compositions are provided as dosage forms suitable for oral or parenteral administration (eg, intravenous administration).
Each of the above-described compositions may contain other active ingredients as long as they do not cause an unfavorable interaction by blending with the antibody.
[0053]
(6) "A cancer preventive / therapeutic agent comprising a compound having a Toll-like receptor activity-modulating action or a salt thereof" and "a compound having a Toll-like receptor expression-controlling action or a salt thereof of the present invention About the preventive / therapeutic agent for cancer comprising
The “compound having a Toll-like receptor activity-modulating action” may be any compound as long as it has a Toll-like receptor activity-regulating action, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer. , Stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, etc. It is used as a prophylactic / therapeutic agent for cancer, apoptosis inducer, anticancer drug sensitivity enhancer, etc.
The “compound having a Toll-like receptor expression regulating action” may be any compound as long as it has a Toll-like receptor expression regulating action, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer. , Stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, etc. It is used as a prophylactic / therapeutic agent for cancer, apoptosis inducer, anticancer drug sensitivity enhancer, etc.
The prophylactic / therapeutic agent is produced in the same manner as described above.
[0054]
(7) DNA transfer animals
The present invention includes a DNA encoding a foreign protein of the present invention (hereinafter abbreviated as the foreign DNA of the present invention) or a mutant DNA thereof (sometimes abbreviated as the foreign mutant DNA of the present invention). A human mammal is provided.
That is, the present invention
(1) a non-human mammal having the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof,
(2) the animal according to (1), wherein the non-human mammal is a rodent;
(3) The animal according to (2), wherein the rodent is a mouse or a rat, and
(4) Provided is a recombinant vector containing the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof and capable of being expressed in mammals.
A non-human mammal having an exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof (hereinafter abbreviated as a DNA-transferred animal of the present invention) can be used for embryos including unfertilized eggs, fertilized eggs, spermatozoa and primordial cells thereof. Preferably, at the stage of embryonic development in non-human mammal development (more preferably at the single cell or fertilized egg cell stage and generally prior to the 8-cell stage), the calcium phosphate method, electric pulse method, lipofection method, aggregation method, It can be produced by transferring the target DNA by the microinjection method, particle gun method, DEAE-dextran method or the like. Further, by the DNA transfer method, the target exogenous DNA of the present invention can be transferred to somatic cells, living organs, tissue cells, etc., and can be used for cell culture, tissue culture, etc. The DNA-transferred animal of the present invention can also be produced by fusing the above-mentioned embryo cells with a known cell fusion method.
Examples of non-human mammals include cows, pigs, sheep, goats, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, mice, rats and the like. Among them, rodents, especially mice (for example, C57BL / 6 strain, DBA2 strain, etc. as pure strains) are relatively short in terms of ontogeny and biological cycle from the viewpoint of creating a disease animal model system, and are easy to reproduce. As a system, B6C3F 1 System, BDF 1 System, B6D2F 1 Strain, BALB / c strain, ICR strain, etc.) or rat (for example, Wistar, SD, etc.) is preferred.
Examples of the “mammal” in the recombinant vector that can be expressed in the mammal include humans and the like in addition to the above non-human mammals.
[0055]
The exogenous DNA of the present invention is not the DNA of the present invention inherently possessed by a non-human mammal but the DNA of the present invention once isolated and extracted from the mammal.
Examples of the mutant DNA of the present invention include those in which a mutation (for example, mutation or the like) has occurred in the base sequence of the original DNA of the present invention, specifically, addition of a base, deletion, substitution to another base, etc. The resulting DNA is used, and abnormal DNA is also included.
The abnormal DNA means DNA that expresses the abnormal protein of the present invention, and for example, DNA that expresses a protein that suppresses the function of the normal protein of the present invention is used.
The exogenous DNA of the present invention may be derived from mammals of the same or different species as the target animal. In transferring the DNA of the present invention to a target animal, it is generally advantageous to use the DNA as a DNA construct bound downstream of a promoter that can be expressed in animal cells. For example, when transferring the human DNA of the present invention, the expression of DNA derived from various mammals (for example, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) having the DNA of the present invention having high homology with this. The DNA of the present invention is highly expressed by microinjecting a DNA construct (eg, a vector) conjugated with the human DNA of the present invention downstream of various promoters into a fertilized egg of a target mammal, for example, a mouse fertilized egg. DNA transfer mammals can be created.
[0056]
Examples of the expression vector for the protein of the present invention include plasmids derived from Escherichia coli, plasmids derived from Bacillus subtilis, plasmids derived from yeast, bacteriophages such as λ phage, retroviruses such as Moloney leukemia virus, animal viruses such as vaccinia virus and baculovirus. Etc. are used. Of these, plasmids derived from Escherichia coli, plasmids derived from Bacillus subtilis or plasmids derived from yeast are preferably used.
Examples of promoters that regulate the above DNA expression include: (1) promoters of DNA derived from viruses (eg, simian virus, cytomegalovirus, Moloney leukemia virus, JC virus, breast cancer virus, poliovirus, etc.); ▼ Promoters from various mammals (human, rabbit, dog, cat, guinea pig, hamster, rat, mouse, etc.), such as albumin, insulin II, uroplakin II, elastase, erythropoietin, endothelin, muscle creatine kinase, glial fibrillary acidity Protein, glutathione S-transferase, platelet-derived growth factor β, keratin K1, K10 and K14, collagen type I and type II, cyclic AMP-dependent protein kinase βI subunit, dyst Lophine, tartrate-resistant alkaline phosphatase, atrial natriuretic factor, endothelial receptor tyrosine kinase (generally abbreviated as Tie2), sodium potassium adenosine 3 kinase (Na, K-ATPase), neurofilament light chain, metallothionein I IIA, metalloproteinase 1 tissue inhibitor, MHC class I antigen (H-2L), H-ras, renin, dopamine β-hydroxylase, thyroid peroxidase (TPO), peptide chain elongation factor 1α (EF-1α), β actin , Α and β myosin heavy chain, myosin light chain 1 and 2, myelin basic protein, thyroglobulin, Thy-1, immunoglobulin, heavy chain variable region (VNP), serum amyloid P component, myoglobin, troponin C, smooth muscle α A Chin, pre-pro-enkephalin A, such as a promoter, such as vasopressin is used. Among these, a cytomegalovirus promoter capable of being highly expressed throughout the body, a human peptide chain elongation factor 1α (EF-1α) promoter, human and chicken β-actin promoters, and the like are preferable.
The vector preferably has a sequence (generally called a terminator) that terminates transcription of the target messenger RNA in a DNA-transferred mammal. For example, the sequence of each DNA derived from viruses and various mammals The SV40 terminator of simian virus or the like is preferably used.
[0057]
In addition, the splicing signal of each DNA, enhancer region, part of intron of eukaryotic DNA, etc. 5 ′ upstream of the promoter region, between the promoter region and the translation region, or the translation region for the purpose of further expressing the target foreign DNA It is also possible to connect it 3 'downstream of the target.
The normal translation region of the protein of the present invention includes liver, kidney, thyroid cell, fibroblast-derived DNA derived from humans or various mammals (eg, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) and commercially available DNA. As a raw material, complementary DNA prepared by a known method as a whole or a part of genomic DNA or from RNA derived from liver, kidney, thyroid cells, or fibroblasts can be obtained. Further, exogenous abnormal DNA can produce a translation region obtained by mutating a normal protein translation region obtained from the cells or tissues described above by a point mutagenesis method.
The translation region can be prepared as a DNA construct that can be expressed in a metastasized animal by an ordinary DNA engineering technique in which it is linked downstream of the promoter and optionally upstream of the transcription termination site.
The transfer of the foreign DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the subject mammal. The presence of the foreign DNA of the present invention in the embryo cells of the produced animal after DNA transfer means that all the progeny of the produced animal retain the foreign DNA of the present invention in all the germ cells and somatic cells. means. The offspring of this type of animal that has inherited the foreign DNA of the present invention has the foreign DNA of the present invention in all of its germ cells and somatic cells.
The non-human mammal to which the exogenous normal DNA of the present invention has been transferred can be subcultured in a normal breeding environment as a DNA-bearing animal after confirming that the exogenous DNA is stably retained by mating. .
The transfer of the exogenous DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be excessively present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. Excessive exogenous DNA of the present invention is present in the embryo cells of the produced animal after the DNA transfer. This means that all the offspring of the produced animal have the exogenous DNA of the present invention in all the germ cells and somatic cells. Means. The offspring of this type of animal that has inherited the foreign DNA of the present invention has an excess of the foreign DNA of the present invention in all germ cells and somatic cells.
By obtaining a homozygous animal having the introduced DNA in both homologous chromosomes and mating the male and female animals, all the offspring can be bred and passaged so as to have the DNA in excess.
[0058]
In the non-human mammal having the normal DNA of the present invention, the normal DNA of the present invention is highly expressed, and finally the function of the endogenous normal DNA is promoted, thereby finally causing the hyperfunction of the protein of the present invention. It can develop and can be used as a disease model animal. For example, the normal DNA-transferred animal of the present invention can be used to elucidate the hyperfunction of the protein of the present invention, the pathological mechanism of the disease associated with the protein of the present invention, and the examination of treatment methods for these diseases. Is possible.
Further, since the mammal to which the exogenous normal DNA of the present invention has been transferred has an increased symptom of the released protein of the present invention, a preventive / therapeutic agent for diseases related to the protein of the present invention, such as colon cancer, Breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, It can also be used in screening tests for prophylactic / therapeutic agents for cancer such as pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor.
On the other hand, the non-human mammal having the exogenous abnormal DNA of the present invention can be subcultured in a normal breeding environment as the DNA-bearing animal after confirming that the exogenous DNA is stably retained by mating. Furthermore, the target foreign DNA can be incorporated into the aforementioned plasmid and used as a raw material. A DNA construct with a promoter can be prepared by a normal DNA engineering technique. The abnormal DNA transfer of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. The presence of the abnormal DNA of the present invention in the embryo cell of the produced animal after DNA transfer means that all the offspring of the produced animal have the abnormal DNA of the present invention in all the germ cells and somatic cells. The offspring of this type of animal that has inherited the foreign DNA of the present invention has the abnormal DNA of the present invention in all of its germ cells and somatic cells. By obtaining a homozygous animal having the introduced DNA in both homologous chromosomes and mating the male and female animals, all the offspring can be bred and passaged so as to have the DNA.
[0059]
In the non-human mammal having the abnormal DNA of the present invention, the abnormal DNA of the present invention is highly expressed, and finally the functional inactive form of the protein of the present invention is inhibited by inhibiting the function of the endogenous normal DNA. It may become refractory and can be used as a model animal for the disease state. For example, by using the abnormal DNA-transferred animal of the present invention, it is possible to elucidate the pathological mechanism of the functional inactive refractory of the protein of the present invention and to examine a method for treating this disease.
Further, as a specific applicability, the abnormal DNA high-expressing animal of the present invention exhibits the function inhibition (dominant negative action) of the normal protein by the abnormal protein of the present invention in the functional inactive refractory disease of the protein of the present invention. It becomes a model to be solved.
Further, since the mammal to which the foreign abnormal DNA of the present invention has been transferred has an increased symptom of the released protein of the present invention, a preventive / therapeutic agent for the protein of the present invention or a functional inactive refractory disease such as the large intestine Cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid gland It can also be used in screening tests for prophylactic / therapeutic agents for cancer such as cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor.
Further, as other applicability of the above-mentioned two kinds of DNA transfer animals of the present invention, for example,
(1) Use as a cell source for tissue culture,
(2) Peptides specifically expressed or activated by the protein of the present invention by directly analyzing DNA or RNA in the tissue of the DNA-transferred animal of the present invention or by analyzing peptide tissue expressed by the DNA Analysis of the relationship with
(3) Cell of tissue having DNA is cultured by a standard tissue culture technique, and using these, research on the function of cells from tissue generally difficult to cultivate,
(4) Screening for drugs that enhance cell function by using the cells described in (3) above, and
(5) Isolation and purification of the mutant protein of the present invention and production of its antibody are conceivable.
[0060]
Furthermore, using the DNA-transferred animal of the present invention, clinical symptoms of diseases related to the protein of the present invention, including functional inactive refractories of the protein of the present invention, can be examined, and the protein of the present invention More detailed pathological findings in each organ of the disease model related to the disease can be obtained, and it is possible to contribute to the development of a new treatment method and further to the study and treatment of secondary diseases caused by the disease.
Moreover, each organ can be taken out from the DNA-transferred animal of the present invention, and after minced, it is possible to obtain free DNA-transferred cells, culture them, or systematize the cultured cells with a proteolytic enzyme such as trypsin. . Furthermore, the protein of the present invention and its action can be investigated by identifying the protein-producing cells of the present invention, examining the relationship with apoptosis, differentiation or proliferation, or the signal transduction mechanism in them, and examining their abnormalities. It becomes an effective research material for.
Furthermore, in order to develop a therapeutic agent for the diseases related to the protein of the present invention, including the functional inactive refractory of the protein of the present invention, using the DNA-transferred animal of the present invention, the above-described test method and quantification It is possible to provide an effective and rapid screening method for a therapeutic agent for the disease using a method or the like. Moreover, it is possible to examine and develop a DNA therapy for a disease associated with the protein of the present invention using the DNA-transferred animal of the present invention or the exogenous DNA expression vector of the present invention.
[0061]
(8) Knockout animals
The present invention provides a non-human mammal embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated and the DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention.
That is, the present invention
(1) a non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated,
(2) The embryonic stem cell according to (1), wherein the DNA is inactivated by introducing a reporter gene (eg, β-galactosidase gene derived from E. coli),
(3) The embryonic stem cell according to (1), which is neomycin-resistant,
(4) The embryonic stem cell according to item (1), wherein the non-human mammal is a rodent.
(5) The embryonic stem cell according to (4), wherein the rodent is a mouse,
(6) the DNA expression-deficient non-human mammal in which the DNA of the present invention is inactivated,
(7) The DNA can be inactivated by introducing a reporter gene (eg, β-galactosidase gene derived from E. coli), and the reporter gene can be expressed under the control of a promoter for the DNA of the present invention (6) The non-human mammal according to Item,
(8) The non-human mammal according to (6), wherein the non-human mammal is a rodent.
(9) The non-human mammal according to item (8), wherein the rodent is a mouse, and
(10) A screening method for a compound or a salt thereof that promotes or inhibits promoter activity against the DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to the animal according to item (7) and detecting the expression of a reporter gene I will provide a.
[0062]
The non-human mammal embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated refers to suppressing the DNA expression ability by artificially adding mutation to the DNA of the present invention possessed by the non-human mammal, or By substantially losing the activity of the protein of the present invention encoded by the DNA, the DNA has substantially no ability to express the protein of the present invention (hereinafter sometimes referred to as the knockout DNA of the present invention). ) Non-human mammal embryonic stem cells (hereinafter abbreviated as ES cells).
As the non-human mammal, the same ones as described above are used.
As a method for artificially adding a mutation to the DNA of the present invention, for example, a part or all of the DNA sequence can be deleted or another DNA can be inserted or replaced by a genetic engineering technique. For example, the knockout DNA of the present invention may be prepared by shifting the codon reading frame or destroying the function of the promoter or exon by these mutations.
[0063]
Specific examples of non-human mammalian embryonic stem cells in which the DNA of the present invention is inactivated (hereinafter abbreviated as the DNA inactivated ES cell of the present invention or the knockout ES cell of the present invention) A DNA of the present invention possessed by a non-human mammal is isolated, and a neomycin resistance gene, a drug resistance gene typified by a hygromycin resistance gene, lacZ (β-galactosidase gene), cat (chloramphenicol acetyl) Inserting a reporter gene or the like typified by a transferase gene) to destroy the function of the exon, or inserting a DNA sequence (for example, a polyA addition signal) that terminates the transcription of the gene into an intron between exons, Preventing the synthesis of complete messenger RNA As a result, a DNA strand having a DNA sequence constructed so as to destroy the gene (hereinafter abbreviated as a targeting vector) is introduced into the chromosome of the animal by, for example, homologous recombination, and the obtained ES cell Southern hybridization analysis using the DNA sequence of the present invention or the vicinity thereof as a probe, or PCR method using the DNA sequence of the targeting vector and the DNA sequence of the neighboring region other than the DNA of the present invention used for the preparation of the targeting vector as primers And can be obtained by selecting the knockout ES cell of the present invention.
In addition, as the original ES cell for inactivating the DNA of the present invention by homologous recombination method or the like, for example, those already established as described above may be used, or in accordance with the known Evans and Kaufman method. Or newly established. For example, in the case of mouse ES cells, currently 129 ES cells are generally used, but since the immunological background is unclear, an alternative purely immunologically genetic background For example, for the purpose of obtaining ES cells with clear clarification, for example, B57 improved by reducing the number of eggs collected in C57BL / 6 mice and C57BL / 6 by crossing with DBA / 2 1 Mouse (F of C57BL / 6 and DBA / 2 1 ) Can be used well. BDF 1 In addition to the advantage that the number of eggs collected is high and the eggs are strong, the mouse has C57BL / 6 mice as a background. Therefore, when ES cells obtained using these mice are used to produce pathological model mice, C57BL / 6 mice can be advantageously used in that the genetic background can be changed to C57BL / 6 mice by backcrossing.
When establishing ES cells, blastocysts on the third day after fertilization are generally used, but in addition to this, many blastocysts can be efficiently obtained by collecting eggs and culturing them to blastocysts. Early embryos can be obtained.
Although both male and female ES cells may be used, male ES cells are usually more convenient for producing germline chimeras. In addition, it is desirable to discriminate between males and females as soon as possible in order to reduce troublesome culture work.
[0064]
One example of a method for determining the sex of an ES cell is a method of amplifying and detecting a gene in the sex-determining region on the Y chromosome by PCR. If this method is used, it is conventionally about 10 times for karyotype analysis. 6 In contrast to the number of cells required, the number of ES cells of about 1 colony (about 50) is sufficient, so primary selection of ES cells in the early stage of culture can be performed by male / female discrimination. Yes, the early labor of the culture can be greatly reduced by enabling the selection of male cells at an early stage.
The secondary selection can be performed, for example, by confirming the number of chromosomes by the G-banding method. The number of chromosomes of the obtained ES cell is preferably 100% of the normal number. However, if it is difficult due to physical operations during establishment, the gene of the ES cell is knocked out, and then normal cells (for example, chromosomes in mice) It is desirable to clone again into cells where the number is 2n = 40.
The embryonic stem cell line obtained in this way is usually very proliferative, but it tends to lose its ontogenic ability, so it needs to be subcultured carefully. For example, in a carbon dioxide incubator (preferably 5% carbon dioxide, 95% air or 5% oxygen, 5%) in the presence of LIF (1-10000 U / ml) on suitable feeder cells such as STO fibroblasts. Culturing is carried out by a method such as culturing at about 37 ° C. with carbon dioxide gas, 90% air, and at the time of passage, for example, a trypsin / EDTA solution (usually 0.001-0.5% trypsin / 0.1-5 mM EDTA, Preferably, the cells are converted into single cells by treatment with about 0.1% trypsin / 1 mM EDTA and seeded on newly prepared feeder cells. Such passage is usually carried out every 1-3 days. At this time, it is desirable to observe the cells, and when morphologically abnormal cells are found, the cultured cells should be discarded.
ES cells can be differentiated into various types of cells such as parietal muscle, visceral muscle, and myocardium by monolayer culture to high density or suspension culture until a cell conglomerate is formed under appropriate conditions. [MJ Evans and MH Kaufman, Nature 292, 154, 1981; GR Martin Proceedings of National Academy of Sciences USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA) 78, 7634, 1981; TC Doetschman et al., Journal of Embrology and Experimental Morphology, 87, 27, 1985], ES cells of the present invention. The DNA expression-deficient cells of the present invention obtained by differentiation are useful for in vitro cell biology of the protein of the present invention.
[0065]
The DNA expression deficient non-human mammal of the present invention can be distinguished from normal animals by measuring the mRNA level of the animal using a known method and comparing the expression level indirectly.
As the non-human mammal, those similar to the above can be used.
The DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention is a DNA in which, for example, a targeting vector prepared as described above is introduced into mouse embryonic stem cells or mouse egg cells, and the DNA of the targeting vector of the present invention is inactivated by the introduction. The DNA of the present invention can be knocked out by homologous recombination in which the sequence replaces the DNA of the present invention on the chromosome of mouse embryonic stem cells or mouse egg cells by gene homologous recombination.
A cell in which the DNA of the present invention is knocked out is obtained by analyzing the DNA sequence of the Southern hybridization analysis or targeting vector using the DNA sequence of or near the DNA of the present invention as a probe and the mouse used for the targeting vector of the present invention. It can be determined by analysis by a PCR method using a DNA sequence in a neighboring region other than DNA as a primer. When a non-human mammalian embryonic stem cell is used, a cell line in which the DNA of the present invention is inactivated by gene homologous recombination is cloned, and the cell is placed at a suitable time, for example, an 8-cell non-human mammal. It is injected into animal embryos or blastocysts, and the produced chimeric embryos are transplanted into the uterus of the non-human mammal that is pseudopregnant. The produced animal is a chimeric animal composed of both cells having the normal DNA locus of the present invention and cells having the artificially mutated DNA locus of the present invention. When some of the germ cells of the chimeric animal have the mutated DNA locus of the present invention, all tissues are artificially mutated from the population obtained by mating such a chimeric individual with a normal individual. It can be obtained by selecting an individual composed of the added cells having the DNA locus of the present invention, for example, by determining the coat color. The individuals thus obtained are usually individuals with deficient hetero-expression of the protein of the present invention, and individuals with deficient hetero-expression of the protein of the present invention are crossed and homozygous expression of the protein of the present invention from their offspring. Failure individuals can be obtained.
[0066]
When using an egg cell, for example, a transgenic non-human mammal having a targeting vector introduced into the chromosome can be obtained by injecting a DNA solution into the nucleus of the egg cell by a microinjection method. Compared to mammals, it can be obtained by selecting those having a mutation at the DNA locus of the present invention by gene homologous recombination.
Thus, an individual in which the DNA of the present invention is knocked out can be reared in a normal breeding environment after confirming that the individual animal obtained by mating has also been knocked out.
In addition, germline acquisition and retention may be followed in accordance with conventional methods. That is, a homozygous animal having the inactivated DNA in both homologous chromosomes can be obtained by mating male and female animals possessed by the inactivated DNA. The obtained homozygous animal can be efficiently obtained by rearing the mother animal in a state where there are 1 normal individual and multiple homozygous animals. By breeding male and female heterozygotes, homozygotes and heterozygotes having the inactivated DNA are bred and passaged.
The non-human mammal embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated is very useful for producing the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention.
In addition, since the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention lacks various biological activities that can be induced by the protein of the present invention, it is a model for diseases caused by inactivation of the biological activity of the protein of the present invention. Therefore, it is useful for investigating the causes of these diseases and examining treatment methods.
[0067]
(8a) Screening method for compounds having therapeutic / preventive effects on diseases caused by deficiency or damage of DNA of the present invention
The DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention can be used for screening a compound having a therapeutic / preventive effect on a disease caused by the deficiency or damage of the DNA of the present invention.
That is, the present invention is caused by the deficiency or damage of the DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention and observing and measuring changes in the animal. Provided is a screening method for a compound having a therapeutic / preventive effect on a disease such as cancer, or a salt thereof.
Examples of the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention used in the screening method include those described above.
Examples of the test compound include peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, plasma, etc. These compounds are novel compounds. It may be a known compound.
Specifically, the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention is treated with a test compound, compared with an untreated control animal, and tested using changes in each organ, tissue, disease symptom, etc. of the animal as an index. The therapeutic / prophylactic effect of the compound can be tested.
As a method for treating a test animal with a test compound, for example, oral administration, intravenous injection and the like are used, and can be appropriately selected according to the symptoms of the test animal, the properties of the test compound, and the like. The dosage of the test compound can be appropriately selected according to the administration method, the properties of the test compound, and the like.
[0068]
For example, colorectal cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer When screening a compound having a therapeutic / preventive effect against cancer such as thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or blood tumor, the test compound is administered to the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention and tested. Differences in the degree of onset of cancer and the degree of cancer healing are observed over time in the above tissues with no compound administration group.
In the screening method, when a test compound is administered to a test animal, the test compound is improved when the disease symptoms of the test animal are improved by about 10% or more, preferably about 30% or more, more preferably about 50% or more. It can be selected as a compound having a therapeutic / prophylactic effect on the above-mentioned diseases.
The compound obtained by using the screening method is a compound selected from the test compounds described above, and has a therapeutic / prophylactic effect on diseases caused by deficiency or damage of the protein of the present invention. It can be used as a medicine such as a safe and low-toxic preventive / therapeutic agent. Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used as well.
The compound obtained by the screening method may form a salt. Examples of the salt of the compound include physiologically acceptable acids (eg, inorganic acids, organic acids, etc.) and bases (eg, alkali metals, etc.). And the like, and physiologically acceptable acid addition salts are particularly preferred. Examples of such salts include salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, etc.), or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, And salts with succinic acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, succinic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and the like.
A medicament containing the compound obtained by the screening method or a salt thereof can be produced in the same manner as the aforementioned medicament containing the protein of the present invention.
Since the preparation thus obtained is safe and low toxic, it can be used, for example, in humans or mammals (eg, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, pigs, cows, horses, cats, dogs, monkeys, etc.). Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the target disease, administration subject, administration route, etc. For example, when the compound is administered orally, generally in an adult (weight 60 kg) breast cancer patient, The compound is administered at about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 20 mg per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, etc., but the compound is usually administered to an adult (60 kg) breast cancer patient in the form of an injection. In this case, it is convenient to administer about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound per day by intravenous injection. In the case of other animals, an amount converted per 60 kg can be administered.
[0069]
(8b) Screening method for compounds that promote or inhibit the activity of the promoter for the DNA of the present invention
The present invention provides a compound that promotes or inhibits the activity of a promoter for the DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to a non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention and detecting the expression of a reporter gene, or a compound thereof A salt screening method is provided.
In the screening method described above, the DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention is inactivated by introducing a reporter gene among the DNA expression-deficient non-human mammals of the present invention described above, A gene capable of expressing the reporter gene under the control of a promoter for the DNA of the present invention is used.
Examples of the test compound are the same as described above.
As the reporter gene, the same ones as described above are used, and a β-galactosidase gene (lacZ), a soluble alkaline phosphatase gene, a luciferase gene, or the like is preferable.
In the non-human mammal of the present invention in which the DNA of the present invention is replaced with a reporter gene, the expression of the substance encoded by the reporter gene is traced because the reporter gene exists under the control of the promoter for the DNA of the present invention. By doing so, the activity of the promoter can be detected.
For example, when a part of the DNA region encoding the protein of the present invention is replaced with the β-galactosidase gene (lacZ) derived from Escherichia coli, the protein of the present invention is originally replaced with the tissue expressing the protein of the present invention. Β-galactosidase is expressed. Therefore, for example, by staining with a reagent that is a substrate of β-galactosidase such as 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-galactopyranoside (X-gal), the present invention can be easily performed. The expression state of the protein in the animal can be observed. Specifically, the protein-deficient mouse of the present invention or a tissue section thereof is fixed with glutaraldehyde or the like, washed with phosphate buffered saline (PBS), and then stained with X-gal at room temperature or around 37 ° C. Then, after reacting for about 30 minutes to 1 hour, the tissue specimen is washed with a 1 mM EDTA / PBS solution to stop the β-galactosidase reaction and observe the coloration. Moreover, you may detect mRNA which codes lacZ according to a conventional method.
The compound obtained by using the screening method or a salt thereof is a compound selected from the above-described test compounds, and is a compound that promotes or inhibits the promoter activity for the DNA of the present invention.
The compound obtained by the screening method may form a salt. Examples of the salt of the compound include physiologically acceptable acids (eg, inorganic acids) and bases (eg, organic acids). In particular, physiologically acceptable acid addition salts are preferred. Examples of such salts include salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, etc.), or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, And salts with succinic acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, succinic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and the like.
[0070]
Since the compound or its salt that promotes or inhibits the promoter activity for the DNA of the present invention can regulate the expression of the protein of the present invention and the function of the protein, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate Cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, brain tumor or It is useful as a prophylactic / therapeutic agent for cancers such as blood tumors.
Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used as well.
The pharmaceutical containing the compound or salt thereof obtained by the screening method can be produced in the same manner as the pharmaceutical containing the protein of the present invention or salt thereof.
Since the preparation thus obtained is safe and low toxic, it can be used, for example, in humans or mammals (eg, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, pigs, cows, horses, cats, dogs, monkeys, etc.). Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the target disease, administration subject, administration route, and the like. For example, when a compound that inhibits the promoter activity against the DNA of the present invention is orally administered, generally an adult (body weight) In a breast cancer patient (as 60 kg), the compound is administered at about 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, the target disease, etc. For example, a compound that inhibits the promoter activity against the DNA of the present invention is usually administered in the form of an injection (in adults) When administered to a breast cancer patient (as 60 kg), about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg is administered by intravenous injection per day. It is convenient to do. In the case of other animals, an amount converted per 60 kg can be administered.
Thus, the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention is extremely useful in screening for compounds or salts thereof that promote or inhibit the activity of the promoter for the DNA of the present invention. It can greatly contribute to the investigation of the causes of various diseases caused or the development of preventive / therapeutic agents.
In addition, using DNA containing the promoter region of the protein of the present invention, genes encoding various proteins are ligated downstream thereof, and this is injected into an egg cell of an animal to produce a so-called transgenic animal (gene transgenic animal). Once created, the protein can be specifically synthesized and its action in the living body can be studied. Furthermore, if a suitable reporter gene is bound to the above promoter portion and a cell line that expresses it is established, a low molecular weight compound that specifically promotes or suppresses the production ability of the protein itself of the present invention in the body. Can be used as a search system.
[0071]
In this specification, when a base, an amino acid, or the like is indicated by an abbreviation, it is based on an abbreviation by the IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature or a common abbreviation in the field, and examples thereof are described below. In addition, when there are optical isomers with respect to amino acids, L form is shown unless otherwise specified.
[0072]
In addition, substituents, protecting groups and reagents frequently used in the present specification are represented by the following symbols.
[0073]
The sequence numbers in the sequence listing in the present specification indicate the following sequences.
[SEQ ID NO: 1]
The amino acid sequence of TLR1 is shown.
[SEQ ID NO: 2]
This shows the base sequence of DNA encoding TLR1 having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
[SEQ ID NO: 3]
The base sequence of DNA containing the full-length gene encoding TLR1 is shown.
[SEQ ID NO: 4]
The base sequence of the antisense used in Example 2 is shown.
[SEQ ID NO: 5]
The base sequence of the primer used in Example 2 is shown.
[SEQ ID NO: 6]
The base sequence of the primer used in Example 2 is shown.
[SEQ ID NO: 7]
The base sequence of the primer used in Example 2 is shown.
[SEQ ID NO: 8]
The base sequence of the primer used in Example 3 is shown.
[SEQ ID NO: 9]
The base sequence of the primer used in Example 3 is shown.
[SEQ ID NO: 10]
The base sequence of the primer used in Example 3 is shown.
[SEQ ID NO: 11]
The base sequence of the primer used in Example 3 is shown.
[SEQ ID NO: 12]
The base sequence of the primer used in Example 3 is shown.
[SEQ ID NO: 13]
The base sequence of the primer used in Example 3 is shown.
[SEQ ID NO: 14]
The base sequence of the DNA fragment inserted in the vector in Example 3 is shown.
[0074]
In the following, the present invention will be more specifically described with reference to examples, but the present invention is not limited thereto.
【Example】
Example 1
In order to clarify the genes that are specifically upregulated in breast cancer tissue, total RNA (Table 1) extracted from 2 cases of breast cancer tissue and 23 other normal tissues was used as a material, oligonucleotide microarray (Human Genome U95A , U95B, U95C, U95D, U95E; Affymetrix)).
The experimental method was in accordance with the Affymetrix experimental analysis technical manual. As a result, expression of the TLR1 gene was detected only in breast cancer tissues. All normal tissues analyzed were below the detection limit (Table 2).
[0075]
[Table 1]
[Table 2]
[0076]
Example 2
In order to analyze the effect of TLR1 gene, whose expression was specifically observed on breast cancer, on apoptosis, a TLR1 antisense oligonucleotide introduction experiment was performed. First, after designing an antisense (SEQ ID NO: 4) to the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3, a phosphorothioated oligonucleotide was synthesized, purified by HPLC, and used in an introduction experiment (Amersham Pharmacia Biotech). As a control oligonucleotide, the reverse sequence (SEQ ID NO: 5) of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 was similarly phosphorothioated and used after HPLC purification (Amersham Pharmacia Biotech).
Breast cancer cell line MDA-MB-231 (In Vitro, 14 (11), 911-915, 1978, purchased from ATCC) was used as a test cell, and 18 × 10 8 the day before oligonucleotide introduction. Three Cells were seeded in a 24-well plate (Falcon). OligofectAMINE (manufactured by Invitrogen) was used for oligonucleotide introduction, and the protocol was followed. Seven hours after introduction, RNA was extracted according to the protocol of RNeasy mini kit (manufactured by Qiagen), and cDNA was prepared using ThermoScriptRT-PCR system (manufactured by GIBCO BRL). Two primers (SEQ ID NO: 6 and SEQ ID NO: 7), 18S rRNA primers and competitors from QuantumRNA 18S Internal Standards (manufactured by Ambion) were added simultaneously according to the manual for RCR reaction, and multiplex PCR was performed. After the PCR reaction, the reaction solution was electrophoresed, and the intensity of the band stained with ethidium bromide was corrected with the band intensity of 18S rRNA using BioImageIQ software (manufactured by Genomic Solutions), and then compared.
On the other hand, the effect on apoptosis was compared with the control oligo-introduced sample using Cell death detection ELISA (manufactured by Roche) on the third day after introduction of the antisense oligonucleotide.
As a result, the expression (RNA) of TLR1 decreased to 55% 7 hours after the introduction of the antisense, compared to the time when the control (reverse) oligonucleotide was introduced (100%). On the third day after introduction, apoptosis increased to 186% compared to control (100%).
From this, it was revealed that TLR1 is not only expressed specifically in cancer but also involved in proliferation and apoptosis of cancer cells.
[0077]
Example 3
(1) Preparation of TLR1 and MD2 expression vectors
In order to prepare a TLR1 expression system, the full-length gene of TLR1 was cloned.
Two types of primers (SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9) were used, and Marathon ready cDNA library (Clontech) was used as a template to perform PCR according to the protocol attached to Pfu polymerase (Straragene). PCR was performed using 20 μl of a reaction solution containing 2 μl of 10 × Pfu buffer, 0.4 μl of 10 mM each dNTP mixture (manufactured by Clontech), 0.8 μl of each of the two primers prepared in 20 mM, 0.5 μl of template cDNA solution, and 0.1 μl of Pfu polymerase. After the pretreatment at 94 ° C. for 2 minutes, the reaction was carried out for 42 cycles of 94 ° C. for 30 seconds, 55 ° C. for 30 seconds, 72 ° C. for 3 minutes and then 72 ° C. for 7 minutes.
After the PCR reaction, the products were separated by agarose gel electrophoresis, and the target band was cut out and cloned into pCR4Blunt-TOPO vector (Invitrogen). As a result of confirming the base sequence of the inserted fragment, it was consistent with the human TLR1 base sequence, so PCR was performed using the vector obtained above as a template using two additional primers (SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11). went. PCR was carried out using 20 μl of a reaction solution containing 2 μl of 10 × Pfu buffer, 0.4 μl of 10 mM each dNTP mixture (manufactured by Clontech), 0.2 μl of each of the two primers prepared in 50 mM, 0.5 μl of template cDNA solution, and 0.4 μl of Pfu polymerase. After the pretreatment at 94 ° C for 2 minutes, the reaction was conducted at 94 ° C for 30 seconds, 55 ° C for 30 seconds, 72 ° C for 3 minutes, followed by 25 cycles, followed by 72 ° C for 7 minutes. After PCR reaction using Pfu polymerase (Straragene), A was added to both ends of the PCR product according to the protocol attached to pCR4-TOPO vector (Invitrogen), and the products were separated by agarose gel electrophoresis. The band was cut out and cloned into pCR4-TOPO vector (Invitrogen). After confirming that there are no errors in the sequence, digest with restriction enzyme BclII (Nippon Gene) and insert into p3XFLAG-CMV-14 (SIGMA) treated with BclII using Ligation kit ver.2 (Takara) did. It was confirmed again that there was no error in the sequence, and the obtained TLR1 expression vector was used in the following experiment.
On the other hand, PCR was performed using KOD polymerase (manufactured by Toyobo) using two types of primers (SEQ ID NO: 12 and SEQ ID NO: 13) and a human spleen-derived cDNA library (manufactured by Clontech) as a template. PCR was performed using 20 μl of reaction solution containing 2 μl of 10 × KOD buffer, 1.6 μl of 2.5 mM each dNTP mixture (manufactured by Clontech), 0.2 μl of each of the above two primers prepared to 50 mM, 1 μl of template cDNA solution, 0.2 μl of KOD polymerase, After the pretreatment at 94 ° C. for 2 minutes, the reaction was carried out for 42 cycles of 94 ° C. for 30 seconds, 55 ° C. for 30 seconds, 72 ° C. for 3 minutes and then 72 ° C. for 7 minutes.
After the PCR reaction, the product was separated by agarose gel electrophoresis, the target band was excised, digested with restriction enzymes KpnI and NotI, and then digested with the same restriction enzymes into pcDNA3.1 / Hyg (+) (manufactured by Invitrogen) Ligation was performed to obtain an MD2 expression vector. The base sequence of the inserted fragment into this vector is shown in SEQ ID NO: 14. As a result of confirming the base sequence of the inserted fragment, it was consistent with the base sequence of human MD2.
[0078]
(2) Effect of TLR1 on reporter activity
Next, in order to see the activity of TLR1 in cancer cells, the expression vector obtained in (1) above was introduced into NCI-H1299 cells (purchased from ATCC) to observe the effect on various reporter activities.
The day before transfection of the expression vector shown below, NCI-H1299 strain was 2 × 10 Four Each was seeded in a 24-well plate (manufactured by Falcon) and transfected using Fugene6 (manufactured by Roche) according to the attached protocol. The TLR1 expression vector obtained in Example 3 (1) above and the pcDNA3.1 vector used as a control were used at 0.19 μg / well. As a reporter, 0.19 μg / well of a vector having AP1 site or NF-κB site upstream of the secreted alkaline phosphatase gene (both manufactured by Clontech) or a vector having an ISRE site upstream of the firefly luciferase gene (manufactured by Clontech), The pRL-TK (manufactured by Toyo Ink) used for correcting the reporter activity was 0.13 μg / well. The reporter secreted alkaline phosphatase activity or firefly luciferase activity was measured on the second day after transfection using the Great EscAPe SEAP Fluorescence Detection Kit kit (manufactured by Clontech) and the Picker Gene Dual Sea Pansy Double Luciferase Assay System (manufactured by Toyo Ink). Measured according to Sea shiitake luciferase activity expressed by pRL-TK was measured according to the protocol of Picker Gene Dual Sea Pansy Double Luciferase Assay System (manufactured by Toyo Ink), and the reporter activity value was corrected.
As a result, TLR1 expression increased AP1 reporter activity by 5.6 times, NF-κB reporter activity by 3.3 times, and ISRE reporter activity by 1.7 times compared to the pcDNA3.1 vector used as a control.
From this, it was found that by expressing TLR1, AP1 signal, NF-κB signal, and ISRE signal are activated in the lung cancer-derived NCI-H1299 strain without any additional ligand.
Therefore, by performing these promoter-reporter assays, it is possible to screen for compounds having a TLR1 signal regulating action.
[0079]
(3) Effects of paclitaxel on apoptosis induction
Next, in order to see the effect of TLR1 signal operation on cancer, the effect on apoptosis induction by paclitaxel was observed.
5 x 10 HCT116 (purchased from ATCC) the day before expression vector transfection Five Individual 10 cm dishes (manufactured by Falcon) were seeded, and transfection was performed according to the protocol of Fugene 6 (manufactured by Roche). Combinations shown in Table 3 so that the TLR1 expression vector and MD2 expression vector obtained in Example 3 (1) above or the pcDNA3.1 vector (manufactured by Invitrogen) used as a control were each 11 μg per dish. Used in. Cells were harvested by trypsinization 4 hours after transfection and 3 × 10 Three N-palmitoyl-S-dilauryl-glyceryl CSK, which is a TLR1 ligand, is seeded individually in a 96-well plate (Falcon). Four (Pam Three CSK Four ) (Manufactured by Peptide Institute) (1 μg / ml) and / or paclitaxel (manufactured by Sigma), an anticancer agent, was added (0.125 μM) to observe the effect on apoptosis.
After 2 days of culture in a 96-well plate, apoptosis was detected using Cell Death Detection ELISA plus kit (Roche) according to the attached protocol. As shown in FIG. 1, when paclitaxel was present, the absorbance was higher than when it was absent, and it was confirmed that apoptosis was induced by paclitaxel (white bar vs. gray bar). In contrast, Pam Three CSK Four Since the absorbance decreased due to the addition of, it was found that apoptosis was decreased by the addition of TLR1 ligand (gray bar vs. hatched bar). Pam Three CSK Four It was found that the apoptosis induced by paclitaxel was reduced by transfection of TLR1 and MD2 without adding (grey bar vs. black bar).
From this, it was revealed that TLR1 signal has an effect of attenuating apoptosis by an anticancer agent.
[0080]
【The invention's effect】
The protein used in the present invention is a cancer diagnostic marker, and therefore, a compound or a salt thereof that regulates (preferably inhibits) the activity of the protein, or a compound that regulates (preferably inhibits) gene expression of the protein Or a salt thereof, an antibody of the present invention, an antisense nucleotide of the present invention, for example, colon cancer, breast cancer, lung cancer, prostate cancer, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, spleen cancer, kidney As a safe drug for cancer, bladder cancer, uterine cancer, ovarian cancer, testicular cancer, thyroid cancer, pancreatic cancer, cancer such as brain tumor or blood tumor, and pro-apoptotic agent It can be used and can also be used as a therapeutic agent for cancer that is resistant to anticancer agents. In addition, in order to increase sensitivity to anticancer agents (eg, paclitaxel, etc.), the dose of existing anticancer agents can be reduced to reduce side effects.
[0081]
[Sequence Listing]
[Brief description of the drawings]
FIG. 1 shows the results of examining the effect of paclitaxel on apoptosis induction.
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