JP4772782B2 - 腫瘍抑制因子として作用するaim3の新規用途 - Google Patents
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Description
本発明者等はアミノアシル−tRNA合成酵素(aminoacyl-tRNA synthetases;ARS)複合体の補助因子として知られたp18を“AIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)”と再命名した。従って、以下でp18をAIM3と記載した。
(a)AIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)蛋白質の分離されたポリペプチド;
(b)前記ポリペプチドと少なくとも70%以上の相同性を有する分離されたポリペプチド;及び
(c)前記(a)または(b)ポリペプチドをコードする分離された核酸からなる群より選ばれるいずれか一つの有効量を細胞、組織、または体内に処理することを特徴とする、細胞、組織、または体内でATM、ATR、及びATMまたはATRにより調節される蛋白質を活性化させる方法を提供する。
(a)AIM3蛋白質の分離されたポリペプチド;
(b)前記ポリペプチドと少なくとも70%以上の相同性を有する分離されたポリペプチド;及び
(c)前記(a)または(b)のポリペプチドをコードする分離された核酸からなる群より選ばれるいずれか一つの有効量を細胞、組織、または体内に投与することを特徴とする、細胞、組織、または体内で、p53またはそのターゲット遺伝子の発現を誘導する方法を提供する。
(a)AIM3蛋白質の分離されたポリペプチド;
(b)前記ポリペプチドと少なくとも70%以上の相同性を有する分離されたポリペプチド;及び
(c)前記(a)または(b)のポリペプチドをコードする分離された核酸からなる群より選ばれるいずれか一つの有効量を細胞、組織、または体内に投与することを特徴とする、腫瘍細胞の増殖を抑制する方法を提供する。
(a)AIM3蛋白質の分離されたポリペプチド;
(b)前記ポリペプチドと少なくとも70%以上の相同性を有する分離されたポリペプチド;及び
(c)前記(a)または(b)のポリペプチドをコードする分離された核酸からなる群より選ばれるいずれか一つの有効量を細胞、組織、または体内に投与することを特徴とする、細胞、組織、または体内でアポトーシスを促進する方法を提供する。
(a)AIM3蛋白質の分離されたポリペプチド;
(b)前記ポリペプチドと少なくとも70%以上の相同性を有する分離されたポリペプチド;及び
(c)前記(a)または(b)のポリペプチドをコードする分離された核酸からなる群より選ばれるいずれか一つの有効量を治療を必要とする個体に投与することを特徴とする、ATMまたはATRに関連する疾患を治療または予防する方法を提供する。
(a)AIM3蛋白質または前記蛋白質を発現する組み換え細胞と候補物質を培養する段階;及び
(b)前記蛋白質の活性または細胞内レベル増加に及ぼす候補物質の効果を測定する段階を含むことを特徴とする、ATMまたはATRに関連する疾患を治療及び/または予防する物質をスクリーニングする方法を提供する。
(a)個体からサンプリングした組織内でAIM3蛋白質の発現レベルを測定する段階;及び
(b)前記組織内AIM3蛋白質のレベルと正常AIM3蛋白質のレベルを比較する段階を含むことを特徴とする、ATMまたはATRに関連する疾患の危険性のある個体を同定する方法を提供する。
AIM3蛋白質をコードする核酸、その断片、前記核酸またはその断片からコードされるペプチド、及び前記ペプチドに対する抗体からなる群より選ばれるいずれか一つを含むATMまたはATRと関係のある疾患の診断用キットを提供する。
(a)AIM3蛋白質の分離されたポリペプチド;
(b)前記ポリペプチドと少なくとも70%以上の相同性を有する分離されたポリペプチド;及び
(c)前記(a)または(b)のポリペプチドをコードする分離された核酸を有効成分とする薬学的組成物を提供する。
本発明ではアミノアシル−tRNA合成酵素(aminoacyl-tRNA synthetases; ARS)複合体の補助因子として知られたAIM3(p18)の新たな活性を確認した。本発明で確認されたAIM3の生理学的活性(機能)は下記の通りである。
第1に、AIM3はDNA合成段階とDNAが損傷された時、核内に移動され高いレベルで誘導される。
第2に、細胞に対して抗増殖活性を示す。
第3に、細胞のアポトーシスを誘導する。
第4に、腫瘍抑制遺伝子であるp53及びこれのターゲット遺伝子の発現を誘導する。
第5に、ATM/ATRと直接的に相互作用してATM、ATR、及びATMまたはATRにより調節される蛋白質を活性化させる。
第6に、AIM3発現レベルの減少は腫瘍形成を誘導し、がん細胞株とがん患者から分離された組織より低いレベルで発現される。
ただし、下記実施例は本発明を例示するものであって本発明の内容がこれに限定されるものではない。
本発明者等は遺伝子トラップ方法(Zambrowicz,B.P.et al.,Nature,392:608-611,1998)を利用してAIM3欠損マウスを製造した。遺伝子トラップベクターが無作為で挿入された129/SvEvBrdマウスの胚性幹細胞ライブラリ(OmniBank Library,Lexicon Genetics)の中で遺伝子トラップベクターの導入により変異されたAIM3遺伝子を含むOST377244クローンを探し出した。前記クローンを利用してレキシコンゼネティックス社の勧奨方法により、AIM3異型接合性C57BL6/アルビノマウスを製造した。同型接合性の子孫を得るために異型接合性マウスを異種交配させた。
〈2-1〉AIM3対立遺伝子内遺伝子トラップベクターが挿入された位置の確認
AIM3突然変異型対立遺伝子内で、遺伝子トラップベクターが挿入された位置を確認するために、塩基配列決定分析を行った。この際、塩基配列決定は塩基配列分析会社であるパンゼノミックス(Pangenomics, 大韓民国)に依頼した。その結果、図1aに示された通り、遺伝子トラップベクターがAIM3遺伝子の一番目のエキソン(Exon I)と二番目のエキソン(Exon II)との間に挿入されていることが確認できた。
前記実施例1で製造した各マウスの尻尾からゲノミックDNAを分離した。次に、AIM3遺伝子のエキソンI領域を含む約1.5kb大のDNA断片を増幅するための、p18F−1及びp18R−1プライマー対(配列番号3及び配列番号4)を利用してPCRを行った(図1a参照)。さらに、AIM3遺伝子の一部と遺伝子トラップベクターの一部を含む約0.8kb大のDNA断片を増幅するために、前記p18F−1プライマーとゲノム内に挿入された遺伝子トラップベクター(約5.7kb)に結合するLTRプライマー(配列番号5)を利用してPCRを行った(図1a参照)。この際、PCRは94℃で5分間鋳型DNAを変性させた後、94℃で1分、54℃で1分、72℃で2分を、30回繰返して行った。
その結果、興味深くも製造された突然変異マウスは全て1.5kb及び0.8kb大のDNA断片を二つとも生産する異型接合性マウス(AIM3+/-マウス)であることを示した(図1b参照)。反面、野生型マウス(AIM3+/+マウス)では1.5kb大のバンド一つだけを確認できた。
各マウスの尻尾からゲノミックDNAを分離し、Sac Iで切断した後、ゲル電気泳動を行い、切断されたDNA切片を分離した。次に、配列番号6及び配列番号7で示されるp18F−2及びp18R−2プライマーにより増幅されたAIM3遺伝子のエキソン領域を含むPCR産物を放射性同位元素で表示した後(図1a参照)、これをプローブ(probe)として前記切断されたDNA切片と混成化させた(southerm, E. M., J. Mol. Biol., 98: 503, 1975)。
その結果、図1cで示した通り、野生型マウスでは12kb付近で一つのバンドが検出される反面、異型接合性マウスでは約3kb大のバンドがまた一つ検出された。
前記実施例〈2-2〉及び〈2-3〉の分析で同型接合性遺伝型の子孫は見当らなかった。従って、本発明者等はAIM3遺伝子の欠損が胎生期致死を誘発するか否かを調査するために、出生後マウスの遺伝型及び受精後時間経過に伴う胎児の遺伝型を前記実施例〈2-2〉と同様の方法により、ゲノミックPCR分析を行い調査した。その結果を下記表1及び表2に示した。
下記表1の通り、生存した総262匹のマウスの中で、野生型マウス(+/+)が114匹、異型接合性マウス(+/−)が148匹と調査された。生存した同型接合性マウス(−/−)は1匹も無いものと確認された。特に、異型接合性マウスは野生型同腹子と類似した比率で表れたものの、これは異型接合性マウスの約50%が出生前段階で死亡することを意味する。さらに、下記表2の通り、7.5〜9.5日齢に分離された全83個の胎児の中で同型接合性遺伝型を含有している胎児は8.5日齢でたった一つが検出された。これはAIM3同型接合性マウスが胎生初期に致死することを示すものである。
ジアク等の方法(Ziak,M,et al.,Biochem.Biophys.Res.Commun.280:363-367,2001)により、多くの器官(小腸、腎臓、心臓及び脾臓)から蛋白質を分離した。次に、パク等の方法(Park S. G., et al., J. Biological Chemistry 274: 16673-16676, 1999)により、多クローンラビット抗AIM3抗体(polyclonal rabbit anti-AIM3 antibody)を利用して、ウェスタンブロット分析を実施した。前記抗AIM3抗体はキム等の方法(Kim,T.et al.,J.Biol.Chem.,275:21768-21772,2000)により製作した。
その結果、図1dに示した通り、各器官によって減少程度が異なったもののAIM3+/-マウスの器官でのAIM3発現レベルが、野生型マウスの器官よりは遥かに低いことが確認できた。
本発明者等はAIM3遺伝子の機能を調べるために、AIM3+/-マウスから組織と器官を分離してこれらの組織学的特性を分析した。
まず、時間間隔をおいてマウスから多様な組織を分離し、分離した組織を10%ホルマリンで固定させた。固定された組織をパラフィンに埋込んだ後、H&E染色をした。さらに、B細胞転移を確認するために、パラフィンスライドを表面マーカーB220で免疫組織化学的染色した。キシレンでパラフィンを除去した後、スライドを抗220抗体(santacruz biotech)を含むブロッキングバッファー(1:100, 5%BSA及び0.1%ツイン20/PBS)で2時間培養した。
次に、スライドをPBSで洗浄した後、スライドに固定されている組織をアビジン結合2次抗体及びDAB溶液と共に再び培養した。
その結果、AIM3+/-マウスより種々の腫瘍が見出された(表3及び図2a参照)。興味深くも腫瘍が発達している18匹のAIM3+/-マウスの内、14匹は脾臓またはリンパ節から由来したリンパ腫が含まれており、5匹のマウスでは複合性腫瘍が発見された。具体的には、15ヶ月齢のAIM3+/-マウス(B-63)及び23ヶ月齢のAIM3+/-マウス(B-95)の乳房から腺がんが発見された。さらに、19ヶ月齢AIM3+/-マウス(B-103)の精嚢から腺がんが発見され、22ヶ月齢のAIM3+/-マウス(B-207)では肝臓がんと由来不明の肉腫が発見された。このような全ての種類のがんは退形成及び侵襲性のような、典型的な悪性表現型を示した。さらに、22ヶ月齢のAIM3+/-マウス(B-232)のリンパ節ではリンパ腫が発見され、17ヶ月齢のAIM3+/-マウス(B-14)では細気管支上皮組織から高分化型の腺がんが観察された。
幾つかのリンパ腫は肝臓、腎臓、肺臓、及び唾液腺のような他の器官に転移したことがわかった(図2b参照)。このような腫瘍の発生率は出生後15ヶ月が経過した後に著しく増加した(図2c及び表3参照)。
早い細胞周期は腫瘍形成(tumorigenesis)の典型的な徴候である(Evan and Vousden, Nature, 411: 342-348, 2001)。従って、AIM3が細胞周期調節に関与するか否かを調査した。
まず、本発明者等はAIM3+/-マウス由来細胞の細胞増殖率を野生型マウスの細胞と比較調査した。このために、4週齢野生型マウスとAIM3+/-マウスから脾臓細胞と胸腺細胞をそれぞれ分離した後、培養時間に伴う細胞数を測定した。その結果、図3aに示された通り、AIM3+/-マウス由来細胞は野生型マウスの細胞より早い増殖を示した。
次に、AIM3+/-マウス由来細胞の細胞周期を調査するためにFACS分析を行った。4週齢野生型マウス及びAIM3+/-マウスから分離した脾臓細胞を一夜培養した。培養した細胞を1%PFA(paraformaldehyde)で固定し、PI(propidium iodide)で染色した。各サンプル当り20,000個の細胞を対象にFACS分析を行った。その結果、図3bに示された通り、AIM3+/-マウスから分離した脾臓細胞は野生型マウスの細胞より早い細胞周期を示した。
次に、細胞周期間のAIM3の機能を調べるために、AIM3が細胞周期に依存して発現するか否かを調査した。HCT116細胞を無血清培地で24時間培養した後、さらに、血清含有培地で培養して細胞周期が始まるようにした。このように、細胞周期を終えた細胞を対象に血清欠乏状態と血清を再供給した状態で時間に伴うAIM3発現レベルを、ウェスタンブロット法で比較分析した。その結果、AIM3はDNA合成段階で著しく誘導された(図3c参照)。
これをさらに確認するために本発明者等はFACS分析を行った。HCT116細胞(Human colon adenocarcinoma cell line)を1%PFAで固定して中和させた。次に、細胞を抗AIM3モノクローナル抗体と共に培養した。FITC結合抗マウスヒツジIgG抗体(Pierce)を添加して再度培養した。次に、PIで細胞を共染色した後、FACS分析を行った。その結果、AIM3はDNA合成段階で著しく誘導された(図3d参照)。これは前記ウェスタンブロット分析結果と一致する結果である。前記結果からAIM3がDNA合成段階で誘導されることが確認できた。
本発明者等はDNA合成段階でAIM3が誘導される機能的な理由を調べるために、細胞の成長が止どまった状態と、細胞が増殖する状態でAIM3の細胞内の位置を調査した。このために、DU145細胞(Prostate cancer cell line)10%血清が含まれているRPMI−1640培地(complete media; CM)と血清が無い培地(serum free media;SF)でそれぞれ培養した後、100%MeOHで固定させ、抗AIM3モノクローナル抗体と反応させた。次に、抗マウスヒツジIgG−FITC(Pierce)と反応させ、PIで染色し蛍光顕微鏡下で細胞内AIM3の位置を調査した。
その結果、図3eに示した通り、血清欠乏により細胞の成長が抑制された時、AIM3は主に細胞質に位置する反面、細胞の成長が再開された時には核に位置することが示された。これにより細胞周期の内、DNA合成の間AIM3が誘導されるのみならず、核内に移動することが確認できた。前記結果はAIM3が核内において新たな機能を持ち得ることを示す。
ストレス等によりDNAが損傷されると、一般的にアポトーシスが誘導され細胞周期が停止する(Zhou BB et al., Cancer Biol. Ther., S(4 Supp11): S16-22, 2003)。ここに、本発明者等はストレスにより誘導されるアポトーシスと細胞が成長停止に対する細胞の反応でAIM3がどのような役割をするのかを調査した。
DNA損傷を誘導するアドリアマイシンを利用して、プロアポトーシスストレスに対するAIM3+/-マウス由来脾臓細胞の反応を調査した。
まず、野生型マウスとAIM3+/-マウスから脾臓細胞を分離した。アポトーシスを誘発するために、前記分離された脾臓細胞に0.2μg/mlアドリアマイシン(Adr,Sigma)を2時間処理した。細胞をFITC結合アネキシンV(FITC-conjugated annexin V,Roche)と5分間培養した。次に、細胞をPBSで洗浄し、FL−1H検出器下でFACS分析を行った。分析にはサンプル当り20,000個の細胞を用いた。
その結果、図4aに示した通り、野生型細胞の場合には、アドリアマイシン処理によりアポトーシスが進行中の細胞が著しく増加したものの、AIM3+/-細胞はアドリアマイシンにより誘導されるアポトーシスに対して抵抗性を示した。これはAIM3がDNA損傷により誘導されるアポトーシスに対して細胞を敏感にするのに必要であることを示唆する。これにより、AIM3がDNA損傷による細胞のアポトーシスを促進することが確認できた。
アドリアマイシンによる細胞の成長停止よりAIM3の重要性を調べるために、流動細胞計測を実施した。まず、野生型マウスとAIM3+/-マウスから胸腺細胞を分離した後、0.2μg/mlアドリアマイシン(Adr,Sigma)を6時間処理した。次に、前記実施例〈5-1〉と同様の方法によりFACS分析を行った。その結果、図4bに示した通り、AIM3+/-マウス細胞の成長はアドリアマイシン処理により若干阻害される反面、野生型細胞の成長は停止することが確認できた。
AIM3のレベルがアドリアマイシン処理により影響を受けるか否かをRT−PCR分析及びウェスタンブロット分析で調査した。
HCT116細胞に0.2μg/mlアドリアマイシンを処理した。次に、時間別に細胞を収得した後、Sol D溶液(4M guanidine thiocyanate,1% laurosarcosine, 25mM sodium citrate, and 0.1% b-mercaptoenthanol)で細胞を溶解させた。細胞抽出物を酸性フェノール(acidic phenol)と4%イソアミルアルコールを含むクロロホルムで培養した後、撹拌した(vortexed)。混合物を14,000rpmで遠心分離した。収得した上澄み液にイソプロパノールを添加してRNAを沈澱させた。沈澱されたRNAを100%エタノールで洗浄し、1μgのRNAを蒸留水に溶解させ、RT−PCRのための鋳型として使用した。次に、配列番号8及び配列番号9で示されるプライマーを用いてRT−PCRを行った。この際、AIM3の発現レベルを定量的に比較するため、GADPHの発現レベルを共に測定した。
一方、ウェスタンブロット分析のため、アドリアマイシンを処理した細胞を蛋白質分解酵素カクテルを含むRIPAで溶解させた。14,000rpmで30分間遠心分離した。抽出された蛋白質20μgをSDS−PAGEで分離した。次に、パク等の方法(Park S.G.,et l.,J.Biol.,Chem.,274:16673-16676,1999)により、ポリクローナルラビット抗AIM3抗体を利用してウェスタンブロットを行った。この際、AIM3の発現レベルを定量的に比較するため、チューブリンの発現レベルを共に測定した。
その結果、図4cに示した通り、アドリアマイシンに反応してAIM3の転写及び翻訳が全て誘導された。さらに、AIM3の誘導はUV、アクチノマイシンD(actinojycin D,Act.D)及びシスプラチン(CDPP)のような他のDNA損傷剤によっても観察された (結果未図示)。特に、AIM3はUVやアドリアマイシンに露出後、5分〜10分以内に誘導された(結果未図示)。前記結果はAIM3がDNA複製またはDNA損傷から引起されるDNA修復に反応する信号伝達経路に機能的に関連していることを示した。
DNA損傷時AIM3の細胞内位置を、大きい核を含むU2OS細胞を利用して調査した。U2OS細胞(osteosarcoma cell line)に254nm波長のUV−C(UV cross linker)で50J/m2で処理した。前記細胞を完全培地で30分間培養した後収集した。次に前記実施例〈4-3〉と同様の方法により実施し、AIM3の細胞内位置を免疫蛍光染色法で調査した。その結果、図4dに示した通り、UVが照射された細胞でAIM3により、形成された核焦点(nuclear foci)の著しい増加が観察された。
前記全ての結果はAIM3が遺伝毒性ストレスにより誘導される、DNA損傷に対する反応に関与することを示した。
本発明者等は前記実施例4を通じてAIM3の欠損によって細胞周期が早くなり、AIM3がDNA合成過程中、高レベルで誘導されることを確認した。従って、AIM3が細胞増殖にも関与するか否かを確認した。
a.チミジン混入法(thymidine incorporation)
野生型マウス及びAIM3+/-マウスから分離したマウス胎児線維芽細胞(MEFs,E14.5d)を1μCi/ml[3H]チミンを含む培地で培養した。培養された細胞を冷PBSで洗浄した後、核酸を沈澱させるために10%TCA溶液で30分間培養した。次に、0.1N NaOHで細胞を溶解させた後、沈澱物内に混入された放射性チミジンの量を液体シンチレーションカウンターを利用して定量した。実験を全3回行いその平均値を算出した。
その結果、図5aに示した通り、AIM3+/-マウスから分離されたMEFsは野生型MEFsに比べて一層高い増殖率を示した。
b)in situ 免疫蛍光染色法
AIM3+/-マウスから腸、精巣、脾臓、及び胸腺を分離した。次に、前記組織における細胞増殖率を調査するために、細胞増殖マーカーであるKi−67を利用してin situ 免疫蛍光染色法を行った(Gerdes J. et al., J. Immunol., 133: 1710-1715, 1984)。
その結果、図5bに示した通り、AIM3+/-マウス由来の各組織で野生型組織に比べて増加した細胞増殖が観察された。
本発明者等は前記実施例〈6-1〉を通じてAIM3の発現減少により、細胞増殖が増加したことを確認した。従って、AIM3の発現が増加すると細胞増殖が抑制されるかを調査した。
AIM3遺伝子(配列番号2)をpcDNA3(invitrogen)ベクターに挿入してAIM3発現ベクターを製造した。次に、前記ベクターをHCT116細胞(Human colon adenocarcinoma cell line)に導入させた。形質導入された各細胞の細胞増殖率を前記実施例〈6-1〉のaと同様の方法により調査した。この際、AIM3遺伝子を含有していないpcDNA3ベクター(empty vector,EV)で形質導入させたHCT116細胞を対照群として用いた。
その結果、図5cに示した通り、AIM3遺伝子が導入された細胞で細胞増殖が減少した。これにより、AIM3が腫瘍細胞に対して抗増殖活性を示すことを確認できた。
腫瘍抑制蛋白質であるp53はDNA損傷により、誘導される細胞周期停止とアポトーシスを調節するにおいて主要な役割をする(Levine, Cell, 88: 323-331, 1997、Vousden, Cell, 103: 691-694, 2000)。従って、AIM3とp53の機能的関連性について調査した。
AIM3+/-マウス及び野生型マウスから分離したマウス胎児線維芽細胞(MEFs)内でp53及びAIM3の発現レベルを前記実施例〈5-3〉と同様の方法により、ウェスタンブロットで調査した。さらに、前記実施例〈6-2〉で製造したAIM3発現ベクターをHCT116細胞に導入し、形質導入されたHCT116細胞でAIM3及びp53の発現レベルをウェスタンブロットで調査した。
その結果、図6aに示した通り、p53の発現レベルは野生型マウスに比べてAIM3+/-マウスのMEFsでさらに低かった。一方、AIM3遺伝子を導入したHCT116細胞ではAIM3遺伝子を導入しない対照群細胞に比べてp53のレベルが増加した。これはAIM3の異所性発現がp53の発現を向上させることを示すものである。
AIM3の増加がp53依存性転写を強化させるか否かを調査するために、p53のターゲット遺伝子として知られているp21のAIM3依存性転写を調査した。
前記実施例〈7-1〉でAIM3遺伝子(1μg/ml)で形質導入されたHCT116細胞を24時間培養した。次に、前記実施例〈5-3〉と同様の方法によりRT−PCR分析を行った。その結果、図6bに示した通り、AIM3遺伝子を導入したHCT116細胞でp21の発現が増加したことが確認できた。
次に、本発明者等はp21転写において、AIM3及び/またはアドリアマイシンの効果を調べるために、ルシフェラーゼ遺伝子と融合されたp21のプロモーターを含むベクターを利用してルシフェラーゼ分析を行った。
ルシフェラーゼ遺伝子がp21プロモーター下で発現されるように操作したpGL−3ベクター(Promega)とAIM3遺伝子を含む組み換えAIM3発現ベクター(1.2μg/ml)でHCT116細胞を共形質導入させた。対照群細胞には前記pGL−3ベクターとAIM3遺伝子を含有していない空ベクターを共導入した。次に、形質導入された各細胞に0.2μg/mlアドリアマイシンを2時間処理した。細胞を溶解した後、ルシフェラーゼ基質を添加し、常温で30分間培養した。各サンプル5μlをルミノメータプレート(luminometer plate)に移して、メーカー(Promega)のプロトコルに従ってルシフェラーゼ活性を測定した。
その結果、図6cに示した通り、p21プロモーターにより調節されるルシフェラーゼ活性がAIM3の形質導入により高レベルで増加され、ここにアドリアマイシンを追加して処理した場合にはその活性が一層増加した。
前記実施例〈7-1〉及び〈7-2〉を通じてp53とp21の発現がAIM3に依存することを確認した。従って、AIM3がp53とp21を通じて腫瘍細胞の増殖を抑制するか否かを調査した。
前記実施例〈6-2〉で製造したAIM3発現ベクターまたは空ベクター(2μg/ml)をHCT116細胞(Human colon adenocarcinoma cell line)、p53遺伝子が欠損されたp53−nullHCT116細胞及びp21遺伝子が欠損されたp21−nullHCT116細胞にそれぞれ導入した。次に、形質導入された各細胞の増殖率を前記実施例〈6-1〉のaと同様の方法により調査した。
その結果、図6dに示した通り、AIM3の抗増殖活性は機能的なp53またはp21の不在により消滅した。これはAIM3がp53とp21を通じて腫瘍細胞の増殖を抑制することを示した。
本発明者等はアンチセンスAIM3(As−AIM3)を利用してAIM3の発現を抑制した後、p53誘導が影響を受けるか否かを調査した。
まず、配列番号10及び配列番号11で示されるプライマーを利用して、ATGを含むAIM3遺伝子のN−末端176bpの領域をPCRで増幅した。PCR産物をpcDNA3.1ベクターに逆方向に挿入した。アンチセンスAIM3を含むベクター(2μg/ml)をHCT116細胞に導入した。形質導入された細胞を24時間培養した。次に、細胞にUV及び0.2μg/mlアドリアマイシンをそれぞれ処理した。次に、抗AIM3抗体または抗p53抗体(Santacruz)を利用して前記実施例〈2-5〉と同様の方法により、ウェスタンブロット分析を行った。この時、AIM3及びp53の発現レベルを定量的に比較するために、アクチンの発現レベルを共に測定した。
その結果、図6eに示した通り、p53のレベルはUVまたはアドリアマイシン処理により増加する反面、As−AIM3によるAIM3の抑制はp53の誘導を阻害した。前記結果からp53の発現を増加させるためにAIM3が必要であることが示された。さらに、p53の直接的な初期ターゲット遺伝子であるPUMAの転写またはUV照射により増加され、その誘導はAIM3がAs−AIM3により抑制された時阻害された(結果未図示)。
前記結果はAIM3がDNA損傷によりp53の誘導を媒介するp53の重要な上位調節者であることを示すものである。
ATM/ATRはDNA損傷に反応してp53を直接的に活性化させる物質である(Canman et al., Science, 281: 1677-1679, 1998、Banin S et al., Science, 11; 281(5383): 1674-7, 1998)。従って、本発明者等はAIM3がATM/ATRを通じて作用するか否かを調査した。
AIM3がATM/ATRを通じてp53を調節できるとの可能性を確認するために、本発明者等はまず、ATM/ATRの阻害剤として知られているカフェインの存在下でAIM3の抗増殖活性調査した。HCT116細胞をAIM3発現ベクターまたは空ベクター(2μg/ml)で24時間形質導入させた。次に、20mMカフェインを添加して4時間培養した。対照群ではPBSを添加した。各細胞の細胞増殖率を前記実施例〈6-1〉のaと同様の方法により調査した。その結果、図7aに示した通り、ATM/ATRの阻害剤であるカフェインにより、AIM3の抗増殖活性が消滅されたことが観察された。これにより、AIM3がATM/ATRを通じて抗増殖活性を示すことが確認された。
次に、本発明者等はAIM3により誘導されるアポトーシスがATM/ATRの阻害剤であるカフェインにより、阻害されるか否かを調査した。HCT116細胞をAIM3発現ベクターまたは空ベクター(4μg/ml)で24時間形質導入させた。次に、20mMカフェインを添加して12時間培養した。対照群ではPBSを添加して培養した。次に、PI染色を行った後、サブG1細胞の部分(%)を測定してアポトーシスを調査した。その結果、図7bに示した通り、アポトーシスがAIM3の発現により誘導され、このような効果はカフェイン処理により緩和されたことを確認できた。
次に、本発明者等はAIM3により誘導されるp53の発現がカフェインにより阻害されるか否かを調査した。まず、HCT116細胞をAIM3発現ベクターまたは空ベクター(2μg/ml)で24時間形質導入させた。次に、20mMカフェインを添加して12時間培養した。対照群にはPBSを添加して培養した。その後、AIM3とp53のレベルを調査するために、前記実施例〈7-5〉と同様の方法により、ウェスタンブロット分析を行った。この際、AIM3及びp53の発現レベルを定量的に比較するために、アクチンの発現レベルを共に測定した。
その結果、図7cに示した通り、AIM3により誘導されたp53の発現はカフェインにより阻害された。さらに、p53のターゲット遺伝子であるPUMAの発現もAIM3により誘導されたものの、これもまたカフェインにより阻害された(結果未図示)。前記結果等はp53のAIM3−依存性誘導でATM/ATRが重要な役割をすることが示された。
p53のAIM3依存性誘導でATM/ATRが重要な役割をすることを、より詳しく確認するため、ATMのキナーゼデッドドメイン(KD−AIM3)でHCT116細胞を間形質導入させた(Canman et al., Science, 281: 1677-1679, 1998)。前記KD−ATMはATMの活性を特異的に阻害した。
まず、KD−ATMドメインまたは野生型ATMを含むベクター(St. Jude Children's HospitalのMicheal Kastanから提供された)をAIM3発現ベクター(2μg/ml)と共に、HCT116細胞にそれぞれ導入した。AIM3発現に対する対照群には、前記ベクターをAIM3遺伝子を含有していない空ベクターと共に、HCT116細胞にそれぞれ導入させた。次に、形質導入された各細胞におけるp53とAIM3の発現レベルを前記実施例〈6-5〉と同様の方法によりウェスタンブロット分析で調査した。この時、AIM3及びp53の発現レベルを定量的に比較するために、アクチンの発現レベルを共に測定した。
その結果、図7dに示した通り、AIM3の発現増加によるp53誘導はKD−ATMにより阻害される反面、野生型ATMによっては阻害されなかった。これはp53のAIM3依存性誘導にATMが必要であることをさらに裏付ける結果である。
前記全ての結果等からAIM3がATM/ATRを通じて抗増殖活性、アポトーシス誘導活性及びp53上向調節(up-regulation)活性を示すことが確認できた。
〈9-1〉AIM3とATMの相互作用分析
a.共免疫沈澱法(co-immunoprecipitation)
AIM3とATM間の相合作用を調査するために、共免疫沈澱法を行った。まず、UV及び0.2μg/mlアドリアマイシンをそれぞれ処理したHCT116細胞から時間別に蛋白質を抽出した。蛋白質抽出物を正常IgGと蛋白質A/Gアガロス(protein A/G-agarose)と共に2時間培養し、次に、非特異的IgG結合蛋白質等を除去するために遠心分離を行った。遠心分離により収得された上澄みに抗ATM抗体(Santacruz)2μg添加して4℃で2時間振盪培養した。次に、蛋白質A/Gアガロスを添加した。冷たいPBSで2回洗浄した後PIRAでもう一度洗浄した。沈澱物等をSDS−サンプルバッファーに溶解させた後、6%SDS−PAGEで分離した。SDS−PAGEから分離された蛋白質をPVDF膜に移して抗−AIM3単一抗体及び2次抗体(horseradish peroxidase conjugated secondary antibody)とこの順序で反応させた。
その結果、図8aに示した通り、AIM3とATMの相互作用はUV及びアドリアマイシンと反応して5分以内に増加した。AIM3の分解反応速度はアドリアマイシンが処理された細胞においてより遅くなったものの、これはUVストレスは細胞に一時的な影響を与える反面、アドリアマイシンは培養する間培地内に継続して存在するためのものと思われる。
b.試験管内プルダウン分析(in vitro pull down assay)
AIM3とATM間の直接的な相互作用を確認するためにGSTプルダウン分析を行った。
まず、AIM3はGSTと融合された形態に変化させ、メーカー(pharmacia)のプロトコルに従って精製した。一方、全体のATMは大きさが極めて大きく合成が困難であっため、本発明者等はATMの機能ドメインとAIM3の相互作用を試験した。このため、ATMの構造でFATドメインを含む612個のアミノ酸からなる断片を配列番号12及び配列番号13で示されるプライマーを利用してPCRで増幅した。さらに、C−末端ドメインを有する145個のアミノ酸からなる断片(対照群)は配列番号14及び配列番号15に示されるプライマーを利用してPCRで増幅した。次に、増幅されたPCR産物を試験管内転写及び翻訳が可能なベクターのpcDNA3.1(Invitrogen)にクローニングした。この際、蛋白質の合成は放射性メチオニンの存在下で試験管内翻訳法(in vitro trnaslation)で行った。合成されたTNT産物10μlをGSTまたはGST−融合AIM3蛋白質が固定されたグルタチオンセパロスビド上で5分間培養した。次に、結合バッファ(0.2% sarcosine 及び0.2% Triton X100を含むPBS)で6回洗浄し、10%SDS−PAGEで溶解した。各ドメインに対するGST−融合AIM3の結合をオートラジオグラフ法(autoradiography)で分析した。
その結果、図8bに示した通り、GST−融合AIM3蛋白質はATMの機能ドメインであるFATドメインとは結合したものの、ATMのc−末端ドメインとは結合しなかった。これにより、AIM3がATRと直接的に相互作用をすることが確認できた。
FATドメインはATMのみならずATRにも存在する(Abraham R,Genes Dev.,15:2177,2001)。従って、AIM3とATRの相互作用を共免疫沈澱法で調査した。
まず、フラグタグを付けたATR(Flag-tagged ATR)を含むATRベクター(ハーバド大学 Elledge S.より提供された)で293細胞を形質導入させた。形質導入された293細胞にUVを処理した後、時間別に蛋白質を抽出した。次に、抗ATM抗体の代わりに抗FLAG抗体(Sigma)を用いたことを除いては前記実施例〈9-1〉のaと同様の方法により行った。
その結果、図8cに示した通り、AIM3はフラグタグを付けたATR(Flag-tagged ATR)と共免疫沈澱させ、前記相互作用はUV露出下で一層強化された。これよりAIM3がATMに作用したのと同様に、ATRにも作用することが確認できた。
前記結果等からAIM3がATM/ATRと直接的な相合作用をすることが確認できた。
本発明者等はATM/ATRの活性がAIM3との結合により強化されるか否かを調査した。
a.AIM3+/-マウス由来の細胞よりH2AXの燐酸化レベル測定
ATM/ATRの基質として知られているH2AX(Burma et al., Biol. Chem., 276: 42462-42467, 2001、Ward, I. M. et al., J. Biol. Chem., 276: 47759-47762, 2001、Iren M. Ward. et al., J. Biol. Chem., 279(11): 9677-9680, 2004)を利用してATM/ATRの活性を調査した。
野生型マウスとAIM3+/-マウスより胸腺細胞と脾臓細胞を分離した後、前記細胞等よりH2AXの燐酸化レベルを前記実施例〈7-5〉と同様の方法により、ウェスタンブロット法で測定したその結果、図9aに示した通り、H2AXの燐酸化(p-H2AX)がAIM3+/-マウス由来の細胞で急激に減少されたことが確認できた。
b.アンチセンスAIM3によるH2AX燐酸化抑制分析
次に、本発明者等はDNA損傷剤であるVP16(Clarke et al., Nature, 362: 849-852,1993)を細胞に処理した後、アンチセンスAIM3(As-AIM3)の存在下でH2AXの燐酸化がAIM3の抑制により阻害されるか否かを調査した。前記実施例〈7-5〉で製造したアンチセンスAIM3を含むベクター(2μg/ml)をHCT116細胞に導入した。形質導入された細胞を24時間培養した後、アポップトシス誘導体であるVP16(Sigma)を100μMの濃度で4時間処理した。次に、抗p53抗体、抗AIM3抗体及び抗pH2AX抗体(Cell signaling)をそれぞれ利用して、前記実施例〈7-5〉と同様の方法によりウェスタンブロット分析をした。この時、各蛋白質の発現レベルを定量的に比較するため、アクチンの発現レベルを共に測定した。その結果、図9bに示した通り、VP16処理によりH2AXの燐酸化が強化されたものの、これはアンチセンスAIM3の発現により阻害された。
c.ATM活性化に対するAIM3の効果分析
ATMの自己燐酸化に対するAIM3の効果を調べるため、本発明者等はATM及びそのターゲットであるp53とchk2の燐酸化をウェスタンブロットで調査した。野生型マウス及びAIM3+/-マウスから分離した細胞に0.2μg/mlアドリアマイシンを処理した。次に、抗燐酸セリンATM抗体(anti-phospho-serine antibody of ATM)、抗p53抗体及び抗chk2の抗体をそれぞれ利用してウェスタンブロットを行った(Bakkenist and Kastan, Nature, 421: 499-506, 2003)。その結果、図9cに示した通り、野生型細胞ではATM及びこれのターゲット蛋白質等の燐酸化がアドリアマイシン処理により、強化される反面、AIM3+/-細胞では前記燐酸化が抑制された。
前記全ての結果はAIM3がATM/ATR及びこれらのターゲット蛋白質の活性化に必要であることを表した。
〈10-1〉ヒトのがん細胞株からAIM3の発現レベル測定
a.RT−PCR分析
ヒトのがんとAIM3の機能的関連性を確認するために、本発明者等は下記表4に記載された多様な種類のがん細胞株内で、AIM3レベルをRT−PCRで調査した。RT−PCRは前記実施例〈5-3〉と同様の方法により行った。
さらに、前記表4の細胞株の内、肺がん細胞株のみを対象にAIM3の発現レベルをウェスタンブロットで比較した結果、前記RT−PCR分析結果と一致する結果を得た(結果未図示)。
前記結果はAIM3の発現レベルが幾つかの細胞株で減少することを示唆する。
b.ゲノミックPCR分析
幾つかの細胞株よりAIM3の発現レベルが低い原因を確認するために、本発明者等はPCR分析を利用してAIM3遺伝子のDNAの量を比較した。H157、H460、HCT116、A549、及びDU145細胞株を対象に前記実施例〈2-2〉と同様の方法によりゲノミックPCR分析を行った。対照群としてアクチン遺伝子を利用した。
その結果、図10bに示した通り、H460及びA549細胞株は他の細胞株よりもさらに少ない量のAIM3 DNAを含有していた。これは前記二つの細胞株より一つのAIM3対立因子が欠損されたことを意味する。
次に、がん患者等から分離された組織よりAIM3及びp21の発現レベルを調査した。9人の白血病患者(5人:急性前骨髄球性白血病(APML)4人:慢性骨髄性白血病(CML)の白血球細胞から全RNAを分離した。次に、前記実施例〈5-3〉と同様の方法によりRT−PCRを行った。p21のためのRT−PCR分析では配列番号16及び配列番号17で示されるプライマーを利用した。
その結果、図10cに示した通り、3人の患者の組織よりAIM3が低いレベルで発現されることが観察された。この場合にはp53のターゲット遺伝子であるp21の発現も強く抑制されることがわかった。これにより、p53の調節にAIM3が機能的に関与することを改めて確認することができた。
固形腫瘍はその頻度が極めて低かったものの、AIM3+/-マウスでも発見されたので、本発明者等は肝臓がん患者等から分離された正常組織とがん組織でAIM3のレベルをRT−PCR分析で比較した。この時、対照群としてアクチンの発現レベルを共に測定した。25個の患者サンプルを分析した結果、12個のサンプルからAIM3によりがんが特異的に減少されたことが観察された。代表的な8個のサンプルの結果を図10dに示した。
前記全ての結果は低いレベルのAIM3発現が多様なヒトの細胞株及び患者組織と高頻度で関連していることを示唆する。さらに、前記結果はAIM3発現レベルを測定してがんを診断できることを示している。
Claims (18)
- 細胞、組織または体内で、ATM、ATR、及びATMまたはATRにより調節される蛋白質から選ばれるいずれか一つを活性化させる薬剤の製造に用いるための、
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸の使用。 - ATMまたはATRの活性化が、AIM3の結合により媒介される請求項1に記載の使用。
- ATMまたはATRにより調節される蛋白質が、H2AX、p53、chk2、chk1、BRCA1、c−Abl、PHAS−1、RPA、RAD9、MDM2、MRE11、Rad17、WRN、PTS、CtIP、eIF−4E結合蛋白質1、LKB1、FANCD2、SMC1、Nibrin、NBS、p95、Pin2/TRF1、DNA5B、BRCA2、及びホスファチジルイノシトル3−キナーゼからなる群より選ばれる請求項1に記載の使用。
- 前記ATM、ATR、及びATMまたはATRにより調節される蛋白質から選ばれるいずれか一つの活性化が、DNA修復、細胞周期調節及び/またはアポトーシスと関連したものである請求項1に記載の使用。
- 細胞、組織または体内で、p53またはそのターゲット遺伝子の発現を誘導する薬剤の製造に用いるための、
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸の使用。 - p53のターゲット遺伝子が、p21、PUMA、GADD45、14−3−3sigma、WIP1、mdm−2、EGFR、PCNA、CyclinD1、CyclinG、TGFα、BAX、BAK、FAS1、Fas/APO1、FASL、IGF−BP3、PAG608、DR5/KILLER、GML、p53AIP1、p53R2、P2XM、TSP−1、BAL1、CSR、PIG3、Apaf−1、p53RDL1、Staf50、CD200、及びSnk/PIk2からなる群より選ばれる請求項5に記載の使用。
- 腫瘍細胞の増殖を抑制する薬剤の製造に用いるための、
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸の使用。 - 細胞、組織または体内でアポトーシスを促進する薬剤の製造に用いるための、
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸の使用。 - がんを治療または予防する薬剤の製造に用いるための、
(a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸の使用。 - 前記がんが、乳房がん、大腸がん、肺がん、小細胞肺がん、胃腸がん、肝臓がん、血液がん、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭部または頸部がん、皮膚または眼球内黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門付近がん、結腸がん、喇叭管がん、子宮内膜がん、子宮頸部がん、腟がん、陰門がん、ホジキン病、食道がん、小腸がん、内分泌腺がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、副腎がん、軟組織肉腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性または急性白血病、リンパ球リンパ腫、膀胱がん、腎臓または輸尿管がん、腎臓細胞がん、腎臓骨盤がん、CNS腫瘍、1次CNSリンパ腫、脊髄腫瘍、脳間神経膠腫、脳下垂体腺腫、またはこれら一つ以上の組合せである請求項9記載の使用。
- (a)AIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)または前記蛋白質を発現する組み換え細胞を候補物質と共に培養する段階;及び
(b)AIM3の活性または細胞内レベル増加に及ぼす候補物質の効果を測定する段階を含むことを特徴とする、がんを治療及び/または予防する物質をスクリーニングする方法。 - (a)個体からサンプリングした組織内でAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の発現レベルを測定する工程;及び
(b)前記組織内のAIM3レベルと正常AIM3レベルを比較し、その差が特定以上である場合にはがんの危険性があることを示すとする工程を含むことを特徴とする、がんの危険性のある個体を同定する方法。 - 配列番号2で示されるヌクレオチド配列を含み、AIM3蛋白質をコードする核酸、その断片及びAIM3蛋白質に対する抗体から選ばれるいずれか一つを含むことを特徴とする、がんの診断用キット。
- (a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸を有効成分として含むことを特徴とする、ATM、ATR、及びATMまたはATRにより調節される蛋白質から選ばれるいずれか一つの活性化剤。 - (a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸を有効成分として含むことを特徴とする、p53またはそのターゲット遺伝子の発現誘導剤。 - (a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸を有効成分として含むことを特徴とする、腫瘍細胞の増殖を抑制するための薬学的組成物。 - (a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸を有効成分として含むことを特徴とする、アポトーシス促進剤。 - (a)配列番号1で示されるアミノ酸配列を有するAIM3(ARS-interacting multifunctional protein 3)の単離されたポリペプチド;または
(b)前記ポリペプチドをコードする単離された核酸を有効成分として含むことを特徴とする、がんを治療または予防するための薬学的組成物。
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