JP5700409B2 - Hsp90を標的にした新規抗がんキメラペプチド - Google Patents
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Description
アミノ酸配列X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12(配列番号1)を有するものであって、ここで
X1は、Kまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X2は、Aまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X3は、Yまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X4は、Aまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X5は、Rまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X6は、Iまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X7は、Gまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X8は、Nまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X9は、Sまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X10は、Yまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X11は、Fまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X12は、Kまたはそれに類似するアミノ酸であるか、あるいは
TPRペプチドを延長させたRQIAKAYARIGNSYFKEEKYK(配列番号43)であり、
ここで、アミノ酸表記は1文字表記によるものである。
アミノ酸配列X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12(配列番号1)を有するものであって、ここで
X1は、K、RまたはAであり(好ましくは、Kであり);
X2は、AまたはGであり;
X3は、YまたはLであり(好ましくは、Yであり);
X4は、AまたはGであり;
X5は、R、AまたはKであり(好ましくは、Rであり);
X6は、I、AまたはRであり(好ましくは、Rであり);
X7は、GまたはAであり;
X8は、NまたはQであり;
X9は、SまたはYであり;
X10は、YまたはSであり;
X11は、FまたはYであり;および/または
X12は、KまたはRであるか、あるいは
TPRペプチドを延長させたRQIAKAYARIGNSYFKEEKYK(配列番号43)である。
X2は、Gであり;
X4は、Gであり;
X7は、Aであり;
X4は、Qであり;
X9は、Yであり;
X10は、Sであり;
X11は、Yであり;および/または
X12は、Rである、ものを含む。
X4は、Gであり;
X9は、Yであり;
X11は、Yである、
ものを含む。
Y1は、Rまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y2は、Qまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y3は、Iまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y4は、Kまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y5は、Iまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y6は、Qまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y7は、Fまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y8は、Qまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y9は、Nまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y10は、Rまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y11は、Rまたはそれに類似するアミノ酸であり;
Y12は、Mまたはそれに類似するアミノ酸である、
Y13は、Kまたはそれに類似するアミノ酸である、
Y14は、Kまたはそれに類似するアミノ酸である、
Y15は、Kまたはそれに類似するアミノ酸である、
Y16は、Kまたはそれに類似するアミノ酸である、
を有するものである。
Y1は、RまたはKであり;
Y2は、QまたはNであり;
Y3は、IまたはLであり;
Y4は、KまたはRであり;
Y5は、IまたはLであり;
Y6は、WまたはYであり;
Y7は、FまたはYであり;
Y8は、QまたはNであり;
Y9は、NまたはQであり;
Y10は、RまたはKであり;
Y11は、RまたはKであり;
Y12は、MまたはCであり;
Y13は、KまたはRであり;
Y14は、WまたはYであり;
Y15は、KまたはRであり;および/または
Y16は、KまたはRである、
配列を有するものである。
Y2は、Nであり;
Y4は、Rであり;
Y8は、Nであり;
Y9は、Qであり;
Y10は、Kであり;
Y11は、Kであり;
Y12は、Cであり;
Y13は、Rであり;
Y14は、Yであり;
Y15は、Rであり;および/または
Y16は、Rである、
配列を有するものを包含する。
Y4は、Rであり;
Y9は、Qであり;
Y12は、Cであり;および/または
Y16は、Rである、
配列を有するものを包含する。
以下に本明細書において特に使用される用語の定義を列挙する。
X1は、Kまたはそれに類似する同じ親水性アミノ酸のR、Aなどのアミノ酸であり;
X2は、Aまたはそれに類似する脂肪族系側鎖のG、V、L、Iなどのアミノ酸であり;
X3は、Yまたはそれに類似する疎水性アミノ酸Lなどのアミノ酸であり;
X4は、Aまたはそれに類似する脂肪族系側鎖のG、V、L、Iなどのアミノ酸であり;
X5は、Rまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X6は、Iまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X7は、Gまたはそれに類似する他のTPRドメインで見受けられるAなどのアミノ酸であり;
X8は、Nまたはそれに類似する他のTPRドメインで見受けられるQなどのアミノ酸であり;
X9は、Sまたはそれに類似するOH基を有するT、Yなどのアミノ酸であり;
X10は、Yまたはそれに類似するOH基を有するS、Tなどのアミノ酸であり;
X11は、Fまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
X12は、Kまたはそれに類似する塩基性のRなどのアミノ酸であり、X1〜X12は任意の組み合わせ有効でありうることが理解される。
X1は、K、RまたはAであり、好ましくはKであり;
X2は、AまたはGであり;
X3は、YまたはLであり、好ましくはYであり;
X4は、AまたはGであり;
X5は、R、AまたはKであり、好ましくはRであり;
X6は、I、AまたはRであり、好ましくはIまたはAであり;
X7は、GまたはAであり;
X8は、NまたはQであり;
X9は、SまたはYであり;
X10は、YまたはSであり;
X11は、FまたはYであり;
X12は、KまたはRであるか、あるいは
TPRペプチドを延長させて得られる
RQIAKAYARIGNSYFKEEKYK(配列番号43)であり、X1〜X12は任意の組み合わせ有効でありうることが理解される。
X2は、Gであり;
X4は、Gであり;
X7は、Aであり;
X4は、Qであり;
X9は、Yであり;
X10は、Sであり;
X11は、Yであり;
X12は、Rである、
ものを含み、これらの好ましい置換は任意の組み合わせが有効でありうることが理解される。本発明において、これらの置換によって、効果の維持または増強が見出されたからである。
X4は、Gであり;
X9は、Yであり;
X11は、Yである、
ものを含み、これらの好ましい置換は任意の組み合わせが有効でありうることが理解される。これらの置換によって、効果の増強が見出されたからである。
野生型に比べてほぼ同程度といえるもの:G7A,Y10S,K12R
野生型に比べて効果はあるが減少するものである:K1A,K1R,Y3L,R5K,R5A,I6R。
RQIKIWFQNRRMKWKK(配列番号5)またはその改変配列であって、該改変配列は、アミノ酸配列Y1Y2Y3Y4Y5Y6Y7Y8Y9Y10Y11Y12Y13Y14Y15Y16(配列番号8)を有するものであって、ここで
Y1は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y2は、Qまたはそれに類似するアミド系のN、Glx(本明細書において「Glx」とは、GlnおよびGluを包含して称する。)としてEなどのアミノ酸であり;
Y3は、Iまたはそれに類似する脂肪族系のLなどのアミノ酸であり;
Y4は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y5は、Iまたはそれに類似する脂肪族系のLなどのアミノ酸であり;
Y6は、Wまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y7は、Fまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y8は、Qまたはそれに類似するアミド系のN、GlxとしてEなどのアミノ酸であり;
Y9は、Nまたはそれに類似するアミド系のQなどのアミノ酸であり;
Y10は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y11は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y12は、Mまたはそれに類似するS含有アミノ酸のCなどのアミノ酸であり;
Y13は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y14は、Wまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y15は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y16は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸である、
ものを有するものであり、Y1〜Y16は任意の組み合わせ有効でありうることが理解される。
Y2は、QまたはNであり;
Y3は、IまたはLであり;
Y4は、KまたはRであり;
Y5は、IまたはLであり;
Y6は、WまたはYであり;
Y7は、FまたはYであり;
Y8は、QまたはNであり;
Y9は、NまたはQであり;
Y10は、RまたはKであり;
Y11は、RまたはKであり;
Y12は、MまたはCであり;
Y13は、KまたはRであり;
Y14は、WまたはYであり;
Y15は、KまたはRであり;
Y16は、KまたはRである、
配列を有するものであり、Y1〜Y16は任意の組み合わせ有効でありうることが理解される。
Y4は、Rであり;
Y8は、Nであり;
Y9は、Qであり;
Y10は、Kであり;
Y11は、Kであり;
Y12は、Cであり;
Y13は、Rであり;
Y14は、Yであり;
Y15は、Rであり;および/または
Y16は、Rである、
配列を有するものを含み、これらの好ましい置換は任意の組み合わせ有効でありうることが理解される。これらの置換によって、効果の維持または増強が見出されたからである。
Y9は、Qであり;
Y12は、Cであり;あるいは
Y16は、Rである、
配列を有するものを含み、これらの好ましい置換は任意の組み合わせ有効でありうることが理解される。これらの置換によって、効果の増強が見出されたからである。
野生型に比べほぼ同程度のもの:Q2N,Q8N,R10K,R11K,K13R,W14Y,K15R
野生型に比べて効果は保持されるが減少するもの:R1K,I3L,I5L,W6Y,F7Y。
A:G、I、V、L
C:M(含Sアミノ酸)
D:N、QまたはE
E:N、QまたはD
F:Y、S、Aなど
G:A
H:Wなど
I:A、L、V、(G)
K:R
L:A、I、V、(G)
M:Sなど
N:E、DまたはQ
P:HyP
Q:N、EまたはD
R:K
S:T、Y
T:S、Y
V:I、L、A、(G)
W:H
Y:F、S、T。
アミノ酸配列X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12(配列番号1)を有するものであって、ここで
X1は、Kまたはそれに類似する同じ親水性アミノ酸のR、Aなどのアミノ酸であり;
X2は、Aまたはそれに類似する脂肪族系側鎖のG、V、L、Iなどのアミノ酸であり;
X3は、Yまたはそれに類似する疎水性アミノ酸Lなどのアミノ酸であり;
X4は、Aまたはそれに類似する脂肪族系側鎖のG、V、L、Iなどのアミノ酸であり;
X5は、Rまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X6は、Iまたはそれに類似するアミノ酸であり;
X7は、Gまたはそれに類似する他のTPRドメインで見受けられるAなどのアミノ酸であり;
X8は、Nまたはそれに類似する他のTPRドメインで見受けられるQなどのアミノ酸)であり;
X9は、Sまたはそれに類似するOH基を有するT、Yなどのアミノ酸であり;
X10は、Yまたはそれに類似するOH基を有するS、Tなどのアミノ酸であり;
X11は、Fまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
X12は、Kまたはそれに類似する塩基性のRなどのアミノ酸である。
Y1は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y2は、Qまたはそれに類似するアミド系のN、GlxとしてEなどのアミノ酸であり;
Y3は、Iまたはそれに類似する脂肪族系のLなどのアミノ酸であり;
Y4は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y5は、Iまたはそれに類似する脂肪族系のLなどのアミノ酸であり;
Y6は、Wまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y7は、Fまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y8は、Qまたはそれに類似するアミド系のN、GlxとしてEなどのアミノ酸であり;
Y9は、Nまたはそれに類似するアミド系のQなどのアミノ酸であり;
Y10は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y11は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y12は、Mまたはそれに類似するS含有アミノ酸のCなどのアミノ酸であり;
Y13は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y14は、Wまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y15は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y16は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸である、
を有するものであり得る。
本発明のペプチド(たとえば、キメラペプチド)は、当該分野で周知の方法(例えば、化学合成、以下に考察される一般的な工学技術)により得られ、または産生され得る。例えば、所望の領域もしくはドメインを含むペプチドの一部と一致するペプチドか、またはインビトロで所望の活性を媒介するペプチドは、ペプチド合成機の使用により合成され得る。ペプチドはまた、ペプチドの疎水性領域および親水性領域を同定するために使用され得る親水性分析(例えば、HoppおよびWoods、1981.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:3824〜3828を参照のこと)により分析され得、従って実験操作(例えば、結合実験、抗体合成)のための物質の設計において助けとなる。二次構造分析はまた、特定の構造的モチーフを確立するペプチドの領域を同定するために行われ得る(例えば、ChouおよびFasman、1974、Biochem 13:222〜223を参照のこと)。操作、翻訳、二次構造の予想、親水性および疎水性プロファイル、オープンリーディングフレームの予想およびプロッティング、ならびに配列の相同性の決定は、当該分野で利用可能なコンピューターソフトプログラムを使用して達成され得る。構造分析の他の方法として、例えば、X線結晶解析(例えば、Engstrom、1974.Biochem Exp Biol 11:7〜13を参照のこと));質量分析およびガスクロマトグラフィー(例えば、METHODS IN PROTEIN SCIENCE、1997.J.WileyおよびSons、NewYork、NYを参照のこと)が挙げられ、そしてコンピュータモデリング(例えば、FletterickおよびZoller、編、1986.Computer Graphics and Molecular Modeling:CURRENT COMMUNICATION IN MOLECULAR BIOLOGY、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、NYを参照のこと)もまた使用され得る。
本発明の化合物または本発明の範囲内であるその製薬上許容される塩もしくは溶媒和は、そのまま単独で投与することも可能であるが、通常各種の医薬製剤として提供するのが好ましい。また、それら医薬製剤は、動物および人に使用される。
本明細書において「送達剤」または「送達媒体」とは、目的の物質の送達を媒介する担体(ビヒクル)をいう。送達される物質が薬物であれば、「薬物送達媒体」という。薬物送達システム(Drug Delivery System、DDS)とは、ドラッグデリバリーシステムとも呼ばれ、吸収制御型DDS、放出制御型DDS、標的指向型DDSに分類することもある。理想的なDDSは、薬物を「体内の必要な部位に」、「必要な量を」、「必要な時間だけ」送り込むシステムである。ターゲティングDDSは、パッシブ・ターゲティングDDSとアクティブ・ターゲティングDDSとに分類される。前者はキャリア(薬物運搬体)の粒子径や親水性など物理化学的性質を利用して体内挙動を制御する方法である。後者はこれらに特殊な仕組みを付け加えて積極的に標的組織への指向性を制御しようとする方法であり、例えば、標的組織を構成する特定細胞の標的分子への特異的分子認識機能を有する抗体(たとえば、本発明のTPR結合ペプチド)などを結合したキャリアを利用する方法があり「ミサイルドラッグ」と呼ばれることもある。
本発明のキメラペプチドが、固形がん細胞株において殺細胞効果、抗腫瘍効果を示すかどうかを検討した。
(細胞株)
ヒト乳がん細胞株(BT−20およびT47D)、肺がん細胞株(H322およびH460)、前立腺がん細胞株(LNCap)、神経膠腫細胞株(U251)、腎臓がん細胞株(Caki−1)および肺線維芽細胞の細胞株(MRC−5)を、American Type Culture Collection(Manassas,VA)から購入した。ヒト膵臓がん細胞株(BXPC−3)を、Europiean Collection of Cell Cultures(ECACC;Salisbury,Wiltshire,UK)から購入した。ヒト胚性腎臓細胞株(HEK293)を、RIKEN Cell Bank(つくば市)から購入した。細胞は、10% FBS(BioWest,Miami,FL)、100μg/ml ペニシリンおよび100μg/ml ストレプトマイシン(ナカライテスク株式会社、京都市)を含有する、RPMI 1640(BT−20、T47D、H322、H460、LNCap、U251およびBXPC−3)、MEM(MARC−5)またはD−MEM(HEK293、Caki−1)中で培養した。
以下のペプチドをInvitrogen,Carlsbad,CAから購入したか、あるいは、ペプチド合成機(たとえば、Applied Biosystems:Model 433A ペプチドシンセサイザ)で合成した。
1.キメラペプチド:RQIKIWFQNRRMKWKK−KAYARIGNSYFK(Antp−TPR wild;配列番号9)
ここで、RQIKIWFQNRRMKWKK(配列番号5)は、本明細書においてAntennapedia homeodomain sequence(Antp)と称することがある。
2.キメラペプチド:RQIKIWFQNRRMKWKK−KAYAR(配列番号42)
3.ペプチド:KAYARIGNSYFK(TPRペプチド;配列番号4)
4.キメラペプチド:RQIKIWFQNRRMKWKK−KAYAAAGNSYTFK(Mutant 1;配列番号44)
5.キメラペプチド:RQIKIWFQNRRMKWKK−KAYARIGNSGGG(Mutant 2;配列番号45)
また、以下も合成した。
RQIKIWFQNRRMKWKKRAYARIGNSYFK(Antp−TPR K1R;配列番号10)、
RQIKIWFQNRRMKWKKAAYARIGNSYFK(Antp−TPR K1A;配列番号11)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKGYARIGNSYFK(Antp−TPR A2G;配列番号12)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKALARIGNSYFK(Antp−TPR Y3L;配列番号13)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYGRIGNSYFK(Antp−TPR A4G;配列番号14)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYAKIGNSYFK(Antp−TPR R5K;配列番号15)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARRGNSYFK(Antp−TPR I6R;配列番号16)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIANSYFK(Antp−TPR G7A;配列番号17)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGQSYFK(Antp−TPR N8Q;配列番号18)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNYYFK(Antp−TPR S9Y;配列番号19)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSSFK(Antp−TPR Y10S;配列番号20)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYYK(Antp−TPR F11Y;配列番号21)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFR(Antp−TPR K12R;配列番号22)。
また、細胞溶解性に関する変異のものも合成した。
KQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnR1K−TPR;配列番号23)、
RNIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnQ2N−TPR;配列番号24)、
RQLKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnI3L−TPR;配列番号25)、
RQIRIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnK4R−TPR;配列番号26)、
RQIKLWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnI5L−TPR;配列番号27)、
RQIKIYFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnW6Y−TPR;配列番号28)、
RQIKIWYQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnF7Y−TPR;配列番号29)、
RQIKIWFNNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnQ8N−TPR;配列番号30)、
RQIKIWFQQRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnN9Q−TPR;配列番号31)、
RQIKIWFQNKRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnR10K−TPR;配列番号32)、
RQIKIWFQNRKMKWKKKAYARIGNSYFK(AnR11K−TPR;配列番号33)、
RQIKIWFQNRRCKWKKKAYARIGNSYFK(AnM12C−TPR;配列番号34)、
RQIKIWFQNRRMRWKKKAYARIGNSYFK(AnK13R−TPR;配列番号35)、
RQIKIWFQNRRMKYKKKAYARIGNSYFK(AnW14Y−TPR;配列番号36)、
RQIKIWFQNRRMKWRKKAYARIGNSYFK(AnK15R−TPR;配列番号37)、
RQIKIWFQNRRMKWKRKAYARIGNSYFK(AnK16R−TPR;配列番号38)、
RQIKIWFQNRRMKWKKRQIAKAYARIGNSYFK(Antp−TPR slong;配列番号39)、
RRRRRRRRRRRKAYARIGNSYFK(R11−TPR;配列番号40)
これらのペプチドを、化学的に合成し、そして、高速液体クロマトグラフィーにより精製して、その後、水に溶解した。
1ウェルあたり合計3×103細胞を、96ウェルプレートに播種し、10% FBSを含有する培地中で24時間培養し、100μlにおいて漸増濃度のペプチドと共に、37℃にて48〜72時間インキュベートした。細胞の生存率を、WST−8溶液(Cell Count Reagent SF;ナカライテスク株式会社)を用いて測定した。
Antp−TPRペプチドががん細胞においてアポトーシスを誘導するかどうかを検討するために、アネキシンVまたはカスパーゼ3,7およびヨウ化プロピジウム(PI)の二重染色を用いて、フローサイトメトリーアッセイを行った。
がん細胞T47Dおよび正常細胞のHEK293Tをそれぞれの培地で6−wellディッシュ(NuncTM)で24時間培養した後、68μMのAntp−TPRキメラペプチドを添加してさらに24時間培養した。培養後、それぞれの細胞懸濁液に対して、ヨウ化プロピジウム(PI)染色、アネキシンV標識(いずれもWako)、あるいは、カスパーゼ3,7標識を行いマルチパラメトリックフローサイトメトリーによって、アネキシンV標識またはカスパーゼ3,7標識およびPI染色について、同時に解析した。
結果を図9に示す。正常細胞HEK293TにAntp−TPRペプチドを加えても影響を与えないが、がん細胞T47Dにペプチドを加えた場合、アネキシンV陽性またはカスパーゼ3,7陽性の細胞集団の増加が観察された。
BIACOREバイオセンサーシステム3000(BIACORE Inc,Uppsala,Sweden)を用いて、表面プラズモン共鳴(SPR)実験を行った。製造業者の説明書にしたがって、N−ヒドロキシスクシンイミドおよびN−エチル−N’−(ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド活性化化学により約5000RUのHsp90をCM5センサーチップの表面に固定した。非特異的な結合のコントロールとしてなにも固定していないセンサーチップの反応していないカルボキシメチル基を、エタノールアミンでブロックした。アッセイの間に非特異的な結合を防ぐために、HBS緩衝液(0.01M HEPES、0.15M NaCl、0.005% Tween 20、3mM EDTA[pH7.4])を泳動緩衝液として用いた。組換えヒトHsp90のTPR結合ドメイン−細胞溶解性ペプチドキメラペプチドとの相互作用解析を、以下のように行った:上述のように、約5000RUのHsp90をCM5のセンサーチップ上に固定し、次いで、いくつかの濃度のペプチドをこのセンサーチップの上に注入した。これらの実験において用いた全てのタンパク質濃度は、Bradford法(Bradford MM.A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein−dye binding.Anal Biochem 1976;72:248−54)により決定した。データの解析は、BIA evaluation ver.3.2ソフトウェア(BIACORE)を用いて行った。
細胞殺傷効果の見受けられたがん細胞と正常細胞をそれぞれの培地で6−well(NuncTM)で24時間培養した後、上清をリン酸緩衝化緩衝液(PBS)で最低二回洗浄後、Cell lysis buffer(Promega)をそれぞれのウェルに300ulずつ添加し、細胞を溶解、これを細胞抽出総タンパク質(total protein)とした。この抽出液をSDS−PAGEで分離した後、セミドライ法でメンブレンに転写した。10%スキムミルク溶液をリン酸緩衝化緩衝液(PBS)で調製し、1時間30分ブロッキングした後、Hsp90、Hsp70、サービビン(survivin)、アクチン(actin)に対する抗体液(Stressgen Bioreagents,SIGMA)中で一晩反応させ、その後、二次抗体(GE Healthcare)と反応させたのち、ECLキット(GE Health science)で化学発色させ、Las3000 systemでバンドを検出した。
新規に設計されたペプチド配列の野生型は、RQIKIWFQNRRMKWKK−KAYARIGNSYFK(配列番号9)である。ここで、N末端側のペプチドは、細胞透過性ペプチドAntpであり、C末端側のペプチドは、図1(A)に示されるように、TPRペプチド(HopのTPR2Aドメイン内にあるHsp90のC末端側に結合するのに重要なへリックスの一部分の配列。)に結合する、Hsp90 TRP結合ペプチドである。
図3および以下の表に、その結果としてAntp−TPRならびに、Antp−TPR変異体ペプチドによる細胞障害活性を示す。
設計したTPRペプチドが、サービビンを含むいくつかのがん原性タンパク質のがん細胞における正確なフォールディングに必須なHsp90とHopのTPR2Aドメインとの相互作用と特異的に競合できるかどうかを検討した。図7および以下の表は、センサーチップ上に固定化されたヒトHopのTPR2Aドメインタンパク質に対して、前もってHsp90とTPRペプチド、TPR scramble、TPR mutant 1、あるいはTPR mutant 2ペプチドをそれぞれ混合させておき、Hsp90に十分に結合させておいてからTPR2Aとの相互作用を確認することで、阻害効果を確認した実験である。センサーグラムとグラフで示されるように、TPRペプチドではその濃度増加によりHsp90とTPR2Aとの相互作用に影響を与える(図7AおよびC)が、TPR scramble、TPR mutant 1、あるいはTPR mutant 2ペプチドでは高濃度を前もって添加しておいてもその完全阻害は見受けられない(図7BおよびC)。
Antp−TPRペプチドを細胞に添加した後のHsp90クライアントタンパク質のレベルを検討したところ、Antp−TPRで処理したT47D細胞は、サービビン、CDK4およびAktを含む複数のHspクライアントペプチドの消失を示した。対照的に、Antp−TPRペプチドは、Hsp90自体のレベルには影響しなかった(図4(A))。これらの結果は、今回設計したAntp−TPRペプチドが、Hsp90クライアントタンパク質の正確なフォールディングに必須のコシャペロン補充と競合することによってがん細胞における細胞生存経路に影響を及ぼすようである。
特に殺傷効果が高かった細胞に関して、ウェスタンブロッティングにより各Hsp90クライアントタンパク質の発現量を調べたところ、図4(B)に示すようにサービビンの発現量が特に多いことが判明した。このことから、今回新規に設計したペプチドががん細胞の中でも特にサービビンの発現量が多いものに効果的であることが判明した。
以上のように、今回新規に設計したペプチドは、Hsp90に特異的に結合すること、単独では機能せず、細胞透過性ペプチドとキメラ化することで、細胞内に取り込まれたときに、がん細胞特異的に殺傷効果を示すこと、特にサービビンが高発現しているがん細胞に効果的であることから、実際に治療が困難ながんの新規治療薬への応用が大いに期待できる。従来の化合物を用いてHsp90を標的とした手法と大きく異なりペプチドを用いていることと、正常細胞に実際に影響を示さなかったことから、がんの治療で問題となる副作用もクリアできることが考えられる。今後は、上記配列のアミノ酸を一つずつ置換すること、あるいは他の細胞透過性ペプチドとの組み合わせを試みることにより、今回設計された配列よりもさらにがん細胞特異的であり、殺傷能力の強い配列を設計できることが大いに期待できる。さらに、このようなペプチドを組み合わせた新規治療薬は、がんだけでなく、ペプチドを用いて炎症性サイトカイン等を抑制することにより、炎症性疾患、間質性肺炎などの難治性疾患にも大いに応用できることが期待される。
(実施例2:TRPドメイン結合ペプチドの網羅的解析)
本実施例では、Hsp90 TPRドメイン結合ペプチドのアナログ(アミノ酸配列X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12(配列番号1);式中
X1は、K、RまたはAであり;
X2は、AまたはGであり;
X3は、YまたはLであり;
X4は、AまたはGであり;
X5は、R、AまたはKであり;
X6は、IまたはRであり;
X7は、GまたはAであり;
X8は、NまたはQであり;
X9は、SまたはYであり;
X10は、YまたはSであり;
X11は、FまたはYであり;
X12は、KまたはRであるか、あるいは
TPRペプチドを延長させたAntp−TPR slong(Antp−RQIAKAYARIGNSYFKEEKYK;配列番号39)ものが使用可能であるかどうかを決定するための実験を行った。また、TPRに代えてR11を使用したものを用いた実験も行った。
配列番号9:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(Antp−wild)
配列番号10:RQIKIWFQNRRMKWKKRAYARIGNSYFK(Antp−K1R)
配列番号11:RQIKIWFQNRRMKWKKAAYARIGNSYFK(Antp−K1A)
配列番号12:RQIKIWFQNRRMKWKKKGYARIGNSYFK(Antp−A2G)
配列番号13:RQIKIWFQNRRMKWKKKALARIGNSYFK(Antp−Y3L)
配列番号14:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYGRIGNSYFK(Antp−A4G)
配列番号15:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYAKIGNSYFK(Antp−R5K)
配列番号16:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARRGNSYFK(Antp−I6R)
配列番号17:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIANSYFK(Antp−G7A)
配列番号18:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGQSYFK(Antp−N8Q)
配列番号19:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNYYFK(Antp−S9Y)
配列番号20:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSSFK(Antp−Y10S)
配列番号21:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYYK(Antp−F11Y)
配列番号22:RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFR(Antp−K12R)
(プロトコール)
それぞれの変異体ペプチドに関して、細胞生存性アッセイを行った。具体的には1ウェルあたり合計Caki−1(American Type Culture Collection(Manassas,VA)を3×103細胞、96ウェルプレート(NuncTM)に播種し、10% FBS(ウシ胎仔血清;Biowest)を含有する培地(DMEM(ナカライテスク株式会社))中で24時間培養し、100μlにおいて漸増濃度のペプチドと共に、37℃にて48〜72時間インキュベートした。細胞の生存率を、WST−8溶液(Cell Count Reagent SF;ナカライテスク株式会社)を用いて測定するこの時に、野生型のAntp−TPRペプチドと比較した。
結果を図5および以下の表に示す。表中の数値野生型を100%としたときの相対値を示す。
アミノ酸配列X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12(配列番号1);
X1は、Kまたはそれに類似する同じ親水性アミノ酸のR、Aなどのアミノ酸であり、好ましくは、Kであり、;
X2は、Aまたはそれに類似する脂肪族系側鎖のG、V、L、Iなどのアミノ酸であり;
X3は、Yまたはそれに類似する疎水性アミノ酸Lなどのアミノ酸であり、好ましくは、Yであり、;
X4は、Aまたはそれに類似する脂肪族系側鎖のG、V、L、Iなどのアミノ酸であり;
X5は、Rまたはそれに類似するK、Aなどのアミノ酸であり、好ましくはRであり;
X6は、Iまたはそれに類似するRなどのアミノ酸であり、好ましくはI(または別途実施例からIもしくはAであり);
X7は、Gまたはそれに類似する他のTPRドメインで見受けられるAなどのアミノ酸であり;
X8は、Nまたはそれに類似する他のTPRドメインで見受けられるQなどのアミノ酸であり;
X9は、Sまたはそれに類似するOH基を有するT、Yなどのアミノ酸であり;
X10は、Yまたはそれに類似するOH基を有するS、Tなどのアミノ酸であり;
X11は、Fまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
X12は、Kまたはそれに類似する塩基性のRなどのアミノ酸である。
本実施例では、Antpペプチド以外の細胞透過性ペプチドが使用可能か調べた。
YGRKKRRQRRR(TAT 配列番号6)
RRRRRRRRRRR(R11 配列番号7)
製造した配列は、以下のとおりである。
TAT−TPR(YGRKKRRQRRRKAYARIGNSYFK;配列番号50)
(結果)
TATについては、図3Dに、R11については、図6および以下の表にその結果を示す。R11−TPRについてもAntp−TPRの野生型と同等の効果を示したことから、R11でも効果の多少の違いはあれ、細胞殺傷効果があるといえる。Antp−TPR slongは、野生型の効果を保持した。したがって、長さを変動させても、抗がん活性は消失しないことが実証された。また、TATでも同様の効果が示された(図3D)ことから、TPRの前に、細胞透過性ペプチドを組み合わせることで、効果を発揮できるペプチドであることを証明できたといえ、本発明の汎用性が立証された。
本実施例では、細胞透過性ペプチド(RQIKIWFQNRRMKWKK(配列番号5))のアナログ(アミノ酸配列Y1Y2Y3Y4Y5Y6Y7Y8Y9Y10Y11Y12Y13Y14Y15Y16(配列番号8)を有するものであって、ここで
Y1は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y2は、Qまたはそれに類似するアミド系のN、GlxとしてEなどのアミノ酸であり;
Y3は、Iまたはそれに類似する脂肪族系のLなどのアミノ酸であり;
Y4は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であり;
Y5は、Iまたはそれに類似する脂肪族系のLなどのアミノ酸であり;
Y6は、Wまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y7は、Fまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸であり;
Y8は、Qまたはそれに類似するアミド系のN、GlxとしてEなどのアミノ酸であり;
Y9は、Nまたはそれに類似するアミド系のQなどのアミノ酸であり;
Y10は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y11は、Rまたはそれに類似する親水性アミノ酸Kなどのアミノ酸であり;
Y12は、Mまたはそれに類似するS含有アミノ酸のCなどのアミノ酸である、
Y13は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸である、
Y14は、Wまたはそれに類似する芳香族を有するYなどのアミノ酸である、
Y15は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸である、
Y16は、Kまたはそれに類似する親水性アミノ酸Rなどのアミノ酸であるものである)を使用することができるかどうかを調べた。ペプチド配列が異なること以外は、すべてのプロトコールは実施例1に準じた。
それぞれの変異体ペプチドに関して、細胞生存性アッセイを行う、具体的には1ウェルあたり合計Caki−1(American Type Culture Collection(Manassas,VA))を3×103細胞、96ウェルプレート(NuncTM)に播種し、10% FBSを含有する培地中で24時間培養し、100μlにおいて漸増濃度のペプチドと共に、37℃にて48〜72時間インキュベートした。細胞の生存率を、WST−8溶液(Cell Count Reagent SF;ナカライテスク株式会社)を用いて測定するこの時に、野生型のAntp−TPRペプチドと比較する。
結果を図8Aおよび以下の表に示す。表中の数値は、野生型を100%としたときの相対値を示す。
本実施例では、実際の治療への応用を確認した。
アテロコラーゲン(atelocollagen;高研)とAntp−TPRペプチドを混合して(Antp−TPRペプチド(配列番号9)400μg/ml濃度中にアテロコラーゲンが0.3%になるように混合)、その安定化をHPLCで測定する、具体的には、ペプチドのみの波形を測定し、アテロコラーゲンとペプチドの混合物を測定したときに、ペプチドの位置の波形が時間ごとにどの程度検出されるかで、アテロコラーゲンからの放出の度合いを知ることができると同時に、ペプチドの安定性を確認することができる。また混合物を下記のように作成した固形がんを移植した動物に投与することで、その治療効果を検討した。
ヒトすい臓がん細胞(Bxpc3)、5.0×106個の細胞をリン酸緩衝化生理食塩水(PBS)150μlに懸濁し、ヌードマウス(BALB/c Slc−nu/nu)に皮下移植した。5日後、固形がんに対してAntp−TPRペプチドを1mg/kg−5mg/kgの濃度で150μlずつPBSに懸濁し固形がんに一日おきに計9回局所投与してその縮小効果を検討した。腫瘍径は、カリパスを用いて測定し、そして、腫瘍容積(mm3)は、式:長径(mm)×短径(mm)2×0.5を用いて計算した。
ヒトすい臓がん細胞(Bxpc3)、5.0×106個の細胞をリン酸緩衝化生理食塩水(PBS)150μlに懸濁し、7〜9週齢のヌードマウス(Balb/c Slc−nu/nu)(体重17〜21g)の側腹部領域に皮下移植した。腫瘍容積が20〜50mm3に到達した時点でマウスを無作為に3群(n=6/群)に分け、そして、PBS(コントロール)またはAntp−TPR(1または5mg/kg)を、週に3回、計9回静脈内注射(50μl/注射)して、腫瘍の縮小効果を検討した。腫瘍径の測定および腫瘍容積の計算は、局所投与の場合と同様にして行った。
結果を図8B(局所投与による抗腫瘍効果)および図8C(静脈内投与による抗腫瘍効果)に示す。
本実施例では、本発明のDDSとしてのがん細胞に対する特異性を確認する目的で、がん細胞殺傷効果を検討した。
がん細胞T47Dおよび正常細胞のHEK293Tをそれぞれの培地で6−wellディッシュ(NuncTM)で24時間培養した後、68μMのAntp−TPRキメラペプチドを添加してさらに48時間培養した。培養後、それぞれの細胞懸濁液に対して、ヨウ化プロピジウム(PI)染色、あるいは、アネキシンV標識(いずれもWako)を行いマルチパラメトリックフローサイトメトリーによって、アネキシンV標識およびPI染色について、同時に解析した。
結果を図9に示す。正常細胞HEK293TにAntp−TPRペプチドを加えても影響を与えないが、がん細胞T47Dにペプチドを加えた場合、アネキシンV陽性またはカスパーゼ3,7陽性の細胞集団の増加が観察された。
TPRペプチドあるいは、TPR scrambleペプチドを市販のtransfection試薬(Profect−P2あるいは、Lipofectamine LTX)などと混合して、20分常温で静置して、リポソームを形成し、その後この複合体をがん細胞(Caki−1(腎臓がん細胞))に添加、その後、細胞の生存率をWST−8溶液(Cell Count Reagent SF;ナカライテスク株式会社)を用いて測定しTPR scrambleペプチドおよびリポソームのみ添加の場合と比較した。
結果を図10および以下の表に示す。図10からも明らかなように、リポソーム単独およびTPR scrambleでは効果がなく、TPRペプチドを導入した場合のみ、殺傷効果が見受けられた。
本発明のキメラペプチドが、血液がん細胞、特に、白血病由来細胞株においても同様に殺細胞効果、抗腫瘍効果を示すかどうかを検討した。
(細胞株)
ヒト白血病由来細胞株:U937(単芽球性白血病)、K562(慢性骨髄性白血病)、THP−1(単球性白血病)、HL−60(骨髄芽球性白血病)、ヒト正常B細胞(RPMI1788)をヒューマンサイエンス振興財団(東京、日本)から購入した。ヒト胚性腎臓細胞株(HEK293)を、RIKEN Cell Bank(つくば市、日本)から購入した。ヒト肺正常上皮細胞(WI38)をAmerican Type Culture Collection(Manassas,VA,USA)から購入した。ヒト正常すい臓上皮細胞(PE)をDSファーマ、バイオメディカルから購入した。細胞は、10% FBS(BioWest,Miami,FL,USA)、100μg/ml ペニシリンおよび100μg/ml ストレプトマイシン(ナカライテスク株式会社、京都市、日本)を含有する、RPMI 1640(U937、K562、THP−1、HL−60、RPMI1788)、CSC(PE)、MEM(WI38)またはD−MEM(HEK293)中で培養した。
以下のペプチドをInvitrogen,Carlsbad,CA,USAから購入したか、あるいは、ペプチド合成機(たとえば、Applied Biosystems,CA USA:Model 433A ペプチドシンセサイザ)で合成した:
キメラペプチドAntp−TPR:RQIKIWFQNRRMKWKK−KAYARIGNSYFK(配列番号9)、
RQIKIWFQNRRMKWKKRAYARIGNSYFK(Antp−TPR K1RまたはAntp−K1R;配列番号10)、
RQIKIWFQNRRMKWKKAAYARIGNSYFK(Antp−TPR K1AまたはAntp−K1A;配列番号11)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKGYARIGNSYFK(Antp−TPR A2GまたはAntp−A2G;配列番号12)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKALARIGNSYFKを(Antp−TPR Y3LまたはAntp−Y3L;配列番号13)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYGRIGNSYFK(Antp−TPR A4GまたはAntp−A4G;配列番号14)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYAKIGNSYFK(Antp−TPR R5KまたはAntp−R5K;配列番号15)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARRGNSYFK(Antp−TPR I6RまたはAntp−I6R;配列番号16)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIANSYFK(Antp−TPR G7AまたはAntp−G7A;配列番号17)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGQSYFK(Antp−TPR N8QまたはAntp−N8Q;配列番号18)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNYYFK(Antp−TPR S9YまたはAntp−S9Y;配列番号19)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSSFK(Antp−TPR Y10SまたはAntp−Y10S;配列番号20)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYYK(Antp−TPR F11YまたはAntp−F11Y;配列番号21)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFR(Antp−TPR K12RまたはAntp−K12R;配列番号22)、
RQIAKAYARIGNSYFKEEKYK(延長型TPRペプチド;配列番号43)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYAAIGNSYFK(Antp−R5A;配列番号51)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARAGNSYFK(Antp−I6A;配列番号52)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKGYGRIGNYYYK(Antp−A2G,A4G,S9Y,F11Y;配列番号53)、
RQIKIWFQNRRMKWKKRKFSAAIGYNKY(Antp−スクランブルペプチド;配列番号54)。
1ウェルあたり合計3×103細胞を、96ウェルプレートに播種し、10% FBSを含有する培地中に、100μlにおいて段階希釈したペプチドと共に、37℃にて48〜72時間インキュベートした。細胞の生存率を、WST−8溶液(Cell Count Reagent SF;ナカライテスク株式会社)を用いて測定した。
白血病細胞株をそれぞれの培地で6−well(NuncTM)で24時間培養した後、上清をリン酸緩衝化緩衝液(PBS)で最低二回洗浄後、Cell lysis buffer(Promega)をそれぞれのウェルに300ulずつ添加し、細胞を溶解、これを細胞抽出総タンパク質(total protein)とした。この抽出液をSDS−PAGEで分離した後、セミドライ法でメンブレンに転写した。10%スキムミルク溶液をリン酸緩衝化緩衝液(PBS)で調製し、1時間30分ブロッキングした後、Hsp90,サービビン,アクチンに対する抗体液(Stressgen Bioreagents,SIGMA)で一晩反応させ、その後、二次抗体(GE Healthcare,USA)を反応させたのち、ECLキットで(GE Health science)で化学発色させ、Las3000 systemでバンドを検出した。
U937細胞、マウス白血病細胞株EL4、または、マウス末梢血から調整された末梢血単核白血球細胞(Peripheral blood mononuclear cells:PBMCs)、1×106細胞に対して、TPR−TAMRA(TAMRA標識体)あるいは、Antp−TPR−TAMRA(TAMRA標識体)を用いて、最終濃度10μMになるように添加し、一時間培養したのち、細胞内に取り込まれたペプチドの様子あるいは、ペプチド透過による細胞への培地の流入をカルセインを培地に添加したものを用いて、コンフォーカル顕微鏡(Olympus FV1000(Olympus))を用いて観察した。
白血病細胞株U937細胞の50μMのAntp−TPRキメラペプチドによるがん細胞殺傷効果を決定するために、ペプチドで処理した培養物を、ヨウ化プロピジウム(PI)染色、あるいは、マルチパラメトリックフローサイトメトリーによって、アネキシンV標識およびPI染色について、同時に解析した。
図11および以下の表に、細胞生存性アッセイの結果としてAntp−TPRによる細胞障害活性を示す。
各白血病細胞株(U937、K562、THP−1、HL−60)に関して、ウェスタンブロッティングにより各タンパク質(Hsp90、サービビン、βアクチン(コントロール))の発現量を調べたところ、図12に示されるように、U937およびTHP−1においてサービビンの発現量が多いことが判明した。このことから、Antp−TPRキメラペプチドは、白血病細胞株においても、固形がん細胞と同様、サービビンの発現量が多いものに効果的であることが分かった。
U937細胞1×106細胞に対して、TPR−TAMRA(TAMRA標識体)あるいはAntp−TPR−TAMRA(TAMRA標識体)を、最終濃度10μMになるように添加し、一時間培養したのち、細胞内に取り込まれたペプチドの様子あるいは、ペプチド透過による細胞への培地の流入を、カルセイン含有培地を用いて、コンフォーカル顕微鏡(Olympus FV1000(Olympus))を用いて観察した。
図14にフローサイトメトリーアッセイの結果を示す。
U937細胞をAntp−TPRキメラペプチドとともに一晩37℃でインキュベートし、その後、細胞抽出液に対して、それぞれ示されるタンパク質に対する抗体でウェスタンブロッティングを行った。図15に示されるように、Antp−TPR(+)では、Antp−TPR(−)よりも各タンパク質の発現量が減少しており、Antp−TPRキメラペプチドが、白血病細胞株U937に対して、Hsp90のクライアントタンパク質のフォールディングに影響を与えていることが予想され、そしてその結果、各タンパク質の減退が起こっていることが分かった。
図16に示すアミノ酸変異を導入したキメラペプチドの各々について、U937に対する殺細胞効果を調べた。その結果、それぞれの位置に保存的アミノ酸の変異を導入してもなお、殺細胞能力を有していることが分かった。また、以下の表には、野生型の数値を100%としたときの相対値を示す。また、評価のために、細胞生存率の低下を数値化したもの、およびがん細胞を死傷させた比率を数値化した抗がん活性を提示する。野生型より強いものについては、細胞生存率の低下を検討することで、よりその抗がん剤としての活性の改善が評価されうる。
マウスの末梢血から採取した正常リンパ球を含む末梢血単核白血球細胞(Peripheral blood mononuclear cells:PBMCs)、ヒト正常B細胞、マウスの白血病細胞株EL4に対して、Antp−TPRキメラペプチドの殺細胞効果を検討した。
マウス白血病細胞株EL4、またはマウス末梢血単核白血球細胞(Peripheral blood mononuclear cells:PBMCs)1×106細胞に対して、TPR−TAMRA(TAMRA標識体)あるいはAntp−TPR−TAMRA(TAMRA標識体)を、最終濃度10μMになるように添加し、一時間培養したのち、細胞内に取り込まれたペプチドの様子あるいは、ペプチド透過による細胞への培地の流入を、カルセイン含有培地を用いて、コンフォーカル顕微鏡(Olympus FV1000(Olympus))を用いて観察した。
配列番号2は、TRPドメイン結合ペプチドであるKAYARXaXbXcXdZ1Z2Z3を示す(ここで、Xa、Xb、XcおよびXdは独立して任意のアミノ酸である)。
配列番号3は、Hsp90 TPRドメイン結合ペプチドであるKAYARを示す。
配列番号4は、Hsp90 TPRドメイン結合ペプチド(TPRペプチドとも称する)であるKAYARIGNSYFKを示す。
配列番号5は、アンテナペディアホメオボックス配列(Antp)であるRQIKIWFQNRRMKWKKを示す。
配列番号6は、TATであるYGRKKRRQRRRを示す。
配列番号7は、R11とも称するRRRRRRRRRRRを示す。
配列番号8は、細胞透過性ペプチドの改変配列であるアミノ酸配列Y1Y2Y3Y4Y5Y6Y7Y8Y9Y10Y11Y12Y13Y14Y15Y16を示す。
配列番号9は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(Antp−TPR wild)を示す。
配列番号10は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKRAYARIGNSYFK(Antp−TPR K1R)を示す。
配列番号11は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKAAYARIGNSYFK(Antp−TPR K1A)を示す。
配列番号12は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKGYARIGNSYFK(Antp−TPR A2G)を示す。
配列番号13は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKALARIGNSYFKを(Antp−TPR Y3L)示す。
配列番号14は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYGRIGNSYFK(Antp−TPR A4G)を示す。
配列番号15は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYAKIGNSYFK(Antp−TPR R5K)を示す。
配列番号16は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARRGNSYFK(Antp−TPR I6R)を示す。
配列番号17は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIANSYFK(Antp−TPR G7A)を示す。
配列番号18は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGQSYFK(Antp−TPR N8Q)を示す。
配列番号19は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNYYFK(Antp−TPR S9Y)を示す。
配列番号20は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSSFK(Antp−TPR Y10S)を示す。
配列番号21は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYYK(Antp−TPR F11Y)を示す。
配列番号22は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFR(Antp−TPR K12R)を示す。
配列番号23は、本発明のキメラペプチドKQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnR1K−TPR)を示す。
配列番号24は、本発明のキメラペプチドRNIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnQ2N−TPR)を示す。
配列番号25は、本発明のキメラペプチドRQLKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnI3L−TPR)を示す。
配列番号26は、本発明のキメラペプチドRQIRIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnK4R−TPR)を示す。
配列番号27は、本発明のキメラペプチドRQIKLWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnI5L−TPR)を示す。
配列番号28は、本発明のキメラペプチドRQIKIYFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnW6Y−TPR)を示す。
配列番号29は、本発明のキメラペプチドRQIKIWYQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnF7Y−TPR)を示す。
配列番号30は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFNNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnQ8N−TPR)を示す。
配列番号31は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQQRRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnN9Q−TPR)を示す。
配列番号32は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNKRMKWKKKAYARIGNSYFK(AnR10K−TPR)を示す。
配列番号33は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRKMKWKKKAYARIGNSYFK(AnR11K−TPR)を示す。
配列番号34は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRCKWKKKAYARIGNSYFK(AnM12C−TPR)を示す。
配列番号35は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMRWKKKAYARIGNSYFK(AnK13R−TPR)を示す。
配列番号36は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKYKKKAYARIGNSYFK(AnW14Y−TPR)を示す。
配列番号37は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWRKKAYARIGNSYFK(AnK15R−TPR)を示す。
配列番号38は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKRKAYARIGNSYFK(AnK16R−TPR)を示す。
配列番号39は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKRQIAKAYARIGNSYFK(Antp−TPR slong)を示す。
配列番号40は、本発明のキメラペプチドRRRRRRRRRRRKAYARIGNSYFK(R11−TPR)を示す。
配列番号41は、Hsp90のC末端配列(EEVD(配列番号63))に結合するTPRドメイン内のアミノ酸配列であるALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDKAKELDPTNMTYITNQAAVYFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAを示す。
配列番号42は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKK−KAYAR(Antp−KAYAR)を示す。
配列番号43は、TPRペプチドを延長させたRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKである。
配列番号44は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKK−KAYAAAGNSYTFK(Antp−変異体(mutant)1)を示す。
配列番号45は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKK−KAYARIGNSGGG(Antp−変異体(mutant)2)を示す。
配列番号46は、human Tom 70の配列KALFRRAKAHEKである。
配列番号47は、Tom 34の配列KAFYRRAQAHAKである。
配列番号48は、FKBP52の配列KGLFRRGEAHLAである。
配列番号49は、CYP40の配列KALYRRAQGWQGである。
配列番号50は、TAT−TPRの配列YGRKKRRQRRRKAYARIGNSYFKである。
配列番号51は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYAAIGNSYFK(Antp−R5A)である。
配列番号52は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKAYARAGNSYFK(Antp−I6A)である。
配列番号53は、本発明のキメラペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKKGYGRIGNYYYK(Antp−A2G,A4G,S9Y,F11Y)である。
配列番号54は、Antp−スクランブルペプチドRQIKIWFQNRRMKWKKRKFSAAIGYNKYである。
配列番号55は、ヒトHsp90のC末端のアミノ酸719〜732の配列:LEGDDDTSRMEEVDである。
配列番号56は、マウスHsp90のC末端のアミノ酸720〜733の配列:LEGDDDTSRMEEVDである。
配列番号57は、ラットHsp90のC末端のアミノ酸720〜733の配列:LEGDDDTSRMEEVDである。
配列番号58は、ウシHsp90のC末端のアミノ酸720〜733の配列:LEGDDDTSRMEEVDである。
配列番号59は、ヒトHOPのTPR2Aドメイン(アミノ酸296〜325)の配列:YRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKである。
配列番号60は、マウスHOPのTPR2Aドメイン(アミノ酸296〜325)の配列:YRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKである。
配列番号61は、ラットHOPのTPR2Aドメイン(アミノ酸296〜325)の配列:YRQIAKAYARIGNSYFKEERYKDAIHFYNKである。
配列番号62は、ウシHOPのTPR2Aドメイン(アミノ酸296〜325)の配列:YRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKである。
配列番号63は、Hsp90のC末端配列EEVDである。
配列番号64は、Hsp90のC末端配列MEEVDである。
配列番号65は、RQIKIWFQNRRMKWKKRAYAR(Antp−RAYAR)である。
配列番号66は、RQIKIWFQNRRMKWKKAAYAR(Antp−AAYAR)である。
配列番号67は、RQIKIWFQNRRMKWKKKGYAR(Antp−KGYAR)である。
配列番号68は、RQIKIWFQNRRMKWKKKALAR(Antp−KALAR)である。
配列番号69は、RQIKIWFQNRRMKWKKKAYGR(Antp−KAYGR)である。
配列番号70は、KAYAAAGNSYTFK(TPR 変異体(mutant)1)である。
配列番号71は、KAYARIGNSGGG(TPR 変異体(mutant)2)である。
配列番号72は、RKFSAAIGYNKY(スクランブルペプチド(TPR scramble))である。
Claims (13)
- Hsp90 TPR(tetratricopeptide repeat)ドメイン結合ペプチドと、細胞透過性ペプチドとを有するキメラペプチドであって、
該Hsp90 TPRドメイン結合ペプチドは、
アミノ酸配列X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12(配列番号1)を有するものであって、ここで
X1は、K、RまたはAであり;
X2は、AまたはGであり;
X3は、YまたはLであり;
X4は、AまたはGであり;
X5は、R、AまたはKであり;
X6は、I、AまたはRであり;
X7は、GまたはAであり;
X8は、NまたはQであり;
X9は、SまたはYであり;
X10は、YまたはSであり;
X11は、FまたはYであり;
X12は、KまたはRであるか、あるいは
RQIAKAYARIGNSYFKEEKYK(配列番号43)であり、
該細胞透過性ペプチドは、RQIKIWFQNRRMKWKK(配列番号5)またはその改変配列、あるいは、TATであるYGRKKRRQRRR(配列番号6)、またはRRRRRRRRRRR(配列番号7)であって、該改変配列は、アミノ酸配列Y1Y2Y3Y4Y5Y6Y7Y8Y9Y10Y11Y12Y13Y14Y15Y16(配列番号8)を有するものであって、ここで
Y1は、RまたはKであり;
Y2は、QまたはNであり;
Y3は、IまたはLであり;
Y4は、KまたはRであり;
Y5は、IまたはLであり;
Y6は、WまたはYであり;
Y7は、FまたはYであり;
Y8は、QまたはNであり;
Y9は、NまたはQであり;
Y10は、RまたはKであり;
Y11は、RまたはKであり;
Y12は、MまたはCであり;
Y13は、KまたはRであり;
Y14は、WまたはYであり;
Y15は、KまたはRであり;
Y16は、KまたはRである、
配列を有するものであり、
ここで、アルファベットは、アミノ酸の1文字表示であり、
抗がん活性を有する、
キメラペプチド。 - 前記Hsp90 TPRドメイン結合ペプチドにおいて、
X2は、Gであり;
X4は、Gであり;
X7は、Aであり;
X8は、Qであり;
X9は、Yであり;
X10は、Sであり;
X11は、Yであり;または
X12は、Rである、
ものを含む、
請求項1に記載のキメラペプチド。 - 前記Hsp90 TPRドメイン結合ペプチドは、KAYAR(配列番号3)もしくはKAYARIGNSYFK(配列番号4)を含むか、またはRQIAKAYARIGNSYFKEEKYK(配列番号43)である、請求項1に記載のキメラペプチド
- 前記細胞透過性ペプチドは、アンテナペディアホメオボックス配列(Antp)であるRQIKIWFQNRRMKWKK(配列番号5)、TATであるYGRKKRRQRRR(配列番号6)、またはRRRRRRRRRRR(配列番号7)である、請求項1に記載のキメラペプチド。
- RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号9)、
RQIKIWFQNRRMKWKKRAYARIGNSYFK(配列番号10)、
RQIKIWFQNRRMKWKKAAYARIGNSYFK(配列番号11)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKGYARIGNSYFK(配列番号12)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKALARIGNSYFK(配列番号13)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYGRIGNSYFK(配列番号14)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYAKIGNSYFK(配列番号15)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARRGNSYFK(配列番号16)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIANSYFK(配列番号17)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGQSYFK(配列番号18)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNYYFK(配列番号19)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSSFK(配列番号20)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYYK(配列番号21)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFR(配列番号22)、
KQIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号23)、
RNIKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号24)、
RQLKIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号25)、
RQIRIWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号26)、
RQIKLWFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号27)、
RQIKIYFQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号28)、
RQIKIWYQNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号29)、
RQIKIWFNNRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号30)、
RQIKIWFQQRRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号31)、
RQIKIWFQNKRMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号32)、
RQIKIWFQNRKMKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号33)、
RQIKIWFQNRRCKWKKKAYARIGNSYFK(配列番号34)、
RQIKIWFQNRRMRWKKKAYARIGNSYFK(配列番号35)、
RQIKIWFQNRRMKYKKKAYARIGNSYFK(配列番号36)、
RQIKIWFQNRRMKWRKKAYARIGNSYFK(配列番号37)、
RQIKIWFQNRRMKWKRKAYARIGNSYFK(配列番号38)、
RQIKIWFQNRRMKWKKRQIAKAYARIGNSYFK(配列番号39)、
RRRRRRRRRRRKAYARIGNSYFK(配列番号40)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYAAIGNSYFK(配列番号51)、
RQIKIWFQNRRMKWKKKAYARAGNSYFK(配列番号52)、または
RQIKIWFQNRRMKWKKKGYGRIGNYYYK(配列番号53)、
の配列を有するものである、請求項1に記載のキメラペプチド - 請求項1〜5のいずれかに記載のキメラペプチドをコードする核酸。
- 請求項1〜5のいずれかに記載のキメラペプチドをコードする核酸を含むベクター。
- 請求項1〜5のいずれかに記載のキメラペプチドをコードする核酸を含む細胞。
- 請求項1〜5のいずれかに記載のキメラペプチドを含む医薬組成物。
- 請求項1〜5のいずれかに記載のキメラペプチドを含む抗がん剤。
- 前記がんは、固形がんおよび血液がんからなる群より選択される少なくとも1つを含む、請求項10に記載の抗がん剤。
- 前記がんは、固形がんである、請求項10に記載の抗がん剤。
- 前記がんは、血液がんである、請求項10に記載の抗がん剤。
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