JP6073775B2 - グリオーマ形成阻害作用を有するmicroRNA - Google Patents
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Description
本願発明に係る一実施形態において、脳腫瘍治療薬にはmiR340またはその前駆体、またはそれらを発現するベクターが用いられる。
(実験手法および材料)
以下に、本発明において用いる実験手法および材料について説明する。なお、本実施形態において、以下の実験手法を用いているが、これら以外の実験手法を用いても、同様の結果を得ることができる。
7つのヒトグリオーマサンプル(膠芽細胞腫株E1−5、未分化希突起グリオーマ(AO)株、およびびまん性星細胞腫(DA)株)を用いた。腫瘍サンプルは、Papain解離システムを用いて分離され、解離された細胞はヒト塩基性線維芽細胞成長因子(bFGF;10nM)、ヒト上皮細胞増殖因子(EGF;10nM)、ヘパリン(5μM)、N2サプリメント(Wako)、10μg/mlインスリン(Wako)、GlutaMAX(商標)サプリメント、100ユニット/mlペニシリンG、および100μg/mlストレプトマイシを含む無血清のダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)/Ham’sF−12(Wako)において浮遊培養細胞塊として培養した。GICをポリ−D−リジン(PDL、15μg/ml、Sigma)およびフィブロネクチン(1μg/ml)で培養し、免疫染色用の8ウェルチャンバースライド(Nunc)に播種した。ヒトのグリオーマ細胞株(U251およびU87)、およびマウスGIC NSCL61をHide and Kondo,Cancer Res,2009に記載の方法に従って培養した。ヒト神経幹細胞(H9ヒト胚性幹細胞由来)を培養した。すべての実験において、細胞は37℃、湿度5%CO2/95%空気に維持した。
TRIzol(登録商標) Plus RNA Purification System (Invitrogen)を用いて細胞株およびグリオーマ組織から全RNAを抽出した。マイクロRNAマイクロアレイはAgilent Technologiesによって製造され、microRNA Microarray Kit protocolを用いて100ngの全RNAにラベルし、ハイブリダイズし、Human miRNA Microarray Release 16.0、またはMouse miRNA Microarray Release 16.0に用いた。ハイブリダイゼーションシグナルはDNAマイクロアレイスキャナ(Agilent Technologies)で検出し、スキャンした画像はAgilent feature extraction softwareを使用して分析した。遺伝子発現分析のためトータルRNAを増幅し、Agilent Low Input Quick Amp Labeling Kit one−color(Agilent Technologies)を使用してCyanine 3(Cy3)でラベルした。ラベルしたcRNAを断片化し、Agilent Human GE 8x60K Microarrayにハイブリダイズした。洗浄後、マイクロアレイをAgilent DNAマイクロアレイ・スキャナを用いてスキャンした。スキャンした各特徴の強度を、バックグラウンド除去法を行うAgilentfeature extraction softwareを用いて定量化した。Agilent GeneSpring GX version 11.0.2を用いてノーマリゼーションした。ノーマリゼーション後、ユークリッド距離および平均結合方法(Agilent GeneSpring GX)を用いて、発現遺伝子(DEGs)で、階層的なサンプルのクラスタリングを行った。パスウェイ分析のため、GenMAPP 2.1(http://www.genmapp.org/)およびConPath(登録商標)ナビゲータを使用した。
Isogen(Nippon gene、日本)を用いて細胞株およびグリオーマ組織からトータルRNAを抽出し、MMLV RT(Invitrogen)を用いて逆転写した。miR−340の発現はMiniOpticon Real Time PCR System(BIO―RAD)のTaqMan small RNA assays (Applied Biosystems)を用いて分析した。PLATの発現はMiniOpticon Real Time PCR System(BIO―RAD)のSYBR Green (Roche)を用いて分析した。以下のオリゴヌクレオチドDNAプライマを合成した。
5’プライマ:5’−CCATTTTGGAAGTTTTCAGG−3’
3’プライマ:5’−GCTTTCATTTTTGTGGTCCT−3’
miR−340前駆体または対照miRは、miRNA lentiviral particles (pEZX−MR03, Genecopoeia)を用いてグリオーマ細胞に過剰発現させた。グリオーマ細胞は37℃で12時間、組換えウイルスと共に培養し、ピューロマイシン(2μg/ml、Sigma)の存在下で3日間培養した。感染効率はGFP発現によって確認した。miR−340の発現は選抜後、RT−PCRによって確認した。いくつかの実験では、グリオーマ細胞はNucleofector device (Lonza)を用いてmiR−340発現ベクター(pBApoCMV―Neo―miR―340、タカラ)でトランスフェクションし、ネオマイシン(300μg/ml、Sigma)の存在下で10日間培養した。選抜後、細胞をヤギ抗ウサギIgG−Alexa488(1:500;分子プローブ)で免疫標識した後に、ウサギ抗PLAT抗体(1:50、Sigma)で免疫標識し、DAPI(1μg/ml)で対比染色した。
グリオーマ細胞(1x104細胞/ウェル)を対照またはmiR−340発現ベクターによってトランスフェクションし、72時間培養した。1日目、2日目および3日目に細胞を収集し、血球計算器で計数した。BrdU染色はKondo and Raff, EMBO J, 2000に従って行った。
細胞浸潤および遊走は、それぞれBioCoat Matrigel Invasion Chamber(Becton−Dickinson)およびBioCoat Tumor Invasion System(Becton−Dickinson)を使用して評価した。トランスフェクションされたグリオーマ細胞(5〜10x104)は、DMEM/Ham’s F−12および1mg/mlウシ血清アルブミン(BSA; Sigma)に再懸濁し、ウェルの上部チャンバに置いた。750μlの10%FCS培地を下部チャンバに置いた。12時間の培養の後、上側の膜面上の細胞を機械的に除去した。膜の下側に湿潤または移動した細胞を固定し、0.1%クリスタルバイオレットで染色し、5以上のランダムに選択した領域において顕微鏡で計数した。
対照細胞およびmiR−340発現細胞を、5μl(1x105)の培地に懸濁し、10%ペントバルビタールで麻酔した6〜8週間目の雌のNOD/SCIDマウスの脳に注射した。注射部位の定位座標は、ラムダから2mm前方、矢状縫合から2mm外側であり、深さ5mmである。
解剖したマウス脳は、一晩、4℃で4%パラホルムアルデヒドに固定した。固定の後、脳は、12〜18%スクロース/PBSで凍結防止し、Tissue−Tek OCT化合物(Miles, Elkhart, IN)に埋め込み、またはパラフィンに埋め込んだ。冠状断面(太さ6〜10μm)を大脳皮質から準備し、標準技術に倣ってヘマトキシリン−エオジン(H&E)で染色した。
完全長マウスplatをRT−PCRおよびKOD−Plus−Ver.2ポリメラーゼ(TOYOBO、日本)を用いてヒトグリオーマcDNAから増幅し、pCDNA3−2×FLAG−cベクター(pCDNA3−hPLAT−2×FLAG−c)およびp3×FLAG−CMV10ベクター(p3×FLAG−CMV10−hPLAT)にクローニングした。以下のオリゴヌクレオチドDNAを完全長ヒトplat用に合成した。
5’プライマ:5’−TGAATTCGCCACCATGACAGAATACAAGCTTGTGGTG−3’
3’プライマ:5’−ACTCGAGTCAGGACAGCACACATTTGCAG−3’
ヒトplatをノックダウンするため、それらのヘアピン配列をpsiRNA−h7SKhygro G1発現ベクター(InvivoGen)に挿入し、psiRNA−h7SKhygro−platshを作製した。siRNAターゲット配列は、5’−GAATTCGATGATGACACTT−3’である。ホタルルシフェラーゼ−ヒトPLAT 3’UTR発現ベクターを構築するため、ヒトplat 3’ゲノムDNAをKODおよびDNAポリメラーゼを用いて増幅し、pT7Blue−2ベクター(Novagen)にクローニングした。plat3’UTRゲノムDNAおよびホタルルシフェラーゼcDNAをpcDNA3.1−hygベクターに挿入し、pcDNA3.1−hyg−Luc−PLAT 3’UTRを得た。以下のオリゴヌクレオチドDNAを完全長ヒトplat3’UTR用に合成した。
5’プライマ:5’−CTCTAGACCAGGAACACCCGACTCCTC−3’
3’プライマ:5’−ACTCGAGCAGAAGTCAATTAAGTCCAAAC−3’
クローニングしたcDNAおよびゲノムDNAのヌクレオチド配列は、BigDye Terminator Kit version 3.1(Applied Biosystems)およびABI sequencer model 3130xl(Applied Biosystems)を用いて確認した。
E3はpEF−Rluc、pcDNA3.1−hyg−Luc−PLAT3’UTR、およびいずれかの対照ベクター、またはpBApoCMV−Neo−miR−340にトランスフェクトされ、それらのルシフェラーゼ活性を測定した。
各連続変数の分布は、その平均、標準偏差および範囲によってまとめた。各分類変数の分布は、その頻度およびパーセンテージによってまとめた。連続変数は、マン−ホイットニー試験によって治療群との間で比較した。2つの対グループを比較する場合にマン−ホイットニー試験を行う。カプラン−マイアー曲線は、事象変数に対する未調整の時間を推定するために用いた。ログランク検定は、グループ間の各時間と事象の変数を比較するために用いた。P値0.05未満(両側)を統計学的に有意であるとみなした。すべての統計分析はStatmateを使用して実行した。エラーバーはSDを示す。
以下に、図面を用いて実験結果について説明する。
(c)はmiR−340過剰発現細胞と対照細胞との相対的な浸潤比率を示すグラフであり、9回の実験の平均±S.D.として示した。(d)はmiR−340過剰発現細胞と対照細胞との相対的な細胞遊走比率を示すグラフであり、9回の実験の平均±S.D.として示した。いずれのグラフにおいても、**P<0.01、***P<0001である。
Claims (5)
- 哺乳動物におけるPLATの発現量を低下させるための医薬組成物であって、miR340またはその前駆体、またはそれらを発現するベクターを有するものである、組成物。
- 請求項1記載の組成物において、前記miR340は配列ID番号1で示される配列を有するものである、組成物。
- 請求項1記載の組成物において、前記miR340は配列ID番号2で示される配列を有するものである、組成物。
- 哺乳動物におけるPLATの発現量を低下させるための薬剤を製造するための、miR340またはその前駆体、またはそれらを発現するベクターの使用。
- グリオーマまたはグリオブラストーマの治療薬を同定する方法であって、
グリオーマまたはグリオブラストーマ細胞に試験剤を接触させる工程と、
前記グリオーマまたはグリオブラストーマ細胞中のPLATの発現量を測定する工程と
を有し、対照細胞と比較して、前記グリオーマまたはグリオブラストーマ細胞中のPLATの発現量の低下が、前記試験剤がグリオーマまたはグリオブラストーマの治療薬であることを示すものである、方法。
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