JP6261166B2 - Atp依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法 - Google Patents
Atp依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6261166B2 JP6261166B2 JP2013006341A JP2013006341A JP6261166B2 JP 6261166 B2 JP6261166 B2 JP 6261166B2 JP 2013006341 A JP2013006341 A JP 2013006341A JP 2013006341 A JP2013006341 A JP 2013006341A JP 6261166 B2 JP6261166 B2 JP 6261166B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- atp
- amino acid
- kinase
- motif
- polyphosphate
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
(1)ATP依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法であって、
GGDGNモチーフを含むアミノ酸配列からなるATP依存キナーゼにおいて、GGDGNモチーフのAsn残基をThr残基に置換することを含む、前記方法。
(2)ATP依存キナーゼがATP依存NADキナーゼである、(1)記載の方法。
(3)ATP依存キナーゼがγプロテオバクテリアに由来する、(1)または(2)記載の方法。
(4)GGDGNモチーフのAsn残基が、配列番号1を参照配列としたときの75位に相当する位置のAsn残基である、(1)〜(3)のいずれかに記載の方法。
(5)ATP依存キナーゼをコードするGGDGNモチーフを含むアミノ酸配列において、GGDGNモチーフのAsn残基がThr残基に置換されたアミノ酸配列からなる、ポリリン酸利用能を有するキナーゼ変異体。
(6)ATP依存キナーゼがATP依存NADキナーゼであり、キナーゼ変異体がNADキナーゼ変異体である、(5)記載のキナーゼ変異体。
(7)ATP依存キナーゼがγプロテオバクテリアに由来する、(5)または(6)記載のキナーゼ変異体。
(8)GGDGNモチーフのAsn残基が、配列番号1を参照配列としたときの75位に相当する位置のAsn残基である、(5)〜(7)のいずれかに記載のキナーゼ変異体。
(9)以下の(a)、(b)または(c)のタンパク質からなるキナーゼ変異体:
(a)配列番号8または10のアミノ酸配列からなるタンパク質
(b)配列番号8または10のアミノ酸配列と70%以上の同一性を有し、GGDGTモチーフが保持されたアミノ酸配列からなり、ポリリン酸を利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質
(c)配列番号8または10のアミノ酸配列において、1または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入または付加されているがGGDGTモチーフが保持されたアミノ酸配列からなり、ポリリン酸を利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質。
(10)(5)〜(9)のいずれかに記載のキナーゼ変異体をコードするDNA。
(11)(10)記載のDNAを含む形質転換体。
(12)NADPの製造方法であって、ポリリン酸またはその塩およびNADを基質とし、(5)〜(9)のいずれかに記載のキナーゼ変異体を用いてリン酸化反応を行うことを含む、前記方法。
ゲノム配列が決定されているすべての種についてNADキナーゼ(NADK)に相同なタンパク質を同定し、ecoNADKのAsn−75に対応するアミノ酸残基を確認するために、BLASTおよびCLUSTALWを使用した。
実施例1において、GGDGNモチーフが、γプロテオバクテリアのNADKホモログにおいて高度に保存されていることから、このGGDGNモチーフの機能を解明するため、ecoNADKのAsn−75およびvchNADKのAsn−76をThr残基に置換した変異体を構築した。また、Ppnk(Polyphosphate−dependent NAD kinase)のThr−87をAsn残基に置換した変異体も構築した。合わせて、各種ecoNADK変異体(ecoNADK E36A、E163V、R232D、L259E、E36A/E136V、R232D/L259E、E36A/E136V/R232D/L259E、R95L、N97R、R95L/N97R、および変異体4)を構築した。変異体4は、ecoNADK E36A/E136V/R232D/L259Eである。
実施例2で作製した野生型または変異体NADKのATP依存NADK活性またはポリリン酸依存NADK活性を、文献に記載の方法により、37℃で連続的にアッセイした(Ohashi,K.,et al.,Mol.Cell.Biochem.355,57−64(2011))。ただし、100mM Tris−HCl(pH8.0)の代わりに、100mM Tris−HCl(pH7.5)を使用した。
Claims (6)
- ATP依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法であって、
GGDGNモチーフを含む配列番号1または3のアミノ酸配列からなるATP依存キナーゼにおいて、GGDGNモチーフのAsn残基をThr残基に置換することを含む、前記方法。 - ATP依存キナーゼがATP依存NADキナーゼである、請求項1記載の方法。
- ATP依存キナーゼがγプロテオバクテリアに由来する、請求項1または2記載の方法。
- GGDGNモチーフのAsn残基が、配列番号1を参照配列としたときの75位に相当する位置のAsn残基である、請求項1〜3のいずれか1項記載の方法。
- ATPを利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質にポリリン酸利用能を付与する方法であって、
配列番号1もしくは3のアミノ酸配列と90%以上の同一性を有し、GGDGNモチーフを含むアミノ酸配列からなり、ATPを利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質、または配列番号1もしくは3のアミノ酸配列において、1または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入または付加されているがGGDGNモチーフを含むアミノ酸配列からなり、ATPを利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質において、GGDGNモチーフのAsn残基をThr残基に置換することを含む、前記方法。 - 以下の(a)、(b)または(c)のタンパク質からなるキナーゼ変異体:
(a)配列番号8または10のアミノ酸配列からなるタンパク質
(b)配列番号8または10のアミノ酸配列と90%以上の同一性を有し、GGDGTモチーフが保持されたアミノ酸配列からなり、ポリリン酸を利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質
(c)配列番号8または10のアミノ酸配列において、1または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入または付加されているがGGDGTモチーフが保持されたアミノ酸配列からなり、ポリリン酸を利用してNADをリン酸化する活性を有するタンパク質。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2013006341A JP6261166B2 (ja) | 2013-01-17 | 2013-01-17 | Atp依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2013006341A JP6261166B2 (ja) | 2013-01-17 | 2013-01-17 | Atp依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2014135930A JP2014135930A (ja) | 2014-07-28 |
| JP6261166B2 true JP6261166B2 (ja) | 2018-01-17 |
Family
ID=51413810
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2013006341A Active JP6261166B2 (ja) | 2013-01-17 | 2013-01-17 | Atp依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP6261166B2 (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114277013B (zh) * | 2020-09-27 | 2023-12-26 | 尚科生物医药(上海)有限公司 | 一种nad激酶突变体及其应用 |
-
2013
- 2013-01-17 JP JP2013006341A patent/JP6261166B2/ja active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2014135930A (ja) | 2014-07-28 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Lipps et al. | A novel type of replicative enzyme harbouring ATPase, primase and DNA polymerase activity | |
| Avarbock et al. | Cloning and characterization of a bifunctional RelA/SpoT homologue from Mycobacterium tuberculosis | |
| Urbonavičius et al. | Identification of a novel gene encoding a flavin-dependent tRNA: m5U methyltransferase in bacteria—evolutionary implications | |
| Szeker et al. | Comparative investigations on thermostable pyrimidine nucleoside phosphorylases from Geobacillus thermoglucosidasius and Thermus thermophilus | |
| Honda et al. | In vitro metabolic engineering for the salvage synthesis of NAD+ | |
| Lindner et al. | NCgl2620 encodes a class II polyphosphate kinase in Corynebacterium glutamicum | |
| Bini et al. | Stability of mRNA in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus. | |
| US20140206042A1 (en) | Method of enzymatically synthesizing 3' -phosphoadenosine-5'-phosphosulfate | |
| Rittmann et al. | Phosphate starvation-inducible gene ushA encodes a 5′ nucleotidase required for growth of Corynebacterium glutamicum on media with nucleotides as the phosphorus source | |
| JPWO2003004654A1 (ja) | ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸(nadp)の製造方法 | |
| JP6439220B2 (ja) | 補酵素の製造方法及び補酵素製造用形質転換体セット | |
| Jeon et al. | A novel ADP-dependent DNA ligase from Aeropyrum pernix K1 | |
| Li et al. | Establishment of a high throughput-screening system for nucleoside deoxyribosyltransferase II mutant enzymes with altered substrate specificity | |
| JP6261166B2 (ja) | Atp依存キナーゼにポリリン酸利用能を付与する方法 | |
| Li et al. | The Methanococcus jannaschiidCTP deaminase is a bifunctional deaminase and diphosphatase | |
| Krath et al. | Implications of secondary structure prediction and amino acid sequence comparison of class I and class II phosphoribosyl diphosphate synthases on catalysis, regulation, and quaternary structure | |
| Suryanti et al. | Cloning, over-expression, purification, and characterisation of N-acetylneuraminate synthase from Streptococcus agalactiae | |
| JPWO2004009830A1 (ja) | Cmp−n−アセチルノイラミン酸の製造法 | |
| Miyamoto et al. | Characterization of N-deoxyribosyltransferase from Lactococcus lactis subsp. lactis | |
| Sandalli et al. | A new DNA polymerase I from Geobacillus caldoxylosilyticus TK4: cloning, characterization, and mutational analysis of two aromatic residues | |
| JP2014064513A (ja) | 2−デオキシ−scyllo−イノソースの調製法 | |
| Sandalli et al. | Cloning, expression, and characterization of a novel CTP synthase gene from Anoxybacillus gonensis G2 | |
| Lu et al. | Unique ligation properties of eukaryotic NAD+-dependent DNA ligase from Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus | |
| WO2001038555A1 (fr) | Nouvelle utilisation de l'uridine-diphosphate-glucose 4-epimerase | |
| JP5068956B2 (ja) | デオキシリボヌクレオシド一リン酸からのデオキシリボヌクレオシド三リン酸の製造方法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20150610 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20150610 |
|
| A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20160127 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160223 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160421 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160830 |
|
| A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20161028 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20161117 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20161117 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170307 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170417 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170822 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20171017 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20171128 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20171212 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6261166 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |