JP6344774B2 - グルクロン酸転移酵素、それをコードする遺伝子及びその利用方法 - Google Patents
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Description
(a)配列番号4に示すアミノ酸配列、
(b)配列番号4に示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列、又は
(c)配列番号4に示すアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(d)配列番号5に示す塩基配列、
(e)配列番号5に示す塩基配列において1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、
(f)配列番号5に示す塩基配列と80%以上の同一性を有する塩基配列、又は
(g)配列番号5に示す塩基配列に相補的な塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列
本発明の第1の態様は、グルクロン酸第二転移活性を有するポリペプチドに関する。
本発明の第2の態様は、第1態様に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、すなわち、グルクロン酸第二転移酵素及びその活性断片をコードするポリヌクレオチドに関する。
本発明の第3の態様は、上記第2態様に記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクターに関する。
本発明の第4の態様は、形質転換体又はその後代に関する。
本発明の第5の態様は、第4態様の形質転換体又はその後代を培養して、その培養物から第1態様に記載のグルクロン酸第二転移活性を有するポリペプチドを抽出することを含む、グルクロン酸第二転移酵素及びその活性断片の製造方法に関する。
本発明の第6の態様は、グリチルレチン酸モノグルクロニドの製造方法に関する。
遺伝子発現を抑制する方法は、標的酵素であるグルクロン酸第二転移酵素の発現自体を抑制して、細胞内における当該標的酵素の絶対量を低減させることによって、その基質に対する比活性を低下させる方法である。遺伝子発現の抑制は、完全抑制のみならず、部分的抑制であってもよい。このような遺伝子発現抑制方法には、転写抑制方法及び転写後翻訳前抑制方法に大別することができる。
転写抑制方法は、前記個体又は細胞におけるグルクロン酸第二転移酵素をコードする遺伝子(以下、グルクロン酸第二転移酵素遺伝子とする)を発現段階で抑制する方法である。遺伝子の転写抑制方法は、特に限定はしないが、例えば、遺伝子発現を人為的に制御する分子遺伝学的方法、グルクロン酸第二転移酵素遺伝子の転写機構を制御する方法、又は当該遺伝子の突然変異株を利用する方法が挙げられる。
転写後翻訳前抑制方法は、前記個体又は細胞におけるグルクロン酸第二転移酵素遺伝子の転写産物であるmRNAの段階で抑制する方法である。
活性阻害物質を用いる方法は、標的酵素であるグルクロン酸第二転移酵素を阻害する物質で個体又は細胞を処理することによって当該酵素の活性を直接的に、又は間接的に抑制方法である。グルクロン酸第二転移酵素の抑制は、完全抑制のみならず、部分的抑制であってもよい。
本発明の第7の態様は、第2態様に記載のポリヌクレオチドを用いた植物選抜法に関する。当該方法は、対象植物における第2態様に記載のポリヌクレオチドの有無又はその発現を検出することによって、第2態様に記載のポリヌクレオチドを有する植物を選抜する方法である。本方法は、対象植物から調製された核酸含有サンプルについて、前記ポリヌクレオチド若しくはその断片を用いて核酸増幅法又は核酸ハイブリダイゼーションを行い、前記ポリヌクレオチドを検出又は定量することを含む。
独立行政法人医薬基盤研究所の薬用植物資源研究センター北海道研究部(北海道名寄市)において圃場栽培されていた7年生のG. uralensisのストロンを6月に採取した。RNA抽出試薬RNAwizTM(Ambion社)を用いて添付のプロトコルに従い、トータルRNAを調製した。得られたトータルRNAからmRNAを調製し、ベクターキャッピング法 (Kato, S. et al., DNA Res., 12, 53-62, 2005) によってcDNA合成を行った。cDNA断片をプラスミドベクターpGCAPzf3(Tsugane, T. et al., Plant Biotechnology., 22, 161-165, 2005)に組み込み、cDNAライブラリーを構築した。
独立行政法人医薬基盤研究所の薬用植物資源研究センター筑波研究部(茨城県つくば市)において圃場栽培されていた定植後4年以上経過したと考えられるG. uralensisのストロンを10月に採取した。RNA抽出試薬TRIzol(登録商標)(life technologies社)及び精製カラムRNeasy(登録商標)(Quiagen社)を用いて添付のプロトコルに従い、トータルRNAを調製した。得られたトータルRNAからmRNAを調製し、オリゴキャップ法(Murayama, K. et al., Gene, 138, 171-174, 1994、及び、Suzuki, Y. et al., Gene, 200, 149-156)によりcDNA合成を行った。cDNA断片をプラスミドベクターpCMVFL3に組み込み、cDNAライブラリーを構築した。
実施例1で得られたcDNAライブラリーで大腸菌株DH12S(life technologies社)あるいはDH10B T1ファージレジスタント(life technologies社)を形質転換し、得られた約30,000個のシングルコロニーをピックアップし、384枚のプレート上に植菌した。コロニーPCRでシークエンス反応の鋳型にするDNAを増幅し、エタノール沈殿による精製を行った。それを鋳型にして、Applied Biosystems社のBigDye ver3.1を用いて、各cDNA断片の5’末端側から、シークエンス反応を行った。エタノール沈殿による精製後、Applied Biosystems社の3730xl DNA Analyzerを用いて塩基配列の解析を行った。
実施例2で得られたcDNAライブラリーで大腸菌株DH5αを形質転換し、得られた約26,000個のシングルコロニーをピックアップし、384枚のプレート上に植菌した。コロニーPCRでシークエンス反応の鋳型にするDNAを増幅し、エタノール沈殿による精製を行った。それを鋳型にして、Applied Biosystems社のBigDye ver3.1を用いて、各cDNA断片の5’末端側から、シークエンス反応を行った。エタノール沈殿による精製後、Applied Biosystems社の3730xl DNA Analyzer を用いて塩基配列の解析を行った。
実施例3で得られた約30,000個のESTデータと実施例4で得られた約26,000個のESTデータを1つのデータセットに統合し、PHRAPプログラム(http://www.phrap.org)を用いてクラスタリングを行った。その結果、10,372個のユニークなコンティグを得た。
実施例5で得られた10,372個のコンティグ配列をクエリとして、NCBI(National Center for Biotechnology Information)データベースに登録されている既知タンパク質に対するBLASTX検索 (Altschul, S.F. et al., Nucleic Acids Res. 25, 3389-3402, 1997)を行った。ファミリー1糖転移酵素がグリチルレチン酸以降のグリチルリチン生合成経路(図2)に関与すると予測し、当該データベースに登録されている既知のファミリー1糖転移酵素に高い相同性を示すコンティグを選抜した。選抜したコンティグを構成する複数のESTクローンから、最も長い5’末端領域を保持すると判定されるものについて、プラスミドDNAを調製し、クローン化された各cDNA断片(31個)の全長塩基配列を決定した。
実施例6で得られた31個のファミリー1糖転移酵素遺伝子群からグリチルリチン生合成に関わる可能性が高い分子種を選抜するために、各ファミリー1糖転移酵素分子種が植物体のどの組織で発現しているのかをRT-PCR法により調べた。グリチルリチンを高蓄積する地下部組織(肥大根及びストロン)とグリチルリチンが検出されない地上部組織(葉及び茎)の計4種の異なる組織からトータルRNAを調製した。得られたトータルRNA 1μgを用いて、SMART RACE cDNA amplification kit (clontech社)を用いて添付のプロトコルに従い、ファーストストランドcDNA合成を行った。
実施例7のスクリーニングで得られたグルクロン酸転移酵素候補GuUGT73.8の全長遺伝子をクローニングした。
G. uralensisと同じマメ科植物であるミヤコグサにおいてGuUGT73.8遺伝子と類似した機能を有することが期待されるオルソログ遺伝子を探索した。
ミヤコグサ(MG20)を人工気象器内(23℃、日長16時間)で育成し、発芽後4週間目の植物の葉、根からそれぞれトータルRNAを調製した。得られたトータルRNAを1μg用いて、SMART RACE cDNA amplification kit (Clontech社)を用いて添付のプロトコルに従いファーストストランドcDNA合成を行った。ファーストストランドcDNA各2μLを鋳型として、LjSGA_046111及びLjSGA_014618から推定されるポリペプチドのN末端とC末端に相当する箇所のオリゴDNAをそれぞれフォワードプライマー(配列番号6)及びリバースプライマー(配列番号7)に用い、KOD plus ver.2 polymerase(TOYOBO社)を用いてアニール温度56℃、反応温度68℃で35サイクルのPCRを行った。なお、pENTRTM/D-TOPO(登録商標)エントリーベクター(life technologies社)へのクローニングの際に必要であることから、配列番号Aのプライマーには、5’末端に4塩基(cacc)が人工的に付加されている。根由来のファーストストランドcDNAから増幅されたDNA断片をpENTRTM/D-TOPOエントリーベクターにクローニングし、得られた3個の独立クローンについてポリヌクレオチド配列を決定した。これにより得られた配列が配列番号8であり、それから推定されるポリペプチド配列が配列番号9である。配列番号9のアミノ酸配列は配列番号4に示すアミノ酸配列に対して66.9%の同一性を有していた。
実施例8において作製した、配列番号5に示すポリヌクレオチドを有するプラスミド(エントリークローン)とデスティネーションベクターpYES-DEST52(life technologies社)を混合し、Gateway LR Clonase II Enzyme Mix(life technologies社)を用いて塩基配列特異的な組み換え反応(GATEWAY attL × attR反応)により、配列番号5で示すDNA断片をpYES-DEST52に移し替えることで配列番号5に示す遺伝子の酵母発現ベクターpDEST52-GuUGT73.8を得た。
酵母INVSc1株(life technologies社)(MATa his3D1 leu2 trp1-289 ura3-52 MATAlpha his3D1 leu2 trp1-289 ura3-52)に、実施例11で得られたpDEST52-GuUGT73.8を導入した。陰性対照として、INVSc1株に空ベクターに相当するpYES2/CT(life technologies社)を導入した。酵母の形質転換は、Frozen-EZ Yeast Transformation II(Zymo Research社)を用いて添付のプロトコルに従い行った。
pDEST52-GuUGT73.8又は陰性対照用pYES2/CTを保持する形質転換酵母を、2%ラフィノースを含む10mLのYeast nitrogen base(YNB)培地(-Ura)を用いて、30℃、165rpmで25時間振とう培養した。その後、1mLの20%ガラクトースを添加し、30℃で25時間さらに振とう培養した。培養液を3,000g、4℃で10分間遠心して酵母細胞のペレットを得た。得られた酵母細胞のペレットを400μLの抽出バッファ(pH7.0、50mM Tris、1mM DTT、14.4mM β-メルカプトエタノール、20% Glycerol)に懸濁した後、同体積のガラスビーズ(SIGMA社)を加えた。酵母細胞を破砕するために、30秒間ボルテクスミキサーで激しく撹拌した後、温度上昇による酵素活性の失活を防ぐため直ちに氷上に移し1分間置く操作を15回繰り返した。得られた液体を、10,000g、4℃で10分間遠心した後、上清を酵母タンパク抽出物として回収した。その結果、配列番号3に示すポリペプチド(GuUGT73.8)を発現する形質転換酵母由来のタンパク抽出物(サンプルA)と、GuUGT73.8を発現しない空ベクターのみの形質転換酵母由来のタンパク抽出物(サンプルB)を得た。Bio-Rad Protein Assay(Bio-Rad社)を用いてサンプルA及びサンプルBにおけるタンパク質濃度を測定した。
実施例13で得られた200μgサンプルA及びサンプルB(80μLのボリュームに調整)、10μLの1Mトリス−塩酸バッファ(pH7.0)、5μLの400mM MgCl2、0.2μLの14.4mM β-メルカプトエタノール、4μLの30mM グリチルレチン酸モノグルクロニド(糖受容体基質)、10μLの100mM UDP-グルクロン酸(糖供与体基質)、91μLの滅菌水を混合した後、30℃、1,000rpmにて撹拌させながら24時間インキュベートし、糖(グルクロン酸)転移反応を行った。インキュベート後に得られた溶液をそれぞれ反応溶液A及び反応溶液Bとした。
実施例14で得られた反応溶液A及びBを200μLの1-ブタノールで抽出した。1-ブタノール区100μLとメタノール400μLを混合し、LC-MS分析の試料とした。LC-MS分析は、LC部 (1100 series, Agilent Technologies)とMS部(QSTAR PULSAR, Applied Biosystems)を連結した機器で行った。カラムにはセンシューパック25 cm × 2 mm i.dを用い、溶媒は0.1%酢酸-アセトニトリル:0.1%酢酸-水 = 20:80 (0〜2分), 20:80-95:5 (2〜12分), 95:5 (12〜20分)、流速は0.2 mL/分の条件にて分析した。変換物の同定は、実施例14で調製したグリチルレチン酸モノグルクロニド及びグリチルリチンを標品としてLCの保持時間及びMSスペクトルを比較することで決定した。
Claims (14)
- オレアナン型トリテルペノイドモノグルクロニドにおけるグルクロン酸の2位のヒドロキシ基にグルクロン酸を転移する活性を有するポリペプチドであって、
以下の(a)〜(c)に示すいずれかのアミノ酸配列を含む、前記ポリペプチド。
(a)配列番号4に示すアミノ酸配列、
(b)配列番号4に示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列、又は
(c)配列番号3に示すアミノ酸配列を含み、かつ該配列番号3に示すアミノ酸配列を除く領域が配列番号4に示すアミノ酸配列と90%以上の同一性を有するアミノ酸配列。 - 前記オレアナン型トリテルペノイドモノグルクロニドが、β-アミリンモノグルクロニド、11-オキソ-β-アミリンモノグルクロニド、30-ヒドロキシ-11-オキソ-β-アミリンモノグルクロニド、30-ヒドロキシ-β-アミリンモノグルクロニド、11-オキソグリチルレチン酸モノグルクロニド、及びグリチルレチン酸モノグルクロニドからなる群から選択される、請求項1に記載のポリペプチド。
- カンゾウ属(Glychyrrhiza属:グルキルリザ属)植物又はウマゴヤシ属(Medicago属:メディカゴ属)植物に由来する、請求項1又は2に記載のポリペプチド。
- カンゾウ属植物がG. uralensis(G.ウラレンシス)である、請求項3に記載のポリペプチド。
- 請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 以下の(d)〜(g)に示すいずれかの塩基配列を含む、請求項5に記載のポリヌクレオチド。
(d)配列番号5に示す塩基配列、
(e)配列番号5に示す塩基配列において1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、又は
(f)配列番号5に示す塩基配列に相補的な塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列 - 請求項5又は6に記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
- 過剰発現型ベクター又は構成的発現型ベクターである、請求項7に記載の組換えベクター。
- 請求項7又は8に記載の組換えベクターを含む形質転換体又はその後代。
- マメ科(Fabaceae)植物である、請求項9に記載の形質転換体又はその後代。
- 請求項9又は10に記載の形質転換体又はその後代を培養する工程、及びその培養物から請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドを抽出する工程を含む、オレアナン型トリテルペノイドモノグルクロニドにおけるグルクロン酸の2位のヒドロキシ基にグルクロン酸を転移する活性を有するポリペプチドの製造方法。
- β-アミリンからグリチルリチンを生合成できる個体又は細胞において、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドの活性を抑制する工程を含むグリチルレチン酸モノグルクロニドの製造方法。
- 前記抑制が請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする遺伝子発現の抑制、又は当該ポリペプチドの活性阻害物質処理による抑制である、請求項11又は12に記載の製造方法。
- 請求項5又は6に記載のポリヌクレオチドの有無又はその発現を検出して、当該ポリヌクレオチドを有する植物を選抜する方法であって、対象植物から調製された核酸含有サンプルについて、前記ポリヌクレオチド若しくはその断片を用いて核酸増幅法又は核酸ハイブリダイゼーションを行い、前記ポリヌクレオチドを検出又は定量することを含む、前記植物選抜法。
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