JP6362162B2 - Oil and fat manufacturing method - Google Patents
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Description
本発明は、微細藻類、培養物、及び油脂の製造方法に関する。 The present invention relates to a method for producing microalgae, cultures, and fats and oils.
近年、化石燃料の代替燃料として、微細藻類を用いた燃料生産が提案されている。微細藻類は、高い集光能力及び炭酸固定能力を有していることから、該微細藻類を用いた燃料生産は、単位面積当たりの生産性が高い点で優れている。 In recent years, fuel production using microalgae has been proposed as an alternative fuel for fossil fuels. Since microalgae have a high light collecting ability and carbonic acid fixing ability, fuel production using the microalgae is excellent in terms of high productivity per unit area.
化石燃料の代替燃料として利用可能な炭化水素類を生産する新規微細藻類として、シュードコリシスチス属株が提案されている(例えば、特許文献1参照。)。シュードコリシスチス属株は、乾燥藻体重量の30%程度の炭化水素類を蓄積でき、増殖速度が速く、また、屋外開放系で他の生物の混入なく培養可能な酸性条件で培養可能(至適pH3〜4)であるため、該シュードコリシスチス属株を用いた炭化水素類の生産方法は、実用化が期待される技術である。 As a novel microalgae that produces hydrocarbons that can be used as an alternative fuel for fossil fuels, Pseudocollistis strains have been proposed (see, for example, Patent Document 1). Pseudocollistis strains can accumulate hydrocarbons of about 30% of the dry alga body weight, have a high growth rate, and can be cultured under acidic conditions that can be cultivated in open-air systems without contamination by other organisms ( Since the optimum pH is 3 to 4), the hydrocarbon production method using the Pseudocollistis strain is a technique expected to be put to practical use.
しかしながら、微細藻類を用いた燃料生産を商業ベースで行うためには、コスト面で問題があり、更なる改良が必要とされている。
本発明は、上記事情に鑑みてなされたものであって、油脂の生産性を向上させた微細藻類、該微細藻類を培養してなる培養物、及び油脂の製造方法を提供する。
However, in order to carry out fuel production using microalgae on a commercial basis, there is a problem in terms of cost, and further improvements are required.
This invention is made | formed in view of the said situation, Comprising: The microalga which improved productivity of fats and oils, the culture formed by culture | cultivating this microalgae, and the manufacturing method of fats and oils are provided.
本発明者らは、上記課題を解決すべく鋭意研究した結果、微細藻類中のTOR(Target of Rapamycin)の酵素活性を阻害することにより、油脂の生産性を向上できることを見出し、本発明を完成させた。 As a result of diligent research to solve the above problems, the present inventors have found that the productivity of fats and oils can be improved by inhibiting the enzyme activity of TOR (Target of Rapamycin) in microalgae, and the present invention has been completed. I let you.
すなわち、本発明は、下記の特徴を有する微細藻類、培養物、及び油脂の製造方法を提供するものである。 That is, this invention provides the manufacturing method of the micro algae, culture, and fats and oils which have the following characteristics.
(1)TORの酵素活性が低下又は失活していることを特徴とする微細藻類。
(2)FKBP12をコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有する前記(1)に記載の微細藻類。
(3)前記FKBP12をコードする構造遺伝子配列は、ラパマイシンに対して感受性を示す生物種由来の配列である前記(2)に記載の微細藻類。
(4)前記TORの酵素活性は、TOR阻害剤により低下又は失活している前記(1)〜(3)のいずれか一つに記載の微細藻類。
(5)前記(1)〜(4)のいずれか一つに記載の微細藻類を培養してなることを特徴とする培養物。
(6)更にTOR阻害剤を含有する前記(5)に記載の培養物。
(7)微細藻類を培養する工程A1と、前記工程A1の後、前記微細藻類を培養してなる培養液にTOR阻害剤を添加する工程B1と、を有することを特徴とする油脂の製造方法。
(8)前記微細藻類は、FKBP12をコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有する前記(7)に記載の油脂の製造方法。
(9)前記FKBP12をコードする構造遺伝子配列は、ラパマイシンに対して感受性を示す生物種由来の配列である前記(8)に記載の油脂の製造方法。
(10)TORの酵素活性が低下又は失活している微細藻類を培養する工程A2を有することを特徴とする油脂の製造方法。
(1) A microalgae characterized in that the enzyme activity of TOR is reduced or inactivated.
(2) The microalgae according to (1) above, which has a structural gene sequence encoding FKBP12 and a promoter sequence and terminator sequence for expressing the structural gene in the chromosome or as an extrachromosomal gene.
(3) The microalgae according to (2), wherein the structural gene sequence encoding FKBP12 is a sequence derived from an organism species sensitive to rapamycin.
(4) The microalgae according to any one of (1) to (3), wherein the enzyme activity of the TOR is reduced or inactivated by a TOR inhibitor.
(5) A culture obtained by culturing the microalgae according to any one of (1) to (4).
(6) The culture according to (5), further comprising a TOR inhibitor.
(7) A method for producing fats and oils comprising: step A1 for culturing microalgae, and step B1 for adding a TOR inhibitor to a culture solution obtained by culturing the microalgae after step A1. .
(8) The microalgae have a structural gene sequence encoding FKBP12 and a promoter sequence and terminator sequence for expressing the structural gene in the chromosome or as an extrachromosomal gene. Of oil and fat.
(9) The method for producing fats and oils according to (8), wherein the structural gene sequence encoding FKBP12 is a sequence derived from a biological species sensitive to rapamycin.
(10) A method for producing fats and oils, comprising the step A2 of culturing microalgae in which the enzyme activity of TOR is reduced or inactivated.
本発明によれば、油脂の生産性を向上させた微細藻類、該微細藻類を培養してなる培養物、及び油脂の製造方法を提供することができる。 ADVANTAGE OF THE INVENTION According to this invention, the micro algae which improved the productivity of fats and oils, the culture formed by culture | cultivating this micro algae, and the manufacturing method of fats and oils can be provided.
<微細藻類>
本発明の微細藻類は、TORの酵素活性が低下又は失活していることを特徴とする。
本発明に用いられる微細藻類としては、特に限定されず、ほぼ全ての藻類を用いることができる。係る藻類としては、シュードコリシスチス エリプソイディア(Pseudochoricystis ellipsoidea;以下、P.ellipsoideaともいう。)、ボトリオコッカス ブラウニー(Botryococcus braunii)、シアニディオシゾン メロラエ(Cyanidioschyzon merolae;以下、C.merolaeともいう。)、クラミドモナス レインハードチイ(Chlamydomonas reinhardtii;以下、C.reinhardtiiともいう。)等が挙げられる。
また、本発明に用いられる微細藻類株としては、シュードコリシスチス エリプソイディア(Pseudochoricystis ellipsoidea)N1株やシュードコリシスチス エリプソイディア(Pseudochoricystis ellipsoidea)Obi株等が挙げられる。
<Microalgae>
The microalgae of the present invention is characterized in that the enzyme activity of TOR is reduced or inactivated.
The microalgae used in the present invention is not particularly limited, and almost all algae can be used. Examples of such algae include Pseudochoristis ellipsoida (hereinafter also referred to as P. ellipsisidea), Botryococcus branii, and Cyanidiosero melodi (C. ), Chlamydomonas reinhardtii (hereinafter also referred to as C. reinhardtii) and the like.
Examples of the microalgae strain used in the present invention include Pseudochoristis ellipsisida N1 strain and Pseudochoristis ellipsisida Obi strain.
TOR(Target of Rapamycin)とは、細胞内シグナル伝達に関与するセリンスレオニンキナーゼである。TORは、抗生物質ラパマイシンの標的タンパク質として同定され、インスリンや他の成長因子、栄養・エネルギー状態、酸化還元状態など細胞内外の環境情報を統合し、転写、翻訳等を通じて、それらに応じた細胞のサイズ、分裂、生存などの調節に中心的な役割を果たすと考えられている。
実施例において後述するように、本発明者らは、微細藻類中のTORの酵素活性を阻害することにより、油脂の蓄積を向上できることを見出した。
TOR (Target of Rapamycin) is a serine threonine kinase involved in intracellular signal transduction. TOR has been identified as a target protein for the antibiotic rapamycin and integrates intracellular and extracellular environmental information such as insulin, other growth factors, nutrition / energy status, and redox status, and through transcription, translation, etc. It is thought to play a central role in regulating size, division and survival.
As described later in Examples, the present inventors have found that fat and oil accumulation can be improved by inhibiting the enzyme activity of TOR in microalgae.
TORの酵素活性を低下又は失活させる方法としては、TORをコードする微細藻類の染色体DNAの少なくとも一部の塩基を置換又は欠損させる方法、該染色体DNAに挿入配列を組み込み、フレームシフトを引き起こさせる方法、TORのドミナントネガティブ型を一過的又は安定的に微細藻類に発現させる方法等が挙げられる。
また、TORの酵素活性阻害剤を微細藻類の培養液に添加する方法も挙げられる。TORの酵素活性阻害剤としては、上述したラパマイシンの他、ATP競合阻害剤であるTorin1(Thoreen CC,et.al., J. Biol. Chem. (2009)Vol. 20, pp.8023−32.参照)、AZD8055(Chresta CM, et.al., Cancer Res.(2010)Vol.70, pp.288−98.参照)等が挙げられる。
これらの方法によりTORの酵素活性を、低下又は失活させることができる。操作が簡便である点から、TORの酵素活性は、TOR阻害剤により低下又は失活していることが好ましい。
As a method for reducing or inactivating the enzyme activity of TOR, a method of substituting or deleting at least a part of the base of chromosomal DNA of microalgae encoding TOR, an insertion sequence is incorporated into the chromosomal DNA, and a frame shift is caused. Examples thereof include a method, a method of allowing a dominant negative type of TOR to be transiently or stably expressed in microalgae, and the like.
Moreover, the method of adding the enzyme activity inhibitor of TOR to the culture solution of a micro algae is also mentioned. As an enzyme activity inhibitor of TOR, in addition to the above-mentioned rapamycin, ATP competitive inhibitor Torin1 (Theoreen CC, et.al., J. Biol. Chem. (2009) Vol. 20, pp. 8023-32. AZD8055 (see Chresta CM, et.al., Cancer Res. (2010) Vol.70, pp.288-98.) And the like.
By these methods, the enzyme activity of TOR can be reduced or inactivated. From the viewpoint of easy operation, it is preferable that the enzyme activity of TOR is reduced or inactivated by a TOR inhibitor.
微細藻類の染色体DNAを欠損させる方法としては、相同組換えを利用した方法が挙げられる。相同組換えを利用した方法としては、微細藻類の染色体DNA上において欠損させたい遺伝子又はDNAの両外側に存在するDNA断片の間に選択マーカーを連結し、該微細藻類内では自律複製できない薬剤耐性遺伝子等を有するプラスミドDNAと連結した相同組換え用プラスミドを用いる方法が挙げられる。
また、微細藻類の染色体DNA上において欠損させたい遺伝子又はDNAの両外側に存在するDNA断片の間に選択マーカーを連結したDNA断片をPCR法にて増幅する方法も挙げられる。該相同組換え用プラスミドを適当な制限酵素で処理して線状にしたDNA断片、またはPCR法で増幅したDNA断片を常法により微細藻類内に導入した後、薬剤耐性や栄養要求性を指標にして、相同組換えによって染色体DNA上に該相同組換え用プラスミドが組込まれた形質転換株が選択される。
Examples of a method for deleting chromosomal DNA of microalgae include a method using homologous recombination. The method using homologous recombination is a drug resistance that cannot be autonomously replicated in the microalgae by linking a selectable marker between the gene fragment to be deleted on the chromosomal DNA of the microalgae or a DNA fragment existing on both outer sides of the DNA. Examples include a method using a plasmid for homologous recombination linked to a plasmid DNA having a gene or the like.
Another example is a method of amplifying a DNA fragment in which a selection marker is linked between a gene to be deleted on a chromosomal DNA of microalgae or a DNA fragment existing on both outer sides of the DNA by a PCR method. After introducing the DNA fragment linearized by treating the plasmid for homologous recombination with an appropriate restriction enzyme or the DNA fragment amplified by the PCR method into microalgae by a conventional method, drug resistance and auxotrophy are indicated. Thus, a transformed strain in which the plasmid for homologous recombination is incorporated on the chromosomal DNA by homologous recombination is selected.
また、微細藻類の染色体DNAを欠損させる他の方法としては、トランスポゾンでランダムに遺伝子を挿入させ、遺伝子挿入された群の中から、目的の遺伝子に挿入が起こった株の選抜をする方法が挙げられる。また、選択マーカーをもった外来遺伝子を細胞内に導入し、それがランダムに(非相同組換え)ゲノムに挿入されることにより、トランスポゾンと同様に遺伝子の欠損を起こした株を得る方法も挙げられる。 Another method for deleting chromosomal DNA of microalgae is a method of randomly inserting a gene with a transposon and selecting a strain in which the target gene has been inserted from the group into which the gene has been inserted. It is done. Another example is a method of obtaining a gene-deficient strain in the same manner as a transposon by introducing a foreign gene having a selectable marker into a cell and randomly inserting it into the genome (non-homologous recombination). It is done.
微細藻類に遺伝子を導入する方法としては、粒子衝撃、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、ポリエチレングリコール、リポフェクション、吸着、感染およびプロトプラスト融合等が挙げられる。具体的には、組換え用プラスミドを、指数増殖期の間の微細藻類に導入する方法が好ましい。また、エレクトロポレーションによる宿主細胞への遺伝子導入の前にプロテアーゼ活性を有する酵素で前処理する方法も挙げられる。 Examples of methods for introducing genes into microalgae include particle bombardment, electroporation, microinjection, polyethylene glycol, lipofection, adsorption, infection, and protoplast fusion. Specifically, a method of introducing the recombination plasmid into microalgae during the exponential growth phase is preferable. In addition, a method of pretreatment with an enzyme having protease activity before gene introduction into a host cell by electroporation can also be mentioned.
以下、本発明の微細藻類の好ましい実施形態について説明するが、これらの実施形態は、発明の趣旨をより良く理解させるために一例として説明するものであり、特に指定のない限り、本発明を限定するものではない。 Hereinafter, preferred embodiments of the microalgae of the present invention will be described, but these embodiments are described as examples for better understanding of the gist of the invention, and the present invention is limited unless otherwise specified. Not what you want.
[第1実施形態]
本実施形態に用いられる宿主微細藻類としては、C.merolae等のラパマイシン非感受性のものが挙げられる。C.merolaeは、高温強酸性の温泉等、真核生物としては最も極限的な環境の一つに生息する単細胞紅藻である。また、C.merolaeは、全ゲノムの塩基配列が決定されており、イントロンを数か所しか有していない。更に、核遺伝子のノックアウトが可能であり、遺伝子の重複性が低いことから植物研究のモデル生物として考えられている。
[First embodiment]
Examples of host microalgae used in this embodiment include C.I. Examples include rapamycin-insensitive ones such as melolae. C. melolae is a single-cell red algae that inhabits one of the most extreme environments for eukaryotes, such as hot and strongly acidic hot springs. In addition, C.I. In the melorae, the base sequence of the entire genome has been determined, and it has only a few introns. Furthermore, it is considered as a model organism for plant research because it can knock out nuclear genes and has low gene duplication.
本実施形態の微細藻類は、FKBP12をコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有する。
FKBP12は、ペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼに属するタンパク質である。ラパマイシンは、FKBP12に結合して複合体を形成し、該複合体がTORに結合して3重複合体を形成することによりTORの酵素活性を阻害する。本実施形態の微細藻類に用いられるC.merolaeは、ラパマイシンに非感受性を示すが、FKBP12を高発現させることにより、ラパマイシンに対して感受性を示すようになる。
The microalgae of this embodiment has a structural gene sequence encoding FKBP12 and a promoter sequence and terminator sequence for expressing the structural gene in the chromosome or as an extrachromosomal gene.
FKBP12 is a protein belonging to peptidylprolyl cis-trans isomerase. Rapamycin binds to FKBP12 to form a complex that inhibits the enzymatic activity of TOR by binding to TOR to form a triple complex. C. used for the microalgae of this embodiment. melolae is insensitive to rapamycin, but becomes highly sensitive to rapamycin by highly expressing FKBP12.
FKBP12をコードする構造遺伝子としては、特に限定されず、ヒト由来の遺伝子であっても酵母由来の遺伝子であってもよく、Saccharomyces cerevisiae由来の遺伝子が好ましい。ここで、FKBP12をコードする構造遺伝子としては、cDNAであってもgenomicDNAであってもよい。
また、FKBP12をコードする構造遺伝子配列は、ラパマイシンに対して感受性を示す生物種由来の配列であることが好ましい。
The structural gene encoding FKBP12 is not particularly limited, and may be a human-derived gene or a yeast-derived gene, and a Saccharomyces cerevisiae-derived gene is preferable. Here, the structural gene encoding FKBP12 may be cDNA or genomi cDNA.
Further, the structural gene sequence encoding FKBP12 is preferably a sequence derived from a biological species sensitive to rapamycin.
酵母FKBP12とヒトFKBP12のアミノ酸配列の相同性(アミノ酸配列の同一性)は、50〜60%であることから、本実施形態に用いられるFKBP12をコードする構造遺伝子は、以下の(a)〜(d)のいずれか一つのDNAからなり、かつ、ラパマイシンと複合体を形成して、TORの酵素活性を阻害するタンパク質をコードするものが好ましい。
(a)配列番号1で表される塩基配列からなるDNA、
(b)配列番号1で表される塩基配列において、1〜数個の塩基が欠失、置換又は付加されている塩基配列からなるDNA、
(c)配列番号1で表される塩基配列と相同性(塩基配列の同一性)が30%以上、好ましくは50%以上、より好ましくは70%以上、さらに好ましくは90%以上である塩基配列からなるDNA、又は、
(d)配列番号1で表される塩基配列からなるDNAと相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズすることができる塩基配列からなるDNA
Since the homology between the amino acid sequences of yeast FKBP12 and human FKBP12 (identity of amino acid sequences) is 50 to 60%, the structural gene encoding FKBP12 used in this embodiment is the following (a) to ( It is preferable that the DNA comprises any one of d) and encodes a protein that forms a complex with rapamycin and inhibits the enzyme activity of TOR.
(A) DNA comprising the base sequence represented by SEQ ID NO: 1,
(B) a DNA comprising a base sequence in which one to several bases have been deleted, substituted or added in the base sequence represented by SEQ ID NO: 1;
(C) a nucleotide sequence having a homology (identity of nucleotide sequences) of 30% or more, preferably 50% or more, more preferably 70% or more, and even more preferably 90% or more with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1. DNA consisting of, or
(D) DNA comprising a base sequence capable of hybridizing under stringent conditions with a DNA comprising a base sequence complementary to the DNA comprising the base sequence represented by SEQ ID NO: 1.
更に、本実施形態に用いられるFKBP12をコードする構造遺伝子は、以下の(e)又は(f)のタンパク質をコードする遺伝子がより好ましい。
(e)配列番号2で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質
(f)(e)のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、ラパマイシンと複合体を形成して、TORの酵素活性を阻害するタンパク質
Furthermore, the structural gene encoding FKBP12 used in this embodiment is more preferably a gene encoding the following protein (e) or (f).
(E) a protein comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 (f) consisting of an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence of (e), and rapamycin A protein that forms a complex and inhibits the enzymatic activity of TOR
プロモーター配列およびターミネーター配列としては、チューブリン、アクチン、ルビスコ、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)35S、アグロバクテリウムNOSなどが挙げられる。
本実施形態の微細藻類において、FKBP12を発現させる方法としては、一過的に過剰発現させる方法、安定的に過剰発現させる方法が挙げられ、後述する[油脂の製造方法]において取扱いが用意であることから、安定的に過剰発現させる方法が好ましい。
Examples of the promoter sequence and terminator sequence include tubulin, actin, rubisco, cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S, Agrobacterium NOS, and the like.
In the microalgae of the present embodiment, examples of the method for expressing FKBP12 include a method for transiently overexpressing and a method for stably overexpressing, and handling is prepared in [Oil and fat production method] described later. Therefore, a method of stably overexpressing is preferable.
本実施形態の微細藻類は、FKBP12を発現しているため、ラパマイシンに対して感受性を示す。そして、ラパマイシンを培養液に添加することにより、微細藻類中のTORの酵素活性が低下又は失活し、本実施形態の微細藻類中に油脂が蓄積する。 Since the microalgae of this embodiment express FKBP12, it is sensitive to rapamycin. And by adding rapamycin to a culture solution, the enzyme activity of TOR in a micro algae falls or deactivates, and fats and oils accumulate in the micro algae of this embodiment.
[第2実施形態]
本実施形態に用いられる微細藻類としては、C.reinhardtii等のラパマイシン感受性のものが挙げられる。ラパマイシンを培養液に添加することにより、微細藻類中のTORの酵素活性が低下又は失活し、本実施形態の微細藻類中に油脂が蓄積する。
更に、ラパマイシンの他、ATP競合阻害剤を用いることができる。ヒトTOR(mammalian target of rapamycin;mTOR)を標的とするATP競合阻害剤は、抗癌剤としての研究開発が進められており、mTORに対する強力な阻害活性と他のキナーゼに対する選択性を有するものが開発されている。係るATP競合阻害剤としては、Torin1、AZD8055等が挙げられる。これらATP競合阻害剤を用いることにより、本実施形態中の微細藻類のTOR活性が強力にかつ選択的に抑制されるため、油脂が効率良く蓄積する。
[Second Embodiment]
Examples of the microalgae used in the present embodiment include C.I. Examples include those sensitive to rapamycin such as reinhardtii. By adding rapamycin to the culture solution, the enzyme activity of TOR in the microalgae is reduced or inactivated, and fats and oils accumulate in the microalgae of this embodiment.
Furthermore, in addition to rapamycin, an ATP competitive inhibitor can be used. ATP competitive inhibitors targeting human TOR (mammalian target of rapamycin; mTOR) have been researched and developed as anticancer agents, and those having potent inhibitory activity against mTOR and selectivity against other kinases have been developed. ing. Such ATP competitive inhibitors include Torin1, AZD8055, and the like. By using these ATP competitive inhibitors, the TOR activity of microalgae in the present embodiment is strongly and selectively suppressed, so that fats and oils accumulate efficiently.
[第3実施形態]
本実施形態に用いられる微細藻類としては、P.ellipsoideaが挙げられ、P.ellipsoideaN1株やP.ellipsoideaObi株が好ましい。P.ellipsoideaは、増殖速度が速いため油脂の生産に優れている(特許第4748154号公報参照)。
第2実施形態と同様、本実施形態においても、ATP競合阻害剤を用いることができる。本実施形態によれば、油脂の生産にすぐれた微細藻類を用いて、TORを強力にかつ選択的に阻害することにより油脂を効率よく蓄積させることができる。
[Third embodiment]
Examples of microalgae used in this embodiment include P.I. ellipsisidea and p. ellipsisideN1 strain and P. aeruginosa. The ellipsiside Obi strain is preferred. P. Elipsoidea is excellent in the production of fats and oils because of its high growth rate (see Japanese Patent No. 4748154).
Similar to the second embodiment, an ATP competitive inhibitor can also be used in this embodiment. According to this embodiment, fats and oils can be efficiently accumulated by strongly and selectively inhibiting TOR using microalgae excellent in the production of fats and oils.
<培養物>
本発明の培養物は、上述した本発明の微細藻類を培養してなるものである、該培養物は、微細藻類に遺伝的操作が加えられておらず、TORの活性が低下又は失活していない場合には、更にTOR阻害剤を含有することが好ましい。
<Culture>
The culture of the present invention is obtained by culturing the above-mentioned microalgae of the present invention. In the culture, genetic manipulation is not applied to the microalgae, and the TOR activity is reduced or inactivated. If not, it is preferable to further contain a TOR inhibitor.
<油脂の製造方法>
以下、本発明の炭化水素類の製造方法の好ましい実施形態について説明するが、これらの実施形態は、発明の趣旨をより良く理解させるために一例として説明するものであり、特に指定のない限り、本発明を限定するものではない。
<Oil and fat manufacturing method>
Hereinafter, preferred embodiments of the method for producing hydrocarbons of the present invention will be described, but these embodiments are described as examples for better understanding of the gist of the invention, and unless otherwise specified, It is not intended to limit the invention.
[第1実施形態]
本実施形態の油脂の製造方法は、微細藻類を培養する工程A1と、前記工程A1の後、前記微細藻類を培養してなる培養液にTOR阻害剤を添加する工程B1と、を有する。
本実施形態における培養対象の微細藻類としては、特に限定されないが、ラパマイシン感受性のものが好ましい。
[First embodiment]
The manufacturing method of fats and oils of this embodiment has process A1 which culture | cultivates a micro algae, and process B1 which adds a TOR inhibitor to the culture solution formed by culture | cultivating the said micro algae after said process A1.
Although it does not specifically limit as a micro algae of the culture | cultivation object in this embodiment, A rapamycin sensitive thing is preferable.
先ず、工程A1において、微細藻類を培養する。微細藻類の培養するための培地としては、各種栄養塩、微量金属塩、ビタミン等を含む公知の淡水産微細藻類用の培地、海産微細藻類用の培地が挙げられる。また、既知の淡水産微細藻類用の培地をベースに作成した寒天平板培地も利用可能である。
栄養塩としては、NaNO3、KNO3、NH4Cl、(NH4)2SO4、尿素等の窒素源;K2HPO4、KH2PO4、グリセロリン酸ナトリウム等のリン源が挙げられる。
微量金属としては、鉄、マグネシウム、マンガン、カルシウム、亜鉛等が挙げられ、ビタミンとしてはビタミンB1、ビタミンB12等が挙げられる。
また、工程A1において、微細藻類の培養条件として、通気条件で二酸化炭素の供給とともに攪拌を行うことが好ましい。その際、蛍光灯で12時間の光照射、12時間の暗条件などの明暗サイクルをつけた光照射、又は、連続光照射して、静置、振盪又は空気通気培養することが好ましい。また、増殖促進の観点から、空気中へ二酸化炭素を1〜5%程度付加しながら培養することが好ましい。
更に、微細藻類の増殖に悪影響を与えない範囲内であれば特に制限はされないが、例えばC.merolaeにおいては、培養液のpHを2〜3とすることが好ましく、培養温度を、42℃にすることが好ましく、;P.ellipsoideaにおいては、培養液のpHを3〜4とすることが好ましく、培養温度を、25℃にすることが好ましく、;C.reinhardtiiにおいては、培養液のpHを5.5〜8.5とすることが好ましく、培養温度を、25℃にすることが好ましい。
First, in step A1, microalgae are cultured. Examples of the medium for culturing microalgae include known freshwater microalgae media and various microalgae media containing various nutrient salts, trace metal salts, vitamins, and the like. Further, an agar plate medium prepared based on a known medium for freshwater microalgae can also be used.
Examples of nutrient salts include nitrogen sources such as NaNO 3 , KNO 3 , NH 4 Cl, (NH 4 ) 2 SO 4 and urea; and phosphorus sources such as K 2 HPO 4 , KH 2 PO 4 and sodium glycerophosphate.
Examples of trace metals include iron, magnesium, manganese, calcium, and zinc, and examples of vitamins include vitamin B1 and vitamin B12.
Further, in step A1, it is preferable to stir together with the supply of carbon dioxide under aeration conditions as the culture conditions for the microalgae. At that time, it is preferable to carry out stationary culture, shaking, or air-aeration culture by irradiation with a fluorescent lamp for 12 hours, light irradiation with a light / dark cycle such as a 12-hour dark condition, or continuous light irradiation. Moreover, it is preferable to culture | cultivate, adding about 1 to 5% of carbon dioxide in the air from a viewpoint of growth promotion.
Further, there is no particular limitation as long as it does not adversely affect the growth of microalgae. In melolae, the pH of the culture solution is preferably 2-3, and the culture temperature is preferably 42 ° C .; In ellipsiside, the pH of the culture solution is preferably 3 to 4, and the culture temperature is preferably 25 ° C .; In reinhardtii, the pH of the culture solution is preferably 5.5 to 8.5, and the culture temperature is preferably 25 ° C.
次いで、工程B1において、微細藻類を培養してなる培養液にTOR阻害剤を添加する。用いられるTOR阻害剤としては、特に限定されず、ラパマイシンであっても、ATP競合阻害剤であってもよい。TOR阻害剤の添加量としては、特に限定されないが、増殖阻害が10%〜70%引き起こされる程度の添加量が好ましく、20%〜60%引き起こされる程度の添加量がより好ましく、50%引き起こされる程度の添加量が特に好ましい。
工程B1を経て、微細藻類中に油脂が蓄積される。
Next, in step B1, a TOR inhibitor is added to a culture solution obtained by culturing microalgae. The TOR inhibitor used is not particularly limited, and may be rapamycin or an ATP competitive inhibitor. The amount of addition of the TOR inhibitor is not particularly limited, but is preferably such that the growth inhibition is caused by 10% to 70%, more preferably 20% to 60%, more preferably 50%. A degree of addition is particularly preferred.
Through step B1, fats and oils are accumulated in the microalgae.
以上のような条件で培養すると、培養開始から6〜8日程度で、油脂が採取できる。
本実施形態によれば、生産性良く油脂を製造できる。
更に、本実施形態によれば、培養を窒素欠乏条件下で行わずとも油脂を製造することができるため、従来の油脂製造方法において必要であった窒素欠乏条件下の培養工程を省略できる。従って、本実施形態の油脂製造方法は、コスト面においても優れている。
When cultured under the above conditions, oil and fat can be collected in about 6 to 8 days from the start of culture.
According to this embodiment, fats and oils can be manufactured with high productivity.
Furthermore, according to this embodiment, since fats and oils can be manufactured even if it does not culture | cultivate on nitrogen deficient conditions, the culture | cultivation process on nitrogen deficient conditions required in the conventional fats and oils manufacturing method can be skipped. Therefore, the method for producing fats and oils of the present embodiment is excellent in terms of cost.
生産された油脂は培養藻体から採取できる。フレンチプレスやホモジナイザーなどの一般的な方法により細胞を破砕してからn−ヘキサンなどの有機溶媒によって抽出する方法や、細胞をガラス繊維等のフィルター上に回収し、乾燥させてから、有機溶媒などによって抽出する方法が挙げられる。また、細胞を遠心分離で回収し、凍結乾燥して粉末化し、その粉末から有機溶媒で抽出する方法も挙げられる。抽出後の溶媒を、減圧又は常圧下で、また加温又は常温で揮散させることにより目的の油脂が得られる。 The produced fats and oils can be collected from cultured algal bodies. A method of crushing cells by a general method such as a French press or a homogenizer and then extracting with an organic solvent such as n-hexane, or collecting cells on a filter such as glass fiber and drying them, followed by an organic solvent, etc. The method of extracting by is mentioned. Moreover, the method of collect | recovering cells by centrifugation, freeze-drying and pulverizing, and extracting with the organic solvent from the powder is also mentioned. The desired oil and fat can be obtained by evaporating the solvent after extraction under reduced pressure or normal pressure, or by heating or normal temperature.
微細藻類中に蓄積する油脂は、脂肪酸がグリセロールとエステル結合した化合物である。係る油脂としては、アシルグリセリドが好ましく、トリアシルグリセリドがより好ましい。例えばこれら油脂をメタノールでメチルエステル化し、従来のディーゼル燃料と同品質な燃料(Biodiesel fuel)へと変換して用いることができる。。 Oils and fats that accumulate in microalgae are compounds in which fatty acids are ester-bonded to glycerol. As such fats and oils, acylglycerides are preferable, and triacylglycerides are more preferable. For example, these fats and oils can be methyl esterified with methanol and converted into a fuel of the same quality as conventional diesel fuel (Biodiesel fuel). .
[第2実施形態]
本実施形態の油脂の製造方法は、FKBP12をコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有する微細藻類を用いる方法である。本実施形態において、FKBP12をコードする構造遺伝子配列は、ラパマイシンに対して感受性を示す生物種由来の配列であることが好ましい。
本実施形態に用いられる宿主微細藻類としては、C.merolae等のラパマイシン非感受性のものが挙げられる。微細藻類の第1実施形態で述べたように、FKBP12を発現させることにより、ラパマイシン非感受性微細藻類は、ラパマイシンに対して感受性を示す。そして、ラパマイシンを培養液に添加することにより、微細藻類中のTORの酵素活性が低下又は失活し、微細藻類中に油脂が蓄積する。
他の構成については、第1実施形態の油脂の製造方法と同様であるためその説明を省略する。
[Second Embodiment]
The method for producing fats and oils of the present embodiment uses a microalgae having a structural gene sequence encoding FKBP12 and a promoter sequence and terminator sequence for expressing the structural gene in the chromosome or as an extrachromosomal gene. Is the method. In the present embodiment, the structural gene sequence encoding FKBP12 is preferably a sequence derived from a biological species that is sensitive to rapamycin.
Examples of host microalgae used in this embodiment include C.I. Examples include rapamycin-insensitive ones such as melolae. As described in the first embodiment of microalgae, by expressing FKBP12, the rapamycin-insensitive microalgae is sensitive to rapamycin. And by adding rapamycin to a culture solution, the enzyme activity of TOR in a micro algae falls or deactivates, and fats and oils accumulate in a micro algae.
About another structure, since it is the same as that of the manufacturing method of the fats and oils of 1st Embodiment, the description is abbreviate | omitted.
[第3実施形態]
本実施形態の油脂の製造方法は、TORの酵素活性が低下又は失活している微細藻類を培養する工程A2を有する。
本実施形態においては、TORをコードする微細藻類の染色体DNAの少なくとも一部の塩基を置換又は欠損させた変異体;TORをコードする微細藻類の染色体DNAに挿入配列を組み込み、フレームシフトを引き起こさせた変異体;TORのドミナントネガティブ型を一過的又は安定的に微細藻類に過剰発現させた形質転換体等を用いることが好ましい。
また、TORの遺伝子の発現をmRNAレベルで抑制し得るRNAi誘導性核酸を微細藻類に発現させた形質転換体も挙げられる。RNAi誘導性核酸とは、微細藻類細胞内に導入されることにより、RNA干渉を誘導し得る核酸を意味する。RNA干渉とは、mRNA(又はその部分配列)に相補する塩基配列を含むRNAが、当該mRNAの発現を抑制する効果をいう。
RNAi誘導性核酸が標的とするmRNAは、コーディング領域であっても、ノンコーディング領域であってもよい。
また、RNAi誘導性核酸としては、例えばsiRNAやmiRNAが挙げられる。微細藻類細胞内に導入され、siRNA と同様にRNAiを引き起こすベクターとしては、shRNA(short hairpin RNA/small hairpin RNA)発現ベクターが挙げられる。
更に、TORの活性阻害が、微細藻類の生育阻害を引き起こすおそれがある観点から、上述したRNAi誘導性核酸をconditionalに発現誘導し、TORの活性を調節することが好ましい。
他の構成については、第1実施形態の油脂の製造方法と同様であるためその説明を省略する。
本実施形態によれば、TOR阻害剤を添加せずとも上記微細藻類変異体又は形質転換体を培養するのみで油脂を製造できる。従って、本実施形態の油脂製造方法は、コスト面において更に優れている。
[Third embodiment]
The manufacturing method of the fats and oils of this embodiment has process A2 which culture | cultivates the micro algae in which the enzyme activity of TOR has fallen or is deactivated.
In the present embodiment, a mutant in which at least a part of the base of chromosomal DNA of microalga encoding TOR is substituted or deleted; an insertion sequence is incorporated into chromosomal DNA of microalga encoding TOR to cause frame shift It is preferable to use a transformant in which a dominant negative type of TOR is transiently or stably overexpressed in microalgae.
Further, a transformant in which an RNAi-inducible nucleic acid capable of suppressing the expression of a TOR gene at the mRNA level is expressed in microalgae is also included. The RNAi-inducible nucleic acid means a nucleic acid that can induce RNA interference by being introduced into microalgal cells. RNA interference refers to the effect that RNA containing a base sequence complementary to mRNA (or a partial sequence thereof) suppresses the expression of the mRNA.
The mRNA targeted by the RNAi-inducing nucleic acid may be a coding region or a non-coding region.
In addition, examples of the RNAi-inducible nucleic acid include siRNA and miRNA. Examples of vectors that are introduced into microalgal cells and cause RNAi as well as siRNA include shRNA (short hairpin RNA / small hairpin RNA) expression vectors.
Further, from the viewpoint that inhibition of TOR activity may cause growth inhibition of microalgae, it is preferable to conditionally induce the expression of the RNAi-inducible nucleic acid described above to regulate the activity of TOR.
About another structure, since it is the same as that of the manufacturing method of the fats and oils of 1st Embodiment, the description is abbreviate | omitted.
According to this embodiment, fats and oils can be manufactured only by culture | cultivating the said micro algae mutant or a transformant, without adding a TOR inhibitor. Therefore, the method for producing fats and oils of the present embodiment is further excellent in terms of cost.
次に実施例を示して本発明をさらに詳細に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。 EXAMPLES Next, although an Example is shown and this invention is demonstrated further in detail, this invention is not limited to a following example.
≪実施例1≫
[ラパマイシンによる増殖抑制効果]
24ウェルプレートの各ウェルに約1.0×107個/mLのC.merolaeを加え、終濃度0μM、0.1μM、0.5μM、1μM、5μM、10μMになるようにラパマイシンを加え、40℃60時間培養した。各ウェルの写真を図1に示す。
図1に示すように、ラパイシンを10μM用いても、0μMのウェルと緑色濃度に差が見られないことから、C.merolaeはラパマイシンに非感受性を示すことが確認された。
培養に用いた培地の組成については、Ohnuma M,et.al., Plant Cell Physiol. (2008)Vol.49,pp.117−120.の記載に従った。
Example 1
[Inhibition of growth by rapamycin]
Approximately 1.0 × 10 7 cells / mL of C.I. melolae was added, rapamycin was added to final concentrations of 0 μM, 0.1 μM, 0.5 μM, 1 μM, 5 μM, and 10 μM, and cultured at 40 ° C. for 60 hours. A photograph of each well is shown in FIG.
As shown in FIG. 1, even when 10 μM of rapaicin is used, there is no difference in green density from the 0 μM well. It was confirmed that merolae was insensitive to rapamycin.
For the composition of the medium used for the culture, see Ohnuma M, et. , Plant Cell Physiol. (2008) Vol. 49, pp. 117-120.
[発現ベクターの作製]
Saccharomyces cerevisiae由来のFKBP12(ScFKBP12)の5’末端にC.merolaeのAPCC(CMO250C; http://merolae.biol.s.u-tokyo.ac.jp/参照 )遺伝子のプロモーター領域を含み、3’末端にAPCC遺伝子のターミネーター領域を含んだ断片を乗り換えPCR法にて増幅した。また、ScFKBP12とAPCC遺伝子のターミネーター領域の間には、3×FLAGタグ配列を付加し、C.merolae細胞内におけるScFKBP12発現の指標のために用いた。このような断片をPCR法にて増幅する際、DNAの5’ 末端と3’末端に制限酵素EcoRIで認識される配列を人為的に付加しておき、該断片をEcoRIで消化した。一方、これとは別にpKFURACm−Gs(Imamura S,et.al., Plant Cell Physiol. (2010)Vol.51,pp.707−717.参照)を制限酵素EcoRIで消化し、アルカリフォスファターゼ処理した。この処理後、アガロース電気泳動に供し、ベクターpKFURACm−Gs断片と、上記のScFKBP12遺伝子を含む断片をアガロースゲルから切出し、ライゲーションした後、大腸菌DH5α(東洋紡社製)に導入して形質転換した。得られた形質転換体よりベクターを調製し、目的とする発現ベクターpKF−ScFKBP12(図2参照。) を取得した。制限酵素地図の作製とキャピラリーシーケンサーによる塩基配列解読から目的とするベクターであることを確認した。
[Preparation of expression vector]
C. at the 5 ′ end of FKBP12 (ScFKBP12) from Saccharomyces cerevisiae. A fragment containing the promoter region of the melolae APCC (CMO250C; http://merolae.biol.su-tokyo.ac.jp/) gene and the APCC gene terminator region at the 3 ′ end was transferred by PCR. Amplified. In addition, a 3 × FLAG tag sequence was added between ScFKBP12 and the terminator region of the APCC gene. Used for indication of ScFKBP12 expression in melolae cells. When such a fragment was amplified by the PCR method, a sequence recognized by the restriction enzyme EcoRI was artificially added to the 5 ′ end and 3 ′ end of the DNA, and the fragment was digested with EcoRI. On the other hand, pKFURACm-Gs (see Immura S, et.al., Plant Cell Physiol. (2010) Vol. 51, pp. 707-717.) Was digested with restriction enzyme EcoRI and treated with alkaline phosphatase. After this treatment, it was subjected to agarose electrophoresis, and the vector pKFURACm-Gs fragment and the above-mentioned fragment containing the ScFKBP12 gene were excised from the agarose gel, ligated, and then introduced into Escherichia coli DH5α (manufactured by Toyobo Co., Ltd.) for transformation. A vector was prepared from the obtained transformant, and the target expression vector pKF-ScFKBP12 (see FIG. 2) was obtained. The target vector was confirmed from the construction of a restriction enzyme map and the decoding of the base sequence using a capillary sequencer.
[ScFKBP12高発現株の作製]
前記pKF−ScFKBP12とその母体ベクターであるpKFURACm−Gsを、それぞれImamura S,et.al., Plant Cell Physiol. (2010)Vol.51,pp.707−717.に従い、C.merolae M4株に導入して形質転換した。その後、ウラシル非要求性を指標として形質転換体を選抜し、ScFKBP12高発現株であるF12株とコントロール株であるC12株が得られた。
[Preparation of a high expression strain of ScFKBP12]
The pKF-ScFKBP12 and its parent vector pKFURACm-Gs were obtained from Imamara S, et. , Plant Cell Physiol. (2010) Vol. 51, pp. 707-717. It was introduced into melolae M4 strain and transformed. Thereafter, transformants were selected using uracil non-requirement as an index, and the F12 strain, which is a high expression strain of ScFKBP12, and the C12 strain, which is a control strain, were obtained.
[ラパマイシンによる増殖抑制効果]
24ウェルプレートの各ウェルに約1.0×107個/mLのScFKBP12高発現株であるF12株もしくはC12株を加え、終濃度0nM、10nM、50nM、100nM、500nM、1000nMになるようにラパマイシンを加え、40℃60時間培養した。各ウェルの写真とScFKBP12高発現株の細胞濁度を図3に示す。また、ScFKBP12高発現株に終濃度500nMになるようにラパマイシンを加えて培養し、経時的に培養液の濁度及び細胞数を測定した。「細胞濁度」と「細胞数」二つの指標で観察した細胞増殖曲線の結果を図4及び図5に示す。
図3に示すように、ScFKBP12発現株においてラパイシン10nMで増殖抑制効果がみられ、500nMで完全な増殖抑制効果が観察された一方、C12株の増殖は阻害されなかった。このことから、ScFKBP12高発現株はラパマイシンに感受性を示すことが確認された。
図4及び図5に示されるように、ラパマイシン非存在下では、ScFKBP12高発現株は、C12株と比較して同様の増殖効率を示したが、ラパマイシン存在下では、増殖抑制されることが確認された。
[Inhibition of growth by rapamycin]
About 1.0 × 10 7 cells / mL of F12 or C12, which is a high expression strain of ScFKBP12, is added to each well of a 24-well plate, and rapamycin is adjusted so that the final concentrations are 0 nM, 10 nM, 50 nM, 100 nM, 500 nM, and 1000 nM. Was added and cultured at 40 ° C. for 60 hours. The photograph of each well and the cell turbidity of the high expression strain of ScFKBP12 are shown in FIG. Further, Rapamycin was added to the high expression strain of ScFKBP12 so as to have a final concentration of 500 nM, followed by culturing, and the turbidity and cell number of the culture solution were measured over time. The results of cell growth curves observed with two indexes of “cell turbidity” and “cell number” are shown in FIG. 4 and FIG.
As shown in FIG. 3, in the ScFKBP12-expressing strain, a growth inhibitory effect was observed at 10 nM of rapaisin, and a complete growth inhibitory effect was observed at 500 nM, while the growth of the C12 strain was not inhibited. From this, it was confirmed that the high expression strain of ScFKBP12 is sensitive to rapamycin.
As shown in FIG. 4 and FIG. 5, in the absence of rapamycin, the ScFKBP12 high-expressing strain showed similar growth efficiency compared to the C12 strain, but it was confirmed that the growth was suppressed in the presence of rapamycin. It was done.
[油脂生産能評価]
ScFKBP12高発現株に終濃度500nMのラパマイシンを加えて培養し、ScFKBP12高発現株における油脂の蓄積を経時的に測定した。BODIPYで油脂を染色した結果を図6下段に示し、クロロプラストの自家蛍光写真を図6中段に示し、ScFKBP12高発現株の明視野像を図6上段に示す。同様に、ScFKBP12高発現株にDMSO添加後の油脂の蓄積を図7に示す。
図6下段に示すように、ラパマイシン添加24時間以降、油脂の蓄積が観察された。特に48時間以降の油脂の蓄積が図7下段のコントロールとしてDMSOを添加した時と比較して顕著であることが確認された。
[Evaluation of oil production capacity]
A rapamycin having a final concentration of 500 nM was added to the high expression strain of ScFKBP12 and cultured, and accumulation of fats and oils in the high expression strain of ScFKBP12 was measured over time. The result of dyeing fats and oils with BODIPY is shown in the lower part of FIG. 6, an autofluorescence photograph of chloroplast is shown in the middle part of FIG. 6, and a bright field image of the high expression strain of ScFKBP12 is shown in the upper part of FIG. Similarly, FIG. 7 shows the accumulation of fats and oils after addition of DMSO to the high expression strain of ScFKBP12.
As shown in the lower part of FIG. 6, accumulation of fats and oils was observed after 24 hours from the addition of rapamycin. In particular, it was confirmed that the accumulation of fats and oils after 48 hours was more remarkable than when DMSO was added as a control in the lower part of FIG.
また、ScFKBP12高発現株におけるラパマイシン添加2日後のトリアシルグリセリド(TAG)の生産量を定量した。詳細には、ラパマイシン添加後2日後の細胞を回収し、−80度で保存した。使用する際は、細胞を凍結乾燥機で約16時間乾燥させ、脂質の抽出に供した。総脂質の抽出は、Bligh & Dyer法 (Bligh EG,et.al., Can.J.Biochem.Physiol. (1959)Vol.37,pp.911−917.) に基づき行った。
乾燥体を水、クロロホルムとメタノール (1:2(vol/vol)) で懸濁し、総脂質を抽出した。その抽出液にクロロホルムと1 %のKClを加え、懸濁後遠心分離を行った。遠心分離後は2層に分離し、総脂質を含む下層の有機溶媒層を回収した。総脂質からのTAGの分離は、薄層クロマトグラフィーにて行った。その際の展開溶媒組成液は、ヘキサン : ジエチルエーテル : 酢酸=160 : 40 : 4 (vol/vol) で行った。分離後のプレートからTAGのスポットを掻きとり、15:0脂肪酸 (pentadecanoic acid) を内部標準試料として、TAGをメタノリシス処理した。具体的には、ネジ栓付きガラス試験管内で、TAGを含むシリカゲル粉末に100μLの1 mM 15 : 0ヘキサン溶液および500μLの5 %塩化水素メタノール溶液を添加して85℃で1時間処理した。メタノリシス処理後、ヘキサンで脂肪酸メチルエステルを回収し、窒素ガスで乾燥後、60 μLのヘキサンで溶解し、そのうち3 μLをガスクロマトグラフィーに供して定量を行った。
Further, the amount of triacylglyceride (TAG) produced 2 days after addition of rapamycin in the high expression strain of ScFKBP12 was quantified. Specifically, cells 2 days after the addition of rapamycin were collected and stored at -80 degrees. When used, the cells were dried with a freeze dryer for about 16 hours and subjected to lipid extraction. Extraction of total lipids was performed based on the Bligh & Dyer method (Blight EG, et.al., Can. J. Biochem. Physiol. (1959) Vol. 37, pp. 911-917.).
The dried product was suspended in water, chloroform and methanol (1: 2 (vol / vol)), and the total lipid was extracted. Chloroform and 1% KCl were added to the extract, suspended and centrifuged. After centrifugation, it was separated into two layers, and the lower organic solvent layer containing the total lipid was recovered. Separation of TAG from total lipids was performed by thin layer chromatography. The developing solvent composition at that time was hexane: diethyl ether: acetic acid = 160: 40: 4 (vol / vol). A TAG spot was scraped from the plate after separation, and the TAG was subjected to methanolysis treatment using 15: 0 fatty acid (pentadecanic acid) as an internal standard sample. Specifically, 100 μL of a 1 mM 15: 0 hexane solution and 500 μL of a 5% hydrogen chloride methanol solution were added to silica gel powder containing TAG in a glass test tube with a screw cap, followed by treatment at 85 ° C. for 1 hour. After the methanolysis treatment, the fatty acid methyl ester was recovered with hexane, dried with nitrogen gas, dissolved with 60 μL of hexane, 3 μL of which was subjected to gas chromatography for quantification.
結果を図8に示す。図8に示すように、コントロールとしてDMSOのみを添加して2日間培養した場合と比較して、ラパマイシン添加して2日間培養することによりTAGの蓄積量が増加することが確認された。 The results are shown in FIG. As shown in FIG. 8, it was confirmed that the amount of accumulated TAG increased by adding rapamycin and culturing for 2 days as compared with the case of adding DMSO alone and culturing for 2 days as a control.
≪実施例2≫
[ラパマイシンによる増殖抑制効果]
6ウェルプレートの各ウェルに約3.0×106個/mLのC.reinhardtiiを加え、終濃度0nM、100nM、200nM、400nM、600nM、1000nMとなるようにラパマイシンを加え、25℃40時間培養した。各ウェルの写真及び濁度を図9に示す。
培養に用いた培地の組成については、Gorman DS,et.al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,. (1965)Vol.54,pp.1665−1669.の記載に従った。
図9に示すように、ラパイシンの用量依存的にC.reinhardtiiの細胞増殖が抑制されていることから、C.reinhardtiiはラパマイシンに感受性を示すことが確認された。
<< Example 2 >>
[Inhibition of growth by rapamycin]
Approximately 3.0 × 10 6 cells / mL of C.I. Reinhardtii was added, rapamycin was added to a final concentration of 0 nM, 100 nM, 200 nM, 400 nM, 600 nM, and 1000 nM, and cultured at 25 ° C. for 40 hours. The photograph and turbidity of each well are shown in FIG.
For the composition of the medium used for the culture, see Gorman DS, et.al. , Proc. Natl. Acad. Sci. USA, (1965) Vol. 54, pp. 1665-1669.
As shown in FIG. Since cell proliferation of reinhardtii is suppressed, C.I. Reinhardtii was confirmed to be sensitive to rapamycin.
[油脂生産能評価]
C.reinhardtiiに400nMのラパマイシンを加えて25℃40時間培養し、C.reinhardtiiにおける油脂の蓄積を測定した。BODIPYで油脂を染色した結果を図10に示す。
図10に示すように、400nMラパマイシン添加により、油脂の蓄積が観察された。
[Evaluation of oil production capacity]
C. C. reinhardtii was added with 400 nM rapamycin and cultured at 25 ° C. for 40 hours. The accumulation of fats and oils in reinhardtii was measured. The result of dyeing fats and oils with BODIPY is shown in FIG.
As shown in FIG. 10, accumulation of fats and oils was observed by adding 400 nM rapamycin.
[ATP競合阻害剤による増殖抑制効果1]
6ウェルプレートの各ウェルに約3.0×106個/mLのC.reinhardtiiを加え、終濃度0nM、1nM、10nM、100nM、1000nM、10000nMとなるようにTorin1(Thoreen CC,et.al., J. Biol. Chem. (2009)Vol. 20, pp.8023−32.参照)を加え、25℃100時間培養した。各ウェルの写真及び濁度を図11に示す。
図11に示すように、Torinの用量依存的にC.reinhardtiiの細胞増殖が抑制されていることから、C.reinhardtiiはTORのATP競合阻害剤であるTorin1に感受性を示すことが確認された。
[Inhibition of growth by ATP competitive inhibitor 1]
Approximately 3.0 × 10 6 cells / mL of C.I. Reinhardtii is added, and Torin1 (Thoren CC, et.al., J. Biol. Chem. (2009) Vol. 20, pp. 8023-32. is adjusted to a final concentration of 0 nM, 1 nM, 10 nM, 100 nM, 1000 nM, and 10000 nM. And the mixture was cultured at 25 ° C. for 100 hours. The photograph and turbidity of each well are shown in FIG.
As shown in FIG. Since cell proliferation of reinhardtii is suppressed, C.I. It was confirmed that reinhardtii is sensitive to Torin1, which is an ATP competitive inhibitor of TOR.
[油脂生産能評価]
C.reinhardtiiに終濃度1000nMのTorin1を加えて25℃100時間培養し、C.reinhardtiiにおける油脂の蓄積を測定した。BODIPYで油脂を染色した結果を図12に示す。
図12に示すように、2か所の異なる視野において、終濃度1000nMTorin1添加により、油脂の蓄積が観察された。
[Evaluation of oil production capacity]
C. Reinhardtii was added with Torin 1 having a final concentration of 1000 nM and cultured at 25 ° C. for 100 hours. The accumulation of fats and oils in reinhardtii was measured. The result of dyeing fats and oils with BODIPY is shown in FIG.
As shown in FIG. 12, in two different visual fields, accumulation of fats and oils was observed by adding a final concentration of 1000 nMTorin1.
[ATP競合阻害剤による増殖抑制効果2]
6ウェルプレートの各ウェルに約3.0×106個/mLのC.reinhardtiiを加え、終濃度0nM、1nM、10nM、100nM、1000nM、10000nMとなるようにAZD8055(Chresta CM, et.al., Cancer Res.(2010)Vol.70, pp.288−98.参照)を加え、25℃48時間培養した。各ウェルの写真及び濁度を図13に示す。
図13に示すように、AZD8055の用量依存的にC.reinhardtiiの細胞増殖が抑制されていることから、C.reinhardtiiはTORのATP競合阻害剤であるAZD8055に感受性を示すことが確認された。
[Inhibition of growth by ATP competitive inhibitor 2]
Approximately 3.0 × 10 6 cells / mL of C.I. Reinhardtii is added, and AZD8055 (Chresta CM, et.al., Cancer Res. (2010) Vol. 70, pp. 288-98.) is used so that the final concentration is 0 nM, 1 nM, 10 nM, 100 nM, 1000 nM, and 10000 nM. In addition, the cells were cultured at 25 ° C. for 48 hours. The photograph and turbidity of each well are shown in FIG.
As shown in FIG. 13, C.D. Since cell proliferation of reinhardtii is suppressed, C.I. It was confirmed that reinhardtii is sensitive to AZD8055, which is an ATP competitive inhibitor of TOR.
[油脂生産能評価]
C.reinhardtiiに終濃度100nMのAZD8055を加えて25℃48時間培養し、C.reinhardtiiにおける油脂の蓄積を測定した。BODIPYで油脂を染色した結果を図14に示す。
図14に示すように、2か所の異なる視野において、100nMAZD8055添加により、油脂の蓄積が観察された。
[Evaluation of oil production capacity]
C. Reinhardtii was added with AZD8055 at a final concentration of 100 nM and cultured at 25 ° C. for 48 hours. The accumulation of fats and oils in reinhardtii was measured. The result of dyeing fats and oils with BODIPY is shown in FIG.
As shown in FIG. 14, accumulation of fats and oils was observed by adding 100 nMAZD8055 in two different visual fields.
≪実施例3≫
[ATP競合阻害剤による増殖抑制効果1]
6ウェルプレートの各ウェルに約5.0×106個/mLのP.ellipsoideaを加え、終濃度0nM、1nM、10nM、100nM、1000nM、10000nMとなるようにTorin1を加え、25℃48時間培養した。各ウェルの写真及び濁度を図15に示す。
培養に用いた培地の組成については、Imamura S,et.al., J. Gen. Appl. Microbiol., (2012)Vol.58,pp.1−10.の記載に従った。
図15に示すように、Torinの用量依存的にP.ellipsoideaの細胞増殖が抑制されていることから、P.ellipsoideaはTORのATP競合阻害剤であるTorin1に感受性を示すことが確認された。
Example 3
[Inhibition of growth by ATP competitive inhibitor 1]
Approximately 5.0 × 10 6 cells / mL of P.I. ellipsiside was added, and Torin1 was added to a final concentration of 0 nM, 1 nM, 10 nM, 100 nM, 1000 nM, and 10000 nM, and cultured at 25 ° C. for 48 hours. The photograph and turbidity of each well are shown in FIG.
For the composition of the medium used for the culture, Imamura S, et al. J. Gen. Appl. Microbiol., (2012) Vol. 58, pp. The description of 1-10 was followed.
As shown in FIG. Since cell growth of ellipsisidea is suppressed, It was confirmed that ellipsisidea is sensitive to Torin1, which is an ATP competitive inhibitor of TOR.
[油脂生産能評価]
P.ellipsoideaに終濃度10000nMとなるようにTorin1を加えて25℃48時間培養し、P.ellipsoideaにおける油脂の蓄積を測定した。BODIPYで油脂を染色した結果を図16に示す。
図16に示すように、10000nMのTorin1添加により、油脂の蓄積が観察された。
[Evaluation of oil production capacity]
P. E. lipsoidea was added with Torin 1 to a final concentration of 10000 nM and cultured at 25 ° C. for 48 hours. The accumulation of fats and oils in ellipsiside was measured. The result of dyeing fats and oils with BODIPY is shown in FIG.
As shown in FIG. 16, accumulation of fats and oils was observed by adding 10,000 nM Torin1.
[ATP競合阻害剤による増殖抑制効果2]
6ウェルプレートの各ウェルに約5.0×106個/mLのP.ellipsoideaを加え、終濃度0nM、1nM、10nM、100nM、1000nM、10000nMとなるようにAZD8055を加え、25℃48時間培養した。各ウェルの写真及び濁度を図17に示す。
図17に示すように、AZD8055の用量依存的にP.ellipsoideaの細胞増殖が抑制されていることから、P.ellipsoideaはTORのATP競合阻害剤であるAZD8055に感受性を示すことが確認された。
[Inhibition of growth by ATP competitive inhibitor 2]
Approximately 5.0 × 10 6 cells / mL of P.I. ellipsiside was added, AZD8055 was added to a final concentration of 0 nM, 1 nM, 10 nM, 100 nM, 1000 nM, and 10000 nM, and cultured at 25 ° C. for 48 hours. The photograph and turbidity of each well are shown in FIG.
As shown in FIG. 17, P.P. Since cell growth of ellipsisidea is suppressed, It was confirmed that ellipsisidea is sensitive to AZD8055 which is an ATP competitive inhibitor of TOR.
[油脂生産能評価]
P.ellipsoideaに1000nMのAZD8055を加えて25℃48時間培養し、P.ellipsoideaにおける油脂の蓄積を測定した。BODIPYで油脂を染色した結果を図18に示す。
図18に示すように、終濃度1000nMとなるようにAZD8055を添加することにより、油脂の蓄積が観察された。
[Evaluation of oil production capacity]
P. E. lipsoidea was added with 1000 nM AZD8055 and cultured at 25 ° C. for 48 hours. The accumulation of fats and oils in ellipsiside was measured. The result of dyeing fats and oils with BODIPY is shown in FIG.
As shown in FIG. 18, accumulation of fats and oils was observed by adding AZD8055 to a final concentration of 1000 nM.
≪実施例4≫
[油脂生産能評価]
50mlの培地(Gorman DS,et.al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,. (1965)Vol.54,pp.1665−1669.参照。)を含む試験管を4つ用意し、それぞれを試験管1、試験管2、試験管3、試験管4とした。各培地にC.reinhardtiiをそれぞれ加えた後、蛍光灯で光をあてながら通気条件下、CO2の供給と共に25℃で攪拌することによって培養を開始した。対数増殖期に達したところで、DMSO、終濃度1.0μMのラパマイシン、終濃度1.0μMのTorin1、又は終濃度0.2μMのAZD8055を加え、25℃24時間培養し、C.reinhardtiiにおけるTAGの生産量を、実施例1に記載のガスクロマトグラフィーによる定量方法と同様の方法にて、定量した。
結果を図19に示す。図19に示すように、コントロールとしてDMSOのみを添加して1日間培養した場合と比較して、TOR阻害剤添加して1日培養することによりTAGの生産量が増加することが確認された。
Example 4
[Evaluation of oil production capacity]
Four test tubes containing 50 ml of medium (see Gorman DS, et.al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, (1965) Vol. 54, pp. 1665-1669.) Are prepared. Were designated as test tube 1, test tube 2, test tube 3 and test tube 4. In each medium, C.I. After each reinhardtii was added, the culture was started by stirring at 25 ° C. with CO 2 supply under aeration conditions while applying light with a fluorescent lamp. When the logarithmic growth phase was reached, DMSO, final concentration of 1.0 μM rapamycin, final concentration of 1.0 μM Torin1, or final concentration of 0.2 μM AZD8055 was added and cultured at 25 ° C. for 24 hours. The production amount of TAG in Reinhardtii was quantified by the same method as the quantification method by gas chromatography described in Example 1.
The results are shown in FIG. As shown in FIG. 19, it was confirmed that the production amount of TAG was increased by adding TOR inhibitor and culturing for 1 day as compared with the case of adding DMSO alone and culturing for 1 day as a control.
≪実施例5≫
[油脂生産能評価]
4つの200mL扁平フラスコを準備し、それぞれをフラスコ1、フラスコ2、フラスコ3、フラスコ4とした。各フラスコに窒素十分培地(Imamura S,et.al., J. Gen. Appl. Microbiol., (2012)Vol.58,pp.1−10.参照。)を入れて、P.ellipsoideaをそれぞれの培地に加えた後、蛍光灯で光をあてながら通気条件下、CO2の供給と共に25℃で攪拌することによって培養を開始した。培養4日後に、フラスコ1の培地を新しい窒素十分培地に交換し、フラスコ2の培地を窒素欠乏培地(窒素十分培地の組成のNaNO3を等モル濃度のNaClに置換した組成の培地)に交換し、フラスコ3の培地にDMSOを添加し、フラスコ4の培地に終濃度1μMのAZD8055を加え、更に培養した。
培養4日後以降のフラスコ1〜フラスコ4の培地を経時的にサンプリングして、それぞれ遠心分離し、上澄みを除去した後、P.ellipsoideaの沈殿物を回収した。フラスコ1〜フラスコ4の培地から得られた沈殿物を凍結乾燥後に、その乾燥体の乾燥重量を測定した。
沈殿物を乾燥後、油分分析用TD-NMR(Time Domain Nuclear Magnetic Resonance、時間領域核磁気共鳴)装置を使用して、乾燥重量当たりのTAG重量比率を測定した。標準試料にオリーブ油を使用した。結果を図20に示す。図20に示すように、乾燥重量当たりのTAG重量比率は、窒素欠乏条件よりもAZD8055添加条件の方が優位に大きかった。
Example 5
[Evaluation of oil production capacity]
Four 200 mL flat flasks were prepared, and flask 1, flask 2, flask 3, and flask 4, respectively. Nitrogen-sufficient culture medium (Imamura S, et.al., J. Gen. Appl. Microbiol., (2012) Vol. 58, pp. 1-10.) Is put in each flask. After adding ellipsiside to each medium, the culture was started by stirring at 25 ° C. with CO 2 supply under aeration conditions while illuminating with a fluorescent lamp. After 4 days of culture, the culture medium in flask 1 was replaced with a new nitrogen-sufficient medium, and the medium in flask 2 was replaced with a nitrogen-deficient medium (a medium with a composition in which NaNO 3 having a composition of nitrogen-sufficient medium was replaced with equimolar NaCl). Then, DMSO was added to the medium of flask 3, AZD8055 having a final concentration of 1 μM was added to the medium of flask 4, and further cultured.
The culture medium of flask 1 to flask 4 after 4 days of culture was sampled over time, centrifuged, and the supernatant was removed. The precipitate of ellipsiside was collected. The precipitate obtained from the culture media of flask 1 to flask 4 was freeze-dried, and the dry weight of the dried product was measured.
After drying the precipitate, the TAG weight ratio per dry weight was measured using a TD-NMR (Time Domain Nuclear Magnetic Resonance, time domain nuclear magnetic resonance) apparatus for oil analysis. Olive oil was used as a standard sample. The results are shown in FIG. As shown in FIG. 20, the AZ weight ratio per dry weight was significantly greater under the AZD8055 addition condition than under the nitrogen deficiency condition.
また、培養液1L当たりのTAG重量を算出した結果を図21に示し、単位細胞数当たりのTAG重量を算出した結果を図22に示し、ラボスケールでのTAG生産性を算出した結果を図23に示す。ここで、ラボスケールでのTAG生産性とは、培養液1L当たりのTAG重量を、総培養日数で割った値を示す。
図21〜図23に示すように、どの算出方法においても、AZD8055添加条件が窒素欠乏条件より大きい値を示すことが確認された。
FIG. 21 shows the result of calculating the TAG weight per liter of the culture solution, FIG. 22 shows the result of calculating the TAG weight per unit cell number, and FIG. 23 shows the result of calculating the TAG productivity on the lab scale. Shown in Here, the TAG productivity at the lab scale indicates a value obtained by dividing the TAG weight per 1 L of the culture solution by the total number of culture days.
As shown in FIGS. 21 to 23, it was confirmed that the AZD8055 addition condition was larger than the nitrogen deficiency condition in any calculation method.
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