JP6873992B2 - プログラム死リガンド(pdl1)に対する単一ドメイン抗体およびその誘導体タンパク質 - Google Patents
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Description
特に明記および規定されない限り、使用される用語はすべて当技術分野における通常の意味を有し、それは当業者に明らかになる。参照は、たとえば、標準的なハンドブック、たとえばSambrook et al.「Molecular Cloning:A Laboratory Manual」(2nd Ed.)、vol.1〜3、Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989);Lewin、「Genes IV」、Oxford University Press、New York、(1990)and Roitt et al.「Immunology」(2nd Ed.)、Gower Medical Publishing、London、 New York(1989)ならびにここで引用した一般的な背景技術に得られる。さらに、特に明記されない限り、特別に詳述されていない方法、工程、技術および操作はすべて、当業者に明らかになるようなそれ自体公知の様式で実行することができ、実行された。参照は、たとえば標準的なハンドブック、上記の一般的な背景技術、およびその中のさらなる引用文献に同様に得られる。
この番号付けによると、
・FR1はアミノ酸残基1〜30位を含み、
・CDR1はアミノ酸残基31〜35位を含み、
・FR2はアミノ酸36〜49位を含み、
・CDR2はアミノ酸残基50〜65位を含み、
・FR3はアミノ酸残基66〜94位を含み、
・CDR3はアミノ酸残基95〜102位を含み、
・FR4はアミノ酸残基103〜113位を含む。
VHHドメイン(軽鎖可変ドメインの存在なしに、およびそれとどんな相互作用もなしに抗原に機能的に結合するように天然に「設計されている」)は、単一の、比較的小さい機能的抗原結合構造単位、ドメインまたはポリペプチドとして機能することができる。これにより、VHHドメインは従来通りの4鎖抗体のVHおよびVLドメインと区別され、一般に、VHおよびVLドメインは、それだけでは単一抗原結合タンパク質または免疫グロブリン単一可変ドメインとしての実際の適用に適しておらず、機能的抗原結合単位を得るにはなんらかのまたは別の形態と組み合わせる必要がある(たとえば従来通りの抗体断片、たとえばFab断片;VLドメインと共有結合したVHドメインからなるscFvなど)。
・高い親和性および高い選択性で抗原を結合するのに単一ドメインだけを必要とし、したがって別々のドメインが2つ存在する必要性はなく、これら2つのドメインが正しい空間的立体配座および構成で存在する(すなわち、scFvと同じ特別に設計されたリンカーの使用による)ことを保証する必要もない;
・VHHドメインは、単一遺伝子から発現させることができ、翻訳後の畳み込みまたは修飾を必要としない;
・VHHドメインは、多価および多重特異的形式(形式化された)に容易に操作することができる;
・VHHドメインは高溶解性であり、凝集傾向を有さない;
・VHHドメインは、熱、pH、プロテアーゼおよび他の変性剤または条件に対して非常に安定しており、したがって、冷凍装置を使用せずに調製、貯蔵または輸送されてもよく、運搬費用、時間および環境の節約になる;
・VHHドメインは、生産に必要とする規模でも、調製が容易であり、比較的安価である;
・VHHドメインは、従来通りの4鎖抗体およびその抗原結合断片と比較して比較的小さく(およそ15kDa、または従来通りのIgGより10倍小さい)、したがって組織への(より)高い侵入を示し、従来通りの4鎖抗体およびその抗原結合断片より高い用量で投与することができる;
・VHHドメインは、いわゆる空洞結合特性(特に、従来通りのVHドメインと比較して拡張されたCDR3ループによる)を示すことができ、したがって従来通りの4鎖抗体ならびにその抗原結合断片には接近しにくい標的およびエピトープに接近することもできる。
本発明のPDL1結合分子
第1の側面において、本発明は、PDL1に特異的に結合することができる免疫グロブリン単一可変ドメインを少なくとも1つ含むPDL1結合分子を提供する。いくつかの態様において、前記PDL1結合分子は、PDL1に特異的に結合する免疫グロブリン単一可変ドメインを1つ含む。いくつかの態様において、前記PDL1結合分子は、PDL1に特異的に結合する免疫グロブリン単一可変ドメインを2つ以上含む。
(1)配列番号1に示すCDR1、配列番号2に示すCDR2、配列番号3に示すCDR3(抗体番号10のCDRに対応する);
(2)配列番号4に示すCDR1、配列番号5に示すCDR2、配列番号6に示すCDR3(抗体番号27のCDRに対応する);
(3)配列番号7に示すCDR1、配列番号8に示すCDR2、配列番号9に示すCDR3(抗体番号38のCDRに対応する);
(4)配列番号10に示すCDR1、配列番号11に示すCDR2、配列番号12に示すCDR3(抗体番号56のCDRに対応する);
(5)配列番号13に示すCDR1、配列番号14に示すCDR2、配列番号15に示すCDR3(抗体番号69のCDRに対応する);
(6)配列番号16に示すCDR1、配列番号17に示すCDR2、配列番号18に示すCDR3(抗体番号81のCDRに対応する);
(7)配列番号19に示すCDR1、配列番号20に示すCDR2、配列番号21に示すCDR3(抗体番号87のCDRに対応する);および
(8)配列番号22に示すCDR1、配列番号23に示すCDR2、配列番号24に示すCDR3(抗体番号94のCDRに対応する)
から選択されるCDR1、CDR2およびCDR3を含む。
(a)1×10-7M未満のKDでヒトPDL1に結合する;
(b)PDL1とPD−1との相互作用を遮断する;
(c)PBMCおよび/またはT細胞の活性化を増強する;
(d)腫瘍成長を阻害する。
核酸、ベクターおよび宿主細胞
別の側面において、本発明は、本発明のPDL1結合分子をコードする核酸分子に関する。本発明の核酸は、RNA、DNAまたはcDNAであってもよい。本発明の一態様によると、本発明の核酸は、本質的に単離された形態である。いくつかの特定の態様において、本発明のPDL1結合分子をコードしている核酸分子は、配列番号58〜65のうちいずれか1つの核酸配列を含む。
・本発明のPDL1結合分子の発現を可能にする条件下で本発明の宿主細胞を培養する工程と;
・培養から宿主細胞によって発現されたPDL1結合分子を回収する工程と;
・任意に、本発明のPDL1結合分子をさらに精製および/または修飾する工程と
を一般に含む。
イムノコンジュゲート
別の側面において、本発明の特徴は、治療部分、たとえば細胞毒素、生物活性のあるタンパク質または放射性同位元素放射性毒素にコンジュゲートされているPDL1結合分子に関する。そのようなコンジュゲートを、「イムノコンジュゲート」とここで称する。1つ以上の細胞毒素を含むイムノコンジュゲートは、「免疫毒素」と称される。細胞毒素または細胞毒性薬剤には、細胞に有害な(たとえば、死滅させる)任意の薬剤がある。例には、タキソール、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1−デヒドロテストステロン、糖質コルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロールおよびピューロマイシンならびにその類似体またはホモログがある。
医薬組成物
別の側面において、本発明は、組成物、たとえば、本発明のPDL1結合分子の1つまたは組み合わせを含有し、薬学的に許容可能な担体と一緒に処方された医薬組成物を提供する。そのような組成物は、本発明のPDL1結合分子または本発明のイムノコンジュゲートの1つもしくは組み合わせ(たとえば、異なる2つ以上)を含んでもよい。たとえば、本発明の医薬組成物は、標的抗原上の異なるエピトープに結合する抗体分子の組み合わせを含むことができる。
疾患の防止および処置
別の側面において、本発明は、PDL1関連疾患を防止および/または処置するためのPDL1結合分子、核酸、宿主細胞、イムノコンジュゲートおよび本発明の医薬組成物の使用、ならびに対応する方法を提供する。本発明のPDL1結合分子で防止および/または処置することができるPDL1関連疾患を、以下に詳細に記述する。
がん
本発明のPDL1結合分子によるPDL1の遮断は、患者においてがん性細胞に対する免疫応答を増強することができる。PDL1は、正常なヒト細胞において発現されないが、様々なヒトがんにおいて豊富である(Dong et al.(2002)Nat Med 8:787〜9)。PD−1とPDL1との相互作用は、腫瘍浸潤性リンパ球の低下、T細胞受容体により媒介される増殖の低下、およびがん性細胞による免疫回避をもたらす(Dong et al.(2003)J MoI Med 81:281〜7;Blank et al.(2004)Cancer Immunol.Immunother.[epub];Konishi et al.(2004)Clin.Cancer Res.10:5094〜100)。免疫抑制は、PD−1に対するPDL1の局所相互作用を阻害することによって後退させることができ、PD−1に対するPDL2の相互作用が同様に遮断される場合、効果は相加的である(Iwai et al.(2002)PNAS 99:12293〜7;Brown et al.(2003)J.Immunol.JTO:1257〜66)。本発明のPDL1結合分子を単独で使用して、がん性腫瘍の成長を阻害してもよい。別法として、本発明のPDL1結合分子は、下記の通り他の免疫原性薬、標準的がん処置、または他の抗体と併用して使用されてもよい。
感染性疾患
本発明の他の方法を使用して、特定の毒素または病原体に曝露された患者が処置される。したがって、本発明の別の側面は、対象が感染性疾患を処置されるように、対象に本発明のPDL1結合分子を投与することを含む、対象において感染性疾患を防止または処置する方法を提供する。
自己免疫反応
抗PDL1抗体は、自己免疫反応を惹起および増幅してもよい。したがって、疾患処置のために様々な自己タンパク質と併用して抗PDL1遮断薬を使用して、これら自己タンパク質に対する免疫応答を効率的に生成するためのワクチン接種プロトコルを考案することを考えることができる。
慢性的炎症性疾患
抗PDL1抗体を使用して、疾患、たとえば慢性炎症性疾患、たとえば扁平苔癬、T細胞により媒介される慢性炎症性皮膚粘膜疾患を処置してもよい(Youngnak−Piboonratanakit et al.(2004)Immunol Letters 94:215〜22)。したがって、別の側面において、本発明は、対象に本発明のPDL1結合分子を投与することを含む、T細胞によって慢性炎症性疾患を無効にする方法を提供する。
ワクチンアジュバント
一側面において、本発明は、ワクチンアジュバントとしての本発明のPDL1結合分子の使用を提供する。抗PDL1抗体を使用して、抗PDL1抗体と対象とする抗原(たとえば、ワクチン)の同時投与によって抗原特異的免疫応答を刺激してもよい。
検出
別の側面において、本発明は、本発明のPDL1結合分子とPDL1との複合体形成が可能な条件下で生体サンプルおよび対照サンプルと本発明のPDL1結合分子とを接触させることを含む、生体サンプル中のPDL1の存在および/またはPDL1の発現レベルを検出する方法も提供する。次いで、複合体の形成が検出され、生体サンプルと対照サンプルの間の複合体形成の差異が、サンプル中のPDL1の存在および/またはPDL1の発現レベルを示す。
キット
また、本発明の範囲には、本発明のPDL1結合分子、イムノコンジュゲートまたは医薬組成物および使用のための説明書を含むキットがある。キットは、少なくとも1つの追加の試薬または1つ以上の追加の本発明のPDL1結合分子(たとえば、PDL1内の異なるエピトープに結合する結合分子)をさらに含有することができる。キットは、キットの内容の使用目的を示すラベルを一般に含む。用語ラベルは、キット上に提供されるまたはキットに同梱される、さもなければキットに付随する任意の筆記もしくは記録材料を含む。
以下に、出願当初の特許請求の範囲に記載された発明を付記する。
[1] PDL1に特異的に結合することができ、少なくとも1つの免疫グロブリン単一可変ドメインを含むプログラム死リガンド1(PDL1)結合分子であって、前記免疫グロブリン単一可変ドメインが:
(1)配列番号1に示すCDR1、配列番号2に示すCDR2、配列番号3に示すCDR3
(2)配列番号4に示すCDR1、配列番号5に示すCDR2、配列番号6に示すCDR3
(3)配列番号7に示すCDR1、配列番号8に示すCDR2、配列番号9に示すCDR3
(4)配列番号10に示すCDR1、配列番号11に示すCDR2、配列番号12に示すCDR3
(5)配列番号13に示すCDR1、配列番号14に示すCDR2、配列番号15に示すCDR3
(6)配列番号16に示すCDR1、配列番号17に示すCDR2、配列番号18に示すCDR3
(7)配列番号19に示すCDR1、配列番号20に示すCDR2、配列番号21に示すCDR3
および
(8)配列番号22に示すCDR1、配列番号23に示すCDR2、配列番号24に示すCDR3
から選択されるCDR1、CDR2およびCDR3を含むプログラム死リガンド1(PDL1)結合分子。
[2] 前記免疫グロブリン単一可変ドメインが、VHHである、[1]に記載のPDL1結合分子。
[3] 前記VHHが、ヒト化VHHである、[2]に記載のPDL1結合分子。
[4] 前記VHHが、配列番号25〜32いずれか1つのアミノ酸配列を含む、[2]に記載のPDL1結合分子。
[5] 前記VHHが、配列番号25〜32のいずれか1つと少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらにより好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、[3]に記載のPDL1結合分子。
[6] 前記ヒト化VHHが、配列番号33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、[3]に記載のPDL1結合分子。
[7] [1]から[6]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子の親和性成熟によって得られるPDL1結合分子。
[8] 免疫グロブリンFc領域をさらに含む、[1]から[7]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子。
[9] 前記免疫グロブリンFc領域が、ヒト免疫グロブリンのFc領域、好ましくはヒトIgG1のFc領域である、[8]に記載のPDL1結合分子。
[10] 前記免疫グロブリンFc領域の前記アミノ酸配列が、配列番号38、70および71から選択される、[9]に記載のPDL1結合分子。
[11] 配列番号39〜51および72〜83から選択されるアミノ酸配列を含む、[10]に記載のPDL1結合分子。
[12] 以下の特徴:
(a)1×10 -7 M未満のKDでヒトPD−PDL1に結合する;
(b)PDL1とPD−1との相互作用を遮断する;
(c)PBMCおよび/またはT細胞の活性化を増強する;
(d)腫瘍成長を阻害する
のうち少なくとも1つを有する、[1]から[11]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子。
[13] 1×10 -7 M未満、好ましくは1×10 -8 M未満、より好ましくは1×10 -9 M未満、より好ましくは1×10 -10 M未満、さらにより好ましくは1×10 -11 M未満のKDでPDL1に結合する、[1]から[11]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子。
[14] [1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子をコードしている核酸分子。
[15] 発現調節エレメントに作動的に連結されている[14]に記載の核酸分子を含む、発現ベクター。
[16] [14]に記載の核酸分子を含む、または[15]に記載の発現ベクターで形質転換されており、前記PDL1結合分子を発現することができる宿主細胞。
[17] a)前記PDL1結合分子の発現を可能にする条件下で[16]に記載の宿主細胞を培養することと;
b)工程a)の前記培養から前記宿主細胞によって発現される前記PDL1結合分子を回収することと;
c)任意に、工程b)から得られる前記PDL1結合分子をさらに精製および/または修飾することと
を含む、[1]から[13]のいずれか一項に記載のPDL1結合分子を産生する方法。
[18] 治療的部分とコンジュゲートされた[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子を含むイムノコンジュゲート。
[19] 前記治療的部分が、細胞毒素、生物活性のあるタンパク質または放射性同位元素を含む、[18]に記載のイムノコンジュゲート。
[20] [1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子または[18]もしくは[19]に記載のイムノコンジュゲート、および薬学的に許容可能な担体を含む医薬組成物。
[21] 対象に[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子または[18]から[19]のいずれか一つに記載のイムノコンジュゲートまたは[20]に記載の医薬組成物の有効量を投与することを含む、対象においてがんを防止および/または処置する方法。
[22] 前記対象に追加の抗腫瘍治療的手段を投与することをさらに含む、[21]に記載の方法。
[23] 前記追加の抗腫瘍治療的手段が、化学療法、放射線療法または他の腫瘍特異抗原に対する抗体を含む、[22]に記載の方法。
[24] 他の腫瘍特異抗原に対する前記抗体が、抗EGFR抗体、抗EGFRバリアント抗体、抗VEGFa抗体、抗HER2抗体、または抗CMET抗体を含む、[23]に記載の方法。
[25] 他の腫瘍特異抗原に対する前記抗体が、モノクローナル抗体である、[24]に記載の方法。
[26] 前記がんが、肺がん、卵巣がん、大腸がん、直腸がん、黒色腫、腎臓がん、膀胱がん、乳がん、肝臓がん、リンパ腫、血液悪性腫瘍、頭頸部がん、膠腫、胃がん、鼻咽頭がん、喉頭がん、子宮頸がん、子宮体がん、骨肉腫からなる群から選択される、[24]に記載の方法。
[27] 対象に[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子または[18]から[19]のいずれか一つに記載のイムノコンジュゲートまたは[20]に記載の医薬組成物の有効量を投与することを含む、対象において感染性疾患を防止および/または処置する方法。
[28] 前記感染性疾患が、HIV、肝炎ウイルス、インフルエンザウイルス、ヘルペスウイルス、ジアルジア、プラスモディウム、リーシュマニア、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)からなる群から選択される病原体によって引き起こされる、[27]に記載方法。
[29] 対象に[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子または[18]もしくは[19]に記載のイムノコンジュゲートまたは[20]に記載の医薬組成物の有効量を投与することを含む、対象において慢性炎症性疾患を防止および/または処置する方法。
[30] 前記慢性炎症性疾患が、扁平苔癬またはT細胞により媒介される慢性炎症性皮膚粘膜疾患である、[29]に記載の方法。
[31] がん、感染性疾患もしくは慢性炎症性疾患を防止および/または処置するための医薬の調製における、[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子または[18]もしくは[19]に記載のイムノコンジュゲートまたは[20]に記載の医薬組成物の使用。
[32] a)[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子とPDL1との複合体の形成が可能な条件下で生体サンプルおよび対照サンプルと[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子とを接触させることと、
b)前記複合体の前記形成を検出することと
を含み、前記生体サンプルと前記対照サンプルの間の前記複合体形成の差異が、前記サンプル中のPDL1の存在および/またはPDL1の発現レベルを示す、生体サンプル中のPDL1の存在および/またはPDL1の発現レベルを検出するための方法。
[33] PDL1関連疾患を診断するためのキットの調製における[1]から[13]のいずれか一つに記載のPDL1結合分子の使用であって、疾患が、高PDL1発現に関連する腫瘍または感染性疾患である、使用。
本発明は、以下の例によってさらに例示されるが、本発明の範囲は、特定の例に決して限定されるべきでない。
1.1 ライブラリ構築
免疫化用のPDL1−Fc融合タンパク質(配列番号52)をCHO細胞によって発現させ(pCDNA4、Invitrogen、Cat V86220)、プロテインA親和性クロマトグラフィーによって精製した。一頭のフタコブラクダ(Camelus bactrianus)を、免疫化ために選んだ。4回の免疫化後に、リンパ球をラクダ末梢血100mlから単離し、トータルRNAをRNA Extractionキット(QIAGEN)で抽出した。抽出したRNAを、Super−Script III FIRST STRANDSUPERMIXキットを使用して説明書にしたがってcDNAに逆転写した。
第1PCR:
上流プライマー: GTCCTGGCTGCTCTTCTACAAGGC(配列番号66);
下流プライマー:GGTACGTGCTGTTGAACTGTTCC(配列番号67)。
鋳型として第1PCRからのPCR産物、
上流プライマー:GATGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGRGGAGG(配列番号68);
下流プライマー:GGACTAGTGCGGCCGCTGGAGACGGTGACCTGGGT(配列番号69)。
1.2 PDL1に対する重鎖単一ドメイン抗体のパニング
マルチウェルプレートを、PDL1−Fc融合タンパク質10μg/ウェルで、4℃で終夜コーティングした。次の日、1%スキムミルクで、室温で2時間ブロッキングした後、ファージ100μl(8×1011tfu、1.1において構築したラクダ重鎖単一ドメイン抗体のファージディスプレイライブラリ由来)を添加し、室温で1時間置いた。次いで結合していないファージを、PBST(PBS中に0.05% tween20)で5回洗浄することによって除去した。PDL1に特異的に結合するファージを、トリエチルアンモニウム(100mM)で解離させ、それを使用して対数期の大腸菌TG1に感染させ、ファージを産生させ、次回のスクリーニング用として次いで精製した。同じスクリーニングを、3〜4回繰り返した。それによって陽性クローンを富化し、ファージディスプレイ技術による抗体ライブラリからPDL1特異的抗体を選択する目的を達成した。
1.3 ファージ酵素結合イムノアッセイ(ELISA)による個々の陽性クローンの特異的選択
3〜4回のパニングした後に得られたPDL1結合陽性ファージを使用して空の大腸菌に感染させ、平板培養した。96個の単一コロニーを無作為に選択して培養し、ファージを産生させ、それぞれ精製した。プレートを、PDL1−Fc融合タンパク質で、4℃で終夜コーティングし;得られたサンプルファージ(対照として空のファージ)を添加し、室温で1時間インキュベートした。洗浄後に1次抗体、マウス抗HAタグ抗体(Beijing Kangwei Shiji Biotech.Ltd.)を添加し、反応のために室温で1時間インキュベートした。洗浄後に2次抗体、ヤギ抗マウスアルカリ性ホスファターゼ標識抗体(Amyject Scientific Ltd.)を添加し、反応のために室温で1時間インキュベートした。洗浄後にアルカリホスファターゼ発色溶液を添加し、吸収値を405nm波長で読み取った。サンプルウェルのODが、対照ウェルのODより3倍高い場合、サンプルを陽性と決定する。プラスミド抽出およびその後の配列決定用として陽性のウェル内の細菌を、100μg/mlアンピシリンで補充したLB液体培地に移し、培養した。
2.1 大腸菌における重鎖単一ドメイン抗体の発現およびその精製
配列決定分析によって得られた重鎖単一ドメイン抗体のコード配列21個を、発現ベクターPET32b(Novagen、製品番号69016−3)にサブクローニングし、正しい組換えプラスミドを、発現宿主株BL1(DE3)(Tiangen Biotech、CB105−02)に形質転換し、100μg/mlアンピシリンを含有するLB固体培地上で、37℃で終夜平板培養した。単一コロニーを植菌し、終夜培養し、次の日振盪培養による37℃での拡大に移した。培養がOD値0.6〜1に達したら、0.5mM IPTGを添加して、振盪培養で、28℃で終夜誘導した。次の日、細菌を遠心分離によって採取し、溶解して、抗体粗抽出物を得た。ニッケルイオン親和性クロマトグラフィーを使用して、抗体タンパク質を次いで精製し、純度90%以上の抗体タンパク質を得た。
2.2 ヒトPDL1タンパク質に対する候補PDL1重鎖単一ドメイン抗体の特異的結合
プレートを、PDL1−Fc融合タンパク質で、4℃で終夜コーティングし、例2.1で得た重鎖単一ドメイン抗体(対照は、PDL1−Fcタンパク質に結合しない単一ドメイン抗体であった)100ngを各ウェルに添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、1次抗体抗Hisタグ抗体(Beijing Kangwei Century Biotechnology Co.、Ltd.社から購入した)を添加し、室温で1時間反応させた。洗浄後に、ヤギ抗マウスホースラディッシュペルオキシダーゼ標識2次抗体(Yiqiao Shenzhou、Cat:SSA007200)を添加し、室温で1時間反応させた。洗浄後に、発色剤を添加し、吸光度を405nmで読み取った。
マウスPDL1−Fcタンパク質(配列番号53)を、HEK293細胞における発現によって得た(pCDNA4、Invitrogen、Cat V86220)。
2.4 競合ELISAによるPD−1とPDL1との相互作用に対するPDL1重鎖単一ドメイン抗体の遮断効果の調査
PDL1−Fcタンパク質およびPD1−Fcタンパク質(配列番号54)を、HEK293細胞における発現によって得た(pCDNA4、Invitrogen、Cat V86220)。ビオチン化タンパク質PD1−Fc−ビオチンを、Thermo Biotinlytionキットを使用して得た。
膜上でヒトPDL1タンパク質を一過性に発現しているHEK293細胞(293−PDL1細胞)を、ヒトHEK293細胞にヒトPDL1完全長遺伝子を保有しているプラスミド(pCDNA4、Invitrogen、Cat V86220)を一過性トランスフェクションすることによって得た。
2.6 PDL1抗原タンパク質に対するPDL1重鎖単一ドメイン抗体の結合曲線
プレートを、得られたPDL1重鎖単一ドメイン抗体0.5μg/ウェルで、4℃で終夜コーティングし、その後PDL1−Fc融合タンパク質の勾配希釈系列を添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、ヤギ抗ヒトIgG−Fcホースラディッシュペルオキシダーゼ標識抗体を添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、ホースラディッシュペルオキシダーゼ発色現像溶液を添加し、波長405nmで吸光度を読み取った。データ処理およびマッピング分析にSotfMax Pro v5.4を使用して、4−パラメータフィッティングによってPDL1に対する抗体の結合曲線およびEC50値(抗体番号56および27について、約5ng/ml)を得た。結果を、図2に示す。
2.7 PD−1とPDL1との相互作用に対するPDL1重鎖単一ドメイン抗体の遮断曲線
プレートを、PDL1−Fc融合タンパク質0.5μg/ウェルで、4℃で終夜コーティングし、その後、ウェル当たり、PDL1を遮断する100μlの単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の勾配希釈系列(100μg/mL PD1−Fc−ビオチンを含有する)を100μl添加し、室温で1時間反応させておいた。SA−HRP(Sigmaから購入した)を添加し、室温で1時間反応させておいた。発色溶液を添加後に、吸光度を波長405nmで読み取った。
ヒト化は、タンパク質表面のアミノ酸ヒト化(表面再建)の方法およびVHHヒト化のための普遍的フレームワーク移植方法(普遍的フレームワークへのCDR移植)によって実行される。
4.1 PDL1単一ドメイン抗体のFc融合タンパク質の調製
ヒトIgGl−Fc領域のアミノ酸配列(配列番号38)を、ヒト免疫グロブリンγ1(IgG1)の定常領域アミノ酸配列に基づいて、タンパク質データベースUniprot(P01857)から得た。ヒトIgG1−Fcをコードしている核酸断片を、逆転写PCRによってヒトPBMCトータルRNAから得、上記の例で得たPDL1単一ドメイン抗体およびFcの融合タンパク質をコードしている核酸断片を、オーバーラッピングPCRによって得、次いでベクターpCDNA4(Invitrogen、Cat V86220)にサブクローニングした。ADCC活性またはCDC活性を部位特異的突然変異誘発によって除去したFc領域配列、たとえば配列番号70または71を使用してもよい。
4.2 MedImmune LLCおよびRoche製PDL1抗体の調製
MedImmune LLC、Inc.製の抗PDL1抗体の遺伝子を、米国特許出願公開第20130034559号の2.14H9の方法によってクローニングし、ベクターpCDNA4にクローニングした。TM004は、Rocheの抗PDL1抗体である。抗体遺伝子を、米国特許出願公開第20130045201号A1のYW243.55.S70.hIgGにしたがってクローニングし、ベクターpCDNA4にクローニングした。
4.3 PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質と既知の2つのPDL1抗体との発現の比較
同じ発現系および一過性トランスフェクション条件を使用した場合、本発明のPDL1単一ドメイン抗体のFc融合タンパク質の発現レベルは、200mg/Lより高かったが、抗体2.41H90Pの発現レベルは、約80mg/L、抗体243.55の発現レベルは、約40mg/Lであった。この結果は、本発明のPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質が、構造的により安定であり、他の2つの公知のPDL1抗体より高い発現レベルをもたらし得ることを示す。
5.1 PDL1に対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の結合能力(ELISAによる)
PDL1−Chisタンパク質(配列番号55)を、HEK293における一過性の発現およびニッケルカラムアフィニティークロマトグラフィーによる精製によって得た。プレートを、得られたPDL1−Chisタンパク質0.5μg/ウェルで、4℃で終夜コーティングした。次いで、上記の例で得たPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の勾配希釈系列を添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、ヤギ抗ヒトIgG−Fcホースラディッシュペルオキシダーゼ標識抗体を添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、発色剤を添加し、吸光度を405nmで読み取った。データ処理およびマッピング分析にSotfMax Pro v5.4を使用して、4−パラメータフィッティングによってPDL1に対する抗体の結合曲線およびEC50値を得(すべての試験抗体のEC50値約150ng/mL)、それによりPDL1に対する親和性を反映させた。
5.2 PDL1に対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の結合能力の同定(SPR法)、および公知の抗体との比較
上記の例で得た組換えヒトPDL1に対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の結合動態を、BIAcore X100機器を使用して表面プラスモン共鳴法(SRP)によって測定した。組換えヒトPDL1−Fcを、CM5バイオセンサーチップに直接コーティングして、およそ1000反応単位(RU)を得た。動力学的測定の場合、抗体をHBS−EP+1×緩衝液(GE、cat#BR−1006−69)に段階希釈し(1.37〜1000nm)、25℃で120秒間注射し、解離時間30分間で、10mMグリシン−HCl(pH2.0)で120秒間再生した。結合速度(kon)および解離速度(koff)を、単純な1対1のラングミュア結合モデルを使用して算出した(BIAcore Evaluation Software バージョン3.2)。平衡解離定数(kD)は、koff/kon比として算出される。
プレートを、PDL1−Fc融合タンパク質0.5μg/ウェルで、4℃で終夜コーティングし、その後上記の例で得たPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の勾配希釈系列(100μg/mL PD1−Fc−ビオチンを含有する)をウェル当たり100μlで添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、SA−HRP(Sigmaから購入した)を添加し、室温で1時間反応させておいた。洗浄後に、発色剤を添加し、吸光度を405nmで読み取った。
5.4 PDL1−CD80相互作用に対するPDL1単一ドメインFc融合タンパク質の遮断効果(競合ELISAによる)
CD80−Fcタンパク質(配列番号56)を、HEK293細胞から得た。ビオチン化タンパク質CD80−Fc−ビオチンを、Thermo Biotinlytionキットを使用して得た。
5.5 PDL1−PD1相互作用に対するPDL1単一ドメインFc融合タンパク質の遮断効果(FACSによる)
ヒトHEK293細胞は、完全長ヒトPDL1遺伝子を含有するプラスミドの一過性トランスフェクションにより膜上にサルPDL1タンパク質を一過性に発現する。
5.6 PDL1タンパク質に対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の結合特異性
ヒトHEK293細胞は、全長ヒトB7ファミリータンパク質遺伝子を保有するプラスミド(pCDNA4、Invitrogen、Cat V86220)の一過性トランスフェクションにより、膜上にヒトPDL1タンパク質を一過性に発現する。膜上で発現されるB7ファミリータンパク質のレベルを緑色蛍光強度によって調べることができるように、このプラスミドでは、標的タンパク質のC末端をEGFPタンパク質に融合することもできる。構築された一過性トランスフェクトした細胞株は、293−PDL1−EGFP、293−PDL2−EGFP、293−B7H3−EGFPおよび293−B7H3−EGFPを含む。
5.7 サルPDL1タンパク質に対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の結合
ヒトHEK293細胞は、サルPDL1遺伝子の完全長を含有するプラスミドの一過性トランスフェクションによりサルPDL1タンパク質(配列番号57)を一過性に発現する。プラスミドは、C末端にEGFPタンパク質を融合させた標的タンパク質も可能にし、そのプラスミドは、サルPDL1タンパク質膜発現レベルを緑色蛍光強度によって調査できることを可能にする。
5.8 PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質は、患者の組織切片上のPDL1陽性細胞集団を効果的に同定することができる
PDL1陽性肺がん患者の腫瘍組織切片を、1次抗体である5μg/mL hu56V2−Fc抗体で終夜染色し、ヤギ抗ヒトHRP標識抗体(Perkin−Elmer、Cat:NEF802001EA)とインキュベートし、次いで可視化した。
5.9 PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質によるPBMCの活性化
末梢血単核細胞(PBMC)を、ヒトリンパ球用の単離溶液を使用する密度勾配遠心分離によって健康なドナーの末梢血から単離した(Tianjin Hao Yang)。
5.10 樹状細胞−T細胞混合リンパ反応におけるPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質によるCD4+T細胞の活性化およびMedImmune LLC抗PDL1抗体との比較
末梢血単核細胞(PBMC)を、ヒトリンパ球用の単離溶液を使用する密度勾配遠心分離によって健康なドナー由来の末梢血の白血球から単離した(Tianjin Hao Yang)。次いでそれらを、無血清RPMI1640培地と1〜2時間インキュベートして非接着細胞を除去し、細胞を、10%FBS、10ng/ml GM−CSFおよび20ng/mL IL−4を含有するRPMI中で培養した。5〜6日間の培養後に、10ng/ml TNF−αを添加し、24時間インキュベートして成熟した樹状細胞を得た。
5.11 PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質によるJurkat/Raji−PDL1混合培養系におけるT細胞のIL−2分泌の刺激、およびMedImmune LLC抗PDL1抗体との比較
T細胞活性化系、Jurkat/Raji−PDL1共培養系を構築して、T細胞活性化におけるPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質による効果を試験し、その効果を、MedImmune LLC抗PDL1抗体と比較した。
5.12 FcRnに対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の親和性
ビオチン化PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質hu56Vl−Fc、hu56V2−Fc、hu56Vl−Fcm1およびhu56V2−Fcm1を、10μg/mlに希釈し、SAバイオセンサーに固定した。ヒトFcRnタンパク質(RnD Systems Cat.No.8639−FC)を、200nM、100nM、50nM、25nM、12.5nMに希釈した。相互作用を、Fortebio Corporation製Octet K2を使用して固定化100秒間、乾燥結合60秒間、解離30秒間で検出した。
PBMCを、エフェクター細胞として8×105個細胞/ウェルの細胞数で300IU/ml IL−2により24時間活性化し;ヒトPDL1タンパク質を安定して発現するRaji−PDL1を、2×105個細胞/ウェルの細胞数で標的細胞として使用し;様々な濃度のhu56V1−Fcm1または陽性対照であるリツキサンタンパク質を添加し、37℃で6時間インキュベーションした後、各濃度でのADCC活性(%)を、CytoTox96(登録商標)非放射性細胞毒性検出キットを使用して測定した。
5.14 腫瘍成長に対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の阻害活性
免疫不全NOD/SCID(非肥満性糖尿病患者/重症複合型免疫不全症)マウスを使用して、マウスPDL1を認識できないPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質、hu56V2−Fcのin vivo活性を研究した。本研究の目的は、NOD/SCIDマウスが、ヒトPDL1発現黒色腫細胞株A375(ATCC登録番号CRL−1619(商標))およびヒト末梢血単核細胞(PBMC)で皮下移植された実験によって達成された。注射前にA375とPBMCを5:1の比で混合し、全容量100μlで皮下注射した(A375 5000000個およびPBMC 1000000個を含有する)。抗体を0.3mg/kgの用量で、腫瘍接種24時間後、次いで週1回腹膜内投与し;PBSを、陰性対照として与えた。実験群当たり4〜6匹のマウス。腫瘍形成を週2回観察し、腫瘍の長短径をノギスで測定した。腫瘍体積を算出し、腫瘍成長曲線を記入した(図13を参照のこと)。0.3mg/kgの用量で抗体hu56V2−Fcが、腫瘍成長を有意に阻害したことが分かる。
5.15 異なる回数投与されたPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の腫瘍成長に対する阻害活性
NOD−SCIDマウスA375/ヒトPBMC異種移植片腫瘍モデルを使用した。A375とヒトPBMCを4:1の比でNOD−SCIDマウスに皮下接種し、hu56V1−Fcm1(0.3mg/kg)を4時間後に腹膜内注射し、その後3日毎に1回腹腔内注射した。最終的な投与回数は、1、2、3、4回であった。腫瘍形成を3日毎に観察し、腫瘍の長径と短径をノギスで測定して、初回投与から33日目までの腫瘍体積を算出した。腫瘍成長曲線を記入した(図18)。結果は、研究期間内の異なる回数の投与すべてで、NOD−SCIDマウスのA375/ヒトPBMC同種異種移植片に対して有意な抗腫瘍効果が有ることを示した。
5.16 PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質による腫瘍成長の阻害およびMedImmune LLC抗PDL1抗体との比較
本研究の目的は、NOD/SCIDマウスが、ヒトPDL1発現黒色腫細胞株A375(ATCC登録番号CRL−1619(商標))およびヒト末梢血単核細胞(PBMC)で皮下移植された実験によって達成された。注射前にA375とPBMCを5:1の比で、全容量100μlで混合した(A375 5000000個およびPBMC 1000000個を含有する)。抗体を、1mg/kgの用量で腫瘍接種24時間後に腹膜内投与し、次いで週1回投与した。処置群は、hu56V2−Fc(hu56と表示した)およびMedImmune LLC抗PDL1抗体群(2.41と表示した)、陰性対照としてPBSを含んだ。実験群当たり4〜6匹のマウス。腫瘍形成を週2回観察し、腫瘍の長径と短径をノギスで測定した。腫瘍体積を算出し、腫瘍成長曲線を記入した(図14Aを参照のこと)。MedImmune LLCの抗PDL1抗体は、本モデルにおいて基本的に効果がなく、35日目に腫瘍体積は陰性対照群を上回り、したがって投与および腫瘍体積測定を中止した。このモデルの下でA375腫瘍成長阻害における1mg/kg用量のhu56V2−Fcの効果は、MedImmune LLCの抗PDL1抗体2.41H90Pより有意に優れていることが分かる。
6.1 アルカリおよび酸化的ストレスに対するPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の抵抗性
500mM重炭酸アンモニウムをアルカリ破壊剤として使用し、融合タンパク質を37℃で38時間処理した。1%過酸化水素を酸化剤として使用し、室温で8時間処理した。
6.2 高濃度でのPDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質の安定性
PDL1単一ドメイン抗体Fc融合タンパク質を、UF/DFによって濃縮し、PBS緩衝液に交換した。そして、その凝集体形成傾向を、SE−HPLCによって調べた。
Sequence listing
>SEQ ID NO:1 antibody No. 10 CDR1
SYCMG
>SEQ ID NO:2 antibody No. 10 CDR2
AIDSDGTTKYADSMKG
>SEQ ID NO:3 antibody No. 10 CDR3
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>SEQ ID NO:4 antibody No. 27 CDR1
RRCMA
>SEQ ID NO:5 antibody No. 27 CDR2
NILTTTGNTYLADSVKG
>SEQ ID NO:6 antibody No. 27 CDR3
DSFHDPTCTVVASSGAFQY
>SEQ ID NO:7 antibody No. 38 CDR1
RRCMG
>SEQ ID NO:8 antibody No. 38 CDR2
NITGTGNTYLADSVKG
>SEQ ID NO:9 antibody No. 38 CDR3
DSFPTCTVVASSGAFQY
>SEQ ID NO:10 antibody No. 56 CDR1
RRCMA
>SEQ ID NO:11 antibody No. 56 CDR2
KLLTTSGSTYLADSVKG
>SEQ ID NO:12 antibody No. 56 CDR3
DSFEDPTCTLVTSSGAFQY
>SEQ ID NO:13 antibody No. 69 CDR1
SYCMA
>SEQ ID NO:14 antibody No. 69 CDR2
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>SEQ ID NO:15 antibody No. 69 CDR3
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>SEQ ID NO:16 antibody No. 81 CDR1
VRCMA
>SEQ ID NO:17 antibody No. 81 CDR2
NILTTTISTYLADSVKG
>SEQ ID NO:18 antibody No. 81 CDR3
DSFGYPTCPGPASSGAFQY
>SEQ ID NO:19 antibody No. 87 CDR1
SCGMG
>SEQ ID NO:20 antibody No. 87 CDR2
TISSDGTTSYADSVKG
>SEQ ID NO:21 antibody No. 87 CDR3
DCPPIPEFTSCSGGYCLSGDY
>SEQ ID NO:22 antibody No. 94 CDR1
SYCMG
>SEQ ID NO:23 antibody No. 94 CDR2
TIDSDGTTRYVDSVKG
>SEQ ID NO:24 antibody No. 94 CDR3
RLNCPGPVDWVPMFPY
>SEQ ID NO:25 antibody No. 10
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>SEQ ID NO:26 antibody No. 27
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>SEQ ID NO:27 antibody No. 38
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>SEQ ID NO:28 antibody No. 56
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>SEQ ID NO:29 antibody No. 69
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>SEQ ID NO:30 antibody No. 81
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>SEQ ID NO:31 antibody No. 87
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>SEQ ID NO:32 antibody No. 94
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>SEQ ID NO:33 Hu56V1
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>SEQ ID NO:36 Hu56V4
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>SEQ ID NO:37 Hu56V5
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>SEQ ID NO:39 10-Fc
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>SEQ ID NO:40 27-Fc
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>SEQ ID NO:41 38-Fc
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>SEQ ID NO:42 56-Fc
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>SEQ ID NO:44 81-Fc
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>SEQ ID NO:45 87-Fc
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>SEQ ID NO:48 Hu56V2-Fc
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>SEQ ID NO:49 Hu56V3-Fc
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>SEQ ID NO:51 Hu56V5-Fc
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>SEQ ID NO:53 mice PDL1-Fc
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>SEQ ID NO:54 Human PD1-Fc
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>SEQ ID NO:55 PDL1-Chis
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>SEQ ID NO:56 CD80-Chis
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>SEQ ID NO:57 monkey PDL1
FTVTVPKDLYVVEYGSNMTIECKFPVEKQLDLTSLIVYWEMEDKNIIQFVHGEEDLKVQHSNYRQRAQLLKDQLSLGNAALRITDVKLQDAGVYRCMISYGGADYKRITVKVNAPYNKINQRILVVDPVTSEHELTCQAEGYPKAEVIWTSSDHQVLSGKTTTTNSKREEKLLNVTSTLRINTTANEIFYCIFRRLDPEENHTAELVIPELPLALPPNERTHLVILGAIFLLLGVALTFIFYLRKGRMMDMKKSGIRVTNSKKQRDTQLEET
>SEQ ID NO:58 10
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>SEQ ID NO:59 27
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGAGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAACATCAGCAGTAGGCGATGTATGGCCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGAGCGCGAAAGAGTCGCGAACATTCTAACTACTACTGGTAACACATACTTGGCCGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCAAAACAACGCCAAGAGCACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGATTCTTTCCATGATCCGACTTGTACGGTGGTAGCTAGTTCGGGGGCCTTTCAGTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID NO:60 38
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGAGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGTATCTGGTTTCATCAGCAGTAGGCGATGTATGGGCTGGTTCCGACAGGCTCCAGGGAAGGAGCGCGTGGGGGTCGCGAACATTACTGGTACTGGTAACACATACTTGGCCGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCAAAACAACGCCAAGAGCACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGATTCTTTCCCGACTTGTACGGTGGTAGCTAGTTCGGGGGCCTTTCAGTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID NO:61 56
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>SEQ ID NO:62 69
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGAGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGTTCAACGAAACATCAGCAGTAGCTACTGTATGGCCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGCAGCGCGAAAGAGTCGATAAGATTCTAACTACTCCAGGTAACACATACTTGGCCGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCAAAACAACGCCAAGAGCACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGATTCTTTCCAAAAGCCGACTTGTACGGTGGTAGCTtcttggccaGCCTTTCAGTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID NO:63 81
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAACATCATTCGTGTGCGATGTATGGCCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGAGCGCGAAAGAGGCCCGAACATTCTAACTACTACTATTAGCACATACTTGGCCGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCAAAACAACGCCAAGAGCACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGATTCTTTCGGTTATCCGACTTGCCCCGGACCAGCTAGTTCGGGGGCCTTTCAGTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID NO:64 87
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATACATCTTCAGTAGCTGCGGAATGGGCTGGTACCGCCAGGCTCCAGGGAAGGAGCGCGAGTTGGTCTCAACTATTAGTAGTGATGGTACCACAAGCTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCAAGACAATGCCAAGAACACGCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAAACTGAGGACACGGCCGTGTATTACTGTGTGGCAGATTGTCCACCCATACCGGAATTTACAAGTTGTAGTGGTGGTTACTGCTTGAGTGGCGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID NO:65 94
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTCTAAATATTTTTAGTAGCTACTGTATGGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGCAGCGCGTGGGGGTCGCGACTATTGATAGTGATGGTACTACAAGATACGTAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAAAGACAACGCCAAGAACACTCTAGATCTCCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCACGTTTGAACTGCCCCGGGCCAGTTGATTGGGTCCCGATGTTTCCTTACAGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID NO:66
GTCCTGGCTGCTCTTCTACAAGGC
>SEQ ID NO:67
GGTACGTGCTGTTGAACTGTTCC
>SEQ ID NO:68
GATGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGRGGAGG
>SEQ ID NO:69
GGACTAGTGCGGCCGCTGGAGACGGTGACCTGGGT
> SEQ ID NO:70 mutant Fc IgG1-Fc-m1
EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAGIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:71 mutant Fc IgG1-Fc-m2
EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:72 56-Fc-m2
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKMSSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISQNNAKSTVYLQMNSLKPEDTAMYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTQVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:73 Hu56V1-Fc-m2
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKMSSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:74 Hu56V2-Fc-m2
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:75 Hu56V3-Fc-m2
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKMSSRRCMAWFRQAPGKGLERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:76 Hu56V4-Fc-m2
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> SEQ ID NO:77 Hu56V5-Fc-m2
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKMSSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:78 56-Fc-m1
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKMSSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISQNNAKSTVYLQMNSLKPEDTAMYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTQVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAGIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:79 Hu56V1-Fc-m1
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>SEQ ID NO:80 Hu56V2-Fc-m1
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAGIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:81 Hu56V3-Fc-m1
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> SEQ ID NO:82 Hu56V4-Fc-m1
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRRCMAWFRQAPGKGLERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAGIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
> SEQ ID NO:83 Hu56V5-Fc-m1
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKMSSRRCMAWFRQAPGKERERVAKLLTTSGSTYLADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCAADSFEDPTCTLVTSSGAFQYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAGIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
>SEQ ID NO:84 human PDL1-muFc
FTVTVPKDLYVVEYGSNMTIECKFPVEKQLDLAALIVYWEMEDKNIIQFVHGEEDLKVQHSSYRQRARLLKDQLSLGNAALQITDVKLQDAGVYRCMISYGGADYKRITVKVNAPYNKINQRILVVDPVTSEHELTCQAEGYPKAEVIWTSSDHQVLSGKTTTTNSKREEKLFNVTSTLRINTTTNEIFYCTFRRLDPEENHTAELVIPELPLAHPPNERTDIEGRMDPKSSDKTHTCPPCPAPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMNTNGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK
>SEQ ID NO:85 Human PD1-muFc
PGWFLDSPDRPWNPPTFSPALLVVTEGDNATFTCSFSNTSESFVLNWYRMSPSNQTDKLAAFPEDRSQPGQDCRFRVTQLPNGRDFHMSVVRARRNDSGTYLCGAISLAPKAQIKESLRAELRVTERRAEVPTAHPSPSPRPAGQFQIEGRMDPKSSDKTHTCPPCPAPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMNTNGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK
Claims (40)
- PDL1に特異的に結合することができ、少なくとも1つの免疫グロブリン単一可変ドメインを含むプログラム死リガンド1(PDL1)結合分子であって、前記免疫グロブリン単一可変ドメインが:
(1)配列番号1に示すCDR1、配列番号2に示すCDR2、配列番号3に示すCDR3
(2)配列番号4に示すCDR1、配列番号5に示すCDR2、配列番号6に示すCDR3
(3)配列番号10に示すCDR1、配列番号11に示すCDR2、配列番号12に示すCDR3
(4)配列番号16に示すCDR1、配列番号17に示すCDR2、配列番号18に示すCDR3
および
(5)配列番号19に示すCDR1、配列番号20に示すCDR2、配列番号21に示すCDR3
から選択されるCDR1、CDR2およびCDR3を含むプログラム死リガンド1(PDL1)結合分子。 - 前記免疫グロブリン単一可変ドメインが、VHHである、請求項1に記載のPDL1結合分子。
- 前記VHHが、ヒト化VHHである、請求項2に記載のPDL1結合分子。
- 前記VHHが、配列番号25〜32のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のPDL1結合分子。
- 前記VHHが、配列番号25〜32のいずれか1つと少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のPDL1結合分子。
- 前記VHHが、配列番号25〜32のいずれか1つと少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のPDL1結合分子。
- 前記VHHが、配列番号25〜32のいずれか1つと少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のPDL1結合分子。
- 前記VHHが、配列番号25〜32のいずれか1つと少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のPDL1結合分子。
- 前記ヒト化VHHが、配列番号33〜37のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項3に記載のPDL1結合分子。
- 免疫グロブリンFc領域をさらに含む、請求項1から9のいずれか一項に記載のPDL1結合分子。
- 前記免疫グロブリンFc領域が、ヒト免疫グロブリンのFc領域である、請求項10に記載のPDL1結合分子。
- 前記免疫グロブリンFc領域が、ヒトIgG1のFc領域である、請求項10に記載のPDL1結合分子。
- 前記免疫グロブリンFc領域の前記アミノ酸配列が、配列番号38、70および71から選択される、請求項10に記載のPDL1結合分子。
- 配列番号39〜41および43〜46から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項13に記載のPDL1結合分子。
- 以下の特徴:
(a)1×10−7M未満のKDでヒトPDL1に結合する;
(b)PDL1とPD−1との相互作用を遮断する;
(c)PBMCおよび/またはT細胞の活性化を増強する;
(d)腫瘍成長を阻害する
のうち少なくとも1つを有する、請求項1から14のいずれか一項に記載のPDL1結合分子。 - 1×10−8M未満のKDでPDL1に結合する、請求項1から15のいずれか一項に記載のPDL1結合分子。
- 1×10−9M未満のKDでPDL1に結合する、請求項1から15のいずれか一項に記載のPDL1結合分子。
- 1×10−10M未満のKDでPDL1に結合する、請求項1から15のいずれか一項に記載のPDL1結合分子。
- 1×10−11M未満のKDでPDL1に結合する、請求項1から15のいずれか一項に記載のPDL1結合分子。
- 請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子をコードしている核酸分子。
- 発現調節エレメントに作動的に連結されている請求項20に記載の核酸分子を含む、発現ベクター。
- 請求項20に記載の核酸分子を含む、または請求項21に記載の発現ベクターで形質転換されており、前記PDL1結合分子を発現することができる宿主細胞。
- a)前記PDL1結合分子の発現を可能にする条件下で請求項22に記載の宿主細胞を培養すること;および
b)工程a)の前記培養から前記宿主細胞によって発現される前記PDL1結合分子を回収すること
を含む、請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子を産生する方法。 - c)工程b)から得られる前記PDL1結合分子を精製および/または修飾することをさらに含む、請求項23に記載の方法。
- 治療的部分とコンジュゲートされた請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子を含むイムノコンジュゲート。
- 前記治療的部分が、細胞毒素、生物活性のあるタンパク質または放射性同位元素を含む、請求項25に記載のイムノコンジュゲート。
- 請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子または請求項25もしくは26に記載のイムノコンジュゲート、および薬学的に許容可能な担体を含む医薬組成物。
- 対象に請求項27に記載の医薬組成物の有効量を投与することを含む、対象においてがんを防止および/または処置する方法で使用するための、請求項27に記載の医薬組成物。
- 前記対象に追加の抗腫瘍治療的手段を投与することをさらに含む、請求項28に記載の医薬組成物。
- 前記追加の抗腫瘍治療的手段が、化学療法、放射線療法または他の腫瘍特異抗原に対する抗体を含む、請求項29に記載の医薬組成物。
- 他の腫瘍特異抗原に対する前記抗体が、抗EGFR抗体、抗EGFRバリアント抗体、抗VEGFa抗体、抗HER2抗体、または抗CMET抗体を含む、請求項30に記載の医薬組成物。
- 他の腫瘍特異抗原に対する前記抗体が、モノクローナル抗体である、請求項31に記載の医薬組成物。
- 前記がんが、肺がん、卵巣がん、大腸がん、直腸がん、黒色腫、腎臓がん、膀胱がん、乳がん、肝臓がん、リンパ腫、血液悪性腫瘍、頭頸部がん、膠腫、胃がん、鼻咽頭がん、喉頭がん、子宮頸がん、子宮体がん、骨肉腫からなる群から選択される、請求項28に記載の医薬組成物。
- 対象に請求項27に記載の医薬組成物の有効量を投与することを含む、対象において感染性疾患を防止および/または処置する方法で使用するための、請求項27に記載の医薬組成物。
- 前記感染性疾患が、HIV、肝炎ウイルス、インフルエンザウイルス、ヘルペスウイルス、ジアルジア、プラスモディウム、リーシュマニア、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)からなる群から選択される病原体によって引き起こされる、請求項34に記載の医薬組成物。
- 対象に請求項27に記載の医薬組成物の有効量を投与することを含む、対象において慢性炎症性疾患を防止および/または処置する方法で使用するための、請求項27に記載の医薬組成物。
- 前記慢性炎症性疾患が、扁平苔癬またはT細胞により媒介される慢性炎症性皮膚粘膜疾患である、請求項36に記載の医薬組成物。
- がん、感染性疾患もしくは慢性炎症性疾患を防止および/または処置するための医薬の調製における、請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子または請求項25もしくは26に記載のイムノコンジュゲートまたは請求項27に記載の医薬組成物の使用。
- a)請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子とPDL1との複合体の形成が可能な条件下で生体サンプルおよび対照サンプルと請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子とを接触させることと、
b)前記複合体の前記形成を検出することと
を含み、前記生体サンプルと前記対照サンプルの間の前記複合体形成の差異が、前記サンプル中のPDL1の存在および/またはPDL1の発現レベルを示す、生体サンプル中のPDL1の存在および/またはPDL1の発現レベルを検出するための方法。 - PDL1関連疾患を診断するためのキットの調製における請求項1から19のいずれか一項に記載のPDL1結合分子の使用であって、疾患が、高PDL1発現に関連する腫瘍または感染性疾患である、使用。
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