JP6942466B2 - 抗原特異的t細胞受容体遺伝子を有する多能性幹細胞の製造方法 - Google Patents
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Description
A. 初期化技術を用いたクローニング法
自家移植を目的としたT細胞のクローニングの問題を解決する技術が提案されている。初期化の技術を用いて特異的TCR遺伝子の構造を有する幹細胞としてクローニングする方法である。具体的には核移植、iPS細胞化などによりT細胞から多能性幹細胞を作製する方法であり、特許出願もされている(WO2008/038579、WO2011/096482)。また、かかる方法についての論文は2010年、2013年に発表されている。
1) Watarai H, A Rybouchkin, N Hongo, Y Nagata, S Sakata, E Sekine, N Dashtsoodol, T Tashiro, S-I Fujii, K Shimizu, K Mori, K. Masuda, H Kawamoto, H Koseki, and M Taniguchi. Generation of functional NKT cells in vitro from embryonic stem cells bearing rearranged invariant Vα14-Jα18 TCRα gene. Blood115:230-237, 2010.
2) Vizcardo R, Masuda K, Yamada D, Ikawa T, Shimizu K, Fujii S-I, Koseki H, Kawamoto H. Regeneration of human tumor antigen-specific T cells from iPS cells derived from mature CD8+ T cells. Cell Stem Cell. 12: 31-36. 2013.
3) Nishimura T et al., Cell Stem Cell.12: 114-126. 2013.
抗原特異的T細胞受容体(TCR)遺伝子を単離し、その遺伝子を患者の正常T細胞(多くのクローンの集合体)に発現させて患者の体に戻す(自家移植)という遺伝子治療の臨床試験が各地で行われている(Morgan R.A. et al, Science, 314:126. 2006)。この方法では患者の正常T細胞がもともと発現しているTCRを例えばsiRNAなどで発現を抑制し(Okamoto S et al, Cancer Res 69:9003, 2009)、特定のTCRのみが発現したT細胞を自家移植する。例えば、WT1抗原特異的T細胞受容体(TCR)遺伝子が単離されていて、WT1を発現するがんに対する遺伝子治療が行われている。
白血病などの血液系の腫瘍に対して行われる骨髄移植は、免疫細胞療法としての側面をもつ。すなわち、移植されたドナーの骨髄細胞の中に含まれるT細胞がレシピエントの白血病細胞を攻撃することが期待されている。効果を高めるためにドナーのT細胞だけを後に追加して投与する、ドナーリンパ球輸注法も知られている。また近年、所望の抗原に対するクローンとして増幅させたT細胞を輸注するという方法が報告された(Chapuis et al, Sci Transl Med, 5:174ra27, 2013)。
臍帯血移植後に免疫力が低下した患者にウイルス感染症が発症することがある。そのようなケースを対象に移植に用いたドナー臍帯血ではなく他の臍帯血中のウイルス特異的CTLを輸注するという方法が提案されている(Blood, 116: 5045, 2010)。類似の発想で、HLAがある程度一致しているが完全には一致しないようなCTLを移植するというアイデアの特許出願が出されている(WO2011/021503)。しかしながら、臍帯血は多数のT細胞クローン、すなわち多種類のTCRを有する細胞の集団であり、移植片対宿主病(GVHD)を起こす危険性を回避できない。
1)移植用T細胞を患者ごとに作製する必要がなく事前準備ができる、
2)事前に移植細胞の安全性および品質を確認した上での処理をすることができる、
3)たとえHLAが一致していたとしてもマイナー抗原は一致しない他家移植であり、一定の期間の後には患者の免疫反応によって拒絶され、移入した細胞ががん化する恐れがない。
1)効果並びに安全性が保障されたTCRの遺伝子を導入することにより、得られる移植用T細胞の品質が保証される。
2)TCR遺伝子挿入箇所を同定し、安全なクローンを確定して用いることができ、移植細胞のがん化の問題を予め回避できる。
3)多能性幹細胞へTCR遺伝子挿入して得られる多能性幹細胞をT細胞へ分化させる場合、分化過程で導入TCRが先に発現することから細胞が元々もっている(以下内因性と表記)TCRが再構成されず、想定外の反応が出現することがほとんどない。
導入する対象の細胞としては京都大学再生医科学研究所再生免疫学分野(日本国京都府京都市)にて作製されたLMP2-T-iPS細胞(クローンLMP2#1)を用いた。
導入したHLA-A2402拘束性を有するWT1 TCRは,大阪大学医学系研究科免疫造血制御学研究室(日本国大阪府吹田市)でクローニングされたB10を用いた(Anticancer Research 32(12); 5201-5209, 2012). このTCRはHLA-A2402拘束性にペプチドCMTWNQMNL(配列番号4)を認識する。
クローンとなるように増幅したWT1特異的CTLもしくはWT1-T-iPS細胞から誘導されたCTLからRNAを調整する。SMARTer RACE cDNA増幅キット(クロンテック社)を用いて完全長cDNAを得,これを鋳型とした。 TCRα鎖の3’側からのプライマー(CACAGGCTGTCTTACAATCTTGCAGATC(配列番号1))もしくはTCRβ鎖の3’側からのプライマー2種(CTCCACTTCCAGGGCTGCCTTCA(配列番号2)またはTGACCTGGGATGGTTTTGGAGCTA(配列番号3))を用い,PCR反応によってWT1-TCRの二本鎖cDNAを得た。得られた二本鎖cDNAをpTA2ベクター(東洋紡社、図1)に組み込み,細胞株に導入することでWT1 TCRの特異性などの検定を行った。
独立行政法人理化学研究所 バイオリソースセンター 細胞運命情報解析技術開発サブチーム(日本国茨城県つくば市)より提供されたCS-UbC-RfA-IRES2-Venusベクター(図2)を用い,GatewayシステムによりWT1-TCRを導入したCS-UbC-RfA-IRES2-Venus/WT1-TCRを作製した。
CS-UbC-RfA-IRES2-Venus/WT1-TCRをX-treamGENE9(ロシュ社)を用いてパッケージング細胞LentiX-293Tに導入した。翌日に培地交換を行い,2日目にレンチウィルスを含む培養上清を回収し,レンチウィルス上清として用いた。
LMP2-T-iPS細胞をTrypLE Select (ライフテクノロジーズ社)を用いて完全な単一細胞とする。遠心後,ペレットをレンチウィルス上清で懸濁し,32℃,3000rpmで1時間遠心し,LMP2-T-iPS細胞に感染させることでWT1-TCRをLMP2-T-iPS細胞に導入した。
感染後,iPS細胞用培地に懸濁し,フィーダー細胞上に播種した。WT1-TCRが導入されたLMP2-T-iPS(WT1-TCR/LMP2-T-iPS)細胞はベクターに含まれるVenusタンパク質の発現によって蛍光顕微鏡下で選択された。
1.2週間後にiPS細胞コロニーを目視により確認した。
2. 200ulチップによりコロニーを物理的に拾い上げた。
3. 各クローンを個別に樹立した。
各培地の組成を下記に示す。
0.1% ゼラチン/PBS溶液6mlを10cm培養ディッシュに入れ,37℃で30分以上静置する。コンフルエントになったOP9細胞をトリプシン/EDTA溶液で剥がし,1/4相当量をゼラチンコートした10cm培養ディッシュに播種した。培地はmedium Aを10mlとなるように加えた。
4日後に播種したOP9細胞培養ディッシュに新たにmedium Aを10ml加え,全量が20mlとなるようにした。
共培養に使用するOP9細胞の培地を吸引し,新しいmedium Aに交換する。またヒトiPS細胞培養ディッシュの培地も同様に吸引し,新しいmedium Aを10ml加える。EZ-passageローラーでヒトiPS細胞を切る。カットしたiPS細胞塊を200ulピペットマンでピペッティングすることで浮遊させ,目視でおおよそ600個のiPS細胞塊をOP9細胞上に播種した。
ヒトiPS細胞1クローンあたり3枚以上のディッシュを用い,継代するときには細胞を一度一つに合わせてから同じ枚数に再分配することでディッシュ間のばらつきを減らした。
ヒトiPS細胞塊が接着し分化し始めているかどうかを確認し,培地を新しいmedium A 20mlに交換した。
Day 5 (培地半量交換)
半量分の培地を新しいmedium A 10mlに交換した。
Day 9 (培地交換)
半量分の培地を新しいmedium A 10mlに交換した。
Day 13 (誘導した中胚葉細胞をOP9細胞上からOP9/DLL1細胞上への移しかえる)
培地を吸引し,HBSS(+Mg+Ca)で細胞表面上の培地を洗い流した。その後250U collagenase IV/HBSS(+Mg+Ca) 溶液10mlを加え,37℃で45分間培養した。
Collagenase溶液を吸引し,PBS(-)10mlで洗い流した。その後5mlの0.05%トリプシン/EDTA溶液を加え,37℃で20分培養した。培養後,細胞が膜状に剥がれてくるのでピペッティングにより物理的に細かくした(接着細胞同士を離すため)。ここに新しいmedium Aを20ml加え,さらに37℃で45分間培養する。培養後、浮遊細胞を含む上清を,100μmのメッシュを通して回収した。4℃,1200rpmで7分間遠心し、ペレットを10mlのmedium Bに懸濁させた。このうち1/10をFACS解析用にとりわけ、残りの細胞を新たに用意したOP9/DLL1細胞上に播種した。複数枚のディッシュから得た細胞をプールした場合,元々の枚数と同じ枚数になるように再分配して細胞を播き直した。
次いで細胞をOP9/DLL1細胞上に播種した。この工程において,CD34lowCD43+細胞分画の細胞のソーティングは行わない。この分画をソーティングした場合,得られる細胞数が減少してしまうことやソーティングによる細胞へのダメージから,ソーティングしなかった場合に比べてT細胞への分化誘導効率が落ちることがある。
OP9/DLL1細胞に緩く接着している細胞を,穏やかに複数回ピペッティングし,100μmのメッシュを通して50mlコニカルチューブに回収した。4℃,1200rpmで7分間遠心し,ペレットを10mlのmedium Bに懸濁させる。これらの細胞を新たに用意したOP9/DLL1細胞上に播種した。
Day 23 (細胞の継代): 血液細胞コロニーが見え始める。
OP9/DLL1細胞に緩く接着している細胞を,穏やかに複数回ピペッティングし,100μmのメッシュを通して50mlコニカルチューブに回収する。4℃,1200rpmで7分間遠心し,ペレットを10mlのmedium Bに懸濁させた。これらの細胞を新たに用意したOP9/DLL1細胞上に播種した。
Day 30 (細胞の継代):
OP9/DLL1細胞に緩く接着している細胞を,穏やかに複数回ピペッティングし,100μmのメッシュを通して50mlコニカルチューブに回収した。4℃,1200rpmで7分間遠心し,ペレットを10mlのmedium Bに懸濁させる。これらの細胞を新たに用意したOP9/DLL1細胞上に播種した。
Day 37 (細胞の継代):
OP9/DLL1細胞に緩く接着している細胞を,穏やかに複数回ピペッティングし,100μmのメッシュを通して50mlコニカルチューブに回収した。4℃,1200rpmで7分間遠心し,ペレットを10mlのmedium Bに懸濁させる。これらの細胞を新たに用意したOP9/DLL1細胞上に播種した。
Day 44: (CD4+CD8+T細胞の確認、CD8 SP細胞の誘導開始)
T細胞が誘導されているかどうかを確かめるために抗CD4抗体,抗CD8抗体を用いてFACS解析した。CD4+CD8+T細胞の生成が確認された。
ここで抗CD3/28抗体をhuIL-2と供に加える.24穴プレートに新たにOP9/DLL1細胞を用意しておき,CD4+CD8+T細胞を含んだT細胞を3x105個/穴となるように播種した.ここに抗CD3抗体(50ng/ml),抗CD28抗体(2ng/ml), huIL-2 (200U/ml)を添加した.
Day 50: (CD4-CD8+細胞が現れる)
抗CD3抗体による刺激後6日目には,成熟CD8SP細胞が生成した.生成した細胞をWT1-テトラマーと抗CD3抗体で染色した(図3)。導入したWT1-TCRを発現するT細胞が生成しているのが確認された。
導入する対象の細胞として京都大学再生医科学研究所再生免疫学分野(日本国京都府京都市)にて健常人末梢血単球より作製されたHLAハプロタイプホモ型iPS細胞を用いた。
このiPS細胞のHLA型はHLA-A*33:03; B*44:03; C*140:3; DRB1*1302
のホモ接合型である。
導入したHLA-A0201拘束性を有するWT1特異的TCR遺伝子は,大阪大学医学系研究科免疫造血制御学研究室(日本国大阪府吹田市)でクローニングされたOpt3E2を用いた.このTCRが認識するペプチド配列はRMFPNAPYL(配列番号5)である。
2. 遺伝子導入後のiPS細胞をディッシュに播種し、クローナルなコロニーとして培養した。図5は培養1週間後のコロニーを示しており、遺伝子が導入されたコロニーは蛍光色素陽性コロニーとして写っている。すなわち、HLA-A0201拘束性WT1特異的TCR遺伝子が導入されたiPS細胞のクローニングできたことを示している。この後、この陽性コロニーをピックアップして分離した。
導入する対象の細胞としては実施例2と同じく京都大学再生医科学研究所再生免疫学分野(日本国京都府京都市)にて健常人末梢血単球より作製されたHLAハプロタイプホモ型iPS細胞を用いた。
導入したWT1特異的TCR遺伝子は,大阪大学医学系研究科免疫造血制御学研究室(日本国大阪府吹田市)でクローニングされたたクラスII拘束性WT1特異的TCR遺伝子、Clone KとClone 10を用いた。CloneKはHLA-DRB1*0405拘束性、Clone10はHLA-DPB1*0501拘束性で、認識するペプチド配列はWT1-332(KRYFKLSHLQMHSRKH(配列番号6))である(Microbiol Immunol 52: 591-600, 2008)。
導入する対象の細胞としては実施例2と同じく京都大学再生医科学研究所再生免疫学分野(日本国京都府京都市)にて健常人末梢血単球より作製されたHLAハプロタイプホモ型iPS細胞を用いた。
導入したWT1特異的TCR遺伝子は,京都大学再生医科学研究所再生免疫学分野(日本国京都府京都市)にてClonn#9とClone#3-3からクローニングされたクラスI拘束性WT1特異的TCR遺伝子である。
Claims (10)
- (1)ヒト多能性幹細胞を提供する工程、
(2)工程(1)のヒト多能性幹細胞へ、所望の抗原特異性T細胞受容体遺伝子を導入して、所望の抗原特異性T細胞受容体を有する多能性幹細胞を得る工程、および
(3)工程(2)の多能性幹細胞からT細胞を誘導する工程
を含む、多能性幹細胞から免疫細胞療法用成熟T細胞をイン・ビトロで誘導する方法。 - 多能性幹細胞がiPS細胞である、請求項1記載の方法。
- iPS細胞が、免疫療法対象者のHLAの何れか一方のハプロタイプをホモで有しているハプロタイプホモ接合型のHLAを有しているヒトから得られたiPS細胞である、請求項2記載の免疫療法用T細胞を誘導する方法。
- 免疫細胞療法が、がん、感染症、自己免疫疾患、アレルギーなど、免疫が関与する疾患を治療するためのものである、請求項1〜3いずれかに記載の方法。
- 免疫細胞療法が、がんを治療するためのものである、請求項4に記載の方法。
- がんがWT1遺伝子を発現するがんである、請求項5に記載の方法。
- 所望の抗原特異性T細胞受容体遺伝子が、WT1特異的T細胞受容体遺伝子である請求項1〜6何れかに記載の方法。
- 所望の抗原特異性T細胞受容体遺伝子が、HLA-A2402拘束性であり、ペプチドCMTWNQMNLを認識するWT1抗原特異的TCRである請求項7記載の方法。
- 所望の抗原特異性T細胞受容体遺伝子が、HLA-A0201拘束性であり、ペプチドRMFPNAPYLを認識するWT1抗原特異的TCRである請求項7記載の方法。
- 所望の抗原特異性T細胞受容体遺伝子が、HLA-DRB1*0405拘束性またはHLA-DPB1*0501拘束性であり、ペプチドKRYFKLSHLQMHSRKHを認識するWT1抗原特異的TCRである請求項7記載の方法。
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