JP6964352B2 - 金属を用いた細胞外小胞の分離方法 - Google Patents
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Description
(1−1.標本細胞外小胞の分離及び精製)
新鮮な得られた大腸癌細胞株SW480培養液を500xgで10分間遠心分離(計2回反復)して、残存する細胞及び沈殿物を除去した。上記上澄み液を再度2,000xgで20分間遠心分離(計2回反復)して、沈殿物を除去した。
上記大腸癌細胞株SW480から精製された標本細胞外小胞の純度を検証するために、HPLCシステムを用いた。HPLC用TSKgel6000カラム(7.5×600mm)に上記方法により精製した標本細胞外小胞をローディングした後、HEPES緩衝溶液を流動相として0.5ml/minで流しながら、280nm吸光度を追跡して精製した試料の純度を検証した。図4に示すように、約16分で溶出された標本細胞外小胞(赤色)は、非常に高い純度(>90%)を示した。これは、対照群として使用されたアルブミン(BSA)(黒色;約50kDa)とIgG抗体(青色;約150kDa)よりも早く溶出され、そのサイズが非常に大きいことが分かった。
ナノ粒子の確認及び定量のために、上記HPLC装置を利用して、標本細胞外小胞の分子サイズ別クロマトグラフィー分画に対してナノ粒子分析(Nanoparticle Tracking Analysis)を行った。ナノ粒子分析においてNanosight LM10装置が使用され、カメラレベル10、検出限界5の条件で60秒間追跡記録し、その結果を図5に示した。
上記標本細胞外小胞の分子サイズ別クロマトグラフィー分画をヒト大腸癌細胞株由来の細胞外小胞に特異的な複数のクローン抗体(rabbit polyclonal anti-SW480 EVs)でコーティングされたマイクロプレート(microplate)に反応させた後、上記結合された細胞外小胞を単一クローン抗−CD9抗体又はビオチン(biotin)が結合された複数のクローン抗−大腸癌細胞株由来の細胞外小胞抗体と共に培養して、西洋ワサビペルオキシダーゼ(horseradish peroxidase)が結合された抗−マウス抗体又は西洋ワサビペルオキシダーゼが結合されたストレプトアビジン(streptavidin)と培養させた後、化学発光を測定することによって、細胞外小胞の量を測定した。
HPLCシステムを利用して、標本細胞外小胞(4×1010パーティクル)を、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に5分間、HEPES緩衝溶液を使用してローディングした後、さらに5分間、同一の緩衝溶液で洗浄した。次に、20カラム体積の間pH7.2で0〜500mMイミダゾール(imidazole)/HEPES緩衝溶液で濃度勾配を行い、結合及び洗浄過程を含む全ての過程の溶出液を1mlずつ分画した。
HPLCシステムを利用して、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に0.5ml 500mM Cu(II)イオンを結合させた後、20カラム体積のHEPES緩衝溶液で結合していない残余物を洗浄した。
固定相(IDA-Sepharose)に添加する金属としてCu(I)イオンを使用したことを除いて、上記実施例3と同様の方法で標本細胞外小胞の親和性を分析した。
HPLCシステムを利用して、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に0.5ml 500mM Zn(II)イオンを結合させた後、20カラム体積のHEPES緩衝溶液で結合していない残余物を洗浄した。
固定相(IDA-Sepharose)に添加する金属としてNi(II)イオンを使用したことを除いて、上記実施例3と同様の方法で標本細胞外小胞の親和性を分析した。
固定相(IDA-Sepharose)に添加する金属としてCo(II)イオンを使用したことを除いて、上記実施例3と同様の方法で標本細胞外小胞の親和性を分析した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、幹細胞の培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、HPLCシステムを利用して、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に0.5ml 500mM Cu(II)イオンを結合させた後、20カラム体積のHEPES緩衝溶液で結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、大腸癌細胞株培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、HPLCシステムを利用して、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に0.5ml 500mM Cu(II)イオンを結合させた後、20カラム体積のHEPES緩衝溶液で結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、大腸癌細胞株培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、注射式(syringe)システムを利用して、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に0.5ml 500mM Cu(II)イオンを結合させた後、20カラム体積のHEPES緩衝溶液で結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、大腸癌細胞株培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、遠心分離(700xg、1分)を利用して、固定相(IDA-Sepharose)を空きのカラムに充填し、0.5ml 500mM Cu(II)イオンをローディングして結合させた後、金属イオンをローディングしたカラムにHEPES緩衝溶液(1mlずつ)を入れ、3回に亘る遠心分離を介して、結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、マウスの肝組織から細胞外小胞を分離した。具体的には、遠心分離(700xg、1分)を利用して、固定相(IDA-Sepharose)を空きのカラムに充填し、0.5ml 500mM Cu(II)イオンをローディングして結合させた後、金属イオンをローディングしたカラムにHEPES緩衝溶液を入れ、計3回、各1mlずつの遠心分離を介して、結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、マウスの癌組織から細胞外小胞を分離した。具体的には、遠心分離(700xg、1分)を利用して、固定相(IDA-Sepharose)を空きのカラムに充填し、0.5ml 500mM Cu(II)イオンをローディングして結合させた後、金属イオンをローディングしたカラムにHEPES緩衝溶液を入れ、計3回、各1mlずつ遠心分離を介して、結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、ヒトの尿試料から細胞外小胞を分離した。具体的には、HPLCシステムを利用して、固定相(IDA-Sepharose)が充填されたカラム(1ml)に0.5ml 500mM Cu(II)イオンを結合させた後、20カラム体積のHEPES緩衝溶液で結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、大腸菌培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、遠心分離(700xg、1分)を利用して、固定相(IDA-Sepharose)を空きのカラムに充填し、0.5ml 500mM Cu(II)イオンをローディングして結合させた後、金属イオンをローディングしたカラムにHEPES緩衝溶液を入れ、計3回、各1mlずつ遠心分離を介して、結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第1の方法(図1a参照)を利用して、ビールから細胞外小胞を分離した。具体的には、遠心分離(700xg、1分)を利用して、固定相(IDA-Sepharose)を空きのカラムに充填し、0.5ml 500mM Cu(II)イオンをローディングして結合させた後、金属イオンをローディングしたカラムにHEPES緩衝溶液で計3回、各1mlずつ遠心分離を介して、結合していない残余物を洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第2の方法(図1b参照)を利用して、大腸癌細胞の培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、大腸癌細胞の培養液を細胞外小胞沈殿誘導溶液と混合して細胞外小胞を沈殿させ、遠心分離を介して取得した非精製細胞外小胞溶液にCu(II)イオンを最終的に5mMになるように添加した。1mlの固定相(IDA-Sepharose)をスパンカラムに充填した後、水で計3回、各1mlずつ遠心分離(700xg、1分)を介して洗浄した。洗浄された固定相にCu(II)イオンが添加された試料をローディングし、遠心分離を介して非結合溶液を取得した後、上記カラムをHEPES緩衝溶液で計3回、各1mlずつ遠心分離で洗浄した。
本発明の細胞外小胞の分離方法のうち第3の方法(図1c参照)を利用して、大腸癌細胞の培養液から細胞外小胞を分離した。具体的には、大腸癌細胞の培養液を細胞外小胞沈殿誘導溶液と混合して細胞外小胞を沈殿させ、遠心分離を介して非精製細胞外小胞を取得した。取得した非精製細胞外小胞溶液と5mMのCu(II)イオン、そして水で洗浄された1mlの固定相(IDA-Sepharose)を含む懸濁液を25℃で30分間培養した。上記懸濁液をスパンカラムにローディングし、遠心分離(700xg、1分)を介して非結合溶液を取得した後、上記カラムをHEPES緩衝溶液で各1mlずつ計3回、遠心分離で洗浄した。
Claims (27)
- (a)固定相(Stationary phase)にキレートリガンドを固定させる段階と、
(b)前記キレートリガンドが固定された固定相に金属を添加し、前記キレートリガンド上に前記金属を固定する段階と、
(c)前記キレートリガンド上に固定されていない金属残余物を洗浄する段階と、
(d)前記洗浄した固定相に細胞外小胞が含まれる試料を注入し、前記細胞外小胞を、前記キレートリガンド上に固定された前記金属に結合させる段階と、
(e)前記固定相で前記金属と結合していない試料の残余物を洗浄する段階と、
(f)前記固定相で前記金属と結合された前記細胞外小胞を溶出させる段階と、
を含む、細胞外小胞の分離方法であって、
前記細胞外小胞は、その膜表面にヒスチジンタグ融合タンパク質を有しない、
前記細胞外小胞の分離方法。 - 前記固定相(Stationary phase)は、アガロースビーズ、セファロースビーズ、マグネチックビーズ、金ナノ粒子、酸化鉄ナノ粒子、ナイロンメンブレン、ニトロセルロースメンブレン、PVDFメンブレン、紙、プラスチック、ガラス及び金属センサーチップからなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項1に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記キレートリガンドは、イミノ二酢酸(IDA:iminodiacetic acid)、ニトリロ三酢酸(NTA:nitrilotriacetic acid)、トリス(カルボキシメチル)エチレンジアミン(TED:tris-(carboxymethyl)ethylenediamine)、エチレンジアミン(ethylenediamine)、エチレンジアミンテトラアセテート(EDTA:ethylendiamine tetraacetate)、アルキレンジアミン三酢酸(alkylenediamine triacetic acid)、ジエチレントリアミンペンタ酢酸(DTPA:diethylenetriaminepentaacetic acid)、エチレングリコールビス(ベータ−アミノエチルエーテル)−N,N,N´,N´−テトラ酢酸(EGTA:ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N’,N’-tetraacetic acid)、ホスホセリン(phosphoserine)及び1,4,7−トリアザシクロノナン(TACN:1,4,7-triazocyclononane)からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項1に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記金属は、スカンジウム(Sc)、イットリウム(Y)、チタニウム(Ti)、ジルコニウム(Zr)、ハフニウム(Hf)、ラザホージウム(Rf)、バナジウム(V)、ニオビウム(Nb)、タンタル(Ta)、ドブニウム(Db)、クロム(Cr)、モリブデン(Mo)、タングステン(W)、シーボーギウム(Sg)、マンガン(Mn)、テクネチウム(Tc)、レニウム(Re)、ボーリウム(Bh)、鉄(Fe)、ルテニウム(Ru)、オスミウム(Os)、ハッシウム(Hs)、コバルト(Co)、ロジウム(Rh)、イリジウム(Ir)、マイトネリウム(Mt)、ニッケル(Ni)、パラジウム(Pd)、白金(Pt)、ダームスタチウム(Ds)、銅(Cu)、銀(Ag)、金(Au)、レントゲニウム(Rg)、亜鉛(Zn)、カドミウム(Cd)、水銀(Hg)、コペルニシウム(Cn)、アルミニウム(Al)及びガリウム(Ga)からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項1に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記試料は、哺乳動物細胞培養培地、バクテリア細胞培養培地、酵母培養培地、組織抽出物、癌組織、血清、血しょう、唾液、涙、汗、尿、糞便、脳脊髄液(CSF:cerebrospinal fluid)、腹水(ascites)、羊水(amniotic fluid)、精液、乳(milk)、粉塵、淡水、海水、土壌及び発酵食品からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項1に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記固定相(Stationary phase)に前記試料を添加する前に、前記試料の前処理段階をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記試料の前処理段階は、遠心分離、超遠心分離、濾過、限外濾過、音波処理、密度勾配超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、ポリマーベースの沈殿及び有機溶媒沈殿からなる群から選択される1つ以上の方法を利用することを特徴とする請求項6に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記金属と結合された前記細胞外小胞を溶出させる段階の後に、溶出物の後処理段階をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記溶出物の後処理段階は、遠心分離、超遠心分離、濾過、限外濾過、音波処理、密度勾配超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、ポリマーベースの沈殿及び有機溶媒沈殿からなる群から選択される1つ以上の方法を利用することを特徴とする請求項8に記載の細胞外小胞の分離方法。
- (a)固定相(Stationary phase)にキレートリガンドを固定させる段階と、
(b)細胞外小胞が含まれる試料に金属を混合して、前記細胞外小胞と前記金属とを結合させる段階と、
(c)前記キレートリガンドが固定された前記固定相に前記金属及び前記試料の混合物を添加し、前記キレートリガンド上に前記金属と結合された前記細胞外小胞を固定する段階と、
(d)前記固定相に結合されていない残余物を洗浄する段階と、
(e)前記固定相で前記金属と結合された前記細胞外小胞を溶出させる段階と、
を含む、細胞外小胞の分離方法であって、
前記細胞外小胞は、その膜表面にヒスチジンタグ融合タンパク質を有しない、
前記細胞外小胞の分離方法。 - 前記固定相(Stationary phase)は、アガロースビーズ、セファロースビーズ、マグネチックビーズ、金ナノ粒子、酸化鉄ナノ粒子、ナイロンメンブレン、ニトロセルロースメンブレン、PVDFメンブレン、紙、プラスチック、ガラス及び金属センサーチップからなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項10に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記キレートリガンドは、イミノ二酢酸(IDA:iminodiacetic acid)、ニトリロ三酢酸(NTA:nitrilotriacetic acid)、トリス(カルボキシメチル)エチレンジアミン(TED:tris-(carboxymethyl)ethylenediamine)、エチレンジアミン(ethylenediamine)、エチレンジアミンテトラアセテート(EDTA:ethylendiamine tetraacetate)、アルキレンジアミン三酢酸(alkylenediamine triacetic acid)、ジエチレントリアミンペンタ酢酸(DTPA:diethylenetriaminepentaacetic acid)、エチレングリコールビス(ベータ−アミノエチルエーテル)−N,N,N´,N´−テトラ酢酸(EGTA:ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N’,N’-tetraacetic acid)、ホスホセリン(phosphoserine)及び1,4,7−トリアザシクロノナン(TACN:1,4,7-triazocyclononane)からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項10に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記金属は、スカンジウム(Sc)、イットリウム(Y)、チタニウム(Ti)、ジルコニウム(Zr)、ハフニウム(Hf)、ラザホージウム(Rf)、バナジウム(V)、ニオビウム(Nb)、タンタル(Ta)、ドブニウム(Db)、クロム(Cr)、モリブデン(Mo)、タングステン(W)、シーボーギウム(Sg)、マンガン(Mn)、テクネチウム(Tc)、レニウム(Re)、ボーリウム(Bh)、鉄(Fe)、ルテニウム(Ru)、オスミウム(Os)、ハッシウム(Hs)、コバルト(Co)、ロジウム(Rh)、イリジウム(Ir)、マイトネリウム(Mt)、ニッケル(Ni)、パラジウム(Pd)、白金(Pt)、ダームスタチウム(Ds)、銅(Cu)、銀(Ag)、金(Au)、レントゲニウム(Rg)、亜鉛(Zn)、カドミウム(Cd)、水銀(Hg)、コペルニシウム(Cn)、アルミニウム(Al)及びガリウム(Ga)からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項10に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記試料は、哺乳動物細胞培養培地、バクテリア細胞培養培地、酵母培養培地、組織抽出物、癌組織、血清、血しょう、唾液、涙、汗、尿、糞便、脳脊髄液(CSF:cerebrospinal fluid)、腹水(ascites)、羊水(amniotic fluid)、精液、乳(milk)、粉塵、淡水、海水、土壌及び発酵食品からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項10に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記固定相(Stationary phase)に前記試料を添加する前に、前記試料の前処理段階をさらに含むことを特徴とする請求項10に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記試料の前処理段階は、遠心分離、超遠心分離、濾過、限外濾過、音波処理、密度勾配超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、ポリマーベースの沈殿及び有機溶媒沈殿からなる群から選択される1つ以上の方法を利用することを特徴とする請求項15に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記金属と結合された前記細胞外小胞を溶出させる段階の後に、溶出物の後処理段階をさらに含むことを特徴とする請求項10に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記溶出物の後処理段階は、遠心分離、超遠心分離、濾過、限外濾過、音波処理、密度勾配超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、ポリマーベースの沈殿及び有機溶媒沈殿からなる群から選択される1つ以上の方法を利用することを特徴とする請求項17に記載の細胞外小胞の分離方法。
- (a)固定相(Stationary phase)にキレートリガンドを固定させる段階と、
(b)前記キレートリガンドが固定された固定相に細胞外小胞が含まれる試料と金属とを添加する段階と、
(c)前記キレートリガンド上に前記金属を固定し、前記細胞外小胞を前記金属に結合させる段階と、
(d)前記固定相に結合されていない残余物を洗浄する段階と、
(e)前記固定相で前記金属と結合された前記細胞外小胞を溶出させる段階と、
を含む、細胞外小胞の分離方法であって、
前記細胞外小胞は、その膜表面にヒスチジンタグ融合タンパク質を有しない、
前記細胞外小胞の分離方法。 - 前記固定相(Stationary phase)は、アガロースビーズ、セファロースビーズ、マグネチックビーズ、金ナノ粒子、酸化鉄ナノ粒子、ナイロンメンブレン、ニトロセルロースメンブレン、PVDFメンブレン、紙、プラスチック、ガラス及び金属センサーチップからなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項19に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記キレートリガンドは、イミノ二酢酸(IDA:iminodiacetic acid)、ニトリロ三酢酸(NTA:nitrilotriacetic acid)、トリス(カルボキシメチル)エチレンジアミン(TED:tris-(carboxymethyl)ethylenediamine)、エチレンジアミン(ethylenediamine)、エチレンジアミンテトラアセテート(EDTA:ethylendiamine tetraacetate)、アルキレンジアミン三酢酸(alkylenediamine triacetic acid)、ジエチレントリアミンペンタ酢酸(DTPA:diethylenetriaminepentaacetic acid)、エチレングリコールビス(ベータ−アミノエチルエーテル)−N,N,N´,N´−テトラ酢酸(EGTA:ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N’,N’-tetraacetic acid)、ホスホセリン(phosphoserine)及び1,4,7−トリアザシクロノナン(TACN:1,4,7-triazocyclononane)からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項19に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記金属は、スカンジウム(Sc)、イットリウム(Y)、チタニウム(Ti)、ジルコニウム(Zr)、ハフニウム(Hf)、ラザホージウム(Rf)、バナジウム(V)、ニオビウム(Nb)、タンタル(Ta)、ドブニウム(Db)、クロム(Cr)、モリブデン(Mo)、タングステン(W)、シーボーギウム(Sg)、マンガン(Mn)、テクネチウム(Tc)、レニウム(Re)、ボーリウム(Bh)、鉄(Fe)、ルテニウム(Ru)、オスミウム(Os)、ハッシウム(Hs)、コバルト(Co)、ロジウム(Rh)、イリジウム(Ir)、マイトネリウム(Mt)、ニッケル(Ni)、パラジウム(Pd)、白金(Pt)、ダームスタチウム(Ds)、銅(Cu)、銀(Ag)、金(Au)、レントゲニウム(Rg)、亜鉛(Zn)、カドミウム(Cd)、水銀(Hg)、コペルニシウム(Cn)、アルミニウム(Al)及びガリウム(Ga)からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項19に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記試料は、哺乳動物細胞培養培地、バクテリア細胞培養培地、酵母培養培地、組織抽出物、癌組織、血清、血しょう、唾液、涙、汗、尿、糞便、脳脊髄液(CSF:cerebrospinal fluid)、腹水(ascites)、羊水(amniotic fluid)、精液、乳(milk)、粉塵、淡水、海水、土壌及び発酵食品からなる群から選択される1つ以上であることを特徴とする請求項19に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記固定相(Stationary phase)に前記試料を添加する前に、前記試料の前処理段階をさらに含むことを特徴とする請求項19に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記試料の前処理段階は、遠心分離、超遠心分離、濾過、限外濾過、音波処理、密度勾配超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、ポリマーベースの沈殿及び有機溶媒沈殿からなる群から選択される1つ以上の方法を利用することを特徴とする請求項24に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記金属と結合された前記細胞外小胞を溶出させる段階の後に、溶出物の後処理段階をさらに含むことを特徴とする請求項19に記載の細胞外小胞の分離方法。
- 前記溶出物の後処理段階は、遠心分離、超遠心分離、濾過、限外濾過、音波処理、密度勾配超遠心分離、サイズ排除クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、ポリマーベースの沈殿及び有機溶媒沈殿からなる群から選択される1つ以上の方法を利用することを特徴とする請求項26に記載の細胞外小胞の分離方法。
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