JP6984657B2 - 抗原または抗抗体が結合したモノクローナル抗体の定量方法 - Google Patents
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Description
1. 測定対象のモノクローナル抗体を細孔内に固定化した多孔質体と、プロテアーゼを固定化したナノ粒子とを液体中で接触させてモノクローナル抗体の選択的プロテアーゼ消化を行い、該消化により得られたペプチド断片を液体クロマトグラフ質量分析(LC-MS)によって検出する方法であって、該モノクローナル抗体が、該モノクローナル抗体に特異的に結合する抗体、又は該モノクローナル抗体の標的分子の存在下でプロテアーゼ消化される、上記方法。
2. 上記モノクローナル抗体の一部又は全てが、上記モノクローナル抗体に特異的に結合する抗体、又は上記モノクローナル抗体の標的分子に結合している、上記1記載の方法。
3. 上記モノクローナル抗体が、上記モノクローナル抗体に特異的に結合する抗体に対して分子比で1:1以下の量で生物学的試料中に存在する、上記1又は2記載の方法。
4. 上記モノクローナル抗体が、上記標的分子に対して1:100以下の量で生物学的試料中に存在する、上記1又は2記載の方法。
5. 上記モノクローナル抗体がトラスツズマブであり、トラスツズマブに特異的に結合する抗体が抗イディオタイプ抗体である、上記1〜3のいずれか記載の方法。
6. 上記モノクローナル抗体がベバシズマブであり、ベバシズマブに特異的に結合する抗体が抗イディオタイプ抗体である、上記1〜3のいずれか記載の方法。
7. 被験者に投与されたモノクローナル抗体の有効性を評価するための方法であって、被験者由来の生物学的試料中のモノクローナル抗体を細孔内に固定化した多孔質体と、プロテアーゼを固定化したナノ粒子とを液体中で接触させてモノクローナル抗体の選択的プロテアーゼ消化を行い、消化されたペプチド断片を液体クロマトグラフ質量分析(LC-MS)によって検出することによって該生物学的試料中の該モノクローナル抗体濃度を算出し、該モノクローナル抗体に対して特異的に結合する抗体の存在による算出結果への影響の有無及び/又は程度を決定することを含む、上記方法。
8. 上記モノクローナル抗体がトラスツズマブであり、配列番号1〜4に示すアミノ酸配列を有するペプチド断片を検出する、上記7記載の方法。
9. 上記モノクローナル抗体がベバシズマブであり、配列番号5〜7に示すアミノ酸配列を有するペプチド断片を検出する、上記7記載の方法。
本発明の方法は、本発明者等のグループが先に開発したnSMOL法を適用して実施する。nSMOL法の詳細は、例えばWO 2015/033479号;及びIwamoto N et.al., Selective detection of complementarity-determining regions of monoclonal antibody by limiting protease access to the substrate: nano-surface and molecular-orientation limited proteolysis, Analyst. 2014 Feb 7; 139(3): 576-80. DOI: 10.1039/c3an02104aに記載されている。また、nSMOL法の改良技術等に関して、例えばWO 2016/143223号;WO 2016/143224号;WO 2016/143226号;WO 2016/143227号;Iwamoto N et.al., Bioanalysis, doi: 10.4155/bio-2016-0018;及びIwamoto N et. al., Biological & Pharmaceutical Bulletin, 2016, doi:10.1248/bpb.b16-00230等に開示されている。これらの文献の開示内容は、参照により本明細書に組み入れるものとする。
本発明の方法における測定対象であるモノクローナル抗体は、FabドメインとFcドメインがヒンジを介してつながった免疫グロブリンIgGであり、抗体分子を構成する2本の重鎖及び2本の軽鎖はそれぞれ定常領域と可変領域から成っている。定常領域は、同一種由来の抗体のほとんどで共通するアミノ酸配列を有し、一方、可変領域には、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる特異的な配列を持つ部位が各3つずつ存在する。このCDR(CDR1、CDR2、CDR3)領域が規定する立体構造が抗原との特異的結合に関わっており、それによって抗体−抗原複合体が形成される。
本発明の方法に使用する多孔質体は、多数の細孔を有するものであれば、その材料は特に限定されず、活性炭、多孔質膜、多孔質樹脂ビーズ、金属粒子等を用いることができる。これらの中でも、抗体を部位特異的に結合可能なものが特に好ましい。
ナノ粒子は、その表面にプロテアーゼを固定化して、多孔質体の細孔内に固定化された抗体へのプロテアーゼのアクセスを制御する目的で用いられる。そのため、ナノ粒子は、多孔質体の細孔の奥深くまで入り込まないように、その平均粒径が、多孔質体の平均細孔径よりも大きいものとする。
nSMOL方法では、プロテアーゼが、多孔質体の細孔内に固定化された抗体を特定のアミノ酸配列部位で切断して、Fab領域のアミノ酸を含むペプチド断片を生じさせることができる。ペプチド断片は、例えばCDR2領域由来のアミノ酸を含むアミノ酸配列を有するものであり得る。
プロテアーゼをナノ粒子の表面に固定化する方法は特に限定されず、プロテアーゼとナノ粒子(あるいはナノ粒子表面を修飾するスペーサ分子)の特性等に応じて適宜の方法を採用でき、例えば、プロテアーゼをスペーサ修飾されたナノ粒子表面に固定化する場合は、ナノ粒子の懸濁液とプロテアーゼを含む溶液とを混合することにより、ナノ粒子表面にプロテアーゼを固定化できる。上記のスペーサ分子の官能基を介したナノ粒子とプロテアーゼのアミンカップリング法が好ましい。例えば、ナノ粒子に表面修飾したカルボキシル基をN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)でエステル化して活性化エステル基とし、これに、プロテアーゼのアミノ基を結合させることができる。このカップリング反応には、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDAC)、N,N'-ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、ビス(2,6-ジイソプロピルフェニル)カルボジイミド(DIPC)等のカルボジイミドを縮合剤の存在下に行うことができる。また、ナノ粒子に表面修飾したアミノ基に、グルタルアルデヒド、2官能性スクシンイミド、ビス(スルホスクシンイミジル)スベレート(BS3)、スルホニルクロリド、マレイミド、ピリジルジスルフィド等の架橋剤を用いてプロテアーゼのアミノ基を結合させてもよい。
抗体が固定化された多孔質体と、プロテアーゼが表面に固定化されたナノ粒子とを液体中で接触させることにより、抗体がプロテアーゼ消化され、ペプチド断片が産生される。ここで、「液体」とは、基質(固相)及び酵素(固相)が液相中で接触することを意味するものであり、またプロテアーゼ消化反応に適した水性媒体を意図する。
プロテアーゼ消化によって得られた目的のペプチド断片を質量分析に供するためには、多孔質体及びナノ粒子を除去することが必要である。これは、プロテアーゼ消化後のサンプルに対して濾過、遠心分離、磁気分離、透析等の操作を行うことで達成できる。
上記で得られたペプチド断片を含む試料を、LC-MSにより分析することで、抗体の同定や定量を行い得る。
抗体医薬として使用することが意図されるモノクローナル抗体は、そのアミノ酸配列情報等が公開されており、重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列、Fab及びFcドメイン、相補性決定領域(CDR)、ジスルフィド結合等の情報を入手することが可能である。従って、nSMOL法によるプロテアーゼ消化で複数のペプチドが得られるが、それぞれのペプチドについてのアミノ酸配列情報が得られれば、そのペプチドがモノクローナル抗体のいずれの位置に存在するものであるかを容易に理解することができる。従って、Fab領域由来の複数のペプチドのうち、特に好適なペプチドを分析対象として選択することができる。このように選択されるペプチドは「シグネチャーペプチド」と呼ばれている。
抗トラスツズマブ抗体(ADA)として、HCA168、HCA176、HCA177(いずれもBIO-RAD社)、及びMAB11130(Abnova社)を使用した。各ADAの作製に使用されている免疫原、ADAの型及びトラスツズマブとの親和性を表1に示す。
本実施例において使用したLC-MS分析条件は以下の通りである。
[LC] NexeraX2 システム(島津製作所)
溶媒A:0.1% ギ酸+水
溶媒B:0.1% ギ酸+アセトニトリル
オートサンプラー洗浄:超純水
流速:0.4 mL/分
カラム:Shim-pack GISS 2.1 x 50 mm, 1.9 μm, 20 nm pore
カラムオーブン温度:50℃
サンプルクーラー温度:5℃
勾配:3%B (1.5 分) / 3-30%B (3.5 分) / 95%B (1 分) / 3%B (1 分)
注入量:10μL
インターフェイス条件:
インターフェイス電圧:4 kV
ネブライザーガス流量:3 L/分
ヒーティングガス流量:10 L/分
ドライイングガス流量:10 L/分
インターフェイス温度:300℃
DL温度:250℃
ヒートブロック温度:400℃
トラスツズマブ濃度50μg/mLとして、実施例1と同様の試験を行った結果を表4に示す。
Protein A上に固定されたトラスツズマブの配向性がnSMOL法による定量へのADAの影響に関与するかを検討した。すべての条件で配向性を揃えるために、先にProtein A上にトラスツズマブを固定し、Protein A上に固定したトラスツズマブにADAを結合させ、実施例1に記載の条件でnSMOL法による測定を行った。ADAは実施例1及び2と同じものを使用した。
ヒトIgG (1 mg/mL、コスモバイオ社) を400μg加え、10分間室温で軽く振盪しながら反応させた。
未反応のIgGを濾過によって除去し、0.1%OTGを含有するPBSで洗浄を行った。
ADAを加えて、30分間室温で軽く振盪しながら反応させた。
ADA結合トラスツズマブの濃度をnSMOL法で定量した。結果を表5に示す。
トラスツズマブ濃度0.5μg/mLとして、異なるキットを用いたELISA法の検出結果を検討した。
ELISAキットとして、捕捉試薬としてトラスツズマブ特異的抗イディオタイプモノクローナル抗体、検出試薬としてトラスツズマブ特異的ポリクローナル抗体を使用するキットA(Trastuzumab PK ELISA, Somru BioScience, SBA-100-007-035)、及び、捕捉試薬としてリガンドとなるヒト組換えHER2、検出試薬としてHRPコンジュゲート抗ヒトIgG Fcモノクローナル抗体を使用するキットB(MATRIKS BIOTEK, TR-TRASV1)を用いた。表6に示すように、ELISAキットの種類によってADA結合トラスツズマブの定量値に差が生じることが明らかとなった。
トラスツズマブ0.5μg/mLとして、標的分子であるHER2の存在下での検出結果への影響を検討した。
ヒト組換えHER2(フナコシ)及びトラスツズマブ(中外製薬株式会社)を、0.1%OTGを含有するPBS中で室温で30分間反応させて結合した。トラスツズマブへのHER2の結合をウェスタンブロットで確認した。
ヒト血漿(コージンバイオ株式会社製、5μmのフィルターで濾過後、0.8μmのフィルターで濾過したもの)を10μL加えた。nSMOL法で定量するサンプルはnSMOL法による前処理及び定量まで-30℃で保存した。
HER2結合トラスツズマブの血漿中濃度を実施例1に記載の条件でELISA法とnSMOL法で定量した。
その結果、表7に示すように、トラスツズマブに対して100倍量のHER2が存在しても、nSMOL法では検出結果にほとんど影響しなかった。これに対してELISA法では、HER2の量に依存して、検出結果が大きく影響を受けた。
抗ベバシズマブ抗体(ADA)として、HCA182、HCA185、HCA177(いずれもBIO-RAD社)、及びMAB11128(clone2C8、Abnova社)を使用した。各ADAの作製に使用されている免疫原、ADAの型及びトラスツズマブとの親和性を表8に示す。
表10は、ベバシズマブ濃度0.5μg/mLに対して様々な比率で抗ベバシズマブ抗体を使用した場合のnSMOL法及びELISA法での検出結果における真度(%)を示す。
ベバシズマブ濃度50μg/mLとして、実施例6と同様の試験を行った結果を表11に示す。
Protein A上に固定されるベバシズマブの配向性がnSMOL法による定量へのADAの影響に関与するかを検討した。すべての条件で配向性を揃えるために、先にProtein A上にベバシズマブを固定し、Protein A上に固定したベバシズマブにADAを結合させ、nSMOL法による測定を行った。ADAは実施例6及び7と同じものを使用した。
ベバシズマブ0.5μg/mLとして、標的分子であるVEGFの存在下での検出結果への影響を検討した。
ヒト組換えVEGF(223-01311、Wako社)及びベバシズマブ(中外製薬株式会社)を、反応条件は0.1%OTGを含有するPBS中で室温で30分間反応させて結合した。ベバシズマブへのVEGFの結合をウェスタンブロットで確認した。
ヒト血漿(コージンバイオ株式会社製、5μmのフィルターで濾過後、0.8μmのフィルターで濾過したもの)を10μL加えた。nSMOL法で定量するサンプルはnSMOL法による前処理及び定量まで-30℃で保存した。
VEGF結合ベバシズマブの血漿中濃度を実施例6と同様にELISA法とnSMOL法で定量した。
VEGFをベバシズマブに等量反応させ、ベバシズマブの各濃度での定量値の真度を実施例9と同様の条件でnSMOL法により検討した。その結果、表14に示すように、nSMOL法によるベバシズマブの定量に対して、VEGFの結合は検量線の範囲内の濃度いずれにも影響を及ぼさなかった。
本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願はそのまま引用により本明細書に組み入れられるものとする。
Claims (3)
- 被験者由来の生物学的試料中のモノクローナル抗体を細孔内に固定化した多孔質体と、
プロテアーゼを固定化したナノ粒子とを液体中で接触させてモノクローナル抗体の選択的プロテアーゼ消化を行うステップと、
消化されたペプチド断片を液体クロマトグラフ質量分析(LC−MS)によって検出することによって該生物学的試料中の該モノクローナル抗体濃度を算出するステップと、
算出した該モノクローナル抗体濃度を基に、該モノクローナル抗体に対して特異的に結合する抗体の存在による算出結果への影響の有無及び/又は程度を決定するステップと、を含み、上記算出結果を該モノクローナル抗体に対して特異的に結合する抗体の存在下での検出結果と比較することによって、上記算出結果への影響の有無及び/又は程度を決定する、モノクローナル抗体の検出方法。 - 上記モノクローナル抗体がトラスツズマブであり、配列番号1〜4に示すアミノ酸配列を有するペプチド断片を検出する、請求項1記載の検出方法。
- 上記モノクローナル抗体がベバシズマブであり、配列番号5〜7に示すアミノ酸配列を有するペプチド断片を検出する、請求項1記載の検出方法。
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