JP7062003B2 - ポックスウイルス内における導入遺伝子の安定性を向上させるための組成物及び方法 - Google Patents
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Description
本明細書で使用する場合、単数形「a」、「an」、及び「the」は、文脈上特に明確に示さない限り、複数の指示対象を含む。それゆえ、例えば、「a nucleic acid(核酸)」への言及は核酸のうちの1以上を含み、また「the method(方法)」への言及は、本明細書に記載の方法に変更または置き換え可能な当業者に周知の同等のステップ及び方法への言及を含む。
本発明の開発において、本発明者らは、組換えポックスウイルス、特に、オルソポックスウイルス(例えば、ワクシニアウイルス、MVA、MVA-BN)及びアビポックスウイルス(例えば、鶏痘ウイルス)の継代過程にわたり、MUC1、CEA及び/またはTRICOMをコードする核酸における1つ以上の領域が変異(例えば、欠失、置換など)し、それにより組換えポックスウイルス及びそこに含まれる導入遺伝子に不安定性がもたらされることを明らかにした。
上記のとおり、VNTR領域は、20アミノ酸の可変数タンデム反復(VNTR)ドメイン(異なる個体において反復数は20~120の範囲で変動する)を含むMUC1の細胞外ドメインである。Brayman et al.を参照されたい。VNTRドメインのアミノ酸配列が通常同一である(例えば、図2Aを参照のこと)一方で、VNTRのヌクレオチド配列は互いに異なり得る。図2Aに示すように、PANVACの一部であるMUC1が6つのVNTRを有するように合成された。
本発明の別の態様では、VNTRドメインの外側の領域に対して1以上の修飾を行った。本発明の開発過程にわたる更に特定の態様では、MUC1 VNTR領域の外側(非VNTR領域)のそれらヌクレオチド領域内における1つ以上の修飾が、MUC1導入遺伝子の安定性を向上させたことが明らかとなった。それら領域(下線を付したヌクレオチド)の代表的なサンプルを以下に示す。VNTR領域は灰色で網掛けしている。
本発明の別の態様では、CEA核酸の反復領域内における1つ以上の修飾が、CEA導入遺伝子の安定性を向上させることが明らかとなった。それら領域の代表的なサンプルを、図5のペアワイズアライメントで示す。それら例示的な反復領域は示した置換(アライメントの非*領域)により示されている。
本発明の別の態様では、TRICOM共刺激分子をコードする1以上の核酸に対して1超の修飾を行った。更に特定の態様では、本発明の開発過程にわたり、TRICOM核酸の反復領域内における1つ以上の修飾が、TRICOM導入遺伝子の安定性を向上させることが明らかとなった。それら領域の代表的なサンプルを、図6~図8のペアワイズアライメントで示す。それら例示的な反復領域は示した置換(アライメントの非*領域)により示されている。
1つ以上の実施形態では、本発明は、本明細書に記載のMUC1核酸のうちの1以上を含む組換えポックスウイルスを含む。より好ましい実施形態では、組換えポックスウイルスは、本明細書に記載のMUC1核酸配列及びCEA核酸配列を含む。
様々な態様では、本明細書に記載の1つ以上の核酸は、1つ以上の核酸が発現制御配列と機能的に連結している1つ以上の発現カセット内に組み入れられる。「機能的に連結する」とは、記載した構成要素同士がそれらの意図した様式で機能するような関係にあることを意味し、例えば、プロモーターが発現される核酸を転写するなどである。コード配列と機能的に連結している発現制御配列は、コード配列の発現が発現制御配列と適合する条件下で達成されるように結合している。発現制御配列としては、適切なプロモーター、エンハンサー、転写ターミネーター、タンパク質コードオープンリーディングフレームの先頭にある開始コドン、イントロン用のスプライシングシグナル、及びインフレーム終止コドンが挙げられるがこれらに限定されない。好適なプロモーターとしては、SV40初期プロモーター、RSVプロモーター、レトロウイルスLTR、アデノウイルス主要後期プロモーター、ヒトCMV前初期Iプロモーター、ならびに、以下のワクシニアウイルスまたはMVA由来プロモーター及びFPV由来プロモーター、30Kプロモーター、I3プロモーター、PrSプロモーター、PrS5Eプロモーター、Pr7.5K、Pr13.5長プロモーター、40Kプロモーター、MVA-40Kプロモーター、FPV 40Kプロモーター、30kプロモーター、PrSynIImプロモーター及びPrLE1プロモーターを含むがこれらに限定されない様々なポックスウイルスプロモーターが挙げられるがこれらに限定されない。追加のプロモーターについては、WO2010/060632、WO2010/102822、WO2013/189611及びWO2014/063832に更に記載されている(それらは全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
当該技術分野において周知の通常の方法を用いて本明細書で提供する組換えポックスウイルスを作製することができる。組換えポックスウイルスを得るための方法または外来コード配列をポックスウイルスゲノム内に挿入するための方法は当業者に周知である。例えば、標準的な分子生物学的手法、例えば、DNAのクローニング、DNA及びRNAの単離、ウェスタンブロット解析、RT-PCR、ならびにPCR増幅手法などの方法については、Molecular Cloning,A laboratory Manual(2nd Ed.)[J.Samb rook et al.,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989)]に記載されており、ウイルスの取り扱い法及び処理法については、Virology Methods Manual[B.W.J.Mahy et al.(eds.),Academic Press(1996)]に記載されている。同様に、MVAの取り扱い、処理及び遺伝子操作のための技術及びノウハウについては、Molecular Virology:A Practical Approach [A.J.Davison & R.M.Elliott(Eds.),The Practical Approach Series,IRL Press at Oxford University Press,Oxford,UK(1993)(例えば、Chapter 9:Expression of genes by Vaccinia virus vectorsを参照のこと)]及びCurrent Protocols in Molecular Biology[John Wiley & Son,Inc.(1998)(例えば、Chapter 16,Section IV:Expression of proteins in mammalian cells using vaccinia viral vectorを参照のこと)]に記載されている。
ある特定の実施形態では、本開示の組換えポックスウイルスは、ワクチンの一部として製剤化することができる。ワクチンを調製するために、ポックスウイルスを生理学的に許容される形態に変換してもよい。ある特定の実施形態では、そのような調製は、天然痘に対するワクチン接種に使用されるポックスウイルスワクチンの調製に関する知見(例えば、Stickl,H.et al.,Dtsch.med.Wschr.99,2386-2392(1974)に記載されている)に基づいている。
様々な実施形態の1つでは、本発明は、本明細書に記載の核酸を含む組換えポックスウイルスを含むキット及び/または組成物を包含する。組成物は医薬組成物または免疫原性組成物であることが好ましい。
1.別の実施形態では、組換えポックスウイルスの連続継代中に安定な前記組換えポックスウイルスを作製するための方法が存在し、前記方法は、
a)少なくとも2つの可変N末端反復(VNTR)ドメインを有するMUC1ペプチドをコードする第1の核酸を提供することを含み、a)前記少なくとも2つのVNTRドメインの配置はシャッフルされ、b)前記少なくとも2つのVNTRドメインはコドン最適化され、前記組換えポックスウイルスは前記組換えポックスウイルスの連続継代中に安定である、前記方法。
CEF培養物の同時の感染及び形質移入により、指定のMUC1核酸配列及びCEA核酸配列をそれらのプロモーターと共に挿入してから、ウイルスゲノムと組換えプラスミドpBN146の間で相同組換えさせることにより、MUC1(例えば、mBN399、mBN400、mBN336、mBN373及びmBN420)をコードするポックスウイルスの作製を実施した。挿入を有するウイルスを単離して特徴づけしてから、ウイルスストックを作製した。
7継代の培養によりMVA-mBN336Bの遺伝的安定性を評価した。MVA-mBN336B(ヒトムチン1(MUC-1)及びヒト癌胎児性抗原(CEA)をこのワクチン候補の標的抗原とする)は、5種類のヒト導入遺伝子、ならびに、強力で直接的な免疫応答を誘導するための補助としてのヒト免疫共刺激分子(TRIad of COstimulatory Molecules(三つ組み共刺激分子)またはTRICOMと呼ばれる)をコードする3種類の遺伝子、白血球機能関連抗原-3(LFA-3)、細胞内接着分子1(ICAM-1)及びB7-1、をコードする。MVA-BN(登録商標)の3つの遺伝子間領域(IGR)、CEA遺伝子を含有するIGR 44/45、hMUC1遺伝子を含有するIGR 88/89及びTRICOM遺伝子を含有するIGR 148/149に、導入遺伝子を挿入した。ポックスウイルスプロモーター、40k-MVA1、30k、I3L及びPrSで導入遺伝子発現を駆動した。
FPV-mBN373Bの遺伝的安定性を7継代にわたり評価した。治験薬の作製に使用する大規模製造中に利用したローラーボトル(RB)内で培養を行った。それぞれの継代について、ウイルス力価をフローサイトメトリーアッセイで、また導入遺伝子インサートの正確なサイズをPCRで解析した。加えて、導入遺伝子のシークエンシングにより最終継代(P7)を解析した。
MVA-mBN420の遺伝的安定性を7継代にわたり評価した。治験薬の作製に使用する大規模製造中に利用したローラーボトル(RB)内で培養を行った。約0.05~0.1のMOI及び4日間のウイルス培養期間を使用して30℃及び34℃で試験を実施した(これらの条件は、治験薬の作製に使用する通常の大規模製造における代表的なものである)。それぞれの継代について、ウイルス力価をフローサイトメトリーアッセイで、また導入遺伝子インサートの正確なサイズをPCRで解析した。
本発明の追加の組換えMVAウイルス及び組換え鶏痘ウイルスの作製は、実施例1に記載のように行う。配列番号31、32、33または34(MUC1)及び配列番号13または14(CEA)を含むMUC1導入遺伝子、CEA導入遺伝子及びTRICOM導入遺伝子をコードする核酸を、実施例1に記載のようにMVA-BNに挿入する。加えて、実施例1に記載のように、TRICOMをMVAに挿入し、配列番号15または17(B7.1)、配列番号18または20(ICAM-1)及び配列番号21または23(LFA-3)を含むTRICOM配列をMVAに挿入する。
なお、本願は特許請求の範囲に記載の発明に関するものであるが、他の態様として以下も包含し得る。
1.連続継代中に安定な前記組換えポックスウイルスであって、前記組換えポックスウイルスは、少なくとも2つの可変N末端反復(VNTR)ドメインを有するMUC1ペプチドをコードする第1の核酸を含み、a)前記少なくとも2つのVNTRドメインの配置がシャッフルされ、b)前記少なくとも2つのVNTRドメインはコドン最適化され、前記組換えポックスウイルスは連続継代中に安定である、前記組換えポックスウイルス。
2.前記第1の核酸は少なくとも3つのVNTRドメインを含む、上記1に記載の組換えポックスウイルス。
3.前記少なくとも2つのVNTRドメインの順番は、配列番号6と比較してシャッフルされている、上記1から上記2のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
4.a)及びb)の存在は、PANVACと比較して連続継代中の安定性を向上させる、上記1から上記3のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
5.前記第1の核酸配列は、配列番号2に対して少なくとも95%、96%、97%または98%の同一性を有する核酸配列を含む、上記1から上記4のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
6.前記第1の核酸配列は配列番号2を含む、上記1から上記5のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
7.癌胎児性抗原(CEA)をコードする第2の核酸を更に含む、上記1から上記6のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
8.前記第2の核酸は配列番号13を含む、上記7に記載の組換えポックスウイルス。
9.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含み、前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGまたはCヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したTヌクレオチドと定義される、上記7に記載の組換えポックスウイルス。
10.前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したCヌクレオチドと更に定義される、上記9に記載の組換えポックスウイルス。
11.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記9から上記10のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
12.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記9から上記10のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
13.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも2、3、4、5または10の前記反復ヌクレオチド領域に少なくとも1つの置換を含む、上記9から上記12のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
14.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも10、少なくとも12、少なくとも15及び/または少なくとも19の反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、上記9から上記13のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
15.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の19領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、上記9から上記14のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
16.前記第2の核酸は配列番号14を含む、上記9から上記14のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
17.前記組換えポックスウイルスはオルソポックスウイルス及びアビポックスウイルスから選択される、上記1から上記16のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
18.前記オルソポックスウイルスはワクシニアウイルスである、上記17に記載の組換えポックスウイルス。
19.前記ワクシニアウイルスは改変ワクシニアウイルスアンカラ(MVA)である、上記18に記載の組換えポックスウイルス。
20.前記MVAはMVA-BNまたはMVA-BNの誘導体である、上記19に記載の組換えポックスウイルス。
21.前記組換えポックスウイルスは、少なくとも継代3及び/または継代4中に安定である、上記1から上記20のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
22.前記アビポックスウイルスは鶏痘ウイルスである、上記17に記載の組換えポックスウイルス。
23.前記組換えポックスウイルスは、少なくとも継代4中に、好ましくは少なくとも継代7中に安定である、上記22に記載の組換えポックスウイルス。
24.前記第1の核酸は、YLAPPAHGV(配列番号25)、YLDTRPAPV(配列番号26)、YLAIVYLIAL(配列番号27)、YLIALAVCQV(配列番号28)、YLSYTNPAV(配列番号29)、SLFRSPYEK(配列番号30)及びこれらの組み合わせからなる群から選択されるペプチド断片をコードするヌクレオチド配列を更に含む、上記1から上記23のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
25.前記ポックスウイルスは、1以上の共刺激分子をコードする核酸を更に含む、上記1から上記24のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
26.前記1以上の共刺激分子は、B7-1、ICAM-1、LFA-3及びこれらの組み合わせから選択される、上記25に記載の組換えポックスウイルス。
27.前記B7-1核酸は、配列番号15、16または17に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記26に記載の組換えポックスウイルス。
28.前記B7-1核酸は配列番号15、16または17を含む、上記26から上記27のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
29.前記B7-1核酸は配列番号17を含む、上記26から上記28のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
30.前記B7-1核酸は配列番号15を含む、上記26から上記28のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
31.前記ICAM-1核酸は、配列番号18、19または20に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記26に記載の組換えポックスウイルス。
32.前記ICAM-1核酸は配列番号18、19または20を含む、上記26及び上記31のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
33.前記ICAM-1核酸は配列番号18を含む、上記26及び上記31から上記32のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
34.前記ICAM-1核酸は配列番号20を含む、上記26及び上記31から上記32のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
35.前記LFA-3核酸は、配列番号21、22または23に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記26に記載の組換えポックスウイルス。
36.前記LFA-3核酸は配列番号21、22または23を含む、上記35に記載の組換えポックスウイルス。
37.前記LFA-3核酸は配列番号21を含む、上記35から上記36のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
38.前記LFA-3核酸は配列番号23を含む、上記35から上記36のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
39.連続継代中に安定な組換えポックスウイルスを作製するための方法であって、前記方法は、
少なくとも2つの可変N末端反復(VNTR)ドメインを有するMUC1タンパク質をコードする第1の核酸を提供することを含み、a)前記少なくとも2つのVNTRドメインの配置はシャッフルされ、b)前記少なくとも2つのVNTRドメインはコドン最適化され、前記組換えポックスウイルスは連続継代中に安定である、前記方法。
40.前記第1の核酸は少なくとも3つのVNTRドメインを含む、上記39に記載の方法。
41.少なくとも2つのVNTRドメインの順番は、配列番号6と比較してシャッフルされている、上記39から上記40のいずれか1項に記載の方法。
42.a)及びb)の存在は、PANVACと比較して連続継代中の安定性を向上させる、上記39から上記41のいずれか1項に記載の方法。
43.前記第1の核酸配列は、配列番号2または配列番号3に対して少なくとも95%、96%、97%または98%の同一性を有する核酸配列を含む、上記39から上記42のいずれか1項に記載の方法。
44.前記第1の核酸配列は配列番号2または配列番号3を含む、上記39から上記43のいずれか1項に記載の方法。
45.癌胎児性抗原(CEA)をコードする第2の核酸を更に含む、上記39から上記44のいずれか1項に記載の方法。
46.前記第2の核酸は配列番号13を含む、上記45に記載の方法。
47.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含み、前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGまたはCヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したTヌクレオチドと定義される、上記45から上記46のいずれか1項に記載の方法。
48.前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したCヌクレオチドと更に定義される、上記45から上記47のいずれか1項に記載の方法。
49.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記45から上記48のいずれか1項に記載の方法。
50.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記47から上記49のいずれか1項に記載の方法。
51.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも2、3、4、5または10の前記反復ヌクレオチド領域に少なくとも1つの置換を含む、上記47から上記50のいずれか1項に記載の方法。
52.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも10、少なくとも12、少なくとも15及び/または少なくとも19の反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、上記47から上記51のいずれか1項に記載の方法。
53.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の19領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、上記47から上記52のいずれか1項に記載の方法。
54.前記第2の核酸は配列番号14を含む、上記47から上記53のいずれか1項に記載の方法。
55.前記組換えポックスウイルスはオルソポックスウイルス及びアビポックスウイルスから選択される、上記39から上記54のいずれか1項に記載の方法。
56.前記オルソポックスウイルスはワクシニアウイルスである、上記55に記載の方法。
57.前記ワクシニアウイルスは改変ワクシニアウイルスアンカラ(MVA)である、上記56に記載の方法。
58.前記MVAはMVA-BNまたはMVA-BNの誘導体である、上記57に記載の方法。
59.前記組換えポックスウイルスは少なくとも継代3または継代4中に安定である、上記39から上記58のいずれか1項に記載の方法。
60.前記アビポックスウイルスは鶏痘ウイルスである、上記55に記載の方法。
61.前記組換えポックスウイルスは少なくとも継代3または継代4中に安定である、上記60に記載の方法。
62.前記第1の核酸は、YLAPPAHGV(配列番号25)、YLDTRPAPV(配列番号26)、YLAIVYLIAL(配列番号27)、YLIALAVCQV(配列番号28)、YLSYTNPAV(配列番号29)、SLFRSPYEK(配列番号30)及びこれらの組み合わせからなる群から選択されるペプチド断片をコードするヌクレオチド配列を更に含む、上記39から上記61のいずれか1項に記載の方法。
63.前記ポックスウイルスは、1以上の共刺激分子をコードする核酸を更に含む、上記39から上記62のいずれか1項に記載の方法。
64.前記1以上の共刺激分子は、B7-1、ICAM-1、LFA-3及びこれらの組み合わせから選択される、上記63に記載の方法。
65.前記B7-1核酸は、配列番号15、16または17に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記64に記載の方法。
66.前記B7-1核酸は配列番号15、16または17を含む、上記64から上記65のいずれか1項に記載の方法。
67.前記B7-1核酸は配列番号17を含む、上記64から上記66のいずれか1項に記載の方法。
68.前記B7-1核酸は配列番号15を含む、上記64から上記66のいずれか1項に記載の方法。
69.前記ICAM-1核酸は、配列番号18、19または20に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記64に記載の方法。
70.前記ICAM-1核酸は配列番号18、19または20を含む、上記64及び上記69のいずれか1項に記載の方法。
71.前記ICAM-1核酸は配列番号18を含む、上記64及び上記69から上記70のいずれか1項に記載の方法。
72.前記ICAM-1核酸は配列番号20を含む、上記64及び上記69から上記70のいずれか1項に記載の方法。
73.前記LFA-3核酸は、配列番号21、22または23に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記64に記載の方法。
74.前記LFA-3核酸は配列番号21、22または23を含む、上記64及び上記73のいずれか1項に記載の方法。
75.前記LFA-3核酸は配列番号21を含む、上記64及び上記73から上記74のいずれか1項に記載の方法。
76.前記LFA-3核酸は配列番号23を含む、上記64及び上記73から上記74のいずれか1項に記載の方法。
77.少なくとも2つの可変N末端反復(VNTR)ドメインを有するMUC1ペプチドをコードする核酸であって、a)前記少なくとも2つのVNTRドメインの配置はシャッフルされ、b)前記少なくとも2つのVNTRドメインはコドン最適化され、組換えポックスウイルスの一部としての前記核酸の存在は、a)及びb)を伴わないMUC1ペプチドをコードする組換えポックスウイルスと比較して連続継代中における前記核酸及び/または前記組換えポックスウイルスの安定性を向上させる、前記核酸。
78.前記第1の核酸は少なくとも3つのVNTRドメインを含む、上記77に記載の核酸。
79.前記少なくとも2つのVNTRドメインの順番は、配列番号6と比較してシャッフルされている、上記77から上記78のいずれか1項に記載の核酸。
80.MUC1ペプチドをコードする核酸であって、前記核酸は少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域にヌクレオチド置換を含み、前記反復領域は前記核酸の可変数タンデム反復(VNTR)ドメインの外側にあり、前記反復ヌクレオチド領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTまたはCヌクレオチドと定義され、組換えポックスウイルスの一部としての前記核酸の存在は、ヌクレオチド置換を伴わないMUC1ペプチドをコードする組換えポックスウイルスと比較して連続継代中における前記核酸及び/または前記組換えポックスウイルスの安定性を向上させる、前記核酸。
81.前記反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記80に記載の核酸。
82.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTまたはCヌクレオチドと更に定義される、上記80から上記81のいずれか1項に記載の核酸。
83.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記80から上記82のいずれか1項に記載の核酸。
84.前記ヌクレオチド置換は、前記核酸の少なくとも2、3、4または5つの反復ヌクレオチド領域にある、上記80から上記83のいずれか1項に記載の核酸。
85.前記ヌクレオチド置換は、前記核酸の少なくとも10、15、20または25の反復ヌクレオチド領域内にある、上記80から上記84のいずれか1項に記載の核酸。
86.前記核酸は前記VNTRドメインに第1の修飾を更に含み、前記第1の修飾は前記VNTRドメイン反復の順番のシャッフルを含む、上記80から上記85のいずれか1項に記載の核酸。
87.前記核酸は前記VNTRドメインに第2の修飾を更に含み、前記第2の修飾は前記VNTRドメイン反復のコドン最適化を含む、上記80から上記86のいずれか1項に記載の核酸。
88.前記ヌクレオチド置換は前記MUC1ペプチドのアミノ酸配列を修飾しない、上記80から上記87のいずれか1項に記載の核酸。
89.前記核酸は、配列番号4に対して少なくとも95%相同である、配列番号3に対して少なくとも95%相同である、配列番号5に対して少なくとも95%相同である、または、配列番号2(336 MUC1)に対して少なくとも95%相同である、上記80から上記88のいずれか1項に記載の核酸。
90.前記核酸は配列番号2に対して少なくとも95%相同である、上記80から上記89のいずれか1項に記載の核酸。
91.前記核酸は配列番号4に対して少なくとも95%相同である、上記80から上記90のいずれか1項に記載の核酸。
92.前記核酸は配列番号3に対して少なくとも95%相同である、上記80から上記91のいずれか1項に記載の核酸。
93.前記核酸は配列番号4を含む、上記80から上記92のいずれか1項に記載の核酸。
94.前記核酸は配列番号3を含む、上記80から上記93のいずれか1項に記載の核酸。
95.前記核酸は配列番号2を含む、上記80から上記94のいずれか1項に記載の核酸。
96.CEAペプチドをコードする核酸であって、前記核酸は少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域にヌクレオチド置換を含み、前記反復領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと定義され、組換えポックスウイルスの一部としての前記核酸の存在は、前記置換を伴わないCEAペプチドをコードする組換えポックスウイルスと比較して連続継代中における前記核酸及び/または前記組換えポックスウイルスの安定性を向上させる、前記核酸。
97.前記反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記96に記載の核酸。
98.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記96から上記97のいずれか1項に記載の核酸。
99.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記96から上記98のいずれか1項に記載の核酸。
100.前記ヌクレオチド置換は、前記核酸の少なくとも2、3、4、5、8または10の反復ヌクレオチド領域にある、上記96から上記99のいずれか1項に記載の核酸。
101.前記ヌクレオチド置換は前記CEAペプチドのアミノ酸配列を修飾しない、上記96から上記100のいずれか1項に記載の核酸。
102.前記核酸は配列番号14を含む、上記96から上記101のいずれか1項に記載の核酸。
103.B7-1ペプチドをコードする核酸であって、前記核酸は少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域にヌクレオチド置換を含み、前記反復領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと定義され、組換えポックスウイルスの一部としての前記核酸の存在は、前記ヌクレオチド置換を伴わないB7-1ペプチドをコードする組換えポックスウイルスと比較して連続継代中における前記核酸及び/または前記組換えポックスウイルスの安定性を向上させる、前記核酸。
104.前記反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記103に記載の核酸。
105.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTまたはCヌクレオチドと更に定義される、上記103から上記104のいずれか1項に記載の核酸。
106.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記103から上記105のいずれか1項に記載の核酸。
107.前記ヌクレオチド置換は、前記核酸の少なくとも2、3、4、5、8または10の反復ヌクレオチド領域にある、上記103から上記106のいずれか1項に記載の核酸。
108.前記ヌクレオチド置換は前記B7-1ペプチドのアミノ酸配列を修飾しない、上記103から上記107のいずれか1項に記載の核酸。
109.前記核酸は配列番号15に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記103から上記108のいずれか1項に記載の核酸。
110.前記核酸は配列番号15を含む、上記103から上記109のいずれか1項に記載の核酸。
111.前記核酸は配列番号17に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記103から上記108のいずれか1項に記載の核酸。
112.前記核酸は配列番号17を含む、上記103から上記109のいずれか1項に記載の核酸。
113.ICAM-1ペプチドをコードする核酸であって、前記核酸は少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域にヌクレオチド置換を含み、前記反復領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと定義され、組換えポックスウイルスの一部としての前記核酸の存在は、前記ヌクレオチド置換を伴わないICAM-1ペプチドをコードする組換えポックスウイルスと比較して連続継代中における前記核酸及び/または前記組換えポックスウイルスの安定性を向上させる、前記核酸。
114.前記反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記113に記載の核酸。
115.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTまたはCヌクレオチドと更に定義される、上記113から上記114のいずれか1項に記載の核酸。
116.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記113から上記115のいずれか1項に記載の核酸。
117.前記ヌクレオチド置換は、前記核酸の少なくとも2、3、4、5、8または10の反復ヌクレオチド領域にある、上記113から上記116のいずれか1項に記載の核酸。
118.前記ヌクレオチド置換は前記ICAM-1ペプチドのアミノ酸配列を修飾しない、上記113から上記117のいずれか1項に記載の核酸。
119.前記核酸は配列番号18に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記113から上記118のいずれか1項に記載の核酸。
120.前記核酸は配列番号18を含む、上記113から上記119のいずれか1項に記載の核酸。
121.前記核酸は配列番号20に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記113から上記118のいずれか1項に記載の核酸。
122.前記核酸は配列番号20を含む、上記113から上記118のいずれか1項に記載の核酸。
123.LFA-3ペプチドをコードする核酸であって、前記核酸は少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域にヌクレオチド置換を含み、前記反復領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTまたはCヌクレオチドと定義され、組換えポックスウイルスの一部としての前記核酸の存在は、前記ヌクレオチド置換を伴わないLFA-3ペプチドをコードする組換えポックスウイルスと比較して連続継代中における前記核酸及び/または前記組換えポックスウイルスの安定性を向上させる、前記核酸。
124.前記反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記123に記載の核酸。
125.前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTまたはCヌクレオチドと更に定義される、上記123から上記124のいずれか1項に記載の核酸。
126.前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記123から上記125に記載の核酸。
127.前記ヌクレオチド置換は、前記核酸の少なくとも2、3、4、5、8または10の反復ヌクレオチド領域にある、上記123から上記126のいずれか1項に記載の核酸。
128.前記ヌクレオチド置換は前記LFA-3ペプチドのアミノ酸配列を修飾しない、上記123から上記127のいずれか1項に記載の核酸。
129.前記核酸は配列番号21に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記123から上記128のいずれか1項に記載の核酸。
130.前記核酸は配列番号21を含む、上記123から上記128のいずれか1項に記載の核酸。
131.前記核酸は配列番号23に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記123から上記128のいずれか1項に記載の核酸。
132.前記核酸は配列番号23を含む、上記123から上記128のいずれか1項に記載の核酸。
133.プロモーター、及び前記プロモーターと機能的に連結した上記77から上記132のいずれか1項に記載の組換え核酸を含む、発現カセット。
134.上記1から上記38のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス、上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸、または、上記133に記載の発現カセットを含む、免疫原性組成物。
135.上記1から上記38のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス、上記76から上記132のいずれか1項に記載の核酸、または、上記133に記載の発現カセットを含む、宿主細胞。
136.上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸、または、上記133に記載の発現カセットを含む、ベクター。
137.組換えポックスウイルスの連続継代中に安定なMUC1導入遺伝子を有する前記組換えポックスウイルスを作製するための方法であって、前記方法は、
上記77から上記132に記載の核酸または上記133に記載の発現カセットのいずれか1つを提供することと、
前記核酸または前記発現カセットを組換えポックスウイルス内に挿入することと、
を含む、前記方法。
138.前記組換えポックスウイルスはオルソポックスウイルス及びアビポックスウイルスから選択される、上記137に記載の方法。
139.前記オルソポックスウイルスはワクシニア、MVA、MVA-BN及びMVA-BNの誘導体から選択される、上記138に記載の方法。
140.前記組換えポックスウイルスは最大4継代中に安定である、上記137から上記139のいずれか1項に記載の方法。
141.前記アビポックスウイルスは鶏痘ウイルスである、上記137に記載の方法。
142.前記アビポックスウイルスは少なくとも3または4継代中に安定である、または、少なくとも7継代中に安定である、上記137及び上記141のいずれか1項に記載の方法。
143.組換えポックスウイルスの連続継代中に安定なMUC1ペプチドをコードする前記組換えポックスウイルスを作製するための方法であって、前記方法は、
MUC1タンパク質をコードする第1の核酸を提供することであって、前記MUC1タンパク質は少なくとも2つのVNTRドメインを含む、前記提供することと、
前記少なくとも2つのVNTRドメイン反復の順番をシャッフルまたは再編成することと、
前記少なくとも2つのVNTRドメイン反復のコドンを最適化することと、
前記第1の核酸配列を前記ポックスウイルス内に挿入して、連続継代中に安定な組換えポックスウイルスを作製することと、
を含む、前記方法。
144.前記置換は前記MUC1ペプチドのアミノ酸配列を修飾しない、上記143に記載の方法。
145.前記第1の核酸は、配列番号2に対して少なくとも95%相同である、配列番号4に対して少なくとも95%相同である、配列番号3に対して少なくとも95%相同である、または、配列番号5に対して少なくとも95%相同である、上記143から上記144のいずれか1項に記載の方法。
146.前記核酸は配列番号2に対して少なくとも95%相同である、上記143から上記145のいずれか1項に記載の方法。
147.前記核酸は配列番号3に対して少なくとも95%相同である、上記143から上記145のいずれか1項に記載の方法。
148.前記核酸は配列番号2を含む、上記143から上記145のいずれか1項に記載の方法。
149.前記核酸は配列番号5を含む、上記143から上記145のいずれか1項に記載の方法。
150.上記143から上記149のいずれか1項に記載の方法であって、前記方法は、CEAペプチドをコードする第2の核酸の反復ヌクレオチド領域内における少なくとも1つのヌクレオチドを置換することであって、前記反復ヌクレオチド領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTまたはCヌクレオチドと定義される、前記置換することと、前記第2の核酸を前記組換えポックスウイルス内に挿入することと、を更に含む、前記方法。
151.前記第2の核酸の前記反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記150に記載の方法。
152.前記第2の核酸の前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTまたはCヌクレオチドと更に定義される、上記150から上記151のいずれか1項に記載の方法。
153.前記第2の核酸の前記反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記150から上記152のいずれか1項に記載の方法。
154.前記置換は、前記第2の核酸の少なくとも2、3、4、5または10の反復ヌクレオチド領域にある、上記150から上記153のいずれか1項に記載の方法。
155.前記第2の核酸は配列番号14を含む、上記150から上記154のいずれか1項に記載の方法。
156.上記143から上記155のいずれか1項に記載の方法であって、前記方法は、B7-1、ICAM-1及び/またはLFA-3、CEAから選択される共刺激分子をコードする第3の核酸の反復ヌクレオチド領域内における少なくとも1つのヌクレオチドを置換することであって、前記反復ヌクレオチド領域は、(i)3以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)3以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTまたはCヌクレオチドと定義される、前記置換することと、前記第3の核酸を前記組換えポックスウイルス内に挿入することと、を更に含む、前記方法。
157.前記共刺激分子反復領域は、(i)3以上の連続したGヌクレオチド、(ii)3以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)3以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記156に記載の方法。
158.前記共刺激分子反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTまたはCヌクレオチドと更に定義される、上記156から上記157のいずれか1項に記載の方法。
159.前記共刺激分子反復領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、上記156から上記158のいずれか1項に記載の方法。
160.前記置換は、前記共刺激分子核酸の少なくとも2、3、4、5または10の反復ヌクレオチド領域にある、上記156から上記159のいずれか1項に記載の方法。
161.前記共刺激分子をコードする前記核酸はB7-1、ICAM-1、LFA-3及びこれらの組み合わせから選択される、上記156から上記160のいずれか1項に記載の方法。
162.前記B7.1共刺激分子をコードする前記核酸は、配列番号15または配列番号17に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記156から上記160のいずれか1項に記載の方法。
163.前記B7.1共刺激分子をコードする前記核酸は配列番号15または配列番号17を含む、上記156から上記162のいずれか1項に記載の方法。
164.前記ICAM-1共刺激分子をコードする前記核酸は、配列番号18または配列番号20に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記156から上記163のいずれか1項に記載の方法。
165.前記ICAM-1共刺激分子をコードする前記核酸は配列番号18または配列番号20を含む、上記156から上記164のいずれか1項に記載の方法。
166.前記LFA-3共刺激分子をコードする前記核酸は、配列番号21または配列番号23に対して少なくとも80%、85%、90%または95%相同である、上記156から上記164のいずれか1項に記載の方法。
167.前記LFA-3共刺激分子をコードする前記核酸は配列番号21または配列番号23を含む、上記156から上記164のいずれか1項に記載の方法。
168.前記ポックスウイルスはオルソポックスウイルスである、上記143から上記167のいずれか1項に記載の方法。
169.前記オルソポックスウイルスはワクシニアウイルスである、上記168に記載の方法。
170.前記ワクシニアウイルスは改変ワクシニアアンカラ(MVA)ウイルスである、上記169に記載の方法。
171.前記MVAはMVA-BNまたはMVA-BNの誘導体である、上記170に記載の方法。
172.前記ポックスウイルスは少なくとも継代3または継代4中に安定である、上記168から上記171のいずれか1項に記載の方法。
173.前記ポックスウイルスはアビポックスウイルスである、上記143から上記167のいずれか1項に記載の方法。
174.前記アビポックスウイルスは鶏痘ウイルスである、上記173に記載の方法。
175.前記ポックスウイルスは少なくとも継代4中に安定である、上記173から上記174のいずれか1項に記載の方法。
176.連続継代中に安定な組換えポックスウイルスを作製するための方法における、a)上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸、b)上記133に記載の発現カセット、c)上記134に記載の組成物、d)上記135に記載の宿主細胞またはe)上記136に記載のベクターの使用。
177.前記ポックスウイルスはワクシニアウイルス、MVA、MVA-BNまたはMVA-BNの誘導体から選択され、前記ポックスウイルスは継代4中に安定である、上記176に記載の使用。
178.前記ポックスウイルスはアビポックスウイルス及び鶏痘ウイルスから選択され、前記ポックスウイルスは少なくとも継代3または継代4中に安定である、上記176に記載の使用。
179.薬剤、好ましくはワクチンの調製における、a)上記1から上記38のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス、b)上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸、b)上記133に記載の発現カセット、c)上記134に記載の組成物、d)上記135に記載の宿主細胞またはe)上記136に記載のベクターの使用。
180.薬剤、好ましくはワクチンとして使用するための、上記1から上記38のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス、b)上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸、b)上記133に記載の発現カセット、c)上記134に記載の組成物、d)上記135に記載の宿主細胞またはe)上記136に記載のベクター。
181.ワクチンの異種プライムブースト投与レジメンに使用するための、上記1から上記38及び上記180のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス、b)上記134に記載の組成物またはc)上記136に記載のベクター。
182.前記異種プライムブースト投与レジメンは、
a)1回または複数回の初回投与量のワクシニアウイルスであって、前記ワクシニアウイルスは上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸を含む、前記ワクシニアウイルスと、
b)上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸を含む1回または複数回のブースト投与量の鶏痘ウイルスと、
を含む、上記181に使用するための組換えポックスウイルス、組成物またはベクター。
183.前記ワクシニアウイルスは改変ワクシニアウイルスアンカラ(MVA)、MVA-BN及びMVA-BNの誘導体から選択される、上記182に使用するための組換えポックスウイルス、組成物またはベクター。
184.連続継代中に安定な組換えポックスウイルスを作製するのに使用するための、上記77から上記132のいずれか1項に記載の核酸、b)上記133に記載の発現カセット、c)上記134に記載の組成物、d)上記135に記載の宿主細胞またはe)上記136に記載のベクター。
185.連続継代中に安定な組換えポックスウイルスを作製するための方法であって、前記方法は、
a)少なくとも2つの可変N末端反復(VNTR)ドメインを有するMUC1ペプチドをコードする第1の核酸を提供することであって、前記少なくとも2つのVNTRドメインの配置はシャッフルされ、b)前記少なくとも2つのVNTRドメインはコドン最適化される、前記提供することと、
b)CEAペプチドをコードする第2の核酸を提供することであって、前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含み、前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGまたはCヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したTヌクレオチドと定義される、前記提供することと、
を含む、前記方法。
186.前記第1の核酸は少なくとも3つのVNTRドメインを含む、上記185に記載の方法。
187.少なくとも2つのVNTRドメインの順番は、配列番号6と比較してシャッフルされている、上記185から上記186のいずれか1項に記載の方法。
188.前記第1の核酸配列は、配列番号2に対して少なくとも95%、96%、97%または98%の同一性を有する核酸配列を含む、上記185から上記187のいずれか1項に記載の方法。
189.前記第1の核酸配列は配列番号2を含む、上記185から上記188のいずれか1項に記載の方法。
190.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を更に含み、前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGまたはCヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したTヌクレオチドと定義される、上記185から上記189のいずれか1項に記載の方法。
191.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも2、3、4、5または10の前記反復ヌクレオチド領域に少なくとも1つの置換を含む、上記185から上記190のいずれか1項に記載の方法。
192.前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも10、少なくとも12、少なくとも15及び/または少なくとも19の反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、上記185から上記191のいずれか1項に記載の方法。
193.前記第2の核酸は配列番号14を含む、上記185から上記192のいずれか1項に記載の方法。
194.前記組換えポックスウイルスはワクシニアウイルス、MVA、MVA-BN及びMVA-BNの誘導体から選択され、少なくとも継代3または継代4中に安定である、上記185から上記193のいずれか1項に記載の方法。
195.前記組換えポックスウイルスはアビポックスウイルス及び鶏痘ウイルスから選択され、少なくとも継代3または継代4中に安定である、上記185から上記193のいずれか1項に記載の方法。
196.前記組換えポックスウイルスはアビポックスウイルス及び鶏痘ウイルスから選択され、少なくとも継代7中に安定である、上記185から上記193のいずれか1項に記載の方法。
Claims (38)
- 連続継代中に安定な組換えポックスウイルスであって、前記組換えポックスウイルスは、3つの可変N末端反復(VNTR)ドメインを有するMUC1ペプチドをコードする第1の核酸を含み、前記第1の核酸の配列は、配列番号2、3または5に対して少なくとも95%の同一性を有する核酸配列を含み、前記組換えポックスウイルスは連続継代中に安定であり、ここで前記の「連続継代中に安定」は前記組換えポックスウイルスの遺伝子組換えヌクレオチド配列が、組換えポックスウイルスの連続継代中に物質的に変化しない状態を少なくとも継代3または継代4となるまで維持することを意味する、前記組換えポックスウイルス。
- PANVACと比較して向上した連続継代中の安定性を有する、請求項1に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第1の核酸の配列は、配列番号2、3または5に対して少なくとも96%、97%または98%の同一性を有する核酸配列を含む、請求項1から請求項2のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第1の核酸の配列は配列番号2、3または5を含む、請求項1から請求項3のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 癌胎児性抗原(CEA)をコードする第2の核酸を更に含む、請求項1から請求項4のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第2の核酸は配列番号13を含む、請求項5に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含み、前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGまたはCヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したTヌクレオチドと定義される、請求項5に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記少なくとも1つの反復ヌクレオチド領域は、a)3以上の連続反復したGヌクレオチド及び/またはb)3以上の連続反復したCヌクレオチドと更に定義される、請求項7に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続反復したヌクレオチド、(ii)4以上の連続したGまたはCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、請求項7から請求項8のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記反復ヌクレオチド領域は、(i)4以上の連続したGヌクレオチド、(ii)4以上の連続したCヌクレオチド及び/または(iii)4以上の連続したTヌクレオチドと更に定義される、請求項7から請求項8のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも2、3、4、5または10の前記反復ヌクレオチド領域に少なくとも1つの置換を含む、請求項7から請求項10のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第2の核酸は、前記第2の核酸の少なくとも10、少なくとも12、少なくとも15及び/または少なくとも19の反復ヌクレオチド領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、請求項7から請求項11のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第2の核酸は、前記第2の核酸の19領域内に少なくとも1つのヌクレオチド置換を含む、請求項7から請求項12のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第2の核酸は配列番号14を含む、請求項7から請求項12のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記組換えポックスウイルスはオルソポックスウイルス及びアビポックスウイルスから選択される、請求項1から請求項14のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記オルソポックスウイルスはワクシニアウイルスである、請求項15に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記ワクシニアウイルスは改変ワクシニアウイルスアンカラ(MVA)である、請求項16に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記MVAはMVA-BN、またはニワトリ胚線維芽細胞(CEF)内において増殖複製可能だが、ヒト角化細胞株HaCat、ヒト骨骨肉腫細胞株143B、ヒト胎児腎臓細胞株293及びヒト子宮頸部腺癌細胞株HeLaにおいては増殖複製不可能であり、MVA-BNと比較してゲノムの1つ以上の部位に差異を示すMVA-BNの誘導体である、請求項17に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記組換えポックスウイルスは、少なくとも継代3及び/または継代4中に安定である、請求項1から請求項18のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記アビポックスウイルスは鶏痘ウイルスである、請求項15に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記組換えポックスウイルスは、少なくとも継代4中に安定である、請求項20に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記第1の核酸は、YLAPPAHGV(配列番号24)、YLDTRPAPV(配列番号25)、YLAIVYLIAL(配列番号26)、YLIALAVCQV(配列番号27)、YLSYTNPAV(配列番号28)、SLFRSPYEK(配列番号29)及びこれらの組み合わせからなる群から選択されるペプチド断片をコードするヌクレオチド配列を更に含む、請求項1から請求項21のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記ポックスウイルスは、1以上の共刺激分子をコードする核酸を更に含む、請求項1から請求項22のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記1以上の共刺激分子は、B7-1、ICAM-1、LFA-3及びこれらの組み合わせから選択される、請求項23に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記B7-1の核酸は、配列番号15、16または17に対して少なくとも90%または95%の同一性を有する、請求項24に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記B7-1の核酸は配列番号15、16または17を含む、請求項24から請求項25のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記B7-1の核酸は配列番号17を含む、請求項24から請求項26のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記B7-1の核酸は配列番号15を含む、請求項24から請求項26のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記ICAM-1の核酸は、配列番号18、19または20に対して少なくとも90%または95%の同一性を有する、請求項24に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記ICAM-1の核酸は配列番号18、19または20を含む、請求項24及び請求項29のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記ICAM-1の核酸は配列番号18を含む、請求項24及び請求項29から請求項30のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記ICAM-1の核酸は配列番号20を含む、請求項24及び請求項29から請求項30のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記LFA-3の核酸は、配列番号21、22または23に対して少なくとも90%または95%の同一性を有する、請求項24に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記LFA-3の核酸は配列番号21、22または23を含む、請求項33に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記LFA-3の核酸は配列番号21を含む、請求項33から請求項34のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 前記LFA-3の核酸は配列番号23を含む、請求項33から請求項34のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルス。
- 請求項1から請求項36のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルスを含む、免疫原性組成物。
- 請求項1から請求項36のいずれか1項に記載の組換えポックスウイルスを含む、宿主細胞。
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