JP7107375B2 - 状態遷移予測装置、予測モデル学習装置、方法およびプログラム - Google Patents
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Description
この発明の一実施形態では、医療健康分野において、ユーザの現在の健康状態を表す検査データをもとに、将来における複数の疾病の併発又は合併症の発症リスクを予測する場合を例にとって説明する。
図1は、この発明の一実施形態に係る状態遷移予測装置の機能構成を示すブロック図である。
状態遷移予測装置1は、例えばサーバコンピュータ又はパーソナルコンピュータからなり、ネットワーク3を介して、電子医療記録(Electronic Medical Records:EMR)サーバ2およびアクセス端末4との間で通信が可能となっている。
次に、以上のように構成された状態遷移予測装置1の動作例を説明する。
(1)学習フェーズ
学習フェーズが設定されると、状態遷移予測装置1は以下のように予測モデルの学習処理を実行する。
図2は、状態遷移予測装置1の制御ユニット10による学習フェーズの処理手順と処理内容の一例を示すフローチャートである。
制御ユニット10は、先ずステップS10において、医療記録データ取得部11の制御の下、インタフェースユニット30を介してEMRサーバ2に対しアクセスし、EMRサーバ2から複数のユーザに係る医療記録データをそれぞれダウンロードする。そして、この医療記録データをユーザIDと関連付けて医療記録データ記憶部21に記憶させる。なお、EMRサーバ以外にEHRサーバからさらに多くの医療記録データを取得するようにしてもよい。
ユーザの医療記録データの取得が終了すると、制御ユニット10は次にステップS11において、学習対象データ選択部12の制御の下で、以下のように学習対象となる医療記録データを選択する処理を実行する。
上記学習対象データの選択が終了すると、制御ユニット10は訓練データ抽出・正解データ算出部13の制御の下、先ずステップS12において、学習対象データ記憶部22から各学習対象データを読み出し、これらの学習対象データからそれぞれユーザの健康状態を表す特徴量として、検査初年度の検査データである、HbA1c、収縮期血圧およびBMIを抽出する。なお、ユーザの健康状態を表す特徴量としては、検体検査や生理検査など、スコア算出に寄与しうる項目で量的に表せる値であれば他のものでも良い。
制御ユニット10は、次に予測モデル学習部14の制御の下、ステップS14において予測モデルの学習処理を実行する。
図6は予測モデルの学習に使用する学習器の構成の一例を示したもので、学習器としては例えば多層ニューラルネットワークが用いられる。多層ニューラルネットワークは、例えば、入力層IL1,IL2、中間層ML1,ML2および出力層OL1,OL2の3層から構成される。このうち入力層IL1,IL2および中間層ML1,ML2は、全結合層とBatch Normalizationと活性化関数ReLUとから構成され、出力層OL1,OL2は全結合層により構成される。
予測フェーズが設定されると、状態遷移予測装置1はユーザの将来における複数の疾病の併発または合併症の発症リスクを予測する処理を以下のように実行する。
図3は、状態遷移予測装置1の制御ユニット10による予測処理の手順と処理内容の一例を示すフローチャートである。
状態遷移予測装置1に対し予測対象ユーザの検査データが入力されると、制御ユニット10は評価データ取得部15の制御の下、ステップS20において上記検査データをインタフェースユニット30を介して評価データとして取り込む。上記検査データとしては、例えば予測対象ユーザの現在の健康状態の特徴量を表すバイタルデータである、HbA1c、収縮期血圧およびBMIが入力される。なお、上記予測対象ユーザの検査データの入力処理は、例えば医師等の医療従事者の端末、ユーザ端末或いは保険会社の端末から行われる。
状態遷移予測装置1の制御ユニット10は、上記評価データの取り込みが終了すると、発症リスクスコア予測処理部16の制御の下、以下のように発症リスクスコアの予測処理を実行する。図7はその処理内容を示す図である。
制御ユニット10は、予測データ出力部17の制御の下、ステップS22において、上記学習済の予測モデルから出力された発症リスクスコアを含む予測結果通知データを生成する。予測結果通知データには、発症リスクスコアをそのまま含めてもよいが、発症リスクスコアをしきい値により判定した発症リスクの度合いを含めるようにしてもよく、また発症リスクの度合いに応じたアドバイスメッセージ等を含めるようにしてもよい。
以上述べたように、この発明の一実施形態では、学習フェーズにおいて、併発または合併症として発症する可能性がある複数の疾病の発症履歴があるかまたは当該各疾病の発症を追跡観察中の医療記録データから、着目する各疾病の発症順序が共通で、かつ当該各疾病が発症するまでの経過時間が異なる医療記録データの組を選択する。そして、この医療記録データの組ごとに、当該組を構成する各医療記録データから、ユーザの健康状態を表す特徴量として検査初年時の検査データを抽出しこれを訓練データとする。また、上記検査初年時の検査データと上記複数の疾病が発症するまでの経過時間とから、当該複数の疾病が併発または合併症として発症するリスクスコアを算出して、これを正解データとする。このとき発症リスクスコアは、発症までの経過時間が長いユーザより短いユーザの方が大きな値となるように計算される。そして、上記訓練データを学習器に入力してその出力が上記正解データとなるように学習器に学習を行わせ、学習済の予測モデルを生成するようにしている。
前記一実施形態を以下のとおり変更してもよい。すなわち、例えば取得した利用データのうち、着目している1つの疾病を発症しており、かつ発症までの経過時間が異なるユーザの組、または発症していないユーザであり、追跡が不能となる時間以降まで延長した経過時間が異なるユーザの組、または発症しているユーザと発症していないユーザであり、かつ発症しているユーザの発症までの経過時間と、発症していないユーザの追跡が不能となる時間以降まで延長した経過時間とが異なるユーザの組、のいずれか1つ以上の組を学習対象データとして選択する。次に訓練データの抽出と正解データの算出において、着目している1つの疾病を発症するまでの経過時間が短い方が大きくなるように定義された発症リスクスコアについて、未発症の状態の特徴量をもとに予測モデルが出力するスコアと、ユーザが発症するまでの経過時間または追跡が不能となるまでの時間以降まで延長した経過時間をもとに算出したリスクスコアの誤差を最小とするようにモデルを学習させてもよい。
このように未発症のユーザを追跡観察が不能となる時間以降に発症したと仮定して学習の対象とすることで、対象数増大による精度向上効果がある。
2…EMRサーバ
3…ネットワーク
4…アクセス端末
10…制御ユニット
11…医療記録データ取得部
12…学習対象データ選択部
13…訓練データ抽出・正解データ算出部
14…予測モデル学習部
15…評価データ取得部
16…発症リスクスコア予測処理部
17…予測データ出力部
20…記憶ユニット
21…医療記録データ記憶部
22…学習対象データ記憶部
23…予測モデル記憶部
30…インタフェースユニット
Claims (10)
- ユーザの健康状態が、第1の状態から第1の症状が発症して第2の状態に遷移し、さらに、第2の状態から第2の症状が発症して第3の状態に遷移する場合に、前記第1の状態に係る特徴量と、前記第1の状態から前記第1の症状が発症するまでの前記第1の症状名に対応付けられた第1の経過時間、および前記第1の状態から前記第2の症状が発症するまでの前記第2の症状名に対応付けられた第2の経過時間とを含む、複数のユーザの前記健康状態を表す医療記録データを取得する医療記録データ取得部と、
取得された前記複数のユーザの前記健康状態を表す医療記録データの中から、前記第1の症状名同士および前記第2の症状名同士がいずれも同一の複数の医療記録データを選択し、かつ選択した前記複数の医療記録データの中で、前記第1の経過時間同士および前記第2の経過時間同士が異なる、第1のユーザの前記健康状態を表す医療記録データと第2のユーザの前記健康状態を表す医療記録データとの組を選択する選択部と、
前記第1および第2のユーザの前記健康状態を表す各医療記録データにそれぞれ含まれる前記第1の状態に係る特徴量を訓練データとすると共に、当該各特徴量をもとにそれぞれ算出されかつ前記第1および第2のユーザの前記健康状態を表す各医療記録データにそれぞれ含まれる前記第1および第2の経過時間が反映された予測スコアを正解データとして学習器を学習させ、予測モデルを生成する予測モデル生成部と
を具備する状態遷移予測装置。 - 予測対象となるユーザの前記第1の状態に係る特徴量を取得して、当該特徴量を評価データとして前記予測モデルに入力し、この入力に応じて前記予測モデルから出力される予測スコアを、前記予測対象となる前記ユーザの健康状態の将来の状態遷移の予測結果を表す情報として出力する予測部を、さらに具備する請求項1に記載の状態遷移予測装置。
- 前記特徴データは、前記第1の状態が第2又は第3の状態に遷移していない場合には、当該状態遷移の追跡が不能となる時間の長さを前記第1又は第2の経過時間として含む、請求項1に記載の状態遷移予測装置。
- コンピュータを備える状態遷移予測装置が実行する状態予測方法であって、
ユーザの健康状態が、第1の状態から第1の症状が発症して第2の状態に遷移し、さらに、第2の状態から第2の症状が発症して第3の状態に遷移する場合に、前記第1の状態に係る特徴量と、前記第1の状態から前記第1の症状が発症するまでの前記第1の症状名に対応付けられた第1の経過時間、および前記第1の状態から前記第2の症状が発症するまでの前記第2の症状名に対応付けられた第2の経過時間とを含む、複数のユーザの前記健康状態を表す医療記録データを取得する過程と、
取得された前記複数のユーザの前記健康状態を表す医療記録データの中から、前記第1の症状名同士および前記第2の症状名同士がいずれも同一の複数の医療記録データを選択し、かつ選択した前記複数の医療記録データの中で、前記第1の経過時間同士および前記第2の経過時間同士が異なる、第1のユーザの前記健康状態を表す医療記録データと第2のユーザの前記健康状態を表す医療記録データとの組を選択する過程と、
前記第1および第2のユーザの前記健康状態を表す各医療記録データにそれぞれ含まれる前記第1の状態に係る特徴量を訓練データとすると共に、当該各特徴量をもとにそれぞれ算出されかつ前記第1および第2のユーザの前記健康状態を表す各医療記録データにそれぞれ含まれる前記第1および第2の経過時間が反映された予測スコアを正解データとして学習器を学習させ、予測モデルを生成する過程と
を具備する状態遷移予測方法。 - 予測対象となるユーザの前記第1の状態に係る特徴量を取得して、当該特徴量を評価データとして前記予測モデルに入力し、この入力に応じて前記予測モデルから出力されるスコアを、前記予測対象となる前記ユーザの健康状態の将来の状態遷移の予測結果を表す情報として出力する過程を、さらに具備する請求項4に記載の状態遷移予測方法。
- 複数のユーザの健康状態に関する特徴データをそれぞれ取得する特徴データ取得部と、
取得された前記特徴データの中から、前記健康状態の遷移パターンが所定の関連性を有する第1および第2の特徴データを選択する選択部と、
選択された前記第1および第2の特徴データを入力とし症状の発症リスクを表すスコアを出力とする予測モデルの学習を行う学習部と
を具備し、
前記特徴データ取得部は、
前記健康状態が第1の状態から第1の症状が発症して第2の状態に遷移し、さらに、当該第2の状態から第2の症状が発症して第3の状態に遷移した場合に、前記第1の状態に係る特徴量、前記第1の状態から前記第2の状態に遷移するまでの第1経過時間、および前記第1の状態から前記第3の状態に遷移するまでの第2経過時間を含む第1のタイプの特徴データ、
および前記健康状態が前記第2の状態から前記第3の状態に遷移しない場合に、前記第2の症状が状態遷移の追跡が不能となる時間以降に発症し前記第3の状態に遷移するものと仮定し、前記第1の状態に係る特徴量と、前記第2経過時間を前記追跡が不能となる時間以降まで延長した第3経過時間を含む第2のタイプの特徴データ、
の少なくとも一方を取得し、
前記選択部は、
複数の前記第1のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士および前記第2の症状同士が何れも同一であり、かつ前記第1経過時間および第2経過時間の少なくとも一方が異なり、かつ片方の前記第1経過時間と前記第2経過時間が他方の前記第1経過時間と前記第2経過時間より共に小さい特徴データの組、
複数の前記第2のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士および前記第2の症状同士が何れも同一であり、かつ前記第1経過時間と前記第3経過時間の少なくとも一方が異なり、かつ片方の前記第1経過時間と前記第3経過時間が他方の前記第1経過時間と前記第3経過時間より共に小さい特徴データの組、
および前記第1のタイプの特徴データと前記第2のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士および前記第2の症状同士がいずれも同一で、かつ前記第1経過時間または前記第2経過時間と前記第3経過時間の少なくとも一方が異なり、かつ前記第1のタイプの特徴データの前記第1経過時間と前記第2経過時間が前記第2のタイプの特徴データの前記第1経過時間と前記第3経過時間に対して共に小さいかまたは大きい特徴データの組、
の少なくとも1つ以上の組を、前記第1および第2の特徴データとして選択し、
前記学習部は、
選択された前記第1および第2の特徴データにそれぞれ含まれる前記第1の状態に係る特徴量の組の入力に対し前記予測モデルが出力する第1および第2のスコアと、前記第1および第2の特徴データの各特徴量と前記第1および第2の特徴データにそれぞれ含まれる前記第1経過時間、第2経過時間または第3経過時間とをもとに算出される第1および第2のリスクスコアとの間の誤差を最小とするように、前記予測モデルを学習させる、
予測モデル学習装置。 - 複数のユーザの健康状態に関する特徴データをそれぞれ取得する特徴データ取得部と、取得された前記特徴データの中から、前記健康状態の遷移パターンが所定の関連性を有する第1および第2の特徴データを選択する選択部と、選択された前記第1および第2の特徴データを入力とし症状の発症リスクを表すスコアを出力とする予測モデルの学習を行う学習部とを具備する学習装置が実行する予測モデル学習方法であって、
前記特徴データ取得部が、
前記健康状態が第1の状態から第1の症状が発症して第2の状態に遷移し、さらに、当該第2の状態から第2の症状が発症して第3の状態に遷移した場合に、前記第1の状態に係る特徴量、前記第1の状態から前記第2の状態に遷移するまでの第1経過時間、および前記第1の状態から前記第3の状態に遷移するまでの第2経過時間を含む第1のタイプの特徴データ、
および前記健康状態が前記第2の状態から前記第3の状態に遷移しない場合に、前記第2の症状が状態遷移の追跡が不能となる時間以降に発症し前記第3の状態に遷移するものと仮定し、前記第1の状態に係る特徴量と、前記第2経過時間を前記追跡が不能となる時間以降まで延長した第3経過時間を含む第2のタイプの特徴データ、
の少なくとも一方を取得し、
前記選択部が、
複数の前記第1のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士および前記第2の症状同士が何れも同一であり、かつ前記第1経過時間および第2経過時間の少なくとも一方が異なり、かつ片方の前記第1経過時間と前記第2経過時間が他方の前記第1経過時間と前記第2経過時間より共に小さい特徴データの組、
複数の前記第2のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士および前記第2の症状同士が何れも同一であり、かつ前記第1経過時間と前記第3経過時間の少なくとも一方が異なり、かつ片方の前記第1経過時間と前記第3経過時間が他方の前記第1経過時間と前記第3経過時間より共に小さい特徴データの組、
および前記第1のタイプの特徴データと前記第2のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士および前記第2の症状同士がいずれも同一で、かつ前記第1経過時間または前記第2経過時間と前記第3経過時間の少なくとも一方が異なり、かつ前記第1のタイプの特徴データの前記第1経過時間と前記第2経過時間が前記第2のタイプの特徴データの前記第1経過時間と前記第3経過時間に対して共に小さいかまたは大きい特徴データの組、
の少なくとも1つ以上の組を、前記第1および第2の特徴データとして選択し、
前記学習部が、
選択された前記第1および第2の特徴データにそれぞれ含まれる前記第1の状態に係る特徴量の組の入力に対し前記予測モデルが出力する第1および第2のスコアと、前記第1および第2の特徴データの各特徴量と前記第1および第2の特徴データにそれぞれ含まれる前記第1経過時間、第2経過時間または第3経過時間とをもとに算出される第1および第2のリスクスコアとの間の誤差を最小とするように、前記予測モデルを学習させる、
予測モデル学習方法。 - 請求項1乃至3のいずれかに記載の状態遷移予測装置が具備する前記各部の処理を、前記状態遷移予測装置が備えるプロセッサに実行させるプログラム。
- 請求項6に記載の予測モデル学習装置が備える前記各部の処理を、前記予測モデル学習装置が備えるプロセッサに実行させるプログラム。
- 複数のユーザの健康状態に関する特徴データをそれぞれ取得する特徴データ取得部と、
取得された前記特徴データの中から、前記健康状態の遷移パターンが所定の関連性を有する第1および第2の特徴データを選択する選択部と、
選択された前記第1および第2の特徴データを入力とし症状の発症リスクを表すスコアを出力とする予測モデルの学習を行う学習部と
を具備し、
前記特徴データ取得部は、
前記健康状態が第1の状態から第1の症状が発症して第2の状態に遷移した場合に、前記第1の状態に係る特徴量、前記第1の状態から前記第2の状態に遷移するまでの第1経過時間を含む第1のタイプの特徴データ、
および前記健康状態が前記第1の状態から前記第2の状態に遷移しない場合に、前記第1症状が状態遷移の追跡が不能となる時刻以降に発症し第2の状態に遷移するものと仮定し、前記第1の状態に係る特徴量と、前記第1経過時間を前記追跡が不能となる時間以降まで延長した第4経過時間を含む第2のタイプの特徴データ、
の少なくとも一方を取得し、
前記選択部は、
複数の前記第2のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状同士が同一であり、かつ前記第4経過時間が異なる特徴データの組、
および前記第1のタイプの特徴データと前記第2のタイプの特徴データの中の、前記第1の症状が同一であり、かつ前記第1経過時間と前記第4経過時間が異なる特徴データの組、
の少なくとも1つ以上の組を、前記第1および第2の特徴データとして選択し、
前記学習部は、
選択された前記第1および第2の特徴データにそれぞれ含まれる前記第1の状態に係る特徴量の組の入力に対し前記予測モデルが出力する第1のスコアと、前記第1および第2の特徴データの各特徴量と前記第1および第2の特徴データにそれぞれ含まれる前記第1または第4経過時間をもとに算出される第1のリスクスコアとの間の誤差を最小とするように、前記予測モデルを学習させる、
予測モデル学習装置。
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