JP7257662B2 - 化合物、化合物の製造方法、および、これらの利用 - Google Patents
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Description
本実施形態の化合物は、本発明者によって見出された新規な化合物であって、後述するシリカ重合剤の有効成分として利用することができる。
本実施形態の化合物の製造方法は、(i)バシラス属細菌、または、バシラス属細菌のBC5213遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入された形質転換体、を培養する培養工程、または、(ii)バシラス属細菌のBC5213タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、基質とを接触させる反応工程、を有する。
本実施形態の化合物の製造方法における培養工程では、バシラス属細菌、または、バシラス属細菌のBC5213遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入された形質転換体を培養する。上記形質転換体は、更に、バシラス属細菌のBC5214遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入されたものであってもよい。
本実施形態の化合物の製造方法における反応工程では、バシラス属細菌のBC5213タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、基質とを接触させる。上記反応工程では、バシラス属細菌のBC5213タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、基質と、バシラス属細菌のBC5214タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、を接触させてもよい。なお、物質同士の接触は、in vitroにて行ってもよいし、in vivoにて行ってもよい。
本実施形態の形質転換体は、バシラス属細菌のBC5213遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入されている。また、本実施形態の形質転換体は、更に、バシラス属細菌のBC5214遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入されていてもよい。上記形質転換体は、タンデム構造を有する化合物の製造に用いることができる。
本実施形態の、アミノプロピル基の付加方法は、(i)バシラス属細菌、または、バシラス属細菌のBC5213遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入された形質転換体、を培養する培養工程、または、(ii)バシラス属細菌のBC5213タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、基質とを接触させる反応工程、を有する。上記構成によれば、アミノプロピル基が付加された化合物を製造することができる。
本実施形態のシリカ重合剤は、下記式(I)にて示される化合物を有効成分として含むものである:
Bacillus cereus ATCC 14579株(ATCCより入手)またはBacillus cereus YH64株(NBRCより入手)を、0.6mM CaCl2、0.03mM MnCl2、0.05mM ZnCl2、0.05mM FeSO4および100μg/mlのケイ酸(Si[OH]4)を加えたR2A培地中で72時間培養することで、表面にシリカ(SiO2)を蓄積した胞子を形成させた。なお、R2A培地の組成の詳細は、文献Aに記載されている(文献A:Reasoner and Geldreich 1985 Appl. Environ. Microbiol. 49, 1)。
共通の繰り返し構造:R-[-NH-CH2-CH2-CH2-]n-NH2、(n=4-34)、
ピーク群A:R=-CH2-CH2-CH2-CH2-NH2、
ピーク群B:R=-CH2-CH2-CH2-NH2、
ピーク群C:R=-C5H10N、
ピーク群D:R=-C6H10N。
H2N-CH2-CH2-CH2-CH2-[-NH-CH2-CH2-CH2-]n-NH2。
Bacillus cereus ATCC 14579株のゲノムの塩基配列を確認したところ、アミノプロピル基転移酵素とホモロジーが高いBC5213タンパク質(Accession Number:NP_834876)、および、当該BC5213タンパク質と機能上関係していると思われるBC5214タンパク質(Accession Number:NP_834877)が存在することが明らかになった。
Bacillus cereus ATCC 14579株のBC5213遺伝子(配列番号3)がコードするタンパク質(配列番号4)から、アミノ末端から数えて2-73番目のアミノ酸残基に相当する部分が除去されたタンパク質(配列番号6)をコードする遺伝子(配列番号5)、ならびに、BC5213遺伝子の下流に存在するBC5214遺伝子(配列番号7)を、1つのポリヌクレオチド断片としてPCRにより増幅した。PCRの鋳型には、Bacillus cereus ATCC 14579株のゲノムDNAを使用し、プライマーとして以下の配列のオリゴDNAを使用した(5’-AAGGAGATATACATATGGATGTGTGGGATGAAATTTCTCT-3’(配列番号1)、5’-GGTGGTGGTGCTCGAGTCAATCGGCAGTAACAATTTCTCCT-3’(配列番号2))。
Claims (4)
- (i)バシラス(Bacillus)属細菌、または、バシラス(Bacillus)属細菌のBC5213遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入された形質転換体、を培養する培養工程、または、
(ii)バシラス(Bacillus)属細菌のBC5213タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、基質とを接触させる反応工程、を有する、下記式(I)にて示される化合物の製造方法であって;
(上記式(I)中、Rは、水素または任意の有機基であり、nは、9以上55以下の整数である)
上記BC5213遺伝子のホモログ遺伝子は、配列番号3または5で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、アミノプロピル基転移酵素活性、または、アミノプロピル基転移酵素補助活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドであり、
上記BC5213タンパク質のホモログタンパク質は、配列番号4または6に示されるアミノ酸配列において、配列番号4に対しては30個以内のアミノ酸、配列番号6に対しては20個以内のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、アミノプロピル基転移酵素活性、または、アミノプロピル基転移酵素補助活性を有するタンパク質である、
製造方法。 - 上記式(I)中、Rが、H2N-(CH2)4-、H2N-(CH2)3-、NH10C5-、または、NH10C6-にて示される有機基である、請求項1に記載の製造方法。
- 上記形質転換体は、更に、バシラス(Bacillus)属細菌のBC5214遺伝子、若しくはそのホモログ遺伝子が導入されたものである、請求項1または2に記載の製造方法であって、
上記BC5214遺伝子のホモログ遺伝子は、配列番号7で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドと相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、アミノプロピル基転移酵素活性、または、アミノプロピル基転移酵素補助活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドである、
製造方法。 - 上記反応工程では、上記バシラス(Bacillus)属細菌のBC5213タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、上記基質と、バシラス(Bacillus)属細菌のBC5214タンパク質、若しくはそのホモログタンパク質と、を接触させる、請求項1または2に記載の製造方法であって、
上記BC5214タンパク質のホモログタンパク質は、配列番号8に示されるアミノ酸配列において10個以内のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、アミノプロピル基転移酵素活性、または、アミノプロピル基転移酵素補助活性を有するタンパク質である、
製造方法。
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Non-Patent Citations (3)
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|---|
| Laura Hobley et al.,Spermidine promotes Bacillus subtilis biofilm formation by activating expression of the matrix regulator slrR,Journal of Biological Chemistry,2017年,Vol. 292, Issue 29,12041-12053 |
| S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme [Bacillus cereus ATCC 14579],NCBI Protein,2016年08月28日,NP_834877 |
| spermidine synthase [Bacillus cereus ATCC 14579],NCBI Protein,2016年08月28日,NP_834876 |
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