JP7328241B2 - タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5(prmt5)の選択的阻害剤 - Google Patents
タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5(prmt5)の選択的阻害剤 Download PDFInfo
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Description
本出願は、2018年10月5日に提出された米国仮特許出願第62/742,048号、2018年5月4日に提出された米国仮特許出願第62/666,726号、および2018年3月14日に提出された米国仮特許出願第62/642,727号の優先権の利益を主張する。これらの出願の各々は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
PRMTの異常発現は、ヒトの癌において確認されており、PRMTは、治療(therapeutic)標的であると考えられている。前立腺癌におけるヒストン改変の包括的分析は、ヒストンH4R3のジメチル化がグレードの増加と正の相関があることを示しており、これらの変化は、臨床転帰を予測するものである。
出生時に始まる、胎児から成人へのヒトグロビン遺伝子サブタイプの発達スイッチは、異常ヘモグロビン症、b-サラセミア、および鎌状赤血球症(SCD)の発症の先駆けである。(胎児ヘモグロビン[HPFH]変異の遺伝性持続性の設定において)成人グロビン遺伝子発現が増加したという観察は、サラセミアの臨床的重症度を大幅に改善し、SCDは、ガンマグロビン遺伝子サイレンシングを逆転させる治療戦略の模索を促進した。ガンマ遺伝子のサイレンシングの中心となるのは、DNAメチル化であり、これは、成体骨髄赤血球細胞の遺伝子転写開始部位に隣接する重要なCpGジヌクレオチドをマークする。これらのマークは、DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3Aがタンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼPRMT5によってガンマプロモーターに補充された結果として確立されることが示されている。Zhao et al.Nat Struct Mol Biol.2009 16,304.ヒストンH4R3のPRMT5を介したメチル化により、遺伝子サイレンシングにおけるヒストンおよびDNAメチル化を連結させたDNMT3Aが補充される。
式中、
Aは、NもしくはC-R3であり、
R1は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C1~C4ハロアルキル、-C3~C6シクロアルキル、-C3~C6ハロシクロアルキル、-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)2-C1~C6アルキル、-CR6R6’CN、-NR6R6’、-NHCR6R6’CN、-NHCONR6R6’、-NHC(O)OR7、NHC(O)-C1~C6アルキル、NHC(O)-C1~C6ハロアルキル、-NH-C1~C6アルク-C(O)-C1~C6アルキル、-NHC(S)NR6R6’、-NH-OR6、もしくは-NH-NR6R6’であり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、もしくはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C2~C6アルケニル、もしくは-C2~C6アルキニルであり、
R4は、H、-C1~C6アルキル、-C1~C6ハロアルキル、-C2~C6アルケニル、もしくは-C2~C6アルキニルであり、
R5は、Hもしくは-C1~C6アルキルであり、
R6およびR6’は、各々独立して、H、C1~C6アルキル、もしくは-C1~C6アルク-OC1~C6アルキルであるか、
またはR6およびR6’は、それらが付着している原子と一緒になって、C2~C6ヘテロシクロアルキル環もしくはC3~C6シクロアルキル環を形成し、
R7は、-C1~C6アルキルもしくは-C0~C6アルク-C3~C6シクロアルキルであり、
Xは、O、S、NH、もしくはN(C1~C6アルキル)であり、Yは、-(CR9R9’)n-、-CR9=CR9’-、C(=O)、-C(=O)-(CR9R9’)n-、-C(=O)-O-(CR9R9’)n-、-CR9R9’-O-、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、-(CR9R9’)n-NR10、C(=O)NR10、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であるか、または
Xは、-SO2-であり、Yは、-(CR9R9’)n-、-CR9=CR9’-、-CR9R9’-O-、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、-(CR9R9’)n-NR10、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であり、
式中、n=1、2、もしくは3、m=1もしくは2であり、
R9もしくはR9’の各場合は、独立して、H、D、C1~C6アルキル、C1~C6ハロアルキル、ハロ、-C1~C6アルコキシ、もしくはヒドロキシであり、
R10は、HもしくはC1~C6アルキルであり、
Zは、O、CH2、もしくはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、もしくは任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である、式Iの化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物を対象とする。
式中、
Aは、NもしくはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、もしくは-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、もしくはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、もしくは-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hもしくは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hもしくは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、NH、もしくはN(C1~C6アルキル)であり、Yは、CH2、-CH2CH2-、C(CH3)2、CF2、C(=O)、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であるか、または
Xは、SO2であり、Yは、CH2、-CH2CH2-、C(CH3)2、CF2、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であり、
Zは、O、CH2、もしくはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、もしくは任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
Yは、-C(=O)-(CR9R9’)n-であり、式中、n=1または2であり、各R9およびR9’は、Hであり、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、SO2、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
Yは、-CR9=CR9’-であり、各R9およびR9’は、Hであり、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
Yは、-C(=O)-O-(CR9R9’)n-であり、式中、n=1または2であり、各R9およびR9’は、Hであり、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
式中、
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、SO2、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
各R9は、H、D、F、OH、OCH3、CH3、またはCF3から独立して選択され、各R9’は、H、D、F、OH、OCH3、CH3、またはCF3から独立して選択され、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
式中、
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、SO2、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
各R9は、H、D、またはFから独立して選択され、各R9’は、H、D、またはFから独立して選択され、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
式中、
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、SO2、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
R9は、H、D、またはFから選択され、R9’は、H、D、またはFから選択され、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
式中、
Aは、NまたはC-R3であり、
R1は、ハロ、NH2、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルであり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、またはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルコキシであり、
R4は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
R5は、Hまたは-C1~C6アルキルであり、
Xは、O、S、SO2、NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
R9は、H、D、またはFから選択され、R9’は、H、D、またはFから選択され、
Zは、O、CH2、またはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、または任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。
主題の医薬組成物は、典型的には、活性成分としての治療的に有効な量の本開示の化合物、またはその薬学的に許容される塩、エステル、プロドラッグ、溶媒和物、水和物、もしくは誘導体を提供するように製剤化される。所望される場合、医薬組成物は、それらの薬学的に許容される塩および/または配位複合体、ならびに1つ以上の薬学的に許容される賦形剤、不活性固体希釈剤および充填剤を含む担体、無菌水溶液および様々な有機溶媒を含む希釈剤、浸透促進剤、可溶化剤、およびアジュバントを含有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、本発明の化合物を含有する経口投与用の医薬組成物、および経口投与に好適な医薬賦形剤を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、本発明の化合物および注射に好適な医薬賦形剤を含有する注射用の医薬組成物を提供する。組成物中の成分および薬剤の量は、本明細書に記載されているとおりである。
いくつかの実施形態では、本発明は、本発明の化合物および経皮送達に好適な医薬賦形剤を含有する経皮送達用の医薬組成物を提供する。
吸入または吹送のための組成物には、薬学的に許容される水性もしくは有機溶媒、またはそれらの混合物中の溶液および懸濁液、ならびに粉末が含まれる。液体または固体の組成物は、上記に記載されるような好適な薬学的に許容される賦形剤を含有し得る。好ましくは、組成物は、局部的または全身的効果のために経口または経鼻呼吸経路によって投与される。好ましくは薬学的に許容される溶媒中の組成物は、不活性ガスを使用することによって噴霧され得る。噴霧された溶液は、噴霧デバイスから直接吸入され得るか、または噴霧デバイスは、フェイスマスクテント、もしくは間欠的陽圧呼吸器に取り付けられ得る。溶液、懸濁液、または粉末組成物は、適切な方法で製剤を送達するデバイスから、好ましくは経口的または経鼻的に投与され得る。
医薬組成物はまた、本明細書に記載の組成物、および舌下、口腔、直腸、骨内、眼内、鼻腔内、硬膜外、または脊髄内投与に好適な1つ以上の薬学的に許容される賦形剤から調製され得る。そのような医薬組成物の調製は、当該技術分野でよく知られている。例えば、Anderson,Philip O.、Knoben,James E.、Troutman,William G,eds.,Handbook of Clinical Drug Data,Tenth Edition,McGraw-Hill,2002、Pratt and Taylor,eds.,Principles of Drug Action,Third Edition,Churchill Livingston,New York,1990、Katzung,ed.,Basic and Clinical Pharmacology,Ninth Edition,McGraw Hill,20037ybg、Goodman and Gilman,eds.,The Pharmacological Basis of Therapeutics,Tenth Edition,McGraw Hill,2001、Remingtons Pharmaceutical Sciences,20th Ed.,Lippincott Williams&Wilkins.,2000、Martindale,The Extra Pharmacopoeia,Thirty-Second Edition(The Pharmaceutical Press,London,1999)(これらのすべてが、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
本方法は、典型的には、本発明の化合物の治療的に有効な量を対象に投与することを含む。対象となる化合物の組み合わせの治療的に有効な量は、意図される用途(インビトロまたはインビボ)、または治療される対象および疾患の状態、例えば、対象の体重および年齢、疾患状態の重症度、投与方法などに依存して変化し得、これらは、当業者が容易に決定することができる。この用語は、標的細胞における特定の反応、例えば、増殖の低下または標的タンパク質の活性のダウンレギュレーションを誘導する用量にも適用される。特定の用量は、選択される特定の化合物、従うべき投薬計画、それが他の化合物と組み合わせて投与されるかどうか、投与のタイミング、投与される組織、およびそれが運搬される物理的送達システムに依存して異なる。
実施例1A。(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例1A)
(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)メタノール(1Aa、5.0g、22.58mmol)のDMF(10mL)溶液に、TBSCl(10.21g、67.73mmol)およびイミダゾール(3073.9mg、45.15mmol)を加えた。反応混合物を25℃で16時間撹拌した。TLC(PE:EA=10:1、Rf=0.8)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、混合物をEA(50mL×3)で抽出した後、有機層を食塩水(100mL×3)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮し、シリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=200:1~100:1)によって精製された粗生成物を得て、無色の油として(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(5.0g、14.9mmol、66%の収率)を得た。
(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(1Ab、4.3g、12.80mmol)のTHF(50mL)溶液に、ブチルリチウム(0.6g、9.10mmol)を-78℃のN2下で加えた。混合物を-78℃で10分間撹拌して、1Acを得た。(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N,2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、1.4g、3.70mmol)のTHF(50mL)溶液を加えた。混合物を-78℃で30分間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を飽和NH4Cl溶液(50mL)でクエンチした。混合物を酢酸エチル(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層を食塩水(40mL×3)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮し、シリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=20:1~10:1)によって精製された粗生成物を得て、淡黄色の油として[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノン(1Ae、1.3g、2.20mmol、61.4%の収率)を得た。LCMS[M+H]:578.2。
[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノン(1Ae、50mg、0.11mmol)のトルエン(5mL)溶液に、水素化ジイソブチルアルミニウム(24.6mg、0.20mmol)を加えた。反応混合物を-78℃のN2下で0.5時間撹拌した。TLC(PE:EA=3:1、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(10mL×3)の食塩水(10mL×3)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=10:1~5:1)によって精製して、淡黄色の固体として(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(1Af、50mg、0.10mmol、99.7%の収率)を得た。
(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(1Af、50mg、0.10mmol)のDMSO(12mL)およびメタノール(0.2mL)溶液に、CsF(39.3mg、0.3mmol)を加え、反応混合物を25℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濾過し、H2O(中性条件)中のCH3CNで10%~55%まで溶出する逆相コンビフラッシュ(combi-flash)によって精製し、淡黄色の油として(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(1Ag、30mg、0.1mmol、71.7%の収率)を得た。LCMS[M+H]:466.1。
(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(100.0mg、0.21mmol)のTHF(20mL)溶液に、25℃でピリジン(0.02mL、0.21mmol)を加え、次に、25℃でトリブチルホスフィン(0.1mL、0.42mmol)を加え、続いて、DIAD(0.1mL、0.52mmol)を加えた。反応物を25℃のN2下で4時間撹拌した。TLC(PE:EA=1:1、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=10:1~1:1)によって精製して、淡黄色の油として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(1Ah、80.0mg、0.2mmol、83.2%の収率)を得た。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(1Ah、80.0mg、0.2mmol)の1,4-ジオキサン(3mL)およびNH3H2O(3mL、77.9mmol)溶液を、120℃のオートクレーブ内で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これをH2O(中性条件)中のCH3CNで10%~95%まで溶出する逆相コンビフラッシュ(reversed-phase combi-flash)によって精製し、淡黄色固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(1Ai、45.0mg、0.11mmol、58.8%の収率)を得た。LCMS[M+H]:429.1。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(1Ai、45.0mg、0.10mmol)の水(3mL)およびTFA(3mL、33.30mmol)の溶液を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濃縮し、H2O中のCH3CNで10%~95%まで溶出する分取HPLC(0.1%のNH3H2O)によって精製し、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例1A、6.0mg、0.02mmol、14.5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:389.1。1H NMR(400M Hz、DMSO-d6):δ8.06(s、1H)、7.42(s、1H)、7.34~7.35(d、J=4.0Hz、1H)、7.29~7.32(m、1H)、7.22~7.24(m、1H)、7.03(s、2H)、6.64(d、J=3.6Hz、1H)、6.14~6.16(d、J=7.6Hz、1H)、5.34~5.36(m、1H)、5.27~5.28(d、J=6.4Hz、1H)、5.19~5.20(d、J=4.0Hz、1H)、5.04~5.12(m、2H)、4.51~4.56(m、1H)、4.05~4.06(m、1H)、3.93~3.95(m、1H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.07(s、1H)、7.43(s、1H)、7.34~7.35(d、J=3.6Hz、1H)、7.30~7.33(m、1H)、7.23~7.25(m、1H)、6.65~6.66(d、J=3.6Hz、1H)、6.14~6.16(d、J=7.6Hz、1H)、5.35~5.36(m、1H)、5.08~5.10(m、2H)、4.51~4.54(m、1H)、4.07~4.09(m、1H)、3.93~3.94(m、1H)。
[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノン(1Ae、630mg、1.10mmol)のメタノール(5mL)溶液に、NaBH4(82.4mg、2.20mmol)を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。TLC(PE:EA=1:1、Rf=0.4)は、出発材料が消費されたことを示した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を飽和NH4Cl溶液(50mL)でクエンチした。混合物を酢酸エチル(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層を食塩水(40mL×3)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=10:1~5:1)によって精製して、淡黄色の油として(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(1Af、10.0mg、0.02mmol、1.6%の収率)および(S)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(1Ba)、520mg、0.9mmol、82.3%の収率)を得た。
(S)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(1Ba、520mg、0.90mmol)のDMSO(5mL)およびメタノール(0.1mL)溶液に、CsF(408.2mg、2.70mmol)を加え、反応混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濾過し、H2O(中性条件)中のCH3CNで10%~95%まで溶出する逆相コンビフラッシュによって精製し、白色の固体として(S)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(1Bb,300mg、0.64mmol、71.8%の収率)を得た。LCMS[M+H]:466.1。
(S)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(1Bb、250mg、0.5mmol)のTHF(5mL))溶液に、ピリジン(0.04mL、0.50mmol)、トリブチルホスフィン(0.3mL、1.10mmol)、およびDIAD(0.2mL、1.10mmol)を加えた。反応混合物を25℃で16時間撹拌した。TLC(PE:EA=3:1、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=50:1~20:1)によって精製して、白色の固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(1Bc、180.0mg、0.4mmol、74.9%の収率)を得た。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(1Bc、180mg、0.40mmol)の1,4-ジオキサン(5mL)溶液に、NH3H2O(5mL、129.81mmol)を加え、反応混合物を25℃のオートクレーブ内で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これをH2O(中性条件)中のCH3CNで10%~90%まで溶出する逆相コンビフラッシュによって精製し、白色の固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(1Bd、140mg、0.32mmol、81.3%の収率)を得た。LCMS[M+H]:429.1。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(1Bd、180mg、0.40mmol)の水(5mL)およびTFA(5mL、67.31mmol)の溶液を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濃縮し、H2O中のCH3CNで10%~95%まで溶出する分取HPLC(0.1%のNH3H2O)によって精製し、1mLのHCl(1M)を加え、凍結乾燥して、淡黄色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1S)-5-クロロ-1,3- ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオールハイドロクロライド(実施例1B、45.1mg、0.10mmol、25.1%の収率)を得た。LCMS[M+H]:389.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ13.89(s、1H)、9.45(s、1H)、8.50(s、1H)、8.36(s、1H)、7.54~7.55(d、J=3.6Hz、1H)、7.30~7.39(m、3H)、7.01~7.02(d、J=3.6Hz、1H)、6.08~6.09(d、J=4.8Hz、1H)、5.39(s、1H)、4.97~5.05(m、2H)、4.32~4.38(m、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.37(s、1H)、7.55~7.56(d、J=3.6Hz、1H)、7.37~7.39(m、1H)、7.30~7.33(m、2H)、7.01~7.02(d、J=3.6Hz、1H)、6.08~6.10(d、J=7.2Hz、1H)、5.39(s、1H)、5.00~5.05(m、2H)、4.32~4.39(m、3H)。
(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(1Ab、1826.0mg、5.44mmol)のTHF(20mL)溶液に、-78℃でブチルリチウム(2.8mL、5.44mmol)を加えた。反応混合物を-78℃で0.5時間撹拌した。次に、(3aS,4R,6S,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-カルバルデヒド(2Aa、1750mg、5.44mmol)を混合物に加えた。反応混合物を-78℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応物をH2O(30mL)でクエンチし、酢酸エチル(60mL)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(PE:EA=3:1)によって精製して、[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(2Ab、360.0mg、0.62mmol、11.4%の収率)を得た。LCMS[M+H]:578.2。
[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]メタノール(2Ab、360mg、0.62mmol)のTHF(5mL)溶液に、0℃でTBAF(0.62mL、THF中に1N、0.62mmol)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物に、酢酸エチル(50mL)を加え、これをH2O(20mL×3)および食塩水(30mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して粗生成物を得、これを分取TLC(PE:EA=3:1)によって精製して、(S)-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(2Ac、42.0mg、0.09mmol、14.5%の収率)および(R)-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(2Ad、55.0mg、0.12mmol、19.0%の収率)を得た。LCMS[M+H]:464.1。
(R)-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(2Ad、100mg、0.22mmol)のTHF(5mL)溶液に、PPh3(56.5mg、0.22mmol)を加え、次に、DIAD(0.04mL、0.22mmol)を加え、混合物を25℃で16時間撹拌した。反応混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これを分取TLC(PE:EA=3:1)によって精製して、7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン(2Ae、70mg、0.16mmol、72.8%の収率)を得た。LCMS[M+H]:446.2。
7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(2Ae、90mg、0.20mmol)の1,4-ジオキサン(3mL)溶液に、アンモニア水和物(3mL、0.60mmol)を加え、次に、混合物を密封し、120℃で16時間撹拌した。LCMSは、混合物が完全であることを示した。反応混合物を真空で濃縮し、酢酸エチル(100mL)を加え、食塩水(60mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥し、真空で濃縮して、7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(2Af、90mg、0.18mmol、92.0%の収率)を得た。LCMS[M+H]:427.1。
7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(2Af、70mg、0.16mmol)の水溶液(2mL)に、TFA(0.9mL、11.45mmol)を加え、反応混合物を30℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を、H2O中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製し、白色の固体として(1R,2S,3R,5S)-3-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]シクロペンタン-1,2-ジオール(実施例2A、30mg、0.08mmol、47%の収率)を得た。LCMS[M+H]:387.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.00(s、1H)、7.31~7.37(m、3H)、7.15~7.16(m、1H)、6.52~6.53(m、1H)、5.41~5.42(m、1H)、5.10~5.14(m、1H)、4.99~5.03(m、1H)、4.78~4.85(m、1H)、4.18~4.21(m、1H)、4.04~4.06(m、1H)、2.47~2.50(m、1H)、1.71~1.79(m、1H)、1.33~1.40(m、1H)。
(S)-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(2Ac、90mg、0.19mmol)のTHF(4mL)溶液に、PPh3(101.7mg、0.39mmol)およびDIAD(0.11mL、0.39mmol)を加えた。混合物を25℃のN2下で16時間撹拌した。TLC(PE:EA=3:1、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これを分取TLC(PE:EA=3:1)によって精製して、7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン(2Ba、70mg、0.16mmol、80.9%の収率)を得た。LCMS[M+H]:446.2。
7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(2Ba、70mg、0.16mmol)の1,4-ジオキサン(3.5mL)溶液に、アンモニア水和物(3.5mL、0.47mmol)を加えた。混合物を密封し、120℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して、7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(2Bb、60mg、0.09mmol、59.2%の収率)を得た。LCMS[M+H]:427.1。
7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(2Bb、60mg、0.09mmol)の水溶液(2mL)に、TFA(1mL、13.0mmol)を加えた。反応混合物を30℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。H2O中のCH3CNで10%~95%まで溶出する反応混合物を分取HPLC(0.1%のNH3H2O)によって精製し、白色の固体として(1R,2S,3R,5S)-3-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1S)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]シクロペンタン-1,2-ジオール(実施例2B、27mg、0.07mmol、76.1%の収率)を得た。LCMS[M+H]:387.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.03(s、1H)、7.41~7.42(m、1H)、7.34~7.36(m、2H)、7.21~7.22(m、1H)、6.57~6.58(m、1H)、5.21~5.22(m、1H)、4.97~5.07(m、2H)、4.86~4.91(m、1H)、4.16~4.191(m、1H)、3.65~3.66(m、1H)、2.38~2.43(m、1H)、2.25~2.32(m、1H)、1.75~1.83(m、1H)。
5-クロロ-2-ヨード安息香酸(3Ab、829.3mg、2.80mmol)のTHF(15mL)溶液に、-20℃でイソプロピルマグネシウムクロライド(2.2mL、2.80mmol)を加え、溶液を-20℃で2時間撹拌した。THF(10mL)中の(3aS,4R,6S,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-カルバルデヒド(3Aa、900mg、2.80mmol)を混合物に加え、0℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物にH2O(30mL)および酢酸エチル(60mL)を加えた。有機層をH2O(30mL)および食塩水(30mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(PE:EA=6:1)によって精製して、(3R)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Ac、330mg、0.72mmol、25.6%の収率)および(3S)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Ad、270.0mg、0.59mmol、21.0%の収率)を得た。LCMS[M+H]:460.0。
(3S)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Ad、170mg、0.37mmol)の1,4-ジオキサン(5mL)溶液に、tert-ブチルカルバメート(86.5mg、0.74mmol)、キサントホス(32.1mg、0.06mmol)、およびPd2(dba)3(13.5mg、0.01mmol)を加えた。混合物を80℃のN2下で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(DCM:CH3OH=30:1)によって精製して、(3S)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Ae、100mg、0.23mmol、61.4%の収率)を得た。LCMS[M+H]:441.2。
(3S)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Ae、100mg、0.23mmol)の水溶液(3mL)に、TFA(1.5mL、19.47mmol)を加えた。反応混合物を30℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物をH2O中のCH3CN(0.1%のTFA)で5%~9%まで溶出する分取HPLCによって精製し、HCl(1mL、2N)を加え、凍結乾燥して、白色固体として(3S)-3-[(1S,2R,3S,4R)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,3-ジヒドロキシ-シクロペンチル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オンハイドロクロライド(実施例3A、15mg、0.03mmol、15.1%の収率)を得た。LCMS[M+H]:401.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.35(s、1H)、7.94~7.95(m、1H)、7.86~7.88(m、1H)、7.74~7.76(m、1H)、7.65~7.66(m、1H)、6.98~6.99(m、1H)、5.78~5.79(m、1H)、4.93~5.00(m、1H)、4.14~4.18(m、1H)、3.54~3.56(m、1H)、2.68~2.69(m、1H)、2.38~2.46(m、1H)、1.95~2.03(m、1H)。
(3R)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Ac、230mg、0.50mmol)の1,4-ジオキサン(6mL)溶液に、tert-ブチルカルバメート(117.1mg、1.00mmol)、キサントホス(43.4mg、0.07mmol)、およびPd2(dba)3(18.3mg、0.02mmol)を加えた。混合物を80℃のN2下で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(DCM:CH3OH=30:1)によって精製して、tert-ブチルN-[7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-3-オキソ-1H-イソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]カルバメート(3Ba、100mg、0.18mmol、37%の収率)を得た。LCMS[M+H]:541.2。
tert-ブチルN-[7-[(3aS,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-5-クロロ-3-オキソ-1H-イソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]カルバメート(3Ba、100mg、0.18mmol)のDCM(3mL)溶液に、TFA(3mL、38.94mmol)を加えた。反応混合物を25℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を真空で濃縮して、粗(3R)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Bb)を得、これを直接次のステップで使用した。LCMS[M+H]:441.1。
(3R)-3-[(3aS,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-4,5,6,6a-テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-6-イル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オン(3Bb、70mg、0.16mmol)の水溶液(3mL)に、TFA(1.4mL、18.2mmol)を加えた。反応混合物を30℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物をH2O中のCH3CN(0.1%のTFA)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製し、HCl(1mL、2N)を加え、凍結乾燥して、白色の固体として(3R)-3-[(1S,2R,3S,4R)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,3-ジヒドロキシ-シクロペンチル]-6-クロロ-3H-イソベンゾフラン-1-オンハイドロクロライド(実施例3B、14.0mg、0.03mmol、19.0%の収率)を得た。LCMS[M+H]:401.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.30(s、1H)、7.80~7.90(m、3H)、7.48~7.49(m、1H)、6.93~6.94(m、1H)、5.94~5.95(m、1H)、4.83~4.89(m、1H)、4.24~4.27(m、1H)、4.15~4.18(m、1H)、2.68~2.76(m、1H)、1.73~1.80(m、1H)、1.18~1.26(m、1H)。
(2-ブロモ-4-クロロ-フェニル)メタノール(5a、5.0g、22.58mmol)およびイミダゾール(3.07g、45.15mmol)のDMF(10mL)混合物に、0℃でTBSCl(5.10g、33.86mmol)を加えた。混合物を室温で2時間撹拌した。TCL(PE:EA=10:1、Rf=0.7)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、混合物を酢酸エチル(50mL×3)で抽出し、次に、有機層を食塩水(100mL×3)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=200:1~100:1)上で精製して、無色の油として(2-ブロモ-4-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(5b、6.80g、18.23mmol、80.7%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ7.70(s、1H)、7.49(s、2H)、4.66(s、2H)、0.91(s、9H)、0.10(s、6H)。
(2-ブロモ-4-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(5b,6.74g、20.06mmol)のTHF(50mL)溶液に、-78℃のN2下でブチルリチウム(8.6mL、13.79mmol)を加えた。得られた5cの溶液を-78℃のN2下で10分間撹拌した。(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N,2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、2.4g、6.27mmol)のTHF(50mL)溶液を加え、混合物を-78℃のN2下で30分間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を飽和NH4Cl溶液(50mL)でクエンチした。混合物を酢酸エチル(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層を食塩水(40mL×3)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=20:1~10:1)によって精製して、淡黄色の油として[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-クロロ-フェニル]メタノン(5d、3.36g、5.81mmol、92.6%の収率)を得た。LCMS[M+H]:578.1。
[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-クロロ-フェニル]メタノン(5d、3.3g、5.71mmol)のトルエン(100mL)溶液に、-78℃のN2下で水素化ジイソブチルアルミニウム(9.5mL、14.26mmol)を加えた。反応混合物を-78℃のN2下で0.5時間撹拌した。TLC(PE:EA=3:1、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(10mL×3)および食塩水(10mL×3)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=10:1~8:1)によって精製して、白色の固体として(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-クロロ-フェニル]メタノール(5e、1.8g、2.67mmol、46.7%の収率)得た。LCMS[M+H]:580.2。
(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-クロロ-フェニル]メタノール(5e、1.8g、3.10mmol)のDMSO(12mL)およびメタノール(0.2mL)溶液に、CsF(1.2g、9.3mmol)を加えた。反応混合物を25℃で4時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濾過し、H2O(中性条件)中のCH3CNで10%~95%まで溶出する逆相コンビフラッシュによって精製し、白色の固体として(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[5-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(5f、560mg、1.19mmol、38.3%の収率)を得た。LCMS[M+H]:466.1。
(R)-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4、6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-[5-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]メタノール(5f、510mg、1.09mmol)のTHF(15.0mL))溶液に、ピリジン(0.1mL、1.09mmol)、トリブチルホスフィン(0.6mL、2.19mmol)、およびDIAD(0.2mL、2.3mmol)を加えた。反応混合物を25℃で2時間撹拌した。TLC(PE:EA=3:1、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカクロマトグラフィーカラム(100~200メッシュサイズ、PE:EA=20:1~10:1)によって精製して、白色の固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(5g、350mg、0.78mmol、71.4%の収率)を得た。LCMS[M+H]:448.1。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(5g、48.1mg、0.11mmol)、1,4-ジオキサン(0.5mL)、およびNH3・H2O(0.5mL、12.98mmol)の混合物を120℃のオートクレーブ内で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して、白色の固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(5h、50mg、0.10mmol、94.6%の収率)を得た。LCMS[M+H]:429.1。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(5h、50mg、0.12mmol)、水(0.5mL)、およびTFA(0.8mL、9.06mmol)の混合物を40℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濃縮し、H2O中のCH3CNで10%~95%まで溶出する分取HPLC(0.1%のNH3・H2O)によって精製し、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例5、19.5mg、0.05mmol、42.9%の収率)を得た。LCMS[M+H]:389.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.07(s、1H)、7.37(s、3H)、7.30(s、1H)、7.03(br、2H)、6.65(d、J=3.6Hz、1H)、6.16(d、J=7.6Hz、1H)、5.36(d、J=2.0Hz、1H)、5.26(d、J=7.2Hz、1H)、5.19(d、J=4.0Hz、1H)、5.04~5.13(m、2H)、4.52(dd、J1=7.2Hz、J2=5.2Hz、1H)、4.11(d、J=4.8Hz、1H)、3.93(t、J=4.4Hz、1H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.07(s、1H)、7.37(s、3H)、7.29(s、1H)、6.66(d、J=3.6Hz、1H)、6.15(d、J=3.6Hz、1H)、5.37(br、1H)、5.04~5.13(m、2H)、4.52(dd、J1=2.0Hz、J2=5.2Hz、1H)、4.11(d、J=5.2Hz、1H)、3.93(d、J=4.8Hz、1H)。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-クロロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(5g、200.0mg、0.45mmol)のTHF(5mL))溶液に、25℃でジメチル亜鉛(4.5mL、4.46mmol)を加えた。反応混合物を80℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を室温に冷却し、飽和NaHCO3(水溶液)でクエンチし、酢酸エチル(100mL×3)で抽出した。有機層を食塩水(50mL×3)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して、褐色の固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-メチル-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(15a、206mg、0.40mmol、90.6%の収率)を得た。LCMS[M+H]:428.1。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]-4-メチル-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(15a、106mg、0.25mmol)、水(0.5mL)、およびTFA(0.8mL、8.33mmol)の混合物を40℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を濾過し、H2O中のCH3CNで10%~95%まで溶出する分取HPLC(0.1%のNH3H2O)によって精製し、白色の固体として(2S,3S,4R,5R)-2-[(1R)-6-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル]-5-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例15、36.6mg、0.09mmol、37.1%の収率)を得た。LCMS[M+H]:388.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.67(s、1H)、7.78(d、J=3.6Hz、1H)、7.38(s、2H)、7.31(s、1H)、6.83(d、J=3.6Hz、1H)、6.29(d、J=7.2Hz、1H)、5.33~5.40(m、3H)、5.06~5.15(m、2H)、4.55~4.58(m、1H)、4.18(d、J=4.8Hz、1H)、3.93(d、J=4.8Hz、1H)、2.68(s、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.67(s、1H)、7.77(d、J=4.0Hz、1H)、7.38(s、2H)、7.31(s、1H)、6.84(d、J=4.0Hz、1H)、6.29(d、J=3.2Hz、1H)、5.39(br、1H)、5.06~5.16(m、2H)、4.55~4.58(m、1H)、4.18(d、J=4.0Hz、1H)、3.93(d、J=3.2Hz、1H)、2.68(s、3H)。
2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)酢酸(20.0g、80.16mmol)のTHF(200mL)溶液に、THF(240.49mL、240.49mmol)中のボランを加え、混合物を40℃で8時間撹拌した。混合物を0℃でMeOHでクエンチし、濃縮して、EA(400mL×2)で抽出した。合わせた有機層を乾燥させ、濃縮し、CH3CN/H2O(中性)で5/95~95/5で溶出するコンビフラッシュによって精製して、無色の油として22b(18.1g、76.854mmol、95.9%の収率)を得た。LCMS[M-18]:217.0/219.0。
22a(18.1g、76.85mmol)のDMF(200mL)溶液に、イミダゾール(7.85g、115.28mmol)およびTBDMSCl(13.9g、92.23mmol)を加え、混合物を25℃で8時間撹拌した。EA(800mL)を加え、混合物を食塩水(400mL×2)で洗浄した。有機層を濃縮し、フラッシュカラム(PE)によって精製して、無色の油として22b(26.7g、76.34mmol、99.3%の収率)を得た。
22b(8.91g、25.6mmol)の乾燥THF(50mL)溶液に、n-BuLi(12.8mL、20.48mmol)を-78℃で加え、混合物を窒素下で10分間撹拌した。1Ad(4.0g、10.24mmol)の乾燥THF(20mL)溶液を加え、混合物を-78℃で5分間撹拌した。TLC(PE:EA=8:1)は、反応が完了したことを示した。反応物を希釈したHCl(pH=6、クエンチプロセス中はpH<8に維持)に注いだ。混合物をEA(200mL×2)で抽出し、合わせた有機層を乾燥させ、濃縮し、CH3CN/H2O(中性)で5/95~95/5まで溶出するコンビフラッシュによって精製し、黄色い固体として22c(5.1g、8.60mmol、84%の収率)を得た。
-78℃の22c(5.0g、8.44mmol)のTHF(30mL)溶液に、DIBAL-H(16.88mL、25.31mmol)を加え、混合物を-78℃で30分間撹拌した。TLC(PE/EA=8/1)は、SM Rf=0.5が主生成物Rf=0.4で完全に消費されたことを示した。反応物を希釈したHCl(pH=6、400mL、クエンチプロセス中はpH<8に維持)に注いだ。混合物をEA(300mL×2)で抽出し、合わせた有機層を乾燥および濃縮して、黄色い固体として粗生成物22d(5.0g)を得た。
22d(3.0g、5.17mmol)のTHF(50mL)溶液に、フッ化テトラブチルアンモニウム(5.17mL、5.17mmol)を加えた。混合溶液を25℃で40分間撹拌した。反応混合物をNH4Cl水溶液に注ぎ、EA(100mL)で抽出した。合わせた有機層を食塩水で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させ、溶媒を減圧下で濃縮した。粗生成物をフラッシュカラム(PE:EA=15:1~3:1)によって精製して、白色の固体として22e(2g、4.08mmol、79%の収率)を得た。LCMS[M+H]:480.1。
22e(2.0g、4.16mmol)のTHF(100mL)溶液に、トリブチルホスフィン(2.1mL、8.33mmol)、イソプロピル(NE)-N-イソプロポキシカルボニルイミノカルバメート(1.72mL、8.74mmol)、およびピリジン(0.34mL、4.16mmol)を加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。
臭化メチルマグネシウム(3.68mL、11.04mmol)を、第二鉄アセチルアセトン(0.13g、0.37mmol)および22f(1.7g、3.68mmol)のTHF(100mL)溶液に、5℃の窒素下で滴下した。反応混合物を室温に温め、1時間撹拌した。TLC(EA:PE=1:1、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。飽和NH4Clを滴下して反応物をクエンチし、これをEA(200mL×2)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濃縮した。残留物をフラッシュカラム(PE:EA=10:1~1:1)によって精製して、白色の固体として22g(900mg、1.93mmol、52.6%の収率)を得た。
HCl(6.0mL、12mmol)のメタノール(10mL)溶液に、22g(900mg、2.04mmol)を加え、反応混合物を40℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残留物をEA(50ml)とともに撹拌し、濾過した。固体を、CH3CN/H2O(0.1%のNH4OH)で5/95~95/5まで溶出する分取HPLCによって精製した。生成物画分をEA(100ml×2)で抽出し、抽出物を濃縮して、白色の固体として実施例22(550mg、1.34mmol、66%の収率)を得た。LCMS[M+H]:402.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.67(s、1H)、7.76(d、J=4.0Hz、1H)、7.22~7.31(m、3H)、6.81(d、J=3.6Hz、1H)、6.31(d、J=7.6Hz、1H)、5.26(d、J=7.2Hz、1H)、5.13(d、J=4.0Hz、1H)、4.90(d、J=3.6Hz、1H)、4.48~4.54(m、1H)、4.42~4.43(m、1H)、4.23~4.27(m、1H)、3.84~3.86(m、1H)、3.66~3.72(m、1H)、2.91~2.99(m、1H)、2.70~2.74(m、1H)、2.67(s、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.86(s、1H)、7.77(d、J=4Hz、1H)、7.22~7.31(m、3H)、6.82(d、J=3.6Hz、1H)、6.31(d、J=7.6Hz、1H)、4.90(d、J=3.6Hz、1H)、4.49~4.53(m、1H)、4.42~4.43(m、1H)、4.24~4.28(m、1H)、3.83~3.85(m、1H)、3.66~3.72(m、1H)、2.91~2.99(m、1H)、2.70~2.75(m、1H)、2.69(s、3H)。
(メトキシメチル)トリフェニルホスホニウムクロライド(22.96g、66.98mmol)のTHF(100mL)溶液に、カリウムtert-ブトキシド(7.16g、63.79mmol)を-10℃のN2下で加えた。5分後、2-ブロモ-5-クロロ-ベンズアルデヒド(44a、7.0g、31.9mmol)を加えた。溶液を-10℃で2時間撹拌した。TLC(PE=100%、Rf=0.8)は、反応が完了したことを示した。反応混合物をH2O(200mL)に注いだ。混合物をEA(200mL)で抽出し、水(60mL)および食塩水(60mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、PE(100%)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い固体として44b(7.2g、29.09mmol、91.2%の収率、EおよびZ異性体の混合物)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ7.99(d、J=2.8Hz、1H)、7.61~7.56(m、2H)、7.43~7.40(m、1H)、7.15~7.10(m、2H)、6.58(d、J=6.8Hz、1H)、5.93(d、J=12.8Hz、2H)、5.44(d、J=7.2Hz)、3.84(s、3H)、3.71(s、3H)。
メタノール(70mL)中のp-トルエンスルホン酸(537mg、2.83mmol)の混合物に、44b(7.0g、28.28mmol)を加えた。混合物を66℃で16時間撹拌した。TLC(PE=100%、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。反応混合物をH2O(200mL)に注いだ。混合物をEA(200mL)で抽出し、水(60mL)および食塩水(60mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、PE(100%)で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として44c(7.2g、25.7mmol、91%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.62(d、J=8.8Hz、1H)、7.43(d、J=2.4Hz、1H)、7.25(dd、J=8.4、2.8Hz、1H)、4.62(t、J=5.2Hz、1H)、3.26(s、6H)、2.99(d、J=5.6Hz、2H)。
THF(30mL)中の44c(3.0g、10.73mmol)の混合物に、-78℃でn-BuLi(2.04g、10.73mmol)を加えた。得られた44dの溶液を-78℃で1分間撹拌し、THF(20mL)中の1Ad(3.24g、8.46mmol)を-78℃で加えた。反応混合物を-78℃で30分間撹拌した。TLC(PE:EA=5:1、Rf=0.5)は、反応が完了したことを示した。反応物をNH4Cl(水溶液、100mL)および水(100mL)でクエンチした。水層をEA(300mL×3)で抽出した。有機層を濃縮して粗生成物を得、これをPE:EA=10:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として44e(3g、5.74mmol、53.5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:522.3
トルエン(30mL)中の44e(3.0g、5.74mmol)の混合物に、-78℃でDIBAL-H(1.33mL、11.49mmol)を加えた。混合物を-78℃で30分間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物をH2O(100mL)に注ぎ、DCM(200mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、DCM:MeOH=5:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として44f(3g、5.72mmol、99.6%の収率)を得た。LCMS[M+H]:524.4
メタノール(20mL)中の(S)-[4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(2.0g、3.81mmol)の混合物に、TsOH(0.03mL、5.72mmol、0℃)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。TLC(PE:EA=5:1、Rf=0.5)は、反応が完了したことを示した。反応混合物をH2O(30mL)に注ぎ、DCM(50mL×3)で抽出した。有機相を飽和NaCl(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、PE:EA=10:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として44g(1.36g、2.76mmol、72%の収率)を得た。LCMS[M+H]:492.2
THF(2mL)中の44g(200mg、0.41mmol)および第二鉄アセチルアセトン(71.73mg、0.20mmol)の混合物に、-10℃でMeMgBr(484mg、4.06mmol)を加えた。反応混合物を0℃に温め、1時間撹拌した。TLC(PE:EA=5:1、Rf=0.7)は、反応が完了したことを示した。反応混合物をH2O(10mL)に注ぎ、DCM(10mL×3)で抽出し、飽和NaCl(20mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、PE:EA=7:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として44h(110mg、0.23mmol、57.4%の収率)を得た。LCMS[M+H]:472.4
メタノール(2mL)中の44時間(110mg、0.23mmol)の混合物に、HCl(42mg、1.17mmol)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。TLC(PE:EA=5:1、Rf=0.7)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物をH2O(10mL)に注ぎ、DCM(10mL×3)で抽出し、飽和NaCl(20mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物を、PE:EA=7:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して粗生成物を得、これをH2O中のCH3CN(0.1%のNH3H2O)で10%~95%まで溶出する分取HPLCによってさらに精製し、白色の固体として実施例44(25mg、0.047mmol、20%の収率)を得た。LCMS[M+H]:432.41H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ8.67(s、1H)、7.79~7.81(d、1H)、7.22~7.32(m、3H)、6.82~6.84(m、1H)、6.31~6.34(m、1H)、5.15~5.30(m、3H)、4.82(d、1H)、4.46~4.58(m、2H)、3.89~3.91(t、1H)、3.38(s、3H)、3.08~3.13(m、1H)、2.77(d、1H)、2.67(s、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ8.68(s、1H)、7.81(d、1H)、7.22~7.32(m、3H)、6.83(d、1H)、6.32(d、1H)、5.26(d、1H)、4.83(d、1H)、4.78~4.57(m、2H)、3.89(d、1H)、3.08(d、1H)、2.77(d、1H)、2.67(s、3H)。
(メトキシメチル)-トリフェニルホスホニウムクロライド(26.24g、76.55mmol)のTHF(70mL)溶液に、-25℃のN2下でカリウムtert-ブトキシド(4.65mL、72.91mmol)を加えた。数分後、2-ブロモ-5-クロロ-ベンズアルデヒド(46a、8.0g、36.45mmol)を加えた。溶液を-25℃で2時間撹拌した。反応物をTLC(石油エーテル=100%、Rf=0.8)によって監視した。反応混合物を水(200mL)に注いだ。酢酸エチル(200mL)を加え、有機相を分離した。溶液を水(100mL)および食塩水(100mL)で洗浄し、乾燥し(Na2SO4)、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテル(100%)を用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として1-ブロモ-4-クロロ-2-(2-メトキシビニル)ベンゼン(46b、8.75g、35.351mmol、97%の収率)を得た。LCMS[M+H]:247.1。
メタノール(70mL)中のTsOH(672mg、3.54mmol)の混合物に、1-ブロモ-4-クロロ-2-(2-メトキシビニル)ベンゼン(46b、8.75g、35.35mmol)を加え、混合物を75℃で16時間撹拌した。TLC(石油エーテル=100%、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(200mL)に注ぎ、酢酸エチル(200mL)を加えた。有機層を飽和NaCl(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、石油エーテル(100%)を用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として1-ブロモ-4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)ベンゼン(46c、5.5g、19.674mmol、56%の収率)を得た。LCMS[M+H]:279.1。
THF(30mL)中の1-ブロモ-4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)ベンゼン(46c、5.5g、19.7mmol)の混合物に、-78℃でBuLi(3.74g、19.7mmol)を加え、1分間撹拌した。(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N、2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、5.94g、15.52mmol)を-78℃で加え、反応物を-78℃で30分間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.5)は、反応が完了したことを示した。反応物をNH4Cl(100mL)および水(100mL)でクエンチした。水層を酢酸エチル(300mL×3)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮した。粗生成物を、石油エーテル:酢酸エチル(10:1)のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として[4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(46d、2.0g、3.8286mmol、19.5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:522.3。
トルエン(30mL)中の[4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(46d、2.0g、3.83mmol)の混合物に、-78℃でDIBAL-H(0.89mL、7.66mmol)を加えた。混合物を-78℃で30分間撹拌した。反応物を水(100mL)に注ぎ、DCM(200mL)で抽出した。水層をDMC(300mL×3)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮した。粗生成物を、DCM:MeOH=5:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として(S)-[4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(46e、2g、3.81mmol、100%の収率)を得た。LCMS[M+H]:524.3。
メタノール(20mL)中の(S)-[4-クロロ-2-(2,2-ジメトキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(46e、2.0g、3.81mmol)の混合物に、0℃でTsOH(0.03mL、5.72mmol)を加え、次に、混合物を25℃で2時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.5)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、DCM(50mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空で濃縮した。粗生成物を、石油エーテル:酢酸エチル=10:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(46f、1.6g、3.25mmol、85%の収率)を得た。LCMS[M+H]:492.0。
THF(10mL)中の4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(46f、800mg、1.62mmol)および第二鉄アセチルアセトン(287mg、0.81mmol)の混合物に、-10℃で臭化メチルマグネシウム(1937.48mg、16.25mmol)を加えた。混合物を0℃に温め、1時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.7)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、DCM(50mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空で濃縮した。粗生成物を石油エーテル:酢酸エチル=7:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(46g、610mg、1.29mmol、80%の収率)を得た。LCMS[M+H]:472.1。
水(6mL)中の4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(46g、590mg、1.25mmol)の混合物に、トリフルオロ酢酸(228mg、2mmol)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテル:酢酸エチル=7:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロ-3-ヒドロキシ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(46h、280mg、0.54mmol、43%の収率)を得た。LCMS[M+H]:418.1。
アセトン(10mL)中の(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロ-3-ヒドロキシ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(46h、50mg、0.12mmol)の混合物に、0℃でTsOH(8.24mg、0.05mmol)を加えた。混合物を25℃で3時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、DCM(50mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテル:酢酸エチル=(7:1)のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オール(46i、76mg、0.13mmol、112%の収率)を得た。LCMS[M+H]:458.1。
DCM(3mL)中の6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オール(46i、75mg、0.16mmol)の混合物に、0℃でPCC(0.09mL、0.49mmol)を加え、混合物を0℃で30分間撹拌した。次に、反応が完了するまで反応物を25℃に温めた。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、DCM(3×50mL)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空で濃縮して、白色の固体として6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オン(46j、79mg、0.172mmol、100%の収率)を得、これをさらに精製することなく次のステップで使用した。LCMS[M+H]:456.3。
水(2mL)中の(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オン(46j、78mg、0.17mmol)の混合物に、トリフルオロ酢酸酸(31.19mg、0.27mmol)を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応物をNaHCO3で中和し、水中のCH3CN(0.1%のTFA)で10%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製して、オフホワイトの固体として(1R)-6-クロロ-1-[(2S,3S,4R,5R)-3,4-ジヒドロキシ-5-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)テトラヒドロフラン-2-イル]イソクロマン-3-オン(実施例46、3.4mg、0.0078mmol、4.6%の収率)を得た。LCMS[M+H]:416.0。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ8.74(s、1H)、7.58(s、1H)、7.30(m、3H)、6.86(s、1H)、6.23(d、J=5.6Hz、1H)、5.73(d、J=4.8Hz、1H)、4.48(m、2H)、4.26(s、1H)、3.77(d、J=4.8Hz、2H)、2.72(s、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ8.82(s、1H)、7.62(d、J=3.2Hz、1H)、7.29(m、3H)、6.93(d、J=3.2Hz、1H)、6.24(d、J=5.6Hz、1H)、5.73(d、J=5.2Hz、1H)、4.49(m、2H)、4.26(s、1H)、3.76(s、2H)、2.76(s、3H)。
(2-ブロモ-5-クロロフェニル)メタノール(55a、6.0g、27.09mmol)およびイミダゾール(3.69g、54.18mmol)のDCM(50mL)溶液に、t-ブチルクロロジフェニルシラン(4.9g、32.51mmol)を室温でゆっくりと加えた。混合物を30℃で3時間撹拌した。TLC(石油エーテル、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル)によって精製して、無色の油として(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(55b、9.0g、26.81mmol、99%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ7.51(d、J=8.4、1H)、7.81(d、J=2.8、1H)、7.22~7.19(m、1H)、4.57(s、1H)、0.83~0.81(m、9H)、0.02~0.01(m、6H)。
(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)メトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(55b、9g、26.8mmol)の乾燥THF(50mL)溶液に、-78℃のAr下で撹拌した。n-BuLi(12.02mL、30.04mmol)を加え、-78℃で10分間撹拌した。(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N、2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、4.6g、12.02mmol)の無水THF(50mL)を加え、反応混合物を-78°Cで30分間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。混合物をHCl(1N)でpH=6に調整した。反応物をEtOAc(2×100mL)で抽出し、有機物を水(100mL×2)で洗浄し、次に、食塩水(50mL×2)で洗浄した。有機層をMgSO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=10:1~5:1)によって精製して、[2-[[tert-ブチル(ジメチル)-シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(55c、4.03g、6.97mmol、58%の収率)を得た。LCMS[M+H]:578.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.67(s、1H)、7.68(d、J=3.6、1H)、7.62(d、J=8.4、1H)、7.47~7.46(m、2H)、7.35(d、J=8.0、1H)、7.26~7.20(m、2H)、6.49(d、J=3.6、1H)、6.42(s、1H)、5.53~5.51(m、2H)、5.42(d、J=5.6、1H)、5.27~5.25(m、1H)、4.54~4.44(m、3H)、1.52(s、3H)、1.31(s、3H)、0.69(s、9H)、0.01~0.070(m、6H)。
[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(55c、4.39g、7.59mmol))のトルエン(10mL)溶液に、-78℃で水素化ジイソブチルアルミニウム(3.23g、22.77mmol、トルエン中に1M)を滴下した。反応物を-78℃で30分間撹拌した。混合物をNH4Cl(50mL)でクエンチした。反応混合物を真空で濃縮し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4で乾燥させた。溶媒を真空で除去して、粗(R)-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-[(7S)-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55d、4.2g)を得、これをさらに精製することなく次のステップで使用した。LCMS[M+H]:580.2。
(R)-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-[(7S)-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55d、4.2g、7.23mmol)のTHF(5mL)溶液に、TBAF(1M)(3.78mL、14.47mmol)を加えた。混合物を25℃のN2中で2時間撹拌した。混合物をNH4Cl(50mL)でクエンチした。反応混合物を真空で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=3:1)によって精製して、(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-[(7S)-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55e、1.8g、3.78mmol、52%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.69(d、J=3.2、1H)、8.03(d、J=3.6、1H)、7.53(d、J=8、1H)、7.39~7.29(m、2H)、6.79(d、J=3.6、1H)、6.32(d、J=3.6、1H)、5.96(d、J=4.4、1H)、5.27~5.17(m、3H)、4.94~4.91(m、1H)、4.46~4.41(m、1H)、4.26~4.19(m、1H)、1.51(s、3H)、1.30(s、3H)。LCMS[M+H]:466.1。
第二鉄アセチルアセトン(22.72mg、0.06mmol)および(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(6R)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55e、300mg、0.64mmol)のTHF(5mL)溶液に、0℃のN2下で臭化メチルマグネシウム(721.9mg、6.43mmol)を加えた。反応混合物を室温に温め、1時間撹拌した。TLC(酢酸エチル:石油エーテル=5:1、Rf=0.6)は、反応が完了したことを示した。飽和NH4Clを滴下して反応物をクエンチした。反応混合物を酢酸エチル(2×50mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=10:1~5:1)によって精製して、無色の油として(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(6R)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55f、105mg、0.23mmol、37%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.74(s、1H)、7.82(d、J=3.6、1H)、7.53(d、J=8、1H)、7.39~7.35(m、2H)、6.81(d、J=3.6、1H)、6.27(d、J=4、1H)、6.00(d、J=4.4、1H)、5.25~5.15(m、3H)、4.92~4.90(m、1H)、4.47~4.41(m、1H)、4.24~4.19(m、2H)、2.68~2.62(m、3H)、1.51(s、3H)、1.30(s、3H)。LCMS[M+H]:446.1。
(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55f、150mg、0.34mmol)のDCM(1.2mL))およびDMF(2.5mL)の溶液に、水素化ナトリウム(80.74mg、3.36mmol)を加えた。混合溶液を80℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物をNH4Cl(50mL)でクエンチした。溶媒を真空で除去して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM:MeOH=50:1)によって精製して、黄色い油として4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,5-ジヒドロ-2,4-ベンゾジオキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(55g、160mg、0.33mmol、97%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.73(s、1H)、7.71(d、J=3.6、1H)、7.38(d、J=1.6、1H)、73.31~7.30(m、2H)、6.80(d、J=3.6、1H)、6.48(d、J=4、1H)、5.33~5.31(m、1H)、5.20~5.14(m、2H)、5.05~5.01(m、2H)、4.83~4.78(m、3H)、2.68~2.62(m、3H)、1.60(s、3H)、1.34(s、3H)。LCMS[M+H]:458.1。
4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,5-ジヒドロ-2,4-ベンゾジオキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(55g、160mg、0.35mmol)の水溶液(1mL)に、2,2,2-トリフルオロ酢酸(2.0mL、2mmol)を加え、混合物を25℃で30分間撹拌した。pH=7になるまでNH3水を加え、混合物を真空で濃縮した。残留物を水中のMeCN(0.1%のNH3水)で10%~90%まで溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ-2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-7-クロロ-1,5-ジヒドロ-2,4-ベンゾジオキセピン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例55、31mg、0.073mmol、21%の収率)を得た。LCMS[M+H]:418.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.68(s、1H)、7.64(d、J=4、1H)、7.41(s、1H)、7.32(d、J=1.2、2H)、6.78(d、J=3.6、1H)、6.32(d、J=8.0、1H)、5.51(d、J=4.4、1H)、5.41(d、J=7.2、1H)、5.34~5.31(m、1H)、5.09(d、J=4.8、1H)、5.04(d、J=6.4、1H)、4.99~4.95(m、1H)、4.85~4.81(m、1H)、4.62~4.56(m、2H)、4.19~4.17(m、1H)、2.66(s、3H)。
22f(100mg、0.22mmol)の1,4-ジオキサン(2mL)溶液に、水中のメチルアミン(2.0mL、0.09mmol)を加えた。混合物を120℃で16時間撹拌した。混合物をCH3CN/H2O(中性)で5/95~95/5まで溶出する分取HPLCによって精製した。生成物画分を凍結乾燥して、黄色い固体として69a(75mg、0.16mmol、75%の収率)を得た。LCMS[M+H]:457.1。
69a(75mg、0.16mmol)のMeCN(1mL)溶液に、TFA/H2O(0.97mL、0.39mmol)を加えた。混合物を40℃で2時間撹拌した。混合物をCH3CN/H2O(0.1%のNH4OH)で5/95~95/5まで溶出する分取HPLCによって精製し、凍結乾燥して、白色の固体として実施例69(36.5mg、0.087mmol、53%の収率)を得た。LCMS[M+H]:417.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.15(s、1H)、7.48~7.49(m、1H)、7.36~7.37(m、1H)、7.28~7.30(m、2H)、7.21~7.23(m、1H)、6.63(d、J=3.2Hz、1H)、6.18(d、J=7.6Hz、1H)、5.16(d、J=7.6Hz、1H)、5.04(d、J=4.0Hz、1H)、4.86~4.87(m、1H)、4.42~4.48(m、1H)、4.35~4.36(m、1H)、4.20~4.24(m、1H)、3.83~3.86(m、1H)、3.65~3.71(m、1H)、2.96(d、J=7.6Hz、3H)、2.89~2.94(m、1H)、2.69~2.74(m、1H)。
銅(898.6mg、14.14mmol)のDMSO(10mL)溶液に、2-ブロモ-2,2-ジフルオロ-酢酸(5739.98mg、28.28mmol)を加え、混合物を室温の窒素下で撹拌した。1-ブロモ-2-ヨード-ベンゼン(2000mg、7.07mmol)を1時間後に混合物に加えた。16時間後、水性NH4Cl(50mL)を混合物に加え、EA(50.0mL×3)で抽出した。有機相を合わせ、水(100mL)および食塩水(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をフラッシュカラム(PE:EA=40:1)によって精製して、76a(750mg、2.66mmol、38%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ7.75~7.73(m、1H)、7.65~7.62(m、1H)、7.46~7.42(m、1H)、7.38~7.34(m、1H)、4.36(q、J=7.2Hz、2H)、1.32(t、J=7.2Hz、3H)。
76a(5.8g、20.78mmol)のメタノール(50mL)溶液に、0℃でNaBH4(1.57g、41.57mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した。TLC(PE:EA=10:1、Rf=0.1)は、反応が完了したことを示した。反応物を濃縮し、HCl(1M)を加えた。混合物をEA(30.0mL×3)で抽出した。有機相を合わせ、水(50mL)および食塩水(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をフラッシュカラム(PE:EA=10:1)によって精製して、油として76b(5.1g、19.36mmol、93%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ7.67~7.633(m、2H)、7.40(t、J=7.6Hz、1H)、7.33~7.26(m、1H)、4.21(t、J=13.8Hz、2H)。
76b(5.1g、21.52mmol)およびイミダゾール(2.93g、43.03mmol)のDCM(20mL)溶液に、t-ブチルクロロジフェニルシラン(4.86g、32.27mmol)をゆっくりと加え、反応混合物を室温で2時間撹拌した。TLC(PE、Rf=0.7)は、新しいスポットを示し、SMは消費された。溶媒を真空で除去し、粗生成物をシリカゲル(PE)のカラムクロマトグラフィーによって精製して、オフホワイトの油として76c(6.2g、15.88mmol、74%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ7.67~7.633(m、2H)、7.39(t、J=7.6Hz、1H)、7.32~7.29(m、1H)、4.23(t、J=13.0Hz、2H)、0.82(s、9H)、0.0(s、6H)。
76b(1.03g、2.95mmol)の乾燥THF(10mL)溶液に、-78℃でn-BuLi(1.5mL、2.4mmol)を加え、混合物を窒素下で10分間撹拌した。乾燥THF(5mL)中の1Ad(720mg、1.84mmol)を加え、混合物を-78℃で30分間撹拌した。TLC(PE:EA=10:1、出発材料Rf=0.3、生成物Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。反応物を希釈したHCl(0.05M)に注ぎ、クエンチのプロセス中にpHを<8に維持した。混合物をEA(200mL×2)で抽出し、合わせた有機層を乾燥させ、濃縮し、シリカゲルカラム(PE:EA=100~10:1)によって精製して、黄色い油として76d(610mg、1.02mmol、55%の収率)を得た。LCMS[M+H]:594.3。
76d(610mg、1.03mmol)のトルエン(20mL)溶液に、-78℃の窒素下で水素化ジイソブチルアルミニウム(2.05mL、3.08mmol)を加え、反応混合物を-78°Cで30分間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl(水溶液)で希釈し、混合物をEAで抽出し、食塩水で洗浄した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、溶媒を真空で除去して、粗生成物として76e(600mg、0.93622mmol、91%の収率)を得、これをさらに精製せずに使用した。
76e(270mg、0.45mmol)のTHF(0.03mL)溶液に、TBAF(0.24mL、0.91mmol)を加え、反応混合物を室温で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl溶液(100mL)で希釈し、混合物をEA(50mL×3)で抽出し、合わせた有機物を飽和NaCl(100mL)で洗浄した。有機物を無水Na2SO4で乾燥させ、溶媒を真空で除去した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA=50:1~10:1)によって精製して、固体として76f(120mg、0.2291mmol、51%の収率)を得た。LCMS[M+H]:482.3。
76f(100mg、0.21mmol)のTHF(4mL)溶液に、NaH(33.2mg、0.83mmol)を加え、10分間撹拌した。TSCl(39.56mg、0.21mmol)を加え、反応物を1時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl溶液に注ぎ、EAで抽出し、有機物を飽和NaClで洗浄した。有機相を無水Na2SO4で乾燥させ、溶媒を減圧下で濃縮して粗生成物を得、これを分取TLC(PE:EA=5:1、Rf=0.3)によって精製して、白色の固体として76g(50mg、0.10mmol、48%の収率)を得た。LCMS[M+H]:464.2。
76g(50mg、0.11mmol)および第二鉄アセチルアセトン(3.81mg、0.01mmol)のTHF(6mL)溶液に、0℃の窒素下でMeTHF中の臭化メチルマグネシウム3.2M(0.36mL、1.08mmol)を加えた。反応物を室温で1時間撹拌した。混合物を水性NH4Cl(30mL)に注ぎ、EA(30.0mL×3)で抽出した。有機相を合わせ、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をフラッシュカラム(PE:EA=8:1~PE:EA=3:1)によって精製して、76h(45mg、0.10148mmol、94%の収率)を得た。LCMS[M+H]:444.3。
76h(45mg、0.10mmol)の水溶液(1mL)に、TFA(0.5mL、6.49mmol)を加え、混合物を室温で30分間撹拌した。残留物を、H2O中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5.0%~95.0%まで溶出する分取HPLCによって精製し、白色の固体として実施例76(8.58mg、0.021mmol、20.5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:404.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ8.68(s、1H)、7.75~7.72(m、2H)、7.57~7.48(m、3H)、6.81(d、J=3.6Hz、1H)、6.34(d、J=8Hz、1H)、5.35(d、J=6.8Hz、1H)、5.20(d、J=4Hz、1H)、5.09(m、1H)、4.61(d、J=3.2Hz、1H)、4.56~4.46(m、2H)、4.16~4.07(m、1H)、3.82(t、J=4.4Hz、1H)、2.68(s、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ8.66(s、1H)、7.74~7.71(m、2H)、7.55~7.46(m、3H)、6.81(d、J=3.6Hz、1H)、6.32(d、J=8Hz、1H)、5.08(m、1H)、4.60(d、J=3.2Hz、1H)、4.55~4.46(m、2H)、4.14~4.04(m、1H)、3.80(d、J=5.2Hz、1H)、2.66(s、3H)。
tert-ブタノール(5mL)中のK2CO3(292.98mg、2.12mmol)、(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(55e、300mg、0.64mmol)、およびビス-(4-メトキシベンジル)アミン(331mg、1.29mmol)の混合物を、95℃のN2下で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応物を真空で濃縮乾固し、残留物をEtOAc(2×50mL)で抽出し、有機層を水(2×10mL)で洗浄し、次に、食塩水(2×10mL)で洗浄した。有機層をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:石油エーテル=1:1)によって精製して、白色の固体として(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-[4-[ビス[(4-メトキシフェニル)メチル]アミノ]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(81a、80mg、0.10mmol、16%の収率)を得た。LCMS[M+H]:687.2。
(R)-[4-クロロ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-[4-[ビス[(4-メトキシフェニル)メチル]アミノ]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(81a、80mg、0.12mmol)のDCM(1.2mL)およびDMF(2.5mL)の溶液に、水素化ナトリウム(28mg、1.16mmol)を加えた。混合物を80℃で2時間撹拌した。反応混合物をNH4Cl(50mL)でクエンチした。溶媒を真空で除去して、黄色い固体としてN,N-ビス[(4-メトキシフェニル)メチル]-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,5-ジヒドロ-2,4-ベンゾジオキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(81b、90mg、0.10mmol、87%の収率)を得た。LCMS[M+H]:699.3。
N,N-ビス[(4-メトキシフェニル)メチル]-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1、5-ジヒドロ-2,4-ベンゾジオキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(81b、90mg、0.13mmol)の水溶液(1mL)に、2,2,2-トリフルオロ酢酸(0.74mL、0.74mmol)を加えた。反応混合物を25℃で30分間撹拌した。pH=7になるまでNH3水を加え、混合物を真空で濃縮した。残留物を水中のMeCN(0.1%のNH3水)で10%~90%まで溶出する分取HPLCによって精製して、粗生成物を得た。粗生成物を水中のMeCN(0.1%のTFA)で10%~90%まで溶出する分取HPLCによってさらに精製し、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-7-クロロ-1,5-ジヒドロ-2,4-ベンゾジオキセピン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例81、2.7mg、0.0063mmol、5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:419.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ:8.33(s、1H)、7.51(d、J=3.6、1H)、7.45(s、1H)、7.42(d、J=1.6、2H)、6.94(d、J=3.2、1H)、6.32(d、J=8.0、1H)、5.33(d、J=6,1H)、5.07~5.03(m、2H)、4.97(d、J=1.2、1H)、4.83(d、J=14.4、1H)、4.61(d、J=4.8、1H)、4.54~4.51(m、1H)、4.17(d、J=4.8、1H)。
1,4-ジオキサン(8mL)中の4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(46f、700mg、1.42mmol)の混合物に、水酸化アンモニウム(0.03mL、14.22mmol)を加えた。混合物を120℃で一晩撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.5)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、DCM(50mL×3)で抽出した。有機層を飽和NaCl(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテル:酢酸エチル=7:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(82a、460mg、0.97mmol、68%の収率)を得た。LCMS[M+H]:458.1。
水(5mL)中の7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-3-メトキシ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(82a、460mg、0.97mmol)の混合物に、トリフルオロ酢酸(177mg、1.56mmol)を加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=3:1、Rf=0.3)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応物をNaHCO3で中和し、石油エーテル:酢酸エチル=7:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して粗生成物を得、これを水中のCH3CN(0.1%のNH3/水)で10%~95%まで溶出する分取HPLCによってさらに精製し、オフホワイトの固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロ-3-ヒドロキシ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(82b、50mg、0.11mmol、12%の収率)を得た。LCMS[M+H]:419.1。
アセトン(10mL)中の(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロ-3-ヒドロキシ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(82b、230.5mg、0.55mmol)の混合物に、0℃でTsOH(38mg、0.22mmol)を加えた。反応混合物を25℃で3時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.3)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(10mL)に注ぎ、DCM(10mL×3)で抽出した。有機層を飽和NaCl(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物を、石油エーテル:酢酸エチル=7:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オール(82c、180mg、0.32mmol、58%の収率)を得た。LCMS[M+H]:458.1。
DCM(10mL)中の6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オール(82c、44mg、0.10mmol)の混合物に、0℃でPCC(0.05mL、0.29mmol)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌し、次に、反応が完了するまで25℃に温めた。反応混合物を水(10mL)に注ぎ、DCM(2×10mL)で抽出した。有機物を真空で濃縮して、白色の固体として6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オン(82d、35mg、0.076mmol、79.5%の収率)を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップで使用した。LCMS[M+H]:457.1。
水(2mL)中の(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-アミノピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン-3-オン(82d、35mg、0.08mmol)の混合物に、トリフルオロ酢酸(14mg、0.12mmol)を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=3:1、Rf=0.3)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応物をNaHCO3で中和し、DCM(3×3mL)で抽出し、有機物を飽和NaCl(20mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物を石油エーテル:酢酸エチル=7:1のシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、水中のCH3CN(0.1%のTFA)で10%~95%まで溶出する分取HPLCでさらに精製し、白色の固体として(1R)-6-クロロ-1-[(2S,3S,4R,5R)-5-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3,4-ジヒドロキシ-テトラヒドロフラン-2-イル]イソクロマン-3-オン;2,2,2-トリフルオロ酢酸(実施例82、3mg、0.0052mmol、7%の収率)を得た。LCMS[M+H]:417.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ:8.50~8.64(m、2H)、8.30(s、1H)、7.30~7.44(m、4H)、6.91(s、1H)、6.10(s、1H)、5.83(s、1H)、5.55~5.67(m、2H)、4.37~4.41(m、3H)、3.74(m、2H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ8.30(s、1H)、7.31~7.42(m、4H)、6.93(s、1H)、6.10(d、J=4Hz、1H)、5.83(s、1H)、4.38~4.43(m、3H)、3.74(m、2H)。
4-ブロモ-1-クロロ-2-フルオロ-ベンゼン(83a、10g、47.75mmol)のTHF(60mL)溶液に、-78℃でLDA(30mL、57.3mmol)を加えた。反応混合物を-78℃で1時間撹拌し、次に、DMF(7.4mL、95.5mmol)を混合物に加え、反応物を-78℃で1時間撹拌した。反応物をNH4Cl(水溶液、100mL)および水(100mL)でクエンチした。水層を酢酸エチル(3×300mL)で抽出した。有機層を真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテル:酢酸エチル=10:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として6-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロベンズアルデヒド(83b、6.1g、25.69mmol、54%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)10.39(s、1H)、7.86(s、1H)、7.56(dd、J=8Hz、1H)。
(メトキシメチル)トリフェニルホスホニウムクロライド(83b、18.2g、53.06mmol)のTHF(60mL)溶液に、-10℃でTHF(5.67g、50.54mmol)中のカリウムt-ブトキシド1.0Mを加えた。反応物を-10℃で10分間撹拌した。反応物を水(150mL)で希釈し、酢酸エチル(150mL)で抽出した。有機層を真空で濃縮し、残留物を、石油エーテル:酢酸エチル=10:1で溶離するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として1-ブロモ-4-クロロ-3-フルオロ-2-[(E)-2-メトキシビニル]ベンゼン(83c、4.50g、16.1mmol、64%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)7.64(s、1H)、7.51(dd、J=10.8Hz、1H)、7.24(dd、J=13.2Hz、1H)、5.73(d、J=13.2Hz、1H)、3.71(s、3H)。
1-ブロモ-4-クロロ-3-フルオロ-2-[(E)-2-メトキシビニル]ベンゼン(83c、4.5g、16.95mmol)のアセトン(45mL)溶液に、HCl(1.86g、50.85mmol)を加え、混合物を60℃で一晩撹拌した。TLC(石油エーテル)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を真空で濃縮し、酢酸エチル(50mL)で抽出した。有機層を真空で濃縮して、黄色い固体として2-(6-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロ-フェニル)アセトアルデヒド(83d、4.0g、14.32mmol、84.5%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)9.72(s、1H)、7.71(s、1H)、7.58(d、J=11.2Hz、1H)、4.02(d、J=8.4Hz、2H)。
2-(6-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロ-フェニル)アセトアルデヒド(83d、3.3g、13.12mmol)のメタノール(30mL)溶液に、0℃で水素化ホウ素ナトリウム(1.5g、39.37mmol)を加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌した。TLC(石油エーテル)は、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮し、残留物を酢酸エチル(50mL)で抽出し、食塩水(50mL)で洗浄し、有機層を真空で濃縮して、黄色い油として2-(6-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロ-フェニル)エタノール(83e、3.20g、11.99mmol、91%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)7.62(s、1H)、7.48(dd、J=9.2Hz、1H)、4.85(t、J=5.6Hz、1H)、7.52(dd、J=12.8Hz、2H)、2.88(dd、J=7.2Hz、2H)。
2-(3-クロロ-2,6-ジフルオロ-フェニル)エタノール(83e、3.20g、16.62mmol)のDCM(30mL)溶液に、tert-ブチルジメチルクロロシラン(3.01g、19.94mmol)およびイミダゾール(2.26g、33.23mmol)を加えた。反応物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を真空で濃縮し、残留物を酢酸エチル(3×50mL)で抽出し、食塩水(3×50mL)で洗浄した。有機層を真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、無色の油としてtert-ブチル-[2-(3-クロロ-2,6-ジフルオロ-フェニル)エトキシ]-ジメチル-シラン(83f、3.9g、12.07mmol、73%の収率)を得た。LCMS[M+H]:306.8。
2-(6-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロ-フェニル)エトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(83f、3074mg、8.36mmol)のTHF(20mL)溶液に、-78℃でn-BuLi(535.5mg、8.36mmol)を加えた。混合物をN2下で10分間撹拌した。THF(10mL)中の(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N,2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、1.6g、4.18mmol)を加えた。混合物を-78℃で30分間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=10:1)は、反応が完了したことを示した。反応物を、希釈したHCl(0.05mol/L)に加え、クエンチのプロセス中、pHを8未満に維持した。混合物を酢酸エチル(2×200mL)で抽出し、合わせた有機層を乾燥させ、真空で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=100%~10:1)によって精製して、黄色い油として[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-3-フルオロ-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(83g、1.2g、1.87mmol、45%の収率)を得た。LCMS[M+H]:610.1。
[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-3-フルオロ-フェニル]-[(3aR,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-[(7S)-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(83g、1.1g、1.8mmol)のトルエン(15mL)溶液に、-78℃のN2下で水素化ジイソブチルアルミニウム(3.6mL、5.4mmol)を加えた。反応混合物を-78℃で30分間撹拌した。水(50mL)を加え、混合物を酢酸エチル(100mL)で抽出し、飽和NaCl(2×50mL)で洗浄した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、溶媒を真空で除去して、(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-3-フルオロ-フェニル]-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-[(7S)-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(83h、1.0g、1.55mmol、86%の収率)を得、直接次のステップに使用した。LCMS[M+H]:612.2。
(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-3-フルオロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(83h、1.0g、1.63mmol)のTHF(3mL)溶液に、TBAF(0.85mL、3.26mmol)を加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=10:1)は、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=50:1~10:1)によって精製して、白色の固体として2-[3-クロロ-2-フルオロ-6-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]エタノール(83i、670mg、1.30mmol、80%の収率)を得た。LCMS[M+H]:498.1。
2-[3-クロロ-2-フルオロ-6-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]エタノール(83i、500mg、1mmol)のTHF(5mL)溶液に、Ar下でPPh3(526mg、2.01mmol)、DIAD(0.56mL、2.01mmol)を加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空で濃縮し、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-5-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(83j、390mg、0.77mmol、77%の収率)を得た。LCMS[M+H]:480.1。
4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-5-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(83j、100mg、0.21mmol)のTHF(2mL)溶液に、N2下で第二鉄アセチルアセトン(7.35mg、0.02mmol)および臭化メチルマグネシウム(0.21mL、0.63mmol)を滴下した。反応物を室温で30分間撹拌した。混合物を酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、水(2×10mL)で洗浄した。有機層を真空で濃縮して、黄色い油として4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-5-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(83k、90mg、0.19mmol、89%の収率)を得た。LCMS[M+H]:460.2。
4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6-クロロ-5-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(83k、100mg、0.22mmol)の水溶液(2mL)に、TFA(1.1mL、12.34mmol)を加えた。混合物を室温で30分間撹拌した。残留物を、水中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロ-5-フルオロ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例83、18mg、0.042mmol、19%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)8.67(s、1H)、7.78(d、J=4Hz、1H)、7.32~7.28(m、2H)、6.82(d、J=4Hz、1H)、6.31(d、J=7.6Hz、1H)、5.31(d、J=6.8Hz、1H)、5.20(d、J=4Hz、1H)、4.91(d、J=7.2Hz、1H)、4.52~4.46(m、2H)、4.32(s、1H)、3.88(t、J=4Hz、1H)、3.69(s、1H)、2.73(s、2H)、2.67(d、J=8Hz、3H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)8.67(s、1H)、7.78(d、J=4Hz、1H)、7.32~7.28(m、2H)、6.82(d、J=4Hz、1H)、6.31(d、J=7.6Hz、1H)、4.91(d、J=7.2Hz、1H)、4.52~4.46(m、2H)、4.32(s、1H)、3.88(t、J=4Hz、1H)、3.69(s、1H)、2.73(s、2H)、2.67(d、J=8Hz、3H)。
2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)エトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(22b、23.6g、68mmol)の乾燥THF(50mL)溶液に、-78℃でn-BuLi(34mL、54.4mmol)を加えた。反応混合物を-78℃のN2下で10分間撹拌した。乾燥THF(10mL)中の(3aR,4R,6S,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルバルデヒド(86a、5.5g、27.2mmol)を混合物に加えた。混合物を-78℃で5分間撹拌した。反応物を希釈したHCl(300mL、0.6M)に加え、pH=6を維持した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテル:酢酸エチル=5:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6aテトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(86b、5.8g、11.6mmol、43%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.54(d、J=8.4Hz、1H)、7.22~7.29(m、2H)、5.36(s、2H)、4.95(d、J=6.0Hz、1H)、4.68(d、J=5.6Hz、1H)、4.50(s、1H)、4.31(s、1H)、3.83~3.90(m、2H)、3.43(s、3H)、2.78~2.99(m、2H)、1.47(s、3H)、1.30(s、3H)、0.87(s、9H)、0.02(s、6H)。
(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(86b、4.8g、10.1mmol)のTHF(10mL)溶液に、室温でフッ化テトラブチルアンモニウム(10.1mL、10.1mmol)を加えた。混合物を室温で1時間撹拌した。混合物を50mlのNH4Cl(水溶液)に注ぎ、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。有機層を真空で濃縮して粗生成物を得、これを石油エーテルから石油エーテル:酢酸エチル=5:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、無色の油として2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]エタノール(86c、3.8g、9.5mmol、94%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.54(d、J=8.4Hz、1H)、7.22~7.29(m、2H)、5.01(s、2H)、4.95(d、J=6.0Hz、1H)、4.65(d、J=6.0Hz、1H)、4.55(s、1H)、4.33(br、1H)、3.85~3.96(m、2H)、3.41(s、3H)、2.78~3.06(m、2H)、1.47(s、3H)、1.30(s、3H)。
2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6aテトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]エタノール(86c、2.3g、6.4mmol)のTHF(50mL)溶液に、イソプロピル(NE)-N-イソプロポキシカルボニルイミノカルバメート(2.5mL、12.8mmol)およびトリフェニルホスフィン(3.3g、12.8mmol)を加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を真空で濃縮して、石油エーテル:酢酸エチル=20:1~5:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン(86d、2.1g、6.1mmol、96%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.58(d、J=8.4Hz、1H)、7.12~7.17(m、2H)、5.09(s、2H)、4.56~4.62(m、2H)、4.14~4.28(m、2H)、3.71~3.77(m、1H)、3.70(s、3H)、2.65~3.01(m、2H)、1.47(s、3H)、1.25(s、3H)。
(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-メトキシ-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]イソクロマン(86d、1.6g、4.7mmol)のトリフルオロ酢酸(16mL、215.4mmol)溶液に、室温で水(10mL)を加えた。混合物を40℃で24時間撹拌した。反応混合物を真空で濃縮し、石油エーテル:酢酸エチル=5:1~1:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、無色の油として(3R,4S,5S)-5-[(1R)-6-クロロイソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-2,3,4-トリオール(86e、700mg、2.4mmol、42%の収率)を得た。LCMS[M+H]:286.1。
4-クロロ-5-フルオロ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(86f、461mg、2.7mmol)およびピリジン(0.8mL、9.8mmol)の乾燥THF(10mL)溶液に、N2下でトリブチルホスファン(1.2mL、4.9mmol)およびDIAD(1.0mL、5.1mmol)を加えた。(3R,4S,5S)-5-[(1R)-6-クロロイソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-2,3,4-トリオール(86e、700mg、2.4mmol)およびピリジン(0.8mL、9.8mmol)を直ちに加えた。反応混合物を30℃のN2下で1.5時間撹拌した。反応混合物を真空で濃縮し、残留物を石油エーテル:酢酸エチル=5:1~1:1で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-クロロ-5-フルオロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロイソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(86g、160mg、0.4mmol、15%の収率)を得たLCMS[M+H]:440.1。
(2R,3R,4S,5S)-2-(4-クロロ-5-フルオロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロイソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(86g、156mg、0.35mmol)の水酸化アンモニウム(10mL、260mmol)および1,4-ジオキサン(10mL)の混合溶液を、105°Cの密閉した管中で撹拌した。混合溶液を真空で濃縮し、残留物を水中のCH3CNで5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製した。生成物画分を酢酸エチル(2×50ml)で抽出し、真空で濃縮して黄色い固体を得、これを石油エーテル:酢酸エチル=100:1(50ml)で粉砕し、濾過し、真空で乾燥させて、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-5-フルオロ-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6-クロロイソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例86、74mg、0.17mmol、49%の収率)を得た。LCMS[M+H]:421.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ8.08(s、1H)、7.23~7.31(m、4H)、7.01(s、2H)、6.23(d、J=7.6Hz、1H)、5.23(d、J=6.8Hz、1H)、5.08(s、1H)、4.87(s、1H)、4.35~4.39(m、2H)、4.23~4.26(m、1H)、3.79~3.82(m、1H)、3.66~3.71(m、1H)、2.89~2.96(m、1H)、2.70~2.74(m、1H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ8.08(s、1H)、7.23~7.30(m、4H)、6.23(d、J=6.0Hz、1H)、4.87(s、1H)、4.35~4.39(m、2H)、4.23~4.26(m、1H)、3.79~3.81(m、1H)、3.65~3.71(m、1H)、2.89~2.96(m、1H)、2.70~2.74(m、1H)。19F NMR(377MHz、DMSO-d6)δ-166.8。
4-ブロモ-1,2-ジクロロベンゼン(88a、25g、110.67mmol)の溶液に、H2SO4(353.95mL、6640.1mmol)中のI2(42.13g、166mmol)を140°CのArの下で72時間撹拌した。反応物を水(5000mL)で希釈し、EtOAc(1500ml)で抽出し、Na2SO3(水溶液、2×100mL)および飽和食塩水(800ml×1)で洗浄した。粗生成物をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、次に、これを石油エーテル中の2%のEtOAcで溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として1-ブロモ-4,5-ジクロロ-2-ヨード-ベンゼン(88b、40g、113.7mmol、100%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.84(s、1H)、7.62(s、1H)。
1-ブロモ-4,5-ジクロロ-2-ヨード-ベンゼン(88b、5g、14.21mmol)のTHF(20mL)溶液に-78℃のAr下で15分間撹拌した。臭化イソプロピルマグネシウム[1MのTHF溶液](15.6mL、15.63mmol)をゆっくりと加え、15分間撹拌した。DMF(1.2mL、15.63mmol)を加え、室温で1時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(80mL)で抽出し、Na2SO3(水溶液、2×30mL)および飽和食塩水(2×30mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。次に、粗生成物を石油エーテル中の0.1%のEtOAcで溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として2-ブロモ-4,5-ジクロロ-ベンズアルデヒド(88c、2.7g、10.6mmol、75%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ10.16(d、J=4.0Hz、1H)、7.89(d、J=4.0Hz、1H)、7.10(d、J=4.0Hz、1H)。
(メトキシメチル)トリフェニルホスホニウムクロライド(7.29g、21.27mmol)およびt-BuOK(2.39g、21.27mmol)のTHF(10mL)溶液を、-25℃のAr下で15分間撹拌した。THF中の2-ブロモ-4,5-ジクロロ-ベンズアルデヒド(88c、2.7g、10.63mmol)を加え、-25℃で1.5時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(100mL)で抽出し、水(2×30mL)で洗浄し、次に、飽和食塩水(30mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物を、石油エーテル中の0.1%のEtOAcで溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として1-ブロモ-4,5-ジクロロ-2-[(E)-2-メトキシビニル]ベンゼン(88d、1.1g、0.0039mmol、75%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.54~7.53(d、J=4.0Hz、1H)、7.37~7.35(d、J=8.0Hz、1H)、6.94~6.89(m、1H)、5.88~5.85(d、J=12.0Hz、1H)、3.66(s、3H)。
1-ブロモ-4,5-ジクロロ-2-[(E)-2-メトキシビニル]ベンゼン(88d、1.1g、3.9mmol)および2Nの塩酸(水溶液)(0.7g、19.51mmol)のアセトン(5mL)溶液を70℃のAr下で2時間撹拌した。反応物を真空で濃縮して、無色の油として2-(2-ブロモ-4,5-ジクロロ-フェニル)アセトアルデヒド(88e、830mg、3.09mmol、79%の収率)を得た。LCMS[M+H]:267.1。
2-(2-ブロモ-4,5-ジクロロ-フェニル)アセトアルデヒド(88e、830mg、3.1mmol)のメタノール(5mL)溶液を0℃のAr下で15分間撹拌した。NaBH4(352mg、9.29mmol)を加え、0℃で30分間撹拌した。反応混合物をEtOAc(50mL)で抽出し、水(2×20mL)および飽和食塩水(10mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して、無色の油として2-(2-ブロモ-4,5-ジクロロ-フェニル)エタノール(88f、800mg、3.0mmol、96%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.71(s、1H)、7.39(s、1H)、3.90~3.86(m、2H)、2.99~2.95(m、2H)、1.46~1.43(m、1H)。
2-(2-ブロモ-4,5-ジクロロ-フェニル)エタノール(88f、810mg、3mmol)のDCM(10mL)溶液に、イミダゾール(409mg、6.0mmol)を加え、続いて、t-ブチルクロロジフェニルシラン(678mg、4.5mmol)を加え、反応物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(50mL)で希釈し、水(2×20mL)および飽和食塩水(10mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物を、PE中の10%のEtOAcで溶出するフラッシュカラムクロマトグラフィーによって精製して、無色の油として2-(2-ブロモ-4,5-ジクロロ-フェニル)エトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(88g、910mg、2.37mmol、79%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.66(s、1H)、7.40(s、1H)、3.83(m、2H)、2.93(t、2H)、7.40(s、9H)、0.00(s、6H)。
[2-(2-ブロモ-4,5-ジクロロ-フェニル)-2,2-ジフルオロ-エトキシ]-tert-ブチル-ジメチル-シラン(88g、713.49mg、1.7mmolのTHF(6.5mL)溶液を-78℃のAr下で20分間撹拌した。n-BuLi(83.67mg、1.31mmol)を加え、-78℃で5分間撹拌した。THF(3mL)中の(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N、2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、250mg、0.65mmol)を加え、5分間撹拌した。TLCは、反応が完了したことを示した。反応を酢酸エチル(25mL)でクエンチした。反応混合物をEtOAc(25mL)で抽出し、水(2×10mL)および飽和食塩水(10mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。次に、粗生成物を石油エーテル中の20%のEtOAcで溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、黄色い油として[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4,5-ジクロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(88h、210mg、0.33mmol、51%の収率)を得た。LCMS[M+H]:626.2。
[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4,5-ジクロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(88h、250mg、0.39mmol)のトルエン(5mL)溶液を、-78℃のAr下で5分間撹拌した。DIBAL-H(0.13mL、1.1mmol)を加え、2.5時間撹拌した。混合物を分取HPLCによって精製して、白色の固体として(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4,5-ジクロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(88i、195mg、0.31mmol、80%の収率)を得た。LCMS[M+H]:628.2。
(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1,1-ジフルオロ-エチル]-4,5-ジクロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(88i、205mg、0.31mmol)のTHF(8mL)溶液を、25℃のAr下で5分間撹拌した。フッ化テトラブチルアンモニウム(0.17mL、0.62mmol)を加え、2.5時間撹拌した。混合物を分取HPLC(水中のMeCN、10%~90%)によって精製して、白色の固体として2-[4,5-ジクロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]エタノール(88j、100mg、0.19mmol、63%の収率)を得た。LCMS[M+H]:514.2。
2-[4,5-ジクロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ-[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]エタノール(88j、100mg、0.19mmol)およびPPh3(101.9mg、0.39mmol)のTHF(3mL)溶液を、25℃のAr下で5分間撹拌した。DIAD(0.11mL、0.39mmol)を加え、2時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(200mL)で抽出し、水(2×100mL)および飽和食塩水(100mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。次に、粗生成物を石油エーテル中の50%のEtOAcで溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6,7-ジクロロイソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(88k、70mg、0.14mmol、72.5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:496.1。
4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6,7-ジクロロイソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(88k、70mg、0.14mmol)およびNH3水(0.54mL、14.09mmol)の1,4-ジオキサン(2mL)溶液を、120℃で16時間撹拌した。混合物を真空で濃縮して、白色の固体として7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6,7-ジクロロイソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(88l、65mg、0.14mmol、97%の収率)を得た。LCMS[M+H]:477.2。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-6,7-ジクロロイソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(88l、70mg、0.15mmol)およびTFA(502mg、4.4mmol)の水溶液(2mL)を、25℃で1.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。混合物を真空で濃縮して粗生成物を得、これを水:CH3CN(0.1%のNH4OH、90:10~5:95)で溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-6,7-ジクロロイソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例88、5.1mg、0.011mmol、8%の収率)を得た。LCMS[M+H]:437.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ8.26(s、1H)、7.97~8.07(m、1.4H)、7.58(m、2H)、7.52(s、1H)、6.85(s、1H)、6.18~6.20(d、J=8Hz、1H)、5.17~5.30(m、2H)、4.88~4.89(d、J=2.8Hz、1H)、4.43~4.47(m、2H)、4.23~4.24(m、1H)、3.84~3.85(d、J=4Hz、1H)、3.64~3.65(m、1H)、2.88~2.95(m、1H)、2.67~2.75(m、1H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ8.25(s、1H)、7.59~7.60(d、J=6.8Hz、1H)、7.54(s、1H)、7.51(s、1H)、6.87~6.88(d、J=3.2Hz、1H)、6.19~6.20(d、J=7.6Hz、1H)、4.90(s、1H)、4.47~4.50(m、1H)、4.42~4.43(d、J=4Hz、1H)、4.22~4.26(m、1H)、3.86~3.87(d、J=5.2Hz、2H)、2.93~2.90(m、1H)、2.70~2.75(m、1H)。
(3aR,4R,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボン酸(89a、9.0g、28.19mmol)の酢酸エチル(100mL)溶液に、氷浴下でモルホリン(2.46g、28.19mmol)およびT3P(35mL、28.19mmol)を加えた。次に、反応物を室温で3時間撹拌した。溶液にNaHCO3(水溶液)を加え、pHを8に調整した。混合物をEA(200mL×3)で抽出した。合わせた有機物を濃縮し、残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(PE:EA=5:1~1:1)によって精製して、黄色い油としてモルホリノ-[(3aR,4R,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(89b、9.5g、24.2mmol、86%の収率)を得た。LCMS[M+H]:389.3。
20mLのバイアル中のマグネシウム(123mg、5.06mmol)をスパチュラでエッチングし、激しく撹拌し、次に、真空下でヒートガン乾燥し、冷却時に窒素を再充填した。2-(2-ブロモ-5-クロロ-3-チエニル)エトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(89c、1.5g、4.22mmol)のTHF(1mL)溶液を加え、続いて、1Mのトルエン中の水素化ジイソブチルアルミニウム(0.05mL、0.05mmol)を加えた。4時間後、溶液は暗くなり、マグネシウムの大部分が消費され、ブロモ-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]マグネシウムの0.82Mの溶液として使用した。乾燥フラスコに、真空下で乾燥させたモルホリノ-[(3aR,4R,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(89b、578.37mg、1.49mmol)および3mLのTHFを入れた。溶液を氷浴で冷却し、シリンジを介してブロモ-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]マグネシウム(2.72mL、2.23mmol)を滴下した。氷浴を除去し、反応物を1時間撹拌した。ブロモ-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]マグネシウム(0.91mL、0.75mmol)を加え、1時間撹拌してから、EtOAcでクエンチした。反応物をNH4Clに注ぎ、有機物を分離し、水層をEtOAcで抽出した。有機層を合わせ、水で洗浄し、続いて、食塩水で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。溶媒を真空で蒸発させ、残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィーによって精製して、[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(89d、320mg、0.553mmol、37%の収率)を得た。
[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(89d、328mg、0.57mmol)のトルエン(6mL)溶液を含有する50mLの丸底フラスコに、窒素を5分間散布し、-78°Cに冷却し、水素化ジイソブチルアルミニウムの1Mのトルエン(1.18mL、1.42mmol)を5分間滴下した。黄色い溶液を-78℃で75分間撹拌した。反応混合物を0℃に温め、水(80μL)、15%の水酸化ナトリウム(80μL)、および水(200μL)をゆっくりと加え、室温で15分間撹拌した。次に、混合物をエーテルで希釈し、MgSO4で乾燥させ、15分間撹拌し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0~45%のEtOAc、DCM/ヘキサンに湿式負荷)によって精製して、フワフワの白色の固体として(S)-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(61mg、0.105mmol、18.5%の収率)および(R)-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(89e、120mg、0.207mmol、36.5%の収率)を得た。1H NMR(500MHz、メタノール-d4)δ8.59(d、J=5.0Hz、1H)、7.92(d、J=3.8Hz、1H)、6.83(d、J=0.8Hz、1H)、6.70(dd、J=3.8、6.2Hz、1H)、6.50~6.25(m、1H)、5.26~5.11(m、1H)、5.09~5.02(m、1H)、4.45(ddd、J=2.5、4.5、15.6Hz、1H)、3.75(q、J=6.6Hz、2H)、2.72(dt、J=6.5、19.3Hz、2H)、2.01(s、2H)、1.61(d、J=4.9Hz、3H)、1.35(d、J=7.4Hz、3H)、0.83(d、J=9.7Hz、8H)、-0.06(d、J=4.5Hz、5H)。
丸底フラスコに、(R)-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2-2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(89e、123mg、0.21mmol)、DMSO(5mL)、フッ化セシウム(98mg、0.64mmol)を入れた。混合物を1時間撹拌し、次に、逆相クロマトグラフィー(10%~70%のMeCN/水/0.1%のTFA)によって直接精製した。生成物画分を凍結乾燥して、2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]-3-チエニル]エタノール;2,2,2-トリフルオロ酢酸(89f、70mg、0.120mmol、56%の収率)を得た。1H NMR(500MHz、メタノール-d4)δ8.96(d、J=9.5Hz、1H)、8.33(dd、J=3.9、28.5Hz、1H)、7.15(dd、J=3.9、8.6Hz、1H)、6.61(dd、J=3.7、18.7Hz、1H)、5.27(d、J=3.4Hz、1H)、5.18(ddd、J=3.0、5.9、8.5Hz、1H)、5.12(dd、J=1.9、5.9Hz、1H)、4.58~4.44(m、1H)、3.79~3.63(m、2H)、2.96(d、J=4.9Hz、3H)、2.86~2.66(m、2H)、1.63(s、3H)、1.39(s、3H)。LCMS:LCmS[M+H]:466.0。
バイアルに、THF(2mL)中の2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]-3-チエニル]エタノール(89f、110mg、0.19mmol)を入れた。ピリジン(0.03mL、0.38mmol)を加え、混合物を20分間撹拌し、次に、トリフェニルホスフィン(99.5mg、0.38mmol)およびアゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.07mL、0.38mmol)を加え、2.5時間撹拌した。追加のアゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.07mL、0.38mmol)およびトリフェニルホスフィン(99.5mg、0.38mmol)を加えた。1時間後、溶媒を蒸発させ、残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~60%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、4-メチル-7-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(89g、94.5mg、0.21mmol、111%の収率)を得た。LCMS[M+H]:448.1。
バイアルに、水(0.50ml)中の4-メチル-7-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(89g、94.5mg、0.21mmol)および2,2,2-トリフルオロ酢酸(0.16mL、2.11mmol)を加えた。反応物を3時間撹拌し、次に、EtOAcおよびNaHCO3で希釈した。有機物を分離し、水および食塩水で洗浄した。溶媒を真空で蒸発させ、残留物を逆相クロマトグラフィー(0~70%のMeCN/水/0.1%のTFA)によって精製して、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール;2,2,2-トリフルオロ酢酸(実施例89、2.3mg、0.0042mmol、2%の収率)を得た。1H NMR(500MHz、メタノール-d4)δ8.78(s、1H)、7.92(s、1H)、6.97(s、1H)、6.76(s、1H)、6.46(d、J=7.5Hz、1H)、4.22(dd、J=5.4、12.1Hz、2H)、3.98~3.76(m、1H)、2.84(s、5H)。LCMS[M+H]:408.0。
マグネシウム(43.52mg、1.79mmol)を含有する20mLのバイアルおよび撹拌棒を真空下でヒートガン乾燥し、冷却時に窒素を再充填した。2-(2-ブロモ-5-クロロ-3-チエニル)エトキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(89c、0.07mL、1.79mmol)の2mLのTHF溶液を加え、続いて、水素化ジイソブチルアルマニリウム(0.02mL、0.02mmol)を加えた。マグネシウムの大部分が消費されるまで、反応物を室温で5時間撹拌した。溶液を-78℃に冷却し、(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N、2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、527mg、1.38mmol)のTHF(3mL)溶液を加え、30分間冷却して撹拌した後、室温に温めた。反応物を室温で3時間撹拌し、次に、-78℃に冷却し、EtOAcでクエンチし、続いて、NH4Clでクエンチした。混合物を室温に温めた。有機物を分離し、水および食塩水で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~70%のEtOAc/ヘキサン)で2回精製して、[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(90a、104mg、0.17mmol、13%の収率)を得た。LCMS[M+H]:599.8。
[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(90a、104mg、0.17mmol)のトルエン(2mL)溶液に、Arを5分間散布し、-78℃に冷却し、次に、水素化ジイソブチルアルミニウムの1Mのトルエン(0.36mL、0.44mmol)を5分間かけて滴下した。黄色い溶液を-78℃で75分間撹拌した。反応混合物を最大0℃まで温め、水(80μL)、15%の水酸化ナトリウム(80μL)、および水(200μL)をゆっくりと加え、室温で15分間撹拌した。次に、混合物をEtOAcで希釈し、有機物を分離し、水相を再びEtOAcで抽出した。有機物を合わせ、水および食塩水で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過した。濾液を減圧下で濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(0~45%のEtOAc/ヘキサン、DCM+ヘキサンに湿式負荷)によって精製して、フワフワの白色の固体として(R)-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(90b、97mg、0.162mmol、93%の収率)を得た。1H NMR(500MHz、メタノール-d4)δ8.59(d、J=5.0Hz、1H)、7.92(d、J=3.8Hz、1H)、6.83(d、J=0.8Hz、1H)、6.70(dd、J=3.8、6.2Hz、1H)、6.50~6.25(m、1H)、5.26~5.11(m、1H)、5.09~5.02(m、1H)、4.45(ddd、J=2.5、4.5、15.6Hz、1H)、3.75(q、J=6.6Hz、2H)、2.72(dt、J=6.5、19.3Hz、2H)、1.61(d、J=4.9Hz、3H)、1.35(d、J=7.4Hz、3H)、0.83(d、J=9.7Hz、9H)、-0.06(d、J=4.5Hz、6H)。
(R)-[3-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-5-クロロ-2-チエニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(90b、202mg、0.34mmol)のDMSO(5mL)溶液に、フッ化セシウム(154mg、1.01mmol)を加え、反応物を1時間撹拌した。混合物を逆相クロマトグラフィー(10%~70%のMeCN/水/0.1%のTFA)によって直接精製して、2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]-3-チエニル]エタノール;2,2,2-トリフルオロ酢酸(90c、62mg、0.103mmol、31%の収率)を得た。LCMS[M+H]:487.5。
2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]-3-チエニル]エタノール(90c、58mg、0.12mmol)のTHF(2mL)溶液に、トリフェニルホスフィン(61.86mg、0.24mmol)およびアゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.05mL、0.24mmol)を加えた。2.5時間後、アゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.05mL、0.24mmol)およびトリフェニルホスフィン(61.86mg、0.24mmol)を加えた。1時間後、反応物を室温に冷却し、EtOAcと水とに分配した。層を分離し、水層を再びEtOAcで抽出し、有機物を合わせ、水および食塩水で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~80%のEtOAc/DCM)によって精製した。生成物を含有する画分を回収し、第一級アルコールのトリフルオロメチルエステルを含有する第2のセットも個別に回収した。エステルを含有するものを合わせてTHFに取り、NaHCO3を加えて2時間撹拌した後、それらをEtOAcで希釈し、有機物を水、食塩水で洗浄し、溶媒を蒸発させて、90cの2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4、6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]-3-チエニル]エタノールを得た。次に、これを元の反応条件に3時間供し、上記に記載されるように後処理および精製し、以前に得られた生成物と合わせて、4-クロロ-7-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(90d1、15mg、0.032mmol、27%の収率);LCMS(M+H):468.1、および4-クロロ-7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-((7R)-2-クロロ-4,7-ジヒドロ-5H-チエノ[2、3-c]ピラン-7-イル)-2,2-ジメチルテトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル)-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン(90d2、6mg、12%)を得た。
4-クロロ-7-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2、3-c]ピラン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(90d1、15mg、0.03mmol)の1,4-ジオキサン(1mL)溶液に、水酸化アンモニウム(0.1mL、2.4mmol)を加え、バイアルに蓋をして、120℃で14時間マイクロ波に置いた。溶媒を真空で蒸発させ、EtOAc(1mL)を加え、混合物を真空で2回蒸発させて、7-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(90e、14mg、0.031mmol、97%の収率)を得た。LCMS[M+H]:449.0/450.9。
7-[(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(90e、6.0mg、0.01mmol)の水(1mL)および2,2,2-トリフルオロ酢酸;TFA(0.0mL、0.01mmol)の溶液を2時間撹拌し、逆相HPLCによって精製して、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(7S)-2-クロロ-5,7-ジヒドロ-4H-チエノ[2,3-c]ピラン-7-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール;2,2,2-トリフルオロ酢酸(実施例90、1.1mg、0.0021mmol、16%の収率)を得た。1H NMR(500MHz、メタノール-d4)δ8.26(s、1H)、7.80~7.56(m、1H)、6.96(d、J=3.7Hz、1H)、6.77(s、1H)、6.37(d、J=7.6Hz、1H)、4.65(dd、J=5.1、7.5Hz、1H)、4.31(dd、J=5.9、11.1Hz、1H)、4.25~4.17(m、2H)、3.83(td、J=3.6、11.1Hz、1H)、2.91~2.75(m、1H)、2.59(d、J=16.2Hz、1H)。5ppmでのぼんやりとした多重線での水のピークLCMS[M+H]:409.1。
2-ブロモ-5-クロロ-ベンズアルデヒド(44a、8000mg、31.9mmol)およびヨウ化亜鉛(21mg、0.07mmol)のDCM(100mL)溶液に、0℃でトリメチルシリルホルモニトリル(3360mg、33.9mmol)を加えた。混合物を25℃で18時間撹拌した。次に、DCM(80mL)中のDAST(5600mg、34.7mmol)を加え、混合物を0℃に冷却した。混合物を25℃で18時間撹拌した。混合物をHCl(50mL、1M)、H2O(50mL)、およびNaHCO3(50mL、水溶液)で洗浄した。反応混合物をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-アセトニトリル(94a、4670mg、16.10mmol、50.5%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ7.87~7.84(m、1H)、7.81(s、1H)、7.63~7.61(m、1H)、6.55(d、J=43.6、1H)。
2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-アセトニトリル(94a、4.47g、17.99mmol)のメタノール(50mL)溶液に、75℃で硫酸(10mL、187.6mmol)を滴下した。反応物を75℃で18時間撹拌した。TLC(PE、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。混合物をNaHCO3(水溶液)でクエンチした。混合物を真空で濃縮し、EA(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4で乾燥させた。溶媒を真空で除去して、メチル2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-酢酸(94b、4.8g、14.7mmol、73%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ7.67(d、J=8.8、1H)、7.60(d、J=2、1H)、7.53~7.50(m、1H)、6.36(d、J=45、1H)、3.752(s、3H)。
メチル2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-酢酸(94b、4.8g、17.05mmol)のメタノール(40mL)溶液に、NaBH4(1.29g、34.1mmol)を加えた。反応物を25℃で2時間撹拌した。TLC(PE:EA=4:1、Rf=0.5)は、反応が完了したことを示した。混合物をHCl(1N)でクエンチした。次に、混合物を真空で濃縮し、EA(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4で乾燥させた。溶媒を真空で除去して、2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-エタノール(94c、3.8g、15mmol、80%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ7.69(d、J=8.4、1H)、7.60(d、J=2.8、1H)、7.43~7.40(m、1H)、5.78~5.76(m、1H)、5.40~5.37(m、1H)、3.83~3.65(m、2H)。
2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-エタノール(94c、3.8g、14.99mmol)およびイミダゾール(2.04g、29.98mmol)のDCM(50mL)溶液に、t-ブチルクロロジフェニルシラン(2.71g、17.99mmol)をゆっくりと加えた。反応混合物を30℃で2時間撹拌した。TLC(PE、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。溶媒を真空で除去し、粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE)によって精製して、淡黄色の油として[2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-エトキシ]-tert-ブチル-ジメチル-シラン(94d、5g、13.6mmol、91%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ7.69(d、J=8.4、1H)、7.48~7.41(m、2H)、5.82~5.71(m、1H)、4.05~3.85(m、2H)、0.82(s、9H)、0.00~0.06(m、6H)。
[2-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-2-フルオロ-エトキシ]-tert-ブチル-ジメチル-シラン(3.63g、9.87mmol)の乾燥THF(8mL)溶液に、-78℃のAr下で撹拌した。n-BuLi(4.7mL、11.76mmol)を加え、反応混合物を10分間撹拌した。次に、無水THF(2.00mL)中の(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N、2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、1.8g、4.7mmol)を加えた。混合物を-78℃で30分間撹拌した。TLC(PE:EA=5:1、Rf=0.5)は、反応が完了したことを示した。反応物をCH3COOHでクエンチした。混合物を別のバッチと合わせて後処理した。反応物をEtOAc(100mL×3)で抽出し、有機物を水(50mL×3)で洗浄し、次に、飽和食塩水(50mL×3)で洗浄した。有機物をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをSFCによってさらに精製して、[4-クロロ-2-[(1S)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ]-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4、6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(94e2、300mg、0.49mmol、10.5%の収率)を得た。LCMS[M+H]:610.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.59(s、1H)、8.09~8.02(m、2H)、7.85~7.75(m、2H)、6.84(d、J=3.6、1H)、6.69(s、1H)、5.62~5.54(m、2H)、5.50~5.37(m、1H)、3.97~3.74(m、2H)、1.74(s、3H)、1.46(s、3H)、0.90(s、9H)、-0.02(d、J=13.6,6H)および[4-クロロ-2-[(1R)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(94e1、800mg、1.31mmol、28%の収率)。LCMS[M+H]:610.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.52(s、1H)、7.77(d、J=9.2、1H)、7.69(d、J=3.6、1H)、7.28~7.26(m、1H)、6.48~6.46(m、2H)、5.77(s、1H)、5.71~5.51(m、2H)、5.44~5.31(m、1H)、3.97~3.33(m、2H)、1.59(s、3H)、1.42(s、3H)、0.83(s、9H)、0.01~0.01(m、6H)。
[4-クロロ-2-[(1S)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(94e2、300mg、0.49mmol)のトルエン(7mL)溶液に、DIBAL-H(0.17mL、1.47mmol)を加えた。混合物を-78℃のN2下で30分間撹拌した。溶液をCH3COOHでクエンチした。混合物を別のバッチと合わせて後処理した。混合物をEtOAc(15mL×3)で抽出し、有機層を水(20mL×3)で洗浄し、次に、食塩水(20mL×3)で洗浄した。有機層をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(PE:EA=5:1)によって精製して、(R)-[4-クロロ-2-[(1S)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(94f、300mg、0.49mmol)を得た。LCMS[M+H]:612.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.75(s、1H)、7.70(d、J=12.8、1H)、7.49(s、1H)、7.73~7.41(m、1H)、7.35~7.32(m、1H)、6.67~6.66(m、1H)、6.63(d、J=1.6、1H)、5.87~5.72(s、1H)、5.29~5.19(m、2H)、5.12~5.11(m、1H)、4.65(s、1H)、3.97~3.81(m、2H)、1.59(s、3H)、1.24(s、3H)、0.87(s、9H)、0.02~0.00(m、6H)。
(R)-[4-クロロ-2-[(1S)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(94f、300mg、0.49mmol)のTHF(5mL)溶液に、TBAF(1M)(0.26mL、0.98mmol)を加えた。混合物を25℃のN2下で30分間撹拌した。混合物を別のバッチと合わせて後処理した。反応をNH4Clでクエンチし、EA(10mL×3)で抽出した。合わせた有機抽出物を食塩水で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EA=1:1)によって精製して、(2S)-2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]-2-フルオロ-エタノール(94g、200mg、0.40mmol、82%の収率)を得た。LCMS[M+H]:498.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.67(s、1H)、7.65(d、J=8、1H)、7.52~7.50(m、1H)、7.45~7.42(m、1H)、7.35~7.31(m、1H)、6.79(s、1H)、6.68(d、J=3.6、1H)、5.31~5.14(m、4H)、4.69(s、1H)、4.15~3.85(m、2H)、1.62(s、3H)、1.33(s、3H)。
2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-[(7S)-4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]-2-フルオロ-エタノール(94g、200mg、0.40mmol)のTHF(mL)溶液に、25℃でNaH(19.26mg、0.80mmol)を加え、10分間撹拌した。塩化トシル(76.52mg、0.40mmol)を加え、1時間撹拌した。反応混合物を別のバッチと合わせて後処理した。混合物をH2Oでクエンチし、EA(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層を食塩水(10mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物を、H2O中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製して、(7S)-4-クロロ-7-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1S,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(94h2、15mg、0.031mmol、8%の収率)、LCMS[M+H]:480.1、および(7S)-4-クロロ-7-[(3aR,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロイソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(94h1、34mg、0.071mmol、17.6%の収率)を得た。LCMS[M+H]:480.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.60(s、1H)、7.60(d、J=4、1H)、7.43~7.42(m、1H)、7.36~7.33(m、1H)、7.15(d、J=8.4、1H)、6.60(d、J=3.6、1H)、6.55(d、J=3.6、1H)、5.25(d、J=50.8、1H)、4.99~4.97(m、1H)、4.86~4.84(m、1H)、4.78~4.74(m、2H)、4.43~4.36(m、1H)、3.83~3.71(m、1H)、1.55(s、3H)、1.19(s、3H)。
テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(2.4mg)および4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(94h1、10mg、0.02mmol)のTHF(4mL)溶液に、ジメチル亜鉛(20mg、0.21mmol)を加えた。混合物を70℃で3時間撹拌した。LCMSは、20%の所望の生成物を示した。別のバッチをこの反応物と合わせ、真空で濃縮して、粗4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(94i)を得、これを次のステップに直接使用した。LCMS[M+H]:460.3。
4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(94i、30mg、0.07mmol)の水溶液(1mL)に、TFA(1.13mL、7.77mmol)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。残留物を、H2O中のCH3CN(0.1%のTFA)で5%~95%で溶出する分取HPLCによって精製して粗生成物を得、これをH2O中のCH3CN(0.1%のNH3/H2O)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによってさらに精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール;2,2,2-トリフルオロ酢酸(実施例94、3.5mg、0.0065mmol、10%の収率)を得た。LCMS[M+H]:420.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.83(s、1H)、7.87(d、J=3.2、1H)、7.67(s、1H)、7.55~7.49(m、2H)、6.96(s、1H)、6.35(d、J=8、1H)、5.52(d、J=50.4、1H)、5.02~5.00(m、1H)、4.94~4.91(m、1H)、4.61(d、J=2.8、1H)、4.53~4.46(m、2H)、3.99~3.82(m、2H)、2.67(s、3H)。
4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロイソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(94h1、35mg、0.07mmol)の1,4-ジオキサン(2.5mL)溶液に、アンモニア(2.5mL、0.07mmol)を加えた。混合物を密封し、120℃で16時間撹拌した。反応混合物を真空で濃縮して、粗7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(95a)を得、これを次のステップに直接使用した。LCMS[M+H]:461.2。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(95a、25mg、0.05mmol)の水溶液(1mL)に、2,2,2-トリフルオロ酢酸(1.0mL、12.98mmol)を加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。残留物を、H2O中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5%~95%で溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R,4R)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例95、6mg、0.014mmol、25%の収率)を得た。LCMS[M+H]:421.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.07(s、1H)、7.65(s、1H)、7.51(s、2H)、7.38(d、J=4、1H)、6.67(d、J=4.4、1H)、6.21(d、J=8、1H)、5.59~5.46(d、J=50、1H)、4.88(d、J=2.8、1H)、4.52(d、J=2.8、1H)、4.46~4.34(m、2H)、3.96~3.87(m、1H)、3.81(d、J=4.8、1H)。
[4-クロロ-2-[(1R)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(94e1、800mg、1.31mmol)のトルエン(7mL)溶液に、DIBAL(0.45mL、3.93mmol)を加えた。混合物を-78℃のN2下で30分間撹拌した。溶液をNH4Clでクエンチした。混合物を別のバッチと合わせて後処理した。混合物をEtOAc(15mL×3)で抽出し、有機層を水(20mL×3)で洗浄し、次に、食塩水(20mL×3)で洗浄した。有機層をMgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(PE:EA=5:1)によって精製して、(R)-[4-クロロ-2-[(1R)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(92a、520mg、0.85mmol、65%の収率)を得た。LCMS[M+H]:612.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.68(s、1H)、7.69(d、J=8、1H)、7.40(s、1H)、7.34(d、J=3.6、1H)、6.67(d、J=3.6、1H)、6.46(d、J=1.2、1H)、5.86(d、J=4.8、1H)、5.83~5.68(m、1H)、5.34(s、1H)、5.27~5.16(m、1H)、5.16~5.16(m、1H)、4.52(s、1H)、4.02~3.78(m、2H)、1.58(s、3H)、1.26(s、3H)、0.83(s、9H)、0.02~0.00(m、6H)。
(R)-[4-クロロ-2-[(1R)-2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-1-フルオロ-エチル]フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(92a、520mg、0.85mmol)のTHF(5mL)溶液に、TBAF(1M)(0.44mL、1.7mmol)を加えた。混合物を25℃のN2下で30分間撹拌した。混合物を別のバッチと合わせて後処理した。溶液をNH4Clでクエンチし、EAで洗浄し、溶媒を真空で除去した。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(PE:EA=3:1)によって精製して、(2R)-2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]-2-フルオロエタノール(92b、330mg、0.66mmol、78%の収率)を得た。LCMS[M+H]:498.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.68(s、1H)、7.73(d、J=8.4、1H)、7.45~7.40(m、2H)、7.33(d、J=4、1H)、6.67(d、J=4、1H)、6.39(d、J=1.6、1H)、5.88~5.73(m、2H)、5.33(s、1H)、5.28~5.25(m、1H)、5.17~5.15(m、1H)、4.48(s、1H)、3.99~3.67(m、2H)、1.59(s、3H)、1.32(s、3H)。
(2R)-2-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]-2-フルオロ-エタノール(92b、300mg、0.60mmol)のTHF(mL)溶液に、0℃でNaH(28.9mg、1.2mmol)を加え、10分間撹拌した。塩化トシル(115mg、0.60mmol)を混合物に加え、1時間撹拌した。混合物を別のバッチと合わせて後処理した。混合物をH2Oでクエンチし、EA(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層を食塩水(10mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EA=5:1)によって精製して、4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(92c、90mg、0.192mmol)を得た。LCMS[M+H]:480.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.61(d、J=6,1H)、7.46~7.43(m、2H)、7.19(d、J=8、1H)、6.98(d、J=8.4、1H)、6.62(d、J=3.6、1H)、6.37(d、J=3.2、1H)、5.57~5.41(m、1H)、5.08~5.05(m、1H)、4.89~4.85(m、2H)、4.53~4.51(m、1H)、4.33~4.27(m、1H)、3.79~3.72(m、1H)、1.54(s、3H)、1.25(s、3H)。
4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(92c、10mg、0.02mmol)および第二鉄アセチルアセトン(0.74mg、0.002mmol)のTHF(4mL)溶液に、-30℃で臭化メチルマグネシウム(23mg、0.21mmol)をゆっくりと加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を真空で濃縮して、粗4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(92d)を得、これを次のステップに直接使用した。LCMS[M+H]:460.2。
4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(92d、10mg、0.02mmol)の水溶液(1mL)に、TFA(1.0mL、6.86mmol)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物を、H2O中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製し、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例92、7mg、0.016mmol、75%の収率)を得た。LCMS[M+H]:420.2。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.67(s、1H)、7.75(d、J=3.6、1H)、7.55(d、J=1.6、1H)、7.36(d、J=8.8、1H)、7.25(d、J=8.4、1H)、6.82(d、J=4、1H)、6.25(d、J=7.2、1H)、5.67~5.52(m、1H)。
4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(92c、10mg、0.02mmol)の1,4-ジオキサン(2.5mL)溶液に、アンモニア(2.5mL、0.02mmol)を加えた。混合物を密封し、120℃で16時間撹拌した。混合物を真空で濃縮して、粗7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(93a)を得、これを次のステップに直接使用した。LCMS[M+H]:461.2。
7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(93a、10mg、0.02mmol)の水溶液(2mL)に、2,2,2-トリフルオロ酢酸(1mL、13mmol)を加えた。混合物を25℃で60分間撹拌した。残留物を、H2O中のCH3CN(0.1%のNH4OH)で5%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R,4S)-6-クロロ-4-フルオロ-イソクロマン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(5mg、0.011mmol、53%の収率)を得た。LCMS[M+H]:421.1。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O):δ8.06(s、1H)、7.55(s、1H)、7.39~7.32(m、1H)、7.28(d、J=19.2、1H)、7.25(d、J=8、1H)、6.65(d、J=3.6、1H)、6.11(d、J=7.2、1H)、5.64~5.51(m、1H)、4.99~4.98(m、1H)、4.53~4.50(m、1H)、4.40~4.33(m、1H)、4.31~4.25(m、1H)、4.12~3.98(m、1H)、3.95~3.91(m、1H)。
2,3-ジフルオロフェノール(97a、3.08g、23.68mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(4.95mL、28.41mmol)の無色透明な溶液に、氷浴中の0°Cの窒素下でクロロメチルメチルエーテル(2.16mL、28.41mmol)を滴下した。氷浴を除去し、透明なオレンジ色の反応物を室温で撹拌した。35分後、TLC(2%のEtOAc/ヘキサン)は、フェノールが残っていないク透明な生成物スポット(rf=0.23)を示す。反応物を濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(0~3%のEtOAc/ヘキサン、最大30%まで上昇させてピークが先細りであるため生成物を洗い流す)によって精製した。生成物画分を、透明な淡黄色の油として1,2-ジフルオロ-3-(メトキシメトキシ)ベンゼン(97b、2.79g、16.022mmol、68%の収率)に濃縮した。LCMSは、良好なイオン化を示していない。
1,2-ジフルオロ-3-(メトキシメトキシ)ベンゼン(97b、181.96mg、1.04mmol)のジエチルエーテル(2mL)溶液を氷浴で冷却した。n-BuLi(0.67mL、1.07mmol)を滴下し、溶液を3分間冷却して撹拌し(乳白色の混合物が得られた)、氷浴を除去した。反応物は淡黄色の懸濁液になる。2時間後、反応物を氷浴に戻し、(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N、2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、150mg、0.39mmol)のジエチルエーテル(1mL))溶液を加えた。氷浴を除去し、反応物を室温で撹拌して、橙赤色の不透明な混合物を得た。2時間後、LCMSは反応が完了したことを示した。反応物を氷浴で冷却し、飽和NH4Clを加え、続いて、EtOAcを加えた。層を分離し、水溶液を2×EtOAcで抽出した。合わせた有機物を食塩水で洗浄し、綿を通して濾過し、オレンジ色の油になるまで濃縮し、これをフラッシュカラムクロマトグラフィー(5%~40%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、[3,4-ジフルオロ-2-(メトキシメトキシ)フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(97c、77mg、0.15529mmol、40%の収率)を得た。LCMS[M+H]:496.0。
[3,4-ジフルオロ-2-(メトキシメトキシ)フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(97c、163mg、0.33mmol)の琥珀色のトルエン(5mL)溶液を、N2下で-78℃に冷却し、次に、水素化ジイソブチルアルミニウム(トルエン中に1M、0.66mL、0.66mmol)をゆっくりと滴下して加えた。得られた透明な黄色い溶液を-78℃で1時間撹拌した。LCMSは、いくつかの出発材料が残っていることを示している。水素化ジイソブチルアルミニウムの追加の部分(トルエン中に1M、0.2mL、0.2mmol)を加えた。30分後、反応物を氷浴に移し、0℃に温め、数mLのEtOAcをゆっくりと加えてクエンチし、続いて、ロッシェル塩の飽和水溶液を数回加えた。氷浴を除去し、追加のEtOAcおよび飽和ロッシェル塩を加え、混合物を激しく撹拌した。層を分離し、水溶液をEtOAcで抽出した。合わせた有機層を食塩水で洗浄し、綿を通して濾過し、濃縮して、(R)-[3,4-ジフルオロ-2-(メトキシメトキシ)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(97d、170mg、0.34145mmol、104%の収率)を得、これをさらに精製せずに次の反応に使用した。LCMS[M+H]:498.0。
(R)-[3,4-ジフルオロ-2-(メトキシメトキシ)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(97d、170mg、0.34mmol)およびテトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)(19.73mg、0.02mmol)に、蓋付き2mLのマイクロ波バイアル中の窒素下でTHF(10mL)を加えた。混合物に窒素を10分間散布した。ジメチル亜鉛(ヘキサン中に2M,0.75mL、1.5mmol)をシリンジ(ガス発生)を介して注意深く加え、より明るい黄色の溶液を得、これを70℃に加熱した。反応物は徐々に濃いオレンジ色になる。2時間後、LCMSは反応が完了したことを示した。反応物を室温に冷却し、飽和NaHCO3でクエンチし、2×EtOAcで抽出した。合わせた有機物を食塩水で洗浄し、綿を通して濾過し、濃縮した。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(14%~100%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、(R)-[3,4-ジフルオロ-2-(メトキシメトキシ)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(97e、111mg、0.23248mmol、68%の収率)を得た。LCMS[M+H]:478.1。
(R)-[3,4-ジフルオロ-2-(メトキシメトキシ)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(97e、85mg、0.18mmol)および臭化テトラエチルアンモニウム(112.24mg、0.53mmol)の混合物にDCM(4mL)を加え、得られた黄色い溶液を氷浴で冷却した。クロロトリメチルシラン(0.07mL、0.53mmol)を加え、反応物を氷浴で室温まで温め、室温で一晩撹拌した。追加の臭化テトラエチルアンモニウム(112.24mg、0.53mmol)およびクロロトリメチルシラン(0.07mL、0.53mmol)を加えた。4時間後、反応物を濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(100%のDCM~8%のMeOH/DCM)によって精製して、2,3-ジフルオロ-6-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェノール(97f、43mg、0.01mmol、56%の収率)を得た。LCMS[M+H]:434.1。
2,3-ジフルオロ-6-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェノール(97f、56mg、0.13mmol)のDMF(5mL)およびDCM(2.5mL)のオレンジ色の溶液に、窒素下で水素化ナトリウム(51.68mg、1.29mmol)を加え、反応物を80℃に加熱した。5時間後、反応物を氷浴で冷却し、飽和NH4Cl水溶液でクエンチし、食塩水で希釈し、3×EtOAcで抽出した。合わせた有機物を3×食塩水で洗浄し、綿を通して濾過し、濃縮し、高真空下で乾燥させた。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(13%~100%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(4R)-7,8-ジフルオロ-4H-1,3-ベンゾジオキシン-4-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(97g、31mg、0.0696mmol、54%の収率)を得た。LCMS[M+H]:446.0。
4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(4R)-7,8-ジフルオロ-4H-1,3-ベンゾジオキシン-4-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(97g、29mg、0.07mmol)の透明なメタノール(2mL)溶液を、氷浴で短時間冷却し、次に、塩酸(2mL、4mmol)を加え、得られたかすかに濁った溶液を室温で撹拌した。5時間後、反応物を氷浴で冷却し、1NのNaOHで注意深くpH約8に塩基性化し、3×EtOAcで抽出した。合わせた抽出物を食塩水で洗浄し、綿を通して濾過し、濃縮した。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~10%のMeOH/DCM)によって精製して、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(4R)-7,8-ジフルオロ-4H-1,3-ベンゾジオキシン-4-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例97、20mg、0.0449mmol、69%の収率)を得た。LCMS[M+H]:406.1。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)δ8.66(s、1H)、7.76(d、J=3.8Hz、1H)、7.15~7.07(m、1H)、7.00(q、J=9.3Hz、1H)、6.80(d、J=3.7Hz、1H)、6.31(d、J=7.7Hz、1H)、5.62(d、J=5.7Hz、1H)、5.35(d、J=6.9Hz、1H)、5.31(d、J=5.7Hz、1H)、5.26~5.22(m、2H)、4.56(td、J=5.1、7.3Hz、1H)、4.41(dd、J=1.4、4.5Hz、1H)、3.94(t、J=4.9Hz、1H)、2.66(s、3H)。D2O交換:1H NMR(500MHz、DMSO-d6)δ8.66(s、1H)、7.75(d、J=3.8Hz、1H)、7.13~7.07(m、1H)、6.99(td、J=7.2、9.2、9.6Hz、1H)、6.80(d、J=3.8Hz、1H)、6.30(d、J=7.7Hz、1H)、5.61(d、J=5.7Hz、1H)、5.30(d、J=5.8Hz、1H)、5.23(d、J=4.4Hz、1H)、4.55(dd、J=5.1、7.7Hz、1H)、4.40(dd、J=1.4、4.5Hz、1H)、3.93(dd、J=1.4、5.1Hz、1H)、2.66(s、3H)。
臭化メチルマグネシウム、3.2MのMeTHF(0.09mL、0.30mmol)を、0℃で(S)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(22d、80mg、0.13mmol)および鉄(III)アセチルアセトン(5mg、0.01mmol)のTHF(0.50mL)の懸濁液に滴下した。反応混合物を0℃で40分間、次に、室温で一晩撹拌した。反応物をEtOAcでクエンチし、続いて、飽和NH4Cl水溶液でクエンチし、混合物をEtOAcで希釈した。有機層を分離し、食塩水で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濃縮した。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~100%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、黄色い油として(S)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(98a、35mg、0.049mmol、36%の収率)を得た。LCMS[M+H]:574.16。
アゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.02mL、0.12mmol)を、(S)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(98a、35mg、0.06mmol)、トリフェニルホスフィン(24mg、0.09mmol)、およびフタルイミド(13.45mg、0.09mmol)のTHF(0.50mL)溶液に滴下した。30分で、TLC(2:1ヘキサン/EA)は反応が完了したことを示した。反応混合物を濃縮し、粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~100%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、黄色い泡状固体として2-[(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]を得た。-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]イソインドリン-1,3-ジオン(98b、37mg、0.042mmol、収率69%)を得た。
LCMS[M+H]:703.2/705.2。
ヒドラジン一水和物(2.7mg、0.08mmol)を、2-[(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]イソインドリン-1,3-ジオン(98b、37mg、0.04mmol)のEtOH(0.50mL)の懸濁液に加えた。得られた混合物を室温で一晩撹拌し、次に、80℃で6時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、粗生成物、(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタンアミン(98c、40mg、0.042mmol、99.5%の収率)を得、これを精製せずに次のステップに送った。LCMS[M+H]:574.2/576.1。
トリエチルアミン(0.01mL、0.08mmol)を、室温で(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタンアミン(98c、40mg、0.04mmol)およびジ-tertブチルジカーボネート(18mg、0.08mmol)の乾燥DCM(0.50mL)の懸濁液に滴下し、得られた混合物を室温で2時間撹拌した。反応物を濃縮し、残留物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(0~8%のMeOH/DCM)によって精製して、tert-ブチルN-[(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4、6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]カルバメート(98d、30mg、0.036mmol、85%の収率)を得た。
LCMS[M+H]:673.1/675.3。1H NMR(500MHz、メタノール-d4)δ8.71(s、1H)、7.50(d、J=3.7Hz、1H)、7.36(d、J=8.4Hz、1H)、7.19~7.01(m、2H)、6.73(d、J=3.7Hz、1H)、6.19(d、J=2.5Hz、1H)、5.33(dd、J=2.4、6.6Hz、1H)、5.24(dd、J=4.4、6.6Hz、1H)、5.16(d、J=8.9Hz、1H)、4.32(dd、J=4.4、8.8Hz、1H)、3.62~3.52(m、1H)、3.46(dt、J=5.6、10.6Hz、1H)、2.72(s、3H)、2.50(t、J=12.1Hz、2H)、1.63(s、2H)、1.60(s、3H)、1.45(d、J=10.3Hz、9H)、1.36(s、3H)、0.77(s、9H)、-0.25(d、J=15.6Hz、6H)。
tert-ブチルN-[(R)-[2-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]カルバメート(98d、20mg、0.02mmol)の懸濁液、DMSO(0.40mL)中のフッ化セシウム(5.5mg、0.04mmol)を室温で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、逆相クロマトグラフィー(10%~100%のMeCN/水)によって直接精製して、tert-ブチルN-[(R)-[4-クロロ-2-(2-ヒドロキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]カルバメート(98e、10mg、0.018mmol、75%の収率)を得た。LCMS[M+H]:559.2/561.1。
アゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.01mL、0.04mmol)を、トリフェニルホスフィン(9.38mg、0.04mmol)およびtert-ブチルN-[(S)-[4-クロロ-2-(2-ヒドロキシエチル)フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]カルバメート(98e、10mg、0.02mmol)の乾燥THF(0.50mL)溶液に加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌した。アゾジカルボン酸ジイソプロピル(0.01mL、0.04mmol)およびトリフェニルホスフィン(9.38mg、0.04mmol)を加え、反応物をさらに1時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0~12%のMeOH)によって精製して、tert-ブチル(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-3,4-ジヒドロ-1H-イソキノリン-2-カルボキシレート(98f、10mg、0.009mmol、52%の収率)を得た。LCMS[M+H]:541.1/543.3。
tert-ブチル(1R)-6-クロロ-1-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]-3,4-ジヒドロ-1H-イソキノリン-2-カルボキシレート(98f、10mg、0.02mmol)、HCl(0.67mg、0.02mmol)およびメタノール(0.50mL)の混合物を室温で一晩撹拌した。LCMSは、アセトニドが開裂したが、Bocは開裂しなかったことを示した。反応混合物を濃縮し、凍結乾燥して白色固体にし、これをDCM(0.50mL)およびTFA(0.26mL、2.89mmol)に溶解し、室温で1時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残留物を逆相クロマトグラフィー(0~70%のMeCN/水/0.1%のTFA)によって精製して、白色の固体として(2R,3S,4R,5R)-2-[(1R)-6-クロロ-1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-1-イル]-5-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール;2,2,2-トリフルオロ酢酸(実施例98、3mg、0.006mmol、30%の収率)を得た。LCMS[M+H]:401.1。1H NMR(500MHz、DMSO-d6)δ8.74(s、1H)、7.37~7.15(m、3H)、7.00(d、J=3.8Hz、1H)、6.75(d、J=3.8Hz、1H)、6.08(d、J=4.0Hz、1H)、4.83(d、J=3.2Hz、1H)、4.50(dd、J=3.3、5.5Hz、1H)、4.39~4.26(m、2H)、3.49(dd、J=6.8、13.3Hz、1H)、3.33(dt、J=6.0、12.3Hz、1H)、3.00~2.82(m、2H)、2.69(s、3H)。
NaH(0.01mL、54.68mmol)の乾燥THF(50mL)溶液に、0℃でエチル2-(ジエトキシホスホリル)酢酸(102a、12.258g、54.68mmol)をゆっくりと加え、10分間撹拌した。2-ブロモ-5-クロロ-ベンズアルデヒド(46a、10g、45.57mmol)を反応混合物に加え、室温で1時間撹拌した。TLC(石油エーテル、Rf=0.2)およびLCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物を氷水(100mL)に注ぎ、酢酸エチル(200mL)で抽出し、水(50mL)および食塩水(50mL)で洗浄した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=100:1~50:1)によって精製して、オフホワイトの油としてエチル3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロパ-2-エノエート(102b、11.6g、36.58mmol、80%の収率)を得た。LCMS[M+H]:291.0。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.92~7.97(m、1H)、7.53~7.57(m、2H)、7.19~7.21(m、1H)、6.37~6.40(m、1H)、4.26~4.31(m、2H)、1.33~1.37(m、3H)。
THF(58mL)/水(58mL)中の3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロパ-2-エノエート(102b、5.0g、17.27mmol)、p-トルエンスルホニルヒドラジド(32.15g、172.68mmol)および酢酸ナトリウム三水和物(35.24g、259.02mmol)の混合物を撹拌し、20時間還流した。水(50mL)を加え、次に、酢酸エチル(100mL)で抽出し、水(2×300mL)および食塩水(100mL)で洗浄した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=100:1~20:1)によって精製して、オフホワイトの油としてエチル3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロパノエート(102c、4.6g、13.8mmol、80%の収率)を得た。LCMS[M+H]:293.0。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.44~7.46(m、1H)、7.25~7.26(m、1H)、7.05~7.08(m、1H)、4.12~4.18(m、H)、3.01~3.05(m、2H)、2.61~2.65(m、2H)。
3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロパノエート(102c、4.6g、15.78mmol)のトルエン(50mL)溶液に、-78°CのN2下で水素化ジイソブチルアルミニウム(31.55mL、47.33mmol)を加え、反応混合物を-78℃で60分間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=40:1、Rf=0.1、石油エーテル:酢酸エチル=10:1、Rf=0.3)は、反応が完了したことを示した。飽和NH4Cl溶液(100mL)を混合物に加え、混合物を酢酸エチル(100mL)で抽出し、食塩水(50mL)で洗浄した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、溶媒を真空で除去して、粗3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロパン-1-オール(102d)を得、これをさらに精製することなく次のステップで使用した。
3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロパン-1-オール(102d、5.1g、20.44mmol)およびイミダゾール(2.78g、40.88mmol)のDCM(20mL)溶液に、t-ブチルクロロジフェニルシラン(3.7g、24.53mmol)をゆっくりと加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌した。TLC(石油エーテル、Rf=0.7)は、反応が完了したことを示した。溶媒を真空で除去して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル)によって精製して、オフホワイトの油として3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)-プロポキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(102e、1.7g、4.67mmol、23%の収率)を得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ7.56(d、0.83(s、J=7.6Hz、1H)、7.37(d、J=2.8Hz、1H)、7.20(d、J=2.8Hz、1H)、3.56~3.59(m、2H)、2.68~2.71(m、2H)、1.69~1.72(m、2H)、0.83(s、9H)、0.00(s、6H)。
3-(2-ブロモ-5-クロロ-フェニル)プロポキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(102e、1130.9mg、3.11mmol)のTHF(15mL)溶液に、-78℃でn-ブチルリチウム(175.71mg、2.74mmol)を加えた。反応混合物を-78℃で10分間撹拌した。4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-N-メトキシ-N,2,2-トリメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-カルボキサミド(1Ad、700mg、1.83mmol)を加え、反応物を-78℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)に注ぎ、酢酸エチル(30mL)で抽出した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=1:7)によって精製して、黄色い油として[2-[3-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシプロピル]-4-クロロ-フェニル]-[4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4、6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(102f、600mg、0.99mmol、54%の収率)を得た。LCMS[M+H]:606.2。
トルエン(3mL)中の[2-[3-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシプロピル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6S,6aS)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノン(102f、600mg、1.02mmol)の混合物に、DIBAL-H(0.24mL、2.05mmol)を-78℃で加えた。混合物を-78℃で30分間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(50mL)に注ぎ、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=8:1)によって精製して、黄色い油として(R)-[2-[3-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシプロピル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(102g、320mg、0.54mmol、53%の収率)を得た。LCMS[M+H]:608.2。
THF(3mL)中の(S)-[2-[3-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシプロピル]-4-クロロ-フェニル]-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メタノール(102g、550mg、0.90mmol)の混合物に、25℃でフッ化テトラブチルアンモニウム(0.03mL、1.08mmol)を加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。反応混合物を水(10mL)に注ぎ、酢酸エチル(20mL)で抽出した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル)によって精製して、黄色い油として3-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]プロパン-1-オール(102h、410mg、0.83mmol、91.8%の収率)を得た。LCMS[M+H]:494.2。
THF(4mL)中の3-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]プロパン-1-オール(102h、100mg、0.20mmol)の混合物に、-5℃で水素化ナトリウム(0.06mL、0.40mmol)を加えた。反応物を-5℃で10分間撹拌した。塩化トシル(38.56mg、0.20mmol)を-5℃で加え、次に、-5℃で30分間撹拌した。反応混合物を水(10mL)に注ぎ、酢酸エチル(20mL)で抽出した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物102iを得、これをさらに精製することなく次のステップで使用した。LCMS[M+H]:476.3。
1,4-ジオキサン(3mL)中の4-クロロ-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(102i、84mg、0.18mmol)の混合物に、水酸化アンモニウム(61.81mg、1.76mmol)を加えた。混合物を110℃で16時間撹拌した。LCMSは、10%の生成物が検出されたことを示した。反応物を水(10mL)に注ぎ、酢酸エチル(20mL)で抽出した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮して粗生成物を得、これを水中のMeCN(0.1%のNH3水)で10%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製して、7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(102j、10mg、0.022mmol、12%の収率)を得た。LCMS[M+H]:457.3。
メタノール(2mL)中の7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-アミン(102j、10mg、0.02mmol)の混合物に、HCl(1.6mg、0.04mmol)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を、水中のMeCN:CH3CN(0.1%のHCl)で10%~95%で溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール;ハイドロクロライド(実施例102、1.46mg、0.0031mmol、14%の収率)を得た。LCMS[M+H]:417.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ:8.44~8.45(m、1H)、8.20(d、J=5.6Hz、1H)、7.08~7.10(m、3H)、6.82(d、J=4Hz、1H)、6.66~6.69(m、1H)、6.22(d、J=3.6Hz、1H)、5.69(m、2H)、5.26(d、J=2Hz 1H)、5.16(d、J=4Hz 2H)、3.94~3.97(m、1H)、3.45~3.59(m、1H)、2.73~2.77(m、2H)、1.96~2.03(m、2H)、1.58~1.62(m、2H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ:8.42~8.43(m、1H)、8.20~8.22(m、1H)、7.07~7.11(m、3H)、6.83(d、J=4Hz、1H)、6.24(d、J=3.6Hz、1H)、5.67~5.71(m、2H)、4.84~4.87(m、1H)、3.95~3.98(m、1H)、2.74~2.77(m、2H)、1.98~2.01(m、2H)、1.54~1.60(m、2H)。
THF(2mL)中の3-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(4-クロロピロロ[2,3-d]-ピリミジン-7-イル)-2,2-ジメチル-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]プロパン-1-オール(102i、20mg、0.04mmol)および第二鉄アセチルアセトン(7.14mg、0.02mmol)の混合物に、-10℃で臭化メチルマグネシウム(48.24mg、0.40mmol)を加えた。混合物を0℃に温め、1時間撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=5:1、Rf=0.7)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を水(5mL)に注ぎ、DCM(3×5mL)で抽出した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=7:1)によって精製して、黄色い油として3-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]プロパン-1-オール(101a、10mg、0.0211mmol、52%の収率)を得た。LCMS[M+H]:474.2。
THF(2mL)中の3-[5-クロロ-2-[(R)-ヒドロキシ-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-4-(4-メチルピロロ[2,3-d]へピリミジン-7-イル)-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-6-イル]メチル]フェニル]プロパン-1-オール(101a、20mg、0.04mmol)の混合物に、-5℃で水素化ナトリウム(0.06mL、0.08mmol)を加え、反応物を-5℃で10分間撹拌した。塩化トシル(8.05mg、0.04mmol)を加え、混合物を-5℃で30分間撹拌した。LCMSは反応が完了したことを示した。反応混合物をNH4Cl(10mL)に注ぎ、酢酸エチル(10mL)で抽出した。有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィークロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=7:1)によって精製して、白色の固体として4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(101b、4mg、0.0088mmol、21%の収率)を得た。LCMS[M+H]:456.3。
メタノール(2mL)中の4-メチル-7-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-ジメチル-6-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]-3a,4,6,6a-テトラヒドロフロ[3,4-d][1,3]ジオキソール-4-イル]ピロロ[2,3-d]ピリミジン(101b、4mg、0.01mmol)の混合物に、HCl(0.64mg、0.02mmol)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を、水中のMeCN(0.1%のTFA)で10%~95%まで溶出する分取HPLCによって精製して、白色の固体として(2R,3R,4S,5S)-2-(4-メチルピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-[(1R)-7-クロロ-1,3,4,5-テトラヒドロ-2-ベンゾキセピン-1-イル]テトラヒドロフラン-3,4-ジオール(実施例101、1mg、0.0024mmol、27%の収率)を得た。LCMS[M+H]:416.3。1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δ:8.66(s、1H)、8.44(s、2H)、7.62(d、J=3.6Hz、1H)、7.30(d、J=1.6Hz、1H)、7.18~7.25(m、2H)、6.77(d、J=3.6Hz、1H)、6.29(d、J=7.6Hz、1H)、5.44~5.53(m、1H)、4.78(d、J=4.2Hz、1H)、4.61~4.64(m、1H)、4.39(d、J=4.8Hz、1H)、4.25~4.30(m、2H)、3.10~3.16(m、1H)、2.89~2.94(m、1H)、2.65~2.67(m、3H)、1.68~1.77(m、2H)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6+D2O)δ:8.67(s、1H)、8.43(s,4H)、7.62(d、J=4Hz、1H)、7.30(d、J=1.6Hz、1H)、7.18~7.25(m、2H)、6.78(d、J=3.6Hz、1H)、6.29(d、J=8Hz、1H)、4.78(d、J=4.2Hz、1H)、4.62~4.65(m、1H)、4.39(d、J=4.2Hz、1H)、4.25~4.30(m、2H)、3.10~3.12(m、1H)、2.89~2.94(m、1H)、2.65~2.69(m、3H)、1.68~1.81(m、2H)。
化合物を可溶化し、100%のDMSOで3倍に希釈した。これらの希釈化合物を、所望のアッセイ濃度よりも10倍高い濃度の10用量IC50モード用のアッセイ緩衝剤(20mMのTris-HCl、pH8.0、50mMのNaCl、0.002%のTween20、1mMのTCEP、1%のDMSO)でさらに希釈した。標準反応は、基質として300nMのヒストンH4ベースのAcH4~23(Anaspec:AS-65002)を用いて、アッセイ緩衝剤中に30μlの総容量で行った。これに、希釈されたPRMT5/MEP50複合体を加えて、2.5nMの最終アッセイ濃度を提供し、化合物を37℃で20分間プレインキュベートした。S-[3H-メチル]-アデノシル-L-メチオニン(PerkinElmer:NET155001MC)を1μMの最終濃度まで加えることによって、反応が開始された。37℃で30分のインキュベーション後、25μLの8MのグアニジンHClを加えることによって、反応を停止させた。アッセイ緩衝剤中に0.3mg/mLのストレプトアビジンYSI SPAビーズ(Perkinelmer:RPNQ0012)を調製する。各反応物に、150μLのSPAビーズ懸濁液を加え、室温で30分間振盪しながらインキュベートする。プレートを100×gで30秒間遠心分離した後に、シンチレーションカウンターで読み取った。IC50値は、GraphPadPrismソフトウェアを使用して、Hill Slopeでデータを標準4パラメータにフィッティングすることによって決定された。以下の表2を参照されたい(PRMT5 IC50)。
対称性ジメチルアルギニン(sDMA)マークを検出するための細胞処理およびウエスタンブロッティング
化合物滴定および細胞培養:化合物をDMSOに溶解して、10mMのストックを作製し、さらに3倍系列希釈を実施して、作業ストックを最大1mMで作製した。Granta-519細胞は、10v/v%のFBS(GE Healthcare、カタログ番号:SH30910.03)を補充したPRMI 1640(Corning Cellgro、カタログ番号:10-040-CV)中に維持され、U-87 MG細胞は、10%のFBSおよび2mMのグルタミン(Corning Cellgro、カタログ番号25005CV)を含むDMEM(Corning Cellgro、カタログ番号:10-013-CV)中に維持した。
実験の1日前に、Granta-519細胞を、0.5×106個の細胞/mlの密度まで継代した。U-87MG細胞をトリプシン処理し、2,000個の細胞を96ウェルプレートに播種し、一晩成長させた。実験の日(0日目)に、Granta-519細胞を1,500rpmで4分間スピンダウンし、新鮮な培地に0.5×106個の細胞/mlに再懸濁し、190μlの細胞を96ウェルプレートに加えた。U-87MG細胞の場合、古い培地を取り除き、190μlの新鮮な培地に交換した。化合物作業ストックを、最初に、96ウェルプレートの新鮮な培地で1:50に希釈し、10μLの希釈薬物を、細胞を含有する96ウェルプレートに加え、3日間インキュベートした。DMSOはビヒクル対照に使用された。
細胞培養および化合物の処理
化合物をDMSOに溶解して10mMのストック溶液を作製し、さらに希釈して1mMおよび0.1mMのストックを作製した。
Quick-RNA Microprepキット(Zymo Research、カタログ番号Z1050)を使用して、RNAを単離し、qScript cDNA SuperMix(Quantabio、カタログ番号95048)を使用して、cDNAを合成した。Bio-Rad CFX ConnectリアルタイムPCR検出システムのPerfeCTa SYBR Green FastMix(Quantabio、カタログ番号95071)を使用して、γ-グロビンの定量的PCRを行った。CFX Managerソフトウェアを使用して、遺伝子発現分析を行った。
化合物による処理の7日目にヒト赤血球細胞を回収した。細胞を0.05%のグルタルアルデヒド(Electron Microscopy Sciences、カタログ番号16019)で固定し、0.1%のトリトン-Xで透過処理し、胎児ヘモグロビンを対象とするFITC結合抗体(ThermoFisher、カタログ番号MHFH01)で染色した。Attune Nxtフローサイトメーター(ThermoFisher)で、胎児ヘモグロビン発現赤血球細胞(%F細胞)の分析を行った。
化合物をDMSOに溶解して10mMのストック溶液を作製し、さらに希釈して1mMおよび0.1mMのストックを作製した。K562細胞をATCCから購入し、37℃のCO2インキュベーター(5%のCO2)中に10v/v%のFBS(GE Healthcare、カタログ番号:SH30910.03)を補充したIscove’s DMEM(Corning Cellgro、カタログ番号15-016-CVR)中に維持した。細胞を5×105個の細胞/mlの密度でプレーティングし、最終濃度0.1および1μMの化合物で処理した。培地および化合物を培養の3日後に更新し、細胞を回収して、6日間の処理後にRNAを単離した。
態様1。式Iの化合物
式中、
Aは、NもしくはC-R3であり、
R1は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C1~C4ハロアルキル、-C3~C6シクロアルキル、-C3~C6ハロシクロアルキル、-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)2-C1~C6アルキル、-CR6R6’CN、-NR6R6’、-NHCR6R6’CN、-NHCONR6R6’、-NHC(O)OR7、NHC(O)-C1~C6アルキル、NHC(O)-C1~C6ハロアルキル、-NH-C1~C6アルク-C(O)-C1~C6アルキル、-NHC(S)NR6R6’、-NH-O-R6、もしくは-NH-NR6R6’であり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、もしくはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C2~C6アルケニル、もしくは-C2~C6アルキニルであり、
R4は、H、-C1~C6アルキル、-C1~C6ハロアルキル、-C2~C6アルケニル、もしくは-C2~C6アルキニルであり、
R5は、Hもしくは-C1~C6アルキルであり、
R6およびR6’は、各々独立して、H、C1~C6アルキル、もしくは-C1~C6アルク-OC1~C6アルキルであるか、
またはR6およびR6’は、それらが付着している原子と一緒になって、C2~C6ヘテロシクロアルキル環もしくはC3~C6シクロアルキル環を形成し、
R7は、-C1~C6アルキルもしくは-C0~C6アルク-C3~C6シクロアルキルであり、
Xは、O,S,SO2,NH、またはN(C1~C6アルキル)であり、
Yは、CH2、-CH2CH2-、C(CH3)2、CF2、C(=O)、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であり、
Zは、O、CH2、もしくはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、もしくは任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である、式Iの化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物。
態様2。R1が、ハロ、-NR6R6’、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルである、態様1の化合物。
態様3。R1が、ハロ、好ましくは、-F、または-Clである、態様2の化合物。
態様4。R1が、-NR6R6’、好ましくは、-NH2である、態様2の化合物。
態様5。R1が、-C1~C6アルキル、好ましくは、-CH3である、態様2の化合物。
態様6。R1が、-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキル、好ましくは、-CH2-O-CH2CH3である、態様2の化合物。
態様7。R2が、Hである、態様1~6のうちのいずれか1つの化合物。
態様8。R4が、Hまたは-C1~C6アルキルである、態様1~7のうちのいずれか1つの化合物。
態様9。R4が、Hである、態様8の化合物。
態様10。R4が、-C1~C6アルキル、好ましくは、メチルである、態様8の化合物。
態様11。R5が、Hである、態様1~10のうちのいずれか1つの化合物。
態様12。R5が、-C1~C6アルキル、好ましくは、-CH3である、態様1~10のうちのいずれか1つの化合物。
態様13。Arが、任意選択的に置換された6員アリール環である、態様1~12のうちのいずれか1つの化合物。
態様14。6員アリール環が、1つ以上のハロゲン原子、好ましくは、-F、または-Clで置換されている、態様13の化合物。
態様15。6員アリール環が、1つ以上の-CH3、CF3、または-OCF3基で置換されている、態様13または14の化合物。
態様16。Arが、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環である、態様1~12のうちのいずれか1つの化合物。
態様17。6員ヘテロアリール環が、1つ以上のハロゲン原子、好ましくは、-F、または-Clで置換されている、態様16の化合物。
態様18。6員ヘテロアリール環が、1つ以上の-CH3、CF3、または-OCF3基で置換されている、態様16または17の化合物。
態様19。Arが、任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である、態様1~12のうちのいずれか1つの化合物。
態様20。5員ヘテロアリール環が、1つ以上のハロゲン原子、好ましくは、-F、または-Clで置換されている、態様19の化合物。
態様21。5員ヘテロアリール環が、1つ以上の-CH3、CF3、または-OCF3基で置換されている、態様19または20の化合物。
態様22。Xが、Oである、態様1~21のうちのいずれか1つの化合物。
態様23。Xが、Sである、態様1~21のうちのいずれか1つの化合物。
態様24。Xが、SO2である、態様1~21のうちのいずれか1つの化合物。
態様25。Xが、NHである、態様1~21のうちのいずれか1つの化合物。
態様26。Xが、N(C1~C6アルキル)、好ましくは、N(CH3)である、態様1~21のうちのいずれか1つの化合物。
態様27。Yが、CH2である、態様1~26のうちのいずれか1つの化合物。
態様28。Yが、-CH2CH2-である、態様1~26のうちのいずれか1つの化合物。
態様29。Yが、C(CH3)2である、態様1~26のうちのいずれか1つの化合物。
態様30。Yが、CF2である、態様1~26のうちのいずれか1つの化合物。
態様31。Yが、C(=O)である、態様1~26のうちのいずれか1つの化合物。
態様32。Yが、CH-C1~C4アルク-NH2である、態様1~26のうちのいずれか1つの化合物。
態様33。Zが、Oである、態様1~32のうちのいずれか1つの化合物。
態様34。Zが、CH2である、態様1~32のうちのいずれか1つの化合物。
態様35。Zが、CF2である、態様1~32のうちのいずれか1つの化合物。
態様36。Aが、Nである、態様1~35のうちのいずれか1つの化合物。
態様37。Aが、C-R3である、態様1~35のうちのいずれか1つの化合物。
態様38。R3が、Hである、態様37の化合物。
態様39。R3が、ハロ、好ましくは、-Fである、態様37の化合物。
態様40。態様1~39のうちのいずれか1つによる化合物および薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
態様41。タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5(PRMT5)酵素を阻害する方法であって、PRMT5酵素を、態様1~39のうちのいずれか1つのうちのいずれか1つの有効量の化合物と接触させることを含む、方法。
態様42。対象における異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害を治療する方法であって、態様1~39のうちのいずれか1つの化合物を対象に投与することを含む、方法。
態様43。異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害が、乳癌、肺癌、膵臓癌、前立腺癌、結腸癌、卵巣癌、子宮癌、子宮頸癌、急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、骨髄異形成、骨髄増殖性疾患、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病(CML)などの白血病、肥満細胞症、慢性リンパ性白血病(CLL)、多発性骨髄腫(MM)、骨髄異形成症候群(MDS)、類表皮癌、b-サラセミアおよび鎌状赤血球症(SCD)などの異常ヘモグロビン症、CDKN2A欠失癌、9P欠失癌、MTAP欠失癌、神経膠芽腫、NSCLC、頭頸部癌、膀胱癌、または肝細胞癌である、態様42の方法。
態様44。式Iの化合物、
式中、
Aは、NもしくはC-R3であり、
R1は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C1~C4ハロアルキル、-C3~C6シクロアルキル、-C3~C6ハロシクロアルキル、-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)2-C1~C6アルキル、-CR6R6’CN、-NR6R6’、-NHCR6R6’CN、-NHCONR6R6’、-NHC(O)OR7、NHC(O)-C1~C6アルキル、NHC(O)-C1~C6ハロアルキル、-NH-C1~C6アルク-C(O)-C1~C6アルキル、-NHC(S)NR6R6’、-NH-O-R6、もしくは-NH-NR6R6’であり、
R2は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、もしくはNH2であり、
R3は、H、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C2~C6アルケニル、もしくは-C2~C6アルキニルであり、
R4は、H、-C1~C6アルキル、-C1~C6ハロアルキル、-C2~C6アルケニル、もしくは-C2~C6アルキニルであり、
R5は、Hもしくは-C1~C6アルキルであり、
R6およびR6’は、各々独立して、H、C1~C6アルキル、もしくは-C1~C6アルク-OC1~C6アルキルであるか、
またはR6およびR6’は、それらが付着している原子と一緒になって、C2~C6ヘテロシクロアルキル環もしくはC3~C6シクロアルキル環を形成し、
R7は、-C1~C6アルキルもしくは-C0~C6アルク-C3~C6シクロアルキルであり、
Xは、O、S、NH、もしくはN(C1~C6アルキル)であり、Yは、-(CR9R9’)n-、-CR9=CR9’-、C(=O)、-C(=O)-(CR9R9’)n-、-C(=O)-O-(CR9R9’)n-、-CR9R9’-O-、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、-(CR9R9’)n-NR10、C(=O)NR10、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であるか、または
Xは、-SO2-であり、Yは、-(CR9R9’)n-、-CR9=CR9’-、-CR9R9’-O-、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、-(CR9R9’)n-NR10、もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であり、
n=1もしくは2、m=1もしくは2であり、
R9もしくはR9’の各場合は、独立して、H、D、C1~C6アルキル、C1~C6ハロアルキル、ハロ、-C1~C6アルコキシ、もしくはヒドロキシであり、
R10は、HもしくはC1~C6アルキルであり、
Zは、O、CH2、もしくはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、もしくは任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である、式Iの化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物。
態様45。R1が、ハロ、-NR6R6’、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルである、態様44の化合物。
態様46。R1が、ハロ、好ましくは、-F、または-Clである、態様45の化合物。
態様47。R1が、-NR6R6’、好ましくは、-NH2である、態様45の化合物。
態様48。R1が、-C1~C6アルキル、好ましくは、-CH3である、態様45の化合物。
態様49。R1は、-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキル、好ましくは、-CH2-O-CH2CH3である、態様45の化合物。
態様50。R2が、Hである、態様44~49のうちのいずれか1つの化合物。
態様51。R4が、Hまたは-C1~C6アルキルである、態様44~50のうちのいずれか1つの化合物。
態様52。R4が、Hである、態様51の化合物。
態様53。R4が、-C1~C6アルキル、好ましくは、メチルである、態様51の化合物。
態様54。R5が、Hである、態様44~53のうちのいずれか1つの化合物。
態様55。R5が、-C1~C6アルキル、好ましくは、-CH3である、態様44~53のうちのいずれか1つの化合物。
態様56。Arが、任意選択的に置換された6員アリール環である、態様44~55のうちのいずれか1つの化合物。
態様57。6員アリール環が、1つ以上のハロゲン原子、好ましくは、-F、または-Clで置換されている、態様56の化合物。
態様58。6員アリール環が、1つ以上の-CH3、CF3、または-OCF3基で置換されている、態様56または57の化合物。
態様59。Arが、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環である、態様44~55のうちのいずれか1つの化合物。
態様60。6員ヘテロアリール環が、1つ以上のハロゲン原子、好ましくは、-F、または-Clで置換されている、態様59の化合物。
態様61。6員ヘテロアリール環が、1つ以上の-CH3、CF3、または-OCF3基で置換されている、態様59または60の化合物。
態様62。Arが、任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である、態様44~55のうちのいずれか1つの化合物。
態様63。5員ヘテロアリール環が、1つ以上のハロゲン原子、好ましくは、-F、または-Clで置換されている、態様62の化合物。
態様64。5員ヘテロアリール環が、1つ以上の-CH3、CF3、または-OCF3基で置換されている、態様62または63の化合物。
態様65。Xが、Oである、態様44~64のうちのいずれか1つの化合物。
態様66。Xが、Sである、態様44~64のうちのいずれか1つの化合物。
態様67。Xが、SO2である、態様44~64のうちのいずれか1つの化合物。
態様68。Xが、NHである、態様44~64のうちのいずれか1つの化合物。
態様69。Xが、N(C1~C6アルキル)、好ましくは、N(CH3)である、態様44~64のうちのいずれか1つの化合物。
態様70。Yが、-(CR9R9’)nである、態様44~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様71。-(CR9R9’)nが、-CH2-、-CH2CH2-、-C(CH3)2-、または-CF2-である、態様70の化合物。
態様72。Yが、-CR9=CR9’-である、態様44~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様73。Yが、-C(=O)-(CR9R9’)n-である、態様44~66および68~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様74。Yが、-C(=O)-O-(CR9R9’)n-である、態様44~66および68~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様75。Yが、-CR9R9’-Oである、態様44~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様76。Yが、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-である、態様44~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様77。Yが、C(=O)である、態様44~66および68~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様78。Yが、CH-C1~C4アルク-NH2である、態様44~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様79。Yが、-(CR9R9’)n-NR10である、態様44~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様80。Yが、-C(=O)NR10である、態様44~66および68~69のうちのいずれか1つの化合物。
態様81。各R9および各R9’が、独立して、H、D、-CH3、OH、-OCH3、F、またはCF3である、態様70、72~76、または79のうちのいずれか1つの化合物。
態様82。n=1である、態様70、73、74、76、79、または81のうちのいずれか1つの化合物。
態様83。n=2である、態様70、73、74、76、79、または81のうちのいずれか1つの化合物。
態様84。m=1である、態様76の化合物。
態様85。m=2である、態様76の化合物。
態様86。Zが、Oである、態様44~85のうちのいずれか1つの化合物。
態様87。Zが、CH2である、態様44~85のうちのいずれか1つの化合物。
態様88。Zが、CF2である、態様44~85のうちのいずれか1つの化合物。
態様89。Aが、Nである、態様44~88のうちのいずれか1つの化合物。
態様90。Aが、C-R3である、態様44~88のうちのいずれか1つの化合物。
態様91。R3が、Hである、態様90の化合物。
態様92。R3が、ハロ、好ましくは、-Fである、態様90の化合物。
態様93。態様44~92のうちのいずれか1つの化合物および薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
態様94。タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5(PRMT5)酵素を阻害する方法であって、PRMT5酵素を、態様44~92のうちのいずれか1つのいずれか1つの有効量の化合物と接触させることを含む、方法。
態様95。対象における異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害を治療する方法であって、態様44~92のうちのいずれか1つの化合物を対象に投与することを含む、方法。
態様96。異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害が、乳癌、肺癌、膵臓癌、前立腺癌、結腸癌、卵巣癌、子宮癌、子宮頸癌、急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、骨髄異形成、骨髄増殖性疾患、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病(CML)などの白血病、肥満細胞症、慢性リンパ性白血病(CLL)、多発性骨髄腫(MM)、骨髄異形成症候群(MDS)、類表皮癌、b-サラセミアおよび鎌状赤血球症(SCD)などの異常ヘモグロビン症、CDKN2A欠失癌、9P欠失癌、MTAP欠失癌、神経膠芽腫、NSCLC、頭頸部癌、膀胱癌、または肝細胞癌である、態様95の方法。
Claims (34)
- 式I:
[式中、
AはNもしくはC-R3であり、
R1はH、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C1~C4ハロアルキル、-C3~C6シクロアルキル、-C3~C6ハロシクロアルキル、-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)-C1~C6アルキル、-C1~C6アルク-S(O)2-C1~C6アルキル、-CR6R6’CN、-NR6R6’、-NHCR6R6’CN、-NHCONR6R6’、-NHC(O)OR7、NHC(O)-C1~C6アルキル、NHC(O)-C1~C6ハロアルキル、-NH-C1~C6アルク-C(O)-C1~C6アルキル、-NHC(S)NR6R6’、-NH-O-R6もしくは-NH-NR6R6’であり、
R2はH、ハロ、-C1~C6アルキルもしくはNH2であり、
R3はH、ハロ、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシ、-C2~C6アルケニルもしくは-C2~C6アルキニルであり、
R4はH、-C1~C6アルキル、-C1~C6ハロアルキル、-C2~C6アルケニルもしくは-C2~C6アルキニルであり、
R5はHもしくは-C1~C6アルキルであり、
R6およびR6’は、各々独立して、H、C1~C6アルキルもしくは-C1~C6アルク-OC1~C6アルキルであるか、
またはR6およびR6’は、それらが付着している原子と一緒になって、C2~C6ヘテロシクロアルキル環もしくはC3~C6シクロアルキル環を形成し、
R7は-C1~C6アルキルもしくは-C0~C6アルク-C3~C6シクロアルキルであり、
XはO、S、NHもしくはN(C1~C6アルキル)であり、Yは-(CR9R9’)n-、-CR9=CR9’-、C(=O)、-C(=O)-(CR9R9’)n-、-C(=O)-O-(CR9R9’)n-、-CR9R9’-O-、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、-(CR9R9’)n-NR10、C(=O)NR10もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であるか、または
Xは-SO2-であり、Yは-(CR9R9’)n-、-CR9=CR9’-、-CR9R9’-O-、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、-(CR9R9’)n-NR10もしくはCH-C1~C4アルク-NH2であり、
式中、n=1、2もしくは3、m=1もしくは2であり、
R9もしくはR9’のどの場合も、独立してH、D、C1~C6アルキル、C1~C6ハロアルキル、ハロ、-C1~C6アルコキシもしくはヒドロキシであり、
R10はHもしくはC1~C6アルキルであり、
ZはO、CH2もしくはCF2であり、
Arは、任意選択的に置換された6員アリール環、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環、もしくは任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である。]
の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物。 - R1がハロ、-NR6R6’、-C1~C6アルキル、-C1~C6アルコキシまたは-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルである、請求項1に記載の化合物。
- R1がハロ、-NR6R6’、-C1~C6アルキル、または-C1~C6アルク-O-C1~C6アルキルである、請求項2に記載の化合物。
- R2がHである、請求項1~3のいずれか1項に記載の化合物。
- R4がHまたは-C1~C6アルキルである、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物。
- R4が-C1~C6アルキルである、請求項5に記載の化合物。
- R5がHまたは-C1~C6アルキルである、請求項1~6のいずれか1項に記載の化合物。
- Arが、任意選択的に置換された6員アリール環;1つ以上のハロゲン原子で置換されている6員アリール環;または、1つ以上の-CH3、CF3もしくは-OCF3基で置換されている6員アリール環である、請求項1~7のいずれか1項に記載の化合物。
- Arが、任意選択的に置換された6員ヘテロアリール環;1つ以上のハロゲン原子で置換されている6員ヘテロアリール環;または、1つ以上の-CH3、CF3もくしは-OCF3基で置換されている6員ヘテロアリール環である、請求項1~7のいずれか1項に記載の化合物。
- Arが任意選択的に置換された5員ヘテロアリール環である、請求項1~7のいずれか1項に記載の化合物。
- 前記5員ヘテロアリール環が1つ以上のハロゲン原子で置換されているか、または1つ以上の-CH3、CF3もしくは-OCF3基で置換されている、請求項10に記載の化合物。
- XがOである、請求項1~11のいずれか1項に記載の化合物。
- XがS、SO2、NH、またはXがN(C1~C6アルキル)である、請求項1~11のいずれか1項に記載の化合物。
- Yが-(CR9R9’)nであり、-(CR9R9’)nが-CH2-、-CH2CH2-、-CH2CH2CH2-、-C(CH3)2-または-CF2-である、請求項1~13のいずれか1項に記載の化合物。
- Yが-CR9=CR9’-、-C(=O)-(CR9R9’)n-、C(=O)-O-(CR9R9’)n-、-CR9R9’-O、-(CR9R9’)n-O-(CR9R9’)m-、C(=O)、CH-C1~C4アルク-NH2、-(CR9R9’)n-NR10、または-C(=O)NR10である、請求項1~13のいずれか1項に記載の化合物。
- 各R9および各R9’が、独立してH、D、-CH3、OH、-OCH3、FまたはCF3である、請求項14または15に記載の化合物。
- n=1、2または3である、請求項14または15に記載の化合物。
- m=1または2である、請求項15に記載の化合物。
- ZがO、CH2またはCF2である、請求項1~18のいずれか1項に記載の化合物。
- AがN;C-R3;または、C-R3であって、R3がHもしくはハロである、請求項1~19のいずれか1項に記載の化合物。
- 請求項1~20のいずれか1項に記載の化合物および薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
- 請求項1~20のいずれか1項の化合物を含む、タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5(PRMT5)酵素を阻害するための医薬組成物。
- 請求項1~20のいずれか1項に記載の化合物を含む、対象における異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害を治療するための組成物。
- 前記異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害が、乳癌、肺癌、膵臓癌、前立腺癌、結腸癌、卵巣癌、子宮癌、子宮頸癌、急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、骨髄異形成、骨髄増殖性疾患、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病(CML)、白血病、肥満細胞症、慢性リンパ性白血病(CLL)、多発性骨髄腫(MM)、骨髄異形成症候群(MDS)、類表皮癌、b-サラセミア、鎌状赤血球症(SCD)、異常ヘモグロビン症、CDKN2A欠失癌、9P欠失癌、MTAP欠失癌、神経膠芽腫、NSCLC、頭頸部癌、膀胱癌、または肝細胞癌である、請求項23に記載の医薬組成物。
- 前記異常なPRMT5活性に関連する疾患または障害が、腺様嚢胞癌、原発性中枢神経系リンパ腫、卵管癌、または非ホジキン腫である、請求項23に記載の医薬組成物。
- (2S,3S,4R,5R)-2-((R)-6-クロロイソクロマン-1-イル)-5-(4-メチル-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくはその溶媒和物である、請求項1に記載の化合物。
- 前記化合物が、(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-6-クロロイソクロマン-1-イル)-5-(4-メチル-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくはその溶媒和物である、請求項21に記載の医薬組成物。
- 前記化合物が、(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-6-クロロイソクロマン-1-イル)-5-(4-メチル-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくはその溶媒和物である、請求項23~25のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- (2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくはその溶媒和物である、請求項1に記載の化合物。
- 前記化合物が、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくはその溶媒和物である、請求項21に記載の医薬組成物。
- 前記化合物が、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-5-クロロ-1,3-ジヒドロイソベンゾフラン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくはその溶媒和物である、請求項23~25のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- (2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-6-クロロイソクロマン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオールである、請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物。
- 前記化合物が、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-6-クロロイソクロマン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物である、請求項21に記載の医薬組成物。
- 前記化合物が、(2R,3R,4S,5S)-2-(4-アミノ-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-7-イル)-5-((R)-6-クロロイソクロマン-1-イル)テトラヒドロフラン-3,4-ジオール、またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物である、請求項23、24および25のいずれか1項に記載の医薬組成物。
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