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JP7557922B2 - Uses of DLL3-targeting multispecific antigen-binding molecules - Google Patents
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JP7557922B2 - Uses of DLL3-targeting multispecific antigen-binding molecules - Google Patents

Uses of DLL3-targeting multispecific antigen-binding molecules Download PDF

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本発明は、DLL3を標的とする多重特異性抗原結合分子、そのような抗原結合分子を含む医薬組成物;およびがん疾患の分野における治療目的での、そのような抗原結合分子またはそのような組成物の使用に関する。 The present invention relates to multispecific antigen-binding molecules targeting DLL3, pharmaceutical compositions comprising such antigen-binding molecules, and the use of such antigen-binding molecules or such compositions for therapeutic purposes in the field of cancer diseases.

がん治療では、健常細胞および組織を無傷で残したまま腫瘍細胞を有効かつ選択的に破壊することが、望ましい目標である。神経内分泌がん(NEC)、神経内分泌腫瘍(NET)、および他の固形腫瘍などの、DLL3の過剰発現に関連する腫瘍性疾患に対する処置を改善するニーズが存在する。 In cancer therapy, the desired goal is to effectively and selectively destroy tumor cells while leaving healthy cells and tissues intact. There is a need for improved treatments for neoplastic diseases associated with DLL3 overexpression, such as neuroendocrine carcinomas (NECs), neuroendocrine tumors (NETs), and other solid tumors.

デルタ様3(DLL3)は、Notchリガンドファミリーメンバーに属するI型膜タンパク質である。DLL3は、シスでNotchに結合し、それによって、典型的(canonical)Notchシグナル伝達の特徴である細胞間相互作用および標的細胞におけるNotchの内部移行を遮断する、Notchシグナル伝達を阻害するように細胞自律的に機能する、非典型的Notchリガンドである。DLL3の主な役割は、胚発生の過程での体節形成である。DLL3ノックアウトを有するマウスは、軸骨格ならびに頭蓋および神経の発生において部分欠損を示す。体節パターン形成の欠損もまた、ある特定の生殖系列 DLL3変異を有するヒトにおいて認められ、これは、脊椎肋骨異骨症と呼ばれる状態をもたらす。染色体上のDLL3遺伝子の増幅およびがん細胞株におけるこの遺伝子の発現の増加(非特許文献1)ならびに一部の神経膠腫の症例におけるDLL3発現の増加(非特許文献2)を報告する以前の研究が存在する。加えて、DLL3は、ADCC増強抗体、抗体-薬物コンジュゲート(ADC)、およびBiTE-Fcフォーマットを用いるT細胞誘導二重特異性分子を用いた、神経膠腫または小細胞肺がん(SCLC)を診断および治療する方法において、これまでに提案されている(特許文献1、2、および3)。 Delta-like 3 (DLL3) is a type I membrane protein that belongs to the Notch ligand family members. DLL3 is an atypical Notch ligand that functions cell-autonomously to inhibit Notch signaling by binding to Notch in cis, thereby blocking cell-cell interactions and internalization of Notch in target cells, which are hallmarks of canonical Notch signaling. The primary role of DLL3 is somitogenesis during embryonic development. Mice with DLL3 knockouts show partial defects in axial skeletal and cranial and neural development. Defects in somitogenesis patterning are also observed in humans with certain germline DLL3 mutations, which result in a condition called spondylocostal dysostosis. There have been previous studies reporting amplification of the DLL3 gene on the chromosome and increased expression of this gene in cancer cell lines (Non-Patent Document 1) as well as increased DLL3 expression in some cases of glioma (Non-Patent Document 2). In addition, DLL3 has previously been proposed in methods for diagnosing and treating glioma or small cell lung cancer (SCLC) using ADCC-enhancing antibodies, antibody-drug conjugates (ADCs), and T cell-inducing bispecific molecules using the BiTE-Fc format (Patent Documents 1, 2, and 3).

WO2011/093097WO2011/093097 WO2013/126746WO2013/126746 WO2017/021349WO2017/021349

Phillips, H. S. (2006) Cancer Cell 9, 157-173.Phillips, H. S. (2006) Cancer Cell 9, 157-173. Mulledndore, M. E. (2009) Clin Cancer Res 15, 2291-2301.Mulledndore, M. E. (2009) Clin Cancer Res 15, 2291-2301.

本発明の目的は、T細胞をDLL3発現細胞の近くに動員し、DLL3発現がん細胞に対するT細胞の細胞傷害性を用いることによって、がん治療が可能な、多重特異性抗原結合分子;多重特異性抗原結合分子を製造するための方法;および細胞傷害活性を誘導するための有効成分としてそのような多重特異性抗原結合分子を含む治療剤を提供することである。本発明の別の目的は、有効成分として上述の抗原結合分子の1つを含む、種々のがんの治療または予防に使用するための医薬組成物、および該医薬組成物を用いる治療方法を提供することである。 The object of the present invention is to provide a multispecific antigen-binding molecule capable of treating cancer by recruiting T cells to the vicinity of DLL3-expressing cells and using the cytotoxicity of T cells against DLL3-expressing cancer cells; a method for producing the multispecific antigen-binding molecule; and a therapeutic agent comprising such a multispecific antigen-binding molecule as an active ingredient for inducing cytotoxic activity. Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for use in treating or preventing various cancers, comprising one of the above-mentioned antigen-binding molecules as an active ingredient, and a therapeutic method using the pharmaceutical composition.

本発明は、それぞれが、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない(すなわち、CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない)、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分と;DLL3、好ましくはヒトDLL3に結合できる第3の抗原結合部分とを含む、多重特異性抗原結合分子に関し、該多重特異性抗原結合分子は、他の多重特異性抗原結合分子が有し得る有害な毒性の懸念または副作用を回避しつつ、より効率的にT細胞依存性細胞傷害活性を誘導する。本発明は、有効成分として抗原結合分子を含むことによって、種々のがん、特に、DLL3発現がんまたはDLL3陽性がんなどのDLL3に関連するがんを治療することができる多重特異性抗原結合分子およびその医薬組成物の医学的使用にさらに関する。1つの局面において、前記DLL3発現がんまたはDLL3陽性がんは、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(medullary thyroid carcinoma; MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がん(medullary thyroid cancer)からなる群より選択される。 The present invention relates to a multispecific antigen-binding molecule comprising a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion, each capable of binding to CD3 and CD137 but not simultaneously (i.e., capable of binding to CD3 and CD137 but not simultaneously); and a third antigen-binding portion capable of binding to DLL3, preferably human DLL3, which induces T cell-dependent cytotoxicity more efficiently while avoiding harmful toxicity concerns or side effects that other multispecific antigen-binding molecules may have. The present invention further relates to medical uses of the multispecific antigen-binding molecule and its pharmaceutical composition, which can treat various cancers, particularly cancers associated with DLL3, such as DLL3-expressing or DLL3-positive cancers, by including the antigen-binding molecule as an active ingredient. In one aspect, the DLL3-expressing or DLL3-positive cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine cancer, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid cancer.

1つの局面において、本発明の多重特異性抗原結合分子は、多重特異性抗原結合分子の有効性を改善または増強する、非常に独特な構造フォーマットを有する。独特な構造フォーマットを有する新規な抗原結合分子は、望ましくない有害作用の低減と共に、エフェクター細胞および標的細胞上の各々の抗原に対する結合価および/または特異性の増加をもたらすための、抗原結合ドメインの数の増加を提供する。 In one aspect, the multispecific antigen-binding molecules of the present invention have a highly unique structural format that improves or enhances the efficacy of the multispecific antigen-binding molecules. The novel antigen-binding molecules with unique structural formats provide an increased number of antigen-binding domains to provide increased valency and/or specificity for each antigen on effector and target cells, along with reduced undesirable adverse effects.

1つの特定の局面において、本発明は、それぞれが、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない(すなわち、CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない)、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分と;DLL3、好ましくはヒトDLL3に結合できる第3の抗原結合部分とを含む、多重特異性抗原結合分子に関し、該多重特異性抗原結合分子は、他の多重特異性抗原結合分子が有し得る有害な毒性の懸念または副作用を回避しつつ、効率的にT細胞依存性細胞傷害活性を誘導する。1つの局面において、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない抗原結合部分は、ヒトCD3およびヒトCD137に結合できる抗原結合部分であり、第1の抗原結合部分は、ヒトCD3およびヒトCD137のいずれか一方に結合する。CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない(すなわち、CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない)抗原結合部分は、以下により具体的に定義されるように、「Dual抗原結合部分」または一部の局面では「Dual-Fab」と呼ばれ得る。1つのそのような局面において、第1のおよび第2の抗原結合部分の各々は、少なくとも1つのアミノ酸変異、例えば、システインの挿入/置換/変異を含み、これは、第1抗原結合部分と第2の抗原結合部分との間にジスルフィド結合を作出して、それらを相互に近くに維持し、かつ、例えば、2つの抗原結合部分(例えば、Dual-Fab)間の立体障害またはより短い距離の結果として同じ単一のエフェクター細胞上の抗原(CD3および/またはCD137)へのシス抗原結合を促進し、それによって、2つの抗原結合部分(CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない)によってDLL3非依存的に媒介される2つのCD3/CD137発現免疫細胞の望ましくない架橋形成を妨げることにより三重特異性抗原結合分子の安全性プロファイルを改善する。1つの特定の局面において、該第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれは、Fabであり、かつCH1領域中に(変異、置換、または挿入を介して)少なくとも1つのシステイン残基を含み、該少なくとも1つのシステイン残基は、第1の抗原結合部分のCH1領域と第2の抗原結合部分のCH1領域との間に少なくとも1つのジスルフィド結合を形成することができる。別の特定の局面において、該第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれは、第1の抗原結合部分のCH1領域と第2の抗原結合部分のCH1領域との間に1つのジスルフィド結合を形成することができる、CH1領域中のEUナンバリングによる191位に(変異、置換、または挿入を介して)1つのシステイン残基を含む。第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分を連結するCH1領域(例えば、EUナンバリングによる191位)でのそのようなジスルフィド結合は、本明細書において「LINC」と呼ばれ得る。 In one particular aspect, the present invention relates to a multispecific antigen-binding molecule comprising a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion, each of which can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously (i.e., can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously); and a third antigen-binding portion capable of binding to DLL3, preferably human DLL3, which efficiently induces T cell-dependent cytotoxicity while avoiding the harmful toxicity concerns or side effects that other multispecific antigen-binding molecules may have. In one aspect, the antigen-binding portion capable of binding to CD3 and CD137 but not simultaneously is an antigen-binding portion capable of binding to human CD3 and human CD137, and the first antigen-binding portion binds to either human CD3 or human CD137. An antigen-binding portion that can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously (i.e., can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously) may be referred to as a "Dual antigen-binding portion" or in some aspects a "Dual-Fab," as more specifically defined below. In one such aspect, each of the first and second antigen-binding moieties contains at least one amino acid mutation, e.g., a cysteine insertion/substitution/mutation, which creates a disulfide bond between the first and second antigen-binding moieties to keep them close to each other and promote cis antigen binding to antigens (CD3 and/or CD137) on the same single effector cell, e.g., as a result of steric hindrance or shorter distance between the two antigen-binding moieties (e.g., Dual-Fab), thereby improving the safety profile of the trispecific antigen-binding molecule by preventing undesired cross-linking of two CD3/CD137 expressing immune cells mediated in a DLL3-independent manner by the two antigen-binding moieties (which can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously). In one particular aspect, each of the first and second antigen-binding moieties is a Fab and includes at least one cysteine residue (through mutation, substitution, or insertion) in the CH1 region, which can form at least one disulfide bond between the CH1 region of the first antigen-binding moiety and the CH1 region of the second antigen-binding moiety. In another particular aspect, each of the first and second antigen-binding moieties includes at least one cysteine residue (through mutation, substitution, or insertion) at position 191 according to EU numbering in the CH1 region, which can form one disulfide bond between the CH1 region of the first antigen-binding moiety and the CH1 region of the second antigen-binding moiety. Such a disulfide bond at the CH1 region (e.g., position 191 according to EU numbering) that links the first and second antigen-binding moieties may be referred to herein as a "LINC".

そのような独特な構造フォーマットを有する抗原結合分子、すなわち、それぞれがCD3およびCD137に結合できるが同時には結合しない2つの一価Dual-Fabと1つの一価DLL3結合アームとを含む三価三重特異性抗体は、「(2+1)」(または「1+2」)と呼ばれてもよく、驚くべきことに、様々な細胞(例えば、T細胞などのエフェクター細胞)間の望ましくない架橋形成に起因するオフターゲット副作用の低減または最小化を示しつつ、他の多重特異性抗体フォーマット(例えば、BiTE)と比較して優れた有効性を示すことが見出された。 Antigen-binding molecules with such a unique structural format, i.e., trivalent trispecific antibodies comprising two monovalent Dual-Fabs and one monovalent DLL3-binding arm, each capable of binding to CD3 and CD137 but not simultaneously, may also be referred to as "(2+1)" (or "1+2"), and have surprisingly been found to exhibit superior efficacy compared to other multispecific antibody formats (e.g., BiTEs) while exhibiting reduced or minimized off-target side effects due to undesired cross-linking between various cells (e.g., effector cells such as T cells).

本発明は以下に関する:
[A-1] 医薬として使用するための抗体;または
がんを治療するのに使用するための抗体;または
抗体と薬学的に許容される担体とを含む医薬製剤;または
医薬として使用するための、抗体と薬学的に許容される担体とを含む医薬製剤;または
がんの治療において使用するための、抗体と薬学的に許容される担体とを含む医薬製剤。
[A-2]抗体が、
(a)第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分であって、それぞれが同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、かつ該抗体可変領域が以下からなる群:
(a1)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a2)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a3)配列番号:82の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:83の重鎖CDR 2、配列番号:84の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域
より独立して選択される、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分;ならびに
(b)ヒトデルタ様3(DLL3)に結合し、かつ配列番号:233を含む重鎖CDR 1、配列番号:234を含む重鎖CDR 2、配列番号:235を含む重鎖CDR 3、配列番号:237を含む軽鎖CDR 1、配列番号:238を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:239を含む軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、第3の抗原結合部分
を含む、[A-1]の抗体または医薬製剤。
[A-3] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、以下の特性:
(i)ヒトCD3に結合する;
(ii)ヒトCD137に結合する;
(iii)ヒトCD3およびヒトCD137に結合でき、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、ヒトCD3およびヒトCD137のいずれか一方に結合する;および
(iv)ヒトCD3およびヒトCD137に結合できるが、ヒトCD3およびヒトCD137に同時には結合しない
のうち1つ、2つまたはそれ以上を有する、[A-2] の抗体または医薬製剤。
[A-4] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、該抗体可変領域が、以下からなる群:
(a1)配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(a2)配列番号:14のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号:58のアミノ酸配列を含むVL;
(a3)配列番号:81のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号:60のアミノ酸配列を含むVL;
(a4)(a1)~(a3)のいずれか1つのVHおよびVLに1つまたは複数のアミノ酸の置換、欠失、付加、および/または挿入を含み、かつ該VHおよびVLのいずれかのものと等価の活性を有する、VHおよびVL;ならびに
(a5)(a1)~(a3)のいずれか1つにおいて定義されたVHおよびVLのアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、または95%の配列同一性を有するVHおよびVL
より独立して選択される、
[A-2]~[A-3] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-5] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、[A-2]~[A-3] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-6] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体可変領域を含む、[A-4] の抗体または医薬製剤。
[A-7] 第3の抗原結合部分が、
(a)配列番号:232を含むVHと配列番号:236を含むVLとを含む抗体可変領域;または
(b)配列番号:232のアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、または95%の配列同一性を有するVHと配列番号:236のアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、または95%の配列同一性を有するVLとを含む抗体可変領域
を含む、[A-2]~[A-6] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-8] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、191位(EUナンバリング)にシステイン残基を有するFabであり、かつ該2つのシステイン残基を連結するジスルフィド結合が存在する、[A-2]~[A-7] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-9] 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれが、VHおよび CH1ドメインを含む重鎖とVLおよび軽鎖定常(CL)ドメインを含む軽鎖とを含むFabであり、かつ第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれかのFab重鎖のN末端に、直接的にまたはペプチドリンカーを介して融合されている、[A-2]~[A-8] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-10-1] 第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれかのFab重鎖のN末端に、ペプチドリンカーを介して融合されており、かつペプチドリンカーが、配列番号:248、配列番号:249、および配列番号:259からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する、[A-9] の抗体または医薬製剤。
[A-10-2] 第3の抗原結合部分が、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子であり、かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、従来型のFab分子である、[A-10-1] の抗体または医薬製剤。
[A-11] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCLドメインにおいて、123位および124位(Kabatナンバリング)にあるアミノ酸がそれぞれ、アルギニンおよびリジンであり;かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCH1ドメインにおいて、147位および213位(EUナンバリング)の各々にあるアミノ酸がグルタミン酸である、[A-10-2]の抗体または医薬製剤。
[A-12] Fcドメインをさらに含む、[A2]~[A-11] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-13] Fcドメインが第1のおよび第2のFc領域サブユニットを含み、
第1のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;および
234位、235位、および297位の各々にアラニン、354位にシステイン、および366位にトリプトファンを含むFc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、かつ
第2のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;および
234位、235位、および297位の各々にアラニン、349位にシステイン、366位にセリン、368位にアラニン、および407位にバリンを含むFc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、
すべての位置がEUナンバリングによるものである、
[A-12] の抗体または医薬製剤。
[A-14]抗体が、以下の(A)~(C)からなる群:
(A)配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5);
(B)配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5);ならびに
(C)配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
より選択される組み合わせで5本のポリペプチド鎖を含む、[A-2]の抗体または医薬製剤。
[A-15] 抗体が、以下の組み合わせ:
配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、[A-2] の抗体または医薬製剤。
[A-16] 抗体が、以下の組み合わせ:
配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、[A-2] の抗体または医薬製剤。
[A-17] 抗体が、以下の組み合わせ:
配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、[A-2] の抗体または医薬製剤。
[A-18] 抗体の5本のポリペプチド鎖(鎖1~鎖5)が、図1(a)に示すように相互に接続および/または結合している、[A-14]~[A-17] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-19] ポリペプチド鎖2および鎖5のそれぞれが、ポリペプチド鎖1と結合し;ポリペプチド鎖4がポリペプチド鎖3と結合し;かつポリペプチド鎖1がポリペプチド鎖3と結合している、[A-14]~[A-17] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-20] 追加の治療剤、好ましくは化学療法剤または免疫チェックポイント阻害剤との組み合わせで使用するための、[A-2]~[A-17] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-21] PD-1軸結合アンタゴニスト、好ましくは抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体、より好ましくはアテゾリズマブである免疫チェックポイント阻害剤との組み合わせで使用するための、[A-20] の抗体または医薬製剤。
[A-22] 微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、抗血管新生剤、エトポシド、イリノテカン、ルルビネクテジン、アムルビシン、および白金製剤(シスプラチンおよびカルボプラチンなど)からなる群より選択される化学療法剤との組み合わせで使用するための、[A-20] の抗体または医薬製剤。
[A-23] 免疫チェックポイント阻害剤または化学療法剤が、抗体または医薬製剤と同時に投与される、[A-20]~[A-22] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-24] 免疫チェックポイント阻害剤または化学療法剤が、抗体または医薬製剤の投与の前にまたは後に投与される、[A-20]~[A-23] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-25]がんが、 DLL3発現がんまたはDLL3陽性がんである、がんの治療において使用するための、[A-2]~[A-24] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-26]がんが、神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌がん(NEC)、および非神経内分泌起源の他の固形腫瘍からなる群より選択される、[A-25] の抗体または医薬製剤。
[A-27]がんが、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんからなる群より選択される、[A-25] の抗体または医薬製剤。
[A-28] がんが、肺がん、好ましくは SCLCである、[A-25] の抗体または医薬製剤。
[A-29] がんが、神経膠腫または膠芽腫(GBM)である、[A-25] の抗体または医薬製剤。
[A-30] がんが神経内分泌前立腺がんである、[A-25] の抗体または医薬製剤。
[A-31] がんが神経芽腫である、[A-25] の抗体または医薬製剤。
[A-32] 抗体が多重特異性抗体である、[A-2]~[A-31] のいずれか1つの抗体または医薬製剤。
[A-33] 化学療法剤が、微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、抗血管新生剤、エトポシド、イリノテカン、ルルビネクテジン、アムルビシン、および白金製剤(シスプラチンおよびカルボプラチンなど)からなる群より選択される、化学療法剤とさらに組み合わされる、[A-21]に記載の使用のための抗体または医薬製剤。
[A-34] 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1軸結合アンタゴニスト、好ましくは抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体、より好ましくはアテゾリズマブである、免疫チェックポイント阻害剤とさらに組み合わされる、[A-22] の抗体または医薬製剤。
[B-1]
(a)第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分であって、それぞれが同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、かつ該抗体可変領域が以下からなる群:
(a1)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a2)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a3)配列番号:82の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:83の重鎖CDR 2、配列番号:84の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域
より独立して選択される、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分;ならびに
(b)ヒトデルタ様3(DLL3)に結合し、かつ配列番号:233を含む重鎖CDR 1、配列番号:234を含む重鎖CDR 2、配列番号:235を含む重鎖CDR 3、配列番号:237を含む軽鎖CDR 1、配列番号:238を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:239を含む軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、第3の抗原結合部分
を含む、多重特異性抗体。
[B-2] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、以下の特性:
(i)ヒトCD3に結合する;
(ii)ヒトCD137に結合する;
(iii)ヒトCD3およびヒトCD137に結合でき、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、ヒトCD3およびヒトCD137のいずれか一方に結合する;および
(iv)ヒトCD3およびヒトCD137に結合できるが、ヒトCD3およびヒトCD137に同時には結合しない
のうち1つ、2つまたはそれ以上を有する、[B-1] の多重特異性抗体。
[B-3] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、該抗体可変領域が、以下からなる群:
(a1)配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(a2)配列番号:14のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号:58のアミノ酸配列を含むVL;
(a3)配列番号:81のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号:60のアミノ酸配列を含むVL;
(a4)(a1)~(a3)のいずれか1つのVHおよびVLに1つまたは複数のアミノ酸の置換、欠失、付加、および/または挿入を含み、かつ該VHおよびVLのいずれかのものと等価の活性を有する、VHおよびVL;ならびに
(a5)(a1)~(a3)のいずれか1つに定義されたVHおよびVLのアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、または95%の配列同一性を有するVHおよびVL
より独立して選択される、
[B-1]~[B-2] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-4] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、[B-1]~[B-2] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-5] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体可変領域を含む、[B-3] の多重特異性抗体。
[B-6] 第3の抗原結合部分が、
(a)配列番号:232を含むVHと配列番号:236を含むVLとを含む抗体可変領域;または
(b)配列番号:232のアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、または95%の配列同一性を有するVHと配列番号:236のアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、または95%の配列同一性を有するVLとを含む抗体可変領域
を含む、[B-1]~[B-5] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-7] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、191位(EUナンバリング)にシステイン残基を有するFabであり、かつ該2つのシステイン残基を連結するジスルフィド結合が存在する、[B-1]~[B-6] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-8] 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれが、VHおよび CH1ドメインを含む重鎖とVLおよび軽鎖定常(CL)ドメインを含む軽鎖とを含むFabであり、かつ第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれかのFab重鎖のN末端に、直接的にまたはペプチドリンカーを介して融合されている、[B-1]~[B-7] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-9-1] 第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれかのFab重鎖のN末端に、ペプチドリンカーを介して融合されており、かつペプチドリンカーが、配列番号:248、配列番号:249、および配列番号:259からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する、[B-8] の多重特異性抗体。
[B-9-2] 第3の抗原結合部分が、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子であり、かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、従来型のFab分子である、[B-9-1] の多重特異性抗体。
[B-10] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCLドメインにおいて、123位および124位(Kabatナンバリング)にあるアミノ酸がそれぞれ、アルギニンおよびリジンであり;かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCH1ドメインにおいて、147位および213位(EUナンバリング)の各々にあるアミノ酸がグルタミン酸である、[B-9-2] の多重特異性抗体。
[B-11] Fcドメインをさらに含む、[B-1]~[B-10] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-12] Fcドメインが第1のおよび第2のFc領域サブユニットを含み、第1のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;および
234位、235位、および297位の各々にアラニン、354位にシステイン、および366位にトリプトファンを含むFc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、かつ
第2のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含むFc領域ポリペプチド;および
234位、235位、および297位の各々にアラニン、349位にシステイン、366位にセリン、368位にアラニン、および407位にバリンを含むFc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、
すべての位置がEUナンバリングによるものである、
[B-11] の多重特異性抗体。
[B-13]抗体が、以下の(A)~(C)からなる群:
(A)配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5);
(B)配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5);ならびに
(C)配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
より選択される組み合わせで5本のポリペプチド鎖を含む、[B-1]の多重特異性抗体。
[B-14] 抗体が、以下の組み合わせ:
配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、[B-1] の多重特異性抗体。
[B-15] 抗体が、以下の組み合わせ:
配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、[B-1] の多重特異性抗体。
[B-16] 抗体が、以下の組み合わせ:
配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、[B-1] の多重特異性抗体。
[B-17] 抗体の5本のポリペプチド鎖(鎖1~鎖5)が、図1(a)に示すように相互に接続および/または結合している、[B-13]~[B-16] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-18]ポリペプチド鎖2および鎖5のそれぞれが、ポリペプチド鎖1と結合し;ポリペプチド鎖4がポリペプチド鎖3と結合し;かつポリペプチド鎖1がポリペプチド鎖3と結合している、[B-13]~[B-16] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-19] 医薬として使用するための、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[B-20] がんの治療において使用するための、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体。
[C-1] [B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体と薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
[C-2] がんの治療のための、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体との組み合わせで使用するための、免疫チェックポイント阻害剤と薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
[C-3] がんの治療のための、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体との組み合わせで使用するための、化学療法剤と薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
[C-4] 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1軸結合アンタゴニスト、好ましくは抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体、より好ましくはアテゾリズマブである、[C-2] の医薬製剤。
[C-5] 化学療法剤が、微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、抗血管新生剤、エトポシド、イリノテカン、ルルビネクテジン、アムルビシン、および白金製剤(シスプラチンおよびカルボプラチンなど)からなる群より選択される、[C-3] の医薬製剤。
[C-6] 免疫チェックポイント阻害剤または化学療法剤が、多重特異性抗体と同時に投与される、[C-2]~[C-5] のいずれか1つの医薬製剤。
[C-7] 免疫チェックポイント阻害剤または化学療法剤が、多重特異性抗体の投与の前にまたは後に投与される、[C-2]~[C-5] のいずれか1つの医薬製剤。
[D-1]がんの治療における、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤の使用。
[E-1] [B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤の有効量を個体に投与する段階を含む、がんを有する個体を治療する方法。
[E-2] [B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤の治療的有効量を対象に投与する段階を含む、がんに対する持続的な免疫応答を活性化または増強する方法。
[E-3] 免疫チェックポイント阻害剤との組み合わせで、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤の治療的有効量を対象に投与する段階を含む、免疫チェックポイント阻害剤の有効性を増加させる方法。
[E-4] [B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤の治療的有効量を対象に投与する段階を含む、対象において転移を低減または予防する方法。
[E-5] [B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤の治療的有効量を対象に投与する段階を含む、対象において腫瘍成長を抑制する方法。
[E-6] 追加の治療剤、好ましくは化学療法剤または免疫チェックポイント阻害剤を対象に投与する段階をさらに含む、[E-1]~[E-5] のいずれか1つの方法。
[E-7] 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1軸結合アンタゴニスト、好ましくは抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体、より好ましくはアテゾリズマブである、[E-6] の方法。
[E-8] 化学療法剤が、微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、抗血管新生剤、エトポシド、イリノテカン、ルルビネクテジン、アムルビシン、および白金製剤(シスプラチンおよびカルボプラチンなど)からなる群より選択される、[E-6] の方法。
[E-9] 追加の治療剤、免疫チェックポイント阻害剤、または化学療法剤が、多重特異性抗体または医薬製剤と同時に投与される、[E-6]~[E-8] のいずれか1つの方法。
[E-10] 追加の治療剤、免疫チェックポイント阻害剤、または化学療法剤が、多重特異性抗体または医薬製剤の投与の前にまたは後に投与される、[E-6]~[E-8] のいずれか1つの方法。
[F-1] がんの治療のための医薬の製造における、[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-3] のいずれか1つの医薬製剤の使用。
[F-2] がんの治療のための医薬の製造における、追加の治療剤(好ましくは化学療法剤または免疫チェックポイント阻害剤)との組み合わせでの[B-1]~[B-18] のいずれか1つの多重特異性抗体または[C-1]~[C-3] のいずれか1つの医薬製剤の使用。
[F-3] 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1軸結合アンタゴニスト、好ましくは抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体、より好ましくはアテゾリズマブである、[F-2] の使用。
[F-4] 化学療法剤が、微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、抗血管新生剤、エトポシド、イリノテカン、ルルビネクテジン、アムルビシン、および白金製剤(シスプラチンおよびカルボプラチンなど)からなる群より選択される、[F-2] の使用。
[G-1] がんが、DLL3発現がんまたはDLL3陽性がんである、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
[G-2] がんが、神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌がん(NEC)、または非神経内分泌起源の他の固形腫瘍からなる群より選択される、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
[G-3] がんが、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんからなる群より選択される、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
[G-4] がんが肺がん、好ましくは SCLCである、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
[G-5] がんが神経膠腫または膠芽腫(GBM)である、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
[G-6] がんが神経内分泌前立腺がんである、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
[G-7] がんが神経芽腫である、[C-1]~[C-7] のいずれか1つの医薬製剤、[D-1]~[F-4] のいずれか1つの方法または使用。
The present invention relates to:
[A-1] An antibody for use as a medicine; or an antibody for use in treating cancer; or a pharmaceutical formulation comprising an antibody and a pharma- ceutically acceptable carrier; or a pharmaceutical formulation comprising an antibody and a pharma- ceutically acceptable carrier for use as a medicine; or a pharmaceutical formulation comprising an antibody and a pharma- ceutically acceptable carrier for use in treating cancer.
[A-2] The antibody
(a) a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety, each of which comprises an antibody variable region, which may be the same or different, and which antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a2) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a3) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion independently selected from an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 82, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 83, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 84, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75; and (b) a third antigen-binding portion that binds to human delta-like 3 (DLL3) and comprises an antibody variable region comprising heavy chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 233, heavy chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 234, heavy chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 235, light chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 237, light chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 238, and light chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 239.
[A-3] Each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion has the following characteristics:
(i) binds to human CD3;
(ii) binds to human CD137;
(iii) capable of binding to human CD3 and human CD137, and each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion binds to either human CD3 or human CD137; and (iv) capable of binding to human CD3 and human CD137 but not simultaneously to human CD3 and human CD137.
[A-4] Each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion comprises an antibody variable region, which may be the same or different, and the antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) a heavy chain variable region (VH) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, and a light chain variable region (VL) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a2) VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a3) VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 81, and VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(a4) a VH and VL comprising one or more amino acid substitutions, deletions, additions, and/or insertions in the VH and VL of any one of (a1) to (a3) and having an activity equivalent to that of any of said VH and VL; and (a5) a VH and VL having at least 80%, 85%, 90%, or 95% sequence identity to the amino acid sequence of the VH and VL defined in any one of (a1) to (a3).
More independently selected,
Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations [A-2] to [A-3].
[A-5] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-2] to [A-3], wherein the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each comprise an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73.
[A-6] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-4], wherein the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each comprise an antibody variable region comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58.
[A-7] A third antigen-binding moiety,
Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-2] to [A-6], comprising: (a) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 232 and a VL comprising SEQ ID NO: 236; or (b) an antibody variable region comprising a VH having at least 80%, 85%, 90%, or 95% sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 232 and a VL having at least 80%, 85%, 90%, or 95% sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236.
[A-8] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-2] to [A-7], wherein each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a Fab having a cysteine residue at position 191 (EU numbering), and a disulfide bond is present linking the two cysteine residues.
[A-9] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-2] to [A-8], wherein each of the first, second, and third antigen-binding moieties is a Fab comprising a heavy chain comprising a VH and CH1 domain and a light chain comprising a VL and a light chain constant (CL) domain, and the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding moiety is fused, directly or via a peptide linker, to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety.
[A-10-1] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-9], wherein the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding portion is fused to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding portion or the second antigen-binding portion via a peptide linker, and the peptide linker has an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, and SEQ ID NO: 259.
[A-10-2] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-10-1], wherein the third antigen-binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light chain and the Fab heavy chain are exchanged, and each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a conventional Fab molecule.
[A-11] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-10-2], wherein the amino acids at positions 123 and 124 (Kabat numbering) in the CL domain of each of the first and second antigen-binding portions are arginine and lysine, respectively; and the amino acids at positions 147 and 213 (EU numbering) in the CH1 domain of each of the first and second antigen-binding portions are glutamic acid.
[A-12] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A2] to [A-11], further comprising an Fc domain.
[A-13] The Fc domain comprises a first and a second Fc region subunit;
The first Fc region subunit comprises:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
and a second Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 354, and a tryptophan at position 366, and the second Fc region subunit is selected from the group consisting of:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 349, a serine at position 366, an alanine at position 368, and a valine at position 407;
All positions are according to EU numbering,
[A-12] An antibody or pharmaceutical preparation.
[A-14] The antibody is selected from the group consisting of the following (A) to (C):
(A) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:208, and two polypeptide chains (chains 4 and 5), each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214;
(B) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214; and (C) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
The antibody or pharmaceutical preparation of [A-2], which contains five polypeptide chains in a combination selected from the following:
[A-15] The antibody comprises the following combination:
A polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:208, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
An antibody or pharmaceutical preparation of [A-2], which contains five polypeptide chains.
[A-16] The antibody comprises the following combination:
A polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
An antibody or pharmaceutical preparation of [A-2], which contains five polypeptide chains.
[A-17] The antibody comprises the following combination:
A polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
An antibody or pharmaceutical preparation of [A-2], which contains five polypeptide chains.
[A-18] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-14] to [A-17], in which the five polypeptide chains (chain 1 to chain 5) of the antibody are connected and/or bound to each other as shown in Figure 1 (a).
[A-19] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-14] to [A-17], in which each of polypeptide chain 2 and chain 5 is bound to polypeptide chain 1; polypeptide chain 4 is bound to polypeptide chain 3; and polypeptide chain 1 is bound to polypeptide chain 3.
[A-20] An antibody or pharmaceutical preparation of any one of [A-2] to [A-17] for use in combination with an additional therapeutic agent, preferably a chemotherapeutic agent or an immune checkpoint inhibitor.
[A-21] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-20] for use in combination with an immune checkpoint inhibitor which is a PD-1 axis binding antagonist, preferably an anti-PD-1 antibody or an anti-PD-L1 antibody, more preferably atezolizumab.
[A-22] An antibody or pharmaceutical preparation of [A-20] for use in combination with a chemotherapeutic agent selected from the group consisting of microtubule disrupting agents, antimetabolites, topoisomerase inhibitors, DNA intercalating agents, alkylating agents, hormonal therapy, kinase inhibitors, receptor antagonists, activators of tumor cell apoptosis, antiangiogenic agents, etoposide, irinotecan, lurbinectedin, amrubicin, and platinum agents (such as cisplatin and carboplatin).
[A-23] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-20] to [A-22], wherein an immune checkpoint inhibitor or a chemotherapeutic agent is administered simultaneously with the antibody or pharmaceutical preparation.
[A-24] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-20] to [A-23], wherein an immune checkpoint inhibitor or a chemotherapeutic agent is administered before or after administration of the antibody or pharmaceutical preparation.
[A-25] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-2] to [A-24] for use in treating cancer, wherein the cancer is a DLL3-expressing cancer or a DLL3-positive cancer.
[A-26] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-25], wherein the cancer is selected from the group consisting of neuroendocrine neoplasms (NENs), neuroendocrine tumors (NETs), neuroendocrine carcinomas (NECs), and other solid tumors of non-neuroendocrine origin.
[A-27] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-25], wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumor (PNET), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma.
[A-28] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-25], wherein the cancer is lung cancer, preferably SCLC.
[A-29] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-25], wherein the cancer is glioma or glioblastoma (GBM).
[A-30] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-25], wherein the cancer is neuroendocrine prostate cancer.
[A-31] An antibody or pharmaceutical preparation of [A-25], wherein the cancer is neuroblastoma.
[A-32] Any one of the antibodies or pharmaceutical preparations of [A-2] to [A-31], wherein the antibody is a multispecific antibody.
[A-33] The antibody or pharmaceutical preparation for use according to [A-21], further combined with a chemotherapeutic agent selected from the group consisting of microtubule disrupting agents, antimetabolites, topoisomerase inhibitors, DNA intercalating agents, alkylating agents, hormonal therapy, kinase inhibitors, receptor antagonists, activators of tumor cell apoptosis, antiangiogenic agents, etoposide, irinotecan, lurbinectedin, amrubicin, and platinum agents (such as cisplatin and carboplatin).
[A-34] The antibody or pharmaceutical preparation of [A-22], wherein the immune checkpoint inhibitor is further combined with an immune checkpoint inhibitor that is a PD-1 axis binding antagonist, preferably an anti-PD-1 antibody or an anti-PD-L1 antibody, more preferably atezolizumab.
[B-1]
(a) a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety, each of which comprises an antibody variable region, which may be the same or different, and which antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a2) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a3) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion independently selected from an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 82, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 83, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 84, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75; and (b) a third antigen-binding portion that binds human delta-like 3 (DLL3) and comprises an antibody variable region comprising heavy chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 233, heavy chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 234, heavy chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 235, light chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 237, light chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 238, and light chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 239.
[B-2] Each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion has the following properties:
(i) binds to human CD3;
(ii) binds to human CD137;
(iii) a multispecific antibody of [B-1] that is capable of binding to both human CD3 and human CD137, and each of the first and second antigen-binding portions binds to either human CD3 or human CD137; and (iv) a multispecific antibody of [B-1] that is capable of binding to both human CD3 and human CD137, but does not bind to both human CD3 and human CD137 simultaneously.
[B-3] Each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion comprises an antibody variable region, which may be the same or different, and the antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) a heavy chain variable region (VH) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, and a light chain variable region (VL) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a2) VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a3) VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 81, and VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(a4) a VH and a VL comprising one or more amino acid substitutions, deletions, additions, and/or insertions in the VH and VL of any one of (a1) to (a3) and having an activity equivalent to that of any of said VH and VL; and (a5) a VH and a VL having at least 80%, 85%, 90%, or 95% sequence identity to the amino acid sequence of the VH and VL defined in any one of (a1) to (a3).
More independently selected,
Any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-2].
[B-4] Any one of the multispecific antibodies of [B-1] to [B-2], wherein the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each comprise an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73.
[B-5] The multispecific antibody of [B-3], wherein the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each comprise an antibody variable region comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58.
[B-6] A third antigen-binding moiety,
Any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-5], comprising: (a) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 232 and a VL comprising SEQ ID NO: 236; or (b) an antibody variable region comprising a VH having at least 80%, 85%, 90%, or 95% sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 232 and a VL having at least 80%, 85%, 90%, or 95% sequence identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236.
[B-7] Any one of the multispecific antibodies of [B-1] to [B-6], in which each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a Fab having a cysteine residue at position 191 (EU numbering), and a disulfide bond is present linking the two cysteine residues.
[B-8] Any one of the multispecific antibodies of [B-1] to [B-7], wherein each of the first, second, and third antigen-binding moieties is a Fab comprising a heavy chain comprising a VH and CH1 domain and a light chain comprising a VL and a light chain constant (CL) domain, and the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding moiety is fused, directly or via a peptide linker, to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety.
[B-9-1] A multispecific antibody according to [B-8], in which the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding portion is fused to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding portion or the second antigen-binding portion via a peptide linker, and the peptide linker has an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, and SEQ ID NO: 259.
[B-9-2] The multispecific antibody of [B-9-1], in which the third antigen-binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light chain and the Fab heavy chain are exchanged, and each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a conventional Fab molecule.
[B-10] The multispecific antibody of [B-9-2], in which the amino acids at positions 123 and 124 (Kabat numbering) in the CL domain of each of the first and second antigen-binding portions are arginine and lysine, respectively; and the amino acids at positions 147 and 213 (EU numbering) in the CH1 domain of each of the first and second antigen-binding portions are glutamic acid.
[B-11] Any one of the multispecific antibodies of [B-1] to [B-10], further comprising an Fc domain.
[B-12] The Fc domain comprises a first and a second Fc region subunit, and the first Fc region subunit is:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
and a second Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 354, and a tryptophan at position 366, and the second Fc region subunit is selected from the group consisting of:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 349, a serine at position 366, an alanine at position 368, and a valine at position 407;
All positions are according to EU numbering,
[B-11] Multispecific antibody.
[B-13] The antibody is selected from the group consisting of the following (A) to (C):
(A) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:208, and two polypeptide chains (chains 4 and 5), each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214;
(B) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214; and (C) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
A multispecific antibody [B-1] comprising five polypeptide chains in a combination selected from the following:
[B-14] The antibody comprises the following combination:
A polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:208, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
A multispecific antibody [B-1] containing five polypeptide chains.
[B-15] The antibody comprises the following combination:
A polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
A multispecific antibody [B-1] containing five polypeptide chains.
[B-16] The antibody comprises the following combination:
A polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
A multispecific antibody [B-1] containing five polypeptide chains.
[B-17] A multispecific antibody selected from any one of [B-13] to [B-16], in which the five polypeptide chains (chain 1 to chain 5) of the antibody are connected and/or bound to each other as shown in Figure 1 (a).
[B-18] Any one of the multispecific antibodies [B-13] to [B-16], in which each of polypeptide chain 2 and chain 5 is bound to polypeptide chain 1; polypeptide chain 4 is bound to polypeptide chain 3; and polypeptide chain 1 is bound to polypeptide chain 3.
[B-19] A multispecific antibody comprising any one of [B-1] to [B-18] for use as a pharmaceutical.
[B-20] A multispecific antibody comprising any one of [B-1] to [B-18] for use in the treatment of cancer.
[C-1] A pharmaceutical formulation comprising any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] and a pharma- ceutical acceptable carrier.
[C-2] A pharmaceutical formulation comprising an immune checkpoint inhibitor and a pharma- ceutical acceptable carrier for use in combination with any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] for the treatment of cancer.
[C-3] A pharmaceutical formulation comprising a chemotherapeutic agent and a pharma- ceutical acceptable carrier for use in combination with any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] for the treatment of cancer.
[C-4] The pharmaceutical formulation of [C-2], wherein the immune checkpoint inhibitor is a PD-1 axis binding antagonist, preferably an anti-PD-1 antibody or an anti-PD-L1 antibody, more preferably atezolizumab.
[C-5] The pharmaceutical formulation of [C-3], wherein the chemotherapeutic agent is selected from the group consisting of microtubule disrupting agents, antimetabolites, topoisomerase inhibitors, DNA intercalating agents, alkylating agents, hormone therapy, kinase inhibitors, receptor antagonists, activators of tumor cell apoptosis, antiangiogenic agents, etoposide, irinotecan, lurbinectedin, amrubicin, and platinum agents (such as cisplatin and carboplatin).
[C-6] Any one of the pharmaceutical formulations of [C-2] to [C-5], in which an immune checkpoint inhibitor or a chemotherapeutic agent is administered simultaneously with the multispecific antibody.
[C-7] Any one of the pharmaceutical formulations of [C-2] to [C-5], wherein an immune checkpoint inhibitor or a chemotherapeutic agent is administered before or after administration of the multispecific antibody.
[D-1] Use of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7] in the treatment of cancer.
[E-1] A method for treating an individual having cancer, comprising administering to the individual an effective amount of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7].
[E-2] A method for activating or enhancing a sustained immune response against cancer, comprising administering to a subject a therapeutically effective amount of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7].
[E-3] A method for increasing the efficacy of an immune checkpoint inhibitor, comprising administering to a subject a therapeutically effective amount of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7] in combination with the immune checkpoint inhibitor.
[E-4] A method for reducing or preventing metastasis in a subject, comprising administering to the subject a therapeutically effective amount of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7].
[E-5] A method for suppressing tumor growth in a subject, comprising administering to the subject a therapeutically effective amount of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7].
[E-6] Any one of the methods of [E-1] to [E-5], further comprising the step of administering to the subject an additional therapeutic agent, preferably a chemotherapeutic agent or an immune checkpoint inhibitor.
[E-7] The method of [E-6], wherein the immune checkpoint inhibitor is a PD-1 axis binding antagonist, preferably an anti-PD-1 antibody or an anti-PD-L1 antibody, more preferably atezolizumab.
[E-8] The method of [E-6], wherein the chemotherapeutic agent is selected from the group consisting of microtubule disrupting agents, antimetabolites, topoisomerase inhibitors, DNA intercalating agents, alkylating agents, hormone therapy, kinase inhibitors, receptor antagonists, activators of tumor cell apoptosis, antiangiogenic agents, etoposide, irinotecan, lurbinectedin, amrubicin, and platinum agents (such as cisplatin and carboplatin).
[E-9] Any one of the methods of [E-6] to [E-8], wherein an additional therapeutic agent, immune checkpoint inhibitor, or chemotherapeutic agent is administered simultaneously with the multispecific antibody or pharmaceutical formulation.
[E-10] Any one of the methods of [E-6] to [E-8], wherein an additional therapeutic agent, immune checkpoint inhibitor, or chemotherapeutic agent is administered before or after administration of the multispecific antibody or pharmaceutical formulation.
[F-1] Use of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-3] in the manufacture of a medicine for the treatment of cancer.
[F-2] Use of any one of the multispecific antibodies [B-1] to [B-18] or any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-3] in combination with an additional therapeutic agent (preferably a chemotherapeutic agent or an immune checkpoint inhibitor) in the manufacture of a medicament for the treatment of cancer.
[F-3] Use of [F-2], wherein the immune checkpoint inhibitor is a PD-1 axis binding antagonist, preferably an anti-PD-1 antibody or an anti-PD-L1 antibody, more preferably atezolizumab.
[F-4] Use of [F-2], wherein the chemotherapeutic agent is selected from the group consisting of microtubule disrupting agents, antimetabolites, topoisomerase inhibitors, DNA intercalating agents, alkylating agents, hormonal therapy, kinase inhibitors, receptor antagonists, activators of tumor cell apoptosis, antiangiogenic agents, etoposide, irinotecan, lurbinectedin, amrubicin, and platinum agents (such as cisplatin and carboplatin).
[G-1] Any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses [D-1] to [F-4], wherein the cancer is a DLL3-expressing cancer or a DLL3-positive cancer.
[G-2] Any one of the pharmaceutical preparations of [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses of [D-1] to [F-4], wherein the cancer is selected from the group consisting of neuroendocrine neoplasms (NEN), neuroendocrine tumors (NET), neuroendocrine carcinomas (NEC), or other solid tumors of non-neuroendocrine origin.
[G-3] Any one of the pharmaceutical preparations of [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses of [D-1] to [F-4], wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumor (PNET), small cell neoplasm (SCNEC), large cell neoplasm (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine cancer, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma.
[G-4] Any one of the pharmaceutical preparations of [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses of [D-1] to [F-4], wherein the cancer is lung cancer, preferably SCLC.
[G-5] Any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses [D-1] to [F-4], wherein the cancer is glioma or glioblastoma (GBM).
[G-6] Any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses [D-1] to [F-4], wherein the cancer is neuroendocrine prostate cancer.
[G-7] Any one of the pharmaceutical preparations [C-1] to [C-7], or any one of the methods or uses [D-1] to [F-4], wherein the cancer is neuroblastoma.

別の局面において、本開示は以下を提供する:
[1] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分であって、それぞれが、以下の特性:
(i)ヒトCD3に結合する;
(ii)ヒトCD137に結合する;
(iii)ヒトCD3およびヒトCD137に結合でき、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、ヒトCD3およびヒトCD137のいずれか一方に結合する;および
(iv)ヒトCD3およびヒトCD137に結合できが、ヒトCD3およびヒトCD137に同時には結合しない
のうち1つ、2つまたはそれ以上を有する、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分;ならびに
第3の抗原、好ましくはがん細胞/組織上に発現している抗原、より好ましくはDLL3、さらにより好ましくはヒトDLL3に結合できる第3の抗原結合部分
を含む、多重特異性抗原結合分子。
[2] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、以下の(a1)~(a17)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:17の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:31の重鎖CDR 2、配列番号:45の重鎖CDR 3、配列番号:64の軽鎖CDR 1、配列番号:69の軽鎖CDR 2、および配列番号:74の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a2)配列番号:18の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:32の重鎖CDR 2、配列番号:46の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a3)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a4)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a5)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a6)配列番号:22の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:36の重鎖CDR 2、配列番号:50の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a7)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a8)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a9)配列番号:24の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:38の重鎖CDR 2、配列番号:52の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a10)配列番号:25の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:39の重鎖CDR 2、配列番号:53の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a11)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a12)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a13)配列番号:27の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:41の重鎖CDR 2、配列番号:55の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a14)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a15)配列番号:82の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:83の重鎖CDR 2、配列番号:84の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a16)(a1)~(a15)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a17)(a1)~(a15)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、[1]の多重特異性抗原結合分子。
[3] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、以下の(a1)~(a18)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:3を含むVHおよび配列番号:59を含むVLを含む抗体可変領域;
(a2)配列番号:4を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a3)配列番号:5を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a4)配列番号:5を含むVHおよび配列番号:60を含むVLを含む抗体可変領域;
(a5)配列番号:6を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a6)配列番号:8を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a7)配列番号:9を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a8)配列番号:9を含むVHおよび配列番号:61を含むVLを含む抗体可変領域;
(a9)配列番号:10を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a10)配列番号:11を含むVHおよび配列番号:61を含むVLを含む抗体可変領域;
(a11)配列番号:12を含むVHおよび配列番号:61を含むVLを含む抗体可変領域;
(a12)配列番号:12を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a13)配列番号:13を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;
(a14)配列番号:14を含むVHおよび配列番号:58を含むVLを含む抗体可変領域;および
(a15)配列番号:81を含むVHおよび配列番号:60を含むVLを含む抗体可変領域;
(a16)配列番号:3~6、8~14および81からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むVH、および/または配列番号:58~61からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むVLを含む、抗体可変領域;
(a17)(a1)~(a15)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a18)(a1)~(a15)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、[1]~[2] のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[4] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、Fab分子であり、かつ第1の抗原結合部分のCH1領域と第2の抗原結合部分のCH1領域との間で形成される少なくとも1つのジスルフィド結合を含む、[1]~[3]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[4A] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、Fab分子であり、かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分の各々のCH1領域におけるEUナンバリングによる191位にあるアミノ酸残基間で形成される1つのジスルフィド結合を含む、[4]の多重特異性抗原結合分子。
[5] 第3の抗原結合部分が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方に融合されている、[1]~[4A]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[5A] 第3の抗原結合部分がFabまたはscFvである、[5]の多重特異性抗原結合分子。
[6] 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれがFab分子であり、第3の抗原結合部分が、Fab重鎖のC末端(CH1)で、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のFab重鎖のN末端に、任意でペプチドリンカーを介して融合されている、[5]~[5A]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[6A] 前記ペプチドリンカーが、配列番号:248、配列番号:249、または配列番号:259のアミノ酸配列からなる群より選択される[5]~[6]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[6B] 第1の抗原結合部分が第2の抗原結合部分と同一である、[1]~[6A]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[7] 第3の抗原結合部分が、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子であり、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれが従来型のFab分子である、[1]~[6B]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[8] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、123位および/または124位にあるアミノ酸が独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、およびヒスチジン(H)で置換され(Kabatによるナンバリング)、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの重鎖の定常ドメインCH1において、147位および/または213位にあるアミノ酸が独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(Kabat EUインデックスによるナンバリング)、[7]の多重特異性抗原結合分子。
[9] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、123位および124位にあるアミノ酸がそれぞれ、アルギニン(R)およびリジン(K)であり(Kabatによるナンバリング)、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの重鎖の定常ドメインCH1において、147位および213位にあるアミノ酸が、グルタミン酸(E)である(Kabat EUインデックスによるナンバリング)[8]の多重特異性抗原結合分子。
[10] DLL3に結合できる第3の抗原結合部分が、以下の(a1)~(a5)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:233の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:234の重鎖CDR 2、配列番号:235の重鎖CDR 3、配列番号:237の軽鎖CDR 1、配列番号:238の軽鎖CDR 2、および配列番号:239の軽鎖CDR 3;
(a2)配列番号:276の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:277の重鎖CDR 2、配列番号:278の重鎖CDR 3、配列番号:279の軽鎖CDR 1、配列番号:280の軽鎖CDR 2、および配列番号:281の軽鎖CDR 3;
(a3)配列番号:285の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:286の重鎖CDR 2、配列番号:287の重鎖CDR 3、配列番号:288の軽鎖CDR 1、配列番号:289の軽鎖CDR 2、および配列番号:290の軽鎖CDR 3;
(a4)(a1)~(a3)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a5)(a1)~(a3)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、[1]~[9]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[11] DLL3に結合できる第3の抗原結合部分が、以下の(a1)~(a6)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:232のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:236のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a2)配列番号:264のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:265のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a3)配列番号:266のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:267のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a4)配列番号:268のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:269のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a5)(a1)~(a4)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a6)(a1)~(a4)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、[1]~[10]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12] Fcドメインをさらに含む、[1]~[11]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12A] Fcドメインが、安定な会合が可能な第1のおよび第2のFc領域サブユニットで構成され、かつFcドメインが、天然型ヒトIgG1 Fcドメインと比較して、ヒトFcγ受容体に対して低下した結合アフィニティを示す、[12] の多重特異性抗原結合分子。
[12B] 第1のFc領域サブユニットが、以下:
(a1)234位にAlaおよび 235位にAlaを含むFc領域ポリペプチド;
(a2)234位にAla、235位にAla、および 297位にAlaを含むFc領域ポリペプチド;
(a3)234位にAla、235位にAla、297位にAla、354位にCys、および 366位にTrpを含むFc領域ポリペプチド
からなる群より選択され、かつ
第2のFc領域ポリペプチドが、以下:
(a4)234位にAlaおよび 235位にAlaを含むFc領域ポリペプチド;
(a5)234位にAla、235位にAla、および 297位にAlaを含むFc領域ポリペプチド;
(a6)234位にAla、235位にAla、297位にAla、349位にCys、366位にSer、368位にAla、および 407位にValを含むFc領域ポリペプチド
からなる群より選択され、
アミノ酸位置がEUインデックスナンバリングを用いてナンバリングされる、[12A]の多重特異性抗原結合分子。
[12C] Fcドメインが、天然型 IgGのFc領域のものと比較して酸性pH条件(例えば、pH 5.8)下で増強されたFcRn結合活性を示す、[12] ~ [12B]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12D] Fcドメインが、EUナンバリングによる、434位にAla;438位にGlu、Arg、Ser、またはLys;および440位にGlu、Asp、またはGlnを含む、[12C]の多重特異性抗原結合分子。
[12E] Fcドメインが、EUナンバリングによる、434位にAla;438位にArgまたはLys;および440位にGluまたはAspを含む、[12D]の多重特異性抗原結合分子。
[12F] Fcドメインが、EUナンバリングによる、428位にIleもしくはLeu;および/または 436位にIle、Leu、Val、Thr、もしくはPheをさらに含む、[12E]の多重特異性抗原結合分子。
[12G] Fcドメインが、EUナンバリングによる、以下:
(a)N434A/Q438R/S440E;
(b)N434A/Q438R/S440D;
(c)N434A/Q438K/S440E;
(d)N434A/Q438K/S440D;
(e)N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(f)N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(g)N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(h)N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(i)N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(j)N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(k)N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(l)N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(m)N434A/R435H/F436T/Q438R/S440E;
(n)N434A/R435H/F436T/Q438R/S440D;
(o)N434A/R435H/F436T/Q438K/S440E;
(p)N434A/R435H/F436T/Q438K/S440D;
(q)N434A/R435H/F436V/Q438R/S440E;
(r)N434A/R435H/F436V/Q438R/S440D;
(s)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440E;
(t)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440D;
(u)M428L/N434A/Q438R/S440E;
(v)M428L/N434A/Q438R/S440D;
(w)M428L/N434A/Q438K/S440E;
(x)M428L/N434A/Q438K/S440D;
(y)M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(z)M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(aa)M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(ab)M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(ac)M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(ad)M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(ae)M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(af)M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(ag)L235R/G236R/S239K/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E;および
(ah)L235R/G236R/A327G/A330S/P331S/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E
からなる群より選択されるアミノ酸置換の組み合わせを含む、[12C] ~ [12F]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12H] Fcドメインが、M428L/N434A/Q438R/S440Eのアミノ酸置換の組み合わせを含む、[12C] ~ [12G]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12I] Fcドメインが、IgG Fcドメイン、好ましくはヒトIgG Fcドメイン、より好ましくはヒトIgG1 Fcドメインである、[12] ~ [12H]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12J] Fcドメインが、以下:
(a)配列番号:100に示されるアミノ酸配列を含む第1のFcサブユニットおよび配列番号:111に示されるアミノ酸配列を含む第2のFcサブユニット;ならびに
(b)配列番号:99に示されるアミノ酸配列を含む第1のFcサブユニットおよび配列番号:109に示されるアミノ酸配列を含む第2のFcサブユニット
のいずれか1つを含む、[12] ~ [12I]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12K] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれがFabであり、第1の抗原結合部分が、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1のまたは第2のサブユニットのN末端に融合され、かつ第2の抗原結合部分が、Fab重鎖のC末端でFcドメインの残りのサブユニットのN末端に融合されている、[12] ~ [12J]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[12L] 第3の抗原結合部分が、C末端で第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のFab重鎖のN末端に、任意でペプチドリンカーを介して融合されている、[12K]の多重特異性抗原結合分子。
[13] 以下の(a1)~(a15)から選択されるいずれか1つの組み合わせ:
(a1)配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a2)配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a3)配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a4)配列番号:205のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a5)配列番号:216のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:229のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a6)配列番号:217のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:210のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a7)配列番号:219のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:211のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a8)配列番号:220のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:211のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a9)配列番号:221のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:211のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a10)配列番号:222のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:230のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a11)配列番号:223のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:212のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a12)配列番号:225のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:213のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a13)配列番号:226のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:213のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a14)配列番号:227のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:213のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);ならびに
(a15)配列番号:228のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:231のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5)
における5本のポリペプチド鎖を含み、
好ましくは、5本のポリペプチド鎖(鎖1~鎖5)が、図1(a)に示す向きに従って互いに接続および/または関連している(より具体的には、ポリペプチド鎖2および鎖5のそれぞれが、ポリペプチド鎖1と結合し;ポリペプチド鎖4がポリペプチド鎖3と結合し;かつポリペプチド鎖1がポリペプチド鎖3と結合する)、
多重特異性抗原結合分子。
[14] [1]~[13]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子をコードする、単離されたポリヌクレオチドまたは複数のポリヌクレオチド。
[15] [14]のポリヌクレオチドまたは複数のポリヌクレオチドをコードするベクター。
[16] [14]のポリヌクレオチドもしくは複数のポリヌクレオチド、または[15]のベクターを含む、宿主細胞。
[17] a)抗原結合分子の発現に適した条件下で[16]の宿主細胞を培養する段階、およびb)抗原結合分子を回収する段階を含む、[1]~[13]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子を製造する方法。
[17A] [17]の方法により製造された、多重特異性抗原結合分子。
[18] [1]~[13]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子と薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
[19] 細胞傷害活性、好ましくはT細胞依存性細胞傷害活性を誘導する、[1]~[13]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子または[18]の医薬組成物。
[20] 医薬として使用するための[1]~[13]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子または[18]の医薬組成物。
[21] それを必要とする対象における疾患の治療または予防において使用するための、[1]~[13]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子または[18]の医薬組成物。
[22]疾患ががんである、[21]の疾患の治療/予防において使用するための多重特異性抗原結合分子または医薬組成物。
[22A] がんが、DLL3発現がんまたはDLL3陽性がん、好ましくは神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌がん(NEC)、または非神経内分泌起源の他の固形腫瘍である、[22] の疾患の治療/予防において使用するための多重特異性抗原結合分子または医薬組成物。
[22B] がんが、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんからなる群より選択される、[22]または[22A] の疾患の治療/予防において使用するための多重特異性抗原結合分子または医薬組成物。
[23] その必要がある個体における疾患の治療または予防のための医薬の製造のための、[1]~[13] のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子または[18] の医薬組成物の使用。
[24] [1]~[13] のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子または[18]の医薬組成物を含む組成物の治療的有効量を前記個体に投与する段階を含む、個体において疾患を治療する方法。
[25]前記疾患が、がん、好ましくはDLL3陽性がんまたはDLL3発現がんである、[23]の使用または[24]の方法。
[25A] がんが、DLL3発現がんまたはDLL3陽性がん、好ましくは神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌がん(NEC)、または非神経内分泌起源の他の固形腫瘍である、[25]の使用または方法。
[25B] がんが、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんからなる群より選択される、[25A] の使用または方法。
[26] T細胞の存在下で、標的細胞を、[1]~[13] のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子または[18]の医薬組成物と接触させる段階を含む、標的細胞の溶解を誘導するための方法。
[27] [18] の組成物と;がん、好ましくは DLL3陽性がんまたはDLL3発現がん、好ましくは神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌がん(NEC)、または非神経内分泌起源の他の固形腫瘍を治療するまたはその進行を遅らせるために対象に投与するための指示書を含む添付文書とを含む、キット。
[27A] がんが、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんからなる群より選択される、[27]のキット。
In another aspect, the present disclosure provides:
[1] A first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion, each of which has the following properties:
(i) binds to human CD3;
(ii) binds to human CD137;
(iii) a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety capable of binding to either human CD3 or human CD137, each of which binds to either human CD3 or human CD137; and (iv) a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety capable of binding to either human CD3 or human CD137, but not simultaneously to human CD3 and human CD137; and a third antigen-binding moiety capable of binding to a third antigen, preferably an antigen expressed on a cancer cell/tissue, more preferably DLL3, even more preferably human DLL3.
[2] The first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each are any one of the following (a1) to (a17):
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 17, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 31, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 45, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 64, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 69, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 74;
(a2) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 18, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 32, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 46, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a3) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a4) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a5) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a6) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 22, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 36, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 50, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a7) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a8) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a9) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 24, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 38, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 52, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a10) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 25, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 39, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 53, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a11) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a12) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a13) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 27, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 41, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 55, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a14) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a15) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 82, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 83, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 84, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a16) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a15); and (a17) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a15). The multispecific antigen-binding molecule of [1].
[3] The first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each are any one of the following (a1) to (a18):
(a1) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 3 and a VL comprising SEQ ID NO: 59;
(a2) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 4 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a3) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 5 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a4) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 5 and a VL comprising SEQ ID NO: 60;
(a5) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 6 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a6) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 8 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a7) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 9 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a8) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 9 and a VL comprising SEQ ID NO: 61;
(a9) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 10 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a10) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 11 and a VL comprising SEQ ID NO: 61;
(a11) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 12 and a VL comprising SEQ ID NO: 61;
(a12) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 12 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a13) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 13 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a14) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 14 and a VL comprising SEQ ID NO: 58; and (a15) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 81 and a VL comprising SEQ ID NO: 60;
(a16) an antibody variable region comprising a VH comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3 to 6, 8 to 14, and 81, and/or a VL comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 58 to 61;
(a17) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a15); and (a18) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a15). Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [2].
[4] The multispecific antigen-binding molecule of any one of [1] to [3], wherein each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a Fab molecule and comprises at least one disulfide bond formed between the CH1 region of the first antigen-binding portion and the CH1 region of the second antigen-binding portion.
[4A] The multispecific antigen-binding molecule of [4], wherein each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a Fab molecule and comprises one disulfide bond formed between the amino acid residue at position 191 according to EU numbering in the CH1 region of each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion.
[5] The multispecific antigen-binding molecule of any one of [1] to [4A], wherein a third antigen-binding portion is fused to either the first antigen-binding portion or the second antigen-binding portion.
[5A] The multispecific antigen-binding molecule of [5], wherein the third antigen-binding portion is a Fab or scFv.
[6] Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [5] to [5A], wherein each of the first, second, and third antigen-binding moieties is a Fab molecule, and the third antigen-binding moiety is fused at the C-terminus (CH1) of the Fab heavy chain to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety, optionally via a peptide linker.
[6A] The multispecific antigen-binding molecule of any one of [5] to [6], wherein the peptide linker is selected from the group consisting of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, or SEQ ID NO: 259.
[6B] The multispecific antigen-binding molecule of any one of [1] to [6A], wherein the first antigen-binding portion is identical to the second antigen-binding portion.
[7] The multispecific antigen-binding molecule of any one of [1] to [6B], wherein the third antigen-binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light chain and the Fab heavy chain are exchanged, and each of the first and second antigen-binding portions is a conventional Fab molecule.
[8] A multispecific antigen-binding molecule according to [7], wherein in the constant domain CL of the light chain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 123 and/or 124 are independently substituted with lysine (K), arginine (R), or histidine (H) (numbering according to Kabat), and in the constant domain CH1 of the heavy chain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 147 and/or 213 are independently substituted with glutamic acid (E) or aspartic acid (D) (numbering according to Kabat EU index).
[9] A multispecific antigen-binding molecule comprising the first and second antigen-binding moieties, each of which has a light-chain constant domain CL in which the amino acids at positions 123 and 124 are arginine (R) and lysine (K), respectively (Kabat numbering), and the first and second antigen-binding moieties, each of which has a heavy-chain constant domain CH1 in which the amino acids at positions 147 and 213 are glutamic acid (E), respectively (Kabat EU index numbering).[8]
[10] The third antigen-binding moiety capable of binding to DLL3 is any one of the following (a1) to (a5):
(a1) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 233, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 234, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 235, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 237, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 238, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 239;
(a2) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 276, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 277, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 278, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 279, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 280, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 281;
(a3) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 285, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 286, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 287, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 288, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 289, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 290;
(a4) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a3); and (a5) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a3). Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [9].
[11] The third antigen-binding moiety capable of binding to DLL3 is any one of the following (a1) to (a6):
(a1) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 232, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236;
(a2) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 264, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 265;
(a3) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 266, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 267;
(a4) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 268, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 269;
(a5) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a4); and (a6) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a4). Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [10].
[12] Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [11], further comprising an Fc domain.
[12A] A multispecific antigen-binding molecule according to [12], wherein the Fc domain is composed of a first and a second Fc region subunit capable of stable association, and the Fc domain exhibits reduced binding affinity for human Fcγ receptors compared to a native human IgG1 Fc domain.
[12B] The first Fc domain subunit comprises:
(a1) an Fc region polypeptide comprising Ala at position 234 and Ala at position 235;
(a2) an Fc region polypeptide comprising Ala at position 234, Ala at position 235, and Ala at position 297;
(a3) an Fc region polypeptide comprising Ala at position 234, Ala at position 235, Ala at position 297, Cys at position 354, and Trp at position 366; and wherein the second Fc region polypeptide is selected from the group consisting of:
(a4) an Fc region polypeptide comprising Ala at position 234 and Ala at position 235;
(a5) an Fc region polypeptide comprising Ala at position 234, Ala at position 235, and Ala at position 297;
(a6) an Fc region polypeptide comprising Ala at position 234, Ala at position 235, Ala at position 297, Cys at position 349, Ser at position 366, Ala at position 368, and Val at position 407;
A multispecific antigen-binding molecule of [12A], in which amino acid positions are numbered using EU index numbering.
[12C] Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [12] to [12B], wherein the Fc domain exhibits enhanced FcRn-binding activity under acidic pH conditions (e.g., pH 5.8) compared to that of the Fc region of native IgG.
[12D] The multispecific antigen-binding molecule of [12C], wherein the Fc domain comprises Ala at position 434; Glu, Arg, Ser, or Lys at position 438; and Glu, Asp, or Gln at position 440, according to EU numbering.
[12E] The multispecific antigen-binding molecule of [12D], wherein the Fc domain comprises, according to EU numbering, Ala at position 434; Arg or Lys at position 438; and Glu or Asp at position 440.
[12F] The multispecific antigen-binding molecule of [12E], wherein the Fc domain further comprises Ile or Leu at position 428; and/or Ile, Leu, Val, Thr, or Phe at position 436, according to EU numbering.
[12G] The Fc domain is:
(a) N434A/Q438R/S440E;
(b) N434A/Q438R/S440D;
(c) N434A/Q438K/S440E;
(d) N434A/Q438K/S440D;
(e) N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(f) N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(g) N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(h) N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(i) N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(j) N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(k) N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(l) N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(m) N434A/R435H/F436T/Q438R/S440E;
(n) N434A/R435H/F436T/Q438R/S440D;
(o) N434A/R435H/F436T/Q438K/S440E;
(p) N434A/R435H/F436T/Q438K/S440D;
(q) N434A/R435H/F436V/Q438R/S440E;
(r)N434A/R435H/F436V/Q438R/S440D;
(s)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440E;
(t)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440D;
(u)M428L/N434A/Q438R/S440E;
(v) M428L/N434A/Q438R/S440D;
(w) M428L/N434A/Q438K/S440E;
(x)M428L/N434A/Q438K/S440D;
(y) M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(z) M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(aa) M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(ab) M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(ac) M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(ad) M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(ae) M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(af) M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(ag) L235R/G236R/S239K/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E; and (ah) L235R/G236R/A327G/A330S/P331S/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E
The multispecific antigen-binding molecule of any one of [12C] to [12F], comprising a combination of amino acid substitutions selected from the group consisting of:
[12H] Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [12C] to [12G], wherein the Fc domain contains a combination of amino acid substitutions of M428L/N434A/Q438R/S440E.
[12I] The multispecific antigen-binding molecule of any one of [12] to [12H], wherein the Fc domain is an IgG Fc domain, preferably a human IgG Fc domain, more preferably a human IgG1 Fc domain.
[12J] The Fc domain:
Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [12] to [12I], comprising: (a) a first Fc subunit having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 100 and a second Fc subunit having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 111; and (b) a first Fc subunit having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 99 and a second Fc subunit having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 109.
[12K] A multispecific antigen-binding molecule of any one of [12] to [12J], wherein each of the first and second antigen-binding moieties is a Fab, the first antigen-binding moiety is fused at the C-terminus of the Fab heavy chain to the N-terminus of the first or second subunit of the Fc domain, and the second antigen-binding moiety is fused at the C-terminus of the Fab heavy chain to the N-terminus of the remaining subunit of the Fc domain.
[12L] The multispecific antigen-binding molecule of [12K], in which a third antigen-binding portion is fused at the C-terminus to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding portion or the second antigen-binding portion, optionally via a peptide linker.
[13] Any combination selected from (a1) to (a15) below:
(a1) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 208, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5), each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a2) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 209, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a3) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 209, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a4) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 209, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a5) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 216, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 229, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a6) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 217, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 210, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a7) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 219, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a8) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a9) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 221, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a10) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 222, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 230, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a11) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 223, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 212, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215;
(a12) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215;
(a13) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 226, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215;
(a14) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 227, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215; and (a15) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 228, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 231, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215.
and
Preferably, five polypeptide chains (chain 1 to chain 5) are connected and/or associated with each other according to the orientation shown in FIG. 1(a) (more specifically, each of polypeptide chain 2 and chain 5 is associated with polypeptide chain 1; polypeptide chain 4 is associated with polypeptide chain 3; and polypeptide chain 1 is associated with polypeptide chain 3),
Multispecific antigen binding molecules.
[14] An isolated polynucleotide or multiple polynucleotides encoding any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [13].
[15] A vector encoding the polynucleotide or polynucleotides of [14].
[16] A host cell comprising the polynucleotide or polynucleotides of [14], or the vector of [15].
[17] A method for producing any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [13], comprising the steps of: a) culturing the host cell of [16] under conditions suitable for expression of the antigen-binding molecule; and b) recovering the antigen-binding molecule.
[17A] A multispecific antigen-binding molecule produced by the method of [17].
[18] A pharmaceutical composition comprising any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [13] and a pharma- ceutical acceptable carrier.
[19] A multispecific antigen-binding molecule according to any one of [1] to [13] or the pharmaceutical composition of [18], which induces cytotoxic activity, preferably T cell-dependent cytotoxic activity.
[20] A multispecific antigen-binding molecule according to any one of [1] to [13] or a pharmaceutical composition according to [18] for use as a medicament.
[21] A multispecific antigen-binding molecule of any one of [1] to [13] or a pharmaceutical composition of [18] for use in treating or preventing a disease in a subject in need thereof.
[22] The multispecific antigen-binding molecule or pharmaceutical composition for use in the treatment/prevention of the disease of [21], wherein the disease is cancer.
[22A] A multispecific antigen-binding molecule or pharmaceutical composition for use in the treatment/prevention of a disease in accordance with [22], wherein the cancer is a DLL3-expressing or DLL3-positive cancer, preferably a neuroendocrine neoplasm (NEN), neuroendocrine tumor (NET), neuroendocrine carcinoma (NEC), or other solid tumor of non-neuroendocrine origin.
[22B] A multispecific antigen-binding molecule or pharmaceutical composition for use in the treatment/prevention of a disease in accordance with [22] or [22A], wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma.
[23] Use of any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [13] or the pharmaceutical composition of [18] for the manufacture of a medicament for the treatment or prevention of a disease in an individual in need thereof.
[24] A method for treating a disease in an individual, comprising administering to the individual a therapeutically effective amount of a composition comprising any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1]-[13] or the pharmaceutical composition of [18].
[25] The use of [23] or the method of [24], wherein the disease is cancer, preferably DLL3-positive cancer or DLL3-expressing cancer.
[25A] The use or method of [25], wherein the cancer is a DLL3-expressing or DLL3-positive cancer, preferably a neuroendocrine neoplasm (NEN), neuroendocrine tumor (NET), neuroendocrine carcinoma (NEC), or other solid tumor of non-neuroendocrine origin.
[25B] The use or method of [25A], wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma.
[26] A method for inducing lysis of a target cell, comprising contacting the target cell with any one of the multispecific antigen-binding molecules of [1] to [13] or the pharmaceutical composition of [18] in the presence of a T cell.
[27] [18] A kit comprising the composition of claim 1; and a package insert containing instructions for administering the composition to a subject to treat or slow the progression of cancer, preferably a DLL3-positive or DLL3-expressing cancer, preferably a neuroendocrine neoplasm (NEN), neuroendocrine tumor (NET), neuroendocrine carcinoma (NEC), or other solid tumor of non-neuroendocrine origin.
[27A] The kit of [27], wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumor (PNET), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma.

本発明の別の局面は、以下に関する:
[28] 第1の抗原結合部分であって、以下の特性:
(i)ヒトCD3に結合する;
(ii)ヒトCD137に結合する;
(iii)ヒトCD3およびヒトCD137に結合でき、第1の抗原結合部分が、ヒトCD3またはヒトCD137のいずれか一方に結合する;および
(iv)ヒトCD3およびヒトCD137に結合できるが、ヒトCD3およびヒトCD137に同時には結合しない
のうち1つ、2つまたはそれ以上を有する第1の抗原結合部分;および
DLL3、好ましくはヒトDLL3に結合できる第2の抗原結合部分
を含む、多重特異性抗原結合分子。
[29] 第1の抗原結合部分が、以下の(a1)~(a17)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:17の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:31の重鎖CDR 2、配列番号:45の重鎖CDR 3、配列番号:64の軽鎖CDR 1、配列番号:69の軽鎖CDR 2、および配列番号:74の軽鎖CDR 3;
(a2)配列番号:18の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:32の重鎖CDR 2、配列番号:46の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a3)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a4)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3;
(a5)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a6)配列番号:22の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:36の重鎖CDR 2、配列番号:50の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a7)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a8)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3;
(a9)配列番号:24の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:38の重鎖CDR 2、配列番号:52の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a10)配列番号:25の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:39の重鎖CDR 2、配列番号:53の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3;
(a11)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3;
(a12)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a13)配列番号:27の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:41の重鎖CDR 2、配列番号:55の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a14)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a15)配列番号:82の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:83の重鎖CDR 2、配列番号:84の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3;
(a16)(a1)~(a15)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a17)(a1)~(a15)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、[28]の多重特異性抗原結合分子。
[30] 第1の抗原結合部分が、以下の(a1)~(a18)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a2)配列番号:4のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a3)配列番号:5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a4)配列番号:5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:60のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a5)配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a6)配列番号:8のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a7)配列番号:9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a8)配列番号:9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a9)配列番号:10のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a10)配列番号:11のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a11)配列番号:12のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a12)配列番号:12のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a13)配列番号:13のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a14)配列番号:14のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a15)配列番号:81のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:60のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a16)配列番号:3~6、8~14、および81からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および/または配列番号:58~61からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a17)(a1)~(a15)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a18)(a1)~(a15)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、[28] ~ [29]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
Another aspect of the present invention relates to:
[28] A first antigen-binding portion, comprising:
(i) binds to human CD3;
(ii) binds to human CD137;
(iii) a first antigen-binding moiety capable of binding to human CD3 and human CD137, wherein the first antigen-binding moiety binds to either human CD3 or human CD137; and (iv) a first antigen-binding moiety capable of binding to human CD3 and human CD137, but not simultaneously to human CD3 and human CD137; and
A multispecific antigen-binding molecule comprising a second antigen-binding portion capable of binding to DLL3, preferably human DLL3.
[29] The first antigen-binding portion is any one of the following (a1) to (a17):
(a1) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 17, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 31, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 45, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 64, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 69, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 74;
(a2) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 18, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 32, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 46, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a3) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a4) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a5) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a6) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 22, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 36, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 50, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a7) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a8) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a9) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 24, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 38, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 52, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a10) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 25, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 39, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 53, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a11) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a12) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a13) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 27, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 41, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 55, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a14) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a15) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 82, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 83, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 84, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a16) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a15); and (a17) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a15). [28] A multispecific antigen-binding molecule comprising the antibody variable fragment (a16) that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a15).
[30] The first antigen-binding portion is any one of the following (a1) to (a18):
(a1) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59;
(a2) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a3) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a4) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(a5) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a6) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a7) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a8) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
(a9) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a10) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
(a11) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
(a12) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a13) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a14) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a15) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 81, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(a16) a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3 to 6, 8 to 14, and 81, and/or a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 58 to 61;
(a17) An antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a15); and (a18) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a15). Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [28] to [29].

本発明のさらに別の局面において、以下に関する:
[31] 以下の(a1)~(a15)から選択される組み合わせ:
(a1)配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a2)配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a3)配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a4)配列番号:205のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a5)配列番号:216のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:229のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a6)配列番号:217のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:210のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a7)配列番号:219のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:211のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a8)配列番号:220のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:211のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a9)配列番号:221のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:211のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a10)配列番号:222のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:230のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:214のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a11)配列番号:223のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:212のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a12)配列番号:225のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:213のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a13)配列番号:226のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:213のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);
(a14)配列番号:227のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:213のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5);ならびに
(a15)配列番号:228のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:231のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、および配列番号:215のアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および鎖5)
のいずれか1つにおける5本のポリペプチド鎖を含む、多重特異性抗原結合分子であって、好ましくは、5本のポリペプチド鎖(鎖1~鎖5)が、図1(a)に示される配向性に従って相互に連結および/または会合される、多重特異性抗原結合分子。
[31A]以下の組み合わせ:
配列番号:201~205および216~228からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1);配列番号:206~207からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2);配列番号:208~213および229~231からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3);ならびに配列番号:214および215からなる群より選択されるアミノ酸配列をそれぞれが含む2本のポリペプチド鎖(鎖4 & 鎖5)
で5本のポリペプチド鎖を含む、多重特異性抗原結合分子。
[31B] ポリペプチド鎖2および鎖5のそれぞれが、ポリペプチド鎖1と結合し;ポリペプチド鎖4がポリペプチド鎖3と結合し;かつポリペプチド鎖1がポリペプチド鎖3と結合している、[31]または[31A]の多重特異性抗原結合分子。
In yet another aspect of the present invention, there is provided a method for treating a pulmonary artery disease comprising:
[31] A combination selected from (a1) to (a15) below:
(a1) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 208, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5), each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a2) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 209, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a3) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 209, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a4) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 209, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a5) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 216, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 229, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a6) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 217, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 210, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a7) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 219, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a8) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a9) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 221, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a10) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 222, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 230, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214;
(a11) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 223, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 212, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215;
(a12) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215;
(a13) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 226, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213, and two polypeptide chains (chain 4 and chain 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215;
(a14) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 227, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215; and (a15) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 228, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 231, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 215.
wherein the five polypeptide chains (chain 1 to chain 5) are linked and/or associated with each other according to the orientation shown in FIG. 1(a).
[31A] Combination of:
A polypeptide chain (chain 1) comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 201-205 and 216-228; a polypeptide chain (chain 2) comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 206-207; a polypeptide chain (chain 3) comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 208-213 and 229-231; and two polypeptide chains (chain 4 & chain 5) each comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 214 and 215.
A multispecific antigen-binding molecule comprising five polypeptide chains.
[31B] The multispecific antigen-binding molecule of [31] or [31A], wherein each of polypeptide chain 2 and chain 5 is bound to polypeptide chain 1; polypeptide chain 4 is bound to polypeptide chain 3; and polypeptide chain 1 is bound to polypeptide chain 3.

本発明のさらに別の局面は以下に関する:
[32] 以下の(a1)~(a5)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:233の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:234の重鎖CDR 2、配列番号:235の重鎖CDR 3、配列番号:237の軽鎖CDR 1、配列番号:238の軽鎖CDR 2、および配列番号:239の軽鎖CDR 3;
(a2)配列番号:276の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:277の重鎖CDR 2、配列番号:278の重鎖CDR 3、配列番号:279の軽鎖CDR 1、配列番号:280の軽鎖CDR 2、および配列番号:281の軽鎖CDR 3;
(a3)配列番号:285の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:286の重鎖CDR 2、配列番号:287の重鎖CDR 3、配列番号:288の軽鎖CDR 1、配列番号:289の軽鎖CDR 2、および配列番号:290の軽鎖CDR 3;
(a4)(a1)~(a3)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a5)(a1)~(a3)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、DLL3に結合できる抗原結合分子。
[33] 以下の(a1)~(a6)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:232のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:236のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a2)配列番号:264のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:265のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a3)配列番号:266のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:267のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a4)配列番号:268のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:269のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a5)(a1)~(a4)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a6)(a1)~(a4)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む、DLL3に結合できる抗原結合分子。
Yet another aspect of the present invention relates to:
[32] Any one of (a1) to (a5) below:
(a1) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 233, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 234, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 235, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 237, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 238, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 239;
(a2) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 276, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 277, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 278, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 279, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 280, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 281;
(a3) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 285, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 286, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 287, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 288, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 289, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 290;
(a4) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a3); and (a5) an antigen-binding molecule capable of binding to DLL3, comprising an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a3).
[33] Any one of (a1) to (a6) below:
(a1) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 232, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236;
(a2) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 264, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 265;
(a3) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 266, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 267;
(a4) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 268, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 269;
(a5) an antibody variable region that binds to the same epitope as any one of the antibody variable regions selected from (a1) to (a4); and (a6) an antigen-binding molecule capable of binding to DLL3, comprising an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any one of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a4).

本発明のさらに別の局面は以下に関する:
[33-1] (a)第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分であって、それぞれがヒトCD137に結合する同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、該抗体可変領域が、以下からなる群:
(a1)配列番号:17の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:31の重鎖CDR 2、配列番号:45の重鎖CDR 3、配列番号:64の軽鎖CDR 1、配列番号:69の軽鎖CDR 2、および配列番号:74の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a2)配列番号:18の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:32の重鎖CDR 2、配列番号:46の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a3)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a4)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a5)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a6)配列番号:22の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:36の重鎖CDR 2、配列番号:50の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a7)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a8)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a9)配列番号:24の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:38の重鎖CDR 2、配列番号:52の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a10)配列番号:25の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:39の重鎖CDR 2、配列番号:53の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a11)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a12)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a13)配列番号:27の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:41の重鎖CDR 2、配列番号:55の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a14)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域; ならびに
(a15)配列番号:82の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:83の重鎖CDR 2、配列番号:84の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域
より独立して選択される、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分;ならびに
(b)ヒトデルタ様3(DLL3)に結合し、かつ、配列番号:233を含む重鎖CDR 1、配列番号:234を含む重鎖CDR 2、配列番号:235を含む重鎖CDR 3、配列番号:237を含む軽鎖CDR 1、配列番号:238を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:239を含む軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、第3の抗原結合部分
を含む、多重特異性抗原結合分子。
[33-2] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれが、同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、該抗体可変領域が、以下からなる群:
(a1)配列番号:3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:59のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a2)配列番号:4のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a3)配列番号:5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a4)配列番号:5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:60のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a5)配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a6)配列番号:8のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a7)配列番号:9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a8)配列番号:9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a9)配列番号:10のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a10)配列番号:11のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a11)配列番号:12のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:61のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a12)配列番号:12のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a13)配列番号:13のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a14)配列番号:14のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;
(a15)配列番号:81のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:60のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;ならびに
(a16)配列番号:3~6、8~14、および81からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および/または配列番号:58~61からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域
より独立して選択される、[33-1]の多重特異性抗原結合分子。
[33-2A] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、
配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域
を含む、[33-1]~[33-2]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[33-2B] 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分がそれぞれ、
配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体可変領域
を含む、[33-2A]の多重特異性抗原結合分子。
[33-2C] 第3の抗原結合部分が、配列番号:232を含むVHと配列番号:236を含むVLとを含む、抗体可変領域
を含む、[33-1]~[33-2B]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[33-3] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれが、191位(EUナンバリング)にシステイン残基を有するFabであり、かつ2つのシステイン残基をつなぐジスルフィド結合が存在する、[33-1]~[33-2C]のいずれか1つの多重特異性抗原結合分子。
[33-4] 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれが、VHおよびCH1ドメインを含む重鎖とVLおよび軽鎖定常(CL)ドメインを含む軽鎖とを含むFabであり、第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のFab重鎖のN末端に、直接またはペプチドリンカーを介して融合されている、[33-3]の多重特異性抗原結合分子。
[33-5A] 第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のFab重鎖のN末端に、ペプチドリンカーを介して融合されており、ペプチドリンカーが、配列番号:248、配列番号:249、および配列番号:259からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する、[33-4]の多重特異性抗原結合分子。
[33-5B] 第3の抗原結合部分が、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子であり、かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、従来型のFab分子である、[33-5A] の多重特異性抗原結合分子。
[33-6] 第1のおよび第2の抗原結合部分それぞれのCLドメインにおいて、123位および124位(Kabatナンバリング)のアミノ酸がそれぞれ、アルギニンおよびリジンであり、第1のおよび第2の抗原結合部分それぞれのCH1ドメインにおいて、147位および213位(EUナンバリング)各々のアミノ酸がグルタミン酸である、[33-5A]の多重特異性抗原結合分子。
[33-7] Fcドメインをさらに含む、[33-6]の多重特異性抗原結合分子。
[33-8] Fcドメインが第1のおよび第2のFc領域サブユニットを含み、
第1のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;ならびに
234位、235位、および297位の各々にアラニン、354位にシステイン、および366位にトリプトファンを含む、Fc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、かつ
第2のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;ならびに
234位、235位、および297位の各々にアラニン、349位にシステイン、および366位にセリン、368位にアラニン、および407位にバリンを含む、Fc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、
すべての位置がEUナンバリングによるものである、
[33-7]の多重特異性抗原結合分子。
Yet another aspect of the present invention relates to:
[33-1] (a) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion, each of which comprises an antibody variable region that binds to human CD137, which may be the same or different, and wherein the antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 17, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 31, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 45, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 64, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 69, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 74;
(a2) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 18, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 32, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 46, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a3) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a4) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a5) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a6) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 22, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 36, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 50, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a7) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a8) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a9) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 24, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 38, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 52, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a10) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 25, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 39, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 53, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a11) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a12) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a13) an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 27, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 41, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 55, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a14) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73; and (a15) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion independently selected from an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 82, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 83, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 84, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75; and (b) a heavy chain CDR 1 that binds human delta-like 3 (DLL3) and comprises SEQ ID NO: 233, a heavy chain CDR 1 that comprises SEQ ID NO: 234, and a heavy chain CDR 1 that comprises SEQ ID NO: 235. 2. a third antigen-binding portion comprising an antibody variable region comprising a heavy chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 235, a light chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 237, a light chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 238, and a light chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 239.
[33-2] Each of the first and second antigen-binding moieties comprises an antibody variable region, which may be the same or different, and the antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59;
(a2) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a3) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a4) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(a5) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a6) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a7) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a8) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
(a9) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a10) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
(a11) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61;
(a12) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a13) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a14) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a15) a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 81, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60; and (a16) a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3 to 6, 8 to 14, and 81, and/or a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 58 to 61. A multispecific antigen-binding molecule of [33-1].
[33-2A] The first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each comprise:
Any one of the multispecific antigen-binding molecules of [33-1] to [33-2], comprising an antibody variable region comprising heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73.
[33-2B] The first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion each comprise:
A multispecific antigen-binding molecule of [33-2A] comprising an antibody variable region comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58.
[33-2C] A multispecific antigen-binding molecule according to any one of [33-1] to [33-2B], wherein the third antigen-binding portion comprises an antibody variable region comprising a VH comprising sequence number: 232 and a VL comprising sequence number: 236.
[33-3] A multispecific antigen-binding molecule of any one of [33-1] to [33-2C], wherein each of the first and second antigen-binding portions is a Fab having a cysteine residue at position 191 (EU numbering) and a disulfide bond is present connecting the two cysteine residues.
[33-4] A multispecific antigen-binding molecule according to [33-3], wherein each of the first, second, and third antigen-binding moieties is a Fab comprising a heavy chain comprising a VH and CH1 domain and a light chain comprising a VL and a light chain constant (CL) domain, and the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding moiety is fused, directly or via a peptide linker, to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety.
[33-5A] The multispecific antigen-binding molecule of [33-4], wherein the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding portion is fused to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding portion or the second antigen-binding portion via a peptide linker, and the peptide linker has an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, and SEQ ID NO: 259.
[33-5B] The multispecific antigen-binding molecule of [33-5A], wherein the third antigen-binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light chain and the Fab heavy chain are exchanged, and each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a conventional Fab molecule.
[33-6] A multispecific antigen-binding molecule according to [33-5A], wherein the amino acids at positions 123 and 124 (Kabat numbering) in the CL domain of each of the first and second antigen-binding moieties are arginine and lysine, respectively, and the amino acids at positions 147 and 213 (EU numbering) in the CH1 domain of each of the first and second antigen-binding moieties are glutamic acid.
[33-7] A multispecific antigen-binding molecule of [33-6], further comprising an Fc domain.
[33-8] the Fc domain comprises a first and a second Fc region subunit;
The first Fc region subunit comprises:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
and a second Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 354, and a tryptophan at position 366, and the second Fc region subunit is selected from the group comprising:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 349, and a serine at position 366, an alanine at position 368, and a valine at position 407;
All positions are according to EU numbering,
[33-7] Multispecific antigen-binding molecule.

本発明のさらに別の局面は以下に関する:
[34-1](a)第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分であって、それぞれがヒトCD3に結合する同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、該抗体可変領域が、以下の(a1)~(a15)からなる群:
(a1)配列番号:17を含む重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:31を含む重鎖CDR 2、配列番号:45を含む重鎖CDR 3、配列番号:64を含む軽鎖CDR 1、配列番号:69を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:74を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a2)配列番号:18を含む重鎖CDR 1、配列番号:32を含む重鎖CDR 2、配列番号:46を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a3)配列番号:19を含む重鎖CDR 1、配列番号:33を含む重鎖CDR 2、配列番号:47を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a4)配列番号:19を含む重鎖CDR 1、配列番号:33を含む重鎖CDR 2、配列番号:47を含む重鎖CDR 3、配列番号:65を含む軽鎖CDR 1、配列番号:70を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:75を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a5)配列番号:20を含む重鎖CDR 1、配列番号:34を含む重鎖CDR 2、配列番号:48を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a6)配列番号:22を含む重鎖CDR 1、配列番号:36を含む重鎖CDR 2、配列番号:50を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a7)配列番号:23を含む重鎖CDR 1、配列番号:37を含む重鎖CDR 2、配列番号:51を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a8)配列番号:23を含む重鎖CDR 1、配列番号:37を含む重鎖CDR 2、配列番号:51を含む重鎖CDR 3、配列番号:66を含む軽鎖CDR 1、配列番号:71を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:76を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a9)配列番号:24を含む重鎖CDR 1、配列番号:38を含む重鎖CDR 2、配列番号:52を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a10)配列番号:25を含む重鎖CDR 1、配列番号:39を含む重鎖CDR 2、配列番号:53を含む重鎖CDR 3、配列番号:66を含む軽鎖CDR 1、配列番号:71を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:76を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a11)配列番号:26を含む重鎖CDR 1、配列番号:40を含む重鎖CDR 2、配列番号:54を含む重鎖CDR 3、配列番号:66を含む軽鎖CDR 1、配列番号:71を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:76を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a12)配列番号:26を含む重鎖CDR 1、配列番号:40を含む重鎖CDR 2、配列番号:54を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a13)配列番号:27を含む重鎖CDR 1、配列番号:41を含む重鎖CDR 2、配列番号:55を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
(a14)配列番号:28を含む重鎖CDR 1、配列番号:42を含む重鎖CDR 2、配列番号:56を含む重鎖CDR 3、配列番号:63を含む軽鎖CDR 1、配列番号:68を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:73を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域; ならびに
(a15)配列番号:82を含む重鎖CDR 1、配列番号:83を含む重鎖CDR 2、配列番号:84を含む重鎖CDR 3、配列番号:65を含む軽鎖CDR 1、配列番号:70を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:75を含む軽鎖CDR 3を含む、抗体可変領域;
より独立して選択される、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分;ならびに
(b)ヒトデルタ様3(DLL3)に結合し、かつ、配列番号:233を含む重鎖CDR 1、配列番号:234を含む重鎖CDR 2、配列番号:235を含む重鎖CDR 3、配列番号:237を含む軽鎖CDR 1、配列番号:238を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:239を含む軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、第3の抗原結合部分
を含む、多重特異性抗原結合分子。
[34-2] (a)第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分であって、それぞれが同じかまたは異なり得る抗体可変領域を含み、該抗体可変領域が、以下からなる群:
(a1)配列番号:3を含む重鎖可変領域(VH)と、配列番号:59を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、抗体可変領域;
(a2)配列番号:4を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a3)配列番号:5を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a4)配列番号:5を含むVHと、配列番号:60を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a5)配列番号:6を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a6)配列番号:8を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a7)配列番号:9を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a8)配列番号:9を含むVHと、配列番号:61を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a9)配列番号:10を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a10)配列番号:11を含むVHと、配列番号:61を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a11)配列番号:12を含むVHと、配列番号:61を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a12)配列番号:12を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a13)配列番号:13を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a14)配列番号:14を含むVHと、配列番号:58を含むVLとを含む、抗体可変領域;
(a15)配列番号:81を含むVHと、配列番号:60を含むVLとを含む、抗体可変領域;ならびに
(a16)配列番号:3~6、8~14、および81からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および/または配列番号:58~61からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域
より独立して選択される、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分;ならびに
(b)配列番号:232を含むVHと配列番号:236を含むVLとを含む抗体可変領域を含む、第3の抗原結合部分
を含む、多重特異性抗原結合分子。
[34-3] 第1のおよび第2の抗原結合部分の抗体可変領域が同じである、[34-1]の多重特異性抗原結合分子。
[34-4] 第1のおよび第2の抗原結合部分の抗体可変領域が同じである、[34-2]の多重特異性抗原結合分子。
[34-5] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれが、191位(EUナンバリング)にシステイン残基を有するFabであり、これら2つのシステイン残基をジスルフィド結合が連結している、[34-3]の多重特異性抗原結合分子。
[34-6] 第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれが、191位(EUナンバリング)にシステイン残基を有するFabであり、これら2つのシステイン残基をジスルフィド結合が連結している、[34-4]の多重特異性抗原結合分子。
[34-7] 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれが、VH、VL、CH1ドメイン、および軽鎖定常(CL)ドメインを含むFabのフォーマットであり、第3の抗原結合部分のCH1ドメインのC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のVHのN末端に、直接またはペプチドリンカーを介して融合されている、[34-5]の多重特異性抗原結合分子。
[34-8] 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれが、VH、VL、CH1ドメインおよび軽鎖定常(CL)ドメインを含むFabのフォーマットであり、第3の抗原結合部分のCH1ドメインのC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のVHのN末端に、直接またはペプチドリンカーを介して融合されている、[34-6]の多重特異性抗原結合分子。
[34-9] 融合が、配列番号:248、配列番号:249、および配列番号:259からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むペプチドリンカーを介するものである、[34-7]の多重特異性抗原結合分子。
[34-10] 融合が、配列番号:248、配列番号:249、および配列番号:259からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むペプチドリンカーを介するものである、[34-8]の多重特異性抗原結合分子。
[34-11] 第3の抗原結合部分が、VHがCLドメインに連結されVLがCH1ドメインに連結されたクロスオーバーFabであり、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分の各々が、VHがCH1ドメインに連結されVLがCLドメインに連結された従来型のFabである、[34-9]の多重特異性抗原結合分子。
[34-12] 第3の抗原結合部分が、VHがCLドメインに連結されVLがCH1ドメインに連結されたクロスオーバーFabであり、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分の各々が、VHがCH1ドメインに連結されVLがCLドメインに連結された従来型のFabである、[34-10]の多重特異性抗原結合分子。
[34-13] 第1のおよび第2の抗原結合部分それぞれのCLドメインにおいて、123位および124位(Kabatナンバリング)のアミノ酸がそれぞれ、アルギニンおよびリジンであり、第1のおよび第2の抗原結合部分それぞれのCH1ドメインにおいて、147位および213位(EUナンバリング)各々のアミノ酸がグルタミン酸である、[34-11]の多重特異性抗原結合分子。
[34-14] 第1のおよび第2の抗原結合部分それぞれのCLドメインにおいて、123位および124位(Kabatナンバリング)のアミノ酸がそれぞれ、アルギニンおよびリジンであり、第1のおよび第2の抗原結合部分それぞれのCH1ドメインにおいて、147位および213位(EUナンバリング)各々のアミノ酸がグルタミン酸である、[34-12]の多重特異性抗原結合分子。
[34-15] Fcドメインをさらに含む、[34-13]の多重特異性抗原結合分子。
[34-16] Fcドメインをさらに含む、[34-14]の多重特異性抗原結合分子。
[34-17] Fcドメインが第1のおよび第2のFc領域サブユニットを含み、
第1のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;ならびに
234位、235位、および297位の各々にアラニン、354位にシステイン、および366位にトリプトファンを含む、Fc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、かつ
第2のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;ならびに
234位、235位、および297位の各々にアラニン、349位にシステイン、および366位にセリン、368位にアラニン、および407位にバリンを含む、Fc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、
すべての位置がEUナンバリングによるものである、
[34-15]の多重特異性抗原結合分子。
[34-18] Fcドメインが第1のおよび第2のFc領域サブユニットを含み、
第1のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;ならびに
234位、235位、および297位の各々にアラニン、354位にシステイン、および366位にトリプトファンを含む、Fc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、かつ
第2のFc領域サブユニットが、以下:
234位および235位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;
234位、235位、および297位の各々にアラニンを含む、Fc領域ポリペプチド;ならびに
234位、235位、および297位の各々にアラニン、349位にシステイン、および366位にセリン、368位にアラニン、および407位にバリンを含む、Fc領域ポリペプチド
を含む群より選択され、
すべての位置がEUナンバリングによるものである、
[34-16]の多重特異性抗原結合分子。
Yet another aspect of the present invention relates to:
[34-1] (a) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion, each of which comprises an antibody variable region that binds to human CD3, which may be the same or different, and which is selected from the group consisting of the following (a1) to (a15):
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 comprising SEQ ID NO: 17, a heavy chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 31, a heavy chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 45, a light chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 64, a light chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 69, and a light chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 74;
(a2) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 18, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 32, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 46, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a3) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 19, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 47, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a4) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 19, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 33, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 47, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 65, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 70, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 75;
(a5) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 20, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 34, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 48, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a6) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 22, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 36, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 50, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a7) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 23, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 37, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 51, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a8) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 23, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 37, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 51, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 66, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 71, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 76;
(a9) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 24, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 38, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 52, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a10) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 25, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 39, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 53, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 66, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 71, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 76;
(a11) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 26, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 40, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 54, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 66, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 71, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 76;
(a12) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 26, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 40, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 54, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a13) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 27, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 41, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 55, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO: 63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO: 73;
(a14) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO:28, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO:42, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO:56, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO:63, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO:68, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO:73; and (a15) an antibody variable region comprising a heavy chain CDR1 comprising SEQ ID NO:82, a heavy chain CDR2 comprising SEQ ID NO:83, a heavy chain CDR3 comprising SEQ ID NO:84, a light chain CDR1 comprising SEQ ID NO:65, a light chain CDR2 comprising SEQ ID NO:70, and a light chain CDR3 comprising SEQ ID NO:75;
and (b) a third antigen-binding portion that binds to human delta-like 3 (DLL3) and comprises an antibody variable region comprising a heavy chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 233, a heavy chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 234, a heavy chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 235, a light chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 237, a light chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 238, and a light chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 239.
[34-2] (a) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion, each of which comprises an antibody variable region, which may be the same or different, wherein the antibody variable region is selected from the group consisting of:
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain variable region (VH) comprising SEQ ID NO: 3 and a light chain variable region (VL) comprising SEQ ID NO: 59;
(a2) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 4 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a3) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 5 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a4) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 5 and a VL comprising SEQ ID NO: 60;
(a5) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 6 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a6) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 8 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a7) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 9 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a8) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 9 and a VL comprising SEQ ID NO: 61;
(a9) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 10 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a10) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 11 and a VL comprising SEQ ID NO: 61;
(a11) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 12 and a VL comprising SEQ ID NO: 61;
(a12) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 12 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a13) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 13 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a14) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 14 and a VL comprising SEQ ID NO: 58;
(a15) an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 81 and a VL comprising SEQ ID NO: 60; and (a16) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion independently selected from a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3-6, 8-14, and 81, and/or a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 58-61; and (b) a third antigen-binding portion comprising an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 232 and a VL comprising SEQ ID NO: 236.
[34-3] The multispecific antigen-binding molecule of [34-1], wherein the antibody variable regions of the first and second antigen-binding portions are the same.
[34-4] The multispecific antigen-binding molecule of [34-2], wherein the antibody variable regions of the first and second antigen-binding portions are the same.
[34-5] A multispecific antigen-binding molecule of [34-3], wherein each of the first and second antigen-binding portions is a Fab having a cysteine residue at position 191 (EU numbering), and these two cysteine residues are linked by a disulfide bond.
[34-6] A multispecific antigen-binding molecule of [34-4], wherein each of the first and second antigen-binding portions is a Fab having a cysteine residue at position 191 (EU numbering), and these two cysteine residues are linked by a disulfide bond.
[34-7] A multispecific antigen-binding molecule of [34-5], wherein each of the first, second, and third antigen-binding moieties is in a Fab format comprising a VH, a VL, a CH1 domain, and a light chain constant (CL) domain, and the C-terminus of the CH1 domain of the third antigen-binding moiety is fused, directly or via a peptide linker, to the N-terminus of the VH of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety.
[34-8] A multispecific antigen-binding molecule according to [34-6], wherein each of the first, second and third antigen-binding moieties is in a Fab format comprising a VH, a VL, a CH1 domain and a light chain constant (CL) domain, and the C-terminus of the CH1 domain of the third antigen-binding moiety is fused, directly or via a peptide linker, to the N-terminus of the VH of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety.
[34-9] The multispecific antigen-binding molecule of [34-7], wherein the fusion is via a peptide linker comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, and SEQ ID NO: 259.
[34-10] The multispecific antigen-binding molecule of [34-8], wherein the fusion is via a peptide linker comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, and SEQ ID NO: 259.
[34-11] The multispecific antigen-binding molecule of [34-9], wherein the third antigen-binding portion is a crossover Fab in which the VH is linked to a CL domain and the VL is linked to a CH1 domain, and each of the first and second antigen-binding portions is a conventional Fab in which the VH is linked to a CH1 domain and the VL is linked to a CL domain.
[34-12] The multispecific antigen-binding molecule of [34-10], wherein the third antigen-binding portion is a crossover Fab in which the VH is linked to a CL domain and the VL is linked to a CH1 domain, and each of the first and second antigen-binding portions is a conventional Fab in which the VH is linked to a CH1 domain and the VL is linked to a CL domain.
[34-13] The multispecific antigen-binding molecule of [34-11], wherein the amino acids at positions 123 and 124 (Kabat numbering) in the CL domain of each of the first and second antigen-binding moieties are arginine and lysine, respectively, and the amino acids at positions 147 and 213 (EU numbering) in the CH1 domain of each of the first and second antigen-binding moieties are glutamic acid.
[34-14] The multispecific antigen-binding molecule of [34-12], wherein the amino acids at positions 123 and 124 (Kabat numbering) in the CL domain of each of the first and second antigen-binding moieties are arginine and lysine, respectively, and the amino acids at positions 147 and 213 (EU numbering) in the CH1 domain of each of the first and second antigen-binding moieties are glutamic acid.
[34-15] A multispecific antigen-binding molecule of [34-13], further comprising an Fc domain.
[34-16] A multispecific antigen-binding molecule of [34-14], further comprising an Fc domain.
[34-17] the Fc domain comprises a first and a second Fc region subunit;
The first Fc region subunit comprises:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
and a second Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 354, and a tryptophan at position 366, and the second Fc region subunit is selected from the group comprising:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 349, and a serine at position 366, an alanine at position 368, and a valine at position 407;
All positions are according to EU numbering,
[34-15] Multispecific antigen-binding molecule.
[34-18] the Fc domain comprises a first and a second Fc region subunit;
The first Fc region subunit comprises:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
and a second Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 354, and a tryptophan at position 366, and the second Fc region subunit is selected from the group comprising:
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234 and 235;
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297; and
an Fc region polypeptide comprising an alanine at each of positions 234, 235, and 297, a cysteine at position 349, and a serine at position 366, an alanine at position 368, and a valine at position 407;
All positions are according to EU numbering,
[34-16] Multispecific antigen-binding molecules.

a)DUAL/LINC(1+2)フォーマットでの三価抗体、b)従来型の抗体フォーマットを有する二重特異性抗体、およびc)BiTEフォーマットを有する二重特異性抗体の設計および命名規則を示す。FIG. 1 shows the design and nomenclature rules for a) trivalent antibodies in the DUAL/LINC (1+2) format, b) bispecific antibodies with a conventional antibody format, and c) bispecific antibodies with a BiTE format. SK-MEL30細胞株に対する抗体のTDCC活性を示す。a)DUAL/LINCおよびCD3二重特異性フォーマット間でのTDCCの比較。b)細胞傷害活性に対するリンカー長の効果。Figure 1 shows TDCC activity of antibodies against the SK-MEL30 cell line. a) Comparison of TDCC between DUAL/LINC and CD3 bispecific formats. b) Effect of linker length on cytotoxic activity. huNOGマウスモデルにおけるNCI-H1436異種移植片に対する抗体のin vivo有効性を示す。Y軸は腫瘍体積(mm3)を意味し、X軸は腫瘍移植後の日数を意味する。1 shows the in vivo efficacy of antibodies against NCI-H1436 xenografts in the huNOG mouse model. Y-axis represents tumor volume (mm 3 ) and X-axis represents days after tumor implantation. CD8 T細胞浸潤を分析した結果を示す。抗体注射後の表示した時点で腫瘍を収集し、フローサイトメーターを用いてT細胞浸潤を分析した。Figure 1 shows the results of analyzing CD8 T cell infiltration. Tumors were harvested at the indicated time points after antibody injection, and T cell infiltration was analyzed using a flow cytometer. CD8 T細胞上の疲弊マーカー(exhaustion marker)を分析した結果を示す。腫瘍を抗体注射後7日目に収集し、フローサイトメーターを用いて疲弊マーカーの発現を分析した。The results of analyzing exhaustion markers on CD8 T cells are shown. Tumors were harvested 7 days after antibody injection, and the expression of exhaustion markers was analyzed using a flow cytometer. 全長ヒトDLL3およびヒトDLL3 ECD断片タンパク質の構造を示す模式図である。抗DLL3抗体の各々によって認識されるエピトープも示す。EGFドメインは、N末端側からC末端側へ、6個の領域EGF1~EGF6を有する。Schematic diagram showing the structure of full-length human DLL3 and human DLL3 ECD fragment protein. The epitopes recognized by each of the anti-DLL3 antibodies are also shown. The EGF domain has six regions, EGF1 to EGF6, from the N-terminus to the C-terminus. NB-1細胞株(神経芽腫)およびQGP-1細胞株(膵島細胞がん)に対する抗DLL3-Dual抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110)のT細胞依存性細胞傷害(TDCC)活性を示す。The figure shows the T cell-dependent cytotoxicity (TDCC) activity of anti-DLL3-Dual antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110) against the NB-1 cell line (neuroblastoma) and the QGP-1 cell line (pancreatic islet cell carcinoma). DMS53小細胞肺がんモデルにおける単独療法またはシスプラチン(CDDP)もしくはカルボプラチン(CBDCA)との組み合わせ療法(Combo)としての抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)の腫瘍体積低減のin vivo有効性を示す。CBDCAはCBDCAの単独療法を意味し、CDDPはCDDPの単独療法を意味する。Y軸は腫瘍体積(mm3)を意味し、X軸は腫瘍移植後の日数を意味する。* P<0.05、** P<0.01。Figure 1 shows the in vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) in reducing tumor volume as monotherapy or in combination with cisplatin (CDDP) or carboplatin (CBDCA) (Combo) in DMS53 small cell lung cancer model. CBDCA means CBDCA monotherapy, CDDP means CDDP monotherapy. Y-axis means tumor volume ( mm3 ), X-axis means days after tumor implantation. * P<0.05, ** P<0.01. ヒト化NOGマウスモデルにおけるNCI-H1436異種移植片に、単回用量で1回、または毎週1回(QW)複数回のスケジュールで投与した、抗DLL3-Dual抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)またはDLL3CD3BiTEの腫瘍体積低減のin vivo有効性を示す。Y軸は腫瘍体積(mm3)を意味し、X軸は腫瘍移植後の日数を意味する。Figure 1 shows the in vivo efficacy of anti-DLL3-Dual antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) or DLL3CD3BiTE administered once in a single dose or on a multiple weekly (QW) schedule to NCI-H1436 xenografts in a humanized NOG mouse model in reducing tumor volume. Y-axis represents tumor volume ( mm3 ) and X-axis represents days after tumor implantation. ステロイドまたはトシリズマブとの組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)のin vivo有効性を示す。a)ステロイドによる前投与実験では、デキサメタゾンを、抗体注射の1および24時間前、または1時間前に、DLL3発現PC-10担持huNOGマウスに腹腔内投与した。a)の上段のパネルは、ステロイドありまたはなしでの抗体による腫瘍抑制を示す。a)の中段のパネルは、抗体誘導性IFN-γ放出(左のパネル)またはTNFα放出(右のパネル)のステロイド媒介性阻害を示す。a)の下段のパネルは、抗体誘導性IL-6放出のステロイド媒介性阻害を示す。b)トシリズマブによる実験では、トシリズマブを、抗DLL3-Dual-LINC抗体の注射の1日前または6時間後に、DLL3発現PC-10担持huNOGマウスに投与した。グラフは、事前のまたは事後のトシリズマブ投与ありまたはなしでの抗体による腫瘍抑制を示す。Figure 1 shows the in vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) in combination with steroids or tocilizumab. a) In steroid pretreatment experiments, dexamethasone was administered intraperitoneally to DLL3-expressing PC-10-bearing huNOG mice 1 and 24 hours or 1 hour prior to antibody injection. a) Top panels show antibody-induced tumor suppression with or without steroids. a) Middle panels show steroid-mediated inhibition of antibody-induced IFN-γ release (left panel) or TNFα release (right panel). a) Bottom panels show steroid-mediated inhibition of antibody-induced IL-6 release. b) In tocilizumab experiments, tocilizumab was administered to DLL3-expressing PC-10-bearing huNOG mice 1 day prior to or 6 hours after injection of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies. The graph shows tumor inhibition by the antibody with or without prior or subsequent tocilizumab administration.

態様の説明
本明細書において記載または参照される技法および手順は、概してよく理解されており、例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3d edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.;Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel, et al. eds., (2003));the series Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.):PCR 2: A Practical Approach (M.J. MacPherson, B.D. Hames and G.R. Taylor eds. (1995))、Harlow and Lane, eds. (1988) Antibodies, A Laboratory Manual、およびAnimal Cell Culture (R.I. Freshney, ed. (1987));Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait, ed., 1984);Methods in Molecular Biology, Humana Press;Cell Biology: A Laboratory Notebook (J.E. Cellis, ed., 1998) Academic Press;Animal Cell Culture (R.I. Freshney), ed., 1987);Introduction to Cell and Tissue Culture (J. P. Mather and P.E. Roberts, 1998) Plenum Press;Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures (A. Doyle, J.B. Griffiths, and D.G. Newell, eds., 1993-8) J. Wiley and Sons;Handbook of Experimental Immunology (D.M. Weir and C.C. Blackwell, eds.);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J.M. Miller and M.P. Calos, eds., 1987);PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994);Current Protocols in Immunology (J.E. Coligan et al., eds., 1991);Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999);Immunobiology (C.A. Janeway and P. Travers, 1997);Antibodies (P. Finch, 1997);Antibodies: A Practical Approach (D. Catty., ed., IRL Press, 1988-1989);Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P. Shepherd and C. Dean, eds., Oxford University Press, 2000);Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow and D. Lane (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999);The Antibodies (M. Zanetti and J. D. Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995);ならびにCancer: Principles and Practice of Oncology (V.T. DeVita et al., eds., J.B. Lippincott Company, 1993) に記載される広く利用されている方法論などの従来の方法論を使用して当業者によって一般的に用いられるものである。
DESCRIPTION OF EMBODIMENTS The techniques and procedures described or referenced herein are generally well understood and may be found in, for example, Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3d edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY; Current Protocols in Molecular Biology (FM Ausubel, et al. eds., (2003)); the series Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.): PCR 2: A Practical Approach (MJ MacPherson, BD Hames and GR Taylor eds. (1995)), Harlow and Lane, eds. (1988) Antibodies, A Laboratory Manual, and Animal Cell Culture (RI Freshney, ed. (1987)); Oligonucleotide Synthesis (MJ Gait, ed., 1984); Methods in Molecular Biology, Humana Press; Cell Biology: A Laboratory Notebook (JE Cellis, ed., 1998) Academic Press; Animal Cell Culture (RI Freshney), ed., 1987); Introduction to Cell and Tissue Culture (JP Mather and PE Roberts, 1998) Plenum Press; Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures (A. Doyle, JB Griffiths, and DG Newell, eds., 1993-8) J. Wiley and Sons; Handbook of Experimental Immun ology (DM Weir and CC Blackwell, eds.); Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (JM Miller and MP Calos, eds., 1987); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994); Current Protocols in Immunology (JE Coligan et al., eds., 1991); Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999); Immunobiology (CA Janeway and P. Travers, 1997); Antibodies (P. Finch, 1997); Antibodies: A Practical Approach (D. Catty., ed., IRL Press, 1988-1989); Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P. Shepherd and C. Dean, eds., Oxford University Press, 2000); Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow and D. Lane (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999); The Antibodies (M. Zanetti and JD Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995); and Cancer: Principles and Practice of Oncology (VT DeVita et al., eds., JB Lippincott Company, 1993) These methods are commonly employed by those skilled in the art using conventional methodologies, such as the widely used methodologies described in.

以下の定義および詳細な説明は、本明細書において説明する本開示の理解を容易にするために提供される。 The following definitions and detailed descriptions are provided to facilitate understanding of the present disclosure described herein.

定義
アミノ酸
本明細書において、アミノ酸は、1文字コードもしくは3文字コードまたはその両方、例えば、Ala/A、Leu/L、Arg/R、Lys/K、Asn/N、Met/M、Asp/D、Phe/F、Cys/C、Pro/P、Gln/Q、Ser/S、Glu/E、Thr/T、Gly/G、Trp/W、His/H、Tyr/Y、Ile/I、またはVal/Vによって記載される。
Definition
Amino Acids As used herein, amino acids are described by the one-letter or three-letter code or both, e.g., Ala/A, Leu/L, Arg/R, Lys/K, Asn/N, Met/M, Asp/D, Phe/F, Cys/C, Pro/P, Gln/Q, Ser/S, Glu/E, Thr/T, Gly/G, Trp/W, His/H, Tyr/Y, Ile/I, or Val/V.

アミノ酸の改変
抗原結合分子のアミノ酸配列中のアミノ酸改変(本明細書において「アミノ酸置換」または「アミノ酸変異」とも記載される)のためには、部位特異的変異誘発法(Kunkelら(Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1985) 82, 488-492))および重複伸長PCRなどの公知の方法が適宜採用され得る。さらに、非天然アミノ酸に置換するためのアミノ酸改変方法として、いくつかの公知の方法もまた採用され得る(Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. (2006) 35, 225-249;およびProc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2003) 100 (11), 6353-6357)。例えば、終止コドンの1つであるUAGコドン(アンバーコドン)の相補的アンバーサプレッサーtRNAに非天然アミノ酸が結合したtRNAを含む無細胞翻訳系 (Clover Direct (Protein Express)) を用いることが適切である。
Amino acid modification For amino acid modification in the amino acid sequence of an antigen-binding molecule (also referred to herein as "amino acid substitution" or "amino acid mutation"), known methods such as site-directed mutagenesis (Kunkel et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1985) 82, 488-492)) and overlap extension PCR may be appropriately employed. In addition, some known methods may also be employed as amino acid modification methods for substituting unnatural amino acids (Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. (2006) 35, 225-249; and Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2003) 100 (11), 6353-6357). For example, it is appropriate to use a cell-free translation system (Clover Direct (Protein Express)) that contains a tRNA in which a non-natural amino acid is bound to the complementary amber suppressor tRNA of the UAG codon (amber codon), which is one of the stop codons.

本明細書において、アミノ酸改変の部位を記載する際の用語「および/または」の意味は、「および」と「または」が適切に組み合わされたあらゆる組み合わせを含む。具体的には、例えば、「33位、55位、および/または96位のアミノ酸が置換されている」は、アミノ酸改変の以下のバリエーション:(a) 33位、(b) 55位、(c) 96位、(d) 33位および55位、(e) 33位および96位、(f) 55位および96位、ならびに (g) 33位、55位、および96位のアミノ酸を含む。 In this specification, the meaning of the term "and/or" when describing the site of amino acid modification includes any combination of "and" and "or" appropriately combined. Specifically, for example, "amino acids at positions 33, 55, and/or 96 are substituted" includes the following variations of amino acid modification: (a) amino acids at positions 33, (b) 55, (c) 96, (d) 33 and 55, (e) 33 and 96, (f) 55 and 96, and (g) 33, 55, and 96.

さらに、本明細書において、アミノ酸の改変を示す表現として、特定の位置を表す数字の前および後に、それぞれ改変前および改変後のアミノ酸の1文字コードまたは3文字コードを示す表現が、適宜使用され得る。例えば、抗体可変領域中に含まれるアミノ酸を置換する際に用いられるN100bLまたはAsn100bLeuという改変は、100b位(Kabatナンバリングによる)におけるAsnの、Leuによる置換を表す。すなわち、数字はKabatナンバリングによるアミノ酸の位置を示し、数字の前に記載される1文字または3文字のアミノ酸コードは置換前のアミノ酸を示し、数字の後に記載される1文字または3文字のアミノ酸コードは置換後のアミノ酸を示す。同様に、抗体定常領域中に含まれるFc領域のアミノ酸を置換する際に用いられるP238DまたはPro238Aspという改変は、238位(EUナンバリングによる)におけるProの、Aspによる置換を表す。すなわち、数字はEUナンバリングによるアミノ酸の位置を示し、数字の前に記載される1文字または3文字のアミノ酸コードは置換前のアミノ酸を示し、数字の後に記載される1文字または3文字のアミノ酸コードは置換後のアミノ酸を示す。 Furthermore, in the present specification, as an expression indicating an amino acid modification, an expression indicating the one-letter code or three-letter code of the amino acid before and after the modification, respectively, before and after the number indicating a specific position may be appropriately used. For example, the modification N100bL or Asn100bLeu used in replacing an amino acid contained in an antibody variable region represents the replacement of Asn at position 100b (according to Kabat numbering) with Leu. That is, the number indicates the position of the amino acid according to Kabat numbering, the one-letter or three-letter amino acid code written before the number indicates the amino acid before the replacement, and the one-letter or three-letter amino acid code written after the number indicates the amino acid after the replacement. Similarly, the modification P238D or Pro238Asp used in replacing an amino acid in the Fc region contained in an antibody constant region represents the replacement of Pro at position 238 (according to EU numbering) with Asp. That is, the number indicates the position of the amino acid according to the EU numbering system, the one-letter or three-letter amino acid code written before the number indicates the amino acid before substitution, and the one-letter or three-letter amino acid code written after the number indicates the amino acid after substitution.

ポリペプチド
本明細書で用いられる用語「ポリペプチド」は、アミド結合(ペプチド結合としても知られる)によって直鎖状に連結された単量体(アミノ酸)で構成される分子を指す。用語「ポリペプチド」は、2アミノ酸以上の任意の鎖を指し、特定の長さの産物を指すものではない。よって、ペプチド、ジペプチド、トリペプチド、オリゴペプチド、「タンパク質」、「アミノ酸鎖」、または2アミノ酸以上の鎖を指すために用いられる任意の他の用語は、「ポリペプチド」の定義内に含まれ、用語「ポリペプチド」は、これらの用語のいずれかの代わりにまたは相互に交換可能に用いられてもよい。用語「ポリペプチド」はまた、限定されないが、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護基/ブロッキング基による誘導体化、タンパク質切断、または非天然アミノ酸による修飾を含む、ポリペプチドの発現後修飾の産物を指すことも意図する。ポリペプチドは、天然の生物学的供給源に由来してもよく、または組換え技術によって産生されてもよいが、必ずしも指定の核酸から翻訳される必要はない。それは、化学合成を含む、任意の方法で生成されてもよい。本明細書において記載されるポリペプチドは、約3アミノ酸以上、5アミノ酸以上、10アミノ酸以上、20アミノ酸以上、25アミノ酸以上、50アミノ酸以上、75アミノ酸以上、100アミノ酸以上、200アミノ酸以上、500アミノ酸以上、1,000アミノ酸以上、または2,000アミノ酸以上のサイズのものであってもよい。ポリペプチドは規定された三次元構造を有し得るが、それらは必ずしもそのような構造を有する必要はない。規定された三次元構造を有するポリペプチドは、折り畳まれたと称され、規定された三次元構造を持たないが多数の異なる立体構造をとり得るポリペプチドは、折り畳まれていないと称される。
Polypeptides The term "polypeptide" as used herein refers to a molecule composed of monomers (amino acids) linked in a linear chain by amide bonds (also known as peptide bonds). The term "polypeptide" refers to any chain of two or more amino acids and does not refer to a specific length of the product. Thus, peptide, dipeptide, tripeptide, oligopeptide, "protein", "amino acid chain", or any other term used to refer to a chain of two or more amino acids, is included within the definition of "polypeptide", and the term "polypeptide" may be used in place of or interchangeably with any of these terms. The term "polypeptide" is also intended to refer to the products of post-expression modifications of the polypeptide, including, but not limited to, glycosylation, acetylation, phosphorylation, amidation, derivatization with known protecting/blocking groups, proteolytic cleavage, or modification with non-natural amino acids. A polypeptide may be derived from a natural biological source or produced by recombinant technology, but need not necessarily be translated from a specified nucleic acid. It may be generated in any manner, including chemical synthesis. The polypeptides described herein may be of a size of about 3 or more amino acids, 5 or more amino acids, 10 or more amino acids, 20 or more amino acids, 25 or more amino acids, 50 or more amino acids, 75 or more amino acids, 100 or more amino acids, 200 or more amino acids, 500 or more amino acids, 1,000 or more amino acids, or 2,000 or more amino acids. Polypeptides may have a defined three-dimensional structure, but they do not necessarily have to have such a structure. Polypeptides that have a defined three-dimensional structure are said to be folded, and polypeptides that do not have a defined three-dimensional structure but can adopt a number of different conformations are said to be unfolded.

パーセント (%) アミノ酸配列同一性
参照ポリペプチド配列に対する「パーセント (%) アミノ酸配列同一性」は、最大のパーセント配列同一性を得るように配列を整列させてかつ必要ならギャップを導入した後の、かつ、いかなる保存的置換も配列同一性の一部と考えないとした時の、参照ポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基の、百分率比として定義される。%アミノ酸配列同一性を決める目的のアラインメントは、当該技術分野における技術の範囲内にある種々の方法、例えば、BLAST、BLAST-2、ALIGN、またはMegalign (DNASTAR) ソフトウェアなどの、公に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用することにより達成することができる。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大のアラインメントを達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、配列のアラインメントをとるための適切なパラメーターを決定することができる。しかしながら、本明細書における目的のために、%アミノ酸配列同一性値は、配列比較コンピュータプログラムであるALIGN-2を使用して生成される。ALIGN-2配列比較コンピュータプログラムは、ジェネンテック社の著作であり、そのソースコードは米国著作権庁 (U.S. Copyright Office, Washington D.C., 20559) に使用者用書類と共に提出され、米国著作権登録番号TXU510087として登録されている。ALIGN-2プログラムは、ジェネンテック社 (Genentech, Inc., South San Francisco, California) から公に入手可能であるし、ソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN-2プログラムは、Digital UNIX V4.0Dを含むUNIXオペレーティングシステム上での使用のためにコンパイルされる。すべての配列比較パラメーターは、ALIGN-2プログラムによって設定され、変動しない。アミノ酸配列比較にALIGN-2が用いられる状況では、所与のアミノ酸配列Bへの、またはそれとの、またはそれに対する、所与のアミノ酸配列Aの%アミノ酸配列同一性(あるいは、所与のアミノ酸配列Bへの、またはそれとの、またはそれに対する、ある%アミノ酸配列同一性を有するまたは含む所与のアミノ酸配列A、ということもできる)は、次のように計算される:
分率X/Yの100倍
ここで、Xは配列アラインメントプログラムALIGN-2によって、当該プログラムのAおよびBのアラインメントにおいて同一である一致としてスコアされたアミノ酸残基の数であり、YはB中のアミノ酸残基の全数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合、AのBへの%アミノ酸配列同一性は、BのAへの%アミノ酸配列同一性と等しくないことが、理解されるであろう。別段特に明示しない限り、本明細書で用いられるすべての%アミノ酸配列同一性値は、直前の段落で述べたとおりALIGN-2コンピュータプログラムを用いて得られるものである。
Percent (%) Amino Acid Sequence Identity "Percent (%) amino acid sequence identity" to a reference polypeptide sequence is defined as the percentage of amino acid residues in a candidate sequence that are identical to amino acid residues in the reference polypeptide sequence after aligning the sequences to obtain the maximum percent sequence identity and introducing gaps, if necessary, and not considering any conservative substitutions as part of the sequence identity. Alignment for purposes of determining percent amino acid sequence identity can be accomplished by a variety of methods within the skill of the art, for example, using publicly available computer software such as BLAST, BLAST-2, ALIGN, or Megalign (DNASTAR) software. Those skilled in the art can determine appropriate parameters for aligning sequences, including any algorithms necessary to achieve maximum alignment over the entire length of the sequences being compared. However, for purposes herein, percent amino acid sequence identity values are generated using ALIGN-2, a sequence comparison computer program. The ALIGN-2 sequence comparison computer program is the copyright of Genentech, Inc., and its source code has been submitted with user documentation to the US Copyright Office, Washington DC, 20559, where it is registered under US Copyright Registration No. TXU510087. The ALIGN-2 program is publicly available from Genentech, Inc., South San Francisco, California, or may be compiled from the source code. The ALIGN-2 program is compiled for use on UNIX operating systems, including Digital UNIX V4.0D. All sequence comparison parameters are set by the ALIGN-2 program and do not vary. In situations where ALIGN-2 is used for amino acid sequence comparison, the % amino acid sequence identity of a given amino acid sequence A to, with, or against a given amino acid sequence B (alternatively, it can be said that a given amino acid sequence A has or contains a certain % amino acid sequence identity to, with, or against a given amino acid sequence B) is calculated as follows:
100 times the fraction X/Y, where X is the number of amino acid residues scored as identical matches by the sequence alignment program ALIGN-2 in said program's alignment of A and B, and Y is the total number of amino acid residues in B. It will be understood that if the length of amino acid sequence A is not equal to the length of amino acid sequence B, then the % amino acid sequence identity of A to B is not equal to the % amino acid sequence identity of B to A. Unless otherwise specified, all % amino acid sequence identity values used herein are obtained using the ALIGN-2 computer program as described in the immediately preceding paragraph.

組換えの方法および構成
例えば、米国特許第4,816,567号に記載されるとおり、抗体および抗原結合分子は組換えの方法や構成を用いて製造することができる。1つの態様において、本明細書に記載の抗体をコードする、単離された核酸が提供される。そのような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列および/またはVHを含むアミノ酸配列(例えば、抗体の軽鎖および/または重鎖)をコードしてもよい。さらなる態様において、このような核酸を含む1つまたは複数のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる態様において、このような核酸を含む宿主細胞が提供される。このような態様の1つでは、宿主細胞は、(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列および抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、または、(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1のベクターと抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2のベクターを含む(例えば、形質転換されている)。1つの態様において、宿主細胞は、真核性である(例えば、チャイニーズハムスター卵巣 (CHO) 細胞)またはリンパ系の細胞(例えば、Y0、NS0、Sp2/0細胞))。1つの態様において、抗体の発現に好適な条件下で、上述のとおり当該抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を培養すること、および任意で、当該抗体を宿主細胞(または宿主細胞培養培地)から回収することを含む、本発明の多重特異性抗原結合分子を作製する方法が提供される。
Recombinant methods and constructs Antibodies and antigen-binding molecules can be produced using recombinant methods and constructs, for example, as described in U.S. Pat. No. 4,816,567. In one embodiment, an isolated nucleic acid is provided that encodes an antibody described herein. Such a nucleic acid may encode an amino acid sequence comprising the VL and/or an amino acid sequence comprising the VH of the antibody (e.g., the light and/or heavy chains of the antibody). In a further embodiment, one or more vectors (e.g., expression vectors) comprising such a nucleic acid are provided. In a further embodiment, a host cell comprising such a nucleic acid is provided. In one such embodiment, the host cell comprises (e.g., is transformed with) (1) a vector comprising a nucleic acid encoding an amino acid sequence comprising the VL of the antibody and an amino acid sequence comprising the VH of the antibody, or (2) a first vector comprising a nucleic acid encoding an amino acid sequence comprising the VL of the antibody and a second vector comprising a nucleic acid encoding an amino acid sequence comprising the VH of the antibody. In one embodiment, the host cell is eukaryotic (e.g., a Chinese hamster ovary (CHO) cell) or a lymphoid cell (e.g., a Y0, NS0, Sp2/0 cell)). In one embodiment, there is provided a method for making a multispecific antigen-binding molecule of the invention, comprising culturing a host cell comprising nucleic acid encoding said antibody as described above under conditions suitable for expression of said antibody, and optionally recovering said antibody from the host cell (or host cell culture medium).

本明細書において記載される抗体の組換え製造のために、(例えば、上述したものなどの)抗体をコードする核酸を単離し、さらなるクローニングおよび/または宿主細胞中での発現のために、1つまたは複数のベクターに挿入する。そのような核酸は、従来の手順を用いて容易に単離および配列決定されるだろう(例えば、抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを用いることで)。 For recombinant production of the antibodies described herein, nucleic acid encoding the antibody (e.g., such as those described above) is isolated and inserted into one or more vectors for further cloning and/or expression in a host cell. Such nucleic acid may be readily isolated and sequenced using conventional procedures (e.g., using oligonucleotide probes capable of specifically binding to genes encoding the antibody heavy and light chains).

抗体をコードするベクターのクローニングまたは発現に好適な宿主細胞は、本明細書に記載の原核細胞または真核細胞を含む。例えば、抗体は、特にグリコシル化およびFcエフェクター機能が必要とされない場合は、細菌中で製造してもよい。細菌での抗体断片およびポリペプチドの発現に関して、例えば、米国特許第5,648,237号、第5,789,199号、および第5,840,523号を参照のこと。(加えて、大腸菌 (E. coli) における抗体断片の発現について記載したCharlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ, 2003), pp.245-254も参照のこと。)発現後、抗体は細菌細胞ペーストから可溶性フラクション中に単離されてもよく、またさらに精製することができる。 Suitable host cells for cloning or expressing antibody-encoding vectors include prokaryotic or eukaryotic cells as described herein. For example, antibodies may be produced in bacteria, particularly if glycosylation and Fc effector functions are not required. See, e.g., U.S. Patent Nos. 5,648,237, 5,789,199, and 5,840,523 for expression of antibody fragments and polypeptides in bacteria. (See also Charlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ, 2003), pp. 245-254, which describes the expression of antibody fragments in E. coli.) After expression, the antibody may be isolated in a soluble fraction from the bacterial cell paste and may be further purified.

原核生物に加え、部分的なまたは完全なヒトのグリコシル化パターンを伴う抗体の産生をもたらす、グリコシル化経路が「ヒト化」されている菌類および酵母の株を含む、糸状菌または酵母などの真核性の微生物は、抗体コードベクターの好適なクローニングまたは発現宿主である。Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004)および Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006) を参照のこと。 In addition to prokaryotes, eukaryotic microbes such as filamentous fungi or yeast, including fungal and yeast strains in which the glycosylation pathway has been "humanized," resulting in the production of antibodies with partial or fully human glycosylation patterns, are suitable cloning or expression hosts for antibody-encoding vectors. See Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004) and Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006).

多細胞生物(無脊椎生物および脊椎生物)に由来するものもまた、グリコシル化された抗体の発現のために好適な宿主細胞である。無脊椎生物細胞の例は、植物および昆虫細胞を含む。昆虫細胞との接合、特にSpodoptera frugiperda細胞の形質転換に用いられる、数多くのバキュロウイルス株が同定されている。 Host cells derived from multicellular organisms (invertebrate and vertebrate) are also suitable for expression of glycosylated antibodies. Examples of invertebrate cells include plant and insect cells. Numerous baculovirus strains have been identified for conjugation with insect cells, particularly for transformation of Spodoptera frugiperda cells.

植物細胞培養物も、宿主として利用することができる。例えば、米国特許第5,959,177号、第6,040,498号、第6,420,548号、第7,125,978号、および第6,417,429号(トランスジェニック植物中で抗体を産生するための、PLANTIBODIES(商標)技術を記載)を参照のこと。 Plant cell cultures can also be used as hosts. See, e.g., U.S. Patent Nos. 5,959,177, 6,040,498, 6,420,548, 7,125,978, and 6,417,429 (describing the PLANTIBODIES™ technology for producing antibodies in transgenic plants).

脊椎動物細胞もまた宿主として使用できる。例えば、浮遊状態で増殖するように適応された哺乳動物細胞株は、有用であろう。有用な哺乳動物宿主細胞株の他の例は、SV40で形質転換されたサル腎CV1株 (COS-7);ヒト胎児性腎株(Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 (1977) などに記載の293または293細胞);仔ハムスター腎細胞 (BHK);マウスセルトリ細胞(Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980) などに記載のTM4細胞);サル腎細胞 (CV1);アフリカミドリザル腎細胞 (VERO-76);ヒト子宮頸部がん細胞 (HELA);イヌ腎細胞 (MDCK);buffalo系ラット肝細胞 (BRL 3A);ヒト肺細胞 (W138);ヒト肝細胞 (Hep G2);マウス乳がん (MMT 060562);TRI細胞(例えば、Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982) に記載);MRC5細胞;および、FS4細胞などである。他の有用な哺乳動物宿主細胞株は、DHFR- CHO細胞 (Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)) を含むチャイニーズハムスター卵巣 (CHO) 細胞;およびY0、NS0、およびSp2/0などの骨髄腫細胞株を含む。抗体産生に好適な特定の哺乳動物宿主細胞株の総説として、例えば、Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ), pp. 255-268 (2003) を参照のこと。 Vertebrate cells can also be used as hosts. For example, mammalian cell lines that have been adapted to grow in suspension may be useful. Other examples of useful mammalian host cell lines include SV40 transformed monkey kidney CV1 line (COS-7); human embryonic kidney line (293 or 293 cells, e.g., as described in Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 (1977)); baby hamster kidney cells (BHK); mouse Sertoli cells (TM4 cells, e.g., as described in Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980)); monkey kidney cells (CV1); African green monkey kidney cells (VERO-76); human cervical carcinoma cells (HELA); canine kidney cells (MDCK); buffalo rat hepatocytes (BRL 3A); human lung cells (W138); human hepatocytes (Hep G2); mouse mammary carcinoma (MMT 060562); TRI cells (see, e.g., Mather et al., Annals NY Acad. Sci. 383:44-68 (1982); MRC5 cells; and FS4 cells. Other useful mammalian host cell lines include Chinese hamster ovary (CHO) cells, including DHFR - CHO cells (Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); and myeloma cell lines such as Y0, NS0, and Sp2/0. For a review of certain mammalian host cell lines suitable for antibody production, see, e.g., Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (BKC Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ), pp. 255-268 (2003).

本明細書において記載される抗原結合分子の組換え産生は、抗原結合分子全体または抗原結合分子の一部を含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む1つまたは複数のベクターを含む(例えば、それによって形質転換されている)宿主細胞を用いることによって、上記に記載されたものと同様の方法で行うことができる。 Recombinant production of the antigen-binding molecules described herein can be performed in a manner similar to that described above, by using a host cell that contains (e.g., is transformed by) one or more vectors that contain a nucleic acid encoding an amino acid sequence that comprises the entire antigen-binding molecule or a portion of the antigen-binding molecule.

抗原結合分子および多重特異性抗原結合分子
本明細書で用いられる用語「抗原結合分子」は、抗原結合部位を含む任意の分子、または抗原に対する結合活性を有する任意の分子を指し、約5アミノ酸以上の長さを有するペプチドまたはタンパク質などの分子をさらに指し得る。ペプチドおよびタンパク質は、生物に由来するものに限定されず、例えば、それらは、人工的に設計された配列から産生されたポリペプチドであってもよい。それらは、天然ポリペプチド、合成ポリペプチド、組換えポリペプチド等のいずれかであってもよい。スキャフォールドとしてα/βバレルなどの公知の安定な立体構造を含み、分子の一部が抗原結合部位になる、スキャフォールド分子もまた、本明細書において記載される抗原結合分子の一態様である。
Antigen-binding molecules and multispecific antigen-binding molecules The term "antigen-binding molecule" as used herein refers to any molecule that contains an antigen-binding site or has binding activity to an antigen, and may further refer to molecules such as peptides or proteins having a length of about 5 amino acids or more. Peptides and proteins are not limited to those derived from organisms, and for example, they may be polypeptides produced from artificially designed sequences. They may be either natural polypeptides, synthetic polypeptides, recombinant polypeptides, etc. Scaffold molecules that contain a known stable conformation such as an α/β barrel as a scaffold, and a part of the molecule becomes an antigen-binding site, are also an embodiment of the antigen-binding molecules described herein.

「多重特異性抗原結合分子」は、2つ以上の抗原に特異的に結合する抗原結合分子を指す。用語「二重特異性」は、抗原結合分子が、少なくとも2種類の異なる抗原決定基に特異的に結合することができることを意味する。用語「三重特異性」は、抗原結合分子が少なくとも3種類の異なる抗原決定基に特異的に結合することができることを意味する。特定の態様において、本出願の多重特異性抗原結合分子は、三重特異性抗原結合分子、すなわち、3種類の異なる抗原に特異的に結合することができる、つまり、CD3またはCD137のいずれか一方に結合することができるが、両方の抗原に同時には結合せず、かつDLL3に特異的に結合することができる、三重特異性抗原結合分子である。 "Multispecific antigen-binding molecule" refers to an antigen-binding molecule that specifically binds to two or more antigens. The term "bispecific" means that the antigen-binding molecule can specifically bind to at least two different antigenic determinants. The term "trispecific" means that the antigen-binding molecule can specifically bind to at least three different antigenic determinants. In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule of the present application is a trispecific antigen-binding molecule, i.e., a trispecific antigen-binding molecule that can specifically bind to three different antigens, i.e., can bind to either CD3 or CD137, but not both antigens simultaneously, and can specifically bind to DLL3.

第1の局面において、本開示は、それぞれが、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分と;第3の抗原、好ましくはがん細胞/組織上に発現している抗原に結合できる第3の抗原結合部分とを含む、多重特異性抗原結合分子を提供する。ある特定の態様において、第3の抗原結合部分によって結合される第3の抗原はDLL3であり、好ましくは、ヒトDLL3である。 In a first aspect, the present disclosure provides a multispecific antigen-binding molecule comprising a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety, each capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously to CD3 and CD137; and a third antigen-binding moiety capable of binding to a third antigen, preferably an antigen expressed on a cancer cell/tissue. In certain embodiments, the third antigen bound by the third antigen-binding moiety is DLL3, preferably human DLL3.

第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分は、CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない、「Dual抗原結合部分」であってもよく、これらは以下においてより詳細に説明される。第3の抗原結合部分は、「DLL3抗原結合部分」であってもよく、これも以下においてより詳細に説明される。 The first antigen-binding moiety and the second antigen-binding moiety may be "dual antigen-binding moieties" capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously, as described in more detail below. The third antigen-binding moiety may be a "DLL3 antigen-binding moiety," as described in more detail below.

いくつかの態様において、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれはFab分子であり、第1の抗原結合部分のCH1領域と第2の抗原結合部分のCH1領域との間で形成される少なくとも1つのジスルフィド結合を含む。ジスルフィド結合は、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分の各々のCH1領域中のEUナンバリングによる191位にあるアミノ酸残基間で形成され得る。 In some embodiments, each of the first and second antigen-binding moieties is a Fab molecule and includes at least one disulfide bond formed between the CH1 region of the first antigen-binding moiety and the CH1 region of the second antigen-binding moiety. The disulfide bond can be formed between the amino acid residue at position 191 according to EU numbering in the CH1 region of each of the first and second antigen-binding moieties.

いくつかの態様において、第3の抗原結合部分は、FabまたはscFvであってもよく、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方に融合される。第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれがFab分子である場合、第3の抗原結合部分は、Fab重鎖のC末端(CH1)で、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のFab重鎖のN末端に、任意でペプチドリンカーを介して融合されてもよい。代表的なペプチドリンカーには、配列番号:248、配列番号:249、または配列番号:259のアミノ酸配列からなるものが含まれる。ある特定の態様において、第1の抗原結合部分は第2の抗原結合部分と同一である。 In some embodiments, the third antigen-binding portion may be a Fab or scFv and is fused to either the first or second antigen-binding portion. When each of the first, second, and third antigen-binding portions is a Fab molecule, the third antigen-binding portion may be fused at the C-terminus (CH1) of the Fab heavy chain to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first or second antigen-binding portion, optionally via a peptide linker. Exemplary peptide linkers include those consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO:248, SEQ ID NO:249, or SEQ ID NO:259. In certain embodiments, the first antigen-binding portion is identical to the second antigen-binding portion.

いくつかの態様において、第3の抗原結合部分は、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されており、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれが従来型のFab分子である、クロスオーバーFab分子である。 In some embodiments, the third antigen-binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light chain and the Fab heavy chain are exchanged, and each of the first and second antigen-binding portions is a conventional Fab molecule.

いくつかの態様において、第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、123位および/または124位にあるアミノ酸が、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)によって独立して置換され(Kabatによるナンバリング)、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの重鎖の定常ドメインCH1において、147位にあるアミノ酸および/または213位にあるアミノ酸が、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)によって独立して置換されている(Kabat EUインデックスによるナンバリング)。別の態様において、第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、123位および124位にあるアミノ酸がそれぞれアルギニン(R)およびリジン(K)であり(Kabatによるナンバリング)、かつ第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれの重鎖の定常ドメインCH1において、147位にあるアミノ酸および213位にあるアミノ酸がグルタミン酸(E)である(Kabat EUインデックスによるナンバリング)。 In some embodiments, in the constant domain CL of the light chain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 123 and/or 124 are independently substituted with lysine (K), arginine (R), or histidine (H) (numbering according to Kabat), and in the constant domain CH1 of the heavy chain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acid at position 147 and/or the amino acid at position 213 are independently substituted with glutamic acid (E) or aspartic acid (D) (numbering according to Kabat EU index). In another embodiment, in the constant domain CL of the light chain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 123 and 124 are arginine (R) and lysine (K), respectively (numbering according to Kabat), and in the constant domain CH1 of the heavy chain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 147 and 213 are glutamic acid (E) (numbering according to Kabat EU index).

多重特異性抗原結合分子は、以下に詳述するFcドメインをさらに含むことができる。第1のおよび第2の抗原結合部分のそれぞれがFabである場合において、第1の抗原結合部分は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1のまたは第2のサブユニットのN末端に融合されてもよく、かつ第2の抗原結合部分は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの残りのサブユニットのN末端に融合されてもよい。いくつかの態様において、第3の抗原結合部分は、C末端で第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれか一方のFab重鎖のN末端に、任意でペプチドリンカーを介して融合される。 The multispecific antigen-binding molecule may further comprise an Fc domain, as described in detail below. When each of the first and second antigen-binding moieties is a Fab, the first antigen-binding moiety may be fused at the C-terminus of the Fab heavy chain to the N-terminus of the first or second subunit of the Fc domain, and the second antigen-binding moiety may be fused at the C-terminus of the Fab heavy chain to the N-terminus of the remaining subunit of the Fc domain. In some embodiments, the third antigen-binding moiety is fused at the C-terminus to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first or second antigen-binding moiety, optionally via a peptide linker.

本発明の別の局面において、本開示は、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない、抗原結合部分と;DLL3、好ましくはヒトDLL3に結合できる抗原結合部分とを含む、多重特異性抗原結合分子を提供する。ある特定の態様において、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない、抗原結合部分は、以下において詳細に説明される、CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない「Dual抗原結合部分」である。 In another aspect of the present invention, the present disclosure provides a multispecific antigen-binding molecule comprising an antigen-binding portion capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously; and an antigen-binding portion capable of binding to DLL3, preferably human DLL3. In certain embodiments, the antigen-binding portion capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously, is a "dual antigen-binding portion" capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously, as described in detail below.

本発明の多重特異性抗原結合分子の構成成分は、様々な配置で相互に融合することができる。例示的な配置は、表10-1~10-3と合わせて読む図1 a)に図示される。 The components of the multispecific antigen-binding molecules of the invention can be fused to each other in a variety of configurations. Exemplary configurations are illustrated in Figure 1a) read in conjunction with Tables 10-1 to 10-3.

上記態様のいずれかによれば、多重特異性抗原結合分子の構成成分(例えば、 抗原結合部分、Fcドメイン)は、直接的に、または種々のリンカー、特に、本明細書において記載されているかまたは当技術分野において公知である1つもしくは複数のアミノ酸、典型的には約2~20個のアミノ酸を含むペプチドリンカーを通じて、融合させてもよい。適切な非免疫原性ペプチドリンカーには、例えば、(G4S)n、(SG4)n、(G4S)n、またはG4(SG4)nペプチドリンカーが含まれ、ここで、nは概して1~10、典型的には2~4の数である。 According to any of the above embodiments, the components of the multispecific antigen-binding molecule (e.g., antigen-binding portion, Fc domain) may be fused directly or through various linkers, particularly peptide linkers comprising one or more amino acids, typically about 2-20 amino acids, as described herein or known in the art. Suitable non-immunogenic peptide linkers include, for example, (G4S)n, (SG4)n, (G4S)n, or G4(SG4)n peptide linkers, where n is generally a number between 1 and 10, typically between 2 and 4.

ピログルタミル化
抗体が細胞において発現した場合、抗体は翻訳後に修飾されることが知られている。翻訳後修飾の例としては、重鎖のC末端にあるリジンの、カルボキシペプチダーゼによる切断;重鎖および軽鎖のN末端にあるグルタミンまたはグルタミン酸の、ピログルタミル化によるピログルタミン酸への修飾;グリコシル化;酸化;脱アミド;および糖化が挙げられ、そのような翻訳後修飾は種々の抗体で生じることが公知である(Journal of Pharmaceutical Sciences, 2008, Vol. 97, p. 2426-2447)。
It is known that when pyroglutamylated antibody is expressed in cells, the antibody is modified after translation.Examples of post-translational modifications include cleavage of lysine at C-terminus of heavy chain by carboxypeptidase; modification of glutamine or glutamic acid at N-terminus of heavy chain and light chain to pyroglutamic acid by pyroglutamylation; glycosylation; oxidation; deamidation; and glycation, and such post-translational modifications are known to occur in various antibodies (Journal of Pharmaceutical Sciences, 2008, Vol. 97, p. 2426-2447).

いくつかの態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子は、翻訳後修飾を含む。翻訳後修飾の例としては、重鎖可変領域のN末端でのピログルタミル化および/または重鎖のC末端でのリジンの欠失が挙げられる。当分野において、N末端でのピログルタミル化およびC末端でのリジンの欠失によるそのような翻訳後修飾が、抗体の活性に何ら影響を有さないことは公知である(Analytical Biochemistry, 2006, Vol. 348, p. 24-39)。 In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecules of the present invention include post-translational modifications. Examples of post-translational modifications include pyroglutamylation at the N-terminus of the heavy chain variable region and/or deletion of lysine at the C-terminus of the heavy chain. It is known in the art that such post-translational modifications by pyroglutamylation at the N-terminus and deletion of lysine at the C-terminus have no effect on the activity of the antibody (Analytical Biochemistry, 2006, Vol. 348, p. 24-39).

抗原結合部分
本明細書で用いられる用語「抗原結合部分」は、抗原に特異的に結合するポリペプチド分子を指す。1つの態様において、抗原結合部分は、それが結合している実体を、標的部位、例えばがん抗原(DLL3)を発現する特定の種類の腫瘍細胞へと方向付けることができる。別の態様において、抗原結合部分は、その標的抗原、例えばT細胞受容体複合体抗原(特に、CD3)および/または共刺激受容体(CD137)を通じてシグナル伝達を活性化することができる。抗原結合部分には、本明細書においてさらに定義される抗体およびその断片が含まれる。具体的な抗原結合部分としては、抗体重鎖可変領域および抗体軽鎖可変領域を含む、抗体の抗原結合ドメインまたは抗体可変領域が挙げられる。特定の態様において、抗原結合部分は、本明細書においてさらに定義されかつ当技術分野において公知である抗体定常領域を含んでもよい。有用な重鎖定常領域には、5つのアイソタイプ:α、δ、ε、γ、またはμのいずれかが含まれる。有用な軽鎖定常領域には、2つのアイソタイプ:κおよびλのいずれかが含まれる。
Antigen-binding moiety The term "antigen-binding moiety" as used herein refers to a polypeptide molecule that specifically binds to an antigen. In one embodiment, an antigen-binding moiety can direct the entity to which it is bound to a target site, for example, a specific type of tumor cell expressing a cancer antigen (DLL3). In another embodiment, an antigen-binding moiety can activate signaling through its target antigen, for example, a T-cell receptor complex antigen (particularly CD3) and/or a costimulatory receptor (CD137). Antigen-binding moieties include antibodies and fragments thereof as further defined herein. Particular antigen-binding moieties include the antigen-binding domain of an antibody or antibody variable region, including an antibody heavy chain variable region and an antibody light chain variable region. In certain embodiments, an antigen-binding moiety may include an antibody constant region as further defined herein and known in the art. Useful heavy chain constant regions include any of the five isotypes: alpha, delta, epsilon, gamma, or mu. Useful light chain constant regions include any of the two isotypes: kappa and lambda.

抗原結合部分等に関して、本明細書で用いられる用語「第1の」、「第2の」、および「第3の」は、2種類以上の種類別の部分等が存在する場合に区別するという利便性のために用いられる。これらの用語の使用は、別段明示しない限り、多重特異性抗原結合分子の特定の順序または向きを付与することを意図しない。 As used herein, the terms "first," "second," and "third" with respect to antigen-binding moieties are used for convenience to distinguish when two or more types of moieties are present. The use of these terms is not intended to confer a particular order or orientation of the multispecific antigen-binding molecules, unless otherwise specified.

別の局面において、本明細書において開示される本発明の抗原結合部分は、本明細書において開示される抗原結合部分の1つまたは複数を含む新規のキメラ抗原受容体(CAR)において用いることができる。ある特定の態様において、本発明のCARはscFv構築物を含み、好ましい態様において、本明細書において開示されるような重鎖および軽鎖可変領域を含む。好ましい態様において、開示されるキメラ抗原受容体は、増殖性疾患およびその任意の再発または転移を治療または予防するのに有用である。 In another aspect, the antigen-binding portions of the invention disclosed herein can be used in novel chimeric antigen receptors (CARs) comprising one or more of the antigen-binding portions disclosed herein. In certain embodiments, the CARs of the invention comprise scFv constructs, which in preferred embodiments comprise heavy and light chain variable regions as disclosed herein. In preferred embodiments, the disclosed chimeric antigen receptors are useful for treating or preventing proliferative diseases and any recurrence or metastasis thereof.

CD3およびCD137に結合できるが、同時には結合しない、抗原結合部分
本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない、少なくとも1つの抗原結合部分(本明細書において「Dual抗原結合部分」または「第1の抗原結合部分」または「Dual-Fab」または「Dual-Ig」とも呼ばれる)を含む。1つの態様において、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない抗原結合部分は、ヒトCD3に結合する抗原結合部分である。別の態様において、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない抗原結合部分は、ヒトCD137に結合する抗原結合部分である。別の態様において、CD3およびCD137に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合しない抗原結合部分は、ヒトCD3およびヒトCD137に結合できる抗原結合部分であり、抗原結合部分は、ヒトCD3およびヒトCD137のいずれか一方に結合する。特定の態様において、多重特異性抗原結合分子は、2つのDual抗原結合部分(それぞれが「Dual-Fab」と呼ばれ得る、「第1の抗原結合部分」および「第2の抗原結合部分」)を含む。いくつかの態様において、2つのDual抗原結合部分のそれぞれ(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、CD3またはCD137に対する一価の結合をもたらすが、CD3およびCD137に同時には結合しない。特定の態様において、多重特異性抗原結合分子は、2つ以下のDual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)を含む。
Antigen-binding moiety that can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously The multispecific antigen-binding molecule described herein comprises at least one antigen-binding moiety that can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously (also referred to herein as "Dual antigen-binding moiety" or "first antigen-binding moiety" or "Dual-Fab" or "Dual-Ig"). In one embodiment, the antigen-binding moiety that can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously is an antigen-binding moiety that binds to human CD3. In another embodiment, the antigen-binding moiety that can bind to CD3 and CD137 but not simultaneously is an antigen-binding moiety that binds to human CD137. In another embodiment, the antigen-binding moiety capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously, is an antigen-binding moiety capable of binding to human CD3 and human CD137, and the antigen-binding moiety binds to either human CD3 or human CD137. In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule comprises two Dual antigen-binding moieties (a "first antigen-binding moiety" and a "second antigen-binding moiety," each of which may be referred to as a "Dual-Fab"). In some embodiments, each of the two Dual antigen-binding moieties (the "first antigen-binding moiety" or the "second antigen-binding moiety" or the "Dual-Fab") provides monovalent binding to CD3 or CD137, but does not simultaneously bind to CD3 and CD137. In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule comprises no more than two Dual antigen-binding moieties (the "first antigen-binding moiety" or the "second antigen-binding moiety" or the "Dual-Fab").

特定の態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は一般に、Fab分子、特に従来型のFab分子である。特定の態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、抗体軽鎖および重鎖可変領域(VLおよびVH)を含むドメインである。抗体軽鎖および重鎖可変領域を含む、そのようなドメインの適切な例としては、「単鎖Fv(scFv)」、「単鎖抗体」、「Fv」、「単鎖Fv 2(scFv2)」、「Fab」、「F(ab’)2」等が挙げられる。 In certain embodiments, the Dual antigen-binding moiety ("first antigen-binding moiety" or "second antigen-binding moiety" or "Dual-Fab") is generally a Fab molecule, in particular a conventional Fab molecule. In certain embodiments, the Dual antigen-binding moiety ("first antigen-binding moiety" or "second antigen-binding moiety" or "Dual-Fab") is a domain comprising an antibody light chain and a heavy chain variable region (VL and VH). Suitable examples of such domains comprising an antibody light chain and a heavy chain variable region include "single chain Fv (scFv)", "single chain antibody", "Fv", "single chain Fv2 (scFv2)", "Fab", "F(ab') 2 ", etc.

特定の態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、CD3の全体もしくはその部分ペプチドの一部分に特異的に結合する。特定の態様において、CD3はヒトCD3またはカニクイザルCD3、特にヒトCD3である。特定の態様において、第1の抗原結合部分は、ヒトおよびカニクイザルCD3に対し交差反応性を有する(すなわち、それらに特異的に結合する)。いくつかの態様において、第1の抗原結合部分は、CD3のεサブユニット、特に、配列番号:7(NP_000724.1)(括弧内にRefSeq登録番号を示す)に示されるCD3のヒトCD3εサブユニットに特異的に結合することができる。いくつかの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、真核細胞の表面上に発現しているCD3ε鎖に特異的に結合することができる。いくつかの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、T細胞の表面上に発現しているCD3ε鎖に結合する。 In certain embodiments, the Dual antigen-binding portion ("first antigen-binding portion" or "second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") specifically binds to the whole of CD3 or a portion of a peptide thereof. In certain embodiments, the CD3 is human CD3 or cynomolgus CD3, particularly human CD3. In certain embodiments, the first antigen-binding portion is cross-reactive with (i.e., specifically binds to) human and cynomolgus CD3. In some embodiments, the first antigen-binding portion can specifically bind to the ε subunit of CD3, particularly the human CD3ε subunit of CD3 as set forth in SEQ ID NO:7 (NP_000724.1) (RefSeq accession number in parentheses). In some embodiments, the Dual antigen-binding portion ("first antigen-binding portion" or "second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") can specifically bind to the CD3ε chain expressed on the surface of a eukaryotic cell. In some embodiments, the Dual antigen-binding moiety ("first antigen-binding moiety" or "second antigen-binding moiety" or "Dual-Fab") binds to the CD3ε chain expressed on the surface of a T cell.

特定の態様において、CD137はヒトCD137である。いくつかの態様において、本発明の抗原結合分子の好適な例には、以下:
SPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAECDCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC配列(配列番号:21)を含む領域を認識する抗体、
DCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC配列(配列番号:35)を含む領域を認識する抗体、
LQDPCSNCPAGTFCDNNRNQICSPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAEC配列(配列番号:49)を含む領域を認識する抗体、および
ヒトCD137タンパク質中のLQDPCSNCPAGTFCDNNRNQIC配列(配列番号:105)を含む領域を認識する抗体
からなる群より選択される抗体によって結合されるヒトCD137エピトープと同じエピトープに結合する、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)が挙げられる。
In certain embodiments, CD137 is human CD137. In some embodiments, preferred examples of the antigen-binding molecules of the present invention include the following:
an antibody recognizing a region including the sequence SPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAECDCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC (SEQ ID NO: 21);
An antibody recognizing a region including the sequence DCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC (SEQ ID NO: 35);
and an antibody recognizing a region including the sequence LQDPCSNCPAGTFCDNNRNQICSPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAEC (SEQ ID NO: 49), and an antibody recognizing a region including the sequence LQDPCSNCPAGTFCDNNRNQIC (SEQ ID NO: 105) in the human CD137 protein.

特定の態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、以下の表1に示される抗体可変領域配列のいずれか1つを含む。特定の態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、表1に示される重鎖可変領域および軽鎖可変領域の組み合わせのいずれか1つを含む。 In certain embodiments, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises any one of the antibody variable region sequences shown in Table 1 below. In certain embodiments, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises any one of the combinations of heavy chain variable region and light chain variable region shown in Table 1.

(表1)Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)の可変領域の配列番号

Figure 0007557922000001
Table 1: SEQ ID NOs of the variable regions of the dual antigen-binding portion (the "first antigen-binding portion" or the "second antigen-binding portion" or the "Dual-Fab").
Figure 0007557922000001

1つの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、配列番号:6に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:58に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:6, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:58. In one embodiment, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:6 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:58.

1つの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、配列番号:14に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:58に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、配列番号:14のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:14, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:58. In one embodiment, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:14, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:58.

1つの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、配列番号:81に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:58に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、配列番号:81のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:81, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:58. In one embodiment, the Dual antigen-binding portion ("First antigen-binding portion" or "Second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:81 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:58.

特定の態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)は、以下の表2に示されるHVR配列の組み合わせのいずれか1つを含む。 In certain embodiments, the Dual antigen-binding portion ("first antigen-binding portion" or "second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") comprises any one of the combinations of HVR sequences shown in Table 2 below.

(表2)Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)のHVR(CDR)配列の配列番号

Figure 0007557922000002
Table 2: SEQ ID NOs of HVR (CDR) sequences of dual antigen-binding portions ("first antigen-binding portion" or "second antigen-binding portion" or "Dual-Fab")
Figure 0007557922000002

いくつかの態様において、Dual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)はそれぞれ、以下の(a1)~(a17)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:17の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:31の重鎖CDR 2、配列番号:45の重鎖CDR 3、配列番号:64の軽鎖CDR 1、配列番号:69の軽鎖CDR 2、および配列番号:74の軽鎖CDR 3;
(a2)配列番号:18の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:32の重鎖CDR 2、配列番号:46の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a3)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a4)配列番号:19の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:33の重鎖CDR 2、配列番号:47の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3;
(a5)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a6)配列番号:22の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:36の重鎖CDR 2、配列番号:50の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a7)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a8)配列番号:23の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:37の重鎖CDR 2、配列番号:51の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3;
(a9)配列番号:24の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:38の重鎖CDR 2、配列番号:52の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a10)配列番号:25の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:39の重鎖CDR 2、配列番号:53の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3;
(a11)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:66の軽鎖CDR 1、配列番号:71の軽鎖CDR 2、および配列番号:76の軽鎖CDR 3;
(a12)配列番号:26の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:40の重鎖CDR 2、配列番号:54の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a13)配列番号:27の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:41の重鎖CDR 2、配列番号:55の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a14)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3;
(a15)配列番号:82の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:83の重鎖CDR 2、配列番号:84の重鎖CDR 3、配列番号:65の軽鎖CDR 1、配列番号:70の軽鎖CDR 2、および配列番号:75の軽鎖CDR 3;
(a16)(a1)~(a15)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a17)(a1)~(a15)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む。
In some embodiments, the Dual antigen-binding portion (the "first antigen-binding portion" or the "second antigen-binding portion" or the "Dual-Fab") is any one of the following (a1) to (a17):
(a1) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 17, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 31, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 45, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 64, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 69, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 74;
(a2) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 18, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 32, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 46, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a3) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a4) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 19, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 33, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 47, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a5) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a6) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 22, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 36, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 50, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a7) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a8) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 23, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 37, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 51, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a9) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 24, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 38, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 52, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a10) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 25, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 39, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 53, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a11) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 66, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 71, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 76;
(a12) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 26, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 40, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 54, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a13) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 27, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 41, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 55, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a14) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a15) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 82, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 83, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 84, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 65, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 70, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 75;
(a16) an antibody variable region that binds to the same epitope as any of the antibody variable regions selected from (a1) to (a15); and (a17) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a15).

いくつかの態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDual抗原結合部分(「第1の抗原結合部分」または「第2の抗原結合部分」または「Dual-Fab」)には、翻訳後修飾も含まれる。翻訳後修飾の例としては、重鎖可変領域のN末端でのピログルタミル化および/または重鎖のC末端でのリジンの欠失が挙げられる。この分野において、N末端でのピログルタミル化およびC末端でのリジンの欠失によるそのような翻訳後修飾は、抗体の活性に何ら影響を有さないことが公知である(Analytical Biochemistry, 2006, Vol. 348, p. 24-39)。 In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecules or Dual antigen-binding portions of the present invention ("first antigen-binding portion" or "second antigen-binding portion" or "Dual-Fab") also include post-translational modifications. Examples of post-translational modifications include pyroglutamylation at the N-terminus of the heavy chain variable region and/or deletion of lysine at the C-terminus of the heavy chain. It is known in the art that such post-translational modifications by pyroglutamylation at the N-terminus and deletion of lysine at the C-terminus have no effect on the activity of the antibody (Analytical Biochemistry, 2006, Vol. 348, p. 24-39).

DLL3に結合できる抗原結合部分
本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、デルタ様3(DLL3)に結合できる抗原結合部分(本明細書において「DLL3抗原結合部分」または「第3の抗原結合部分」または「DLL3に結合する抗原結合部分」とも呼ばれる)を少なくとも1つ含む。
Antigen-binding moiety capable of binding to DLL3 The multispecific antigen-binding molecules described herein comprise at least one antigen-binding moiety capable of binding to Delta-like 3 (DLL3) (also referred to herein as a "DLL3 antigen-binding moiety" or a "third antigen-binding moiety" or an "antigen-binding moiety that binds DLL3").

ある特定の態様において、多重特異性抗原結合分子は、DLL3に結合できる抗原結合部分を1つ含む。ある特定の態様において、多重特異性抗原結合分子は、DLL3に結合できる抗原結合部分(「DLL3抗原結合部分」)を2つ含む。特定のそのような態様において、これらの抗原結合部分のそれぞれは、DLL3の同じエピトープに特異的に結合する。さらにより具体的な態様において、これらの「DLL3抗原結合部分」はすべて、同一である。1つの態様において、多重特異性抗原結合分子は、DLL3に特異的に結合できる免疫グロブリン分子(「DLL3抗原結合部分」)を含む。1つの態様において、多重特異性抗原結合分子は、DLL3に結合できる抗原結合部分(「DLL3抗原結合部分」)を2つ以下含む。 In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule comprises one antigen-binding moiety capable of binding to DLL3. In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule comprises two antigen-binding moieties capable of binding to DLL3 ("DLL3 antigen-binding moieties"). In certain such embodiments, each of these antigen-binding moieties specifically binds to the same epitope of DLL3. In even more specific embodiments, all of these "DLL3 antigen-binding moieties" are identical. In one embodiment, the multispecific antigen-binding molecule comprises an immunoglobulin molecule capable of specifically binding to DLL3 ("DLL3 antigen-binding moiety"). In one embodiment, the multispecific antigen-binding molecule comprises no more than two antigen-binding moieties capable of binding to DLL3 ("DLL3 antigen-binding moieties").

ある特定の態様において、DLL3抗原結合部分は、クロスオーバーFab分子、すなわち、Fab重鎖および軽鎖の可変領域または定常領域のいずれかが交換されているDLL3分子である。ある特定の態様において、DLL3抗原結合部分は、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子である。 In certain embodiments, the DLL3 antigen binding portion is a crossover Fab molecule, i.e., a DLL3 molecule in which either the variable or constant regions of the Fab heavy and light chains have been swapped. In certain embodiments, the DLL3 antigen binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light and Fab heavy chains have been swapped.

いくつかの態様において、DLL3抗原結合部分は、DLL3の細胞外ドメインに特異的に結合する。いくつかの態様において、DLL3抗原結合部分は、DLL3の細胞外ドメイン内のエピトープに特異的に結合する。いくつかの態様において、DLL3抗原結合部分は、真核細胞の表面上に発現しているDLL3タンパク質に結合する。いくつかの態様において、DLL3抗原結合部分は、がん細胞の表面上に発現しているDLL3タンパク質に結合する。 In some embodiments, the DLL3 antigen binding portion specifically binds to an extracellular domain of DLL3. In some embodiments, the DLL3 antigen binding portion specifically binds to an epitope within the extracellular domain of DLL3. In some embodiments, the DLL3 antigen binding portion binds to a DLL3 protein expressed on the surface of a eukaryotic cell. In some embodiments, the DLL3 antigen binding portion binds to a DLL3 protein expressed on the surface of a cancer cell.

いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、細胞外ドメイン(ECD)内、すなわち、N末端からTM領域の直前までだが、TM領域またはC末端細胞内ドメインまでではない、ドメイン内のエピトープに結合する。多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ECD内の上述のドメイン/領域のいずれか内のエピトープに結合し得る。好ましい態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、EGF6からTM領域の直前までの領域内のエピトープに結合する。より具体的には、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ヒトDLL3中の配列番号:89で定義される領域内のエピトープに結合し得る。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ヒトDLL3のEGF1、EGF2、EGF3、EGF4、EGF5、もしくはEGF6領域、またはEGF6からTM領域の直前までの領域、またはヒトDLL3のEGF1、EGF2、EGF3、EGF4、EGF5、もしくはEGF6領域、またはEGF6からTM領域の直前までの領域内のエピトープに結合する。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、結合されるDLL3エピトープが特性解析されているこれまでの報告された抗DLL3抗体(例えば、WO2019131988およびWO2011093097)に由来し得る。 In some embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion binds to an epitope within the extracellular domain (ECD), i.e., the domain from the N-terminus to just before the TM region, but not to the TM region or the C-terminal intracellular domain. The multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion may bind to an epitope within any of the above-mentioned domains/regions within the ECD. In a preferred embodiment, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion binds to an epitope within the region from EGF6 to just before the TM region. More specifically, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion may bind to an epitope within the region defined by SEQ ID NO: 89 in human DLL3. In some embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion binds to an epitope within the EGF1, EGF2, EGF3, EGF4, EGF5, or EGF6 region of human DLL3, or the region from EGF6 to just before the TM region, or the EGF1, EGF2, EGF3, EGF4, EGF5, or EGF6 region of human DLL3, or the region from EGF6 to just before the TM region. In some embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion can be derived from a previously reported anti-DLL3 antibody (e.g., WO2019131988 and WO2011093097) in which the DLL3 epitope bound has been characterized.

特定の態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、以下の表3に示す抗体可変領域配列のいずれか1つを含む。特定の態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、表3に示す重鎖可変領域および軽鎖可変領域の組み合わせのいずれか1つを含む。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、表3に示す抗体可変領域のいずれか1つとDLL3への結合について競合する抗体可変断片を含むドメインを含む。 In certain embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion comprises any one of the antibody variable region sequences shown in Table 3 below. In certain embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion comprises any one of the combinations of heavy chain variable region and light chain variable region shown in Table 3. In some embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion comprises a domain comprising an antibody variable fragment that competes for binding to DLL3 with any one of the antibody variable regions shown in Table 3.

(表3)例示的なDLL3抗原結合部分の可変領域の配列番号

Figure 0007557922000003
Table 3. SEQ ID NOs for the variable regions of exemplary DLL3 antigen binding moieties
Figure 0007557922000003

1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:232に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:236に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:232のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:236のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:232, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:236. In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:232, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:236.

1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:300に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:236に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:300のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:236のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:300, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:236. In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:300, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:236.

1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:301に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:236に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:301のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:236のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:301, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:236. In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:301, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:236.

1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:274に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:275に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:274のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:275のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:274, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:275. In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:274, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:275.

1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:264に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である重鎖可変領域配列、および配列番号:265に対して少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である軽鎖可変領域配列を含む。1つの態様において、DLL3抗原結合部分は、配列番号:264のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号:265のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。 In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:264, and a light chain variable region sequence that is at least about 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to SEQ ID NO:265. In one embodiment, the DLL3 antigen binding portion comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:264, and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:265.

特定の態様において、DLL3抗原結合部分は、以下の表4に示すHVR配列の組み合わせのいずれか1つを含む。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、表4に示す抗体可変領域のいずれか1つとDLL3への結合について競合するか、または表4に示す抗体可変領域のHVR領域と同一であるHVR配列を含む任意の抗体可変断片とDLL3への結合について競合する、抗体可変断片を含むドメインを含む。 In certain embodiments, the DLL3 antigen binding portion comprises any one of the combinations of HVR sequences shown in Table 4 below. In some embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion comprises a domain that comprises an antibody variable fragment that competes for binding to DLL3 with any one of the antibody variable regions shown in Table 4 or that competes for binding to DLL3 with any antibody variable fragment that comprises an HVR sequence that is identical to an HVR region of an antibody variable region shown in Table 4.

(表4)例示的なDLL3抗原結合部分のHVR(CDR)配列の配列番号

Figure 0007557922000004
Table 4. SEQ ID NOs for HVR (CDR) sequences of exemplary DLL3 antigen binding portions
Figure 0007557922000004

いくつかの態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、以下の(a1)~(a5)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:233の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:234の重鎖CDR 2、配列番号:235の重鎖CDR 3、配列番号:237の軽鎖CDR 1、配列番号:238の軽鎖CDR 2、および配列番号:239の軽鎖CDR 3;
(a2)配列番号:276の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:277の重鎖CDR 2、配列番号:278の重鎖CDR 3、配列番号:279の軽鎖CDR 1、配列番号:280の軽鎖CDR 2、および配列番号:281の軽鎖CDR 3;
(a3)配列番号:285の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号:286の重鎖CDR 2、配列番号:287の重鎖CDR 3、配列番号:288の軽鎖CDR 1、配列番号:289の軽鎖CDR 2、および配列番号:290の軽鎖CDR 3;
(a4)(a1)~(a3)から選択される抗体可変領域のいずれかと同じエピトープに結合する抗体可変領域;ならびに
(a5)(a1)~(a3)から選択される抗体可変断片のいずれかの結合と競合する抗体可変断片
を含む抗体可変領域を含む。
In some embodiments, the multispecific antigen binding molecule or DLL3 antigen binding portion of the invention comprises any one of the following (a1) to (a5):
(a1) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 233, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 234, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 235, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 237, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 238, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 239;
(a2) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 276, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 277, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 278, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 279, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 280, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 281;
(a3) heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 285, heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 286, heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 287, light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 288, light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 289, and light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 290;
(a4) an antibody variable region that binds to the same epitope as any of the antibody variable regions selected from (a1) to (a3); and (a5) an antibody variable region that comprises an antibody variable fragment that competes with the binding of any of the antibody variable fragments selected from (a1) to (a3).

いくつかの態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分には、翻訳後修飾も含まれる。翻訳後修飾の例としては、重鎖可変領域のN末端でのピログルタミル化および/または重鎖のC末端でのリジンの欠失が挙げられる。この分野において、N末端でのピログルタミル化およびC末端でのリジンの欠失によるそのような翻訳後修飾は、抗体の活性に何ら影響を有さないことが公知である(Analytical Biochemistry, 2006, Vol. 348, p. 24-39)。 In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecules or DLL3 antigen-binding portions of the present invention also include post-translational modifications. Examples of post-translational modifications include pyroglutamylation at the N-terminus of the heavy chain variable region and/or deletion of lysine at the C-terminus of the heavy chain. It is known in the art that such post-translational modifications by pyroglutamylation at the N-terminus and deletion of lysine at the C-terminus have no effect on the activity of the antibody (Analytical Biochemistry, 2006, Vol. 348, p. 24-39).

別の局面において、本発明のDLL3抗原結合部分は、DLL3結合ドメインを組み込む新たなキメラ抗原受容体(CAR)(DLL3 CAR)において用いることができる。ある特定の態様において、本発明のDLL3結合ドメイン(およびDLL3 CAR)は、scFv構築物を含み、好ましい態様において、本明細書において開示されるような重鎖および軽鎖可変領域を含む。他の好ましい態様において、本発明のDLL3結合ドメイン(およびDLL3 CAR)は、本明細書において開示される重鎖および軽鎖可変領域を含むscFv構築物またはその断片を含む。好ましい態様において、開示されるキメラ抗原受容体は、増殖性疾患およびその任意の再発または転移を治療または予防するのに有用である。 In another aspect, the DLL3 antigen binding portion of the present invention can be used in a new chimeric antigen receptor (CAR) incorporating a DLL3 binding domain (DLL3 CAR). In certain embodiments, the DLL3 binding domain of the present invention (and DLL3 CAR) comprises an scFv construct, which in a preferred embodiment comprises heavy and light chain variable regions as disclosed herein. In other preferred embodiments, the DLL3 binding domain of the present invention (and DLL3 CAR) comprises an scFv construct or fragment thereof comprising heavy and light chain variable regions disclosed herein. In a preferred embodiment, the disclosed chimeric antigen receptor is useful for treating or preventing a proliferative disease and any recurrence or metastasis thereof.

ある特定の態様において、DLL3タンパク質は腫瘍始原細胞上に発現している。DLL3 CARは、遺伝子改変(例えば、形質導入)を介して細胞傷害性リンパ球(好ましくは自己細胞傷害性リンパ球)上に発現し、DLL3陽性腫瘍細胞を標的としかつそれを殺傷するために用いることができるDLL3感受性リンパ球をもたらす。本明細書において広く論じられるように、本発明のCARは典型的には、細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ある特定のリンパ球を活性化し、DLL3陽性腫瘍細胞の免疫応答を生じさせるDLL3結合ドメインを含む。本発明の選択される態様は、開示されたCARを示す免疫学的に活性な宿主細胞、ならびに本発明のDLL3 CARをコードする種々のポリヌクレオチド配列およびベクターを含む。他の局面には、DLL3 CAR分子を発現する宿主細胞をがんに罹患している個体に導入し、個体を治療することによって、個体におけるTリンパ球またはナチュラルキラー(NK)細胞の活性を増強する方法が含まれる。そのような局面には、特に、肺がん(例えば、小細胞肺がん)および黒色腫が含まれる。 In certain embodiments, the DLL3 protein is expressed on tumor-initiating cells. The DLL3 CAR is expressed on cytotoxic lymphocytes (preferably autologous cytotoxic lymphocytes) via genetic modification (e.g., transduction) to result in DLL3-sensitive lymphocytes that can be used to target and kill DLL3-positive tumor cells. As broadly discussed herein, the CARs of the invention typically include an extracellular domain, a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain, and include a DLL3-binding domain that activates certain lymphocytes and generates an immune response of DLL3-positive tumor cells. Selected embodiments of the invention include immunologically active host cells that exhibit the disclosed CARs, as well as various polynucleotide sequences and vectors that encode the DLL3 CARs of the invention. Other aspects include methods of enhancing the activity of T lymphocytes or natural killer (NK) cells in an individual by introducing host cells expressing a DLL3 CAR molecule into an individual suffering from cancer and treating the individual. Such aspects include, inter alia, lung cancer (e.g., small cell lung cancer) and melanoma.

抗原
本明細書で用いられる用語「抗原」は、抗原結合部分が結合するポリペプチド巨大分子上の部位(例えば、連続した一続きのアミノ酸、または非連続アミノ酸の別々の領域から構成される立体構造)を指し、抗原結合部分-抗原複合体を形成する。有用な抗原決定基は、例えば、腫瘍細胞の表面上に、ウイルス感染細胞の表面上に、他の疾患細胞の表面上に、免疫細胞の表面上に、血清中に遊離した状態で、および/または細胞外基質(ECM)中に見出すことができる。別段示さない限り、本明細書において抗原と称されるタンパク質(例えば、CD3、CD137、DLL3)は、霊長類(例えば、ヒト)およびげっ歯類(例えば、マウスおよびラット)などの哺乳動物を含む、任意の脊椎動物供給源由来のタンパク質の任意の天然形態であり得る。特定の態様において、抗原はヒトCD3、ヒトCD137、またはヒトDLL3である。本明細書において特定のタンパク質への言及がなされる場合、該用語は、「全長」の、プロセシングを受けていないタンパク質、ならびに細胞中でのプロセシングによって生じるタンパク質の任意の形態を包含する。該用語はまた、タンパク質の天然に存在するバリアント、例えば、スプライスバリアントまたは対立遺伝子バリアントも包含する。
Antigens The term "antigen" as used herein refers to the site on a polypeptide macromolecule to which an antigen-binding moiety binds (e.g., a three-dimensional structure composed of a continuous stretch of amino acids or a discrete region of non-contiguous amino acids) to form an antigen-binding moiety-antigen complex. Useful antigenic determinants can be found, for example, on the surface of tumor cells, on the surface of virus-infected cells, on the surface of other diseased cells, on the surface of immune cells, free in serum, and/or in the extracellular matrix (ECM). Unless otherwise indicated, the proteins referred to herein as antigens (e.g., CD3, CD137, DLL3) can be any native form of the protein from any vertebrate source, including mammals such as primates (e.g., humans) and rodents (e.g., mice and rats). In certain embodiments, the antigen is human CD3, human CD137, or human DLL3. When a particular protein is referred to herein, the term encompasses the "full-length", unprocessed protein, as well as any form of the protein that results from processing in the cell. The term also encompasses naturally occurring variants of the protein, such as splice variants or allelic variants.

特定の態様において、本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、異なる種のCD3、CD137、またはDLL3の間で保存されているCD3、CD137、またはDLL3のエピトープに結合する。特定の態様において、本出願の多重特異性抗原結合分子は、三重特異性抗原結合分子、すなわち、3種類の異なる抗原に特異的に結合することができる、つまり、CD3またはCD137のいずれか一方に結合することができるが、両方の抗原に同時には結合せず、かつDLL3に特異的に結合することができる、三重特異性抗原結合分子である。 In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecules described herein bind to epitopes of CD3, CD137, or DLL3 that are conserved among different species of CD3, CD137, or DLL3. In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecules of the present application are trispecific antigen-binding molecules, i.e., trispecific antigen-binding molecules that can specifically bind to three different antigens, i.e., can bind to either CD3 or CD137, but not both antigens simultaneously, and can specifically bind to DLL3.

特定の態様において、多重特異性抗原結合分子は、CD3の部分ペプチドの全体または一部に特異的に結合する。特定の態様において、CD3はヒトCD3またはカニクイザルCD3、最も典型的にはヒトCD3である。特定の態様において、多重特異性抗原結合分子は、ヒトCD3およびカニクイザルCD3に対して交差反応性である(すなわち、それらに特異的に結合する)。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子は、CD3のεサブユニット、特に、配列番号:7(NP_000724.1)(括弧内にRefSeq登録番号を示す)に示されるCD3のヒトCD3εサブユニットに特異的に結合することができる。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子は、真核細胞の表面上に発現しているCD3ε鎖に特異的に結合することができる。いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子は、T細胞の表面上に発現しているCD3ε鎖に結合する。 In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule specifically binds to all or part of a partial peptide of CD3. In certain embodiments, the CD3 is human CD3 or cynomolgus CD3, most typically human CD3. In certain embodiments, the multispecific antigen-binding molecule is cross-reactive with (i.e., specifically binds to) human CD3 and cynomolgus CD3. In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecule can specifically bind to the ε subunit of CD3, in particular the human CD3ε subunit of CD3 as set forth in SEQ ID NO: 7 (NP_000724.1) (RefSeq accession number in parentheses). In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecule can specifically bind to the CD3ε chain expressed on the surface of eukaryotic cells. In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecule binds to the CD3ε chain expressed on the surface of T cells.

特定の態様において、CD137はヒトCD137である。いくつかの態様において、本発明の抗原結合分子の好適な例には、以下からなる群:
SPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAECDCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC配列(配列番号:21)を含む領域を認識する抗体、
DCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC配列(配列番号:35)を含む領域を認識する抗体、
LQDPCSNCPAGTFCDNNRNQICSPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAEC配列(配列番号:49)を含む領域を認識する抗体、および
ヒトCD137タンパク質中のLQDPCSNCPAGTFCDNNRNQIC配列(配列番号:105)を含む領域を認識する抗体
より選択される抗体によって結合されるヒトCD137エピトープと同じエピトープに結合する抗原結合分子が含まれる。
In certain embodiments, CD137 is human CD137. In some embodiments, preferred examples of the antigen-binding molecules of the present invention include those selected from the group consisting of:
an antibody recognizing a region including the sequence SPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAECDCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC (SEQ ID NO: 21);
An antibody recognizing a region including the sequence DCTPGFHCLGAGCSMCEQDCKQGQELTKKGC (SEQ ID NO: 35);
The present invention also includes an antigen-binding molecule that binds to the same epitope as the human CD137 epitope bound by an antibody selected from an antibody that recognizes a region including the sequence LQDPCSNCPAGTFCDNNRNQICSPCPPNSFSSAGGQRTCDICRQCKGVFRTRKECSSTSNAEC (SEQ ID NO: 49), and an antibody that recognizes a region including the sequence LQDPCSNCPAGTFCDNNRNQIC (SEQ ID NO: 105) in the human CD137 protein.

用語「DLL3」は、本明細書において用いられる場合、別段の指示がない限り、霊長類(例えば、ヒト)およびげっ歯類(例えば、マウスおよびラット)などの哺乳動物を含む、任意の脊椎動物供給源由来の任意の天然型 DLL3(デルタ様3)を指す。該用語は、プロセシングを受けていない「全長」DLL3、ならびに細胞でのプロセシングによって生じる任意の形態のDLL3を包含する。該用語はまた、DLL3の天然に生じるバリアント、例えば、スプライスバリアントまたはアレルバリアントも包含する。例示的なヒトDLL3のアミノ酸配列はNCBI参照配列(RefSeq)NM_016941.3として公知であり、例示的なカニクイザルDLL3のアミノ酸配列はNCBI参照配列XP_005589253.1として公知であり、例示的なマウスDLL3のアミノ酸配列はNCBI参照配列NM_007866.2として公知である。 The term "DLL3", as used herein, unless otherwise indicated, refers to any native DLL3 (delta-like 3) from any vertebrate source, including mammals such as primates (e.g., humans) and rodents (e.g., mice and rats). The term encompasses unprocessed "full-length" DLL3, as well as any form of DLL3 that results from processing in the cell. The term also encompasses naturally occurring variants of DLL3, such as splice variants or allelic variants. An exemplary human DLL3 amino acid sequence is known as NCBI Reference Sequence (RefSeq) NM_016941.3, an exemplary cynomolgus monkey DLL3 amino acid sequence is known as NCBI Reference Sequence XP_005589253.1, and an exemplary mouse DLL3 amino acid sequence is known as NCBI Reference Sequence NM_007866.2.

ヒトDLL3タンパク質は、C末端側に膜貫通(TM)領域および細胞内ドメイン、ならびにN末端側にDSL(Notch)ドメインを含む(例えば、図6を参照)。加えて、DLL3は、N末端側からC末端側へ、6個の領域EGF1からEGF6を含む、EGFドメインを有する。いくつかの態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、細胞外ドメイン(ECD)内、すなわち、N末端からTM領域の直前までだが、TM領域またはC末端細胞内ドメインまでではない、ドメイン内のエピトープに結合する。本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ECD内の上述のドメイン/領域のいずれか内のエピトープに結合し得る。好ましい態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、EGF6からTM領域の直前までの領域内のエピトープに結合する。より具体的には、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ヒトDLL3中の配列番号:89で定義される領域内のエピトープに結合し得る。いくつかの態様において、本発明の分子/抗体は、ヒトDLL3のEGF1、EGF2、EGF3、EGF4、EGF5、もしくはEGF6領域、またはEGF6からTM領域の直前までの領域、またはヒトDLL3のEGF1、EGF2、EGF3、EGF4、EGF5、もしくはEGF6領域、またはEGF6からTM領域の直前までの領域内のエピトープに結合する。 The human DLL3 protein contains a transmembrane (TM) region and an intracellular domain at the C-terminus, and a DSL (Notch) domain at the N-terminus (see, for example, FIG. 6). In addition, DLL3 has an EGF domain, which includes six regions EGF1 to EGF6 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the multispecific antigen-binding molecule or DLL3 antigen-binding portion of the present invention binds to an epitope within the extracellular domain (ECD), i.e., a domain from the N-terminus to just before the TM region, but not to the TM region or the C-terminal intracellular domain. The multispecific antigen-binding molecule or DLL3 antigen-binding portion of the present invention may bind to an epitope within any of the above-mentioned domains/regions within the ECD. In a preferred embodiment, the multispecific antigen-binding molecule or DLL3 antigen-binding portion of the present invention binds to an epitope within the region from EGF6 to just before the TM region. More specifically, the multispecific antigen-binding molecule or DLL3 antigen-binding portion of the present invention may bind to an epitope within the region defined by SEQ ID NO: 89 in human DLL3. In some embodiments, the molecules/antibodies of the invention bind to an epitope within the EGF1, EGF2, EGF3, EGF4, EGF5, or EGF6 region of human DLL3, or the region from EGF6 to just before the TM region, or the EGF1, EGF2, EGF3, EGF4, EGF5, or EGF6 region of human DLL3, or the region from EGF6 to just before the TM region.

ヒトDLL3では、上述のドメイン/領域は、以下のアミノ酸残基:
細胞外ドメイン(ECD):1位~492位にあるアミノ酸残基;
DSLドメイン:176位~215位にあるアミノ酸残基;
EGFドメイン:216位~465位にあるアミノ酸残基;
EGF1領域:216位~249位にあるアミノ酸残基;
EGF2領域:274位~310位にあるアミノ酸残基;
EGF3領域:312位~351位にあるアミノ酸残基;
EGF4領域:353位~389位にあるアミノ酸残基;
EGF5領域:391位~427位にあるアミノ酸残基;
EGF6領域:429位~465位にあるアミノ酸残基;
EGF6からTM領域の直前までの領域:429位~492位にあるアミノ酸残基;
TM領域:493位~513位にあるアミノ酸残基;および
C末端細胞内ドメイン:516位~618位にあるアミノ酸残基(または一部のアイソフォームでは516位~587位)
を有する(例えば、 http://www.uniprot.org/uniprot/Q9NYJ7またはWO2013/126746を参照)。
上記のアミノ酸位置はまた、配列番号:90に示されるアミノ酸配列におけるアミノ酸位置も指す。したがって、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ヒトDLL3中の上述の位置にあるアミノ酸残基を有する上述の領域/ドメインに結合し得る。すなわち、本発明の多重特異性抗原結合分子またはDLL3抗原結合部分は、ヒトDLL3中の上述の位置にあるアミノ酸残基を有する上述の領域/ドメイン内のエピトープに結合し得る。
In human DLL3, the above mentioned domains/regions are represented by the following amino acid residues:
Extracellular domain (ECD): amino acid residues located at positions 1–492;
DSL domain: amino acid residues at positions 176–215;
EGF domain: amino acid residues at positions 216 to 465;
EGF1 region: amino acid residues at positions 216 to 249;
EGF2 region: amino acid residues at positions 274-310;
EGF3 region: amino acid residues at positions 312 to 351;
EGF4 region: amino acid residues at positions 353 to 389;
EGF5 region: amino acid residues at positions 391 to 427;
EGF6 region: amino acid residues at positions 429–465;
The region from EGF6 to just before the TM region: amino acid residues at positions 429 to 492;
TM region: amino acid residues at positions 493 to 513; and
C-terminal intracellular domain: amino acid residues at positions 516-618 (or 516-587 in some isoforms)
(see, for example, http://www.uniprot.org/uniprot/Q9NYJ7 or WO2013/126746).
The above amino acid positions also refer to the amino acid positions in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 90. Thus, the multispecific antigen-binding molecules or DLL3 antigen-binding portions of the present invention can bind to the above-mentioned regions/domains having amino acid residues at the above-mentioned positions in human DLL3. That is, the multispecific antigen-binding molecules or DLL3 antigen-binding portions of the present invention can bind to epitopes within the above-mentioned regions/domains having amino acid residues at the above-mentioned positions in human DLL3.

本発明で用いられるDLL3タンパク質は、上記に記載される配列を有するDLL3タンパク質であってもよく、または1つまたは複数のアミノ酸の改変によって上記に記載される配列から導き出された配列を有する改変タンパク質であってもよい。1つまたは複数のアミノ酸の改変によって上記に記載される配列から導き出された配列を有する改変タンパク質の例は、上記に記載されるアミノ酸配列に対して、70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上、さらにより好ましくは95%以上の同一性を有するポリペプチドを含み得る。あるいは、これらのDLL3タンパク質の部分ペプチドが用いられてもよい。 The DLL3 protein used in the present invention may be a DLL3 protein having the sequence described above, or may be a modified protein having a sequence derived from the sequence described above by modifying one or more amino acids. Examples of modified proteins having a sequence derived from the sequence described above by modifying one or more amino acids may include polypeptides having 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, and even more preferably 95% or more identity to the amino acid sequence described above. Alternatively, partial peptides of these DLL3 proteins may be used.

本発明において用いられるDLL3タンパク質はその起源によって限定されず、好ましくはヒトまたはカニクイザルDLL3タンパク質である。 The DLL3 protein used in the present invention is not limited by its origin, and is preferably a human or cynomolgus monkey DLL3 protein.

いくつかの態様において、DLL3タンパク質として、DLL3 ECD断片タンパク質(またはECDバリアント)が用いられ得る。切断の部位に応じて、断片/バリアントは、N末端側からC末端側へ、DSLドメインからEGF6、EGF1からEGF6、EGF2からEGF6、EGF3からEGF6、EGF4からEGF6、EGF5およびEGF6、またはEGF6を含んでもよい。断片/バリアントは、EGF6領域の直後からTM領域直前に及ぶ領域をさらに含んでもよい。Flagタグを、当技術分野に周知の技術を用いて断片/バリアントのC末端に付着させてもよい。 In some embodiments, a DLL3 ECD fragment protein (or ECD variant) may be used as the DLL3 protein. Depending on the site of truncation, the fragment/variant may include, from N-terminus to C-terminus, DSL domain to EGF6, EGF1 to EGF6, EGF2 to EGF6, EGF3 to EGF6, EGF4 to EGF6, EGF5 and EGF6, or EGF6. The fragment/variant may further include a region extending from just after the EGF6 region to just before the TM region. A Flag tag may be attached to the C-terminus of the fragment/variant using techniques known in the art.

抗原結合ドメイン
用語「抗原結合ドメイン」は、抗原の一部またはすべてに特異的に結合しかつそれに相補的である領域を含む抗体の一部を指す。抗原結合ドメインは、例えば、1つまたは複数の抗体可変ドメイン(抗体可変領域とも呼ばれる)によってもたらされてもよい。好ましくは、抗原結合ドメインは、抗体軽鎖可変領域(VL)および抗体重鎖可変領域(VH)の両方を含む。そのような好ましい抗原結合ドメインには、例えば、「単鎖Fv(scFv)」、「シングルドメイン抗体またはVHH」、「単鎖抗体」、「Fv」、「単鎖Fv2(scFv2)」、「Fab」、および「F(ab')2」が含まれる。
Antigen-binding domain The term "antigen-binding domain" refers to a portion of an antibody that comprises an area that specifically binds to and is complementary to a portion or all of an antigen. An antigen-binding domain may be provided, for example, by one or more antibody variable domains (also called antibody variable regions). Preferably, an antigen-binding domain comprises both an antibody light chain variable region (VL) and an antibody heavy chain variable region (VH). Such preferred antigen-binding domains include, for example, "single-chain Fv (scFv)", "single-domain antibody or VHH", "single-chain antibody", "Fv", "single-chain Fv2 (scFv2)", "Fab", and "F(ab')2".

可変領域
用語「可変領域」または「可変ドメイン」は、抗体を抗原へと結合させることに関与する、抗体の重鎖または軽鎖のドメインを指す。天然型抗体の重鎖および軽鎖の可変ドメイン(それぞれVHおよびVL)は、通常、各ドメインが4つの保存されたフレームワーク領域 (FR) および3つの超可変領域 (HVR) を含む、類似の構造を有する。(例えば、Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., page 91 (2007) 参照。)1つのVHまたはVLドメインで、抗原結合特異性を与えるに十分であろう。さらに、ある特定の抗原に結合する抗体は、当該抗原に結合する抗体からのVHまたはVLドメインを使ってそれぞれVLまたはVHドメインの相補的ライブラリをスクリーニングして、単離されてもよい。例えばPortolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991) 参照。
Variable Region The term "variable region" or "variable domain" refers to the domain of an antibody's heavy or light chain that is involved in binding the antibody to an antigen. The heavy and light chain variable domains (VH and VL, respectively) of natural antibodies usually have a similar structure, with each domain containing four conserved framework regions (FR) and three hypervariable regions (HVR). (See, for example, Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., WH Freeman and Co., page 91 (2007).) One VH or VL domain may be sufficient to confer antigen-binding specificity. Furthermore, antibodies that bind to a particular antigen may be isolated by screening a complementary library of VL or VH domains, respectively, with a VH or VL domain from an antibody that binds to the antigen. See, e.g., Portolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991).

HVRまたはCDR
本明細書で用いられる用語「超可変領域」または「HVR」は、配列において超可変であり(「相補性決定領域」または「CDR」)、および/または構造的に定まったループ(「超可変ループ」)を形成し、および/または抗原接触残基(「抗原接触」)を含む、抗体の可変ドメインの各領域を指す。超可変領域(HVR)は、「相補性決定領域」(CDR)とも称され、これらの用語は、本明細書では、抗原結合領域を形成する可変領域の部分に関して相互に交換可能に用いられる。通常、抗体は6つのHVRを含む:VHに3つ(H1、H2、H3)、およびVLに3つ(L1、L2、L3)である。
本明細書での例示的なHVRは、以下のもの:
(a) アミノ酸残基26-32 (L1)、50-52 (L2)、91-96 (L3)、26-32 (H1)、53-55 (H2)、および96-101 (H3)のところで生じる超可変ループ (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987));
(b) アミノ酸残基24-34 (L1)、50-56 (L2)、89-97 (L3)、31-35b (H1)、50-65 (H2)、 および95-102 (H3)のところで生じるCDR (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991));
(c) アミノ酸残基27c-36 (L1)、46-55 (L2)、89-96 (L3)、30-35b (H1)、47-58 (H2)、および93-101 (H3) のところで生じる抗原接触 (MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996));ならびに、
(d) HVRアミノ酸残基46-56 (L2)、47-56 (L2)、48-56 (L2)、49-56 (L2)、26-35 (H1)、26-35b (H1)、49-65 (H2)、93-102 (H3)、および94-102 (H3)を含む、(a)、(b)、および/または(c)の組み合わせ
を含む。
HVR or CDR
The term "hypervariable region" or "HVR" as used herein refers to each region of an antibody variable domain that is hypervariable in sequence ("complementarity determining region" or "CDR") and/or forms structurally defined loops ("hypervariable loops") and/or contains antigen contact residues ("antigen contacts"). Hypervariable regions (HVRs) are also referred to as "complementarity determining regions" (CDRs), and these terms are used interchangeably herein with respect to the portions of the variable regions that form the antigen binding region. Typically, antibodies contain six HVRs: three in the VH (H1, H2, H3) and three in the VL (L1, L2, L3).
Exemplary HVRs herein are the following:
(a) hypervariable loops occurring at amino acid residues 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2), and 96-101 (H3) (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987));
(b) the CDRs occurring at amino acid residues 24-34 (L1), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (H1), 50-65 (H2), and 95-102 (H3) (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991));
(c) antigenic contacts occurring at amino acid residues 27c-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (H2), and 93-101 (H3) (MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996)); and
(d) Combinations of (a), (b), and/or (c) including HVR amino acid residues 46-56 (L2), 47-56 (L2), 48-56 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (H1), 49-65 (H2), 93-102 (H3), and 94-102 (H3).

別段示さない限り、HVR残基および可変ドメイン中の他の残基(例えば、FR残基)は、本明細書では上記のKabatらに従ってナンバリングされる。 Unless otherwise indicated, HVR residues and other residues in the variable domain (e.g., FR residues) are numbered herein according to Kabat et al., supra.

HVR-H1、HVR-H2、HVR-H3、HVR-L1、HVR-L2、およびHVR-L3は、それぞれ、「H-CDR1」、「H-CDR2」、「H-CDR3」、「L-CDR1」、「L-CDR2」、および「L-CDR3」とも記載される。 HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2, and HVR-L3 are also referred to as "H-CDR1", "H-CDR2", "H-CDR3", "L-CDR1", "L-CDR2", and "L-CDR3", respectively.

CD3およびCD137に結合することができるが、CD3およびCD137に同時には結合しない
本発明の抗体可変領域が「CD3およびCD137に結合することができる」かどうかは、当技術分野において公知の方法によって判定することができる。
Whether an antibody variable region of the present invention that is capable of binding to CD3 and CD137, but not simultaneously binding to CD3 and CD137 , is "capable of binding to CD3 and CD137" can be determined by methods known in the art.

これは、例えば、電気化学発光法(ECL法)によって判定することができる(BMC Research Notes 2011, 4:281)。 This can be determined, for example, by electrochemiluminescence (ECL) (BMC Research Notes 2011, 4:281).

具体的には、例えば、ビオチン標識された被験抗原結合分子の、CD3およびCD137に結合することができる領域、例えば、Fab領域から構成される低分子抗体、またはその一価抗体(通常の抗体が有する2つのFab領域のうち1つが欠けている抗体)を、sulfo-tag(Ru錯体)で標識されたCD3またはCD137と混合し、混合物をストレプトアビジン固定化プレート上に添加する。この操作において、ビオチン標識された被験抗原結合分子は、プレート上のストレプトアビジンに結合する。sulfo-tagから光を発生させ、その発光シグナルを、Sector Imager 600または2400(MSD K.K.)などを用いて検出し、それによって、CD3またはCD137に対する被験抗原結合分子の上述の領域の結合を確認することができる。 Specifically, for example, a region of a biotin-labeled test antigen-binding molecule capable of binding to CD3 and CD137, such as a low molecular weight antibody composed of the Fab region, or a monovalent antibody thereof (an antibody lacking one of the two Fab regions that a normal antibody has) is mixed with CD3 or CD137 labeled with a sulfo-tag (Ru complex), and the mixture is added to a streptavidin-immobilized plate. In this operation, the biotin-labeled test antigen-binding molecule binds to the streptavidin on the plate. Light is generated from the sulfo-tag, and the luminescence signal is detected using a Sector Imager 600 or 2400 (MSD K.K.), etc., thereby allowing the binding of the above-mentioned region of the test antigen-binding molecule to CD3 or CD137 to be confirmed.

あるいは、このアッセイは、ELISA、FACS(蛍光活性化細胞選別)、ALPHAScreen(増幅発光近接ホモジニアスアッセイスクリーン)、表面プラズモン共鳴(SPR)現象に基づくBIACORE法などによって実施されてもよい(Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010)。 Alternatively, the assay may be performed by ELISA, FACS (fluorescence activated cell sorting), ALPHAScreen (amplified luminescence proximity homogeneous assay screen), BIACORE method based on the surface plasmon resonance (SPR) phenomenon, etc. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010).

具体的には、アッセイは、例えば、表面プラズモン共鳴(SPR)現象に基づく相互作用解析機器であるBiacore(GE Healthcare Japan Corp.)を用いて実施することができる。Biacore解析機器には、Biacore T100、T200、X100、A100、4000、3000、2000、1000、またはCなどの任意の機種が含まれる。CM7、CM5、CM4、CM3、C1、SA、NTA、L1、HPA、またはAuチップなどの任意のBiacore用センサーチップを、センサーチップとして用いることができる。プロテインA、プロテインG、プロテインL、抗ヒトIgG抗体、抗ヒトIgG-Fab、抗ヒトL鎖抗体、抗ヒトFc抗体、抗原タンパク質、または抗原ペプチドなどの、本発明の抗原結合分子を捕捉するためのタンパク質を、アミンカップリング、ジスルフィドカップリング、またはアルデヒドカップリングなどのカップリング法によって、センサーチップ上に固定化する。その上にCD3またはCD137をアナライトとしてインジェクトし、相互作用を測定してセンサーグラムを取得する。この操作において、CD3またはCD137の濃度は、アッセイサンプルの相互作用の強さ(例えば、KD)に従って数μMから数pMの範囲内で選択することができる。 Specifically, the assay can be performed using, for example, Biacore (GE Healthcare Japan Corp.), an interaction analysis instrument based on the surface plasmon resonance (SPR) phenomenon. Biacore analysis instruments include any model such as Biacore T100, T200, X100, A100, 4000, 3000, 2000, 1000, or C. Any Biacore sensor chip, such as CM7, CM5, CM4, CM3, C1, SA, NTA, L1, HPA, or Au chip, can be used as the sensor chip. Proteins for capturing the antigen-binding molecules of the present invention, such as protein A, protein G, protein L, anti-human IgG antibody, anti-human IgG-Fab, anti-human L chain antibody, anti-human Fc antibody, antigen protein, or antigen peptide, are immobilized on the sensor chip by a coupling method such as amine coupling, disulfide coupling, or aldehyde coupling. CD3 or CD137 is injected onto the sensor chip as an analyte, and the interaction is measured to obtain a sensorgram. In this procedure, the concentration of CD3 or CD137 can be selected within the range of several μM to several pM according to the strength of the interaction (e.g., KD) of the assay sample.

あるいは、CD3またはCD137を、抗原結合分子の代わりにセンサーチップ上に固定化して、次に、評価したい抗体サンプルを相互作用させてもよい。本発明の抗原結合分子の抗体可変領域がCD3またはCD137に対する結合活性を有するかどうかを、相互作用のセンサーグラムから算出された解離定数(KD)値に基づいて、または抗原結合分子サンプルの作用前のレベルを上回る、作用後のセンサーグラムの増加の程度に基づいて、確認することができる。 Alternatively, CD3 or CD137 may be immobilized on a sensor chip instead of the antigen-binding molecule, and then the antibody sample to be evaluated may be allowed to interact with it. Whether the antibody variable region of the antigen-binding molecule of the present invention has binding activity to CD3 or CD137 can be confirmed based on the dissociation constant (KD) value calculated from the sensorgram of the interaction, or based on the degree of increase in the sensorgram after the action of the antigen-binding molecule sample, which exceeds the level before the action.

いくつかの態様において、目的の抗原(すなわち、CD3またはCD137)に対する本発明の抗体可変領域の結合活性または親和性を、例えば、Biacore T200機器(GE Healthcare)またはBiacore 8K機器(GE Healthcare)を用いて、37℃(CD137について)または25℃(CD3について)で評価する。抗ヒトFc(例えば、GE Healthcare)を、アミンカップリングキット(例えば、GE Healthcare)を用いてCM4センサーチップのすべてのフローセル上に固定化する。抗原結合分子または抗体可変領域を、抗Fcセンサー表面上に捕捉し、次いで、抗原(CD3またはCD137)をフローセル上にインジェクトする。抗原結合分子または抗体可変領域の捕捉レベルは、200レゾナンスユニット(RU)を目指してもよい。組換えヒトCD3またはCD137を、2倍段階希釈によって調製した2000~125 nMでインジェクトし、その後解離させてもよい。すべての抗原結合分子または抗体可変領域およびアナライトは、20 mM ACES、150 mM NaCl、0.05% Tween 20、0.005% NaN3を含有するACES pH 7.4において調製する。センサー表面は、サイクル毎に3M MgCl2で再生させる。結合親和性は、例えば、Biacore Insight Evaluation software, version 2.0(GE Healthcare)またはBiacore 8K Evaluation software(GE Healthcare)を用いて、データをプロセシングし、1:1結合モデルにフィットさせることによって決定する。本発明の抗原結合ドメインの特異的結合活性または親和性を評価するために、KD値を算出する。 In some embodiments, the binding activity or affinity of the antibody variable region of the present invention for the antigen of interest (i.e., CD3 or CD137) is evaluated at 37°C (for CD137) or 25°C (for CD3) using, for example, a Biacore T200 instrument (GE Healthcare) or a Biacore 8K instrument (GE Healthcare). Anti-human Fc (e.g., GE Healthcare) is immobilized on all flow cells of a CM4 sensor chip using an amine coupling kit (e.g., GE Healthcare). The antigen-binding molecule or antibody variable region is captured on the anti-Fc sensor surface, and then the antigen (CD3 or CD137) is injected onto the flow cell. The capture level of the antigen-binding molecule or antibody variable region may aim for 200 resonance units (RU). Recombinant human CD3 or CD137 may be injected at 2000-125 nM prepared by two-fold serial dilution, followed by dissociation. All antigen-binding molecules or antibody variable regions and analytes are prepared in ACES pH 7.4 containing 20 mM ACES, 150 mM NaCl, 0.05% Tween 20, 0.005% NaN3. The sensor surface is regenerated with 3 M MgCl2 every cycle. Binding affinity is determined by processing the data and fitting to a 1:1 binding model, for example, using Biacore Insight Evaluation software, version 2.0 (GE Healthcare) or Biacore 8K Evaluation software (GE Healthcare). To evaluate the specific binding activity or affinity of the antigen-binding domain of the present invention, the KD value is calculated.

ALPHAScreenは、2種類のビーズ(ドナーおよびアクセプター)を用いるALPHAテクノロジーによって、以下の原理に基づいて実施される:ドナービーズに結合した分子とアクセプタービーズに結合した分子との間の生物学的相互作用によりこれら2つのビーズが近接して位置する時にのみ、発光シグナルが検出される。レーザーによって励起されたドナービーズ中のフォトセンシタイザーは、周辺の酸素を励起状態の一重項酸素に変換する。一重項酸素は、ドナービーズ周辺に拡散し、それに近接して位置するアクセプタービーズに到達すると、それによってビーズにおける化学発光反応を引き起こし、最終的に光が放出される。ドナービーズに結合した分子とアクセプタービーズに結合した分子との間の相互作用がない場合には、ドナービーズによって産生される一重項酸素がアクセプタービーズに到達しない。したがって、化学発光反応は起きない。 ALPHAScreen is implemented by ALPHA technology using two types of beads (donor and acceptor) based on the following principle: A luminescence signal is detected only when a biological interaction between a molecule bound to a donor bead and a molecule bound to an acceptor bead brings these two beads into close proximity. A photosensitizer in the donor bead excited by a laser converts the surrounding oxygen into excited singlet oxygen. The singlet oxygen diffuses around the donor bead and reaches the acceptor bead located close to it, thereby triggering a chemiluminescence reaction in the bead, which ultimately emits light. In the absence of an interaction between the molecules bound to the donor bead and the molecules bound to the acceptor bead, the singlet oxygen produced by the donor bead does not reach the acceptor bead. Therefore, no chemiluminescence reaction occurs.

その間の相互作用を観察する物質の一方(リガンド)を、センサーチップの金薄膜上に固定する。金薄膜とガラスとの境界面で全反射するように、センサーチップの裏側から光を当てる。結果として、反射光の一部に、反射強度が低下した部位(SPRシグナル)が形成される。その間の相互作用を観察する物質の他方(アナライト)を、センサーチップの表面上にインジェクトする。アナライトがリガンドに結合すると、固定化されているリガンド分子の質量が増加して、センサーチップ表面上の溶媒の屈折率が変化する。この屈折率の変化により、SPRシグナルの位置がシフトする(逆に、結合した分子が解離すると、シグナルは元の位置に戻る)。Biacoreシステムは、シフトの量、すなわち、センサーチップ表面上の質量変化を縦座標にプロットし、質量の時間依存的変化をアッセイデータとして表示する(センサーグラム)。センサーチップ表面上に捕捉されたリガンドに結合したアナライトの量(アナライトを相互作用させた前後でのセンサーグラム上でのレスポンスの変化の量)を、センサーグラムから決定することができる。しかし、結合量はリガンドの量にも依存するため、比較は、実質的に同じ量のリガンドの量を用いる条件下で行わなければならない。キネティクス、すなわち、会合速度定数(ka)および解離速度定数(kd)は、センサーグラムの曲線から決定することができ、一方、親和性(KD)は、これらの定数の比から決定することができる。阻害アッセイもまた、BIACORE法において好適に用いられる。阻害アッセイの例は、Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010に記載されている。 One of the substances (ligand) whose interaction is to be observed is immobilized on the gold film of the sensor chip. Light is applied from the back of the sensor chip so that total reflection occurs at the interface between the gold film and the glass. As a result, a region of reduced reflection intensity (SPR signal) is formed in part of the reflected light. The other substance (analyte) whose interaction is to be observed is injected onto the surface of the sensor chip. When the analyte binds to the ligand, the mass of the immobilized ligand molecule increases, changing the refractive index of the solvent on the sensor chip surface. This change in refractive index shifts the position of the SPR signal (conversely, when the bound molecule dissociates, the signal returns to its original position). The Biacore system plots the amount of shift, i.e., the change in mass on the sensor chip surface, on the ordinate, and displays the time-dependent change in mass as assay data (sensorgram). The amount of analyte bound to the ligand captured on the sensor chip surface (the amount of change in response on the sensorgram before and after the analyte is allowed to interact) can be determined from the sensorgram. However, the amount of binding also depends on the amount of ligand, so comparisons must be made under conditions using substantially the same amount of ligand. Kinetics, i.e., the association rate constant (ka) and dissociation rate constant (kd), can be determined from the sensorgram curve, while affinity (KD) can be determined from the ratio of these constants. Inhibition assays are also suitable for use in the BIACORE method. Examples of inhibition assays are described in Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010.

用語「CD3とCD137(4-1BB)に同時(at the same time)には結合しない」または「CD3とCD137(4-1BB)に同時(simultaneously)には結合しない」は、本発明の抗原結合部分または抗体可変領域が、CD3と結合している状態ではCD137に結合できず、逆に、抗原結合部分または抗体可変領域が、CD137と結合している状態ではCD3に結合できないことを意味する。ここで、「CD3とCD137に同時には結合しない」という句には、CD3を発現する細胞とCD137を発現する細胞とを架橋しないこと、または、各々が異なる細胞上で発現しているCD3とCD137に同時には結合しないことも含まれる。この句にはさらに、CD3およびCD137が可溶性タンパク質のように細胞膜上に発現していないか、または両方が同じ細胞上に存在する時には、可変領域が、CD3とCD137の両方に同時に結合することができるが、各々が異なる細胞上で発現しているCD3とCD137には同時には結合することができない場合も含まれる。そのような抗体可変領域は、これらの機能を有している限り、特に限定されない。その例には、所望の抗原に結合するようにそのアミノ酸の一部を改変した、IgG型の抗体可変領域に由来する可変領域が含まれ得る。改変されるアミノ酸は、例えば、CD3またはCD137に結合する抗体可変領域における、その改変が抗原に対する結合を喪失させないアミノ酸から選択される。 The term "does not bind to CD3 and CD137 (4-1BB) at the same time" or "does not bind to CD3 and CD137 (4-1BB) simultaneously" means that the antigen-binding moiety or antibody variable region of the present invention cannot bind to CD137 when bound to CD3, and conversely, the antigen-binding moiety or antibody variable region cannot bind to CD3 when bound to CD137. Here, the phrase "does not bind to CD3 and CD137 simultaneously" also includes not cross-linking cells expressing CD3 and cells expressing CD137, or not simultaneously binding to CD3 and CD137, each expressed on different cells. This phrase further includes cases where the variable region can simultaneously bind to both CD3 and CD137 when CD3 and CD137 are not expressed on the cell membrane as soluble proteins or when both are present on the same cell, but cannot simultaneously bind to CD3 and CD137 when each is expressed on a different cell. Such antibody variable regions are not particularly limited as long as they have these functions. Examples include variable regions derived from IgG-type antibody variable regions in which some of the amino acids have been modified so as to bind to a desired antigen. The modified amino acids are selected from, for example, amino acids in antibody variable regions that bind to CD3 or CD137, whose modification does not abolish binding to the antigen.

ここで、「異なる細胞上で発現している」という句は、単に、抗原が別々の細胞上で発現していることを意味する。そのような細胞の組み合わせは、例えば、T細胞と別のT細胞のように同じ種類の細胞であってもよいし、またはT細胞とNK細胞のように異なる種類の細胞であってもよい。 Here, the phrase "expressed on different cells" simply means that the antigens are expressed on separate cells. Such a combination of cells may be of the same type of cell, such as, for example, a T cell and another T cell, or may be of different types of cell, such as, for example, a T cell and an NK cell.

本発明の抗原結合分子が「CD3とCD137に同時には結合しない」かどうかは、抗原結合分子がCD3およびCD137の両方に対する結合活性を有することを確認すること;次いで、この結合活性を有する可変領域を含む抗原結合分子に、CD3またはCD137のいずれかを予め結合させること;および次いで、上述の方法によってもう1つのものに対するその結合活性の有無を判定すること、によって確認することができる。あるいは、これはまた、ELISAプレート上またはセンサーチップ上に固定化されたCD3またはCD137のいずれかに対する抗原結合分子の結合が、溶液中へのもう1つのものの添加によって阻害されるかどうかを判定することによって、確認することもできる。いくつかの態様において、本発明の抗原結合分子のCD3またはCD137のいずれかに対する結合は、もう1つに対する抗原結合分子の結合によって、少なくとも50%、好ましくは60%以上、より好ましくは70%以上、より好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、またはいっそうより好ましくは95%以上阻害される。 Whether or not the antigen-binding molecule of the present invention "does not bind to CD3 and CD137 simultaneously" can be confirmed by confirming that the antigen-binding molecule has binding activity to both CD3 and CD137; then, pre-binding either CD3 or CD137 to an antigen-binding molecule containing a variable region having this binding activity; and then determining the presence or absence of its binding activity to the other by the above-mentioned method. Alternatively, this can also be confirmed by determining whether the binding of the antigen-binding molecule to either CD3 or CD137 immobilized on an ELISA plate or a sensor chip is inhibited by the addition of the other to the solution. In some embodiments, the binding of the antigen-binding molecule of the present invention to either CD3 or CD137 is inhibited by the binding of the antigen-binding molecule to the other by at least 50%, preferably 60% or more, more preferably 70% or more, more preferably 80% or more, even more preferably 90% or more, or even more preferably 95% or more.

1つの局面において、1つの抗原(例えば、CD3)を固定化している間に、CD3に対する抗原結合分子の結合の阻害を、先行技術において公知の方法(すなわち、ELISA、BIACOREなど)によって、他の抗原(例えば、CD137)の存在下で決定することができる。別の局面において、CD137を固定化している間に、CD137に対する抗原結合分子の結合の阻害もまた、CD3の存在下で決定することができる。上述の2つの局面のうちのいずれか1つが実施される時に、結合が、少なくとも50%、好ましくは60%以上、好ましくは70%以上、さらに好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、またはいっそうより好ましくは95%以上阻害されるならば、本発明の抗原結合分子は、CD3とCD137に同時には結合しないと判定される。 In one aspect, while one antigen (e.g., CD3) is immobilized, inhibition of binding of the antigen-binding molecule to CD3 can be determined in the presence of another antigen (e.g., CD137) by a method known in the prior art (i.e., ELISA, BIACORE, etc.). In another aspect, while CD137 is immobilized, inhibition of binding of the antigen-binding molecule to CD137 can also be determined in the presence of CD3. If, when any one of the above two aspects is performed, binding is inhibited by at least 50%, preferably 60% or more, preferably 70% or more, more preferably 80% or more, even more preferably 90% or more, or even more preferably 95% or more, it is determined that the antigen-binding molecule of the present invention does not bind to CD3 and CD137 simultaneously.

いくつかの態様において、アナライトとしてインジェクトされる抗原の濃度は、固定化される他の抗原の濃度よりも少なくとも1倍、2倍、5倍、10倍、30倍、50倍、または100倍高い。 In some embodiments, the concentration of the antigen injected as the analyte is at least 1-fold, 2-fold, 5-fold, 10-fold, 30-fold, 50-fold, or 100-fold higher than the concentration of the other antigen that is immobilized.

好ましい様式において、アナライトとしてインジェクトされる抗原の濃度は、固定化される他の抗原の濃度よりも100倍高く、結合は、少なくとも80%阻害される。 In a preferred mode, the concentration of the antigen injected as the analyte is 100 times higher than the concentration of the other antigen immobilized, and binding is inhibited by at least 80%.

1つの態様において、抗原結合分子のCD137(固定化)結合活性についてのKD値に対する抗原結合分子のCD3(アナライト)結合活性についてのKD値の比(KD(CD3)/ KD(CD137))を算出し、CD137(固定化)濃度よりもKD値の比(KD(CD3)/ KD(CD137))の10倍、50倍、100倍、または200倍高い、CD3(アナライト)濃度を、上記の競合測定のために用いることができる。(例えば、KD値の比が0.1である場合は、1倍、5倍、10倍、または20倍高い濃度を選択することができる。さらに、KD値の比が10である場合は、100倍、500倍、1000倍、または2000倍高い濃度を選択することができる。) In one embodiment, the ratio of the KD value for the CD3 (analyte) binding activity of the antigen-binding molecule to the KD value for the CD137 (immobilized) binding activity of the antigen-binding molecule (KD(CD3)/KD(CD137)) is calculated, and a CD3 (analyte) concentration that is 10 times, 50 times, 100 times, or 200 times higher than the CD137 (immobilized) concentration can be used for the above competitive measurement. (For example, when the KD value ratio is 0.1, a concentration that is 1 times, 5 times, 10 times, or 20 times higher can be selected. Furthermore, when the KD value ratio is 10, a concentration that is 100 times, 500 times, 1000 times, or 2000 times higher can be selected.)

1つの局面において、1つの抗原(例えば、CD3)を固定化している間に、CD3に対する抗原結合分子の結合シグナルの減弱を、先行技術において公知の方法(すなわち、ELISA、ECLなど)によって、他の抗原(例えば、CD137)の存在下で決定することができる。別の局面において、CD137を固定化している間に、CD137に対する抗原結合分子の結合シグナルの減弱もまた、CD3の存在下で決定することができる。上述の2つの局面のうちのいずれか1つが実施される時に、結合シグナルが、少なくとも50%、好ましくは60%以上、好ましくは70%以上、さらに好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、またはいっそうより好ましくは95%以上減弱されるならば、本発明の抗原結合分子は、CD3とCD137に同時には結合しないと判定される。 In one aspect, while one antigen (e.g., CD3) is immobilized, the attenuation of the binding signal of the antigen-binding molecule to CD3 can be determined in the presence of another antigen (e.g., CD137) by a method known in the prior art (i.e., ELISA, ECL, etc.). In another aspect, while CD137 is immobilized, the attenuation of the binding signal of the antigen-binding molecule to CD137 can also be determined in the presence of CD3. If the binding signal is attenuated by at least 50%, preferably 60% or more, preferably 70% or more, more preferably 80% or more, even more preferably 90% or more, or even more preferably 95% or more when any one of the above two aspects is performed, it is determined that the antigen-binding molecule of the present invention does not bind to CD3 and CD137 simultaneously.

いくつかの態様において、アナライトとしてインジェクトされる抗原の濃度は、固定化される他の抗原の濃度よりも少なくとも1倍、2倍、5倍、10倍、30倍、50倍、または100倍高い。 In some embodiments, the concentration of the antigen injected as the analyte is at least 1-fold, 2-fold, 5-fold, 10-fold, 30-fold, 50-fold, or 100-fold higher than the concentration of the other antigen that is immobilized.

好ましい様式において、アナライトとしてインジェクトされる抗原の濃度は、固定化される他の抗原の濃度よりも100倍高く、結合は、少なくとも80%阻害される。 In a preferred mode, the concentration of the antigen injected as the analyte is 100 times higher than the concentration of the other antigen immobilized, and binding is inhibited by at least 80%.

1つの態様において、抗原結合分子のCD137(固定化)結合活性についてのKD値に対する抗原結合分子のCD3(アナライト)結合活性についてのKD値の比(KD(CD3)/ KD(CD137))を算出し、CD137(固定化)濃度よりもKD値の比(KD(CD3)/ KD(CD137))の10倍、50倍、100倍、または200倍高い、CD3(アナライト)濃度を、上記の測定のために用いることができる。(例えば、KD値の比が0.1である場合は、1倍、5倍、10倍、または20倍高い濃度を選択することができる。さらに、KD値の比が10である場合は、100倍、500倍、1000倍、または2000倍高い濃度を選択することができる。) In one embodiment, the ratio of the KD value for the CD3 (analyte) binding activity of the antigen-binding molecule to the KD value for the CD137 (immobilized) binding activity of the antigen-binding molecule (KD(CD3)/KD(CD137)) is calculated, and a CD3 (analyte) concentration that is 10 times, 50 times, 100 times, or 200 times higher than the CD137 (immobilized) concentration can be used for the above measurement. (For example, when the KD value ratio is 0.1, a concentration that is 1 times, 5 times, 10 times, or 20 times higher can be selected. Furthermore, when the KD value ratio is 10, a concentration that is 100 times, 500 times, 1000 times, or 2000 times higher can be selected.)

具体的には、例えば、ECL法を用いる場合、ビオチン標識された被験抗原結合分子、sulfo-tag(Ru錯体)で標識されたCD3、および標識されていないCD137を準備する。被験抗原結合分子が、CD3およびCD137に結合することができるが、CD3とCD137に同時には結合しない場合、被験抗原結合分子と標識されたCD3との混合物をストレプトアビジン固定化プレート上に添加すること、およびその後の発光によって、sulfo-tagの発光シグナルが、標識されていないCD137の非存在下で検出される。対照的に、発光シグナルは、標識されていないCD137の存在下で減少する。この発光シグナルの減少を定量して、相対的な結合活性を決定することができる。この解析は、標識されたCD137および標識されていないCD3を用いて、同様に実施され得る。 Specifically, for example, when using the ECL method, a biotin-labeled test antigen-binding molecule, CD3 labeled with a sulfo-tag (Ru complex), and unlabeled CD137 are prepared. If the test antigen-binding molecule can bind to CD3 and CD137 but does not bind to CD3 and CD137 simultaneously, the luminescence signal of the sulfo-tag is detected in the absence of unlabeled CD137 by adding a mixture of the test antigen-binding molecule and labeled CD3 onto a streptavidin-immobilized plate and then emitting light. In contrast, the luminescence signal decreases in the presence of unlabeled CD137. The decrease in the luminescence signal can be quantified to determine the relative binding activity. This analysis can be performed similarly using labeled CD137 and unlabeled CD3.

ALPHAScreenの場合、被験抗原結合分子は、競合するCD137の非存在下でCD3と相互作用して、520~620 nmのシグナルを生成する。タグ付けされていないCD137は、被験抗原結合分子との相互作用についてCD3と競合する。競合の結果として引き起こされる蛍光の減少を定量し、それによって相対的な結合活性を決定することができる。スルホ-NHS-ビオチンなどを用いたポリペプチドのビオチン化は、当技術分野において公知である。例えば、CD3をコードするポリヌクレオチドとGSTをコードするポリヌクレオチドとをインフレームで融合すること;および、結果として生じた融合遺伝子を、その発現が可能なベクターを保有する細胞などによって発現させ、その後グルタチオンカラムを用いて精製することを含む、適宜採用される方法によって、CD3をGSTでタグ付けすることができる。得られたシグナルは、好ましくは、例えば、非線形回帰解析に基づく一部位競合(one-site competition)モデルに適合したソフトウェアGRAPHPAD PRISM(GraphPad Software, Inc., San Diego)用いて解析される。この解析は、タグ付けされたCD137およびタグ付けされていないCD3を用いて、同様に解析され得る。 In the case of ALPHAScreen, the test antigen-binding molecule interacts with CD3 in the absence of competing CD137 to generate a signal at 520-620 nm. Untagged CD137 competes with CD3 for interaction with the test antigen-binding molecule. The decrease in fluorescence caused as a result of the competition can be quantified, thereby determining the relative binding activity. Biotinylation of polypeptides using sulfo-NHS-biotin or the like is known in the art. For example, CD3 can be tagged with GST by any suitable method, including fusing a polynucleotide encoding CD3 with a polynucleotide encoding GST in frame; and expressing the resulting fusion gene, such as by a cell carrying a vector capable of expressing it, followed by purification using a glutathione column. The resulting signal is preferably analyzed using, for example, the software GRAPHPAD PRISM (GraphPad Software, Inc., San Diego) fitted to a one-site competition model based on nonlinear regression analysis. This analysis can be performed similarly using tagged CD137 and untagged CD3.

あるいは、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を用いた方法が用いられてもよい。FRETとは、励起エネルギーが、近接して位置する2つの蛍光分子の間で互いに、電子共鳴によって直接移動する現象である。FRETが起こると、ドナー(励起状態を有する蛍光分子)の励起エネルギーがアクセプター(ドナーの近くに位置するもう1つの蛍光分子)に移動するため、ドナーから放射される蛍光が消失し(正確には、蛍光の寿命が短縮し)、代わりにアクセプターから蛍光が放射される。この現象の使用によって、CD3とCD137に同時に結合するか否かを解析することができる。例えば、蛍光ドナーを有するCD3および蛍光アクセプターを有するCD137が、被験抗原結合分子に同時に結合すると、ドナーの蛍光は消失し、一方、アクセプターから蛍光が放射される。そのため、蛍光波長の変化が観察される。そのような抗体は、CD3とCD137に同時に結合するものと確認される。他方で、CD3、CD137、および被験抗原結合分子の混合が、CD3と結合した蛍光ドナーの蛍光波長を変化させないならば、この被験抗原結合分子は、CD3およびCD137に結合することができるが、CD3とCD137に同時には結合しない抗原結合ドメインとみなすことができる。 Alternatively, a method using fluorescence resonance energy transfer (FRET) may be used. FRET is a phenomenon in which excitation energy is transferred directly between two fluorescent molecules located in close proximity to each other through electronic resonance. When FRET occurs, the excitation energy of the donor (a fluorescent molecule having an excited state) is transferred to the acceptor (another fluorescent molecule located near the donor), so that the fluorescence emitted from the donor disappears (more precisely, the fluorescence lifetime is shortened) and instead, fluorescence is emitted from the acceptor. By using this phenomenon, it is possible to analyze whether or not an antibody binds to CD3 and CD137 simultaneously. For example, when CD3 having a fluorescent donor and CD137 having a fluorescent acceptor simultaneously bind to a test antigen-binding molecule, the fluorescence of the donor disappears, while fluorescence is emitted from the acceptor. Therefore, a change in the fluorescence wavelength is observed. Such an antibody is confirmed to bind to CD3 and CD137 simultaneously. On the other hand, if mixing CD3, CD137, and the test antigen-binding molecule does not change the fluorescence wavelength of the fluorescent donor bound to CD3, the test antigen-binding molecule can be considered as an antigen-binding domain that can bind to CD3 and CD137, but does not bind to CD3 and CD137 simultaneously.

例えば、ビオチン標識された被験抗原結合分子を、ドナービーズ上のストレプトアビジンに結合させ、一方、グルタチオンSトランスフェラーゼ(GST)でタグ付けされたCD3を、アクセプタービーズに結合させる。被験抗原結合分子は、競合する第2の抗原の非存在下でCD3と相互作用して、520~620 nmのシグナルを生成する。タグ付けされていない第2の抗原は、被験抗原結合分子との相互作用についてCD3と競合する。競合の結果として引き起こされる蛍光の減少を定量し、それによって相対的な結合活性を決定することができる。スルホ-NHS-ビオチンなどを用いたポリペプチドのビオチン化は、当技術分野において公知である。例えば、CD3をコードするポリヌクレオチドとGSTをコードするポリヌクレオチドとをインフレームで融合すること;および、結果として生じた融合遺伝子を、その発現が可能なベクターを保有する細胞などによって発現させ、その後グルタチオンカラムを用いて精製することを含む、適宜採用される方法によって、CD3をGSTでタグ付けすることができる。得られたシグナルは、好ましくは、例えば、非線形回帰解析に基づく一部位競合モデルに適合したソフトウェアGRAPHPAD PRISM(GraphPad Software, Inc., San Diego)を用いて解析される。 For example, a biotin-labeled test antigen-binding molecule is bound to streptavidin on donor beads, while CD3 tagged with glutathione S-transferase (GST) is bound to acceptor beads. The test antigen-binding molecule interacts with CD3 in the absence of a competing second antigen to generate a signal at 520-620 nm. The untagged second antigen competes with CD3 for interaction with the test antigen-binding molecule. The decrease in fluorescence caused as a result of the competition can be quantified, thereby determining the relative binding activity. Biotinylation of polypeptides using sulfo-NHS-biotin or the like is known in the art. For example, CD3 can be tagged with GST by any suitable method, including fusing a polynucleotide encoding CD3 with a polynucleotide encoding GST in frame; and expressing the resulting fusion gene, such as by a cell carrying a vector capable of expressing it, followed by purification using a glutathione column. The resulting signals are preferably analyzed using, for example, the software GRAPHPAD PRISM (GraphPad Software, Inc., San Diego) fitted to a one-site competition model based on nonlinear regression analysis.

タグ付けは、GSTタグ付けに限定されず、ヒスチジンタグ、MBP、CBP、Flagタグ、HAタグ、V5タグ、c-mycタグなどであるがそれらに限定されない、任意のタグで実施されてもよい。被験抗原結合分子のドナービーズへの結合は、ビオチン-ストレプトアビジン反応を用いた結合に限定されない。特に、被験抗原結合分子がFcを含む場合、可能な方法には、ドナービーズ上のプロテインAまたはプロテインGなどのFc認識タンパク質を介して被験抗原結合分子を結合させることが含まれる。 Tagging is not limited to GST tagging, and may be performed with any tag, including but not limited to histidine tag, MBP, CBP, Flag tag, HA tag, V5 tag, c-myc tag, etc. Binding of the test antigen-binding molecule to the donor beads is not limited to binding using a biotin-streptavidin reaction. In particular, when the test antigen-binding molecule contains Fc, possible methods include binding the test antigen-binding molecule via an Fc-recognizing protein, such as protein A or protein G, on the donor beads.

また、CD3およびCD137が、可溶性タンパク質のように細胞膜上に発現していない時、または両方が同じ細胞上に存在する時には、可変領域が、CD3とCD137に同時に結合することができるが、各々が異なる細胞上で発現しているCD3とCD137に同時には結合することができない場合もまた、当技術分野において公知の方法によってアッセイすることができる。 Also, when CD3 and CD137 are not expressed on the cell membrane as soluble proteins, or when both are present on the same cell, the variable region can bind to CD3 and CD137 simultaneously, but cannot bind to CD3 and CD137 each expressed on a different cell, and this can also be assayed by methods known in the art.

具体的には、CD3およびCD137に対する同時の結合を検出するためのECL-ELISAにおいて陽性であると確認されている被験抗原結合分子をまた、CD3を発現する細胞およびCD137を発現する細胞と混合する。被験抗原結合分子は、抗原結合分子およびこれらの細胞が互いに同時に結合しない限り、異なる細胞上で発現しているCD3とCD137に同時には結合することができないことが示され得る。このアッセイは、例えば、細胞ベースのECL-ELISAによって実施することができる。CD3を発現する細胞を、予めプレート上に固定化する。被験抗原結合分子をそれに結合させた後に、CD137を発現する細胞をプレートに添加する。CD137を発現する細胞上でのみ発現している異なる抗原は、この抗原に対するsulfo-tagで標識された抗体を用いて検出される。抗原結合分子が、それぞれ2つの細胞上で発現している2つの抗原に同時に結合する場合は、シグナルが観察される。抗原結合分子がこれらの抗原に同時には結合しない場合は、いかなるシグナルも観察されない。 Specifically, a test antigen-binding molecule that has been confirmed to be positive in an ECL-ELISA for detecting simultaneous binding to CD3 and CD137 is also mixed with cells expressing CD3 and cells expressing CD137. It can be shown that the test antigen-binding molecule cannot simultaneously bind to CD3 and CD137 expressed on different cells unless the antigen-binding molecule and these cells simultaneously bind to each other. This assay can be performed, for example, by cell-based ECL-ELISA. Cells expressing CD3 are immobilized on a plate in advance. After the test antigen-binding molecule is bound to it, cells expressing CD137 are added to the plate. A different antigen expressed only on cells expressing CD137 is detected using an antibody labeled with a sulfo-tag against this antigen. If the antigen-binding molecule simultaneously binds to two antigens expressed on two cells, respectively, a signal is observed. If the antigen-binding molecule does not simultaneously bind to these antigens, no signal is observed.

あるいは、このアッセイは、ALPHAScreen法によって実施されてもよい。被験抗原結合分子を、ドナービーズに結合したCD3を発現する細胞およびアクセプタービーズに結合したCD137を発現する細胞と混合する。抗原結合分子が、それぞれ2つの細胞上で発現している2つの抗原に同時に結合する場合は、シグナルが観察される。抗原結合分子がこれらの抗原に同時には結合しない場合は、シグナルは観察されない。 Alternatively, this assay may be performed by the ALPHAScreen method. A test antigen-binding molecule is mixed with cells expressing CD3 bound to donor beads and cells expressing CD137 bound to acceptor beads. If the antigen-binding molecule simultaneously binds to two antigens expressed on two cells, respectively, a signal is observed. If the antigen-binding molecule does not simultaneously bind to these antigens, no signal is observed.

あるいは、このアッセイは、Octet相互作用解析法によって実施されてもよい。最初に、ペプチドタグを付加したCD3を発現する細胞を、ペプチドタグを認識するバイオセンサーに結合させる。CD137を発現する細胞および被験抗原結合分子を、ウェルに入れて、相互作用について解析する。抗原結合分子が、それぞれ2つの細胞上で発現している2つの抗原に同時に結合する場合は、被験抗原結合分子およびCD137を発現する細胞のバイオセンサーへの結合によって引き起こされる大きな波長シフトが観察される。抗原結合分子がこれらの抗原に同時には結合しない場合は、被験抗原結合分子のみのバイオセンサーへの結合によって引き起こされる小さな波長シフトが観察される。 Alternatively, this assay may be performed by the Octet interaction analysis method. First, cells expressing peptide-tagged CD3 are bound to a biosensor that recognizes the peptide tag. Cells expressing CD137 and the test antigen-binding molecule are placed in a well and analyzed for interaction. If the antigen-binding molecule simultaneously binds to two antigens expressed on two cells, respectively, a large wavelength shift caused by the binding of the test antigen-binding molecule and the cells expressing CD137 to the biosensor is observed. If the antigen-binding molecule does not simultaneously bind to these antigens, a small wavelength shift caused by the binding of only the test antigen-binding molecule to the biosensor is observed.

結合活性に基づくこれらの方法の代わりに、生物活性に基づくアッセイが実施されてもよい。例えば、CD3を発現する細胞およびCD137を発現する細胞を、被験抗原結合分子と混合して培養する。それぞれ2つの細胞上で発現している2つの抗原は、抗原結合分子がこれらの2つの抗原に同時に結合する場合は、被験抗原結合分子を介して相互に活性化される。そのため、抗原のそれぞれの下流のリン酸化レベルの増加などの活性化シグナルの変化を、検出することができる。あるいは、サイトカインの産生が、活性化の結果として誘導される。そのため、産生されるサイトカインの量を測定し、それによって、2つの細胞に同時に結合するか否かを確認することができる。あるいは、CD137を発現する細胞に対する細胞傷害活性が、活性化の結果として誘導される。あるいは、レポーター遺伝子の発現が、活性化の結果として、CD137またはCD3のシグナル伝達経路の下流で活性化されるプロモーターによって誘導される。そのため、細胞傷害活性または産生されるレポータータンパク質の量を測定し、それによって、2つの細胞に同時に結合するか否かを確認することができる。 Instead of these methods based on binding activity, an assay based on biological activity may be performed. For example, cells expressing CD3 and cells expressing CD137 are mixed and cultured with a test antigen-binding molecule. Two antigens expressed on the two cells, respectively, are mutually activated via the test antigen-binding molecule when the antigen-binding molecule simultaneously binds to these two antigens. Therefore, a change in activation signal, such as an increase in phosphorylation level downstream of each of the antigens, can be detected. Alternatively, the production of cytokines is induced as a result of activation. Therefore, the amount of cytokines produced can be measured, and thereby it can be confirmed whether or not they bind to the two cells simultaneously. Alternatively, cytotoxic activity against cells expressing CD137 is induced as a result of activation. Alternatively, the expression of a reporter gene is induced by a promoter that is activated downstream of the signaling pathway of CD137 or CD3 as a result of activation. Therefore, it can be confirmed whether or not they bind to the two cells simultaneously by measuring the cytotoxic activity or the amount of reporter protein produced.

少なくとも1つのジスルフィド結合
本発明の1つの局面において、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれは、好ましくはCH1領域において、(変異、置換、または挿入を介して)少なくとも1つのシステイン残基を含み、該少なくとも1つのシステイン残基は、第1の抗原結合部分と第2の抗原結合部分との間に少なくとも1つのジスルフィド結合を形成することができる。ある特定の態様において、システイン残基は、抗体重鎖定常領域のCH1領域内に存在し、例えば、CH1領域中のEUナンバリングによる119位、122位、123位、131位、132位、133位、134位、135位、136位、137位、139位、140位、148位、150位、155位、156位、157位、159位、160位、161位、162位、163位、165位、167位、174位、176位、177位、178位、190位、191位、192位、194位、195位、197位、213位、および214位からなる群より選択される位置に存在する。1つの態様において、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれは、第1の抗原結合部分のCH1領域と第2の抗原結合部分のCH1領域との間に1つのジスルフィド結合を形成することができる、CH1領域中のEUナンバリングによる191位に(変異、置換、または挿入を介して)1個のシステイン残基を含む。
At least one disulfide bond In one aspect of the invention, each of the first and second antigen-binding moieties comprises (through mutation, substitution, or insertion), preferably in the CH1 region, at least one cysteine residue, which is capable of forming at least one disulfide bond between the first and second antigen-binding moieties. In certain embodiments, the cysteine residue is present in the CH1 region of the antibody heavy chain constant region, e.g., at a position selected from the group consisting of: 119, 122, 123, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 139, 140, 148, 150, 155, 156, 157, 159, 160, 161, 162, 163, 165, 167, 174, 176, 177, 178, 190, 191, 192, 194, 195, 197, 213, and 214 according to EU numbering in the CH1 region. In one embodiment, the first antigen-binding moiety and the second antigen-binding moiety each contain (via mutation, substitution, or insertion) one cysteine residue at position 191 according to EU numbering in the CH1 region that is capable of forming one disulfide bond between the CH1 region of the first antigen-binding moiety and the CH1 region of the second antigen-binding moiety.

上記局面のある態様において、形成される「少なくとも1つの結合」は、上記に記載される第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分を連結し、2つの抗原結合部分(すなわち、上記に記載されるような第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分)を空間的に近い位置に保持することができる。ジスルフィド結合を介する第1の抗原結合部分と第2の抗原結合部分との間の連結のために、本発明の抗原結合分子は、2つの抗原結合部分間に導入された追加の結合を有さないという点でのみ本発明の抗原結合分子と相違する対照抗原結合分子より近い位置で、2つの抗原結合部分を保持することができる。いくつかの態様において、用語「空間的に近い位置」または「より近い位置」は、上記に記載される第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインが短縮された距離および/または低い可動性で保持されるという意味を含む。 In some embodiments of the above aspects, the "at least one bond" formed links the first and second antigen-binding moieties described above and can hold the two antigen-binding moieties (i.e., the first and second antigen-binding moieties as described above) in a spatially closer position. Due to the link between the first and second antigen-binding moieties via a disulfide bond, the antigen-binding molecule of the present invention can hold the two antigen-binding moieties in a closer position than a control antigen-binding molecule that differs from the antigen-binding molecule of the present invention only in that it does not have an additional bond introduced between the two antigen-binding moieties. In some embodiments, the term "spatially closer position" or "closer position" includes the meaning that the first and second antigen-binding domains described above are held at a shortened distance and/or with reduced mobility.

結果として、本発明の抗原結合分子の2つの抗原結合部分(すなわち、上記に記載されるような第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分)は、同じ単一の細胞上に発現している抗原に結合する。換言すると、本発明の抗原結合分子の2つの抗原結合部分(すなわち、上記に記載されるような第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分)の各々は、異なる細胞の架橋をもたらすような、異なる細胞上に発現している抗原には結合しない。本出願において、本発明の抗原結合分子のそのような抗原結合様式は「シス結合」と呼ぶことができるのに対して、抗原結合分子の2つの抗原結合部分の各々が、異なる細胞の架橋をもたらすように異なる細胞上に発現している抗原に結合する、抗原結合分子の抗原結合様式は、「トランス結合」と呼ぶことができる。いくつかの態様において、本発明の抗原結合分子は主に、「シス結合」様式で同じ単一の細胞上に発現している抗原に結合する。 As a result, the two antigen-binding portions of the antigen-binding molecule of the present invention (i.e., the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion as described above) bind to antigens expressed on the same single cell. In other words, each of the two antigen-binding portions of the antigen-binding molecule of the present invention (i.e., the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion as described above) does not bind to antigens expressed on different cells, resulting in cross-linking of different cells. In the present application, such an antigen-binding mode of the antigen-binding molecule of the present invention can be referred to as "cis-binding", whereas the antigen-binding mode of the antigen-binding molecule in which each of the two antigen-binding portions of the antigen-binding molecule binds to antigens expressed on different cells, resulting in cross-linking of different cells, can be referred to as "trans-binding". In some embodiments, the antigen-binding molecule of the present invention mainly binds to antigens expressed on the same single cell in a "cis-binding" manner.

上記局面のある態様において、上記に記載されているようなジスルフィド結合を介する第1の抗原結合部分と第2の抗原結合部分との間のジスルフィド結合のために、本発明の抗原結合分子は、免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、またはDC細胞等)の望ましくない架橋形成および活性化を低下させるおよび/または妨げることができる。すなわち、本発明のいくつかの態様において、本発明の抗原結合分子の第1の抗原結合部分は、T細胞などの免疫細胞上に発現している任意のシグナル伝達分子(例えば、第1の抗原)に結合し、本発明の抗原結合分子の第2の抗原結合ドメインもまた、T細胞などの免疫細胞上に発現している任意のシグナル伝達分子(例えば、第1の抗原、または第1の抗原とは異なる第2の抗原)に結合する。したがって、本発明の抗原結合分子の第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、同じ単一の免疫細胞、例えばT細胞などの上(すなわち、シス結合様式)に、または異なる免疫細胞、例えばT細胞などの上(すなわち、トランス結合様式)に発現している第1のまたは第2のシグナル伝達分子のいずれかに結合することができる。第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインが、トランス結合様式で異なる免疫細胞、例えばT細胞上に発現しているシグナル伝達分子に結合する場合、それらの異なる免疫細胞、例えばT細胞は架橋され、ある特定の状況において、T細胞などの免疫細胞のそのような架橋形成は、T細胞などの免疫細胞の望ましくない活性化を引き起こし得る。 In some embodiments of the above aspects, due to the disulfide bond between the first and second antigen-binding moieties via the disulfide bond as described above, the antigen-binding molecule of the present invention can reduce and/or prevent undesired cross-linking and activation of immune cells (e.g., T cells, NK cells, or DC cells, etc.). That is, in some embodiments of the present invention, the first antigen-binding moiety of the antigen-binding molecule of the present invention binds to any signaling molecule (e.g., a first antigen) expressed on an immune cell such as a T cell, and the second antigen-binding domain of the antigen-binding molecule of the present invention also binds to any signaling molecule (e.g., a first antigen, or a second antigen different from the first antigen) expressed on an immune cell such as a T cell. Thus, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain of the antigen-binding molecule of the present invention can bind to either a first or a second signaling molecule expressed on the same single immune cell, such as a T cell (i.e., in a cis-binding manner) or on different immune cells, such as a T cell (i.e., in a trans-binding manner). When the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain bind to signaling molecules expressed on different immune cells, e.g., T cells, in a trans-binding manner, the different immune cells, e.g., T cells, are cross-linked, and in certain circumstances, such cross-linking of immune cells, e.g., T cells, can cause undesired activation of immune cells, e.g., T cells.

一方、本発明の抗原結合分子、すなわち、CH1領域中(EUナンバリングによる191位)の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して相互に連結される第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分を含む抗原結合分子の別の態様の場合、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分はどちらも、抗原結合分子を介する異なる免疫細胞、例えばT細胞の架橋形成が低減し、免疫細胞の望ましくない活性化を回避できるように、同じ単一の免疫細胞、例えばT細胞上に発現しているシグナル伝達分子に「シス結合」様式で結合することができる。 On the other hand, in another embodiment of the antigen-binding molecule of the present invention, i.e., the antigen-binding molecule comprising a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety linked to each other via at least one disulfide bond in the CH1 region (position 191 according to EU numbering), both the first antigen-binding moiety and the second antigen-binding moiety can bind to a signaling molecule expressed on the same single immune cell, e.g., a T cell, in a "cis-binding" manner, such that cross-linking of different immune cells, e.g., T cells, via the antigen-binding molecule is reduced, and undesired activation of the immune cell can be avoided.

本出願において、上記の特徴、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分を連結するCH1領域中(例えば、EUナンバリングによる191位)の少なくとも1つのジスルフィド結合は、略語「LINC」で記載され得る。この略語を用いると、いくつかの態様において、該少なくとも1つのジスルフィド結合を有する本発明の上記の抗原結合分子は、例えば、「LINCフォーマット」、「Dual/LINC」または「DLL3-Dual/LINC」等として表示され得る。同様に、CH1領域中(例えば、EUナンバリングによる191位)の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して相互に連結されない/まだ連結されていない第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分の抗原結合分子は、略語「UnLINC」で記載され得る。 In the present application, the above-mentioned feature, at least one disulfide bond in the CH1 region (e.g., at position 191 according to EU numbering) linking the first and second antigen-binding moieties, may be described by the abbreviation "LINC". Using this abbreviation, in some embodiments, the above-mentioned antigen-binding molecules of the present invention having the at least one disulfide bond may be indicated, for example, as "LINC format", "Dual/LINC" or "DLL3-Dual/LINC", etc. Similarly, an antigen-binding molecule of a first antigen-binding moiety and a second antigen-binding moiety that are not/yet linked to each other via at least one disulfide bond in the CH1 region (e.g., at position 191 according to EU numbering) may be described by the abbreviation "UnLINC".

Fab分子
「Fab分子」は、免疫グロブリンの重鎖のVHおよびCH1ドメイン(「Fab重鎖」)ならびに軽鎖のVLおよびCLドメイン(「Fab軽鎖」)からなるタンパク質を指す。
Fab Molecule "Fab molecule" refers to a protein consisting of the VH and CH1 domains of an immunoglobulin heavy chain (a "Fab heavy chain") and the VL and CL domains of a light chain (a "Fab light chain").

融合される
「融合される」は、構成成分(例えば、Fab分子およびFcドメインサブユニット)が、直接的に、または1つもしくは複数のペプチドリンカーを介して、ペプチド結合によって連結されることを意味する。
Fused "Fused" means that the components (e.g., a Fab molecule and an Fc domain subunit) are linked by a peptide bond, either directly or via one or more peptide linkers.

「クロスオーバー」Fab
「クロスオーバー」Fab分子(「Crossfab」とも呼ばれる)は、Fab重鎖およびFab軽鎖の可変領域または定常領域のいずれかが交換されている、Fab分子を意味し、すなわち、クロスオーバーFab分子は、軽鎖可変領域および重鎖定常領域で構成されたペプチド鎖と、重鎖可変領域および軽鎖定常領域で構成されたペプチド鎖とを含む。明確にするために記すと、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子では、重鎖定常領域を含むペプチド鎖が、本明細書において、クロスオーバーFab分子の「重鎖」と称される。反対に、Fab軽鎖およびFab重鎖の定常領域が交換されているクロスオーバーFab分子では、重鎖可変領域を含むペプチド鎖が、本明細書において、クロスオーバーFab分子の「重鎖」と称される。
"Crossover" Fab
A "crossover" Fab molecule (also called "Crossfab") refers to a Fab molecule in which either the variable or constant regions of the Fab heavy and Fab light chains are exchanged, i.e., the crossover Fab molecule comprises a peptide chain composed of a light chain variable region and a heavy chain constant region, and a peptide chain composed of a heavy chain variable region and a light chain constant region. For clarity, in a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light and Fab heavy chains are exchanged, the peptide chain comprising the heavy chain constant region is referred to herein as the "heavy chain" of the crossover Fab molecule. Conversely, in a crossover Fab molecule in which the constant regions of the Fab light and Fab heavy chains are exchanged, the peptide chain comprising the heavy chain variable region is referred to herein as the "heavy chain" of the crossover Fab molecule.

「従来型の」Fab
それに対して、「従来型の」Fab分子は、その天然のフォーマットでのFab分子、すなわち、重鎖の可変領域および定常領域で構成された重鎖(VH-CH1)、ならびに軽鎖の可変領域および定常領域で構成された軽鎖(VL-CL)を含むFab分子を意味する。用語「免疫グロブリン分子」は、天然に存在する抗体の構造を有するタンパク質を指す。例えば、IgGクラスの免疫グロブリンは、ジスルフィド結合で結合された2つの軽鎖および2つの重鎖で構成された、約150,000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。各重鎖は、N末端からC末端へ、可変重鎖ドメインまたは重鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域(VH)と、その後に続く重鎖定常領域とも呼ばれる3種類の定常ドメイン(CH1、CH2、およびCH3)とを有する。同様に、各軽鎖は、N末端からC末端へ、可変軽鎖ドメインまたは軽鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域(VL)と、その後に続く軽鎖定常領域とも呼ばれる定常軽鎖(CL)ドメインとを有する。免疫グロブリンの重鎖は、α(IgA)、δ(IgD)、ε(IgE)、γ(IgG)、またはμ(IgM)と呼ばれる5つのタイプのうちの1つに割り当てられてもよく、それらの一部は、サブタイプ、例えば、γ1(IgG1)、γ2(IgG2)、γ3(IgG3)、γ4(IgG4)、α1(IgA1)、およびα2(IgA2)にさらに分類されてもよい。免疫グロブリンの軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、カッパおよびラムダと呼ばれる2つのタイプのうちの1つに割り当てられもよい。免疫グロブリンは、免疫グロブリンヒンジ領域を介して連結された、2つのFab分子およびFcドメインから本質的になる。
"Traditional" Fab
In contrast, a "conventional" Fab molecule refers to a Fab molecule in its native format, i.e., a Fab molecule that includes a heavy chain (VH-CH1) composed of the variable and constant regions of the heavy chain, and a light chain (VL-CL) composed of the variable and constant regions of the light chain. The term "immunoglobulin molecule" refers to a protein that has the structure of a naturally occurring antibody. For example, immunoglobulins of the IgG class are heterotetrameric glycoproteins of about 150,000 daltons, composed of two light chains and two heavy chains linked by disulfide bonds. Each heavy chain has, from the N-terminus to the C-terminus, a variable region (VH), also called the variable heavy chain domain or the heavy chain variable domain, followed by three constant domains (CH1, CH2, and CH3), also called the heavy chain constant region. Similarly, each light chain has, from the N-terminus to the C-terminus, a variable region (VL), also called the variable light chain domain or the light chain variable domain, followed by a constant light chain (CL) domain, also called the light chain constant region. The heavy chains of an immunoglobulin may be assigned to one of five types, called α (IgA), δ (IgD), ε (IgE), γ (IgG), or μ (IgM), some of which may be further classified into subtypes, e.g., γ1 (IgG1), γ2 (IgG2), γ3 (IgG3), γ4 (IgG4), α1 (IgA1), and α2 (IgA2). The light chains of an immunoglobulin may be assigned to one of two types, called kappa and lambda, based on the amino acid sequence of their constant domains. Immunoglobulins essentially consist of two Fab molecules and an Fc domain linked via an immunoglobulin hinge region.

親和性
「親和性」は、分子(例えば、抗原結合分子または抗体)の結合部位1個と、分子の結合パートナー(例えば、抗原)との間の、非共有結合的な相互作用の合計の強度を指す。別段示さない限り、本明細書で用いられる「結合親和性」は、ある結合対のメンバー(例えば、抗原結合分子と抗原、または抗体と抗原)の間の1:1相互作用を反映する、固有の結合親和性を指す。分子Xの、そのパートナーYに対する親和性は、一般的に、解離速度定数と会合速度定数(それぞれkoffおよびkon)との比である、解離定数(KD)により表すことができる。したがって、速度定数の比が同じままである限り、等価の親和性は異なる速度定数を含んでもよい。親和性は、本明細書に記載のものを含む、当技術分野において公知の確立した方法によって測定することができる。親和性を測定するための具体的な方法は、表面プラズモン共鳴(SPR)である。
Affinity "Affinity" refers to the strength of the total non-covalent interactions between one binding site of a molecule (e.g., an antigen-binding molecule or an antibody) and the binding partner of the molecule (e.g., an antigen). Unless otherwise indicated, "binding affinity" as used herein refers to the inherent binding affinity that reflects a 1:1 interaction between members of a binding pair (e.g., an antigen-binding molecule and an antigen, or an antibody and an antigen). The affinity of a molecule X for its partner Y can generally be expressed by the dissociation constant (KD), which is the ratio of the dissociation rate constant to the association rate constant (koff and kon, respectively). Thus, equivalent affinities may include different rate constants, as long as the ratio of the rate constants remains the same. Affinity can be measured by established methods known in the art, including those described herein. A specific method for measuring affinity is surface plasmon resonance (SPR).

親和性を決定する方法
特定の態様において、本明細書で提供される抗原結合分子または抗体は、その抗原に対して、1μM以下、120nM以下、100nM以下、80nM以下、70nM以下、50nM以下、40nM以下、30nM以下、20nM以下、10nM以下、2nM以下、1nM以下、0.1nM以下、0.01nM以下または0.001nM以下(例えば、10-8M以下、10-8M~10-13M、10-9M~10-13M)の解離定数 (KD) を有する。特定の態様において、CD3、CD137、またはDLL3に対する、抗体/抗原結合分子のKD値は、1~40、1~50、1~70、1~80、30~50、30~70、30~80、40~70、40~80、または60~80nMの範囲内に入る。
Methods for Determining Affinity In certain embodiments, an antigen-binding molecule or antibody provided herein has a dissociation constant (KD) for its antigen of 1 μM or less, 120 nM or less, 100 nM or less, 80 nM or less, 70 nM or less, 50 nM or less, 40 nM or less, 30 nM or less, 20 nM or less, 10 nM or less, 2 nM or less, 1 nM or less, 0.1 nM or less, 0.01 nM or less, or 0.001 nM or less (e.g., 10 −8 M or less, 10 −8 M to 10 −13 M, 10 −9 M to 10 −13 M). In certain embodiments, the KD value of the antibody/antigen binding molecule for CD3, CD137, or DLL3 falls within the range of 1-40, 1-50, 1-70, 1-80, 30-50, 30-70, 30-80, 40-70, 40-80, or 60-80 nM.

1つの態様において、KDは、放射性標識抗原結合測定法 (radiolabeled antigen binding assay: RIA) によって測定される。1つの態様において、RIAは、目的の抗体のFabバージョンおよびその抗原を用いて実施される。例えば、抗原に対するFabの溶液中結合親和性は、非標識抗原の漸増量系列の存在下で最小濃度の (125I) 標識抗原によりFabを平衡化させ、次いで結合した抗原を抗Fab抗体でコーティングされたプレートにより捕捉することによって測定される。(例えば、Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881(1999) を参照のこと)。測定条件を構築するために、MICROTITER(登録商標)マルチウェルプレート (Thermo Scientific) を50mM炭酸ナトリウム (pH9.6) 中5μg/mlの捕捉用抗Fab抗体 (Cappel Labs) で一晩コーティングし、その後に室温(およそ23℃)で2~5時間、PBS中2% (w/v) ウシ血清アルブミンでブロックする。非吸着プレート (Nunc #269620) において、100 pMまたは26 pMの [125I]-抗原を、(例えば、Presta et al., Cancer Res. 57:4593-4599 (1997) における抗VEGF抗体、Fab-12の評価と同じように)目的のFabの段階希釈物と混合する。次いで、目的のFabを一晩インキュベートするが、このインキュベーションは、平衡が確実に達成されるよう、より長時間(例えば、約65時間)継続され得る。その後、混合物を、室温でのインキュベーション(例えば、1時間)のために捕捉プレートに移す。次いで溶液を除去し、プレートをPBS中0.1%のポリソルベート20(TWEEN-20(登録商標))で8回洗浄する。プレートが乾燥したら、150μl/ウェルのシンチラント(MICROSCINT-20(商標)、Packard)を添加し、TOPCOUNT(商標)ガンマカウンター (Packard) においてプレートを10分間カウントする。最大結合の20%以下を与える各Fabの濃度を、競合結合アッセイにおいて使用するために選択する。 In one embodiment, KD is measured by radiolabeled antigen binding assay (RIA). In one embodiment, RIA is performed using a Fab version of the antibody of interest and its antigen. For example, the solution binding affinity of the Fab to the antigen is measured by equilibrating the Fab with a minimal concentration of ( 125 I)-labeled antigen in the presence of an increasing series of unlabeled antigens, and then capturing the bound antigen with a plate coated with an anti-Fab antibody. (See, e.g., Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881(1999)). To establish the assay conditions, MICROTITER® multi-well plates (Thermo Scientific) are coated overnight with 5 μg/ml of capture anti-Fab antibody (Cappel Labs) in 50 mM sodium carbonate (pH 9.6), then blocked with 2% (w/v) bovine serum albumin in PBS for 2-5 hours at room temperature (approximately 23° C.). In a non-adsorbent plate (Nunc #269620), 100 pM or 26 pM of [ 125 I]-antigen is mixed with serial dilutions of the Fab of interest (e.g., as in the evaluation of the anti-VEGF antibody, Fab-12, in Presta et al., Cancer Res. 57:4593-4599 (1997)). The Fab of interest is then incubated overnight, although the incubation can be continued for longer (e.g., about 65 hours) to ensure that equilibrium is reached. The mixture is then transferred to a capture plate for incubation (e.g., 1 hour) at room temperature. The solution is then removed and the plate is washed 8 times with 0.1% polysorbate 20 (TWEEN-20®) in PBS. Once the plate has dried, 150 μl/well of scintillant (MICROSCINT-20™, Packard) is added and the plate is counted for 10 minutes in a TOPCOUNT™ gamma counter (Packard). The concentration of each Fab that gives 20% or less of maximum binding is selected for use in the competitive binding assay.

別の態様によれば、Kdは、BIACORE(登録商標)表面プラズモン共鳴アッセイを用いて測定される。例えば、BIACORE(登録商標)-2000またはBIACORE(登録商標)-3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ) を用いる測定法が、およそ10反応単位 (response unit: RU) の抗原が固定されたCM5チップを用いて25℃で実施される。1つの態様において、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ (CM5、BIACORE, Inc.) は、供給元の指示に従いN-エチル-N'-(3-ジメチルアミノプロピル)-カルボジイミドヒドロクロリド (EDC) およびN-ヒドロキシスクシンイミド (NHS) を用いて活性化される。抗原は、およそ10反応単位 (RU) のタンパク質の結合を達成するよう、5μl/分の流速で注入される前に、10mM酢酸ナトリウム、pH4.8を用いて5μg/ml(およそ0.2μM)に希釈される。抗原の注入後、未反応基をブロックするために1Mエタノールアミンが注入される。キネティクスの測定のために、25℃、およそ25μl/分の流速で、0.05%ポリソルベート20(TWEEN-20(商標))界面活性剤含有PBS (PBST) 中のFabの2倍段階希釈物 (0.78nM~500nM) が注入される。会合速度 (kon) および解離速度 (koff) は、単純な1対1ラングミュア結合モデル(BIACORE(登録商標)評価ソフトウェアバージョン3.2)を用いて、会合および解離のセンサーグラムを同時にフィッティングすることによって計算される。平衡解離定数 (Kd) は、koff/kon比として計算される。例えば、Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881 (1999) を参照のこと。上記の表面プラズモン共鳴アッセイによってオン速度が106M-1s-1を超える場合、オン速度は、分光計(例えばストップフロー式分光光度計 (Aviv Instruments) または撹拌キュベットを用いる8000シリーズのSLM-AMINCO(商標)分光光度計 (ThermoSpectronic))において測定される、漸増濃度の抗原の存在下でのPBS、pH7.2中20nMの抗抗原抗体(Fab形態)の25℃での蛍光発光強度(励起=295nm;発光=340nm、バンドパス16nm)の増加または減少を測定する蛍光消光技術を用いることによって決定され得る。 In another embodiment, Kd is measured using a BIACORE® surface plasmon resonance assay. For example, measurements using a BIACORE®-2000 or BIACORE®-3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ) are performed at 25° C. using a CM5 chip with approximately 10 response units (RU) of antigen immobilized. In one embodiment, a carboxymethylated dextran biosensor chip (CM5, BIACORE, Inc.) is activated with N-ethyl-N'-(3-dimethylaminopropyl)-carbodiimide hydrochloride (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS) according to the supplier's instructions. The antigen is diluted to 5 μg/ml (approximately 0.2 μM) with 10 mM sodium acetate, pH 4.8, before being injected at a flow rate of 5 μl/min to achieve approximately 10 response units (RU) of protein binding. After injection of antigen, 1 M ethanolamine is injected to block unreacted groups. For kinetic measurements, two-fold serial dilutions of Fab (0.78 nM to 500 nM) are injected in PBS containing 0.05% polysorbate 20 (TWEEN-20™) detergent (PBST) at 25° C. and a flow rate of approximately 25 μl/min. Association rates (k on ) and dissociation rates (k off ) are calculated by simultaneously fitting the association and dissociation sensorgrams with a simple one-to-one Langmuir binding model (BIACORE® Evaluation Software Version 3.2). The equilibrium dissociation constant (Kd) is calculated as the ratio k off /k on . See, e.g., Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881 (1999). If the on-rate exceeds 10 6 M -1 s -1 by the surface plasmon resonance assay described above, the on-rate can be determined by using a fluorescence quenching technique to measure the increase or decrease in fluorescence emission intensity (excitation = 295 nm; emission = 340 nm, band pass 16 nm) of 20 nM anti-antigen antibody (Fab form) in PBS, pH 7.2 at 25°C in the presence of increasing concentrations of antigen, as measured in a spectrometer (e.g. a stopped-flow spectrophotometer (Aviv Instruments) or an 8000 series SLM-AMINCO (trademark) spectrophotometer (ThermoSpectronic) using a stirred cuvette).

抗原結合分子または抗体の親和性を測定する上記の方法に従って、当業者は、様々な抗原に対する他の抗原結合分子または抗体の親和性測定を行うことができる。 Following the above-described methods for measuring the affinity of an antigen-binding molecule or antibody, one skilled in the art can perform affinity measurements of other antigen-binding molecules or antibodies for various antigens.

抗体
本明細書で用語「抗体」は、最も広い意味で使用され、所望の抗原結合活性を示す限りは、これらに限定されるものではないが、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)および抗体断片を含む、種々の抗体構造を包含する。
Antibodies The term "antibody" is used herein in the broadest sense and encompasses a variety of antibody structures, including, but not limited to, monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, multispecific antibodies (e.g., bispecific antibodies), and antibody fragments, so long as they exhibit the desired antigen-binding activity.

抗体断片
「抗体断片」は、完全抗体が結合する抗原に結合する当該完全抗体の一部分を含む、当該完全抗体以外の分子を指す。抗体断片の例は、これらに限定されるものではないが、Fv、Fab、Fab'、Fab’-SH、F(ab')2、ダイアボディ、線状抗体、単鎖抗体分子(例えば、scFv)、およびシングルドメイン抗体を含む。特定の抗体断片についての総説として、Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003) を参照のこと。scFv断片の総説として、例えば、Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp.269-315 (1994);加えて、WO93/16185;ならびに米国特許第5,571,894号および第5,587,458号を参照のこと。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含みin vivoにおける半減期の長くなったFabおよびF(ab')2断片についての論説として、米国特許第5,869,046号を参照のこと。ダイアボディは、二価または二重特異的であってよい、抗原結合部位を2つ伴う抗体断片である。例えば、EP404,097; WO1993/01161; Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003); およびHollinger et al., Proc Natl Acad Sci USA 90, 6444-6448 (1993) 参照。トリアボディ (triabody) やテトラボディ (tetrabody) も、Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003) に記載されている。シングルドメイン抗体は、抗体の重鎖可変ドメインのすべてもしくは一部分、または軽鎖可変ドメインのすべてもしくは一部分を含む、抗体断片である。特定の態様において、シングルドメイン抗体は、ヒトシングルドメイン抗体である(Domantis, Inc., Waltham, MA;例えば、米国特許第6,248,516号B1参照)。抗体断片は、これらに限定されるものではないが、本明細書に記載の、完全抗体のタンパク質分解的消化、組換え宿主細胞(例えば、大腸菌またはファージ)による産生を含む、種々の手法により作ることができる。
Antibody Fragment An "antibody fragment" refers to a molecule other than a complete antibody that contains a portion of the complete antibody that binds to the antigen to which the complete antibody binds. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, diabodies, linear antibodies, single-chain antibody molecules (e.g., scFv), and single-domain antibodies. For a review of specific antibody fragments, see Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003). For a review of scFv fragments, see, e.g., Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp.269-315 (1994); in addition, WO93/16185; and U.S. Patent Nos. 5,571,894 and 5,587,458. See U.S. Patent No. 5,869,046 for a discussion of Fab and F(ab') 2 fragments that contain salvage receptor binding epitope residues and have increased half-life in vivo. Diabodies are antibody fragments with two antigen binding sites that may be bivalent or bispecific. See, e.g., EP 404,097; WO 1993/01161; Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003); and Hollinger et al., Proc Natl Acad Sci USA 90, 6444-6448 (1993). Triabodies and tetrabodies are also described in Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003). A single domain antibody is an antibody fragment that contains all or a portion of the heavy chain variable domain or all or a portion of the light chain variable domain of an antibody. In certain embodiments, a single domain antibody is a human single domain antibody (Domantis, Inc., Waltham, MA; see, e.g., U.S. Pat. No. 6,248,516 B1). Antibody fragments can be produced by a variety of techniques, including, but not limited to, proteolytic digestion of whole antibodies, production by recombinant host cells (e.g., E. coli or phage), as described herein.

抗体のクラス
抗体の「クラス」は、抗体の重鎖に備わる定常ドメインまたは定常領域のタイプを指す。抗体には5つの主要なクラスがある:IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMである。そして、このうちいくつかはさらにサブクラス(アイソタイプ)に分けられてもよい。例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2である。異なるクラスの免疫グロブリンに対応する重鎖定常ドメインを、それぞれ、α、δ、ε、γ、およびμと呼ぶ。
Antibody ClassesAn antibody "class" refers to the type of constant domain or constant region present in the antibody's heavy chain. There are five major classes of antibodies: IgA, IgD, IgE, IgG, and IgM. Some of these may be further divided into subclasses (isotypes), e.g., IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, and IgA2. The heavy chain constant domains corresponding to the different classes of immunoglobulins are called α, δ, ε, γ, and μ, respectively.

別段示さない限り、軽鎖定常領域中のアミノ酸残基は、本明細書ではKabatらに従ってナンバリングされ、重鎖定常領域中のアミノ酸残基のナンバリングは、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991に記載されているような、EUインデックスとも呼ばれる、EUナンバリングシステムに従う。 Unless otherwise indicated, amino acid residues in the light chain constant region are numbered herein according to Kabat et al., and numbering of amino acid residues in the heavy chain constant region is according to the EU numbering system, also known as the EU index, as described in Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991.

フレームワーク
「フレームワーク」または「FR」は、超可変領域 (HVR) 残基以外の、可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのFRは、通常4つのFRドメイン:FR1、FR2、FR3、およびFR4からなる。それに応じて、HVRおよびFRの配列は、通常次の順序でVH(またはVL)に現れる:FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
Framework "Framework" or "FR" refers to variable domain residues other than the hypervariable region (HVR) residues. The FR of a variable domain typically consists of four FR domains: FR1, FR2, FR3, and FR4. Accordingly, the sequences of the HVRs and FRs typically appear in the VH (or VL) in the following order: FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.

ヒトコンセンサスフレームワーク
「ヒトコンセンサスフレームワーク」は、ヒト免疫グロブリンVLまたはVHフレームワーク配列の選択群において最も共通して生じるアミノ酸残基を示すフレームワークである。通常、ヒト免疫グロブリンVLまたはVH配列の選択は、可変ドメイン配列のサブグループからである。通常、配列のサブグループは、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, NIH Publication 91-3242, Bethesda MD (1991), vols. 1-3におけるサブグループである。1つの態様において、VLについて、サブグループは上記のKabatらによるサブグループκIである。1つの態様において、VHについて、サブグループは上記のKabatらによるサブグループIIIである。
Human consensus framework "Human consensus framework" is a framework that represents the most commonly occurring amino acid residues in a selection of human immunoglobulin VL or VH framework sequences. Usually, the selection of human immunoglobulin VL or VH sequences is from a subgroup of variable domain sequences. Usually, the subgroup of sequences is a subgroup in Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, NIH Publication 91-3242, Bethesda MD (1991), vols. 1-3. In one embodiment, for VL, the subgroup is subgroup kappa I according to Kabat et al., supra. In one embodiment, for VH, the subgroup is subgroup III according to Kabat et al., supra.

キメラ抗体
用語「キメラ」抗体は、重鎖および/または軽鎖の一部分が特定の供給源または種に由来する一方で、重鎖および/または軽鎖の残りの部分が異なった供給源または種に由来する抗体を指す。同様に、用語「キメラ抗体可変ドメイン」は、重鎖および/または軽鎖可変領域の一部分が特定の供給源または種に由来する一方で、重鎖および/または軽鎖可変領域の残りの部分が異なった供給源または種に由来する抗体可変領域を指す。
Chimeric Antibodies The term "chimeric" antibody refers to an antibody in which a portion of the heavy and/or light chain is derived from a particular source or species, while the remaining portions of the heavy and/or light chain are derived from a different source or species. Similarly, the term "chimeric antibody variable domain" refers to an antibody variable region in which a portion of the heavy and/or light chain variable region is derived from a particular source or species, while the remaining portions of the heavy and/or light chain variable region are derived from a different source or species.

ヒト化抗体
「ヒト化」抗体は、非ヒトHVRからのアミノ酸残基およびヒトFRからのアミノ酸残基を含む、キメラ抗体を指す。ある態様では、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、当該可変領域においては、すべてのもしくは実質的にすべてのHVR(例えばCDR)は非ヒト抗体のものに対応し、かつ、すべてのもしくは実質的にすべてのFRはヒト抗体のものに対応する。ヒト化抗体は、任意で、ヒト抗体に由来する抗体定常領域の少なくとも一部分を含んでもよい。抗体(例えば、非ヒト抗体)の「ヒト化された形態」は、ヒト化を経た抗体を指す。「ヒト化抗体可変領域」は、ヒト化抗体の可変領域を指す。
Humanized antibody A "humanized" antibody refers to a chimeric antibody that contains amino acid residues from non-human HVRs and amino acid residues from human FRs. In certain embodiments, a humanized antibody contains substantially all of at least one, typically two, variable domains, in which all or substantially all HVRs (e.g., CDRs) correspond to those of a non-human antibody and all or substantially all FRs correspond to those of a human antibody. A humanized antibody may optionally contain at least a portion of an antibody constant region derived from a human antibody. A "humanized form" of an antibody (e.g., a non-human antibody) refers to an antibody that has undergone humanization. A "humanized antibody variable region" refers to the variable region of a humanized antibody.

ヒト抗体
「ヒト抗体」は、ヒトもしくはヒト細胞によって産生された抗体またはヒト抗体レパートリーもしくは他のヒト抗体コード配列を用いる非ヒト供給源に由来する抗体のアミノ酸配列に対応するアミノ酸配列を備える抗体である。このヒト抗体の定義は、非ヒトの抗原結合残基を含むヒト化抗体を、明確に除外するものである。「ヒト抗体可変領域」は、ヒト抗体の可変領域を指す。
Human antibody A "human antibody" is an antibody with an amino acid sequence that corresponds to that of an antibody produced by a human or human cell, or from a non-human source that uses a human antibody repertoire or other human antibody coding sequence. This definition of a human antibody specifically excludes humanized antibodies, which contain non-human antigen-binding residues. "Human antibody variable region" refers to the variable region of a human antibody.

ポリヌクレオチド(核酸)
本明細書で相互に交換可能に使用される「ポリヌクレオチド」または「核酸」は、任意の長さのヌクレオチドのポリマーを指し、DNAおよびRNAを含む。ヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾ヌクレオチドもしくは塩基、および/またはそれらのアナログ、またはDNAもしくはRNAポリメラーゼによってまたは合成反応によってポリマーに組み込まれ得る任意の物質であり得る。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびそれらのアナログなどの修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチドの配列に、非ヌクレオチド成分が割り込んでいてもよい。ポリヌクレオチドは、標識へのコンジュゲーションなどの、合成後になされる修飾を含み得る。他のタイプの修飾は、例えば、「キャップ」、1つまたは複数の天然に存在するヌクレオチドとアナログとの置換、ヌクレオチド間修飾、例えば、非荷電連結(例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホロアミド酸、カルバメート等)および荷電連結(例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート等)を伴うもの、例えばタンパク質(例えば、ヌクレアーゼ、毒素、抗体、シグナルペプチド、ポリ-L-リジン等)などのペンダント部分を含むもの、インターカレート剤(例えば、アクリジン、ソラレン等)を伴うもの、キレート剤(例えば、金属、放射性金属、ホウ素、酸化金属等)を含むもの、アルキル化剤を含むもの、修飾連結(例えば、アルファアノマー核酸等)や非修飾形態のポリヌクレオチドを伴うものを含む。さらに、通常糖に存在する任意のヒドロキシル基は、例えば、ホスホネート基、ホスフェート基によって置き換えられ得、標準的な保護基によって保護され得、もしくはさらなるヌクレオチドへのさらなる連結を生成するよう活性化され得、または固体もしくは半固体支持体にコンジュゲートされ得る。5’および3’末端のOHは、リン酸化またはアミンもしくは1~20炭素原子の有機キャップ基部分で置換され得る。他のヒドロキシルもまた、標準的な保護基に誘導体化され得る。ポリヌクレオチドはまた、例えば以下のものを含む、当技術分野で一般に公知となっているリボースまたはデオキシリボース糖の類似形態を含み得る:2'-O-メチル-、2'-O-アリル-、2'-フルオロ-、または2'-アジド-リボース、炭素環式糖アナログ、α-アノマー糖、アラビノースまたはキシロースまたはリキソースなどのエピマー糖、ピラノース糖、フラノース糖、セドヘプツロース、非環式アナログ、およびメチルリボシドなどの塩基性ヌクレオシドアナログ。1つまたは複数のホスホジエステル結合は、代替の連結基によって置き換えられ得る。これらの代替の連結基は、これらに限定されるものではないが、ホスフェートが以下のものによって置き換えられている態様を含む:P(O)S(「チオエート」)、P(S)S(「ジチオエート」)、(O)NR2(「アミデート」)、P(O)R、P(O)OR'、CO、またはCH2(「ホルムアセタール」)、ここで、各RまたはR'は独立してH、または、任意でエーテル(-O-)連結、アリール、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、もしくはアラルジルを含む置換もしくは非置換アルキル(1~20C)である。ポリヌクレオチド中のすべての連結が同一である必要はない。上記の説明は、RNAおよびDNAを含む本明細書で言及されるすべてのポリヌクレオチドに適用される。
Polynucleotides (nucleic acids)
"Polynucleotide" or "nucleic acid", as used interchangeably herein, refers to a polymer of nucleotides of any length, including DNA and RNA. Nucleotides can be deoxyribonucleotides, ribonucleotides, modified nucleotides or bases, and/or their analogs, or any substance that can be incorporated into a polymer by DNA or RNA polymerase or by a synthetic reaction. Polynucleotides can include modified nucleotides, such as methylated nucleotides and their analogs. The sequence of nucleotides can be interrupted by non-nucleotide components. Polynucleotides can include modifications made after synthesis, such as conjugation to a label. Other types of modifications include, for example, "caps", substitution of one or more naturally occurring nucleotides with analogs, internucleotide modifications, such as those with uncharged linkages (e.g., methylphosphonates, phosphotriesters, phosphoramidates, carbamates, etc.) and charged linkages (e.g., phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.), those containing pendant moieties such as proteins (e.g., nucleases, toxins, antibodies, signal peptides, poly-L-lysine, etc.), those with intercalating agents (e.g., acridine, psoralen, etc.), those containing chelating agents (e.g., metals, radioactive metals, boron, metal oxides, etc.), those containing alkylating agents, those with modified linkages (e.g., alpha anomeric nucleic acids, etc.) and unmodified forms of polynucleotides. Additionally, any hydroxyl groups normally present on the sugar can be replaced, for example, by phosphonate groups, phosphate groups, protected by standard protecting groups, or activated to generate additional linkages to additional nucleotides, or conjugated to solid or semi-solid supports. The 5' and 3' terminal OH may be phosphorylated or substituted with amines or organic capping group moieties of 1-20 carbon atoms. Other hydroxyls may also be derivatized to standard protecting groups. Polynucleotides may also contain analogous forms of ribose or deoxyribose sugars commonly known in the art, including, for example, 2'-O-methyl-, 2'-O-allyl-, 2'-fluoro-, or 2'-azido-ribose, carbocyclic sugar analogs, α-anomeric sugars, epimeric sugars such as arabinose or xylose or lyxose, pyranose sugars, furanose sugars, sedoheptulose, acyclic analogs, and basic nucleoside analogs such as methyl riboside. One or more phosphodiester linkages may be replaced by alternative linking groups. These alternative linking groups include, but are not limited to, embodiments in which phosphate is replaced by: P(O)S ("thioate"), P(S)S ("dithioate"), (O) NR2 ("amidate"), P(O)R, P(O)OR', CO, or CH2 ("formacetal"), where each R or R' is independently H or substituted or unsubstituted alkyl (1-20C), optionally including an ether (-O-) linkage, aryl, alkenyl, cycloalkyl, cycloalkenyl, or araldyl. Not all linkages in a polynucleotide need be identical. The above description applies to all polynucleotides referred to herein, including RNA and DNA.

単離された(核酸)
「単離された」核酸分子は、そのもともとの環境の成分から分離されたものを指す。単離された核酸分子はさらに、その核酸分子を通常含む細胞の中に含まれた核酸分子を含むが、その核酸分子は染色体外に存在しているかまたは本来の染色体上の位置とは異なる染色体上の位置に存在している。
Isolated (nucleic acid)
An "isolated" nucleic acid molecule refers to one that is separated from a component of its original environment. Isolated nucleic acid molecules further include nucleic acid molecules contained in cells that normally contain the nucleic acid molecule, but where the nucleic acid molecule is present extrachromosomally or in a chromosomal location that is different from its natural chromosomal location.

ベクター
本明細書で用いられる用語「ベクター」は、それが連結されたもう1つの核酸を増やすことができる、核酸分子を指す。この用語は、自己複製核酸構造としてのベクター、および、それが導入された宿主細胞のゲノム中に組み入れられるベクターを含む。あるベクターは、自身が動作的に連結された核酸の、発現をもたらすことができる。そのようなベクターは、本明細書では「発現ベクター」とも称される。ベクターは、ウイルスまたはエレクトロポレーションを用いて宿主細胞に導入することができる。しかしながら、ベクターの導入は、in vitroでの方法に限定されない。例えば、ベクターは、in vivoでの方法を用いて対象に直接導入することもできる。
Vector The term "vector" as used herein refers to a nucleic acid molecule that can propagate another nucleic acid to which it is linked. This term includes vectors as self-replicating nucleic acid structures and vectors that are integrated into the genome of a host cell to which it is introduced. A vector can cause the expression of a nucleic acid to which it is operatively linked. Such vectors are also referred to herein as "expression vectors." A vector can be introduced into a host cell using a virus or electroporation. However, the introduction of a vector is not limited to in vitro methods. For example, a vector can also be directly introduced into a subject using in vivo methods.

本発明の別の局面において、本開示の、CD3およびCD137に結合できるが同時には結合しない抗原結合部分、DLL3に結合できる抗原結合部分、抗原結合分子、または抗体をコードする核酸分子を含むベクターは、本開示の抗原結合部分、抗原結合分子、または抗体を対象内で直接的に発現するように、対象に導入され得る。用いられる可能性があるベクターの例は、これらに限定されないが、アデノウイルスである。本開示の抗原結合部分、抗原結合分子、または抗体をコードする核酸分子を対象に直接的に投与すること、または本開示の抗原結合部分、抗原結合分子、または抗体をコードする核酸分子をエレクトロポレーションを介して対象に移入すること、または発現および分泌させるべき本開示の抗原結合部分、抗原結合分子、または抗体をコードする核酸分子を含む細胞を対象に投与し、対象において本開示の抗原結合部分、抗原結合分子、または抗体を連続的に発現および分泌させることもまた可能である。 In another aspect of the invention, a vector containing a nucleic acid molecule encoding an antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure capable of binding to CD3 and CD137 but not simultaneously, an antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure may be introduced into a subject to directly express the antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure in the subject. An example of a vector that may be used is, but is not limited to, an adenovirus. It is also possible to directly administer a nucleic acid molecule encoding an antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure to a subject, or to transfer a nucleic acid molecule encoding an antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure to a subject via electroporation, or to administer a cell containing a nucleic acid molecule encoding an antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure to be expressed and secreted to a subject, thereby continuously expressing and secreting the antigen-binding portion, antigen-binding molecule, or antibody of the present disclosure in the subject.

宿主細胞
用語「宿主細胞」、「宿主細胞株」、および「宿主細胞培養物」は、相互に交換可能に用いられ、外来核酸を導入された細胞(そのような細胞の子孫を含む)を指す。宿主細胞は「形質転換体」および「形質転換細胞」を含み、これには初代の形質転換細胞および継代数によらずその細胞に由来する子孫を含む。子孫は、親細胞と核酸の内容において完全に同一でなくてもよく、変異を含んでいてもよい。オリジナルの形質転換細胞がスクリーニングされたまたは選択された際に用いられたものと同じ機能または生物学的活性を有する変異体子孫も、本明細書では含まれる。
Host Cells The terms "host cell,""host cell line," and "host cell culture" are used interchangeably and refer to cells into which exogenous nucleic acid has been introduced, including the progeny of such cells. Host cells include "transformants" and "transformed cells," which include the originally transformed cell and progeny derived from that cell regardless of the number of passages. The progeny may not be completely identical in nucleic acid content to the parent cell, and may contain mutations. Mutant progeny that have the same function or biological activity as that for which the original transformed cell was screened or selected are also included herein.

特異性
「特異的」とは、1つまたは複数の結合パートナーに特異的に結合する分子が、該パートナー以外の分子に対して何ら有意な結合を示さないことを意味する。さらに、「特異的」はまた、抗原結合部位が、抗原中に含まれる複数のエピトープのうちの特定のエピトープに特異的である場合にも用いられる。抗原結合分子が抗原に特異的に結合する場合、それは「抗原結合分子が、抗原に/抗原に対して特異性を有する/示す」とも記載される。抗原結合部位が結合するエピトープが複数の異なる抗原中に含まれる場合、該抗原結合部位を含む抗原結合分子は、該エピトープを有する様々な抗原に結合し得る。
Specificity "Specific" means that a molecule that specifically binds to one or more binding partners does not show any significant binding to molecules other than the partners. Furthermore, "specific" is also used when an antigen-binding site is specific to a particular epitope among multiple epitopes contained in an antigen. When an antigen-binding molecule specifically binds to an antigen, it is also described as "an antigen-binding molecule has/shows specificity to/for an antigen". When the epitope that an antigen-binding site binds to is contained in multiple different antigens, an antigen-binding molecule that includes the antigen-binding site can bind to various antigens that have the epitope.

抗体断片
「抗体断片」は、インタクトな抗体が結合する抗原に結合する、インタクトな抗体の一部を含む、インタクトな抗体以外の分子を指す。抗体断片の例としては、これらに限定されないが、Fv、Fab、Fab'、Fab’-SH、F(ab')2;ダイアボディ;線状抗体(linear antibody);単鎖抗体分子(例えば、scFv);および抗体断片から形成された多重特異性抗体が挙げられる。
Antibody fragments "Antibody fragment" refers to a molecule other than an intact antibody that contains a portion of an intact antibody that binds to the antigen to which the intact antibody binds. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab') 2 ; diabodies; linear antibodies; single-chain antibody molecules (e.g., scFv); and multispecific antibodies formed from antibody fragments.

用語「全長抗体」、「インタクトな抗体」、および「全抗体(whole antibody)」は、天然型の抗体構造に実質的に類似している構造を有するか、または本明細書において定義されるようなFc領域を含有する重鎖を有する抗体を指すために、本明細書において互換的に用いられる。 The terms "full length antibody," "intact antibody," and "whole antibody" are used interchangeably herein to refer to an antibody having a structure substantially similar to a native antibody structure or having a heavy chain that contains an Fc region as defined herein.

可変断片(Fv)
本明細書において、用語「可変断片(Fv)」は、抗体の軽鎖可変領域(VL)と抗体の重鎖可変領域(VH)とのペアから構成される抗体由来の抗原結合部位の最小単位を指す。1988年にSkerraとPluckthunは、細菌のシグナル配列の下流に抗体遺伝子を挿入し大腸菌中で当該遺伝子の発現を誘導することによって、均一でかつ活性な抗体が大腸菌のペリプラズム画分から調製され得ることを見出した(Science (1988) 240 (4855), 1038-1041)。ペリプラズム画分から調製されたFvにおいては、抗原に結合するような様式でVHとVLが会合している。
Fragment variable (Fv)
As used herein, the term "variable fragment (Fv)" refers to the minimum unit of an antibody-derived antigen-binding site consisting of a pair of an antibody light chain variable region (VL) and an antibody heavy chain variable region (VH). In 1988, Skerra and Pluckthun found that a homogeneous and active antibody can be prepared from the periplasmic fraction of E. coli by inserting an antibody gene downstream of a bacterial signal sequence and inducing expression of the gene in E. coli (Science (1988) 240 (4855), 1038-1041). In the Fv prepared from the periplasmic fraction, VH and VL are associated in such a manner that they bind to antigens.

scFv、単鎖抗体、およびsc(Fv) 2
本明細書において、用語「scFv」、「単鎖抗体」、および「sc(Fv)2」はいずれも、重鎖および軽鎖に由来する可変領域を含むが、定常領域を含まない、単一ポリペプチド鎖の抗体断片を指す。一般に、単鎖抗体は、抗原結合を可能にすると思われる所望の構造の形成を可能にする、VHドメインとVLドメインの間のポリペプチドリンカーをさらに含む。単鎖抗体は、「The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, Vol. 113, Rosenburg and Moore, eds., Springer-Verlag, New York, 269-315 (1994)」においてPluckthunによって詳細に考察されている。同様に、国際公開公報WO1988/001649、米国特許第4,946,778号および同第5,260,203号を参照のこと。特定の態様において、単鎖抗体は、二重特異性でありかつ/またはヒト化され得る。
scFv, single chain antibodies, and sc(Fv) 2
As used herein, the terms "scFv", "single-chain antibody" and "sc(Fv) 2 " all refer to a single polypeptide chain antibody fragment that contains variable regions derived from heavy and light chains but does not contain a constant region. Generally, single-chain antibodies further contain a polypeptide linker between the VH and VL domains that allows the formation of a desired structure that may allow antigen binding. Single-chain antibodies are discussed in detail by Pluckthun in "The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, Vol. 113, Rosenburg and Moore, eds., Springer-Verlag, New York, 269-315 (1994)". See also International Publication WO1988/001649, U.S. Patent Nos. 4,946,778 and 5,260,203. In certain embodiments, single-chain antibodies can be bispecific and/or humanized.

scFvはFvを形成するVHとVLとがペプチドリンカーによって共に連結された単鎖低分子量抗体である(Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (1988) 85 (16), 5879-5883)。当該ペプチドリンカーによってVHとVLとが近接した状態に保持され得る。 scFv is a single-chain low molecular weight antibody in which the VH and VL that form the Fv are linked together by a peptide linker (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (1988) 85 (16), 5879-5883). The peptide linker can hold the VH and VL in close proximity.

sc(Fv)2は、2つのVLと2つのVHの4つの可変領域がペプチドリンカー等のリンカーによって連結され一本鎖を形成する単鎖抗体である(J Immunol. Methods (1999) 231 (1-2), 177-189)。この2つのVHと2つのVLは異なるモノクローナル抗体に由来してもよい。そのようなsc(Fv)2としては、例えば、Journal of Immunology (1994) 152 (11), 5368-5374に開示されるような、単一抗原中に存在する2つのエピトープを認識する二重特異性sc(Fv)2が好適に挙げられる。sc(Fv)2は、当業者に公知の方法によって製造され得る。例えば、sc(Fv)2は、scFvをペプチドリンカー等のリンカーで連結することによって製造され得る。 sc(Fv) 2 is a single-chain antibody in which four variable regions, two VL and two VH, are linked by a linker such as a peptide linker to form a single chain (J Immunol. Methods (1999) 231 (1-2), 177-189). The two VH and two VL may be derived from different monoclonal antibodies. Suitable examples of such sc(Fv) 2 include bispecific sc(Fv) 2 that recognizes two epitopes present in a single antigen, as disclosed in Journal of Immunology (1994) 152 (11), 5368-5374. sc(Fv) 2 can be produced by methods known to those skilled in the art. For example, sc(Fv) 2 can be produced by linking scFvs with a linker such as a peptide linker.

本明細書において、sc(Fv)2は、一本鎖ポリペプチドのN末端を基点としてVH、VL、VH、VL([VH]-リンカー-[VL]-リンカー-[VH]-リンカー-[VL])の順に並んでいる2つのVH単位および2つのVL単位を含む。2つのVH単位と2つのVL単位の順序は上記の構成に限定されず、どのような順序で並べられていてもよい。構成の例を以下に列挙する。
[VL]-リンカー-[VH]-リンカー-[VH]-リンカー-[VL]
[VH]-リンカー-[VL]-リンカー-[VL]-リンカー-[VH]
[VH]-リンカー-[VH]-リンカー-[VL]-リンカー-[VL]
[VL]-リンカー-[VL]-リンカー-[VH]-リンカー-[VH]
[VL]-リンカー-[VH]-リンカー-[VL]-リンカー-[VH]
As used herein, sc(Fv) 2 comprises two VH units and two VL units arranged in the following order, starting from the N-terminus of a single-chain polypeptide: VH, VL, VH, VL ([VH]-linker-[VL]-linker-[VH]-linker-[VL]). The order of the two VH units and the two VL units is not limited to the above configuration, and they may be arranged in any order. Examples of configurations are listed below.
[VL]-linker-[VH]-linker-[VH]-linker-[VL]
[VH]-linker-[VL]-linker-[VL]-linker-[VH]
[VH]-linker-[VH]-linker-[VL]-linker-[VL]
[VL]-linker-[VL]-linker-[VH]-linker-[VH]
[VL]-linker-[VH]-linker-[VL]-linker-[VH]

sc(Fv)2の分子形態についてはWO2006/132352においても詳細に記載されている。当業者であればこれらの記載に従って、本明細書で開示されるポリペプチド複合体を製造するために所望のsc(Fv)2を適宜調製することが可能である。 The molecular form of sc(Fv) 2 is also described in detail in WO2006/132352. Those skilled in the art can follow these descriptions to appropriately prepare a desired sc(Fv) 2 for producing the polypeptide complex disclosed herein.

さらに本開示の抗原結合分子または抗体に、PEG等の担体高分子や抗がん剤等の有機化合物をコンジュゲートしてもよい。あるいは、糖鎖が所望の効果をもたらすように、糖鎖付加配列が抗原結合分子または抗体に好適に挿入される。 Furthermore, a carrier polymer such as PEG or an organic compound such as an anticancer drug may be conjugated to the antigen-binding molecule or antibody of the present disclosure. Alternatively, a glycosylation sequence is suitably inserted into the antigen-binding molecule or antibody so that the glycosylation provides the desired effect.

抗体の可変領域の連結に使用するリンカーは、遺伝子工学により導入され得る任意のペプチドリンカー、合成リンカー、および例えばProtein Engineering, 9 (3), 299-305, 1996に開示されるリンカーを含む。しかしながら、本開示においてはペプチドリンカーが好ましい。ペプチドリンカーの長さは特に限定されず、目的に応じて当業者が適宜選択することが可能である。長さは、好ましくは5アミノ酸以上(特に限定されないが、上限は通常、30アミノ酸以下、好ましくは20アミノ酸以下)であり、特に好ましくは15アミノ酸である。sc(Fv)2に3つのペプチドリンカーが含まれる場合には、それらの長さはすべて同じであってもよいし異なってもよい。 Linkers used to link the variable regions of antibodies include any peptide linker that can be introduced by genetic engineering, synthetic linkers, and linkers disclosed in, for example, Protein Engineering, 9 (3), 299-305, 1996. However, in the present disclosure, peptide linkers are preferred. The length of the peptide linker is not particularly limited, and can be appropriately selected by those skilled in the art depending on the purpose. The length is preferably 5 amino acids or more (although not particularly limited, the upper limit is usually 30 amino acids or less, preferably 20 amino acids or less), and is particularly preferably 15 amino acids. When sc(Fv) 2 contains three peptide linkers, their lengths may all be the same or different.

例えば、そのようなペプチドリンカーには以下のものが含まれる:
Ser、
Gly-Ser、
Gly-Gly-Ser、
Ser-Gly-Gly、
Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:91)、
Ser-Gly-Gly-Gly(配列番号:92)、
Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:93)、
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(配列番号:94)、
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:95)、
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly(配列番号:96)、
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:97)、
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly(配列番号:98)、
(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(配列番号:93))n、および
(Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(配列番号:94))n。
ここでnは1以上の整数である。ペプチドリンカーの長さや配列は目的に応じて当業者が適宜選択することができる。
For example, such peptide linkers include:
Ser,
Gly-Ser,
Gly-Gly-Ser,
Ser-Gly-Gly,
Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO: 91),
Ser-Gly-Gly-Gly (SEQ ID NO: 92),
Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO: 93),
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly (SEQ ID NO: 94),
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO: 95),
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly (SEQ ID NO: 96),
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO: 97),
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly (SEQ ID NO: 98),
(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO:93)), and
(Ser-Gly-Gly-Gly-Gly (SEQ ID NO: 94)).
Here, n is an integer equal to or greater than 1. The length and sequence of the peptide linker can be appropriately selected by those skilled in the art depending on the purpose.

合成リンカー(化学架橋剤)は、ペプチドの架橋に通常用いられており、例としては、
N-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)、
ジスクシンイミジルスベレート(DSS)、
ビス(スルホスクシンイミジル)スベレート(BS3)、
ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)(DSP)、
ジチオビス(スルホスクシンイミジルプロピオネート)(DTSSP)、
エチレングリコールビス(スクシンイミジルスクシネート)(EGS)、
エチレングリコールビス(スルホスクシンイミジルスクシネート)(スルホ-EGS)、
ジスクシンイミジル酒石酸塩(DST)、ジスルホスクシンイミジル酒石酸塩(スルホ-DST)、
ビス[2-(スクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(BSOCOES)、および
ビス[2-(スルホスクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(スルホ-BSOCOES)
が挙げられる。これらの架橋剤は市販されている。
Synthetic linkers (chemical cross-linking agents) are commonly used to cross-link peptides, examples of which include:
N-hydroxysuccinimide (NHS),
Disuccinimidyl suberate (DSS),
Bis(sulfosuccinimidyl) suberate (BS3),
Dithiobis(succinimidyl propionate) (DSP),
Dithiobis(sulfosuccinimidyl propionate) (DTSSP),
Ethylene glycol bis(succinimidyl succinate) (EGS),
Ethylene glycol bis(sulfosuccinimidyl succinate) (sulfo-EGS),
Disuccinimidyl tartrate (DST), disulfosuccinimidyl tartrate (sulfo-DST),
Bis[2-(succinimidooxycarbonyloxy)ethyl]sulfone (BSOCOES), and bis[2-(sulfosuccinimidooxycarbonyloxy)ethyl]sulfone (sulfo-BSOCOES)
These crosslinking agents are commercially available.

4つの抗体可変領域を連結するには、通常、3つのリンカーが必要となる。用いられるリンカーは、同じ種類のものであっても異なる種類のものであってもよい。 Three linkers are usually required to link four antibody variable regions. The linkers used may be of the same type or different types.

Fab、F(ab') 2 、およびFab'
「Fab」は、1本の軽鎖、ならびに1本の重鎖のCH1ドメインおよび可変領域からなる。Fab分子の重鎖は、別の重鎖分子とジスルフィド結合を形成できない。
Fab, F(ab') 2 , and Fab'
"Fab" consists of one light chain and the CH1 domain and variable region of one heavy chain. The heavy chain of a Fab molecule cannot form disulfide bonds with another heavy chain molecule.

「F(ab')2」または「Fab」は、免疫グロブリン(モノクローナル抗体)をペプシンおよびパパイン等のプロテアーゼで処理することにより製造され、免疫グロブリン(モノクローナル抗体)を2本の各H鎖のヒンジ領域間に存在するジスルフィド結合の近くで消化することによって生成される抗体断片を指す。例えばパパインは、IgGを、2本の各H鎖のヒンジ領域間に存在するジスルフィド結合の上流で切断し、VL(L鎖可変領域)およびCL(L鎖定常領域)を含むL鎖がVH(H鎖可変領域)およびCHγ1(H鎖定常領域中のγ1領域)を含むH鎖断片とそれらのC末端領域でジスルフィド結合により連結されている、相同な2つの抗体断片を生成する。これら2つの相同な抗体断片はそれぞれFab'と呼ばれる。 "F(ab') 2 " or "Fab" refers to an antibody fragment produced by treating an immunoglobulin (monoclonal antibody) with a protease such as pepsin or papain, and digesting the immunoglobulin (monoclonal antibody) near the disulfide bond between the hinge regions of the two H chains. For example, papain cleaves IgG upstream of the disulfide bond between the hinge regions of the two H chains, producing two homologous antibody fragments in which the L chain containing VL (light chain variable region) and CL (light chain constant region) is linked to the H chain fragment containing VH (light chain variable region) and CHγ1 (γ1 region in the heavy chain constant region) by disulfide bonds at their C-terminal regions. Each of these two homologous antibody fragments is called Fab'.

「F(ab')2」は、2本の軽鎖、ならびにジスルフィド結合が2本の重鎖間で形成されるようにCH1ドメインおよびCH2ドメインの一部分の定常領域を含む2本の重鎖からなる。本明細書において開示されるF(ab')2は、次のように好適に製造され得る。所望の抗原結合部位を含むモノクローナル全部抗体等を、ペプシン等のプロテアーゼで部分消化し、Fc断片をプロテインAカラムに吸着させることにより除去する。プロテアーゼは、pH等の適切な設定酵素反応条件下で選択的にF(ab')2をもたらすように全部抗体を切断し得るものである限り、特に限定はされない。例えば、そのようなプロテアーゼにはペプシンおよびフィシンが含まれる。 "F(ab') 2 " consists of two light chains and two heavy chains containing constant regions of the CH1 domain and a part of the CH2 domain such that a disulfide bond is formed between the two heavy chains. The F(ab') 2 disclosed herein can be suitably produced as follows. A monoclonal whole antibody or the like containing a desired antigen-binding site is partially digested with a protease such as pepsin, and the Fc fragment is removed by adsorption onto a protein A column. The protease is not particularly limited as long as it can cleave the whole antibody so as to selectively produce F(ab') 2 under appropriately set enzyme reaction conditions such as pH. For example, such proteases include pepsin and ficin.

シングルドメイン抗体
本明細書において、用語「シングルドメイン抗体」は、該ドメインがそれ単独で抗原結合活性を発揮できる限りは、その構造によって限定されない。一般的な抗体、例えば、IgG抗体は、可変領域がVHおよびVLのペアリングによって形成されている状態で抗原結合活性を示すのに対して、シングルドメイン抗体のそれ自体のドメイン構造は、別のドメインとのペアリングなしにそれ単独で抗原結合活性を発揮できることが公知である。通常、シングルドメイン抗体は、比較的低い分子量を有し、単量体の形態で存在する。
As used herein, the term "single domain antibody" is not limited by its structure, as long as the domain can exhibit antigen-binding activity by itself. It is known that while a general antibody, for example an IgG antibody, exhibits antigen-binding activity when the variable region is formed by pairing VH and VL, the domain structure of a single domain antibody can exhibit antigen-binding activity by itself without pairing with another domain. Usually, a single domain antibody has a relatively low molecular weight and exists in the form of a monomer.

シングルドメイン抗体の例としては、これらに限定されないが、軽鎖を生来欠いているラクダ科の動物のVHHおよびサメVNARなどの抗原結合分子、および抗体VHドメインの全体もしくは一部または抗体VLドメインの全体もしくは一部を含有する抗体断片が挙げられる。抗体VHドメインまたは抗体VLドメインの全体または一部を含有する抗体断片であるシングルドメイン抗体の例としては、これらに限定されないが、米国特許第6,248,516号B1などに記載されているようなヒト抗体VHまたはヒト抗体VLを起源とする、人工的に調製したシングルドメイン抗体が挙げられる。本発明のいくつかの態様において、1つのシングルドメイン抗体は、3種類のCDR(CDR1、CDR2、およびCDR3)を有する。 Examples of single domain antibodies include, but are not limited to, antigen-binding molecules such as camelid VHH and shark VNAR that naturally lack light chains, and antibody fragments containing all or part of an antibody VH domain or all or part of an antibody VL domain. Examples of single domain antibodies that are antibody fragments containing all or part of an antibody VH domain or antibody VL domain include, but are not limited to, artificially prepared single domain antibodies originating from human antibody VH or human antibody VL, such as those described in U.S. Pat. No. 6,248,516 B1. In some embodiments of the present invention, a single domain antibody has three types of CDRs (CDR1, CDR2, and CDR3).

シングルドメイン抗体は、シングルドメイン抗体を産生できる動物から、またはシングルドメイン抗体を産生できる動物の免疫化によって、得ることができる。シングルドメイン抗体を産生できる動物の例としては、これらに限定されないが、ラクダ科の動物、およびシングルドメイン抗体を生じさせることができる遺伝子を保有するトランスジェニック動物が挙げられる。ラクダ科の動物には、ラクダ、ラマ、アルパカ、ヒトコブラクダ、およびグアナコ等が含まれる。シングルドメイン抗体を生じさせることができる遺伝子を保有するトランスジェニック動物の例としては、これらに限定されないが、国際公開公報番号WO2015/143414および米国特許公報番号US2011/0123527 A1に記載のトランスジェニック動物が挙げられる。該動物から得られたシングルドメイン抗体のフレームワーク配列は、ヒト化シングルドメイン抗体を得るために、ヒト生殖系列配列またはそれに類似する配列に変換されてもよい。ヒト化シングルドメイン抗体(例えば、ヒト化VHH)もまた、本発明のシングルドメイン抗体の一態様である。 Single domain antibodies can be obtained from animals capable of producing single domain antibodies or by immunization of animals capable of producing single domain antibodies. Examples of animals capable of producing single domain antibodies include, but are not limited to, camelids and transgenic animals carrying genes capable of producing single domain antibodies. Camelids include camels, llamas, alpacas, dromedaries, and guanacos. Examples of transgenic animals carrying genes capable of producing single domain antibodies include, but are not limited to, the transgenic animals described in International Publication No. WO2015/143414 and U.S. Patent Publication No. US2011/0123527 A1. The framework sequences of the single domain antibodies obtained from the animals may be converted to human germline sequences or sequences similar thereto to obtain humanized single domain antibodies. Humanized single domain antibodies (e.g., humanized VHHs) are also an embodiment of the single domain antibodies of the present invention.

あるいは、シングルドメイン抗体は、シングルドメイン抗体を含有するポリペプチドライブラリからELISAまたはパニング等によって得ることができる。シングルドメイン抗体を含有するポリペプチドライブラリの例としては、これらに限定されないが、種々の動物またはヒトから得られたナイーブ抗体ライブラリ(例えば、Methods in Molecular Biology 2012 911 (65-78);およびBiochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics 2006 1764: 8 (1307-1319))、種々の動物の免疫化によって得られた抗体ライブラリ(例えば、Journal of Applied Microbiology 2014 117: 2 (528-536))、および種々の動物またはヒトの抗体遺伝子から調製した合成抗体ライブラリ(例えば、Journal of Biomolecular Screening 2016 21: 1 (35-43); Journal of Biological Chemistry 2016 291:24 (12641-12657);およびAIDS 2016 30: 11 (1691-1701))が挙げられる。
Fc領域
本発明において、用語「Fc領域」または「Fcドメイン」は、抗体分子中の、ヒンジまたはその一部、ならびにCH2およびCH3ドメインからなる断片を含む領域を指す。IgGクラスのFc領域は、例えば、システイン226(EU ナンバリング(本明細書においてEUインデックスとも称される))からC末端まで、またはプロリン230(EUナンバリング)からC末端までの領域を意味するが、それに限定されない。Fc領域は、好ましくは、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4モノクローナル抗体を、ペプシンなどのタンパク質分解酵素で部分消化した後に、プロテインAカラムまたはプロテインGカラムに吸着された画分を再溶出することによって取得することができる。そのようなタンパク質分解酵素は、適宜設定される酵素の反応条件(例えば、pH)の下で制限的にFabまたはF(ab')2を形成するように全長抗体を消化することができる限り、特に限定されない。その例には、ペプシンおよびパパインが含まれ得る。
Alternatively, single domain antibodies can be obtained by ELISA or panning, etc. from a polypeptide library containing single domain antibodies. Examples of polypeptide libraries containing single domain antibodies include, but are not limited to, naive antibody libraries obtained from various animals or humans (e.g., Methods in Molecular Biology 2012 911 (65-78); and Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics 2006 1764: 8 (1307-1319)), antibody libraries obtained by immunization of various animals (e.g., Journal of Applied Microbiology 2014 117: 2 (528-536)), and synthetic antibody libraries prepared from antibody genes of various animals or humans (e.g., Journal of Biomolecular Screening 2016 21: 1 (35-43); Journal of Biological Chemistry 2016 291:24 (12641-12657); and AIDS 2016 30: 11 ( ... (1691-1701).
Fc region
In the present invention, the term "Fc region" or "Fc domain" refers to a region in an antibody molecule that includes a hinge or a part thereof, and a fragment consisting of the CH2 and CH3 domains. The Fc region of the IgG class refers to, for example, but is not limited to, a region from cysteine 226 (EU numbering (also referred to herein as EU index)) to the C-terminus, or from proline 230 (EU numbering) to the C-terminus. The Fc region can be preferably obtained, for example, by partially digesting an IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 monoclonal antibody with a protease such as pepsin, and then re-eluting the fraction adsorbed on a protein A column or a protein G column. Such a protease is not particularly limited as long as it can digest a full-length antibody to form Fab or F(ab') 2 in a limited manner under appropriately set enzyme reaction conditions (e.g., pH). Examples of such proteases include pepsin and papain.

本発明において、例えば、天然型IgGに由来するFc領域を、本発明の「Fc領域」として用いることができる。ここで、天然型IgGとは、天然に見出されるIgGと同一のアミノ酸配列を含有し、免疫グロブリンγ遺伝子により実質的にコードされる抗体のクラスに属するポリペプチドを意味する。天然型ヒトIgGとは、例えば、天然型ヒトIgG1、天然型ヒトIgG2、天然型ヒトIgG3、または天然型ヒトIgG4を意味する。天然型IgGにはまた、自然発生的にそれに由来するバリアントなども含まれる。遺伝子多型に基づく複数のアロタイプ配列が、ヒトIgG1、ヒトIgG2、ヒトIgG3、およびヒトIgG4抗体の定常領域としてSequences of proteins of immunological interest, NIH Publication No.91-3242に記載されており、それらはいずれも、本発明において用いることができる。特に、ヒトIgG1の配列は、EUナンバリング356~358位のアミノ酸配列として、DELまたはEEMを有してもよい。 In the present invention, for example, an Fc region derived from natural IgG can be used as the "Fc region" of the present invention. Here, natural IgG means a polypeptide that contains the same amino acid sequence as IgG found in nature and belongs to the class of antibodies substantially encoded by the immunoglobulin gamma gene. Natural human IgG means, for example, natural human IgG1, natural human IgG2, natural human IgG3, or natural human IgG4. Natural IgG also includes naturally occurring variants thereof. Multiple allotype sequences based on genetic polymorphisms are described in Sequences of proteins of immunological interest, NIH Publication No. 91-3242 as the constant regions of human IgG1, human IgG2, human IgG3, and human IgG4 antibodies, and any of them can be used in the present invention. In particular, the sequence of human IgG1 may have DEL or EEM as the amino acid sequence at positions 356 to 358 of the EU numbering system.

いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、免疫グロブリン分子の重鎖ドメインを含むポリペプチド鎖の対からなる。例えば、免疫グロブリンG(IgG)分子のFcドメインは、その各サブユニットがCH2およびCH3 IgG重鎖定常ドメインを含む、二量体である。Fcドメインの2つのサブユニットは、相互に安定的に会合することができる。1つの態様において、本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、1つ以下のFcドメインを含む。 In some embodiments, the Fc domain of a multispecific antigen-binding molecule consists of a pair of polypeptide chains comprising the heavy chain domains of an immunoglobulin molecule. For example, the Fc domain of an immunoglobulin G (IgG) molecule is a dimer, each subunit of which comprises the CH2 and CH3 IgG heavy chain constant domains. The two subunits of the Fc domain can stably associate with each other. In one embodiment, the multispecific antigen-binding molecules described herein comprise no more than one Fc domain.

本明細書において記載される1つの態様において、多重特異性抗原結合分子のFcドメインはIgG Fcドメインである。別の態様において、FcドメインはIgG1 Fcドメインである。さらなる特定の態様において、FcドメインはヒトIgG1 Fc領域である。 In one embodiment described herein, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecule is an IgG Fc domain. In another embodiment, the Fc domain is an IgG1 Fc domain. In a further particular embodiment, the Fc domain is a human IgG1 Fc region.

ある特定の態様において、多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、安定な会合が可能な第1のおよび第2のFc領域サブユニットで構成され、かつFcドメインは、天然型ヒトIgG1 Fcドメインと比較して、ヒトFcγ受容体に対して低下した結合アフィニティを示す。 In certain embodiments, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecule is composed of a first and a second Fc region subunit capable of stable association, and the Fc domain exhibits reduced binding affinity for human Fcγ receptors compared to native human IgG1 Fc domain.

ある特定の態様において、本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、Fcドメインの第1のおよび第2のサブユニットの会合を促進する改変を含む。特定の態様において、該改変は、Fcドメインの2つのサブユニットの一方に「ノブ(knob)」改変およびFcドメインの2つのサブユニットのもう一方に「ホール(hole)」改変を含む、いわゆる「knob-into-hole」改変であり、以下においてより詳細に記載される。 In certain embodiments, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecules described herein comprises a modification that promotes the association of the first and second subunits of the Fc domain. In certain embodiments, the modification is a so-called "knob-into-hole" modification that comprises a "knob" modification in one of the two subunits of the Fc domain and a "hole" modification in the other of the two subunits of the Fc domain, as described in more detail below.

特定の態様において、安定な会合が可能な第1のおよび第2のFc領域サブユニットで構成され、かつ天然型ヒトIgG1 Fcドメインと比較してヒトFcγ受容体に対して低下した結合アフィニティを示す、Fcドメインにおいて、第1のFc領域サブユニットは、以下:
(a1)変異L234A、L235Aを含むFc領域ポリペプチド;
(a2)変異L234A、L235A、N297Aを含むFc領域ポリペプチド;
(a3)変異L234A、L235A、N297A、S354C、T366Wを含むFc領域ポリペプチド
からなる群より選択され、かつ
第2のFc領域サブユニットは、以下:
(a4)変異L234A、L235Aを含むFc領域ポリペプチド;
(a5)変異L234A、L235A、N297Aを含むFc領域ポリペプチド;および
(a6)変異L234A、L235A、N297A、Y349C、T366S、L368A、Y407Vを含むFc領域ポリペプチド
からなる群より選択される(アミノ酸位置はEUインデックスナンバリングを用いてナンバリングされる)。
In a particular embodiment, in an Fc domain comprised of a first and a second Fc region subunit capable of stable association and exhibiting reduced binding affinity for human Fcγ receptors compared to a native human IgG1 Fc domain, the first Fc region subunit comprises:
(a1) an Fc region polypeptide comprising the mutations L234A, L235A;
(a2) an Fc region polypeptide comprising the mutations L234A, L235A, N297A;
(a3) an Fc region polypeptide comprising the mutations L234A, L235A, N297A, S354C, T366W, and wherein the second Fc region subunit is selected from the group consisting of:
(a4) an Fc region polypeptide comprising the mutations L234A, L235A;
(a5) an Fc region polypeptide comprising the mutations L234A, L235A, N297A; and (a6) an Fc region polypeptide comprising the mutations L234A, L235A, N297A, Y349C, T366S, L368A, Y407V (amino acid positions are numbered using EU index numbering).

ある特定の態様において、本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、天然型 IgGのFc領域のものと比較して酸性pH条件(例えば、pH 5.8)下で増強されたFcRn結合活性を示す。そのようなFcドメインは、例えば、EUナンバリングによる、434位にAla;438位にGlu、Arg、Ser、またはLys;および440位にGlu、Asp、またはGlnを含む。いくつかの態様において、Fcドメインは、EUナンバリングによる、434位にAla;438位にArgまたはLys;および440位にGluまたはAspを含む。いくつかの態様において、Fcドメインは、EUナンバリングによる、428位にIleもしくはLeu;および/または 436位にIle、Leu、Val、Thr、もしくはPheをさらに含む。いくつかの態様において、Fcドメインは、EUナンバリングによる、以下:
(a)N434A/Q438R/S440E;
(b)N434A/Q438R/S440D;
(c)N434A/Q438K/S440E;
(d)N434A/Q438K/S440D;
(e)N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(f)N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(g)N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(h)N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(i)N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(j)N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(k)N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(l)N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(m)N434A/R435H/F436T/Q438R/S440E;
(n)N434A/R435H/F436T/Q438R/S440D;
(o)N434A/R435H/F436T/Q438K/S440E;
(p)N434A/R435H/F436T/Q438K/S440D;
(q)N434A/R435H/F436V/Q438R/S440E;
(r)N434A/R435H/F436V/Q438R/S440D;
(s)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440E;
(t)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440D;
(u)M428L/N434A/Q438R/S440E;
(v)M428L/N434A/Q438R/S440D;
(w)M428L/N434A/Q438K/S440E;
(x)M428L/N434A/Q438K/S440D;
(y)M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(z)M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(aa)M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(ab)M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(ac)M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(ad)M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(ae)M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(af)M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(ag)L235R/G236R/S239K/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E;および
(ah)L235R/G236R/A327G/A330S/P331S/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E
からなる群より選択されるアミノ酸置換の組み合わせを含む。
In certain embodiments, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecule described herein exhibits enhanced FcRn binding activity under acidic pH conditions (e.g., pH 5.8) compared to that of the Fc region of native IgG. Such an Fc domain comprises, for example, Ala at position 434; Glu, Arg, Ser, or Lys at position 438; and Glu, Asp, or Gln at position 440, according to EU numbering. In some embodiments, the Fc domain comprises Ala at position 434; Arg or Lys at position 438; and Glu or Asp at position 440, according to EU numbering. In some embodiments, the Fc domain further comprises Ile or Leu at position 428; and/or Ile, Leu, Val, Thr, or Phe at position 436, according to EU numbering. In some embodiments, the Fc domain comprises the following, according to EU numbering:
(a) N434A/Q438R/S440E;
(b) N434A/Q438R/S440D;
(c) N434A/Q438K/S440E;
(d) N434A/Q438K/S440D;
(e) N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(f) N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(g) N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(h) N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(i) N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(j) N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(k)N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(l) N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(m) N434A/R435H/F436T/Q438R/S440E;
(n) N434A/R435H/F436T/Q438R/S440D;
(o) N434A/R435H/F436T/Q438K/S440E;
(p) N434A/R435H/F436T/Q438K/S440D;
(q) N434A/R435H/F436V/Q438R/S440E;
(r)N434A/R435H/F436V/Q438R/S440D;
(s)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440E;
(t)N434A/R435H/F436V/Q438K/S440D;
(u)M428L/N434A/Q438R/S440E;
(v) M428L/N434A/Q438R/S440D;
(w) M428L/N434A/Q438K/S440E;
(x)M428L/N434A/Q438K/S440D;
(y) M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E;
(z) M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440D;
(aa) M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440E;
(ab) M428L/N434A/Y436T/Q438K/S440D;
(ac) M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440E;
(ad) M428L/N434A/Y436V/Q438R/S440D;
(ae) M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440E;
(af) M428L/N434A/Y436V/Q438K/S440D;
(ag) L235R/G236R/S239K/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E; and (ah) L235R/G236R/A327G/A330S/P331S/M428L/N434A/Y436T/Q438R/S440E
The amino acid substitutions include a combination of amino acid substitutions selected from the group consisting of:

いくつかの態様において、多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、M428L/N434A/Q438R/S440Eのアミノ酸置換の組み合わせを含む。いくつかの態様において、Fcドメインは、IgG Fcドメイン、好ましくはヒトIgG Fcドメイン、より好ましくはヒトIgG1 Fcドメインである。ある特定の態様において、多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、以下:(a)配列番号:100に示されるアミノ酸配列を含む第1のFcサブユニットおよび配列番号:111に示されるアミノ酸配列を含む第2のFcサブユニット;ならびに(b)配列番号:99に示されるアミノ酸配列を含む第1のFcサブユニットおよび配列番号:109に示されるアミノ酸配列を含む第2のFcサブユニットのいずれかを含む。 In some embodiments, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecule comprises a combination of amino acid substitutions of M428L/N434A/Q438R/S440E. In some embodiments, the Fc domain is an IgG Fc domain, preferably a human IgG Fc domain, more preferably a human IgG1 Fc domain. In certain embodiments, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecule comprises any of the following: (a) a first Fc subunit comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 100 and a second Fc subunit comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 111; and (b) a first Fc subunit comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 99 and a second Fc subunit comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 109.

低下したFcγ受容体結合活性を有するFc領域
本明細書において、「低下したFcγ受容体結合活性」は、例えば、上記の分析方法に基づき、試験抗原結合分子または抗体の競合活性が、対照抗原結合分子または抗体の競合活性と比べて50%以下、好ましくは 45%以下、40%以下、35%以下、30%以下、20%以下、または15%以下、特に好ましくは 10%以下、9%以下、8%以下、7%以下、6%以下、5%以下、4%以下、3%以下、2%以下、または1%以下であることを意味する。
Fc Region with Reduced Fcγ Receptor-Binding Activity As used herein, "reduced Fcγ receptor-binding activity" means that the competitive activity of a test antigen-binding molecule or antibody is 50% or less, preferably 45% or less, 40% or less, 35% or less, 30% or less, 20% or less, or 15% or less, and particularly preferably 10% or less, 9% or less, 8% or less, 7% or less, 6% or less, 5% or less, 4% or less, 3% or less, 2% or less, or 1% or less, compared to the competitive activity of a control antigen-binding molecule or antibody, for example, based on the above-mentioned analytical method.

モノクローナルIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4抗体のFcドメインを含む抗原結合分子または抗体は、対照抗原結合分子または抗体として適切に用いることができる。Fcドメイン構造は、配列番号:85(AがRefSeqアクセッション番号 AAC82527.1のN末端に付加される)、配列番号:86(AがRefSeqアクセッション番号 AAB59393.1のN末端に付加される)、配列番号:87(AがRefSeqアクセッション番号 CAA27268.1のN末端に付加される)、および配列番号:88(AがRefSeqアクセッション番号 AAB59394.1のN末端に付加される)に示される。さらに、特定のアイソタイプの抗体のFcドメイン変異体を含む抗原結合分子または抗体が試験物質として用いられる場合、Fcγ受容体結合活性に対する変異体の変異の作用は、同じアイソタイプのFcドメインを含む抗原結合分子または抗体を対照として用いて評価される。上記に記載されるように、そのFcγ受容体結合活性が低下していると判断されているFcドメイン変異体を含む抗原結合分子または抗体が適切に調製される。 Antigen-binding molecules or antibodies containing the Fc domain of a monoclonal IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 antibody can be suitably used as a control antigen-binding molecule or antibody. The Fc domain structures are shown in SEQ ID NO: 85 (A is added to the N-terminus of RefSeq Accession No. AAC82527.1), SEQ ID NO: 86 (A is added to the N-terminus of RefSeq Accession No. AAB59393.1), SEQ ID NO: 87 (A is added to the N-terminus of RefSeq Accession No. CAA27268.1), and SEQ ID NO: 88 (A is added to the N-terminus of RefSeq Accession No. AAB59394.1). Furthermore, when an antigen-binding molecule or antibody containing an Fc domain mutant of an antibody of a particular isotype is used as a test substance, the effect of the mutation of the mutant on the Fcγ receptor binding activity is evaluated using an antigen-binding molecule or antibody containing an Fc domain of the same isotype as a control. As described above, an antigen-binding molecule or antibody containing an Fc domain mutant whose Fcγ receptor binding activity has been determined to be reduced is appropriately prepared.

そのような公知の変異体には、例えば、アミノ酸231A~238S(EUナンバリング)の欠失を有する変異体(WO 2009/011941)、ならびに変異体 C226S、C229S、P238S、(C220S)(J. Rheumatol (2007) 34, 11);C226SおよびC229S(Hum. Antibod. Hybridomas (1990) 1(1), 47-54);C226S、C229S、E233P、L234V、およびL235A(Blood (2007) 109, 1185-1192)が含まれる。 Such known mutants include, for example, mutants with a deletion of amino acids 231A to 238S (EU numbering) (WO 2009/011941), as well as mutants C226S, C229S, P238S, (C220S) (J. Rheumatol (2007) 34, 11); C226S and C229S (Hum. Antibod. Hybridomas (1990) 1(1), 47-54); C226S, C229S, E233P, L234V, and L235A (Blood (2007) 109, 1185-1192).

具体的には、好ましい抗原結合分子または抗体には、特定のアイソタイプの抗体のFcドメインを形成するアミノ酸において、以下のアミノ酸位置:220位、226位、229位、231位、232位、233位、234位、235位、236位、237位、238位、239位、240位、264位、265位、266位、267位、269位、270位、295位、296位、297位、298位、299位、300位、325位、327位、328位、329位、330位、331位、または332位(EUナンバリング)から選択される少なくとも1つのアミノ酸の変異(例えば、置換)を有するFcドメインを含むものが含まれる。Fcドメインの起源である抗体のアイソタイプは、特に限定されず、モノクローナル IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4抗体に由来する適切なFcドメインを用いることが可能である。IgG1抗体に由来するFcドメインを用いることが好ましい。 Specifically, preferred antigen-binding molecules or antibodies include those that contain an Fc domain having at least one amino acid mutation (e.g., substitution) selected from the following amino acid positions forming the Fc domain of an antibody of a particular isotype: 220, 226, 229, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 264, 265, 266, 267, 269, 270, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 325, 327, 328, 329, 330, 331, or 332 (EU numbering). The antibody isotype from which the Fc domain originates is not particularly limited, and an appropriate Fc domain derived from a monoclonal IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 antibody can be used. It is preferable to use an Fc domain derived from an IgG1 antibody.

好ましい抗原結合分子または抗体には、例えば、その位置が、IgG1抗体のFcドメインを形成するアミノ酸におけるEUナンバリングにより指定されている(各数字がEUナンバリングでのアミノ酸残基の位置を表し;かつ数字の前にある1文字アミノ酸記号が置換前のアミノ酸残基を表し、数字の後にある1文字アミノ酸記号が置換後のアミノ酸残基を表す)、以下に示す置換のいずれか1つ:
(a)L234F、L235E、P331S;
(b)C226S、C229S、P238S;
(c)C226S、C229S;または
(d)C226S、C229S、E233P、L234V、L235A
を有するFcドメインを含むもの、ならびに231位から238位にあるアミノ酸配列の欠失を有するFcドメインを有するものが含まれる。
Preferred antigen-binding molecules or antibodies include, for example, any one of the following substitutions, whose positions are designated by EU numbering in the amino acids forming the Fc domain of an IgG1 antibody (each number represents the position of an amino acid residue in EU numbering; and the one-letter amino acid code preceding the number represents the amino acid residue before substitution, and the one-letter amino acid code following the number represents the amino acid residue after substitution):
(a) L234F, L235E, P331S;
(b) C226S, C229S, P238S;
(c) C226S, C229S; or (d) C226S, C229S, E233P, L234V, L235A.
as well as those having an Fc domain with a deletion of the amino acid sequence at positions 231 to 238.

さらに、好ましい抗原結合分子または抗体には、その位置が、IgG2抗体のFcドメインを形成するアミノ酸におけるEUナンバリングにより指定されている、以下に示す置換のいずれか1つ:
(e)H268Q、V309L、A330S、およびP331S;
(f)V234A;
(g)G237A;
(h)V234Aおよび G237A;
(i)A235Eおよび G237A;または
(j)V234A、A235E、およびG237A
を有するFcドメインを含むものも含まれる。各数字は、EUナンバリングでのアミノ酸残基の位置を表し;かつ数字の前にある1文字アミノ酸記号は置換前のアミノ酸残基を表し、数字の後にある1文字アミノ酸記号は置換後のアミノ酸残基を表す。
Further, preferred antigen binding molecules or antibodies include any one of the following substitutions, whose positions are designated by EU numbering in the amino acids forming the Fc domain of IgG2 antibodies:
(e) H268Q, V309L, A330S, and P331S;
(f) V234A;
(g) G237A;
(h) V234A and G237A;
(i) A235E and G237A; or (j) V234A, A235E, and G237A.
Each number represents the position of an amino acid residue in the EU numbering system; the one-letter amino acid code preceding the number represents the amino acid residue before substitution, and the one-letter amino acid code following the number represents the amino acid residue after substitution.

さらに、好ましい抗原結合分子または抗体には、その位置が、IgG3抗体のFcドメインを形成するアミノ酸におけるEUナンバリングにより指定されている、以下に示す置換のいずれか1つ:
(k)F241A;
(l)D265A;または
(m)V264A
を有するFcドメインを含むものも含まれる。各数字は、EUナンバリングでのアミノ酸残基の位置を表し;かつ数字の前にある1文字アミノ酸記号は置換前のアミノ酸残基を表し、数字の後にある1文字アミノ酸記号は置換後のアミノ酸残基を表す。
Further, preferred antigen binding molecules or antibodies include any one of the following substitutions, whose positions are designated by EU numbering in the amino acids forming the Fc domain of IgG3 antibodies:
(k) F241A;
(l) D265A; or (m) V264A.
Each number represents the position of an amino acid residue in the EU numbering system; the one-letter amino acid code preceding the number represents the amino acid residue before substitution, and the one-letter amino acid code following the number represents the amino acid residue after substitution.

さらに、好ましい抗原結合分子または抗体には、その位置が、IgG4抗体のFcドメインを形成するアミノ酸におけるEUナンバリングにより指定されている、以下に示す置換のいずれか1つ:
(n)L235A、G237A、およびE318A;
(o)L235E;または
(p)F234AおよびL235A
を有するFcドメインを含むものも含まれる。各数字は、EUナンバリングでのアミノ酸残基の位置を表し;かつ数字の前にある1文字アミノ酸記号は置換前のアミノ酸残基を表し、数字の後にある1文字アミノ酸記号は置換後のアミノ酸残基を表す。
Further, preferred antigen binding molecules or antibodies include any one of the following substitutions, whose positions are designated by EU numbering in the amino acids forming the Fc domain of IgG4 antibodies:
(n) L235A, G237A, and E318A;
(o) L235E; or (p) F234A and L235A.
Each number represents the position of an amino acid residue in the EU numbering system; the one-letter amino acid code preceding the number represents the amino acid residue before substitution, and the one-letter amino acid code following the number represents the amino acid residue after substitution.

他の好ましい抗原結合分子または抗体には、例えば、IgG1抗体のFcドメインを形成するアミノ酸における233位、234位、235位、236位、237位、327位、330位、または331位(EUナンバリング)にある任意のアミノ酸が、対応するIgG2またはIgG4における対応するEUナンバリングでの位置のアミノ酸で置換されているFcドメインを含むものが含まれる。 Other preferred antigen-binding molecules or antibodies include, for example, those that contain an Fc domain in which any amino acid at positions 233, 234, 235, 236, 237, 327, 330, or 331 (EU numbering) forming the Fc domain of an IgG1 antibody is substituted with an amino acid at the corresponding position in the EU numbering in the corresponding IgG2 or IgG4.

好ましい抗原結合分子または抗体には、例えば、IgG1抗体のFcドメインを形成するアミノ酸における234位、235位、および297位(EUナンバリング)にあるアミノ酸のいずれか1つまたは複数が他のアミノ酸で置換されているFcドメインを含むものも含まれる。置換後のアミノ酸の種類は特に限定されない;しかしながら、234位、235位、および297位にあるアミノ酸のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されているFcドメインを含む抗原結合分子または抗体が特に好ましい。 Preferred antigen-binding molecules or antibodies include, for example, those that contain an Fc domain in which any one or more of the amino acids at positions 234, 235, and 297 (EU numbering) in the amino acid sequence that forms the Fc domain of an IgG1 antibody are substituted with other amino acids. The type of amino acid after substitution is not particularly limited; however, antigen-binding molecules or antibodies that contain an Fc domain in which any one or more of the amino acids at positions 234, 235, and 297 are substituted with alanine are particularly preferred.

好ましい抗原結合分子または抗体には、例えば、IgG1抗体のFcドメインを形成するアミノ酸における265位(EUナンバリング)にあるアミノ酸が別のアミノ酸で置換されているFcドメインを含むものも含まれる。置換後のアミノ酸の種類は特に限定されない;しかしながら、265位にあるアミノ酸がアラニンで置換されているFcドメインを含む抗原結合分子または抗体が特に好ましい。 Preferred antigen-binding molecules or antibodies include, for example, those that contain an Fc domain in which the amino acid at position 265 (EU numbering) in the amino acids that form the Fc domain of an IgG1 antibody is substituted with another amino acid. The type of amino acid after substitution is not particularly limited; however, antigen-binding molecules or antibodies that contain an Fc domain in which the amino acid at position 265 is substituted with alanine are particularly preferred.

Fc受容体
用語「Fc受容体」または「FcR」は、抗体のFc領域に結合する受容体を指す。いくつかの態様において、FcRは、天然型ヒトFcRである。いくつかの態様において、FcRは、IgG抗体に結合するもの(ガンマ受容体)であり、FcγRI、FcγRII、およびFcγRIIIサブクラスの受容体を、これらの受容体の対立遺伝子バリアントおよび選択的スプライシングによる形態を含めて、含む。FcγRII受容体は、FcγRIIA(「活性化受容体」)およびFcγRIIB(「阻害受容体」)を含み、これらは主としてその細胞質ドメインにおいて相違する類似のアミノ酸配列を有する。活性化受容体FcγRIIAは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシン活性化モチーフ (immunoreceptor tyrosine-based activation motif: ITAM) を含む。阻害受容体FcγRIIBは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシン阻害モチーフ(immunoreceptor tyrosine-based inhibition motif: ITIM)を含む。(例えば、Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15:203-234 (1997) を参照のこと。)FcRは、例えば、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991);Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994);およびde Haas et al., J. Lab. Clin. Med 126:330-41 (1995)において総説されている。将来同定されるものを含む他のFcRも、本明細書の用語「FcR」に包含される。
Fc Receptor The term "Fc receptor" or "FcR" refers to a receptor that binds to the Fc region of an antibody. In some embodiments, the FcR is a native human FcR. In some embodiments, the FcR is one that binds IgG antibodies (gamma receptors) and includes receptors of the FcγRI, FcγRII, and FcγRIII subclasses, including allelic variants and alternatively spliced forms of these receptors. FcγRII receptors include FcγRIIA ("activating receptor") and FcγRIIB ("inhibiting receptor"), which have similar amino acid sequences that differ primarily in their cytoplasmic domains. Activating receptor FcγRIIA contains an immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM) in its cytoplasmic domain. Inhibiting receptor FcγRIIB contains an immunoreceptor tyrosine-based inhibition motif (ITIM) in its cytoplasmic domain. (See, e.g., Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15:203-234 (1997).) FcRs are reviewed, e.g., in Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991); Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994); and de Haas et al., J. Lab. Clin. Med 126:330-41 (1995). Other FcRs, including those identified in the future, are also encompassed by the term "FcR" herein.

用語「Fc受容体」または「FcR」はまた、母体のIgGの胎児への移動(Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976)およびKim et al., J. Immunol. 24:249 (1994))ならびに免疫グロブリンのホメオスタシスの調節を担う、新生児型受容体FcRnを含む。FcRnへの結合を測定する方法は公知である(例えば、Ghetie and Ward., Immunol. Today 18(12):592-598 (1997); Ghetie et al., Nature Biotechnology, 15(7):637-640 (1997); Hinton et al., J. Biol. Chem. 279(8):6213-6216 (2004); WO2004/92219 (Hinton et al.)を参照のこと)。 The term "Fc receptor" or "FcR" also includes the neonatal receptor FcRn, which is responsible for regulating maternal IgG transfer to the fetus (Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976) and Kim et al., J. Immunol. 24:249 (1994)) and immunoglobulin homeostasis. Methods for measuring binding to FcRn are known (see, e.g., Ghetie and Ward., Immunol. Today 18(12):592-598 (1997); Ghetie et al., Nature Biotechnology, 15(7):637-640 (1997); Hinton et al., J. Biol. Chem. 279(8):6213-6216 (2004); WO2004/92219 (Hinton et al.)).

in vivoでのヒトFcRnへの結合およびヒトFcRn高親和性結合ポリペプチドの血漿半減期は、例えばヒトFcRnを発現するトランスジェニックマウスもしくはトランスフェクトされたヒト細胞株においてまたはバリアントFc領域を伴うポリペプチドが投与される霊長類において測定され得る。WO2000/42072 (Presta) は、FcRに対する結合が増加したまたは減少した抗体バリアントを記載している。例えば、Shields et al. J. Biol. Chem. 9(2):6591-6604 (2001) も参照のこと。 Binding to human FcRn in vivo and plasma half-life of human FcRn high affinity binding polypeptides can be measured, for example, in transgenic mice or transfected human cell lines expressing human FcRn or in primates to which the polypeptide with the variant Fc region is administered. WO2000/42072 (Presta) describes antibody variants with increased or decreased binding to FcR. See also, e.g., Shields et al. J. Biol. Chem. 9(2):6591-6604 (2001).

Fcγ受容体
Fcγ受容体は、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4モノクローナル抗体のFcドメインに結合し得る受容体を指し、これにはFcγ受容体遺伝子によって実質的にコードされるタンパク質のファミリーに属するすべてのメンバーが含まれる。ヒトにおいて、このファミリーには、アイソフォームFcγRIa、FcγRIb、およびFcγRIcを含むFcγRI (CD64);アイソフォームFcγRIIa(アロタイプH131およびR131を含む)、FcγRIIb(FcγRIIb-1およびFcγRIIb-2を含む)、およびFcγRIIcを含むFcγRII (CD32);ならびにアイソフォームFcγRIIIa(アロタイプV158およびF158を含む)およびFcγRIIIb(アロタイプFcγRIIIb-NA1およびFcγRIIIb-NA2を含む)を含むFcγRIII (CD16);ならびに未同定のヒトFcγ受容体、Fcγ受容体アイソフォーム、およびそれらのアロタイプのすべてが含まれる。しかしながら、Fcγ受容体はこれらの例に限定されない。Fcγ受容体には、これらに限定されないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、およびサルに由来するものが含まれる。Fcγ受容体は任意の生物に由来してよい。マウスFcγ受容体には、これらに限定されないが、FcγRI (CD64)、FcγRII (CD32)、FcγRIII (CD16)、およびFcγRIII-2 (CD16-2)、ならびに未同定のマウスFcγ受容体、Fcγ受容体アイソフォーム、およびそれらのアロタイプのすべてが含まれる。そのような好ましいFcγ受容体には、例えば、ヒトFcγRI (CD64)、FcγRIIA (CD32)、FcγRIIB (CD32)、FcγRIIIA (CD16)、および/またはFcγRIIIB (CD16) が含まれる。FcγRIのポリヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、それぞれRefSeq登録番号NM_000566.3およびRefSeq登録番号NP_000557.1に示され;FcγRIIAのポリヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、それぞれRefSeq登録番号BC020823.1およびRefSeq登録番号AAH20823.1に示され;FcγRIIBのポリヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、それぞれRefSeq登録番号BC146678.1およびRefSeq登録番号AAI46679.1に示され;FcγRIIIAのポリヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、それぞれRefSeq登録番号BC033678.1およびRefSeq登録番号AAH33678.1に示され;ならびにFcγRIIIBのポリヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、それぞれRefSeq登録番号BC128562.1およびRefSeq登録番号AAI28563.1に示される。Fcγ受容体がIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4モノクローナル抗体のFcドメインに対する結合活性を有するかどうかは、上記のFACSおよびELISAフォーマットに加えて、ALPHAスクリーン(増幅発光近接ホモジニアスアッセイ)、表面プラズモン共鳴 (SPR) ベースのBIACORE法、およびその他によって評価することができる (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010)。
Fcγ receptors
Fcγ receptor refers to a receptor capable of binding to the Fc domain of an IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 monoclonal antibody and includes all members of a family of proteins substantially encoded by Fcγ receptor genes. In humans, this family includes FcγRI (CD64), which includes isoforms FcγRIa, FcγRIb, and FcγRIc; FcγRII (CD32), which includes isoforms FcγRIIa (including allotypes H131 and R131), FcγRIIb (including FcγRIIb-1 and FcγRIIb-2), and FcγRIIc; and FcγRIII (CD16), which includes isoforms FcγRIIIa (including allotypes V158 and F158) and FcγRIIIb (including allotypes FcγRIIIb-NA1 and FcγRIIIb-NA2); as well as all of the unidentified human Fcγ receptors, Fcγ receptor isoforms, and their allotypes. However, Fcγ receptors are not limited to these examples. Fcγ receptors include, but are not limited to, those derived from humans, mice, rats, rabbits, and monkeys. Fcγ receptors may be from any organism. Mouse Fcγ receptors include, but are not limited to, FcγRI (CD64), FcγRII (CD32), FcγRIII (CD16), and FcγRIII-2 (CD16-2), as well as unidentified mouse Fcγ receptors, Fcγ receptor isoforms, and allotypes thereof. Such preferred Fcγ receptors include, for example, human FcγRI (CD64), FcγRIIA (CD32), FcγRIIB (CD32), FcγRIIIA (CD16), and/or FcγRIIIB (CD16). The polynucleotide and amino acid sequences of FcγRI are set forth in RefSeq Accession Nos. NM_000566.3 and NP_000557.1, respectively; the polynucleotide and amino acid sequences of FcγRIIA are set forth in RefSeq Accession Nos. BC020823.1 and AAH20823.1, respectively; the polynucleotide and amino acid sequences of FcγRIIB are set forth in RefSeq Accession Nos. BC146678.1 and AAI46679.1, respectively; the polynucleotide and amino acid sequences of FcγRIIIA are set forth in RefSeq Accession Nos. BC033678.1 and AAH33678.1, respectively; and the polynucleotide and amino acid sequences of FcγRIIIB are set forth in RefSeq Accession Nos. BC128562.1 and AAI28563.1, respectively. Whether an Fcγ receptor has binding activity to the Fc domain of an IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 monoclonal antibody can be assessed by ALPHA screens (amplified luminescence proximity homogeneous assays), surface plasmon resonance (SPR)-based BIACORE methods, and others, in addition to the FACS and ELISA formats described above (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010).

その一方で、「Fcリガンド」または「エフェクターリガンド」は、抗体Fcドメインに結合してFc/Fcリガンド複合体を形成する分子、および好ましくはポリペプチドを指す。該分子は任意の生物に由来してよい。FcリガンドのFcへの結合は、好ましくは1つまたは複数のエフェクター機能を誘導する。そのようなFcリガンドには、Fc受容体、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcβ受容体、FcRn、C1q、およびC3、マンナン結合レクチン、マンノース受容体、スタフィロコッカス(Staphylococcus)プロテインA、スタフィロコッカスプロテインG、ならびにウイルスFcγ受容体が含まれるが、これらに限定されない。Fcリガンドには、Fcγ受容体と相同なFc受容体のファミリーであるFc受容体相同体 (FcRH) (Davis et al., (2002) Immunological Reviews 190, 123-136) もまた含まれる。Fcリガンドには、Fcに結合する未同定の分子もまた含まれる。 On the other hand, "Fc ligand" or "effector ligand" refers to a molecule, and preferably a polypeptide, that binds to an antibody Fc domain to form an Fc/Fc ligand complex. The molecule may be from any organism. Binding of the Fc ligand to Fc preferably induces one or more effector functions. Such Fc ligands include, but are not limited to, Fc receptors, Fcγ receptors, Fcα receptors, Fcβ receptors, FcRn, C1q, and C3, mannan-binding lectin, mannose receptor, Staphylococcus protein A, Staphylococcus protein G, and viral Fcγ receptors. Fc ligands also include Fc receptor homologs (FcRH), a family of Fc receptors that are homologous to Fcγ receptors (Davis et al., (2002) Immunological Reviews 190, 123-136). Fc ligands also include unidentified molecules that bind to Fc.

Fcγ受容体結合活性
FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、FcγRIIIA、および/またはFcγRIIIBのいずれかのFcγ受容体に対するFcドメインの結合活性が損なわれていることは、上記のFACSおよびELISAフォーマット、ならびにALPHAスクリーン(増幅発光近接ホモジニアスアッセイ)および表面プラズモン共鳴 (SPR) ベースのBIACORE法を用いることによって評価することができる (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010)。
Fcγ receptor binding activity
Impaired binding activity of the Fc domain to any of the Fcγ receptors FcγRI, FcγRIIA, FcγRIIB, FcγRIIIA, and/or FcγRIIIB can be assessed using the FACS and ELISA formats described above, as well as ALPHA screens (amplified luminescent proximity homogeneous assays) and surface plasmon resonance (SPR)-based BIACORE methods (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103 (11), 4005-4010).

ALPHAスクリーンは、2種類のビーズ:ドナービーズおよびアクセプタービーズを用いる、下記の原理に基づいたALPHA技術によって実施される。ドナービーズに連結された分子がアクセプタービーズに連結された分子と生物学的に相互作用し、かつ2つのビーズが近接して位置する場合にのみ、発光シグナルが検出される。ドナービーズ内の光増感剤は、レーザー光によって励起されて、ビーズ周辺の酸素を励起状態の一重項酸素に変換する。一重項酸素がドナービーズ周辺に拡散し、近接して位置するアクセプタービーズに到達すると、アクセプタービーズ内の化学発光反応が誘導される。この反応によって最終的に光が放出される。ドナービーズに連結された分子がアクセプタービーズに連結された分子と相互作用しないのであれば、ドナービーズによって生成される一重項酸素はアクセプタービーズに到達せず、化学発光反応は起こらない。 The ALPHA screen is carried out by ALPHA technology, which uses two types of beads: donor beads and acceptor beads, and is based on the following principle: A luminescence signal is detected only if the molecule linked to the donor bead interacts biologically with the molecule linked to the acceptor bead and the two beads are located in close proximity. A photosensitizer in the donor bead is excited by laser light and converts oxygen around the bead into excited singlet oxygen. When the singlet oxygen diffuses around the donor bead and reaches the nearby acceptor bead, it induces a chemiluminescence reaction in the acceptor bead. This reaction ultimately produces light. If the molecule linked to the donor bead does not interact with the molecule linked to the acceptor bead, the singlet oxygen generated by the donor bead will not reach the acceptor bead and the chemiluminescence reaction will not occur.

例えば、ビオチン標識された抗原結合分子または抗体をドナービーズに固定化し、グルタチオンSトランスフェラーゼ (GST) でタグ付けされたFcγ受容体をアクセプタービーズに固定化する。競合的変異Fcドメインを含む抗原結合分子または抗体の非存在下では、Fcγ受容体は、野生型Fcドメインを含む抗原結合分子または抗体と相互作用し、結果として520~620 nmのシグナルを誘導する。タグ付けされていない変異Fcドメインを有する抗原結合分子または抗体は、野生型Fcドメインを含む抗原結合分子または抗体と、Fcγ受容体との相互作用に関して競合する。競合の結果としての蛍光の減少を定量化することによって、相対的結合親和性を決定することができる。Sulfo-NHS-ビオチンなどを用いて抗体などの抗原結合分子または抗体をビオチン化する方法は公知である。GSTタグをFcγ受容体に付加するための適切な方法には、Fcγ受容体をコードするポリペプチドとGSTをコードするポリペプチドをインフレームで融合し、該融合遺伝子を保有するベクターが導入された細胞を用いて該遺伝子を発現させ、次いでグルタチオンカラムを用いて精製することを伴う方法が含まれる。誘導されたシグナルは好ましくは、例えば、GRAPHPAD PRISM(GraphPad;San Diego)などのソフトウェアを用いて非線形回帰分析に基づく一部位競合モデルに適合させることにより、解析することができる。 For example, a biotin-labeled antigen-binding molecule or antibody is immobilized on donor beads, and an Fcγ receptor tagged with glutathione S-transferase (GST) is immobilized on acceptor beads. In the absence of an antigen-binding molecule or antibody containing a competitive mutant Fc domain, the Fcγ receptor interacts with an antigen-binding molecule or antibody containing a wild-type Fc domain, resulting in a signal at 520 to 620 nm. An antigen-binding molecule or antibody with an untagged mutant Fc domain competes with an antigen-binding molecule or antibody containing a wild-type Fc domain for interaction with the Fcγ receptor. Relative binding affinity can be determined by quantifying the decrease in fluorescence as a result of the competition. Methods for biotinylating antigen-binding molecules or antibodies such as antibodies using Sulfo-NHS-biotin or the like are known. Suitable methods for adding a GST tag to an Fcγ receptor include those involving fusing a polypeptide encoding an Fcγ receptor in frame with a polypeptide encoding GST, expressing the gene using cells transfected with a vector carrying the fusion gene, and then purifying the gene using a glutathione column. The induced signal can be preferably analyzed by fitting to a one-site competition model based on nonlinear regression analysis using software such as, for example, GRAPHPAD PRISM (GraphPad; San Diego).

相互作用を観察するための物質の一方を、リガンドとしてセンサーチップの金薄膜上に固定化する。金薄膜とガラスとの境界面で全反射が起こるようにセンサーチップの裏面から光を当てると、ある特定の部位において反射光の強度が部分的に低下する(SPRシグナル)。相互作用を観察するための他方の物質を、分析物としてセンサーチップの表面上に注入する。分析物がリガンドに結合すると、固定化リガンド分子の質量が増加する。これにより、センサーチップの表面上の溶媒の屈折率が変化する。屈折率の変化は、SPRシグナルの位置のシフトを引き起こす(逆に、解離するとシグナルは元の位置にシフトして戻る)。Biacoreシステムでは、上記のシフトの量(すなわち、センサーチップ表面上での質量の変化)を縦軸にプロットし、そのようにして経時的な質量の変化を測定データとして表示する(センサーグラム)。センサーグラムの曲線から動態パラメーター(会合速度定数 (ka) および解離速度定数 (kd))が決定され、これら2つの定数の比率から親和性 (KD) が決定される。BIACORE法では、阻害アッセイが好ましく用いられる。そのような阻害アッセイの例は、Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103(11), 4005-4010に記載されている。 One of the substances for observing the interaction is immobilized on the gold film of the sensor chip as a ligand. When light is applied from the back of the sensor chip so that total reflection occurs at the interface between the gold film and the glass, the intensity of the reflected light is partially reduced at a certain site (SPR signal). The other substance for observing the interaction is injected onto the surface of the sensor chip as an analyte. When the analyte binds to the ligand, the mass of the immobilized ligand molecule increases. This changes the refractive index of the solvent on the surface of the sensor chip. The change in refractive index causes a shift in the position of the SPR signal (conversely, when dissociated, the signal shifts back to its original position). In the Biacore system, the amount of the above shift (i.e., the change in mass on the sensor chip surface) is plotted on the vertical axis, and the change in mass over time is displayed as measurement data (sensorgram). The kinetic parameters (association rate constant (ka) and dissociation rate constant (kd)) are determined from the curve of the sensorgram, and the affinity (KD) is determined from the ratio of these two constants. In the BIACORE method, an inhibition assay is preferably used. An example of such an inhibition assay is described in Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103(11), 4005-4010.

多重特異性抗体の産生および精製
本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、両方がCD3およびCD137に結合できる、異なる結合特異性を有する2種類の抗原結合部分(例えば、「第1の抗原結合部分」および「第2の抗原結合部分」)と、別の抗原に結合できる「第3の抗原結合部分」とを含み、その各々がFcドメインの2つのサブユニットの一方またはもう一方に最終的に融合され、よって、Fcドメインの2つのサブユニットは典型的には、2本の同一でないポリペプチド鎖に含まれる。これらのポリペプチドの組換え同時発現および続いての二量体化は、2つのポリペプチドの複数の組み合わせの可能性をもたらす。よって、組換え産生における多重特異性抗原結合分子の収量および純度を改善するために、所望のポリペプチドの会合を促進する改変を多重特異性抗原結合分子のFcドメイン中に導入することは有利となる。
Production and purification of multispecific antibodies The multispecific antigen-binding molecules described herein comprise two antigen-binding moieties with different binding specificities (e.g., a "first antigen-binding moiety" and a "second antigen-binding moiety"), both capable of binding to CD3 and CD137, and a "third antigen-binding moiety" capable of binding to another antigen, each of which is ultimately fused to one or the other of the two subunits of the Fc domain, such that the two subunits of the Fc domain are typically contained in two non-identical polypeptide chains. Recombinant co-expression of these polypeptides and subsequent dimerization provide the possibility of multiple combinations of the two polypeptides. Thus, in order to improve the yield and purity of multispecific antigen-binding molecules in recombinant production, it is advantageous to introduce modifications into the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecule that promote the association of the desired polypeptides.

したがって、特定の態様において、本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子のFcドメインは、Fcドメインの第1のサブユニットと第2のサブユニットの会合を促進する改変を含む。ヒトIgG Fcドメインの2つのサブユニット間での最も広範囲のタンパク質-タンパク質相互作用の部位は、FcドメインのCH3ドメイン中にある。したがって、1つの態様において、該改変はFcドメインのCH3ドメイン中にある。 Thus, in certain embodiments, the Fc domain of the multispecific antigen-binding molecules described herein comprises a modification that promotes association of the first and second subunits of the Fc domain. The site of the most extensive protein-protein interaction between the two subunits of the human IgG Fc domain is in the CH3 domain of the Fc domain. Thus, in one embodiment, the modification is in the CH3 domain of the Fc domain.

特定の態様において、該改変は、Fcドメインの2つサブユニットの一方における「knob」改変と、Fcドメインの2つのサブユニットのもう一方における「hole」改変とを含む、いわゆる「knob-into-hole」改変である。 In a particular embodiment, the modification is a so-called "knob-into-hole" modification, which includes a "knob" modification in one of the two subunits of the Fc domain and a "hole" modification in the other of the two subunits of the Fc domain.

knob-into-holeテクノロジーは、例えば、米国特許第5,731,168号;米国特許第7,695,936号;Ridgway et al., Prot Eng 9, 617-621 (1996);およびCarter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)に記載されている。一般に、方法は、突起(「knob」)が空隙(「hole」)中に位置し、ヘテロ二量体の形成を促進しかつホモ二量体の形成を妨げることができるように、突起を第1のポリペプチドの界面に、および対応する空隙を第2のポリペプチドの界面に導入する段階を伴う。突起は、第1のポリペプチドの界面の小さなアミノ酸側鎖を、より大きな側鎖(例えば、チロシンまたはトリプトファン)で置き換えることによって構築される。突起と同じまたは同様のサイズの補償的な空隙は、大きなアミノ酸側鎖をより小さなもの(例えば、アラニンまたはスレオニン)で置き換えることによって第2のポリペプチドの界面に作出される。 Knob-into-hole technology has been described, for example, in U.S. Pat. No. 5,731,168; U.S. Pat. No. 7,695,936; Ridgway et al., Prot Eng 9, 617-621 (1996); and Carter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001). In general, the method involves introducing a protrusion ("knob") into the interface of a first polypeptide and a corresponding cavity ("hole") into the interface of a second polypeptide, such that the protrusion can be positioned in the cavity ("hole") to promote heterodimer formation and prevent homodimer formation. The protrusion is constructed by replacing a small amino acid side chain in the interface of the first polypeptide with a larger side chain (e.g., tyrosine or tryptophan). A compensatory cavity of the same or similar size as the protrusion is created in the interface of the second polypeptide by replacing the large amino acid side chain with a smaller one (e.g., alanine or threonine).

したがって、特定の態様においては、多重特異性抗原結合分子のFcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおいて、アミノ酸残基は、より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、第2のサブユニットのCH3ドメイン内の空隙中に位置することができる第1のサブユニットのCH3ドメイン内の突起が生成され、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおいて、アミノ酸残基は、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、第1のサブユニットのCH3ドメイン内の突起が位置することができる第2のサブユニットのCH3ドメイン内の空隙が生成される。 Thus, in a particular embodiment, in the CH3 domain of a first subunit of an Fc domain of a multispecific antigen-binding molecule, an amino acid residue is replaced with an amino acid residue having a larger side chain volume, thereby generating a protrusion in the CH3 domain of the first subunit that can be positioned in a cavity in the CH3 domain of the second subunit, and in the CH3 domain of a second subunit of an Fc domain, an amino acid residue is replaced with an amino acid residue having a smaller side chain volume, thereby generating a cavity in the CH3 domain of the second subunit in which the protrusion in the CH3 domain of the first subunit can be positioned.

突起および空隙は、ポリペプチドをコードする核酸を例えば部位特異的変異誘発によって変更することによって、またはペプチド合成によって、作ることができる。 The protrusions and gaps can be created by modifying the nucleic acid encoding the polypeptide, for example by site-directed mutagenesis, or by peptide synthesis.

特定の態様において、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおいて、366位のスレオニン残基は、トリプトファン残基で置き換えられ(T366W)、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおいて、407位のチロシン残基は、バリン残基で置き換えられる(Y407V)。1つの態様において、Fcドメインの第2のサブユニットにおいて、さらに、366位のスレオニン残基は、セリン残基で置き換えられ(T366S)、368位のロイシン残基は、アラニン残基で置き換えられる(L368A)。 In a particular embodiment, in the CH3 domain of the first subunit of the Fc domain, the threonine residue at position 366 is replaced with a tryptophan residue (T366W), and in the CH3 domain of the second subunit of the Fc domain, the tyrosine residue at position 407 is replaced with a valine residue (Y407V). In one embodiment, in the second subunit of the Fc domain, furthermore, the threonine residue at position 366 is replaced with a serine residue (T366S), and the leucine residue at position 368 is replaced with an alanine residue (L368A).

なおさらなる態様において、Fcドメインの第1のサブユニットにおいて、さらに、354位のセリン残基は、システイン残基で置き換えられ(S354C)、Fcドメインの第2のサブユニットにおいて、さらに、349位のチロシン残基は、システイン残基によって置き換えられる(Y349C)。これらの2つのシステイン残基の導入は、Fcドメインの2つのサブユニット間にジスルフィド架橋の形成をもたらし、二量体をさらに安定化する(Carter, J Immunol Methods 248, 7-15 (2001))。 In yet a further embodiment, in the first subunit of the Fc domain, the serine residue at position 354 is further replaced by a cysteine residue (S354C), and in the second subunit of the Fc domain, the tyrosine residue at position 349 is further replaced by a cysteine residue (Y349C). The introduction of these two cysteine residues results in the formation of a disulfide bridge between the two subunits of the Fc domain, further stabilizing the dimer (Carter, J Immunol Methods 248, 7-15 (2001)).

他の態様において、本発明の多重特異性抗原結合分子には、所望の組み合わせを有するH鎖間およびL鎖H鎖間の会合を促進するための他の技術を適用することができる。 In other embodiments, other techniques can be applied to the multispecific antigen-binding molecules of the present invention to promote association between H chains and L chains having the desired combinations.

例えば、多重特異性抗体の会合には、抗体H鎖の第2の定常領域または第3の定常領域(CH2またはCH3)の界面に静電気的反発を導入することにより望ましくないH鎖会合を抑制する技術を適用することができる(WO2006/106905)。 For example, in the case of multispecific antibody association, a technique can be applied that suppresses undesired heavy chain association by introducing electrostatic repulsion to the interface of the second or third constant region (CH2 or CH3) of the antibody heavy chain (WO2006/106905).

CH2またはCH3の界面に静電気的反発を導入することにより意図しないH鎖会合を抑制する技術において、H鎖の他方の定常領域の界面で接触するアミノ酸残基の例には、CH3領域におけるEUナンバリング位置356位、439位、357位、370位、399位、および409位の残基に対応する領域が含まれる。 In a technique for suppressing unintended H-chain association by introducing electrostatic repulsion at the CH2 or CH3 interface, examples of amino acid residues that contact the interface of the other constant region of the H-chain include regions corresponding to residues at EU numbering positions 356, 439, 357, 370, 399, and 409 in the CH3 region.

より具体的には、2種のH鎖CH3領域を含む抗体であって、第1のH鎖CH3領域における、以下の(1)~(3)に示すアミノ酸残基の対から選択される1~3対のアミノ酸残基が同種の電荷を有する抗体が、例として挙げられる:(1)H鎖CH3領域に含まれる、EUナンバリング位置356位および439位のアミノ酸残基、(2)H鎖CH3領域に含まれる、EUナンバリング位置357位および370位のアミノ酸残基、ならびに(3)H鎖CH3領域に含まれる、EUナンバリング位置399位および409位のアミノ酸残基。 More specifically, examples include antibodies that contain two types of H chain CH3 regions, in which one to three pairs of amino acid residues selected from the pairs of amino acid residues shown in (1) to (3) below in the first H chain CH3 region have the same charge: (1) the amino acid residues at EU numbering positions 356 and 439 in the H chain CH3 region, (2) the amino acid residues at EU numbering positions 357 and 370 in the H chain CH3 region, and (3) the amino acid residues at EU numbering positions 399 and 409 in the H chain CH3 region.

さらに、該抗体は、上記第1のH鎖CH3領域とは異なる第2のH鎖CH3領域におけるアミノ酸残基の対が、前記(1)~(3)のアミノ酸残基の対から選択され、前記第1のH鎖CH3領域において同種の電荷を有する前記(1)~(3)のアミノ酸残基の対に対応する1~3対のアミノ酸残基が、前記第1のH鎖CH3領域における対応するアミノ酸残基とは反対の電荷を有する抗体であってもよい。 Furthermore, the antibody may be an antibody in which pairs of amino acid residues in a second H chain CH3 region different from the first H chain CH3 region are selected from the pairs of amino acid residues (1) to (3) above, and 1 to 3 pairs of amino acid residues corresponding to the pairs of amino acid residues (1) to (3) having the same charge in the first H chain CH3 region have an opposite charge to the corresponding amino acid residues in the first H chain CH3 region.

上記(1)~(3)に示されるそれぞれのアミノ酸残基は、会合した際に互いに接近している。当業者であれば、所望のH鎖CH3領域またはH鎖定常領域において、市販のソフトウェアを用いたホモロジーモデリング等により、上記(1)~(3)のアミノ酸残基に対応する位置を見出すことができ、適宜、これらの位置のアミノ酸残基を改変に供することが可能である。 The amino acid residues shown in (1) to (3) above are close to each other when associated. A person skilled in the art can find positions corresponding to the amino acid residues in (1) to (3) above in the desired H chain CH3 region or H chain constant region by homology modeling using commercially available software, and can appropriately modify the amino acid residues at these positions.

上記抗体において、「電荷を有するアミノ酸残基」は、例えば、以下の群のいずれか1つに含まれるアミノ酸残基から選択されることが好ましい:
(a) グルタミン酸(E)およびアスパラギン酸(D)、ならびに
(b) リジン(K)、アルギニン(R)、およびヒスチジン(H)。
In the above-mentioned antibody, the "charged amino acid residue" is preferably selected from amino acid residues included in any one of the following groups:
(a) glutamic acid (E) and aspartic acid (D), and
(b) Lysine (K), arginine (R), and histidine (H).

上記抗体において、語句「同じ電荷を有する」とは、例えば、2つ以上のアミノ酸残基のいずれもが、上記の群(a)および(b)のうちいずれか1つに含まれるアミノ酸残基から選択されることを意味する。語句「反対の電荷を有する」とは、例えば、2つ以上のアミノ酸残基のうちの少なくとも1つのアミノ酸残基が、上記の群(a)および(b)のうちいずれか1つに含まれるアミノ酸残基から選択される場合に、残りのアミノ酸残基が他の群に含まれるアミノ酸残基から選択されることを意味する。 In the above antibody, the phrase "having the same charge" means, for example, that two or more amino acid residues are all selected from amino acid residues included in any one of the above groups (a) and (b). The phrase "having opposite charges" means, for example, that when at least one amino acid residue out of two or more amino acid residues is selected from amino acid residues included in any one of the above groups (a) and (b), the remaining amino acid residue is selected from amino acid residues included in the other group.

好ましい態様において上記抗体は、その第1のH鎖CH3領域と第2のH鎖CH3領域がジスルフィド結合により架橋されていてもよい。 In a preferred embodiment, the first H chain CH3 region and the second H chain CH3 region of the antibody may be cross-linked by a disulfide bond.

本発明において、改変に供するアミノ酸残基は、上述した抗体可変領域または抗体定常領域のアミノ酸残基に限られない。当業者であれば、変異ポリペプチドまたは異種多量体において、市販のソフトウェアを用いたホモロジーモデリング等により、界面を形成するアミノ酸残基を同定することができ、次いでこれらの位置のアミノ酸残基を、会合を制御するように改変に供することが可能である。 In the present invention, the amino acid residues to be modified are not limited to those in the antibody variable region or antibody constant region described above. A person skilled in the art can identify amino acid residues that form an interface in a mutant polypeptide or heteromultimer by homology modeling using commercially available software, and can then modify the amino acid residues at these positions to control the association.

加えて、本発明の多重特異性抗体の形成には他の公知技術を用いることもできる。抗体の一方のH鎖CH3の一部を対応するIgA由来の配列に変え、対応するIgA由来の配列を他方のH鎖CH3の相補的な部分に導入することにより生成された鎖交換操作ドメインCH3(strand-exchange engineered domain CH3)を用いて、異なる配列を有するポリペプチドの会合をCH3の相補的な会合によって効率的に誘導することができる (Protein Engineering Design & Selection, 23; 195-202, 2010)。この公知技術を用いて効率的に目的の多重特異性抗体を形成させることもできる。 In addition, other known techniques can also be used to form the multispecific antibodies of the present invention. Using a strand-exchange engineered domain CH3 generated by changing a portion of the CH3 of one of the antibody's H chains to a sequence derived from the corresponding IgA and introducing the corresponding IgA sequence into the complementary portion of the CH3 of the other H chain, association of polypeptides having different sequences can be efficiently induced by complementary association of CH3 (Protein Engineering Design & Selection, 23; 195-202, 2010). Using this known technique, the desired multispecific antibodies can also be efficiently formed.

加えて、多重特異性抗原結合分子の形成には、WO2011/028952、WO2014/018572およびNat Biotechnol. 2014 Feb;32(2):191-8に記載されるような抗体のCH1とCLの会合およびVHとVLの会合を利用した抗体製造技術、WO2008/119353およびWO2011/131746に記載されるような別々に調製したモノクローナル抗体を組み合わせて使用して二重特異性抗体を製造する技術(Fab Arm Exchange)、WO2012/058768およびWO2013/063702に記載されるような抗体重鎖CH3間の会合を制御する技術、WO2012/023053に記載されるような2種類の軽鎖と1種類の重鎖とから構成される多重特異性抗体を製造する技術、Christophら(Nature Biotechnology Vol. 31, p 753-758 (2013))によって記載されるような1本のH鎖と1本のL鎖を含む抗体の片鎖をそれぞれ発現する2つの細菌細胞株を利用した多重特異性抗体を製造する技術等を用いてもよい。 In addition, for the formation of multispecific antigen-binding molecules, there are various techniques, such as those described in WO2011/028952, WO2014/018572 and Nat Biotechnol. 2014 Feb;32(2):191-8 for producing antibodies using the association of CH1 and CL and the association of VH and VL, those described in WO2008/119353 and WO2011/131746 for producing bispecific antibodies by combining monoclonal antibodies prepared separately (Fab Arm Exchange), those described in WO2012/058768 and WO2013/063702 for controlling the association between antibody heavy chain CH3, those described in WO2012/023053 for producing multispecific antibodies composed of two types of light chains and one type of heavy chain, those described in Christoph et al. (Nature Biotechnology Vol. 31, p 753-758 (2013)) may be used to produce multispecific antibodies using two bacterial cell lines each expressing one half of an antibody chain, including one heavy chain and one light chain.

あるいは、目的の多重特異性抗体を効率的に形成させることができない場合であっても、産生された抗体から目的の多重特異性抗体を分離し精製することによって、本発明の多重特異性抗体を得ることが可能である。例えば、2種類のH鎖の可変領域にアミノ酸置換を導入することにより等電点の差を付与することで、2種類のホモ体と目的のヘテロ抗体をイオン交換クロマトグラフィーで精製することを可能にする方法が報告されている(WO2007114325)。ヘテロ抗体を精製する方法として、これまでに、プロテインAに結合するマウスIgG2aのH鎖とプロテインAに結合しないラットIgG2bのH鎖とを含むヘテロ二量化抗体を、プロテインAを用いて精製する方法が報告されている(WO98050431およびWO95033844)。さらに、IgGとプロテインAの結合部位であるEUナンバリング位置435位および436位のアミノ酸残基を、異なるプロテインA親和性をもたらすアミノ酸であるTyr、Hisなどに置換したH鎖を用いて、あるいは、異なるプロテインA親和性を有するH鎖を用いて、各H鎖とプロテインAとの相互作用を変化させ、次いでプロテインAカラムを用いることにより、ヘテロ二量化抗体のみを効率的に精製することができる。 Alternatively, even if the desired multispecific antibody cannot be efficiently formed, it is possible to obtain the multispecific antibody of the present invention by separating and purifying the desired multispecific antibody from the produced antibodies. For example, a method has been reported in which an amino acid substitution is introduced into the variable regions of two types of H chains to impart a difference in isoelectric point, thereby making it possible to purify two types of homoantibodies and the desired heteroantibody by ion exchange chromatography (WO2007114325). As a method for purifying a heteroantibody, a method has been reported in which a heterodimerized antibody containing a mouse IgG2a H chain that binds to protein A and a rat IgG2b H chain that does not bind to protein A is purified using protein A (WO98050431 and WO95033844). Furthermore, by using an H chain in which the amino acid residues at EU numbering positions 435 and 436, which are the binding sites between IgG and Protein A, are replaced with amino acids such as Tyr and His that confer different Protein A affinities, or by using H chains with different Protein A affinities, the interaction between each H chain and Protein A can be changed, and then using a Protein A column, it is possible to efficiently purify only the heterodimerized antibody.

さらに、本発明のFc領域として、Fc領域のC末端のヘテロジェニティーが改善されたFc領域が適宜使用され得る。より具体的には、本発明は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4由来のFc領域を構成する2つのポリペプチドのアミノ酸配列のうちEUナンバリングによって特定される446位のグリシンおよび447位のリジンを欠失させることにより生成されたFc領域を提供する。 Furthermore, as the Fc region of the present invention, an Fc region with improved C-terminal heterogeneity may be appropriately used. More specifically, the present invention provides an Fc region generated by deleting glycine at position 446 and lysine at position 447, as specified by EU numbering, from the amino acid sequences of two polypeptides constituting an Fc region derived from IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4.

本明細書において記載されるように調製された多重特異性抗原結合分子は、例えば、高速液体クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、アフィニティクロマトグラフィー、およびサイズ排除クロマトグラフィー等の当技術分野において公知の技術によって精製されてもよい。特定のタンパク質を精製するために用いられる実際の条件は、正味電荷、疎水性、親水性等の因子に一部依存し、当業者に明らかである。アフィニティクロマトグラフィー精製では、多重特異性抗原結合分子が結合する、抗体、リガンド、受容体、または抗原を用いることができる。例えば、本発明の多重特異性抗原結合分子のアフィニティクロマトグラフィー精製では、プロテインAまたはプロテインGを有するマトリックスが用いられてもよい。多重特異性抗原結合分子を単離するために、連続したプロテインAまたはGアフィニティクロマトグラフィーおよびサイズ排除クロマトグラフィーを用いることができる。多重特異性抗原結合分子の純度は、ゲル電気泳動および高圧液体クロマトグラフィー等を含む、様々な周知の分析方法のいずれかによって決定することができる。 The multispecific antigen-binding molecules prepared as described herein may be purified by techniques known in the art, such as, for example, high performance liquid chromatography, ion exchange chromatography, gel electrophoresis, affinity chromatography, and size exclusion chromatography. The actual conditions used to purify a particular protein will depend in part on factors such as net charge, hydrophobicity, hydrophilicity, and the like, and will be apparent to one of skill in the art. Affinity chromatography purification can use an antibody, ligand, receptor, or antigen to which the multispecific antigen-binding molecule binds. For example, affinity chromatography purification of the multispecific antigen-binding molecules of the invention can use a matrix with protein A or protein G. Sequential protein A or G affinity chromatography and size exclusion chromatography can be used to isolate the multispecific antigen-binding molecules. The purity of the multispecific antigen-binding molecules can be determined by any of a variety of well-known analytical methods, including, for example, gel electrophoresis and high pressure liquid chromatography.

抗体依存性細胞媒介性細胞傷害
「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害」または「ADCC」は、分泌されたIgが特定の細胞傷害性細胞(例えば、NK細胞、好中球およびマクロファージ)上に存在するFc受容体 (FcR) に結合しそれによってこれらの細胞傷害性エフェクター細胞が抗原を有する標的細胞に特異的に結合することができそしてその後にその標的細胞を細胞毒によって殺傷することができるようになる、細胞傷害の一形態を指す。ADCCを媒介するプライマリ細胞であるNK細胞はFcγRIIIのみを発現し、単球はFcγRI、FcγRII、およびFcγRIIIを発現する。造血細胞上のFcRの発現は、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991) の第464頁の表3にまとめられている。目的の分子のADCC活性を評価するために、in vitroADCC測定法、例えば米国特許第5,500,362号もしくは第5,821,337号または米国特許第6,737,056号 (Presta) に記載のものが実施され得る。そのような測定法に有用なエフェクター細胞は、PBMCおよびNK細胞を含む。あるいはまたは加えて、目的の分子のADCC活性は、例えばClynes et al. PNAS (USA) 95:652-656 (1998)に開示される動物モデルのような動物モデルにおいて、in vivoで評価されてもよい。
Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity "Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity" or "ADCC" refers to a form of cytotoxicity in which secreted Ig binds to Fc receptors (FcR) present on certain cytotoxic cells (e.g., NK cells, neutrophils, and macrophages), thereby enabling these cytotoxic effector cells to specifically bind to antigen-bearing target cells and subsequently kill the target cells with cytotoxins. NK cells, the primary cells mediating ADCC, express only FcγRIII, whereas monocytes express FcγRI, FcγRII, and FcγRIII. Expression of FcRs on hematopoietic cells is summarized in Table 3 on page 464 of Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991). To assess the ADCC activity of a molecule of interest, an in vitro ADCC assay can be performed, such as those described in U.S. Patent Nos. 5,500,362 or 5,821,337 or U.S. Patent No. 6,737,056 (Presta). Useful effector cells for such assays include PBMCs and NK cells. Alternatively or additionally, the ADCC activity of a molecule of interest can be assessed in vivo in an animal model, such as the animal model disclosed in Clynes et al. PNAS (USA) 95:652-656 (1998).

補体依存性細胞傷害
「補体依存性細胞傷害」または「CDC」は、補体の存在下での標的細胞の溶解を指す。古典的補体経路の活性化は、(適切なサブクラスの)抗体(対応する抗原に結合している)への補体系の第1要素(C1q)の結合によって開始される。補体活性化を評価するため、例えばGazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996) に記載のCDC測定法が実施され得る。改変されたFc領域アミノ酸配列を伴うポリペプチドバリアント(バリアントFc領域を伴うポリペプチド)および増加または減少したC1q結合能は、例えば、米国特許第6,194,551号B1およびWO1999/51642に記載されている。例えば、Idusogie et al. J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000) も参照のこと。
Complement-dependent cytotoxicity "Complement-dependent cytotoxicity" or "CDC" refers to the lysis of target cells in the presence of complement. Activation of the classical complement pathway is initiated by the binding of the first component of the complement system (C1q) to antibodies (of the appropriate subclass) that are bound to the corresponding antigen. To assess complement activation, a CDC assay can be performed, for example, as described in Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996). Polypeptide variants with altered Fc region amino acid sequences (polypeptides with variant Fc regions) and increased or decreased C1q binding capacity are described, for example, in U.S. Patent No. 6,194,551 B1 and WO1999/51642. See also, for example, Idusogie et al. J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000).

T細胞依存性細胞傷害
「T細胞依存性細胞傷害」または「TDCC」は、標的細胞に対する細胞傷害がT細胞により誘導されるように、抗原結合分子が、標的細胞上に発現している抗原とT細胞上に発現している別の抗原との両方に結合し、T細胞を標的細胞の近くに方向付け直す、細胞傷害の形態を指す。T細胞依存性細胞傷害を評価するための方法である、in vitro TDCCアッセイは、本明細書の「T細胞依存性細胞傷害の測定」のセクションでも説明される。
T cell dependent cytotoxicity "T cell dependent cytotoxicity" or "TDCC" refers to a form of cytotoxicity in which an antigen binding molecule binds to both an antigen expressed on a target cell and another antigen expressed on a T cell, redirecting the T cell to the vicinity of the target cell so that cytotoxicity against the target cell is induced by the T cell. A method for assessing T cell dependent cytotoxicity, the in vitro TDCC assay, is also described in the "Measurement of T cell dependent cytotoxicity" section of this specification.

T細胞依存性細胞傷害の測定
抗原結合分子がDLL3およびCD3/CD137の両方に結合する態様において、本開示の抗原結合分子を、本開示の抗原結合分子における抗原結合部位が結合するDLL3発現細胞と接触させることによって引き起こされるT細胞依存性細胞傷害(TDCC)を評価または決定するための方法として、好ましくは、以下に記載する方法が用いられる。細胞傷害活性をin vitroで評価または決定するための方法には、細胞傷害性T細胞等の活性を決定するための方法が含まれる。T細胞媒介性細胞傷害を誘導する活性を本開示の抗原結合分子が有するかどうかは、公知の方法によって決定することができる(例えば、Current protocols in Immunology, Chapter 7. Immunologic studies in humans, Editor, John E, Coligan et al., John Wiley & Sons, Inc., (1993)を参照)。細胞傷害アッセイにおいて、DLL3と異なりかつ細胞において発現していない抗原と、CD3/CD137とに結合することができる抗原結合分子が、対照抗原結合分子として用いられる。対照抗原結合分子は同じようにアッセイされる。次いで、活性は、本開示の抗原結合分子が、対照抗原結合分子のものより強い細胞傷害活性を示すかどうかを試験することによって評価される。
Measurement of T-cell-dependent cytotoxicity In an embodiment in which an antigen-binding molecule binds to both DLL3 and CD3/CD137, the following method is preferably used to evaluate or determine T-cell-dependent cytotoxicity (TDCC) caused by contacting an antigen-binding molecule of the present disclosure with a DLL3-expressing cell to which the antigen-binding site in the antigen-binding molecule of the present disclosure binds. Methods for evaluating or determining cytotoxic activity in vitro include methods for determining the activity of cytotoxic T cells, etc. Whether an antigen-binding molecule of the present disclosure has the activity of inducing T-cell-mediated cytotoxicity can be determined by known methods (see, for example, Current protocols in Immunology, Chapter 7. Immunologic studies in humans, Editor, John E, Coligan et al., John Wiley & Sons, Inc., (1993)). In the cytotoxicity assay, an antigen-binding molecule capable of binding to an antigen different from DLL3 and not expressed in cells and to CD3/CD137 is used as a control antigen-binding molecule. The control antigen-binding molecule is assayed in the same manner. Activity is then evaluated by testing whether an antigen-binding molecule of the present disclosure exhibits stronger cytotoxic activity than that of a control antigen-binding molecule.

一方、in vivo抗腫瘍有効性は、例えば、以下の手法によって、評価または決定される。本開示の抗原結合分子における抗原結合部位が結合する抗原を発現する細胞は、非ヒト動物対象に皮内または皮下移植される。次いで、移植の日からまたはその後、被験抗原結合分子が、静脈内または腹膜腔内に毎日または数日間隔で投与される。腫瘍サイズは経時的に測定される。腫瘍サイズの変化の差は細胞傷害活性として定義することができる。in vitroアッセイと同様に、対照抗原結合分子が投与される。腫瘍サイズが、対照抗原結合分子を投与された群のものより、本開示の抗原結合分子を投与された群で小さい場合に、本開示の抗原結合分子は、細胞傷害活性を有すると判断することができる。 On the other hand, in vivo antitumor efficacy is evaluated or determined, for example, by the following method. Cells expressing an antigen to which the antigen-binding site in the antigen-binding molecule of the present disclosure binds are implanted intradermally or subcutaneously into a non-human animal subject. Then, from the day of implantation or thereafter, the test antigen-binding molecule is administered intravenously or intraperitoneally daily or at intervals of several days. Tumor size is measured over time. The difference in the change in tumor size can be defined as cytotoxic activity. As in the in vitro assay, a control antigen-binding molecule is administered. If the tumor size is smaller in the group administered with the antigen-binding molecule of the present disclosure than in the group administered with the control antigen-binding molecule, it can be determined that the antigen-binding molecule of the present disclosure has cytotoxic activity.

抗原結合分子の抗原結合部位が結合する抗原を発現する細胞の増殖を抑制する本開示の抗原結合分子との接触の作用を評価または決定するために、好ましくは、MTT法および細胞内へのアイソトープ標識チミジン取り込みの測定が用いられる。一方、in vivoで細胞増殖を抑制する活性を評価または決定するために、好ましくは、in vivo細胞傷害活性を評価または決定するための上記に記載の同じ方法を用いることができる。 To evaluate or determine the effect of contact with the antigen-binding molecule of the present disclosure in suppressing the proliferation of cells expressing an antigen to which the antigen-binding site of the antigen-binding molecule binds, the MTT method and measurement of isotope-labeled thymidine incorporation into cells are preferably used. On the other hand, to evaluate or determine the activity of suppressing cell proliferation in vivo, preferably, the same method described above for evaluating or determining in vivo cytotoxic activity can be used.

本開示の抗体または抗原結合分子のTDCCは、当技術分野で公知の任意の適切な方法によって評価することができる。例えば、TDCCは、乳酸脱水素酵素 (LDH) 放出アッセイによって測定することができる。このアッセイでは、標的細胞(例えば、DLL3発現細胞)を被験抗体または抗原結合分子の存在下でT細胞(例えば、PBMC)と共にインキュベートし、T細胞によって殺傷された標的細胞から放出されたLDHの活性を、適切な試薬を用いて測定する。典型的には、細胞傷害活性は、(例えば、Triton-Xでの処理によって溶解された)標的細胞の100%の死滅によって生じたLDH活性に対する、抗体または抗原結合分子とのインキュベーションによって生じたLDH活性の割合として算出される。上述のように算出された細胞傷害活性がより高い場合、被験抗体または抗原結合分子は、より高いTDCCを有すると判定される。 The TDCC of the antibody or antigen-binding molecule of the present disclosure can be evaluated by any suitable method known in the art. For example, TDCC can be measured by lactate dehydrogenase (LDH) release assay. In this assay, target cells (e.g., DLL3-expressing cells) are incubated with T cells (e.g., PBMCs) in the presence of the test antibody or antigen-binding molecule, and the activity of LDH released from target cells killed by the T cells is measured using a suitable reagent. Typically, the cytotoxic activity is calculated as the ratio of LDH activity generated by incubation with the antibody or antigen-binding molecule to the LDH activity generated by 100% killing of target cells (e.g., lysed by treatment with Triton-X). If the cytotoxic activity calculated as described above is higher, the test antibody or antigen-binding molecule is determined to have a higher TDCC.

加えてまたはその代わりに、例えば、TDCCは、リアルタイム細胞増殖阻害アッセイによって測定することもできる。このアッセイでは、96ウェルプレートにおいて、標的細胞(例えば、DLL3発現細胞)を被験抗体または抗原結合分子の存在下でT細胞(例えば、PBMC)と共にインキュベートし、当技術分野で公知の方法によって、例えば適切な分析機器(例えば、xCELLigenceリアルタイム細胞分析装置)を用いることによって、標的細胞の増殖をモニターする。細胞増殖阻害率 (CGI:%) を、CGI (%) = 100 - (CIAb×100 / CINoAb) として与えられる式に従って、Cell Indexから決定する。「CIAb」は、特定の実験時間における、抗体または抗原結合分子ありのウェルのCell Indexを表し、「CINoAb」は、抗体または抗原結合分子なしのウェルの平均Cell Indexを表す。抗体または抗原結合分子のCGI率が高い、すなわち有意な正の値を有する場合、その抗体または抗原結合分子はTDCC活性を有するということができる。 Additionally or alternatively, for example, TDCC can be measured by a real-time cell proliferation inhibition assay. In this assay, target cells (e.g., DLL3-expressing cells) are incubated with T cells (e.g., PBMCs) in the presence of a test antibody or antigen-binding molecule in a 96-well plate, and proliferation of the target cells is monitored by methods known in the art, for example, by using a suitable analytical instrument (e.g., xCELLigence real-time cell analyzer). The cell proliferation inhibition rate (CGI:%) is determined from the Cell Index according to the formula given as CGI (%) = 100 - (CIAb x 100 / CINoAb). "CIAb" represents the Cell Index of wells with the antibody or antigen-binding molecule at a particular experimental time, and "CINoAb" represents the average Cell Index of wells without the antibody or antigen-binding molecule. If the CGI rate of an antibody or antigen-binding molecule is high, i.e., has a significant positive value, the antibody or antigen-binding molecule can be said to have TDCC activity.

1つの局面において、本開示の抗体または抗原結合分子はT細胞活性化活性を有する。T細胞活性化は、その活性化に応答してレポーター遺伝子(例えば、ルシフェラーゼ)を発現する改変T細胞株(例えば、Jurkat / NFAT-REレポーター細胞株(T細胞活性化バイオアッセイ、Promega))を用いる方法などの、当技術分野で公知の方法によってアッセイすることができる。この方法では、標的細胞(例えば、DLL3発現細胞)を被験抗体または抗原結合分子の存在下でT細胞と共に培養し、次いでレポーター遺伝子の発現産物のレベルまたは活性を、T細胞活性化の指標として適切な方法によって測定する。レポーター遺伝子がルシフェラーゼ遺伝子である場合、ルシフェラーゼとその基質との反応によって生じた発光を、T細胞活性化の指標として測定することができる。上記のように測定されたT細胞活性化がより高い場合、被験抗体または抗原結合分子は、より高いT細胞活性化活性を有すると判定される。 In one aspect, the antibody or antigen-binding molecule of the present disclosure has T cell activation activity. T cell activation can be assayed by methods known in the art, such as using a modified T cell line (e.g., Jurkat/NFAT-RE reporter cell line (T cell activation bioassay, Promega)) that expresses a reporter gene (e.g., luciferase) in response to its activation. In this method, target cells (e.g., DLL3-expressing cells) are cultured with T cells in the presence of the test antibody or antigen-binding molecule, and the level or activity of the expression product of the reporter gene is then measured by a suitable method as an indicator of T cell activation. When the reporter gene is a luciferase gene, the luminescence generated by the reaction of luciferase with its substrate can be measured as an indicator of T cell activation. If the T cell activation measured as described above is higher, the test antibody or antigen-binding molecule is determined to have higher T cell activation activity.

医薬組成物
1つの局面において、本開示は、本開示の抗原結合分子または抗体を含む医薬組成物または医薬製剤を提供する。特定の態様において、本開示の医薬組成物または医薬製剤は、T細胞依存性細胞傷害を誘導する、言い換えると、本開示の医薬組成物または医薬製剤は、細胞傷害を誘導するための治療剤である。特定の態様において、本開示の医薬組成物または医薬製剤は、がんの治療および/または予防のための医薬組成物または医薬製剤である。特定の態様において、本開示の医薬組成物または医薬製剤は、肺がん(小細胞肺がんを含む)および黒色腫を含む、またはDLL3を発現する神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)もしくは神経内分泌がん(NEC)、またはDLL3を発現する非神経内分泌起源の他の固形腫瘍を含む、DLL3陽性がんまたはDLL3発現がんの治療および/または予防に用いられる医薬組成物または医薬製剤である。いくつかの好ましい態様において、がんの例としては、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)もしくは大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC);または他の固形腫瘍、例えば、神経芽腫、神経膠腫もしくは膠芽腫(GBM)、黒色腫、甲状腺髄様がんが挙げられる。好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、肺がん、好ましくは SCLCである。別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、神経膠腫または膠芽腫(GBM)である。別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は神経内分泌前立腺がんである。特定の態様において、本開示の医薬組成物または医薬製剤は細胞増殖抑制剤である。特定の態様において、本開示の医薬組成物または医薬製剤は抗がん剤である。
Pharmaceutical Compositions
In one aspect, the present disclosure provides a pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation comprising the antigen-binding molecule or antibody of the present disclosure. In certain embodiments, the pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure induces T cell-dependent cytotoxicity, in other words, the pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure is a therapeutic agent for inducing cytotoxicity. In certain embodiments, the pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure is a pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation for treating and/or preventing cancer. In certain embodiments, the pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure is a pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation for treating and/or preventing DLL3-positive cancer or DLL3-expressing cancer, including lung cancer (including small cell lung cancer) and melanoma, or including DLL3-expressing neuroendocrine neoplasms (NEN), neuroendocrine tumors (NET) or neuroendocrine carcinomas (NEC), or other solid tumors of non-neuroendocrine origin that express DLL3. In some preferred embodiments, examples of cancer include pancreatic neuroendocrine tumors (PNET), small cell NEC (SCNEC) or large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine cancer, medullary thyroid cancer (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC); or other solid tumors, such as neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, medullary thyroid cancer. In a preferred embodiment, the tumor or cancer disease is lung cancer, preferably SCLC. In another preferred embodiment, the tumor or cancer disease is glioma or glioblastoma (GBM). In another preferred embodiment, the tumor or cancer disease is neuroendocrine prostate cancer. In a particular embodiment, the pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure is a cytostatic agent. In a particular embodiment, the pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure is an anti-cancer agent.

本開示の医薬組成物もしくは医薬製剤、本開示の細胞傷害を誘導するための治療剤、細胞増殖抑制剤、または抗がん剤は、必要に応じて、様々な種類の抗原結合分子または抗体と共に製剤化することができる。例えば、本開示の複数の抗原結合分子または抗体のカクテルによって、抗原を発現する細胞に対する細胞傷害作用を増強させることができる。 The pharmaceutical composition or pharmaceutical preparation of the present disclosure, the therapeutic agent for inducing cytotoxicity of the present disclosure, the cell proliferation inhibitor, or the anticancer agent can be formulated with various types of antigen-binding molecules or antibodies as necessary. For example, a cocktail of multiple antigen-binding molecules or antibodies of the present disclosure can enhance the cytotoxic effect against cells expressing an antigen.

本明細書に記載の抗原結合分子または抗体の医薬組成物または医薬製剤は、所望の純度を有する抗原結合分子または抗体を、1つまたは複数の任意の薬学的に許容される担体 (Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)) と混合することによって、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、調製される。薬学的に許容される担体は、概して、用いられる際の投与量および濃度ではレシピエントに対して非毒性であり、これらに限定されるものではないが、以下のものを含む:リン酸塩、クエン酸塩、および他の有機酸などの緩衝液;アスコルビン酸およびメチオニンを含む、抗酸化剤;保存料(オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル、またはベンジルアルコール;メチルまたはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レソルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾールなど);低分子(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、またはリジンなどのアミノ酸;グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む、単糖、二糖、および他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、ソルビトールなどの、砂糖類;ナトリウムなどの塩形成対イオン類;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);および/またはポリエチレングリコール (PEG) などの非イオン系表面活性剤。本明細書の例示的な薬学的に許容される担体は、さらに、可溶性中性活性型ヒアルロニダーゼ糖タンパク質 (sHASEGP)(例えば、rHuPH20 (HYLENEX(登録商標)、Baxter International, Inc.) などのヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質)などの間質性薬剤分散剤を含む。特定の例示的sHASEGPおよびその使用方法は(rHuPH20を含む)、米国特許出願公開第2005/0260186号および第2006/0104968号に記載されている。1つの局面において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼなどの1つまたは複数の追加的なグリコサミノグリカナーゼと組み合わせられる。 Pharmaceutical compositions or formulations of the antigen-binding molecules or antibodies described herein are prepared in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions by mixing the antigen-binding molecules or antibodies having the desired purity with any one or more pharma- ceutically acceptable carriers (Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)). Pharmaceutically acceptable carriers are generally non-toxic to recipients at the dosages and concentrations employed, and include, but are not limited to, the following: buffers such as phosphate, citrate, and other organic acids; antioxidants, including ascorbic acid and methionine; preservatives, such as octadecyldimethylbenzyl ammonium chloride; hexamethonium chloride; benzalkonium chloride; benzethonium chloride; phenol, butyl, or benzyl alcohol; alkyl parabens, such as methyl or propyl paraben; catechol; resorcinol; cyclohexanol; 3-pentanol; and m-cresol); small (less than about 10 residues) polypeptides; proteins such as serum albumin, gelatin, or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids such as glycine, glutamine, asparagine, histidine, arginine, or lysine; monosaccharides, disaccharides, and other carbohydrates, including glucose, mannose, or dextrin; chelating agents such as EDTA; sugars such as sucrose, mannitol, trehalose, sorbitol; salt-forming counterions such as sodium; metal complexes (e.g., Zn-protein complexes); and/or non-ionic surfactants such as polyethylene glycol (PEG). Exemplary pharmacologic carriers herein further include interstitial drug dispersing agents, such as soluble neutral activated hyaluronidase glycoproteins (sHASEGPs) (e.g., human soluble PH-20 hyaluronidase glycoproteins, such as rHuPH20 (HYLENEX®, Baxter International, Inc.)). Certain exemplary sHASEGPs and methods of use thereof (including rHuPH20) are described in U.S. Patent Application Publication Nos. 2005/0260186 and 2006/0104968. In one aspect, the sHASEGP is combined with one or more additional glycosaminoglycanases, such as chondroitinases.

例示的な凍結乾燥抗体製剤は、米国特許第6,267,958号に記載されている。水溶液抗体製剤は、米国特許第6,171,586号およびWO2006/044908に記載のものを含み、後者の製剤はヒスチジン-アセテート緩衝液を含んでいる。 Exemplary lyophilized antibody formulations are described in U.S. Pat. No. 6,267,958. Aqueous antibody formulations include those described in U.S. Pat. No. 6,171,586 and WO2006/044908, the latter formulations including a histidine-acetate buffer.

本明細書の製剤は、治療される特定の適応症のために必要であれば1つより多くの有効成分を含んでもよい。互いに悪影響を与えあわない相補的な活性を伴うものが好ましい。このような有効成分は、意図された目的のために有効である量で、好適に組み合わせられて存在する。 The formulations herein may contain more than one active ingredient as necessary for the particular indication being treated, preferably with complementary activities that do not adversely affect each other. Such active ingredients are present in any suitable combination and in amounts that are effective for the intended purpose.

必要に応じて、本開示の抗原結合分子または抗体は、マイクロカプセル(ヒドロキシメチルセルロース、ゼラチン、ポリ[メチルメタクリレート]などから作製されたマイクロカプセル)中に封入してもよく、コロイド薬物送達系(リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、およびナノカプセル)の構成成分としてもよい(例えば、「Remington's Pharmaceutical Science 16th edition」、Oslo Ed. (1980)を参照)。さらに、薬剤を徐放性薬剤として調製するための方法も公知であり、これらは本開示の抗原結合分子に適用することができる(J. Biomed. Mater. Res. (1981) 15, 267-277; Chemtech. (1982) 12, 98-105;米国特許第3773719号;欧州特許出願 (EP)番号EP58481およびEP133988;Biopolymers (1983) 22, 547-556)。 If necessary, the antigen-binding molecules or antibodies of the present disclosure may be encapsulated in microcapsules (microcapsules made of hydroxymethylcellulose, gelatin, poly[methyl methacrylate], etc.) or may be components of colloidal drug delivery systems (liposomes, albumin microspheres, microemulsions, nanoparticles, and nanocapsules) (see, for example, "Remington's Pharmaceutical Science 16th edition", Oslo Ed. (1980)). In addition, methods for preparing drugs as sustained-release drugs are also known and can be applied to the antigen-binding molecules of the present disclosure (J. Biomed. Mater. Res. (1981) 15, 267-277; Chemtech. (1982) 12, 98-105; U.S. Patent No. 3,773,719; European Patent Application (EP) Nos. EP58481 and EP133988; Biopolymers (1983) 22, 547-556).

本開示の医薬組成物、細胞増殖抑制剤、または抗がん剤は、経口または非経口のいずれかで患者に投与され得る。非経口投与が好ましい。具体的には、そのような投与法には、注射、経鼻投与、経肺投与、および経皮投与が含まれる。注射には、例えば、静脈内注射、筋肉内注射、腹腔内注射、および皮下注射が含まれる。例えば、本開示の医薬組成物、細胞傷害を誘導するための治療剤、細胞増殖抑制剤、または抗がん剤は、注射により局所的にまたは全身的に投与することができる。さらに、適切な投与方法が患者の年齢および症状に応じて選択することができる。投与用量は、例えば、各投与につき体重1 kgあたり0.0001 mg~1,000 mgの範囲から選択することができる。あるいは、用量は、例えば、1患者あたり0.001 mg~100,000 mgの範囲から選択することができる。しかしながら、本開示の医薬組成物の用量は、これらの用量に限定されない。 The pharmaceutical composition, cell proliferation inhibitor, or anticancer agent of the present disclosure may be administered to a patient either orally or parenterally. Parenteral administration is preferred. Specifically, such administration methods include injection, nasal administration, pulmonary administration, and transdermal administration. Injection includes, for example, intravenous injection, intramuscular injection, intraperitoneal injection, and subcutaneous injection. For example, the pharmaceutical composition, therapeutic agent for inducing cell damage, cell proliferation inhibitor, or anticancer agent of the present disclosure may be administered locally or systemically by injection. Furthermore, an appropriate administration method may be selected according to the age and symptoms of the patient. The administration dose may be selected, for example, from the range of 0.0001 mg to 1,000 mg per kg of body weight for each administration. Alternatively, the dose may be selected, for example, from the range of 0.001 mg to 100,000 mg per patient. However, the dose of the pharmaceutical composition of the present disclosure is not limited to these doses.

好ましくは、本開示の医薬組成物は、本明細書において記載されるような抗原結合分子または抗体を含む。1つの局面において、組成物は、細胞傷害を誘導することにおいて使用するための医薬組成物である。別の局面において、組成物は、がんを治療または予防することにおいて使用するための医薬組成物である。好ましくは、がんは、肺がん(小細胞肺がんを含む)および黒色腫であるか、またはDLL3を発現する神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)もしくは神経内分泌がん(NEC)、またはDLL3を発現する非神経内分泌起源の他の固形腫瘍を含む。いくつかの好ましい態様において、がんの例としては、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)もしくは大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC);または他の固形腫瘍、例えば、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、甲状腺髄様がんが挙げられる。好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、肺がん、好ましくは SCLCである。別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、神経膠腫または膠芽腫(GBM)である。別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は神経内分泌前立腺がんである。本開示の医薬組成物は、がんを治療または予防するために用いることができる。したがって、本開示は、その必要がある患者に本願明細書に記載される抗原結合分子または抗体が投与される、がんを治療または予防するための方法を提供する。 Preferably, the pharmaceutical composition of the present disclosure comprises an antigen-binding molecule or antibody as described herein. In one aspect, the composition is a pharmaceutical composition for use in inducing cytotoxicity. In another aspect, the composition is a pharmaceutical composition for use in treating or preventing cancer. Preferably, the cancer is lung cancer (including small cell lung cancer) and melanoma, or includes neuroendocrine neoplasms (NENs), neuroendocrine tumors (NETs) or neuroendocrine carcinomas (NECs) that express DLL3, or other solid tumors of non-neuroendocrine origin that express DLL3. In some preferred embodiments, examples of cancer include pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NEC (SCNEC) or large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine cancer, medullary thyroid cancer (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC); or other solid tumors, such as neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, medullary thyroid cancer. In a preferred embodiment, the tumor or cancer disease is lung cancer, preferably SCLC. In another preferred embodiment, the tumor or cancer disease is glioma or glioblastoma (GBM). In another preferred embodiment, the tumor or cancer disease is neuroendocrine prostate cancer. The pharmaceutical composition of the present disclosure can be used to treat or prevent cancer. Thus, the present disclosure provides a method for treating or preventing cancer, in which an antigen binding molecule or antibody described herein is administered to a patient in need thereof.

本開示はまた、DLL3を発現する細胞を、DLL3に結合する本開示の抗原結合分子と接触させることによって、DLL3を発現する細胞を損傷するための、または細胞増殖を抑制するための方法も提供する。本開示の抗原結合分子が結合する細胞は、それがDLL3を発現する限り、特に限定されない。具体的には、本開示において、好ましいDLL3発現細胞は、肺がん(小細胞肺がんを含む)および黒色腫を含むか、またはDLL3を発現する神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)もしくは神経内分泌がん(NEC)、またはDLL3を発現する非神経内分泌起源の他の固形腫瘍を含む。いくつかの好ましい態様において、がんの例としては、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)もしくは大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC);または他の固形腫瘍、例えば、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、甲状腺髄様がんが挙げられる。好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、肺がん、好ましくは SCLCである。別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、神経膠腫または膠芽腫(GBM)である。別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は神経内分泌前立腺がんである。 The present disclosure also provides a method for damaging cells expressing DLL3 or inhibiting cell proliferation by contacting the cells expressing DLL3 with an antigen binding molecule of the present disclosure that binds to DLL3. The cells to which the antigen binding molecule of the present disclosure binds are not particularly limited, as long as they express DLL3. Specifically, in the present disclosure, preferred DLL3-expressing cells include lung cancer (including small cell lung cancer) and melanoma, or include neuroendocrine neoplasms (NEN), neuroendocrine tumors (NET) or neuroendocrine carcinomas (NEC) that express DLL3, or other solid tumors of non-neuroendocrine origin that express DLL3. In some preferred embodiments, examples of cancer include pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NEC (SCNEC) or large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine cancer, medullary thyroid cancer (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC); or other solid tumors, such as neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, medullary thyroid cancer. In a preferred embodiment, the tumor or cancer disease is lung cancer, preferably SCLC. In another preferred embodiment, the tumor or cancer disease is glioma or glioblastoma (GBM). In another preferred embodiment, the tumor or cancer disease is neuroendocrine prostate cancer.

本開示において、「接触」は、例えば、in vitroで培養されたDLL3を発現する細胞の培地に本開示の抗原結合分子を添加することによって行うことができる。この場合、添加すべき抗原結合分子は、溶液、または凍結乾燥等によって調製された固体などの適切な形態で用いることができる。本開示の抗原結合分子を水溶液として添加する場合、該溶液は、抗原結合分子を単独で含有する純粋な水溶液、または例えば上記の界面活性剤、賦形剤、着色剤、着香剤、保存剤、安定化剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、流動性促進剤、および矯味剤を含有する溶液であってよい。添加濃度は特に限定されない;しかしながら、培地中の最終濃度は、好ましくは1 pg/ml~1 g/mlの範囲内、より好ましくは1 ng/ml~1 mg/ml、およびさらにより好ましくは1μg/ml~1 mg/mlの範囲内である。 In the present disclosure, "contact" can be performed, for example, by adding the antigen-binding molecule of the present disclosure to the medium of cells expressing DLL3 cultured in vitro. In this case, the antigen-binding molecule to be added can be used in an appropriate form, such as a solution or a solid prepared by lyophilization or the like. When the antigen-binding molecule of the present disclosure is added as an aqueous solution, the solution may be a pure aqueous solution containing the antigen-binding molecule alone, or a solution containing, for example, the above-mentioned surfactants, excipients, colorants, flavoring agents, preservatives, stabilizers, buffers, suspending agents, isotonicity agents, binders, disintegrants, lubricants, flow enhancers, and flavoring agents. The concentration of the added agent is not particularly limited; however, the final concentration in the medium is preferably within the range of 1 pg/ml to 1 g/ml, more preferably 1 ng/ml to 1 mg/ml, and even more preferably 1 μg/ml to 1 mg/ml.

本開示の別の態様において、「接触」はまた、in vivoでDLL3発現細胞を移植された非ヒト動物、またはDLL3を内因的に発現するがん細胞を有する動物に投与することによって行うこともできる。投与方法は、経口または非経口であってよい。非経口投与が特に好ましい。具体的には、非経口投与方法には、注射、経鼻投与、経肺投与、および経皮投与が含まれる。注射には、例えば、静脈内注射、筋肉内注射、腹腔内注射、および皮下注射が含まれる。例えば、本開示の医薬組成物、細胞傷害を誘導するための治療剤、細胞増殖抑制剤、または抗がん剤は、注射によって局所投与または全身投与することができる。さらに、適切な投与方法は、動物対象の年齢および症状に応じて選択することができる。
抗原結合分子を水溶液として投与する場合、該溶液は、抗原結合分子を単独で含有する純粋な水溶液、または例えば上記の界面活性剤、賦形剤、着色剤、着香剤、保存剤、安定化剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、流動性促進剤、および矯味剤を含有する溶液であってよい。投与用量は、例えば、各投与につき体重1 kgあたり0.0001~1,000 mgの範囲から選択することができる。あるいは、用量は、例えば、各患者につき0.001~100,000 mgの範囲から選択することができる。しかしながら、本開示の抗原結合分子の用量は、これらの例に限定されない。
In another embodiment of the present disclosure, "contact" can also be performed by administration to a non-human animal transplanted with DLL3-expressing cells in vivo, or an animal with cancer cells that endogenously express DLL3. The administration method can be oral or parenteral. Parenteral administration is particularly preferred. Specifically, parenteral administration methods include injection, intranasal administration, pulmonary administration, and transdermal administration. Injection includes, for example, intravenous injection, intramuscular injection, intraperitoneal injection, and subcutaneous injection. For example, the pharmaceutical composition of the present disclosure, the therapeutic agent for inducing cell damage, the cell proliferation inhibitor, or the anticancer agent can be administered locally or systemically by injection. Furthermore, the appropriate administration method can be selected according to the age and symptoms of the animal subject.
When the antigen-binding molecule is administered as an aqueous solution, the solution may be a pure aqueous solution containing the antigen-binding molecule alone, or a solution containing, for example, the above-mentioned surfactants, excipients, colorants, flavoring agents, preservatives, stabilizers, buffers, suspending agents, isotonicity agents, binders, disintegrants, lubricants, flow enhancers, and flavoring agents. The administration dose can be selected, for example, from the range of 0.0001 to 1,000 mg per kg of body weight per administration. Alternatively, the dose can be selected, for example, from the range of 0.001 to 100,000 mg per patient. However, the dose of the antigen-binding molecule of the present disclosure is not limited to these examples.

本開示はまた、本開示の抗原結合分子または本開示の方法によって産生された抗原結合分子を含有する、本開示の方法において使用するためのキットも提供する。該キットは、追加の薬学的に許容される担体もしくは媒体、またはキットの使用方法を記載した取扱説明書等と共に包装され得る。 The present disclosure also provides a kit for use in the method of the present disclosure, containing an antigen-binding molecule of the present disclosure or an antigen-binding molecule produced by the method of the present disclosure. The kit may be packaged with additional pharma- ceutically acceptable carriers or vehicles, or instructions for use of the kit, etc.

本発明の別の局面において、上述の障害の治療、予防、および/または診断に有用な器材を含んだ製品が、提供される。製品は、容器、および当該容器上のラベルまたは当該容器に付属する添付文書を含む。好ましい容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどが含まれる。容器類は、ガラスやプラスチックなどの、様々な材料から形成されていてよい。容器は組成物を単体で保持してもよいし、症状の治療、予防、および/または診断のために有効な別の組成物と組み合わせて保持してもよく、また、無菌的なアクセスポートを有していてもよい(例えば、容器は、皮下注射針によって突き通すことのできるストッパーを有する静脈内投与用溶液バッグまたはバイアルであってよい)。組成物中の少なくとも1つの有効成分は、本発明の抗体である。
ラベルまたは添付文書は、組成物が選ばれた症状を治療するために使用されるものであることを示す。さらに製品は、(a)第1の容器であって、その中に収められた本発明の抗体を含む組成物を伴う、第1の容器;および、(b)第2の容器であって、その中に収められたさらなる細胞傷害剤またはそれ以外で治療的な剤を含む組成物を伴う、第2の容器を含んでもよい。本発明のこの態様における製品は、さらに、組成物が特定の症状を治療するために使用され得ることを示す、添付文書を含んでもよい。あるいはまたは加えて、製品はさらに、注射用制菌水 (BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンガー溶液、およびデキストロース溶液などの、薬学的に許容される緩衝液を含む、第2の(または第3の)容器を含んでもよい。他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、およびシリンジなどの、他の商業的観点またはユーザの立場から望ましい器材をさらに含んでもよい。
In another aspect of the present invention, an article of manufacture is provided that includes materials useful for the treatment, prevention, and/or diagnosis of the above-mentioned disorders. The article of manufacture includes a container and a label on the container or a package insert associated with the container. Preferred containers include, for example, bottles, vials, syringes, IV solution bags, and the like. The containers may be formed from a variety of materials, such as glass or plastic. The container may hold the composition alone or in combination with another composition effective for the treatment, prevention, and/or diagnosis of a condition, and may have a sterile access port (e.g., the container may be an intravenous solution bag or vial with a stopper that can be pierced by a hypodermic needle). At least one active ingredient in the composition is an antibody of the present invention.
The label or package insert indicates that the composition is used to treat a selected condition. The article of manufacture may further comprise (a) a first container with a composition comprising an antibody of the invention contained therein; and (b) a second container with a composition comprising an additional cytotoxic or otherwise therapeutic agent contained therein. The article of manufacture in this aspect of the invention may further comprise a package insert indicating that the composition may be used to treat a particular condition. Alternatively or additionally, the article of manufacture may further comprise a second (or third) container comprising a pharma- ceutically acceptable buffer, such as bacteriostatic water for injection (BWFI), phosphate buffered saline, Ringer's solution, and dextrose solution. It may further comprise other equipment desirable from a commercial or user standpoint, such as other buffers, diluents, filters, needles, and syringes.

添付文書
用語「添付文書」は、治療用製品の市販パッケージに通常含まれる説明書を指すために用いられ、そのような治療用製品の使用に関する適応症、用法、投与量、投与方法、併用療法、禁忌、および/または警告についての情報を含む。
Package Insert The term "package insert" is used to refer to instructions typically included in the commercial packaging of a therapeutic product, which contain information about the indications, usage, dosage, method of administration, concomitant therapy, contraindications, and/or warnings regarding the use of such therapeutic product.

医薬製剤
用語「医薬製剤」または「医薬組成物」は、その中に含まれた有効成分の生物学的活性が効果を発揮し得るような形態にある調製物であって、かつ製剤が投与される対象に許容できない程度に毒性のある追加の要素を含んでいない、調製物を指す。
Pharmaceutical Formulations The term "pharmaceutical formulation" or "pharmaceutical composition" refers to a preparation in a form such that the biological activity of the active ingredients contained therein can be effective, and which does not contain additional components that are unacceptably toxic to the subject to which the formulation is administered.

薬学的に許容される担体
「薬学的に許容される担体」は、対象に対して無毒な、医薬製剤中の有効成分以外の成分を指す。薬学的に許容される担体は、これらに限定されるものではないが、緩衝液、賦形剤、安定化剤、または保存剤を含む。
Pharmaceutically acceptable carrier : A "pharmaceutically acceptable carrier" refers to an ingredient, other than an active ingredient, in a pharmaceutical formulation that is non-toxic to a subject. Pharmaceutically acceptable carriers include, but are not limited to, buffers, excipients, stabilizers, or preservatives.

治療
本明細書で用いられる「治療」(および、その文法上の派生語、例えば「治療する」、「治療すること」など)は、治療される個体の自然経過を改変することを企図した臨床的介入を意味し、予防のためにも、臨床的病態の経過の間にも実施され得る。治療の望ましい効果は、これらに限定されるものではないが、疾患の発生または再発の防止、症状の軽減、疾患による任意の直接的または間接的な病理的影響の減弱、転移の防止、疾患の進行速度の低減、疾患状態の回復または緩和、および寛解または改善された予後を含む。いくつかの態様において、本開示の抗原結合分子または抗体は、疾患の発症を遅らせる、または疾患の進行を遅くするために用いられる。
Treatment As used herein, "treatment" (and its grammatical derivatives, such as "treat", "treating", etc.) refers to a clinical intervention intended to modify the natural course of the individual being treated, and may be performed for prophylaxis or during the course of a clinical condition. Desirable effects of treatment include, but are not limited to, prevention of disease onset or recurrence, relief of symptoms, attenuation of any direct or indirect pathological effects of the disease, prevention of metastasis, reduction in the rate of disease progression, amelioration or palliation of the disease state, and remission or improved prognosis. In some embodiments, the antigen binding molecules or antibodies of the present disclosure are used to delay the onset of disease or slow the progression of disease.

がん
用語「がん」および「がん性」は、調節されない細胞成長/増殖によって典型的に特徴づけられる哺乳動物における生理学的状態を指すまたは説明するものである。特定の態様において、がんは、DLL3を発現する神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)もしくは神経内分泌がん(NEC)、またはDLL3を発現する非神経内分泌起源の他の固形腫瘍を含むDLL3発現がんまたはDLL3陽性がんである。いくつかの態様において、がんの例としては、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)もしくは大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC);または他の固形腫瘍、例えば、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、甲状腺髄様がんが挙げられる。本発明の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、肺がん、好ましくは SCLCである。本発明の別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は、神経膠腫または膠芽腫(GBM)である。本発明の別の好ましい態様において、腫瘍またはがん疾患は神経内分泌前立腺がんである。
The terms "cancer" and "cancerous" refer to or describe a physiological condition in mammals that is typically characterized by unregulated cell growth/proliferation. In certain embodiments, the cancer is a DLL3-expressing or DLL3-positive cancer, including neuroendocrine neoplasms (NENs), neuroendocrine tumors (NETs) or neuroendocrine carcinomas (NECs) that express DLL3, or other solid tumors of non-neuroendocrine origin that express DLL3. In some embodiments, examples of cancer include pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NECs (SCNECs) or large cell NECs (LCNECs), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC); or other solid tumors, such as neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, medullary thyroid carcinoma. In a preferred embodiment of the present invention, the tumor or cancer disease is lung cancer, preferably SCLC.In another preferred embodiment of the present invention, the tumor or cancer disease is glioma or glioblastoma (GBM).In another preferred embodiment of the present invention, the tumor or cancer disease is neuroendocrine prostate cancer.

腫瘍
用語「腫瘍」は、悪性か良性かによらず、すべての新生物性細胞成長および増殖ならびにすべての前がん性およびがん性細胞および組織を指す。用語「がん」、「がん性」、「細胞増殖性障害」、「増殖性障害」および「腫瘍」は、本明細書でいう場合、相互に排他的でない。
The term "tumor" refers to all neoplastic cell growth and proliferation, whether malignant or benign, and all pre-cancerous and cancerous cells and tissues. The terms " cancer ,""cancerous,""cell proliferative disorder,""proliferativedisorder," and "tumor" are not mutually exclusive as used herein.

他の剤および治療
本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、治療において1つまたは複数の他の剤との組み合わせで投与されてもよい。例えば、本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、少なくとも1つの追加の治療剤と同時投与されてもよい。用語「治療剤」は、そのような治療の必要がある個体において症状または疾患を治療するために投与される任意の剤を包含する。そのような追加治療剤は、治療される特定の適応症に適している任意の有効成分、好ましくは、互いに悪影響を与えあわない相補的な活性を伴うものを含み得る。特定の態様において、追加治療剤は、免疫治療剤、細胞分裂阻害剤、細胞接着の阻害剤、細胞傷害剤、細胞アポトーシスの活性化剤、またはアポトーシス誘導因子に対する細胞の感受性を増加させる剤である。
Other Agents and Treatment The multispecific antigen-binding molecules described herein may be administered in combination with one or more other agents in treatment. For example, the multispecific antigen-binding molecules described herein may be co-administered with at least one additional therapeutic agent. The term "therapeutic agent" includes any agent administered to treat a condition or disease in an individual in need of such treatment. Such additional therapeutic agents may include any active ingredient that is suitable for the particular indication being treated, preferably with complementary activities that do not adversely affect each other. In certain embodiments, the additional therapeutic agent is an immunotherapeutic agent, a cytostatic agent, an inhibitor of cell adhesion, a cytotoxic agent, an activator of cell apoptosis, or an agent that increases the sensitivity of cells to apoptosis inducers.

上記態様の特定の態様において、追加の治療剤は免疫療法剤である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、免疫応答を調節する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、抗腫瘍免疫応答を増強する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、細胞媒介性免疫を増加させる作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、T細胞活性を増加させる作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、細胞溶解性T細胞(CTL)活性を増加させる作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、NK細胞活性を増加させる作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、免疫応答の抑制を抑制する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、サプレッサー細胞を阻害するかまたは細胞の活性を抑制する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、Treg活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、MDSC活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、抑制性免疫チェックポイント受容体の活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、PD-1の活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、PD-L1および/またはPD-L2の活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、CTLA-4の活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、CD80および/またはCD86の活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、TIGITの活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、KIRの活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、IDO 1の活性を阻害する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、免疫チェックポイント受容体を活性化する活性を増強または刺激する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、GITRの活性を増強または刺激する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、OX 40の活性を増強または刺激する作用物質である。いくつかの態様において、免疫療法剤は、CD40の活性を増強または刺激する作用物質である。 In certain of the above embodiments, the additional therapeutic agent is an immunotherapeutic agent. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that modulates an immune response. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that enhances an anti-tumor immune response. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that increases cell-mediated immunity. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that increases T cell activity. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that increases cytolytic T cell (CTL) activity. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that increases NK cell activity. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits suppression of an immune response. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits suppressor cells or inhibits the activity of cells. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits Treg activity. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits MDSC activity. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of an inhibitory immune checkpoint receptor. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of PD-1. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of PD-L1 and/or PD-L2. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of CTLA-4. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of CD80 and/or CD86. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of TIGIT. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of KIR. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that inhibits the activity of IDO 1. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that enhances or stimulates the activity of activating immune checkpoint receptors. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that enhances or stimulates the activity of GITR. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that enhances or stimulates the activity of OX 40. In some embodiments, the immunotherapeutic agent is an agent that enhances or stimulates the activity of CD40.

本明細書において記載されるいくつかの態様において、免疫療法剤は、PD-1アンタゴニスト、PD-L1アンタゴニスト、PD-L2アンタゴニスト、CTLA-4アンタゴニスト、CD80アンタゴニスト、CD86アンタゴニスト、TIGITアンタゴニスト、KIRアンタゴニスト、Tim-3アンタゴニスト、LAG3アンタゴニスト、CD96アンタゴニスト、CD20アンタゴニスト、またはIDO1アンタゴニストである。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1に特異的に結合する抗体である。いくつかの態様において、PD-1に結合する抗体は、ペムブロリズマブ、ピディリズマブ(ピディリズマブ)(CT-011)、またはニモツズマブ(ニボルマブ)である。いくつかの態様において、PD-L1アンタゴニストは、PD-L1に特異的に結合する抗体である。いくつかの態様において、PD-L1に結合する抗体は、アテゾリズマブ、デュルバルマブ(MEDI4736)、またはBMS-936559である。いくつかの態様において、CTLA-4アンタゴニストは、CTLA-4に特異的に結合する抗体である。いくつかの態様において、CTLA-4に結合する抗体は、イピリムマブまたはトレメリムマブ(トレメリムマブ)(CP-675、206)である。いくつかの態様において、KIRアンタゴニストは、KIRに特異的に結合する抗体である。いくつかの態様において、KIRに結合する抗体は、リツキシマブ(リリルマブ)である。本明細書において記載される方法のいくつかの態様において、免疫療法剤は、CD28アゴニスト、4-1BBアゴニスト、OX40アゴニスト、CD27アゴニスト、CD80アゴニスト、CD86アゴニスト、CD40アゴニスト、またはGITRアゴニストである。本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子は、適切なまたは必要な場合には、T細胞エンゲージャーおよびCAR-T細胞などのT細胞関連治療剤の一般的な有害事象であるサイトカイン放出症候群(CRS)を制御するために、ステロイドまたは他の抗体医薬、例えばトシリズマブとの組み合わせで投与されてもよい。 In some embodiments described herein, the immunotherapeutic agent is a PD-1 antagonist, a PD-L1 antagonist, a PD-L2 antagonist, a CTLA-4 antagonist, a CD80 antagonist, a CD86 antagonist, a TIGIT antagonist, a KIR antagonist, a Tim-3 antagonist, a LAG3 antagonist, a CD96 antagonist, a CD20 antagonist, or an IDO1 antagonist. In some embodiments, the PD-1 antagonist is an antibody that specifically binds to PD-1. In some embodiments, the antibody that binds to PD-1 is pembrolizumab, pidilizumab (CT-011), or nimotuzumab (nivolumab). In some embodiments, the PD-L1 antagonist is an antibody that specifically binds to PD-L1. In some embodiments, the antibody that binds to PD-L1 is atezolizumab, durvalumab (MEDI4736), or BMS-936559. In some embodiments, the CTLA-4 antagonist is an antibody that specifically binds to CTLA-4. In some embodiments, the antibody that binds to CTLA-4 is ipilimumab or tremelimumab (tremelimumab) (CP-675, 206). In some embodiments, the KIR antagonist is an antibody that specifically binds to KIR. In some embodiments, the antibody that binds to KIR is rituximab (lirilumab). In some embodiments of the methods described herein, the immunotherapeutic agent is a CD28 agonist, a 4-1BB agonist, an OX40 agonist, a CD27 agonist, a CD80 agonist, a CD86 agonist, a CD40 agonist, or a GITR agonist. The multispecific antigen-binding molecules described herein may be administered, where appropriate or necessary, in combination with steroids or other antibody drugs, such as tocilizumab, to control cytokine release syndrome (CRS), a common adverse event of T cell-related therapeutics such as T cell engagers and CAR-T cells.

化学療法剤
上記態様の特定の態様において、追加の治療剤は、化学療法剤、例えば、微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、または抗血管新生剤である。「化学療法剤」は、がんの治療に有用な化学化合物を指す。化学療法剤の例としては、アルキル化剤、例えば、チオテパおよびシクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標));アルキルスルホン酸塩類、例えば、ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン;アジリジン類、例えば、ベンゾドーパ(benzodopa)、カルボコン、メツレドーパ(meturedopa)、およびウレドーパ(uredopa);アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミドおよびトリメチロールメラミン(trimethylomelamine)を含むエチレンイミン類およびメチロールメラミン類;アセトゲニン類(特に、ブラタシンおよびブラタシノン);デルタ-9-テトラヒドロカンナビノール(ドロナビノール、MARINOL(登録商標));β-ラパコン;ラパコール;コルヒチン;ベツリン酸;カンプトテシン(合成類似体トポテカン(HYCAMTIN(登録商標)を含む)、CPT-11(イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、アセチルカンプトテシン、スコポレクチン(scopolectin)、および9-アミノカンプトテシン);ブリオスタチン;カリスタチン; CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシンおよびビゼレシン合成類似体を含む);ポドフィロトキシン;ポドフィリン酸;テニポシド;クリプトフィシン(特にクリプトフィシン1およびクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成類似体、KW-2189およびCB1-TM1を含む);エロイテロビン;パンクラチスタチン;サルコジクチイン;スポンギスタチン;ナイトロジェンマスタード類、例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド(chlorophosphamide)、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩(mechlorethamine oxide hydrochloride)、メルファラン、ノブエンビキン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード;ニトロソ尿素、例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、ホテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、およびラニムスチン;抗生物質、例えば、エンジイン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケアマイシンγ1IおよびカリケアマイシンωI1(例えば、Nicolaou et al., Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)を参照); CDP323、経口α-4インテグリン阻害剤;ジネミシンAを含むジネミシン、;エスペラマイシン;ならびにネオカルジノスタチンクロモホアおよび関連する色素タンパク質エンジイン抗生物質クロモホア)、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、アントラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン(cactinomycin)、カルビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、モルホリノドキソルビシン、シアノモルホリノドキソルビシン、2-ピロリノドキソルビシン、ドキソルビシンHClリポソーム注射(DOXIL(登録商標))、リポソームドキソルビシンTLC D-99(MYOCET(登録商標)を含む)、ペグ化リポソームドキソルビシン(CAELYX(登録商標))、およびデオキシドキソルビシノン)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン類、例えば、マイトマイシンC、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン類、ペプロマイシン、ポルフィロマイシン、ピューロマイシン、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン;代謝拮抗剤、例えば、メトトレキサート、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、テガフール(UFTORAL(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、エポチロン、および5-フルオロウラシル(5-FU);葉酸類似体、例えば、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン(pteropterin)、トリメトレキサート;プリン類似体、例えば、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン;ピリミジン類似体、例えば、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロキシウリジン;アンドロゲン類、例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン;抗副腎剤(anti-adrenals)、例えば、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン;葉酸補充剤(folic acid replenisher)、例えば、ホリン酸;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド(aldophosphamide glycoside);アミノレブリン酸;エニルウラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトレキサート;デフォファミン(defofamine);デメコルシン;ジアジクオン;エフロルニチン(elfornithine);エリプチニウムアセタート;エポチロン;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダミン;メイタンシノイド、例えば、メイタンシンおよびアンサミトシン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモール;ニトラエリン(nitraerine);ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ロソキサントロン;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン; PSK(登録商標)多糖類複合体(JHS Natural Products, Eugene、OR);ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクオン;2,2’,2’-トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン類(特にT-2トキシン、ベルカリンA(verracurin A)、ロリジンAおよびアングイジン);ウレタン;ビンデシン(ELDISINE(登録商標)、FILDESIN(登録商標));ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン(gacytosine);アラビノシド(「Ara-C」);チオテパ;タキソイド、例えば、パクリタキセル(TAXOL(登録商標))、パクリタキセルのアルブミンで改変したナノ粒子製剤(ABRAXANE(商標))、およびドセタキセル(TAXOTERE(登録商標));クロラムブシル;6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;白金製剤、例えば、シスプラチン、オキサリプラチン(例えば、ELOXATIN(登録商標))、およびカルボプラチン;ビンブラスチン(VELBAN(登録商標))、ビンクリスチン(ONCOVIN(登録商標))、ビンデシン(ELDISINE(登録商標)、FILDESIN(登録商標))、およびビノレルビン(NAVELBINE(登録商標))を含む、微小管を形成しないようにチューブリン重合を妨げる、ビンカ系;エトポシド(VP-16);イホスファミド;ミトキサントロン;ロイコボリン;ノバントロン;エダトレキサート;ダウノマイシン;アミノプテリン;イバンドロナート;トポイソメラーゼ阻害剤RFS 2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイド、例えば、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))を含むレチノイン酸;ビスホスホナート類、例えば、クロドロナート(例えば、BONEFOS(登録商標)またはOSTAC(登録商標))、エチドロナート(DIDROCAL(登録商標))、NE-58095、ゾレドロン酸/ゾレドロナート(ZOMETA(登録商標))、アレンドロナート(FOSAMAX(登録商標))、パミドロナート(AREDIA(登録商標))、チルドロナート(SKELID(登録商標))、またはリセドロナート(ACTONEL(登録商標));トロキサシタビン(a1,3-ジオキソランヌクレオシドシトシン類似体);アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に、異常な細胞増殖に関与するシグナル伝達経路での遺伝子、例えば、PKC-アルファ、Raf、H-Ras、および上皮増殖因子受容体(EGF-R)などの発現を阻害するもの;ワクチン、例えば、THERATOPE(登録商標)ワクチンおよび遺伝子療法ワクチン、例えば、ALLOVECTIN(登録商標)ワクチン、LEUVECTIN(登録商標)ワクチン、およびVAXID(登録商標)ワクチン;トポイソメラーゼ1阻害剤(例えば、LURTOTECAN(登録商標));rmRH(例えば、ABARELIX(登録商標));BAY439006(ソラフェニブ;Bayer);SU-11248(スニチニブ、SUTENT(登録商標)、Pfizer);ペリホシン、COX-2阻害剤(例えば、セレコキシブまたはエトリコキシブ)、プロテオソーム阻害剤(例えば、PS341);ボルテゾミブ(VELCADE(登録商標));CCI-779;チピファルニブ(R11577); ソラフェニブ、ABT510;Bcl-2阻害剤、例えば、オブリメルセンナトリウム(GENASENSE(登録商標));ピキサントロン;EGFR阻害剤(下記定義を参照);チロシンキナーゼ阻害剤(下記定義を参照);セリン-スレオニンキナーゼ阻害剤、例えば、ラパマイシン(シロリムス、RAPAMUNE(登録商標));ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、例えば、ロナファルニブ(SCH 6636、SARASAR(商標));ルルビネクテジンまたはアムルビシン;および上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体;ならびに上記の2以上の組み合わせ、例えば、シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、およびプレドニゾロンの組み合わせ療法の略称である、CHOP;および5-FUおよびロイコボリンと組み合わせたオキサリプラチン(ELOXATIN(商標))による治療レジメンの略称であるFOLFOXが挙げられる。
Chemotherapeutic Agents In certain of the above embodiments, the additional therapeutic agent is a chemotherapeutic agent, e.g., a microtubule disrupting agent, antimetabolite, topoisomerase inhibitor, DNA intercalator, alkylating agent, hormonal therapy, kinase inhibitor, receptor antagonist, activator of tumor cell apoptosis, or antiangiogenic agent. "Chemotherapeutic agent" refers to a chemical compound useful in the treatment of cancer. Examples of chemotherapeutic agents include alkylating agents, e.g., thiotepa and cyclophosphamide (CYTOXAN®); alkylsulfonates, e.g., busulfan, improsulfan, and piposulfan; aziridines, e.g., benzodopa, carboquone, meturedopa, and uredopa; altretamine, triethylenemelamine, triethylenephosphoramide, triethylenethiophosphoramide, and trimethylomelamine. ethylenimines and methylolmelamines, including; acetogenins (especially bullatasin and bullatasinone); delta-9-tetrahydrocannabinol (dronabinol, MARINOL®); beta-lapachone; lapachol; colchicine; betulinic acid; camptothecins (including the synthetic analogs topotecan (HYCAMTIN®), CPT-11 (irinotecan, CAMPTOSAR®), acetylcamptothecin, scopolectin, and 9-aminocamptothecin); bryostatin; kallistatin; CC-1065 (including its adozelesin, carzelesin, and bizelesin synthetic analogs); podophyllotoxin; podophyllic acid; teniposide; cryptophycins (especially cryptophycin 1 and cryptophycin 8); dolastatins; duocarmycins (including synthetic analogs, KW-2189 and CB1-TM1); elatherobin; pancratistatin; sarcodictyin; spongistatin; nitrogen mustards, e.g., chlorambucil, chlornaphazine, chlorophosphamide, estramustine, ifosfamide, mechlorethamine, mechlorethamine oxide hydrochloride. hydrochloride), melphalan, nobuenbiquine, phenesterine, prednimustine, trofosfamide, uracil mustard; nitrosoureas, e.g., carmustine, chlorozotocin, fotemustine, lomustine, nimustine, and ranimustine; antibiotics, e.g., enediyne antibiotics, e.g., the calicheamicins, particularly calicheamicin γ1I and calicheamicin ω11 (see, e.g., Nicolaou et al., Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)); CDP323, an oral alpha-4 integrin inhibitor; dynemicins, including dynemicin A; esperamicin; and neocarzinostatin chromophores and related chromoprotein enediyne antibiotic chromophores), aclacinomycin, actinomycin, anthramycin, azaserine, bleomycin, cactinomycin, carubicin, carminomycin, carzinophilin, chromomycin, dactinomycin, daunorubicin, detorubicin, 6-diazo-5-oxo-L-norleucine, doxorubicin (ADRIAMYCIN®), morpholinodoxorubicin, cyanomorpholinodoxorubicin, 2-pyrrolinodoxorubicin, doxorubicin HCl liposome injection (DOXIL®), liposomal doxorubicin TLC D-99 (including MYOCET®), pegylated liposomal doxorubicin (CAELYX®), and deoxydoxorubicinone), epirubicin, esorubicin, idarubicin, marcelomycin, mitomycins such as mitomycin C, mycophenolic acid, nogalamycin, olivomycins, peplomycin, porfiromycin, puromycin, quelamycin, rodorubicin, streptonigrin, streptozocin, tubercidin, ubenimex, zinostatin, zorubicin; antimetabolites such as methotrexate, gemcitabine (GEMZAR®), tegafur (UFTORAL®), capecitabine (XELODA®), (registered trademark), epothilones, and 5-fluorouracil (5-FU); folic acid analogues such as denopterin, methotrexate, pteropterin, trimetrexate; purine analogues such as fludarabine, 6-mercaptopurine, thiamiprine, thioguanine; pyrimidine analogues such as ancitabine, azacitidine, 6-azauridine, carmofur, cytarabine, dideoxyuridine, doxifluridine, enocitabine, floxuridine; androgens such as calsterone, dromostanolone propionate, epithiostanol, mepitiostane, testolactone; anti-adrenals such as aminoglutethimide, mitotane, trilostane; folic acid supplements acid replenishers), such as folinic acid; aceglatone; aldophosphamide glycoside; aminolevulinic acid; eniluracil; amsacrine; bestravcil; bisantrene; edatrexate; defofamine; demecolcine; diaziquone; elfornithine; elliptinium acetate; epothilone; etoglucide; gallium nitrate; hydroxyurea; lentinan; lonidamine; maytansinoids, such as maytansine and ansamitocin; mitoguazone; mitoxantrone; mopidamol; nitraerine; pentostatin; phenamet; pirarubicin; rosoxantrone; 2-ethylhydrazide; procarbazine; PSK® polysaccharide complex (JHS Natural Products, Eugene, OR); razoxane; rhizoxin; schizophyllan; spirogermanium; tenuazonic acid; triaziquone; 2,2',2'-trichlorotriethylamine; trichothecenes (especially T-2 toxin, verracurin A) A), Roridin A, and Anguidine); urethane; vindesine (ELDISINE®, FILDESIN®); dacarbazine; mannommustine; mitobronitol; mitolactol; pipobroman; gacytosine; arabinoside ("Ara-C");thiotepa; taxoids such as paclitaxel (TAXOL®), albumin modified nanoparticle formulations of paclitaxel (ABRAXANE™), and docetaxel (TAXOTERE®); chlorambucil; 6-thioguanine; mercaptopurine; methotrexate; platinum agents such as cytosine; vincas, which block tubulin polymerization so that it does not form microtubules, including suplatin, oxaliplatin (e.g., ELOXATIN®), and carboplatin; vinblastine (VELBAN®), vincristine (ONCOVIN®), vindesine (ELDISINE®, FILDESIN®), and vinorelbine (NAVELBINE®); etoposide (VP-16); ifosfamide; mitoxantrone; leucovorin; novantrone; edatrexate; daunomycin; aminopterin; ibandronate; topoisomerase inhibitors RFS 2000; difluoromethylornithine (DMFO); retinoids, such as retinoic acid, including bexarotene (TARGRETIN®); bisphosphonates, such as clodronate (e.g., BONEFOS® or OSTAC®), etidronate (DIDROCAL®), NE-58095, zoledronic acid/zoledronate (ZOMETA®), alendronate (FOSAMAX®), pamidronate (AREDIA®), tiludronate (SKELID®), or risedronate (ACTONEL®); troxacitabine (a 1,3-dioxolane nucleoside cytosine analog); antisense oligonucleotides, particularly those targeting genes in signal transduction pathways involved in abnormal cell proliferation, such as PKC-alpha, those that inhibit expression of Raf, H-Ras, and epidermal growth factor receptor (EGF-R); vaccines, such as THERATOOPE® vaccine and gene therapy vaccines, such as ALLOVECTIN® vaccine, LEUVECTIN® vaccine, and VAXID® vaccine; topoisomerase 1 inhibitors (e.g., LURTOTECAN®); rmRH (e.g., ABARELIX®); BAY439006 (sorafenib; Bayer); SU-11248 (sunitinib, SUTENT®, Pfizer); perifosine, COX-2 inhibitors (e.g., celecoxib or etoricoxib), proteosome inhibitors (e.g., PS341); bortezomib (VELCADE®); CCI-779; tipifarnib (R11577); sorafenib, ABT510; Bcl-2 inhibitors, e.g., oblimersen sodium (GENASENSE®); pixantrone; EGFR inhibitors (see definition below); tyrosine kinase inhibitors (see definition below); serine-threonine kinase inhibitors, e.g., rapamycin (sirolimus, RAPAMUNE®); farnesyltransferase inhibitors, e.g., lonafarnib (SCH 6636, SARASAR™); lurbinectedin or amrubicin; and pharmacologic acceptable salts, acids, or derivatives of any of the above; and combinations of two or more of the above, e.g., CHOP, which is an abbreviation for combination therapy of cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisolone; and FOLFOX, which is an abbreviation for a treatment regimen with oxaliplatin in combination with 5-FU and leucovorin (ELOXATIN™).

本明細書において定義されるような化学療法剤には、がんの成長を促進することができるホルモンの作用を制御、低減、遮断、または阻害するように機能する「抗ホルモン剤」または「内分泌治療剤」も含まれ得る。それらはホルモン自体であってもよく、これらに限定されないが、タモキシフェン(NOLVADEX(登録商標))、4-ヒドロキシタモキシフェン、トレミフェン(FARESTON(登録商標))、イドキシフェン、ドロロキシフェン、ラロキシフェン(EVISTA(登録商標))、トリオキシフェン、ケオキシフェン、および選択的エストロゲン受容体調節因子(SERM)、例えば、SERM3を含む、混合型アゴニスト/アンタゴニストプロファイルを有する抗エストロゲン薬;アゴニスト特性を有さない純粋な抗エストロゲン薬、例えば、フルベストラント(FASLODEX(登録商標))、およびEM800(そのような作用物質は、エストロゲン受容体(ER)二量体化を遮断する、DNA結合を阻害する、ERターンオーバーを増加させる、および/またはERレベルを抑制する可能性がある);ステロイド性アロマターゼ阻害剤、例えば、ホルメスタンおよびエキセメスタン(AROMASIN(登録商標))、ならびに非ステロイド性アロマターゼ阻害剤、例えば、アナストロゾール(ARIMIDEX(登録商標))、レトロゾール(FEMARA(登録商標))およびアミノグルテチミド、ならびにボロゾール(RIVISOR(登録商標))、メゲストロールアセタート(MEGASE(登録商標))、ファドロゾール、および 4(5)-イミダゾールを含む他のアロマターゼ阻害剤を含む、アロマターゼ阻害剤;リュープロリド(LUPRON(登録商標)およびELIGARD(登録商標))、ゴセレリン、ブセレリン、およびトリプトレリンを含む、黄体形成ホルモン放出ホルモンアゴニスト;プロゲスチン、例えば、メゲストロールアセタートおよび酢酸メドロキシプロゲステロン、エストロゲン、例えば、ジエチルスチルベストロールおよびプレマリン、ならびにアンドロゲン類/レチノイド類、例えば、フルオキシメステロン、オールトランスレチノイン酸およびフェンレチニドを含む、性ステロイド;オナプリストン;抗プロゲステロン;エストロゲン受容体ダウンレギュレーター(ERD);抗アンドロゲン剤、例えば、フルタミド、ニルタミドおよびビカルタミド;および上記のいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体;ならびに上記の2以上の組み合わせを含む。 Chemotherapeutic agents as defined herein may also include "anti-hormonal agents" or "endocrine therapeutic agents" that function to control, reduce, block, or inhibit the action of hormones that can promote cancer growth. They may be hormones themselves, including, but not limited to, antiestrogens with a mixed agonist/antagonist profile, including tamoxifen (NOLVADEX®), 4-hydroxytamoxifen, toremifene (FARESTON®), idoxifene, droloxifene, raloxifene (EVISTA®), trioxyfene, ketoxifene, and selective estrogen receptor modulators (SERMs), e.g., SERM3; pure antiestrogens without agonist properties, e.g., fulvestrant (FASLODEX®), and EM800 ( Such agents may block estrogen receptor (ER) dimerization, inhibit DNA binding, increase ER turnover, and/or suppress ER levels); steroidal aromatase inhibitors, such as formestane and exemestane (AROMASIN®), and nonsteroidal aromatase inhibitors, such as anastrozole (ARIMIDEX®), letrozole (FEMARA®), and aminoglutethimide, as well as vorozole (RIVISOR®), megestrol acetate (MEGASE®), fadrozole, and aromatase inhibitors, including other aromatase inhibitors including 4(5)-imidazoles; luteinizing hormone releasing hormone agonists, including leuprolide (LUPRON® and ELIGARD®), goserelin, buserelin, and triptorelin; sex steroids, including progestins, e.g., megestrol acetate and medroxyprogesterone acetate, estrogens, e.g., diethylstilbestrol and premarin, and androgens/retinoids, e.g., fluoxymesterone, all-trans retinoic acid, and fenretinide; onapristone; antiprogesterones; estrogen receptor downregulators (ERDs); antiandrogens, e.g., flutamide, nilutamide, and bicalutamide; and pharmaceutically acceptable salts, acids, or derivatives of any of the above; and combinations of two or more of the above.

そのような他の剤は、意図された目的のために有効である量で、好適に組み合わせられて存在する。そのような他の剤の有効量は、用いられる多重特異性抗原結合分子の量、障害または治療の種類、および上で論じた他の要因に依存する。多重特異性抗原結合分子は概して、本明細書に記載されるものと同じ投与量および投与経路で、または本明細書に記載される投与量の約1から99%で、または経験的/臨床的に適切と判断される任意の投与量および任意の経路で用いられる。 Such other agents are present in suitable combinations in amounts that are effective for the intended purpose. The effective amount of such other agents will depend on the amount of multispecific antigen-binding molecule used, the type of disorder or treatment, and other factors discussed above. Multispecific antigen-binding molecules are generally used in the same dosages and routes of administration as described herein, or at about 1 to 99% of the dosages described herein, or at any dosage and by any route as empirically/clinically determined to be appropriate.

上記のそのような併用療法は、併用投与(2種類以上の治療剤が同じまたは別々の組成物中に含まれている)、および個別投与を包含し、個別投与の場合、本明細書に記載される多重特異性抗原結合分子の投与が追加治療剤および/またはアジュバントの投与に先立って、と同時に、および/または、続いて、行われ得る。本明細書において記載される多重特異性抗原結合分子はまた、放射線療法との組み合わせで用いることができる。 Such combination therapy includes combined administration (wherein two or more therapeutic agents are included in the same or separate compositions) and separate administration, where administration of the multispecific antigen-binding molecules described herein may precede, be concurrent with, and/or follow administration of additional therapeutic agents and/or adjuvants. The multispecific antigen-binding molecules described herein may also be used in combination with radiation therapy.

本明細書において引用したすべての文献は、参照により本明細書に組み入れられる。 All references cited herein are hereby incorporated by reference.

以下は、本開示の方法および組成物の実施例である。上述の一般的な記載に照らし、種々の他の態様が実施され得ることが、理解されるであろう。 Below are examples of the methods and compositions of the present disclosure. It will be understood that various other embodiments may be practiced in light of the general description above.

[実施例1] [Example 1]

腫瘍細胞に対するin vitro細胞傷害活性の改善に関する、親Dual-Fab H183L072の親和性成熟バリアントのスクリーニング
1.1 親和性成熟バリアントの配列
CD3およびCD137に結合するが、CD3およびCD137に同時には結合しない、免疫グロブリン可変(Fab)領域(Dual-Fab)を提供するという概念は、WO2019111871(参照により本明細書に組み入れられる)に開示されている。WO2019111871に開示されている親Dual-Fab H183L072(重鎖:配列番号:1;軽鎖:配列番号:57)の結合アフィニティを増加させるために、H183L072を鋳型として用いて、可変領域に単一のまたは複数の変異を導入することにより、1,000個を上回るDual-Fabバリアントを作製した。抗体を、Expi293(Invitrogen)を用いて発現させ、プロテインA精製、続いて、ゲル濾過が必要な場合にはゲル濾過によって精製した。複数の変異を有する22個の代表的なDual-Fabバリアントの配列を、表6および表8-1~8-6に列記し、CD3およびCD137に対する結合アフィニティおよび動態を、実施例1.2.2(表9)において下記に記載されるように、Biacore T200機器(GE Healthcare)を用いて25℃および/または37℃で評価した。
Screening of affinity matured variants of the parent Dual-Fab H183L072 for improved in vitro cytotoxic activity against tumor cells
1.1 Sequences of affinity matured variants
The concept of providing immunoglobulin variable (Fab) regions that bind to CD3 and CD137 but do not bind to CD3 and CD137 simultaneously (Dual-Fab) is disclosed in WO2019111871 (incorporated herein by reference). In order to increase the binding affinity of the parent Dual-Fab H183L072 (heavy chain: SEQ ID NO: 1; light chain: SEQ ID NO: 57) disclosed in WO2019111871, more than 1,000 Dual-Fab variants were generated by introducing single or multiple mutations into the variable region using H183L072 as a template. Antibodies were expressed using Expi293 (Invitrogen) and purified by Protein A purification followed by gel filtration when gel filtration was required. The sequences of 22 representative Dual-Fab variants with multiple mutations are listed in Table 6 and Tables 8-1 to 8-6, and the binding affinity and kinetics to CD3 and CD137 were evaluated at 25°C and/or 37°C using a Biacore T200 instrument (GE Healthcare) as described below in Example 1.2.2 (Table 9).

1.2 親和性成熟バリアントの結合動態情報
1.2.1 ヒトCD3およびCD137の発現および精製
ヒトCD3複合体(ヒトCD3egリンカー)のγサブユニットおよびεサブユニットを29-merリンカーによって連結し、Flag-タグをγサブユニットのC末端に融合させた(配列番号:102、表5および7)。この構築物を、FreeStyle293F細胞株(Thermo Fisher)を用いて一過性に発現させた。ヒトCD3egリンカーを発現する培養上清を、Q HP樹脂(GE healthcare)を充填したカラムを用いて濃縮し、次いで、FLAG-タグ親和性クロマトグラフィーに適用した。ヒトCD3egリンカーを含有する画分を収集し、続いて、1×D-PBSで平衡化したSuperdex 200ゲル濾過カラム(GE healthcare)に供した。次いで、ヒトCD3egリンカーを含有する画分をプールした。そのC末端にヘキサヒスチジン(His-タグ)およびビオチンアクセプターペプチド(BAP)を有するヒトCD137細胞外ドメイン(ECD)(配列番号:103、表5および7)を、FreeStyle293F細胞株(Thermo Fisher)を用いて一過性に発現させた。ヒトCD137 ECDを発現する培養上清をHisTrap HPカラム(GE healthcare)に適用し、イミダゾール(Nacalai)を含有する緩衝液で溶出した。ヒトCD137 ECDを含有する画分を収集し、続いて、1×D-PBSで平衡化したSuperdex 200ゲル濾過カラム(GE healthcare)に供した。次いで、ヒトCD137 ECDを含有する画分をプールし、-80℃で保管した。
1.2 Binding kinetics information of affinity matured variants
1.2.1 Expression and purification of human CD3 and CD137 The γ and ε subunits of the human CD3 complex (human CD3eg linker) were linked by a 29-mer linker, and a Flag-tag was fused to the C-terminus of the γ subunit (SEQ ID NO: 102, Tables 5 and 7). This construct was transiently expressed using the FreeStyle293F cell line (Thermo Fisher). Culture supernatants expressing the human CD3eg linker were concentrated using a column packed with Q HP resin (GE healthcare) and then applied to FLAG-tag affinity chromatography. Fractions containing the human CD3eg linker were collected and subsequently subjected to a Superdex 200 gel filtration column (GE healthcare) equilibrated with 1×D-PBS. The fractions containing the human CD3eg linker were then pooled. Human CD137 extracellular domain (ECD) (SEQ ID NO: 103, Tables 5 and 7) with hexahistidine (His-tag) and biotin acceptor peptide (BAP) at its C-terminus was transiently expressed using the FreeStyle293F cell line (Thermo Fisher). Culture supernatant expressing human CD137 ECD was applied to a HisTrap HP column (GE healthcare) and eluted with a buffer containing imidazole (Nacalai). Fractions containing human CD137 ECD were collected and subsequently subjected to a Superdex 200 gel filtration column (GE healthcare) equilibrated with 1xD-PBS. Fractions containing human CD137 ECD were then pooled and stored at -80°C.

1.2.2 ヒトCD3およびCD137に対する親和性測定
ヒトCD3に対するDual-Fab抗体(Dual-Ig)の結合親和性を、Biacore 8K機器(GE Healthcare)を用いて25℃で評価した。抗ヒトFc(GE Healthcare)を、アミンカップリングキット(GE Healthcare)を用いてCM4センサーチップのすべてのフローセルの上に固定化した。抗体を抗Fcセンサー表面の上に捕捉し、次いで、組換えヒトCD3またはCD137をフローセルの上にインジェクトした。すべての抗体およびアナライトを、20 mM ACES、150 mM NaCl、0.05% Tween 20、0.005% NaN3を含有するACES pH 7.4において調製した。センサー表面は、3M MgCl2でサイクル毎に再生させた。結合親和性は、Biacore Insight Evaluation software、version 2.0(GE Healthcare)を用いて、データをプロセシングし、1:1結合モデルにフィットさせることによって決定した。CD137結合親和性アッセイを、アッセイ温度を37℃に設定したことを除いて、同じ条件で行った。組換えヒトCD3およびCD137に対するDual-Fab抗体の結合親和性を表9-1および9-2に示す(表中でKon値、Koff値、およびKD値を表すのに用いられる語句Eは、「10の_乗」を意味し、例えば、3.54E+04=3.54*104である)。表9-1および9-2に示すように、Dual Fabバリアントは、CD3およびCD137に対し、H183/L072と比較して異なる結合動態を示した。
1.2.2 Affinity measurements for human CD3 and CD137 The binding affinity of Dual-Fab antibodies (Dual-Ig) for human CD3 was evaluated at 25 °C using a Biacore 8K instrument (GE Healthcare). Anti-human Fc (GE Healthcare) was immobilized onto all flow cells of a CM4 sensor chip using an amine coupling kit (GE Healthcare). Antibodies were captured onto the anti-Fc sensor surface, and then recombinant human CD3 or CD137 was injected onto the flow cells. All antibodies and analytes were prepared in ACES pH 7.4 containing 20 mM ACES, 150 mM NaCl, 0.05% Tween 20, 0.005% NaN3 . The sensor surface was regenerated every cycle with 3 M MgCl2 . Binding affinity was determined by processing the data and fitting to a 1:1 binding model using Biacore Insight Evaluation software, version 2.0 (GE Healthcare). CD137 binding affinity assay was performed under the same conditions, except that the assay temperature was set at 37° C. The binding affinities of Dual-Fab antibodies to recombinant human CD3 and CD137 are shown in Tables 9-1 and 9-2 (the term E used to represent K on , K off and K D values in the tables means "10 to the power of __", e.g., 3.54E+04=3.54 * 10 4 ). As shown in Tables 9-1 and 9-2, the Dual Fab variants showed different binding kinetics to CD3 and CD137 compared to H183/L072.

(表5)表7の配列番号のアノテーション(表9のアフィニティ測定で用いられるヒトCD3およびCD137抗原の配列番号)

Figure 0007557922000005
Table 5: Annotation of the SEQ ID NOs in Table 7 (SEQ ID NOs for human CD3 and CD137 antigens used in affinity measurements in Table 9)
Figure 0007557922000005

(表6)表8-1~8-6の配列番号のアノテーション(抗体名、ならびにCDR 1、2、および3を含む可変領域の配列番号)

Figure 0007557922000006
Table 6: Annotation of SEQ ID NOs in Tables 8-1 to 8-6 (antibody name and SEQ ID NOs of variable regions including CDRs 1, 2, and 3)
Figure 0007557922000006

(表7)抗原の全長アミノ酸配列

Figure 0007557922000007
Table 7. Full-length amino acid sequences of antigens
Figure 0007557922000007

(表8-1)表6でアノテーション付けした抗体の可変領域の全長アミノ酸配列と、続いてのCDR 1、2、および3領域のアミノ酸配列

Figure 0007557922000008
Table 8-1: Full length amino acid sequences of the variable regions of the antibodies annotated in Table 6, followed by the amino acid sequences of the CDR 1, 2, and 3 regions.
Figure 0007557922000008

(表8-2)表8-1の続き

Figure 0007557922000009
(Table 8-2) Continued from Table 8-1
Figure 0007557922000009

(表8-3)表8-2の続き

Figure 0007557922000010
(Table 8-3) Continued from Table 8-2
Figure 0007557922000010

(表8-4)表8-3の続き

Figure 0007557922000011
(Table 8-4) Continued from Table 8-3
Figure 0007557922000011

(表8-5)表8-4の続き

Figure 0007557922000012
(Table 8-5) Continued from Table 8-4
Figure 0007557922000012

(表8-6)表8-5の続き

Figure 0007557922000013
(Table 8-6) Continued from Table 8-5
Figure 0007557922000013

(表9-1)ヒトCD3およびヒトCD137に対するDualバリアントの結合動態

Figure 0007557922000014
(Table 9-1) Binding kinetics of dual variants to human CD3 and human CD137
Figure 0007557922000014

(表9-2)ヒトCD3およびヒトCD137に対するDualバリアントの結合動態

Figure 0007557922000015
(Table 9-2) Binding kinetics of dual variants to human CD3 and human CD137
Figure 0007557922000015

[実施例2]
二重特異性および三重特異性抗体の配列および調製
2.1.二重特異性または三重特異性抗体(1+1)フォーマットの設計および調製
実施例1で調製したDual-Igバリアント(DualAE05等)の効果を評価するために、腫瘍抗原 DLL3を認識する1つのアーム(抗DLL3抗体 D30841AE13由来)と、エフェクター細胞、主にT細胞を認識する別のアームとを有する二重特異性および三重特異性抗体を作製した。DLL3/CD3ε(1+1)抗体およびDLL3/DualAE05(1+1)抗体を、Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Mar 26; 110(13):5145-5150に記載されている方法によるFab-アーム交換(FAE)を用いることによって作製した。(1+1)フォーマットを図 1(b)に示す。(1+1)フォーマットでの二重特異性および三重特異性抗体における各Fv領域の標的抗原および各結合ドメインの命名規則を表10-2に示し、配列番号を表12に示す。
[Example 2]
Sequence and preparation of bispecific and trispecific antibodies
2.1. Design and preparation of bispecific or trispecific antibody (1+1) formats
To evaluate the effect of the Dual-Ig variants (DualAE05, etc.) prepared in Example 1, bispecific and trispecific antibodies were generated with one arm recognizing the tumor antigen DLL3 (derived from anti-DLL3 antibody D30841AE13) and another arm recognizing effector cells, mainly T cells. DLL3/CD3ε (1+1) and DLL3/DualAE05 (1+1) antibodies were generated by using Fab-arm exchange (FAE) according to the method described in Proc Natl Acad Sci US A. 2013 Mar 26; 110(13):5145-5150. The (1+1) format is shown in Figure 1(b). The naming rules of the target antigens and each binding domain of each Fv region in the bispecific and trispecific antibodies in the (1+1) format are shown in Table 10-2, and the sequence numbers are shown in Table 12.

2.2.1つの一価DLL3結合アームと2つのDual-Fabとを含む三価抗体(1+2)フォーマットの設計および調製
固形腫瘍における標的抗原の発現は極めて不均一である可能性が高く、抗原発現が低い腫瘍の領域は、CD3またはCD137の十分な架橋形成をもたらさない場合がある。特に、CD137受容体クラスター形成は、効果的なアゴニスト活性にとって重大な意味を持つ(Trends Biohem Sci. 2002 Jan;27(1)19-26)。CD3結合および活性化によって媒介される細胞傷害活性を改善するために、新たな三価三重特異性抗体フォーマット、すなわち、DLL3-DUAL/LINC、1+2)を、CD137分子に対する結合ドメインの数を増加させるように設計した。具体的には、新たな抗体フォーマットは、それぞれが1つのCD3またはCD137に結合できるが同時には結合しない一価Dual-Fabを2つ(図1aのFvBおよびFvC)、および一価DLL3結合アームを1つ(図1aのFvA)含む、「1+2」フォーマットを有する三価三重特異性抗体であり、1つのジスルフィド結合(「LINC」)が、例えば、2つのDual-FabのそれぞれのCH1ドメインの191位に、システイン置換(KabatナンバリングでS191C)を導入することによって、2つのDual-Fab間に導入/設計されている(図1(a)および表10-1)。理論に束縛されるものではないが、本発明者らは、そのように設計されたジスルフィド結合(「LINC」)は、2つのDual-Fab間の立体障害または短い距離の結果として、2つのDual-Fabの抗原(CD3またはCD137)結合配向性をシス抗原結合(すなわち、同じ細胞上の2つの抗原への結合)に制限し、それによって、DLL3非依存的に2つのDual-Fabによって媒介される2つのCD3/CD137発現免疫細胞の望ましくない架橋形成を妨げることによって三重特異性抗体の安全性プロファイルを改善することを企図した。具体的には、DLL3に対する一価腫瘍抗原結合能、2つのDual-Fabに起因する二価CD3および二価CD137 結合特性を有するDLL3-Dual/Dual抗体バリアント(DLL3-Dual/LINC、1+2)を調製した(図1(a)および表10-1)。CrossMabテクノロジー(WO2017055539)も利用した。Fc領域は、FcγRサイレントであり、かつ脱グリコシル化された。三重特異性抗体における各Fv領域の標的抗原および各結合ドメインの命名規則を表10-1に示し、配列番号を表11-1および12に示す。陰性対照については、DLL3に結合しないCtrl(VHR IC17HdKおよびVLR IC17L)を、一価DLL3結合アームの代わりに用いた(表12)。すべての抗体をExpi293細胞(Invitrogen)での一過性発現によって三価形態として発現させ、実施例1.1に従って精製した。純度を向上させるために、抗体を、UnLINCフォーマット(すなわち、操作されたジスルフィド結合を有さない三価1+2抗体)に特異的に結合するが、LINCフォーマット(すなわち、操作されたジスルフィド結合を有する三価1+2抗体)には結合しないアフィニティカラムを通過させることによってさらに精製した。
2.2. Design and Preparation of Trivalent Antibody (1+2) Format Containing One Monovalent DLL3 Binding Arm and Two Dual-Fabs Expression of target antigens in solid tumors is likely to be highly heterogeneous, and areas of tumors with low antigen expression may not result in sufficient cross-linking of CD3 or CD137. In particular, CD137 receptor clustering is critical for effective agonist activity (Trends Biohem Sci. 2002 Jan;27(1)19-26). To improve the cytotoxic activity mediated by CD3 binding and activation, a new trivalent trispecific antibody format, i.e., DLL3-DUAL/LINC, 1+2), was designed to increase the number of binding domains for the CD137 molecule. Specifically, the new antibody format is a trivalent trispecific antibody with a "1+2" format, comprising two monovalent Dual-Fabs (FvB and FvC in FIG. 1a), each of which can bind to one CD3 or CD137 but not simultaneously, and one monovalent DLL3-binding arm (FvA in FIG. 1a), in which one disulfide bond ("LINC") is introduced/engineered between the two Dual-Fabs, for example, by introducing a cysteine substitution (S191C in Kabat numbering) at position 191 in the CH1 domain of each of the two Dual-Fabs (FIG. 1(a) and Table 10-1). Without being bound by theory, the inventors contemplated that the disulfide bond ("LINC") designed in this way would restrict the antigen (CD3 or CD137) binding orientation of the two Dual-Fabs to cis antigen binding (i.e., binding to two antigens on the same cell) as a result of steric hindrance or short distance between the two Dual-Fabs, thereby improving the safety profile of the trispecific antibody by preventing undesired cross-linking of two CD3/CD137 expressing immune cells mediated by the two Dual-Fabs in a DLL3-independent manner. Specifically, a DLL3-Dual/Dual antibody variant (DLL3-Dual/LINC, 1+2) was prepared that has monovalent tumor antigen binding ability to DLL3, bivalent CD3 and bivalent CD137 binding properties due to the two Dual-Fabs (Figure 1(a) and Table 10-1). CrossMab technology (WO2017055539) was also utilized. The Fc region was FcγR silent and deglycosylated. The naming rules of the target antigens and each binding domain of each Fv region in the triabody are shown in Table 10-1, and the SEQ ID NOs are shown in Tables 11-1 and 12. For negative controls, Ctrl (VHR IC17HdK and VLR IC17L), which does not bind DLL3, was used instead of the monovalent DLL3 binding arm (Table 12). All antibodies were expressed in trivalent form by transient expression in Expi293 cells (Invitrogen) and purified according to Example 1.1. To improve purity, the antibodies were further purified by passing them through an affinity column that specifically binds to the UnLINC format (i.e., trivalent 1+2 antibodies without engineered disulfide bonds) but not to the LINC format (i.e., trivalent 1+2 antibodies with engineered disulfide bonds).

2.3.二重特異性抗体(BiTE)の作製
三価抗体(DLL3-DUAL/LINC、2+1)の効果を他のDLL3/CD3二重特異性フォーマット抗体と比較するために、半減期延長型BiTEフォーマットを有する抗体を作製し、DLL3CD3BiTEと名付けた。DLL3CD3BiTEは、腫瘍関連抗原DLL3に向けられた一本鎖可変断片が、CD3に向けられたものに融合されている、2本の一本鎖可変断片(ScFv)で構成された(図1(c))。BiTEフォーマット二重特異性抗体中の各Fv領域の標的抗原を表10-3に示し、配列番号を表11-2および表14に示す。
2.3. Construction of Bispecific Antibodies (BiTEs) To compare the effect of the trivalent antibody (DLL3-DUAL/LINC, 2+1) with other DLL3/CD3 bispecific format antibodies, an antibody with a half-life extended BiTE format was constructed and named DLL3CD3BiTE. DLL3CD3BiTE was composed of two single-chain variable fragments (ScFvs) in which a single-chain variable fragment directed against the tumor-associated antigen DLL3 was fused to one directed against CD3 (Figure 1(c)). The target antigens of each Fv region in the BiTE format bispecific antibody are shown in Table 10-3, and the sequence numbers are shown in Tables 11-2 and 14.

(表10-1)抗体名、標的アーム、およびFcの情報

Figure 0007557922000016
Table 10-1: Antibody name, target arm, and Fc information
Figure 0007557922000016

(表10-2)二重特異性および三重特異性抗体(1+1)

Figure 0007557922000017
Table 10-2: Bispecific and trispecific antibodies (1+1)
Figure 0007557922000017

(表10-3)二重特異性抗体(BiTE)

Figure 0007557922000018
(Table 10-3) Bispecific antibody (BiTE)
Figure 0007557922000018

(表11-1)抗体鎖の番号および配列ID

Figure 0007557922000019
Table 11-1: Antibody chain numbers and sequence IDs
Figure 0007557922000019

(表11-2)抗体鎖の番号および配列ID

Figure 0007557922000020
Table 11-2: Antibody chain numbers and sequence IDs
Figure 0007557922000020

(表12)可変領域およびそれらのCDR1~3配列のID

Figure 0007557922000021
Table 12: Variable regions and their CDR1-3 sequence IDs
Figure 0007557922000021

(表13)表14のFc領域の配列ID番号

Figure 0007557922000022
Table 13: Sequence ID numbers of the Fc regions of Table 14
Figure 0007557922000022

(表14-1)

Figure 0007557922000023
(Table 14-1)
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(表14-2)

Figure 0007557922000024
(Table 14-2)
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(表14-3)

Figure 0007557922000025
(Table 14-3)
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(表14-4)

Figure 0007557922000026
(Table 14-4)
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(表14-5)

Figure 0007557922000027
(Table 14-5)
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(表14-6)

Figure 0007557922000028
(Table 14-6)
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(表14-7)

Figure 0007557922000029
(Table 14-7)
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(表14-8)

Figure 0007557922000030
(Table 14-8)
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(表14-9)

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(Table 14-9)
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(表14-10)

Figure 0007557922000032
(Table 14-10)
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(表14-11)

Figure 0007557922000033
(Table 14-11)
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[実施例3]
DLL3発現細胞株に対するDLL3-Dual-LINC抗体のin vitro有効性
3.1.抗DLL3/Dual-Linc(1+2)抗体、Dual(1+1)抗体、DLL3CD3BiTE、およびDLL3/CD3ε(1+1)抗体を用いた、TDCC活性の測定
PBMCの存在下でxCELLigence Real-Time Cell Analyzer(Roche Diagnostics)を用いて腫瘍細胞増殖抑制率を観察することによって、細胞傷害活性を評価した。図2は、表10-13に従って調製した抗DLL3/Dual-Linc抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05, 1+2)、Dual(1+1)抗体(DLL3/DualAE05)、DLL3CD3BiTE、およびDLL3/CD3ε(1+1)抗体のTDCC活性を示す。SK-MEL30細胞株を標的細胞として用いた。標的細胞をディッシュから剥離し、細胞を5×103細胞/ウェルに調整することによって100μL/ウェルの分割量で、細胞をE-plate 96(Roche Diagnostics)にプレーティングし、xCELLigence Real-Time Cell Analyzerを用いて、細胞増殖の測定を開始した。24時間後に、プレートを取り出して、各濃度(10 nMから開始した5倍系列希釈、すなわち、0.25、1.25、2.5、5、および10 nM)に調製したそれぞれの抗体50μLを、プレートに加えた。室温で15分間の反応後に、50μLの新鮮なヒトPBMC溶液を、エフェクター:標的比 2(すなわち、1×104細胞/ウェル)で加え、細胞増殖の測定を、xCELLigence Real-Time Cell Analyzerを用いて再開した。反応は、5%二酸化炭素ガスの条件下、37℃で実施した。CD137シグナル伝達は、T細胞生存を増強し、かつ活性化誘導細胞死を阻止するため、TDCCアッセイを低いE:T比で実施した。CD137活性化が寄与する優れた細胞傷害活性を観察するために、期間の延長が必要とされる場合がある。よって、PBMCの添加のおよそ68時間後に、下記の式を用いて、細胞増殖抑制(CGI)率(%)を決定した。計算において用いたxCELLigence Real-Time Cell Analyzerから得られたCell Index値は、抗体添加の直前の時点のCell Index値を1として定義した正規化値であった。
細胞増殖抑制率(%)=(A-B)×100/(A-1)
Aは、抗体を添加していないウェル(標的細胞およびヒトPBMCのみを含有する)におけるCell Index値の平均値を表し、Bは、標的ウェルのCell Index値の平均値を表す。試験は二連で実施した。
[Example 3]
In vitro efficacy of DLL3-Dual-LINC antibodies against DLL3-expressing cell lines
3.1. Measurement of TDCC activity using anti-DLL3/Dual-Linc(1+2) antibody, Dual(1+1) antibody, DLL3CD3BiTE, and DLL3/CD3ε(1+1) antibody
Cytotoxic activity was evaluated by observing the tumor cell proliferation inhibition rate using xCELLigence Real-Time Cell Analyzer (Roche Diagnostics) in the presence of PBMC. Figure 2 shows the TDCC activity of anti-DLL3/Dual-Linc antibody (DLL3-DualAE05/DualAE05, 1+2), Dual (1+1) antibody (DLL3/DualAE05), DLL3CD3BiTE, and DLL3/CD3ε (1+1) antibody prepared according to Table 10-13. SK-MEL30 cell line was used as target cells. The target cells were detached from the dish, and the cells were plated on E-plate 96 (Roche Diagnostics) in an aliquot of 100 μL/well by adjusting the cells to 5×10 3 cells/well, and the measurement of cell proliferation was started using xCELLigence Real-Time Cell Analyzer. After 24 hours, the plate was removed and 50 μL of each antibody prepared at each concentration (5-fold serial dilution starting from 10 nM, i.e., 0.25, 1.25, 2.5, 5, and 10 nM) was added to the plate. After 15 minutes of reaction at room temperature, 50 μL of fresh human PBMC solution was added at an effector:target ratio of 2 (i.e., 1× 104 cells/well), and cell proliferation measurement was resumed using the xCELLigence Real-Time Cell Analyzer. The reaction was carried out at 37°C under 5% carbon dioxide gas. Because CD137 signaling enhances T cell survival and prevents activation-induced cell death, the TDCC assay was performed at a low E:T ratio. To observe the superior cytotoxic activity contributed by CD137 activation, an extended period may be required. Therefore, approximately 68 hours after the addition of PBMC, the cytostatic inhibition (CGI) rate (%) was determined using the following formula: The Cell Index value obtained from the xCELLigence Real-Time Cell Analyzer used in the calculation was a normalized value defined as 1 for the Cell Index value immediately before antibody addition.
Cell proliferation inhibition rate (%) = (A-B) x 100/(A-1)
A represents the average Cell Index value in wells without antibody (containing only target cells and human PBMCs), and B represents the average Cell Index value in target wells. The test was performed in duplicate.

図2 a)に示すように、抗DLL3/Dual-Linc抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05、1+2)は、Dual(1+1)抗体(DLL3/DualAE05)およびDLL3/CD3ε(1+1)抗体のものより強いTDCC活性を示した。このことは、Dual-Linc分子フォーマットは改善された細胞傷害活性に寄与することを示唆する。加えて、これらの抗体の濃度で、抗DLL3/Dual-Linc抗体のTDCC活性は、DLL3/CD3BiTEと同等である。 As shown in Figure 2a), anti-DLL3/Dual-Linc antibody (DLL3-DualAE05/DualAE05, 1+2) showed stronger TDCC activity than Dual (1+1) antibody (DLL3/DualAE05) and DLL3/CD3ε (1+1) antibody, suggesting that the Dual-Linc molecular format contributes to improved cytotoxic activity. In addition, at these antibody concentrations, the TDCC activity of anti-DLL3/Dual-Linc antibody is comparable to that of DLL3/CD3BiTE.

3.2.細胞傷害活性に対するリンカー長の効果の評価
腫瘍細胞に対する細胞傷害活性を改善するためには、腫瘍細胞とエフェクター細胞との間のより近接したより強固な結合が重大な意味を持つことになる。これは、より短い距離が、T細胞と腫瘍細胞をより近接させるのに役立つ可能性があり、TDCCに役立つ可能性があることを意味する。したがって、本発明者らは、異なる長さのリンカーを有する、3種類の抗DLL3/Dual-Linc抗体バリアントを作製した。DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110(中程度のリンカー)およびDLL3-DualAE05/DualAE05-FF111(短いリンカー)のリンカー長は、DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091(長いリンカー)のものより短い(本明細書の以下において、これらのバリアントはそれぞれ、DLL3-AE05/AE05-FF110、DLL3-AE05/AE05-FF111、およびDLL3-AE05/AE05-FF091と略される場合がある)。細胞傷害活性に対するリンカー長の効果を評価するために、TDCC測定を、0.2、1、および5 nMの抗体を用いて実施例3.1に記載されるように行った。
3.2. Evaluation of the effect of linker length on cytotoxic activity To improve cytotoxic activity against tumor cells, closer and tighter binding between tumor cells and effector cells is crucial. This means that a shorter distance may help bring T cells and tumor cells closer together, which may be beneficial for TDCC. Therefore, we generated three anti-DLL3/Dual-Linc antibody variants with different linker lengths. The linker lengths of DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110 (medium linker) and DLL3-DualAE05/DualAE05-FF111 (short linker) are shorter than that of DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091 (long linker) (hereinafter these variants may be abbreviated as DLL3-AE05/AE05-FF110, DLL3-AE05/AE05-FF111, and DLL3-AE05/AE05-FF091, respectively). To evaluate the effect of linker length on cytotoxic activity, TDCC measurements were performed as described in Example 3.1 using 0.2, 1, and 5 nM of antibody.

図2 b)に示すように、DLL3-AE05/AE05-FF110(中程度のリンカー)およびDLL3-AE05/AE05-FF111(短いリンカー)は、0.2 nMでDLL3-AE05/AE05-FF091(長いリンカー)のものより強いTDCC活性を示した。DLL3-AE05/AE05-FF110(中程度のリンカー)は最も強いTDCC活性を示した。これらの結果は、リンカー長がTDCC活性にとって重要であり、かつ中程度の長さのリンカーが、in vitroでのTDCC活性にとって最も適切であることを示唆する。 As shown in Figure 2 b), DLL3-AE05/AE05-FF110 (medium linker) and DLL3-AE05/AE05-FF111 (short linker) showed stronger TDCC activity than that of DLL3-AE05/AE05-FF091 (long linker) at 0.2 nM. DLL3-AE05/AE05-FF110 (medium linker) showed the strongest TDCC activity. These results suggest that the linker length is important for TDCC activity, and that the medium-length linker is the most suitable for TDCC activity in vitro.

[実施例4]
DLL3CD3BiTEと比較したDLL3-DualAE05/DualAE05-FF091三重特異性抗体のin vivo有効性の評価
実施例2で調製したDLL3-DualAE05/DualAE05-FF091抗体およびDLL3CD3BiTEの抗腫瘍活性を、ヒト小細胞肺がんNCI-H1436がんモデルで試験した。NCI-H1436細胞をNOGヒト化マウスに皮下移植した。NOG雌マウスをIn-Vivo Scienceから購入した。ヒト化のために、マウスを致死量以下で照射し、続いて1日後に100,000個のヒト臍帯血細胞(ALLCELLS)を注射した。ヒト化後、NCI-H1436(5×106細胞)をMatrigel Basement Membrane Matrix(Corning)と混合して、ヒト化 NOGマウスの右側腹部に移植した。移植の日を0日目と定義した。11日目に、マウスを、腫瘍体積および体重に基づいてランダム化した。翌日、ビヒクル(0.05%Tween を含有するPBS)、6.5 mg/kg DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091、および3.5 mg/kg DLL3CD3BiTEのいずれかを、マウスに静脈内注射した。
[Example 4]
Evaluation of the in vivo efficacy of DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091 trispecific antibody compared to DLL3CD3BiTE
The antitumor activity of DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091 antibody and DLL3CD3BiTE prepared in Example 2 was tested in a human small cell lung cancer NCI-H1436 cancer model. NCI-H1436 cells were subcutaneously implanted into NOG humanized mice. NOG female mice were purchased from In-Vivo Science. For humanization, mice were sublethally irradiated, followed by injection of 100,000 human umbilical cord blood cells (ALLCELLS) one day later. After humanization, NCI-H1436 (5× 106 cells) were mixed with Matrigel Basement Membrane Matrix (Corning) and implanted into the right flank of humanized NOG mice. The day of implantation was defined as day 0. On day 11, mice were randomized based on tumor volume and body weight. The next day, mice were injected intravenously with either vehicle (PBS containing 0.05% Tween), 6.5 mg/kg DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091, or 3.5 mg/kg DLL3CD3BiTE.

T細胞浸潤の分析のために、マウスが有する異種移植した腫瘍を、抗体投与後の表示されている時点で収集した。腫瘍を計量し、製造業者のプロトコールに従ってヒト用Tumor Dissociation Kit(Miltenyi)を用いることによって細分化し、分離後にCountBright Absolute Counting Beads(ThermoFisher scientific)を加えた。腫瘍内のCD8+T細胞の数を、LSRFortessa X-20(BD)を用いて評価した。 For analysis of T cell infiltration, xenografted tumors from mice were harvested at the indicated time points after antibody administration. Tumors were weighed and disaggregated by using a Tumor Dissociation Kit for Humans (Miltenyi) according to the manufacturer's protocol, and CountBright Absolute Counting Beads (ThermoFisher scientific) were added after disaggregation. The number of CD8+ T cells in the tumor was assessed using an LSRFortessa X-20 (BD).

T細胞疲弊の分析のために、マウスが有する異種移植した腫瘍を、抗体投与後7日目に収集した。腫瘍を、製造業者のプロトコールに従ってヒト用Tumor Dissociation Kit(Miltenyi)によって細分化し、T細胞疲弊マーカー、Tim-3、PD-1、およびLag-3の発現について、腫瘍内T細胞を評価した。 For analysis of T cell exhaustion, mouse-borne xenografted tumors were harvested 7 days after antibody administration. Tumors were disaggregated using a human Tumor Dissociation Kit (Miltenyi) according to the manufacturer's protocol, and intratumoral T cells were evaluated for expression of T cell exhaustion markers, Tim-3, PD-1, and Lag-3.

結果として、DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091は、DLL3CD3BiTEより強い効果と高いT細胞浸潤を示した(図3および図4)。さらに、DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091処置群のT細胞は、PD-1、Tim-3、およびLAG3のより低い発現を有し(図5)、このことは、DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091がより低いT細胞疲弊を誘導することを示唆した。 As a result, DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091 showed stronger efficacy and higher T cell infiltration than DLL3CD3BiTE (Figures 3 and 4). Furthermore, T cells in the DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091-treated group had lower expression of PD-1, Tim-3, and LAG3 (Figure 5), suggesting that DLL3-DualAE05/DualAE05-FF091 induced lower T cell exhaustion.

[実施例5]
非SCLC細胞株に対する抗DLL3-Dual-LINC抗体のin vitro有効性
非SCLC細胞株に対する、抗DLL3-Dual抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110)および非標的対照(untargeted control)Dual-LINC抗体(Ctrl-DualAE05/DualAE05-FF110)のin vitro細胞傷害活性を、LDH細胞傷害活性検出キット(Takara Bio)によって評価した。NB-1細胞株(神経芽腫、JCRB細胞バンクIFO50295)およびQGP-1細胞株(膵島細胞がん、JCRB細胞バンクJCRB0183)を標的細胞として用いた。標的細胞を96ウェル培養プレート中に1×104細胞/ウェルで播種し、各濃度(10nM~0.00064nMの5倍段階希釈)で調製した抗体を加えた。その後、2×105細胞のヒト PBMCを加え、37℃にてインキュベートした。24時間後、高対照試料をTriton-X 100によって溶解し、50 μLの上清をすべてのウェルから収集した。細胞傷害活性(%)を製造業者のプロトコールに従って算出した。図7に示されるように、抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110)は、NB-1細胞株およびQGP-1細胞株を含む非SCLC細胞株に対してin vitro細胞殺傷活性を示した。
[Example 5]
In vitro efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies against non-SCLC cell lines
The in vitro cytotoxicity of anti-DLL3-Dual antibody (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110) and untargeted control Dual-LINC antibody (Ctrl-DualAE05/DualAE05-FF110) against non-SCLC cell lines was evaluated using the LDH cytotoxicity detection kit (Takara Bio). NB-1 cell line (neuroblastoma, JCRB Cell Bank IFO50295) and QGP-1 cell line (pancreatic islet cell carcinoma, JCRB Cell Bank JCRB0183) were used as target cells. Target cells were seeded at 1 × 104 cells/well in a 96-well culture plate, and antibodies were added at various concentrations (10 nM to 0.00064 nM, 5-fold serial dilutions). Then, 2 × 105 human PBMCs were added and incubated at 37°C. After 24 hours, the high control samples were lysed by Triton-X 100, and 50 μL of supernatant was collected from all wells. The cytotoxic activity (%) was calculated according to the manufacturer's protocol. As shown in Figure 7, anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110) exhibited in vitro cell killing activity against non-SCLC cell lines, including NB-1 and QGP-1 cell lines.

[実施例6]
化学療法試薬との組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体のin vivo有効性
抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)と白金試薬との組み合わせ治療の抗腫瘍有効性をDMS53小細胞肺がんモデルで評価した。NOG雌マウスをIn-Vivo Scienceから購入した。ヒト化のために、マウスを致死量以下で照射し、続いて1日後に、100,000個のヒト臍帯血細胞(LONZA)を注射した。DMS53細胞(ATCC CRL-2062)をMatrigel Basement Membrane Matrix(Corning)と混合して、ヒト化NOGマウスの右側腹部に接種した。腫瘍体積がおよそ150 mm3であった9日目に、マウスを腫瘍体積および体重に基づいてランダム化し、ビヒクル(0.05%Tweenを含有するPBS)、1.3 mg/kg抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)、7.5 mg/kgシスプラチン(CDDP)、および40 mg/kgカルボプラチン(CBDCA)を単独療法としてまたは組み合わせで、静脈内(i.v.)注射した。結果として、抗DLL3-Dual-LINC抗体 DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114と白金試薬との組み合わせは、CDDP、CBDCA、または抗DLL3-Dual-LINC抗体単独の単独療法より有意に高い有効性を示した(図8)。
[Example 6]
In vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies in combination with chemotherapy agents
The antitumor efficacy of combination treatment of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) and platinum reagents was evaluated in the DMS53 small cell lung cancer model. NOG female mice were purchased from In-Vivo Science. For humanization, mice were sublethally irradiated and then injected with 100,000 human umbilical cord blood cells (LONZA) one day later. DMS53 cells (ATCC CRL-2062) were mixed with Matrigel Basement Membrane Matrix (Corning) and inoculated into the right flank of humanized NOG mice. On day 9, when the tumor volume was approximately 150 mm3 , mice were randomized based on tumor volume and body weight and intravenously (iv) injected with vehicle (PBS containing 0.05% Tween), 1.3 mg/kg anti-DLL3-Dual-LINC antibody (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114), 7.5 mg/kg cisplatin (CDDP), and 40 mg/kg carboplatin (CBDCA) as monotherapy or in combination. As a result, the combination of anti-DLL3-Dual-LINC antibody DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114 with platinum reagents showed significantly higher efficacy than the monotherapy of CDDP, CBDCA, or anti-DLL3-Dual-LINC antibody alone (Figure 8).

[実施例7]
NCI-H1436を有するヒト化モデルに対する抗DLL3-Dual-LINC抗体のin vivo有効性
抗DLL3-Dual-LINC抗体 DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114の抗腫瘍有効性をNCI-H1436小細胞肺がんモデルで評価した。NOG雌マウスをIn-Vivo Scienceから購入した。ヒト化のために、マウスを致死量以下で照射し、続いて1日後に、100,000個のヒト臍帯血細胞(LONZA)を注射した。NCI-H1436細胞(ATCC CRL-5871)をMatrigel Basement Membrane Matrix(Corning)と混合して、ヒト化NOGマウスの右側腹部に接種した。腫瘍体積がおよそ150 mm3であった16日目に、マウスを腫瘍体積および体重に基づいてランダム化し、ビヒクル(0.05%Tweenを含有するPBS)、6.5 mg/kg抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)、および3.5 mg/kg DLL3CD3BiTEをi.v.注射した。抗DLL3-Dual-LINC抗体 DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114およびDLL3CD3BiTEを単回用量でまたは毎週(QW)投与した。結果として、抗DLL3-Dual-LINC抗体 DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114は、両方の治療レジメンにおいて、DLL3CD3BiTEより強い有効性を示した(図9)。
[Example 7]
In vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies against a humanized model with NCI-H1436
The antitumor efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114 was evaluated in the NCI-H1436 small cell lung cancer model. NOG female mice were purchased from In-Vivo Science. For humanization, mice were sublethally irradiated and then injected with 100,000 human umbilical cord blood cells (LONZA) one day later. NCI-H1436 cells (ATCC CRL-5871) were mixed with Matrigel Basement Membrane Matrix (Corning) and inoculated into the right flank of humanized NOG mice. On day 16, when the tumor volume was approximately 150 mm3 , mice were randomized based on tumor volume and body weight and injected iv with vehicle (PBS containing 0.05% Tween), 6.5 mg/kg anti-DLL3-Dual-LINC antibody (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114), and 3.5 mg/kg DLL3CD3BiTE. Anti-DLL3-Dual-LINC antibody DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114 and DLL3CD3BiTE were administered in a single dose or weekly (QW). As a result, anti-DLL3-Dual-LINC antibody DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114 showed stronger efficacy than DLL3CD3BiTE in both treatment regimens (Figure 9).

[実施例8]
他の非SCLC細胞株に対する抗DLL3-Dual-LINC抗体のin vitro有効性
他の非SCLC細胞株に対する、抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110またはDLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)および非標的対照Dual LINC抗体のin vitro細胞傷害活性を、実施例5に記載のように評価する。評価される非SCLC細胞株の例は、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんの細胞株である。
[Example 8]
In vitro efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies against other non-SCLC cell lines
The in vitro cytotoxic activity of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110 or DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) and non-targeting control Dual LINC antibodies against other non-SCLC cell lines is evaluated as described in Example 5. Examples of non-SCLC cell lines evaluated are pancreatic neuroendocrine tumor (PNET), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma cell lines.

[実施例9]
他の化学療法試薬またはチェックポイント阻害剤との組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体のin vitroおよびin vivo有効性
SCLC細胞株または他の非SCLC細胞株に対する、他の化学療法試薬またはチェックポイント阻害剤(抗PD-L1抗体または抗PD1抗体)との組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110またはDLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)のin vitro細胞傷害活性を、実施例5に記載されるような方法を用いて評価する。
他の化学療法試薬またはチェックポイント阻害剤(抗PD-L1抗体または抗PD1抗体)との組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110またはDLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)のin vivo抗腫瘍有効性を、実施例6に記載されるようにDMS53小細胞肺がんモデルおよび他の非SCLCがんモデルで評価する。
この実施例では、評価される非SCLC細胞株(または非SCLCがんモデル)は、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がんからなる群より選択されるがんの細胞株(またはがんモデル)である。
この実施例では、抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110またはDLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)による組み合わせ療法のために評価されるチェックポイント阻害剤は、ペムブロリズマブ、ピディリズマブ(ピディリズマブ)、ニモツズマブ(ニボルマブ)、アテゾリズマブ、およびデュルバルマブからなる群より選択され、特にアテゾリズマブである。
[Example 9]
In vitro and in vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies in combination with other chemotherapeutic agents or checkpoint inhibitors
The in vitro cytotoxic activity of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110 or DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) in combination with other chemotherapeutic agents or checkpoint inhibitors (anti-PD-L1 antibodies or anti-PD1 antibodies) against SCLC cell lines or other non-SCLC cell lines is evaluated using methods such as those described in Example 5.
The in vivo anti-tumor efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110 or DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) in combination with other chemotherapy reagents or checkpoint inhibitors (anti-PD-L1 antibodies or anti-PD1 antibodies) is evaluated in the DMS53 small cell lung cancer model and other non-SCLC cancer models as described in Example 6.
In this example, the non-SCLC cell line (or non-SCLC cancer model) evaluated is a cell line (or cancer model) of a cancer selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine carcinoma, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma (GBM), melanoma, and medullary thyroid carcinoma.
In this example, the checkpoint inhibitor evaluated for combination therapy with anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF110 or DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) is selected from the group consisting of pembrolizumab, pidilizumab (pidilizumab), nimotuzumab (nivolumab), atezolizumab, and durvalumab, in particular atezolizumab.

[実施例10]
ステロイドまたはトシリズマブとの組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体のin vivo有効性
サイトカイン放出症候群(CRS)は、T細胞エンゲージャーおよびCAR-T細胞などのT細胞関連治療剤の一般的な有害事象である。臨床では、CRSを制御するために、ステロイドおよび/またはトシリズマブによる治療が広く用いられている。したがって、ステロイドまたはトシリズマブとの組み合わせでの抗DLL3-Dual-LINC抗体(DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114)のin vivo有効性を評価した。免疫ヒト化NOGマウスを、実施例7に記載されるように作製した。ヒトDLL3を発現するPC-10細胞(Immuno-Biological Laboratories)をヒト化NOGマウスの右側腹部に移植した。腫瘍体積がおよそ200 mm3であったときに、腫瘍体積および体重に基づいてマウスをランダム化した。ステロイドによる前投与実験では、抗体注射の1および24時間前、または1時間前に、33 mg/kgデキサメタゾンを腹腔内に投与した。トシリズマブによる実験では、抗DLL3-Dual-LINC抗体の注射の1日前または6時間後に、10 mg/kgトシリズマブを投与した。血漿試料を、抗DLL3-Dual-LINC抗体の注射の前ならびに6、24、および96時間後に収集し、サイトカインの血漿濃度を、製造業者の指示に従ってHuman Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel(HCYTMAG-60K-PX38, Millipore)を用いて測定した。結果として、デキサメタゾンによる前投与は、腫瘍成長阻害に影響を及ぼすことなく、サイトカイン産生の著しい低下を誘導した(図10a)。同様に、トシリズマブの前投与および後投与は、抗DLL3-Dual-LINC抗体の抗腫瘍有効性にいかなる影響も有さなかった(図10b)。
[Example 10]
In vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies in combination with steroids or tocilizumab
Cytokine release syndrome (CRS) is a common adverse event of T cell-related therapeutic agents such as T cell engagers and CAR-T cells. In clinical practice, treatment with steroids and/or tocilizumab is widely used to control CRS. Therefore, the in vivo efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibodies (DLL3-DualAE05/DualAE05-FF114) in combination with steroids or tocilizumab was evaluated. Immunized humanized NOG mice were generated as described in Example 7. PC-10 cells (Immuno-Biological Laboratories) expressing human DLL3 were implanted into the right flank of humanized NOG mice. Mice were randomized based on tumor volume and body weight when the tumor volume was approximately 200 mm3 . In steroid pretreatment experiments, 33 mg/kg dexamethasone was administered intraperitoneally 1 and 24 hours or 1 hour before antibody injection. In the tocilizumab experiment, 10 mg/kg tocilizumab was administered 1 day before or 6 hours after injection of anti-DLL3-Dual-LINC antibody. Plasma samples were collected before and 6, 24, and 96 hours after injection of anti-DLL3-Dual-LINC antibody, and plasma concentrations of cytokines were measured using Human Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel (HCYTMAG-60K-PX38, Millipore) according to the manufacturer's instructions. As a result, pretreatment with dexamethasone induced a significant reduction in cytokine production without affecting tumor growth inhibition (Fig. 10a). Similarly, pre- and post-treatment with tocilizumab did not have any effect on the anti-tumor efficacy of anti-DLL3-Dual-LINC antibody (Fig. 10b).

本発明は、CD3およびCD137(4-1BB)に結合できるが、CD3およびCD137に同時には結合できず、かつDLL3に結合できる、多重特異性抗原結合分子を提供する。本発明の抗原結合分子は、CD3/CD37およびDLL3への結合を通じて、増強されたT細胞依存性細胞傷害活性をDLL3依存的に示す。抗原結合分子およびその医薬組成物は、種々のがん、特に、DLL3陽性がんなどのDLL3に関連するがんを治療するための免疫療法での使用のために、DLL3を発現する細胞を標的とするのに用いることができる。 The present invention provides a multispecific antigen-binding molecule capable of binding to CD3 and CD137 (4-1BB), but not simultaneously to CD3 and CD137, and capable of binding to DLL3. The antigen-binding molecule of the present invention exhibits enhanced T cell-dependent cytotoxicity in a DLL3-dependent manner through binding to CD3/CD37 and DLL3. The antigen-binding molecule and pharmaceutical compositions thereof can be used to target cells expressing DLL3 for use in immunotherapy to treat various cancers, particularly cancers associated with DLL3, such as DLL3-positive cancers.

Claims (19)

がんの治療において使用するための、抗体と薬学的に許容される担体とを含む医薬製剤であって、抗体が、
(a)以下の(a1)または(a2)のいずれか1つを含むFab分子である、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分:
(a1)配列番号:20の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:34の重鎖CDR 2、配列番号:48の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
(a2)配列番号:28の重鎖相補性決定領域(CDR) 1、配列番号:42の重鎖CDR 2、配列番号:56の重鎖CDR 3、配列番号:63の軽鎖CDR 1、配列番号:68の軽鎖CDR 2、および配列番号:73の軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域;
ならびに
(b)ヒトデルタ様3(DLL3)に結合し、かつ配列番号:233を含む重鎖CDR 1、配列番号:234を含む重鎖CDR 2、配列番号:235を含む重鎖CDR 3、配列番号:237を含む軽鎖CDR 1、配列番号:238を含む軽鎖CDR 2、および配列番号:239を含む軽鎖CDR 3を含む抗体可変領域を含む、第3の抗原結合部分
を含み
第1の抗原結合部分のCH1領域と第2の抗原結合部分のCH1領域との間で形成される少なくとも1つのジスルフィド結合を含み、且つ
第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、以下の特性:
(i)ヒトCD3に結合する;
(ii)ヒトCD137に結合する;または
(iii)ヒトCD3およびヒトCD137に結合でき、ヒトCD3およびヒトCD137のいずれか一方に結合する
のうち1つ、2つまたはそれ以上を有する
前記医薬製剤。
1. A pharmaceutical formulation comprising an antibody and a pharma- ceutical acceptable carrier for use in the treatment of cancer, wherein the antibody is
(a) a first antigen-binding portion and a second antigen-binding portion that are Fab molecules comprising any one of the following (a1) or (a2):
(a1) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 20, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 34, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 48, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
(a2) an antibody variable region comprising a heavy chain complementarity determining region (CDR) 1 of SEQ ID NO: 28, a heavy chain CDR 2 of SEQ ID NO: 42, a heavy chain CDR 3 of SEQ ID NO: 56, a light chain CDR 1 of SEQ ID NO: 63, a light chain CDR 2 of SEQ ID NO: 68, and a light chain CDR 3 of SEQ ID NO: 73;
and (b) a third antigen-binding portion that binds human Delta-like 3 (DLL3) and comprises an antibody variable region comprising a heavy chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 233, a heavy chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 234, a heavy chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 235, a light chain CDR 1 comprising SEQ ID NO: 237, a light chain CDR 2 comprising SEQ ID NO: 238, and a light chain CDR 3 comprising SEQ ID NO: 239 ;
at least one disulfide bond formed between the CH1 region of the first antigen-binding portion and the CH1 region of the second antigen-binding portion ; and
Each of the first antigen-binding moiety and the second antigen-binding moiety has the following properties:
(i) binds to human CD3;
(ii) binds to human CD137; or
(iii) capable of binding to human CD3 and human CD137, and capable of binding to either human CD3 or human CD137
having one, two or more of the following :
The pharmaceutical preparation.
第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、以下の(a1)または(a2)のいずれか1つ:
(a1)配列番号:6のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および配列番号:58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(a2)配列番号:14のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号:58のアミノ酸配列を含むVL;
を含む、
請求項1記載の医薬製剤。
Each of the first antigen-binding moiety and the second antigen-binding moiety is any one of the following (a1) or (a2):
(a1) a heavy chain variable region (VH) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, and a light chain variable region (VL) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(a2) VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
Including,
2. The pharmaceutical formulation of claim 1.
第3の抗原結合部分が、配列番号:232を含むVHと配列番号:236を含むVLとを含む抗体可変領域を含む、請求項1または請求項2記載の医薬製剤。 The pharmaceutical formulation according to claim 1 or 2, wherein the third antigen-binding portion comprises an antibody variable region comprising a VH comprising SEQ ID NO: 232 and a VL comprising SEQ ID NO: 236. 前記少なくとも1つのジスルフィド結合が、第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCH1領域の191位(EUナンバリング)のシステイン残基で形成される、請求項1または請求項2記載の医薬製剤。 The pharmaceutical formulation according to claim 1 or 2, wherein the at least one disulfide bond is formed with a cysteine residue at position 191 (EU numbering) of the CH1 region of each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion. 第1の、第2の、および第3の抗原結合部分のそれぞれが、VHおよび CH1ドメインを含む重鎖とVLおよび軽鎖定常(CL)ドメインを含む軽鎖とを含むFabであり、かつ第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれかのFab重鎖のN末端に、直接的にまたはペプチドリンカーを介して融合されている、請求項1または請求項2記載の医薬製剤。 The pharmaceutical formulation according to claim 1 or claim 2, wherein each of the first, second, and third antigen-binding moieties is a Fab comprising a heavy chain comprising a VH and CH1 domain and a light chain comprising a VL and a light chain constant (CL) domain, and the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding moiety is fused, directly or via a peptide linker, to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding moiety or the second antigen-binding moiety. 第3の抗原結合部分の重鎖のC末端が、第1の抗原結合部分または第2の抗原結合部分のいずれかのFab重鎖のN末端に、ペプチドリンカーを介して融合されており、かつペプチドリンカーが、配列番号:248、配列番号:249、および配列番号:259からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する、請求項5記載の医薬製剤。 6. The pharmaceutical formulation of claim 5, wherein the C-terminus of the heavy chain of the third antigen-binding portion is fused to the N-terminus of the Fab heavy chain of either the first antigen-binding portion or the second antigen-binding portion via a peptide linker, and the peptide linker has an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, and SEQ ID NO: 259 . 第3の抗原結合部分が、Fab軽鎖およびFab重鎖の可変領域が交換されているクロスオーバーFab分子であり、かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれが、従来型のFab分子である、請求項6記載の医薬製剤。 7. The pharmaceutical formulation of claim 6, wherein the third antigen-binding portion is a crossover Fab molecule in which the variable regions of the Fab light chain and the Fab heavy chain have been exchanged, and each of the first antigen-binding portion and the second antigen-binding portion is a conventional Fab molecule. 第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCLドメインにおいて、123位および124位(Kabatナンバリング)にあるアミノ酸がそれぞれ、アルギニンおよびリジンであり;かつ第1の抗原結合部分および第2の抗原結合部分のそれぞれのCH1ドメインにおいて、147位および213位(EUナンバリング)の各々にあるアミノ酸がグルタミン酸である、請求項7記載の医薬製剤。 8. The pharmaceutical formulation of claim 7, wherein in the CL domain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 123 and 124 (Kabat numbering) are arginine and lysine, respectively; and in the CH1 domain of each of the first and second antigen-binding moieties, the amino acids at positions 147 and 213 (EU numbering) are glutamic acid. 抗体が、Fcドメインをさらに含む、請求項1または請求項2記載の医薬製剤。 3. The pharmaceutical formulation of claim 1 or claim 2, wherein the antibody further comprises an Fc domain. 以下の(A)~(C)からなる群:
(A)配列番号:201のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:208のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、およびそれぞれが配列番号:214のアミノ酸配列を含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5);
(B)配列番号:203のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、およびそれぞれが配列番号:214のアミノ酸配列を含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5);ならびに
(C)配列番号:204のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖1)、配列番号:206のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖2)、配列番号:209のアミノ酸配列を含むポリペプチド鎖(鎖3)、およびそれぞれが配列番号:214のアミノ酸配列を含む2本のポリペプチド鎖(鎖4および5)
より選択される組み合わせで5本のポリペプチド鎖を含む抗体と薬学的に許容される担体とを含む、がんの治療において使用するための医薬製剤。
The group consisting of the following (A) to (C):
(A) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:201, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:208, and two polypeptide chains (chains 4 and 5), each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214;
(B) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:203, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214; and (C) a polypeptide chain (chain 1) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:204, a polypeptide chain (chain 2) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:206, a polypeptide chain (chain 3) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:209, and two polypeptide chains (chains 4 and 5) each comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO:214.
23. A pharmaceutical formulation for use in the treatment of cancer comprising an antibody comprising five polypeptide chains in a combination selected from the following:
がんが、DLL3発現がんまたはDLL3陽性がんである、請求項1、2または10記載の医薬製剤。 11. The pharmaceutical formulation of claim 1, 2 or 10 , wherein the cancer is a DLL3-expressing or DLL3-positive cancer. がんが、DLL3を発現するか、若しくはDLL3陽性である、神経内分泌新生物(NEN)、神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌がん(NEC)、または非神経内分泌起源の他の固形腫瘍である、請求項11記載の医薬製剤。 12. The pharmaceutical formulation of claim 11, wherein the cancer is a neuroendocrine neoplasm (NEN), neuroendocrine tumor (NET), neuroendocrine carcinoma (NEC), or other solid tumor of non-neuroendocrine origin that expresses or is DLL3 positive. がんが、膵神経内分泌腫瘍(PNET)、小細胞型NEC(SCNEC)、大細胞型NEC(LCNEC)、小細胞肺がん(SCLC)、大細胞神経内分泌肺がん、神経内分泌前立腺がん(NEPC)、メルケル細胞がん、小細胞膀胱がん、GI神経内分泌がん、甲状腺髄様がん(medullary thyroid carcinoma; MTC)、膵消化管神経内分泌がん(GEP NEC)、神経芽腫、神経膠腫または膠芽腫(GBM)、黒色腫、および甲状腺髄様がん(medullary thyroid cancer)からなる群より選択されるがんである、請求項1、2または10記載の医薬製剤。 11. The pharmaceutical formulation of claim 1, 2 or 10, wherein the cancer is selected from the group consisting of pancreatic neuroendocrine tumor (PNET), small cell NEC (SCNEC), large cell NEC (LCNEC), small cell lung cancer (SCLC), large cell neuroendocrine lung cancer, neuroendocrine prostate cancer (NEPC), Merkel cell carcinoma, small cell bladder cancer, GI neuroendocrine cancer, medullary thyroid carcinoma (MTC), gastrointestinal pancreatic neuroendocrine carcinoma (GEP NEC), neuroblastoma, glioma or glioblastoma ( GBM ), melanoma, and medullary thyroid cancer. 追加の治療剤と組み合わせて使用するための、請求項1、2または10記載の医薬製剤。 13. The pharmaceutical formulation of claim 1, 2 or 10 for use in combination with an additional therapeutic agent. 追加の治療剤が、化学療法剤または免疫チェックポイント阻害剤である、請求項14記載の医薬製剤。 15. The pharmaceutical formulation of claim 14 , wherein the additional therapeutic agent is a chemotherapeutic agent or an immune checkpoint inhibitor. 免疫チェックポイント阻害剤が、PD-1軸結合アンタゴニストである、請求項15記載の医薬製剤。 16. The pharmaceutical formulation of claim 15 , wherein the immune checkpoint inhibitor is a PD-1 axis binding antagonist. PD-1軸結合アンタゴニストが、抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体である、請求項16記載の医薬製剤。 17. The pharmaceutical formulation of claim 16 , wherein the PD-1 axis binding antagonist is an anti-PD-1 antibody or an anti-PD-L1 antibody. 化学療法剤が、微小管破壊剤、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレート剤、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化剤、抗血管新生剤、エトポシド、イリノテカン、ルルビネクテジン、アムルビシン、または白金製剤である、請求項15記載の医薬製剤。 16. The pharmaceutical formulation of claim 15, wherein the chemotherapeutic agent is a microtubule disrupting agent, antimetabolite, topoisomerase inhibitor, DNA intercalating agent, alkylating agent, hormonal therapy, kinase inhibitor, receptor antagonist, activator of tumor cell apoptosis, antiangiogenic agent, etoposide, irinotecan, lurbinectedin, amrubicin, or a platinum agent. 白金製剤が、シスプラチンまたはカルボプラチンである、請求項18記載の医薬製剤。 19. The pharmaceutical preparation of claim 18 , wherein the platinum agent is cisplatin or carboplatin.
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