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JP7588969B2 - Transformants capable of producing gallic acid - Google Patents
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JP7588969B2 - Transformants capable of producing gallic acid - Google Patents

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Description

本発明は、没食子酸生産能を有する形質転換体、及び当該形質転換体を用いた没食子酸又はその塩の製造方法に関する。 The present invention relates to a transformant capable of producing gallic acid, and a method for producing gallic acid or a salt thereof using the transformant.

没食子酸は、還元性が強いことから、写真の現像剤や青インクの製造原料等に使用される。また、没食子酸プロピル等のエステルは、油脂やバターの酸化防止剤として使用されている。さらに、没食子酸を脱炭酸して合成されるピロガロールは、電子材料、有機合成試薬、写真の現像液、毛織物の媒染剤等として使用されている。 Gallic acid has a strong reducing effect, and is therefore used as a raw material for manufacturing photographic developers and blue inks. In addition, esters such as propyl gallate are used as antioxidants for oils and butter. Furthermore, pyrogallol, which is synthesized by decarboxylating gallic acid, is used as an electronic material, an organic synthesis reagent, a photographic developer, and a mordant for woolen fabrics.

従来、没食子酸の製造方法としては、茶、没食子、五倍子からの抽出法が挙げられるが、当該方法は製造コストが高いことから、工業的に安価に製造する方法が求められていた。
斯かる状況下、微生物を利用した発酵生産により、テレフタル酸、フタル酸、イソフタル酸またはパラヒドロキシ安息香酸等の原料から没食子酸を製造する方法が報告されている(特許文献1)。
Conventional methods for producing gallic acid include extraction from tea, gall nuts, and Chinese gall nut. However, these methods are expensive, and there has been a demand for an industrially inexpensive method for producing gallic acid.
Under these circumstances, a method for producing gallic acid from raw materials such as terephthalic acid, phthalic acid, isophthalic acid, or parahydroxybenzoic acid by fermentation using a microorganism has been reported (Patent Document 1).

そして、最近では、安価な原料であるグルコースを用いて没食子酸を生産する方法が所望され、例えばエシェリヒア属細菌又はクレブシェラ属細菌に、3-デヒドロシキミ酸をプロトカテク酸に変換する酵素(3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ)をコードする遺伝子とプロトカテク酸を没食子酸に変換する酵素(p-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ)をコードする遺伝子を導入した形質転換体を用いて、糖類からプロトカテク酸を経由して、没食子酸を製造する方法(特許文献2)等が報告されている。 Recently, there has been a demand for a method for producing gallic acid using glucose, an inexpensive raw material. For example, a method for producing gallic acid from sugars via protocatechuic acid has been reported (Patent Document 2), in which a transformant containing a gene encoding an enzyme that converts 3-dehydroshikimic acid to protocatechuic acid (3-dehydroshikimate dehydratase) and a gene encoding an enzyme that converts protocatechuic acid to gallic acid (p-hydroxybenzoic acid hydroxylase) has been introduced into a bacterium belonging to the genus Escherichia or Klebsiella.

特開2009-213392号公報JP 2009-213392 A 米国特許第6472190号明細書U.S. Pat. No. 6,472,190

本発明は、糖類を原料として没食子酸又はその塩を生産可能な形質転換体、及びこの形質転換体を用いて没食子酸又はその塩を製造する方法を提供することに関する。 The present invention relates to a transformant capable of producing gallic acid or a salt thereof using sugars as a raw material, and a method for producing gallic acid or a salt thereof using the transformant.

本発明者らは、没食子酸又はその塩を効率よく生産可能な形質転換体を得るべく研究を重ねた結果、従来行われていた3-デヒドロシキミ酸をプロトカテク酸に変換する反応とは別に、シキミ酸経路の最終代謝産物であるコリスミ酸からプロトカテク酸へ戻す経路を導入することで、没食子酸又はその塩を効率よく生産できる形質転換体が得られることを見出した。 As a result of extensive research aimed at obtaining a transformant capable of efficiently producing gallic acid or a salt thereof, the present inventors discovered that by introducing a pathway that converts chorismate, the final metabolic product of the shikimate pathway, back to protocatechuate, in addition to the conventional reaction of converting 3-dehydroshikimic acid to protocatechuic acid, a transformant capable of efficiently producing gallic acid or a salt thereof can be obtained.

すなわち、本発明は、以下の1)及び2)に係るものである。
1)(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドの発現が強化された没食子酸又はその塩の生産能を有する形質転換体。
2)1)の形質転換体を糖類の存在下で培養する工程を含む、没食子酸又はその塩の製造方法。
That is, the present invention relates to the following 1) and 2).
1) A transformant capable of producing gallic acid or a salt thereof, in which expression of (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid hydroxylase activity is enhanced.
2) A method for producing gallic acid or a salt thereof, comprising a step of culturing the transformant of 1) in the presence of a saccharide.

本発明によれば、没食子酸又はその塩を、環境負荷の少ない発酵法によって、安価かつ大量に生産することが可能となる。また、本発明の形質転換体では、コリスミ酸からの各代謝反応は阻害されておらず非栄養要求性であることから、当該形質転換体の培養に際し芳香族アミノ酸や芳香族ビタミンを添加する必要がない。 According to the present invention, it is possible to mass-produce gallic acid or its salts at low cost by a fermentation method that places little strain on the environment. In addition, in the transformant of the present invention, the metabolic reactions from chorismic acid are not inhibited and the transformant is non-auxotrophic, so there is no need to add aromatic amino acids or aromatic vitamins when culturing the transformant.

宿主としてコリネ型細菌を用いた場合の本発明の形質転換体における没食子酸生成経路を示す図。点線は、外来遺伝子産物による代謝反応を示す。1 is a diagram showing the gallic acid production pathway in the transformant of the present invention when a coryneform bacterium is used as a host, in which the dotted line indicates the metabolic reaction mediated by the foreign gene product.

本発明において、アミノ酸配列又はヌクレオチド配列の同一性は、Lipman-Pearson法(Science,1985,227:1435-1441)によって計算される。具体的には、遺伝情報処理ソフトウェアGENETYX Ver.12のホモロジー解析(Search homology)プログラムを用いて、Unit size to compare(ktup)を2として解析を行うことにより算出される。 In the present invention, the identity of an amino acid sequence or a nucleotide sequence is calculated by the Lipman-Pearson method (Science, 1985, 227: 1435-1441). Specifically, it is calculated by performing an analysis using the Search homology program of the genetic information processing software GENETYX Ver. 12 with the Unit size to compare (ktup) set to 2.

本発明において、アミノ酸配列又はヌクレオチド配列に関する「少なくとも90%の同一性」とは、90%以上、好ましくは95%以上、より好ましくは96%以上、さらに好ましくは97%以上、さらにより好ましくは98%以上、なお好ましくは99%以上の同一性をいう。 In the present invention, "at least 90% identity" with respect to an amino acid sequence or a nucleotide sequence means identity of 90% or more, preferably 95% or more, more preferably 96% or more, even more preferably 97% or more, even more preferably 98% or more, and even more preferably 99% or more.

本発明において、「1又は複数個のアミノ酸が欠失、置換、付加、又は挿入されたアミノ酸配列」とは、1個以上10個以下、好ましくは1個以上8個以下、より好ましくは1個以上5個以下、さらに好ましくは1個以上3個以下のアミノ酸が欠失、置換、付加、又は挿入されたアミノ酸配列をいう。また本明細書における「1又は複数個のヌクレオチドが欠失、置換、付加、又は挿入されたヌクレオチド配列」とは、1個以上30個以下、好ましくは1個以上24個以下、より好ましくは1個以上15個以下、さらにより好ましくは1個以上9個以下のヌクレオチドが欠失、置換、付加、又は挿入されたヌクレオチド配列をいう。本明細書において、アミノ酸又はヌクレオチドの「付加」には、配列の一末端及び両末端へのアミノ酸又はヌクレオチドの付加が含まれる。 In the present invention, "an amino acid sequence in which one or more amino acids have been deleted, substituted, added, or inserted" refers to an amino acid sequence in which 1 to 10, preferably 1 to 8, more preferably 1 to 5, and even more preferably 1 to 3 amino acids have been deleted, substituted, added, or inserted. In addition, in the present specification, "a nucleotide sequence in which one or more nucleotides have been deleted, substituted, added, or inserted" refers to a nucleotide sequence in which 1 to 30, preferably 1 to 24, more preferably 1 to 15, and even more preferably 1 to 9 nucleotides have been deleted, substituted, added, or inserted. In the present specification, "addition" of an amino acid or nucleotide includes addition of an amino acid or nucleotide to one end and both ends of a sequence.

本発明において、制御領域と遺伝子との「作動可能な連結」とは、遺伝子と制御領域とが、該遺伝子が該制御領域の制御の下で発現し得るように連結されていることをいう。遺伝子と制御領域との「作動可能な連結」の手順は当業者に周知である。 In the present invention, "operably linked" between a regulatory region and a gene means that the gene and regulatory region are linked in such a way that the gene can be expressed under the control of the regulatory region. The procedure for "operably linked" between a gene and a regulatory region is well known to those skilled in the art.

本発明において、細胞の機能や性状、形質に対して使用する用語「本来」とは、当該機能や性状、形質が当該細胞の野生型に存在していることを表すために使用される。対照的に、用語「外来」とは、当該細胞に元から存在するのではなく、外部から導入された機能や性状、形質を表すために使用される。例えば、「外来」遺伝子又はポリヌクレオチドとは、細胞に外部から導入された遺伝子又はポリヌクレオチドである。外来遺伝子又はポリヌクレオチドは、それが導入された細胞と同種の生物由来であっても、異種の生物由来(すなわち異種遺伝子又はポリヌクレオチド)であってもよい。 In the present invention, the term "native" used in reference to a function, property, or trait of a cell is used to indicate that the function, property, or trait is present in the wild-type form of the cell. In contrast, the term "exogenous" is used to indicate a function, property, or trait that is not inherently present in the cell, but is introduced from outside. For example, a "exogenous" gene or polynucleotide is a gene or polynucleotide that is introduced into a cell from outside. The exogenous gene or polynucleotide may be from the same organism as the cell into which it is introduced, or from a different organism (i.e., a heterologous gene or polynucleotide).

本発明において、「没食子酸」とは、3,4,5-トリヒドロキシ安息香酸(3,4,5-trihydroxybenzoic acid)を意味し、没食子酸の塩としては、斯かる塩としては、例えば、ナトリウム、カリウム等のアルカリ金属との塩、カルシウム、マグネシウム等のアルカリ土類金属との塩等が挙げられる。 In the present invention, "gallic acid" means 3,4,5-trihydroxybenzoic acid, and examples of salts of gallic acid include salts with alkali metals such as sodium and potassium, and salts with alkaline earth metals such as calcium and magnesium.

本発明において、没食子酸又はその塩の生産能を有する形質転換体は、(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドの発現が強化された微生物細胞である。
すなわち、本発明の形質転換体においては、シキミ酸経路の最終代謝産物であるコリスミ酸からプロトカテク酸へ戻す経路が導入され、当該プロトカテク酸から没食子酸が生産される(図1)。
ここで、(A)の3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドは、プロトカテク酸から没食子酸を生成する反応を触媒するポリペプチドであり、例えば、(A1)配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(A2)配列番号2で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3,4ージヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
ここで、配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コリネバクテリウム グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)由来のp-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ(pobA)の変異体である3,4ージヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドである(図1では「pobA*」と表記)。
In the present invention, the transformant capable of producing gallic acid or a salt thereof is a microbial cell in which expression of (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid hydroxylase activity is enhanced.
That is, in the transformant of the present invention, a pathway is introduced that converts chorismate, the final metabolic product of the shikimate pathway, back to protocatechuate, and gallic acid is produced from the protocatechuate (FIG. 1).
Here, the polypeptide (A) having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity is a polypeptide that catalyzes the reaction of producing gallic acid from protocatechuic acid, and examples thereof include (A1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, or (A2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 and having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity.
Here, the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity, which is a mutant of p-hydroxybenzoate hydroxylase (pobA) derived from Corynebacterium glutamicum (represented as "pobA*" in Figure 1).

(B)の3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドは、コリスミ酸から3-ヒドロキシ安息香酸を生成する反応を触媒するポリペプチドであり、例えば、(B1)配列番号6で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(B2)配列番号6で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
ここで、配列番号6で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、ストレプトマイセス ハイグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus)由来の3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼであり、「hyg5」として知られている。
The polypeptide (B) having 3-hydroxybenzoate synthase activity is a polypeptide that catalyzes the reaction of producing 3-hydroxybenzoic acid from chorismate, and examples thereof include (B1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 6, or (B2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 6 and having 3-hydroxybenzoate synthase activity.
Here, the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6 is 3-hydroxybenzoate synthase derived from Streptomyces hygroscopicus and is known as "hyg5."

(C)の3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドは、3-ヒドロキシ安息香酸からプロトカテク酸を生成する反応を触媒するポリペプチドであり、例えば、(C1)配列番号8で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(C2)配列番号8で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
ここで、配列番号8で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コマモナス テストステロニ(Comamonas testosteroni)由来の3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼであり、「mobA」として知られている。
The polypeptide (C) having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity is a polypeptide that catalyzes the reaction of producing protocatechuic acid from 3-hydroxybenzoic acid, and examples thereof include (C1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8, or (C2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8 and having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity.
Here, the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8 is 3-hydroxybenzoate hydroxylase derived from Comamonas testosteroni and is known as "mobA."

また、本発明の形質転換体は、没食子酸又はその塩の生産量を高める点から、さらに(D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドの発現を強化することができる。
(D)の3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドは、3-デヒドロシキミ酸からプロトカテク酸を生成する反応を触媒するポリペプチドであり、例えば、(D1)配列番号10で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(D2)配列番号10で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
ここで、配列番号10で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コリネバクテリウム グルタミカム由来の3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼであり、「qsuB」として知られている。
Furthermore, in order to increase the production amount of gallic acid or a salt thereof, the transformant of the present invention can further enhance the expression of (D) a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity.
The polypeptide (D) having 3-dehydroshikimic acid dehydratase activity is a polypeptide that catalyzes a reaction to produce protocatechuic acid from 3-dehydroshikimic acid, and examples thereof include (D1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10, or (D2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 and having 3-dehydroshikimic acid dehydratase activity.
Here, the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:10 is 3-dehydroshikimate dehydratase derived from Corynebacterium glutamicum and is known as "qsuB."

本発明の形質転換体は、さらに、(E)3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸(DAHP)シンターゼ活性を有するポリペプチド、(F)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド及び(G)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドからなる群より選ばれる少なくとも一つのポリペプチドの発現を強化することができる。
(E)のDAHPシンターゼ活性を有するポリペプチドは、エリスロース-4-リン酸及びホスホエノールピルビン酸とから、芳香族化合物生合成経路の初発代謝産物であるDAHPを生成するポリペプチドであり、例えば、(E1)配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(E2)配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つDAHPシンターゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
配列番号12で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コリネバクテリウム グルタミカム由来のDAHPシンターゼであり、「aroF」として知られている。
配列番号14で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コリネバクテリウム グルタミカム由来のDAHPシンターゼであり、「aroG」として知られている。
The transformant of the present invention can further enhance the expression of at least one polypeptide selected from the group consisting of (E) a polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate (DAHP) synthase activity, (F) a polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity, and (G) a polypeptide having transketolase activity.
The polypeptide (E) having DAHP synthase activity is a polypeptide that produces DAHP, the initial metabolic product in the aromatic compound biosynthetic pathway, from erythrose-4-phosphate and phosphoenolpyruvate. Examples of the polypeptide include (E1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 or SEQ ID NO:14, and (E2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 or SEQ ID NO:14 and having DAHP synthase activity.
The polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 is a DAHP synthase derived from Corynebacterium glutamicum and is known as "aroF."
The polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:14 is a DAHP synthase derived from Corynebacterium glutamicum and is known as "aroG."

(F)の3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドは、3-デヒドロキナ酸から3-デヒドロシキミ酸への変換を触媒するポリペプチドであり、例えば、(F1)配列番号16で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(F2)配列番号16で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
配列番号16で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コリネバクテリウム グルタミカム由来の3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼであり、「aroD」として知られている。
The polypeptide (F) having 3-dehydroquinate dehydratase activity is a polypeptide that catalyzes the conversion of 3-dehydroquinic acid to 3-dehydroshikimic acid, and examples thereof include (F1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16, or (F2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16 and having 3-dehydroquinate dehydratase activity.
The polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:16 is 3-dehydroquinate dehydratase derived from Corynebacterium glutamicum and is known as "aroD."

(G)のトランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドは、2種の反応を触媒する活性を有する。一つ目の反応は、非酸化的ペントース・リン酸経路において、D-キシルロース-5-リン酸からグリセルアルデヒド-3-リン酸への変換と、D-リボース-5-リン酸(R5P)からセドヘプツロース-7-リン酸(S7P)への変換とを触媒する反応である。これらの反応は可逆的で共役している。また、二つ目の反応は、D-フルクトース-6-リン酸(F6P)からエリスロース-4-リン酸(E4P)への変換と、グリセルアルデヒド-3-リン酸からD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒する反応である。これらの反応は可逆的で共役している。トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えば、(G1)配列番号18で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は(G2)配列番号18で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つトランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。
配列番号18で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、コリネバクテリウム グルタミカム由来のトランスケトラーゼであり、「tkt」として知られている。
The polypeptide having transketolase activity (G) has activity to catalyze two types of reactions. The first reaction is a reaction that catalyzes the conversion of D-xylulose-5-phosphate to glyceraldehyde-3-phosphate and the conversion of D-ribose-5-phosphate (R5P) to sedoheptulose-7-phosphate (S7P) in the nonoxidative pentose phosphate pathway. These reactions are reversible and coupled. The second reaction is a reaction that catalyzes the conversion of D-fructose-6-phosphate (F6P) to erythrose-4-phosphate (E4P) and the conversion of glyceraldehyde-3-phosphate to D-xylulose-5-phosphate. These reactions are reversible and coupled. Examples of polypeptides having transketolase activity include (G1) a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18, or (G2) a polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18 and having transketolase activity.
The polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:18 is a transketolase derived from Corynebacterium glutamicum and is known as "tkt."

配列番号2、6、8、10、12、14、16及び18で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列の例としては、配列番号2、6、8、10、12、14、16及び18で示されるアミノ酸配列に対して1又は複数個のアミノ酸が欠失、置換、付加、又は挿入されたアミノ酸配列が挙げられる。 Examples of amino acid sequences having at least 90% identity with the amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 2, 6, 8, 10, 12, 14, 16, and 18 include amino acid sequences in which one or more amino acids have been deleted, substituted, added, or inserted relative to the amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 2, 6, 8, 10, 12, 14, 16, and 18.

(A2)の配列番号2で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3,4ージヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばコリネバクテリウム属細菌由来の3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが挙げられ、具体的には、コリネバクテリウム グルタミカム由来の4-ヒドロキシ安息香酸-3-モノオキシゲナーゼ、コリネバクテリウム スラナレアエ(Corynebacterium suranareeae)由来の4-ヒドロキシ安息香酸-3-モノオキシゲナーゼ、コリネバクテリウム クルディラクティス(Corynebacterium crudilactis)由来の4-ヒドロキシ安息香酸-3-モノオキシゲナーゼ等が挙げられる。 (A2) Examples of polypeptides having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity and consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2 include polypeptides having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity derived from bacteria of the genus Corynebacterium, specifically 4-hydroxybenzoate-3-monooxygenase derived from Corynebacterium glutamicum, 4-hydroxybenzoate-3-monooxygenase derived from Corynebacterium suranareeae, and 4-hydroxybenzoate-3-monooxygenase derived from Corynebacterium crudilactis.

(B2)の配列番号6で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばストレプトマイセス属細菌由来の3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼが挙げられ、具体的には、ストレプトマイセス ハイグロスコイピカス由来の3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ、ストレプトマイセス マレイシエンシス(Streptomyces malaysiensis)由来のイミンデアミナーゼ等が挙げられる。 (B2) Examples of polypeptides having an amino acid sequence with at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6 and having 3-hydroxybenzoate synthase activity include 3-hydroxybenzoate synthase derived from bacteria of the genus Streptomyces, specifically 3-hydroxybenzoate synthase derived from Streptomyces hygroscoipicus, imine deaminase derived from Streptomyces malaysiensis, etc.

(C2)の配列番号8で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばコマモナス属細菌由来の3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼが挙げられ、具体的には、コマモナス テストステロニ由来の3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ、コマモナス チオオキシダンス(Comamonas thiooxydans)由来のフェノール-2-モノオキシゲナーゼ等が挙げられる。 (C2) Examples of polypeptides having an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8 and that have 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity include 3-hydroxybenzoate hydroxylases derived from bacteria of the genus Comamonas, specifically 3-hydroxybenzoate hydroxylase derived from Comamonas testosteroni and phenol-2-monooxygenase derived from Comamonas thiooxydans.

(D2)の配列番号10で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばコリネバクテリウム属細菌由来の3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼが挙げられ、具体的には、コリネバクテリウム グルタミカム由来の3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ、コリネバクテリウム スラナレアエ由来の3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ等が挙げられる。 (D2) Examples of polypeptides having an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:10 and that have 3-dehydroshikimate dehydratase activity include 3-dehydroshikimate dehydratase derived from bacteria of the genus Corynebacterium, specifically 3-dehydroshikimate dehydratase derived from Corynebacterium glutamicum and 3-dehydroshikimate dehydratase derived from Corynebacterium sulanareae.

(E2)の配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つDAHPシンターゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばコリネバクテリウム属細菌由来のDAHPシンターゼが挙げられ、具体的には、コリネバクテリウム グルタミカム由来のDAHPシンターゼ、コリネバクテリウム スラナレアエ由来のDAHPシンターゼ、コリネバクテリウム エフィシエンス由来のDAHPシンターゼ等が挙げられる。 (E2) Examples of polypeptides having an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 12 or SEQ ID NO: 14 and that have DAHP synthase activity include DAHP synthases derived from bacteria of the genus Corynebacterium, specifically DAHP synthases derived from Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium thalanaeae, and Corynebacterium efficiens.

(F2)の配列番号16で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つ3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばコリネバクテリウム属細菌由来の3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼが挙げられ、具体的には、コリネバクテリウム グルタミカム由来の3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ、コリネバクテリウム クルディラクティス由来の3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ、コリネバクテリウム デセルティ由来の3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ等が挙げられる。 (F2) Examples of polypeptides having an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:16 and that have 3-dehydroquinate dehydratase activity include 3-dehydroquinate dehydratases derived from bacteria of the genus Corynebacterium, specifically 3-dehydroquinate dehydratases derived from Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium curdilactis, and Corynebacterium desertii.

(G2)の配列番号18で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つトランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドとしては、例えばコリネバクテリウム属細菌由来のトランスケトラーゼが挙げられ、具体的には、コリネバクテリウム グルタミカム由来のトランスケトラーゼ、コリネバクテリウム クルディラクティス由来のトランスケトラーゼ、コリネバクテリウム スラナレアエ由来のトランスケトラーゼ等が挙げられる。 Examples of polypeptides having transketolase activity and consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:18 of (G2) include transketolase derived from bacteria of the genus Corynebacterium, specifically transketolase derived from Corynebacterium glutamicum, transketolase derived from Corynebacterium curdilactis, transketolase derived from Corynebacterium thalanareae, etc.

上記ポリペプチドのアミノ酸配列に対してアミノ酸の欠失、置換、付加、又は挿入等の変異を導入する方法としては、例えば、該アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列に対してヌクレオチドの欠失、置換、付加、又は挿入等の変異を導入する方法が挙げられる。ヌクレオチド配列への変異導入の手法としては、例えば、エチルメタンスルホネート、N-メチル-N-ニトロソグアニジン、亜硝酸等の化学的変異原又は紫外線、X線、ガンマ線、イオンビーム等の物理的変異原による突然変異誘発、部位特異的変異導入法、Dieffenbachら(Cold Spring Harbar Laboratory Press,New York,581-621,1995)に記載の方法、等が挙げられる。部位特異的変異導入の手法としては、Splicing overlap extension(SOE)PCR(Horton et al.,Gene 77,61-68,1989)を利用した方法、ODA法(Hashimoto-Gotoh et al.,Gene,152,271-276,1995)、Kunkel法(Kunkel,T.A.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1985,82,488)等が挙げられる。あるいは、Site-Directed Mutagenesis System Mutan-SuperExpress Kmキット(タカラバイオ社)、TransformerTM Site-Directed Mutagenesisキット(Clonetech社)、KOD-Plus-Mutagenesis Kit(東洋紡社)等の市販の部位特異的変異導入用キットを利用することもできる。 Examples of methods for introducing mutations such as deletion, substitution, addition, or insertion of amino acids into the amino acid sequence of the above-mentioned polypeptide include methods for introducing mutations such as deletion, substitution, addition, or insertion of nucleotides into the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence. Examples of methods for introducing mutations into nucleotide sequences include mutagenesis using chemical mutagens such as ethyl methanesulfonate, N-methyl-N-nitrosoguanidine, and nitrous acid, or physical mutagens such as ultraviolet light, X-rays, gamma rays, and ion beams, site-directed mutagenesis, and the method described in Dieffenbach et al. (Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 581-621, 1995), and the like. Examples of the site-specific mutagenesis technique include a method using splicing overlap extension (SOE) PCR (Horton et al., Gene 77, 61-68, 1989), the ODA method (Hashimoto-Gotoh et al., Gene, 152, 271-276, 1995), and the Kunkel method (Kunkel, T. A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1985, 82, 488). Alternatively, commercially available site-directed mutagenesis kits such as Site-Directed Mutagenesis System Mutan-SuperExpress Km Kit (Takara Bio), Transformer Site-Directed Mutagenesis Kit (Clonetech), and KOD-Plus-Mutagenesis Kit (Toyobo) can also be used.

本発明において、上記(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド、及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、所望により(D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド、所望により(E)DAHPシンターゼ活性を有するポリペプチド、(F)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド及び(G)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドからなる群より選ばれる少なくとも一つのポリペプチドの発現が強化された形質転換細胞としては、具体的には、当該ポリペプチドの発現に必要なポリヌクレオチドが発現可能なように導入された細胞であって、そのポリペプチドは外来のものであっても、当該細胞が本来有しているものであっても良い。例えば、当該ポリヌクレオチドが発現可能なように導入された細胞、当該ポリヌクレオチドの発現の程度が増強された細胞が挙げられる。具体的には、当該ポリヌクレオチド及びこれと作動可能に連結された制御領域を含むベクターやDNA断片が導入された細胞や、当該ポリヌクレオチドの制御領域が強制御領域に置換された細胞等が挙げられる。 In the present invention, the transformed cell in which the expression of at least one polypeptide selected from the group consisting of (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid hydroxylase activity, optionally (D) a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity, optionally (E) a polypeptide having DAHP synthase activity, (F) a polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity, and (G) a polypeptide having transketolase activity is enhanced is specifically a cell into which a polynucleotide necessary for the expression of the polypeptide has been introduced so as to be expressible, and the polypeptide may be foreign or may be inherent to the cell. For example, a cell into which the polynucleotide has been introduced so as to be expressible, and a cell in which the degree of expression of the polynucleotide has been enhanced are included. Specifically, examples of such cells include cells into which a vector or DNA fragment containing the polynucleotide and a control region operably linked thereto has been introduced, and cells in which the control region of the polynucleotide has been replaced with a strong control region.

ここで、ポリヌクレオチドとしては、(a)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(a1)又は(a2)のポリヌクレオチド、(b)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(b1)又は(b2)のポリヌクレオチド、(c)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(c1)又は(c2)のポリヌクレオチド、(d)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(d1)又は(d2)のポリヌクレオチド、(e)DAHPシンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(e1)又は(e2)のポリヌクレオチド、(f)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(f1)又は(f2)のポリヌクレオチド、(g)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとして、下記(g1)又は(g2)のポリヌクレオチド、が挙げられる(これらのポリヌクレオチドを、「本発明のポリヌクレオチド」とも称する)。 Here, the polynucleotides include (a) the polynucleotide (a1) or (a2) below as a polynucleotide encoding a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity, (b) the polynucleotide (b1) or (b2) below as a polynucleotide encoding a polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity, (c) the polynucleotide (c1) or (c2) below as a polynucleotide encoding a polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity, and (d) the polynucleotide encoding a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity. Examples of the polynucleotide that encodes a polypeptide having DAHP synthase activity include the polynucleotide (d1) or (d2) below; (e) a polynucleotide that encodes a polypeptide having DAHP synthase activity includes the polynucleotide (e1) or (e2) below; (f) a polynucleotide that encodes a polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity includes the polynucleotide (f1) or (f2) below; and (g) a polynucleotide that encodes a polypeptide having transketolase activity includes the polynucleotide (g1) or (g2) below (these polynucleotides are also referred to as "polynucleotides of the present invention").

(a1)配列番号1又は配列番号3で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(a2)配列番号1又は配列番号3で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。なお、ここで、配列番号3で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドは、配列番号4で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするが、当該ポリペプチドは配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドと同一である。
(b1)配列番号5で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(b2)配列番号5で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
(c1)配列番号7で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(c2)配列番号7で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
(d1)配列番号9で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(d2)配列番号9で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
(e1)配列番号11又は配列番号13で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(e2)配列番号11又は配列番号13で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、DAHPシンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
(f1)配列番号15で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(f2)配列番号15で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
(g1)配列番号17で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド、又は(g2)配列番号17で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
(a1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:1 or SEQ ID NO:3, or (a2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:1 or SEQ ID NO:3 and encoding a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity. Note that, here, the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:3 encodes a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:4, which is identical to the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2.
(b1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:5, or (b2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:5, and encoding a polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity.
(c1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 7, or (c2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 7, and encoding a polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity.
(d1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:9, or (d2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:9 and encoding a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity.
(e1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:11 or SEQ ID NO:13, or (e2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:11 or SEQ ID NO:13, and encoding a polypeptide having DAHP synthase activity.
(f1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 15, or (f2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 15, and encoding a polypeptide having 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE activity.
(g1) A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 17, or (g2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 17, and encoding a polypeptide having transketolase activity.

配列番号1、3、5、7、9、11、13、15及び17で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列の例としては、配列番号1、3、5、7、9、11、13、15及び17で示されるヌクレオチド配列に対して1又は複数個のヌクレオチドが欠失、置換、付加、又は挿入されたヌクレオチド配列が挙げられる。ヌクレオチド配列にヌクレオチドの欠失、置換、付加、又は挿入等の変異を導入する方法は、上述したとおりである。上記ポリヌクレオチドは、1本鎖若しくは2本鎖の形態であり得、又はDNAであってもRNAであってもよい。該DNAは、cDNA、化学合成DNA等の人工DNAであり得る。 Examples of nucleotide sequences having at least 90% identity to the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, and 17 include nucleotide sequences in which one or more nucleotides have been deleted, substituted, added, or inserted relative to the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, and 17. Methods for introducing mutations such as deletion, substitution, addition, or insertion of nucleotides into a nucleotide sequence are as described above. The polynucleotide may be in the form of a single strand or a double strand, or may be DNA or RNA. The DNA may be artificial DNA such as cDNA or chemically synthesized DNA.

上記ポリヌクレオチドは、ベクターに組み込まれていてもよい。好ましくは、本発明のポリヌクレオチドを含有するベクターは、発現ベクターである。また好ましくは、該ベクターは、本発明のポリヌクレオチドを宿主微生物に導入することができ、かつ宿主微生物内で該ポリヌクレオチドを発現することができる発現ベクターである。好ましくは、該ベクターは、本発明のポリヌクレオチド、及びこれと作動可能に連結された制御領域を含む。該ベクターは、プラスミド等の染色体外で自立増殖及び複製可能なベクターであってもよく、又は染色体内に組み込まれるベクターであってもよい。 The polynucleotide may be incorporated into a vector. Preferably, the vector containing the polynucleotide of the present invention is an expression vector. Also preferably, the vector is an expression vector capable of introducing the polynucleotide of the present invention into a host microorganism and expressing the polynucleotide in the host microorganism. Preferably, the vector contains the polynucleotide of the present invention and a control region operably linked thereto. The vector may be a vector capable of autonomously replicating and replicating outside a chromosome, such as a plasmid, or may be a vector that is incorporated into a chromosome.

具体的なベクターの例としては、例えば、pBluescript II SK(-)(Stratagene)、pUC18/19、pUC118/119等のpUC系ベクター(タカラバイオ)、pET系ベクター(タカラバイオ)、pGEX系ベクター(GEヘルスケア)、pCold系ベクター(タカラバイオ)、pHY300PLK(タカラバイオ)、pUB110(Mckenzie,T.et al.,1986,Plasmid 15(2):93-103)、pBR322(タカラバイオ)、pRS403(Stratagene)、pMW218/219(ニッポンジーン)、pRI909/910等のpRI系ベクター(タカラバイオ)、pBI系ベクター(クロンテック)、IN3系ベクター(インプランタイノベーションズ)、pPTR1/2(タカラバイオ)、pDJB2(D.J.Ballance et al.,Gene,36,321-331,1985)、pAB4-1(van Hartingsveldt W et al.,Mol Gen Genet,206,71-75,1987)、pLeu4(M.I.G.Roncero et al.,Gene,84,335-343,1989)、pPyr225(C.D.Skory et al.,Mol Genet Genomics,268,397-406,2002)、pFG1(Gruber,F.et al.,Curr Genet,18,447-451,1990)等が挙げられる。 Specific examples of vectors include pBluescript II SK(-) (Stratagene), pUC18/19, pUC118/119 and other pUC vectors (Takara Bio), pET vectors (Takara Bio), pGEX vectors (GE Healthcare), pCold vectors (Takara Bio), pHY300PLK (Takara Bio), and pUB110 (Mckenzie, T. et al., 1986, Plasmid 15(2):93-103), pBR322 (Takara Bio), pRS403 (Stratagene), pMW218/219 (Nippon Gene), pRI-based vectors such as pRI909/910 (Takara Bio), pBI-based vectors (Clontech), IN3-based vectors (Implanta Innovations), pPTR1/2 (Takara Bio), pDJB2 (D.J.Ballance et al., Gene,36,321-331,1985), pAB4-1 (van Hartingsveldt W et al., Mol Gen Genet,206,71-75,1987), pLeu4 (M.I.G.Roncero et al., al., Gene, 84, 335-343, 1989), pPyr225 (C.D.Skory et al., Mol Genet Genomics, 268, 397-406, 2002), pFG1 (Gruber, F. et al., Curr Genet, 18, 447-451, 1990), etc.

また、上記ポリヌクレオチドは、これを含むDNA断片として構築されていてもよい。該DNA断片としては、例えば、PCR増幅DNA断片及び制限酵素切断DNA断片が挙げられる。好ましくは、該DNA断片は、本発明のポリヌクレオチド、及びこれと作動可能に連結された制御領域を含む発現カセットであり得る。 The polynucleotide may be constructed as a DNA fragment containing the polynucleotide. Examples of the DNA fragment include a PCR-amplified DNA fragment and a restriction enzyme-cleaved DNA fragment. Preferably, the DNA fragment may be an expression cassette containing the polynucleotide of the present invention and a control region operably linked thereto.

上記ベクター又はDNA断片に含まれる制御領域は、該ベクター又はDNA断片が導入された宿主細胞内で本発明のポリヌクレオチドを発現させるための配列であり、例えばプロモーターやターミネーター等の発現調節領域、複製開始点等が挙げられる。該制御領域の種類は、ベクター又はDNA断片を導入する宿主微生物の種類に応じて適宜選択することができる。必要に応じて、該ベクター又はDNA断片はさらに、抗生物質耐性遺伝子、アミノ酸合成関連遺伝子等の選択マーカーを有していてもよい。 The control region contained in the vector or DNA fragment is a sequence for expressing the polynucleotide of the present invention in a host cell into which the vector or DNA fragment has been introduced, and examples of such control regions include expression control regions such as promoters and terminators, and replication origins. The type of control region can be appropriately selected depending on the type of host microorganism into which the vector or DNA fragment is introduced. If necessary, the vector or DNA fragment may further have a selection marker such as an antibiotic resistance gene or an amino acid synthesis-related gene.

宿主細胞へのベクター又はDNA断片の導入には、一般的な形質転換法、例えばエレクトロポレーション法、トランスフォーメーション法、トランスフェクション法、接合法、プロトプラスト法、パーティクル・ガン法、アグロバクテリウム法等を用いることができる。 To introduce a vector or DNA fragment into a host cell, a general transformation method such as electroporation, transformation, transfection, conjugation, protoplast, particle gun, or Agrobacterium can be used.

目的のベクター又はDNA断片が導入された形質転換細胞は、選択マーカーを利用して選択することができる。例えば、選択マーカーが抗生物質耐性遺伝子である場合、該抗生物質添加培地で培養することで、目的のベクター又はDNA断片が導入された細胞を選択することができる。また例えば、選択マーカーがアミノ酸合成関連遺伝子である場合、該アミノ酸要求性の宿主細胞に遺伝子導入した後、該アミノ酸要求性の有無を指標に、目的のベクター又はDNA断片が導入された細胞を選択することができる。あるいは、PCR等によって形質転細胞のDNA配列を調べることで目的のベクター又はDNA断片の導入を確認することもできる。 Transformed cells into which a vector or DNA fragment of interest has been introduced can be selected using a selection marker. For example, if the selection marker is an antibiotic resistance gene, cells into which a vector or DNA fragment of interest has been introduced can be selected by culturing the cells in a medium containing the antibiotic. For example, if the selection marker is an amino acid synthesis-related gene, the gene can be introduced into a host cell that requires the amino acid, and then the presence or absence of the amino acid requirement can be used as an indicator to select cells into which a vector or DNA fragment of interest has been introduced. Alternatively, the introduction of a vector or DNA fragment of interest can be confirmed by examining the DNA sequence of transformed cells using PCR or the like.

また、強制御領域としては、公知の高発現プロモーターであるT7プロモーター、lacプロモーター、tacプロモーター、trpプロモーター、tuプロモーター、gapプロモーター等が例示されるが、これらに特に限定されない。
更に、強制御領域としては原核生物由来の誘導プロモーターを用いることができ、フェルラ酸、バニリン酸またはバニリンの添加により誘導がかかるvanAプロモーター、レゾルシノールまたは2,4-ジヒドロキシ安息香酸の添加により誘導がかかるrhcHプロモーター、4-ヒドロキシ安息香酸の添加により誘導がかかるpcaIプロモーター、3-ヒドロキシ安息香酸の添加により誘導がかかるnagI(cg3351)遺伝子のプロモーター、安息香酸の添加により誘導がかかるbenA(cg2637)遺伝子のプロモーター(以下、Pbenと略す)、もしくはフラクトースまたはスクロースのいずれかの添加により誘導がかかるcg2118遺伝子のプロモーターまたはptsS(cg2925)遺伝子のプロモーター等が例示されるが、これらに特に限定されない。
宿主細胞のゲノム上に存在する前記ポリヌクレオチドの制御領域を強制御領域に置換する方法としては、強制御領域と選択マーカーのポリヌクレオチド配列を含むDNA断片を宿主細胞に導入し、相同組換え又は非相同組換え等により形質転換された細胞を選択する方法等が挙げられる。
Furthermore, examples of strong regulatory regions include known high expression promoters such as T7 promoter, lac promoter, tac promoter, trp promoter, tu promoter, and gap promoter, but are not particularly limited to these.
Furthermore, as the strong regulatory region, an inducible promoter derived from a prokaryote can be used, and examples thereof include, but are not limited to, the vanA promoter which is induced by the addition of ferulic acid, vanillic acid, or vanillin, the rhcH promoter which is induced by the addition of resorcinol or 2,4-dihydroxybenzoic acid, the pcaI promoter which is induced by the addition of 4-hydroxybenzoic acid, the promoter of the nagI (cg3351) gene which is induced by the addition of 3-hydroxybenzoic acid, the promoter of the benA (cg2637) gene which is induced by the addition of benzoic acid (hereinafter, abbreviated as Pben), or the promoter of the cg2118 gene or the promoter of the ptsS (cg2925) gene which are induced by the addition of either fructose or sucrose.
Methods for replacing the regulatory region of the polynucleotide present on the genome of a host cell with a strong regulatory region include a method in which a DNA fragment containing the strong regulatory region and a polynucleotide sequence of a selection marker is introduced into a host cell, and cells transformed by homologous recombination or non-homologous recombination are selected.

本発明において、宿主細胞は、没食子酸又はその塩の生産に適するものであれば、大腸菌、枯草菌、放線菌、シュードモナス属細菌、ストレプトコッカス属細菌、ラクトバチルス属細菌、真菌(ノイロスポラ属、アスペルギルス属、トリコデルマ属等)、酵母(サッカロマイセス属、クライベロマイセス属、シゾサッカロマイセス属、ヤロウィア属、トリコスポロン属、ロドスポリジウム属、ピキア属、キャンディダ属等)等、いずれを用いてもよいが、放線菌が好ましい。 In the present invention, the host cell may be any suitable cell for producing gallic acid or a salt thereof, such as Escherichia coli, Bacillus subtilis, actinomycetes, bacteria of the genus Pseudomonas, bacteria of the genus Streptococcus, bacteria of the genus Lactobacillus, fungi (such as those of the genus Neurospora, Aspergillus, and Trichoderma), yeasts (such as those of the genus Saccharomyces, Kluyveromyces, Schizosaccharomyces, Yarrowia, Trichosporon, Rhodosporidium, Pichia, and Candida), but actinomycetes are preferred.

放線菌としては、コリネ型細菌として定義されている一群の微生物(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology、Vol. 8、599(1974))が好ましく、具体的には、コリネバクテリウム属菌、ブレビバクテリウム属菌、アースロバクター属菌、マイコバクテリウム属菌、ロドコッカス属菌、ストレプトマイセス属菌、マイクロコッカス属菌、等が挙げられる。
コリネバクテリウム属菌としては、コリネバクテリウム グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)、コリネバクテリウム エフィシェンス(Corynebacterium efficiens)、コリネバクテリウム アンモニアゲネス(Corynebacterium ammoniagenes)、コリネバクテリウム ハロトレランス(Corynebacterium halotolerance)、コリネバクテリウム アルカノリティカム(Corynebacterium alkanolyticum)等が挙げられる。
ブレビバクテリウム属菌としては、ブレビバクテリウム アンモニアゲネス(Brevibacterium ammoniagenes)等が挙げられる。
アースロバクター属菌としては、アースロバクター グロビフォルミス(Arthrobacter globiformis)等が挙げられる。
マイコバクテリウム属菌としては、マイコバクテリウム ボビス等が挙げら、マイクロコッカス属菌としては、マイクロコッカス フロイデンライヒ(Micrococcus freudenreichii)、マイクロコッカス ルテウス(Micrococcus leuteus)、マイクロコッカス ウレアエ(Micrococcus ureae)、マイクロコッカス ロゼウス(Micrococcus roseus)等が挙げられる。
コリネ型細菌のうち、好ましくはコリネバクテリウム属菌であり、より好ましくはコリネバクテリウム グルタミカムである。
As actinomycetes, a group of microorganisms defined as coryneform bacteria (Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, Vol. 8, 599 (1974)) is preferred, and specific examples thereof include bacteria of the genus Corynebacterium, Brevibacterium, Arthrobacter, Mycobacterium, Rhodococcus, Streptomyces, Micrococcus, etc.
Examples of bacteria of the genus Corynebacterium include Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium halotolerance, and Corynebacterium alkanolyticum.
Examples of the Brevibacterium genus include Brevibacterium ammoniagenes.
Examples of the Arthrobacter genus include Arthrobacter globiformis.
Examples of bacteria belonging to the genus Mycobacterium include Mycobacterium bovis, and examples of bacteria belonging to the genus Micrococcus include Micrococcus freudenreichii, Micrococcus leuteus, Micrococcus ureae, Micrococcus roseus, and the like.
Among the coryneform bacteria, the genus Corynebacterium is preferred, and Corynebacterium glutamicum is more preferred.

また、コリネ型細菌は、野生株の他に、その変異株や人為的な遺伝子組換え体であってもよい。例えば、ラクテート(乳酸)デヒドロゲナーゼ(lactate dehydrogenase:LDH)、ホスホエノールピルベートカルボキシラーゼ(phosphoenolpyruvate carboxylase)、マレートデヒドロゲナーゼ(malate dehydrogenase)等の遺伝子の破壊株が挙げられる。 In addition to wild-type strains, coryneform bacteria may be mutants or artificially genetically modified strains. For example, they may be strains in which genes such as lactate dehydrogenase (LDH), phosphoenolpyruvate carboxylase, and malate dehydrogenase are disrupted.

作製された形質転換体において、(A)~(G)の各酵素の活性が強化されていることは、該形質転換体の細胞抽出液中の各酵素活性を測定することにより確認することができる。そして、作製された形質転換細胞を培養し、没食子酸又はその塩の生産性を評価し、適切な形質転換細胞を選択することにより、有用な没食子酸又はその塩の生産株を得ることができる。生産物の測定方法は、後記参考例に記載の方法にしたがって行うことができる。 The enhanced activity of each of the enzymes (A) to (G) in the prepared transformant can be confirmed by measuring the activity of each enzyme in a cell extract of the transformant. The prepared transformed cells are then cultured, the productivity of gallic acid or a salt thereof is evaluated, and an appropriate transformed cell is selected to obtain a useful strain producing gallic acid or a salt thereof. The product can be measured according to the method described in the Reference Example below.

本発明の没食子酸又はその塩の製造方法は、上述した形質転換細胞を糖類の存在下で培養することにより実施される。 The method for producing gallic acid or a salt thereof of the present invention is carried out by culturing the above-mentioned transformed cells in the presence of sugars.

糖類としては、グルコースが好適であるが、フルクトース、マンノース、アラビノース、キシロース、ガラクトース等の単糖類の他、代謝によりグルコースを生成し得る糖類も使用できる。このような糖類にはグルコース単位を有するオリゴ糖又は多糖類が含まれ、セロビオース、スクロース(ショ糖)、ラクトース、マルトース、トレハロース、セロビオース、キシロビオース等の二糖類;デキストリン又は可溶性澱粉等の多糖類等が挙げられる。
また、例えばこれらの原料化合物を含む原料として、糖蜜も用いることができる。また、わら(稲わら、大麦わら、小麦わら、ライ麦わら、オート麦わら等)、バガス、コーンストーバー等の非可食農産廃棄物や、スイッチグラス、ネピアグラス、ミスキャンサス等のエネルギー作物や、木くず、古紙等を糖化酵素等で糖化した、グルコース等の複数の糖を含む糖化液を用いることもできる。
As the saccharide, glucose is preferred, but in addition to monosaccharides such as fructose, mannose, arabinose, xylose, galactose, etc., saccharides that can generate glucose through metabolism can also be used. Such saccharides include oligosaccharides or polysaccharides having glucose units, such as disaccharides such as cellobiose, sucrose (cane sugar), lactose, maltose, trehalose, cellobiose, xylobiose, etc.; polysaccharides such as dextrin or soluble starch, etc.
Molasses can also be used as a raw material containing these raw material compounds. In addition, inedible agricultural waste such as straw (rice straw, barley straw, wheat straw, rye straw, oat straw, etc.), bagasse, corn stover, etc., energy crops such as switchgrass, napier grass, and miscanthus, wood chips, waste paper, etc. can be saccharified with a saccharification enzyme or the like to produce a saccharified liquid containing multiple sugars such as glucose.

形質転換細胞を培養する培地は、炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、本発明の形質転換細胞の培養を効率的に行うことができる培地であれば、天然培地、合成培地のいずれを用いてもよい。
炭素源としては、上記の糖類又はそれを含む糖蜜や糖化液が用いられるが、上記の糖類の他に、マンニトール、ソルビトール、キシリトール、グリセリンのような糖アルコール;酢酸、クエン酸、乳酸、フマル酸、マレイン酸、グルコン酸のような有機酸;エタノール、プロパノールのようなアルコール;ノルマルパラフィンのような炭化水素等も用いることができる。炭素源は、1種を単独で、又は2種以上を混合して使用できる。
培養液中の原料化合物である糖類の濃度は、1~20w/v%が好ましく、2~10w/v%がより好ましく、2~5w/v%がさらに好ましい。
The medium for culturing the transformed cells may be either a natural medium or a synthetic medium, as long as it contains a carbon source, a nitrogen source, inorganic salts, etc. and is a medium in which the transformed cells of the present invention can be efficiently cultured.
As the carbon source, the above-mentioned sugars or molasses or saccharified solution containing them can be used, but in addition to the above-mentioned sugars, sugar alcohols such as mannitol, sorbitol, xylitol, and glycerin, organic acids such as acetic acid, citric acid, lactic acid, fumaric acid, maleic acid, and gluconic acid, alcohols such as ethanol and propanol, hydrocarbons such as normal paraffin, etc. The carbon source can be used alone or in combination of two or more kinds.
The concentration of the saccharide as the raw material compound in the culture medium is preferably 1 to 20 w/v %, more preferably 2 to 10 w/v %, and even more preferably 2 to 5 w/v %.

窒素源としては、例えば、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、カゼイン加水分解物、大豆粕アルカリ抽出物、メチルアミン等のアルキルアミン類、アミノ酸等の含窒素有機化合物、アンモニアもしくはその塩(塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、硝酸アンモニウム、酢酸アンモニウムのような無機又は有機アンモニウム化合物)、尿素、アンモニア水、硝酸ナトリウム、硝酸カリウム等を使用することができる。 Examples of nitrogen sources that can be used include peptone, meat extract, yeast extract, casein hydrolysate, alkaline extract of soybean meal, alkylamines such as methylamine, nitrogen-containing organic compounds such as amino acids, ammonia or its salts (inorganic or organic ammonium compounds such as ammonium chloride, ammonium sulfate, ammonium nitrate, and ammonium acetate), urea, aqueous ammonia, sodium nitrate, and potassium nitrate.

無機塩類としては、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硝酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸亜鉛、硫酸コバルト、炭酸カルシウム等が挙げられる。
さらに、必要に応じて、ビタミン類や消泡剤等を添加することもできる。ビタミン類としては、ビオチン、チアミン(ビタミンB1)、ピリドキシン(ビタミンB6)、パントテン酸、イノシトール、ニコチン酸等が挙げられる。
Examples of inorganic salts include monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, magnesium sulfate, sodium chloride, ferrous nitrate, manganese sulfate, zinc sulfate, cobalt sulfate, and calcium carbonate.
Furthermore, if necessary, vitamins, antifoaming agents, etc. can be added. Examples of vitamins include biotin, thiamine (vitamin B1), pyridoxine (vitamin B6), pantothenic acid, inositol, nicotinic acid, etc.

コリネ型細菌用培地としては、A培地〔J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 7:182-196 (2004)〕、BT培地〔J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 8:91-103 (2004)〕、CGXII培地〔特許第6322576号〕等が挙げられ、これらの培地において、糖類濃度を上記範囲にして用いればよい。 Examples of media for coryneform bacteria include A medium [J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 7:182-196 (2004)], BT medium [J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 8:91-103 (2004)], and CGXII medium [Patent No. 6322576]. These media can be used with the sugar concentration in the above range.

なお、糖類を含む反応又は培養に先立ち、同様の培地で、形質転換体を好気条件下で、温度約25~38℃で、約12~48時間培養して増殖させることが好ましい。 Prior to the reaction or culture containing sugars, it is preferable to grow the transformant in a similar medium under aerobic conditions at a temperature of about 25 to 38°C for about 12 to 48 hours.

培養温度又は反応温度は、15~45℃が好ましく、25~37℃がより好ましい。
また、培養又は反応時間は、24時間~168時間、好ましくは24時間~96時間、より好ましくは24時間~72時間、必要に応じ撹拌又は振とうしながら行うことができる。また、培養中は必要に応じてアンピシリンやカナマイシン等の抗生物質を培地に添加してもよい。
培養は、バッチ式、流加式、連続式の何れでもよい。中でも、バッチ式が好ましい。
培養又は反応は、好気的条件で行ってもよく、還元条件で行ってもよいが、好気的条件下で行うのが好ましい。
好気的条件下で反応又は培養を行う場合、没食子酸又はその塩の生成効率の点から、形質転換体の過度の増殖を抑制する条件下で行うのが好ましい。
没食子酸の酸化を防ぐため、培養は溶存酸素濃度が低い条件で行うことが好ましい。具体的には溶存酸素濃度が0.1~3ppmが好ましく、0.1~1ppmがより好ましい。
The culture temperature or reaction temperature is preferably 15 to 45°C, more preferably 25 to 37°C.
The culture or reaction time is 24 to 168 hours, preferably 24 to 96 hours, more preferably 24 to 72 hours, and can be performed with stirring or shaking as necessary. During culture, antibiotics such as ampicillin and kanamycin may be added to the medium as necessary.
The culture may be any of a batch system, a fed-batch system, and a continuous system, of which the batch system is preferred.
The culture or reaction may be carried out under aerobic conditions or reducing conditions, but is preferably carried out under aerobic conditions.
When the reaction or culture is carried out under aerobic conditions, it is preferable to carry out the reaction or culture under conditions that suppress excessive growth of the transformant, in terms of the efficiency of production of gallic acid or a salt thereof.
In order to prevent oxidation of gallic acid, it is preferable to carry out the culture under conditions of low dissolved oxygen concentration, specifically, a dissolved oxygen concentration of 0.1 to 3 ppm is preferable, and 0.1 to 1 ppm is more preferable.

培養物からの没食子酸又はその塩の回収及び精製方法は特に制限されない。すなわち、周知のイオン交換樹脂法、沈澱法、晶析法、再結晶法、濃縮法その他の方法を組み合わせることにより実施できる。例えば、菌体を遠心分離等で除去した後、カチオン及びアニオン交換樹脂でイオン性の物質を除き、濃縮すれば没食子酸又はその塩を取得することができる。培養物中に蓄積された没食子酸又はその塩は、そのまま単離することなく用いてもよい。 There are no particular limitations on the method for recovering and purifying gallic acid or its salts from the culture. In other words, it can be carried out by combining well-known ion exchange resin methods, precipitation methods, crystallization methods, recrystallization methods, concentration methods, and other methods. For example, gallic acid or its salts can be obtained by removing the bacterial cells by centrifugation or the like, removing ionic substances with cation and anion exchange resins, and concentrating the mixture. Gallic acid or its salts accumulated in the culture may be used as is without isolation.

上述した実施形態に関し、本発明においては更に以下の態様が開示される。
<1>(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドの発現が強化された没食子酸又はその塩の生産能を有する形質転換体。
<2>(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な状態で含む、<1>に記載の形質転換体。
<3>3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが下記の(A1)又は(A2)で示されるポリペプチドであり、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(B1)又は(B2)で示されるポリペプチドであり、3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが下記の(C1)又は(C2)で示されるポリペプチドである、<2>に記載の形質転換体。
(A1)配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(A2)配列番号2で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド
(B1)配列番号6で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(B2)配列番号6で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド
(C1)配列番号8で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(C2)配列番号で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド
<4>3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(a1)又は(a2)で示されるポリヌクレオチドであり、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(b1)又は(b2)で示されるポリヌクレオチドであり、3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(c1)又は(c2)で示されるポリヌクレオチドである、<2>に記載の形質転換体。
(a1)配列番号1又は配列番号3で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(a2)配列番号1又は配列番号3で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
(b1)配列番号5で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(b2)配列番号5で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
(c1)配列番号7で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(c2)配列番号7で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
<5>さらに、(D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドの発現が強化された、<1>~<4>のいずれかに記載の形質転換体。
<6>(D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な状態で含む、<5>に記載の形質転換体。
<7>(D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(D1)又は(D2)で示されるポリペプチドである、<6>に記載の形質転換体。
(D1)配列番号10で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(D2)配列番号10で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド
<8>(d)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(d1)又は(d2)で示されるポリヌクレオチドである、<6>に記載の形質転換体。
(d1)配列番号9で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(d2)配列番号9で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
<9>さらに、(E)3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチド、(F)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド及び(G)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドからなる群より選ばれる少なくとも一つのポリペプチドの発現が強化された<1>~<8>のいずれかに記載の形質転換体。
<10>(E)3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチド、(F)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド及び(G)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドからなる群より選ばれる少なくとも一つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な状態で含む、<9>に記載の形質転換体。
<11>3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(E1)又は(E2)で示されるポリペプチドであり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(F1)又は(F2)で示されるポリペプチドであり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドが下記の(G1)又は(G2)で示されるポリペプチドである、<10>に記載の形質転換体。
(E1)配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(E2)配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、DAHPシンターゼ活性を有するポリペプチド
(F1)配列番号16で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(F2)配列番号16で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド
(G1)配列番号18で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(G2)配列番号18で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するポリペプチド配列からなり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチド
<12>3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(e1)又は(e2)で示されるポリヌクレオチドであり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(f1)又は(f2)で示されるポリヌクレオチドであり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが下記の(g1)又は(g2)で示されるポリヌクレオチドである、<10>に記載の形質転換体。
(e1)配列番号11又は配列番号13で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(e2)配列番号11又は配列番号13で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、DAHPシンターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
(f1)配列番号15で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(f2)配列番号15で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
(g1)配列番号17で示されるヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
(g2)配列番号17で示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
<13>コリネ型細菌である、<1>~<12>のいずれか1項に記載の形質転換体。
<14>コリネ型細菌がコリネバクテリウム属細菌である、<13>に記載の形質転換体。
<15>コリネバクテリウム属細菌がコリネバクテリウム グルタミカムである、<14>に記載の形質転換体。
<16><1>~<15>のいずれかに記載の形質転換体を糖類の存在下で培養する工程を含む、没食子酸又はその塩の製造方法。
In relation to the above-described embodiment, the present invention further discloses the following aspects.
<1> A transformant capable of producing gallic acid or a salt thereof, in which expression of (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoic acid hydroxylase activity is enhanced.
<2> The transformant according to <1>, comprising, in an expressible state, a polynucleotide encoding (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity.
<3> The transformant according to <2>, wherein the polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity is a polypeptide represented by the following (A1) or (A2), the polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity is a polypeptide represented by the following (B1) or (B2), and the polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity is a polypeptide represented by the following (C1) or (C2).
(A1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2. (A2) A polypeptide consisting of an amino acid sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2, and having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity. (B1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6. (B2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6, and having 3-hydroxybenzoic acid synthase activity. (C1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8. (C2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 8 , and having 3-hydroxybenzoic acid hydroxylase activity. <4> The transformant according to <2>, wherein the polynucleotide encoding the polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity is a polynucleotide represented by the following (a1) or (a2), the polynucleotide encoding the polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity is a polynucleotide represented by the following (b1) or (b2), and the polynucleotide encoding the polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity is a polynucleotide represented by the following (c1) or (c2).
(a1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:1 or SEQ ID NO:3; (a2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:1 or SEQ ID NO:3, and encoding a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity; (b1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:5; (b2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:5, and encoding a polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity; (c1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:7; (c2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:7, and encoding a polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity. <5> The transformant according to any one of <1> to <4>, further comprising (D) enhanced expression of a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity.
<6> (D) The transformant according to <5>, which contains, in an expressible state, a polynucleotide encoding a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity.
<7> The transformant according to <6>, wherein the polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity (D) is a polypeptide represented by the following (D1) or (D2):
(D1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10. (D2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 and having 3-dehydroshikimate dehydratase activity. <8> (d) The transformant according to <6>, wherein the polynucleotide encoding the polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity is a polynucleotide shown in the following (d1) or (d2).
(d1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:9; (d2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity to the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:9, and encoding a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity. <9> The transformant according to any of <1> to <8>, further comprising enhanced expression of at least one polypeptide selected from the group consisting of (E) a polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase activity, (F) a polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity, and (G) a polypeptide having transketolase activity.
<10> The transformant according to <9>, comprising, in an expressible state, a polynucleotide encoding at least one polypeptide selected from the group consisting of (E) a polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase activity, (F) a polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity, and (G) a polypeptide having transketolase activity.
<11> The transformant according to <10>, wherein the polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase activity is a polypeptide represented by the following (E1) or (E2), the polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity is a polypeptide represented by the following (F1) or (F2), and the polypeptide having transketolase activity is a polypeptide represented by the following (G1) or (G2).
(E1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 or SEQ ID NO:14. (E2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 or SEQ ID NO:14, and having DAHP synthase activity. (F1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:16. (F2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:16, and having 3-dehydroquinate dehydratase activity. (G1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:18. (G2) A polypeptide consisting of a polypeptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:18, and having transketolase activity. <12> The transformant according to <10>, wherein the polynucleotide encoding the polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase activity is a polynucleotide represented by the following (e1) or (e2), the polynucleotide encoding the polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity is a polynucleotide represented by the following (f1) or (f2), and the polynucleotide encoding the polypeptide having transketolase activity is a polynucleotide represented by the following (g1) or (g2).
(e1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:11 or SEQ ID NO:13. (e2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:11 or SEQ ID NO:13, and encoding a polypeptide having DAHP synthase activity. (f1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:15. (f2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:15, and encoding a polypeptide having 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE activity. (g1) a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:17. (g2) a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence having at least 90% identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:17, and encoding a polypeptide having transketolase activity. <13> The transformant according to any one of <1> to <12>, which is a coryneform bacterium.
<14> The transformant according to <13>, wherein the coryneform bacterium is a bacterium of the genus Corynebacterium.
<15> The transformant according to <14>, wherein the bacterium of the genus Corynebacterium is Corynebacterium glutamicum.
<16> A method for producing gallic acid or a salt thereof, comprising a step of culturing the transformant according to any one of <1> to <15> in the presence of a saccharide.

実施例1 没食子酸の製造
(1)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド導入形質転換体の作製
1)cg0620遺伝子領域を3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド遺伝子と置換するためのプラスミドの構築
cg0620遺伝子領域の5’側上流領域(配列番号19)を2種類のDNAプライマー(配列番号20と21)にて増幅し、またcg0620遺伝子領域の3’側下流領域(塩基番号22)を2種類のDNAプライマー(配列番号23と24)にて増幅し、DNA断片を得た。また、コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13032株が有するtuf遺伝子(cg0587)のプロモーター(以下、tuプロモーターと称する)を含むDNA断片(配列番号25)を人工遺伝子合成にて作製し、2種類のDNAプライマー(配列番号26と27)にて増幅して、DNA断片を得た。また、3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド遺伝子(以下、hfm145VFと略記する)を含むDNA断片を人工遺伝子合成にて2種類(配列番号28と29)作製した。それぞれのDNA断片を鋳型にし、それぞれ2種類のDNAプライマー(配列番号30と31及び32と33)にて増幅して2種類のDNA断片を得た。また、pHKPsacB1(これは特願2014-523757により参照される。)を鋳型にし、2種類のDNAプライマー(配列番号34と35)にて増幅し、得られたPCR産物に対してDpnI(タカラバイオ)による処理を行った。得られた6種類のPCR産物に対し、NucleoSpin Gel and PCR Clean-up(タカラバイオ)を用いて各DNA断片を精製し、In-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ)により連結することでプラスミドpHKPsacB_cg0620-Ptu-hfm145VF-hfm145VFoptを作製した。
Example 1 Production of gallic acid (1) Preparation of transformant into which a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity has been introduced 1) Construction of a plasmid for replacing the cg0620 gene region with a polypeptide gene having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity The 5' upstream region of the cg0620 gene region (SEQ ID NO: 19) was amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NO: 20 and 21), and the 3' downstream region of the cg0620 gene region (base number 22) was amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NO: 23 and 24) to obtain a DNA fragment. In addition, a DNA fragment (SEQ ID NO: 25) containing the promoter of the tuf gene (cg0587) of Corynebacterium glutamicum ATCC13032 strain (hereinafter referred to as tu promoter) was prepared by artificial gene synthesis, and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NO: 26 and 27) to obtain a DNA fragment. In addition, two types of DNA fragments (SEQ ID NOs: 28 and 29) containing a polypeptide gene having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity (hereinafter abbreviated as hfm145VF) were prepared by artificial gene synthesis. Each DNA fragment was used as a template and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NOs: 30 and 31, and 32 and 33), respectively, to obtain two types of DNA fragments. In addition, pHKPsacB1 (referenced in Japanese Patent Application No. 2014-523757) was used as a template and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NOs: 34 and 35), and the obtained PCR products were treated with DpnI (Takara Bio). The six types of PCR products obtained were each purified using NucleoSpin Gel and PCR Clean-up (Takara Bio) and ligated using In-Fusion HD Cloning Kit (Takara Bio) to produce the plasmid pHKPsacB_cg0620-Ptu-hfm145VF-hfm145VFopt.

2)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド遺伝子導入株の作製
エレクトロポレーションによる形質転換法を用いて、上述のプラスミドpHKPsacB_cg0620-Ptu-hfm145VF-hfm145VFoptをCY44株(CY44株は、特願2014-523757の参考例14記載のtkt株であり、aroF、aroG、aroB、aroD及びtkt遺伝子の転写をtuプロモーターによって制御することによって発現が強化されている。また、qsuB遺伝子の転写をPbenプロモーターによって制御することによって発現が強化されている。)に導入し、カナマイシン耐性で選択することにより、KC148sr株を取得した。配列番号20と36のプライマーを用いるPCR法(Sapphire Amp(タカラバイオ))によりKC148sr株を解析したところ、予想通りの結果が得られたことから、KC148sr株はプラスミドpHKPsacB_cg0620-Ptu-hfm145VF-hfm145VFoptがcg0620遺伝子領域に導入された1回交差型相同組換え体であることを確認した。
KC148sr株を1mLのLB液体培地(10g/Lトリプトン、5g/L酵母エキス、10g/L塩化ナトリウム)の中で24時間培養し、培養液の一部を20%スクロース含有LB寒天培地上で塗抹培養することにより、KC148株を得た。配列番号36と37のプライマーを用いるPCR法(Sapphire Amp(タカラバイオ))により、KC148株が予想通りPtu-hfm145VF-hfm145VFop遺伝子がcg0620遺伝子領域に導入されている2回交差型相同組換え体であることを確認した。
2) Preparation of a strain carrying a polypeptide gene having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity Using a transformation method by electroporation, the above-mentioned plasmid pHKPsacB_cg0620-Ptu-hfm145VF-hfm145VFopt was introduced into the CY44 strain (the CY44 strain is a tkt strain described in Reference Example 14 of Japanese Patent Application No. 2014-523757, in which the expression of the aroF, aroG, aroB, aroD and tkt genes is enhanced by controlling the transcription of the aroF, aroG, aroB, aroD and tkt genes with the tu promoter. In addition, the expression of the qsuB gene is enhanced by controlling the transcription of the Pben promoter.) was introduced and selected for kanamycin resistance to obtain the KC148sr strain. When the KC148sr strain was analyzed by PCR (Sapphire Amp (Takara Bio)) using primers of SEQ ID NOs: 20 and 36, the expected results were obtained, confirming that the KC148sr strain is a single-crossover homologous recombination transformant in which the plasmid pHKPsacB_cg0620-Ptu-hfm145VF-hfm145VFopt has been introduced into the cg0620 gene region.
The KC148sr strain was cultured in 1 mL of LB liquid medium (10 g/L tryptone, 5 g/L yeast extract, 10 g/L sodium chloride) for 24 hours, and a portion of the culture was smeared and cultured on LB agar medium containing 20% sucrose to obtain the KC148 strain. By PCR (Sapphire Amp (Takara Bio)) using primers of SEQ ID NOs: 36 and 37, it was confirmed that the KC148 strain was a double-crossover homologous recombinant in which the Ptu-hfm145VF-hfm145VFop gene was introduced into the cg0620 gene region, as expected.

(2)3-ヒドロキシ安息香酸-4-ヒドロキシラーゼ及び3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ及び形質転換体の作製
1)cg1625遺伝子領域を3-ヒドロキシ安息香酸-4-ヒドロキシラーゼ遺伝子及び3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ遺伝子と置換するためのプラスミドの構築
cg1625遺伝子領域の5’側上流領域(配列番号38)を2種類のDNAプライマー(配列番号39と40)にて増幅し、またcg1625遺伝子領域の3’側下流領域(塩基番号41)を2種類のDNAプライマー(配列番号42と43)にて増幅し、DNA断片を得た。また、先行文献記載のプロモーター(以下、tytuプロモーターと称する)DNA断片(配列番号44)を人工遺伝子合成(ユーロフィンジェノミクス)にて作製し、2種類のDNAプライマー(配列番号27と45)にて増幅して、DNA断片を得た。また、3-ヒドロキシ安息香酸-4-ヒドロキシラーゼ遺伝子を人工遺伝子合成(ユーロフィンジェノミクス)にて作製し(配列番号46)、2種類のDNAプライマー(配列番号47と48)にて増幅して、DNA断片を得た。また、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ遺伝子を含むDNA断片(配列番号49)を人工遺伝子合成(ユーロフィンジェノミクス)にて作製し、2種類のDNAプライマー(配列番号50と51)にて増幅して、DNA断片を得た。また、pHKPsacB1(特願2014-523757)を鋳型にし、2種類のDNAプライマー(配列番号34と35)にて増幅し、得られたPCR産物に対してDpnI(タカラバイオ)による処理を行った。得られた6種類のPCR産物に対し、NucleoSpin Gel and PCR Clean-up(タカラバイオ)を用いて各DNA断片を精製し、In-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ)により連結することでプラスミドpHKPsacB_cg1625-Ptytu-mobA-hyg5を作製した。
(2) Preparation of 3-hydroxybenzoate-4-hydroxylase and 3-hydroxybenzoate synthase and transformant 1) Construction of a plasmid for replacing the cg1625 gene region with the 3-hydroxybenzoate-4-hydroxylase gene and the 3-hydroxybenzoate synthase gene The 5' upstream region of the cg1625 gene region (SEQ ID NO: 38) was amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NO: 39 and 40), and the 3' downstream region of the cg1625 gene region (base number 41) was amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NO: 42 and 43) to obtain a DNA fragment. In addition, a DNA fragment (SEQ ID NO: 44) of a promoter (hereinafter referred to as tytu promoter) described in a prior literature was prepared by artificial gene synthesis (Eurofins Genomics), and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NO: 27 and 45) to obtain a DNA fragment. In addition, a 3-hydroxybenzoate-4-hydroxylase gene (SEQ ID NO: 46) was prepared by artificial gene synthesis (Eurofins Genomics), and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NOs: 47 and 48) to obtain a DNA fragment. In addition, a DNA fragment (SEQ ID NO: 49) containing a 3-hydroxybenzoate synthase gene was prepared by artificial gene synthesis (Eurofins Genomics), and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NOs: 50 and 51) to obtain a DNA fragment. In addition, pHKPsacB1 (Patent Application No. 2014-523757) was used as a template, and amplified with two types of DNA primers (SEQ ID NOs: 34 and 35), and the obtained PCR product was treated with DpnI (Takara Bio). The six types of PCR products obtained were each purified using NucleoSpin Gel and PCR Clean-up (Takara Bio) and ligated using In-Fusion HD Cloning Kit (Takara Bio) to produce the plasmid pHKPsacB_cg1625-Ptytu-mobA-hyg5.

2).3-ヒドロキシ安息香酸-4-ヒドロキシラーゼ遺伝子及び3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ遺伝子導入株の作製
エレクトロポレーションによる形質転換法を用いて、上述のプラスミドpHKPsacB_cg1625-Ptytu-mobA-hyg5をKC148株に導入し、カナマイシン耐性で選択することにより、KC152sr株を取得した。配列番号39と52のプライマーを用いるPCR法(Sapphire Amp(タカラバイオ))によりKC152sr株を解析したところ、予想通りの結果が得られたことから、KC152sr株はプラスミドpHKPsacB_cg1625-Ptytu-mobA-hyg5がcg1625遺伝子領域に導入された1回交差型相同組換え体であることを確認した。
KC152sr株を1mLのLB液体培地(10g/Lトリプトン、5g/L酵母エキス、10g/L塩化ナトリウム)の中で24時間培養し、培養液の一部を20%スクロース含有LB寒天培地上で塗抹培養することにより、KC152株を得た。配列番号52と53のプライマーを用いるPCR法(Sapphire Amp(タカラバイオ))により、KC152株が予想通りPtytu-mobA-hyg5遺伝子がcg1625遺伝子領域に導入されている2回交差型相同組換え体であることを確認した。
2) Preparation of strains carrying 3-hydroxybenzoate-4-hydroxylase gene and 3-hydroxybenzoate synthase gene The above-mentioned plasmid pHKPsacB_cg1625-Ptytu-mobA-hyg5 was introduced into the KC148 strain by electroporation transformation, and the strain was selected for kanamycin resistance to obtain the KC152sr strain. The KC152sr strain was analyzed by PCR (Sapphire Amp (Takara Bio)) using primers of SEQ ID NO: 39 and 52, and the expected results were obtained. It was therefore confirmed that the KC152sr strain is a single-crossover homologous recombinant in which the plasmid pHKPsacB_cg1625-Ptytu-mobA-hyg5 was introduced into the cg1625 gene region.
The KC152sr strain was cultured in 1 mL of LB liquid medium (10 g/L tryptone, 5 g/L yeast extract, 10 g/L sodium chloride) for 24 hours, and a portion of the culture was smeared on a 20% sucrose-containing LB agar medium to obtain the KC152 strain. By PCR (Sapphire Amp (Takara Bio)) using primers of SEQ ID NOs: 52 and 53, it was confirmed that the KC152 strain was a double-crossover homologous recombinant in which the Ptytu-mobA-hyg5 gene was introduced into the cg1625 gene region, as expected.

(3)形質転換株の培養
表に示すCGXII培地1.5mLに終濃度1mMとなるよう安息香酸ナトリウムを添加し、上記で得られた形質転換株を接種し、32℃で培養し24時間目と32時間目の培養液を回収し、培養液を希硫酸で適宜希釈し、遠心にて菌体を除去した後、上清を回収した。上清中のグルコース濃度と没食子酸濃度を定量した。
(3) Cultivation of the transformant: Sodium benzoate was added to 1.5 mL of the CGXII medium shown in the table to a final concentration of 1 mM, and the transformant obtained above was inoculated and cultivated at 32° C. The culture solution was collected after 24 hours and 32 hours, appropriately diluted with dilute sulfuric acid, and centrifuged to remove the bacterial cells, and the supernatant was collected. The glucose and gallic acid concentrations in the supernatant were quantified.

Figure 0007588969000001
Figure 0007588969000001

(4)結果
KC148株とKC152株を比較すると、KC152株の方が消費糖収率の向上が確認され、mobA及びhyg5を強化することが没食子酸生産に優位に働くことが示された。
(4) Results Comparing the KC148 strain and the KC152 strain, it was confirmed that the KC152 strain had an improved sugar consumption yield, indicating that enhancing mobA and hyg5 has an advantageous effect on gallic acid production.

Figure 0007588969000002
Figure 0007588969000002

(5)消費糖収率の計算方法
培養後24時間目と32時間目の培養上清中のグルコース量から培養24時間から32時間におけるグルコース消費量を算出した。培養後24時間目と32時間目の培養上清中の没食子酸濃度から培養24時間から32時間における没食子酸生産量を算出した。以下の式を用いて消費糖収率(%)を算出した。
消費糖収率(%:g/g)= 没食子酸生産量/グルコース消費量×100
(5) Method for calculating the consumed sugar yield The amount of glucose consumed from 24 to 32 hours of culture was calculated from the amount of glucose in the culture supernatant 24 and 32 hours after culture. The amount of gallic acid produced from 24 to 32 hours of culture was calculated from the concentration of gallic acid in the culture supernatant 24 and 32 hours after culture. The consumed sugar yield (%) was calculated using the following formula.
Consumed sugar yield (%: g/g) = Gallic acid production / glucose consumption x 100

(6)分析条件
回収した上清はアクロプレップ96フィルタープレート(0.2μmGHP膜、日本ポール)を用いて不溶物の除去を行ない、反応液をHPLCに供した。
HPLCの装置はChromaster(日立ハイテクサイエンス)を用いた。没食子酸の分析には、L-カラム ODS(4.6mm I.D.×150mm、化学物質評価研究機構)を用い、溶離液Aを0.1M リン酸二水素カリウムの0.1%リン酸溶液、溶離液Bを70%メタノールとし、流速1.0mL/分、カラム温度40℃の条件にてグラジエント溶出を行なった。没食子酸の検出にはUV検出器(検出波長280nm)を用いた。
グルコースの分析にはICsep ION-300(7.8mm×300mm、東京化成工業)を用い、溶離液を37mM硫酸溶液とし、流速0.5mL/分、カラム温度50℃の条件で検出を行った。グルコースの検出にはRIを用いた。
(6) Analytical Conditions Insoluble matter was removed from the collected supernatant using an AcroPrep 96 filter plate (0.2 μm GHP membrane, Nippon Pall), and the reaction solution was subjected to HPLC.
The HPLC device used was a Chromaster (Hitachi High-Tech Science). For the analysis of gallic acid, an L-column ODS (4.6 mm ID x 150 mm, Chemicals Evaluation and Research Institute, Japan) was used, and gradient elution was performed under the conditions of a flow rate of 1.0 mL/min and a column temperature of 40°C, with eluent A being a 0.1% phosphoric acid solution of 0.1 M potassium dihydrogen phosphate and eluent B being 70% methanol. For the detection of gallic acid, a UV detector (detection wavelength 280 nm) was used.
Glucose was analyzed using ICsep ION-300 (7.8 mm x 300 mm, Tokyo Chemical Industry Co., Ltd.), and detection was performed using a 37 mM sulfuric acid solution as the eluent at a flow rate of 0.5 mL/min and a column temperature of 50° C. RI was used for glucose detection.

Claims (10)

(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドの発現が強化された没食子酸又はその塩の生産能を有する形質転換体であって、
該3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが下記の(A1)又は(A2)で示されるポリペプチドであり、該3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(B1)又は(B2)で示されるポリペプチドであり、該3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドが下記の(C1)又は(C2)で示されるポリペプチドであり、該形質転換体がコリネバクテリウム属細菌である、形質転換体。
(A1)配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(A2)配列番号2で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド
(B1)配列番号6で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(B2)配列番号6で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド
(C1)配列番号8で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(C2)配列番号8で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド
A transformant capable of producing gallic acid or a salt thereof, in which expression of (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity is enhanced,
the polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity is a polypeptide represented by the following (A1) or (A2), the polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity is a polypeptide represented by the following (B1) or (B2), the polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity is a polypeptide represented by the following (C1) or (C2), and the transformant is a bacterium of the genus Corynebacterium.
(A1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2.
(A2) A polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoic acid hydroxylase activity, which comprises an amino acid sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2.
(B1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6.
(B2) A polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity, comprising a peptide sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6.
(C1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8.
(C2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8 and having 3-hydroxybenzoic acid hydroxylase activity .
(A)3,4-ジヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチド、(B)3-ヒドロキシ安息香酸シンターゼ活性を有するポリペプチド及び(C)3-ヒドロキシ安息香酸ヒドロキシラーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な状態で含む、請求項1に記載の形質転換体。 The transformant according to claim 1, comprising, in an expressible state, a polynucleotide encoding (A) a polypeptide having 3,4-dihydroxybenzoate hydroxylase activity, (B) a polypeptide having 3-hydroxybenzoate synthase activity, and (C) a polypeptide having 3-hydroxybenzoate hydroxylase activity. さらに、(D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドの発現が強化された、請求項1又は2に記載の形質転換体。 The transformant according to claim 1 or 2 , further comprising enhanced expression of a polypeptide (D) having 3-dehydroshikimate dehydratase activity. (D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な状態で含む、請求項に記載の形質転換体。 The transformant according to claim 3 , which comprises (D) a polynucleotide encoding a polypeptide having 3-dehydroshikimate dehydratase activity in an expressible state. (D)3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(D1)又は(D2)で示されるポリペプチドである、請求項に記載の形質転換体。
(D1)配列番号10で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(D2)配列番号10で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-デヒドロシキミ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド
The transformant according to claim 4 , wherein the polypeptide (D) having 3-dehydroshikimate dehydratase activity is a polypeptide represented by the following (D1) or (D2):
(D1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10. (D2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 and having 3-dehydroshikimate dehydratase activity.
さらに、(E)3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチド、(F)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド及び(G)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドからなる群より選ばれる少なくとも一つのポリペプチドの発現が強化された請求項1~のいずれか1項に記載の形質転換体。 The transformant according to any one of claims 1 to 5, further comprising enhanced expression of at least one polypeptide selected from the group consisting of (E) a polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase activity, (F) a polypeptide having 3- dehydroquinate dehydratase activity, and (G) a polypeptide having transketolase activity. (E)3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチド、(F)3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド及び(G)トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドからなる群より選ばれる少なくとも一つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現可能な状態で含む、請求項に記載の形質転換体。 The transformant according to claim 6, comprising, in an expressible state, a polynucleotide encoding at least one polypeptide selected from the group consisting of (E) a polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate- 7 -phosphate synthase activity, (F) a polypeptide having 3-dehydroquinate dehydratase activity, and (G) a polypeptide having transketolase activity. 3-デオキシ-D-アラビノ-ヘプツロソネート-7-リン酸シンターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(E1)又は(E2)で示されるポリペプチドであり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチドが下記の(F1)又は(F2)で示されるポリペプチドであり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチドが下記の(G1)又は(G2)で示されるポリペプチドである、請求項に記載の形質転換体。
(E1)配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド (E2)配列番号12又は配列番号14で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、DAHPシンターゼ活性を有するポリペプチド
(F1)配列番号16で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(F2)配列番号16で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するペプチド配列からなり、3-デヒドロキナ酸デヒドラターゼ活性を有するポリペプチド
(G1)配列番号18で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド
(G2)配列番号18で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するポリペプチド配列からなり、トランスケトラーゼ活性を有するポリペプチド
The transformant according to claim 7, wherein the polypeptide having 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase activity is a polypeptide represented by the following (E1) or (E2), the polypeptide having 3 -dehydroquinate dehydratase activity is a polypeptide represented by the following (F1) or (F2), and the polypeptide having transketolase activity is a polypeptide represented by the following (G1) or (G2).
(E1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 or SEQ ID NO:14. (E2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:12 or SEQ ID NO:14, and having DAHP synthase activity. (F1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:16. (F2) A polypeptide consisting of a peptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:16, and having 3-dehydroquinate dehydratase activity. (G1) A polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:18. (G2) A polypeptide consisting of a polypeptide sequence having at least 90% identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:18, and having transketolase activity.
コリネバクテリウム属細菌がコリネバクテリウム グルタミカムである、請求項1~8のいずれか1項に記載の形質転換体。 The transformant according to any one of claims 1 to 8 , wherein the bacterium of the genus Corynebacterium is Corynebacterium glutamicum. 請求項1~のいずれか1項に記載の形質転換体を糖類の存在下で培養する工程を含む、没食子酸又はその塩の製造方法。 A method for producing gallic acid or a salt thereof, comprising a step of culturing the transformant according to any one of claims 1 to 9 in the presence of a saccharide.
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