JP7597346B2 - Tag peptide and method for purifying polypeptide - Google Patents
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Description
本発明はタグペプチドや、タグペプチド融合ポリペプチドや、タグペプチドをコードするポリヌクレオチドや、前記ポリヌクレオチドを含有する発現ベクターや、ポリペプチドの精製方法や、前記発現ベクターを含有するポリペプチドの精製キットに関する。 The present invention relates to a tag peptide, a tag peptide fusion polypeptide, a polynucleotide encoding the tag peptide, an expression vector containing the polynucleotide, a method for purifying a polypeptide, and a kit for purifying a polypeptide containing the expression vector.
遺伝子工学の知見により、大腸菌や酵母を用いたタンパク質合成を行った場合、その目的とするタンパク質等のポリペプチドを分離して精製する場合が多い。そのタンパク質精製法として、ポリヒスチジンとニッケルカラムを用いた精製法が広く行われている。具体的には、以下の(1)~(4)のように6連続させたヒスチジン、すなわちヒスチジンタグを付加した目的タンパク質を、ヒスチジン~ニッケル金属の接合能力を使って精製する方法である。 When protein synthesis is performed using E. coli or yeast, genetic engineering knowledge has led to the separation and purification of the target protein or other polypeptide. A widely used protein purification method is one that uses polyhistidine and a nickel column. Specifically, this method purifies a target protein to which six consecutive histidines, i.e. a histidine tag, have been added, as shown in (1) to (4) below, using the binding ability of histidine to nickel metal.
(1)6連続ヒスチジンからなるヒスチジンタグを付加した目的タンパク質を酵母、大腸菌などの宿主細胞で生産する。
(2)宿主細胞からの目的タンパク質抽出液をニッケルカラムに通し、上記の目的タンパク質をニッケルに吸着させる。
(3) 低濃度(5~10mM程度)イミダゾール水溶液を上記カラムに通して洗浄する。ここで、目的タンパク質はニッケルに吸着し、それ以外はこの洗浄によりカラムから流れ落ちる。
(4)高濃度(200mM程度)イミダゾール水溶液を上記カラムに通し、(2)でトラップされていた目的タンパク質をニッケルからはがして溶出させる。
(1) A target protein tagged with six consecutive histidines is produced in a host cell such as yeast or E. coli.
(2) A target protein extract from the host cells is passed through a nickel column to adsorb the target protein onto the nickel.
(3) A low-concentration (approximately 5 to 10 mM) imidazole solution is passed through the column to wash it. During this process, the target protein is adsorbed onto the nickel, while the rest of the protein is washed off the column.
(4) A high concentration (approximately 200 mM) imidazole aqueous solution is passed through the column to strip the target protein trapped in (2) from the nickel and elute it.
しかし、タンパク質合成を行わせた大腸菌や酵母の細胞内には、ヒスチジンを多く含むタンパク質やニッケル金属と結合するタンパク質も多数存在するため、それらのタンパク質もニッケルカラムに吸着してしまい、目的タンパク質を高純度で精製することが困難であった。また、ニッケルに吸着した目的タンパク質を溶出液にてニッケルから外して溶出する際に、通常イミダゾール水溶液を用いるが、目的タンパク質を利用するときにはイミダゾールを取り除く作業が必要な場合があった。 However, since many proteins containing a lot of histidine and proteins that bind to nickel metal are present within the cells of E. coli or yeast in which protein synthesis has been performed, these proteins also adsorb to the nickel column, making it difficult to purify the target protein with a high purity. In addition, when removing the target protein adsorbed to the nickel from the nickel with an elution solution, an imidazole aqueous solution is usually used, but when using the target protein, it is sometimes necessary to remove the imidazole.
タグペプチドとしては6連続させたヒスチジン以外にも、たとえば、式:(His)x-(A)y-(His)z[式中、Aは1またはそれ以上のアミノ酸であり;xは0~10であり;yは0~4であり;zは0~10である]で示されるキレート化ペプチド(特許文献1参照)や、式R1-(His)2-6-R2(式中R1は、水素、1個のアミノ酸または数個のアミノ酸を示し、R2は、Q、Q-Ile-Glu-Gly-Arg又はQ-Asp-Asp-Asp-Lys-を示し、及びQはペプチド結合、1個のアミノ酸又は数個の、最大30個のアミノ酸の配列を示す)(特許文献2参照)や、塩基性アミノ酸が3個以上連続した配列(特許文献3参照)が開示されている。しかしながら、イミダゾールで溶出することが主であり、必要に応じてイミダゾール以外で精度良く溶出が可能なタグペプチドではなかった。 Other than six consecutive histidines, tag peptides include, for example, a chelating peptide represented by the formula: (His)x-(A)y-(His)z [wherein A is one or more amino acids; x is 0-10; y is 0-4; z is 0-10] (see Patent Document 1), a peptide of the formula R1-(His)2-6-R2 (wherein R1 is hydrogen, one or several amino acids, R2 is Q, Q-Ile-Glu-Gly-Arg, or Q-Asp-Asp-Asp-Lys-, and Q is a peptide bond, one or several amino acids, up to a maximum of 30 amino acids) (see Patent Document 2), and a sequence of three or more consecutive basic amino acids (see Patent Document 3). However, most of them are eluted with imidazole, and there was no tag peptide that could be eluted with a high accuracy using a compound other than imidazole as necessary.
また、本発明者らは、500mM以上の濃度のイミダゾールを用いても、ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンと結合可能なタグペプチドを提案した(特許文献4参照)。かかるタグペプチドは、高濃度のイミダゾールでも溶出されにくいため、高純度で目的とするタンパク質を固定化することは可能である。しかしながら、必要に応じて目的とするタンパク質を溶出することが難しかった。 The inventors have also proposed a tag peptide that can bind to one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt even when imidazole at a concentration of 500 mM or more is used (see Patent Document 4). Such a tag peptide is difficult to elute even with a high concentration of imidazole, making it possible to immobilize a target protein with high purity. However, it has been difficult to elute the target protein as needed.
本発明の課題は、ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンと結合可能であり、イミダゾール以外を用いても溶出が可能なタグペプチドを提供することにある。 The objective of the present invention is to provide a tag peptide that can bind to one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt, and can be eluted using a substance other than imidazole.
本発明者らは、目的タンパク質のみが効率よく分離、精製できるペプチドタグやペプチドタグが付与されたタンパク質の効率的な分離・精製方法の研究を進めていた。その過程で、連続するヒスチジンをタンパク質に付加することで、タンパク質の活性を低下させることを確認した。そこで、タンパク質の活性の低下を抑制可能なヒスチジンタグペプチドを検討した。 The present inventors have been conducting research into peptide tags that can efficiently isolate and purify only the target protein, and into efficient methods for isolating and purifying proteins that have peptide tags. In the process, they confirmed that adding consecutive histidines to a protein reduces the activity of the protein. Therefore, they investigated histidine tag peptides that can suppress the decrease in protein activity.
その結果、アスパラギン酸、グルタミン酸、グリシンやプロリン等をヒスチジンに組み込むように連結したタグペプチドを目的タンパク質に付加することで連続するヒスチジンのタグペプチドを用いた場合と比較してタンパク質の活性低下が抑制され、活性の高いタンパク質を得られることを見出した。さらに、ニッケルからの溶出について検討したところ、従来用いられているイミダゾールだけでなく、低濃度の塩溶液や水で溶出が可能であることを見出し、本発明を完成した。 As a result, they found that by adding a tag peptide in which aspartic acid, glutamic acid, glycine, proline, etc. are linked to histidine to the target protein, the decrease in protein activity is suppressed compared to when a tag peptide of consecutive histidines is used, and a highly active protein can be obtained. Furthermore, when they investigated elution from nickel, they found that elution is possible not only with the conventionally used imidazole, but also with low-concentration salt solutions and water, and thus completed the present invention.
すなわち、本発明は、以下のとおりである。
〔1〕以下の(1-1)~(1-11)のいずれかのポリペプチドからなるタグペプチド。
(1-1)配列番号1に示すアミノ酸配列において1個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-2)配列番号2に示すアミノ酸配列において1又は2個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-3)配列番号3に示すアミノ酸配列において1~3個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-4)配列番号4に示すアミノ酸配列において1~4個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-5)配列番号5に示すアミノ酸配列において1~5個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-6)配列番号6に示すアミノ酸配列において1~6個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-7)配列番号7に示すアミノ酸配列において1~7個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-8)配列番号8に示すアミノ酸配列において1~8個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-9)配列番号9に示すアミノ酸配列において1~9個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-10)配列番号10に示すアミノ酸配列において1~10個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-11)配列番号11に示すアミノ酸配列において1~11個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
〔2〕配列番号12~15のいずれかに示すアミノ酸配列からなるトリペプチドを含有することを特徴とする上記〔1〕記載のタグペプチド。
〔3〕配列番号16又は配列番号17に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドであることを特徴とする上記〔1〕又は〔2〕記載のタグペプチド。
〔4〕上記〔1〕~〔3〕のいずれか記載のタグペプチドとポリペプチドが融合したタグペプチド融合ポリペプチド。
〔5〕タグペプチドと融合するポリペプチドがタンパク質であることを特徴とする上記〔4〕記載のタグペプチド融合ポリペプチド。
〔6〕上記〔1〕~〔3〕のいずれか記載のタグペプチドをコードするポリヌクレオチド。
〔7〕上記〔6〕記載のポリヌクレオチドを含有する発現ベクター。
〔8〕以下の工程(2-1)~(2-3)を備えたポリペプチドの精製方法。
(2-1)ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンを固定化した担体と、上記〔4〕又は〔5〕記載のタグペプチド融合ポリペプチドとを吸着液の存在下で混合して、前記タグペプチド融合ポリペプチドを前記担体に吸着させる工程;
(2-2)タグペプチド融合ポリペプチドが吸着した担体を洗浄液で洗浄する工程;
(2-3)溶出液を用いて前記担体に吸着したタグペプチド融合ポリペプチドを前記担体から溶出する工程;
〔9〕工程(2-1)において、吸着液が0.03M以上のアルカリ金属塩溶液であることを特徴とする上記〔8〕記載のポリペプチドの精製方法。
〔10〕工程(2-2)において、洗浄液が0.03M以上のアルカリ金属塩溶液であることを特徴とする上記〔8〕又は〔9〕記載のポリペプチドの精製方法。
〔11〕工程(2-3)において、溶出液がイミダゾール溶液、L-ヒスチジン溶液、緩衝液、アルカリ金属塩溶液又は水であることを特徴とする上記〔8〕~〔10〕のいずれか記載のポリペプチドの精製方法。
〔12〕金属イオンがニッケルであることを特徴とする上記〔8〕~〔11〕のいずれか記載のポリペプチドの精製方法。
〔13〕上記〔7〕記載の発現ベクターを含有するポリペプチドの精製キット。
That is, the present invention is as follows.
[1] A tag peptide consisting of any one of the following polypeptides (1-1) to (1-11):
(1-1) A polypeptide in which one histidine in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1 is replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-2) A polypeptide in which one or two histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-3) A polypeptide in which 1 to 3 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-4) A polypeptide in which 1 to 4 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-5) A polypeptide in which 1 to 5 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:5 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-6) A polypeptide in which 1 to 6 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-7) A polypeptide in which 1 to 7 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-8) A polypeptide in which 1 to 8 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 8 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-9) A polypeptide in which 1 to 9 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 9 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-10) A polypeptide in which 1 to 10 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 are substituted with aspartic acid or glutamic acid;
(1-11) A polypeptide in which 1 to 11 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 11 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
[2] The tag peptide according to [1] above, which comprises a tripeptide consisting of an amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 12 to 15.
[3] The tag peptide according to [1] or [2] above, which is a polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16 or SEQ ID NO: 17.
[4] A tag peptide fusion polypeptide in which the tag peptide according to any one of [1] to [3] above is fused with a polypeptide.
[5] The tag peptide fusion polypeptide according to [4] above, wherein the polypeptide fused to the tag peptide is a protein.
[6] A polynucleotide encoding the tag peptide according to any one of [1] to [3] above.
[7] An expression vector containing the polynucleotide described in [6] above.
[8] A method for purifying a polypeptide, comprising the following steps (2-1) to (2-3):
(2-1) a step of mixing a carrier having one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt immobilized thereon with the tag peptide fusion polypeptide according to [4] or [5] above in the presence of an adsorption solution to adsorb the tag peptide fusion polypeptide onto the carrier;
(2-2) washing the carrier onto which the tag peptide fusion polypeptide is adsorbed with a washing solution;
(2-3) eluting the tag peptide fusion polypeptide adsorbed to the carrier from the carrier using an elution solution;
[9] The method for purifying the polypeptide according to [8] above, wherein in the step (2-1), the adsorption solution is an alkali metal salt solution having a concentration of 0.03 M or more.
[10] The method for purifying the polypeptide according to [8] or [9] above, wherein in the step (2-2), the washing solution is an alkali metal salt solution having a concentration of 0.03 M or more.
[11] The method for purifying the polypeptide according to any one of [8] to [10] above, wherein in the step (2-3), the eluent is an imidazole solution, an L-histidine solution, a buffer solution, an alkali metal salt solution or water.
[12] The method for purifying the polypeptide according to any one of [8] to [11] above, wherein the metal ion is nickel.
[13] A kit for purifying a polypeptide comprising the expression vector according to [7] above.
本発明のタグペプチドを用いれば、ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンを固定化した担体にポリペプチドが吸着させた後、イミダゾールだけでなく、L-ヒスチジン、トリス塩基、又は水によっても溶出が可能となる。 By using the tag peptide of the present invention, after the polypeptide is adsorbed to a carrier on which one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt are immobilized, it can be eluted not only with imidazole but also with L-histidine, Tris base, or water.
本発明の一態様は、
(1-1)配列番号1に示すアミノ酸配列において1個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-2)配列番号2に示すアミノ酸配列において1又は2個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-3)配列番号3に示すアミノ酸配列において1~3個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-4)配列番号4に示すアミノ酸配列において1~4個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-5)配列番号5に示すアミノ酸配列において1~5個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-6)配列番号6に示すアミノ酸配列において1~6個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-7)配列番号7に示すアミノ酸配列において1~7個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-8)配列番号8に示すアミノ酸配列において1~8個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-9)配列番号9に示すアミノ酸配列において1~9個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-10)配列番号10に示すアミノ酸配列において1~10個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
(1-11)配列番号11に示すアミノ酸配列において1~11個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換したポリペプチド;
の(1-1)~(1-11)のいずれかのポリペプチドからなるタグペプチドであり、以下、「本件タグペプチド」ともいう。
One aspect of the present invention is
(1-1) A polypeptide in which one histidine in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1 is replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-2) A polypeptide in which one or two histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:2 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-3) A polypeptide in which 1 to 3 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-4) A polypeptide in which 1 to 4 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-5) A polypeptide in which 1 to 5 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:5 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-6) A polypeptide in which 1 to 6 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-7) A polypeptide in which 1 to 7 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-8) A polypeptide in which 1 to 8 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 8 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-9) A polypeptide in which 1 to 9 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 9 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
(1-10) A polypeptide in which 1 to 10 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 are substituted with aspartic acid or glutamic acid;
(1-11) A polypeptide in which 1 to 11 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 11 are replaced with aspartic acid or glutamic acid;
The tag peptide is a tag peptide consisting of any one of the polypeptides (1-1) to (1-11) above, and hereinafter may be referred to as the "tag peptide of the present invention."
また、本発明の他の態様の一つは、
(2-1)ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンを固定化した担体と、上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとを混合して、前記タグペプチド融合ポリペプチドを前記担体に吸着させる工程;
(2-2)タグペプチド融合ポリペプチドを吸着した担体を洗浄液で洗浄する工程;
(2-3)イミダゾール、L-ヒスチジン、トリス塩基、又は水を用いて、前記担体に吸着したタグペプチド融合ポリペプチドを前記担体から溶出する工程;
の工程(2-1)~(2-3)を備えたポリペプチドの精製方法であり、以下、「本件ポリペプチドの精製方法」ともいう。
Another aspect of the present invention is
(2-1) mixing the present tag peptide fusion polypeptide with a carrier having one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt immobilized thereon, thereby allowing the tag peptide fusion polypeptide to be adsorbed onto the carrier;
(2-2) washing the carrier onto which the tag peptide fusion polypeptide is adsorbed with a washing solution;
(2-3) eluting the tag peptide fusion polypeptide adsorbed to the carrier from the carrier using imidazole, L-histidine, Tris base, or water;
This is a method for purifying a polypeptide, comprising steps (2-1) to (2-3), and hereinafter may be referred to as the "method for purifying the polypeptide of the present invention."
本明細書において、ヒスチジンをH、アスパラギン酸をD、グルタミン酸をE、トリプトファンをW、バリンをV、トレオニンをT、アルギニンをR、メチオニンをM、ロイシンをL、プロリンをP、アスパラギンをN、リシンをK、グルタミンをQ、イソロイシンをI、フェニルアラニンをF、システインをC、チロシンをY、セリンをS、グリシンをG、アラニンをAで表すこともある。 In this specification, histidine may be represented as H, aspartic acid as D, glutamic acid as E, tryptophan as W, valine as V, threonine as T, arginine as R, methionine as M, leucine as L, proline as P, asparagine as N, lysine as K, glutamine as Q, isoleucine as I, phenylalanine as F, cysteine as C, tyrosine as Y, serine as S, glycine as G, and alanine as A.
本明細書における「ポリペプチド」とは、5残基以上のアミノ酸がペプチド結合によって連結されて形成されたペプチドを意味する。また、本明細書における「タグペプチド」とは、ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンと親和性を有するアフィニティタグを意味する。 In this specification, "polypeptide" refers to a peptide formed by linking five or more amino acid residues through peptide bonds. In addition, in this specification, "tag peptide" refers to an affinity tag that has affinity for one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt.
本件タグペプチドとしては、上記(1-1)~(1-11)のいずれかのポリペプチドからなるタグペプチドであるかぎり特に制限されないが、かかるタグペプチドのN末端又はC末端には、さらに任意のアミノ酸、好ましくはヒスチジン、アスパラギン酸又グルタミン酸が1~5残基、好ましくは1~3残基、より好ましくは1又は2残基、さらに好ましくは1残基連結していてもよい。 The tag peptide of the present invention is not particularly limited as long as it is a tag peptide consisting of any of the above polypeptides (1-1) to (1-11), but any amino acid, preferably histidine, aspartic acid or glutamic acid, may be further linked to the N-terminus or C-terminus of the tag peptide by 1 to 5 residues, preferably 1 to 3 residues, more preferably 1 or 2 residues, and even more preferably 1 residue.
本明細書における(1-1)~(1-11)のポリペプチドにおいて、アスパラギン酸又はグルタミン酸に置換するヒスチジンの位置は特に制限されないが、ヒスチジンとヒスチジンとの間にアスパラギン酸又はグルタミン酸が連結するように置換することが好ましい。具体的には、配列番号12に示すHEH、配列番号13に示すEHE、配列番号14に示すHDH、又は配列番号15に示すDHDのいずれかのトリペプチドを少なくとも1カ所含むことが好ましい。 In the polypeptides (1-1) to (1-11) of the present specification, the position of the histidine to be substituted with aspartic acid or glutamic acid is not particularly limited, but it is preferable to substitute so that aspartic acid or glutamic acid is linked between the histidines. Specifically, it is preferable to include at least one of the tripeptides HEH shown in SEQ ID NO: 12, EHE shown in SEQ ID NO: 13, HDH shown in SEQ ID NO: 14, or DHD shown in SEQ ID NO: 15.
また、(1-2)又は(1-3)のポリペプチドにおいては、HE、EH、HD、又はDHを2カ所以上、より好ましくは3カ所以上、(1-4)又は(1-5)のポリペプチドにおいては、HE、EH、HD、又はDHを2カ所以上、より好ましくは3カ所以上、さらに好ましくは4カ所以上、(1-6)又は(1-7)のポリペプチドにおいては、HE、EH、HD、又はDHを2カ所以上、より好ましくは3カ所以上、さらに好ましくは4カ所以上、さらにより好ましくは5カ所以上、(1-8)又は(1-9)のポリペプチドにおいては、HE、EH、HD、又はDHを2カ所以上、より好ましくは3カ所以上、さらに好ましくは4カ所以上、さらにより好ましくは5カ所以上、中でも6カ所以上、(1-10)又は(1-11)のポリペプチドにおいては、HE、EH、HD、又はDHを
2カ所以上、より好ましくは3カ所以上、さらに好ましくは4カ所以上、さらにより好ましくは5カ所以上、中でも6カ所以上、特に好ましくは7カ所以上、最も好ましくは8カ所以上含んでもよい。(1-7)のポリペプチドとしては、たとえば、HDを5カ所含有する配列番号16に示すアミノ酸配列やHEを5カ所含有する配列番号17に示すアミノ酸配列を挙げることができる。
In addition, in the polypeptide of (1-2) or (1-3), HE, EH, HD, or DH is present at two or more positions, more preferably three or more positions; in the polypeptide of (1-4) or (1-5), HE, EH, HD, or DH is present at two or more positions, more preferably three or more positions, and even more preferably four or more positions; in the polypeptide of (1-6) or (1-7), HE, EH, HD, or DH is present at two or more positions, more preferably three or more positions, even more preferably four or more positions, and even more preferably five or more positions; In the case of the polypeptide of (1-8) or (1-9), HE, EH, HD, or DH may be present at two or more sites, more preferably three or more sites, even more preferably four or more sites, even more preferably five or more sites, and among these, six or more sites, and in the case of the polypeptide of (1-10) or (1-11), HE, EH, HD, or DH may be present at two or more sites, more preferably three or more sites, even more preferably four or more sites, even more preferably five or more sites, and among these, six or more sites, particularly preferably seven or more sites, and most preferably eight or more sites. Examples of the polypeptide of (1-7) include the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16, which contains five HD sites, and the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 17, which contains five HE sites.
複数箇所のヒスチジンが置換する場合における置換するアスパラギン酸又はグルタミン酸の組み合わせは特に制限されず、すべてがアスパラギン酸であっても、すべてがグルタミン酸であっても、アスパラギン酸とグルタミン酸との組み合わせでも良い。 When multiple histidines are substituted, the combination of aspartic acid or glutamic acid that substitutes is not particularly limited, and may be all aspartic acid, all glutamic acid, or a combination of aspartic acid and glutamic acid.
本発明のタグペプチド融合ポリペプチドとしては、上記本件タグペプチドとポリペプチドが融合したタグペプチド融合ポリペプチド(以下、「本件タグペプチド融合ポリペプチド」ともいう)であればよく、かかるタグペプチド融合ポリペプチドにおいて、融合させるポリペプチドとタグペプチドとの間に任意のアミノ酸が結合していても、融合させるポリペプチドとタグペプチドとが直接連結していてもよい。なお、任意のアミノ酸としては1~3000残基、好ましくは2~1000残基、より好ましくは3~100残基を挙げることができる。 The tag peptide fusion polypeptide of the present invention may be a tag peptide fusion polypeptide in which the above-mentioned tag peptide and a polypeptide are fused (hereinafter, also referred to as the "tag peptide fusion polypeptide of the present invention"). In such a tag peptide fusion polypeptide, any amino acid may be bound between the polypeptide to be fused and the tag peptide, or the polypeptide to be fused and the tag peptide may be directly linked. The any amino acid may be 1 to 3000 residues, preferably 2 to 1000 residues, and more preferably 3 to 100 residues.
上記本件タグペプチドと融合するポリペプチドとしては、タンパク質、ペプチドホルモン、エピトープ等を挙げることができる。タンパク質としては特に制限されないが、酵素、蛍光タンパク質、構造タンパク質、金属結合タンパク質、補因子タンパク質、抗体、糖タンパク質等を挙げることができる。 Examples of the polypeptide to be fused with the tag peptide of the present invention include proteins, peptide hormones, epitopes, etc. Examples of the protein include, but are not limited to, enzymes, fluorescent proteins, structural proteins, metal binding proteins, cofactor proteins, antibodies, glycoproteins, etc.
さらに、タグペプチド融合ポリペプチドには標識配列を含んでもよい。標識配列の位置はタグペプチドのN末端側、C末端側のいずれか、又は両方のいずれでもよく、標識配列としては、FLAG配列、HA配列、MYC配列、GFP配列、MBP配列、GST配列、SNAP配列、ACP配列、CLIP配列、TAP配列、V5配列などを挙げることができる。 Furthermore, the tag peptide fusion polypeptide may contain a tag sequence. The tag sequence may be located on either the N-terminus or C-terminus of the tag peptide, or on both sides. Examples of the tag sequence include a FLAG sequence, an HA sequence, a MYC sequence, a GFP sequence, an MBP sequence, a GST sequence, a SNAP sequence, an ACP sequence, a CLIP sequence, a TAP sequence, and a V5 sequence.
また、タグペプチド融合ポリペプチドにおいて、タグペプチドとポリペプチドの間にプロテアーゼを認識するアミノ酸配列からなるポリペプチドを含んでもよい。プロテアーゼを認識するアミノ酸配列としては、トロンビン、エンテロキナーゼ、TEVプロテアーゼ、Xa因子、PreScission(登録商標)を認識するアミノ酸配列からなるポリペプチドを挙げることができる。かかるプロテアーゼを認識するアミノ酸配列からなるポリペプチドを備えていれば、必要に応じてプロテアーゼを用いてタグペプチドとポリペプチドとの融合を切断することが可能となる。 In addition, the tag peptide fusion polypeptide may contain a polypeptide consisting of an amino acid sequence that recognizes a protease between the tag peptide and the polypeptide. Examples of amino acid sequences that recognize a protease include polypeptides consisting of amino acid sequences that recognize thrombin, enterokinase, TEV protease, factor Xa, and PreScission (registered trademark). If a polypeptide consisting of an amino acid sequence that recognizes such a protease is provided, it becomes possible to cleave the fusion between the tag peptide and the polypeptide using a protease as necessary.
上記本件タグペプチドや、本件タグペプチドと融合するポリペプチドは、遺伝子工学的手法や、液相法や固相法によるペプチド合成法などの公知の手法によって作製することが可能である。 The above-mentioned tag peptide and the polypeptide fused to the tag peptide can be produced by known techniques such as genetic engineering techniques and peptide synthesis using liquid phase or solid phase methods.
本発明のタグペプチドをコードするポリヌクレオチドとしては、本件タグペプチドをコードするポリヌクレオチド(以下、「本件ポリヌクレオチド」ともいう)であれば特に制限されず、かかるポリヌクレオチドは遺伝子工学的手法を用いた公知の手法によって作製することが可能である。本件タグペプチドをコードするポリヌクレオチドとしては、たとえば配列番号18又は19に示すポリヌクレオチドを挙げることができるが、これらのヌクレオチドにおけるヒスチジン、アスパラギン酸又はグルタミン酸の対応する他のコドンに置換した配列を用いてもよい。 The polynucleotide encoding the tag peptide of the present invention is not particularly limited as long as it is a polynucleotide that encodes the tag peptide of the present invention (hereinafter also referred to as the "polynucleotide of the present invention"), and such a polynucleotide can be prepared by a known method using genetic engineering techniques. Examples of the polynucleotide encoding the tag peptide of the present invention include the polynucleotides shown in SEQ ID NO: 18 or 19, but sequences in which the histidine, aspartic acid, or glutamic acid in these nucleotides are replaced with other corresponding codons may also be used.
本発明のポリヌクレオチドを含有する発現ベクターとしては、上記本件ポリヌクレオチドを含んでいる発現ベクター(以下、「本件発現ベクター」ともいう)であれば特に制限されず、発現ベクターとしては、宿主に応じて適宜選択することができ、pETベクター、pBTベクター、pGEXベクター、pKKベクター、pSEベクター、pQEベクター等の細菌用発現ベクターや、pcDNAベクター、pCMV-FLAGベクター、pEGFPベクター、pcDMベクター等の哺乳動物用発現ベクターや、YEpベクター等の酵母用発現ベクターや、pFastBaclベクター、BakPAKベクター等の昆虫用発現ベクターや、タバコモザイクウイルスベクター等の植物用発現ベクターを挙げることができる。 The expression vector containing the polynucleotide of the present invention is not particularly limited as long as it is an expression vector containing the above-mentioned polynucleotide of the present invention (hereinafter also referred to as "the expression vector of the present invention"). The expression vector can be appropriately selected depending on the host, and examples thereof include bacterial expression vectors such as pET vectors, pBT vectors, pGEX vectors, pKK vectors, pSE vectors, and pQE vectors; mammalian expression vectors such as pcDNA vectors, pCMV-FLAG vectors, pEGFP vectors, and pcDM vectors; yeast expression vectors such as YEp vectors; insect expression vectors such as pFastBacI vectors and BakPAK vectors; and plant expression vectors such as tobacco mosaic virus vectors.
本発明のポリペプチドの精製方法としては、
(2-1)ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンを固定化した担体と、上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとを吸着液の存在下で混合して、前記タグペプチド融合ポリペプチドを前記担体に吸着させる工程;
(2-2)タグペプチド融合ポリペプチドが吸着した担体を洗浄液で洗浄する工程;
(2-3)イミダゾール、L-ヒスチジン、トリス塩基、又は水を用いて、前記担体に吸着したタグペプチド融合ポリペプチドを前記担体から溶出する工程;
の工程(2-1)~(2-3)を備えたポリペプチドの精製方法(以下、「本件ポリペプチドの精製方法」ともいう)であればよく、金属イオンとしてはニッケルであることが好ましい。
The method for purifying the polypeptide of the present invention includes the steps of:
(2-1) mixing a carrier having one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt immobilized thereon with the present tag peptide fusion polypeptide in the presence of an adsorption solution to adsorb the tag peptide fusion polypeptide onto the carrier;
(2-2) washing the carrier onto which the tag peptide fusion polypeptide is adsorbed with a washing solution;
(2-3) eluting the tag peptide fusion polypeptide adsorbed to the carrier from the carrier using imidazole, L-histidine, Tris base, or water;
Any method for purifying a polypeptide comprising steps (2-1) to (2-3) above (hereinafter also referred to as the "method for purifying the polypeptide of the present invention") may be used, and the metal ion is preferably nickel.
上記金属イオンと本件タグペプチド融合ポリペプチドが結合することにより、タグペプチドが融合したポリペプチドを上記担体に固定化することが可能となる。なお、本件タグペプチドが融合したポリペプチドと、上記金属イオンを固定化した担体とは吸着液の存在下で混合後直ちに配位結合するが、混合した後に1分以上、1時間以上、又は6時間以上静置してもよい。 By binding the metal ion to the tag peptide fusion polypeptide of the present invention, it becomes possible to immobilize the tag peptide fused polypeptide on the carrier. The tag peptide fused polypeptide and the carrier on which the metal ion is immobilized are coordinated immediately after mixing in the presence of an adsorption solution, but they may be allowed to stand for 1 minute or more, 1 hour or more, or 6 hours or more after mixing.
上記担体としては、水に対して不溶なものであれば特に制限されず、シリカゲル、多孔性ガラス、セルロース、アガロース、デキストラン、ポリアクリルアミド、磁気ビーズを挙げることができる。 The above carrier is not particularly limited as long as it is insoluble in water, and examples of the carrier include silica gel, porous glass, cellulose, agarose, dextran, polyacrylamide, and magnetic beads.
上記吸着液としては、上記金属イオンを固定化した担体と上記本件タグペプチド融合ポリペプチドを混合して、上記担体に固定化された金属イオンと上記本件タグペプチド融合ポリペプチドが結合し、上記担体に上記本件タグペプチド融合ポリペプチドが吸着できるものであれば特に制限されないが、カリウム、ナトリウム、リチウム、ルビジウム等のアルカリ金属塩を含む溶液や、カルシウム、マグネシウム等のアルカリ土類金属塩を含む溶液や、リン酸緩衝液、トリス緩衝液等の緩衝液を挙げることができる。アルカリ金属塩を含む溶液としては、KCl、NaCl、LiCl、RbCl溶液を挙げることができ、アルカリ土類金属塩を含む溶液としては、CaCl2やMgCl2溶液を挙げることができる。 The adsorption solution is not particularly limited as long as it is capable of mixing the carrier on which the metal ions are immobilized with the present tag peptide fusion polypeptide, binding the metal ions immobilized on the carrier with the present tag peptide fusion polypeptide, and allowing the present tag peptide fusion polypeptide to be adsorbed to the carrier, and examples of the adsorption solution include solutions containing alkali metal salts such as potassium, sodium, lithium, rubidium, etc., solutions containing alkaline earth metal salts such as calcium, magnesium, etc., and buffers such as phosphate buffer, Tris buffer, etc. Examples of the solutions containing alkali metal salts include KCl, NaCl, LiCl, and RbCl solutions, and examples of the solutions containing alkaline earth metal salts include CaCl2 and MgCl2 solutions.
上記吸着液としてアルカリ金属塩を含む溶液やアルカリ土類金属塩を含む溶液を用いる場合の濃度としては、0.03~2.5M、0.05~2.2M、0.1~2M、0.5~1.8M、1~1.5Mを挙げることができる。0.03M以上とすることで、上記担体に固定化された金属イオンと上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとの吸着効率を高めることが可能となる。 When a solution containing an alkali metal salt or an alkaline earth metal salt is used as the adsorption solution, the concentration can be 0.03 to 2.5 M, 0.05 to 2.2 M, 0.1 to 2 M, 0.5 to 1.8 M, or 1 to 1.5 M. By making the concentration 0.03 M or higher, it is possible to increase the adsorption efficiency between the metal ions immobilized on the carrier and the tag peptide fusion polypeptide of the present invention.
上記吸着液として緩衝液を用いる場合のpHとしては、用いる緩衝液の種類や濃度により適宜調整できるが、pH6~10、好ましくはpH6.5~9、より好ましくはpH7~8.6を挙げることができる。また、緩衝液の濃度としては、0.05~2M、好ましくは0.1~1Mを挙げることができる。 When a buffer solution is used as the adsorption solution, the pH can be adjusted as appropriate depending on the type and concentration of the buffer solution used, but examples of the pH include pH 6 to 10, preferably pH 6.5 to 9, and more preferably pH 7 to 8.6. The concentration of the buffer solution can be 0.05 to 2 M, and preferably 0.1 to 1 M.
上記洗浄液としては、上記担体に固定化された金属イオンと上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとの結合が維持又はほとんど維持される溶液であれば特に制限されず、ここで、「上記担体に固定化された金属イオンと上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとの結合がほとんど維持される溶液」とは、上記担体に固定化された金属イオンと上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとの結合がいったん外れても、周辺の(カラムを用いた場合は下方の)担体に固定化された金属イオンと再度結合しうる溶液を意味する。 The washing solution is not particularly limited as long as it maintains or almost maintains the bond between the metal ion immobilized on the carrier and the tag peptide fusion polypeptide of the present invention. Here, "a solution in which the bond between the metal ion immobilized on the carrier and the tag peptide fusion polypeptide of the present invention is almost maintained" means a solution in which, even if the bond between the metal ion immobilized on the carrier and the tag peptide fusion polypeptide of the present invention is once released, the metal ion can re-bind to the metal ion immobilized on the surrounding carrier (lower in the case of using a column).
上記洗浄液は、上記吸着液を用いることができる。上記洗浄液としてアルカリ金属塩を含む溶液やアルカリ土類金属塩を含む溶液を用いる場合の濃度としては、0.03~2.5M、0.05~2.2M、0.1~2M、0.5~1.8M、1~1.5Mを挙げることができる。ただし、目的外のポリペプチドが担体に固定化された金属イオンへ非特異的に結合すること防ぐという観点からは、アルカリ金属塩を含む溶液やアルカリ土類金属塩を含む溶液を用いる場合の濃度の下限としては、0.07M、好ましくは0.05M、より好ましくは0.03Mを挙げることができ、上限としては0.1M、好ましくは0.08M、より好ましくは0.06Mを挙げることができる。 The above-mentioned adsorption solution can be used as the washing solution. When a solution containing an alkali metal salt or a solution containing an alkaline earth metal salt is used as the washing solution, the concentration can be 0.03 to 2.5 M, 0.05 to 2.2 M, 0.1 to 2 M, 0.5 to 1.8 M, or 1 to 1.5 M. However, from the viewpoint of preventing non-specific binding of non-target polypeptides to metal ions immobilized on the carrier, the lower limit of the concentration when a solution containing an alkali metal salt or a solution containing an alkaline earth metal salt is used can be 0.07 M, preferably 0.05 M, and more preferably 0.03 M, and the upper limit can be 0.1 M, preferably 0.08 M, and more preferably 0.06 M.
また、上記洗浄液として緩衝液を用いる場合のpHとしては、用いる緩衝液の種類や濃度により適宜調整できるが、pH6~10、好ましくはpH6.5~9、より好ましくはpH7~8.6を挙げることができる。また、緩衝液の濃度としては、0.05~2M、好ましくは0.1~1Mを挙げることができる。ただし、目的外のポリペプチドが担体に固定化された金属イオンへ非特異的に結合することを防ぐという観点から、pHとしてはpH7~8、好ましくはpH7.2~7.4を挙げることができる。 When a buffer solution is used as the washing solution, the pH can be adjusted as appropriate depending on the type and concentration of the buffer solution used, but examples of the pH include pH 6 to 10, preferably pH 6.5 to 9, and more preferably pH 7 to 8.6. Examples of the concentration of the buffer solution include 0.05 to 2 M, and preferably 0.1 to 1 M. However, from the viewpoint of preventing non-specific binding of unintended polypeptides to metal ions immobilized on the carrier, examples of the pH include pH 7 to 8, and preferably pH 7.2 to 7.4.
上記溶出液は、上記担体に固定化された金属イオンと上記本件タグペプチド融合ポリペプチドとの結合が外れる溶液であれば特に制限されないが、イミダゾール溶液、L-ヒスチジン溶液、緩衝液、アルカリ金属塩溶液又は水を挙げることができる。 The elution solution is not particularly limited as long as it is a solution that can release the bond between the metal ion immobilized on the carrier and the tag peptide fusion polypeptide of the present invention, but examples of the elution solution include an imidazole solution, an L-histidine solution, a buffer solution, an alkali metal salt solution, and water.
上記溶出液としてイミダゾール溶液を用いる場合は、好ましくは0.005~1M、好ましくは0.05~0.1Mを挙げることができ、所定の濃度のイミダゾール溶液を用いて溶出してもよいが、たとえば0-100mMのイミダゾールの濃度勾配により溶出を行ってもよい。 When an imidazole solution is used as the eluent, the concentration is preferably 0.005 to 1 M, more preferably 0.05 to 0.1 M. Elution may be performed using an imidazole solution of a predetermined concentration, but elution may also be performed using a concentration gradient of, for example, 0-100 mM imidazole.
上記溶出液としてL-ヒスチジン溶液を用いる場合は、好ましくは0.005~1M、より好ましくは0.05~0.1Mを挙げることができ、所定の濃度のL-ヒスチジン溶液を用いて溶出してもよいが、たとえば0-100mMのヒスチジンの濃度勾配により溶出を行ってもよい。 When an L-histidine solution is used as the eluent, the concentration is preferably 0.005 to 1 M, more preferably 0.05 to 0.1 M. Elution may be performed using an L-histidine solution of a predetermined concentration, but elution may also be performed using a concentration gradient of, for example, 0-100 mM histidine.
上記溶出液として緩衝液を用いる場合のpHとしては、用いる緩衝液の種類や濃度により適宜調整できるが、好ましくはpH6~10、より好ましくはpH8.5~9を挙げることができる。緩衝液の濃度としては、0.1~2M、好ましくは0.5~1Mを挙げることができる。 When a buffer solution is used as the eluent, the pH can be adjusted as appropriate depending on the type and concentration of the buffer solution used, but is preferably pH 6 to 10, and more preferably pH 8.5 to 9. The concentration of the buffer solution can be 0.1 to 2 M, and preferably 0.5 to 1 M.
本発明のポリペプチドの精製キットとしては、上記本件発現ベクターを含有していればよく、ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンを固定化した担体を含んでもよい。また、必要に応じてポリペプチドを精製するための説明書や、上記本件ポリペプチドの精製方法において用いる吸着液、洗浄液、溶出液を含んでもよい。 The kit for purifying the polypeptide of the present invention may contain the expression vector of the present invention, and may also contain a carrier on which one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt are immobilized. If necessary, the kit may also contain instructions for purifying the polypeptide, and an adsorption solution, a washing solution, and an elution solution used in the method for purifying the polypeptide of the present invention.
以下、実施例により本発明をより具体的に説明するが、本発明の技術的範囲はこれらの
例示に限定されるものではない。
The present invention will be described in more detail below with reference to examples, but the technical scope of the present invention is not limited to these examples.
[実施例1]
これまで6つのヒスチジンからなるヒスチジンタグが広く使われているが、かかるヒスチジンが連続したタグを用いるとタンパク質の活性が低下することが知られている。そこで、ヒスチジンとヒスチジン以外のアミノ酸との組み合わせによりタンパク質の活性低下を抑制できないか検討した。赤色蛍光タンパク質(RFPタンパク質)のC末端側に、ヒスチジンが連続したタグペプチドを融合したRFP及び3つのヒスチジンの間に様々なアミノ酸を配置したタグペプチドが付加したタグペプチドを作製した。かかるタグペプチドを融合したRFPを生産する株を作製し、RFPによる蛍光を調べることでタンパク質の活性を評価した。
[Example 1]
Although histidine tags consisting of six histidines have been widely used, it is known that the use of such a tag with consecutive histidines reduces the activity of the protein. Therefore, we investigated whether the reduction in protein activity could be suppressed by combining histidine with an amino acid other than histidine. We produced a red fluorescent protein (RFP protein) with a tag peptide with consecutive histidines fused to the C-terminus of the RFP protein, and a tag peptide with various amino acids arranged between three histidines. We produced a strain that produces RFP fused with such a tag peptide, and evaluated the activity of the protein by examining the fluorescence of RFP.
(a-1)6H:HHHHHH(配列番号2)
(a-2)12H:HHHHHHHHHHHH(配列番号8)
(a-3)15H:HHHHHHHHHHHHHHH(配列番号11)
(a-4)18H:HHHHHHHHHHHHHHHHHH(配列番号20)
(a-5)3HW×5:HHHWHHHWHHHWHHHWHHH(配列番号21)
(a-6)3HV×5:HHHVHHHVHHHVHHHVHHH(配列番号22)
(a-7)3HT×5:HHHTHHHTHHHTHHHTHHH(配列番号23)
(a-8)3HR×5:HHHRHHHRHHHRHHHRHHH(配列番号24)
(a-9)3HM×5:HHHMHHHMHHHMHHHMHHH(配列番号25)
(a-10)3HL×5:HHHLHHHLHHHLHHHLHHH(配列番号26)
(a-11)3HP×5:HHHPHHHPHHHPHHHPHHH(配列番号27)
(a-12)3HN×5:HHHNHHHNHHHNHHHNHHH(配列番号28)
(a-13)3HK×5:HHHKHHHKHHHKHHHKHHH(配列番号29)
(a-14)3HQ×5:HHHQHHHQHHHQHHHQHHH(配列番号30)
(a-15)3HI×5:HHHIHHHIHHHIHHHIHHH(配列番号31)
(a-16)3HF×5:HHHFHHHFHHHFHHHFHHH(配列番号32)
(a-17)3HE×5:HHHEHHHEHHHEHHHEHHH(配列番号33)
(a-18)3HD×5:HHHDHHHDHHHDHHHDHHH(配列番号34)
(a-19)3HC×5:HHHCHHHCHHHWHHHCHHH(配列番号35)
(a-20)3HY×5:HHHYHHHYHHHYHHHYHHH(配列番号36)
(a-21)3HS×5:HHHSHHHSHHHSHHHSHHH(配列番号37)
(a-22)3HG×5:HHHGHHHGHHHGHHHGHHH(配列番号38)
(a-23)3HA×5:HHHAHHHAHHHAHHHAHHH(配列番号39)
(a-1) 6H: HHHHHH (SEQ ID NO: 2)
(a-2) 12H: HHHHHHHHHHHH (SEQ ID NO: 8)
(a-3) 15H: HHHHHHHHHHHHHHHH (SEQ ID NO: 11)
(a-4) 18H: HHHHHHHHHHHHHHHHHHH (SEQ ID NO: 20)
(a-5) 3HW × 5: HHHWHHHHWHHHHWHHHH (SEQ ID NO: 21)
(a-6) 3HV × 5: HHHVHHHVHHHVHHHVHHH (SEQ ID NO: 22)
(a-7) 3HT × 5: HHHTHHHHHHHHHHHHHH (SEQ ID NO: 23)
(a-8) 3HR × 5: HHHRHHRHHRHHRHHRHHHH (SEQ ID NO: 24)
(a-9) 3HM × 5: HHHMHHHMHHHMHHHMHHHH (SEQ ID NO: 25)
(a-10) 3HL x 5: HHHLHHHLHHHLHHHLHHH (SEQ ID NO: 26)
(a-11) 3HP × 5: HHHPHHHPHHHHHHHHHH (SEQ ID NO: 27)
(a-12) 3HN × 5: HHHNHHHNHHHNHHHNHHH (SEQ ID NO: 28)
(a-13) 3HK × 5: HHHKHHHKHHHKHHHKHHH (SEQ ID NO: 29)
(a-14) 3HQ × 5: HHHQHHHQHHHQHHHQHHH (SEQ ID NO: 30)
(a-15) 3HI × 5: HHHIHHHIHHHIHHHIHHH (SEQ ID NO: 31)
(a-16) 3HF × 5: HHHFHHHFHHHFHHHFHHH (SEQ ID NO: 32)
(a-17) 3HE × 5: HHHEHHHEHHHEHHHEHHHH (SEQ ID NO: 33)
(a-18) 3HD × 5: HHHDHHDHHDHHDHHDHHHH (SEQ ID NO: 34)
(a-19) 3HC × 5: HHHCHHHCHHHWHHHCHHH (SEQ ID NO: 35)
(a-20) 3HY × 5: HHHYHHHYHHHYHHHYHHH (SEQ ID NO: 36)
(a-21) 3HS × 5: HHHSHHSHHSHHSHHSHH (SEQ ID NO: 37)
(a-22) 3HG × 5: HHGHHHHGHHHHHGHHHH (SEQ ID NO: 38)
(a-23) 3HA × 5: HHHAHHHAHHHAHHHAHHH (SEQ ID NO: 39)
YEpGAPcherryベクター(特開2017-88536参照)をテンプレートとして上記タグペプチドがRFPタンパク質のC末端側に付加するようにプライマーを設計してPCRを行い、上記タグペプチド融合RFPをコードする塩基配列をPCRにより増幅した。かかるPCR産物をYEpGAPcherryベクターに相同組み換えにより組み込み、サッカロマイセス・セレビシエのBY4741株(Brachmann et al., Yeast Volume14, Issue2 30 January 1998参照)へ形質転換し、それぞれのタグペプチドを融合したRFPを生産する形質転換体を作製した。 Using the YEpGAPcherry vector (see JP 2017-88536 A) as a template, primers were designed to add the tag peptide to the C-terminus of the RFP protein, and PCR was performed to amplify the base sequence encoding the tag peptide-fused RFP. The PCR product was inserted into the YEpGAPcherry vector by homologous recombination and transformed into the BY4741 strain of Saccharomyces cerevisiae (see Brachmann et al., Yeast Volume 14, Issue 2, 30 January 1998), to produce transformants that produce RFPs fused with the respective tag peptides.
次に、24-well プレートにYPDを1mL加え、上記で作製した形質転換体を植菌し、28℃、150rpmで24時間培養した。その後、培養液10μLを取り、YPD1mLに混ぜてさらに28℃、150rpmで24時間培養した。培養液10μLを蒸留水で100倍希釈してSynergy MX SMATBL(BioTek社)でOD600及び蛍光(excitation 558, emission 613)を測定した。RFPの活性(赤色の強度)は、「RFP活性=蛍光/OD600」で算出した。結果を図1に示す。 Next, 1 mL of YPD was added to a 24-well plate, and the transformant prepared above was inoculated and cultured at 28°C and 150 rpm for 24 hours. After that, 10 μL of the culture solution was taken and mixed with 1 mL of YPD, and cultured at 28°C and 150 rpm for another 24 hours. 10 μL of the culture solution was diluted 100-fold with distilled water, and OD600 and fluorescence (excitation 558, emission 613) were measured using a Synergy MX SMATBL (BioTek). RFP activity (intensity of red color) was calculated as "RFP activity = fluorescence / OD600". The results are shown in Figure 1.
図1に示すように、連続するヒスチジンの数が多くなるほどRFPの活性が低下していた。また、同じヒスチジンを15個有しているタグと比較して、3連続するヒスチジンの間にプロリン(P)、グルタミン酸(E)、アスパラギン酸(D)、グリシン(G)、アラニン(A)、アスパラギン(N)、グルタミン(Q)を有していれば、1.5倍以上の活性を有していることが明らかとなった。 As shown in Figure 1, the activity of RFP decreased as the number of consecutive histidines increased. In addition, it was revealed that the activity of RFP was 1.5 times higher when there were proline (P), glutamic acid (E), aspartic acid (D), glycine (G), alanine (A), asparagine (N), and glutamine (Q) between three consecutive histidines, compared to a tag with the same 15 histidines.
[実施例2]
実施例1により、連続するヒスチジンにプロリン(P)、グルタミン酸(E)、アスパラギン酸(D)、グリシン(G)、アラニン(A)、アスパラギン(N)、又はグルタミン(Q)が含まれることでタンパク質の活性低下を抑制していることが確認された。そこで、以下に示すヒスチジンとアスパラギン酸との様々な組み合わせにおけるタンパク質の活性を調べた。
[Example 2]
It was confirmed from Example 1 that the decrease in protein activity was suppressed by including proline (P), glutamic acid (E), aspartic acid (D), glycine (G), alanine (A), asparagine (N), or glutamine (Q) in consecutive histidines. Therefore, the activity of the protein was examined in various combinations of histidine and aspartic acid shown below.
(b-1)タグペプチド無し
(b-2)HHHHHH(配列番号2)
(b-3)HDHDHDHDHDH(配列番号16)
(b-4)HHDHHDHH(配列番号40)
(b-5)HHHDHHH(配列番号41)
(b-6)HHHHHHDDDDDD(配列番号42)
(b-7)DDDDDDHHHHHH(配列番号43)
(b-8)DDDHHHHHHDDD(配列番号44)
(b-9)HHHHHHDDD(配列番号45)
(b-10)DDDHHHHHH(配列番号46)
(b-1) No tag peptide (b-2) HHHHHH (SEQ ID NO: 2)
(b-3) HDHDHDHDHDH (SEQ ID NO: 16)
(b-4) HHDHHDHH (SEQ ID NO: 40)
(b-5) HHHDHHH (SEQ ID NO: 41)
(b-6) HHHHHHDDDDDDD (SEQ ID NO: 42)
(b-7) DDDDDDHHHHHH (SEQ ID NO: 43)
(b-8) DDDHHHHHHDDD (SEQ ID NO: 44)
(b-9) HHHHHHDDD (SEQ ID NO: 45)
(b-10) DDDHHHHHH (SEQ ID NO: 46)
ガウシアルシフェラーゼ(GLuc)のC末端側に、上記(b-1)~(b-10)のタグペプチドが付加したタグペプチド融合GLucを生産する形質転換体を作製し、GLucによる蛍光を調べることでタンパク質の活性を評価した。 A transformant was prepared that produced tag peptide-fused GLuc in which the tag peptides (b-1) to (b-10) were added to the C-terminus of Gaussia luciferase (GLuc), and the activity of the protein was evaluated by examining the fluorescence of GLuc.
GLucを含むベクター(New England Biolabs Japan社)をテンプレートとして上記タグペプチドがGLucタンパク質のC末端側に付加するようにプライマーを設計してPCRを行い、上記タグペプチド融合GLucをコードする塩基配列をPCRにより増幅した。かかるPCR産物を上記YEpGAPcherryベクターに相同組み換えにより組み込んで、サッカロマイセス・セレビシエの上記BY4741株へ形質転換し、それぞれのタグペプチドを融合したGLucを生産する形質転換体を作製した。 Using a vector containing GLuc (New England Biolabs Japan) as a template, primers were designed to add the tag peptide to the C-terminus of the GLuc protein, and PCR was performed to amplify the base sequence encoding the tag peptide-fused GLuc. The PCR product was incorporated into the YEpGAPcherry vector by homologous recombination and transformed into the BY4741 strain of Saccharomyces cerevisiae, producing transformants that produce GLuc fused with each tag peptide.
次に、24-well プレートにYPDを1mL加え、上記で作製した形質転換体を植菌し、28℃、150rpmで24時間培養した。その後、培養液10μLを取り、YPD1mLに混ぜてさらに28℃、150rpmで24時間培養した。培養液10μLを蒸留水で100倍希釈して分光光度計でOD600を測定した。また、BioLux(登録商標)Gaussia Luciferase Assay Kit(New England Biolabs社)とルミノメータ(Glo Max20/20n Luminometer:Promega社)を用いて培養液中のルシフェラーゼの相対発現量(RLU/(μL・OD))をルシフェラーゼ活性として算出した。結果を図2に示す。 Next, 1 mL of YPD was added to a 24-well plate, and the transformant prepared above was inoculated and cultured at 28°C and 150 rpm for 24 hours. Then, 10 μL of the culture solution was taken, mixed with 1 mL of YPD, and cultured at 28°C and 150 rpm for another 24 hours. 10 μL of the culture solution was diluted 100-fold with distilled water, and the OD600 was measured using a spectrophotometer. In addition, the relative expression level of luciferase in the culture solution (RLU/(μL·OD)) was calculated as luciferase activity using BioLux (registered trademark) Gaussia Luciferase Assay Kit (New England Biolabs) and a luminometer (Glo Max20/20n Luminometer: Promega). The results are shown in Figure 2.
図2から明らかなように、6個のヒスチジン(H)が連続した6Hの場合と比較して、アスパラギン酸(D)を含有した場合にはルシフェラーゼ活性が2倍以上となっており、特に配列番号16に示すヒスチジンとアスパラギン酸を交互に配置したHDHDHDHDHDHにおいては6Hと比較して10倍以上活性が高いことが確認された。したがって、ヒスチジンの連続を少なくすること、及び/又はアスパラギン酸の連続性を少なくすることで高いルシフェラーゼ活性が維持できると考えられた。 As is clear from FIG. 2, luciferase activity is more than doubled when aspartic acid (D) is contained compared to 6H, which is a sequence of six consecutive histidines (H). In particular, HDHDHDHDHDHDH, which is an alternating sequence of histidines and aspartic acids as shown in SEQ ID NO: 16, was confirmed to have activity more than 10 times higher than 6H. Therefore, it was believed that high luciferase activity could be maintained by reducing the number of consecutive histidines and/or the number of consecutive aspartic acids.
[実施例3]<チューブ内でのニッケルビーズへの吸着-1>
実施例2によりタグペプチドとして配列番号16に示すアミノ酸配列からなるHDHDHDHDHDH(6HD)を用いればタンパク質の活性低下を抑制することが確認された。ここで、タグペプチドを利用してタンパク質を精製するには、タグペプチドがニッケルに吸着する必要がある。そこで、配列番号16に示すアミノ酸配列からなるタグペプチド(HDHDHDHDHDH:6HD)又は配列番号17に示すアミノ酸配列からなるタグペプチドHEHEHEHEHEH:6HE)のニッケルビーズへの吸着を調べた。
[Example 3] <Adsorption to nickel beads in a tube-1>
It was confirmed in Example 2 that the use of HDHDHDHDHDDHDH (6HD) consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16 as a tag peptide suppresses the decrease in protein activity. In order to purify a protein using a tag peptide, the tag peptide must be adsorbed to nickel. Thus, the adsorption of the tag peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16 (HDHDHDHDHDDHDH: 6HD) or the tag peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 17 (HEHEHEHEHEH: 6HE) to nickel beads was examined.
(RFPタンパク質抽出液の調製)
上記実施例1と同様に、YEpGAPcherryベクターを用いてRFPタンパク質のC末端側に配列番号16に示すアミノ酸配列からなるタグペプチドを融合したタグペプチド融合ポリペプチド(RFP-6HD)又はRFPタンパク質のC末端側に配列番号17に示すアミノ酸配列からなるタグペプチドを融合したタグペプチド融合ポリペプチド(RFP-6HE)を生産するサッカロマイセス・セレビシエのBY4741株の形質転換体を作製した。かかる形質転換体、及び実施例1で作製したRFP-6Hを生産する形質転換体、タグペプチドなしのRFPを生産する形質転換体を培養し、培養液を15mLチューブに移し、3000rpmで1分ほど遠心分離し、上清を捨てた。そこに0.1M トリス塩基を5mL加え、攪拌後に3000rpmで1分遠心分離して上清を捨てた。そこに0.1M トリス塩基+1% TritonX-100を1.5mL加え、攪拌後に50℃で1時間熱した。その後、9000rpmで5分遠心分離し、上清をRFP-6HD、RFP-6HE、RFP-6H、又はRFPのタンパク質抽出液とした。
(Preparation of RFP protein extract)
As in Example 1 above, a tag peptide fusion polypeptide (RFP-6HD) in which a tag peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16 is fused to the C-terminus of the RFP protein, or a tag peptide fusion polypeptide (RFP-6HE) in which a tag peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 17 is fused to the C-terminus of the RFP protein, was produced using the YEpGAPcherry vector. The transformant, the transformant producing RFP-6H produced in Example 1, and the transformant producing RFP without a tag peptide were cultured, the culture solution was transferred to a 15 mL tube, centrifuged at 3000 rpm for about 1 minute, and the supernatant was discarded. 5 mL of 0.1 M Tris base was added thereto, and after stirring, the mixture was centrifuged at 3000 rpm for 1 minute and the supernatant was discarded. 1.5 mL of 0.1 M Tris base + 1% Triton X-100 was added thereto, and after stirring, the mixture was heated at 50° C. for 1 hour. Then, the mixture was centrifuged at 9000 rpm for 5 minutes, and the supernatant was used as a protein extract of RFP-6HD, RFP-6HE, RFP-6H, or RFP.
(ニッケルビーズへの吸着)
ニッケルビーズ(His-Select Nickel Affinity Gel:シグマアルドリッチ社)50μL、上記RFP-6HE、RFP-6HD、RFP-6H又はRFPのタンパク質抽出液100μL及び吸着液(0.1M Tris-HCl pH7)100μLを1.5mLマイクロ遠心チューブ(sorenson社)に加えて混合し、Intelli-mixterを用いて、30rpmで10分混合し、その後6000rpmで数秒遠心した。結果を図3に示す。
(Adsorption onto nickel beads)
Nickel beads (His-Select Nickel Affinity Gel: Sigma-Aldrich) 50 μL, the above RFP-6HE, RFP-6HD, RFP-6H or RFP protein extract 100 μL, and adsorption solution (0.1 M Tris-HCl pH 7) 100 μL were added to a 1.5 mL microcentrifuge tube (Sorenson) and mixed, and mixed at 30 rpm for 10 minutes using an Intelli-mixer, and then centrifuged at 6000 rpm for several seconds. The results are shown in FIG. 3.
図3から明らかなように、6HE、6HDをタグペプチドとして融合したRFP-6HE及びRFP-6HDはニッケルビーズに吸着することが確認された。
[実施例4]<チューブ内でのニッケルビーズへの吸着-2>
As is clear from FIG. 3, it was confirmed that RFP-6HE and RFP-6HD, which are fused with 6HE and 6HD as tag peptides, were adsorbed to nickel beads.
[Example 4] <Adsorption to nickel beads in a tube-2>
(塩の影響)
実施例3では吸着液としてTris-HClを用いたが、他の吸着液を用いてタグペプチド融合ペプチドのニッケルビーズへの吸着を調べた。また、実施例3ではタグペプチド融合ペプチドとして酵母で生産したタンパク質抽出液を用いたが、以下の方法で大腸菌で生産したRFP-6HE、RFP-6Hタンパク質抽出液を用いた。
(Effect of salt)
Although Tris-HCl was used as the adsorption solution in Example 3, other adsorption solutions were used to examine the adsorption of the tag peptide fusion peptide to nickel beads. In addition, although a protein extract produced in yeast was used as the tag peptide fusion peptide in Example 3, RFP-6HE and RFP-6H protein extracts produced in E. coli by the following method were used.
RFPのC末端側に6HEが結合したRFP-6HEを発現する形質転換体RAK26118株(DH5α株/genotype:pAmpOri-srlA100p-eEmRFP-6HE:Nakamura et al., molecular Biotechnology December 2018, Volume 60, Issue 12, pp 912-923)、及びRFPのC末端側に6Hが結合したRFP-6Hを発現する形質転換体RAK26117株(DH5α株/genotype:pAmpOri-srlA100p-eEmRFP-6H)を酵母エキス及びポリペプトンを含む培地で37℃、48時間、175rpmで培養した。次に、培養液を50mLチューブに移し、12,000rpmで1分遠心して上清を捨てた。1%TritonX-100を含む溶液を3mL加えて攪拌し、RFP-6HE又はRFP-6Hタンパク質抽出液を得た。 The transformant RAK26118 strain (DH5α strain/genotype: pAmpOri-srlA100p-eEmRFP-6HE: Nakamura et al., molecular Biotechnology December 2018, Volume 60, Issue 12, pp 912-923) expressing RFP-6HE with 6HE bound to the C-terminus of RFP, and the transformant RAK26117 strain (DH5α strain/genotype: pAmpOri-srlA100p-eEmRFP-6H) expressing RFP-6H with 6H bound to the C-terminus of RFP were cultured at 37°C, 48 hours, and 175 rpm in a medium containing yeast extract and polypeptone. Next, the culture solution was transferred to a 50 mL tube, centrifuged at 12,000 rpm for 1 minute, and the supernatant was discarded. 3 mL of a solution containing 1% Triton X-100 was added and stirred to obtain RFP-6HE or RFP-6H protein extract.
また、吸着液として、吸着液の種類を0.1M LiCl、0.1M NaCl、0.1M KClとした場合、吸着液の濃度を1M KCl、0.1M KCl、0.01M KClとした場合に分けて行った。それぞれの吸着液を用いた場合の結果をそれぞれ図4(a)、(b)に示す。 The adsorption solution was also tested using 0.1M LiCl, 0.1M NaCl, and 0.1M KCl, and with concentrations of 1M KCl, 0.1M KCl, and 0.01M KCl. The results for each adsorption solution are shown in Figure 4(a) and (b), respectively.
図4(a)、(b)から明らかなように、RFP-6HEは0.1M LiCl、NaCl、KClのいずれの塩の存在下でもニッケルビーズに吸着することが明らかとなった。なお、吸着液として蒸留水を用いた場合にはRFP-6HEはニッケルビーズに吸着しなかった(図示なし)。また、KClにおいて、塩濃度が0.01Mでは吸着せず、0.1M、1Mで吸着した。かかる結果より、RFP-6HEは一定の濃度以上の塩の存在下でニッケルビーズに吸着することが確認された。一方、RFP-6Hは蒸留水や0.01M KClでも吸着しており、RFP-6Hは塩濃度に依存せずにニッケルビーズに吸着すると考えられた。また、通常、1Mの濃度のKCl溶液は、通常のイオン交換クロマトグラフィーでは溶出に用いる塩濃度であるため、1Mの濃度のKClを用いてニッケルに吸着させれば、目的外のタンパク質の非特異的な吸着を低減させることが可能となる。 As is clear from Figures 4(a) and (b), it was revealed that RFP-6HE was adsorbed to nickel beads in the presence of any of the salts 0.1M LiCl, NaCl, and KCl. When distilled water was used as the adsorption solution, RFP-6HE was not adsorbed to nickel beads (not shown). In addition, in KCl, RFP-6HE was not adsorbed at a salt concentration of 0.01M, but was adsorbed at 0.1M and 1M. From these results, it was confirmed that RFP-6HE is adsorbed to nickel beads in the presence of salt at a certain concentration or higher. On the other hand, RFP-6H was adsorbed even with distilled water and 0.01M KCl, and it was considered that RFP-6H is adsorbed to nickel beads regardless of the salt concentration. In addition, since a KCl solution with a concentration of 1M is usually the salt concentration used for elution in normal ion exchange chromatography, if RFP-6HE is adsorbed to nickel using a KCl solution with a concentration of 1M, it is possible to reduce nonspecific adsorption of untargeted proteins.
また、一定の塩の存在下での吸着ということから、RFP-6HEとニッケルビーズとの吸着にはグルタミン酸の側鎖が関与している可能性が示唆された。 In addition, since adsorption occurred in the presence of a certain amount of salt, it was suggested that the side chain of glutamic acid may be involved in the adsorption of RFP-6HE to nickel beads.
[実施例5]<RFP-6HEの溶出(チューブ)>
上記実施例3及び4によりRFP-6HEはニッケルビーズに吸着することが確認できた。ここで、タンパク質を精製するには、ニッケルビーズに吸着したタンパク質を溶出する必要がある。そこで、さらに吸着したタンパク質をニッケルビーズから溶出できるかどうかをマイクロ遠心チューブを用いて調べた。
[Example 5] <Elution of RFP-6HE (tube)>
It was confirmed from the above Examples 3 and 4 that RFP-6HE is adsorbed to nickel beads. In order to purify the protein, it is necessary to elute the protein adsorbed to the nickel beads. Therefore, it was further examined using a microcentrifuge tube whether the adsorbed protein can be eluted from the nickel beads.
(イミダゾールによる溶出)
吸着液として2M KPO4 pH8.0を用いて実施例3と同様にニッケルビーズに6HEを吸着させた。次に、0.1Mのイミダゾールで溶出を行った。結果を図5に示す。図5から明らかなようにチューブ全体が青紫色となり、RFP-6HEはRFP-6Hと同様に0.1Mのイミダゾールでニッケルビーズから溶出することが確認された。
(Elution with imidazole)
6HE was adsorbed onto nickel beads in the same manner as in Example 3, using 2 M KPO 4 pH 8.0 as the adsorption solution. Next, elution was performed with 0.1 M imidazole. The results are shown in Figure 5. As is clear from Figure 5, the entire tube turned blue-purple, and it was confirmed that RFP-6HE was eluted from the nickel beads with 0.1 M imidazole, similar to RFP-6H.
(ヒスチジンによる溶出)
イミダゾールによる溶出が確認されたが、イミダゾールは塩基性であるため、溶出するタンパク質の種類及び溶出したタンパク質の用途によっては、溶出液からイミダゾールを取り除く必要がある。ここで、イミダゾールは構造的にヒスチジンと部分的に類似している。また、ヒスチジンはイミダゾールより低コストであると共にpHの調整が容易である。そこで、イミダゾールの代わりにヒスチジン(1、10、20、40、60、80、100mM)での溶出を試みた。結果を図6に示す。図6から明らかなように、ヒスチジンによってもRFP-6HEはニッケルビーズから溶出することが確認された。
(Elution with histidine)
Elution by imidazole was confirmed, but since imidazole is basic, it may be necessary to remove imidazole from the elution solution depending on the type of protein to be eluted and the use of the eluted protein. Here, imidazole is structurally partially similar to histidine. Histidine is also less expensive than imidazole and the pH can be easily adjusted. Therefore, elution was attempted with histidine (1, 10, 20, 40, 60, 80, 100 mM) instead of imidazole. The results are shown in FIG. 6. As is clear from FIG. 6, it was confirmed that RFP-6HE was also eluted from nickel beads by histidine.
(Tris緩衝液による溶出)
ヒスチジンタグのイミダゾールを用いた溶出ではpHを制御するためにTris緩衝液を用いることが多い。そこで、吸着液として2M KPO4 pH8.0を用いて実施例3と同様にニッケルビーズにRFP-6HEを吸着させた。次に、Tris緩衝液(pH8、9、及び10、濃度0.5及び1M)で溶出を行った。結果を図7に示す。図7から明らかなように、いずれのTris緩衝液でもRFP-6HEはニッケルビーズから溶出すること、0.5Mより1Mの方が溶出されやすいことが分かった。なお、0.5MではRFP-6Hの場合には溶出されにくいのに対して、RFP-6HEでは溶出でき、特にpH9及び10で溶出されやすいことが明らかとなった。
(Elution with Tris buffer)
In the elution of histidine tag using imidazole, Tris buffer is often used to control pH. Therefore, RFP-6HE was adsorbed to nickel beads in the same manner as in Example 3 using 2M KPO 4 pH 8.0 as the adsorption solution. Next, elution was performed with Tris buffer (pH 8, 9, and 10, concentration 0.5 and 1M). The results are shown in FIG. 7. As is clear from FIG. 7, it was found that RFP-6HE was eluted from nickel beads with any Tris buffer, and that elution was easier with 1M than with 0.5M. It was revealed that RFP-6H was difficult to elute at 0.5M, whereas RFP-6HE could be eluted, and was particularly easy to elute at pH 9 and 10.
[実施例6]<RFP-6HEの溶出(カラム)>
実施例5ではチューブを用いて所定の溶出液で溶出を行ったが、タンパク質の精製ではカラムを用いて溶出することが一般的である。そこで、カラムを用いた溶出を検討した。
[Example 6] <Elution of RFP-6HE (column)>
In Example 5, elution was performed using a tube with a predetermined elution solution, but elution using a column is common in protein purification, so elution using a column was examined.
ペリスタルティックポンプ UVモニター一体型クロマトグラフィーシステム AKTA start(GEヘルスケアジャパン社)にニッケル充填カラム(His Trap HP:GEヘルスケアジャパン社)を連結した。RFP-6HE又はRFP-6Hを上記ニッケル充填カラムにアプライし、1M KPO4 pH8.0で吸着後、10分同液で洗浄し、さらに蒸留水で5分洗浄した。次に、0-100mMイミダゾールの濃度勾配によりRFP-6HE又はRFP-6Hを溶出してUV280nmの吸収を測定した。溶出したときピークが見られた液をSDS-PAGEにより解析した。ゲルはExtra PAGE One Precast Gel 10-20%を用いて300V、35分で電気泳動した。イミダゾールの濃度勾配による溶出結果を図8(a)、(b)に、SDS-PAGE解析の結果を図8(c)に示す。 A nickel-filled column (His Trap HP: GE Healthcare Japan) was connected to a peristaltic pump UV monitor integrated chromatography system AKTA start (GE Healthcare Japan). RFP-6HE or RFP-6H was applied to the nickel-filled column, adsorbed with 1M KPO 4 pH 8.0, washed with the same solution for 10 minutes, and further washed with distilled water for 5 minutes. Next, RFP-6HE or RFP-6H was eluted with a concentration gradient of 0-100 mM imidazole to measure UV280 nm absorption. The liquid in which a peak was observed upon elution was analyzed by SDS-PAGE. The gel was electrophoresed at 300 V for 35 minutes using Extra PAGE One Precast Gel 10-20%. The results of elution using a concentration gradient of imidazole are shown in Figures 8(a) and (b), and the results of SDS-PAGE analysis are shown in Figure 8(c).
図8(a)、(b)から明らかなように、RFP-6Hと比較してRFP-6HEはシャープなピークで溶出していること、及び低濃度のイミダゾールで溶出可能であることが明らかとなった。また、図8(c)から明らかなように、RFP-6HEはRFP-6Hと同程度に精製されていることが確認された。 As is clear from Figures 8(a) and (b), RFP-6HE elutes with a sharper peak than RFP-6H, and can be eluted with a low concentration of imidazole. In addition, as is clear from Figure 8(c), it was confirmed that RFP-6HE was purified to the same extent as RFP-6H.
なお、実施例1において、タグペプチドとして3連続するヒスチジンの間にプロリン(P)、グリシン(G)を有している場合にタンパク質の活性が高かったため、RFP-6HP及びRFP-6HGを実施例2と同様の方法で作製して、上記と同様に0-100mMイミダゾールの濃度勾配によりニッケル充填カラムからの溶出を試みた。結果を図9(a)、(b)に示す。 In Example 1, since the activity of the protein was high when the tag peptide contained proline (P) and glycine (G) between three consecutive histidines, RFP-6HP and RFP-6HG were prepared in the same manner as in Example 2, and elution from a nickel-packed column was attempted using a concentration gradient of 0-100 mM imidazole as described above. The results are shown in Figures 9(a) and (b).
図9(a)、(b)から明らかなように、RFP-6HP及びRFP-6HGではニッケル充填カラムからの溶出がほとんどなく、タンパク質の精製にはRFP-6HP及びRFP-6HGではなくRFP-6HEの方が好ましいことが明らかとなった。 As is clear from Figures 9(a) and (b), RFP-6HP and RFP-6HG were hardly eluted from the nickel-packed column, demonstrating that RFP-6HE is preferable for purifying proteins, rather than RFP-6HP and RFP-6HG.
[実施例7]<RFP-6HEの溶出(カラム)-2>
実施例6においては、イミダゾールの濃度勾配による溶出の前に蒸留水で洗浄していたが、その後の本発明者らの解析により蒸留水でも一部溶出することが確認された。そこで、より精製度を向上させるために、実施例6における溶出において蒸留水での洗浄工程を除いた溶出を検討した。結果を図10に示す。
[Example 7] <Elution of RFP-6HE (column)-2>
In Example 6, washing with distilled water was performed before elution with the imidazole concentration gradient, but subsequent analysis by the present inventors confirmed that some of the product was also eluted with distilled water. Therefore, in order to further improve the degree of purification, an elution method was investigated in which the washing step with distilled water was omitted from the elution method in Example 6. The results are shown in FIG.
図10から明らかなように、RFP-6HEの溶出が図8と比較してよりシャープになった。したがって、溶出前の洗浄では水を用いない方がよいことが明らかとなった。 As is clear from Figure 10, the elution of RFP-6HE became sharper compared to Figure 8. Therefore, it became clear that it is better not to use water for washing before elution.
[実施例8]<RFP-6HEの洗浄(カラム)>
実施例4の結果により、塩の濃度によってはRFP-6HEがニッケルに吸着しづらい。一方で、精製度を高めるためには、ニッケルに対する目的外タンパク質の非特異的な結合を防ぐために洗浄液として低い塩濃度の方が好ましい。そこで、NaCl、KCl、LiCl及びRbClを用いて濃度勾配をかけて洗浄し、塩溶液を用いて洗浄をする場合の濃度の検討を行った。
[Example 8] <Washing of RFP-6HE (column)>
The results of Example 4 show that RFP-6HE is less likely to adsorb to nickel depending on the salt concentration. On the other hand, in order to increase the degree of purification, a low salt concentration is preferable as a washing solution in order to prevent non-specific binding of non-target proteins to nickel. Therefore, washing was performed using a concentration gradient of NaCl, KCl, LiCl, and RbCl, and the concentration of the salt solution was examined when washing was performed.
実施例6と同様にニッケル充填カラムにRFP-6HEをアプライし、1M KPO4 pH8.0で吸着後、1-0.1MのNaCl、1-0.1M KCl、又は1-0.1M Liclでの濃度勾配、及び0.1-0.01MのNaCl、0.1-0.01M KCl、0.1-0.01M LiCl、又は0.1-0.01M RbClでの濃度勾配により洗浄し、UV280nmを測定した。NaClの結果を図11に、KCl、LiCl、及びRbClの結果を図12(a)~(c)に示す。 RFP-6HE was applied to a nickel-filled column in the same manner as in Example 6, and after adsorption with 1M KPO 4 pH 8.0, it was washed with a concentration gradient of 1-0.1M NaCl, 1-0.1M KCl, or 1-0.1M LiCl, and a concentration gradient of 0.1-0.01M NaCl, 0.1-0.01M KCl, 0.1-0.01M LiCl, or 0.1-0.01M RbCl, and UV280nm was measured. The results for NaCl are shown in Figure 11, and the results for KCl, LiCl, and RbCl are shown in Figures 12(a) to (c).
図11、12に示すようにNaCl、KCl、LiCl及びRbClのいずれも0.1Mの濃度では溶出されていなかった。一方、0.01Mではニッケルカラム内での移動が観察されていた。したがって、タンパク質の精製における精製度の向上及び収率の向上の観点からは、塩溶液を用いて洗浄をする場合の濃度としては0.03M以上が妥当であると考えられた。 As shown in Figures 11 and 12, none of NaCl, KCl, LiCl, or RbCl was eluted at a concentration of 0.1 M. On the other hand, movement within the nickel column was observed at 0.01 M. Therefore, from the viewpoint of improving the degree of purification and the yield in protein purification, it was considered appropriate to use a salt solution with a concentration of 0.03 M or more for washing.
[実施例9]<RFP-6HEの溶出(カラム)-3>
実施例8により、NaCl、KCl、LiCl及びRbClを用いて洗浄する場合には、0.03M付近であればRFP-6HEがニッケルカラムに吸着したままであることが確認された。そこで、上記洗浄後に、イミダゾール、ヒスチジン、又は水で溶出が可能かどうかを調べた。
[Example 9] <Elution of RFP-6HE (column)-3>
It was confirmed from Example 8 that when washing was performed using NaCl, KCl, LiCl, and RbCl, RFP-6HE remained adsorbed to the nickel column at approximately 0.03 M. Therefore, after the above washing, it was examined whether elution was possible with imidazole, histidine, or water.
実施例6と同様にニッケル充填カラムにRFP-6HEをアプライし、1M KPO4 pH8.0で吸着後、0.05M KClで30分洗浄後、0-100mMの濃度勾配のイミダゾール又はL-ヒスチジンで溶出した。結果を図13、14に示す。 RFP-6HE was applied to a nickel-filled column in the same manner as in Example 6, and after adsorption with 1 M KPO 4 pH 8.0, it was washed with 0.05 M KCl for 30 minutes and then eluted with a concentration gradient of 0-100 mM imidazole or L-histidine. The results are shown in Figures 13 and 14.
図13から明らかなように、低濃度(5~20mM)のイミダゾールでシャープなピークが観察された。また、図14から明らかなように、低濃度(5~15mM)のL-ヒスチジンでシャープな溶出となった。 As is clear from Figure 13, a sharp peak was observed at low concentrations (5-20 mM) of imidazole. Also, as is clear from Figure 14, a sharp elution was observed at low concentrations (5-15 mM) of L-histidine.
さらに、 実施例6と同様にニッケル充填カラムにRFP-6HEをアプライし、1M KPO4 pH8.0で吸着後、0.1M KClで50分洗浄後、蒸留水で30分ほど溶出した。結果を図15に示す。 Furthermore, RFP-6HE was applied to a nickel-packed column in the same manner as in Example 6, and after adsorption with 1 M KPO 4 pH 8.0, it was washed with 0.1 M KCl for 50 minutes and then eluted with distilled water for about 30 minutes. The results are shown in FIG.
図15から明らかなように、低濃度の塩での洗浄後、水によってもシャープな溶出となることが明らかとなった。 As is clear from Figure 15, after washing with low-concentration salt, sharp elution occurs even with water.
[実施例10]<DNAポリメラーゼの溶出(カラム)>
上記ではRFPの精製を行ったが、他のタンパク質としてDNAポリメラーゼでの精製を検討した。
[Example 10] <Elution of DNA polymerase (column)>
In the above, RFP was purified, but purification using another protein, DNA polymerase, was also examined.
実施例2と同様の方法で、DNAポリメラーゼのC末端側にタグペプチド6HEが付加したタグペプチド融合DNAポリメラーゼを生産する大腸菌HST08株の形質転換体を作製した。次に、0.1M Tris-HCl pH8.0及び1%TritonX-100を3mL加えて攪拌後の温浴を95℃、5分とする以外は実施例3と同様の方法でDNAポリメラーゼ-6HEのタンパク質抽出液とした。 A transformant of E. coli HST08 strain that produces a tag peptide fusion DNA polymerase in which the tag peptide 6HE is added to the C-terminus of the DNA polymerase was prepared in the same manner as in Example 2. Next, a protein extract of DNA polymerase-6HE was prepared in the same manner as in Example 3, except that 3 mL of 0.1 M Tris-HCl pH 8.0 and 1% Triton X-100 was added and the hot bath after stirring was set to 95°C for 5 minutes.
実施例6と同様にニッケル充填カラムに上記DNAポリメラーゼ-6HEをアプライし、1M KPO4 pH8.0で吸着後、1M KClにより30分洗浄し、100mM イミダゾールで30分ほど溶出し、UV280nmを測定した。結果を図16に示す。 The DNA polymerase-6HE was applied to a nickel-packed column in the same manner as in Example 6, and after adsorption with 1M KPO 4 pH 8.0, it was washed with 1M KCl for 30 minutes and eluted with 100 mM imidazole for about 30 minutes, and UV at 280 nm was measured. The results are shown in FIG.
図16から明らかなように、極めてシャープにDNAポリメラーゼ-6HEが溶出することが確認された。したがって、本件タグペプチドを用いれば、タンパク質の種類にかかわらずタンパク質を高純度で精製可能であることが明らかとなった。 As is clear from Figure 16, it was confirmed that DNA polymerase-6HE eluted extremely sharply. Therefore, it became clear that by using this tag peptide, it is possible to purify proteins to a high degree of purity regardless of the type of protein.
Claims (14)
(1-3’)配列番号3に示すアミノ酸配列において2又は3個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を2又は3か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを2又は3か所含むポリペプチド;
(1-4’)配列番号4に示すアミノ酸配列において2又は3個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を2又は3か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを2又は3か所含むポリペプチド;
(1-5’)配列番号5に示すアミノ酸配列において3個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を3か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを3か所含むポリペプチド;
(1-6’)配列番号6に示すアミノ酸配列において3又は4個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を3又は4か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを3又は4か所含むポリペプチド;
(1-7’)配列番号7に示すアミノ酸配列において4又は5個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を4又は5か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを4又は5か所含むポリペプチド;
(1-8’)配列番号8に示すアミノ酸配列において4又は5個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を4又は5か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを4又は5か所含むポリペプチド;
(1-9’)配列番号9に示すアミノ酸配列において5又は6個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を5又は6か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン若しくはグルタミン酸-ヒスチジンを5又は6か所含むポリペプチド; A tag peptide consisting of any one of the following polypeptides ( 1-3' ) to (1-9 ' ) :
( 1-3 ' ) In the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3, two or three histidines are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing two or three histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid residues, or two or three aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine residues ;
(1-4 ' ) Two or three histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing two or three histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid residues, or two or three aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine residues ;
(1-5 ' ) Three histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:5 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing three histidine-aspartic acid or three histidine-glutamic acid residues, or three aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine residues ;
(1-6 ' ) Three or four histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:6 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing three or four histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid units, or three or four aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine units ;
(1-7 ' ) 4 or 5 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing four or five histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid residues, or four or five aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine residues ;
(1-8 ' ) 4 or 5 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 8 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing four or five histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid residues, or four or five aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine residues ;
(1-9 ' ) 5 or 6 histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:9 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
a polypeptide containing five or six histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid units, or five or six aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine units ;
(2-1)ニッケル、銅、亜鉛、及び、コバルトから選択される1又は2以上の金属イオンを固定化した担体と、請求項4又は5記載のタグペプチド融合ポリペプチドとを吸着液の存在下で混合して、前記タグペプチド融合ポリペプチドを前記担体に吸着させる工程;
(2-2)タグペプチド融合ポリペプチドが吸着した担体を洗浄液で洗浄する工程;
(2-3)溶出液を用いて前記担体に吸着したタグペプチド融合ポリペプチドを前記担体から溶出する工程; A method for purifying a polypeptide, comprising the following steps (2-1) to (2-3):
(2-1) a step of mixing a carrier having one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt immobilized thereon with the tag peptide fusion polypeptide according to claim 4 or 5 in the presence of an adsorption solution to adsorb the tag peptide fusion polypeptide onto the carrier;
(2-2) washing the carrier onto which the tag peptide fusion polypeptide is adsorbed with a washing solution;
(2-3) eluting the tag peptide fusion polypeptide adsorbed to the carrier from the carrier using an elution solution;
(2-2’)タグペプチド融合ポリペプチドが吸着した担体を洗浄液で洗浄する工程;
(2-3’)L-ヒスチジン溶液、緩衝液(イミダゾールを含有する緩衝液を除く)、又は水を用いて前記担体に吸着したタグペプチド融合ポリペプチドを前記担体から溶出する工程;
の上記工程(2-1’)~(2-3’)を備えたポリペプチドの精製方法であって、上記(2-1’)におけるタグ融合ペプチドが、
(1-4’’)配列番号4に示すアミノ酸配列において4個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を4か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン又はグルタミン酸-ヒスチジンを4か所含むポリペプチドからなるタグペプチド;又は
(1-5’’)配列番号5に示すアミノ酸配列において4個のヒスチジンがアスパラギン酸又はグルタミン酸に置換し、かつ
ヒスチジン-アスパラギン酸若しくはヒスチジン-グルタミン酸を4か所、又はアスパラギン酸-ヒスチジン又はグルタミン酸-ヒスチジンを4か所含むポリペプチドからなるタグペプチド;とポリペプチドが融合したタグペプチド融合ポリペプチドである、前記精製方法。
(2-1') mixing a carrier having one or more metal ions selected from nickel, copper, zinc, and cobalt immobilized thereon with a tag peptide fusion polypeptide in the presence of an adsorption solution to adsorb the tag peptide fusion polypeptide onto the carrier;
(2-2') washing the carrier onto which the tag peptide fusion polypeptide is adsorbed with a washing solution;
(2-3') eluting the tag peptide fusion polypeptide adsorbed on the carrier from the carrier using an L-histidine solution, a buffer solution (excluding buffers containing imidazole) , or water;
The method for purifying a polypeptide comprising the steps (2-1') to (2-3'), wherein the tag fusion peptide in the step (2-1') is
( 1-4″ ) Four histidines in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:4 are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
A tag peptide consisting of a polypeptide containing four histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid residues, or four aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine residues ; or ( 1-5'' ) an amino acid sequence shown in SEQ ID NO:5 in which four histidine residues are replaced with aspartic acid or glutamic acid , and
The above purification method, wherein the polypeptide is a tag peptide fusion polypeptide in which the polypeptide is fused with a tag peptide consisting of a polypeptide containing four sites of histidine-aspartic acid or histidine-glutamic acid, or four sites of aspartic acid-histidine or glutamic acid-histidine.
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