JP7598538B2 - SARS-CoV-2由来のアミノ酸配列およびその利用 - Google Patents
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Description
LNESLIDLQELGKYEQYIKWP(配列番号1);
を含み、 総アミノ酸残基数が25以下である。
これによれば、かかる合成ペプチドは配列番号1に示すアミノ酸配列を有している。該アミノ酸配列は、SARS-CoV-2由来のSタンパク質が備えるHR2の一部の配列であるため、哺乳類に外来性の異物(抗原)として容易に認識される。そのため、哺乳類はかかるアミノ酸配列に対して優れた抗体価を有する抗体を産生することができる。
かかる構成によると、キャリアタンパク質はサイズが大きく複雑性が高いため、免疫原性を高めることができる。
かかる構成によると、合成ペプチドがキャリアタンパク質の表面から、より離れた状態となるため、上記合成ペプチドを認識する抗体が産生される確率を向上させることができる。
また、本明細書中で引用されている全ての文献の全ての内容は本明細書中に参照として組み入れられている。
ここで「ペプチド」とは、複数のペプチド結合を有するアミノ酸ポリマーを指す用語であり、ペプチド鎖に含まれるアミノ酸残基の数によって限定されないが、典型的には全アミノ酸残基数が概ね100以下(好ましくは80以下、より好ましくは70以下、例えば60以下)のような比較的分子量の小さいものをいう。
また、本明細書において「アミノ酸残基」とは、特に言及する場合を除いて、ペプチド鎖のN末端アミノ酸およびC末端アミノ酸を包含する用語である。
また、本明細書において「コンジュゲート」とは、上記合成ペプチドにキャリアタンパク質およびその他の成分(例えば架橋剤、Cys残基、スペーサー等)が結合することで構成される生成物であり、ここに開示される組成物に包含される。
なお、本明細書中に記載されるアミノ酸配列は、常に左側がN末端側であり右側がC末端側である。
一般的な技法によって、この組換えベクターを所定の宿主細胞(例えばイースト、昆虫細胞、植物細胞)に導入し、所定の条件で当該宿主細胞または該細胞を含む組織や個体を培養する。このことにより、目的とするペプチドを細胞内で発現、生産させることができる。そして、宿主細胞(分泌された場合は培地中)からペプチドを単離し、必要に応じてリフォールディング、精製等を行うことによって、目的の抗ウイルス性ペプチドを得ることができる。
なお、組換えベクターの構築方法および構築した組換えベクターの宿主細胞への導入方法等は、当該分野で従来から行われている方法をそのまま採用すればよく、かかる方法自体は特に本発明を特徴付けるものではないため、詳細な説明は省略する。
こうして得られるポリヌクレオチドは、上述のように、種々の宿主細胞中でまたは無細胞タンパク質合成システムにて、合成ペプチド生産のための組換え遺伝子(発現カセット)を構築するための材料として使用することができる。
架橋剤としては、ペプチドの架橋に通常用いられているホモ二官能性基またはヘテロ二官能性基を有するものを使用し得る。架橋剤が有する一般的な官能基としては、N-ヒドロキシスクシンイミド活性化エステル(NHSエステル)、マレイミド、アジドおよびヨードアセトアミドが挙げられる。また、かかる架橋剤の官能基と反応する好ましい反応性官能基としては、各種アミン含有化合物(例えば第1級アミン)、チオまたは他の硫黄含有基、カルボキシルおよびヒドロキシルが挙げられる。上記NHSエステルは、アミンと中性以上のpHで効率良く反応し、非常に安定なアミド結合を形成することができる。また、上記マレイミドは、反応がSH基選択的で、中性ではアミンに比べSH基との反応性に優れる。
PEGの長さとしては、従来からスペーサーまたは架橋剤として使用されているものを使用すればよく、例えば、PEGユニット(-CH2-CH2-O-)が2~24個繰り返されたものを使用することができる。
典型的な使用方法の一例として、ワクチンが挙げられ、上記合成ペプチドおよび組成物をSARS-CoV-2に対する予防接種や治療薬等に使用することができる。また、他の典型例として、上記合成ペプチドおよび組成物を抗原として哺乳類等の生物に投与し、当該合成ペプチドを認識する抗体を生産することが挙げられる。
免疫する哺乳類は、モルモット、ラット、マウス、ウサギ、ヒツジ等の実験動物が用いられるが、モノクローナル抗体あるいはポリクローナル抗体を得るためには、ラット、マウス、ウサギが好適である。免疫方法は、例えば、皮下、腹腔内、静脈内、筋肉内、皮内等のいずれの投与経路を用いてもよいが、主として、皮下、皮内、腹腔内、静脈内に注入するのが好ましい。また、免疫間隔、免疫量等も特に制限なく種々の方法を用いることが可能であるが、例えば、2週間隔で約2~10回免疫し、最終免疫後、約1~5回、好ましくは約2~7日後に生体内から検体を採取する方法がよく用いられる。また、免疫量は1回に投与するペプチド量を限定するものではいが、例えば、ウサギ1羽当たり50~300μg程度を用いることが好ましい。また、特に限定するものではないが、初回は合成ペプチドと、キャリアタンパク質とを備えるコンジュゲートをアジュバント(例えば、FCA(Freund’s complete adjuvant))とよく混合してマウスの腹腔内に投与し、細胞を増殖させ、2週間隔で再び該コンジュゲートをアジュバント(例えば、FCAまたはFIA(Freund’s incomplete adjuvant))をよく混合して腹腔内に投与し、腹水を採取することにより、上記合成ペプチドへの抗体価の高いモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体を効率良く取得することができる。なお、目的のモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体の精製は、アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過法、硫安塩析法等の公知の方法により行うことができる。
上記担体を含む合成ペプチドおよび組成物の用途や形態に応じて適宜異なり得るが、上記担体として、典型的には、水、生理学的緩衝液、種々の有機溶媒が挙げられる。また、適当な濃度のアルコール(エタノール等)水溶液、グリセロール、オリーブ油のような不乾性油であり得る。あるいはリポソームであってもよい。また、上記組成物に含有させ得る副次的成分としては、種々の充填剤、増量剤、結合剤、付湿剤、表面活性剤、色素、香料、アジュバント等が挙げられる。
上記担体を含む合成ペプチドおよび組成物の典型的な形態として、液剤、懸濁剤、乳剤、エアロゾル、泡沫剤、顆粒剤、粉末剤、錠剤、カプセル、軟膏、水性ジェル剤等が挙げられる。また、注射等に用いるため、使用直前に生理食塩水または適当な緩衝液(例えばPBS)等に溶解して薬液を調製するための凍結乾燥物、造粒物とすることもできる。
なお、合成ペプチド(主成分)および種々の担体(副成分)を材料にして種々の形態の組成物(薬剤)を調製するプロセス自体は従来公知の方法に準じればよく、かかる製法自体は本発明を特徴付けるものでもないため詳細な説明は省略する。処方に関する詳細な情報源として、例えばComprehensive Medicinal Chemistry, Corwin Hansch監修,Pergamon Press刊(1990)が挙げられる。この書籍の全内容は本明細書中に参照として援用されている。
市販のペプチド合成機を用いて配列番号1に示すアミノ酸配列から成るペプチドのC末端にスペーサーとしてのPEG、Cys残基とが結合したPEG含有合成ペプチドを製造した。即ち、通常のアミノ酸配列と同様、左側をN末端側、右側をC末端側として、以下の配列:
(配列番号1からなる合成ペプチド)-(PEG)-(Cys残基)
となるように合成した。かかる合成は、ペプチド合成機のマニュアルに従い、固相合成法(Fmoc法)で実施した。なお、ペプチド合成機の使用態様自体は本発明を特徴づけるものではないため、詳細な説明は省略する。
得られたPEG含有合成ペプチドに、キャリアタンパク質であるキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)を架橋剤であるN-(6-マレイミドカプロイルオキシ)スクシンイミド(EMCS)を用いて結合し、コンジュゲートを作製した。これらを結合させる反応自体は本発明を特徴づけるものではないため詳細な説明は省略するが、簡単に説明すると、まず、KLHが有するアミノ基と、EMCSが有するNHSエステルを反応させることでKLHの表面にEMCSを結合させた。その後、かかるEMCSが有するマレイミドと、上記PEG含有合成ペプチドのC末端側に存在するCys残基のチオール基とを反応させ結合させることで、上記PEG含有合成ペプチドとKLHとが架橋剤を介して結合したコンジュゲートを作製した。
得られたコンジュゲートを日本白色種のウサギ2羽(以下、ウサギ個体を区別するときには、これらウサギをそれぞれ第一のウサギ、第二のウサギともいう。)に投与することにより、上記合成ペプチドに対する抗体を作製した。また、後述する抗体価の評価のために適宜上記ウサギの採血を行った。具体的には、1日目(以下、この日を基準とした日数を記載する)にコンジュゲートを投与する前に5mlの試採血を行い、免疫前血清の調製を行った。また、同日に上記コンジュゲート0.15mgと、等容量のFCAとを混合した組成物を上記ウサギに皮内投与(1回目皮内投与)を行った。15日目、上記コンジュゲート0.3mgと、等容量のFCAとを混合した組成物を上記ウサギに皮内投与(2回目皮内投与)を行った。29日目、上記コンジュゲート0.3mgと、等容量のFCAとを混合した組成物を上記ウサギに皮内投与(3回目皮内投与)を行った。36日目、上記ウサギから5mlの試採血を行い、1回目評価用血清を調製した。43日目、上記コンジュゲート0.3mgと、等容量のFCAとを混合した組成物を上記ウサギに皮内投与(4回目皮内投与)を行った。50日目、上記ウサギから5mlの試採血を行い、2回目評価用血清を調製した。なお、調製した免疫前血清、1回目評価用血清および2回目評価用血清には調製時にアジ化ナトリウムを0.09%となるように添加し保存した。
ELISA(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay)法により、免疫前血清、1回目評価用血清および2回目評価用血清の抗体価を評価した。
まず、上記合成した合成ペプチドを5μg/mlとなるようにpH7.2のPBS(Phosphate-Buffered Saline)に溶解し、マイクロプレート(NalgeNunc社製、cat#442404、平底96ウェル)の各ウェルに100μlずつ添加し、室温で2時間インキュベートした。次に、各ウェル中の液を除去後、0.2%Tween-20(Polyoxyethylene(20) Sorbitan Monolaurate、富士フィルム和光純薬株式会社製)を含むPBS(洗浄液)で3回洗浄した。その後、当該洗浄液を各ウェルに添加し、4℃で一晩インキュベートした。インキュベート後、0.05%Tween-20を含むPBS(希釈液)を用いて、免疫前血清、1回目評価用血清および2回目評価用血清をそれぞれ1000倍、2000倍、4000倍、8000倍、16000倍、32000倍、64000倍、128000倍希釈を行い、各ウェルの上記洗浄液を除去後、各希釈液100μlをそれぞれ別のウェルに添加し、37℃で30分間インキュベートした後、さらに室温で15分間インキュベートした。各ウェルの液を除去後、上記洗浄液で3回洗浄を行い、goat f(ab)’2 anti rabbit IgG’s HRP conjugate(MP Biomedicals,LLC-Cappel Products社製)を上記希釈液で5000倍希釈したものを、各ウェルに100μlずつ添加し、37℃で30分間インキュベートした後、さらに室温で15分間インキュベートした。各ウェルの液を除去後、上記洗浄液で3回洗浄を行い、OPD(O-phenylene diamin、SIGMA社製)10mgをクエン酸-リン酸緩衝液25mlに溶解し過酸化水素5μl添加した基質液を各ウェルに100μlずつ添加した。その後、室温で20分間発色を行い、1Mの硫酸を100μlずつ各ウェルに加えることで発色を停止させた後、Immno Readerを用いて各ウェルの490nmの吸光度を測定した。その結果を図1および図2に示す。なお、評価基準として、490nmの吸光度が0.5以上である場合に、抗体価が担保された抗体であるとする。また、上記吸光度がImmno Readerの測定上限を超えた場合(上記吸光度が3.0を超えた場合)は吸光度3.0として示している。
Claims (4)
- 少なくとも一種の哺乳類に対して抗原として認識される合成ペプチドであって、
以下のアミノ酸配列:
LNESLIDLQELGKYEQYIKWP(配列番号1);
から成る、合成ペプチド。 - 少なくとも一種の哺乳類に対して抗原として認識される部分を含む組成物であって、
以下のアミノ酸配列:
LNESLIDLQELGKYEQYIKWP(配列番号1);
から成る合成ペプチドと、キャリアタンパク質と、
を備えた、組成物。 - 前記合成ペプチドを構成するアミノ酸配列のC末端側またはN末端側に、所定の架橋剤を介して前記キャリアタンパク質が結合している、請求項2に記載の組成物。
- 抗SARS-CoV-2抗体を生産する方法であって、
該抗体を生産するための抗原として、以下のアミノ酸配列:
LNESLIDLQELGKYEQYIKWP(配列番号1);
から成る合成ペプチドを含む組成物をヒト以外の生物に投与することを含む、抗体生産方法。
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