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JP7600218B2 - 新規なｃｌｄｎ１８．２結合分子 - Google Patents
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Description

優先権の主張
本出願は、２０１９年５月２４日に提出された中国特許出願２０１９１０４３７８００．２及び２０１９１０４３７８０６．Ｘの優先権を主張し、その内容の全てが参照により本明細書に組み込まれる。
配列表
本出願は、配列表を含み、その内容の全てが参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、一般的に抗体に関する。より具体的には、本出願は、ＣＬＤＮ１８．２を特異的に認識する単一ドメイン抗体、その調製方法及びその用途に関する。
細胞結合は、細胞間のコミュニケーション構造であり、多細胞生物における隣接する細胞間の相互コミュニケーション、相乗作用の重要な基盤である。一般的には、動物細胞には、密着結合、接着結合、ギャップ結合及びデスモソーム／ヘミデスモソームという４つの種類の結合がある。
密着結合は、閉鎖結合とも呼ばれ、内皮細胞又は上皮細胞間に形成されている構造であり、組織間の物質が細胞間隙を介して拡散することを防止でき、能動輸送のみによって細胞に入ることができるようにする。密着結合の構造は、数十種類のＣｌａｕｄｉｎタンパクが細胞内及び細胞間のタンパク質相互作用によって形成され、これらのタンパク質の発現はある程度の組織特異性を有する。ＣＬＤＮ１８は、密着結合に存在するＣｌａｕｄｉｎタンパクの重要なタンパク質の１つである。
ＣＬＤＮ１８は、４回膜貫通領域を有する膜タンパクであり、２つの細胞外ドメインを含む。人体内に２種類のＣＬＤＮ１８変異体が存在し、それぞれＣＬＤＮ１８．１及びＣＬＤＮ１８．２である。両者は、異なる組織に分布し、前者は、主に肺上皮細胞において発現され、後者は、胃上皮細胞において特異的に発現され、且つ胃幹細胞において発現されない。タンパク質配列では、ＣＬＤＮ１８．１とＣＬＤＮ１８．２の配列類似性が非常に高く、両者の主な違いは、Ｎ末端にあり、第１の細胞外ドメインにおいて両者には僅か８アミノ酸の違いがある。Ｎ末端を除き、Ｃ末端の配列は全く同じである。
抗体療法は、癌患者を治療する最も有望な方法の１つとなっている。ＣＬＤＮ１８．２は、腫瘍細胞及び正常組織における発現特異性によって、現在、高度に潜在力のある抗体薬物の作用標的となっている。しかしながら、ＣＬＤＮ１８．１及びＣＬＤＮ１８．２の配列類似性が非常に高いため、ＣＬＤＮ１８．１に対することなく、ＣＬＤＮ１８．２のみに対する抗体の開発は、非常に困難になり、世界中でほとんど報告されていない。今まで、ドイツＧａｎｙｍｅｄ社が開発したＩＭＡＢ３６２は、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする唯一の臨床的に研究されている抗体である。ＩＭＡＢ３６２は、２本のタンパク質重鎖と２本のタンパク質軽鎖とからなるモノクローナル抗体である。現在、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする単一ドメイン抗体は未だない。
単一ドメイン抗体は、ｓｄＡｂ（ｓｉｎｇｌｅ ｄｏｍａｉｎ ａｎｔｉｂｏｄｙ，シングルドメイン抗体）と略称され、単一の単量体可変抗体ドメイン（例えば、抗体重鎖可変ドメイン）からなる抗体である。完全な抗体（例えばＩｇＧ）と同様に、特定の抗原に選択的に結合することができる。しかしながら、単一ドメイン抗体の分子量は、２本のタンパク質重鎖と２本のタンパク質軽鎖とからなる一般的な抗体よりも遥かに小さい。最初の単一ドメイン抗体は、ラクダ科動物において見出された重鎖抗体から改造されたものである（Ｈａｍｅｒｓ－Ｃａｓｔｅｒｍａｎ Ｃ，Ａｔａｒｈｏｕｃｈ Ｔ，Ｍｕｙｌｄｅｒｍａｎｓ Ｓ，Ｒｏｂｉｎｓｏｎ Ｇ，Ｈａｍｅｒｓ Ｃ，Ｓｏｎｇａ ＥＢ，Ｂｅｎｄａｈｍａｎ Ｎ，Ｈａｍｅｒｓ Ｒ（１９９３）Ｎａｔｕｒａｌｌｙ ｏｃｃｕｒｒｉｎｇ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｄｅｖｏｉｄ ｏｆ ｌｉｇｈｔ ｃｈａｉｎｓ．Ｎａｔｕｒｅ ３６３（６４２８）：４４６－４４８）。これらのラクダ科動物において見出された重鎖抗体は、ＶＨＨ断片とも呼ばれる。現在、単一ドメイン抗体に対する研究は、殆ど重鎖可変ドメインに基づくものである。
単一ドメイン抗体は、多くの利点を有する。例えば、通常、高い溶解度、優れた熱安定性及び組織透過性を示し、単一ドメイン抗体は、第２対の分子内ジスルフィド結合が存在するため、更にパパインなどによる分解に耐えることができる。また、単一ドメイン抗体は、酵母、植物及び哺乳動物細胞などの様々な宿主細胞において発現することができ、且つ発現量が高いため、コストの面で非常に大きなメリットを有する。単一ドメイン抗体は、そのメリットによって、様々なバイオテクノロジー及び治療用途に適する。例えば、癌、感染性疾患、炎症性疾患及び神経変性疾患を含むが、これらに限定されない疾患を治療するために使用することができる。
現在、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする臨床的に研究されているモノクローナル抗体薬物が既に存在しているが、治療剤として、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする抗体を開発し続けることが急務となっている。本分野では、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする新しい抗体、特にＣＬＤＮ１８．２のみを特異的に認識するがＣＬＤＮ１８．１を認識しない単一ドメイン抗体の開発が望まれている。
広義には、本開示は、抗体の新規な化合物、調製方法、組成物及び製品を提供する。本開示により提供される利点は、抗体治療及び診断の分野に広く適用される。より具体的には、本開示は、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする単一ドメイン抗体、及び前記抗体の調製方法、前記抗体を発現するための発現ベクター及び宿主細胞などを提供する。本開示の抗体は、Ｃｌａｕｄｉｎタンパクに関連する、特にＣＬＤＮ１８．２に関連する疾患を治療又は予防する方法及びその応用を提供する。
本発明者らは、ヒトＣＬＤＮ１８．２の細胞外ドメイン１（ＥＣＤ１）に特異的に結合できるＣＬＤＮ１８．２結合分子（例えば、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする単一ドメイン抗体）を初めて発見した。
本開示は、それぞれ「Ｎ」（「Ｎ」は数字を表す）で順序付けられて列挙される、以下の実施形態を少なくとも含む。以下の列挙は網羅的ではなく、当業者は異なる技術的解決手段を組み合わせることができる。
１．少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメインを含むＣＬＤＮ１８．２結合分子であって、前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、及び、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列を含むＣＤＲ３から選択される何れか１組のＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含むＣＬＤＮ１８．２結合分子。
２．
（ａ）ＣＤＲ１は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、ＣＤＲ２は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、及び／又はＣＤＲ３は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、又は、
（ｂ）ＣＤＲ１は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、ＣＤＲ２は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、及び／又はＣＤＲ３は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在する実施形態１に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
３．
（ａ）ＣＤＲ１は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に対して１アミノ酸のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、ＣＤＲ２は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に対して１アミノ酸のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、及び／又はＣＤＲ３は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に対して１アミノ酸のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、又は、
（ｂ）ＣＤＲ１は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に対して１アミノ酸のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、ＣＤＲ２は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に対して１アミノ酸のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、及び／又はＣＤＲ３は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２に対して１アミノ酸のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在する実施形態１に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
４．前記ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、ＣＬＤＮ１８．２に対する抗体又はその抗原結合断片である実施形態１～３の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
５．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、ＶＨＨであり、例えば、ラクダ科動物（例えばアルパカ）に由来するＶＨＨである実施形態１～４の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
６．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、式ＩＳＲＧＧＸ１Ｔに示すアミノ酸配列のＣＤＲ２（Ｘ１はＴ又はＳである）、及び式ＮＡＱＡＷＤＸ２ＧＴＸ３ＲＹＬＥＶに示すアミノ酸配列のＣＤＲ３（Ｘ２はＰ又はＶであり、Ｘ３はＦ又はＩである）、及び、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０、３３、３４、３５、３６、３８、３９又は４０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、式Ｘ４ＳＴＧＧＴＴに示すアミノ酸配列のＣＤＲ２（Ｘ４はＩ又はＭである）、及び式ＮＶＬＶＸ５ＳＧＩＧＳＸ６ＬＥＶに示すアミノ酸配列のＣＤＲ３（Ｘ５はＩ又はＶであり、Ｘ６はＨ又はＴである）から選択される何れか１組のＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む実施形態１～５の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
７．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、又は、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｈ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｊ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｋ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｌ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、又は、
（ｍ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３を含む実施形態１～６の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
８．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７のアミノ酸配列、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列、又はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７に対して１つ又は複数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個）のアミノ酸の付加、欠失及び／又は置換を有するアミノ酸配列、及び、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７に示すアミノ酸配列、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列、又はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７に対して１つ又は複数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個）のアミノ酸の付加、欠失及び／又は置換を有するアミノ酸配列から選択される何れか１つを含む実施形態１～７の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
９．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７の、第１、４、５、１４、１６、３５、４７、５６、５８、６５、９２、１０２、１０５又は１２１位のアミノ酸の１つ又は複数が修飾され（例えば、アミノ酸の置換）、又は、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７の第１、４、５、１１、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３５、５１、７５、７６、９２、１００、１０６又は１２０位のアミノ酸の１つ又は複数が修飾される（例えば、アミノ酸の置換及び／又は付加）実施形態１～８の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１０．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７～１４、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４２～５１及び６３のうちの何れか１つの配列を含むか又はそれからなる実施形態１～９の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１１．前記ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、重鎖単一ドメイン抗体などの単一ドメイン抗体、キメラ抗体、又はヒト化抗体である実施形態１～１０の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１２．前記免疫グロブリン単一可変ドメインは、別の分子に融合し、前記別の分子は、例えば免疫グロブリン（例えばＩｇＧ）のＦｃドメイン又は蛍光タンパク質である実施形態１～１１の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１３．前記ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、ラクダ科動物に由来するＶＨＨ及びヒトＩｇＧ（例えば、ヒトＩｇＧ１又はＩｇＧ４）のＦｃドメインを含むキメラ抗体である実施形態１２に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１４．前記ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、アルパカに由来するＶＨＨ及びヒトＩｇＧ１のＦｃドメインを含むキメラ抗体である実施形態１３に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１５．前記ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、ヒトＣＬＤＮ１８．２の細胞外ドメイン１（ＥＣＤ１）に結合する実施形態１～１４の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１６．同じエピトープについて実施形態１～１５の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子と競合するＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１７．ＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合するが、ＣＬＤＮ１８．１に結合しない実施形態１～１６の何れか一項に記載されたＣＬＤＮ１８．２結合分子。
１８．実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子をコードする核酸配列を含む単離された核酸分子。
１９．ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２～２９、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２～６１及び６４のうちの何れか１つの配列を含むか又はそれからなる実施形態１８に記載された単離された核酸分子。
２０．実施形態１８又は１９に記載されたような単離された核酸分子を含む発現ベクター。
２１．実施形態２０に記載された発現ベクターを含む宿主細胞。
２２．前記宿主細胞は、細菌細胞（例えば大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ））、真菌細胞（例えば酵母）又は哺乳動物細胞である実施形態２１に記載された宿主細胞。
２３．少なくとも１つの実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子及び薬学的に許容されるベクターを含む薬物組成物。
２４．
実施形態２１又は２２の宿主細胞において実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子を発現するステップと、
宿主細胞からＣＬＤＮ１８．２結合分子を単離するステップと、を含む実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子の調製方法。
２５．被験者に治療有効量の実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子を投与するステップを含む被験者におけるＣＬＤＮ１８．２に関連する病症を治療する方法。
２６．前記ＣＬＤＮ１８．２に関連する病症は、ＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞が関与する疾患又はＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞に関連する疾患を含む実施形態２５に記載された方法。
２７．前記ＣＬＤＮ１８．２に関連する病症は癌を含む実施形態２５又は２６に記載された方法。
２８．前記癌は、骨癌、血液癌、肺癌、肝臓癌、膵臓癌、皮膚癌、頭頸部癌、皮膚又は眼内黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門部癌、胃癌、結腸癌、乳癌、前立腺癌、性器及び生殖器の癌、ホジキン病、食道癌、小腸癌、内分泌系癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟組織肉腫、膀胱癌、腎臓癌、腎細胞癌、腎盂癌、中枢神経系（ＣＮＳ）腫瘍、神経外胚葉癌、脊髄軸腫瘍、神経膠腫、髄膜腫及び下垂体腺腫を含む実施形態２７に記載された方法。
２９．前記癌は胃癌である実施形態２８に記載された方法。
３０．実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子のＣＬＤＮ１８．２に関連する病症を治療又は予防するための薬物の調製における用途。
３１．実施形態１～１７の何れか一項に定義されたＣＬＤＮ１８．２結合分子を含む容器を含むＣＬＤＮ１８．２に関連する病症を治療又は予防するためのキット。
以上の内容は、総括的な説明であり、必要に応じて細部の簡略化、総括及び省略を含んでよい。従って、当業者であれば、この総括的な説明は単なる例示であり、如何なる手段でも限定することを全く意図していないことが意識される。本明細書に記載された方法、組成物及び／又は装置及び／又は他の主題の他の態様、特徴及びメリットは、本明細書に示される教示において明らかになる。いくつかの選択された概念を簡単に紹介するために総括的な説明を提供し、これらの総括的な説明について、以下の詳細な説明において更に説明する。以上の総括的な説明は、保護を求めようとする主題の肝心な特徴又は基本的な特徴を特定することを意図しておらず、保護を求めようとする主題の範囲を特定する補助手段として用いられることも意図していない。なお、本出願全文において引用される全ての参照文献、特許及び公開された特許出願の内容は、その全体が引用により本明細書に組み込まれる。
実施例１における過剰発現細胞株及び腫瘍細胞株のフローサイトメトリーによる同定結果を示す。ここでは、図１ａは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３の過剰発現細胞株のフローサイトメトリーによる同定結果を示す。 実施例１における過剰発現細胞株及び腫瘍細胞株のフローサイトメトリーによる同定結果を示す。図１ｂは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株のフローサイトメトリーによる同定結果を示す。 複数の候補抗体間の配列比較を示す。ここでは、候補抗体の可変領域全長配列及びその中のＣＤＲ配列が示され、且つ候補抗体間のアミノ酸配列の差異が示されている。 複数の候補抗体間の配列比較を示す。ここでは、候補抗体の可変領域全長配列及びその中のＣＤＲ配列が示され、且つ候補抗体間のアミノ酸配列の差異が示されている。 候補抗体ＮＡ１－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３の過剰発現細胞株での交差結合実験結果を示す。 候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３の過剰発現細胞株での交差結合実験結果を示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ及び対照抗体の細胞レベルでの結合の比較実験結果を示す。ここでは、図４ａは、抗体ＮＡ１－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞でのフローレベルの比較実験結果を示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ及び対照抗体の細胞レベルでの結合の比較実験結果を示す。図４ｂは、抗体ＮＡ１－Ｓ及び対照抗体のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株でのフローレベルの比較実験結果を示す。 候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ、ＮＡ６－Ｓ及び対照抗体の細胞レベルでの結合の比較実験結果を示す。ここでは、図５ａは、抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ６－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞でのフローレベルの比較実験結果を示す。 候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ、ＮＡ６－Ｓ及び対照抗体の細胞レベルでの結合の比較実験結果を示す。図５ｂは、抗体ＮＡ５－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞でのフローレベルの比較実験結果を示す。 候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ、ＮＡ６－Ｓ及び対照抗体の細胞レベルでの結合の比較実験結果を示す。図５ｃは、抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ、ＮＡ６－Ｓ及び対照抗体のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株でのフローレベルの比較実験結果を示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ１－Ｓにより媒介された補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を示す。ここでは、図６ａは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔで抗体ＮＡ１－Ｓにより媒介されたＣＤＣを示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ１－Ｓにより媒介された補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を示す。図６ｂは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で抗体ＮＡ１－Ｓにより媒介されたＣＤＣを示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓにより媒介された補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を示す。ここでは、図７ａは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔで抗体ＮＡ３－Ｓにより媒介されたＣＤＣ細胞傷害効果を示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓにより媒介された補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を示す。図７ｂ及び図７ｃは、それぞれＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞でのＣＤＣ殺傷効果を示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓにより媒介された補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を示す。図７ｂ及び図７ｃは、それぞれＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞でのＣＤＣ殺傷効果を示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ過剰発現細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓにより媒介された補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）を示す。図７ｄは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で抗体ＮＡ３－Ｓにより媒介されたＣＤＣを示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介された抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）を示す。ここでは、図８ａ及び図８ｃは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株で抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介されたＡＤＣＣを示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介された抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）を示す。図８ｂ及び図８ｄは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介されたＡＤＣＣを示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介された抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）を示す。ここでは、図８ａ及び図８ｃは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株で抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介されたＡＤＣＣを示す。 ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介された抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）を示す。図８ｂ及び図８ｄは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株で抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓにより媒介されたＡＤＣＣを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ異種移植モデルにおける腫瘍阻害効果を示す。ここでは、マウスは、免疫不全マウスＳＣＩＤを採用し、ＮＡ１－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２の投与量は、質量濃度に応じて計算され、投与方法としては、尾静脈と腹腔の交差投与を採用する。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ異種移植モデルにおける腫瘍阻害効果を示す。ここでは、マウスは、免疫不全マウスＳＣＩＤを採用し、ＮＡ１－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２の投与量は、質量濃度に応じて計算され、投与方法としては、尾静脈と腹腔の交差投与を採用する。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。ここでは、図１０ａ～図１０ｂは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔでの候補抗体ＮＡ１－Ｓ（図１０ａ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｂ）とＩＭＡＢ３６２の競合結合アッセイを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。ここでは、図１０ａ～図１０ｂは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔでの候補抗体ＮＡ１－Ｓ（図１０ａ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｂ）とＩＭＡＢ３６２の競合結合アッセイを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｃ～図１０ｄは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔでの抗体ＩＭＡＢ３６２とＮＡ１－Ｓ（図１０ｃ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｄ）の競合結合アッセイを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｃ～図１０ｄは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔでの抗体ＩＭＡＢ３６２とＮＡ１－Ｓ（図１０ｃ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｄ）の競合結合アッセイを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｅは、抗ＣＬＤＮ１８抗体を使用してヒトＣＬＤＮ１８．２突然変異体細胞株における突然変異又は野生ＣＬＤＮ１８．２の発現レベルを測定した結果である。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｆ～図１０ｇは、ヒトＣＬＤＮ１８．２突然変異体細胞株でのＮＡ１－Ｓ（図１０ｆ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｇ）及びＩＭＡＢ３６２とＣＬＤＮ１８．２突然変異体との結合レベルを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｆ～図１０ｇは、ヒトＣＬＤＮ１８．２突然変異体細胞株でのＮＡ１－Ｓ（図１０ｆ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｇ）及びＩＭＡＢ３６２とＣＬＤＮ１８．２突然変異体との結合レベルを示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｈ～図１０ｉは、ヒトＣＬＤＮ１８．２突然変異体細胞株での野生細胞株に対するＮＡ１－Ｓ（図１０ｈ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｉ）とＩＭＡＢ３６２との相対的結合百分率を示す。 候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合する場合のエピトープ及び結合時の肝心なアミノ酸部位を示す。図１０ｈ～図１０ｉは、ヒトＣＬＤＮ１８．２突然変異体細胞株での野生細胞株に対するＮＡ１－Ｓ（図１０ｈ）又はＮＡ３－Ｓ（図１０ｉ）とＩＭＡＢ３６２との相対的結合百分率を示す。 Ｆａｂ－ＺＡＰの存在下でのＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔに対するＮＡ１－Ｓ（図１１ａ）又はＮＡ３－Ｓ（図１１ｂ）及びＩＭＡＢ３６２の細胞殺傷効率を示す。ここでは、試験は、ｈＩｇＧ及びＦａｂ－ＺＡＰを対照とし、Ｆａｂ－ＺＡＰ及び細胞の長時間インキュベーションも、細胞に対してある程度の傷害作用を有する。 Ｆａｂ－ＺＡＰの存在下でのＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔに対するＮＡ１－Ｓ（図１１ａ）又はＮＡ３－Ｓ（図１１ｂ）及びＩＭＡＢ３６２の細胞殺傷効率を示す。ここでは、試験は、ｈＩｇＧ及びＦａｂ－ＺＡＰを対照とし、Ｆａｂ－ＺＡＰ及び細胞の長時間インキュベーションも、細胞に対してある程度の傷害作用を有する。 配列がヒト化修飾される前後のＮＡ３－ＳのＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での結合活性を示す。ここでは、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１はヒト化された分子である。 高濃度でのＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での抗体結合強度及び抗体結合陽性率を示す。ここでは、図１３ａは、異なる濃度のＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での結合強度を示す。 高濃度でのＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での抗体結合強度及び抗体結合陽性率を示す。図１３ｂは、高濃度（１００μｇ／ｍｌ）でのＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での結合陽性率を示し、試験は、いずれもアイソタイプ抗体を対照とする。 ヒト化分子ＮＡ３Ｓ－Ｈ１のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ胃癌細胞でのＣＤＣ細胞殺傷効率を示す。ここでは、対照抗体はＩＭＡＢ３６２である。 ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２により媒介されたＮＫ細胞の異なる標的細胞でのＡＤＣＣ細胞殺傷効果を示す。ここでは、図１５ａは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩを標的細胞とし、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２により媒介されたＡＤＣＣ細胞殺傷効果を示す。 ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２により媒介されたＮＫ細胞の異なる標的細胞でのＡＤＣＣ細胞殺傷効果を示す。図１５ｂは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔを標的細胞とし、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２により媒介されたＡＤＣＣ細胞殺傷効果を示す。
本発明は、多くの異なる形態で実施可能であるが、ここに開示されたのは、本発明の原理を検証する具体的且つ例示的な実施形態である。本発明は、例示された具体的な実施形態に限定されないことを強調すべきである。また、本明細書で使用される如何なる章の見出しは、単なる構文のためのものであり、説明される主題を制限するものとして解釈すべきではない。
ここで特に定義されていない限り、本発明と組み合わせて使用される科学用語及び技術用語は、当業者に一般的に理解されている意味を有する。また、文脈で別段の要求がない限り、単数形の用語は、複数形を含むべきであり、複数形の用語は、単数形を含むべきである。より具体的には、文脈で別途明らかに指摘されていない限り、本明細書及び添付される特許請求の範囲において使用される単数形「１」、「１つ」及び「当該」は、複数の指示対象を含む。従って、例えば、「１種類のタンパク質」に言及する場合、複数のタンパク質を含み、「１つの細胞」に言及する場合、細胞の混合物などを含む。本出願において、特に断りのない限り、「又は」を使用する場合、「及び／又は」を意味する。また、用語「からなる」及び他の形態（例えば「含む」及び「含有」）の使用は、限定的ではない。また、明細書及び添付される特許請求の範囲で提供される範囲は、端点及び端点間の全ての値を含む。
通常、本明細書で説明される細胞及び組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学及びタンパク質、並びに核酸化学及びハイブリダイゼーションに関する用語及びその技術は、当分野で公知であるとともに一般的に使用される用語である。特に断りのない限り、本発明の方法及び技術は、通常、当分野で公知である通常の方法によって行われ、且つ、本明細書全体において引用及び検討される様々な一般的及びより具体的な参照文献に記載されるように行われる。例えば、Ａｂｂａｓら，Ｃｅｌｌｕｌａｒ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，６ｔｈ ｅｄ．，Ｗ．Ｂ．Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏｍｐａｎｙ（２０１０）；Ｓａｍｂｒｏｏｋ Ｊ．＆ Ｒｕｓｓｅｌｌ Ｄ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，３ｒｄ ｅｄ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．（２０００）；Ａｕｓｕｂｅｌら，Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ ｏｆ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｒｏｍ Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ，Ｊｏｈｎ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（２００２）；Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ Ｕｓｉｎｇ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．（１９９８）；及びＣｏｌｉｇａｎら，Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｗｉｌｅｙ，Ｊｏｈｎ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（２００３）を参照する。本明細書で説明される分析化学、合成有機化学及び薬物化学に関する用語、実験室手順及び技術は、当分野で公知であるとともに一般的に使用される用語である。また、本明細書で使用される如何なる章の見出しは、単なる構文のためのものであり、説明される主題を制限するものとして解釈すべきではない。
定義
本発明をより良好に理解するために、関連する用語の定義及び解釈は、以下のように提供される。
本明細書で使用される「抗体」又は「Ａｂ」という用語は、通常、所望の生物学的活性又は結合活性を示す任意の形態の抗体を指す。ヒト化抗体、完全ヒト抗体、キメラ抗体及び単一ドメイン抗体を含むが、これらに限定されない。抗体は、重鎖及び軽鎖を含み得る。重鎖は、それぞれ抗体のアイソタイプをＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡ及びＩｇＥに定義するμ、δ、γ、α及びεに分けることができる。各重鎖は、重鎖可変領域（ＶＨ）と重鎖定常領域（ＣＨ）とからなる。重鎖定常領域は、３つのドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３）からなる。各軽鎖は、軽鎖可変領域（ＶＬ）と軽鎖定常領域（ＣＬ）とからなる。ＶＨ及びＶＬ領域は、相対的に保存的な領域（フレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる）及びＦＲにより離隔される超可変領域（相補性決定領域（ＣＤＲ）と呼ばれる）に更に分けることができる。各ＶＨ及びＶＬは、Ｎ末端からＣ末端へのＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４の順序で３つのＣＤＲ及び４つのＦＲからなる。各種の領域又はドメインでのアミノ酸の分布は、Ｋａｂａｔ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ（Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９８７ ａｎｄ １９９１））又はＣｈｏｔｈｉａ ＆ Ｌｅｓｋ（１９８７）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１－９１７；Ｃｈｏｔｈｉａら，（１９８９）Ｎａｔｕｒｅ ３４２：８７８－８８３における定義に従う。抗体は、ＩｇＧ（例えばＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３又はＩｇＧ４サブタイプを含む）、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤ、ＩｇＥ又はＩｇＭ抗体などの異なる抗体アイソタイプを有することができる。
本明細書で使用される「ヒト化抗体」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖系列に由来するＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列に移植された抗体を指す。ヒトフレームワーク配列内に更なるフレームワーク領域修飾を行うことができる。
本明細書で使用される「キメラ抗体」という用語は、広く言えば、１つの抗体の１つ又は複数の領域及び１つ又は複数の他の抗体の１つ又は複数の領域に由来する操作された抗体を指す。具体的には、キメラ抗体は、非ヒト動物抗体に由来する可変領域及び別の抗体の定常領域を含み、例えば、マウスに由来する可変領域及びヒトに由来する定常領域を含む。キメラ抗体は、少なくとも２つの異なる抗原に対して特異性を有する多重特異性抗体を更に指すことができる。
本明細書で使用される「ＣＬＤＮ１８．２結合分子」という用語は、ＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合する分子を指す。
本明細書で使用される「ＣＬＤＮ１８．２抗体」、「ＣＬＤＮ１８．２に対する抗体」、「ＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合する抗体」、「ＣＬＤＮ１８．２を特異的に標的とする抗体」、「ＣＬＤＮ１８．２を特異的に認識する抗体」という用語は、交換して使用されてもよく、ＣｌａｕｄｉｎタンパクＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合できる抗体を意味する。特に、具体的な実施形態において、ヒトＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合する抗体を指し、特にヒトＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合するがヒトＣＬＤＮ１８．１に特異的に結合しない抗体を指す。ヒトＣＬＤＮ１８．２及びヒトＣＬＤＮ１８．１のアミノ酸配列は、それぞれＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６に示され、マウスＣＬＤＮ１８．２及びマウスＣＬＤＮ１８．１のアミノ酸配列は、それぞれＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８に示される。
本明細書で使用される「免疫グロブリン単一可変ドメイン」又は「ＩＳＶ」という用語は、本明細書において、通常、免疫グロブリンフォールドを含むか又は適当な条件（例えば、生理条件）で免疫グロブリンフォールド（即ちフォールドによって）を形成でき、即ち、免疫グロブリン可変ドメイン（例えば、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨＨドメイン）を形成できるアミノ酸配列、及び、機能性抗原結合部位（別の免疫グロブリン可変ドメインとの相互作用（例えばＶＨ－ＶＬ相互作用）を要することなく機能性抗原結合部位を形成する意味で）を含む免疫グロブリン可変ドメインを形成する（又は適用な条件で形成できる）アミノ酸配列として定義される。
本明細書で使用される「Ｋａ」という用語は、特定の抗体－抗原相互作用の会合速度を表すことを意図し、本明細書で使用される「Ｋｄ」という用語は、特定の抗体－抗原相互作用の解離速率を表すことを意図する。本明細書で使用される「ＫＤ」又は「ＫＤ値」という用語は、ＫｄとＫａの比率（即ち、Ｋｄ／Ｋａ）から得られ且つモル濃度（Ｍ）として表される、特定の抗体－抗原相互作用の解離定数を表すことを意図する。抗体のＫＤ値は、当分野で十分に確立された方法を使用して決定することができる。抗体のＫＤ値を決定する好ましい方法は、表面プラズモン共鳴を使用し、好ましくは、Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）システムのようなバイオセンサシステムを使用することである。
本明細書で使用される「特異的結合」又は「に特異的に結合する」という用語は、２つの分子間、例えば抗体と抗原の間の非ランダム結合反応を指す。
本明細書で使用される「結合を阻害する」、「結合を遮断する」又は「同じエピトープについて競合する」能力は、抗体が２つの分子の結合を任意の検出可能な程度まで阻害する能力を指す。いくつかの実施形態において、２つの分子間の結合を遮断する抗体は、２つの分子間の結合相互作用を少なくとも５０％阻害する。いくつかの実施形態において、当該阻害は、６０％よりも大きく、７０％よりも大きく、８０％よりも大きく、又は９０％よりも大きくてもよい。
本明細書で使用される「高親和性」抗体という用語は、標的抗原に対して１×１０－７Ｍ以下、より好ましくは５×１０－８Ｍ以下、更に好ましくは１×１０－８Ｍ以下、更に好ましくは５×１０－９Ｍ以下、更に好ましくは１×１０－９Ｍ以下であるＫＤ値を有する抗体を指す。
本明細書で使用される「ＥＣ５０」という用語は、「半有効濃度」とも呼ばれ、特定の暴露時間後にベースラインと最大値の間の５０％の応答を誘導する薬物、抗体又は毒剤の濃度を指す。本出願の文脈において、ＥＣ５０の単位は「ｎＭ」である。本明細書で使用される「エピトープ」という用語は、免疫グロブリン又は抗体が特異的に結合する抗原部分を指す。「エピトープ」は、「抗原決定基」とも呼ばれる。エピトープ又は抗原決定基は、通常、アミノ酸、炭水化物又は糖側鎖などの分子の化学的に活性な表面基からなり、且つ、通常、特定の３次元構造及び特定の電荷特徴を有する。例えば、エピトープは、通常、独特の立体構造における少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個の連続又は不連続アミノ酸を含み、「線形エピトープ」又は「立体構造エピトープ」であってよい。例えば、Ｅｐｉｔｏｐｅ Ｍａｐｐｉｎｇ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．６６，Ｇ．Ｅ．Ｍｏｒｒｉｓ，Ｅｄ．（１９９６）を参照する。線形エピトープにおいて、タンパク質と相互作用分子（例えば抗体）との間の全ての相互作用部位は、タンパク質の一次アミノ酸配列に沿って線形に存在する。立体構造エピトープにおいて、相互作用部位は、タンパク質において互いに単離されたアミノ酸残基に跨る。当業者に知られている通常の技術により検出された同じエピトープへの結合の競合性に応じて、抗体をスクリーニングすることができる。例えば、競合又は交差競合を研究することによって抗原（例えばＣＬＤＮ１８．２）への結合について互いに競合又は交差競合する抗体を得ることができる。国際特許出願ＷＯ ０３／０４８７３１には、交差競合に基づいて、同じエピトープに結合する抗体を得るための高スループット方法が記載されている。
本明細書で使用される「単離された」という用語は、手動で天然状態から得られた物質又は成分の状態を指す。ある「単離された」物質又は成分が天然に存在する場合、その位置する天然環境が変化したこと、又は天然環境で当該物質又は成分が単離されたこと、又は以上の両方による可能性がある。例えば、ある単離されていないポリヌクレオチド又はポリペプチドがある生体動物体内に天然に存在し、当該天然状態で単離された同じ高純度ポリヌクレオチド又はポリペプチドは、単離されたポリヌクレオチド又はポリペプチドと呼ばれる。「単離された」という用語は、混合された人工物質又は合成物質を排除するものではなく、単離された物質の活性に影響しない他の不純物質を排除するものでもない。
本明細書で使用される「単離された抗体」という用語は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指すことを意図する。また、単離された抗体は、他の細胞材料及び／又は化学物質を実質的に含まなくてもよい。
本明細書で使用される「ベクター」という用語は、その中にポリヌクレオチドを挿入できる核酸媒体を指す。ベクターがその中に挿入されるポリヌクレオチドによってコードされたタンパク質の発現を可能にする場合、当該ベクターは、発現ベクターと呼ばれる。当該ベクターは、宿主細胞に形質転換、形質導入、トランスフェクションされることで運ばれる遺伝物質要素を宿主細胞において発現させることができる。ベクターは、当業者に熟知のものであり、プラスミド、コスミド、酵母人工染色体（ＹＡＣ）、細菌人工染色体（ＢＡＣ）又はＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）などの人工染色体、λファージ又はＭ１３ファージなどのファージ及び動物ウイルスを含むが、これらに限定されない。ベクターとして使用できる動物ウイルスは、レトロウイルス（レンチウイルスを含む）、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス）、ポックスウイルス、バキュロウイルス、パピローマウイルス、パポーバウイルス（例えば、ＳＶ４０）を含むが、これらに限定されない。ベクターは、発現を制御する複数の要素を含むことができ、プロモーター配列、転写開始配列、エンハンサー配列、選択要素及びレポーター遺伝子を含むが、これらに限定されない。更に、ベクターは、複製起点を含むことができる。
本明細書で使用される「宿主細胞」という用語は、ベクターに導入できる任意の種類の細胞系を指し、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）又は枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）などの原核細胞、酵母細胞又はアスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）などの真菌細胞、Ｓ２ショウジョウバエ細胞又はＳｆ９などの昆虫細胞、及び線維芽細胞、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、ＮＳＯ細胞、ＨｅＬａ細胞、ＢＨＫ細胞、ＨＥＫ２９３細胞又はヒト細胞などの動物細胞を含むが、これらに限定されない。
宿主細胞を利用して本発明の抗体を製造する方法は、当分野における通常のものであり、原核又は真核細胞において抗体を発現し、その後に抗体を単離し、且つ、通常、薬学的に許容される純度まで精製することを含む。例えば、いくつかの実施形態において、当分野で既知の標準的な技術によって抗体をコードする核酸を発現ベクターに挿入するとともに、発現ベクターを適切な原核又は真核宿主細胞に導入し、本発明の抗体又はその機能的断片を産生するために十分な条件及び時間で、ＣＨＯ細胞、ＮＳＯ細胞、ＳＰ２／０細胞、ＨＥＫ２９３細胞、ＣＯＳ細胞、ＰＥＲ．Ｃ６（Ｒ）細胞、酵母又は大腸菌細胞などの宿主細胞を培養し、細胞（溶解後の上清又は細胞）から抗体を回收して抗体を精製する。抗体を製造するための通常の方法は、当分野の従来技術で公知のものであり、例えば、Ｍａｋｒｉｄｅｓ，Ｓ．Ｃ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｘｐｒ．Ｐｕｒｉｆ．１７（１９９９）１８３－２０２；Ｇｅｉｓｓｅ，Ｓ．ら，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｘｐｒ．Ｐｕｒｉｆ．８（１９９６）２７１－２８２；Ｋａｕｆｍａｎ，Ｒ．Ｊ．，Ｍｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１６（２０００）１５１－１６０；Ｗｅｒｎｅｒ，Ｒ．Ｇ．，Ｄｒｕｇ Ｒｅｓ．４８（１９９８）８７０－８８０による総説論文で述べられている。
本明細書で使用される「同一性」という用語は、配列をアラインメント又は比較することで決定された２つ以上のポリペプチド分子又は２つ以上の核酸分子の配列間の関係を指す。「同一性百分率」は、比較される分子におけるアミノ酸又はヌクレオチドの間の同じ残基の百分率を指し、且つ比較される最小分子の大きさに基づいて計算される。これらの計算では、アラインメントのギャップ（存在する場合）に対して、特定の数学モデル又はコンピュータプログラム（即ち、「アルゴリズム」）によってアドレス指定することが好ましい。アライメントされる核酸又はポリペプチドの同一性を計算するために使用できる方法は、Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，（Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｍ．，ｅｄ．），１９８８，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ；Ｂｉｏｃｏｍｐｕｔｉｎｇ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｇｅｎｏｍｅ Ｐｒｏｊｅｃｔｓ，（Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｗ．，ｅｄ．），１９９３，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ；Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｄａｔａ，Ｐａｒｔ Ｉ，（Ｇｒｉｆｆｉｎ，Ａ．Ｍ．，ａｎｄ Ｇｒｉｆｆｉｎ，Ｈ．Ｇ．，ｅｄｓ．），１９９４，Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙ：Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ；ｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅ，Ｇ．，１９８７，Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ；Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐｒｉｍｅｒ，（Ｇｒｉｂｓｋｏｖ，Ｍ．ａｎｄ Ｄｅｖｅｒｅｕｘ，Ｊ．，ｅｄｓ．），１９９１，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｍ．Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ；及びＣａｒｉｌｌｏら，１９８８，ＳＩＡＭＪ．Ａｐｐｌｉｅｄ Ｍａｔｈ．４８：１０７３に記載されたものを含む。
本明細書で使用される「免疫原性」という用語は、生物体における特異的抗体又は感作リンパ球の形成を刺激する能力を指す。それは、抗原が特定の免疫細胞の活性化、増殖及び分化を刺激して抗体及び感作リンパ球などの免疫エフェクター物質を最終的に生成する性質を指すだけでなく、抗原が生物体を刺激した後に生物体の免疫系において抗体又は感作Ｔリンパ球の特異的免疫応答を形成できる性質も指す。免疫原性は、抗原の最も重要な特性である。抗原が宿主における免疫応答の発生を誘導することに成功できるか否かは、抗原の性質、宿主の反応性及び免疫手段という３つの要因によるものである。
本明細書で使用される「トランスフェクション」という用語は、核酸を真核細胞、特に哺乳動物細胞に導入するプロセスを指す。トランスフェクションに用いられる解決策及び技術は、リポフェクション、エレクトロポレーションなどの化学的及び物理的方法によるトランスフェクションを含むが、これらに限定されない。多くのトランスフェクション技術は、当分野で公知のものであり、例えば、Ｇｒａｈａｍら，１９７３，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ５２：４５６；Ｓａｍｂｒｏｏｋら，２００１，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ；Ｄａｖｉｓら，１９８６，Ｂａｓｉｃ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ；Ｃｈｕ ｅｔ ａｌ，１９８１，Ｇｅｎｅ １３：１９７を参照する。
本明細書で使用される「蛍光活性化細胞選別」又は「ＦＡＣＳ」という用語は、特別なタイプのフローサイトメトリーを指す。それは、各細胞の特定の光散乱及び蛍光特徴に基づき、１回に１細胞、生物細胞の不均質混合物を２つ以上の容器に選別する方法を提供する（ＦｌｏｗＭｅｔｒｉｃ．「Ｓｏｒｔｉｎｇ Ｏｕｔ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ａｃｔｉｖａｔｅｄ Ｃｅｌｌ Ｓｏｒｔｉｎｇ」．２０１７－１１－０９）。ＦＡＣＳを行うための機器は、当業者に知られて一般に市販されているものである。このような機器の例は、Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡ）のＦＡＣＳ Ｓｔａｒ Ｐｌｕｓ、ＦＡＣＳｃａｎ及びＦＡＣＳｏｒｔ機器、Ｃｏｕｌｔｅｒ Ｅｐｉｃｓ Ｄｉｖｉｓｉｏｎ（Ｈｉａｌｅａｈ，ＦＬ）からのＥｐｉｃｓ Ｃ及びＣｙｔｏｍａｔｉｏｎ（Ｃｏｌｏｒａｄｏ Ｓｐｒｉｎｇｓ，Ｃｏｌｏｒａｄｏ）からのＭｏＦｌｏを含む。
「被験者」という用語は、如何なるヒト又は非ヒト動物を含み、好ましくは、ヒトである。
本明細書で使用される「ＣＬＤＮ１８．２に関連する病症」という用語は、ＣＬＤＮ１８．２（例えば、ヒトＣＬＤＮ１８．２）の発現又は活性の増加又は低減によって引き起こされるか悪化する病症、又は他の形でそれに関連する如何なる病症を指す。
本明細書で使用される「癌」という用語は、医学的病症を誘発する如何なる腫瘍又は悪性細胞の成長、増殖又は転移によって媒介される固形腫瘍又は白血病などの非固形腫瘍を指す。
本明細書において病状を治療する場合に使用される「治療」という用語は、一般的に、進行速度の低下、進行速度の停滞を含む病状の進行の阻害、病状の退行、病状の改善及び病状の治癒などの望ましい治療効果を実現する、人又は動物の治療及び療法に関するものである。予防対策（即ち、予防）である治療も含む。癌に対して、「治療」は、腫瘍又は悪性細胞の成長、増殖や転移又はこれらの組み合わせの阻害又は緩和を指す場合がある。腫瘍に対して、「治療」は、腫瘍の全部又は一部の除去、腫瘍の成長及び転移の阻害又は緩和、腫瘍の進行の予防又は遅延又はそれらの組み合わせを含む。
本明細書で使用される「治療有効量」という用語は、所望の治療レジメンに応じて投与する場合に妥当な利益／リスク比に見合う所望の治療効果を発生させるために有効である、活性化合物又は活性化合物を含む材料、組成物又は剤形の量に関するものである。具体的には、「治療有効量」は、抗体又はその抗原結合部分がＣＬＤＮ１８．２に関連する病状を治療するために有効な量又は濃度を指す。
本明細書で使用される「薬学的に許容される」という用語は、ベクター、希釈剤、賦形剤及び／又はその塩が化学的及び／又は物理的に製剤における他の成分と適合し、且つ受容者と生理学的に適合することを指す。
本明細書で使用される「薬学的に許容されるベクター及び／又は賦形剤」という用語は、薬理学的及び／又は生理学的に被験者及び活性剤と適合するベクター及び／又は賦形剤を指し、当分野で公知のものであり（例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ．Ｅｄｉｔｅｄ ｂｙ Ｇｅｎｎａｒｏ ＡＲ，１９ｔｈ ｅｄ．Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａ：Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，１９９５を参照）、且つ、ｐＨ調整剤、界面活性剤、アジュバント及びイオン強度強化剤を含むが、これらに限定されない。例えば、ｐＨ調整剤は、リン酸緩衝液を含むが、これに限定されない。表面活性剤は、カチオン性、アニオン性又は非イオン性の界面活性剤を含むが、これらに限定されず、例えばＴｗｅｅｎ（登録商標）８０である。イオン強度強化剤は、塩化ナトリウムを含むが、これに限定されない。
本明細書で使用される「アジュバント」という用語は、抗原と共に生物体に送達されるか又は事前に生物体に送達される場合に生物体内の抗原に対する免疫応答を増強するか又は免疫応答のタイプを変更することができる、非特異的な免疫賦活薬を指す。従来の技術において、アルミニウムアジュバント（例えば、水酸化アルミニウム）、フロイントアジュバント（例えばフロイント完全アジュバント及びフロイント不完全アジュバント）、コリネバクテリウム・パルバム、リポ多糖、サイトカインなどを含む、種々のアジュバントが存在するが、これらに限定されない。フロイントアジュバントは、現在、動物実験において最も一般的に使用されているアジュバントである。水酸化アルミニウムアジュバントは、臨床試験においてより一般的に使用されている。
ＣＬＤＮ１８．２結合分子
いくつかの態様において、本開示は、ＣＬＤＮ１８．２結合分子を含む。
一般的に、ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、ＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合する如何なる分子を含み得る。いくつかの場合に、「ＣＬＤＮ１８．２結合分子」は、「ＣＬＤＮ１８．２アンタゴニスト」を含み得る。ＣＬＤＮ１８．２結合分子又はＣＬＤＮ１８．２アンタゴニストは、抗体、より具体的には、ＣＬＤＮ１８．２（例えば、ヒトＣＬＤＮ１８．２）に特異的に結合する抗体などのポリペプチド又はタンパク質である。
抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体又は単一ドメイン抗体などを含むが、これらに限定されない。具体的な実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、単一ドメイン抗体であり、通常、単一の単量体可変抗体ドメインからなる抗体を指す。完全な抗体と同様に、単一ドメイン抗体は、特定の抗原に選択的に結合することができる。
より具体的には、ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、重鎖単一ドメイン抗体であり、「ＶＨＨ」、「ＶＨＨ抗体」、「ＶＨＨドメイン」、「ＶＨＨ抗体断片」、「ＶＨＨ」又は「ナノ抗体」などの用語と交換して使用されてもよい。ラクダ科抗体に由来するＶＨＨ分子は、既知の最小の完全な抗原結合ドメインの１つ（約１５ＫＤａ、又は通常のＩｇＧの１／１０）であるため、緻密な組織に送達されること、及び高分子間の限られた空間に入ることに非常に適する。
本明細書で公開された単一ドメイン抗体は、当業者が当分野で知られている方法又は任意の将来の方法によって調製可能である。例えば、当分野で知られている方法によってＶＨＨを得ることができ、例えばラクダを免疫することによって標的抗原に結合するとともに標的抗原を中和するＶＨＨを得るか、又は当分野で知られている分子生物学技術を利用して本発明のＶＨＨのライブラリーをクローニングし、その後にファージディスプレイを利用して選択する。いくつかの実施形態において、本発明の単一ドメイン抗体は、ラクダ科動物において天然に産生され、即ち、本明細書において他の抗体について記載された技術を使用し、ＣＬＤＮ１８．２又はその断片を用いてラクダを免疫することで製造される。
いくつかの実施形態において、所望の抗原でラマ又はアルパカを免疫してから重鎖抗体をコードするｍＲＮＡを単離することによって単一ドメイン抗体を得る。逆転写及びポリメラーゼ連鎖反応により、数百万個のクローニングされた単一ドメイン抗体を含む遺伝子ライブラリーが産生される。ファージディスプレイ及びリボソームディスプレイなどのスクリーニング技術は、抗原に結合するクローンを同定することに役立つ。ファージディスプレイは、ファージにおいて抗体ライブラリーを合成し、目的抗原又はその抗体結合部分を用いてライブラリーをスクリーニングし、抗原に結合するファージを単離し、そこから免疫反応性断片を得ることができる。このようなライブラリーを調製及びスクリーニングするための方法は、当分野で公知のものであり、且つ、ファージディスプレイライブラリーを産生するためのキットは、市販されているものであってよい（例えば、Ｐｈａｒｍａｃｉａ組換えファージ抗体系、カタログ番号２７－９４００－０１；及びＳｔｒａｔａｇｅｎｅ ＳｕｒｆＺＡＰ（商標）ファージディスプレイキット、カタログ番号２４０６１２）。抗体ディスプレイライブラリーの産生及びスクリーニングに使用可能な方法は、他にもある（例えば、Ｂａｒｂａｓら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８８：７９７８－７９８２（１９９１）を参照）。
最も効果的なクローンが同定される場合、例えば親和性成熟又はヒト化によってそのＤＮＡ配列を最適化することで、人体の抗体に対する免疫反応を防止することができる。
従って、（１）天然に存在する重鎖抗体のＶＨＨドメインの単離、（２）天然に存在するＶＨＨドメインをコードするヌクレオチド配列の発現、（３）天然に存在するＶＨＨドメインの「ヒト化」又はこのようなヒト化されたＶＨＨドメインをコードする核酸の発現、（４）任意の動物種、特に哺乳動物種、例えばヒトに由来する天然に存在するＶＨドメインの「ラクダ化」、又はこのようなラクダ化されたＶＨドメインをコードする核酸の発現、（５）「ドメイン抗体」又は「ｄＡｂ」の「ラクダ化」（例えば、Ｗａｒｄら，１９８９、Ｎａｔｕｒｅ ３４１：５４４－５４６を参照）、又はこのようなラクダ化されたＶＨドメインをコードする核酸の発現、（６）合成又は半合成技術によりタンパク質、ポリペプチド又は他のアミノ酸配列を調製すること、（７）核酸合成に用いられる技術によってＶＨＨをコードする核酸を調製し、これによって得られた核酸を発現すること、及び／又は（８）それらの任意の組み合わせにより、本発明の単一ドメイン抗体を得ることができる。本明細書の開示内容に基づき、前記内容を実行するための好適な方法及び技術は、当業者にとって明らかであり、且つ、例えば以下で更に詳しく説明される方法及び技術を含む。
単一ドメイン抗体は、通常、免疫された動物から得られた血液、リンパ節又は脾臓リンパ球のｃＤＮＡからファージディスプレイベクターに可変ドメインライブラリーをＰＣＲクローニングすることによって産生される。通常、固定化抗原（例えば試験管のプラスチック表面に塗布された抗原、ストレプトアビジンビーズに固定されたビオチン化抗原又は細胞の表面で発現された膜タンパク）で対応するライブラリーをパンニングすることによって抗原特異的単一ドメイン抗体を選択する。この戦略をインビトロでシュミレーションすることによってｓｄＡｂの親和性を向上させることができ、例えば、ＣＤＲ領域の部位特異的突然変異誘発により、追加した厳しい条件（より高い温度、高又は低塩濃度、高又は低ｐＨ及び低抗原濃度）で、固定化抗原を更にパンニングする（Ｗｅｓｏｌｏｗｓｋｉら，Ｓｉｎｇｌｅ ｄｏｍａｉｎ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：ｐｒｏｍｉｓｉｎｇ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ａｎｄ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｔｏｏｌｓ ｉｎ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ａｎｄ ｉｍｍｕｎｉｔｙ．Ｍｅｄ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ（２００９）１９８：１５７－１７４）。
抗原又はエピトープに特異的に結合するＶＨＨを調製するための方法は、参考文献に記載されており、例えば、Ｒ．ｖａｎ ｄｅｒ Ｌｉｎｄｅｎら，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ，２４０（２０００）１８５－１９５；Ｌｉら，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ．，２８７（２０１２）１３７１３－１３７２１；Ｄｅｆｆａｒら，Ａｆｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｖｏｌ．８（１２），ｐｐ．２６４５，１７ Ｊｕｎｅ，２００９及びＷＯ ９４／０４６７８を参照する。
いくつかの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２結合分子におけるＶＨＨは、抗体のＦｃドメイン（例えばＩｇＧ（例えばＩｇＧ１又はＩｇＧ４）のＦｃドメイン）に融合する。ＶＨＨをＦｃドメインに融合させることにより、ＡＤＣＣ及びＣＤＣなどのエフェクター機能をより効果的に動員することができる。また、ＶＨＨとＦｃドメインの融合により、ＣＬＤＮ１８．２結合分子が二量体を形成するのに役立つことができるだけでなく、更にＣＬＤＮ１８．２結合分子のインビボ半減期の延長にも役立つことができる。
本明細書で使用される「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用」又は「ＡＤＣＣ」という用語は、何らかの細胞傷害エフェクター細胞（例えばナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、好中球及びマクロファージ）に存在するＦｃ受容体（ＦｃＲ）に結合する分泌された抗体により、これらの細胞傷害エフェクター細胞が抗原を運ぶ標的細胞に特異的に結合でき、続いて細胞毒素で標的細胞を殺傷させる細胞傷害形態を指す。抗体で細胞傷害性細胞を「武装」することは、このような殺傷には絶対に必要なことである。ＡＤＣＣを媒介する主な細胞であるＮＫ細胞は、ＦｃγＲＩＩＩのみを発現し、単核細胞は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞でのＦｃＲ発現は、Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ ９：４５７－９２（１９９１）の第４６４ページの表３に纏められている。目的分子のＡＤＣＣ活性を評価するために、米国特許ＵＳ ５５００３６２又はＵＳ ５８２１３３７に記載された測定方法などのインビトロＡＤＣＣ測定を行うことができる。このような測定に使用できるエフェクター細胞は、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及びナチュラルキラー（ＮＫ）細胞を含む。代替的又は付加的に、目的分子のＡＤＣＣ活性は、インビボで評価することができ、例えば、ＣｌｙｎｅｓらＰＮＡＳ（ＵＳＡ）９５：６５２－６５６（１９９８）に開示された動物モデルで評価される。
「補体依存性細胞傷害作用」又は「ＣＤＣ」という用語は、補体存在下の標的細胞の溶解を指す。古典的補体経路の活性化は、補体系の第１成分（Ｃ１ｑ）とその相同抗原に結合する抗体（適切なサブクラス）との結合によって開始される。補体の活性化を評価するために、例えばＧａｚｚａｎｏ－Ｓａｎｔｏｒｏら，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０２：１６３（１９９６）に記載された方法により、ＣＤＣ測定を実施することができる。
説明の便宜上、以下、ＣＬＤＮ１８．２結合分子をＣＬＤＮ１８．２抗体として説明する。
ＣＬＤＮ１８．２の特定のエピトープに特異的に結合できるＣＬＤＮ１８．２抗体
１つの態様において、本発明は、ＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合するが、ＣＬＤＮ１８．１に結合しないか又は実質的に結合しない単一ドメイン抗体に関する。
本発明者らは、ヒトＣＬＤＮ１８．２の細胞外ドメイン１（ＥＣＤ１）に特異的に結合できるＣＬＤＮ１８．２結合分子（例えば、ＣＬＤＮ１８．２を標的とする単一ドメイン抗体）を初めて発見した。
前述したように、ＣＬＤＮ１８．２は、２つの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を有し、ヒトＣＬＤＮ１８．２の全長配列は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５に示される。ＥＣＤ１は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９に示すように、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５の第２８～８０位のアミノ酸である。
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５：
Figure 0007600218000001
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９：
Figure 0007600218000002
また、マウスＣＬＤＮ１８．２は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７に示される。
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７：
Figure 0007600218000003
ヒト及びマウスのＣＬＤＮ１８．１について、その配列は、それぞれＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８に示される。
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６：
Figure 0007600218000004
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８：
Figure 0007600218000005
特定の配列と配列同一性を有するＣＤＲを含むＣＬＤＮ１８．２抗体
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含み、且つ、ＣＤＲ１は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含み、ＣＤＲ２は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含み、ＣＤＲ３は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３と少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む。
特に断りのない限り、Ｋａｂａｔら（１９９１）Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ（５ｔｈ Ｅｄ．），ＵＳ Ｄｅｐｔ．ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，ＰＨＳ，ＮＩＨ，ＮＩＨ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ ｎｏ．９１－３２４２；Ｃｈｏｔｈｉａら，１９８７，ＰＭＩＤ：３６８１９８１；Ｃｈｏｔｈｉａら，１９８９，ＰＭＩＤ：２６８７６９８；ＭａｃＣａｌｌｕｍら，１９９６，ＰＭＩＤ：８８７６６５０；又はＤｕｂｅｌ，Ｅｄ．（２００７）Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，３ｒｄ Ｅｄ．，Ｗｉｌｙ－ＶＣＨ Ｖｅｒｌａｇ ＧｍｂＨ ａｎｄ Ｃｏ．により提供された番号付けスキームのうちの１つに基づいてアミノ酸を各ＣＤＲに割り当てることができる。
抗体配列における可変領域及びＣＤＲは、当分野で既に開発された一般的な規則（前述したように、例えばＫａｂａｔ番号付けシステム）に基づき、又は配列と既知の可変領域のデータベースとのアライメントによって同定することができる。Ｋｏｎｔｅｒｍａｎｎ ａｎｄ Ｄｕｂｅｌ，ｅｄｓ．，Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ，２００１及びＤｉｎａｒｅｌｌｏら，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ Ｉｎｃ．，Ｈｏｂｏｋｅｎ，ＮＪ，２０００には、これらの領域を同定する方法が記載されている。抗体配列の例示的なデータベースは、ｗｗｗ．ｂｉｏｉｎｆ．ｏｒｇ．ｕｋ／ａｂｓの「Ａｂｙｓｉｓ」ウェブサイト（Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ＆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｃｏｌｌｅｇｅ Ｌｏｎｄｏｎ，Ｌｏｎｄｏｎ，ＥｎｇｌａｎｄのＡ．Ｃ．Ｍａｒｔｉｎによってメンテナンスされる）及びＶＢＡＳＥ２ウェブサイトｗｗｗ．ｖｂａｓｅ２．ｏｒｇに記載され、且つそれらから得ることができ、Ｒｅｔｔｅｒら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，３３（Ｄａｔａｂａｓｅ ｉｓｓｕｅ）：Ｄ６７１－Ｄ６７４（２００５）に記載された通りである。好ましくは、Ｋａｂａｔ、ＩＭＧＴ及びタンパク質データベース（ＰＤＢ）からの配列データとＰＤＢからの構造データとを統合したＡｂｙｓｉｓデータベースを用いて配列を解析し、Ｄｒ．Ａｎｄｒｅｗ Ｃ．Ｒ．Ｍａｒｔｉｎの著書におけるＰｒｏｔｅｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｖａｒｉａｂｌｅ Ｄｏｍａｉｎｓ．Ｉｎ：Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｌａｂ Ｍａｎｕａｌを参照する（Ｅｄ．：Ｄｕｅｂｅｌ，Ｓ．ａｎｄ Ｋｏｎｔｅｒｍａｎｎ，Ｒ．，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ，ＩＳＢＮ－１３：９７８－３５４０４１３５４７、ウェブサイトｂｉｏｉｎｆｏｒｇ．ｕｋ／ａｂｓからも得られる）。Ａｂｙｓｉｓデータベースウェブサイトは、本明細書の教示によって使用できるＣＤＲを認識するために開発された一般的な規則を更に含む。
２つのアミノ酸配列間の同一性百分率は、Ｅ．Ｍｅｙｅｒｓ及びＷ．Ｍｉｌｌｅｒのアルゴリズム（Ｃｏｍｐｕｔ．Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｓｃｉ．，４：１１－１７（１９８８））により決定することができ、当該アルゴリズムは、既にＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）に組み込まれ、ＰＡＭ１２０重量残基表、１２のギャップ長ペナルティ、４のギャップペナルティを使用する。また、２つのアミノ酸配列間の同一性百分率は、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈのアルゴリズム（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４４－４５３（１９７０））により決定することができ、当該アルゴリズムは、既にＧＣＧソフトウェアパッケージ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｃｇ．ｃｏｍから得られる）におけるＧＡＰプログラムに組み込まれ、Ｂｌｏｓｓｕｍ ６２行列又はＰＡＭ２５０行列、１６、１４、１２、１０、８、６又は４のギャップ重み、１、２、３、４、５又は６の長さ重みを使用する。
付加的又は代替的に、本発明のタンパク質配列は、更に、例えば関連配列を認識するために、公開データベースに対する検索を実行するための「問い合わせ配列」として使用できる。このような検索は、Ａｌｔｓｃｈｕｌら，（１９９０）Ｊ．ＭｏＩ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－１０のＸＢＬＡＳＴプログラム（バージョン２．０）により実行することができる。本発明の抗体分子に相同のアミノ酸配列を得るために、スコア＝５０、ワード長＝３としてＸＢＬＡＳＴプログラムによりＢＬＡＳＴタンパク質の検索を行うことができる。比較目的のためのギャップありアライメントを得るために、Ａｌｔｓｃｈｕｌら，（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５（１７）：３３８９－３４０２に記載されたように、Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴを使用することができる。ＢＬＡＳＴ及びＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを使用する場合、各プログラム（例えば、ＸＢＬＡＳＴ及びＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメータを使用することができ、ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖを参照する。
別の実施形態において、ＣＤＲのアミノ酸配列は、上記で与えられた各配列と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％同一である。
アミノ酸付加、欠失又は置換を有するＣＤＲを含むＣＬＤＮ１８．２抗体
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含み、且つ、ＣＤＲ１は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、ＣＤＲ２は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在し、及び／又はＣＤＲ３は、アミノ酸配列においてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に対して２アミノ酸以下のアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在する。例えば、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３は、それぞれＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に示すアミノ酸配列に対して１アミノ酸のみのアミノ酸付加、欠失又は置換の差異が存在する。
好ましくは、単離された抗体又はその抗原結合部分のＣＤＲは、２アミノ酸以下又は１アミノ酸以下の保存的置換を含有する。本明細書で使用される「保存的置換」という用語は、アミノ酸配列を含むタンパク質／ポリペプチドの基本性質に悪影響を及ぼしたり変化させたりしないアミノ酸置換を指す。例えば、保存的置換は、当分野で知られている標準的技術（例えば、部位特異的突然変異誘発及びＰＣＲ媒介突然変異誘発）によって導入することができる。保存的アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似する側鎖を有する別のアミノ酸残基で置換されるという置換を含み、例えば、物理的又は機能的に類似する残基（例えば、類似する大きさ、形状、電荷を有し、化学的性質は、共有結合又は水素結合を形成する能力などを含む）は、対応するアミノ酸残基で置換される。当分野では、類似する側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが既に定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン及びヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸及びグルタミン酸）、非電荷極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン）、β－分岐側鎖を有するアミノ酸（例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン）及び芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を含む。従って、対応するアミノ酸残基は、好ましくは、同じ側鎖ファミリーに由来する別のアミノ酸残基で置換される。アミノ酸保存的置換を同定するための方法は、当分野で公知のものである（例えば、Ｂｒｕｍｍｅｌｌら，Ｂｉｏｃｈｅｍ．３２：１１８０－１１８７（１９９３）；Ｋｏｂａｙａｓｈｉら，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．１２（１０）：８７９－８８４（１９９９）；及びＢｕｒｋｓら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９４：４１２－４１７（１９９７）を参照し、それらは引用により本明細書に組み込まれる）。
いくつかの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２抗体の免疫グロブリン単一可変ドメインは、
ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、
ｉｉ）式ＩＳＲＧＧＸ１Ｔに示すアミノ酸配列のＣＤＲ２（Ｘ１はＴ又はＳである）、及び、
ｉｉｉ）式ＮＡＱＡＷＤＸ２ＧＴＸ３ＲＹＬＥＶに示すアミノ酸配列のＣＤＲ３（Ｘ２はＰ又はＶであり、Ｘ３はＦ又はＩである）を含む。
いくつかの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２抗体の免疫グロブリン単一可変ドメインは、
ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０、３３、３４、３５、３６、３８、３９又は４０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、
ｉｉ）式Ｘ４ＳＴＧＧＴＴに示すアミノ酸配列のＣＤＲ２（Ｘ４はＩ又はＭである）、及び、
ｉｉｉ）式ＮＶＬＶＸ５ＳＧＩＧＳＸ６ＬＥＶに示すアミノ酸配列のＣＤＲ３（Ｘ５はＩ又はＶであり、Ｘ６はＨ又はＴである）を含む。
ＣＤＲを含むＣＬＤＮ１８．２抗体
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、又は、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３から選択されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｈ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、
（ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３、又は、
（ｊ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４０に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列を含むＣＤＲ３から選択されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、又は、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３から選択されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、
（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｄ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｅ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｆ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｇ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｈ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２にアミノ酸配列のＣＤＲ３、
（ｉ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３、及び、
（ｊ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４０に示すアミノ酸配列のＣＤＲ１、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１に示すアミノ酸配列のＣＤＲ２及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７に示すアミノ酸配列のＣＤＲ３から選択されるＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３を含む。
ＶＨＨ配列により定義されたＣＬＤＮ１８．２抗体
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つ（例えば、１つ）の免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、
（Ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３に示すアミノ酸配列、
（Ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列、又は、
（Ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３に対して１つ又は複数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個）のアミノ酸の付加、欠失及び／又は置換を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、少なくとも１つ（例えば、１つ）の免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばＶＨＨ）を含み、前記ＶＨＨは、
（Ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３に示すアミノ酸配列からなり、
（Ｂ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３と少なくとも８０％、８５％、９０％又は９５％同一であるアミノ酸配列からなり、又は、
（Ｃ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３に対して１つ又は複数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個）のアミノ酸の付加、欠失及び／又は置換を有するアミノ酸配列からなる。
他の実施形態において、前記ＶＨＨのアミノ酸配列は、上記各配列と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％同一である。例示的な例として、抗体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７、４７又は６３と少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の配列同一性を有するＶＨＨを含み得る。
いくつかの更なる実施形態において、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体は、重鎖可変領域におけるアミノ酸の保存的置換又は修飾を含み得る。当分野において理解されるように、抗原結合特性を除去しない保存的配列修飾を行うことができる。例えば、Ｂｒｕｍｍｅｌｌら（１９９３）Ｂｉｏｃｈｅｍ ３２：１１８０－８；ｄｅ Ｗｉｌｄｔら（１９９７）Ｐｒｏｔ．Ｅｎｇ．１０：８３５－４１；Ｋｏｍｉｓｓａｒｏｖら（１９９７）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２：２６８６４－２６８７０；Ｈａｌｌら（１９９２）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４９：１６０５－１２；Ｋｅｌｌｅｙ ａｎｄ Ｏ’ Ｃｏｎｎｅｌｌ（１９９３）Ｂｉｏｃｈｅｍ．３２：６８６２－３５；Ａｄｉｂ－Ｃｏｎｑｕｙら（１９９８）Ｉｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１０：３４１－６及びＢｅｅｒｓら（２０００）Ｃｌｉｎ．Ｃａｎ．Ｒｅｓ．６：２８３５－４３を参照する。
いくつかの実施形態において、本開示の単一ドメインＣＬＤＮ１８．２抗体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７の第１、４、５、１４、１６、３５、４７、５６、５８、６５、９２、１０２、１０５又は１２１位のアミノ酸の１つ又は複数が修飾される（例えば、アミノ酸の置換）。いくつかの実施形態において、本開示の単一ドメインＣＬＤＮ１８．２抗体は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７の第１、４、５、１１、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３５、５１、７５、７６、９２、１００、１０６又は１２０位のアミノ酸の１つ又は複数が修飾される（例えば、アミノ酸の置換）。
いくつかの具体的な実施形態において、本開示の単一ドメインＣＬＤＮ１８．２抗体の可変領域は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７～１４及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４２～５１、６３のうちの何れか１つを含む。
いくつかの具体的な実施形態において、本開示の単一ドメインＣＬＤＮ１８．２抗体の可変領域は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７～１４及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４２～５１、６３のうちの何れか１つからなる。
本開示の抗体をコードする核酸分子
いくつかの態様において、本発明は、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体又はその可変領域断片をコードする核酸配列を含む単離された核酸分子に関する。
本発明の核酸は、標準的な分子生物学技術により得ることができる。免疫グロブリン遺伝子ライブラリーから得られた抗体（例えば、ファージディスプレイ技術を使用する）について、このような抗体をコードする核酸は、遺伝子ライブラリーから回収されることが可能である。
本発明の例示的な核酸分子の配列は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２～２９、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２～６１及び６４のうちの何れか１つに示される。
いくつかの実施形態において、前記核酸は、それぞれＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２～２９及び５２～６１、６４のうちの何れか１つに示す核酸分子と少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有する。いくつかの実施形態において、同一性百分率は、遺伝暗号の縮重に由来するものであり、且つコードされたタンパク質配列が変わらない。
当分野で知られている組換え技術により、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体をコードする核酸分子をベクターに挿入して更にクローニング（ＤＮＡの増幅）したり発現に使用したりすることができる。多くのベクターは利用可能である。ベクター又はベクター成分は、通常、シグナル配列、複製起点、１つ又は複数のマーカー遺伝子、エンハンサー要素、プロモーター（例えば、ＳＶ４０、ＣＭＶ、ＥＦ－１α）、及び転写終結配列のうちの１つ又は複数を含むが、これらに限定されない。選択マーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞（例えば、米国特許第４，３９９，２１６、４，６３４，６６５及び５，１７９，０１７号を参照）を選択することに役立つ。例えば、通常、選択マーカー遺伝子は、ベクターが既に導入された宿主細胞の薬物（例えば、Ｇ４１８、ハイグロマイシン又はメトトレキサート）に対する抗性を付与する。１つの実施形態において、選択マーカー遺伝子は、ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）遺伝子（メトトレキサート選択／増幅を有するｄｈｆｒ－宿主細胞に用いられる）及びｎｅｏ遺伝子（Ｇ４１８選択に用いられる）を含み得る。別の実施形態において、抗体は、当分野で知られている相同組換えによって産生可能である。モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、通常の方法で（例えば、抗体重鎖をコードする遺伝子に特異的に結合できるオリゴヌクレオチドプローブを使用することにより）単離及び配列決定を行うことが容易である。
いくつかの実施形態において、ベクター系は、哺乳動物、細菌、酵母系などを含み、且つ、ｐＡＬＴＥＲ、ｐＢＡＤ、ｐｃＤＮＡ、ｐＣａｌ、ｐＬ、ｐＥＴ、ｐＧＥＭＥＸ、ｐＧＥＸ、ｐＣＩ、ｐＣＭＶ、ｐＥＧＦＰ、ｐＥＧＦＴ、ｐＳＶ２、ｐＦＵＳＥ、ｐＶＩＴＲＯ、ｐＶＩＶＯ、ｐＭＡＬ、ｐＭＯＮＯ、ｐＳＥＬＥＣＴ、ｐＵＮＯ、ｐＤＵＯ、Ｐｓｇ５Ｌ、ｐＢＡＢＥ、ｐＷＰＸＬ、ｐＢＩ、ｐ１５ＴＶ－Ｌ、ｐＰｒｏ１８、ｐＴＤ、ｐＲＳ４２０、ｐＬｅｘＡ、ｐＡＣＴ２．２などを含むがこれらに限定されないプラスミド、及び他の実験室及び商業的に利用可能なベクターを含む。適切なベクターは、プラスミド又はウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルス）を含み得る。本発明の１つの実施形態において、ベクターは、ヘキサヒスチジンタグ及びｃ－Ｍｙｃ－タグ遺伝子を含有するｐＥＴｂａｃなどのｐＥＴであり得る。
本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体をコードする核酸配列を含むベクターは、クローニング又は遺伝子発現のために宿主細胞に導入することができる。本明細書のベクターにおいてＤＮＡをクローニング又は発現するための適切な宿主細胞は、原核生物、酵母又は高等真核生物細胞である。この目的に使用される適切な原核生物は、グラム陰性菌又はグラム陽性菌などの真正細菌、例えば、エシェリキア属などの腸内細菌科、例えば、大腸菌、エンテロバクター属、エルウィニア属、クレブシエラ属、プロテウス属、ネズミチフス菌などのサルモネラ属、セラチアマルセッセンス及び赤痢菌などのセラチア属、並びに枯草菌及びバシラス・リケニフォルミスなどのバシラス属、緑膿菌及びストレプトマイセスなどのシュードモナス属を含む。
原核生物に加え、糸状菌又は酵母などの真核微生物は、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体を発現するために適切な宿主細胞である。サッカロミセス・セルビシエ又は一般的なパン酵母は、下等真核宿主微生物の中で最も一般的に使用されている。しかしながら、シゾサッカロマイセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ）；クルイベロミセス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）宿主、例えばクルイベロミセス・ラクティス（Ｋ．ｌａｃｔｉｓ）、クルイベロミセス・フラギリス（Ｋ．ｆｒａｇｉｌｉｓ）（ＡＴＣＣ １２，４２４）、クルイベロミセス・ブルガリカス（Ｋ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）（ＡＴＣＣ １６，０４５）、クルイベロミセス・ウィッカーラミ（Ｋ．ｗｉｃｋｅｒａｍｉｉ）（ＡＴＣＣ ２４，１７８）、クルイベロミセス・ウォルティ（Ｋ．ｗａｌｔｉｉ）（ＡＴＣＣ ５６，５００）、クルイベロミセス・ドロソフィラルム（Ｋ ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａｒｕｍ）（ＡＴＣＣ ３６，９０６）、クルイベロミセス・サーモトレランス（Ｋ．ｔｈｅｒｍｏｔｏｌｅｒａｎｓ）及びクルイベロミセス・マルキアヌス（Ｋ．ｍａｒｘｉａｎｕｓ）；ヤロウィア（ｙａｒｒｏｗｉａ）（ＥＰ ４０２，２２６）；ピキア・パストリス（ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）（ＥＰ １８３，０７０）；カンジダ属（Ｃａｎｄｉｄａ）；トリコデルマ・レーシア（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｉａ）（ＥＰ ２４４，２３４）；ニューロスポラ・クラッサ（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ ｃｒａｓｓａ）；シュワニオミセス属（ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ）、例えば、シュワニオミセス・オクシデンタリス（ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｉｓ）；並びに、糸状菌、例えばアカパンカビ属（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ）、ペニシリウム属（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ）、トリポクラジウム属（Ｔｏｌｙｐｏｃｌａｄｉｕｍ）、及びアスペルギルス属宿主、例えばアスペルギルス・ニジュランス（Ａ．ｎｉｄｕｌａｎｓ）及びアスペルギルス・ニガー（Ａ．ｎｉｇｅｒ）などの、多くの他の属、種及び菌株は、通常、入手可能で且つ本発明に使用可能である。
本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体を発現するための他の適切な宿主細胞は、多細胞生物に由来する。無脊椎動物細胞の例としては、植物及び昆虫細胞を含む。現在、ツマジロクサヨトウ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ Ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ，毛虫）、ネッタイシマカ（Ａｅｄｅｓ ａｅｇｙｐｔｉ，蚊）、ヒトスジシマカ（Ａｅｄｅｓ ａｌｂｏｐｉｃｔｕｓ，蚊）、キイロショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ ｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ）及びカイコ（Ｂｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ）といった宿主から多くのバキュロウイルス株及び変異体並びに対応する許容型昆虫宿主細胞が同定された。オートグラファ・カリフォルニカ（Ａｕｔｏｇｒａｐｈａ ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ）ＮＰＶのＬ－１変異体及びカイコＮＰＶのＢｍ－５株などのトランスフェクションに使用される各種のウイルス株は、公的に入手可能であり、且つ、本開示によれば、これらのウイルスは、ＣＬＤＮ１８．２抗体が適切な宿主細胞において発現される場合のトランスフェクションプロセス、特にツマジロクサヨトウ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ）細胞のトランスフェクションに使用可能である。綿、トウモロコシ、ジャガイモ、大豆、ペチュニア、トマト及びタバコの植物細胞培養物も、宿主として使用可能である。
本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体の産生に用いられる前記ベクターで宿主細胞を形質転換し、プロモーターの誘導、形質転換体の選択又は所望の配列をコードする遺伝子の増幅に用いられる、必要に応じて改変された通常の栄養培地で培養する。
本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体を産生するための宿主細胞は、各種の培地で培養することができる。Ｈａｍ’ｓ Ｆ１０（Ｓｉｇｍａ）、Ｍｉｎｉｍａｌ Ｅｓｓｅｎｔｉａｌ Ｍｅｄｉｕｍ（ＭＥＭ）、（Ｓｉｇｍａ）、ＲＰＭＩ－１６４０（Ｓｉｇｍａ）及びＤｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ Ｍｏｄｉｆｉｅｄ Ｅａｇｌｅ’ｓ Ｍｅｄｉｕｍ（ＤＭＥＭ，Ｓｉｇｍａ）といった市販されている培地は、宿主細胞の培養に適する。また、Ｈａｍら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．５８：４４（１９７９），Ｂａｒｎｅｓｒら，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１０２：２５５（１９８０），Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．４，７６７，７０４、４，６５７，８６６、４，９２７，７６２、４，５６０，６５５、又は５，１２２，４６９；ＷＯ ９０／０３４３０、ＷＯ ８７／００１９５、又はＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｒｅ．３０，９８５に記載された任意の培地は、宿主細胞の培地として使用可能である。必要に応じて、ホルモン及び／又は他の成長因子（例えば、インスリン、トランスフェリン又は上皮成長因子）、塩（例えば、塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム及びリン酸塩）、緩衝液（例えば、ＨＥＰＥＳ）、ヌクレオチド（例えば、アデノシン及びチミジン）、抗生物質（例えば、ＧＥＮＴＡＭＹＣＩＮ薬物）、微量元素（無機化合物として定義され、通常、マイクロモル範囲内の最終濃度で存在する）、及びグルコース又は等価エネルギー源をこれらの任意の培地に添加することができる。任意の他の必要なサプリメントも、当業者に知られている適切な濃度で含まれてよい。温度、ｐＨなどの培養条件は、発現のために以前に選択された宿主細胞と共に使用されたものであり、且つ当業者にとって明らかである。
組換え技術を使用する場合、抗体は、細胞内において、ペリプラズム空間に産生することができ、又は培地に直接分泌することができる。抗体が細胞内に産生されると、最初のステップとして、例えば遠心分離又は限外濾過によって微粒子破片（宿主細胞又は溶解断片）を除去する。Ｃａｒｔｅｒら，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：１６３－１６７（１９９２）には、大腸菌のペリプラズム空間に分泌される抗体の単離方法が記載されている。簡潔に言えば、約３０分以内に、酢酸ナトリウム（ｐＨ ３．５）、ＥＤＴＡ及びフェニルメタンスルホニルフルオリド（ＰＭＳＦ）の存在下で細胞を融解させる。細胞破片は、遠心分離によって除去することができる。抗体が培地に分泌された場合、通常、まず、Ａｍｉｃｏｎ又はＭｉｌｌｉｐｏｒｅ Ｐｅｌｌｉｃｏｎ限外濾過ユニットなどの市販されているタンパク質濃縮フィルタによりこの発現系からの上清を濃縮する。ＰＭＳＦなどのプロテアーゼ阻害剤は、タンパク質分解を阻害するために前記ステップのいずれに含まれてもよく、外来性の汚染物の成長を防止するために抗生物質を含んでもよい。
例えばヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、ＤＥＡＥ－セルロースイオン交換クロマトグラフィー、硫酸アンモニウム沈殿、塩析及びアフィニティークロマトグラフィーを用いて細胞から調製された抗体を精製することができ、アフィニティークロマトグラフィーは、好ましい精製技術である。
任意の予備精製ステップの後、目的抗体及び汚染物を含む混合物に対してｐＨが約２．５～４．５の間の溶出緩衝液で低ｐＨ疎水性相互作用クロマトグラフィーを行うことができ、低塩濃度（例えば約０～０．２５Ｍの塩）で行うことが好ましい。
薬物組成物
いくつかの態様において、本発明は、少なくとも１つの本明細書に開示されたＣＬＤＮ１８．２結合分子（例えば、本開示のＣＬＤＮ１８．２抗体）及び薬学的に許容されるベクターを含む薬物組成物に関する。
薬物組成物の成分
薬物組成物は、任意選択的に、別の抗体又は薬物などの１つ又は複数の追加の薬物有効成分を含み得る。本発明の薬物組成物は、更に、抗ＣＬＤＮ１８．２抗体のワクチンに対する免疫反応を補強するように、例えば別の免疫刺激剤、抗癌剤、抗ウイルス剤又はワクチンと組み合わせて投与することができる。薬学的に許容されるベクターは、例えば、薬学的に許容される液体、ゲル又は固体のベクター、水性媒体、非水性媒体、抗微生物剤、等張化剤、緩衝剤、酸化防止剤、麻酔薬、懸濁／分散剤、キレート剤、希釈剤、アジュバント、賦形剤又は無毒の補助物質、当分野で知られている各種の成分の組み合わせ又はより多くのものを含み得る。
適切な成分は、例えば、酸化防止剤、充填剤、バインダー、崩壊剤、緩衝剤、防腐剤、滑沢剤、香味料、増粘剤、着色剤、乳化剤又は糖及びシクロデキストリンなどの安定剤を含み得る。適切な酸化防止剤は、例えば、メチオニン、アスコルビン酸、ＥＤＴＡ、チオ硫酸ナトリウム、白金、カタラーゼ、クエン酸、システイン、メルカプトグリセロール、チオグリコール酸、メルカプトソルビトール、ブチルメチルアニソール、ブチル化ヒドロキシトルエン及び／又はプロピルヒ酸塩を含み得る。本発明に開示されるように、抗体又はその抗原結合断片を還元するメチオニンなどの１つ又は複数の酸化防止剤を含む、本発明に開示された組成物の抗体又は抗原結合断片を含有する溶媒において、抗体又は抗原結合断片が酸化されてよい。酸化還元は、結合親和性の低下を防止又は低減し、抗体の安定性を向上させるとともに保存期間を延長することができる。従って、いくつかの実施形態において、本発明は、１つ又は複数の抗体又はその抗原結合断片及びメチオニンなどの１つ又は複数の酸化防止剤を含む組成物を提供する。本発明は、抗体又はその抗原結合断片とメチオニンなどの１つ又は複数の酸化防止剤を混合する多くの方法を更に提供する。それにより、抗体又はその抗原結合断片は、その酸化が防止され、保存期間を延長し、及び／又は活性を増加することができる。
更に説明するために、薬学的に許容されるベクターは、例えば、塩化ナトリウム注射液、リンゲル注射液、等張デキストロース注射液、滅菌水注射液又はデキストロース及び乳酸リンゲル注射液などの水性ベクター、植物由来の不揮発性油、綿実油、トウモロコシ油、ゴマ油又はピーナッツ油などの非水性ベクター、静菌剤又は静真菌濃度の抗微生物剤、塩化ナトリウム又はグルコースなどの等張化剤、リン酸塩又はクエン酸塩緩衝剤などの緩衝剤、硫酸水素ナトリウムなどの酸化防止剤、塩酸プロカインなどの局所麻酔剤、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ヒドロキシプロピルメチルセルロース又はポリビニルピロリドンなどの懸濁剤及び分散剤、ポリソルベート８０（ＴＷＥＥＮ（登録商標）８０）などの乳化剤、ＥＤＴＡ（エチレンジアミン四酢酸）又はＥＧＴＡ（エチレングリコール四酢酸）、エタノール、ポリエチレングリコール、プロピレングリコール、水酸化ナトリウム、塩酸、クエン酸又は乳酸などのキレート剤を含み得る。ベクターとしての抗微生物剤は、フェノール又はクレゾール、水銀製剤、ベンジルアルコール、クロロブタノール、メチルパラベン及びプロピルパラベン、チメロサール、塩化ベンザルコニウム及び塩化ベンゼトニウムを含む多回投与容器における薬物組成物に添加することができる。適切な賦形剤は、例えば、水、生理食塩水、デキストロース、グリセリン又はエタノールを含み得る。適切な无毒の補助物質は、例えば、湿潤剤又は乳化剤、ｐＨ緩衝剤、安定剤、溶解増強剤又は酢酸ナトリウム、ソルビタンモノラウレート、トリエタノールアミンオレエート又はシクロデキストリンの試薬を含み得る。
投与、製剤及び用量
本発明の薬物組成物は、種々の経路を介して必要のある被験者にインビボで投与することができ、前記経路は、経口、静脈内、動脈内、皮下、非経口、鼻腔内、筋肉内、頭蓋内、心臓内、心室内、気管内、口腔、直腸、腹腔内、皮内、局所、経皮及び髄腔内、又は植込み又は吸入を含むが、これらに限定されない。本発明の薬物組成物は、固体、半固体、液体又はガス形態の製剤に調製されてよく、錠剤、カプセル剤、粉剤、顆粒剤、軟膏剤、溶液剤、坐剤、浣腸剤、注射剤、吸入剤及びエアロゾルを含むが、これらに限定されない。所期の応用及び治療レジメンに応じて適切な製剤及び投与経路を選択することができる。
腸内投与用の適切な製剤は、硬又は軟ゼラチンカプセル、ピル、被覆錠剤を含む錠剤、エリキシル剤、懸濁剤、シロップ剤又は吸入剤及びその徐放性製剤を含む。
非経口投与（例えば注射による）に適する製剤は、有効成分が溶解し、その中に懸濁するか又は他の方式で提供される（例えば、リポソーム又は他の微粒子に）水性又は非水性で、等張性で、発熱物質を含まない無菌液体（例えば溶液、懸濁剤）を含む。これらの液体は、酸化防止剤、緩衝剤、防腐剤、安定剤、静菌剤、懸濁剤、増粘剤及び製剤を対象受容者の血液（又は他の関連する体液）と等張化させる溶質などの、他の薬学的に許容される成分を更に含み得る。賦形剤の例は、例えば、水、アルコール、ポリオール、グリセリン、植物油などを含む。このような製剤に適する等張ビヒクルの例は、塩化ナトリウム注射液、リンゲル液又は乳酸リンゲル注射液を含む。同様に、特定の用量レジメン（即ち、用量、時間及び反復は、特定の個人及び個人の病歴、並びに薬物動態（例えば、半減期、クリアランス率など）といった経験的考慮事項によって決定される。
投与頻度は、治療プロセスにおいて決定して調節することができ、且つ増殖又は腫瘍形成性細胞の数の減少に基づき、このような腫瘍細胞の減少を維持し、腫瘍細胞の増殖を減少するか又は転移の進行を遅延させる。いくつかの実施形態において、投与の用量は、潜在的な副作用及び／又は毒性を制御するために調節したり減少したりすることができる。又は、本発明の治療用の薬物組成物の持続的な連続放出製剤が適切である場合がある。
当業者であれば、適切な用量は、患者によって異なってよいことが理解される。通常、治療効果のレベルと任意のリスク又は有害な副作用とのバランスを考えながら、最適な用量を決定する。選択される用量レベルは、特定の化合物の活性、投与、投与時間、化合物クリアランス速度、治療持続時間、組み合わせて使用される他の薬物、化合物及び／又は材料、病症の重症度、及び種、患者の性別、年齢、体重、病態、一般的な健康状態及び以前の病歴を含む多くの要因によるが、これらに限定されない。化合物の量及び投与経路は、最終的に医師、獣医又は臨床医によって決定されるが、通常、用量は、実質的な有害又は不利な副作用を引き起こすことなく、所望の効果を達成する作用位置での局所濃度に達するように選択される。
通常、ＣＬＤＮ１８．２結合分子は、各種の用量範囲で投与することができる。いくつかの実施形態において、本明細書により提供されるＣＬＤＮ１８．２結合分子は、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約１００ｍｇ／ｋｇ（例えば、約０．０１ｍｇ／ｋｇ、約０．５ｍｇ／ｋｇ、約１ｍｇ／ｋｇ、約２ｍｇ／ｋｇ、約５ｍｇ／ｋｇ、約１０ｍｇ／ｋｇ、約１５ｍｇ／ｋｇ、約２０ｍｇ／ｋｇ、約２５ｍｇ／ｋｇ、約３０ｍｇ／ｋｇ、約３５ｍｇ／ｋｇ、約４０ｍｇ／ｋｇ、約４５ｍｇ／ｋｇ、約５０ｍｇ／ｋｇ、約５５ｍｇ／ｋｇ、約６０ｍｇ／ｋｇ、約６５ｍｇ／ｋｇ、約７０ｍｇ／ｋｇ、約７５ｍｇ／ｋｇ、約８０ｍｇ／ｋｇ、約８５ｍｇ／ｋｇ、約９０ｍｇ／ｋｇ、約９５ｍｇ／ｋｇ、又は約１００ｍｇ／ｋｇ）の治療有効量で投与することができる。これらの実施形態のいくつかにおいて、抗体は、約５０ｍｇ／ｋｇ以下の用量で投与され、且つ、これらの実施形態のいくつかにおいて、用量は、１０ｍｇ／ｋｇ以下、５ｍｇ／ｋｇ以下、１ｍｇ／ｋｇ以下、０．５ｍｇ／ｋｇ以下、又は０．１ｍｇ／ｋｇ以下である。いくつかの実施形態において、投与用量は、治療プロセスで変更することができる。例えば、いくつかの実施形態において、初期の投与用量は、後続の投与用量よりも大きくてもよい。いくつかの実施形態において、被験者の反応により、投与用量を治療プロセスで変更することができる。
とにかく、本発明の抗体又はその抗原結合部分は、必要に応じて必要のある被験者に投与されることが好ましい。当業者であれば、投与頻度を決定することができ、例えば、主治医は、治療される病症、治療される被験者の年齢、治療される病症の重症度、治療される被験者の一般的な健康状態などに基づいて考慮する。
いくつかの好ましい実施形態において、本発明の抗体又はその抗原結合部分に関する治療プロセスは、数週間又は数ヶ月の期間にわたって多回投与型の選択された薬物製品を投与することを含む。より具体的には、本発明の抗体又はその抗原結合部分は、毎日、２日ごと、４日ごと、毎週、１０日ごと、２週間ごと、３週間ごと、毎月、６週間ごと、２ヶ月ごと、１０週間ごと又は３ヶ月ごとに投与することができる。これに関して、患者の応答及び臨床診療に基づいて用量を変更したり間隔を調整したりすることができることが理解される。
一回又は複数回の投与を行う個体に対して、開示された治療に使用される薬物組成物の用量及びレジメンを経験的に決定することもできる。例えば、個体に本明細書に記載された薬物組成物を増量投与することができる。選択された実施形態において、用量は、それぞれ経験的に決定され、又は観察された副作用又は毒性に基づいて徐々に増加又は減少することができる。選択された組成物の効果を評価するために、特定の疾患、病症又は病態のマーカーを追跡することができる。癌に対して、これらは、触診又は目視観察による腫瘍の大きさの直接測定、Ｘ線又は他のイメージング技術による腫瘍の大きさの間接測定、直接腫瘍生検及び顕微鏡検査による腫瘍サンプルの評価の改善、本明細書に記載された方法に基づいて同定された間接腫瘍マーカー（例えば前立腺癌に使用されるＰＳＡ）又は腫瘍形成性抗原、痛みや麻痺の減少の測定、腫瘍に関する言語、視力、呼吸又は他の機能障害の改善、食欲の増加、又は受けた試験により測定された生活の質の向上又は生存期間の延長を含む。当業者であれば、用量は、個体、腫瘍病態のタイプ、腫瘍病態の階段、腫瘍病態が個体の他の位置に転移し始めたか否か、並びに、過去に使用された治療及び並行して使用される治療によって変化することを理解できる。
非経口投与（例えば静脉内注射）に使用される製剤は、濃度が約１０μｇ／ｍｌ～約１００ｍｇ／ｍｌの本明細書に提供されるＣＬＤＮ１８．２結合分子を含み得る。いくつかの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２結合分子の濃度は、２０μｇ／ｍｌ、４０μｇ／ｍｌ、６０μｇ／ｍｌ、８０μｇ／ｍｌ、１００μｇ／ｍｌ、２００μｇ／ｍｌ、３００μｇ／ｍｌ、４００μｇ／ｍｌ、５００μｇ／ｍｌ、６００μｇ／ｍｌ、７００μｇ／ｍｌ、８００μｇ／ｍｌ、９００μｇ／ｍｌ又は１ｍｇ／ｍｌを含み得る。他の好ましい実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２結合分子の濃度は、２ｍｇ／ｍｌ、３ｍｇ／ｍｌ、４ｍｇ／ｍｌ、５ｍｇ／ｍｌ、６ｍｇ／ｍｌ、８ｍｇ／ｍｌ、１０ｍｇ／ｍｌ、１２ｍｇ／ｍｌ、１４ｍｇ／ｍｌ、１６ｍｇ／ｍｌ、１８ｍｇ／ｍｌ、２０ｍｇ／ｍｌ、２５ｍｇ／ｍｌ、３０ｍｇ／ｍｌ、３５ｍｇ／ｍｌ、４０ｍｇ／ｍｌ、４５ｍｇ／ｍｌ、５０ｍｇ／ｍｌ、６０ｍｇ／ｍｌ、７０ｍｇ／ｍｌ、８０ｍｇ／ｍｌ、９０ｍｇ／ｍｌ又は１００ｍｇ／ｍｌを含む。モル濃度に基づいて計算すれば、いくつかの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２結合分子の濃度は、例えば、１３３ｎＭ、２６６ｎＭ、４００ｎＭ、５３３ｎＭ、６６７ｎＭ、１．３μＭ、２μＭ、２．６７μＭ、３．３３μＭ、４μＭ、４．６７μＭ、５．３３μＭ、６μＭ又は６．６７μＭを含み得る。
本発明の応用
本発明のＣＬＤＮ１８．２結合分子は、多くのインビトロ及びインビボの用途を有する。
疾患の治療
ＣＬＤＮ１８．２に関連する病症及び障害は、免疫に関連する疾患又は病症であってよく、「ＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞が関与する疾患」又は「ＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞に関連する疾患」又は類似する表現を含むが、これらに限定されず、ＣＬＤＮ１８．２の罹患組織又は器官の細胞での発現を意味する。１つの実施形態において、対応する健康な組織又は器官における状態と比べ、ＣＬＤＮ１８．２の罹患組織又は器官の細胞での発現が増加する。増加は、少なくとも１０％、特に少なくとも２０％、少なくとも５０％、少なくとも１００％、少なくとも２００％、少なくとも５００％、少なくとも１０００％、少なくとも１００００％又はそれ以上の増加を意味する。１つの実施形態において、発現は、罹患組織のみで見られ、対応する健康な組織での発現が阻害される。本発明によれば、ＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞に関連する疾患は、癌疾患を含む。また、本発明によれば、癌疾患は、癌細胞がＣＬＤＮ１８．２を発現する疾患であることが好ましい。
「癌疾患」又は「癌」という用語は、個体で通常、無秩序な細胞成長を特徴とする生理的状態を指すか又は説明する。癌の例は、上皮癌、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫及び白血病を含むが、これらに限定されない。より具体的には、このような癌の例は、骨癌、血液癌、肺癌、肝臓癌、膵臓癌、皮膚癌、頭頸部癌、皮膚又は眼内黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門部癌、胃癌、結腸癌、乳癌、前立腺癌、性器及び生殖器の癌、ホジキン病（Ｈｏｄｇｋｉｎ′ｓ Ｄｉｓｅａｓｅ）、食道癌、小腸癌、内分泌系癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟組織肉腫、膀胱癌、腎臓癌、腎細胞癌、腎盂癌、中枢神経系（ＣＮＳ）腫瘍、神経外胚葉癌、脊髄軸腫瘍、神経膠腫、髄膜腫及び下垂体腺腫を含む。本発明の「癌」という用語は、癌転移を更に含む。好ましくは、「癌疾患」は、ＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞、及び癌細胞によるＣＬＤＮ１８．２の発現を特徴とする。ＣＬＤＮ１８．２を発現する細胞は、好ましくは、癌細胞であり、好ましくは、本明細書に記載された癌の癌細胞である。
本開示によれば、「腫瘍」又は「腫瘍疾患」という用語は、細胞（新生物細胞、腫瘍形成性細胞又は腫瘍細胞と呼ばれる）の異常な成長、好ましくは、腫脹又は病変の形成を指す。「腫瘍細胞」は、急速な無制御の細胞増殖によって成長するとともに新たな成長を誘導する刺激が中断した後にも成長し続ける異常細胞を指す。腫瘍は、構造的組織及び正常組織との機能的協調の部分的又は完全な欠失を示し、通常、良性、前悪性又は悪性である可能性のある特別な組織塊を形成する。本発明によれば、「癌疾患」は、「腫瘍疾患」であることが好ましい。しかしながら、通常、「癌」及び「腫瘍」という用語は、本明細書において交換して使用することができる。
１つの実施形態において、本開示による癌は、ＣＬＤＮ１８．２を発現する癌細胞に関する。１つの実施形態において、癌は、ＣＬＤＮ１８．２陽性である。１つの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２は、細胞の表面において発現される。１つの実施形態において、少なくとも５０％、好ましくは６０％、７０％、８０％又は９０％の癌細胞は、ＣＬＤＮ１８．２陽性であり、及び／又は、少なくとも４０％、好ましくは少なくとも５０％の癌細胞は、ＣＬＤＮ１８．２の表面発現に対して陽性である。１つの実施形態において、少なくとも９５％又は少なくとも９８％の癌細胞は、ＣＬＤＮ１８．２陽性である。１つの実施形態において、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％又は少なくとも９０％の癌細胞は、ＣＬＤＮ１８．２の表面発現に対して陽性である。
１つの実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２を発現する癌、ＣＬＤＮ１８．２を発現する癌細胞の癌又はＣＬＤＮ１８．２陽性癌は、胃癌、食道癌、膵臓癌、肺癌（例えば非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ））、卵巣癌、結腸癌、肝臓癌、頭頸部癌及び胆嚢癌、及びそれらの転移、特に胃癌転移（例えばクルーケンベルグ腫瘍）、腹膜転移及びリンパ節転移から選択される。１つの実施形態において、癌は、腺癌、特に進行した腺癌である。特に好ましい癌疾患は、胃、食道、膵管、胆管、肺及び卵巣の腺癌である。１つの実施形態において、癌は、胃癌、食道癌（特に下部食道癌）、食道－胃接合部癌及び胃食道癌から選択される。１つの特に好ましい実施形態において、癌は、胃食道癌であり、例えば転移性、難治性又は再発性の進行した胃食道癌である。
なお、本開示の抗体又はその抗原結合部分は、化学療法又は放射線療法と組み合わせて使用することができる。
化学療法との組み合わせ使用
抗体又はその抗原結合部分は、抗癌剤、細胞毒性剤又は化学療法剤と組み合わせて使用することができる。
「抗癌剤」又は「抗増殖剤」という用語は、癌などの細胞増殖性障害の治療に使用可能な如何なる薬剤を指し、細胞毒性剤、細胞阻害剤、抗血管新生剤、放射線療法と放射線療法剤、標的抗癌剤、ＢＲＭ、治療用抗体、癌ワクチン、サイトカイン、ホルモン療法と抗転移剤及び免疫療法剤を含むが、これらに限定されない。上記の選択された実施形態において、このような抗癌剤は、コンジュゲートを含んでもよく、且つ投与前に開示された部位特異的抗体に結合してもよいことを理解すべきである。より具体的には、いくつかの実施形態において、選択された抗癌剤を操作された抗体の対になっていないシステインに連結し、本明細書に記載されたような操作されたコンジュゲートを提供する。従って、このような操作されたコンジュゲートは、本発明の範囲内にあることが明確に考慮されている。他の実施形態において、開示された抗癌剤は、上記の異なる治療剤を含む部位特異的コンジュゲートと組み合わせて投与される。
本明細書で使用される「細胞毒性剤」という用語は、細胞に対して毒性があり、且つ細胞機能を低下させたり阻害したりし、及び／又は細胞破壊を引き起こす物質を指す。いくつかの実施形態において、当該物質は、生きている生物に由来する天然に存在する分子である。細胞毒性剤の例は、細菌（例えば、ジフテリア毒素、シュードモナス内毒素及び外毒素、ブドウ球菌エンテロトキシンＡ）、真菌（例えばアルファサルシン及びレストリクトシン）、植物（アブリン、リシン、モデシン、ビスクミン、アメリカヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、サポリン、ゲロニン、モモルジン（ｍｏｍｏｒｉｄｉｎ）、トリコサンチン、オオムギ毒素、シナアブラギリ（Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉ）タンパク質、ジアンチンタンパク質、ヨウシュヤマゴボウ（Ｐｈｙｔｏｌａｃｃａ ｍｅｒｉｃａｎａ）タンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ及びＰＡＰ－Ｓ）、ニガウリ阻害剤、クルシン、クロチン、サボンソウ阻害剤、ミテゲリン（ｍｉｔｅｇｅｌｌｉｎ）、フェノマイシン、ネオマイシン及びトリコテセン）、動物（例えば、その断片及び／又は変異体を含む、細胞外膵臓ＲＮアーゼなどの細胞毒性ＲＮアーゼ、ＤＮアーゼＩ）の低分子毒素又は酵素的活性毒素を含むが、これらに限定されない。
本発明の目的のために、「化学療法剤」は、癌細胞の成長、増殖及び／又は生存を非特異的に低下させるか又は阻害する化学的化合物（例えば細胞毒性剤又は細胞阻害剤）を含む。これらの化学試薬は、通常、細胞成長又は分裂に必要な細胞内プロセスを対象とするため、一般的に急速に成長及び分裂する癌細胞に対して特に有効である。例えば、ビンクリスチンにより微小管を解重合させ、細胞が有糸分裂に入ることを阻害する。通常、化学療法剤は、癌細胞又は癌性になる可能性のある細胞又は腫瘍形成生後代（例えばＴＩＣ）を産生する細胞を阻害するか又は阻害するように設計された、任意の化学薬品を含み得る。これらの薬剤は、通常、組み合わせて使用され、例えば、ＣＨＯＰ又はＦＯＬＦＩＲＩなどのレジメンで、通常、最も有効である。
本発明の部位特異的構築物と組み合わせて使用できる抗癌剤（部位特異的コンジュゲートの成分として、又は非コンジュゲート状態）の例は、アルキル化剤、アルカンスルホン酸塩、アジリジン、エチレンイミン及びメチルメラミン、アセトゲニン（ａｃｅｔｏｇｅｎｉｎｓ）、カンプトテシン、ブリオスタチン、カリスタチン（ｃａｌｌｙｓｔａｔｉｎ）、ＣＣ－１０６５、クリプトフィシン（ｃｒｙｐｔｏｐｈｙｃｉｎｓ）、ドラスタチン、デュオカルマイシン、エリュテロビン（ｅｌｅｕｔｈｅｒｏｂｉｎ）、パンクラチスタチン、サルコジクチン（ｓａｒｃｏｄｉｃｔｙｉｎ）、スポンジスタチン（ｓｐｏｎｇｉｓｔａｔｉｎ）、ナイトロジェンマスタード、抗生物質、エンジイン類抗生物質、ダイネミシン（ｄｙｎｅｍｉｃｉｎ）、ビスホスホネート、エスペラミシン、色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団、アクラシノマイシン類（ａｃｌａｃｉｎｏｍｙｓｉｎｓ）、アクチノマイシン、アントラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、アクチノマイシンＣ、カラビシン（ｃａｒａｂｉｃｉｎ）、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシニス類（ｃｈｒｏｍｏｍｙｃｉｎｉｓ）、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、６－ジアゾ－５－オキソ－Ｌ－ノルロイシン、ＡＤＲＩＡＭＹＣＩＮ（登録商標）ドキソルビシン、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン（ｐｏｔｆｉｒｏｍｙｃｉｎ）、ピューロマイシン、ケラマイシン（ｑｕｅｌａｍｙｃｉｎ）、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン；代謝拮抗物質、エルロチニブ、ベムラフェニブ、クリゾチニブ、ソラフェニブ、イブルチニブ、エンザルタミド、葉酸類似体、プリン類縁体、アンドロゲン、抗アドレナリン、フォリン酸（ｆｒｏｌｉｎｉｃ ａｃｉｄ）などの葉酸補充薬、アセグラトン、アルドホスファミドグリコシド、アミノレブリン酸、エニルウラシル、アムサクリン、ベストラブシル（ｂｅｓｔｒａｂｕｃｉｌ）、ビサントレン、エダトレキサート、デフォファミン（ｄｅｆｏｆａｍｉｎｅ）、デメコルチン、ジアジクオン、エフロルニチン（ｅｌｆｏｒｎｉｔｈｉｎｅ）、酢酸エリプチニウム、エポチロン、エトグルシド、硝酸ガリウム、ヒドロキシウレア、レンチナン、ロニダミン、マイタンシノイド（ｍａｙｔａｎｓｉｎｏｉｄｓ）、ミトグアゾン、ミトキサントロン、モピダンモール（ｍｏｐｉｄａｎｍｏｌ）、ニトラエリン（ｎｉｔｒａｅｒｉｎｅ）、ペントスタチン、フェナメット、ピラルビシン、ロソキサントロン、ポドフィリン酸、２－エチルヒドラジン、プロカルバジン、ＰＳＫ（登録商標）多糖複合体（ＪＨＳ Ｎａｔｕｒａｌ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ，Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ）、ラゾキサン；リゾキシン；シゾフィラン；スピロゲルマニウム；テヌアゾン酸；トリアジクオン；２，２’，２’’－トリクロロエチルアミン；トリコテセン（特にＴ－２トキシン、ベラキュリンＡ（ｖｅｒｒａｃｕｒｉｎ Ａ）、バシロスポリンＡ及びジアセトキシスシルペノール）；ウレタン；ビンデシン；ダカルバジン；マンノムスチン；ミトブロニトール；ミトラクトール；ピポブロマン；ガシ卜シン（ｇａｃｙｔｏｓｉｎｅ）；アラビノシド（「Ａｒａ－Ｃ」）；シクロホスファミド；チオテパ；タキサン類；クロランブシル（ｃｈｌｏｒａｎｂｕｃｉｌ）；ＧＥＭＺＡＲ（登録商標）ゲムシタビン；６－チオグアニン；メルカプトプリン；メトトレキサート；白金類似体；ビンブラスチン；白金；エトポシド（ＶＰ－１６）；イホスファミド；ミトキサントロン；ビンクリスチン、ＮＡＶＥＬＢＩＮＥ（登録商標）ビノレルビン；ノバントロン；テニポシド；エダトレキサート；ダウノルビシン；アミノプテリン；ゼローダ；イバンドロネート；イリノテカン（Ｃａｍｐｔｏｓａｒ，ＣＰＴ－１１）；トポイソメラーゼ阻害剤ＲＦＳ ２０００；ジフルオロメチルオルニチン；レチノイド；カペシタビン；コンブレタスタチン；ロイコボリン；オキサリプラチン；ＰＫＣ－α、Ｒａｆ、Ｈ－Ｒａｓ、ＥＧＦＲ及びＶＥＧＦ－Ａの阻害剤（細胞増殖を減少する）、及び上述の何れかの薬学的に許容される塩、酸又は誘導体を含むが、これらに限定されない。この定義には、抗エストロゲン及び選択的エストロゲン受容体モジュレーター、副腎中のエストロゲンの産生を調節するアロマターゼを阻害するアロマターゼ阻害剤、抗アンドロゲンなどの、腫瘍に対するホルモン作用を調節又は阻害するための抗ホルモン剤；及びトロキサシタビン（１，３－ジオキソランヌクレオシドシトシン類似体）；アンチセンスオリゴヌクレオチド、ＶＥＧＦ発現阻害剤及びＨＥＲ２発現阻害剤などのリボザイム、ワクチン、ＰＲＯＬＥＵＫＩＮ（登録商標） ｒＩＬ－２；ＬＵＲＴＯＴＥＣＡＮ（登録商標）トポイソメラーゼ１阻害剤、ＡＢＡＲＥＬＩＸ（登録商標） ｒｍＲＨ；ビノレルビン及びエスペラミシン、並びに上記の何れかの薬学的に許容される塩、酸又は誘導体が更に含まれる。
放射線療法との組み合わせ使用
本発明は、抗体又はその抗原結合部分と放射線療法（即ち、例えば、γ線照射、Ｘ線、ＵＶ照射、マイクロ波、電子放出などの、腫瘍細胞においてＤＮＡ損傷を局所的に誘導する任意のメカニズム）との組み合わせを更に提供する。腫瘍細胞への放射性同位体の標的化送達を使用する併用療法も考慮され、且つ開示されたコンジュゲートは、標的化抗癌剤又は他の標的化手段と組み合わせて使用することができる。通常、放射線療法は、約１週間～約２週間の期間にわたってパルスで投与される。放射線療法は、頭頸部癌に罹患する被験者に約６～７週間投与することができる。任意選択的に、放射線療法は、単回投与又は複数回の連続投与を行うことができる。
診断
本発明は、増殖性疾患の検出、診断及び監視に用いられるインビトロ及びインビボ方法、及び患者からの細胞をスクリーニングして腫瘍形成性細胞を含む腫瘍細胞を同定する方法を提供する。前記方法は、治療を必要とする、癌に罹患している個体を同定したり癌の進行を監視したりすることを含み、患者又は患者から得られたサンプル（インビトロ又はインビボ）を本明細書に記載された抗体に接触させるとともに、サンプルにおける結合又は遊離した標的分子に結合する抗体の有無又は結合レベルを検出することを含む。いくつかの実施形態において、抗体は、検出可能なマーカー又はレポーター分子を含む。
いくつかの実施形態において、抗体とサンプルにおける特定の細胞との結合は、サンプルに腫瘍形成性細胞を含む可能性があることを示すことができ、癌を有する個体を本明細書に記載された抗体を用いて効果的に治療できることが証明される。
放射免疫測定法、酵素免疫測定法（例えばＥＬＩＳＡ）、競合結合測定法、蛍光免疫測定法、免疫ブロット測定法、Ｗｅｓｔｅｒｎブロット解析及びフローサイトメトリー測定法などの、多くの測定法によってサンプルを解析することができる。適合性を有するインビボ診断又は診断測定は、例えば、当業者に知られている磁気共鳴イメージング、コンピュータ断層撮影（例えばＣＡＴスキャン）、陽電子断層撮影（例えばＰＥＴスキャン）、放射線写真術、超音波などの、当分野で公知のイメージング又は監視技術を含み得る。
薬物パック及びキット
本発明は、１つ又は複数の用量の抗体又はその抗原結合部分を含む１つ又は複数の容器の薬物パック及びキットを更に提供する。いくつかの実施形態において、所定量の組成物を含有する単位用量を提供し、前記組成物は、例えば、１つ又は複数の他の試薬を伴うか伴わない抗体又はその抗原結合部分を含む。他の実施形態に対して、この単位用量は、使い捨てのプレフィルド注射用注射器によって供給される。他の実施形態において、単位用量に含まれる組成物は、生理食塩水、スクロース又は類似体、リン酸塩などの緩衝液を含み、及び／又は安定且つ有効なｐＨ範囲に調製され得る。又は、いくつかの実施形態において、前記組成物は、コンジュゲート組成物であり、凍結乾燥粉末として提供され、且つ適切な液体（例えば滅菌水又は塩溶液）を加えると再構成することができる。容器上の又は容器に関連する任意のラベルは、封入されたコンジュゲート組成物が選択された腫瘍疾患を治療するために使用されることを指示する。いくつかの好ましい実施形態において、組成物は、タンパク質の凝集を阻害する１つ又は複数の物質を含み、この物質は、スクロース及びアルギニンを含むが、これらに限定されない。
本発明は、部位特異的コンジュゲート及び任意に１つ又は複数の抗癌剤の単回投与又は多回投与の投与単位を産生するためのキットを更に提供する。当該キットは、容器、及び容器上の又は容器に関連するラベル又は添付文書を含む。適切な容器は、例えば、ボトル、バイアル、注射器などを含む。容器は、例えばガラス又はプラスチックなどの各種の材料で形成されてよく、且つ、薬学的有効量の開示されたコンジュゲート形態又は非コンジュゲート形態のコンジュゲートを含む。他の好ましい実施例において、容器は、無菌アクセスポートを含む（例えば、容器は、静脈内溶液バッグ又は皮下注射針により穿刺可能な栓を有するバイアルであってよい）。このようなキットは、通常、適切な容器に操作されたコンジュゲートの薬学的に許容される製剤を含み、且つ、任意選択的に、同じ又は異なる容器に１つ又は複数の抗癌剤を含む。キットは、診断又は併用治療に用いられる、他の薬学的に許容される製剤を更に含有してもよい。例えば、本発明の抗体又はその抗原結合部分に加えて、このようなキットは、例えば化学療法剤又は放射線療法剤、抗血管新生剤、抗転移剤、標的抗癌剤、細胞毒性剤、及び／又は他の抗癌剤などの任意の１つ又は複数の抗癌剤を含んでもよい。
より具体的には、キットは、別の成分を含むか含まない、開示された抗体又はその抗原結合部分を含有する単一の容器を有してもよく、又は所望の試薬ごとに異なる容器を有してもよい。コンジュゲートに用いられる併用治療剤を提供する場合、モル当量で組み合わせるか、又は１つの成分が別の成分よりも多いように単一の溶液を予備混合することができる。又は、キットのコンジュゲート及び任意選択的な抗癌剤は、患者に投与される前に異なる容器に別々に保存することができる。キットは、注射用静菌水（ＢＷＦＩ）、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）、リンゲル液及びグルコース溶液などの、無菌の薬学的に許容される緩衝液又は他の希釈剤を収容するための第２／第３の容器装置を更に含んでもよい。
キットの成分が１つ又は複数の液体溶液として提供される場合、液体溶液は、好ましくは水溶液であり、特に好ましくは滅菌水溶液又は生理食塩水溶液である。しかしながら、キットの成分は、乾燥粉末として提供することができる。試薬又は成分が乾燥粉末として提供される場合、適切な溶媒を追加して粉末を再構成することができる。溶媒は、別の容器に提供されてもよいことが想定される。
上記に簡潔に説明されたように、前記キットは、１つ又は複数の針、Ｉ．Ｖ．バッグ又は注射器、又は、更に点眼器、ピペット又は他の類似する装置などの、患者に抗体又はその抗原結合部分及び任意選択な成分を投与する器具を更に含んでもよく、前記器具によって製剤を動物体内に注射又は導入するか、或いは、身体の疾患領域に適用することができる。本発明のキットは、通常、その中に所望のバイアル及び他の装置が置かれて保持される、注射又はブロー成形プラスチック容器などの、バイアル又は類似体を収容するための装置、及び市販のために密閉された他の部品を更に含む。
本発明のメリット
ＣＬＤＮ１８．２、特にヒトＣＬＤＮ１８．２に対する抗体の開発は、少なくとも以下のメリットを有する。
第１、ヒトＣＬＤＮ１８．２は、癌細胞において高度に発現されるが、正常細胞において、胃上皮細胞のみにおいて特異的に発現されるため、毒性及び副作用が低く、創薬可能性がより高い。
第２、ＣＬＤＮ１８．２は、胃上皮細胞の密着結合において発現され、抗体が緩んだ癌細胞に作用しにくく、上皮細胞が抗体によって殺傷されても、上皮細胞の下の幹細胞は、ＣＬＤＮ１８．２を発現しないため、分化して損傷された胃上皮細胞を補充することができる。
第３、ＣＬＤＮ１８．２に対する抗体は、ＡＤＣＣ及びＣＤＣを介して細胞を殺傷できるだけでなく、抗体をＣＬＤＮ１８．２と架橋させることで細胞のアポトーシスを媒介することもでき、且つ細胞の増殖をある程度阻害することができる。
これまで、ＣＬＮＤ１８．２に対するナノ抗体がまだなく、ナノ抗体は、新規な抗体として、販売が承認された抗体ｃａｐｌａｃｉｚｕｍａｂがあり、ナノ抗体の創薬可能性が十分に説明された。このような抗体は、他の抗体に対して顕著な利点を有し、例えば、その半減期の長さは、化学修飾又はタンパク質融合による改変によって調節することができ、浸透性が高く、一般的な抗体がアクセスできない潜在性エピトープを認識することができ、ペプシン耐性、耐酸性及び耐熱性を有し、製造しやすく、且つ、単鎖であるため、他のタイプの抗体と組み合わせてダイアボディ及び多価抗体としやすい。
本発明の一部の実施形態において、ＣＬＤＮ１８．２に対する抗体は、アルパカ免疫ライブラリーを通してスクリーニングして得られ、これに基づき、Ｃ末端はＩｇＧ１のＦｃ断片と融合し、現在、一部の候補抗体の細胞レベルでのＣＤＣ及びＡＤＣＣの実験結果は、いずれも対照抗体よりも良好な活性又は少なくとも同等の活性を示す。ＣＬＤＮ１８．２標的の特性と組み合わせ、この抗体は、癌の免疫療法に用いられ、より低い毒性及び副作用及びより優れた臨床的効力を有し、患者により多くの薬物の選択肢を提供する。
実施例
以下の実施例を参照しながら、本明細書で一般的に説明される本発明がより容易に理解され、これらの実施例は、例示として提供され、且つ本発明を制限することを意図するものではない。これらの実施例は、以下の実験が全ての実験又は実施された実験のみであることを表す旨ではない。
実施例１
過剰発現細胞株及び腫瘍細胞株の構築及び同定
本実施例において、それぞれ異なるタイプの過剰発現細胞株及び腫瘍細胞株を構築し、それらに対してフローサイトメトリーによる同定を行った。
１．過剰発現細胞株の構築及び同定
全長ヒトＣＬＤＮ１８．１（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６）、マウスＣＬＤＮ１８．２（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７）、マウスＣＬＤＮ１８．１（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８）の核酸配列をｐＬＶＸ－ｐｕｒｏプラスミド（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｃａｔ＃６３２１６４）に構築する。その後、得られたプラスミドをＨＥＫ２９３細胞（ＡＴＣＣ（登録商標） ＣＲＬ－１５７３（商標））に電気形質転換する。スクリーニングにより、全長ヒトＣＬＤＮ１８．１を発現する過剰発現細胞株（ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３）、マウスＣＬＤＮ１８．２を発現する過剰発現細胞株（マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３）及びマウスＣＬＤＮ１８．１を発現する過剰発現細胞株（マウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３）を得る。その後、ＩＭＡＢ３６２抗体（特許ＵＳ ２０１８０１２７４８９ Ａ１に開示された配列情報に基づいて発現し、精製して得られる）及びＣ末端ＣＬＤＮ１８細胞内セグメント（ＧＦＫＡＳＴＧＦＧＳＮＴＫＮ，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１）を認識する抗ＣＬＤＮ１８抗体［３４Ｈ１４Ｌ１５］（Ａｂｃａｍ，ａｂ２０３５６３）によってフローサイトメトリーによる同定を行い、形質転換に成功した過剰発現細胞株を得て、具体的な方法は、以下の通りである。
１．１ 電気形質転換
まず、ＨＥＫ２９３細胞を蘇生して培養し、２～３回連続継代し、トランスフェクションの１日前に細胞を３×１０５個／ｍＬの密度で細胞培養皿に接種し、翌日、細胞コンフルエンスが約７０％に達すると使用できる。体積百分率が０．２５％のＥＤＴＡを含有するＴｒｙｐｓｉｎ（Ｇｉｂｃｏ，２５２００－０７２）で細胞を２ｍｉｎ消化した後に細胞を収集し、常温、１００ｇで細胞を５ｍｉｎ遠心分離し、上清を捨てた後、１×ＤＰＢＳ（源培，Ｂ２１０）に細胞を再懸濁させてカウントし、５×１０６個の細胞を遠心分離して收集し、２５０μＬのＢｕｆｆｅｒ Ｒ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｎｅｏｎ（商標） Ｋｉｔ，ＰＫ１００９６）緩衝液で細胞を再懸濁させ、その中に２５μｇの目的プラスミドを加え、ピペットで軽くて均一に混合する。その後、懸濁液をエレクトロポレーター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，ＮｅｏｎＴＭ Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ，ＭＰ９２２９４７）に置いて電気形質転換し、反応条件を１１００Ｖ／２０ｍｓ／２回に設定して電気形質転換する。
１．２ 細胞培養
電気形質転換後、得られた細胞をそれぞれ体積百分率が１０％のＦＢＳ（Ｇｉｂｃｏ，１５１４０－１４１）を含有するが抗生物質を含まないＤＭＥＭ培地（Ｇｉｂｃｏ，１１９９５０６５）に移し、その後、細胞を１０ｃｍ×１０ｃｍの細胞培養皿に接種して４８ｈ培養し、続いて平均０．５個／ウェルの密度で細胞を９６ウェル細胞培養プレートに分注し、最終濃度が２μｇ／ｍＬのピューロマイシン（Ｇｉｂｃｏ，Ａ１１１１３８－０３）をスクリーニング圧力として加え、２週間程度で細胞株クローンの成長状況を観察し、クローンを形成する細胞株を選択して同定する。
１．３ 過剰発現細胞株のフローサイトメトリーによる同定
上記の１．２節で得られた細胞株をフローサイトメトリーによって同定し、具体的に以下の通りである。
１．３．１ ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びマウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３細胞株のフローサイトメトリーによる同定
ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ（康源博創，ＫＣ－０９８６）及びマウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３細胞株に対して、ＩＭＡＢ３６２抗体を直接使用して同定する。
１×１０５個の細胞を（３００ｇ）低速遠心分離し、上清を除去する。遠心分離管の底部の細胞を配合されたＦＡＣＳ緩衝液（体積百分率が２％のＦＢＳを含む１×ＰＢＳ緩衝液）で１回リンスし、リンスした後の細胞に１２．５μｇ／ｍＬの抗体ＩＭＡＢ３６２を加え、４℃で１ｈインキュベートし、続いて、更に上記のＦＡＣＳ緩衝液で３回リンスし、ＰＥ標識のヤギ抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ抗体（Ａｂｃａｍ，ａｂ９８５９６）を０．５μｇ加え、４℃で１ｈインキュベートする。その後、ＦＡＣＳ緩衝液で３回リンスし、細胞に２００μＬのＦＡＣＳ緩衝液を加えて細胞を再懸濁させ、最後にフローサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ，ＣｙｔｏＦＬＥＸ ＡＯＯ－１－１１０２）によって検出する。
１．３．２ ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞株のフローサイトメトリーによる同定
ＩＭＡＢ３６２抗体は、ＣＬＤＮ１８．２のみを認識し、ＣＬＤＮ１８．１を認識しないため、他の方法と組み合わせてヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞株を同定する必要がある。ヒトＣＬＤＮ１８．１及びマウスＣＬＤＮ１８．１の配列一致性を考慮した上で、まず、細胞破裂キット（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，８８－８８２４－００）の仕様書の方法に応じて細胞を固定して破裂させ、その後、抗ＣＬＤＮ１８抗体［３４Ｈ１４Ｌ１５］のＣ末端ＣＬＤＮ１８細胞内セグメントに対する認識結果及びＩＭＡＢ３６２抗体との特異的結合結果に基づいてフローサイトメトリーによる同定を行う。
具体的な方法は、以下の通りである。１×１０５個の細胞を（３００ｇ）低速遠心分離し、上清を除去する。遠心分離管の底部の細胞をＦＡＣＳ緩衝液で１回リンスし、リンスした後の細胞に２００μＬのＩＣ固定液（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，００－８２２２）を加え、４℃で１ｈインキュベートし、続いて、破裂緩衝液（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，００－８３３３）で２回リンスし、前記抗ＣＬＤＮ１８抗体を加え、４℃で１ｈインキュベートする。再び上記破裂緩衝液で３回リンスした後、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標） ４８８蛍光標識のロバ抗ウサギＩｇＧ Ｈ ＆ Ｌ（ａｂｃａｍ，ａｂ１５００７３）を０．５μｇ加え、４℃で１ｈインキュベートし、最後にフローサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ，ＣｙｔｏＦＬＥＸ ＡＯＯ－１－１１０２）によって検出する。
同時に、前記１．３．１の方法により、ＩＭＡＢ３６２抗体を用いてヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞株に結合するか否かを測定する。
フローサイトメトリーによる同定の結果を図１ａに示す。図１ａから分かるように、抗ＣＬＤＮ１８抗体は、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、ＨＥＫ２９３及びＨＥＫ２９３Ｔ細胞を認識することができるが、抗体ＩＭＡＢ３６２は、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔのみを認識し、マウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３及びヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３を認識しない。これは、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３といった４つの細胞株がいずれも対応するＣＬＤＮ１８タンパク質の発現に成功したことを示す。
２．過剰発現腫瘍細胞株の構築及び同定
ヒトＣＬＤＮ１８．２を過剰発現する胃癌細胞株ＫＡＴＯＩＩＩ（ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株）の構築は、レンチウイルストランスフェクションの方法を採用し、且つ抗体ＩＭＡＢ３６２によって同定する。具体的な方法は、以下の通りである。
状態が良好なヒト胃癌細胞ＫＡＴＯＩＩＩ（ＡＴＣＣ（登録商標） ＨＴＢ－１０３（商標））５×１０４個を３０：１のＭＯＩ比で包装されたヒトＣＬＤＮ１８．２配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５）を含有するレンチウイルスに加え、十分に均一に混合し、その後、８μｇ／ｍＬのポリブレン（Ｐｏｌｙｂｒｅｎｅ，Ｓｉｇｍａ，１０７６８９）を含有するＩＭＤＭ完全培地（Ｇｉｂｃｏ，１２４４００６１）を加え、均一に混合し、３７℃、５％ ＣＯ２の恒温インキュベーターで２０ｈインキュベートした後に培地を除去し、新鮮なＩＭＤＭ完全培地に交換して２４ｈインキュベートし続け、平均０．５個の細胞／ウェルの密度でトランスフェクション後のＫＡＴＯＩＩＩ細胞を９６ウェルプレートに接種し、最終濃度が２μｇ／ｍＬのピューロマイシンを加えて耐性加圧スクリーニングを行い、３７℃、５％ ＣＯ２の恒温インキュベーターで２～３週間培養し、クローンを選択して同定する。
上記１．３．１節と同様に、抗体ＩＭＡＢ３６２によって耐性スクリーニングされた細胞株にフローサイトメトリーによる同定を行う。
フローサイトメトリーによる同定の結果を図１ｂに示す。図１ｂから分かるように、ＣＬＤＮ１８．２がトランスフェクションされていないＫＡＴＯＩＩＩ細胞は、抗体ＩＭＡＢ３６２によってほとんど認識されず、このＫＡＴＯＩＩＩ細胞株においてＣＬＤＮ１８．２をほとんど発現しないか又は発現量が極めて低いことを示す。レンチウイルストランスフェクションによって構築できたヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株は、抗体ＩＭＡＢ３６２によって識別されることができ、この細胞株の構築に成功したことを示す。
実施例２
動物免疫及び血清免疫力価の検出
１．免疫接種
本実施例において、アルパカ免疫を採用する。具体的な操作は、以下の通りである。免疫原としては、細胞株ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ（康源博創，ＫＣ－０９８６）及びヒトＣＬＤＮ１８．２ ＥＣＤ１（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９）を含有するｈＣＬＤＮ１８．２－ｐＬＶＸ－ｐｕｒｏプラスミドを採用する。それぞれ２×１０７個のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞（多点皮下注射）及び２ｍｇのプラスミド（多点筋肉内注射）を用いてアルパカ（南昌大佳生物飼養）を週ごとに交互に免疫し、アルパカの記号はＮＳＹ００２であり、合計で８回免疫する。最後に、２×１０７個のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を用いて追加免疫を行う。
２．血清免疫力価の測定
免疫力価の検出は、ＥＬＩＳＡ方法によって、抗原組換えタンパク質ＣＬＤＮ１８．２（ジェンスクリプト，ＣＰ０００７）における免疫血清のシグナルに基づいて測定する。具体的な方法は、以下の通りである。
免疫力価測定の１日前に、抗原組換えタンパク質ＣＬＤＮ１８．２をＰＢＳで１μｇ／ｍＬに希釈し、希釈液を得る。３０μＬの希釈液をＥｌｉｓａプレートに加え、４℃で一晩コーティングする。血清免疫力価の測定の当日、コーティングされたプレートをＰＢＳで２回リンスし、体積百分率が５％の脱脂粉乳を含有するＰＢＳＴにより室温で２時間ブロックし、更にＰＢＳで２回リンスする。別の９６ウェル希釈プレートで免疫されていない陰性血清及び免疫された血清をＰＢＳで希釈し、最初のウェルを１０００倍に希釈し、残りの７つのウェルを２倍に勾配希釈する。希釈した血清を抗原組換えタンパク質ＣＬＤＮ１８．２がコーティングされた１枚目のＥｌｉｓａプレートに対応して加え、３７℃で１ｈインキュベートし、ＰＢＳで２リンスした後に１：５０００で二次抗体ＭｏｎｏＲａｂ（商標）ウサギ抗ラクダ科ＶＨＨ抗体（金斯瑞，Ａ０１８６２－２００）を加え、最後にマイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ，ＳｐｅｃｔｅｒＭａｘ １９０）によって４５０ｎｍの波長でＯＤ値を読み取る。結果を表１に示し、アルパカ免疫力価は、ほぼ１：８０００程度である。
Figure 0007600218000006
実施例３
アルパカ免疫ライブラリーの構築及びスクリーニング
動物免疫が終了した後、アルパカから８０ｍＬ採血し、Ｆｉｃｏｌｌ－Ｐａｑｕｅ密度勾配分離溶液（ＧＥ，１７１４４００３Ｓ）でＰＢＭＣを分離してアルパカ免疫ライブラリーの構築に用いる。具体的な方法は、以下の通りである。
Ｆｉｃｏｌｌ－Ｐａｑｕｅ密度勾配分離溶液１５ｍＬを５０ｍＬの遠心分離管に徐々に加え、続いて、採取されたアルパカ血液１５ｍＬを徐々に加え、２つの液体が明確な分離界面を保持するようにする。１５℃程度で、４００ｇ、２０ｍｉｎ、加速度３、減速０の条件で遠心分離を行う。遠心分離後、液面全体は、４つの層に分けられ、上層は血漿混合物であり、下層は赤血球及び顆粒球であり、中層はＦｉｃｏｌｌ－Ｐａｑｕｅ液体であり、上層と中層の境界にＰＢＭＣを主とする狭幅帯状白濁層があり、即ちＰＢＭＣ細胞層である。まず、滅菌パスツールピペットで上層の血漿混合物を注意深く吸引し、続いて新しい滅菌パスツールピペットでＰＢＭＣを吸引し、単離されたＰＢＭＣを得る。ＰＢＳで２回リンスし、４℃、１５００ｒｐｍで１０ｍｉｎ水平遠心分離し、最後に１．５ｍＬのＰＢＳで再懸濁させ、サイトメーター（ＣｏｕｎｔＳｔａｒ，ＣｏｕｎｔＳｔａｒ Ａｌｔａｉｒ）でカウントする。
単離されたＰＢＭＣからそのＲＮＡを抽出し、逆転写キット（ＴａＫａＲａ，６２１０Ａ）によってｃＤＮＡに逆転写する。アルパカ抗体の分子形態が一般的な抗体と異なり、軽鎖を含まず、且つ重鎖がＣＨ１を含有しないため、ＶＨ ｇｅｒｍｌｉｎｅ遺伝子前端及びＣＨ２にプライマーを設計することにより、ＰＣＲにより、大きさの異なる２つの断片を得て、タッピングにより小さい目的断片を回収する。ＶＨＨ抗体の全てのＶ遺伝子及びＪ遺伝子の全ての配列をアライメントすることにより、ＮｃｏＩ及びＮｏｔＩ制限酵素切断部位を含有する縮重プライマーを設計し、続いて、回収されたＤＮＡ断片産物をテンプレートとして全てのＶＨＨ遺伝子を増幅し、最後に二重酵素切断及び連結によって目的抗体の遺伝子断片をファージディスプレイ用のベクターに挿入し、ＶＨＨは、Ｃ末端にＧＩＩＩ遺伝子と融合した。連結産物を回収キット（Ｏｍｅｇａ，Ｄ６４９２－０２）によって回収し、最後にエレクトロポレーター（Ｂｉｏ－Ｒａｄ，ＭｉｃｒｏＰｕｌｓｅｒ）によってコンピテント大腸菌ＳＳ３２０（Ｌｕｃｉｇｅｎ，ＭＣ１０６１ Ｆ）になるまで形質転換し、アンピシリン耐性を有する２－ＹＴ固体プレートに塗布する（トリプトン１．５％、酵母エキス１％、ＮａＣｌ ０．５％、寒天１．５％で質量体積ｇ／ｍＬに応じて調製される）。ライブラリーサイズを計算するために、１μＬの菌液で希釈した後にプレートに形成されたクローンで、電気形質転換によって形成された全てのクローンの総数、即ちライブラリーサイズを計算する。この免疫ライブラリーのライブラリーサイズは１×１０９ｃｆｕである。
ライブラリーサイズに基づき、５０個のＯＤ（１つのＯＤは５×１０８ｃｆｕである）のアルパカライブラリー菌を選択して新鮮な２－ＹＴ液体培地に加え、初期ＯＤ値を０．０５にする。３７℃、２２０ｒｐｍで対数増殖期まで培養し、この時、細菌数の５倍の量でＶＳＣＭ１３ヘルパーファージを加え、十分に均一に混合し、３０ｍｉｎ静置し、その後、２２０ｒｐｍの条件で１ｈ培養し、１００００ｒｐｍで５ｍｉｎ遠心分離した後、上清を捨て、Ｃ＋／Ｋ＋２－ＹＴ培地に置き換え、３０℃、２２０ｒｐｍで一晩培養する。翌日、１３０００ｇで１０ｍｉｎ遠心分離し、その上清に２０％のＰＥＧ／ＮａＣｌ（体積濃度が２０％のＰＥＧ６０００及び２．５ＭのＮａＣｌで調製される）を加えることにより、沈殿させてアルパカライブラリーに対応するファージを得て、ＰＢＳで１回リンスした後、ファージスクリーニングに使用する。
細胞スクリーニング方法により、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株をスクリーニング抗原とし、ファージディスプレイライブラリーからヒトＣＬＤＮ１８．２に対する抗体をスクリーニングし、具体的な方法は、以下の通りである。Ｔ２５培養フラスコにヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ又はヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３を培養する。９０％程度の密度に成長した時、成長状態は最適であり、培養上清を除去し、ＰＢＳ（源培，Ｂ３１０ＫＪ）で１回リンスし、その後、５ｍＬの４％パラホルムアルデヒド（生工，Ｅ６７２００２－０５００）を加えて１ｈ固定し、最後にＰＢＳで２回リンスし、抗原材料としてファージの細胞スクリーニングに使用することができる。スクリーニング時に、まず、アルパカライブラリーに対応するファージを固定されたヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞と培養フラスコにおいて室温で１ｈインキュベートし、続いて、吸着後の上清ファージを吸引し、固定されたヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞と培養フラスにおいて２ｈコインキュベートする。ＰＢＳで２回リンスした後、３ｍＬのグリシン－ＨＣｌ（ｐＨ２．０）を加えて１０ｍｉｎ軽くて均一に混合し、目的膜タンパクＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合するファージを溶出させ、続いて、溶出した上清で対数期のＳＳ３２０菌体（Ｌｕｃｉｇｅｎ，６０５１２－１）に感染し、３０ｍｉｎ静置し、続いて２２０ｒｐｍの条件下で１ｈ培養し、更にＶＳＣＭ１３ヘルパーファージを加え、３０ｍｉｎ静置し、２２０ｒｐｍの条件下で１ｈ培養し続け、遠心分離してＣ＋／Ｋ＋ ２－ＹＴ培地に置き換え、最終的に得られたファージを引き続き２回目のスクリーニングに使用する。このように繰り返し、毎回ランダムに選択された１０個のクローンに対して配列分析を行い、その結果、３回のスクリーニングを経て、３回目のスクリーニングを行った後に配列の富化が明らかにある。
３回目にスクリーニングされたクローンを選択して９６ウェルプレートにファージの上清を調製し、ファージＥＬＩＳＡによってＣＬＤＮ１８．２組換えタンパク質に対する陽性クローンをスクリーニングし、その後、全ての陽性クローンを選択して配列決定分析を行い、続いて、配列が唯一のクローンをファージの上清として調製し、更にフローレベルで検証し、ヒトＣＬＤＮ１８．２のみに結合するがヒトＣＬＤＮ１８．１に結合しない候補抗体をスクリーニングする。
具体的なフローレベルの検証方法は、以下の通りである。
まず、それぞれ１×１０５個のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞を５００ｇで低速遠心分離して上清を除去し、細胞を１．３．１に記載されたＦＡＣＳ緩衝液でリンスした後、１０％ ＦＢＳ（Ｇｉｂｃｏ，１５１４０－１４１）で１ｈブロックされたファージを用いて上清を調製し、４℃で１ｈインキュベートし、続いてＦＡＣＳ緩衝液で２回リンスし、１：５０で抗Ｍ１３マウスモノクローナル抗体（Ｓｉｎｏ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ，１１９７３－ＭＭ０５Ｔ）を加え、４℃で１ｈインキュベートする。続いて、ＦＡＣＳ緩衝液で２回リンスし、ＡＰＣ標識の抗マウスＦｃ二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ，１１５１３６０７１）を加え、４℃で１ｈインキュベートし、ＦＡＣＳ緩衝液で２回リンスし、最後にフローサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ，ＣｙｔｏＦＬＥＸ ＡＯＯ－１－１１０２）によって検出する。
具体的な結果を以下の表２に示す。
Figure 0007600218000007
以上の結果から分かるように、本開示の抗体は、いずれもヒトＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合することができる。
それぞれクローン番号で対応する候補抗体に名付ける。各候補抗体のアミノ酸配列を以下の表３及び４に示す。
Figure 0007600218000008
Figure 0007600218000009
Figure 0007600218000010
Figure 0007600218000011
スクリーニングされた複数の候補抗体間のアミノ酸配列を比較し、その結果を図２に示す。
各候補抗体間の可変領域アミノ酸の配列同一性の比較を以下の表５－１及び表５－２に示す。
Figure 0007600218000012
Figure 0007600218000013
実施例４
キメラＶＨＨ－Ｆｃ（ｈＩｇＧ１）抗体の産生及び発現
ＣＬＤＮ１８．２は、胃癌などの癌細胞において高度に発現され、このような腫瘍関連標的の抗体薬物は、補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）及び抗体依存性、細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）によって腫瘍を殺傷することができる。本実施例は、実施例３でスクリーニングされた候補ナノ抗体に基づいてキメラ抗体を設計し、発現して後続のＣＤＣ及びＡＤＣＣ実験に使用する。標的の特異性を考慮し、候補ナノ抗体遺伝子を一過性発現プラスミドｐｃＤＮＡ３．４（Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ，Ａ１４６９７）に構築する場合、候補ナノ抗体のＣ末端にヒトＩｇＧ１ Ｆｃ断片
Figure 0007600218000014
 を融合させ、この断片は、連結領域及びＩｇＧ１の定常領域を含み、ＡＤＣＣ及びＣＤＣなどの効果を媒介するために用いられる。本実施例は、候補ナノ抗体Ａ－２－４を選択し、これを基礎にヒトＩｇＧ１ Ｆｃ断片を融合させ、キメラ抗体ＮＡ１－Ｓ（本開示では、「候補抗体ＮＡ１－Ｓ」、「抗体ＮＡ１－Ｓ」又は「ＮＡ１－Ｓ抗体」とも呼ばれる）を得て、候補ナノ抗体Ａ１８－１－６３、Ａ１８－１－４２及びＡ２９３－３４を選択し、それぞれを基礎にヒトＩｇＧ１ Ｆｃ断片を融合させ、それぞれキメラ抗体ＮＡ３－Ｓ（本開示では、「候補抗体ＮＡ３－Ｓ」、「抗体ＮＡ３－Ｓ」又は「ＮＡ３－Ｓ抗体」とも呼ばれ、候補ナノ抗体Ａ１８－１－６３とヒトＩｇＧ１ Ｆｃを融合させて得られたキメラ抗体である）、ＮＡ５－Ｓ（本開示では、「候補抗体ＮＡ５－Ｓ」、「抗体ＮＡ５－Ｓ」又は「ＮＡ５－Ｓ抗体」とも呼ばれ、候補ナノ抗体Ａ１８－１－４２とヒトＩｇＧ１ Ｆｃを融合させて得られたキメラ抗体である）及びＮＡ６－Ｓ（本開示では、「候補抗体ＮＡ６－Ｓ」、「抗体ＮＡ６－Ｓ」又は「ＮＡ６－Ｓ抗体」とも呼ばれ、候補ナノ抗体Ａ２９３－３４とヒトＩｇＧ１ Ｆｃを融合させて得られたキメラ抗体である）を得る。
抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓの発現は、ＥｘｐｉＣＨＯ一過性発現システム（Ｇｉｂｃｏ，Ａ２９１３３）を採用し、具体的な方法は、以下の通りである。
トランスフェクションの当日、細胞密度が７×１０６～１×１０７個の生細胞／ｍＬ程度であり、細胞生存率＞９８％であることが確認され、この場合、３７℃に予熱された新鮮なＥｘｐｉＣＨＯ発現培地２５ｍＬを用いて細胞を最終濃度が６×１０６個の細胞／ｍＬになるように調節し、４℃に予冷されたＯｐｔｉＰＲＯ（商標）ＳＦＭ １ｍＬを用いて目的プラスミド（合計２５μｇ）を希釈し、同時に、９２０μＬのＯｐｔｉＰＲＯ（商標）ＳＦＭを８０μＬのＥｘｐｉＦｅｃｔａｍｉｎｅ（商標）ＣＨＯを希釈し、更に両者を混合して軽くピペッティングして均一に混合し、ＥｘｐｉＦｅｃｔａｍｉｎｅ（商標）ＣＨＯ／プラスミドＤＮＡ混合液を調製し、室温で１～５ｍｉｎインキュベートした後に用意された細胞懸濁液に移し、徐々に加えながら細胞懸濁液を軽く振とうし、最後に細胞培養シェーカーに置いて、３７℃、８％ ＣＯ２の条件下で培養する。
トランスフェクション後の１８～２２時間内にＥｘｐｉＣＨＯ（商標）Ｅｎｈａｎｃｅｒ及びＥｘｐｉＣＨＯ（商標）Ｆｅｅｄを加え、振とうフラスコを３２℃のシェーカー及び５％ ＣＯ２の条件下で培養し続け、トランスフェクションから５日目に、同体積のＥｘｐｉＣＨＯ（商標）Ｆｅｅｄを加え、徐々に加えながら細胞懸濁液を軽くて均一に混合し、トランスフェクションの１２～１５日後に、細胞発現上清を高速遠心分離（１５０００ｇ，１０ｍｉｎ）し、得られた上清をＰｒｏｔｅｉｎ Ａ（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，Ｐ２５４５）で親和性精製し、その後、１００ｍＭの酢酸ナトリウム（ｐＨ３．０）で目的タンパク質を溶出させ、続いて１ＭのＴｒｉｓ－ＨＣｌで中和し、最後に得られたタンパク質（即ち、抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ又はＮＡ６－Ｓ）を濃縮管（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，ＵＦＣ９０１０９６）の方法によってＰＢＳ緩衝液に置き換える。
実施例５
候補抗体の特異的結合及び種の交差特異的結合の測定
候補抗体ＮＡ１－Ｓを例とし、０．２５％ ＥＤＴＡを含有するＴｒｙｐｓｉｎ（Ｇｉｂｃｏ，２５２００－０７２）で成長状態が良好なヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ、ＨＥＫ２９３Ｔ、ＨＥＫ２９３、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３、マウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞を消化し、１×１０５個の細胞及び１０μｇ／ｍＬの候補抗体ＮＡ１－Ｓを１ｈインキュベートし、また、ｈＩｇＧ１アイソタイプ抗体を対照とする。ＦＡＣＳ緩衝液で２回リンスし、その後、０．５μｇのＰＥ標識のヤギ抗ヒトＩｇＧ－Ｆｃ二次抗体（Ａｂｃａｍ，ａｂ９８５９６）と４℃で１ｈインキュベートする。その後、ＦＡＣＳ緩衝液で３回リンスし、フローサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ，ＣｙｔｏＦＬＥＸ ＡＯＯ－１－１１０２）によって候補抗体の細胞での結合を検出する。ＮＡ１－Ｓと同様の方法で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓの特異的結合及び種の交差特異的結合を測定する。
フローサイトメトリー結果（図３に示す）に示すように、対照抗体ＩＭＡＢ３６２と類似し、候補抗体ＮＡ１－Ｓ（図３ａ）、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓ（図３ｂ）は、いずれもヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ及びマウスＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３に特異的に結合するが、ＨＥＫ２９３Ｔ、ＨＥＫ２９３、ヒトＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３及びマウスＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞に結合しない。これは、候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳがＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合できるが、ＣＬＤＮ１８．１に結合せず、且つヒトとマウスＣＬＤＮ１８．２を交差認識できることを示す。
実施例６
候補抗体のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株及びヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株での結合能力の比較
培養状態が良好なヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、３倍に勾配希釈した候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓとそれぞれ４℃で１ｈインキュベートする。ＦＡＣＳ緩衝液で２回リンスし、その後、ＰＥ標識のヤギ抗ヒトＩｇＧ－Ｆｃ抗体（Ａｂｃａｍ，ａｂ９８５９６）を０．５μｇ加え、４℃で１ｈインキュベートし、更にＦＡＣＳ緩衝液で２回リンスした後、フローサイトメータによって検出する。
フローサイトメトリー結果を図４ａ、図５ａ及び図５ｂに示し、結果から分かるように、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞では、候補抗体は、いずれも対照抗体に相当する細胞結合活性を示す。
同様の方法で候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株での結合能力を測定する。フローサイトメトリー結果を図４ｂ及び図５ｃに示し、結果から分かるように、ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞株では、候補抗体は、いずれも対照抗体に相当する細胞結合活性を示す。
実施例７
候補抗体の補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）
ＭＴＳ法を用いて候補抗体のＣＤＣ細胞殺傷効果を測定する。候補抗体ＮＡ１－Ｓ、ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓは、ＩｇＧ１ Ｆｃ断片を含むため、ＣＤＣによって細胞を殺傷することができ、ＭＴＳ試薬は、生細胞により産生されたＮＡＤＰＨ又はＮＡＤＨによって着色化合物に還元され得るため、色の濃淡は、抗体により媒介されたＣＤＣの殺傷效果を代表する。具体的な操作方法は、以下の通りである。
候補抗体ＮＡ１－Ｓを例とする。まず、ｔｒｙｐｓｉｎにより培養状態が良好なヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を消化した後、５×１０４個の細胞を５倍に希釈したウサギ血清と混合し、それぞれ勾配希釈した候補抗体ＮＡ１－Ｓ又は対照抗体ＩＭＡＢ３６２を５０μＬずつ加え、３７℃で３ｈインキュベートする。その後、候補抗体ＮＡ１－Ｓ又は対照抗体ＩＭＡＢ３６２にそれぞれＭＴＳ試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｇ３５８０）を３０μＬ加え、十分に均一に混合し、３７℃、５％ ＣＯ２の恒温インキュベーターに入れて４ｈ培養し、この期間中に培地の色の変化を観察し、マイクロプレートリーダーによって４９２ｎｍ波長でのＯＤ値を測定する。１０％Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００及び標的細胞を完全溶解対照とし、標的細胞のみをブランク陰性対照とし、ウサギ補体及び標的細胞をバックグラウンド陰性対照とする。
細胞殺傷率は、以下の式によって計算される。細胞殺傷率（％）＝（候補抗体ウェルＯＤ値－バックグラウンドウェルＯＤ値）／（完全溶解ウェルＯＤ値－ブランクウェルＯＤ値）×１００％。
候補抗体ＮＡ１－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ腫瘍細胞でのＣＤＣ殺傷効果の結果を図６ａに示す。図６ａから分かるように、対照抗体ＩＭＡＢ３６２に対して、候補抗体ＮＡ１－Ｓは、等モル濃度でより高いＣＤＣ細胞殺傷効果を示し、ＮＡ１－ＳのＥＣ５０は０．５２８９ｎＭであり、ＩＭＡＢ３６２のＥＣ５０は０．９３６ｎＭである。同様の方法で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞でのＣＤＣ殺傷効果を測定し、その結果を図７ａ～図７ｃに示す。図７ａ～図７ｃから分かるように、対照抗体ＩＭＡＢ３６２に対して、候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－Ｓも、等モル濃度で同等のＣＤＣ細胞殺傷効果を示す。
同様の方法で候補抗体ＮＡ１－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞でのＣＤＣ殺傷効果を測定し、その結果を図６ｂに示す。図６ｂから分かるように、ＮＡ１－Ｓは、等モル濃度で対照抗体ＩＭＡＢ３６２よりも高いＣＤＣ細胞殺傷効果を示し、ＮＡ１－ＳのＥＣ５０は１．９１ｎＭであり、ＩＭＡＢ３６２のＥＣ５０は５０．８６ｎＭである。ＮＡ１－Ｓと同じ方法で候補抗体ＮＡ３－Ｓ、ＮＡ５－Ｓ及びＮＡ６－ＳのＣＤＣ効果を測定し、ＮＡ１－Ｓと類似し、それらも、対照抗体ＩＭＡＢ３６２よりも高いＣＤＣ細胞殺傷効果を有する。例えば、ＮＡ３－Ｓは、等モル濃度で対照抗体ＩＭＡＢ３６２より高いＣＤＣ細胞殺傷効果を示し、ナノ抗体ＮＡ３－ＳのＥＣ５０は４．８３１ｎＭであり、ＩＭＡＢ３６２のＥＣ５０は８５．８３ｎＭ（図７ｄ）である。
実施例８
抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）
乳酸脱水素酵素（ＬＤＨ）放出法によってＡＤＣＣ効果を検出する。その原理は、以下の通りである。抗体の可変領域は、標的細胞上の目的抗原に結合し、抗体のＦｃセグメントがＰＢＭＣにおけるＮＫエフェクター細胞上のＦｃＲＩＩＩａ（別名ＣＤ１６ａ）に結合した後、ＮＫ細胞は、パーフォリン、グランザイムなどを放出して標的細胞を溶解し、その後、ＬＤＨ乳酸脱水素酵素キット（Ｔａｋａｒａ，ＭＫ４０１）によって細胞上清における乳酸脱水素酵素の放出を検出することができ、それによってＮＫ細胞の標的細胞に対する殺傷程度を測定する。具体的な操作は、以下の通りである。
９６ウェル細胞培養プレートの各ウェルに５０μＬの密度が２×１０５個／ｍＬのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を加え、３７℃のインキュベーターで一晩（１６～２０ｈ）培養する。勾配希釈した候補抗体ＮＡ１－Ｓ又はＮＡ３－Ｓを５０μＬ加え、均一に混合した後に３７℃のインキュベーターに２０ｍｉｎインキュベートし、更に蘇生した５×１０５個／ウェルのヒトＰＢＭＣ細胞（エフェクター細胞／標的細胞の比率が５０：１）を加え、３７℃のインキュベーターで４ｈインキュベートした後、３００ｇで遠心分離することによって上清を得て、その後、ＬＤＨ検出試薬を加え、６０ｍｉｎ反応させ、最後にマイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ，ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ１９０）によって波長４９２ｎｍでのＯＤ値を測定して検出結果を分析する。１０％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００及び標的細胞を完全溶解対照とし、標的細胞のみをブランク陰性対照とし、ＰＢＭＣ及び標的細胞をバックグラウンド陰性対照とする。
細胞殺傷率は、以下の式によって計算される。殺傷率（％）＝（候補抗体孔ＯＤウェル－バックグラウンドウェルＯＤウェル）／（完全溶解ウェルＯＤ値－バックグラウンドウェルＯＤ値）×１００％
結果（図８ａ及び図８ｃ）から分かるように、候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓは、等モル濃度でいずれも対照抗体ＩＭＡＢ３６２に相当する細胞殺傷活性を有する。
同様の方法で候補抗体ＮＡ１－Ｓ又はＮＡ３－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ腫瘍細胞でのＡＤＣＣ殺傷効果を測定し、結果を図８ｂ及び図８ｄに示す。図８ｂの結果から分かるように、ＮＡ１－Ｓは、等モル濃度で対照抗体ＩＭＡＢ３６２より高いＡＤＣＣ細胞殺傷効果を示し、候補抗体の殺傷率は４５％と高く、ＩＭＡＢ３６２対照抗体の殺傷率は僅か１７％である。図８ｄの結果から分かるように、ＮＡ３－Ｓも、等モル濃度で対照抗体ＩＭＡＢ３６２より高いＡＤＣＣ細胞殺傷効果を示し、候補抗体の殺傷率はほぼ５０％であり、ＩＭＡＢ３６２対照抗体の殺傷率は僅か２０～２５％である。
実施例９
インビボ腫瘍阻害実験（ヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔを腫瘍形成細胞株とする）
実験には、６～８週齢の雌ＳＣＩＤマウス（体重２４～２６ｇ）を使用する。実験マウスを恒温恒湿の独立した換気ボックスで飼育し、飼育室の温度は２１～２４℃であり、湿度は３０～５３％である。
１×１０７個のヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を右腋窩に皮下注射する。皮下腫瘍塊の体積が８０～１００ｍｍ３に達した時、腫瘍の体積差が大きいマウスサンプルを除去し、腫瘍の体積に基づいてランダムに群分けし（１群当たり８匹のマウス）、それぞれＰＢＳ処置群、ＩＭＡＢ３６２抗体処置群、候補抗体ＮＡ１－Ｓ処置群である。細胞接種の６日後に抗体による処置を開始し（候補抗体ＮＡ１－Ｓは、分子量に基づいてＩＭＡＢ３６２抗体と等モル濃度の用量を使用し、質量濃度に換算すれば、それぞれ２．５ｍｇ／ｋｇ及び５ｍｇ／ｋｇである）、週に２回投与し、それぞれ静脈内注射及び腔内注射の両方で交互に投与する。腫瘍の長さ（ｍｍ）及び幅（ｍｍ）を随時観察して記録し、その腫瘍成長体積（Ｖ）を計算し、計算式は、Ｖ＝（長さ×幅２）／２である。同様の方法で候補抗体ＮＡ３－Ｓを試験し、候補抗体ＮＡ３－Ｓは、分子量に基づいてＩＭＡＢ３６２抗体と等モル濃度の用量を使用し、質量濃度に換算すれば、それぞれ５ｍｇ／ｋｇ及び１０ｍｇ／ｋｇである。
抗体による腫瘍阻害の結果を図９ａ～図９ｂに示し、結果から分かるように、対照抗体ＩＭＡＢ３６２に対して、候補抗体ＮＡ１－Ｓは、この質量用量では、低濃度での腫瘍成長阻害効果が高濃度の対照抗体と類似し、腫瘍成長阻害率は５５％程度である。候補抗体ＮＡ３－Ｓは、低質量濃度の用量での腫瘍成長阻害効果が高濃度の対照抗体と類似し、ほとんど全てが腫瘍成長を阻害することができる。
実施例１０
候補抗体のヒトＣＬＤＮ１８．２での結合エピトープの測定
候補抗体及び対照抗体ＩＭＡＢ３６２は、いずれもＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合するが、ＣＬＤＮ１８．１に結合せず、ＣＬＤＮ１８．２及びＣＬＤＮ１８．１の膜外領域は、ＥＣＤ１領域のみに８アミノ酸の差異を有するため、候補抗体及び対照抗体ＩＭＡＢ３６２の抗原結合エピトープがＥＣＤ１領域にあると推測し、候補抗体とＩＭＡＢ３６２の抗原結合位置が一致するか否かを確認するために、本実施例は、競合結合方法を採用し、具体的な方法は、以下の通りである。
２～４回継代し且つ成長状態が良好なＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を実験に使用し、４℃、３００ｇで遠心分離して上清を除去し、その後、細胞をＦＡＣＳ緩衝液で再懸濁させ、カウント後に細胞密度を２×１０６個の細胞／ｍＬに調節し、１ウェルあたり１００μＬで新しい９６ウェル丸底プレートに加え、４℃、３００ｇで遠心分離して上清を除去する。
候補抗体ＮＡ１－Ｓを例とし、ＦＡＣＳ緩衝液（１Ｘ ＰＢＳ＋２％ ＦＢＳ）を配合し、ＦＡＣＳ緩衝液で競合抗体ＮＡ１－Ｓ（又はＩＭＡＢ３６２）を勾配希釈し、同様にＦＡＣＳ緩衝液でビオチン標識のＩＭＡＢ３６２（又はＮＡ１－Ｓ）タンパク質を１３．４ｎＭに希釈し、それぞれ９６ウェルプレートに１００μＬの勾配希釈液及び１００μＬのビオチン標識タンパク質希釈液を加え、マルチチャンネルピペットで軽くピペッティングして均一に混合し、９６ウェルプレートを４℃で１ｈインキュベートする。インキュベート後の抗体と細胞の混合液を４℃、３００ｇで遠心分離して上清を除去し、その後、対応するウェルにそれぞれ２００μＬのＦＡＣＳ緩衝液を加えて細胞を再懸濁させ、４℃、３００ｇで遠心分離することによって上清を除去する。このステップを２回繰り返す。ＦＡＣＳ緩衝液でＰＥ標識ストレプトアビジン（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，１２－４３１７－８７）を１：２００で希釈し、マルチチャンネルピペットで対応する細胞に２００μＬ／ウェル加え、軽くピペッティングして細胞を再懸濁させ、その後、細胞を４℃で暗所で３０ｍｉｎインキュベートし、インキュベート終了後、細胞を４℃、３００ｇで遠心分離して上清を除去し、ＦＡＣＳ緩衝液を加えて細胞を再懸濁させ、このステップを２回繰り返す。最後にフローサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ，ＣｙｔｏＦＬＥＸ ＡＯＯ－１－１１０２）によって検出する。
フローサイトメトリー結果は、１０ａに示すように、ＮＡ１－Ｓ濃度の増加につれ、ＩＭＡＢ３６２－ｂｉｏｔｉｎのＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での結合が減少し、同様に、図１０ｃのフローサイトメトリー結果に示すように、ＩＭＡＢ３６２濃度の増加につれ、ＮＡ１－Ｓ－ｂｉｏｔｉｎのＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での結合が減少し、これらは、全てＮＡ１－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．２での抗原エピトープが類似することを示す。ＮＡ３－Ｓの結果は、図１０ｂ及び１０ｄに示すように、ＮＡ１－Ｓと類似する。
ＮＡ１－Ｓ又はＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．２での肝心なアミノ酸部位を更に理解するために、ＣＬＤＮ１８．２及びＣＬＤＮ１８．１がＥＣＤ１に８アミノ酸の差異を有することに基づき、本実施例は、８つの突然変異体ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株を構築し、ＣＬＤＮ１８．２上の８つの差異を有するアミノ酸をＣＬＤＮ１８．１に対応するアミノ酸に突然変異させ、その後、被測定抗体の野生株及び突然変異株での結合能力の差異を測定することによってこのアミノ酸が抗体結合に肝心なアミノ酸であるか否かを判定する。具体的な方法は、以下の通りである。
まず、ＣＬＤＮ１８．２野生及び突然変異体ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株の発現を測定し、方法は、１．３．２の方法と同様であり、細胞破裂キット（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，８８－８８２４－００）の仕様書の方法に応じて細胞を固定して破裂させ、その後、抗ＣＬＤＮ１８抗体［３４Ｈ１４Ｌ１５］のＣ末端ＣＬＤＮ１８細胞内セグメントに対する結合能力に基づいて発現を判定し、結果を図１０ｅに示し、各突然変異細胞株及び野生株のＣＬＤＮ１８．２は、いずれも高い発現を有する。
これに基づき、１．３．１の方法を参照し、候補抗体ＮＡ１－Ｓ又はＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．２野生及び突然変異体ＨＥＫ２９３Ｔ細胞株での結合強度を測定し、また、候補抗体の結合強度を各細胞株の発現レベルで割り、候補抗体の野生株での結合を１００％とし、正規化処理して最終的な相対結合強度とし、図１０ｆ～図１０ｉに示すように、ＣＬＤＮ１８．２ＥＣＤ１における３つの部位は、それぞれＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－ＳのヒトＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔでの結合に対して非常に肝心なＱ２９、Ｑ４７及びＥ５６であり、Ａ４２、Ｅ５６及びＧ６５は、ＩＭＡＢ３６２がＣＬＤＮ１８．２に結合するための３つの肝心なアミノ酸である。
実施例１１
候補抗体により媒介されたＦａｂ－ＺＡＰ細胞殺傷効果
ＣＬＤＮ１８．２は、多くの腫瘍において高度に発現され、且つ、正常組織において、胃上皮細胞の密着結合構造において特異的に発現されるため、望ましいＡＤＣ薬物標的となる見込みがある。本実験は、抗体によりＦａｂ－ＺＡＰエンドサイトーシスを媒介する場合の細胞傷害性によって抗体のエンドサイトーシス活性を検出し、Ｆａｂ－ＺＡＰ（Ａｔｓｂｉｏ，ＩＴ－５１－１００）は、ｓａｐｏｒｉｎ（サポリン）の抗Ｆｃ領域が連結されたＦａｂ断片であり、ｓａｐｏｒｉｎは、リボソーム阻害剤であり、タンパク質の合成を阻害することで細胞死を引き起こすことができる。Ｆａｂ－ＺＡＰ及びＣＬＤＮ１８．２の抗体をインキュベートした後にＣＬＤＮ１８．２の抗体にＦａｂ－ＺＡＰを付け、ＣＬＤＮ１８．２の抗体がエンドサイトーシスされる際に、Ｆａｂ－ＺＡＰは、抗体と共に細胞内に入り、細胞を殺し、その後、ＭＴＳ（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｇ３５８０）によって細胞の活性を検出することで候補抗体及び対照抗体のエンドサイトーシス活性を検出して比較する。具体的な方法は、以下の通りである。
対数増殖期のＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、細胞間が接着せず且つキャップが生じるまでトリプシン（０．２５％（ｗ／ｖ）Ｔｒｙｐｓｉｎ ０．５３ｍＭ ＥＤＴＡ）で消化し、完全培地で消化を終了する。細胞を十分に均一に混合した後、細胞をカウントしてその生存率を測定する。細胞密度を４ｘ１０４細胞／ｍＬに調節し、１ウェルあたり５０μＬで細胞培養プレートに加えて３７℃の細胞インキュベーターに入れて１６時間インキュベートする。同時に、ＤＭＥＭ完全培地でＦａｂ－ＺＡＰを２μｇ／ｍＬまで希釈し、これを希釈液として更に候補抗体ＮＡ１－Ｓ又はＮＡ３－Ｓ及び対照抗体を勾配希釈し、且つ、マルチチャンネルピペットで５０μＬ取って細胞培養プレートに加え、ＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔと軽くピペッティングして均一に混合し、細胞培養プレートを３７℃の細胞インキュベーターに入れて７２時間インキュベートし続ける。続いて、マルチチャンネルピペットで各ウェルに２０μＬのＭＴＳを加えて軽くピペッティングして均一に混合し、３７℃で２～４時間インキュベートし、最後に細胞プレートを卓上遠心分離機により１０００ｒｐｍの回転数で５時間遠心分離した後、マイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ，ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ１９０）からデータを読み取り、検出波長が４９２ｎｍである。
結果を図１１ａ～図１１ｂに示し、対照抗体ＩＭＡＢ３６２に対して、候補抗体ＮＡ１－Ｓ及びＮＡ３－Ｓは、Ｆａｂ－ＺＡＰによって目的細胞ＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔをより効果的に殺傷することができ、ＮＡ１－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２のＩＣ５０は、それぞれ０．１ｎＭ及び０．２４ｎＭであり、ＮＡ３－Ｓ及びＩＭＡＢ３６２のＩＣ５０は、それぞれ０．０７ｎＭ及び０．３２ｎＭである。これは、候補抗体がＣＬＤＮ１８．２を介して細胞に入ることができることを十分に説明しただけでなく、更に対照抗体ＩＭＡＢ３６２よりも優れ、ＡＤＣ抗体薬物複合体の開発に使用される見込みがある。
実施例１２
候補抗体ＮＡ３－Ｓのヒト化改変
マウス抗体に対して、アルパカ由来のナノ抗体はヒト抗体との相同性が高いが、その構造が特殊であるため、ＮＡ３－Ｓのヒト化設計プロセスにおいて、ヒトに最も近い生殖系遺伝子ｇｅｒｍｌｉｎｅを選択し、且つ、復帰突然変異を行う時に抗体の構造の維持をも考慮し、最終的に一連のヒト化抗体を設計し、そのうち、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１は、最も好ましい分子であり、その抗体配列を以下の表に示す。
Figure 0007600218000015
可変領域配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３）：
Figure 0007600218000016
ただし、斜体の太字のＶ（第５位）及びＳ（最後）は、ヒト化部位である。当該可変領域配列をコードするヌクレオチド配列は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４に示される。
ＮＡ３－Ｓのヒト化後の親和性が低下するか否かを考察するために、１．３．１に記載された方法でＮＡ３－Ｓ及びＮＡ３Ｓ－Ｈ１のＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔ細胞での結合能力を比較し、結果を図１２に示し、ヒト化された分子ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及び親抗体ＮＡ３－Ｓは、類似する親和性を有し、且つ対照抗体ＩＭＡＢ３６２よりも優れる。
実施例１３
高濃度での候補抗体ＮＡ３Ｓ－Ｈ１の結合特異性
ＣＬＤＮ１８．２及びＣＬＤＮ１８．１の候補抗体結合領域ＥＣＤ１に８アミノ酸のみの差異が存在し、後者は、肺部上皮細胞において発現されるため、抗体薬物は、ＣＬＤＮ１８．１に非特異的に結合すると、重篤な肺損傷又は毒性を引き起こし、臨床的応用を制限するため、本実施例は、インビトロで異なる濃度の抗体（１００μｇ／ｍＬの高濃度）及びＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３を用いてインキュベートし、方法は、１．３．１に記載されたとおりであり、異なる濃度の抗体及び目的細胞ＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３を４℃で１ｈインキュベートし、続いて、上記ＦＡＣＳ緩衝液で３回リンスし、ＰＥ標識のヤギ抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ抗体（Ａｂｃａｍ，ａｂ９８５９６）０．５μｇ（０．５ｍｇ／ｍｌ）を加え、４℃で１ｈインキュベートする。その後、ＦＡＣＳ緩衝液で３回リンスした後、細胞に２００μＬのＦＡＣＳ緩衝液を加えて細胞を再懸濁させ、最後にフローサイトメータ（Ｂｅｃｋｍａｎ，ＣｙｔｏＦＬＥＸ ＡＯＯ－１－１１０２）によって検出し、結合強度及び細胞結合陽性率を記録する。
結果を図１３ａに示し、結合強度の面で、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及び対照抗体ＩＭＡＢ３６２のＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３での結合は、濃度の増加につれて増加せず、アイソタイプ対照の結合強度とほとんど一致し、図１３ｂの細胞結合陽性率の面で、１００μｇ／ｍＬの高濃度でも、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及びＩＭＡＢ３６２の陽性率は、いずれも低く、０．０４～０．１８％の間であり、３回繰り返した場合、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１の陽性率は、０．１４５％、０．１７％及び０．１７３％であり、ＩＭＡＢ３６２の陽性率は、０．０４２％、０．１２８％及び０．０４１％であり、アイソタイプ対照ｈＩｇＧ１の陽性率は０．０６３％、０．２３３％及び０．１１５％である。図１３ａ及び１３ｂの結果を纏め、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及び対照抗体ＩＭＡＢ３６２は、いずれもＣＬＤＮ１８．１－ＨＥＫ２９３細胞に結合せず、いずれもＣＬＤＮ１８．２に特異的に結合することができるが、ＣＬＤＮ１８．１に結合しない。
実施例１４
候補抗体ＮＡ３Ｓ－Ｈ１の補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）
本実施例は、ヒト化分子ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及び対照抗体ＩＭＡＢ３６２の補体依存性細胞傷害作用を比較し、実施例７の方法を参照して測定し、簡単に言えば、５×１０４個のＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ細胞を５倍に希釈したウサギ血清と混合し、それぞれ勾配希釈した候補抗体ＮＡ３Ｓ－Ｈ１又は対照抗体ＩＭＡＢ３６２を５０μＬずつ加え、３７℃で３ｈインキュベートする。続いて、ＭＴＳ試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｇ３５８０）を３０μＬ加え、十分に均一に混合し、３７℃、５％ ＣＯ２の恒温インキュベーターに入れて４ｈ培養し、その間に培地の色の変化を観察し、最後にマイクロプレートリーダーによって波長４９２ｎｍでのＯＤ値を測定し、１０％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００及び標的細胞を完全溶解対照とし、標的細胞のみをブランク陰性対照とし、ウサギ補体及び標的細胞をバックグラウンド陰性対照とし、抗体の細胞殺傷効果を推定するために使用する。
結果を図１４に示し、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１は、対照抗体ＩＭＡＢ３６２に比べてより高いＣＤＣ細胞殺傷効果を有し、ＮＡ３Ｓ－Ｈ１のＥＣ５０は１０．４１ｎＭであるが、ＩＭＡＢ３６２のＥＣ５０は１４９．４ｎＭである。
実施例１５
ヒト化抗体ＮＡ３Ｓ－Ｈ１により媒介されたＮＫ細胞の細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）
本実施例は、ヒト化抗体ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及び対照抗体により媒介された細胞傷害作用を比較し、方法としては、実施例８の方法を採用し、勾配希釈した候補抗体を一定の比率の標的細胞及びヒトＰＢＭＣ細胞と４ｈインキュベートした後、ＬＤＨ乳酸脱水素酵素キット（Ｔａｋａｒａ，ＭＫ４０１）方法によって波長４９２ｎｍで細胞上清における乳酸脱水素酵素の放出を検出し、それによって抗体により媒介されたＮＫ細胞の標的細胞に対する殺傷效果を測定する。
図１５ａ及び図１５ｂは、抗体により媒介されたＮＫ細胞のＣＬＤＮ１８．２－ＫＡＴＯＩＩＩ又はＣＬＤＮ１８．２－ＨＥＫ２９３Ｔに対する細胞殺傷效果を示し、その結果、候補抗体ＮＡ３Ｓ－Ｈ１及び対照抗体ＩＭＡＢ３６２により媒介されたＡＤＣＣ効果が類似することを示す。
当業者であれば、本発明は、その精神又は中心特徴から逸脱することなく、他の具体的な形態で実施されてもよいことを更に理解できる。本発明の前記説明がその例示的な実施形態のみを開示したため、他の変化は本発明の範囲内に属すると考えられることを理解すべきである。従って、本発明は、ここで詳しく説明された特定の実施形態に限定されない。逆に、添付される特許請求の範囲を参照して本発明の範囲及び内容を指示すべきである。

Claims (19)

  1. 少なくとも１つの免疫グロブリン単一可変ドメインを含む抗体であって，
    前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，CLDN18.2に結合するものであり、
    前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，VHHであり、
    前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，以下のいずれかの群のCDR1、CDR2及びCDR3を含む：
    (a)CDR1はSEQ ID NO: 30で示されるアミノ酸配列を有し,CDR2はSEQ ID NO: 31で示されるアミノ酸配列を有し,CDR3はSEQ ID NO: 32で示されるアミノ酸配列を有する; 及び
    (b)CDR1はSEQ ID NO: 1で示されるアミノ酸配列を有し,CDR2はSEQ ID NO: 2で示されるアミノ酸配列を有し,CDR3はSEQ ID NO: 3で示されるアミノ酸配列を有する。
  2. 前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，
    （a）SEQ ID NO: 7のアミノ酸配列、又はSEQ ID NO: 7と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列、及び
    （b）SEQ ID NO: 47に示すアミノ酸配列、又はSEQ ID NO: 47と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列
    から選択される何れか１つを含む，請求項１に記載された抗体。
  3. 前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，SEQ ID NO: 7, 47 又は 63の配列を含むか又はそれからなる，請求項１又は２に記載された抗体。
  4. 前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，別の分子に融合し，前記別の分子は，免疫グロブリンのFcドメイン又は蛍光タンパク質である請求項１～３の何れか一項に記載された抗体。
  5. 前記抗体は，ラクダ科動物に由来するVHH及びヒトIgG1又はIgG4のFcドメインを含むキメラ抗体、又はラクダ科動物に由来するVHHをヒト化した後に得られたVHH及びヒトIgG1又はIgG4のFcドメインを含むヒト化抗体である請求項４に記載された抗体。
  6. 前記抗体は，アルパカに由来するVHH及びヒトIgG1のFcドメインを含むキメラ抗体である請求項５に記載された抗体。
  7. 前記抗体は，ヒトCLDN18.2の細胞外ドメイン1（ECD1）に結合する請求項１～６の何れか一項に記載された抗体。
  8. 請求項１～７の何れか一項に記載された抗体をコードする核酸配列を含む単離された核酸分子。
  9. SEQ ID NO: 22,58及び64のうちの何れか１つの配列を含むか又はそれからなる請求項８に記載された単離された核酸分子。
  10. 請求項８又は９に記載された単離された核酸分子を含む発現ベクター。
  11. 請求項１０に記載された発現ベクターを含む宿主細胞。
  12. 少なくとも１つの請求項１～７の何れか一項に記載された抗体及び医薬上許容される担体を含む薬物組成物であって、
    前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，IgGのFcドメインに融合する、薬物組成物。
  13. 前記抗体をコードする発現ベクターを含有する宿主細胞を培養するステップと，
    培養上清から前記抗体を単離するステップと，
    を含む，請求項１～７の何れか一項に記載された抗体の調製方法。
  14. 被験者におけるCLDN18.2に関連する病症を治療するための請求項１～７の何れか一項に記載された抗体であって、
    前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，IgGのFcドメインに融合する、抗体。
  15. 前記CLDN18.2に関連する病症は，CLDN18.2を発現する細胞が関与する疾患又はCLDN18.2を発現する細胞に関連する疾患を含む請求項１４に記載された抗体。
  16. 前記CLDN18.2に関連する病症は癌である請求項１４又は１５に記載された抗体。
  17. 前記癌は，骨癌、血液癌、肺癌、肝臓癌、膵臓癌、皮膚癌、頭頸部癌、皮膚又は眼内黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門部癌、胃癌、結腸癌、乳癌、前立腺癌、性器及び生殖器の癌、ホジキン病、食道癌、小腸癌、内分泌系癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟組織肉腫、膀胱癌、腎臓癌、腎細胞癌、腎盂癌、中枢神経系（CNS）腫瘍、神経外胚葉癌、脊髄軸腫瘍、神経膠腫、髄膜腫及び下垂体腺腫を含む請求項１６に記載された抗体。
  18. 前記癌は胃癌である請求項１７に記載された抗体。
  19. 請求項１～７の何れか一項に記載された抗体を含む容器を含むCLDN18.2に関連する病症を治療又は診断するためのキットであって、
    前記免疫グロブリン単一可変ドメインは，IgGのFcドメインに融合する、キット。
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