JP7611894B2 - 抗体およびその抗原結合フラグメントの機能的な親和性を高めるための修飾されたFc領域 - Google Patents
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Description
本発明の抗原結合分子は、抗体のフラグメント、具体的には抗体の抗原結合フラグメントであり得る。抗原結合フラグメントは、1つ以上の抗原結合領域を含む。全抗体のフラグメントは、抗原結合の機能を行うことができることが示されている。結合フラグメントの例は、(i)VLドメイン、VHドメイン、CLドメイン、およびCH1ドメインからなるFabフラグメント;(ii)VHドメインおよびCH1ドメインからなるFdフラグメント;(iii)単一の抗体のVLドメインおよびVHドメインからなるFvフラグメント;(iv)VHドメインからなるdAbフラグメント(Ward, E.S. et al., Nature 341:544-546(1989));(v)単離されたCDR領域;(vi)2つの結合したFabフラグメントを含む二価フラグメントである、F(ab’)2フラグメント;(vii)VHドメインおよびVLドメインが、抗原結合部位を形成するために2つのドメインを結合させるペプチドリンカーにより結合している、一本鎖Fv分子(scFv)(Bird et al., Science 242:423-426 (1988);Huston et al., PNAS USA 85:5879-5883 (1988));(viii)二重特異性の一本鎖Fv二量体(国際特許公開公報第92/09965号)、ならびに(ix)「ジアボディ」(遺伝子融合により構築される多価または多重特異性フラグメント)(国際特許公開公報第94/13804号;P. Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993))である。通常、フラグメントは、Fab、F(ab’)2もしくはFvフラグメント、またはscFv分子である。
また本発明は、本明細書中開示されるいずれかのペプチド配列のバリアントまで及ぶ。本明細書中使用される場合、用語「バリアント」は、同様のアミノ酸配列を有し、かつ/または同じ機能を保持するタンパク質に関する。たとえば、用語「バリアント」は、1つ以上のアミノ酸の付加、欠失、置換などを含むタンパク質またはポリペプチドを包有する。本発明のバリアントの例は、1つ以上のアミノ酸を1つ以上の他のアミノ酸で置換されていることを除き以下に定義されるペプチドを含むタンパク質である。アミノ酸の置換は、たとえば、アミノ酸配列の傾向を低減または排除するためになされ得る。あるいは、アミノ酸の置換は、必要に応じて、抗原の親和性を改善するため、または抗体をヒト化もしくは非免疫化(deimmunise)するためになされ得る。記述した抗体の親和性が成熟したバリアント、ヒト化バリアント、および非免疫化したバリアント、ならびに抗体の配列の何らかの傾向を低減または排除するためのアミノ酸の置換を含むバリアントが、本明細書中に提供される。
当業者は、様々なアミノ酸が同様の特性を有することを認識している。物質の1つ以上のこのようなアミノ酸は、多くの場合、その物質の望ましい活性を排除することなく、1つ以上の他のこのようなアミノ酸で置換され得る。
抗体などの治療用タンパク質は、化学的な修飾および翻訳後修飾(PTM)により、本来は異種性かつ複雑である。修飾は、宿主細胞系、保存または製造の間の製造または条件で使用されるプロセスなどの多くの要因により引き起こされ得る。修飾は、分子自体の化学的安定性または集積の可能性に関連し得、よってこれは、抗体の固有の物理的な安定性に作用する。製造または保存の間に修飾を自然に起こし得る所定の抗体配列におけるアミノ酸のモチーフまたは残基は、傾向(liability)と呼ばれる。よって、修飾および分解に対する抗体の影響の受けやすさを低減するための傾向を提示するため、抗体配列に対して変異が作製され得る。
材料、細胞、および抗体
全てのがん細胞株:COLO205、HCT15(C170、C170HM2)、AGS、COLO201、ST16、MCF7、OVCAR3、H322、OVCA4、LoVo、MKN45、791T、BT474、MDA-MB231、SKBR3、SKOV3、および791T、ならびにマウスのメラノーマNS0細胞株は、ATCC(Virginia, USA)から購入した。全ての細胞株は、短いタンデム反復プロファイリングを使用して確認した。ヒト血清アルブミン(HSA)-APD-シアリル-LewisaおよびHSA-APD-Lewisaは、IsoSepAB(Sweden)製であった。Erb2-Hisは、AbcamおよびStratechから供給された。細胞株は、10%のウシ胎仔血清、L-グルタミン(2mM)、および緩衝された炭酸水素ナトリウムを含むRPMI1640培地(Sigma)またはDMEM高グルコースで維持した。親のマウスFG88およびFG129のmAbは、以前に記載されるように作製した(Chua et al. 2015)。
本発明者らのハイブリドーマにより産生されるmAbのキメラIgG1バリアント(FG88.2およびFG129)を作製するために、各mAbをコードする重鎖および軽鎖の可変領域を、制限酵素BamHI/BsiWI(軽鎖の位置)またはHindIII/AfeI(重鎖の位置)を使用してpDCOrigベクターに導入した(Metheringham et al. 2009)。完全なmIgG3定常領域および相互交換されたmIgG3-IgG1ドメインおよび単一の残基の変化を含む、合成の重鎖定常領域が、Eurofins MWG(Ebersberg, Germany)から設計および注文された。通常、これは、1054bpのカセットを含み、JH/CHジャンクションのAfeI制限部位からCHストップコドンに対するXbaI部位の3´末端にわたる。合成遺伝子は、専売のEurofinsベクターで供給した。マキシプレップ(plasmid maxi kit, Qiagen)の後、15μgのプラスミドDNAを、AfeIおよびXbaI(両方ともNEB)で消化し、インサートゲルを精製した(QIAquick gel extraction kit, Qiagen)。このインサートを、ライゲーション(T4 DNAリガーゼ、NEB、製造社の推奨による)によりAfeI/XbaIで消化したベクターpOrigHiB(Metheringham et al. 2009)に導入した。配列の確認およびmaxiprepの後、15μgのプラスミドDNAをAfeIおよびAvrII(両方ともNEB)で消化し、インサートゲルを精製した。次に、このインサートを、ライゲーションによりAfeI/AvrIIで消化したベクターpDCOrigに導入した。
mAbコンストラクトを、ExpiFectamine(商標)293 Transfection kit(Gibco, LifeTechnologies)を使用するExpi293F(商標)細胞の一時的なトランスフェクションにより得た。簡潔に述べると、HEK293細胞の懸濁液(100ml、2×106/ml)を100μgのDNAでトランスフェクトし、トランスフェクションから7日後に、条件付けした培地を回収した。条件付けしたトランスフェクションの上清を、0.22μmのボトルトップフィルター(Merck Millipore)を介してろ過し、アジ化ナトリウムを0.2(w/v)%の最終濃度となるまで添加した。抗体を、AKTA FPLC(GE Healthcare)を使用してプロテインGのカラム(HiTrap ProteinG HP, GE Healthcare)で精製した。カラムを、PBS/Trisバッファー(50mMのTris/HClを含むPBS、pH7.0)で洗浄した後、100mMのグリシン、pH12(0.05(v/v)%のTween 20が補充されている)に、迅速(2ml)な勾配で抗体を溶出し、2mlのフラクションを回収した。mAbを含むフラクションを、集め、中和し(1MのHClを使用)、濃度を決定した。次に、全ての一時的に発現したmAbコンストラクトを、mAbコンストラクトの正確なフォールディングの読み取りとしてフローサイトメトリーを使用し、親のmAbと比較し細胞の結合に関して分析した(データ不図示)。
がん細胞(1×105)を、以前に記載(Chua et al. 2015)されているように、一次mAb(33.3nmol/Lまたは滴定済み)と4℃で1時間インキュベートした後、抗マウス/抗ヒトFITC標識二次抗体と4℃で1時間インキュベートし、0.4%のホルムアルデヒドで固定した。染色したサンプルを、MACSQuant 10フローサイトメーターで分析し、FlowJo v10を使用して分析した。
Lewisa-またはシアリル-Lewisa-APD-HSAに対する88および129mAbの結合の動的なパラメータを、表面プラズモン共鳴(SPR, Biacore 3000, GE Healthcare)により決定した。増大する濃度(0.3nmol/Lから200nmol/L)のmAbを、CM5チップを通して注入し、データを、BIAevaluation 4.1を使用して異種性のリガンド結合モデルに適合した。このチップは、4種の細胞を含み、このうちの2つは、HSAでコーティングされており(インライン参照細胞)、残りの2つは、少量(30~80の応答単位(RU))および多量(360~390RU)の各グリカン-APD-HSAでコーティングされていた。
PIの取り込みおよび増殖阻害を行わせ、mAbの直接的な細胞傷害性作用を分析した。COLO205細胞、HCT-15細胞、またはBT474細胞(5×104)を、mAbと37℃で2時間インキュベートした後、1μgのPIを30分間添加した。細胞を、PBSに再懸濁し、Beckman Coulter FC-500またはMACSQuant 10フローサイトメーターにて実験を行い、それぞれWinMDI 2.9またはFlowJo v10ソフトウェアで分析した。
HCT-15またはCOLO205細胞(1×105)を、無菌性のカバーチップ上で24時間増殖させた後、37℃で18時間にわたりmAb(0.2μmol/L)を添加した。対照は、培地単独および0.5(v/v)%の過酸化水素(H2O2)(Sigma)を含んでいた。細胞を、あらかじめ温めた0.1Mのカコジル酸ナトリウムバッファーpH7.4(SDB)で洗浄し、12.5(v/v)%のグルタルアルデヒドで24時間固定した。固定した細胞を、SDBで2回洗浄し、1(v/v)%の四酸化オスミウム(pH7.4)で45分間さらに固定(post-fixed)した。H2Oで最終的な洗浄を行った後、細胞を、増大する濃度のエタノールにおいて脱水させ、臨界点乾燥に曝した後、金でスパッタリングを行い、SEM分析を行った(JSM-840 SEM, JEOL)。
この試験は、NCRI、LASA、およびFELASのガイドラインに従い、UK Home Office Licenceの下CrownBio UKにより行った。COLO 205のヒトの結腸直腸腺癌モデルの皮下腫瘍を、年齢が一致した雌性のBALB/cヌードマウスCharles River, UK)において、5×106個の生細胞を含む0.1mlの血清フリーのRPMI:Matrigel(1:1)を各マウスの左側腹部に注射することにより確立した。試験6日目に、マウス(n=10)を、それらの平均腫瘍体積(約103mm3±13mm3)に基づく処置グループに無作為に割り当て、最大5週目まで、mAb(0.1mg)またはビヒクル(PBS、100μl)を、隔週にて静脈内(i.v.)に投与した。体重および腫瘍体積を、週に3回評価し、腫瘍体積の低減を、Bonferroniの事後検定(相互作用係数;GraphPad Prism v 7.4(GraphPad Inc, La Jolla, CA)を伴う2元ANOVA検定を使用して統計的に分析した。
ここで、本発明を、以下の実施例および添付の図面を参照してさらに説明する。
以前に、ハイブリドーマにより産生されたmIgG3 mAb FG88.2が、補体またはエフェクター細胞の非存在下で、COLO205およびHCT15などの高結合がん細胞株に直接的な細胞傷害性作用を発揮することが示されている(Chua et al. 2015)。この直接的な細胞傷害性は、腫瘍溶解性の機構を介して、mAbにより誘導される細胞の凝集、増殖阻害、および不規則なポア形成を含んでいた。その後、本発明者らは、臨床での実施のため、キメラのHEK293により発現されるIgG1 mAb、88IgG1を作製した。88IgG1は、ハイブリドーマにより産生されるFG88.2およびHEK293により発現される88mIgG3と比較して、同等のHCT15およびCOLO205がん細胞の結合レベルを維持していた(図1A)。後者のmAbは、マウスハイブリドーマ対HEK293細胞の使用により、差次的なFcグリコシル化などの発現系に関連する作用を排除するように作製された。驚くべきことに、88IgG1は、2つの機能的なアッセイのPIの取り込みおよび増殖阻害を通して、88mIgG3と比較して有意に低いCOLO205およびHCT15での直接的な細胞傷害性を呈した(図1B-D)。また88mIgG3は、ハイブリドーマにより産生されるFG88.2と比較して控えめな直接的な細胞傷害性の低減を示し、2つの発現状況(マウスハイブリドーマ対HEK293細胞)によるFc領域の差次的なグリコシル化が、この作用に寄与し得ることが示唆される。これは、直接的な細胞殺滅が異なるアイソタイプの動的な結合に関連していたことを示唆している。結果として、本発明者らのアイソタイプを切り替えたmAbの動的な結合を、SPRを使用してLewisa-APD-HSAでコーディングしたチップで分析した(表1)。FG88.2は、高密度のフローセルでの迅速な見かけ上のオン速度(kon約104 1/smol/L)および非常に遅いオフ速度(koff約10-6 1/s)を伴う強力なLewisa-APD-HSA結合を呈した。HEK293により産生される88mIgG3は、FG88.2と比較してより速い見かけ上のオン速度(kon約×105 1/smol/L)およびいくらか速いオフ速度(koff約10-4 1/s)を呈し、これは、FG88.2と比較してわずかに低い細胞傷害性を説明し得る。比較すると、88IgG1は、迅速な見かけ上のオン速度(kon約105 1/smol/L)でその標的と結合するが、mIgG3アイソタイプとは対照的に、はるかに速い解離相(見かけのkoff約10-2 1/smol/L)を呈し、これは、がん細胞結合後のその細胞傷害性活性の低減の根拠となる可能性がある。低密度フローセルでのmAb結合挙動は、3つ全てのmAbで10-8mol/Lの大きさの平衡解離定数(Kd)を伴う3つのmAb間でほぼ同等であった。
まとめると、この結果は、高いLewisa-APD-HSAの機能的な親和性が、FG88および88mIgG3により呈され、おそらくはこのアイソタイプの分子間協同作用からもたらされる、それらの遅い解離により主に駆動され、高結合がん細胞株に及ぼすそれらの直接的な細胞傷害性作用に寄与することを示唆していた。よって、本発明者らは、選択されたmIgG3定常領域の残基を88IgG1へ移動することを介して、直接的な細胞傷害性活性を伴うIgG1のがんグリカンを標的とするmAbを操作することに着手した。最初に、mIgG3の寄与領域を、mIgG3 CH1、CH2、またはCH3ドメインを含む、ハイブリッド88IgG1コンストラクトの作製を介して同定した。予備分析は、mIgG3 CH1の88IgG1への導入(1m1)が細胞傷害性の有意な増大をもたらさなかったため88mIgG3の直接的な細胞傷害能に対するmIgG3 CH1の寄与はごくわずかであることを解明した(図2Aおよび2B)。逆に、IgG1 CH1を88mIgG3へ導入すること(3h1)は、同様に、殺滅活性の有意な低減を引き起こさなかった(図2Aおよび2B)。次に、機能獲得の手法において、mIgG3 CH2ドメインおよびCH3ドメインを、別々に、88IgG1に導入した。マウスCH3を含む88IgG1(1m3)は、88IgG1と比較して、HCT15でのPIの取り込みの有意な増加およびCOLO205細胞の増殖阻害の有意な増大を呈した(図2CおよびD)。マウスCH2を88IgG1に導入すること(1m2)は、両方のアッセイを通してく有意ではない殺滅活性の増大をもたらした(図2CおよびD)。両方のドメインによりなされた寄与の確認として、逆の戦略を続けて行い、これにより、細胞傷害性活性の喪失が、IgG1のCH2ドメインまたはCH3ドメインの88mIgG3への導入により評価された。このシナリオは、IgG1 CH3を含む88mG3(3h3)で細胞傷害性の有意な減少をもたらし、以前の機能獲得の結果を裏付けている。重要なことに、この戦略はまた、ヒトCH2を含む88mIgG3(3h2)が細胞傷害性活性の有意な減少を呈したため、マウスCH2による小さな寄与を同定した(図2CおよびD)。次に、ハイブリッドコンストラクトの動的な結合の挙動を分析した。ハイブリッドコンストラクト1m3は、中程度ではあるが有意な機能的な親和性の増大(Kdの減少)を呈し、対してヒトCH3を含む3h3は、機能的な親和性の有意な減少(Kdの増大、図2E)を呈し、両方の場合において、直接的な細胞傷害性が反映されている。コンストラクト3h2におけるヒトCH2もまた、中程度ではあるが有意な機能的な親和性の低下をもたらした。全ての場合で、機能的な親和性の変化は、主に、mAbのオフ速度の変化により駆動され、ここで1m3は、88IgG1と比較して有意に減少したオフ速度を示し、3h3および3h2は、88mIgG3と比較して有意に高いオフ速度を呈する(図2F)。コンストラクト1m2におけるマウスCH2は、機能的な親和性の増大も、オフ速度の減少ももたらさず、88IgG1と比較して有意ではないこのコンストラクトの細胞傷害性の根拠をなす(図2CおよびD)。まとめると、この結果は、マウスCH3が、細胞傷害性および動的な結合へのより顕著な寄与を有し、対してマウスCH2による寄与は小さく、機能喪失の状況でのみ観察されることを表している。
マウスCH3により提供される細胞傷害性作用は完全ではないため、他の寄与する残基をさらに絞り込むために、本発明者らは、ハイブリッド88mAbコンストラクトを設計した(ここでCH2ドメインおよびCH3ドメインは、10の残基の重複を含むジャンクション領域を伴う2つのサブドメイン(SD)にさらに細分された:CH2:SD232-294およびSD286-345ならびにCH3:SD339-397およびSD390-447)。COLO205では、SD339-397およびSD286-345は両方とも、類似する有意な細胞傷害性の増大をもたらし、これは低い濃度で最も明らかであり、対して単独または組み合わせた(不図示)SD232-294およびSD390-447は、細胞傷害性に重要ではなかった(図3AおよびC)。しかしながら、HCT15では、SD339-397の中の残基による有意な寄与は、SD286-345の寄与よりも大きく(図3BおよびD)、グリコ抗原密度および組成物のわずかな差異が、mAb結合およびその後の細胞傷害性活性を調節し得ることを示唆している。厳密に述べると、組み合わせたmIgG3 SD286-345およびSD339-397(SD286-397)を含む88IgG1は、両細胞株にて両方のアッセイを通して88mIgG3の全ての細胞傷害性を実質的に回復させ(図3A~D)、さらなるサブドメインを追加する必要性を排除した。88IgG1と比較したサブドメインコンストラクトの機能的な親和性の分析は、SD286-397、およびSD339-397での機能的な親和性の著しい改善を明らかにし、これは両方とも88mIgG3の機能的な親和性と一致し、SD286-345ではより控えめに改善した(図3E)。機能的な親和性の改善は、SD286-397およびSD339-397での見かけのオフ速度(~約10-6 1/s)の著しい低下から主にもたらされ、ここでSD286-345のオフ速度は、より控えめな改善(約10-3 1/s)を示している(図3F)。これら結果は、細胞傷害性の知見にさらに重みを与え、低減した標的解離速度を有するmAbを作製することが直接的な細胞傷害性を支援することを示唆している。
26のmIgG3残基の存在により作製した、本発明者らのハイブリッドSD286-306+339-378コンストラクトの潜在的な免疫原性を評価するために、本発明者らは、MHCII結合エピトープに関するSD286-306+339-378の配列のin silicoでのスクリーニングを行った(Immune Epitope Database, IEDB)。クラスII制限Tヘルパー細胞は、液性免疫応答により関連しており、予測された結合クラスターは、T細胞応答の強力な指標であることが示されている(Jawa et al. 2013)。いくつかの高いスコアの結合エピトープを含む2つのMHCII結合クラスター:クラスター1(残基294-315)およびクラスター2(残基365-393)を同定した(図5/図20)。クラスター1の中でのヒトの残基への3つのマウスの残基、294(AからE)、300(FからY)および305(AからV)の復帰は、個体が寛容化されているヒト配列セクションをもたらした。同様に、339-378領域の中の2つの残基351(IからL)および371(NからG)の反転は、2つのMHCII結合コアを除去した。よって、本発明者らは、上記のin silicoでのスクリーニングに基づき、2つのさらなるSD286-306+339-378ベースのコンストラクト:それぞれ3つおよび2つの復帰したヒト残基を含むクラスター1(DI1)および2(DI2)を作製し、それらの細胞傷害性をアッセイした。DI1およびDI2は、88IgG1と比較して細胞傷害性の改善を有意に維持したが、DI2は、88mIgG3と比較して小さいが一定した活性の減少を示した(図6AおよびB)。さらに、88DI1の場合、直接的な細胞傷害性は、88mIgG3と有意に異ならない見かけのオフ速度(約10-4 1/s)および0.5×10-9nmol/LのKdを伴う、有用な機能的な親和性のプロファイルと一致していた(図6C、表2)。対照的に、DI2は、88mIgG3と比較して有意に減少した機能的な親和性を呈した(図6C)。これら知見に基づき、本発明者らは、その免疫エフェクター機能のさらなる分析のため、23のmIgG3残基を含む88DI1に焦点を当て、改善された「i」(improved)88G1と再度名付けた。88IgG1は、ナノモル以下のEC50を伴うCOLO205での強力なADCC活性を示し(図6D)、これは、FG88の強力な免疫エフェクター機能と一致していた(Chua et al. 2015)。同様に、i88G1は、88IgG1(EC50 0.13nmol/L)と比較していくらか低減したが強力な、ナノモル以下のEC50(0.35nmol/L)を伴うADCCを呈した。i88G1のCDC活性は、88IgG1と比較して控えめに改善した(図6E、表2)。
近年、本発明者らは、がんの免疫療法に対し可能性のある開発でシアリル-ジ-Lewisaを認識するmAb(129mAb)の作製を記載した。129mAbは、主にその非常に制限された正常な組織の反応性からもたらされる上述の88mAbと比較したより有用な腫瘍対正常なヒト組織の分布を有する。ハイブリドーマにより産生されるFG129、マウスIgG1mAb、およびキメラ129IgG1は全て直接的な細胞傷害性を呈さない。これにより、本発明者らは、23の上記で選択したmIgG3の定常領域の残基のCH129のFc領域への導入が、直接的な細胞傷害性および改善した機能的な親和性を伴う「i」129G1をもたらし、よって優れた臨床上の有用性を呈するとの仮説を試験した。
また本発明者らは、幅広い範囲の腫瘍組織分布および好ましい正常ヒト組織への結合性を伴うモノ特異的なLewisy結合のmAbの、27mAbを作製した。このmIgG3 mAbは、Lewisyを発現するAGSおよびMCF7細胞株で直接的な細胞殺滅を呈し、キメラ27IgG1はこれを呈さなかった(図8AおよびB)。本発明者らは、本発明者らの選択された23のmG3残基を27IgG1へ導入することにより、i27G1を作製し、その直接的な細胞殺滅能を分析した。MCF7およびAGSの両方で、i27G1は、27IgG1と比較して有意に改善した直接的な細胞殺滅を呈し、これは、27mG3 mAbと同等であった(図8AおよびB)。さらに、i27G1は、27IgG1と比較して有意に改善した機能的なLewisyの親和性を呈する(図8C)。重要なことに、i27G1のエフェクター機能、ADCC、およびCDCは全て、MCF7で27IgG1と同等であった(図8Dおよび8E)。
23の選択されたmG3残基のそれぞれの個別の寄与を評価するために、i88G1(実施例4)に基づく単一の復帰変異体の戦略を行った。i88G1における23のmG3残基のそれぞれを、単独で、hG1残基に復帰させ、結果得られるコンストラクトを、細胞増殖アッセイ(CCK-8, Sigma 96992)を使用して、親のi88G1と比較して、直接的な細胞殺滅に関してCOLO205およびHCT15で分析した。一定の濃度のパーセンテージの殺滅を、同じ実験の同じ濃度のi88G1による対応するパーセンテージの殺滅に対して正規化し、複数の実験を通した細胞殺滅を関連付けた。大部分のi88G1復帰変異体コンストラクトは、COLO205細胞に対して良好な直接的な細胞殺滅を保持していた(図9A)。残基342、343、345、361、362、374、および376(合計7つ)は、1未満の正規化された殺滅の平均を有し、高結合COLO205細胞株での直接的な細胞殺滅に重要であるとみなされた。対照的に、これら7つの残基が単独で復帰した場合、この最小コンストラクトは、発現/フォールディングせず、よってこのコンストラクトは追跡されていない。中程度の結合のHCT15の直接的な細胞殺滅は、hG1残基への反転に対してより感受性があることが証明されており、ここでは、8つの復帰した残基(339、344、354、356、357、358、370、373)のみが1標準偏差の範囲内までi88G1の細胞殺滅を維持しており、よって15のmG3残基:N286T、K288W、K290Q、Q342R、P343A、E345T、L351I、T359S、N361K、Q362K、G371N、P374S、S375E、D376A、A378Sの保持を必要とする(図9B)。後者のコンストラクトは、88および129mAb、i88G1v2およびi129G1v2のそれぞれの両方で作製し、COLO205およびHCT15でそれらの細胞殺滅を分析した。i88G1v2およびi129G1v2によるCOLO205の直接的な細胞殺滅は、i88G1およびi129G1のそれぞれにより観察されるものと同等であった(図9Cおよび9D)。また、i88G1v2によるHCT15の直接的な細胞殺滅は、i88G1により観察されるものと一致していた(図9E)。
免疫処置に対する抗体応答の分析:最初に抗体の力価を、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)によりモニタリングした。その後、ST16の全体および細胞膜の脂質抽出物を使用する薄層クロマトグラフィー(TLC)分析、ST16腫瘍細胞を使用するフローサイトメトリー分析(FACS)ならびにST16の全細胞抽出物、全体および細胞膜の脂質抽出物を使用するウェスタンブロットを行った。出血させる前の血清対照と比較して最良の応答を有するとみなしたマウスに、融合前のST16細胞膜脂質抽出物を静脈内(i.v.)にブーストした。
多くの抗グリカンmAbは、エフェクター細胞または補体を必要とせずに抗原陽性細胞株で直接的な細胞死を誘導することが示されている。これは、腫瘍が免疫が介在する細胞死を回避するための機構を開発し得るため、それらのin vivoでの効果を潜在的に高め得る。この特性は、主に、mIgG3のアイソタイプのグリカン結合mAbに関連し、よってその特性は、キメラ化またはヒト化により失われる。
ヒト化したmAb(ヒト化27)およびキメラmAb(CH27)は、がん細胞株での滴定で類似の細胞結合パターンを示した(図13A~E)。平衡親和性定数は、全体的に同じ位数であるが、親のマウス抗体と比較してわずかに高く(図13F~G)、ヒト化27およびCH27の最大結合能は、マウスmAbの値と比較して大きかった。この結果は、ヒト化プロセスのアウトカムの成功を示唆している。
ヒトIgG1 27のキメラ(27IgG1)の直接的な細胞殺滅を高めるために、本発明者らは、選択したmIgG3定常領域の残基をIgG1のFcドメインに移し、これにより、in vitroでの直接的な細胞殺滅能が改善された、改善された「i27G1」LewisYグリカン結合mAbを作製した。
がんに関連するタンパク質を標的とする抗体のアミノ酸残基を変えることが機能的な親和性の増大をもたらしたかどうかを評価するために、「iG1」残基(23、「v1」および15、「v2」)を変え、SPR分析を介して、結果得られる「改善された」抗体のバリアントの親和性を決定した。機能的な親和性を決定するために、3つのトラスツズマブ抗体コンストラクトを、3つの異なるリガンド密度にてHER2でコーティングしたチップを通して滴定した。複数回の動態解析(90nM~0.37Mの濃度範囲)が行われ、これは、低密度(20RU)および高密度(200RU)の表面の両方でWTと比較して高いiTv1およびiTv2による機能的な親和性を示した(図18A)。この改善は、高密度の表面でより顕著であり、主にオフ速度の低下(WTの6.0×10-7 1/sに対しiTV1で8.5×10-8 1/sおよびiTv2で7.4×10-8 1/s)により駆動された。HEK293で発現した野生型のトラスツズマブ(WT)および「改善された」バリアント(iTv1およびiTv2)は、HER2を発現する細胞株SKBR3およびBT474に対して高結合、ならびにMDA-MB231およびSKOV3に対して低い~中程度の結合を示した(図18B)。iTv1およびiTv2によるより強力な結合が差次的な細胞傷害性をもたらすかどうかを評価するために、MDA-MB231での増殖阻害およびBT474でのPIの取り込みを探索した。iTv2は、MDA-MB231にてWTと比較して有意に改善した増殖阻害を呈し(図18C)、ここでiTv1およびiTv2は、WTと比較してBT474細胞で改善されたPIの取り込みを示し、これは試験した最も高い濃度で最も顕著であった(図18D)。HER2でコーティングしたELISAプレートで直接HRPO標識したmAbの滴定から、WTと比較して改善したiTv2による結合が明らかとなった。まとめると、これら結果は、「iG1」による改善された機能的な親和性が、トラスツズマブコンストラクトを操作することを表しており、本発明者らの手法が、グリカン標的に加え、タンパク質を標的とするmAbにも有用であり得ることが示唆される。しかしながら、本発明者らの操作手法の最終的な結果は、標的密度と組み合わせたmAbの複雑な結合活性間での関係に依存する。
本発明の特定の実施形態を、以下に記載する。以下の実施形態の様々な特性は、他の実施形態の特性と組み合わされてよく、たとえば、配列モチーフなどの構造的な特性は、請求される抗体またはその抗原結合フラグメントの機能的な特性と組み合わせられ得る。
(i)TXWXQ
(ii)RAXTXXXXXI
(iii)SXKKXXXXXXXXNXXSEAXS
(iv)NXXSEAXS
(式中Xは任意のアミノ酸である)
から選択されるいずれか1つ以上のモチーフを含む、修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
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Claims (28)
- イムノグロブリンのFc領域の残基および結合領域を含む修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントであって、Fc領域のN286、K288、K290、Q342、P343、E345、L351、T359、N361、Q362、G371、P374、S375、D376、およびA378を含む残基が、マウスIgG3抗体由来の対応する残基へと修飾されており、修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントが、野生型のFc領域残基を含む対応するIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントと比較して高い機能的な親和性を有する、修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントの機能的な親和性が、野生型のFc領域残基を含む対応するIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントと比較して少なくとも10%高い、請求項1に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントが、野生型のFc領域残基を含む対応するIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントと比較して高い直接的な細胞殺滅を有する、請求項1または2に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントの直接的な細胞殺滅が、野生型のFc領域残基を含む対応するIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントと比較して少なくとも10%高い、請求項3に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- Fc領域の修飾された残基が、N286T、K288W、K290Q、Q342R、P343A、E345T、L351I、T359S、N361K、Q362K、G371N、P374S、S375E、D376A、A378Sを含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- N286、K288、K290、A339、Q342、P343、R344、E345、L351、S354、D356、E357、L358、T359、N361、Q362、K370、G371、Y373、P374、S375、D376、A378を含むFc領域の残基が、マウスIgG3抗体由来の対応する残基へと修飾されている、請求項1~5のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記修飾された残基が、N286T、K288W、K290Q、A339P、Q342R、P343A、R344Q、E345T、L351I、S354P、D356E、E357Q、L358M、T359S、N361K、Q362K、K370T、G371N、Y373F、P374S、S375E、D376A、A378Sを含む、請求項1~6のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- N286、K288、K290、E294、Y300、V305、A339、Q342、P343、R344、E345、L351、S354、D356、E357、L358、T359、N361、Q362、K370、G371、Y373、P374、S375、D376、A378を含むFc領域の残基が、マウスIgG3抗体由来の対応する残基へと修飾されている、請求項1~7のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記修飾された残基が、N286T、K288W、K290Q、E294A、Y300F、V305A、A339P、Q342R、P343A、R344Q、E345T、L351I、S354P、D356E、E357Q、L358M、T359S、N361K、Q362K、K370T、G371N、Y373F、P374S、S375E、D376A、A378Sを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメント。
- イムノグロブリンのFc領域の残基および結合領域を含むIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントの直接的な細胞殺滅能を増大させる方法であって、前記Fc領域のCH2ドメインおよび/またはCH3ドメインの残基を、マウスIgG3のCH2ドメインおよび/またはCH3ドメイン由来の対応する残基と置き換えるステップを含み、置き換えられた前記残基が、N286、K288、K290、Q342、P343、E345、L351、T359、N361、Q362、G371、P374、S375、D376、A378を含む、方法。
- 前記修飾された残基が、N286T、K288W、K290Q、Q342R、P343A、E345T、L351I、T359S、N361K、Q362K、G371N、P374S、S375E、D376A、A378Sを含む、請求項10に記載の方法。
- 前記置き換えられた残基が、N286、K288、K290、A339、Q342、P343、R344、E345、L351、S354、D356、E357、L358、T359、N361、Q362、K370、G371、Y373、P374、S375、D376、A378を含む、請求項10または11に記載の方法。
- 前記修飾された残基が、N286T、K288W、K290Q、A339P、Q342R、P343A、R344Q、E345T、L351I、S354P、D356E、E357Q、L358M、T359S、N361K、Q362K、K370T、G371N、Y373F、P374S、S375E、D376A、A378Sを含む、請求項12に記載の方法。
- 前記置き換えられた残基が、N286、K288、K290、E294、Y300、V305、A339、Q342、P343、R344、E345、L351、S354、D356、E357、L358、T359、N361、Q362、K370、G371、Y373、P374、S375、D376、A378を含む、請求項10~13のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾された残基が、N286T、K288W、K290Q、E294A、Y300F、V305A、A339P、Q342R、P343A、R344Q、E345T、L351I、S354P、D356E、E357Q、L358M、T359S、N361K、Q362K、K370T、G371N、Y373F、P374S、S375E、D376A、A378Sを含む、請求項14に記載の方法。
- 請求項1~9のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体またはその抗原結合フラグメントと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 少なくとも1つの他の治療用作用物質をさらに含む、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記他の治療用作用物質が免疫調節剤である、請求項17に記載の医薬組成物。
- 医薬として使用するための、請求項1~9のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体もしくはその抗原結合フラグメントまたは請求項16、17、もしくは18に記載の組成物。
- がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、または感染性疾患の処置に使用するための、請求項1~9のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体もしくはその抗原結合フラグメントまたは請求項16、17、もしくは18に記載の組成物。
- 疾患を有する個体を処置する方法に使用するための、請求項16、17、または18に記載の医薬組成物であって、前記方法は、請求項16、17、または18に記載の組成物の薬学的有効量を前記個体に投与するステップを含む、医薬組成物。
- 前記疾患が、がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、および感染性疾患の群から選択される、請求項21に記載の医薬組成物。
- 前記方法が、さらなる治療用作用物質を前記個体に投与するステップをさらに含む、請求項21または22に記載の医薬組成物。
- 前記さらなる治療用作用物質が免疫調節剤である、請求項23に記載の医薬組成物。
- 請求項1~9のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体もしくはその抗原結合フラグメントまたは請求項16、17、もしくは18に記載の組成物を含むキットであって、前記修飾されたIgG1抗体もしくはその抗原結合フラグメントまたは組成物が、バイアルなどの1つ以上の容器の中にある、キット。
- 前記修飾されたIgG1抗体もしくはその抗原結合フラグメントまたは組成物が、治療における同時使用、別々の使用、または連続的な使用のためのものである、請求項25に記載のキット。
- 疾患の処置用の医薬の製造のための、請求項1~9のいずれか1項に記載の修飾されたIgG1抗体もしくはその抗原結合フラグメントまたは請求項16、17、もしくは18に記載の組成物の使用。
- 前記疾患が、がん、自己免疫疾患、炎症性疾患、または感染性疾患である、請求項27に記載の使用。
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