JP7624497B2 - ヒトpd-l2抗体およびその使用方法 - Google Patents
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Description
本出願は、参照によりその全体が本明細書に組み入れられる、2018年3月23日に出願された米国仮出願第62/647,546号の優先権の恩典を主張するものである。
2019年3月13日に作成された22.9KB(Microsoft Windows(登録商標)での測定)の「UTFC.P1340WO_ST25.txt」という名称のファイルに含有される配列表が電子的提出により本明細書と共に提出され、当該配列表は参照により本明細書に組み入れられる。
本開示は全体として、薬剤、腫瘍学、および免疫学の分野に関する。より具体的には、本開示は、PD-L2に結合するヒト抗体およびがん治療におけるその使用に関する。
Programmed death-1(PD-1)は、適応免疫応答を調節するB細胞およびT細胞上に発現する細胞表面分子である。T細胞上のPD-1受容体はT細胞活性化後に発現し、細胞表面上に経時的に蓄積し、ホメオスタシス調節の機序としてT細胞応答の減弱に関与し得る。そのリガンドであるPD-L1またはPD-L2によるPD-1の結合は、T細胞増殖、サイトカイン産生、および細胞溶解機能を阻害するシグナルを伝達し、細胞死の重要なチェックポイントを特徴付ける。
そのような状況の下、本開示にしたがって、PD-L2に選択的に結合する、それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対を含む抗体または抗体断片が提供される。抗体または抗体断片は、表1に示されるクローンの可変領域配列対によってコードされてもよいし、表1に示されるクローンの可変領域配列対に対して70%、80%、もしくは90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされてもよいし、表1に示されるクローンの配列対に対して95%もしくはより高い同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされてもよい。抗体または抗体断片は、表2からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列を含んでもよいし、表2からのクローンの配列対に対して70%、80%もしくは90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含んでもよいし、表2からのクローンの配列対に対して95%もしくはより高い同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含んでもよい。
それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対を含む、抗体または抗体断片。
[本発明1002]
表1からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1001の抗体または抗体断片。
[本発明1003]
表1からのクローンの配列対に対して少なくとも70%、80%、または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1001の抗体または抗体断片。
[本発明1004]
表1からのクローンの配列対に対して少なくとも95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1001の抗体または抗体断片。
[本発明1005]
表2からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1001の抗体または抗体断片。
[本発明1006]
表2からのクローンの配列対に対して70%、80%または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1001の抗体または抗体断片。
[本発明1007]
表2からのクローンの配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1001の抗体または抗体断片。
[本発明1008]
前記抗体断片が、組換えscFv(単鎖可変領域フラグメント)抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、またはFv断片である、本発明1001~1007のいずれかの抗体または抗体断片。
[本発明1009]
前記抗体がキメラ抗体である、本発明1001~1007のいずれかの抗体または抗体断片。
[本発明1010]
前記抗体がIgGである、本発明1001~1009のいずれかの抗体または抗体断片。
[本発明1011]
細胞透過性ペプチドをさらに含みかつ/またはイントラボディである、本発明1001~1010のいずれかの抗体または抗体断片。
[本発明1012]
ヒト抗体である、本発明1001~1011のいずれかの抗体または断片。
[本発明1013]
ヒト化抗体である、本発明1001~1011のいずれかの抗体または断片。
[本発明1014]
がんを有する対象を治療する方法であって、それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対を有する抗体または抗体断片を該対象に送達することを含む、方法。
[本発明1015]
前記抗体または抗体断片が、表1に示されるクローンの軽鎖および重鎖の可変領域配列対によってコードされる、本発明1014の方法。
[本発明1016]
前記抗体または抗体断片が、表1に示されるものに対して95%の同一性を有するクローンの軽鎖および重鎖の可変領域配列対によってコードされる、本発明1014または1015の方法。
[本発明1017]
前記抗体または抗体断片が、表1からのクローンの配列対に対して70%、80%、または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1014または1015の方法。
[本発明1018]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1014の方法。
[本発明1019]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対に対して70%、80%または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1014の方法。
[本発明1020]
表2からのクローンの配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1014の方法。
[本発明1021]
前記抗体断片が、組換えscFv(単鎖可変領域フラグメント)抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、またはFv断片である、本発明1014~1020のいずれかの方法。
[本発明1022]
前記抗体がIgGである、本発明1014~1021のいずれかの方法。
[本発明1023]
前記抗体がキメラ抗体である、本発明1014~1020のいずれかの方法。
[本発明1024]
送達が、抗体もしくは抗体断片の投与、または該抗体もしくは抗体断片をコードするRNAもしくはDNA配列もしくはベクターを用いる遺伝子送達を含む、本発明1014~1023のいずれかの方法。
[本発明1025]
抗体または抗体断片をコードするハイブリドーマまたは操作された細胞であって、該抗体または抗体断片が、それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対により特徴付けられる、ハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1026]
前記抗体または抗体断片が、表1からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1025のハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1027]
前記抗体または抗体断片が、表1からのクローンの可変領域配列対に対して少なくとも70%、80%、または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1025のハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1028]
前記抗体または抗体断片が、表1からのクローンの可変領域配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1025のハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1029]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1025のハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1030]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの可変領域配列対に対して少なくとも70%、80%、または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1025のハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1031]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1025のハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1032]
前記抗体断片が、組換えscFv(単鎖可変領域フラグメント)抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、またはFv断片である、本発明1025~1031のいずれかのハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1033]
前記抗体がキメラ抗体である、本発明1025~1032のいずれかのハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1034]
前記抗体がIgGである、本発明1025~1032のいずれかのハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1035]
前記抗体または抗体断片が、細胞透過性ペプチドをさらに含みかつ/またはイントラボディである、本発明1025~1034のいずれかのハイブリドーマまたは操作された細胞。
[本発明1036]
それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対により特徴付けられる1つまたは複数の抗体または抗体断片を含む、ワクチン製剤。
[本発明1037]
少なくとも1つの抗体または抗体断片が、表1からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1036のワクチン製剤。
[本発明1038]
少なくとも1つの抗体または抗体断片が、表1からのクローンの配列対に対して少なくとも70%、80%、または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1036のワクチン製剤。
[本発明1039]
少なくとも1つの抗体または抗体断片が、表1からのクローンの配列対に対して少なくとも95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1036のワクチン製剤。
[本発明1040]
少なくとも1つの抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1036のワクチン製剤。
[本発明1041]
少なくとも1つの抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1036のワクチン製剤。
[本発明1042]
少なくとも1つの抗体断片が、組換えscFv(単鎖可変領域フラグメント)抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、またはFv断片である、本発明1036~1041のいずれかのワクチン製剤。
[本発明1043]
少なくとも1つの抗体がキメラ抗体である、本発明1036~1041のいずれかのワクチン製剤。
[本発明1044]
少なくとも1つの抗体がIgGである、本発明1036~1043のいずれかのワクチン製剤。
[本発明1045]
少なくとも1つの抗体または抗体断片が、細胞透過性ペプチドをさらに含みかつ/またはイントラボディである、本発明1036~1044のいずれかのワクチン製剤。
[本発明1046]
対象においてPD-L2発現細胞を検出する方法であって、
(a)該対象からの試料を、それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対を有する抗体または抗体断片と接触させる工程、ならびに
(b)該試料中の細胞への該抗体または抗体断片の結合によって該試料中のPD-L2発現細胞を検出する工程
を含む、方法。
[本発明1047]
前記試料が体液である、本発明1046の方法。
[本発明1048]
前記試料が組織試料である、本発明1046または1047の方法。
[本発明1049]
検出が、ELISA、RIAまたはウエスタンブロットを含む、本発明1046または1047の方法。
[本発明1050]
工程(a)および(b)の2回目を行い、1回目のアッセイと比較してオルソポックスウイルス抗原レベルの変化を決定することをさらに含む、本発明1046~1049のいずれかの方法。
[本発明1051]
前記抗体または抗体断片が、表1に示されるクローンの可変領域配列対によってコードされる、本発明1046~1050のいずれかの方法。
[本発明1052]
前記抗体または抗体断片が、表1に示されるクローンの可変領域配列対に対して70%、80%、または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1046~1050のいずれかの方法。
[本発明1053]
前記抗体または抗体断片が、表1に示されるクローンの配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列によってコードされる、本発明1046~1050のいずれかの方法。
[本発明1054]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対の通りの軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1046~1050のいずれかの方法。
[本発明1055]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対に対して70%、80%または90%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1046~1050のいずれかの方法。
[本発明1056]
前記抗体または抗体断片が、表2からのクローンの配列対に対して95%の同一性を有する軽鎖および重鎖の可変領域配列を含む、本発明1046~1050のいずれかの方法。
[本発明1057]
前記抗体断片が、組換えscFv(単鎖可変領域フラグメント)抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、またはFv断片である、本発明1046~1056のいずれかの方法。
[本発明1058]
前記細胞ががん細胞である、本発明1046~1057のいずれかの方法。
[本発明1059]
前記がん細胞が、リンパ腫細胞、乳癌細胞、または腎細胞癌細胞である、本発明1058の方法。
[本発明1060]
前記細胞が、免疫抑制に関連する細胞である、本発明1046~1057のいずれかの方法。
[本発明1061]
免疫抑制に関連する前記細胞が、腫瘍微小環境中の非がん性細胞である、本発明1060の方法。
[本発明1062]
前記腫瘍微小環境中の前記非がん性細胞が間質細胞または内皮細胞である、本発明1061の方法。
[本発明1063]
腫瘍微小環境における免疫抑制を治療する方法であって、それぞれ表3および表4からのクローンの重鎖および軽鎖のCDR配列対を有する抗体または抗体断片を対象に送達することを含む、方法。
本発明の他の目的、特徴、および利点は、以下の詳細な説明から明らかとなるであろう。しかしながら、詳細な説明および特定の例は、本発明のある特定の態様を示すが、それは例示のみを目的としていることが理解されるべきであり、本明細書の詳細な説明から本発明の精神および範囲内での様々な変更および改良が当業者に明らかとなるであろう。
本発明者らは、ヒトPD-L2タンパク質に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体を生成した。これらの抗体はPD-L2に結合することが実証されたので、それらはPD-1へのPD-L2の結合を遮断する機会を提供する。それらはまた、治療ペイロードをPD-L2発現がん細胞に送達するために使用され得る。本開示のこれらおよび他の局面は、以下においてよりいっそう詳細に記載されている。
A. 構造
プログラム細胞死リガンド2(PD-L2)は、CD273遺伝子によってコードされるタンパク質である。PD-L2は、妊娠、組織同種移植、自己免疫疾患、がん、および他の疾患状態などの様々な事象の間の免疫抑制において大きな役割を果たし得る31kDaのタンパク質である。ヒトPD-L2タンパク質は、以下に示されるアミノ酸配列によってコードされる。
PD-L2は、その受容体であるPD-1に対するリガンドである。PD-1は、活性化T細胞、B細胞、および骨髄細胞上に見出され得る。PD-1へのPD-L2の結合は免疫学的カスケードを開始させ、それがT細胞の増殖、サイトカイン産生、細胞溶解機能および生存を障害する。PD-1は、抗原特異的CD8+T細胞およびCD4+ヘルパーT細胞の増殖を低減する阻害シグナルを伝達する。PD-L2はまた、複数のがんにおけるPD-1抗体ペムブロリズマブに対する応答性の独立した予測因子であることが示されている(Yearley et al., 2017)。
A. 一般的方法
PD-L2に対する抗体は、当技術分野において周知の標準的方法によって生成され得る(例えば、Antibodies:A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988; U.S.Patent 4,196,265を参照)。モノクローナル抗体(mAb)を生成する方法は、一般に、ポリクローナル抗体を調製する方法と同じ道筋に沿って始まる。これらの両方の方法の最初の工程は、適切な宿主の免疫化、または以前の自然感染により免疫のある対象の同定である。当技術分野において周知の通り、免疫化のための所与の組成物は、その免疫原性が様々であり得る。したがって、多くの場合、宿主免疫系を増強することが必要であり、これはペプチドまたはポリペプチド免疫原をキャリアに連結させることにより達成され得る。例示的かつ好ましいキャリアは、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)およびウシ血清アルブミン(BSA)である。オボアルブミン、マウス血清アルブミン、またはウサギ血清アルブミンなどの他のアルブミンもまたキャリアとして使用することができる。キャリアタンパク質にポリペプチドをコンジュゲートさせるための手段は当技術分野において周知であり、グルタルアルデヒド、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル、カルボジイミド、およびビスジアゾ化ベンジジンが挙げられる。これも当技術分野において周知の通り、アジュバントとして公知の免疫応答の非特異的刺激因子の使用により特定の免疫原組成物の免疫原性を増進させることができる。例示的かつ好ましいアジュバントとしては、完全フロイントアジュバント(殺滅した結核菌(Mycobacterium tuberculosis)を含有する免疫応答の非特異的刺激因子)、不完全フロイントアジュバント、および水酸化アルミニウムアジュバントが挙げられる。
本開示による抗体は、第1の例では、それらの結合特異性(すなわち、PD-L2に対する結合性)により定義することができる。当業者は、当業者に周知の技術を使用して所与の抗体の結合特異性/親和性を評価することにより、そのような抗体が本願の請求項の範囲内に入るかどうかを決定することができる。一局面では、それぞれ表3および4に示されているクローンの重鎖および軽鎖のCDR対を有するモノクローナル抗体が提供される。そのような抗体は、本明細書に記載されている方法を使用して実施例セクションにおいて下記に議論されるクローンにより製造されてもよい。
様々な態様において、発現の向上、交差反応性の向上、またはオフターゲット結合の減少などの様々な理由のために、同定された抗体の配列を改変することを選択することができる。以下は、抗体工学のための関連技術の一般的議論である。
単鎖可変断片(scFv)は、短い(通常、セリン、グリシン)リンカーと共に連結した免疫グロブリンの重鎖および軽鎖の可変領域の融合物である。このキメラ分子は、定常領域の除去およびリンカーペプチドの導入にもかかわらず、元々の免疫グロブリンの特異性を保持する。この改変は、通常、変化されないまま特異性を残す。これらの分子は歴史的に、単一のペプチドとして抗原結合ドメインを発現することが高度に簡便であるファージによる提示を促進するために作出された。あるいは、scFvは、ハイブリドーマに由来するサブクローニングされた重鎖および軽鎖から直接的に作出することができる。単鎖可変断片は、完全抗体分子中に見出され、したがって抗体を精製するために使用される一般的な結合部位(例えば、タンパク質A/G)である定常Fc領域を欠いている。プロテインLはκ軽鎖の可変領域と相互作用するので、これらの断片は、多くの場合、プロテインLを使用して精製/固定化することができる。
ある特定の態様では、本開示の抗体は精製されてもよい。「精製された」という用語は、本明細書において使用される場合、他の成分から単離可能な組成物であって、タンパク質がその天然に得られ得る状態と比べて任意の程度まで精製された組成物を指すことが意図される。したがって、精製されたタンパク質はまた、それが天然に存在し得る環境から解放されたタンパク質を指す。「実質的に精製された」という用語が使用される場合、この指定は、タンパク質またはペプチドが組成物の主成分を形成し、例えば、組成物中のタンパク質の約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約95%、またはそれより多くを構成する組成物を指す。
A. がん
がんは、組織からの細胞のクローン集団の増殖からもたらされる。発がんと称されるがんの発生は、多数の方法でモデル化および特性評価され得る。がんの発生と炎症との関連性が長期にわたり認められてきた。炎症応答は微生物感染に対する宿主防御に関与し、そしてまた組織修復および再生を推進する。かなりの証拠が炎症とがん発生リスクとの繋がりを指摘しており、すなわち、慢性炎症は異形成症に繋がり得る。
本開示は、抗PD-L2抗体を含む薬学的組成物を提供する。特定の態様では、「薬学的に許容される」という用語は、動物、より具体的にはヒトにおいて使用するために連邦もしくは州政府の規制機関により承認され、または米国薬局方もしくは他の一般に認識される薬局方に列記されることを意味する。「担体」という用語は、治療剤がそれと共に投与される希釈剤、賦形剤、またはビヒクルを指す。そのような薬学的担体は、無菌の液体、例えば水および油であってもよく、石油、動物、野菜または合成起源のもの、例えば、ピーナッツ油、大豆油、鉱油、ゴマ油などが挙げられる。他の好適な薬学的賦形剤としては、デンプン、グルコース、ラクトース、スクロース、生理食塩水、デキストロース、ゼラチン、麦芽、コメ、小麦粉、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、タルク、塩化ナトリウム、乾燥スキムミルク、グリセロール、プロピレン、グリコール、水、エタノールなどが挙げられる。
本開示の文脈において、本明細書に記載の抗PD-L2抗体が化学療法的もしくは放射線療法的介入または他の治療と組み合わせて同様に使用され得ることもまた企図されている。特に、抗PD-L2抗体を、PD-L2機能の異なる局面を標的とする他の治療法(例えば、PD-L2の細胞質ドメインを標的とするペプチドおよび小分子)と組み合わせることも効果的であり得る。
がん治療はまた、化学物質ベースの治療と放射線ベースの治療の両方を伴う様々な併用療法を含む。併用化学療法としては、例えば、シスプラチン(CDDP)、カルボプラチン、プロカルバジン、メクロレタミン、シクロホスファミド、カンプトテシン、イホスファミド、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン、ニトロソウレア、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ブレオマイシン、プリカマイシン、マイトマイシン、エトポシド(VP16)、タモキシフェン、ラロキシフェン、エストロゲン受容体結合剤、タキソール、ゲムシタビン、ナベルビン、ファルネシル-タンパク質トランスフェラーゼ阻害剤、トランス白金、5-フルオロウラシル、ビンクリスチン、ビンブラスチンおよびメトトレキサート、テモゾロミド(DTICの水性形態)、または上記のものの任意のアナログもしくは誘導体バリアントが挙げられる。生物学的療法と化学療法の組合せは、生化学療法として公知である。本発明は、がんを治療または予防するために用いられまたは当該技術分野において公知であり得る任意の化学療法剤を企図している。
DNA損傷を引き起こしかつ大規模に使用されてきた他の因子としては、γ線、X線、および/または放射性同位体の腫瘍細胞指向性送達として一般的に公知のものが挙げられる。マイクロ波およびUV照射などの他の形態のDNA損傷因子も企図されている。これらの因子は全て、DNA、DNA前駆体、DNAの複製および修復、ならびに染色体の構築および維持に対する広範囲の損傷をもたらす可能性が最も高い。X線の線量範囲は、長期間(3~4週)にわたる1日当たり50~200レントゲンの線量から、2000~6000レントゲンの単回線量に及ぶ。放射性同位体の線量範囲は広く変動し、同位体の半減期、放出される放射線の強度および種類、ならびに新生物細胞による吸収に依存する。
免疫療法剤は、概して、がん細胞をターゲティングして破壊するために、免疫エフェクター細胞および分子の使用に依拠する。免疫エフェクターは、例えば、腫瘍細胞の表面上の一部のマーカーに特異的な抗体であってもよい。抗体は、単独で治療法のエフェクターとして働いてもよいし、他の細胞を局在化させて実際に細胞殺滅をもたらしてもよい。抗体はまた、薬物または毒素(化学療法剤、放射性核種、リシンA鎖、コレラ毒素、百日咳毒素など)にコンジュゲートしていてもよく、単にターゲティング剤として働いてもよい。代替的に、エフェクターは、腫瘍細胞標的と直接的または間接的に相互作用する表面分子を有するリンパ球であってもよい。様々なエフェクター細胞には、細胞傷害性T細胞およびNK細胞が含まれる。治療モダリティーの組合せ、すなわち、直接的な細胞傷害活性およびFortilinの阻害または低減は、がんの治療において治療的利益を提供する。
さらに別の態様では、二次的治療は、腫瘍関連HLA拘束性ペプチドが投与される前、後、または同時に治療用ポリヌクレオチドが投与される遺伝子療法である。以下の遺伝子産物のうちの1つをコードする第2のベクターと組み合わせた、腫瘍関連HLA拘束性ペプチドをコードするベクターの送達は、標的組織に対する併用抗過剰増殖効果を有する。代替的に、両方の遺伝子をコードする単一のベクターが使用されてもよい。様々なタンパク質が本発明に包含され、その一部が以下に記載されている。本発明と併用されるいくつかの形態の遺伝子療法の標的とされ得る様々な遺伝子が当業者に周知であり、当該遺伝子にはがんに関与する任意の遺伝子が含まれ得る。
がんを有する人々の約60%がある種の手術を受け、当該手術には、予防的手術、診断的または病期分類的手術、治癒的手術、および緩和手術が含まれる。治癒的手術は、本発明の治療、化学療法、放射線療法、ホルモン療法、遺伝子療法、免疫療法および/または代替療法などの他の療法と組み合わせて使用され得るがん治療である。
抗体を少なくとも1つの薬剤と連結させて抗体コンジュゲートを形成させることができる。診断または治療剤としての抗体分子の有効性を高めるために、少なくとも1つの所望の分子または部分を連結または共有結合させるかまたは複合体化させることが慣例として為されている。そのような分子または部分は、少なくとも1つのエフェクターまたはレポーター分子であってもよいがこれらに限定されない。エフェクター分子には、所望の活性、例えば、免疫抑制/抗炎症性を有する分子が含まれる。そのような分子の非限定的な例は上記に示されている。そのような分子は、任意で、該分子が標的部位においてまたはその近くで放出されることを可能とするように設計された切断可能なリンカーを介して取り付けられる。
またさらなる態様では、PD-L2およびその関連抗原に結合し、それを精製する、除去する、定量化する、およびそれ以外に一般に検出するための免疫検出法がある。少数を挙げると、いくつかの免疫検出法としては、酵素連結免疫吸着アッセイ(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、イムノラジオメトリックアッセイ、フルオロイムノアッセイ、化学発光アッセイ、生物発光アッセイ、およびウエスタンブロットが挙げられる。特に、PD-L2抗体の検出および定量のための競合アッセイも提供される。様々な有用な免疫検出法の工程が、例えば、Doolittle and Ben-Zeev(1999)、Gulbis and Galand(1993)、De Jager et al.(1993)、およびNakamura et al.(1987)などの科学文献に記載されている。一般に、免疫結合法は、試料を得ること、および、場合により、免疫複合体の形成を可能とするために効果的な条件下で、本明細書に記載の態様による第1の抗体と試料を接触させることを含む。
最も単純な意味において、イムノアッセイは結合アッセイである。ある特定の好ましいイムノアッセイは、当技術分野において公知の様々な種類の酵素連結免疫吸着アッセイ(ELISA)およびラジオイムノアッセイ(RIA)である。組織切片を使用する免疫組織化学検出もまた特に有用である。しかしながら、検出はそのような技術に限定されないこと、およびウエスタンブロッティング、ドットブロッティング、FACS分析などもまた使用されてもよいことが容易に理解されるであろう。
ウエスタンブロット(あるいはタンパク質イムノブロット)は、組織ホモジネートまたは抽出物の所与の試料中の特定のタンパク質を検出するために使用される分析技術である。それは、ポリペプチドの長さにより(変性条件)またはタンパク質の3D構造(天然/非変性条件)により天然または変性タンパク質を分離するためにゲル電気泳動を使用する。次に、タンパク質を膜(典型的にニトロセルロースまたはPVDF)に転写し、標的タンパク質に特異的な抗体を使用してプロービング(検出)する。
抗体はまた、免疫組織化学(IHC)による研究のために調製された新鮮凍結組織ブロックおよび/またはホルマリン固定、パラフィン包埋組織ブロックのいずれとも組み合わせて使用することができる。これらの粒子検体から組織ブロックを調製する方法は、様々な予後因子の先行するIHC研究において使用されて成功しており、当業者に周知である(Brown et al, 1990; Abbondanzo et al, 1990; Allred et al, 1990)。
またさらなる態様では、上記される免疫検出法と共に使用するための免疫検出キットがある。したがって、免疫検出キットは、好適な容器手段中に、PD-L2抗原に結合する第1の抗体、および任意で免疫検出試薬を含む。
以下の実施例は、本発明の好ましい態様を実証するために含めたものである。以下の実施例に開示される技術は、本発明の実施において良好に機能することが本発明者らにより発見された技術を提示するものであり、したがってその実施のための好ましい様式を構成すると考えることができることが当業者により理解されるべきである。しかしながら、開示される特定の態様において多くの変更を行うことができ、それでもなお本発明の精神および範囲から離れることなく同様または類似の結果を得ることができることを当業者は本開示に照らして理解するべきである。
抗体の選択、生成、および製造。 追加の詳細がその後の実施例において提供され得るが、開示される抗体の選択、生成、および製造は、概して以下のように行った。
PD-1へのPD-L2の結合を遮断するPD-L2抗体の同定。 上記の実施例1に記載のように同定された候補抗体を、PD-L2に結合してPD-1へのPD-L2の結合を遮断する能力について試験した。Alexafluor 532標識PD-1の最大蛍光強度を測定し、FACS分析におけるAlexa532蛍光の低減としてPD-L2遮断を調べた。抗PD-L2クローン16501、16425、16510、および16478を、非染色細胞、対照Ig抗体、および商用抗体24Fと照らし合わせて評価した。クローン16501、16425、および16478を使用した場合に、PD-1へのPD-L2の結合において有意な低減があることが見出された。サブクローンを、活性化に応答してルシフェラーゼを産生するJurkat T細胞を刺激することができるCHO-PD-L2細胞を使用するPD-L2:PD-1アッセイを使用して試験した(図2)。PD-L2:PD-1アッセイ曲線からIC50値および親和性を生成した。PD-L2:PD-1結合を遮断する能力についてクローンをキイトルーダと照らし合わせて評価した(図3)。評価した各クローン(16501、20810、20237)は、FDA承認済みの抗体治療剤であるキイトルーダよりも良好にPD-1へのPD-L2の結合を防止することが見出された(図3)。
SEQUENCE LISTING
<110> Board of Regents, The University of Texas System
<120> HUMAN PD-L2 ANTIBODIES AND METHODS OF USE THEREFOR
<150> US 62/647,546
<151> 2018-03-23
<160> 51
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 273
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 1
Met Ile Phe Leu Leu Leu Met Leu Ser Leu Glu Leu Gln Leu His Gln
1 5 10 15
Ile Ala Ala Leu Phe Thr Val Thr Val Pro Lys Glu Leu Tyr Ile Ile
20 25 30
Glu His Gly Ser Asn Val Thr Leu Glu Cys Asn Phe Asp Thr Gly Ser
35 40 45
His Val Asn Leu Gly Ala Ile Thr Ala Ser Leu Gln Lys Val Glu Asn
50 55 60
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65 70 75 80
Pro Leu Gly Lys Ala Ser Phe His Ile Pro Gln Val Gln Val Arg Asp
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Lys Tyr Leu Thr Leu Lys Val Lys Ala Ser Tyr Arg Lys Ile Asn Thr
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His Ile Leu Lys Val Pro Glu Thr Asp Glu Val Glu Leu Thr Cys Gln
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Ala Thr Gly Tyr Pro Leu Ala Glu Val Ser Trp Pro Asn Val Ser Val
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Pro Ala Asn Thr Ser His Ser Arg Thr Pro Glu Gly Leu Tyr Gln Val
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Ile Phe Ile Pro Phe Cys Ile Ile Ala Phe Ile Phe Ile Ala Thr Val
225 230 235 240
Ile Ala Leu Arg Lys Gln Leu Cys Gln Lys Leu Tyr Ser Ser Lys Asp
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Ile
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<211> 381
<212> DNA
<213> Homo sapiens
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atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggcggtgt actactgcgc cagagatggt 300
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acaactgtca ccgtctcctc a 381
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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gaagatattg caacatatta ctgtcagcag gccgataact actacacttt tggcggaggg 300
accaaggttg agatcaaa 318
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<213> Homo sapiens
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<213> Homo sapiens
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<212> DNA
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<212> DNA
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Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr
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Gly Ser Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
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Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
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Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Asp Gly Val Thr Ala Ala Ala Ala Ser Ile Thr Tyr Tyr Tyr
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Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
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<213> Homo sapiens
<400> 15
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Phe
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Leu Val Gly Ala Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 16
<211> 119
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 16
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Asn Tyr
20 25 30
Ala Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Trp Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Arg Thr Trp Ser Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 17
<211> 107
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 17
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Val Val Thr Leu Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 18
<211> 119
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 18
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Ala
20 25 30
Ala Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Leu Ala Gln Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Arg Thr Trp Ser Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 19
<211> 107
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 19
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Val Val Thr Leu Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
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<211> 119
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 20
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ile Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro His Phe Gly Val Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Val Pro Gln Tyr His Gly Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 21
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 21
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1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Asn Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Gly Asn Ser Phe Pro Thr
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Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 22
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 22
Gly Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Ile Ser
1 5
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 23
Ser Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 24
<211> 20
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 24
Ala Arg Asp Gly Val Thr Ala Ala Ala Ala Ser Ile Thr Tyr Tyr Tyr
1 5 10 15
Gly Met Asp Val
20
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<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
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Gly Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Ile Ser
1 5
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<211> 17
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<213> Homo sapiens
<400> 26
Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
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1 5 10
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<211> 9
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<213> Homo sapiens
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Gly Thr Phe Ser Asn Tyr Ala Ile His
1 5
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<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 29
Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Trp Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 30
<211> 12
<212> PRT
<213> Homo sapiens
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Ala Arg Leu Pro Arg Thr Trp Ser Ala Phe Asp Ile
1 5 10
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<213> Homo sapiens
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Gly Thr Phe Ser Ser Ala Ala Ile His
1 5
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<213> Homo sapiens
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Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Leu Ala Gln Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
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<213> Homo sapiens
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Ala Arg Leu Pro Arg Thr Trp Ser Ala Phe Asp Ile
1 5 10
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<213> Homo sapiens
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Gly Thr Phe Ser Ser Tyr Leu Ile Ala
1 5
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<213> Homo sapiens
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Gly Ile Ile Pro His Phe Gly Val Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
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Ala Arg Val Pro Gln Tyr His Gly Tyr Phe Asp Leu
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<213> Homo sapiens
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1 5
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Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Phe Leu Asn
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<213> Homo sapiens
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Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr Leu Ala
1 5 10
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<213> Homo sapiens
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1 5
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1 5
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Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr Leu Ala
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Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr
1 5
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<400> 48
Gln Gln Val Val Thr Leu Pro Pro Thr
1 5
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<400> 49
Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp Leu Ala
1 5 10
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<213> Homo sapiens
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Ala Ala Ser Asn Leu Gln Ser
1 5
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<211> 8
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<213> Homo sapiens
<400> 51
Gln Gln Gly Asn Ser Phe Pro Thr
1 5
Claims (20)
- それぞれSEQ ID NO:34、35、および36に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、それぞれSEQ ID NO:49、50、および51に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、およびCDR3を含み、かつPD-L2に結合する、抗体または抗体断片。
- それぞれSEQ ID NO:11および10に示される核酸配列によってコードされる、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- SEQ ID NO:11および10に対して、それぞれ、少なくとも90%もしくは95%の同一性を有する核酸配列によってコードされる、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- それぞれSEQ ID NO:21および20に示される、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- SEQ ID NO:21および20に対して、それぞれ、少なくとも90%もしくは95%の同一性を有する、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- 前記抗体断片が、組換えscFv(単鎖可変領域フラグメント)抗体、Fab断片、F(ab’)2断片、またはFv断片である、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- 前記抗体がキメラ抗体である、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- 前記抗体がIgGである、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- 細胞透過性ペプチドをさらに含みかつ/またはイントラボディである、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- ヒト化抗体である、請求項1記載の抗体または抗体断片。
- 請求項1記載の抗体または抗体断片を含む、対象におけるがんを治療するための薬学的組成物。
- 前記抗体または抗体断片が、SEQ ID NO:11および10に対して、それぞれ、少なくとも90%もしくは95%の同一性を有する核酸配列によってコードされる、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項11記載の薬学的組成物。
- 前記抗体または抗体断片が、それぞれSEQ ID NO:21および20に示される、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項11記載の薬学的組成物。
- 前記抗体または抗体断片が、SEQ ID NO:21および20に対して、それぞれ、少なくとも90%もしくは95%の同一性を有する、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項11記載の薬学的組成物。
- 抗体または抗体断片をコードする核酸を含む、操作された細胞であって、該抗体または抗体断片が、それぞれSEQ ID NO:34、35、および36に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、それぞれSEQ ID NO:49、50、および51に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、およびCDR3により特徴付けられ、かつPD-L2に結合する、操作された細胞。
- それぞれSEQ ID NO:34、35、および36に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、それぞれSEQ ID NO:49、50、および51に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、およびCDR3により特徴付けられ、かつPD-L2に結合する、1つまたは複数の抗体または抗体断片を含む、薬学的製剤。
- 少なくとも1つの抗体または抗体断片が、SEQ ID NO:11および10に対して、それぞれ、少なくとも90%もしくは95%の同一性を有する核酸配列によってコードされる、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項16記載の薬学的製剤。
- 少なくとも1つの抗体または抗体断片が、SEQ ID NO:21および20に対して、それぞれ、少なくとも90%もしくは95%の同一性を有する、軽鎖可変配列および重鎖可変配列を含む、請求項16記載の薬学的製剤。
- 対象からの試料においてPD-L2発現細胞を検出する方法であって、
(a)該試料を、請求項1~10のいずれか一項記載の抗体または抗体断片と接触させる工程、ならびに
(b)該試料中の細胞への該抗体または抗体断片の結合によって該試料中のPD-L2発現細胞を検出する工程
を含む、方法。 - 請求項1記載の抗体または抗体断片を含む、腫瘍微小環境における免疫抑制を治療するための薬学的組成物。
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