JP7638527B2 - 性ホルモン非感受性greb1陽性腫瘍の治療剤 - Google Patents
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Description
項1. GREB1の発現を抑制する物質を有効成分とする、性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍の治療剤。
項2. 前記物質が、GREB1に対するsiRNA、shRNA、dsRNA、アンチセンス核酸、及びリボザイムよりなる群から選択される少なくとも1種の核酸医薬である、項1に記載の治療剤。
項3. 前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫である、項1又は2に記載の治療剤。
項4. 肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫の罹患の有無を予測するための検査方法であって、
被験者から採取された肝臓組織、皮膚組織、又は神経組織において、GREB1の発現量を測定する工程を含む、検査方法。
項5. 前記織肝臓組織、皮膚組織、又は神経組織におけるGREB1の発現量を、抗GREB1抗体を用いた組織免疫によって測定する、項4に記載の検査方法。
項6. GREB1を検出するための試薬を含む、肝芽腫の検査薬。
項7. GREB1を検出するための試薬が、抗GREB1抗体又はその断片、或はGREB1 mRNA又はGREB1 cDNAとハイブリダイズできるプライマーである、項6に記載の検査薬。
項8. 性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍を罹患している患者に、GREB1の発現を抑制する物質を治療有効量投与する、性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍の治療方法。
項9. 前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫である、項9に記載の治療方法。
項10. GREB1の発現を抑制する物質の、性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍の治療剤の製造のための使用。
項11. 前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫である、項10に記載の使用。
項12. 性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍の治療に使用される、GREB1の発現を抑制する物質。
項13. 前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫である、項12に記載のGREB1の発現を抑制する物質。
本発明の治療剤は、性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍の治療に使用される医薬であって、有効成分としてGREB1の発現を抑制する物質を有効成分とすることを特徴とする。以下、本発明の治療剤について詳述する。
本発明の治療剤では、有効成分として、GREB1の発現を抑制する物質を使用する。GREB1は、性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍細胞においてWnt/β-カテニンシグナルやMITFの標的遺伝子になり、遺伝子増幅することもあり、当該腫瘍細胞の増殖を亢進させる作用がある。本発明の治療剤では、GREB1の発現を抑制することによって、当該腫瘍の増殖を効果的に抑制させることが可能になっている。
5(Y)^G(Y)^A(Y)^a^t^g^g^c^a^g^g^a^5(Y)^A(Y)^g(配列A:実施例においてASO-6434として使用)
G(Y)^T(Y)^5(Y)^t^g^t^t^t^c^a^a^g^T(Y)^A(Y)^a(配列B:実施例においてASO-6921として使用)
T(Y)^5(Y)^T(Y)^a^g^t^t^c^t^c^a^t^5(Y)^A(Y)^a(配列C:実施例においてASO-6968として使用)
A(Y)^T(Y)^T(Y)^g^a^g^g^g^t^a^g^g^5(Y)^A(Y)^a(配列D:実施例においてASO-7724として使用)
GREB1は、性ホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍細胞において特異的に発現し、当該腫瘍細胞の増殖を亢進させているので、本発明の治療剤では、GREB1の発現を抑制することにより、当該腫瘍細胞の増殖抑制が可能になっている。従って、本発明の治療剤はホルモン非感受性GREB1陽性腫瘍の治療に使用される。
本発明の治療剤の投与形態については、抗腫瘍効果が得られることを限度として、経口投与又は非経口投与のいずれであってもよく、使用する有効成分の種類に応じて適宜設定すればよい。具体的には、本発明の治療剤の投与形態として、注射投与(静脈注射、皮下注射、筋肉注射、腹腔注射、患部への局所注射等)、座薬投与等の非経口投与が挙げられる。
本発明の治療剤は、有効成分の種類や投与形態に応じた製剤形態に調製される。本発明の抗腫瘍剤の製剤形態としては、例えば、液剤、懸濁剤、乳剤、注射剤等の液状製剤等が挙げられる。
本発明の検査方法は、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫の罹患の有無を予測するための検査方法であって、被験者から採取された肝臓組織、皮膚組織、又は神経組織において、GREB1の発現量を測定する工程を含むことを特徴とする。本発明によれば、被験者から採取された肝臓組織、皮膚組織、又は神経組織中のGREB1の発現量を指標とすることにより、被験者が肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫に罹患しているか否かを診断することが可能になる。
1-1.細胞及び抗体
HepG2細胞、CHP212細胞、及びSKNDZ細胞は、American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA, USA)より購入した。MCF7細胞、HLE細胞、Huh7細胞、HLF細胞、NBTU110細胞、SKMEL28細胞、Mewo細胞、G361細胞、及びCOLO679細胞は、Japanese Collection of Research Bioresources (JCRB, 大阪, 日本)より購入した。また、Lenti-XTM293T (X293T)細胞は、タカラバイオ株式会社(日本)から購入した。Huh6細胞は、Dr. H. Okuyama (大阪大学、日本)から提供されたものを使用した。SNU387細胞、SNU449細胞、BMEL細胞、及びHepG2細胞は、Dr. T. Kodama(大阪大学、日本)から提供されたものを使用した。
TruSeq Stranded mRNA Sample Prep kit (Illumina, San Diego, CA)を用いて、コントロールsiRNA又はβ-カテニン siRNAをトランスフェクトしたHepG2細胞のライブラリーを作製した。Illumina HiSeq 2500 platformにて、75-base single-endモードで、配列解析を行った。ベースコールは、CASAVA 1.8.2 software (Illumina)を用いて行った。Bowtie2 ver. 2.2.3とSAMtools ver. 0.1.19を組み合わせて、TopHat v2.0.13を使用して、ヒト参照ゲノム配列(hg19)にマッピングし、配列解読を行った。Cuffnorm version 2.2.1を用いて、百万個のフラグメントがマッピングされたエクソン1キロベース当たりのフラグメント数(FPKMs)を計算した。
がん患者のクリニカルデータは、ウェブサイト‘depmap portal (https://depmap.org/portal/)’、TCGA SpliceSeq (http://projects.insilico.us.com/TCGASpliceSeq)、及び'R2: Genomics Analysis and Visualization Platform (http://r2.amc.nl)'から得られるThe Cancer Genome Atlas (TCGA) datasetsを用いて、分析及び取得した。全ての遺伝子発現のデータ、P値、及びr値をダウンロードした。
2008年1月~2015年3月の間に大阪大学医学部付属病院にて外科的処置を受けた肝芽腫患者から得られた肝芽腫組織(n=11)を本試験に使用した。患者の年齢は、0~16歳(中央値は3歳)である。
Greb1 shRNA#3(配列番号8)(20 μg)又はコントロールとpLIVE-SB13 (8 μg)の存在下、pT2BH-YAPS127A (20 μg)、pT2BH-ΔN90βカテニン-mutLuc3 (20 μg)、pT3-EF1a-cMET (20 μg)、及びGFP2ALucを、生理食塩水2.5 mlに希釈し、8~9週齢のold wild-type C57BL6/N雄マウスの尾静脈に5~7秒以内で注射した。肝臓を、注射後の一定時間(又は罹患時)に採取して、腫瘍形成に関する種々のパラメーターを調べた。なお、具体的手法は、Tao, J. et al., (2014). Gastroenterology 147, 690-701.及びTward, A. D. et al, (2007). Proc Natl Acad Sci U S A 104, 14771-14776を参照した。なお、ΔN90βカテニンとはヒトβ-カテニンの1~90位のアミノ酸を欠失させたβカテニン変異体であり、YAPS127AとはYAPの127位のセリンをアラニンに置換したYAP変異体である。
AmNAモノマーを含み、ホスホチオエート化された15-merのアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASOs)を準備した(GeneDesign (Ibaraki, Japan)によって合成)。合成したASOsの配列は、表8及び9に示す通りである。なお、本明細書において、「hGREB1-6424-AmNA(15)」は、単に「ASO-6424」又は「GREB1 ASO-6424」と略記する。他のASOsについても同様に略記する。RNAiMAX (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA)を使用して、HepG2又はCOLO679細胞を10 nMのASOsでトランスフェクトした。実験には、トランスフェクトから36~48時間後の細胞を使用した。
HepG2細胞のペレット(1×107 cells)を100μlの高濃度マトリゲル(Corning)中に懸濁させ、8週齢の雄BALB/cAJcl-nu/nu mice (nude mice; CLEA Japan)に麻酔下で肝臓に直接注射し移植した。0日目から週2回の頻度で、ASO (50 μg/body;約2.5 mg/kg)を皮下投与した。移植から27日後にマウスを安楽死させ、腫瘍を回収し、組織学的分析に供した。
siRNAを用いた分析において、使用したsiRNAの塩基配列は、表1に示す通りである。
組織標本の免疫組織化学的染色は、DakoRealTMEnVisionTM Detection System (Dako, Carpentaria, CA, USA)及びWarp Red? Chromogen Kit (Biocare Medical, Concord, CA, USA)を用いて、製造元の推奨する方法に従って行った。具体的には、decloaking chamber (Biocare Medical, Walnut Creek, CA, USA)を用いて、組織標本の抗原賦活化を行った。次いで、内在性ペルオキシダーゼ活性を3% H2O2-メタノールで15分間ブロックし、次いで切片をヤギ血清と共に1時間インキュベートして、非特異的抗体結合部位をブロックした。その後、組織標本にマウス抗GREB1抗体(1:100)、マウス抗β-カテニン抗体(1:100)又はラビット抗YAP1抗体(1:100)を添加して4℃で16時間インキュベートし、次いで、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)標識ヤギ抗マウスIgG又はヤギ抗ラビットIgGで1時間インキュベートした。色素原としてジアミノベンジジン(DAB)(Dako)を用いて、組織切片に結合しているマウス抗GREB1抗体、マウス抗β-カテニン抗体、又はラビット抗YAP1抗体を可視化した。更に、組織切片を0.1%(w/v)のヘマトキシリンで対比染色した。β-カテニン、GREB1、及びYAPの染色された領域は、3段階(<5%、5-30%、及び30-95%)で分類し、腫瘍病変領域に対して染色された領域(陽性染色)が、5%以上である腫瘍は、陽性と判定した。
ガラスカバースリップ上で増殖させた細胞を、4%(w/v)パラホルムアルデヒドを含有するPBS中で室温で10分間固定し、0.2%(w/v)Triton X-100及び2mg/mlのBSAを含むPBS中で10分間透過処理した。また、三次元培養にて増殖させた細胞を、4%(w / v)パラホルムアルデヒドを含有するPBS中で室温で30分間固定し、0.5%(w/v)Triton X-100及び40mg/mlのBSAを含有するPBS中で30分間ブロッキングした。固定及び透過処理した細胞を一次抗体と共に室温で3時間又は4℃で終夜インキュベートし、更に製造元のプロトコール(Molecular Probes, Carlsbad, CA)に従い、二次抗体共にインキュベートして、サンプルを作製した。サンプルの分析は、LSM880レーザー共焦点顕微鏡(Carl-Zeiss、Jena、Germany)を用いて観察することによって行った。
各遺伝子発現量の値は、GAPDH mRNAで標準化し、正常肝臓に対する比率として算出した。データをmin-max normalizationによって正規化した後に、Excel software (Microsoft, Redmond, WA, USA)を用いてカラー化したヒートマップを作製した。
細胞をプレートに1.0×104cells/mLとなるように播種し、12時間後に10%血清を含む培地に交換した。48時間毎に細胞数を計測しながら、最長10日間培養した。細胞数の計測は、Cyquant NF assays (Life Technologies/Thermo Fisher Scientific)を用いて、製造元の推奨プロトコールに従って行った。
HepG2細胞(直径100mmディッシュ)を、細胞溶解バッファー(10 mM Tris-HCl [pH 7.4], 140 mM NaCl, 5mM EDTA, 1% NP40, 25mM NaF, 20mg/ml leupeptin, 20mg/ml aprotinin, and 10 mMPMSF)400μlで溶解させた。得られた溶解液を抗Smad2/3抗体で免疫沈降させ、免疫沈降物を所定の抗体でプローブ化した。
リコンビナントSmad2/MH1又はリコンビナントSmad2/MH2とGREB1との結合を分析するために、HepG2細胞又はGFP-GREB1を発現するHuh6細胞の全細胞溶解液をglutathione-Sepharoseビーズに結合した20μgのグルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)、GST-Smad2/MH1、又はGST-Smad2/MH2と1時間インキュベーションした。沈降後のビーズを細胞溶解バッファー(10 mM Tris-HCl [pH 7.4], 140 mM NaCl, 5mM EDTA, 1% NP40, 25mM NaF, 20mg/ml leupeptin, 20mg/ml aprotinin, and 10 mMPMSF)で3回洗浄し、得られた沈降物を抗GREB1抗体又は抗GFP抗体でプローブ化した。
HA-FLAG-GREB1を発現又は非発現のGFP-Smad3発現細胞に対して、1 mMのEUで30分間処理した後に、固定化し、Click-iT RNA Alexa Fluor 594 Imaging Kit (Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA)を用いた検出を行った。
5週齢の雄BALB/cAnNCrj-nuヌードマウス(Charles River Laboratory Japan Inc, Osaka, Japan)をメデトミジン(0.3 mg/kg体重)及びミダゾラム(4 mg/kg体重)で麻酔を行った後に、100μlの高濃度マトリゲル(Corning, NY, USA)に懸濁したHepG2細胞(7×106 cells)を背部の皮下に注入した。次いで、移植から28日後にヌードマウスを殺して、移植細胞を含む領域を測定し、免疫組織化学的分析のための処理に供した。本試験における全ての動物実験に関する全てのプロトコールは、大阪大学動物実験委員会の承認(No. 2867)の下で行った。
5週齢のBALB/cAJcl-nu/nu mice (nude mice; CLEA Japan)に対してメデトミジン(0.3?mg/kg)及びミダゾラム(4?mg/kg)を組み合わせて投与して麻酔を行った。次いで、Hep3B細胞又はJHH7細胞(1×107 cells)を150 μlの高濃度マトリゲル(Corning)中に懸濁させ、マウスの皮下に移植した。移植後3日目から1週間に2回の頻度で、ASO (50 μg/body;約2.5 mg/kg)を皮下投与した。Hep3B細胞を移植したマウスは、移植から6.5週間後に安楽死させた。JHH7細胞を移植したマウスは、移植から2週間後に安楽死させた。安楽死させたマウスから腫瘍を回収し、組織学的分析に供した。本試験における全ての動物実験に関する全てのプロトコールは、大阪大学動物実験委員会の承認(No. 26-032-048)の下で行った。
CRISPR Genome Engineering Resources (http://www.genome-engineering.org/crispr/)を利用して、ヒトGREB1の標的配列5’-CTTCTCGGTGTTGAAGCCGA-3’(配列番号102)をデザインした。pX330(addgene#42230)のBbsIサイトに所定のオリゴヌクレオチドをライゲートすることにより、hCas9及びシングルガイドRNA(sgRNA)を発現するプラスミドを作製した。Lipofectamine LTX reagent (Life Technologies/Thermo Fisher Scientific)を用いて、製造元の推奨プロトコールに従って、GREB1又はMITFを標的とするsgRNA配列及びブラストサイジン耐性を有するプラスミドpX330を、HepG2細胞、Hep3B細胞、JHH7細胞、又はCOLO679細胞に導入し、5μg/mLのブラストサイジンSを含む培地で2日間培養することによって、GREB1ノックアウト細胞又はMITFノックアウト細胞を選択した。次いで、単一のコロニーを採取し、機械的に解離させ、24ウェルプレートの個々のウェルに再度播種した。
10cmディッシュ中のコンフルエントなHepG2細胞を、5 ng/mlのTGFβ1の存在下又は非存在下で3時間刺激した。その後、細胞を1%ホルムアルデヒドで室温で10分間架橋させ、0.125 Mグリシンで架橋反応を停止させた。冷PBSで細胞を3回洗浄した後に、細胞を剥がして回収した。更に、細胞を遠心分離にて沈降させて、硫酸ドデシルナトリウム(SDS)溶解バッファー(50 mM Tris/HCl [pH 8.0], 10 mM EDTA, and 0.5% SDS)で溶解させた。細胞溶解液に超音波処理を行うことによりDNAを剪断し、DNAのサイズを200~1000bpにした。剪断したクロマチン上澄液を、プロテアーゼ阻害剤及びホスファターゼ阻害剤を含むChIPdilution buffer (16.7 mM Tris/HCl [pH 8.0], 167 mM NaCl, 1.2 mM EDTA, and 1.1% Triton X-100)で希釈し、サケ精子DNA/プロテインA-アガロースビーズ(Millipore, Billerica, MA, USA)を加えてプレクリアした。次いで、抗Tcf-4抗体、抗β-カテニン抗体、抗アセチル化ヒストンH4抗体又はネガティブコントロールIgG (Diagenode, Liege, Belgium)を加えて、4℃で12時間インキュベートした。サケ精子DNA/プロテインA-アガロースビーズに吸着した免疫複合体に対して、高塩バッファー(20 mM Tris/HCl [pH 8.0], 500 mM NaCl, 0.1% SDS, 1% TritonX-100, and 2 mM EDTA)で1回洗浄、更にLiClバッファー(10 mM Tris/HCl [pH 8.0], 0.25 M LiCl, 1 mM EDTA, 1% deoxycholic acid, and 1% Nonidet P-40)で1回洗浄、及びTEバッファー(10 mM Tris/HCl (pH 8.0), and 1 mM EDTA)で4回洗浄を行った。次いで、溶出バッファー(50 mM Tris/HCl [pH 8.0], 10 mM EDTA, 1% SDS)中で65℃で4時間インキュベートすることにより、免疫複合体をビーズから溶出させ、脱クロスリンクを行った。次いで、サンプルにRNase Aを添加して37℃で30分間処理し、更にproteinase Kを添加して55℃で1時間処理した。そして、フェノール-クロロホルム抽出によりDNAを精製し、表3に示すプライマーを用いてPCRを行った。
標準的な組換えDNA技術を用いて、全長GREB1又はその各種突然変異体を有するプラスミドを設計した。NSL(nuclear localization sequence)融合GREB1変異体を作成するために、SV40 T抗原由来のNSLの3コピーをGFP-GREB1変異体のN末端に結合させた。
各試験は、少なくとも3回実施した。統計分析は、Excel (Microsoft, Redmond, WA, USA)及びGraphPad Prism 7 (GraphPad Software, La Jolla, CA, USA)を用いて行った。P値が0.05未満の場合には、統計学的に有意差があるとみなした。
2-1.ヒト肝芽腫において、GREB1はWnt/β-カテニンシグナルの下流標的遺伝子である
肝芽腫の腫瘍形成メカニズムを解明するために、エキソン3及び4でβ-カテニン遺伝子が短縮型変異(truncated mutation)を有しているHepG2肝芽腫細胞を使用して、Wnt/β-カテニンシグナルの下流新規標的遺伝子をスクリーニングした。コントロールsiRNA又はβ-カテニンに対するsiRNA(β-カテニン siRNA)をトランスフェクトしたHepG2細胞において、RNA配列解析を行った。その結果、8929遺伝子の内、発現量が高いこと(FPKM≧3)、且つβ-カテニン siRNAをトランスフェクトした細胞(β-カテニンノックダウン細胞)において、コントロールsiRNAをトランスフェクトした細胞(コントロール細胞)よりも発現量が3倍以上低下していることを基準として、候補遺伝子として76遺伝子が選択された(図1のa参照)。更に、ENCODE Transcription Factor Binding Site Profiles (TCF7L2#HepG2#hg19#1)の遺伝子セットを用いてHepG2におけるChIP配列解析で見出されたTCF7L2 (TCF4)のDNA結合部位の存在を基準として、候補遺伝子を絞り込むと、11種の遺伝子が選択された(図1のa、及び表4参照)。図1のaの下図には、コントロール細胞とβ-カテニンノックダウン細胞において、発現量が変化している候補遺伝子のヒートマップを示している。図1のaの下図の左に示す各遺伝子は、変動した76種の候補遺伝子のうち11遺伝子をランダムに示している。
過去に報告されている通り、β-カテニンのノックダウンはHepG2細胞の細胞増殖を低下させた(図3のa参照)。また、外来性のGREB1の発現は、β-カテニンのノックダウンの表現型を部分的に回復させた(図3のa参照)。そこで、HepG2細胞におけるGREB1の役割を解明するために2つの異なるsiRNAを使用してGREB1をノックダウンした。GREB1をノックダウンした細胞の溶解液に、抗GREB1抗体、抗Axin2抗体、抗β-カテニン抗体、及び抗HSP90抗体でプローブ化した結果、siRNA(GREB1 #1 siRNA及びGREB1 #2 siRNA)は、GREB1をノックダウンさせるが(図3のb参照)、GREB1のノックダウンは、ERシグナルの標的遺伝子であるPRLRやXBP1の発現には影響せず(図3のc参照)、β-カテニン及びAxin2の発現にも影響しないことが確認された(図3のb参照)。即ち、これらの結果は、GREB1は、ER及びWnt/β-カテニンシグナルの上流で機能する遺伝子ではないことが示唆された。
過去の乳がん細胞での報告と一致して、X293T細胞ではHA-FLAG-GREB1は主に核内に局在した(図5のa参照)。GREB1の核局在配列(NLS)である310~319位のアミノ酸を欠失させた変異体GREB1(HA-FLAG-ΔNLS-GREB1)は細胞質に局在位した(図5のa参照)。どのような機構でGREB1がERシグナルとは独立して肝芽腫細胞の増殖を制御しているかを解明するために、Biological General Repository for Interaction Datasets (BioGRID) (https://thebiogrid.org/)を用いて、GREB1と相互作用し得る候補タンパク質を同定した。その結果、GREB1と相互作用し得る候補タンパク質として、表6に示すタンパク質が見出された。
TGFβシグナルにおけるGREB1の役割を解明するために、標的遺伝子の発現、Smad2の核内移行、Smad2/3とSmad4との複合体の形成、及び内在レベルでのSmad2/3のリン酸化について検討を行った。
GFP-GREB1を発現するHepG2細胞を固定化して、抗GFP抗体及びHoechst33342で染色した結果、GFP-GREB1は、クロマチン領域ではなく、クロマチン間の区画でドットとして観察された(図10のa参照)。また、GFP-GREB1を発現するHepG2細胞を固定化して、抗GFP抗体、抗Fibrillarin抗体、抗SC34抗体、抗PML抗体、又は抗Coilin抗体とHoechst33342で染色したところ、GREB1の染色が認められるドットは、フィブリラリン、SC35、PML、及びCoilinとは共存していないことが確認された(図10のb参照)。これらの結果から、GREB1は、核小体、核スペックル、PML(Promyelocytic leukemia)体、及びカハール小体とは、独立して存在していることが示唆された。また、GFP-GREB1及びFLAG-SMAD3を発現するHepG2細胞を固定化して、抗GFP抗体、抗FLAG抗体及びHoechst33342で染色したところ、GFP-GREB1及びFLAG-Smad3は複合体を形成し、クロマチン間の区画に存在することが観察された(図10のc参照)。
がん遺伝子のゲノム操作及び/又はハイドロダイナミックトランスフェクションを用いて、肝細胞がん及び肝芽腫のマウス肝臓腫瘍モデルが、いくつか開発されている。また、ハイドロダイナミックトランスフェクションを用いた恒常的活性化型β-カテニン及びYAPの過剰発現は、肝細胞がん及び肝芽腫の特徴を伴う肝腫瘍を急速に導くことが報告されている。実際、肝芽腫組織(n=11)を抗β-カテニン抗体及びヘマトキシリンで免疫染色したところ、YAPは11例の肝芽腫組織において、9例(陽性率81.8%)で腫瘍細胞特異的に細胞質又は核内で過剰発現しており、当該9例は全例、β-カテニン及びGREB1が陽性であった(図12のa参照)。更に、HGF-c-Met経路は肝芽腫において活性化されており、マウスにおいてβ-カテニン及びc-Metの構成的に活性な形態の同時発現は、肝腫瘍を誘導することも報告されている。
GREB1が肝芽腫治療の標的分子になり得るかを調べるために、CRISPR/Cas9系を用いて、GREB1をノックアウトしたHepG2細胞(GREB1 KO細胞)、GREB1をノックアウトしたHepG2細胞にGGREB1を発現させた細胞(GREB1 KO/GREB1細胞)、GREB1をノックアウトしたHepG2細胞にGREB1ΔNLSを導入した細胞(GREB1 KO/GREB1ΔNLS細胞)、及びGREB1とSmad2/3をノックアウトした細胞(GREB1 KO/Smad2/3 KO細胞)を作製した。
ヒトGREB1に対するアンチセンスオリゴヌクレオチド(GREB1 ASO)の腫瘍の増殖に対する効果を検証するために、GREB1 mRNAの二次構造に基づいて、GREB1 ASOの標的となるヒトGREB1の塩基配列(15ヌクレオチド)を設計した。具体的には、先ず、数千個のGREB1 ASOの候補の中から、細胞毒性を示す可能性があるものを排除し、高次元構造予測によって20個のGREB1 ASO配列を選択した。それらの配列に基づいて、各種修飾を施したGREB1 ASOを設計して合成した(表8)。
各種ヒトがん細胞株におけるGREB1のmRNA発現について、The Cancer Cell Line Encyclopedia 1 (CCLE)のデータセットをもとに解析した。GREB1は、これまでに報告されている乳がん細胞株に加えて、皮膚がん(メラノーマ)細胞株、神経芽腫細胞株、及び一部の肝細胞がん細胞株において高発現していた(図18のA参照)。神経芽腫細胞株SKNDZ細胞、CHP212細胞、及びNBTU110細胞におけるGREB1の発現をタンパク質レベルで解析したところ、GREB1を高発現する肝芽腫細胞株HepG2細胞と同程度、且つGREB1高発現の肝細胞がん細胞株Hep3B細胞及びJHH7細胞より高い発現を認めた(図18のB参照)。13症例の神経芽腫組織におけるGREB1とβ-カテニンの発現を免疫組織学的に検討した。前記の通り、小児肝がんである肝芽腫においては、GREB1はβ-カテニンの下流標的遺伝子として発現する。GREB1は、神経芽腫4例(30.7%)で腫瘍細胞の核に検出され、β-カテニンは11例(84.6%)で細胞質又は核に検出された(図18のC参照)。GREB1とβ-カテニンの発現の間に有意な発現相関は認められなかった(図18のD参照)。これらの結果から、GREB1は神経芽腫細胞においてβ-カテニン非依存的に過剰発現することが示唆された。
前記の通り、GREB1は小児肝がんである肝芽腫において、β-カテニンの下流標的遺伝子として発現する。一方、CCLEデータセットからGREB1は一部の成人肝細胞がんにおいても高発現することが示唆された(図18のA参照)。そこで、210症例の肝細胞がん組織におけるGREB1とβ-カテニンの発現を免疫組織学的に検討した。その結果、GREB1のみが核に高発現する症例、β-カテニンのみが核または細胞質に高発現する症例、GREB1とβ-カテニンがともに高発現する症例、又は共に染色が認められない陰性症例が認められた(図19のA参照)。GREB1は、肝細胞がん73例(34.7%)で腫瘍細胞の核に検出され、β-カテニンは93例(44.2%)で細胞質または核に検出された(図19のB参照)。また、GREB1とβ-カテニンの発現の間には有意な正の発現相関(ファイ相関係数: 0.41、P値<0.0001)が認められた(図19のB参照)。更に、CCLEデータセットからGREB1が高発現していたHep3B細胞、JHH7細胞、Huh7細胞、及びGREB1が低発現であったHLE細胞、HLF細胞におけるGREB1の発現をウエスタンブロット法で解析した。その結果、肝細胞がん細胞Hep3B細胞、JHH7細胞、及びHuh7細胞において、GREB1はGREB1陽性乳がん細胞株MCF7細胞と肝芽腫細胞株HepG2細胞と比較するとやや低い発現量で、GREB1弱発現肝芽腫細胞株Huh6細胞と比較すると高い発現を認めた。一方、HLE細胞及びHLF細胞においてはGREB1の発現は認められなかった(図19のC参照)。GREB1高発現肝細胞がん細胞株におけるGREB1のβ-カテニン依存性を検討した。Hep3B細胞、JHH7細胞、及びHuh7細胞においてβ-カテニンを、siRNAを用いて発現抑制したところ、いずれもGREB1の発現が抑制された(図19のD参照)。これらの結果から、GREB1は一部の肝細胞がん細胞において、β-カテニン依存的に過剰発現することが示された。
CCLEデータセットからGREB1は皮膚メラノーマ細胞において高頻度に高発現することが示唆された(図18のA参照)。そこで、CCLEデータセットからGREB1が高発現していたメラノーマ細胞株であるMewo細胞、SKMEL28細胞、及びG361細胞におけるGREB1の発現をウエスタンブロット法で解析した。その結果、肝芽腫細胞HepG2細胞においてGREB1は野生型である216 kDa付近に検出されるのに対して、メラノーマ細胞ではいずれも100 kDa付近に検出された(図20のA参照)。そこで、GREB1の転写バリアントの発現を明らかにするために、TCGAデータセットをもとに、TCGA SpliceSeq (http://projects.insilico.us.com/TCGASpliceSeq)を用いて、乳がんと皮膚メラノーマにおけるGREB1のエクソン発現を検討した。GREB1には、The Universal Protein Resource (UniProt)上に4つのアイソフォーム(isoform; IS)(転写バリアント)が登録されている。IS1はGREB1aとも呼ばれ、1949アミノ酸(216kDa)の全長型;IS2はGREB1bとも呼ばれ、C末端側458-1949アミノ酸を欠失した457アミノ酸(49 kDa)の転写物;IS3はGREB1cとも呼ばれ、C末端側410-1949アミノ酸を欠失した409アミノ酸(43 kDa)の転写物;IS4はN末端側1-1002アミノ酸を欠失した947アミノ酸(107 kDa)の転写物である(図20のB参照)。GREB1は38のエクソンから構成され、乳がん組織においてはタンパクをコードするエクソン(エクソン4-38)全体にわたって発現を認めた。一方で、皮膚メラノーマにおいてGREB1は、エクソン24以降が発現しており、IS4が特異的に発現することが明らかになった(図20のB参照)。TCGA上では、IS4を発現するがんは皮膚及び眼内メラノーマのみであった(データ示さない)。
Claims (4)
- 性ホルモン感受性を示さないGREB1陽性腫瘍の治療剤であって、
GREB1の発現を抑制する物質を有効成分として含み、
前記物質が、GREB1に対するsiRNA、shRNA、dsRNA、アンチセンス核酸、及びリボザイムよりなる群から選択される少なくとも1種の核酸医薬であり、
前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫である、前記治療剤。 - 性ホルモン感受性を示さないGREB1陽性腫瘍の罹患の有無を予測するための検査方法であって、
被験者から採取された肝臓組織、皮膚組織、又は神経組織において、GREB1の発現量を、抗GREB1抗体又はその断片、及びGREB1 mRNA又はGREB1 cDNAとハイブリダイズできるプライマーよりなる群から選択される少なくとも1種によって測定する工程を含み、
前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫であり、
前記測定が免疫染色により行われ、腫瘍が疑われる領域においてGREB1の発現が認められる領域が5%以上存在する場合に前記腫瘍に罹患している可能性が高いことを示す;或いは、前記測定が定量的PCRにより行われ、腫瘍が疑われる部位の細胞溶解液におけるGREB1量が、同一症例の非腫瘍部位の細胞溶解液におけるGREB1量よりも多い場合に前記腫瘍に罹患している可能性が高いことを示す、前記検査方法。 - 請求項2に記載の検査方法に用いるための検査薬であって、
GREB1の検出試薬として、抗GREB1抗体又はその断片、及びGREB1 mRNA又はGREB1 cDNAとハイブリダイズできるプライマーよりなる群から選択される少なくとも1種を含む、前記検査薬。 - GREB1の発現を抑制する物質の、性ホルモン感受性を示さないGREB1陽性腫瘍の治療剤の製造のための使用であり、
前記物質が、GREB1に対するsiRNA、shRNA、dsRNA、アンチセンス核酸、及びリボザイムよりなる群から選択される少なくとも1種の核酸医薬であり、
前記腫瘍が、肝芽腫、肝細胞がん、悪性黒色腫、又は神経芽腫である、前記使用。
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