Deprecated: The each() function is deprecated. This message will be suppressed on further calls in /home/zhenxiangba/zhenxiangba.com/public_html/phproxy-improved-master/index.php on line 456
JP7653408B2 - 抗pd-l1抗体 - Google Patents
[go: Go Back, main page]

JP7653408B2 - 抗pd-l1抗体 - Google Patents

抗pd-l1抗体 Download PDF

Info

Publication number
JP7653408B2
JP7653408B2 JP2022502425A JP2022502425A JP7653408B2 JP 7653408 B2 JP7653408 B2 JP 7653408B2 JP 2022502425 A JP2022502425 A JP 2022502425A JP 2022502425 A JP2022502425 A JP 2022502425A JP 7653408 B2 JP7653408 B2 JP 7653408B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
seq
amino acid
antigen
acid sequence
binding
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
JP2022502425A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2022541192A5 (ja
JP2022541192A (ja
Inventor
スティーヴ ホームズ
Original Assignee
センテッサ ファーマシューティカルズ (ユーケー) リミテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by センテッサ ファーマシューティカルズ (ユーケー) リミテッド filed Critical センテッサ ファーマシューティカルズ (ユーケー) リミテッド
Publication of JP2022541192A publication Critical patent/JP2022541192A/ja
Publication of JP2022541192A5 publication Critical patent/JP2022541192A5/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP7653408B2 publication Critical patent/JP7653408B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • A61K39/39533Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals
    • A61K39/3955Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals against proteinaceous materials, e.g. enzymes, hormones, lymphokines
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2827Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against B7 molecules, e.g. CD80, CD86
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • A61K2039/507Comprising a combination of two or more separate antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/31Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency multispecific
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/34Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/77Internalization into the cell
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/94Stability, e.g. half-life, pH, temperature or enzyme-resistance

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Description

本発明は、pHに依存してプログラム死リガンド1(PD-L1)に結合し、阻害受容体プログラム死1ポリペプチド(PD-1)及び共刺激分子CD80へのPD-L1結合と競合する抗原結合分子、特に抗体、そのフラグメント及び変異体、並びに癌等の疾患の治療及び/又は予防への上記抗原結合分子の使用に関する。
T細胞に対する2つの異なるシグナルによる共刺激は、抗原提示細胞による静止Tリンパ球の免疫応答活性化を調整し、厳密に調節するのに重要な機構である(非特許文献1)。初期抗原特異的シグナルは、MHCによって提示される外来ペプチド抗原の認識後にT細胞受容体(TCR)を介して伝達される。第2のシグナルは、抗原提示細胞(APC)上に発現される共刺激分子によってT細胞に送られ、T細胞のクローン性増殖、サイトカイン分泌及びエフェクター機能を誘導する(非特許文献2)。共刺激の非存在下では、T細胞が抗原刺激に対して不応性となる可能性があり、有効な免疫応答を開始せず、枯渇又は外来抗原に対する寛容を引き起こす場合がある。
T細胞は、正及び負の両方の二次共刺激シグナルを受け取り、かかるシグナルの調節は、免疫寛容を維持し、自己免疫を防止しながら宿主の防御免疫応答を最大化するのに極めて重要である。負の二次シグナルがT細胞寛容の誘導に必要とされるようであり、正のシグナルがT細胞活性化を促進する。単純な2シグナルモデルが依然としてナイーブリンパ球について妥当な説明を与えるが、宿主の免疫応答は動的プロセスであり、共刺激シグナルが抗原曝露されたT細胞にも与えられ得る。
共刺激シグナルの操作が細胞ベースの免疫応答を増強するか又は停止させる手段を与えることが示されているため、共刺激の機構は治療的に重要である。T細胞機能不全又はアネルギーが阻害受容体プログラム死1ポリペプチド(PD-1)の誘導及び持続発現と同時に生じることが発見されている。PD-L1/B7H1/CD274及びPD-L2/B7-DC/CD273の2つのPD-1リガンドが記載されている。PD-L1は、B細胞、樹状細胞、マクロファージ及びT細胞等の免疫細胞上に低レベルで発現され、活性化後に上方調節される。PD-L1は、内皮細胞、心臓、肺、膵臓、筋肉、ケラチノサイト及び胎盤等の非リンパ系器官でも発現される。非リンパ系組織内での発現は、PD-L1が末梢組織において自己反応性T及びB細胞並びに骨髄性細胞の機能を調節する可能性があるか、又は標的器官において炎症応答を調節する可能性があることを示唆する。PD-L1発現は主に、内皮及び上皮細胞におけるPD-L1の主要調節因子である1型及び2型インターフェロンによって調節される。PD-L1は、腫瘍サンプルにおいて発現され、予後不良と関連する(非特許文献3)。PD-L2/B7-DC細胞表面発現は、主にマクロファージ及び樹状細胞に限定される。PD-L1は、様々なヒト癌において豊富に見られ(非特許文献4)、PD-1とPD-L1との間の相互作用は、腫瘍浸潤リンパ球の減少、T細胞受容体媒介性増殖の減少、及び癌性細胞による免疫回避をもたらす(非特許文献5、非特許文献6、非特許文献7)。免疫抑制は、PD-1とPD-L1との局所的相互作用を阻害することによって逆転させることができる(非特許文献8)。PD-L1シグナル伝達の阻害は、癌の治療についてT細胞免疫を増強することが示されている(非特許文献9)。
チェックポイント阻害剤による免疫療法は現在、増え続ける癌型に対する標準的技法となっている。これまで、1つの抗CTLA-4抗体(イピリムマブ)、2つの抗PD-1抗体(ペムブロリズマブ及びニボルマブ)及び3つの抗PD-L1抗体(アテゾリズマブ、アベルマブ及びデュルバルマブ)が承認されており、多くの臨床試験によって明白な利点を示している。これらの作用物質と関連する免疫性の有害事象は、皮膚、結腸、内分泌腺、肺及び肝臓に影響を及ぼすことが多い。これらの免疫関連有害事象(AE)は、異なる腫瘍型にわたって生じ、あらゆるグレードの事象が、抗CTLA-4イピリムマブで治療した患者の約90%及び任意の抗PD-1又は抗PD-L1抗体で治療した患者のおよそ70%において起こる(非特許文献10)。併用チェックポイント阻害剤治療については、グレード3~4の免疫関連AEの割合が顕著に高い(非特許文献11)。
Warburgは、酸素の存在下であっても癌細胞のエネルギー代謝が主に解糖に限られることを初めて報告した(非特許文献12)。解糖の増加は、ヌクレオシド及びアミノ酸を生成する経路を含む様々な生合成経路への解糖中間体の転用を可能にし、これにより、新生物疾患における新たな細胞の集合及び活発な細胞増殖の支持に必要とされる巨大分子及び細胞小器官の生合成が促進される(非特許文献13)。乳酸の細胞内産生の増加の結果が細胞外腫瘍アシドーシスである。弱アルカリ性(約pH7.4)の細胞内pH(pHi)を維持するために、腫瘍細胞はNa/H交換輸送体、HCO 輸送体及び炭酸脱水酵素IX等の幾つかのプロトン放出機構を上方調節する(非特許文献14)。過剰なプロトンが細胞外基質に排出され、腫瘍微小環境の細胞外pH(pHe)を酸性にする。或る特定の腫瘍型においては、pH6~6.5と低いpHが測定されている(非特許文献15、非特許文献16)。
Mondino and Jenkins, J Leukoc Biol. 1994;55:805-15 Lenschow et al., Ann. Rev. Immunol. 1996;14:233 Wang et al. Medicine 2017;96:e6369 Dong et al. Nat. Med 2002;8:787 Dong et al. J. Mol. Med. 2003;81:281 Blank et al. Cancer Immunol. Immunother. 2005;54:307 Konishi et. al. Clin. Cancer Res. 2004;10:5094 Iwai et al. J Biomed. Sci. 2017;24: 26 Alsaab et al. Front. Pharmacol. 2017;8:561 Michot et al. Eur J Cancer 2016;54:139 Wolchok et al. N Engl J Med 2017;377:1345 Warburg Science 1956;123:309 Heiden et al. Science 2009;324:1029 Gillies et al. J Magnetic Resonance Imaging 2002;16:430 Gatenby and Gillies Nature Rev. Cancer 2004;4:891 Muller-Klieser and Vaupel Adv. Physiol. Sci. 1981 25:253
本発明者らは、腫瘍中和を増強しながら上記のような末梢チェックポイント阻害剤治療毒性を低減するために、7.4の生理的pHで活性が低下し、腫瘍の酸性pHであるpH6~6.5で最大活性を有する抗PD-L1 Fabを生成した。本発明は、肺実質の炎症として広く定義され、単独又は組合せでの抗PD-1又はPD-L1療法を受けている患者において記載されており、肺癌の患者においてより一般に見られる肺臓炎の低減に特に有用である(Brahmer J et al. N Engl J Med 2015; 373: 123-135、Rivzi NA et al. J Clin Oncol 2015; 33: 15s)。
本発明の抗原結合分子は、生理的pH(pH7.4)と比較して酸性pH(pH6.0)でPD-L1に対して顕著に高い親和性を示した。これは、pH特異的結合を示さず、多くは実際にpH7.4と比較してpH6.0で低い親和性を示す、当該技術分野で既知の他のPD-L1結合分子とは対照的である。
したがって、本発明の抗原結合分子は、当該技術分野で既知のPD-L1抗体よりもはるかに低い末梢毒性を有する。このことは、腫瘍細胞死滅戦略(Fc媒介性又は毒性薬物コンジュゲート)が、健常な細胞を破壊することなく、腫瘍陽性PD-L1細胞のみに対して用いられ得ることを意味する。これにより重大な副作用及び末梢チェックポイント阻害剤治療毒性が低減する。
これらの抗PD-L1 Fabは、単剤又は他の関連の癌若しくは免疫腫瘍学標的との二重特異性フォーマットとしてフォーマッティングすることができる。幾つかの実施の形態においては、抗原結合分子は、PD-L1結合について一価である。
PD-L1抗体又は組成物は、放射線療法、化学療法、標的療法、免疫療法、ホルモン療法、血管新生阻害、及び癌療法のための緩和ケアからなる群から選択される従来の療法を更に含む治療レジメンと組み合わせることができる。化学療法治療がゲムシタビン、シクロフォスファミド、ドキソルビシン、パクリタキセル、シスプラチンからなる群から選択することができる。
本発明者らは、PD-L1に特異的に結合する抗原結合分子を特定した。
一態様においては、本発明は、配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR1を含む抗PD-L1抗原結合分子を提供する。
更なる態様においては、本発明は、PD-L1に特異的に結合し、本発明の抗原結合分子へのPD-L1の結合を阻害する抗原結合分子を提供する。
更なる態様においては、本発明は、ヒトPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子であって、エピトープが配列番号19で構成される、抗原結合分子を提供する。
更なる態様においては、本発明は、カニクイザルPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子を提供する。
更なる態様においては、本発明は、抗体2A09の親和性成熟突然変異体である、抗PD-L1抗原結合分子を提供する。
また更なる態様においては、本発明は、本発明の抗原結合分子を含む医薬組成物を提供する。
更なる態様においては、本発明は、本発明の抗原結合分子又は本発明の医薬組成物を含み、付加的な治療的活性剤を更に含むキットを提供する。
更なる態様においては、本発明は、癌の治療又は予防に使用される、本発明の抗原結合分子又は本発明の医薬組成物を提供する。
また更なる態様においては、本発明は、被験体に本発明の抗原結合分子又は医薬組成物を投与することを含む、PD-L1媒介性疾患又は障害を治療又は予防する方法であって、PD-L1媒介性疾患又は障害が癌である、方法を提供する。
更なる態様においては、本発明は、ヒトPD-L1又はPD-L1発現細胞と本発明の抗原結合分子とを接触させることを含む、PD-1及び/又はCD80へのヒトPD-L1の結合、又はPD-1及び/又はCD80へのPD-L1発現細胞の結合を阻害する方法を提供する。
更なる態様においては、本発明は、本発明の抗原結合分子をコードする核酸を提供する。
本発明の更なる態様においては、本発明の抗原結合分子をコードする核酸を含むベクター又はプラスミドが提供される。
本発明の更なる態様においては、本発明の抗原結合分子をコードする核酸を含むベクター又はプラスミドを含む宿主細胞が提供される。
更なる態様においては、本発明は、細胞に本発明の核酸を含むプラスミド又はベクターをトランスフェクトすることを含む、抗PD-L1抗原結合分子を発現する細胞を作製する方法を提供する。
更なる態様においては、本発明は、本発明による宿主細胞を細胞培養培地においてプラスミド又はベクターのコード化核酸配列を細胞内で発現させる条件下で培養することを含む、抗PD-L1抗原結合分子を作製する方法を提供する。
3つのリードmAbである1A06、1E08及び2A09のPD-L1中和ELISAの結果を示す図である。抗HEL mAbを陰性対照として使用した。 3つのリードmAbである1A06、1E08及び2A09のCD80中和ELISAの結果を示す図である。 抗PD-L1 mAbのBIAcore分析の結果を示す図である。mAbである2A09、1A06及び1E08のpH6.0及びpH7.4でのPD-L1-Fcに対する結合のKd(1/s)。 クレブスバッファー中にてpH7.4、6.5及び6.0でのMDA-MB-231細胞への2A09 mAb及びFabの結合を示す図である。 ELISAによるKRBバッファー中にてpH7.4及びpH6.0でのPD-L1への親和性成熟抗PD-L1 Fab結合を示す図である。 ELISAによるKRBバッファー中にてpH7.4、6.5及び6.0でのPD-L1:PD-1結合の親和性成熟抗PD-L1 Fab阻害を示す図である。ODを陰性対照Fab 2A11(抗HEL)に対して正規化した。 クレブスバッファー中にてpH7.4、6.5及び6.0のmAbでのMDA-MB-231細胞への親和性成熟抗PD-L1 Fab結合を示す図である。抗PD-L1 Fab 2.7A04OPTを陽性対照として使用した。 本発明の幾つかの抗原結合分子の重鎖及び軽鎖可変領域並びにCDRを示す図である。
本明細書において使用される場合、「抗原結合分子」は、互いに結合特異性を有する分子対のメンバーである。抗原結合対のメンバーは、天然由来であっても、又は完全若しくは部分的に合成にて作製されてもよい。分子対の一方のメンバーは、分子対のもう一方のメンバーの特定の空間的及び極性構成に特異的に結合し、したがって相補的である、突起又は空洞であり得る領域を表面上に有する。このため、対のメンバーは、互いに特異的に結合する特性を有する。抗原結合対のタイプの例は、抗原-抗体、ビオチン-アビジン、ホルモン-ホルモン受容体、受容体-リガンド及び酵素-基質である。本発明は概して、抗原-抗体タイプの相互作用に関する。本発明において使用される抗原結合分子は、PD-L1、ヒトPD-L1、カニクイザルPD-L1、PD-L1のエピトープ、hPD-L1のエピトープ又はカニクイザルPD-L1のエピトープに対して他の分子よりも大きな親和性で結合し、すなわち、PD-L1、hPD-L1、カニクイザルPD-L1、PD-L1のエピトープ、hPD-L1のエピトープ及び/又はカニクイザルPD-L1のエピトープに特異的に結合する。PD-L1、hPD-L1、カニクイザルPD-L1、PD-L1のエピトープ、hPD-L1のエピトープ又はカニクイザルPD-L1のエピトープに対する抗原結合分子の結合親和性は、解離定数(K)を用いて測定することができる。PD-L1、hPD-L1、カニクイザルPD-L1、PD-L1のエピトープ、hPD-L1のエピトープ又はカニクイザルPD-L1のエピトープに対する抗原結合分子の結合親和性は、会合定数(Ka)を用いて測定することもできる。本明細書に記載されるPD-L1に対する抗原結合分子のK値は、非PD-L1に対する抗原結合分子のK値よりも低い。
PD-L1及び/又はhPD-L1に結合する抗原結合分子には、抗PD-L1抗体が含まれる。本発明において使用される抗原結合分子は通例、抗体(そのフラグメントを含む)である。
本明細書において使用される場合、PD-L1は、ヒトPD-L1及び/又はカニクイザルPD-L1を指す場合がある。
「抗体」という用語は、本明細書において使用される場合、天然であるか、又は部分的若しくは完全に合成にて作製されるかに関わらず、免疫グロブリン分子及び免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、抗原に特異的に結合する抗原結合部位を含有する分子を指す。この用語は、抗体結合ドメインであるか又はそれと相同な結合ドメインを有する任意のポリペプチド又はタンパク質も包含する。抗体は、ポリクローナル又はモノクローナルであり得る。これらは、天然源に由来していても、又は部分的若しくは完全に合成にて作製されてもよい。抗体は、通例、2つの同一の重鎖と、重鎖よりも小さな2つの同一の軽鎖とを含有するポリペプチドである。哺乳動物においては、ラムダ(λ)及びカッパ(κ)と呼ばれる2つのタイプの軽鎖が存在する。重鎖のそれぞれ及び軽鎖のそれぞれが可変領域及び定常領域から構成される。重鎖可変領域がVH領域と称され、軽鎖可変領域がVL領域と称される。カッパ軽鎖については、VL領域がVK領域と称される場合もある。軽鎖及び重鎖の可変領域のそれぞれがCDR1、CDR2及びCDR3の3つの相補性決定領域(CDR)を含む。これらは、それぞれVLCDR1、VLCDR2、VLCDR3、VHCDR1、VHCDR2及びVHCDR3と名付けられている。抗体の例は、免疫グロブリンアイソタイプ(例えばIgG、IgE、IgM、IgD及びIgA)及びそれらのアイソタイプサブクラスであり、Fab、F(ab’)2、Fv、scFv、dAb、Fd等の抗原結合ドメインを含むフラグメント、及びダイアボディも本発明において企図される。
本発明の抗原結合分子は、典型的には抗体、より典型的にはモノクローナル抗体である。好ましい実施形態においては、抗体は、ヒト定常領域が用いられる完全ヒトモノクローナル抗体である。幾つかの実施形態においては、本発明のモノクローナル抗体は、ヒト化抗体である。
モノクローナル抗体を作製する方法は、例えばFrenzel et al., "Expression of Recombinant Antibodies", Front Immunol, 2013, 4:217(その内容が引用することにより本明細書の一部をなす)に記載されているように当業者に既知である。
本発明のモノクローナル抗体は、抗体のアミノ酸配列を修飾することによってヒト化することができる。本発明の抗原結合分子の免疫原性を低下させる方法としては、好適な抗体フレームワーク足場へのCDRグラフティング、又は例えば部位特異的突然変異誘発若しくは他の一般に用いられる分子生物学的手法による可変表面残基リモデリングが挙げられる(Roguska et al Protein Eng. 9 895-904 (1996))。
適用可能な他の方法としては、分子内の潜在的T細胞エピトープの特定、及びその後の、例えば部位特異的突然変異誘発によるこれらの除去(脱免疫化)を挙げることができる。抗原結合分子のヒト化は、分子を治療剤として使用する場合に所望される可能性がある。CDR領域又は周囲のフレームワーク配列のヒト化を所望に応じて行うことができる。
モノクローナル抗体及び他の抗体を用い、組換えDNA技術の手法を用いて、元の抗体の特異性を保持する他の抗体又はキメラ分子を作製することが可能である。かかる手法は、抗体の免疫グロブリン可変領域又は相補性決定領域(CDR)をコードするDNAを、異なる免疫グロブリンの定常領域又は定常領域+フレームワーク領域に導入することを含み得る。抗体を産生するハイブリドーマ又は他の細胞は、遺伝子突然変異又は他の変化を受ける可能性があり、これにより産生される抗体の結合特異性が変化する場合も又は変化しない場合もある。
一実施形態においては、重鎖可変領域及び/又は軽鎖可変領域は、少なくとも85%ヒト化、少なくとも90%ヒト化、少なくとも95%ヒト化、少なくとも96%ヒト化、少なくとも97%ヒト化、少なくとも98%ヒト化又は少なくとも99%ヒト化されている。幾つかの実施形態においては、抗体は、例えばより良好な抗原結合を保持するように保存的にヒト化される。かかる保存的にヒト化された抗体においては、ヒト化抗体と比較してより少ない抗体置換が行われ得る。
本発明の抗原結合分子は、幾つかの実施形態においては、例えばJones et al., "Deimmunization of monoclonal antibodies", Methods Mol Biol, 2009, 525:405-23(その内容が引用することにより本明細書の一部をなす)に記載される方法を用いて脱免疫化される。脱免疫化により、免疫学的及び分子生物学的手法の組合せを用いてT細胞エピトープが配列から除去される。
したがって、本発明の幾つかの実施形態においては、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体の6つのCDR領域の脱免疫化変異体を含む、脱免疫化抗PD-L1抗原結合分子又はその抗原結合フラグメントが提供される。本発明の更なる実施形態においては、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体に由来するVH及び/又はVL配列の脱免疫化変異体を含む、脱免疫化抗PD-L1抗原結合分子又はその抗原結合フラグメントが提供される。本発明のまた更なる実施形態においては、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体の脱免疫化変異体である脱免疫化抗PD-L1抗体が提供される。
抗原結合分子及びその抗原結合フラグメントは、1つの親抗体2A09をベースとする。本発明は、親抗体に加えて、親抗体の親和性成熟変異体に特に関する。本発明はまた、本発明の抗体に由来する1つ以上の抗原結合ドメインを含む抗体フラグメント、並びに1つ以上の保存的アミノ酸置換を有する抗原結合ドメインを有する抗体又はその抗原結合フラグメント等の更なる変異体をベースとする。一実施形態においては、抗体又はその抗原結合フラグメントは、1個~10個の保存的アミノ酸置換を有する抗原結合ドメインを有する。一実施形態においては、抗体又はその抗原結合フラグメントは、1つ~5つの保存的アミノ酸置換を有する抗原結合ドメインを有する。一実施形態においては、抗体又はその抗原結合フラグメントは、1つ又は2つの保存的アミノ酸置換を有する抗原結合ドメインを有する。本発明の抗原結合分子は全て、PD-L1に特異的に結合する。
本発明の抗原結合分子、特に抗体は、IgA、IgD、IgE、IgG、IgM及びIgYを含む任意の好適なタイプとすることができるが、IgGが好ましい可能性がある。IgG1骨格が最も好ましい可能性がある。関連の実施形態においては、本発明の抗体の定常領域を有利な効果、例えば安定性の増大及びFcγ受容体相互作用の低減のために修飾することができる。
かかる有利な修飾としては、Fc領域における修飾又は置換、例えばエフェクター細胞死滅機能を増強するものが挙げられる。エフェクター細胞死滅機能は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞食作用(ADCP)及び/又は補体依存性細胞傷害(CDC)を指す。
一実施形態においては、Fc領域は、ADCC及び/又はADCP及び/又はCDC活性を増強するように修飾される。増強は、修飾前の抗体と比較して強いADCC及び/又はADCP及び/又はCDC活性を指す。
一実施形態においては、Fc領域は、ADCC及び/又はADCP及び/又はCDC活性を増強するようにタンパク質工学によって修飾される。一実施形態においては、Fc受容体親和性は、C1qに対する親和性を高めるアミノ酸突然変異によって高めることができ、これによりCDCが増強する。
別の実施形態においては、Fc受容体親和性は、Fc領域のグリコシル化プロファイルを変化させることによって高めることができる。一実施形態においては、Fc領域は、ADCC活性を高めるように脱フコシル化又は低フコシル化(under fucosylation)によって修飾される。
抗体及び抗原結合分子のフラグメント
本発明の抗原結合分子は、抗体のフラグメント、具体的には抗体の抗原結合フラグメントとすることができる。抗原結合フラグメントは、1つ以上の抗原結合領域を含む。全抗体のフラグメントが抗原に結合する機能を果たし得ることが示されている。結合フラグメントの例は、(i)VL、VH、CL及びCH1ドメインからなるFabフラグメント、(ii)VH及びCH1ドメインからなるFdフラグメント、(iii)単一抗体のVL及びVHドメインからなるFvフラグメント、(iv)VHドメインからなるdAbフラグメント(Ward, E.S. et al., Nature 341:544-546 (1989))、(v)単離CDR領域、(vi)2つの連結したFabフラグメントを含む二価フラグメントであるF(ab’)2フラグメント、(vii)2つのドメインが会合して抗原結合部位を形成することを可能にするペプチドリンカーによってVHドメイン及びVLドメインが連結した一本鎖Fv分子(scFv)(Bird et al., Science 242:423-426 (1988)、Huston et al., PNAS USA 85:5879-5883 (1988))、(viii)二重特異性一本鎖Fv二量体(国際出願PCT/US92/09965号)、並びに(ix)遺伝子融合によって構築される多価又は多重特異性フラグメントである「ダイアボディ」(国際公開第94/13804号、P. Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993))。通例、フラグメントは、Fab、F(ab’)2若しくはFvフラグメント又はscFv分子である。幾つかの実施形態においては、フラグメントは、Fabフラグメントであってもよい。
二重特異性抗体は、2つの抗原又は2つのエピトープ等の2つの標的分子に同時に結合することができる抗体である。二重特異性抗体は、二重結合抗体と称されることもある。二重特異性抗体フォーマットの例としては、(mAb)2、Fcab、F(mAb’)2、クアドローマ、scFv(一本鎖可変フラグメント)、bsDb(二重特異性ダイアボディ)、scBsDb(一本鎖二重特異性ダイアボディ)、BiTE(二重特異性T細胞誘導抗体)、DART(二重親和性再標的化抗体)、チャージペア(charge pairs)、タンデム抗体、タンデムscFv-Fc、Fab-scFv-Fc、Fab-scFv、ミニボディ、zybody(zybodies)、DNL-F(ab)3(ドックアンドロック(dock-and-lock)三価Fab)、bssdAb(二重特異性単一ドメイン抗体)及びノブインホール(knobs-in-holes)が挙げられるが、これらに限定されない。
ダイアボディは、ポリペプチドの多量体であり、各ポリペプチドは、免疫グロブリン軽鎖の結合領域を含む第1のドメインと、免疫グロブリン重鎖の結合領域を含む第2のドメインとを含み、2つのドメインは連結している(例えばペプチドリンカーによる)が、互いに会合して抗原結合部位を形成することはできない。抗原結合部位は、多量体内の1つのポリペプチドの第1のドメインと多量体内の別のポリペプチドの第2のドメインとの会合によって形成される(国際公開第94/13804号)。
二重特異性抗体を使用する場合、これらは従来の二重特異性抗体であってもよく、様々な方法で製造することができ(Hollinger & Winter, Current Opinion Biotechnol. 4:446-449 (1993))、例えば化学的に若しくはハイブリッドハイブリドーマから作製しても、又は下記の二重特異性抗体フラグメントのいずれかであってもよい。全抗体ではなく、scFv二量体又はダイアボディを使用することが好ましい場合がある。ダイアボディ及びscFvは、Fc領域なしに、可変ドメインのみを用いて構築することができ、抗イディオタイプ反応の影響を低減する可能性がある。二重特異性抗体の他の形態としては、Traunecker et al., EMBO Journal 10:3655-3659 (1991)に記載される一本鎖「ジャヌシン(Janusins)」が挙げられる。
二重特異性ダイアボディはまた、二重特異性全抗体とは対照的に、大腸菌(E. coli)内で容易に構築し、発現させることができるため、有用であり得る。適切な結合特異性のダイアボディ(及び抗体フラグメント等の多くの他のポリペプチド)は、ファージディスプレイ(国際公開第94/13804号)を用いてライブラリから容易に選択することができる。ダイアボディの或るアームを、例えば抗原Xに対する特異性で一定に保つ場合、別のアームを変化させてライブラリを作成し、適切な特異性の抗体を選択することができる。
幾つかの実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対して一価であり、例えば一価抗体フラグメントである。一価抗原結合分子(単量体抗原結合分子としても知られる)は、エピトープ又は抗原に対する結合部位を1つしか有しない抗原結合分子である。例えば、Fab、ノブインホール、1アームIgG、scFvは、一価結合を示し、2つのFab領域を有する完全モノクローナル抗体は、二価結合を示す。抗原結合分子が一価である場合、抗原結合分子及び抗原は、1:1の比率で結合する。したがって、本発明は、pHに依存してPD-L1に特異的に結合する一価抗体又は抗体フラグメントを提供する。
幾つかの実施形態においては、抗原結合分子は、PD-L1に対して一価である。これは、抗原結合分子がPD-L1に対して最大で1つの結合部位を有することを意味する。したがって、抗原結合分子は、PD-L1分子に1:1の比率で結合する。一価抗原結合分子はまた、概して単一特異性である。かかる実施形態においては、一価抗原結合分子は、PD-L1のみに特異的に結合する。幾つかの実施形態においては、抗体結合分子は、PD-L1に1:1の比率で特異的に結合する一価結合部位と、PD-L1とは異なる抗原に特異的に結合する1つ以上の付加的な結合部位とを含み得る。例えば、幾つかの実施形態においては、抗原結合分子は、PD-L1に対して一価である(PD-L1に1:1の比率で特異的に結合する)第1の結合部位と、第2の異なる抗原に特異的に結合する第2の結合部位とを含む二重特異性抗原結合分子である。別の実施形態においては、抗原結合分子は、PD-L1に対して一価である(PD-L1に1:1の比率で特異的に結合する)第1の結合部位と、第2の異なる抗原に対して一価である(第2の異なる抗原に1:1の比率で特異的に結合する)第2の結合部位とを含む二重特異性抗原結合分子であり得る。かかる実施形態においては、抗原結合分子は、その抗原に1つの抗原結合分子対2つの抗原分子の比率で結合するが、1つの抗原結合分子対1つのPD-L1分子の比率でも結合する。多重及び二重特異性構成は、他の部分で論考され、本明細書に開示される多重及び二重特異性抗原結合分子がPD-L1に対して一価であり得る(すなわち、PD-L1に1つの二重特異性抗原結合分子対1つのPD-L1分子の比率で結合する)ことが直接企図される。
幾つかの実施形態においては、本発明の抗原結合分子又は抗体は、PD-L1及び別の抗原又はエピトープに対して二重特異性であってもよい。一実施形態においては、他の抗原は、T細胞共刺激アゴニスト又はT細胞共刺激アンタゴニストからなる群から選択することができる。一実施形態においては、他の抗原は、CD47、SIRPα、CD25、TIGIT、ICOS、CD70、BTLA、GITR、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、CD137、OX40、EGFR、TGF、VEGF及びCD40からなる群から選択することができる。
一実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合するとともに、免疫チェックポイント阻害剤に特異的に結合する。更なる実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合するとともに、免疫チェックポイント阻害剤に特異的に結合する。更なる実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合するとともに、免疫チェックポイント阻害剤に特異的に結合し、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1、CTLA-4、TIM-3、CD137、CD40、LAG-3、VISTA、ICOS、BTLA、GITR及びTIGITからなる群から選択される。
一実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合するとともに、免疫エフェクターに特異的に結合する。更なる実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合するとともに、OX40、EGFR、TGF、VEGF、CD40、CD137、GITR、CXCR3、BTLA、CD3、CD70、CD25、CD47、SIRPα及びCD27からなる群から選択される免疫エフェクターに特異的に結合する。
一実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合し、また、T細胞等の他の細胞を動員し、係合するように作用する。二重特異性抗原結合分子又は抗体の二重抗原特異性は、細胞傷害性T細胞上に存在する抗原とともにPD-L1特異的抗原に同時に結合することを可能にする。これにより、T細胞の細胞傷害活性が二重特異性抗原結合分子又は抗体の係合活性によって腫瘍細胞に指向される。更なる実施形態においては、本発明の二重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的に結合するとともに、T細胞リクルーターに特異的に結合する。T細胞リクルーター分子としては、CD3及びCD137が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明の抗体又は抗原結合分子は、三重特異性であってもよい。本発明の三重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的な結合部位と、T細胞を動員するための結合部位とを含む。一実施形態においては、かかる抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的な結合部位と、CD3に特異的な結合部位とを含む。さらに、これらの実施形態においては、三重特異性抗原結合分子又は抗体のFc領域は、アクセサリー細胞上のFc受容体に結合することもできる。単球、マクロファージ、NK細胞及び/又は樹状細胞等の付加的なアクセサリー細胞の動員は、三重特異性抗体がT細胞、アクセサリー細胞及び腫瘍細胞の連結を可能にするため、三重特異性抗原結合分子又は抗体を腫瘍細胞の破壊について他の抗体よりも強力なものとする。一実施形態においては、三重特異性抗原結合分子又は抗体は、PD-L1に特異的な1つの結合部位と、CD3に特異的な1つの結合部位と、単球、マクロファージ、NK細胞及び樹状細胞上のFc受容体と相互作用し得る無傷Fc領域とを含む。
本発明の抗体又は抗原結合分子は、薬物、プロドラッグ又は毒性部分等の他の分子にコンジュゲートしてもよい。これは、これらの分子を腫瘍細胞に標的化するのに役立つ。本発明の抗体又は抗原結合分子は、他のPD-L1抗体よりもはるかに低い末梢毒性を有するため、健常な細胞を破壊することなく、腫瘍陽性PD-L1細胞のみに対して腫瘍細胞死滅戦略を用いることができる。一実施形態においては、本発明のPD-L1特異的抗原結合分子は、細胞毒素(例えばメイタンシノイド、オーリスタチン、ドラスタチン、クリプトフィシン、カリケアマイシン、ズオカルマイシン、ピロロベンゾジアゼピン)、タンパク質毒素(例えば緑膿菌外毒素、ジフテリア毒素、リボソーム不活性化タンパク質)、及び放射性核種(例えば90Y、111In)からなる群から選択される分子にコンジュゲートされる。
同一性及び相同性
当該技術分野で既知の「同一性」は、配列を比較することによって決定される、2つ以上のポリペプチド配列又は2つ以上のポリヌクレオチド配列間の関係である。当該技術分野において、同一性は、ポリペプチド又はポリヌクレオチド配列間の配列関連性の程度も意味し、場合によっては、かかる配列の文字列間の一致によって決定される。2つのポリペプチド又は2つのポリヌクレオチド配列間の同一性を測定する多数の方法があるが、同一性の決定に一般に用いられる方法は、コンピュータプログラムにコード化されている。2つの配列間の同一性を決定するのに好ましいコンピュータプログラムとしては、GCGプログラムパッケージ(Devereux, et al., Nucleic Acids Research, 12, 387 (1984))、BLASTP、BLASTN及びFASTA(Atschul et al., J. Molec. Biol. 215, 403 (1990))が挙げられるが、これらに限定されない。
アミノ酸配列を比較するためにCLUSTALプログラム等のプログラムを使用することができる。このプログラムは、アミノ酸配列を比較し、必要に応じていずれかの配列に空白を挿入することによって最適アラインメントを見出すものである。最適アラインメントについてアミノ酸の同一性又は類似性(同一性+アミノ酸タイプの保存)を算出することが可能である。BLASTxのようなプログラムは、類似した配列の最長ストレッチをアラインメントし、適合度に値を割り当てるものである。このため、幾つかの類似性領域が見出され、各々が異なるスコアを有する比較を得ることが可能である。どちらのタイプの同一性分析も本発明において企図される。
2つのアミノ酸配列又は2つの核酸配列の同一性パーセントは、最適比較目的で配列をアラインメントし(例えば、配列との最良アラインメントのために最初の配列にギャップを導入することができる)、対応する位置でアミノ酸残基又はヌクレオチドを比較することによって決定される。「最良アラインメント」は、最高の同一性パーセントをもたらす2つの配列のアラインメントである。同一性パーセントは、比較される配列中の同一のアミノ酸残基又はヌクレオチドの数によって決定される(すなわち、同一性%=同一の位置の数/位置の総数×100)。概して、本明細書における同一性%への言及は、文脈上他に指定又は示唆されない限り、分子の全長にわたる同一性%を指す。
2つの配列間の同一性パーセントの決定は、当業者に既知の数学アルゴリズムを用いて達成することができる。2つの配列を比較するための数学アルゴリズムの一例は、Karlin and Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877のように修正された、Karlin and Altschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-2268のアルゴリズムである。Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410のNBLAST及びXBLASTプログラムは、かかるアルゴリズムを組み込んでいる。BLASTヌクレオチド検索をNBLASTプログラム、スコア=100、ワード長=12を用いて行い、本発明の核酸分子に相同なヌクレオチド配列を得ることができる。BLASTタンパク質検索をXBLASTプログラム、スコア=50、ワード長=3で行い、本発明のタンパク質分子に相同なアミノ酸配列を得ることができる。比較目的でギャップ付きアラインメントを得るために、Gapped BLASTをAltschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402に記載のように用いることができる。代替的には、PSI-Blastを用いて、分子間の距離関係を検出する反復検索を行うことができる(同上)。BLAST、Gapped BLAST及びPSI-Blastプログラムを用いる場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLAST及びNBLAST)のデフォルトパラメーターを用いることができる。http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照されたい。配列の比較に用いられる数学アルゴリズムの別の例は、Myers and Miller, CABIOS (1989)のアルゴリズムである。CGC配列アラインメントソフトウェアパッケージの一部であるALIGNプログラム(バージョン2.0)は、かかるアルゴリズムを組み込んでいる。当該技術分野で既知の配列分析のための他のアルゴリズムとしては、Torellis and Robotti (1994) Comput. Appl. Biosci., 10 :3-5に記載されるADVANCE及びADAM、並びにPearson and Lipman (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. 85:2444-8に記載されるFASTAが挙げられる。FASTAにおいては、ktupが検索の感度及び速度を設定する制御オプションである。
典型的には、本発明において提供される抗原結合分子のCDRのアミノ酸配列は、例えばHGMP(ヒトゲノムマッピングプロジェクト)によって提供されるBLASTコンピュータプログラム(Atschul et al., J. Mol. Biol. 215, 403-410 (1990))のデフォルトパラメーターを用いて、下記のCDRのアミノ酸配列に対してアミノ酸レベルで少なくとも70%の同一性を有する。より典型的には、CDR配列は、下に示す配列に対してアミノ酸レベルで少なくとも75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は少なくとも99%の同一性を有する。通例、本発明において使用される抗原結合分子のCDR配列の各々が、下記のCDRのアミノ酸配列に対して、このレベルの同一性を有する。代替的には、本発明において使用される抗原結合分子のCDRのいずれか1つ、2つ、3つ、4つ又は5つが、下記のCDRのアミノ酸配列に対して、このレベルの同一性を有する。
本発明において提供される抗原結合分子のVH及びVL領域のアミノ酸配列は、例えばHGMP(ヒトゲノムマッピングプロジェクト)によって提供されるBLASTコンピュータプログラム(Atschul et al., J. Mol. Biol. 215, 403-410 (1990))のデフォルトパラメーターを用いて、下記のVH及びVL領域のアミノ酸配列に対してアミノ酸レベルで少なくとも70%の同一性を有する。より典型的には、VH及びVL領域は、下に示す配列に対してアミノ酸レベルで少なくとも75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は少なくとも99%の同一性を有する。通例、本発明において使用される抗原結合分子のVH及びVL領域の各々が、下記のVH及びVL領域のアミノ酸配列に対して、このレベルの同一性を有する。代替的には、本発明において使用される抗原結合分子のVH及びVL領域のいずれか1つが、下記のVH及びVL領域のアミノ酸配列に対して、このレベルの同一性を有する。
同一性は、本明細書において使用される場合、「相同性」及び「類似性」と区別なく用いられ得る。特定の同一性%への言及は、相同性%及び類似性%に等しく当てはまる。相同性及び類似性は、適切なアルゴリズム、例えばFASTA、BLAST及びGapped BLAST等を用いて決定することができる。これらの分析を行うためのソフトウェアは、公表されている。
変異体
本発明はまた、以下に言及するペプチド配列の変異体にまで及ぶ。本明細書において使用される場合、「変異体」という用語は、同様のアミノ酸配列を有し、及び/又は同じ機能を保持するタンパク質に関する。例えば、「変異体」という用語は、1つ以上のアミノ酸の付加、欠失、置換等を含むタンパク質又はポリペプチドを包含する。本発明の変異体の一例は、1つ以上の他のアミノ酸による1つ以上のアミノ酸の置換を除いて、以下に定義されるペプチドを含むタンパク質である。アミノ酸置換は例えば、アミノ酸配列における障害を低減又は排除するために行うことができる。代替的には、アミノ酸置換は、必要に応じて抗原親和性を改善するか、又は抗体をヒト化若しくは脱免疫化するために行うことができる。指定の抗体の親和性成熟変異体、ヒト化変異体及び脱免疫化変異体、並びに抗体の配列における任意の障害を低減又は排除するためにアミノ酸置換を含む変異体が、本明細書において提供される。
置換
当業者は、様々なアミノ酸が同様の特性を有することを認識している。物質の1つ以上のかかるアミノ酸は、多くの場合、その物質の所望の活性を排除することなく、1つ以上の他のかかるアミノ酸によって置換され得る。
このため、アミノ酸のグリシン、アラニン、バリン、ロイシン及びイソロイシンは、互いに置換され得ることが多い(脂肪族側鎖を有するアミノ酸)。これらの可能な置換の中でも、グリシン及びアラニンが互いの置換に使用され(比較的短い側鎖を有するため)、バリン、ロイシン及びイソロイシンが互いの置換に使用される(疎水性のより大きな脂肪族側鎖を有するため)ことが好ましい。互いに置換され得ることが多い他のアミノ酸としては、フェニルアラニン、チロシン及びトリプトファン(芳香族側鎖を有するアミノ酸)、リジン、アルギニン及びヒスチジン(塩基性側鎖を有するアミノ酸)、アスパルテート及びグルタメート(酸性側鎖を有するアミノ酸)、アスパラギン及びグルタミン(アミド側鎖を有するアミノ酸)、並びにシステイン及びメチオニン(硫黄含有側鎖を有するアミノ酸)が挙げられる。
この種の置換は、「保存的」又は「半保存的」アミノ酸置換と称されることが多い。
自然発生アミノ酸は、3文字及び1文字のコードを用いて以下のように称され得る:グリシン(G又はGly)、アラニン(A又はAla)、バリン(V又はVal)、ロイシン(L又はLeu)、イソロイシン(I又はIle)、プロリン(P又はPro)、フェニルアラニン(F又はPhe)、チロシン(Y又はTyr)、トリプトファン(W又はTrp)、リジン(K又はLys)、アルギニン(R又はArg)、ヒスチジン(H又はHis)、アスパラギン酸(D又はAsp)、グルタミン酸(E又はGlu)、アスパラギン(N又はAsn)、グルタミン(Q又はGln)、システイン(C又はCys)、メチオニン(M又はMet)、セリン(S又はSer)及びトレオニン(T又はThr)。残基がアスパラギン酸又はアスパラギンであり得る場合、記号Asx又はBを用いることができる。残基がグルタミン酸又はグルタミンであり得る場合、記号Glx又はZを用いることができる。文脈上他に指定のない限り、アスパラギン酸への言及はアスパルテートを含み、グルタミン酸への言及はグルタメートを含む。
以下に言及する融合タンパク質のアミノ酸配列に対し、アミノ酸の欠失又は挿入を行うこともできる。このため、例えば、ポリペプチドの活性に実質的な影響を及ぼさないか、又は少なくともかかる活性を排除しないアミノ酸を欠失させることができる。かかる欠失は、活性を保持しながらポリペプチドの全長及び分子量を減少させることができるため、有利であり得る。これにより、特定の目的に必要とされるポリペプチドの量を減少させることが可能であり、例えば投与量レベルを減少させることができる。
このため、アミノ酸のグリシン、アラニン、バリン、ロイシン及びイソロイシンは、互いに置換され得ることが多い(脂肪族側鎖を有するアミノ酸)。これらの可能な置換の中でも、グリシン及びアラニンが互いの置換に使用され(比較的短い側鎖を有するため)、バリン、ロイシン及びイソロイシンが互いの置換に使用される(疎水性のより大きな脂肪族側鎖を有するため)ことが好ましい。互いに置換され得ることが多い他のアミノ酸としては、フェニルアラニン、チロシン及びトリプトファン(芳香族側鎖を有するアミノ酸)、リジン、アルギニン及びヒスチジン(塩基性側鎖を有するアミノ酸)、アスパルテート及びグルタメート(酸性側鎖を有するアミノ酸)、アスパラギン及びグルタミン(アミド側鎖を有するアミノ酸)、並びにシステイン及びメチオニン(硫黄含有側鎖を有するアミノ酸)が挙げられる。
幾つかの実施形態においては、以下のアミノ酸を保存的アミノ酸置換のために交換することができる。
Figure 0007653408000001
したがって、「保存的」アミノ酸置換への言及は、抗体の配列(例えば、CDR又はVH若しくはVL配列)中のアミノ酸の1つ以上が、上で示したように同じクラスの別のアミノ酸で置換されるアミノ酸置換を指す。保存的アミノ酸置換は、抗体の機能に対する悪影響を最小限に抑えるためにCDR領域にあるのが好ましい場合がある。しかしながら、保存的アミノ酸置換は、フレームワーク領域に生じてもよい。
下記の配列に対するアミノ酸変化は、任意の好適な手法、例えば部位特異的突然変異誘発又は固相合成を用いて行うことができる。
本発明の範囲内のアミノ酸置換又は挿入は、自然発生又は非自然発生アミノ酸を用いて行うことができるが、自然発生アミノ酸が好ましい場合があることを理解されたい。天然又は合成アミノ酸が使用されるか否かを問わず、L-アミノ酸のみが存在することが好ましい。
本発明の一実施形態においては、抗体結合ドメイン又は抗原結合ドメインに1個~10個、好ましくは1個~5個、より好ましくは1又は2個のアミノ酸置換を含む、本発明の抗原結合分子又はその抗原結合フラグメントが提供される。例えば、本発明の一実施形態においては、抗PD-L1抗体又はその抗原結合フラグメントが提供され、抗PD-L1抗体又はその抗原結合フラグメントは、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体の6つのCDR領域を含み、任意に、抗原結合分子が、そのCDR領域全体にわたって1個~10個のアミノ酸置換、好ましくはそのCDR領域全体にわたって1個~5個のアミノ酸置換を有する。本発明の更なる実施形態においては、抗PD-L1抗原結合分子又はその抗原結合フラグメントが提供され、抗PD-L1抗体又はその抗原結合フラグメントは、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体のVH及びVL配列を含み、任意に、抗原結合分子が、そのVH及びVL配列にわたって1個~10個のアミノ酸置換、好ましくはそのVH及びVL配列にわたって1個~5個のアミノ酸置換を有する。本発明のまた更なる実施形態においては、抗PD-L1抗体が提供され、抗PD-L1抗体は2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体であり、抗体は1個~10個のアミノ酸置換、好ましくは1個~5個のアミノ酸置換を有する。置換は当然ながら、出発抗体の元のCDR又は可変鎖配列を基準にした置換である。
幾つかの実施形態においては、1つ以上のアミノ酸置換は、CDR領域(単数又は複数)にある。他の実施形態においては、1つ以上のアミノ酸置換は、フレームワーク領域、すなわち可変重鎖及び軽鎖にあるが、CDR領域(単数又は複数)にはない。他の実施形態においては、1つ以上のアミノ酸置換は、可変重領域及び/又は可変軽領域内の任意の位置にあり得る。幾つかの実施形態においては、アミノ酸置換は、抗体の結合特異性及び/又は親和性に悪影響を及ぼさない。したがって、変異体抗体は、それが由来する抗体と同じか又は優れた機能プロファイルを有し得る。
例えば、幾つかの実施形態においては、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体であり、そのフレームワーク領域全体にわたって1個~10個のアミノ酸置換、好ましくはそのフレームワーク領域全体にわたって1個~5個のアミノ酸置換を有する(すなわち、置換が参照抗体と比べてフレームワーク領域に見られ、CDR配列は変化しない)、抗PD-L1抗体が提供される。
親和性成熟変異体
本発明の範囲内の他の変異体には、PD-L1又はPD-L1のエピトープに対する親和性が増大するように修飾された本発明の抗原結合分子が含まれる。一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、親和性成熟抗体である。一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、完全ヒト親和性成熟抗体である。
任意の既知の方法を用いて本発明の抗原結合分子の親和性を増大させ、PD-L1又はPD-L1のエピトープに対する親和性が増大した親和性成熟抗体又は完全ヒト親和性成熟抗体を生成することができる。
本発明は、提供される抗原結合物質の親和性成熟変異体を提供する。親和性成熟変異体は、親抗体よりも大きな親和性でPD-L1に結合する。作製される抗体は、例えばKdによって測定されるように、親抗体がPD-L1に結合するよりも少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、より好ましくは少なくとも50%大きな親和性でPD-L1に結合するのが好ましい。
幾つかの実施形態においては、本発明は、本明細書に記載される抗原結合分子(例えば、抗PD-L1結合分子若しくは抗体、又はその抗原結合フラグメント若しくは変異体)を準備することと、抗体を親和性成熟に供することとを含む、本発明の抗原結合分子を作製する方法を提供し、作製される抗体は、親抗体よりも大きな親和性でPD-L1に結合する。作製される抗体は、例えばKdによって測定されるように、親抗体がPD-L1に結合するよりも少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、より好ましくは少なくとも50%大きな親和性でPD-L1に結合するのが好ましい。親和性を測定する方法は、当該技術分野で既知であり、下記実施例に記載される。かかる方法によって作製された親和性成熟抗体は、他の抗PD-L1結合分子について本明細書に記載されるように配合及び使用することができる。
親和性成熟は、当業者に既知の任意の好適な方法に従って行うことができる。例えば、in vitro抗体ディスプレイシステムが高親和性の特異抗体の生成に広く使用されている。これらのシステムにおいては、表現型(すなわち、抗体フラグメント)と遺伝子型(すなわち、抗体遺伝子)とを組み合わせ、抗体の配列を直接決定することが可能である。抗体レパートリーのディスプレイを達成し、その後の結合剤の選択を可能にする幾つかのシステムが開発されており、選択の厳密性を高めることで、更に高い親和性の変異体を選択することが可能である。抗体フラグメントは、酵母、リボソーム、ファージディスプレイ粒子において又はDNAへの直接結合によって発現させることができる。
現在の抗体親和性成熟法は、確率的及び非確率的の2つの突然変異誘発カテゴリーに属する。エラープローン(Error-prone)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、突然変異誘発細菌株及び飽和突然変異誘発が確率的突然変異誘発法の典型例である。非確率的手法においては、アラニンスキャニング又は部位特異的突然変異誘発を用いて特定の変異体の限られたコレクションを生成することが多い。加えて、親抗体のシャッフリング変異体を得るシャッフリングアプローチを用いて、抗体の親和性を更に改善することもできる。
したがって、本発明の一実施形態においては、親和性成熟の方法は、確率的突然変異誘発(例えば、エラープローンポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、突然変異誘発細菌株又は飽和突然変異誘発)、非確率的突然変異誘発(例えば、アラニンスキャニング又は部位特異的突然変異誘発)、シャッフリング(例えば、DNAシャッフリング、鎖シャッフリング又はCDRシャッフリング)、及び修飾を導入するためのCRISPR-Cas9システムの使用からなる群から選択される。
親和性成熟方法は例えば、Rajpal et al., Proc Natl Acad Sci USA, 2005, 102(24):8466-71、Steinwand et al., MAbs, 2014, 6(1):204-18、及びHandbook of Therapeutic Antibodies, Wiley, 2014, Chapter 6, Antibody Affinity (pages 115-140)に記載されている。
幾つかの実施形態においては、上記の(すなわち、親和性成熟によって抗体を作製する)方法に従って作製された抗体を準備することと、抗体と少なくとも1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤とを共配合することとを含む、医薬組成物を調製する方法が提供される。医薬組成物の調製に使用される抗体は、2A09の親和性成熟変異体であり得る。医薬組成物の調製に使用される抗体は、8G08、8D06、8A04、8B06又は8D04の親和性成熟変異体であり得る。かかる方法によって作製される医薬組成物は、他の抗PD-L1結合分子について本明細書に記載されるように本発明の治療方法に使用することができる。したがって、本発明の抗原結合分子の親和性成熟突然変異体又は変異体である抗原結合分子が提供される。例えば、一実施形態においては、2A09、8G08、8D06、8A04、8B06及び8D04からなる群から選択される抗体の親和性成熟変異体が提供される。概して、親和性成熟突然変異体は、PD-L1に対して親抗体(突然変異体が由来する抗体)よりも高い親和性を有する。本発明の抗原結合分子又は抗体の親和性成熟によって得ることができる又は得られる抗原結合分子及び抗体も本発明によって提供される。
製造上の障害
抗体等の治療用タンパク質は、化学修飾及び翻訳後修飾(PTM)のために本来的に不均一かつ複雑である。修飾は、宿主細胞系、製造に用いられるプロセス、又は貯蔵若しくは製造時の条件等の多数の要因によって引き起こされる可能性がある。修飾は、分子自体の化学的安定性、又は凝集能、及びこれが抗体の固有の物理的安定性に及ぼす影響に関連する可能性がある。製造又は貯蔵時に自発的な修飾を受ける可能性がある所与の抗体配列中のアミノ酸モチーフ又は残基は、障害と称される。したがって、抗体配列に対して突然変異を行うことで、障害に対処し、修飾及び分解に対する抗体の感受性を低下させることができる。
抗体配列中の障害の結果としてのかかる修飾には、グリコシル化、脱アミド化、酸化、並びにC末端及びN末端の変異が含まれ得る。かかる修飾は、製造時に生じる可能性がある。或る特定の残基及び構造又は配列モチーフは、或る特定の修飾をより受けやすい。修飾に対するかかる障害の例としては、AsnのN-結合型グリコシル化、Ser/ThrのO-結合型グリコシル化、Asnの脱アミド化、Aspの異性化/断片化、Lysの糖化、Met/Trpの酸化、遊離チオール基、ピログルタメート、C末端Lysが挙げられる。
当業者は、潜在的に修飾を引き起こし得る構造及び配列の障害を予測及び特定するために計算ツールを用いることができることを認識している。修飾の発生を最小限に抑えるために、製造プロセスを変更することができる。リスクを低下させるためにタンパク質工学を検討してもよい。例えば、これらの障害の選択的突然変異は、抗体の安定性を危うくする修飾のリスクを特定し、低下させるのに役立ち得る。
アスパラギン酸残基(Asp)は、自発的な修飾を受ける可能性がある。Asp-Gly配列等のAsp含有モチーフは、自発的な異性化を受け、イソアスパラギン酸を形成する可能性がある。イソアスパルテートの形成は、抗体の結合を弱体化させるか又は完全に消失させる恐れがある。これは、Asp残基が抗体のCDRに見られる場合に更に重要である。
したがって、アスパラギン酸残基(Asp)を任意の自然発生アミノ酸で置換し、修飾に対するこの障害を低減することができる。任意に、アスパラギン酸残基(Asp)をアラニン(Ala)、グルタミン(Gln)又はグルタミン酸(Glu)で置換し、修飾に対するこの障害を低減することができる。異性化を低減するために作製/配合の最適化を調査してもよい。代替的には、Asp残基の置換によってではなく、グリシン残基を別の自然発生アミノ酸で置換することによってAsp-Glyモチーフを修飾し、脱アミド化を阻害することもできる。
メチオニン残基(Met)は、自発的な修飾を受ける可能性がある。特に溶媒に曝露される場合のCDRにおけるメチオニン(Met)の存在は、メチオニンが酸化され、これが結合を妨げる場合に問題を生じることがある。したがって、メチオニン残基を任意の他の自然発生アミノ酸で置換し、修飾に対するこの障害を低減することができる。メチオニン残基は、好ましくはAla又はLeuで置換され得る。酸化を低減するために作製/配合の最適化を調査してもよい。
Figure 0007653408000002
したがって、8A04、8B06、8G08、8D06、8D04及び2A09のいずれかに由来するが、上に要約した障害の1つ以上に対処するために1つ以上のアミノ置換を含む変異体抗体も本明細書において提供される。
例えば、本明細書の1つ以上のアミノ酸配列によって定義される任意の抗原結合分子について、1つ以上のMet残基が存在する場合、1つ以上のMet残基は、それぞれ独立してAla残基又はLeu残基で置換されていてもよい。1つ以上のAsp残基が存在する場合、1つ以上のAsp残基は、それぞれ独立してAla残基、Gln残基又はGlu残基で置換されていてもよい。
提供される抗原結合分子の概要
本発明によって提供される抗原結合分子の概要を、添付の配列表において割り当てられる配列番号を特定して下に提示する。その抗原結合変異体、誘導体及びフラグメントも本発明の一部として提供される。
Figure 0007653408000003
少なくとも以下の変異体を含む変異体も提供される。
Figure 0007653408000004
例えば、本明細書において提供される8G08の変異体には、配列番号35のVL及び配列番号26のVH、又は配列番号36のVL及び配列番号27のVH、又は配列番号37のVL及び配列番号28のVHを有する変異体が含まれる。本明細書において提供される8D06の変異体には、配列番号38のVL及び配列番号26のVH、又は配列番号39のVL及び配列番号27のVH、又は配列番号40のVL及び配列番号28のVHを有する変異体が含まれる。本明細書において提供される8A04の変異体には、配列番号41のVL及び配列番号26のVH、又は配列番号42のVL及び配列番号27のVH、又は配列番号43のVL及び配列番号28のVHを有する変異体が含まれる。本明細書において提供される8B06の変異体には、配列番号47のVL及び配列番号26のVH、又は配列番号48のVL及び配列番号27のVH、又は配列番号49のVL及び配列番号28のVHを有する変異体が含まれる。本明細書において提供される8A04の変異体には、配列番号50のVL及び配列番号26のVH、又は配列番号51のVL及び配列番号27のVH、又は配列番号52のVL及び配列番号28のVHを有する変異体が含まれる。本明細書において提供される2A09の変異体には、配列番号20のVL及び配列番号26のVH、又は配列番号21のVL及び配列番号27のVH、又は配列番号22のVL及び配列番号28のVHを有する変異体が含まれる。
本明細書において提供される8G08の他の変異体としては、
配列番号10のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号23のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号29のVHCDR2及び配列番号32のVHCDR3、
配列番号10のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号24のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号30のVHCDR2及び配列番号33のVHCDR3、又は、
配列番号10のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号25のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号31のVHCDR2及び配列番号34のVHCDR3を有する変異体が挙げられる。
本明細書において提供される8D06の他の変異体としては、
配列番号12のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号23のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号29のVHCDR2及び配列番号32のVHCDR3、
配列番号12のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号24のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号30のVHCDR2及び配列番号33のVHCDR3、又は、
配列番号12のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号25のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号31のVHCDR2及び配列番号34のVHCDR3を有する変異体が挙げられる。
本明細書において提供される8A04の他の変異体としては、
配列番号44のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号23のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号29のVHCDR2及び配列番号32のVHCDR3、
配列番号45のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号24のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号30のVHCDR2及び配列番号33のVHCDR3、又は、
配列番号46のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号25のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号31のVHCDR2及び配列番号34のVHCDR3を有する変異体が挙げられる。
本明細書において提供される8B06の他の変異体としては、
配列番号16のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号23のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号29のVHCDR2及び配列番号32のVHCDR3、
配列番号16のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号24のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号30のVHCDR2及び配列番号33のVHCDR3、又は、
配列番号16のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号25のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号31のVHCDR2及び配列番号34のVHCDR3を有する変異体が挙げられる。
本明細書において提供される8D04の他の変異体としては、
配列番号16のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号23のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号29のVHCDR2及び配列番号32のVHCDR3、
配列番号16のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号24のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号30のVHCDR2及び配列番号33のVHCDR3、又は、
配列番号16のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号25のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号31のVHCDR2及び配列番号34のVHCDR3を有する変異体が挙げられる。
本明細書において提供される2A09の他の変異体としては、
配列番号2のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号23のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号29のVHCDR2及び配列番号32のVHCDR3、
配列番号2のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号24のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号30のVHCDR2及び配列番号33のVHCDR3、又は、
配列番号2のVLCDR1、配列番号3のVLCDR2、配列番号25のVLCDR3、配列番号6のVHCDR1、配列番号31のVHCDR2及び配列番号34のVHCDR3を有する変異体が挙げられる。
ここで、本発明の様々な実施形態について、より詳細に論考する。
VLCDR1領域を含む抗原結合分子
8B06
一実施形態においては、アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。一実施形態においては、アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)に対して少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。特定の実施形態においては、抗原結合分子は、抗体又はそのフラグメント若しくは変異体であり、該抗体又はそのフラグメント若しくは変異体のVLCDR1領域は、RETELSRRLHYVR(配列番号16)である。
幾つかの実施形態においては、少なくとも30のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8B06抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8B06 VLCDR1領域における障害を低減又は排除するために行ってもよい。
8D06
一実施形態においては、アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。一実施形態においては、アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)に対して少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。特定の実施形態においては、抗原結合分子は、抗体又はそのフラグメント若しくは変異体であり、該抗体又はそのフラグメント若しくは変異体のVLCDR1領域は、VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)である。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8D06抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8D06 VLCDR1領域における障害を低減又は排除するために行ってもよい。
8G08
一実施形態においては、アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。一実施形態においては、アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)に対して少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。特定の実施形態においては、抗原結合分子は、抗体又はそのフラグメント若しくは変異体であり、該抗体又はそのフラグメント若しくは変異体のVLCDR1領域は、ISNDVPASGHYHR(配列番号10)である。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8G08抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8G08 VLCDR1領域における障害を低減又は排除するために行ってもよい。
8A04
一実施形態においては、アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。一実施形態においては、アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)に対して少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。特定の実施形態においては、抗原結合分子は、抗体又はそのフラグメント若しくは変異体であり、該抗体又はそのフラグメント若しくは変異体のVLCDR1領域は、MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)である。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約30のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8A04抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8A04 VLCDR1領域における障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列XRTGTGNKGHYTR(配列番号44)を含むVLCDR1を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、XがMet、Ala又はLeuからなる群から選択されるアミノ酸配列XRTGTGNKGHYTR(配列番号45)を含むVLCDR1を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、XがAla又はLeuからなる群から選択されるアミノ酸配列XRTGTGNKGHYTR(配列番号46)を含むVLCDR1を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
8D04
一実施形態においては、アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。一実施形態においては、アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)に対して少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。特定の実施形態においては、抗原結合分子は、抗体又はそのフラグメント若しくは変異体であり、該抗体又はそのフラグメント若しくは変異体のVLCDR1領域は、RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)である。
アミノ酸置換を、例えば8D04 VLCDR1領域における障害を低減又は排除するために行ってもよい。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8D04抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
2A09_WT
一実施形態においては、アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。一実施形態においては、アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)に対して少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含む軽鎖可変領域を含む抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。特定の実施形態においては、抗原結合分子は、抗体又はそのフラグメント若しくは変異体であり、該抗体又はそのフラグメント若しくは変異体のVLCDR1領域は、TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)である。
アミノ酸置換を、例えば2A09_WT VLCDR1領域における障害を低減又は排除するために行ってもよい。
重鎖及び/又は軽鎖CDR
8B06
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約30のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8B06抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8B06 CDRにおける障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号29)を含むVHCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号32)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号23)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号30)を含むVHCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号33)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号24)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号31)を含むVHCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号34)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号25)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含み、
任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される、抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
8D06
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8D06抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8D06 CDRにおける障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号29)を含むVHCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号32)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号23)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号30)を含むVHCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号33)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号24)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号31)を含むVHCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号34)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号25)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含み、
任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される、抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
8G08
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8G08抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を8G08 CDRにおける障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号29)を含むVHCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号32)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号23)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号30)を含むVHCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号33)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号24)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号31)を含むVHCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号34)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号25)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含み、
任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される、抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
8A04
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約30のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8A04抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8A04 CDRにおける障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号29)を含むVHCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号32)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列XRTGTGNKGHYTR(配列番号44)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号23)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号30)を含むVHCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号33)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
XがMet、Ala又はLeuからなる群から選択されるアミノ酸配列XRTGTGNKGHYTR(配列番号45)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号24)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号31)を含むVHCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号34)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
XがAla又はLeuからなる群から選択されるアミノ酸配列XRTGTGNKGHYTR(配列番号46)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号25)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含み、
任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される、抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
8D04
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
幾つかの実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有し得る、8D04抗体に由来する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば8D04 CDRにおける障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号29)を含むVHCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号32)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号24)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号30)を含むVHCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号33)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号25)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号31)を含むVHCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号34)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号26)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含み、
任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される、抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
2A09 WT
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)に対して少なくとも90%の同一性を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)に対して少なくとも90%の同一性を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
アミノ酸置換を、例えば2A09_WT CDRにおける障害を低減又は排除するために行ってもよい。
例えば、一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号29)を含むVHCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号32)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
Xが任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号23)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号30)を含むVHCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号33)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号24)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、
及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列VISYXGSNKYYAXSVKG(配列番号31)を含むVHCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列GALTHWGVVIGXGMDV(配列番号34)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、
アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及び、
XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列QSFXSTNPWV(配列番号25)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、
アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/又は、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2、及びアミノ酸配列QSFDSTNPWV(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含み、
任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される、抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
重鎖及び/又は軽鎖可変領域
一実施形態においては、本発明は、配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有する重鎖可変領域、及び/又は配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17、配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有する軽鎖可変領域を含む、PD-L1に結合する抗原結合分子、特に抗体を提供する。
かかる実施形態においては、少なくとも約5のpH6.0:7.4 EC50比を有する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
一実施形態においては、抗体はPD-L1に結合し、配列番号5のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、及び/又は配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17、配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態においては、抗原結合分子、例えば抗体、その変異体又はフラグメントが提供され、抗原結合分子は、以下からなる群から選択される重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む:
a)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号15のアミノ酸配列を含むVL(又はそれぞれ配列番号5及び配列番号15に対して少なくとも90%同一のVH及びVL配列を含む)、
b)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号11のアミノ酸配列を含むVL(又はそれぞれ配列番号5及び配列番号11に対して少なくとも90%同一のVH及びVL配列を含む)、
c)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号9のアミノ酸配列を含むVL(又はそれぞれ配列番号5及び配列番号9に対して少なくとも90%同一のVH及びVL配列を含む)、
d)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号13のアミノ酸配列を含むVL(又はそれぞれ配列番号5及び配列番号13に対して少なくとも90%同一のVH及びVL配列を含む)、
e)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号17のアミノ酸配列を含むVL(又はそれぞれ配列番号5及び配列番号17に対して少なくとも90%同一のVH及びVL配列を含む)、
f)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号1のアミノ酸配列を含むVL(又はそれぞれ配列番号5及び配列番号1に対して少なくとも90%同一のVH及びVL配列を含む)。
一実施形態においては、抗原結合分子、例えば抗体、その変異体又はフラグメントが提供され、抗原結合分子は、以下からなる群から選択される重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む:
a)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH若しくは配列番号5のVH配列と比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVH(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、及び/又は配列番号15のアミノ酸配列を含むVL若しくは配列番号15のVLと比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVL配列(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、
b)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH若しくは配列番号5のVH配列と比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVH(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、及び/又は配列番号11のアミノ酸配列を含むVL若しくは配列番号11のVLと比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVL配列(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、
c)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH若しくは配列番号5のVH配列と比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVH(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、及び/又は配列番号9のアミノ酸配列を含むVL若しくは配列番号9のVLと比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVL配列(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、
d)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH若しくは配列番号5のVH配列と比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVH(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、及び/又は配列番号13のアミノ酸配列を含むVL若しくは配列番号13のVLと比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVL配列(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、
e)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH若しくは配列番号5のVH配列と比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVH(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、及び/又は配列番号17のアミノ酸配列を含むVL若しくは配列番号17のVLと比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVL配列(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、
f)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH若しくは配列番号5のVH配列と比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVH(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)、及び/又は配列番号1のアミノ酸配列を含むVL若しくは配列番号1のVLと比較して最大5つのアミノ酸置換を有するVL配列(又はその親和性成熟変異体等のその変異体)。
幾つかの実施形態においては、アミノ酸置換は全て、可変領域のCDRに生じる。幾つかの実施形態においては、アミノ酸置換は全て、可変領域のフレームワーク領域に生じる。
幾つかの実施形態においては、アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。幾つかの実施形態においては、アミノ酸置換は、配列における1つ以上の潜在的障害に対処するためのものであり得る。幾つかの変異体抗体が1つ以上の障害に対処するための1つ以上のアミノ酸置換を有していてもよく、保存的アミノ酸置換である1つ以上の更なるアミノ酸置換を含んでいてもよい。
一実施形態においては、少なくとも5のpH6.0:7.4 EC50比を有する抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供される。
したがって、上記で論考されるように、そのヒト化及び親和性成熟変異体、並びに指定の配列(複数の場合もある)に対してより小さい又はより大きい%同一性又は相同性、例えば少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性又は相同性を有する変異体を含む変異体も提供される。1つ以上のアミノ酸置換を有する変異体も提供される。
本発明の一実施形態においては、配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び配列番号1に対して少なくとも89%同一の軽鎖可変領域を含む抗PD-L1抗原結合分子が提供される。かかる抗原結合分子は、変異体抗原結合分子が由来する抗原結合分子の機能活性(例えば、選択的pH結合、EC50、IC50及び/又はKd)を保持し得る。
幾つかの実施形態においては、%配列同一性は、指定の重鎖又は軽鎖可変領域の6つ全てのCDRの配列を含まずに算出される。かかる実施形態においては、配列の変動は、フレームワーク領域にのみ生じる。例えば、抗PD-L1抗原結合分子は、配列番号5の可変重鎖領域に対して少なくとも95%の同一性を有する可変重鎖領域、及び/又は配列番号15、11、9、13、17若しくは1の可変軽鎖領域に対して少なくとも95%の同一性を有する可変軽鎖領域を含むことができ、任意のアミノ酸変動が可変重鎖及び軽鎖配列のフレームワーク領域にのみ生じる。かかる実施形態においては、指定の配列同一性を有する抗PD-L1抗原結合分子は、配列番号5の完全な重鎖CDR1、CDR2及びCDR3配列、並びに配列番号15、11、9、13、17又は1の完全な軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3配列(すなわち、変異体が由来する抗体の完全な重鎖及び軽鎖CDR配列)を含む。
上述のように、アミノ酸置換は、本発明の抗原結合分子の重鎖可変領域及び/又は軽鎖可変領域における障害を低減又は排除するために行うことができる。障害を低減又は排除するためのかかる置換は、CDRに生じ得る。障害を低減又は排除するためのかかる置換は、可変領域のフレームワーク領域に生じ得る。
例えば、一実施形態においては、PD-L1に結合し、X、X及びXが各々独立して任意の自然発生アミノ酸であり得るアミノ酸配列:QVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMYWVRQAPGKGLEWVAVISYXGSNKYYAXSVKGRFTISRDNSKNTLNLQMNSLRAEDTAVYYCAKGALTHWGVVIGXGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号26)を有する重鎖可変領域、及び/又は、
a)X及びXが任意の自然発生アミノ酸であり得るNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGSIASNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号20)、
b)X及びXが各々独立して任意の自然発生アミノ酸であり得るNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCISNDVPASGHYHRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号35)、
c)X及びXが各々独立して任意の自然発生アミノ酸であり得るNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCVLSPRTHAGHYYRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号38)、
d)X、X及びXが各々独立して任意の自然発生アミノ酸であり得るNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCXRTGTGNKGHYTRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号41)、
e)X及びXが各々独立して任意の自然発生アミノ酸であり得るNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCRETELSRRLHYVRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号47)、及び、
f)X及びXが各々独立して任意の自然発生アミノ酸であり得るNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCRGTGSSFHHKYVRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号50)からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗原結合分子(例えば、抗体又はその抗原結合フラグメント)が提供される。
一実施形態においては、PD-L1に結合し、X、X及びXが各々独立してAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列:QVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMYWVRQAPGKGLEWVAVISYXGSNKYYAXSVKGRFTISRDNSKNTLNLQMNSLRAEDTAVYYCAKGALTHWGVVIGXGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号27)を有する重鎖可変領域、及び/又は、
a)XがMet又はLeuからなる群から選択され、XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGSIASNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号21)、
b)XがMet又はLeuからなる群から選択され、XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCISNDVPASGHYHRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号36)、
c)XがMet又はLeuからなる群から選択され、XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCVLSPRTHAGHYYRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号39)、
d)XがMet又はLeuからなる群から選択され、XがMet、Ala及びLeuからなる群から選択され、XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCXRTGTGNKGHYTRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号42)、
e)XがMet又はLeuからなる群から選択され、XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCRETELSRRLHYVRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号48)、及び、
f)XがMet又はLeuからなる群から選択され、XがAsp、Gln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCRGTGSSFHHKYVRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号51)からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗原結合分子(例えば、抗体又はその抗原結合フラグメント)が提供される。
一実施形態においては、PD-L1に結合し、X、X及びXが各々独立してGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるアミノ酸配列:QVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMYWVRQAPGKGLEWVAVISYXGSNKYYAXSVKGRFTISRDNSKNTLNLQMNSLRAEDTAVYYCAKGALTHWGVVIGXGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号28)を有する重鎖可変領域、及び/又は、
a)XがLeuであり、XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGSIASNYVQWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号22)、
b)XがLeuであり、XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCISNDVPASGHYHRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号37)、
c)XがLeuであり、XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCVLSPRTHAGHYYRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号40)、
d)XがLeuであり、XがAla及びLeuからなる群から選択され、XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCXRTGTGNKGHYTRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号43)、
e)XがLeuであり、XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCRETELSRRLHYVRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号49)、及び、
f)XがLeuであり、XがGln、Glu及びAlaからなる群から選択されるNFXLTQPHSVSESPGKTVTISCRGTGSSFHHKYVRWYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFXSTNPWVFGGGTKLTVL(配列番号52)からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗原結合分子(例えば、抗体又はその抗原結合フラグメント)が提供される。
一実施形態においては、抗原結合分子、例えば抗体、その変異体又はフラグメントが提供され、抗原結合分子は、
a)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号15のアミノ酸配列を含むVL、
b)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号11のアミノ酸配列を含むVL、
c)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号9のアミノ酸配列を含むVL、
d)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号13のアミノ酸配列を含むVL、
e)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号17のアミノ酸配列を含むVL、
f)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号1のアミノ酸配列を含むVL、
からなる群から選択される重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、任意に、Met残基が各々独立してAla及びLeuからなる群から選択されるアミノ酸で置換され、Asp残基が各々独立してAla、Gln及びGluからなる群から選択されるアミノ酸で置換される。
1つ以上のアミノ酸置換を有する変異体抗原結合分子は、変異体抗原結合分子が由来する抗原結合分子の機能活性(例えば選択的pH結合、EC50、IC50及び/又はKd)を保持し得る。本発明の変異体抗原結合分子は、それらが由来する抗原結合分子について記載したものと同じ方法で使用及び配合することができる。
本発明の他の抗原結合分子
本発明は、以下のCDRH及びCDRL配列を有する抗PD-L1抗原結合分子も提供する。
Figure 0007653408000005
ここで、X~X16は各々、任意のアミノ酸、好ましくは任意の自然発生アミノ酸であり得る。
好ましい実施形態においては、X~X16は各々独立してT、I、V、M、R、S、L、E、G、N、D、P、A、H、F、K、Y、Qからなる群から選択される。
一実施形態においては、
はA、L、T、I、V、M、R又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はR、S、L、E、G又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はS、N、T又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はS、D、P、G、E又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はG、V、R、T、L及びS、又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はS、P、T、G又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はI、A、H、N、R、F又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はA、S、K、R、H又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はS、G、L、H又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
10はN、H、K又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
11はV、H、Y、T又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
12はQ、R又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
13はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
14はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
15はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
16はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択される。
一実施形態においては、
はA、L、T、I、V、M及びRからなる群から選択され、
はR、S、L、E及びGからなる群から選択され、
はS、N及びTからなる群から選択され、
はS、D、P、G及びEからなる群から選択され、
はG、V、R、T、L及びSからなる群から選択され、
はS、P、T及びGからなる群から選択され、
はI、A、H、N、R及びFからなる群から選択され、
はA、S、K、R及びHからなる群から選択され、
はS、G、L及びHからなる群から選択され、
10はN、H及びKからなる群から選択され、
11はV、H、Y及びTからなる群から選択され、
12はQ及びRからなる群から選択され、
13はD、Q、E及びAからなる群から選択され、
14はD、Q、E及びAからなる群から選択され、
15はD、Q、E及びAからなる群から選択され、
16はD、Q、E及びAからなる群から選択される。
一実施形態(配列番号57)においては、
はA、L、T、I、V及びRからなる群から選択され、
はR、S、L、E及びGからなる群から選択され、
はS、N及びTからなる群から選択され、
はS、D、P、G及びEからなる群から選択され、
はG、V、R、T、L及びSからなる群から選択され、
はS、P、T及びGからなる群から選択され、
はI、A、H、N、R及びFからなる群から選択され、
はA、S、K、R及びHからなる群から選択され、
はS、G、L及びHからなる群から選択され、
10はN、H及びKからなる群から選択され、
11はV、H、Y及びTからなる群から選択され、
12はQ及びRからなる群から選択され、
13はQ、E及びAからなる群から選択され、
14はQ、E及びAからなる群から選択され、
15はQ、E及びAからなる群から選択され、
16はQ、E及びAからなる群から選択される。
かかる抗体は、好ましくは8B06、8D06、8G08、8A04、8D04又は2A09の1つ以上の機能プロファイルを有し得る。
本発明はまた、以下のVH及びVL配列を有する抗PD-L1抗原結合分子を提供する:
VH:QVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMYWVRQAPGKGLEWVAVISYXGSNKYYAXSVKGRFTISRDNSKNTLNLQMNSLRAEDTAVYYCAKGALTHWGVVIGXGMDVWGQGTTVTVSS
VL:NFXLTQPHSVSESPGKTVTISCX1011121314YX1516WYQQRPGSSPTTVIYEDDQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYCQSFX17STNPWVFGGGTKLTVL
ここで、X~X17は各々、任意のアミノ酸、好ましくは任意の自然発生アミノ酸であり得る(すなわち、VH配列が配列番号53を含み、VL配列が配列番号58を含む)。
好ましい実施形態においては、X~X17は各々独立してT、I、V、M、R、S、L、E、G、N、D、P、A、H、F、K、Y、Q(すなわち、VH配列が配列番号54を含み、VL配列が配列番号59を含む)からなる群から選択される。
一実施形態においては、
はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はM、L又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はA、L、T、I、V、M、R又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はR、S、L、E、G又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はS、N、T又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はS、D、P、G、E又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
はG、V、R、T、L及びS又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
10はS、P、T、G又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
11はI、A、H、N、R、F又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
12はA、S、K、R、H又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
13はS、G、L、H又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
14はN、H、K又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
15はV、H、Y、T又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
16はQ、R又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択され、
17はD、Q、E、A又はその保存的アミノ酸置換からなる群から選択される(すなわち、VH配列が配列番号55を含み、VL配列が配列番号60を含む)。
一実施形態においては、
はD、Q、E及びAからなる群から選択され、
はD、Q、E及びAからなる群から選択され、
はD、Q、E及びAからなる群から選択され、
はM及びLからなる群から選択され、
はA、L、T、I、V、M及びRからなる群から選択され、
はR、S、L、E及びGからなる群から選択され、
はS、N及びTからなる群から選択され、
はS、D、P、G及びEからなる群から選択され、
はG、V、R、T、L及びSからなる群から選択され、
10はS、P、T及びGからなる群から選択され、
11はI、A、H、N、R及びFからなる群から選択され、
12はA、S、K、R及びHからなる群から選択され、
13はS、G、L及びHからなる群から選択され、
14はN、H及びKからなる群から選択され、
15はV、H、Y及びTからなる群から選択され、
16はQ及びRからなる群から選択され、
17はD、Q、E及びAからなる群から選択される(すなわち、VH配列が配列番号56を含み、VL配列が配列番号61を含む)。
一実施形態においては、
はQ、E及びAからなる群から選択され、
はQ、E及びAからなる群から選択され、
はQ、E及びAからなる群から選択され、
はLであり、
はL、T、I、V、M及びRからなる群から選択され、
はS、L、E及びGからなる群から選択され、
はN及びTからなる群から選択され、
はD、P、G及びEからなる群から選択され、
はV、R、T、L及びSからなる群から選択され、
10はP、T及びGからなる群から選択され、
11はA、H、N、R及びFからなる群から選択され、
12はS、K、R及びHからなる群から選択され、
13はG、L及びHからなる群から選択され、
14はH及びKからなる群から選択され、
15はH、Y及びTからなる群から選択され、
16はRであり、
17はE及びAからなる群から選択される(すなわち、VH配列が配列番号57を含み、VL配列が配列番号62を含む)。
抗原結合分子をコードする核酸配列
本発明の一態様においては、本発明の抗原結合分子(そのフラグメント及び変異体を含む)をコードする核酸配列が提供される。
一実施形態においては、配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有する重鎖可変領域、及び/又は配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17、配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有する軽鎖可変領域を含む、PD-L1に結合する抗原結合分子をコードするヌクレオチドが提供される。
一実施形態においては、配列番号5のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、及び/又は配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17、配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む、PD-L1に結合する抗原結合分子をコードするヌクレオチドが提供される。
本発明はまた、1つ以上のアミノ酸置換を含む、本明細書に開示される変異体抗体配列の全てをコードする核酸分子を提供する。
配列番号1~62のいずれか1つによるアミノ酸配列をコードする核酸分子も提供される。
本発明の抗原結合分子をコードする核酸配列を含むプラスミド及びベクターも提供される。核酸は発現、特に真核生物発現系、より具体的には哺乳動物細胞株における発現のためにプラスミド又はベクターに組み込んでもよい。したがって、本発明のプラスミド又はベクターをトランスフェクトした宿主細胞、例えばHEK細胞、NS0マウス骨髄腫細胞又はCHO細胞等も提供される。
本発明の宿主を細胞培養培地においてプラスミド又はベクターのコード化核酸配列を細胞内で発現させる条件下で培養することを含む、抗PD-L1抗原結合分子を作製する方法も提供される。方法は、抗PD-L1抗原結合分子を細胞培養上清から得ることを更に含み得る。さらに、細胞に本発明のプラスミド又はベクターをトランスフェクトすることを含む、抗PD-L1抗原結合分子を発現する細胞を作製する方法が提供される。次いで、抗原結合分子の作製のために上記細胞を培養することができる。
抗原
本発明の抗原結合分子は、PD-L1、特にヒトPD-L1又はhPD-L1に特異的に結合する。本発明の抗原結合分子はまた、カニクイザルPD-L1に特異的に結合する。最も好ましくは、本発明の抗原結合分子は、ヒトPD-L1に特異的に結合する。
本発明の抗原結合分子は概して、マウスPD-L1には結合しない。PD-L1(プログラム死リガンド1)は、阻害受容体PD-1(プログラム死1ポリペプチド)について記載された2つのリガンドの1つである。PD-L1は、適応免疫系の抑制に関与する1型膜貫通タンパク質である。PD-L1の上方調節は、癌が免疫系を回避することを可能にし得る。
PD-L1は、B細胞、樹状細胞、マクロファージ及びT細胞等の免疫細胞上に低レベルで発現され、活性化後に上方調節される。PD-L1は、内皮細胞、心臓、肺、膵臓、筋肉、ケラチノサイト及び胎盤等の非リンパ系器官でも発現される。非リンパ系組織内での発現は、PD-L1が末梢組織において自己反応性T及びB細胞並びに骨髄性細胞の機能を調節する可能性があるか、又は標的器官において炎症応答を調節する可能性があることを示唆する。PD-L1発現は主に、内皮及び上皮細胞におけるPD-L1の主要調節因子である1型及び2型インターフェロンによって調節される。PD-L1は、様々なヒト癌において豊富に見られ、PD-1とPD-L1との間の相互作用は、腫瘍浸潤リンパ球の減少、T細胞受容体媒介性増殖の減少、及び癌性細胞による免疫回避をもたらす。PD-L1は、腫瘍サンプルにおいて発現され、予後不良と関連する。免疫抑制は、PD-1とPD-L1との局所的相互作用を阻害することによって逆転させることができる。PD-L1シグナル伝達の阻害は、癌の治療についてT細胞免疫を増強することが示されている。
本発明の抗原結合分子に結合するヒトPD-L1のアミノ酸配列を以下に提示する。
ヒトPD-L1(NCBI参照配列:NP_054862.1)
アミノ酸配列(配列番号19)
MRIFAVFIFMTYWHLLNAFTVTVPKDLYVVEYGSNMTIECKFPVEKQLDLAALIVYWEMEDKNIIQFVHGEEDLKVQHSSYRQRARLLKDQLSLGNAALQITDVKLQDAGVYRCMISYGGADYKRITVKVNAPYNKINQRILVVDPVTSEHELTCQAEGYPKAEVIWTSSDHQVLSGKTTTTNSKREEKLFNVTSTLRINTTTNEIFYCTFRRLDPEENHTAELVIPELPLAHPPNERTHLVILGAILLCLGVALTFIFRLRKGRMMDVKKCGIQDTNSKKQSDTHLEET
本発明の抗PD-L1抗原結合分子は、pHに依存してPD-L1に特異的に結合する。
一実施形態においては、本発明の抗PD-L1抗原結合分子は、例えば一価フォーマットの場合にpHに依存してPD-L1に特異的に結合する。一価フォーマットには、Fabフラグメント等のフォーマットが含まれる。これは、モノクローナル抗体よりも低い(例えば、およそ100倍低い)Fabの親和性、及び/又はCDRにおけるヒスチジン残基の存在のためであり得ると仮定される。
本発明の抗原結合分子は、生理的pH(約pH7.4)と比較して酸性pH(約pH6.0)でPD-L1に対して顕著に高い親和性を示した。これは、pH特異的結合を示さず、多くは実際にpH7.4と比較してpH6.0で低い親和性を示す、当該技術分野で既知の他のPD-L1結合分子とは対照的である。
本発明の抗原結合分子はまた、明らかなpH依存性の阻害を示した。本発明の抗原結合分子は、生理的pH(約pH7.4)と比較して酸性pH(約pH6.0)でPD-L1に対して顕著に高い阻害活性を有する。pH7.4では、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対する阻害活性を殆ど有しない。これは、pH依存性の阻害を示さない当該技術分野で既知の他のPD-L1結合分子とは対照的である。
腫瘍及びそれらの微小環境が酸性(例えば、約pH6.0~約pH6.5)であるため、このpH特異的結合は重要である。したがって、pH6~6.5(腫瘍の酸性pH)で最大活性を有し、7.4の生理的pHで活性が低下する抗PD-L1結合分子は、末梢チェックポイント阻害剤治療の毒性及び他の副作用を低減することができる。したがって、本発明の抗原結合分子は、潜在的抗癌剤として特に有用である。
したがって、PD-L1に結合する本発明の抗原結合分子は、PD-L1を発現する細胞にも結合する。
EC50
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1又はPD-L1陽性細胞に対してpH6.0で約15nM未満のEC50値を有する。一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対してpH6.0で約1.45nM~約15nMのEC50値を有する。
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対してpH7.4で少なくとも約10nMのEC50値を有する。一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対してpH7.4で約13.2nM~約100nMのEC50値を有する。
本発明の抗原結合分子は、PD-L1に結合する際に酸性pH(pH6.0)で生理的pH(pH7.4)よりも顕著に高い効力(EC50)を有する。本発明の抗原結合分子は、少なくとも約5のpH6.0:7.4結合比を有し、すなわち、pH6.0でのEC50がpH7.4より少なくとも約5倍低く、抗原結合分子がpH7.4よりもpH6.0で少なくとも約5倍強力である。
好ましい実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対するpH6.0でのEC50値が約15nM未満であり、PD-L1に対するpH7.4でのEC50値が少なくとも約10nMであり、抗原結合分子は、少なくとも約5のpH6.0:7.4結合比を有する。
EC50という用語は、当業者に既知であり、薬物若しくは物質の50%有効濃度、すなわち指定の曝露時間後の最大応答とベースラインとの中間の応答を誘導する、その物質の濃度を指す。EC50は、効力の尺度である。EC50が低いほど、薬物又は物質の効力が大きい。EC50は、当業者に既知の任意の好適な手段によって測定することができる。
細胞結合アッセイにおいては、EC50は、0.60E05個のMDA-MB-231細胞との約4℃で約60分間のインキュベーション後にベースラインと最大値とのほぼ中間の応答を誘導するFabの濃度(MFI)を指す場合がある。ELISAアッセイにおいては、EC50は、約1μg/mlのヒトPD-L1-Fcタンパク質コーティングウェルとの室温(例えば約15℃~約25℃)で約2時間のインキュベーション後にベースラインと最大値とのほぼ中間の応答を誘導するFabの濃度(OD)を指す場合がある。
IC50
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1:PD-1結合の阻害についてpH6.0で約50nM未満のIC50値を有する。一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対してpH6.0で約12.1nM~約42.3nMのIC50値を有する。
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1:PD-1結合の阻害についてpH7.4で少なくとも約50nMのIC50値を有する。一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対してpH7.4で約81.2nM~約100nMのIC50値を有する。
本発明の抗原結合分子は、PD-L1:PD-1結合に対して酸性pH(pH6.0)で生理的pH(pH7.4)よりも顕著に高い阻害活性(IC50)を有する。本発明の抗原結合分子は、少なくとも2のpH6.0:7.4阻害比を有し、すなわち、pH6.0でのIC50がpH7.4より少なくとも2倍低く、抗原結合分子が阻害についてpH7.4よりもpH6.0で少なくとも5倍強力である。
好ましい実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、PD-L1に対するpH6.0でのIC50値が約50nM未満であり、PD-L1に対するpH7.4でのIC50値が少なくとも約50nMであり、抗原結合分子は、少なくとも約2のpH6.0:7.4阻害比を有する。
IC50という用語は、当業者に既知であり、薬物若しくは物質の50%阻害濃度、すなわち50%の阻害を誘導する、その物質の濃度を指す。IC50は、特定の生物学的又は生化学的機能の阻害における物質の効力の尺度である。IC50が低いほど、阻害剤としての拮抗薬又は物質の効力が大きい。IC50は、当業者に既知の任意の好適な手段によって測定することができる。例えば、PD-L1-PD-1阻害ELISAにおいて、IC50は、約1μg/mlのPD-1-Fcタンパク質でコーティングしたウェルに対する約1μg/mlのPD-L1ビオチン結合を阻害するFabの50%阻害濃度であり得る。
当然ながら、抗体の機能的特徴のいずれについても、機能的特徴の比較は、pHの変化の影響を測定することから、pHを除いて実質的に同じ実験条件下で行われる。機能的特徴(IC50、EC50又はK等)を測定するアッセイの他の特徴は、可能な限り同じに保たれる。
本発明の幾つかの実施形態においては、本発明者らは、抗原結合分子が阻害受容体プログラム死1ポリペプチド(PD-1)及び共刺激分子CD80へのPD-L1結合と競合することを発見した。PD-L1が様々なヒト癌において豊富に見られ、PD-1とPD-L1との間の相互作用が腫瘍浸潤リンパ球の減少、T細胞受容体媒介性増殖の減少、及び癌性細胞による免疫回避をもたらすことから、この機構は重要である。免疫抑制は、PD-1とPD-L1との局所的相互作用を阻害することによって逆転させることができる。PD-L1シグナル伝達の阻害は、癌の治療についてT細胞免疫を増強することが示されている。本発明の抗原結合分子は、PD-L1及びその受容体の結合を少なくとも40%、少なくとも50%又は少なくとも80%阻害する。
本発明者らはまた、本発明の抗原結合分子がPD-1及び/又はCD80へのPD-L1発現細胞の結合を阻害することを見出した。
本発明の抗原結合分子のpH感受性結合性は、酸性pH(例えばpH6)で生理的pH(例えば約pH7.4)よりも少なくとも5倍高い親和性を有する抗原結合分子をもたらし得る。本発明の抗原結合分子のそのエピトープに対する親和性は、表面プラズモン共鳴(SPR)を用いて測定することができる。例えば、BIAcore SPRシステム(BIAcore 3000、GE Healthcare)を使用することができる。BIAcoreシステムは、分子相互作用をリアルタイムでモニタリングするために使用され、検出原理は、センサー表面から約150nm以内の屈折率の変化に感受性がある表面プラズモン共鳴(SPR)に基づく。例えば、PD-L1-Fcを表面に付着させることができ、被験抗PD-L1抗原結合分子を、サンプル溶液の連続流中で表面上を通過させることができる。SPR応答は、表面近くの質量濃度の変化に正比例し、動態パラメーターをセンサーグラム(sensogram)の結合及び解離相から評価する。
一態様においては、抗PD-L1抗原結合分子、例えば抗体、そのフラグメント又は変異体が提供され、抗原結合分子は、上で定義したようにPD-L1への結合について本発明の抗原結合分子と競合する。
例えば、一実施形態においては、本発明は、PD-L1、特にヒトPD-L1に特異的に結合し、PD-L1への結合について8B06、8D06、8G08、8A04、8D04及び2A09からなる群から選択される抗体と競合する抗原結合分子(好ましくは抗体)を提供する。PD-L1への結合についてそのフラグメント及び変異体と競合する抗原結合分子(例えば、上記の抗体の6つのCDR領域又はVH及びVL配列を含む抗原結合分子、並びに他の変異体)も提供される。
被験抗体が本発明の抗体が結合するエピトープと同じエピトープへの結合について競合することができるかを決定するために、交差遮断アッセイ、例えば競合ELISAアッセイを行うことができる。例示的な競合ELISAアッセイにおいては、マイクロタイタープレートのPD-L1コーティングウェル又はPD-L1コーティングセファロースビーズを、候補競合抗体とともに又は候補競合抗体なしでプレインキュベートした後、本発明のビオチン標識抗PD-L1抗体を添加する。ウェル内又はビーズ上のPD-L1抗原に結合した標識抗PD-L1抗体の量は、アビジンペルオキシダーゼコンジュゲート及び適切な基質を用いて測定することができる。
代替的には、抗PD-L1抗体を、例えば放射性標識若しくは蛍光標識、又は幾つかの他の検出可能及び測定可能な標識で標識することができる。抗原に結合する標識抗PD-L1抗体の量は、抗原上の同じエピトープへの結合について競合する候補競合抗体(被験抗体)の能力と逆相関を有し、すなわち、同じエピトープに対する被験抗体の親和性が高いほど、抗原コーティングウェルに結合する標識抗PD-L1抗体が少なくなる。候補競合抗体が、候補競合抗体の非存在下で(但し、既知の非競合抗体の存在下であってもよい)並行して行われる対照と比較して、抗PD-L1抗体の結合を少なくとも20%、好ましくは少なくとも20%~50%、更により好ましくは少なくとも50%遮断することができる場合、候補競合抗体は、本発明の抗PD-L1抗体と同じエピトープに実質的に結合するか、又は同じエピトープへの結合について競合する抗体とみなされる。このアッセイが同じ定量値に至るように様々に行われ得ることが理解される。
PD-L1に特異的に結合し、本発明の抗原結合分子へのPD-L1の結合を阻害する抗原結合分子も提供される。
例えば、一実施形態においては、抗原結合分子(好ましくは抗体)は、PD-L1に特異的に結合し、8B06、8D06、8G08、8A04、8D04及び2A09からなる群から選択される抗体へのPD-L1の結合を阻害する。PD-L1に特異的に結合し、そのフラグメント及び変異体へのPD-L1の結合を阻害する抗原結合分子(例えば、上記の抗体の6つのCDR領域又はVH及びVL配列を含む抗原結合分子、並びに他の変異体)も提供される。
本発明の抗原結合分子が結合するPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子も提供される。
例えば、一実施形態においては、本発明は、8B06、8D06、8G08、8A04、8D04及び2A09からなる群から選択される抗体が結合するPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子(好ましくは抗体)を提供する。そのフラグメント及び変異体が結合するPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子(例えば、上記の抗体の6つのCDR領域又はVH及びVL配列を含む抗原結合分子、並びに他の変異体)も提供される。
組成物
本発明の一態様においては、本発明の抗原結合分子を含む医薬組成物が提供される。
本発明のこの態様による組成物は、任意の簡便な経路で使用するために配合することができる。本発明の医薬組成物は通常、本発明の抗原結合分子に加えて薬学的に許容可能な担体、賦形剤、希釈剤、アジュバント、ビヒクル、緩衝剤又は安定剤を含む。かかる担体としては、生理食塩水、緩衝食塩水、デキストロース、リポソーム、水、グリセロール、ポリエチレングリコール、エタノール及びそれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
医薬組成物は、それを患者に投与する所望の方法に応じて任意の好適な形態であり得る。
本発明の医薬組成物は、1回の投与当たり所定量の各有効成分を含有する単位投与形態にて与えることができる。かかる単位は、0.5mg/kg~50mg/kg、好ましくは1mg/kg~10mg/kg、1mg/kg~5mg/kg、5mg/kg~10mg/kg又は10mg/kg~50mg/kgのいずれかの化合物を与えるように適合することができる。かかる用量は、単回投与にて又は多数の個別の投与として与えることができる。最終用量は、当然ながら治療される病態、投与経路、並びに患者の年齢、体重及び状態によって異なり、医師の判断による。
本発明の医薬組成物は、任意の適切な経路、例えば経口(口腔内又は舌下を含む)、直腸、経鼻、局所(口腔内、舌下又は経皮を含む)、膣内、又は非経口(皮下、筋肉内、静脈内又は皮内を含む)経路による投与に適合することができる。IV投与が好ましい場合がある。かかる製剤は、薬学の技術分野で既知の任意の方法によって、例えば有効成分と担体(複数の場合もある)又は賦形剤(複数の場合もある)とを合わせることによって調製することができる。
経口投与に適した医薬製剤は、カプセル若しくは錠剤;粉末若しくは顆粒;水性若しくは非水性液体中の溶液若しくは懸濁液;食用のフォーム若しくはホイップ;又は水中油型液体エマルション若しくは油中水型液体エマルション等の個別の単位として与えることができる。
経皮投与に適した医薬製剤は、長時間にわたってレシピエントの表皮と密接に接触したままであることを意図した個別のパッチとして与えることができる。例えば、有効成分は、Pharmaceutical Research, 3(6), 318 (1986)に概して記載されているイオントフォレシスによってパッチから送達され得る。
局所投与に適した医薬製剤は、軟膏、クリーム、懸濁液、ローション、粉末、溶液、ペースト、ゲル、スプレー、エアロゾル又は油として配合することができる。
眼又は他の外部組織、例えば口及び皮膚への適用については、製剤を局所軟膏又はクリームとして適用するのが好ましい。軟膏に配合する場合、有効成分をパラフィン系又は水混和性の軟膏基剤のいずれかとともに用いることができる。代替的には、水中油型クリーム基剤又は油中水型基剤を用いて有効成分をクリームに配合することができる。
眼への局所投与に適した医薬製剤には、有効成分を好適な担体、特に水性溶媒に溶解又は懸濁した点眼剤が含まれる。
口内への局所投与に適した医薬製剤には、トローチ剤、パステル剤及び含嗽剤が含まれる。
直腸投与に適した医薬製剤は、坐剤又は浣腸として与えることができる。
担体が固体である経鼻投与に適した医薬製剤には、嗅ぎたばこを吸う方法、すなわち鼻に近付けて保持した粉末の容器から鼻腔を通して素早く吸入することによって投与される、例えば20ミクロン~500ミクロンの範囲の粒径を有する粗粉末が含まれる。担体が液体である、鼻腔スプレー又は点鼻薬としての投与に適した製剤には、有効成分の水溶液又は油溶液が含まれる。
吸入による投与に適した医薬製剤には、様々なタイプの定量加圧エアロゾル、ネブライザー又は吸入器によって生成され得る微粒子ダスト又はミストが含まれる。
膣内投与に適した医薬製剤は、ペッサリー、タンポン、クリーム、ゲル、ペースト、フォーム又はスプレー製剤として与えることができる。
非経口投与に適した医薬製剤には、抗酸化剤、緩衝剤、制菌剤、及び製剤を意図されるレシピエントの血液と等張にする溶質を含有し得る水性及び非水性滅菌注射液、並びに懸濁化剤及び増粘剤を含み得る水性及び非水性滅菌懸濁液が含まれる。製剤は、単回投与又は複数回投与用の容器、例えば密閉アンプル及びバイアルに入れて与えることができ、滅菌液体担体、例えば注射用水を使用直前に添加するだけでよいフリーズドライ(凍結乾燥)状態で保管することができる。即時調合注射液及び懸濁液を滅菌粉末、顆粒及び錠剤から調製してもよい。
本発明の医薬組成物は、本発明の分子に加えて1つ以上の他の治療的活性剤を含有していてもよい。
幾つかの実施形態においては、活性薬物濃縮物の製剤は、薬学的に許容可能な等張化剤、緩衝剤及び薬学的に許容可能な界面活性剤を含み得る。
代替的には、製剤は、有効成分に加えて、任意にpHを約6.0~7.0、例えば6.5前後に調整した一塩基性リン酸ナトリウム、二塩基性リン酸ナトリウム、塩化ナトリウム、ポリソルベート80又はポリソルベート20(撹拌による凝集のリスクを最小限に抑えるための界面活性剤)及び水(USP/Ph.Eur)を含み得る。
好ましい単位投与製剤は、有効成分の本明細書において上で列挙した1日用量若しくは部分用量又はその適切な部分を含有するものである。
製剤が、特に上述した成分に加えて、問題の製剤のタイプを考慮して、当該技術分野において常用の他の作用物質を含んでいてもよく、例えば経口投与に適した製剤が着香料を含み得ることを理解されたい。
治療方法
本発明の抗原結合分子は、PD-L1媒介性障害又は疾患、特に癌の予防及び/又は治療に有用である。したがって、本発明のこの態様は、被験体に本発明の抗原結合分子を投与することを含む、被験体においてPD-L1媒介性障害又は疾患(癌等)を治療する方法も含む。したがって、本発明は、PD-L1媒介性障害又は疾患(癌等)の治療及び/又は予防に使用される薬剤の製造への本発明の抗原結合分子の使用、並びにかかる病態の予防及び/又は治療への本発明の抗原結合分子の使用にも及ぶ。
治療方法は、ヒト又は動物被験体のものとすることができ、本発明は、人間医学及び/又は獣医学の両方における使用に等しく及ぶ。本発明の抗原結合分子は、個体に対して利益を示すのに十分な「治療有効量」にて個体に投与するのが好ましい。本明細書において使用される場合、「治療」は、ヒト又は非ヒト動物、好ましくは哺乳動物に利益をもたらし得る任意のレジームを含む。治療は、既存の病態に関するものであっても、又は予防的なもの(予防治療)であってもよい。方法は、in vitro方法であってもよい。方法は、in vivo方法であってもよい。
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、in vitro又はin vivoで投与した場合にT細胞免疫を増強する。
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、in vitro又はin vivoで投与した場合に免疫抑制を逆転させる。
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、免疫チェックポイント阻害剤である。
一実施形態においては、本発明の抗原結合分子は、癌の治療又は予防に使用される。本明細書において使用される場合、「癌」は、異常細胞の無制御な分裂によって引き起こされる疾患に関する。これらは心臓の肉腫(血管肉腫、線維肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫)、粘液腫、転移性横紋筋腫、線維腫、脂肪腫及び奇形腫;肺の気管支原性癌(扁平上皮癌、未分化小細胞癌、未分化大細胞癌、腺癌)、肺胞(細気管支)癌、気管支腺腫、肉腫、リンパ腫、軟骨性過誤腫、中皮腫;消化管:食道(扁平上皮癌、腺癌、平滑筋肉腫、リンパ腫)、胃(癌、リンパ腫、平滑筋肉腫)、膵臓(管状腺癌、インスリノーマ、グルカゴノーマ、ガストリノーマ、カルチノイド腫瘍、ビポーマ)、小腸(腺癌、リンパ腫、カルチノイド腫瘍、カポジ肉腫、平滑筋腫、血管腫、脂肪腫、神経線維腫、線維腫)、大腸(腺癌、管状腺腫、絨毛腺腫、過誤腫、平滑筋腫)、結腸直腸癌;尿生殖路:腎臓(腺癌、ウィルムス腫瘍(腎芽腫)、リンパ腫、白血病)、膀胱及び尿道(扁平上皮癌、移行上皮癌、腺癌)前立腺(腺癌、肉腫)、精巣(精上皮腫、奇形腫、胎生期癌、奇形癌、絨毛癌、肉腫、間質細胞癌、線維腫、線維腺腫、腺腫様腫瘍、脂肪腫);肝臓:肝癌(肝細胞癌)、胆管癌、肝芽腫、血管肉腫、肝細胞腺腫、血管腫;骨:骨原性肉腫(骨肉腫)、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性リンパ腫(細網肉腫)、多発性骨髄腫、悪性巨細胞腫、脊索腫、骨軟骨腫(骨軟骨性外骨症)、良性軟骨腫、軟骨芽細胞腫、軟骨粘液線維腫(chondromyxofibroma)、類骨骨腫及び巨細胞腫;神経系:頭蓋骨(骨腫、血管腫、肉芽腫、黄色腫、変形性骨炎)、髄膜(髄膜腫、髄膜肉腫、神経膠腫症)、脳(星状細胞腫、髄芽腫、神経膠腫、上衣腫、胚細胞腫(松果体腫)、多形性膠芽腫、乏突起膠腫、シュワン細胞腫、網膜芽細胞腫、先天性腫瘍)、脊髄神経線維腫、髄膜腫、神経膠腫、肉腫);女性生殖器:子宮(子宮内膜癌)、子宮(頸部の子宮頸癌、前腫瘍性子宮頸部異形成)、卵巣(卵巣癌(漿液性嚢胞腺癌、粘液性嚢胞腺癌、分類不能癌)、顆粒膜卵胞膜細胞腫、セルトリ-ライディッヒ細胞腫、未分化胚細胞腫、悪性奇形腫)、外陰部(扁平上皮癌、上皮内癌、腺癌、線維肉腫、黒色腫)、膣(明細胞癌、扁平上皮癌、ブドウ状肉腫(胎児性横紋筋肉腫)、ファローピウス管(癌)、乳癌;血液系:血液(骨髄性白血病(急性及び慢性)、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病、骨髄増殖性疾患、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群)、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(悪性リンパ腫);皮膚:悪性黒色腫、基底細胞癌、扁平上皮癌、カポジ肉腫、異形成母斑(moles dysplastic nevi)、脂肪腫、血管腫、皮膚線維腫、ケロイド、乾癬;並びに副腎:神経芽細胞腫を含む。別の実施形態においては、癌は癌腫、リンパ腫、白血病、芽細胞腫及び肉腫である。かかる癌のより具体的な例としては、扁平上皮癌、骨髄腫、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、神経膠腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、急性骨髄性白血病(AML)、多発性骨髄腫、胃腸(管)癌、腎癌、卵巣癌、肝臓癌、リンパ芽球性白血病、リンパ性白血病、大腸癌、子宮内膜癌、腎臓癌、前立腺癌、甲状腺癌、黒色腫、軟骨肉腫、神経芽細胞腫、膵癌、多形性膠芽腫、子宮頸癌、脳癌、胃癌、膀胱癌、肝癌、乳癌、結腸癌及び頭頸部癌が挙げられる。癌の別の具体的な例としては、腎細胞癌が挙げられる。癌の更に別の具体的な例は、非ホジキンリンパ腫又は皮膚T細胞リンパ腫である。
特に対象となるのは、黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌の治療又は予防である。
一実施形態においては、癌は、黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌からなる群から選択され得る。
治療される病態に応じて、本発明の抗原結合分子は、同時、別々又は順次の使用のために他の薬学的に活性な成分と組み合わせて使用することができる。例えば、癌を治療又は予防する場合、本発明の抗原結合分子を別の療法又は付加的な治療的活性剤と組み合わせて使用することができる。好適な療法又は付加的な治療的活性剤としては、放射線療法、化学療法治療、標的療法、免疫療法、モノクローナル抗体療法、ホルモン療法、血管新生阻害、癌ワクチン、腫瘍溶解性ウイルス、toll様受容体アゴニスト、後成的修飾、改変T細胞、T細胞共刺激アゴニスト、チロシンキナーゼ阻害剤、他の抗癌化学物質、癌療法のための緩和ケア、免疫チェックポイント阻害剤、免疫抑制剤、抗炎症薬、免疫調節剤、免疫賦活剤、及び/又は阻害剤、例えばIDO阻害剤、CSF-1R阻害剤、TGFB阻害剤、T細胞共刺激アンタゴニスト、Treg阻害剤、マクロファージ調節剤、ナチュラルキラー細胞調節剤、及びケモカイン受容体阻害剤が挙げられる。
好適な化学療法治療としては、ゲムシタビン、シクロフォスファミド、ドキソルビシン、パクリタキセル、シスプラチンが挙げられる。好適なT細胞共刺激アゴニストとしては、4-1BB、OX40、CD40、GITR及びICOSが挙げられる。免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1、CTLA-4、TIM-3、LAG-3、VISTA、BTLA、CD70及びTIGITからなる群のメンバーに作用し得る。
他の療法又は付加的な治療的活性剤は別の抗原結合分子であってもよい。付加的な抗原結合分子は抗PD-L1抗原結合分子、抗PD-1抗原結合分子、抗CTLA-4抗原結合分子、抗OX40抗原結合分子、抗ICOS抗原結合分子、抗GITR抗原結合分子からなる群から選択され得る。
本発明の医薬組成物は、上に挙げたような1つ以上の追加の薬学的に活性な成分を含むように配合することができる。本発明の抗原結合分子は、キットの一部として提供してもよい。かかるキットは、使用説明書及び/又は追加の薬学的に活性な成分を含み得る。抗原結合分子及び追加の薬学的に活性な成分は、キット内で別個に配置されてもよく、又は幾つかの実施形態においては、抗原結合分子及び追加の薬学的に活性な成分をともに配合してもよい。
本発明の一実施形態においては、PD-L1に特異的に結合する抗体、特にFabフラグメント等の一価抗体が提供される。抗体は、8B06、8D06、8G08、8A04、8D04及び2A09からなる群から選択される。抗体は、癌の治療又は予防に使用される。
ここで、例示目的で提示され、本発明の範囲を限定すると解釈されるものではない多数の具体的な実施例を参照して本発明を更に説明する。
ヒトナイーブライブラリの構築:
6人の健常ドナーのPBMC(0.5Lの血液/ドナー)からRNAを抽出した。240μgのRNAを、ランダムプライマーを用いるcDNA合成に使用した。cDNAを、FR1のVH、Vκ及びVλ並びにヒンジCH1領域にアニーリングする非タグ付きプライマーを用いる一次PCR増幅、続いてVH、Vλ及びVκ遺伝子をpCB3ファージミドベクターにクローニングするための制限エンドヌクレアーゼ部位を導入する二次PCR増幅に使用した。ライブラリをTG1大腸菌細胞にエレクトロポレーションし、ヒトライブラリの細菌グリセロールストックを-80℃で保管した(ヒトナイーブFabライブラリプールH002κ-H007κ及びヒトナイーブFabライブラリプールH002λ-H007λ)。
選択:pH選択的抗PD-L1 Fab
ヒトナイーブFabライブラリプールH002κ-H007κ及びヒトナイーブFabライブラリプールH002λ-H007λからのファージ作製を、ヒトPD-L1を用いた2ラウンド連続のパンニングファージディスプレイ選択、続いてカニクイザル及びマウスPD-L1タンパク質を用いた第3ラウンドのパンニング選択、並びにマウスPD-L1を用いた第4ラウンドのパンニングに使用し、交差反応性クローンの可能性を高めた(ヒト及びマウスPD-L1 Fcは、R&D Systemsから入手し、カニクイザルPD-L1 Fcは、Sino biologicalから入手した)。全ての選択ラウンドを、10μg/mlの組換えPD-L1タンパク質を用いてpH6.0で行い(CPAバッファー;10mMクエン酸ナトリウム、10mMリン酸ナトリウム、10mM酢酸ナトリウム、115mM塩化ナトリウム)、非特異的ファージを洗い流し、続いてトリプシンにより特異的ファージを溶出させた(完全溶出)。溶出ファージの段階希釈を行い、指数関数的に成長するTG1への感染に使用した。感染したTG1をLBCarb100Glu2%プレート上にプレーティングし、バックグラウンド(選択に抗原を用いない)に対する富化値を算出した。
ELISAスクリーニング:
第3及び第4ラウンドのパンニング選択条件のアウトプットからの個々のクローンを96ウェルマスタープレートに選別し、ファージ及びペリプラズム抽出物(P.E.)としてpH6.0対pH7.4でのヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1への結合について結合ELISAによって試験した。
ファージ結合ELISAについては、MaxiSorp(商標)高タンパク質結合能96ウェルELISAプレートに、PBSで希釈した1μg/mlのPD-L1-Fcタンパク質を4℃で一晩コーティングした。翌日、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、250μl/ウェルの4%Marvel/CPA(pH6.0)を用いて室温で1時間ブロッキングした。ブロッキング後に、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、1ウェル当たり90μlの1%Marvel/CPA(pH6.0)中10μlのファージとともに、振盪しながら室温で1時間インキュベートした。次いで、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、1ウェル当たり1%Marvel/CPA(pH6.0)中100μlの抗M13-HRP(GEのカタログ番号27-9421-01)とともに、振盪しながらRTで1時間インキュベートした。プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、基質溶液(TMB、ThermoFisher)を添加し、反応をHSO(ThermoFisher)で停止させ、吸光度を450nmで読み取った。
ペリプラズム抽出物(P.E.)結合ELISAについては、MaxiSorp(商標)高タンパク質結合能96ウェルELISAプレートに、PBSで希釈した1μg/mlのPD-L1-Fcタンパク質を4℃で一晩コーティングした。翌日、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、250μl/ウェルの4%Marvel/CPA(pH6.0)又は4%Marvel/PBS(pH7.4)を用いて室温で1時間ブロッキングした。
ブロッキング後に、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、1ウェル当たり20μlのP.E+80μlの1%Marvel/CPA(pH6.0)又は1%Marvel/PBS(pH7.4)とともに、振盪しながらRTで1時間インキュベートした。次いで、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、1ウェル当たり1%Marvel/CPA(pH6.0)又は1%Marvel/PBS(pH7.4)中100μlの抗c-Myc-HRP(Bethylのカタログ番号A190-105P)とともに、振盪しながらRTで1時間インキュベートした。次いで、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、基質溶液(TMB溶液)をプレートに添加した。反応をHSOで停止させ、吸光度を450nmで読み取った。クローンの殆どについて、両方のpHでの結合が観察された。ヒトPD-L1に対する陽性結合剤をシークエンシングし、クローンを異なるHCDR3配列によってファミリー毎に分類した。
CDR3にヒスチジンを有するファミリーからのクローンは、pH6.0でpH7.4よりも高いOD値を示し、ELISAにおいてヒト、カニクイザル及び/又はマウスPD-L1に結合するファミリー代表のクローンのパネルをヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1トランスフェクトHEK293FF細胞への結合についてスクリーニングするために選択した。
細胞における選択クローンのスクリーニング:
ヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1でのHEK293FF細胞のトランスフェクション。HEK293FF細胞をFreestyle(商標)293発現培地中で培養し、トランスフェクション当日に0.8E+06細胞/mlで播種した。(Lipofectamine 2000+ヒト、カニクイザル又はマウスプラスミドのDNA 70μg)のミックスを調製し、細胞に添加した(哺乳動物発現プラスミドは、Sino Biologicalから入手した)。細胞を37℃、5%COで18時間インキュベートし、ヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1発現についてフローサイトメトリーによってQCした。簡潔に述べると、2.0E+05個のHEK293FF WT、ヒトPD-L1、カニクイザルPD-L1及びマウスPD-L1細胞を2.5μg/mlの抗ヒト/マウス/カニクイザル(R&D Systems)PD-L1(ヤギIgG)とともに50μl/ウェルの最終容量にて4℃で30分間、軽く振盪しながらインキュベートした。細胞を300gで3分間、150μlのFACSバッファー(PBS/0.5%FBS)で3回洗浄し、二次抗ヤギAlexa Fluor 647(ThermoFisher)とともに50μl/ウェルの最終容量にて4℃で30分間、軽く振盪しながら暗所でインキュベートした。次いで、細胞を150μl/ウェルのFACSバッファーで3回洗浄し、75μl/ウェルのFACSバッファーに再懸濁して、FACS機器(Accuri C6)のFL-4チャネル(APCチャネル)において測定し、1サンプル当たり合計10000個の細胞を取得した。
PD-L1トランスフェクト細胞へのペリプラズム抽出物(P.E)の結合:
選択クローンからのペリプラズム抽出物(P.E)を、可溶性Fabに存在するc-mycタグに特異的な抗c-myc抗体とともに、撹拌しながら室温(RT)で30分間インキュベートした。ミックス(P.E+抗c-myc抗体)をWT又はヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1 HEK293FFトランスフェクト細胞に添加し、軽く振盪しながら4℃で60分間インキュベートした。次いで、細胞を150μl/ウェルのFACSバッファーで3回洗浄した後、50μl/ウェルの二次抗体ヤギ抗マウスAPC(ThermoFisher)とともに4℃で30分間、遮光して振盪しながらインキュベートした。細胞を再び洗浄し、150μl/ウェルのFACSバッファーを用いて3回遠心分離した後、75μl/ウェルのFACSバッファーに再懸濁して、FACS機器(Accuri C6)のFL-4チャネル(APCチャネル)において測定し、1サンプル当たり合計10000個の細胞を取得した。幾つかのクローンがヒト及びカニクイザルPD-L1細胞に結合した。マウスPD-L1結合剤は見られなかった。
PD-1:PD-L1阻害についての選択クローンのスクリーニング:
PD-L1細胞結合クローンをpH6.0でのPD-1:PD-L1阻害についてELISAによってスクリーニングした。MaxiSorp(商標)高タンパク質結合能96ウェルELISAプレートに、PBSで希釈した1μg/mlのヒトPD-1 Fcタンパク質(R&D Systems)を4℃で一晩コーティングした。翌日、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、250μl/ウェルの1%カゼイン/CPA(pH6.0)を用いて室温で1時間ブロッキングした。ブロッキング後に、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、CPA/0.1%カゼイン中50μlのビオチン化PD-L1(2μg/ml、R&D Systems)+競合のためのCPA/0.1%カゼイン中50μlのP.E(1:2.5)とともに、100μlの最終容量にて振盪しながらRTで1時間インキュベートした。プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、P.Eの存在下でコーティングPD-1 Fcへのビオチン化ヒトPD-L1の結合を検出するために、0.1%カゼイン/CPA(pH6.0)で2000倍希釈した50μlのExtravidin-HRP(Sigma-Aldrich)をウェルに添加した。プレートを室温で1時間インキュベートした。次いで、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、基質溶液(TMB)をプレートに添加し、反応をHSOで停止させ、プレートを450nmで読み取った。PD-1:PD-L1相互作用を遮断するクローンの能力を、関連及び無関連P.Eの存在下でビオチン化PD-L1を有するウェルのOD値の比較によって評価した。対照として、またP.E阻害効果の比較のために、中和抗PD-L1抗体もアッセイに使用した。1E08、1A06、2A09及び2C11の4つのクローンは、PD-1:PD-L1相互作用を40%~80%阻害することができた。これらのクローンをIgGフォーマッティング後のpH6.0及びpH7.4でのBIAcore分析に使用した。
IgGのフォーマッティング、作製及び精製:
VH、Vκ及びVλ抗体可変ドメインをコードする合成遺伝子をInvitrogenから購入した。各DNAを製造説明書に従って再構成した。200ngのDNAを大腸菌TOP10ケミカルコンピテントセルに形質転換した。DNA精製を、QIAGENのQIAprep Spin Miniprepキットを用いて行った。各DNA構築物を制限酵素消化し、挿入断片をゲル精製し、各可変ドメイン挿入断片を、VH挿入断片については抗体重鎖定常ドメイン又はVκ若しくはVλ挿入断片については軽鎖定常ドメインを有する哺乳動物発現ベクターとライゲートした。ExpiCHO-S細胞に製造業者(ThermoFisher)の説明書に従ってクローンをトランスフェクトした。VH及びVk鎖を有する全DNAプラスミド構築物40μgを、50mLの細胞の総容量にて4日間~10日間のタンパク質産生(32℃、5%CO)に使用した。4日間及び10日間のタンパク質産生後に、非還元条件では150kDaのバンド、還元条件ではIgG分子量に相当する50kDa及び25kDaのバンドの存在を分析することによってSDS-Pageによる品質管理を行った。AKTA Pure 25システムでHitrap MabSelect Sureカラムを用いて抗体を精製した。続いて、0.1Mグリシンを用いてpH2.7でIgGを溶出させ、中和のために0.1mlのTris-HCl(pH9.0)の入ったチューブに1.0mlの画分を収集した。抗体含有画分をプールし、AKTA PureでHiTrap脱塩カラムを用いて脱塩を行い、1×PBS(pH7.4のリン酸緩衝生理食塩水)溶液にバッファー交換した。分取サイズ排除クロマトグラフィーを用いてプロテインA画分から凝集体を除去した。280nmでの吸光度を測定することによってタンパク質濃度を決定した。
WT、ヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1トランスフェクトHEK293FFへの精製抗体の結合
ヒト、カニクイザル及びマウスPD-L1でのHEK293FF細胞のトランスフェクションを上記のように行った。簡潔に述べると、2×10個のHEK293FF WT、ヒトPD-L1、カニクイザルPD-L1及びマウスPD-L1細胞をFACSバッファー(PBS/0.5%FBS)中の精製抗PD-L1 IgG1クローン(500nM~0.69nM)とともにインキュベートし、2×10個のWT又はヒト、カニクイザル及びマウスHEK293FFトランスフェクト細胞とともに、100μl/ウェルの最終容量にて軽く振盪しながら4℃で1時間インキュベートした。特異性の対照として無関連抗体を使用した。インキュベーション後に細胞を150μlのFACSバッファーで3回洗浄し、軽く振盪しながら4℃で1時間、50μl/ウェルの抗ヒトIgG-Fc FITC標識抗体(ThermoFisher)を細胞に添加した。細胞を洗浄した後、75μl/ウェルのFACSバッファーに再懸濁し、FACS機器(Accuri C6)のFL-1チャネル(FITCチャネル)において測定し、1サンプル当たり合計10000個の細胞を取得した。
異なるpHでのPD-L1へのELISA結合:
精製抗PD-L1 IgG1クローンを、pH6.0対pH7.4でのヒトPD-L1への結合について結合ELISAによって試験した。MaxiSorp(商標)高タンパク質結合能96ウェルELISAプレートに、PBSで希釈した1μg/mlのヒトPD-L1-Fcタンパク質を4℃で一晩コーティングした。翌日、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、250μl/ウェルの4%Marvel/CPA(pH6.0)又はPBS(pH7.4)を用いて室温で1時間ブロッキングした。ブロッキング後に、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、1%Marvel CPA(pH6.0)又はPBS(pH7.4)中で調製した抗体の段階希釈物(3倍希釈物;100nM~0.137nM)100μlとともにインキュベートし、振盪しながら室温(RT)で2時間インキュベートした。次いで、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、1%Marvel CPA(pH6.0)又はPBS(pH7.4)中で調製した100μl/ウェルの二次抗体である抗ヒトCH1特異的HRP(BD Pharmingenのカタログ番号555788)を添加し、振盪しながらRTで1時間インキュベートした。プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)又はPBS Tween 0.05%(pH7.4)で3回洗浄し、基質溶液(TMB)を添加し、反応をHSOで停止させ、プレートを450nmで読み取った。最終スクリーニングアッセイにおいて、pH7.4については1mM乳酸(Sigmaのカタログ番号252476-500G)を含むクレブスリンガー重炭酸バッファー(KRB、Amsbioのカタログ番号KRB-1000)、pH6.5についてはKRB+15mM乳酸、pH6.0についてはKRB+20mM乳酸も使用した。
PD-1:PD-L1阻害についての抗体のスクリーニング:
抗体をpH6.0でのPD-1:PD-L1阻害についてELISAによってスクリーニングした。
MaxiSorp(商標)高タンパク質結合能96ウェルELISAプレートに、PBSで希釈した1μg/mlのヒトPD-1-Fcタンパク質を4℃で一晩コーティングした。翌日、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、250μl/ウェルの1%カゼイン/CPA(pH6.0)を用いて室温で1時間ブロッキングした。ブロッキング後に、プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、100nMから開始して0.05nMまでの抗PD-L1 IgG1クローンの3倍希釈物を1時間(RT)、0.1%カゼイン/CPA(pH6.0)中の1μg/mlのヒトPD-L1ビオチンとともに100μl/ウェルの総容量にてインキュベートした。プレートをCPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、抗体の存在下でコーティングPD-1-Fcに結合し得るビオチン化ヒトPD-L1の検出のために0.1%カゼイン/CPA(pH6.0)中のExtravidin-HRP(2000倍希釈)をウェルに添加した。プレートを室温で1時間インキュベートした後、CPA Tween 0.05%(pH6.0)で3回洗浄し、基質溶液(TMB)を添加し、反応をHSOで停止させ、プレートを450nmで読み取った。PD-1:PD-L1相互作用を遮断する抗体の能力を、抗PD-L1抗体対無関連抗体の存在下でビオチン化PD-L1を有するウェルのOD値の比較によって評価した。このアッセイは、上記のバッファー中のCPAをPBSに置き換えてpH6.5及びpH7.4でも行った。最終スクリーニングアッセイにおいて、pH7.4については1mM乳酸(Sigmaのカタログ番号252476-500G)を含むクレブスリンガー重炭酸バッファー(KRB、Amsbioのカタログ番号KRB-1000)、pH6.5についてはKRB+15mM乳酸、pH6.0についてはKRB+20mM乳酸も使用した。
CD80:PD-L1阻害についての抗体のスクリーニング
ELISAアッセイは、コーティング抗原が1μg/mlのヒトB7-1-Fc(CD80)(R&D Systemsのカタログ番号140-B1)である以外は上記の「PD-1:PD-L1阻害についての抗体のスクリーニング」と同じである。
BIAcore分析:
pH6.0及びpH7.4でのヒトPD-L1に対する選択されたIgGフォーマット精製クローンの親和性を評定するために、ヒトPD-L1-Fcタンパク質をアミンカップリングによってコーティングした。表面プラズモン共鳴(SPR)(BIAcore 3000、GE Healthcare)を用いて、pH6.0及びpH7.4でのヒトPD-L1に対する選択されたIgGフォーマット精製クローンの結合動態を決定した。pH5.0の酢酸バッファー中50μg/mlのヒトPD-L1 Fc(R&D Systems)およそ3000RUを、標準的なアミンカップリング手順を用いてCM5チップに固定化した。PD-L1固定化のQCを、市販の抗PD-L1抗体(R&D systemsのカタログ番号AF156)を2.0μg/mlで用いて行った。1×HBS-EP(pH7.4)又はHBS-EP(pH7.0)又はHBS-EP 10nMクエン酸バッファー(pH6.5)又はHBS-EP 10nMクエン酸バッファー(pH6.0)を結合動態測定において泳動バッファーとして用いた。抗体の勾配は、適切なpHバッファー中で50nMから開始して0.13nMまでの3倍希釈からなり、30μl/分の流量で120秒間注入した。解離後に、PD-L1-Fc表面の再生を1M NaCl中の10mM NaOH(20μl/分で30秒間の注入)に続く、20μl/分での10mMグリシン(pH1.5)の30秒間の単回注入によって達成した。物質移動による1:1結合のフィッティングを、BIAevaluationソフトウェアを用いて曲線に適用し、会合速度(ka)、解離速度(kd)及び親和性(K)を含む抗体-抗原相互作用の速度定数を算出した。
親和性成熟ライブラリの生成:
ファージディスプレイライブラリの構築は、遺伝子アセンブリによって生成した。ライブラリ設計において定義される或る特定の位置に特定の突然変異を有する重複オリゴヌクレオチド及び/又は三量体を用い、V遺伝子をPCRによって合成的に生成した。オリゴヌクレオチドは、完全なVH及びVλ配列をアセンブルするように設計され、HCDR1、HCDR2、HCDR3又はLCDR1、LCDR2、LCDR3領域に特異的なプライマーは、異なる変異体の構築を可能にするために親ヌクレオチド又は縮重コドンのいずれかを含有していた。クローニング制限部位をVH及びVλ遺伝子に導入し、ファージミドベクターに更に挿入した。全ての遺伝子アセンブリPCRを、3つの異なるアニーリング温度を用いて行い、異なるアニーリング温度のPCR産物間で差異が観察されない場合、PCR産物をプールした。ゲル精製したVλ遺伝子を、定常ヒト重及び軽遺伝子(CH及びCL)並びに親VH鎖ドメインを有するpCB13_2A09VH_WTファージミドベクターにクローニングし、AFF2A09_LCDR1、AFF2A09_LCDR2及びAFF2A09_LCDR3親和性成熟ライブラリを構築した。ゲル精製したVHランダム化遺伝子を、CH及びCLヒト定常領域並びに親Vλドメインを有するpCB13_2A09Vλ_WTファージミドベクターにクローニングし、AFF2A09_HCDR1、AFF2A09_HCDR2及びAFF2A09_HCDR3親和性成熟ライブラリを構築した。全てのFabファージディスプレイライブラリは、完全Fab挿入断片を含有する形質転換体が80%超となり、ライブラリ1つ当たり48個の形質転換体をシークエンシングに送り、標的重及び軽CDRにおけるアミノ酸頻度導入について、親クローン2A09のWT配列と比較して分析した。
親和性成熟ファージディスプレイ選択:
ラウンドI:パンニング選択。pH6.0でヒトPD-L1に対するFabを選択するために、2A09親和性成熟サブライブラリを用いるパンニング選択の第1ラウンドを行った。プレートに1×PBS中の10μg/mlのヒトPD-L1を100μl/ウェル、O/N、4℃でコーティングし、続いて250μl/ウェルのPBS中の4%スキムミルク(Marvel、カタログ番号928964)を用いてRTで2時間ブロッキングした。2A09親和性成熟サブライブラリからのファージを、1選択条件につき4%スキムミルク/CPA(pH6.0)中にてRTで30分間、回転させながらブロッキングした。1選択条件につき4%スキムミルク/1×PBS中の親和性成熟サブライブラリからの50μlのファージを、抗原でコーティングしたプレートにおいてRTで2時間、100μl/ウェルでインキュベートした。インキュベーション後に、ウェルを1×CPA-Tween 0.05%で15回洗浄し(5回の洗浄毎に5分間の振盪インキュベーションを含む)、更に250μl/ウェルの1×CPA(pH6.0)で5回洗浄した。1mg/mlのトリプシン(Sigma、カタログ番号T1426-5G)を用いて、PD-L1に結合したファージの完全溶出を行った。150μl/ウェルのトリプシンを添加し、RTで20分間インキュベートした。トリプシンプロテアーゼ活性の阻害を、10μlのAEBSF(Sigma、カタログ番号A8456)を用いて行った。溶出ファージの段階希釈を行い、指数関数的に成長するTG1への感染に使用した。感染したTG1をLBCarb100Glu2%プレート上にプレーティングし、抗原選択条件により溶出したファージの数と抗原選択条件なしで溶出したファージの数との比率として富化を算出した。全てのサブライブラリについて良好な富化が観察され、アウトプットを溶液中での第2ラウンドに供した。
ラウンドII:親和性による溶液中での選択。溶液中の抗原を認識するPD-L1に対する親和性成熟Fabの選択のために、ビオチン化PD-L1及びストレプトアビジンコーティング磁性ビーズを用いて第2ラウンドを行った。抗原ブロッキング:10nM及び1nMのビオチン化PD-L1を、2%Marvel CPAバッファー(pH6.0)を用いてRTで30分間、回転させながらブロッキングした。ファージブロッキング:第1ラウンドから得たアウトプットからの10μlのインプットファージを、4%Marvel CPAバッファー(1条件当たり)を用いてRTで回転させながら30分間ブロッキングした。ファージ+抗原ミックス:100μlのブロッキング抗原(bio-PD-L1)+100μlのブロッキングファージ(1条件当たり)を、RTで回転させながら2時間インキュベートした。ビーズ洗浄/ブロッキング:1選択条件当たり30μlのDynabeads(商標) MyOne(商標) Streptavidin T1磁性ビーズ(Invitrogen、カタログ番号65601)をCPAバッファー-Tween 0.05%で3回洗浄し、2%Marvel CPAバッファー中で30分間、RTで回転させながらブロッキングした。ミックスファージ+抗原ビーズ捕捉:200μlのミックス(ファージ+抗原bio-PD-L1)をRTで15分間、回転させながら磁性ビーズに添加した。インキュベーション後に、ビーズをCPAバッファー-Tween 0.05%で5回洗浄し、更に1mlのCPAバッファーで2回洗浄した。溶出:PD-L1に結合したファージの完全溶出を、1mg/mlのトリプシンを200μl/条件で用いて20分間、RTで回転させながら行った。トリプシンプロテアーゼ活性の阻害を、10μlのAEBSFを用いて行った。富化:溶出ファージの段階希釈を行い、指数関数的に成長するTG1への感染に使用した。感染したTG1をLBCarb100Glu2%プレート上にプレーティングし、抗原選択条件により溶出したファージの数と抗原選択条件なしで溶出したファージの数との比率として組換えタンパク質選択時の富化を算出した。
ラウンド3:2時間又は20時間のオフレート洗浄を伴う親和性による溶液中での選択。溶液中の抗原を認識するPD-L1に対して親和性成熟したFabを選択するために、100倍過剰な非ビオチン化PD-L1を用いた2時間又は20時間のオフレート洗浄を伴うストレプトアビジンコーティング磁性ビーズを用いた第3ラウンドの溶液中の選択を行い、高親和性クローンを選択した。抗原ブロッキング:1nM、0.1nM、0.01nM及び0nMのビオチン化PD-L1を、2%Marvel CPAバッファー(pH6.0)を用いてRTで30分間、回転させながらブロッキングした。ファージブロッキング:第2ラウンドから得たアウトプットからの10μlのインプットファージを、4%MarvelのCPAバッファー(1条件当たり)を用いてRTで回転させながら30分間ブロッキングした。ファージ+抗原ミックス:100μlのブロッキング抗原(bio-PD-L1)+100μlのブロッキングファージ(1条件当たり)を、RTで回転させながら2時間インキュベートした。ビーズ洗浄/ブロッキング:1選択条件当たり30μlのDynabeads(商標) MyOne(商標) Streptavidin T1磁性ビーズ(Invitrogen、カタログ番号65601)をCPAバッファー-Tween 0.05%で3回洗浄し、2%Marvel CPAバッファー中で30分間、RTで回転させながらブロッキングした。ミックスファージ+抗原ビーズ捕捉:200μlのミックス(ファージ+抗原bio-PD-L1)をRTで15分間、回転させながら磁性ビーズに添加した。インキュベーション後に、ビーズをCPAバッファー-Tween 0.05%で5回洗浄し、更にCPAバッファーで2回洗浄した。オフレート洗浄:100倍過剰な非ビオチン化PD-L1(10nM、1nM及び0.1nM)又はCPAバッファーを選択ウェルに添加し、RTで2時間又は20時間、回転させながらインキュベートした。溶出:PD-L1に結合したファージの完全溶出を、1mg/mlのトリプシンを200μl/条件で用いて20分間、RTで回転させながら行った。トリプシンプロテアーゼ活性の阻害を、10μlのAEBSFを用いて行った。富化:溶出ファージの段階希釈を行い、指数関数的に成長するTG1への感染に使用した。感染したTG1をLBCarb100Glu2%プレート上にプレーティングし、抗原選択条件により溶出したファージの数と抗原選択条件なしで溶出したファージの数との比率として組換えタンパク質選択時の富化を算出した。1nMのビオチン化PD-L1及び100nMのPD-L1を用いた2時間又は20時間のオフレート洗浄によって選択したアウトプットを、細胞中でのラウンドIVの選択に供した。
ラウンド4:細胞選択。細胞表面に存在するネイティブPD-L1に対する親和性成熟Fabを選択するために、MDA-MB-231細胞(PD-L1を発現する内在性細胞)を用いたpH6.0での選択ラウンドを行った。細胞:1サブライブラリ条件につき、10%FBS/PBS(pH6.0)(1M HCLで酸性化)中の5.0E+06個のMDA-MB-231細胞を使用した。また、細胞を、pH7.4又はpH6.0のFACSバッファー中で300nM、100nM、33.3nM、11.1nM、3.70nM、1.23nM、0nMのmAb 2A09又はmAb 12A4(米国特許第9856320号による)とともに4℃で1時間、振盪しながらインキュベートすることにより、二次抗体(Alexa Fluor(商標) 488 AffiniPure Mouse Anti-Human IgG;Jackson ImmunoResearch Laboratoriesのカタログ番号209-545-098)を検出に用いてPD-L1発現についてQCした。ファージブロッキング:1サブライブラリにつき、ラウンド3の選択(100nM PD-L1で2時間又は20時間のオフレート洗浄)から得たアウトプットファージをプールし、10%FBS/PBS(pH6.0)を用いて4℃で20分間、回転させながらブロッキングした。ファージ+細胞:1条件当たり5E+06個のMDA-MB-231細胞をブロッキングファージで再懸濁し、回転させながら4℃で2時間インキュベートした。インキュベーション後に、細胞を10%FBS/PBS(pH6.0)で4回洗浄し、更に1回の洗浄当たり1mlのPBS(pH6.0)で1回洗浄した。溶出:PD-L1に結合したファージの完全溶出を1mg/mlのトリプシンを200μl/条件で用いてRTで20分間、回転させながら行い、トリプシンプロテアーゼ活性を10μlのAEBSFで阻害した。富化:溶出ファージの段階希釈を行い、指数関数的に成長するTG1への感染に使用した。感染したTG1をLBCarb100Glu2%プレート上にプレーティングし、バックグラウンド(選択に抗原を用いない)に対する富化値を算出した。
HCDR1及びHCDR2ライブラリ並びにLCDR3ライブラリは、2A09 WTと比較して顕著なヒットを生じなかった。HCDR3ライブラリは、1つの主要ヒットを生じ、2A09と比較して結合が改善された3つの他の特有の配列が単離され、LCDR1ライブラリは、36個の特有のヒットを生じ、LCDR2ライブラリは、結合が改善された6つの特有のヒットを生じた。
これらのヒットを上記のようにpH6及びpH7.4で細胞結合アッセイ、BIAcoreアッセイ及びPD-L1中和アッセイによって更に分析した。
リードFabを上記のように精製IgGからPierce(商標)Fab Preparation Kit(カタログ番号44985)によって作製した。
腫瘍様バッファー中でのMDA-MB-231細胞への抗PD-L1 mAb又はFabの結合
PD-L1を発現する腫瘍細胞を用いて酸性腫瘍環境(environment milieu)を模倣するために(The metabolism of tumors in the body, Warburg et al. J Gen Physiol. 1927;8:519-30)、以下のバッファーを用いた:pH7.4については1mM乳酸(Sigmaのカタログ番号252476-500G)を含むクレブスリンガー重炭酸バッファー(KRB、Amsbioのカタログ番号KRB-1000)、pH6.5についてはKRB+15mM乳酸、pH6.0についてはKRB+20mM乳酸。Fab又はIgGの3倍希釈物(100nM~0.0005nM;0)をそれぞれのpHバッファー中で調製し、0.60E05個のMDA-MB-231細胞とともに4℃で60分間インキュベートした。次いで、細胞をそれぞれのpHバッファーで300gにて3分間、3回洗浄した。次いで、細胞を50μlの抗ヒトIgG(Fab特異的)-FITC(Sigma、カタログ番号F5512-1ML)とともに、それぞれのpHバッファーで100倍希釈してインキュベートした。PD-L1発現細胞へのIgG又はFabの結合をFACS(Attune Nxt)によって測定し、1サンプル当たり合計10000個の細胞を取得した。
統計分析
GraphPad Prism 7ソフトウェア(GraphPad 50 Software, Inc.,La Jolla,CA,USA)をIC50、EC50の分析及び統計分析に用いた。
結果
Fabライブラリの初期スクリーニングカスケードは、ヒト及びカニクイザルPD-L1に対するpH6でのファージELISAに続く、PD-L1-PD-1阻害ELISA及びPD-L1陽性細胞(MDA-MB-231)への結合であった。これらのアッセイにより陽性となった異なるファミリーからの20個のクローンをP.Eとして再スクリーニングした。ヒト及びカニクイザルPD-L1に対するELISAにおけるpH6でのFab作製に続く、PD-L1-PD-1阻害ELISA及びMDA-MB-231細胞における細胞結合アッセイ。これらのスクリーニングから、16個のクローンがファージ及びP.Eの両方としてヒト及びカニクイザル細胞に結合することが見出され、7つが弱い中和活性を有し、高い中和活性を有する4つのFabを選択した。これらのクローンのうち2つが同一のCDRを有していたため、3つのFabを更なる分析のためにIgGに変換した。ELISA(図1A)によると3つ全てのmAbがPD-1へのPD-L1結合を阻害し、図1Aから算出されたIC50値は、2A09については0.4nM、1A06については0.9nM、1E08については1.1nMであった。図1Bに示すようにELISAによると3つ全てのmAbがCD80へのPD-L1結合も阻害し、図1Bから算出されたIC50値は、2A09については1.2nM、1A06については6.3nM、1E08については2.8nMであった。mAb 2A09はまた、ヒト及びカニクイザルPD-L1に対して同等の結合を示した。
2A09のFab配列を表4に示す。
Figure 0007653408000006
BIAcoreによるオフレートの初期分析(図2)により、pH6と比較してpH7.4での低いKd値によって示されるように、mAbの2つ(1A06及び1E08)がpH7.4でPD-L1に対して選択的結合を有することが明らかになった。全く対照的に、mAb 2A09は、PD-L1に対してpH6.0でより良好な結合を有し、オフレートはおよそ5倍良好であった。BIAcore分析をより広範囲のpHで繰り返し、抗PD-L1 mAb 12A4(米国特許第9856320号による)と比較し、結果を表5に示した。
mAb 2A09は、pH7.4と比較してpH6でおよそ20倍高い親和性を示したが、これは、pH特異的結合に選択されず、実際にpH6でpH7.4と比較して低い親和性を示すmAb 12A4とは全く対照的である。
Figure 0007653408000007
表5に提示したデータは、結合のpH依存性を反映するが、BIAcore表面上でのPD-L1へのmAbの結合についてアビディティ成分が存在する。この問題を回避し、腫瘍微小環境に似たバッファー中で細胞への2A09の結合を分析するために、PD-L1発現MDA-MB-231細胞を、ラクテートを含むクレブスバッファー中にてpH6、6.5及び7.4で2A09 mAb及びFabとともにインキュベートした(図3)。PD-L1への2A09結合のEC50が図3から算出され、pH7.4で16.3nM、pH6.6で6.1nM、pH6.0で2.4nMであった。これらの条件下では、2A09のFabは、結合活性を殆ど有しなかった(図3)。
2A09 Fabの低い親和性の結果として、このクローンの親和性成熟キャンペーンを行った。2A09について上に概説したようなスクリーニングキャンペーンを行い、結合のpH依存性及び親2A09クローンと比べて増大した親和性を示し、PD-L1に結合する5つのFab親和性成熟リードを選択した(表6)。軽鎖のCDR1における突然変異を包含する5つ全てのリードを選択した。
Figure 0007653408000008
選択した5つ全てのFabを精製し、初めにELISAによって調べた(図4)。全てのFabがpH特異的結合を示し、陽性対照の抗PD-L1 Fab又はmAb 2.7A04OPT(国際公開第2011066389号による)は、pH依存性結合を示さなかった。陰性対照Fab(2A11、抗HEL)は、特異的結合を示さなかった。このELISAによる初期アッセイから、Fabが調べた濃度にわたってpH6ではるかに大きな親和性(表7)及びpH7.4で弱い非飽和結合を有することが実証された。EC50は、pH7.4ではこの方法論により正確に測定することができなかったが、結合の比率を表7に示し、両方のpH曲線上のOD読取りを比較することで、FabがpH6で9倍~53倍良好に結合することが実証された。このアッセイにおいて、pH6では全てのFabが4nMで結合の飽和に達したが、pH7.4では5つのFabのいずれも飽和に達しなかった(図4)。
Figure 0007653408000009
抗PD-L1親和性成熟Fabを、PD-L1阻害ELISAにおいてpH6.0、6.5及び7.4でそれらの阻害活性について試験した(図5)。このアッセイにおいては、抗PD-L1 Fab 2.7A04OPTを陽性対照として使用し、Fab 2A11を陰性対照として使用した。IC50を曲線から算出し、表8に示した。pH6での抗PD-L1 Fab 8D06、8A04、8G08及び8B06によるPD-1へのPD-L1結合の阻害のIC50は、対照Fab 2.7A04OPTよりもおよそ3倍しか低くない。pH6、6.5及び7.4では、抗PD-L1 Fab 2.7A04OPTは、阻害についてpH選好性を示さない。これは、阻害の明らかなpH依存性を示す本発明のFabとは全く対照的である(図5及び表8)。Fab 8D06、8A04、8G08及び8B06は、pH6と比較してpH6.5でおよそ3倍低い阻害活性を有し、pH7.4では殆ど活性を有しない。抗PD-L1 Fab 8D04は、このアッセイによるとFab 8D06、8A04、8G08及び8B06よりもおよそ3倍効力が低い。100nMでは、いずれのFabもpH7.4でPD-1へのPD-L1結合を完全に阻害せず、およそ60%の阻害を有するFab 8A04が最良であることに留意することが重要である(図5)。
Figure 0007653408000010
抗PD-L1親和性成熟Fabを、腫瘍微小環境に似たバッファー(クレブス-ラクテート)中にて細胞株(MDA-MB-231細胞)においてネイティブPD-L1に結合するそれらの能力について試験した。この場合も、5つ全ての親和性成熟FabがpH依存性結合を示した(図6及び表9A)。陽性対照である抗PD-L1 Fab 2.7A04OPTは、pH結合選好性を示さなかった。pH結合選好性は、8倍(Fab 8G08)及び11倍(Fab 8D06)から100倍超(Fab 8A04、8D04及び8B06)の範囲であった。全てのFabについて、pH7.4及び100nM Fabでの全結合(MFI)がpH6よりもはるかに低く、飽和に達しなかった。また、FabをIgG1にフォーマットし、pH7.4、6.5及び6.0でのMDA-MB-231細胞への結合を調査した(表9B)。驚くべきことに、mAbは結合のpH依存性を示さなかった(表9B)。結合のpH依存性は、フォーマット(Fab、単量体結合剤)、FabのEC50結合がmAbよりもおよそ100倍低いことから親和性、及びCDRへのヒスチジン残基の導入に関連している(表10)。
Figure 0007653408000011
Figure 0007653408000012
プロトン関連結合事象は、例えばヘモグロビンにおけるボーア効果(Perutz MF et al. J Mol Biol. 1980;138:649-68)、セリンプロテアーゼ阻害剤のpH依存性結合(Ascenzi P. et al. J Mol Recognit. 1991, 4:113-9)、pH8から6.7への僅かなpHの低下により受容体に対する結合親和性の大きな減少を示すことが報告されているヒトプロラクチン(Kulkarni MV et al. J Biol Chem. 2010;285:38524-33)を含む生物学的調節において重要な役割を果たしている。高度にpH依存性の結合事象は、複数のイオン化可能な残基(例えば、ヒスチジン)を必要とするが、これらは、本明細書に記載の方法論に用いられるスクリーニング法によって首尾よく導入することができる。イミダゾールは、ヒスチジンの側鎖を形成し、そのpK(≒6.0)は生理的pH範囲内であるのに加え、イミダゾールのプロトン化及び非プロトン化形態は、化学的に非常に異なる。非プロトン化形態が疎水性及び芳香族性を有するのに対し、プロトン化形態は親水性であり、正に帯電している。したがって、化学的相互作用は、pK前後のpHで顕著に異なる。pH7.0では非プロトン化形態が優勢であり、他の疎水性基との相互作用に有利であり、pH5.0ではイミダゾール基がプロトン化され、親水性環境が好まれる。
5つの親和性成熟抗PD-L1 FabのHCDR1、HCDR2及びHCDR3、並びにLCDR2及びLCDR3配列は、野生型2A09 Fabと同じである。HCDR3には1つのHis残基しか存在せず、これにより、このクローンの低いpH感度が説明され得る。5つの親和性成熟抗PD-L1 Fabは、CDR1配列に1つ又は2つの付加的なHis残基を有し(表10)、VL及びVH配列を表11に示す。
付加的なpH特異性及び親和性は、一部には、PD-L1エピトープと相互作用し、「pHスイッチ」を生じることができる、LCDR1に付加的なHis残基を有するクローンの選択によるものであり得る。
Figure 0007653408000013
Figure 0007653408000014
国際公開第2014055897号によるAb-52及びAb-55の評価
国際公開第2014055897号(DANA FARBER CANCER INST INC)は、PD-L1に結合するヒトモノクローナル抗体を開示している。国際公開第2014055897号に開示されているAb-52及びAb-55のVL配列は、配列番号2の配列を含む。これらの抗体を評価し、pH依存性結合の証拠があるかどうかを確かめた。
方法
Ab-52及びAb-55の完全長抗PD-L1抗体を国際公開第2014055897号の配列から作製した(国際公開第2014055897号の16頁を参照されたい)。陽性対照の抗PD-L1 mAbである2.7A04OPTは、国際公開第2011066389号によるものであり(国際公開第2011066389号の71頁を参照されたい)、陰性対照mAb(2A11)は、抗HEL(鶏卵リゾチーム)である。
Fabを無傷mAbから市販のキットを用いて作製した。
PD-L1中和ELISA
mAb又はFab(100nM~0.14nM)を、1μg/mlのPD-1でコーティングした96ウェルプレートに添加し、1μg/mlのPD-L1-ビオチンの阻害を測定し、各mAb又はFabの中和能を決定した。PD-L1-ビオチンとのPD-L1相互作用を、Extravidin-HRPを用いて検出した。用いたバッファーは、0.1%カゼイン/クレブス/ラクテート(pH6.0又はpH7.4)であった。
実施したアッセイの完全な方法論は、本願の実施例のセクションに「異なるpHでのPD-L1へのELISA結合」及び「PD-1:PD-L1阻害についての抗体のスクリーニング」の見出しで提示されている。
結果
第1の実験(図8)においては、Ab-52及びAb-55のFabを、pH6又はpH7.4でPD-L1を中和するそれらの能力について本発明の5つのFab(8B06、8D06、8G08、8A04、8D04)のそれぞれに対して比較した。国際公開第2011066389号によるFab 2.7A04OPTを陽性対照として使用した。
陽性対照の比較用mAbである2.7A04OPTは、pH7.4と比較してpH6でPD-1へのPD-L1結合を等しく阻害した。
本発明の5つのFab(8D06、8A04、8G08、8D04、8B06)は、pH6でPD-1へのPD-L1結合を阻害し、予想されるようにpH7.4では阻害が殆ど観察されなかった。対照的に、Ab-52及びAb-55のFabでは、いずれのpHでも結合の阻害が観察されなかった。これは、図8において使用される他のFabと比較して低いFab Ab-52及びAb-55の中和の親和性に起因し得る。
この理由から、Ab-52及びAb-55 mAbを第2の実験に用い、それらがpH依存性の中和活性を有するかを決定した(図9)。
本発明のFabの2つ(8G08及び8B06)をこのアッセイに使用し、この場合もpH6及びpH6.5でpH依存性の中和が示され、pH7.4では活性は殆ど示されなかった。全く対照的に、mAb Ab-52及びAb-55は、PD-1へのPD-L1結合のpH依存性の中和を示さなかった。このデータは、陽性対照のFab 2.7A04OPTと同等である。
したがって、配列の僅かな重複にもかかわらず、Ab-52及びAb-55は、本発明の抗PD-L1抗原結合分子の新規の特性を共有しない。具体的には、Ab-52及びAb-55は、本発明の抗PD-L1抗原結合分子が示す、pH6.0でpH7.4よりも高いPD-L1に対する親和性を共有しない。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR1を含む、抗PD-L1抗原結合分子。
(項目2)
配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVLCDR1を含む、項目1に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目3)
配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVHCDR1、
配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVHCDR2、
及び、
配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVHCDR3、
並びに/或いは、
配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR1、
配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR2、
及び、
配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR3を含む、
項目1又は2に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目4)
配列番号6のアミノ酸配列を含むVHCDR1、
配列番号7のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び、
配列番号8のアミノ酸配列を含むVHCDR3、並びに/或いは、
配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVLCDR1、
配列番号3のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、
配列番号4のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む、
項目1~3のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目5)
配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有する重鎖可変領域、
及び/又は、
配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17及び配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有する軽鎖可変領域を含む、
項目1~4のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目6)
配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、及び/又は、
配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17及び配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、
項目1~5のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目7)
(a)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(b)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(c)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(d)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(e)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(f)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
からなる群から選択される、項目1~6のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目8)
(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号15のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号15に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(b)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号11のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号11に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(c)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号9のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号9に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(d)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号13のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号13に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(e)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号17のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号17に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(f)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号1のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号1に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
からなる群から選択される重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、項目1~7のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目9)
8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体である、項目1~8のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目10)
前記抗体が6つのCDR領域全体にわたって1個~10個、1個~5個又は1個~2個の保存的アミノ酸置換を含む、項目9に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目11)
PD-L1に特異的に結合し、項目1~10のいずれか一項に記載の抗原結合分子へのPD-L1の結合を阻害する抗PD-L1抗原結合分子。
(項目12)
ヒトPD-L1のエピトープに特異的に結合し、PD-L1への結合について8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体と競合する抗PD-L1抗原結合分子。
(項目13)
前記抗原結合分子が抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体であり、任意に、該抗体フラグメント又は誘導体がFab、F(ab’)2、Fv、scFv、dAb、Fd又はダイアボディである、項目1~12のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目14)
前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が一価である、項目13に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
(項目15)
前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が完全にヒトである、項目14に記載の抗PD-L1抗体。
(項目16)
前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体がIgA、IgD、IgE、IgG、IgM若しくはIgY抗体、又はそれらの抗原結合フラグメント若しくは誘導体であり、任意に、前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体がIgG抗体であり、更に任意に、該IgG抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体がIgG1抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、項目13~15のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗体又は抗原結合フラグメント若しくは誘導体。
(項目17)
前記抗体が二重特異性抗体又はその二重特異性抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、項目16に記載の抗PD-L1抗体又は抗体フラグメント。
(項目18)
pHに依存してPD-L1に特異的に結合する、項目1~17のいずれか一項に記載の抗原結合分子。
(項目19)
pH7.4よりもpH6.0でPD-L1に対して高い親和性を有する、項目1~18のいずれか一項に記載の抗原結合分子。
(項目20)
7.4のpHよりもpH6.0でPD-L1に対して少なくとも約5倍高い親和性を有する、項目1~19のいずれか一項に記載の抗原結合分子。
(項目21)
少なくとも5のpH6.0:7.4結合比を有する、項目1~20のいずれか一項に記載の抗原結合分子。
(項目22)
PD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値がpH6.0よりもpH7.4で高い、項目1~21のいずれか一項に記載の抗原結合分子。
(項目23)
in vivo又はin vitroで投与した場合に、
a.免疫抑制を逆転させ、及び/又は、
b.T細胞免疫を増強する、
項目1~22のいずれか一項に記載の抗原結合分子。
(項目24)
項目1~23のいずれか一項に記載の抗原結合分子と薬学的に許容可能な賦形剤とを含む医薬組成物。
(項目25)
付加的な治療的活性剤を更に含むか、又は別の療法若しくは付加的な治療的活性剤と組み合わせて使用される、項目24に記載の医薬組成物。
(項目26)
医薬に使用される、項目1~23のいずれか一項に記載の抗原結合分子又は項目24若しくは25に記載の医薬組成物。
(項目27)
癌の治療又は予防に使用される、項目1~23のいずれか一項に記載の抗原結合分子又は項目24若しくは25に記載の医薬組成物。
(項目28)
前記癌が黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌からなる群から選択される、項目27に記載の使用のための抗原結合分子又は医薬組成物。
本発明の実施形態
本発明は少なくとも、番号付きの項目として列挙される以下の実施形態を提供する:
1. 配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR1を含む、抗PD-L1抗原結合分子。
2. 配列番号16、12、10、14、18及び2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有するVLCDR1を含む、項目1の抗PD-L1抗原結合分子。
3. 配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVLCDR1を含む、項目1の抗PD-L1抗原結合分子。
4. 配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVHCDR1、
配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVHCDR2、及び、
配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVHCDR3、及び/又は、
配列番号16、12、10、14、18及び2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR1、
配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR2、
配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するVLCDR3を含む、項目1~3のいずれか一項の抗PD-L1抗原結合分子。
5. 配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR1、
配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR2、及び、
配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVHCDR3、及び/又は、
配列番号16、12、10、14、18及び2のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR1、
配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR2、及び、
配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有するVLCDR3を含む、項目1~4のいずれか一項の抗PD-L1抗原結合分子。
6. 配列番号6のアミノ酸配列を含むVHCDR1、
配列番号7のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び、
配列番号8のアミノ酸配列を含むVHCDR3、及び/又は、
配列番号16、12、10、14、18又は2のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVLCDR1、
配列番号3のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、
配列番号4のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む、項目1~5のいずれか一項の抗PD-L1抗原結合分子。
7. 配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有する重鎖可変領域、及び/又は、
配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17、配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有する軽鎖可変領域を含む、項目1~6のいずれか一項の抗PD-L1抗原結合分子。
8. 配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有する重鎖可変領域、及び/又は、
配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17、配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%若しくは99%の同一性を有する軽鎖可変領域を含む、項目1~7のいずれか一項の抗PD-L1抗原結合分子。
9. 配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、及び/又は、
配列番号15、配列番号11、配列番号9、配列番号13、配列番号17及び配列番号1からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、項目1~8のいずれか一項の抗PD-L1抗原結合分子。
10. (a)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列RETELSRRLHYVR(配列番号16)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(b)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列VLSPRTHAGHYYR(配列番号12)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(c)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列ISNDVPASGHYHR(配列番号10)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(d)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列MRTGTGNKGHYTR(配列番号14)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(e)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列RGTGSSFHHKYVR(配列番号18)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子、
(f)アミノ酸配列SYGMY(配列番号6)を含むVHCDR1、アミノ酸配列VISYDGSNKYYADSVKG(配列番号7)を含むVHCDR2、アミノ酸配列GALTHWGVVIGDGMDV(配列番号8)を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域と、
アミノ酸配列TRSSGSIASNYVQ(配列番号2)を含むVLCDR1、アミノ酸配列EDDQRPS(配列番号3)を含むVLCDR2及びアミノ酸配列QNVLTTPWT(配列番号4)を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域とを含むか、
又はそれらと少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVHCDR及びVLCDR配列を含む抗PD-L1抗原結合分子からなる群から選択される、上記いずれかの項目の抗PD-L1抗原結合分子。
11. (a)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号15のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号15に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(b)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号11のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号11に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(c)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号9のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号9に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(d)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号13のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号13に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(e)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号17のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号17に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列、
(f)配列番号5のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号1のアミノ酸配列を含むVL、又は配列番号5及び配列番号1に対してそれぞれ少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%同一のVH及びVL配列からなる群から選択される重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、上記いずれかの項目の抗PD-L1抗原結合分子。
12. 8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体である、上記いずれかの項目の抗PD-L1抗原結合分子。
13. 抗体が6つのCDR領域全体にわたって1個~10個、1個~5個又は1個若しくは2個の保存的アミノ酸置換を含む、項目12の抗PD-L1抗原結合分子。
14. 抗体が可変重領域及び可変軽領域の一方又は両方に1個~10個、1個~5個又は1個若しくは2個の保存的アミノ酸置換を含む、項目12の抗PD-L1抗原結合分子。
15. 抗体がフレームワーク領域に1個~10個、1個~5個又は1個若しくは2個の保存的アミノ酸置換を含む、項目12の抗PD-L1抗原結合分子。
16. PD-L1に特異的に結合し、項目1~15のいずれか一項の抗原結合分子へのPD-L1の結合を阻害する抗原結合分子。
17. PD-L1に特異的に結合し、8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体へのPD-L1の結合を阻害する、項目16の抗原結合分子。
18. 項目1~15のいずれか一項の抗原結合分子が結合するPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子。
19. 8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体が結合するPD-L1のエピトープに特異的に結合する、項目18の抗原結合分子。
20. ヒトPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子であって、エピトープが配列番号19で構成される、抗原結合分子。
21. カニクイザルPD-L1のエピトープに特異的に結合する抗原結合分子。
22. 8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09、並びにそれらのフラグメント及び変異体からなる群から選択される、項目20の抗原結合分子。
23. 8B06である、項目20の抗原結合分子。
24. 8A04である、項目20の抗原結合分子。
25. PD-L1に特異的に結合し、PD-L1への結合について項目1~15のいずれか一項の抗原結合分子と競合する抗原結合分子。
26. PD-L1に特異的に結合し、PD-L1への結合について8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体と競合する、項目25の抗原結合分子。
27. 指定の配列(単数又は複数)に1個~10個のアミノ酸置換を含む、項目1~15のいずれか一項による抗PD-L1抗原結合分子。
28. 指定の配列(単数又は複数)に1個~5個のアミノ酸置換を含む、項目27による抗PD-L1抗原結合分子。
29. 指定の配列(単数又は複数)に1個若しくは2個のアミノ酸置換を含む、項目27による抗PD-L1抗原結合分子。
30. 1個~10個、1個~5個又は1個若しくは2個のアミノ酸置換が抗原結合分子のCDR領域(単数又は複数)にある、項目27~29のいずれか一項による抗PD-L1抗原結合分子。
31. 1個~10個、1個~5個又は1個若しくは2個のアミノ酸置換が抗原結合分子の可変領域の一方又は両方にある、項目27~29のいずれか一項による抗PD-L1抗原結合分子。
32. 1個~10個、1個~5個又は1個若しくは2個のアミノ酸置換が抗原結合分子のフレームワーク領域にある、項目27~29のいずれか一項による抗PD-L1抗原結合分子。
33. 8B06、8D06、8G08、8A04、8D04、2A09からなる群から選択される抗体に由来する変異体である、項目27~29のいずれか一項による抗PD-L1抗原結合分子。
34. アミノ酸置換が保存的アミノ酸置換である、項目13~15又は27~29のいずれか一項による抗PD-L1抗原結合分子。
35. 抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、上記いずれかの項目の抗PD-L1抗原結合分子。
36. 抗原結合抗体フラグメント又は誘導体がFab、F(ab’)2、Fv、scFv、dAb、Fd又はダイアボディである、項目35の抗PD-L1抗原結合分子。
37. 抗原結合抗体フラグメントがFabである、項目35の抗PD-L1抗原結合分子。
38. 抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が一価である、項目35の抗PD-L1抗原結合分子。
39. 抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が完全にヒトである、項目35の抗PD-L1抗体。
40. IgA、IgD、IgE、IgG、IgM若しくはIgY抗体、又はそれらの抗原結合抗体フラグメント若しくは誘導体である、項目35~39のいずれか一項の抗PD-L1抗体又はその抗原結合抗体フラグメント若しくは誘導体。
41. 抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が、IgG抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、項目35~39のいずれか一項の抗PD-L1抗体又は抗体フラグメント。
42. IgG抗体又は抗原結合抗体フラグメント若しくは誘導体が、IgG1抗体又はその抗原結合抗体フラグメント若しくは誘導体である、項目41の抗PD-L1抗体又は抗原結合抗体フラグメント若しくは誘導体。
43. 抗PD-L1抗原結合分子であって、抗体2A09の親和性成熟突然変異体である、抗PD-L1抗原結合分子。
44. 親和性成熟突然変異体が8B06、8D06、8G08、8A04及び8D04からなる群から選択される、項目43の抗PD-L1抗原結合分子。
45. ヒト又はカニクイザルPD-L1に特異的に結合する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
46. pHに依存してPD-L1に特異的に結合する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
47. 酸性pHでPD-L1に特異的に結合する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
48. 約pH6~約pH6.5のpHでPD-L1に特異的に結合する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
49. 生理的pHよりも酸性pHでPD-L1に対して高い親和性を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
50. 約pH7.4よりも約pH6.0でPD-L1に対して高い親和性を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
51. 酸性pHが約pH6.5以下である、項目49の抗原結合分子。
52. 生理的pHが約pH7.4である、項目49の抗原結合分子。
53. 約7.4のpHよりも約pH6.0でPD-L1に対して少なくとも約5倍高い親和性を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
54. PD-L1に対してpH6.0で約15nM未満のEC50値を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
55. PD-L1に対してpH6.0で約1.45nM~約15nMのEC50値を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
56. PD-L1に対してpH7.4で少なくとも約10nMのEC50値を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
57. PD-L1に対してpH7.4で約13.2nM~約100nMのEC50値を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
58. 少なくとも約5のpH6.0:7.4結合比を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
59. pH6.0で約15nM未満のPD-L1に対するEC50値及びpH7.4で少なくとも約10nMのPD-L1に対するEC50値を有し、少なくとも5のpH6.0:7.4結合比を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
60. PD-1及び/又はCD80へのPD-L1の結合、又はPD-1及び/又はCD80へのPD-L1発現細胞の結合を阻害する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
61. 結合を少なくとも約40%、少なくとも約50%又は少なくとも約80%阻害する、項目60の抗原結合分子。
62. PD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が約pH6.0よりも約pH7.4で高い、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
63. 約pH6.0でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が約12.1nM~約42.3nMである、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
64. 約pH6.0でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が約50nM未満である、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
65. 約pH7.4でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が約81.2nM~約100nMである、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
66. pH7.4でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が少なくとも50nMである、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
67. pH7.4でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が少なくとも80nMである、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
68. 少なくとも約2のpH6.0:7.4阻害比を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
69. pH6.0でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が約50nM未満であり、pH7.4でのPD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値が少なくとも約80nMであり、抗原結合分子が少なくとも約2のpH6.0:7.4阻害比を有する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
70. PD-L1がヒトPD-L1又はカニクイザルPD-L1である、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
71. in vivo又はin vitroで投与した場合に免疫抑制を逆転させる、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
72. in vivo又はin vitroで投与した場合にT細胞免疫を増強する、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
73. 免疫チェックポイント阻害剤である、上記いずれかの項目の抗原結合分子。
74. 上記いずれかの項目の抗原結合分子を含み、任意に1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤を更に含む医薬組成物。
75. 付加的な治療的活性剤を更に含むか、又は別の療法若しくは付加的な治療的活性剤と組み合わせて使用される、項目74の医薬組成物。
76. 他の療法又は付加的な治療的活性剤が放射線療法、化学療法治療、標的療法、免疫療法、モノクローナル抗体療法、ホルモン療法、血管新生阻害、癌ワクチン、腫瘍溶解性ウイルス、toll様受容体アゴニスト、後成的修飾、改変T細胞、T細胞共刺激アゴニスト、チロシンキナーゼ阻害剤、他の抗癌化学物質、癌療法のための緩和ケア、免疫チェックポイント阻害剤、免疫抑制剤、抗炎症薬、免疫調節剤、免疫賦活剤、及び/又は阻害剤、例えばIDO阻害剤、CSF-1R阻害剤、TGFB阻害剤、T細胞共刺激アンタゴニスト、Treg阻害剤、マクロファージ調節剤、ナチュラルキラー細胞調節剤、又はケモカイン受容体阻害剤からなる群から選択される、項目75の医薬組成物。
77. 化学療法治療がゲムシタビン、シクロフォスファミド、ドキソルビシン、パクリタキセル、シスプラチンからなる群から選択される、項目76の医薬組成物。
78. T細胞共刺激アゴニストが4-1BB、OX40、CD40、GITR、BTLA、CD70及びICOSからなる群から選択される、項目76の医薬組成物。
79. 免疫チェックポイント阻害剤がPD-1、CTLA-4、TIM-3、LAG-3、VISTA及びTIGITからなる群のメンバーに作用する、項目76の医薬組成物。
80. 他の療法又は付加的な治療的活性剤が別の抗原結合分子である、項目75の医薬組成物。
81. 付加的な抗原結合分子が抗PD-L1抗原結合分子、抗PD-1抗原結合分子、抗CTLA-4抗原結合分子、抗OX40抗原結合分子、抗ICOS抗原結合分子、抗GITR抗原結合分子からなる群から選択され、任意に、付加的な抗原結合分子が抗体である、項目80の医薬組成物。
82. 項目1~73のいずれか一項の抗原結合分子又は項目74~81のいずれか一項による医薬組成物を含み、付加的な治療的活性剤を更に含むキット。
83. 使用説明書を更に含む、項目82のキット。
84. 医薬成分がキット内で別個に配置される、項目82又は83のキット。
85. 付加的な治療的活性剤が免疫チェックポイント阻害剤、免疫抑制剤、抗炎症薬、免疫調節剤、免疫賦活剤、及び/又は阻害剤、例えばIDO阻害剤、CSF-1R阻害剤、TGFB阻害剤、T細胞共刺激アンタゴニスト、Treg阻害剤、マクロファージ調節剤、ナチュラルキラー細胞調節剤、又はケモカイン受容体阻害剤からなるリストから選択される、項目82~84のいずれかのキット。
86. 付加的な治療的活性剤が免疫チェックポイント阻害剤である、項目82~84のいずれかのキット。
87. 抗原結合分子又は医薬組成物及び付加的な治療的活性剤が別々、順次又は同時の投与のためのものである、項目82~86のいずれかのキット。
88. 医学に使用される、項目1~73のいずれか一項の抗原結合分子又は項目74~81のいずれか一項の医薬組成物。
89. 癌の治療又は予防に使用される、項目1~73のいずれか一項の抗原結合分子又は項目78~81のいずれか一項の医薬組成物。
90. 癌が心臓の肉腫、血管肉腫、線維肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫、粘液腫、転移性横紋筋腫、線維腫、脂肪腫及び奇形腫;肺の気管支原性癌、扁平上皮癌、未分化小細胞癌、非小細胞癌、未分化大細胞癌、腺癌、肺胞(細気管支)癌、気管支腺腫、肉腫、リンパ腫、軟骨性過誤腫、中皮腫;消化管:食道の扁平上皮癌、腺癌、平滑筋肉腫、リンパ腫、胃(stomach)の癌、リンパ腫、平滑筋肉腫、頭頸部、胃(gastric)、膵臓の管状腺癌、インスリノーマ、グルカゴノーマ、ガストリノーマ、カルチノイド腫瘍、ビポーマ、小腸の腺癌、リンパ腫、カルチノイド腫瘍、カポジ肉腫、平滑筋腫、血管腫、脂肪腫、神経線維腫、線維腫、大腸の腺癌、管状腺腫、絨毛腺腫、過誤腫、平滑筋腫、結腸直腸癌;尿生殖路:腎臓の腺癌、ウィルムス腫瘍(腎芽腫)、リンパ腫、白血病、膀胱及び尿道の扁平上皮癌、移行上皮癌、腺癌、尿路上皮癌、前立腺の腺癌、肉腫、精巣の精上皮腫、奇形腫、胎生期癌、奇形癌、絨毛癌、肉腫、間質細胞癌、線維腫、線維腺腫、腺腫様腫瘍、脂肪腫;肝臓の肝癌、肝細胞癌、胆管癌、肝芽腫、血管肉腫、肝細胞腺腫、血管腫;骨:骨原性肉腫(骨肉腫)、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性リンパ腫(細網肉腫)、多発性骨髄腫、悪性巨細胞腫、脊索腫、骨軟骨腫(骨軟骨性外骨症)、良性軟骨腫、軟骨芽細胞腫、軟骨粘液線維腫、類骨骨腫及び巨細胞腫;神経系:頭蓋骨の骨腫、血管腫、肉芽腫、黄色腫、変形性骨炎、髄膜の髄膜腫、髄膜肉腫、神経膠腫症、脳の星状細胞腫、髄芽腫、神経膠腫、上衣腫、胚細胞腫(松果体腫)、多形性膠芽腫、乏突起膠腫、シュワン細胞腫、網膜芽細胞腫、先天性腫瘍、脊髄神経線維腫、髄膜腫、神経膠腫、肉腫;女性生殖器:子宮の子宮内膜癌、子宮頸部の子宮頸癌、前腫瘍性子宮頸部異形成、卵巣の卵巣癌、漿液性嚢胞腺癌、粘液性嚢胞腺癌、分類不能癌、顆粒膜卵胞膜細胞腫、セルトリ-ライディッヒ細胞腫、未分化胚細胞腫、悪性奇形腫、外陰部の扁平上皮癌、上皮内癌、腺癌、線維肉腫、黒色腫、膣の明細胞癌、扁平上皮癌、ブドウ状肉腫(胎児性横紋筋肉腫)、ファローピウス管癌、乳癌;血液系:血液の骨髄性白血病(急性及び慢性)、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病、骨髄増殖性疾患、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群)、ホジキンリンパ腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(悪性リンパ腫);皮膚:悪性黒色腫、基底細胞癌、扁平上皮癌、カポジ肉腫、異形成母斑、脂肪腫、血管腫、皮膚線維腫、ケロイド、乾癬;並びに副腎:神経芽細胞腫からなる群から選択される、項目89のような使用のための抗原結合分子又は医薬組成物。
91. 癌が癌腫、リンパ腫、白血病、芽細胞腫及び肉腫からなる群から選択される、項目89又は90のような使用のための抗原結合分子、親和性成熟突然変異体又は医薬組成物。
92. 癌が黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌からなる群から選択される、項目89~91のいずれか一項の使用のための抗原結合分子又は医薬組成物。
93. 癌の治療に使用される薬剤の製造における項目1~73のいずれか一項の抗原結合分子の使用。
94. 癌が心臓の肉腫、血管肉腫、線維肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫、粘液腫、転移性横紋筋腫、線維腫、脂肪腫及び奇形腫;肺の気管支原性癌、扁平上皮癌、未分化小細胞癌、非小細胞癌、未分化大細胞癌、腺癌、肺胞(細気管支)癌、気管支腺腫、肉腫、リンパ腫、軟骨性過誤腫、中皮腫;消化管:食道の扁平上皮癌、腺癌、平滑筋肉腫、リンパ腫、胃の癌、リンパ腫、平滑筋肉腫、頭頸部、胃、膵臓の管状腺癌、インスリノーマ、グルカゴノーマ、ガストリノーマ、カルチノイド腫瘍、ビポーマ、小腸の腺癌、リンパ腫、カルチノイド腫瘍、カポジ肉腫、平滑筋腫、血管腫、脂肪腫、神経線維腫、線維腫、大腸の腺癌、管状腺腫、絨毛腺腫、過誤腫、平滑筋腫、結腸直腸癌;尿生殖路:腎臓の腺癌、ウィルムス腫瘍(腎芽腫)、リンパ腫、白血病、膀胱及び尿道の扁平上皮癌、移行上皮癌、腺癌、尿路上皮癌、前立腺の腺癌、肉腫、精巣の精上皮腫、奇形腫、胎生期癌、奇形癌、絨毛癌、肉腫、間質細胞癌、線維腫、線維腺腫、腺腫様腫瘍、脂肪腫;肝臓の肝癌、肝細胞癌、胆管癌、肝芽腫、血管肉腫、肝細胞腺腫、血管腫;骨:骨原性肉腫(骨肉腫)、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性リンパ腫(細網肉腫)、多発性骨髄腫、悪性巨細胞腫、脊索腫、骨軟骨腫(骨軟骨性外骨症)、良性軟骨腫、軟骨芽細胞腫、軟骨粘液線維腫、類骨骨腫及び巨細胞腫;神経系:頭蓋骨の骨腫、血管腫、肉芽腫、黄色腫、変形性骨炎、髄膜の髄膜腫、髄膜肉腫、神経膠腫症、脳の星状細胞腫、髄芽腫、神経膠腫、上衣腫、胚細胞腫(松果体腫)、多形性膠芽腫、乏突起膠腫、シュワン細胞腫、網膜芽細胞腫、先天性腫瘍、脊髄神経線維腫、髄膜腫、神経膠腫、肉腫;女性生殖器:子宮の子宮内膜癌、子宮頸部の子宮頸癌、前腫瘍性子宮頸部異形成、卵巣の卵巣癌、漿液性嚢胞腺癌、粘液性嚢胞腺癌、分類不能癌、顆粒膜卵胞膜細胞腫、セルトリ-ライディッヒ細胞腫、未分化胚細胞腫、悪性奇形腫、外陰部の扁平上皮癌、上皮内癌、腺癌、線維肉腫、黒色腫、膣の明細胞癌、扁平上皮癌、ブドウ状肉腫(胎児性横紋筋肉腫)、ファローピウス管癌、乳癌;血液系:血液の骨髄性白血病(急性及び慢性)、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病、骨髄増殖性疾患、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群)、ホジキンリンパ腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(悪性リンパ腫);皮膚:悪性黒色腫、基底細胞癌、扁平上皮癌、カポジ肉腫、異形成母斑、脂肪腫、血管腫、皮膚線維腫、ケロイド、乾癬;並びに副腎:神経芽細胞腫からなる群から選択される、項目93による抗原結合分子の使用。
95. 癌が黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌からなる群から選択される、項目93による抗原結合分子の使用。
96. 被験体に項目1~73のいずれか一項の抗原結合分子又は項目74~81のいずれか一項による医薬組成物を投与することを含む、PD-L1媒介性疾患又は障害を治療又は予防する方法。
97. PD-L1媒介性疾患又は障害が癌である、項目96の方法。
98. 癌が心臓の肉腫、血管肉腫、線維肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫、粘液腫、転移性横紋筋腫、線維腫、脂肪腫及び奇形腫;肺の気管支原性癌、扁平上皮癌、未分化小細胞癌、非小細胞癌、未分化大細胞癌、腺癌、肺胞(細気管支)癌、気管支腺腫、肉腫、リンパ腫、軟骨性過誤腫、中皮腫;消化管:食道の扁平上皮癌、腺癌、平滑筋肉腫、リンパ腫、胃の癌、リンパ腫、平滑筋肉腫、頭頸部、胃、膵臓の管状腺癌、インスリノーマ、グルカゴノーマ、ガストリノーマ、カルチノイド腫瘍、ビポーマ、小腸の腺癌、リンパ腫、カルチノイド腫瘍、カポジ肉腫、平滑筋腫、血管腫、脂肪腫、神経線維腫、線維腫、大腸の腺癌、管状腺腫、絨毛腺腫、過誤腫、平滑筋腫、結腸直腸癌;尿生殖路:腎臓の腺癌、ウィルムス腫瘍(腎芽腫)、リンパ腫、白血病、膀胱及び尿道の扁平上皮癌、移行上皮癌、腺癌、尿路上皮癌、前立腺の腺癌、肉腫、精巣の精上皮腫、奇形腫、胎生期癌、奇形癌、絨毛癌、肉腫、間質細胞癌、線維腫、線維腺腫、腺腫様腫瘍、脂肪腫;肝臓の肝癌、肝細胞癌、胆管癌、肝芽腫、血管肉腫、肝細胞腺腫、血管腫;骨:骨原性肉腫(骨肉腫)、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性リンパ腫(細網肉腫)、多発性骨髄腫、悪性巨細胞腫、脊索腫、骨軟骨腫(骨軟骨性外骨症)、良性軟骨腫、軟骨芽細胞腫、軟骨粘液線維腫、類骨骨腫及び巨細胞腫;神経系:頭蓋骨の骨腫、血管腫、肉芽腫、黄色腫、変形性骨炎、髄膜の髄膜腫、髄膜肉腫、神経膠腫症、脳の星状細胞腫、髄芽腫、神経膠腫、上衣腫、胚細胞腫(松果体腫)、多形性膠芽腫、乏突起膠腫、シュワン細胞腫、網膜芽細胞腫、先天性腫瘍、脊髄神経線維腫、髄膜腫、神経膠腫、肉腫;女性生殖器:子宮の子宮内膜癌、子宮頸部の子宮頸癌、前腫瘍性子宮頸部異形成、卵巣の卵巣癌、漿液性嚢胞腺癌、粘液性嚢胞腺癌、分類不能癌、顆粒膜卵胞膜細胞腫、セルトリ-ライディッヒ細胞腫、未分化胚細胞腫、悪性奇形腫、外陰部の扁平上皮癌、上皮内癌、腺癌、線維肉腫、黒色腫、膣の明細胞癌、扁平上皮癌、ブドウ状肉腫(胎児性横紋筋肉腫)、ファローピウス管癌、乳癌;血液系:血液の骨髄性白血病(急性及び慢性)、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病、骨髄増殖性疾患、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群)、ホジキンリンパ腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(悪性リンパ腫);皮膚:悪性黒色腫、基底細胞癌、扁平上皮癌、カポジ肉腫、異形成母斑、脂肪腫、血管腫、皮膚線維腫、ケロイド、乾癬;並びに副腎:神経芽細胞腫である、項目97の治療方法。
99. 癌が黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌からなる群から選択される、項目97の治療方法。
100. ヒトPD-L1又はPD-L1発現細胞と項目1~73のいずれか一項による抗原結合分子とを接触させることを含む、PD-1及び/又はCD80へのヒトPD-L1の結合、又はPD-1及び/又はCD80へのPD-L1発現細胞の結合を阻害する方法。
101. in vitro方法である、項目100の方法。
102. in vivo方法である、項目100の方法。
103. 項目1~73のいずれか一項の抗原結合分子をコードする核酸。
104. 項目103の核酸を含むプラスミド。
105. 項目103の核酸を含むベクター。
106. 項目104又は項目105によるプラスミド又はベクターを含む宿主細胞。
107. 細胞に項目104又は105によるプラスミド又はベクターをトランスフェクトすることを含む、抗PD-L1抗原結合分子を発現する細胞を作製する方法。
108. 項目106による宿主細胞を細胞培養培地においてプラスミド又はベクターのコード化核酸配列を細胞内で発現させる条件下で培養することを含む、抗PD-L1抗原結合分子を作製する方法。
109. 抗PD-L1抗原結合分子を細胞培養上清から得ることを更に含む、項目108の方法。
110. 得られた抗PD-L1抗原結合分子を1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤とともに医薬組成物に配合することを更に含む、項目109の方法。

Claims (17)

  1. 抗PD-L1抗原結合分子であって、以下:
    (a)重鎖可変(VH)領域であって、以下:
    (i)配列番号6のアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、
    (ii)配列番号7のアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域2(VHCDR2)、
    及び、
    (iii)配列番号8のアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域3(VHCDR3)、
    を含む、VH領域、
    並びに
    (b)軽鎖可変(VL)領域であって、以下:
    (i)配列番号16のアミノ酸配列を含む軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、
    (ii)配列番号3のアミノ酸配列を含む軽鎖相補性決定領域2(VLCDR2)、
    及び、
    (iii)配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖相補性決定領域3(VLCDR3)、
    を含む、VL領域、
    を含み、pH7.4よりもpH6.0でPD-L1に対して高い親和性を有する、抗PD-L1抗原結合分子。
  2. 前記VH領域が、配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、
    前記VL領域が、配列番号15のアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、
    請求項1に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  3. 前記VH領域が、配列番号5のアミノ酸配列に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含み、前記VL領域が、配列番号15のアミノ酸配列に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、
    請求項1又は2に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  4. 前記VH領域が、配列番号5のアミノ酸配列を含み、前記VL領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  5. 前記抗原結合分子が、抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体であり、そして、該抗体フラグメント又は誘導体がFab、F(ab’)2、Fv、scFv、dAb、Fd又はダイアボディである、請求項1~4のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子
  6. 前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が、一価である、請求項5に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  7. 前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が完全にヒトのものである、請求項5または6に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  8. 前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体がIgA、IgD、IgE、IgG、IgM若しくはIgY抗体、又はそれらの抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、請求項5~7のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  9. 前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が、IgG抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、請求項8に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  10. 前記IgG抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が、IgG1抗体又はその抗原結合フラグメントである、請求項9に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  11. 前記抗体又はその抗原結合フラグメント若しくは誘導体が、二重特異性抗体又はその二重特異性抗原結合フラグメント若しくは誘導体である、請求項8~10のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  12. 7.4のpHよりもpH6.0でPD-L1に対して少なくとも5倍高い親和性を有する、請求項1~11のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  13. 少なくとも5のpH6.0:7.4結合比を有する、請求項1~12のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  14. PD-1へのPD-L1結合のIC50阻害値がpH6.0よりもpH7.4で高い、請求項1~13のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子。
  15. 請求項1~14のいずれか一項に記載の抗PD-L1抗原結合分子と薬学的に許容可能な賦形剤とを含む医薬組成物。
  16. 付加的な治療的活性剤を更に含むか、又は別の療法若しくは付加的な治療的活性剤と組み合わせて使用される、請求項15に記載の医薬組成物。
  17. 癌の治療又は予防のための、請求項15又は16に記載の医薬組成物であって、ここで、前記癌が黒色腫、転移性癌、非小細胞肺癌、頭頸部癌、ホジキンリンパ腫、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、肝細胞癌及び膀胱癌からなる群から選択される、医薬組成物。
JP2022502425A 2019-07-15 2020-07-15 抗pd-l1抗体 Active JP7653408B2 (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1910138.5 2019-07-15
GBGB1910138.5A GB201910138D0 (en) 2019-07-15 2019-07-15 Anti-pd-l1 antibodies
PCT/EP2020/070065 WO2021009267A1 (en) 2019-07-15 2020-07-15 Anti-pd-l1 antibodies

Publications (3)

Publication Number Publication Date
JP2022541192A JP2022541192A (ja) 2022-09-22
JP2022541192A5 JP2022541192A5 (ja) 2023-07-18
JP7653408B2 true JP7653408B2 (ja) 2025-03-28

Family

ID=67700332

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2022502425A Active JP7653408B2 (ja) 2019-07-15 2020-07-15 抗pd-l1抗体

Country Status (8)

Country Link
US (1) US20220356255A1 (ja)
EP (1) EP3999113A1 (ja)
JP (1) JP7653408B2 (ja)
KR (1) KR20220057526A (ja)
CN (1) CN114829400B (ja)
CA (1) CA3143957A1 (ja)
GB (1) GB201910138D0 (ja)
WO (1) WO2021009267A1 (ja)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR112023016706A2 (pt) * 2021-02-19 2023-10-31 Seoul Nat Univ R&Db Foundation Anticorpo ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, molécula de ácido nucleico, métodos para produzir um anticorpo ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo e para detectar agrupamento de diferenciação 47 ou determinar uma quantidade de agrupamento de diferenciação 47 em uma amostra, e, uso do anticorpo ou de um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo
CN116917322A (zh) * 2021-02-19 2023-10-20 沙裴隆有限公司 针对pd-l1及cd47的双特异性单域抗体及其用途

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2008544755A (ja) 2005-07-01 2008-12-11 メダレックス インコーポレーティッド プログラム死リガンド1(pd−l1)に対するヒトモノクローナル抗体
JP2013511959A (ja) 2009-11-24 2013-04-11 メディミューン リミテッド B7−h1に対する標的結合剤
JP2015500207A (ja) 2011-11-28 2015-01-05 メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテ 抗pd−l1抗体及びその使用
JP2015535691A (ja) 2012-10-04 2015-12-17 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,イ ヒトモノクローナル抗pd−l1抗体および使用方法
JP2017507650A (ja) 2014-01-23 2017-03-23 リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッドRegeneron Pharmaceuticals, Inc. Pd−l1に対するヒト抗体
JP2019503687A (ja) 2016-01-04 2019-02-14 ジアンスー ヒャマブ ファーマシューティカル カンパニー リミテッド 抗pd−l1抗体およびその使用
JP2019516394A (ja) 2016-03-23 2019-06-20 マブスペース バイオサイエンシズ (スーチョウ) カンパニー,リミテッド 新規抗pd−l1抗体

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2156149T3 (es) 1992-12-04 2001-06-16 Medical Res Council Proteinas de union multivalente y multiespecificas, su fabricacion y su uso.
AU2003281200A1 (en) * 2002-07-03 2004-01-23 Tasuku Honjo Immunopotentiating compositions
HK1203971A1 (en) 2012-05-15 2015-11-06 Bristol-Myers Squibb Company Cancer immunotherapy by disrupting pd-1/pd-l1 signaling
US9209965B2 (en) 2014-01-14 2015-12-08 Microsemi Semiconductor Ulc Network interface with clock recovery module on line card
CN105777906B (zh) * 2014-12-19 2019-04-23 苏州丁孚靶点生物技术有限公司 抗pd-l1全人抗体及其应用
CN108948193B (zh) * 2017-05-18 2022-12-09 上海健信生物医药科技有限公司 针对tim-3的抗体分子,抗原结合片段及其医药用途

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2008544755A (ja) 2005-07-01 2008-12-11 メダレックス インコーポレーティッド プログラム死リガンド1(pd−l1)に対するヒトモノクローナル抗体
JP2013511959A (ja) 2009-11-24 2013-04-11 メディミューン リミテッド B7−h1に対する標的結合剤
JP2015500207A (ja) 2011-11-28 2015-01-05 メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテ 抗pd−l1抗体及びその使用
JP2015535691A (ja) 2012-10-04 2015-12-17 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,イ ヒトモノクローナル抗pd−l1抗体および使用方法
JP2017507650A (ja) 2014-01-23 2017-03-23 リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッドRegeneron Pharmaceuticals, Inc. Pd−l1に対するヒト抗体
JP2019503687A (ja) 2016-01-04 2019-02-14 ジアンスー ヒャマブ ファーマシューティカル カンパニー リミテッド 抗pd−l1抗体およびその使用
JP2019516394A (ja) 2016-03-23 2019-06-20 マブスペース バイオサイエンシズ (スーチョウ) カンパニー,リミテッド 新規抗pd−l1抗体

Also Published As

Publication number Publication date
GB201910138D0 (en) 2019-08-28
CA3143957A1 (en) 2021-01-21
KR20220057526A (ko) 2022-05-09
EP3999113A1 (en) 2022-05-25
CN114829400A (zh) 2022-07-29
US20220356255A1 (en) 2022-11-10
WO2021009267A1 (en) 2021-01-21
CN114829400B (zh) 2024-05-17
JP2022541192A (ja) 2022-09-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2021405058A1 (en) Multispecific antibodies having specificity for il-4r and il-31
AU2016369307A1 (en) Multi-specific antibody molecules having specificity for TNF-alpha, IL-17A and IL-17F
JP2022084832A (ja) ヒト化抗ベイシジン抗体およびその使用
US20240309087A1 (en) Anti-cd112r antibody and use thereof
US20240294655A1 (en) Antigen binding molecules that bind light
WO2021063352A1 (zh) 一种抗pd-l1抗原结合蛋白及其应用
CA3189473A1 (en) Novel human antibodies binding to human cd3 epsilon
TW202202529A (zh) 一種雙特異性抗體及其用途
CN108948193B (zh) 针对tim-3的抗体分子,抗原结合片段及其医药用途
TW201922798A (zh) 靶向rankl的治療性抗體
CN117355540A (zh) 抗cd137抗体和使用方法
JP7653408B2 (ja) 抗pd-l1抗体
KR20210016056A (ko) 항-bcma 항체 및 그 용도
WO2025162161A1 (zh) 特异性结合pd-1的单克隆抗体及其医药用途
JP2025526279A (ja) 抗TNFα抗体および組成物
WO2022247826A1 (zh) 靶向pd-l1和cd73的特异性结合蛋白
TWI843182B (zh) 一種抗b7-h4抗體及其製備方法和應用
US20250154242A1 (en) Anti-tnf-alpha antibodies and compositions
WO2025163564A1 (en) Antigen binding molecules that bind bdca-2
JP2025539145A (ja) 抗cd137抗体及びその使用方法
WO2025228298A1 (zh) 靶向TROP2xPD-L1的双特异性抗体药物偶联物及其制备方法与应用
TW202430556A (zh) 治療癌症患者之pd-1拮抗劑、tigit拮抗劑及結合191p4d12蛋白之抗體藥物結合物之組合療法
JP2026503602A (ja) Nkg2a及びpd-l1に結合する薬剤、及びその使用
WO2022012639A1 (zh) Pd-1抗原结合蛋白及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20220307

RD01 Notification of change of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7426

Effective date: 20220307

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20230707

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20230707

RD03 Notification of appointment of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423

Effective date: 20240308

RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20240313

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20240621

A711 Notification of change in applicant

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711

Effective date: 20240624

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20240924

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20241025

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20250127

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20250310

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20250317

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 7653408

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150