JP7670286B2 - Information processing system, specific system and program - Google Patents
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Description
本発明は、情報処理システム、特定システムおよびプログラムに関する。 The present invention relates to an information processing system, a specific system, and a program.
特許文献1には、インフルエンザウイルスの核タンパク質(NP)をAIV抗体検出抗原として用いるインフルエンザ感染検査薬および検査方法が開示されている。 Patent Document 1 discloses an influenza infection test drug and test method that uses the influenza virus nucleoprotein (NP) as an antigen for detecting AIV antibodies.
予め定められた一の生体分子が生体から検出された場合に、この生体が特定の状態であると診断する技術が存在する。しかしながら、この場合、予め定められた一の生体分子とは異なる生体分子に基づいて生体の状態を特定することができず、複数の生体分子を用いて生体の状態を特定することができなかった。 There is a technology that diagnoses that a living organism is in a specific state when a predetermined biomolecule is detected from the organism. However, in this case, the state of the organism cannot be identified based on a biomolecule that is different from the predetermined biomolecule, and the state of the organism cannot be identified using multiple biomolecules.
本発明の目的は、複数の生体分子を用いて生体の状態を特定することにある。 The objective of the present invention is to identify the state of a living organism using multiple biomolecules.
本発明の情報処理システムは、特定生体の複数の生体分子の各々が第1の物理量および第2の物理量の分布として示された分布画像を、複数の時点の前記分布について取得する取得手段と、前記特定生体の状態の特定を行う特定手段と、を備え、前記第1の物理量と前記第2の物理量とは、生体分子の異なる物理量であり、前記分布画像は、前記特定生体の前記複数の生体分子の各々について、生体分子を示す画像として表示された分子画像から前記第1の物理量および前記第2の物理量が特定される画像であり、前記分子画像は、前記分布画像において、少なくとも前記第1の物理量に応じた領域に表示され、前記特定手段による前記特定は、前記特定生体の前記状態が、複数の時点の前記分布について取得された複数の前記分布画像から特定される前記第2の物理量の変化について定められた変化条件を満たす前記分布画像の領域に応じて異なる状態に特定されるように行われ、前記取得手段は、生体の生体分子の前記第2の物理量が示された分子情報を、当該生体の複数の生体分子について取得し、前記特定手段による前記特定は、前記分布画像から特定される前記特定生体の生体分子の前記第2の物理量と、前記分子情報から特定される前記生体の生体分子の前記第2の物理量との比較によって行われ、前記分布画像において前記比較に用いられる前記特定生体の生体分子は当該分布画像が前記取得手段に取得される前には定められず、前記分布画像に示された前記複数の生体分子が当該比較の候補であり、前記特定手段による前記特定は、前記特定生体の生体分子の前記第2の物理量の前記変化との関係について定められた関係条件を満たす生体分子の前記第2の物理量の変化が特定される前記分子情報をもとに行われ、前記関係は、前記変化条件を満たす前記分布画像の領域から特定される前記第1の物理量である前記特定生体の生体分子の前記第2の物理量の前記変化と、当該領域に対応する前記第1の物理量における、生体分子について前記分子情報から特定される前記第2の物理量の変化との関係である、情報処理システムである。 The information processing system of the present invention comprises an acquisition means for acquiring a distribution image in which each of a plurality of biomolecules of a specific organism is shown as a distribution of a first physical quantity and a second physical quantity, for the distribution at a plurality of time points, and an identification means for identifying a state of the specific organism, wherein the first physical quantity and the second physical quantity are different physical quantities of the biomolecule, the distribution image is an image in which the first physical quantity and the second physical quantity are identified for each of the plurality of biomolecules of the specific organism from a molecular image displayed as an image showing a biomolecule, the molecular image is displayed in an area in the distribution image corresponding to at least the first physical quantity, the identification by the identification means is performed such that the state of the specific organism is identified as a different state depending on an area of the distribution image that satisfies a change condition defined for a change in the second physical quantity identified from the plurality of distribution images acquired for the distribution at a plurality of time points, and the acquisition means acquires molecular information in which the second physical quantity of the biomolecules of the organism is shown, for the plurality of biomolecules of the organism. the identification by the identification means is performed by comparing the second physical quantity of the biomolecule of the specified organism identified from the distribution image with the second physical quantity of the biomolecule of the organism identified from the molecular information, the biomolecule of the specified organism used for the comparison in the distribution image is not determined before the distribution image is acquired by the acquisition means, and the multiple biomolecules shown in the distribution image are candidates for the comparison, the identification by the identification means is performed based on the molecular information in which a change in the second physical quantity of a biomolecule that satisfies a relationship condition determined for a relationship with the change in the second physical quantity of the biomolecule of the specified organism is identified, and the relationship is a relationship between the change in the second physical quantity of the biomolecule of the specified organism, which is the first physical quantity identified from a region of the distribution image that satisfies the change condition, and the change in the second physical quantity identified from the molecular information for the biomolecule in the first physical quantity corresponding to the region.
本発明によれば、複数の生体分子を用いて生体の状態を特定することができる。 According to the present invention, the state of a living organism can be identified using multiple biomolecules.
以下、添付図面を参照して、本発明の実施形態について詳細に説明する。
<第1の実施形態>
図1は、状態特定システム1の全体構成例を示した図である。
情報処理システムの一例としての状態特定システム1は、生体の状態を特定するシステムである。生体としては、例えば、動物、植物、および微生物などが挙げられる。動物としては、例えば、陸生動物や水生動物などが挙げられる。また、動物には、人間も含まれる。また、植物には、農作物も含まれる。
Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in detail with reference to the accompanying drawings.
First Embodiment
FIG. 1 is a diagram showing an example of the overall configuration of a condition specifying system 1.
A condition specifying system 1, which is an example of an information processing system, is a system that specifies the condition of a living organism. Examples of living organisms include animals, plants, and microorganisms. Examples of animals include terrestrial animals and aquatic animals. Animals also include humans. Plants also include agricultural crops.
生体の状態としては、例えば、生体の健康の状態、生体の美容に関する状態、生体が動物である場合における生体の肉体の状態、生体が動物である場合における生体の脳の状態、生体が食物である場合における生体の品質の状態、生体が植物や微生物である場合における生体の生育の状態などが挙げられる。食物である生体としては、例えば、農作物や動物などが挙げられる。生体の健康の状態としては、例えば、生体における怪我や病気に関する状態、生体における疲労に関する状態などが挙げられる。また、生体の肉体の状態としては、例えば、生体の身長に関する状態、生体の体重に関する状態、生体の体脂肪率に関する状態、生体の筋肉量に関する状態、生体の身体に関する状態等が挙げられる。また、生体における疲労に関する状態は、生体の肉体の状態として捉えてもよい。また、生体の脳の状態としては、例えば、生体の記憶力に関する状態、生体の思考力に関する状態などが挙げられる。また、生体の品質の状態としては、例えば、生体の味に関する状態などが挙げられる。また、生体の生育の状態としては、例えば、生体における各部分または全体の大きさに関する状態、生体の色に関する状態、生体の臭いに関する状態、生体の枯れに関する状態、生体が有する細菌やウィルスに関する状態などが挙げられる。 Examples of the state of a living organism include the health state of the living organism, the beauty state of the living organism, the physical state of the living organism when the living organism is an animal, the brain state of the living organism when the living organism is an animal, the quality state of the living organism when the living organism is food, and the growth state of the living organism when the living organism is a plant or microorganism. Examples of living organisms that are food include agricultural crops and animals. Examples of the health state of a living organism include the injury or illness state of the living organism, and the fatigue state of the living organism. Examples of the physical state of a living organism include the height state of the living organism, the weight state of the living organism, the body fat rate state of the living organism, the muscle mass state of the living organism, and the body state of the living organism. The fatigue state of a living organism may also be considered as the physical state of the living organism. Examples of the brain state of a living organism include the memory state of the living organism, the thinking state of the living organism, and the like. Examples of the quality state of a living organism include the taste state of a living organism. In addition, the state of growth of a living organism may include, for example, the state of the size of each part or the whole organism, the state of the color of the organism, the state of the odor of the organism, the state of withering of the organism, and the state of bacteria and viruses that the organism possesses.
状態特定システム1は、サーバ装置10と、生体分子解析装置20と、端末30とを備える。サーバ装置10と、生体分子解析装置20および端末30とは、ネットワークを介して接続されている。 The condition identification system 1 includes a server device 10, a biomolecule analysis device 20, and a terminal 30. The server device 10, the biomolecule analysis device 20, and the terminal 30 are connected via a network.
サーバ装置10は、一の生体の生体分子と、この生体分子とは異なる他の生体分子とを比較し、比較の結果に基づいて、一の生体の状態を特定する。サーバ装置10が状態を特定する対象の生体を、以下では、対象生体と称することがある。また、サーバ装置10が対象生体と比較する対象の生体を、以下では、比較生体と称することがある。
サーバ装置10は、生体分子の物理量が示された情報を取得する。生体分子としては、例えば、タンパク質、アミノ酸、ペプチドなどが挙げられる。また、生体分子の物理量としては、生体分子の物質量、生体分子の分子量、生体分子の等電点、生体分子の電荷量などが挙げられる。等電点とは、電離後の生体分子の電荷の平均が0になるpHである。また、生体分子の物理量が示された情報には、例えば、生体分子の物理量の分布が示された情報も含まれる。なお、生体分子の物理量が示された情報を、以下では、分子情報と称することがある。また、対象生体の生体分子の物理量が示された情報を、以下では、対象分子情報と称することがある。また、比較生体の生体分子の物理量が示された情報を、以下では、比較分子情報と称することがある。
The server device 10 compares a biomolecule of one organism with another biomolecule different from the biomolecule, and identifies the state of the one organism based on the result of the comparison. The organism whose state is identified by the server device 10 may be referred to as a target organism below. Also, the organism whose state is compared with the target organism by the server device 10 may be referred to as a comparison organism below.
The server device 10 acquires information indicating the physical quantity of a biomolecule. Examples of biomolecules include proteins, amino acids, and peptides. Examples of the physical quantity of a biomolecule include the substance amount of the biomolecule, the molecular weight of the biomolecule, the isoelectric point of the biomolecule, and the charge amount of the biomolecule. The isoelectric point is the pH at which the average charge of the biomolecule after ionization is zero. The information indicating the physical quantity of the biomolecule also includes, for example, information indicating the distribution of the physical quantity of the biomolecule. Hereinafter, the information indicating the physical quantity of the biomolecule may be referred to as molecular information. Hereinafter, the information indicating the physical quantity of the biomolecule of the target organism may be referred to as target molecular information. Hereinafter, the information indicating the physical quantity of the biomolecule of the comparison organism may be referred to as comparison molecular information.
タンパク質としては、例えば、ヘモグロビン、アルブミン、トランスフェリン、ハプトグロビン、グロブリン、リポタンパク質、ペプチドホルモン、サイトカイン、プレアルブミン、ユビキチン、ラクトアルブミン、グルタチオンペルオキシダーゼ、スーパーオキシドディスムターゼ、トロンビン、プロトロンビン、アクチン、アシルホスファターゼ、アドレノドキシン、アビジン、アルドラーゼ、ウテログロビン、エラスターゼ、オブアルブミン、パルプアルブミン、プラストシアニン、レラクシン、ミオグロビン、レグヘモグロビン等が挙げられる。タンパク質は、血液や唾液などの体液に含まれるタンパク質であってもよい。また、タンパク質は、血清に含まれるタンパク質であってもよい。また、タンパク質は、生体の一部に含まれるタンパク質であってもよい。すなわち、タンパク質は、生体の成分に含まれるものであればよい。また、タンパク質は、上述した何れの例とも異なるタンパク質であってもよい。
アミノ酸としては、例えば、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、リジン、フェニルアラニン、トリプトファン、スレオニン、ヒスチジン等が挙げられる。アミノ酸は、血液や唾液などの体液に含まれるアミノ酸であってもよい。また、アミノ酸は、血清に含まれるアミノ酸であってもよい。また、アミノ酸は、生体の一部に含まれるアミノ酸であってもよい。すなわち、アミノ酸は、生体の成分に含まれるものであればよい。また、アミノ酸は、上述した何れの例とも異なるアミノ酸であってもよい。
Examples of the protein include hemoglobin, albumin, transferrin, haptoglobin, globulin, lipoprotein, peptide hormone, cytokine, prealbumin, ubiquitin, lactalbumin, glutathione peroxidase, superoxide dismutase, thrombin, prothrombin, actin, acylphosphatase, adrenodoxin, avidin, aldolase, uteroglobin, elastase, ovalbumin, parvalbumin, plastocyanin, relaxin, myoglobin, and leghemoglobin. The protein may be a protein contained in a body fluid such as blood or saliva. The protein may also be a protein contained in serum. The protein may also be a protein contained in a part of a living body. That is, the protein may be any protein contained in a component of a living body. The protein may also be a protein different from any of the above examples.
Examples of amino acids include valine, isoleucine, leucine, methionine, lysine, phenylalanine, tryptophan, threonine, and histidine. The amino acid may be an amino acid contained in a body fluid such as blood or saliva. The amino acid may be an amino acid contained in serum. The amino acid may be an amino acid contained in a part of a living body. That is, the amino acid may be any amino acid contained in a component of a living body. The amino acid may be an amino acid different from any of the above examples.
サーバ装置10は、複数の比較分子情報を取得する。この複数の比較分子情報は、一の比較生体についてそれぞれ異なる時点の生体分子が示された分子情報である。また、サーバ装置10は、この複数の時点を含む期間における比較生体の状態を、取得した複数の比較分子情報に関連付ける。サーバ装置10は、上述した、複数の比較分子情報の取得、および比較生体の状態の複数の比較分子情報への関連付けを、比較生体ごとに行う。これにより、サーバ装置10には、生体の状態が関連付けられた複数の比較分子情報が、比較生体ごとに記憶される。
また、サーバ装置10は、複数の対象分子情報を取得する。この複数の対象分子情報は、一の対象生体についてそれぞれ異なる時点の生体分子が示された分子情報である。
The server device 10 acquires a plurality of pieces of comparative molecular information. The plurality of pieces of comparative molecular information are molecular information in which biomolecules at different time points are shown for one comparison organism. The server device 10 also associates the state of the comparison organism in a period including the plurality of time points with the acquired plurality of pieces of comparative molecular information. The server device 10 acquires the plurality of pieces of comparative molecular information and associates the state of the comparison organism with the plurality of pieces of comparative molecular information for each comparison organism, as described above. As a result, the server device 10 stores a plurality of pieces of comparative molecular information associated with the state of the organism for each comparison organism.
The server device 10 also acquires a plurality of pieces of target molecule information, each of which indicates a biomolecule at a different time point for a single target organism.
サーバ装置10は、複数の対象分子情報から、時間の経過に伴う生体分子の変化を検出する。また、サーバ装置10は、検出した生体分子と、比較分子情報に示された生体分子とを比較することで、サーバ装置10に記憶されている比較分子情報のうちの、対象生体について検出した生体分子の変化に対応する生体分子の変化が示された比較分子情報を抽出する。そして、抽出した比較分子情報に関連付けられている比較生体の状態を、対象生体の状態として特定する。さらに、サーバ装置10は、特定した状態に関する情報を、端末30に出力する。 The server device 10 detects changes in biomolecules over time from multiple pieces of target molecular information. The server device 10 also compares the detected biomolecules with the biomolecules shown in the comparative molecular information to extract comparative molecular information from the comparative molecular information stored in the server device 10 that indicates changes in biomolecules that correspond to the changes in the biomolecules detected in the target organism. The server device 10 then identifies the state of the comparative organism associated with the extracted comparative molecular information as the state of the target organism. The server device 10 also outputs information related to the identified state to the terminal 30.
サーバ装置10は、例えば、コンピュータにより実現される。サーバ装置10は、単一のコンピュータにより構成しても良いし、複数のコンピュータによる分散処理により実現しても良い。また、サーバ装置10は、クラウドコンピューティングにより提供される仮想的なハードウェア上にて実現してもよい。 The server device 10 is realized, for example, by a computer. The server device 10 may be configured by a single computer, or may be realized by distributed processing using multiple computers. The server device 10 may also be realized on virtual hardware provided by cloud computing.
生体分子解析装置20は、生体から採取された成分に含まれる生体分子を解析する。より具体的には、生体分子解析装置20は、生体から採取された成分に含まれる生体分子を解析することで、生体分子の分布を検出する。生体分子解析装置20としては、例えば、2次元電気泳動装置が用いられる。この2次元電気泳動装置は、生体から採取された成分に含まれる生体分子の各々を分子量ごとに分離するとともに等電点ごとに分離することで、生体分子の各々の分子量の分布と等電点の分布とが示された2次元電気泳動像を作成する。2次元電気泳動像においては、例えば、x軸に生体分子の等電点の分布が示され、y軸に生体分子の分子量の分布が示された2次元直交座標系で、生体分子を示す画像を構成する画素が配置された位置が定義されている。すなわち、2次元電気泳動像においては、生体分子が存在するか否かを示す情報が画素の座標ごとに書き込まれている。この2次元電気泳動像は、分子情報の一例として捉えられる。また、2次元電気泳動像のように、生体分子の分布が示された情報を、以下では、分布情報と称することがある。また、対象生体の生体分子の分布が示された情報を、以下では、対象分布情報と称することがある。また、比較生体の生体分子の分布が示された情報を、以下では、比較分布情報と称することがある。
また、2次元電気泳動像には、生体分子の物質量の分布を示す情報が含まれる。すなわち、生体分子の分布には、生体分子の分子量の分布、生体分子の等電点の分布、生体分子の存在の分布、生体分子の物質量の分布が含まれる。2次元電気泳動像において生体分子の物質量を示す情報は、例えば、生体分子を示す画像の濃淡によって表示されてもよい。一例を挙げると、2次元電気泳動像において生体分子を示す画像の濃度が高いほど、生体分子の物質量が多いことを示してもよい。
The biomolecule analyzer 20 analyzes biomolecules contained in the components collected from a living organism. More specifically, the biomolecule analyzer 20 detects the distribution of biomolecules by analyzing the biomolecules contained in the components collected from a living organism. For example, a two-dimensional electrophoresis device is used as the biomolecule analyzer 20. This two-dimensional electrophoresis device separates each of the biomolecules contained in the components collected from a living organism by molecular weight and by isoelectric point, thereby creating a two-dimensional electrophoretic image showing the molecular weight distribution and isoelectric point distribution of each biomolecule. In the two-dimensional electrophoretic image, for example, the position where the pixels constituting the image showing the biomolecule are arranged is defined in a two-dimensional orthogonal coordinate system in which the distribution of the isoelectric points of the biomolecules is shown on the x-axis and the distribution of the molecular weights of the biomolecules is shown on the y-axis. That is, in the two-dimensional electrophoretic image, information indicating whether or not a biomolecule is present is written for each pixel coordinate. This two-dimensional electrophoretic image can be regarded as an example of molecular information. In addition, information showing the distribution of biomolecules, such as a two-dimensional electrophoretic image, may be referred to as distribution information below.In addition, information showing the distribution of biomolecules in a target organism may be referred to as target distribution information below.In addition, information showing the distribution of biomolecules in a comparison organism may be referred to as comparison distribution information below.
The two-dimensional electrophoretic image also includes information indicating the distribution of the substance amount of the biomolecules. That is, the distribution of the biomolecules includes the distribution of the molecular weights of the biomolecules, the distribution of the isoelectric points of the biomolecules, the distribution of the presence of the biomolecules, and the distribution of the substance amount of the biomolecules. The information indicating the substance amount of the biomolecules in the two-dimensional electrophoretic image may be displayed, for example, by the shading of the image showing the biomolecules. For example, a higher density of the image showing the biomolecules in the two-dimensional electrophoretic image may indicate a larger substance amount of the biomolecules.
また、生体分子解析装置20として、例えば、バイオセンサが用いられてもよい。このバイオセンサは、生体における生体分子を識別する。また、バイオセンサは、識別した生体分子を分子量ごとに分離するとともに等電点ごとに分離し、生体分子の分子量の分布および等電点の分布が示された画像を作成する。そのため、バイオセンサを用いて作成される画像も、分布情報として捉えられる。さらに、バイオセンサに作成される画像に、生体分子の物質量の分布を示す情報が含まれてもよい。 In addition, for example, a biosensor may be used as the biomolecule analysis device 20. This biosensor identifies biomolecules in a living organism. The biosensor also separates the identified biomolecules by molecular weight and by isoelectric point, and creates an image showing the distribution of molecular weights and isoelectric points of the biomolecules. Therefore, the image created using the biosensor can also be regarded as distribution information. Furthermore, the image created by the biosensor may include information showing the distribution of the substance amount of the biomolecules.
本実施形態では、状態特定システム1のユーザが、生体分子解析装置20を用いて、一の期間における複数の時点で得られた比較生体の成分を解析して、この成分に含まれる各生体分子の分布が示された複数の時点ごとの比較分布情報をそれぞれ作成する。この複数の時点は、それぞれ、比較生体が何れの状態であったかが特定されている時点である。また、一の期間とは、複数の時点での比較生体の状態を包括する状態が特定されている期間である。比較生体についての複数の時点での個々の状態を、以下では、個々状態と称することがある。また、複数の時点での個々状態を包括する比較生体の状態を、以下では、包括状態と称することがある。包括状態としては、例えば、比較生体がインフルエンザである状態が挙げられる。また、個々状態としては、例えば、インフルエンザである比較生体において、インフルエンザウイルスに感染した状態や、発熱した状態等が挙げられる。
また、ユーザは、生体分子解析装置20を用いて、比較生体ごとに、生体分子を含む比較生体の成分が得られた時点がそれぞれ異なる複数の比較分布情報を作成する。これにより、個々状態であった複数の時点での生体分子がそれぞれ示された複数の比較分布情報が、比較生体ごとに作成される。
In this embodiment, a user of the condition identification system 1 uses the biomolecule analyzer 20 to analyze the components of a comparative organism obtained at multiple time points in one period, and creates comparative distribution information for each of the multiple time points showing the distribution of each biomolecule contained in the components. Each of the multiple time points is a time point at which the state of the comparative organism is specified. Also, one period is a period in which a state that includes the states of the comparative organism at multiple time points is specified. Hereinafter, each individual state of the comparative organism at multiple time points may be referred to as an individual state. Hereinafter, a state of the comparative organism that includes each individual state at multiple time points may be referred to as a comprehensive state. An example of the comprehensive state is a state in which the comparative organism has influenza. Also, an example of an individual state is a state in which the comparative organism has influenza, a state in which the comparative organism has a fever, etc.
Furthermore, the user creates, for each comparison organism, a plurality of pieces of comparative distribution information, each of which represents a different time point at which the components of the comparison organism, including the biomolecules, were obtained, using the biomolecule analyzer 20. In this way, a plurality of pieces of comparative distribution information, each of which shows the biomolecules in their individual states at a plurality of time points, are created for each comparison organism.
特に、本実施形態では、ユーザは、生体分子解析装置20を用いて、包括状態および個々状態が互いに同じである複数の比較生体について、個々状態であった時点ごとに得られた生体分子を解析して、比較分子情報を作成する。
また、ユーザは、生体分子解析装置20を用いて、複数の時点で得られた対象生体の成分を解析して、この成分に含まれる各生体分子の分布が示された複数の時点ごとの対象分布情報をそれぞれ作成する。この複数の時点は、状態特定システム1が対象生体の状態を特定する対象の時点である。
In particular, in this embodiment, the user uses the biomolecular analysis device 20 to analyze the biomolecules obtained at each point in time when multiple comparison organisms have the same inclusion state and individual state, and creates comparison molecular information.
In addition, the user analyzes the components of the target organism obtained at multiple time points using the biomolecule analyzer 20, and creates target distribution information for each of the multiple time points showing the distribution of each biomolecule contained in the components. These multiple time points are the time points at which the condition identification system 1 identifies the condition of the target organism.
生体分子解析装置20は、分布情報を作成すると、作成した分布情報を、分布情報から特定される生体分子が得られた日時を示す日時情報、および、分布情報が示す生体分子を有した生体を示す生体情報とともに、サーバ装置10へ送信する。なお、生体分子を「有した」生体には、対象の生体分子を有している生体のみならず、生体から対象の生体分子が採取されたことにより生体がこの対象の生体分子を有しなくなったものの採取されるまでこの対象の生体分子を有していた生体も含まれる。 When the biomolecule analysis device 20 creates the distribution information, it transmits the created distribution information to the server device 10 together with date and time information indicating the date and time when the biomolecule identified from the distribution information was obtained, and bioinformation indicating the organism having the biomolecule indicated by the distribution information. Note that an organism that "has" a biomolecule includes not only an organism that has the target biomolecule, but also an organism that had the target biomolecule until it was collected, even though the organism no longer has the target biomolecule due to the target biomolecule being collected from the organism.
なお、生体分子解析装置20は、生体から採取された成分に含まれる各生体分子を解析するものに限定されない。例えば、生体から生体分子を含む成分を採取することなく、生体分子解析装置20が生体における各生体分子を解析して分布情報を作成可能である場合には、このような生体分子解析装置20を用いてもよい。 The biomolecule analyzer 20 is not limited to analyzing each biomolecule contained in a component collected from a living organism. For example, if the biomolecule analyzer 20 is capable of analyzing each biomolecule in a living organism and creating distribution information without collecting a component containing the biomolecule from the living organism, such a biomolecule analyzer 20 may be used.
端末30は、情報を表示する表示部31を有する。端末30は、サーバ装置10から情報を取得すると、取得したこの情報を表示部31に表示する。
端末30は、例えば、コンピュータ、タブレット型情報端末、その他の情報処理装置により実現される。端末30は、例えば、スマートフォンであってもよい。すなわち、端末30は、何れの種類の端末であってもよい。
The terminal 30 has a display unit 31 for displaying information. When the terminal 30 acquires information from the server device 10, the terminal 30 displays the acquired information on the display unit 31.
The terminal 30 is realized by, for example, a computer, a tablet information terminal, or another information processing device. The terminal 30 may be, for example, a smartphone. That is, the terminal 30 may be any type of terminal.
サーバ装置10と生体分子解析装置20および端末30との接続に用いられるネットワークは、データの送受信が可能であれば、その種類は特に限定されず、例えばインターネット、LAN(Local Area Network)、WAN(Wide Area Network)等として良い。データの送受信に用いられる通信回線は、有線であっても無線であっても良い。また、複数のネットワークや通信回線を介して各装置を接続する構成としても良い。 The network used to connect the server device 10 to the biomolecule analysis device 20 and the terminal 30 is not particularly limited in type as long as data can be sent and received, and may be, for example, the Internet, a LAN (Local Area Network), a WAN (Wide Area Network), etc. The communication line used to send and receive data may be wired or wireless. In addition, the devices may be connected via multiple networks or communication lines.
<ハードウェア構成例>
図2は、サーバ装置10および端末30のハードウェア構成例を示した図である。
図2に示すように、サーバ装置10および端末30は、演算手段であるCPU(Central Processing Unit)10aと、主記憶手段であるメモリ10cとを備える。また、各装置は、外部デバイスとして、不揮発性記録デバイス10g、ネットワークインターフェイス10f、表示機構10d、音声機構10h、キーボードやマウス等の入力デバイス10i等を備える。
<Hardware configuration example>
FIG. 2 is a diagram showing an example of the hardware configuration of the server device 10 and the terminal 30. As shown in FIG.
2, the server device 10 and the terminal 30 each include a central processing unit (CPU) 10a, which is a computing means, and a memory 10c, which is a main storage means. Each device also includes, as external devices, a non-volatile storage device 10g, a network interface 10f, a display mechanism 10d, an audio mechanism 10h, and an input device 10i, such as a keyboard or a mouse.
メモリ10cおよび表示機構10dは、システムコントローラ10bを介してCPU10aに接続されている。また、ネットワークインターフェイス10f、不揮発性記録デバイス10g、音声機構10hおよび入力デバイス10iは、ブリッジコントローラ10eを介してシステムコントローラ10bと接続されている。各構成要素は、システムバスや入出力バスなどの各種のバスによって接続される。 The memory 10c and the display mechanism 10d are connected to the CPU 10a via the system controller 10b. The network interface 10f, the non-volatile recording device 10g, the audio mechanism 10h, and the input device 10i are connected to the system controller 10b via the bridge controller 10e. Each component is connected by various buses such as a system bus and an input/output bus.
不揮発性記録デバイス10gには、各機能を実現するためのプログラムが格納されている。そして、このプログラムがメモリ10cにロードされ、このプログラムに基づく処理がCPU10aにより実行されることで、各種の機能が実現される。不揮発性記録デバイス10gとしては、例えば、SSD(Solid State Drive)等の半導体メモリやHDD(Hard Disk Drive)等の磁気ディスク装置などが挙げられる。 The non-volatile recording device 10g stores programs for implementing each function. These programs are then loaded into the memory 10c, and the CPU 10a executes processing based on these programs to implement various functions. Examples of non-volatile recording devices 10g include semiconductor memories such as SSDs (Solid State Drives) and magnetic disk devices such as HDDs (Hard Disk Drives).
<サーバ装置の機能構成>
次に、サーバ装置10の機能構成について説明する。
図3は、サーバ装置10の機能構成例を示した図である。
サーバ装置10は、情報取得部101と、記憶部102と、領域識別部103と、区画部104と、物質量特定部105と、統計部106と、検出部107と、対象決定部108と、状態特定部109と、出力部110とを備える。
<Functional configuration of server device>
Next, the functional configuration of the server device 10 will be described.
FIG. 3 is a diagram showing an example of the functional configuration of the server device 10. As shown in FIG.
The server device 10 includes an information acquisition unit 101, a memory unit 102, an area identification unit 103, a partition unit 104, a substance amount identification unit 105, a statistics unit 106, a detection unit 107, a target determination unit 108, a state identification unit 109, and an output unit 110.
取得手段の一例としての情報取得部101は、生体分子解析装置20から分布情報を取得する。より具体的には、情報取得部101は、対象分布情報または比較分布情報からなる分布情報を、日時情報および生体情報とともに取得する。また、情報取得部101は、比較生体の状態を示す情報を取得する。比較生体の状態を示す情報を、以下では、状態情報と称することがある。また、比較生体の個々状態を示す情報を、以下では、個々状態情報と称することがある。また、比較生体の包括状態を示す情報を、以下では、包括状態情報と称することがある。
状態特定システム1のユーザは、比較分布情報に対応する個々状態情報を、比較分布情報ごとに端末30に入力する。比較分布情報に対応する個々状態情報とは、個々状態のうちの、比較分布情報に示された生体分子が得られた時点における状態を示す情報である。また、ユーザは、複数の比較分布情報に対応する包括状態情報を端末30に入力する。複数の比較分布情報に対応する包括状態情報とは、複数の比較分布情報に示された生体分子が得られた複数の時点を含む期間における包括状態を示す情報である。
The information acquisition unit 101, which is an example of an acquisition means, acquires distribution information from the biomolecule analysis device 20. More specifically, the information acquisition unit 101 acquires distribution information consisting of target distribution information or comparison distribution information, together with date and time information and bioinformation. The information acquisition unit 101 also acquires information indicating the state of the comparison organism. The information indicating the state of the comparison organism may be referred to as state information below. The information indicating the individual states of the comparison organism may be referred to as individual state information below. The information indicating the overall state of the comparison organism may be referred to as overall state information below.
A user of the condition identification system 1 inputs individual state information corresponding to the comparative distribution information to the terminal 30 for each piece of comparative distribution information. The individual state information corresponding to the comparative distribution information is information indicating a state of each individual state at the time when the biomolecule indicated in the comparative distribution information was obtained. In addition, the user inputs comprehensive state information corresponding to a plurality of pieces of comparative distribution information to the terminal 30. The comprehensive state information corresponding to a plurality of pieces of comparative distribution information is information indicating a comprehensive state in a period including a plurality of time points at which the biomolecule indicated in the plurality of pieces of comparative distribution information was obtained.
情報取得部101は、比較分布情報および状態情報を取得すると、取得した状態情報を、この状態情報に対応する比較分布情報に関連付けて記憶部102に記憶させる。
本実施形態では、上述の通り、包括状態および個々状態が互いに同じである複数の比較生体について、個々状態であった時点ごとの比較分子情報が作成される。そのため、それぞれ異なる比較生体に係る比較分布情報であっても、これらの比較分子情報には、同一の内容の個々状態を示す個々状態情報や、同一の内容の包括状態を示す包括状態情報が関連付けられる。なお、情報取得部101は、分子情報を取得する分子情報取得手段としても捉えられる。
When the information acquiring unit 101 acquires the comparative distribution information and the state information, the information acquiring unit 101 stores the acquired state information in the storage unit 102 in association with the comparative distribution information corresponding to this state information.
In this embodiment, as described above, for a plurality of comparison organisms whose comprehensive state and individual state are the same, comparative molecular information is created for each time point when the organisms were in their individual states. Therefore, even if the comparative distribution information is related to different comparison organisms, these comparative molecular information are associated with individual state information showing the same individual state and comprehensive state information showing the same comprehensive state. The information acquisition unit 101 can also be regarded as a molecular information acquisition means for acquiring molecular information.
記憶部102は、情報取得部101に取得された分布情報、日時情報、生体情報、状態情報等を記憶する。なお、記憶部102の記憶内容については、後に詳述する。 The storage unit 102 stores the distribution information, date and time information, biometric information, status information, etc. acquired by the information acquisition unit 101. The contents stored in the storage unit 102 will be described in detail later.
領域識別部103は、分布情報において生体分子が存在する領域を識別する。領域識別部103は、対象分布情報および比較分子情報の何れも、領域を識別する対象にする。
分布情報において生体分子が存在する領域の領域識別部103による識別の手法の一例を説明する。領域識別部103は、分布情報において生体分子が示された画像を検出するとともに、検出した画像が示された座標を特定することにより、生体分子が存在する領域を識別する。
分布情報において複数の生体分子が存在する場合、領域識別部103は、存在する生体分子ごとに、生体分子が存在する領域を識別する。また、領域識別部103は、分布情報ごとに、生体分子が存在する領域を識別する。領域識別部103は、対象の分布情報において生体分子が存在する領域を識別すると、識別した領域を示す領域情報を、対象の分布情報に関連付ける。
The region identification unit 103 identifies a region in the distribution information where a biomolecule exists. The region identification unit 103 uses both the target distribution information and the comparison molecule information as targets for region identification.
An example of a method for identifying a region where a biomolecule exists in the distribution information by the region identification unit 103 will be described below. The region identification unit 103 detects an image showing a biomolecule in the distribution information, and identifies the coordinates where the detected image is shown, thereby identifying the region where the biomolecule exists.
When multiple biomolecules are present in the distribution information, the region identification unit 103 identifies a region in which the biomolecule exists for each of the biomolecules present. Furthermore, the region identification unit 103 identifies a region in which the biomolecule exists for each of the distribution information. When the region identification unit 103 identifies a region in which the biomolecule exists in the distribution information of the target, it associates region information indicating the identified region with the distribution information of the target.
区画部104は、分布情報において生体分子が存在する領域を区画する。より具体的には、区画部104は、領域識別部103に作成された領域情報に基づいて、分子情報において生体分子が存在する領域を区画する。また、区画部104は、分布情報ごとに、生体分子が存在する領域を区画する。なお、区画部104は、分子情報において一の生体分子が存在する領域を、一の領域に区画してもよいし、複数の領域に分割して区画してもよい。また、区画部104は、分布情報において生体分子が存在しない領域を区画してもよい。なお、区画部104に区画された領域を、以下では、区画領域と称することがある。
区画部104は、対象分布情報および比較分子情報の何れも、領域を区画する対象にする。
The partitioning unit 104 partitions a region in which a biomolecule exists in the distribution information. More specifically, the partitioning unit 104 partitions a region in which a biomolecule exists in the molecular information based on the region information created by the region identification unit 103. The partitioning unit 104 also partitions a region in which a biomolecule exists for each distribution information. The partitioning unit 104 may partition a region in which a biomolecule exists in the molecular information into one region, or may divide the region into multiple regions. The partitioning unit 104 may also partition a region in which a biomolecule does not exist in the distribution information. The region partitioned by the partitioning unit 104 may be referred to as a partitioned region hereinafter.
The partitioning unit 104 uses both the target distribution information and the comparison molecule information as targets for partitioning the regions.
物質量特定部105は、分布情報に示された生体分子の物質量を特定する。より具体的には、物質量特定部105は、分布情報における区画領域に含まれる生体分子の物質量を、区画領域ごとに特定する。物質量特定部105は、分布情報における対象の区画領域に含まれる生体分子の物質量を特定すると、特定した物質量を示す物質量情報を、対象の区画領域に関連付ける。
物質量特定部105は、対象分布情報および比較分子情報の何れも、生体分子の物質量を特定する対象にする。
The substance amount specifying unit 105 specifies the amount of substance of the biomolecule shown in the distribution information. More specifically, the substance amount specifying unit 105 specifies the amount of substance of the biomolecule included in the partitioned area in the distribution information for each partitioned area. When the substance amount specifying unit 105 specifies the amount of substance of the biomolecule included in a target partitioned area in the distribution information, it associates substance amount information indicating the specified amount of substance with the target partitioned area.
The substance amount specifying unit 105 uses both the target distribution information and the comparison molecule information as targets for specifying the substance amount of a biomolecule.
統計部106は、同一の個々状態情報が関連付けられた比較分布情報の各々に示された生体分子の物質量の統計を算出する。
統計部106は、記憶部102に記憶されている比較分布情報のうちの、同一の個々状態情報が関連付けられた比較分布情報を抽出する。そして、統計部106は、抽出した比較分布情報の各々において区画領域に含まれる生体分子の物質量の統計を、区画領域ごとに算出する。より具体的には、統計部106は、抽出した比較分布情報の各々において座標が同一である区画領域に含まれる生体分子の物質量の統計を、この区画領域に関連付けられた物質量情報に基づいて算出する。また、統計部106は、同一の個々状態情報が関連付けられた比較分布情報ごとに、生体分子の物質量の統計を算出する。これにより、個々状態ごとに、生体分子の物質量の統計が算出される。
The statistics section 106 calculates statistics of the substance amounts of the biomolecules indicated in each of the comparative distribution information associated with the same individual state information.
The statistics unit 106 extracts comparative distribution information associated with the same individual state information from the comparative distribution information stored in the storage unit 102. Then, the statistics unit 106 calculates statistics of the substance amounts of biomolecules included in the partitioned areas in each of the extracted comparative distribution information for each partitioned area. More specifically, the statistics unit 106 calculates statistics of the substance amounts of biomolecules included in partitioned areas having the same coordinates in each of the extracted comparative distribution information based on the substance amount information associated with this partitioned area. Furthermore, the statistics unit 106 calculates statistics of the substance amounts of biomolecules for each of the comparative distribution information associated with the same individual state information. In this way, statistics of the substance amounts of biomolecules are calculated for each individual state.
統計部106は、統計の対象である生体分子の物質量の平均値を算出することで、生体分子の物質量の統計を算出してもよい。また、統計部106は、統計の対象である生体分子の物質量の中央値を算出することで、生体分子の物質量の統計を算出してもよい。このように、統計部106による統計の手法としては、何れの手法が用いられてもよい。
また、統計部106は、一の包括状態に包括された個々状態ごとに生体分子の物質量の統計を算出すると、算出した各統計を、それぞれ対応する個々状態情報に関連付ける。これにより、統計部106に算出された統計を示す情報が個々状態ごとに作成される。個々状態ごとの統計部106に算出された統計を示す情報を、以下では、統計情報と称することがある。統計部106は、作成した統計情報を、この統計情報の対象である区画領域を識別する区画領域情報に関連付けて、記憶部102に記憶させる。
なお、統計情報は、統計された生体分子の物質量が示された情報である。そのため、統計情報も、広義には、分子情報として捉えられる。
The statistics unit 106 may calculate statistics of the amounts of substance of the biomolecules by calculating an average value of the amounts of substance of the biomolecules that are the subject of the statistics. The statistics unit 106 may also calculate statistics of the amounts of substance of the biomolecules by calculating a median value of the amounts of substance of the biomolecules that are the subject of the statistics. In this way, any method may be used as the statistical method used by the statistics unit 106.
Furthermore, when the statistics unit 106 calculates statistics of the substance amounts of biomolecules for each individual state included in one inclusive state, it associates each calculated statistic with the corresponding individual state information. As a result, information indicating the statistics calculated by the statistics unit 106 is created for each individual state. Hereinafter, the information indicating the statistics calculated by the statistics unit 106 for each individual state may be referred to as statistical information. The statistics unit 106 associates the created statistical information with partitioned area information that identifies the partitioned area that is the subject of this statistical information, and stores it in the storage unit 102.
The statistical information is information showing the statistical amounts of substances of biomolecules, and therefore, in a broad sense, the statistical information can also be regarded as molecular information.
検出部107は、対象生体の生体分子の変化を検出する。
検出部107は、二つの対象分布情報に係る物質量情報に基づいて、この二つの対象分布情報に示された生体分子の物質量を比較する。この二つの対象分布情報は、対象生体から異なる時点に得られた生体分子がそれぞれ示された分布情報である。なお、比較の対象である二つの対象分布情報のうちの、得られた時点が早い生体分子が示された対象分布情報を、以下では、前期分布情報と称することがある。また、比較の対象である二つの対象分布情報のうちの、得られた時点が遅い生体分子が示された対象分布情報を、以下では、後期分布情報と称することがある。また、比較の対象になる対象生体分子は、二つの対象分布情報において座標が同一である区画領域に含まれる生体分子である。
The detection unit 107 detects changes in biomolecules of a target organism.
The detection unit 107 compares the amounts of substance of the biomolecules shown in the two pieces of target distribution information based on the substance amount information related to the two pieces of target distribution information. The two pieces of target distribution information are distribution information showing biomolecules obtained from a target organism at different times. Of the two pieces of target distribution information to be compared, the target distribution information showing the biomolecule obtained at an earlier time point may be referred to as early distribution information below. Of the two pieces of target distribution information to be compared, the target distribution information showing the biomolecule obtained at a later time point may be referred to as late distribution information below. The target biomolecules to be compared are biomolecules included in partitioned areas with the same coordinates in the two pieces of target distribution information.
検出部107は、比較の対象である生体分子が変化条件を満たすか否かを判定する。変化条件は、対象生体の状態の変化に伴う生体分子の変化を検出するために定められた条件である。本実施形態では、比較の対象である二つの生体分子の物質量の差が予め定められた値以上であることが、変化条件として定められている。検出部107は、変化条件を満たす二つの生体分子を、物質量が変化した生体分子として検出する。なお、変化条件を満たすものとして検出部107に検出された二つの生体分子を、以下では、検出分子と称することがある。また、検出部107に検出された二つの生体分子の物質量の差を、以下では、検出値と称することがある。
なお、複数の区画領域において生体分子が変化条件を満たす場合、検出部107は、この複数の区画領域における生体分子を何れも検出する。
The detection unit 107 judges whether the biomolecules to be compared satisfy the change condition. The change condition is a condition determined for detecting a change in the biomolecules accompanying a change in the state of the target organism. In this embodiment, the change condition is determined to be that the difference in the amount of substance between the two biomolecules to be compared is equal to or greater than a predetermined value. The detection unit 107 detects the two biomolecules that satisfy the change condition as biomolecules whose amount of substance has changed. Note that, hereinafter, the two biomolecules detected by the detection unit 107 as satisfying the change condition may be referred to as detected molecules. Also, hereinafter, the difference in the amount of substance between the two biomolecules detected by the detection unit 107 may be referred to as a detection value.
When the biomolecules satisfy the change condition in a plurality of partitioned regions, the detection unit 107 detects all of the biomolecules in the plurality of partitioned regions.
対象決定部108は、記憶部102に記憶されている統計情報のうちの、検出分子と比較する対象の統計情報を決定する。
対象決定部108は、検出分子が示された区画領域と座標が同一である区画領域を対象とする統計情報を、検出分子と比較する対象の統計情報に決定する。対象決定部108は、統計情報に関連付けられた区画領域情報を参照し、検出分子が示された区画領域と座標が同一である区画領域を対象とする統計情報を抽出する。また、複数の区画領域において検出分子が検出されている場合、対象決定部108は、検出分子ごとに、比較の対象にする統計情報を決定する。なお、検出分子との比較の対象として対象決定部108に決定された統計情報を、以下では、比較統計情報と称することがある。
The target determining unit 108 determines target statistical information to be compared with the detection molecule from the statistical information stored in the storage unit 102 .
The target determination unit 108 determines the statistical information for the partitioned area having the same coordinates as the partitioned area in which the detection molecule is shown as the statistical information to be compared with the detection molecule. The target determination unit 108 refers to the partitioned area information associated with the statistical information, and extracts the statistical information for the partitioned area having the same coordinates as the partitioned area in which the detection molecule is shown. In addition, when the detection molecule is detected in multiple partitioned areas, the target determination unit 108 determines the statistical information to be compared for each detection molecule. Note that the statistical information determined by the target determination unit 108 as the target for comparison with the detection molecule may be referred to as comparison statistical information hereinafter.
特定手段の一例としての状態特定部109は、対象生体の状態を特定する。
状態特定部109は、比較統計情報に示された生体分子のうちの、同一類似条件を満たす生体分子を抽出する。同一類似条件は、検出分子についての検出値が示す生体分子の物質量の変化と同一または類似する生体分子の変化を特定するために定められた条件である。本実施形態では、比較統計情報に示された生体分子の物質量の変化と、検出値が示す生体分子の物質量の変化と、が同一または類似であることが、同一類似条件として定められている。また、同一類似条件の一例としては、比較統計情報に示された生体分子の物質量の変化と検出値との差が予め定められた値以下であることが挙げられる。状態特定部109は、同一類似条件を満たす比較統計情報に関連付けられた包括状態を、対象生体の状態として特定する。同一類似条件を満たす比較統計情報とは、同一類似条件を満たす生体分子が示された比較統計情報である。
The condition specifying unit 109, which is an example of a specifying means, specifies the condition of the target living body.
The state identification unit 109 extracts biomolecules that satisfy the same similarity condition from among the biomolecules shown in the comparison statistical information. The same similarity condition is a condition determined to identify a change in a biomolecule that is the same as or similar to a change in the substance amount of the biomolecule indicated by the detection value of the detection molecule. In this embodiment, the same similarity condition is determined to be that the change in the substance amount of the biomolecule indicated in the comparison statistical information and the change in the substance amount of the biomolecule indicated by the detection value are the same as or similar to each other. In addition, an example of the same similarity condition is that the difference between the change in the substance amount of the biomolecule indicated in the comparison statistical information and the detection value is equal to or less than a predetermined value. The state identification unit 109 identifies the comprehensive state associated with the comparison statistical information that satisfies the same similarity condition as the state of the target organism. The comparison statistical information that satisfies the same similarity condition is comparison statistical information in which a biomolecule that satisfies the same similarity condition is indicated.
出力手段の一例としての出力部110は、状態特定部109に特定された状態に関する情報を、端末30に出力する。 The output unit 110, which is an example of an output means, outputs information about the state identified by the state identification unit 109 to the terminal 30.
<記憶部の記憶内容>
次に、記憶部102に記憶されている情報の内容について説明する。
図4(A)および図4(B)は、生体情報管理テーブルの一例を示した図である。生体情報管理テーブルは、比較生体に関する情報を管理するためのテーブルである。この生体情報管理テーブルは、生体の種類ごとに設けられている。図4(A)には、動物の一種である「人間」の生体情報管理テーブルが示されており、図4(B)には、農作物の一種である「バナナ」の生体情報管理テーブルが示されている。
<Storage contents of storage unit>
Next, the contents of the information stored in the storage unit 102 will be described.
4(A) and 4(B) are diagrams showing examples of a biometric information management table. The biometric information management table is a table for managing information on a comparison organism. This biometric information management table is provided for each type of organism. Fig. 4(A) shows a biometric information management table for "humans," a type of animal, and Fig. 4(B) shows a biometric information management table for "bananas," a type of agricultural crop.
図4(A)に示す生体情報管理テーブルでは、「名前」に、比較生体の名前が示されている。
また、「日時」には、日時情報が示されている。
また、「分布」には、比較分布情報が示されている。より具体的には、「分布」には、分布情報から特定される生体分子の物理量の分布が、生体分子ごとに示されている。
In the biological information management table shown in FIG. 4A, the name of the comparison biological body is shown in the "name" field.
In addition, the "date and time" field indicates date and time information.
Moreover, comparative distribution information is shown in "distribution." More specifically, in "distribution," the distribution of the physical quantities of the biomolecules identified from the distribution information is shown for each biomolecule.
また、「個々状態」には、個々状態情報が示されている。本実施形態では、「個々状態」が、「健康状態」、「肉体状態」、「脳状態」および「美容状態」からなる四つの項目に区分けされている。
「健康状態」には、比較生体の健康の状態が示されている。また、「肉体状態」には、比較生体の肉体の状態が示されている。また、「脳状態」には、比較生体の脳の状態が示されている。また、「美容状態」には、比較生体の美容の状態が示されている。「個々状態」には、比較生体の生育の状態が示されてもよい。
また、「包括状態」には、包括状態情報が示されている。
In addition, individual condition information is shown in "individual condition." In this embodiment, the "individual condition" is divided into four items: "health condition,""physicalcondition,""braincondition," and "beauty condition."
"Health condition" indicates the health condition of the comparison organism. "Physical condition" indicates the physical condition of the comparison organism. "Brain condition" indicates the brain condition of the comparison organism. "Cosmetic condition" indicates the cosmetic condition of the comparison organism. "Individual condition" may indicate the growth condition of the comparison organism.
In addition, in the "comprehensive state" field, comprehensive state information is shown.
図4(A)に示す生体情報管理テーブルの「個々状態」および「包括状態」について、具体的に説明する。
例えば、生体「A」の比較分布情報には、「包括状態」である「インフルエンザ」が関連付けられるとともに、「感染」や「発熱」等の「健康状態」が関連付けられている。「インフルエンザ」は、比較生体がインフルエンザである状態である。また、「感染」は、比較生体がインフルエンザウイルスに感染した状態である。また、「発熱」は、比較生体が発熱した状態である。
また、例えば、生体「H」の比較分布情報には、「包括状態」である「抗がん剤効果あり」が関連付けられるとともに、「抗がん剤摂取」や「倦怠感」等の「健康状態」が関連付けられている。「抗がん剤効果あり」は、比較生体が抗がん剤を摂取したことによる効果がある状態である。また、「抗がん剤摂取」は、比較生体が抗がん剤を摂取した状態である。また、「倦怠感」は、比較生体が倦怠感を有した状態である。
また、例えば、生体「I」の比較分布情報には、「包括状態」である「抗がん剤効果なし」が関連付けられるとともに、「抗がん剤摂取」や「頭痛」等の「健康状態」が関連付けられている。「抗がん剤効果なし」は、比較生体が抗がん剤を摂取したことによる効果がない状態である。また、「頭痛」は、比較生体が頭痛を有した状態である。
The "individual state" and "comprehensive state" in the biological information management table shown in FIG. 4A will be specifically described.
For example, the comparative distribution information of organism "A" is associated with "influenza" which is an "overall condition", as well as with "health conditions" such as "infection" and "fever". "Influenza" is a state in which the comparative organism has influenza. "Infection" is a state in which the comparative organism is infected with the influenza virus. "Fever" is a state in which the comparative organism has a fever.
For example, the comparative distribution information of organism "H" is associated with the "comprehensive state" of "anticancer drug effective," as well as with "health states" such as "anticancer drug intake" and "fatigue.""Anticancer drug effective" is a state in which the comparative organism is experiencing the effects of taking an anticancer drug. "Anticancer drug intake" is a state in which the comparative organism has taken an anticancer drug. "Fatigue" is a state in which the comparative organism has experienced fatigue.
For example, the comparative distribution information of organism "I" is associated with a "general state" of "no effect of anticancer drug," as well as with "health states" such as "taking anticancer drug" and "headache.""No effect of anticancer drug" is a state in which the comparative organism experiences no effect from taking anticancer drug. Also, "headache" is a state in which the comparative organism has a headache.
また、例えば、生体「J」の比較分布情報には、「包括状態」である「トレーニング効果あり」が関連付けられるとともに、「トレーニング実施」や「筋肉痛」等の「肉体状態」が関連付けられている。「トレーニング効果あり」は、比較生体がトレーニングを実施したことによる効果がある状態である。また、「トレーニング実施」は、比較生体がトレーニングを実施した状態である。また、「筋肉痛」は、比較生体に筋肉痛が生じた状態である。
また、例えば、生体「J」の比較分布情報には、「包括状態」である「トレーニング効果なし」が関連付けられるとともに、「トレーニング実施」や「疲労感」等の「肉体状態」が関連付けられている。「トレーニング効果なし」は、比較生体がトレーニングを実施したことによる効果がない状態である。また、「疲労感」は、比較生体が疲労感を有する状態である。
また、例えば、生体「K」の比較分布情報には、「包括状態」である「記憶力向上」が関連付けられるとともに、「8時間睡眠」等の「肉体状態」や「3時間学習」等の「脳状態」が関連付けられている。「記憶力向上」は、比較生体の記憶力が向上した状態である。また、「8時間睡眠」は、比較生体が8時間睡眠した状態である。また、「3時間学習」は、比較生体が3時間学習した状態である。
また、例えば、生体「L」の比較分布情報には、「包括状態」である「記憶力低下」が関連付けられるとともに、「4時間睡眠」等の「肉体状態」や「3時間学習」等の「脳状態」が関連付けられている。「記憶力低下」は、比較生体の記憶力が低下した状態である。また、「4時間睡眠」は、比較生体が4時間睡眠した状態である。
Furthermore, for example, the comparative distribution information of organism "J" is associated with a "general state" of "training effective," as well as with "physical states" such as "training performed" and "muscle pain.""Trainingeffective" is a state in which the comparative organism has experienced the effects of training. "Training performed" is a state in which the comparative organism has performed training. "Muscle pain" is a state in which the comparative organism has experienced muscle pain.
For example, the comparative distribution information of organism "J" is associated with a "general state" of "no training effect," as well as with "physical states" such as "training performed" and "fatigue.""No training effect" is a state in which there is no effect from the training performed by the comparative organism. "Fatigue" is a state in which the comparative organism has a feeling of fatigue.
Furthermore, for example, the comparative distribution information of organism "K" is associated with "improved memory" which is a "comprehensive state", as well as with "physical states" such as "sleep 8 hours" and "brain states" such as "study 3 hours". "Improved memory" is a state in which the memory of the comparison organism has improved. Furthermore, "sleep 8 hours" is a state in which the comparison organism has slept for 8 hours. Furthermore, "study 3 hours" is a state in which the comparison organism has studied for 3 hours.
For example, the comparative distribution information of the organism "L" is associated with "deteriorating memory" which is a "comprehensive state", as well as with "physical states" such as "sleep for 4 hours" and "brain states" such as "study for 3 hours". "Deteriorating memory" is a state in which the memory of the comparative organism has deteriorated. "Sleep for 4 hours" is a state in which the comparative organism has slept for 4 hours.
また、例えば、生体「M」の比較分布情報には、「包括状態」である「肌年齢40歳」が関連付けられるとともに、「スキンクリームA使用」等の「美容状態」が関連付けられている。「肌年齢40歳」は、比較生体の肌年齢が40歳であると特定された状態である。また、「スキンクリームA使用」は、比較生体が「スキンクリームA」を使用した状態である。
また、例えば、生体「M」の比較分布情報には、「包括状態」である「肌年齢25歳」が関連付けられるとともに、「スキンクリームB使用」等の「美容状態」が関連付けられている。「肌年齢25歳」は、比較生体の肌年齢が25歳であると特定された状態である。また、「スキンクリームB使用」は、比較生体が「スキンクリームB」を使用した状態である。
For example, the comparative distribution information of the organism "M" is associated with a "comprehensive state" of "skin age 40 years old" and with "beauty states" such as "use of skin cream A.""Skin age 40 years old" is a state in which the skin age of the comparative organism is identified as 40 years old. "Use of skin cream A" is a state in which the comparative organism has used "skin cream A."
For example, the comparative distribution information of the organism "M" is associated with a "general state" of "skin age 25 years old" and with "beauty states" such as "use of skin cream B.""Skin age 25 years old" is a state in which the skin age of the comparative organism is identified as 25 years old. "Use of skin cream B" is a state in which the comparative organism has used "skin cream B."
図4(B)に示す生体情報管理テーブルでは、「識別名」に、比較生体を識別する名称が示されている。図示の例では、「識別名」に、「バナナ」の各々を識別する名称が示されている。
また、「日時」には、日時情報が示されている。
また「分布」には、図4(A)の例と同じように、比較分布情報が示されている。
また、「個々状態」には、個々状態情報が示されている。本実施形態では、「個々状態」として、「品質状態」が示されている。「品質状態」は、比較生体の品質の状態である。
また、「包括状態」には、包括状態情報が示されている。
In the biometric information management table shown in Fig. 4B, the name for identifying the comparison organism is shown in "identification name". In the illustrated example, the "identification name" shows the name for identifying each "banana".
In addition, the "date and time" field indicates date and time information.
In addition, in the "distribution" section, comparison distribution information is shown, similar to the example in FIG.
Further, individual condition information is shown in "individual condition". In this embodiment, "quality condition" is shown as "individual condition". "Quality condition" is the quality condition of the comparison living body.
In addition, in the "comprehensive state" field, comprehensive state information is shown.
図4(B)に示す生体情報管理テーブルの「個々状態」および「包括状態」について、具体的に説明する。
生体「X」の比較分布情報には、「包括状態」である「品質良」が関連付けられるとともに、「糖度20度」等の「品質状態」が関連付けられている。「品質良」は、比較生体の品質が良いと特定された状態である。また、「糖度20度」は、比較生体の糖度が20度として特定された状態である。
また、生体「Y」の比較分布情報には、「包括状態」である「品質悪」が関連付けられるとともに、「糖度10度」等の「品質状態」が関連付けられている。「品質悪」は、比較生体の品質が悪いと特定された状態である。また、「糖度10度」は、比較生体の糖度が10度として特定された状態である。
なお、図4(A)、(B)では記載が省略されているが、記憶部102には、比較生体の種類ごとに、生体情報管理テーブルが設けられている。
The "individual state" and "comprehensive state" in the biological information management table shown in FIG. 4B will be specifically described.
The comparative distribution information of organism "X" is associated with a "comprehensive state" of "good quality" as well as with "quality states" such as "sugar content 20 degrees.""Goodquality" is a state in which the quality of the comparative organism is specified as good. Furthermore, "sugar content 20 degrees" is a state in which the sugar content of the comparative organism is specified as 20 degrees.
The comparative distribution information of organism "Y" is associated with a "general state" of "poor quality" as well as with "quality states" such as "sugar content 10 degrees.""Poorquality" is a state in which the quality of the comparative organism is identified as poor. Furthermore, "sugar content 10 degrees" is a state in which the sugar content of the comparative organism is identified as 10 degrees.
Although not shown in FIGS. 4A and 4B, the storage unit 102 has a biological information management table for each type of comparison biological specimen.
<統計作成処理>
次に、統計作成処理の流れについて、統計情報が作成されるまでの一例を参照しながら説明する。統計作成処理は、サーバ装置10が統計情報を作成する処理である。本実施形態では、状態特定システム1のユーザが、一の包括状態を指定して統計作成処理の実行をサーバ装置10に指示すると、統計作成処理が開始される。なお、ユーザに指定された一の包括状態を、以下では、指定状態と称することがある。また、以下では、指定状態が「インフルエンザ」である場合について説明する。
図5は、統計作成処理の流れを示したフローチャートである。また、図6および図7は、統計情報が作成されるまでの一例を示した図である。
<Statistics creation process>
Next, the flow of the statistics creation process will be described with reference to an example up to the creation of statistical information. The statistics creation process is a process in which the server device 10 creates statistical information. In this embodiment, the statistics creation process is started when a user of the condition identification system 1 designates one comprehensive state and instructs the server device 10 to execute the statistics creation process. Note that, hereinafter, the one comprehensive state designated by the user may be referred to as a designated state. Also, hereinafter, a case in which the designated state is "influenza" will be described.
Fig. 5 is a flow chart showing the flow of the statistics creation process, and Figs. 6 and 7 are diagrams showing an example of the process up to the creation of statistical information.
まず、サーバ装置10は、指定状態であった比較生体のうちの、一の比較生体を指定する(ステップ(以下、「S」と称する)101)。サーバ装置10は、指定状態を示す包括状態情報が関連付けられた生体情報から、指定状態であった比較生体を特定する。なお、ステップ101においてサーバ装置10に指定された一の比較生体を、以下では、指定生体と称することがある。
次に、サーバ装置10は、指定状態を示す包括状態情報が関連付けられた比較分布情報のうちの一つを指定する(S102)。ステップ102においてサーバ装置10に指定される比較分布情報は、指定生体の生体分子が示された比較分布情報である。また、ステップ102においてサーバ装置10に指定された比較分布情報を、以下では、指定分布情報と称することがある。
First, the server device 10 designates one of the comparison biomimetics that were in the designated state (step (hereinafter referred to as "S") 101). The server device 10 identifies the comparison biomimetics that were in the designated state from the biomimetics information associated with the comprehensive state information that indicates the designated state. Hereinafter, the one comparison biomimetics designated by the server device 10 in step 101 may be referred to as the designated biomimetics.
Next, the server device 10 designates one of the comparative distribution information associated with the comprehensive state information indicating the designated state (S102). The comparative distribution information designated to the server device 10 in step 102 is comparative distribution information indicating the biomolecules of the designated organism. In addition, the comparative distribution information designated to the server device 10 in step 102 may be referred to as designated distribution information hereinafter.
本例では、上述の通り、指定状態が「インフルエンザ」である。この場合において、指定生体が生体「A」になると、ステップ102において、図6(A)に示すように、生体「A」についての比較分布情報であって「インフルエンザ」が関連付けられた比較分布情報が指定される。図6(A)に示す指定分布情報は、「人間」を対象とする生体情報管理テーブル(図4(A)参照)において、生体「A」および「インフルエンザ」が関連付けられた比較分布情報のうちの一つである。この指定分布情報は、生体分子の等電点を図中横軸とし、生体分子の分子量を図中縦軸とした場合における生体分子の物質量の分布を示す情報である。また、図6(A)に示す指定分布情報において、斜線およびこの斜線を囲む線により示された画像は、生体分子を意味する。図6(A)に示す分布情報には、互いに異なる七つの生体分子が示されている。
なお、図示の例では、分布情報において各生体分子が離間しているが、分布情報においては、複数の生体分子が隣接していてもよい。
In this example, as described above, the designated state is "influenza". In this case, when the designated organism becomes organism "A", comparative distribution information for organism "A" associated with "influenza" is designated in step 102, as shown in FIG. 6(A). The designated distribution information shown in FIG. 6(A) is one of the comparative distribution information associated with organism "A" and "influenza" in the organism information management table (see FIG. 4(A)) for "humans". This designated distribution information is information showing the distribution of the substance amount of the biomolecule when the isoelectric point of the biomolecule is the horizontal axis in the figure and the molecular weight of the biomolecule is the vertical axis in the figure. In addition, in the designated distribution information shown in FIG. 6(A), the image shown by the diagonal line and the line surrounding the diagonal line represents the biomolecule. Seven different biomolecules are shown in the distribution information shown in FIG. 6(A).
In the illustrated example, the biomolecules are spaced apart in the distribution information, but multiple biomolecules may be adjacent to each other in the distribution information.
次に、領域識別部103は、指定分布情報において生体分子が存在する領域を識別する(S103)。
区画部104は、指定分布情報において領域識別部103に識別された領域を区画する(S104)。
本例では、ステップ104において、区画部104は、指定分布情報において生体分子が示された領域を、図6(B)に示すように、領域1乃至領域20からなる二十の領域に区画する。図6(B)に示す例では、一の生体分子が、領域1乃至領域5からなる五つの領域に区画されている。また、一の生体分子が、領域6からなる一つの領域に区画されている。また、一の生体分子が、領域7からなる一つの領域に区画されている。また、一の生体分子が、領域8乃至領域13からなる六つの領域に区画されている。また、一の生体分子が、領域14および領域15からなる二つの領域に区画されている。また、一の生体分子が、領域16乃至領域19からなる四つの領域に区画されている。また、一の生体分子が、領域20からなる一つの領域に区画されている。
Next, the region identification unit 103 identifies a region in which a biomolecule exists in the designated distribution information (S103).
The partitioning unit 104 partitions the area identified by the area identification unit 103 in the designated distribution information (S104).
In this example, in step 104, the partitioning unit 104 partitions the region in which the biomolecule is indicated in the designated distribution information into twenty regions consisting of region 1 to region 20, as shown in FIG. 6(B). In the example shown in FIG. 6(B), one biomolecule is partitioned into five regions consisting of region 1 to region 5. Also, one biomolecule is partitioned into one region consisting of region 6. Also, one biomolecule is partitioned into one region consisting of region 7. Also, one biomolecule is partitioned into six regions consisting of region 8 to region 13. Also, one biomolecule is partitioned into two regions consisting of region 14 and region 15. Also, one biomolecule is partitioned into four regions consisting of region 16 to region 19. Also, one biomolecule is partitioned into one region consisting of region 20.
次に、物質量特定部105は、区画領域ごとに、区画領域に含まれる生体分子の物質量を特定する(S105)。
本例では、ステップ105において、物質量特定部105は、図6(C)に示すように、区画領域に含まれる生体分子の物質量を特定する。図6(C)は、生体分子が得られた時点を図中横軸とし、生体分子の物質量を図中縦軸とした場合において、区画領域である領域20に存在する生体分子を示した図である。図6(C)において、「●」の記号は、生体「A」の生体分子を意味する。また、図6(C)に示された生体分子には、個々状態の一つである「感染」が関連付けられている。この「感染」は、図6(C)にて特定された生体「A」の生体分子が示された比較分布情報に関連付けられた個々状態(図4(A)参照)の一つである。なお、図6(C)の例では、領域20における生体分子のみが示されているが、ステップ105においては、領域1乃至領域20の各々の領域、すなわち指定分布情報における全ての区画領域について、生体分子の物質量が特定される。
Next, the substance amount specifying unit 105 specifies the substance amount of the biomolecule contained in each divided region (S105).
In this example, in step 105, the substance amount specifying unit 105 specifies the substance amount of the biomolecule contained in the partitioned region as shown in FIG. 6C. FIG. 6C is a diagram showing the biomolecule present in the partitioned region, region 20, when the time when the biomolecule was obtained is the horizontal axis in the figure and the substance amount of the biomolecule is the vertical axis in the figure. In FIG. 6C, the symbol "●" means the biomolecule of organism "A". In addition, the biomolecule shown in FIG. 6C is associated with "infection", which is one of the individual states. This "infection" is one of the individual states (see FIG. 4A) associated with the comparison distribution information in which the biomolecule of organism "A" specified in FIG. 6C is shown. In the example of FIG. 6C, only the biomolecule in region 20 is shown, but in step 105, the substance amount of the biomolecule is specified for each of regions 1 to 20, i.e., all partitioned regions in the specified distribution information.
次に、サーバ装置10は、指定生体に係る比較分布情報のうちの、指定状態を示す包括状態情報が関連付けられた全ての比較分布情報について、生体分子の物質量が特定されたか否かを判定する(S106)。
指定状態を示す包括状態情報が関連付けられた比較分布情報の何れかについて生体分子の物質量が特定されていない場合(S106にてNO)、サーバ装置10は、物質量が特定されていない比較分布情報の一つを、新たに指定する(S102)。この後、ステップ103以降の処理が行われる。
Next, the server device 10 determines whether or not the substance amount of the biomolecule has been specified for all comparative distribution information associated with comprehensive state information indicating the designated state among the comparative distribution information related to the designated organism (S106).
If the substance amount of the biomolecule is not specified for any of the comparative distribution information associated with the comprehensive state information indicating the designated state (NO in S106), the server device 10 newly specifies one of the comparative distribution information for which the substance amount is not specified (S102). After this, the process from step 103 onwards is performed.
このように、指定生体に係る比較分布情報のうちの、指定状態を示す包括状態情報が関連付けられた全ての比較分布情報について生体分子の物質量が特定されるまで、ステップ102以降の処理が繰り返される。これにより、本例では、図6(D)に示すように、生体「A」について特定された「インフルエンザ」が関連付けられた全ての比較分布情報について、区画領域に存在する生体分子の物質量が特定される。図6(D)は、生体分子が得られた時点を図中横軸とし、生体分子の物質量を縦軸とした場合において、「インフルエンザ」と特定された期間に生体分子が得られた時点ごとの領域20に存在する生体分子を示した図である。図6(D)に示された生体分子には、それぞれ、個々状態が関連付けられている。この個々状態は、図6(D)にて特定された生体「A」の生体分子が示された比較分布情報に関連付けられた個々状態(図4(A)参照)である。また、この個々状態には、「1日」乃至「14日」の日数が示されている。この日数は、生体「A」がインフルエンザウイルスに感染してから経過した日数を意味する。
なお、図6(D)の例では、領域20における生体分子のみが示されているが、ステップ102乃至ステップ106が繰り返されることにより、全ての区画領域における生体分子の物質量が特定される。
In this way, the process from step 102 onwards is repeated until the substance amount of the biomolecule is specified for all comparative distribution information associated with the comprehensive state information indicating the specified state among the comparative distribution information related to the specified organism. As a result, in this example, as shown in FIG. 6(D), the substance amount of the biomolecule present in the partitioned area is specified for all comparative distribution information associated with "influenza" specified for the organism "A". FIG. 6(D) is a diagram showing the biomolecules present in the area 20 at each time point when the biomolecule was obtained during the period specified as "influenza", with the horizontal axis representing the time point when the biomolecule was obtained and the vertical axis representing the substance amount of the biomolecule. Each of the biomolecules shown in FIG. 6(D) is associated with an individual state. This individual state is an individual state (see FIG. 4(A)) associated with the comparative distribution information in which the biomolecule of the organism "A" specified in FIG. 6(D) is shown. In addition, the individual state shows the number of days from "1 day" to "14 days". This number of days means the number of days that have passed since the organism "A" was infected with the influenza virus.
In the example of FIG. 6D, only the biomolecules in region 20 are shown, but by repeating steps 102 to 106, the substance amounts of the biomolecules in all partitioned regions are identified.
指定生体に係る比較分布情報のうちの、指定状態を示す包括状態情報が関連付けられた比較分布情報の全てについて生体分子の物質量が特定されると(S106にてYES)、次のステップに進む。サーバ装置10は、指定状態であった全ての比較生体について、比較分布情報における生体分子の物質量が特定されたか否かを判定する(S107)。
指定状態であった比較生体の何れかについては比較分布情報における生体分子の物質量が特定されていない場合(S107にてNO)、サーバ装置10は、比較分布情報における生体分子の物質量が特定されていない一の比較生体を新たに指定する(S101)。この後、ステップ102以降の処理が行われる。
When the substance amounts of the biomolecules are identified for all of the comparative distribution information related to the designated organism that is associated with the comprehensive state information indicating the designated state (YES in S106), the server device 10 proceeds to the next step. For all of the comparison organisms that were in the designated state, the server device 10 determines whether the substance amounts of the biomolecules in the comparative distribution information are identified (S107).
If the substance amount of the biomolecule in the comparative distribution information is not specified for any of the comparison organisms that were in the designated state (NO in S107), the server device 10 newly specifies one comparison organism in which the substance amount of the biomolecule in the comparative distribution information is not specified (S101). After this, the process from step 102 onwards is performed.
このように、指定状態であった全ての比較生体について、比較分布情報における生体分子の物質量が特定されるまで、ステップ101以降の処理が繰り返される。これにより、本例では、図7(E)に示すように、指定状態であった全ての比較生体である生体「A」、生体「B」、生体「C」の、「インフルエンザ」が関連付けられた全ての比較分布情報について、区画領域に存在する生体分子の物質量が特定される。図7(E)は、生体「A」、生体「B」、生体「C」について、「インフルエンザ」と特定された期間に生体分子が得られた時点ごとの領域20に存在する生体分子を示した図である。図7(E)において、横軸は生体分子が得られた時点であり、縦軸は生体分子の物質量である。また、図7(E)において、「●」の記号は、生体「A」の生体分子を意味し、「▲」の記号は、生体「B」の生体分子を意味し、「■」の記号は、生体「C」の生体分子を意味する。また、生体「A」の生体分子の物質量、生体「B」の生体分子の物質量、および生体「C」の生体分子の物質量には、それぞれ、同一の個々状態情報が関連付けられている。この個々状態は、図7(E)にて特定された生体「A」、生体「B」、生体「C」の生体分子がそれぞれ示された比較分布情報に関連付けられた個々状態(図4(A)参照)である。また、図7(E)の例では、領域20における生体分子のみが示されているが、ステップ101乃至ステップ107が繰り返されることにより、全ての区画領域における生体分子の物質量が特定される。 In this way, the process from step 101 onwards is repeated until the amount of substance of the biomolecule in the comparative distribution information is specified for all the comparison organisms that were in the designated state. As a result, in this example, as shown in FIG. 7(E), the amount of substance of the biomolecule present in the partitioned area is specified for all the comparison distribution information associated with "influenza" for all the comparison organisms "A", "B", and "C" that were in the designated state. FIG. 7(E) is a diagram showing the biomolecules present in the area 20 at each time point when the biomolecule was obtained during the period specified as "influenza" for the organisms "A", "B", and "C". In FIG. 7(E), the horizontal axis is the time point when the biomolecule was obtained, and the vertical axis is the amount of substance of the biomolecule. In addition, in FIG. 7(E), the symbol "●" means the biomolecule of the organism "A", the symbol "▲" means the biomolecule of the organism "B", and the symbol "■" means the biomolecule of the organism "C". The amount of substance of the biomolecule of organism "A", the amount of substance of the biomolecule of organism "B", and the amount of substance of the biomolecule of organism "C" are each associated with the same individual state information. This individual state is the individual state (see FIG. 4(A)) associated with the comparative distribution information in which the biomolecules of organism "A", organism "B", and organism "C" identified in FIG. 7(E) are respectively shown. In the example of FIG. 7(E), only the biomolecules in region 20 are shown, but by repeating steps 101 to 107, the amounts of substance of the biomolecules in all partitioned regions are identified.
指定状態であった全ての比較生体について、比較分布情報における生体分子の物質量が特定されると(S107にてYES)、統計部106は、個々状態のうちの同一の状態が関連付けられた生体分子の物質量の統計を算出する。より具体的には、統計部106は、個々状態のうちの同一の状態が関連付けられた生体分子の物質量の統計を、個々状態ごとに算出することで、個々状態ごとの生体分子の物質量の統計を示す統計情報を作成する(S108)。また、統計部106は、区画領域ごとに統計情報を作成する。
本例では、統計部106が、個々状態のうちの同一の状態が関連付けられた生体「A」、生体「B」、および生体「C」の生体分子の物質量の統計を、個々状態ごとに算出することで、図7(F)に示す統計情報が作成される。図7(F)には、領域20における生体分子の物質量の統計が示されている。この統計情報には、個々状態ごとに、生体「A」、生体「B」、および生体「C」の各々の生体分子の物質量の統計が示されている。
When the substance amounts of the biomolecules in the comparative distribution information are specified for all comparison organisms that were in the designated state (YES in S107), the statistical unit 106 calculates statistics of the substance amounts of the biomolecules associated with the same state among the individual states. More specifically, the statistical unit 106 calculates statistics of the substance amounts of the biomolecules associated with the same state among the individual states for each individual state, thereby creating statistical information indicating the statistics of the substance amounts of the biomolecules for each individual state (S108). In addition, the statistical unit 106 creates statistical information for each partitioned region.
In this example, the statistical unit 106 calculates statistics of the amounts of substance of biomolecules of organism "A", organism "B", and organism "C" associated with the same state among the individual states, for each individual state, to create the statistical information shown in Fig. 7(F). Fig. 7(F) shows statistics of the amounts of substance of biomolecules in region 20. This statistical information shows statistics of the amounts of substance of biomolecules of organism "A", organism "B", and organism "C" for each individual state.
<状態特定処理>
次に、状態特定処理の流れについて、状態特定処理により特定された状態に関する情報が端末30に出力されるまでの一例を参照しながら説明する。状態特定処理は、サーバ装置10が対象生体の状態を特定する処理である。本実施形態では、状態特定システム1のユーザが、状態特定処理に用いられる対象分布情報を指定して状態特定処理の実行をサーバ装置10に指示すると、状態特定処理が開始される。なお、状態特定処理に用いられる対象分布情報としてユーザに指定された対象分布情報を、以下では、使用分布情報と称することがある。
<Status Identification Processing>
Next, the flow of the condition identification process will be described with reference to an example up to the point where information on the condition identified by the condition identification process is output to the terminal 30. The condition identification process is a process in which the server device 10 identifies the condition of a target living organism. In this embodiment, the condition identification process is started when a user of the condition identification system 1 specifies target distribution information to be used in the condition identification process and instructs the server device 10 to execute the condition identification process. Note that, hereinafter, the target distribution information specified by the user as the target distribution information to be used in the condition identification process may be referred to as usage distribution information.
図8は、状態特定処理の流れを示したフローチャートである。また、図9乃至図12は、状態特定処理において特定された状態に関する情報が端末30に出力されるまでの一例を示した図である。
なお、以下では、対象生体が生体「D」であり、且つ、図9(A)に示す二つの対象分布情報が使用分布情報である例について説明する。図9(A)には、使用分布情報として、生体「D」についての前期分布情報および後期分布情報が示されている。この前期分布情報および後期分布情報には、それぞれ、図6(A)に示した分布情報と同じように、互いに異なる七つの生体分子の分布が示されている。また、生体「D」は、例えば、人間である。
Fig. 8 is a flowchart showing the flow of the state specification process. Figs. 9 to 12 are diagrams showing an example of the process up to when information on the state specified in the state specification process is output to the terminal 30.
In the following, an example will be described in which the target organism is organism "D" and the two target distribution information shown in Fig. 9(A) is usage distribution information. In Fig. 9(A), early distribution information and late distribution information for organism "D" are shown as usage distribution information. The early distribution information and late distribution information each show the distribution of seven different biomolecules, similar to the distribution information shown in Fig. 6(A). Moreover, organism "D" is, for example, a human being.
まず、領域識別部103は、使用分布情報において生体分子が存在する領域を、使用分布情報ごとに識別する(S201)。
区画部104は、領域識別部103に識別された領域を、使用分布情報ごとに区画する(S202)。
本例では、ステップ202において、区画部104は、前期分布情報および後期分布情報において生体分子が示された領域を、図9(B)に示すように、領域1乃至領域20からなる二十の領域に区画する。すなわち、区画部104は、使用分布情報において生体分子が示された領域を、比較分布情報に対して行った区画(図6(B)参照)と同じように区画する。
First, the region identification unit 103 identifies a region in which a biomolecule exists in the usage distribution information for each piece of usage distribution information (S201).
The partitioning unit 104 partitions the area identified by the area identification unit 103 for each piece of usage distribution information (S202).
In this example, in step 202, the partitioning unit 104 partitions the regions in which biomolecules are indicated in the early distribution information and the later distribution information into twenty regions consisting of regions 1 to 20, as shown in Fig. 9(B) . That is, the partitioning unit 104 partitions the regions in which biomolecules are indicated in the usage distribution information in the same manner as the partitioning performed on the comparison distribution information (see Fig. 6(B) ).
次に、物質量特定部105は、各使用分布情報について、区画領域に含まれる生体分子の物質量を区画領域ごとに特定する(S203)。これにより、本例では、図9(C)に示すように、生体「D」について前期分布情報および後期分布情報に示された生体分子の物質量が、区画領域ごとに特定される。図9(C)は、生体分子が得られた時点を図中横軸とし、生体分子の物質量を図中縦軸とした場合において、区画領域に存在する生体分子を区画領域ごとに示した図である。図9(C)において、「●」の記号は、前期分布情報に示された生体分子を意味し、「▲」の記号は、後期分布情報に示された生体分子を意味する。 Next, the substance amount identification unit 105 identifies the substance amount of the biomolecule contained in each partition area for each used distribution information (S203). As a result, in this example, as shown in FIG. 9(C), the substance amount of the biomolecule shown in the early distribution information and the late distribution information for organism "D" is identified for each partition area. FIG. 9(C) is a diagram showing the biomolecules present in each partition area, with the time when the biomolecule was obtained being plotted on the horizontal axis and the substance amount of the biomolecule being plotted on the vertical axis. In FIG. 9(C), the symbol "●" refers to the biomolecule shown in the early distribution information, and the symbol "▲" refers to the biomolecule shown in the late distribution information.
次に、検出部107は、変化条件を満たす生体分子を検出する(S204)。より具体的には、検出部107は、区画領域ごとに、生体分子が変化条件を満たすか否かを判定し、変化条件を満たすと判定した生体分子を検出する。
本例では、図9(C)に示す、領域14、領域15、および領域20において、後期分布情報に示された生体分子の物質量が、前期分布情報に示された生体分子の物質量から変化している。より具体的には、領域14においては、後期分布情報に示された生体分子の物質量が、前期分布情報に示された生体分子の物質量よりも増加している。また、領域15および領域20においては、後期分布情報に示された生体分子の物質量が、前期分布情報に示された生体分子の物質量よりも減少している。そして、この領域14、領域15、および領域20にそれぞれ含まれる生体分子が、何れも、変化条件を満たすものとして検出部107に検出される。
Next, the detection unit 107 detects biomolecules that satisfy the change condition (S204). More specifically, the detection unit 107 determines whether or not the biomolecule satisfies the change condition for each partitioned region, and detects the biomolecule that is determined to satisfy the change condition.
In this example, in regions 14, 15, and 20 shown in FIG. 9C, the amount of substance of the biomolecule indicated in the later distribution information has changed from the amount of substance of the biomolecule indicated in the early distribution information. More specifically, in region 14, the amount of substance of the biomolecule indicated in the later distribution information has increased compared to the amount of substance of the biomolecule indicated in the early distribution information. Also, in regions 15 and 20, the amount of substance of the biomolecule indicated in the later distribution information has decreased compared to the amount of substance of the biomolecule indicated in the early distribution information. Then, the biomolecules contained in regions 14, 15, and 20 are all detected by detection unit 107 as satisfying the change condition.
なお、変化条件を満たす複数の生体分子、すなわち、領域14および領域15に含まれる生体分子と領域20に含まれる生体分子とは、異なる生体分子である。異なる生体分子の一例としては、ヘモグロビンとトランスフェリン等が挙げられる。また、異なる生体分子の他の一例としては、ヘモグロビンHbAとヘモグロビンHbA2等が挙げられる。すなわち、異なる生体分子は、生体分子を構成する分子が同一でなければよい。 The multiple biomolecules that satisfy the change condition, i.e., the biomolecules contained in regions 14 and 15 and the biomolecules contained in region 20, are different biomolecules. One example of different biomolecules is hemoglobin and transferrin. Another example of different biomolecules is hemoglobin HbA and hemoglobin HbA2. In other words, different biomolecules may be any biomolecules as long as the molecules that make up the biomolecules are not identical.
次に、対象決定部108は、検出分子と比較する対象である比較統計情報を決定する(S205)。対象決定部108は、記憶部102に記憶されている統計情報のうちの、検出分子が示された区画領域と座標が同一である区画領域を対象とする統計情報を、比較統計情報に決定する。
本例では、対象決定部108は、領域20を対象とする統計情報の各々を、生体「D」について領域20に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。この比較統計情報には、図10(D)に示すように、包括状態である「インフルエンザ」が関連付けられ領域20を対象とする統計情報も含まれる。また、図示を省略するが、対象決定部108は、領域15を対象とする統計情報の各々を、生体「D」について領域15に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。さらに、対象決定部108は、領域14を対象とする統計情報の各々を、生体「D」について領域14に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。
Next, the object determining unit 108 determines comparative statistical information to be compared with the detected molecule (S205). The object determining unit 108 determines, from the statistical information stored in the storage unit 102, statistical information that targets a partitioned area having the same coordinates as the partitioned area in which the detected molecule is indicated, as the comparative statistical information.
In this example, the object determining unit 108 determines each piece of statistical information targeting the region 20 as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region 20 for the organism "D". This comparative statistical information includes statistical information associated with the inclusive state "influenza" and targeting the region 20, as shown in FIG. 10(D). Furthermore, although not shown, the object determining unit 108 determines each piece of statistical information targeting the region 15 as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region 15 for the organism "D". Furthermore, the object determining unit 108 determines each piece of statistical information targeting the region 14 as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region 14 for the organism "D".
次に、状態特定部109は、比較統計情報に示された生体分子のうちの、同一類似条件を満たす生体分子を抽出する(S206)。より具体的には、状態特定部109は、検出分子と、比較統計情報に示された生体分子とを比較することで、比較統計情報に示された生体分子のうちの同一類似条件を満たす生体分子を抽出する。
本例では、状態特定部109は、図10(E)に示すように、二つの比較統計情報にそれぞれ示された生体分子が、何れも、生体「D」についての領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと判定する。この二つの比較統計情報のうちの一方は、包括状態である「インフルエンザ」が関連付けられ領域20を対象とする比較統計情報である。この比較統計情報の図中破線箇所Aには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されており、この箇所Aに示された生体分子が、生体「D」についての領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。なお、「インフルエンザ」が関連付けられ領域20を対象とするこの比較統計情報は、図7(F)に示した統計情報である。また、二つの比較統計情報のうちのもう一方は、包括状態である「COVID(Corona Virus Disease)-19」が関連付けられ領域20を対象とする比較統計情報である。この比較統計情報の図中破線箇所Bにもまた、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されており、この箇所Bに示された生体分子が、生体「D」についての領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。
Next, the state identifying unit 109 extracts biomolecules that satisfy the sameness/similarity condition from among the biomolecules shown in the comparison statistical information (S206). More specifically, the state identifying unit 109 compares the detection molecule with the biomolecules shown in the comparison statistical information to extract biomolecules that satisfy the sameness/similarity condition from among the biomolecules shown in the comparison statistical information.
In this example, as shown in FIG. 10(E), the state specifying unit 109 determines that the biomolecules shown in the two comparative statistical information pieces both satisfy the same similarity condition with respect to the detection molecule included in the region 20 for the organism "D". One of the two comparative statistical information pieces is comparative statistical information that is associated with the inclusive state "influenza" and targets the region 20. The dotted line portion A in the comparative statistical information piece shows a decrease in the substance amount of the biomolecule over time, and the state specifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion A satisfies the same similarity condition with respect to the detection molecule included in the region 20 for the organism "D". The comparative statistical information that is associated with "influenza" and targets the region 20 is the statistical information shown in FIG. 7(F). The other of the two comparative statistical information pieces is comparative statistical information that is associated with the inclusive state "COVID (Corona Virus Disease)-19" and targets the region 20. The dotted line point B in the figure of this comparison statistical information also shows a decrease in the amount of substance of the biomolecule over time, and the state determination unit 109 determines that the biomolecule shown at this point B satisfies the same similarity condition with the detected molecule contained in region 20 for organism "D."
このように、複数の比較統計情報にそれぞれ示された生体分子が、何れも、一の区画領域に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと判定される場合がある。付言すると、インフルエンザウイルスとCOVID-19とは、ともに感染症である点で共通しており、対象生体がインフルエンザウイルスに感染した場合とCOVID-19に感染した場合とで、対象生体における特定の生体分子が、同一のまたは類似する変化を示すことがある。この場合、状態特定部109は、抽出した比較統計情報に示された生体分子と、比較が済んでいない区画領域に含まれる検出分子とを比較する。
本例では、状態特定部109は、図11(F)に示すように、生体「D」についての領域14に示された検出分子と、「インフルエンザ」が関連付けられ領域14を対象とする比較統計情報に示された生体分子とを比較する。また、状態特定部109は、生体「D」についての領域14に示された検出分子と、「COVID-19」が関連付けられ領域14を対象とする比較統計情報に示された生体分子とを比較する。さらに、状態特定部109は、生体「D」についての領域15に示された検出分子と、「インフルエンザ」が関連付けられ領域15を対象とする比較統計情報に示された生体分子とを比較する。また、状態特定部109は、生体「D」についての領域15に示された検出分子と、「COVID-19」が関連付けられ領域15を対象とする比較統計情報に示された生体分子とを比較する。
In this way, it may be determined that the biomolecules shown in the multiple pieces of comparison statistical information all satisfy the same or similar condition with respect to the detection molecule included in one partitioned area. In addition, influenza virus and COVID-19 have in common the fact that they are both infectious diseases, and a specific biomolecule in the target organism may show the same or similar changes when the target organism is infected with influenza virus and when the target organism is infected with COVID-19. In this case, the state identification unit 109 compares the biomolecule shown in the extracted comparison statistical information with the detection molecule included in the partitioned area that has not yet been compared.
In this example, as shown in FIG. 11(F), the state identification unit 109 compares the detection molecule shown in the region 14 for the organism "D" with the biomolecule shown in the comparative statistical information associated with "influenza" and targeting the region 14. The state identification unit 109 also compares the detection molecule shown in the region 14 for the organism "D" with the biomolecule shown in the comparative statistical information associated with "COVID-19" and targeting the region 14. The state identification unit 109 also compares the detection molecule shown in the region 15 for the organism "D" with the biomolecule shown in the comparative statistical information associated with "influenza" and targeting the region 15. The state identification unit 109 also compares the detection molecule shown in the region 15 for the organism "D" with the biomolecule shown in the comparative statistical information associated with "COVID-19" and targeting the region 15.
ここで、「インフルエンザ」が関連付けられ領域14を対象とする比較統計情報の図中破線箇所Cには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増大が示されている。そして、この箇所Cに示された生体分子が、生体「D」についての領域14に示された検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。また、「インフルエンザ」が関連付けられ領域15を対象とする比較統計情報の図中破線箇所Dには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。そして、この箇所Dに示された生体分子が、生体「D」についての領域15に示された検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。
一方で、「COVID-19」が関連付けられ領域14を対象とする比較統計情報には、時間が経過しても生体分子の物質量が変化しないことが示されている。そして、この生体分子は、生体「D」についての領域14に示された検出分子に対して同一類似条件を満たさないと状態特定部109に判定される。また、「COVID-19」が関連付けられ領域15を対象とする比較統計情報には、時間が経過しても生体分子の物質量が変化しないことが示されている。そのため、この生体分子もまた、生体「D」についての領域15に示された検出分子に対して同一類似条件を満たさないと状態特定部109に判定される。
この場合、状態特定部109は、「インフルエンザ」が関連付けられている統計情報に示された生体分子を、同一類似条件を満たす生体分子として抽出する。なお、同一類似条件を満たすものとして状態特定部109に抽出された生体分子が示された比較統計情報を、以下では、抽出統計情報と称することがある。
Here, the dashed line portion C in the comparative statistical information associated with "influenza" and targeting region 14 shows an increase in the amount of substance of the biomolecule over time. The state identifying unit 109 then determines that the biomolecule shown at this portion C satisfies the same similarity condition with respect to the detected molecule shown in region 14 for organism "D". Also, the dashed line portion D in the comparative statistical information associated with "influenza" and targeting region 15 shows a decrease in the amount of substance of the biomolecule over time. The state identifying unit 109 then determines that the biomolecule shown at this portion D satisfies the same similarity condition with respect to the detected molecule shown in region 15 for organism "D".
On the other hand, the comparative statistical information associated with "COVID-19" and targeting region 14 indicates that the amount of substance of the biomolecule does not change over time. The state identifying unit 109 then determines that this biomolecule does not satisfy the same-similar condition with respect to the detection molecule shown in region 14 for organism "D". The comparative statistical information associated with "COVID-19" and targeting region 15 also indicates that the amount of substance of the biomolecule does not change over time. Therefore, the state identifying unit 109 also determines that this biomolecule does not satisfy the same-similar condition with respect to the detection molecule shown in region 15 for organism "D".
In this case, the state identifying unit 109 extracts the biomolecule indicated in the statistical information associated with "influenza" as a biomolecule satisfying the same similarity condition. Note that the comparison statistical information indicating the biomolecule extracted by the state identifying unit 109 as satisfying the same similarity condition may be referred to as extracted statistical information below.
次に、状態特定部109は、抽出統計情報から、対象生体の状態を特定する。より具体的には、状態特定部109は、抽出統計情報に関連付けられた包括状態を、対象生体の状態に特定する(S207)。なお、状態特定部109が特定した対象生体の状態を、以下では、特定状態と称することがある。
本例では、状態特定部109は、抽出統計情報に関連付けられている包括状態である「インフルエンザ」を、生体「D」の状態に特定する。
Next, the state identifying unit 109 identifies the state of the target organism from the extracted statistical information. More specifically, the state identifying unit 109 identifies the comprehensive state associated with the extracted statistical information as the state of the target organism (S207). Note that the state of the target organism identified by the state identifying unit 109 may be referred to as a specific state hereinafter.
In this example, the condition identifying unit 109 identifies "influenza," which is a comprehensive condition associated with the extracted statistical information, as the condition of the living body "D."
なお、本例では、「インフルエンザ」が関連付けられた比較統計情報に示された生体分子、および「COVID-19」が関連付けられた比較統計情報に示された生体分子が、何れも、領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすことを説明した。 In this example, it has been explained that the biomolecules shown in the comparative statistical information associated with "influenza" and the biomolecules shown in the comparative statistical information associated with "COVID-19" both satisfy the same similarity condition for the detected molecules included in region 20.
ここで、図11(G)は、前期分布情報および後期分布情報の領域7に含まれる生体分子、「インフルエンザ」が関連付けられ領域7を対象とする比較統計情報、および「COVID-19」が関連付けられ領域7を対象とする比較統計情報を示した図である。図11(G)に示した各図において、横軸は生体分子が得られた時点であり、縦軸は生体分子の物質量である。また、図11(G)において、「●」の記号は、前期分布情報に示された生体分子を意味し、「▲」の記号は、後期分布情報に示された生体分子を意味する。
図11(G)に示すように、生体「D」についての領域7においては、前期分布情報に示された生体分子の物質量と、後期分布情報に示された生体分子の物質量とで、変化がない。また、「インフルエンザ」が関連付けられ領域7を対象とする比較統計情報においても、時間の経過に伴う生体分子の物質量の変化はない。一方で、「COVID-19」が関連付けられ領域7を対象とする比較統計情報の図中破線箇所Eには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そのため、生体「D」について、領域20における生体分子が図10(E)の箇所Bの変化を示し、領域7における生体分子が図11(G)の箇所Eの変化を示す場合、状態特定部109は、生体「D」の状態を「COVID-19」に特定する。
Here, Fig. 11(G) is a diagram showing biomolecules included in region 7 of the early distribution information and the late distribution information, comparative statistical information associated with "influenza" and targeting region 7, and comparative statistical information associated with "COVID-19" and targeting region 7. In each diagram shown in Fig. 11(G), the horizontal axis indicates the time point at which the biomolecule was obtained, and the vertical axis indicates the substance amount of the biomolecule. In Fig. 11(G), the symbol "●" indicates a biomolecule shown in the early distribution information, and the symbol "▲" indicates a biomolecule shown in the late distribution information.
As shown in FIG. 11(G), in region 7 for organism "D", there is no change between the amount of substance of the biomolecule shown in the early distribution information and the amount of substance of the biomolecule shown in the later distribution information. Also, in the comparative statistical information associated with "influenza" and targeting region 7, there is no change in the amount of substance of the biomolecule over time. On the other hand, the dashed line portion E in the comparative statistical information associated with "COVID-19" and targeting region 7 shows an increase in the amount of substance of the biomolecule over time. Therefore, when, for organism "D", the biomolecule in region 20 shows the change at portion B in FIG. 10(E) and the biomolecule in region 7 shows the change at portion E in FIG. 11(G), the state identification unit 109 identifies the state of organism "D" as "COVID-19".
なお、本実施形態では、状態特定部109は、「インフルエンザ」が関連付けられた比較統計情報に示された生体分子が、領域20、領域15および領域14に含まれる各検出分子の何れに対しても同一類似条件を満たすことに応じて、対象生体の状態を「インフルエンザ」に特定している。ここで、「インフルエンザ」が関連付けられた比較統計情報に示された生体分子が、領域20に含まれる検出分子および領域15に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たす一方で、領域14に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たさない場合がある。この場合、対象生体の状態を、「インフルエンザ」とは異なる状態に特定してもよい。 In this embodiment, the state identification unit 109 identifies the state of the target organism as "influenza" in response to the biomolecule indicated in the comparative statistical information associated with "influenza" satisfying the same similarity condition with respect to each of the detection molecules contained in region 20, region 15, and region 14. Here, while the biomolecule indicated in the comparative statistical information associated with "influenza" satisfies the same similarity condition with respect to the detection molecules contained in region 20 and region 15, there are cases in which the biomolecule does not satisfy the same similarity condition with respect to the detection molecules contained in region 14. In this case, the state of the target organism may be identified as a state other than "influenza."
次に、出力部110は、特定状態に関する情報を、端末30に出力する(S208)。
本例では、出力部110は、図12に示すように、端末30の表示部31に、状態通知画面40を表示させる。状態通知画面40は、特定状態をユーザに通知するための画面である。状態通知画面40には、生体識別部41と、状態通知部42と、時期通知部43と、将来状態通知部44とが表示されている。
なお、以下では、状態通知画面40が表示された日にちは、後期分布情報に示された生体分子が得られた日にちと同一であるものとする。
Next, the output unit 110 outputs the information on the specific state to the terminal 30 (S208).
In this example, the output unit 110 displays a status notification screen 40 on the display unit 31 of the terminal 30 as shown in Fig. 12. The status notification screen 40 is a screen for notifying the user of a specific status. The status notification screen 40 displays a biometric identification section 41, a status notification section 42, a time notification section 43, and a future status notification section 44.
In the following description, it is assumed that the date on which the status notification screen 40 is displayed is the same as the date on which the biomolecule indicated in the later distribution information was obtained.
生体識別部41には、対象生体を識別するための情報が示されている。図示の例では、生体識別部41には、対象生体を識別する情報を含む「Dさん」のテキストが示されている。
状態通知部42には、特定状態が示されている。図示の例では、状態通知部42には、「現在の状態」のテキスト、および、特定状態である「インフルエンザ」のテキストが示されている。
Information for identifying a target living body is displayed in the biometric identification section 41. In the illustrated example, the biometric identification section 41 displays text for "Mr. D" including information for identifying the target living body.
The specific status is displayed in the status notification section 42. In the illustrated example, the status notification section 42 displays the text "Current Status" and the text "Influenza", which is the specific status.
時期通知部43には、対象生体が特定状態になった時期が示されている。図示の例では、時期通知部43には、「現在の状態になった時期」のテキスト、および、対象生体が特定状態になった時期である「1日前」のテキストが示されている。なお、対象生体が特定状態になった時期は、比較生体が抽出統計情報に関連付けられた包括状態になった時点と、同一類似条件を満たす生体分子が得られた時点との関係から、状態特定部109に特定される。
本例では、図7(F)に示す抽出統計情報において、同一類似条件を満たす生体分子、すなわち、図中破線箇所Aに示した生体分子が得られた時点は、個々状態のうちの一つである「1日」の時点である。また、比較生体が「インフルエンザ」になった時点は、個々状態のうちの一つである「感染」が関連付けられた生体分子が得られた時点であり、「1日」の時点の1日前である。そのため、状態特定部109は、対象生体が特定状態になった時期を、時期通知部43に表示された「1日前」に特定する。
The time notifying unit 43 indicates the time when the target organism entered the specific state. In the illustrated example, the time notifying unit 43 indicates the text "time when the current state was reached" and the text "one day ago", which is the time when the target organism entered the specific state. The time when the target organism entered the specific state is identified by the state identifying unit 109 from the relationship between the time when the comparison organism entered the inclusive state associated with the extracted statistical information and the time when a biomolecule satisfying the identical similarity condition was obtained.
In this example, in the extracted statistical information shown in Figure 7 (F), the time when the biomolecule satisfying the identical similarity condition, i.e., the biomolecule shown at dashed line point A in the figure, was obtained is the time of "1 day", which is one of the individual states. Furthermore, the time when the comparison organism became "influenza" is the time when the biomolecule associated with "infection", which is one of the individual states, was obtained, which is one day before the time of "1 day". Therefore, the state identification unit 109 identifies the time when the target organism became in the specified state as "1 day ago", which is displayed in the time notification unit 43.
将来状態通知部44には、対象生体について状態特定部109に特定された将来の状態が、この将来の状態になる時期とともに示されている。対象生体について状態特定部109に特定された将来の状態を、以下では、将来状態と称することがある。図示の例では、将来状態通知部44には、「今後の状態」のテキストと、将来の状態と将来の状態になる時期とを含む「1日後:発熱」のテキストおよび「5日後:平熱」のテキストが示されている。なお、将来状態は、抽出統計情報に関連付けられた個々状態のうちの、同一類似条件を満たす生体分子が得られた時点よりも後の時点に関連付けられた状態である。また、将来状態になる時期は、同一類似条件を満たす生体分子が得られた時点と、将来状態が関連付けられた時点との関係から、状態特定部109に特定される。
本例では、図7(F)に示す統計情報において、将来状態である「発熱」および「平熱」が関連付けられた時点は、「2日目」および「6日目」であり、同一類似条件を満たす生体分子が得られた時点の1日後および5日後である。そのため、状態特定部109は、対象生体が将来状態である「発熱」および「平熱」になる時期を、将来状態通知部44に表示された「1日後」および「5日後」に特定する。
The future state notification unit 44 indicates the future state of the target organism specified by the state specification unit 109 together with the time when this future state will be reached. The future state of the target organism specified by the state specification unit 109 may be referred to as the future state below. In the illustrated example, the future state notification unit 44 indicates the text "future state", and the text "1 day later: fever" and the text "5 days later: normal temperature" which include the future state and the time when the future state will be reached. The future state is a state associated with a time later than the time when a biomolecule satisfying the same similarity condition was obtained, among the individual states associated with the extracted statistical information. The time when the future state will be reached is specified by the state specification unit 109 based on the relationship between the time when a biomolecule satisfying the same similarity condition was obtained and the time when the future state was associated.
7(F), the time points when the future states "fever" and "normal temperature" are associated are "day 2" and "day 6", which are one day and five days after the time points when the biomolecules satisfying the same similarity conditions were obtained. Therefore, the condition specifying unit 109 specifies the time points when the target organism will reach the future states of "fever" and "normal temperature" as "one day later" and "five days later", which are displayed on the future condition notifying unit 44.
以上の通り、本実施形態では、検出部107は、対象分布情報に示された複数の生体分子のうちの、変化条件を満たす生体分子を検出する。また、対象決定部108は、変化条件を満たす生体分子を含む区画領域に応じて、比較統計情報を決定する。そして、状態特定部109は、変化条件を満たす生体分子と、比較統計情報に示された生体分子との関係から、対象生体の状態を特定する。すなわち、本実施形態では、状態特定部109は、複数の生体分子のうちの、分子情報から特定される生体分子の変化について定められた条件を満たす生体分子の対象に応じて、対象生体の状態を特定する。生体分子の変化について定められた条件としては、例えば、変化条件などが挙げられる。また、生体分子の対象としては、複数の生体分子のうちの、区画領域に含まれる生体分子などが挙げられる。
この場合、一の生体分子のみならず、複数の生体分子を用いて対象生体の状態を特定することができる。また、特定された対象生体の状態を踏まえて、この対象生体の状態を改善する方法が決定されてもよい。すなわち、対象生体への関わり方を決定するために、対象生体の状態の特定結果が用いられてもよい。
As described above, in this embodiment, the detection unit 107 detects a biomolecule that satisfies a change condition among the multiple biomolecules shown in the target distribution information. Furthermore, the target determination unit 108 determines the comparison statistical information according to the partitioned area including the biomolecule that satisfies the change condition. Then, the state specification unit 109 specifies the state of the target organism from the relationship between the biomolecule that satisfies the change condition and the biomolecule shown in the comparison statistical information. That is, in this embodiment, the state specification unit 109 specifies the state of the target organism according to the target of the biomolecule that satisfies the condition determined for the change of the biomolecule determined from the molecular information among the multiple biomolecules. Examples of the condition determined for the change of the biomolecule include a change condition. Furthermore, examples of the target of the biomolecule include a biomolecule included in the partitioned area among the multiple biomolecules.
In this case, the state of the target organism can be identified using not only one biomolecule but also multiple biomolecules. In addition, a method for improving the state of the target organism may be determined based on the identified state of the target organism. In other words, the result of identifying the state of the target organism may be used to determine how to interact with the target organism.
特に、本実施形態の状態特定システム1は、対象生体から何れの生体分子を採取するかを予め定めることなく、対象生体から採取した成分を用いて2次元電気泳動像を作成し、作成した2次元電気泳動像に示された生体分子の各々から、対象生体の状態を特定する。
ここで、対象生体について特定する対象の状態に応じて、対象生体から何れの生体分子を採取するかを予め決定しておき、決定した生体分子のみを用いて、対象生体の状態を特定する手法も考えられる。しかしながら、この場合、決定した生体分子とは異なる他の生体分子が時間の経過に伴い変化した場合であっても、他の生体分子に応じて対象生体の状態を特定することができない。
そこで、本実施形態では、対象生体から得られた成分に含まれる全ての生体分子を用いて、対象生体の状態を特定している。
In particular, the condition identification system 1 of this embodiment creates a two-dimensional electrophoretic image using components collected from the target organism, without determining in advance which biomolecules will be collected from the target organism, and identifies the state of the target organism from each of the biomolecules shown in the created two-dimensional electrophoretic image.
Here, a method is also conceivable in which a biomolecule to be collected from a target organism is determined in advance according to the target state of the target organism, and the state of the target organism is determined using only the determined biomolecule. However, in this case, even if other biomolecules different from the determined biomolecule change over time, the state of the target organism cannot be determined according to the other biomolecules.
Therefore, in this embodiment, the state of the target living organism is identified using all biomolecules contained in the components obtained from the target living organism.
なお、本実施形態の状態特定部109は、対象生体の現在の状態のみならず、対象生体の今後の状態も特定している(図12参照)。すなわち、上述した「対象生体の状態を特定する」ことには、対象生体の現在の状態を特定することのみならず、対象生体の将来の状態を特定することも含まれる。 Note that the state determination unit 109 of this embodiment determines not only the current state of the target organism, but also the future state of the target organism (see FIG. 12). In other words, the above-mentioned "determining the state of the target organism" includes not only determining the current state of the target organism, but also determining the future state of the target organism.
また、本実施形態では、2次元電気泳動像に示された生体分子には、機能が既知である生体分子のみならず、機能が未知である生体分子も含まれている。
ここで、機能が既知である生体分子のみを用いて、対象生体の状態を特定する手法も考えられる。しかしながら、この場合、機能が既知である生体分子の何れも変化条件を満たさない場合には、対象生体の状態を特定できない。そこで、本実施形態では、機能が既知である生体分子のみならず、機能が未知である生体分子も用いて、対象生体の状態を特定している。
Furthermore, in this embodiment, the biomolecules displayed in the two-dimensional electrophoretic image include not only biomolecules with known functions, but also biomolecules with unknown functions.
Here, a method of identifying the state of the target organism using only biomolecules with known functions is also conceivable. However, in this case, if none of the biomolecules with known functions satisfy the change condition, the state of the target organism cannot be identified. Therefore, in this embodiment, the state of the target organism is identified using not only biomolecules with known functions, but also biomolecules with unknown functions.
また、本実施形態では、出力部110は、対象生体の状態に関して、分子情報から特定される生体分子の変化について定められた条件を満たす生体分子の対象に応じた情報を出力する。
この場合、一の生体分子のみならず、複数の生体分子を用いて対象生体の状態に関する情報を出力することができる。
Furthermore, in this embodiment, the output unit 110 outputs information according to the subject of a biomolecule that satisfies a condition set for a change in a biomolecule identified from molecular information, with respect to the state of the subject living organism.
In this case, information regarding the state of the target organism can be output using not only one biomolecule but multiple biomolecules.
特に、本実施形態では、生体分子の対象は、生体分子のうちの変化条件を満たす部分である。
この場合、生体分子の全体としては、生体分子の変化について定められた条件を満たさない場合であっても、対象生体の状態を特定することができる。
In particular, in this embodiment, the target of the biomolecule is a portion of the biomolecule that satisfies the change condition.
In this case, even if the biomolecules as a whole do not satisfy the conditions defined for the changes in the biomolecules, the state of the target living organism can be identified.
また、本実施形態では、生体「A」について、領域14および領域15に含まれる一の生体分子が変化条件を満たすとともに、領域20に含まれる一の生体分子が変化条件を満たすことに応じて、この生体「A」の状態が「インフルエンザ」と特定された。また、上述の通り、生体「A」について、領域20に含まれる一の生体分子が変化条件を満たすとともに、領域7に含まれる一の生体分子が変化条件を満たす場合には、生体「A」の状態が「COVID-19」と特定されることを説明した。すなわち、本実施形態では、状態特定部109は、複数の生体分子のうちの何れの生体分子の対象が変化条件を満たすかに応じて、対象生体の状態を特定する。
この場合、複数の生体分子に応じて対象生体の状態を特定することができる。
In addition, in this embodiment, the state of the organism "A" is identified as "influenza" when one biomolecule contained in region 14 and region 15 satisfies the change condition and one biomolecule contained in region 20 satisfies the change condition. As described above, the state of the organism "A" is identified as "COVID-19" when one biomolecule contained in region 20 satisfies the change condition and one biomolecule contained in region 7 satisfies the change condition. That is, in this embodiment, the state identification unit 109 identifies the state of the target organism depending on which of the multiple biomolecules satisfies the change condition.
In this case, the state of the target living organism can be identified according to a plurality of biomolecules.
また、本実施形態では、分布情報において、生体分子の物理量に応じて分けられた複数の区分の各々における生体分子に関する情報が含まれる。そして、変化条件は、複数の区分の各々について定められている。生体分子の物理量としては、例えば、分子量や等電点等が挙げられる。また、区分としては、例えば、区画領域が挙げられる。
この場合、変化条件を満たす生体分子の対象の物理量に応じて、対象生体の状態を特定することができる。
In this embodiment, the distribution information includes information about biomolecules in each of a plurality of sections divided according to the physical quantities of the biomolecules. The change condition is determined for each of the plurality of sections. Examples of the physical quantities of the biomolecules include molecular weights and isoelectric points. Examples of the sections include partitioned regions.
In this case, the state of the target organism can be identified according to the target physical quantity of the biomolecule that satisfies the change condition.
また、本実施形態では、生体「A」について、領域20に含まれる一の生体分子が変化条件を満たすとともに、領域14および領域15に含まれる一の生体分子が変化条件を満たすことに応じて、この生体「A」の状態が「インフルエンザ」と特定されている。すなわち、本実施形態では、状態特定部109は、対象生体における第1生体分子の特定の対象と第2生体分子の特定の対象とが何れも変化条件を満たすことに応じて、対象生体の状態を特定する。
この場合、単一の生体分子における特定の対象が変化条件を満たすことのみに応じて対象生体の状態を特定する構成に比べて、対象生体の状態を特定する精度を向上させることができる。
In addition, in this embodiment, the state of the organism "A" is identified as "influenza" when one biomolecule contained in region 20 satisfies the change condition and when one biomolecule contained in region 14 and region 15 satisfies the change condition. That is, in this embodiment, the state identifying unit 109 identifies the state of the target organism when both the specific target of the first biomolecule and the specific target of the second biomolecule in the target organism satisfy the change condition.
In this case, the accuracy of identifying the state of the target organism can be improved compared to a configuration in which the state of the target organism is identified only based on a specific target in a single biomolecule satisfying a change condition.
特に、本実施形態では、生体「A」について、領域20において物質量が減少した一の生体分子が変化条件を満たし、領域14において物質量が増加した一の生体分子が変化条件を満たしている。すなわち、本実施形態では、第1生体分子における特定の対象の物理量の増加が変化条件を満たし、第2生体分子における特定の対象の物理量の減少が変化条件を満たす。
この場合、第1生体分子における物理量の変化の傾向と、第2生体分子における物理量の変化の傾向とが異なる場合であっても、対象生体の状態を特定することができる。
In particular, in this embodiment, for organism "A," one biomolecule with a decreased amount of substance in region 20 satisfies the change condition, and one biomolecule with an increased amount of substance in region 14 satisfies the change condition. That is, in this embodiment, an increase in the physical quantity of a specific target in the first biomolecule satisfies the change condition, and a decrease in the physical quantity of a specific target in the second biomolecule satisfies the change condition.
In this case, even if the tendency of change in the physical quantity of the first biomolecule differs from the tendency of change in the physical quantity of the second biomolecule, the state of the target living organism can be identified.
また、本実施形態では、生体「A」について、領域20に含まれる一の生体分子および領域14に含まれる一の生体分子が変化条件を満たし、領域7に含まれる一の生体分子が変化条件を満たさないことに応じて、生体「A」の状態が「インフルエンザ」と特定された。また、生体「A」について、領域20に含まれる一の生体分子および領域7に含まれる一の生体分子が変化条件を満たし、領域14に含まれる一の生体分子が変化条件を満たさない場合には、生体「A」の状態が「COVID-19」と特定されることを説明した。すなわち、本実施形態では、状態特定部109は、対象生体の第1生体分子における特定の対象および第2生体分子における特定の対象が変化条件を満たし且つ第3生体分子の特定の対象が変化条件を満たさない場合に、対象生体の状態を第1状態に特定する。また、状態特定部109は、対象生体の第1生体分子における特定の対象および第3生体分子における特定の対象が変化条件を満たし且つ第2生体分子における特定の対象が変化条件を満たさない場合に、対象生体の状態を第2状態に特定する。
この場合、第1状態と、第2状態とで、共通の生体分子が生体分子の変化について定められた条件を満たす場合であっても、対象生体の状態を特定することができる。
In this embodiment, the state of the organism "A" is identified as "influenza" when one biomolecule contained in the region 20 and one biomolecule contained in the region 14 satisfy the change condition and one biomolecule contained in the region 7 does not satisfy the change condition. In addition, it has been described that the state of the organism "A" is identified as "COVID-19" when one biomolecule contained in the region 20 and one biomolecule contained in the region 7 satisfy the change condition and one biomolecule contained in the region 14 does not satisfy the change condition. That is, in this embodiment, the state identifying unit 109 identifies the state of the target organism as the first state when a specific target in the first biomolecule and a specific target in the second biomolecule of the target organism satisfy the change condition and a specific target in the third biomolecule does not satisfy the change condition. In addition, the state identifying unit 109 identifies the state of the target organism as the second state when a specific target in the first biomolecule and a specific target in the third biomolecule of the target organism satisfy the change condition and a specific target in the second biomolecule does not satisfy the change condition.
In this case, even if a common biomolecule between the first state and the second state satisfies a condition defined for a change in the biomolecule, the state of the target living organism can be identified.
また、本実施形態では、生体「A」について、一の生体分子のうちの領域14に含まれる部分と領域15に含まれる部分とが変化条件を満たすことに応じて、この生体「A」の状態が「インフルエンザ」と特定されている。すなわち、本実施形態では、状態特定部109は、特定の生体分子の第1部分と第2部分とが何れも変化条件を満たすことに応じて、対象生体の状態を特定する。
この場合、一の生体分子における一の部分が変化条件を満たすことのみに応じて対象生体の状態を特定する構成に比べて、対象生体の状態を特定する精度を向上させることができる。
In addition, in this embodiment, the state of the living organism "A" is identified as "influenza" when a portion of one biomolecule contained in region 14 and a portion contained in region 15 satisfy a change condition. That is, in this embodiment, the state identifying unit 109 identifies the state of the target living organism when both the first portion and the second portion of a specific biomolecule satisfy the change condition.
In this case, the accuracy of identifying the state of the target organism can be improved compared to a configuration in which the state of the target organism is identified only in accordance with one portion of one biomolecule satisfying a change condition.
特に、本実施形態では、生体「A」について、一の生体分子のうちの、領域14に含まれる部分の物質量の増加が変化条件を満たし、領域15に含まれる部分の物質量の減少が変化条件を満たすことに応じて、この生体「A」の状態が「インフルエンザ」と特定されている。すなわち、本実施形態では、第1部分の特定の物理量の増加が変化条件を満たし、第2部分の物理量の減少が変化条件を満たす。
この場合、第1部分における物理量の変化の傾向と、第2部分における物理量の変化の傾向とが異なる場合であっても、対象生体の状態を特定することができる。
In particular, in this embodiment, for a living organism "A," an increase in the amount of substance in a portion of a biomolecule contained in region 14 satisfies the change condition, and a decrease in the amount of substance in a portion of a biomolecule contained in region 15 satisfies the change condition, and accordingly, the state of this living organism "A" is identified as "influenza." That is, in this embodiment, an increase in a specific physical quantity in the first portion satisfies the change condition, and a decrease in the physical quantity in the second portion satisfies the change condition.
In this case, even if the tendency of the change in the physical quantity in the first portion differs from the tendency of the change in the physical quantity in the second portion, the state of the target living body can be identified.
なお、状態特定部109による状態の特定の手法は、上記の例に限定されない。例えば、比較統計情報に示された生体分子との関係から、領域1乃至領域5からなる一の生体分子について、領域1に含まれる部分の物質量の変化が変化条件を満たすか、領域5に含まれる部分の物質量の変化が変化条件を満たすかによって、対象生体について特定される状態が異なってもよい。すなわち、状態特定部109は、対象生体の特定の生体分子の第1部分が変化条件を満たし且つ第2部分が変化条件を満たさない場合に、対象生体の状態を第1状態に特定し、対象生体の特定の生体分子の第1部分が変化条件を満たさずに第2部分が変化条件を満たす場合に、対象生体の状態を第1状態とは異なる第2状態に特定してもよい。
生体分子のうち翻訳後修飾される箇所によって、この生体分子の状態が異なる場合がある。一例を挙げると、アミノ酸を含む特定の生体分子にリン酸基が付加される場合において、20番目のアミノ酸がリン酸化されている場合と、45番目のアミノ酸がリン酸化されている場合とで、この特定の生体分子の活性化状態や機能が異なる。本実施形態では、このような、生体分子の異なる状態から、対象生体のそれぞれの状態を特定することができる。より具体的には、それぞれ異なる状態である生体分子の物理量の変化から、対象生体のそれぞれの状態を特定することができる。
The method of identifying the state by the state identifying unit 109 is not limited to the above example. For example, the state identified for the target organism may differ depending on whether the change in the amount of substance of the portion included in region 1 satisfies the change condition or the change in the amount of substance of the portion included in region 5 satisfies the change condition for one biomolecule consisting of regions 1 to 5 from the relationship with the biomolecule shown in the comparison statistical information. That is, the state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as a first state when a first portion of a specific biomolecule of the target organism satisfies the change condition and a second portion does not, and may identify the state of the target organism as a second state different from the first state when a first portion of a specific biomolecule of the target organism does not satisfy the change condition and a second portion satisfies the change condition.
The state of a biomolecule may differ depending on the site of post-translational modification of the biomolecule. For example, when a phosphate group is added to a specific biomolecule containing an amino acid, the activation state and function of the specific biomolecule differs between when the 20th amino acid is phosphorylated and when the 45th amino acid is phosphorylated. In this embodiment, the respective states of the target organism can be identified from such different states of the biomolecule. More specifically, the respective states of the target organism can be identified from the change in the physical quantity of the biomolecules in the respective different states.
(状態特定処理の他の例)
次に、図9(A)に示した例とは異なる対象分布情報が用いられる場合に行われる状態特定処理の例について説明する。
図13および図14は、状態特定処理により対象生体の状態が特定されるまでの一例を示した図である。
(Another example of the state identification process)
Next, an example of the state specification process that is performed when object distribution information different from the example shown in FIG. 9A is used will be described.
13 and 14 are diagrams showing an example of how the state of a target living organism is identified by the state identifying process.
以下では、対象生体が生体「E」であり、且つ、図13(A)に示す二つの対象分布情報が使用分布情報である例について説明する。図13(A)には、使用分布情報として、生体「E」についての前期分布情報および後期分布情報が示されている。この前期分布情報および後期分布情報には、それぞれ、図6(A)に示した分布情報と同じように、互いに異なる七つの生体分子の分布が示されている。また、図13(A)に示す前期分布情報は、生体「E」が抗がん剤を摂取する前日に生体「E」から得られた成分に含まれる各生体分子が示された対象分布情報である。また、図13(A)に示す後期分布情報は、生体「E」が抗がん剤を摂取した翌日に生体「E」から得られた成分に含まれる各生体分子が示された対象分布情報である。なお、生体「E」は、例えば、人間である。
領域識別部103は、各使用分布情報において生体分子が存在する領域を識別する。また区画部104は、各使用分布情報において、生体分子が存在する領域を、比較分布情報に対して行った区画(図6(B)参照)と同じように、領域1乃至領域20からなる二十の領域に区画する。
In the following, an example will be described in which the target organism is an organism "E" and the two target distribution information shown in FIG. 13(A) are use distribution information. In FIG. 13(A), early distribution information and late distribution information for the organism "E" are shown as use distribution information. The early distribution information and late distribution information each show the distribution of seven different biomolecules, similar to the distribution information shown in FIG. 6(A). The early distribution information shown in FIG. 13(A) is target distribution information showing each biomolecule contained in the component obtained from the organism "E" on the day before the organism "E" takes an anticancer drug. The late distribution information shown in FIG. 13(A) is target distribution information showing each biomolecule contained in the component obtained from the organism "E" on the day after the organism "E" takes an anticancer drug. The organism "E" is, for example, a human being.
The region identification unit 103 identifies the region where the biomolecule exists in each piece of usage distribution information. The partitioning unit 104 partitions the region where the biomolecule exists in each piece of usage distribution information into twenty regions consisting of region 1 to region 20, in the same manner as the partitioning performed on the comparison distribution information (see FIG. 6B).
物質量特定部105は、各使用分布情報について、区画領域に含まれる生体分子の物質量を区画領域ごとに特定する。また、検出部107は、区画領域ごとに、生体分子が変化条件を満たすか否かを判定し、変化条件を満たすと判定した生体分子を検出する。
本例では、図13(A)に示す、領域6、領域19、および領域20において、後期分布情報に示された生体分子の物質量が、前期分布情報に示された生体分子の物質量から変化している。より具体的には、領域6および領域19においては、後期分布情報に示された生体分子の物質量が、前期分布情報に示された生体分子の物質量よりも減少している。また、領域20においては、後期分布情報に示された生体分子の物質量が、前期分布情報に示された生体分子の物質量よりも増加している。そして、この領域6、領域19、および領域20の各々の前期分布情報と後期分布情報とに示された生体分子が、変化条件を満たすものとして検出部107に検出される。
The substance amount specifying unit 105 specifies the substance amount of the biomolecule contained in each partitioned region for each use distribution information. The detection unit 107 determines whether the biomolecule satisfies a change condition for each partitioned region, and detects the biomolecule determined to satisfy the change condition.
In this example, in regions 6, 19, and 20 shown in FIG. 13A, the amounts of substance of the biomolecules shown in the later distribution information have changed from the amounts of substance of the biomolecules shown in the early distribution information. More specifically, in regions 6 and 19, the amounts of substance of the biomolecules shown in the later distribution information have decreased compared to the amounts of substance of the biomolecules shown in the early distribution information. Also, in region 20, the amounts of substance of the biomolecules shown in the later distribution information have increased compared to the amounts of substance of the biomolecules shown in the early distribution information. Then, the biomolecules shown in the early distribution information and the later distribution information of each of regions 6, 19, and 20 are detected by the detection unit 107 as satisfying the change condition.
次に、対象決定部108は、変化条件を満たす生体分子である検出分子と比較する対象である比較統計情報を決定する。
本例では、対象決定部108は、図13(B)に示すように、領域20を対象とする統計情報の各々を、生体「E」について領域20に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。また、対象決定部108は、領域19を対象とする統計情報の各々を生体「E」について領域19に示された検出分子に対する比較統計情報に決定し、領域6を対象とする統計情報の各々を生体「E」について領域6に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。これらの比較統計情報には、図13(B)に示すように、包括状態である「抗がん剤効果あり」が関連付けられた統計情報、および、包括状態である「抗がん剤効果なし」が関連付けられた統計情報が含まれる。図13(B)は、状態特定部109に比較される情報を示した図である。より具体的には、図13(B)は、前期分布情報および後期分布情報に含まれる生体分子、「抗がん剤効果あり」が関連付けられた比較統計情報、および「抗がん剤効果なし」が関連付けられた比較統計情報を示した図である。また、図13(B)において、「●」の記号は、前期分布情報に示された生体分子を意味し、「▲」の記号は、後期分布情報に示された生体分子を意味する。
Next, the target determining unit 108 determines the comparison statistical information to be compared with the detection molecule, which is a biomolecule that satisfies the change condition.
In this example, as shown in FIG. 13(B), the target determining unit 108 determines each piece of statistical information for the region 20 as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region 20 for the organism "E". Also, the target determining unit 108 determines each piece of statistical information for the region 19 as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region 19 for the organism "E", and determines each piece of statistical information for the region 6 as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region 6 for the organism "E". As shown in FIG. 13(B), these comparative statistical information include statistical information associated with the comprehensive state "anticancer drug effective" and statistical information associated with the comprehensive state "anticancer drug ineffective". FIG. 13(B) is a diagram showing information to be compared by the state identifying unit 109. More specifically, FIG. 13(B) is a diagram showing biomolecules included in the early distribution information and the late distribution information, comparative statistical information associated with "anticancer drug effective", and comparative statistical information associated with "anticancer drug ineffective". In addition, in FIG. 13(B), the symbol "●" indicates a biomolecule shown in the early distribution information, and the symbol "▲" indicates a biomolecule shown in the later distribution information.
次に、状態特定部109は、比較統計情報のうちの、同一類似条件を満たす生体分子を抽出する。
本例では、「抗がん剤効果あり」が関連付けられ領域20を対象とする比較統計情報の図中破線箇所aには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そして、この箇所aに示された生体分子が、生体「E」についての領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。また、「抗がん剤効果なし」が関連付けられ領域20を対象とする比較統計情報の図中破線箇所bには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そして、この箇所bに示された生体分子が、生体「E」についての領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。この場合、状態特定部109は、抽出した比較統計情報に示された生体分子と、比較が済んでいない区画領域に示された検出分子とを比較する。より具体的には、状態特定部109は、生体「E」についての領域19に含まれる検出分子と、領域19を対象とする比較統計情報とを比較する。また、状態特定部109は、生体「E」についての領域6に含まれる検出分子と、領域6を対象とする比較統計情報とを比較する。
Next, the state specifying unit 109 extracts biomolecules that satisfy the identical or similar condition from the comparison statistical information.
In this example, the dotted line portion a in the comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" and targeting the region 20 shows an increase in the substance amount of the biomolecule over time. The state specifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion a satisfies the same similarity condition with respect to the detection molecule included in the region 20 for the organism "E". The dotted line portion b in the comparative statistical information associated with "anticancer drug ineffective" and targeting the region 20 shows an increase in the substance amount of the biomolecule over time. The state specifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion b satisfies the same similarity condition with respect to the detection molecule included in the region 20 for the organism "E". In this case, the state specifying unit 109 compares the biomolecule shown in the extracted comparative statistical information with the detection molecule shown in the partitioned region that has not been compared. More specifically, the state specifying unit 109 compares the detection molecule included in the region 19 for the organism "E" with the comparative statistical information targeting the region 19. Furthermore, the condition specifying unit 109 compares the detection molecules contained in the region 6 for the organism “E” with the comparative statistical information for the region 6 .
ここで、「抗がん剤効果あり」が関連付けられ領域19を対象とする比較統計情報の図中破線箇所cには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。そして、この箇所cに示された生体分子が、生体「E」についての領域19に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に特定される。また、「抗がん剤効果あり」が関連付けられ領域6を対象とする比較統計情報の図中破線箇所dには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。そして、この箇所dに示された生体分子が、生体「E」についての領域6に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に特定される。
一方で、「抗がん剤効果なし」が関連付けられ領域19を対象とする比較統計情報には、時間が経過しても生体分子の物質量が変化しないことが示されている。そして、この生体分子は、領域19に示された検出分子に対して同一類似条件を満たさないと状態特定部109に判定される。また、「抗がん剤効果なし」が関連付けられ領域6を対象とする比較統計情報には、時間が経過しても生体分子の物質量が変化しないことが示されている。そして、この生体分子は、領域6に示された検出分子に対して同一類似条件を満たさないと状態特定部109に判定される。
Here, the dotted line portion c in the comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" and targeting region 19 shows a decrease in the substance amount of the biomolecule over time. The state specifying unit 109 specifies that the biomolecule shown in this portion c satisfies the same similarity condition with respect to the detection molecule included in region 19 for the organism "E". The dotted line portion d in the comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" and targeting region 6 shows a decrease in the substance amount of the biomolecule over time. The state specifying unit 109 specifies that the biomolecule shown in this portion d satisfies the same similarity condition with respect to the detection molecule included in region 6 for the organism "E".
On the other hand, the comparative statistical information associated with "no anticancer drug effect" and targeting region 19 indicates that the substance amount of the biomolecule does not change over time. The state specifying unit 109 then determines that this biomolecule does not satisfy the same similarity condition with respect to the detection molecule shown in region 19. On the other hand, the comparative statistical information associated with "no anticancer drug effect" and targeting region 6 indicates that the substance amount of the biomolecule does not change over time. The state specifying unit 109 then determines that this biomolecule does not satisfy the same similarity condition with respect to the detection molecule shown in region 6.
この場合、状態特定部109は、「抗がん剤効果あり」が関連付けられている比較統計情報に示された生体分子を、同一類似条件を満たす生体分子として抽出する。また、状態特定部109は、抽出した比較統計情報に関連付けられた包括状態である「抗がん剤効果あり」を、生体「E」の状態に特定する。
また、出力部110は、状態特定部109に特定された状態に関する状態通知画面40(図12参照)を、端末30の表示部31に表示させる。
In this case, the state identifying unit 109 extracts the biomolecule indicated in the comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" as a biomolecule that satisfies the same similarity condition. The state identifying unit 109 also identifies the comprehensive state "anticancer drug effective" associated with the extracted comparative statistical information as the state of organism "E".
Furthermore, the output unit 110 causes the display unit 31 of the terminal 30 to display a status notification screen 40 (see FIG. 12) relating to the status identified by the status identification unit 109 .
なお、本例では、「抗がん剤効果あり」が関連付けられた比較統計情報に示された生体分子、および「抗がん剤効果なし」が関連付けられた比較統計情報に示された生体分子が、何れも、領域20に含まれる検出分子に対して同一類似条件を満たすことを説明した。 In this example, it has been explained that the biomolecules shown in the comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" and the biomolecules shown in the comparative statistical information associated with "anticancer drug ineffective" both satisfy the same similarity condition with respect to the detected molecules contained in region 20.
ここで、図14(C)は、前期分布情報および後期分布情報の領域1に含まれる生体分子、「抗がん剤効果あり」が関連付けられ領域1を対象とする比較統計情報、および「抗がん剤効果なし」が関連付けられ領域1を対象とする比較統計情報を示した図である。図14(C)に示した各図において、横軸は生体分子が得られた時点であり、縦軸は生体分子の物質量である。また、図14(C)において、「●」の記号は、前期分布情報に示された生体分子を意味し、「▲」の記号は、後期分布情報に示された生体分子を意味する。
図14(C)に示すように、生体「E」についての領域1においては、前期分布情報に示された生体分子の物質量と、後期分布情報に示された生体分子の物質量とで、変化がない。また、「抗がん剤効果あり」が関連付けられ領域1を対象とする比較統計情報においても、時間の経過に伴う生体分子の物質量の変化がない。一方で、「抗がん剤効果なし」が関連付けられ領域1を対象とする比較統計情報の図中破線箇所eには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そのため、生体「E」について、領域20に含まれる生体分子が図13(B)の箇所bの変化を示し、領域1に含まれる生体分子が図14(C)の箇所eの変化を示す場合には、状態特定部109は、生体「E」の状態を「抗がん剤効果なし」に特定する。
Here, Fig. 14(C) is a diagram showing biomolecules included in region 1 of the early distribution information and the late distribution information, comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" and targeting region 1, and comparative statistical information associated with "anticancer drug ineffective" and targeting region 1. In each diagram shown in Fig. 14(C), the horizontal axis is the time point at which the biomolecule was obtained, and the vertical axis is the substance amount of the biomolecule. In Fig. 14(C), the symbol "●" means a biomolecule shown in the early distribution information, and the symbol "▲" means a biomolecule shown in the late distribution information.
As shown in FIG. 14C, in region 1 for organism "E", there is no change between the amount of substance of the biomolecule shown in the early distribution information and the amount of substance of the biomolecule shown in the later distribution information. Also, in the comparative statistical information associated with "anticancer drug effective" and targeting region 1, there is no change in the amount of substance of the biomolecule over time. On the other hand, the comparative statistical information associated with "anticancer drug ineffective" and targeting region 1 shows an increase in the amount of substance of the biomolecule over time at the dotted line portion e in the figure. Therefore, for organism "E", when the biomolecule contained in region 20 shows a change at portion b in FIG. 13B and the biomolecule contained in region 1 shows a change at portion e in FIG. 14C, the state identification unit 109 identifies the state of organism "E" as "anticancer drug ineffective".
以上の通り、本実施形態では、情報取得部101は、対象生体に特定の作用が働く前からこの特定の作用が働いた以降への時間の経過に伴う生体分子の状態の特定が可能である使用分布情報を取得する。特定の作用としては、例えば、抗がん剤の摂取が挙げられる。そして、状態特定部109は、特定の生体分子における特定の対象が変化条件を満たす場合に、対象生体の状態を特定の作用に係る第1状態に特定し、特定の生体分子における特定の対象が変化条件を満たさない場合に、対象生体の状態を特定の作用に係る第2状態に特定する。特定の生体分子における特定の対象としては、例えば、生体分子のうちの領域19に示された部分が挙げられる(図13(A)、図13(B)参照)。また、第1状態としては、例えば、対象生体が抗がん剤を摂取したことによる効果がある状態が挙げられる。また、第2状態としては、例えば、対象生体が抗がん剤を摂取したことによる効果がない状態が挙げられる。
この場合、対象生体に特定の作用が働いたことによる対象生体への影響を特定することができる。
As described above, in this embodiment, the information acquisition unit 101 acquires usage distribution information that can identify the state of a biomolecule over time from before a specific action acts on the target organism to after the specific action acts. An example of the specific action is the ingestion of an anticancer drug. Then, the state identification unit 109 identifies the state of the target organism as a first state related to the specific action when a specific target in the specific biomolecule satisfies a change condition, and identifies the state of the target organism as a second state related to the specific action when a specific target in the specific biomolecule does not satisfy a change condition. An example of the specific target in the specific biomolecule is a part of the biomolecule shown in the region 19 (see FIG. 13(A) and FIG. 13(B)). Also, an example of the first state is a state in which the target organism has an effect due to the ingestion of an anticancer drug. Also, an example of the second state is a state in which the target organism has no effect due to the ingestion of an anticancer drug.
In this case, it is possible to identify the effect on the target organism caused by a specific action being exerted on the target organism.
特に、本実施形態では、状態特定部109は、第1生体分子における特定の対象が変化条件を満たし、且つ、第2生体分子における特定の対象が変化条件を満たさない場合に、対象生体の状態を第1状態に特定し、第1生体分子における特定の対象が変化条件を満たさずに第2生体分子における特定の対象が変化条件を満たす場合に、対象生体の状態を第2状態に特定する。第2生体分子における特定の対象としては、例えば、生体分子のうちの領域1に示された部分が挙げられる(図13(A)、14(C)参照)。
この場合、第1生体分子における特定の対象が変化条件を満たさないことのみに応じて対象生体の状態が第2状態に特定される構成に比べて、対象生体の状態を第2状態に特定する精度を向上させることができる。
In particular, in this embodiment, the state determination unit 109 determines the state of the target organism to be a first state when the specific target in the first biomolecule satisfies the change condition and the specific target in the second biomolecule does not satisfy the change condition, and determines the state of the target organism to be a second state when the specific target in the first biomolecule does not satisfy the change condition and the specific target in the second biomolecule satisfies the change condition. An example of the specific target in the second biomolecule is the part of the biomolecule shown in region 1 (see Figures 13(A) and 14(C)).
In this case, the accuracy of identifying the state of the target organism as the second state can be improved compared to a configuration in which the state of the target organism is identified as the second state solely based on the fact that a specific target in the first biological molecule does not satisfy a change condition.
なお、本実施形態では、使用分布情報において、領域20に含まれる生体分子と、領域19に含まれる生体分子と、領域6に含まれる生体分子とが何れも変化条件を満たす場合に、状態特定部109が対象生体を第1状態に特定しているが、これに限定されない。
例えば、使用分布情報において、領域19に含まれる生体分子が変化条件を満たし、領域6に含まれる生体分子が変化条件を満たさない場合において、「抗がん剤効果あり」が関連付けられ領域19を対象とする比較統計情報に示された生体分子が同一類似条件を満たす場合には、状態特定部109は、対象生体を「抗がん剤効果あり」に特定してもよい。すなわち、状態特定部109は、第1生体分子における特定の対象および第2生体分子における特定の対象が何れも変化条件を満たす場合に、対象生体の状態を第1状態に特定し、第1生体分子における特定の対象が変化条件を満たさずに第2生体分子における特定の対象が変化条件を満たす場合に、対象生体の状態を第1状態に特定してもよい。第1生体分子における特定の対象としては、例えば、生体分子のうちの領域19に含まれる部分が挙げられる。また、第2生体分子における特定の対象としては、例えば、生体分子のうちの領域6に含まれる部分が挙げられる(図13(A)、図13(B)参照)。
この場合、対象生体が第1状態であるにも関わらず対象生体が第1状態とは異なる状態であると特定されることを抑制することができる。
In this embodiment, when the biomolecules contained in region 20, the biomolecules contained in region 19, and the biomolecules contained in region 6 in the usage distribution information all satisfy the change conditions, the state determination unit 109 determines that the target organism is in the first state, but this is not limited to this.
For example, in the usage distribution information, when the biomolecule included in the region 19 satisfies the change condition and the biomolecule included in the region 6 does not satisfy the change condition, if the biomolecule shown in the comparative statistical information that is associated with "anticancer drug effective" and targets the region 19 satisfies the identical similarity condition, the state specifying unit 109 may specify the target organism as "anticancer drug effective". That is, when the specific target in the first biomolecule and the specific target in the second biomolecule both satisfy the change condition, the state specifying unit 109 may specify the state of the target organism as the first state, and when the specific target in the first biomolecule does not satisfy the change condition and the specific target in the second biomolecule satisfies the change condition, the state of the target organism may be specified as the first state. An example of the specific target in the first biomolecule is a portion of the biomolecule included in the region 19. Also, an example of the specific target in the second biomolecule is a portion of the biomolecule included in the region 6 (see FIG. 13(A) and FIG. 13(B)).
In this case, it is possible to prevent the target living organism from being identified as being in a state different from the first state even though the target living organism is in the first state.
また、本実施形態では、状態特定部109は、対象生体の特定の作用に係る状態を、個々状態としての健康状態が関連付けられた包括状態に特定しているが、これに限定されない。
状態特定部109は、例えば、対象生体の生体分子の変化に基づいて、対象生体の状態を、個々状態としての肉体状態が関連付けられた包括状態に特定してもよい。一例を挙げると、状態特定部109は、対象生体の状態を、肉体状態である「筋肉痛」(図4(A)参照)が関連付けられた「トレーニング効果あり」に特定してもよい。また、他の一例を挙げると、状態特定部109は、対象生体の状態を、肉体状態である「疲労感」が関連付けられた「トレーニング効果なし」に特定してもよい。「トレーニング効果あり」および「トレーニング効果なし」は、対象生体によるトレーニングの実施に係る状態の一例である。また、トレーニングの実施は、特定の作用の一例である。
また、状態特定部109は、例えば、対象生体の生体分子の変化に基づいて、対象生体の状態を、個々状態としての脳状態が関連付けられた包括状態に特定してもよい。一例を挙げると、状態特定部109は、対象生体の状態を、脳状態である「3時間学習」(図4(A)参照)および肉体状態である「8時間睡眠」が関連付けられた「記憶力向上」に特定してもよい。また、他の一例を挙げると、状態特定部109は、対象生体の状態を、脳状態である「3時間学習」および肉体状態である「4時間睡眠」が関連付けられた「記憶力低下」に特定してもよい。このように、包括状態情報には、個々状態情報のうちの二つ以上の情報が関連付けられてもよい。「記憶力向上」および「記憶力低下」は、対象生体による学習に係る状態の一例である。また、学習は、特定の作用の一例である。また、特定の作用が働いた対象生体の状態として状態特定部109が特定する状態は、特定の作用が働いたことの効果がある状態および効果がない状態のみならず、特定の作用が働いたことにより良い影響が生じた状態および悪い影響が生じた状態の何れかであってもよい。
また、状態特定部109は、例えば、対象生体の生体分子の変化に基づいて、対象生体の状態を、個々状態としての美容状態が関連付けられた包括状態に特定してもよい。一例を挙げると、状態特定部109は、例えば、対象生体の状態を、美容状態である「スキンクリームA使用」(図4(A)参照)が関連付けられた「肌年齢40歳」に特定してもよい。また、他の一例を挙げると、状態特定部109は、対象生体の状態を、美容状態である「スキンクリームB使用」が関連付けられた「肌年齢25歳」に特定してもよい。「肌年齢40歳」および「肌年齢25歳」は、対象生体によるスキンクリームの使用に係る状態の一例である。また、スキンクリームの使用は、特定の作用の一例である。
In addition, in this embodiment, the condition specifying unit 109 specifies a condition related to a specific action of the target living body as a comprehensive condition associated with a health condition as an individual condition, but the present invention is not limited to this.
The state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as a comprehensive state associated with a physical state as an individual state based on, for example, a change in the biomolecules of the target organism. As one example, the state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as "training effective" associated with the physical state of "muscle pain" (see FIG. 4(A)). As another example, the state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as "training ineffective" associated with the physical state of "fatigue.""Trainingeffective" and "training ineffective" are examples of states related to the implementation of training by the target organism. Implementation of training is also an example of a specific action.
In addition, the state identification unit 109 may identify the state of the target organism as a comprehensive state associated with a brain state as an individual state based on, for example, changes in the biomolecules of the target organism. As an example, the state identification unit 109 may identify the state of the target organism as "improved memory" associated with the brain state "study for 3 hours" (see FIG. 4A) and the physical state "sleep for 8 hours". As another example, the state identification unit 109 may identify the state of the target organism as "deteriorated memory" associated with the brain state "study for 3 hours" and the physical state "sleep for 4 hours". In this way, two or more pieces of information among the individual state information may be associated with the comprehensive state information. "Improved memory" and "deteriorated memory" are examples of states related to learning by the target organism. Learning is also an example of a specific action. In addition, the state identified by the state identification unit 109 as the state of the target organism in which a specific action has occurred may not only be a state in which the specific action has an effect or a state in which the specific action has no effect, but also a state in which a positive effect or a negative effect has occurred as a result of the specific action.
Furthermore, the state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as a comprehensive state associated with a cosmetic state as an individual state, for example, based on a change in the biomolecules of the target organism. As one example, the state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as "skin age 40 years old" associated with the cosmetic state "skin cream A used" (see FIG. 4(A)). As another example, the state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as "skin age 25 years old" associated with the cosmetic state "skin cream B used". "Skin age 40 years old" and "skin age 25 years old" are examples of states related to the use of skin cream by the target organism. The use of skin cream is also an example of a specific action.
(状態特定処理の他の例)
次に、図9(A)に示した例および図13(A)に示した例の何れとも異なる対象分布情報が用いられる場合に行われる状態特定処理の例について説明する。
図15および図16は、状態特定処理により対象生体の状態が特定されるまでの一例を示した図である。
(Another example of the state identification process)
Next, an example of the state specification process that is performed when target distribution information different from either the example shown in FIG. 9(A) or the example shown in FIG. 13(A) is used will be described.
15 and 16 are diagrams showing an example of how the state of a target living organism is identified by the state identifying process.
以下では、対象生体が生体「F」であり、且つ、図15に示す四つの対象分布情報が使用分布情報である例について説明する。図15には、使用分布情報として、生体「F」について生体分子が得られた時点がそれぞれ異なる四つの対象分布情報が示されている。この四つの使用分布情報には、それぞれ、図6(A)に示した分布情報と同じように、互いに異なる七つの生体分子の分布が示されている。以下では、図15に示す四つの使用分布情報において、生体分子が得られた時点が早い分布情報から、順に、第1時点分布情報、第2時点分布情報、第3時点分布情報、第4時点分布情報とそれぞれ称することがある。なお、生体「F」は、例えば、バナナである。 In the following, an example will be described in which the target organism is organism "F" and the four pieces of target distribution information shown in FIG. 15 are usage distribution information. In FIG. 15, four pieces of target distribution information are shown as usage distribution information, each of which has a different time point at which the biomolecules were obtained for organism "F". Each of these four pieces of usage distribution information shows the distribution of seven different biomolecules, similar to the distribution information shown in FIG. 6(A). In the following, the four pieces of usage distribution information shown in FIG. 15 may be referred to as the first time point distribution information, the second time point distribution information, the third time point distribution information, and the fourth time point distribution information, in order from the distribution information at which the biomolecules were obtained earliest. Note that organism "F" is, for example, a banana.
本例では、区画部104は、各使用分布情報において、全ての領域を区画する。付言すると、各使用分布情報は、図15に示すように、横軸が生体分子の等電点について1乃至11からなる座標により示され、縦軸が生体分子の分子量について1乃至9からなる座標により示された2次元直交座標系である。また、横軸の座標が大きいほど、生体分子の等電点が大きいことを意味し、縦軸の座標が大きいほど、生体分子の分子量が大きいことを意味する。そして、区画部104は、各使用分布情報に示された領域を、座標ごとの領域に区画する。図15に示す例では、各使用分布情報においては、全ての領域が区画されることにより、生体分子が存在する区画領域と、生体分子が存在しない区画領域とが設けられる。 In this example, the partitioning unit 104 partitions all the regions in each piece of usage distribution information. In addition, as shown in FIG. 15, each piece of usage distribution information is a two-dimensional orthogonal coordinate system in which the horizontal axis is indicated by coordinates of 1 to 11 for the isoelectric point of the biomolecule and the vertical axis is indicated by coordinates of 1 to 9 for the molecular weight of the biomolecule. In addition, the larger the coordinate on the horizontal axis, the higher the isoelectric point of the biomolecule, and the larger the coordinate on the vertical axis, the higher the molecular weight of the biomolecule. Then, the partitioning unit 104 partitions the regions indicated in each piece of usage distribution information into regions for each coordinate. In the example shown in FIG. 15, all the regions are partitioned in each piece of usage distribution information, so that partitioned regions where biomolecules are present and partitioned regions where biomolecules are not present are provided.
なお、図示を省略するが、本例では、区画部104は、記憶部102に記憶されている比較分布情報についても、図15に示す使用分布情報と同じように、全ての領域を区画する。また、物質量特定部105は、比較分布情報における区画領域に含まれる生体分子の物質量を、区画領域ごとに特定する。さらに、統計部106は、生体分子の物質量の統計を区画領域ごとに算出し、区画領域ごとに統計情報を作成する。 Although not shown in the figure, in this example, the partitioning unit 104 partitions all areas of the comparative distribution information stored in the memory unit 102 in the same manner as the usage distribution information shown in FIG. 15. Furthermore, the substance amount identification unit 105 identifies the substance amount of the biomolecule contained in the partitioned area in the comparative distribution information for each partitioned area. Furthermore, the statistics unit 106 calculates statistics of the substance amount of the biomolecule for each partitioned area and creates statistical information for each partitioned area.
物質量特定部105は、各使用分布情報について、区画領域に含まれる生体分子の物質量を区画領域ごとに特定する。また、検出部107は、区画領域ごとに、生体分子が変化条件を満たすか否かを判定し、変化条件を満たすと判定した生体分子を検出する。
本例では、横軸の座標が「9」であり縦軸の座標が「5」である領域、すなわち領域(9、5)においては、第2時点分布情報に示された生体分子の物質量が、第1時点分布情報に示された生体分子の物質量よりも減少している。また、領域(9、5)においては、第4時点分布情報に示された生体分子の物質量が、第3時点分布情報に示された生体分子の物質量よりも増加している。さらに、領域(3、7)においては、第3時点分布情報には生体分子が示されていない一方で、第4時点分布情報には生体分子が示されている。そして、この場合、検出部107は、領域(9、5)の第1時点分布情報と第2時点分布情報とに示された生体分子を、変化条件を満たすものとして検出する。また、検出部107は、領域(9、5)の第3時点分布情報と第4時点分布情報とに示された生体分子を、変化条件を満たすものとして検出する。さらに、検出部107は、領域(3、7)の第4時点分布情報に示された生体分子を、変化条件を満たすものとして検出する。
なお、領域(3、7)においては、第1時点分布情報と、第2時点分布情報と、第3時点分布情報とで、生体分子の物質量に変化はない。より具体的には、領域(3、7)においては、第1時点分布情報と、第2時点分布情報と、第3時点分布情報とで、生体分子が示されていない。
The substance amount specifying unit 105 specifies the substance amount of the biomolecule contained in each partitioned region for each use distribution information. The detection unit 107 determines whether the biomolecule satisfies a change condition for each partitioned region, and detects the biomolecule determined to satisfy the change condition.
In this example, in the region where the horizontal coordinate is "9" and the vertical coordinate is "5", that is, the region (9, 5), the amount of substance of the biomolecule shown in the second time distribution information is decreased compared to the amount of substance of the biomolecule shown in the first time distribution information. In addition, in the region (9, 5), the amount of substance of the biomolecule shown in the fourth time distribution information is increased compared to the amount of substance of the biomolecule shown in the third time distribution information. Furthermore, in the region (3, 7), the third time distribution information does not show a biomolecule, while the fourth time distribution information shows a biomolecule. In this case, the detection unit 107 detects the biomolecule shown in the first time distribution information and the second time distribution information of the region (9, 5) as satisfying the change condition. In addition, the detection unit 107 detects the biomolecule shown in the third time distribution information and the fourth time distribution information of the region (9, 5) as satisfying the change condition. Furthermore, the detection unit 107 detects the biomolecule indicated in the fourth time point distribution information in the region (3, 7) as satisfying the change condition.
In the region (3, 7), there is no change in the amount of the biomolecule substance in the first, second, and third time point distribution information. More specifically, in the region (3, 7), the biomolecule is not shown in the first, second, and third time point distribution information.
次に、対象決定部108は、変化条件を満たす生体分子である検出分子と比較する対象である比較統計情報を決定する。
本例では、対象決定部108は、図16に示すように、領域(9、5)を対象とする統計情報の各々を、生体「F」について領域(9、5)に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。また、対象決定部108は、領域(3、7)を対象とする統計情報の各々を、生体「F」について領域(3、7)に示された検出分子に対する比較統計情報に決定する。これらの比較統計情報には、図16に示すように、包括状態である「品質良」が関連付けられた統計情報、および、包括状態である「品質悪」が関連付けられた統計情報が含まれる。図16は、状態特定部109に比較される情報を示した図である。より具体的には、図16は、使用分布情報の各々に示された生体分子、「品質良」が関連付けられた比較統計情報、および「品質悪」が関連付けられた比較統計情報を示した図である。
Next, the target determining unit 108 determines the comparison statistical information to be compared with the detection molecule, which is a biomolecule that satisfies the change condition.
In this example, as shown in FIG. 16, the target determination unit 108 determines each of the statistical information targeting the region (9, 5) as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region (9, 5) for the organism "F". Also, the target determination unit 108 determines each of the statistical information targeting the region (3, 7) as comparative statistical information for the detection molecule shown in the region (3, 7) for the organism "F". As shown in FIG. 16, these comparative statistical information include statistical information associated with the comprehensive state "good quality" and statistical information associated with the comprehensive state "poor quality". FIG. 16 is a diagram showing information to be compared by the state identification unit 109. More specifically, FIG. 16 is a diagram showing the biomolecules shown in each of the usage distribution information, the comparative statistical information associated with "good quality", and the comparative statistical information associated with "poor quality".
なお、図16に示す生体「F」の生体分子において、●の記号は、第1時点分布情報に示された生体分子を意味し、▲の記号は、第2時点分布情報に示された生体分子を意味し、■の記号は、第3時点分布情報に示された生体分子を意味し、★の記号は、第4時点分布情報に示された生体分子を意味する。 In the biomolecules of organism "F" shown in FIG. 16, the ● symbol represents the biomolecule shown in the first time point distribution information, the ▲ symbol represents the biomolecule shown in the second time point distribution information, the ■ symbol represents the biomolecule shown in the third time point distribution information, and the ★ symbol represents the biomolecule shown in the fourth time point distribution information.
次に、状態決定部109は、比較統計情報のうちの、同一類似条件を満たす生体分子を抽出する。
本例では、包括状態である「品質良」が関連付けられ領域(9、5)を対象とする比較統計情報の図中破線箇所アには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。そして、この箇所アに示された生体分子が、第1時点分布情報および第2時点分布情報の領域(9、5)に示された生体分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。また、包括状態である「品質悪」が関連付けられ領域(9、5)を対象とする比較統計情報の図中破線箇所イには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。そして、この箇所イに示された生体分子が、第1時点分布情報および第2時点分布情報の領域(9、5)に示された生体分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。
Next, the state determining unit 109 extracts biomolecules that satisfy the identical similarity condition from the comparison statistical information.
In this example, the dotted line portion A in the comparative statistical information for the region (9, 5) associated with the inclusive state "good quality" shows a decrease in the amount of substance of the biomolecule over time. The state identifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion A satisfies the same similarity condition with respect to the biomolecule shown in the region (9, 5) of the first time point distribution information and the second time point distribution information. The dotted line portion B in the comparative statistical information for the region (9, 5) associated with the inclusive state "poor quality" shows a decrease in the amount of substance of the biomolecule over time. The state identifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion B satisfies the same similarity condition with respect to the biomolecule shown in the region (9, 5) of the first time point distribution information and the second time point distribution information.
また、本例では、包括状態である「品質良」が関連付けられ領域(9、5)を対象とする比較統計情報の図中破線箇所ウには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そして、この箇所ウに示された生体分子が、第3時点分布情報および第4時点分布情報の領域(9、5)に示された生体分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。また、包括状態である「品質良」が関連付けられ領域(3、7)を対象とする比較統計情報の図中破線箇所エには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そして、この箇所エに示された生体分子が、第4時点分布情報の領域(3、7)に示された生体分子に対して同一類似条件を満たすと状態特定部109に判定される。
一方で、包括状態である「品質悪」が関連付けられ領域(9、5)を対象とする比較統計情報には、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加は示されていない。この場合、この比較統計情報に示された生体分子は、第3時点分布情報および第4時点分布情報の領域(9、5)に示された生体分子に対して同一類似条件を満たさないと状態特定部109に判定される。また、包括状態である「品質悪」が関連付けられ領域(3、7)を対象とする比較統計情報には、時間が経過しても生体分子の物質量が変化しないことが示されている。この場合、この比較統計情報に示された生体分子は、第4時点分布情報の領域(3、7)に示された生体分子に対して同一類似条件を満たさないと状態特定部109に判定される。
In this example, the dotted line portion C in the comparative statistical information for the region (9, 5) associated with the inclusive state "good quality" shows an increase in the amount of substance of the biomolecule over time. The state specifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion C satisfies the same similarity condition with respect to the biomolecule shown in the region (9, 5) of the third time point distribution information and the fourth time point distribution information. The dotted line portion D in the comparative statistical information for the region (3, 7) associated with the inclusive state "good quality" shows an increase in the amount of substance of the biomolecule over time. The state specifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this portion D satisfies the same similarity condition with respect to the biomolecule shown in the region (3, 7) of the fourth time point distribution information.
On the other hand, the comparative statistical information associated with the inclusive state "poor quality" and targeting the region (9, 5) does not show an increase in the amount of substance of the biomolecule over time. In this case, the state identifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this comparative statistical information does not satisfy the same similarity condition with respect to the biomolecule shown in the region (9, 5) of the third time point distribution information and the fourth time point distribution information. In addition, the comparative statistical information associated with the inclusive state "poor quality" and targeting the region (3, 7) shows that the amount of substance of the biomolecule does not change over time. In this case, the state identifying unit 109 determines that the biomolecule shown in this comparative statistical information does not satisfy the same similarity condition with respect to the biomolecule shown in the region (3, 7) of the fourth time point distribution information.
この場合、状態特定部109は、「品質良」が関連付けられている比較統計情報に示された生体分子を、同一類似条件を満たす生体分子として抽出する。また、状態特定部109は、抽出した比較統計情報に関連付けられた包括状態である「品質良」を、生体「F」の状態に特定する。
また、出力部110は、状態特定部109に特定された状態に関する状態通知画面40(図12参照)を、端末30の表示部31に表示させる。
In this case, the state identifying unit 109 extracts the biomolecule indicated in the comparison statistical information associated with "good quality" as a biomolecule that satisfies the same similarity condition. In addition, the state identifying unit 109 identifies "good quality", which is the comprehensive state associated with the extracted comparison statistical information, as the state of biomolecule "F".
Furthermore, the output unit 110 causes the display unit 31 of the terminal 30 to display a status notification screen 40 (see FIG. 12) relating to the status identified by the status identification unit 109 .
以上の通り、図15に示す使用分布情報のうちの、第1時点分布情報、第2時点分布情報、および第3時点分布情報においては、領域(3、7)に生体分子が示されていない。すなわち、本実施形態では、使用分布情報には、複数の区画領域の各々における複数の時点での生体分子の存在に関する情報が含まれ、この複数の区画領域には、複数の時点のうちの少なくとも一の時点において対象生体の生体分子が存在していない領域が含まれる。
この場合、生体分子が存在していなかった領域における生体分子の変化に応じて、対象生体の状態を特定することができる。
As described above, no biomolecules are shown in the region (3, 7) in the first time point distribution information, the second time point distribution information, and the third time point distribution information of the usage distribution information shown in Fig. 15. That is, in this embodiment, the usage distribution information includes information on the presence of biomolecules at multiple time points in each of the multiple partitioned regions, and the multiple partitioned regions include regions in which no biomolecules of the target organism are present at at least one of the multiple time points.
In this case, the state of the target living organism can be identified based on the change in the biomolecules in the area where the biomolecules were not present.
また、本実施形態では、情報取得部101は、第1期間における対象生体の生体分子の変化の特定が可能な情報と、第1期間よりも後の第2期間における生体分子の変化の特定が可能な情報とを含む情報を取得する。第1期間としては、例えば、第1時点分布情報に示された生体分子が得られた時点から、第2時点分布情報に示された生体分子が得られた時点までの期間が挙げられる。また、第2期間としては、例えば、第3時点分布情報に示された生体分子が得られた時点から、第4時点分布情報に示された生体分子が得られた時点までの期間が挙げられる。そして、状態特定部109は、第1期間における変化について変化条件を満たす生体分子の対象と、第2期間における変化について変化条件を満たす生体分子の対象とに応じて、対象生体の状態を特定する。
この場合、生体分子が単一の期間における変化について変化条件を満たすことのみに応じて対象生体の状態を特定する構成に比べて、対象生体の状態を特定する精度を向上させることができる。
In this embodiment, the information acquisition unit 101 acquires information including information that can identify changes in the biomolecules of the target organism in a first period and information that can identify changes in the biomolecules in a second period after the first period. The first period can be, for example, a period from the time when the biomolecules shown in the first time distribution information are obtained to the time when the biomolecules shown in the second time distribution information are obtained. The second period can be, for example, a period from the time when the biomolecules shown in the third time distribution information are obtained to the time when the biomolecules shown in the fourth time distribution information are obtained. The state identification unit 109 then identifies the state of the target organism according to the target of the biomolecules that satisfy the change condition for the change in the first period and the target of the biomolecules that satisfy the change condition for the change in the second period.
In this case, the accuracy of identifying the state of the target organism can be improved compared to a configuration in which the state of the target organism is identified based only on whether a biomolecule changes in a single period of time and satisfies a change condition.
特に、本実施形態では、第1期間における変化について変化条件を満たす生体分子の対象は、第2期間における変化について変化条件を満たす生体分子の対象と同じである。この生体分子の対象は、例えば、領域(9、5)に含まれる生体分子が挙げられる(図15、図16参照)。
この場合、特定の生体分子の複数の期間における変化に応じて対象生体の状態を特定することができる。
In particular, in this embodiment, the target biomolecule that satisfies the change condition for the change in the first time period is the same as the target biomolecule that satisfies the change condition for the change in the second time period. For example, the target biomolecule is the biomolecule included in the region (9, 5) (see FIG. 15 and FIG. 16).
In this case, the state of the target living organism can be identified based on changes in a specific biomolecule over multiple periods.
<第2の実施形態>
次に、第2の実施形態について説明する。第2の実施形態は、状態特定システム1が対象生体の状態を特定する点で、第1の実施形態と共通する。
一方で、第2の実施形態は、状態特定システム1のユーザが、対象生体について状態特定部109に何れの種類の状態を特定させるかを選択できる点で、第1の実施形態とは異なる。
以下、第2の実施形態について説明する。なお、第2の実施形態は、以下で説明する点を除き、第1の実施形態と同じ構成である。また、以下では、第1の実施形態と異なる構成について説明し、第1の実施形態と同じ構成については、説明を省略することがある。
Second Embodiment
Next, a second embodiment will be described. The second embodiment is common to the first embodiment in that a condition specifying system 1 specifies a condition of a target living body.
On the other hand, the second embodiment differs from the first embodiment in that the user of the condition identifying system 1 can select what type of condition the condition identifying unit 109 is to identify for the target living organism.
The second embodiment will be described below. The second embodiment has the same configuration as the first embodiment except for the points described below. In addition, the following will describe the configuration different from the first embodiment, and the description of the same configuration as the first embodiment may be omitted.
図17は、第2の実施形態の状態特定処理の流れを示したフローチャートである。また、図18は、第2の実施形態の状態特定処理が行われる場合に端末30の表示部31に表示される画像を示した図である。また、図19は、第2の実施形態の状態特定処理により対象生体の状態が特定されるまでの一例を示した図である。なお、以下では、対象生体が生体「G」である例について説明する。また、生体「G」は、例えば、人間である。
本実施形態においても、状態特定システム1のユーザが、状態特定処理に用いられる対象分布情報を指定して状態特定処理の実行をサーバ装置10に指示すると、状態特定処理が開始される。
Fig. 17 is a flowchart showing the flow of the condition identification process of the second embodiment. Fig. 18 is a diagram showing an image displayed on the display unit 31 of the terminal 30 when the condition identification process of the second embodiment is performed. Fig. 19 is a diagram showing an example of how the condition of a target living organism is identified by the condition identification process of the second embodiment. In the following, an example will be described in which the target living organism is a living organism "G". Furthermore, the living organism "G" is, for example, a human being.
In the present embodiment as well, when a user of the condition identification system 1 designates target distribution information to be used in the condition identification process and instructs the server device 10 to execute the condition identification process, the condition identification process is started.
まず、情報取得部101は、対象生体の状態を特定する指示があったか否かを判定する(図17のS301)。ユーザが対象生体の状態を特定する指示を端末30に入力すると、指示があった旨が端末30からサーバ装置10に通知される。情報取得部101は、この通知を受けたか否かにより、対象生体の状態を特定する指示があったか否かを判定する。また、否定結果が継続する間、情報取得部101は、ステップ301の処理を繰り返す。 First, the information acquisition unit 101 determines whether or not an instruction to identify the state of the target living organism has been given (S301 in FIG. 17). When the user inputs an instruction to identify the state of the target living organism into the terminal 30, the terminal 30 notifies the server device 10 that an instruction has been given. The information acquisition unit 101 determines whether or not an instruction to identify the state of the target living organism has been given based on whether or not this notification has been received. Furthermore, while a negative result continues, the information acquisition unit 101 repeats the processing of step 301.
対象生体の状態を特定する指示があった旨が端末30からサーバ装置10に通知された場合(S301にてYES)、情報取得部101は、状態特定部109に何れの種類の状態を特定させるかが選択されたか否かを判定する(S302)。ユーザが何れの種類の状態を状態特定部109に特定させるかを端末30において選択すると、選択された状態の種類を示す種類情報が、端末30からサーバ装置10に送信される。情報取得部101は、この種類情報を取得したか否かにより、状態特定部109に何れの種類の状態を特定させるかが選択されたか否かを判定する。また、否定結果が継続する間、情報取得部101は、ステップ302の処理を繰り返す。 When the terminal 30 notifies the server device 10 that an instruction to identify the state of the target living organism has been given (YES in S301), the information acquisition unit 101 determines whether or not a type of state has been selected for the state identification unit 109 to identify (S302). When the user selects on the terminal 30 which type of state the state identification unit 109 is to identify, type information indicating the type of selected state is transmitted from the terminal 30 to the server device 10. The information acquisition unit 101 determines whether or not a type of state has been selected for the state identification unit 109 to identify, depending on whether or not this type information has been acquired. Also, while a negative result continues, the information acquisition unit 101 repeats the process of step 302.
本例では、状態特定処理において、ユーザが対象生体の状態を特定する指示を端末30に入力すると、図18(A)に示すように、端末30の表示部31には、選択画面50が表示される。選択画面50は、状態特定部109に何れの種類の状態を特定させるかをユーザに選択させるための画面である。選択画面50には、選択促進部51と、項目部52と、決定部53とが示されている。
選択促進部51には、状態特定部109に何れの種類の状態を特定させるかの選択をユーザに促すための情報が示されている。図示の例では、選択促進部51には、「知りたい状態の種類を選んでください」のテキストが示されている。
In this example, when the user inputs an instruction to identify the state of a target living organism to the terminal 30 in the state identification process, a selection screen 50 is displayed on the display unit 31 of the terminal 30, as shown in Fig. 18 (A). The selection screen 50 is a screen for allowing the user to select which type of state is to be identified by the state identification unit 109. The selection screen 50 shows a selection prompting unit 51, an item unit 52, and a decision unit 53.
The selection prompting section 51 displays information for prompting the user to select which type of status should be identified by the status identification section 109. In the illustrated example, the selection prompting section 51 displays the text "Please select the type of status you want to know about."
項目部52には、ユーザが選択できる項目が示される。項目部52には、項目選択部521が示されている。
項目選択部521は、状態特定部109が特定する状態の種類について区分けされた項目が示される。図示の例では、項目選択部521には、状態特定部109が特定する状態について区分けされた「健康状態」、「肉体状態」、「脳状態」、「美容状態」を含む項目が示されている。また、図示の例では、項目選択部521において「健康状態」が選択されている。
Items that the user can select are displayed in the item section 52. In the item section 52, an item selection section 521 is displayed.
The item selection section 521 displays items classified according to the type of condition identified by the condition identification section 109. In the illustrated example, the item selection section 521 displays items including "health condition,""physicalcondition,""braincondition," and "beauty condition" classified according to the condition identified by the condition identification section 109. In the illustrated example, "health condition" is selected in the item selection section 521.
項目選択部521において「健康状態」が選択されている状態で、ユーザが、決定部53を選択すると、図18(B)に示すように、選択画面50の項目部52には、選択項目部522と、詳細選択部523とが表示される。また、選択画面50には、戻り部54と、決定部55とが表示される。 When "health condition" is selected in the item selection section 521 and the user selects the decision section 53, as shown in FIG. 18 (B), a selection item section 522 and a detailed selection section 523 are displayed in the item section 52 of the selection screen 50. In addition, a return section 54 and a decision section 55 are displayed on the selection screen 50.
項目部52の選択項目部522には、項目選択部521において選択された項目が示される。図示の例では、選択項目部522には、「健康状態」が示されている。
項目部52の詳細選択部523には、選択項目部522に示された項目についてさらに区分けされた項目が示されている。詳細選択部523に示された項目は、ユーザが選択できる項目である。図示の例では、詳細選択部523には、選択項目部522に示された「健康状態」についてさらに区分けされた「インフルエンザ」、「COVID-19」、「ノロウイルス」、「肝炎」を含む項目が示されている。また、図示の例では、詳細選択部523において、「インフルエンザ」が選択されている。
The selection item section 522 of the item section 52 displays the item selected in the item selection section 521. In the illustrated example, the selection item section 522 displays "health condition".
The detailed selection section 523 of the item section 52 shows items that are further divided from the items shown in the selection item section 522. The items shown in the detailed selection section 523 are items that can be selected by the user. In the illustrated example, the detailed selection section 523 shows items including "influenza,""COVID-19,""norovirus," and "hepatitis," which are further divided from the "health condition" shown in the selection item section 522. Also, in the illustrated example, "influenza" is selected in the detailed selection section 523.
ユーザが戻り部54を選択すると、図18(A)に示す選択画面50が再び端末30の表示部31に表示される。
また、詳細選択部523において「インフルエンザ」が選択されている状態で、ユーザが決定部55を選択すると、選択された状態の種類である「インフルエンザ」を示す種類情報が、端末30からサーバ装置10に送信される。
When the user selects the return section 54, the selection screen 50 shown in FIG.
In addition, when “influenza” is selected in the detailed selection section 523 and the user selects the decision section 55, type information indicating “influenza”, which is the type of the selected condition, is transmitted from the terminal 30 to the server device 10.
情報取得部101が種類情報を取得すると(S302にてYES)、次のステップに進む。対象決定部108は、記憶部102に記憶されている統計情報のうちの、情報取得部101に取得された種類情報が包括状態情報として関連付けられている統計情報を、対象生体の生体分子と比較する対象の統計情報として抽出する(S303)。より具体的には、対象決定部108は、種類情報が関連付けられている統計情報であって、抽出条件を満たす生体分子が示されている領域を対象とする統計情報を抽出する。抽出条件は、対象決定部108が対象生体の生体分子と比較する対象の統計情報を抽出するために定められた条件である。本実施形態の抽出条件は、時間の経過に伴い物質量が変化した生体分子が示されている領域を対象とする統計情報を抽出する観点から定められている。また、本実施形態では、統計情報に含まれる生体分子の物質量が時間の経過に伴い予め定められた値以上変化していることが、抽出条件として定められている。 When the information acquisition unit 101 acquires the type information (YES in S302), the process proceeds to the next step. The target determination unit 108 extracts, from the statistical information stored in the storage unit 102, statistical information to which the type information acquired by the information acquisition unit 101 is associated as comprehensive state information, as statistical information to be compared with the biomolecule of the target organism (S303). More specifically, the target determination unit 108 extracts statistical information to which the type information is associated, the statistical information targeting an area in which a biomolecule satisfying the extraction condition is shown. The extraction condition is a condition determined for the target determination unit 108 to extract statistical information to be compared with the biomolecule of the target organism. The extraction condition of this embodiment is determined from the viewpoint of extracting statistical information targeting an area in which a biomolecule whose substance amount has changed over time is shown. In addition, in this embodiment, the extraction condition is determined to be that the substance amount of the biomolecule included in the statistical information has changed by more than a predetermined value over time.
図19(A)は、記憶部102に記憶されている統計情報の一例を示した図である。本例では、記憶部102には、図19(A)に示すように、種類情報である「インフルエンザ」が包括状態情報として関連付けられている統計情報が記憶されている。また、「インフルエンザ」が関連付けられ領域20を対象とする統計情報の図中破線箇所Iには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。また、「インフルエンザ」が関連付けられ領域15を対象とする統計情報の図中破線箇所IIには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の減少が示されている。さらに、「インフルエンザ」が関連付けられ領域14を対象とする統計情報の図中破線箇所IIIには、時間の経過に伴う生体分子の物質量の増加が示されている。そして、この場合、対象決定部108は、「インフルエンザ」がそれぞれ関連付けられた、領域20を対象とする統計情報、領域15を対象とする統計情報、および領域14を対象とする統計情報を、何れも、抽出条件を満たす統計情報として抽出する。 19A is a diagram showing an example of statistical information stored in the storage unit 102. In this example, as shown in FIG. 19A, the storage unit 102 stores statistical information associated with the type information "influenza" as comprehensive state information. In addition, the dashed line portion I in the figure of the statistical information associated with "influenza" and targeting the region 20 shows a decrease in the substance amount of the biomolecule over time. In addition, the dashed line portion II in the figure of the statistical information associated with "influenza" and targeting the region 15 shows a decrease in the substance amount of the biomolecule over time. In addition, the dashed line portion III in the figure of the statistical information associated with "influenza" and targeting the region 14 shows an increase in the substance amount of the biomolecule over time. In this case, the target determination unit 108 extracts the statistical information associated with "influenza" and targeting the region 20, the statistical information associated with the region 15, and the statistical information associated with the region 14 as statistical information that satisfies the extraction condition.
次に、物質量特定部105は、各使用分布情報について、区画領域に示された生体分子の物質量を区画領域ごとに特定する(S304)。
次に、対象決定部108は、ステップ303において抽出した統計情報に示された生体分子と比較する対象生体の生体分子を決定する(S305)。より具体的には、対象決定部108は、ステップ303において抽出された統計情報と対象の座標が同一である区画領域に含まれる生体分子を、比較の対象の生体分子に決定する。
Next, the substance amount specifying unit 105 specifies, for each partition area, the substance amount of the biomolecule shown in the partition area for each piece of usage distribution information (S304).
Next, the target determining unit 108 determines (S305) a biomolecule of a target organism to be compared with the biomolecule indicated in the statistical information extracted in step 303. More specifically, the target determining unit 108 determines a biomolecule included in a partitioned area in which the statistical information extracted in step 303 and the target coordinates are the same as each other as the biomolecule to be compared.
本例では、上記の通り、領域20を対象とする統計情報、領域15を対象とする統計情報、および領域14を対象とする統計情報が抽出されている。この場合、対象決定部108は、生体「G」についての使用分布情報に示された生体分子のうちの、領域20に含まれる生体分子、領域15に含まれる生体分子、および領域14に含まれる生体分子を、それぞれ、比較の対象の生体分子に決定する。
図19(B)は、ステップ303において抽出された統計情報と、この統計情報との比較の対象として対象決定部108に決定された対象生体の生体分子を示した図である。図19(B)には、統計情報として、「インフルエンザ」がそれぞれ関連付けられ、領域20を対象とする統計情報、領域15を対象とする統計情報、および領域14を対象とする統計情報が示されている。また、図19(B)には、生体「G」の生体分子として、各使用分布情報において、領域20に含まれる生体分子、領域15に含まれる生体分子、および領域14に含まれる生体分子が示されている。図19(B)に示した各図において、横軸は生体分子が得られた時点であり、縦軸は生体分子の物質量である。
In this example, as described above, statistical information for region 20, statistical information for region 15, and statistical information for region 14 are extracted. In this case, the target determination unit 108 determines the biomolecules included in region 20, the biomolecules included in region 15, and the biomolecules included in region 14, among the biomolecules shown in the usage distribution information for organism "G", as the biomolecules to be compared.
Fig. 19(B) is a diagram showing the statistical information extracted in step 303 and the biomolecules of the target organism determined by the target determination unit 108 as the target for comparison with this statistical information. Fig. 19(B) shows statistical information for region 20, statistical information for region 15, and statistical information for region 14, each of which is associated with "influenza" as statistical information. Fig. 19(B) also shows the biomolecules included in region 20, the biomolecules included in region 15, and the biomolecules included in region 14 in each usage distribution information as the biomolecules of organism "G". In each diagram shown in Fig. 19(B), the horizontal axis indicates the time point when the biomolecule was obtained, and the vertical axis indicates the substance amount of the biomolecule.
次に、状態特定部109は、統計情報と対象生体の生体分子とを比較し、比較した結果から、対象生体の状態を特定する(S306)。より具体的には、状態特定部109は、比較の対象として対象決定部108に決定された生体分子が、特定条件を満たすか否かに基づいて、対象生体の状態を特定する。特定条件は、状態特定部109が、対象生体の状態を、統計情報に関連付けられた包括状態であると特定するために定められた条件である。本実施形態では、対象生体における生体分子の物質量の時間の経過に伴う変化の値と、統計情報において抽出条件を満たす生体分子の物質量の変化の値との差が、予め定められた値以下であることが、特定条件として定められている。 Next, the state identification unit 109 compares the statistical information with the biomolecules of the target organism, and identifies the state of the target organism from the comparison result (S306). More specifically, the state identification unit 109 identifies the state of the target organism based on whether or not the biomolecules determined by the target determination unit 108 as the subjects of comparison satisfy a specific condition. The specific condition is a condition determined so that the state identification unit 109 identifies the state of the target organism as a comprehensive state associated with the statistical information. In this embodiment, the specific condition is determined such that the difference between the value of the change over time in the substance amount of the biomolecules in the target organism and the value of the change in the substance amount of the biomolecules that satisfy the extraction condition in the statistical information is equal to or less than a predetermined value.
状態特定部109は、対象生体の生体分子が特定条件を満たす場合、ステップ303において抽出された統計情報に関連付けられた包括状態を、対象生体の状態に特定する。また、状態特定部109は、対象生体の生体分子が特定条件を満たさない場合、ステップ303において抽出された統計情報に関連付けられた包括状態ではない状態を、対象生体の状態に特定する。
なお、対象決定部108に比較の対象として決定された対象生体の生体分子が、複数の区画領域における生体分子である場合がある。この場合、状態特定部109は、各区画領域に含まれる生体分子が、何れも特定条件を満たす場合に、対象生体の生体分子が特定条件を満たすと判定する。また、状態特定部109は、各区画領域に含まれる生体分子の何れかが特定条件を満たさない場合、対象生体の生体分子が特定条件を満たさないと判定する。
When the biomolecules of the target organism satisfy the specific condition, the state identifying unit 109 identifies the inclusive state associated with the statistical information extracted in step 303 as the state of the target organism. When the biomolecules of the target organism do not satisfy the specific condition, the state identifying unit 109 identifies a non-inclusive state associated with the statistical information extracted in step 303 as the state of the target organism.
In addition, the biomolecule of the target organism determined as the comparison target by the target determination unit 108 may be a biomolecule in multiple partitioned regions. In this case, the state determination unit 109 determines that the biomolecule of the target organism satisfies the specific condition when all of the biomolecules contained in each partitioned region satisfy the specific condition. In addition, the state determination unit 109 determines that the biomolecule of the target organism does not satisfy the specific condition when any of the biomolecules contained in each partitioned region does not satisfy the specific condition.
本例では、図19(B)に示すように、生体「G」について領域20に含まれる生体分子は、時間が経過しても物質量が変化していない。
また、生体「G」について領域15に含まれる生体分子は、時間の経過に伴い物質量が増加している。この生体分子の物質量の変化は、「インフルエンザ」が関連付けられ領域15を対象とする統計情報に示された生体分子の物質量の減少とは逆の傾向の変化である。
さらに、生体「G」について領域14に含まれる生体分子は、時間が経過しても物質量が変化していない。
この場合、状態特定部109は、対象生体の生体分子が特定条件を満たさないと判定する。さらに、状態特定部109は、生体「G」が、統計情報に関連付けられた「インフルエンザ」ではない状態であると特定する。
In this example, as shown in FIG. 19B, the amount of substance of the biomolecules contained in region 20 for organism "G" does not change over time.
Furthermore, the amount of substance of the biomolecule contained in region 15 for the organism "G" increases over time. This change in the amount of substance of the biomolecule is an opposite trend to the decrease in the amount of substance of the biomolecule associated with "influenza" and shown in the statistical information for region 15.
Furthermore, for the organism "G," the amount of substance of the biomolecules contained in region 14 does not change over time.
In this case, the state identifying unit 109 determines that the biomolecule of the target organism does not satisfy the specific condition. Furthermore, the state identifying unit 109 identifies the organism "G" as being in a state other than "influenza" associated with the statistical information.
次に、出力部110は、状態特定部109に特定された状態に関する情報を、端末30に出力する(S307)。
本例では、出力部110は、図18(C)に示すように、端末30の表示部31に、状態通知画面40を表示させる。本実施形態の状態通知画面40には、生体識別部41と、状態通知部42と、注意喚起部45と、詳細促進部46と、否定部47と、決定部48とが示されている。
Next, the output unit 110 outputs information on the state identified by the state identifying unit 109 to the terminal 30 (S307).
18(C), the output unit 110 displays a status notification screen 40 on the display unit 31 of the terminal 30. The status notification screen 40 of this embodiment includes a biometric identification unit 41, a status notification unit 42, a warning unit 45, a detail prompting unit 46, a negation unit 47, and a decision unit 48.
生体識別部41には、対象生体を識別する情報を含む「Gさん」のテキストが示されている。
状態通知部42には、「現在の状態」のテキストと、状態特定部109に特定された状態を示す「インフルエンザではありません」のテキストとが示されている。
The biometric identification section 41 displays the text of "Mr. G" including information for identifying the target biometric entity.
The status notification section 42 displays the text "Current Status" and the text "Not influenza" indicating the status identified by the status identification section 109.
注意喚起部45には、対象生体の状態についてユーザに注意を喚起するための情報が示されている。本実施形態では、出力部110は、使用分布情報における何れかの区画領域に含まれる生体分子が変化条件を満たす場合に、注意喚起部45を表示させる。
対象生体の生体分子の物質量が変化した場合、この変化に伴い対象生体の状態に変化が生じた場合がある。そこで、本実施形態のサーバ装置10は、使用分布情報に示された生体分子が変化条件を満たす場合には、対象生体の生体分子が特定条件を満たさない場合であっても、対象生体の状態についてユーザに注意喚起をする。
The attention-calling unit 45 displays information for calling the user's attention to the state of the target living body. In this embodiment, the output unit 110 displays the attention-calling unit 45 when a biomolecule included in any of the partitioned regions in the usage distribution information satisfies a change condition.
When the amount of a substance of a biomolecule of a target organism changes, the state of the target organism may change accordingly. Therefore, in the server device 10 of the present embodiment, when the biomolecule indicated in the usage distribution information satisfies the change condition, even if the biomolecule of the target organism does not satisfy the specific condition, the server device 10 alerts the user to the state of the target organism.
本例では、図19(B)に示すように、生体Gについて領域15に含まれる生体分子のうちの、図中破線箇所IVに示す生体分子は、時間の経過に伴い物質量が増加しており、この箇所IVに示された生体分子が、変化条件を満たす。そのため、状態通知画面40に、注意喚起部45が表示される。図示の例では、注意喚起部45には、「注意」のテキストと、「健康状態について、健康ではない他の状態である可能性があります」のテキストとが示されている。 In this example, as shown in FIG. 19(B), among the biomolecules contained in region 15 for organism G, the biomolecule shown at dashed line portion IV in the figure increases in substance amount over time, and the biomolecule shown at this portion IV satisfies the change condition. Therefore, a warning section 45 is displayed on the status notification screen 40. In the illustrated example, warning section 45 displays the text "Caution" and the text "Your health condition may be in another unhealthy state."
詳細促進部46には、対象生体の詳細な状態を状態特定部109に特定させることをユーザに促す情報が示されている。図示の例では、詳細促進部46には、「他の状態を特定しますか?」のテキストが示されている。
ユーザが否定部47を選択すると、対象生体の詳細な状態は特定されず、状態特定処理が終了する。
また、ユーザが決定部48を選択すると、図8に示す状態特定処理が実行される。これにより、対象生体について、対象生体の詳細な状態が特定されるとともに、特定された状態に関する状態通知画面40(図12参照)が端末30の表示部31に表示される。
The detail prompting section 46 displays information that prompts the user to have the condition specifying section 109 specify a detailed condition of the target living body. In the illustrated example, the detail prompting section 46 displays the text "Do you want to specify another condition?"
When the user selects the negation section 47, the detailed condition of the target living body is not specified, and the condition specifying process ends.
Furthermore, when the user selects the determination unit 48, the condition identification process shown in Fig. 8 is executed. As a result, the detailed condition of the target living body is identified, and a condition notification screen 40 (see Fig. 12) relating to the identified condition is displayed on the display unit 31 of the terminal 30.
以上の通り、本実施形態では、対象生体について状態特定部109に何れの種類の状態を特定させるかがユーザに選択されると、情報取得部101は、選択された状態の種類を示す種類情報を取得する。そして、対象決定部108は、種類情報から特定される状態の種類から、対象生体の状態の特定に用いる使用分布情報を決定する。さらに、状態特定部109は、対象決定部108に決定された使用分布情報に示された生体分子の変化から、対象生体の状態を特定する。すなわち、本実施形態では、情報取得部101は、生体の状態について区分けされた複数の項目のうちの、状態特定システム1に特定される対象の項目に関する項目情報を取得する。そして、状態特定部109は、項目情報から特定される項目に応じて定められる生体分子の対象について使用分布情報から特定される変化に応じて、対象生体の状態を特定する。項目情報としては、例えば、種類情報が挙げられる。また、情報取得部101は、項目情報を取得する項目情報取得手段としても捉えられる。
この場合、複数の生体分子のうちの、対象生体について特定される対象の状態の項目によって定められた生体分子に応じて、対象生体の状態を特定することができる。
As described above, in this embodiment, when the user selects which type of state the state specifying unit 109 should specify for the target organism, the information acquiring unit 101 acquires type information indicating the type of the selected state. Then, the target determining unit 108 determines the usage distribution information used to specify the state of the target organism from the type of state specified from the type information. Furthermore, the state specifying unit 109 specifies the state of the target organism from the change in the biomolecules indicated in the usage distribution information determined by the target determining unit 108. That is, in this embodiment, the information acquiring unit 101 acquires item information regarding the target item specified by the state specifying system 1 among a plurality of items classified for the state of the organism. Then, the state specifying unit 109 specifies the state of the target organism according to the change specified from the usage distribution information for the target of the biomolecule determined according to the item specified from the item information. For example, type information can be given as the item information. The information acquiring unit 101 can also be regarded as an item information acquiring means for acquiring item information.
In this case, the state of the target living organism can be identified according to the biomolecule, among the multiple biomolecules, that is determined by the item of the target state identified for the target living organism.
なお、本実施形態において、使用分布情報が図9(A)に示した二つの対象分布情報であり、状態特定部109に特定させる状態の種類として「インフルエンザ」が選択された場合、状態特定部109は、対象生体の状態を「インフルエンザ」に特定する。また、この場合、出力部110は、図12に示した状態通知画面40を端末30の表示部31に表示させる。
また、本実施形態において、使用分布情報が図13(A)に示した二つの対象分布情報であり、状態特定部109に特定される状態の種類として「抗がん剤の効果」が選択された場合、状態特定部109は、対象生体の状態を「抗がん剤効果あり」に特定する。また、出力部110は、状態特定部109に特定された状態に関する状態通知画面40を表示部31に表示する。
また、本実施形態において、使用分布情報が図15に示した四つの対象分布情報であり、状態特定部109に特定される状態の種類として「品質」が選択された場合、状態特定部109は、対象生体の状態を「品質良」に特定する。また、出力部110は、状態特定部109に特定された状態に関する状態通知画面40を表示部31に表示する。
In this embodiment, when the usage distribution information is the two target distribution information shown in Fig. 9(A) and "influenza" is selected as the type of condition to be identified by the condition identification unit 109, the condition identification unit 109 identifies the condition of the target living body as "influenza." In this case, the output unit 110 causes the display unit 31 of the terminal 30 to display the condition notification screen 40 shown in Fig. 12.
13A and “anticancer drug effect” is selected as the type of condition identified by the condition identifying unit 109, the condition identifying unit 109 identifies the condition of the target organism as “anticancer drug effect.” The output unit 110 displays a condition notification screen 40 related to the condition identified by the condition identifying unit 109 on the display unit 31.
15 and “quality” is selected as the type of state to be identified by the state identifying unit 109, the state identifying unit 109 identifies the state of the target organism as “good quality.” The output unit 110 displays a state notification screen 40 related to the state identified by the state identifying unit 109 on the display unit 31.
次に、本発明者が行った実施例について説明する。 Next, we will explain the examples carried out by the inventor.
[実施例]
本発明者は、生体の生体分子が複数示された2次元電気泳動像を、複数の時点で得られた生体分子についてそれぞれ作成し、作成した複数の2次元電気泳動像から、2次元電気泳動に示された各生体分子の物質量の時間の経過に伴う変化を調べた。この実施例においては、生体分子の物質量の変化を調べる対象の生体を、三頭の競走馬とした。この三頭の馬を個別に説明する場合、それぞれ、「馬A」、「馬B」、「馬C」と称する場合がある。また、生体分子の物質量の変化を調べる対象の馬を区別することなく説明する場合、対象馬と称する場合がある。本発明者は、対象馬から得られた血清を用いて、血清に含まれる各タンパク質が示された2次元電気泳動像を作成した。
なお、血清が得られた時点における対象馬の年齢は、何れも、2歳である。また、対象馬から血清が得られた時点において、馬Aの体重は、348kgであり、馬Bの体重は、379kgであり、馬Cの体重は、377kgであった。
[Example]
The present inventors prepared two-dimensional electrophoretic images showing a plurality of biomolecules of a living organism for each of the biomolecules obtained at a plurality of time points, and examined the change over time in the substance amount of each biomolecule shown in the two-dimensional electrophoresis from the prepared plurality of two-dimensional electrophoretic images. In this embodiment, the living organisms to be examined for the change in the substance amount of the biomolecules were three racehorses. When describing the three horses individually, they may be referred to as "horse A", "horse B", and "horse C", respectively. When describing the horses to be examined for the change in the substance amount of the biomolecule without distinction, they may be referred to as the subject horses. The present inventors prepared two-dimensional electrophoretic images showing each protein contained in the serum using serum obtained from the subject horses.
The age of all the subject horses at the time when the serum was obtained was 2 years old. Furthermore, at the time when the serum was obtained from the subject horses, the body weight of Horse A was 348 kg, the body weight of Horse B was 379 kg, and the body weight of Horse C was 377 kg.
図20(A)は、馬Aから一の時点で得られた血清に含まれる各タンパク質が示された2次元電気泳動像を示した図である。この2次元電気泳動像においては、図中横軸にタンパク質の等電点の分布が示され、図中縦軸にタンパク質の分子量の分布が示された2次元直交座標系で、各タンパク質の物質量の分布が示されている。この2次元電気泳動像に示された黒色の画像は、それぞれ、タンパク質である。また、この黒色の画像の濃度が高いほど、それぞれのタンパク質の物質量が多いことを意味する。
本発明者は、各対象馬について、十五の時点で対象馬から血清を得て、得られた血清ごとに2次元電気泳動像を作成した。より具体的には、各対象馬をインフルエンザウイルスに感染させ、感染させた日から14日が経過するまでの各日で対象馬から血清を得て、得られた血清ごとに2次元電気泳動像を作成した。
20(A) is a diagram showing a two-dimensional electrophoretic image showing each protein contained in serum obtained from horse A at a single time point. In this two-dimensional electrophoretic image, the distribution of the substance amount of each protein is shown in a two-dimensional orthogonal coordinate system in which the horizontal axis shows the distribution of the isoelectric point of the protein and the vertical axis shows the distribution of the molecular weight of the protein. Each black image shown in this two-dimensional electrophoretic image represents a protein. Also, the higher the density of this black image, the greater the substance amount of each protein.
The inventors obtained serum from each subject horse at 15 time points and created a two-dimensional electrophoretic image for each serum obtained. More specifically, each subject horse was infected with influenza virus, serum was obtained from the subject horse on each day up to 14 days after the day of infection, and a two-dimensional electrophoretic image was created for each serum obtained.
また、本発明者は、作成した2次元電気泳動像に示された領域を、複数の領域に区画した。図20(B)は、図20(A)の2次元電気泳動像が複数の領域に区画された状態を示す図である。図示の例では、2次元電気泳動像に示された領域が、338の領域に区画されている。また、区画した領域の一例である二十の領域に対して、それぞれ、1乃至20の番号を付した。本発明者は、作成した2次元電気泳動像の各々について、図20(B)に示した例と同じように、領域を区画した。 The inventor also divided the area shown in the two-dimensional electrophoretic image into multiple regions. Figure 20(B) is a diagram showing the state in which the two-dimensional electrophoretic image of Figure 20(A) has been divided into multiple regions. In the example shown, the area shown in the two-dimensional electrophoretic image is divided into 338 regions. Furthermore, the twenty regions, which are an example of the divided regions, are numbered 1 to 20, respectively. The inventor divided the regions in each of the two-dimensional electrophoretic images he created in the same manner as the example shown in Figure 20(B).
また、本発明者は、作成した2次元電気泳動像の各々について、区画した領域ごとに、領域に含まれるタンパク質の物質量を特定した。さらに、本発明者は、特定したタンパク質の物質量について、各対象馬の統計を算出した。より具体的には、発明者は、対象馬をインフルエンザウイルスに感染された日から経過した日ごとの、タンパク質の物質量の統計を算出した。また、この統計の算出は、2次元電気泳動像において区画された領域ごとに行われた。そして、発明者は、算出した統計から、時間の経過に伴うタンパク質の物質量の変化を評価した。 The inventor also identified the amount of protein contained in each divided region of each of the created two-dimensional electrophoretic images. Furthermore, the inventor calculated statistics for each subject horse regarding the amount of protein contained in the identified region. More specifically, the inventor calculated statistics regarding the amount of protein contained in each day since the subject horse was infected with influenza virus. Furthermore, the calculation of these statistics was performed for each divided region in the two-dimensional electrophoretic image. The inventor then evaluated the change in the amount of protein contained in each region over time from the calculated statistics.
(比較例)
また、実施例に対する比較例として、各対象馬について、対象馬がインフルエンザウイルスに感染した日から14日が経過するまでの各日において、体温を測定するとともに、対象馬から得られたタンパク質の一例としてのアミロイドAの物質量を測定した。
図21(A)は、対象馬の体温を示した図である。図21(A)において、横軸には、対象馬がインフルエンザウイルスに感染してから経過した日数が示され、縦軸には、対象馬の体温が示されている。また、図21(A)において、「●」の記号は、馬Aを示し、「▲」の記号は、馬Bを示し、「■」の記号は、馬Cを示す。
また、図21(B)は、対象馬から得られたアミロイドAの物質量を示した図である。図21(B)において、横軸には、対象馬がインフルエンザウイルスに感染してから経過した日数が示され、縦軸には、対象馬のアミロイドAの物質量が示されている。また、図21(B)において、「●」の記号は、馬Aを示し、「▲」の記号は、馬Bを示し、「■」の記号は、馬Cを示す。
Comparative Example
In addition, as a comparative example to the examples, the body temperature of each subject horse was measured every day up to 14 days after the day the subject horse was infected with the influenza virus, and the amount of amyloid A substance, an example of a protein, obtained from the subject horse was measured.
Figure 21 (A) is a diagram showing the body temperatures of the subject horses. In Figure 21 (A), the horizontal axis shows the number of days that have passed since the subject horse was infected with influenza virus, and the vertical axis shows the body temperature of the subject horse. In Figure 21 (A), the symbol "●" indicates horse A, the symbol "▲" indicates horse B, and the symbol "■" indicates horse C.
Moreover, Figure 21 (B) is a diagram showing the amount of amyloid A substance obtained from the subject horses. In Figure 21 (B), the horizontal axis shows the number of days that have passed since the subject horses were infected with influenza virus, and the vertical axis shows the amount of amyloid A substance in the subject horses. In Figure 21 (B), the symbol "●" indicates horse A, the symbol "▲" indicates horse B, and the symbol "■" indicates horse C.
図21(A)から、何れの対象馬についても、インフルエンザウイルスに感染してから二日が経過したときに、体温の上昇が確認された。そのため、馬がインフルエンザウイルスに感染してから二日経過したときの体温の上昇に基づいて、この馬がインフルエンザウイルスに感染していると特定される。すなわち、ユーザが、馬の体温からこの馬がインフルエンザウイルスに感染していることを特定するためには、馬がインフルエンザウイルスに感染してから二日を要する。 As can be seen from FIG. 21(A), for each of the subject horses, an increase in body temperature was confirmed two days after infection with the influenza virus. Therefore, the horse is identified as being infected with the influenza virus based on the increase in body temperature two days after infection with the influenza virus. In other words, it takes two days after the horse is infected with the influenza virus for a user to identify that the horse is infected with the influenza virus from the horse's body temperature.
また、図21(B)から、何れの対象馬についても、インフルエンザウイルスに感染してから三日が経過したときに、アミロイドAの物質量の増加が確認された。そのため、馬がインフルエンザウイルスに感染してから三日経過したときのアミロイドAの物質量の増加に基づいて、この馬がインフルエンザウイルスに感染していると特定される。すなわち、ユーザが、馬のアミロイドAの物質量からこの馬がインフルエンザウイルスに感染していることを特定するためには、馬がインフルエンザウイルスに感染してから三日を要する。なお、比較例において説明した手法は、機能が既知である生体分子のみを用いて対象生体の状態を特定する手法の一例として捉えられる。 Furthermore, from FIG. 21(B), an increase in the amount of amyloid A was confirmed for each of the subject horses three days after infection with the influenza virus. Therefore, the horse is identified as being infected with the influenza virus based on the increase in the amount of amyloid A three days after infection with the influenza virus. In other words, it takes three days for a user to identify that a horse is infected with the influenza virus from the amount of amyloid A in the horse. The method described in the comparative example can be regarded as an example of a method for identifying the state of a subject organism using only biomolecules with known functions.
図22は、各対象馬の血清に含まれる各タンパク質の物質量について算出された統計を示した図である。図22には、2次元電気泳動像において区画された338の領域のうちの、タンパク質の物質量の変化が確認された領域に含まれるタンパク質の物質量の統計が示されている。図22に示す各図において、横軸には、対象馬がインフルエンザウイルスに感染してから経過した日数が示され、縦軸には、2次元電気泳動像において区画された領域に含まれるタンパク質の物質量が示されている。図示の例では、領域11、領域18、領域20、領域25、領域37、領域38、領域42、領域56、領域58、領域59、領域80、領域101、領域105、領域106、領域107、領域108、領域116、領域119、領域124、領域125、領域136、領域137、領域169を対象として、各対象馬のタンパク質の物質量、および各対象馬のタンパク質の物質量の統計が、対象馬がインフルエンザウイルスに感染してから経過した日数ごとに示されている。
なお、図22の各領域における数字の「1」は、馬Aのタンパク質の物質量を意味する。また、図22の各領域における数字の「2」は、馬Bのタンパク質の物質量を意味する。また、図22の各領域における数字の「3」は、馬Cのタンパク質の物質量を意味する。また、図22の各領域における実線は、各対象馬のタンパク質の物質量について算出された統計を意味する。
Figure 22 shows statistics calculated for the amount of each protein contained in the serum of each subject horse. Figure 22 shows statistics for the amounts of proteins contained in regions where changes in the amounts of proteins were confirmed, out of 338 regions defined in the two-dimensional electrophoretic image. In each of the graphs shown in Figure 22, the horizontal axis shows the number of days since the subject horse was infected with influenza virus, and the vertical axis shows the amount of protein contained in the region defined in the two-dimensional electrophoretic image. In the illustrated example, the amount of protein substance for each subject horse and statistics on the amount of protein substance for each subject horse are shown for each number of days since the subject horse was infected with the influenza virus, for areas 11, 18, 20, 25, 37, 38, 42, 56, 58, 59, 80, 101, 105, 106, 107, 108, 116, 119, 124, 125, 136, 137, and 169.
The number "1" in each region of Fig. 22 represents the amount of protein substance of horse A. The number "2" in each region of Fig. 22 represents the amount of protein substance of horse B. The number "3" in each region of Fig. 22 represents the amount of protein substance of horse C. The solid lines in each region of Fig. 22 represent statistics calculated for the amount of protein substance of each subject horse.
図22から、何れの対象馬についても、インフルエンザウイルスに感染してからの時間の経過に伴うタンパク質の物質量の変化が確認された。特に、領域11、領域18、領域20、領域101、領域105、領域106、領域107、領域119、領域124、領域125、領域136、および領域137における統計から、インフルエンザウイルスに感染してから一日が経過したときの、タンパク質の物質量の減少が確認された。また、領域37、領域38、領域42、領域56、領域58、領域80、領域116における統計から、インフルエンザウイルスに感染してから一日が経過したときの、タンパク質の物質量の増加が確認された。
そのため、馬がインフルエンザウイルスに感染してから一日経過したときの図22に示すタンパク質の物質量の変化に基づいて、この馬がインフルエンザウイルスに感染していると特定される。すなわち、ユーザが、図22に示すタンパク質の物質量の変化から馬がインフルエンザウイルスに感染していることを特定するためには、馬がインフルエンザウイルスに感染してから一日を要する。言い換えると、ユーザが、生体の状態を特定するために、生体分子が示された2次元電気泳動像を用いる場合、生体の体温を用いる場合や生体のアミロイドAの物質量を用いる場合に比べて、早期に生体の状態を特定することができる。また、2次元電気泳動像に示された各生体分子の変化から生体の状態を特定するため、単一の生体分子の変化から生体の状態を特定する構成に比べて、生体の状態を特定する精度を向上させることができる。なお、本実施例において説明した手法は、機能が既知である生体分子のみならず機能が未知である生体分子も用いて対象生体の状態を特定する手法の一例として捉えられる。
22, it was confirmed that the amount of protein changed over time after infection with influenza virus for all the subject horses. In particular, the statistics for regions 11, 18, 20, 101, 105, 106, 107, 119, 124, 125, 136, and 137 confirmed a decrease in the amount of protein after one day had passed since infection with influenza virus. Furthermore, the statistics for regions 37, 38, 42, 56, 58, 80, and 116 confirmed an increase in the amount of protein after one day had passed since infection with influenza virus.
Therefore, the horse is identified as being infected with the influenza virus based on the change in the amount of substance of the protein shown in FIG. 22 one day after the horse is infected with the influenza virus. That is, it takes one day after the horse is infected with the influenza virus for the user to identify the horse as being infected with the influenza virus from the change in the amount of substance of the protein shown in FIG. 22. In other words, when the user uses a two-dimensional electrophoretic image showing biomolecules to identify the state of the living organism, the state of the living organism can be identified earlier than when the body temperature of the living organism or the amount of substance of amyloid A in the living organism is used. In addition, since the state of the living organism is identified from the change in each biomolecule shown in the two-dimensional electrophoretic image, the accuracy of identifying the state of the living organism can be improved compared to a configuration in which the state of the living organism is identified from the change in a single biomolecule. The method described in this embodiment can be regarded as an example of a method for identifying the state of a target living organism using not only biomolecules with known functions but also biomolecules with unknown functions.
以上、本発明の実施形態について説明したが、本発明の技術的範囲は上記の実施形態に記載の範囲には限定されない。上記の実施形態に、種々の変更又は改良を加えたものも、本発明の技術的範囲に含まれることは、特許請求の範囲の記載から明らかである。 Although the embodiments of the present invention have been described above, the technical scope of the present invention is not limited to the scope described in the above embodiments. It is clear from the claims that the technical scope of the present invention also includes various modifications or improvements to the above embodiments.
上述した実施形態では、状態特定処理において用いられた使用分布情報(図9(A)、図13(A)、図15参照)に応じて、対象生体について状態特定部109に特定された状態が異なっている。ここで、各使用分布情報に示された生体分子は、何れも、各対象生体から得られた成分に含まれる全ての生体分子であり、何れの生体分子を対象生体から取得するか予め定められたものではない。 In the above-described embodiment, the state identified by the state identification unit 109 for the target organism varies depending on the usage distribution information (see FIG. 9(A), FIG. 13(A), FIG. 15) used in the state identification process. Here, the biomolecules shown in each usage distribution information are all biomolecules contained in the components obtained from each target organism, and it is not predetermined which biomolecules are obtained from the target organism.
上述した実施形態では、情報取得部101は、複数の生体分子に関する情報が含まれる2次元電気泳動像を分子情報として取得しているが、これに限定されない。
情報取得部101は、例えば、単一の生体分子に関する情報である分子情報を、生体分子ごとに取得してもよい。すなわち、情報取得部101が分子情報を複数の生体分子について取得することには、複数の生体分子に関する情報である分子情報を取得すること、および、分子情報を生体分子ごとに複数取得することの何れも含まれる。
In the above-described embodiment, the information acquiring unit 101 acquires a two-dimensional electrophoretic image including information on a plurality of biomolecules as molecular information, but the invention is not limited to this.
The information acquiring unit 101 may acquire molecular information, which is information about a single biomolecule, for each biomolecule. In other words, the information acquiring unit 101 acquiring molecular information about multiple biomolecules includes both acquiring molecular information, which is information about multiple biomolecules, and acquiring multiple pieces of molecular information for each biomolecule.
また、上述した実施形態では、生体分子の物理量の分布を示す情報が、生体分子の分子量を示す情報、生体分子の等電点を示す情報、生体分子の物質量を示す情報等であることを説明したが、これに限定されない。
生体分子の物理量の分布を示す情報は、例えば、生体分子の電荷量の分布を示す情報であってもよい。また、例えば、2次元電気泳動像において、生体分子の等電点の分布が示される代わりに、生体分子の電荷量の分布が示されてもよい。また、生体分子の物理量の分布を示す情報は、例えば、生体分子の疎水性の分布を示す情報や、生体分子の立体構造を示す情報であってもよい。この場合において、2次元電気泳動像においては、x軸およびy軸の一方に生体分子の疎水性の分布が示され、他方に生体分子の分子量の分布が示された画像であってもよい。また、2次元電気泳動像においては、x軸およびy軸の一方に生体分子の立体構造が示され、他方に生体分子の等電点の分布が示された画像であってもよい。付言すると、2次元電気泳動像において、x軸に示される情報と、y軸に示される情報は、それぞれ異なる物性を示す情報であれば、何れの物性を示す情報であってもよい。また、生体分子解析装置20は、上述した物性を示す情報のうちの、それぞれ異なる物性を示す3つの情報が、x軸、y軸、z軸にそれぞれ示された3次元からなる電気泳動像を作成してもよい。そして、この3次元からなる電気泳動像が、生体の状態の特定に用いられてもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the information indicating the distribution of physical quantities of biomolecules is described as information indicating the molecular weight of the biomolecules, information indicating the isoelectric point of the biomolecules, information indicating the amount of substance of the biomolecules, etc., but is not limited to this.
The information indicating the distribution of the physical amount of the biomolecule may be, for example, information indicating the distribution of the charge amount of the biomolecule. Also, for example, in the two-dimensional electrophoretic image, instead of the distribution of the isoelectric point of the biomolecule, the distribution of the charge amount of the biomolecule may be shown. Also, the information indicating the distribution of the physical amount of the biomolecule may be, for example, information indicating the distribution of the hydrophobicity of the biomolecule or information indicating the three-dimensional structure of the biomolecule. In this case, in the two-dimensional electrophoretic image, the distribution of the hydrophobicity of the biomolecule may be shown on one of the x-axis and the y-axis, and the distribution of the molecular weight of the biomolecule may be shown on the other. Also, in the two-dimensional electrophoretic image, the three-dimensional structure of the biomolecule may be shown on one of the x-axis and the y-axis, and the distribution of the isoelectric point of the biomolecule may be shown on the other. In addition, in the two-dimensional electrophoretic image, the information indicated on the x-axis and the information indicated on the y-axis may be information indicating any physical property as long as they are information indicating different physical properties. Furthermore, the biomolecule analyzer 20 may create a three-dimensional electrophoretic image in which three pieces of information indicating different physical properties among the above-mentioned pieces of information indicating physical properties are shown on the x-axis, y-axis, and z-axis, respectively. This three-dimensional electrophoretic image may be used to identify the state of a living organism.
また、上述した実施形態では、分布情報に生体分子の分布が示されることを説明したが、これに限定されない。
例えば、生体分子の物質量を示す情報が、生体分子の等電点ごとや生体分子の電荷量ごとに作成されてもよい。また、生体分子の物質量を示す情報が、生体分子の分子量ごとに作成されてもよい。そして、サーバ装置10は、生体分子の等電点ごとに作成された情報、生体分子の電荷量ごとに作成された情報、生体分子の分子量ごとに作成された情報などから、生体分子の分布を特定してもよい。
In the above-described embodiment, the distribution information indicates the distribution of biomolecules, but the present invention is not limited to this.
For example, information indicating the amount of substance of a biomolecule may be created for each isoelectric point of the biomolecule or for each charge amount of the biomolecule. Also, information indicating the amount of substance of a biomolecule may be created for each molecular weight of the biomolecule. Then, the server device 10 may identify the distribution of the biomolecule from the information created for each isoelectric point of the biomolecule, the information created for each charge amount of the biomolecule, the information created for each molecular weight of the biomolecule, etc.
また、上述した実施形態では、分子情報は、生体分子の物理量が示された情報であることを説明したが、これに限定されない。
分子情報は、例えば、生体分子が存在するか否かが示された情報であってもよい。すなわち、分子情報は、生体分子に関する情報であればよい。
In the above-described embodiment, the molecular information is information indicating the physical quantities of biomolecules, but the present invention is not limited to this.
The molecular information may be, for example, information indicating whether or not a biomolecule is present. In other words, the molecular information may be any information related to a biomolecule.
また、上述した実施形態では、統計部106により統計される対象の生体分子は、それぞれ、個々状態のうちの同一の状態が関連付けられている生体分子であることを説明したが、これに限定されない。
統計部106により統計される対象の生体分子は、例えば、複数の生体が特定の包括状態になったときから経過した日数が同一であるときにこの複数の生体からそれぞれ得られた生体分子であってもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the biomolecules to be statistically analyzed by the statistical unit 106 are biomolecules that are associated with the same state among the individual states, but this is not limited to this.
The biomolecules to be statistically collected by the statistical unit 106 may be, for example, biomolecules obtained from multiple organisms when the number of days that have elapsed since the multiple organisms entered a specific inclusion state is the same.
また、上述した実施形態では、統計部106により統計される対象の生体分子は、それぞれ、異なる生体の生体分子であったが、これに限定されない。
統計部106により統計される対象の生体分子には、同一の生体の生体分子が含まれてもよい。
In the above-described embodiment, the biomolecules for which statistics are collected by the statistics unit 106 are biomolecules of different organisms, but the present invention is not limited to this.
The biomolecules that are the subject of statistical analysis by the statistical unit 106 may include biomolecules of the same organism.
また、上述した実施形態では、検出部107が比較に用いる分布情報が、三つ以上の使用分布情報のうちの、生体分子が得られた時点が最も近い二つの分布情報であることを説明したが、これに限定されない。検出部107が比較に用いる分布情報は、三つ以上の使用分布情報のうちの、生体分子が得られた時点が離れた二つの分布情報であってもよい。一例を挙げると、検出部107は、図15に示す第1時点分布情報および第4時点分布情報を比較に用いて、第1時点分布情報に示された生体分子から、第4時点分布情報に示された生体分子への変化を検出してもよい。 In the above embodiment, the distribution information used by the detection unit 107 for comparison is described as two pieces of distribution information among three or more pieces of usage distribution information that have the closest time points at which the biomolecules were obtained, but this is not limited thereto. The distribution information used by the detection unit 107 for comparison may be two pieces of distribution information among three or more pieces of usage distribution information that have different time points at which the biomolecules were obtained. As an example, the detection unit 107 may use the first time point distribution information and the fourth time point distribution information shown in FIG. 15 for comparison to detect a change from the biomolecules shown in the first time point distribution information to the biomolecules shown in the fourth time point distribution information.
また、上述した実施形態では、検出部107が比較する生体分子や、対象決定部108が比較の対象に決定する生体分子は、それぞれ、座標が同一である区画領域に含まれる生体分子であることを説明したが、これに限定されない。
検出部107が比較する生体分子や、対象決定部108が比較の対象に決定する生体分子は、互いに対応する区画領域に含まれる生体分子であれば、それぞれ座標が異なる区画領域に含まれる生体分子であってもよい。この場合に、検出部107や対象決定部108は、比較の対象である生体分子が、それぞれ、予め定められた座標の範囲に示されていることを条件として、互いに対応する区画領域に含まれる生体分子を特定してもよい。また、検出部107や対象決定部108は、比較の対象である生体分子と他の生体分子との分布情報における配置の関係から、互いに対応する区画領域に含まれる生体分子を特定してもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the biomolecules compared by the detection unit 107 and the biomolecules determined as the targets for comparison by the target determination unit 108 are each described as biomolecules contained in partitioned areas with the same coordinates, but this is not limited to this.
The biomolecules compared by the detection unit 107 and the biomolecules determined as the comparison targets by the target determination unit 108 may be biomolecules contained in partitioned regions with different coordinates, as long as they are contained in corresponding partitioned regions. In this case, the detection unit 107 and the target determination unit 108 may identify the biomolecules contained in the corresponding partitioned regions on the condition that the biomolecules to be compared are each shown in a predetermined coordinate range. Furthermore, the detection unit 107 and the target determination unit 108 may identify the biomolecules contained in the corresponding partitioned regions from the arrangement relationship in the distribution information between the biomolecules to be compared and other biomolecules.
また、上述した実施形態では、状態特定部109は、対象生体の状態を、同一類似条件を満たす生体分子が示された統計情報に関連付けられた包括状態に特定しているが、これに限定されない。
状態特定部109は、対象生体の状態を、同一類似条件を満たす生体分子が示された統計情報に関連付けられた個々状態の何れかに特定してもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the state identification unit 109 identifies the state of the target organism as a comprehensive state associated with statistical information indicating biomolecules that satisfy the same similarity condition, but this is not limited to this.
The state identifying unit 109 may identify the state of the target organism as any one of the individual states associated with statistical information indicating biomolecules that satisfy the same similarity condition.
また、上述した実施形態では、状態特定部109は、対象生体における生体分子の物質量の変化に応じて、対象生体の状態を特定しているが、これに限定されない。
例えば、検出部107が、対象生体に係る分子情報から、生体分子の分子量の変化、生体分子の等電点の変化、生体分子の電荷量の変化、生体分子の存在の有無の変化等を検出してもよい。そして、状態特定部109は、検出部107に検出された変化に対応する変化があった比較生体に係る分子情報を抽出し、抽出した分子情報に関連付けられた比較生体の状態を、対象生体の状態に特定してもよい。すなわち、対象生体の状態の特定に用いられる生体分子の変化は、生体分子の物質量の変化に限定されない。
In the above-described embodiment, the state specifying unit 109 specifies the state of the target living organism in accordance with changes in the substance amounts of biomolecules in the target living organism, but the present invention is not limited to this.
For example, the detection unit 107 may detect a change in the molecular weight of a biomolecule, a change in the isoelectric point of a biomolecule, a change in the charge amount of a biomolecule, a change in the presence or absence of a biomolecule, etc. from the molecular information related to the target organism. Then, the state identification unit 109 may extract molecular information related to a comparison organism that has experienced a change corresponding to the change detected by the detection unit 107, and identify the state of the comparison organism associated with the extracted molecular information as the state of the target organism. In other words, the change in the biomolecule used to identify the state of the target organism is not limited to a change in the substance amount of the biomolecule.
また、上述した実施形態では、サーバ装置10は、一の生体について生体分子が得られた時点が異なる複数の分子情報を取得し、取得した複数の分子情報から時間の経過に伴う生体分子の変化を特定しているが、これに限定されない。
サーバ装置10は、特定の期間における生体分子の変化が示された情報など、時間の経過に伴う生体分子の変化が示された分子情報を取得してもよい。生体分子の変化としては、例えば、生体分子の特定の物理量の変化や、生体分子の存在の有無の変化等が挙げられる。また、特定の物理量としては、例えば、物質量、分子量、等電点、電荷量等が挙げられる。そして、サーバ装置10は、取得した分子情報から、時間の経過に伴う生体分子の変化を特定してもよい。すなわち、分子情報は、サーバ装置10による生体分子の変化の特定が可能な情報であれば、何れの態様の情報であってもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the server device 10 acquires multiple pieces of molecular information for a single living organism at different times when the biomolecules were obtained, and identifies changes in the biomolecules over time from the acquired multiple pieces of molecular information, but is not limited to this.
The server device 10 may acquire molecular information indicating changes in a biomolecule over time, such as information indicating changes in a biomolecule over a specific period of time. Examples of changes in a biomolecule include changes in a specific physical quantity of a biomolecule and changes in the presence or absence of a biomolecule. Examples of specific physical quantities include the amount of substance, molecular weight, isoelectric point, and charge amount. The server device 10 may then identify changes in a biomolecule over time from the acquired molecular information. That is, the molecular information may be any type of information as long as it allows the server device 10 to identify changes in a biomolecule.
また、上述した実施形態では、生体分子が変化することが変化条件として定められているが、これに限定されない。
例えば、生体分子が変化しないことが変化条件として定められてもよい。一例を挙げると、二つの生体分子の物質量の差が予め定められた値以下であることが、変化条件として定められてもよい。そして、状態特定部109は、変化条件を満たす生体分子に対応する比較生体の生体分子が示された分子情報を抽出し、抽出した分子情報に関連付けられた状態を、対象生体の状態に特定してもよい。
一例を挙げると、図9(B)に示す使用分布情報において、領域20に含まれる生体分子の物質量が変化しないことで変化条件を満たし、且つ、領域15に含まれる生体分子の物質量が変化しないことで変化条件を満たす場合に、対象生体の状態を、「インフルエンザ」および「COVID-19」の何れでもない他の状態に特定すること等が挙げられる。他の状態としては、例えば、対象生体が健康である状態等が挙げられる。
In the above-described embodiment, the change condition is set to be a change in a biomolecule, but the change condition is not limited to this.
For example, the change condition may be that the biomolecules do not change. As one example, the change condition may be that the difference in the amount of substance between two biomolecules is equal to or less than a predetermined value. Then, the state identification unit 109 may extract molecular information indicating a biomolecule of a comparison organism corresponding to a biomolecule that satisfies the change condition, and identify the state associated with the extracted molecular information as the state of the target organism.
As an example, when the change condition is satisfied by the fact that the amount of substance of the biomolecule contained in region 20 does not change and the change condition is satisfied by the fact that the amount of substance of the biomolecule contained in region 15 does not change in the usage distribution information shown in Fig. 9 (B), the state of the target organism is specified as another state other than either "influenza" or "COVID-19". An example of the other state is a state in which the target organism is healthy.
また、上述した、対象生体に特定の作用が働く前からこの特定の作用が働いた以降への時間の経過に伴う生体分子の状態の特定が可能である分子情報には、時間の経過に伴い生体分子が変化したことの特定が可能である情報のみならず、時間の経過に伴う生体分子の変化がないことの特定が可能である情報も含まれる。 The above-mentioned molecular information that can identify the state of a biomolecule over time from before a specific action is exerted on a target organism to after this specific action is exerted includes not only information that can identify that a biomolecule has changed over time, but also information that can identify that a biomolecule has not changed over time.
また、検出部107は、生体分子の変化の程度を検出してもよい。より具体的には、検出部107は、各使用分布情報から、区画領域に含まれる生体分子の変化の程度が、複数段階のうちの何れの段階であるかを検出してもよい。そして、状態特定部109は、検出部107に検出された段階に対応する変化が示された比較生体に係る分布情報を抽出し、抽出した分布情報に関連付けられた状態を、対象生体の状態に特定してもよい。 The detection unit 107 may also detect the degree of change in the biomolecules. More specifically, the detection unit 107 may detect which of multiple stages the degree of change in the biomolecules contained in the partitioned area is from each usage distribution information. Then, the state identification unit 109 may extract distribution information related to a comparison organism in which a change corresponding to the stage detected by the detection unit 107 has been shown, and identify the state associated with the extracted distribution information as the state of the target organism.
また、状態特定部109は、検出分子と統計情報に示された生体分子とを比較することを説明したが、これに限定されない。
状態特定部109は、例えば、検出分子と、一の比較生体に係る比較分布情報に示された生体分子とを比較してもよい。そして、この比較分布情報に示された生体分子が同一類似条件を満たす場合には、この比較分布情報に関連付けられた状態を、対象生体の状態に特定してもよい。
Further, the state specifying unit 109 compares the detected molecules with the biomolecules shown in the statistical information, but this is not limiting.
The state identification unit 109 may, for example, compare the detection molecule with a biomolecule indicated in comparative distribution information relating to one comparison organism, and if the biomolecule indicated in the comparative distribution information satisfies the same similarity condition, may identify the state associated with the comparative distribution information as the state of the target organism.
また、上述した実施形態では、対象生体が、比較生体とは異なっているが、これに限定されない。
対象生体は、比較生体と同一の生体であってもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the subject organism is different from the comparison organism, but this is not limiting.
The subject organism may be the same organism as the comparison organism.
また、上述した実施形態においては、状態特定部109は、対象生体の生体分子と、対象生体と同じ属性の生体である比較生体の生体分子とを比較することにより、対象生体の状態を特定しているが、これに限定されない。
状態特定部109は、対象生体の生体分子と、対象生体とは異なる属性の生体である比較生体の生体分子とを比較することにより、対象生体の状態を特定してもよい。一例を挙げると、状態特定部109は、対象生体である人間の生体分子と、比較生体である馬の生体分子とを比較することにより、対象生体の状態を特定してもよい。この場合において、サーバ装置10は、生体分子の物理量についての特性を、生体の属性ごとに特定し、特定した特性に基づいて、比較分子情報に示される生体分子の物理量を、比較生体の属性ごとに補正してもよい。そして、サーバ装置10は、対象生体の生体分子と、比較分子情報における補正後の生体分子とを比較することにより、対象生体の状態を特定してもよい。
In addition, in the above-described embodiment, the condition determination unit 109 determines the condition of the target organism by comparing the biomolecules of the target organism with the biomolecules of a comparison organism, which is an organism with the same attributes as the target organism, but this is not limited to this.
The state identification unit 109 may identify the state of the target organism by comparing the biomolecules of the target organism with the biomolecules of a comparison organism, which is an organism with attributes different from the target organism. For example, the state identification unit 109 may identify the state of the target organism by comparing the biomolecules of a human organism, which is the target organism, with the biomolecules of a horse, which is the comparison organism. In this case, the server device 10 may identify the characteristics of the physical amount of the biomolecules for each attribute of the organism, and correct the physical amount of the biomolecules shown in the comparison molecule information for each attribute of the comparison organism based on the identified characteristics. Then, the server device 10 may identify the state of the target organism by comparing the biomolecules of the target organism with the corrected biomolecules in the comparison molecule information.
また、状態特定部109は、機械学習の成果に基づいて、対象生体の状態を特定してもよい。
状態特定部109は、2次元電気泳動像に示された各生体分子の物質量の分布と、この2次元電気泳動像に示された生体分子が生体から得られた時点における生体の状態と、が関連付けられた分布情報および個々状態情報を教師データとして、生体分子の分布と生体の状態との関係を学習する。状態特定部109は、学習結果に基づいて、分布情報を入力として、個々状態情報を出力する学習モデルを生成する。そして、状態特定部109は、生成した学習モデルに基づき、対象生体に係る分布情報から、この対象生体の状態を特定してもよい。言い換えると、状態特定部109は、入力された分布情報に示された生体分子の分布を個々状態情報に関連付けてパターン認識することで、対象生体に係る分布情報に示された生体分子の分布のパターンから対象生体の状態を特定してもよい。このように、状態特定部109は、対象生体の生体分子を、他の生体分子と比較することなく、対象生体の状態を特定してもよい。なお、分布情報において状態特定部109にパターン認識された生体分子は、分子情報から特定される生体分子の変化について定められた条件を満たす生体分子の対象として捉えられる。また、分子情報から特定される生体分子の変化について定められた条件とは、分布情報から特定される生体分子が状態特定部109にパターン認識されることである。また、条件を満たす生体分子の対象は、分布情報に示された生体分子の分布である。
Furthermore, the condition identifying unit 109 may identify the condition of the target living organism based on the results of machine learning.
The state specifying unit 109 learns the relationship between the distribution of biomolecules and the state of a living organism, using as teacher data distribution information and individual state information in which the distribution of the substance amount of each biomolecule shown in the two-dimensional electrophoretic image is associated with the state of the living organism at the time when the biomolecule shown in the two-dimensional electrophoretic image was obtained from the living organism. The state specifying unit 109 generates a learning model that inputs the distribution information and outputs the individual state information based on the learning result. Then, the state specifying unit 109 may specify the state of the target living organism from the distribution information related to the target living organism based on the generated learning model. In other words, the state specifying unit 109 may specify the state of the target living organism from the distribution pattern of the biomolecules shown in the distribution information related to the target living organism by associating the distribution of the biomolecules shown in the input distribution information with the individual state information and performing pattern recognition. In this way, the state specifying unit 109 may specify the state of the target living organism without comparing the biomolecules of the target living organism with other biomolecules. The biomolecules that are pattern-recognized by the state specifying unit 109 in the distribution information are regarded as targets of biomolecules that satisfy a condition defined for a change in the biomolecules identified from the molecular information. The condition defined for a change in the biomolecules identified from the molecular information is that the biomolecules identified from the distribution information are pattern-recognized by the state specifying unit 109. The targets of biomolecules that satisfy the condition are the distribution of biomolecules shown in the distribution information.
また、上述した実施形態では、状態特定システム1に、サーバ装置10と生体分子解析装置20とがそれぞれ設けられる構成を説明したが、これに限定されない。
例えば、サーバ装置10と生体分子解析装置20とが一体化された装置が状態特定システム1に設けられてもよい。すなわち、状態特定システム1に設けられる一の装置を用いて、生体分子の解析、分子情報の作成、および、対象生体の状態の特定を行うようにしてもよい。
In the above embodiment, the condition specifying system 1 is configured to include the server device 10 and the biomolecule analyzer 20, but the present invention is not limited to this.
For example, an apparatus in which the server apparatus 10 and the biomolecule analysis apparatus 20 are integrated may be provided in the condition determination system 1. That is, a single apparatus provided in the condition determination system 1 may be used to analyze biomolecules, create molecular information, and determine the condition of a target living organism.
また、本実施形態では、ユーザが端末30やサーバ装置10を操作することにより個々状態情報や包括状態情報を入力することを説明したが、これに限定されない。
例えば、ビデオカメラ等の撮影手段を用いて生体を撮影してもよい。さらに、生体を解析する解析手段を用いて、撮影された動画に映っている生体を解析し、解析結果から、この生体の状態を示した個々状態情報や包括状態情報を作成し、作成した情報を情報取得部101に送信してもよい。このように、情報取得部101は、端末30とは異なる機能手段から情報を取得してもよい。
In the present embodiment, the user inputs individual status information and comprehensive status information by operating the terminal 30 and the server device 10, but the present invention is not limited to this.
For example, a living body may be photographed using a photographing means such as a video camera. Furthermore, a living body shown in the photographed video may be analyzed using an analysis means for analyzing the living body, and individual status information or comprehensive status information showing the status of the living body may be created from the analysis result, and the created information may be transmitted to the information acquisition unit 101. In this manner, the information acquisition unit 101 may acquire information from a functional means different from the terminal 30.
また、本実施形態では、サーバ装置10が、対象生体の状態を特定する構成としたが、これに限定されない。
例えば、端末30がサーバ装置10の機能を有してもよい。言い換えると、端末30が、サーバ装置10の情報取得部101、記憶部102、領域識別部103、区画部104、物質量特定部105、統計部106、検出部107、対象決定部108、状態特定部109、出力部110等の機能を備えることとしてもよい。
In addition, in the present embodiment, the server device 10 is configured to identify the state of the target living body, but the present invention is not limited to this.
For example, the terminal 30 may have the functions of the server device 10. In other words, the terminal 30 may have the functions of the server device 10, such as the information acquisition unit 101, the storage unit 102, the region identification unit 103, the partition unit 104, the substance amount identification unit 105, the statistics unit 106, the detection unit 107, the target determination unit 108, the state identification unit 109, and the output unit 110.
また、本発明の実施形態を実現するプログラムは、磁気記録媒体(磁気テープ、磁気ディスクなど)、光記録媒体(光ディスクなど)、光磁気記録媒体、半導体メモリなどのコンピュータが読取可能な記録媒体に記憶した状態で提供し得る。また、インターネットなどの通信手段を用いて提供することも可能である。 In addition, a program for implementing an embodiment of the present invention may be provided in a state where it is stored on a computer-readable recording medium, such as a magnetic recording medium (such as a magnetic tape or a magnetic disk), an optical recording medium (such as an optical disk), a magneto-optical recording medium, or a semiconductor memory. It may also be provided using a communication means such as the Internet.
また、上記では、複数の実施形態を説明したが、一の実施形態に含まれる構成と他の実施形態に含まれる構成とを入れ替えたり、一の実施形態に含まれる構成を他の実施形態に付加したりしても良い。 Although multiple embodiments have been described above, the configuration included in one embodiment may be interchanged with the configuration included in another embodiment, or the configuration included in one embodiment may be added to another embodiment.
1…状態特定システム、10…サーバ、20…生体分子解析装置、30…端末、40…状態通知画面、101…情報取得部、102…記憶部、109…状態特定部、110…出力部 1...Status identification system, 10...Server, 20...Biomolecular analysis device, 30...Terminal, 40...Status notification screen, 101...Information acquisition unit, 102...Storage unit, 109...Status identification unit, 110...Output unit
Claims (16)
前記特定生体の状態の特定を行う特定手段と、
を備え、
前記第1の物理量と前記第2の物理量とは、生体分子の異なる物理量であり、
前記分布画像は、前記特定生体の前記複数の生体分子の各々について、生体分子を示す画像として表示された分子画像から前記第1の物理量および前記第2の物理量が特定される画像であり、
前記分子画像は、前記分布画像において、少なくとも前記第1の物理量に応じた領域に表示され、
前記特定手段による前記特定は、前記特定生体の前記状態が、複数の時点の前記分布について取得された複数の前記分布画像から特定される前記第2の物理量の変化について定められた変化条件を満たす前記分布画像の領域に応じて異なる状態に特定されるように行われ、
前記取得手段は、生体の生体分子の前記第2の物理量が示された分子情報を、当該生体の複数の生体分子について取得し、
前記特定手段による前記特定は、前記分布画像から特定される前記特定生体の生体分子の前記第2の物理量と、前記分子情報から特定される前記生体の生体分子の前記第2の物理量との比較によって行われ、
前記分布画像において前記比較に用いられる前記特定生体の生体分子は当該分布画像が前記取得手段に取得される前には定められず、前記分布画像に示された前記複数の生体分子が当該比較の候補であり、
前記特定手段による前記特定は、前記特定生体の生体分子の前記第2の物理量の前記変化との関係について定められた関係条件を満たす生体分子の前記第2の物理量の変化が特定される前記分子情報をもとに行われ、
前記関係は、前記変化条件を満たす前記分布画像の領域から特定される前記第1の物理量である前記特定生体の生体分子の前記第2の物理量の前記変化と、当該領域に対応する前記第1の物理量における、生体分子について前記分子情報から特定される前記第2の物理量の変化との関係である、情報処理システム。 an acquisition means for acquiring a distribution image in which each of a plurality of biomolecules of a specific organism is shown as a distribution of a first physical quantity and a second physical quantity, for the distribution at a plurality of time points;
A determination means for determining the state of the specific living body;
Equipped with
The first physical quantity and the second physical quantity are different physical quantities of a biomolecule,
the distribution image is an image in which the first physical quantity and the second physical quantity are identified for each of the plurality of biomolecules of the specific organism from a molecular image displayed as an image showing the biomolecule,
the molecular image is displayed in an area of the distribution image corresponding to at least the first physical quantity,
The identification by the identification means is performed such that the state of the specific living body is identified to a different state depending on an area of the distribution image that satisfies a change condition determined for a change in the second physical quantity identified from a plurality of distribution images acquired for the distribution at a plurality of time points ,
The acquisition means acquires molecular information indicating the second physical quantity of a biomolecule of a living organism for a plurality of biomolecules of the living organism;
The identification by the identification means is performed by comparing the second physical amount of the biomolecule of the specified organism identified from the distribution image with the second physical amount of the biomolecule of the specified organism identified from the molecular information;
the biomolecules of the specific organism used for the comparison in the distribution image are not determined before the distribution image is acquired by the acquisition means, and the plurality of biomolecules shown in the distribution image are candidates for the comparison;
The identification by the identification means is performed based on the molecular information that identifies a change in the second physical quantity of a biomolecule that satisfies a relationship condition defined regarding a relationship between the change in the second physical quantity of the biomolecule of the specified organism,
The information processing system, wherein the relationship is a relationship between the change in the second physical quantity of a biomolecule of the specific organism, which is the first physical quantity identified from a region of the distribution image that satisfies the change condition, and the change in the second physical quantity identified from the molecular information for the biomolecule in the first physical quantity corresponding to the region .
前記分布画像における第1領域が前記変化条件を満たす場合、前記特定生体について、生体の状態について区分けされた項目のうちの第1項目との関係を示す状態を特定せずに、当該項目のうちの当該第1項目とは異なる第2項目との関係を示す状態を特定し、
前記分布画像における前記第1領域とは異なる第2領域が前記変化条件を満たす場合、前記特定生体について、前記第2項目との関係を示す状態を特定せずに、前記第1項目との関係を示す状態を特定する、請求項1記載の情報処理システム。 The identification means is
When a first region in the distribution image satisfies the change condition, a state indicating a relationship with a first item among the items classified with respect to the state of the specific living body is not specified, but a state indicating a relationship with a second item different from the first item among the items is specified;
The information processing system of claim 1, wherein when a second region in the distribution image different from the first region satisfies the change condition, a state indicating a relationship with the first item is identified for the specific living organism without identifying a state indicating a relationship with the second item.
前記特定手段に前記関係が特定される前記項目が前記複数の項目のうちの何れであるかは、前記比較の前には定められず、
前記特定手段は、前記関係条件を満たす前記第2の物理量の変化が特定される前記分子情報を特定することに応じて、前記関係を特定する対象の前記項目と、当該項目との関係を示す前記状態とを特定する請求項1記載の情報処理システム。 The identification means identifies the state of the specific living body as a state indicating a relationship with at least one item among a plurality of items classified regarding the state of the living body,
which of the plurality of items is the item for which the relationship is identified by the identification means is not determined prior to the comparison;
The information processing system according to claim 1 , wherein the identification means identifies the item for which the relationship is to be identified and the state indicating the relationship with the item in response to identifying the molecular information in which a change in the second physical quantity that satisfies the relationship condition is identified.
前記変化条件は、前記複数の区分の各々について定められている請求項1記載の情報処理システム。 a display area of the distribution image is divided into a plurality of sections according to the first physical quantity of a biomolecule;
2. The information processing system according to claim 1, wherein the change condition is determined for each of the plurality of sections.
前記特定手段は、前記分布画像において、前記第1生体分子に係る前記分子画像が表示された領域と前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域とが何れも前記変化条件を満たすことに応じて、前記状態を特定する請求項1記載の情報処理システム。 The plurality of biomolecules of the specific organism include a first biomolecule and a second biomolecule different from the first biomolecule,
The information processing system according to claim 1, wherein the identification means identifies the state in accordance with a state in which both an area in the distribution image in which the molecular image relating to the first biomolecule is displayed and an area in which the molecular image relating to the second biomolecule is displayed satisfy the change condition.
前記分布画像における前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域は、前記第2の物理量の減少により前記変化条件を満たす領域である請求項7記載の情報処理システム。 a region in the distribution image in which the molecular image of the first biomolecule is displayed is a region that satisfies the change condition due to an increase in the second physical quantity,
The information processing system according to claim 7 , wherein the region in the distribution image in which the molecular image of the second biomolecule is displayed is a region that satisfies the change condition by a decrease in the second physical quantity.
前記特定手段は、
前記分布画像において前記特定生体の前記第1生体分子に係る前記分子画像が表示された領域および前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たし且つ前記第3生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たさない場合に、前記状態を第1状態に特定し、
前記分布画像において前記特定生体の前記第1生体分子に係る前記分子画像が表示された領域および前記第3生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たし且つ前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たさない場合に、前記状態を第2状態に特定する請求項7記載の情報処理システム。 The plurality of biomolecules of the specific organism further includes a third biomolecule different from both the first biomolecule and the second biomolecule,
The identification means is
When a region in the distribution image in which the molecular image related to the first biomolecule of the specific organism and a region in which the molecular image related to the second biomolecule are displayed satisfy the change condition and a region in which the molecular image related to the third biomolecule is displayed does not satisfy the change condition, the state is specified as a first state;
The information processing system of claim 7, wherein the state is identified as a second state when an area in the distribution image where the molecular image relating to the first biomolecule of the specific organism and an area where the molecular image relating to the third biomolecule are displayed satisfy the change condition, and an area where the molecular image relating to the second biomolecule is displayed does not satisfy the change condition.
前記分布画像において前記第2部分に係る前記分子画像が表示された領域は、前記第2の物理量の減少により前記変化条件を満たす領域である請求項10記載の情報処理システム。 a region in the distribution image in which the molecular image relating to the first portion is displayed is a region in which the change condition is satisfied by an increase in the second physical quantity,
11. The information processing system according to claim 10 , wherein the region in the distribution image in which the molecular image relating to the second portion is displayed is a region in which the change condition is satisfied by a decrease in the second physical quantity.
前記特定手段は、
前記分布画像において前記複数の生体分子のうちの特定の生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たす場合に、前記状態を前記作用に係る第1状態に特定し、
前記分布画像における前記特定の生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たさない場合に、前記状態を前記作用に係る第2状態に特定する請求項1記載の情報処理システム。 The acquisition means acquires the distribution image showing the distribution at a time point before a specific action is applied to the specific living body, and the distribution image showing the distribution at a time point after the action is applied to the specific living body,
The identification means is
specifying the state as a first state related to the action when a region in the distribution image in which the molecular image related to a specific biomolecule among the plurality of biomolecules is displayed satisfies the change condition;
The information processing system according to claim 1 , wherein when an area in the distribution image in which the molecular image relating to the specific biomolecule is displayed does not satisfy the change condition, the state is specified as a second state relating to the action.
前記特定の生体分子は、第1生体分子であり、
前記特定手段は、
前記分布画像において、前記第1生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たし、且つ、前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たさない場合に、前記状態を前記第1状態に特定し、
前記分布画像において、前記第1生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たさずに前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たす場合に、前記状態を前記第2状態に特定する請求項12記載の情報処理システム。 The plurality of biomolecules of the specific organism include a first biomolecule and a second biomolecule different from the first biomolecule,
The specific biomolecule is a first biomolecule,
The identification means is
When an area in the distribution image where the molecular image of the first biomolecule is displayed satisfies the change condition and an area in which the molecular image of the second biomolecule is displayed does not satisfy the change condition, the state is specified as the first state;
The information processing system of claim 12, wherein the state is identified as the second state when, in the distribution image, an area in which the molecular image relating to the first biomolecule is displayed does not satisfy the change condition but an area in which the molecular image relating to the second biomolecule is displayed satisfies the change condition.
前記特定の生体分子は、前記第1生体分子であり、
前記特定手段は、
前記分布画像において、前記第1の生体分子に係る前記分子画像が表示された領域および前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が何れも前記変化条件を満たす場合に、前記状態を前記第1状態に特定し、
前記分布画像において、前記第1の生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たさずに前記第2生体分子に係る前記分子画像が表示された領域が前記変化条件を満たす場合に、前記状態を前記第2状態に特定する請求項12記載の情報処理システム。 The plurality of biomolecules of the specific organism include a first biomolecule and a second biomolecule different from the first biomolecule,
the specific biomolecule is the first biomolecule,
The identification means is
specifying the state as the first state when a region in the distribution image in which the molecular image of the first biomolecule is displayed and a region in which the molecular image of the second biomolecule is displayed both satisfy the change condition;
The information processing system of claim 12, wherein the state is identified as the second state when, in the distribution image, an area in which the molecular image relating to the first biomolecule is displayed does not satisfy the change condition but an area in which the molecular image relating to the second biomolecule is displayed satisfies the change condition.
前記特定手段は、前記第1分布画像において前記変化条件を満たす領域と、前記第2分布画像において前記変化条件を満たす領域とに応じて、前記状態を特定する請求項1記載の情報処理システム。 The distribution images acquired by the acquisition means include a first distribution image showing the distribution at a first time point and a second distribution image showing the distribution at a second time point after the first time point,
2 . The information processing system according to claim 1 , wherein the specifying means specifies the state according to an area in the first distribution image that satisfies the change condition and an area in the second distribution image that satisfies the change condition.
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