JP7678802B2 - Siglec-9ECD融合分子及びその使用方法 - Google Patents
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Description
本出願は、すべてあらゆる目的のために参照により本明細書に援用される2019年11月4日出願の米国仮出願第62/930,227号、2020年4月24日出願の同第63/014,940号、及び2020年10月16日出願の同第63/092,753号の優先権の利益を主張する。
本開示は、Siglec-9ECD融合分子及びそのような融合タンパク質の治療用途に関する。
シアル酸結合Ig様レクチン-9(Siglec-9)は、単球、マクロファージ、樹状細胞、好中球、及び小グリア細胞などの未熟及び成熟骨髄細胞、さらにはナチュラルキラー細胞及びT細胞のサブセットなどのリンパ細胞を含む、免疫細胞及び造血細胞上に発現される1型免疫グロブリン様膜貫通タンパク質である(Crocker et al.(2007) Nat Rev Immunol. 7:255-266;O’Reilly and Paulson(2009) Trends in Pharm. Sci. 30:5:240-248;及びMacauley et al.(2014) Nat. Rev. Imm. 14:653-666)。Siglec-9は、糖タンパク質及び糖脂質のシアル酸残基に結合するレクチンのSiglecファミリーのメンバーである。Siglecタンパク質のための潜在的なリガンドは、シアル化グリカンに連結しているセラミドを含む糖脂質であるガングリオシドである。Siglecリガンドにおける多様性は、分枝または末端のいずれかでの種々の連結での他の天然糖及びシアル酸の付加、ならびにシアル酸自体の改変により生じている。
a)Siglec-3、Siglec-5、Siglec-7、Siglec-9、Siglec-10、及びSiglec-15から選択されるいずれか1つまたは複数のSiglecファミリーメンバーの細胞結合をブロックする;
b)任意選択でIFNγ発現の増大またはT細胞増殖の増大を測定することにより決定されるとおり、T細胞のMDSC媒介抑制を解除する;
c)MDSCを炎症誘発性表現型に再分極する;
d)MDSC上でのCD86の発現を増大させる、MDSC上でのCD11bの発現を増大させる、及び/またはMDSC上でのCD163の発現を減少させる;
e)腫瘍マクロファージをM2表現型から再分極する;
f)CD163+及び/またはCD206+マクロファージを減少させる;
g)MDSCにおいてCCL3、CCL4、CCL5、CCL17、CXCL1、CXCL9、及びIL-8から選択される1つまたは複数のケモカインの発現を誘導する;
h)腫瘍微小環境への骨髄細胞の動員を減少させる;
i)100nM未満、50nM未満、25nM未満、20nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、1~50nM、1~25nM、1~20nM、1~10nM、1~5nM、もしくは1~2nMの親和性で、MDSCに結合する;または
j)(a)から(i)のいずれか1つまたは複数を行う。
一部のそのような実施形態では、MDSCは、ヒトMDSCであり、及び/またはマクロファージはヒトマクロファージである。
Siglec-9の細胞外ドメイン及び融合パートナー、例えば、Fcドメインを含むポリペプチドを、本明細書において提供する。Siglec-9ECD-Fc融合分子は予想外に、骨髄細胞への協合的結合を示し、Siglec-9または他のSiglecタンパク質に対する抗体と比較して、これらの先天免疫細胞の強力な活性化をもたらす。そのような活性化は、例えば、免疫系がさもなければ不適切に抑制され得るがん、神経変性障害、ならびに他の疾患及び障害の処置において有用である。さらに、安定性、溶解性、リガンド結合及び/または他の特性を改善するために操作されているSiglec-9細胞外ドメインのバリアントを特にIgVドメインに含むポリペプチドを本明細書において提供する。そのようなバリアントは、前記のとおり免疫応答を活性化するための融合分子において有用である。他の発明及び実施形態をさらに、本明細書において記載する。
「Siglec-9細胞外ドメイン」及び「Siglec-9ECD」という用語は、細胞の表面上のシアル酸に結合するSiglec-9の細胞外ドメインポリペプチドまたはその断片を指す。この用語は、天然及びその操作バリアントを含む。一部の実施形態では、Siglec-9ECDは、Siglec-9のIgVドメインを含む。一部の実施形態では、Siglec-9ECDは、Siglec-9のIgVドメインならびにC2タイプ1(C2T1)ドメイン及びC2タイプ2(C2T2)ドメインを含む。非限定的な例示的Siglec-9ECDは、配列番号78~138で示されている。
一部の実施形態では、本明細書における実施形態のいずれかによるSiglec-9ECDまたはSiglec-9ECD融合分子は、本明細書に記載のとおりの特徴のいずれかを単一で、または組み合わせで組み込んでいてよい。
本明細書において提供されるSiglec-9ECD融合分子のいずれかの一部の実施形態では、融合分子は、Fcドメインを含んでよい。一部の実施形態では、Fcドメインは、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、及び/またはIgG4アイソタイプである。
本明細書において提供されるポリペプチドのいずれかの一部の実施形態では、アミノ酸配列バリアントが企図される。例えば、ポリペプチドの結合親和性及び/または他の生物学的特性を改善することが望ましいことがある。
本明細書において提供されるポリペプチドのいずれかの一部の実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸置換を有するポリペプチドバリアントを提供する。ポリペプチドのアミノ酸配列バリアントは、適切な改変を、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に導入することにより、またはペプチド合成により調製することができる。そのような改変には、例えば、ポリペプチドのアミノ酸配列からの残基の欠失及び/またはそれへの挿入及び/またはその中での置換が含まれる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖の配向に影響する残基:Gly、Pro;及び
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe
の群に分類することができる。
ポリペプチドのいずれかの一部の実施形態では、ポリペプチドは誘導体である。「誘導体」という用語は、アミノ酸(または核酸)の挿入、欠失、または置換以外の化学的改変を含む分子を指す。ある特定の実施形態では、誘導体は、これに限定されないが、ポリマー、脂質、または他の有機もしくは無機部分との化学結合を含む共有結合的改変を含む。ある特定の実施形態では、化学的改変されたポリペプチドは、化学的に改変されていないポリペプチドよりも長い循環半減期を有し得る。ある特定の実施形態では、化学的改変された抗原結合タンパク質は、所望の細胞、組織、及び/または臓器について改善された標的化能力を有し得る。一部の実施形態では、誘導体ポリペプチドは、これに限定されないが、ポリエチレングリコール、ポリオキシエチレングリコール、またはポリプロピレングリコールを含む、1つまたは複数の水溶性ポリマー付着を含むように共有結合的に改変されている。例えば、米国特許第4640835号、同第4496689号、同第4301144号、同第4670417号、同第4791192号及び同第4179337号を参照されたい。ある特定の実施形態では、誘導体ポリペプチドは、これに限定されないが、モノメトキシ-ポリエチレングリコール、デキストラン、セルロース、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ポリ-1,3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキサン、エチレン/マレイン酸無水物コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか)、ポリ-(N-ビニルピロリドン)-ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)及びポリビニルアルコール、さらには、そのようなポリマーの混合物を含む、1つまたは複数のポリマーを含む。
本開示のSiglec-9ECD融合分子は、組み換え方法及び組成物を使用して生成することができる。一部の実施形態では、本開示のSiglec-9ECD融合分子のいずれかをコードするヌクレオチド配列を有する単離核酸を提供する。例えば、本明細書の核酸は、配列番号10~39、78、138、148~170、及び227のいずれか1つのポリペプチドをコードし得る。本明細書の核酸は、配列番号45~77、171~193、及び228~233のいずれか1つから選択されるアミノ酸配列をコードし得る。
Siglec-9ECDを含むポリペプチドを本明細書において提供し、その際、そのポリペプチドは、細胞の表面上のシアル酸に結合する。Siglec-9ECDを含むポリペプチドは、Siglec-9ECD-Fc融合分子などのSiglec-9ECD融合分子であり得る。Siglec-9ECDを含むポリペプチドは、100nM未満、または90nM未満、または80nM未満、または70nM未満、または60nM未満、または50nM未満、または40nM未満、または30nM未満の親和性(Kd)で、シアル酸を表面上に含む細胞に結合し得る。一部の実施形態では、ポリペプチドは、0.1~100nM、または0.1~90nM、または0.1~80nM、または0.1~70nM、または0.1~60nM、または0.1~50nM、または0.1~40nM、または0.1~30nMの親和性(Kd)で、シアル酸を表面上に含む細胞に結合する。一部の実施形態では、Siglec-9ECDまたはSiglec-9ECD融合分子は、例えば、100nM未満、または90nM未満、または80nM未満、または70nM未満、または60nM未満、または50nM未満、または40nM未満、または30nM未満、または25nM未満、または20nM未満、または10nM未満、または5nM未満、または2nM未満、または0.1~50nM、または1~50nM、または1~25nM、または1~20nM、または1~10nM、または1~5nM、または1~2nMのKdで、MDSCに結合し得る。様々な実施形態で、細胞は骨髄由来抑制細胞(MDSC)である。場合によっては、MDSCはヒトMDSCである。
本開示のSiglec-9ECD-Fc融合分子などのSiglec-9ECD融合分子と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物を、本明細書において提供する。一部の実施形態では、所望の純度を有する本開示のSiglec-9ECD融合分子を生理学的に許容される担体、添加剤または安定剤中に含む医薬組成物を、本明細書において提供する(Remington’s Pharmaceutical Sciences (1990) Mack Publishing Co., Easton, Pa.)。許容される担体、添加剤、または安定剤は、用いられる投薬量及び濃度で受容者に対して非毒性である。
本明細書に開示のとおり、Siglec-9ECD融合分子、例えば、本開示のSiglec-9ECD-Fc融合分子を、疾患及び障害を予防する、そのリスクを低下させる、または処置するために使用することができる。加えて、Siglec-9ECD融合分子、例えば、本開示のSiglec-9ECD-Fc融合分子を、骨髄由来抑制細胞(MDSC)を炎症誘発性表現型に再分極する方法において使用することができ、例えば、その際、対象は、後記のとおり、がんまたは神経性もしくは神経変性疾患を有する。Siglec-9ECD融合分子、例えば、本開示のSiglec-9ECD-Fc融合分子を、骨髄細胞を活性化する方法において使用することもでき、例えば、その際、対象は、後記のとおり、がんまたは神経性もしくは神経変性疾患を有する。Siglec-9ECD融合分子、例えば、本開示のSiglec-9ECD-Fc融合分子をさらに、本明細書に記載のとおりのがんを有する対象において腫瘍マクロファージをM2表現型から再分極する方法において使用することができる。
チェックポイント阻害薬治療後に再発しているがんを有し、個体に治療有効量の本開示のSiglec-9ECD融合分子、例えば、Siglec-9ECD-Fc融合分子を投与することによる、方法を提供する。ある特定の実施形態では、個体は、PD-1またはPD-L1アンタゴニスト、例えば、後で提示されるものなどのPD-1またはPD-L1抗体での治療後に再発しているがんを有する。
認知症は、これまでに障害のなかった人において、正常な老化から予想され得るものを超える全体的認知能力の重大な損失として現れる非特異的症候群(すなわち、一連の徴候及び症状)である。認知症は、固有の全体的な脳損傷の結果として、変化しないこともある。別法では、認知症は、進行性である場合もあり、身体の損傷または疾患により長期的な減退がもたらされる。認知症は、高齢者集団においてより多く一般的にみられるが、65歳以前に発症することもある。認知症により影響を受ける認知領域には、限定ではないが、記憶、注意持続時間、言語及び問題解決が含まれる。一般に、個体が認知症と診断されるまでには、少なくとも6ヶ月間、症状が存在する必要がある。
前頭側頭型認知症(FTD)は、脳の前頭葉の進行性変性から生じる状態である。この変性は、時間の経過とともに側頭葉に進むことがある。罹患率では、FTDは、アルツハイマー病(AD)に次いで、初老年性認知症症例の20%を占める。FTDの臨床的特徴には、記憶欠損、行動異常、人格変化、及び言語障害が含まれる(Cruts, M. & Van Broeckhoven, C., Trends Genet. 24:186-194 (2008);Neary, D., et al., Neurology 51:1546-1554 (1998);Ratnavalli, E., Brayne, C., Dawson, K. & Hodges, J. R., Neurology 58:1615-1621 (2002))。
アルツハイマー病(AD)は、認知症の最も一般的な形態である。この疾患に治療法はなく、進行するにつれて悪化し、最終的には死に至る。ほとんどの場合、ADは、65歳を超えた人において診断される。しかしながら、あまり一般的ではない早期発症型アルツハイマー病は、より早期に発症することがある。アルツハイマー病の一般的症状には、近時事象の想起困難などの行動症状;認知症状、混乱、易刺激性及び攻撃性、気分変動、言語障害ならびに長期の記憶喪失が含まれる。疾患が進行するにつれて、身体機能が失われ、最終的に死に至る。アルツハイマー病は、完全に明らかになるまでに未知の可変時間量で発症し、何年も診断未確定で進行する場合がある。
パーキンソン病は、特発性もしくは原発性パーキンソニズム低運動性硬直症候群(HRS)、または振戦麻痺と称されることもあり、運動系制御に影響を及ぼす神経変性脳障害である。脳内におけるドーパミン産生細胞の進行性死がパーキンソン病の主要な症状を引き起こす。ほとんどの場合、パーキンソン病は、50歳を超えた人において診断される。パーキンソン病は、ほとんどの人で特発性(原因不明)である。しかしながら、遺伝的要因がこの疾患にも関与している。
本明細書で使用される場合、筋萎縮性側索硬化症(ALS)または運動ニューロン疾患またはルーゲーリッグ病は、互換的に使用され、急速に進行する筋力低下、筋萎縮及び線維束性収縮、筋痙縮、発話困難(構音障害)、嚥下困難(嚥下障害)、ならびに呼吸困難(呼吸障害)により特徴づけられる様々な病因を有する消耗性疾患を指す。
ハンチントン病(HD)は、ハンチンチン遺伝子(HTT)の常染色体優性変異により引き起こされる遺伝性神経変性疾患である。ハンチンチン遺伝子内のサイトカイン-アデニン-グアニン(CAG)トリプレットリピートが増加すると、その遺伝子によりコードされるハンチンチンタンパク質(Htt)の変異体が産生される。この変異ハンチンチンタンパク質(mHtt)は、毒性であり、ニューロン死に関与する。ハンチントン病の症状は最も一般的には、35~44歳の間に現れるが、あらゆる年齢で現れ得る。
タウパチー病またはタウオパチーは、脳内における微小管関連タンパク質タウの凝集によって引き起こされる神経変性疾患の1群である。アルツハイマー病(AD)が最もよく知られたタウオパチー病であり、タウタンパク質がニューロン内で不溶性神経原線維変化(NFT)の形態で蓄積することを伴う。他のタウパチー病及び障害には、進行性核上性麻痺、ボクサー認知症(慢性外傷性脳症)、染色体17に連鎖する前頭側頭型認知症パーキンソニズム、Lytico-Bodig病(グアムのパーキンソン-認知症複合症候群)、神経原線維変化優性認知症、神経節膠腫及び神経節細胞腫、髄膜血管腫症、亜急性硬化性全脳炎、鉛脳症、結節性硬化症、ハレルフォルデン-スパッツ病、リポフスチン症、ピック病、皮質基底核変性症、嗜銀顆粒病(AGD)、ハンチントン病、ならびに前頭側頭葉変性症が含まれる。
多発性硬化症(MS)は、散在性硬化症または散在性脳脊髄炎と称されることもある。MSは、脳及び脊髄の軸索を覆う脂質性ミエリン鞘が損傷を受けて、脱髄及び瘢痕化、さらには広範な徴候及び症状が生じる炎症性疾患である。MSは、脳及び脊髄の神経細胞が互いに有効的に情報伝達を行う能力に影響を及ぼす。神経細胞は、ミエリンと呼ばれる絶縁性物質内にある軸索と呼ばれる長い線維に沿って活動電位と呼ばれる電気信号を送ることにより情報伝達を行っている。MSでは、身体自体の免疫系がミエリンを攻撃し、損傷を与える。ミエリンが失われると、軸索は、シグナル伝達を有効的に行うことができなくなる。MS発症は通常、若年成人で起こり、女性でより一般的である。
本明細書において提供されるSiglec-9ECD-Fc融合分子などのSiglec-9ECD融合分子(及び任意の追加の治療薬)を、非経口、肺内、鼻腔内、腫瘍内、病変内投与、脳脊髄内、頭蓋内、髄腔内、滑液包内、髄腔内、経口、局所、または吸入経路を含む、任意の適切な手段により投与することができる。非経口注入には、筋肉内、ボーラス剤としての静脈内投与、または一定期間にわたる連続注入、動脈内、関節内、血管周囲、または皮下投与が含まれる。一部の実施形態では、投与は静脈内投与である。一部の実施形態では、投与は皮下である。投薬は、任意の適切な経路により、例えば、部分的に、投与が短期間であるか長期間であるかに応じて静脈内または皮下注射剤などの注射剤によるものであってよい。これに限定されないが、様々な時点での単回または複数回の投与、ボーラス投与、及びパルス注入を含む様々な投薬スケジュールが本明細書では企図される。
一部の実施形態では、本明細書において提供されるSiglec-9ECD融合分子は、試料または個体におけるSiglecリガンド、例えば、シアル酸の存在を検出するために有用である。本明細書で使用される場合の「検出する」という用語は、定量的または定性的検出を含む。個体、または個体に由来する組織試料でのシアル酸の検出など、診断目的で本開示のSiglec-9ECD融合分子を使用する方法を本明細書において提供する。一部の実施形態では、個体はヒトである。
本明細書に記載のとおりのSiglec-9ECD融合分子、例えば、Siglec-9ECD-Fc融合分子を含む製品(例えば、キット)を本明細書において提供する。製品は、本明細書に記載のSiglec-9ECD融合分子を含む1つまたは複数の容器を含み得る。容器は、これに限定されないが、バイアル、ボトル、ジャー、可撓性包装(例えば、密封したMylarまたはプラスチックバッグ)などを含む、任意の適切な包装であってよい。これらの容器は、単位用量、バルクパッケージ(例えば、複数用量パッケージ)、またはサブユニット用量であってよい。
ヒト腫瘍において免疫細胞上のSiglec-9の発現を検査するために、新たに切除された原発性ヒト腫瘍を酵素的消化により処理し、フローサイトメトリー分析を続けた。図1に示されているとおり、代表的な肺腺癌試料では、Siglec-9が腫瘍浸潤マクロファージ及び顆粒球の表面では検出されたが、T細胞では検出されなかった。同様のSiglec-9発現プロファイルが、結腸直腸、肝臓、卵巣、及び頭頚部癌からの試料において観察された。Siglec-9骨髄細胞発現のさらなる特徴付けは、Siglec-9発現がHLA-DRlo細胞で最高であり、これは骨髄由来抑制細胞(MDSC)として特徴づけられ得ることを明らかにした。
Siglec-9-hIgG1短縮化バリアントを、発現及びA375黒色腫細胞への結合の効率について評価した。Siglec-9のECDは3つのドメインからなり:リガンド結合IgVドメインがN末端に配置されていて、C2T1及びC2T2ドメインが続く。3つのドメインのうち、C2T2ドメインが、形質膜に最も近く配置されている。表1に示されているとおり、3つのドメインすべてを含有するSiglec-9ECD-Fcバリアントのみが、Expi293細胞で効率的に発現された。Siglec-9-hIgG1結合を検出するために、A375細胞を250μg/mlのSiglec-9ECD-Fcバリアントと共に2時間にわたって、氷上で、暗所でインキュベートし、続いて、蛍光コンジュゲートした抗ヒトIgG(Jackson Immunoresearch)と共に30分間にわたってインキュベートした。結合を、BD FACS Cantoを用いてフローサイトメトリーにより評価し、かつFlowJoソフトウェアを用いて分析した。表1のデータは、Siglec-9ECDにおいて主なリガンド認識ドメインとして機能するIgVドメインと一致して、A375細胞への結合にはIgVドメインが必要とされることを示している。
Siglec9-Fc融合タンパク質を、Siglec9-IgVホモロジーモデルを作製することにより操作して、溶解性を改善し、かつ電荷分布を再調整するための変異の設計を可能にした。構造ベースのタンパク質ホモロジーモデリング及び安定性の計算を用いて、溶解性の改善及び表面電荷の再分布を伴うSiglec-9バリアントを設計したが、その際、MOE(Molecular Operating Environment, Chemical Computing Group, Montreal, Canada)のタンパク質モデリング及びタンパク質設計モジュールを利用した。
Siglec-7の高分解能結晶構造をSiglec-9モデルと比較した(Alpheny, M.S., et al;High Resolution Crystal Structures of Siglec-7, Insights into Ligand Specificity in the Siglec Family;J. Biol. Chem. 278 (2003) 3372-3377)。VDSQTDSD(配列番号8)から構成される負電荷Siglec-7ループと比較した場合、SHGWIYPG(配列番号9)から構成される等配電子のSiglec-9ループは、より大きな疎水性表面をもたらす。したがって、系統的なインシリコでのループスワッピングタンパク質操作を適用した;Siglec-7ループの各アミノ酸をSiglec-9残基により置き換えるか、またはSiglec-7残基と共に最高8つの残基を保持すると、255の変異体及び1つの野生型バリアントを含めて全部で256バリアントが生じた。安定性変化を256のバリアントすべてについて計算した。安定性の改善、正電荷パッチの減少、及び疎水性パッチの減少に基づき、変異体をさらなる特徴付けのために選択した。これらの変異体S9.23~S9.39のアミノ酸配列は配列番号32~39に示されている。
安定性の変化(負の値が大きいほど安定)、疎水性タンパク質パッチの面積、正電荷タンパク質パッチの面積、負電荷タンパク質パッチの面積、等電点、及び実効電荷を含むインシリコ生物物理学的特性をpH7.4、100mM濃度のNaCl、及び298Kで計算し、親コンストラクトと比較した。結果は図3に示されている。「安定性変化」カラムにおける負の値は、安定性の上昇を示している。安定性変化の改善は大部分、電荷の再分配及び露出疎水性表面積の減少による。そのような変化は通常、タンパク質発現及び産生の増加をもたらす。
がん細胞系のパネルへのSiglec-9-Fc結合を評価するために、S9.1-hIgG1バリアント(配列番号10)を使用した。S9.1-hIgG1は、天然配列Siglec-9ECDを含むが、C2T2ドメインの後、そして膜貫通ドメインの前に生じているアミノ酸残基LQSKATSGVTQG(配列番号147)の欠失を伴い、シグナル配列は産生中に切断される。用量決定量のS9.1-hIgG1を、実質的に実施例2に示されているとおりの表2に列挙されているがん細胞系と共にインキュベートした。FACS Kdを、実質的にDrake and Klakamp, Journal of Immunological Methods, 2007に記載されているとおりに計算した。
一次ヒト細胞上でのSiglec-9-Fc結合を検査するために、S9.A-mIgG1を使用して、骨髄由来抑制細胞(MDSC)へのSiglec-9-Fcの親和性を評価した。S9.A-mIgG1(配列番号43)は、7アミノ酸リンカーを介してマウスIgG1Fcドメインに融合している全長Siglec-9ECD(配列番号1のアミノ酸残基1~348)を含み、その際、シグナル配列は産生中に切断される。MDSCは、実質的に次のとおりに生成した:CD14+単球を、RosetteSep Human Monocyte Enrichment Cocktailキット(StemCell)を使用して健康人ドナーから単離し、37℃及び5%CO2で7日間にわたって、10ng/ml hGM-CSF(R&D)及び10ng/ml hIL-6(R&D)を含有するRPMI培地中で分化させた。MDSCを用量決定量のS9.A-mIgG1と共に2時間にわたって氷上で、暗所でインキュベートし、続いて、蛍光コンジュゲートした抗マウスIgG(Jackson Immunoresearch)と共に30分間にわたってインキュベートすることにより、細胞結合を評価した。結合を、フローサイトメトリーによりBD FACS Cantoで評価し、FlowJoソフトウェアを使用して分析した。MDSCでの抗ヒト検出は法外に高いバックグラウンド結合をもたらすので、マウスFcを有するバリアントS9.A-mIgG1を使用した。表3に示されているとおり、S9.A-mIgG1についてMDSCで計算されたFACS Kdは、3人の独立したドナーで低いnM範囲にあり、肺癌上皮細胞系である参照がん細胞系A549では約10~100倍弱かった。これらの研究は、Siglec-9-Fcが、がん細胞に対してよりも高い親和性で、MDSCなどの骨髄細胞に結合することを示している。したがって、これらの研究は、FcRを発現しないがん細胞上でのシアル酸のみへのSiglec-9-Fcの結合と比較して、Siglec-9-Fcが骨髄細胞上ではFcR及びシアル酸の両方に結合する協合的結合機構についてのさらなる証拠を提示している。これは、FcRを発現しないA549肺癌細胞系と比較して、MDSCについてのS9.A-mIgG1の親和性の増強を説明するであろう。
S9.A-hIgG1(配列番号40)及びS9.A-hIgG1 LALAPS(配列番号42)を、MDSCを再分極する能力について評価した。S9.A-hIgG1(配列番号40)及びS9.A-hIgG1 LALAPS(配列番号42)は、7アミノ酸リンカーを介してヒトIgG1 Fcドメインに融合している全長Siglec-9ECD(配列番号1のアミノ酸残基1~348)を含み、その際、シグナル配列は産生中に切断される。S9.A-hIgG1では、ヒトIgG1 Fcドメインは天然配列hIgG1であり、S9.A-hIgG1 LALAPSでは、ヒトIgG1 Fcドメインは「LALAPS」置換を含む。既に記載したとおり、LALAPSは、Fc-FcR相互作用を実質的に排除する。
S9.1-hIgG1(配列番号10)処置の効果をヒトMDSC-T細胞同時培養システムで評価した。簡単に述べると、ヒトMDSCを、実施例7に示されているとおりに生成した。RosetteSep(商標)Human CD8+T Cell Enrichment Cocktailキット(StemCell)を使用して、自己CD8+T細胞を血液から単離した。MDSCを48時間にわたって、37℃及び5%CO2で、10μg/mlのS9.1-hIgG1またはIgG対照で処理し、続いて、自己CD8+T細胞と共に、Dynabeads(登録商標)Human T-Activator CD3/CD28の存在下で、1:2:2のMDSC:T細胞:Dynabeads(登録商標)の比で同時培養した。一部の条件では、CD3/CD28 Dynabeads(登録商標)のみと共にインキュベートされたCD8+T細胞を、S9.1-hIgG1で処理した。すべての細胞条件を4日間にわたって37℃及び5%CO2で培養し、続いて、ELISA(Thermo Fisher)により培養上清中のIFNγを定量化した。
T細胞のMDSC媒介抑制を解除するS9.A-hIgG1(配列番号40)の能力を、機能性抗Siglec抗体のパネルと直接的に比較した。実施例9に示されているとおり、MDSC及び自己CD8+T細胞を同時培養のために調製した。MDSCを、15μg/mlのS9.A-hIgG1または標的受容体の下方制御を誘導するか、もしくは同族リガンド結合をブロックするSiglec-3、Siglec-7、もしくはSiglec-9を指向する抗体で48時間にわたって処理し、続いて、CD8+T細胞及びCD3/CD28 Dynabeads(登録商標)と共に4日間にわたって同時培養した。IFNγを、ELISAにより培養上清中で評価した。
ヒトMDSC-T細胞同時培養システムにおいて、S9.l-hIgG1(配列番号10)の効力をS9.A-hIgG1 LALAPS(配列番号42)と比較した。実施例9に示されているとおりに、同時培養のためにMDSC及び自己CD8+T細胞を調製した。MDSCを、表示の量のS9.l-hIgG1、S9.A-hIgG1 LALAPS、またはアイソタイプ対照で48時間にわたって処理し、続いて、CD8+T細胞及びCD3/CD28 Dynabeads(登録商標)と共に4日間にわたって同時培養した。ELISAにより、培養上清において、IFNγを評価した。
融合タンパク質のFc部分においてNSLF変異を含むSiglec-9-Fcのバリアントを、ヒトMDSCを再分極する能力について評価した。NSLF変異は、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)を誘導するヒトIgG1 FcとヒトClq(補体成分1q)とヒトCD16/FcRIIIとの間の相互作用を破壊する。既に記載したとおり、MDSCをCD14+単球から生成した。7日目に、MDSCを48時間にわたって37℃及び5%CO2で、表示の量のS9.A-hIgG1(配列番号40)またはS9.A-hIgG1 NSLF(配列番号41)で処理した。LEGENDplex(商標)Human Proinflammatory Chemokine Panelキット(Biolegend)を使用して、上清を採取し、分泌されたケモカインを分析した。
既に記載されたとおり、ヒトMDSCをCD14+単球から生成した。7日目に、MDSCを48時間にわたって37℃及び5%CO2で、表示の量のS9.A-hIgG1(配列番号40)またはS9.A-hIgG1 NSLF配列番号41)で処理し、その後、抗CD86抗体(クローンIT2.2、Biolegend)及び抗CD163抗体(クローンGHI/61、BD)を使用して、CD86、炎症誘発性マーカー、及びCD163、M2マクロファージマーカーの発現を定量化した。
ヒト化マウスモデルを使用して、インビボでのSiglec-9-Fc処置の効果を評価した。ヒトIL-3及びGM-CSF導入遺伝子を発現する免疫不全HuNOG-EXLマウスに、ヒトCD34+造血前駆細胞細胞(Taconic)を移植して、ヒト免疫応答を有効に再構成した。マウスに、3×106のA375ヒト黒色腫細胞を皮下移植した。16日後に、腫瘍がおよそ300mm3になったときに、マウスを、10mg/kgのS9.1-hIgG1(配列番号10)、S9.A-hIgG1 NSLF(配列番号41)、またはhIgG1アイソタイプ対照の血管周囲(i.p.)注射で3日空けて2回処置した。組織を2回目の投与から24時間後に分析した。
S9.1-hIgG1またはS9.A-hIgG1 NSLFで処置された腫瘍担持HuNOG-EXLマウスを、標準的な全血球数を用いて血液細胞不足についても評価した。血液を組織収集の日に(2回目の10mg/kg投与から24時間後)、心臓穿刺により収集し、ヘパリン含有血液捕集管に入れた。
ヒトSiglec-3、Siglec-7、及びSiglec-9を発現する細菌人工染色体(BAC)トランスジェニックC57BL/6マウスを作製し、これらのマウスにおいて、MC38同系腫瘍増殖を評価した。S3/7/9BACマウスに、MC38細胞(マウス結腸腺癌細胞系)を皮下移植し、腫瘍が平均で100mm3に達したら、マウスを、3mg/kgの抗PD-L1抗体(BMI)で1週あたり2回、3週間にわたって腹腔内で処置した。
Siglec-9-mIgG2a(S9.B-mIgG2a;配列番号44)を生成して、Fc-FcR相互作用を最大化するであろうFcを有するマウス同系腫瘍モデルにおけるSiglec-9-Fcの効果を分析した。S3/7/9BACマウスに、MC38細胞を皮下移植した。腫瘍が平均で100mm3に達したら、マウスを、10mg/kgのS9.B-mIgG2aで1週あたり2回、3週間にわたって腹腔内で処置した。
S3/7/9BACマウスに、MC38細胞を皮下移植した。腫瘍が平均で100mm3に達したら、マウスを、10mg/kgのS9.B-mIgG2a及び3mg/kgの抗PD-L1抗体で1週あたり2回、3週間にわたって腹腔内で処置した。
既に記載したとおり、ヒトMDSCをCD14+単球から生成した。7日目に、MDSCを初めに、用量決定量のS9.1-hIgG1と共に20分間にわたって、氷上で、暗所でインキュベートし、続いて、マウスIgG1融合タンパク質としての表示のSiglecファミリーメンバーと共に、さらに2時間にわたって、氷上、暗所でインキュベートした。結合を、蛍光コンジュゲートした抗マウスIgG(Jackson lmmunoresearch)を用いて検出し、フローサイトメトリーにより分析した。各Siglecファミリーメンバーの細胞結合を非ブロッキング対照(S9.1-hIgG1を添加せず)に対して正規化した。
タンパク質サーマルシフトアッセイ及び40℃での長期インキュベーションを用いて、Siglec-9-Fcバリアントを安定性について評価する。サーマルシフトアッセイでは、リアルタイムPCR機器を使用して、融解温度を決定する。実施例2に示されているとおり、Siglec-9-Fcバリアントの結合親和性をA375ヒト黒色腫細胞でのフローサイトメトリーにより測定する。実施例9に示されているとおり、生物学的機能を、MDSC-T細胞同時培養アッセイにおいてMDSC媒介抑制を解除する能力として評価する。薬物動態(PK)特性をインビトロで、マトリゲルプレートを用いる細胞外マトリックス結合アッセイを用いて、またはインビボで、マウスにおいて標準的なPK評価を用いて評価する。
実施例14に示されているとおり、ヒト化マウスを生成する。これらのマウスに、3×106のA375ヒト黒色腫細胞を皮下移植する。2~3週間後に、腫瘍がおよそ300mm3になったときに、マウスを、10mg/kgのSiglec-9-FcまたはhIgG1アイソタイプ対照の腹腔内注射で3日空けて2回処置する。組織を2回目の投与から24時間後に分析する。LEGENDplex(Biolegend)サイトカイン及びケモカインパネルキットまたは標準的なサンドイッチELISAを用いて、血清中で薬力学的(PD)効果を評価する。別に、ヒトCD45MicroBeads(Miltenyi)を用いて、脾臓及び腫瘍中のヒトCD45+細胞を単離し、Nanostring Myeloid Innate Immunity Panelを用いて、転写発現プロファイルを生成する。
同系腫瘍細胞系を、S3/7/9BACマウスにおいて静脈内注射するか、または皮下移植する。皮下設定では、腫瘍が平均で100mm3に達したら、マウスを、単独の、または3mg/kgの抗PD-L1抗体と組み合わせた10mg/kgのSiglec-9-Fcで1週あたり2回、3週間にわたって腹腔内処置する。腫瘍増殖を1週あたり2~3回、キャリパーを用いて測定する。実験終点は50日間か、または腫瘍が2000mm3に達したときである。腫瘍増殖の減少、生存の延長、腫瘍におけるより多量のT細胞流入、及び腫瘍マクロファージ上のCD163またはCD206の減少は、Siglec-9-Fcの抗がん作用の指標の一部である。
CNS及び末梢臓器の両方において骨髄細胞は、それらの表現型及び機能において本質的に可塑的である。これは、M1及びM2タイプマクロファージに分化し得て、異なる食細胞及び炎症潜在性、表現型、ならびに活性を示すマクロファージによりインビトロでモデリングすることができる。末梢臓器では、M1表現型と関連するマクロファージは、より炎症誘発性及び抗微生物であると考えられる一方で、M2様マクロファージは、より恒常性及び抗炎症性である。CNS内では、恒常性条件下の小グリア細胞も、CD200R、CD163などのM2マーカーを発現し、この細胞型における調節機能を示唆している。
様々な腫瘍型Fcでのシアル酸の発現を免疫組織化学により評価した。副腎、膀胱、乳房、骨、脳、食道、胃、小腸、結腸、直腸、腎臓、肝臓、肺、リンパ腫、卵巣、膵臓、前立腺、皮膚、精巣、甲状腺、及び子宮の癌のヒト試料を含有する腫瘍マルチアレイ(Pantomics)を0.1μg/mlのS9.A-mIgG1で染色し、比色検出により可視化した。図17に示されているとおり、腫瘍試料を染色の強度及び出現率(1+は低い強度及び/または出現率、2+は中程度の強度または出現率、及び3+は高い強度または出現率)に基づき質的にスコアリングした。複数の腫瘍型でのスコアを表5にまとめる。
実施例6(結合)及び実施例13(MDSC活性/マーカー発現)において記載の方法と同様の方法を用いて、S9.1 Fcのバリアントを発現させ、腫瘍細胞への結合及びMDSCでの機能活性について試験した。バリアントを、サイズ排除クロマトグラフィーを用いてモノマー含分について、かつタンパク質サーマルシフトアッセイ及び40℃での長期インキュベーションでの安定性についても試験した。サーマルシフトアッセイでは、リアルタイムPCRを用いて、融解温度を決定した。
静脈内腫瘍設定におけるSiglec-9-mIgG2aの効果を分析するために、B16F10マウス黒色腫細胞を、尾静脈を介してS3/7/9BACまたはWTマウスに注射した。移植から24時間後に、すべてのマウスを、B16F10細胞上に高度に発現される腫瘍抗原を認識して、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)及び抗体依存的細胞食作用(ADCP)により腫瘍細胞死をもたらす抗TRPI27μgで腹腔内処置した。加えて、移植から24時間後に開始して、マウスを3日ごとに1回、研究の終了まで、10mg/kgのS9.B-mIgG2aまたはmIgG2aアイソタイプ対照で腹腔内処置した。移植から15日後に、マウスから肺を採取し、腫瘍結節をカウントした。
固体腫瘍増殖を縮小させるSiglec-9-Fcの能力をE0771同系乳癌モデルにおいて試験した。この腫瘍モデルは、骨髄細胞含分が相対的に豊富である。S3/7/9BACマウスに、E0771細胞を皮下移植した。腫瘍が平均で100mm3に達したら、マウスを20mg/kgのS9.B-mIgG2aまたはアイソタイプ対照で、1週あたり2回、3週間にわたって腹腔内処置した。
Siglec-9-Fcの結合に対するFcγ受容体エンゲージメントの作用を決定するために、S9-hIgG1 NSLF(配列番号48、シグナル配列は産生中に切断される)及びS9.A-hIgG1 LALAPS(配列番号42、シグナル配列は産生中に切断される)をMDSCへの結合について試験した。MDSCを以前に記載されたとおり生成し、用量決定量のS9-hIgG1 NSLFと共に2時間にわたって、氷上で、暗所でインキュベートし、続いて、蛍光コンジュゲートした抗マウスIgG(Jackson Immunoresearch)と共に30分間にわたってインキュベートした。結合をフローサイトメトリーにより、BD FACS Cantoを用いて評価し、FlowJo(商標)ソフトウェアを用いて分析した。図22に示されているとおり、S9-hIgG1 NSLFについてMDSCで計算されたFACS Kdは低いnM範囲にあり(図22A)、S9.A-hIgG1 LALAPSでは約75倍低かった(図22B)。S9.A-hIgG1 LALAPSで計算されたFACS Kdは、Fcγ受容体を発現しない参照がん細胞系、A549でのS9.A-hIgG1(配列番号40)について以前に計算されたFACS Kdと、より類似した(図22C)。これらの研究は、Fc-Fcγ受容体結合がインタクトである場合に、Siglec-9-Fcが、より高い親和性でヒト一次骨髄細胞に結合することを示しており、かつ協合的結合機構のための追加の証拠を提示している。
別個のシアル酸グリカンへの複数のSiglecの結合を評価するために、シアル酸含有グリカン及びシアル酸非含有グリカンを含む300の異なるグリカン部分から構成されるグリカンアレイを、R&D systems製のSiglec-3-Fc、Siglec-5-Fc、Siglec-7-Fc、Siglec-10-Fc及びSiglec-15-Fc;Siglec-9-hIgG1(配列番号40、シグナル配列は産生中に切断される);またはアイソタイプ対照で染色した。蛍光標識抗ヒト抗体を用いて、結合を評価した。データを正規化し、正規化された蛍光値を計算した。シアル酸含有グリカンのサブセットに対する染色は図23に示されている。Siglec-9-hIgG1は、すべてではないが多くのタイプのシアル酸部分への強固な結合を示した。Siglec-3-Fc、Siglec-5-Fc、Siglec-7-Fc、Siglec-10-Fc及びSiglec-15-Fcの結合は一般に、より限定された。Siglec-9-hIgG1は、すべてのSiglec10及び15リガンド、Siglec3及び7リガンドの大部分、ならびにSiglec5リガンドのほぼ半分に結合した。これらの結果は、Siglec-9-hIgG1が、他のSiglec-Fcコンストラクトと比較して、複数の異なるSiglecリガンドの効率的なブロッカーであり、したがって、治療設定において有意性を有し得ることを示している。
Siglec-9-Fcの協合的結合が全血において起こり得ることをさらに実証するために、Siglec-9-Fcの結合を健康人ドナーの血液において評価した。全血100μlを系列希釈のAlexa 647-コンジュゲートしたS9-hIgG1(配列番号48、シグナル配列は産生中に切断される)またはS9-hIgG1 NSLF(配列番号45、シグナル配列は産生中に切断される)と共にインキュベートした。赤血球(RBC)を溶解させ、すべての試料をBD Fortessa(商標)で得た。平均蛍光強度(MFI)及びIgGと比べての結合%を計算した。S9-hIgG1 NSLFは、S9-hIgG1と比較して、血液単球への結合の増強を示した(図24A)。これは、野生型hIgG1と比較しての、FcγRIIaに対するS9-hIgG1 NSLFの親和性の所望の上昇と一致する。S9-hIgG1 NSLFの最高の結合は単球で観察され、より低い程度の結合が顆粒球、NK細胞及びB細胞で、かつT細胞及び血小板へのわずかな結合が観察された(図24B)。これらのデータは、Siglec-9-Fcが血清免疫グロブリンの存在下で免疫細胞に、特に、単球、顆粒球、及びNK細胞に結合することを実証している。
実施例10及び図5に記載の方法と同様の方法を使用して、Siglec-9-hIgG1 NSLF(配列番号45、シグナル配列は産生中に切断される)の作用を決定した。MDSCをヒト単球から、GM-CSF及びIL-6と共に5~6日間にわたって培養することにより生成した。MDSCを採取し、自己CD8+T細胞と共に、抗CD3及び抗CD28抗体ならびにSiglec-9-hIgG1 NSLFまたは対照IgGのいずれかの存在下で同時培養した。3~5日後に、T細胞増殖を評価した。図25Aに示されているとおり、MDSCの存在は、T細胞増殖を阻害したが、Siglec-9-hIgG1 NSLFにより回復した。図25Bに示されているとおり、Siglec-9-hIgG1 NSLFの効力を用量応答で評価した。T細胞増殖の回復において一桁のnMのEC50(約1~2nM)が観察された。
実施例10に記載のMDSC T細胞アッセイにおいて、Siglec-9-hIgG1 NSLF(配列番号45、シグナル配列は産生中に切断される)をSiglec-9-hIgG1(配列番号48、シグナル配列は産生中に切断される)と直接比較した。図26に示されているとおり、Siglec-9-hIgG1 NSLFは、Siglec-9-hIgG1と比較して、約10倍の効力の上昇を実証した。まとめると、これらのデータは、T細胞の骨髄抑制の解除におけるSiglec-9-hIgG1 NSLFでの強力な作用を実証している。
Siglec-9- hIgG1 NSLF(配列番号45、シグナル配列は産生中に切断される)による種々のサイトカイン、ケモカイン、及び共刺激分子の誘導をMDSCで、RNAseqにより分析した。図27に示されているとおり、Siglec-9-hIgG1 NSLFは、MDSCと共にインキュベートした場合に、強固な遺伝子発現プロファイルを誘導し、このプロファイルは、再分極と一致した。同様のプロファイルがマクロファージ及び樹状細胞でも観察された(データは図示せず)。
Siglec-9-hIgG1 NSLF(配列番号45、シグナル配列は産生中に切断される)を、抑制骨髄細胞を再分極する能力について、他の免疫チェックポイント経路を標的化する抗体と直接比較した。図28に示されているとおり、Siglec-9-hIgG1 NSLFは、それらの抗体と比較して、MDSCの再分極において高度に有効である。抗Siglec-15、抗LILRB2、及び抗PD-L1は、Siglec-9-hIgG1 NSLFほどには、MDSCの表面においてCD86上方制御またはCD206下方制御を誘導することはできない。これらの結果は、Siglec-9-hIgG1 NSLFがチェックポイント阻害薬よりも潜在的に有効な、高度に有効な治療である可能性を実証している。
実施例27に示されているとおりの方法を使用して、抗PD-L1と組み合わせたSiglec-9-Fcの効果を決定した。S3/7/9BACマウスに、E0771細胞を皮下移植した。腫瘍が平均で100mm3に達したら、マウスを、20mg/kgのS9.B-mIgG2a及び10mg/kgの抗PD-L1抗体で1週あたり2回、3週間にわたって腹腔内処置した。図29に示されているとおり、Siglec-9-Fcと抗PD-L1抗体との組み合わせは、単独でのSiglec-9-Fcまたは抗PD-L1抗体処置のいずれかよりも高度に、E0771腫瘍増殖を減少させた。移植後25日目に、Siglec-9-Fc単剤治療と比較して、腫瘍増殖阻害58%が達成された。平均±SEMが示されている。これらの研究は、Siglec-9-Fcと、抗PD-1または抗PD-L1抗体などのPD-1またはPD-L1阻害薬との組み合わせが抗腫瘍応答を改善し得ることを示している。
作用機構を明瞭にし、かつ応答の潜在的な薬力学的(PD)マーカーを同定するために、免疫モニタリング研究を行った。マウスに、E0771腫瘍細胞を接種し、100mm3の平均体積で2群に無作為化し、S9.B-mIgG2a(配列番号44、シグナル配列は産生中に切断される)またはアイソタイプ対照を3~4日ごとに3回投与した。最終投与から24時間後に、マウスを安楽死させ、脾臓及び腫瘍をフローサイトメトリー分析のために採取した。CD11bは、接着、遊走、食作用、及び細胞活性化の調節を含む骨髄細胞機能の多面レギュレーターである。S9.B-mIgG2は、脾臓骨髄細胞上でのCD11b及びCD86発現の有意な増加を誘導した(図30)。脾臓骨髄細胞におけるこれらの変化は、ヒトMDSCにおいて観察されたものと一致し、Siglec-9-Fcの潜在的な薬力学的マーカーを示す。
安定性及び/またはPKなどの特性を改善し得るであろうさらなるSiglec-9-Fcバリアントを作製した。作製された特定のバリアントが図31に示されており、企図されたバリアントのすべてが、下の配列表に含まれる。S9.32~S9.38と名付けられたバリアントでは、IgVドメイン内の不所望の疎水性パッチ内の単一のトリプトファン(W38)が、疎水性の低い残基で置換された。S9.39及びS9.41~S9.45と名付けられたバリアントは、不所望の疎水性パッチの作用をさらに減少させ得るように、IgVドメインにおいて追加の置換を含む。S9.47~S9.53と名付けられたバリアントは、安定性を付与し得るように、IgVドメインの外側に置換を含む。図31に示されているとおり、特定のバリアントを特定の特性について試験した。加えて、MDSCにおける再分極のマーカーに対する作用を検査するために、特定のバリアントを実施例13に記載のものと同様のアッセイで試験した。図32に示されているとおり、バリアントS9.36、S9.37及びS9.38は、Siglec-9-Fc-hIgG1に匹敵する挙動を示し、CD163の減少(図32A)及びCD206の減少(図32B)及びCD86の増加(図32C)を示した。
その半減期を改善することができるように、さらなる置換及び変更をSiglec-9-hIgG1 NSLF(配列番号45)のFc領域において行った。Siglec-9-hIgG1 NSLFのFc領域は、Siglec-9-hIgG1 NSLFがインビボで細胞に取り込まれるときに、エンドソームの酸性環境において新生児Fc受容体(FcRn)により結合されることが予測される。この結合の結果として、Siglec-9-hIgG1 NSLFは、細胞表面に逆に向けられて、生理的pH条件下で、酸性エンドソーム内で分解される代わりに、細胞外環境に放出されるであろう。内在化の後に、逆に細胞外環境へとSiglec-9-hIgG1 NSLFを「リサイクルする」ことにより、このプロセスは、循環中のSiglec-9-hIgG1 NSLFの量を増加させ、それにより、半減期の改善をもたらし得る。次いで、これは、より少量の投薬量またはより低い頻度の投薬を可能にし得る。
Siglec-9-hIgG1 NSLF(配列番号45、シグナル配列は産生中に切断される)及びSiglec-9-hIgG1(配列番号48、シグナル配列は産生中に切断される)の薬物動態特性を比較した。カニクイザルを、Siglec-9-hIgG1またはSiglec-9-hIgG1 NSLFの80mg/kgの静脈内注射の単回投与で処置した。カニクイザルの血清中におけるSiglec- 9-hIgG1及びSiglec-9-hIgG1 NSLFでの平均濃度-時間プロファイルを決定した。図33は、Siglec-9-hIgG1 NSLF(四角形)が、Siglec-9-hIgG1(円形)を上回ってPKを改善していることを示している。
実施例37に示されているとおり、特定のSiglec-9-Fcバリアントの薬物動態特性を決定した。S9.1、S9.36、S9.37、S9.38、及びS9.45を、静脈内大量注射により単回投与として、Siglec3/7/9BAC遺伝子導入マウスに与えた。図34に示されているとおり、S9.37は、Cmax及びAUC0-infの上昇を示した。平均T1/2は他のバリアントと同様であるが、AUCの上昇は特に、他のバリアントと比較して、S9.37の曝露(生物学的利用能)の改善を示し得る。
Claims (43)
- そのC末端でFcドメインに結合している配列番号78のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドであって、前記FcドメインがヒトIgG1アイソタイプを有する、単離されたポリペプチド。
- 前記Fcドメインが、配列番号142のIgG1ポリペプチドと比べて、
a)FcγRIIIへの結合の減少;
b)抗体依存性細胞傷害性(ADCC)の低下及び/もしくは補体結合活性の低下;
c)FcγRIIaへの結合の増大;または
d)a)、b)、及び/もしくはc)の任意の組み合わせ
を有する、請求項1に記載の単離されたポリペプチド。 - 前記Fcドメインが、配列番号142~144及び234~239のいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1または2に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記Fcドメインが配列番号142のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の単離されたポリペプチド。
- 配列番号10のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記Fcドメインが配列番号143のアミノ酸配列を含む、請求項1または2に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが配列番号227のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の単離されたポリペプチド。
- アミノ酸残基1~19を欠く配列番号45~48及び228~233のいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の単離されたポリペプチド。
- 配列番号45~48及び228~233のいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の単離されたポリペプチド。
- アミノ酸残基1~19を欠く配列番号45のアミノ酸配列を含む、請求項8に記載の単離されたポリペプチド。
- 配列番号45のアミノ酸配列を含む、請求項9に記載の単離されたポリペプチド。
- アミノ酸残基1~19を欠く配列番号48のアミノ酸配列を含む、請求項8に記載の単離されたポリペプチド。
- そのC末端で配列番号143に結合している配列番号78のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが細胞の表面上のシアル酸に結合する、請求項1~13のいずれか1項に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記細胞が腫瘍細胞である、請求項14に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記細胞がFcRを発現する、請求項14に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記細胞が骨髄細胞である、請求項14に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記骨髄細胞が、単球、マクロファージ、樹状細胞、小グリア細胞、及び骨髄由来抑制細胞(MDSC)から選択される、請求項17に記載の単離されたポリペプチド。
- a)Siglec-3、Siglec-5、Siglec-7、Siglec-9、Siglec-10、及びSiglec-15から選択されるいずれか1つもしくは複数のSiglecファミリーメンバーの細胞結合をブロックする;
b)T細胞のMDSC媒介抑制を解除する;
c)MDSCを炎症誘発性表現型に再分極する;
d)MDSC上でのCD86の発現を増大させる、MDSC上でのCD11bの発現を増大させる、かつ/もしくはMDSC上でのCD163の発現を減少させる;
e)腫瘍マクロファージをM2表現型から再分極する;
f)CD163+及び/もしくはCD206+マクロファージを減少させる;
g)MDSCにおいてCCL3、CCL4、CCL5、CCLI7、CXCL1、CXCL9、及びIL-8から選択される1つもしくは複数のケモカインの発現を誘導する;
h)腫瘍微小環境への骨髄細胞の動員を減少させる;
i)100nM未満、50nM未満、25nM未満、20nM未満、10nM未満、5nM未満、2nM未満、1~50nM、1~25nM、1~20nM、1~10nM、1~5nMもしくは1~2nMの親和性で、MDSCに結合する;または
j)(a)から(i)のいずれか1つもしくは複数を行う、請求項1~18のいずれか1項に記載の単離されたポリペプチド。 - b)において、T細胞のMDSC媒介抑制を解除することが、IFNγ発現の増大もしくはT細胞増殖の増大を測定することにより決定される、請求項19に記載の単離されたポリペプチド。
- 前記MDSCがヒトMDSCであり、かつ/または前記マクロファージがヒトマクロファージである、請求項19に記載の単離されたポリペプチド。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載の単離されたポリペプチドをコードする核酸配列を含む単離された核酸。
- 配列番号45~48及び228~233のいずれか1つから選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項22に記載の単離された核酸。
- 配列番号78または227のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、請求項22に記載の単離された核酸。
- 請求項22~24のいずれか1項に記載の単離された核酸を含む発現ベクター。
- 請求項22または23に記載の単離された核酸または請求項25に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載の単離されたポリペプチドを発現する宿主細胞。
- 請求項26または請求項27に記載の宿主細胞を培養することを含み、ポリペプチドを単離することを含んでもよい、ポリペプチドを生成する方法。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載のポリペプチドと、薬学的に許容される担体とを含む薬学的組成物。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載のポリペプチドまたは請求項29に記載の薬学的組成物を含む、がんを処置するための医薬。
- 前記がんが、骨髄細胞を含む腫瘍微小環境と関連する固形腫瘍である、請求項30に記載の医薬。
- 前記がんが、腎細胞癌、肉腫、膵臓がん、神経膠芽腫、卵巣がん、結腸直腸がん、肺がん、黒色腫、膀胱がん、頭頚部がん、乳がん及び子宮がんから選択される、請求項30または31に記載の医薬。
- 前記がんが転移性である、請求項30~32のいずれか1項に記載の医薬。
- PD-1またはPD-L1のアンタゴニストがさらに投与され、PD-1またはPD-L1の前記アンタゴニストがそれぞれ、PD-1またはPD-L1に結合する抗体であってもよい、請求項30~33のいずれか1項に記載の医薬。
- 化学療法薬がさらに投与される、請求項30~34のいずれか1項に記載の医薬。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載のポリペプチドまたは請求項29に記載の薬学的組成物を含む、対象における骨髄由来抑制細胞(MDSC)を炎症誘発性表現型に再分極するための医薬。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載のポリペプチドまたは請求項29に記載の薬学的組成物を含む、がんを有する対象において腫瘍マクロファージをM2表現型から再分極するための医薬。
- 請求項1~21のいずれか1項に記載のポリペプチドまたは請求項29に記載の薬学的組成物を含む、対象において骨髄細胞を活性化するための医薬。
- 前記骨髄細胞が小グリア細胞である、請求項38に記載の医薬。
- 前記対象ががんを有する、請求項36、38または39のいずれか一項に記載の医薬。
- 前記がんが、骨髄細胞を含む腫瘍微小環境と関連する固形腫瘍である、請求項37または40に記載の医薬。
- 前記がんが、腎細胞癌、肉腫、膵臓がん、神経膠芽腫、卵巣がん、結腸直腸がん、肺がん、黒色腫、膀胱がん、頭頚部がん、乳がん及び子宮がんから選択される、請求項40または41に記載の医薬。
- 前記がんが転移性である、請求項40~42のいずれか1項に記載の医薬。
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