JP7685461B2 - 多発性硬化症の遺伝子発現マーカー及び治療 - Google Patents
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Description
本出願は、2015年1月28日に出願された米国仮出願第62/108,914号の利益を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、ASCII形式で電子的に提出された配列表を含み、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。2016年1月13日に作成された該ASCIIの複写は、P32496WO_PCTSequenceListing.txtという名称であり、34,331バイトの大きさである。
多発性硬化症(MS)は、炎症の発症が、非常に変化しやすい症状の経過及び進行をもたらす、中枢神経系に影響を及ぼす脱髄疾患である(Compston,A.et al.,Lancet 372:1502-1517(2008))。発病は通常、30~50歳の間の年齢であり、女性におけるより高い発病率と高い地理的変動性とを有する(Rosati,G.,Neurol Sci 22:117-139(2001))。脱髄の多様な解剖標的を反映した幅広い症状があるが、典型的なシンドロームとしては、虚弱、疲労、視力喪失、認知機能障害、ならびにバランス及び協調障害(Compston(上記))が挙げられる。MSの発症はタイミングについても不規則であり、MS病変が空間(位置)及び時間の両方において汎発するという一般原則を導く(Adams,R et al.,Principles of Neurology.sixth edn,(McGraw-Hill,1997))。これらの症状は多くの場合、MSの診断をするのに十分であるが、脳脊髄液の分析及び神経誘発電位測定に加えて、磁気共鳴画像法(MRI)もまた有益である。MSは通常、晩年に固定化した障害(二次進行期)へとやがて進行する、可逆性神経障害(再発寛解期、またはRRMS)で始まる(Adams et al.(上記))。疾患の他の態様と同様に、この進行のパターン、重度、及びタイミングは、患者間で大きく異なり得、一部は初めから急速な進行を伴う甚大な障害を経験する(一次進行性MSまたはPPMS)一方、少数の他の患者は単発の比較的軽度の症状を有する。
インターロイキン-17A(IL-17A、当該技術分野ではしばしばIL-17と称される)は、IL-6、IL-8、G-CSF、及びMCP-1を含む他の炎症性サイトカイン及びケモカインを産生するように上皮、内皮、及び線維芽細胞を刺激する、T細胞由来の炎症誘発性分子である(Yao,Z.et al.,J.Immunol.122(12):5483-5486(1995)、Yao,Z.et al,Immunity,3(6):811-821(1995)、Fossiez,F.,et al.,J.Exp.Med.,183(6):2593-2603(1996)、Kennedy,J.,et al.,J.Interferon Cytokine Res.,16(8):611-7(1996)、Cai,X.Y.,et al.,Immunol.Lett,62(1):51-8(1998)、Jovanovic,D.V.,et al.,J.Immunol.160(7):3513-21(1998)、Laan,M.,et al.,J.Immunol.162(4):2347-52(1999)、Linden,A.,et al.,Eur Respir J,15(5):973-7(2000)、及びAggarwal,S.and Gurney,A.L.,J Leukoc Biol.71(1):1-8(2002)を参照されたい)。IL-17はまた、TNF-α及びIL-1βを含む他のサイトカインと協同して、ケモカイン発現を更に誘発する(Chabaud,M.,et al.,J.Immunol.161(1):409-14(1998))。IL-17Aは、様々な細胞型で多面的な生物活性を呈する。IL-17Aはまた、ICAM-1表面発現、T細胞の増殖、ならびにCD34+ヒト前駆細胞の好中球への成長及び分化を誘発する能力も有する。IL-17Aはまた、骨代謝と関係づけられてきており、活性化T細胞の存在及びTNF-α産生を特徴とする病態、例えば関節リウマチ及び骨インプラントのゆるみにおいて重要な役割を果たすことが示されている(Van Bezooijen et al.,J.Bone Miner.Res.,14:1513-1521(1999))。
別途定義されない限り、本明細書で使用される専門用語及び科学用語は、本発明が属する当業者が一般に理解する意味と同じ意味を有するものとする。Singleton et al.,Dictionary of Microbiology and Molecular Biology 2nd ed.,J.Wiley&Sons(New York,NY 1994)及びMarch,Advanced Organic Chemistry Reactions,Mechanisms and Structure 4th ed.,John Wiley&Sons(New York,NY 1992)は、本出願で使用される用語の多くについて一般的基準を当業者に提供する。
本発明によると、以下の遺伝子が、RRMS患者におけるIL-17AAの増加したレベルと関連するものとして同定された:TIMP1、LRG1、CXCL1、CXCL5、CXCL10、IL8、NFκBIZ、YKL40(CHI3L1)、及びG-CSF(CSF3)。これらの遺伝子は表1にも列挙され、この表は、それらを表すNCBI GenBank受託番号と共に本明細書で分析される選択された遺伝子を列挙する。対象から取得した生体試料中の1つ以上の遺伝子のRNA転写物またはそのタンパク質産物の対照と比べて増加した発現レベルは、対照が、MSを有し得るか、MSを発症する危険性があるか、及び/またはIL-17抗体等のIL-17アンタゴニストでの治療に応答性である可能性がより高いことを示す。開示される遺伝子のうちの1つ以上の対照と比べて減少した発現レベル、または対照と比べて同じレベルは、対象がMSを有しないか、MSを発症する危険性がないか、及び/またはIL-17アンタゴニストでの治療に応答性である可能性が低いことを示す。
様々な態様において、本発明は、MSを有する、MSを発症する危険性がある、及び/またはIL-17アンタゴニストでの治療に応答性である可能性が高い対象を同定する方法を提供する。本方法は、TIMP1、LRG1、CXCL1、CXCL5、CXCL10、IL8、NFκBIZ、YKL40(CHI3L1)、及びG-CSF(CSF3)の群から選択される1つ以上の遺伝子の発現レベルを、対象から取得した生体試料中で測定するステップを含む。本方法は、遺伝子(複数可)の発現レベルを対照遺伝子の発現レベルと比較することを更に含んでもよい。対照と比べて増加した発現レベルは、対象がMSを有する、MSを発症する危険性がある、及び/またはIL-17アンタゴニストでの治療に応答性である可能性が高いことを示す。あるいは、対照と比べて減少した発現レベル、または同じ発現レベルは、対象がMSを有しない、MSを発症する危険性がない、及び/またはIL-17アンタゴニストでの治療に応答性である可能性が低いことを示す。
RNA転写物(例えば、mRNA)またはタンパク質の発現レベルを決定する様々な方法としては、遺伝子発現プロファイリング、定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)を含むポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、市販の機器により製造業者のプロトコルに従って、例えばAffymetrix GenChip技術を使用して行うことができるマイクロアレイ分析、遺伝子発現の逐次分析(SAGE)(Velculescu et al.,Science 270:484-487(1995)、及びVelculescu et al.,Cell 88:243-51(1997))、MassARRAY、Massively Parallel Signature Sequencing(MPSS)法による遺伝子発現分析(Brenner et al.,Nature Biotechnology 18:630-634(2000))、プロテオミクス、免疫組織化学(IHC)等が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の一実施形態では、mRNAは定量化される。更なる実施形態では、かかるmRNA分析は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)の技術を使用して、またはマイクロアレイ分析によって行われる。PCRを利用する場合、PCRの好ましい形態は、定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)である。
1)放射性同位体、例えば、35S、14C、125I、3H、及び131I。抗体は、例えばCurrent Protocols in Immunology,Volumes 1 and 2,Coligen et al.(1991)Ed.Wiley-Interscience,New York,New York,Pubs.に記載される技術を使用して、放射性同位体で標識されてもよく、放射能は、シンチレーション測定を使用して測定することができる。
2)蛍光標識、例えば、希土キレート(ユーロピウムキレート)またはフルオレセイン及びその誘導体、ローダミン及びその誘導体、ダンシル、リサミン、フィコエリトリン、及びテキサスレッドが利用可能である。蛍光標識は、例えば、Current Protocols in Immunology(上述)に開示される技術を使用して抗体にコンジュゲートすることができる。蛍光標識は、蛍光光度計を使用して定量化することができる。
3)様々な酵素-基質標識が利用可能であり、米国特許第4,275,149号は、これらのうちのいくつかについての概説を提供する。酵素は、一般に、様々な技術を使用して測定することができる発色基質の化学的改変を触媒する。例えば、酵素は、基質における色の変化を触媒し得、これは、分光光度法により測定することができる。あるいは、酵素は、基質の蛍光または化学発光を改変させ得る。蛍光の改変を定量化するための技術は、上に記載されている。化学発光基質は、化学反応により電子的に励起されるようになり、次いで光を放出し得、(例えば、化学発光計を用いて)それを測定してもよく、またはそれが蛍光アクセプターにエネルギーを与える。酵素標識の例としては、ルシフェラーゼ(例えば、ホタルルシフェラーゼ及び細菌ルシフェラーゼ;米国特許第4,737,456号)、ルシフェリン、2,3-ジヒドロフタラジンジオン、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、ウレアーゼ、ペルオキシダーゼ、例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRPO)、アルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖質酸化酵素(例えば、グルコース酸化酵素、ガラクトース酸化酵素、及びグルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ)、複素環酸化酵素(例えば、ウリカーゼ及びキサンチン酸化酵素)、ラクトペルオキシダーゼ、ミクロペルオキシダーゼ等が挙げられる。酵素を抗体にコンジュゲートするための技術は、O’Sullivan et al.(1981)Methods for the Preparation of Enzyme-Antibody Conjugates for use in Enzyme Immunoassay,in Methods in Enzym.(ed J.Langone&H.Van Vunakis),Academic press,New York 73:147-166に記載されている。
a)水素ペルオキシダーゼが、色素前駆体(例えば、オルトフェニレンジアミン(OPD)または3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン塩酸塩(TMB))を酸化させる、水素ペルオキシダーゼを基質とする西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRPO)と、
b)パラ-ニトロフェニルホスフェートを発色基質とするアルカリホスファターゼ(AP)と、
c)発色基質(例えば、p-ニトロフェニル-β-D-ガラクトシダーゼ)または蛍光基質4-メチルウンベリフェリル-β-D-ガラクトシダーゼとのβ-D-ガラクトシダーゼ(β-D-Gal)と、が挙げられる。
本発明に従ってIL-17、具体的にはIL-17AAと相関するバイオマーカーを発現すると同定された対象は、IL-17アンタゴニストでの治療に応答性である可能性が高い。よって、本発明は、上記のように、TIMP1、LRG1、CXCL1、CXCL5、CXCL10、IL8、NFκBIZ、YKL40(CHI3L1)、及びG-CSF(CSF3)の群から選択される1つ以上の遺伝子のRNA転写物またはそのタンパク質産物の発現レベルを、対象から取得した生体試料中で測定することにより、MSを有するか、MSを発症する危険性がある対象を治療する方法を提供する。本方法は、遺伝子(複数可)の発現レベルを対照遺伝子の発現レベルと比較することを更に含んでもよい。対象と比べて1つ以上の遺伝子の増加した発現レベルを有する対象は、有効量のIL-17アンタゴニストで治療される。
IL-17アンタゴニストは、IL-17AA、IL-17FF、及び/またはIL-17A/F等のIL-17の機能もしくは受容体への結合を阻害、低減、または干渉、IL-17の関連活性を遮断及び/または無効化する任意の分子を含む。IL-17アンタゴニストは、IL-17(IL-17AA、IL-17FF、及び/またはIL-17A/Fを含む)とその受容体のうちの1つ以上との間の相互作用を予防し得る。かかるアンタゴニストは、例えば、IL-17活性に干渉するのに十分な親和性及び特異性でIL-17またはIL-17の受容体に結合することで、この効果を達成する。「IL-17アンタゴニスト」という用語は、IL-17AA、IL-17FF、IL-17A/F、IL-17RA、及びIL-17RCのいずれか及び全てのアンタゴニストを指すために使用される。特定の実施形態では、阻害、低減、干渉、遮断、または無効化は、IL-17AA、IL-17FF、及び/またはIL-17AFの活性の部分的または完全な阻害、低減、干渉、遮断、または無効化であり得る。特定の他の実施形態では、阻害、低減、干渉、遮断、または無効化は、IL-17AA、IL-17FF、及び/またはIL-17AFの活性の阻害、低減、干渉、遮断、または無効化の10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、または100%であり得る。
産生の例示的な技術について、本発明に従って使用される抗体が以下に提供される。抗体の産生に使用される抗原は、所望のエピトープを含有する全長、またはその一部であってもよい。あるいは、所望の抗原またはエピトープをそれらの細胞表面で発現する細胞を使用して、抗体を生成してもよい。抗体を生成するのに有用な抗原の他の形態は、当業者には明らかになるであろう。
ポリクローナル抗体は、関連抗原及びアジュバントを複数回、皮下(sc)または腹腔内(ip)注射することにより動物で産生するのが好ましい。二官能性剤または誘導化剤、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を介したコンジュゲーション)、N-ヒドロキシスクシンイミド(リジン残基を介する)、グルタールアルデヒド、コハク酸無水物、SOCl2、またはR1N=C=NR(式中、R及びR1は異なるアルキル基である)を使用し、関連抗原を、免疫する種において免疫原性であるタンパク質、例えば、キーホールリンペットヘモシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリン、またはダイズトリプシン阻害剤とコンジュゲートすることが有用であり得る。
本明細書におけるモノクローナル抗体を作製する様々な方法が当該技術分野で利用可能である。例えば、モノクローナル抗体は、Kohler et al.,Nature,256:495(1975)に最初に記載されたハイブリドーマ法を使用して、組み換えDNA法(米国特許第4,816,567号)によって作製することができる。
非ヒト抗体のヒト化方法は、当該技術分野において記載されている。好ましくは、ヒト化抗体は、非ヒトである供給源からそれに導入された1つ以上のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、多くの場合、典型的には「移入」可変ドメインから得られる「移入」残基と称される。ヒト化は、Winter及び協力者の方法(Jones et al.,Nature,321:522-525(1986)、Riechmann et al.,Nature,332:323-327(1988)、Verhoeyen et al.,Science,239:1534-1536(1988))に従い、ヒト抗体の対応する配列について超可変領域配列を置換することによって、本質的に行うことができる。したがって、かかる「ヒト化」抗体は、キメラ抗体であり(米国特許第4,816,567号)、実質的に無傷未満のヒト可変ドメインは、非ヒト種由来の対応する配列によって置換されている。実際に、ヒト化抗体は、通常、いくつかの超可変領域残基、及びおそらくいくつかのFR残基が、げっ歯類抗体内の類似部位由来の残基によって置換されたヒト抗体である。
ヒト化の代わりとして、ヒト抗体を生成してもよい。例えば、免疫付与時に、内在性免役グロブリン産生の非存在下で、ヒト抗体の完全なレパートリーを産生することができるトランスジェニック動物(例えば、マウス)を産生することが現在は可能である。例えば、キメラ及び生殖細胞系変異体マウスにおける抗体重鎖結合領域(JH)遺伝子のホモ接合欠失が、内在性抗体産生の完全阻害をもたらすことが記載されている。かかる生殖細胞系変異体マウスにおけるヒト生殖細胞系免役グロブリン遺伝子アレイの導入は、抗原攻撃に際してヒト抗体の産生をもたらすことになる。例えば、Jakobovits et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:2551(1993)、Jakobovits et al.,Nature,362:255-258(1993)、Bruggermann et al.,Year in Immuno.,7:33(1993)、ならびに米国特許第5,591,669号、同第5,589,369号、及び同第5,545,807号を参照されたい。あるいは、ファージディスプレイ法(McCafferty et al.,Nature 348:552-553(1990))を使用して、未免疫のドナー由来の免疫グロブリン可変(V)ドメイン遺伝子レパートリーから、ヒト抗体及び抗体断片を生体外で産生することができる。この技術に従い、抗体Vドメイン遺伝子は、M13またはfd等の糸状バクテリオファージのメジャーまたはマイナーコートタンパク質遺伝子のいずれかにインフレームでクローニングされ、ファージ粒子の表面上の機能性抗体断片としてディスプレイされる。糸状粒子がファージゲノムの一本鎖DNAコピーを含有するため、抗体の機能特性に基づく選択はまた、これらの特性を呈する抗体をコードする遺伝子の選択をもたらす。よって、ファージは、B細胞の特性のいくつかを模倣する。ファージディスプレイは、多様な形態で行うことができ、これらの概説については、例えば、Johnson,Kevin S.and Chiswell,David J.,Current Opinion in Structural Biology 3:564-571(1993)を参照されたい。V遺伝子セグメントのいくつかの供給源をファージディスプレイに使用することができる。Clackson et al.,Nature,352:624-628(1991)は、免疫付与したマウスの脾臓に由来するV遺伝子の小型のランダムコンビナトリアルライブラリーから、抗オキサゾロン抗体の異なるアレイを単離した。未免疫のヒトドナー由来のV遺伝子のレパートリーを構築することができ、異なるアレイの交点(自己抗原を含む)に対する抗体を、Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581-597(1991)、またはGriffith et al.,EMBO J.12:725-734(1993)によって記載される技術に実質的に従って単離することができる。また、米国特許第5,565,332及び同第5,573,905号も参照されたい。
1つ以上の抗原結合領域を含む抗体断片の産生のための様々な技術が開発されている。従来、これらの断片は、無傷抗体のタンパク質分解消化を介して得られた(例えば、Morimoto et al.,Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117(1992)、及びBrennan et al.,Science,229:81(1985)を参照されたい)。しかしながら、現在、これらの断片は、組み換え宿主細胞によって直接産生することができる。例えば、抗原結合断片は、上記の抗体ファージライブラリから単離することができる。あるいは、Fab’-SH断片E.coliから直接回収し、化学カップリングして、F(ab’)2断片を形成することができる(Carter et al.,Bio/Technology 10:163-167(1992))。別のアプローチに従い、F(ab’)2断片は、組み換え宿主細胞培養から直接単離することができる。抗体断片の生成のための他の技術は、当業者には明らかとなるであろう。他の実施形態では、選択した抗体は、一本鎖Fv断片(scFv)である。WO93/16185、米国特許第5,571,894号、及び米国特許第5,587,458号を参照されたい。抗体断片はまた、例えば、米国特許第5,641,870号に記載されるような直鎖状抗体であってもよい。かかる直鎖状抗体断片は、単一特異性または二重特異性であり得る。
多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なるエピトープに対する結合特異性を有し、これらのエピトープは、通常、異なる抗原由来である。かかる分子は、通常、2つの異なるエピトープ(すなわち、二重特異性抗体、BsAb)のみに結合することになるが、本明細書で使用される場合、三重特異性抗体等の追加の特異性を有する抗体がこの発現に包含される。二重特異性抗体の作製方法は、当該技術分野で既知である。全長二重特異性抗体の従来の産生は、2つの鎖が異なる特異性を有する2つの免疫グロブリン重鎖-軽鎖対の共発現に基づく(Millstein et al.,Nature,305:537-539(1983))。免疫グロブリン重鎖及び軽鎖のランダムな分類により、これらのハイブリドーマ(クアドローマ)は10個の異なる抗体分子の潜在的な混合物を産生し、それらの抗体分子のうちの1個のみが正しい二重特異性構造を有する。通常は親和性クロマトグラフィーステップによって行われる正しい分子の精製は幾分煩雑であり、産物収率が低い。同様の手順は、WO93/08829及びTraunecker et al.,EMBO J.,10:3655-3659(1991)に開示されている。異なるアプローチに従い、所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン(抗体-抗原組み合わせ部位)を免疫グロブリン定常ドメイン配列に融合する。融合は、好ましくは、ヒンジ領域、CH2領域、及びCH3領域の少なくとも一部を含む、免疫グロブリン重鎖定常ドメインとのものである。融合のうちの少なくとも1つに存在する軽鎖結合に必要な部位を含む、第1の重鎖定常領域(CH1)を有することが好ましい。免疫グロブリン重鎖融合をコードするDNA、及び所望の場合には免疫グロブリン軽鎖を別個の発現ベクター中に挿入し、好適な宿主生物へと同時導入する。これにより、構築物中で使用される3つのポリペプチド鎖の不均衡な比率により最適な収率が提供される実施形態において、3つのポリペプチド断片の相互の割合を調整する際に優れた柔軟性が提供される。しかしながら、等しい比率の少なくとも2つのポリペプチド鎖の発現により高い収率がもたらされるとき、または比率が特別に有意でないときには、2つまたは3つ全てのポリペプチド鎖のコード配列を1つの発現ベクター中に挿入することが可能である。
本明細書に記載される抗体のアミノ酸配列修飾(複数可)が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/または他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列変異型は、適切なヌクレオチド変化を抗体核酸中に導入するか、ペプチド合成によって調製される。かかる修飾には、例えば、抗体のアミノ酸配列からの残基の欠失、及び/またはそこへの残基の挿入、及び/またはその中での残基の置換が含まれる。最終構築物に到達するように、欠失、挿入、及び置換を任意に組み合わせることができるが、但し、その最終構築物が、所望の特性を保有することを条件とする。アミノ酸変化はまた、グリコシル化部位の数または位置が変化する等、抗体の翻訳後プロセスを変化させ得る。
無極性:Ala(A)、Val(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M)
非荷電極性:Gly(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q)
酸性:Asp(D)、Glu(E)
塩基性:Lys(K)、Arg(R)、His(H)
あるいは、転任に存在する残基は、共通の側鎖特性に基づいて分類され得る:
疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
酸性:Asp、Glu;
塩基性:His、Lys、Arg;
鎖配向に影響を及ぼす残基:Gly、Pro;
芳香族:Trp、Tyr、Phe。
IL-17アンタゴニストは、任意の好適な経路で投与されてもよく、これには、投与の非経口経路、例えば、静脈内(IV)、筋肉内(IM)、皮下(SC)、及び腹腔内(IP)、ならびに経皮、口腔、舌下、直腸内、鼻腔内、及び吸入経路が含まれるが、これらに限定されない。IV、IM、SC、及びIP投与は、ボーラスまたは点滴であってもよく、SCの場合には、ポンプ、緩効性製剤、及び医療機器等(これらに限定されない)の緩効性埋込装置によるものであってもよい。本発明の一実施形態では、投与は全身的である。
本発明の方法での使用のための材料は、キットの調製に適している。本発明のキットは、本明細書に開示される遺伝子のRNA転写物の発現レベルを定量化するための、1つ以上の遺伝子特異的または遺伝子選択的プローブ及び/またはプライマーを含んでもよい。かかるキットは、任意で、生体試料からのRNAの抽出のための1つ以上の試薬を含有する。キットは、例えば、クロマトグラフカラム、既製マイクロアレイ、緩衝剤、適切なヌクレオチドトリホスページ(triphospage)、逆転写酵素、DNAポリメラーゼ、RNAポリメラーゼを含む方法に利用されるそれぞれ様々な材料または試薬のうちの1つ以上を有する1つ以上の容器と、本明細書に開示されるRNA転写物の発現レベルを定量化するための1つ以上のプローブ及びプライマーとを含んでもよい。
CSF IL17レベル及び他の炎症性メディエーターが、RRMS患者において上昇している
IL-17AA、IL-17FF、及び様々な他のタンパク質を、標準治療の療法を受けている50人のRRMS患者、及び20人の健常ドナー(HD)からの脳脊髄液(CSF)及び血清中で、IL-17A及びIL-17Fの場合にはErenna(登録商標)免疫測定プラットフォーム(Singulex,Inc.)に基づく免疫測定法、または標準サンドイッチ免疫測定法を使用して測定した。IL-17A免疫測定法は、およそ30%のIL-17AFヘテロ二量体との交差反応性を有するIL-17AAホモ二量体サイトカインを明確に測定した一方、IL-17Fアッセイは、IL-17AFまたはAAとの検出可能な交差反応性を有しないIL-17FFホモ二量体のみを測定した。全ての免疫測定法は、モノクローナル捕捉及び検出抗体を用いた。
ヒト脳内皮細胞及びミクログリアにおける生体内でのIL-17応答性遺伝子の上方制御
hCMEC/D3不死化ヒト脳内皮細胞系及びSV40形質転換ヒトミクログリア細胞系を、標準細胞培養プロトコルを使用して増殖し、次いで、TNFa、IL-6プラスsIL-6R、IL-17AA、またはこれらのサイトカインの組み合わせで6時間、刺激した。RNAを次いで細胞から単離し、マイクロアレイ分析を行い、追加のサイトカインを伴って、または伴わずにIL-17によって誘発された遺伝子発現を比較した。
EAEモデルにおける生体内でのRRMSバイオマーカーの同定
マウスにおける実験的自己免疫性脳脊髄炎(EAE)は、CD4+T細胞媒介性自己免疫疾患であり、これは、血管周囲CD4+T細胞及び単核細胞の炎症、ならびにそれに続く中枢神経系(CNS)内の軸索経路の原発性脱髄を特徴とし、これは後肢麻痺をもたらす。EAEは、CD4+TH1/TH17媒介性組織損傷の病因及び免疫調節の研究のための強力なモデルを提供し、一般に、ヒト免疫媒介性脱髄疾患である多発性硬化症のための関連モデルと見なされている。C57BL/6マウスにおいて、MOGの免疫優性エピトープ(MOG35-55)に対応するペプチドでの免疫付加によりEAEを誘発することができる。EAEモデルは、様々なIL-17遮断抗体によるバイオマーカーの調節を決定することによってIL-17AAと相関するバイオマーカーを同定するために有用である。
ヒト試料中のRRMSバイオマーカー
IL-17A、IL-17F、及び様々な標的タンパク質を、50人のRRMS患者及び20人の健常ドナー(HD)からの脳脊髄液(CSF)及び血清中で、Erenna(登録商標)免疫測定プラットフォーム(Singulex,Inc.)または実施例1に記載されるサンドイッチアッセイを使用して測定した。
RRMSの血清マーカーとしてのG-CSF
G-CSF(CSF3)は、複数の細胞系譜中でIL-17によって調節されるサイトカインであり、好中球増殖の主要因である。G-CSFを、CSFでは検出できなかったが、血清中では検出することができた。よって、G-CSF血清レベルのIL-17AAとの相関を、EAEモデル及びヒト血清試料の両方において調査した。
Claims (60)
- 再発寛解型多発性硬化症(RRMS)を有するか、またはそれを発症する危険性がある哺乳動物対象を同定する方法であって、
LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを、前記対象から取得した生体試料中で測定することを含み、
対照と比べて増加した少なくとも2の遺伝子の発現レベルは、前記対象がRRMSを有するか、それを発症する危険性があることを示す、前記方法。 - 多発性硬化症(MS)を有するか、またはそれを発症する危険性がある哺乳動物対象を同定する方法であって、
LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを、前記対象から取得した生体試料中で測定することを含み、
対照と比べて増加した発現のレベルは、前記対象が多発性硬化症を有するか、それを発症する危険性があることを示す、前記方法。 - 多発性硬化症は、再発寛解型多発性硬化症(RRMS)である、請求項2に記載の方法。
- 前記哺乳動物対象が、ヒト患者である、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- 前記多発性硬化症が、IL-17の増加したレベルを特徴とする、請求項1~4のいずれか1項に記載の方法。
- IL-17のレベルが、前記対象の脳脊髄液(CSF)中で上昇している、請求項5に記載の方法。
- 前記IL-17が、IL-17AAである、請求項5または6に記載の方法。
- 1つ以上の遺伝子のRNA転写物の発現レベルが測定される、請求項1~7のいずれか1項に記載の方法。
- 1つ以上の遺伝子のタンパク質産物の発現レベルが測定される、請求項1~7のいずれか1項に記載の方法。
- 前記生体試料が、生体液である、請求項1~9のいずれか1項に記載の方法。
- 前記生体液が、脳脊髄液(CSF)である、請求項10に記載の方法。
- 前記生体液が、血清である、請求項10に記載の方法。
- 前記生体液が、血漿である、請求項10に記載の方法。
- NFκBIZのRNA転写物の発現レベルが測定される、請求項1~8及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
- CXCL1の発現レベルが前記血漿中で測定される、請求項13に記載の方法。
- 前記遺伝子のうちの3つ以上の発現レベルが測定される、請求項1~15のいずれか1項に記載の方法。
- IL-17アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が高い、多発性硬化症(MS)を有する哺乳動物対象を同定または予測する方法であって、
(a)LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを、前記対象から取得した生体試料中で測定すること;
(b)MS陰性対照の少なくとも2の遺伝子の参照発現レベルと、(a)において測定された発現レベルを比較すること;及び
(c)(a)において測定された少なくとも2の遺伝子の発現レベルが参照発現レベルを超えている場合、前記対象がIL-17アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が高いと同定すること、
を含む、前記方法。 - IL-17アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が低い、多発性硬化症(MS)を有する哺乳動物対象を同定または予測する方法であって、
(a)LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを、前記対象から取得した生体試料中で測定すること;
(b)MS陰性対照の少なくとも2の遺伝子の参照発現レベルと、(a)において測定された発現レベルを比較すること;及び
(c)(a)において測定された少なくとも2の遺伝子の発現レベルが参照発現レベルを下回るか、または同じレベルである場合、前記対象がIL-17アンタゴニストを含む治療をする可能性が低いと同定すること、
を含む、前記方法。 - 前記哺乳動物対象が、ヒト患者である、請求項17または18に記載の方法。
- 前記多発性硬化症が、IL-17の増加したレベルを特徴とする、請求項17~19のいずれか1項に記載の方法。
- IL-17のレベルが、前記対象の脳脊髄液(CSF)中で上昇している、請求項20に記載の方法。
- 前記多発性硬化症が、再発寛解型多発性硬化症(RRMS)である、請求項17~21のいずれか1項に記載の方法。
- 前記IL-17が、IL-17AAである、請求項20または21に記載の方法。
- 1つ以上の遺伝子のRNA転写物の発現レベルが測定される、請求項17~23のいずれか1項に記載の方法。
- 1つ以上の遺伝子のタンパク質産物の発現レベルが測定される、請求項17~23のいずれか1項に記載の方法。
- 前記生体試料が、生体液である、請求項17~25のいずれか1項に記載の方法。
- 前記生体液が、脳脊髄液(CSF)である、請求項26に記載の方法。
- 前記生体液が、血清である、請求項26に記載の方法。
- 前記生体液が、血漿である、請求項26に記載の方法。
- NFκBIZのRNA転写物の発現レベルが測定される、請求項17~24及び26~29のいずれか1項に記載の方法。
- CXCL1の発現レベルが前記血漿中で測定される、請求項29に記載の方法。
- 前記遺伝子のうちの3つ以上の発現レベルが測定される、請求項17~31のいずれか1項に記載の方法。
- LRG1の発現レベルが前記CSF中で測定される、請求項27に記載の方法。
- 多発性硬化症(MS)を有する哺乳動物対象を治療するための医薬であって、
請求項17に記載の方法により、IL-17アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が高いと同定された対象に投与される有効量のIL-17アンタゴニストを含む、前記医薬。 - 前記IL-17アンタゴニストが、抗体またはその抗原結合断片である、請求項34に記載の医薬。
- 前記抗体が、IL-17抗体もしくはIL-17受容体抗体、またはそれらの抗原結合断片である、請求項35に記載の医薬。
- 前記抗体が、ブロダルマブ、セクキヌマブ、イキセキズマブ、ビメキズマブ(bimekizumab)、CNTO 6785、ALX-0761、及びアファセビクマブ(afasevikumab)の群から選択される少なくとも1つの抗体である、請求項36に記載の医薬。
- 前記抗体がIL-17抗体であり、前記IL-17抗体が、IL-17Aホモ二量体、IL-17Fホモ二量体、及び/またはIL-17AFヘテロ二量体に結合する、請求項36に記載の医薬。
- 前記抗体が、IL-17Aホモ二量体に結合するIL-17抗体である、請求項36に記載の医薬。
- 前記IL-17抗体が、IL-17AA及びIL-17AFに結合する、請求項39に記載の医薬。
- 前記抗体が、IL-17Fホモ二量体に結合するIL-17抗体である、請求項36に記載の医薬。
- 前記抗体が、IL-17AFヘテロ二量体に結合するIL-17抗体である、請求項36に記載の医薬。
- 前記抗体が、モノクローナル抗体である、請求項35~42のいずれか1項に記載の医薬。
- 前記抗体が、キメラ、ヒト化、またはヒト抗体である、請求項43に記載の医薬。
- 前記抗体が、二重特異性、多重特異性、または交差反応性抗体である、請求項43に記載の医薬。
- 有効量の多発性硬化症(MS)治療剤が更に投与される、請求項34~45のいずれか1項に記載の医薬。
- 前記MS治療剤が、フマル酸ジメチル、FTY-720、ナタルジマブ(nataluzimab)、コルチコステロイド、β-インターフェロン、酢酸グラチラマー、テリフルノミド、ミトキサントロン、及び抗CD20抗体の群から選択される少なくとも1つの薬剤である、請求項46に記載の医薬。
- 再発寛解型多発性硬化症(RRMS)を有するか、またはそれを発症する危険性がある哺乳動物対象中で、少なくとも2の遺伝子の発現レベルを検出するためのキットであって、
LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを検出するための2つ以上の試薬を含む少なくとも1つの容器を含む、前記キット。 - 多発性硬化症(MS)を有するか、またはそれを発症する危険性がある哺乳動物対象中で、少なくとも2の遺伝子の発現レベルを検出するためのキットであって、
LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを検出するための2つ以上の試薬を含む少なくとも1つの容器を含む、前記キット。 - IL-17アンタゴニストを含む治療に応答性である可能性が高い、多発性硬化症(MS)を有する哺乳動物対象を同定または予測するためのキットであって、
LRG1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを検出するための2つ以上の試薬を含む少なくとも1つの容器を含む、前記キット。 - 前記2つ以上の試薬が、前記少なくとも2の遺伝子のRNA転写物の発現レベル及び/またはタンパク質産物の発現レベルを検出するための試薬を含む、請求項48または49に記載のキット。
- 前記2つ以上の試薬が、前記少なくとも2の遺伝子の遺伝子特異的プライマーまたはプローブを含む、請求項51に記載のキット。
- 前記2つ以上の試薬が、前記少なくとも2の遺伝子のタンパク質産物の発現レベルを検出するための試薬を含む、請求項48または49に記載のキット。
- 前記2つ以上の試薬が、前記少なくとも2の遺伝子のタンパク質産物に結合する、1つ以上の抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項53に記載のキット。
- IL-17アンタゴニストを含む容器と、前記IL-17アンタゴニストを前記対象に投与するためのラベルまたは指示書と、を更に含む、請求項48~54のいずれか1項に記載のキット。
- 前記IL-17アンタゴニストが、抗体またはその抗原結合断片である、請求項55に記載のキット。
- 前記抗体が、IL-17抗体またはIL-17受容体抗体である、請求項56に記載のキット。
- 前記抗体が、IL-17Aホモ二量体、IL-17Fホモ二量体、及び/またはIL-17AFヘテロ二量体に結合するIL-17抗体である、請求項57に記載のキット。
- 前記MSが、再発寛解型MS(RRMS)である、請求項49または50に記載のキット。
- 再発寛解型多発性硬化症(RRMS)を有するか、またはそれを発症する危険性がある哺乳動物対象を同定する方法であって、
TIMP1、並びにCXCL1、NFκBIZ、及びYKL40の群から選択される少なくとも1の遺伝子の発現レベルを、前記対象から取得した生体試料中で測定することを含み、
対照と比べて増加した少なくとも2の遺伝子の発現レベルは、前記対象がRRMSを有するか、それを発症する危険性があることを示す、前記方法。
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