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JP7701911B2 - Ceacam5およびcd3に対する二特異性抗体 - Google Patents
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JP7701911B2 - Ceacam5およびcd3に対する二特異性抗体 - Google Patents

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Description

発明の分野
本発明は、ヒト癌胎児性抗原CEACAM5(CEA)およびヒトCD3εに結合する二特異性抗体(CEAxCD3二特異性抗体)に関する。加えて、本発明は、そのような二特異性抗体をコードするポリヌクレオチド、ならびにそのようなポリヌクレオチドを含むベクターおよび宿主細胞に関する。本発明は、そのような抗体を選択および生成するための方法、ならびに疾患の処置におけるそのよう抗体を使用する方法にさらに関する。
発明の背景
例えば、膵臓がん、結腸直腸がん、胃がん、肺がんなどのような進行性/転移性固形がんの処置を成功させることが、依然として課題となっている。最新のがん免疫療法は、身体の免疫細胞が、がん細胞をより良く攻撃するおよび殺滅するのを助ける方法/技法を導入した。例えば、いくつかの技法/方法が、T細胞による腫瘍細胞の攻撃を増加させるために開発された。例は、例えば、PD-1/PD-L1を阻害するモノクローナル抗体のような免疫チェックポイント阻害剤、腫瘍関連抗原(TAA)およびT細胞上のCD3に結合するT細胞二特異性抗体またはCAR-T細胞である。CAR-T細胞および二特異性抗体は、血液悪性腫瘍において有効であり、例えば、B細胞悪性腫瘍または急性リンパ球性白血病ALLの処置のために承認されているが、今までのところ、進行性/転移性固形がんの治療におけるこれらの方法の実際の画期的成功はない。治療において使用されるモノクローナル抗体、および二特異性抗体はまた、種々の有害作用を引き起こし得る。重要な毒性の問題は、サイトカイン放出症候群(CRS)であり、これは、例えば、アレムツズマブ、ムロモナブ-CD3、リツキシマブ、トシツズマブおよびCD19xCD3二特異性抗体のブリナツモマブによる治療において見出された。
Taberneroら (J Clin Oncol 35, 2017 (suppl. abstr. 3002))は、ASCO 2017で、単剤療法および抗PD-L1抗体のアテゾリズマブとの組合せにおけるCEAxCD3二特異性抗体(RO6958688、シビサタマブ、下記を参照されたい)による進行性/転移性結腸直腸がんを有する患者におけるフェーズ1臨床データを提示した。シビサタマブは、CD3に結合する1つのFab断片およびCEAに結合する2つのFab断片を有する、いわゆる2+1フォーマットを有する。そのような抗体は、例えば、米国特許出願公開第20140242079号(国際公開第2014131712号)および米国特許出願公開第20140242080号(国際公開第2014131711号)に記載されている。
本明細書で使用される場合、「TCB2014」は、CDRとして、米国特許出願公開第20140242080号の配列番号270~276および290~296に示されるCDRを含む(その全体が参照により組み込まれる米国特許出願公開第20140242079号の配列番号4~10および24~30のCDRも参照されたい)、米国特許出願公開第20140242080号(その全体が参照により組み込まれる)に記載されるような2+1フォーマットでCEAおよびCD3に結合する二特異性抗体を指す。本明細書で使用される場合、「TCB2017」は、CDRとして、国際公開第2017055389号の配列番号4~6、8~10および14~19に示されるCDRを含む国際公開第2017055389号(その全体が参照により組み込まれる)に記載されるように、電荷改変(CD3バインダーにおけるVH/VL交換、CEAバインダー、ヒト化CEAバインダーにおける電荷改変)を有する「2+1 IgG CrossFab、逆位」フォーマットの分子Bを指す。
2+1構造は、かなり、ネイティブIgG抗体とは異なる。その構造は、人工アミノ酸(aa)架橋、およびFc部分におけるノブイントゥホール技術/aa配列によって一緒にされた2つの異なる重鎖も含有する(例えば、米国特許第6737056号、国際公開第2013055958号を参照されたい)。そのような二特異性抗体(例えば、RO6958688、シビサタマブ)は、免疫原性であり、したがって、抗薬物抗体(ADA)の形成、およびADAによる薬物の中和に起因する薬物曝露の喪失を引き起こす。Meleroらは、60~200mg用量で、ADAを有する患者の50%またはそれよりも多く、および患者の45%で、曝露の喪失を報告した(Meleroら, ASCO 2017, Abstract 2549 and Poster No. 41, AbstractはJournal of Clinical Oncology 35, no. 15_suppl (May 20, 2017) 2549-2549を参照されたい)。曝露の喪失は、実際の治療を管理することを困難にし、成功の確率を有意に減少させる。ADA形成を最小化するために、シビサタマブを、それぞれ、シビサタマブおよびアテゾリズマブの組合せで、抗CD20抗体のオビヌツズマブによる前処置後に組合せにおいて臨床的に試験する(ClinicalTrials.gov Trial NCT03866239を参照されたい)。前処置は、転移性結腸直腸癌を有する患者のB細胞を枯渇させるために施される。B細胞の枯渇は、患者の免疫グロブリンの低下、したがって、潜在的なADAをもたらすが、同時に、これは、免疫系の弱体化をもたらす。
さらなる二特異性CEAxCD3抗体の一本鎖抗体であるMEDI-565(AMG211)は、臨床開発されており、結果が公開されている(例えば、M. Pishvaianら Clin Colorectal Cancer. 2016 DEC; 15(4) 345-351を参照されたい)。研究NCT01284231(ClinicalTrials.gov)は、完了したと報告しており、新たな治験は、何年も開始されていない。この一本鎖二特異性抗体(aaリンカーによって接続された2つのscFv)は、2.2~6.5時間の極めて短い排泄半減期を有する(Pishvaianら; Clin. Colorectal Cancer, 2016 DEC; 15(4) 345-351)(参照により本明細書に組み込まれる)。
本発明は、高有効性の免疫原性がより低いCEAxCD3二特異性抗体を提供する。そのような抗体は、共通重鎖を含み、一実施形態では、CEA結合部分中にカッパ軽鎖、およびCD3結合部分中にラムダ軽鎖を含む。
二特異性抗体を得るために共通重鎖を使用する概念は、Fischerら, Nature Communications 6 (2015): 6113. https://doi.org/10.1038/ncomms7113およびMagistrelli G.ら, MABS 9 (2017) 231-239において言及されている。カッパラムダ二特異性抗体は、例えば、国際公開第2014087248号(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。それらの構造は、ネイティブIgGの構造からほとんど区別ができず、その結果、ADA形成がないか、またはADA形成が最小限であり、したがって、曝露の喪失が少ないまたは最小限である。共通重鎖可変領域VHの配列および本発明のhuCD3 VL 1A4の配列は、国際公開第2019175658号(米国特許出願公開第2019/0284297号)(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
上記で言及したように、国際公開第2017055389号は、2+1フォーマットを有するが、シビサタマブと異なるドメインに結合する二特異性CEAxCD3抗体を記載している。これらの抗体の1つ(RO7172508またはRG6123)は、オビヌツズマブ前処置およびアテゾリズマブとの組合せでも、局所進行性および/または転移性CEA陽性固形腫瘍を有する患者において、臨床試験で試験されている(ClinicalTrials.gov;RO7172508について検索)。一部のコホートについてのClinicalTrials.govにおける臨床試験の記載によれば、ある特定の閾値を下回る血清CEA(脱落(shed)可溶性CEACAM5、sCEA)レベルが、処置される患者において、処置に対して患者が適格となるために必要であり、より高いレベルの脱落可溶性CEACAM5がこのCEAxCD3二特異性抗体の有効性を低下させ得ることを示唆している。本発明の抗体は、それらの腫瘍細胞殺滅有効性に対する脱落可溶性CEAの最小限の影響を示す。
脱落可溶性CEACAM5は、確立された腫瘍マーカーである。がん患者の血漿中のsCEAのレベルは、1000ng/mlを超え得るが、健康な個体における血漿濃度は、10ng/mlを下回る(例えば、Sandler Bら Anticancer Res 1999, 19(5B), 4229-33)。したがって、脱落可溶性CEACAM5は、治療用抗CEA抗体および抗CEA二特異性抗体の結合について、腫瘍細胞上に存在する膜結合CEAと競合することができ、潜在的に抗CEA抗体またはCEAxCD3抗体の有効性の減少を引き起こす。TCB2017およびTCB2014(上記を参照されたい)は、可溶性CEAの存在下、CEA陽性腫瘍細胞のT細胞媒介溶解についての試験において、in vitroで、本発明者らによって試験されている。試験へのsCEAの添加が、溶解曲線を、したがって、TCB2014およびTCB2017のEC50値をより高濃度にシフトさせることが見出され、TCB2014およびTCB2017の両方が、sCEAに有意に結合することを示唆した。
ヒトCEAファミリーは、29個の遺伝子を含み、そのうち、7個がCEAサブグループに属し11個が妊娠特異的糖タンパク質サブグループに属する、18個が発現される。いくつかのCEAサブグループのメンバーは、細胞接着特性を持つと思われる。CEACAM5は、結腸直腸がん細胞によって発現されるだけでなく、膵臓がん、胃がん、肺がんおよび他のがんの種類によっても発現される。CEACAM5は、自然免疫において役割を有すると思われる(Hammarstroem S., Semin. Cancer Biol. 9(2):67-81 (1999))。癌胎児性抗原5(CEA、CEACAM5またはCD66e;UniProtKB-P06731)は、癌胎児性抗原関連細胞接着分子(CEACAMファミリー)および腫瘍関連抗原のメンバーである(Gold and Freedman, J Exp. Med., 121:439-462, 1965;Berinstein N. L., J Clin Oncol., 20:2197-2207, 2002)。複数のモノクローナル抗体が、研究目的のため、診断ツールとして、および治療目的のために、CEACAM5に対して産生されている(例えば、国際公開第2012117002号を参照されたい)。癌胎児性抗原ファミリー(CEACAM)のメンバーは、広く発現され、組織に応じて、腫瘍促進、腫瘍抑制、血管新生および好中球活性化を含む多様な機能を調節することができる。このファミリーの4つのメンバーのCEACAM1、CEACAM3、CEACAM6およびCEACAM8は、ヒト好中球において、発現および富化される(http://www.proteinatlas.org)。CEAxCD3二特異性抗体の作用機構を考えると、他のCEACAMとの交差反応性は、重要な循環する健康な細胞集団の枯渇をもたらす可能性がある。例えば、好中球または造血幹細胞によって発現されるCEACAM8との交差反応性は、そのような細胞集団の枯渇をもたらす可能性がある。本発明は、CEACAMファミリーのCEACAM1、CEACAM3、CEACAM4、CEACAM6、CEACAM7、CEACAM8、CEACAM16、CEACAM18、CEACAM19、CEACAM20およびCEACAM21のメンバーの1つまたは複数との低い交差反応性を有するCEAxCD3二特異性抗体を提供する。
マウスモノクローナル抗CEACAM5抗体のPR1A3は、NS1(P3/NS l/I-Ag-4-l)骨髄腫細胞と正常な結腸直腸上皮で免疫されたマウス由来の脾臓細胞との融合によって産生された。Richman P. I. and Bodmer W. F., Int. J. Cancer, 39:317-328, 1987は、マウスモノクローナル抗体PR1A3を記載している。PR1 A3のエピトープマッピングは、この抗体が、CEA分子のB3ドメインおよびGPIアンカーを標的にすることを示す(Durbin H.ら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91 :4313-4317, 1994)。PR1 A3が結合するエピトープは、直鎖状エピトープではなく、立体構造エピトープである(Stewartら, Cancer Immunol. Immunother., 47 (1999) 299-06)。ヒト化PRlA3(hPRlA3)抗体は、例えば、Conaghhan P. J.ら, Br. J. Cancer, 98 (2008)1217-1225および国際公開第2012117002号によって記載されている。TCB2014において使用されるCEAバインダー(CH1A1Aという)は、PR1A3抗体に由来する、ヒト化され、親和性成熟され、安定性が操作されたバージョンである。M. Bacacら, Clin. Cancer Research 22(13);3286-97 (2016)、Conaghan P,ら, Br J Cancer 2008;98:1217-25およびDurbin H,ら Proc Natl Acad Sci U S A 1994;91:4313-7。
ヒトPD-1軸アンタゴニストおよび二特異性抗CEAxCD3抗体の組合せによりがんを処置するための方法は、国際公開第2017118657号に言及されており、臨床結果は、ASCOカンファレンス2017(Taberneroら, J Clin Oncol 35, 2017 (suppl. abstr. 3002))で公開されている。免疫チェックポイント経路の2つまたはそれよりも多くの異なる標的を結合する免疫チェックポイントアンタゴニストならびにCEAおよびT細胞表面抗原に結合するT細胞リダイレクト剤を投与することによって腫瘍を処置する方法は、国際公開第2015112534号に言及されている。シングルドメイン抗CEACAM6抗体およびウレアーゼからなるコンジュゲートは、今のところ、臨床試験中である(NCT02309892;国際公開第2016116907号)。CEACAM5、CEACAM6および顆粒球に結合するクラスI抗体は、米国特許出願公開第20110064653号に言及されている。互いと共有結合した第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖を含む二特異性抗体は、国際公開第2018053328号に言及されている。
現在の技術水準において記載される抗CD3ε抗体は、SP34である(Yang SJ, The Journal of Immunology (1986) 137; 1097-1100))。SP34は、霊長類およびヒトのCD3の両方と反応する。SP34は、BD Biosciencesから入手可能である。現在の技術水準において記載されるさらなる抗CD3抗体は、UCHT-1である(国際公開第2000041474号を参照されたい)。現在の技術水準において記載されるさらなる抗CD3抗体は、BC-3である(Fred Hutchinson Cancer Research Institute;GvHDのフェーズI/II試験において使用、Anasettiら, Transplantation 54: 844 (1992))。SP-34は、CD3のもっぱらε鎖上に存在するエピトープを認識するが(Salmeronら, (1991) J. Immunol. 147: 3047を参照されたい)、UCHT-1およびBC-3は、εおよびγ鎖の両方によって寄与されるエピトープを認識するという点で、SP34は、UCHT-1およびBC-3と異なる。抗CD3抗体は、国際公開第2007042261号、国際公開第2008119565号、国際公開第2008119566号、国際公開第2008119567号、国際公開第2010037836号、国際公開第2010037837号、国際公開第2010037838号および米国特許第8236308号にも記載されている。CEAに特異的な結合部分およびCD3εに特異的な結合部分を含む二特異性抗体は、例えば、米国特許出願公開第20140242079号、国際公開第2007071426号、国際公開第2013012414号、国際公開第2015112534号、国際公開第2017118675号および国際公開第2017055389号に記載されている。本発明による抗体の第2の結合部分の配列を含む抗CD3抗体は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願第62/643,095号および国際出願第PCT/US2019/000232号に言及されている。米国特許出願公開第2012321626号は、CD3イプシロンのN末端に結合するFab断片を含む多特異性Fab融合タンパク質に言及している。国際公開第2018199593号は、HER3およびCD3に結合する二特異性抗体に言及している。
上記で既に言及したように、進行性固形腫瘍を有する患者におけるT細胞二特異性抗体のTAAxCD3(TAA=腫瘍関連抗原)による最初の臨床試験の結果は、期待外れであったが、最近の予備フェーズ1の結果が、進行性結腸直腸がんの患者において、単剤療法およびPD-L1阻害との組合せで、部分奏効および安定な疾患を示す(J.Taberneroら, J. Clin. Oncol. 35, 2017 (suppl. Abstr. 3002))CEAxCD3二特異性抗体のシビサタマブ(RO6958688、例えば、Bacacら Clin. Cancer Res., 22(13), 3286-97 (2016);および米国特許出願公開第20140242079号を参照されたい)について、公開されている。より良好な結果を得るための別の手法は、T細胞二特異性抗体に、PD-1チェックポイント軸の阻害剤を追加することだけでなく、さらなるチェックポイント阻害剤またはアゴニストを追加することである。しかし、今までのところ、利用可能なそのような組合せ手法について見込みのある臨床データは存在しないと考えられる。
進行性固形腫瘍内でのT細胞の利用度が限られていることが、確実に、T細胞二特異性抗体とPD-1軸阻害剤により達成可能な有効性を制限する重要なメカニズムである。
進行性固形腫瘍の腫瘍細胞に対してT細胞を向け直すことを目的として、T細胞二特異性抗体とPD-1軸阻害剤の他の治療剤との組み合わせを追加する代わりに、他の免疫細胞、特に、マクロファージまたはマクロファージおよびナチュラルキラー(NK)細胞を腫瘍細胞に向け直す治療剤を追加することは、より大きな成功を収め得る。
本発明は、新規のCEAxCD3二特異性抗体を、CEAを発現する固形腫瘍に対して、マクロファージおよびNK細胞も向け直すCEAxCD47二特異性抗体と並行して投与することができる方法で設計される、該CEAxCD3二特異性抗体を提供する。CEAを発現する腫瘍に標的化されるT細胞およびマクロファージおよびNK細胞の組合せ攻撃は、CEAを発現する腫瘍細胞の優れた有効性/殺滅およびファゴサイトーシスについてかなりの機会を提供する。
固形腫瘍におけるCAR T細胞によるこれまでの期待外れの結果は、固形腫瘍に浸透し、そこに分布するCAR T細胞の数が十分ではなかっただけである、という単純な説明を有し得る。これは、血液学的悪性腫瘍の大多数において確かに異なり、CAR T細胞は、腫瘍細胞に十分に接近することができ、固形腫瘍における期待外れの有効性と比較して、これらの悪性腫瘍における高い有効性の差を説明する。加えて、CAR T細胞は、大部分は強く免疫抑制である固形腫瘍の腫瘍微小環境(TME)によって重度に抑制され得る。
本発明は、高い有効性、有効性に対するsCEAの低い影響、CEACAM5(=CEA)以外の他のCEACAMとの低い交差反応性または交差反応性がない、ならびに、したがって、減少した毒性、低い免疫原性、CEAxCD47抗体との並行併用療法の機会を有する、および有益な薬物動態学的特性を有する、新規の二特異性抗CEAxCD3抗体を提供する。
米国特許第20140242079号明細書 国際公開第2014131712号
Taberneroら、J Clin Oncol 35, 2017 (suppl. abstr. 3002) Meleroら, ASCO 2017, Abstract 2549 and Poster No. 41, Journal of Clinical Oncology 35, no. 15_suppl (May 20, 2017) 2549-2549
発明の概要
一実施形態では、本発明は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分(さらに「CEA」ともいう)およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分(さらに「CD3」ともいう)を含む二特異性抗体(さらに「bsAb CEAxCD3」または「CEAxCD3二特異性抗体」ともいう)に関する。
一実施形態では、二特異性抗体は、前記抗体が、第1の結合部分について一価、および第2の結合部分について一価であることを特徴とする。
一実施形態では、二特異性抗体は、定常および可変フレームワーク領域の配列がヒトであることを特徴とする。
一実施形態では、二特異性抗体は、第1および第2の結合部分のそれぞれが、免疫グロブリンの重鎖および免疫グロブリンの軽鎖を含むことを特徴とする。
一実施形態では、二特異性抗体は、重鎖を含む第1の結合部分、および重鎖を含む第2の結合部分を有し、それぞれの結合部分中の重鎖は同じ(すなわち、共通重鎖)である。一実施形態では、共通重鎖可変領域は、CDRとして、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む。一実施形態では、共通重鎖可変領域は、配列番号1のものである。一実施形態では、共通定常重鎖は、配列番号30のものである。一実施形態では、共通重鎖は、配列番号43のものである。一実施形態では、共通重鎖は、配列番号44のものである。一実施形態では、共通重鎖は、配列番号45のものである。
一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分および第2の結合部分中に、重鎖として、共通重鎖を含むこと、第1の結合部分中に、軽鎖として、カッパ軽鎖、および第2の結合部分中に、軽鎖として、ラムダ軽鎖を含むことを特徴とする。一実施形態では、第2の結合部分の軽鎖は、配列番号28のものであり、第2の結合部分の重鎖は、配列番号45のものである(例えば、AB1およびAB13L3-1/N、AB14L3-1/N、AB15L3-1/N、AB17L3-1/N、AB20L3-1/N、AB54L3-1/N、AB60L3-1/N、AB66L3-1N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/NのようなAB-1L3-1/Nに由来する二特異性抗体;CDRおよびVL配列について、配列表を参照されたい)。
AB13、14、15などは、本発明の二特異性抗体の第1の結合部分(抗CEACAM5抗体アーム)について表し、L3-1は、本発明の二特異性抗体の第2の結合部分(抗CD3抗体アーム、1A4とも呼ぶ)について表す。任意のABXX抗CEAアームは、L3-1抗CD3アームと組み合わされて、二特異性抗体を形成することができ、例えば、ABXXL3-1は、WT hIgG1 Fc部分を含む本発明によるCEAxCD3二特異性抗体を表し;ABXXL3-1/Dは、L234A+L235A変異を持つhIgG1 Fc部分を含む本発明によるCEAxCD3二特異性抗体を表し;ABXXL3-1/Nは、L234A+L235A+P329A変異を持つhIgG1 Fc部分を含む本発明によるCEAxCD3二特異性抗体を表す。
一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分および第2の結合部分中に、重鎖として、共通重鎖を含むこと、第1の結合部分中に、軽鎖可変領域として、ラムダ型領域、および軽鎖定常領域として、カッパ型領域(「ハイブリッドフォーマット軽鎖」)、ならびに第2の結合部分中に、軽鎖として、ラムダ軽鎖を含むことを特徴とする(例えば、L3-1AB8 H-CK5/D、図2および図2の説明を参照されたい)。
一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分および第2の結合部分中に、重鎖として、共通重鎖を含むこと、第1の結合部分中に、軽鎖可変領域として、ラムダ型領域、および軽鎖定常領域として、ラムダ型領域、ならびに第2の結合部分中に、軽鎖可変領域として、ラムダ型領域、および軽鎖定常領域として、カッパ型領域(「ハイブリッドフォーマット軽鎖」)を含むことを特徴とする;例えば、AB8L3-1 H-CK5/D。
本発明の二特異性抗体は、CEACAM5以外のCEACAMファミリーメンバーに対する低い結合/交差反応性を示す。一実施形態では、二特異性抗体は、CEACAM1、CEACAM3、CEACAM4、CEACAM6、CEACAM7、CEACAM8、CEACAM16、CEACAM18、CEACAM19、CEACAM20およびCEACAM21からなる群から選択されるCEACAMを発現するPEAKrapid細胞(ATCC(登録商標) CRL-2828(商標))への結合についてのMFI値が、同じ実験条件下のWT PEAK細胞(すなわち、トランスフェクトされていないPEAK細胞)への結合についてのMFI値と比較して、2倍以下であることを特徴とする。一実施形態では、二特異性抗体は、CEACAM1、CEACAM3、CEACAM4、CEACAM6およびCEACAM8からなる群から選択されるCEACAMを発現するPEAKrapid細胞への結合についてのMFI値が、同じ実験条件下のWT PEAK細胞への結合についてのMFI値と比較して、2倍以下であることを特徴とする。一実施形態では、二特異性抗体は、CEACAM8を発現するPEAKrapid細胞への結合についてのMFI値が、同じ実験条件下のWT PEAK細胞への結合についてのMFI値と比較して、2倍以下であることを特徴とする。PEAK細胞のトランスフェクションのため、およびこれらのPEAK細胞への抗体の結合を測定するための実験手順を、実施例1および5に記載する。
一実施形態では、二特異性抗体は、0.5nM~50nMのEC50値でMKN-45細胞(DSMZ番号:ACC 409)に結合する。一実施形態では、二特異性抗体は、0.5nM~30nMのEC50値でMKN-45細胞に結合する。一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、200nM、1000nMおよび5000nMでのMKN-45細胞への結合についてのMFI値が、TCB2014で得られたMFI値の少なくとも2倍であることを特徴とする。結合アッセイを、実施例7aに記載する。一実施形態では、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて測定される腫瘍細胞系MKN-45の殺滅についてのEC50は、本発明の二特異性抗体について、TCB2014について測定されるEC50よりも40%以上低い。一実施形態では、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて測定される腫瘍細胞系LS-174Tの殺滅についてのEC50は、本発明の二特異性抗体について、TCB2014について測定されるEC50よりも40%以上低い。
一実施形態では、二特異性抗体は、0.01~10nMのEC50値で、濃度依存性の様式で、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて、LS174T細胞を殺滅している。一実施形態では、二特異性抗体は、0.01~1nMのEC50値で、濃度依存性の様式で、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて、LS174T細胞を殺滅している。
CEA陽性細胞のT細胞再標的化溶解/殺滅を測定するためのアッセイを、実施例8に記載する。
一実施形態では、二特異性抗体は、同じアッセイ(CEA陽性LS174T腫瘍細胞の殺滅)におけるEC50値が、同じ実験条件下での可溶性CEACAM5なしの溶解についてのEC50値と比較して、5μg/mlの可溶性CEACAM5の存在下で、20倍を超えて増加せず、一実施形態では、15以下、一実施形態では、10以下であることを特徴とする。
別の実施形態では、二特異性抗体は、同じアッセイにおけるEC50値が、同じ実験条件下での可溶性CEACAM5なしの溶解についてのEC50値と比較して、1μg/mlの可溶性CEACAM5の存在下で、10倍を超えて増加せず、一実施形態では、5以下であることを特徴とする。
一実施形態では、二特異性抗体は、前記二特異性抗体が、同じ実験条件下でのビヒクル群における腫瘍体積の成長と比較して、18日目まで、25%またはそれよりも大きく、HPAF-IIモデルにおいて腫瘍体積の成長を阻害することを特徴とする。一実施形態では、二特異性抗体は、前記二特異性抗体が、同じ実験条件下でのTCB2014と比較して、同様に、18日目まで、HPAF-IIモデルにおいて腫瘍体積の成長を阻害し、統計的に有意な様式で異ならないことを特徴とする。マウス腫瘍モデルを、実施例9aに記載する。
一実施形態では、二特異性抗体は、Fcドメインのそれぞれのサブユニット中に、活性化しているFc受容体への結合を低減し、および/またはエフェクター機能を低減する、アミノ酸置換を含み、ここで、前記アミノ酸置換は、L234AおよびL235A、ならびに/またはP329A、P329GおよびP329R(Kabat EUインデックス番号付け)からなる群から選択されるP329の置換である。一実施形態では、二特異性抗体は、Fcドメインのそれぞれのサブユニット中に、アミノ酸置換L234AおよびL235AおよびP329A(Kabat EUインデックス番号付け)を含む。L234AおよびL235A(LALA)は、234/235位のアミノ酸のロイシンが、アラニンによって置き換えられることを意味する。P329A(PA)は、329位のアミノ酸のプロリンが、アラニンによって置き換えられることを意味する。
一実施形態では、二特異性抗体は、共通重鎖を含む。一実施形態では、二特異性抗体は、CDRとして、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む共通重鎖を含む。一実施形態では、二特異性抗体は、第2の結合部分中に、CDRとして、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖領域を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分中に、軽鎖定常領域として、配列番号39の領域を含む。一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分中に、軽鎖定常領域として、配列番号41の領域を含む。一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分中に、軽鎖定常領域として、配列番号58の領域を含む。一実施形態では、二特異性抗体は、配列番号43の共通重鎖、または配列番号44の共通重鎖、または配列番号45の共通重鎖を含む。一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分中に、軽鎖定常領域として、配列番号39の領域および配列番号45の配列番号の共通重鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号25、26、27、28および29からなる群から、または配列番号67、68、69、70および71のハイブリッドフォーマット軽鎖(LC)群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、第1の結合部分中に、軽鎖定常領域として、配列番号39の領域、配列番号45の共通重鎖、および第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、VLおよびVHドメインとして、配列番号48および49の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(抗CEA抗体MEDI)、VLおよびVHドメインとして、配列番号46および47の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(抗体SM3E)、VLおよびVHドメインとして、配列番号56および57の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(ラベツズマブ(Lab))、VLおよびVHドメインとして、配列番号50および51の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(SAR)、VLおよびVHドメインとして、配列番号54および55の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(T86.66)、ならびにVLおよびVHドメインとして、配列番号52および53の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(CH1A1A)からなる群から選択される抗CEA抗体と競合する。図1および実施例5c)も参照されたい。
本発明による二特異性抗体におけるCEA VLまたはCL領域として有用であり、かつ組換えCEAへの結合についてMEDIと競合する抗体についての例は、抗CEA抗体AB1、およびAB1のリード最適化によって得られる抗体である(実験方法について、実施例11を参照されたい)。抗CEA抗体のAB13、14、15、17、20、54、60、66、71、72、73、ならびにそれぞれの二特異性抗CEAxCD3抗体のAB13L3-1、AB14L3-1、AB15L3-1、AB17L3-1、AB20L3-1、AB54L3-1、AB60L3-1、AB66L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1およびAB73L3-1は、抗体のAB1のそれぞれのAB1L3-1と同じ様式で競合している。本発明による二特異性抗体におけるCEA VLまたはCL領域として有用であり、かつ組換えCEAへの結合についてSM3Eと競合する抗体についての例は、抗CEA抗体AB8、および縮重オリゴヌクレオチドを使用するAB8のオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって得られる抗体である。本発明による二特異性抗体におけるCEA VLまたはCL領域として有用であり、かつ組換えCEAへの結合についてT84.66と競合する抗体についての例は、抗CEA抗体1B4、および縮重オリゴヌクレオチドを使用する1B4のオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって得られる抗体である。
本発明による二特異性抗体におけるCEA VLまたはCL領域として有用であるが、組換えCEAへの結合について参照抗体のいずれとも競合しない抗体についての例は、抗CEA抗体C11、および縮重オリゴヌクレオチドを使用するC11のオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって得られる抗体である。
AB1は、それぞれ、配列番号80および78に示される核酸配列によってコードされる、配列番号43のHCおよび配列番号40のカッパLCを有する抗CEA抗体である。
AB8は、それぞれ、配列番号80および79に示される核酸配列によってコードされる、配列番号43のHCおよび配列番号42のラムダLCを有する抗CEA抗体である。
1B4は、それぞれ、配列番号80および77に示される核酸配列によってコードされる、配列番号43のHCおよび配列番号74のラムダLCを有する抗CEA抗体である。
C11は、それぞれ、配列番号80および76に示される核酸配列によってコードされる、配列番号43のHCおよび配列番号73のカッパLCを有する抗CEA抗体である。
カッパ軽鎖として有用なCEA軽鎖は、配列番号40のものである。カッパ軽鎖として有用なCEA軽鎖は、配列番号73のものである。ラムダ軽鎖として有用なCEA軽鎖は、配列番号74のものである。ハイブリッドカッパ軽鎖として有用なCEA軽鎖は、配列番号75のものである。
一実施形態では、二特異性抗体は、Fcドメインのそれぞれのサブユニット中に、活性化しているFc受容体への結合および/またはエフェクター機能を低減する、最大で3つのアミノ酸置換を含み、ここで、前記アミノ酸置換は、L234A、L235A、ならびにP329A、P329GおよびP329R(Kabat EUインデックス番号付け)からなる群から選択されるP329の置換である。一実施形態では、本発明による抗体の共通重鎖は、配列番号43、44または45のものである。一実施形態では、本発明による抗体の共通重鎖は、配列番号45(L234A、L235AおよびP329A)のものである。
一実施形態では、二特異性抗体は、a)0.5nM~50nMのEC50値でMKN-45細胞に結合すること、b1)VLおよびVHドメインとして、配列番号48および49の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(MEDI)と競合すること、またはb2)VLおよびVHドメインとして、配列番号46および47の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(SM3E)と競合すること、またはb3)VLおよびVHドメインとして、配列番号54および55の配列のVLおよびCHを含む抗CEA抗体(T84.66)と競合すること、またはb4)ツール抗体(ツール抗体について、実施例5cを参照されたい)のいずれとも競合しないこと、c)Fcドメインのそれぞれのサブユニット中に、活性化しているFc受容体への結合および/もしくはエフェクター機能を低減するアミノ酸置換を含むことであって、前記アミノ酸置換は、L234AおよびL235A、ならびにP329A、P329GおよびP329R(Kabat EUインデックス番号付け)からなる群から選択されるP329の置換である、こと、d)0.01~10nMのEC50値で、濃度依存性の様式で、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて、MKN-45、HPAF-IIおよび/またはLS174T細胞を殺滅することの群から選択される1つまたは複数の特性を示す。
一実施形態では、二特異性抗体は、
a)0.5nM~50nMのEC50値で、MKN-45細胞に結合すること、
b)0.01~10nMのEC50値で、濃度依存性の様式で、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて、MKN-45、HPAF-IIまたはLS174T細胞を殺滅すること、
c)CEACAM5を発現するPEAK細胞に結合するが、CEACAM8を発現するPEAK細胞と交差反応しないこと、
d)TDCCアッセイ(実施例8)における殺滅EC50が、LS174T腫瘍細胞を標的細胞として使用する場合に、1μg/mLのsCEAの存在下で、5倍を超えて増加しないこと、
e)対照群(ビヒクルのみ)と比較して、25%またはそれよりも大きく、HPAF-IIモデルにおける腫瘍成長を阻害すること、
f)VLおよびVHドメインとして、配列番号48および49の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体(MEDI)と競合すること、ならびに
g)Fcドメインのそれぞれのサブユニット中に、アミノ酸置換L234A、L235AおよびP329A(Kabat EUインデックス番号付け)を含むこと
の群から選択される1つまたは複数の特性を示す。
一実施形態では、二特異性抗体は、a)~d)の特性を示す。一実施形態では、二特異性抗体は、a)~f)のすべて特性を示す。一実施形態では、二特異性抗体は、a)~d)およびg)の特性を示す。一実施形態では、二特異性抗体は、a)~d)およびf)およびg)の特性を示す。一実施形態では、二特異性抗体は、a)~g)のすべての特性を示す。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖(cHC)を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、
i)カッパ軽鎖定常領域(CL)、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、配列番号32のCDRL1、配列番号33のCDRL2および配列番号34のCDRL3を含む軽鎖可変領域(VL)、または縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号31から得られる軽鎖可変領域
を含み、
c)第2の結合部分が、CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む軽鎖可変領域を含み、
d)第2の結合部分が、ラムダ軽鎖定常領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号25、26、27、28および29からなる群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む重鎖を含み、
b)第1の結合部分が、CDRとして、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号32から得られ、かつ最大で4つのアミノ酸置換を含むCDRL1、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号33から得られ、かつ最大で4つのアミノ酸置換を含むCDRL2、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号34から得られ、かつ最大で4つのアミノ酸置換を含むCDRL3を含む、軽鎖可変領域VLを含み、
c)第2の結合部分が、CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域を含む
ことを特徴とする。
そのような二特異性抗体は、限定されるものではないが、二特異性抗CEAxCD3抗体のAB13L3-1、AB14L3-1、AB15L3-1、AB17L3-1、AB20L3-1、AB54L3-1、AB60L3-1、AB66L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1およびAB73L3-1である。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分が、CDRH1、CDRH2およびCDRH3として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む、重鎖可変領域VHを含み、
b)第1の結合部分が、軽鎖可変領域として、
b1)配列番号32のCDRL1、配列番号33のCDRL2および配列番号34のCDRL3、
b2)配列番号81のCDRL1、配列番号82のCDRL2および配列番号83のCDRL3、
b3)配列番号84のCDRL1、配列番号85のCDRL2および配列番号86のCDRL3、
b4)配列番号87のCDRL1、配列番号88のCDRL2および配列番号89のCDRL3、
b5)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
b6)配列番号93のCDRL1、配列番号94のCDRL2および配列番号95のCDRL3、
b7)配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3、
b8)配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3、
b9)配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3、
b10)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、
b11)配列番号108のCDRL1、配列番号109のCDRL2および配列番号110のCDRL3、ならびに
b12)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む重鎖可変領域VH、ならびに配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域VLを含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分が、CDRH1、CDRH2およびCDRH3として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む、重鎖可変領域VHを含み、
b)第1の結合部分が、軽鎖可変領域として、
b1)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
b2)配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3、
b3)配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3、
b4)配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3、
b5)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、ならびに
b6)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む重鎖可変領域VH、ならびに配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域VLを含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分が、CDRH1、CDRH2およびCDRH3として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む、重鎖可変領域VHを含み、
b)第1の結合部分が、軽鎖可変領域として、
b1)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
b2)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、ならびに
b3)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む重鎖可変領域VH、ならびに配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域VLを含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、本発明は、
a)第1の結合部分中に、配列番号1と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、配列番号2のCDR1、配列番号3のCDR2および配列番号4のCDR3を含む重鎖可変領域VH、
b)b1)配列番号31と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、ならびに配列番号32のCDRL1、配列番号33のCDRL2および配列番号34のCDRL3を含む軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号114と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、ならびに配列番号81のCDRL1、配列番号82のCDRL2および配列番号83のCDRL3を含む軽鎖可変領域VL、
b3)配列番号115と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号84のCDRL1、配列番号85のCDRL2および配列番号86のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b4)配列番号116と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号87のCDRL1、配列番号88のCDRL2および配列番号89のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b5)配列番号117と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b6)配列番号118と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号93のCDRL1、配列番号94のCDRL2および配列番号95のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b7)配列番号119と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b8)配列番号120と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b9)配列番号121と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b10)配列番号122と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b11)配列番号123と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号108のCDRL1、配列番号109のCDRL2および配列番号110のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、ならびに
b12)配列番号124と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、
c)第2の結合部分に、配列番号1と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、配列番号2のCDR1、配列番号3のCDR2および配列番号4のCDR3を含む重鎖可変領域VH、ならびに配列番号17と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域VL
を含むことを特徴とする、本発明による二特異性抗体に関する。
一実施形態では、本発明は、
a)第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、ならびに
b)b1)配列番号31の軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号114の軽鎖可変領域VL、
b3)配列番号115の軽鎖可変領域VL、
b4)配列番号116の軽鎖可変領域VL、
b5)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
b6)配列番号118の軽鎖可変領域VL、
b7)配列番号119の軽鎖可変領域VL、
b8)配列番号120の軽鎖可変領域VL、
b9)配列番号121の軽鎖可変領域VL、
b10)配列番号122の軽鎖可変領域VL、
b11)配列番号123の軽鎖可変領域VL、および
b12)配列番号124の軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
c)第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
を含むことを特徴とする、本発明による二特異性抗体に関する。
一実施形態では、本発明は、
a)第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、ならびに
b)b1)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号119の軽鎖可変領域VL、
b3)配列番号120の軽鎖可変領域VL、
b4)配列番号121の軽鎖可変領域VL、
b5)配列番号122の軽鎖可変領域VL、および
b6)配列番号124の軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
c)第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
を含むことを特徴とする、本発明による二特異性抗体に関する。
一実施形態では、本発明は、
a)第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、ならびに
b)b1)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号122の軽鎖可変領域VL、および
b3)配列番号124の軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
c)第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
を含むことを特徴とする、本発明による二特異性抗体に関する。
一実施形態では、本発明は、第1の結合部分中に、
a)配列番号1の重鎖可変領域VH、ならびに
b)b1)配列番号40の軽鎖、
b2)配列番号125の軽鎖、
b3)配列番号126の軽鎖、
b4)配列番号127の軽鎖、
b5)配列番号128の軽鎖、
b6)配列番号129の軽鎖、
b7)配列番号130の軽鎖、
b8)配列番号131の軽鎖、
b9)配列番号132の軽鎖、
b10)配列番号133の軽鎖、および
b11)配列番号134の軽鎖、および
b12)配列番号135の軽鎖
からなる群から選択される軽鎖、ならびに、
c)第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号28の軽鎖
を含むことを特徴とする、本発明による二特異性抗体に関する。
一実施形態では、本発明は、第1の結合部分中に、
a)a1)配列番号43の重鎖、
a2)配列番号44の重鎖、または
a3)配列番号45の重鎖
からなる群から選択される共通重鎖、および
b)b1)配列番号40の軽鎖、
b2)配列番号125の軽鎖、
b3)配列番号126の軽鎖、
b4)配列番号127の軽鎖、
b5)配列番号128の軽鎖、
b6)配列番号129の軽鎖、
b7)配列番号130の軽鎖、
b8)配列番号131の軽鎖、
b9)配列番号132の軽鎖、
b10)配列番号133の軽鎖、
b11)配列番号134の軽鎖、または
b12)配列番号135の軽鎖
からなる群から選択される軽鎖、および
c)第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖
を含むことを特徴とする、本発明による二特異性抗体に関する。
一実施形態では、本発明による二特異性抗体(AB17L3-1/N)は、配列番号45の共通重鎖(/N)、ならびに第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号28の軽鎖(1A4 LCそれぞれL3-1)、および第1の結合部分中に、軽鎖として、配列番号128の軽鎖(AB17)を含む。一実施形態では、本発明による二特異性抗体(AB71L3-1/N)は、配列番号45の共通重鎖(/N)、ならびに第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号28の軽鎖(L3-1)、および第1の結合部分中に、軽鎖として、配列番号133の軽鎖(AB71)を含む。一実施形態では、本発明による二特異性抗体(AB73L3-1/N)は、配列番号45の共通重鎖(/N)、ならびに第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号28の軽鎖(L3-1)、および第1の結合部分中に、軽鎖として、配列番号135の軽鎖(AB73)を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、
i)ラムダ軽鎖定常領域(CL)、ならびに
ii)CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、配列番号36のCDRL1、配列番号37のCDRL2および配列番号38のCDRL3を含む軽鎖可変領域(VL)、または縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号35から得られる軽鎖可変領域
を含み、
c)第2の結合部分が、CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む軽鎖可変領域を含み、
d)第2の結合部分が、ハイブリッドカッパ鎖定常領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号67、68、69、70および71からなる群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、第2の結合部分は、軽鎖定常領域として、配列番号41のラムダ軽鎖定常領域を含むことができ、その場合において、第1の結合部分は、一実施形態では、軽鎖定常領域として、配列番号58のハイブリッドカッパ軽鎖領域を含む。一実施形態では、ハイブリッド軽鎖定常領域を持つアームは、限定されるものではないが、安定性および生産性を含む、bsAbの全体的な特性に基づく。
一実施形態では、第1の結合部分の軽鎖可変領域は、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号35から得られ共通重鎖は、配列番号45のものであり、共通重鎖の可変領域は、配列番号1のものである。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、
i)カッパ軽鎖定常領域(CL)、ならびに
ii)CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、配列番号64のCDRL1、配列番号65のCDRL2および配列番号66のCDRL3を含む軽鎖可変領域(VL)、またはオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号63から得られる軽鎖可変領域
を含み、
c)第2の結合部分が、CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む軽鎖可変領域を含み、
d)第2の結合部分が、ラムダ軽鎖定常領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号25、26、27、28および29からなる群から選択される軽鎖を含む。
本発明の一実施形態では、第1の結合部分の軽鎖可変領域は、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号63から得られ、共通重鎖は、配列番号45のものである。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、ラムダ軽鎖定常領域(CL)、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、配列番号60のCDRL1、配列番号61のCDRL2および配列番号62のCDRL3を含む軽鎖可変領域(VL)、または縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号59から得られる軽鎖可変領域、
c)第2の結合部分が、CDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む軽鎖可変領域を含み、
d)第2の結合部分が、ハイブリッドカッパ鎖定常領域を含む
ことを特徴とする。
本発明のさらなる一実施形態では、第2の結合部分は、軽鎖定常領域として、配列番号41のラムダ軽鎖定常領域(a lambda light constant chain region)を含み、その場合において、第1の結合部分は、一実施形態では、軽鎖定常領域として、配列番号58のハイブリッドカッパ軽鎖定常領域を含む。ハイブリッド軽鎖定常領域を持つアームの選択は、限定されるものではないが、安定性および生産性を含む、最終bsAbの全体的な特性に基づく。
一実施形態では、第1の結合部分の軽鎖可変領域は、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号59から得られる。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、ヒトカッパ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、0、1、2、3または4個のアミノ酸の置換を有する配列番号32のCDRL1、0、1、2、3または4個のアミノ酸の置換を有する配列番号33のCDRL2、および0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号34のCDRL3を含む、ヒトカッパ型の軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、ヒトラムダ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む、ヒトラムダ型の軽鎖可変領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号25、26、27、28および29からなる群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、ヒトラムダ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号36のCDRL1、0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号37のCDRL2、および0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号38のCDRL3からなる群から選択されるCDRLのセットを含む、ヒトラムダ型の軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、ハイブリッドカッパ軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む、ヒトラムダ型の軽鎖可変領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号67、68、69、70および71からなる群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、ヒトラムダ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、0、1、2、3または4個のアミノ酸の置換を有する配列番号60のCDRL1、0、1、2、3または4個のアミノ酸の置換を有する配列番号61のCDRL2、および0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号62のCDRL3からなる群から選択されるCDRLのセットを含む、ヒトラムダ型の軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、ヒトカッパ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む、ヒトラムダ型の軽鎖可変領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号67、68、69、70および71からなる群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)第1の結合部分および第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、共通重鎖を含み、可変領域として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3をCDRH1、CDRH2およびCDRH3として含む、可変領域を含み、
b)第1の結合部分が、ヒトカッパ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号64のCDRL1、0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号65のCDRL2、および0、1、2、3、4または5個のアミノ酸の置換を有する配列番号66のCDRL3からなる群から選択されるCDRLのセットを含む、ヒトカッパ型の軽鎖可変領域を含み、
c)第2の結合部分が、ヒトラムダ型の軽鎖定常領域、ならびにCDRL1、CDRL2およびCDRL3として、
I)配列番号6のCDRL1、配列番号7のCDRL2および配列番号8のCDRL3、
II)配列番号10のCDRL1、配列番号11のCDRL2および配列番号12のCDRL3、
III)配列番号14のCDRL1、配列番号15のCDRL2および配列番号16のCDRL3、
IV)配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3、ならびに
V)配列番号22のCDRL1、配列番号23のCDRL2および配列番号24のCDRL3
からなる群から選択されるCDRの群を含む、ヒトラムダ型の軽鎖可変領域を含む
ことを特徴とする。
一実施形態では、c)における第2の結合部分は、配列番号25、26、27、28および29からなる群から選択される軽鎖を含む。
一実施形態では、二特異性抗体は、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含み、
a)第1の結合部分は、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む重鎖可変領域(VH)を含み、
b)第1の結合部分は、CDRL1が、配列番号136のコンセンサス配列を有し、CDRL2が、配列番号137のコンセンサス配列を有し、CDRL3が、配列番号138のコンセンサス配列を有するCDRLのセットを含む軽鎖可変領域(VL)を含み、
c)第2の結合部分は、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含むVHを含む。
一実施形態では、第1の結合部分は、可変軽鎖フレームワーク配列として、配列番号31のフレームワーク配列を含む。一実施形態では、第1の結合部分は、可変軽鎖フレームワーク配列として、配列番号35のフレームワーク配列を含む。一実施形態では、第1の結合部分は、可変軽鎖フレームワーク配列として、配列番号59のフレームワーク配列を含む。一実施形態では、第1の結合部分は、可変軽鎖フレームワーク配列として、配列番号63のフレームワーク配列を含む。
一実施形態では、CEAに特異的に結合する第1の結合部分は、重鎖可変領域として、配列番号1のアミノ酸配列の重鎖可変領域、および軽鎖可変領域として、配列番号31または配列番号35、配列番号59または配列番号63の群から選択されるアミノ酸配列と98%、99%または100%同一であるアミノ酸配列の軽鎖可変領域を含み、CD3に特異的に結合する第2の結合部分は、重鎖可変領域として、配列番号1のアミノ酸配列の重鎖可変領域、ならびに軽鎖可変領域として、配列番号5、配列番号9、配列番号13、配列番号17および配列番号21からなる群から選択されるアミノ酸配列の軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、カッパ軽鎖可変ドメインおよびカッパ軽鎖定常ドメインを含むCEAに特異的な第1の結合部分、ならびにラムダ軽鎖可変ドメインおよびラムダ軽鎖定常ドメインを含むCD3εに特異的な第2の結合部分を含むことを特徴とする。
一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、ラムダ軽鎖可変ドメインおよびカッパ軽鎖定常ドメインを含むCEAに特異的な第1の結合部分、ならびにラムダ軽鎖可変ドメインおよびラムダ軽鎖定常ドメインを含むCD3εに特異的な第2の結合部分を含むことを特徴とする。
一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、ラムダ軽鎖可変ドメインおよびラムダ軽鎖定常ドメインを含むCEAに特異的な第1の結合部分、ならびにラムダ軽鎖可変ドメインおよびカッパ軽鎖定常ドメインを含むCD3εに特異的な第2の結合部分を含むことを特徴とする。
特定の実施形態では、Fcドメインは、ネイティブ/野生型IgG1 Fcドメインと比較して、Fc受容体に対する低減された結合親和性および/または低減されたエフェクター機能を示す。ある特定の実施形態では、Fcドメインは、操作されていないFcドメインと比較して、Fc受容体に対する低減された結合親和性および/または低減されたエフェクター機能を有するように操作される。一実施形態では、Fcドメインは、1つもしくは複数のFc受容体への結合を低減し、および/またはエフェクター機能を低減する、1つまたは複数のアミノ酸置換を含む。一実施形態では、そのような1つまたは複数の置換は、Pro238、Asp265、Asp270、Asn297(Fc炭水化物の喪失)、Pro329、Leu234、Leu235、Gly236、Gly237、Ile253、Ser254、Lys288、Thr307、Gln311、Asn434およびHis435からなる群から選択される(Shields, R. L.,ら, J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604;Lund, J.,ら, FASEB J. 9 (1995) 115-119;Morgan, A., ら, Immunology 86 (1995) 319-324;欧州特許出願第0307434号)。一実施形態では、抗体は、S228、L234、L235および/またはD265に変異を有するIgG4サブクラスまたはIgG1もしくはIgG2サブクラスのFcR結合に関わるか、ならびに/あるいはPVA236変異を含有する。一実施形態では、Fcドメイン中の変異は、S228P、L234A、L235A、L235Eおよび/またはPVA236である。別の実施形態では、Fcドメイン中の変異は、IgG4ではS228Pに、ならびにIgG1ではL234AおよびL235Aにある。一実施形態では、1つもしくは複数のFc受容体への結合を低減し、および/またはエフェクター機能を低減する、Fcドメイン中の1つまたは複数のアミノ酸置換は、L234、L235およびP329(Kabat EUインデックス番号付け)の群から選択される1つまたは複数の位置においてである。特定の実施形態では、Fcドメインのそれぞれのサブユニットは、Fc受容体への結合を低減し、および/またはエフェクター機能を低減する、2つのアミノ酸置換を含み、ここで、前記アミノ酸置換は、L234AおよびL235A(Kabat EUインデックス番号付け)である。特定の実施形態では、Fcドメインのそれぞれのサブユニットは、Fc受容体への結合を低減し、および/またはエフェクター機能を低減する、3つのアミノ酸置換を含み、ここで、前記アミノ酸置換は、L234A、L235AおよびP329A(Kabat EUインデックス番号付け)である。そのような一実施形態では、Fcドメインは、IgG1Fcドメイン、特に、ヒトIgG1Fcドメイン(Kabat EUインデックス番号付け)である。一実施形態では、Fcドメインは、IgG4サブクラスのものであり、一実施形態では、S228Pの変異を有するIgG4サブクラスのものである。
一実施形態では、Fc受容体は、Fcγ受容体である。一実施形態では、Fc受容体は、ヒトFc受容体である。一実施形態では、Fc受容体は、活性化しているFc受容体である。具体的な実施形態では、Fc受容体は、ヒトFcγRIIIA、FcγRIおよび/またはFcγRIIIAである。一実施形態では、エフェクター機能は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)であるが、ADCCのみに限定されない。
本発明の実施形態は、配列番号43、44または45の共通重鎖、および第1の結合部分におけるCL領域として配列番号41のラムダCL領域を含む、二特異性抗体の構築における第2の結合部分におけるCL領域としての使用のための配列番号58のカッパCL領域である。
本発明の実施形態は、配列番号43、44または45の共通重鎖、およびCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分におけるCL領域として配列番号41のラムダCL領域を含む、本発明による二特異性抗体の構築におけるCD3に特異的に結合する第2の結合部分におけるCL領域としての使用のための配列番号58のカッパCL領域である。
本発明の実施形態は、配列番号43、44または45の共通重鎖、配列番号5、9、13、17または21の可変軽鎖、およびCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分におけるCL領域として配列番号41のラムダCL領域を含む、本発明による二特異性抗体の構築におけるCD3に特異的に結合する第2の結合部分におけるCL領域としての使用のための配列番号58のカッパCL領域である。
本発明のさらなる実施形態は、配列番号31、35、59および63のそれぞれの軽鎖可変領域の縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発による抗体の親和性成熟における使用のための配列番号76、77、78および79からなる群から選択されるオリゴヌクレオチドである。
別の態様では、本発明の二特異性を生成する方法であって、a)本発明の宿主細胞を、二特異性抗体の発現のために好適な条件下で培養するステップ、およびb)二特異性抗体を回収するステップを含む方法が提供される。本発明は、本発明の方法によって生成する二特異性抗体も包含する。
本発明は、本発明の二特異性抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物をさらに提供する。本発明の二特異性抗体および医薬組成物を使用する方法も本発明に包含される。一態様では、本発明は、医薬としての使用のための本発明の二特異性抗体または医薬組成物を提供する。一態様では、それを必要とする個体における疾患の処置における使用のための本発明による二特異性抗体または医薬組成物が提供される。具体的な実施形態では、疾患は、がんである。
それを必要とする個体における疾患の処置のための医薬の製造における使用のための本発明の二特異性抗体、および個体における疾患を処置する方法であって、前記個体に、薬学的に許容される形態で、本発明による二特異性抗体を含む治療有効量の組成物を投与することを含む、方法も提供される。具体的な実施形態では、疾患は、がんである。上記の実施形態のいずれかでは、個体は、好ましくは、哺乳動物、特に、ヒトである。
本発明は、標的細胞、特に、腫瘍細胞の溶解を誘導するための方法であって、T細胞、特に、細胞傷害性T細胞の存在下、標的細胞を本発明の二特異性抗体と接触させることを含む、方法も提供する。
本発明のさらなる実施形態は、CEAを発現するがんを有する対象を処置するための医薬の製造における使用のための本発明による二特異性抗体である。
本発明のさらなる実施形態は、本発明による医薬の製造における使用のための本発明による二特異性抗体であって、がんが、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、食道がん、胃/食道接合部がん、膵臓がんおよび乳がんからなる群から選択されることを特徴とする、本発明による二特異性抗体である。
本発明のさらなる実施形態は、抗CD47抗体との同時、別々または逐次的組合せでの使用のための本発明による二特異性抗体である。一実施形態では、抗CD47抗体は、マグロリマブ、ALX148もしくはTTI-621および/またはTTI-622である。
本発明のさらなる実施形態は、CEAを発現するがんを有する対象の処置における、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第3の結合部分およびヒトCD47に特異的に結合する第4の結合部分を含む第2の二特異性抗体との同時、別々または逐次的組合せでの使用のための本発明による二特異性抗体である。
そのような第2の二特異性CEAxCD47抗体は、国際出願第PCT/IB2019/054559号および米国出願第16/428,359号に記載されている。
本発明のさらなる実施形態は、本発明による使用のための本発明による二特異性抗体であって、本発明による二特異性抗体および第2の二特異性CEAxCD47抗体が、前記対象に、そのような間隔に限定されないが、6~15日の間隔で交互に投与されることを特徴とする、本発明による使用のための本発明による二特異性抗体である。
本発明のさらなる実施形態は、本発明によるがんの処置における使用のための本発明によるヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3に特異的に結合する第2の結合部分を含む本発明による第1の二特異性抗体ならびに第2の二特異性抗体CEAxCD47であって、前記がんが、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、食道がん、膵臓がんおよび乳がんであることを特徴とする、本発明による第1の二特異性抗体ならびに第2の二特異性抗体CEAxCD47である。
本発明のさらなる実施形態は、本発明による二特異性抗体を含む組成物であって、CEAを発現するがんを有する対象の処置における使用のための上記に定義された前記第2のCEAxCD47二特異性抗体と競合しないことを特徴とする、組成物である。
本発明のさらなる実施形態は、腫瘍(がん)、特に、固形腫瘍、特に、CEAを発現する固形がん、特に、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、食道がん、膵臓がんおよび乳がんを有すると診断されたヒト患者の処置のための方法であって、有効量の、本発明による二特異性抗体、ならびにCEAおよびCD47に対する国際出願第PCT/IB2019/054559号および米国出願第16/428,359号に記載される第2の二特異性抗体を、ヒト患者に投与することを含み、方法が、その後、
患者に、0.1~30mg/kgの用量、さらなる実施形態では、0.5~10mg/kgの用量、さらなる実施形態では、1~10mg/kgの用量の前記第2の抗CEAxCD47抗体を、例えば、4~12週間にわたって毎週投与すること、
患者に、前記第2の抗体を、q1、q2w、q3w、または必要に応じて、q4wで投与すること、
これらの4~12週間後および前記抗CEAxCD47抗体の追加の2または3または4の排泄半減期後に、患者に、0.1~10mg/kgの用量の本発明による抗体を投与すること、
患者に、本発明による前記抗体を、q1、q2w、q3w、または必要に応じて、q4wで投与すること、
本発明による前記抗体の2または3または4の排泄半減期を待つこと、ならびに、次いで必要に応じて、CEAxCD47二特異性抗体の投与と、それに続くCEAxCD3二特異性抗体の投与の前記サイクルを繰り返すこと、ならびに必要に応じて、このサイクルを再び繰り返すこと
を含む、方法である。
この「交互」方法は、本発明の抗体および第2の二特異性抗体が、CEAへの結合に関して競合する場合に適用される。
本発明による前記CEAxCD47二特異性抗体およびCEAxCD3二特異性抗体が競合的ではない場合では、2つの二特異性抗体は、例えば、患者への、およそ同時での、0.1~30mg/kgの用量、さらなる実施形態では、0.5~10mg/kgの用量、さらなる実施形態では、1~10mg/kgの用量のCEAxCD47二特異性抗体、および0.1~10mg/kgの本発明のCEAxCD3二特異性抗体の投与、それに続いて、例えば、q1wもしくはq2wもしくはq3w、または必要に応じて、q4wの頻度での1つまたは複数のこれらの組合せ投与による、患者が並行して両方の二特異性抗体の治療的に有効な血漿および組織濃度を経験する様式(「同時様式」)で投与することもできる。
「q1w」という用語は、週に1回の投与を意味し、q2wは、2週間ごとの投与を意味するなどである。
本発明のさらなる実施形態は、本発明による抗体および薬学的に許容される賦形剤または担体を含む医薬組成物である。
本発明のさらなる好ましい実施形態は、医薬としての使用のための本発明による抗体を含む医薬組成物である。
本発明のさらなる好ましい実施形態は、CEAを発現する固形腫瘍障害の処置における医薬としての使用のための本発明による抗体を含む医薬組成物である。
本発明のさらなる好ましい実施形態は、結腸直腸がん、NSCLC(非小細胞肺がん)、胃がん、食道がん、膵臓がんまたは乳がんの処置における医薬としての使用のための本発明による抗体を含む医薬組成物である。
本発明のさらなる実施形態は、がんが、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、食道がん、膵臓がんまたは乳がんであることを特徴とする、本発明による組成物である。
本発明のさらなる実施形態は、医薬組成物の製造における使用のための本発明による抗体である。
本発明のさらなる実施形態は、医薬組成物の製造における使用のための本発明による抗体および薬学的に許容される賦形剤または担体である。
本発明のさらなる実施形態は、固形腫瘍障害の処置における医薬の製造における使用のための本発明による抗体の実施形態である。
本発明のさらなる実施形態は、結腸直腸がん、NSCLC(非小細胞肺がん)、胃がん、食道がん、膵臓がんまたは乳がんの処置における使用のための本発明による抗体の実施形態である。
本発明の別の態様は、腫瘍細胞の細胞溶解を誘導する方法であって、腫瘍細胞を上記に記載される実施形態のいずれかの二特異性抗体と接触させることを含む、方法を提供する。一部の実施形態では、腫瘍細胞は、結腸直腸がん細胞、NSCLC(非小細胞肺がん)、胃がん細胞、食道がん細胞、膵臓がん細胞または乳がん細胞である。
一実施形態では、細胞溶解は、T細胞依存性細胞傷害(TDCC)によって誘導される。
本発明の別の態様は、CEAを発現するがんを有する対象を処置する方法であって、方法が、対象に、治療有効量の上記に記載される実施形態のいずれかの二特異性抗体を投与することを含む、方法を提供する。
本発明の別の態様は、CEAを発現するがんを有する対象を処置する方法であって、方法が、対象に、治療有効量の上記に記載される実施形態のいずれかの二特異性抗体を、ヒトCEAおよびヒトCD47に結合する二特異性抗体と組み合わせて投与することを含む、方法を提供する。CEAxCD47抗体およびCEAxCD3抗体が競合している場合、それらは、腫瘍細胞の表面上のCEA受容体について競合し、それぞれの組合せパートナーについての受容体占有および有効性は、それらの結合親和性およびそれらの血漿濃度に依存し、したがって、予測することは困難であり、また、2つの薬物の濃度がそれぞれ身体からのクリアランスの異なる排泄半減期を有する場合に、経時的に変動する。したがって、競合するCEAxCD3およびCEAxCD47二特異性抗体は、逐次的に(交互に)与えられなければならない。CEAxCD3およびCEAxCD47二特異性抗体が競合していないか、または最小限、競合しているだけである場合、それらは、逐次的に与えられ得るだけでなく、並行して(同時に)与えられ得、これは、CEAxCD3二特異性抗体によるT細胞の関与を介し、かつ同時のCEAxCD47二特異性抗体によるマクロファージの関与を介する腫瘍細胞殺滅が、相加的であると予想されるか、またはさらに相乗的である場合があり、これは、有効性が、両方の薬物が並行して与えられる場合に増加することを意味するので、十分に有利であり得る。
本発明の別の態様は、CEAを発現するがんを有する対象における無増悪生存期間および/または全生存期間を増加させる方法であって、前記方法が、前記対象に、治療有効量の上記に記載される実施形態のいずれかの二特異性抗体を投与することを含む、方法を提供する。一実施形態では、がんは、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、食道がん、膵臓がん、乳がん、頭頸部癌、子宮がん、膀胱がんまたは別のCEAを発現するがんである。
これらの方法のある特定の実施形態では、二特異性抗体は、化学療法または放射線療法と組み合わせて投与される。一実施形態では、対象は、結腸直腸がん、または肺がん、または胃がん、食道がん、または膵臓がん、または乳がん、または別のCEAを発現するがんを患っている患者である。
これらの方法のある特定の実施形態では、本発明の二特異性抗体は、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される。ある特定の実施形態では、本発明の二特異性抗体は、患者に、1~20mg/kgの範囲の用量で投与される。
本発明の別の態様は、CEAを発現するがんを有する対象を処置する方法であって、方法が、対象に、治療有効量の上記に記載される実施形態のいずれかの二特異性抗体を、ヒトCEAおよびヒトCD47に対する二特異性抗体と組み合わせて投与することを含む、方法を提供する。これらの方法のある特定の実施形態では、二特異性抗体は、同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体と組み合わせて投与される。これらの方法のある特定の実施形態では、二特異性抗CEAxCD47抗体は、本発明の抗体との交互のパターンで、本発明の抗体および二特異性抗CEAxCD47抗体の投与の間が6~15日の間隔で投与される。ある特定の実施形態では、抗CEAxCD47抗体は、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される。
これらの方法のある特定の実施形態では、二特異性抗体は、同時、別々または逐次的組合せで、PD-1軸アンタゴニストと組み合わせて投与される。これらの方法のある特定の実施形態では、二特異性抗体は、同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体およびPD-1軸アンタゴニストと組み合わせて投与される。ある特定の実施形態では、PD-1軸アンタゴニストは、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される。
本発明の別の態様は、CEAを異常に発現するがんを有する対象における無増悪生存期間および/または全生存期間を増加させる方法であって、前記方法が、前記対象に、治療有効量の上記に記載される実施形態のいずれかの二特異性抗体を投与することを含む、方法を提供する。一実施形態では、がんは、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、食道がん、膵臓がんまたは乳がんである。
これらの方法のある特定の実施形態では、二特異性抗体は、化学療法または放射線療法と組み合わせて投与される。一実施形態では、対象は、結腸直腸がん、または肺がん、または胃がん、食道がん、または膵臓がん、または乳がん、または別のCEAを発現するがんを有するがん患者である。
本発明の別の実施形態は、上記に記載される処置の方法のいずれかにおける使用のための本発明による二特異性抗体を提供する。一実施形態では、がんは、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、食道がん、膵臓がんおよび乳がんからなる群から選択される。
本発明の別の実施形態は、CEACAM5またはCD3εに免疫特異的に結合する本明細書に開示される二特異性抗体またはそのドメイン(例えば、可変軽鎖領域および/または可変重鎖領域)をコードするポリヌクレオチドを提供する。ある特定の態様では、本明細書に記載される抗体の軽鎖または重鎖をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドが本明細書に提供される。ポリヌクレオチドは、本明細書に記載される抗体のVHまたは重鎖CDRを含む重鎖をコードするヌクレオチド配列を含むことができる。ポリヌクレオチドは、本明細書に記載される抗体のVLまたは軽鎖CDRを含む軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含むことができる。
ある特定の実施形態は、本明細書に開示される単離されたポリヌクレオチドを含むベクターである。ある特定の他の実施形態は、本明細書に開示される二特異性抗体をコードする単離されたポリヌクレオチドまたはベクターを含む細胞である。一部の実施形態では、細胞は、Streptomyces、酵母、CHO、YB/20、NS0、PER-C6、HEK-293T、NIH-3T3、HeLa、BHK、Hep G2、SP2/0、R1.1、B-W、L-M、COS 1、COS 7、BSC1、BSC40、BMT10細胞、植物細胞、昆虫細胞、および組織培養におけるヒト細胞からなる群から選択される。
ある特定の実施形態は、本明細書に開示される抗体を作製する方法である。一部の実施形態では、抗体を作製する方法は、本明細書に開示される二特異性抗体をコードする単離されたポリヌクレオチドまたはベクターを含む細胞を使用して、抗体を発現させることを含む。一部の実施形態では、抗体を作製する方法は、本明細書に開示される二特異性抗体をコードする単離されたポリヌクレオチドまたはベクターを含有する細胞を培養すること、およびそこで発現した抗体を単離することを含む。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、
a)前記第1の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む、重鎖可変領域(VH)を含み、
b)前記第1の結合部分が、
b1)配列番号32のCDRL1、配列番号33のCDRL2および配列番号34のCDRL3、
b2)配列番号81のCDRL1、配列番号82のCDRL2および配列番号83のCDRL3、
b3)配列番号84のCDRL1、配列番号85のCDRL2および配列番号86のCDRL3、
b4)配列番号87のCDRL1、配列番号88のCDRL2および配列番号89のCDRL3、
b5)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
b6)配列番号93のCDRL1、配列番号94のCDRL2および配列番号95のCDRL3、
b7)配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3、
b8)配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3、
b9)配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3、
b10)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、
b11)配列番号108のCDRL1、配列番号109のCDRL2および配列番号110のCDRL3、ならびに
b12)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域(VL)を含み、
c)前記第2の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含むVHを含み、
d)前記第2の結合部分が、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含むVLを含む、
二特異性抗体。
(項目2)
前記第1の結合部分が、
a1)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
a2)配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3、
a3)配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3、
a4)配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3、
a5)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、ならびに
a6)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域を含むことを特徴とする、項目1に記載の二特異性抗体。
(項目3)
前記第1の結合部分が、
a1)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
a2)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、ならびに
a3)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域を含む、項目1に記載の二特異性抗体。
(項目4)
a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
b)前記第1の結合部分中に、
b1)配列番号31の軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号114の軽鎖可変領域VL、
b3)配列番号115の軽鎖可変領域VL、
b4)配列番号116の軽鎖可変領域VL、
b5)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
b6)配列番号118の軽鎖可変領域VL、
b7)配列番号119の軽鎖可変領域VL、
b8)配列番号120の軽鎖可変領域VL、
b9)配列番号121の軽鎖可変領域VL、
b10)配列番号122の軽鎖可変領域VL、
b11)配列番号123の軽鎖可変領域VL、および
b12)配列番号124の軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
を含む、項目1に記載の二特異性抗体。
(項目5)
a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
b)前記第1の結合部分中に、
b1)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号119の軽鎖可変領域VL、
b3)配列番号120の軽鎖可変領域VL、
b4)配列番号121の軽鎖可変領域VL、
b5)配列番号122の軽鎖可変領域VL、および
b6)配列番号124の軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
を含む、項目2に記載の二特異性抗体。
(項目6)
a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
b)前記第1の結合部分中に、
b1)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
b1)配列番号122の軽鎖可変領域VL、および
b4)配列番号124の軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
を含む、項目3に記載の二特異性抗体。
(項目7)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、
a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
b)前記第1の結合部分中に、
b1)配列番号40の軽鎖、
b2)配列番号125の軽鎖、
b3)配列番号126の軽鎖、
b4)配列番号127の軽鎖、
b5)配列番号128の軽鎖、
b6)配列番号129の軽鎖、
b7)配列番号130の軽鎖、
b8)配列番号131の軽鎖、
b9)配列番号132の軽鎖、
b10)配列番号133の軽鎖、
b11)配列番号134の軽鎖、および
b12)配列番号135の軽鎖
からなる群から選択される軽鎖、ならびに、
c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号28の軽鎖を含む、二特異性抗体。
(項目8)
a)配列番号43の重鎖、
b)配列番号44の重鎖、および
c)配列番号45の重鎖
からなる群から選択される共通重鎖を含むことを特徴とする、項目1~7のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目9)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、配列番号45の共通重鎖、ならびに前記第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖、および前記第1の結合部分中に、配列番号128の軽鎖を含む、二特異性抗体。
(項目10)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、配列番号45の共通重鎖、ならびに前記第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖、および前記第1の結合部分中に、配列番号133の軽鎖を含む、二特異性抗体。
(項目11)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、配列番号45の共通重鎖、ならびに前記第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖、および前記第1の結合部分中に、配列番号135の軽鎖を含む、二特異性抗体。
(項目12)
がんの処置における使用のための二特異性抗体であって、ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含むことを特徴とし、
a)0.5nM~50nMのEC50値でMKN-45細胞に結合すること、
b)0.01~10nMのEC50値で、濃度依存性の様式で、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて、MKN-45、HPAF-IIまたはLS174T細胞を殺滅すること、
c)CEACAM5を発現するPEAK細胞に結合するが、CEACAM8を発現するPEAK細胞と交差反応しないこと、
d)標的細胞としてLS174T腫瘍細胞を使用するTDCCアッセイにおける殺滅についてのEC50値が、1μg/mLのsCEAの存在下で、5倍を超えて増加しないことを特徴とする、二特異性抗体。
(項目13)
前記抗体が、
a)ビヒクル対照群と比較して、25%またはそれよりも大きく、HPAF-IIモデルにおける腫瘍成長を阻害し、
b)VLおよびVHドメインとして、それぞれ、配列番号48および49のVLおよびVHを含む抗CEA抗体と競合する(MEDI)、
項目12に記載の使用のための二特異性抗体。
(項目14)
Fcドメインのそれぞれのサブユニットが、アミノ酸置換L234A、L235AおよびP329A(Kabat EUインデックス番号付け)を含む、項目12または13に記載の使用のための二特異性抗体。
(項目15)
結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、膵臓がんおよび/または乳がんの処置における使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目16)
in vivoで癌を処置する使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目17)
がんを患っているヒト対象への、本発明の二特異性抗体を含有する薬学的有効量の組成物の投与に使用するための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目18)
結腸直腸癌、食道がん、膵臓腺癌、胃がん、非小細胞肺がん、乳がん、頭頸部癌、子宮がんおよび膀胱がんの処置における使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目19)
CEAを発現する固形腫瘍の処置のための単剤療法における使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目20)
同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体と組み合わせたがんの処置における使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目21)
同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体および/またはPD-1軸アンタゴニストと組み合わせたがんの処置における使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目22)
同時、別々または逐次的組合せで、PD-1軸アンタゴニストと組み合わせたがんの処置における使用のための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目23)
がんの処置における本発明の抗体および二特異性抗CEAxCD47抗体の投与の間が6~15日の間隔の交互投与において投与に使用するための、項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体および二特異性抗CEAxCD47抗体。
(項目24)
本発明の抗体が、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される、項目15~23のいずれか一項に記載の使用のための二特異性抗体。
(項目25)
本発明の抗体が、患者に、1~20mg/kgの範囲の用量で投与されることを特徴とする、項目23に記載の使用のための二特異性抗体。
(項目26)
前記抗CEAxCD47抗体が、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与されることを特徴とする、項目20または21のいずれか一項に記載の使用のための二特異性抗体。
(項目27)
前記PD-1軸アンタゴニストが、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される、項目22に記載の使用のための二特異性抗体。
(項目28)
項目1~14のいずれか一項に記載の二特異性抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
(項目29)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、
a)前記第1の結合部分および前記第2の結合部分が、それぞれ、重鎖として、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む可変領域を含む共通重鎖を含み、
b)前記第1の結合部分が、
i)ラムダ軽鎖定常領域、ならびに
ii)縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号32から得られるCDRL1、縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号33から得られるCDRL2、および縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって配列番号34から得られるCDRL3を含む軽鎖可変領域
を含み、
c)前記第2の結合部分が、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域を含み、
d)前記第2の結合部分が、配列番号41の軽鎖定常領域を含む、
二特異性抗体。
(項目30)
c)における前記第2の結合部分が、配列番号25、26、27、28および29からなる群から選択される軽鎖を含む、項目29に記載の二特異性抗体。
(項目31)
ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、
a)前記第1の結合部分中に、配列番号1と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、配列番号2のCDR1、配列番号3のCDR2および配列番号4のCDR3を含む重鎖可変領域VH、
b)b1)配列番号31と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、ならびに配列番号32のCDRL1、配列番号33のCDRL2および配列番号34のCDRL3を含む軽鎖可変領域VL、
b2)配列番号114と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、ならびに配列番号81のCDRL1、配列番号82のCDRL2および配列番号83のCDRL3を含む軽鎖可変領域VL、
b3)配列番号115と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号84のCDRL1、配列番号85のCDRL2および配列番号86のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b4)配列番号116と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号87のCDRL1、配列番号88のCDRL2および配列番号89のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b5)配列番号117と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b6)配列番号118と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号93のCDRL1、配列番号94のCDRL2および配列番号95のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b7)配列番号119と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b8)配列番号120と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b9)配列番号121と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b10)配列番号122と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、
b11)配列番号123と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号108のCDRL1、配列番号109のCDRL2および配列番号110のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL、ならびに
b12)配列番号124と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性、ならびに配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3を有する軽鎖可変領域VL
からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、
c)前記第2の結合部分に、配列番号1と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、配列番号2のCDR1、配列番号3のCDR2および配列番号4のCDR3を含む重鎖可変領域VH、ならびに配列番号17と97%、98%、99%または100%のアミノ酸同一性を有し、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含む軽鎖可変領域VL
を含む、二特異性抗体。
(項目32)
前記共通重鎖が、配列番号43のものである、項目29~31のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目33)
前記共通重鎖が、配列番号44のものである、項目29~31のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目34)
前記共通重鎖が、配列番号45のものである、項目29~31のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
(項目35)
がんを処置する方法であって、有効量の、項目1~11もしくは29~34のいずれか一項に記載の二特異性抗体、または項目28に記載の医薬組成物を、それを必要とする対象に投与することを含む、方法。
(項目36)
前記二特異性抗体が、0.5nM~50nMのEC50値でMKN-45細胞に結合する、項目35に記載の方法。
(項目37)
前記二特異性抗体が、0.01~10nMのEC50値で、濃度依存性の様式で、ヒトPBMCを含有するアッセイにおいて、MKN-45、HPAF-IIまたはLS174T細胞を殺滅する、項目35または36に記載の方法。
(項目38)
前記二特異性抗体が、CEACAM5を発現するPEAK細胞に結合するが、CEACAM8を発現するPEAK細胞と交差反応しない、項目35~37のいずれか一項に記載の方法。
(項目39)
標的細胞としてLS174T腫瘍細胞を使用するTDCCアッセイにおける殺滅についての前記二特異性抗体のEC50値が、sCEAの非存在下での前記EC50と比べて、1μg/mLのsCEAの存在下で、5倍を超えて増加しない、項目35~38のいずれか一項に記載の方法。
(項目40)
前記二特異性抗体が、ビヒクル対照群と比較して、25%またはそれよりも大きく、HPAF-IIモデルにおける腫瘍成長を阻害する、項目35~39のいずれか一項に記載の方法。
(項目41)
前記二特異性抗体が、VLおよびVHとして、配列番号48および49の配列のVLおよびVHを含む抗CEA抗体と競合する、項目35~40のいずれか一項に記載の方法。
(項目42)
前記二特異性抗体が、Kabat EUインデックス番号付けに従って番号付けして、Fcドメインのそれぞれのサブユニット中にアミノ酸置換L234A、L235AおよびP329Aを含む、項目35~41のいずれか一項に記載の方法。
(項目43)
前記対象が、ヒトである、項目35~42のいずれか一項に記載の方法。
(項目44)
前記対象が、結腸直腸がん、非小細胞肺がん(NSCLC)、胃がん、膵臓がんまたは乳がんを有する、項目35~43のいずれか一項に記載の方法。
(項目45)
前記対象が、癌を有する、項目35~43のいずれか一項に記載の方法。
(項目46)
前記対象が、結腸直腸癌、食道がん、膵臓腺癌、胃がん、非小細胞肺がん、乳がん、頭頸部癌、子宮がんまたは膀胱がんを有する、項目35~43のいずれか一項に記載の方法。
(項目47)
前記二特異性抗体が、単剤療法として投与される、項目35~46のいずれか一項に記載の方法。
(項目48)
前記二特異性抗体が、CEAを発現する固形腫瘍の処置として投与される、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記二特異性抗体が、同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体と組み合わせて投与される、項目35~46のいずれか一項に記載の方法。
(項目50)
前記二特異性抗体が、二特異性抗CEAxCD47抗体との交互の様式で、本発明の二特異性抗体および前記二特異性抗CEAxCD47抗体の投与の間が6~15日の間隔で投与される、項目49に記載の方法。
(項目51)
前記二特異性抗体が、同時、別々または逐次的組合せで、PD-1軸アンタゴニストと組み合わせて投与される、項目35~46、49または50のいずれか一項に記載の方法。
(項目52)
前記二特異性抗体が、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の用量で投与される、項目35~51のいずれか一項に記載の方法。
(項目53)
前記二特異性抗体が、1~20mg/kgの用量で投与される、項目35~52のいずれか一項に記載の方法。
(項目54)
前記二特異性抗体が、分割用量で投与される、項目52または53に記載の方法。
(項目55)
前記二特異性抗体が、持続注入によって投与される、項目52または53に記載の方法。
(項目56)
前記二特異性抗CEAxCD47抗体が、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される、項目49~55のいずれか一項に記載の方法。
(項目57)
前記PD-1軸アンタゴニストが、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される、項目51~56のいずれか一項に記載の方法。
(項目58)
項目1~34のいずれか一項に記載の抗体またはその結合部分をコードする単離されたポリヌクレオチド。
(項目59)
項目58に記載の単離されたポリヌクレオチドを含むベクター。
(項目60)
項目58に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは項目59に記載のベクターを含む細胞。
(項目61)
Streptomyces、酵母、CHO、YB/20、NS0、PER-C6、HEK-293T、NIH-3T3、HeLa、BHK、Hep G2、SP2/0、R1.1、B-W、L-M、COS 1、COS 7、BSC1、BSC40、BMT10細胞、植物細胞、昆虫細胞、および組織培養におけるヒト細胞からなる群から選択される、項目60に記載の細胞。
(項目62)
二特異性抗体を作製する方法であって、項目項目60または61に記載の細胞中で前記二特異性抗体を発現させることを含む、方法。
(項目63)
二特異性抗体を作製する方法であって、項目60または61に記載の細胞を培養すること、およびそこで発現した前記抗体を単離することを含む、方法。
図1:カッパ/ラムダ(KL)CEAxCD3二特異性抗体において使用される新たなCEAバインダーのエピトープビニング(実施例5cに詳述する) 本発明の新たなCEA結合抗体の特性評価のために、競合的イムノアッセイを使用する。抗体であって、全てがCEACAM5(CEA)に結合し、結合エピトープが既に公開されている抗体に対して、競合的ブロッキングプロファイルを作出する。SM3E、MEDI(=MEDI-565)、SAR、T84.66、ラベツズマブおよびCH1A1Aは、そのような抗体であり、これらの抗体およびアッセイの詳細について、実施例5cを参照されたい。
図2:精製された二特異性抗体のAgilentプロファイル 実施例6の表現において、新たなカッパラムダ二特異性CEAxCD3抗体の精製および分析を記載する。精製された二特異性抗体は、変性および還元条件下、電気泳動によって分析する。Agilent 2100 Bioanalyzerを使用し、図は、本発明のカッパラムダ抗体のAB1 L3-1/D(配列番号28のラムダCD3 LCおよび配列番号40のカッパCEA LCおよび配列番号44の共通HCを有するKL CEAxCD3二特異性抗体)およびL3-1AB8 H-CK5/D(配列番号70のハイブリッドカッパCD3 LCおよび配列番号42のラムダCEA LCおよび配列番号44の共通HCを有するハイブリッドKL CEAxCD3二特異性抗体)について得られた典型的な結果を示す。Y4 L3-1/Dは、AB1 L3-1/DおよびL3-1AB8 H-CK5/Dと同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、二特異性抗体であり、この抗体は、対照抗体として、薬理学的アッセイにおいて頻繁に使用される。
図3:CD3POSJurkat細胞(およびCD3NEGTIB-153細胞)への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB1 L3-1/DおよびL3-1AB8 H-CK5/DのCD3を発現するJurkat細胞への濃度依存性結合。両方のKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。Y4L3-1/Dは、同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体である。右側の図は、100nMの二特異性抗体の濃度でも、CD3陰性細胞系のTIB-153への結合がないことを示す。
図4:CEAPOSMKN-45細胞(およびCEANEGMKN-45_hCEAKO細胞)への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB1 L3-1/DおよびL3-1AB8 H-CK5/DのCEAを発現するMKN-45細胞への濃度依存性結合。両方のKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Dは、MKN-45細胞に結合しない。右側の図は、CEACAM5のノックアウト後に、100nMの濃度でも、MKN-45細胞への結合がないことを示す。
図5:CEAPOSLS174T細胞への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB1 L3-1/DおよびL3-1AB8 H-CK5/DのCEAを発現するLS 174T細胞への濃度依存性結合。両方のKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Dは、LS 174T細胞に結合しない。
図6:CEAPOSMKN-45細胞(およびCEANEGMKN-45_hCEAKO細胞)の殺滅 本発明のKL二特異性抗体のAB1 L3-1/DおよびL3-1AB8 H-CK5/DによるMKN-45細胞の濃度依存性のT細胞再標的化殺滅/溶解(実施例8aに記載されるアッセイ)。両方のKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。両方のKL二特異性抗体は、同じ殺滅効力を示す。これは、AB1 L3-1/DのMKN-45への結合が、L3-1AB8 H-CK5/Dの結合よりも非常に弱いので、驚くべきことである/予想外である(図4を参照されたい)。 同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Dは、およそ100倍高い濃度で、非常に低い殺滅/溶解効力を示すにすぎない。 右側の図:3つの二特異性抗体のすべてによるCEAノックアウトMKN-45細胞のただ単に非常に低い非特異的殺滅/溶解。
図7:CEAPOSLS-174Tの殺滅 本発明のKL二特異性抗体のAB1 L3-1/DおよびL3-1AB8 H-CK5/DによるLS-174T細胞の濃度依存性のT細胞再標的化殺滅/溶解(実施例8aに記載されるアッセイ)。両方のKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。L3-1AB8 H-CK5/Dは、AB1 L3-1/Dよりも強い殺滅効力を示す。L3-1AB8 H-CK5/DのLS-174T細胞への結合は、AB1 L3-1/Dの結合よりも強力である(図5を参照されたい)。 同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Dは、100倍よりも高い濃度で、非常に低い殺滅/溶解効力を示すにすぎない。
図8:モノクローナル抗CEA mAb 1B4の異なる組換えタンパク質への結合(ELISA)。 CEA ECD=CEAの細胞外ドメイン;CEA A3B3は、CEAのA3 B3ドメインである。組換えメソテリンMSLNを対照として使用して、非特異的結合(結合は、CEAのECDに、それぞれCEAのA3B3ドメインに特異的でない)を測定する。
図9:モノクローナル抗CEA mAb C11の異なる組換えタンパク質への結合(ELISA)。 CEA ECD=CEAの細胞外ドメイン;CEA A3B3は、CEAのA3 B3ドメインである。組換えメソテリンMSLNを対照として使用して、非特異的結合(結合は、CEAのECDに、それぞれCEAのA3B3ドメインに特異的でない)を測定する。
図10:Lead Optimization Wave 1抗体のCD3 OSJurkat細胞(およびCD3NEGTIB-153細胞)への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB13L3-1/N、AB14L3-1/N、AB15L3-1/N、AB17L3-1/NおよびAB20L3-1/NのCD3を発現するHUT-78細胞への濃度依存性結合。すべてのKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。AB1L3-1/Nは、リードの最適化によって上記で言及したbsAbがそれから得られる親のKL二特異性抗体である。Y4L3-1/Nは、同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体である。TCB 2014は、米国特許出願公開第20140242079に記載される別のCEAxCD3 T細胞二特異性抗体に相当し、これは、参照抗体として含めた。hIgG1は、アイソタイプ対照として使用される非結合性ヒトIgG1抗体に相当する。右側の図は、100nMの二特異性抗体の濃度でも、CD3陰性細胞系のJKTβ-delへの結合がないことを示す。方法を、実施例7bに記載する。
図11:Lead Optimization Wave 1抗体のCEAPOSMKN-45細胞、HPAF-II細胞およびLS174T(ATCC(登録商標)CL-188(商標))細胞(およびCEANEGMKN-45_hCEAKO細胞)への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB13L3-1/N、AB14L3-1/N、AB15L3-1/N、AB17L3-1/NおよびAB20L3-1/Nの、CEA陽性のMKN-45(A);HPAF-II(C)およびLS174T(D)、またはCEA陰性のMKN-45_hCEAKO(B)細胞への濃度依存性結合。すべてのKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。AB1L3-1/Nは、親和性成熟によって上記で言及したbsAbがそれから得られる親のKL二特異性抗体である。Y4L3-1/Nは、同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体である。TCB 2014は、米国特許出願公開第20140242079に記載される別のCEAxCD3 T細胞二特異性抗体に相当し、これは、参照抗体として含めた。hIgG1は、アイソタイプ対照として使用される非結合性ヒトIgG1抗体に相当する。図10Bは、100nMの二特異性抗体の濃度でも、CEA陰性細胞系のMKN-45_hCEAKO細胞への結合がないことを示す。100nMの濃度での本発明の抗体のMKN-45および/またはHPAF-II細胞への結合は、TCB2014の結合よりも40%以上高い。実施例7aに記載される方法。 同上。
図12:Lead Optimization Wave 1抗体によるCEAPOSMKN-45、HPAF-IIおよびLS174T細胞(およびCEANEGMKN-45_hCEAKO細胞)の殺滅 本発明のKL二特異性抗体のAB13L3-1/N、AB14L3-1/N、AB15L3-1/N、AB17L3-1/NおよびAB20L3-1/Nによる、CEA陽性のMKN-45(A);HPAF-II(C)およびLS174T(D)、またはCEA陰性のMKN-45_hCEAKO(B)細胞の濃度依存性のT細胞再標的化殺滅/溶解(実施例8aに記載されるアッセイ)。すべてのKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。すべてのKL二特異性抗体は、リードの最適化によってそれらがそれから得られる親のAB1L3-1/N抗体と比較して、改善された殺滅を示すが、CEA陽性細胞が使用された場合(A、C、D)、CEAノックアウトMKN-45細胞(B)の非常に低い非特異的殺滅/溶解を示すにすぎない。同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Nは、試験された最大濃度で、非常に低い殺滅/溶解効力を示すにすぎない。TCB 2014は、米国特許出願公開第20140242079号に記載される別のCEAxCD3 T細胞二特異性抗体に相当し、これは、参照抗体として含めた。本発明の二特異性抗体のEC50は、TCB2014のEC50よりも低く、腫瘍細胞殺滅についての改善された効力を実証する。実施例8aに記載される方法。 同上。
図13:Lead Optimization Wave 2抗体のCD3POS初代T細胞(CD4+およびCD8+)ならびにCD3NEGB細胞および単球への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB54L3-1/N、AB60L3-1/N、AB66L3-1/N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/Nの、CD3陽性の初代CD4+ T細胞(A)および初代CD8+ T細胞(B)、またはCD3陰性のB細胞(C)および単球(D)への細胞への濃度依存性結合。すべてのKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持ち、CD3陽性T細胞集団に同様に結合する。同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Nは、CD3陽性T細胞に、同様に良好に結合する。TCB 2014は、米国特許出願公開第20140242079号に記載される別のCEAxCD3 T細胞二特異性抗体に相当し、これは、参照抗体として含めた。抗ヒトCD47抗体B6H12(aCD47 mAb)を陽性対照として使用した(T細胞、B細胞および単球はCD47を発現する)。二次Abは、検出抗体のみが細胞に添加された条件にのみ対応し、バックグラウンドシグナルを決定するのに役立つ(陰性対照)。すべての試験された抗体は、200nMの濃度でも、CD3陰性細胞集団への結合がないことを示す。 同上。
図14:Lead Optimization Wave 2抗体のCEAPOSMKN-45細胞、HPAF-II細胞およびLS174T細胞(およびCEANEGMKN-45_hCEAKO細胞)への結合 本発明のKL二特異性抗体のAB54L3-1/N、AB60L3-1/N、AB66L3-1/N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/Nの、CEA陽性のMKN-45(A);HPAF-II(C)およびLS174T(D)、またはCEA陰性のMKN-45_hCEAKO(B)細胞への濃度依存性結合。すべてのKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。Y4L3-1/Nは、同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体である。TCB 2014は、米国特許出願公開第20140242079号に記載される別のCEAxCD3 T細胞二特異性抗体に相当し、これは、参照抗体として含めた。図14Bは、200nMの二特異性抗体の濃度でも、CEA陰性細胞系のMKN-45_hCEAKO細胞への結合がないことを示す。図14Aについて、EC50値を表4に報告する。200nMの濃度での本発明の二特異性抗体の結合は、TCB2014の結合よりも40%以上高い。 同上。
図15:Lead Optimization Wave 2抗体によるCEAPOSMKN-45、HPAF-IIおよびLS174T細胞(およびCEANEGMKN-45_hCEAKO細胞)の殺滅 本発明のKL二特異性抗体のAB54L3-1/N、AB60L3-1/N、AB66L3-1/N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/Nによる、CEA陽性のMKN-45(A);HPAF-II(C)およびLS174T(D)、またはCEA陰性のMKN-45_hCEAKO(B)細胞の濃度依存性のT細胞再標的化殺滅/溶解(実施例8aに記載されるアッセイ)。すべてのKL二特異性抗体は、同じCD3アームを持つ。同じCD3アームを有するが、第2のアームがCEAに結合しない、KL二特異性抗体のY4L3-1/Nは、試験された最大濃度で、非常に低い殺滅/溶解効力を示すにすぎない。TCB 2014は、米国特許出願公開第20140242079号に記載される別のCEAxCD3 T細胞二特異性抗体に相当し、これは、参照抗体として含めた。この参照抗体のTCB2014と比較して、本発明のKL二特異性抗体のAB54L3-1/N、AB60L3-1/N、AB66L3-1/N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/Nはすべて、より低いEC50値を、CEA陽性標的細胞のそれぞれのより強力な殺滅(A、C、D)を示すが、CEAノックアウトMKN-45細胞の同等の低い非特異的殺滅/溶解を示す(B)。図15A、CおよびDについて、EC50値を表5に報告する。 同上。
図16:MKN45腫瘍細胞のT細胞媒介殺滅後のサイトカインの分泌 MKN45腫瘍細胞のT細胞媒介殺滅後の本発明のKL二特異性抗体のAB17L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/Nによって媒介されるパーフォリン(B);グランザイムB(C);IFN-γ(D);TNF-α(E);IL-2(F);IL-6(G);IL-10(H)の分泌(E:T(ヒトPBMC:腫瘍細胞)=10:1、48時間のインキュベーション、特異性溶解を(A)に示す)。実施例8eに記載される方法。 同上。
図17:MKN-45腫瘍細胞のT細胞媒介殺滅後のT細胞活性化 CEA陽性MKN-45腫瘍細胞のT細胞媒介殺滅の2日後の本発明のKL二特異性抗体のAB17L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/Nによって媒介されるCD25(AおよびB)およびCD69(CおよびD)のヒトCD4+およびCD8+T細胞の上方調節(図16Aに示す腫瘍細胞の殺滅/溶解)。
100nMでの統計的に異ならない腫瘍細胞溶解にもかかわらず、TCB2014と比較して本発明の抗体のより少ないT細胞活性化は、同じ腫瘍溶解でのより低い副作用を示唆する。実施例8cに記載される方法。
同上。
図18:huPBMC移入を有するNOGマウスのHPAF-IIモデルにおけるin vivo抗腫瘍有効性 huPBMC移入を有するNOGマウスのHPAF-II腫瘍細胞系モデルにおける本発明のKL二特異性抗体のAB17L3-1/N、AB72L3-1/NおよびAB73L3-1/N、ならびにTCB2014のin vivo抗腫瘍有効性(すべて単回10mg/kg注射)。マウスは、平均腫瘍体積が150mmに近くなった11日目に無作為化した。結果は、異なる研究群において、キャリパーによって測定された8匹のマウスの腫瘍体積からの平均およびSEMを示す。AB73L3-1/NおよびTCB2014の間に統計学的差異は見出されなかった。実施例9aに記載される方法。
定義
用語は、他に定義されない限り、以下のように、当技術分野で一般に使用されるように本明細書で使用する。
本明細書で使用される場合、「抗原結合部分、結合部分」という用語は、その最も広い意味で、CEA、CD47およびCD3などの抗原決定基を特異的に結合する抗体の部分を指す。
より具体的には、本明細書で使用される場合、膜結合ヒト癌胎児性抗原(CEA、CEACAM5と同じ)を結合する、またはCD3に結合する結合部分は、CEAまたはCD3に、より詳細には、細胞表面または膜結合CEAもしくはCD3に特異的に結合する。「特異的に結合する、に特異的な、に結合する」とは、結合が、抗原に対して選択的であり、望ましくないか、または非特異的な相互作用と区別することができることを意味する。一部の実施形態では、抗標的抗体の、関連しない非標的タンパク質への結合の程度は、例えば、表面プラズモン共鳴(SPR)、例えば、Biacore(登録商標)、酵素結合免疫吸着(ELISA)またはフローサイトメトリー(FACS)によって測定されるように、抗体の前記標的への結合よりも、約10倍、好ましくは、>100倍低い。標的は、本明細書で議論されるタンパク質、例えば、CEA、CD47およびCD3εである。
「CEA、CD3に特異的に結合する、CEA、CD3に結合する」は、一実施形態では、抗体が、CD3の、CEAの、それぞれの結合を介した腫瘍細胞へのT細胞の再標的化において治療剤として有用であるような十分な親和性で、標的のCEAに、CD3に、それぞれ結合することができる抗体を指す。
好ましくは、本発明による二特異性抗体は、異なる種から、好ましくは、ヒトおよびカニクイザルの間で保存されているCD3のエピトープに結合する。
本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む抗体を指す。一実施形態では、抗体は、全長抗体である。本明細書で使用される場合、「抗体重鎖」という用語は、全長抗体について定義されるように、可変領域(可変ドメイン)および定常領域(定常ドメイン)からなる抗体重鎖を指す。本明細書で使用される場合、「抗体軽鎖」という用語は、全長抗体について定義されるように、可変領域および定常領域からなる抗体軽鎖を指す。本発明のために有用な定常軽鎖は、本発明に開示される軽鎖に含まれる。
「全長抗体」という用語は、2つの「全長抗体重鎖」および2つの「全長抗体軽鎖」からなる抗体を表す。「全長抗体重鎖」は、N末端からC末端の方向に、抗体重鎖可変ドメイン(VH)、抗体定常重鎖ドメイン1(CH1)、抗体ヒンジ領域(HR)、抗体重鎖定常ドメイン2(CH2)および抗体重鎖定常ドメイン3(CH3)からなるポリペプチドであり、VH-CH1-HR-CH2-CH3と略される。「全長抗体軽鎖」は、N末端からC末端の方向に、抗体軽鎖可変ドメイン(VL)および抗体軽鎖定常ドメイン(CL)からなるポリペプチドであり、VL-CLと略される。抗体軽鎖定常ドメイン(CL)は、κ(カッパ)またはλ(ラムダ)であり得る。2つの全長抗体ドメインは、CLドメインおよびCH1ドメインの間、ならびに全長抗体重鎖のヒンジ領域間のポリペプチド間ジスルフィド結合を介して一緒に連結される。典型的な全長抗体の例は、IgG(例えば、IgG1およびIgG2)、IgM、IgA、IgDおよびIgEのような天然抗体である。本発明による全長抗体は、一実施形態では、ヒトIgG1型のものであり、さらなる一実施形態では、下記に定義されるFc部分中に1つまたは複数のアミノ酸置換を含む。本発明による全長抗体は、VHおよびVLの対によってそれぞれ形成される2つの結合部分を含み、一方がCEAに結合し、他方がCD3に結合する。
本明細書で使用される場合、「Fc領域;Fcドメイン」という用語は、IgG重鎖のC末端領域を指し、IgG1抗体の場合では、C末端領域は、-CH2-CH3を含む(上記を参照されたい)。IgG重鎖のFc領域の境界は、非常にわずかに変動する可能性があるが、ヒトIgG重鎖Fc領域は、通常、Cys226の位置のアミノ酸残基からカルボキシル末端まで伸びるとして定義される。
定常領域は、現在の技術水準において周知であり、例えば、Kabat,E.Aによって記載されている(例えば、Johnson, G., and Wu, T.T., Nucleic Acids Res. 28 (2000) 214-218;Kabat, E.A.,ら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72 (1975) 2785- 2788を参照されたい)。
「エピトープ」という用語は、抗体に特異的に結合することができる任意のポリペプチド決定基を含む。ある特定の実施形態では、エピトープ決定基は、アミノ酸、糖側鎖、ホスホリルまたはスルホニルなどの分子の化学的に活性な表面の基(surface grouping)を含み、ある特定の実施形態では、特定の三次元構造の特徴および/または特定の電荷特徴を有し得る。エピトープは、抗体によって結合される標的の領域である。
本明細書で使用される場合、「共通重鎖(cHC)」という用語は、N末端からC末端の方向に、抗体重鎖可変ドメイン(VH)、抗体重鎖定常ドメイン1(CH1)、抗体ヒンジ領域(HR)、抗体重鎖定常ドメイン2(CH2)および抗体重鎖定常ドメイン3(CH3)からなるポリペプチドを指し、VH-CH1-HR-CH2-CH3と略される。本発明による二特異性抗体のために好適な共通重鎖は、国際公開第2012023053号、国際公開第2013088259号、国際公開第2014087248号、国際公開第2019175658号および国際公開第2016156537号(これらのそれぞれの全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている重鎖である。一実施形態では、本発明による二特異性抗体のcHCは、重鎖CDRとして、配列番号2のCDRL1、配列番号3のCDRL2および配列番号4のCDRL3を含む。一実施形態では、本発明による二特異性抗体のcHCは、重鎖可変領域として、配列番号1のVH領域を含む。一実施形態では、本発明による二特異性抗体のcHCは、配列番号43、44または45のものである。
本発明による、共通重鎖を含む二特異性抗体のフォーマットは、標準的なIgG分子と区別ができず、かつ標準的なモノクローナル抗体と区別ができない特徴を有する、二特異性抗体のアフィニティー精製を可能にし(例えば、国際公開第2013088259号、国際公開第2012023053号を参照されたい)、患者における免疫原性の可能性がないか、またはそれが低いことが見込まれる。
本明細書で使用される場合、「AB1L3-1、AB17L3-1、AB54L3-1、AB60L3-1、AB66L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1、AB73L3-1など」は、重鎖CDRとして、配列番号2、3および4のCDRを含む共通重鎖、ならびに第2の結合部分中に、軽鎖CDRとして、配列番号18、19および20のCDRを含む軽鎖を含む、本発明による二特異性CEAxCD3抗体を指す。AB1などは、したがって、第1の結合部分(抗CEACAM5結合部分)を表し、L3-1は、第2の結合部分(抗CD3結合部分)を表す。
一実施形態では、AB1L3-1、AB17L3-1、AB54L3-1、AB60L3-1、AB66L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1、AB73L3-1などは、配列番号43の共通重鎖(WT hIgG1)、および第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号28の軽鎖を含む。そのような本発明の二特異性抗体は、実施例において、AB1L3-1、AB17L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1、AB73L3-1としても指定される。
一実施形態では、AB1L3-1、AB17L3-1、AB54L3-1、AB60L3-1、AB66L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1、AB73L3-1などは、配列番号44の共通重鎖(L234A+L235A変異を有するhIgG1)、および第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号28の軽鎖を含む。そのような本発明の二特異性抗体は、実施例において、AB1L3-1/D、AB17L3-1/D、AB71L3-1/D、AB72L3-1/D、AB73L3-1/Dなどとして指定される。
一実施形態では、AB1L3-1、AB17L3-1、AB54L3-1、AB60L3-1、AB66L3-1、AB71L3-1、AB72L3-1、AB73L3-1などは、配列番号45の共通重鎖(L234A+L235A+P329A変異を有するIgG1)、および第2の結合部分中に、軽鎖として、配列番号28の軽鎖を含む。そのような本発明の二特異性抗体は、実施例において、AB1L3-1/N、AB17L3-1/N、AB54L3-1/N、AB60L3-1/N、AB66L3-1/N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/N、AB73L3-1/Nなどとして指定される。
共通重鎖を含む本発明の二特異性抗体は、例えば、国際公開第2012023053号に従って、作製することができる。国際公開第2012023053号に記載される方法は、ヒト免疫グロブリンと構造が同一である二特異性抗体を生成する。この種類の分子は、2コピーのユニークな重鎖ポリペプチド、カッパ定常ドメインに融合された第1の軽鎖可変領域、およびラムダ定常ドメインに融合された第2の軽鎖可変領域から構成される。
本発明の二特性抗体では、一方の結合部位は、CEAへの特異性を示し、他方の部位は、CD3への特異性を示し、ここで、それぞれに対して、重鎖およびそれぞれの軽鎖が寄与する。軽鎖可変領域は、ラムダまたはカッパファミリーのものであり得、好ましくは、それぞれ、ラムダおよびカッパ定常ドメインに融合される。これは、非天然ポリペプチド結合の発生を回避するために好ましい。しかしながら、2つの特異性のいずれかについて、カッパ軽鎖可変ドメインをラムダ定常ドメインに融合することによって、または2つの特異性のいずれかについても、ラムダ軽鎖可変ドメインをカッパ定常ドメインに融合することによって、本発明の二特異性抗体の生成のために用いることができる抗体アームを得ることも可能である。国際公開第2012023053号に記載されている二特異性抗体は、「κλボディ」である。このκλ-ボディフォーマットは、標準的なモノクローナル抗体と区別ができない特徴を有する標準的なIgG分子と区別ができない二特異性抗体のアフィニティー精製を可能にし、したがって、例えば、アミノ酸架橋または他の非天然エレメントを含む以前のフォーマットと比較して、好ましい。
方法の必須のステップは、同じ重鎖可変ドメインを共有する異なる抗原特異性を有する(可変軽ドメインおよび可変重ドメインによってそれぞれ構成される)2つの抗体Fv領域の同定である。モノクローナル抗体およびその断片の作製についての多数の方法が記載されている(例えば、Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow E, and Lane D, 1988, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NYを参照されたい)。完全ヒト抗体は、CDR1および2を含む軽鎖ならびに重鎖の両方の配列がヒト遺伝子から生じる抗体分子である。CDR3領域は、ヒト起源のものであり得るか、または合成手段により設計され得る。そのような抗体は、「ヒト抗体」または「完全ヒト抗体」と称される。ヒトモノクローナル抗体は、トリオーマ技法;ヒトB細胞ハイブリドーマ技法(Kozbor,ら, 1983 Immunol Today 4: 72を参照されたい);およびヒトモノクローナル抗体を産生させるためのEBVハイブリドーマ技法(Cole,ら, 1985 In: Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc., pp. 77-96を参照されたい)を使用することによって、調製することができる。ヒトモノクローナル抗体が、利用され得、ヒトハイブリドーマを使用することによって(Cote,ら, 1983. Proc Natl Acad Sci USA 80: 2026-2030を参照されたい)、またはin vitroで、エプスタインバーウイルスでヒトB細胞を形質転換することによって(Cole,ら、上記を参照されたい)、産生され得る。
「CD3εまたはCD3」という用語は、本明細書で使用される場合、UniProt P07766(CD3E_HUMAN)で記載されるヒトCD3εに関する。「CD3に対する抗体、抗CD3抗体」という用語は、CD3εに結合する抗体に関する。
本明細書で使用される場合、「CEA、CEACAM5」という用語は、細胞表面糖タンパク質および腫瘍関連抗原(Gold and Freedman, J Exp. Med., 121:439-462, 1965; Berinstein NL, J Clin Oncol., 20:2197-2207, 2002)であるヒト癌胎児性抗原(CEA、CEACAM-5またはCD66e;UniProtKB-P06731)を指す。本明細書で使用される場合、「CEACAM6」という用語は、癌胎児性抗原関連細胞接着分子(CEACAM)ファミリーのメンバーでもある、ヒトCEACAM6(CD66c;UniProtKB-P40199)を指す。本明細書で使用される場合、「CEACAM1」という用語は、癌胎児性抗原関連細胞接着分子(CEACAM)ファミリーのメンバーでもある、ヒトCEACAM1(UniProtKB-P13688(CEAM1_HUMAN))を指す。本明細書で使用される場合、「CEACAM8」という用語は、癌胎児性抗原関連細胞接着分子(CEACAM)ファミリーのメンバーでもある、ヒトCEACAM8(UniProtKB-P31997(CEAM8_HUMAN))を指す。さらなる情報およびCEAファミリーの他のメンバーに対する情報は、http://www.uniprot.orgに見出すことができる。
本明細書で使用される場合、「CEAに特異的に結合する、CEAに結合する、CEA結合部分」という用語は、本発明による二特異性抗体の文脈では、細胞の表面上のCEACAM5に対する特異性を指す。細胞におけるCEAへの結合は、細胞あたり100,000~400,000個のCEAコピーを含む胃腺癌MKN-45細胞を用いて測定することができる。本発明による抗体の濃度は、上記で定義されるMKN-45細胞への結合について得られたEC50値に関して適切な範囲内で変動する。本発明による二特異性抗体は、そのような細胞膜結合CEACAM5に特異的に結合する。
本明細書で使用される場合、「膜結合ヒトCEA」という用語は、細胞の膜部分に、または細胞の表面に、特に、腫瘍細胞の表面に結合するヒト癌胎児性抗原(CEA)を指す。「膜結合ヒトCEA」という用語は、ある特定の状況では、細胞の膜に結合しないが、本発明による抗体が結合する膜結合CEAエピトープを保存するように構築されたCEAを指し得る。
本明細書で使用される場合、「CEACAM8に対する交差反応性なし」という用語は、本発明による二特異性抗体の文脈では、本発明による二特異性抗体の結合が、WT PEAK細胞への結合との比較において、CEACAM8を発現するPEAK細胞において試験されること(詳細については、実施例1および5を参照されたい)を指し、交差反応性なしは、CEACAM8を発現するPEAK細胞について測定されるMFIが、WT PEAK細胞について測定されるMFIの2倍以下であることを意味する。本明細書で使用される場合、「ある特定のCEACAMに対する交差反応性なし」という用語は、本発明による二特異性抗体の文脈では、CEACAM8について記載された同じ実験手順および定義の下での前記交差反応性を指す。
本明細書で使用される場合、「ヒトCEAおよびヒトCD3に結合する二特異性抗体、CEAxCD3 bsAb」という用語は、ヒトCEACAM5およびCD3εに結合する二特異性抗体を意味する。
本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」(「CDR」)という用語は、重鎖および軽鎖ポリペプチドの両方の可変領域内で見出される非隣接抗原結合(combining)部位(抗原結合(binding)領域としても公知である)を記載する。CDRは、「超可変領域」とも称され、その用語は、本明細書では、抗原結合領域を形成する可変領域の部分に関して、「CDR」という用語と互換的に使用される。この特定の領域は、Kabatら, U.S. Dept. of Health and Human Services, ”Sequences of Proteins of Immunological Interest” (1983)によって、およびChothiaら, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)によって、記載されている。Kabatらは、任意の抗体に適用可能な可変ドメイン配列の番号付けシステムも定義した。当業者は、配列それ自体を超える任意の実験データに依拠することなく、「Kabat番号付け」のこのシステムを任意の可変ドメイン配列に明確に割り当てることができる。本明細書で使用される場合、「Kabat番号付け」は、Kabatら, U.S. Dept. of Health and Human Services, ”Sequence of Proteins of Immunological Interest” (1983)によって記載される番号付けシステムを指す。他に規定されない限り、本発明による二特異性抗体(例えば、CDR配列)における特定のアミノ酸残基位置の番号付けへの言及は、Kabat番号付けシステムに従う。
本明細書で使用される場合、「オリゴヌクレオチド特異的変異誘発」という用語は、縮重オリゴヌクレオチドを使用するそのような方法に関する。それぞれのCDRの変異誘発のために、さまざまな縮重オリゴヌクレオチドの組合せが使用される。これらは、(限定されるものではないが)縮重コドンNNS、HMT、DMT、NHTを含む。
本明細書で使用される場合、「発現ベクター」という用語は、現在の技術水準から公知の適切な様式で、本発明による抗体の重鎖および軽鎖を含む1つまたは複数のベクターを指す。本明細書で使用される場合、「宿主細胞」という用語は、本発明の二特異性抗体を生成するように操作され得る任意の種類の細胞系を包含する。一実施形態では、宿主細胞は、抗原結合分子の産生を可能にするように操作される。
本明細書で使用される場合、「アミノ酸の置換」という用語は、1個のアミノ酸の、20個のタンパク新生標準アミノ酸の群からの別のアミノ酸による置換を指す。
本発明による抗CEAxCD3抗体を使用する治療的適用および方法
本発明によるCEACAMxCD3二特異性抗体は、単剤療法において、または併用療法、特に、抗CD47抗体、抗CEAxCD47抗体および/もしくはPD-1軸アンタゴニストと一緒の併用療法においてのいずれかで、固形腫瘍の処置のために最適化される。本発明による抗体およびCD47抗体またはCEAxCD47抗体は、下記に記載されるように投与することができる。
特定の実施形態では、疾患のそれぞれの固形腫瘍は、限定されるものではないが、結腸直腸腫瘍、非小細胞肺腫瘍、胃腫瘍、食道がん、膵臓腫瘍および乳房腫瘍の群を含む、CEAを発現またはさらに過剰発現するがんである。特定の実施形態では、腫瘍は、結腸直腸腫瘍である。本明細書に記載されるすべての治療的適用、使用の方法、使用、組合せなどは、特に、これらの腫瘍/疾患の処置のための実施形態である。
本発明者らは、本発明による抗体が、それぞれ有効性を喪失させるADAを中和することにより、それぞれ曝露を喪失させるADAを形成する潜在能が低いかそれがないことを示すことを認識する。
一実施形態では、本発明は、in vivoで、癌(がん、腫瘍、例えば、ヒト癌)、特に、CEAを発現する腫瘍を処置する方法を提供する。この方法は、対象に、本発明の二特異性抗体を含有する薬学的有効量(pharmaceutically effective amount)の組成物を投与することを含む。「対象」とは、ヒト対象、一実施形態では、がん/腫瘍/癌を患っている患者を意味する。
さまざまな腫瘍実体、特に、結腸直腸癌、食道がん、膵臓腺癌、胃がん、非小細胞肺がん、乳がん、頭頸部癌、子宮がんおよび膀胱がんなどにおけるCEA発現は、一般に非常に高い。消化管における健康な正常な腺上皮では、CEAは、細胞の頂端表面において偏ったパターンで、主に発現される。この偏った発現パターンは、全身投与される抗CEA単一特異性または二特異性の抗体による影響の受け易さ(accessibility)を、したがって、潜在的な毒性を制限する。この偏った発現パターンは、消化管の悪性腫瘍の細胞において失われる。CEAは、がん細胞の細胞表面全体にわたって等しく発現され、これは、がん細胞が、正常な健康な細胞よりも本発明の抗体にはるかに良好に接近可能であり、それぞれの本発明のCEAxCD3二特異性抗体によって、上記で言及した組合せによって、選択的に殺滅され得ることを意味する。
一実施形態では、本発明の二特異性抗体は、進行性固形腫瘍、一実施形態では、CEAを発現する腫瘍の処置のための単剤療法において使用することができる。一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、同時、別々または逐次的組合せで、CEAxCD47 bsAbと組み合わせて使用される。一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、同時、別々または逐次的組合せで、CEAxCD47 bsAbおよび/またはPD-1軸アンタゴニストと組み合わせて使用される。一実施形態では、本発明による二特異性抗体は、同時、別々または逐次的組合せで、PD-1軸アンタゴニストと組み合わせて使用される。そのようなPD-1軸アンタゴニストは、例えば、国際公開第2017118675号に記載されている。そのような組合せは、マクロファージおよびT細胞によって、固形がんを攻撃する。CD47抗体は、例えば、国際公開第2009091601号、国際公開第2009091547号、国際公開第2011143624号、国際公開第2009131453号、国際公開第2013119714号、国際公開第2015105995号、国際公開第2017181033号、国際公開第2018026600号、国際公開第2019157432号および国際公開第2013032948号に記載されており、CEAおよびCD47に対する二特異性抗体は、国際出願第PCT/IB2019/054559号および米国出願第16/428,539号に記載されている。
本明細書で使用される場合、本発明による抗体、ならびにヒトCD47またはヒトCEAおよびヒトCD47に結合する第2の抗体との「組合せ、同時、別々または逐次的組合せ」という用語は、2つの抗体(または、本発明の抗体、CD47 mAbまたはCEAxCD47 bsAbおよびPD-1軸アンタゴニストの組合せの場合には、3つの抗体)の、別々または一緒のいずれかでの任意の投与を指し、ここで、2つまたは3つの抗体は、例えば、別々の、逐次的な、同時の、並行の、時間的にずらしたまたは交互の投与において、併用療法の利益を得るために設計された適切な投与レジメンの一部として投与される。したがって、2つまたは3つの抗体は、同じ医薬組成物の一部として、または別々の医薬組成物でのいずれかで投与することができる。本発明による抗体は、第2の二特異性抗体の投与の前に、それと同時に、もしくはその後に、またはそれらの一部の組合せで、投与することができる。本発明による抗体が、患者に、例えば、処置の標準的な過程の間に反復間隔で投与される場合、第2の二特異性抗体は、本発明の抗体のそれぞれの投与の前に、それと同時に、もしくはその後に、またはそれらの一部の組合せで、あるいは本発明の抗体による処置に関連して異なる間隔で、あるいは本発明の抗体による処置の過程の前に、その間の任意の時に、またはその後に単回投与で、投与され得る。一実施形態では、本発明による抗体および第2の二特異性抗体は、一実施形態では、本発明の抗体および第2の抗体の投与の間に6~15日の間隔で、交互投与で投与される。そのような交互投与では、最初の投与は、本発明の抗体または第2の抗体であり得る。
「PD-1軸アンタゴニスト」という用語は、抗PD-1抗体または抗PD-L1抗体を指す。抗PD-1抗体は、例えば、ペムブロリズマブ(Keytruda(登録商標)、MK-3475)、ニボルマブ、ピディリズマブ、ランブロリズマブ、MEDI-0680、PDR001およびREGN2810である。抗PD-1抗体は、例えば、国際公開第200815671号、国際公開第2013173223号、国際公開第2015026634号、米国特許第7521051号、米国特許第8008449号、米国特許第8354509号、国際公開第20091/14335号、国際公開第2015026634号、国際公開第2008156712号、国際公開第2015026634号、国際公開第2003099196号、国際公開第2009101611号、国際公開第2010/027423号、国際公開第2010/027827号、国際公開第2010/027828号、国際公開第2008/156712号および国際公開第2008/156712号に記載されている。抗PD-L1抗体は、例えば、アテゾリズマブ、MDX-1 105、デュルバルマブおよびアベルマブである。抗PD-L1抗体は、例えば、国際公開第2015026634号、国際公開第2013/019906号、国際公開第2010077634号、米国特許第8383796号、国際公開第2010077634号、国際公開第2007005874号および国際公開第2016007235号に記載されている。
本発明による抗体および第2の二特異性抗体の組合せ投与に関して、両方の化合物は、1つの単一剤形で、または別々の剤形で、例えば、2つの異なるもしくは同一の剤形で、存在し得る。
本発明の抗体および第2の抗体が、CEACAM5に関して競合しない場合、一実施形態では、両方の抗体は、同時に投与される。本発明の抗体および第2の抗体が、CEACAM5に関して競合する場合、一実施形態では、抗体は、交互投与で投与される。
本発明の抗体は、典型的には、患者に、当技術分野において公知のように、患者が処置されているがんの(有効性および安全性の両方の視点から)最も有効な処置を提供する投与レジメンで投与される。この手法の完全な治療ポテンシャルを達成するためには、好ましくは、腫瘍細胞は、T細胞およびマクロファージによって同時に攻撃され、CEAxCD3およびCEAxCD47二特異性抗体は、細胞表面上のCEAへの結合に関して非競合的でなければならない。
上記で議論されたように、投与される抗体の量および本発明の抗体の投与のタイミングは、処置される患者の種類(例えば、性別、年齢、体重)および状態、処置される疾患または状態の重症度、ならびに投与の経路に依存し得る。例えば、本発明の抗体および第2の抗体は、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与され得る。一実施形態では、本発明の抗体および第2の抗体のそれぞれは、患者に、1~20mg/kgの範囲の用量で投与される。一部の場合では、前述の範囲の下限を下回る投与量レベルが適切であり得るが、他の場合では、さらに高い用量が、任意の有害な副作用を引き起こすことなく、用いられ得る。
本明細書で使用される場合、「抗体の半減期」という用語は、通常の薬物動態アッセイにおいて測定される前記抗体の半減期を指す。本発明による抗体ならびにCEAおよびCD47に対する第2の二特異性抗体は、3~14日間の排泄半減期を有する。
別の態様では、本発明は、疾患、特に、CEAが発現される、特に、CEAが同じ細胞型の正常組織と比較して異常に発現される(例えば、細胞表面上において過剰発現または異なるパターンで発現される)細胞増殖障害の処置における本発明による二特異性抗体の使用も対象とする。そのような障害としては、限定されるものではないが、結腸直腸がん、NSCLC(非小細胞肺がん)、胃がん、食道がん、膵臓がんおよび乳がんが挙げられる。CEAの発現レベルは、当技術分野において公知の方法によって(例えば、免疫組織化学アッセイ、免疫蛍光アッセイ、免疫酵素アッセイ、ELISA、フローサイトメトリー、ラジオイムノアッセイなどを介して)、決定され得る。
一態様では、本発明の二特異性抗体は、CEAを発現するin vivoまたはin vitroで細胞を標的化するために使用することができる。本発明の二特異性抗体は、腫瘍細胞のTDCCの誘導を介した、腫瘍形成の予防、腫瘍の根絶および腫瘍成長または転移の阻害において特に有用である。本発明の二特異性抗体は、CEAを発現する任意の腫瘍を処置するために使用することができる。本発明の二特異性抗体で処置され得る特定の悪性腫瘍としては、限定されるものではないが、結腸直腸がん、非小細胞肺がん、胃がん、食道がん、膵臓がんおよび乳がんが挙げられる。
本発明の二特異性抗体は、哺乳動物、好ましくは、ヒトに、ボーラスとして静脈内に、または一定期間にわたる持続注入によって、筋肉内、腹腔内、脳脊髄内、皮下、関節内、滑膜内、髄腔内、経口、局所もしくは吸入経路によって、ヒトに投与され得るものを含む、下記で議論されるものなどの薬学的に許容され得る剤形で、投与される。本発明の二特異性抗体はまた、好適には、腫瘍内、腫瘍周辺、病変内、または病変周辺の経路によって投与されて、局所的および全身的な治療効果を発揮する。
疾患の処置について、本発明の二特異性抗体の適切な投与量は、処置される疾患の種類、疾患の重症度および過程、以前の治療、患者の病歴および抗体に対する応答、ならびに主治医の裁量に依存する。本発明の二特異性抗体は、好適には、患者に、1回または一連の処置にわたって投与される。本発明は、CEAを発現する腫瘍細胞を選択的に殺滅するための方法を提供する。
この方法は、本発明の二特異性抗体と前記腫瘍細胞との相互作用を含む。これらの腫瘍細胞は、結腸直腸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、胃癌、食道がん、膵臓癌および乳癌を含む、ヒト癌に由来し得る。
別の態様では、本発明は、異常なCEA発現に関係する疾患を処置するための医薬の製造における使用のための本発明の二特異性抗体を対象とする。特定の実施形態では、疾患は、限定されるものではないが、結腸直腸腫瘍、非小細胞肺腫瘍、胃腫瘍、食道がん、膵臓腫瘍および乳房腫瘍を含む、CEAを発現またはさらに過剰発現するがんである。特定の実施形態では、腫瘍は、結腸直腸腫瘍である。
組成物、製剤、投与量および投与の経路
一態様では、本発明は、本発明の二特異性抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を対象とする。本発明は、がんなどの疾患の処置の方法における使用のため、またはがんなどの疾患の処置のための医薬の製造における使用のためのそのような医薬組成物をさらに対象とする。具体的には、本発明は、疾患の処置のための、より詳細にはがんの処置のための方法であって、方法が、治療有効量の本発明の医薬組成物を投与することを含む、方法を対象とする。
一態様では、本発明は、上記で定義されるように、ヒトの癌、腫瘍を処置するための医薬組成物、組合せおよび方法を包含する。例えば、本発明は、ヒトの癌の処置における使用のための薬学的有効量の本発明の抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を含む。
本発明の二特異性抗体組成物は、限定されるものではないが、静脈内、腹腔内、経口、リンパ内、または直接腫瘍内の投与を含む、従来の投与の様式を使用して投与することができる。静脈内投与または皮下投与が好ましい。
本発明の一態様では、本発明の二特異性抗体を含有する治療製剤は、所望の純度を有する抗体を必要に応じた薬学的に許容される担体、賦形剤または安定剤と混合することによって(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980))、凍結乾燥製剤または液体製剤の形態で、保管のために調製される。許容される担体、賦形剤または安定剤は、用いられる投与量および濃度でレシピエントに非毒性である。in vivo投与のために使用される製剤は、無菌でなければならない。これは、滅菌濾過膜を通す濾過によって容易に達成される。本発明の医薬組成物のための最も有効な投与の様式および投与量レジメンは、疾患の重症度および過程、患者の状態および処置に対する応答、ならびに処置する医師の判断に依存する。したがって、組成物の投与量は、均一な用量であり得るか、または個々の患者、例えば、体重に適合され得る。それにもかかわらず、本発明の組成物の有効用量は、一般に、0.1~20mg/kgの範囲である。
本発明の二特異性抗体は、1モルあたり150kDの大きさの分子量を有する。それらは、一実施形態では、Fc部分を持つ。患者における排泄半減期は、3~14日の範囲である。この半減期は、限定されるものではないが、1日に1回、1週間に1回または2週間ごとに1回の投与を可能にする。
本発明の二特異性抗体およびそれらのそれぞれの組成物は、限定されるものではないが、液状の液剤または懸濁剤、錠剤、丸剤、散剤、坐剤、ポリマーマイクロカプセルまたは微小胞、リポソーム、および注射用または注入用液剤を含む、各種の剤形であり得る。好ましい形態は、投与の様式および治療的適用に依存する。
本発明の二特異性抗体を含む組成物は、適正診療規範と適合する方法で、製剤化され、投薬され、投与される。この文脈における考慮のための因子としては、処置される特定の疾患または障害、処置される特定の哺乳動物、個々の患者の臨床状態、疾患または障害の原因、薬剤の送達の部位、投与の方法、投与のスケジュール、および医療実務者に公知の他の因子が挙げられる。
製品
本発明の別の態様では、上記に記載される障害の処置、予防および/または診断のために有用な材料を含有する製品が提供される。製品は、容器、および容器の上またはそれに付随するラベルまたは添付文書を含む。好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどが挙げられる。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの各種の材料から形成され得る。容器は、それ自体によって、または状態を処置するため、予防するためおよび/もしくは診断するために有効な別の組成物と組み合わせて組成物を保持し、滅菌アクセスポートを有していてもよい(例えば、容器は、皮下注射針により穿刺可能なストッパーを有する点滴静注バッグまたはバイアルであり得る)。組成物中の1つの活性剤は、本発明の二特異性抗体である。ラベルまたは添付文書は、組成物が、選択した状態を処置するために使用されることを示す。また、製品は、(a)組成物がその中に含有される第1の容器であって、組成物が本発明の二特異性抗体を含む、第1の容器;および(b)組成物がその中に含有される第2の容器であって、組成物がさらなる細胞傷害剤または他の治療剤を含む、第2の容器を含み得る。本発明のこの実施形態における製品は、組成物が、特定の状態を処置するために使用することができることを示す添付文書をさらに含んでいてもよい。あるいは、または加えて、製品は、薬学的に許容されるバッファー、例えば、注射用の静菌水(BWFI)、リン酸緩衝食塩水、リンゲル液およびデキストロース溶液を含む第2の(または第3の)容器をさらに含んでいてもよい。それは、他のバッファー、希釈剤、フィルター、針およびシリンジを含む、商業的および使用者の観点から望ましい他の材料をさらに含んでいてもよい。
表1
配列表
(実施例1)
ヒトCEACAMファミリーメンバーのクローニング、発現および精製
クローニング
CEACAM5の完全細胞外ドメイン(ECD)およびA3-B3ドメインに相当する配列を、合成し、pEAK8哺乳動物発現ベクター(Edge Biosystems、Gaithersburg、Md.)にサブクローニングした。ベクターを、改変して、C末端に、Avitag(商標)(Avidity、Denver Colo.)およびヘキサヒスチジンタグ、ヒトFC領域またはマウスFC領域のいずれかを導入した。構築物を、DNA配列決定によって検証した。組換え可溶性タンパク質の精製を、IMAC(固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィー)、FcXLまたはCaptureSelect(商標)IgG-Fc(ms) Affinity Matrix(Thermo Fisher Scientific)によって行った。
ヒトCEACAM1、3、4、5、6、7、8、18、19、20、21、およびカニクイザルCEACAM5およびCEACAM6の全長バージョンをコードするベクターも、PEAKおよび/またはCHO細胞の細胞表面での発現のために生成した。可溶性の全長ヒトCEACAM16も同様にクローニングした。
加えて、ヒトCEACAM5の以下のトランケートバージョンをコードするベクターも、PEAKおよび/またはCHO細胞の細胞表面での発現のために生成した:A1-B1-A2-B2-A3-B3;B1-A2-B2-A3-B3;A2-B2-A3-B3;B2-A3-B3;A3-B3。B3サブドメインは、ヒトCD86タンパク質の最初の140aaへの融合タンパク質として発現される。
発現
次いで、上記で言及したプラスミドを、Lipofectamine2000(Thermo Fisher Scientific)などのリポソーム系トランスフェクション試薬を使用して、哺乳動物細胞にトランスフェクトする。トランスフェクションステップは、ごく少量のDNAおよび細胞、典型的には、ウェルあたり4×10個の細胞および2μgのプラスミドDNAを必要とし、トランスフェクションを、6ウェルプレートで行った。異なる哺乳動物細胞系を使用することができるが、下記に示される実施例では、形質転換ヒト胎児腎臓単層上皮細胞(PEAK細胞)をトランスフェクトする。これらの細胞は、エピソーム複製プロセスをさらにサポートするEBNA-1遺伝子を安定に発現し、半接着性であり、標準的な細胞培養条件(5%のCO;10%のウシ胎仔血清が補充されたDMEM培地中、37℃)下で成長することができる。24時間後、細胞を、0.5~2μg/mLのピューロマイシンを含有する培地を追加することによって、選択的条件下に置く:エピソームベクターを保有する細胞は、この抗生物質に対して耐性である。
トランスフェクションの2~3週間後、増幅および選択された細胞を、産生ステップのための使い捨てCELLine(商標)バイオリアクター(Sigma Aldrich)に注入した。CELLine(商標)は、標準的な細胞培養インキュベーターにおいて使用することができる2区画バイオリアクターである。より小さな区画(15ml)は、細胞を含有し、10kDaのカットオフサイズを有する半透膜によって、より大きな(1リットル)培地を含有する区画から分離される(Bruceら 2002, McDonaldら 2005)。このシステムは、細胞および分泌タンパク質をより小さな区画に保持しながら、栄養素、ゲイズ(gazes)および代謝廃棄物の拡散を可能にする。培養物を、上清の回収前に、7~10日間維持する。培地は血清を含有するので、細胞は、良好な生存率を維持し、数回のプロダクションランを、同じ細胞および容器を使用して、行うことができる。
精製
回収後、細胞培養上清を、遠心分離によって清澄化する。次いで、上清に、100mMのイミダゾールを補充し、Ni-NTAアフィニティークロマトグラフィー樹脂(Qiagen)上にロードする。比較的高濃度のイミダゾールは、樹脂への夾雑物の結合を最小化する。カラムの洗浄後、タンパク質を、AKTA Primeクロマトグラフィーシステム(Cytiva)において、30mLのイミダゾール勾配(20~400mMのイミダゾール)を使用して、2mL/分の流量で溶出させる。溶出勾配は、組換えタンパク質の純度をさらに改善するが、クロマトグラフィーシステムが利用可能ではない場合、段階的溶出手法によって置き換えることができる。溶出した画分を、SDS-PAGEまたはELISAによって分析して、組換えタンパク質中のそれらの含有量を決定することができる。目的の画分をプールし、リン酸緩衝食塩水または別の適切な緩衝液で平衡化したAmicon(登録商標)10kDaカラム(Millipore)において脱塩する。次いで、脱塩されたタンパク質を、さまざまな技法を使用して定量することができ、それらの純度を、SDS-PAGEによって分析することができる。組換えタンパク質を、製造者の指示に従って、ビオチンリガーゼ(Avidity、Denver Colo.)を使用して、in vitroでビオチン化する。脱塩後、ビオチン化レベルを、ストレプトアビジン磁気ビーズを使用するプルダウンアッセイおよびSDS-PAGE分析によって評価する。
(実施例2)
固定された可変重ドメインを含有するヒトscFvライブラリーを使用するCEACAM5 Fvのファージディスプレイ選択
M13バクテリオファージ上にディスプレイされるヒトscFvライブラリーの構築および取り扱いについての一般的な手順は、その全体が参照により本明細書に組み込まれるVaughanら (Nat. Biotech. 1996, 14:309-314)に記載されている。選択およびスクリーニングのためのライブラリーは、同じVHドメインをすべて共有し、VLドメインにおいて単に多様化されるscFvをコードする。固定されたVHライブラリーの生成のための方法、ならびに二特異性抗体の同定およびアセンブリーのためのそれらの使用は、米国特許出願公開第2012/0184716号および国際公開第2012/023053号に記載されており、それらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。ヒトCEACAM5に結合するscFvを同定するための手順を、下記に記載する。
タンパク質選択
scFvファージライブラリーのアリコート(1012Pfu)を、ロータリーミキサーで、3%(w/v)のスキムミルクを含有するPBSで、室温で1時間、ブロッキングする。ブロッキングされたファージを、ロータリーミキサーで、室温で1時間、ストレプトアビジン磁気ビーズ(Dynabeads(商標)M-280)上で、選択解除する。選択解除したファージ(deselected phage)を、ロータリーミキサーで、ストレプトアビジン磁気ビーズ上に捕捉された100nMのビオチン化ヒトCEACAM5またはA3-B3ドメインのいずれかとともに、室温で2時間、インキュベートする。ビーズを、磁気スタンドを使用して捕捉し、続いて、PBS/0.1%のTween(登録商標)20で5回洗浄し、PBSで2回洗浄する。ファージを、ロータリーミキサーで、100nMのTEAにより、室温で30分間、溶出させる。溶出したファージおよびビーズを、Tris-HCl 1M pH7.4で中和し、10mlの指数関数的に成長しているTG1細胞(ファージディスプレイにおいて一般に使用されるE.coli株)に直接添加し、ゆっくりと振とうしながら(90rpm)、37℃で1時間、インキュベートする。感染したTG1のアリコートを、段階希釈して、選択アウトプットを力価測定する。残りの感染したTG1を、3800rpmで10分間スピンし、2mlの2xTYに再懸濁させ、2xTYAG(100μg/mlのアンピシリンおよび2%のグルコースを含有する2xTY培地)寒天バイオアッセイプレート上に広げる。30℃での終夜のインキュベーション後、10mlの2xTYをプレートに添加し、細胞を、表面からこすり取り、50mlのポリプロピレン管に移す。50%のグリセロール溶液を、細胞懸濁物に添加して、17%のグリセロールの最終濃度を得る。選択ラウンドのアリコートを、-80℃で保つ。
ファージレスキュー
先の選択ラウンドから得られた50μlの細胞懸濁物を、50mlの2xTYAGに添加し、0.3~0.5のOD600に達するまで、撹拌しながら(240rpm)、37℃で成長させる。次いで、培養物を、1.2×1011個のM13K07ヘルパーファージで超感染させ、37℃(90rpm)で1時間、インキュベートする。細胞を3800rpmで10分間遠心分離すること、培地を除去すること、およびペレットを50mlの2xTYAK(100μg/mlのアンピシリン;50μg/mlのカナマイシンを含有する2xTY培地)に再懸濁することによって、培地を交換する。次いで、培養物を、30℃(240rpm)で終夜、成長させる。翌日、ファージを含有する上清を、次の選択ラウンドのために使用する。
細胞表面選択
ファージを含有する上清を、ロータリーミキサーで、3%(w/v)のスキムミルクを含有するPBSで、室温で1時間、ブロッキングする。次いで、ブロッキングされたファージを、ヒトCEACAM5を発現しないMKN-45 CEACAM5KO細胞上で、1時間、選択解除する。選択解除したファージを、(PBS、3%のBSA、0.1%のNaNでブロッキングした)CEACAM5を発現する2×10個のMKN-45細胞とともに、穏やかに撹拌しながら、室温で2時間、インキュベートする。細胞を、ペレット化し、PBSで6回洗浄する。結合したファージを、76mMのクエン酸で溶出させ、10分間、振とうする。Tris-HCl 1M pH8での中和後、細胞を、10mlの指数関数的に成長しているTG1に直接添加し、ゆっくりと振とうしながら、37℃で1時間、インキュベートする。感染したTG1のアリコートを、段階希釈して、選択アウトプットを力価測定する。感染したTG1を、3800rpmで10分間スピンし、2mlの2xTY培地に再懸濁させ、2xTYAG寒天バイオアッセイプレート上に広げる。30℃での終夜のインキュベーション後、10mlの2xTYをプレートに添加し、細胞を、表面からこすり取り、50mlのポリプロピレン管に移す。50%のグリセロール溶液を、細胞懸濁物に添加して、17%のグリセロールの最終濃度を得る。選択ラウンドのアリコートを、-80℃で保つ。
(実施例3)
可溶性CEACAM5、CEACAM6およびCEACAM1へのscFv結合/非結合についてのスクリーニング
結合および機能試験のためのscFvペリプラズム調製
選択アウトプットからの個々の形質転換されたTG1クローンを、ウェルあたり0.9mlの2xTYAG培地(100μg/mlのアンピシリン、0.1%のグルコースを含有する2xTY培地)を含有するディープウェルマイクロタイタープレートに接種し、37℃で5~6時間、成長させる(240rpm)。次いで、2xTY培地中のウェルあたり100μlの0.2mMのIPTGを添加して、0.02mMのIPTGの最終濃度を得る。プレートを、240rpmで振とうしながら、30℃で終夜、インキュベートする。ディープウェルプレートを、3200rpmで、4℃で10分間、遠心分離し、上清を、注意深く除去する。ペレットを、150μlのTES緩衝液(50mMのTris-HCl(pH8)、1mMのEDTA(pH8)、20%のスクロース、完全プロテアーゼ阻害剤、Rocheを補充)に再懸濁させる。低張ショックを、150μlの希釈TES緩衝液(1:5のTES:水希釈)を添加すること、および氷上での30分間のインキュベーションによって生じさせる。プレートを、4000rpmで、4℃で10分間、遠心分離して、細胞および残屑をペレット化する。上清を、別のマイクロタイタープレートに注意深く移し、機能アッセイまたは結合アッセイですぐに試験するために、氷上で保つ。
結合
CEACAM5への結合についてのscFvのスクリーニングを、CellInsight(商標)技術を使用して、ホモジニアスアッセイにおいて試験する。以下の試薬を、384透明底ウェルプレート(Corning)のそれぞれウェル中で混合する:ビオチン化CEACAM5、ビオチン化ドメインA3-B3または対照タンパク質のためのビオチン化NusAのいずれかでコーティングされた30μlのストレプトアビジンポリスチレンビーズ懸濁物(Polysciences;3000個ビーズ/ウェル);60μlのブロッキングされたscFvペリプラズム調製物;10μlの検出緩衝液(5μg/mlのマウス抗c-myc抗体;1:200希釈された抗マウスFc AlexaFluor(登録商標)647を含有するPBS)。600rpmで5分間混合した後、384ウェルプレートを、室温でインキュベートし、2時間後、CellInsight(商標)CX5 High-Content Screeningプラットフォーム(ThermoFisher Scientific)において読み取る。NusAではなくCEACAM5に特異的なシグナルを与えるscFvを発現するクローンを、さらなる分析または配列決定のために選択する。
CEACAM1、CEACAM6および他のCEACAMへの結合を、同じ様式で測定することができる。
クローン配列決定
単一クローンを、ウェルあたり1mlのLBAG培地(100μg/mlのアンピシリンおよび2%のグルコースを有するLB培地)を含有する96ディープウェルマイクロタイタープレートに接種し、300rpmで、37℃で終夜、成長させる。DNAを、Zyppy-96 Plasmid Miniprepキット(Zymo Research)を使用して抽出し、配列決定する。
(実施例4)
固定されたVH候補のIgGへの再フォーマット化および哺乳動物細胞における一過性発現
スクリーニングおよび配列決定の後、所望の結合特性を有するscFv候補を、IgGに再フォーマットし、PEAK細胞への一過性トランスフェクションによって、発現させる。選択されたscFvのVHおよびVL配列を、特定のオリゴヌクレオチドを用いて増幅し、重鎖および軽鎖定常領域を含有する発現ベクターにクローニングし、構築物を、配列決定することによって検証する。発現ベクターを、製造者の指示に従って、Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific)を使用して、哺乳動物細胞にトランスフェクトする。簡潔には、4×10個のPEAK細胞を、T75フラスコにおいて、ウシ胎仔血清を含有する25mlの培養培地中で培養する。トランスフェクトされた細胞を、37℃で5~6日間培養し、IgG産生を、Octet RED96装置を使用して定量する。上清を、製造者の指示に従って、FcXLアフィニティー樹脂(Thermo Fisher Scientific)において、IgG精製のために回収する。簡潔には、トランスフェクトされた細胞からの上清を、適切な量のFcXL樹脂とともに、4℃で終夜、インキュベートする。PBSによる樹脂の洗浄後、試料を、Amicon Proカラムにロードし、その後、IgGを、50mMのグリシンpH3.5で溶出させる。次いで、溶出したIgG画分を、ヒスチジンNaCl pH6.0緩衝液に対して、Amicon 50kDaによって透析し、IgG含有量を、280nmでの吸収によって定量する。純度およびIgG完全性を、製造者の指示に従って、Agilent Bioanalyzer 2100を使用する電気泳動によって検証する(Agilent Technologies、Santa Clara、Calif.、USA)。
(実施例5)
CEACAM5モノクローナル抗体の特性評価
a)抗CEACAM5アームのCEACAMファミリーの異なるメンバーでトランスフェクトされた細胞への結合
二価mAbまたは一価bsAbとして試験される抗CEACAM5抗体アームの特異性を、CEACAMファミリーの異なるメンバーでトランスフェクトされたPEAKおよび/またはCHO細胞を使用して、フローサイトメトリーによって示す。
ヒトCEACAM1、3、4、5、6、7、8、18、19、20および21および20の全長バージョンをコードするベクターを使用して、実施例1に記載されているように、PEAKおよび/またはCHO細胞の表面でこれらのタンパク質を発現させる。同様に、カニクイザルCEACAM5および6の全長バージョンをコードするベクターも使用して、PEAKおよび/またはCHO細胞の表面でこれらのタンパク質を発現させる。トランスフェクトされていないPEAKおよび/またはCHO細胞を、陰性対照として使用する。細胞を、回収し、カウントし、生存率についてチェックし、FACS緩衝液(PBS 2%のBSA、0.1%NaN)中に3×10個細胞/mlで再懸濁させる。100μlの細胞懸濁物を、V底96ウェルプレートに分配する(3×10個細胞/ウェル)。上清を、1300rpm、4℃で3分間の遠心分離によって除去し、細胞を、漸増濃度の本発明による抗体とともに、4℃で15分間、インキュベートする。試験するための抗CEACAM5アームを持つ抗体を、FACS緩衝液に希釈し、濃度範囲は、30pM~500nMである。細胞を、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、適合性抗ヒトIgG二次抗体とともに、4℃でさらに15分間、再インキュベートする。細胞を、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、1:1500希釈されたTOPRO-3(Invitrogen)を有する300μlのFACS緩衝液に再懸濁させる。蛍光を、FACSCalibur(商標)(BD Biosciences)またはCytoflex Platform(Beckman Coulter)を使用して、測定する。用量反応結合曲線を、GraphPad Prism8ソフトウェアを使用して、フィットさせる。同じ様式で、CEACAM1、CEACAM6および他のCEACAMを特性評価することができる。
実施例1および5aに記載される実験手順を使用することによって得られた結果を、表2および3に示す(10mcg/mlの全サイズの抗体で試験した;BiTE MEDI-565を等モル濃度で試験した)。二特異性抗体のAB17L3-1/N、AB71L3-1/N、AB72L3-1/N、AB73L3-1/Nについて、CEACAM5がトランスフェクトされた細胞への結合について測定されたMFIは、29000~41000に見出された(表2)。対照的に、CEACAM1、3、4、6、8でトランスフェクトされたPEAK細胞を使用することによって見出されたMFIは、CEACAM8がトランスフェクトされた細胞におけるAB72L3-1/Nについての強いシグナルのみを除き、1000を下回ることが見出された。任意の所与のCEACAMを発現するトランスフェクトされた細胞において得られたMFI値をWT PEAK細胞において得られた値によって割る場合、「PEAK WTに対する倍数」を計算することができる(表3)。AB72L3-1/Nを除いて、本発明の抗体は、「PEAK WTに対する倍数」値がすべて2.0を下回るので、すべてCEACAM5に特異的である。対照的に、MEDI-565 BiTEは、CEACAM8について2よりも高い「PEAK WTに対する倍数」を示し、そのようなCEACAMファミリーメンバーに対する交差反応性を示唆する。これは、上記で既に言及したように、ヒト好中球が表面上でCEACAM8を発現するので、例えば、好中球の殺滅を引き起こし得る。
表2 PEAK細胞における一過性発現したCEACAMxへの結合[MFI]
表3 PEAK細胞における一過性発現したCEACAMxへの結合[PEAK WTに対する倍数]
b)酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)におけるCEACAM5モノクローナル抗体の組換えタンパク質への結合
ビオチン化組換えヒトCEACAM5タンパク質を、ストレプトアビジンでコーティングされた96ウェルマイクロプレートにおいて、0.5μg/mLで捕捉する。プレートを洗浄し、本発明のモノクローナル抗TAA二価抗体を、幅広い濃度範囲(例えば、5×10-4~1μg/mL)で添加し、1時間の間、インキュベートする。プレートを洗浄し、結合した抗体を、抗ヒトIgG(Fc)-HRP(Jackson ImmunoResearch)で検出する。洗浄後、プレートを、Amplex Red(登録商標)試薬(Molecular Probes)で明らかにする。蛍光シグナルを、Synergy HTプレートリーダー(Biotek)において測定する。
CEACAM1およびCEACAM6などの他の組換えCEACAMファミリーメンバーへの結合を、同様に評価することができる。結合結果を、それぞれ、1B4 mAbおよびC11 mAbについて、図8および9に示す。
c)参照抗体との競合による本発明の抗体のエピトープビニング
エピトープビニングは、例えば、標的タンパク質に対する新たなモノクローナル抗体の結合を特性評価するために使用される競合イムノアッセイである。標的タンパク質に結合する新たな抗体の競合ブロッキングプロファイルを、この標的タンパク質にも結合し、結合エピトープが既に確立/公開されている抗体について作出する。これらの参照抗体の1つとの競合は、新たな抗体が、同じまたは近い場所にあるエピトープを有し、それらが一緒に「ビニング」されることを示す。
CEACAM5参照抗体と競合する本発明のCEACAM5 mAbの能力を、マウスFc領域を持つ以下の参照抗体を用いた組換えヒトCEACAM5についてのELISAによって試験する:SM3E、米国特許出願公開第20050147614A1号特許に記載されているsm3Eに由来するmAb;MEDI、国際公開第2016036678A1号特許に記載されているMEDI-565に由来するmAb;SAR、欧州特許出願公開第3199552A1号特許に記載されているMab2_VLg5VHg2に由来するmAb;CH1A1A、米国特許出願公開第20120251529号特許およびKleinら in Oncoimmunology, 2017 Jan 11;6(3)に記載されているCH1A1A-2F1に由来するmAb;ヒト化T84.66、国際公開第2017055389号特許に記載されているバリアント1に由来するmAb;LAB、米国特許出願公開第2002/0165360A1号特許に記載されているhMN14に由来するmAb。
SM3Eは、例えば、CEAのN末端の細胞膜遠位部分により多く結合し、MEDIは、中央部分に結合し、CH1A1Aは、膜の近くに結合する。
ビオチン化ヒトCEACAM5を、ストレプトアビジンでコーティングされた96ウェルプレートに、0.5μg/mlでコーティングし、10μg/mlの参照mAbまたはマウスFc領域を持つ無関係なmAbとともに、1時間インキュベートする。本発明のCEACAM5 mAb(二価モノクローナル抗CEA抗体を意味する)を、0.2μg/mlで、室温で1時間、添加する。プレートを洗浄し、結合したCEACAM5 mAbを、抗ヒトIgG(Fc)-HRP(Jackson ImmunoResearch)で検出する。洗浄後、プレートを、Amplex(登録商標) Red試薬で明らかにする。蛍光シグナルを、Synergy HTプレートリーダー(Biotek)において測定する。
CEACAM5 mAbで見出された結果に基づいて、本発明による誘導されたCEAxCD3は、ツール抗体の添加ありおよびなしの結果を比較する場合にCEACAM5への結合が80%より大きく低減される場合、参照抗体と競合すると考えられる。CEAxCD3抗体は、ツール抗体の添加ありおよびなしの結果を比較する場合にCEACAM5への結合が20%未満、低減される場合、ツール抗体と非競合として同定される。図1は、実施例5cにおいて使用された参照抗体の結合領域を、模式的な方法で示す。
d)トランケート型のCEACAM5を使用する本発明の抗体が結合するCEACAM5ドメインの決定
その細胞外サブドメインの1つまたは複数を欠くトランケート型のCEACAM5を使用して、本発明の抗体が結合するサブドメインを決定することができる。
ヒトCEACAM5の全長バージョン(その細胞外ドメインをすべて含有する、すなわち、N-A1-B1-A2-B2-A3-B3)をコードするベクター、およびCEACAM5の細胞外ドメインのサブセット(A1-B1-A2-B2-A3-B3;B1-A2-B2-A3-B3;A2-B2-A3-B3;B2-A3-B3;A3-B3およびB3)のみをコードするベクターを使用して、実施例1に記載されるように、PEAKおよび/またはCHO細胞の表面でこれらのタンパク質を発現させる。トランスフェクトされていないPEAKおよび/またはCHO細胞を、陰性対照として使用する。フローサイトメトリー染色および取得を、実施例5のサブセクションa)に記載されるようにして行う。
本発明による抗体は、結合した抗体がPEコンジュゲート化抗ヒトIgG Fc二次抗体によって検出される場合に、所与のトランケートされたCEACAM5タンパク質に結合するものとして見出される。
(実施例6)
ラムダおよびカッパ軽鎖を持つ二特異性抗体の発現および精製
同じ細胞中の1つの重鎖および2つの軽鎖の同時発現は、3つの異なる抗体のアセンブリーをもたらすことができる。同時発現は、共発現される鎖の1つを発現する複数のベクターのトランスフェクション、または複数の遺伝子発現を駆動するベクターを使用することによるなどの異なる方法で、達成することができる。異なる抗CEACAM5抗体をコードするベクターを、抗CD3抗体の重鎖および軽鎖を発現する別のベクターと共トランスフェクトする。あるいは、それらのそれぞれが、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2012/0184716号および国際公開第2012/023053号に記載されるようにして、2つの軽鎖を、1つの重鎖、1つのカッパ軽鎖および1つのラムダ軽鎖の共発現を可能にするように以前に生成されたベクターpNovi κHλにクローニングする。3つの遺伝子の発現を、ヒトサイトメガロウイルスプロモーター(hCMV)によって駆動し、ベクターは、安定細胞系の選択および樹立を可能にするグルタミンシンテターゼ遺伝子(GS)も含有する。抗CEACAM5 IgGおよび抗CD3 IgGの共通VHおよびVL遺伝子を、哺乳動物細胞における一過性発現のために、ベクターpNovi κHλにクローニングする。Expi293細胞を、適切な数の細胞および培養培地体積を有する適切なエルレンマイヤーフラスコ中、懸濁培養する。プラスミドDNAを、最後に、PEIを使用して、Expi293細胞にトランスフェクトする。トランスフェクト細胞の上清中の抗体濃度を、産生の間、Octet RED96を使用して測定する。抗体濃度に従って、上清を、トランスフェクションの5~7日後に回収し、1300gで10分間遠心分離することにより清澄化する。精製は、3ステップの精製プロセスに基づく。最初に、CaptureSelect(商標)FcXLアフィニティーマトリックス(Thermo Fisher Scientific)を、PBSで洗浄し、次いで、清澄化された上清中に添加する。+4℃および20rpmでの終夜のインキュベーション後、上清を2000gで10分間、遠心分離し、フロースルーを保存し、樹脂をPBSで2回洗浄する。次いで、樹脂を、Amicon Proカラムに移し、pH3.0の50mMのグリシンを含有する溶液を、溶出のために使用する。いくつかの溶出画分を、生成し、Tris-HCl pH7.4で中和し、プールする。総ヒトIgGを含有するプール(二特異性および2つの単一特異性の抗体)を、Nanodrop分光光度計(NanoDrop Technologies、Wilmington、Del.)を使用して定量し、次いで、適切な体積のCaptureSelect(商標)KappaXLアフィニティーマトリックス(Thermo Fisher Scientific).GE Healthcare)とともに、20rpmで、室温で30分間、インキュベートする。樹脂の回収および洗浄、溶出、ならびに中和ステップを、先に記載されるようにして行う。最後のアフィニティー精製ステップを、カッパ精製ステップについてと同じプロセスを適用して、CaptureSelect(商標)ラムダFabアフィニティーマトリックス(Thermo Fisher Scientific)を使用して行う。すべての溶出画分を、プールし、50kDaのAmicon超遠心分離フィルターユニット(Merck Millipore)を使用して、His-NaCl pH6製剤緩衝液に対して脱塩する。最終産物を、Nanodropを使用して、定量する。
精製された二特異性抗体を、製造者(Agilent Technologies、Santa Clara、Calif.、USA)によって記載されるようにして、Agilent 2100 BioanalyzerとProtein 80キットを使用して、変性および還元条件下での電気泳動によって分析する。4μLの精製された試料を、ジチオスレイトール(DTT;Sigma Aldrich、St.Louis、Mo.)が補充された試料緩衝液と混合する。試料を、95℃で5分間加熱し、次いで、チップにロードする。すべての試料を、Limulus Amebocyte Lysate試験(LAL;Charles River Laboratories、Wilmington、Mass.)を使用して、エンドトキシン混入について試験する。
(実施例7)
一価および二特異性抗体のin vitro特性評価
a)一価および二特異性抗体のCEACAM5を発現する細胞およびCEACAM5を発現しない細胞への結合
CD3xCEACAM5κλ抗体の標的細胞への結合を実証するために、CD3xCEACAM5κλ抗体の結合をそれらの一価対応物と比較するフローサイトメトリーに基づく一連の実験を行うことができる。使用され得る細胞の例は、胃腺癌細胞系MKN45(細胞あたり155,000個のCEACAM5分子を発現する)または膵臓腺癌細胞系HPAF-II(細胞あたり108,000個のCEACAM5分子を発現する)または結腸直腸腺癌細胞系LS174T(細胞あたり26,000個のCEACAM5分子を発現する)などのCEACAM5陽性細胞系、ならびに肺癌細胞系A549およびCRISPR-CAS9方法論によって生成されたMKN45 CEACAM5ノックアウト細胞系などのCEACAM5陰性細胞系を含む。細胞染色および結合評価を、上記に記載されるようにして行うことができる。得られた結合曲線を、図4、5、11および14に示す。EC50値を、MKN45細胞への結合について、GraphPad Prism8を使用して計算することができ、データを表4に示す。200nM、1000nMおよび5000nMでの本発明のbsAbの結合は、TCB2014の結合と比較して、40%およびそれよりも高い(表4、また図11および14を参照されたい)。
表4: MKN-45細胞に対する結合EC50。N/A:該当せず
b)一価および二特異性抗体のCD3を発現する細胞およびCD3を発現しない細胞への結合
CD3xCEACAM5κλ抗体のエフェクターT細胞への結合を実証するために、CD3xCEACAM5κλ抗体の結合をそれらの一価対応物と比較するフローサイトメトリーに基づく一連の実験を行うことができる。使用され得る細胞の例は、ヒト初代T細胞、およびCD3陽性(Jurkatおよび/またはHuT 78)またはCD3陰性(TIB-153および/またはJKT-ベータ-del)細胞系を含む。細胞染色および結合評価を、上記に記載されるようにして行うことができる。結果を図3および10に示す。
c)参照抗体との競合によるCEACAM5抗体のエピトープビニング
エピトープビニングは、本発明による抗体の結合、または、例えば、第1の結合部分の関連抗CEA(標的タンパク質)抗体の結合を特性評価するために使用される競合イムノアッセイである。標的タンパク質に結合する抗体の競合ブロッキングプロファイルを、この標的タンパク質にも結合し、結合エピトープが既に確立/公開されている抗体に対して作出する。これらの参照抗体の1つとの競合は、抗体が、同じまたは近い場所にあるエピトープを有し、それらが一緒に「ビニング」されることを示す。抗CEACAM5参照抗体と競合する本発明の二特異性抗体の部分である抗CEACAM5アームの能力を、組換えヒトCEACAM5およびマウスFc領域を持つ以下の参照抗体を用いてELISAによって試験する:SM3E、米国特許出願公開第20050147614A1号特許に記載されているSM3Eに由来するmAbの配列、標準的な方法を使用して産生されたmAb;MEDI、国際公開第2016036678A1号特許に記載されているMEDI-565に由来するmAb;CH1A1A、米国特許出願公開第20120251529号特許およびKleinら in Oncoimmunology, 2017 Jan 11;6(3)に記載されているCH1A1A-2F1に由来するmAb。SM3Eは、CEAのN末端の細胞膜遠位部分により多く結合し、MEDIは、中央部分に結合し、CH1A1Aは、膜の近くに結合する。
1μg/mlで使用されるκλボディを、96ウェル黒色マイクロプレートに10μg/mlでコーティングされたヤギ抗ヒトIgG(Fcγ)(Jackson ImmunoResearch)によって捕捉し、ブロッキング緩衝液(PBS 2%のBSA、0.05%のTween(登録商標) 20)でブロッキングする。競合相手のIgG(0.03~20μg/ml)を、ブロッキング緩衝液中の0.1μg/mlのビオチン化ヒトCEACAM5とともに、1時間、プレインキュベートする。κλボディのプレートを、洗浄し、プレインキュベートされた競合相手のIgG/CEACAM5混合物とともに、1時間、インキュベートする。洗浄後、CEACAM5を、ストレプトアビジン-HRP(Jackson ImmunoResearch)を用いて検出する。プレートを、Amplex(商標)Red試薬(Molecular Probes)で明らかにし、蛍光シグナルを、Synergy HTプレートリーダー(Biotek)において測定する。
CEACAM5のκλボディへの結合が、それぞれのツール抗体によって80%またはそれよりも大きく低減される場合、CEAxCD3二特異性抗体が、ツール抗体と競合的に結合するように分類されると結論付けることができる。したがって、CEAxCD3抗体は、CEACAM5のそれぞれのκλボディへの結合が、ツール抗体の添加ありおよびなしの結果を比較する場合に20%またはそれ未満、低減される場合、ツール抗体と非競合として同定される。
d)二特異性抗体の初代ヒト血液細胞への結合
CD3xCEACAM5κλ抗体の、初代T細胞への結合、ならびに初代B細胞および単球(CEA陰性集団)への結合の欠如を実証するために、フローサイトメトリーに基づく一連の実験を行うことができる。細胞染色および結合評価を、実施例7aに記載されるようにして行うことができる。データを図13に示す。
(実施例8)
二特異性抗体によって媒介されるT細胞依存性細胞傷害(TDCC)
a)CEACAM5陽性およびCEACAM5陰性の細胞系のTDCC
本発明のCEAxCD3二特異性抗体によって誘導される異なるCEACAM5陽性およびCEACAM5陰性の腫瘍細胞系のT細胞依存性細胞傷害(TDCC)を、エフェクター細胞としてヒトPBMCまたは精製された初代T細胞のいずれかを使用して、評価する。
標的細胞を、PBSでの2回の洗浄後、トリプシンまたは細胞解離溶液で脱離させる。遠心分離ステップ後、細胞を、アッセイ媒体に再懸濁させ、必要な濃度に調整し、96ウェルプレートに蒔く。
エフェクター細胞は、ヒト末梢血単核細胞(PBMC)または精製されたT細胞のいずれかであり得る。PBMCは、SepMate(商標)チューブ(Stemcell Technologies)とLymphoprep(商標)緩衝液(Stemcell Technologies)とを使用して、健康なヒトドナーから得られたバフィコートから単離される。精製されたT細胞をエフェクター細胞として使用する場合、追加の精製ステップを行い、ここで、T細胞は、T細胞免疫磁気陰性選択キット(STEMCELL Technologies)の使用により、PBMCから負に単離される。
TDCCアッセイのために、PBMCをエフェクター細胞として使用する場合、これらを10:1の最終E:T比で標的細胞に添加し、精製されたT細胞を使用する場合、5:1の最終E:T比を使用する。次いで、本発明のCEAxCD3抗体および関連対照抗体を、用量範囲の濃度(最大で100nM、二連)で、事前に蒔かれた標的細胞およびエフェクター細胞に添加する。標的細胞殺滅を、37℃、5%のCOでの24時間、48時間または72時間のいずれかのインキュベーション後に、アポトーシス/壊死細胞(Cytotoxicity Detection KitPLUS (LDH)、Roche)により媒体に放出されたLDHを定量することによって、評価する。最大LDH放出(=100%溶解)を、1%のTriton(登録商標) X-100とともに標的細胞をインキュベートすることによって得た。自然LDH放出(=0%溶解)は、添加されるいかなる抗体もなしで、エフェクター細胞と共培養された標的細胞を指す。TDCC曲線(図6、7、12および15)およびEC50値(表5)を、MKN-45およびLS174T細胞系について、GraphPad Prism8を使用して計算することができ、表5に示される本発明のbsAbで見出されたEC50が、TCB2014で測定されたEC50よりも有意に低く、これらの本発明のbsAbのin vitro腫瘍細胞殺滅についてのより高い効力を実証する。
表5 3つのCEA+細胞系の殺滅EC50
b)CEAxCD3およびCEAxCD47二特異性抗体の組合せによる殺滅アッセイ
本発明の二特異性抗体と抗CD47 mAb(例えば、米国特許出願公開第20140140989号および国際公開第2017196793号に記載)との、またはCEAxCD47二特異性抗体(国際出願第PCT/IB2019/054559号に記載、参照により本明細書に組み込まれる)との組合せを、上記に記載されるモデルにおいて試験することができる。追加の試験条件を、実験設計に追加し、ここで、そのようなCD47標的化抗体(単一または二特異性)を、単独で、または本発明のCEAxCD3抗体との組合せのいずれかで、異なる用量で、使用する。
c)CEAxCD3 bsAbによって誘導されるCEAを発現する腫瘍細胞の殺滅におけるT細胞活性化マーカーの上方調節
CEAxCD3 bsAbによって誘導されるCEA陽性腫瘍細胞の殺滅は、T細胞の活性化を必要とし、これは、CD69(早期活性化マーカー)またはCD25(後期活性化マーカー)などの特異的T細胞活性化マーカーを認識する抗体を使用して、フローサイトメトリーによって定量することができる。
殺滅アッセイ(上記の実施例8aに記載)の最後でのT細胞の活性化状態を評価するために、以下の手順を続ける:浮遊細胞(CD4+およびCD8+T細胞の両方を含む)を、新たなV底96ウェルプレート中に移す。上清を、遠心分離(4℃で3分間、1300rpm)によって除去し、細胞を、冷FACS緩衝液(PBS 2%のBSA、0.1%のNaN)で2回洗浄した後、Fc-ブロック試薬(BD Biosciences)とともに、4℃で15分間、インキュベートする。FACS緩衝液で2回洗浄した後、細胞を、以下の抗体とともに、4℃で15分間、インキュベートする(製造者の推奨に従って使用):抗CD45(V500コンジュゲート化、BD Biosciences)、CD69(FITCコンジュゲート化、Biolegend)、CD8(PerCP-Cy5.5コンジュゲート化、Biolegend)、CD25(PEコンジュゲート化、Biolegend)、CD4(APCコンジュゲート化、ThermoFisher)、CD3(APC-R700コンジュゲート化、BD Biosciences)。
細胞を、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、200μlのFACS緩衝液に再懸濁させる。蛍光を、Cytoflex Platform(Beckman Coulter)を使用して測定し、データを、FlowJo(商標)v10ソフトウェア(BD Life Sciences)を使用して分析する。結果を図17に示す。
d)CEAxCD3 bsAb分子によって誘導されるT細胞増殖
CEAxCD3 bsAbを、CEA陽性腫瘍標的細胞の存在下での架橋の際にT細胞増殖を誘導するそれらの能力について分析する。陰性対照として、CEA陰性悪性細胞を、同様に使用する。新鮮な単離されたヒトPBMCを、温PBSで、1mLあたり100万個細胞に調整し、PBS中の0.2μMのカルボキシルフルオレセインジアセテートスクシンイミジルエステル(CFSE、ThermoFisher Scientific)で、37℃で15分間、染色し、完全RPMI培地(10%のFCS、2mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、10mMのHEPES、50μMの2-メルカプトエタノールおよび25μg/mLのゲンタマイシンを含有する)で数回洗浄し、96ウェルプレートに、1mLあたり2×10個細胞で移す。0.02×10個の標的細胞を、平底96ウェルプレートのウェルごとに蒔き、異なるCEAxCD3 bsAbを、示された濃度で添加する。CFSE標識PBMCを、10:1の最終E:T比を得るために添加し、アッセイプレートを、加湿インキュベーター中、37℃で5日間、インキュベートする。5日目に、エフェクター細胞を回収し、FACS緩衝液(PBS、2%のBSA、0.1%のNaN)で2回洗浄し、次いで、細胞を、死細胞を排除するBD Horizon 620(BD Biosciences、564996)、ならびに抗CD45(V500コンジュゲート化、BD Biosciences)、抗CD4-APC(ThermoFischer、17-0049-41)および抗CD8-PerCP-Cy5.5(Biolegend、301032)で染色する。CFSE染色を、生CD4またはCD8細胞において、CytoFLEX(Beckman Coulter)を使用して、フローサイトメトリーによって分析し、結果を、FlowJoソフトウェアによって評価する。
e)CEAxCD3 bsAbによって誘導されるCEAを発現する腫瘍細胞の殺滅の際に上清中に放出されたサイトカイン
CEAxCD3 bsAbによって誘導されるCEA陽性腫瘍細胞の殺滅は、T細胞活性化を必要とする。活性化の際に、T細胞は、免疫モジュレート剤としてさらに作用し得る複数のサイトカインを放出することができる。CEAを発現する腫瘍細胞の殺滅の際にT細胞によるサイトカイン放出を誘導する本発明の二特異性抗体の能力を、実施例8aに記載されるTDCCアッセイの最後に、上清中の選択されたサイトカインを定量することによって評価した。CEA陽性標的細胞およびCD3陽性エフェクターT細胞の共培養の2日後に、培養上清を、遠心分離によって回収し、さらなる分析まで-80℃で凍結保存した。グランザイムB、IL2、IL6、IL10、TNFαおよびIFNγなどのサイトカイン/酵素を、マルチプレックスキットを使用することによる、Mesoscale Discovery Platformを使用して定量し、結果を図16に示す。
f)脱落CEAの存在下でのCEACAM5陽性細胞のTDCC
CEA陽性腫瘍は、CEAを脱落させることが公知である。そのような脱落CEAは、膜結合CEAに優先的に結合しないCEA標的化抗体の抗腫瘍有効性に負の影響を与え得る。本発明の二特異性抗体が、脱落CEA(sCEA)によって影響を受けるかどうかを評価するために、実施例8aに記載されるT細胞依存性細胞傷害(TDCC)アッセイを、様々な濃度のスパイクされたsCEA(BioRad# PHP282)の存在下で行う。次いで、sCEAの存在下でのEC50値を、sCEAの非存在下で得られたEC50と比較する(表6)。次いで、所与のsCEA濃度(0.2、1または1μg/mL)について計算されたEC50を、sCEAの非存在下(0μg/mL)で得られたものと比較し、脱落CEAなしの条件と比較したEC50の倍数変化として表す。そのような値を表7に報告する。
表6 sCEAの存在下でのLS174T細胞の殺滅のEC50
*トッププラトーなし
表7 脱落CEAなし条件と比較したEC50の倍数変化(0 μg/mL)
*トッププラトーなし
1および5μg/mLのsCEAで、本発明の二特異性抗体と比較して、TCB2014およびTCB2017に、sCEAが添加される場合に、腫瘍細胞殺滅についてのEC50の有意なより高いシフトが見出された。1μg/mLおよびそれを上回るsCEAの濃度が、CEA陽性腫瘍を有する患者において見出される。本発明のbsAbの殺滅曲線のsCEAに起因するより低いシフトは、TCB2014およびTCB2017と比較して、本発明のbsAbの有効性に対する高sCEAレベルの影響をあまり阻害しないことを示唆する。
g)CEACAM5陰性初代血液細胞集団のTDCC
CEAxCD3二特異性抗体の作用機構を考えると、他のCEACAMとの交差反応性は、重要な循環する健康な細胞集団の枯渇をもたらし得る。例えば、好中球によって発現されるCEACAM8との交差反応性は、そのような細胞集団の枯渇をもたらし得る。結合の非存在、したがって、そのようなCEA陰性の循環する健康な細胞集団の殺滅の非存在を確認するために、好中球などの精製された初代細胞を、実施例8aに記載される実験手順におけるCEA陽性細胞系の代わりに「標的細胞」として使用する。
(実施例9)
ヒト化マウス腫瘍モデルにおける、単剤としてまたはCD47標的化抗体との併用療法におけるCEAxCD3 T細胞再標的化分子の抗腫瘍活性の評価
a)PBMCヒト化マウス腫瘍モデルにおけるCEAxCD3分子の抗腫瘍活性
8~10週齢のNOGマウス(NOD/Shi-scid/OL-2Rγnullマウス、Taconic Biosciences)に、1~5×10個のCEA陽性腫瘍細胞(細胞系由来または患者由来)を皮下に(s.c.)移植し、いくつかの処置群に無作為化する。4~7日後、すべてのマウスに、ヒト化プロセスのために、i.p.またはi.v.で、10×10個または20×10個のヒトPBMC(末梢血単核細胞)を注射する。次いで、CD3xCEA分子または対照を、異なる用量で、PBMC注射の3~6日後に開始して、週に1回または2回、i.v.投与する。マウスを、腫瘍の発生について、週に3回、モニターし、腫瘍を、実験のエンドポイント(腫瘍体積=1500mmまたはGvHD症状の発症)まで、デジタルキャリパーによって測定する。腫瘍体積を、式(長さ×幅)×0.5を使用して、計算する。統計分析を、研究の最後に、一元配置分散分析の比較分析を使用して行う。100万個のHPAF-II細胞をNOGマウスにおいて皮下に生着させ、その後1000万個のヒトPBMCを注射した実験からの結果を、図19に示す。
b)CD34ヒト化マウス腫瘍モデルにおけるCEAxCD3分子の抗腫瘍活性
14週齢の血液中に>25%のヒトCD45細胞を有する完全ヒト化CD34-huNOGマウス(CD34生着(engrafted)NOD/Shi-scid/OL-2Rγnullマウス、Taconic Biosciences)に、1~5×10個のCEA陽性腫瘍細胞(細胞系由来または患者由来)を皮下(s.c.)移植し(implanted)、いくつかの処置群に無作為化する。平均腫瘍体積が、所定の値(100~200mmの範囲)に達したときに、CD3xCEA分子または対照を、異なる用量で、週に1回または2回、i.v.投与する。マウスを、腫瘍成長について、週に3回、モニターし、腫瘍を、実験のエンドポイント(腫瘍体積=1500mm)まで、デジタルキャリパーによって測定する。腫瘍体積を、式(長さ×幅)×0.5を使用して、計算する。統計分析を、研究の最後に、一元配置分散分析の比較分析を使用して行う。
c)ヒト化マウス腫瘍モデルにおけるCD47標的化抗体(単一特異性または(of)二特異性)と組み合わせたCEAxCD3分子の抗腫瘍活性
本発明の二特異性抗体と抗CD47 mAb(例えば、米国特許出願公開第20140140989号および国際公開第2017196793号に記載)またはCEAxCD47二特異性抗体(国際出願第PCT/IB2019/054559号に記載、参照により本明細書に組み込まれる)との組合せを、上記に記載されるモデルにおいて試験することができる。CD47標的化抗体(単一特異性または二特異性)が、さまざまな用量で、単独または本発明のCEAxCD3抗体と組み合わせてのいずれかで、毎週1回または2回、i.v.投与される処置群を含む追加群を実験設計に追加する。
d)トランスジェニックマウス腫瘍モデルにおけるCD47標的化抗体(単一特異性または(of)二特異性)と組み合わせたCEAxCD3分子の抗腫瘍活性
本発明の二特異性抗体と抗CD47 mAb(例えば、米国特許出願公開第20140140989号および国際公開第2017196793号に記載)またはCEAxCD47二特異性抗体(国際出願第PCT/IB2019/054559号に記載、参照により本明細書に組み込まれる)との組合せを、ヒトCEAおよびヒトCD47を発現するように操作された0.5~5×10個マウス腫瘍細胞を皮下に(s.c.)移植された、ヒトCD3、ヒトCD47およびヒトSIRPαを発現するように操作されたトランスジェニックマウスにおいて試験することができる。平均腫瘍体積が、所定の値(100~200mmの範囲)に達したときに、マウスを無作為化する。処置を、異なる用量で、週に1回または2回、i.v.投与する。マウスを、腫瘍成長について、週に3回、モニターし、腫瘍を、実験のエンドポイント(腫瘍体積=1500mm)まで、デジタルキャリパーによって測定する。腫瘍体積を、式(長さ×幅)×0.5を使用して、計算する。統計分析を、研究の最後に、一元配置分散分析の比較分析を使用して行う。
(実施例10)
健康なヒトドナーのヒト血液由来の全血およびPBMCにおいて試験されるサイトカイン放出
in vitroサイトカイン放出アッセイを、水性状態(aqueous presentation)中の試験抗体(95%v/v血液)による最小希釈の全血(WB CRA)を使用して行う。このアッセイフォーマットは、サイトカイン放出の機構に影響を与え得る生理学的濃度で因子を含有する、in vivo環境を厳密に模倣すると考えられる。しかしながら、このフォーマットは、T細胞媒介性サイトカイン放出(例えば、抗CD28)を予測するのに不十分であると考えられる。
あるいは、サイトカイン放出アッセイを、T細胞媒介性サイトカイン放出(PBMC AP CRA)を評価するために、健康なヒトドナー由来の末梢血単核細胞(PBMC)を使用して、水性状態(水相、AP)中の抗体を用いて行うことができる。このフォーマットは、架橋の際に抗CD3抗体で観察される高いサイトカイン放出を回避するために、mAbの架橋を制限する。
それぞれのアッセイフォーマットについての陰性対照(抗EGFR mAbおよびPBS)および特異的陽性対照(抗CD52 mAb、CEAxCD3 BiTEおよび/または抗CD28 mAb)を、CEAxCD3二特異性抗体と並行して試験する。WB CRAについて24時間後、およびPBMC AP CRAについて48時間後、上清を、読み取りとして電気化学発光を使用するマルチプレックスアッセイ(Mesoscale Discovery,Sector 600)において、サイトカインについて試験する。IFNγ、TNFαおよびIL-6を、WB CRAについて測定し、IFNγ、IL-2、IL-10およびTNFαを、PBMC AP CRAについて測定する。結果をサイトカインごとにプロットし、各ドナーは単一のデータポイントとして表示する。
(実施例11)
縮重オリゴヌクレオチドを使用するオリゴヌクレオチド特異的変異誘発(リード最適化;LO)によるCEA抗体の親和性成熟
実施例3に記載されるスクリーニングプロセスの間に同定された抗体を、それらの親和性および効力を増加させるために、親和性成熟のために選択する。すべてのこれらの抗体は、同じ可変重鎖を共有するが、異なる可変軽鎖を有する。AB1およびC11は、カッパ軽鎖(それぞれ、IGKV3-11およびIGKV1-5、IMGT命名法に従う)を含有するが、AB8および1B4は、ラムダ軽鎖(それぞれ、IGLV2-14およびIGLV3-21)を含有する。scFvバリアントを提示するいくつかのファージライブラリーを、重鎖可変領域を未改変に保ちながら、可変軽鎖領域のCDR1、CDR2およびCDR3に多様性を導入することによって、生成する。異なる多様化戦略を使用して、それぞれの候補についてライブラリーを生成し、ここで、CDRL1+CDRL2;またはCDRL3のみ、またはすべての3つのCDRLを、縮重オリゴヌクレオチドを使用する親配列のオリゴヌクレオチド特異的変異誘発によって、多様化させる(CDRL1+CDRL2+CDRL3)。CDRL1は、1~5のアミノ酸位置で多様化され、CDRL2は、1~4のアミノ酸位置で多様化され、CDRL3は、1~5のアミノ酸位置で多様化される。最大で1014の理論多様性を部分的にカバーする合計で最大で5×10個の形質転換体を、それぞれの候補について生成する。
候補AB1および1B4について、すべてのCDRLにわたって最大で17のアミノ酸位置で多様化された追加のライブラリーを、最大で1021の理論多様性を部分的にカバーする最大で5×10個の形質転換体で生成する。
選択ストリンジェンシーを、異なる選択ラウンド間で組換え体hCEACAM5の濃度を100nMから0.01nMまで徐々に下げて低減することによって、またはSNUC-1細胞系のようにより低いレベルのhCEACAM5を発現する細胞を使用することによって、ラウンド間で増加させることを除いて、これらのライブラリーを、実施例2に記載されるようにして、ファージディスプレイ選択のために使用する。選択されたバリアントを、実施例3に記載されるアッセイを使用して、CEACAM5に結合する能力についてスクリーニングする。陽性クローンを、IgGとして再フォーマットし、実施例4および5にそれぞれ記載されるようにして、特性評価する。
抗CEAアームAB1(配列番号31~34)を、2つの連続するリード最適化ウェーブにおいて最適化した。ウェーブ1は、抗CEAアームAB13、AB14、AB15、AB17およびAB20をもたらした。ウェーブ2は、抗CEAアームAB54、AB60、AB66、AB71、AB72およびAB73をもたらした。
(実施例12)
腫瘍に由来するオルガノイドのTDCC(T細胞依存性細胞傷害)および/またはTDCCとADCP
腫瘍細胞に由来するオルガノイドは、T細胞再標的化化合物ならびに/またはマクロファージおよびNK細胞再標的化化合物を試験するための高度なトランスレーショナルモデルである。
オルガノイドを、標準手順(Schuetteら, Nature Communications 2017; DOI:10.1038/ncomms14262)に従って調製し、PBMCとの共培養で最長で8日間、化合物とともにインキュベートし、in vitroでマクロファージを生成する。培地を、4日ごとに交換し、新鮮な培地で置き換える。
オルガノイドを、収集し、Accutaseを使用して、37℃で5分間、単一細胞に酵素的に解離させる。細胞を、ペレット化し、FACS緩衝液(PBS、2%のFBS、2mMのEDTA)に再懸濁させ、400μmの細胞ストレーナーを通して濾過する。等細胞数の懸濁物を、CD45、CD4、CD8、CEAおよびCD14に対する抗体(すべて、Thermo Fisher Scientific、Dreieich、Germany由来)とともに、氷上で30分間、インキュベートする。生細胞ゲーティングのために、ヨウ化プロピジウムを使用し、測定し、FlowJoソフトウェア(FlowJo、LLC、Ashland、OR、USA)を使用して分析する。
それぞれのウェルからの上清を、ELISAを使用することによるT細胞活性の分析のために、-80℃で凍結する。
(実施例13)
患者に由来する腫瘍組織スライスのTDCCおよび/またはTDCCとADCP
患者に由来する新鮮な腫瘍組織スライスは、T細胞および/またはマクロファージおよび/またはNK細胞再標的化化合物を試験するための別の高度なトランスレーショナルモデルである。
新鮮な腫瘍組織試料を、以前に公開された標準手順(Soennichsenら, Clinical Colorectal Cancer, 17 (2018) e189-e199)に従って、切断する。簡潔には、外科的切除および最初の肉眼での病理学的評価の直後に、腫瘍試料を、組織チョッパー(McIlwain TC752;Campden Instruments、Leicestershire、England)を使用して、350μmのスライスに切断する。次いで、組織スライスの直径を、3mmのコアリングツール(kai Europe、Solingen、Germany)を使用することによって、標準化する。3つの組織スライスを、無作為にプールし、膜インサートに置き、6ウェルプレート中で培養する。スライスを、37℃および5%のCOの標準化条件下でインキュベートする。培地を、処理の前に、調製の2時間および24時間後に交換する。
標準細胞培養培地中での事前培養の24時間後、三連のスライスを、それぞれ、単独でまたは組合せで、本発明による二特異性抗体に、最長で120時間、曝露することができる。必要により、インキュベーション時間を72時間に減らす。培地を、72時間後に交換する。
化合物曝露後、腫瘍スライスを、4%のパラホルムアルデヒドを使用して、終夜、固定する。それぞれのウェルからの上清を、ELISAを使用するT細胞活性の分析のために、-80℃で凍結する。
パラホルムアルデヒド固定スライスを、パラフィンに包埋し、5μmの切片に処理する。ヘマトキシリンおよびエオシン(HE)染色を行って、病理組織学的態様および腫瘍細胞の割合を評価する。全細胞カウント、腫瘍細胞カウントおよび増殖を、免疫蛍光染色によって分析する。簡潔には、パラフィン切片を、脱パラフィン化する。抗原回復後、切片を、0.3%のPBS/Triton(登録商標)Xで洗浄し、5%の正常ヤギ血清(Jackson ImmunoResearch、Suffolk、UK)で、30分間、ブロッキングする。それぞれ、サイトケラチン
、Ki67および切断PARPに対する一次抗体を、0.5%のウシ血清アルブミンに希釈し、4℃で終夜、インキュベートする。切片を、0.3%のリン酸緩衝食塩水/Triton(登録商標)Xですすぎ、二次抗体で標識する。核を、Hoechst 33342(Sigma-Aldrich、St.Louis、MO)で染色する。さらなる分析のために、CEA(腫瘍細胞)、CD163(マクロファージ)、およびCD3、CD4、CD8、PD-L1ならびにFoxP3(すべてT細胞)に対する抗体を、腫瘍スライスの利用可能性に応じて含める。
腫瘍細胞を含有する領域を、スライドスキャン(Pannoramic SCANおよびPannoramic Viewer、3D Histech、Budapest、Hungary)を使用して、HE切片中で分析して、様々な腫瘍細胞画分を調べる。新生物性上皮細胞よりも多くの良性上皮細胞を含有するスライスを、分析から除外する。腫瘍細胞を含有していなかったスライスを、増殖している腫瘍細胞画分の分析から除外するが、条件ごとの腫瘍細胞の分析に含める。さらなる分析のために、組織スライスごとに5枚の写真(20×)を、Olympus BX51蛍光顕微鏡(Olympus Deutschland、Hamburg、Germany)を使用して、蛍光染色された切片から取得する。陽性ピクセルカウントを、Image Jのための染色特異的セグメンテーションアルゴリズムを用いて、Hoechst 33342、サイトケラチン、Ki67および切断PARP染色について決定する。増殖/アポトーシス腫瘍領域を、サイトケラチン陽性ピクセルの周囲のKi67/切断PARP陽性核のピクセルを分析することによって計算する。
すべての写真について、総細胞カウント(Hoechst陽性)、腫瘍細胞カウント(Hoechstおよびサイトケラチン陽性)および増殖している腫瘍細胞カウント(Hoechst、サイトケラチン、およびKi67陽性/切断PARP)を計算する。腫瘍細胞カウントを、総細胞カウントに対して正規化し、増殖している腫瘍細胞カウントを、腫瘍細胞カウントに対して正規化し、写真ごとの異なる腫瘍細胞画分を考慮する。次いで、平均スライス値を、単一の画像値から計算する。条件についての平均値を、平均スライス値を使用して計算する。
本明細書で引用されるすべての刊行物、特許、特許出願、インターネットサイト、ならびにポリヌクレオチド配列およびポリペプチド配列の両方を含む受託番号/データベース配列は、それぞれの個々の刊行物、特許、特許出願、インターネットサイトまたは受託番号/データベース配列が、参照によりそのように組み込まれることが具体的かつ個別に示されているのと同じ程度に、すべての目的のために、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。

Claims (28)

  1. ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、
    a)前記第1の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含む、重鎖可変領域(VH)を含み、
    b)前記第1の結合部分が、
    b1)配列番号90のCDRL1、配列番号91のCDRL2および配列番号92のCDRL3、
    b2)配列番号96のCDRL1、配列番号97のCDRL2および配列番号98のCDRL3、
    b3)配列番号99のCDRL1、配列番号100のCDRL2および配列番号101のCDRL3、
    b4)配列番号102のCDRL1、配列番号103のCDRL2および配列番号104のCDRL3、
    b5)配列番号105のCDRL1、配列番号106のCDRL2および配列番号107のCDRL3、
    b6)配列番号108のCDRL1、配列番号109のCDRL2および配列番号110のCDRL3、ならびに
    b7)配列番号111のCDRL1、配列番号112のCDRL2および配列番号113のCDRL3
    からなる群から選択されるCDRLのセットを含む軽鎖可変領域(VL)を含み、
    c)前記第2の結合部分が、配列番号2のCDRH1、配列番号3のCDRH2および配列番号4のCDRH3を含むVHを含み、
    d)前記第2の結合部分が、配列番号18のCDRL1、配列番号19のCDRL2および配列番号20のCDRL3を含むVLを含む、
    二特異性抗体。
  2. a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
    b)前記第1の結合部分中に、
    b1)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
    b2)配列番号119の軽鎖可変領域VL、
    b3)配列番号120の軽鎖可変領域VL、
    b4)配列番号121の軽鎖可変領域VL、
    b5)配列番号122の軽鎖可変領域VL、
    b6)配列番号123の軽鎖可変領域VL、および
    b7)配列番号124の軽鎖可変領域VL
    からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
    c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
    を含む、請求項1に記載の二特異性抗体。
  3. a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
    b)前記第1の結合部分中に、
    b1)配列番号117の軽鎖可変領域VL、
    b2)配列番号122の軽鎖可変領域VL、および
    b3)配列番号124の軽鎖可変領域VL
    からなる群から選択される軽鎖可変領域VL、ならびに
    c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号17の軽鎖可変領域VL
    を含む、請求項2に記載の二特異性抗体。
  4. ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、
    a)前記第1の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VH、
    b)前記第1の結合部分中に、
    b1)配列番号128の軽鎖、
    b2)配列番号130の軽鎖、
    b3)配列番号131の軽鎖、
    b4)配列番号132の軽鎖、
    b5)配列番号133の軽鎖、
    b6)配列番号134の軽鎖、および
    b7)配列番号135の軽鎖
    からなる群から選択される軽鎖、ならびに、
    c)前記第2の結合部分中に、配列番号1の重鎖可変領域VHおよび配列番号28の軽鎖を含む、二特異性抗体。
  5. a)配列番号43の重鎖、
    b)配列番号44の重鎖、および
    c)配列番号45の重鎖
    からなる群から選択される共通重鎖を含むことを特徴とする、請求項1~4のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
  6. ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、配列番号45の共通重鎖、ならびに前記第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖、および前記第1の結合部分中に、配列番号128の軽鎖を含む、二特異性抗体。
  7. ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、配列番号45の共通重鎖、ならびに前記第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖、および前記第1の結合部分中に、配列番号133の軽鎖を含む、二特異性抗体。
  8. ヒトCEACAM5に特異的に結合する第1の結合部分およびヒトCD3εに特異的に結合する第2の結合部分を含む二特異性抗体であって、前記抗体が、配列番号45の共通重鎖、ならびに前記第2の結合部分中に、配列番号28の軽鎖、および前記第1の結合部分中に、配列番号135の軽鎖を含む、二特異性抗体。
  9. Fcドメインのそれぞれのサブユニットが、アミノ酸置換L234A、L235AおよびP329A(Kabat EUインデックス番号付け)を含む、Fcドメインを含むことを特徴とする、請求項1~8のいずれか一項に記載の二特異性抗体。
  10. in vivoで癌を処置する使用のための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物。
  11. がんを患っているヒト対象への投与に使用するための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物。
  12. 結腸直腸癌、食道がん、膵臓腺癌、胃がん、非小細胞肺がん、乳がん、頭頸部癌、子宮がんおよび膀胱がんの処置における使用のための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物。
  13. CEAを発現する固形腫瘍の処置のための単剤療法における使用のための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物。
  14. がんの処置における使用のための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物であって、同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体と組み合わせて投与されることを特徴とする、組成物。
  15. がんの処置における使用のための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物であって、同時、別々または逐次的組合せで、二特異性抗CEAxCD47抗体および/またはPD-1軸アンタゴニストと組み合わせて投与されることを特徴とする、組成物。
  16. がんの処置における使用のための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物であって、同時、別々または逐次的組合せで、PD-1軸アンタゴニストと組み合わせて投与されることを特徴とする、組成物。
  17. 前記PD-1軸アンタゴニストが、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、ピディリズマブ、およびランブロリズマブからなる群より選択される、請求項16に記載の組成物。
  18. がんの処置における使用するための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体および二特異性抗CEAxCD47抗体を含む組み合わせ物であって、本発明の抗体および前記二特異性抗CEAxCD47抗体が、本発明の抗体および前記二特異性抗CEAxCD47抗体の投与の間が6~15日の間隔の交互投与において投与されることを特徴とする、組み合わせ物。
  19. 前記抗体が、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される、請求項10~17のいずれか一項に記載の組成物または請求項18に記載の組み合わせ物。
  20. 本発明の抗体が、患者に、1~20mg/kgの範囲の用量で投与されることを特徴とする、請求項19に記載の組成物または組み合わせ物。
  21. 前記抗CEAxCD47抗体が、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与されることを特徴とする、請求項14、15または18のいずれか一項に記載の組成物または組み合わせ物。
  22. 前記PD-1軸アンタゴニストが、患者に、1日あたりまたは1週間あたり0.1~100mg/kg体重の範囲の用量で、単回もしくは分割用量でまたは持続注入によって投与される、請求項19に記載の組成物。
  23. 請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
  24. 請求項1~9のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチド。
  25. 請求項24に記載の単離されたポリヌクレオチドを含むベクター。
  26. 請求項24に記載の単離されたポリヌクレオチドまたは請求項25に記載のベクターを含む細胞。
  27. がんの処置における使用するための、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体を含む組成物であって、前記組成物は、前記組成物および二特異性抗CEAxCD47抗体の投与の間が6~15日の間隔の前記二特異性抗CEAxCD47抗体との交互投与において投与されることを特徴とする、組成物。
  28. がんの処置における使用するための、二特異性抗CEAxCD47抗体を含む組成物であって、前記組成物は、請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体および前記組成物の投与の間が6~15日の間隔の請求項1~9のいずれか一項に記載の二特異性抗体との交互投与において投与されることを特徴とする、組成物。
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