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JP7702230B2 - Method for producing monoacylglycerol lipase - Google Patents
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Description

本発明は、モノアシルグリセロールリパーゼの製造方法に関する。 The present invention relates to a method for producing monoacylglycerol lipase.

モノアシルグリセロール(MAG)は、乳化剤や抗菌剤等として食品、医薬品、化粧品等の分野に広く利用されている物質である。さらに近年、MAGが、食後の血中トリグリセリドの上昇抑制、食後血中インスリン上昇抑制、食後GIP分泌抑制等の優れた生理活性を有することが見出されている。MAGは、化学的には、高温条件下、アルカリ触媒の存在下で脂肪酸とグリセリンとをエステル化する方法や、高温高圧条件下で油脂をグリセロリシスする方法などにより製造される。しかし、これらの方法では、高温処理や排水のための設備が必要である。一方、脂肪酸とグリセリンとをリパーゼの存在下で反応させるMAGの生化学的な製造方法は、より穏和な条件下で利用可能な方法として注目されている(例えば特許文献1)。この方法で用いるリパーゼとしては、モノグリセリドリパーゼ(MGLP)などの脂肪酸モノグリセリド又は脂肪酸ジグリセリドを基質として認識するリパーゼが好ましい。 Monoacylglycerol (MAG) is a substance that is widely used in the fields of food, medicine, cosmetics, etc. as an emulsifier, antibacterial agent, etc. Furthermore, in recent years, MAG has been found to have excellent physiological activities such as suppressing the rise in blood triglycerides after meals, suppressing the rise in blood insulin after meals, and suppressing postprandial GIP secretion. MAG is chemically produced by a method of esterifying fatty acids and glycerin in the presence of an alkaline catalyst under high temperature conditions, or a method of glycerolysis of oils and fats under high temperature and high pressure conditions. However, these methods require equipment for high temperature treatment and drainage. On the other hand, a biochemical method of producing MAG by reacting fatty acids and glycerin in the presence of lipase has attracted attention as a method that can be used under milder conditions (for example, Patent Document 1). As the lipase used in this method, a lipase that recognizes fatty acid monoglycerides or fatty acid diglycerides as a substrate, such as monoglyceride lipase (MGLP), is preferable.

MGLPについては、特許文献2に、バチルス・エスピー(Bacillus sp.)H-257由来MGLPであるH-257が開示されている。また、ゲオバチルス・サーモデニトリフィカンス(Geobacillus thermodenitrificans)由来MGLPであるEstGtA2(非特許文献1)などのH-257リパーゼと近縁のMGLPが公知である。 Regarding MGLP, Patent Document 2 discloses H-257, which is an MGLP derived from Bacillus sp. H-257. In addition, MGLPs closely related to H-257 lipase, such as EstGtA2 (Non-Patent Document 1), an MGLP derived from Geobacillus thermodenitrificans, are known.

バチルス属等の微生物由来MGLPは、それを生産する微生物を培養し、次いで培養物からMGLPを抽出することによって製造することができる。さらに、特許文献3には、H-257リパーゼの遺伝子を導入した大腸菌株を培養し、培養物からMGLPを採取することにより、MGLPを効率よく量産することができることが開示されている。しかしながら、従来の方法は、生産されたMGLPを回収するために培養した細胞を破砕する工程が必要であるため、手順が煩雑であった。 MGLP derived from microorganisms such as Bacillus can be produced by culturing the microorganisms that produce it and then extracting MGLP from the culture. Furthermore, Patent Document 3 discloses that MGLP can be mass-produced efficiently by culturing an Escherichia coli strain into which the H-257 lipase gene has been introduced and collecting MGLP from the culture. However, conventional methods require a step of disrupting the cultured cells in order to recover the produced MGLP, making the procedure complicated.

一方、目的タンパク質を高生産するよう改変された変異バチルス属菌が知られている。特許文献4には、菌体外プロテアーゼAprEをコードするaprE遺伝子が削除又は不活性化されており、かつバチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ産生遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナルペプチド領域と目的タンパク質をコードする遺伝子とを含むDNA断片を保持するベクターで形質転換された組換え枯草菌を培養するタンパク質の製造方法が開示されている。特許文献5には、枯草菌のaprX遺伝子と、枯草菌のaprE、nprB、nprE、bpr、vpr、mpr、epr及びwprAから選ばれる遺伝子とを欠失又は不活性化させた微生物を宿主とし、これに異種のタンパク質又はポリペプチドをコードする遺伝子を導入した組換え微生物を用いたタンパク質の製造方法が開示されている。特許文献6には、枯草菌168株からaprX、aprE、nprB、nprE、bpr、vpr、mpr、epr及びwprAから選択される8つ以上のプロテアーゼ遺伝子を欠失させた枯草菌変異株を用い、枯草菌エンドグルカナーゼ遺伝子bglCを発現させ、完全長BglCを枯草菌細胞外に分泌させることを特徴とする、BglCの製造法が開示されている。特許文献7には、不活性化されたaprE、nprE、epr、ispA、bpr、vpr、wprA、mpr-ybjF及びnprB遺伝子を有し、かつシグナル配列とストレプトマイセス・スブチリシン阻害剤(SSI)タンパク質の融合タンパク質をコードする核酸を含む組換えバチルス属細胞を培養することを含むSSIタンパク質を生産する方法が開示されている。特許文献8には、グルカノトランスフェラーゼ、緑色蛍光タンパク質、アスパラギナーゼ等の外来タンパク質を生産するための宿主細胞として、AprE、Bpr、Epr、Mpr、NprE、Vpr及びWprAからなる群から選択される1つまたは複数のプロテアーゼをコードする遺伝子を破壊したバチルス属宿主細胞を用いることが記載されている。 On the other hand, mutant Bacillus bacteria modified to produce a high level of a target protein are known. Patent Document 4 discloses a method for producing a protein by culturing a recombinant Bacillus subtilis transformed with a vector carrying a DNA fragment containing the promoter region and secretory signal peptide region of an alkaline cellulase producing gene derived from a Bacillus bacterium and a gene encoding a target protein, in which the aprE gene encoding the extracellular protease AprE has been deleted or inactivated. Patent Document 5 discloses a method for producing a protein using a recombinant microorganism as a host in which a Bacillus subtilis aprX gene and a gene selected from Bacillus subtilis aprE, nprB, nprE, bpr, vpr, mpr, epr, and wprA are deleted or inactivated, and a gene encoding a heterologous protein or polypeptide is introduced into the host. Patent Document 6 discloses a method for producing BglC, which is characterized by expressing the Bacillus subtilis endoglucanase gene bglC and secreting full-length BglC outside the Bacillus subtilis cell using a Bacillus subtilis mutant strain in which eight or more protease genes selected from aprX, aprE, nprB, nprE, bpr, vpr, mpr, epr and wprA are deleted from Bacillus subtilis strain 168. Patent Document 7 discloses a method for producing a Streptomyces subtilisin inhibitor (SSI) protein, which comprises culturing a recombinant Bacillus cell having inactivated aprE, nprE, epr, ispA, bpr, vpr, wprA, mpr-ybjF and nprB genes and a nucleic acid encoding a fusion protein of a signal sequence and a Streptomyces subtilisin inhibitor (SSI) protein. Patent Document 8 describes the use of Bacillus host cells in which genes encoding one or more proteases selected from the group consisting of AprE, Bpr, Epr, Mpr, NprE, Vpr, and WprA have been disrupted as host cells for producing foreign proteins such as glucanotransferase, green fluorescent protein, and asparaginase.

特開2008-220236号公報JP 2008-220236 A 特開2010-183873号公報JP 2010-183873 A 特開平5-168468号公報Japanese Patent Application Publication No. 5-168468 特開2004-313169号公報JP 2004-313169 A 特開2006-174707号公報JP 2006-174707 A 特開2012-115219号公報JP 2012-115219 A 特表2011-508610号公報Special Publication No. 2011-508610 特表2016-521579号公報Special Publication No. 2016-521579

PLoS ONE, 2013, 8(10):e76675PLoS ONE, 2013, 8(10):e76675

本発明は、モノアシルグリセロールリパーゼを製造する方法を提供する。 The present invention provides a method for producing monoacylglycerol lipase.

本発明者らは、天然では非分泌型のモノアシルグリセロールリパーゼの生産において、分泌型プロテアーゼAprEの活性が低減されたバチルス属菌を培養して該モノアシルグリセロールリパーゼを生産させることで、細胞を破砕する工程を行うことなく、生産されたモノアシルグリセロールリパーゼを培養上清から回収できることを見出した。 The present inventors have found that, in the production of monoacylglycerol lipase, which is naturally non-secreted, by culturing a Bacillus bacterium in which the activity of the secretory protease AprE is reduced to produce the monoacylglycerol lipase, the produced monoacylglycerol lipase can be recovered from the culture supernatant without a cell disruption step.

したがって、本発明は、枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減したバチルス属菌を培養してモノアシルグリセロールリパーゼを発現させることを含む、モノアシルグリセロールリパーゼの製造方法を提供する。
また本発明は、枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されており、かつモノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが外来的に導入されている、組換えバチルス属菌を提供する。
また本発明は、枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されたバチルス属菌に、モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドを組み込むことを含む、組換えバチルス属菌の製造方法を提供する。
Therefore, the present invention provides a method for producing monoacylglycerol lipase, which comprises culturing a Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto, and expressing monoacylglycerol lipase.
The present invention also provides a recombinant Bacillus bacterium in which the activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto has been reduced, and into which a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase has been exogenously introduced.
The present invention also provides a method for producing a recombinant Bacillus bacterium, which comprises incorporating a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase into a Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto.

本発明によれば、天然では非分泌型のモノアシルグリセロールリパーゼを、微生物細胞外に分泌生産させて、培養後の細胞を破砕する工程を行うことなく培養上清から容易に回収できることができる。本発明によれば、簡便な手順でモノアシルグリセロールリパーゼを製造することができる。 According to the present invention, monoacylglycerol lipase, which is naturally non-secreted, can be secreted outside the microbial cells and easily recovered from the culture supernatant without a process of disrupting the cells after culture. According to the present invention, monoacylglycerol lipase can be produced by a simple procedure.

各種遺伝子欠失組換え枯草菌株の96時間培養後に得られた培養上清における相対リパーゼ活性。Relative lipase activity in culture supernatants obtained after 96 hours of culture of various gene-deleted recombinant Bacillus subtilis strains. 各種遺伝子欠失組換え枯草菌株の96時間培養後に得られた培養上清のSDS-PAGE結果。矢印はEstGtA2のバンドを示す。SDS-PAGE results of the culture supernatant obtained after culturing various gene-deleted recombinant Bacillus subtilis strains for 96 hours. The arrow indicates the EstGtA2 band. 各種MGLPを発現するaprE欠失組換え枯草菌株の培養物の上清のSDS-PAGE結果。矢印は、左から、H-257、stLP、CI220-6、CI220-10、及びCI220-12のバンドを示す。SDS-PAGE results of the culture supernatant of aprE-deleted recombinant Bacillus subtilis strains expressing various MGLPs. Arrows indicate, from the left, the bands of H-257, stLP, CI220-6, CI220-10, and CI220-12.

本明細書に記載の枯草菌の遺伝子の名称は、JAFAN:Japan Functional Analysis Network for Bacillus subtilis(BSORF DB)でインターネット公開([bacillus.genome.ad.jp/]、2006年1月18日更新)された枯草菌ゲノムデータに基づいて記載されている。本明細書に記載される枯草菌の遺伝子番号は、BSORF DBに登録されている遺伝子番号を表す。 The names of the Bacillus subtilis genes described in this specification are based on the Bacillus subtilis genome data published on the Internet at JAFAN: Japan Functional Analysis Network for Bacillus subtilis (BSORF DB) ([bacillus.genome.ad.jp/], updated January 18, 2006). The gene numbers of Bacillus subtilis described in this specification refer to the gene numbers registered in the BSORF DB.

本明細書において、ヌクレオチド配列及びアミノ酸配列の同一性は、Lipman-Pearson法(Science,1985,227:1435-1441)によって計算される。具体的には、遺伝情報処理ソフトウェアGenetyx-Winのホモロジー解析(Search homology)プログラムを用いて、Unit size to compare(ktup)を2として解析を行うことにより算出される。 In this specification, the identity of nucleotide sequences and amino acid sequences is calculated by the Lipman-Pearson method (Science, 1985, 227:1435-1441). Specifically, it is calculated by performing an analysis using the Search homology program of the genetic information processing software Genetyx-Win with a unit size to compare (ktup) of 2.

本明細書において、アミノ酸配列又はヌクレオチド配列に関する「少なくとも90%の同一性」とは、90%以上、好ましくは95%以上、より好ましくは96%以上、さらに好ましくは97%以上、さらにより好ましくは98%以上、なお好ましくは99%以上の同一性をいう。 As used herein, "at least 90% identity" with respect to an amino acid sequence or a nucleotide sequence means identity of 90% or more, preferably 95% or more, more preferably 96% or more, even more preferably 97% or more, even more preferably 98% or more, and even more preferably 99% or more.

また本明細書において、制御領域と遺伝子との「作動可能な連結」とは、遺伝子と制御領域とが、該遺伝子が該制御領域の制御の下で発現し得るように連結されていることをいう。遺伝子と制御領域との「作動可能な連結」の手順は当業者に周知である。 In addition, in this specification, "operably linked" between a regulatory region and a gene means that the gene and regulatory region are linked in such a way that the gene can be expressed under the control of the regulatory region. The procedure for "operably linked" between a gene and a regulatory region is well known to those skilled in the art.

本明細書において、遺伝子に関する「上流」及び「下流」とは、該遺伝子の転写方向の上流及び下流をいう。例えば、「プロモーターの下流に配置された遺伝子」とは、DNAセンス鎖においてプロモーターの3’側に該遺伝子が存在することを意味し、遺伝子の上流とは、DNAセンス鎖における該遺伝子の5’側の領域を意味する。 In this specification, "upstream" and "downstream" in relation to a gene refer to the upstream and downstream in the transcription direction of the gene. For example, "a gene located downstream of a promoter" means that the gene is present on the 3' side of the promoter in the DNA sense strand, and "upstream of a gene" means the region on the 5' side of the gene in the DNA sense strand.

本明細書において、細胞の機能や性状、形質に対して使用する用語「本来」とは、当該機能や性状、形質が当該細胞に元から存在していることを表すために使用される。対照的に、用語「外来」とは、当該細胞に元から存在するのではなく、外部から導入された機能や性状、形質を表すために使用される。例えば、「外来」遺伝子又はポリヌクレオチドとは、細胞に外部から導入された遺伝子又はポリヌクレオチドである。外来遺伝子又はポリヌクレオチドは、それが導入された細胞と同種の生物由来であっても、異種の生物由来(すなわち異種遺伝子又はポリヌクレオチド)であってもよい。 As used herein, the term "native" when referring to a function, property, or trait of a cell is used to indicate that the function, property, or trait is inherently present in the cell. In contrast, the term "exogenous" is used to indicate a function, property, or trait that is not inherently present in the cell, but is introduced from outside. For example, a "exogenous" gene or polynucleotide is a gene or polynucleotide that is introduced into a cell from outside. An exogenous gene or polynucleotide may be from the same organism as the cell into which it is introduced, or from a different organism (i.e., a heterologous gene or polynucleotide).

本発明のモノアシルグリセロールリパーゼ(以下、MGLPともいう)の製造方法は、特定の分泌型プロテアーゼ(細胞外プロテアーゼともいう)の活性が低減された微生物を培養して、モノアシルグリセロールリパーゼを発現させることを含む。 The method for producing monoacylglycerol lipase (hereinafter also referred to as MGLP) of the present invention includes culturing a microorganism in which the activity of a specific secretory protease (also referred to as an extracellular protease) is reduced, and expressing monoacylglycerol lipase.

本発明でMGLPの製造に使用される微生物としては、枯草菌等のバチルス属(Bacillus)菌や、クロストリジウム属(Clostridium)菌、酵母などが挙げられ、このうちバチルス属菌が好ましい。さらに、全ゲノム情報が明らかにされている点、ゲノム工学技術が確立されている点、及びタンパク質を菌体外に分泌生産させる能力を有する点などから、枯草菌又はその変異株がより好ましい。 The microorganisms used in the production of MGLP in the present invention include Bacillus bacteria such as Bacillus subtilis, Clostridium bacteria, yeast, etc., among which Bacillus bacteria are preferred. Furthermore, Bacillus subtilis or its mutant strains are more preferred because the complete genome information has been revealed, genome engineering technology has been established, and it has the ability to produce and secrete proteins outside the bacterial cell.

本発明で用いる微生物において活性が低減される分泌型プロテアーゼとしては、枯草菌AprE(以下、単にAprEという)、及びこれに相当するプロテアーゼが挙げられる。AprEは、枯草菌遺伝子aprE(以下、単にaprEという)にコードされる、セリンアルカリプロテアーゼ(ズブチリシンE)である。aprEは、BSORF DBでの遺伝子番号BG10190で示される遺伝子である。 Examples of secreted proteases whose activity is reduced in the microorganisms used in the present invention include Bacillus subtilis AprE (hereinafter simply referred to as AprE) and proteases corresponding thereto. AprE is a serine alkaline protease (subtilisin E) encoded by the Bacillus subtilis gene aprE (hereinafter simply referred to as aprE). AprE is a gene designated by gene number BG10190 in the BSORF DB.

AprEに相当するプロテアーゼとしては、AprEとアミノ酸配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつAprEと同等の機能を有するプロテアーゼが挙げられ、好ましくは、aprEに相当する遺伝子にコードされる、アルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチド(すなわちセリンアルカリプロテアーゼ)が挙げられる。本明細書において、aprEに相当する遺伝子とは、aprEとヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子をいう。AprEに相当するプロテアーゼの具体的な例としては、バチルス・モジャベンシス(Bacillus mojavensis)のpeptidase S8、バチルス・ハロトレランス(Bacillus halotolerans)のpeptidase S8、バチルス・テキレンシス(Bacillus tequilensis)のpeptidase S8などが挙げられる。 Proteases corresponding to AprE include proteases that have at least 90% identity to AprE in amino acid sequence and have the same function as AprE, and preferably include a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side (i.e., serine alkaline protease) that is encoded by a gene corresponding to aprE. In this specification, a gene corresponding to aprE refers to a gene that has at least 90% identity to aprE in nucleotide sequence and encodes a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side. Specific examples of proteases equivalent to AprE include peptidase S8 from Bacillus mojavensis, peptidase S8 from Bacillus halotolerans, and peptidase S8 from Bacillus tequilensis.

本発明で用いる微生物は、AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性の低減に加えて、1種又は2種以上の他の本来のプロテアーゼの活性が低減されていてもよい。当該他の本来のプロテアーゼとしては、例えば枯草菌遺伝子epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX(以下、単にepr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprXという)、及びこれらに相当する遺伝子にコードされるプロテアーゼが挙げられる。AprE又はこれに相当するプロテアーゼとあわせてこれらの他の本来のプロテアーゼの活性を低減させることにより、細胞外へのMGLPの放出が促進され、培養上清から回収されるMGLPの収量を向上させることができる。このような微生物の例としては、aprE又はこれに相当する遺伝子が欠失又は不活性化されており、さらにepr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及びこれらに相当する遺伝子からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子が欠失又は不活性化されている微生物が挙げられる。epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr及びaprX、又は及びこれらに相当する遺伝子は、いずれか1つを欠失させればよいが、いずれか2種以上を組み合わせて欠失又は不活性化させてもよい。 In addition to the reduced activity of AprE or a protease equivalent thereto, the microorganism used in the present invention may also have reduced activity of one or more other native proteases. Examples of such other native proteases include the Bacillus subtilis genes epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX (hereinafter simply referred to as epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX), and proteases encoded by genes corresponding thereto. By reducing the activity of these other native proteases together with AprE or a protease equivalent thereto, the release of MGLP outside the cells is promoted, and the yield of MGLP recovered from the culture supernatant can be improved. Examples of such microorganisms include those in which aprE or a gene equivalent thereto has been deleted or inactivated, and further in which at least one gene selected from the group consisting of epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, aprX, and genes equivalent thereto has been deleted or inactivated. Of epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX, and/or genes equivalent thereto, any one of them may be deleted, or two or more of them may be deleted or inactivated in combination.

epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及びaprXの遺伝子番号と、それらがコードするタンパク質の機能を表1に示す。epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及びaprXに相当する遺伝子としては、それぞれ、epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及びaprXと、ヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ(表1に記載される)同じ機能のタンパク質をコードする遺伝子が挙げられる。 The gene numbers of epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX and the functions of the proteins they encode are shown in Table 1. Genes corresponding to epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX include genes that have at least 90% identity in nucleotide sequence with epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX, respectively, and encode proteins with the same functions (described in Table 1).

Figure 0007702230000001
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AprE又はこれに相当するプロテアーゼや他の本来のプロテアーゼなどの微生物の標的タンパク質の活性の低減は、該微生物における該標的タンパク質の発現量を低減させることによって実現することができる。例えば、該微生物中の該標的タンパク質をコードする遺伝子(すなわち標的遺伝子、例えばaprE又はこれに相当する遺伝子)を欠失又は不活性化させること、該標的遺伝子から転写されたmRNAを不活性化すること、又は該標的遺伝子のmRNAからタンパク質への翻訳を阻害することなどによって該標的タンパク質の発現を抑制することで、該標的タンパク質の活性を低減させることができる。あるいは、発現した該標的タンパク質の活性を低減させてもよい。 The activity of a target protein of a microorganism, such as AprE or an equivalent protease or other native proteases, can be reduced by reducing the expression level of the target protein in the microorganism. For example, the activity of the target protein can be reduced by suppressing the expression of the target protein by deleting or inactivating a gene encoding the target protein in the microorganism (i.e., a target gene, e.g., aprE or an equivalent gene), inactivating the mRNA transcribed from the target gene, or inhibiting the translation of the mRNA of the target gene into protein. Alternatively, the activity of the expressed target protein may be reduced.

細胞中の標的遺伝子の欠失又は不活性化は、標的遺伝子のヌクレオチド配列の一部若しくは全部をゲノム中から除去するか又は他のヌクレオチド配列と置き換えること、標的遺伝子の配列中に他のポリヌクレオチド断片を挿入すること、標的遺伝子の転写又は翻訳開始領域に変異を与えること、などによって実現することができる。好適には、標的遺伝子のヌクレオチド配列の一部若しくは全部を欠失させるか又は不活性化させる。より具体的な例としては、細胞のゲノム上の標的遺伝子を特異的に欠失又は不活性化させる方法、及び、細胞中の遺伝子にランダムな欠失又は不活性化変異を与えた後、標的タンパク質の発現量や活性評価、又は遺伝子解析を行って所望の変異を有する細胞を選択する方法が挙げられる。 The deletion or inactivation of a target gene in a cell can be achieved by removing part or all of the nucleotide sequence of the target gene from the genome or replacing it with another nucleotide sequence, inserting another polynucleotide fragment into the sequence of the target gene, or mutating the transcription or translation initiation region of the target gene. Preferably, part or all of the nucleotide sequence of the target gene is deleted or inactivated. More specific examples include a method of specifically deleting or inactivating a target gene on the genome of a cell, and a method of randomly deleting or inactivating a gene in a cell, and then evaluating the expression level or activity of the target protein, or performing genetic analysis to select cells having the desired mutation.

標的遺伝子の特異的な欠失又は不活性化には、例えば相同組換えによる方法を用いればよい。すなわち、塩基置換や塩基挿入等によって不活性化変異を導入した標的遺伝子のDNA断片、又は標的遺伝子の外側領域を含むが標的遺伝子を含まないDNA断片を構築し、これを親微生物細胞内に組み込んで親微生物ゲノムの標的遺伝子を含む領域に相同組換えを起こさせることにより、ゲノム上の標的遺伝子を欠失又は不活性化させることが可能である。あるいは、標的遺伝子の一部領域を含むDNA断片を有する組換えベクター(プラスミド等)を親微生物細胞内に組み込み、親微生物ゲノムの標的遺伝子の一部領域を相同組換えにより分断することによって、標的遺伝子を不活性化することも可能である。細胞中の遺伝子をランダムに欠失又は不活性化させる方法としては、不活性化変異を導入した遺伝子をランダムにクローニングしたDNA断片を細胞に導入し、該細胞のゲノム上の遺伝子との間に相同組換えを起こさせる方法、細胞に紫外線、γ線等を照射して突然変異を誘発する方法などが挙げられる。遺伝子の不活性化変異とは、サイレンス変異、ミスセンス変異、ナンセンス変異、フレームシフト変異等により、標的とする遺伝子が本来有する機能が失われる変異を意味する。例えば、不活性化変異を導入した遺伝子はタンパク質を発現しないか、又は本来の活性が損なわれたタンパク質を発現する。 For example, a method using homologous recombination may be used to specifically delete or inactivate a target gene. That is, a DNA fragment of a target gene into which an inactivating mutation has been introduced by base substitution or base insertion, or a DNA fragment containing an outer region of the target gene but not the target gene, is constructed, and the DNA fragment is introduced into a parent microbial cell to cause homologous recombination in a region of the parent microbial genome containing the target gene, thereby deleting or inactivating the target gene on the genome. Alternatively, a recombinant vector (plasmid, etc.) having a DNA fragment containing a partial region of the target gene can be introduced into a parent microbial cell, and a partial region of the target gene in the parent microbial genome can be disrupted by homologous recombination, thereby inactivating the target gene. Methods for randomly deleting or inactivating genes in cells include a method in which a DNA fragment in which an inactivating mutation has been introduced is randomly cloned into a cell, and homologous recombination occurs between the gene and the genome of the cell, and a method in which a cell is irradiated with ultraviolet light, gamma rays, etc. to induce mutations. An inactivating mutation in a gene refers to a mutation that causes the target gene to lose its original function due to a silence mutation, missense mutation, nonsense mutation, frameshift mutation, etc. For example, a gene into which an inactivating mutation has been introduced does not express a protein, or expresses a protein whose original activity is impaired.

不活性化変異を導入した標的遺伝子を含むDNA断片を作製する方法としては、部位特異的変異導入が挙げられる。部位特異的変異導入は、導入すべきヌクレオチド変異を含む変異用プライマーを用いて行うことができる。例えば、導入すべきヌクレオチド変異を含む2組のプライマーを用いた標的遺伝子を鋳型とするPCRにより、標的遺伝子を含む領域の上流側及び下流側をそれぞれ増幅したDNA断片を作製し、次いでこれらをSOE-PCR(splicing by overlap extension PCR)(Gene,1989,77(1):p61-68)により1つに連結することにより、所望の変異を含むDNA断片を構築することができる。あるいは、部位特異的変異導入には、インバースPCR法やアニーリング法など(村松ら編、「改訂第4版 新遺伝子工学ハンドブック」、羊土社、p82-88)、又はStratagene社のQuickChange II Site-Directed Mutagenesis Kitや、QuickChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kit等の市販の部位特異的変異導入用キットを使用することもできる。 A method for producing a DNA fragment containing a target gene into which an inactivating mutation has been introduced includes site-specific mutagenesis. Site-specific mutagenesis can be carried out using a mutation primer containing the nucleotide mutation to be introduced. For example, DNA fragments are produced by amplifying the upstream and downstream sides of a region containing the target gene by PCR using two pairs of primers containing the nucleotide mutation to be introduced as a template, and then these are linked together by SOE-PCR (splicing by overlap extension PCR) (Gene, 1989, 77(1): p61-68), thereby constructing a DNA fragment containing the desired mutation. Alternatively, site-specific mutagenesis can be performed using inverse PCR or annealing methods (Muramatsu et al., eds., "Revised 4th Edition New Genetic Engineering Handbook," Yodosha, pp. 82-88), or commercially available site-specific mutagenesis kits such as Stratagene's QuickChange II Site-Directed Mutagenesis Kit and QuickChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kit.

変異用プライマーは、ホスホロアミダイト法(Nucleic Acids Research,1989,17:7059-7071)等の周知のオリゴヌクレオチド合成法により作製することができる。鋳型とする標的遺伝子は、上述したMGLPの製造に使用される微生物から、常法により調製してもよく、又は化学合成してもよい。 The mutation primer can be prepared by a well-known oligonucleotide synthesis method such as the phosphoramidite method (Nucleic Acids Research, 1989, 17:7059-7071). The target gene used as a template may be prepared by a conventional method from the microorganism used for the production of MGLP described above, or may be chemically synthesized.

DNA断片やベクターを微生物細胞に導入するには、例えば、リン酸カルシウム法、エレクトロポレーション法、リポフェクション法、パーテイクルガン法、PEG法等の周知の技術を適用することができる。例えばバチルス属細菌に適用可能な方法としては、コンピテントセル形質転換法(J Bacteriol,1967,93:1925-1937)、エレクトロポレーション法(FEMS Microbiol Lett,1990,55:135-138)、プロトプラスト形質転換法(Mol Gen Genet,1979,168:111-115)、Tris-PEG法(J Bacteriol,1983,156:1130-1134)などが挙げられる。 To introduce a DNA fragment or vector into a microbial cell, well-known techniques such as the calcium phosphate method, electroporation, lipofection, particle gun method, and PEG method can be applied. For example, methods that can be applied to Bacillus bacteria include competent cell transformation (J Bacteriol, 1967, 93: 1925-1937), electroporation (FEMS Microbiol Lett, 1990, 55: 135-138), protoplast transformation (Mol Gen Genet, 1979, 168: 111-115), and Tris-PEG method (J Bacteriol, 1983, 156: 1130-1134).

標的遺伝子が欠失又は不活性化した細胞は、そのゲノム配列を確認することにより選択することができる。あるいは、標的タンパク質の発現量又は活性を指標に、標的遺伝子が欠失又は不活性化された細胞を選択することができる。 Cells in which the target gene has been deleted or inactivated can be selected by confirming their genomic sequence. Alternatively, cells in which the target gene has been deleted or inactivated can be selected using the expression level or activity of the target protein as an indicator.

細胞中の標的遺伝子のmRNAを不活性化させる方法としては、siRNAを用いた標的特異的なmRNA阻害が挙げられる。発現した標的タンパク質の活性を低減させる方法としては、標的タンパク質の阻害剤を用いる方法などが挙げられる。 Methods for inactivating the mRNA of a target gene in a cell include target-specific mRNA inhibition using siRNA. Methods for reducing the activity of an expressed target protein include the use of an inhibitor of the target protein.

本発明のMGLP製造に用いる微生物は、本来MGLPの生産能を有する微生物であってもよく、又はMGLP生産能を獲得もしくは向上させるように改変された微生物であってもよい。微生物のMGLP生産能を獲得もしくは向上させる方法としては、目的のMGLPをコードするポリヌクレオチドを微生物に組み込む方法が挙げられる。好ましい実施形態において、本発明のMGLP製造に用いる微生物は、製造すべき目的のMGLPをコードする外来ポリヌクレオチドが組み込まれた組換え微生物である。 The microorganism used in the MGLP production of the present invention may be a microorganism that originally has the ability to produce MGLP, or may be a microorganism that has been modified to acquire or improve the ability to produce MGLP. A method for acquiring or improving the MGLP production ability of a microorganism includes a method of incorporating a polynucleotide encoding the MGLP of interest into the microorganism. In a preferred embodiment, the microorganism used in the MGLP production of the present invention is a recombinant microorganism into which an exogenous polynucleotide encoding the MGLP of interest to be produced has been incorporated.

本発明で製造されるMGLPの種類は、特に限定されないが、Bacterial Lypolytic Enzyme Family XV(非特許文献1)に属するMGLPが好ましい例として挙げられる。より好ましい例としては、当該Family XVに属するバチルス属菌又はゲオバチルス属菌由来の非分泌型MGLPが挙げられる。該非分泌型MGLPの好ましい例としては、ゲオバチルス・サーモデニトリフィカンス由来MGLPであるEstGtA2(GenBank:AEN92268.1、配列番号1)、バチルス・エスピーH-257由来MGLPであるH-257(PDB:4KE8、配列番号2)が挙げられる。該非分泌型MGLPの他の例としては、配列番号3のアミノ酸配列からなるゲオバチルス・ステアロサーモフィリス(Geobacillus stearothermophilus)由来MGLP(NCBI Reference Sequence:WP_053414863.1、以下stLPと呼ぶ)、配列番号4のアミノ酸配列からなるバチルス・エスピーFJAT-29814由来MGLP(NCBI Reference Sequence:WP_066306313.1、以下CI220-6と呼ぶ)、配列番号5のアミノ酸配列からなるバチルス・エスピーEB01由来MGLP(NCBI Reference Sequence:WP_04392037.1、以下CI220-10と呼ぶ)、及び配列番号6のアミノ酸配列からなるバークホルデリア・シングラリス(Burkholderia singularis)由来MGLP(GenBank:SMF98887.1、以下CI220-12と呼ぶ)が挙げられる。 The type of MGLP produced by the present invention is not particularly limited, but preferred examples include MGLP belonging to Bacterial Lypolytic Enzyme Family XV (Non-Patent Document 1). More preferred examples include non-secreted MGLP derived from Bacillus or Geobacillus bacteria belonging to Family XV. Preferred examples of the non-secreted MGLP include EstGtA2 (GenBank: AEN92268.1, SEQ ID NO: 1), which is an MGLP derived from Geobacillus thermodenitrificans, and H-257 (PDB: 4KE8, SEQ ID NO: 2), which is an MGLP derived from Bacillus sp. H-257. Other examples of the non-secreted MGLP include Geobacillus stearothermophilus-derived MGLP consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 (NCBI Reference Sequence: WP_053414863.1, hereinafter referred to as stLP), Bacillus sp. FJAT-29814-derived MGLP consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 (NCBI Reference Sequence: WP_066306313.1, hereinafter referred to as CI220-6), and Bacillus sp. EB01-derived MGLP consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 (NCBI Reference Sequence: WP_066306313.1, hereinafter referred to as CI220-6). Sequence: WP_04392037.1, hereafter referred to as CI220-10), and Burkholderia singularis-derived MGLP consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO:6 (GenBank: SMF98887.1, hereafter referred to as CI220-12).

本発明で製造されるMGLPのさらに好ましい例としては、配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチド、及び配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノアシルグリセロールリパーゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。本発明で製造されるMGLPのより好ましい例としては、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチド、及び配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノアシルグリセロールリパーゼ活性を有するポリペプチドが挙げられる。 More preferred examples of MGLP produced by the present invention include a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 6, and a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 6 and has monoacylglycerol lipase activity. More preferred examples of MGLP produced by the present invention include a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, and a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and has monoacylglycerol lipase activity.

なお本明細書において、「モノグリセリドリパーゼ活性」とは、トリアシルグリセロールをジアシルグリセロールと脂肪酸に分解する活性及びジアシルグリセロールをモノアシルグリセロールと脂肪酸に分解する活性に比較して、より選択的にモノアシルグリセロールをグリセリンと脂肪酸に分解する活性をいうか、又はグリセリンと脂肪酸との合成反応において、トリアシルグリセロール及びジアシルグリセロールに比較して、より選択的にモノアシルグリセロールを合成する活性をいう。 In this specification, "monoglyceride lipase activity" refers to the activity of more selectively decomposing monoacylglycerol into glycerin and fatty acids compared to the activity of decomposing triacylglycerol into diacylglycerol and fatty acids and the activity of decomposing diacylglycerol into monoacylglycerol and fatty acids, or the activity of more selectively synthesizing monoacylglycerol compared to triacylglycerol and diacylglycerol in the synthetic reaction between glycerin and fatty acids.

上記Bacterial Lypolytic Enzyme Family XVに属するMGLPは、非特許文献1に記載の通り、Lipase Engineering Database([www.led.uni-stuttgart.de/])におけるFamily abH11.03と配列相同性の面で同等であることが提唱されている。したがって、本発明で製造されるMGLPの種類の別の好ましい例としては、当該Family abH11.03に属するMGLPが挙げられる。 As described in Non-Patent Document 1, it has been proposed that the MGLP belonging to the Bacterial Lypolytic Enzyme Family XV is equivalent in terms of sequence homology to Family abH11.03 in the Lipase Engineering Database ([www.led.uni-stuttgart.de/]). Therefore, another preferred example of the type of MGLP produced by the present invention is MGLP belonging to the Family abH11.03.

本発明で用いる微生物に組み込まれる目的のMGLPをコードするポリヌクレオチドは、上述した本発明で製造されるMGLPをコードするものであればよい。必要に応じて、当該ポリヌクレオチドは、それを組み込んで発現させる細胞におけるコドン使用頻度にあわせてコドン至適化されている。各種生物が使用するコドンの情報は、Codon Usage Database([www.kazusa.or.jp/codon/])から入手可能である。例えば、枯草菌用にコドン至適化した配列番号1~6のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドは、それぞれ、配列番号7~12のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドである。 The polynucleotide encoding the desired MGLP to be incorporated into the microorganism used in the present invention may be any polynucleotide encoding the MGLP produced by the present invention described above. If necessary, the polynucleotide is codon-optimized according to the codon usage frequency in the cell in which it is incorporated and expressed. Information on the codons used by various organisms is available from the Codon Usage Database ([www.kazusa.or.jp/codon/]). For example, polynucleotides encoding the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6 that have been codon-optimized for Bacillus subtilis are polynucleotides consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 7 to 12, respectively.

好ましくは、該MGLPをコードするポリヌクレオチドは、遺伝子の転写又は翻訳に関わる制御領域と作動可能に連結されている。該制御領域としては、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域が挙げられる。転写開始制御領域としては、プロモーター及び転写開始点が挙げられる。翻訳開始領域としては、リボソーム結合部位及び開始コドンが挙げられる。好ましくは、該MGLPをコードするポリヌクレオチドは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域からなる群より選択される1以上の領域と作動可能に連結されている。より好ましくは、該MGLPをコードするポリヌクレオチドは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されている。一方、該MGLPをコードするポリヌクレオチドは、タンパク質の分泌に関わる領域(例えば分泌シグナルペプチド)と連結されている必要はなく、好ましくは、該タンパク質の分泌に関わる領域と連結されていない。 Preferably, the polynucleotide encoding the MGLP is operably linked to a control region involved in the transcription or translation of a gene. Examples of the control region include a transcription initiation control region and a translation initiation control region. Examples of the transcription initiation control region include a promoter and a transcription start point. Examples of the translation initiation region include a ribosome binding site and a start codon. Preferably, the polynucleotide encoding the MGLP is operably linked to one or more regions selected from the group consisting of a transcription initiation control region and a translation initiation control region. More preferably, the polynucleotide encoding the MGLP is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region. On the other hand, the polynucleotide encoding the MGLP does not need to be linked to a region involved in the secretion of a protein (e.g., a secretory signal peptide), and is preferably not linked to a region involved in the secretion of the protein.

該制御領域の例としては、バチルス属細菌由来のα-アミラーゼ遺伝子の制御領域、プロテアーゼ遺伝子の制御領域、aprE遺伝子の制御領域、spoVG遺伝子の制御領域、バチルス・エスピーKSM-S237株のセルラーゼ遺伝子(特開2000-210081号公報)の制御領域、バチルス・エスピーKSM-64株のセルラーゼ遺伝子(特開2011-103875公報)の制御領域、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)由来のカナマイシン耐性遺伝子の制御領域、クロラムフェニコール耐性遺伝子の制御領域(いずれも、特開2009-089708号公報を参照)、などが挙げられるが、特に限定されない。該制御領域のより好ましい例として、該制御領域のより好ましい例として、バチルス・エスピーKSM-S237株のセルラーゼ遺伝子の制御領域(配列番号78)、バチルス・エスピーKSM-64株のセルラーゼ遺伝子の制御領域(配列番号79)が挙げられる。また、好ましい制御領域としては、配列番号78又は79と少なくとも90%の同一性を有し、かつ遺伝子の転写及び翻訳を制御する機能を有するヌクレオチド配列が挙げられる。該MGLPをコードするポリヌクレオチドと制御領域との連結は、制限酵素法や、上述したSOE-PCR等により行うことができる。 Examples of the control region include, but are not limited to, the control region of the α-amylase gene derived from a bacterium of the genus Bacillus, the control region of a protease gene, the control region of the aprE gene, the control region of the spoVG gene, the control region of the cellulase gene of Bacillus sp. KSM-S237 strain (JP 2000-210081 A), the control region of the cellulase gene of Bacillus sp. KSM-64 strain (JP 2011-103875 A), the control region of the kanamycin resistance gene derived from Staphylococcus aureus, and the control region of the chloramphenicol resistance gene (for all, see JP 2009-089708 A). More preferred examples of the control region include the control region of the cellulase gene of Bacillus sp. KSM-S237 strain (SEQ ID NO: 78) and the control region of the cellulase gene of Bacillus sp. KSM-64 strain (SEQ ID NO: 79). In addition, preferred control regions include nucleotide sequences that have at least 90% identity with SEQ ID NO: 78 or 79 and have the function of controlling gene transcription and translation. The polynucleotide encoding MGLP can be linked to the control region by the restriction enzyme method, the above-mentioned SOE-PCR, or the like.

該MGLPをコードするポリヌクレオチドの微生物への組み込みには、該MGLPをコードするポリヌクレオチド、及び必要に応じてさらに制御領域を含むDNA断片又はベクターを構築し、これを微生物に組み込めばよい。DNA断片やベクターを微生物細胞に導入する方法については、上述したとおりである。 To introduce the polynucleotide encoding the MGLP into a microorganism, a DNA fragment or vector containing the polynucleotide encoding the MGLP and, if necessary, a control region may be constructed and introduced into the microorganism. The method for introducing the DNA fragment or vector into the microbial cell is as described above.

該ベクターは、該MGLPをコードするポリヌクレオチド、及び必要に応じて制御領域を、常法により任意のベクター中に挿入し連結することにより構築することができる。該ベクターの種類は特に限定されず、プラスミド、ファージ、ファージミド、コスミド、ウイルス、YACベクター、シャトルベクター等の任意のベクターであってよい。また該ベクターは、好ましくは、本発明で用いる微生物内で増幅可能なベクターであり、より好ましくは発現ベクターである。好ましいベクターの例としては、限定するものではないが、pHA3040SP64、pHSP64R又はpASP64(特許第3492935号)、pHY300PLK(大腸菌と枯草菌の両方を形質転換可能な発現ベクター;Jpn J Genet,1985,60:235-243)、pAC3(Nucleic Acids Res,1988,16:8732)等のシャトルベクター;pUB110(J Bacteriol,1978,134:318-329)、pTA10607(Plasmid,1987,18:8-15)等のバチルス属細菌の形質転換に利用可能なプラスミドベクター、等が挙げられる。また大腸菌由来のプラスミドベクター(例えばpET22b(+)、pBR322、pBR325、pUC57、pUC118、pUC119、pUC18、pUC19、pBluescript等)を用いることもできる。 The vector can be constructed by inserting and linking the polynucleotide encoding the MGLP and, if necessary, a control region into any vector by a conventional method. The type of the vector is not particularly limited, and may be any vector such as a plasmid, a phage, a phagemid, a cosmid, a virus, a YAC vector, or a shuttle vector. The vector is preferably a vector that can be amplified in the microorganism used in the present invention, and more preferably an expression vector. Preferred examples of the vector include, but are not limited to, shuttle vectors such as pHA3040SP64, pHSP64R or pASP64 (Patent No. 3492935), pHY300PLK (an expression vector capable of transforming both Escherichia coli and Bacillus subtilis; Jpn J Genet, 1985, 60:235-243), and pAC3 (Nucleic Acids Res, 1988, 16:8732); and plasmid vectors that can be used for transformation of bacteria of the genus Bacillus, such as pUB110 (J Bacteriol, 1978, 134:318-329) and pTA10607 (Plasmid, 1987, 18:8-15). Plasmid vectors derived from Escherichia coli (e.g., pET22b(+), pBR322, pBR325, pUC57, pUC118, pUC119, pUC18, pUC19, pBluescript, etc.) can also be used.

本発明でMGLPの製造に使用される微生物を製造する場合、AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減された微生物に、目的のMGLPをコードするポリヌクレオチドを組み込んでもよく、又は、目的のMGLPをコードするポリヌクレオチドが組み込まれた微生物を、AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性を低減するよう改変してもよい。いずれの場合でも、AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されており、かつモノアシルグリセロールリパーゼをコードする外来ポリヌクレオチドが組み込まれている、本発明の組換え微生物を得ることができる。 When producing a microorganism used to produce MGLP in the present invention, a polynucleotide encoding the MGLP of interest may be incorporated into a microorganism in which the activity of AprE or a protease equivalent thereto is reduced, or a microorganism in which a polynucleotide encoding the MGLP of interest has been incorporated may be modified to reduce the activity of AprE or a protease equivalent thereto. In either case, a recombinant microorganism of the present invention can be obtained in which the activity of AprE or a protease equivalent thereto is reduced and an exogenous polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase has been incorporated.

以上の手順で得られたAprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減された微生物を培養して、MGLPを発現させることにより、MGLPを製造することができる。MGLP製造のための該微生物の培養は、該微生物の種や形質に応じて、当該分野の一般的な方法に従って行うことができる。例えば、該微生物がバチルス属菌である場合、その培養のための培地は、バチルス属菌の生育に必要な炭素源、及び無機窒素源もしくは有機窒素源を含む。炭素源としては、例えばグルコース、デキストラン、可溶性デンプン、ショ糖、メタノールなどが挙げられる。無機窒素源もしくは有機窒素源としては、例えばアンモニウム塩類、硝酸塩類、アミノ酸、コーンスチープ・リカー、ペプトン、カゼイン、肉エキス、大豆粕、バレイショ抽出液などが挙げられる。必要に応じて、該培地は、他の栄養素、例えば無機塩(例えば、塩化ナトリウム、塩化カルシウム、リン酸二水素ナトリウム、塩化マグネシウム)、ビタミン類、抗生物質(例えばテトラサイクリン、ネオマイシン、カナマイシン、スペクチノマイシン、エリスロマイシン等)などを含んでいてもよい。培養条件、例えば温度、通気撹拌条件、培地のpH及び培養時間等は、微生物の種や形質、培養スケール等に応じて適宜選択され得る。 MGLP can be produced by culturing the microorganisms with reduced activity of AprE or a protease corresponding thereto obtained by the above procedure and expressing MGLP. The microorganisms for producing MGLP can be cultured according to a general method in the field depending on the species and characteristics of the microorganisms. For example, when the microorganism is a Bacillus genus bacterium, the medium for culturing the microorganism contains a carbon source necessary for the growth of the Bacillus genus bacterium, and an inorganic or organic nitrogen source. Examples of carbon sources include glucose, dextran, soluble starch, sucrose, and methanol. Examples of inorganic or organic nitrogen sources include ammonium salts, nitrates, amino acids, corn steep liquor, peptone, casein, meat extract, soybean meal, and potato extract. If necessary, the medium may contain other nutrients, such as inorganic salts (e.g., sodium chloride, calcium chloride, sodium dihydrogen phosphate, magnesium chloride), vitamins, antibiotics (e.g., tetracycline, neomycin, kanamycin, spectinomycin, erythromycin, etc.), etc. Culture conditions, such as temperature, aeration and agitation conditions, pH of the medium, and culture time, can be appropriately selected depending on the species and characteristics of the microorganism, the culture scale, etc.

本発明のMGLPの製造方法においては、微生物が発現したMGLPは、細胞外に放出される。したがって、培養物の上清から目的のMGLPを回収することができる。例えば、遠心分離やろ過などにより培養上清を集め、次いでタンパク質精製に用いられる一般的な方法、例えば硫酸アンモニウム沈殿、ゲルクロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー等を単独で又は適宜組み合わせて用いることにより、培養上清から目的のMGLPを回収することができる。あるいは、回収又は濃縮した培養上清を、粗酵素液としてそのまま使用することができる。本発明の方法においては、培養した細胞破砕する工程を行うことなく、MGLPを回収することができる。 In the method for producing MGLP of the present invention, MGLP expressed by the microorganism is released outside the cells. Therefore, the target MGLP can be recovered from the culture supernatant. For example, the culture supernatant is collected by centrifugation or filtration, and then the target MGLP can be recovered from the culture supernatant by using a common method used for protein purification, such as ammonium sulfate precipitation, gel chromatography, ion exchange chromatography, affinity chromatography, etc., either alone or in appropriate combination. Alternatively, the recovered or concentrated culture supernatant can be used as it is as a crude enzyme solution. In the method of the present invention, MGLP can be recovered without performing a step of disrupting the cultured cells.

本発明はまた、例示的実施形態として以下の物質、製造方法、用途、方法等を包含する。但し、本発明はこれらの実施形態に限定されない。 The present invention also includes the following substances, manufacturing methods, uses, methods, etc. as exemplary embodiments. However, the present invention is not limited to these embodiments.

〔1〕枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減したバチルス属菌を培養してモノアシルグリセロールリパーゼを発現させることを含む、モノアシルグリセロールリパーゼの製造方法。
〔2〕好ましくは、培養物の上清から前記モノアシルグリセロールリパーゼを回収することをさらに含む、〔1〕記載の製造方法。
〔3〕好ましくは、前記バチルス属菌に、前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが外来的に導入されている、〔1〕又は〔2〕記載の製造方法。
〔4〕前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが、
好ましくは、制御領域と作動可能に連結されており、
好ましくは、タンパク質の分泌に関わる領域と連結されておらず、
より好ましくは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されており、
さらに好ましくは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されており、かつタンパク質の分泌に関わる領域と連結されていない、
〔3〕記載の製造方法。
〔5〕前記モノアシルグリセロールリパーゼが、
好ましくは、前記モノアシルグリセロールリパーゼが、Bacterial Lipolytic Enzyme Family XVに属するモノアシルグリセロールリパーゼであり、
より好ましくは、該Family XVに属する、バチルス属菌又はゲオバチルス属菌由来の非分泌型モノアシルグリセロールリパーゼであり、
さらに好ましくは、配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであり、
さらに好ましくは、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであるか、配列番号3~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号3~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであり、
さらに好ましくは、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドである、
〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の製造方法。
〔6〕好ましくは、前記枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減したバチルス属菌が、枯草菌aprE又はこれに相当する遺伝子が欠失又は不活性化されたバチルス属菌である、〔1〕~〔5〕のいずれか1項記載の製造方法。
〔7〕好ましくは、前記aprEに相当する遺伝子が、aprE(BG10190)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子である、〔6〕記載の製造方法。
〔8〕前記バチルス属菌が、好ましくは、枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及びこれらに相当する遺伝子からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子がさらに欠失又は不活性化されたものである、
〔6〕又は〔7〕記載の製造方法。
〔9〕好ましくは、前記枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及びaprXに相当する遺伝子が以下である、
eprに相当する遺伝子:epr(BG10561)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつマイナー細胞外セリンプロテアーゼをコードする遺伝子;
wprAに相当する遺伝子:wprA(BG11846)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞壁結合型プロテアーゼ前駆体をコードする遺伝子;
mprに相当する遺伝子:mpr(BG10690)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外金属プロテアーゼをコードする遺伝子;
nprBに相当する遺伝子:nprB(BG10691)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外中性プロテアーゼBをコードする遺伝子;
bprに相当する遺伝子:bpr(BG10233)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつバシロペプチダーゼFをコードする遺伝子;
nprEに相当する遺伝子:nprE(BG10448)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外中性金属プロテアーゼをコードする遺伝子;
vprに相当する遺伝子:vpr(BG10591)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつマイナー細胞外セリンプロテアーゼをコードする遺伝子;
aprXに相当する遺伝子:aprX(BG12567)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ菌体内セリンプロテアーゼをコードする遺伝子、
〔8〕記載の製造方法。
〔10〕好ましくは、前記バチルス属菌が枯草菌又はその変異株である、〔1〕~〔9〕のいずれか1項記載の製造方法。
[1] A method for producing monoacylglycerol lipase, comprising culturing a Bacillus bacterium in which Bacillus subtilis AprE or a protease activity equivalent thereto has been reduced, and expressing monoacylglycerol lipase.
[2] The method according to [1], further comprising recovering the monoacylglycerol lipase from the culture supernatant.
[3] The production method according to [1] or [2], wherein a polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is exogenously introduced into the Bacillus bacterium.
[4] The polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is
Preferably, it is operably linked to a control region,
Preferably, it is not linked to a region involved in the secretion of a protein,
More preferably, it is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region,
More preferably, it is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region, and is not linked to a region involved in the secretion of a protein.
The manufacturing method described in [3].
[5] The monoacylglycerol lipase,
Preferably, the monoacylglycerol lipase is a monoacylglycerol lipase belonging to Bacterial Lipolytic Enzyme Family XV,
More preferably, the non-secretory monoacylglycerol lipase is derived from a bacterium of the genus Bacillus or Geobacillus belonging to Family XV,
More preferably, it is a polypeptide consisting of any one of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to any one of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity,
More preferably, the polypeptide is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, a polypeptide consisting of an amino acid sequence at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity, a polypeptide consisting of an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 3 to 6, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 3 to 6 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity,
More preferably, it is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity.
The method according to any one of [1] to [4].
[6] The production method according to any one of [1] to [5], wherein the Bacillus bacterium in which the activity of Bacillus subtilis AprE or a protease corresponding thereto is reduced is a Bacillus bacterium in which Bacillus subtilis aprE or a gene corresponding thereto has been deleted or inactivated.
[7] The production method according to [6], wherein the gene corresponding to aprE preferably has at least 90% identity in nucleotide sequence to aprE (BG10190) and encodes a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side.
[8] The Bacillus bacterium is preferably one in which at least one gene selected from the group consisting of Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, aprX, and genes corresponding thereto has been further deleted or inactivated.
The manufacturing method according to [6] or [7].
[9] Preferably, the genes corresponding to Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX are as follows:
Gene corresponding to epr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with epr (BG10561) and encoding a minor extracellular serine protease;
A gene corresponding to wprA: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with wprA (BG11846) and encoding a cell wall-bound protease precursor;
A gene corresponding to mpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with mpr (BG10690) and encoding an extracellular metalloprotease;
A gene corresponding to nprB: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with nprB (BG10691) and encoding extracellular neutral protease B;
A gene corresponding to bpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with bpr (BG10233) and encoding bacillopeptidase F;
A gene corresponding to nprE: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with nprE (BG10448) and encoding an extracellular neutral metalloprotease;
Gene corresponding to vpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with vpr (BG10591) and encoding a minor extracellular serine protease;
A gene corresponding to aprX: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with aprX (BG12567) and encoding an intracellular serine protease;
The manufacturing method described in [8].
[10] The method according to any one of [1] to [9], wherein the Bacillus bacterium is Bacillus subtilis or a mutant thereof.

〔11〕枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されており、かつモノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが外来的に導入されている、組換えバチルス属菌。
〔12〕前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが、
好ましくは、制御領域と作動可能に連結されており、
好ましくは、タンパク質の分泌に関わる領域と連結されておらず、
より好ましくは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されており、
さらに好ましくは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されており、かつタンパク質の分泌に関わる領域と連結されていない、
〔11〕記載の組換えバチルス属菌。
〔13〕前記モノアシルグリセロールリパーゼが、
好ましくは、前記モノアシルグリセロールリパーゼが、Bacterial Lipolytic Enzyme Family XVに属するモノアシルグリセロールリパーゼであり、
より好ましくは、該Family XVに属する、バチルス属菌又はゲオバチルス属菌由来の非分泌型モノアシルグリセロールリパーゼであり、
さらに好ましくは、配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであり、
さらに好ましくは、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであるか、配列番号3~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号3~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであり、
さらに好ましくは、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドである、
〔11〕又は〔12〕記載の組換えバチルス属菌。
〔14〕好ましくは、枯草菌aprE又はこれに相当する遺伝子が欠失又は不活性化されている、〔11〕~〔13〕のいずれか1項記載の組換えバチルス属菌。
〔15〕好ましくは、前記aprEに相当する遺伝子が、aprE(BG10190)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子である、〔14〕記載の組換えバチルス属菌。
〔16〕好ましくは、枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及びこれらに相当する遺伝子からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子がさらに欠失又は不活性化されている、
〔14〕又は〔15〕記載の組換えバチルス属菌。
〔17〕好ましくは、前記枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及びaprXに相当する遺伝子が以下である、
eprに相当する遺伝子:epr(BG10561)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつマイナー細胞外セリンプロテアーゼをコードする遺伝子;
wprAに相当する遺伝子:wprA(BG11846)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞壁結合型プロテアーゼ前駆体をコードする遺伝子;
mprに相当する遺伝子:mpr(BG10690)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外金属プロテアーゼをコードする遺伝子;
nprBに相当する遺伝子:nprB(BG10691)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外中性プロテアーゼBをコードする遺伝子;
bprに相当する遺伝子:bpr(BG10233)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつバシロペプチダーゼFをコードする遺伝子;
nprEに相当する遺伝子:nprE(BG10448)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外中性金属プロテアーゼをコードする遺伝子;
vprに相当する遺伝子:vpr(BG10591)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつマイナー細胞外セリンプロテアーゼをコードする遺伝子;
aprXに相当する遺伝子:aprX(BG12567)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ菌体内セリンプロテアーゼをコードする遺伝子、
〔16〕記載の組換えバチルス属菌。
〔18〕好ましくは、前記バチルス属菌が枯草菌又はその変異株である、〔11〕~〔17〕のいずれか1項記載の組換えバチルス属菌。
[11] A recombinant Bacillus bacterium, in which the activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto has been reduced, and a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase has been exogenously introduced.
[12] The polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is
Preferably, it is operably linked to a control region,
Preferably, it is not linked to a region involved in the secretion of a protein,
More preferably, it is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region,
More preferably, it is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region, and is not linked to a region involved in the secretion of a protein.
The recombinant Bacillus bacterium described in [11].
[13] The monoacylglycerol lipase,
Preferably, the monoacylglycerol lipase is a monoacylglycerol lipase belonging to Bacterial Lipolytic Enzyme Family XV,
More preferably, the non-secretory monoacylglycerol lipase is derived from a bacterium of the genus Bacillus or Geobacillus belonging to Family XV,
More preferably, it is a polypeptide consisting of any one of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to any one of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity,
More preferably, the polypeptide is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, a polypeptide consisting of an amino acid sequence at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity, a polypeptide consisting of an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 3 to 6, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 3 to 6 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity,
More preferably, it is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity.
The recombinant Bacillus bacterium according to [11] or [12].
[14] The recombinant Bacillus bacterium according to any one of [11] to [13], preferably in which Bacillus subtilis aprE or a gene corresponding thereto is deleted or inactivated.
[15] The recombinant Bacillus bacterium according to [14], wherein the gene corresponding to aprE preferably has at least 90% identity in nucleotide sequence to aprE (BG10190) and encodes a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side.
[16] Preferably, at least one gene selected from the group consisting of Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, aprX, and genes corresponding thereto is further deleted or inactivated.
The recombinant Bacillus bacterium according to [14] or [15].
[17] Preferably, the genes corresponding to Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX are as follows:
Gene corresponding to epr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with epr (BG10561) and encoding a minor extracellular serine protease;
A gene corresponding to wprA: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with wprA (BG11846) and encoding a cell wall-bound protease precursor;
A gene corresponding to mpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with mpr (BG10690) and encoding an extracellular metalloprotease;
A gene corresponding to nprB: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with nprB (BG10691) and encoding extracellular neutral protease B;
A gene corresponding to bpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with bpr (BG10233) and encoding bacillopeptidase F;
A gene corresponding to nprE: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with nprE (BG10448) and encoding an extracellular neutral metalloprotease;
Gene corresponding to vpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with vpr (BG10591) and encoding a minor extracellular serine protease;
A gene corresponding to aprX: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with aprX (BG12567) and encoding an intracellular serine protease;
The recombinant Bacillus bacterium described in [16].
[18] The recombinant Bacillus bacterium according to any one of [11] to [17], wherein the Bacillus bacterium is Bacillus subtilis or a mutant thereof.

〔19〕枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されたバチルス属菌に、モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドを組み込むことを含むか、又は、モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが組み込まれたバチルス属菌において枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性を低減させることを含む、組換えバチルス属菌の製造方法。
〔20〕前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが、
好ましくは、制御領域と作動可能に連結されており、
好ましくは、タンパク質の分泌に関わる領域と連結されておらず、
より好ましくは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されており、
さらに好ましくは、転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域と作動可能に連結されており、かつタンパク質の分泌に関わる領域と連結されていない、
〔19〕記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
〔21〕前記モノアシルグリセロールリパーゼが、
好ましくは、前記モノアシルグリセロールリパーゼが、Bacterial Lipolytic Enzyme Family XVに属するモノアシルグリセロールリパーゼであり、
より好ましくは、該Family XVに属する、バチルス属菌又はゲオバチルス属菌由来の非分泌型モノアシルグリセロールリパーゼであり、
さらに好ましくは、配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号1~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであり、
さらに好ましくは、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであるか、配列番号3~6のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号3~6のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドであり、
さらに好ましくは、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチドであるか、又は配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなり、かつモノグリセリドリパーゼ活性を有するポリペプチドをコードするポリペプチドである、
〔19〕又は〔20〕記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
〔22〕好ましくは、枯草菌aprE又はこれに相当する遺伝子が欠失又は不活性化されている、〔19〕~〔21〕のいずれか1項記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
〔23〕好ましくは、前記aprEに相当する遺伝子が、aprE(BG10190)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子である、〔22〕記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
〔24〕好ましくは、枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及びこれらに相当する遺伝子からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子がさらに欠失又は不活性化されている、
〔22〕又は〔23〕記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
〔25〕好ましくは、前記枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、及びaprXに相当する遺伝子が以下である、
eprに相当する遺伝子:epr(BG10561)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつマイナー細胞外セリンプロテアーゼをコードする遺伝子;
wprAに相当する遺伝子:wprA(BG11846)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞壁結合型プロテアーゼ前駆体をコードする遺伝子;
mprに相当する遺伝子:mpr(BG10690)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外金属プロテアーゼをコードする遺伝子;
nprBに相当する遺伝子:nprB(BG10691)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外中性プロテアーゼBをコードする遺伝子;
bprに相当する遺伝子:bpr(BG10233)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつバシロペプチダーゼFをコードする遺伝子;
nprEに相当する遺伝子:nprE(BG10448)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ細胞外中性金属プロテアーゼをコードする遺伝子;
vprに相当する遺伝子:vpr(BG10591)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつマイナー細胞外セリンプロテアーゼをコードする遺伝子;
aprXに相当する遺伝子:aprX(BG12567)とヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつ菌体内セリンプロテアーゼをコードする遺伝子、
〔24〕記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
〔26〕好ましくは、前記バチルス属菌が枯草菌又はその変異株である、〔19〕~〔25〕のいずれか1項記載の組換えバチルス属菌の製造方法。
[19] A method for producing a recombinant Bacillus bacterium, comprising incorporating a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase into a Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto, or comprising reducing the activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto in a Bacillus bacterium having incorporated a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase.
[20] The polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is
Preferably, it is operably linked to a control region,
Preferably, it is not linked to a region involved in the secretion of a protein,
More preferably, it is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region,
More preferably, it is operably linked to a transcription initiation control region and a translation initiation control region, and is not linked to a region involved in the secretion of a protein.
A method for producing the recombinant Bacillus bacterium described in [19].
[21] The monoacylglycerol lipase,
Preferably, the monoacylglycerol lipase is a monoacylglycerol lipase belonging to Bacterial Lipolytic Enzyme Family XV,
More preferably, the non-secretory monoacylglycerol lipase is derived from a bacterium of the genus Bacillus or Geobacillus belonging to Family XV,
More preferably, it is a polypeptide consisting of any one of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to any one of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 6 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity,
More preferably, the polypeptide is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, a polypeptide consisting of an amino acid sequence at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity, a polypeptide consisting of an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 3 to 6, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 3 to 6 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity,
More preferably, it is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 and encoding a polypeptide having monoglyceride lipase activity.
The method for producing the recombinant Bacillus bacterium according to [19] or [20].
[22] The method for producing a recombinant Bacillus bacterium according to any one of [19] to [21], preferably wherein Bacillus subtilis aprE or a gene corresponding thereto is deleted or inactivated.
[23] The method for producing a recombinant Bacillus bacterium according to [22], wherein the gene corresponding to aprE preferably has at least 90% identity in nucleotide sequence to aprE (BG10190) and encodes a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side.
[24] Preferably, at least one gene selected from the group consisting of Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, aprX, and genes corresponding thereto is further deleted or inactivated.
The method for producing the recombinant Bacillus bacterium according to [22] or [23].
[25] Preferably, the genes corresponding to Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, and aprX are as follows:
Gene corresponding to epr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with epr (BG10561) and encoding a minor extracellular serine protease;
A gene corresponding to wprA: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with wprA (BG11846) and encoding a cell wall-bound protease precursor;
A gene corresponding to mpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with mpr (BG10690) and encoding an extracellular metalloprotease;
A gene corresponding to nprB: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with nprB (BG10691) and encoding extracellular neutral protease B;
A gene corresponding to bpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with bpr (BG10233) and encoding bacillopeptidase F;
A gene corresponding to nprE: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with nprE (BG10448) and encoding an extracellular neutral metalloprotease;
Gene corresponding to vpr: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with vpr (BG10591) and encoding a minor extracellular serine protease;
A gene corresponding to aprX: a gene having at least 90% identity in nucleotide sequence with aprX (BG12567) and encoding an intracellular serine protease;
A method for producing the recombinant Bacillus bacterium described in [24].
[26] The method for producing a recombinant Bacillus bacterium according to any one of [19] to [25], wherein the Bacillus bacterium is Bacillus subtilis or a mutant thereof.

以下、実施例を用いて本発明をさらに具体的に説明する。但し、本発明の技術的範囲はこれら実施例に限定されるものではない。 The present invention will be described in more detail below using examples. However, the technical scope of the present invention is not limited to these examples.

以下の実施例において、PCRはPrimeSTAR Max Premix(タカラバイオ)を使用して行った。In-fusion法はIn-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ)を使用して行った。宿主微生物へのプラスミドの導入は、プロトプラスト法(Mol.Gen.Genet,1979,168:111-115)にて行った。タンパク質生産のための組換え微生物の培養には、LB培地(1%トリプトン、0.5%酵母エキス、1%NaCl)、又は2×L-マルトース培地(2%トリプトン、1%酵母エキス、1%NaCl、7.5%マルトース、7.5ppm硫酸マンガン4-5水和物)を用いた。培養上清におけるリパーゼ活性の測定は、以下の手順で行った。 In the following examples, PCR was performed using PrimeSTAR Max Premix (Takara Bio). The in-fusion method was performed using the In-Fusion HD Cloning Kit (Takara Bio). Plasmids were introduced into host microorganisms by the protoplast method (Mol. Gen. Genet, 1979, 168: 111-115). Recombinant microorganisms for protein production were cultured in LB medium (1% tryptone, 0.5% yeast extract, 1% NaCl) or 2x L-maltose medium (2% tryptone, 1% yeast extract, 1% NaCl, 7.5% maltose, 7.5 ppm manganese sulfate 4-5 hydrate). Lipase activity in the culture supernatant was measured as follows.

(リパーゼ活性測定方法)
適宜希釈した培養上清5μLを96穴アッセイプレート(IWAKI)の各ウェルに分注した。各ウェルに、さらに脱イオン水183μL、1M Tris-HCl(pH8.0)10μL、及び基質溶液2μLを分注し、反応を開始した。基質溶液には、4-Nitrophenyl octanoate(SIGMA-ALDRICH)を100mM含むジメチルスルホキシド(DMSO)溶液を用いた。40℃にて15分間反応させ、反応液の405nmの吸光度をマイクロプレートリーダー(TECAN)を用いて測定した。1Uは40℃で1分間に1μmolのpNAを遊離する酵素量と定義した。
(Lipase activity measurement method)
5 μL of appropriately diluted culture supernatant was dispensed into each well of a 96-well assay plate (IWAKI). 183 μL of deionized water, 10 μL of 1M Tris-HCl (pH 8.0), and 2 μL of substrate solution were further dispensed into each well to initiate the reaction. A dimethyl sulfoxide (DMSO) solution containing 100 mM 4-nitrophenyl octanoate (SIGMA-ALDRICH) was used as the substrate solution. The reaction was carried out at 40°C for 15 minutes, and the absorbance of the reaction solution at 405 nm was measured using a microplate reader (TECAN). 1 U was defined as the amount of enzyme that liberates 1 μmol of pNA per minute at 40°C.

表2~7に、以下の実施例で使用したプライマーの名称とヌクレオチド配列を示す。 Tables 2 to 7 show the names and nucleotide sequences of the primers used in the following examples.

Figure 0007702230000002
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Figure 0007702230000003
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Figure 0007702230000004
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Figure 0007702230000005
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Figure 0007702230000006
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Figure 0007702230000007
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実施例1 遺伝子欠失枯草菌株の構築
(1)aprE欠失株の構築
(遺伝子欠失用プラスミドの構築)
枯草菌168株から抽出したゲノムDNAを鋳型とし、表3に示すaprEfw1とaprEUpr(配列番号27及び28)、及びaprEDNfとaprErv-repU(配列番号29及び30)の各プライマーセットを用いて、ゲノム上のaprE遺伝子の上流に隣接する0.6kb断片(A)、及び下流に隣接する0.5kb断片(B)をそれぞれ調製した。別途、プラスミドpC194(J.Bacteriol,150(2),815,1982)由来のクロラムフェニコール耐性遺伝子の上流にプラスミドpUB110(Plasmid,1986,15:93-103)由来のrepU遺伝子のプロモーター領域(Nucleic Acids Res,1989,17:4410)を連結した1.2kb断片(C)を調製した。断片(C)の調製では、まず、repUfwとrepUr-Cm(配列番号32及び33、表3)のプライマーセット及び鋳型としてプラスミドpUB110を用いて、repU遺伝子プロモーター領域を含む0.4kb断片(D)を調製した。さらにCmUf-repとCmrv1(配列番号34及び35、表3)のプライマーセット及び鋳型としてプラスミドpC194を用いて、クロラムフェニコール耐性遺伝子を含む0.8kb断片(E)調製した。次いで、断片(D)と(E)の混合物を鋳型とし、プライマーrepUfwとCmrv1を用いたSOE-PCRにより断片(C)を調製した。次に、得られた(A)、(B)及び(C)断片の混合物を鋳型とし、プライマーaprEfw2とCmrv2(配列番号31及び36、表3)を用いたSOE-PCRによって、(A)(B)(C)の順に断片を結合させ、2.2kbのDNA断片を得た。このDNA断片の末端を平滑化及び5’-リン酸化し、プラスミドpUC118(Methods Enzymol,1987,153:3-11)のSmaI制限酵素部位に挿入してaprE遺伝子欠失用プラスミドpUC118-CmrΔaprEを構築した。
Example 1 Construction of a gene-deleted Bacillus subtilis strain (1) Construction of an aprE-deleted strain (Construction of a plasmid for gene deletion)
A 0.6 kb fragment (A) adjacent to the upstream side of the aprE gene on the genome and a 0.5 kb fragment (B) adjacent to the downstream side of the aprE gene on the genome were prepared using the genomic DNA extracted from Bacillus subtilis strain 168 as a template and the primer sets of aprEfw1 and aprEUpr (SEQ ID NOs: 27 and 28), and aprEDNf and aprErv-repU (SEQ ID NOs: 29 and 30) shown in Table 3. Separately, a 1.2 kb fragment (C) was prepared by linking the promoter region (Nucleic Acids Res, 1989, 17: 4410) of the repU gene derived from plasmid pUB110 (Plasmid, 1986, 15: 93-103) to the upstream side of the chloramphenicol resistance gene derived from plasmid pC194 (J. Bacteriol, 150 (2), 815, 1982). In preparing fragment (C), first, a 0.4 kb fragment (D) containing the repU gene promoter region was prepared using a primer set of repUfw and repUr-Cm (SEQ ID NOs: 32 and 33, Table 3) and plasmid pUB110 as a template. Further, a 0.8 kb fragment (E) containing a chloramphenicol resistance gene was prepared using a primer set of CmUf-rep and Cmrv1 (SEQ ID NOs: 34 and 35, Table 3) and plasmid pC194 as a template. Next, fragment (C) was prepared by SOE-PCR using primers repUfw and Cmrv1 with a mixture of fragments (D) and (E) as a template. Next, the resulting mixture of fragments (A), (B) and (C) was used as a template, and the fragments were ligated in the order of (A), (B) and (C) by SOE-PCR using primers aprEfw2 and Cmrv2 (SEQ ID NOs: 31 and 36, Table 3) to obtain a 2.2 kb DNA fragment. The ends of this DNA fragment were blunted and 5'-phosphorylated, and the fragment was inserted into the SmaI restriction enzyme site of plasmid pUC118 (Methods Enzymol, 1987, 153: 3-11) to construct a plasmid for deleting the aprE gene, pUC118-CmrΔaprE.

(遺伝子欠失株の構築)
構築したプラスミドpUC118-CmrΔaprEをコンピテントセル形質転換法(J Bacteriol,1967,93,1925-1937)によって枯草菌変異株trpC2(trpC2株)に導入した。aprE遺伝子上流領域又は下流領域の相当する領域間での1重交差の相同組換えによりプラスミドとゲノムDNAとが融合した形質転換株を、クロラムフェニコール耐性を指標に取得した。得られた形質転換株をLB培地に接種し、37℃にて2時間培養後、再度コンピテンス誘導操作を行い、導入したプラスミドとゲノム上に重複して存在するaprE遺伝子上流領域又は下流領域の間におけるゲノム内相同組換えを誘導した。プラスミド導入の際と異なる領域で相同組換えが起こった場合、aprE遺伝子、及びプラスミドに由来するクロラムフェニコール耐性遺伝子が欠失する。
(Construction of gene deletion strains)
The constructed plasmid pUC118-CmrΔaprE was introduced into a Bacillus subtilis mutant strain trpC2 (trpC2 strain) by a competent cell transformation method (J Bacteriol, 1967, 93, 1925-1937). A transformed strain in which the plasmid and genomic DNA were fused by single-crossover homologous recombination between the regions corresponding to the upstream or downstream region of the aprE gene was obtained using chloramphenicol resistance as an indicator. The resulting transformed strain was inoculated into LB medium and cultured at 37° C. for 2 hours, after which competence induction was performed again to induce intragenomic homologous recombination between the introduced plasmid and the upstream or downstream region of the aprE gene present in duplicate on the genome. If homologous recombination occurs in a region different from that at the time of plasmid introduction, the aprE gene and the chloramphenicol resistance gene derived from the plasmid are deleted.

次に、クロラムフェニコール感受性株の存在比率を高める為、以下の要領でアンピシリン濃縮操作を行なった。コンピテントセル誘導後の培養液を、終濃度5ppmのクロラムフェニコール及び終濃度100ppmのアンピシリンナトリウムを含むLB培地1mLに600nmにおける濁度(OD600)が0.003になるように接種した。37℃にて5時間培養後、10,000ppmのアンピシリンナトリウム水溶液を10μL添加してさらに3時間培養した。培養終了後、2%塩化ナトリウム水溶液にて菌体を遠心洗浄した後、1mLの2%塩化ナトリウム水溶液に懸濁し、懸濁液100μLをLB寒天培地に塗沫した。37℃にて約15時間インキュベーションし、生育した菌株のうち、プラスミド領域の脱落に伴ってクロラムフェニコール感受性となったものを選抜した。選抜した菌株のゲノムDNAを鋳型とし、プライマーaprEfw2とaprErv-repU(配列番号31及び30、表3)を用いたPCRを行なうことによりaprE遺伝子欠失を確認して、aprE遺伝子欠失株trpC2/ΔaprEを取得した。 Next, in order to increase the proportion of chloramphenicol-sensitive strains, ampicillin concentration was performed as follows. The culture solution after competent cell induction was inoculated into 1 mL of LB medium containing chloramphenicol at a final concentration of 5 ppm and ampicillin sodium at a final concentration of 100 ppm so that the turbidity at 600 nm (OD600) was 0.003. After 5 hours of cultivation at 37°C, 10 μL of 10,000 ppm ampicillin sodium aqueous solution was added and cultivated for another 3 hours. After the cultivation was completed, the cells were centrifuged and washed with a 2% sodium chloride aqueous solution, then suspended in 1 mL of a 2% sodium chloride aqueous solution, and 100 μL of the suspension was spread on an LB agar medium. The cells were incubated at 37°C for about 15 hours, and among the grown strains, those that became chloramphenicol-sensitive due to the loss of the plasmid region were selected. The genomic DNA of the selected strain was used as a template to perform PCR using primers aprEfw2 and aprErv-repU (sequence numbers 31 and 30, Table 3) to confirm the deletion of the aprE gene, and the aprE gene-deleted strain trpC2/ΔaprE was obtained.

(2)epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE又はvpr欠失株の構築
(1)と同様の操作を繰り返すことにより、trpC2株からepr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、及びvprの各遺伝子を欠失させた遺伝子欠失株trpC2/Δepr、trpC2/ΔwprA、trpC2/Δmpr、trpC2/ΔnprB、trpC2/Δbpr、trpC2/ΔnprE、及びtrpC2/Δvprを取得した。各欠失株の作製に用いたプライマーの配列を表4~5に、また各プライマーと(1)で用いたaprE遺伝子欠失用プライマーとの対応を表6に示す。
(2) Construction of epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, or vpr deletion strains By repeating the same procedure as in (1), the epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, and vpr genes were deleted from the trpC2 strain to obtain gene deletion strains trpC2/Δepr, trpC2/ΔwprA, trpC2/Δmpr, trpC2/ΔnprB, trpC2/Δbpr, trpC2/ΔnprE, and trpC2/Δvpr. The sequences of the primers used to prepare each deletion strain are shown in Tables 4 and 5, and the correspondence between each primer and the aprE gene deletion primer used in (1) is shown in Table 6.

(3)aprX欠失株の構築
二重交差法によりaprX遺伝子がスペクチノマイシン耐性遺伝子に置換されたaprX遺伝子欠失株を構築した。枯草菌168株から抽出したゲノムDNAを鋳型とし、表7に示すaprX+5FとaprX+563R(配列番号72及び73)、及びaprX+775FとaprX+1320R(配列番号74及び75)の各プライマーセットを用いて、ゲノム上のaprX遺伝子の上流を含む5’末端側の558bp断片(F)、及び3’末端側の545bp断片(G)をそれぞれ調製した。別途、プラスミドpDG1727(Gene,167,335,1995)のBamHI及びXhoI制限酵素切断点よりスペクチノマイシン耐性遺伝子領域を切り出し、pBluescript II SK(+)(Stratagene)のBamHI及びXhoI制限酵素切断点に挿入し、プラスミドpBlueSPRを構築した。pBlueSPRのDNAを鋳型とし、PB-M13-20とPB-M13Rev(配列番号76及び77、表7)のプライマーセットを用いてスペクチノマイシン耐性遺伝子領域(H)を増幅した。(F)、(G)及び(H)断片の混合物を鋳型とし、aprX+5FとaprX+1320R(配列番号72及び75、表7)のプライマーセットを用いたSOE-PCR法により、(E)(H)(G)の順に結合したDNA断片を調製した。調製したDNA断片を用い、コンピテントセル形質転換法によるtrpC2株の形質転換を行い、次いでスペクチノマイシン(100μg/mL)を含むLB寒天培地上に生育したコロニーを形質転換体として分離した。得られた形質転換体のゲノムを抽出し、PCRによってaprX遺伝子が欠失してスペクチノマイシン耐性遺伝子に置換していることを確認して、aprX遺伝子欠失株trpC2/ΔaprXを取得した。
(3) Construction of aprX deletion strain An aprX deletion strain in which the aprX gene was replaced with a spectinomycin resistance gene was constructed by double crossover. Using genomic DNA extracted from Bacillus subtilis 168 strain as a template, a 558 bp fragment (F) on the 5'-end side including the upstream of the aprX gene on the genome and a 545 bp fragment (G) on the 3'-end side were prepared using the primer sets aprX+5F and aprX+563R (SEQ ID NOs: 72 and 73) and aprX+775F and aprX+1320R (SEQ ID NOs: 74 and 75) shown in Table 7. Separately, a spectinomycin resistance gene region was excised from the BamHI and XhoI restriction enzyme cleavage site of plasmid pDG1727 (Gene, 167, 335, 1995) and inserted into the BamHI and XhoI restriction enzyme cleavage site of pBluescript II SK(+) (Stratagene) to construct plasmid pBlueSPR. Using pBlueSPR DNA as a template, a spectinomycin resistance gene region (H) was amplified using a primer set of PB-M13-20 and PB-M13Rev (SEQ ID NOs: 76 and 77, Table 7). A DNA fragment in which the fragments (E), (H) and (G) were linked in this order was prepared by SOE-PCR using a primer set of aprX+5F and aprX+1320R (SEQ ID NOs: 72 and 75, Table 7) with a mixture of the fragments (F), (G) and (H) as a template. The prepared DNA fragment was used to transform the trpC2 strain by competent cell transformation, and colonies grown on LB agar medium containing spectinomycin (100 μg/mL) were isolated as transformants. The genome of the obtained transformant was extracted, and it was confirmed by PCR that the aprX gene had been deleted and replaced with a spectinomycin resistance gene, to obtain an aprX gene-deleted strain trpC2/ΔaprX.

実施例2 各種遺伝子欠失株のMGLP生産性比較
(1)EstGtA2発現組換え枯草菌株の構築
実施例1で作製した遺伝子欠失株にモノアシルグリセロールリパーゼEstGtA2(配列番号1)をコードする遺伝子を導入した組換え枯草菌株を構築した。枯草菌用にコドン至適化したEstGtA2をコードする遺伝子(配列番号7)をプラスミドpUC57に挿入したプラスミド(EstGtA2-pUC57)を、GenScript社の人工遺伝子合成サービスを利用して作製した。これを鋳型とし、プライマーEstGtA2-F及びプライマーEstGtA2-R(配列番号13及び14、表2)のプライマーセットを用いてPCRを行った。同様に、WO2006/068148A1の実施例7に記載のプラスミドpHY-S237を鋳型とし、プライマーpHY-S237-F及びpHY-S237-R(配列番号15及び16、表2)を使用してPCR反応を行った。それぞれのPCR産物をDpnI(New England Biolabs)にてDpnI処理を行った。得られた両断片を適量混合し、In-fusion法を用いてプラスミドを合成した(pHY-EstGtA2)。この際、セルラーゼS237の制御領域(転写開始制御領域及び翻訳開始制御領域を含む領域、配列番号78)とEstGtA2の遺伝子が作動可能に連結するように設計した。得られたプラスミドをプロトプラスト形質転換法にてtrpC2株(対照)、及び実施例1で作製した遺伝子欠失株trpC2/ΔaprE、trpC2/Δepr、trpC2/ΔwprA、trpC2/Δmpr、trpC2/ΔnprB、trpC2/Δbpr、trpC2/ΔnprE、trpC2/Δvpr、及びtrpC2/ΔaprXに導入した。
Example 2 Comparison of MGLP productivity of various gene deletion strains (1) Construction of EstGtA2-expressing recombinant Bacillus subtilis strain A recombinant Bacillus subtilis strain was constructed by introducing a gene encoding monoacylglycerol lipase EstGtA2 (SEQ ID NO: 1) into the gene deletion strain prepared in Example 1. A plasmid (EstGtA2-pUC57) was prepared by inserting a gene (SEQ ID NO: 7) encoding EstGtA2 codon-optimized for Bacillus subtilis into plasmid pUC57, using the artificial gene synthesis service of GenScript Inc. Using this as a template, PCR was performed using a primer set of primer EstGtA2-F and primer EstGtA2-R (SEQ ID NOs: 13 and 14, Table 2). Similarly, a PCR reaction was carried out using the plasmid pHY-S237 described in Example 7 of WO2006/068148A1 as a template and primers pHY-S237-F and pHY-S237-R (SEQ ID NOs: 15 and 16, Table 2). Each PCR product was treated with DpnI (New England Biolabs). Appropriate amounts of the two obtained fragments were mixed, and a plasmid was synthesized using the in-fusion method (pHY-EstGtA2). At this time, the control region of cellulase S237 (a region including a transcription initiation control region and a translation initiation control region, SEQ ID NO: 78) and the EstGtA2 gene were designed to be operably linked. The obtained plasmid was introduced into the trpC2 strain (control) and the gene deletion strains trpC2/ΔaprE, trpC2/Δepr, trpC2/ΔwprA, trpC2/Δmpr, trpC2/ΔnprB, trpC2/Δbpr, trpC2/ΔnprE, trpC2/Δvpr, and trpC2/ΔaprX prepared in Example 1 by protoplast transformation.

(2)MGLP生産性比較
(1)で得られた組換え枯草菌株を3mL/大試験管(φ18×180mm)のLB培地で30℃、15時間、250rpmで振盪培養した。得られた培養液0.02mLを20mL/500mL容ヒダ付三角フラスコ(バイオット)の2×L-マルトース培地に接種し、30℃で96時間、210rpmで振盪培養した。培養後、培養液を遠心分離(8000rpm×30分)し、得られた上清からフィルター(0.45μm、PVDF、メルクミリポア製)によって菌体を除き、残った培養上清のリパーゼ活性を測定した。またSDS-PAGEにより、培養上清におけるEstGtA2の蓄積を確認した。SDS-PAGEでは、タンパク質のバンドはBio-Safe CBB G-250ステイン(Bio-Rad)を用いて確認した。
(2) MGLP Productivity Comparison The recombinant Bacillus subtilis strain obtained in (1) was cultured in LB medium (3 mL/large test tube (φ18×180 mm) at 30° C. for 15 hours with shaking at 250 rpm. 0.02 mL of the resulting culture was inoculated into 2×L-maltose medium in a 20 mL/500 mL pleated Erlenmeyer flask (Bioit) and cultured at 30° C. for 96 hours with shaking at 210 rpm. After the culture, the culture was centrifuged (8000 rpm×30 min), and the cells were removed from the resulting supernatant using a filter (0.45 μm, PVDF, Merck Millipore), and the lipase activity of the remaining culture supernatant was measured. Accumulation of EstGtA2 in the culture supernatant was also confirmed by SDS-PAGE. In SDS-PAGE, protein bands were identified using Bio-Safe CBB G-250 stain (Bio-Rad).

図1は、各組換え枯草菌株の96時間培養後に得られた培養上清におけるリパーゼ活性を示す。図中、横軸は組換え枯草菌株の宿主(trpC2、trpC2/Δepr、trpC2/ΔwprA、trpC2/Δmpr、trpC2/ΔnprB、trpC2/Δbpr、trpC2/ΔnprE、trpC2/Δvpr、trpC2/ΔaprE、trpC2/ΔaprX)を示し、縦軸は各株についての培養上清中のリパーゼ活性を示す。リパーゼ活性値はtprC2株についての活性を100%とした相対活性で示している。aprE欠失株で培養上清中のリパーゼ活性が顕著に向上した。図2は、各組換え枯草菌株についての96時間培養後の培養上清でのSDS-PAGEの結果を示す。各レーンは組換え枯草菌株の欠失遺伝子で表示されている。aprE欠失株では培養上清中にEstGtA2が蓄積されていた一方、他の欠失株では、培養上清中におけるEstGtA2の蓄積が確認できなかった。以上の結果から、aprE遺伝子又はそれに相当する遺伝子を欠失又は不活化した株を用いることで、本来菌体内酵素であるモノアシルグリセロールリパーゼEstGtA2を細胞外に分泌させて、培養上清中から回収することができることが分かった。 Figure 1 shows lipase activity in the culture supernatant obtained after 96 hours of culture of each recombinant Bacillus subtilis strain. In the figure, the horizontal axis shows the host of the recombinant Bacillus subtilis strain (trpC2, trpC2/Δepr, trpC2/ΔwprA, trpC2/Δmpr, trpC2/ΔnprB, trpC2/Δbpr, trpC2/ΔnprE, trpC2/Δvpr, trpC2/ΔaprE, trpC2/ΔaprX), and the vertical axis shows lipase activity in the culture supernatant for each strain. Lipase activity values are shown as relative activities, with the activity for the tprC2 strain taken as 100%. Lipase activity in the culture supernatant was significantly improved with the aprE deletion strain. FIG. 2 shows the results of SDS-PAGE of the culture supernatant after 96 hours of culture for each recombinant Bacillus subtilis strain. Each lane indicates the deleted gene of the recombinant Bacillus subtilis strain. While EstGtA2 accumulated in the culture supernatant of the aprE deleted strain, accumulation of EstGtA2 in the culture supernatant of the other deleted strains was not confirmed. From these results, it was found that by using a strain in which the aprE gene or a gene equivalent thereto is deleted or inactivated, monoacylglycerol lipase EstGtA2, which is originally an intracellular enzyme, can be secreted outside the cells and recovered from the culture supernatant.

実施例3 aprE欠失株による各種MGLP生産性
(1)MGLP発現組換え枯草菌株の構築
Bacterial Lipolytic Enzyme Family XVに属するMGLPであるH-257、stLP、CI220-6、CI220-10、及びCI220-12(配列番号2~6)を発現する組換え枯草菌株を構築した。枯草菌用にコドン至適化した各MGLPをコードする遺伝子(配列番号8~12)をプラスミドpUC57に挿入したプラスミド(H-257-pUC57、stLP-pUC57、CI220-6-pUC57、CI220-10-pUC57、及びCI220-12-pUC57)をGenScript社の人工遺伝子合成サービスを利用して作製した。作製したプラスミドを鋳型として、表2に示すプライマーペアH257-F/R(配列番号17及び18)、stLP-F/R(配列番号19及び20)、CI220-6-F/R(配列番号21及び22)、CI220-10-F/R(配列番号23及び24)、及びCI220-12-F/R(配列番号25及び26)をそれぞれ用いてPCRを行った。同様に、プラスミドpHY-S237を鋳型とし、プライマーpHY-S237-F及びpHY-S237-R(配列番号15及び16)を使用してPCR反応を行った。実施例2(1)と同様に、PCR産物のDpnI処理し、In-fusion法を用いてプラスミドを合成し(pHY-H-257、pHY-stLP、pHY-CI220-6、pHY-CI220-10、及びpHY-CI220-12)、得られたプラスミドをプロトプラスト形質転換法にてtrpC2株及びtrpC2/ΔaprE株に導入した。
Example 3 Productivity of various MGLPs by aprE-deficient strains (1) Construction of recombinant Bacillus subtilis strains expressing MGLPs A recombinant Bacillus subtilis strain was constructed that expresses H-257, stLP, CI220-6, CI220-10, and CI220-12 (SEQ ID NOs: 2 to 6), which are MGLPs belonging to Bacterial Lipolytic Enzyme Family XV. Plasmids (H-257-pUC57, stLP-pUC57, CI220-6-pUC57, CI220-10-pUC57, and CI220-12-pUC57) in which genes (SEQ ID NOs: 8 to 12) encoding each MGLP that had been codon-optimized for Bacillus subtilis were inserted into plasmid pUC57 were prepared using the artificial gene synthesis service provided by GenScript. Using the prepared plasmid as a template, PCR was performed using the primer pairs H257-F/R (SEQ ID NOs: 17 and 18), stLP-F/R (SEQ ID NOs: 19 and 20), CI220-6-F/R (SEQ ID NOs: 21 and 22), CI220-10-F/R (SEQ ID NOs: 23 and 24), and CI220-12-F/R (SEQ ID NOs: 25 and 26) shown in Table 2. Similarly, PCR reaction was performed using the plasmid pHY-S237 as a template and the primers pHY-S237-F and pHY-S237-R (SEQ ID NOs: 15 and 16). As in Example 2(1), the PCR products were treated with DpnI and plasmids were synthesized by in-fusion method (pHY-H-257, pHY-stLP, pHY-CI220-6, pHY-CI220-10, and pHY-CI220-12), and the obtained plasmids were introduced into the trpC2 strain and the trpC2/ΔaprE strain by protoplast transformation method.

(2)aprE欠失組換え枯草菌株のMGLP生産性
(1)で得られた組換え枯草菌株を1mLのLB培地で一夜、30℃で振盪培養した。得られた培養液0.003mLを3mLの2×L-マルトース培地に接種し、30℃で72時間振盪培養した。培養後、実施例2(2)と同様の手順で、培養上清を分離し、SDS-PAGEにより菌体外に生産されたMGLPの量を確認した。タンパク質のバンドはミニプロティアンTGX Stain-Freeゲル(Bio-Rad)により確認した。
(2) MGLP productivity of aprE-deleted recombinant Bacillus subtilis strain The recombinant Bacillus subtilis strain obtained in (1) was cultured overnight at 30°C with shaking in 1 mL of LB medium. 0.003 mL of the resulting culture was inoculated into 3 mL of 2xL-maltose medium and cultured at 30°C for 72 hours with shaking. After the culture, the culture supernatant was separated in the same manner as in Example 2(2), and the amount of MGLP produced outside the cells was confirmed by SDS-PAGE. Protein bands were confirmed by Mini-Protean TGX Stain-Free Gel (Bio-Rad).

図3は、各組換え枯草菌株についての72時間培養後の培養上清におけるSDS-PAGEの結果を示す。各レーンは組換え枯草菌株の欠失遺伝子及び発現させたMGLPの種類で表示されている。発現させたいずれのMGLP(H-257、stLP、CI220-6、CI220-10、及びCI220-12)も、aprE欠失株の培養上清中に蓄積されていた一方、trpC2株の培養上清中ではいずれのMGLPの蓄積も確認できなかった。以上の結果から、aprE遺伝子又はそれに相当する遺伝子を欠失又は不活化した株を用いることで、菌体内酵素である各種MGLPを細胞外に分泌させて、培養上清中から回収することができること分かった。 Figure 3 shows the results of SDS-PAGE of the culture supernatant after 72 hours of culture for each recombinant Bacillus subtilis strain. Each lane indicates the deleted gene of the recombinant Bacillus subtilis strain and the type of MGLP expressed. All of the expressed MGLPs (H-257, stLP, CI220-6, CI220-10, and CI220-12) accumulated in the culture supernatant of the aprE deleted strain, whereas no accumulation of any MGLP was confirmed in the culture supernatant of the trpC2 strain. These results demonstrate that by using a strain in which the aprE gene or a gene equivalent thereto is deleted or inactivated, various MGLPs, which are intracellular enzymes, can be secreted outside the cells and recovered from the culture supernatant.

以上、本発明の実施形態を説明したが、これらが、本発明を、説明した特定の実施形態に限定することを意図するものではないことを理解すべきである。本発明の範囲内にある様々な他の変更及び修正は当業者には明白である。
本明細書に引用されている文献及び特許出願は、あたかもそれが本明細書に完全に記載されているかのように参考として援用される。
Although embodiments of the present invention have been described above, it should be understood that they are not intended to limit the present invention to the specific embodiments described. Various other changes and modifications within the scope of the present invention will be apparent to those skilled in the art.
All publications and patent applications cited herein are incorporated by reference as if fully set forth herein.

Claims (15)

枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減したバチルス属菌を培養してモノアシルグリセロールリパーゼを発現させることを含む、モノアシルグリセロールリパーゼの製造方法であって、
該枯草菌AprEが、枯草菌遺伝子aprEにコードされるセリンアルカリプロテアーゼであるズブチリシンEであり、
枯草菌AprEに相当するプロテアーゼが、該枯草菌AprEとアミノ酸配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドであり、
該モノアシルグリセロールリパーゼが、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなるポリペプチドである、
方法
1. A method for producing monoacylglycerol lipase, comprising culturing a Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease corresponding thereto, and expressing monoacylglycerol lipase,
the Bacillus subtilis AprE is subtilisin E, a serine alkaline protease encoded by the Bacillus subtilis gene aprE;
the protease corresponding to the Bacillus subtilis AprE is a polypeptide having at least 90% identity in amino acid sequence to the Bacillus subtilis AprE and having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side;
The monoacylglycerol lipase is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 .
method .
培養物の上清から前記モノアシルグリセロールリパーゼを回収することをさらに含む、請求項1記載の製造方法。 The method of claim 1, further comprising recovering the monoacylglycerol lipase from the culture supernatant. 前記バチルス属菌に、前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが外来的に導入されている、請求項1又は2記載の製造方法。 The method according to claim 1 or 2, wherein a polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is exogenously introduced into the Bacillus bacterium. 前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが制御領域と作動可能に連結されている、請求項3記載の製造方法。 The method according to claim 3, wherein the polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is operably linked to a control region. 前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが分泌シグナルペプチドをコードするポリヌクレオチド領域と連結されていない、請求項3又は4記載の製造方法。 The method according to claim 3 or 4, wherein the polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is not linked to a polynucleotide region encoding a secretory signal peptide. 前記枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減したバチルス属菌が、前記枯草菌遺伝子aprE又はこれに相当する遺伝子が欠失又は不活性化されたバチルス属菌であり、
該aprEに相当する遺伝子が、該aprEとヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子である、
請求項1~のいずれか1項記載の製造方法。
the Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease corresponding thereto is a Bacillus bacterium in which the Bacillus subtilis gene aprE or a gene corresponding thereto has been deleted or inactivated;
The gene corresponding to aprE has at least 90% identity in nucleotide sequence with aprE and encodes a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side.
The method according to any one of claims 1 to 5 .
前記バチルス属菌が、枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及びこれらに相当する遺伝子からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子がさらに欠失又は不活性化されたものである、請求項記載の製造方法。 7. The method according to claim 6, wherein the Bacillus bacterium is one in which at least one gene selected from the group consisting of Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, aprX , and genes corresponding thereto has been further deleted or inactivated. 前記バチルス属菌が枯草菌又はその変異株である、請求項1~のいずれか1項記載の製造方法。 The method according to any one of claims 1 to 7 , wherein the Bacillus bacterium is Bacillus subtilis or a mutant thereof. 枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されており、かつモノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが外来的に導入されている、組換えバチルス属菌であって、
該枯草菌AprEが、枯草菌遺伝子aprEにコードされるセリンアルカリプロテアーゼであるズブチリシンEであり、
枯草菌AprEに相当するプロテアーゼが、該枯草菌AprEとアミノ酸配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドであり、
該モノアシルグリセロールリパーゼが、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなるポリペプチドである、
組換えバチルス属菌。
A recombinant Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto, and having an exogenously introduced polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase,
the Bacillus subtilis AprE is subtilisin E, a serine alkaline protease encoded by the Bacillus subtilis gene aprE;
the protease corresponding to the Bacillus subtilis AprE is a polypeptide having at least 90% identity in amino acid sequence to the Bacillus subtilis AprE and having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side;
The monoacylglycerol lipase is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 .
Recombinant Bacillus spp.
前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが制御領域と作動可能に連結されている、請求項記載の組換えバチルス属菌。 The recombinant Bacillus of claim 9 , wherein the polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is operably linked to a regulatory region. 前記モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドが分泌シグナルペプチドをコードするポリヌクレオチド領域と連結されていない、請求項又は10記載の組換えバチルス属菌。 The recombinant Bacillus bacterium according to claim 9 or 10 , wherein the polynucleotide encoding the monoacylglycerol lipase is not linked to a polynucleotide region encoding a secretory signal peptide. 前記枯草菌遺伝子aprE又はこれに相当する遺伝子が欠失又は不活性化されており、
該aprEに相当する遺伝子が、該aprEとヌクレオチド配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子である、
請求項9~11のいずれか1項記載の組換えバチルス属菌。
the Bacillus subtilis gene aprE or a corresponding gene is deleted or inactivated,
The gene corresponding to aprE has at least 90% identity in nucleotide sequence with aprE and encodes a polypeptide having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side.
The recombinant Bacillus bacterium according to any one of claims 9 to 11 .
枯草菌epr、wprA、mpr、nprB、bpr、nprE、vpr、aprX、及びこれらに相当する遺伝子からなる群より選択される少なくとも1つの遺伝子がさらに欠失又は不活性化されている、請求項12記載の組換えバチルス属菌。 13. The recombinant Bacillus bacterium of claim 12, wherein at least one gene selected from the group consisting of Bacillus subtilis epr, wprA, mpr, nprB, bpr, nprE, vpr, aprX , and genes corresponding thereto, is further deleted or inactivated. 前記バチルス属菌が枯草菌又はその変異株である、請求項9~13のいずれか1項記載の組換えバチルス属菌。 The recombinant Bacillus bacterium according to any one of claims 9 to 13 , wherein the Bacillus bacterium is Bacillus subtilis or a mutant thereof. 枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性が低減されたバチルス属菌に、モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドを組み込むことを含むか、又は、モノアシルグリセロールリパーゼをコードするポリヌクレオチドを組み込んだバチルス属菌において枯草菌AprE又はこれに相当するプロテアーゼの活性を低減させることを含む、組換えバチルス属菌の製造方法であって、
該枯草菌AprEが、枯草菌遺伝子aprEにコードされるセリンアルカリプロテアーゼであるズブチリシンEであり、
枯草菌AprEに相当するプロテアーゼが、該枯草菌AprEとアミノ酸配列において少なくとも90%の同一性を有し、かつアルカリ側に至適pHを持つセリンプロテアーゼ活性を有するポリペプチドであり、
該モノアシルグリセロールリパーゼが、配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は配列番号1及び2のいずれかのアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列からなるポリペプチドである、
方法。
A method for producing a recombinant Bacillus bacterium, comprising: incorporating a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase into a Bacillus bacterium having reduced activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto; or reducing activity of Bacillus subtilis AprE or a protease equivalent thereto in a Bacillus bacterium having incorporated a polynucleotide encoding monoacylglycerol lipase,
the Bacillus subtilis AprE is subtilisin E, a serine alkaline protease encoded by the Bacillus subtilis gene aprE;
the protease corresponding to the Bacillus subtilis AprE is a polypeptide having at least 90% identity in amino acid sequence to the Bacillus subtilis AprE and having serine protease activity with an optimal pH on the alkaline side;
The monoacylglycerol lipase is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2, or a polypeptide consisting of an amino acid sequence that is at least 90% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 and 2 .
method.
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