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JP7759174B2 - 繊毛病のための遺伝子治療 - Google Patents
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JP7759174B2 - 繊毛病のための遺伝子治療 - Google Patents

繊毛病のための遺伝子治療

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Description

本発明は、バルデ・ビードル症候群をはじめとする繊毛病の処置のための遺伝子治療ベクターに関する。
繊毛病は、体内のほとんどの細胞上で見出される非運動性繊毛の機能不全により誘発される疾患の医療的に重要な分類として近年になり話題となっている (Waters & Beales, Pediatr Nephrol (2011) 26:1039-1056)。ほとんどの繊毛病が、網膜変性をはじめとする
共通の表現型を有する。恐らく繊毛の機能不全から生じる疾患が100種より多く存在すると予測されており、30種より多くの疾病が現在、立証されている。これらの疾病の全てが衰弱性で、多くが致死性であり、それらはほぼ全てが機能損失性であるため、ほとんどが処置の遺伝子治療的アプローチから利益を享受するであろう。繊毛病は、一般人口500人中およそ1人の集合的有病率を有する。繊毛病の全てが、繊毛機能の破壊と、それによる臓器病変の重複を有する。
常染色体劣性バルデ・ビードル症候群(BBS)は、最もよく特徴づけられた繊毛病の1種であり、早期発症型失明、重度肥満、複合的な内分泌機能不全、認知障害及び腎不全に関連する。遺伝性バルデ・ビードル症候群として出生した患者は、一定範囲の衰弱性の医学的問題に見舞われることになり、それらの一部は致死性である。罹患した小児は、目の裏側(網膜)にある感光性細胞の障害により通常、10歳までに失明し始めて、最終的に失明する。患者は、最初の歳に異常な量で体重が増加し、チェックされなければ、生命を脅かす肥満、糖尿病及び高血圧にまで進行するであろう。多くの患者は、一生のある時点で腎不全も発症し(透析処置及び/又は腎移植を必要とする場合もある)、ほとんどが、何らかの形態の学習困難を有するであろう。同時に、これらの問題は、成人患者が独立して生活する能力に影響を与え、ほとんどの患者が無職である。早期に診断された場合でも、症状に基づく処置は、網膜変性及び食事の手段に応答しない肥満などの予防不能の合併症を管理するに過ぎない。
BBSは、多くの繊毛病と同様に、常染色体劣性遺伝子障害である。これまでに、21種の遺伝子に因果関係が見出されている。これらの遺伝子産物の多くは、マルチサブユニット複合体において相互作用する。例えば、多数のこれらのタンパク質は、BBSomeと呼ばれる複合体を形成する。BBSomeは、一次繊毛へのタンパク質輸送を媒介すると考えられている。BBS/CCTシャペロニン複合体という別の複合体は、BBSomeの組み立てを容易にし、複数のBBSタンパク質と多数のCCTシャペロニンタンパク質とで構成されている。BBS遺伝子のタンパク質産物が物理的に相互作用して共通の機能を実施する結果、多くの異なる遺伝子の突然変異が、表現型所見の同じ異常な組み合わせを誘発する。BBS患者において突然変異する最も共通する遺伝子は、BBS1(42%)及びBBS10(22%)である。BBS1遺伝子内の30を超える突然変異が、バルデ・ビードル症候群の人々で同定されている。ヒトBBS1遺伝子は、13位の染色体11の長い(q)アームに配置される。BBS1遺伝子内の突然変異は、同様に繊毛の正常な形成及び機能に影響を及ぼす。これらの細胞構造の欠損は、発達の間の重要な化学的シグナル伝達経路を破壊し、感覚認知の異常に導く。ヒトBB1遺伝子は、17のエキソンを含み、およそ23kbに及ぶ。ほとんどのBBS1遺伝子の突然変異は、ミスセンス又はストップ突然変異であり、最も共通する突然変異は、タンパク質390位(Met390Arg又はM390R)でアミノ酸メチオニンをアミノ酸アルギニンと交換する。M390R突然変異は、全BBS1突然変異のおよそ80%を占める。ヒトBBS10遺伝子は、染色体12上に存在し、BBS10転写産物は、723のアミノ酸タンパク質をコ
ードするエキソンを2つだけ含有する。BBS10患者に見出される突然変異は、ミスセンスと、ノンセンスとフレームシフトの各突然変異の混合である。最も共通する変化は、C91fsであり、ほぼ50%の頻度である。
これまでの繊毛病のための現行の遺伝子治療は全て、1つの損傷臓器を処置することを目的としている。例えば、多数のグループが、遺伝子治療ベクターの網膜下注射を利用して目の網膜症を処置する試みを行った(例えば、Seo et al., Invest Ophthalmol Vis Sci. 54(9):6118-32 (2013))。しかし、単一臓器を直接標的化したそのようなアプローチの利用は、繊毛病などの多系統の障害では個々の標的臓器に異なるベクターをあつらえる必要があるということになる。多くのベクターを使用する必要があるなら、経費が法外になり、定期的操作が厄介になる。多系統の注射よりむしろ単回注射の利用が、患者にとって非常に望ましく、侵襲性も低く、外来回数も減少し、反復処置によるリスクも低減するであろう。それゆえ、個別の臓器よりむしろ幾つか又は全ての罹患臓器の欠陥に取り組み得るアプローチの利用が、求められている。
Williams CLら(Mol Ther. 25(4):904-916(2017))は、バルデ・ビードル症候群におけ
る末梢嗅覚障害の回復を記載している。先に議論された研究と同様に、Williamsは、単一臓器の標的化を記載しており、多臓器の処置を企図していない。Williamsは、蛍光タンパク質(GFP又はmCherry)を標識されたマウスBBS遺伝子を含有する遺伝子治療ベクターの鼻内投与を通してマウス鼻内組織中の嗅覚感覚ニューロン(OSN)を標的とする。決定的なこととして、Williamsにより用いられたマウスモデルにおいて、BBSタンパク質の機能は、成熟した嗅覚ニューロン(OSN)内のみで欠損しているため、このマウスモデルは、OSN細胞の回復を示し得るに過ぎない。このことは、用いられたマウスモデルのせいで、Williamsの文献に記載された実験が他の細胞型又は組織におけるBBS遺伝子発現に関するいかなる情報も提供し得ず、多臓器回復を示し得ない、ということを意味する。
WO03/102141には、突然変異したBBS1遺伝子の同定及びそれらの様々な使用が記載されている。
本発明の第一の態様において、繊毛病を処置するためのベクターであって、該ベクターが、繊毛病遺伝子に動作可能に連結されたプロモーターを含み、該ベクターが、多臓器への繊毛病遺伝子の形質導入を提供することができ、該プロモーターが、形質導入された臓器における繊毛病遺伝子の発現を提供し得るユビキタスプロモーターであり、該繊毛病遺伝子が、繊毛病において突然変異された機能的タンパク質に対応する該タンパク質をコードする、ベクターが提供される。
繊毛病は、一般に、体内のほとんどの細胞上で見出された非運動性繊毛の機能不全をもたらす単一遺伝子への突然変異により誘発される。それゆえ、機能的タンパク質を発現する正しい遺伝子の導入で、突然変異された遺伝子を補填し、繊毛病の影響を改善する。先に定義されたベクターは、多臓器における形質導入を提供する。それゆえ1つの投与経路による該ベクターの投与を利用して、多臓器での遺伝子発現を提供し、繊毛病に関連する病状を改善することができる。これは、先に実施されたような罹患した各臓器又は組織を個別に処置する必要がないということである。多臓器を一度に標的化するこのアプローチは、繊毛病において過去に用いられておらず、そのようなアプローチが作用することが企図されなかった。
繊毛病は、繊毛の異常な形成又は機能をもたらす欠損タンパク質をコードする遺伝子突然変異に関連する障害の群である。それゆえ繊毛病は、「繊毛の異常な形成又は機能をもたらす、いずれのタンパク質もコードしない、又は欠損タンパク質をコードする遺伝子突然変異に関連する障害」と定義される。繊毛は、ほぼ全ての脊椎動物細胞の成分であるため、繊毛の機能不全は、特徴的に網膜変性、腎疾患及び大脳異常を含む特色群として症状発現し得る。追加的な症状発現としては、肝臓の先天性線維嚢胞性疾患、糖尿病、肥満及び骨格異形成が挙げられる。繊毛病の特色は、40を超える遺伝子の突然変異に関連づけられている。
先に記載されたベクターを用いで処置され得る繊毛病は、繊毛病において突然変異された機能的タンパク質に対応する該タンパク質の発現により処置され得る任意の繊毛病であり得る。主としてこれは、タンパク質機能の喪失を誘発する突然変異から生じる繊毛病である。該機能的タンパク質の発現は、タンパク質の機能を回復させて、繊毛の異常な形成又は機能を改善する。そのような繊毛病は、当業者に公知である。処置され得る繊毛病は、バルデ・ビードル症候群、メッケル・グルーバー症候群、髄質性嚢胞腎、シニア・ローケン症候群、マキュージック・カウフマン症候群、レーバー先天性黒内障及びジュベール症候群から選択されてもよい。幾つかの実施形態において、該ベクターで処置される繊毛病は、バルデ・ビードル症候群、髄質性嚢胞腎、シニア・ローケン症候群、マキュージック・カウフマン症候群及びレーバー先天性黒内障から選択される。他の実施形態において、該ベクターで処置される繊毛病は、バルデ・ビードル症候群、シニア・ローケン症候群、マキュージック・カウフマン症候群及びレーバー先天性黒内障から選択される。様々な実施形態において、該ベクターで処置される繊毛病は、バルデ・ビードル症候群及びマキュージック・カウフマン症候群から選択される。特別な実施形態において、該ベクターで処置される繊毛病は、バルデ・ビードル症候群である。
該ベクターは、繊毛病において突然変異された機能的タンパク質に対応する該タンパク質をコードする繊毛病遺伝子を含む。言い換えると、該繊毛病遺伝子は、繊毛病を誘発する突然変異タンパク質に対応する機能的タンパク質をコードする。該繊毛病遺伝子は、好ましくはヒトタンパク質、例えば野生型ヒトタンパク質をコードする。正確な繊毛病遺伝子は、処置される繊毛病、及び突然変異されていて繊毛病の病状を誘発する遺伝子に依存する。そのため例えば、患者がBBS1遺伝子における突然変異により誘発された繊毛病を有する場合、この患者を処置するためのベクターは、機能的BBS1タンパク質をコードする繊毛病遺伝子を含むことになる。
幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、BBS1、BBS2、BBS3/ARL6、BBS4、BBS5、BBS6/MKKS、BBS7、BBS8、BBS9、BBS10、BBS11/TRIM32、BBS12、BBS13/MKS1、BBS14/CEP290、BBS15/C2ORF86、BBS16/SDCCAG8、BBS17/LZTFL1、BBS18/BBIP1、BBS19/IFT27、BBS20/IFT74及びBBS21/C8ORF37タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、BBS1、BBS2、BBS3/ARL6、BBS4、BBS5、BBS6/MKKS、BBS7、BBS8、BBS9、BBS10、BBS11/TRIM32、BBS12、BBS14/CEP290、BBS15/C2ORF86、BBS16/SDCCAG8、BBS17/LZTFL1、BBS18/BBIP1、BBS19/IFT27及びBBS20/IFT74タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、BBS1、BBS2、BBS3/ARL
6、BBS4、BBS5、BBS6/MKKS、BBS7、BBS8、BBS9、BBS10、BBS11/TRIM32、BBS12、BBS15/C2ORF86、BBS16/SDCCAG8、BBS17/LZTFL1、BBS18/BBIP1、BBS19/IFT27及びBBS20/IFT74タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
複数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、BBS1、BBS2、BBS3/ARL6、BBS4、BBS5、BBS6/MKKS、BBS7、BBS8、BBS9、BBS10、BBS12、及びBBS18/BBIP1タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、BBS1、BBS2、BBS3/ARL6、BBS4、BBS5、BBS6/MKKS、BBS7、BBS8、BBS9、BBS10及びBBS12タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
具体的な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、BBS1及びBBS10タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS1タンパク質をコードする。
他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS10タンパク質をコードする。
幾つかの実施形態において、処置される繊毛病は、バルデ・ビードル症候群であり、該繊毛病遺伝子は、BBS1、BBS2、BBS3/ARL6、BBS4、BBS5、BBS6/MKKS、BBS7、BBS8、BBS9、BBS10、BBS11/TRIM32、BBS12、BBS13/MKS1、BBS14/CEP290、BBS15/C2ORF86、BBS16/SDCCAG8、BBS17/LZTFL1、BBS18/BBIP1、BBS19/IFT27、BBS20/IFT74及びBBS21/C8ORF37タンパク質から選択される機能的タンパク質をコードする。
他の実施形態において、処置される繊毛病は、メッケル・グルーバー症候群であり、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS13/MKS1タンパク質をコードする。
様々な実施形態において、処置される繊毛病は、髄質性嚢胞腎であり、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS14/CEP290タンパク質をコードする。
特別な実施形態において、処置される繊毛病は、シニア・ローケン症候群であり、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS14/CEP290タンパク質をコードする。
幾つか実施形態において、処置される繊毛病は、マキュージック・カウフマン症候群であり、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS6/MKKSタンパク質をコードする。
他の実施形態において、処置される繊毛病は、レーバー先天性黒内障であり、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS14/CEP290タンパク質をコードする。
様々な実施形態において、処置される繊毛病は、ジュベール症候群であり、該繊毛病遺伝子は、機能的BBS14/CEP290タンパク質をコードする。
繊毛病遺伝子によりコードされる機能的タンパク質は、好ましくは野生型タンパク質中で見出されない追加的アミノ酸を含有しない。任意の追加的アミノ酸が、該タンパク質の正常な機能を妨害し得る。例えば、該機能的タンパク質が、緑色蛍光タンパク質(GFP)若しくはmCherryなどの蛍光タンパク質、又はFLAGタグ若しくはポリヒスチジンタグなどのタグを含まないことが、好ましい。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド
配列を有するか、又はそれと少なくとも70%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも72%の配列同一性を有し
、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも74%
の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと
少なくとも76%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有
するか、又はそれと少なくとも78%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌ
クレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも80%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも82%の配列同一
性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくと
も84%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか
、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも86%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも88%の配列同一性を有
し、機能的BBS1タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも90%
の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれ
と少なくとも92%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を
有するか、又はそれと少なくとも94%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1の
ヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも95%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ
ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも96%の配列同
一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少な
くとも97%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有する
か、又はそれと少なくとも98%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌク
レオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも99%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:1のヌクレオチド配列を有する。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド
配列を有するか、又はそれと少なくとも70%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも72%の配列同一性を有
し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも7
4%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又は
それと少なくとも76%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド
配列を有するか、又はそれと少なくとも78%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも80%の配列同一性を有し
、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも82
%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又は
それと少なくとも84%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも86%の配列同一性を有
し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも8
8%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又は
それと少なくとも90%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド
配列を有するか、又はそれと少なくとも92%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも94%の配列同一性を有し
、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも95
%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又は
それと少なくとも96%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも97%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも98%の配列同一性を有
し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも
99%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:2のヌクレオチド配列を有する。
先の実施形態において、該繊毛病遺伝子のヌクレオチド配列は、該タンパク質の発現を最大にするようにコドン最適化されてもよい。コドン最適化において、該コードされたタンパク質のアミノ酸配列は同一のままであり、そのため依然として機能的であろう。それは、単に修飾されたヌクレオチド配列である。SEQ ID NO:11及び12は、B
BS1をコードするコドン最適化されたヌクレオチド配列であり、SEQ ID NO:
13及び14は、BBS10をコードするコドン最適化されたヌクレオチド配列である。これらの配列は、遺伝子発現の予想外に大きな増加を与えることが見出されている。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも70%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも72%の配列同一性を
有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも
74%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも76%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも78%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも80%の配列同一性を有
し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも8
2%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも84%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも86%の配列同一性を
有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも
88%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも90%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも92%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも94%の配列同一性を有
し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも9
5%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも96%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも97%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも98%の配列同一性を
有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくと
も99%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:11のヌクレオチド配列を有する。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも70%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも72%の配列同一性を
有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも
74%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも76%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも78%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも80%の配列同一性を有
し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも8
2%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも84%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも86%の配列同一性を
有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも
88%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも90%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも92%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも94%の配列同一性を有
し、機能的BBS1タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも9
5%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又
はそれと少なくとも96%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも97%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも98%の配列同一性を
有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくと
も99%の配列同一性を有し、機能的BBS1タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:12のヌクレオチド配列を有する。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも70%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID
NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも72%の配列同一性
を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なく
とも74%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有する
か、又はそれと少なくとも76%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌ
クレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも78%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ
ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも80%の配列
同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと
少なくとも82%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列
を有するか、又はそれと少なくとも84%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有し
、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも8
6%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、
又はそれと少なくとも88%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID
NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも92%の配列同一性
を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なく
とも94%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有す
るか、又はそれと少なくとも95%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13の
ヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも96%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも97%の
配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有するか、又はそ
れと少なくとも98%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも99%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:13のヌクレオチド配列を有する。
特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも70%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID
NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも72%の配列同一性
を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なく
とも74%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有する
か、又はそれと少なくとも76%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌ
クレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも78%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ
ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも80%の配列
同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと
少なくとも82%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列
を有するか、又はそれと少なくとも84%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有し
、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも8
6%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、
又はそれと少なくとも88%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオ
チド配列を有するか、又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID
NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも92%の配列同一性
を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なく
とも94%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有す
るか、又はそれと少なくとも95%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特定の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14の
ヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも96%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも97%の
配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。多数の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有するか、又はそ
れと少なくとも98%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチ
ド配列を有するか、又はそれと少なくとも99%の配列同一性を有し、機能的BBS10タンパク質をコードする。特別な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:14のヌクレオチド配列を有する。
様々な実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:9のタンパク質配
列、又はそれと少なくとも80%の配列同一性を有する機能的BBS1タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該機能的BBS1タンパク質は、SEQ ID NO:9のタンパク質配列、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有する。他の実施
形態において、該機能的BBS1タンパク質は、SEQ ID NO:9のタンパク質配
列、又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する。多数の実施形態において、該機能的BBS1タンパク質は、SEQ ID NO:9のタンパク質配列、又はそれと少な
くとも95%の配列同一性を有する。特別な実施形態において、該機能的BBS1タンパク質は、SEQ ID NO:9のタンパク質配列を有する。
他の実施形態において、該繊毛病遺伝子は、SEQ ID NO:10のタンパク質配
列、又はそれと少なくとも80%の配列同一性を有する機能的BBS10タンパク質をコードする。幾つかの実施形態において、該機能的BBS10タンパク質は、SEQ ID
NO:10のタンパク質配列、又はそれと少なくとも85%の配列同一性を有する。様
々な実施形態において、該機能的BBS10タンパク質は、SEQ ID NO:10の
タンパク質配列、又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する。多数の実施形態において、該機能的BBS10タンパク質は、SEQ ID NO:10のタンパク質配列
、又はそれと少なくとも95%の配列同一性を有する。特別な実施形態において、該機能的BBS10タンパク質は、SEQ ID NO:10のタンパク質配列を有する。
先の記載において、用語「同一性」は、2つの配列の類似性を指すために用いられる。本発明の目的では、同一性は、2つの配列の同一性%を決定するために、該配列を最適な比較目的でアライメントすること、と本明細書で定義される(例えば、第一の配列内に、第二のアミノ酸又は核酸配列との最適なアライメントのためにギャップを導入することができる)。その後、各位置のヌクレオチド/アミノ酸残基を比較する。第一の配列内のある位置が、第二の配列内の対応する位置と同じアミノ酸又はヌクレオチド残基に占有されていれば、該分子は、その位置で同一である。2つの配列間の同一性%は、該配列によって共有される同一位置の数の関数である(即ち、%同一性=同一位置の数/位置の総数(即ち、重複する位置)×100)。一般に2つの配列は、同じ長さである。配列の比較は、典型的には比較される2つの配列の全長にわたって実施される。
当業者は、2つの配列間の同一性を決定するために複数の異なるコンピュータプログラムを利用可能であることを、察知するであろう。例えば、2つの配列の配列比較及び同一性%の決定は、数学アルゴリズムを利用して完遂され得る。好ましい実施形態において、2つの核酸配列間の同一性%は、グローバルDNAアライメント、パラメータ:両鎖、スコアリングマトリクス:線形(ミスマッチ2、OpenGap 4、ExtGap 1)を利用した配列アライメントソフトウエアClone Manager 9(Sci-Ed software - www.scied.com)を利用して決定される。
或いは、2つのアミノ酸又は核酸配列間の同一性%は、Blosum 62マトリクス又はPAM250マトリクスのいずれか、並びに16、14、12、10、8、6、又は4のギャップウ
ェイト、及び1、2、3、4、5、又は6のレングスウェイトを用いて、Accelrys GCGソフトウエアパッケージ(http://www.accelrys.com/products/gcg/から入手)内のGAPプロ
グラムないに組み込まれたNeedleman及びWunsch (1970)のアルゴリズムを利用して決定され得る。2つのアミノ酸又は核酸配列間の同一性%を評定するさらなる方法 は、 National Center for Biotechnology Information(NCBI)ウェブサイト(www.blast.ncbi.nlm.nih.gov)から入手可能なBLAST配列比較ツールを使用すること、例えばデフォル
トパラメータを用いたヌクレオチド配列用のBLASTn又はアミノ酸配列用のBLASTpを使用することであり得る。
該繊毛病遺伝子は、「機能的」タンパク質をコードする。このことは、該タンパク質が発現される場合に、野生型ヒトタンパク質と同じ機能及び活性を有することを意味する。これは、当業者により容易に決定され得る。繊毛病遺伝子によりコードされたタンパク質は、野生型ヒトタンパク質であってもよい。先に議論された様々なタンパク質の野生型ヒト配列は、当業者に周知である。例えばそれらは、National Center for Biotechnology Informationの公的にアクセル可能なデータベースに見出すことができる。さらにこれら
のタンパク質をコードする(そして該ベクター内に含まれる)ヌクレオチド配列は、例えば特別なヌクレオチドコドンを特別なアミノ酸と相関させる遺伝子コードを利用して、当業者により即座に発見又は決定され得る。
該ベクター内に含まれるプロモーターは、繊毛病遺伝子に動作可能に連結されたユビキタスプロモーターであるため、該プロモーターは、形質導入された臓器内での繊毛病遺伝子の発現を指揮する。ユビキタスプロモーターは、広範囲の細胞及び組織内で強い活性を有し、構成的発現を提供するものである。適切なユビキタスプロモーターは、当業者に周
知である。ユビキタスプロモーターは、組織特異性ではない。それは、複数の組織/臓器における発現を提供する。該ユビキタスプロモーターは、形質導入された臓器において繊毛病遺伝子の発現をもたらし、該発現されたタンパク質は、繊毛病に関連する病状を改善する。
適切なユビキタスプロモーターとしては、短い伸長因子プロモーター(EFS)、CAGプロモーター、サイトメガロウイルス前初期プロモーター(CMV)、ユビキチンCプロモーター(UBC)、ホスホグリセラートキナーゼプロモーター(PGK)及びベータアクチンプロモーター、例えばニワトリベータアクチンプロモーター(CBA)が挙げられる。これらのプロモーターは当業者によく知られている。これらのプロモーターの配列の例は、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、S
EQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8及びSEQ I
D NO:45として与えられる。それゆえ幾つかの実施形態において、該プロモーター
は、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ
ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8及びSEQ ID
NO:45から選択された配列を有する。
特別な実施形態において、該プロモーターは、SEQ ID NO:3又はSEQ I
D NO:46のヌクレオチド配列を有し得るEFSプロモーターである。
幾つかの実施形態において、該プロモーターは、SEQ ID NO:4又はSEQ
ID NO:47のヌクレオチド配列を有し得るCAGプロモーターである。
様々な実施形態において、該プロモーターは、SEQ ID NO:6又はSEQ I
D NO:45のヌクレオチド配列を有し得るCMVプロモーターである。
特定の実施形態において、該プロモーターは、SEQ ID NO:5又はSEQ I
D NO:48のヌクレオチド配列を有し得るUBCプロモーターである。
多数の実施形態において、該プロモーターは、SEQ ID NO:7のヌクレオチド
配列を有し得るPGKプロモーターである。
複数の実施形態において、該プロモーターは、SEQ ID NO:8又はSEQ I
D NO:49のヌクレオチド配列を有し得るベータアクチンプロモーターである。
要素の特別な組み合わせに関して、該ベクターは、BBS1遺伝子に動作可能に連結されたEFSプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS1遺伝子は、SEQ ID NO:1、11及び12
から選択されてもよい。例えば該ベクターは、SEQ ID NO:15、16及び17
のうちの1つの配列を含んでいてもよい。或いは該ベクターは、BBS10遺伝子に動作可能に連結されたEFSプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS10遺伝子は、SEQ ID NO:2
、13及び14から選択されてもよい。例えば該ベクターは、SEQ ID NO:30
、31及び32のうちの1つの配列を含んでいてもよい。
該ベクターは、BBS1遺伝子に動作可能に連結されたUBCプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS1遺伝子は、SEQ ID NO:1、11及び12から選択されてもよい。例えば該ベ
クターは、SEQ ID NO:18、19及び20のうちの1つの配列を含んでいても
よい。或いは該ベクターは、BBS10遺伝子に動作可能に連結されたUBCプロモータ
ーを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS10遺伝子は、SEQ ID NO:2、13及び14から選択されてもよ
い。例えば該ベクターは、SEQ ID NO:33、34及び35のうちの1つの配列
を含んでいてもよい。
該ベクターは、BBS1遺伝子に動作可能に連結されたCMVプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS1遺伝子は、SEQ ID NO:1、11及び12から選択されてもよい。例えば該ベ
クターは、SEQ ID NO:21、22及び23のうちの1つの配列を含んでいても
よい。或いは該ベクターは、BBS10遺伝子に動作可能に連結されたCMVプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS10遺伝子は、SEQ ID NO:2、13及び14から選択されてもよ
い。例えば該ベクターは、SEQ ID NO:36、37及び38のうちの1つの配列
を含んでいてもよい。
該ベクターは、BBS1遺伝子に動作可能に連結されたCBAプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS1遺伝子は、SEQ ID NO:1、11及び12から選択されてもよい。例えば該ベ
クターは、SEQ ID NO:24、25及び26のうちの1つの配列を含んでいても
よい。或いは該ベクターは、BBS10遺伝子に動作可能に連結されたCBAプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS10遺伝子は、SEQ ID NO:2、13及び14から選択されてもよ
い。例えば該ベクターは、SEQ ID NO:39、40及び41のうちの1つの配列
を含んでいてもよい。
該ベクターは、BBS1遺伝子に動作可能に連結されたCAGプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS1遺伝子は、SEQ ID NO:1、11及び12から選択されてもよい。例えば該ベ
クターは、SEQ ID NO:27、28及び29のうちの1つの配列を含んでいても
よい。或いは該ベクターは、BBS10遺伝子に動作可能に連結されたCAGプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS10遺伝子は、SEQ ID NO:2、13及び14から選択されてもよ
い。例えば該ベクターは、SEQ ID NO:42、43及び44のうちの1つの配列
を含んでいてもよい。
該ベクターは、BBS1遺伝子に動作可能に連結されたPGKプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS1遺伝子は、SEQ ID NO:1、11及び12から選択されてもよい。或いは該ベ
クターは、BBS10遺伝子に動作可能に連結されたPGKプロモーターを含んでいてもよく、該ベクターは、バルデ・ビードル症候群の処置のためのものである。該BBS10遺伝子は、SEQ ID NO:2、13及び14から選択されてもよい。
先に記載されたベクターは、多臓器への繊毛病遺伝子の形質導入を提供することができる。これは、任意の適切なベクターであり得、そのようなベクターは、当業者に周知である。特別な実施形態において、該ベクターは、血液脳関門を交差し得る。これは、目をはじめとする脳及び神経系内、並びに内臓器官及び筋系において形質導入を可能にする。それゆえ単一ベクターを用いて多臓器における遺伝子発現を提供して、繊毛病に関連する病状を改善することができる。この遺伝子発現は、身体全体の複数の部位で起こり得るため、全身性であり得る。さらに、限定された経路数によるベクターの投与を利用して全身の遺伝子発現を提供し、身体全体の繊毛病に関連する病状を改善することができる。これは
、罹患した各組織を個別に処置する必要がない、ということを意味する。多臓器を一度に標的化するこのアプローチは、過去に繊毛病で用いられておらず、そのようなアプローチが作用することは、企図されなかった。
先に記載されたベクターを形質導入され得る臓器は、中枢神経系、目(例えば、網膜光受容部及び網膜色素上皮)、心臓、肝臓、筋肉、膵臓、脾臓、肺及び腎臓から選択されてもよい。それゆえ幾つかの実施形態において、該ベクターは、中枢神経系、目、心臓、肝臓、筋肉、膵臓、脾臓、肺及び腎臓から選択される多臓器への繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。他の実施形態において、該ベクターは、中枢神経系、目、心臓、肝臓、筋肉、膵臓、脾臓、肺及び腎臓から選択される少なくとも3つの臓器への繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。様々な実施形態において、該ベクターは、言及された臓器のうちの少なくとも4つへの繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。多数の実施形態において、該ベクターは、言及された臓器のうちの少なくとも5つへの繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。幾つかの実施形態において、該ベクターは、言及された臓器のうちの少なくとも6つへの繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。他の実施形態において、該ベクターは、言及された臓器のうちの少なくとも7つへの繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。様々な実施形態において、該ベクターは、言及された臓器のうちの少なくとも8つへの繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。特別な実施形態において、該ベクターは、中枢神経系、目、心臓、肝臓、筋肉、膵臓、脾臓、肺及び腎臓への繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。特定の実施形態において、該ベクターは、少なくとも中枢神経系(例えば、脳)及び目への繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。様々な実施形態において、該ベクターは、少なくとも中枢神経系(例えば、脳)、目、そして肝臓、腎臓及び脾臓のうちの1つへの繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。幾つかの実施形態において、該ベクターは、少なくとも中枢神経系(例えば、脳)、目及び肝臓への繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。特別な実施形態において、該ベクターは、少なくとも中枢神経系(例えば、脳)、目、肝臓、腎臓及び脾臓への繊毛病遺伝子の形質導入を提供する。
適切なベクターとしては、アデノ随伴ウイルス-8(AAV8)及びアデノ随伴ウイルス-9(AVV9)、並びにAAV8又はAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化された他のAAV(例えば、AAV2)が挙げられる。そのようなベクターは、WO2005/033321に記載されている。他の適切なベクターとしては、AAV-PHP.A及びAAVPHP.B(Nature Biotechnology 34, 204-209 (2016))、AAV9
.47(Hum Gene Ther. 2016 Jul;27(7):497-508)、AAV-B1(Mol. Ther. 24, 1247-1257)、AAV8(Y733F)(Mol Ther 2009; 17: 463-471)、並びにAAV2-TT
(WO2015/121501に記載)が挙げられる。例えばTrends in Molecular Medicine, April 2016, Vol. 22, No. 4及びTher Deliv. 2010 October; 1(4): 517-534に記載される通り、レンチウイルスベクターもまた、用いることができる。
幾つかの実施形態において、該ベクターは、AAV8、AAV9などのAAVベクター、AAV8若しくはAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター、AAV-PHP.A、AAV-PHP.B、AAV9.47、AAV-B1、AAV8(Y733F)又はAAV2-TTである。他の実施形態において、該ベクターは、AAV8、AAV9、AAV8又はAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター、AAV-PHP.A、AAV-PHP.B、AAV9.47及びAAV-B1から選択される。様々な実施形態において、該ベクターは、AAV8、AAV9、AAV8又はAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター、AAV-PHP.A及びAAV-PHP.Bから選択される。多数の実施形態において、該ベクターは、AAV8、AAV9、AAV8又はAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター、及びAAV-PHP.Bから選択さ
れる。特別な実施形態において、該ベクターは、AAV8、AAV9、AAV8又はAA
V9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクターから選択される。幾つかの実施形態において、該ベクターは、AAV8、及びAAV8からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター(例えば、AAV8からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAV2(AAV2/8))から選択される。他の実施形態において、該ベクターは、AAV9、及びAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター(例えば、AAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAV2(AAV2/9))から選択される。
該アデノ随伴ウイルスベクターは、組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクターであってもよい。AAVは、Kenneth I. Berns, "Parvoviridae: The Viruses and Their Replication," Chapter 69 in Fields Virology (3d Ed. 1996)に記載されたパルボウイルス科の1つである。
全ての公知AAV血清型のゲノム編成は、非常に類似している。AAVのゲノムは、約5,000ヌクレオチド(nt)未満の長さの直鎖状一本鎖DNA分子である。末端逆位配列(ITR)が、非構造複製(Rep)タンパク質及び構造(VP)タンパク質のための特有のコードヌクレオチド配列に隣接している。VPタンパク質(VP1、-2及び-3)は、カプシドを形成している。末端145ntは、自己相補性であり、T形ヘアピンを形成するエネルギー的に安定した分子内デュプレックスが形成され得るように組織化される。これらのヘアピン構造は、ウイルスDNA複製の起点として機能し、細胞内DNAポリメラーゼ複合体のためのプライマーとして働く。哺乳動物細胞における野生型(wt)AAV感染に続いて、Rep遺伝子(即ち、Rep78及びRep52タンパク質をコードする)が、それぞれP5プロモーター及びP19プロモーターから発現され、両方のRepタンパク質が、ウイルスゲノムの複製における機能を有する。Rep ORFにおけるスプライシングイベントが、事実上4つのRepタンパク質(即ち、Rep78、Rep68、Rep52及びRep40)の発現をもたらす。しかし、哺乳動物細胞におけるRep78及びRep52タンパク質をコードする非スプライシングmRNAが、AAVベクター生成に充分であることが示されている。同じく昆虫細胞において、Rep78及びRep52タンパク質は、AAVベクター生成に充分である。
遺伝子治療ベクターとしての使用に適したAAVにおいて、該ベクターゲノムは、典型的には標的細胞への送達のために包装された核酸(例えば、繊毛病遺伝子)を含む。この特別な実施形態によれば、該異種ヌクレオチド配列は、ベクターゲノムのいずれかの末端にあるウイルスITRの間に配置される。さらなる好ましい実施形態において、該パルボウイルス(例えば、AAV)cap遺伝子及びパルボウイルス(例えば、AAV)rep遺伝子が、鋳型ゲノムから(そしてそれによりそこから生成されたビリオンDNAから)欠失されている。この構造が、パルボウイルスカプシドにより運搬され得る核酸配列(複数可)のサイズを最大にする。
この特別な実施形態によれば、該核酸は、基質のいずれかの末端のウイルスITRの間に配置される。パルボウイルスゲノムは、1つのITRのみで機能することが可能である。こうしてパルボウイルスに基づく遺伝子治療ベクターにおいて、該ベクターゲノムは、少なくとも1つのITRに、しかしより典型的には2つのAAV ITR(一般にはベクターゲノムのいずれか一方の側、即ち5’末端の1つ及び3’末端の1つ)に隣接される。ベクターゲノム内の核酸と、ITRの1つ又は複数との間に介在する配列が存在してもよい。
一般に繊毛病遺伝子(即ち、(哺乳動物細胞内の発現のために)繊毛病において突然変異された機能的タンパク質に対応する該タンパク質をコードするヌクレオチド配列))は、2つの通常のITRの間に配置されるか、又は2つのD領域で操作されたITRのいず
れかの側に配置される、パルボウイルスゲノムに組み込まれる。
一態様において、本発明は、先に記載されたベクターと、1種又は複数の医薬的に許容できる賦形剤と、を含む医薬組成物を提供する。該1種又は複数の賦形剤としては、担体、希釈剤及び/又は他の薬品、医薬剤若しくはアジュバントが挙げられる。
本発明はまた、先に記載された通り治療有効量のベクターを、繊毛病に罹患した患者に投与することを含む、繊毛病を処置する方法を提供する。好ましくは該患者は、ヒトである。
繊毛病が、上記方法で「処置」される場合、これは、繊毛病の1つ又は複数の症状が改善されることを意味する。それは、該症状がもはや患者に存在しなくなるように完全に療養されることを意味しないが、幾つかの方法において、これがあてはまる場合がある。該処置の方法により、繊毛病の1つ又は複数の症状で処置前よりも重症度が低くなる。該処置の方法により、繊毛病の複数の症状で処置前よりも重症度が低くなる場合がある。多臓器における形質導入及び遺伝子発現により、該症状の改善が多臓器で生じる。
「治療有効量」は、(繊毛病の症状を改善するのに充分なレベルに導くために)対象における機能的タンパク質のレベルの上昇など、所望の治療結果を実現するのに必要となる投与量及び期間で効果的となる量を指す。
処置の方法は、対象における機能的タンパク質のレベルの上昇を誘発する。幾つかの実施形態において、該処置の方法は、約正常レベル(即ち、正常な健康対象に見出されるレベル)までの機能的タンパク質レベルの上昇を生じる。一実施形態において、該処置方法は、最も正常なレベルまでの機能的タンパク質レベルの上昇を誘発する。
該ベクターは、多臓器での繊毛病遺伝子の発現を可能にするように、任意の適切な方法で投与されてもよい。特別な実施形態において、該ベクターの単回投与を利用して遺伝子発現を提供し、繊毛病に関連する病状を改善することができる。該ベクターの投与は、全身性の遺伝子発現を提供して、身体全体の繊毛病に関連する病状を改善してもよい。該ベクターは、静脈内又は頭蓋内に投与されてもよい。特別な実施形態において、該ベクターは、静脈内に投与される。幾つかの実施形態において、該ベクターは、頭蓋内に投与される。様々な実施形態において、該ベクターは、静脈内及び頭蓋内に投与される。
該ベクターは、髄腔内に投与されてもよい。これは、単独であり得る、又は静脈内及び/若しくは頭蓋内投与に加えられ得る。
頭蓋内投与は、定位注射を利用した脳の特定領域へのベクターの直接送達である。頭蓋内投与は、網膜下投与、例えば網膜下注射を含まない。
さらに該ベクターは、好ましくは鼻内に投与されるべきではない。鼻内投与経路は、ベクターの発現を鼻内細胞の小区分に制限する可能性があり、身体の他の部分にある主要罹患組織をベクターに標的化させることができない。加えて該鼻内経路は、鼻内細胞の小区分の急速な交換により、導入遺伝子の長期持続的発現を可能にしない。
該ベクターが、複数の投与経路、例えば静脈内及び頭蓋内で投与される場合、該ベクターは、同日に両部位に投与される。幾つかの実施形態において、該複数の投与は、6時間間隔以内、4時間間隔以内、又は2時間間隔以内で与えられる。幾つかの実施形態において、該複数の投与は、同時に与えられる。
該ベクターは、一時点で投与されてもよい。例えば単回注射が、与えられてもよい。該ベクターが、複数の投与経路、例えば静脈内及び頭蓋内で投与される場合、該ベクターは、両部位に1回のみ(そして先に記載された通り少なくとも同日に)投与される。次に、さらなる投与が与えられない。
さらに本発明は、治療における、例えば繊毛病の処置における使用のために、上記のベクターを提供する。
加えて本発明は、繊毛病を処置するための薬剤の製造における上記のベクターの使用を提供する。
本明細書で引用された全ての特許及び文献の参考資料は、全体として参照により本明細書に組み入れられる。
ここに、本発明を以下の通り図のみを参照して実施例により詳細に記載する。
制限消化。Xho1を用いて消化されたAAV2/8、ヘルパーウイルス及びBBS1のプラスミドDNA。1%アガロースゲル上が制限酵素Xho1で消化された各ヘルパープラスミド(pHGTI、レーン2)、AAV2/8プラスミド(pLT-AAV2/8、レーン3)及びBBS1プラスミド(pAV-EFS-BBS1、レーン4)のプラスミドDNAを示したゲル電気泳動。HyperLadderが、レーン1に認められる。プラスミドを用いて、hAAV2/8-EFS-BBS1を作製した。ヘルパープラスミドのバンドサイズは、それぞれ6318bp及び11549bp(レーン2)、そしてAAV2/8プラスミドでは186bp、2109bp及び4844bp(レーン3)であった。pAV-EFS-BBS1では、バンドサイズは、236bp、643bp、1195bp及び5078bp(レーン4)であった。 293T細胞のヒトBBS1トランスフェクション。EFS-BBS1プラスミドによる293Tのトランスフェクション後のタンパク質及びmRNAの発現。A)トランスフェクト及び非トランスフェクト293T細胞から抽出されたmRNAからの逆転写PCR後の2%アガロースゲル。レーン1マーカー、並びにレーン2、4及び6は、トランスフェクトcDNAを示し;レーン3、5及び7は逆転写されていないトランスフェクト細胞を示し;レーン8、10及び12は非トランスフェクトcDNAを示し、レーン9、11及び13は、非トランスフェクトの非逆転写酵素対照を示す。レーン14は、陰性対照としてのPCR用のddH20試料を示す。B)トランスフェクション後のBBS1タンパク質発現は、トランスフェクション後の293T細胞で可視であった。レーン2、3及び4は、トランスフェクト細胞であり、レーン5、6及び7は、トランスフェクトされていない。HSP90β及びGAPDHのタンパク質発現を、内部対照として用いた。 網膜及びCNS(中枢神経系)におけるヒトBBS1の発現。導入遺伝子のヒトBBS1発現を示したRT-PCR。頭蓋内及び全身送達後のP35動物。AAV2/8-EFS-BBS1の頭蓋内注射(I.C.)は、脳及び目におけるマウスBbs1に並んだヒトBBS1の明確な発現を示しており(黒い矢印)、良好な形質導入及び発現が示される。ヒトBBS1の明確な発現は、静脈内(全身)注射された動物(I.V.)の目で観察される(白い矢印)。マウス及びヒトBBS1を識別するための特異的プライマーを設計した。mBbs1(マウスBbs1);AAV-hBBS1(形質導入されたヒトBBS1);β-アクチン(β-アクチン陽性対照);ネフリン(陰性対照)。 マウスにおけるP0頭蓋内及び全身送達後のP180(注射後180日目)の網膜及びCNS(中枢神経系)におけるRT-PCRによるヒトBBS1の発現。A)ヒトBBS1の明確な発現は、静脈内(全身)注射された動物(I.V.)の脳及び目で観察される。B)AAV2/8-EFS-BBS1の頭蓋内注射(I.C.)は、脳におけるヒトBBS1の明確な発現を示しており、良好な形質導入及び発現が示される。マウス及びヒトBBS1を識別するための特異的ヒトプライマーを設計した。M390R=Bbs1M390R/M390R動物。+/+=野生型動物。RT-=RT-PCR陰性対照。 処置及び非処置Bbs1M390R/M390Rにおける表現型発現から、P0頭蓋内処置動物における体重減少が実証される。AAV2/8-EFS-BBS1構築物で頭蓋内処置された場合、Bbs1M390R/M390R動物は、雄及び雌の野生型レベルまでの統計学的有意な体重回復を示している(p値参照)。IC=頭蓋内。Het=ヘテロ接合型動物のBbs1M390R/M390R。WT=野生型動物。M390R=ホモ接合動物のBbs1M390R/M390R。エラーバーは、平均の標準誤差(S.E.M)を示す。p値は、非線形曲線フィッティング(ゴンペルツの成長曲線フィッティング)と、続く分散分析及びテューキー検定の後に得られた。 処置及び非処置Bbs1M390R/M390Rにおける表現型発現から、P0全身処置動物における体重減少が実証される。AAV2/8-EFS-BBS1構築物で静脈内処置された場合、Bbs1M390R/M390R動物は、雄及び雌の野生型レベルまでの体重増加の減弱を示す(p値参照)。IV=静脈内。Het=ヘテロ接合型動物のBbs1M390R/M390R。WT=野生型動物。M390R=ホモ接合動物のBbs1M390R/M390R。エラーバーは、平均の標準誤差(S.E.M)を示す。p値は、非線形曲線フィッティング(ゴンペルツの成長曲線フィッティング)と、続く分散分析及びテューキー検定の後に得られた。 ゴンペルツ成長非線形回帰解析のグラフ表示。検定された全ての非線形回帰曲線関数の最良にフィットされたゴンペルツ成長。A.頭蓋内P0処置の雄。B.全身P0処置の雄。C.頭蓋内P0処置の雌。D.全身P0処置の雌。I.C.=頭蓋内。I.V.=静脈内。 血清レプチン血漿濃度/体重。AAV2/8-EFS-BBS1 IV及びIC Bbs1M390R/M390R処置動物は、処置の6ヶ月後に低下された血清レプチン濃度を有した。M390R=ホモ接合動物のBbs1M390R/M390R。WT=野生型動物。IC=頭蓋内処置。IV=静脈内処置。 AAV2/8-EFS-BBS1 IV処置Bbs1M390R/M390R動物が処置の6ヶ月後に光受容部喪失の減弱を有したことを示すエオジン・ヘマトキシリン網膜区分。定量については、図11参照。ONL=外顆粒層。IN=内顆粒層。全ての画像が40倍の対物レンズで撮影された。 AAV2/8-EFS-BBS1 IC処置Bbs1M390R/M390R動物が処置の6ヶ月後に光受容部喪失の減弱を有したことを示すエオジン・ヘマトキシリン網膜区分。定量については、図11参照。ONL=外顆粒層。IN=内顆粒層。全ての画像が40倍の対物レンズで撮影された。 外顆粒層区分の網膜厚の定量。Bbs1M390R/M390R処置動物において回復されたONLの顆粒の数は、非処置動物に比較して2倍である。 ベクターのマップは、主要な特色が示された、以下の実施例で用いられたEFS及びヒトBBS1(EFS-hBBS1)を含む。このベクターを用いて、AAV2/8-EFS-BBS1ウイルスを生成した。本発明の特定の実施形態において、該プロモーター、繊毛病遺伝子及び制限部位は、最終生成物に応じて異なり得る。 P0頭蓋内AAV2/8-EFS-BBS1送達後52週目の目及び脳におけるRT-PCRによるヒトBBS1の発現。ヒトBBS1の明確な発現が、AAV2/8-EFS-BBS1の頭蓋内注射(IC処置)後の注射された動物の目及び脳で観察され、良好な形質導入及び長期持続性の発現が示される。マウス及びヒトBBS1を識別するための特異的ヒトプライマーを設計し、マウスBbs1の検出は観察されなかった。M390R=Bbs1M390R/M390R、WT:野生型動物、UT:非処置、IC処置:頭蓋内処置。 注射の1年後の構築物の有効性。構築物であるAAV2/8-EFS-BBS1での出生期頭蓋内処置12ヶ月後に、Bbs1M390R/M390R処置の雄は、野生型非処置同腹子に比較して体重減少を継続して示した。WT=野生型動物。M390R=ホモ接合動物のBbs1M390R/M390R。エラーバーは、平均の標準誤差(S.E.M)を示す。 処置52週後の循環レプチンのレベル。雄及び雌Bbs1M390R/M390R動物は、レプチンレベルの上昇を示している。雄AAV2/8-EFS-BBS1処置動物は、非処置野生型動物と同じレプチンレベルを有する。処置Bbs1M390R/M390R対非処置野生型は、有意差がない(p値0.647)。非処置Bbs1M390R/M390R対処置Bbs1M390R/M390Rは、有意なp値0.027を有する。雌AAV2/8-EFS-BBS1処置動物は、非処置Bbs1M390R/M390R動物に比較してレプチンレベルの有意な低下を示す(p値0.041)。M:雄、F:雌、WT:野生型;HOM:Bbs1M390R/M390R、UT:非処置、IC:頭蓋内。 SEQ ID NO:15~SEQ ID NO:29の全ての構築物での個別のトランスフェクション後のBBS1の発現を示すリアルタイムPCR。構築物のトランスフェクション後に、総RNAを抽出して、RNAのレベルを定量し、SEQ ID NO:15を有する構築物について正規化させた(EFS-WTBBS1)。 SEQ ID NO:30~SEQ ID NO:44の全ての構築物での個別のトランスフェクション後のBBS10の発現を示すリアルタイムPCR。構築物のトランスフェクション後に、総RNAを抽出して、RNAのレベルを定量し、非トランスフェクトのHEK293T総mRNAを有する構築物について正規化させた。 SEQ ID NO:15~SEQ ID NO:29の構築物での個別のトランスフェクション後のBBS1タンパク質の発現を示すウェスタンブロット。Image Jを用いてブロットを定量し、BBS1発現レベルをSEQ ID NO:15について正規化させた(EFS-WTBBS1)。 Image Jを用いて図18のブロットを定量し、全てのBBS1発現レベルをSEQ ID NO:15について正規化させた(EFS WTBBS1)。ほぼ全ての構築物及び新しいBBS1配列が、初期EFS-WTBBS1構築物に比較してBBS1タンパク質発現の増加を示した。 P0 AAV2/9-CAG-COSEQ1-BBS1を頭蓋内注射された動物の試料からのCOSEQ1-BBS1のRT-PCR。Bbs1+M390R動物を、P0 AAV2/9-CAG-COSEQ1-BBS1での注射後8日、14日及び40日目に殺処分した。総RNAを抽出して、cDNAを合成した。188のヌクレオチドの予測されたバンドを有するCOSEQ1-BBS1のPCRを実施して、遺伝子発現を脳及び目で検出した。P:注射後の日数、C:注射された対照ビヒクル、bp:塩基対。
発明の詳細な記載
本発明者らは、簡単な注射により投与され、多臓器を一度に標的化する、単一のベクターを開発した。このアプローチは、代わりのマルチベクターアプローチよりも簡単で、確かにより費用対効果がある。1つより多くの臓器の機能を回復させること(例えば、視力及び体重減少)が、繊毛病患者の健康及び生活の質を改善して人生を変えることになる。
繊毛病において広範囲の臓器病変があることを条件に、中枢神経系及び内蔵症状の両方に取り組む多臓器治療が求められている。さらに、幼児患者における症状の早期出現は、理想的にはそのような治療が可能な限り早期に施されることを必要とする。新生児期での単一治療薬の送達は、多臓器を効果的に標的化して、不可逆的な病状を予防し、費用対効果がある。
これらの目標を実現するために、本発明者らは、アデノ随伴ウイルスを利用して多臓器治療を実現する、遺伝子治療に基づくプロトコルを利用した。近年になるまで、末梢臓器を標的として血液脳関門を交差することが可能なウイルスベクターを見出すことができず、多臓器遺伝子送達が困難であった。しかし、AAV8及びAAV9が、マウス(Foust KD et al. Nat Biotechnol. 2009;27(1):59-65)及び非ヒト霊長類(Foust KD et al. Nat Biotechnol. 2010; 28(3): 271-4; Bevan AK et al. Mol Ther. 2011; 19(11): 1971-80)
の血液脳関門を交差すること、及び中枢神経系への高度に効率的な遺伝子送達を媒介することが可能であるという発見が、この分野の見通しを変化させた。ここに、ベクター投与の簡便化を検討することを実行可能にし、臓器レジメンごとに1回の投与を利用するよりもむしろ少ない投与経路で多臓器を処置することを可能にする。例えば、新生マウスに緑色蛍光タンパク質(GFP)遺伝子を運搬するAAV8又はAAV9の静脈内投与が、目をはじめとする脳及び神経系の広範囲かつ包括的な形質導入に導くことが実証された。さらに本発明者らは、このアプローチが内臓器官及び筋系をはじめとする広範囲の全身形質導入も導くことを示すデータを有する(FASEB J. 2015 Sep;29(9):3876-88.)。
バルデ・ビードル症候群など、幼児において症状を提示する多系統及び進行性の障害は、新生児期治療性AAV送達の理想的候補である。BBSを誘発する最も共通する突然変異は、BBS1に見出されるため、本発明者らは、1つのBBSネズミ疾患モデルBbs1M390R/M390Rにおいてヒト遺伝子BBS1を運搬するAAV8及びAAV9ベクターをテストした。このモデルは、共通する突然変異の「ノックイン」であり、ヒトBBS表現型(失明及び肥満など)を再現することが十分に検証され、特徴づけられている。外来BBS1遺伝子の転写は、標的臓器内で広く発現される哺乳動物のユビキタスEFSプロモーターにより駆動される。このアプローチは、AAV8及びAAV9の能力を発揮して血液脳関門を交差し、その後、網膜、海馬/歯状回又は視床下部食欲中枢などの神経欠損を標的とし、これによりそれぞれ網膜機能及び肥満を回復させることができる。これらの疾患モデルにおける有効な全身遺伝子移入は、患者のための臨床試験に先立って、ベクターの必要な原理証明、最適な投与量情報、回復の有効性、並びに毒性及び安全性プロファイルを提供する。
本発明者らは、短い伸長因子プロモーター(EFS)の制御下にあるヒトBBS1 cDNAを、アデノ随伴ウイルス-8(AAV2/8)からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAV-2ベクター内にクローニングした。これらのデータから、EFS-BBS1構築物を効率的にトランスフェクトして、HEK293T細胞内でヒトBBS1を発現することが実証される。P0の子犬の頭蓋内送達又は全身(IV)送達を介したウイルス生成及び感染の後、良好な形質導入が網膜及び脳において示された。処置マウスにおける毒性的影響は、観察されなかった。本発明者らは、突然変異体Bbs1M30R/M390R動物が処置された場合に、肥満及び網膜表現型が高度に救済され得ることを実証することができた。
BBS1ヌクレオチド及びアミノ酸配列は、ヒトとマウスの間で高度に保存されている(92.2%)。患者で最も共通する突然変異であるBbs1遺伝子のM390R突然変異を含むノックインマウスが生成された(Proc Natl Acad Sci USA. 2007 Dec 4; 104(49): 19422-19427)。Bbs1M390R/M390Rマウス網膜の連続組織学的検査から、誕生後6ヶ月までに緩やかで完全な内部及び外部区分(IS及びOS)の進行性の変性が示された。Bbs1M390R/M390Rノックインマウスの網膜電図(ERG)は、a波及びb波における有意な減弱と、c波のより小さな減弱を示し、この変性が円錐形及び円柱形の光受容部細胞に優先的に影響を及ぼし、網膜色素上皮(RPE)には影響を及ぼさないことが示唆される。加えて、Bbs1M390R/M390Rマウスはまた、脂肪細胞由来レプチンホルモンの高い血清レベルに関連する肥満を発症し、レプチン抵抗性、食物摂取の増加及び自発運動活性の低下が示唆される。同じく、認知及び学習に重要
な領域である線条体及び海馬のサイズ減少など、数多くの神経解剖学的欠損が検出される。これらの表現型は、ヒト疾患を再現し、新規な処置を評定するのに理想的なマウスモデルを作製させる。マウスBbs10及びヒトBBS10遺伝子は両者とも、2つのエキソンによりコードされる。それらのタンパク質は、67%同一のアミノ酸配列で保存されている。Bbs10ヌル(Bbs10-/-)マウスは、Bbs10のエキソン2を完全に欠いている。Bbs10-/-マウスは、周産期に矮小で8日後から(from 8 onwards)肥満を発症するという典型的なBBS表現型を示し、3ヶ月齢で過体重になる。Bbs10-/-マウスはまた、過食症及び高レベルの循環レプチンを発症する。Bbs10-/-マウスは、重度の網膜変性を発症し、3ヶ月齢までに光受容部の内部IS及びOS並びにONLの明確な喪失を生じる(Cilia 2015 4:10)。
材料と方法
ヒトBBS1 cDNA(SEQ ID NO:1 - NM_024649.4)が
AAV2/8ウイルスプラスミド内でのEFSプロモーター(ヒト真核生物翻訳伸長因子1 α1ショートプロモーター)の制御下でクローニングされた構築物を生成した。この実験計画の目標は、バルデ・ビードル症候群1(BBS1)のためのウイルス遺伝子治療に向けて始動することであるため、ヒト野生型BBS1 cDNAを含み、伸長因子1αショート(EFS)プロモーターにより駆動されるアデノ随伴ウイルス(AAV)を生成した。ウイルス生成のために、通常の方法を用いた。4000cmのHEK293T細胞単層細胞に、EFS-BBS1-AAV-ITR含有プラスミド、AAV2 Rep-Capプラスミド及びヘルパープラスミドをトランスフェクトした。細胞変性効果を示したら、細胞を回収して溶解し、ウイルスを遊離させた。該アデノ随伴ウイルスを、2つの連続塩化セシウム勾配を利用した遠心分離により精製した。最終生成物を脱塩し、ウイルス粒子のために分光光度法で、そしてPFU/IFUのためにプラーク形成アッセイで力価測定した。
本発明者らはまた、EFSプロモーターの制御下でBBS10野生型cDNA(SEQ
ID NO:2)を、そしてBBS1(SEQ ID NO:11及び12)及びBBS10(SEQ ID NO:13及び14)のための完全に新規なコドン最適化配列をクローニングして、遺伝子発現及び有効性のレベルを改善した。新規な配列を、EFS、CAG、CMV、CBA、UBCプロモーターの制御下でクローニングした。記載されたプロモーターと、記載されたBBS1及びBBS10配列との全ての可能な組み合わせを、pAV-AAV-ITR含有プラスミドにクローニングした。プロモーターをSpeIとEcoRIの制限部位の間にクローニングし、その後、プロモーターの3’下流側のBBSコード配列をEcoRI及びSalI制限酵素で挿入した。クローンを配列決定して、プロモーター及びコード配列内の望まない突然変異をチェックした。該プロモーター及び遺伝子配列を含有する全ての配列を、SEQ ID NO:15~SEQ ID NO:
44として提示する。
改善された遺伝子発現をテストするために、HEK293T細胞を、Lipofectamine 2000プロトコルを利用し、1μg/μl DNAを用いて、全ての異なる構築物:pAV-EFS-WTBBS1、pAV-EFS-COSEQ1-BBS1、pAV-EFS-COSEQ2-BBS1、pAV-UBC-WTBBS1、pAV-UBC-COSEQ1-BBS1、pAV-UBC-COSEQ2-BBS1、pAV-CMV-WTBBS1、pAV-CMV-COSEQ1-BBS1、pAV-CMV-COSEQ2-BBS1、pAV-CBA-WTBBS1、pAV-CBA-COSEQ1-BBS1、pAV-CBA-COSEQ2-BBS1、pAV-CAG-WTBBS1、pAV-CAG-COSEQ1-BBS1、pAV-CAG-COSEQ2-BBS1、pAV-EFS-WTBBS10、pAV-EFS-COSEQ1-BBS10、pAV-EFS-COSEQ2-BBS10、pAV-UBC-WTBBS10、pAV-UBC-COSEQ1-
BBS10、pAV-UBC-COSEQ2-BBS10、pAV-CMV-WTBBS10、pAV-CMV-COSEQ1-BBS10、pAV-CMV-COSEQ2-BBS10、pAV-CBA-WTBBS10、pAV-CBA-COSEQ1-BBS10、pAV-CBA-COSEQ2-BBS10、pAV-CAG-WTBBS10、pAV-CAG-COSEQ1-BBS10、pAV-CAG-COSEQ2-BBS10でトランスフェクトした。
細胞を、総mRNAのために0.5ml Trizolで回収した。総mRNAを定量して、リアルタイムPCRを、各トランスフェクションのためにmRNA 1μgを利用して実施した。各配列の特異的プライマーを、各構築物のために使用して、ヒトBBS1発現のレベルを定量した。Ct値発現レベルを、全てのBBS構築物のためにEFS-BBS1について、そしてBBS10構築物のために非トランスフェクト試料について正規化した。
別の実験において、細胞を同じくBBS1タンパク質発現のためにトランスフェクトした。RIPA緩衝液を用いて、総タンパク質を抽出し、総タンパク質を各トランスフェクションのために定量した。各トランスフェクションのための1μg/μlの試料タンパク質を、4~20%アクリルアミドゲルにロードした。ウェスタンブロットを、BBS1に対する特異的抗体で実施し、ゲルをスキャニングして、分析した。ローディング対照として、第二のウェスタンブロットをGAPDH抗体で実施した。最初に、各レーンをGAPDHについて正規化し、その後、各ゲルをEFS-WTBBS1発現に正規化することにより、ブロットを定量した。
ウイルス投与及び力価
Bbs1M390R/+雄とBbs1M390R/+雌の間で、時限的な交尾(timed matings)を調製した。P0の子犬を、性別及びBbs1遺伝子型についてジェノタイプ
化した。アデノウイルス随伴ベクターを、a)頭蓋内(3.5×1013vg/ml(ベクターゲノム/ml)5μl)及び全身に(IV)(3.5×1013vg/ml 20μl)の2つの投与経路を介してP0動物に与えた。全身注射は、側部顔面静脈を通して実行した。
本発明者らは、3つの異なる動物群:Bbs1M390R/M390R動物、野生型及びヘテロ接合型に注射した。非注射対照を、各群の対照として用いた。総数6匹/群を用いた。処置された動物は、注射の6ヶ月後に任意の物理的又は行動的苦痛を示さない。
コドン最適化配列及び構築物での結果に基づき、本発明者らは、ヒトBBS1を異なる組織に送達及び発現する新しい構築物の能力をテストすることを決定した。著者らは、新しいウイルスカプシド(AAV2/9)、新しいCAGプロモーター及び新しいCAG-COSEQ1-BBS1構築物(SEQ ID NO:28)をテストした。CAG-COSEQ1-BBS1構築物(SEQ ID NO:28)を含むAAV2/9ベクターを生成して、P0新生犬に投与してBbs1活性を回復させることによる有効性をテストした。Bbs1M390R/M390R新生動物に、0.175×1012vg/動物を5μl注射で頭蓋内注射した。対照、Bbs1+/M390及びWT動物に、AAV2/9-CAG-COSEQ1-BBS1又はビヒクルを注射して、注射後14及び40日目にヒトBBS1発現についてテストした。
結果
本発明者らは、遺伝子治療技術を利用した、繊毛病のバルデ・ビードル症候群により罹患された多組織の処置を初めて示す。ユビキタスプロモーターEFSの制御下でのヒトBBS1 cDNAは、AAV2/8ベクターにおけるBBS1タンパク質の発現を形質導
入した。図1は、クローニングされたpAV-EFS-BBS1の消化後の正しいサイズを示しており(レーン4)、正確なクローニングが実証されている。このAAVを作製するために、プロデューサープラスミドpHGTI、pLT-AAV2-8、及びpAV-EFS-BBS1を得た。ヘルパープラスミドはpHGTIであり、単純ヘルペスウイルスタンパク質をコードする配列を含む。これらは、AAVの効率的生成に必須である。pLT-AAV2-8プラスミドは、AAV2及びAAV8からそれぞれAAV rep及びcap遺伝子をコードする配列を含む。rep遺伝子は、AAV複製に必須であり、cap遺伝子は、カプシドタンパク質をコードし、AAVの向性を決定する。最後に、該pLT-AAV2-8プラスミドは、BBS1 cDNAと共に、AAV末端逆位配列を含み、EFSプロモーターにより制御される。それは、AAV内に包装されて細胞に送達されるこれらの配列である。
得られたプロデューサープラスミドが、予測された通りであるかを評定するために、pLT-AAV2-8、pHGTI、及びpAV-EFS-BBS1プラスミドDNAを消化することにより、制限酵素消化を実行した(図1)。pLT-AAV2-8プラスミドのバンドサイズは、それぞれ186bp、2109bp及び4844bpであった(レーン3、図1)。導入遺伝子pAV-EFS-BBS1構築物の場合、バンドサイズは、236bp、643bp、1195bp及び5078bpであった(レーン4、図1)。ヘ
ルパープラスミドの場合、可視のバンドサイズは、それぞれ6318bp及び11549であり(レーン2、図1)、プラスミド内に追加の望まないDNAが存在しないことが検証された。
HEK293T細胞をpAV-EFS-BBS1プラスミドでトランスフェクトした場合に、BBS1の高発現が観察された。このデータから、EFSがインビトロでのヒトBBS1の発現を駆動する可能性が示される(図2)。本発明者らは、AAV2/8-EFS-BBS1を生成及び精製して、頭蓋内及び全身送達でP0野生型胚に注射した。AAV2/8-EFS-BBS1の形質導入能力が、網膜及び脳の両組織で実証された。網膜及び脳におけるヒトBBS1の特異的発現が、認められた(図3、図4)。
Bbs1M390R/M390RマウスモデルにおけるBBS1発現の有効性を評定する機能的試験を実行した。野生型、ヘテロ接合型Bbs1M390R/+及びBbs1M390R/M390Rの同腹子に、AAV2/8-EFS-BBS1をP0で注射した。並行して、3つの遺伝子型全てからの非処置動物のコホートを、対象として飼育した。本発明者らは、このコホートを26週間追跡し、各動物の体重を毎週測定した。頭蓋内及び全身注射の両方のBbs1M390R/M390R動物における体重維持について、有意な改善が実証された(図5~7)。AAV2/8-EFS-BBS1で処置された野生型動物と非処置動物の間に、体重差は観察されなかった。ヒトBBS1が、頭蓋内注射の52週後に目及び網膜において発現されることが見出されたため、ヒトBBS1発現レベルが少なくとも1年間持続することが示された(図13)。体重の調節における改善もまた、図14に示される通り、1年間全体を通して維持された。非線形回帰と、続くテューキー検定統計解析を含む一元配置分散分析の工程により、体重の救済が、非処置動物に比較してAAV2/8-EFS-BBS1で処置されたBbs1M390R/M390R動物で有意であることが、統計学的に立証された(図6)。血清中のレプチンレベルを、分析した。AAV2/8-EFS-BBS1で静脈内及び頭蓋内処置されたBbs1M390R/M390R動物において、正常なレプチンレベルまで回復した(図8)。正常なレプチンレベルは、出生時にAAV2/8-EFS-BBS1で処置された雄及び雌の両方で52週間維持された(図15)。
P0にAAV2/8-EFS-BBS1で処置されたBbs1M390R/M390R動物はまた、外顆粒細胞ONL数損失の減弱を示した。その減弱は、非処置Bbs1M3
90R/M390R動物に比較して、6ヶ月目の処置動物の網膜に存在する生存する光受容部の顆粒数を定量することにより実証された。この効果は、静脈内及び頭蓋内の両方の処置群で観察された(図9、10及び11)。
研究者らは、新規なコドン最適化配列を用いて、BBS1 mRNAの相対的発現がBBS1構築物のトランスフェクション後に改善されることを示した(図16参照)。CMVプロモーターは、最高レベルの発現を示し、その後にCAGプロモーターの発現を示した。BBS1コドン最適化配列であるCOSEQ1-BBS1及びCOSEQ2-BBS1は、野生型ヒトBBS1 cDNAよりもかなり良好な発現を有する。良好な発現を有する該構築物は、19倍増加のCMV-COSEQ1-BBS1、10倍増加のCMV-WTBBS1、及び7倍増加のCAG-COSEQ1-BBS1である。全ての発現を、EFS-WTBBS1発現に対して正規化する。新規なBBS10構築物でのトランスフェクションもまた、ヒトBBS10発現の増加を示し、プロモーター-BBS10配列の組み合わせのほとんどにおいて、新しいコドン最適なBBS10配列は、BBS10 RNAをより良好な収率で送達する(図17)。
全てのBBS1構築物のトランスフェクションからのタンパク質抽出物のウェスタンブロットは、全てのBBS1構築物のためのタンパク質発現の増加を示した。BBS1(65kDa)及びGAPDH(38kDa)の特異的バンド(図18参照)が検出された。タンパク質量の分析及び正規化は、図19に示された通り実施した。
ゲルの分析から、発現を駆動するために用いられるプロモーターに関わらず、新しいコドン最適化配列であるCOSEQ1-BBS1及びCOSEQ1-BBS2がどのようにして野生型BBS1よりも良好にBBS1を発現することができるかが示される。最高の発現が、配列COSEQ1-BBS1で見出され、それはCMVプロモーターでは33倍増加を、そしてCAGプロモーターでは24倍増加を実現する。
本発明者らは、ベクターの形質導入の40日後に、脳及び目におけるAAV2/9-CAG-COSEQ1-BBS1構築物中の新しいコドン最適化配列COSEQ1-BBS1の発現を実証した(図20参照)。バンドの特異性をチェックするために、バンドを切断して洗浄し、サンガー配列決定を行い、COSEQ1-BBS1の正しい配列を観察した。
考察
これらの結果は、本発明者らが野生型BBS1タンパク質を発現するヒト機能性BBS1遺伝子を、遺伝子治療ベクターの単回投与により複数の罹患した臓器に送達し得たことを実証している。CNS中のWT Bbs1の発現増加に続いて、体重減少及び循環レプチン減少により示された通り視床下部レプチン調節機能が回復した。同様に、目におけるヒトBBS1の発現に続いて、全身送達6ヶ月後の網膜変性が減弱した(図3~15)。
ほとんどの繊毛病の多組織的性質が、単回処置による異なる幾つか又は全ての罹患臓器の処置を困難にする。特異的臓器を処置するために遺伝子治療を現在開発しているという状況においても、その遺伝子治療は、その特異的表現型のみに有用であり、より疾病をより全般的に処置することはないであろう。
全ての繊毛病は、異なる重症度で罹患された同じ臓器を有する(N Engl J Med 2011; 364:1533-1543 April 21, 2011のレビュー参照)。それらの全てのうち、BBSは、より
多くの臓器がBBS遺伝子内の突然変異により直接罹患されている繊毛病の1種である。本発明者らは、遺伝子治療が単一ベクターの投与で複数の罹患組織を標的化し得ることを立証した。それゆえ本発明は、単回投与により、罹患した臓器内の特異的繊毛病遺伝子を
標的化して機能を回復させ得るであろう。
一部の繊毛機能による網膜障害の場合のように、繊毛病が主に単一臓器を罹患している場合であっても、静脈内投与、頭蓋内投与、並びに/又は静脈内及び頭蓋内投与が、網膜下治療の現在の技術よりも効果的でリスクを伴わないであろう。
他の繊毛病の処置
先に記載された実験で、繊毛病、この場合バルデ・ビードル症候群を担う突然変異遺伝子の機能を交換するタンパク質の全身発現が、繊毛病により罹患された一部又は全ての臓器を処置する効果的方法になることが示される。それゆえこれは、過去の試みよりも効果的な、繊毛病を処置する方法となる。全ての繊毛病は、繊毛機能又は構造に何らかの形で影響を及ぼす類似範囲の障害の一部である。その関連性の表現型による収穫が、同じ遺伝子が1つより多くの繊毛病に因果関係があることを見出されている、ということである。異なる繊毛病で共有される遺伝子を見出すことができ、例えばMKKS/BBS6は、バルデ・ビードル症候群及びマキュージック・カウフマン症候群に関連する。同じ臓器が罹患したことを意味する表現型発現の共有、及び同じ遺伝子が1つより多くの繊毛病に関与することを意味する遺伝的等質性という事実により、本発明のこの遺伝子送達及び発現が、多くの繊毛病を処置するための特有のアプローチになる。それゆえこのアプローチは、バルデ・ビードル症候群のみに限定されず、多くの繊毛病に適用可能である。その上、全ての繊毛病が、単一遺伝子内の突然変異により誘発され、それゆえ適当な非突然変異遺伝子の全身発現が、繊毛病関連の病状を全身で改善させる。
先に実証された通り、バルデ・ビードル症候群は、この遺伝子治療アプローチを用いて処置され得る。以下の表は、突然変異を生じてバルデ・ビードル症候群に関連する表現型の病状を誘発し得る多数の遺伝子を示している。それゆえ野生型非突然変異タンパク質を発現する適当な遺伝子を含む先に記載された遺伝子治療ベクターを使用すれば、バルデ・ビードル症候群を処置することができる。
加えて、バルデ・ビードル症候群に関連する遺伝子の幾つかは、他の関係する繊毛病にも関連づけられている。その結果、適当な遺伝子を用いた上記のアプローチを利用して、ジュベール症候群、メッケル・グルーバー症候群、髄質性嚢胞腎、シニア・ローケン症候群、マキュージック・カウフマン症候群及びレーバー先天性黒内障などの他の繊毛病を処置することもできる。例えばマキュージック・カウフマン症候群は、MKKS/BBS6遺伝子内の突然変異によって誘発される。それゆえ、野生型MKKS/BBS6タンパク質が発現されるようにMKKS/BBS6遺伝子の発現を提供するベクターを用いて、マキュージック・カウフマン症候群及びバルデ・ビードル症候群を処置又は改善することができる。このことは、以下の表で参照される様々な他の繊毛病にもあてはまる。
配列
SEQ ID NO.1 - ヒトバルデ・ビードル症候群1(BBS1)ヌクレオチド配列(WT)、cDNA(NM_024649.4)
SEQ ID NO. 2 - ヒトバルデ・ビードル症候群10(BBS10)ヌクレオチド配列(WT)、cDNA(NM_024685.3)
SEQ ID NO. 3 - 短い伸長因子(EFS)プロモーター配列
SEQ ID NO. 4 - CAGプロモーター配列
SEQ ID NO. 5 - ユビキチンC(UBC)プロモーター配列
SEQ ID NO. 6 - サイトメガロウイルス(CMV)前初期プロモーター配列SEQ ID NO. 7 - ホスホグリセラートキナーゼ(PGK)プロモーター配列SEQ ID NO. 8 - ニワトリベータアクチン(CBA)プロモーター配列
SEQ ID NO. 9 - ヒトBBS1全長タンパク質配列(Q8NFJ9)
SEQ ID NO. 10 - ヒトBBS10全長タンパク質配列(Q8TAM1)
SEQ ID NO. 11 - ヒトBBS1タンパク質をコードするコドン最適化ヌクレオチド配列(COSEQ1-BBS1と称する)
SEQ ID NO. 12 - ヒトBBS1タンパク質をコードするコドン最適化ヌクレオチド配列(COSEQ2-BBS1と称する)
SEQ ID NO. 13 - ヒトBBS10タンパク質をコードするコドン最適化ヌクレオチド配列(COSEQ1-BBS10と称する)
SEQ ID NO. 14 - ヒトBBS10タンパク質をコードするコドン最適化ヌクレオチド配列(COSEQ2-BBS10と称する)
SEQ ID NO 15 - EFSプロモーター(nt41~272)及び野生型B
BS1ヌクレオチド配列(nt1238~3019)を含む構築物(EFS-WTBBS1と称する)
SEQ ID NO 16 - EFSプロモーター(nt41~272)及びCOSE
Q1-BBS1ヌクレオチド配列(nt1243~3024)を含む構築物(EFS-COSEQ1-BBS1と称する)
SEQ ID NO 17 -EFSプロモーター(nt41~272)及びCOSEQ2
-BBS1ヌクレオチド配列(nt1243~3024)を含む構築物(EFS-COSEQ2-BBS1と称する)
SEQ ID NO 18 - UBCプロモーター(nt29~1198)及び野生型
BBS1ヌクレオチド配列(nt1281~3062)を含む構築物(UBC-WTBBS1と称する)
SEQ ID NO 19 - UBCプロモーター(nt29~1198)及びCOS
EQ1-BBS1ヌクレオチド配列(nt1285~3066)を含む構築物(UBC-COSEQ11BBS1と称する)
SEQ ID NO 20 - UBCプロモーター(nt29~1198)及びCOS
EQ2-BBS1ヌクレオチド配列(nt1285~3066)を含む構築物(UBC-COSEQ2-BBS1と称する)
SEQ ID NO 21 - CMVプロモーター(nt367~570)及び野生型
BBS1ヌクレオチド配列(nt626~2407)を含む構築物(CMV-WTBBS1と称する)
SEQ ID NO 22 - CMVプロモーター(nt367~570)及びCOS
EQ1-BBS1ヌクレオチド配列(nt630~2411)を含む構築物(CMV-COSEQ1-BBS1と称する)
SEQ ID NO 23 - CMVプロモーター(nt367~570)及びCOS
EQ2-BBS1ヌクレオチド配列(nt630~2411)を含む構築物(CMV-COSEQ2-BBS1と称する)
SEQ ID NO 24 - CBAプロモーター(nt42~319)及び野生型B
BS1ヌクレオチド配列(nt469~2250)を含む構築物(CBA-WTBBS1と称する)
SEQ ID NO 25 - CBAプロモーター(nt42~319)及びCOSE
Q1-BBS1ヌクレオチド配列(nt473~2254)を含む構築物(CBA-COSEQ1-BBS1と称する)
SEQ ID NO 26 - CBAプロモーター(nt42~319)及びCOSE
Q2-BBS1ヌクレオチド配列(nt473~2254)を含む構築物(CBA-COSEQ2-BBS1と称する)
SEQ ID NO 27 - CAGプロモーター(nt35~562)及び野生型B
BS1ヌクレオチド配列(nt712~2493)を含む構築物(CAG-WTBBS1と称する)
SEQ ID NO 28 - CAGプロモーター(nt35~562)及びCOSE
Q1-BBS1ヌクレオチド配列(nt716~2497)を含む構築物(CAG-COSEQ1-BBS1と称する)
SEQ ID NO 29 - CAGプロモーター(nt35~562)及びCOSEQ2-BBS1ヌクレオチド配列(nt716~2497)を含む構築物(CAG-COSEQ2-BBS1と称する)
SEQ ID NO 30 - EFSプロモーター(nt41~272)及び野生型B
BS10ヌクレオチド配列(nt1243~3414)を含む構築物(EFS-WTBBS10と称する)
SEQ ID NO 31 - EFSプロモーター(nt41~272)及びCOSE
Q1-BBS10ヌクレオチド配列(nt1243~3414)を含む構築物(EFS-COSEQ1-BBS10と称する)
SEQ ID NO 32 - EFSプロモーター(nt41~272)及びCOSE
Q2-BBS10ヌクレオチド配列(nt1243~3414)を含む構築物(EFS-COSEQ2-BBS10と称する)
SEQ ID NO 33 - UBCプロモーター(nt29~1198)及び野生型
BBS10ヌクレオチド配列(nt1285~3456)を含む構築物(UBC-WTBBS10と称する)
SEQ ID NO 34 - UBCプロモーター(nt29~1198)及びCOS
EQ1-BBS10ヌクレオチド配列(nt1285~3456)を含む構築物(UBC-COSEQ1BBS10と称する)
SEQ ID NO 35 - UBCプロモーター(nt29~1198)及びCOS
EQ2-BBS10ヌクレオチド配列(nt1285~3456)を含む構築物(UBC-COSEQ2-BBS10と称する)
SEQ ID NO 36 - CMVプロモーター(nt367~570)及び野生型
BBS10ヌクレオチド配列(nt630~2801)を含む構築物(CMV-WTBBS10と称する)
SEQ ID NO 37 - CMVプロモーター(nt367~570)及びCOS
EQ1-BBS10ヌクレオチド配列(nt630~2801)を含む構築物(CMV-COSEQ1-BBS10と称する)
SEQ ID NO 38 - CMVプロモーター(nt367~570)及びCOS
EQ2-BBS10ヌクレオチド配列(nt630~2801)を含む構築物(CMV-COSEQ2-BBS10と称する)
SEQ ID NO 39 - CBAプロモーター(nt42~319)及び野生型B
BS10ヌクレオチド配列(nt473~2644)を含む構築物(CBA-WTBBS10と称する)
SEQ ID NO 40 - CBAプロモーター(nt42~319)及びCOSE
Q1-BBS10ヌクレオチド配列(nt473~2644)を含む構築物(CBA-COSEQ1-BBS10と称する)
SEQ ID NO 41 - CBAプロモーター(nt42~319)及びCOSE
Q2-BBS10ヌクレオチド配列(nt473~2644)を含む構築物(CBA-COSEQ2-BBS10と称する)
SEQ ID NO 42 - CAGプロモーター(nt35~562)及び野生型B
BS10ヌクレオチド配列(nt716~2887)を含む構築物(CAG-WTBBS10と称する)
SEQ ID NO 43 - CAGプロモーター(nt35~562)及びCOSE
Q1-BBS10ヌクレオチド配列(nt716~2887)を含む構築物(CAG-COSEQ1-BBS10と称する)
SEQ ID NO 44 - CAGプロモーター(nt35~562)及びCOSE
Q2-BBS10ヌクレオチド配列(nt716~2887)を含む構築物(CAG-COSEQ2-BBS10と称する)
SEQ ID NO. 45 - 代わりのCMVプロモーター配列
SEQ ID NO. 46 - 代わりの短い伸長因子(EFS)プロモーター配列
SEQ ID NO. 47 - 代わりのCAGプロモーター配列
SEQ ID NO. 48 - 代わりのユビキチンC(UBC)プロモーター配列
SEQ ID NO. 49 - 代わりのニワトリベータアクチン(CBA)プロモーター配列

Claims (11)

  1. クターを含む、バルデ・ビードル症候群を処置するための医薬組成物であって、
    前記ベクターが、繊毛病遺伝子に動作可能に連結されたプロモーターを含み
    記プロモーターが、形質導入された臓器における前記繊毛病遺伝子の発現を提供し得るユビキタスプロモーターであり
    記繊毛病遺伝子が、SEQ ID NO.1のヌクレオチド配列を有するか、又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有し、機能的ヒトBBS1タンパク質をコードし、
    医薬組成物が、静脈内及び/又は頭蓋内投与されること、並びに、多臓器への前記繊毛病遺伝子の形質導入を提供することを特徴とする、医薬組成物
  2. 前記ベクターがアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター又はレンチウイルスベクターである、請求項1に記載の医薬組成物
  3. 前記ベクターがAAVベクターである、請求項1又は2に記載の医薬組成物
  4. 前記ベクターが、AAV8、AAV9、AAV8若しくはAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクター、AAV-PHP.A、AAV-PHP.B、AAV9.47、AAV-B1、AAV8(Y733F)又はAAV2-TTから選択される、請求項1~3のいずれか一項に記載の医薬組成物
  5. 前記ベクターが、AAV8ベクター、AAV9ベクター、又はAAV8若しくはAAV9からのカプシドタンパク質でシュードタイプ化されたAAVベクターである、請求項1~4のいずれか一項に記載の医薬組成物
  6. 前記プロモーターが、短い伸長因子プロモーター(EFS)、CAGプロモーター、サイトメガロウイルス前初期プロモーター(CMV)、ユビキチンCプロモーター(UBC)、ホスホグリセラートキナーゼプロモーター(PGK)及びベータアクチンプロモーターから選択される、請求項1~5のいずれか一項に記載の医薬組成物
  7. 前記プロモーターが、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ I
    D NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8及びSEQ ID NO.45から選択される配列を有する、請求項1~6のいずれか一項に記載の医薬組成物
  8. 前記プロモーターが、CAGプロモーターである、請求項1~7のいずれか一項に記載の医薬組成物
  9. 前記プロモーターが、SEQ ID NO.4又はSEQ ID NO.47のヌクレオチド配列を有し得るCAGプロモーターである、請求項1~8のいずれか一項に記載の医薬組成物
  10. 種又は複数の医薬的に許容できる賦形剤を含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  11. 一時点で投与され、反復投与されない、請求項1~10のいずれか一項に記載の医薬組成物。
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