JP7795478B2 - βシート凝集体を形成するタンパク質のβシート凝集体形態を検出する方法 - Google Patents
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-免疫検出と組み合わされた濾過:この方法では、生体試料は、高分子量種、特に、PAFβを保持可能なメンブレンで濾過される。発色または蛍光またはさらには発光トレーサーで直接的または間接的に標識されたPAFβに特異的な抗体が、次いで、メンブレンに適用される。測定されるシグナルは、PAFβの量に正比例する。この方法は、アミロイドタンパク質の凝集パラメータまたは凝集のレベルに対する化合物の効果を研究するためにマイクロプレート形式に適応するように構成される場合がある。しかし、方法の自動化および処理能力は、この技術によって必要とされる濾過および洗浄ステップのために制限されている[2]。
a)第1の容器において:
a1)PAFβを含有する可能性が高い試料を入れるステップ、
a2)βシート凝集体を形成するタンパク質のβシート非凝集体形態(PNAFβ)を得るためにPAFβのすべてまたは一部分を脱凝集するために、pHを9.7~13.2の範囲のpHに調整するステップ、
a3)pHを6~9の範囲のpHに調整するステップ、
b)適切な免疫学的方法を用いて第1の容器中のPNAFβ含量を測定するステップ、
c)第2の容器において:
c1)ステップa1)と同一の試料を入れるステップ、
c2)pHを6~9の範囲のpHに調整するステップ、
d)ステップb)と同一の方法を使用して第2の容器中のPNAFβ含量を測定するステップ、
e)ステップb)およびd)において測定された含量を比較し、ステップb)において測定された含量と比較したステップd)において測定された含量の減少が、試料がPAFβを含有することを示すステップ
を含む、方法に関する。
A)ステップe)が、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比(「試料1の比b)/d)」)を決定することからなる、第1の試料で本発明による方法を実行するステップ、
B)第2の試料でステップA)と同一の方法を実行して、「試料2の比b)/d)」を決定するステップ、
C)ステップA)およびB)において決定された比を比較し、ステップB)において決定された比が、ステップA)において決定された比よりも低い場合に治療効力が観察されるステップ
を含む方法に関する。
A)ステップe)が、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比(「試料1の比b)/d)」)を決定することからなる、第1の試料で本発明による方法を実行するステップ、
B)第2の試料でステップA)と同一の方法を実行して、「試料2の比b)/d)」を決定するステップ、
C)ステップA)およびB)において決定された比を比較し、ステップB)において決定された比が、ステップA)において決定された比よりも低い場合に薬理学的有効性が観察されるステップ
を含む、方法に関する。
「βシート型凝集体を形成するタンパク質」または「PFβ」という表現は、βシートの豊富な凝集体を形成可能なタンパク質、いわゆる、βシートの豊富な多量体形態(またはオリゴマー形態)を形成可能なタンパク質を示す。一般に、PFβの非凝集体形態は正常であるが、その凝集体形態は、特に、神経変性疾患、例えば、アルツハイマー病、クロイツフェルト・ヤコブ病、パーキンソン病または筋萎縮性側索硬化症(ALS)によって特徴付けられる。ヒトまたは動物の天然または組換えタンパク質であり得る。本発明の文脈では、PFβの非凝集体形態は、「βシート凝集体を形成するタンパク質のβシート非凝集体形態」または「PNAFβ」という表現によって示される。PFβの凝集体形態は、「βシート凝集体を形成するタンパク質のβシート凝集体形態」または「PAFβ」と呼ばれる。
第1の態様によれば、本発明は、試料においてβシート凝集体を形成するタンパク質のβシート凝集体形態(PAFβ)を検出するためのin vitro法であって、以下のステップ:
a)第1の容器において:
a1)PAFβを含有する可能性が高い試料を入れるステップ、
a2)βシート凝集体を形成するタンパク質のβシート非凝集体形態(PNAFβ)を得るためにPAFβのすべてまたは一部分を脱凝集するために、pHを9.7~13.2の範囲のpHに調整するステップ、
a3)pHを6~9の範囲のpHに調整するステップ、
b)適切な免疫学的方法を用いて第1の容器中のPNAFβ含量を測定するステップ、
c)第2の容器において:
c1)ステップa1)と同一の試料を入れるステップ、
c2)pHを6~9の範囲のpHに調整するステップ、
d)ステップb)と同一の方法を使用して第2の容器中のPNAFβ含量を測定するステップ、
e)ステップb)およびd)において測定された含量を比較し、ステップb)において測定された含量と比較したステップd)において測定された含量の減少が、試料がPAFβを含有することを示すステップ
を含む方法に関する。
ステップa)
ステップa1)は、第1の容器において、PAFβを含有する可能性が高い試料を入れるステップからなる。試料は、方法のステップ、特に、PNAFβ含量を測定するステップを適宜実施できるように事前に調製できる。例えば、試料が組織または細胞である場合に、適切な溶媒、例えば、水中で溶解すること、粉砕すること、濾過することおよび/または分解することによって事前に調製できる。当業者ならば、試料を調製することは困難ではないであろう。
ステップb)は、適切な免疫学的方法(または適切な「イムノアッセイ」)を用いて第1の容器においてPNAFβ含量を測定するステップからなる。
(i)PNAFβに特異的に結合可能なリガンドであって、トレーサーで標識されているリガンド、または
(ii)PNAFβに特異的に結合可能なリガンドの対であって、リガンドの対の少なくとも1つのリガンドがトレーサーで標識されている、リガンドの対
を使用する。
(b1)容器中に、RETパートナーの対の第1のメンバーで標識された第1のPNAFβリガンドおよびRETパートナーの対の第2のメンバーで標識された第2のPNAFβリガンドを入れ、リガンドの対は、PNAFβに特異的に結合できるステップ、ならびに
(b2)容器において放出されたRETシグナルを測定するステップ
からなる。
(b1)底部に第1のPNAFβリガンドが固定化されている容器中に、試料のすべてまたは一部分を入れ、次いで、トレーサーで標識された第2のPNAFβリガンドを入れ、リガンドの対がPNAFβに特異的に結合可能であるステップ、
(b2)容器において放出されたELISAシグナルを測定するステップ
からなる。
ステップc)は、第1の容器中に、c1)ステップa1)と同一の試料を入れるステップからなる。
ステップd)は、ステップb)と同一の方法を用いて第2の容器中のPNAFβ含量を測定するステップからなる。ステップd)は、ステップb)と同一の方法で実行され、測定値を比較し、ステップe)を実行できる。
(d1)容器中に、RETパートナーの対の第1のメンバーで標識された第1のPNAFβリガンドおよびRETパートナーの対の第2のメンバーで標識された第2のPNAFβリガンドを入れ、リガンドの対が、PNAFβに特異的に結合できるステップ、ならびに
(d2)容器において放出されたRETシグナルを測定するステップ
からなる。
(d1)底部に第1のPNAFβリガンドが固定化されている容器中に、試料のすべてまたは一部分を入れ、次いで、トレーサーで標識された第2のPNAFβリガンドを入れ、リガンドの対がPNAFβに特異的に結合可能であるステップ、
(d2)容器において放出されたELISAシグナルを測定するステップ
からなる。
ステップe)は、ステップb)において、およびステップd)において測定された含量を比較し、ステップb)において測定された含量と比較したステップd)において測定された含量の減少が、試料がPAFβを含有することを示すステップからなる。
本発明はまた、患者においてPAFβと関連する疾患の処置の治療効力をモニタリングするためのin vitro法であって、以下のステップ:
A)ステップe)が、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比(「試料1の比b)/d)」)を決定することからなる、前記患者の第1の試料で本発明による方法を実行するステップ、
B)前記患者の第2の試料でステップA)と同一の方法を実行して、「試料2の比b)/d)」を決定するステップ、
C)ステップA)およびB)において決定された比を比較し、ステップB)において決定された比が、ステップA)において決定された比よりも低い場合に治療効力が観察されるステップ
を含む、方法に関する。
本発明はまた、試験試料においてPAFβと関連する疾患に対する薬物分子または薬物候補の薬理学的有効性を測定するためのin vitro法であって、以下のステップ:
A)ステップe)が、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比(「試料1の比b)/d)」)を決定することからなる、前記試験試料の第1の試料で本発明による方法を実行するステップ、
B)前記試験試料の第2の試料でステップA)と同一の方法を実行して、「試料2の比b)/d)」を決定するステップ、
C)ステップA)およびB)において決定された比を比較し、ステップB)において決定された比が、ステップA)において決定された比よりも低い場合に薬理学的有効性が観察されるステップ
を含む、方法に関する。
PNAFβに特異的な抗体を同定する方法
マウス免疫化
BALB/cマウスを、生理学的条件下で調製されたリン酸バッファーで事前に希釈したPNAFβタンパク質の注射によって免疫化する。PNAFβ多量体または凝集体の有無は、マウスの免疫応答を非凝集体形態に向けるために注射のために意図されるバッファー中で確認される。第1の注射に、3回のブースターを毎月の間隔で続ける。
この目的のために、PFβの性質に応じてELISA型免疫検出試験を実行する。アミロイド型PFβまたはペプチドについては、PNAFβを、ビオチン、炭素リンカーおよびNHS(N-ヒドロキシスクシンイミド)反応性基から構成される試薬を使用して、ビオチンを用いてその第一級リジンで事前に標識する。非アミロイドまたはアミロイドPFβについては、GST融合物中のPNAFβを、グルタチオン基で機能付与されたELISAマイクロプレートを使用することによってGSTタグを介して96ウェルプレート上に直接的に固定化する。ビオチン標識されたタンパク質を、ストレプトアビジンを用いて機能付与されたマイクロプレートを使用してビオチンを介して96ウェルELISAプレート上に固定化する。この目的のために、100μlのGST融合物および/またはビオチン化PNAFβ溶液を各ウェルに添加し、次いで、室温で2時間インキュベートする。次いで、ウェルを0.05% Tween-20を補給したPBSバッファーで3回洗浄する。洗浄溶液を除去した後、次いで、各ウェルを、PBS、5% BSAから構成される200μLのブロッキング溶液とともに4℃で一晩インキュベートする。
最良の抗PNAFβ抗体力価(シグナル、すなわち、450nmで高い光学濃度)を有し、抗TAG対照の場合にはシグナルの最小の低下を有するマウスを、融合とも呼ばれるリンパ球ハイブリダイゼーションの次のステップのために選択する。マウス脾臓を摘出して、リンパ球および形質細胞の混合物を単離する。この多細胞試料をポリエチレングリコール(PEG)タイプの細胞融合触媒の存在下でin vitroで骨髄腫細胞株と融合する。酵素HGPRT(ヒポキサンチングアノシンホスホリボシルトランスフェラーゼ)を欠損した突然変異体骨髄腫細胞株を使用して、ハイブリドーマと呼ばれるハイブリッド細胞の選択を可能にする。これらの細胞をヒポキサンチン、アミノプテリン(メトトレキサート)およびチアミンを含有する培地(HAT培地)で培養して、融合されていない骨髄腫細胞の排除を可能にし、したがって、目的のハイブリドーマを選択する。他方、融合していない脾臓細胞は、それらがin vitroで増殖できないので死滅する。したがって、ハイブリドーマのみがin vitroでこの選択圧を生き残る。
腹水の液体における多量の抗体の産生を可能にするために、目的のハイブリドーマのクローンを培養物に戻し、次いで、細胞接種材料をBALB/cマウス中に注射(腹腔内注射、IP)する。
PAFβに対してPNAFβを優先的に認識する抗体の対を選択するために、ELISA型試験を実行する。この目的のために、試験される対の抗体の一方を、Lightning-LinkラピッドビオチンタイプAキット(Expedeon、参照SKU 370-0005)を供給業者の推奨に従って使用してビオチン化する。1から20μg/mLの間で構成される濃度にPBSバッファーで事前に希釈した試験される対の第2の抗体を、「高結合」ELISA型の96ウェルプレート上に吸着させる。この目的のために、100μLの抗体を各ウェルに添加し、次いで、4℃で20時間インキュベートし、続いて、PBS 1×バッファー、0.05% Tween20で3回洗浄する。洗浄溶液を除去した後、次いで、各ウェルを、200μLの、PBS、5% BSAから構成されるブロッキング溶液とともに4℃で一晩インキュベートする。次いで、吸引によってこのブロッキング溶液を除去し、プレートを将来の使用のために4℃で保存する。
PAFβを上回ってPNAFβを優先的に認識する抗体の対を選択するために、FRET試験を設定する。この試験は、Cisbio Bioassays HTRF(登録商標)技術に基づいている。この技術の原理は、ドナー分子、テルビウムクリプテート(ドナー)と蛍光エネルギーアクセプター分子d2(アクセプター)間の蛍光エネルギー移動に基づいている。図4で図示されるように、これら2つの蛍光分子を、共有結合によって抗体にグラフトし、免疫学的アッセイを実行する。この目的のために、試験される対の抗体の一方を、テルビウムクリプテート標識キット(Cisbio Bioassays、参照62TBSPEA)であるキットを製造業者の推奨に従って使用してドナーLumi4テルビウムで標識する。使用前に、ドナーで標識された抗体を20mM HepesバッファーpH=7.4、0.1% BSAで0.5nMの濃度に希釈する。試験される対の第2の抗体を、d2標識キット(Cisbio Bioassays参照62D2DPEA)を供給業者の推奨に従って使用してアクセプターd2で標識する。使用前に、ドナーで標識された抗体を20mM HepesバッファーpH=7.4、0.1% BSAで5nMの濃度に希釈する。同一初期濃度のPNAFβまたはPAFβを含有する試料の1~1/100倍の段階希釈を、16μL/ウェルのレベルで384マイクロプレートに分配する。次いで、ドナーで標識された抗体の0.5nM溶液2μLおよびアクセプターで標識された抗体の5nM溶液2μLを各ウェルに添加する。マイクロプレートを室温で20時間インキュベートする。種々のプレートにおけるFRETシグナルの検出を、HTRF検出モジュールを使用するPHERAstar FS Lamp装置(BMG Labtech)で実施した。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対の同定を可能にする方法(FRET法)
TDP-43 AFβまたはTDP-43 NAFβを含有する試料を得るための代替法は、HeLa細胞を培養することおよびそれらをスタウロスポリンを用いて少なくとも6時間処置することまたはしないことからなる。SDS-PAGEおよびウエスタンブロットによる細胞溶解物の分析は、未処置HeLa細胞溶解物がTDP-43 NAFβを含有するが、一方で、スタウロスポリンで処置されたHeLa溶解物は本質的にTDP-43 AFβを含有することを示す[12]。
TDP-43に対して向けられる5種の抗体を、ドナーを用いて、およびアクセプターを用いてそれぞれ標識した。これらの標識は、Cisbio Bioassaysによって販売されている標識キット(商業的参照62EUSUEAおよび62D2DPEA)を使用して実施した。得られた標識比率(抗体あたりの蛍光分子数)は、見込みと一致した。ドナーマーキング比率は5.9から7.9の間で構成された。アクセプター標識比率は、2.3から3.3の間で構成された。
フラスコ(175cm2)において、完全培養培地(MEMアルファ培地+2mM Hepes+10% 補体除去ウシ胎児血清+1%抗生物質、ペニシリン5000U/mlおよびストレプトマイシン5000μg/ml)中で、500万個の細胞を用いてHeLa細胞を播種した。78時間後、培養培地を吸引した。次いで、細胞溶解バッファーを用いて細胞を溶解した。TDP-43 NAFβを含有する得られた溶解物(本明細書において以下「単量体試料」)を、その使用を目的として-80℃で凍結した。この試料を、文献[12]において推奨されるようにウエスタンブロットによって調べて、非凝集TDP43(TDP-43 NAFβ)を本質的に含有することを確実にした。
フラスコ(175cm2)において、完全培養培地(MEMアルファ培地+2mM Hepes+10% 補体除去ウシ胎児血清+1%抗生物質、ペニシリン5000U/mlおよびストレプトマイシン5000μg/ml)中で、500万個の細胞を用いてHeLa細胞を播種した。72時間後、培養培地を吸引した。完全培地中の1μMのスタウロスポリン溶液を、培養細胞に6時間添加した。スタウロスポリンを用いる細胞の処置によって、TDP-43が凝集され、TDP-43 AFβを得ることが可能となる。次いで、培養培地を吸引し、その後、細胞溶解バッファーを添加した。TDP-43 AFβを含有する得られた溶解物(本明細書において以下「凝集体試料」)を、その後の使用を目的として-80℃で凍結した。この試料を、文献[12]において推奨されるようにウエスタンブロットによって調べて、凝集されたTDP43(TDP-43 AFβ)を本質的に含有することを確実にした。
試験当日に、単量体および凝集体試料を解凍し、その後、384ウェルマイクロプレート(Greiner参照784075)に分配した。
-16μLの単量体試料または凝集体試料、
-2μLのドナー抗体、
-2μLのアクセプター抗体。
ベータ1-40アミロイドペプチドNAFβに特異的に結合可能な抗体の対を同定する方法(FRET法)
方法は、実施例1において詳述されたFRET技術(Cisbio BioassaysからのHTRF(登録商標)技術)に基づいている。
ドナーを用いて、およびアクセプターを用いてそれぞれ標識されたベータ1-40アミロイドペプチドに対して向けられる抗体は、Cisbio Bioassaysによって販売されたアミロイドベータ1-40 HTRFキット中に含有されるもの(参照62B40PEG)である。それらをアミロイドベータ1-40 HTRFキットマニュアルによって推奨されるように参照希釈剤62RB3FDGで希釈した。
凍結乾燥ヒトベータ1-40アミロイドペプチド(ERI275BAS、The ERI Amyloid Laboratory、LLC、オックスフォード)を、供給業者の推奨に従って再懸濁し、次いで、10mMリン酸ナトリウムpH7.4バッファーで30μMの濃度に希釈した。次いで、ベータ1-40アミロイドペプチドNAFβを含有する溶液(本明細書において以下「単量体試料」)を-80℃で凍結した。この溶液でチオフラビンT試験を実施した。90%より多いベータ1-40アミロイドペプチド単量体を含有することを示す。
凍結乾燥ヒトベータ1-40アミロイドペプチド(ERI275BAS、The ERI Amyloid Laboratory、LLC、オックスフォード)を、供給業者の推奨に従って再懸濁し、次いで、10mMリン酸ナトリウムpH7.4バッファーで30μMの濃度に希釈した。次いで、この溶液を25℃で495時間インキュベートし、これによって、ベータ1-40アミロイドペプチドが凝集し、ベータ1-40アミロイドペプチドAFβを得ることが可能となる。次いで、ベータ1-40アミロイドペプチドAFβを含有する溶液(本明細書において以下「凝集体試料」)を-80℃で凍結した。この溶液でチオフラビンT試験を実施した。90%より多いベータ1-40アミロイドペプチド凝集体を含有することを示す。
試験当日に、単量体および凝集体試料を解凍し、次いで、10mMリン酸ナトリウムpH7.4バッファーで20.3ng/mLの濃度に希釈し、その後、384ウェルマイクロプレート(Greiner参照784075)に分配した。
-5μLの単量体試料または凝集体試料
-5μLの希釈剤(参照62DL1DDD、Cisbio Bioassays)
-5μLのドナー抗体
-5μLのアクセプター抗体
ベータアミロイドペプチド1-42NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を同定する方法(FRET法)
方法は、実施例1において詳述されたFRET技術(Cisbio BioassaysからのHTRF(登録商標)技術)に基づいている。
ドナーおよびアクセプターを用いてそれぞれ標識されたベータアミロイドペプチド1-42に対して向けられる2つの抗体を、それぞれ3nM(ドナー)および30nM(アクセプター)の濃度に希釈した。
凍結乾燥ヒトベータアミロイドペプチド1-42(The ERI Amyloid Laboratory、LLC、オックスフォード)を、供給業者の推奨に従って再懸濁し、次いで、10mMリン酸ナトリウムpH7.4バッファーで30μMの濃度に希釈した。次いで、ベータアミロイドペプチド1-42 NAFβを含有する溶液(本明細書において以下「単量体試料」)を-80℃で凍結した。この溶液でチオフラビンT試験を実施した。90%より多いベータアミロイドペプチド1-42単量体を含有することを示す。
凍結乾燥ヒトベータアミロイドペプチド1-42(ERI275BAS、The ERI Amyloid Laboratory、LLC、オックスフォード)を、供給業者の推奨に従って再懸濁し、次いで、10mMリン酸ナトリウムpH7.4バッファーで30μMの濃度に希釈した。次いで、この溶液を25℃で188時間インキュベートする。次いで、ベータ1-42アミロイドペプチドAFβを含有する溶液(本明細書において以下「凝集体試料」)を-80℃で凍結した。この溶液でチオフラビンT試験を実施した。90%より多いベータアミロイドペプチド1-42凝集体を含有することを示す。
試験当日に、単量体および凝集体試料を解凍し、次いで、10mMリン酸ナトリウムpH7.4バッファーで2.4ng/mLの濃度に希釈し、その後、384ウェルマイクロプレート(Greiner参照784075)に分配した。
-16μLの単量体試料または凝集体試料
-2μLのドナー抗体
-2μLのアクセプター抗体。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する、ヘキサフルオロイソプロパノール(HFIP)の効果の試験
HFIPは純粋(100%)で使用するか、または溶解バッファーで希釈して、20%、10%および2%溶液を得た。
1)8μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの、100%、20%、10%および2%のHFIPの、または補給された溶解バッファーの種々の溶液。
3)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 AFβの脱凝集剤としてのHFIPの試験
HFIPを溶解バッファーで希釈して、2%溶液を得た。
1)8μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
2)8μLの2% HFIP溶液または溶解バッファー。
3)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する尿素の効果の試験
尿素を溶解バッファーで希釈して、7M、3.5M、1.75Mおよび0.88M溶液を得た。
1)8μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの種々の7M、3.5M、1.75Mおよび0.88M尿素溶液または溶解バッファー。
3)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 AFβの崩壊剤としての尿素の試験
尿素を補給した溶解バッファーで希釈して、3.5M、1.75Mおよび0.88M溶液を得た。
1)8μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
2)8μLの種々の濃度(3.5M、1.75Mおよび0.88M)の尿素溶液または溶解バッファー。
3)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1。
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する塩化グアニジウムの効果の試験
塩化グアニジウムを補給された溶解バッファーで希釈し、6M、3Mおよび1.5M溶液を得た。
1)8μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの、6M、3Mおよび1.5Mのさまざまな塩化グアニジウム溶液または補給された溶解バッファー。
3)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対するギ酸(FA)およびトリフルオロ酢酸(TFA)の効果の試験
FAおよびTFAを、補給された溶解バッファーで希釈して、20%、10%および2%溶液を得た。
1)8μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβ。
2)8μLの、20%、10%および2%のFAもしくはTFAの種々の溶液または補給された溶解バッファー。
3)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対するギ酸(FA)と、それに続くNaOHを用いる中和の効果の試験
FAを、補給された溶解バッファーで希釈して、20%溶液を得た。
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの20% FA溶液または補給された溶解バッファー。混合物を室温で15分間インキュベートした。このステップで測定されるpHは、2.5に等しい。
3)9μLの5N NaOH溶液または補給された溶解バッファー。これらの添加後に測定されるpHは、7.6に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する、トリフルオロ酢酸(TFA)と、それに続くNaOHを用いる中和の効果の試験
TFAを、補給した溶解バッファーで希釈して、20%溶液を得た。
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの20% TFA溶液または補給された溶解バッファー。混合物を室温で15分間インキュベートした。このステップで測定されるpHは、0.6に等しい。
3)4.5μLの5N NaOH溶液または補給された溶解バッファー。この添加後に測定されるpHは、7.5に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 AFβの崩壊剤としての、トリフルオロ酢酸(TFA)と、それに続くNaOHを用いる中和の効果の試験
1)60μlの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
2)8μLの20% TFA溶液またはTFA/NaOH混合物(8容積の20% TFA溶液を4.5容積の5N NaOH溶液と混合することによって得た)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)4.5μLの5N NaOH溶液またはTFA/NaOH混合物。この添加後に測定されるpHは、7.5に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する、ギ酸(FA)と、それに続くNH4OHを用いる中和の効果の試験
FAを、補給された溶解バッファーで希釈して、20%溶液を得た。
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの20% FA溶液または補給された溶解バッファー。混合物を室温で15分間インキュベートした。このステップで測定されるpHは、2.5に等しい。
3)12μLの5N NH4OH溶液。この添加後に測定されるpHは、7.2に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 AFβの崩壊剤としての、ギ酸(FA)と、それに続くNH4OHを用いる中和の効果の試験
FAを、補給した溶解バッファーで希釈し、20%溶液を得た。
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
2)8μLの20% FA溶液またはFA/NH4OH混合物(8容積の20% TFA溶液を12容積の5N NH4OH溶液と混合することによって得た)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)12μLの5N NH4OH溶液またはFA/NH4OH混合物。この添加後に測定されるpHは、7.2に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する、トリフルオロ酢酸(TFA)と、それに続くNH4OHを用いる中和の効果の試験
TFAを、補給された溶解バッファーで希釈し、20%溶液を得た。
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
2)8μLの20% TFA溶液または補給された溶解バッファー。混合物を室温で15分間インキュベートした。このステップで測定されるpHは、0.6に等しい。
3)7μLの5N NH4OH溶液。この添加後に測定されるpHは、7.5に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 AFβの崩壊剤としての、トリフルオロ酢酸(TFA)と、それに続くNH4OHを用いる中和の効果の試験
TFAを、補給した溶解バッファーで希釈し、20%溶液を得た。
以下の試薬を以下の順序で96ウェルプレートに分配した:
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
2)8μLの20% TFA溶液またはTFA/NH4OH混合物(8容積の20% TFA溶液を7容積の5N NH4OH溶液と混合することによって得た)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)7μlの5N NH4OH溶液またはTFA/NH4OH混合物。この添加後に測定されるpHは、7.5に等しい。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβ検出試薬を使用する方法に対する、8.2から13.3の間で構成されるpH値を示すNaOH溶液と、それに続くHClを用いる中和の効果
試験されたNaOH溶液
-60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
-10μLの種々のNaOH溶液(A、B、C、D、EもしくはF)またはバッファー。混合物を室温で15分間インキュベートした。
-10μLの種々のHCl溶液(A、B、C、D、EもしくはF)またはバッファー。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
NaOHを用いてTDP-43 AFβを脱凝集する最小および最大pHの決定
試験されたNaOH溶液
-60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
-10μLの種々のNaOH溶液(A、B、C、DもしくはE)または対応するNaOH/HCl混合物(A、B、C、DもしくはE)。混合物は室温で15分間インキュベートした。
-10μLの種々のHCl溶液(A、B、C、D、E)または対応するNaOH/HCl混合物(A、B、C、D、E)。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
12.8のpHでTDP-43 AFβを脱凝集するのに必要な時間の決定
以下の試薬を以下の順序で96ウェルプレートに分配した:
1)60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料
2)10μLの1.2N NaOH溶液(12.8に導かれた試料のpH)またはNaOH/HCl混合物(1.2N NaOH溶液および1N HCl溶液の同一容量を混合することによって得られた)。混合物をウェルに応じて室温で30秒から1時間インキュベートした。
3)1.2N NaOHを用いて処置されたウェル中の10μLの1N HCl溶液(7.5に導かれた試料のpH)またはNaOH/HCl混合物を用いて処置されたウェル中の10μLのNaOH/HCl混合物。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 NAFβの検出を測定する場合の最小および最大pHの決定
試験されたNaOH溶液
-60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
-10μLの種々の1.2N NaOH溶液または対応するNaOH/HCl混合物(A、B、C、D、E、F、G、HまたはI)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
-10μLの種々のHCl溶液(A、B、C、D、E、F、G、HもしくはI)または対応するNaOH/HCl混合物(A、B、C、D、E、F、G、HもしくはI)。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
脱凝集剤としてNaOHを、中和剤としてHClを使用するベータアミロイドペプチド1-42の凝集のレベルの測定
以下に記載される方法は、HTRF技術(原理については実施例1を参照されたい)に基づいている。
1)12μLの1-42 AFβ試料または1-42 NAFβ試料。
2)2μLの1.2N NaOH溶液またはNaOH/HCl混合物(1.2N NaOH溶液および1N HCl溶液の等容量を混合することによって得られた)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)2μLの1N HCl溶液またはNaOH/HCl混合物。
4)FRET検出試薬の添加:
-2μLの実施例4に記載されたように調製されたドナー抗体。
-2μLの実施例4に記載されたように調製されたアクセプター抗体。
TDP-43 NAFβに特異的に結合できる抗体の対を使用する方法の検出能力に対する、NaOH、水酸化カリウム(KOH)またはNH4OHを用いる処置と、それに続くHClを用いる中和の効果
TDP43-AFβ溶解物を処置するための、NaOH、KOH、NH4OHおよびHCl溶液の調製
-60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 NAFβの試料。
-10μLの種々の塩基溶液(A、B、C、DもしくはE)または対応する塩基/HCl混合物(A、B、C、DもしくはE)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
-10μLの種々のHCl溶液(A、B、C、D、E)または対応する塩基/HCl混合物(A、B、C、D、E)。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
TDP-43 AFβの脱凝集に対する、NaOH、水酸化カリウム(KOH)またはNH4OHを用いる処置と、それに続くHClを用いる中和の効果
TDP43-AFβ溶解物を処置するための、NaOH、KOH、NH4OHおよびHCl溶液の調製
-60μLの実施例2に記載されたプロトコールに従って調製されたTDP-43 AFβの試料。
-10μLの種々の塩基溶液(A、B、C、DもしくはE)または対応する塩基/HCl混合物(A、B、C、DもしくはE)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
-10μLの種々のHCl溶液(A、B、C、D、E)または対応する塩基/HCl混合物(A、B、C、D、E)。
-16μLの96ウェルプレートからの混合物
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたドナー抗体Ac1
-2μLの実施例2に記載されたように調製されたアクセプター抗体Ac2。
アルファ-シヌクレインNAFβ(Alpha-Syn NAFβ)に特異的に結合可能な抗体の対を同定することを可能にする方法
当該方法は、実施例1において詳述されたFRET技術(Cisbio BioassaysからのHTRF(登録商標)技術)に基づいている。
ドナーを用いて、およびアクセプターを用いてそれぞれ標識されたアルファ-シヌクレインに対して向けられる抗体の対は、Cisbio Bioassaysによって販売されたHTRFトータル-アルファ-シヌクレインキット中に含有されたもの(参照6FNSYPEG)である。各抗体をユーザーマニュアルによって推奨されるようにキット希釈剤で希釈した。
Alpha-Syn NAFβおよびAlpha-Syn AFβは、StressMarq(StressMarq活性ヒト組換えA53T突然変異体アルファシヌクレインタンパク質単量体、参照SPR-325および活性ヒト組換えA53T突然変異体アルファシヌクレインタンパク質事前形成原線維タイプ1参照SPR-326)から入手した。それらをHTRFトータル-Aシヌクレインキットの溶解バッファーで15.6ng/mLに希釈した。
以下の試薬を以下の順序で384ウェルプレートに分配した:
1)12μLの15.6ng/mLのAlpha-Syn NAFβまたはAlpha-Syn AFβ。
2)2μLの溶解バッファー。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)2μLの溶解バッファー。
4)2μLのドナー抗体。
5)2μLのアクセプター抗体。
Alpha-Syn NAFβに特異的に結合可能な抗体の対を使用する方法の検出能力に対する1.2N NaOH溶液と、それに続く1N HClを用いる中和の効果
Alpha-Syn NAFβ(StressMarq、活性ヒト組換えA53T突然変異体アルファシヌクレインタンパク質単量体、参照SPR-326)を、HTRFトータル-アルファシヌクレインキット(Cisbio Bioassays、参照6FNSYPEG)の溶解バッファーで15.6ng/mLに希釈した。HTRFトータル-Aシヌクレインキット中のドナーおよびアクセプター抗体を、キットマニュアルにおいて供給業者によって推奨されるように希釈した。
1)12μLの15.6ng/mLのAlpha-Syn NAFβ。
2)2μLの1.2N NaOH溶液(12.8に導かれた試料のpH)またはNaOH/HCl混合物(1.2N NaOH溶液および1N HCl溶液の同一容量を混合することによって得られた)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)1.2N NaOHを用いて処置されたウェル中の2μLの1N HCl溶液(7.5に導かれた試料のpH)またはNaOH/HCl混合物を用いて処置されたウェル中の2μLのNaOH/HCl混合物。
4)2μLの実施例25に記載されたように調製されたドナー抗体
5)2μLの実施例25に記載されたように調製されたアクセプター抗体
崩壊剤としてNaOHおよび中和剤としてHClを使用するアルファ-シヌクレインの凝集のレベルの測定
方法は、実施例1において詳述されたFRET技術(Cisbio BioassaysからのHTRF(登録商標)技術)に基づいている。
ドナーを用いて、およびアクセプターを用いてそれぞれ標識されたアルファ-シヌクレインに対して向けられる抗体は、Cisbio Bioassaysによって販売されたHTRFトータル-アルファ-シヌクレインキット中に含有されたもの(参照6FNSYPEG)である。それらをユーザーマニュアルによって推奨されるようにキット希釈剤で希釈した。
Alpha-Syn NAFβおよびAlpha-Syn AFβは、StressMarq(StressMarq活性ヒト組換えA53T突然変異体アルファシヌクレインタンパク質単量体、参照SPR-325および活性ヒト組換えA53T突然変異体アルファシヌクレインタンパク質事前形成原線維タイプ1参照SPR-326)から入手した。それらをHTRFトータル-アルファシヌクレインキットの溶解バッファーで15.6ng/mLに希釈した。
以下の試薬を以下の順序で384ウェルプレートに分配した:
1)12μLの15.6ng/mLのAlpha-Syn NAFβまたはAlpha-Syn AFβ。
2)2μLの1.2N NaOH溶液(12.8に導かれた試料のpH)またはNaOH/HCl混合物(1.2N NaOH溶液および1N HCl溶液の同一容量を混合することによって得られた)。混合物を室温で15分間インキュベートした。
3)1.2N NaOHを用いて処置されたウェル中の2μLの1N HCl溶液(7.5に導かれた試料のpH)またはNaOH/HCl混合物を用いて処置されたウェル中の2μLのNaOH/HCl混合物。
4)2μLのドナー抗体。
5)2μLのアクセプター抗体。
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Claims (12)
- 試料においてβシート凝集体を形成するタンパク質のβシート凝集体形態(PAFβ)を検出するためのin vitro法であって、以下のステップ:
a)第1の容器において:
a1)PAFβを含有する可能性が高い試料を入れるステップ、
a2)βシート凝集体を形成するタンパク質のβシート非凝集体形態(PNAFβ)を得るためにPAFβのすべてまたは一部分を脱凝集するために、NaOHを用いてpHを9.7~13.2の範囲のpHに調整するステップ、
a3)HClを用いてpHを6~9の範囲のpHに調整するステップ、
b)RET法を用いて第1の容器中のPNAFβ含量を測定するステップ、
c)第2の容器において:
c1)ステップa1)と同一の試料を入れるステップ、
c2)NaOH/HCl混合物を用いてpHを6~9の範囲のpHに調整するステップ、
d)ステップb)と同一の方法を使用して第2の容器中のPNAFβ含量を測定するステップ、
e)ステップb)およびd)において測定された含量を比較し、ステップb)において測定された含量と比較したステップd)において測定された含量の減少が、試料がPAFβを含有することを示すステップ
を含み、
前記βシート凝集体を形成するタンパク質が、α-シヌクレインまたはTDP-43である、
方法。 - 前記試料が、PAFβと関連する疾患を有する、または有すると疑われている個体に由来する、請求項1に記載の方法。
- 前記試料が、in vitroで培養された細胞または組織に由来する、請求項1または2に記載の方法。
- 前記試料が、血液試料、血漿試料、血清試料、脳脊髄液試料、細胞溶解物、細胞ホモジネート、組織溶解物または組織ホモジネートから選択される、請求項1~3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記試料が、脳ホモジネートである、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記試料が、細胞溶解物、細胞ホモジネート、組織溶解物、組織ホモジネート、細胞培養上清、組織培養上清、細胞細画分またはタンパク質(天然または組換え)から選択される、請求項1または3に記載の方法。
- ステップb)およびd)において実行される免疫学的方法が、
(i)PNAFβに特異的に結合可能なリガンドであって、トレーサーで標識されているリガンド、または
(ii)PNAFβに特異的に結合可能なリガンドの対であって、リガンドの対の少なくとも1つのリガンドがトレーサーで標識されているリガンドの対
を使用する、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。 - -リガンド(i)が、抗体、抗体断片、ペプチドもしくはアプタマーから選択される、または
-リガンドの対(ii)が、抗体の対、抗体断片の対、ペプチドの対もしくはアプタマーの対から選択される、請求項7に記載の方法。 - -リガンドの対(ii)が、抗体の対である、請求項8に記載の方法。
- ステップb)およびd)が、RET法によって実施され、
(b1)容器中に、RETパートナーの対の第1のメンバーで標識された第1のPNAFβリガンドおよびRETパートナーの対の第2のメンバーで標識された第2のPNAFβリガンドを入れ、リガンドの対は、PNAFβに特異的に結合できるステップ、
(b2)容器において放出されたRETシグナルを測定するステップ、
(d1)容器中に、RETパートナーの対の第1のメンバーで標識された第1のPNAFβリガンドおよびRETパートナーの対の第2のメンバーで標識された第2のPNAFβリガンドを入れ、リガンドの対は、PNAFβに特異的に結合できるステップ、ならびに
(d2)容器において放出されたRETシグナルを測定するステップ
からなる、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。 - 患者においてPAFβと関連する疾患の処置の治療効力をモニタリングするためのin vitro法であって、以下のステップ:
A)ステップe)がステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比を決定することからなる、前記患者の第1の試料で請求項1~9のいずれか一項に記載の方法を実行するステップ、
B)前記患者の第2の試料でステップA)と同一の方法を実行して、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比を決定するステップ、
C)ステップA)およびB)において決定された比を比較し、ステップB)において決定された比が、ステップA)において決定された比よりも低い場合に治療効力が観察されるステップ
を含み、
前記第1の試料は、前記第2の試料より前の時点で患者から採取されたものである、
方法。 - 試験試料においてPAFβと関連する疾患に対する薬物分子または薬物候補の薬理学的有効性を測定するためのin vitro法であって、以下のステップ:
A)ステップe)が、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比を決定することからなる、前記試験試料の第1の試料で請求項1~10のいずれか一項に記載の方法を実行するステップ、
B)前記試験試料の第2の試料でステップA)と同一の方法を実行して、ステップb)で測定された含量とステップd)で測定された含量の間の比を決定するステップ、
C)ステップA)およびB)において決定された比を比較し、ステップB)において決定された比が、ステップA)において決定された比よりも低い場合に薬理学的有効性が観察されるステップ
を含み、
前記第1の試料は、前記第2の試料より前の時点で患者から採取されたものである、
方法。
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