JP7796619B2 - 糖化酵素の製造方法 - Google Patents
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Description
しかしながら、多種の酵素混合物を使用してバイオマスを糖化するには非常にコストがかかることから、大規模でのキャッサバ残渣の糖化の実施にはこれらの技術は実用的ではなく、糖化酵素を安価に製造できる技術が求められている。
1)下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子のいずれか一方又は両方を導入した組み換え糸状菌を培養することを含む、バイオマス糖化酵素の製造方法。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子、
2)下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子のいずれか一方又は両方を導入した組み換え糸状菌を培養して得られる培養物をバイオマス糖化剤として用いる、バイオマスの糖化方法。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子、
本発明において、アミノ酸配列又はヌクレオチド配列の同一性は、Lipman-Pearson法(Science,1985,227:1435-1441)によって計算される。具体的には、遺伝情報処理ソフトウェアGENETYCS Ver.12のホモロジー解析(Search homology)プログラムを用いて、Unit size to compare(ktup)を2として解析を行うことにより算出される。
あるアミノ酸配列又はヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列又はヌクレオチド配列の例としては、1又は複数個のアミノ酸が欠失、置換、付加、又は挿入されたアミノ酸配列、1又は複数個のヌクレオチドが欠失、置換、付加、又は挿入されたヌクレオチド配列が挙げられる。
ここで、「1又は複数個のアミノ酸が欠失、置換、付加、又は挿入されたアミノ酸配列」とは、1個以上10個以下、好ましくは1個以上8個以下、より好ましくは1個以上5個以下、さらに好ましくは1個以上3個以下のアミノ酸が欠失、置換、付加、又は挿入されたアミノ酸配列をいう。また、「1又は複数個のヌクレオチドが欠失、置換、付加、又は挿入されたヌクレオチド配列」とは、1個以上30個以下、好ましくは1個以上24個以下、より好ましくは1個以上15個以下、さらにより好ましくは1個以上9個以下のヌクレオチドが欠失、置換、付加、又は挿入されたヌクレオチド配列をいう。本明細書において、アミノ酸又はヌクレオチドの「付加」には、配列の一末端及び両末端へのアミノ酸又はヌクレオチドの付加が含まれる。
ンス鎖においてプロモーターの3’側に遺伝子が存在することを意味し、遺伝子の上流とは、DNAセンス鎖における該遺伝子の5’側の領域を意味する。
本発明の組換え糸状菌は、特定のペクチナーゼの遺伝子が導入された糸状菌である。具体的には、下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子のいずれか一方又は両方を導入した糸状菌である。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子
斯かるポリガラクツロナーゼ遺伝子は、糸状菌に由来するものが好ましく、例えば、アスペルギルス(Aspergillus)属微生物(例えば、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)、アスペルギルス・ジャポニクス(Aspergillus japonicus)、アスペルギルス・アクリータス(Aspergillus aculeatus))、リゾプス(Rhizopus)属微生物(例えば、リゾプス・オリゼ(Rhizopus oryzae)、リゾプス・デレマ(Rhizopus delemar))、タラロマイセス(Talaromyces)属微生物(例えば、タラロマイセス・セルロリティカス(Talaromyces cellulolyticus))、ペニシリウム(Penicillium)属微生物(例えば、ペニシリウム・ロッケフォーティ(Penicillium roqueforti))等に由来するものが好適に挙げられる。
このうち、アスペルギルス・ニガーのPgaB遺伝子又は当該PgaB遺伝子に相当する遺伝子、PgaI遺伝子又は当該PgaI遺伝子に相当する遺伝子、PgaII遺伝子又は当該PgaII遺伝子に相当する遺伝子等がより好ましい。
1)配列番号1に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
2)配列番号1に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
3)配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列
からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
4)配列番号3に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
5)配列番号3に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
6)配列番号4に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
7)配列番号5示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
8)配列番号5に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
9)配列番号6に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
872 uncharacterized protein(ASPACDRAFT_41690)(アクセッション番号XM_020200977.1)、Aspergillus japonicus CBS 114.51 putative endopolygalacturonase II(BO86DRAFT_431298)(アクセッション番号XM_025675761.1)等が該当する。
このうち、好ましくは、アスペルギルス・ニガーのPelD遺伝子又は当該PelD遺伝子に相当する遺伝子、がより好ましい。
10)配列番号7に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
11)配列番号7に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
12)配列番号8に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
japonicus CBS 114.51 pectin lyase pelD (BO86DRAFT_402188)(アクセッション番号XM_025673839.1)、ペニシリウム・ディギタータムのPenicillium digitatum
strain Pd01 PL1 mRNA,complete cds(アクセッション番号JX298853.1)等が該当する。
13)配列番号9に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
14)配列番号9に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレ
オチド配列からなり、且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
15)配列番号10に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
japonicus CBS 114.51 pectin lyase 1(BO86DRAFT_306335)(XM_025667691.1)(アクセッション番号XM_025673839.1)、ペニシリウム・グリセオフルバム (Penicillium griseofulvum)のPenicillium griseofulvum Pectin lyase fold/virulence factor(PGRI_010780)(アクセッション番号XM_040788791.1)等が該当する。
ここで、本発明のポリヌクレオチドを含有するベクターは発現ベクターであり、好ましくは該ポリヌクレオチドを宿主糸状菌に導入することができ、かつ宿主内で該ポリヌクレオチドを発現することができる発現ベクターである。また、該ベクターは、好ましくは本発明のポリヌクレオチド、及びこれと作動可能に連結された制御領域を含む。該ベクターは、プラスミド等の染色体外で自立増殖及び複製可能なベクターであってもよく、又は染色体内に組み込まれるベクターであってもよい。
15(2):93-103)、pBR322(タカラバイオ)、pRS403(Stratagene)、pMW218/219(ニッポンジーン)、pRI909/910等のpRI系ベクター(タカラバイオ)、pBI系ベクター(クロンテック)、IN3系ベクター(インプランタイノベーションズ)、pPTR1/2(タカラバイオ)、pDJB2(D.J.Ballance et al.,Gene,36,321-331,1985)、pAB4-1(van Hartingsveldt W et al.,Mol Gen Genet,206,71-75,1987)、pLeu4(M.I.G.Roncero et al.,Gene,84,335-343,1989)、pPyr225(C.D.Skory et al.,Mol Genet Genomics,268,397-406,2002)、pFG1(Gruber,F.et al.,Curr Ge
net,18,447-451,1990)等が挙げられる。
強制御領域のさらなる例としては、これらに限定されないが、rRNAオペロンの制御領域、リボソームタンパク質をコードする遺伝子の制御領域等が挙げられる。
(Oomycota)に属する糸状菌が挙げられる。具体的には、上記糸状菌としては、トリコデルマ(Trichoderma)属、アルペルギルス(Aspergillus)属、ペニシリウム(Penicillium)属、ニューロスポラ(Neurospora)属、フサリウム(Fusarium)属、クリソスポリウム(Chrysosporium)属、フミコーラ(Humicola)属、エメリセラ(Emericella)属、ハイポクレア(Hypocrea)属、アクレモニウム(Acremonium)属、クリソスポリウム(Chrysosporium)属、ミセリオフトラ(Myceliophthora)属、ピロマイセス(Piromyces)属、タラロマイセス(Talaromyces)属、サーモアスカス(Thermoascus)属、チエラビア(Thielavia)属等の糸状菌が挙げられるが、好ましくはトリコデルマ属の糸状菌である。
尚、粘度としては、例えば、B型粘度計で、固形分濃度10-20質量%及び50℃にて測定される粘度が挙げられる。
したがって、本発明の組み換え糸状菌を用いれば、ペクチン質を多く含むキャッサバ等のバイオマスの糖化処理において、高粘度化を抑制し、糖化効率を高めることができる。
上記の組み換え糸状菌をセルラーゼ誘導物質の存在下で培養し、培養物中にセルラーゼ及びペクチナーゼを含む酵素を生成、蓄積させ、当該培養物から当該酵素を採取することにより、バイオマス糖化酵素を製造することができる。
このうち、一括添加する場合の添加量は、好ましくは0.1質量%以上、より好ましくは0.5質量%以上、より好ましくは1質量%以上であり、かつ好ましくは16質量%以下、より好ましくは14質量%以下、より好ましくは12質量%以下である。また、好ましくは0.1~16質量%、より好ましくは0.5~14質量%、より好ましくは1~12質量%である。
培養時のpHは3~9、好ましくは4~5である。培養時間は、10時間~10日間、好ましくは2~7日間である。
また、「ペクチナーゼ」とは、ペクチン質(D-ガラクチュロン酸のα-1,4結合からなる多糖類)を分解する酵素群の総称であり、ポリガラクツロナーゼ、ペクチンリアーゼ、ペクチンエステラーゼが包含されるが、本発明の糖化酵素としては、好ましくはポリガラクツロナーゼ及びペクチンリアーゼである。
本発明の組み換え糸状菌を用いることにより、バイオマスを分解、糖化し、単糖を製造することができるが、斯かる方法は公知の手法を用いて行うことができる。
すなわち、上述した、本発明の組み換え糸状菌をセルラーゼ誘導物質の存在下で培養して得られる培養物をバイオマス糖化剤とし、これとバイオマスを水性媒体中に共存させ、撹拌または振とうしながら加温することにより、バイオマスを糖化し、単糖を製造することができる。
本発明において、バイオマスとしては、セルロース及びペクチン含有物質、例えば、キャッサバ、キャッサバ残渣、コーン、コーンハル、リンゴの残渣、柑橘類の皮等が挙げられ、好ましくはキャッサバ残渣である。
バイオマスの糖化において、反応液のpH及び温度は、セルラーゼ及びペクチナーゼが失活しない範囲内であればよく、一般的に、常圧で反応を行う場合、温度は5~95℃、pHは1~11の範囲で行われる。
バイオマスの糖化の工程は、バッチ式で行っても、連続式で行ってもよい。
<1>下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子のいずれか一方又は両方を導入した組み換え糸状菌を培養することを含む、バイオマス糖化酵素の製造方法。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子
<2>ポリガラクツロナーゼ遺伝子がアスペルギルス・ニガーのPgaB遺伝子又は当該PgaB遺伝子に相当する遺伝子であり、ペクチンリアーゼ遺伝子がアスペルギルス・ニガーのPelD又は当該PelD遺伝子に相当する遺伝子である、<1>に記載の方法。
<3>バイオマスがセルロース及びペクチンを含むバイオマスである、<1>又は<2>に記載の方法。
<4>バイオマスがキャッサバである、<1>又は<2>に記載の方法。
<5>糸状菌がセルラーゼを生産する糸状菌である<1>~<4>のいずれかに記載の方法。
<6>糸状菌がトリコデルマ属糸状菌である、<1>~<5>のいずれかに記載の方法。
<7>糸状菌がトリコデルマ・リーセイである、<6>に記載の方法。
<8>下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子のいずれか一方又は両方を導入した組み換え糸状菌を培養して得られる培養物をバイオマス糖化剤として用いる、バイオマスの糖化方法。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子
<9>スラリーの高粘度化を抑制する、<8>に記載の方法。
<10>糸状菌がセルラーゼを生産する糸状菌である<8>又は<9>のいずれかに記載の方法。
<11>糸状菌がトリコデルマ属糸状菌である、<8>~<10>のいずれかに記載の方法。
<12>糸状菌がトリコデルマ・リーセイである、<11>に記載の方法。
<13>アスペルギルス・ニガーのPgaB遺伝子又は当該PgaB遺伝子に相当する遺伝子が、以下の1)~3)のいずれかである、<1>~<12>のいずれかに記載の方法。
1)配列番号1に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
2)配列番号1に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
3)配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
<14>アスペルギルス・ニガーのPgaI遺伝子又は当該PgaI遺伝子に相当する遺伝子が、以下の4)~6)のいずれかである、<1>~<12>のいずれかに記載の方法。
4)配列番号3に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
5)配列番号3に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
6)配列番号4に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
<15>アスペルギルス・ニガーのPgaII遺伝子又は当該PgaII遺伝子に相当する遺伝子が、以下の7)~9)のいずれかである、<1>~<12>のいずれかに記載の方法。
7)配列番号5示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
8)配列番号5に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリ
ヌクレオチド
9)配列番号6に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つポリガラクツロナーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
<16>アスペルギルス・ニガーのPelD遺伝子又は当該PelD遺伝子に相当する遺伝子が、以下の10)~12)のいずれかである、<1>~<12>のいずれかに記載の方法。
10)配列番号7に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
11)配列番号7に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
12)配列番号8に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
<17>アスペルギルス・ニガーのPelF遺伝子又は当該PelF遺伝子に相当する遺伝子としては、以下の13)~15)のいずれかである、<1>~<12>のいずれかに記載の方法。
13)配列番号9に示すヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド
14)配列番号9に示すヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有するヌクレオチド配列からなり、且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
15)配列番号10に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列からなり、且つペクチンリアーゼ活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド
(1)Aspergillus niger NBRC105649株のcDNA合成
Aspergillus niger NBRC105649株は、製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンターより購入した。NBRC105649株を、ペクチン培地(1% Pectin, from citrus(和光純薬)、0.14%(NH4)2SO4、0.2% KH2PO4、0.03% CaCl2・2H2O、0.03%
MgSO4・7H2O、0.1% Bacto Polypepton、0.05% Bacto Yeast extract、0.1% Tween 80、0.1% Trace element2、50mM 酒石酸バッファー(pH4.0);%はいずれもw/v%)に、植菌した。Trace element2の組成は以下のとおりである:6mg H3BO3、26mg(NH4)6Mo7O24・4H2O、100mg FeCl3・6H2O、40mg CuSO4・5H2O、8mg MnCl2・4H2O、200mg ZnCl2を蒸留水にて100mLにメスアップ。28℃にて3日間振とう培養を行い、培養した菌体をMiracloth(ミリポア)を用いて回収後、液体窒素にて凍結し、マルチビーズショッカー(安井器械)を用いて破砕した。この際、粉砕媒体にはメタルコーンを使用し1700rpmにて30秒破砕を行った。破砕した菌体からはRNeasy Mini Kit(キアゲン)を用いプロトコルに従ってRNAを抽出した。その後、RNA溶液はSuperScript III First-Strand Synthesis System for RT-PCR(Thermo Fisher Scientific)に供することで、Aspergillus niger
NBRC105649株のcDNAを合成した。
pUC118(タカラバイオ)のHincII制限酵素切断点にトリコデルマ・リーセイ由来のxyn2遺伝子の上流から下流までの領域(配列番号11)を挿入したプラスミ
ドを鋳型とし、表1に示したFwプライマー1(配列番号12)とRvプライマー1(配列番号13)を用いてPCRすることで断片(A)を増幅した。また、トリコデルマ・リーセイのゲノムDNAを鋳型として表1に示したFwプライマー2(配列番号14)とRvプライマー2(配列番号15)を用いてPCRすることで増幅された断片(B)を増幅した。得られたDNA断片(A)及び(B)はIn-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ)のプロトコルに従って処理し、xyn2の遺伝子にcbh1ターミネーターが連結されたプラスミドpUCf-xyn2を構築した。さらに、このpUCf-xyn2を鋳型とし、表1に示したFwプライマー3(配列番号16)とRvプライマー3(配列番号17)を用いてPCRすることで増幅した断片(C)と、トリコデルマ・リーセイのゲノムDNAを鋳型として表1に示したFwプライマー4(配列番号18)とRvプライマー4(配列番号19)を用いてPCRすることで増幅された断片(D)とを、同様にはIn-Fusion HD Cloning Kitによって処理することで、プラスミドpUCf-xyn2-pyr4を得た。続いて、このpUCf-xyn2-pyr4を鋳型とし、表1に示したFwプライマー5(配列番号20)とRvプライマー5(配列番号21)を用いてPCRすることで増幅した断片(E)と、トリコデルマ・リーセイのゲノムDNAを鋳型として表1に示したFwプライマー6(配列番号22)とRvプライマー6(配列番号23)を用いてPCRすることで増幅された断片(F)とを、同様にはIn-Fusion HD Cloning Kitによって処理することで、プラスミドpUCf-xyn2-pyr4recを得た。
pUCf-xyn2-pyr4recを鋳型とし、表1に示したFwプライマー7(配列番号24)とRvプライマー7(配列番号25)を用いてPCRすることで断片(G)を増幅した。また、Aspergillus niger NBRC105649株のcDNAを鋳型とし、表1に示したFwプライマー8(配列番号26)とRvプライマー8(配列番号27)、Fwプライマー9(配列番号28)とRvプライマー9(配列番号29)、Fwプライマー10(配列番号30)とRvプライマー10(配列番号31)、Fwプライマー11(配列番号32)とRvプライマー11(配列番号33)、Fwプライマー12(配列番号34)とRvプライマー12(配列番号35)を用いてPCRすることで、それぞれ増断片(H)~(L)を増幅した。断片(G)とそれぞれ断片(H)~断片(L)を用い、In-Fusion HD Cloning Kitによって処理することで、それぞれPgaI、PgaII、PgaB、PelD、PelFの発現用ベクターであるpUCf-Pxyn2-pgaI-pyr4rec、pUCf-Pxyn2-pgaII-pyr4rec、pUCf-Pxyn2-pgaB-pyr4rec、pUCf-Pxyn2-pelD-pyr4rec、pUCf-Pxyn2-pelF-pyr4recを得た。
トリコデルマ・リーセイE1AB1株(Enzyme and Microbial Technology Volume 82,
January 2016, Pages 89-95)のウラシル要求性株に対して上記(1)で構築したベクターの形質転換を行った。導入はプロトプラストPEG法で行った。形質転換体は選択培地(2% グルコース、1.1M ソルビトール、2% アガー、0.2% KH2PO4(pH5.5)、0.06% CaCl2・2H2O、0.06% CsCl2、0.06% MgSO4・7H2O、0.5% (NH4)2SO4、0.1% Trace element1;%はいずれもw/v%)にて選抜した。Trace element1の組成は以下のとおりである:0.5g FeSO4・7H2O、0.2g CoCl2、0.16g MnSO4・H2O、0.14g ZnSO4・7H2Oを蒸留水にて100mLにメスアップ。選抜した形質転換体を植え継ぎにより安定化した後、コロニーPCRにより目的の遺伝子が安定に保持された菌株をさらに選別した。
アビセル培地(1% アビセル(シグマアルドリッチ)、0.14%(NH4)2SO4、0.2% KH2PO4、0.03% CaCl2・2H2O、0.03% MgSO
4・7H2O、0.1% Bacto Polypepton、0.05% Bacto Yeast extract、0.1% Tween 80、0.1% Trace element2、50mM 酒石酸バッファー(pH4.0);%はいずれもw/v%)に、上記(3)で選択した菌株の胞子を2×105個/mLとなるよう植菌し、28℃にて5日間振とう培養を行った。Trace element2の組成は以下のとおりである:6mg H3BO3、26mg(NH4)6Mo7O24・4H2O、100mg FeCl3・6H2O、40mg CuSO4・5H2O、8mg MnCl2・4H2O、200mg ZnCl2を蒸留水にて100mLにメスアップ。得られた培養物を遠心分離した後フィルターろ過することで、各培養上清を取得した。得られた培養上清は糖化酵素溶液として検討に使用した。
(1)糖化酵素溶液のタンパク質濃度の定量は、bradford法にて測定した。bradford法に基づくQuick Startプロテインアッセイ(BioRad)を使用し、ウシγグロブリンを標準タンパク質とした検量線をもとに上清のタンパク質濃度を計算した。
グルコース 63.1%
キシロース 5.2%
アラビノース 2.2%
ガラクトース 6.5%
リグニン 7.4%
ガラクツロン酸 7.0%
ラムノース 0.7%
キャッサバ残渣を糖化酵素処理した後のスラリー粘度を、B型粘度計VISCOMETER TVB-10(東機産業株式会社製)を用いて、回転速度 60rpm、回転時間
180sec、温度 50℃の条件にて測定し、ペクチナーゼ発現酵素6種と、ペクチナーゼを発現させていない酵素で、得られた粘度の値をそれぞれ比較した。結果、ペクチナーゼを発現させていない酵素に対し、ペクチナーゼを発現させた酵素では総じて粘度が
低下し、異種のペクチナーゼを共発現させた酵素では最も粘度が低下した。
(1)Aspergillus niger NBRC105649株のcDNA合成
A.niger NBRC105649株は、製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンターより購入した。NBRC105649株を、ペクチン培地(1% Pectin, from citrus(和光純薬)、0.14% (NH4)2SO4、0.2% KH2PO4、0.03% Cacl2・2H2O、0.03% MgSO4・7H2O、0.1% Bacto Peptone、0.05% Bacto Yeast Extract、0.1% Trace element、50mM 酒石酸バッファー(pH4.0)に植菌した。28℃にて3日間振とう培養を行い、培養した菌体をMiracloth(ミリポア)を用いて回収後、液体窒素にて凍結し、マルチビーズショッカー(安井器械)を用いて破砕した。この際、粉砕媒体にはメタルコーンを使用し1700rpmにて30秒破砕を行った。破砕した菌体からはRNeasy Mini Kit(キアゲン)を用いプロトコルに従ってRNAを抽出した。その後、RNA溶液はSuperScript III First-Strand Synthesis System for RT-PCR(Thermo Fisher Scientific)に供することで、NBRC105649株のcDNAを合成した。
公開されているDNA情報をもとに、F.oxysporum由来のpgx1遺伝子を人工合成した。
Pgx1はペクチナーゼの一種であるエキソポリガラクチュロナーゼであり、そのアミノ酸配列は配列番号41で示され、Pgx1遺伝子は配列番号40で示されるヌクレオチド配列からなる。
ピキア発現ベクターpD912(ATUM社)を鋳型とし、表3に示したFwプライマー13(配列番号42)とRvプライマー13(配列番号43)を用いてPCRすることで断片(A)を増幅した。NBRC105649株のcDNAを鋳型として表1に示したFwプライマー14(配列番号44)とRvプライマー14(配列番号45)を用いてPCRすることで増幅された断片(B)を増幅した。得られたDNA断片(A)及び(B)はIn-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ)のプロトコルに従って処理し、連結されたプラスミドpD912-PgxCを構築した。
NBRC105649株のcDNAを鋳型として表3に示したFwプライマー15(配列番号46)とRvプライマー15(配列番号47)を用いてPCRすることで増幅された断片(C)を増幅した。得られたDNA断片(A)及び(C)はIn-Fusion HD Cloning Kitのプロトコルに従って処理し、連結されたプラスミドpD912-RgxCを構築した。
人工合成したF.oxysporum由来のpgx1遺伝子を鋳型として表3に示したFwプライマー16(配列番号48)とRvプライマー16(配列番号49)を用いてP
CRすることで増幅された断片(D)を増幅した。得られたDNA断片(A)及び(D)はIn-Fusion HD Cloning Kitのプロトコルに従って処理し、連結されたプラスミドpD912-Pgx1を構築した。
NBRC105649株のcDNAを鋳型として表3に示したFwプライマー17(配列番号50)とRvプライマー18(配列番号51)を用いてPCRすることで増幅された断片(E)を増幅した。得られたDNA断片(A)及び(E)はIn-Fusion HD Cloning Kitのプロトコルに従って処理し、連結されたプラスミドpD912-PgaBを構築した。
NBRC105649株のcDNAを鋳型として表3に示したFwプライマー18(配列番号52)とRvプライマー18(配列番号53)を用いてPCRすることで増幅された断片(D)を増幅した。得られたDNA断片(A)及び(D)はIn-Fusion HD Cloning Kitのプロトコルに従って処理し、連結されたプラスミドpD912-PelDを構築した。
また、RgxCはペクチナーゼの一種であるエキソラムノガラクチュロナンハイドロラーゼであり、そのアミノ酸配列は配列番号39で示され、RgxC遺伝子は配列番号38で示されるヌクレオチド配列からなる。
(3)で作製した各目的遺伝子発現ベクターをPichia pastoris PPS-90102(ATUM社)に対して、ATUM社のプロトコルに従って形質転換を行
った。
P.pastorisの培養は以下のように行った。BMD1%培地(0.2M リン酸カリウム(pH6.0)、13.4g/L Yeast Nitrogen Base、0.4mg/L Biotin、1.1% グルコース)に各形質転換体を植菌し、28℃で振とう培養し、菌体が一定量に増えたらメタノールを添加し、発現誘導を行い、3-5日後に得られた各培養物はSDS-PAGEで酵素発現量を確認した後、各培養物を遠心分離した後フィルターろ過することで、各培養上清を取得した。得られた培養上清を濃縮し、各種ペクチナーゼ(PgxC、RgxC、Pgx1、PgaB、PelD)の酵素液として使用した。
キャッサバ残渣を100mL容バッフル付き三角フラスコに乾燥重量として4gとなるよう量りとり、α-アミラーゼ(シグマアルドリッチ社製、α-Amylase from Bacillus licheniformis Type XII-A)を0.002mg-protein/g-基質、milli-Q水を基質濃度が15wt%となるように加えた。その後、バッフルフラスコを十分に混和し、綿栓で封をした上にアルミホイルを被せ、90℃、2h(オートクレーブ、TOMY社製LSX-700)の糊化処理を行った。その後、50℃に設定した振盪機(PRECI社製PRXY-30-R-3F)にて50℃になるまで冷却した後、グルコアミラーゼ(シグマアルドリッチ社製、Amyloglucosidase from Aspergillus niger)を0.05mg-protein/g-基質で、実施例1に従ってE1AB1株を培養して得られた糖化酵素を計0.2mg―protein/g-基質となるように添加し、50℃、200rpmで18時間反応させた。その後、音叉振動式粘度計(株式会社エー・アンド・デイ社製SV-10H)を用いて粘度を測定した。糖化後のスラリーは液体の状態とならず、粘度は測定不可であった。
糊化処理後の基質に、E1AB1株由来糖化酵素を0.14mg-protein/g-基質、PgxCを0.06mg-protein/g-基質で添加した以外は、試験例1と同様の検討を行った。糖化後のスラリーは液体の状態とならず、粘度は測定不可であった。
糊化処理後の基質に、E1AB1株由来糖化酵素を0.14mg-protein/g-基質、RgxCを0.06mg-protein/g-基質で添加した以外は、試験例1と同様の検討を行った。糖化後のスラリーは液体の状態とならず、粘度は測定不可であった。
糊化処理後の基質に、E1AB1株由来糖化酵素を0.14mg-protein/g-基質、Pgx1を0.06mg-protein/g-基質で添加した以外は、試験例1と同様の検討を行った。糖化後のスラリーは液体の状態とならず、粘度は測定不可であった。
糊化処理後の基質に、E1AB1株由来糖化酵素を0.18mg-protein/g-基質、PgaBを0.02mg-protein/g-基質で添加した以外は、試験例1と同様の検討を行った。糖化後のスラリーの粘度は84mPa・sであった。
糊化処理後の基質に、E1AB1株由来糖化酵素を0.14mg-protein/g-基質、PelDを0.06mg-protein/g-基質で添加した以外は、試験例1と同様の検討を行った。糖化後のスラリーの粘度は459mPa・sであった。以上から粘度低減にはPgaBやPelDなどが有効であると考えられた。
Claims (10)
- 下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子の両方を導入した組み換え糸状菌を培養することを含む、キャッサバ糖化酵素の製造方法。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子 - ポリガラクツロナーゼ遺伝子がアスペルギルス・ニガーのPgaB遺伝子又は当該PgaB遺伝子に相当する遺伝子であり、ペクチンリアーゼ遺伝子がアスペルギルス・ニガーのPelD又は当該PelD遺伝子に相当する遺伝子である、請求項1に記載の方法。
- 糸状菌がセルラーゼを生産する糸状菌である、請求項1に記載の方法。
- 糸状菌がトリコデルマ属の糸状菌である、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- 糸状菌がトリコデルマ・リーセイである、請求項4に記載の方法。
- 下記の(a)で示される遺伝子群から選択されるポリガラクツロナーゼ遺伝子、及び(b)で示される遺伝子群から選択されるペクチンリアーゼ遺伝子の両方を導入した組み換え糸状菌を培養して得られる培養物をキャッサバ糖化剤として用いる、キャッサバの糖化方法。
(a)PgaB遺伝子、PgaI遺伝子、PgaII遺伝子
(b)PelD遺伝子、PelF遺伝子 - スラリーの高粘度化を抑制する、請求項6に記載の方法。
- 糸状菌がセルラーゼを生産する糸状菌である、請求項6に記載の方法。
- 糸状菌がトリコデルマ属の糸状菌である、請求項6~8のいずれか1項に記載の方法。
- 糸状菌がトリコデルマ・リーセイである、請求項9に記載の方法。
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