JP7802282B2 - 抗tspan8-抗cd3二重特異性抗体及び抗tspan8抗体 - Google Patents
抗tspan8-抗cd3二重特異性抗体及び抗tspan8抗体Info
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Description
さらに、T細胞による抗原選択的な抗腫瘍活性を高めるために、配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域及び配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域、並びに配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域を含む、抗TSPAN8-抗CD3二重特異的抗体を作製した(実施例7)。この二重特異性抗体は、TSPAN8及びCD3に結合し(実施例8)、細胞表面にTSPAN8を発現するがん細胞に対して細胞傷害活性を示し(実施例9、10、12-1、12-2)、in vivoにおいてマウスの生存期間を延長し、抗腫瘍作用を発揮することを確認した(実施例11及び12-3)。
[1] TSPAN8及びCD3に結合する二重特異性抗体であって、
(a)抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域を含む重鎖フラグメント及び抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域を含む軽鎖からなる抗TSPAN8抗体のFab領域、
(b)抗CD3抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域、並びに、
(c)(a)のFab領域の重鎖フラグメントに連結される第一Fcポリペプチド及び(b)の抗CD3-scFv領域に連結される第二FcポリペプチドからなるFc領域、
を含む、二重特異性抗体。
[2] [1]に記載の二重特異性抗体であって、
抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域が、配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含み、抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域が、配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む;又は、
抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域が、配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含み、抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域が、配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む、
二重特異性抗体。
[3] [1]に記載の二重特異性抗体であって、
抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域が、配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなり、抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域が配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる;又は、
抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域が、配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなり、抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域が配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる、
二重特異性抗体。
[4] [1]に記載の二重特異性抗体であって、
抗TSPAN8抗体のFab領域が、配列番号6のアミノ酸番号1から219までのアミノ酸配列からなる重鎖フラグメント及び配列番号8のアミノ酸配列からなる軽鎖からなる;又は、
抗TSPAN8抗体のFab領域が、配列番号10のアミノ酸番号1から219までのアミノ酸配列からなる重鎖フラグメント及び配列番号12のアミノ酸配列からなる軽鎖からなる、
二重特異性抗体。
[5] 抗CD3抗体の重鎖可変領域が、配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含み、抗CD3抗体の軽鎖可変領域が、配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む、[1]~[4]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[6] 抗CD3抗体の重鎖可変領域が配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなり、抗CD3抗体の軽鎖可変領域が配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる、[1]~[4]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[7] 抗CD3-scFv領域が配列番号14のアミノ酸番号1から254までのアミノ酸配列からなる、[1]~[4]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[8] [1]に記載の二重特異性抗体であって、
該二重特異性抗体は、配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む;又は、
該二重特異性抗体は、配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、
二重特異性抗体。
[9] [1]に記載の二重特異性抗体であって、
該二重特異性抗体は、配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む;又は、
該二重特異性抗体は、配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、
二重特異性抗体。
[10] LALA変異(L234A及びL235A(ここで、前記変異位置はヒトIgγ1定常領域におけるEUインデックスに従うアミノ酸位置である))を含むFc領域を含む、[1]~[9]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[11] N297G変異(ここで、前記変異位置はヒトIgγ1定常領域におけるEUインデックスに従うアミノ酸位置である)を含むFc領域を含む、[1]~[10]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[12] ノブズ・イントゥー・ホールズ(Knobs into holes)変異を含むFc領域を含む、[1]~[11]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[13] LALA変異、N297G変異、及びノブズ・イントゥー・ホールズ変異を含むFc領域を含む、[1]~[12]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[14] ノブズ・イントゥー・ホールズ変異が、Fc領域を形成する1つのFcポリペプチドにおけるT366W変異、並びにFc領域を形成するもう1つのFcポリペプチドにおけるT366S、L368A及びY407V変異である(ここで、前記変異位置はヒトIgγ1定常領域におけるEUインデックスに従うアミノ酸位置である)、[12]又は[13]に記載の二重特異性抗体。
[15] 第一Fcポリペプチドが配列番号6の235から451までのアミノ酸配列からなり、第二Fcポリペプチドが配列番号14の270から486までのアミノ酸配列からなるFc領域を含む、[1]~[14]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[16] 抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドがヒンジ領域を介して連結され、抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドがヒンジ領域を介して連結されている、[1]~[15]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[17] [1]に記載の二重特異性抗体であって、
配列番号6のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号8のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖、及び配列番号14のアミノ酸配列からなる抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、二重特異性抗体。
[18] 翻訳後修飾された、[2]~[17]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[19] 翻訳後修飾が、重鎖可変領域N末端のピログルタミル化及び/又は重鎖C末端リジン欠失である、[18]に記載の二重特異性抗体。
[20] 下記(a)~(e)からなる群より選択されるポリヌクレオチド:
(a)配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(b)配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(d)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(e)配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
[21] 下記(a)~(c)からなる群より選択されるポリヌクレオチド:
(a)配列番号6のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(b)配列番号8のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号14のアミノ酸配列からなる抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
[22] [20]又は[21]に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
[23] [22]に記載の発現ベクターで形質転換された、宿主細胞。
[24] 配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドを含む、宿主細胞。
[25] 配列番号6のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、配列番号8のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び、配列番号14のアミノ酸配列からなる抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドを含む、宿主細胞。
[26] TSPAN8及びCD3に結合する二重特異性抗体の生産方法であって、[23]~[25]のいずれか一項に記載の宿主細胞を培養する工程を含む、生産方法。
[27] [1]~[19]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体及び薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
[28] がんの治療に使用するための、[1]~[19]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体。
[29] がんの治療のための、[27]に記載の医薬組成物。
[30] [1]~[19]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体の治療有効量を対象に投与する工程を含む、がんを治療する方法。
[31] がんの治療のための医薬組成物の製造における、[1]~[19]のいずれか一項に記載の二重特異性抗体の使用。
[32] ヒトTSPAN8発現がん細胞に選択的に結合する抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[33] 配列番号2のアミノ酸番号126から155までのヒトTSPAN8の領域に存在する少なくとも1個のアミノ酸に結合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[34] [33]に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントであって、前記ヒトTSPAN8の領域に存在する少なくとも配列番号2のアミノ酸番号131のアミノ酸に結合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[35] 下記(a)及び(b)から選択される抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント:
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域、並びに、配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域、並びに、配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[36] 下記(a)及び(b)から選択される、[35]に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント:
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域、及び、配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域、及び、配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[37] 下記(a)及び(b)から選択される、[35]に記載の抗TSPAN8抗体:
(a)配列番号4のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号8のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む、抗TSPAN8抗体;
(b)配列番号10のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号12のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む、抗TSPAN8抗体。
[38] ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して[33]~[37]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントと競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[39] T細胞又はNK細胞の表面抗原に対する抗体又はその抗原結合フラグメントと連結された、[32]~[38]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[40] T細胞の表面抗原がCD3である、[39]に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[41] T細胞の表面抗原に対する抗原結合フラグメントが抗CD3抗体のscFvである、[40]に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[42] 翻訳後修飾された、[32]~[41]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[43] 翻訳後修飾が、重鎖可変領域N末端のピログルタミル化及び/又は重鎖C末端リジン欠失である、[42]に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
[44][32]~[43]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの融合体又は複合体、或いは[32]~[43]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8又はその抗原結合フラグメントを細胞表面に発現させた細胞。
[45] 下記(a)~(d)からなる群より選択される、ポリヌクレオチド:
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(b)配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(d)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
[46] 下記(a)~(d)からなる群より選択されるポリヌクレオチド:
(a)配列番号4のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(b)配列番号8のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号10のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(d)配列番号12のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
[47] [45]又は[46]に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
[48] [47]に記載の発現ベクターで形質転換された、宿主細胞。
[49] 下記(a)又は(b)より選択される、宿主細胞:
(a)[45]に記載の抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド及び[45]に記載の抗体の抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドを含む、宿主細胞;
(b)[46]に記載の抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド及び[46]に記載の抗体の抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドを含む、宿主細胞。
[50] 抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの生産方法であって、[48]又は[49]のいずれかの宿主細胞を培養する工程を含む、生産方法。
[51] がんの治療に使用するための、[32]~[43]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグメント、又は[44]に記載の融合体、複合体若しくは細胞。
[52] [32]~[43]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグメント、又は[44]に記載の融合体、複合体若しくは細胞を含み、さらに薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
[53] がんの治療のための、[52]に記載の医薬組成物。
[54] [32]~[43]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグメントの治療有効量を対象に投与する工程、又は[44]に記載の融合体、複合体若しくは細胞の治療有効量を対象に投与する工程を含む、がんを治療する方法。
[55] がんの治療のための医薬組成物の製造における、[32]~[43]のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグメントの使用、又は[44]に記載の融合体、複合体若しくは細胞の使用。
本明細書の用語は、以下で特に定義されない限り、当該技術分野で当業者に一般に使用されている意味にて使用される。
また、C末端側の断片をFc(結晶化可能断片、Fragment,crystallizable)領域とよぶ。本明細書において、「Fcポリペプチド」は、重鎖のCH2ドメイン及びCH3ドメインからなるポリペプチドをいい、「Fc領域」は2つのFcポリペプチドからなる複合体を指す。
重鎖フラグメントとFcポリペプチドはヒンジ領域とよばれる部分で繋がっている。また、抗体の2本の重鎖はヒンジ領域でジスルフィド結合している。
本明細書において「scFv領域」とは、リンカーで連結されたVHとVLを含む、一価の抗原結合フラグメントを含む領域を指す。
Gap Open Penalty = 10
Gap Extend Penalty = 0.5
Matrix = EBLOSUM62
End Gap Penalty = false
本発明は、以下に示すTSPAN8及びCD3に結合する二重特異性抗体(「抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体」とも称する)を提供する:
TSPAN8及びCD3に結合する二重特異性抗体であって、
(a)抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域を含む重鎖フラグメント及び抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域を含む軽鎖からなる抗TSPAN8抗体のFab領域、
(b)抗CD3抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域、並びに
(c)(a)のFab領域の重鎖フラグメントに連結される第一Fcポリペプチド及び(b)の抗CD3-scFv領域に連結される第二FcポリペプチドからなるFc領域、
を含む、二重特異性抗体。
Ser
Gly-Ser
Gly-Gly-Ser
Ser-Gly-Gly
Gly-Gly-Gly-Ser (配列番号15)
Ser-Gly-Gly-Gly (配列番号16)
Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (配列番号17)
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly (配列番号18)
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (配列番号19)
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly (配列番号20)
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (配列番号21)
Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly (配列番号22)
(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser)n
(Ser-Gly-Gly-Gly-Gly)n
Gly-Lys-Pro-Gly-Ser (配列番号23)
(Gly-Lys-Pro-Gly-Ser)n
上記のnは1以上の整数を示す。ペプチドリンカーの長さや配列は目的に応じて当業者が適宜選択することができる。
また、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体において、抗CD3-scFv領域とFcポリペプチド(第二Fcポリペプチド)は、ヒンジ領域を介して連結されても良い。
本発明はまた、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体を生産するために使用されうる、以下のポリヌクレオチド(「本発明の二重特異性抗体のポリヌクレオチド」とも称する)を提供する。
(1)抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドを含む抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(2)抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(3)抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドを含むポリペプチドを含むポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の6アミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の8アミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、並びに配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
本発明はまた、以下の(1)~(3)に記載の本発明の二重特異性抗体のポリヌクレオチドを含む発現ベクター(「本発明の二重特異性抗体の発現ベクター」とも称する)を提供する。これらのポリヌクレオチドは、それぞれが別々のベクターに含まれていてもよく、又は複数のポリヌクレオチドが1つのベクターに含まれていてもよい。
(1)抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(2)抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(3)抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドを含むポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の6アミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の8アミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、並びに配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(c)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(d)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(e)配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、並びに配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の6アミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号の8アミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(c)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(d)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(e)配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号8のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(c)配列番号14のアミノ酸配列からなる抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
本発明はまた、本発明の二重特異性抗体の発現ベクターによって形質転換された宿主細胞(「本発明の形質転換された宿主細胞」とも称する)を提供する。本発明の形質転換された宿主細胞は、本発明の二重特異性抗体の発現ベクターによる形質転換によって、以下の(1)~(3)の本発明の二重特異性抗体のポリヌクレオチドの1つ又は複数のポリヌクレオチドを含んでよく、1つの実施形態において、本発明の形質転換された宿主細胞は、以下の(1)~(3)のポリヌクレオチドを全て含む:
(1)抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(2)抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(3)抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドを含むポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の6アミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号の8アミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、並びに配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域、配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(c)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(d)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(e)配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、並びに配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(b)配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(d)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(e)配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の重鎖可変領域及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFvと第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号6のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号8のアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(c)配列番号14のアミノ酸配列からなる抗CD3-scFvと第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
本発明はまた、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体を生産する方法(「本発明の生産方法」とも称する)を提供する。本発明の生産方法には、<本発明の形質転換された宿主細胞>に記載の形質転換された宿主細胞を培養し、該細胞又は該培養上清中に該抗体を発現させる工程、該抗体を回収、単離、精製する方法等が含まれうるが、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体が生産される限りにおいて、これらの方法に限定されるものではない。
本発明の医薬組成物には、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体及び薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物が含まれる。本発明の医薬組成物は、当該分野において通常用いられている賦形剤、即ち、薬剤用賦形剤や薬剤用担体等を用いて、通常使用される方法によって調製することができる。これら医薬組成物の剤型の例としては、例えば、注射剤、点滴用剤等の非経口剤が挙げられ、静脈内投与、皮下投与、腹腔内投与等により投与することができる。製剤化にあたっては、薬学的に許容される範囲で、これら剤型に応じた賦形剤、担体、添加剤等を使用することができる。
(a)配列番号6のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号6のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号6のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、二重特異性抗体;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の重鎖可変領域、及び配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗CD3抗体の軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、二重特異性抗体。
(a)配列番号6のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、二重特異性抗体;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の重鎖フラグメントと第一Fcポリペプチドが連結された抗TSPAN8抗体の重鎖、配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖、並びに、配列番号14のアミノ酸番号1から125までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号14のアミノ酸番号146から254までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗CD3-scFv領域と第二Fcポリペプチドが連結されたポリペプチドを含む、二重特異性抗体。
本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体、及びそれらを含有する医薬組成物は、がんの治療のために用いることができる。また、本発明には、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体の治療有効量を対象に投与する工程を包含する、がんを治療する方法が含まれる。また、本発明には、がんの治療に使用するための、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体を含む。また、本発明には、がんの治療用医薬組成物の製造における、本発明の抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体の使用が含まれる。本発明による治療の対象となるがんは、特に限定されないが、例えば、種々の腹膜播種がん、胃がん、肺がん、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、ホジキンリンパ腫、ノンホジキンリンパ腫、B細胞リンパ腫、多発性骨髄腫、T細胞リンパ腫等の血液がん、骨髄異形成症候群、腺がん、扁平上皮がん、腺扁平上皮がん、未分化がん、大細胞がん、非小細胞肺がん、小細胞肺がん、中皮腫、皮膚がん、皮膚T細胞リンパ腫、乳がん、前立腺がん、膀胱がん、膣がん、頸部がん、頭頸部がん、子宮がん、子宮頸がん、肝臓がん、胆のうがん、胆管がん、腎臓がん、膵臓がん、結腸がん、大腸がん、直腸がん、小腸がん、胃がん、食道がん、精巣がん、卵巣がん、脳腫瘍等の固形がん、並びに骨組織、軟骨組織、脂肪組織、筋組織、血管組織及び造血組織のがんの他、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性血管内皮腫、悪性シュワン腫、骨肉腫、軟部組織肉腫などの肉腫や、膠芽腫、多形性膠芽腫、肝芽腫、髄芽腫、腎芽腫、神経芽腫、膵芽腫、胸膜肺芽腫、網膜芽腫などの芽腫等が挙げられる。
本発明はまた、以下に説明する、ヒトTSPAN8に対する新規な抗TSPAN8抗体又はその結合フラグメントを提供する。本発明により提供される抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントを纏めて「本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント」とも称する。
ここで、ヒトTSPAN8発現がん細胞とは、がん患者より単離したヒトTSPAN8発現するがん細胞をいい、実施例1-1に記載した患者由来のがん腹膜播種細胞の他に、American Type Culture Collection(ATCC)等の細胞バンク等より入手可能ながん細胞株を用いることができる。がん細胞株としては、例えば、実施例1-1に記載した方法にて患者腹水から樹立された細胞株の他に、AGS、KATOIII、SNU5、SNU16、SNU520、ANU719、NCI-N87、HT-29、LoVo、GP2d、AsPC-1、OE19、Li-7Hs746、NUGC-4、OCUM1、MNK45等のTSPAN8を発現する細胞株を使用することができる。また、正常細胞とは、正常組織由来の細胞をいい、実施例1-5で用いた患者由来腹膜中皮細胞の他に、実施例1-3で用いたヒト末梢血単核細胞、実施例1-3で用いた培養腹膜中皮細胞等の市販の初代培養細胞又は細胞株を使用することができる。1つの実施形態において、正常細胞はTSPAN8を発現している。1つの実施形態において、TSPAN8を発現している正常細胞は患者由来腹膜中皮細胞及び実施例1-3で用いた培養腹膜中皮細胞である。1つの実施形態において、正常細胞はTSPAN8を発現していない細胞である。1つの実施形態において、TSPAN8を発現していない正常細胞は実施例1-3で用いたヒト末梢血単核細胞である。
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域、並びに、配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域、並びに、配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域、及び、配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域、及び、配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント又はその抗原結合フラグメント。
(a)配列番号4のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号8のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む、抗TSPAN8抗体;
(b)配列番号10のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号12のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む、抗TSPAN8抗体。
(a)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(c)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号34のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号36のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(d)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号35のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号37のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
(a)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号4のアミノ酸配列からなる重鎖と配列番号8のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント、
(b)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号10のアミノ酸配列からなる重鎖と配列番号12のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
(c)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号34のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域と配列番号36のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント、
(d)ヒトTSPAN8発現がん細胞に対する結合に関して配列番号35のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域及び配列番号37のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む抗TSPAN8抗体と競合する、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。
本発明は、T細胞又はナチュラルキラー(Natural Killer;NK)細胞の表面抗原に対する抗体又はその抗原結合フラグメントと連結された本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントを含む二重特異性抗体を提供する。該二重特異性抗体の形状は特に限定されず、例えば非特許文献3又は4に記載されている種々の形状の抗体等、当業者によって一般的に使用されうる形状をとることができる。
TSPAN8及びT細胞又はNK細胞の表面抗原に結合する二重特異性抗体であって、
(a)本発明の抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域を含む重鎖フラグメント及び本発明の抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域を含む軽鎖からなる、抗TSPAN8抗体のFab領域、
(b)T細胞又はNK細胞の表面抗原に対する抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、T細胞又はNK細胞の表面抗原に対する抗体のscFv領域、及び
(c)(a)のFab領域の重鎖フラグメントに連結された第一Fcポリペプチド及び(b)のscFv領域に連結された第二Fcポリペプチドからなる、Fc領域、
からなる、二重特異性抗体。
本発明はまた、TSPAN8以外の他タンパク質(抗体を含む)やポリペプチドを連結した、本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント(「本発明の融合体」ともいう)を提供する。本発明の融合体に用いられるタンパク質やポリペプチドは特に限定されず、例えば、各種抗体、サイトカイン、ケモカイン、ヒト血清アルブミン、各種タグペプチド、人工ヘリックスモチーフペプチド、マルトース結合タンパク質、グルタチオンSトランスフェラーゼ、その他の多量体化を促進しうるペプチド又はタンパク質等を使用しうる。本発明の融合体の1つの実施形態において、タンパク質やポリペプチドが、本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントに連結されている。1つの実施形態において、本発明の融合体に用いられるタンパク質やポリペプチドは、例えば顆粒球、ナチュラルキラーT(Natural Killer T;NKT)細胞等の免疫細胞、樹状細胞、マクロファージ等の血球細胞の表面抗原に対する抗体若しくはその抗原結合フラグメント、又は各種インターロイキン(例えばIL-2、IL-7、IL-12、IL-15)等の免疫細胞を活性化するポリペプチドであってよい。この場合、本発明の融合体に用いられるタンパク質やポリペプチドは、本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントに直接連結していてもよく、また、任意のリンカー(例えば、ペプチドリンカー)を介して連結させてもよい。
本発明はまた、以下の(1)~(4)に記載のポリヌクレオチドを提供する:
(1)本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド
(2)本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(3)本発明の抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(4)本発明の抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(1)本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(2)本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(3)本発明の抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(4)本発明の抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号8に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号12に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(1)本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド
(2)本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントの軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(3)本発明の抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(4)本発明の抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドである。
(a)配列番号8に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号12に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドである。
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(a)配列番号4に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号8に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド;
(b)配列番号10に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の重鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び配列番号12に示されるアミノ酸配列からなる抗TSPAN8抗体の軽鎖をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド。
本発明はまた、本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント、本発明の融合体、本発明の複合体及び本発明の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメントを細胞表面に発現させた細胞(纏めて以下本項において「本発明の抗TSPAN8抗体等」と称する)、並びに薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物を提供する。当該医薬組成物は、がんの治療のために用いることができる。本発明はまた、本発明の抗TSPAN8抗体等の治療有効量を対象に投与する工程を含むがんを治療する方法、がんの治療に使用するための本発明の抗TSPAN8抗体等、がんの治療用医薬組成物の製造における本発明の抗TSPAN8抗体等の使用を提供する。本発明の抗TSPAN8抗体等の医薬用途は、前述の<本発明の二重特異性抗体の医薬組成物等>の記載に準じて当業者であれば実施し得る。本発明の抗TSPAN8抗体等の医薬用途の治療の対象となるがんは、前述の<本発明の二重特異性抗体の医薬組成物等>に記載のがんが挙げられる。
本発明はまた、以下に示す、抗CD3抗体又はその抗原結合フラグメントを提供する:
配列番号14のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号50から68までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号101から114までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変領域、並びに、配列番号14のアミノ酸番号168から181までのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号14のアミノ酸番号197から203までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番号14のアミノ酸番号236から244までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、抗CD3抗体又はその抗原結合フラグメント。
[実施例1-1:患者由来のがん腹膜播種細胞の取得]
患者からのがん腹膜播種細胞の取得を以下の方法で行った。患者からのがん腹膜播種細胞取得は、千脇史子、佐々木博己による文献「腹膜転移がん(胃、膵、卵巣がんなど)細胞株の樹立」(佐々木博己編『患者由来がんモデルを用いたがん研究実践ガイド』羊土社、2019年、p.28-37)に記載した方法に準じて行った。患者より採取した腹水をプロテオセーブ(登録商標)SS 50mL遠沈管(住友ベークライト社、MS-52550、以下、「50mL遠沈管」)に分注し、室温、430×gで3分間遠心した。上清を除去した後に、沈殿に溶血緩衝液を添加し、室温で10~20分間溶血させた。溶血緩衝液は、0.75% 塩化アンモニウムを含む17mM Tris-HCL(pH7.65)を孔径0.22μmのフィルターで濾過して調製した。遠心後に上清を除去し、ダルベッコPBS(-)(日水製薬社、05913、以下「PBS(-)」)を50mL加えて細胞を洗浄した。その後、室温、430×gで3分間遠心して細胞を回収した。回収した腹水中の全細胞を10% FBS(Thermo Fisher Scientific社、10270-106)、×1 Antibiotic-Antimycotic(Thermo Fisher Scientific社、15240062)を含むRPMI-1640(L-グルタミン含有)培地(富士フイルム和光純薬社、189-02025)、(以下、FBS等を添加後の培地を「RPMI-1640培地」と称する。)に再懸濁した。100mmコラーゲンコートディッシュ(以下、「ディッシュ」)(IWAKI社、4020-010)に細胞を5×106~1×107個/10mLずつ播種し、37℃、5% CO2インキュベーターで培養した。
腹水中の細胞には、接着系細胞と浮遊系細胞が存在する。接着系細胞には、がん細胞だけでなくがん細胞以外の細胞(線維芽細胞、腹膜中皮細胞等)も含まれている。がん細胞以外の細胞ががん細胞より短時間で剥離する性質を利用し、これらの細胞を腹水中の全細胞より分離した。具体的には、前述の腹水中の全細胞を培養したディッシュをPBS(-)で洗浄後、0.05%トリプシン-EDTA(Thermo Fisher Scientific社、15400054)2mLで数分間処理することによってがん細胞以外の細胞を剥離した。剥離した細胞に含まれるがん細胞以外の細胞は、新たなディッシュにて継続培養し、実施例1-5にて使用した。
がん細胞以外の細胞を除いた後、がん細胞がディッシュ面積の80%コンフルエント程度まで増殖した後に、全細胞の1/2を新しいディッシュへ継代する作業を繰り返し、5回以上継代したものを接着系がん細胞とした。浮遊系細胞については、培養ディッシュより培養上清5mLとRPMI-1640培地5mLを新しい100mmディッシュへ播種して継代し、5回以上継代したものを浮遊系がん細胞とした。1人の患者に由来するがん腹膜播種細胞が接着系がん細胞と浮遊系がん細胞の両方を含んだまま増殖する場合は、それらを混合系がん細胞とした。
本明細書において、上記方法にて患者から採取した腹水より単離した接着系がん細胞、浮遊系がん細胞又は混合系がん細胞を総称して「がん腹膜播種細胞」と称する。取得した12細胞(NSC-7C、NSC-9C、NSC-10C、NSC-14C、NSC-15CF、NSC-16C、NSC-20C、NSC-22C、NSC-24C、NSC-32C、NSC-34C及びNSC-35C-1(以下、「12種のがん腹膜播種細胞」とも称する。))を以後の検討に用いた。
ヒ卜モノクローナル抗体開発技術「ベロシミューン」(VelocImmune(登録商標) antibody technology;Regeneron(米国特許6596541号))マウスを用いてがん腹膜播種細胞に結合する抗胃がん抗原抗体を取得した。
実施例1-1にて取得したがん腹膜播種細胞のうちNSC-10C、NSC-35C-1、NSC-24C、NSC-7C、NSC-14C、NSC-34Cを3細胞ずつに分けて混合し、TiterMax(登録商標)Gold ADJUVANT(MERCK社、T2684)又はPBS(-)に懸濁し、がん腹膜播種細胞懸濁液を調製した。この懸濁液をベロシミューンマウスに免疫し、常法に従いハイブリドーマを作製した。自動ピッキング装置にてハイブリドーマの単コロニーを単離し、モノクローン化ハイブリドーマ細胞(以下、「クローン」)を取得した。単離したクローンを37℃、8% CO2インキュベーターにて培養し、培養4日後の上清を96ウェルプレートに回収し、以下の実験に用いた。
1.がん腹膜播種細胞及びEpCAM発現細胞への抗胃がん抗原抗体の結合確認
実施例1-2にて得られたクローンの細胞上清には抗体(以下、「クローン上清に含まれる抗体」)が含まれている。
まず、クローン上清に含まれる抗体と実施例1-1で取得した12種のがん腹膜播種細胞との結合をフローサイトメトリー法にて測定し、がん腹膜播種細胞に強く結合する抗体を産生するクローンを選抜した。フローサイトメトリーには、BV421 Goat Anti-Mouse Ig(Becton, Dickinson and Company社、563846)を用いた。次に、がん抗原であるEpCAMに結合する抗体を提供するクローンを除外するために、クローン上清に含まれる抗体とヒトEpCAM-Myc-DDK発現CHO-K1細胞との結合を測定した。ヒトEpCAM-Myc-DDK発現CHO-K1細胞は、EPCAM(Myc-DDK-tagged)-Human epithelial cell adhesion molecule(EPCAM)(ORIGENE社、RC201989)をCHO-K1細胞(ATCC、CCL-61)にトランスフェクションすることにより作製した。当該細胞とクローン上清に含まれる抗体の結合をフローサイトメトリー法にて測定した。フローサイトメトリー法には、BV421 Goat Anti-Mouse Igを用いた。EpCAM発現細胞に結合活性を示さない上清を提供するクローンを選択するために、当該細胞に結合するクローンを除外した。陽性コントロールとして、CD326(EpCAM) Monoclonal Antibody(1B7)(eBioscience社、14-9326)を使用した。
上記実験により、12種のがん腹膜播種細胞中の10種以上について結合し、且つ、ヒトEpCAMには結合しない抗体を提供するクローンを選定した。
さらに、がん腹膜播種細胞に選択的に結合する抗体を提供するクローンを選抜するために、ヒト末梢血単核細胞に結合する抗体を提供するクローンを除外した。
ヒト末梢血単核細胞と各クローンが提供する抗体との結合の測定にはフローサイトメトリー法を用いた。ヒト末梢血由来単核細胞として、Human Mononuclear Cells from Peripheral Blood(hMNC-PB),pooled,ultra-pure(PromoCell社、C-12908)を用いた。フローサイトメトリー法には、PE Goat Anti-Mouse Ig(Multiple Adsorption)(Becton, Dickinson and Company社、550589、以下「PE Goat Anti-Mouse Ig」)、BV421 Mouse Anti-Human CD3(Becton, Dickinson and Company社、562426)、APC Mouse Anti-Human CD14(Becton, Dickinson and Company社、555399)、BB515 Mouse Anti-Human CD19(Becton, Dickinson and Company社、564456)を用いた。
実施例1-3の1.及び2.の工程において選別したクローンをCDハイブリドーマメディウム(Thermo Fisher Scientific社、11279023)で培養した。培養上清から、MabSelectSuRe(GEヘルスケア社、17-5438-02)を用いて、抗体を精製した(以下、「精製抗体」)。抗体の精製は常法に従った。
がん腹膜播種細胞に選択的に結合する抗体を選抜するために、実施例1-3の3.で得た精製抗体から培養ヒト腹膜中皮細胞に結合する抗体を除外した。培養ヒト腹膜中皮細胞としてHuman Mesothelial Cells(Zenbio社、MES-F、Lot.MESM012916B)(本明細書にて「培養ヒト腹膜中皮細胞」と称す)を用い、Mesothelial Cell Growth Medium(Zenbio社、MSO-1)にて培養した。精製抗体と培養ヒト腹膜中皮細胞との結合の測定にはフローサイトメ卜リ一法を用いた。フローサイトメ卜リ一法には、PE Goat Anti-Mouse Igを用いた。培養ヒト腹膜中皮細胞に結合しない又は弱い結合を示す抗体を選別し、14種の精製抗体を取得した(以下、「14種の精製抗体」)。
14種の精製抗体について抗原候補分子の同定を行った。同定方法の例として、16B11、16B12及び21F7における抗原候補分子の同定方法を詳述する。
本実験におけるコントロール抗体として、がん腹膜播種細胞への結合パターンが16B11と異なっていた5D3、9A1、21A3を使用した。
NSC-15CF細胞の細胞破砕液を作製した。細胞破砕液に、16B11、16B12、21F7及びコントロール抗体3種(5D3、9A1、21A3)のうちのいずれか1抗体を添加した。さらにDynabeads Protein G (Life Technologies社、10003D)を加えて攪拌及び洗浄を行った。Dynabeads Protein Gに結合したタンパク質をTripsin/LysC(Promega社、V5072)を用いて消化し、ペプチド混合物を得た。ペプチド混合物を含む溶液をUltiMate 3000 RSnano(Thermo Fisher Scientific社)及びOrbitrap Fusion(Thermo Fisher Scientific社)を用いたLC-MS/MS測定に供した。得られたLC-MS/MSデータをProgenesis QI for Proteomics(Waters社)及びMascot(マトリクスサイエンス社)のソフトを用いて比較定量解析及びペプチド/タンパク質同定を行い、結合タンパク質を同定した。16B11、16B12、又は21F7のデータをそれぞれコントロール抗体のデータと比較し、16B11及び21F7の抗原候補分子としてTSPAN8を同定した。本実験では16B12の抗原候補分子は同定できなかった。
5B7、9F6、12C12、13A9、15D1、18C10及び19E4についても上記と同様の手法を用いて実験を行い、TSPAN8を抗原候補分子として同定した。コントロール抗体として5D3、9A1、21A3に加え24C7を用いた。16B12は、抗原候補分子の同定には至らなかったが、実施例1-3にて16B11と同様の結合プロファイルを示したので、TSPAN8を抗原候補と推定して後の検討を行った。
さらに、抗原を特定するために、ヒトTSPAN8-Myc-DDK発現CHO-K1細胞に対する結合実験を行った。ヒトTSPAN8-Myc-DDK発現CHO-K1細胞は、CHO-K1細胞にTSPAN8(Myc-DDK-tagged)-Human tetraspanin 8(TSPAN8)(ORIGENE社、RC202694)(配列番号2)をトランスフェクションすることにより作製した。結果、16B11、16B12、5B7、9F6、12C12、13A9、15D1、18C10、19E4、21F7の10種の抗体(「10種類の抗TSPAN8抗体」ともいう)がヒトTSPAN8-Myc-DDK発現CHO-K1細胞に結合し、TSPAN8を抗原として認識することが確認された。
1.がん腹膜播種細胞に対する結合活性の確認及び数値化
胃がん患者腹水より単離した7種のがん腹膜播種細胞(KM-291-As、KM-555-As、KM-556-As、P-249-As、KM-568-As、KM-570-As及びKM-577-As)と4種類の抗TSPAN8抗体との結合をフローサイトメトリー法により測定した。
KM-291-Asは、患者の腹水より実施例1-1と同様の方法を用いて調製した。調製したKM-291-Asには、CD45を発現する血球系細胞が多く含まれていたため、がん細胞を濃縮するために、CD45発現細胞をカラムで除去した。詳細には、5×107個の細胞を含む細胞懸濁液を、CD45 MicroBeads,human(Miltenyi Biotec社、130-045-801)を用い、常法に従いPre-Separation Columns(30μm)(Miltenyi Biotec社、130-041-407)とSeparation Columns(Miltenyi Biotec社、130-042-401)(以下、「Column」)に通した。Column通過液を50mL遠沈管に回収して遠心分離した。沈殿にbuffer 10mLを加え細胞を再懸濁した。この細胞懸濁液から5×106個の細胞を1.5mLマイクロチューブ(WATSON社、131-7155C)へ分取し、遠心分離により沈殿を得た。沈殿に2% FBS、100μg/mL Penicillin-Streptomycin(Thermo Fisher Scientific社、15140-122)を含むPBS(FCM buffer)を950μL加えて細胞懸濁液を調製した。FcR Blocking Reagentを50μL加え、氷中で10分間反応させた。この反応液を7本の1.5mLマイクロチューブへ100μLずつ分注し、以下の方法で細胞の染色を行った。7本中3本のマイクロチューブにmouse IgG1-PE抗体(Miltenyi Biotec社、130-092-212)を5μLずつ加え、次にAlexa Fluor647標識されたコントロール抗体を各マイクロチューブへ2.5μLずつ添加し、Isotype controlとした。コントロール抗体として、mouse IgG2a Isotype control(Becton, Dickinson and Company社、558053)、mouse IgG2b Isotype control(Becton, Dickinson and Company社、558713)、mouse IgG3 Isotype control(Becton, Dickinson and Company社、560803)のいずれか使用した。残り4本のマイクロチューブには、CD326(EpCAM)-PE(Miltenyi Biotec社、130-091-253)を5μLずつ加え、さらに16B11、16B12、9F6、18C10をマイクロチューブにそれぞれ2.5μL(0.25μg/チューブ)ずつ加えて細胞を染色し、4種類の評価抗体サンプルとした。各マイクロチューブは、抗体を添加した後に、氷中で30分間反応させた。FCM buffer 1mLを加えて遠心分離を行い、得られた沈殿に、FCM bufferを500μL加えて細胞を再懸濁した。7-AAD(Becton, Dickinson and Company社、559925)を5μL添加し、5mLセルストレーナーキャップ付きラウンドボトムポリスチレンチューブ(CORNING社、352235)に全量を移し、FACSVerse flow cytometer(Becton, Dickinson and Company社)を用いて測定を行った。データ取得にはBD FACSuiteソフトウェア(Becton, Dickinson and Company社)を用いた。
KM-555-As、KM-556-As、P-249-As、KM-568-As、KM-570-As、KM-577-Asの調製も、KM-291-Asの調製と同様の方法にて行った。KM-555-As、KM-556-Asとの結合測定においては、評価抗体サンプルとして16B11、9F6及び18C10を用いた。P-249-Asとの結合測定においては、評価抗体サンプルとして16B11及び市販抗TSPAN8抗体であるTSPAN8 Antibody,anti-human,REAfinity(130-106-855、Miltenyi社、本明細書において「REA443」)と称する)を用いた。KM-568-As、KM-570-As、KM-577-Asとの結合測定においては評価抗体サンプルとして16B11、9F6、18C10及びREA443を用いた。すべての実験において、Isotype Control Antibody, mouse IgG1(130-113-196, Miltenyi社)をisotype controlに用いた。また、細胞の染色にはIgG2a-VioBlue抗体(Miltenyi Biotec社、130-113-277)及びCD326(EpCAM)-VioBlue抗体(Miltenyi Biotec社、131-113-266)を用いた。
各がん腹膜播種細胞のフローサイトメトリーによる測定結果の解析は、BD FACSuiteソフトウェアを用いて行った。詳細には、FSC-A(lin)/SSC-A(log)にてプロットし、得られた細胞集団にゲートをかけ、再度FSC-W(lin)/FSC-A(lin)で展開し、Singlet集団のみをゲートしてサブセットを作成して解析を行った。KM-291-As細胞の測定結果の解析においては、サブセットを、PE(log)/Alexa Fluor647(log)にて展開した。KM-555-As、KM-556-As、P-249-As、KM-568-As、KM-570-As、KM-577-Asの測定結果の解析においては、VioBlue(log)/Alexa Fluor647(log)で展開したデータを用いた。各サンプルについて1×104個の細胞サブセットについてデータを取得した。取得したfcsファイルをFlowJo(Becton, Dickinson and Company社)で解析し、Alexa Fluor647におけるヒストグラムを作成した。Isotypeと各評価抗体について、陽性集団のAlexa Fluor647のMFIをそれぞれ算出し、各抗体のMFIより各Isotype MFIを引いてΔMFIを算出した(表1)。
得られたヒストグラムの例として、KM-291-Asとの結合測定における16B11及び16B12並びにKM-555-As及びKM-556-Asとの結合測定における16B11、9F6、18C10の結合を示すヒストグラムをそれぞれ図1-1から図1-3に示す。
実施例1-4にて同定された10種類の抗TSPAN8抗体と培養ヒト腹膜中皮細胞の結合活性を測定した。培養ヒト腹膜中皮細胞は正常細胞である。
実施例1-3にて得た10種類の抗TSPAN8抗体及び市販抗TSPAN8抗体のPurified anti-human TSPAN8 Antibody(BioLegend社、363702 Clone TAL69、本明細書にて「TAL69」と称する)の培養ヒト腹膜中皮細胞への結合をフローサイトメトリー法により測定した。2次抗体としてPE Goat Anti-Mouse Igを使用した。得られたヒストグラムを図2-1及び図2-2に示す。また、フローサイトメトリーの結果を、FlowJoを用いて解析することにより、各細胞集団のPEについてのMFIをそれぞれ算出した。陰性コントロール抗体として、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG1,κ Isotype Ctrl Antibody(BioLegend社、401408)、Purified NA/LE Mouse IgG2a,κ Isotype Control(Becton, Dickinson and Company社、554645)及びPurified NA/LE Mouse IgG2b,κ Isotype Control(Becton, Dickinson and Company社、559530)の3種の抗体を解析に用いた。16B11、16B12、9F6、18C10及びTAL69のΔMFI値を表1に記載する。抗体のΔMFI値は、各抗体のMFI値から陰性コントロール抗体のMFI値を引いて算出した。
ヒト胃がん腹膜播種患者の腹水中から単離された腹膜中皮細胞(本明細書にて「患者由来腹膜中皮細胞」と称する。)であるKM-501-As及びKM-503-Asの取得を以下の方法で行った。
実施例1-1の細胞樹立の過程において、ディッシュ一面に敷石状に増殖した中皮細胞が見られた。この中皮細胞を0.05%トリプシン-EDTAを用いて回収し、10% FBS、×1 Antibiotic-Antimycoticを含むD-MEM(高グルコース)(富士フイルム和光純薬社、044-29765)10mLに再懸濁した。4×105個の細胞を1.5mLマイクロチューブへ分取し、遠心分離後に上清を除去し、FCM bufferを96μL加えて細胞を懸濁した。FcR Blocking Reagentを4μL加え、氷中で10分間反応させた。この反応液50μLを別の1.5mLマイクロチューブへ分注し、細胞2×105個/50μLのマイクロチューブ2本とした。1本のマイクロチューブへCD45-APC抗体(Miltenyi Biotec社、130-091-230)2μL、CD326(EpCAM)-PE(Miltenyi Biotec社、130-113-264)0.5μLを加えた。もう1本のチューブにはmouse IgG2a-APC抗体(Miltenyi Biotec社、130-091-836)2μL、mouse IgG1-PE抗体0.5μLを加えた。それぞれのマイクロチューブを氷中で30分間反応させた。FCM bufferをマイクロチューブに各1mL加え、遠心分離して上清を除去した。沈殿にFCM buffer 500μLを加えて細胞を再懸濁させ、FACSVerseを用いて解析を行った。FSC-A(lin)とSSC-A(log)により細胞集団をゲーティングし、そのサブセットをPE(log)とAPC(log)で再度展開してデータを取得した。取得したfcsファイルをFlowJoで解析した。結果、この細胞集団はCD45陰性且つEpCAM陰性の正常細胞であることが確認できた。当該患者由来腹膜中皮細胞は、腹膜播種時にがん細胞が生着、増殖するための足場となる大網や腸管膜に由来する正常細胞であると考えられる。単離した患者由来腹膜中皮細胞のKM-501-As及びKM-503-Asを以下の実験に使用した。
KM-501-As及びKM-503-Asに対する10種類の抗TSPAN8抗体及びTAL69の結合は、実施例1-5の2.に記載の培養ヒト腹膜中皮細胞に対する結合の測定と同様の方法にて実施した。KM-501-As及びKM-503-Asに対する16B11、16B12、9F6、18C10及びTAL69のヒストグラムを図3-1及び図3-2に、ΔMFI値を表1に記載する。
培養ヒト臍帯血管内皮細胞に対する10種類の抗TSPAN8抗体及びTAL69の結合をフローサイトメトリー法により測定した。培養ヒト臍帯血管内皮細胞(PromoCell社、C-12200)はEndothelial Cell Growth Medium 2 Kit(PromoCell社、C-22111)を用いて培養した。陰性コントロール抗体として、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG1,κ Isotype Ctrl Antibody、Purified NA/LE Mouse IgG2a,κ Isotype Control、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG2b,κ Isotype Ctrl Antibody(BioLegend社、400348)、LEAF Purified Mouse IgG3,κ Isotype Ctrl Antibody(BioLegend社、401310)を用いた。2次抗体としてPE Goat Anti-Mouse Igを使用した。
10種類の抗TSPAN8抗体及びTAL69の結合のヒストグラムを図4に示す。16B11、16B12、9F6、18C10及びTAL69についてのΔMFI値を表1に記載する。ΔMFI値は、各抗体のMFIより陰性コントロール抗体のMFIを引いて算出した。
図1から図4のヒストグラムの結果及び表1の結果より、16B11及び16B12は、がん腹膜播種細胞に対して高い結合を示すが、正常細胞(培養ヒト腹膜中皮細胞、患者由来腹膜中皮細胞、培養ヒト臍帯血管内皮細胞)への結合は低いことが示された。一方、他の抗TSPAN8抗体である9F6、18C10及び市販抗TSPAN8抗体(TAL69又はREA443)のがん腹膜播種細胞に対しての結合は16B11及び16B12よりも低く、正常細胞に対しての結合は16B11及び16B12よりも高いことが示された。この結果から、16B11及び16B12と他の抗TSPAN8抗体(9F6、18C10、TAL69等)とは性質が大きく異なっていることが明らかとなった。
常法に従い、16B11及び16B12の重鎖及び軽鎖をコ一ドする遺伝子をクロ一ニングし、抗体の配列決定を行った。ベロシミュ一ン技術は、内因性の免疫グロブリン重鎖及び軽鎖の可変領域が対応するヒ卜可変領域で置換されたトランスジェニックマウスを用いて抗体を作製する技術である。よって、ベロシミュ一ン技術を用いて得られた抗体は、ヒ卜抗体の可変領域とマウス抗体の定常領域を有する抗体(本明細書において「キメラ抗体」とも称する)である。得られた16B11の重鎖可変領域のアミノ酸配列を配列番号34に、該抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列を配列番号36にそれぞれ示す。得られた16B12の重鎖可変領域のアミノ酸配列を配列番号35に、該抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列を配列番号37にそれぞれ示す。
[実施例3-1:完全ヒ卜抗TSPAN8抗体作製に用いる発現ベクターの作製]
16B11及び16B12の完全ヒト抗体を、実施例2にて同定したヒト可変領域のアミノ酸配列とヒト定常領域のアミノ酸配列とを連結して作製した。
16B11及び16B12の重鎖可変領域のN末に配列番号38に記載のシグナル配列をコードするアミノ酸配列を、C末にヒ卜IgG1定常領域のアミノ酸配列(配列番号4又は10のアミノ酸番号122から451までの配列)をそれぞれ連結したポリペプチドを設計した。さらに、当該ポリペプチドの重鎖可変領域の16から19番目のアミノ酸配列からなるフーリン切断配列(J.Biol.Chem.、1992、Vol.267、p.16396-16402)の16番目のアルギニン(R)をグリシン(G)に置換する変異を導入した。設計したポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをpcDNA3.4 TOPO(登録商標)ベクター(Thermo Fisher Scientific社)に導入した。作製した重鎖ベクターをそれぞれpcDNA3.4-16B11.1_HC及びpcDNA3.4-16B12.1_HCと称する。
また、16B11の軽鎖可変領域のN末に配列番号39に記載のシグナル配列をコードするアミノ酸配列を、16B12の軽鎖可変領域のN末に配列番号40に記載のシグナル配列をコードするアミノ酸配列をそれぞれ連結し、両抗体のC末側にヒ卜κ鎖の定常領域アミノ酸配列(配列番号8又は12のアミノ酸番号108から213までの配列)をそれぞれ連結したポリペプチドを設計した。設計したポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをpcDNA3.4 TOPO(登録商標)ベクターに導入した。作製した軽鎖ベクターをそれぞれpcDNA3.4-16B11_LC及びpcDNA3.4-16B12_LCと称する。
pcDNA3.4-16B11.1_HC及びpcDNA3.4-16B11_LCを用いて16B11.1抗体の作製を行った。
詳細には、ExpiCHOExpression Medium(Thermo Fisher Scientific社、A2910001)でおよそ6.0×106個/mLの濃度に達するまで培養されたExpiCHO-S細胞(Thermo Fisher Scientific社、A29127)に対し、pcDNA3.4-16B11.1_HC及びpcDNA3.4-16B11_LCを遺伝子導入試薬ExpiFectamineCHO Transfection Kit(Thermo Fisher Scientific社、A29129)を用いてでトランスフェクションし、12日間培養した。培養上清を、MabSelectSuReを用いて精製し、完全ヒ卜抗体の精製抗体を得た。得られた抗体を16B11.1と称する。16B11.1の重鎖の塩基配列を配列番号3に、それによりコードされるアミノ酸配列を配列番号4に、該抗体の軽鎖の塩基配列を配列番号7に、それによりコードされるアミノ酸配列を配列番号8にそれぞれ示す。
16B12.1は、pcDNA3.4-16B12.1_HC及びpcDNA3.4-16B12_LCを用いて上記と同様の方法により作製することができる。16B12.1の重鎖の塩基配列を配列番号9に、それによりコードされるアミノ酸配列を配列番号10に、該抗体の軽鎖の塩基配列を配列番号11に、それによりコードされるアミノ酸配列を配列番号12にそれぞれ示す。
[実施例4-1:水素-重水素交換質量分析法によるエピトープマッピング]
16B11.1のエピトープを同定するために、水素-重水素交換質量分析(HDX-MS)を実施した。結果、配列番号2のアミノ酸番号126~155に相当するヒトTSPAN8領域が16B11.1の存在下で重水素交換度が減少する領域として検出された。この結果から、配列番号2のアミノ酸番号126~155に相当するヒトTSPAN8領域が16B11.1のエピトープであると推定された。
実施例4-1で推定された領域が16B11.1のエピトープであるかどうかを確認するために、当該領域をマウス又はラットのTSPAN8の相同する領域と入れ替えたキメラタンパク質を作製して結合を評価した。ヒトTSPAN8のアミノ酸番号126~155に相当するマウスTSPAN8のアミノ酸番号126~155を配列番号41に、ラットTSPAN8のアミノ酸番号126~155を配列番号42に示す。
TSPAN8とGFPの融合タンパク質を発現する細胞を作製するために、実施例1-4で用いたTSPAN8(Myc-DDK-tagged)-Human tetraspanin 8(TSPAN8)(ORIGENE社、RC202694)から制限酵素を用いヒトTSPAN8配列を切り出した。切り出したヒトTSPAN8配列pCMV6-AC-GFPベクター(ORIGENE社、PS100010)にサブクローニングした(以下、「ヒトTSPAN8-GFP発現ベクター」)。更に、In-Fusion(登録商標)HD Cloning Kit(タカラバイオ社、639633)を用いて、配列番号2に記載のヒトTSPAN8-GFP発現ベクターのアミノ酸番号126~155に相当する配列をマウス又はラットTSPAN8のアミノ酸番号126~155の配列に置換したベクターを作製した。作製したベクターをCHO-K1細胞にそれぞれ導入し、ヒトTSPAN8-GFPタンパク、ヒトマウスTSPAN8-GFPキメラタンパク又はヒトラットTSPAN8-GFPキメラタンパクを一過性に発現する細胞を作製した。作製した細胞をそれぞれ野生型ヒトTSPAN8発現CHO-K1細胞、ヒトマウスTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞又はヒトラットTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞と称する。またpCMV6-AC-GFPベクターをCHO-K1細胞に導入した細胞(モック細胞と称する)を作製した。これらの細胞中のGFP陽性細胞に対する16B11、16B12及びTAL69の結合をフローサイトメトリー法により測定した。TAL69はヒトラット、ヒトマウスTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞のいずれに対しても結合の低下は認められなかった。16B11及び16B12は、ヒトラットTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞に対しては野生型ヒトTSPAN8発現CHO-K1細胞と同等の結合を示した。一方で、ヒトマウスTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞に対しては野生型ヒトTSPAN8発現CHO-K1細胞と比べて結合の減弱が認められた(図5-1)。
ヒトマウスTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞に対する結合活性の減弱に寄与するアミノ酸配列を特定するために、ヒト、マウス、ラット及びカニクイザルのTSPAN8タンパク質について、ヒトTSPAN8のアミノ酸配列の126~155に相当する配列の比較を行った(図5-2)。マウス、ラット及びカニクイザルTSPAN8のアミノ酸配列の126~155に相当する配列をそれぞれ配列番号41、42及び43に示す。結果、マウスのTSPAN8タンパク質のみでアミノ酸配列が異なるのは131番目のアミノ酸だけであった。この情報により、配列番号2に記載のヒトTSPAN8タンパク質の131番目のトレオニン(T)が16B11又は16B12との結合に重要であることが推察された。
さらに、ヒトTSPAN8の131番目のアミノ酸が16B11又は16B12の結合に寄与しているかどうかを確かめるために、当該アミノ酸の置換体を作製した。具体的には、配列番号2のヒトTSPAN8-GFPにおけるヒトTSPAN8のアミノ酸配列の131番目のトレオニン(T)をアラニン(A)又はアスパラギン(N)に置換したヒトTSPAN8-GFP融合タンパク質(それぞれ、「ヒトTSPAN8(T131A)-GFP」又は「ヒトTSPAN8(T131N)-GFP」と称する)をコードする塩基配列を含むベクターを作製し、CHO-K1細胞にそれらベクターを遺伝子導入し、ヒトTSPAN8(T131A)-GFP、ヒトTSPAN8(T131N)-GFPを一過性に発現させた細胞を構築した。構築した細胞をヒトTSPAN8(T131A)発現CHO-K1細胞又はヒトTSPAN8(T131N)細胞と称する。これらの細胞中のGFP陽性細胞に対する16B11、16B12及びTAL69の結合をフローサイトメトリー法により測定した(図5-3)。結果、ヒトTSPAN8(T131A)発現CHO-K1細胞及びヒトTSPAN8(T131N)発現CHO-K1細胞に対する16B11及び16B12の結合は、野生型ヒトTSPAN8発現CHO-K1細胞に対する結合に比べて減弱していた。一方で、TAL69はいずれの細胞に対しても同等の結合活性を示した。結果、エピトープと同定された配列番号2のアミノ酸番号126~155に対応するヒトTSPAN8の領域において、131番目のトレオニンが16B11及び16B12との結合に必須なアミノ酸であることが分かった。
各TSPAN8発現細胞への結合のMFIからモック細胞への結合のMFIを引いて算出したΔMFIの値を表2-1に記載する。また、表2-1の野生型ヒトTSPAN8発現CHO-K1細胞への結合のΔMFIを100とした時のヒトマウスTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞、ヒトラットTSPAN8キメラタンパク発現CHO-K1細胞及びヒトTSPAN8(T131A又はT131N)発現CHO-K1細胞への結合のΔMFI相対値を表2-2に示す。
16B11又は16B12と他の抗TSPAN8抗体(9F6、18C10又はTAL69)がTSPAN8との結合において競合するかどうかを調べた。
16B11と他の抗TSPAN8抗体(9F6、18C10又はTAL69)との競合を調べるために、NSC-15CF細胞への16B11の結合量の変化をフローサイトメトリー法により測定した(実験1;図6-1)。具体的には、2×105個のNSC-15CFに、終濃度1μg/mLのAlexa Fluor647標識16B11と他の抗TSPAN8抗体(16B11、9F6、18C10又はTAL69のうちの1抗体)を終濃度100μg/mLとなるように添加し、NSC-15CFへの16B11の結合量をフローサイトメーターにて測定した。陰性コントロール抗体として、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG1,κ Isotype Ctrl Antibody、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG2a,κ Isotype Ctrl Antibody(BioLegend社、400264)、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG2b,κ Isotype Ctrl Antibodyを用いた。結果、16B11の結合は自身の16B11を添加した場合にのみ減弱した。
16B12と他の抗TSPAN8抗体(16B11、9F6、18C10又はTAL69)との競合を調べるために、NSC-15CFへの16B12による16B11、9F6又は18C10の結合量の変化をフローサイトメトリー法により測定した(実験2;図6-2)。具体的には、1×105個のNSC-15CFに、終濃度0.25μg/mLのAlexa Fluor647標識16B11、9F6又は18C10と終濃度100μg/mLの16B12を添加し、NSC-15CFへの16B11、9F6又は18C10の結合量をフローサイトメーターにて測定した。陰性コントロール抗体として、LEAF Purified Mouse IgG3,κ Isotype Ctrl Antibodyを用いた。結果、16B12により16B11の結合が減弱した。その他の抗体の結合には影響しなかった。同様にAlexa Fluor647標識16B12と他の抗TSPAN8抗体(16B11、16B12、9F6、18C10又はTAL69)を用いた競合実験を実施した(実験3;図6-3)。陰性コントロール抗体として、LEAF Purified Mouse IgG3,κ Isotype Ctrl Antibody、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG2a,κ Isotype Ctrl Antibody、Ultra-LEAF Purified Mouse IgG2b,κ Isotype Ctrl Antibody及びUltra-LEAF Purified Mouse IgG1,κ Isotype Ctrl Antibodyを用いた。結果、16B12の結合は16B11及び16B12自身を添加した場合にのみ減弱した。16B11及び16B12の結合は互いに競合することから、16B11と16B12は近似のエピトープを認識すると推察された。各標識抗体結合のMFIから未染色細胞のMFIを引いて算出した値においてIsotype Controlを競合抗体として添加した時の値を100とした時の競合抗体添加時の相対値を表3に示す。
胃がん患者腹水由来株化細胞である60As6細胞にluciferaseタンパク質及び緑色蛍光タンパク質(GFP)を発現させた60As6-Luc/GFP細胞を、以下の方法で作製した。
[実施例5-1:Luc/GFPを含むウイルス溶液の作製]
L293T細胞(Thermo Fisher Scientific社、K4975-00)を用い、常法に従ってレンチウイルスの作製を行った。
レンチウイルスの作製には、MISSION(登録商標)Lentiviral Packaging Mix(SIGMA社、SHP001)及びpCDH-CMV-GL3-EF1a-GFP-T2A-puro改変ベクター(広島大学 医系科学研究科 細胞分子生物学研究室 高橋陵宇准教授より寄贈(PLoS One、2015、Vol.10、e0123407、Front Biosci.、2008、Vol.13、p.1619-1633))を用いた。ウイルスを含む細胞の培養上清から、45μm Millex(登録商標)-HVフィルター(Merck Millipore社、SLHV033RS)を用いてウイルスをろ過したものをウイルス溶液とし、-80℃で凍結保存した。
[実施例5-2:60As6細胞へのウイルスの感染]
60As6細胞(国立がん研究センター 柳原 五吉 先生より寄贈)へのウイルスの感染は、常法に従って行った。培地には、10%FBSを含むRPMI-1640を使用した。感染3日後に60As6細胞プレートより培養液を除去し、10%FBS、2μg/mL Puromaycin(Thermo Fisher Scientific社、A-11138-02)含むRPMI-1640(selection培地)へ置換し、培養を継続した。その後、selection培地での培養及び継代を繰り返すことにより未感染の細胞を除去し、ウイルスが完全に除去されたことを確認した。樹立した細胞を60As6-Luc/GFP細胞と称する。この細胞は、luciferase及びGFPを発現していた。さらに、60As6-Luc/GFP細胞は内因性にTSPAN8が高発現していることをフローサイトメトリー法により確認した。
完全ヒト抗体抗TSPAN8抗体の16B11.1によって誘導されるADCC活性を測定した。ADCC活性は、エフェクター細胞が標的細胞を傷害する作用を評価することで測定が可能である。本実施例では、エフェクター細胞であるNK細胞と標的細胞である60As6-Luc/GFP細胞の共培養下において、16B11.1によりNK細胞が活性化され、その結果として60As6-Luc/GFP細胞がADCC活性により傷害される細胞傷害活性を、Luciferaseを指標に測定した。
NK細胞は、凍結ヒトPBMC(ePBMC(登録商標),Characterized Cryopreserved Human PBMC、Cellular Technology Limited社、CTL-CP1)からNK細胞単離キット(NK Cell Isolation Kit、human、Miltenyi Biotec社、130-092-657)を用いて単離し、NK細胞用培地(NK MACS Medium、Miltenyi Biotec社、130-114-429)にて培養したものを使用した。
丸底96ウェルプレート(Sumitomo Bakelite社、MS-9096U)に5% FBS(Hyclone社、SH30084.03)含有RPMI-1640(SIGMA社、R8758-500mL)培地に懸濁した60As6-Luc/GFP細胞を5×103個/25μL/well、NK細胞を5×104個/50μL/wellずつ播種した。さらに、16B11.1又は陰性コントロール抗体としての自社製の抗KLH抗体(3G6)を終濃度1、10、100、1000、10000ng/mLとなるように希釈した溶液を25μL/well添加し、24時間後のLuciferaseの発光量をルシフェラーゼ定量化キット(ONE-GloLuciferase Assay System、Promega社、E6120)を用いて測定した。Luciferaseの発光量は60As6-Luc/GFP細胞の生存量を示すため、Luciferaseの発光量の減少によりADCC活性による細胞傷害活性を測定することができる。
図7の縦軸は培地のみを測定した場合のLuciferaseの発光量を100%とし、抗体無添加時の60As6-Luc/GFP細胞中のLuciferaseの発光量を0%とした場合の各サンプルのLuciferaseの発光量の相対値を表す。横軸は各ウェルに添加した抗体の濃度を示す。図7に示した通り、16B11.1を添加した場合のみADCC活性により標的細胞が傷害された。
[実施例7-1:抗TSPAN8抗体の二重特異性抗体ベクター作製]
16B11.1の重鎖のアミノ酸番号238及び239(EUインデックス:234及び235)のアミノ酸をそれぞれロイシン(L)からアラニン(A)に置換したLALA変異(L234A及びL235A)、アミノ酸番号370、372及び411(EUインデックス:366、368及び407)のアミノ酸をそれぞれトレオニン(T)からセリン(S)、LからA、チロシン(Y)からバリン(V)に置換するノブズ・イントゥー・ホールズ(Knobs into holes)変異、並びに、アミノ酸番号301(EUインデックス:297)のアミノ酸をアスパラギン(N)からグリシン(G)に置換する変異を導入した。設計した16B11.1の重鎖アミノ酸配列を配列番号6に示す。作製したベクターをpcDNA3.4-16B11.1_HC_Hと称する。
ヒト化抗CD3抗体の配列設計は、日本特許第5686953号に記載のマウス抗CD3抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域の配列をもとに、文献(Front Biosci.、2008、Vol.13、p.1619-1633)記載の方法に準じて行った。この際に、バックミューテーションを導入した。立体構造情報(PDB Code:5FCS)をMOLSIS Inc.社が提供する統合計算化学システムMOEで解析して、フレームワーク領域内のバックミューテーション導入位置を決定した。ヒト化抗CD3抗体は、重鎖可変領域(配列番号14 アミノ酸番号1から125)、リンカー(配列番号14 アミノ酸番号126から145)、軽鎖可変領域(配列番号14 アミノ酸番号146から254)、ヒンジ(配列番号14 アミノ酸番号255から269)、CH2ドメイン(配列番号14 アミノ酸番号270から379)及び、CH3ドメイン(配列番号14 アミノ酸番号380から486)の順に配置されるように設計した。さらに、配列番号14には(1)アミノ酸番号44とアミノ酸番号247に該当するアミノ酸をシステイン(C)に置換、(2)アミノ酸番号259(EUインデックス:220)のアミノ酸をCからSに置換、(3)アミノ酸番号273及び274(EUインデックス:234及び235)のアミノ酸をLからAに置換するLALA変異、(4)アミノ酸番号405(EUインデックス:366)のアミノ酸をTからトリプトファン(W)に置換するKnobs into holes変異、(5)アミノ酸番号336(EUインデックス:297)のアミノ酸をNからGに置換する変異が導入されている。これらの変異を導入するため、それぞれの変異点を含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを合成し、pcDNA3.1(+)ベクター(Thermo Fisher scientific社 、V79020)に挿入した。作製したベクターをpcDNA3.1-m7_scFV_Kと称する。作製したヒト化抗CD3抗体の塩基配列を配列番号13に、アミノ酸配列を配列番号14に示す。
抗TSPAN8抗体のFab領域と、抗CD3抗体のscFv領域と、Fc領域により構成される二重特異性抗体を作製するために、pcDNA3.4-16B11.1_HC_H、pcDNA3.4-16B11_LC、pcDNA3.1-m7_scFV_Kを実施例3の方法と同様にExpiCHO-S(登録商標)細胞にトランスフェクションした。培養上清をMabSelect SuReを用いて精製し、更にゲル濾過カラムHiLoad26/600 Superdex(登録商標) 200pg(GE ヘルスケア社、28-9893-36)を用いて精製することにより、純度95%以上の精製抗体を得た。得られた抗体を抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体と称する。
抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体のTSPAN8とCD3に対する結合活性を、TSPAN8のLELタンパク又はCD3εδ複合タンパクを用いたELISA法によりそれぞれ評価した。
詳細には、PBSで希釈したTSPAN8 Protein,Human,Recombinant(SinoBiological社、15683-H07H)又はHuman CellExp CD3 epsilon & CD3 delta Heterodimer, Human Recombinant(BioVision社、P1183-10)1μg/mLを384-Well White Plates, MaxiSorp(Nunc社、460372)に30μL/well添加した。4℃にて終夜静置した後に上清を除去し、Blocking One(Nacalai Tesque社、03953-95)を120μL/well添加した。室温に1時間静置した後に、上清を除去し、TBST buffer(Thermo Fisher scientific社、28360)で2回洗浄後、10% Blocking One含有TBSTで希釈した抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体を30μL/wellずつ添加し、室温にて1時間静置した。抗体溶液を除去し、TBST bufferで2回洗浄後、10% Blocking One含有TBSTで5000倍希釈したGoat Anti-Human Kappa, Mouse ads-HRP(SouthernBiotech社、2061-05)を30μL/well添加し、室温にて30分間静置した。抗体溶液を除去し、TBST bufferで4回洗浄後、BM Chemiluminescence ELISA Substrate(POD)(Roche社、11582950001)を30μL/well添加した。室温にて15分反応させた後に、ARVO X3(Perkin Elmer社)にて化学発光を測定した。結果、TSPAN8及びCD3に対するEC50値はそれぞれ1.0μg/mL(8.1nM)、4.6μg/mL(36nM)と算出された(図8)。
RPMI-1640(Thermo Fisher Scientific社、11875-119)500mLにFBS 50mL、MEM Non-essential Amino Acid(Merck社、M7145)5mL、Sodium pyruvate(Merck社、S8636)5mL、GlutaMAX I(Thermo Fisher Scientific社、35050-061)5mL、ペニシリンストレプトマイシン(Thermo Fisher Scientific社、15070-063)5mL、HEPES(Thermo Fisher Scientific社、15630-080)5mLを加えたものを培養培地として用いた(以下、本実施例で「培養培地」と称する)。実施例4にて作製した60As6-Luc/GFP細胞を培養培地で2×105個/mLに調製した細胞懸濁液を平底96ウェルプレート(IWAKI社、3860-096)に50μLずつ播種し、37℃、5% CO2インキュベーターにて培養した。3時間後、培養培地にて1×106個/mLに調製した凍結ヒト末梢血単核細胞(LP.CR.MNC 10M;AllCells LLC社、4W-270)を、培養中の96ウェルプレートに100μLずつ播種した。終濃度0、3、10、30、100、300、1000、3000、10000 ng/mLになるように調製した抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体を50μLずつ添加し、37℃、5% CO2培養下、IncuCyte(登録商標) ZOOM(ザルトリウス社)にて各ウェルの蛍光(GFP)面積を3日後に測定した。蛍光面積を細胞増殖の指標とし、図9に細胞増殖曲線を示した。図9の縦軸は、培地のみのウェルの蛍光面積を0%とし、抗体溶液未添加のウェルの蛍光面積を100%とした場合の60As6-Luc/GFP細胞の蛍光面積の相対値を示す。結果、抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体はTSPAN8発現胃がん細胞である60As6-Luc/GFP細胞に対し、in vitroにおいて細胞増殖抑制作用を示した。
患者腹水細胞に含まれるがん細胞及び免疫細胞に抗TSPAN8-抗CD3二重特異性抗体が結合すると、免疫細胞が活性化され、がん細胞が傷害される。抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体によるがん細胞傷害作用及び免疫細胞活性化作用を以下の方法で評価した。
患者腹水細胞は実施例1-1と同様に患者腹水を溶血処理まで実施した後、凍結保存された細胞を用いた。融解した細胞を実施例9と同様の培養培地で2×106個/mLとなるように調製し、その細胞溶液を平底96ウェルプレートに100μL/wellずつ播種した。被験抗体として抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体及び対照抗体(16B11.1のFabを抗KLH(キーホールリンペットヘモシアニン)抗体のFabに置き換えた抗KLH抗体と抗CD3抗体のバイスペシフィック抗体)を使用した。被験抗体は、10μg/mLから10倍公比で0.1ng/mLまで希釈した。被験抗体を、細胞を播種した96ウェルプレートに添加した後に、37℃、5% CO2インキュベーターにて培養した。培養には、培養培地を使用した。3日後に細胞を回収し、V底マイクロプレートに撒種した。回収時にプレートに接着していた細胞はAccutase(Innovative Cell Technologies社、AT-104)で剥離した後、V底マイクロプレートに添加した。720×g 2分遠心分離した後に上清を除去し、staining buffer(10% FBS含有PBS 0.09% NaN3 2mM EDTA)に40分の1量のHuman BD Fc Block(Becton, Dickinson and Company社、564220)を加えた液体を20μL/wellで添加した。それぞれのウェルに対しstaining bufferで希釈したFITC Mouse Anti-Human CD4(Becton, Dickinson and Company社、 550628)、APC-H7 Mouse anti-Human CD8(Becton, Dickinson and Company社、560179)、APC Mouse Anti-Human CD45(Becton, Dickinson and Company社、555485)、PE Mouse Anti-Human CD25(Becton, Dickinson and Company社、555432)、Brilliant Violet 421 anti-human CD326 (EpCAM) Antibody(BioLegend社、324220)を10μL/wellずつ加え、4℃で50分静置した。細胞をstaining bufferで1回洗浄した後、1/200量の7-AAD solutionを含むstaining bufferに再懸濁し、CytoFLEX S(Beckman Coulter社)を用いてフローサイトメトリー法により各種抗体の腹水細胞への結合を測定した。デ一タ解析はFlowJoで行った。生細胞の指標である7-AAD陰性細胞画分について、免疫細胞の指標であるCD45及びがん細胞の指標であるEpCAMで展開した。CD45陰性EpCAM陽性がん細胞はFsc(lin)とSsc(lin)に展開し、断片化した分画を除いた細胞をがん細胞の生細胞数とした。さらに、CD45陽性画分のCD4又はCD8陽性細胞における活性化マーカーのCD25の発現を測定し、anti-CD25-PE蛍光強度のMFIを算出した。図10-1には、がん細胞の生細胞数の変化を示す。縦軸は、抗体溶液未添加時のがん細胞の細胞数を100%とした時の細胞数の相対値を示す。図10-2及び10-3には、被験抗体によるCD4陽性T細胞及びCD8陽性T細胞上のCD25発現量の変化を示す。縦軸は、anti-CD25-PE蛍光強度のMFIの相対値を算出した値を示す。
結果、図10-1に示すように抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体添加により腹水中がん細胞の生細胞数の減少が認められ、図10-2、図10-3に示すように腹水中CD4陽性T細胞とCD8陽性T細胞の活性化が観察された。この結果から、抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体は腹水中CD4陽性T細胞とCD8陽性T細胞を活性化し腹水中がん細胞を殺傷させることが示唆された。
抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体によるin vivo抗腫瘍作用を、胃がん腹膜播種モデルを用いて評価した。
[実施例11-1:Expanded panT細胞の作製]
PBSで3μg/mLに溶解した抗CD3抗体(BioLegend社、317315)を24ウェルプレート(IWAKI社、3820-024)に250μLずつ添加し、4℃にて静置した。翌日、プレートを培養培地で2度洗浄した後に培養培地を添加し、後述の細胞播種まで室温で静置した。HPBMC,human peripheral blood mononuclear cells,Cryopreserved(LONZA社、CC-2702)からpanT細胞(CD4T細胞及びCD8T細胞の両方を含む)を単離した。単離にはPanT Cell Isolation Kit,human(Miltenyi Biotec社、130-096-535)を用い、添付のプロトコルに基づいて実験を行った。前述の24ウェルプレートから培養培地を除き、プレートに培養培地にて3×106個/mLに調製したpanT細胞を500μLずつ播種した。さらに20ng/mLのヒトIL-2(PeproTech社、200-2)及び2μg/mLの抗CD28抗体(BioLegend社、302923)を含む培養培地を500μLずつ添加し、37℃、5% CO2インキュベーターにて培養を行った。細胞を、新たなプレート(IWAKI社、3810-006)に培養開始3日後、5日後及び7日後に継代し、終濃度10ng/mLになるようにIL-2を添加した。培養開始7日後と10日後の細胞を回収し、実施例10-2において使用した。ここで単離、増殖させた細胞をExpanded panT細胞と称する。
各群7例の7週齢C.B17/Icr-scid/scidJcl雌マウス(日本クレア社)の腹腔内に1×106個/1mL/PBSの60As6-Luc/GFP細胞を移植した。移植6日後に60As6-Luc/GFP細胞に導入されているLuciferaseによる基質Luciferinの発光量を指標とし、各群が均等になるように群分けを行った。Luciferinの発光量は腫瘍体積を示す指標として用いた。
詳細には、各個体に3mg Luciferin(VivoGlo Luciferin,In Vivo Grade、Promega社、P1043)を0.5mLのPBSに溶解した溶液を腹腔内に投与し、投与10分後に発光量をIVIS Lumina II(perkinelmer社)にて測定した。次に60As6-Luc/GFP細胞移植7日後及び10日後に1×107個のexpanded panT細胞を0.5mLのPBSに懸濁した液及び0、0.3、1.0、3.0mg/kg 抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体を0.2mLのPBSに懸濁した液を腹腔内投与した。胃がん細胞移植14日後に、Luciferinの発光量を測定し、腫瘍体積の増減を評価した。また、同腹膜播種モデルマウスの生存を60As6-Luc/GFP細胞移植34日後まで観察した。図11-1に示す通り、抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体投与群において、有意な腫瘍体積縮小作用が示され、図11-2に示す通り、1.0及び3.0mg/kg投与群においては、有意な生存期間延長効果が認められた。表4に生存中央値及び検定結果を示す。表中の有意確率P値は、ログランク検定により対照群(溶媒投与群)の生存期間と抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体投与群の生存期間を比較することにより求めた。**は、P値がボンフェローニの方法にて補正した有意水準0.01/3より小さい群を示す。
[実施例12-1:抗TSPAN8抗体の各癌腫細胞株に対する結合活性の確認]
胃がん細胞株(KATOIII細胞:Japanese Collection of Research Bioresources(JCRB)、JCRB0611、NUGC-4細胞:RIKEN BioResource Research Center(BRC)、RCB1939、60As6-Luc/GFP細胞)、結腸がん細胞株(HT-29細胞:ATCC、HTB-38、LoVo細胞:ATCC、CCL-229、GP2d細胞:The European Collection of Authenticated Cell Cultures(ECACC)、95090714)、膵臓がん細胞株(AsPC-1細胞:ATCC、CRL-1682)、食道がん細胞株(OE19細胞:ECACC、96071721)、肝臓がん細胞株(Li-7細胞:RIKEN BRC、RCB1941)に対するAlexa Fluor647標識16B11の結合をフローサイトメトリー法により測定した。陰性コントロール抗体として、自社製の抗KLH抗体(173A1)をAlexa Fluor647標識して用いた。各癌腫細胞株における16B11と陰性コントロール抗体の結合のヒストグラムを図12に示す。
KATOIII細胞、NUGC-4細胞、HT-29細胞、LoVo細胞、GP2d細胞、AsPC-1細胞、OE19細胞、Li-7細胞を培養培地にて2×105個/mLに調製し、平底96ウェルプレート(IWAKI社、3860-096)に50μLずつ播種し、37℃、5% CO2インキュベーターにて培養した。培養培地にて1×106個/mLに調製した凍結ヒト末梢血単核細胞(LONZA社、CC-2702)を、培養中の96ウェルプレートに100μLずつ播種した。抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体を、40μg/mL又は20μg/mLを最高濃度とし、2倍公比となるように培養培地で希釈した。希釈した抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体を50μL添加した(最高終濃度は10μg/mL又は5μg/mL)。がん細胞株、凍結ヒト末梢血単核細胞及び抗体を添加した96ウェルプレートを37℃、5% CO2インキュベーターにて培養した。3日後に細胞を回収し、V底マイクロプレートに撒種した。回収時に培養プレートに接着していた細胞はAccutase(Innovative Cell Technologies社、AT104)で剥離した後、V底マイクロプレートに添加した。720×gにて2分間遠心分離した後に上清を除去し、staining bufferに40分の1量のHuman BD Fc Blockを加えた液体を20μL/well添加した。それぞれのウェルに対しstaining bufferで希釈したAPC Mouse Anti-Human CD4(Becton, Dickinson and Company社、 555349)、APC-H7 Mouse anti-Human CD8、Brilliant Violet 421 Mouse Anti-Human CD45(Becton, Dickinson and Company社、563879)、PE Mouse Anti-Human CD25を10μL/wellずつ加え、4℃で1時間静置した。staining bufferで1回洗浄した後、1/200量の7-AAD solutionを加えた。staining bufferに再懸濁し、CytoFLEX Sを用いてフローサイトメトリー法により各種抗体の結合を測定した。デ一タ解析はFlowJoで行った。生細胞の指標の7-AAD陰性細胞画分中のCD45陰性細胞数をがん細胞の生細胞数とした。抗体溶液未添加を100%とした。さらにCD45陽性画分のCD4又はCD8陽性細胞について活性化マーカーのCD25の発現をanti-CD25-PE蛍光強度のMFIを、抗体溶液未添加を1とした場合の倍率変化としてそれぞれ算出した。結果、図13-1に示すように抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体添加によりTSPAN8発現がん細胞の生細胞数の減少が見られた。さらに、図13-2及び図13-3に示すように、CD4陽性T細胞とCD8陽性T細胞の活性化がそれぞれ観察された。
正常ヒトPBMC(Precision for Medicine、33000-10M)を1.25×107個/mLとなるようにPBSに懸濁し、6週齢NOD/Shi-scid,IL-2RγKO(NOG)雌マウス(インビボサイエンス)に2.5×106個/200μLの細胞をマウス尾静脈内に注射した。ヒトPBMC移入の10日後、HT-29細胞を5×107個/mLとなるようにPBSに懸濁し、5×106個/100μLでマウスの皮下に担癌した。HT-29細胞の担癌から10日後にノギスを使って腫瘍体積を測定し、各群均等になるように群分けを行った(n=10)。抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体の投与を同日から開始した。投与初日を0日目と定義した。0、4、7日目にマウスにPBS又は0.3、1、3、10mg/kgの抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体を静脈内投与した。0、4、7、及び11日目に腫瘍体積を測定した(図14-1)。腫瘍体積[mm3]は次式で計算した。
(腫瘍長軸の長さ[mm])×(腫瘍短軸の長さ[mm])2×0.5
図14-2に示す通り、抗TSPAN8(16B11)-抗CD3二重特異性抗体は、HT-29腫瘍の増殖を0.3、1、3、及び10 mg/kgで有意に抑制した。
Claims (10)
- 下記(a)及び(b)から選択される抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメン
ト:
(a)配列番号4のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、配
列番号4のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配列番
号4のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重鎖可変
領域、並びに、配列番号8のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列からなるCD
R1、配列番号8のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるCDR2、及
び配列番号8のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む軽
鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)配列番号10のアミノ酸番号31から35までのアミノ酸配列からなるCDR1、
配列番号10のアミノ酸番号50から66までのアミノ酸配列からなるCDR2、及び配
列番号10のアミノ酸番号99から110までのアミノ酸配列からなるCDR3を含む重
鎖可変領域、並びに、配列番号12のアミノ酸番号24から34までのアミノ酸配列から
なるCDR1、配列番号12のアミノ酸番号50から56までのアミノ酸配列からなるC
DR2、及び配列番号12のアミノ酸番号89から96までのアミノ酸配列からなるCD
R3を含む軽鎖可変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。 - 下記(a)及び(b)から選択される、請求項1に記載の抗TSPAN8抗体又はその
抗原結合フラグメント:
(a)配列番号4のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領域
、及び、配列番号8のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可変領
域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント;
(b)配列番号10のアミノ酸番号1から121までのアミノ酸配列からなる重鎖可変領
域、及び、配列番号12のアミノ酸番号1から107までのアミノ酸配列からなる軽鎖可
変領域を含む、抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。 - 下記(a)及び(b)から選択される、請求項2に記載の抗TSPAN8抗体:
(a)配列番号4のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号8のアミノ酸配列からなる軽
鎖を含む、抗TSPAN8抗体;
(b)配列番号10のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号12のアミノ酸配列からな
る軽鎖を含む、抗TSPAN8抗体。 - 翻訳後修飾された、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体又はその
抗原結合フラグメント。 - 翻訳後修飾が、重鎖可変領域N末端のピログルタミル化及び/又は重鎖C末端リジン欠
失である、請求項4に記載の抗TSPAN8抗体又はその抗原結合フラグメント。 - 請求項1~5のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグ
メントの融合体、又は複合体、又は請求項1~5のいずれか一項に記載の抗TSPAN8
抗体若しくはその抗原結合フラグメントを細胞表面に発現させた細胞。 - がんの治療に使用するための、請求項1~5のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗
体若しくはその抗原結合フラグメント、又は請求項6に記載の融合体、複合体若しくは細
胞。 - 請求項1~5のいずれか一項に記載の抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグ
メント、又は請求項6に記載の融合体、複合体若しくは細胞を含み、さらに薬学的に許容
される賦形剤を含む、医薬組成物。 - がんの治療のための、請求項8に記載の医薬組成物。
- がんの治療のための医薬組成物の製造における、請求項1~5のいずれか一項に記載の
抗TSPAN8抗体若しくはその抗原結合フラグメントの使用、又は請求項6に記載の融
合体、複合体若しくは細胞の使用。
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