JP7811540B2 - Mhcクラスii分子及びその使用方法 - Google Patents
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Description
本PCT出願は、2019年7月30日に出願の米国特許仮出願番号第62/880,501号及び2020年5月22日に出願の米国特許仮出願番号第63/029,114号の利益を請求し、それぞれの内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる。
電子的に提出された配列表の内容(名称:4285-011PC02_SL_ST25.txt, サイズ: 34,403バイト;及び作成日:2020年7月28日)は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示をより容易に理解し得るようにするために、特定の用語を最初に定義する。本出願で使用するとき、本明細書に別段に明記されない限り、次の用語の各々は、下記に示す意味を有するものとする。追加の定義は、本出願全体を通して記載される。
本開示は、CD4結合が強化されたHLAクラスII分子に関する。本開示のある特定の態様は、ベータ鎖を含むHLAクラスII分子に関し、ここで、ベータ鎖は1つ以上の変異を含む。ある特定の態様において、ベータ鎖の1つ以上の変異は、CD4に対するベータ鎖の親和性を強化する。ある特定の態様において、ベータ鎖は、HLA-DQ(「DQ」)ベータ鎖である。
ヒト白血球抗原(HLA)系(ヒトの主要組織適合遺伝子複合体[MHC])は、免疫系の重要な部分であり、第6染色体上の遺伝子によって制御される。これは、抗原ペプチドをT細胞上のT細胞受容体(TCR)に提示することに特化した細胞表面分子をコードしている。(Immune Systemの概要を参照されたい)。抗原(Ag)を提示するMHC分子は、クラスIMHC分子及びクラスIIMHC分子の2つの主要なクラスに分類される。
ある特定の態様において、HLAクラスII分子は、DQベータ鎖を含み、ここで、該DQベータ鎖は、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にロイシン以外のアミノ酸を含む。ロイシン以外の任意のアミノ酸が、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基に存在してもよい。いくつかの態様において、ロイシン以外のアミノ酸は、疎水性側鎖を含むアミノ酸である。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、アラニン、バリン、イソロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンから選択されるアミノ酸である。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、アラニンである。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、バリンである。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、イソロイシンである。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、メチオニンである。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、フェニルアラニンである。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、チロシンである。ある特定の態様において、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、トリプトファンである。
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:09:02、DQB1*06:09:03、DQB1*06:09:04、DQB1*06:09:05、DQB1*06:09:06、DQB1*06:09:07、DQB1*06:09:08、DQB1*06:09:09、DQB1*06:09:10、DQB1*06:10、DQB1*06:100、DQB1*06:101、DQB1*06:102N、DQB1*06:103、DQB1*06:104、DQB1*06:105、DQB1*06:106、DQB1*06:107、DQB1*06:108、DQB1*06:109、DQB1*06:110、DQB1*06:111、DQB1*06:112N、DQB1*06:113、DQB1*06:114、DQB1*06:115、DQB1*06:116、DQB1*06:117、DQB1*06:118:01、DQB1*06:118:02、DQB1*06:118:03、DQB1*06:119、DQB1*06:11:01、DQB1*06:11:02、DQB1*06:11:03、DQB1*06:11:04、DQB1*06:12、DQB1*06:120、DQB1*06:121、DQB1*06:122、DQB1*06:123、DQB1*06:124、DQB1*06:125、DQB1*06:126、DQB1*06:127、DQB1*06:128、DQB1*06:129、DQB1*06:130、DQB1*06:131、DQB1*06:132、DQB1*06:133、DQB1*06:134、DQB1*06:135、DQB1*06:136、DQB1*06:137、DQB1*06:138、DQB1*06:139、DQB1*06:13:01、DQB1*06:13:02、DQB1*06:13:03、DQB1*06:140、DQB1*06:141、DQB1*06:142、DQB1*06:143、DQB1*06:144N、DQB1*06:145、DQB1*06:146:01、DQB1*06:146:02、DQB1*06:147、DQB1*06:148、DQB1*06:149、DQB1*06:14:01、DQB1*06:14:02、DQB1*06:14:03、DQB1*06:150、DQB1*06:151、DQB1*06:152、DQB1*06:153:01、DQB1*06:153:02、DQB1*06:154、DQB1*06:155、DQB1*06:156、DQB1*06:157、DQB1*06:158N、DQB1*06:159、DQB1*06:15:01、DQB1*06:15:02、DQB1*06:16、DQB1*06:160、DQB1*06:161、DQB1*06:162、DQB1*06:163、DQB1*06:164、DQB1*06:165、DQB1*06:166、DQB1*06:167、DQB1*06:168、DQB1*06:169、DQB1*06:17、DQB1*06:170、DQB1*06:171、DQB1*06:172、DQB1*06:173、DQB1*06:174、DQB1*06:175、DQB1*06:176、DQB1*06:177、DQB1*06:178、DQB1*06:179N、DQB1*06:180、DQB1*06:181、DQB1*06:182、DQB1*06:183、DQB1*06:184、DQB1*06:185、DQB1*06:186、DQB1*06:187、DQB1*06:188、DQB1*06:189、DQB1*06:18:01、DQB1*06:18:02、DQB1*06:190:01、DQB1*06:190:02、DQB1*06:191、DQB1*06:192、DQB1*06:193N、DQB1*06:194、DQB1*06:195、DQB1*06:196、DQB1*06:197、DQB1*06:198、DQB1*06:199、DQB1*06:19:01、DQB1*06:19:02、DQB1*06:20、DQB1*06:200、DQB1*06:201、DQB1*06:202、DQB1*06:203、DQB1*06:204、DQB1*06:205、DQB1*06:206:01、DQB1*06:206:02、DQB1*06:207、DQB1*06:208、DQB1*06:209、DQB1*06:21、DQB1*06:210、DQB1*06:211、DQB1*06:212、DQB1*06:213、DQB1*06:214、DQB1*06:215、DQB1*06:216N、DQB1*06:217、DQB1*06:218、DQB1*06:219、DQB1*06:221、DQB1*06:222、DQB1*06:223、DQB1*06:224、DQB1*06:225、DQB1*06:226、DQB1*06:227、DQB1*06:228、DQB1*06:229、DQB1*06:22:01、DQB1*06:22:02、DQB1*06:22:03、DQB1*06:23、DQB1*06:230、DQB1*06:231、DQB1*06:232、DQB1*06:233、DQB1*06:234、DQB1*06:235、DQB1*06:236、DQB1*06:237、DQB1*06:238、DQB1*06:239、DQB1*06:24、DQB1*06:240、DQB1*06:241、DQB1*06:242、DQB1*06:243、DQB1*06:244、DQB1*06:245、DQB1*06:246、DQB1*06:247、DQB1*06:248、DQB1*06:249、DQB1*06:25、DQB1*06:250、DQB1*06:251、DQB1*06:252N、DQB1*06:253、DQB1*06:254、DQB1*06:255、DQB1*06:256、DQB1*06:257、DQB1*06:258、DQB1*06:259、DQB1*06:260、DQB1*06:261、DQB1*06:262、DQB1*06:263、DQB1*06:264、DQB1*06:265、DQB1*06:266、DQB1*06:267、DQB1*06:268、DQB1*06:269、DQB1*06:26N、DQB1*06:270:01、DQB1*06:270:02、DQB1*06:271、DQB1*06:272、DQB1*06:273、DQB1*06:274、DQB1*06:275、DQB1*06:276、DQB1*06:277、DQB1*06:278、DQB1*06:279、DQB1*06:27:01、DQB1*06:27:02、DQB1*06:28、DQB1*06:280、DQB1*06:281、DQB1*06:282、DQB1*06:283、DQB1*06:284、DQB1*06:285、DQB1*06:286、DQB1*06:287、DQB1*06:288、DQB1*06:289、DQB1*06:29、DQB1*06:290、DQB1*06:291、DQB1*06:292、DQB1*06:293、DQB1*06:294、DQB1*06:295、DQB1*06:296、DQB1*06:297、DQB1*06:298、DQB1*06:299、DQB1*06:30、DQB1*06:300、DQB1*06:301、DQB1*06:302、DQB1*06:303N、DQB1*06:304N、DQB1*06:305、DQB1*06:306N、DQB1*06:307、DQB1*06:308N、DQB1*06:309、DQB1*06:31、DQB1*06:310、DQB1*06:311、DQB1*06:312、DQB1*06:313、DQB1*06:314、DQB1*06:315、DQB1*06:316、DQB1*06:317N、DQB1*06:318、DQB1*06:319、DQB1*06:320、DQB1*06:321、DQB1*06:322、DQB1*06:323、DQB1*06:324、DQB1*06:325、DQB1*06:326、DQB1*06:32:01、DQB1*06:32:02、DQB1*06:33、DQB1*06:34、DQB1*06:35、DQB1*06:36、DQB1*06:37、DQB1*06:38、DQB1*06:39、DQB1*06:40、DQB1*06:41、DQB1*06:42、DQB1*06:43、DQB1*06:44、DQB1*06:45、DQB1*06:46、DQB1*06:47、DQB1*06:48:01、DQB1*06:48:02、DQB1*06:49、DQB1*06:50、DQB1*06:51:01、DQB1*06:51:02、DQB1*06:52、DQB1*06:53:01、DQB1*06:53:02、DQB1*06:54N、DQB1*06:55、DQB1*06:56、DQB1*06:57、DQB1*06:58、DQB1*06:59、DQB1*06:60、DQB1*06:61、DQB1*06:62、DQB1*06:63、DQB1*06:64、DQB1*06:65、DQB1*06:66、DQB1*06:67、DQB1*06:68、DQB1*06:69:01、DQB1*06:69:02、DQB1*06:70、DQB1*06:71、DQB1*06:72、DQB1*06:73、DQB1*06:74、DQB1*06:75NX、DQB1*06:76、DQB1*06:77N、DQB1*06:78、DQB1*06:79:01、DQB1*06:79:02、DQB1*06:80、DQB1*06:81、DQB1*06:82、DQB1*06:83、DQB1*06:84、DQB1*06:85、DQB1*06:86、DQB1*06:87、DQB1*06:88、DQB1*06:89、DQB1*06:90、DQB1*06:91、DQB1*06:92:01、DQB1*06:92:02、DQB1*06:93、DQB1*06:94、DQB1*06:95、DQB1*06:96:01、DQB1*06:96:02、DQB1*06:97、DQB1*06:98、DQB1*06:99:01、DQB1*06:99:02、及びこれらの任意の組み合わせから選択される対立遺伝子を含む。
本開示のいくつかの態様において、MHCクラスII分子は、アルファ鎖をさらに含む。いくつかの態様において、アルファ鎖は、野生型アルファ鎖である。いくつかの態様において、アルファ鎖は、DQアルファ鎖である。任意のDQアルファ鎖が、本開示の組成物及び方法で使用されてよい。いくつかの態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*01、HLA-DQA1*02、HLA-DQA1*03、HLA-DQA1*04、HLA-DQA1*05またはHLA-DQA1*06対立遺伝子を含む。ある特定の態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*01対立遺伝子を含む。ある特定の態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*02対立遺伝子を含む。ある特定の態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*03対立遺伝子を含む。ある特定の態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*04対立遺伝子を含む。ある特定の態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*05対立遺伝子を含む。ある特定の態様において、DQアルファ鎖は、HLA-DQA1*06対立遺伝子を含む。
いくつかの態様において、DQベータ鎖及び/またはDQアルファ鎖は、シグナルペプチドをさらに含む。当技術分野で既知の任意のシグナルペプチドが、本明細書にて開示される組成物及び方法で使用されてよい。いくつかの態様において、DQベータ鎖シグナルペプチドは、DQアルファシグナルペプチドと同じである。いくつかの態様において、DQベータ鎖シグナルペプチドは、DQアルファシグナルペプチドとは異なる。
いくつかの態様において、DQベータ鎖及び/またはDQアルファ鎖は、膜貫通ドメインをさらに含む。膜貫通ドメインは、任意の長さ及び任意の起源であってよい。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、少なくとも約1~少なくとも約50個のアミノ酸の長さである。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在する膜貫通ドメインに由来する。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在する膜貫通ドメインを含む。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在するHLA膜貫通ドメインに由来する。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在するHLA膜貫通ドメインを含む。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在するDQベータ鎖膜貫通ドメインに由来する。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在するDQベータ鎖膜貫通ドメインを含む。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在するDQアルファ鎖膜貫通ドメインに由来する。いくつかの態様において、膜貫通ドメインは、天然に存在するDQアルファ鎖膜貫通ドメインを含む。
いくつかの態様において、DQベータ鎖及び/またはDQアルファ鎖は、1つ以上のロイシンジッパー(LZip)配列をさらに含む。当技術分野で既知の任意のLZip配列が、本明細書にて開示される組成物及び方法で使用されてよい。いくつかの態様において、DQベータ鎖及び/またはDQアルファ鎖は、酸性LZip(αLZip)、塩基性LZip(βLZip)、またはその両方を含む。いくつかの態様において、1つ以上のLZip配列は、天然に存在するLZip配列に由来する。いくつかの態様において、1つ以上のLZip配列は、天然に存在するLZip配列を含む。いくつかの態様において、1つ以上のLZip配列は、合成物である。ある特定の態様において、1つ以上のLZip配列は、配列番号4に記載されているLZip配列を含む(表1)。
いくつかの態様において、本開示に有用なDQベータ鎖及び/またはDQアルファ鎖は、リンカーをさらに含む。当技術分野で既知の任意のリンカーが、本明細書にて開示される組成物及び方法で使用されてよい。ある特定の態様において、リンカーは、Gly/Serリンカーを含む。いくつかの態様において、リンカーは、GlySer、Gly2Ser、Gly3Ser、及びGly4Serから選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの態様において、リンカーは、DQアルファ鎖またはDQベータ鎖の細胞外ドメインのN末端に位置する。いくつかの態様において、リンカーは、DQアルファ鎖またはDQベータ鎖の細胞外ドメインのC末端に位置する。いくつかの態様において、リンカーは、DQアルファ鎖またはDQベータ鎖の細胞外ドメインと膜貫通ドメインとの間に位置する。いくつかの態様において、リンカーは、DQアルファ鎖またはDQベータ鎖の細胞外ドメインと1つ以上のLZip配列との間に位置する。いくつかの態様において、リンカーは、DQアルファ鎖またはDQベータ鎖の細胞外ドメインとシグナルペプチドとの間に位置する。
本開示のある特定の態様において、本開示のMHCクラスII分子は、細胞の膜に連結または結合している。ある特定の態様において、MHCクラスII分子のベータ鎖は、細胞の膜に連結または結合している。ある特定の態様において、MHCクラスII分子のアルファ鎖は、細胞の膜に連結または結合している。ある特定の態様において、MHCクラスII分子のアルファ鎖及びベータ鎖は、細胞の膜に連結または結合している。
ある特定の態様において、MHCクラスII分子は、細胞の膜に結合しておらず、例えば、MHCクラスII分子は、可溶性形態である。本発明で使用される場合、可溶性MHCクラスII分子は、本明細書に記載の任意のMHCクラスII分子またはその一部を含み、細胞膜に結合していない。ある特定の態様において、MHCクラスII分子またその一部は、どの膜にも結合していない。いくつかの態様において、MHCクラスII分子またはその一部は、不活性粒子に結合している。いくつかの態様において、MHCクラスII分子またはその一部は、細胞外小胞の膜に結合している。いくつかの態様において、MHCクラスII分子は、人工膜または人工表面、例えばアレイプレートの表面に結合している。
本開示のある特定の態様は、本明細書にて開示されるMHCクラスII分子をコードする核酸分子に関する。いくつかの態様において、核酸分子は、本明細書にて開示されるMHCクラスIIベータ鎖をコードする。ある特定の態様において、MHCクラスIIベータ鎖をコードする核酸分子は、配列番号2に記載されている配列と、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
本開示のある特定の態様は、対象の疾患または病態を治療する方法に関する。いくつかの態様において、本開示は、それを必要とする対象の免疫応答を増強する方法に関する。
本開示のある特定の態様は、がんを治療することを、それを必要とする対象において方法に関し、該方法は、本明細書にて開示されるHLAクラスII分子、本明細書にて開示される核酸分子、本明細書にて開示されるベクター、または本明細書にて開示される細胞を、対象に投与することを含む。
本開示のある特定の態様は、ヒト対象から得たT細胞の標的集団を濃縮する方法に関する。いくつかの態様において、方法は、T細胞を本明細書にて開示されるHLAクラスII分子と接触させることを含む。いくつかの態様において、方法は、T細胞を本明細書にて開示される細胞、例えばAPCと接触させることを含む。いくつかの態様において、接触後、T細胞の濃縮された集団は、接触前にHLAクラスII分子に結合することができるT細胞の数と比較して、HLAクラスII分子に結合することができるT細胞をより多数含む。
細胞
末梢単核細胞は、密度勾配遠心法(Ficoll-Paque PLUS, GE Healthcare Life Sciences, Marlborough, MA)によって得た。K562細胞株は、HLAクラスI/II発現に欠陥のある赤血白血病細胞株である。A375は、黒色腫細胞株である。HEK293T細胞及びA375細胞を、10%FBS及び50μg/mlゲンタマイシンを補充したDMEM(Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA)で増殖させた。K562及びJurkat76細胞株を、10%FBS及び50μg/mlゲンタマイシンを補充したRPMI1640で培養した。
合成ペプチドを、Genscript (Piscataway, NJ)から購入し、DMSOに50μg/mlで溶解した。
フローサイトメトリー解析には、PE複合抗クラスII(9-49(I3)、Beckman Coulter, Brea, CA;Tu39)、APC-Cy7-複合抗CD4(RPA-T4, Biolegend, San Diego, CA)及びPE複合抗Hisタグ(AD1.1.10, Abcam, Cambridge, MA)、の抗体を使用した。死細胞を、LIVE/DEAD Fixable Near-IR Dead Cell Stain Kit 465(Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA)を用いて分類した。染色された細胞を、Canto IIまたはLSRFortessa X-20(BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ)を用いて解析した。細胞選別を、FACS Aria II (BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ)を用いて行った。データ解析を、FlowJoソフトウエア(Tree Star, Ashland, OR)を用いて実施した。
CD3+T細胞及びCD4+T細胞を、Pan T Cell Isolation Kit(Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany)及びCD4+T Cell Isolation Kit(Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany)を用いてそれぞれ精製した。精製したT細胞を、E:T比20:1、200Gyで照射したaAPC/mOKT3によって刺激した。翌日から開始して、連続3日間、1,000×g、32℃で1時間の遠心分離によって、またはRetronectinコーティングプレート(Takara Bio, Shiga, Japan)を用いて、クローニングしたTCR遺伝子を活性化したT細胞にレトロウイルスを介して形質導入した。翌日、100IU/mlのIL-2及び10ng/mlのIL-15を、TCR形質導入済みT細胞に加えた。培養液を2~3日ごとに補充した。
可溶性CD4(sCD4)遺伝子を、GSリンカーによってヒトCD4細胞外ドメインを6xHisタグと融合させることによって生成した。sCD4遺伝子をHEK293T細胞にレトロウイルスを介して形質導入し、sCD4単量体を含有する培養物上澄液を回収した。sCD4を、PE標識抗6xHisタグmAb(AD1.1.10, Abcam, Cambridge, MA)で二量体化し、それを使用した。ヤギ血清の存在下で、室温で30分、HLAクラスII発現K562細胞を二量体化されたsCD4で染色した。種々のクラスII遺伝子を個別に発現するK562由来細胞での表面HLAクラスII発現を、図3A~3Qに示す。
野生型クラスIIα遺伝子の細胞外ドメインを、GGGSリンカーによって酸性ロイシンジッパーと、続いてGSリンカーによって6xHisタグと融合させた(配列番号8を参照)。変異のあるクラスIIβ遺伝子の外部ドメイン(配列番号3を参照)を、GGGSリンカーによって塩基性ロイシンジッパーと連結させた(配列番号4を参照)。HEK293T細胞及びA375細胞に、293GPG細胞ベースのレトロウイルスシステムを使用して、α及びβ遺伝子をトランスフェクトし、10%FBS及び50μg/mlゲンタマイシンを補充したDMEMで培養した。DQ5二量体染色では、可溶性DQ5L114W/V143M+4reps(つまり、L114W/V143Mに加えてN110Q/I116V/S118H/P146N置換(4reps)を有する)タンパク質を安定して分泌するHEK293T細胞及びA375細胞を、コンフルエントになるまで増殖させ、48時間後、培地を回収した。次に、可溶性HLAクラスIIを含有する上澄液を、37℃で20~24時間、100μg/mlの目的のペプチドと混合して、インビトロでペプチド交換を行った。ペプチド交換を行わなかった単量体を対照として使用した。単量体の濃度を、ニッケルコーティングプレート(XPressBio, Frederick, MD)及び抗Hisタグビオチン化mAb(AD1.1.10, R&D Systems, Minneapolis, MN)を用いて、特異的ELISAによって測定した。可溶性HLAクラスII単量体を、染色のために、PE複合抗His mAb(AD1.1.10, Abcam, Cambridge, MA)を用いて2:1のモル比で、4℃で1.5時間かけて二量体化した。
外因性TCR遺伝子を形質導入した初代T細胞を、50nMダサチニブ(LC Laboratories, Woburn, MA)を用いて、37℃で30分間、前処理して、室温で4~5時間、5~15μg/mlのクラスII二量体で染色した。洗浄後、細胞表面分子を、APC-Cy7-複合抗CD4mAbで対比染色した。
統計的解析を、GraphPad Prism 6.0ソフトウエア(GraphPad Software, San Diego, CA)を用いて実施した。2つの標本比較には、対応がない両側スチューデントのt検定を使用した。標本サイズの事前決定には、統計的方法は使用しなかった。研究者は、実験中または結果の評価中の割り当てを理解していた。実験は無作為なものではかった。
親和性が強化されたDQ分子を、L114W/V143M変異を導入することによって生成し、これらの置換が、CD4へのDQ5(DQA1*01:01-DQB1*05:01)などのHLA-DQ分子の結合を改善できるかどうかを測定した。DQB1*05:01は、114及び143に加えて110、116、118及び146の位置に4つの異なるアミノ酸をコードしている。したがって、本発明者らは、L114W/V143Mに加えてN110Q/I116V/S118H/P146N置換(4reps)を有するDQ5L114W/V143M+4repsを発現するK562細胞を生成し(図1A)、sCD4で細胞を染色した。DQ5L114W/V143M+4repsを発現するK562細胞は、CD4結合を強化するが、DQ5L114W/V143M、DQ54reps、または野生型DQ5は、CD4結合を強化しないことが実証された(図1B~1C)。重要なことに、4つの位置のうち1つで単一のアミノ酸反転がある種々のDQ5L114W/V143M+4reps変異体を個別に発現する一連のK562細胞は、強化されたCD4結合能力を欠いていた(図1D)。これらの結果は、観察したDQ5:CD4結合の強化の中でN110Q、I116V、S118H、及びP146Nの4つの追加の置換が、L114W/V143M変異の有効性にとって重要であることを示唆している。
実施例2に記載の変異を有する親和性成熟DQ二量体の能力を、抗原特異的CD4+T細胞を識別する能力に関して評価した。DQ5L114W/V143M+4reps及びDQ6L114W/V143M+3reps二量体は、それぞれDQ5制限DDX3Y特異的TCR(E6)、及びDQ6制限インフルエンザウイルス特異的TCR(DM2)を正常に染色した(図2A~2B)。
野生型DQ5及びDQ5L114W/V143M二量体(表3)、ならびにDQ5L114W/V143M+4reps二量体を生成し、TCR形質導入済みCD4+T細胞へのそれらの染色を比較した。野生型DQ5二量体では、E6形質導入済みCD4+T細胞は検出されなかった。DQ5L114W/V143M二量体は、DQ5L114W/V143M+4reps二量体と比較してE6形質導入済みCD4+T細胞の弱い染色しか示さなかったが、DQ5L114W/V143M+4repsは強固な染色を示した(図4A~4L)。DQ5L114W/V143M+4reps二量体染色を検証するために、本発明者らは、GPC3138-157に特異的なDQ5制限TCR遺伝子を、インビトロでペプチド特異的に増殖させた二量体+CD4+T細胞からクローニングした。ヒトCD4+TCR欠損T細胞でクローン型に再構成された場合、TCRは、同族DQ5L114W/V143M+4reps二量体によって正常に染色され、DQ5制限的及び抗原特異的に機能した(図5A~5G)。
細胞
末梢単核細胞は、密度勾配遠心法によって得た。CD80及びCD83に関連する単一のHLA対立遺伝子として、種々のHLAクラスII遺伝子を個別に発現するK562ベースの人工抗原提示細胞(aAPC)が、これまでに報告されている(Butler, M.O. et al., PLoS One 7, e30229 (2012))。Jurkat76細胞株は、内因性TCR、CD4、及びCD8発現を欠くT細胞白血病細胞株である(Heemskerk, M.H. et al., Blood 102, 3530-3540 (2003)を参照されたい)。Jurkat76/CD4細胞を、ヒトCD4遺伝子をレトロウイルスを介して形質導入することによって生成した。A375細胞は、黒色腫細胞株である。HEK293T細胞及びA375細胞を、10%FBS及び50μg/mlゲンタマイシンを補充したDMEMで増殖させた。Jurkat76細胞株を、10%FBS及び50μg/mlゲンタマイシンを補充したRPMI1640で培養した。
新規のTCR遺伝子を、5’cDNA末端高速増幅(RACE)PCRによってクローニングして、上述したように配列決定した(例えば、Nakatsugawa, M. et al., Sci Rep 6, 23821 (2016)、Nakatsugawa, M. et al., J Immunol 194, 3487-3500 (2015)、及びOchi, T. et al., Cancer Immunol Res 3, 1070-1081 (2015)を参照されたい。これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。全ての遺伝子をpMXレトロウイルスベクターにクローニングし、293GPG及びPG13細胞ベースのレトロウイルスシステムを用いて細胞株に形質導入した(例えば、Hirano, N. et al., Blood 107, 1528-1536 (2006)、Butler, M.O. et al., Clin Cancer Res 13, 1857-1867 (2007)、Hirano, N. et al., Clin Cancer Res 12, 2967-2975 (2006)を参照されたい。これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
フローサイトメトリー解析には、APC-Cy7-複合抗CD4(RPA-T4, Biolegend, San Diego, CA;Wooldridge, L. et al., Eur J Immunol 36, 1847-1855 (2006)を参照)及びPE複合抗Hisタグ(AD1.1.10, ABCAM, Cambridge, MA)、の抗体を使用した。死細胞を、LIVE/DEAD Fixable Aqua Dead Cell Stain Kitを用いて分類した。染色された細胞を、FACSCanto IIまたはLSRFortessa X-20を用いて解析した。細胞選別を、FACSAria IIを用いて行った。データ解析を、FlowJoソフトウエア(バージョン9.9.6)を用いて実施した。
A375細胞に、293GPG細胞ベースのレトロウイルスシステムを使用して、α及びβ遺伝子をトランスフェクトし(例えば、Hirano, N. et al., Blood 107, 1528-1536 (2006)、Butler, M.O. et al., Clin Cancer Res 13, 1857-1867 (2007)、及びHirano, N. et al., Blood 108, 2662-2668 (2006)を参照されたい。これらのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、10%FBS及び50μg/mlゲンタマイシンを補充したDMEMで培養した。48時間後、馴化培地を回収し、濾過(分画分子量(MWCO)10kDa)によって濃縮した。次に、可溶性HLAクラスIIを含有する上澄液を、37℃で20~24時間、100μg/mlの目的のペプチドと混合して、インビトロでペプチド交換を行った。単量体の濃度を、ニッケルコーティングプレート及び抗Hisタグビオチン化mAbを用いて、特異的ELISAによって測定した。可溶性HLAクラスII単量体を、染色向けに、PE複合抗HismAbを用いて2:1のモル比で、4℃で1.5時間かけて二量体化した。
CD4+T細胞を精製して、次いで、10μg/mlのGPC3138-157をパルスし、かつE:T比20:1、200Gyで照射したDQ5発現aAPCによって刺激した。48時間後、10IU/mlのIL-2及び10ng/mlのIL-15を、CD4+T細胞に加えた。IL-2(10IU/ml)及びIL-15(10ng/ml)を補充した培養液を、2~3日ごとに補充した。2週間後、T細胞を、DQ5L114W/V143M+4reps二量体染色に供した。
抗原特異的TCR遺伝子を形質導入した初代CD4+T細胞及びJurkat76/CD4T細胞を、50nMダサチニブを用いて、37℃で30分間、前処理して、室温で4~5時間、5~15μg/mlのクラスII二量体で染色した。洗浄後、細胞表面分子を、APC-Cy7-複合抗CD4mAbで対比染色した。
サイトカインELISPOTアッセイを、以前に報告されたように実施した(例えば、Yamashita, Y. et al., Nat Commun 8, 15244 (2017)、及びAnczurowski, M. et al., Sci Rep 8, 4804 (2018))を参照されたい。そのそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
DQベータ鎖を含むHLAクラスII分子であって、前記DQベータ鎖は、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にロイシン以外のアミノ酸を含む、前記HLAクラスII分子。
(項目2)
DQベータ鎖を含むHLAクラスII分子であって、前記DQベータ鎖は、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基に置換変異を含み、前記置換変異は、ロイシン以外のアミノ酸によるものである、前記HLAクラスII分子。
(項目3)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にバリン以外のアミノ酸をさらに含む、項目1または2に記載のHLAクラスII分子。
(項目4)
DQベータ鎖を含むHLAクラスII分子であって、前記DQベータ鎖は、配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にバリン以外のアミノ酸を含む、前記HLAクラスII分子。
(項目5)
DQベータ鎖を含むHLAクラスII分子であって、前記DQベータ鎖は、配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基に置換変異を含み、前記置換変異は、バリン以外のアミノ酸によるものである、前記HLAクラスII分子。
(項目6)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にロイシン以外のアミノ酸をさらに含む、項目4または5に記載のHLAクラスII分子。
(項目7)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にアスパラギン以外のアミノ酸をさらに含む、項目1~6のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目8)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にイソロイシン以外のアミノ酸をさらに含む、項目1~7のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目9)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にセリン以外のアミノ酸をさらに含む、項目1~8のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目10)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にプロリン以外のアミノ酸をさらに含む、項目1~9のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目11)
前記DQベータ鎖は、
(i)配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にアスパラギン以外のアミノ酸、
(ii)配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にイソロイシン以外のアミノ酸、(iii)配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にセリン以外のアミノ酸、及び、
(iv)配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にプロリン以外のアミノ酸、のうち少なくとも3つをさらに含む、項目1~10のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目12)
前記DQベータ鎖は、
(i)配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にアスパラギン以外のアミノ酸、
(ii)配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にイソロイシン以外のアミノ酸、
(iii)配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にセリン以外のアミノ酸、及び、
(iv)配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にプロリン以外のアミノ酸、をさらに含む、項目1~11のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目13)
前記配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、疎水性側鎖を含む、項目1~3、及び6~12のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目14)
前記配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、アラニン、バリン、イソロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンからなる群から選択される、項目1~3、及び6~13のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目15)
前記配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基のロイシン以外のアミノ酸は、トリプトファンである、項目1~3、及び6~14のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目16)
前記配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基のバリン以外のアミノ酸は、疎水性側鎖を含む、項目4~15のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目17)
前記配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基のバリン以外のアミノ酸は、アラニン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンから選択される、項目4~16のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目18)
前記配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基のバリン以外のアミノ酸は、メチオニンである、項目4~17のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目19)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にアスパラギン以外のアミノ酸を含む、項目7~18のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目20)
前記配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基のアスパラギン以外のアミノ酸は、セリン、スレオニン、及びグルタミンから選択される、項目7~19のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目21)
前記配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基のアスパラギン以外のアミノ酸は、グルタミンである、項目7~20のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目22)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にイソロイシン以外のアミノ酸を含む、項目8~21のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目23)
前記配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基のイソロイシン以外のアミノ酸は、アラニン、バリン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンから選択される、項目8~22のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目24)
前記配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基のイソロイシン以外のアミノ酸は、バリンである、項目8~23のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目25)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にセリン以外のアミノ酸を含む、項目9~24のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目26)
前記配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基のセリン以外のアミノ酸は、アルギニン、ヒスチジン、及びリシンから選択される、項目9~25のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目27)
前記配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基のセリン以外のアミノ酸は、ヒスチジンである、項目9~26のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目28)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にプロリン以外のアミノ酸を含む、項目10~27のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目29)
前記配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基のプロリン以外のアミノ酸は、セリン、スレオニン、アスパラギン及びグルタミンから選択される、項目10~28のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目30)
前記配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基のプロリン以外のアミノ酸は、グルタミンである、項目10~29のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目31)
前記DQベータ鎖は、配列番号1、3、4及び5から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項目1~30のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目32)
前記DQベータ鎖は、配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にトリプトファン、及び配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にメチオニンを含む、項目1~13のいずれか1項に記載のHLA。
(項目33)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、
(a)配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にトリプトファン、
(b)配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にメチオニン、ならびに
(c)
(i)配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、
(ii)配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にバリン、
(iii)配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にヒスチジン、及び
(iv)配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、のうち少なくとも1つを含む、項目1~32のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目34)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、
(a)配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にトリプトファン、
(b)配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にメチオニン、ならびに
(c)
(i)配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、
(ii)配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にバリン、
(iii)配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にヒスチジン、及び
(iv)配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、のうち少なくとも2つを含む、項目1~33のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目35)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、
(a)配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にトリプトファン、
(b)配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にメチオニン、ならびに
(c)
(i)配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、
(ii)配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にバリン、
(iii)配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にヒスチジン、及び
(iv)配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、のうち少なくとも3つを含む、項目1~34のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目36)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、
(a)配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にトリプトファン、
(b)配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にメチオニン、
(c)配列番号1の110位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、
(d)配列番号1の116位に相当するアミノ酸残基にバリン、
(e)配列番号1の118位に相当するアミノ酸残基にヒスチジン、及び
(f)配列番号1の146位に相当するアミノ酸残基にグルタミン、を含む、項目1~35のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目37)
前記DQベータ鎖は、配列番号3に記載されているアミノ酸配列を含む、項目1~36のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目38)
前記DQベータ鎖は、配列番号4に記載されているアミノ酸配列を含む、項目1~37のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目39)
前記HLAクラスII分子の前記ベータ鎖は、DQ2、DQ3、DQ4、DQ5、またはDQ6対立遺伝子を含む、項目1~38のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目40)
前記MHCクラスII分子の前記ベータ鎖は、HLA-DQB1*02、HLA-DQB1*03、HLA-DQB1*04、HLA-DQB1*05、またはHLA-DQB1*06対立遺伝子を含む、項目1~38のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目41)
DQアルファ鎖をさらに含む、項目1~40のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目42)
前記MHCクラスII分子の前記アルファ鎖は、HLA-DQA1*01、HLA-DQA1*02、HLA-DQA1*03、HLA-DQA1*04、HLA-DQA1*05またはHLA-DQA1*06対立遺伝子を含む、項目41に記載のHLAクラスII分子。
(項目43)
前記DQアルファ鎖は、配列番号6または8に対して少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項目41または42に記載のHLAクラスII分子。
(項目44)
前記DQアルファ鎖は、配列番号6または8に記載されているアミノ酸配列を含む、項目43に記載のHLAクラスII分子。
(項目45)
前記DQベータ鎖は、参照HLAクラスII分子と比較してCD4タンパク質に対する親和性が高く、前記参照HLAクラスII分子は、(i)配列番号1の114位に相当するアミノ酸残基にロイシン、及び/または(ii)配列番号1の143位に相当するアミノ酸残基にバリンを含むDQベータ鎖を含む、項目1~44のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目46)
前記親和性は、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約3倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、少なくとも約6倍、少なくとも約7倍、少なくとも約8倍、少なくとも約9倍、少なくとも約10倍、少なくとも約15倍、少なくとも約20倍、少なくとも約25倍、少なくとも約30倍、少なくとも約35倍、少なくとも約40倍、少なくとも約45倍、少なくとも約50倍、少なくとも約75倍、少なくとも約100倍、少なくとも約200倍、少なくとも約300倍、少なくとも約400倍、少なくとも約500倍、または少なくとも約1000倍高い、項目45に記載のHLAクラスII分子。
(項目47)
前記DQベータ鎖は、細胞の膜に結合している、項目1~46のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目48)
前記DQベータ鎖は、細胞の膜に結合していない、項目1~46のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目49)
前記DQベータ鎖は、完全長DQアルファ鎖の細胞外ドメインを含む、項目1~46のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目50)
前記DQベータ鎖は、完全長DQベータ鎖の膜貫通ドメインを含まない、項目49に記載のHLAクラスII分子。
(項目51)
前記DQアルファ鎖は、細胞の膜に結合している、項目41~50のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目52)
前記DQアルファ鎖は、細胞の膜に結合していない、項目41~50のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目53)
前記DQアルファ鎖は、完全長DQアルファ鎖の細胞外ドメインを含む、項目41~50のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目54)
前記DQアルファ鎖は、完全長DQアルファ鎖の膜貫通ドメインを含まない、項目53に記載のHLAクラスII分子。
(項目55)
前記DQベータ鎖は、不活性粒子に連結または結合している、項目48~54のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目56)
前記不活性粒子は、ビーズである、項目55に記載のHLAクラスII分子。
(項目57)
前記不活性粒子は、ナノ粒子である、項目55に記載のHLAクラスII分子。
(項目58)
前記ナノ粒子は、ペグ化酸化鉄、キトサン、デキストラン、ゼラチン、アルギナート、リポソーム、澱粉、分枝ポリマー、炭素ベース担体、ポリ乳酸、ポリ(シアノ)アクリレート、ポリエチルエイネミン(polyethyleinemine)、ブロックコポリマー、ポリカプロラクトン、SPIONS、USPIONS、Cd/Zn-セレン化物、またはシリカナノ粒子から選択される、項目57に記載のHLAクラスII分子。
(項目59)
前記ナノ粒子は、ペグ化酸化鉄ナノ粒子である、項目57または58に記載のHLAクラスII分子。
(項目60)
前記DQベータ鎖は、シグナルペプチドを含む、項目1~59のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目61)
前記DQアルファ鎖は、シグナルペプチドを含む、項目41~60のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目62)
前記シグナルペプチドは、配列番号9に記載されているアミノ酸配列を含む、項目60または61に記載のHLAクラスII分子。
(項目63)
項目1~62のいずれか1項に記載のDQベータ鎖をコードする、核酸分子。
(項目64)
項目41~63のいずれか1項に記載のDQアルファ鎖をさらにコードする、項目63に記載の核酸分子。
(項目65)
配列番号2に対して少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、項目63または64に記載の核酸分子。
(項目66)
項目63~65のいずれか1項に記載の核酸分子を含む、ベクター。
(項目67)
項目1~62のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子、項目63~65のいずれか1項に記載の核酸分子、または項目66に記載のベクターを含む、細胞。
(項目68)
哺乳動物細胞または昆虫細胞である、項目67に記載の細胞。
(項目69)
K562細胞、T2、HEK293、HEK293T、A375、SK-MEL-28、Me275、COS、線維芽細胞、腫瘍細胞、またはこれらの任意の組み合わせから選択される、項目67または68に記載の細胞。
(項目70)
内因性MHCクラスIIDQベータ鎖発現を欠いている、項目67~69のいずれか1項に記載の細胞。
(項目71)
内因性MHCクラスIIDQアルファ鎖発現を欠いている、項目67~70のいずれか1項に記載の細胞。
(項目72)
MHCクラスII複合体のエピトープと結合することができるT細胞受容体を識別する方法であって、項目67~71のいずれか1項に記載の細胞に前記エピトープを含む1つ以上のペプチドをパルスすることと、1つ以上のCD4 + T細胞を前記APCで刺激することと、を含む、前記方法。
(項目73)
疾患または病態を治療することを、それを必要とする対象において行う方法であって、項目1~62のいずれか1項に記載のMHCクラスII分子を前記対象に投与することを含む、前記方法。
(項目74)
前記疾患または病態は、がんまたは感染である、項目73に記載の方法。
(項目75)
前記がんは、黒色腫、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭頸部癌、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、胃癌、子宮癌、肺癌、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(NHL)、食道癌、小腸癌、尿道癌、慢性または急性白血病、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、急性リンパ芽球性白血病(ALL)(非T細胞ALLを含む)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、膀胱癌、腎臓または尿管癌、腎盤癌、神経膠腫、扁平上皮癌、及び上記がんの組み合わせ、からなる群から選択される、項目74に記載の方法。
(項目76)
前記がんは、再発性または難治性である、項目74または75に記載の方法。
(項目77)
前記がんは、局所的に進行性である、項目74~76のいずれか1項に記載の方法。
(項目78)
前記がんは、進行性である、項目74~77のいずれか1項に記載の方法。
(項目79)
前記がんは、転移性である、項目74~78のいずれか1項に記載の方法。
(項目80)
約100μM未満のK D でCD4と結合する、項目1~62のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目81)
約10μM未満のK D でCD4と結合する、項目1~62のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目82)
約8.9μM以下のK D でCD4と結合する、項目1~62のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。
(項目83)
項目1~62及び80~82のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子、ならびにペプチドを含む複合体であって、前記ペプチドは、DDX3Y 171-190 、HA 255-270 、GPC3 138-157 、またはこれらの任意の組み合わせを含む、前記複合体。
Claims (7)
- 配列番号3に記載されているアミノ酸配列を含むDQベータ鎖の細胞外ドメインを含む、HLAクラスII分子。
- 前記DQベータ鎖の前記細胞外ドメインは、配列番号4に記載されているアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のHLAクラスII分子。
- DQアルファ鎖をさらに含む、請求項1または2に記載のHLAクラスII分子。
- 前記DQアルファ鎖は、配列番号6に記載されているアミノ酸配列を含む、請求項3に記載のHLAクラスII分子。
- 前記DQアルファ鎖は、配列番号8に記載されているアミノ酸配列を含む、請求項3に記載のHLAクラスII分子。
- (a)前記DQベータ鎖は、細胞の膜に結合している、
(b)前記DQベータ鎖は、完全長DQアルファ鎖の細胞外ドメインを含む、
(c)前記DQベータ鎖は、不活性粒子に連結または結合している、
(d)前記DQベータ鎖は、シグナルペプチドを含む、
(e)前記HLAクラスII分子が、細胞の膜に結合しているDQアルファ鎖をさらに含む、
または
(f)(a)~(e)の任意の組み合わせである、
請求項1~5のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子。 - 請求項1~6のいずれか1項に記載のHLAクラスII分子、ならびにペプチドを含む複合体であって、前記ペプチドは、DDX3Y171-190、HA255-270、GPC3138-157、またはこれらの任意の組み合わせを含む、前記複合体。
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