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JP7823448B2 - Method for stabilizing adeno-associated virus binding proteins - Google Patents
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JP7823448B2 - Method for stabilizing adeno-associated virus binding proteins - Google Patents

Method for stabilizing adeno-associated virus binding proteins

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JP7823448B2 JP2022043221A JP2022043221A JP7823448B2 JP 7823448 B2 JP7823448 B2 JP 7823448B2 JP 2022043221 A JP2022043221 A JP 2022043221A JP 2022043221 A JP2022043221 A JP 2022043221A JP 7823448 B2 JP7823448 B2 JP 7823448B2
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Description

本発明は、アデノ随伴ウイルス(AAV)結合性タンパク質を安定化させる方法に関する。特に本発明は、AAV結合性タンパク質の熱に対する安定性を向上させる方法に関する。 The present invention relates to a method for stabilizing an adeno-associated virus (AAV) binding protein. In particular, the present invention relates to a method for improving the heat stability of an AAV binding protein.

アデノ随伴ウイルス(AAV)はパルボウイルス科(Parvoviridae)、ディペンドウイルス属(Dependovirus)に分類される非エンベロープウイルスである。AAV外殻粒子は3種類のタンパク質(VP1、VP2およびVP3)で構成されており、約60のタンパク質分子がおよそVP1:VP2:VP3=1:1:10の比率で混在し集合することで、直径20nmから30nmの正二十面体の形状をしている。 Adeno-associated virus (AAV) is a non-enveloped virus classified in the Parvoviridae family and Dependovirus genus. AAV envelope particles are composed of three types of proteins (VP1, VP2, and VP3), and are formed by the assembly of approximately 60 protein molecules in a ratio of VP1:VP2:VP3 = 1:1:10, resulting in a regular icosahedral shape with a diameter of 20 to 30 nm.

自然界でのAAVは自立性の増殖能を欠き、複製はアデノウイルスやヘルペスウイルスなどのヘルパーウイルスに依存する。前記ヘルパーウイルスが存在すると、AAVゲノムは宿主細胞内で複製され、AAVゲノムを含む完全なAAV粒子が形成され、宿主細胞からAAV粒子が放出される。一方、前記ヘルパーウイルスが存在しない場合、AAVゲノムはエピソームに維持された状態または宿主染色体に組込まれた状態(潜伏状態)となる。 In nature, AAV lacks the ability to replicate autonomously and depends on helper viruses such as adenovirus and herpesvirus for replication. In the presence of the helper virus, the AAV genome replicates within the host cell, forming complete AAV particles containing the AAV genome, which are then released from the host cell. On the other hand, in the absence of the helper virus, the AAV genome is maintained episomally or integrated into the host chromosome (latent state).

AAVはヒトを含む広範な種の細胞に感染可能で、血球、筋、神経細胞などの分化を終えた非分裂細胞にも感染すること、ヒトに対する病原性がないため副作用の心配が低いこと、ウイルス粒子が物理化学的に安定であること、などから、先天性遺伝子疾患の治療を目的とした遺伝子導入用のベクターとしての利用価値が注目されている。 AAV is capable of infecting cells from a wide range of species, including humans, and can also infect non-dividing cells that have completed differentiation, such as blood cells, muscle, and nerve cells. It is also non-pathogenic to humans, meaning there is little risk of side effects. Furthermore, the viral particles are physicochemically stable. For these reasons, AAV is attracting attention as a potential vector for gene transfer aimed at treating congenital genetic diseases.

遺伝子組換えAAVベクター(以下、単にAAVベクターとも表記)の製造は、通常、AAV粒子形成に必須な要素をコードする核酸を細胞に導入することで、AAVを産生する能力を有する細胞(以下、AAV産生細胞とも表記)を作製し、当該細胞を培養してAAV粒子形成に必須な要素を発現させることで行なう。製造したAAVベクターはAAV産生細胞から回収精製し、治療用AAVベクター製剤を得る。 Recombinant AAV vectors (hereinafter simply referred to as AAV vectors) are typically produced by introducing nucleic acids encoding elements essential for AAV particle formation into cells to produce cells capable of producing AAV (hereinafter also referred to as AAV-producing cells), and then culturing these cells to express the elements essential for AAV particle formation. The produced AAV vector is recovered and purified from the AAV-producing cells to obtain a therapeutic AAV vector preparation.

AAVベクターの回収精製方法として、不溶性担体と当該担体に固定化したAAV結合性タンパク質とを含む吸着剤を用いた、AAVとの結合親和性に基づくアフィニティクロマトグラフィによる方法があり、夾雑物質が共存したAAVベクターを含む試料から当該ベクターを回収精製できる(特許文献1)。しかしながら、特許文献1に記載の方法でAAVベクターを大量に回収精製しようとした場合、吸着剤のリガンドタンパク質として用いる、AAV結合性タンパク質の安定性に問題があった。 One method for recovering and purifying AAV vectors is an affinity chromatography method based on the binding affinity with AAV, which uses an adsorbent comprising an insoluble carrier and an AAV-binding protein immobilized on the carrier. This method makes it possible to recover and purify AAV vectors from samples containing AAV vectors that are coexistent with contaminants (Patent Document 1). However, when attempting to recover and purify AAV vectors in large quantities using the method described in Patent Document 1, there was a problem with the stability of the AAV-binding protein used as the ligand protein for the adsorbent.

WO2021/106882号WO2021/106882

本発明の目的は、アデノ随伴ウイルス結合性タンパク質の安定性、特に熱に対する安定性を向上させる方法を提供することである。 An object of the present invention is to provide a method for improving the stability, particularly heat stability, of adeno-associated virus binding proteins.

本発明者らは、上記課題を解決するため、鋭意検討した結果、アデノ随伴ウイルス(AAV)結合性タンパク質を含む溶液にカルシウムイオンを添加することで、前記課題を解決できることを見出し、本発明の完成に至った。 The inventors conducted extensive research to solve the above-mentioned problems, and discovered that the problem could be solved by adding calcium ions to a solution containing an adeno-associated virus (AAV) binding protein, leading to the completion of the present invention.

すなわち本発明は、以下の態様を包含する:
[1]AAV結合性タンパク質の熱に対する安定性を向上させる方法であって、前記タンパク質を含む溶液にカルシウムイオンをさらに添加する、前記方法。
That is, the present invention includes the following aspects:
[1] A method for improving the heat stability of an AAV binding protein, the method comprising further adding calcium ions to a solution containing the protein.

[2]AAV結合性タンパク質が、以下の(i)から(iii)のいずれかから選択されるポリペプチドである、[1]に記載の方法;
(i)配列番号1に記載のアミノ酸配列のうち312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含むポリペプチド、
(ii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基において、1もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を有し、かつAAV結合活性を有するポリペプチド、
(iii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基からなるアミノ酸配列に対して70%以上の相同性を有し、かつAAV結合活性を有するポリペプチド。
[2] The method according to [1], wherein the AAV-binding protein is a polypeptide selected from any one of the following (i) to (iii):
(i) a polypeptide containing at least the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1;
(ii) A polypeptide having an amino acid sequence comprising at least the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, with the proviso that the amino acid sequence from position 312 to position 500 contains substitution, deletion, insertion, or addition of one or several amino acid residues at one or several positions, and having AAV-binding activity;
(iii) A polypeptide comprising at least the amino acid residues from the serine at position 312 to the aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, wherein the polypeptide has 70% or more homology to the amino acid sequence consisting of the amino acid residues at positions 312 to 500, and has AAV-binding activity.

以下、本発明について詳細に説明する。 The present invention is described in detail below.

本発明においてAAVは、自然界に存在するAAVであってもよいし、人工的に作製されたAAVでもよい。自然界に存在するAAVの例として、血清型1(AAV1)、血清型2(AAV2)、血清型3(AAV3)、血清型4(AAV4)、血清型5(AAV5)、血清型6(AAV6)、血清型7(AAV7)、血清型8(AAV8)、血清型9(AAV9)、血清型10(AAV10)、血清型11(AAV11)、血清型12(AAV12)、血清型13(AAV13)があげられる。また人工的に作製されたAAVとしては、AAVrh8、AAVrh10や、これら血清型のうち二以上の特徴(細胞指向性や感染能)を有したキメラAAVがあげられる。 In the present invention, the AAV may be a naturally occurring AAV or an artificially produced AAV. Examples of naturally occurring AAV include serotype 1 (AAV1), serotype 2 (AAV2), serotype 3 (AAV3), serotype 4 (AAV4), serotype 5 (AAV5), serotype 6 (AAV6), serotype 7 (AAV7), serotype 8 (AAV8), serotype 9 (AAV9), serotype 10 (AAV10), serotype 11 (AAV11), serotype 12 (AAV12), and serotype 13 (AAV13). Artificially produced AAV include AAVrh8, AAVrhlO, and chimeric AAVs that share characteristics (cell tropism and infectivity) of two or more of these serotypes.

本発明においてAAV結合性タンパク質は、AAVと結合可能なポリペプチドであれば特に制限はなく、インテグリンなどのラミニン受容体、抗AAV抗体やAAV受容体(AAVR)が例示できる。AAV結合性タンパク質がAAVRである場合の好ましい態様として、以下の(i)から(iii)のいずれかに示すポリペプチドがあげられる。
(i)配列番号1に記載のアミノ酸配列のうち312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含むポリペプチド、
(ii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基において、1もしくは数個の位置での1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含むアミノ酸配列を有し、かつAAV結合活性を有するポリペプチド、
(iii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基からなるアミノ酸配列に対して70%以上の相同性を有し、かつAAV結合活性を有するポリペプチド。
In the present invention, the AAV-binding protein is not particularly limited as long as it is a polypeptide capable of binding to AAV, and examples thereof include laminin receptors such as integrins, anti-AAV antibodies, and AAV receptors (AAVRs). When the AAV-binding protein is an AAVR, preferred embodiments include polypeptides shown in any of (i) to (iii) below.
(i) a polypeptide containing at least the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1;
(ii) A polypeptide having an amino acid sequence comprising at least the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, with the proviso that the amino acid sequence from position 312 to position 500 contains substitution, deletion, insertion, or addition of one or several amino acid residues at one or several positions, and having AAV-binding activity;
(iii) A polypeptide comprising at least the amino acid residues from the serine at position 312 to the aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, wherein the polypeptide has 70% or more homology to the amino acid sequence consisting of the amino acid residues at positions 312 to 500, and has AAV-binding activity.

なお配列番号1に記載のアミノ酸配列は、AAVRの一態様であるKIAA0319L(公式データベース:UniProt、アクセッションナンバー:Q8IZA0)のアミノ酸配列であり、配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリン(Ser)から500番目のアスパラギン酸(Asp)までのアミノ酸残基は、KIAA0319Lの細胞外領域ドメイン1(PKD1)およびドメイン2(PKD2)に相当する領域である。 The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 is the amino acid sequence of KIAA0319L (official database: UniProt, accession number: Q8IZA0), which is one embodiment of AAVR, and the amino acid residues from serine (Ser) at position 312 to aspartic acid (Asp) at position 500 in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 correspond to the extracellular domain 1 (PKD1) and domain 2 (PKD2) of KIAA0319L.

前記(i)から(iii)のいずれかに示すポリペプチドは、前述したKIAA0319LのPKD1およびPKD2に相当する領域を少なくとも含んでいればよく、例えば、PKD2のC末端側にある他の細胞外領域ドメイン(ドメイン3(PKD3)、ドメイン4(PKD4)およびドメイン5(PKD5))に相当する領域の全てまたは一部を含んでもよいし、PKD1のN末端側にあるMANSC(Motif At N terminus with Seven Cysteines)ドメインなどのシグナル配列に相当する領域やシステインリッチな領域の全てまたは一部を含んでもよいし、細胞外領域のN末端側および/またはC末端側にある膜貫通領域ならびに細胞内領域の全てまたは一部を含んでもよい。 A polypeptide described in any of (i) to (iii) above may contain at least the regions corresponding to the aforementioned PKD1 and PKD2 of KIAA0319L. For example, it may contain all or part of the regions corresponding to other extracellular domains (domain 3 (PKD3), domain 4 (PKD4), and domain 5 (PKD5)) located on the C-terminal side of PKD2; it may contain all or part of a region corresponding to a signal sequence or a cysteine-rich region, such as the MANSC (Motif At N terminus with Seven Cysteines) domain located on the N-terminal side of PKD1; or it may contain all or part of a transmembrane region and an intracellular region located on the N-terminal and/or C-terminal side of the extracellular region.

前記(ii)の一例として、配列番号2に記載のアミノ酸配列のうち25番目のセリンから213番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含むポリペプチドや、WO2021/106882号で開示のAAV結合性タンパク質、があげられる。また前記(ii)に記載の置換、欠失、挿入、または付加の例として、WO2021/106882号で開示しているアミノ酸残基の置換があげられる。 An example of (ii) above is a polypeptide containing at least the amino acid residues from serine at position 25 to aspartic acid at position 213 in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, and the AAV-binding protein disclosed in WO2021/106882. An example of the substitution, deletion, insertion, or addition described in (ii) above is the amino acid residue substitution disclosed in WO2021/106882.

前記(ii)における、「1もしくは数個」とは、AAVRの立体構造におけるアミノ酸置換の位置やアミノ酸残基の種類によっても異なるが、一例として、1個以上50個以下、1個以上30個以下、1個以上20個以下、1個以上10個以下、1個以上9個以下、1個以上8個以下、1個以上7個以下、1個以上6個以下、1個以上5個以下、1個以上4個以下、1個以上3個以下、1個以上2個以下、1個のいずれかを意味する。「1もしくは数個」のアミノ酸残基の置換は、例えば、AAV結合活性を有する限り、WO2021/106882号で開示のアミノ酸残基の置換以外の位置に生じてよい。 In (ii) above, "one or several" refers to any of the following: 1 to 50, 1 to 30, 1 to 20, 1 to 10, 1 to 9, 1 to 8, 1 to 7, 1 to 6, 1 to 5, 1 to 4, 1 to 3, 1 to 2, or 1 amino acid residue, depending on the position of the amino acid substitution in the three-dimensional structure of the AAVR and the type of amino acid residue. For example, the substitution of "one or several" amino acid residues may occur at positions other than those disclosed in WO2021/106882, as long as the resulting product has AAV-binding activity.

なお前記(ii)における「1もしくは数個のアミノ酸残基の置換」には、前述した特定位置におけるアミノ酸置換の他に、物理的性質および/または化学的性質が類似したアミノ酸間で置換が生じる保守的置換が生じてもよい。保守的置換は、一般に、置換が生じているものと置換が生じていないものとの間でタンパク質の機能が維持されることが当業者において知られている。保守的置換の一例としては、グリシンとアラニン間、セリンとプロリン間、またはグルタミン酸とアラニン間での置換があげられる(タンパク質の構造と機能,メディカル・サイエンス・インターナショナル社、9、2005)。また前記(ii)における「1もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加」には、AAVRの由来の違いや、種の違いなどに基づく、天然にも存在する変異(mutantまたはvariant)も含まれる。 The "substitution of one or several amino acid residues" in (ii) above may include not only amino acid substitutions at specific positions as described above, but also conservative substitutions between amino acids with similar physical and/or chemical properties. Conservative substitutions generally maintain protein function between substituted and unsubstituted amino acids, as known to those skilled in the art. Examples of conservative substitutions include substitutions between glycine and alanine, between serine and proline, or between glutamic acid and alanine (Protein Structure and Function, Medical Science International, 9, 2005). Furthermore, the "substitution, deletion, insertion, or addition of one or several amino acid residues" in (ii) above also includes naturally occurring mutations (mutants or variants) based on differences in the origin of AAVR or differences in species.

前記(iii)におけるアミノ酸配列の相同性は70%以上あればよく、それ以上の相同性(例えば、80%以上、85%以上、90%以上または95%以上)を有してもよい。なお本明細書において「相同性」とは、類似性(similarity)または同一性(identity)を意味してよく、特に同一性を意味してもよい。「アミノ酸配列の相同性」とは、アミノ酸配列全体に対する相同性を意味する。アミノ酸配列間の「同一性」とは、それらアミノ酸配列における種類が同一であるアミノ酸残基の比率を意味する(実験医学、31(3)、羊土社)。アミノ酸配列間の「類似性」とは、それらアミノ酸配列における種類が同一であるアミノ酸残基の比率と側鎖の性質が類似したアミノ酸残基の比率の合計を意味する(実験医学、31(3)、羊土社)。アミノ酸配列の相同性は、BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)やFASTA等のアラインメントプログラム(alignment program)を利用して決定できる。 The homology of the amino acid sequences in (iii) above may be 70% or greater, and may be even greater (e.g., 80% or greater, 85% or greater, 90% or greater, or 95% or greater). As used herein, "homology" may refer to similarity or identity, and may specifically refer to identity. "Amino acid sequence homology" refers to homology across the entire amino acid sequence. "Identity" between amino acid sequences refers to the proportion of amino acid residues of the same type in those amino acid sequences (Experimental Medicine, 31(3), Yodosha). "Similarity" between amino acid sequences refers to the sum of the proportion of amino acid residues of the same type and the proportion of amino acid residues with similar side chain properties in those amino acid sequences (Experimental Medicine, 31(3), Yodosha). Amino acid sequence homology can be determined using alignment programs such as BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) and FASTA.

本発明は、AAV結合性タンパク質を含む溶液にカルシウムイオンをさらに添加することで、前記タンパク質の熱に対する安定性を向上させることを特徴としている。カルシウムイオンの添加量は、終濃度で0.03mM以上100mM以下とすると好ましく、終濃度0.3mM以上70mM以下とするとより好ましく、3mM以上30mM以下とするとさらに好ましい。カルシウムイオンの添加は、例えば水溶性のカルシウム塩を添加して行なえばよい。水溶性のカルシウム塩の一例として塩化カルシウムや硝酸カルシウムがあげられる。 The present invention is characterized by improving the heat stability of an AAV-binding protein by further adding calcium ions to the solution containing the protein. The amount of calcium ions added is preferably 0.03 mM to 100 mM in final concentration, more preferably 0.3 mM to 70 mM in final concentration, and even more preferably 3 mM to 30 mM in final concentration. Calcium ions can be added, for example, by adding a water-soluble calcium salt. Examples of water-soluble calcium salts include calcium chloride and calcium nitrate.

本発明は、アデノ随伴ウイルス(AAV)結合性タンパク質を含む溶液にカルシウムイオンをさらに添加することで、当該タンパク質の熱に対する安定性を向上させることを特徴としている。本発明で安定化したAAV結合性タンパク質を用いて、AAVを含む溶液から、当該AAVとの結合親和性に基づく分離を行なうことで、AAVの大量回収および精製が可能となる。 The present invention is characterized by improving the heat stability of an adeno-associated virus (AAV)-binding protein by further adding calcium ions to the solution containing the protein. Using the AAV-binding protein stabilized by the present invention, separation based on binding affinity with AAV from a solution containing AAV becomes possible, enabling the large-scale recovery and purification of AAV.

金属イオンの添加による、アデノ随伴ウイルス(AAV)結合性タンパク質の耐熱性をOptim 2(商品名)により評価した結果である。(a)はカルシウムイオンを添加したとき(実施例3)の、(b)はマグネシウムイオンを添加したとき(比較例1)の、それぞれ結果である。1 shows the results of evaluating the heat resistance of an adeno-associated virus (AAV) binding protein with the addition of metal ions using Optim 2 (trade name). (a) shows the results when calcium ions were added (Example 3), and (b) shows the results when magnesium ions were added (Comparative Example 1). カルシウムイオンの添加による、AAVとAAV結合性タンパク質との結合親和性の変化をELISA法で測定した結果である。This shows the results of measuring the change in binding affinity between AAV and AAV-binding protein due to the addition of calcium ions by ELISA.

以下、実施例および比較例を用いて本発明を詳細に説明するが、本発明はこれら例に限定されるものではない。また参考例は本発明を構成しない。 The present invention will be explained in detail below using examples and comparative examples, but the present invention is not limited to these examples. Furthermore, the Reference Examples do not constitute the present invention.

実施例1 AAV結合性タンパク質の調製
(1)配列番号2に記載のアミノ酸配列からなる、AAV結合性タンパク質AVR10sを含むポリペプチド、をコードするポリヌクレオチド(配列番号3)を含むプラスミドpET-AVR10sで大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し得られた、AVR10sを発現可能な形質転換体を50μg/mLのカナマイシンを含む3mLの2YT液体培地に接種し、37℃で一晩、好気的に振とう培養することで前培養を行なった。なお配列番号2において、1番目のメチオニン(Met)から22番目のアラニン(Ala)までがPelBシグナルペプチドであり、25番目のセリン(Ser)から213番目のアスパラギン酸(Asp)までがAAV結合性タンパク質AVR10sであり、220番目のシステイン(Cys)から226番目のグリシン(Gly)までが固定化用のタグであるシステインタグ配列である。またAVR10sは、KIAA0319L(配列番号1)の細胞外ドメイン1およびドメイン2に相当する領域である、配列番号1の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基に対して、以下の(I)から(X)に示すアミノ酸置換が生じたポリペプチドである。
(I)配列番号1の317番目(配列番号2では30番目)のバリンがアスパラギン酸に置換
(II)配列番号1の342番目(配列番号2では55番目)のチロシンがセリンに置換
(III)配列番号1の362番目(配列番号2では75番目)のリジンがグルタミン酸に置換
(IV)配列番号1の371番目(配列番号2では84番目)のリジンがアスパラギンに置換
(V)配列番号1の381番目(配列番号2では94番目)のバリンがアラニンに置換
(VI)配列番号1の382番目(配列番号2では95番目)のイソロイシンがバリンに置換
(VII)配列番号1の390番目(配列番号2では103番目)のグリシンがセリンに置換
(VIII)配列番号1の399番目(配列番号2では112番目)のリジンがグルタミン酸に置換
(IX)配列番号1の476番目(配列番号2では189番目)のセリンがアルギニンに置換
(X)配列番号1の487番目(配列番号2では200番目)のアスパラギンがアスパラギン酸に置換
(2)1Lのバッフルフラスコに50μg/mLのカナマイシンを添加した200mLの2YT液体培地に(1)の前培養液を2mL接種し、37℃で好気的に振とう培養を行なった。
Example 1 Preparation of AAV-binding protein (1) Escherichia coli BL21(DE3) strain was transformed with plasmid pET-AVR10s containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 3) encoding a polypeptide comprising the AAV-binding protein AVR10s consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2. The resulting transformant capable of expressing AVR10s was inoculated into 3 mL of 2YT liquid medium containing 50 μg/mL kanamycin and precultured overnight at 37° C. with shaking under aerobic conditions. In SEQ ID NO: 2, the PelB signal peptide is located from methionine (Met) at position 1 to alanine (Ala) at position 22, the AAV-binding protein AVR10s is located from serine (Ser) at position 25 to aspartic acid (Asp) at position 213, and the cysteine tag sequence, which is a tag for immobilization, is located from cysteine (Cys) at position 220 to glycine (Gly) at position 226. AVR10s is a polypeptide in which the amino acid substitutions shown in (I) to (X) below have occurred in the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 of SEQ ID NO: 1, which is the region corresponding to extracellular domain 1 and domain 2 of KIAA0319L (SEQ ID NO: 1).
(I) Valine at position 317 of SEQ ID NO: 1 (position 30 in SEQ ID NO: 2) is substituted with aspartic acid. (II) Tyrosine at position 342 of SEQ ID NO: 1 (position 55 in SEQ ID NO: 2) is substituted with serine. (III) Lysine at position 362 of SEQ ID NO: 1 (position 75 in SEQ ID NO: 2) is substituted with glutamic acid. (IV) Lysine at position 371 of SEQ ID NO: 1 (position 84 in SEQ ID NO: 2) is substituted with asparagine. (V) Valine at position 381 of SEQ ID NO: 1 (position 94 in SEQ ID NO: 2) is substituted with alanine. (VI) (VII) Substitution of glycine at position 390 of SEQ ID NO: 1 (position 103 of SEQ ID NO: 2) with serine; (VIII) Substitution of lysine at position 399 of SEQ ID NO: 1 (position 112 of SEQ ID NO: 2) with glutamic acid; (IX) Substitution of serine at position 476 of SEQ ID NO: 1 (position 189 of SEQ ID NO: 2) with arginine; (X) Substitution of asparagine at position 487 of SEQ ID NO: 1 (position 200 of SEQ ID NO: 2) with aspartic acid. (2) 2 mL of the preculture solution from (1) was inoculated into 200 mL of 2YT liquid medium supplemented with 50 μg/mL kanamycin in a 1 L baffled flask, and the mixture was aerobically cultured at 37°C with shaking.

(3)培養開始2.0時間後、氷上にて冷却し、終濃度0.1mMとなるようIPTG(IsoPropyl-β-D-ThioGalactopyranoside)を添加後、引き続き37℃で3時間、好気的に振とう培養した。 (3) 2.0 hours after the start of cultivation, the medium was cooled on ice, IPTG (IsoPropyl-β-D-ThioGalactopyranoside) was added to a final concentration of 0.1 mM, and the medium was then cultured aerobically with shaking at 37°C for 3 hours.

(4)培養終了後、培養液を4℃、8000rpmで20分間遠心分離することで菌体を回収した。 (4) After the cultivation was completed, the culture medium was centrifuged at 4°C and 8,000 rpm for 20 minutes to collect the bacterial cells.

(5)(4)で回収した菌体を150mMの塩化ナトリウムおよび20mMのイミダゾールを含む20mMのトリス塩酸緩衝液(pH7.4)(以下、「緩衝液A」とも表記)に5mL/1g(菌体)となるように懸濁後、超音波発生装置(インソネーター201M[久保田商事社製])を用いて、8℃で約10分間、約150Wの出力で菌体を破砕した。菌体破砕液は4℃で20分間、8000rpmの遠心分離を2回行ない、上清を回収した。 (5) The bacterial cells recovered in (4) were suspended in 20 mM Tris-HCl buffer (pH 7.4) containing 150 mM sodium chloride and 20 mM imidazole (hereinafter also referred to as "Buffer A") at a concentration of 5 mL/1 g (bacterial cells), and then disrupted using an ultrasonic generator (Insonator 201M [Kubota Shoji Co., Ltd.]) at 8°C for approximately 10 minutes at an output of approximately 150 W. The disrupted bacterial cell solution was centrifuged twice at 8,000 rpm for 20 minutes at 4°C, and the supernatant was recovered.

(6)(5)で得られた上清を、あらかじめ緩衝液Aで平衡化した、Ni Sepharose 6 Fast Flow(サイティバ社製)50mLを充填したXK26/20カラム(サイティバ社製)にアプライした。緩衝液Aで洗浄後、150mMの塩化ナトリウムおよび0.5Mのイミダゾールを含む20mMのトリス塩酸緩衝液(pH7.4)で溶出した。 (6) The supernatant obtained in (5) was applied to an XK26/20 column (manufactured by Cytiva) packed with 50 mL of Ni Sepharose 6 Fast Flow (manufactured by Cytiva) that had been previously equilibrated with buffer A. After washing with buffer A, the column was eluted with 20 mM Tris-HCl buffer (pH 7.4) containing 150 mM sodium chloride and 0.5 M imidazole.

(7)(6)で得た溶出液を、150mMの塩化ナトリウムを含む20mMのトリス緩衝液(pH7.4)で透析することで、AVR10sを調製した。 (7) The eluate obtained in (6) was dialyzed against 20 mM Tris buffer (pH 7.4) containing 150 mM sodium chloride to prepare AVR10s.

実施例2 カルシウムイオン添加によるAAV結合性タンパク質の耐熱性への影響(その1)
カルシウムイオン添加による、AAV結合性タンパク質の耐熱性への影響を示差走査熱量計(DSC)を用いて評価した。
Example 2: Effect of calcium ion addition on the heat resistance of AAV binding proteins (part 1)
The effect of calcium ion addition on the heat resistance of AAV binding proteins was evaluated using differential scanning calorimetry (DSC).

(1)実施例1で得られたAVR10sを、終濃度10mMの塩化カルシウムを添加した、または塩化カルシウムを添加しない、150mMの塩化ナトリウムを含む20mM HEPES(4-(2-HydroxyEthyl)-1-PiperazineEthaneSulfonic acid)緩衝液(pH7.4)を用いて濃度1mg/mLに調製した。 (1) The AVR10s obtained in Example 1 was prepared at a concentration of 1 mg/mL using 20 mM HEPES (4-(2-HydroxyEthyl)-1-PiperazineEthaneSulfonic acid) buffer (pH 7.4) containing 150 mM sodium chloride, with or without calcium chloride added to a final concentration of 10 mM.

(2)(1)で調製したAVR10sを含む溶液を、マルバーンパナリティカル社製DSCを用いて、温度上昇によるAVR10sの変性温度Tm(℃)を測定し、当該タンパク質の安定性を評価した。 (2) The solution containing AVR10s prepared in (1) was measured for the denaturation temperature Tm (°C) of AVR10s due to temperature increase using a Malvern Panalytical DSC to evaluate the stability of the protein.

結果、変性温度Tm(℃)は、終濃度10mMの塩化カルシウムを添加したときが62℃であり、塩化カルシウムを添加しないときが48.7℃であった。以上の結果より、AAV結合性タンパク質を含む溶液にカルシウムイオンをさらに添加することで当該タンパク質の熱安定性が向上することがわかる。 As a result, the denaturation temperature Tm (°C) was 62°C when calcium chloride was added at a final concentration of 10 mM, and 48.7°C when calcium chloride was not added. These results demonstrate that the thermal stability of an AAV binding protein is improved by further adding calcium ions to the solution containing the protein.

実施例3 カルシウムイオン添加によるAAV結合性タンパク質の耐熱性への影響(その2)
実施例2ではAAV結合性タンパク質の耐熱性評価をDSCで行なったが、本実施例ではOptim 2(アヴァクタ社製)を用いて評価を行なった。
Example 3: Effect of calcium ion addition on the heat resistance of AAV binding proteins (part 2)
In Example 2, the heat resistance of the AAV binding protein was evaluated by DSC, but in this example, the evaluation was performed using Optim 2 (manufactured by Avacta).

(1)実施例1で得られたAAV結合性タンパク質を含む溶液に、終濃度0.1mM、終濃度1mMおよび終濃度10mMのいずれかの塩化カルシウムを添加した、150mMの塩化ナトリウムを含む20mMトリス塩酸緩衝液(pH7.4)(以下、「緩衝液B」とも表記)を用いて濃度0.1mg/mLに調製した。 (1) The solution containing the AAV-binding protein obtained in Example 1 was adjusted to a concentration of 0.1 mg/mL using 20 mM Tris-HCl buffer (pH 7.4) containing 150 mM sodium chloride (hereinafter also referred to as "Buffer B") to which calcium chloride was added at a final concentration of 0.1 mM, 1 mM, or 10 mM.

(2)(1)で調製したAVR10sを含む溶液を、アヴァクタ社製Optim 2を用いて、温度上昇によるAVR10sの変性曲線を取得した。 (2) The solution containing AVR10s prepared in (1) was used to obtain a temperature-dependent denaturation curve of AVR10s using an Optim 2 (Avacta).

(3)陰性コントロールとして、緩衝液Bで0.1mg/mLに調製したAAV結合性タンパク質溶液(塩化カルシウム非添加)、および緩衝液Bそのものを、(2)と同様に測定し、変性曲線を取得した。 (3) As a negative control, an AAV-binding protein solution (without calcium chloride) prepared at 0.1 mg/mL in buffer B and buffer B itself were measured in the same manner as in (2), and denaturation curves were obtained.

比較例1 マグネシウムイオン添加によるAAV結合性タンパク質の耐熱性への影響
塩化カルシウムの代わりに塩化マグネシウムを用いた他は、実施例3と同様な方法で変性曲線を取得した。
Comparative Example 1 Effect of Addition of Magnesium Ions on Heat Resistance of AAV Binding Protein A denaturation curve was obtained in the same manner as in Example 3, except that magnesium chloride was used instead of calcium chloride.

実施例3および比較例1で得られた変性曲線を図1に示す。AAV結合性タンパク質を含む溶液にカルシウムイオン(塩化カルシウム)を添加することで当該タンパク質の熱安定性が向上することがわかる。さらにカルシウムイオン(塩化カルシウム)の添加量を増加させると、添加濃度に応じてAAV結合性タンパク質の熱安定性が向上することがわかる(実施例3、図1(a))。 Figure 1 shows the denaturation curves obtained in Example 3 and Comparative Example 1. It can be seen that adding calcium ions (calcium chloride) to a solution containing an AAV-binding protein improves the thermal stability of the protein. Furthermore, it can be seen that increasing the amount of calcium ions (calcium chloride) added improves the thermal stability of the AAV-binding protein in proportion to the added concentration (Example 3, Figure 1(a)).

一方、AAV結合性タンパク質を含む溶液にマグネシウムイオン(塩化マグネシウム)を添加したとき(比較例1)は、終濃度10mM添加したときに極僅かに前記タンパク質の熱安定性が向上したのみで、マグネシウムイオン添加による熱安定性の向上は確認できなかった(比較例1、図1(b))。 On the other hand, when magnesium ions (magnesium chloride) were added to a solution containing an AAV-binding protein (Comparative Example 1), the thermal stability of the protein was only slightly improved when added to a final concentration of 10 mM, and no improvement in thermal stability due to the addition of magnesium ions was confirmed (Comparative Example 1, Figure 1(b)).

参考例1 VLP(ウイルス様粒子)の作製
(1)血清型2(AAV2)または血清型9(AAV9)のカプシドをコードするポリヌクレオチドを含むプラスミド(以下、総称して「pRCX Vector」と表記)およびpHelper Vector(タカラバイオ社製)で大腸菌JM109株を形質転換した。
Reference Example 1 Preparation of VLPs (Virus-Like Particles) (1) Escherichia coli JM109 strain was transformed with a plasmid (hereinafter collectively referred to as "pRCX Vector") containing a polynucleotide encoding the capsid of serotype 2 (AAV2) or serotype 9 (AAV9) and pHelper Vector (manufactured by Takara Bio Inc.).

(2)得られた形質転換体を、100μg/mLのカルベニシリンを含む2YT培地(1.6%(w/v)Tryptone、1%(w/v)Yeast Extract、0.5%(w/v)塩化ナトリウム)1Lが入った、5Lバッフルフラスコにて、37℃で一晩振とう培養した。培養終了後、遠心分離することで菌体を回収した。Plasmid Mega Kit(キアゲン社製)を用いて、回収した菌体からEGFPを発現するベクターpRCX VectorおよびpHelperを大量に調製した。 (2) The resulting transformants were cultured overnight at 37°C with shaking in a 5-L baffled flask containing 1 L of 2YT medium (1.6% (w/v) Tryptone, 1% (w/v) Yeast Extract, 0.5% (w/v) Sodium Chloride) containing 100 μg/mL carbenicillin. After cultivation, the cells were collected by centrifugation. Using a Plasmid Mega Kit (Qiagen), EGFP-expressing vectors pRCX Vector and pHelper were prepared in large quantities from the collected cells.

(3)5%(v/v)のウシ血清を含むD-MEM培地(富士フイルム和光純薬社製)500mLが入ったセルスタック細胞培養表面処理済み5チャンバー(コーニング社製)8枚でHEK293T細胞を培養した。そこへ(2)で調製したpRCX VectorおよびpHelper、ならびにポリエチレンイミン(Polysciences社製)の複合体を添加することで遺伝子導入し、5%(v/v)の二酸化炭素、37℃の条件で3日間静置培養した。 (3) HEK293T cells were cultured in eight Cellstack cell culture surface-treated 5-chamber plates (Corning) containing 500 mL of D-MEM medium (Fujifilm Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) containing 5% (v/v) bovine serum. The pRCX Vector and pHelper complex prepared in (2) and polyethyleneimine (Polysciences) were added for gene transfer, and the cells were then statically cultured for 3 days at 37°C in 5% (v/v) carbon dioxide.

(4)(3)で得られた培養液に、終濃度0.1%(v/v)となるようにTriton X-100(シグマアルドリッチ社製)およびBenzonase(メルクミリポア社製)(終濃度1U/mL)を培養液中に添加して37℃の条件で3時間静置後、遠心分離した。 (4) Triton X-100 (Sigma-Aldrich) and Benzonase (Merck Millipore) (final concentration 1 U/mL) were added to the culture medium obtained in (3) to a final concentration of 0.1% (v/v), and the medium was left to stand at 37°C for 3 hours and then centrifuged.

(5)上清を回収し、300kD-cutoffのタンジェンシャルフローシステム用メンブレンカセット(ポール社製)を用いて濃縮および0.5Mの塩化ナトリウムを含む20mMのトリス塩酸緩衝液(pH8.0)(以下、「緩衝液C」とも表記)への置換を行なった。得られた濃縮液を孔径0.22μmのフィルターに供し、浮遊物を除去した。 (5) The supernatant was collected and concentrated using a 300 kD-cutoff membrane cassette for a tangential flow system (Pall Corporation) and then replaced with 20 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) containing 0.5 M sodium chloride (hereinafter also referred to as "Buffer C"). The resulting concentrate was passed through a filter with a pore size of 0.22 μm to remove suspended matter.

(6)浮遊物を除去した溶液を、7mLのAVB Sepharoseカラム(サイティバ社製)またはPOROS AAVXカラム(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)にアプライした。 (6) The solution from which the suspended matter had been removed was applied to a 7 mL AVB Sepharose column (manufactured by Cytiva) or a POROS AAVX column (manufactured by Thermo Fisher Scientific).

(7)緩衝液Cで洗浄後、0.5Mの塩化ナトリウムを含む0.1Mの酢酸緩衝液(pH2.5)で溶出した。得られたVLPを含む溶出画分に、20mMの塩化マグネシウムを含む1Mのトリス塩酸緩衝液(pH8.5)を1/4量加えて中和することで、各血清型のVLPであるVLP2およびVLP9溶液を得た(以下、総称して「VLP」とも表記)。 (7) After washing with buffer C, the mixture was eluted with 0.1 M acetate buffer (pH 2.5) containing 0.5 M sodium chloride. The resulting eluted fraction containing VLPs was neutralized with 1/4 volume of 1 M Tris-HCl buffer (pH 8.5) containing 20 mM magnesium chloride to obtain solutions of VLP2 and VLP9, which are VLPs of each serotype (hereinafter collectively referred to as "VLPs").

(8)(7)で得られた溶液中に含まれるVLPの濃度を、DLS(動的光散乱法)により測定した。また前記溶液をSDS-PAGE(SDSポリアクリルアミド電気泳動)に供した後、Pierce Silver Stain Kit(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)を用いた銀染色により、前記溶液中に含まれるVLPの純度を確認した。 (8) The concentration of VLPs in the solution obtained in (7) was measured by DLS (dynamic light scattering). The solution was then subjected to SDS-PAGE (SDS-polyacrylamide gel electrophoresis), and the purity of the VLPs in the solution was confirmed by silver staining using a Pierce Silver Stain Kit (Thermo Fisher Scientific).

溶液中に含まれるVLPの濃度測定の結果、VLP2溶液が3.1×1013cp/mL(cpは粒子数を示す。以下同じ)であり、VLP9溶液が8.0×1013cp/mLであった。またSDS-PAGEおよび銀染色による純度確認の結果、いずれの溶液もVLPを構成する3種類の外殻タンパク質(VP1、VP2、VP3)に相当するバンドのみが観測され、純度に問題ないことを確認した。 Measurement of the VLP concentration in the solution revealed that the VLP2 solution had a concentration of 3.1 x 10 cp/mL (cp indicates the number of particles; the same applies below), and the VLP9 solution had a concentration of 8.0 x 10 cp/mL. Purity was confirmed by SDS-PAGE and silver staining, and only bands corresponding to the three types of outer coat proteins (VP1, VP2, and VP3) that constitute VLP were observed in both solutions, confirming that there was no problem with purity.

参考例2 カルシウムイオン添加による、AAVとAAV結合性タンパク質との結合親和性への影響評価
カルシウムイオン添加による、AAVとAAV結合性タンパク質との結合親和性への影響を以下に示すELISA法で評価した。
Reference Example 2 Evaluation of the effect of calcium ion addition on the binding affinity between AAV and AAV-binding protein The effect of calcium ion addition on the binding affinity between AAV and AAV-binding protein was evaluated by the ELISA method shown below.

(1)参考例1で調製したAAVのウイルス様粒子(VLP2またはVLP9)を緩衝液Bで200倍に希釈後、96穴マイクロプレート(サーモフィッシャーサイエンティフィック社製)に100μL/wellで加え、固定化した(4℃で18時間)。 (1) The AAV virus-like particles (VLP2 or VLP9) prepared in Reference Example 1 were diluted 200-fold with buffer B, added to a 96-well microplate (Thermo Fisher Scientific) at 100 μL/well, and immobilized (at 4°C for 18 hours).

(2)固定化後、2%(w/v)のSKIM MILK(Becton Dickinson社製)および緩衝液Bでブロッキングした。 (2) After immobilization, the cells were blocked with 2% (w/v) skim milk (Becton Dickinson) and buffer B.

(3)洗浄バッファー(0.05%[w/v]のTween 20(商品名)を含む緩衝液B)で洗浄後、10mMの塩化カルシウムを含む、または塩化カルシウムを含まない緩衝液Bで濃度0.01mg/mLに調製したAAV結合性タンパク質AVR10sを添加することで、AVR10sとVLP2またはVLP9とを反応させた(30℃で1時間)。 (3) After washing with a washing buffer (Buffer B containing 0.05% [w/v] Tween 20 (trade name)), the AAV binding protein AVR10s, prepared at a concentration of 0.01 mg/mL in Buffer B containing 10 mM calcium chloride or not containing calcium chloride, was added to react AVR10s with VLP2 or VLP9 (at 30°C for 1 hour).

(4)反応終了後、前記洗浄バッファーで洗浄し、100ng/mLに希釈したAnti-6His抗体(Bethyl Laboratories社製)を100μL/well添加した。 (4) After the reaction was completed, the plate was washed with the washing buffer, and 100 μL/well of anti-6His antibody (manufactured by Bethyl Laboratories) diluted to 100 ng/mL was added.

(5)30℃で1時間反応後、前記洗浄バッファーで洗浄し、TMB Peroxidase Substrate(KPL社製)を50μL/wellで添加した。1Mのリン酸を50μL/wellで添加することで発色を止め、マイクロプレートリーダー(テカン社製)にて450nmの吸光度を測定した。 (5) After incubation at 30°C for 1 hour, the plate was washed with the wash buffer and TMB Peroxidase Substrate (KPL) was added at 50 μL/well. Color development was stopped by adding 50 μL/well of 1 M phosphoric acid, and the absorbance at 450 nm was measured using a microplate reader (Tecan).

結果を図2に示す。VLP2およびVLP9とも、終濃度10mMのカルシウムイオン(塩化カルシウム)を添加すると450nmの吸光度が上昇しており、AVR10sとの結合親和性が向上していた。以上の結果より、AAV結合性タンパク質を含む溶液にカルシウムイオンを添加しても、前記タンパク質とAAVとの結合親和性が低下するおそれはないことがわかる。 The results are shown in Figure 2. For both VLP2 and VLP9, the addition of calcium ions (calcium chloride) to a final concentration of 10 mM increased the absorbance at 450 nm, indicating improved binding affinity with AVR10s. These results demonstrate that adding calcium ions to a solution containing an AAV-binding protein does not reduce the binding affinity between the protein and AAV.

Claims (2)

以下の(i)から(iii)のいずれかから選択されるアデノ随伴ウイルス(AAV)結合性タンパク質を含む溶液と、カルシウムイオンを接触させる工程を含む、前記タンパク質の熱に対する安定性を向上させる方法:
(i)配列番号1に記載のアミノ酸配列のうち312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を含み、ただしそのアミノ酸残基に対して下記(I)から(X)までに示すアミノ酸置換を有するポリペプチド
(I)配列番号1の317番目のバリン残基に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸残基に置換
(II)配列番号1の342番目のチロシン残基に相当するアミノ酸残基がセリン残基に置換
(III)配列番号1の362番目のリジン残基に相当するアミノ酸残基がグルタミン酸残基に置換
(IV)配列番号1の371番目のリジン残基に相当するアミノ酸残基がアスパラギン残基に置換
(V)配列番号1の381番目のバリン残基に相当するアミノ酸残基がアラニン残基に置換
(VI)配列番号1の382番目のイソロイシン残基に相当するアミノ酸残基がバリン残基に置換
(VII)配列番号1の390番目のグリシン残基に相当するアミノ酸残基がセリン残基に置換
(VIII)配列番号1の399番目のリジン残基に相当するアミノ酸残基がグルタミン酸残基に置換
(IX)配列番号1の476番目のセリン残基に相当するアミノ酸残基がアルギニン残基に置換
(X)配列番号1の487番目のアスパラギン残基に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸残基に置換、
(ii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基に対して上記(I)から(X)までに示すアミノ酸置換を有し、さらに1個以上10個以下のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含み、かつAAV結合活性を有するポリペプチド、
(iii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基に対して上記(I)から(X)までに示すアミノ酸置換を有するアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつAAV結合活性を有するポリペプチド。
A method for improving the heat stability of an adeno-associated virus (AAV) binding protein selected from the following (i) to (iii), comprising a step of contacting a solution containing the protein with calcium ions :
(i) A polypeptide comprising the amino acid residues from the 312th serine to the 500th aspartic acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, with the amino acid substitutions (I) to (X) for the amino acid residues:
(I) The amino acid residue corresponding to the 317th valine residue in SEQ ID NO: 1 is substituted with an aspartic acid residue
(II) The amino acid residue corresponding to the tyrosine residue at position 342 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a serine residue.
(III) The amino acid residue corresponding to the lysine residue at position 362 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a glutamic acid residue
(IV) The amino acid residue corresponding to the lysine residue at position 371 of SEQ ID NO: 1 is substituted with an asparagine residue.
(V) the amino acid residue corresponding to the 381st valine residue of SEQ ID NO: 1 is substituted with an alanine residue
(VI) The amino acid residue corresponding to the isoleucine residue at position 382 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a valine residue.
(VII) The amino acid residue corresponding to the glycine residue at position 390 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a serine residue
(VIII) The amino acid residue corresponding to the lysine residue at position 399 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a glutamic acid residue
(IX) The amino acid residue corresponding to the serine residue at position 476 of SEQ ID NO: 1 is substituted with an arginine residue.
(X) an amino acid residue corresponding to the asparagine residue at position 487 of SEQ ID NO: 1 is substituted with an aspartic acid residue;
(ii) A polypeptide comprising at least the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, with the amino acid substitutions shown in (I) to (X) above for the amino acid residues at positions 312 to 500, and further comprising substitutions, deletions, insertions, or additions of 1 to 10 amino acid residues, and having AAV-binding activity;
(iii) A polypeptide having 90% or more identity to an amino acid sequence comprising at least the amino acid residues from the serine at position 312 to the aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that the amino acid residues at positions 312 to 500 have any of the amino acid substitutions (I) to (X) set forth above, and having AAV-binding activity.
以下の(i)から(iii)のいずれかから選択されるアデノ随伴ウイルス(AAV)結合性タンパク質とカルシウムイオンを含む溶液:A solution comprising an adeno-associated virus (AAV) binding protein selected from any one of the following (i) to (iii) and calcium ions:
(i)配列番号1に記載のアミノ酸配列のうち312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を含み、ただしそのアミノ酸残基に対して下記(I)から(X)までに示すアミノ酸置換を有するポリペプチド(i) A polypeptide comprising the amino acid residues from the 312th serine to the 500th aspartic acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, with the proviso that the amino acid residues have the amino acid substitutions shown in (I) to (X) below:
(I)配列番号1の317番目のバリン残基に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸残基に置換(I) The amino acid residue corresponding to the 317th valine residue in SEQ ID NO: 1 is substituted with an aspartic acid residue
(II)配列番号1の342番目のチロシン残基に相当するアミノ酸残基がセリン残基に置換(II) The amino acid residue corresponding to the tyrosine residue at position 342 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a serine residue.
(III)配列番号1の362番目のリジン残基に相当するアミノ酸残基がグルタミン酸残基に置換(III) The amino acid residue corresponding to the lysine residue at position 362 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a glutamic acid residue
(IV)配列番号1の371番目のリジン残基に相当するアミノ酸残基がアスパラギン残基に置換(IV) The amino acid residue corresponding to the lysine residue at position 371 of SEQ ID NO: 1 is substituted with an asparagine residue.
(V)配列番号1の381番目のバリン残基に相当するアミノ酸残基がアラニン残基に置換(V) the amino acid residue corresponding to the 381st valine residue of SEQ ID NO: 1 is substituted with an alanine residue
(VI)配列番号1の382番目のイソロイシン残基に相当するアミノ酸残基がバリン残基に置換(VI) The amino acid residue corresponding to the isoleucine residue at position 382 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a valine residue.
(VII)配列番号1の390番目のグリシン残基に相当するアミノ酸残基がセリン残基に置換(VII) The amino acid residue corresponding to the glycine residue at position 390 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a serine residue
(VIII)配列番号1の399番目のリジン残基に相当するアミノ酸残基がグルタミン酸残基に置換(VIII) The amino acid residue corresponding to the lysine residue at position 399 of SEQ ID NO: 1 is substituted with a glutamic acid residue
(IX)配列番号1の476番目のセリン残基に相当するアミノ酸残基がアルギニン残基に置換(IX) The amino acid residue corresponding to the serine residue at position 476 of SEQ ID NO: 1 is substituted with an arginine residue.
(X)配列番号1の487番目のアスパラギン残基に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸残基に置換、(X) an amino acid residue corresponding to the asparagine residue at position 487 of SEQ ID NO: 1 is substituted with an aspartic acid residue;
(ii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基に対して上記(I)から(X)までに示すアミノ酸置換を有し、さらに1個以上10個以下のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、または付加を含み、かつAAV結合活性を有するポリペプチド、(ii) A polypeptide comprising at least the amino acid residues from serine at position 312 to aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, with the amino acid substitutions shown in (I) to (X) above for the amino acid residues at positions 312 to 500, and further comprising substitutions, deletions, insertions, or additions of 1 to 10 amino acid residues, and having AAV-binding activity;
(iii)配列番号1に記載のアミノ酸配列の312番目のセリンから500番目のアスパラギン酸までのアミノ酸残基を少なくとも含み、ただし当該312番目から500番目までのアミノ酸残基に対して上記(I)から(X)までに示すアミノ酸置換を有するアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有し、かつAAV結合活性を有するポリペプチド。(iii) A polypeptide having 90% or more identity to an amino acid sequence comprising at least the amino acid residues from the serine at position 312 to the aspartic acid at position 500 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that the amino acid residues at positions 312 to 500 have any of the amino acid substitutions (I) to (X) set forth above, and having AAV-binding activity.
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