JP7839733B2 - 脳腫瘍を処置するための血液脳関門を横断する免疫療法剤を送達するための方法および組成物 - Google Patents
脳腫瘍を処置するための血液脳関門を横断する免疫療法剤を送達するための方法および組成物Info
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Description
本出願は、2020年1月10日に出願された米国仮特許出願第62/959,625号明細書の利益を主張する。前述の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
本方法は、例えば、AAV、例えば、AAV1、AAV2、AAV8、またはAAV9のカプシド内に挿入されると、または化学的にもしくは融合タンパク質としての発現により、生物学的因子、例えば、抗体もしくは他の大きな生体分子にコンジュゲートすると、BBBを通過する浸透性を増強する複数の可能性のある標的化ペプチドを同定した。
(i)X1、X2、X3、X4は、V、A、L、I、G、P、S、T、またはMの内の任意の4個の同一ではないアミノ酸であり、
(ii)X5は、K、R、H、D、またはEである(配列番号73)。
(i)X1は、Tであり、
(ii)X2X3X4X5は、V、A、L、I、G、P、S、T、またはMの内の任意の4個の同一ではないアミノ酸であり、
(iii)X6は、K、R、H、D、またはEである(配列番号74)。
(i)X1X2X3X4は、V、A、L、I、G、P、S、T、またはMからの任意の4個の同一ではないアミノ酸であり、
(ii)X5は、K、R、H、D、またはEであり、
(iii)X6は、EまたはDである(配列番号75)。
(i)X1は、F、L、W、またはYであり、
(ii)X2は、Tであり、
(iii)X3、X4、X5、X6は、V、A、L、I、G、P、S、T、またはMの内の任意の4個の同一ではないアミノ酸であり、
(iv)X7は、K、R、H、D、またはEである(配列番号76)。
(i)X1は、Tであり、
(ii)X2、X3、X4、X5は、V、A、L、I、G、P、S、T、またはMの内の任意の4個の同一ではないアミノ酸であり、
(iii)X6は、K、R、H、D、またはEであり、
(iv)X7は、EまたはDである(配列番号77)。
(i)X1、X2、X3、X4は、V、A、L、I、G、P、S、T、またはMの内の任意の4個の同一ではないアミノ酸であり、
(ii)X5は、K、R、H、D、またはEであり、
(iii)X6は、EまたはDであり、
(iv)X7は、AまたはIである(配列番号78)。
本方法および組成物に使用するためのウイルスベクターには、本明細書に記載される標的化ペプチドおよび必要に応じて、標的組織で発現するための導入遺伝子を含む、組換えレトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、アルファウイルス、およびレンチウイルスが含まれる。
一部の実施形態では、AAVはまた、例えば、本明細書に記載されるか、または当該技術分野で公知のような、免疫療法剤をコードする導入遺伝子配列(すなわち、異種配列)を含む。導入遺伝子は、好ましくは、標的組織における導入遺伝子の発現を促進/駆動する配列に連結される。
本明細書に記載される方法および組成物は、免疫療法組成物を、組織、例えば、中枢神経系(脳)、心臓、筋肉、または後根神経節もしくは脊髄(末梢神経系)に送達するために使用され得る。一部の実施形態では、方法は、特定の脳領域、例えば、大脳皮質、小脳、海馬、黒質、または扁桃体への送達を含む。一部の実施形態では、方法は、神経細胞、星状膠細胞、および/またはグリア細胞への送達を含む。
本明細書に記載される方法は、(i)標的化ペプチド、および(ii)有効成分として免疫療法剤をコードする配列を含むAAVを含む医薬組成物の使用を含む。
以下の材料および方法を以下の実施例において使用した。
カプシドバリアントプラスミドを生成するために、細胞透過性ペプチド(表3)をコードするDNA断片を合成し(GenScript)、CloneEZシームレスクローニング技術(GenScript)を使用してアミノ酸位置588および589(VPAアミノ酸番号付け)の間でAAV9 Rep-capプラスミド(pRC9)の主鎖に挿入した。CPP BIP1(VPALR、配列番号1)およびBIP2(VSALK、配列番号2)、ならびにそれらの誘導体、例えば、AAV.CPP.16におけるTVSALK(配列番号4)およびAAV.CPP.21におけるTVSALFK(配列番号8)は、Ku70タンパク質に由来し、その配列は以下に提供される:
標準的な3プラスミド共トランスフェクションプロトコール(pRCプラスミド、pヘルパープラスミド、およびpAAVプラスミド)を使用して、組換えAAVをパッケージングした。導入遺伝子(例えば、ユビキタスEF1aプロモーターにより駆動される核指向性(nucleus-directed)RFP H2B-mCherry)を有するpRC9(またはそのバリアント)、pヘルパー、およびpAAVを、ポリエチレンイミン(PEI、Polysciences)を使用して、HEK 293T細胞に共トランスフェクトした。rAAVベクターを、トランスフェクションの72時間および120時間後に血清フリー培地から回収し、ならびにトランスフェクションの120時間後に細胞から回収した。この培地中のAAV粒子を、8%のPEG-8000(重量/体積)によるPEG沈殿法を使用して濃縮した。ウイルス粒子を含む細胞ペレットを再懸濁させ、超音波処理により溶解させた。PEG沈殿および細胞溶解物から組み合わせたウイルスベクターを、30分にわたり37℃でDNアーゼおよびRNアーゼにより処理し、次いで超遠心分離(VTi 50ローター、40,000r.p.m、18℃、1時間)によるイオジキサノール勾配(15%、25%、40%、および60%)によって精製した。次いで、rAAVを、Millipore Amiconフィルタユニット(UFC910008、100K MWCO)を使用して濃縮し、0.001%のPluronic F68(Gibco)を含むDulbeccoのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化した。
ウイルス力価を、定量PCRを使用してDNアーゼ耐性ゲノムコピーを測定することにより決定した。pAAV-CAG-GFPをPVUII(NEB)で消化してプラスミドITR用のフリー末端を生成し、標準曲線の生成に使用した。ウイルス試料をDNアーゼIと共にインキュベートして夾雑DNAを除去し、続いて水酸化ナトリウム処理してウイルスカプシドを溶解させてウイルスゲノムを放出させた。定量PCRを、ITRフォワードプライマー5’-GGAACCCCTAGTGATGGAGTT(配列番号91)およびITRリバースプライマー5’-CGGCCTCAGTGAGCGA(配列番号92)を使用して実施した。ベクター力価を、rAAV-2参照標準物質(RSM、ATCC、カタログ番号:VR-1616、Manassas、VA)に対して正規化した。
静脈内投与のために、滅菌生理食塩水(0.2ml)で希釈したAAVを、成体マウス(6週齢超)で尾静脈注射により投与した。次いで、動物を3週間にわたり生存させた後、安楽死させて組織を採取した。脳内注射のために、PBS(10ul)で希釈したAAVを、十字縫合から1.0mm右、0.3後方、2.6mm深さの座標に、Hamiltonシリンジを使用して注射した。全ての動物実験を、IACUCにより承認されたAAALAC認定施設で実施した。
麻酔した動物に、冷リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を経心的に灌流させ、続いて4%パラホルムアルデヒド(PFA)を経心的に灌流させた。組織を、一晩4%PFAで後固定し、次いで、2日にわたり30%ショ糖溶液に浸漬した後、OCTに埋め込んでスナップ凍結させた。典型的には、80um厚の脳切片を、自然蛍光の画像化のために切断し、40um厚の脳切片を、IHCのために切断した。
熱い1%アガロース(重量/体積、50ul)を96ウェルプレートに入れて、冷却した/固化させた。次いで、このアガロースゲル上に、初代ヒト星状膠細胞(Lonza Bioscience)、ヒト脳微小血管周皮細胞(HBVP、ScienCell Research Laboratories)、およびヒト脳微小血管内皮細胞(hCMEC/D3;Cedarlane)を、1:1:1の比(各タイプ1500個の細胞)で播種した。細胞を、48~72時間にわたり5%CO2インキュベータ中において37℃で培養して、多細胞BBBスフェロイドの自発的構築を可能にした。このスフェロイドの周辺では、BBBを模倣する多細胞による関門が形成されることが報告された。この培養培地にAAV-H2B-mCherryを添加し、4日後に、全てのスフェロイドを、4%PFAを使用して固定し、Nunc Lab-Tek II薄ガラス8ウェルチャンバーカバーガラス(Thermo Scientific)に移し、Zeiss LSM710共焦点顕微鏡を使用して画像化した。このスフェロイド内のRFPシグナルの強度を調べて、「リードアウト」として使用した。
全てのNHP試験を、IACUCにより承認されたAAALAC認定施設でCROにより実施した。カニクイザルを、AAV9に対する中和抗体がほぼ存在しないかまたは存在しないかに関して予めスクリーニングした(<1:5の力価)。PBS/0.001%F68で希釈したAAVを、蠕動ポンプを使用して(橈側皮静脈または大腿静脈を介して)静脈内注射した。3週間後、動物にPBSを経心的に灌流させ、続いて4%PFAを経心的に灌流させた。次いで、組織を回収し、パラフィン埋め込みおよび切片化のために処理した。
10%ロバ血清および2%Triton X-100を含むPBSで希釈した一次抗体により、マウス組織切片のフローティング染色を実施した。使用した一次抗体には、ニワトリ抗GFP(1:1000);ウサギ抗RFP(1:1000);マウス抗NeuN(1:500);ラット抗GFAP(1:500);ヤギ抗GFAP(1:500);マウス抗CD31(1:500)が含まれる。Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 555、またはAlexa Fluor 647のフルオロフォアにコンジュゲートした二次抗体を、1:200の希釈で、一次抗体の宿主種に対して適用した。
HEK293T細胞を、5%CO2インキュベータ中において37℃で培養した。1つのウェル当たり250,000個の細胞の密度での24ウェルプレートへのHEK293T細胞の播種の1日後に、200ulのDMEM(31053028;Gibco)、1ugのDNAプラスミド、および3ugのPEIのトランスフェクション混合物を使用して、この細胞に、LY6AのcDNAプラスミドを一過的にトランスフェクトした。トランスフェクションの48時間後、細胞を氷上に置いて10分にわたり冷却した。次いで、培地を、10000のMOIでrAAV-mCherryを含む500ulの氷冷血清フリーDMEM培地に交換した。1時間にわたる氷上でのインキュベーション後、おそらくAAVが表面に結合している細胞を冷PBSで3回洗浄し、次いでゲノムDNAを単離した。細胞に結合しているウイルス粒子を、mCherryに特異的なプライマーによるqPCRを使用することにより定量し、参照としてヒトGCGを使用してHEK293Tゲノムに対して正規化した。
全ての実験を、Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical SchoolにてAnimal Care and Use Committees(IACUC)により承認されたプロトコールに従って実施した。20+/-1g(Envigo)の重量の同系免疫応答性C57BL/6雌マウスを使用した。2μlのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)に再懸濁させたGL261-Luc(100,000個のマウス膠芽腫細胞)を、26ゲージ針(80075;Hamilton)を備えた10μlのシリンジを使用して、頭蓋内に注射した。定位固定フレームを使用して、移植部位の位置を決めた(十字縫合からの座標(mm):2右、0.5前方、大脳皮質への3.5の深さで)。7日後、200ulのAAV-HSV-TK1(1E+12個のウイルスゲノム、IV)を1回投与し、ガンシクロビル(50mg/kg)を10日にわたり毎日投与した。
AAV9カプシドの改変
血液脳関門を横断する生体分子またはウイルスの浸透を増強するであろうペプチド配列を同定するために、AAVペプチドディスプレイ技術を使用した。表3で列挙されている個々の細胞透過性ペプチドを、図1Aに例示されているように、アミノ酸588および589(VP1番号付け)の間でAAV9カプシドに挿入した。この挿入を、AAVパッケージングのために共トランスフェクトされる3種のプラスミドの内の1つであるRCプラスミドを改変することにより実行し、図1Bは、この実験の例示的な模式図を示す。個々のAAVバリアントを、別々に製造してスクリーニングした。さらなる詳細に関しては、材料および方法#1~3を参照されたい。
in vivoでのスクリーニングの最初のラウンド
核RFP(H2B-RFP)を発現するAAVを、C57BL/6遺伝子背景およびBALB/c遺伝子背景が混在している成体マウスに静脈内注射した。3週間後、脳組織を採取して切片化して、RFP標識細胞を明らかにした(図2Aおよび図2Cでの白色の点、それぞれ図2Bおよび図2Dで定量されている)。CPP BIP1およびBIP2を、それぞれAAV.CPP.11およびAAV.CPP.12のカプシドに挿入した。さらなる詳細に関しては、材料および方法#4~5を参照されたい。
改変AAV9カプシドの最適化
BIP標的化配列を最適化することにより、AAV.CPP.11およびAAV.CPP.12をさらに操作した。BIPインサートは、タンパク質Ku70に由来した(完全な配列に関しては、図3Aおよび材料/方法#1を参照されたい)。「合成」起源であるBIP配列VSALKを、操作AAVベクターの潜在的な種特異性を最小限に抑えるための研究焦点として選択した。AAVを製造し、AAV9と比較して脳形質導入効率に関して別々に試験した(図3B~Cを参照されたい)。レポーター遺伝子RFPを送達するいくつかのAAVバリアントのIV注射後3週間でのマウス肝臓における細胞形質導入の割合を、図3Dに示す。さらなる詳細に関しては、材料および方法#1~5を参照されたい。
in vitroモデル-BBB浸透スクリーニング
AAVバリアントの一部を、in vitroでのスフェロイドBBBモデルを使用して、ヒトBBBを超える能力に関してスクリーニングした。このスフェロイドは、表面で関門を形成するヒト微小血管内皮細胞と、ヒト周皮細胞および星状膠細胞とを含む。レポーターとして核RFPを有するAAVを、周囲の培地からこのスフェロイドの内部に透過させて内部で細胞に形質導入する能力に関して評価した。図4Aは、実験の概要を示す。図4B~Dは、wt AAV9、AAV.CPP.16、およびAAV.CPP.21それぞれの結果を示し、これらのおよび他のペプチドを図4Eで定量する。このモデルでは、ペプチド11、15、16、および21が、スフェロイドへの最大の浸透を引き起こした。さらなる詳細に関しては、材料および方法#6を参照されたい。
in vivoでのBBB浸透スクリーニング
実施例2に関して上述したように実施した実験において、in vivoでのモデルでのさらなる評価のために、AAV.CPP.16およびAAV.CPP.21を選択した。全てのAAVが、レポーターとして核RFPを有した。両方とも、C57BL/6J成体マウス(図5Aでの脳切片における白色の点、図5Bで定量されている)およびBALB/c成体マウス(図6Aでの脳切片における白色の点、図6Bで定量されている)において、AAV9に対して、静脈内投与後に脳細胞に形質導入する能力の増強を示した。
改変AAVのin vivoでの分布
図8Aで示すように、AAV.CPP.16およびAAV.CPP.21は、大脳皮質、中脳、および海馬を含む、マウスにおける複数の脳領域にわたり、神経細胞(NeuN抗体により標識されている)を優先的に標的とした。両方のAAVが、レポーターとして核RFPを有した。
非ヒト霊長類モデルでのBBB浸透
2×1013vg/kgのAAVs-CAG-AADC(レポーター遺伝子として)を、3カ月齢のカニクイザルに静脈内注射した。AAV形質導入細胞(黒色で示す)を、AADCに対する抗体染色を使用して可視化した。図10A~Dに示すように、AAV.CPP.16およびAAV.CPP.21は、AAV9に対して、非ヒト霊長類での静脈内投与後に脳組織に形質導入する能力の増強を示した。AAV.CPP.16は、一次視覚野(図10A)、頭頂葉皮質(図10B)、視床(図10C)、および小脳(図10D)において、wt AAV9と比べて有意に多くの細胞に形質導入した。さらなる詳細に関しては、材料および方法#7~8を参照されたい。
AAV.CPP.16およびAAV.CPP.21はLY6Aに結合しない
LY6AはAAV.PHP.eBの受容体として機能し、ある特定のマウス株でのBBBの横断におけるAAV.PHP.eBの頑強な効果を媒介する。培養された293細胞におけるマウスLY6Aの過剰発現により、細胞表面へのAAV.PHP.eBの結合が有意に増加した(図11Aを参照されたい)。逆に、LY6Aの過剰発現により、AAV9、AAV.CPP.16、またはAAV.CPP.21に関するウイルス結合は増加しない(図11Bを参照されたい)。このことは、AAV.CPP.16またはAAV.CPP.21が受容体としてLY6AをAAV.PHP.eBと共有しないことを示唆する。さらなる詳細に関しては、材料および方法#9を参照されたい。
AAV.CPP.21を使用する脳への治療用タンパク質の送達
AAV.CPP.21を使用して、脳腫瘍のマウスモデルにおいて「自殺遺伝子」HSV.TK1を全身送達した(材料および方法#10)。HSV.TK1は、その他の方法で「休眠」しているガンシクロビルを腫瘍死滅剤へと変える。静脈内投与されたAAV.CPP.21-H2BmCherry(図12A、左下および右中央のパネル)は、腫瘤、特に、腫瘍が拡がるフロンティアを標的とすることが示された。図12B~Cに示すように、「自殺遺伝子」HSV.TK1を全身送達するためのAAV.CPP.21の使用により、プロドラッグであるガンシクロビルと併用した場合に、脳腫瘤の縮小がもたらされた。これらの結果は、AAV.CPP.21を使用して脳腫瘍に治療用遺伝子を全身送達し得ることを示す。さらなる詳細に関しては、材料および方法#10を参照されたい。
AAV.CPP.21の脳内投与
(例えば実施例2での)全身投与に加えて、本明細書で記載されているAAVを、マウス脳に局所的に投与した。AAV9-H2B-RFPおよびAAV.CPP.21-H2B-RFPの脳内注射(図13)により、AAV9で処置された脳切片に対して、AAV.CPP.21で処置された脳切片において広範なかつ高強度のRFPシグナルが生じた。さらなる詳細に関しては、材料および方法#4を参照されたい。
膠芽腫腫瘍微小環境へのAAV.CPP.16の全身送達
(例えば実施例2での)全身投与を使用して、本明細書に記載されているAAVを、同所性免疫応答性マウスの膠芽腫モデル(GL261モデル)の脳へ送達する(材料および方法#10に記載されている)。図14に示すように、AAV.CRP16は、腫瘍および周囲の微小環境の両方への有意な送達に関して、AAV9をはるかに上回った。
GBM腫瘍におけるHAタグ化抗PD-L1抗体の発現
ウェスタンブロッティングによって測定したGBM腫瘍におけるHAタグ化抗PD-L1抗体の発現を、図17A~17Bに示す。マウスでの腫瘍移植から5日後に1e12vgのAAVまたはPBSを静脈内注射した。IV注射から14日後に腫瘍組織を採取した。HAタグ染色の強度(図17A)を、抗PD-L1抗体発現の尺度として定量した(図17B)。
本発明を、その詳細な説明と併せて記載しているが、上記の記載は、添付の特許請求の範囲により画定される本発明の範囲を例示することが意図されており限定することは意図されていないことを理解しなければならない。他の態様、利点、および改変は、下記の特許請求の範囲内である。
以下に、当初の特許請求の範囲に記載の発明を列挙する。
[発明1]
対象におけるがんに免疫療法剤を送達する方法であって、(i)配列TVSALFK(配列番号8);TVSALK(配列番号4);KLASVT(配列番号83);またはKFLASVT(配列番号84)からの少なくとも4個の連続するアミノ酸を含むアミノ酸配列を含むカプシドタンパク質と、(ii)免疫療法剤をコードする導入遺伝子とを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)を、前記対象に投与するステップを含み、必要に応じて、がん細胞がヒト対象の脳内にある、前記方法。
[発明2]
前記アミノ酸配列が、配列TVSALK(配列番号4);TVSALFK(配列番号8);KLASVT(配列番号83);またはKFLASVT(配列番号84)からの少なくとも5個の連続するアミノ酸を含む、発明1に記載の方法。
[発明3]
前記アミノ酸配列が、配列TVSALK(配列番号4);TVSALFK(配列番号8);KLASVT(配列番号83);またはKFLASVT(配列番号84)からの少なくとも6個の連続するアミノ酸を含む、発明1に記載の方法。
[発明4]
対象におけるがんに免疫療法剤を送達する方法であって、(i)配列V[S/p][A/m/t/]L(配列番号79)、TV[S/p][A/m/t/]L(配列番号80)、TV[S/p][A/m/t/]LK(配列番号81)、またはTV[S/p][A/m/t/]LFK.(配列番号82)からの少なくとも4個の連続するアミノ酸を含むアミノ酸配列を含むカプシドタンパク質と、(ii)免疫療法剤をコードする導入遺伝子とを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)を、前記対象に投与するステップを含み、必要に応じて、がん細胞がヒト対象の脳内にある、前記方法。
[発明5]
標的化配列が、VPALR(配列番号1);VSALK(配列番号2);TVPALR(配列番号3);TVSALK(配列番号4);TVPMLK(配列番号12);TVPTLK(配列番号13);FTVSALK(配列番号5);LTVSALK(配列番号6);TVSALFK(配列番号8);TVPALFR(配列番号9);TVPMLFK(配列番号10)またはTVPTLFK(配列番号11)を含む、発明4に記載の方法。
[発明6]
前記免疫療法剤をコードする導入遺伝子が、PD-1またはPD-L1を標的化する抗体をコードする、発明1から5のいずれかに記載の方法。
[発明7]
前記対象が、哺乳動物対象である、発明6に記載の方法。
[発明8]
前記AAVが、AAV9である、発明7に記載の方法。
[発明9]
前記AAV9が、AAV9 VP1を含む、発明8に記載の方法。
[発明10]
前記標的化配列が、配列番号85を含むAAV9 VP1のアミノ酸588および589に対応する位置に挿入されている、発明9に記載の方法。
[発明11]
前記細胞が、前記対象の脳内にあり、前記AAVが、非経口送達、脳内、または髄腔内送達によって投与される、発明7に記載の方法。
[発明12]
前記非経口送達が、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、または筋肉内送達による、発明11に記載の方法。
[発明13]
前記髄腔内送達が、腰椎注射、大槽注射、または実質内注射による、発明12に記載の方法。
[発明14]
化学療法剤、放射線、および/または外科的切除を前記対象に投与するステップをさらに含む、発明1から13のいずれかに記載の方法。
[発明15]
前記化学療法剤が、テモゾラミド、ロムスチン、またはそれらの組合せを含む、発明14に記載の方法。
Claims (13)
- 対象におけるがんに免疫療法剤を送達する方法において使用するための医薬組成物であって、前記医薬組成物は、(i)TVSALFK(配列番号8)またはTVSALK(配列番号4)のペプチド挿入物を含むカプシドタンパク質と、(ii)免疫療法剤をコードする導入遺伝子とを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)を含む、前記医薬組成物。
- 前記免疫療法剤をコードする導入遺伝子が、PD-1またはPD-L1を標的化する抗体をコードする、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記対象が、哺乳動物である、請求項1または2に記載の医薬組成物。
- 前記AAVが、AAV9である、請求項1~3のいずれか一項に記載の医薬組成物。
- 前記AAV9が、AAV9 VP1を含む、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記ペプチド挿入物が、配列番号85を含むAAV9 VP1のアミノ酸588および589に対応する位置に挿入されている、請求項5に記載の医薬組成物。
- 前記がんが、前記対象の脳内にある、請求項1~6のいずれか一項に記載の医薬組成物。
- 前記AAVが非経口送達、脳内、または髄腔内送達によって投与されるように用いられるものである、請求項1~7のいずれか一項に記載の医薬組成物。
- 前記非経口送達が、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、または筋肉内送達による、請求項8に記載の医薬組成物。
- 前記髄腔内送達が、腰椎注射、大槽注射、または実質内注射による、請求項8に記載の医薬組成物。
- 前記方法が、化学療法剤、放射線、および/または外科的切除を前記対象に投与するステップをさらに含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の医薬組成物。
- 前記化学療法剤が、テモゾラミド、ロムスチン、またはそれらの組合せを含む、請求項11に記載の医薬組成物。
- 前記がんが、膠芽腫を含む、請求項1~12のいずれか一項に記載の医薬組成物。
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